HRP970077A2 - Thrombin muteins as antidotes for thrombin inhibitors - Google Patents

Thrombin muteins as antidotes for thrombin inhibitors Download PDF

Info

Publication number
HRP970077A2
HRP970077A2 HR19605126.6A HRP970077A HRP970077A2 HR P970077 A2 HRP970077 A2 HR P970077A2 HR P970077 A HRP970077 A HR P970077A HR P970077 A2 HRP970077 A2 HR P970077A2
Authority
HR
Croatia
Prior art keywords
thrombin
seq
prothrombin
sequence
mutant
Prior art date
Application number
HR19605126.6A
Other languages
English (en)
Inventor
Martin Raditsch
Thomas Friedrich
Claus Bollschweiler
Martin Schmidt
Hans Wolfgang Hoeffken
Juergen Schweden
Klaus Ruebsamen
Original Assignee
Basf Ag
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Basf Ag filed Critical Basf Ag
Publication of HRP970077A2 publication Critical patent/HRP970077A2/hr

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6424Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12N9/6429Thrombin (3.4.21.5)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/04Antihaemorrhagics; Procoagulants; Haemostatic agents; Antifibrinolytic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21005Thrombin (3.4.21.5)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Description

Predloženi izum odnosi se na nove mutante trombina, njihovu proizvodnju i njihovu upotrebu kao antidota za inhibitore trombina.
Antikoagulanti, koji djeluju na načelu izravnog suzbijanja trombina, dobivaju sve veći značaj za terapiju protiv tromboze. Nužna pretpostavka za široku primjenu antikoagulanata je mogućnost neutralizacije djelovanja kod prekomjernog doziranja, poremećajne razgradnje ili produljenog izlučivanja, da bi se tada zaustavilo opasna hemoralgijska sporedna djelovanja, kao npr. krvarenja u području peritoneuma, perikarda, pleure. Dok kod heparina s protaminsulfatom, polilizinom i platelet faktorom 4 stoji na raspolaganju vrlo učinkovit antidot, za primjenu na ljudima još uvijek nedostaje prikladni antidot za neutralizaciju inhibitora trombina.
U literaturi su opisana različita načela antidota. Fareed raspravlja o aktiviranim plazma frakcijama kao npr. pripravcima autokompleksa, ili FEIBA, kao načelu neutralizacije hirudina. Međutim, zbog djelovanja sličnog tromboplastičnosti, oni nisu prikladni za neutralizaciju. (Fareed, Fed Proc 1989; A 328; Walenga Sem. Thromb. Hemost. 1989; 15: 316-333).
Markwardt (Thrombosis Research, Vol 74, br. 1, str. 1-23, 1994) opisuje upotrebu trombina i derivata trombina. Primjeri za to su kompleksi. trombina, trombin-2-makroglobulina i meizotrombin. On također se opisuje upotrebu kemijski inaktiviranog trombina, kao npr. DFP-trombina ili benzoil-trombina, za neutralizaciju hirudina (Markwardt, Pharmazie 1989; 44; 648-649).
Međutim, ti pripravci nisu prikladni kao antidot za primjenu na ljudima zbog zgrušavaiućeg djelovanja i zbog do 1000 puta manjeg afiniteta prema hirudinu: (F. Doyle u Methods Enzymol; vol. 222, str. 299 i dalje, Moriata in Methods Enzymol; Vol 80, str. 303 i dalje, Stone et al., Biochemistry; 1987, 26, 4617-4624, Markwardt, Pharmazie; 44, 1989, str. 648-649).
Humani protrombin je poznat i opisali su ga Friezner et al., (Biochemistry, Vol 22, 1983, str. 2087-2097). Aminokiselinska sekvenca humanog protrombina navedena je također i u SEQ ID NO: 14. U literaturi se mogu naći različiti načini brojenja za humane sekvence trombina, zbog čega će se u nastavku - ako nije navedeno drugačije koristiti način brojenja, odnosno SEQ ID NO:14.
Lentz (Lentz et al., JBC; Vol 266, br. 15, str. 9598-9604) opisali enzimski inaktivan trombin proizveden genskom tehnologijom. Zamjena serinskog ostatka, potrebnog za katalizu, na položaju 205 (položaj 525 i SEQ ID NO: 14), s alaninom dovodi, ovdje do enzimski inaktivne varijante trombina, koja prema sintetičkim supstratima i prirodnim supstratima fibrinogena ne pokazuje nikakvu aktivnost cijepanja (Lentz et al., JBC Vol 266, br. 15, str. 9598-9604), ali pokazuje niži afinitet vezanja prema inhibitiru trombina densilarginin-N-(3-etil-l,5-penta-dienil)amidu.
Iz radova Stonea i sur. (Biochemistry; Vol 30, 6392-6397) poznata je prirodna varijanata trombina Qick II. Quick II-trombin razlikuje se od prirodnog trombina samo na položaju 238 (položaj 558 u SEQ ID NO: 14). Ovdje je glicinski ostatak 238 prirodnog trombina mutiran s hidroforbnim ostatkom valina. Ta neznatna izmjena u P1-džepu enzima dovodi do značajnog smanjenja cijepanja fibrinogena (2% prvobitne aktivnosti) i istovremeno do drastičnog smanjenja vezanja kako niskomolekulskih supstrata, tako također i hirudina. Stone je pokazao da se je konstanta vezanja te mutante za hirudin pogoršala za faktor veći od 1000, i taj rezultat objašnjava kako steričkim blokiranjem veznog džepa, tako također i s konformacijskom reorganizacijom okoline aktivnog središta.
Dosada poznate mutante trombina nisu prikladne kao antidot za inhibitore trombina, jer one imaju ili premali afinitet prema inhibitoru trombina, ili previše vežu fibrinogen i prema njemu pokazuju preveliku enzimsku aktivnost.
Zadatak se je stoga sastojao u pripravi nove mutante trombina, koja je enzimski maksimalno inaktivna, koja pokazuje dobro vezanje inhibitora trombina i istovremeno, kao nemodificirani trombin, veže prirodni supstrat fibrinogena s neznatnom aktivnošću.
Predmet izuma su mutante trombina, koje prema prirodnom trombinu pokazuju slijedeće razlike sekvenci:
(a) zamjena jednog Gly s Ala, pri čemu se Gly nalazi u okruženju sekvence Tyr-Gly-Phe, i u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO: 14) zauzima položaj 558;
(b) najmanje jedna zamjena ili delecija slijedećih ostataka:
- (b1) His koji se nalazi u okruženju sekvence Ala-His-Cys i u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO:14) zauzima položaj 363;
- (b2) Asp koji se nalazi u okruženju sekvence Agr-Asp-Ile i u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO:14) zauzima položaj 419;
- (b3) Ser koji se nalazi u okruženju sekvence Asp-Ser-Gly i u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO:14) zauzima položaj 525.
Nove mutante trombina mogu se proizvesti polazeći od poznatih prirodnih trombina, kao eventualno ljudskog trombina, i drugih sisavaca, primjerice, primata, goveda, svinje, psa, mačke, miša, štakora. Pod prirodnim trombinom podrazumijeva se polipeptidna sekvenca koja pokazuje aktivnost trombina i prirodnim putem nastaje u organizmu.
Pod mutantama trombina ne podrazumijevaju se samo dvolančane molekule premoštene s disulfidom (A- i B-lanac), već također i lančaste molekule kao pretrombin ili proteini koji se sastoje samo iz B-lanca ili dijelova B-lanca, ponajprije iz N- i/ili C-terminalno skraćenih B-lanaca. Za mutante trombina prema izumu presudno je da pokazuju učinkovitost, odnosno vežu inhibitor trombina.
