WO2001040450A1 - Nouvelle carbonyl reductase, son gene et son procede d'utilisation - Google Patents

Nouvelle carbonyl reductase, son gene et son procede d'utilisation Download PDF

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WO2001040450A1
WO2001040450A1 PCT/JP2000/008321 JP0008321W WO0140450A1 WO 2001040450 A1 WO2001040450 A1 WO 2001040450A1 JP 0008321 W JP0008321 W JP 0008321W WO 0140450 A1 WO0140450 A1 WO 0140450A1
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butyl
tert
polypeptide
chloro
amino acid
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PCT/JP2000/008321
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Noriyuki Kizaki
Yukio Yamada
Yoshihiko Yasohara
Junzo Hasegawa
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Kaneka Corporation
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    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/37Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
    • C07K14/39Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi from yeasts
    • C07K14/40Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi from yeasts from Candida
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    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P41/00Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P41/00Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture
    • C12P41/002Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture by oxidation/reduction reactions
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/62Carboxylic acid esters

Definitions

  • the present invention provides a novel polypeptide, a gene encoding the polypeptide, an expression vector for expressing the polypeptide, a transformant obtained by transforming a host cell using the expression vector,
  • the present invention also relates to a method for producing a compound useful as a raw material for synthesizing medicines, agricultural chemicals, etc. using the transformant.
  • the present invention provides an asymmetric reduction of tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate to give (3R, 5S) -6-chloro
  • the present invention relates to an expression vector and a transformant transformed with the expression vector.
  • the present invention also relates to a method for producing tert-butyl (3R, 5S) -6-chloro-3,5-dihydroxyhexanoate, which method comprises converting the transformant or a processed product thereof into (S) -Step of reacting with tert-butyl 6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate and forming (3R, 5S) -6-chloro-3,5-dihydroxyhexanoic acid! Collecting ert monobutyl.
  • (3R, 5S) -tert-butyl 6-chloro-1,5-dihydroxyhexanoate is a compound useful as a raw material for the synthesis of pharmaceuticals, pesticides, etc., especially HMG-CoA reductase inhibitors.
  • the present inventors asymmetrically reduce tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate to give (3R, 5S) -6-chloro-3,5-
  • a polypeptide derived from a microorganism that produces tert-butyl dihydroxyhexanoate was discovered, and it was possible to efficiently produce tert-butyl (3R, 5S) -6-chloro-1,3,5-dihydroxyhexanoate.
  • the inventors have found that the present invention is possible, and have completed the present invention.
  • the present invention provides an asymmetric reduction of tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate to give (3R, 5S) -6-chloro-3,5. —
  • an object of the present invention is to efficiently produce the polypeptide using a genetic recombination technique.
  • the present invention provides a transformant which simultaneously produces the polypeptide and a polypeptide having glucose dehydrogenase activity at a high level, and further provides a practical (3R, 5S ) It is an object to provide a method for producing tert-butyl —6-chloro-3,5-dihydroxyhexanoate.
  • the present invention provides an asymmetric reduction of tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate to (3R, 5S) -6-chloro-3,5-dihydrido.
  • the present invention relates to a polypeptide having an enzymatic activity for producing tert-butyl roxyhexanoate.
  • This polypeptide has the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing, Includes an amino acid sequence having at least one amino acid substitution, insertion, deletion or addition in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.
  • the polypeptide may be derived from a microorganism belonging to the genus Candida. More preferably, the microorganism can be Candida magnoliae IFO0705 strain.
  • the present invention relates in one aspect to a polynucleotide encoding the above polypeptide.
  • the present invention provides, in one aspect, an asymmetric reduction of tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate to give (3R, 5S) -16-chloro —
  • the present invention also relates in one aspect to an expression vector comprising the polynucleotide.
  • this expression vector may be the plasmid pNTCR.
  • the expression vector may, in one embodiment, further include a polynucleotide encoding a polypeptide having glucose dehydrogenase activity.
  • the polypeptide having glucose dehydrogenase activity may be darcose dehydrogenase derived from Bacillus megaterium (Bacillus megaterium).
  • the expression vector may be plasmid pNTCRG.
  • the present invention also relates, in one aspect, to a transformant transformed with the above expression vector.
  • the transformant is Escherichia coli, and more preferably, E. coii HB101 (pNTCR) or E. coli HB101 (pNTCRG).
  • the present invention also relates, in one aspect, to a method for producing tert-butyl (3R, 5S) -6-chloro-3,5-dihydroxyhexanoate, which comprises the transformant and / or Or a step of reacting the treated product with tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-13-oxohexanoate, and the resulting (3R, 5S) -6-chloro-3,5 And collecting tert-butyl dihydroxyhexanoate.
  • the step of reacting is performed in the presence of a coenzyme regeneration system.
  • FIG. 1 shows a polynucleotide sequence and a deduced amino acid sequence of the present invention.
  • FIG. 2 is a diagram showing a method for producing a recombinant plasmid pNTCRG. BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
  • the polypeptide included in the present invention includes asymmetrically reducing tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate represented by the following formula (I).
  • S tert-butyl
  • tert-butyl
  • polypeptide for example, a polypeptide containing the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing, Or contains an amino acid sequence having at least one amino acid substitution, insertion, deletion or addition in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 of the sequence listing or a part thereof, and (S) -6-clo-5 Asymmetric reduction of tert-butyl hydroxy-3-hydroxyhexanoate to give (3R, 5S) — tert-butyl 6-chloro-3,5-dihydroxyhexanoate And the polypeptides possessed.
  • the polypeptide included in the present invention is obtained by asymmetrically reducing (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-tert-butylhexanoate to (3R, 5S) -6-chloro-3,3. It can be obtained from a microorganism having an activity of producing tert-butyl 5-dihydroxyhexanoate. Accordingly, the microorganism used as the source of the polypeptide is not particularly limited, and examples thereof include yeast of the genus Candida, and particularly preferred is Candida's magnolie IFO. 0705 can be mentioned.
  • the microorganism that produces the polypeptide of the present invention can be either a wild-type strain or a mutant strain. Alternatively, cell fusion or
  • microorganisms derived by genetic techniques such as genetic manipulation can also be used.
  • a microorganism producing the polypeptide of the present invention which has been genetically engineered, may be, for example, a step of isolating and / or purifying these enzymes to determine a part or all of the amino acid sequence of the enzymes, Determining a nucleotide sequence encoding the polypeptide; obtaining a nucleotide sequence encoding the polypeptide based on the amino acid sequence; introducing the nucleotide sequence into another microorganism to obtain a recombinant microorganism; and This recombinant microorganism can be obtained by a method including the step of culturing and obtaining the enzyme of the present invention.
  • a usual liquid nutrient medium containing a carbon source, a nitrogen source, inorganic salts, organic nutrients, etc. can be used as long as the microorganism grows. .
  • the term “culture of a microorganism” refers to a microorganism or a culture containing a microorganism
  • the processed product refers to a culture of the microorganism or a culture containing the microorganism.
  • Purification of the polypeptide from a microorganism having the polypeptide included in the present invention can be performed by a conventional method.
  • the cells of the microorganism are cultured in an appropriate medium, and the cells are collected from the culture solution by centrifugation.
  • the obtained cells are broken, for example, with a Dynomill (manufactured by Willy A. Bachofen), and the cells are removed by centrifugation to obtain a cell-free extract.
  • salting out ammonium sulfate precipitation, sodium phosphate precipitation, etc.
  • solvent precipitation protein fractionation precipitation with acetone or ethanol, etc.
  • dialysis gel filtration, ion exchange, reverse phase, etc.
  • Polypeptides can be purified using techniques such as column chromatography, ultrafiltration, etc., alone or in combination.
  • the enzyme activity was determined by adding 10 mM OmM phosphate buffer (pH 6.5), 5 mM tert-butyl substrate (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate, 5 mM coenzyme NAD PHO 3 Add 3 mM and enzyme and in 30 This can be done by measuring the decrease in absorbance at a wavelength of 340 nm.
  • the polypeptide of the present invention may include, for example, the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.
  • the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 of the present invention includes an amino acid sequence having at least one amino acid substitution, insertion, deletion or addition or a part thereof, and (S) -6-clothone Enzyme that asymmetrically reduces tert-butyl 5-hydroxy-3-oxohexanoate to produce tert-butyl (3R, 5S) — 6-chloro-3,5-dihydroxyhexanoate
  • the active polypeptide was obtained from the polypeptide having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the Sequence Listing from Curent Protocolsin Molecular Bioloy (John Wiley and Sons, Inc., 1989).
  • any polynucleotide can be used as long as it encodes the above-mentioned polypeptide.
  • a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing; Polynucleotides that hybridize with polynucleotides under stringent conditions can be mentioned.
  • a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing and a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions are defined by using a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing as a probe.
  • 0.1- to 2-fold concentration of SSC solution (The composition of 1-fold concentration SSC solution consists of 15 OmM sodium chloride and 15 mM sodium citrate. ) Can be used to identify polynucleotides that can be identified by washing the filter under the conditions of 65.
  • the polynucleotide capable of being hybridized has at least 60% sequence identity, preferably at least 80% sequence identity, and more preferably at least 90% sequence identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2.
  • Polynucleotides having identity, even more preferably at least 95% sequence identity, most preferably at least 99% sequence identity can be mentioned.
  • the tertiary butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate of the present invention is asymmetrically reduced to give (3R, 5S) -6-chloro-3,5-
  • a polynucleotide encoding a polypeptide having an enzymatic activity for producing tert-butyl dihydroxyhexanoate is represented by SEQ ID NO: 2 in the sequence listing as long as the encoded polypeptide has the above-mentioned enzymatic activity.
  • sequence identity means that the two compared polynucleotide sequences are identical, and the percentage sequence identity between the two compared polynucleotide sequences is the percentage of the compared two sequence. After optimally aligning two polynucleotide sequences, the number of matching positions where identical nucleobases (e.g., A, T, G, ⁇ , or I) occur in both sequences is taken as the number of matching positions. Compare the number of matched positions Divide by a number and multiply this result by 100.
