CN105548585B - 通过差分带电荷微粒迁移率进行脂蛋白分析 - Google Patents
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Abstract
本发明提供利用差分带电荷微粒迁移率分析方法,由生物样品制备用于诊断目的的脂蛋白的仪器和方法,该脂蛋白包括HDL、LDL、Lp(a)、IDL和VLDL。还提供通过差分带电荷微粒迁移率分析脂蛋白的大小分布的方法,该脂蛋白通过本发明的方法制备。还提供评估脂质相关的健康风险、心血管状况、心血管疾病的风险和对治疗性介入的反应性的方法,该方法利用通过本发明的方法测定的脂蛋白大小分布。
Description
本分案申请为分案申请201410475329.3的分案申请,原始申请的申请日是2008年6月6日、申请号是200880101850.3(PCT/US2008/066178)、发明名称为“通过差分带电荷微粒迁移率进行脂蛋白分析”。
发明领域
本发明总体涉及利用离子迁移率测量装置和方法进行用于诊断目的的微粒大小分析和包括脂蛋白的生物微粒的分析的领域。本发明还提供用于纯化和分离包括但不限于脂蛋白和含有脂蛋白的生物复合物的生物分子的方法和仪器。
发明背景
提供以下描述仅仅帮助理解本发明。引用的文献或提供的信息没有一个被承认是本发明的现有技术。
在美国,心血管疾病是死亡的主要原因。除了患者人口特征和当前的健康外,用于测定将来心脏病风险的最常用和接受的方法包括测定胆固醇和脂蛋白的血清浓度水平。存在完善确定的生化标志——包括例如但不限于胆固醇和脂蛋白水平——的截断值的推荐值,用于测定风险。然而,胆固醇和脂蛋白测量显然不是全部情况,因为多达50%的处于早期心脏疾病风险的人们目前没有被ATP III指南(即,由National Cholesterol EducationProgram and the National Heart,Lung and Blood Institute发布的Adult TreatmentPanel III guidelines)所包含。
测量血液中脂蛋白和其它脂质的方法包括例如但不限于评价禁食的总胆固醇、三酸甘油脂、HDL(高密度脂蛋白)和/或LDL(低密度脂蛋白)胆固醇浓度。当前,测量LDL胆固醇最广泛使用的方法是间接Friedewald方法(Friedewald等,Clin.Chem.,1972,18:499-502)。Friedewald测定方法需要三个步骤:1)测定血浆三酸甘油脂(TG)和总胆固醇(TC),2)沉淀VLDL(极低密度脂蛋白)和LDL(低密度脂蛋白),和3)定量HDL胆固醇(HDLC)。将VLDLC估算为血浆三酸甘油脂的五分之一,由公式:LDLC=TC-(HDLC+VLDLC)计算LDL胆固醇浓度(LDLC)。虽然一般是有用的,但是在某些情况下Friedewald方法的准确度有限。例如,误差可能出现在三个步骤的任何一步中,部分因为这个方法要求在每个步骤中使用不同的方法。而且,Friedewald方法在某种程度上为间接的,因为它假定VLDLC浓度是血浆三酸甘油脂的五分之一。因此,当一些患者的VLDL偏离这个比例时,出现进一步的不准确。
评价血液脂蛋白的另一种方法考虑测量脂蛋白的大小和密度。由于遗传和非遗传的影响,脂蛋白的大小分布在个体中呈现不同。脂蛋白的直径一般为大约7nm到大约120nm的范围。在这个直径大小范围中,存在为心血管疾病重要预测物的微粒亚组分。例如,在血流中,VLDL运输三酸甘油脂;因此,血液中高的VLDL水平是高甘油三酯血症的指示。通过显示物质数量为脂蛋白大小或密度的函数的分析技术,可以识别这些亚组分。
关于脂蛋白密度分析,通过在不同盐密度背景中的分析超离心,可以分析超离心分离的脂蛋白的漂浮性质,以便测定水合LDL的密度,如在Lindgren等,Blood Lipids andLipoproteins:Quantitation Composition and Metabolism,Ed.G.L.Nelson,Wiley,1992,p.181-274中显示,其通过引用并入本文。例如,通过使用已知为平衡密度梯度超离心分离的制备分离技术,基于密度或直径,LDL类别可以被进一步地分成七个亚类。已知特定LDL亚类LDL-IIIa、IIIb、IVa和IVb的升高水平与包括动脉粥样硬化的CHD(即,冠心病)增加的风险密切相关。而且,测定总血清胆固醇水平以及LDL和HDL组分中的胆固醇水平常规地用作冠心病风险的诊断试验。脂蛋白类和亚类分布是更具预测性的试验,然而,由于它昂贵和费时,因此医生一般安排它仅用于有限数量的患者。
关于脂蛋白大小的测量,目前没有单一的接受方法。在临床环境中测量脂蛋白大小的已知方法包括垂直自动方案(vertical auto profile)(VAP)(参见,例如Kulkarni等,J.Lip.Res.,1994,35:159-168),其中使用流式分析仪(flow analyzer)对脂蛋白类中胆固醇进行酶法分析,随后进行分光光度测定并分析得到的数据,所述脂蛋白类是通过短暂旋转单垂直超离心(short spin single vertical ultracentrifugation)进行分离的。
另一种方法(参见例如Jeyarajah,E.J.等,Clin Lab Med.,2006,26:847-70)使用核磁共振(NMR)测定脂蛋白亚类的浓度。在这个方法中,获得血浆或血清样品的NMR化学位移谱。观察到的整个血浆样品的谱随后通过计算机方法与先前获得的脂蛋白亚类NMR谱的已知加权和进行匹配。给出样品谱和计算谱之间最佳拟合的加权因子随后用于估算血液样品中组成脂蛋白亚类的浓度。
另一种方法,梯度凝胶电泳分离(参见例如美国专利5,925,229;通过在此引用并入)是分离LDL亚类的梯度凝胶电泳方法。通过梯度凝胶电泳分离LDL组分,产生了与通过超离心分离获得的结果相当的结果。这种方法产生了LDL亚类的高分辨率,并且主要由研究工作实验室使用这种方法。然而,凝胶分离方法——其依赖于随后被光学测量的所有成分的均匀染色——受制于非均匀的显色性。也就是,不是所有的脂蛋白同等地良好染色。因此,有差别的染色吸收可能产生错误的定量结果。另外,不均匀的显色性可能产生错误的定性结果,因为测量的峰可以被扭曲到足够的程度以致引起脂蛋白的一类或一个亚类与另一类或亚类混淆。而且,梯度凝胶电泳可能花费许多小时才完成。
实际上,定量和定性测定来自生物样品的脂蛋白的更近方法已经由Benner等(美国专利7,259,018;通过在此引用并入)描述,该方法使用微粒大小和/或离子迁移率装置。
发明概述
通过本发明提供用于对脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析(differentialcharged-particle mobility analysis)(在本文也称为“离子迁移率分析”)的样品的制备方法,和可用于对脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析的仪器,所述对脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析利用气相电泳迁移分子分析仪。
在第一方面,本发明提供脂蛋白的纯化方法,该脂蛋白适合于脂蛋白类和亚类的差分带电荷微粒迁移率分析,该方法包括以下步骤:(a)制备含有在样品下面的第一溶液的离心管,该样品具有一种或多种脂蛋白和非脂蛋白成分,该第一溶液具有大于1.00g/mL和小于或等于大约1.21g/mL的第一密度;和(b)使离心管受到足以使非脂蛋白成分向离心管底部迁移并且远离脂蛋白的离心,由此提供纯化的脂蛋白。在一些实施方式中,第一密度的范围为大约1.15g/mL到大约1.21g/mL。在一些实施方式中,第一溶液优选地为水溶液,更优选地为水或其氘化形式。
在本发明的这个方面的情况下,通过处理哺乳动物的血液标本,获得含有脂蛋白的样品,如本文所述,该处理任选地包括通过加入包括例如但不限制于Na、K和/或Cs的Cl、Br和/或I盐的盐调整密度。
本发明的这个方面进一步在某些实施方式中提供在离心管里面、在样品上面并且邻近样品的第二溶液,该第二溶液优选地为比第一溶液的密度低。因此,第二溶液的密度大于或等于1.00g/mL并小于第一溶液的密度。在一些实施方式中,第二溶液是水溶液。出人意料地,已经发现在离心管中用具有较低密度的溶液覆盖含脂蛋白的样品导致离心分离后脂蛋白的回收提高。不希望被任何理论约束,相信从较致密的含脂蛋白溶液到较不致密的、优选地水溶液的、覆盖在上面的第二溶液的离子流调节了其中脂质的浮力,导致脂蛋白的回收提高。
如本文使用的,“离心”指通过使溶液在适当的仪器中受到高速旋转产生的离心力,根据密度和密度相关的分子量,分离或分析在溶液中的物质。
如本文使用的,“纯化”和相似的术语指特定成分的相对浓度相对于其它成分增加。例如但不限于,在例如损失脂质组分的情况下,从脂蛋白溶液中去除脂质构成脂蛋白组分的纯化。应该理解的是,在离心的情况下“纯化”和相似的术语指在离心后离心管中充分的分离,以允许通过本领域熟知的方法包括但不限于抽出和/或分级,提取分离的成分。出人意料地,已经发现在离心前,减小含有脂蛋白的溶液的密度——例如,但不限于通过减小其盐浓度——导致脂蛋白的某些组分包括LDL和HDL组分的回收提高。
如本文使用的术语“脂蛋白”和“脂蛋白微粒”指从哺乳动物的血液中获得的微粒,其包括以非共价键生物学装配以包封例如但不限于胆固醇和其它脂质的脱脂载脂蛋白。脂蛋白优选地指具有大约7到120nm大小范围的生物微粒,并且包括如本文所定义的VLDL(极低密度脂蛋白)、IDL(中密度脂蛋白)、LDL(低密度脂蛋白)、Lp(a)[脂蛋白(a)]、HDL(高密度脂蛋白)和乳糜微粒。
如本文使用的术语“脱脂载脂蛋白”指组成脂蛋白的结合脂质的蛋白质。如在本领域中已知的,脱脂载脂蛋白分成五个大类:Apo A、Apo B、Apo C、Apo D和Apo E。
如本文使用的术语“生物微粒”指源于生命来源(living sourece)的具有非共价结合分子装配体的物质。生物微粒的非限制的例子包括例如由脱脂载脂蛋白和脂质装配的脂蛋白;由非共价结合的外壳蛋白和糖蛋白装配的病毒成分;由抗体和它们相关的抗原装配的免疫复合物等。
如本文使用的术语“标志”、“生化标志”和相似的术语指具有与疾病或状况已知相关性的自然出现的生物分子(或其衍生物)。
在数值情况下,如本文使用,术语“大约”表示其值的+/-10%。
在另一方面,本发明提供纯化脂蛋白的方法,该方法包括以下步骤:(a)制备含有样品和位于样品的下面并邻近样品的第一溶液的离心管,样品包括一种或多种脂蛋白和非脂蛋白成分,其中样品还包括活性绿葡聚糖(Reactive Green dextran)和葡聚糖硫酸酯(DS),其中第一溶液含有氧化氘(D2O);和(b)使离心管受到足以使非脂蛋白成分向离心管底部迁移并远离脂蛋白的离心。在一些实施方式中,随后移出如此分离的纯化脂蛋白,用于差分带电荷微粒迁移率分析。在一些实施方式中,第一溶液的密度为1.0g/mL到大约1.21g/mL。在一些实施方式中,第一溶液的密度为1.00g/mL到大约1.10g/mL。在一些实施方式中,第一溶液基本上为D2O。
在另一方面,本发明提供用于差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白的纯化方法,该方法不包括离心,该方法包括以下步骤:a)使含有脂蛋白和非脂蛋白的溶液与一种或多种多阴离子化合物和一种或多种二价阳离子混合;b)使含有脂蛋白的沉淀物在混合溶液中形成;和c)在步骤b)之后,收集沉淀的脂蛋白并在再溶解之后对沉淀的脂蛋白进行差分带电荷微粒分析。
在另一方面,本发明提供用于差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白的纯化方法,该方法不包括离心,该方法包括以下步骤:a)使含有脂蛋白和非脂蛋白的溶液与一种或多种脂蛋白-捕获配体混合,该脂蛋白-捕获配体能够结合脂蛋白,形成脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物;b)分离脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物;和c)从脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物释放脂蛋白并对脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析。在一些实施方式中,脂蛋白选自HDL、LDL、Lp(a)、IDL和VLDL。在一些实施方式中,脂蛋白-捕获配体选自适配体和抗体。在一些实施方式中,脂蛋白-捕获配体是抗体。
