CZ247798A3 - Thrombinové mutace a jejich použití - Google Patents

Thrombinové mutace a jejich použití Download PDF

Info

Publication number
CZ247798A3
CZ247798A3 CZ982477A CZ247798A CZ247798A3 CZ 247798 A3 CZ247798 A3 CZ 247798A3 CZ 982477 A CZ982477 A CZ 982477A CZ 247798 A CZ247798 A CZ 247798A CZ 247798 A3 CZ247798 A3 CZ 247798A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
thrombin
seq
mutations
asp
gly
Prior art date
Application number
CZ982477A
Other languages
English (en)
Inventor
Martin Raditsch
Thomas Friedrich
Claus Bollschweiler
Martin Schmidt
Hans Wolfgang HÖFFKEN
Jürgen Schweden
Klaus Rübsamen
Original Assignee
Basf Aktiengesellschaft
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Basf Aktiengesellschaft filed Critical Basf Aktiengesellschaft
Publication of CZ247798A3 publication Critical patent/CZ247798A3/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6424Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12N9/6429Thrombin (3.4.21.5)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/04Antihaemorrhagics; Procoagulants; Haemostatic agents; Antifibrinolytic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21005Thrombin (3.4.21.5)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Description

T h r o m b i n o v e ,m u t a c tec h n j k v
P ř e α 1 ožeň y v v n a i s z s e t y k á n o v e t h ro m bí n o ve m u t a i a j e j í ho použití jako a n t i ď o t p r o i n h i b i t o r y t hr o rnb i n u .
D o s a v a d n i s t a v t e c h n i k v
Antikoagulantv. které působí na principu thrombinove inhibice, získávají pro antithrombozovou praxi na významu, Naléhavým předpokladem pro široké použití antikoagulantů je možnost neutralizovat působení při předávkováni, při rušivém odbourávaní nebo dlouhodobém oddělovaní. aby se tak znemožnily hrozivé vedlejší účinky. jako například krvácení v oblasti oeritonea, perikardu a pleora. Zatímco u heparinu s protamineíranem, polvlysinem a plate letovým faktorem jsou k di sdozic i č t vř i vvsoce účinné a n t i do t v . dosud chybí ant i do t vhodný p r o in h i b i torů.
použití na lidech. k neutralizaci thrombinových literatuře jsou popsaný různé principy anti dotů.
Jako p r in ci p k neutrál i z a c i h i r a d inu dis
aktivovované p 1 a z ma t ické f r a k c e . i ako napři k1
preparáty nebo FE I BA . Z důvodu a k t i v i t y p o d o b n é
však pro neutra 1 i z a c i nevhodné. V i z F a r sed, F e d
A 328, Walenqa Sem. Thromb. Herno st . 19 8 9 , 15, 316
číslo 1
Markwardt popisuje v Thrombosis Research. svazek 74. str. 1 až 23, 1994 použití t hr omb inů a thrombinových derivátů. Příkladem t hr o mb in-2 -mak r o g 1 o b u 1 i nové proto jsou thrombin, komplexy a mei z othrombin. Je také popsáno pro neutralizaci hirudinu použití chemicky inaktivních thrombinů, jako například DFP-thrombinu nebo benzoyl-thrombinu • · • · • · · · « • · « • ♦ · · • · ·· k · · • · · · · • · · « • · · « • * · · ·· ·· • · · ► · ·· » · » «
I · · « ·· ·· lidech z důvodu : k h i r u dinu nevhod; str. 299, M o r i a t a Stone a k o 1 e k t i
1989, 44 0 4 8 až 6' 4 9 ;
y vsak ISO u i a k o a n t i d o t O Γ 0 O 0 u ž i ti n a
c í a k 11 v i t y a až 10 0 0 k r a t íne n 3 i a f í n i t ě
. D o v 1 e v M e t h o d s E n z ymo1 . 6 v a z e R 2 2 o d
Methods E n z ymo i , s v a z e k 8 0 , o d s t r „ 3 0 3 .
i o c h e m i s t r y 1 9 8 7 . 2 6, 4 6 1 7 a ž 4 6 24 ,
44, 1989 .. ‘qí t r , 6 4 8 až 649)
Humánní prothrombín je známý a je popsán Freiznerem a kolektiv (Biochemis t. ry. svazek 22. 19 8 3 , str. 2087 až 2097 ) . Použití aminové kyseliny u humánního prothrombinu je uvedeno také v SE O ID č: 14. V literatuře se nachází různé údaje o thrombinu, přičemž, když není uvedeno nic jiného, po užívá jí se údaje zejména z SE O ID č: 14.
Genovým inaktivní t h r o m b i n svazek 266, č.
inženýrstvím vyrobitelný, enzymaticky je popsán Le n t zem (Lentz a kole k t i v, . J BC, 15. str. 9598 až 9604). Dochází zde k enzymaticky inaktivní thrombinové variante, která nemá žádnou inhibitoru
t i c k v m substrát ům a přírodní mu
1 e k 11 v, J8C . s va z e k 266, číslo
nižší vazební afin i t u vzhledem
d a n s y i a r g i n i n-N-( 3 -e t hv 1 -1 ,5 -·-
k u n a pozici 205 (pozice 525
t a 1yz u za alanin.
( B i o c h a mistr y , s va zek 30. 6392
k thrombinovému oráče S t o n e a
až 6397) j e známá přírodní va r i a n t a t h r o m b i n u q u i c k II.
Thrombin qui c k II se o d 1 i š u i e od p ř (rodního t h r o m b i nu pouze na
poloze 238 ( poloha 558 v SEQ ID č : 14), Zde je mutován oproti
hydr o f o bn i mu z b y t k u va1 i nu g1yc i no vy zbytek 238, vvs k,yt u i ící se
v přírodním t hro mb i nu. Tato nepatrná změna vede k: e zřetelně
redukované štěpí ci skupí ně p r o f i b r i n o g e n (2 % stávající
• · · · » 4 4 » 4 444 • 4 4 « * · · 1 • · 4 4 ·· ·· • · 4 • ·· » 4 4 « » · 4 a • · · ·
4· · 4
44 • •44 · • 4 «
4 4 4
a k t i v i t v’) a 5 o u č a s n e k d r a s t i c k é minimai izaci v a z b y rovněž
n i z k o mo l e kula r n i c h s u b s t. r a t ů . i a k o ž t a k é h i r u d i n u S tone
ukazuje. Ž. Θ v a z e b n í k o n s t a n t a p r o h i r u d i n t é to m u t a c e se
z horši 1 a 0 V i c e n e ž 1 0 0 0 a v y s v ě t 1 u i e tento výs l e d e k s t e r i c k ý m
b 1 o k o v a n i m v a Z 0 bnich ka p e s. i a ko ž tak e κ o n r o r rnn i r e o r g a n i z a c í
okol i akt i vn i ho centra.
Dosud známé thrombinové mutace nejsou jako antidot pro thrombinové inhibitory vhodné, poněvadž mají malou afinitu k thrombinovým inhibitorům nebo velkou vaznost a enzymatickou aktivitu vzhledem k fibrinoaenu.
ř.ř e drně t........vynalezu
Existuje proto úkol připravit nové thrombinové mutace, které jsou více enzymaticky inaktivní, mají dobrou vazbu fchrombi nových inhibitorů a současně váží přírodní substrát f i br i nogen s menší afinitou než nemodifikovaný t hr o mb i n.
Předmětem vynalezu jsou thrombinové mutace, které mají oproti přírodnímu thrombinu následující sekvenční rozdíly:
a) výměna gly po ala, přičemž se gly nachází v sekvenčním okolí tyr-gly-phe a v přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID č : 14) obsazuje pozici 558,
b) alespoň výměna nebo vynechání následujících zbytků, b1) his. ktere se naléza v sekvenčním okolí ala-his-cys a v přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID č: 14) obsazuje pozici 363, b2) asp, které se nalézá v sekvenčním okolí arg-asp-ile a v přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID č: 14) obsazuje • ·
I · · « » · ·· ··· · 4 • · 4 • · · · ·· ·· » · · » · · · · • · · 1 • · · <
·· ·· • · » · · 4 > · ·· » · · 4 » · · 4 • · · · aso-ser-glv a v b3 ) ser. které se nalézá v s ek venč η ím okol p ř i r o d η í rn h u m a η η í m p r o t h r o m b i n u (SEQ ID č : 14) ob s a z u i pozici 525,
Nové thrombinové mutace se mohou vyrobit na základě při rodních t hr o mb i η ú, i a ko j sou thrombi ny z lidí a ji nýc h savců, například primátů, hovězího dobytka, prasat, psa. kočky myši a potkana. Přírodním thrombinem se rozumí polypetidová sekvence, která je charakterizována thrombinovou aktivitou a do organismu vstupuje přírodní cesto u.
Thrombi novými mutacemi se nerozumí přemostěné dvouřetězové molekuly (řetěz A jednořetěz ové molekuly jako prethrombin nebo řetězu B nebo částí řetězu B a/nebo C- terminálem je rozhodující, :
jen d i s u1 f i d e m
B) , nýbrž také
o r o t e i n y, které
přednostně z B
Pro thromb i no vé
j s 0 u ú č i η n é .
sestávají jen řetězů zkrácených Nmutace podle vynálezu respektive je k dispozici vazba thrombinového inhibitoru.
Thrombinové mutace se mohou vyrobit také na základě produktů proteolýzy t h r o m b i n u, například B-thrombin, μ-thrombin, w-thrombin nebo předstupně thrombino, jako prothrombin prothrombinovy meziprodukt nebo také meizothromfoiny, které se potom mohou vhodnými štěpnými metodami, například pomocí faktoru Xa, frakcemi hadího jednu z e c h i s carinatus nebo také oxyranus scutellatas převést na aktivní molekuly thrombinu.
Thrombinové mutace podle vynálezu jsou vhodné k neutralizaci hirud i nu, hirudí nových derivátů nebo jiných thrombi nových inhibitorů.
·· «·
I 4 4 · » 4 44 • · ·· ft 4 4 • · · · · ·· 44 • 4 44
44
I 4 4 « » 4 44
444 4 «
4 «
4· 44
P ř e d n o s t n i i e v v r o fc a ρ o rn o c í g e n o v e h o i n ž e n v r s t V i . P ř i
k te r é se vyrobí g e n o d p o v í d a i í c í pro t h r o ni b i n o v o u m u t a c i
a t e n t o g e n 5Θ £ Xpf i rn u i e d o v h o d n é h o h o s t i t e l s k ě h o o r g a n i s rn u .
No ve t h r o m b i nove mutace ma i i o p r o t. i p ř í rodní m u