  • nucleobases e.g., A, T, G, ⁇ , or I
  • Sequence identity can be calculated, for example, using the following tools for sequence analysis: Unix-based GCG Wis on sin Pa ckae (Prog r am Manu a 1 for the Wis on sin Pack age, Ve rsion 8, September 1994, Genetics Computer Group Group, 575 Science drivve Mad is on, Wi sc on sin, USA53711; R ice, P.
  • the polynucleotide of the present invention is obtained by asymmetrically reducing tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-13-oxohexanoate to (3R, 5S) -16-chloro It can be obtained from microorganisms having an enzymatic activity to produce tert-butyl 3,5-dihydroxyhexanoate.
  • yeast belonging to the genus Candida can be mentioned, and particularly preferred is Candida's magnolier (Candida magnolia) IFO0705.
  • the tertiary butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate is asymmetrically reduced to give (3R, 5S) -6-chloro-3,5-dihydroxy
  • An example of a method for obtaining a polynucleotide contained in the present invention from a microorganism having an enzymatic activity for producing tert-butyl hexanoate is described, but the present invention is not limited thereto.
  • the purified amino acid sequence of the polypeptide and the partial amino acid sequence of the peptide fragment obtained by digesting the polypeptide with an appropriate endopeptidase are described as follows: Determined by the Mann method. Then, a nucleotide primer is synthesized based on the amino acid sequence information. Next, chromosomal DNA of the microorganism is prepared from the microorganism which is the source of the polynucleotide by a conventional nucleotide isolation method, for example, the Hereford method (Ce 11, 18, 1261 (1979)). Using this chromosomal DNA as type III, PCR is performed using the nucleotide primers described above to amplify a part of the polypeptide gene.
  • a part of the polypeptide gene amplified here is labeled by a commonly used method, for example, a random priming labeling method (Ana 1. Biochem., 132, 6 (1983)), and the nucleotide sequence is amplified.
  • a chromosomal DNA library of the microorganism is constructed by cleaving the chromosome DN of the microorganism with an appropriate restriction enzyme, incorporating the restriction enzyme fragment into a vector, and introducing the vector into an appropriate host cell. This DNA library is screened by the colony hybridization method, the plaque hybridization method, and the like using the nucleotide probe described above to obtain DNA containing the polypeptide gene.
  • the nucleotide sequence of the DNA fragment containing the polypeptide gene thus obtained can be determined by the dideoxy * sequence method, the dideoxy chain 'termination method, or the like. For example, AB I PR I SM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reacti on Kit (manufactured by Perkin E1mer) and ABI373A DNA Sequencer (manufactured by Perkin E1mer) ).
  • a vector used to introduce the polynucleotide of the present invention into a host microorganism and express it in the host microorganism into which the polynucleotide has been introduced is a vector that can express the enzyme gene in an appropriate host microorganism. Either can be used.
  • Such vectors include, for example, those selected from plasmid vectors, phage vectors, and cosmid vectors. Further, a shuttle vector capable of exchanging genes with other host strains may be used.
  • Such vectors are usually Includes regulatory elements such as 1 ac UV5 promoter, trp promoter, trc promoter, tac promoter, lpp promoter, tuf B promoter, recA promoter, pL promoter, etc., and can operate with the polynucleotide of the present invention. It can be suitably used as an expression vector containing an expression unit linked to a.
  • regulatory refers to a nucleotide sequence having a functional promoter and any associated transcription elements (eg, enhancer, CCAAT box, TATA box, SPI site, etc.).
  • ⁇ operably linked '' refers to the ability of a polynucleotide to regulate the expression of a gene, including promoters, enhancers, and other regulatory elements, such as a gene, to act in a host cell. Connected in a state. It is well known to those skilled in the art that the type and type of the regulatory element may vary depending on the host cell.
  • Examples of the host cell into which the vector having the nucleotide of the present invention is introduced include bacteria, yeast, filamentous fungi, plant cells, animal cells, etc., and Escherichia coli is particularly preferred.
  • the nucleotide of the present invention can be introduced into a host cell by a conventional method. When Escherichia coli is used as a host cell, the nucleotide of the present invention can be introduced by, for example, the calcium chloride method.
  • the tertiary butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate is asymmetrically reduced using the polypeptide of the present invention to give (3R, 5S) -6-chloro-3
  • coenzymes such as NAD PH and NADH are required.
  • an enzyme having an ability to convert the oxidized coenzyme to a reduced form hereinafter referred to as a coenzyme regeneration ability
  • a coenzyme regeneration system is combined with the polypeptide of the present invention to perform the reaction. By doing so, the amount of expensive coenzymes used can be significantly reduced.
  • Examples of enzymes capable of regenerating coenzymes include hydrogenase, formate dehydrogenase, alcohol dehydrogenase, aldehyde dehydrogenase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, and glucose. Dehydrogenase or the like can be used. Preferably, glucose dehydrogenase is used.
  • Such a reaction can also be carried out by adding a coenzyme regeneration system to the asymmetric reaction system, but the (S) -6-clo-5-5-hydroxy-3 Encodes a polypeptide that has enzymatic activity to asymmetrically reduce tert-butyl oxohexanoate to produce tert-butyl (3R, 5S) -16-cyclo-3,5-dihydroxyhexanoate
  • a transformant transformed with both a polynucleotide to be transformed and a polynucleotide encoding a polypeptide having glucose dehydrogenase activity is used as a catalyst, an enzyme having coenzyme regeneration ability is separately prepared and reacted.
  • the reaction can be carried out efficiently without adding it to the system.
  • Such transformants can asymmetrically reduce tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-13-oxohexanoate to give (3R, 5S) -6-chloro-3,
  • a polynucleotide encoding a polypeptide having an enzymatic activity to generate tert-butyl 5-dihydroxyhexanoate and a polynucleotide encoding a polypeptide having a glucose dehydrogenase activity are incorporated into the same vector.
  • the glucose dehydrogenase activity in the transformant was determined by adding 0.1 M substrate glucose, 2 mM coenzyme NADP and enzyme to 1 M Tris-HCl buffer (pH 8.0), This can be done by measuring the increase in absorbance at a wavelength of 340 nm.
  • tert-butyl (3R, 5S) -16-chloro-3,5-dihydroxyhexanoate using the transformant included in the present invention can be carried out as follows. First, a coenzyme such as tert-butyl substrate (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate and NADP in a suitable solvent, and a culture of the transformant or a processed product thereof Is added, and the mixture is stirred and reacted under pH adjustment. The reaction is carried out at a temperature of 10:70 and the pH of the reaction solution is maintained at 4-10 during the reaction. The reaction can be performed in a batch mode or a continuous mode.
  • a coenzyme such as tert-butyl substrate (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate and NADP in a suitable solvent, and a culture of the transformant or a processed product thereof Is added, and the mixture is stirred and reacted under pH adjustment.
  • the reaction substrate is added at a feed concentration of 0.1% to 70% (w / v).
  • the processed product of the transformant or the like means, for example, a crude extract, a cultured cell, a lyophilized organism, an acetone-dried organism, or a ground product thereof. Further, they can be used by immobilizing the enzyme itself or the cells as they are by known means.
  • the amount of coenzyme used can be reduced by further adding glucose to the reaction system. It can be significantly reduced.
  • the (3R, 5S) -16-chloro-3,5-dihydroxyhexanoate tert-butyl produced by the reaction can be purified by a conventional method. For example, if necessary, centrifugation, filtration, etc. are performed to remove suspensions such as bacterial cells, and then extracted with an organic solvent such as ethyl acetate or toluene, and dehydrated with a dehydrating agent such as sodium sulfate. The organic solvent is removed under reduced pressure. Further, it can be purified by a treatment such as crystallization or chromatography.
  • tert-butyl (S) -6-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate serving as a substrate can be used, for example, as described in US Pat. No. 52,52, incorporated herein by reference. No. 783,131.
  • Example 1 Purification of a polypeptide having an asymmetric reductase activity (Example 1: Purification of a polypeptide having asymmetric reductase activity) )
  • the cells were collected from the culture broth by centrifugation and washed with physiological saline. Thus, 1350 g of wet cells of the strain were obtained. After suspending the wet cells in 2700 ml of 10 OmM phosphate buffer (PH6.7), 2-mercaptoethanol and phenylmethylsulfonyl fluoride were added to a final concentration of 5 mM and 0.1 mM, respectively. The cells were disrupted with a Dynomill (Wi11yA. Bacoffen). The cell debris was removed by centrifugation to obtain 2880 ml of a cell-free extract.
  • PH6.7 10 OmM phosphate buffer
  • 2-mercaptoethanol and phenylmethylsulfonyl fluoride were added to a final concentration of 5 mM and 0.1 mM, respectively.
  • the cells were disrupted with a Dynomill (Wi11yA. Bacoffen). The cell debris was removed by centrifugation to obtain 2880 ml of a
  • Ammonium sulfate was added to the cell-free extract obtained above to make it 60% saturated and dissolved, and the resulting precipitate was removed by centrifugation (at this time, the pH of the cell-free extract was adjusted to pH 6.7 with aqueous ammonia). I went while keeping it). While maintaining the pH of 6.7 as before, ammonium sulfate was further added to the centrifugal supernatant to be 75% saturated and dissolved, and the resulting precipitate was collected by centrifugation. Dissolve the precipitate in 1 OmM phosphate buffer ( ⁇ 70) containing 2 mM 2-mercaptoethanol, The dialysate was dialyzed overnight.
  • the crude enzyme solution obtained above was previously equilibrated with a 10 mM phosphate buffer (pH 7.0) containing 2 mM 2-mercaptoethanol, and a DEAE-TOYOPEARL 650M (manufactured by Tosoh Corporation) column (50 Oml) to adsorb the polypeptide having enzymatic activity. After washing the column with the same buffer, the active fraction was eluted with a linear gradient of NaCl (from 01 ⁇ to 0.5M). The active fractions were collected and dialyzed overnight against 1 OmM phosphate buffer (pH 7.0) containing 2 mM 2-mercaptoethanol.