Mutanti trombina prema izumu mogu se proizvesti također i polazeći od poznatih proizvoda proteolize, primjerice β-trombina, γ-trombina, ω-trombina ili također od predstupnjava trombina, kao protrombinskih intermedijata, ili također meizotrombina, koji se zatim, po potrebi, mogu prevesti u aktivne molekule trombina prikladnom metodom cijepanja, primjerice pomoću faktora Xa, s frakcijama zmijskih otrova iz Echis carinatus ili također iz Oxyranus scutellatus.
Mutante trombina prema izumu prikladne su za neutralizaciju hirudina, derivata hirudina ili drugih inhibitora trombina.
Prednost se daje proizvodnji genskom tehnologijom, pri čemu se proizvede odgovarajući gen za mutantu trombina i taj gen se eksprimira u prikladnom mikroorganizmu.
U suporedbi s prirodnim trombinom nove mutante trombina imaju najmanje dvije sekvencne razlike, pri čemu prva razliku predstavlja zamjena jednog glicinskog ostatka s alaninskim ostatkom. Položaj zamjene ovisi o podrijetlu prirodnog polaznog trombina. Međutim, radi se ipak o položaju glicina, koji se nalazi u okruženju sekvence Tyr-Gly-Phe, i koji u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO: 14) zauzima položaj 558.
Druga sekvencna razlika je ili zamjena, ili delecija aminokiselinskog ostatka na jednom od tri položaja (His, Asp, Ser), koji tvore katalitičku trijadu proteaze trombina. Ti položaji u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO: 14) su položaj 363 za His, 419 za Asp i 525 za Ser. Kod ostalih, ne-humanih trombina, ti položaji mogu biti malo pomaknuti, ovisno o ukupnoj duljini molekule. Međutim, okruženje sekvence, tj. aminokiselinski ostatak ispred i iza odgovarajuće amino kiseline, je kod trombina konzerviran, i stoga se pomoću sekvencnog okruženja lako mogu utvrditi točni položaji odgovarajućih aminokiselinskih ostataka.
Mutante trombina prema izumu mogu također imati i više promjena (delecija ili supstitucija) na katalitičkim trijadama. Prednost se daje mutantama trombina koje imaju jednu jedinu promjenu na katalitičkoj trijadi.
Promjene kojima se daje prednost su one kod kojih su izvršene supstitucije amino kiselina katalitičkih trijada. Supstitucije histidinskog ostatka su ponajprije one s polarnim ili hidrofobnim amino kiselinama, naročito s Phe, Tyr, Ala ili Val. Aspartatski ostatak se ponajprije supstituira s drugim polarnim amino kiselinama, primjerice Gln ili Asn.
Posebnu prednost imaju mutante trombina kod kojih je promijenjen serinski ostatak, naročito supstitucije serina s amino kiselinama koje nemaju nijedne hidroksi funkcionalne skupine, naročito takve koje imaju sličnu prostornu popunjenost. Posve osobitu prednost ima supstitucija Ser sa Ala.
Što se tiče njihove učinkovitosti, mutante trombina mogu se dalje poboljšati unošenjem drugih promjena molekule. Tako se npr. može zamisliti daljnje poboljšanje proteolitičke stabilnosti da se primjerice omogući dulje trajanje djelovanja in vivo. Ovdje se primjerice bazični ostaci Arg 393, Lys 465, Arg 390 ili Arg 382 (SEQ ID NO:14) mogu zamijeniti s nekom nebazičnom amino kiselinom.
Daljnji predmet izuma su sekvence nukleinskih kiselina, naročito sekvence DNA koje kodiraju za opisane mutante trombina. One se mogu lako odrediti retranslacijom polipeptidne sekvence u odgovarajuću DNA sekvencu prema genetičkom kodu. Ponajprije se upotrebljavaju takvi kodoni koji u željenom organizmu domaćina dovode do dobre ekspresije.
Sekvence nukleinske kiseline mogu se proizvesti polazeći od prirodnih sekvenci trombina lokalno specifičnom mutagenezom, ili također potpuno sintetički sintezom DNA.
Mutante trombina prema izumu prikladne su naročite kao antidot za inhibitore trombina, kao hirudine, derivate hirudina i niskomolekulske inhibitore trombina.
Hirudini su proteini prvobitno izolirani iz pijavica, koji se sastoje iz 65 amino kiselina i koji se odlikuju ekstremno visokim afinitetom prema trombinu (ki = 10-12 mol/l) i istaknutom selektivnošću prema trombinu. Učinkovitost hirudina pokazana je kako u pokusima na životinjama, tako također i kod ljudi. Pored prvobitno izoliranih hirudina, postoje također i brojne mutante hirudina, a također i izohirudini, koji u usporedbi s prirodnim hirudinom imaju sekvencne promjene. Pod hirudinima se stoga, osim prirodnih hirudina, podrazumijevaju također i takvi hirudini koji u odnosu prema hirudinu iz Hirudo medicalis nose jednu ili više sekvencnih promjena i posjeduju barem jednako velik afinitet prema trombinu.
Hirudini su lako dostupni pomoću metoda genske tehnologije. Njihovo vrijeme poluraspadanja kod ljudi je otprilike 45 minuta.
Također su poznati derivati hirudina kod kojih je farmakokinetika modificirana pomoću kemijske kinetike. Markwardt opisuje konjugate dekstrana i hirudina s različitim trajanjem djelovanja. Iz EP 345616, EP 502962 i EP 557199 poznati su polimerni konjugati dugotrainog djelovanja. U WO 9515183 opisani su hidrofobni derivati hirudina dugotrajnog djelovanja. Također su poznati depot oblici kao i dimeri hirudina dugotrajnog djelovanja (W0 9504823) Daljnji inhibitori trombina su niskomolekulski inhibitori trombina, koji su poznati primjerice iz EP 236164, DE 2801478, EP 293881 ili EP 185390.
Daljnji inhibitori trombina su rekombinantno proizvedeni desulfato-hirudini, hirudin-mutante, polimerno modificirani hirudini, kao npr. dekstran-hirudini, PEG-hirudini, hidrofobno derivatizirani hirudini, kao i mutante hirudina s produljenim trajanjem djelovanja. Nadalje, novi trombini mogu se upotrijebiti za antagoniziranje hirudisina, skraćenih hirudina, kao i za analoge hirudina izvedene od hirudina i njegovih djelomičnih sekvenci, kao npr. hiruloga ili C-terminalnih hirudinskih peptida. Neutralizirati se mogu također i drugi peptidni inhibitori trombina, koji su bili opisani u organizmima koji sisaju krv i proizvedeni genskom tehnologijom upotrebljavaju se za terapiju, kao npr. rodnin; infestin.
Primjeri inhibitora trombina koji se mogu neutralizirati su također sintetički, ponajprije niskomolekulski inhibitori trombina, kao primjerice derivati tripeptida D-Phe-Pro-Arg, NAPAP, derivati borne kiseline, arginali ili derivati benzamidina.
Upotreba prema izumu kao antidota može se primijeniti na sve prethodno navedene inhibitore trombina.
Mutante trombina prema izumu neutraliziraju inhibitore trombina bolje od dosada opisanih principija za neutralizaciju inhibitora trombina. Trombini prema izumu sigurni su u primjeni samo kod prekomjernog doziranja, i stoga u slučaju potrebe omogućuju brzu i potpuno učinkovitu neutralizaciju inhibitora trombina.
Mutante trombina prema izumu postoje obliku prikladnom za parenteralno davanje, ti. subkutano, intramuskularno ili intravensko. Prednost se daje intravenskom davanju.
Mutante trombina prema izumu mogu se po potrebi dati također i kao trajna infuzija. Količina datog inaktivnog trombina ravna se npr. po mjeri prekomjernog doziranja, tjelesnoj težini i odabranom načinu doziranja. Veličinu prekomjernog doziranja može odrediti stručnjak ili se također može odrediti prikladnim ispitivanjem tijekom aplikacije trombina.