t hro mb i n u dvě odliš nos t i , p ř i č e m ž p r v η í o d 1 i š n o s t í j e záměna
g 1 yc i n o ve ho z b y t k u a 1 a n inovým zbytkem. Poloha záměny i e závisíá
na vstupu pří rod n í ho výchozí ho t h r o m b i nu. Jedná se ale
o glycinovou polohu, která se nachází v okolí tyr-gly-phe a která má v přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID č: 14) polohu 558.
Druhá sekvenční odlišnost je buď záměna nebo vynechání zbytku aminové kyseliny na jedné ze tří poloh (his, asp, ser), které tvoří katalytické triády proteázy thrombinu. Těmito polohami jsou u přírodních humánních prothrombinu (SEO ID 6: 14) polohy 363 pro his, 419 pro asp a 525 pro ser. U jiných nehumanních thrombinu mohou v závislosti na délce molekuly, aminové kyseliny před a za příslušnou aminovou kyselinou však je u thrombinu konzervováno, a je proto snadno možné, že přesná poloha zbytku příslušné aminové kyseliny je sekvenčního okolí .
být tyto polohy posunuty Okolí, to znamená u zbytku ; t a n o ve na pomoc i
Thrombinové mutace podle vynálezu katalytické triádě také více změn, tj. substutici. Přednostní jsou thrombinové mutace, katalytické triádě jednotlivé změny.
mohou mí t na vynechání neb o které ma i í na
Přednostní zrněny jsou takové, u substituce aminových kyselin katalytické h i s t i d i n u jsou přednostní hydrofobních aminových kyselin, zbytek, například subst i tuce
A sparta t o v ý nichž se pro v á d í triády. Pro zbytky polárních nebo ejrnéna phe, tyr, ala nebo val .. gin nebo asn, se přednostně ·· ·· · ·
Β · · ·· • · · 1 • · · ·· ·· ·· > · ·· ·· ·· > · · ·
I · ·· ··· · · • · « ·· ·· s u bs t i t u u i e pomo c i d a i s í c h polárních a m i n o výc h kyselin
2 e jmen a př ed n o s t n í i s o u t h r o m b i n o v ť~ m u t a c e , u n i c h ž s e
mění seri n o v ý z b y t e k , z e jrnena subsu t u c i serin u a m i n o v ý m i
k vsel i n a m i ktere nemají žádné hydro x v t 0 V' é s k u p i n v , z e i mé n a
takové, k teré mají podobné prostorové US p o ř a d á n i j a k o ser .
2 e jména je přednostní s u b s t i . t u c e s e r p o a .1 a
Thrombinové mutace se mohou dále
1eoš it ve ve účinnosti dalšími změnami molekuly. Tak je například možné se dále zlepši proteolytická stabilita,. například k umožněni delší doby působeni. K tomu se mohou zaměnit například bazické zbytky arg 393. lys 465. arg 330 nebo arg 382 (SEO ID č: 14) za jiné nebazické aminové kyseliny.
Dalším předmětem vynálezu jsou sekvence kyseliny nukleové. zejména DNA sekvence, které se kódují pro popsané thrombinové mutace. Tyto lze snadno zjistit pomocí zpětného převodu po 1 ype pt i do vé sekvence na odpovídající DNA sekvenci podle genetického k ódu. Přednostně se používají takové kódy,, které vedou v požadovaném hostitelském organismu k dobré expresi.
místně
Sekvence nukleové specifické geneze kyseliny mohou vycházet buď Domoci přírodntch thrombi nových sekvenci nebo se také mohou vyrobit zcela syntetické pomocí DNA syntézy.
Thrombinové mutace podle vynálezu jsou vhodné zvláště jako a n t i d o t. pro thrombinové inhibitory jako h i r u d i η , hirudinove deriváty a nízkomolekulární thrombinové inhibitory.
H i r u d i n y gelu, sestává ,j í c í jsou proteiny prvotně izolované z krevního z 65 aminových kyselin, které se vyznačují extrémně vysokou afinitou k thrombinu (ki
0~ 1 2 mo 1 / 1 ) a ·· ·· > · · «
I · ·· • · · · • · <
·· ··
I ·· • · • ··· • · <
·· ·· ► · · · • · ·· • · · « • · · · ·· ··
v vnikají ' c í s e 1 e k t i v
u k a z u j e j a k při exp
prvotně i z o 1 o v a n ýc h
m u táce a také i z
hirudin ů m s e k v e n č n í
ridinů s e zís k a i í ta k é pocet n é h i ru d ino vé irud i n v, k t eré ma j i oproti př t rod n ím mě n y . Z a h i r u d i n y .jsou proto vedle př í rodníc h hiru d i n u c ha pa ny také takové hirudiny, které nesou jednu nebo vice sekvenčních směna z hi rudo medicinalis na hirudin a mají alespoň stejně velkou afinitu k thrombinu.
Hirudiny jsou lehce přístupné pomocí metod genové techniky. Jejich poločas rozpadu činí u lidi 45 minut.
Také rno d i f i ko vá n a jsou známé deriváty hirudinu Domoci chemické modifikace u kterých byla farmakoki netiká hurudinu. Merkwardt popisuje konjugáty dextranu a hirudin u s prodlouženou 557199 jsou působení.
s dlouhou viz. např
Ve dobou
WO dobou působeni. známé polymerové WO 9515183 jsou působení. 9504823.
Z E P 345616, EP 502962 a E P k o n j u g a t y s dlouhou dob o u popsány hydrofobní deriváty
Rovněž jsou známé h i r ud i n-d i me r y Další thromb i no vé inhibitotry jsou nízkomolekalární thrombinové inhibitory. které jsou například známé z EP 236164. DE 2801478, EP 293881 nebo EP 185390.
thrombi nové inhibitory vvrobené d e s u1f á t o -h i rudí n y, hirudinové i s o u rekombi nantně mutace, hirudiny modfifikováné polymerem, PEG-hirud iny, hydrofobní hirudinu s prodlouženou například dextran-hirudiny, de r i va t i z o va ne dobou působení t r o mb i n y použít k antagonizaci h i r u d i s i η ΰ, hirudiny a mutace Dále se mohou nové zkrácených hirudinu a rovněž d i 1 č í c h hirudinových analogů odvozených od hirudinu a sekvencí.
ako například j e h o nebo
C termina 1 izovaného hi rudinpeptitu. Neutralizovat se mohou také jiné peptidické thrombinové inhibitory, které například byly popsány z organismů sajících krev a potom byly vyrobeny genovým ·· ·· • · · • ·· ( · · «
I · · « ·· ·· ·· «· • · • ··· ·· ·· ( · · · > · ·· ··· · · • · · ·· ·· in žernv r s t v i m a použity k t h e r a p i i i n f e 51 i n .
i a k o n a d ř í k 1 a d r h o d n i n
Pří k1 a d e m neutr a i i z o va t e i ný ch thro m fa ίn o v y ch inhibitorů jsou také syntetické, přednostně nizkomolekulární thrombinové inhibitory. jako například deriváty tripeptidu d-phe-pro-arg, NAPAP, deriváty kyseliny boronové, arginalů nebo benzamido vyc h derivátů. Použití jako ant i dot podle vynalezu je aplikovatelné na všechny uvedené thrombinové inhibitory.
Thrombinové mutace thrombinové inhibitory lépe k neutralizaci thrombi nových podle vynálezu neutralizují než dosud popsané principy inhibitorů. Trombinv podle vynálezu jsou z hlediska použiti při předávkování bezpečné a umožňují proto v situacích naléhavé potřeby a rychlou a účinnou neutralizaci thrombinových inhibitorů.
Thrombinové mutace podle vynálezu jsou k dipozici ve vhodné formě subkutanní, Intravenozní pro parenterální aplikaci, to znamená pro intra mu skulám í nebo intravenozní aplikací, aplikace je přednostní . Eventuálně se mohou thrombinové mutanty aplikovat také jako trvalá infuze. Množství poskytovaného inaktivního thrombinu se volí například podle rozsahu předávkování, tělesné váhy a zvolené formy poskytování. Rozsah předávkování se může zjistit odborníkem před nebo ta k é během použití thrombinu pomocí vhodného testu.
Thrombinové mutace jsou vyrob i tel né pomocí metod genového inženýrství . Přednostní je výroba předběžné formy thrombinové mutace genovým inženýrstvím, analogicky jako prothrombin, ze které Droteolitické aktivace.
se thrombinové mutace uvolní pomocí
Dalším přednostním výrobním způsobem především pro ·· » « • · ··
I · · • · ··· • · · 1 • · · 4 ·· ·· ·· » · · · > · ·· ··· · « • · I ♦ · ·· thrombinové mutace, které sestávají z B-řs-tězu. je exprese genů pro B-řetězy změněné podle vynálezu v mikroorganismech, přednostně v ba k t e r i ich i a k o E. coli.
Získaný produkt exprese musí podle okolností odborník k získání činných molekul thrombinové mutace běžnými metodami renaturovat. Při ex pres i B-ř etěz u v bakteriích se tak é jevila jako výhodná záměna cys-zbytku humánních thrombinech k S-S aminových kvselin. například ser nebo ala který přispívá v přírodních přemostění. za jiné zbytky
.......pro.y e ci e nj vvn ále z u
N ásledující příklady slouží vynálezu, aniž ho však omezují.
k dalšímu objasnění
Prothrombin byl klonován podle publikace Degen a kolektiv. Biochemie 1983, 22, strana 2087 až 2097 z lidských jater c D N A bankou.
Cílenou genezí mutace v thrombinové části byla vyrobena mutace podle vynálezu.
Příklad........1
Výroba Ala 558 prothrombinu.
Cílenou genezí mutace se mutoval kodon GGC pro aminové
kyseliny (a s ) g 1 l yc i n v poloze 558 (SEQ ID č: 14) humánního
prothrombinu na kodon GCC pro as ala.
K tomu byly směru genu a k němu 6 v protismys1 ovém o 1 i gonuk1eot i d komolementární směru s yn t e t i s mys 1 o vé rn SEQ ID č : výměno u