  • Ammonium sulfate was dissolved in the crude enzyme solution obtained above to a final concentration of 1 M (at this time, the pH of the crude enzyme solution was maintained at pH 7.0 with aqueous ammonia), and 2 mM 2-mercaptoethanol was added.
  • the crude enzyme solution obtained above was pre-equilibrated with 10 mM phosphate buffer (pH 7.0) containing 2 mM 2-mercaptoethanol, and B 1 uese ph arose CL-6B (Pharmacia Biotech) was applied to a column (40 ml) to adsorb the polypeptide having enzyme activity. After washing the column with the same buffer, the active fraction was eluted with a linear gradient of NaCl (from 01 ⁇ to 11 ⁇ ). After collecting the active fractions, contains 2 mM 2-mercaptoethanol Dialysis was performed overnight against 1 OmM phosphate buffer (pH 7.0).
  • Super Q-TOYOPEA RL 65 OS was obtained by pre-equilibrating the crude enzyme solution obtained above with 1 OmM phosphate buffer (pH 7.0) containing 2 mM 2-mercaptoethanol.
  • 1 OmM phosphate buffer (pH 7.0) containing 2 mM 2-mercaptoethanol was applied to a column (12 ml) to adsorb a polypeptide having enzyme activity.
  • the active fraction was eluted with a linear gradient of NaCl (from 0M to 0.4M). Active fractions were collected and dialyzed overnight against 1 OmM phosphate buffer (pH 7.0) containing 2 mM 2-mercaptoethanol to obtain a single purified polypeptide sample by electrophoresis. .
  • this polypeptide is referred to as CR enzyme.
  • the purified CR enzyme obtained in Example 1 was denatured in the presence of 8 M urea and then digested with lysyl endopeptidase from Achromobacter (manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.), and the amino acid sequence of the peptide fragment obtained.
  • Achromobacter manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.
  • the amino acid sequence of the peptide fragment obtained. was determined using an ABI 492 type protein sequencer (PerkinElmer). Based on this amino acid sequence, two nucleotide primers shown in SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4 were synthesized according to a conventional method.
  • Chromosomal DNA was extracted from the cultured cells of Candida magnolia IF ⁇ 0705 according to the Hereford method (Ce 11, 18, 1261 (1979)). Next, when the obtained chromosomal DNA was subjected to PCR using the nucleotide primers prepared as described above, a nucleotide fragment of about 350 bp, which is considered to be a part of the CR enzyme gene, was amplified. (Preparation of chromosomal DNA library)
  • the chromosomal DNA of Candida magnoliae IFO0705 was completely digested with the restriction enzyme ApaI and then separated by agarose gel electrophoresis. Next, using the DNA fragment of about 35 Obp obtained above as a probe, the chromosomal DNA digest was analyzed by the Southern method (J. Mo 1. Biol., 98, 503 (1975)). (Nucleotide probe labeling and detection were performed using a Gene Images labeling / detection system (Amersham)). As a result, it was found that a nucleotide fragment of about 5.5 kb hybridized with the nucleotide probe.
  • the digest was separated by agarose gel electrophoresis, and then a 4.3 kb to 6.2 kb nucleotide fragment was recovered. These nucleotide fragments were inserted into the Ap I site of the vector plasmid pB1uescript II KS (-) (manufactured by STRATAGEN E), and then introduced into Escherichia coli JM109 to create a chromosomal DNA library of the same strain. .
  • the chromosomal DNA library prepared above was screened by colony hybridization (the labeling of the nucleotide probe and its detection were performed by Gene Image Labeling).
  • the experimental procedure was in accordance with the instruction manual of the system.) As a result, one positive colony was obtained.
  • the recombinant plasmid into which about 5.5 kb of DNA was obtained from this positive colony and was inserted was double-digested with EcoRI and SphI, and analyzed by the Southern method as before. Approximately 1. O kb of nucleotide fragment generated upon digestion with the restriction enzyme was hybridized.
  • plasmid pUC-ES in which the nucleotide fragment of about 1.0 kb was inserted into the EcoRI-Sphl site of plasmid pUC19 (Takara Shuzo Co., Ltd.) was constructed, and the chromosomal DN containing the CR enzyme gene was constructed. Selected as A clone.
  • Okb nucleotide fragment expected to contain the target gene The nucleotide sequence is shown in FIG.
  • the amino acid sequence deduced from the nucleotide sequence is shown in the lower part of the nucleotide sequence in FIG.
  • Comparison of this amino acid sequence with the partial amino acid sequence of the lysyl endopeptidase digested fragment of the purified CR enzyme revealed that all of the partial amino acid sequence of the purified CR enzyme was present in the amino acid sequence deduced from the nucleotide sequence. The part was completely identical (underlined part of the amino acid sequence in FIG. 1). Based on this, it was determined that this gene was a CR enzyme gene.
  • the obtained DNA fragment was digested with NdeI and EcoRI and inserted into NdeI and EcoRI sites downstream of the 1 ac promoter of plasmid pUCNT (WO 94/03613).
  • the recombinant plasmid pNTCR was obtained.
  • Bacillus 1 us mega teri um I Escherichia coli S
  • the N-terminal nucleotide primer thus prepared and the C-terminal nucleotide primer having a S a1 I site added immediately after the termination codon of the GDH structural gene were synthesized by a conventional method.
  • the nucleotide sequences of these two nucleotide primers are shown in SEQ ID NOs: 7 and 12; Using these two nucleotide primers, the plasmid pGDK1 (Eur. J. Biochem. 186, 389 (1989)) was transformed into type III. Double-stranded DNA was synthesized by PCR.
  • E. coli HB101 (manufactured by Takara Shuzo Co., Ltd.) was transformed using the recombinant plasmid pNTCR obtained in Example 3 and the recombinant plasmid pNTCRG obtained in Example 4, and recombinant E. coli HB101 (pNTCR) and HB101 were transformed from each. (pNTCRG) was obtained.
  • the recombinant E. coli HB101 (pNTCR) obtained in Example 5 was cultured in 2 XYT medium containing 120 ⁇ gm1 of ampicillin, collected, suspended in lO OmM phosphate buffer (pH 6.5), A cell-free extract was obtained by sonication. The CR enzyme activity of this cell-free extract was measured as follows. The CR enzyme activity was measured in 100 mM phosphate buffer (pH 6.5), tert-butyl substrate (S) — 6-cloth — 5-hydroxy-3-oxohexanoate 5 mM, coenzyme NADPH 0.333 m This was done by adding M and enzyme and measuring the decrease in absorbance at 340 nm at 30 ° C.
  • E. coli HB101 (pNTCR) showed a clear increase in CR enzyme activity compared to E. coli HB101 (pUCNT), which is a transformant containing only vector plasmid. Approximately 34 times the activity was obtained compared to Magnolie (Candida magno liae) I FO0705.
  • the GDH activity of the cell-free extract obtained by treating the recombinant E. coli HB101 (pNTCRG) obtained in Example 5 in the same manner as in Example 6 was measured as follows. GDH activity was measured by adding 0.1 M substrate glucose, 2 mM coenzyme NADP and enzyme to 1 M Tris-HCl buffer (pH 8.0) and measuring the increase in absorbance at 340 nm at 25 X: It was done by doing. Under these reaction conditions, the enzymatic activity of reducing 1 mol NADP to NADPH per minute was defined as 1 unit. The CR enzyme activity was also measured in the same manner as in Example 5. The CR enzyme and GDH activities in the cell-free extract measured in this way are expressed as specific activities and compared with E. coli HB101 (pNTCR) and the vector-only transformant HB101 (pUCNT). Show.
  • E. coli HB101 pNTCRG
  • pUCNT E. coli HB101
  • Example 8 (3R, 5) from t tert-butyl (S) -6-clo-5-hydroxy-3-oxohexanoate by recombinant Escherichia coli into which the CR enzyme gene was introduced
  • E. coli HB101 (pNTCRG) obtained in Example 4 was sterilized in a 500 ml Sakaguchi flask in 100 ml of 2XYT medium (Bacto-tryptone 1.6% (w / v), Bacto yeast extract 1.0 % (w / v), NaCl 0.5% (w / v), pH 7.0), and cultured with shaking at 37 for 16 hours.
  • 2XYT medium Bacto yeast extract 1.0 % (w / v), NaCl 0.5% (w / v), pH 7.0
  • 5.0 g of glucose, 1.5 mg of NADP, and 5.0 g of tert-butyl (S) 16-chloro-5-hydroxy-3-oxohexanoate were added to 25 ml of the obtained culture solution, and 5 M was added.
  • the (3R, 5S) -16-chloro-3,5- (3R) -5-hydroxy-3-tert-butyl-5-hydroxy-3-oxohexanoate can be obtained from tert-butyl. It has become possible to efficiently synthesize tert-butyl dihydroxyhexanoate.