Mutante trombina prema izumu mogu se proizvesti metodama genske tehnologije. Prednost se daje proizvodnji genskom tehnologijom prethodnog oblika mutante trombina (analgnog protrombinu) iz kojeg se mutanta trombina oslobađa proteolitičkim aktiviranjem.
Daljnji način proizvodnje, kojem se daje prednost, prije svega za mutantu trombina koja se sastoji samo iz B lanca, je ekspresija gena za B lanac, promijenjen prema izumu, u mikroorganizmima, ponajprije u bakterijama kao E. coli.
Dobiveni proizvod ekspresije mora se po potrebi renaturirati metodama poznatim stručnjacima, da se dobije učinkovitu molekulu mutante trombina. Kod ekspresije B lanca u bakterijama pokazalo se je također od prednosti Cys-ostatak, koji u prirodnom humanom trombinu doprinosi S-premoštenju, zamijeniti s drugim aminokiselinskim ostatkom, primjerice Ser ili Ala.
Slijedeći primjeri služe za daljnje objašnjenje izuma, međutim izum se ne graničava na njih.
Protrombin je kloniran prema publikaciji Degena i sur. (Biochemie 1983, 22, str. 2087-97) iz cDNS banke humane jetre.
Ciljanom mutagenezom u dijelu trombina proizvedene su mutante prema izumu.
Primjer 1
Priprava Ala 558 protrombina
Ciljanom mutagenezom mutiran je kodon GGC za amino kiselinu (As)glicin u položaju 558 (SEQ ID NO: 14) humanog protrombina u kodon GCC za As Ala.
U tu svrhu sintetiziran je oligonukleotid SEQ ID NO: 5 u analognom smjeru gena i njemu komplementaran oligonukleotid SEQ ID NO: 6 u suprotnom smjeru s odgovarajućom nukleotidnom zamjenom. Sukladno 5' kraju protrombinskog gena sintetiziran je u analognom smjeru oligonukleotid SEQ ID NO: 1. Njemu je na kraju 5' dodatno naljepljena sekvenca za restrikcijsko presjecište Eco Rl. Sukladno kraju 3' protrombinskog gena u suprotnom smjeru sintetiziran je oligonukleotid SEQ ID NO: 2 i njenu je također na završetku 5' naljepljena sekvenca za restrikcijsko presjecište Eco Rl .
S 50 mg humane protrombin cDNA kao kalupa i svaki puta po 50 pmolova oligonukleotida SEQ ID NO: 5 i SEQ ID NO. 2, nakon dodatka 2 nM dNTPs, polimeraznog pufera i Pfu-polimeraze (Stratagene) PCR reakcija je provedena u 35 ciklusa od po 1 minute pri 94°C, 2 minute pri 55°C i 3 minute pri 72°C. Sukladno tome provedena je druga PCR s istim kalupom i oligonukleotidima SEQ ID NO: 6 i SEQ ID NO: 1. Obadva tako nastala fragmenta DNA očišćena su po standardnom propisu (PCR purification kit, Quiagen, Hilden). Po 0,1 pmola obaju fragmenata stavljeno je zajedno, zagrijano 5 minuta na 95°C za denaturiranje i držano 1 sat pri sobnoj temperaturi za renaturiranje. Da bi se postiglo potpunu DNA dvostruku uzvojnicu, nakon dodatka 2 nM dNTPs, polimeraznog pufera i Pfu polimeraze, provedeno je 10 ciklusa od po 1 minutu pri 94°C i po 5 minuta pri 72°C. Za povećanje ukupnih duljina fragmenata za slijedeću PCR reakcijskoj smjesi dodana je po 50 pmolova vanjskih oligonukleotida SEQ ID NO: 1 i SEQ ID NO: 2 i nakon još jednog dodatka Pfu-polimeraze provedeno je još 35 ciklusa od po 1 minutu pri 94°C, 2 minute pri 55°C i 3 minute pri 72°C. Tako proizvedena mutirana protrombin cDNA sa zamjenom Gly s Ala u položaju 558 očišćena je po standardnom propisu, naknadno je presječena s restrikcijskom endonukleazom Eco Rl i s T4 ligazom po standardnom propisu klonirana u vektor pUC 18 također presiječen u Eco Rl (Pharmacia Biotech Europe GmbH, Freiburg).
Primjer 2
Priprava Ala 525, Ala 558 protrombina
Ciljanom mutagenezom mutiran je kodon AGT za As Ser u položaju 525 (SEQ ID NO: 14) humanog protrombina u kodon GCT za As Ala i kodon GGC za As Gly u položaju 558 (SEQ ID NO: 14) u kodon GCC za As Ala.
U tu svrhu provedena je PCR na osnovi protrornbinske mutante DNA iz primjera 1 i oligonukleotida SEQ ID NO: 3 SEQ ID NO: 3 s odgovarajućom nukleotidnom zamjenom u Ala na položaju 525 u analognom smjeru, kao i s oligo-nukleotidom SEQ ID NO: 2 (kraj 3' protrombina). Uvjeti pokusa bili su isti kao u primjeru 1. Druga PCR provedena je s cligonukleotidom SEQ ID NO: 4, koji je komplementaran sa SEQ ID NO: 3, te SEQ ID NO: 1 (5' kraj protrombina) Tako dobiveni fragmenti DNA su denaturirani, hibridizirani, popunjeni u dvostruku uzvojnicu i zatim je u skladu s primjerom 1 provedena slijedeća PCR s vanjskim oligonukleotidima SEQ ID NO: li SEQ ID NO: 2.
Tako proizvedena protrombin - mutanta cDNA je očišćena, presiječena s Eco Rl, klonirana u vektor pUC 18 i sekvencirana za kontrolu.
Primjer 3
Priprava Ala 363, Ala 558 protrombina
Ciljanom mutagenezom mutiran je kodon AGT za As His u položaju 363 (SEQ ID NO: 14) humanog protrombina u kodon GCA za As Ala i kodon GGC za As Gly u položaju 558 (SEQ ID NO: 14; u kodon GCC za As Ala.
U tu svrhu provedena je PCR na osnovi protrombinske mutante DNA iz primjera 1 i oligonukleotida SEQ ID NO: 12 s odgovarajućom nukleotidnom zamjenom u Asm na položaju 419 u analognom smjeru, kao i s oligonukleotidom SEQ ID NO: 2 (kraj 3' protrombina). Uvjeti pokusa bili su sukladni onima iz primjera 1. Druga PCR provedena je s oligonukleotidom SEQ ID NO: 13, koji je komplementaran sa SEQ ID NO:12 i sa oligonukleotidom SEQ ID NO: 1 (5' kraj protrombina). Tako dobiveni fragmenti DNA su denaturirani, hibridizirani, nadopunjeni u dvostruku uzvojnicu i zatim je u skladu s primjerom 1 provedena slijedeća PCR s vanjskim oligonukleotidIma SEQ ID NO:1i oligom SEQ ID NO: 2.
Tako dobivena protrombin - mutanta cDNA je očišćena, zatim presiječena s Eco Rl, klonirana u vektor pUC 18 i sekvencirana za kontrolu.
Primjer 4
Ciljanom mutagenezom mutiran je kodon GAC za As Asp u položaju 419 (SEQ ID NO: 14) humanog protrombina u kodon GCA za As Asn i kodon GGC za As Gly u položaju 558 (SEQ ID NO: 14) u kodon GCC za As Ala.
U tu svrhu provedena je PCR na osnovi protrombinske mutante DNA iz primjera 1 i oligonukleotida SEQ ID NO: 12 s odgovarajućom nukleotidnom zamjenom u Asm na položaju 419 u analognom smjeru, kao i oligonukleotidom SEQ ID NO: 2 (kraj 3' protrombina). Uvjeti pokusa bili su sukladni onima iz primjera 1. Druga PCR provedena je s oligonukleotidom SEQ ID NO: 13, koji je komplementaran sa SEQ ID NO: 12 i sa oligonukleotidom SEQ ID NO: 1 (5' kraj protrombina). Tako dobiveni fragmenti DNA su denaturirani, hibridizirani, nadopunjeni u dvostruku uzvojnicu i zatim je u skladu s primjerom 1 provedena slijedeća PCR s vanjskim oligonukleotidima SEQ ID NO: li oligom SEQ ID NO: 2.
Tako dobivena protrombin - mutanta cDNA je očišćena, presječena s Eco Rl, klonirana u vektor pUC 18 i sekvencirana za kontrolu.
Primjer 5
Priprava Ala 525 protrombina
Ciljanom mutagenezom mutiran je kodon AGT za As Ser u položaju 525 (SEQ ID NO: 14) humanog proteina u kodon GCT za As Ala.
U tu svrhu provedena je PCR na osnovi protrombinske mutante DNA iz primjera 1 i oligonukleotida SEQ ID NO: 3 s odgovarajućom nukleotidnom zamjenom u Ala na položaju 525 u analognom smjeru kao i oligonukleotida