在考虑分离和/或纯化本文描述的脂蛋白方面的某些实施方式中,本发明提供分析脂蛋白的大小分布的方法,该方法包括以下步骤:(a)依照本文描述的任一方法提供一种或多种脂蛋白;和(b)对一种或多种脂蛋白进行带电荷微粒迁移率分析,由此测定脂蛋白的大小分布。在以上方面的一些实施方式中,方法用于测定患者样品中的HDL、LDL、IDL和VLDL和更优选地为HDL、LDL、IDL、VLDL和Lp(a)的浓度。患者样品优选为血浆或血清。本文描述的方法也可以包括使用内标例如一种或多种标记的脂蛋白(例如,荧光标记)以在处理期间监测样品损耗,以获得被评估的起始样品中脂蛋白浓度的更准确测定。
在另一方面,本发明提供分析脂蛋白大小分布的方法,该方法包括以下步骤:(a)对进行差分带电荷微粒迁移率分析的一种或多种脂蛋白,在微粒大小的一个或多个区域中,测定差分迁移率微粒大小分布;(b)减去非脂蛋白试剂或非脂蛋白样品物质对微粒大小分布的供量(基值,contribution),获得脂蛋白微粒大小分布;和(c)输出脂蛋白微粒大小分布到显示器、打印机或存储器。
在另一方面,本发明提供包括储存在其上的计算机编码的计算机可读媒介,用于分析脂蛋白大小分布的计算机编码包括(a)对进行差分带电荷微粒迁移率分析的一种或多种脂蛋白,在微粒大小的一个或多个区域中,测定差分迁移率微粒大小分布;(b)减去非脂蛋白试剂或非脂蛋白样品物质对微粒大小分布的供量,获得脂蛋白微粒大小分布;和(c)输出脂蛋白微粒大小分布到显示器、打印机或存储器。
在另一方面,本发明提供用于差分带电荷微粒迁移率分析的仪器,其包括:(a)一个或多个适合于通过毛细管运输样品的泵,(b)当样品流入毛细管里面时,适合于使样品的微粒带电荷的电离器,和(c)适合于对带电荷微粒的样品进行差分带电荷微粒迁移率分析的离子迁移率分析仪。电离器可以包括在一部分毛细管周围的传导性连接器(union)。在一种实施方式中,传导性连接器在部分毛细管中形成微量滴定区(microtite region)并施加电荷到流过其中的样品上,因而使样品的微粒带电荷。
本仪器的某些实施方式还包括适合于提供用于差分带电荷微粒迁移率分析的样品到一个或多个泵的自动进样器。
在一些实施方式中,一个或多个泵可以包括适合于提供样品到纳流量泵(nanoflow pump)的高流量泵,所述纳流量泵适合于提供样品到毛细管。高流量泵可以以大约15-25微升/分钟的速度泵送样品,以及纳流量泵可以以大约100-200纳升/分钟的速度泵送样品。
附图简述
图1A至1D显示在3.7小时的超离心期间密度对脂蛋白从血浆样品中回收的影响。使用不同密度溶液并离心3.7小时,一式两份制备样品。在收集脂蛋白组分后,在差分带电荷微粒迁移率分析之前进行透析。每个图显示每个重复的曲线。溶液的密度:A=1.23g/mL;B=1.181g/mL;C=1.170g/mL;D=1.165g/mL。横坐标是脂蛋白直径(nm),和纵坐标是任意刻度的质量坐标,该质量坐标与作为尺寸(即直径)的函数算出的微粒实际数目线性相关。
图2显示在离心分离试验中使用D2O或低盐方案(没有D2O)从血浆中回收脂蛋白的比较。暗的曲线反映使用D2O作为稠密溶液(1.107g/mL)的2小时离心。浅的曲线反映使用KBr作为稠密溶液(1.151g/mL)的3.7小时离心。A-表示2小时离心的白蛋白的峰高;B-表示3.7小时离心的白蛋白峰高。横坐标是脂蛋白直径(nm),和纵坐标是任意刻度的质量坐标,如在图1的图例中所讨论。
图3显示在离心分离试验中使用与RGD/DS[RGD:与葡聚糖结合的活性绿19(Reactive Green 19)(RG 19);RGD/DS:与DS结合的RGD]联合的D2O,从血浆回收Apo A1、Apo B和总胆固醇(TC)的结果。横坐标表示测量的分析物。与每个框相关的数字指唯一的患者识别数字系统。
图4显示使用RGD、在离心纯化后从血浆回收脂蛋白的结果。RGD以不同浓度加入到样品并且使用D2O作为稠密溶液离心2小时15分钟。白蛋白峰高被表示出使用的RGD的四种不同浓度;A,10mg/mL RGD;B,15mg/mL RGD;C,20mg/mL RGD;和D,25mg/mL RGD。横坐标是脂蛋白直径(nm),和纵坐标是任意刻度的质量坐标,如在图1的图例中所讨论。
图5显示在用RGD和乙二胺四乙酸(EDTA)、或用RGD/DS和EDTA和任选地醋酸铵(AA)离心纯化后从血浆回收脂蛋白的结果。图例:(A)用7.5mg/mL RGD和2.5mg/mL DS提取,用与5ug/mL DS一起的25mM醋酸铵稀释;(B)用7.5mg/mL RGD和2.5mg/mL DS提取,用25mM醋酸铵稀释;(C)用7.5mg/mL RGD提取,用与5ug/mL DS一起的25mM醋酸铵稀释;(D)用7.5mg/mLRGD提取,用25mM醋酸铵稀释。横坐标是脂蛋白直径(nm),和纵坐标是任意刻度的质量坐标,如在图1的图例中所讨论。
图6显示在传统的密度分离和透析后,在稀释的缓冲液中包含DS的结果。A和B:在醋酸铵稀释缓冲液中包含5ug/mL DS。C和D:在醋酸铵稀释缓冲液中没有DS。横坐标是脂蛋白直径(nm),和纵坐标是任意刻度的质量坐标,如在图1的图例中所讨论。
图7显示通过差分带电荷微粒迁移率分析获得的脂蛋白曲线与关于脂蛋白组分的典型报告。横坐标是脂蛋白直径(nm),和纵坐标是质量,由差分带电荷微粒迁移率数据和本领域已知的参数计算。用交叉线显示的区域表示相对风险,斜线部分表示中等风险,垂直线部分表示较低风险,交叉线部分表示较高风险,和阴影部分表示不确定的风险。
图8图解依照本发明的实施方式的用于差分带电荷微粒迁移率分析的仪器。
图9A和9B图解与图8的仪器一起使用的连接器(conjunctive unions)的实施方式。
发明详述
如在表1中显示,“VLDL、IDL、LDL和HDL”指脂蛋白的分类。应该理解的是,在表1中使用的尺寸的值通过凝胶电泳的方法来测定,如本领域已知的。用本文公开的差分带电荷微粒迁移率分析方法,与用凝胶电泳获得的数据相比,观察到用差分带电荷微粒迁移率分析获得的脂蛋白直径的所有测量值转变为较小的直径。不希望被任何理论约束,相信这种不同是由于测量凝胶尺寸引起。这种转变表现出是线性相关的和通过下式近似:
0.86*凝胶直径=IM直径
表1描述使用传统的凝胶电泳测量,指定给各种脂蛋白组分的标准类和亚类名称:具有亚类VLDL I和II的极低密度脂蛋白(VLDLs);具有亚类IDL I和II的中密度脂蛋白(IDLs);具有亚类I、IIa、IIb、IIIa、IIIb、IVa和IVb的低密度脂蛋白(LDLs);和高密度脂蛋白(HDLs),其一般包括数个亚类,例如HDL IIa、IIb、IIIa、IIIb和IIIc。
不希望被任何理论约束,相信观察到的差分带电荷微粒迁移率分析直径和凝胶电泳直径之间的不同,可能也是因为在电泳凝胶的固有外加电场影响下与凝胶基质相互作用的脂蛋白的变形。该尺寸差异也可能是因为用于转化微粒密度(由分析超离心分离获得)为电子显微镜术获得的微粒大小的历史数据。
如本文使用,“乳糜微粒”表示具有大小为70-120nm、相应密度小于1.006g/mL的生物微粒。没有发现乳糜微粒在预测心脏疾病例如CHD中具有任何临床意义。
在本领域已知的“Apo A”是HDL的蛋白质成分。“Apo B”是LDL、IDL、Lp(a)和VLDL的蛋白质成分,并且实际上为低密度脂蛋白的主要的脱脂载脂蛋白,其具有人遗传基因座(genetic locus)2p24-p23,如本领域已知的。
如本文使用,“白蛋白”指组成大约60%的血浆的普遍存在的蛋白质,其具有大约1.35g/mL的密度,如本领域已知的。
“Lp(a)”和“脂蛋白(a)”指在血清中发现的具有不同于IDL和LDL的分子组成的脂蛋白类型,发现其与脱脂载脂蛋白a[apo(a)]复合。Lp(a)具有与LDL和IDL重叠的微粒大小,并且因此当样品中存在Lp(a)微粒时可能干扰微粒大小分析。虽然一些患者具有天然存在的低Lp(a)浓度,但是相信对于那些具有显著Lp(a)浓度的患者,在LDL大小测量之前去除Lp(a)以排除其他不准确的测量是好的做法。以这种方式,可以避免可能的Lp(a)大小干扰问题。
本发明考虑用于差分带电荷微粒迁移率和制备差分带电荷微粒迁移率的样品中的仪器和方法。差分带电荷微粒迁移率利用这样的原理:特定大小和电荷状态的微粒当在层流中传送穿过电场时以可预测的方式表现。因此,差分带电荷微粒迁移率分析是当带电荷微粒暴露于电场时,测定被分析的带电荷微粒的大小的技术。
电迁移率是离子的物理性质并且与离子受到电场时获得的速度相关。电迁移率Z被定义为:
其中V=终速和E=引起微粒运动的电场。微粒直径可以由以下获得:
其中n=在微粒上的电荷数量(在本情况下为单电荷),e=1.6×10-19库仑/电荷,Cc=微粒大小依赖性滑移校正因子(slip correction factor),η=气体粘度,和d=微粒直径。因此,解出d提供以下的关系:
因此,微粒直径作为已知参数的函数的明确关系产生。通过把参数设置为不同的值,如在以下进一步地描述和本领域已知的,可以选择不同微粒直径的带电荷微粒。在差分带电荷微粒迁移率分析的优选方法中,在分析期间改变作用于带电荷微粒的电场强度E。
在差分带电荷微粒迁移率分析中,使用一系列的层流运送微粒(例如,脂蛋白等)穿过系统。在易挥发的溶液中的脂蛋白被引入含有大约5%CO2的电雾化槽(electrospraychamber)中,其中脂蛋白脱溶剂。在电雾化槽中,脱溶剂的、带电荷的脂蛋白被电离空气中和,电离空气例如但不限于通过在槽中的α粒子发射器引入。根据Fuch式,可预测比例的微粒从含有单电荷的槽浮出并且被从槽运送到差分迁移率分析仪(Differential MobilityAnalyzer)(DMA)。有关Fuch公式细节,参考Fuchs,N.A.:The Mechanics of Aerosols,Macmillan,1964。“差分迁移率分析仪”、“DMA”和类似术语指基于离子的电迁移率分类带电微粒的装置,如在本领域已知和在本文描述的。在差分带电荷微粒迁移率分析中,当微粒具有已知的均匀电荷时,可以从其迁移率确定分类的微粒的大小。在DMA中,微粒在槽的顶部外表面进入并在快速流动的层流(即,“鞘流(sheath flow)”)中被运送。鞘流是被过滤的(除去微粒)空气,其不断地以20升/分钟的等速度再循环穿过DMA。当微粒穿过DMA(在鞘流中运行)时,槽上的电势以已知的速率上升。当电势改变时,通过在槽底部内表面的切口收集不同直径的微粒。微粒根据它们的电荷和直径顺着非直线路径穿过DMA。在任何给定的电势下,已知大小的微粒将沿着会允许它们穿过收集切口的路径。穿过收集切口的微粒被另一个不同的层流气流加快,并且被运送到粒子计数器。粒子计数器通过压缩使微粒增大到例如通过激光检测系统可以被检测和计数的大小。了解当微粒被收集时被施加到DMA的电势允许准确测定以该大小存在的微粒直径和微粒数量。收集这种数据并储存在接收器(bins)中,作为不同微粒大小的时间函数。用这种方式,基于收集数据所需的时间、引入电雾化装置中的样品流速和该大小的带电荷微粒的数量,任何给定大小范围的微粒的数量可以被测定并转化为微粒的浓度。
在考虑脂蛋白的分离和/或纯化的本发明方法中,最初的样品收集和制备可以通过本领域熟知的方法进行。典型地,首先取出2到5ml的空腹血液样品。在已经禁食了至少12小时时间的受试者中,乳糜微粒一般不存在;因此,通过禁食消除了VLDL大小和乳糜微粒大小的重叠。样品随后先在离心机(例如,临床离心机)中旋转,优选地以大约2000×G离心大约10分钟,该离心足以从样品中去除细胞成分。在这个过程中,密度更大的细胞成分在样品底部分层。随后使用本领域熟知的方法例如吸出,抽出余下在上面的含有脂蛋白的较小密度血浆样品。
过去,在制备用于离心中,血浆样品可以使用无机盐如氯化钠(NaCl)、溴化钠(NaBr)等的高纯度溶液或固体调整密度到特定密度。在一些以前的方案中,可以选择特定密度大于或等于待分析的脂蛋白物质的最高密度,使得当密度分层时,脂蛋白物质将漂浮。“密度分层”和类似术语指在进行离心的溶液中成分的分层。这些密度在表1中列表。密度调整的样品随后可以被超离心,例如在100,000×G进行大约18小时,以从脂蛋白中分离非脂蛋白。优选地通过超离心,非脂蛋白蛋白质特别是白蛋白可以从血浆样品中去除。在超离心期间,脂蛋白将漂浮到样品的顶部。因此,通过从密度调整的最低密度到最高密度顺序地离心,脂蛋白的各种类和亚类可以被顺序地提取。一般地,在离心样品的提取后,需要透析步骤,以除去为调整密度而引入的盐,在本领域熟知的条件下,该透析步骤一般需要4-12小时。