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Description

明細書
新規カルボニル還元酵素、 その遺伝子、 およびその利用法 技術分野
本発明は、 新規ポリペプチド、 該ポリペプチドをコードする遺伝子、 該ポリべ プチドを発現するための発現べクタ一、 該発現ベクターを用いて宿主細胞を形質 転換して得られた形質転換体、 および該形質転換体を用いた医薬 ·農薬などの合 成原料として有用な化合物の製造方法に関する。 より詳細には、 本発明は、 (S) - 6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチル を不斉的に還元して (3 R, 5 S) — 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサ ン酸 t e r t—ブチルを生成する酵素活性を持つ微生物より単離された、 該酵素 活性を有するポリペプチド、 該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、 該 ポリヌクレオチドを含む発現べクタ一、 および該発現ベクターで形質転換された 形質転換体に関する。
本発明はまた、 (3R, 5 S) — 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン 酸 t e r t—ブチルの製造方法に関し、 この方法は、 該形質転換体またはその処 理物を (S) - 6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3—ォキソへキサン酸 t e r t— ブチルと反応させる工程、 および生成する (3R, 5 S) —6—クロロー 3, 5 ージヒドロキシへキサン酸!; e r t一ブチルを採取する工程を包含する。
(3R, 5S) — 6—クロ口一 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブ チルは医薬 ·農薬等、 特に HMG— C o A還元酵素阻害剤の合成原料として有用 な化合物である。 背景技術
(S) 一 6—クロ口— 5—ヒドロキシ一 3—ォキソへキサン酸 t e r t—プチ ルを不斉的に還元し、 (3R, 5 S) 一 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキ サン酸 t e r t 一ブチルを生成する方法としては、 ジェチルメトキシポランと水 素化ホウ素ナトリゥムを用いる方法が唯一報告されている (米国特許第 52, 783, 1 31号) 。 しかし、 該技術には、 -78でという極低温反応容器を必要とすること、 高価な試材を用いることなど課題が多く、 実用的な反応処方の開発が望まれてい る。 発明の開示
本発明者らは、 (S ) —6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3—ォキソへキサン酸 t e r t —ブチルを不斉的に還元し、 (3 R, 5 S ) — 6—クロロー 3, 5—ジ ヒドロキシへキサン酸 t e r t 一ブチルを生成する微生物由来のポリペプチドを 見出し、 (3 R, 5 S ) — 6 -クロ口一 3 , 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t一ブチルを効率良く製造することが可能であることを見出して本発明を完成す るに至った。
本発明は, (S ) —6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3—ォキソへキサン酸 t e r t一ブチルを不斉的に還元して、 (3 R, 5 S ) —6—クロ口— 3, 5—ジヒ ドロキシへキサン酸 t e r t 一ブチルを生成し得るポリペプチドを提供すること を課題とする。 さらに、 本発明は、 遺伝子組み換え技術を利用して該ポリべプチ ドを効率よく生産することを課題とする。 また、 本発明は、 該ポリペプチドとグ ルコース脱水素酵素活性を有するポリペプチドを同時に高生産する形質転換体を 提供し、 さらに、 該形質転換体を用いた実用的な (3 R, 5 S ) —6—クロロー 3 , 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t —ブチルの製造方法を提供することを 課題とする。
本発明は、 (S ) — 6—クロロー 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S ) —6—クロ口— 3, 5—ジヒド ロキシへキサン酸 t e r t 一ブチルを生成する酵素活性を有するポリペプチドに 関する。 このポリペプチドは、 配列表の配列番号 1に示したアミノ酸配列、 また は配列表の配列番号 1に示したアミノ酸配列中で少なくとも 1つのアミノ酸の置 換、 挿入、 欠失または付加を有するアミノ酸配列を含む。
好ましくは、 このポリペプチドは、 キャンディダ (Cand i d a) 属に属す る微生物に由来し得る。 さらに好ましくは、 上記微生物は、 キャンディダ'マグ ノリエ (Cand i d a magno l i ae) I F O 0705株であり得る。 本発明は、 1つの局面で、 上記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに 関する。
本発明は、 1つの局面で、 (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3—ォキソ へキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) 一 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生成する酵素活性を有する ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであって、 配列表の配列番号 2に示 したヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイプリダイズするポリヌ クレオチドに関する。
本発明はまた、 1つの局面で、 上記ポリヌクレオチドを含む発現べクタ一に関 する。 好ましくは、 この発現ベクターはプラスミド pNTCRであり得る。 上記発現ベクターは、 1つの実施態様で、 グルコース脱水素酵素活性を有する ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをさらに含み得る。
好ましくは、 上記グルコース脱水素酵素活性を有するポリペプチドは、 バシラ ス ·メガテリゥム (Ba c i l l u s me g a t e r i um) 由来のダルコ一 ス脱水素酵素であり得る。
好ましくは、 上記発現ベクターは、 プラスミド pNTCRGであり得る。 本発明はまた、 1つの局面で、 上記の発現ベクターにより形質転換された、 形 質転換体に関する。
好ましくは、 上記形質転換体は大腸菌であって、 より好ましくは、 E. c o i i HB 101 (pNTCR) または E. c o 1 i HB 101 (pNTCR G) であり得る。 本発明はまた、 1つの局面で、 (3R, 5 S) —6—クロ口— 3, 5—ジヒド ロキシへキサン酸 t e r t一ブチルの製造方法に関し、 この方法は、 上記の形質 転換体および/またはそれらの処理物を、 (S) —6—クロロー 5—ヒドロキシ 一 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルと反応させる工程、 および生成した ( 3 R, 5S) — 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチル を採取する工程を包含する。
好ましくは、 上記反応させる工程は、 補酵素再生系の存在下で行われる。 図面の簡単な説明
図 1は、 本発明のポリヌクレオチド配列および推定アミノ酸配列を示す図であ る。
図 2は、 組換えプラスミド p NT CRGの作製方法を示す図である。 発明を実施するための最良の形態
以下、 詳細に本発明を説明する。 本発明に含まれるポリペプチドとしては、 以 下の式(I)で表される (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3—ォキソへキサ ン酸 t e r t _ブチルを不斉的に還元して、 以下の式(Π)で表される (3R, 5 S) 一 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生成す る酵素活性を有するポリペプチドであればいずれも用いることができる。
Figure imgf000006_0001
COOtBu (I) (S)— 6—クロロー 5—ヒドロキジ一 3—ォキソへキサン酸 tert—ブチル COOtBu (Π)
Figure imgf000007_0001
(3R,5S)— 6—ク□□ー3,5—ジヒドロキシへキ ン酸 tert—ブチル このようなポリペプチドとして、 例えば、 配列表の配列番号 1に示したァミノ 酸配列を含むポリペプチド、 または配列表の配列番号 1に示したアミノ酸配列中 で少なくとも 1つのアミノ酸の置換、 挿入、 欠失または付加を有するアミノ酸配 列またはその一部を含み、 かつ (S) —6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3—ォキ ソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5S) — 6—クロ口 -3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生成する酵素活性を有す るポリペプチドをあげることができる。
本発明に含まれるポリペプチドは、 (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3 —ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3R, 5 S) - 6 - クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生成する活性を有 する微生物から取得することができる。 従って、 ポリペプチドの起源として用い られる微生物は特に限定されないが、 例えばキャンディダ (Cand i da) 属 酵母が挙げられ、 特に好ましいものとしてはキャンディダ'マグノリエ (Can d i d a ma gn o 1 i a e) I FO 0705を挙げることができる。 この 株は、 もとは、 Cen t r aa l bu r e au voo r Sch imme l c u 1 t u r e s (CBS ; Oo s t e r s t r aa t 1, P o s t b u s 273, NL - 3740 AG B a a r n, N e t h e r 1 a n d s ) に C B S 166の番号の下で寄託されていた微生物であり、 その単離および性質は、 「 The Ye a s t s, a Taxonomi c S t udy. 3 rd e d . 」 pp. 731 (1984)に記載されている。 本発明のポリペプチドを生産する 微生物は、 野生株または変異株のいずれでもあり得る。 あるいは、 細胞融合また
0 は遺伝子操作などの遺伝学的手法により誘導された微生物も用いられ得る。 遺伝 子操作された本発明のポリペプチドを生産する微生物は、 例えば、 これらの酵素 を単離および/または精製して酵素のアミノ酸配列の一部または全部を決定する 工程、 このアミノ酸配列に基づいてポリペプチドをコードするヌクレオチド配列 を決定する工程、 このアミノ酸配列に基づいてポリペプチドをコードするヌクレ ォチド配列を得る工程、 このヌクレオチド配列を他の微生物に導入して組換え微 生物を得る工程、 およびこの組換え微生物を培養して、 本発明の酵素を得る工程 を包含する方法により得られ得る。