SEQ ID NO: 2. (kraj 3' protrombina). Druga PCR provedena je s oligonukleotidom SEQ ID NO: 4 koji je komplementaran sa SEQ ID NO: 3, kao i s oligonukleotidom SEQ ID NO: 1 (5' kraj protrombina) . Tako dobiveni fragmenti DNA su denaturirani, hibridizirani, nadopopunjeni u dvostruku uzvojnicu i zatim je u skladu s primjerom 1 provedena slijedeća PCR s vanjskim oligonukleotidima SEQ ID NO: li SEQ ID NO: 2.
Tako dobivena protrombin - mutanta cDNA je očišćena, presječena s Eco R1., klonirana u vektor pUC 18 i sekvencirana za kontrolu.
Primjer 6
Konstrukcija vektora ekspresije za humanu mutantu protrombina
Za sekretorijsku rekombinantnu ekspresiju u CHO stanicama sisavca na 5' krajeve mutirane protrombin cDNA (vidi primjere 1 do 5) naljepljene su sekrecijske liderske sekvence humanoa pPA gena (Pennica et al., Nature 301, 214-221, 1983). Polazeći od jedne tPA cDNA sa sintetičkim oligonukleotidima SEQ ID NO: 9 (kraj 5' pPA lidera i Eco RI mjesto) kao i SEQ ID NO: 8 (3' kraj tPA lidera, 5' kraj protrombina) tPA sekrecijski lider cDNA povećan je na osnovi PCR. Mutirani fragmenti mutante protrombina povećani su svaki puta s oligonukleotidom SEQ ID NO: 7, koji je komplementaran sa SEQ ID NO: 8, i sa oligonukleotidom SEQ ID NO: 2. tPa liderski fragmenti dodani su dotičnim fragmentima mutante protrombina. Reakcijska smjesa je denaturirana, hibridizirana i nadopunjena u dvostruku uzvojnicu i dotične tPA-lider-protrombin mutante DNA proizvedene su slijedećom PCR provedenom s oligo-nukleotidima SEQ ID NO: 9 i SEQ ID NO: 2. One su presječene s Eco Rl, klonirane u pUC 18 i sekvencirane za kontrolu.
Za ekspresiju u CHO stanicama te DNA su presječene s Eco R1 iz pUC 18 vektora, izolirane i ponovno uljepljene u Eco Rl presjecišta vektora pc DNA3 neo (Invitrogen, San Diego, SAD). Transkripcija protrombin cDNA stoji u tom vektoru pod kontrolom jakog citomegalivirusanog promotora. Selekcija na transficirane stanice provodi se preko neomicin rezistentnog gena, koji se nalazi u plazmidu, koji omogućuje rast samo G 418 rezistentnih kolonija.
Za transfekciju odgovarajuće DNA, predviđene za ekspresiju u CHO stanicama, linearizirane su s restrikcijskim enzimom PvuI, precipitirane i sterilno preuzete u 10 mM TRIS-pufera (pH 8, 5).
Primjer 7
Ekspresija protrombinske mutante u stanicama sisavca DNA ekspresijskog vektora transificirana je s lipofektaminom (tvrtka Gibco; Life Technologies GmbH; Diesel straβe 5, 76334 Eggenstein, Njemačka; br. 530-8324SA) u stanice sisavca. Upotrijebljene stanice bile su CHO-K1 (ATCC CCL 61); 293 (ATCC CRL 1573).
Po 2x105 stanica /ml stavljeno je u 3 ml medija za rast po jamici ploče za uzgoj kultura sa 6 jamica. Transfekcija je provedena slijedećeg dana. U tu svrhu stanice su jednom isprane s medijem bez seruma. Transfekcija je provedena s lipofektaminom prema podacima proizvođača, tvrtke Gibco (Focus, 1993, 15, br. 3, 73-78). Svaka jamica sadržavala je 1 µg DNA i 6 µl lipofektamina, koji su stavljeni zajedno u 1000 µl medija za staničnu kulturu bez seruma. Nakon 6 sati inkubacije pri 37°C transfekcijski medij je odsisan i stanice su inkubirane preko noći s normalnim medijem za rast (koji je sadržavao fetalni teleći serum, FCS).
Primjer 8
Transijentna ekspresija protrombinskih mutanti u 293 stanicama držane su u DMEM mediju (Gibco br. 41965) + 10%
FCS (Biowhittaker br.11601B).
Transfekcija jc provedena kako je gore opisano. Pri tome, za povišenje ekspresije provedena je ko-transfekcija s plazmidom pAdVantage (tvrtka Promega br. E1711). 0,2 µg pAdVantagE DNA, kao i 0,8 µg DNA dotične protrombinske mutante transficirano je u vektor ekspresije pcDNA3, kako je gore opisano. Prvi dan nakon transfekcije odsisan je medij koji je sadržavao serum i nadomješten je s medijem bez seruma (bez fenolnog crvenog). Treći dan nakon transfekcije uzet je ostatak stanične kulture i do ispitivanja je odložen pri -20°C,
Primjer 9
Stabilna ekspresija protrombinske mutante u CHO-K1 stanicama.
Transfekcija je provedena kako je gore opisano. CHO stanice držane su i hranjene u DMEM/F12 = 1:1 (Gibco br. 21331-020) + 10% FCS. Prvi dan nakon transfekcije stanice su smrvljene, tako da je iz jedne jamice 6 jamične ploče zasijano 20 do 100 Petrijevih zdjelica veličine 10 cm. Istovremeno započeta je selekcija rekombinantnih stanica obradom s G148 (tvrtka Gibco, 1200 µg/ml u mediju). Dobivene rezistentne kolonije podijeljene su metodom "cilindra za kloniranje" i nakon obilnog hranjenja kad se je dobio dovoljan broj stanica, ispitane su što se tiče ekspresije mutante trombina. U tu svrhu odsisan je medij od konfluentnih stanica i nadomješten je sa svježim medijem bez seruma. Nakon utvrđenog vremena, npr. nakon 24 sata, 48 sati uzet je ostatak stanične kulture i ispitan što se tiče prisutnog protrombina pomoću ELlSA.
Za povećanje ekspresije dobivene rekombinantne stanice djelomično su klonirane prorjeđivanjem u mikrotitarskim pločama.
Da bi se pripremile dovoljne količine ostatka stanične kulture bez seruma, dobro eksprimirajuće CHO stanice hranjene su s 10% FCS-a u različitim posudama za kulture do konfluencije u mediju. Na kraju, stanice su isprane s PBS-om i inkubirane s DMEM/F12 mediju (DMEM: Gibco br. 11880-028; F12: Gibco br. 21765-029 mješavina se sastoji iz jednakih volumnih udjela). DMEM koji se je koristio za tu svrhu bio je bez fenolnog crvenog. Nakon dva, odnosno tri dana uvijek je slijedila zamjena medija ("žetva"), da se pokupi ostatak stanične kulture koji sadrži protrombinsku mutantu. Na taj način moglo se je pokupiti do 10 puta iz jedne posude za kulture. Pri tome su različite žetve iz različitih posuda za kulture sjedinjene da se postigne volumen dovoljan za čišćenje.
Primjer 10
Dokazivanje ekspresije rekombinantne mutante protrombina
Stanice, koje eksprimiraju protrombin i secerniraju u mediju za staničnu kulturu, ispitane su na prisutnost rekombinantnog protrombina, tako da je ostatak stanične kulture od konfluentnih stanica ispitan na prisutnost protrombina pomoću ELISA, ili nakon cijepanja protrombina, na trombinsku aktivnost, odnosno trombin-antigen.
U tu svrhu uzet je ostatak stanične kulture bez seruma nakon različitog trajanja kulture. Cijepanje protrombina prisutnog u suvišku stanične kulture postignuto je pomoću snake vernoma (tvrtka Sigma; kat. br. V3129). Svaka reakcijska smjesa obrađena je na slijedeći način:
388 µl uzorka (ostatka stanične kulture ili protrombina bez seruma),
63 µl snake venoma (0,2 mg/ml u H20) ,
50 µl pufera (1 M NaCl; 100 mM CaCl2; 200 mM TRIS, pH 7,4),
100 µl H20.
Reakcijska smjesa za cijepanje inkubirana je 45 minuta pri sobnoj temperaturi.
Na kraju je nastali trombin karakteriziran različitim ispitivanjima.
Primjer 11
Dokazivanje mutanti protrombina i mutanti trombina pomoću ELISA
ELISA za određivanje protrombina i trombina provedena je po slijedećoj shemi:
- Mikrotirarske ploče prevučene su sa 0,1 ml/jamici anti-trombin-antitijela; 5 µg/ml 0,05 M, NaHC03, pH 9,2; 16 sati/4°C,
- hranjenje s 1% BSA/PBS; 0,3 ml/jamici; 0,5-1 sat pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje 3x sa 0,5% Tween 20/PBS,
- 11 standardno razrjeđenje humanog trombina
(Calbiochem 605195; 3,159 NIH U/mg), započeto s 10 ng/ml 0,1% BSA/0,05% Tween 20/PBS u drugoj fazi; paralelno s tim razrjeđenje uzoraka za ispitivanje; 0,1 ml/jamici; 2-4 sata pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici biotiniliranih anti-trombin-antitijela
1:200; razrijeđeno u 0,1% BSA/0,05% Tween 20/ PBS; 2-4 sata pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici kompleksa streptavidin-peroksidaze
(B.M. 1089153); razrijeđeno 1:10000 u 0,1% BSA/0,05% Tween 20/PBS; 30 minuta pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici peroksidaznog supstrata,
- zaustavljanje reakcije s 0,1 ml/jamici 2 M H2S04,
- mjerenje apsorpcije pri 450 nm, peroksidazni supstrat: 0,1 ml TBM otopine (42 mM TBM u DMSO) i 10 ml supstratnog pufera, (0,1 M natrijevog acetata pH 4,9), miješanje; zatim dodatak 14,7 µl 3%-tnog H202.
Primjer 12
Priprava antitijela prema humanog trombinu
Za indukciju poliklonalnih antitijela imuniziraju se kunići kako slijedi:
1. dan: 200 µg humanog trombina u 0,5 ml PBS/cjelovit Freundov dodatak (Sigma F5881),
14. dan: 200 µg humanog trombina u 0,5 ml PBS/nepotpun Freundov dodatak (Sigma F5506),
28. dan: 200 µg humanog trombina u 0,5 ml PBS/nepotpun Freundov dodatak,
42. dan: 200 µg humanog trombina u 0,5 ml PBS~a.
7 dana nakon posljednje imunizacije slijedilo je uzimanje krvi iz vene uha kunića.
Čišćenje poliklonalnih kunić-antitijela iz dobivenog seruma slijedilo je preko proteina A Sepharose (po uputama proizvođača, tvrtka Pharmacia) s iskorištenjem od 65 mg IgG/10 ml seruma. Prije biotinilacije antitijela su dijalizirana prema 0,05 M NaHC03, pH 9,0 (2x2 1), zatim je slijedio dodatak 200 µl Biotin-X-NHS-estera (Calbiochem 203189; 1 mg/ml H20) na 600 µl antitijela (2,4 mg/ml) i mućkano je 2 sata pri sobnoj temperaturi. Na kraju je dijalizirano 3 puta prema PBS-u.
S dobivenim antitijelima izgrađen je sendvič-ELISA:
- Mikrotirarske ploče prevučene su sa 0,1 ml/jamici anti-trombin-antitijela; 5 µg/ml u 0,05 M NaHC03, pH 9,2; 16 sati/4°C,
- hranjenje s 1% BSA; 0,3 ml/jamici; 0,5 sata pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje 3x sa 0,05% Tween 20/PBS,
- 11 standardno razrjeđenje humanog trombina
(Calbiochem 605195) hvatanje s 10 ng/ml 0,1% BSA/PBS/0,05% Tween 20 u drugoj fazi; paralelno s tim razrjeđenje uzoraka za ispitivanje; 0,1 ml/jamici; 2 sata pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici biotiniliranih anti-trombin-antitijela
1:200; razrijeđeno u 0,1% BSA/PBS 0,05% Tween 20; 2 sata pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici kompleksa streptavidin-peroksidaze
B.M. 1089153); razrjeđenje 1:10000 u 0,1% BSA/PBS/0,05% Tween 20; 30 minuta pri sobnoj temperaturi,
- 0,1 ml/jamici peroksidaznog supstrata,
- zaustavljanje reakcije s 0, 1 ml/jamici 2 M H2S04,
- mjerenje apsorpcije (OD) pri 450 nm.
Na slici 1 prikazana je apsorpcija (OD) u ovisnosti o koncentraciji trombina.
Peroksidazni supstrat: 0,1 ml TBM otopine (42 mM TBM u DMSO) i 10 ml supstratnog pufera (0,1 M natrijevog acetata pH 4,9), miješanje; zatim dodatak 14,7 µl 3%-tnog H202.
Dokazivanje protrombinskih mutanti i mutanti trombina pomoću ELISA:
ELISA za određivanje protrombina i trombina provedena je po slijedećoj shemi:
- Mikrotirarske ploče prevučene su sa 0,1 ml/jamici anti-trombin-antitijela; 5 µg /ml u 0,05 M NaHCO3, pH 9,2; 16 sati/4ºC
- hranjenje s 1% BSA/PBS; 0,3 ml/jamici; 0, 5-1 sat pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje 3x sa 0,05% Tween 20/PBS,
- 11 standardno razrjeđenje humanog trombina
(Calbiochem 605195; 3,159 NIH U/mg), hvatanje s 10 ng/ml 0,1% BSA/0,05% Tween 20/PBS u drugoj fazi; paralelno s tim razrjeđenje uzoraka za ispitivanje; 0,1 ml/jamici; 2-4 sata pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici biotiniliranih anti-trombin-antitijela 1:200; razrijeđeno u 0,1% BSA/0,05% Tween 20/PBS; 2-4 sata pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici kompleksa streptavidin-peroksidaze
(B.M. 1089153); razrjeđenje 1:1000 u 0,1% BSA/PBS/0,05% Tween 20/PBS; 30 minuta pri sobnoj temperaturi,
- ispiranje kao gore,
- 0,1 ml/jamici peroksidaznog supstrata,
- zaustavljanje reakcije s 0,1 ml/jamici 2 M H2S04,
- mjerenje apsorpcije pri 450 nm.
Peroksidazni supstrat: 0,1 ml TBM otopine (42 mM TBM u DMSO) i 10 ml supstratnog pufera (0, 1 M natrijevog acetata pH 4,9), miješanje; zatim dodatak 14,7 µl 3%-tnog H202.
Primjer 13a
Čišćenje humanog trombina iz krvne plazme
Čišćenje humanog protrombina iz humane citraplazme izvršeno je kako je opisao Henrikson (Methods in Enzymology, Vol 222, str. 312-3279). Cijepanje protrombina i čišćenje trombina izvršeno je heparinskom kromatografijom kako je opisano u primjerima 14 i 15. Frakcije koje su sadržavale trombin određene su kromogenim ispitivanjem trombina sa S 2238 i skoncentrirane ultrafiltracijom na 1 mg/ml i dijafi1trirane prema PBS-u.
Određivanje aktivnosti trombina s kromogenim supstratom S 2238
Aktivnost mutante trombina određuje se cijepanjem jednog tripeptida. U tu svrhu postupa se po slijedećoj shemi pipetiranja:
50 µl zorka (trombin 0,5 U/ml; ili rascijepljeni protrombin različitih razređenja),
100 µl vode,
50 µl S-2238 (1 mg/ml u vodi; tvrtka Chromogenix, Mölndal, Švedska).
Reakcijske smjese inkubiraju se 10-15 minuta pri 37°C. Na kraju se mjeri apsorpcija pri valnim duljinama od 405 nM i količine trombina se odrede pomoću baždarne krivulje između 0,01 i 1 U/ml.
Primjer 13b0
Čišćenje protrombinske mutante kromatografijom s anionskom i zmjenom
35 l ostatka stanične kulture iz CHO stanične kulture, koji sadrži protrombin, najprije se koncentrira ultrafiItracijom pri 4C (SPS 400 Membran, Fresenius, St. Wendel) na 400 ml i dijafiltrira se prema 10 mM TRIS pH 7,5 dok se dobije vodljivost od 1,1 mS/cm. Odsoljeni filtrat se zatim prenese na Q-Sepharosnu FF kolonu (promjera 5 cm, volumena 530 ml) s brzinom protoka od 6 ml/min, kolonu se ispere s početnim puferom (20 mM TRIS/HC1 pH 7,5) i na kraju se razvije s gradijentima nakon 400 mM NaCl preko 15 volumena kolone. Frakciie koje sadrže protrombin identificiraju se pomoću ELISA. Protrombmska mutanta ispire se od 280 mM NaCl. Iz te kolone izolira se otprilike 150 - 200 mg proteina.
Primjer 14
Oslobađanje mutante trombina iz protrombina
Frakcije koncentrirane na Amiconu YM 30 (krajnji volumen 20 ml, ukupno 170 mg proteina) Q-Sepharose kromatografije dijaliziraju se prema 2 litre 20 mM TRIS/HC1 pH 7,5, 100 mM NaCl i za cijepanje se namjeste na krajnju koncentraciju od 10 mM dodatkom 1 M CaCl2, 20 mM TRIS HC1 pH 7,5. Nakon dodatka 30 mg zmijskog otrova iz Oxiranus scutellatus cijepa se uz miješanje pri 4°C i reakciju se zaustavi nakon. 12 sati dodatkom 2 ml 20 mM otopine EGTA, pH 7,5.