SEQ ID NO:5 ve o 1 igonekleotid z o vány příslušou ·· ·· » · · « » · ·· ·· • · · · • · ·· • 4« · 4 • · « ·· ·· ·· » · « » · · · · » · · 4 » · · 4 »· ·· ·· ·· nukleotidů. Podle 5 konce prothrombingu byl syntetizován ve konec p ri a a v n e e c o R. 1 . P o d 1 e 3 s mys 1 o ve m s mě ru o 1 i g o n u kIeot id SEO ID č : 1 . Tímto bv1 a na 5 p ři po ien a s e kve nc e pro místo restrikéni ho ř e z u konce prothrombingu byl v protismyslovém směru syntetizován ologonukleotid SEO ID NO:2 a tímto byla na 5 konec rovněž p ř i po ) en a sekvence pro místo restrikčního řezu eco R.1 .
S 50 ng humánní ho prothrombinu c D N A jako zák1 a dní ho
materiálu a 5 0 pmo1 o 1 i go s u SEQ ID č: 5 a SEO ID č: 2 byla po
pří dávku 2nM dNTPs. po 1 vme r o vé ho regulátoru a pf u-po1vme r ů
(stratagenu) provedena PCR. r e a k c e s 35 cykly za 1 rn i n . p ř i 9 4
0 C, 2 min. při 55 0 C a 3 min při 7 2 0 C. Příslušně byla
provedena ‘5 © s t e j n ý m z á k 1 a dn í m mater i á 1 e rn a o 1 i gosem SE 0 I D č :
6 a SEQ I D č: 1 druhá PCR. reakce. Oba takto vznikající DNA
f r a grne n t y by 1y vyč i š t ě ny podle s tandardn í ho předpisu (PCR
p u r i f i c a t i o n k i t , 0 u i a g e n H i 1 d e n ) . 0,1 pmo1 obou fragmentů
byly dány dohromady, byly ohřívány po dobu 5 min. na 95 °C k docílení denaturace a 1 hodinu udržovány k renaturaci. K docílení zcela zdvojeného p r o v a z c e DNA bylo po přídavku 2 ηM dNTPs, polymerového regulátoru a pfu polymerů provedeno 10
cyklů po 1 min. a př i 94 0 C a 5 min. při 7 2 0 C K r o Z š i ř e n i
úplného f r a grne n t u bylo k usazenině pro da 1š i P C R reakce i dáno
5 0 pmo1 vně ležíc i h o o 1 i gosu SEQ ID č : 1 a SEQ ID č : a p o
o p ě t o v něm přidav k u pf u polymeru bylo provedeno 35 cykl ů po 1
min. při 9 4 0 C, 2 m i n při 55 0 C a 3 rn i n .. při 7 2 0 C Takt o
vyrobený prothrombi n cDNA se záměnou gly po ala v poloze 558 byl čištěn podle i t a n d ardnih o postupu, dořezán r e s t r i k č n í endonukleazou eco R 1 a klonován T4-ligázou podle standardních předpis ů na vektor B i o t e c h E u r o p e GmbH.
sekvencováno.
pUC 18 řezaný rovněž v eco R.l (Pharmacia Freiburgi. Ke kontrole bylo DMA
Příklad 2
4 • ·
-1144 ·· » · 9 ft 9 999
9 » « » « ·· » · ·· • · 4 9 <
V v r o ba a 1 a 5 ? 5 . 1 a 5 5 3 p i f; t h r o m b i n u
C i 1 e n o u m u t a č n t q e n e z i b v i k o d o n A G T p r o a s s e r
v o olo z e 5 2 5 ( SE( 3 I D č : i 4 ) humá ηo i ho prothr omb i nu m u t o v a η n a
k o d o n tí C T o r o a s ala a k od o n G 6 C p ro a s g1y v polo ze 558 (SEQ
ID č:14) na kodon 6 C C p r o a s ala.
K tomu byl a n a bázi pr o t hr o mb i no vé mutace DMA
z příkladu 1 a o 1 i g o SE 0 ID č : 3 s odpovídaj ící výměnou
nukleotidů na a 1 č i v polo z e 525 ve smyslu genu a r o v n ě ž oligo
SEQ ID č: 2 provedena PC R reakce. P o d m í n k y z k o u š e k o d p o v í d a i i
podmínkám v příkladu 1. Druhá PCR reakce byla provedena s oligo
SEQ ID č : 4 , komplementárním s SEQ ID č: 3, a s 0 ] ligo SEQ ID
č : 1 . Ta k t o d o c í leně DNA fragmenty byly denaturovány.
h y b r i d i s ovány. doplněny na d VO j i t ý p r o v a z e c a pot o rn byla podle
p ř í k 1 a d u 1 provedena další ' PCR reakce s vně lež í c í m o 1 i qosem
SEQ ID č : 1 a SEQ ID č: 2.
Takto vyrobená prothrombin-motace cDNA byla čištěna., dořezána eco R1, klonována na vektor pUC 18 a ke kontrole sekvencována.
Přiklad.......3
Výroba ala 363. ala 558 prothrombinu
Cílenou mutační genezí byl kodon A 6 T pro as his v poloze 363 (SEQ ID č: 14) humánního prothrombinu mutován na kodon GC A pro as ala a codon G6C pro as g1y v poloze 558 (SE O ID č: 14) na kodon GCC p r o as a 1 a.
K t o mu byla na báz
z příkladu 1 a oligo SEQ ID
n u k 1 e o t i d ů na a 1 a v p o 1 . o z e 3 6 3
prothrombinové mutace DMA ó: 10 s odpovídající výměnou ve smyslu genu a rovněž oligo « ·· .5 E 0 ID ·· ·»
B · · » · · · · » · · ·
B · · « ·· ·*
I · · ·
B · ··
B · · « t · · « ·«
I * · « í · ·· • · · « « • · « ·· ·· pr o ve den a P CR re a k e e . Po dm ί n kv p o d m ί n k a m v p ř i k 1 a d u 1 D r u h á P C R r s a k c e b y l a S E 0 ID c : 11, k o m ρ l e m e n t a r n i m s S E 0 I D č : 10 , ó : 1 . T a k t o d o c i i e n & D N A f r a g m e n t y b hybridi so vány, doplněny na dvojitý p r o v a z e c příkladu 1 p r o v e d e n a da 1s t P C R r e akce s vn ě SEQ ID č: 1 a SEQ ID č : 2.
z k o u š s k od o o '! i d a j í p r o v a d e n a s o I i g o a s oligo SE O ID y ! y d e n a t u r o v a n y, a potom byla p o d1e ležícím o 1 i σ o s em
Takto vyrobená prothromb i n-mutáce c DNA byla č i š t é n a .
dořezána ec o R1 , k1 ono vána na v e k tor p U C 18a k e k o n t role
sekvenco vá na
Přiklad 4
Výroba asn 4 1 9 r ala 558 o r o t h r o mb i n u
Cí 1 e no u mutační g e n e z í byl kodon G A C pro as as p
v poloze 419 (SEQ ID č: 14) humánního prothrombinu mutován na kodo n 6CA pro as asn a kodon G6C pro as g 1 y v poloze 558 (SEQ ID č: 14) na kodon GCC pro as ala.
K to mu byla na b á z i prothrombi nové mutace DNA
z příkladu 1 a oligo SEQ ID č : 12 s odpovídá jící výměnou
nukleotid ů n a asn v ρ o 1 o ze 4 19 ve smyslu genu a rovněž oligo
SEQ ID č: 2 p r o ve d e na P C R r e a k c Podmínky zkouše k o d p o v i d a j í
podmínkám v i k1 adu 1 . Druhá PC R r e akce byla p r o v e děna s o 1 i go
SEQ ID č: 1 3 . k o m p 1 e m e n t a r n i m s SEQ ID č: 12, a s oligo SEQ ID
č : 1 . Takto docílené DNA fragmenty byly de na tu r o vány, hybridisovány, doplněny na dvojitý provazec a potom byla podle příkladu 1 provedena další PCR reakce s vně ležícím oligosem SEQ ID č: 1 a SEQ ID č: 2.
Takto vyrobená prothrombinová mutace c D N A byla čištěna. dořezána eco R1, klonována na vektor pUC 18 a ke • · • · • · • · • · ·· ·· ··· • · • · ·· ·· ·· • 4 4 · • · ·· • · · · 9 · · · ·«* ·· ·· «· • · · ·
4 44 • ···· · • · · ·· »*
k o n t r o 1e se k ven c o v á n a .
P ř i k J s d......5
V v r o b a a i a 5 2 5 o r o t h i o m o < n o
C í 1 e n o u mutační genezí bvl kodon AGT pro a s ser
v po 1 o z e 5 2 5 ( SEQ ID č: 14 ) humánního prothrombino mut o v á n na
k o d o n GCT pro a s ala.
K tom u byla na ba z i prothrombinové mutace DNA a o i i go
SEQ ID č: 3 s odpoví d a j í c i výměnou nukleotidů na ala v pe- loze
525 ve s mys 1 u g e n u a r o v n ě ž oligo SEQ ID č: 2 provede ří a P C R.
r e a k c e . Druhá P C R r e a k c e b y 1 a p r o· v e d e n a s o 1 i g o S E 0 I D NO: 4 ,
kompl e rne nt á r n í m s SEQ ID N 0: 3 , a s oligo SEQ ID NO: 1 .. Takto
d o, c i 1 e n é DNA fragment y byly denaturovany, hybridisovány,
d o p 1 n ě n y n as a v o jitý p r o v a z e c a p o t o m b y 1 a prove d e n a d a 1s í P C R
reakce s vn ě lež í c í m o 1 i g o sem SEQ ID NO:1 a SEQ ID NO:2.
Takto vyr o be na pr o t hr o mb i no vá mutace cDNA byla
čištěna. do pr o f i 1 o v á n a e c ci R 1 . klonována na vektor pUC 18 a k e
k o n t r o 1 e sekvencována.
Příklad 6
Konstrukce exp r e s n i c h v ektorů pro humánní prothromb i π o v é
m u t a c e
K sekrecní re ko m bi n a č n i exp r esi v CHO přísa v n ý c h
b u n k á c h bylo na 5 konci c h mutovaného pr o thrombi nu cDNAs (viz..
p ř(klad 1 a ž 5 ) p ř i p o j e n o sekreční vedeni sekvence humánního
t P A g e n u ( P e η n i c a a kol e k t iv. Nátuře 30 1, 2 14 až 22 1, 1983 )..
Když se vy c h á z i z tPA cDNA bylo tPA sekreční vedení cDNA
ro z š í ře no na b a z i PCR reak c e syntetickými oligonukleotidy SEQ
I 0 č : 9 ( 5 ' konec t P A v e d e ní a eco SI místo) a rovněž SEQ ID
• · • · • · • · · · • ·
- 14 ·· ·· ···· · • · · · · · • · ·· ·· ··
č : 8 (3 konec t P A v e d e n í , 5 k o n e c prothrombin u) . 0 1 i g e m 3 E 0
I D č : 7 k o· mole m e n t a r ním s S E 0 í D č : 8 a SEO ID č : 2 b y 1 v
r o z š i ř e n y f r a g m e n t y p r o t h r o rn b i n o v e m u t ace. Fragmenty t P A v e d e n í
b y 1 y p ř i d a n y k fragmentům oro t h r o m b i n o v e mutace. V s á z k a b y 1 a
d e n a t urována, hybridizována a d o p i n é na na dvojit ý pr o vazec
a dalš ί P C R r e a kc í s oligonakleotidy SEQ ID č: 9 a S E O ID č: 2 byla vyrobena tPA prothrombinová mutace DNAs. Tato látka byla řezána eco R. 1 , klonována na pUC 18 a ke kontrole sekvencována.
K expresi do CHO buněk byla tato DNAs vyříznuta z pUC
18, i , z o 1 o v á n a a vpravena do mís t a řezu e c o R. 1 vektoru pc DNA3
n e o ( Invitrogen, S a n D i e g o USA) . T r a n k r i pce prothrombi n u cDNA
j e v tomto vektoru pod kontrolou s i t né ho c yt o me ga 1 i e v i r u s oro-
motoru. Selekce na transf i k o van é buňky se provádí pomoci g e n u
odolného proti neomycinu, ležícího v plasmidu, který dovoluje růst jen kolonií rezistentních ke 6 418.
Před transfekcí byly odpovídající DNAs, které byly určeny pro expresi do CHO buněk, linearizovány restrikčním enzymem pvul, precipovány a sterilně absorbovány v 10 mM trispufru.
Příklad 7
Exprese prothrombinových mutaci v buňkách savců