本発明のポリペプチドを生産する微生物のための培養培地としては、 その微生 物が増殖する限り、 通常の、 炭素源、 窒素源、 無機塩類、 有機栄養素などを含む 液体栄養培地が用いられ得る。
本明細書で用いられる用語 「微生物の培養物」 は、 微生物の菌体または菌体を 含む培養液を意味し、 そして 「その処理物」 は、 微生物の菌体または菌体を含む 培養液から抽出または精製などの処理を行って得られた抽出物または精製物を意 味する。
本発明に含まれるポリぺプチドを有する微生物からの該ポリぺプチドの精製は、 常法により行い得る。 例えば、 該微生物の菌体を適当な培地で培養し、 培養液か ら遠心分離により菌体を集める。 得られた菌体を例えば、 ダイノミル (W i l l y A. B a c h o f e n社製) などで破枠し、 遠心分離にて菌体残さを除き、 無細胞抽出液を得る。 この無細胞抽出液に、 例えば、 塩析 (硫酸アンモニゥム沈 殿、 リン酸ナトリウム沈殿など) 、 溶媒沈殿 (アセトンまたはエタノールなどに よる蛋白質分画沈殿法) 、 透析、 ゲル濾過、 イオン交換、 逆相等のカラムクロマ トグラフィー、 限外濾過等の手法を単独で、 または組み合わせて用いて、 ポリべ プチドが精製され得る。 該酵素活性は、 1 0 O mMリン酸緩衝液 (p H 6 . 5 ) に、 基質 (S ) — 6—クロロー 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t 一ブチル 5 mM、 補酵素 NAD P H O . 3 3 mMおよび酵素を添加し、 3 0でで 波長 340 nmの吸光度の減少を測定することにより行い得る。
本発明のポリペプチドは、 例えば、 配列表の配列番号 1に示したアミノ酸配列 を含み得る。 本発明の配列表の配列番号 1に示したアミノ酸配列中で少なくとも 1つのアミノ酸の置換、 挿入、 欠失または付加を有するアミノ酸配列またはその —部を含み、 かつ (S) — 6—クロ口一 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) — 6—クロ口— 3, 5—ジ ヒドロキシへキサン酸 t e r t一ブチルを生成する酵素活性を有するポリべプチ ドは、 配列表の配列番号 1に示したアミノ酸配列をもつポリペプチドから、 Cu r r en t P r o t o c o l s i n Mo l e c u l a r B i o l o y (J ohn Wi l e y and Son s, I nc. , 1989) 等に記載の 公知の方法に準じて調製することができ、 (S) — 6—クロロー 5—ヒドロキシ 一 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) - 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—プチルを生成する酵素 活性を有する限り本発明のポリぺプチドに包含される。
本発明に含まれるポリヌクレオチドとしては、 上記ポリペプチドをコードする ポリヌクレオチドであればいずれも用いることができるが、 例えば、 配列表の配 列番号 2に示したヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、 および該ポリヌ クレオチドとストリンジェントな条件下でハイプリダイズするポリヌクレオチド をあげることができる。
配列表の配列番号 2に示したヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドとス トリンジェン卜な条件下でハイプリダイズするポリヌクレオチドとは、 配列表の 配列番号 2に示したヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドをプローブとし て、 コロニー ·ハイブリダィゼーシヨン法、 プラーク ·ハイブリダィゼーシヨン 法、 あるいはサザンハイブリダィゼーシヨン法等を用いることにより得られるポ リヌクレオチドを意味し、 具体的には、 コロニーあるいはプラーク由来のポリヌ クレオチドを固定化したフィルターを用いて、 0. 7~1. 0Mの NaC l存在 下、 65ででハイブリダィゼーシヨンを行った後、 0. 1〜2倍濃度の SSC溶 液 (1倍濃度の S SC溶液の組成は、 15 OmM塩化ナトリウム、 15mMクェ ン酸ナトリウムよりなる) を用い、 65での条件下でフィル夕一を洗浄すること により同定できるポリヌクレオチドをあげることができる。
ハイブリダイゼーション【ま、 Mo l e c u l a r C l on i ng, A l a bo r a t o ry manua l, s e c ond e d i t i on (Co l d Sp r i ng Ha r bo r Labo r a t o r y P r e s s, 1989) 等に記載されている方法に準じて行うことができる。 八イブリダィズ可能なポリ ヌクレオチドとして具体的には、 配列番号 2に示されるヌクレオチド配列と、 少 なくとも 60 %の配列同一性、 好ましくは少なくとも 80 %の配列同一性、 より 好ましくは少なくとも 90%の配列同一性、 さらにより好ましくは少なくとも 9 5%の配列同一性、 最も好ましくは少なくとも 99%の配列同一性を有するポリ ヌクレオチドをあげることができる。
本発明の (S) —6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) — 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロ キシへキサン酸 t e r t一ブチルを生成する酵素活性を有するポリペプチドをコ ―ドするポリヌクレオチドは、 コードされるポリぺプチドが上記酵素活性を有す る限り、 配列表の配列番号 2に示されるヌクレオチド配列と、 少なくとも 60% の配列同一性、 好ましくは少なくとも 80%の配列同一性、 より好ましくは少な くとも 90%の配列同一性、 さらにより好ましくは少なくとも 95%の配列同一 性、 最も好ましくは少なくとも 99 %の配列同一性を有するポリヌクレオチドを 包含する。 用語 「配列の同一性」 は、 対比される 2つのポリヌクレオチド配列が 同一であることを意味し、 対比される 2つのポリヌクレオチド配列間の配列同一 性の割合(%)は、 対比される 2つのポリヌクレオチド配列を最適に整列させた後、 同一の核酸塩基 (例えば、 A、 T、 G、 ϋ、 または I)が両方の配列で生じて適合し た位置の数を得て適合位置数とし、 適合した位置の数を比較ポリヌクレオチド総 数で除し、 そして、 この結果に 100を乗じて計算される。 配列同一性は、 例えば、 以下の配列分析用ツールを用いて算出し得る: Un i xベースの GCG W i s c on s i n Pa c k a e (P r og r am Manu a 1 f o r t h e Wi s c on s i n P a c k age, Ve r s i o n 8, 1994年 9月、 G ene t i c s Compu t e r Gr oup, 575 S c i e nc e D r i ve Mad i s on, Wi s c on s i n, USA53711 ; R i c e、 P. (1996) P r og r am Manu a l f o r EGCG P a c k age, P e t e r R i c e、 The S ange r Cen t r e, H i nx t on H a l l、 Camb r i d g e, CB 10 1 RQ、 Eng l and) および t h e ExPASy Wo r i d Wi d e We b分子生物学用サーバー (Gen e v a Un i v e r s i t y Ho s p i t a 1 and Un i v e r s i t y o f Ge neva, Genev a、 Swi t z e r l and) 。
本発明のポリヌクレオチドは、 (S) -6—クロ口— 5—ヒドロキシ一 3—ォ キソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) 一 6—クロ ロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生成する酵素活性を有 する微生物より取得することができる。 該微生物として、 例えばキャンディダ ( Cand i d a) 属酵母が挙げられ、 特に好ましいものとしてはキャンディダ' マグノリエ (C a n d i d a magno l i a e) I FO0705を挙げる ことができる。
以下に、 (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) — 6—クロロー 3, 5—ジヒドロ キシへキサン酸 t e r t一ブチルを生成する酵素活性を有する微生物より、 本発 明に含まれるポリヌクレオチドを取得する方法の例を記載するが、 本発明はこれ に限定されない。
まず、 精製した該ポリペプチド、 および該ポリペプチドを適当なエンドべプチ ダーゼで消化することにより得られるぺプチド断片の部分アミノ酸配列を、 ェド マン法により決定する。 そして、 このアミノ酸配列情報をもとにヌクレオチドプ ライマーを合成する。 次に、 該ポリヌクレオチドの起源となる微生物より、 通常 のヌクレオチド単離法、 例えば He r e f o r d法 (C e 1 1, 18, 1261 (1979) ) により、 該微生物の染色体 DNAを調製する。 この染色体 DNA を铸型として、 先述のヌクレオチドプライマーを用いて PCRを行い、 該ポリべ プチド遺伝子の一部を増幅する。 さらに、 ここで増幅された該ポリペプチド遺伝 子の一部を通常用いられる方法、 例えばランダムプライムラべリング法 (Ana 1. B i o chem. , 132, 6 (1983) ) で標識し、 ヌクレオチドプロ —ブを調製する。 該微生物の染色体 DN Αを適当な制限酵素により切断し、 該制 限酵素切断断片をベクターに組み込み、 これを適当な宿主細胞に導入することに より、 該微生物染色体の DNAライブラリーを構築する。 先述のヌクレオチドプ ローブを用いて、 コロニー ·ハイブリダィゼ一シヨン法、 プラークハイブリダィ ゼーシヨン法等により、 この DNAライブラリ一のスクリーニングを行い、 該ポ リぺプチド遺伝子を含む D N Aを得ることができる。 このようにして得られた該 ポリペプチド遺伝子を含む DNA断片のヌクレオチド配列は、 ジデォキシ *シ ークエンス法、 ジデォキシ ·チェイン 'ターミネイシヨン法などにより決定する ことができる。 例えば、 AB I PR I SM Dye Te rmi n a t o r Cyc l e S e qu e n c i ng Re ady Re a c t i on K i t ( Pe r k i n E 1 me r社製) および AB I 373 A DNA S e q e n c e r (Pe r k i n E 1 m e r社製) を用いて行われ得る。
本発明のポリヌクレオチドを宿主微生物内に導入し、 それをその導入された宿 主微生物内で発現させるために用いられるベクターとしては、 適当な宿主微生物 内で該酵素遺伝子を発現できるものであればいずれもが用いられ得る。 このよう なベクターとしては、 例えば、 プラスミドベクター、 ファージベクタ一、 コスミ ドベクタ一、 から選ばれたものが挙げられる。 また、 他の宿主株との間で遺伝子 交換が可能なシャトルベクターであってもよい。 このようなベクターは、 通常、 1 a c UV 5プロモーター、 t r pプロモータ一、 t r cプロモーター、 t a c プロモータ一、 l ppプロモーター、 t u f Bプロモー夕一、 r e cAプロモー 夕一、 pLプロモーター等の制御因子を含み、 本発明のポリヌクレオチドと作動 可能に連結された発現単位を含む発現ベクターとして好適に用いられ得る。