本文描述的含有脂蛋白样品的离心条件在生物化学分离领域是众所周知的。例如但不限于,样品一般以223,000×G在10℃离心1-4小时。在一些实施方式中,离心使用50,000-100,000、100,000-120,000、120,000-150,000、150,000-200,000、200,000-230,000、230,000-250,000×G的离心力或更大的力。在一些实施方式中,离心的时间是1、2、2.2、2.4、2.6、2.8、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18小时或甚至更长。在差分带电荷微粒迁移率分析之前,整分试样的脂质组分被从离心管的顶部移出(例如,10-200μL)并以pH 7.4的25mM醋酸铵(AA)、0.5mM氢氧化铵稀释(例如,1∶800)。有利地,在本文描述的一些实施方式中,透析步骤不必与本发明的方法连用,使得分析需要较少的时间。
在考虑脂蛋白的本发明实施方式中,脂蛋白选自HDL、LDL、IDL、Lp(a)和VLDL。在一些实施方式中,脂蛋白是HDL。
在考虑脂蛋白的本文提供方面的一些实施方式中,脂蛋白可以源于血浆样品,其通过本领域熟知或如本文描述的方法获得。术语“生物样本”、“生物样品”和相似的术语指外植的、取出的或其它方法收集的生物组织或流体,其包括例如但不限于全血、血清和血浆。在血液情况下术语“血浆”指当分离全血成为固体和液体成分时获得的流体。在血液情况下术语“血清”指在血液已经被凝块后,当分离全血成为固体和液体成分时获得的流体。在本发明的任一方面的一些实施方式中,生物样品是人源的。在本文提供的任一方面的一些实施方式中,生物样品是血清。在本文提供的任一方面的一些实施方式中,生物样品是血浆。
在考虑离心的本发明的一些实施方式中,离心没有达到平衡。“离心平衡”和相似术语指进行足够时间和在足够离心力下的离心,使得被离心的溶液的成分已经达到中密度浮力,如本领域所熟知的。出人意料地,已经发现,缩短的离心方案——如在本文描述其中离心平衡没有达到,然而可以提供脂蛋白的显著纯化。
在考虑离心含有脂蛋白和非脂蛋白成分的样品的本发明的一些实施方式中,纯化的脂蛋白在离心后从离心管的顶端部分收集。“离心管的顶端部分”和类似术语指当从离心机转子外面观看时,在离心管上面部分中的液体,其可以但不必包括在极其上面的液体。
进一步,涉及纯化脂蛋白的本发明的任一方法,已经出人意料地发现,当离心没有到平衡时,溶液密度减少到小于或等于大约1.21g/mL的值实际上导致LDL和HDL的回收提高,因而导致LDL和HDL纯化。
通过本领域熟知的各种物理生物化学方法,包括但不限于平衡密度超离心和分析超离心(analytic ultracentrifugation),可以直接测定脂蛋白密度。基于微粒大小和微粒大小和密度之间的已知关系,也可以间接地测定脂蛋白密度。通过本领域熟知的各种生物化学方法,包括但不限于本文描述的方法,可以测定脂蛋白大小。
离子迁移率分析也称为离子电迁移率或带电荷微粒迁移率分析,比本文描述的其它方法具有优势,因为它不仅基于物理原理准确地测量微粒大小,而且直接计数以每个尺寸存在的微粒数量,因而提供直接测量脂蛋白大小和每种脂蛋白的浓度。在分析气溶胶中的微粒中通常使用离子迁移率分析,并且适合于离子迁移率分析的分析器已经适合于分析大的生物大分子。离子迁移率分析是非常灵敏和准确的方法,然而其具有离子迁移率分析测量引入系统的所有微粒的缺点。因此,最重要的是在分析之前分离和/或纯化感兴趣的化合物。脂蛋白是这种方法的候选者,因为脂蛋白可以基于密度和本文描述的其它特征与其它血白蛋白中分离。
通过用各种密度的溶液离心纯化的血浆样品的脂蛋白的示例性差分带电荷微粒迁移率结果在图1中显示。在这些试验中,血清样品(25uL)被覆盖在四种不同密度盐(KBr)溶液的层(200uL)上。溶液的密度是1.165、1.170、1.181和1.23g/mL。每个样品在223,000×G超离心3.7小时的时间。去除在离心分离后的顶部100uL。每个密度的分级脂蛋白样品被用pH 7.4的醋酸铵(25mM)、氢氧化铵(0.5mM)透析过夜。在透析之后,通过差分带电荷微粒迁移率分析每个样品,得到的曲线在图1中显示。在与1.23g/mL相比更低密度处所见的HDL区域中,脂蛋白曲线的降低是明显的。不希望被任何理论所约束,这种观察结果被认为是由于使用较低密度盐溶液而更有效去除了血浆蛋白质。
进一步参考图1,横坐标是微粒大小(即,直径),和纵坐标是任意刻度的质量。在以微粒质量对独立变量(例如大小、密度、迁移率等)分布中曲线下的面积直接表示脂蛋白微粒质量。测量技术依赖于作为大小(直径)的函数对各个微粒计数。因此可能使用微粒的体积和密度,将特定大小的微粒数转化为质量值。脂蛋白的密度是微粒大小的熟知的函数并且可以从例如文献中获得。与该图相关的质量值被简单地标刻度,表示为相对值,但是使用稀释因子以及样品和空气穿过离子迁移率分光计的流速,可以转化为血浆中脂蛋白的实际质量。因此,在一些实施方式中,在非平衡离心之前,调整含脂蛋白溶液的密度到低于分离较高密度脂蛋白(例如,HDL)所预期的密度,实际上导致HDL和LDL的分离。有利地,减小含有脂蛋白样品的密度的方法也导致与白蛋白的分离提高。
在考虑离心含有脂蛋白和非脂蛋白成分的样品的本文提供方面的一些实施方式中,第一溶液包括D2O。在一些实施方式中,通过D2O的含量基本确定第一溶液的密度,其中第一溶液具有1.00到大约1.10g/mL的密度。D2O的密度在25℃近似为1.107gm/mL。因此,在本发明的一些实施方式中,含水的成分包括0-99%D2O或甚至更高。在一些实施方式中,D2O的量在例如但不限于10-99、20-99、30-99、40-99、50-99、10-90、20-90、30-90、40-90、50-90%等的范围中。在一些实施方式中,D2O的含量是一个具体值,其例如但不限于大约1、2、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、95、96、97、98、99或甚至100%的D2O。在一些实施方式中,第一溶液基本上为D2O。术语“本质上D2O”指包括水性成分而不具有另外加入的H2O的D2O。术语“基本上为D2O”和类似术语指在大于50%的范围中的D2O含量,例如但不限于55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%或甚至100%D2O。
在这个方面的一些实施方式中,含有脂蛋白的样品包括很少任何加入的盐,如果有的话。参考图2(试验条件在实施例1中提供),其显示使用D2O而没有另外的密度调整用盐以及使用无D2O的低密度盐溶液进行离心操作的结果,在2小时(D2O)和3.7小时(低密度盐溶液)后,观察到LDL和某些HDL组分(例如,HDL-IIb和HDL-IIa)的大约相同的回收。进一步参考图2,D2O和低密度盐离心过程的曲线产生了相似的曲线,尽管对于D2O样品,白蛋白增加(在HDL第3区域起始的峰)是因为离心时间减少判断的。不希望被任何理论所约束,使用D2O,减少了盐含量同时增加了密度,表现出导致从含有脂蛋白的样品中离心和纯化脂蛋白需要较短的时间。
参考图3,在图3的使用条件(实施例2的试验条件)下,观察到离心后Apo A1和ApoB近似相等的回收,这表明用D2O获得的较低密度没有产生更大的、较小密度微粒的选择性回收。
在涉及在离心之前通过在含有脂蛋白的样品溶液上面并邻近放置较小密度的溶液来纯化脂蛋白的本发明方法的一些实施方式中,使用无机盐优选地为NaCl和/或NaBr进行含有脂蛋白的溶液的单个密度调整。例如,在离心管中的这个样品上面可以放置一层第二溶液,该第二溶液的密度小于含有脂蛋白的样品溶液的密度。可选地,在离心管中的第二溶液下面,可以引入含有脂蛋白的样品溶液。依照表1中的密度,可以选择含有脂蛋白样品的密度调整在1.00到大约1.21g/mL的范围内,以分离具有相同或较小密度的脂蛋白类。可以选择第二溶液的密度在1.00g/mL至恰好小于含有脂蛋白的样品溶液密度的范围中,优选地在1.00到大约1.15g/mL的范围中,更优选地为1.00g/mL。以这种方式,密度小于含有脂蛋白的样品溶液的密度的HDL、IDL、LDL、Lp(a)和VLDL脂蛋白可以被同时提取。出人意料地,已经发现,给在离心管中含有脂蛋白的溶液提供具有更低密度的、在该含有脂蛋白的溶液的上面并与之邻近的溶液,导致使用离心分离使脂蛋白的回收提高。在优选的实施方式中,从离心管的最顶部、在弯液面处,向下吸取含有脂蛋白的组分至适当的期望体积。
进一步说明这些方法,已经发现当与较高密度样品所需的相应时间期间比较,在较低密度样品中含有脂蛋白的样品的离心分离所需的时间减少。在离心分离的情况下,术语“相应时间期间”和类似术语指在离心期间离心力相等的条件下,获得规定水平的离心所需的离心时间长度。例如但不限于,已经发现,需要至少2个小时离心(在例如230,000×G)以从典型的含有脂蛋白的样品中移出足够的白蛋白,较少的离心时间导致较少的白蛋白移出。不希望被任何理论所约束,看来,通过降低样品的密度,更容易使白蛋白和甚至其它非脂蛋白血浆蛋白质分层且因此更容易从脂蛋白中分离。因此,在优化脂蛋白的纯化中关键因素是缩短离心的时间,以最大化白蛋白和其它血浆蛋白的损失同时保留HDL。
在考虑离心分离含有脂蛋白和非脂蛋白成分的样品的本文提供方面的一些实施方式中,样品还包括可以作为其中的选定脂蛋白成分的沉淀剂的化合物,如在本领域已知的。“沉淀剂”指当加入到生物分子的溶液时,可以引起或促进这种生物分子沉淀的化合物。沉淀剂可以要求提供沉淀的另外试剂。“提供沉淀的另外试剂”和类似术语指与沉淀剂作用且可以被要求来通过沉淀剂提供沉淀的化合物。示例性沉淀剂包括但不限于,带电荷无机离子的盐,优选地为硫酸铵;抗体;任选地在离子种类(例如,二价阳离子)存在下的带电荷聚合物(例如DS等)、凝集素等。在一些实施方式中,即使在其中脂蛋白不被沉淀的条件下(例如,pH、浓度、缺少必要的其他试剂等),沉淀剂也存在。在一些实施方式中,沉淀剂是DS。在一些实施方式中,沉淀剂是DS和必要的其他试剂是二价阳离子。在一些实施方式中,含有脂蛋白的样品包括DS,但是缺少二价阳离子。不希望被任何理论所约束,相信在二价阳离子存在下DS结合到含有脂质的微粒,并且DS结合可以阻止非特异性结合相互作用,产生某些脂蛋白回收率的提高。例如但不限于,观察到,包含DS显著提高了从本文描述的一些制剂中LDL的回收率。
在考虑离心含有脂蛋白和非脂蛋白成分的样品的本文提供方面的一些实施方式中,在适合于使包括白蛋白和白蛋白结合化合物的复合物形成的条件下,样品还包括白蛋白结合化合物。代表性白蛋白结合化合物包括但不限于芳香族的白蛋白结合染料。芳香族的白蛋白结合染料可以包括重氮染料;碱金属盐,碱土金属盐或所述重氮染料的胺盐;磺酸染料;生理上可接受的碱金属盐、碱土金属盐或所述磺酸染料的胺盐;或其混合物。在本发明中特别有用的芳香族的白蛋白结合染料包括活性蓝2、伊文思蓝(Evans Blue)、台盼蓝(Trypan Blue)、溴甲酚绿(Bromcresol Green)、溴甲酚紫(Bromcresol Purple)、甲基橙、普施安红(Procion red)HE 3B等。在某些实施方式中,白蛋白结合化合物是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的类似物。适合于用作白蛋白结合化合物的代表性的NAD类似物包括但不限于RG 19和汽巴蓝(Cibacrom Blue)3GA(CB 3GA)。
在考虑使用白蛋白结合化合物的方法的实施方式中,在白蛋白结合化合物与含有脂蛋白的样品混合后,样品如本文描述进行离心。在一些实施方式中,白蛋白结合化合物与层析介质结合,该结合促进与白蛋白结合化合物复合的白蛋白容易例如但不限于通过过滤移出。在一些实施方式中,观察到结合的白蛋白结合化合物在离心管的底部分层,由此有利于移出(例如通过吸出等)含有脂蛋白的组分。在其中白蛋白结合化合物与层析介质结合的一些实施方式中,层析介质可以是顺磁性微粒、葡聚糖、琼脂糖或优选地为葡聚糖。如在本领域已知的,“顺磁性微粒”指具有包覆了配体的磁心的微粒,例如但不限于链霉亲和素。生物素对链霉亲和素的亲和性(Kd=10-15M)是生物学中最强和最稳定的相互作用之一。因此,顺磁性微粒将便利的磁分离技术与相互作用例如生物素-链霉亲和素相互作用的多功能性和高亲和性结合起来。观察到,结合白蛋白结合化合物的葡聚糖往往比本文描述的其他结合层析介质保持更长时间可溶。不希望被任何理论所约束,相信白蛋白结合化合物能够与在含有脂蛋白的样品中的白蛋白相互作用越长,含有白蛋白的复合物将形成得越多,因此增加了脂蛋白的纯度和回收率。