Primjer 15
Čišćenje mutante trombina heparinskom kromatografijom
Reakcijska smjesa za cijepanje iz primjera 14, koja sadrži trombin, prenese se na kraju na kolonu heparinske Sepharose (14 cm x 1 cm, Pharmacia) s brzinom protoka od 38 cm/h. Nakon ispiranja kolone s 20 ml 20 mM Na fosfata, 0,1 M NaCl, pH 7,5, 0,01% Pluriola F 68, kolonu se razvije s linearnim gradijentima nakon 600 mM NaCl, 20 mM Na fosfata, pH 7,5, 0,01% Pluriola F68 preko 150 ml. Mutanta trombina odredi se pomoću ELISA. Mutante se ispiru pri otprilike 400 mM NaCl. Dobiveno je 30 - 35 mg mutante i nakon dodatka BSA (1 mg/ml) dijalizirano je prema PBS-u, 0,01% Pluriola F68 i odloženu pri 20ºC.
Primjer 16
Neutralizacija hirudina u sistemu in vitro
Antidot djelovanje inaktivnih rekombinantnih trombina na hirudin dokazano je ispitivanjem aktivnosti trombina. U tu svrhu zajedno su inkubirani hirudin, ispitna mutanta trombina, aktivni tromibn i S-2238. Ovo ispitavanje temelji se na načelu neutralizacije (ili kompeticije) hirudina s ispitnim inaktivnim trombinom, kao i višom aktivnošću aktivnog trombina koja iz toga proizlazi.
U tu svrhu postupilo se je po slijedećoj shemi pipetiranja:
100 µl hirudina HL20 (1,5 U/ml), odnosno 0,1 BSA u TBS pH 7,5 i 100 ul mutante trombina (proizvedene u primjeru 2) prethodno je inkubirano 5 minuta pri sobnoj temperaturi. Nakon dodatka 50 µl aktivnog trombina (0,5 U/ml) reakcija je započeta dodatkom 50 µl S-2238 (1 mg/ml u vodi; tvrtka Chromogenix, Mölndal, Švedska). Reakcijske smjese inkubirane su 15 minuta pri 37°C. Na kraju je izmjerena apsorpcija pri valnim duljinama od 410 nM. Neutralizacija hirudina s inaktivnom mutantom trombina dovodi do povišenja apsorpcije (Slika 2).
Primjer 17
Neutralizacija PEG hirudina u psu
Psima Beagle (9,81-13,5 kg) subkutano je apliciran PEG-hirudin dozom od 10 mg/kg. 180 minuta nakon injekcije aplicirana je mutanta trombina (trombin mut#3), proizvedena kao u primjeru 2, kao intravenska infuzija s dozom od 20 mg/kg tijekom 50 minuta. Uzorci krvi psima su uzeti punkcijom vene brachialis na početku pokusa, a slijedeći uzorci uzimani su nakon 150 minuta u vremenskom razdoblju do 6 sati. Iz citrat-krvi plazma je dobivena centrifugiranjem pri 2000 g tijekom 20 minuta i do analize je odložena pri -20°C.
U uzorcima krvi. određena je antitrombinska aktivnost kako su opisali Spannagel et al., Blood Coagulation Fibrinolvsis, 1991, 2; 121-127. Antikoagulacijska aktivnost (aPTT) određena je pomoću Pathromtin sistema (Behring).
Rezultati su prikazani na slici. Dok u kontrolnim životinjama nakon aplikacije PEG-hirudina antitrombinska aktivnost brzo raste, kod životinja obrađenih s antidotom moglo se je spriječiti antitrombinsku aktivnost (slika 3b). Po završetku infuzije antidota, plazma razina PEG-hirudina rasla je dalje brzinom sličnom onoj u kontrolnih životinja.
Prilog: Protokol sekvenci
SEQUENZPROTOKOLL
(1) ALGEMEINE INFORMATION:
(i) ANMELDER:
(A) NAME: BASF Aktiengesellschaft
(B) STRASSE: Carl-Bosch-Strasse 38
(C) ORT: Ludwigshafen
(E) LAND: Bundesrepublik Deutschland
(F) POSTLEITZAHL: 67056
(G) TELEPHON: 0621/6048526
(H) TELEFAX: 0621/6043123
(I) TELEX: 1762175170
(ii) ANMELDETITEL: Neue Thrombinmuteine und ihre Verwendung als Antidot
(iii) ANZAHL DER SEQUENZEN: 14
(iv) COMPUTER-LESBARE FORM:
(A) DATENTRÄGER: Floppy disk
(B) COMPUTER: IBM PC compatible
(C) BETRIEBSSYSTEM: PC-DOS/MS-DOS
(D) SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Version #1.25 (EPA)
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 1:
(i) SEQUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 33 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 1:
GGGGGGGAAT TCGCCAACAC CTTCTTGGAG GAG 33
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 2:
(i) SEQUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 33 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 2:
GGGGGGGAAT TCCTACTCTC CAAACTGATC AAT 33
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 3:
(i) SEQUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 40 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKULS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEOUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 3:
GGATGCCTGT GAAGGTGACG CTGGGGGACC CTTTGTCATG 40
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 4:
(i) SEQUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 40 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 4:
CATGACAAAG GGTCCCCCAG CGTCACCTTC ACAGGCATCC 40
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 5:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 40 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 5:
GACCGGGATG GGAAATATGC CTTCTACACA CATGTGTTCC 40
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 6:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 40 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 6:
GGAACACATG TGTGTAGAAG GCATATTTCC CATCCCGGTC 40
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 7:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 40 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 7:
TCCATGCCCG ATTCAGACGC GCCAACACCT TCTTGGAGGA 40
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 8:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 40 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 8:
TCCTCCAAGA AGGTGTTGGC GCGTCTGAAT CGGGCATGGA 40
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 9:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 27 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 9:
GGGGGGGAAT TCGTGAAGCA ATCATGG 27
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 10:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 30 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 10:
CTCACCGCCG CCGCATGCCT CCTGTACCCG 30
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 11:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 30 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 11:
CGGGTACAGG AGGCACACGG CGGCGGTGAG 30
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 12:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 27 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 12:
GAACCTGGAC CGGAACATTG CCCTGAT 27
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 13:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 27 Basenpaare
(B) ART: Nukleinsäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: cDNS zu mRNS
(iii) HYPOTHETISCH: NEIN
(iii) ANTISENSE: NEIN
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 13:
ATCAGGGCAA TGTTCCGGTC CAGGTTC 27
(2) INFORMATION ZU SEQ ID NO: 14:
(i) SEOUENZ CHARAKTERISTIKA:
(A) LÄNGE: 579 Aminosäuren
(B) ART: Aminosäure
(C) STRANGFORM: Einzel
(D) TOPOLOGIE: linear
(ii) ART DES MOLEKÜLS: Protein
(vi) URSPRÜNGLICHE HERKUNFT:
(A) ORGANISMUS: Homo sapiens
(xi) SEQUENZBESCHREIBUNG: SEQ ID NO: 14:
[image] [image]