本願明細書で用いる用語 「制御因子」 は、 機能的プロモーターおよび、 任意の 関連する転写要素(例えば、 ェンハンサ一、 CCAATボックス、 TATAポッ クス、 SP I部位など)を有するヌクレオチド配列をいう。
本願明細書で用いる用語 「作動可能に連結」 は、 遺伝子が発現するように、 ポ リヌクレオチド力 その発現を調節するプロモータ一、 ェンハンサ一等の種々の 調節エレメントとが宿主細胞中で作動し得る状態で連結されることをいう。 制御 因子のタイプおよび種類が、 宿主細胞に応じて変わり得ることは、 当業者に周知 の事項である。
本発明のヌクレオチドを有するベクターを導入する宿主細胞としては、 細菌、 酵母、 糸状菌、 植物細胞、 動物細胞などがあげられるが、 大腸菌が特に好ましい。 本発明のヌクレオチドは常法により宿主細胞に導入され得る。 宿主細胞として大 腸菌を用いる場合、 例えば塩化カルシウム法により、 本発明のヌクレオチドを導 入することができる。
本発明のポリペプチドを用いて (S) — 6—クロロー 5—ヒドロキシー 3—ォ キソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3R, 5 S) —6—クロ 口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生産する場合、 NAD PH、 NADH等の補酵素が必要となる。 しかし、 酸化された該補酵素を還元型 に変換する能力 (以後、 補酵素再生能と呼ぶ) を有する酵素をその基質とともに、 つまり補酵素再生系を本発明のポリぺプチドと組み合わせて反応を行うことによ り、 高価な補酵素の使用量を大幅に削減することができる。 補酵素再生能を有す る酵素としては、 例えば、 ヒドロゲナーゼ、 ギ酸脱水素酵素、 アルコール脱水素 酵素、 アルデヒド脱水素酵素、 グルコース— 6—リン酸脱水素およびグルコース 脱水素酵素などを用いることが出来る。 好適には、 グルコース脱水素酵素が用い られる。 このような反応は、 補酵素再生系を不斉反応系内に添加することによつ ても行われ得るが、 本発明に含まれる、 (S ) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元し (3 R, 5 S ) 一 6— クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生成する酵素活性 を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、 およびグルコース脱水素 酵素活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの両者により形質 転換せしめられた形質転換体を触媒として用いた場合、 補酵素再生能を有する酵 素を別に調製し反応系内に添加することなしに、 該反応を効率良く実施し得る。 このような形質転換体は、 (S ) — 6—クロロー 5—ヒドロキシ一 3—ォキソへ キサン酸 t e r t一ブチルを不斉的に還元し (3 R, 5 S ) —6—クロ口— 3 , 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを生成する酵素活性を有するポリ ぺプチドをコ一ドするポリヌクレオチド、 およびグルコース脱水素酵素活性を有 するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、 同一のベクターに組み込み、 これを宿主細胞に導入することにより得られる他、 これら 2種のポリヌクレオチ ドを不和合性グループの異なる 2種のベクターにそれぞれ組み込み、 それらのポ リヌクレオチドを同一の宿主細胞に導入することによつても得られ得る。
形質転換体中のグルコース脱水素酵素活性は、 1 Mトリス塩酸緩衝液 (p H 8 . 0 ) に、 基質グルコース 0 . 1 M、 補酵素 NAD P 2 mMおよび酵素を添加し、 2 5でで波長 3 4 0 n mの吸光度の増加を測定することにより行い得る。
本発明に含まれる形質転換体を用いた (3 R, 5 S ) 一 6—クロ口— 3, 5— ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルの生産は以下のように実施され得る。 まず最初に、 適当な溶媒中に基質 (S ) —6—クロロー 5—ヒドロキシー 3— ォキソへキサン酸 t e r t—ブチル、 NAD P等の補酵素、 および該形質転換体 の培養物またはその処理物等を添加し、 P H調整下、 攪拌して反応させる。 この 反応は 1 0 :〜 7 0での温度で行われ、 反応中反応液の PHは 4〜 1 0に維持する。 反応はバッチ方式あるいは連続方式で行われ得る。 バッチ方式の場合、 反応基質 は 0. 1%から 70% (w/v) の仕込み濃度で添加される。 ここで形質転換体 の処理物等とは、 例えば、 粗抽出液、 培養菌体、 凍結乾燥生物体、 アセトン乾燥 生物体、 あるいはそれらの磨砕物等を意味する。 さらにそれらは、 酵素自体ある いは菌体のまま公知の手段で固定化されて用いられ得る。 また、 本反応を行う際、 形質転換体として本発明のポリペプチドとグルコース脱水素酵素の両者を生産す るものを用いる場合、 反応系にさらにグルコースを添加することにより、 補酵素 の使用量を大幅に減らすことが可能である。
反応で生じた (3R, 5 S) 一 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t一ブチルは常法により精製され得る。 例えば、 必要に応じ遠心分離、 濾 過などの処理を施して菌体等の懸濁物を除去した後、 酢酸ェチル、 トルエン等の 有機溶媒で抽出し、 硫酸ナトリウム等の脱水剤で脱水後、 有機溶媒を減圧下で除 去する。 さらに晶析またはクロマトグラフィー等の処理を行うことにより、 精製 され得る。
本反応において、 基質となる (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキ ソへキサン酸 t e r t一ブチルは、 例えば、 本明細書に参考として援用される、 米国特許第 52, 783, 131号に記載の方法で調製され得る。
(S) —6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—プチ ル、 (3 R, 5 S) — 6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t— ブチルの定量、 および (3 R, 5 S) —6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキ サン酸 t e r t—プチルのジァステレオマー比の測定は、 高速液体クロマトグラ フィー (カラム:ナカライテスク社製 COSMOS I L 5 CN-R ( I D4. 6 X 250mm) 、 溶離液: 1 mMリン酸水溶液 ァセトニトリル = 5 Z 1、 流速: 0. 7m 1 /mi n、 検出: 210 nm、 カラム温度: 3 Ot) で行い得 る。
以上のように、 本発明に従えば、 本発明に含まれるポリべフチドの効率的生産 が可能であり、 それを利用することにより、 (3R, 5 S) 一 6—クロ口— 3, 5ージヒドロキシへキサン酸 t e r t—プチルの優れた製造法が提供される。 以 下、 実施例で本発明を詳細に説明するが、 本発明はこれらにより限定されるもの ではない。 実施例
以下の実施例において用いた組み換え DNA技術に関する詳細な操作方法など は、 次の成書に記載されている。
Mo l e c u l a r C l on i ng 2nd Ed i t i on (Co l d S p r i n g Ha r o r Labo r a t o ry P r e s s, 1989)
Cu r r en t P r o t o c o l s i n Mo l e c u l a r B i o l o gy (Gr e en e Pub l i s h i ng As s oc i a t e s and W i 1 ey— I n t e r s c i enc e) (実施例 1 :不斉還元酵素活性を有するポリペプチドの精製)
以下の方法に従って、 キャンディダ ·マグノリエ (Cand i d a ma g no l i a e) I FO0705より (S) — 6—クロ口一 5—ヒドロキシ一 3— ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルを不斉的に還元して (3R, 5 S) 一 6—ク ロロ一 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t一ブチルを生成する酵素活性を 有するポリぺプチドを単一に精製した。
(キャンディダ 'マグノリエ (C and i d a ma gn o 1 i a e) I F OO 705株の培養)
3 OLジャーフアーメンター (丸菱バイオェンジ社製) に下記の組成からなる 液体培地 18 Lを調製し、 120 で 20分間蒸気殺菌をおこなった。
培地組成:水道水中の、 グルコース 4. 0%、 イーストエキス 0. 5%、 KH 2P〇4 0. 1 %、 (NH4) 2HP04 0. 65%、 NaC l 0. 1 %、 Mg S04 - 7H20 0. 8%、 Z n S04 · 7H20 0. 06%, F e S04 - 7H 20 0. 09%、 CuS04 · 5H20 0. 005%、 MnS〇4 * 4〜6H2〇 0. 01%、 アデ力ノール LG— 109 (日本油脂製) 0. 02%、 pH7. 0。
この培地に >予め同培地にて前培養しておいたキャンディダ ·マグノリエ I
FO 0705 (Cand i d a ma g n o 1 i a e I FO 0705) 株の培 養液を 180m 1ずつ接種し、 攪拌回転数 295 r pm、 通気量 5. ONL/m i n、 33 :で、 30% (wZw) 水酸化ナトリウム水溶液を滴下することによ り下限 PHを 6. 5に調整しながら培養した。 培養開始から 22時間後と 25時 間後に 55% (wZw) グルコース水溶液 655 gを添加し、 30時間培養を行 つた。
(無細胞抽出液の調整)
上記の培養液 10しから遠心分離により菌体を集め、生理食塩水にて菌体を洗 浄した。 このようにして, 該菌株の湿菌体 1350 gを得た。 この湿菌体を 27 00mlの 10 OmMリン酸緩衝液 (PH6. 7) に懸濁した後、 2—メルカプ トェタノ一ルおよびフッ化フエ二ルメチルスルホニルをそれぞれ終濃度 5 mM、 0. ImMとなるよう添加し、 菌体をダイノミル ( W i 1 1 y A. B a c ho f e n社製) で破砕した。 この菌体破砕物から遠心分離にて菌体残渣を除き、 無細胞抽出液 2880mlを得た。
(硫酸アンモニゥム分画)
上記で得た無細胞抽出液に 60%飽和となるように硫酸アンモニゥムを添加し て溶解し、 生じた沈殿を遠心分離により除去した (この際無細胞抽出液の pHを アンモニア水で PH6. 7に維持しながら行った) 。 先と同様 pH6. 7を維持 しながら、 この遠心上清に 75%飽和となるようさらに硫酸アンモニゥムを添加 して溶解し、 生じた沈殿を遠心分離により集めた。 この沈殿を 2mMの 2—メル カプトエタノールを含む 1 OmMリン酸緩衝液 (ρΗ7· 0) に溶解し、 同一緩 衝液で 1夜透析した。
(DEAE— TOYO PEARLカラムクロマトグラフィー)
上記で得られた粗酵素液を、 2 mMの 2—メルカプトエタノールを含む 10m Mリン酸緩衝液 (pH7. 0) で予め平衡化した DEAE— TOYOPEARL 650M (東ソ一株式会社製) カラム (50 Oml) に供して酵素活性を有す るポリペプチドを吸着させた。 同一緩衝液でカラムを洗浄した後、 NaC l ( 01^から0. 5Mまで) のリニアグラジェントにより活性画分を溶出させた。 活 性画分を集め, 2 mMの 2—メルカプトエタノールを含む 1 OmMリン酸緩衝液 (pH7. 0) にて 1夜透析を行った。