在考虑使用白蛋白结合化合物的方法的进一步实施方式中,在离心期间,白蛋白结合化合物以多达50mg/mL或甚至更高浓度存在,从血浆样品中回收的脂蛋白的数量和相对比例没有显著变化。例如,参考图4,在离心之前包括不同量RG 19的含有脂蛋白的样品的差分带电荷微粒迁移率分析显示,包含与葡聚糖结合的RG 19(RGD)导致脂蛋白的回收,其对脂蛋白的分布影响很小——如果有的话;比较图1与图4。参考实施例3和图4,虽然HDL和LDL的差分带电荷微粒迁移率曲线相似,但是在HDL 3峰的开始处峰(白蛋白)的大小减小,伴随RGD浓度提高。而且,在较高浓度的峰高度与在较低密度盐和3.7小时旋转的制备物中看见的峰高度相似。在其它实施方式中,白蛋白结合化合物的浓度是例如但不限于1、2、5、10、15、20、25、30、35、40、45或甚至50mg/mL。
在某些实施方式中,本发明提供与DS结合使用白蛋白结合化合物。参考图5,如通过差分带电荷微粒迁移率分析判断的,使用RGD、任选地DS和任选地醋酸铵(AA)引起LDL和HDL组分回收率的调变。参考实施例4和图5,在图5中显示的曲线的HDL区域存在相似性,当在提取物中存在DS时HDL的回收率增加。另外,观察到低的白蛋白峰高。相信在HDL 2a(图5)中的一个制备中,峰的增加不是典型的再现。也具有意义的是LDL的回收率增加。不希望被任何理论所约束,本文的结果表明,在提取物和稀释液中存在DS提供了最佳的回收率和再现性。
在某些实施方式中,在差分带电荷微粒迁移率分析之前,通过本发明方法获得的纯化的含有脂蛋白的样品被进一步地稀释。参考图6和实施例5,在差分带电荷微粒迁移率分析之前,评估了在用25mM醋酸铵进行1∶200稀释步骤中DS(+/-5ug/mL)存在或不存在的影响。如图6中显示,在DS存在时LDL峰高有显著的增加,而HDL峰轮廓相对地不受影响。
在某些方面和实施方式中,本发明考虑使用白蛋白结合化合物的方法,该白蛋白结合化合物与结合DS的层析介质结合并且进一步地在离心管中与在含有脂蛋白的样品的下面并邻近该样品的D2O溶液结合。使用这个方案的典型步骤在实施例6中提供。
在考虑离心含有脂蛋白和非脂蛋白成分的样品的本文提供方面的一些实施方式中,样品还包括能够结合非脂蛋白成分以形成非脂蛋白/非脂蛋白捕获配体复合物的非脂蛋白捕获配体,进一步地,其中离心使非脂蛋白/非脂蛋白捕获配体复合物与脂蛋白成分分离。“非脂蛋白捕获配体”和相似术语指结合不是脂蛋白的血浆成分的化合物。示例性非脂蛋白捕获配体包括但不限于如本领域理解的抗体和适配体。例如但不限于,从抗原(即,非脂蛋白)中分离抗体(即,如非脂蛋白捕获配体)可以用各种方法包括调节温度、pH、盐浓度等来实现。进一步例如但不限于,从适配体靶标(即,非脂蛋白)中分离适配体(即,如非脂蛋白捕获配体)可以用各种方法包括调节温度、pH、盐浓度、DNase或RNase等来实现。
在考虑离心含有脂蛋白和非脂蛋白成分的样品的本文提供方面的一些实施方式中,样品还包括能够结合脂蛋白成分以形成脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物的脂蛋白-捕获配体,进一步地,其中离心使脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物与非脂蛋白成分分离。“脂蛋白-捕获配体”和相似术语指能够结合脂蛋白的化合物。示例性脂蛋白-捕获配体包括但不限于如本领域理解的抗体和适配体。在优选的实施方式中,脂蛋白-捕获配体是抗体。
在不考虑离心含有脂蛋白和非脂蛋白成分的样品的本文提供方面的一些实施方式中,该方法考虑能够结合脂蛋白成分以形成脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物的脂蛋白-捕获配体。
术语“适配体”指由核酸例如RNA或DNA组成、紧紧地结合到特定分子靶标的大分子。术语“结合(bind,binding)”和类似术语指产生足够稳定的复合物以允许分离的相互作用或复合(络合)。在一些实施方式中,适配体特异性地结合Apo A1、Apo B或Apo(a)。对本发明有用的适配体的产生和筛选方法在本领域是熟知的;参见例如,Griffin等,美国专利5,756,291,其通过整体引用并入本文并且用于所有的目的。
如在本领域所实践的,适配体的选择(即,训练(training))的方法需要单链随机DNA寡聚体库,该库包括作为随后的聚合酶链反应(PCR)扩增的引物结合位点的随机序列和已知序列的侧翼区。使用在本领域熟知的常规合成方法,生成这些DNA寡聚体。作为起始和任选的步骤,通过常规的方法进行PCR扩增,并且留下扩增的库成为双螺旋DNA或用作在链分离后的单链DNA。任选地,可以进行转录成为RNA。在这种情况下的术语“寡聚体库”指这种单链或双螺旋DNA、或从其转录的RNA。术语“精制的寡聚体库”指已经进行至少一轮如本文描述的选择的寡聚体库。
进一步说明前面提到的适配体训练,使用具有靶分子连接在其上的柱或其它载体基质(即,靶标结合载体)进行“选择”步骤。在本领域熟知的连接可以通过共价或非共价的方法。为了允许形成寡核苷酸-靶标复合物,培育寡聚体库或精制的寡聚体库和靶标结合载体,并且通过例如本领域熟知方法洗涤,从载体环境中去除寡聚体库或精制的寡聚体库的未复合组分。随后通过本领域熟知的方法去除寡核苷酸产生精制的寡聚体库组分,其相对于前驱物寡聚体库或精制的寡聚体库具有增强的靶标特异性。
可选地,前面提到的适配体训练可以使用“反向选择”步骤,其中选择适配体以结合到生物样品的其它成分。在这种情况下,使用具有连接在其上的生物样品的其它成分的柱或其它载体基质(即,成分结合载体)。为了允许形成寡核苷酸-成分复合物,培育寡聚体库或精制的寡聚体和成分结合载体,并且通过例如本领域熟知方法洗涤,从载体环境中去除寡聚体库或精制的寡聚体库的未复合组分。随后通过本领域熟知的方法去除寡核苷酸产生精制的寡聚体库组分,其相对于前驱物寡聚体库或精制的寡聚体库具有增强的生物样品其它成分的特异性。在反向选择步骤中使用的生物样品的其它成分的例子包括但不限于免疫球蛋白和白蛋白。
在典型的生产训练方案中,在与靶标或生物样品的其它成分复合后,对回收的寡核苷酸进行PCR扩增。随后重复选择/扩增步骤,一般3到6次,以提供对靶标或生物样品其它成分具有增强的结合和特异性的精制的寡聚体库。可以克隆和测序如此获得的扩增序列。任选地,当多个对靶标特异的个体适配体序列已经获得和被测序时,在本领域熟知的配对和多重比对检查可以产生“共有序列”的说明,其中任选邻接核苷酸的核苷酸序列或区域被识别,其存在与结合到靶标的适配体相关。当共有序列被识别时,可以通过常规的合成或重组方法产生含有共有序列的寡核苷酸。
术语“抗体”指高亲和性和高特异性结合抗原(例如,脂蛋白或样品的其它成分)的免疫球蛋白。在这种情况下,“高亲和性”指例如但不限于1μM、100nM、10nM、1nM、100pM的解离常数或甚至更高的亲和性,以抗体与该抗体已经被培养其中的抗原的结合反应为特征。术语“培养(raise)”指通过本领域早就知道的方法生产高亲和性抗体。对这种情况下进一步地说明,术语“高特异性”指相对于非靶标抗原,试验抗体优先结合靶标抗原,其有利于结合试验抗体已经被培养其中的靶标抗原,以例如但不限于1、2、5、10、20、50、100、200、500、1000、10000或更高的解离常数的比为特征。
本发明考虑的抗体和适配体的衍生方法包括例如但不限于生物素化。在一些实施方式中,抗体或适配体被生物素化,以便随后在抗生物素蛋白结合的基质例如但不限于抗生物素蛋白层析柱上的分离使通过生物化学纯化领域熟知的方法容易分离。在一些实施方式中,与脂蛋白复合的生物素化的抗体或适配体还经受链霉亲和素-结合的磁珠。三元脂蛋白-生物素化亲和性试剂-链霉亲和素结合磁珠的复合物随后通过本领域熟知的免疫磁性方法来分离。
在这个方面的一些实施方式中,通过使用在本领域熟知的合适的连接体,脂蛋白-捕获配体与固体载体连接。示例性固体载体包括但不限于顺磁性微粒、小珠子、凝胶基质材料(例如,琼脂糖、)等。
对这个方面的进一步说明,在一些实施方式中,本发明提供在离心之前,从样品中移出Lp(a)的方法,该方法包括以下步骤:(a)在足以引起Lp(a)沉淀的条件下,通过样品与含有Apo B的脂蛋白的沉淀剂的混合形成Lp(a)的沉淀物;和(b)从第一溶液中分离含有Lp(a)的沉淀物。“含有Apo B的脂蛋白的沉淀剂”和相似的术语指沉淀Apo B的已知化合物,如在本领域熟知的。
在考虑纯化通过本文提供的离心方法收集的脂蛋白的本发明的一些实施方式中,本发明提供从收集的脂蛋白中移出Lp(a)的方法,该方法包括以下步骤:(a)在足以引起Lp(a)沉淀的条件下,通过收集的脂蛋白与含有Apo B的脂蛋白沉淀剂的混合形成Lp(a)的沉淀物;和(b)从收集的脂蛋白中分离含有Lp(a)的沉淀物。
对本文提供的从含有脂蛋白的溶液中移出Lp(a)的方法进一步说明,Apo B的示例性沉淀剂是但不限于二价阳离子存在下的DS。在一些实施方式中,二价阳离子是Mg2+。已经观察到,包含DS引起LDL回收率显著增加,对HDL的回收率影响很小。DS可以以在大约0.1到50mg/mL范围的浓度与含有脂蛋白的样品混合。在一些实施方式中,DS浓度是大约0.1、0.2、0.5、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、4.0、5.0、10.0、15.0、20.0、25.0、30.0、40.0或甚至50.0mg/mL。
在进一步的实施方式中,本发明提供获得纯化的Lp(a)的方法,该方法包括以下步骤:(a)溶解依照本文为此提供的任一方法获得的含有Lp(a)的沉淀物;(b)在适合于允许形成Lp(a)-凝集素复合物的条件下,使溶解的Lp(a)与含有连接到固体载体的凝集素的固体载体试剂混合;(c)分离Lp(a)-凝集素复合物;和(d)从Lp(a)-凝集素复合物中释放Lp(a),由此提供适合例如用于差分带电荷微粒迁移率分析的纯化脂蛋白。
对这个方法的进一步说明,凝集素可以选自麦胚凝集素(WGA)、利马豆凝集素(LGA)、植物凝集素(PHA)和鲎凝集素(HCL)。在一些实施方式中,凝集素是WGA。在一些实施方式中,固体载体包括琼脂糖。包括与Lp(a)反应形成复合物、分离这种复合物和连接凝集素到固体载体在内的处理这些凝集素的方法在本领域是熟知的。
对这个方法的进一步说明,在一些实施方式中,释放步骤包括用凝集素的竞争性配体洗涤Lp(a)-凝集素复合物。在一些实施方式中,竞争性配体是N-乙酰氨基葡萄糖(NAG)。在一些实施方式中,释放步骤包括使用如在本领域已知的二硫化物还原剂的二硫化物还原,以还原连接apo(a)和Apo B的二硫化物,由此释放LDL。
在考虑进一步纯化通过本文提供的离心方法收集的脂蛋白的本发明的一些实施方式中,本发明提供从收集的脂蛋白中移出Lp(a)的方法,该方法包括以下步骤:(a)溶解依照本文为此提供的任一方法获得的含有Lp(a)的沉淀物;(b)使溶解的Lp(a)与γ-球蛋白和脯氨酸混合;(c)通过加入沉淀剂沉淀混合物;和(d)从沉淀物中回收Lp(a),由此提供适合于差分带电荷微粒迁移率分析的纯化脂蛋白。如在本领域已知的,“γ-球蛋白”指γ-类的免疫球蛋白。示例性沉淀剂包括但不限于带高电荷的无机离子的盐,优选地为硫酸铵。对本实施方式有用的γ-球蛋白的浓度可以是在0.01-0.1ug/mL、0.1-1.0ug/mL、1.0-2.0ug/mL、2.0-5.0ug/mL、5.0-10.0ug/mL、10.0-100ug/mL、100-1000ug/mL或更高的范围内。脯氨酸的浓度可以是在10uM-100uM、100-100-uM、1-2mM、2-5mM、5-10mM或甚至更高的范围中。
对考虑收集的脂蛋白的本文提供的方法的进一步说明,在一些实施方式中,含有脂蛋白的溶液与惰性离心基质接触。在本发明的离心纯化方法的情况下,“惰性离心基质”和相似的术语指不与脂蛋白化学反应、但尽管如此增强了纯化的材料。不希望被任何理论所约束,相信惰性离心基质在离心后起到稳定离心管所含之物的作用,使得例如在减速和/或从离心管中吸取脂蛋白或其它组分的期间引入的人为因素被最小化。示例性惰性离心基质包括但不限于凝胶浆液(gel slurry)或惰性珠子。在一些实施方式中,凝胶浆液是凝胶基质。在一些实施方式中,惰性离心基质包括惰性珠子。示例性惰性珠子包括但不限于适合于下沉到离心管中第一溶液的底部的玻璃珠、聚苯乙烯珠等。惰性珠子可以是任意合适的大小,例如但不限于大约0.1、0.2、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、2.0、2.2、2.4、2.6、2.8、3.0、3.3、3.6、3.9、4.0mm或甚至更小或更大。