DNA expresních vektorů buňkách transf i kována 1 i pofektaminem (firma Gibco. Life GmbH, Diese1strasse 5, 76334 Eggstein, SRN, č.
Techno1ogi es 530-8324SA)
Použité buňky byly CHO-K1 (ATCC CCL 61)
293 (ATCC CRL 1573).
2x10s buněk bylo nasyceno v kalíšek kulitivační desky 6-well. Př transfekce. K tomu byly buňky .jednou ml růstového í š t. í den byla vvprány v médiu média na provedena bez séra.
• · • · • · •· ·· ·· ·· ···· · · · · ···· · ··· · ··· • · ··· ·· ·· ··· · · ··· ···· ··· 99 · · ·· · * ·· · ·
T ransfekce lipofektaminem byl a f i r my Gibco (Focus (19 9 3 ) . 15.
obsahoval 1 μ m DNA a 6 μ rn 1 i p o v celkem 1000 μ rn b u n ě č n é h o k u l t hodinové inkubaci při 37 °C by a buňky s normálním růstovým med inkubují přes noc.
p i·' o v e d e n a pod 1 e úd a iů výrobní
3 , 7 3 až 7 8). Kaž d ý kalí š sk
e k t a rn i n u e r ý byl a p 1 i k o vá n
v a č n i h o mé d i a bez s éra . Po 6
O 0 d S 8 t O t r a n s f e k t a č ní médium
e m ( vč e t n ě t e 1 e c t h o sera. F S C)
Přechodná exprese prothromfainových mutací do buněk 293
Buňky 293 jsou udržovaný v DMEM médiu (Gibco č. 41965) a 10 % FCS (Bíowhittaker č. 14601 B) .
provedena. jak je exprese provedena Promega č shora popsáno.
kotransfekce s
E 1 7 1 1 ) . 0,2 μ g prothrombi no ve mutace bylo
Transfekce byla Přitom byla ke zvýšení plasmidem pAdVantage (firma pAdVantage-DNA a 0,8 μ g DNA transfi kováno ve vektoru exprese pcDNAS, jak je shora uvedeno. První den po transfekci bylo odsáto médium obsahující sérum a nahrazeno mediem bez séra (bez fenolové červeně). Třetí den po transfekci byla odebrána buněčná kultura a uložena až k provedení testu při -20 0 C.
Přiklad 9
Stabilní exprese prothrombi nové mutace v
CHO-K1 buňkách
Transfekce byla provedena, jak jsou udržovány a
21331-020) rozštěpeny
Současně a 1 0 takže byla chovány v DMEM/F12 v % F CS. První den po bylo odsáto 20 až 100 zahájena selektáce je shora popsáno. CHO poměru 1:1 (Gibco č. transfekci byly buňky 10 cm Petři ho misek, rekombíno váných buněk • · • · • · • ·
4 » I
4 > · · · ·
Β 4 · 4 4 » 4 4 4
4 4<· zpracováním G4 13 (firma Gibco. 1200 pg/ml v médiu). Získané >·' ez i stent ni kol o n i e s e j edno t i pomocí c 1 on i ng cy 1 i nder “ me t ody a P o k u1ti v a ci s a p r o v ě ř i d o s ožeň í dost a t e č n é h o p o č t u b u n é k pro exp r esi o dpovt da jic i thro mb i nové mut ac e. K t o m u b y1 o médi um odsáto z konfluentních buněk a nahrazeno čerstvým médiem bez sera. Po upiynutí pevné doby, například 24 hodin. 48 hodin, byl odebrán inkubovaný přebytek buněčných kultur a testován pomocí ELISA na ρ ř í t o mno s t pr o t hr o mb i nu.
Získané rekombinované buňky byly částečně k nárůstu exprese klonovány jednocením na mikrotitračnich destičkách.
různých nádobách pro F C S. Následně byly séra/F12-med i um 21765-029, směs dvou, případné změna média k odebrání mutaci prothrombinu. U až 10
K připravení dostatečného množství přebytku buněčné kultury bez sera byly dobře exprimerované CHO buňky pěstovány v kultury až ke ko nf 1 uenc i do média s 10 1¾ buňky prány PBS a inkabovány DMEM bez (DMEM: 6 ibco-Nr. 1 1880-028, F12: Gibco c.
sestává ze stejných objemových podílů). Po třech dnech nastala přebytku buněčné kultury obsahující tohoto druhu by se mohlo odebírat z nádoby pro kultury krát. Různé odběry z různých nádob pro kultury přitom byly k dosažení akceptovalného objemu pro čištění jednoceny.
Přiklad 10
Důkaz exprese rekombinované oothrombinové mutace
Buňky, které vytvářejí prothrombin a ve kterých vzniká médium buněčné kultury, byly testovány na přítomnost rekombinovaného prothrombinu tím, že přebytek buněčné kultury v knfluentních buňkách byl prověřován na přítomnost prothrombinu pomocí ELISA nebo podle štěpení prothrombini na thrombinovou aktivitu, případně thrombinový antigen.
• · • ·· · ·· · · ·· < • ···· · ··· · ··· • ·· · · · · · · · · · · · 1
Κ t ο rn ti b y l o d e b i r a n p o r ů 2 n ě d louh o π d o b u p ř e b y t e k buněčné kultury bez sé.ra. Štěpeni prothrcmbtRU přítomného v ořebvtku buněčné kutturv bvl dosažen Domoci snake './enom (firma
8 8 μ l z k o u š k y !’ p ř s b y t e fc b u něč né k u i t u r y bez s é r .3 nebo pr o · t hr o mb i n )
3 μΐ snake venom ( 0 , 2 mg/ml ve vodě i
0 μΐ pufru (1M NaCl, 100 mM CaCl?, 200 mM tris pH 7,4)
100 μΐ vody
Štěpná vsázka byla 4 b m i n u t. i n k u b o v á n a při teplotě
Následně byl v různých testech charakterizován vznikající thrombi n.
P,ř,í „klad.........1 1
Důkaz prothrombi no vé mutace a thrombinové mutace pomocí ELISA
ELISA ke stanovení prothrombi nu a thrombinu byla provedena podle následujícího schématu:
- mikrotitrační destičky byly převrstveny 0.1 ml/well anitithrombinová protilátka, 5 μ g / m 1 0.05 M
NaHCOz, pH 9,.2, 16 hodin/4 °C.
- nasycení 1 ž; BSA/pbs, 0,3 ml/well, 0.5 až 1 hodina/teplota o k o 1 i
- 3x praní 0,05 % tween 20,/PBS
- 11 standardních zředění humáního prothrombi nu (Calbiochem
605195, 3, 159 NIH U/mg), začíná 10ng/ml 0,1 % BSA/0,05 % tween 20,/PBS ve dvou krocích, souběžně s tím zředěni stanovovaných zkoušek.. 0,1 ml/well, 2 až • · · · · · · · · · * • ···· · ··· · · β · • 4 · ·· · · · · · · · · · · ···· · · · · · · · «*· ·· «« · · ·· · *
-IQ -
4 hodin y/teplota okolí
- práni j a k je s h o r a u v e d e n o
-· 0 , 1 rn i /we 1 1 b i o t i n y l ové a n í i t hr o mbi no v s a n t i 1 á t k y 1 : 2 0 0 .
zředěno v 0, 1 BSA./ 0,05 a t W Θ 6 n 20/PB5. 2 až 4 hodiny/ t e p 1 o t a
o k o 1 í
- praní ) a k j e s h o r a u v e d a n o
- 0 , 1 m 1 ,/ w e 1 1 střep t a v i d i n o v é h o p e r o x i d a s o ve ho komp1e xu ( B . M ..
1089153 ) , zře děno 1 : 10 0 0 0 v 0 , 1 % ESA./0.0 5 % tween 20/ PBS, 3 0
minut ./teplota okolí
- praní jak je shora uvedeno
- 0,1 ml/well peroxidaso veho substrátu
- reakce k o n č i 0,1 rn 1 / w e 1 1 2 M Hz S 0<i
- měření absorpce při 450 nm
Peroxydasový substrát: 0,1 ml TMB roztoku (42mM TMB v DMSO) a 10 ml substrátového pufru (0,1 M octanu sodného pH 4,9) míchání, potom přídavek 14.7 pl 3% Hz 0?
Příklad.......1.2
Výroba antilátky proti humánnímu thrombinu
k r á líci K jak indukci polyklonálních následuje: anti látek byly i mu n i z o vá n y
1 . den 200 pg humánního t hr o mb i nu v 0,5 ml PBS./ ko mp1e t n í ho
F r e u n d s Ad j uvant (S i qrna F588 1)
1 4 . den 2 00 pg hu ma η n i ho t hr o mb i n u v 0. 5 ml PBS./ i n k o mp1e t n í ho
F r e u n ď s Ad j u van t ( S i gma F5506)
28 . den 2 00 pg humánní ho t hr o mb i n u v 0 , 5 ml PBS/ i nkompletního
F r s u n ď s Ad j uvant
42 . den 200 pg humanní ho thrombinu v 0,5 mL PBS
Ssdm dní po poslední imunizaci byl proveden odběr krve
- 1 9 ·· ·· « · · · • · · fl • · · · • · · * · r: v k r á ) i k a ..
C i a t ě n i p o i y k i o n a 1 n i c h a n t i i a t s !· sera by i o provedeno pomoci proteinu Pharmacia) s výtěžkem 65 mg IgG/10 m b y1y proti látky d i a i y z o v βny 0,0 5 M p o tom 2 hodí n v, p ř i teplotě oko 1 i o r κ r a 1 i k a
z. i s k a n e h <
s e p h a r 0 za ( p 0 d i e v ý r 0 b c e
s é r a . P ř e d b i 0 t i n v 1 i z a c i
a H C Cy , d.H 9 , 0 (2x2 1),
řs ba vá n p ř í d a v k e m 2 0 0 μ i
03189, 1 mg / m 1 H.? O) n a
b y i y 3 k. r á t d i a 1 y t 0 v á n y
proti P B S ískaným i protilátkami byl vytvořen sanduich ELISA:
převrstveny 0,1 ml/well qH 9.2. 16 (Calbiochem
- mikrotitrační destičky jsou antithrombínové protilátky 5 pg/l v 0.05 M NaCO· hodin/4 °C
- nasyceni 1 % BS A, 0.3 ml/well, 0,5 hodin/teplota ok o 1 i
- 3x praní 0,05 £ tween 20./PBS
- 11 stardadnich zředěni humánního thrombinn
605195), začínajících 10 ng/ml 0,1 BSA/PBS/0,05 % tween 20 ve dvou krocích, souběžné s tím zředění stanovovaných zkoušek, 01 ml/well, 2 hodíny/pokojová teplota
- praní, j a k je s h o r a u v e deno
- 0,1 ml/well biotinylové antithrombínové protilátky 1:200 se zředí v 1 % BSA/PBS/0,05 % tween 20. 2 hodίny/pokojová teplota
- praní, jak je shora uvedeno
- 0,1 ml/well straptavi di nového 10 8 9 15 3), zředěno '1:10000 na 0,1 minut/teptota okolí
- 0,1 ml/well peroxidasového substrátu ~ reakce se zastaví 0,1 ml/weil 2M Hg SO4
- meření absorbce (OD) při 450 nm.
peroxidasového komplexu (B.M. % BSA/PBS/0,05 X tween 20, 30
Na vyobrazeni je znázorněna absorpce (OD) proti • · · · • · · · • · · · · · • · · 9 9 9
9 9 9 · • 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9
9 · · · · 4 • · · 9 9 9 9
9 9 9999 4 • · · · 9 4
9 9 9 9 9 9 9 thr o m b i n o v é k o n c e n t r a 1
P e r o x i da s o v v s u b s t r a t : o r o m i c h á n o ml T Μ B r o z t o k <42 mři v DMSO) a 10 mí sabstratoweho pufru <0.1 M octanu s o d n e h o . p H 4 . 9 ) . p o t o m p ř t d a v g k I 4 , 7 μ m 3 % H? Cm .