(Pheny l s e p h a r o s eカラムクロマトグラフィー)
上記で得られた粗酵素液に終濃度 1Mとなるよう硫酸アンモニゥムを溶解し ( この際粗酵素液の pHをアンモニア水で pH7. 0に維持しながら行った) 、 2 mMの 2—メルカプトエタノ一ルおよび 1 Mの硫酸アンモニゥムを含む 10 mM リン酸緩衝液 (ρΗ7. 0) で予め平衡化した Ph e ny 1 s e ph a r o s e CL-4B (Ph a rma c i a B i o t e c h社製) カラム ( 140 m 1) に供して酵素活性を有するポリペプチドを吸着させた。 同一緩衝液でカラム を洗浄した後、 硫酸アンモニゥム (1Mから0Mまで) のリニアグラジェントに より活性画分を溶出させた。 活性画分を集め、 2mMの 2—メルカプトエタノー ルを含む 1 OmMリン酸緩衝液 (pH7. 0) にて 1夜透析を行った。
(B l u e s e ph a r 0 s eカラムクロマトグラフィー)
上記で得られた粗酵素液を、 2mMの 2—メルカプトエタノールを含む 10m Mリン酸緩衝液 (pH7. 0) で予め平衡化した B 1 u e s e ph a r o s e CL-6B (Ph a rma c i a B i o t e c h社製) カラム (40ml) に供して酵素活性を有するポリペプチドを吸着させた。 同一緩衝液でカラムを洗 浄した後、 NaC l (01^から 11^まで) のリニアグラジェントにより活性画分 を溶出させた。 活性画分を集めた後、 2mMの 2—メルカプトエタノールを含む 1 OmMリン酸緩衝液 (pH 7. 0) にて 1夜透析を行った。
(Su e r <3—丁〇¥0?£八1 しカラムクロマトグラフィ一)
上記で得られた粗酵素液を、 2 mMの 2—メルカプトエタノールを含む 1 Om Mリン酸緩衝液 (pH7. 0) で予め平衡化した S u p e r Q— TOYOPEA RL 65 O S (東ソ一株式会社製) カラム (12ml) に供し、 酵素活性を有 するポリペプチドを吸着させた。 同一緩衝液でカラムを洗浄した後、 NaC l ( 0Mから 0. 4Mまで) のリニアグラジェントにより活性画分を溶出させた。 活 性画分を集め > 2 mMの 2—メルカプトエタノールを含む 1 OmMリン酸緩衝液 (pH7. 0) にて 1夜透析を行い、 電気泳動的に単一な精製ポリペプチド標品 を得た。 以後、 このポリペプチドを CR酵素と呼ぶことにする。
(実施例 2 : CR酵素遺伝子のクローニング)
(合成オリゴヌクレオチドプローブの作成)
実施例 1で得られた精製 C R酵素を 8 M尿素存在下で変性した後、 ァクロモバ クタ一由来のリシルエンドべプチダーゼ (和光純薬工業株式会社製) で消化し、 得られたペプチド断片のアミノ酸配列を AB I 492型プロテインシーケンサー (パーキンエルマ一社製) により決定した。 このアミノ酸配列をもとに、 配列番 号 3および配列番号 4に示す 2種のヌクレオチドプライマ一を常法に従つて合成 した。
(PCRによる CR酵素遺伝子の増幅)
キャンディダ 'マグノリエ (C a n d i d a ma g n o 1 i a e) I F〇 0705の培養菌体から He r e f o r d法 (C e 1 1, 18, 1261 (19 79) ) に従って染色体 DNAを抽出した。 次に、 上記で調整したヌクレオチ ドプライマ一を用い、 得られた染色体 D N Aを铸型として P C Rを行つたところ、 CR酵素遺伝子の一部と考えられる約 350 b pのヌクレオチド断片が増幅され た。 (染色体 DNAライブラリーの作成)
キャンディダ ·マグノリエ (Cand i d a magno l i a e) I FO 0705の染色体 DNAを制限酵素 A p a Iで完全消化した後、 ァガロースゲル 電気泳動により分離した。 次に、 上記で得られた約 35 Obpの DNA断片をプ ローブとして用い、 サザン法 (J. Mo 1. B i o l. , 98, 503 (197 5) ) により該染色体 DNA消化物の解析を行った (ヌクレオチドプローブの標 識およびその検出は Ge n e I m a g e sラベリング ·検出システム (アマシ ャム株式会社製) を用いて行った) 。 その結果、 約 5. 5 kbのヌクレオチド断 片が該ヌクレオチドプローブとハイプリダイズすることが判った。
そこで、 該消化物をァガロースゲル電気泳動により分離した後、 4. 3 kb力 ら 6. 2 kbのヌクレオチド断片を回収した。 これらのヌクレオチド断片をべク タープラスミド pB 1 u e s c r i p t I I KS (—) (STRATAGEN E社製) の Ap a I部位に挿入した後、 大腸菌 JM109株に導入し、 同菌株の 染色体 DNAライブラリーを作成した。
(染色体 DNAライブラリ一のスクリーニング)
上記で得られたヌクレオチド断片をプローブとして用い、 コロニーハイブリダ ィゼーション法により上記で作成した染色体 D N Aライブラリーのスクリ一ニン グを行った (ヌクレオチドプローブの標識およびその検出は Ge n e I mag e sラベリング ·検出システム (アマシャム株式会社製) を用い、 実験手順も同 システムの取り扱い説明書に従った) 。 その結果、 1個の陽性コロニーが得られ た。 次に、 この陽性コロニーから得られた約 5. 5 kbの DNAが挿入された組 換えプラスミドを E c o R Iおよび S p h Iで二重消化し、 先と同様にサザン法 で解析した結果、 両制限酵素で消化した際に生じる約 1. O kbのヌクレオチド 断片がハイブリダィズした。 そこで、 この約 1. 0 kbのヌクレオチド断片をプ ラスミド pUC 19 (宝酒造株式会社製) の Ec oR I— Sph l部位に挿入し た組み換えプラスミド pUC— ESを構築し、 CR酵素遺伝子を含む染色体 DN Aクローンとして選択した。
(ヌクレオチド配列の決定)
上記で得られた組換えプラスミド p U C— E Sについて、 種々の制限酵素を作 用させた際に生じる消化断片の解析を行い、 制限酵素切断地図を作成した。 次に、 この解析の際に得られた各種ヌクレオチド断片を pUC 19のマルチクローニン グサイトに揷入した組換えプラスミドを構築した。 これらの組み換えプラスミド を用いて、 各々の挿入断片のヌクレオチド配列分析を AB I PR I SM Dy e Te rmi n a t o r Cyc l e S e que nc i ng Re ady Re a c t i on K i t (P e r k i n E lme r社製) および AB I 3 73 A DNA S e qenc e r (P e r k i n E lme r社製) を用いて 行い、 目的遺伝子が含まれると予想される約 1. Okbのヌクレオチド断片の全 ヌクレオチド配列を決定した。 そのヌクレオチド配列を図 2に示した。 また、 こ のヌクレオチド配列中の構造遺伝子部分については、 そのヌクレオチド配列から 推定されるアミノ酸配列を図 1中でヌクレオチド配列の下段に示した。 このアミ ノ酸配列と、 精製 CR酵素のリジルエンドべプチダ一ゼ消化断片の部分アミノ酸 配列を比較した結果、 精製 CR酵素の部分アミノ酸配列は全て、 ヌクレオチド配 列から推定されるアミノ酸配列中に存在し、 その部分で完全に一致した (図 1中 のアミノ酸配列の下線部分) 。 このことから、 本遺伝子が CR酵素遺伝子である と判断した。
(実施例 3 : CR酵素遺伝子を含む組み換えプラスミドの作製)
CR酵素の構造遺伝子の開始コドン部分に Nd e I部位を付加し、 終始コドン の直後に新たな終止コドン (TAA) と E c oR I切断点を付加し、 さらに、 同 遺伝子内に存在する S a 1 I切断点をアミノ酸コードを変更せずに破壊する目的 で同遺伝子の 5' 末端から 6ヌクレオチド目の Gを Tに変換した二本鎖 DNAを 以下の方法により取得した。 実施例 2で決定されたヌクレオチド配列を基に、 C R酵素遺伝子の開始コドン部分に Nd e I部位を付加し、 同遺伝子の 5' 末 端から 6ヌクレオチド目の Gを Tに変換した N末端ヌクレオチドプライマーと、 同遺伝子の終始コドンの直後に新たな終止コドン (TAA) と Ec oR I部位を 付加した C末端ヌクレオチドプライマーを合成した。 これら 2つのプライマーの ヌクレオチド配列を配列番号 5および配列番号 6に示した。 これら 2つの合成ヌ クレオチドプライマーを用い、 実施例 2で得たプラスミド p U C— E Sを铸型と して PCRにより二本鎖 DNAを増幅した。 得られた DNA断片を Nd e Iおよ び E c oR Iで消化し、 プラスミド pUCNT (WO 94/03613) の 1 a cプロモーターの下流の Nd e I、 E c oR I部位に挿入することにより、 組換 えプラスミド pNTCRを得た。
(実施例 4 : CR酵素遺伝子およびグルコース脱水素酵素遺伝子の両者を同時 に含む組換えプラスミドの作製)
ノ シラス 'メガテリゥム (B a c i 1 1 u s me ga t e r i um) I AM 1030株由来のグルコース脱水素酵素 (以後、 GDHと呼ぶことにする) の遺 伝子の開始コドンから 5ヌクレオチド上流に大腸菌の S ha i n e-Da 1 ga r no配列 (9ヌクレオチド) を、 さらにその直前に Ec oR I切断点を、 また、 終止コドンの直後に Sail切断点を付加した二本鎖 DN Aを、 以下の方法により取 得した。 GDH遺伝子のヌクレオチド配列情報を基に、 GDHの構造遺伝子の開 始コドンから 5ヌクレオチド上流に大腸菌の Sh a i n e— Da l g a rno配 列 (9ヌクレオチド) を、 さらにその直前に Ec oR I切断点を付加した N末端 ヌクレオチドプライマーと、 GDHの構造遺伝子の終始コドンの直後に S a 1 I 部位を付加した C末端ヌクレオチドプライマーを常法に従って合成した。 これら 2つのヌクレオチドプライマ一のヌクレオチド配列を配列番号 7および 12列番号 8に示した。 これら 2つのヌクレオチドプライマーを用い、 プラスミド pGDK 1 (Eu r. J. B i o c hem. 186, 389 (1989) ) を铸型として PCRにょりニ本鎖DNAを合成した。 得られた DNA断片を E c o R Iおよび S a i lで消化し、 実施例 3において構築した p NT CRの E c o R I、 S a l I部位 (CR酵素遺伝子の下流に存在する) に挿入した組み換えプラスミド pN TCRGを得た。 p NT C R Gの作製法および構造を図 2に示す。
(実施例 5 :組み換え大腸菌の作製)
実施例 3で得た組み換えプラスミド p NTC Rおよび実施例 4で得た組み換え プラスミド pNTCRGを用いて大腸菌 HB 101 (宝酒造株式会社製) を形質 転換し、 各々から組み換え大腸菌 HB 101 (pNTCR) および HB 101 ( pNTCRG) を得た。 こうして得られた形質転換体である大腸菌 HB 101 ( pNTCR) および HB 101 (pNTCRG) は、 それぞれ、 受託番号 FER M BP— 6897および FERM B P— 6898として 1 999年 9月 28 日付けで、 特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブ夕ぺス卜条約に基 づいて工業技術院生命工学工業技術研究所 (日本国茨城県つくば市東 1丁目 1一 3) に寄託されている。
(実施例 6 :組み換え大腸菌における CR酵素の発現)