在涉及通过使用多阴离子化合物和一种或多种二价阳离子,纯化用于差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白的本发明的方面的一些实施方式中,多阴离子化合物选自DS、支链淀粉和聚硫酸乙烯酯(polyvinyl sulfate),优选地为DS。在一些实施方式中,二价阳离子选自Mg2+和Ca2+,优选地为Mg2+。
在一些实施方式中,本发明提供纯化用于差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白的方法,该方法不包括离心。在一些实施方式中,包括脂蛋白和非脂蛋白的溶液与一种或多种能够结合脂蛋白以形成脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物的脂蛋白-捕获配体混合。在一些实施方式中,在脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物的形成后,通过本领域已知的方法包括但不限于免疫磁性方法分离如此形成的复合物。在一些实施方式中,在脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物的分离后,通过本领域已知和本文描述的方法,脂蛋白从脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物中释放。
在另一方面,本发明提供通过差分带电荷微粒迁移率分析进行分析脂蛋白的大小分布的方法。在一些实施方式中,从体液例如个体的血浆样品中获得一种或多种脂蛋白。在一些实施方式中,一种或多种脂蛋白选自HDL、LDL、Lp(a)、IDL和VLDL。在一些实施方式中,方法还包括使用测定的脂蛋白大小分布进行个体评估的步骤,评估选自脂质相关的健康风险、心血管状况、心血管疾病的风险和对治疗性介入的反应性。
在脂质相关的健康风险、心血管状况和心血管疾病的风险的情况下,“评估”指生成的脂蛋白大小分布与人群的死亡率和危险因子的统计相关性,如本领域所熟知的。在对治疗性介入的反应性的情况下,评估指比较在进行治疗性介入之前和之后的脂蛋白大小分布。示例性治疗性介入包括但不限于为了降低胆固醇、降低LDL、IDL和VLDL、Lp(a)和/或提高HDL的目的,给与药物到个体,如在本领域已知的。
在一些实施方式中,在分析报告中报告脂蛋白分析物的结果。在由本发明考虑的脂蛋白和其它脂质分析物的情况下,“分析报告”指提供给例如临床医生、其它保健提供者、流行病学家等的报告,该报告包括个体的生物样品例如血浆样品的分析结果。分析报告可以以打印或电子形式、或任何方便分析、综合和/或归档其中数据的形式出现,如在本领域已知的。分析报告可以包括关于报告的个体受试者的识别信息,包括但不限于姓名、地址、性别、标识信息(例如,社会安全号、保险号)等。分析报告可以包括样品中脂质的生物化学特征,样品中脂质例如但不限于三酸甘油脂、总胆固醇、LDL胆固醇和/或HDL胆固醇等,如在本领域已知和/或本文描述的。分析报告还可以包括在通过本文提供的方法制备的样品上实施的脂蛋白的特征和由此得出的参考范围。术语“参考范围”和相似的术语指在本领域已知的生物样品的成分的浓度,以反映在个体群中一般正常观察到的范围。分析报告中脂蛋白的示例性特征可以包括通过差分带电荷微粒迁移率测定的非-HDL脂蛋白和Lp(a)的浓度。进一步的脂蛋白示例性特征——例如通过本发明方法制备的样品上实施的差分带电荷微粒迁移率分析测定——包括VLDL、IDL、Lp(a)、LDL和HDL以及它们的亚类的浓度和参考范围。分析报告还可以包括通过本发明的方法制备的样品的脂蛋白大小分布,例如通过差分带电荷微粒迁移率分析获得。在实施例7中提供了在示例性分析报告中包括的项目。
实施例
实施例1-使用D2O和低盐溶液纯化脂蛋白的比较
使用低密度盐溶液(1.151g/mL)(即,“低密度盐样品”)或D2O(各200uL)处理血清样品(25uL)。样品在223,000×G离心3.7小时(低密度盐样品)或2小时(D2O)。离心后移出顶部的100uL之后,用醋酸铵溶液透析低密度盐样品,并且在差分带电荷微粒迁移率分析之前稀释到1∶200。在差分带电荷微粒迁移率分析之前,D2O样品在离心后用醋酸铵直接稀释到1∶200。差分带电荷微粒迁移率分析的结果在图2中显示。
实施例2-纯化对Apo A、Apo B和TC回收的影响
为了评估HDL(Apo A1)在使用D2O的步骤中是否优先损失,如图3中显示的三个样品(即,749、1043、14:任意和惟一的患者标识号)经受脂蛋白分离,使用D2O连同RGD/DS溶液(分别为7.5/2.5mg/mL)溶液移出白蛋白。以六份制备每个样品。分析每个分离的各顶部100uL的Apo A1(HDL)、Apo B(LDL、IDL、VLDL)和总胆固醇(TC)的含量。使用商购的单克隆捕获抗体(Biodesign International,Saco,MN)和抗人山羊多克隆检测抗体,通过标准的ELISA测量血浆或血清脱脂载脂蛋白AI和B,在非竞争性夹心式免疫测定中纯化和生物素化(International Immunology Corp.,Murrieta,CA)脱脂载脂蛋白AI和B。通过加入链霉亲和素连接的过氧化物酶、接着使用邻苯二胺(ortho-phenyline-diamine)显色来测量浓度。使用CDC#1883血清参照材料(Center for Disease Control,Atlanta,GA)和混合的参照血清(Northwest Lipid Research Clinic,Seattle,WA),使脂蛋白校准器标准化。依照制造商的说明书,使用商购的测定试剂盒试剂(Bayer Health Care,Tarrytown,NY)测量总胆固醇,并修改用于分析每个微量滴定板孔的25μl血清或血浆加上200μl胆固醇试剂。在显色后,使用微量滴定板读出器,测量标准、对照、样品和试剂背景。结果(图3)显示与在每个血清中存在的总数比较的每个样品的平均回收率。不希望被任何理论所约束,纯化步骤没有引起HDL优先损失,如通过Apo A1和Apo B的相等回收率所判断的。
实施例3-不同RGD对脂蛋白组分回收的影响
在被铺在D2O垫层上面之前,血清样品与不同量的RGD(10、15、20、25mg/mL)混合并在冰上培育15分钟。在223,000×G离心120分钟后,顶部100uL被移出并用醋酸铵溶液1∶200稀释。随后通过差分带电荷微粒迁移率分析,分析样品。结果在图4中显示。
实施例4-使用RG 19、DS、AA纯化脂蛋白
参考图5,为了评估在提取/纯化和稀释中DS对白蛋白移出和脂蛋白回收的影响,用只有20uL的7.5mg/mL RGD(图5中图例“C/D”)或7.5mg/mL RGD和2.5mg/mL DS的20uL组合(图5中图例“A/B”),提取血清样品(5uL)。用于提取和稀释的DS分子量是10K。在冰上培育15分钟后,在10℃,每个样品在223,000×G离心2小时15分钟。顶部100uL被移出,并且用25mM醋酸铵溶液(图5中的图例“B/D”)或含有5ug/mL DS的25mM醋酸铵(图5中的图例“A/C”)1∶200稀释。
实施例5-在稀释剂中使用DS的脂蛋白纯化结果
参考图6,使用本领域已知的方法,由18小时密度分离制备的含有脂蛋白的血清样品在透析后用于评估稀释液中DS对LDL回收的影响。离心的血清样品的等分试样用不存在DS的25mM醋酸铵1∶200稀释,并且进行差分带电荷微粒迁移率分析。另一个等分试样用存在5ug/mL DS的25mM醋酸铵1∶200稀释。每个样品的重复试验在图6中显示。
实施例6-使用RG 19、DS、D2O纯化脂蛋白
从血浆获得的含有脂蛋白的样品通过涡旋短暂地混合。5uL的样品或任选地对照与20uL的含有7.5mg/mL RGD(Sigma)、2.5mg/mL DS(Sigma)和0.5mg/mL EDTA(SpectrumChemicals)的白蛋白去除试剂混合,并在冰上培育15分钟。培育后,样品的混合物被置于Ti42.2超离心管(Beckmann)中200uL的D2O(Medical Isotopes)上。样品随后在10℃、223,000×G(42,000rpm)超离心135分钟。超离心后,脂质组分(85μL)被从离心管的顶部移出。在通过差分带电荷微粒迁移率分析之前,样品用pH 7.4的25mM醋酸铵、0.5mM氢氧化铵稀释到1∶800的最终稀释度,用于HDL分析。对于LDL分析,样品用含有5ug/mL DS的相同稀释液1∶200稀释。在差分带电荷微粒迁移率分析之前,在深孔96孔板中产生最终的稀释物,并放置在维持6℃的具有冷却管组(cool stack)的自动进样器中。
实施例7-血清样品中脂蛋白纯化和分析的结果
血清从经过静脉穿刺收集的全血中分离。分离后,血清分成三部分,一个等分试样使用在本领域熟知的传统方法用于分析HDL、三酸甘油脂和总胆固醇含量。由这些结果计算LDL。在优选的实施方式中,如果三酸甘油脂大于400mg/dL,那么直接测量LDL。使用本领域熟知的免疫测定,分析第二等分试样的Lp(a)含量。对第三等分试样,应用差分带电荷微粒迁移率分析,以分级脂蛋白。
在典型的生产操作中,样品(一种或多种)与对照一起,如在本领域已知的,一种样品已知是LDL类型A(对照A)和一种样品已知是类型B(对照B),被放置在Perkin ElmerJANUS多功能探针(multiprobe)上。30uL的对照和样品(一种或多种)转移到分离试管并被混合,并加入120uL的RG19葡聚糖、DS、EDTA溶液。试管随后转移到冰上培育15分钟。15分钟培育后,试管回到到多功能探针。同时,离心管已经具有加入它们的两个4mm珠子,这些随后放置在其中120uL的D2O被加到每个离心管中的多功能探针上。随后在被转移到超离心转头(Ti42.2)之前,对照和样品(一种或多种)通过多功能探针被铺在D2O上。样品随后在10℃、223,000×G(42,000rpm)旋转135分钟。在离心后,小心地移去离心管并放置在多功能探针上,其中移走在试管中顶部85uL(+/-5uL)到分离的试管中。一旦收集了所有的样品,多功能探针产生每种对照和样品的两种稀释物。一种稀释物是用含有5ug/mL DS的醋酸铵溶液1∶200的最终稀释;第二种是用只有醋酸铵的溶液的1∶800稀释。两种稀释物随后在差分带电荷微粒迁移率仪器上运行。分析后,微粒数量使用本领域熟知的换算转化为nmol/L。合并HDL试验(1∶800)和较大的脂蛋白(1∶200)的数据,并且该数据与等分试样1和2的生物化学数据一起被报告。也报告脂蛋白的曲线以及总的LDL微粒浓度和LDL峰值微粒大小,用于确定LDL表型。合并这些数据得到的示例性评估报告在表2(数字表示)和图7(脂蛋白曲线的图形表示)中提供。
*“高”和“低”分别指在范围以上或以下。
**“类型”指通过微粒大小确定的表型,其中大约在LDL II(215.4A)处截断,如本领域已知的。
为了使用如上讨论的差分带电荷微粒迁移率分析获得更准确的脂蛋白曲线,可以在差分带电荷微粒迁移率仪器之前,在处理(例如样品离心、吸量和稀释)期间针对脂蛋白的任何损失调整结果。这可以通过加入一种或多种类型的标记脂蛋白到样品作为内标来实现。通过在处理期间跟踪标记,标记脂蛋白的回收率可以用于向上调整在原始的样品中存在的相同但未标记的脂蛋白的浓度。例如,测量在离心之后分离的等分试样脂蛋白的荧光信号,并与直接来自于起始的储用样品(没有离心)的等分试样比较。信号的不同表示回收的未知样品的比例,并且允许更准确计算在血浆或血清中的脂蛋白浓度。
使用以下的方法连接荧光分子到HDL亚组分。这个方法可以应用于其它类型的脂蛋白。通过顺序的漂浮从血浆中分离HDL以获得密度区间1.063-1.20g/mL的脂蛋白。随后透析总HDL组分到1.184g/mL的盐背景密度,并且在固定角度50.3Beckman转头中以40,000rpm、10℃下离心28小时。随后吸量6ml离心管以主要获得大、中等和小的HDL亚组分,各自为T[0-1]、T[1-3]和T[3-6]。随后亚组分对pH 8.5的100mM NaHCO3在4℃透析过夜。使用Lowry方法测量每个亚组分中的蛋白质浓度。