Důkaz prothrombinové mutace a thrombinové mutace pomocí ELISA
ELISA ke stanovení prothrombi nu a thrombinu byla provedena podle následujícího schématu:
- mikrotitrační destičky jsou převrstveny 0,1 ml/well ant i thrombi nové antilátky, 5 μα/1 v 0,05 M NaHCOs , pH 9,2, 16 h o d i n / 4 0 C
..... nasyceni 1 % BSA/PBS, 0.3 ml/well, 0,5 až 1 hodina ./teplota o k o 1 i
- 3x praní 0,05 % tween 20/PBS
- 11 stanrdadních zředění humánního thrombinu (Calbiochem 605195, 3,159 NIH U/rng), začínajících 10 ng/ml 0,1 % BSA/0,05 % tween 20/PBS ve dvou krocích. souběžně s tím zředění stanovovaných zkoušek. 0 1 ml/well, 2 až 4 hod iny/pokojová teplot a
- praní, jak je shoř a uv eden o
- 0,1 ml/well biotinylového antithrombinové protilátky 1:200 se zředí v 1 % BSA/PBS/0,05 % tween 20, 2 až 4 hod iny/pokojová t e p 1 o t a
- p r a ní, jak je shoř a u v e d e n o
- 0,1 ml/well straptavidinového peroxidasového komplexu (B..M. 10 89153), zředěno 1:1000 0 v 0,1 % BSA/0,0 5 tween 20/PBS, 30 minut/teplota okolí
- praní, jak je shora uvedeno
- 0,1 ml/well peroxidasového substrátu
- reakce se zastaví 0,1 ml/well 2M H? SΟμ meření absorbce (OD) při 450 nm.
4 • 4 4 4 4 · · • 4444 4 444 4 4 · 4 » · » «·· 44 44 4444 4 ««44 4444 4 4 4 ·· 44 4 4 44 44 44
P e r o x i d a s o v y s u b s t r á t. : p r o m i c h a n o 0 ,1 ml TMĚ· roztoku
(42 m M TBM v DMSO) a 10 ml substrátového pufru (0,1 M o c t a n u
sodného. p H 4,9), potom p ř í dávek 14,7 μπι 3 % Hz O? .
P ř í k 1 a d 1 3a
Čištění humánního thrombinu z krevní plazmy
Čištění humánního prothrombinu z humánní citratplazmy se provedlo iak popisuje HenriRson (Methods in Enzymology, svážel 222, str. 312 až 3279), Štěpení prothrombinu a čištění thrombinu se provádí heparinchromatografiί, jak je uvedeno v příkladu 14 a 15. Frakce obsahující thrombin byly zjišťovány pomocí chromogenní thrombinové zkoušky pomocí S 2238 a podrobeny ultrafiltraci na 1 mg/ml a dias filtraci pomocí PBS..
Stanovení thrombinové aktivity pomocí chromogenního substrátu S 2238
Aktivita thrombinové mutace tripeptidu. K tomu se postupuje podle pipetování:
se zjistí štěpením následujícího schématu μΐ zkoušky (thrombin 0,5 U/ml, různých zředěních)
0 μ 1 Hz O
0 μ 1 S-2238 (1 mg/ml v Hz O,
Švédsko).
nebo štěpený prothrombin v firma Chromogenix, Molndal,
Vsázky Nakonec se měří množství se z ji
U/ml .
se odstaví adsorpce při šťuje pomocí až 15 min. při teplotě 37 0 C. vlnové délce 405 nM a trombínové kalibrační křivky mezi 0,01 a 1 • · · · • · • · «
-99 Příklad 13b
Čištění prothrombi nové mutace pomocí chromatografie výměny a η i o n ů
5 1 přebytku.buněčné kultury, obsahující prothrombin, se nejprve koncentruje pomocí ultrafi 1trace při 4C (SPS 400 membrána. Fresenius, St. Wendel) na 400 ml a diafiltruje pomocí 10 mM tris pH 7,5 až vodivost činí 1,1 mS/cm. Demineralizovaný filtrát se potom umístí na FF sloupec 0 separace (průměr 5 cm, objem 530 ml) s průtokem 6 m1/m i η., sloupec se o mí vá pufrem (20 mM tris/HCl pH 7,5) a následně se vyvíjí s gradientem podle 400 mM NaCl přes 15 objemů sloupců. Frakce obsahující prothrombin se identifikují pomocí ELISA. Prothrombi nová mutace eluuje 280 mM NaCl. 2 tohoto sloupce se izoluje 150 až 200 mg proteinu.
P ři.k 1 ad........1.4.
Uvolnění thrombinové mutace z prothrombinu
Chromátoarafi cké frakce O separace koncentrující amicon YM 30 (20ml koncový objem, dial i zují 2 litry 20mM tris/HCl
175 mg celkového proteinu) se pH 7,5, 100 mM NaCl a pro
štěpení se pří d a v k e m 1 M CaCl2, 20 mM tris p H 7,5 nastaví na
koncovou koncentraci 1 0 mM. Po př í da vku 3 0 mg hadího jedu
z oxyranus scutellatus s e při 4 0 C z a mí chání štěpí a reakce
po 12 hodinách ukončí př í davkem 2 ml 20 mM roztoku EGTA, pH
7.5.
Příklad 15
Čištění thrombinové mutace heparinovou chromatografií
Štěpená vsázka z příkladu 14, obsahující thrombin se • · • ·
7,5, se vyvine přes 150 ml mutace se potom zjišťují následně umístí na sloupec heparinové separace (14 cm x 1 cm, Pharmacia) s průtokem 38 cm,/hod. Po omytí sloupce 20 ml 20 mM fosforečnanu sodného, 0,1 Μ NaCl p H
0,01 ® pluriolu F68. Thrombinové pomocí ELISA. Mutace se eluují při 400 mM NaCl. Získalo se 30 až 35 mg mutace a po přídavku BSA (1 mg/ml) bylo dialyzováno pomocí PBS 0,01 % pluriolu F68 a bylo uloženo při
Příklad 16
Neutralizace hirudinu v in vitro systému
Antidotové působení inaktivních rekombinovaných thrombinů na hirudin bylo prokázáno v testu thrombinové aktivity. K tomu byly hirudin, testovaná thrombinové mutace, aktivní t hr o mb i n a S-2238 navzájem i nkubovány. Tento test spočívá v neutralizaci hirudinu pomocí testovaného inaktivního thr o mb i nu thrombinu z toho vyplývající vyšší aktivitě aktivního
K tomu bylo provedeno následující pipetační schéma:
100 μΐ hirudinu HL.20 (1,5 U/ml ) , případně 0,1 % BSA v TES pH 7,5 a 100 μ 1 thrombinové mutace (vyrobené v příkladu 2) bylo inkubováno po dobu 5 minut při teplotě okolí. Po přídavku 50 μΐ aktivního thrombinu (0,5 U/ml) byla přídavkem 50 μΐ S-2238 (1 mg/ml ve vodě. Firma Chromogenix, Mólndal, Švédsko) zahájena reakce. Vsázka byla odložena po do dobu 15 minut při teplotě 37 0 C. Následně byla : měřena absorpce při vlnové délce
410 nm. Neutralizace hirudinu inaktivní thrombinovou mutací vedla ke zvýšení absorbce.
Příklad 1?
- 24 • ft ·· ftft ftft ftft • ftft ···· ···· • ···· · ftftft · ftftft «··· ···· ·· • ft ftft ·· ·· · · ft·
Neutrál i z a c e PEG hirudinu v p s o v i .
Na psy rasy b e a g 1 e (9,8 až 13, 5 kg) by) l a p 1 i kován
s u b k u t a η η i P EG hi rudi n v dávce 10 mg/kg. 180 mi n u t po i n i e k c i
PEG hirudinu byla a p 1 i kována thrombinová mutace vyrobená podle
příkladu 2 jako i ntráveno z n i i n f u se s dávkován í m 2 0 g /kg p o
dobu 5 0 min. Krevní zkoušky byly psum odebrány punkc í v. brachialis na začátku experimentu a další zkoušky byly odebrány po 150 v časovém intervalu až 6 hodin. Z krevního citranu byla získána centrifugací 2000 g po dobu 20 min. plazma a byla uschována na analýzu při - 20 °C.
Ve zkouškách plazmy byly stanoveny antithrombi nové aktivity, jako popisuje Spannagel a kolektiv, Bio od Coagulation Fobri no 1ysis, 1991. 2, 121 až 127. Ant ikoagu1ační aktivita byla stanovena pomocí systému s pathromtinem (Behring).
Výsledky jsou shrnuty v tabulkové části. Tím, že v kontrolovaných zvířatech antithrombi nová aktivita po aplikaci PE6 hirudinu rapidně narůstá, může se ve zvířatech ošetřovaných antidotem zabránit antithrombi nové aktivitě. Po ukončeni antidotové infuze narůstá dále hladina PEG hirudinové plazmy srovnatelně s kontrolovanými zvířaty. Kvalitativně shodný průběh je pozorován také u aPTT.
• · · 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 99 9 9 99 9 9 99 • · · 9 · · 9 9 9 9 999 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
SEKVENČNÍ protokol (1) OBECNE INFORMACE (i) PŘIHLAŠOVATEL
( A) JMÉNO : BASF a , s .
( B) ULICE : Carl-Bosch-Strasse 38
( C) MI STO : L u d w i g s h a f e n
( E ) ZEMĚ : Spolková republika Ně me c ko
( F ) PSČ: 67056
(G) TELEFON: 0621/6048526
( H) TELEFAX: 0621/6043123
( I ) TELEX : 1762175170
(i i) PŘIHLAŠOVANÝ NÁZEV: Nová thrombinové mutace a její použití jako a n t i d o t (iii) POČET SEKVENCI: 14
TYP POČÍTAČE
( A) NOSIČ DAT : floppy disk
( B) POČÍTAČ: kompatibilní IBM PC
(C) PRACOVNÍ SYSTÉM: PC-DOS./MS -DOS
( D) SOFTWARE: PatentIn Re 1ease 1 . 0
(2) INFORMACE K SEQ ID č (i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
( A) DÉLKA: 33 báz ických párů
( B) TYP: kyselina nukleinová
(C) TVAR PROVAZCE : j e d n o t 1 i v
( D) TOPOLOGIE: li n e á r n f
(ii) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS • · • · ·
- 26 • · • · ·· • · · · · · · · · • · ·· ·· ·· · · (iii) HYPOTETICKY: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID c: 1:
GGGGGGGAAT TCGCCAACAC CTTCTTGGAG GAG (2) INFORMACE K SEQ ID č: 2:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 33 bazických párů (B) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární (i i) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS (iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ANTISENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 2:
GGGGGGGAAT TCCTACTCTC CAAACTGATC AAT (2) INFORMACE K SEQ ID č: 3:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 40 bazických párů (B) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární (i i) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS • · · ·
(iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ANTISENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEO ID č: 3:
GGATGCCTGT GAAGGTGACG CTGGGG6ACC CTTTGTCATG (2) INFORMACE K SEQ ID č: 4:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
( A) DÉLKA: 40 bazických párů (B) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR PROVAZCE: jedotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární
TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS (iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ANTISENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEO ID č: 4:
CATGACAAAAG GGTCCCCCAG CGTCACCTTC ACAGGCATCC (2) INFORMACE K SEQ ID č: 5:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 40 bazických párů (B) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární
• · · · · · · • · · · ···· · • · · · · · «· ·· ·· · · (ii) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS (iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ANTISENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 5:
GACCGGGATG GGAAATATGC CTTCTACACA CATGTGTTCC (2) INFORMACE K SEQ ID č: 6:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 40 bazických párů (B) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární
TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS (iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ANTISENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 6:
G6AACACATG TGTGTAGAAG GCATATTTCC CATCCCGGTC (2) INFORMACE K SEQ ID č: 7:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 40 bázických párů (B) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý ·· toto ·· β· ·· »·· ···· · · to · » ···· · to · to · · · · (D) TOPOLOGIE: lineární (i i) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS ( i i i ) HYPOTETICKY: ne (iii) ANTISENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 7:
TCCAT6CCCG ATTCAGACGC GCCAACACCT TCTTGGAGGA (2) INFORMACE K SEQ ID č: 8:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 40 bazických párů (B) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR. PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární (i i) TYP' MOLEKULY: cDNS k mRNS (iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ANTISENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEO ID č: 8:
TCCTCCAAGA AGGTGTTGGC GCGTCTGAAT CGGGATGGA (i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 27 bazických párů (2) INFORMACE K SEQ ID č: 9:
(B) TYP: kyselina nuk 1e i nová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární
(i 1 ) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS
( i i i ) HYPOTETICKY: ne
( i i i ) ANTISENSE: ne
(xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 9:
GGGGGGGAAT TCGTAAGCA ATCATGG (2) INFORMACE K SEQ ID č: 10:
SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA: (A) DÉLKA: 30 bazických párů (B) TYP: kyselina nuklsinová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární
TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS
HYPOTETICKY: ne
ANTISENSE: ne
SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 1 0
CTCACCGCCG CCGCATGCCT CCTGTACCCG (2) INFORMACE K SEQ ID č: 11:
-31·· ·· ·· ·· ·· ··· · · · · ···· • ···· · ··· · · · · • · · ··· · · · · ··· · · ···· · · · · ··· • · · · · · ·· · · ··
SEKVENČNÍ CHARAKTERIŠTIKA:
(A) DÉLKA: 30 bazických párů ( B) TYP: kyselina nuk 1s i no vá (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOP OLOGIE: lineární
TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS (iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ΑΝΤΙSENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 11
CGT6TACAGG AGGCACACGG CGGCGGTGAG (2) INFORMACE K SEQ ID č: 12:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 27 bazických párů ( 8) TYP: kyselina nukleinová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární (i i) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS (iii) HYPOTETICKY: ne (iii) ΑΝΤΙSENSE: ne (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 12:
GAACCTGGAC CGGAACATTG CCCTGAT
- 32 4 4 ·4
444 4444 4444
4444 4 444 4 444
4 · · · 4 44 44 444 · 4 · · 4 4444 444
( 2) INFORMACE K SEO ID č: 13:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA: (A) DÉLKA: 27 bazických páru (B) TYP: kyselina n uk1e i nová (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: lineární
(i i) TYP MOLEKULY: cDNS k mRNS
( i i i) HYPOTETICKY: ne
( i ii) ANTISENSE: ne
(xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 13:
ATCAGGGCAA TGTTCCGGTC CA6GTTC (2) INFORMACE K SEQ ID č: 14:
(i) SEKVENČNÍ CHARAKTERISTIKA:
(A) DÉLKA: 579 aminových kyselin (B) TYP: aminová kyselina (C) TVAR PROVAZCE: jednotlivý (D) TOPOLOGIE: 1 i neární
TYP MOLEKULY: protein (vi) PŮVOD VZNIKU:
(A) ORGANISMUS: homo sapiens (xi) SEKVENČNÍ POPIS: SEQ ID č: 14:
ala asn thr phe leu glu glu val arg lys gly asn leu glu arg glu ·· ··
I · · I
I · · · ·· · · « • 9 «
- 33 10 15
5 ·· ·· • · · I • · ··
c y s va 1 g 1 u g i u 20 t hr c ys s e r tyr g 1 u 25 g 1 u a 1 a phe g 1 u a 1 a 30 l e u g 1 u
s e r ser thr a 1 a t hr 3 S p va 1 phe trp a 1 a i ys tyr thr a l a o ys g 1 u
3 5 4 0 45
t h r a 1 a arg thr pro arg a s p 1 ys 1 e u a 1 a a 1 a c ys 1 e u g i u g i y asn
50 55 60
c ys a i a g 1 u g i y 1 e u g 1 y t hr asn t yr er g g l y h i s va 1 asn i 1 e t hr
65 70 75 80
arg ser g i y i 1 e g 1 u c ys g 1 n 1 e u trp arg ser arg t yr pro h i s 1 ys
85 90 8 5
p r o g 1 u i 1 e asn ser t hr t hr h i s pro g i y a 1 a asp 1 e u g 1 n g 1 u asn
100 105 1 1 0
phe g 1 u arg asn pro a s p ser ser t hr thr g i y pro trp c ys tyr thr
1 1 5 120 125
t hr a s p pro t hr va 1 arg arg g 1 n g 1 u c ys ser i 1 e pro va 1 c .ys g i y
1 3 0 1 3 5 140
g 1 n a s p g 1 n va 1 thr va 1 ala me t thr pro arg ser g 1 u g i y ser ser
1 45 150 155 1 6 0
v a 1 asn 1 e u ser pro pro 1 e u g i u g 1 n o v s va 1 pro asp arg g 1 y g 1 n
165 170 175
'3 1 n t yr g 1 n g i y arg 1 e u a 1 a va 1 t hr thr h i s g i y 1 e u pro cys 1 e u
180 185 190
a 1 a trp a 1 a ser a 1 a g 1 n a 1 a 1 ys a 1 a 1 e u ser i ys h i s g 1 n asp phe
1 95 200 205
asn ser a 1 a v a 1 g 1 n 1 e u va 1 g 1 u asn phe c ys arg asn pro asp g 1 y
2 1 0 2 1 5 220
a s p g 1 u g 1 u g t y va 1 trp c ys t yr va 1 a 1 a g i y i ys pro gi y asp phe
225 230 235 240
g l y tyr c ys a s p 1 e u í3 3 Π t yr cys g l u g 1 u a 1 a va 1 g l u g 1 u g 1 u t hr
245 250 255
g i y a s p g 1 V 1 e u a s p g 1 u asp ser asp arg a 1 a i 1 e g 1 u gi y arg thr
260 265 270
99 » 9 9 «
I · · ·
9 9 4 • · « • 9 9 9
a 1 a thr ser 2 7 5 g 1 u g 1 n g 1 n thr phe 280 phe a s n pro a r g thr 285 phe g i y ser
g 1 y g 1 u a 1 a asp c ys g i y 1 e u arg pro 1 e u phe g 1 u i ys 1 ys s e r 1 e u
290 295 300
g 1 u asp 1 ys t hr g 1 u arg g 1 u 1 e u 1 e u g 1 u ser tyr i 1 e asp 9 i y a r g
305 3 1 0 3 1 5 320
i 1 e va 1 g 1 u g i y ser asp a 1 a g 1 u i 1 e g i y me t ser pro trp g 1 n va 1
32 5 330 335
me t 1 e u phe arg 1 ys ser pro g 1 n g 1 u 1 e u 1 e u c ys g i y a 1 a ser 1 e u
340 345 350
i 1 e ser asp arg t r p va 1 1 e u thr a 1 a ala h i s c ys 1 e u 1 e u t yr p r o
355 360 365
pro trp asp 1 ys a s n phe t hr g i u a s n asp 1 e u 1 e u va 1 arg i 1 e g i y
370 375 380
i ys h i s ser arg t hr arg t yr g 1 u arg asn i 1 e g 1 u i ys i 1 e ser me t
3 3 5 390 395 400
1 e u g 1 u 1 ys i 1 e t yr i 1 e h i s pro arg t yr asn trp arg g 1 u asn 1 e u
405 4 1 0 4 1 5
3 Sp arg asp i 1 e a 1 a 1 e u me t i ys 1 e u i ys 1 ys pro va 1 a 1 a phe ser
420 425 430
asp t yr i 1 e h i s pro va 1 c ys 1 e u pro asp arg g 1 u thr a 1 a a 1 a ser
435 440 445
1 e u 1 e u g 1 n a 1 a g 1 y tyr 1 ys g i y arg va 1 t hr g 1 y trp g i y asn 1 e u
450 455 460
1 ys g 1 u t hr trp t hr a 1 a asn va 1 g i y 1 ys g 1 y g 1 n pro ser va 1 1 e u
4 6 5 470 475 480
g 1 n va i va 1 asn 1 eu pro i 1 e va 1 g 1 u arg pro va 1 c ys 1 ys asp ser
4 85 490 495
t hr arg i 1 e arg i 1 e t hr asp asn me t phe c ys a 1 a g i y t yr 1 ys pro
500 505 5 1 0
asp g 1 u g 1 y 1 ys arg g i y asp a 1 a c ys g 1 u g i y asp ser g i y g l y p r o
5 1 5 520 525
phe va 1 me t 1 ys ser pro phe asn asn arg trp tyr g 1 n me t g i y i .1 e
530 535 540 ·· ·· ·· 99 99
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 99 9 999 9 999
99 999 99 99 999 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 99
-35 va 1 ser trp g1y 5 45 thr his val phe
P he g1y glu glu gly cys asp 550 arg leu lys lys 555 arg asp gly lys 5 5 5 trp i 1e gin 1ys 570
tyr g'y phe t y r
56 0
va 1 i i e a s p 575 g 1 n
JUDr. Petr KALENSKÝ advokát > , z /'^· +
SPOLEČNÁ ADVOKÁTNÍ KANCELÁŘ VŠETEČKA ZELtNV ČVORČÍK KALENSKÝ A PARTNEŘI
120 00 Praha 2, Hálkova 2 Česká republika • · • · « 9
PATENTOVÉ ·· 99 ·· • · · ···· 9 9 9 9 • 9 999 9 999 9 999 • 9 9 9 9 9 9 9 9 9 999 9 ·
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 ·· 99 99 99 99 99

