TWI707871B - 抗lag3抗體 - Google Patents

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Abstract

本發明係關於抗LAG3抗體、產生此等分子之方法,以及使用該等抗體之方法。

Description

抗LAG3抗體
本發明係關於抗LAG3抗體、產生此等分子之方法以及使用該等抗體之方法。
淋巴細胞活化基因-3 (LAG3或CD223)最初係在經設計以選擇性分離在IL-2相關NK細胞株中表現之分子的實驗中被發現(Triebel F等人,Cancer Lett. 235 (2006),147-153)。LAG-3係結構與CD4同源且具有四個細胞外免疫球蛋白超家族樣結構域(D1至D4)的一種獨特跨膜蛋白。遠膜IgG結構域含有短胺基酸序列,即在其他IgG超家族蛋白質中未發現的所謂額外環(extra loop)。細胞內結構域含有使LAG-3對T細胞功能發揮負面作用所需的獨特胺基酸序列(KIEELE)。金屬蛋白酶可在連接肽(CP)處切割LAG-3以產生在血清中可檢測到的可溶形式。類似於CD4,LAG3蛋白質與II類MHC分子結合,但其親和力更高且結合位點不同於CD4 (Huard等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94 (1997),5744-5749)。LAG3係由T細胞、B細胞、NK細胞及漿細胞樣樹突狀細胞(pDC)表現且在T細胞活化之後上調。其調節T細胞功能以及T細胞動態平衡。無反應性或展示減弱之功能的習知T細胞亞群表現LAG3。LAG3+ T細胞在腫瘤部位處以及在慢性病毒感染期間富集(Sierro等人,Expert Opin. Ther. Targets 15 (2011),91-101)。已表明LAG3在CD8 T細胞耗竭中發揮作用(Blackburn等人,Nature Immunol. 10 (2009),29-37)。因此,需要拮抗LAG3之活性且可以用於產生並恢復針對腫瘤之免疫反應的抗體。 針對LAG3之單株抗體在例如WO 2004/078928中已有描述,其中主張包含特異性結合至CD223之抗體及抗癌疫苗之組合物。WO 2010/019570揭示結合LAG3之人類抗體,例如抗體25F7及26H10。US 2011/070238係關於適用於治療或預防器官移植排斥反應及自體免疫疾病之細胞毒性抗LAG3抗體。WO 2014/008218描述功能特性相較於抗體25F7有所優化(亦即,脫醯胺位點減少)的LAG3抗體。此外,LAG3抗體揭示於WO 2015/138920 (例如BAP050)、WO 2014/140180、WO 2015/116539、WO 2016/028672、WO 2016/126858、WO 2016/200782及WO 2017/015560中。
本發明提供抗LAG3抗體及使用其之方法。 本發明提供一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含 A) (a)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3;或 B) (a)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3;或 C) (a)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3;或 D) (a)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3;或 E) (a)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 本發明進一步提供一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含 A) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3;或 B) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3;或 C) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3;或 D) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3;或 E) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 本發明進一步提供一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體 i)包含SEQ ID NO:7之VH序列及SEQ ID NO:8之VL序列; ii)包含SEQ ID NO:15之VH序列及SEQ ID NO:16之VL序列; iii)包含SEQ ID NO:23之VH序列及SEQ ID NO:24之VL序列; iv)包含SEQ ID NO:31之VH序列及SEQ ID NO:32之VL序列;或 v)包含SEQ ID NO:39之VH序列及SEQ ID NO:40之VL序列。 本發明進一步提供結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體: i)與包含具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列之VH及具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列之VL的抗LAG3抗體競爭結合至LAG3,及/或 ii)結合至人類及食蟹獼猴LAG3;及/或 iii)抑制在人類A375腫瘤細胞上表現之MHC-II之結合;及/或 iv)促進混合淋巴細胞反應(mMLR)分析中之顆粒酶B或IL-2釋放。 在一個實施例中,根據本發明之抗LAG3抗體為單株抗體。 在一個實施例中,根據本發明之抗LAG3抗體為人類、人類化或嵌合抗體。 在一個實施例中,根據本發明之抗LAG3抗體為結合至LAG3之抗體片段。 