Claims (10)

1. Mutanta trombina, naznačena time, da u usporedbi s prirodnim trombinom ima slijedeće sekvencne razlike (a) zamjena jednog Gly s Ala, pri čemu se Gly nalazi u okruženju sekvence Tyr-Gly-Phe i u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO: 14) zauzima položaj 558; (b) najmanje jedna zamjena ili delecija slijedećih ostataka. (b1) His koji se nalazi u okruženju sekvence Ala-His-Cys i u prirodnom humanom protrombinu (SEQ ID NO: 14) zauzima položaj 363 (b2) ASp koji se nalazi u okruženju sekvence Agr-Asp-Ile i u prirodnom humanom, protrombinu (SEQ ID NO: 14) zauzima položaj 419; (b3) Ser koji se nalazi u okruženju sekvence Asp-Ser-Gly i u prirodnom humanom protrombinu (SEQ TD NO: 14) zauzima po1ož aj 525.
2. Mutanta trombina prema zahtjevu 1, naznačena time, da u usporedbi s prirodnim protrombinom (SEQ ID NO: 14) ima slijedeće sekvencne razlike (a) zamjena Gly sa Ala, na položaju 558 i (b) najmanje jedna zamjena ili delecija slijedećih ostataka (b1) His na. položaju 363; (b2) Asp na položaju 419; (b3) Ser na položaju 525.
3. Mutanta trombina prema zahtjevu 2, naznačena time da je sekvencna razlika (b) zamjena na položaju 525.
4. Mutanta trombina prema zahtjevu 3, naznačena time, da je sekvencna razlika (b) zamjena Ser s Ala.
5. Sekvenca nukleinske kiseline, naznačena time, da kodira za mutantu trombina prema zahtjevima 1 do 4 .
6. Upotreba mutante trombina prema zahtjevima 1 do 4, naznačena time, da se rabi kod liječenja poremećaja zgrušavanja.
7. Upotreba prema zahtjevu 6, naznačena time, da se primjenjuje kao antidot za inhibitore trombina.
8. Upotreba prema zahtjevu 7, naznačena time, da se primjenjuje kao antidot za hirudine, mutante hirudina ili derivate hirudina.
9. upotreba prema zahtjevu », naznačena time, da se primjenjuje kao antidot za derivate hirudina modificirane s polietilen glikolom.
10. Antidot za inhibitore trombina, naznačen time, da sadrži mutantu trombina prema zahtjevima 1 do 4 zajedno s farmaceutski uobičajenim pomoćnim tvarima.
HR19605126.6A 1996-02-12 1997-02-11 Thrombin muteins as antidotes for thrombin inhibitors HRP970077A2 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19605126A DE19605126A1 (de) 1996-02-12 1996-02-12 Thrombinmuteine als Antidot für Thrombininhibitoren