Claims (1)

1. Thrombinové mutace vyznačující se tím, že mají oproti přírodnímu thrombinu následující sekvenční odlišnosti:
a) výměna gly po ala, přičemž se gly nachází v sekvenčním okolí tyr-gly-phe a v přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID č: 14) obsazuje pozici 558,
b) alespoň výměna nebo vynechání následujících zbytků, b I ) his, které se nalézá v sekvenčním okolí ala-his-cys a v přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID č: 14) obsazuje pozici 363, b2) b3 ) asp, které se nalézá v sekvenčním okolí přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID pozici 419, sér, které se nalézá v sekvenčním okolí přírodním humánním prothrombinu (SEQ ID arg-asp-ile a v č : 14) obsazuje asp-ser-gly a v č: 14) obsazuje pozici 525.
Thrombinové mutace podle nároku 1, vyznačující se tím, že oproti přírodnímu humánnímu prothrombinu (SEQ ID č: 14) mají následující sekvenční odlišnosti:
a) výměna gly po ala na pozici 558 čí
b) alespoň jedna výměna nebo vynechání následujících z byt ků
b1 ) h i s na pozici 363 b2) asp n a pozici 4 1 9 b3) ser na pozici 525
·· ·· • · · ·· ·· ·· ·· • · · · ···· • · · · · • · ·· ···· · ·· ·· ·· ·· ·· ·· - 37 - Thrombinové mutace podl e nároku 2. vyznačující se tím, že sekvenčním rozdílem je v y měna na pozic: i 525 . Thrombinové mutace podl e n á r o k u 3. vyznačující se tím, že sekvenčním rozdílem ie vymě na ser- oo a l 1 a . Sekvence nukleinové ky seliny kódují c í t hr o mb i novou mutac i podle nároku 1 až 4. Použití thrombi nových mutací podle nároku 1 a z 4 př i ošetřováni poruch sráží i vo s t i krve.
Použití podle inhibitory. nároku 8 jako antidot pro t hr o mb i nové Použití podle nároku 7 jako hirud i nové mutace nebo hirudí nové antidot de r i váty. pro hi r ud i ny, Použití podle nároku 8 jako antidot pro hirudinové deriváty, které jsou modi f i kované po 1 ye t h.y 1 e n g1yk o 1e m.
Antidot pro thrombinové inhibitory, obsahující thrombinovou mutaci podle nároků 1 až 4 s farmaceuticky obvyklými pomocnými látkami.
CZ982477A 1996-02-12 1997-02-11 Thrombinové mutace a jejich použití CZ247798A3 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19605126A DE19605126A1 (de) 1996-02-12 1996-02-12 Thrombinmuteine als Antidot für Thrombininhibitoren