随后依照制造商的说明书,用荧光探针AlexaFluor 488(羧酸、琥珀酰亚胺酯“混合异构物”,Molecular Probes Cat#A-2000,分子量643.42,Abs@494nm/Em 517nm)标记HDL亚组分。简单地说,维持分别为>2mg/ml和10mg/ml的HDL和AF488的最适浓度,HDL亚组分与AF488以建议的最适比例10∶1(wt∶wt)结合。使用溶液的方案和数量在以下的表3中列出。
表3:培育混合物
1-加HDL亚组分到带有磁力搅拌棒的玻璃管形瓶中
2-在室温搅拌的同时,缓慢加AF488体积到配体中。
3-培育混合物1小时,同时继续搅拌。
4-加终止液(1.5M Tris,pH 8.0)。在室温培育30分钟。
5-透析标记的HDL亚组分至pH8的20mM Tris、150mM NaCl、0.27mM EDTA
[在冷箱中,避光]
对比1升 过夜(overnite),和2×1L透析物体积改变。
随后在从250到>30000的缓冲液中不同稀释度下测试AF488标记的HDL亚组分的信号灵敏度。在离心分离脂蛋白之前和之后,当用各种血浆制剂稀释时,也测试标记的HDL亚组分的信号灵敏度。
在第二次离心分离密度<1.23g/mL的标记HDL亚组分以从HDL:AF488结合物中去除未结合的荧光标记之后,进行另外的稀释和灵敏度测试。
从Molecular Probes(Cat#F-6130)获得的荧光探针荧光素-5-EX琥珀酰亚胺酯被用于以与以上描述的针对AF488的相同方式标记HDL亚组分。也可以使用以上的方法荧光标记VLDL和LDL。对于含有甲状腺球蛋白、脱铁铁蛋白、过氧化氢酶、乳酸脱氢酶和白蛋白的结合荧光标记的高分子量标准(Pharmacia HMW Standard Mix),进行另外的检测。
在考虑脂蛋白分布的分析和/或显示的本发明方面的实施方式中,例如但不限于图1、图7等,在提供以便临床解释之前,可以处理用离子迁移率分析仪获得的差分带电荷微粒迁移率数据。除非另有规定,在差分带电荷微粒迁移率分析的原始数据或提供以便临床解释的加工数据的情况下,“差分带电荷微粒迁移率数据”和相似的术语指具有与微粒直径相关的自变量和与观察的微粒计数相关的因变量的差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布。在一些实施方式中,自变量是电压或由电压产生的相应的电场(参见等式3)。在一些实施方式中,自变量是微粒直径。在一些实施方式中,因变量是微粒计数。在一些实施方式中,因变量是在规定的时间期间计数的微粒数量,该规定的时间期间例如但不限于0.001-0.01、0.01-0.1、0.1-1、1-2秒或甚至更长。在一些实施方式中,规定的时间期间是0.1秒。
“差分带电荷微粒迁移率数据的加工”和相似的术语指这样处理数据,当整个地考虑时,该处理可以提供准确和可重现地反映样品中脂蛋白分布和/或各脂蛋白类和其亚类的浓度的图形和/或数字结果。在差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据的加工中有用的示例性处理包括但不限于乘以常数、与函数卷积、加和/或减去常数数值或函数——包括但不限于校正杂质的供量、数值积分、平滑和本领域已知的其它算术处理。因此,可以由于各种原因应用差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据的加工,其包括但不限于,校正以准确反映样品中脂蛋白的生理浓度、调节以校正特定的仪器和方法的有效性、去除代表杂志供量的数据等。“特定的仪器和方法的有效性”和相似的术语指在处理和分析期间分析物(例如,脂蛋白)浓度的变化的检测和校正。示例性特定的仪器有效性包括在电雾化期间引入的明显的稀释,其中在形成的载微粒的气流中泰勒锥(Taylor cone)的形成产生了脂蛋白的明显稀释。通过使用具有本领域专业人员熟知的量化有效性的仪器的方法,测量有效性。在差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据的情况下,“杂质的供量”和相似的术语指例如但不限于离子迁移率仪器的微粒计数,其产生于在差分带电荷微粒迁移率仪器中计算的和在从中获得的差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据中包括的非脂蛋白种类的数据。在这种情况下,示例性非脂蛋白种类包括但不限于本文公开的任意试剂和单体和/或多体形式的白蛋白。
在一些实施方式中,在数据的加工期间,将由于本文描述的试剂带来的对差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据的供量从差分带电荷微粒迁移率大小分布数据中减去。例如,不希望被任何理论所约束,相信在差分带电荷微粒迁移率分析的微粒大小分布数据(即,具有微粒计数对微粒直径的差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据)中RGD引起的供量可以在选择的直径区间由一种或多种指数衰减函数表示。因此,在一些实施方式中,将差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据在选择区间中拟合至具有等式4形式的函数:
y1=k1*e(-0.7*d)(4)
其中y1是由本领域熟知的方法测定的对差分带电荷微粒迁移率的供量的最佳拟合,k1是拟合的经验常数,和d是微粒直径。上式4对于大于2nm的微粒直径是有效的。在一些实施方式中,拟合区间是3-6、3-4、3-5、3-6、4-6或5-6nm(微粒直径),优选地为3-4nm。在一些实施方式中,通过产生于等式4的拟合的函数,校正整组的差分带电荷微粒迁移率数据。
在一些实施方式中,进一步加工差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据,以说明在差分带电荷微粒迁移率分析的取样中白蛋白包含物的供量。在一些实施方式中,首先通过具有以下形式的分段函数,提供对白蛋白校正(即,“白蛋白校正曲线”)的解释:
其中y2和y3分别是区间2和3中的函数值,k2和k3是通过本领域熟知的方法测定的经验常数,和d是微粒直径。“经验值(来自锥形白蛋白数据)”指从分布中减去等于所测量分布中白蛋白量的白蛋白量对差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据的影响。
在一些实施方式中,白蛋白校正曲线被进一步地修改以说明白蛋白二聚体的存在。已经经验地发现,白蛋白二聚体一般在用于差分带电荷微粒迁移率分析的样品中以1-10%、1-8%、2-8%、2-7%、2-6%、2-5%的范围存在,优选地为2%,并且发现在特定的区间中可以调节白蛋白校正曲线,以说明和逐渐地抑制白蛋白二聚体的存在。在一些实施方式中,这种特定区间的直径下限是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或者甚至12nm。在一些实施方式中,这种特定区间的直径上限是1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或者甚至15nm。在一些实施方式中,这种特定区间的范围是0-15、5-10、7-9,优选地为7.9-8.4nm。因此,可以由具有式7形式的函数修改白蛋白校正曲线:
y’=y*((d-下限)*2*二聚体+(上限-d)*2)(7)
其中y是白蛋白校正曲线,y’是在逐渐抑制白蛋白二聚体的存在后的白蛋白校正曲线,d是微粒直径,下限和上限分别是用于校正的大小下限和上限,和二聚体是选择的百分比二聚体浓度。在一些实施方式中,二聚体的存在被抑制的区间在7.9nm(下限)和8.4nm(上限)之间。
在一些实施方式中,使用本领域熟知的曲线拟合方法,将代表白蛋白单体的理论曲线与在特定区间的样品的差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布拟合。在一些实施方式中,这种理论曲线由具有等式8形式的函数代表:
其中ym是白蛋白单体的理论数量分布,km和ka是经验导出常数。在一些实施方式中,ka是在0.1-10、1-5、2-4或2-3的范围内。在一些实施方式中,ka是2.56。在一些实施方式中,该特定区间是0-15、5-10、6-9、7-8nm的范围,优选地为7.3-7.5nm。在一些实施方式中,在确定导致与等式8最佳拟合的白蛋白单体的供量后,通过从其中减去等式7,由同一供量进行调节的,校正差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据。在一些实施方式中,在特定区间中实施通过减去等式7进行的校正,该特定区间例如但不限于0-15、2-12、4-10,优选地为6-10nm。在其中校正不考虑范围10-11nm的一些实施方式中,通过以(11-直径)的因子乘以等式7和减去差分带电荷微粒迁移率微粒大小分布数据的结果,在10-11nm区间进行相应校正。
举例而言,可以用各种电子装置执行以上描述的过程,例如台式机或笔记本电脑或手持式装置。这些装置为本领域技术人员所熟知。另外,结果可以被显示在显示器上、被打印或被储存在存储设备上,例如硬盘、CD ROM、CD R/W、闪存等。进一步地,通过网络,结果可以提供给其它装置,网络可以是私人网络或公用网络,例如Internet。就这点而言,电子设备和/或存储设备可以通过网络进入。
在一种实施方式中,将测量的值与经验确定的范围比较,以便基于落入或超出范围的患者血清或血浆值进行诊断。下面的图表说明这种诊断的一组示例性范围:
差分带电荷微粒迁移率光谱法提供了基于气相微粒电迁移率测量纳米颗粒的大小分布的方法。这种方法适于测量脂蛋白微粒的大小分布。对该方法自动化并在大约1分钟内产生微粒数量和微粒质量对微粒直径的曲线。首先通过超离心富集脂蛋白(去除血浆蛋白),并且随后在挥发性缓冲液中稀释以及电雾化。电中和过程留下带有单电荷的微粒的充分表征的组分。通过差分迁移率分析仪(DMA)抽出带电荷微粒,这使窄小尺寸的微粒穿过作为施加于DMA上电压的函数的微粒计数器。通过扫描施加的电压,获得HDL、LDL、IDL和VLDL的微粒数量分布。测量基于第一原理并且该测量不需要相对于微粒大小进行校正。将微粒数量分布转化为微粒质量分布。使用这种方法,LDL直径的分析内变化量(intra-assayvariation)<0.6%、HDL和LDL浓度的分析内变化量<10%,以及IDL和VLDL浓度的分析内变化量<15%。LDL微粒大小的分析之间重复性<1.0%,HDL和LDL浓度的分析之间重复性<15%,和IDL浓度的分析之间重复性<20%,VLDL浓度的分析之间重复性<25%。以下的表显示概括数据,表示为均值和SD,用于产生个体脂蛋白组分的参考范围。在研究中使用了总数259个健康个体(191女、68男),他们满足目前的最适脂质/脂蛋白水平的NCEPATP III标准:总胆固醇(chol)<200、LDL chol<100、HDL chol>40(男)>50(女)、三酸甘油脂<150mg/dL。结果显示出预期的性别之间差异,男性具有较高浓度的较小LDL微粒而女性具有增加的HDL 2b。
确定一个或多个标准在ATP III准则之外的人群剩余部分(异常)的范围。这些显示出预期的区别——较小LDL的浓度增加、以及HDL 2b(B)的大小减小且浓度下降,而HDL2a和3的变化很小。
可以用各种仪器完成以上描述的方法。例如,Benner等的美国专利7,259,018描述了一种仪器,通过该仪器,离心管中的样品溶液经过毛细管被排出,当从毛细管出来时,它通过电雾化过程离子化。因此,由压力舱产生的压差将离子化样品转移到气流中,气流随后运载样品到迁移率分析仪。在分析离心管中的样品之后,另一管样品被放置在压力舱里面。然而,在这种安排中,由于在离心管中任何时间仅提供小体积的样品,所以经过毛细管的样品的流速可以随着时间大幅度地变化,即使保持压力舱中的压力,因而影响离子迁移率分析仪基于预测的流速进行定量测定。
本发明的实施方式解决这些问题。依照发明的实施方式,在流到离子迁移率分析仪期间,通过泵送样品穿过毛细管和通过在毛细管里面离子化样品(或使其带电荷),获得恒定的流速。图8图解依照本发明的实施方式的用于离子迁移率分析的示例性仪器。图8的离子迁移率分析仪器10包括类似于美国专利7,259,018中说明的离子迁移率分析仪20。离子迁移率分析仪20能够计数从其中流过的微粒。离子迁移率分析仪20可以设有能够依照例如以上描述的算法处理(加工)数据的电子装置(没有显示),例如计算机。