実施例 5で得た組み換え大腸菌 HB 1 01 (pNTCR) を 120 ^ g m 1 のアンピシリンを含む 2 XYT培地で培養し、 集菌後、 l O OmMリン酸緩衝液 (pH6. 5) に懸濁し、 超音波破碎により無細胞抽出液を得た。 この無細胞抽 出液の CR酵素活性を以下のように測定した。 CR酵素活性の測定は、 100m Mリン酸緩衝液 (pH6. 5) に、 基質 (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3ーォキソへキサン酸 t e r t—ブチル 5mM、 補酵素 NADPH 0. 333m Mおよび酵素を添加し、 30°Cで波長 340 nmの吸光度の減少を測定すること により行った。 この反応条件において、 1分間に 1 ^mo 1の NADPHを NA DPに酸化する酵素活性を 1 u n i tと定義した。 この様に測定した無細胞抽出 液中の CR酵素活性を比活性として表し、 コントロールとしてベクタープラスミ ドを保持する形質転換体の値と比較した。 また、 実施例 1と同様の方法で調製し たキャンディダ ·マグノリエ (C a n d i d a magno l i a e) I FO 0705の無細胞抽出液中の CR酵素活性についても同様に比較した。 それらの 結果を表 1に示す。
表 1. 組換え大腸菌における CR酵素の発現
Figure imgf000024_0001
表 1に示されるように、 大腸菌 HB 101 (pNTCR) では、 ベクターブラ スミドのみの形質転換体である大腸菌 HB 101 (pUCNT) と比較して明らかな CR酵素活性の増加が見られ、 キャンディダ 'マグノリエ (Cand i d a magno l i a e) I FO0705と比較して約 34倍の活性が得られた。
(実施例 7 :組換え大腸菌における CR酵素および GDHの同時発現)
実施例 5で得た組み換え大腸菌 HB 101 (pNTCRG) を、 実施例 6と同 様に処理して得られる無細胞抽出液の GDH活性を、 以下のように測定した。 G DH活性の測定は 1Mトリス塩酸緩衝液 (pH8. 0) に、 基質グルコース 0. 1M、 補酵素 NAD P 2 mM及び酵素を添加し、 25 X:で波長 340 nmの吸光 度の増加を測定することにより行った。 この反応条件において、 1分間に l m o 1の NADPを NADPHに還元する酵素活性を 1 un i tと定義した。 また、 CR酵素活性についても実施例 5と同様に測定した。 このように測定した無細胞 抽出液中の CR酵素および GDH活性を比活性として表し、 大腸菌 HB 101 (pNTCR) およびべクタ一のみの形質転換体 HB 101 (pUCNT) と 比較した結果を表 2に示す。
(以下余白) 表 2. 組換え大腸菌における CR酵素および GDHの同時発現
Figure imgf000025_0001
表 2に示されるように、 大腸菌 HB 101 (pNTCRG) では、 ベクター プラスミドのみの形質転換体である大腸菌 HB 101 (pUCNT) と比較して、 明らかな C R酵素および G D H活性の増加が見られた。
(実施例 8 : CR酵素遺伝子を導入した組換え大腸菌による (S) — 6—クロ 口— 5—ヒドロキシ一 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルからの (3R, 5
S) —6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルの合成) 実施例 5で得た組換え大腸菌 HB 101 (pNTCR) を、 500ml容坂ロ フラスコ中で滅菌した 50m lの 2 X YT培地 (バクト ' トリプトン 1. 6% (wノ V) 、 バクト ·イーストエキス 1. 0% (w/v) 、 NaC 1 0. 5 %
(w/v) 、 pH7. 0) に接種し、 37でで 16時間振とう培養した。 得られ た培溶液 25mlにグルコース脱水素酵素 (天野製薬株式会社製) 680 u n i t、 グルコース 5. 0 g、 NADP 3. 0mg、 (S) 一 6—クロ口一 5—ヒ ドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチル 4. 5 gを添加し、 5Mの水 酸化ナトリウム水溶液を滴下することにより PH 6. 5に調整しながら、 30 で 40時間撹拌した。 反応終了後、 反応液を酢酸ェチルで抽出し、 脫溶剤した後 抽出物の分析を行ったところ、 収率 96. 9%で (3R, 5 S) 一 6—クロロー
3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルが得られた。 この際、 生成し た (3R, 5 S) —6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブ チルのジァステレオマー過剰率は、 98. 2%d eであった。
(S) 一 6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—プチ ル、 (3 R, 5 S) — 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t— ブチルの定量、 および (3R, 5 S) 一 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシへキ サン酸 t e r t—ブチルのジァステレオマー比の測定は、 高速液体クロマトダラ フィ一 (カラム:ナカライテスク社製 COSMOS I L 5 CN-R (I D4. 6X25 Omm) 、 溶離液: 1 mMリン酸水溶液 Zァセトニトリル = 5ノ 1、 流 速: 0. 7m 1 Zm i n、 検出: 210 nm、 カラム温度: 30で) で行った。
(実施例 9 : CR酵素およびグルコース脱水素酵素を同時発現させた組み換え 大腸菌による (S) —6—クロロー 5—ヒドロキシ一 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルからの (3 R, 5 S) — 6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサ ン酸 t e r t—ブチルの合成)
実施例 4で得た組換え大腸菌 HB 101 (pNTCRG) を、 500ml容坂 口フラスコ中で滅菌した 100mlの 2XYT培地 (バクト · トリプトン 1. 6 % (w/v) 、 バクト ·イーストエキス 1. 0% (w/v) 、 NaC l 0. 5% (w/v) 、 pH7. 0) に接種し、 37でで 16時間振とう培養した。 得られた培養液 25m 1にグルコース 5. 0 g、 NADP 1. 5mg、 (S) 一 6—クロ口— 5—ヒドロキシー 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチル 5. 0 g を添加し、 5 Mの水酸化ナトリウム水溶液で pH 6. 5に調製しつつ 30 で 2 4時間撹拌した。 反応終了後、 反応液を酢酸ェチルで抽出し、 脱溶剤した後抽出 物の分析を行ったところ、 収率 97. 2%で (3R, 5S) —6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t一ブチルが得られた。 この際、 生成した (3 R, 5S) — 6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチ ルのジァステレオマー過剰率は、 98. 5%d eであった。 産業上の利用可能性
(S) - 6—クロ口一 5—ヒドロキシー 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチ ルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) 一 6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキ サン酸 t e r t一ブチルを生成する酵素活性を有するポリペプチド遺伝子のクロ 一二ング、 およびそのヌクレオチド配列の解析により、 該ポリペプチド産生能の 高い形質転換体を得ることが可能になった。 また、 該ポリペプチドおよびダルコ —ス脱水素酵素を同時に高生産する能力を有する形質転換体をも得ることが可能 になった。 さらに、 これらの形質転換体を用いることにより、 (S ) —6—クロ 口— 5—ヒドロキシー 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルからの (3 R, 5 S ) 一 6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルの合成を 効率良く行うことが可能となった。

Claims

請求の範囲
1. (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシ一 3—ォキソへキサン酸 t e r t— ブチルを不斉的に還元して (3R, 5 S) 一 6—クロ口— 3, 5—ジヒドロキシ へキサン酸 t e r t一ブチルを生成する酵素活性を有するポリペプチドであって、 配列表の配列番号 1に示したアミノ酸配列、 または配列表の配列番号 1に示した アミノ酸配列中で少なくとも 1つのアミノ酸の置換、 挿入、 欠失または付加を有 するアミノ酸配列を含む、 ポリペプチド。
2. キャンディダ (C and i d a) 属に属する微生物に由来する、 請求項 1 に記載のポリペプチド。
3. 前記微生物が、 キャンディダ'マグノリエ (Cand i d a magno 1 i a e) I FO 0705株である、 請求項 2に記載のポリペプチド。
4. 請求項 1ないし 3のいずれかに記載のポリペプチドをコードするポリヌク レオチド。
5. (S) — 6—クロ口— 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t— ブチルを不斉的に還元して (3 R, 5 S) 一 6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシ へキサン酸 t e r t一ブチルを生成する酵素活性を有するポリペプチドをコード するポリヌクレオチドであって、 配列表の配列番号 2に示したヌクレオチド配列 とストリンジェン卜な条件下でハイプリダイズするポリヌクレオチド。
6. 請求項 4および 5に記載のポリヌクレオチドを含む、 発現ベクター。
7. プラスミド pNTCRである、 請求項 6記載の発現ベクター。
8. グルコース脱水素酵素活性を有するポリぺプチドをコ一ドするポリヌクレ ォチドをさらに含む、 請求項 6に記載の発現ベクター。
9. 前記グルコース脱水素酵素活性を有するポリペプチドがバシラス ·メガテ リゥム (Ba c i l l u s me g a t e r i urn) 由来のグルコース脱水素酵 素である、 請求項 8に記載の発現ベクター。
10. プラスミド p NT CRGである、 請求項 9に記載の発現ベクター。
1 1. 請求項 6から 10のいずれかに記載の発現ベクターを用いて宿主細胞を 形質転換して得られた、 形質転換体。
12. 前記宿主細胞が大腸菌である、 請求項 1 1に記載の形質転換体。
13. E. c o l i HB 101 (pNTCR) である、 請求項 12に記載の 形質転換体。
14. E. c o l i HB 101 (pNTCRG) である請求項 12に記載の 形質転換体。
15. 請求項 11から 14のいずれかに記載の形質転換体および/またはそれ らの処理物を、 (S) —6—クロロー 5—ヒドロキシ— 3—ォキソへキサン酸 t e r t—ブチルと反応させる工程、 および生成した (3R, 5 S) — 6—クロ口 —3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチルを採取する工程を包含する、
(3R, 5S) — 6—クロロー 3, 5—ジヒドロキシへキサン酸 t e r t—ブチ ルの製造方法。
16. 前記反応させる工程が、 補酵素再生系の存在下で行われる、 請求項 15 に記載の方法。
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