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ247798A3 true CZ247798A3 (cs) 1999-03-17

Family

ID=7785198

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ982477A CZ247798A3 (cs) 1996-02-12 1997-02-11 Thrombinové mutace a jejich použití

Country Status (18)

Country Link
US (1) US6060300A (cs)
EP (1) EP0880591A1 (cs)
JP (1) JPH11512621A (cs)
KR (1) KR19990082479A (cs)
CN (1) CN1211280A (cs)
AR (1) AR005797A1 (cs)
AU (1) AU1768497A (cs)
BR (1) BR9707280A (cs)
CA (1) CA2245546A1 (cs)
CO (1) CO4600682A1 (cs)
CZ (1) CZ247798A3 (cs)
DE (1) DE19605126A1 (cs)
HR (1) HRP970077A2 (cs)
HU (1) HUP9900574A2 (cs)
IL (1) IL125077A0 (cs)
NO (1) NO983677D0 (cs)
WO (1) WO1997029198A1 (cs)
ZA (1) ZA971107B (cs)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20000018933A (ko) * 1998-09-07 2000-04-06 김승수 내피세포 성장억제 활성을 가지는 사람 프로트롬빈 크링글단백질 및 이를 암호하는 유전자
GB2355161B (en) * 1999-10-05 2001-09-12 3Com Corp Network device incorporating selective compression of stored data packets
KR20020008471A (ko) * 2000-07-20 2002-01-31 김승수 내피세포 성장 억제활성을 가지는 인간 프로트롬빈크링글, 그것의 재조합벡터 및 이를 발현하는 재조합 숙주
EP2407561A3 (en) * 2006-03-06 2012-05-30 Humagene, Inc. A method for the preparation of recombinant human fibrinogen
CN102559644B (zh) 2007-09-28 2015-03-25 普托拉制药有限公司 用于因子xa抑制剂的解毒剂和其使用方法
NZ592837A (en) 2008-11-14 2012-10-26 Portola Pharm Inc Antidotes for factor xa inhibitors and methods of using the same in combination with blood coagulating agents
EP2414517B1 (en) 2009-03-30 2016-09-21 Portola Pharmaceuticals, Inc. Antidotes for factor xa inhibitors and methods of using the same
JP6163304B2 (ja) 2009-07-15 2017-07-12 ポートラ ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 第Xa因子インヒビターの解毒剤の単位用量処方物およびその使用方法
EP2316931B1 (de) * 2009-10-30 2016-12-28 Senova Gesellschaft für Biowissenschaft und Technik mbH Polymergekoppelte Peptidasen
TWI513466B (zh) 2010-01-20 2015-12-21 Boehringer Ingelheim Int 抗凝血劑解毒劑
AP2013007046A0 (en) 2011-03-30 2013-08-31 Boehringer Ingelheim Int Anticoagulant antidotes
JP6640198B2 (ja) 2014-05-26 2020-02-05 アカデ−ミッシュ ズィーケンハウス ライデンAcademisch Ziekenhuis Leiden 出血治療のための止血促進タンパク質

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE4203965A1 (de) * 1992-02-11 1993-08-12 Max Planck Gesellschaft Antidot fuer hirudin und synthetische thrombininhibitoren

Also Published As

Publication number Publication date
AR005797A1 (es) 1999-07-14
IL125077A0 (en) 1999-01-26
CO4600682A1 (es) 1998-05-08
HRP970077A2 (en) 1998-04-30
HUP9900574A2 (hu) 1999-06-28
US6060300A (en) 2000-05-09
AU1768497A (en) 1997-08-28
EP0880591A1 (de) 1998-12-02
CN1211280A (zh) 1999-03-17
ZA971107B (en) 1998-08-11
BR9707280A (pt) 1999-07-20
JPH11512621A (ja) 1999-11-02
KR19990082479A (ko) 1999-11-25
NO983677L (no) 1998-08-11
WO1997029198A1 (de) 1997-08-14
NO983677D0 (no) 1998-08-11
CA2245546A1 (en) 1997-08-14
DE19605126A1 (de) 1997-08-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN100537770C (zh) 酶切范威尔邦德因子(vWF)的蛋白酶
CZ298298B6 (cs) Analogy faktoru X s modifikovanými štepnými místyproteas, preparáty tyto látky obsahující, jejich použití a zpusob jejich výroby
KR20010031370A (ko) 변형된 비타민 k-의존성 폴리펩티드
MX2011001351A (es) Anticuerpos monoclonales contra el inhibidor de la via del factor tisular.
NO175066B (no) DNA-konstruksjon, plasmid og fremgangsmåte for ekspresjon av faktor VII og IX aktiviteter i pattedyrceller
CZ286046B6 (cs) Přípravky na bázi analogů erythropoietinu a způsoby jejich přípravy a farmaceutické přípravky s jejich obsahem
JPH05508150A (ja) 酸化抵抗性トロンボモジュリン類縁体
CZ247798A3 (cs) Thrombinové mutace a jejich použití
CZ298296B6 (cs) Delecní mutanty faktoru X a jejich analogy
KR100983878B1 (ko) 유전자 재조합 기술에 의한 인간 트롬빈 제조 방법
JPH04505554A (ja) 可溶性トロンボモジュリン類似体
RU2183214C2 (ru) Природный и рекомбинантный ингибиторы тромбина, их получение и применение
AU741798B2 (en) Recombinant protein C and protein S variants
WO2007040162A1 (ja) 培養細胞による組換えヒトトロンビンの製造方法
Sinha et al. Expression, purification, and characterization of inactive human coagulation factor Xa (Asn322Ala419)
US20150337284A1 (en) Factor ix variants
JPH11341990A (ja) 高純度可溶性トロンボモジュリンの製造方法
BLOM et al. Intracellular coupling of bikunin and the heavy chain of rat pre-α-inhibitor in COS-1 cells
US8088372B2 (en) Thrombin mutant
Miyata et al. Chemical cross-linking of activated coagulation factor VII with soluble tissue factor: calcium ions are not essential for full amidolytic activity of the factor VIIa-tissue factor complex after complex formation
KR20000047835A (ko) 혈액 응고 인자 및 p-셀렉틴의 dna 작제물
Stenberg Expression and characterization of a recombinant human factor x/protein c chimeric protein
Côté Studies of structure-function relationships in two human coagulation proteins: factor XII and prothrombin
CZ20004422A3 (cs) Polypeptid lidský protein C
MXPA99007768A (en) Factor x analogues with a modified protease cleavage site

Legal Events

Date Code Title Description
PD00 Pending as of 2000-06-30 in czech republic