由自动进样器22提供样品的带电荷微粒流到离子迁移率分析仪20。自动进样器22可以是自动提供样品的机器人系统。一种这样的自动进样器是型号HTC PAL,由LeapTechnologies of Carrboro,North Carolina制造。在一种实施方式中,自动进样器是仅提供纯化样品从一机架试管或从多孔板到泵(一个或多个)的机器人装置。自动进样器22在不需要大量人介入的情况下,可以提供基本连续的样品供应,用于离子迁移率分析。
来自自动进样器22的样品经过注射口24被提供到第一泵26。就这点而言,自动进样器22可以包括容纳纯化样品的储蓄器(没有显示)。注射口24可以是第一泵26的一部分。第一泵26是能够以相对高的流速(例如,大于或等于1.0微升/分钟)泵送来自自动进样器22的样品的高流速(或高流量)泵。在一种实施方式中,高流量泵以大约5-20微升/分钟的速度泵送来自自动进样器22的样品。最优选地,高流量泵以大约10微升/分钟的速度泵送样品。从Eksigent Technologies,2021 Las Positas Ct Suite 161,Livermore,CA获得合适的高流量泵。
由第一泵26,样品被提供到第二泵30。第二泵30是能够以相对低的速度(例如,小于或等于1.0微升/分钟)泵送样品到毛细管34的低流速(或纳流量(nanoflow))泵,使得样品的微粒能够适当的离子化或带电荷,如以下描述。在一种实施方式中,纳流量泵以大约100-200纳升/分钟的速度泵送样品到毛细管。最优选地,纳流量泵以大约200纳升/分钟的速度泵送样品。从Eksigent Technologies,2021 Las Positas Ct Suite 161,Livermore,CA获得合适的纳流量泵。
在一种实施方式中,可以使用联合泵组件代替两个泵。例如,泵组件可以包括高流量元件和一种或多种纳流元件。示例性联合泵组件是NanoLC 1-D,可以从EksigentTechnologies,2021 Las Positas Ct Suite 161,Livermore,CA获得。
在一种实施方式中,经过单个阀28或多个阀,第一泵26可以提供样品给多个纳流量泵。
通过阀32可以控制到和经过毛细管34的流量,阀32可以是第二泵的一部分或者可以是位于毛细管34里面的单独的阀。阀32保证了经过在阀32下游的毛细管34的样品的恒定流速。可以电子地控制阀32以维持恒定流速。就这点而言,对放置在阀32下游的传感器或仪表做出反应,可以控制阀。
样品微粒在它们流过毛细管34期间通过电离器40使其带电荷。如本领域技术人员将理解的,当微粒离开毛细管进入离子迁移率分析仪时,微粒的实际电离或带电荷可以发生。在一种实施方式中,电离器40是位于一部分毛细管34周围的传导性连接器组件。传导性连接器(也称为传导性接头)在极细流周围施加电流以提供电荷到该流体。一个示例性的传导性连接器组件在美国专利7,075,066中描述,其通过整体引用并入本文。随后经过毛细管34提供带电荷样品微粒到离子迁移率分析仪20。
图9A和9B图解在使经过毛细管的样品微粒流带电荷中使用的传导性连接器的示例性实施方式。先参考图9A,在毛细管34周围形成传导性连接器组件40a。毛细管34的电离区35被传导性连接器42包围。施加到传导性连接器42上的电压引起经过毛细管34的电离区35的流体中微粒带电荷。对于操作传导性连接器组件40a的详细说明,可以参考美国专利7,075,066。
现在参考图9B,传导性连接器组件的另一个实施方式被图解。在图9B的实施方式中,传导性连接器组件40b在样品流过其中的一部分毛细管34中形成微量滴定区37。微量滴定区37可以在毛细管的两个截面之间形成接头或封接。微量滴定区37具有样品微粒在其中被带电荷的小的死体积。在一种实施方式中,微量滴定区37具有大约5-50纳升的死体积。在最优选的实施方式中,微量滴定区37具有大约10-15纳升的死体积。微量滴定区37优选地由不锈钢形成。传导性连接器组件40b包括在微量滴定区37周围形成的传导性连接器44。施加到传导性连接器44上的电压使经过微量滴定区37的流体中微粒带电荷。
因此,离子迁移率分析仪20被提供了基本不随时间变化(substantially time-invariant)的速率下的样品的受控制纳流。就这点而言,流速优选地从正常速率的变化小于5%、更优选地小于2%、最优选地小于1%。这允许通过离子迁移率分析仪20进行更一致和可靠的分析。
附加实施方式:
1.纯化脂蛋白的方法,所述脂蛋白适合于脂蛋白类和亚类的差分带电荷微粒迁移率分析,所述方法包括:
(a)制备含有在样品下面的第一溶液的离心管,所述样品包括一种或多种脂蛋白和非脂蛋白成分,所述第一溶液具有大于1.00g/mL并小于或等于大约1.21g/mL的第一密度;和
(b)使所述离心管受到足以使所述非脂蛋白成分向所述试管的底部迁移并且远离所述脂蛋白的离心。
2.根据实施方式1所述的方法,其中所述第一溶液具有在大约1.15g/mL到大约1.21g/mL范围的密度。
3.根据实施方式1所述的方法,其中所述离心管还包括第二溶液,其具有大于或等于1.00g/mL并小于所述第一密度的第二密度,并且
其中所述第二溶液在离心之前位于所述样品上面并且邻近所述样品。
4.根据实施方式1所述的方法,其中所述一种或多种脂蛋白选自HDL、LDL、IDL、Lp(a)和VLDL。
5.根据实施方式4所述的方法,其中所述一种或多种脂蛋白是HDL。
6.根据实施方式1所述的方法,其中所述一种或多种脂蛋白和非脂蛋白成分来自血浆样品。
7.根据实施方式1或3所述的方法,其中所述离心没有达到平衡。
8.根据实施方式1或3所述的方法,其还包括:
(c)离心后,从所述离心管的顶部收集所述纯化的脂蛋白。
9.根据实施方式1或3所述的方法,其中在所述一种或多种脂蛋白不从所述样品沉淀的条件下,所述样品还包括葡聚糖硫酸酯。
10.根据实施方式1所述的方法,其中所述样品还包括白蛋白结合化合物,该白蛋白结合化合物能够结合白蛋白,形成白蛋白-白蛋白结合化合物复合物,并且
其中所述离心使所述白蛋白-白蛋白结合化合物复合物与所述纯化的脂蛋白分离。
11.根据实施方式10所述的方法,其中所述白蛋白结合化合物是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的类似物。
12.根据实施方式11所述的方法,其中所述NAD类似物选自活性绿19和汽巴蓝3GA。
13.根据实施方式11所述的方法,其中所述NAD类似物被结合到选自顺磁性微粒、葡聚糖、琼脂糖和的层析介质。
14.根据实施方式1所述的方法,其中所述样品还包括非脂蛋白捕获配体,该非脂蛋白捕获配体能够结合非脂蛋白,形成非脂蛋白/非脂蛋白捕获配体复合物,并且
其中所述离心使所述非脂蛋白/非脂蛋白捕获配体复合物与所述脂蛋白成分分离。
15.根据实施方式14所述的方法,其中所述非脂蛋白捕获配体选自适配体和抗体。
16.根据实施方式1或3所述的方法,其中在离心之前通过下述步骤将Lp(a)从所述样品中移出:
(i)在足以引起Lp(a)沉淀的条件下,通过使所述样品与含有Apo B的脂蛋白的沉淀剂混合,形成Lp(a)的沉淀物;和
(ii)从所述样品分离含有所述Lp(a)的沉淀物。
17.根据实施方式8所述的方法,其中Lp(a)通过下述步骤从所述收集的脂蛋白中移出:
(i)在足以引起Lp(a)沉淀的条件下,通过使所述收集的脂蛋白与含有Apo B的脂蛋白的沉淀剂混合,形成含有Lp(a)的沉淀物;和
(ii)从所述收集的脂蛋白分离含有所述Lp(a)的沉淀物。
18.根据实施方式16或17所述的方法,其中所述含有Apo B的脂蛋白的沉淀剂包括葡聚糖硫酸酯和二价阳离子。
19.根据实施方式18所述的方法,其中所述二价阳离子是Mg2+。
20.获得纯化的Lp(a)的方法,所述方法包括:
(1)溶解依照实施方式16或17获得的含有所述Lp(a)的沉淀物;
(2)在适合允许形成Lp(a)-凝集素复合物的条件下,使所述溶解的Lp(a)与含有连接到固体载体的凝集素的固体-载体试剂混合;
(3)分离所述Lp(a)-凝集素复合物;和
(4)从所述Lp(a)-凝集素复合物释放所述Lp(a),由此提供适合于差分带电荷微粒迁移率分析的纯化脂蛋白。
21.根据实施方式20所述的方法,其中所述凝集素选自麦胚凝集素(WGA)、利马豆凝集素(LGA)、植物凝集素(PHA)和鲎凝集素(HCL)。
22.根据实施方式21所述的方法,其中所述凝集素是WGA。
23.根据实施方式21所述的方法,其中所述固体载体包括琼脂糖。
24.根据实施方式21所述的方法,其中所述释放包括用WGA的竞争性配体洗涤所述Lp(a)-凝集素复合物。
25.根据实施方式24所述的方法,其中所述竞争性配体是N-乙酰氨基葡萄糖(NAG)。
26.根据实施方式21所述的方法,其中所述释放包括所述Lp(a)-凝集素复合物的二硫化物还原。
27.获得纯化的Lp(a)的方法,所述方法包括:
(1)溶解依照实施方式16或17获得的含有所述Lp(a)的沉淀物;
(2)使所述溶解的Lp(a)与γ-球蛋白和脯氨酸混合,形成混合物;
(3)通过加入沉淀剂沉淀所述混合物;和
(4)从所述沉淀物中回收Lp(a),由此提供适合于差分带电荷微粒迁移率分析的纯化脂蛋白。
28.根据实施方式27所述的方法,其中所述沉淀剂是硫酸铵。
29.根据实施方式1所述的方法,其中所述第一溶液是水溶液并且包括氧化氘。
30.根据实施方式29所述的方法,其中所述水溶液基本为氧化氘。
31.根据实施方式1所述的方法,其中所述第一溶液与惰性离心基质接触。
32.根据实施方式31所述的方法,其中所述惰性离心基质包括凝胶浆液或惰性珠子。
33.根据实施方式32所述的方法,其中所述凝胶浆液包括凝胶基质。
34.根据实施方式32所述的方法,其中所述惰性离心基质包括惰性珠子。
35.纯化脂蛋白的方法,所述方法包括:
(a)制备含有样品和位于所述样品下面并邻近所述样品的第一溶液的离心管,所述样品包括一种或多种脂蛋白和非脂蛋白成分,
其中所述样品还包括活性绿葡聚糖和葡聚糖硫酸酯,
其中所述第一溶液包括氧化氘;和
(b)使所述离心管受到足以使所述非脂蛋白成分向所述试管的底部迁移并且远离所述脂蛋白的离心。
36.根据实施方式35所述的方法,其中所述第一溶液具有1.00g/mL到大约1.21g/mL的密度。
37.根据实施方式35所述的方法,其中所述第一溶液具有1.00g/mL到大约1.10g/mL的密度。
38.纯化用于差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白的方法,所述方法不包括离心,所述方法包括:
(a)使含有脂蛋白和非脂蛋白的溶液与一种或多种多阴离子化合物和一种或多种二价阳离子混合;
(b)使含有脂蛋白的沉淀物在所述混合的溶液中形成;和
(c)在步骤(b)后,收集沉淀的脂蛋白并对其进行差分带电荷微粒迁移率分析。
39.根据实施方式38所述的方法,其中所述多阴离子化合物选自葡聚糖硫酸酯、支链淀粉和聚硫酸乙烯酯,并且
其中所述二价阳离子选自Mg2+和Ca2+。
40.分析脂蛋白大小分布的方法,所述方法包括:
(i)依照实施方式1、35或38的任一项所述的方法,提供一种或多种脂蛋白;和
(ii)对所述一种或多种脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析,由此测定所述脂蛋白的大小分布。
41.根据实施方式40所述的方法,其中所述一种或多种脂蛋白来自从个体获得的血浆样品。
42.根据实施方式40所述的方法,其中所述一种或多种脂蛋白选自HDL、LDL、Lp(a)、IDL和VLDL。
43.根据实施方式41所述的方法,其还包括:
(iii)使用所述测定的脂蛋白大小分布,对所述个体进行评估,所述评估选自脂质相关的健康风险、心血管状况、心血管疾病的风险和对治疗性介入的反应性。
44.纯化用于差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白的方法,所述方法不包括离心,所述方法包括:
(a)使包括脂蛋白和非脂蛋白的溶液与一种或多种脂蛋白-捕获配体混合,所述脂蛋白-捕获配体能够结合脂蛋白,形成脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物;
(b)分离所述脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物;和
(c)从所述脂蛋白/脂蛋白-捕获配体复合物释放所述脂蛋白和对所述脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析。