Publications (1)

Publication Number Publication Date
HRP970077A2 true HRP970077A2 (en) 1998-04-30

Family

ID=7785198

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HR19605126.6A HRP970077A2 (en) 1996-02-12 1997-02-11 Thrombin muteins as antidotes for thrombin inhibitors

Country Status (18)

Country Link
US (1) US6060300A (hr)
EP (1) EP0880591A1 (hr)
JP (1) JPH11512621A (hr)
KR (1) KR19990082479A (hr)
CN (1) CN1211280A (hr)
AR (1) AR005797A1 (hr)
AU (1) AU1768497A (hr)
BR (1) BR9707280A (hr)
CA (1) CA2245546A1 (hr)
CO (1) CO4600682A1 (hr)
CZ (1) CZ247798A3 (hr)
DE (1) DE19605126A1 (hr)
HR (1) HRP970077A2 (hr)
HU (1) HUP9900574A2 (hr)
IL (1) IL125077A0 (hr)
NO (1) NO983677D0 (hr)
WO (1) WO1997029198A1 (hr)
ZA (1) ZA971107B (hr)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20000018933A (ko) * 1998-09-07 2000-04-06 김승수 내피세포 성장억제 활성을 가지는 사람 프로트롬빈 크링글단백질 및 이를 암호하는 유전자
GB2355161B (en) * 1999-10-05 2001-09-12 3Com Corp Network device incorporating selective compression of stored data packets
KR20020008471A (ko) * 2000-07-20 2002-01-31 김승수 내피세포 성장 억제활성을 가지는 인간 프로트롬빈크링글, 그것의 재조합벡터 및 이를 발현하는 재조합 숙주
JP2009528843A (ja) * 2006-03-06 2009-08-13 ヒューマジーン・インコーポレイテッド 組換えヒトトロンビンおよびフィブリノゲンの調製法
CN103446579B (zh) 2007-09-28 2015-04-22 普托拉制药有限公司 用于因子xa抑制剂的解毒剂和其使用方法
NZ592837A (en) 2008-11-14 2012-10-26 Portola Pharm Inc Antidotes for factor xa inhibitors and methods of using the same in combination with blood coagulating agents
EP2414517B1 (en) 2009-03-30 2016-09-21 Portola Pharmaceuticals, Inc. Antidotes for factor xa inhibitors and methods of using the same
US9056106B2 (en) 2009-07-15 2015-06-16 Portola Pharmaceuticals, Inc. Unit dose formulation of antidotes for factor Xa inhibitors and methods of using the same
ES2620421T3 (es) * 2009-10-30 2017-06-28 Senova Gesellschaft für Biowissenschaft und Technik mbH Peptidasas acopladas a polímero
AR079944A1 (es) 2010-01-20 2012-02-29 Boehringer Ingelheim Int Anticuerpo neutralizante de la actividad de un anticoagulante
AP2013007046A0 (en) 2011-03-30 2013-08-31 Boehringer Ingelheim Int Anticoagulant antidotes
KR102245264B1 (ko) 2014-05-26 2021-04-28 아카데미슈 지켄후이스 라이덴 출혈 치료를 위한 프로혈액응고 단백질

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE4203965A1 (de) * 1992-02-11 1993-08-12 Max Planck Gesellschaft Antidot fuer hirudin und synthetische thrombininhibitoren

Also Published As

Publication number Publication date
BR9707280A (pt) 1999-07-20
NO983677L (no) 1998-08-11
ZA971107B (en) 1998-08-11
CN1211280A (zh) 1999-03-17
JPH11512621A (ja) 1999-11-02
NO983677D0 (no) 1998-08-11
IL125077A0 (en) 1999-01-26
DE19605126A1 (de) 1997-08-14
KR19990082479A (ko) 1999-11-25
WO1997029198A1 (de) 1997-08-14
US6060300A (en) 2000-05-09
CO4600682A1 (es) 1998-05-08
CA2245546A1 (en) 1997-08-14
CZ247798A3 (cs) 1999-03-17
EP0880591A1 (de) 1998-12-02
HUP9900574A2 (hu) 1999-06-28
AR005797A1 (es) 1999-07-14
AU1768497A (en) 1997-08-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU744428B2 (en) Factor X analogues with a modified protease cleavage site
EP1781782B1 (en) Modified vitamin k dependent polypeptides
AU643247B2 (en) Activatable fibrinolytic and anti-thrombotic proteins
JP2004525074A (ja) 炎症を治療するための方法
AU732953B2 (en) Factor X deletion mutants and analogues thereof
US20060234935A1 (en) Mutants of the factor VII epidermal growth factor domain
HRP970077A2 (en) Thrombin muteins as antidotes for thrombin inhibitors
AU646633B2 (en) Soluble analogs of thrombomodulin
US5876971A (en) Thrombin inhibitor from the saliva of protostomia
EP0861326A1 (en) Hybrid factor viii with modified activity
AU741798B2 (en) Recombinant protein C and protein S variants
US20150337284A1 (en) Factor ix variants
Meulien et al. Increased biological activity of a recombinant factor IX variant carrying alanine at position+ 1
US8088372B2 (en) Thrombin mutant
AU2003212739A1 (en) Recombinant protein c variants
MXPA99007817A (en) Factor x deletion mutants and analogues thereof
MXPA99007768A (en) Factor x analogues with a modified protease cleavage site

Legal Events

Date Code Title Description
A1OB Publication of a patent application
ODBC Application rejected