45.根据实施方式44所述的方法,其中所述脂蛋白选自HDL、LDL、Lp(a)、IDL和VLDL。
46.根据实施方式44所述的方法,其中所述脂蛋白-捕获配体选自适配体和抗体。
47.根据实施方式44所述的方法,其中所述脂蛋白-捕获配体是抗体。
48.根据实施方式40所述的方法,其中步骤(ii)包括:
(1)在微粒大小的一个或多个区间中,测定微粒大小分布;
(2)减去非脂蛋白试剂或非脂蛋白样品物质对所述微粒大小分布的供量,获得脂蛋白微粒大小分布;和
(3)输出所述脂蛋白微粒大小分布到显示器、打印机或存储器。
49.根据实施方式48所述的方法,其中所述测定微粒大小分布包括确定所述一种或多种区间的最佳拟合。
50.根据实施方式49所述的方法,其中所述最佳拟合是以下形式:
y1=k1*e(-0.7*d);
其中y1是对所测量的差分迁移率大小分布的供量,k1是所述拟合的经验常数,和d是微粒直径;
其中所述测定最佳拟合包括计算k1的值。
51.根据实施方式48所述的方法,其中所述减去包括应用代表所述非脂蛋白试剂或所述非脂蛋白样品物质的微粒大小分布的理论曲线。
52.根据实施方式48所述的方法,其中所述非脂蛋白试剂是与葡聚糖结合的活性绿19(RGD)。
53.根据实施方式48所述的方法,其中所述非脂蛋白样品物质是白蛋白。
54.分析脂蛋白大小分布的方法,其包括:
(a)对一种或多种进行差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白,在微粒大小的一个或多个区间中,测定差分迁移率微粒大小分布;
(b)减去非脂蛋白试剂或非脂蛋白样品物质对微粒大小分布的供量,获得脂蛋白微粒大小分布;和
(c)输出所述脂蛋白微粒大小分布到显示器、打印机或存储器。
55.根据实施方式54所述的方法,其中所述测定微粒大小分布包括确定所述一个或多个区间的最佳拟合。
56.根据实施方式55所述的方法,其中所述最佳拟合具有如下的形式:
y1=k1*e(-0.7*d);
其中y1是对所测量的差分迁移率大小分布的供量,k1是所述拟合的经验常数,和d是微粒直径;
其中所述确定最佳拟合包括计算k1的值。
57.根据实施方式54所述的方法,其中所述减去包括应用代表所述非脂蛋白试剂或所述非脂蛋白样品物质的微粒大小分布的理论曲线。
58.根据实施方式54所述的方法,其中所述非脂蛋白试剂是与葡聚糖结合的活性绿19(RGD)。
59.根据实施方式54所述的方法,其中所述非脂蛋白样品物质是白蛋白。
60.计算机可读媒介,其包括储存在其上的计算机编码,用于分析脂蛋白大小分布的所述计算机编码包括:
(a)对一种或多种进行差分带电荷微粒迁移率分析的脂蛋白,在微粒大小的一个或多个区间中,测定差分迁移率微粒大小分布;
(b)减去非脂蛋白试剂或非脂蛋白样品物质对微粒大小分布的供量,获得脂蛋白微粒大小分布;和
(c)输出所述脂蛋白微粒大小分布到显示器、打印机或存储器。
61.根据实施方式60所述的计算机可读媒介,其中所述计算机编码还包括:
通过确定所述一个或多个区间的最佳拟合,确定微粒大小分布。
62.根据实施方式61所述的计算机可读媒介,其中所述最佳拟合是以下的形式:
y1=k1*e(-0.7*d);
其中y1是对所测量的差分迁移率大小分布的供量,k1是所述拟合的经验常数,和d是微粒直径;
其中所述确定最佳拟合包括计算k1的值。
63.根据实施方式60所述的计算机可读媒介,其中所述减去包括应用代表所述非脂蛋白试剂或所述非脂蛋白样品物质的微粒大小分布的理论曲线。
64.根据实施方式60所述的计算机可读媒介,其中所述非脂蛋白试剂是与葡聚糖结合的活性绿19(RGD)。
65.根据实施方式60所述的计算机可读媒介,其中所述非脂蛋白样品物质是白蛋白。
66.用于差分带电荷微粒迁移率分析的仪器,其包括:
(a)一个或多个适合于运输样品经过毛细管的泵;
(b)适合于在所述样品流入毛细管内时,使所述样品的微粒带电荷的电离器;和
(c)适合于对带电荷微粒的所述样品进行差分带电荷微粒迁移率分析的离子迁移率分析仪。
67.根据实施方式66所述的仪器,其还包括适合于提供用于差分带电荷微粒迁移率分析的样品到所述一个或多个泵的自动进样器。
68.根据实施方式66所述的仪器,其中所述样品包括脂蛋白。
69.根据实施方式66所述的仪器,其中所述一个或多个泵包括适合于提供所述样品到纳流量泵的高流量泵,所述纳流量泵适合于提供所述样品到所述毛细管。
70.根据实施方式69所述的仪器,其中所述高流量泵以大约15-25微升/分钟的速度泵送所述样品,和其中所述纳流量泵以大约100-200纳升/分钟的速度泵送所述样品。
71.根据实施方式66所述的仪器,其中所述电离器包括在一部分所述毛细管周围的传导性连接器。
72.根据实施方式71所述的仪器,其中所述传导性连接器施加电荷到流过其中的所述样品上,因而使所述样品的微粒带电荷。
73.根据实施方式71所述的仪器,其中所述传导性连接器在一部分所述毛细管中形成微量滴定区并施加电荷到流过其中的所述样品上,因而使所述样品的微粒带电荷。
74.根据实施方式73所述的仪器,其中所述微量滴定区具有大约5-50纳升的死体积。
75.根据实施方式74所述的仪器,其中所述微量滴定区具有大约10-15纳升的死体积。
76.纯化脂蛋白的方法,所述脂蛋白用于差分带电荷微粒迁移率分析,所述方法包括:
a)在所述脂蛋白结合到包含顺磁性微粒的固体载体的条件下,培育包含脂蛋白、非脂蛋白、葡聚糖硫酸酯和所述固体载体的溶液;
b)从溶液中分离所述固体载体,从而将所述脂蛋白与所述非脂蛋白分离;和
c)从所述固体载体释放所述脂蛋白,其中所述释放的脂蛋白适合于测定所述脂蛋白的大小分布的差分带电荷微粒迁移率分析;
其中所述脂蛋白包含HDL。
77.根据实施方式76所述的方法,其中一种或多种所述脂蛋白进一步选自LDL、Lp(a)、IDL和VLDL。
78.根据实施方式76所述的方法,其中所述方法不包括离心。
79.根据实施方式76所述的方法,其中所述固体载体包含珠子。
80.根据实施方式76所述的方法,其中所述固体载体包含能够结合脂蛋白的脂蛋白-捕获配体。
81.根据实施方式80所述的方法,其中所述脂蛋白-捕获配体选自适配体和抗体。
82.根据实施方式76所述的方法,进一步包括对所述脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析,所述分析包括:
(a)在微粒大小的一个或多个区间中对所述脂蛋白测定差分迁移率微粒大小分布;
(b)减去非脂蛋白试剂或非脂蛋白样品物质对微粒大小分布的供量,获得脂蛋白微粒大小分布;和
(c)输出所述脂蛋白微粒大小分布到显示器、打印机或存储器。
83.根据实施方式82所述的方法,其中所述测定微粒大小分布包括确定所述一个或多个区间的最佳拟合。
84.根据实施方式83所述的方法,其中所述最佳拟合具有如下的形式:
y1=k1*e(-0.7*d);
其中y1是对所测量的差分迁移率大小分布的供量,k1是所述拟合的经验常数,和d是微粒直径;
其中所述确定最佳拟合包括计算k1的值。
85.根据实施方式82所述的方法,其中所述减去包括应用代表所述非脂蛋白试剂或所述非脂蛋白样品物质的微粒大小分布的理论曲线。
86.根据实施方式82所述的方法,其中所述非脂蛋白试剂是与葡聚糖结合的活性绿19(RGD)。
87.根据实施方式82所述的方法,其中所述非脂蛋白样品物质是白蛋白。
88.纯化脂蛋白的方法,所述方法包括:
(a)制备含有样品和位于所述样品下面并邻近所述样品的第一溶液的离心管,所述样品包括一种或多种脂蛋白和非脂蛋白成分,
其中所述样品还包括活性绿葡聚糖和葡聚糖硫酸酯,所述第一溶液包括氧化氘;和
(b)使所述管受到足以使所述非脂蛋白成分向所述管的底部迁移并且远离所述脂蛋白的离心。
89.根据实施方式88所述的方法,其中所述第一溶液具有1.00g/mL到大约1.21g/mL范围内的密度。
90.根据实施方式88所述的方法,其中所述第一溶液具有1.00g/mL到大约1.10g/mL范围内的密度。
91.分析脂蛋白大小分布的方法,所述方法不包括离心,所述方法包括:
(a)使含有脂蛋白和非脂蛋白的溶液与一种或多种多阴离子化合物和一种或多种二价阳离子混合;
(b)使含有脂蛋白的沉淀物在所述混合的溶液中形成;
(c)在步骤(b)后,收集沉淀的脂蛋白;和
(d)对所述一种或多种脂蛋白进行差分带电荷微粒迁移率分析,所述分析包括:
(i)在微粒大小的一个或多个区间中,测定微粒大小分布;
(ii)减去非脂蛋白试剂或非脂蛋白样品物质对所述微粒大小分布的供量,获得脂蛋白微粒大小分布;和
(iii)输出所述脂蛋白微粒大小分布到显示器、打印机或存储器,
由此测定所述脂蛋白的大小分布,
所述测定微粒大小分布包括确定所述一种或多种区间的最佳拟合。
92.根据实施方式91所述的方法,其中所述多阴离子化合物选自葡聚糖硫酸酯、支链淀粉和聚硫酸乙烯酯,并且
其中所述二价阳离子选自Mg2+和Ca2+。
93.根据实施方式91所述的方法,其中所述一种或多种脂蛋白来自从个体获得的血浆样品。
94.根据实施方式93所述的方法,进一步包括:
(e)使用所述测定的脂蛋白大小分布,对所述个体进行评估,所述评估选自脂质相关的健康风险、心血管状况、心血管疾病的风险和对治疗性介入的反应性。
95.根据实施方式91所述的方法,其中所述一种或多种脂蛋白选自HDL、LDL、Lp(a)、IDL和VLDL。
96.根据实施方式91所述的方法,其中所述最佳拟合具有如下的形式:
y1=k1*e(-0.7*d);
其中y1是对所测量的差分迁移率大小分布的供量,k1是所述拟合的经验常数,和d是微粒直径;
其中所述确定最佳拟合包括计算k1的值。
97.根据实施方式91所述的方法,其中所述减去包括应用代表所述非脂蛋白试剂或所述非脂蛋白样品物质的微粒大小分布的理论曲线。
98.根据实施方式91所述的方法,其中所述非脂蛋白样品物质是白蛋白。
通过整体地引用,并入在说明书中引用的所有专利和其它文献,包括任何表格和图,其引用程度如同每篇文献通过整体引用被单独地并入一样。
本领域技术人员将容易地意识到,本发明非常适合于获得提到的结果和优势以及在其中固有的结果和优势。本文作为现在代表性的优选实施方式描述的方法、变化和组合物是示例性的而不意欲限制本发明范围。包括在本发明精神内的、本领域技术人员将想到的其中的改变和其它用途由权利要求的范围限定。
对于本领域技术人员将非常显而易见的是,不偏离本发明的范围和精神,可以对本文公开的发明进行各种替代和修改。因此,这些另外的实施方式在本发明和所附权利要求的范围内。
在缺少未被本文具体公开的任何元件或多个元件、限定或多个限定的情况下,可以合适地实施本文图解描述的发明。因此,例如,在本文的每种情况下,术语“包括”、“基本由......组成”和“由......组成”中任一个可以用其它两个术语替换。已经使用的术语和表达被作为描述而不是限制的术语使用,并且在这些术语和表达的使用中不意欲排除所显示或描述的特征的任何等同物或其部分,而是认识到在要求保护的发明的范围内各种修改是可能的。因此,应该理解,虽然本发明已经通过优选的实施方式和任选的特征具体地公开,但是本领域技术人员可以采取本文公开的概念的修改和变化,并且这些修改和变化被考虑在所附权利要求限定的本发明的范围内。
此外,在按照马库什组或其它替代性方案组描述本发明的特征或方面的地方,本领域技术人员将认识到,由此也按照马库什组或其它组的任何个体成员或成员的亚组描述本发明。
同时,除非有相反的说明,在提供实施方式各种数值的地方,通过采用任何两个不同的值作为范围的端点描述另外的实施方式。这些范围也在所描述的发明的范围内。
因此,另外的实施方式在本发明的范围内和在所附权利要求之内。
Claims (2)
1.纯化脂蛋白的方法,所述脂蛋白用于差分带电荷微粒迁移率分析,所述方法不包括离心,所述方法包括:
(a)使含有脂蛋白和非脂蛋白的溶液与一种或多种多阴离子化合物和一种或多种二价阳离子混合;
(b)使含有脂蛋白的沉淀物在所述混合的溶液中形成;和
(c)在步骤(b)后,使用脂蛋白-捕获配体收集沉淀的脂蛋白,
其中:
所述一种或多种脂蛋白来自从个体获得的血浆样品并且包括选自HDL、LDL、Lp(a)和VLDL的一种或多种脂蛋白。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述多阴离子化合物选自葡聚糖硫酸酯、支链淀粉和聚硫酸乙烯酯,并且其中所述二价阳离子选自Mg2+和Ca2+。
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