在一個實施例中,根據本發明之抗LAG3抗體為Fab片段。 本發明提供一種編碼如前述技術方案中任一者之抗體的分離核酸。 本發明提供一種包含此核酸之宿主細胞。 本發明提供一種產生抗體之方法,該方法包含培養宿主細胞以使得產生抗體。 本發明提供產生抗體之此方法,其進一步包含自宿主細胞回收抗體。 本發明提供一種包含本文所述之抗體及醫藥學上可接受之載劑的醫藥調配物。 本發明提供用作藥劑之本文所述之抗體。 本發明提供用於治療癌症之本文所述之抗體。 本發明提供在藥劑製造中之本文所述之抗體之用途。在一個實施例中,該藥劑係用於治療癌症,用於治療免疫相關疾病(諸如腫瘤免疫)或延緩其進展,或用於刺激免疫反應或功能(諸如T細胞活性)。 本發明提供一種治療患有癌症之個體的方法,該方法包含向該個體投與有效量的本文所述之抗體。 本發明之抗體顯示出誘導人類CD4 T細胞之顆粒酶B釋放、IFN-γ釋放及IL-2分泌之可貴特性,且因此可單獨或與PD1抑制劑組合而刺激經由T細胞之免疫反應(增強之腫瘤抗原特異性T細胞效應功能)。
出於本文之目的,「接受體人類構架」為包含來源於如下文所定義之人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之輕鏈可變結構域(VL)構架或重鏈可變結構域(VH)構架之胺基酸序列的構架。「來源於」人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之接受體人類構架可包含人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之相同胺基酸序列,或其可含有胺基酸序列變化。在一些實施例中,胺基酸變化之數目為10個或更少、9個或更少、8個或更少、7個或更少、6個或更少、5個或更少、4個或更少、3個或更少或2個或更少。在一些實施例中,VL接受體人類構架序列與VL人類免疫球蛋白構架序列或人類共同構架序列在序列上一致。「親和力」係指分子(例如抗體)之單一結合位點與其結合搭配物(例如抗原)之間的非共價相互作用之總和之強度。除非另外指明,否則如本文中所使用,「結合親和力」係指反映結合對(例如抗體與抗原)成員之間1:1相互作用之固有結合親和力。分子X對其搭配物Y之親和力一般可由解離常數(Kd)表示。可藉由此項技術中已知之常用方法(包括本文所描述之彼等方法)來量測親和力。用於量測結合親和力之特定說明性及例示性實施例描述於下文中。「親和力成熟」抗體係指相比於在一或多個高變區(HVR)中不具有一或多個變化之親本抗體,在一或多個高變區中具有此類變化之抗體,此類變化使抗體對抗原之親和力得到改良。 除非另有指示,否則如本文所用,術語「LAG3」係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物,諸如靈長類動物(例如人類)及嚙齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何天然LAG3。該術語涵蓋「全長」、未處理之LAG3以及由在細胞中處理得到之任何形式之LAG3。該術語亦涵蓋LAG3之天然存在之變異體,例如剪接變異體或對偶基因變異體。在一個較佳實施例中,術語「LAG3」係指人類LAG3。例示性經處理(不含信號序列)之LAG3的胺基酸序列顯示於SEQ ID NO:54中。LAG3之例示性細胞外結構域(ECD)之胺基酸序列顯示於SEQ ID NO:55中。 術語「抗LAG3抗體」及「結合至LAG3之抗體」係指能夠以足夠親和力結合LAG3之抗體,使得該抗體可用作靶向LAG3之診斷劑及/或治療劑。在一個實施例中,如例如藉由放射免疫分析(RIA)所量測,抗LAG3抗體與不相關的非LAG3蛋白質之結合程度小於該抗體與LAG3之結合程度的約10%。在某些實施例中,結合至LAG3之抗體的解離常數(Kd) ≤ 1 μM、≤ 100 nM、≤ 10 nM、≤ 1 nM、≤ 0.1 nM、≤ 0.01 nM或≤ 0.001 nM (例如,10- 8 M或更小,例如10- 8 M至10- 13 M,例如10- 9 M至10- 13 M)。在某些實施例中,抗LAG3抗體結合至LAG3中在來自不同物種之LAG3之間保守的抗原決定基。在一個較佳實施例中,「抗LAG3抗體」、「特異性結合至人類LAG3之抗體」及「結合至人類LAG3之抗體」係指以KD 值為1.0×10- 8 mol/l或更低,在一個實施例中KD 值為1.0×10- 9 mol/l或更低,在一個實施例中KD 值為1.0×10- 9 mol/l至1.0×10- 13 mol/l之結合親和力特異性結合至人類LAG3抗原或其細胞外結構域(ECD)的抗體。在此情形中,結合親和力係用標準結合分析,諸如表面電漿子共振技術(BIAcore®,GE-Healthcare Uppsala,Sweden),例如使用LAG3細胞外結構域來測定。 術語「抗體」在本文中以最廣泛意義使用且涵蓋各種抗體結構,包括(但不限於)單株抗體、多株抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)及抗體片段,只要其展現所需抗原結合活性即可。 「抗體片段」係指不同於完整抗體,包含完整抗體之一部分,結合完整抗體所結合之抗原的分子。抗體片段之實例包括(但不限於) Fv、Fab、Fab'、Fab'-SH、F(ab')2 ;雙功能抗體;線性抗體;單鏈抗體分子(例如scFv);及由抗體片段形成之多特異性抗體。 術語「抗原決定基」表示抗LAG3抗體所結合之抗原上之蛋白質位點或非蛋白質位點。抗原決定基可由以下兩種方式形成:連續胺基酸伸展(線性抗原決定基);或包含例如由於抗原之摺疊(亦即藉由蛋白質抗原之三級摺疊)而在空間上鄰近的非連續胺基酸(構形抗原決定基)。線性抗原決定基通常在蛋白質抗原暴露於變性劑之後仍與抗LAG3抗體結合,而構形抗原決定基通常在用變性劑處理之後被破壞。抗原決定基在獨特空間構形中包含至少3個、至少4個、至少5個、至少6個、至少7個或8至10個胺基酸。 對結合至特定抗原決定基之抗體(亦即結合至同一抗原決定基之抗體)的篩檢可使用本領域中之常規方法進行,該等方法諸如(但不限於)丙胺酸掃描、肽墨點法(參見Meth. Mol. Biol. 248 (2004) 443-463)、肽切割分析、抗原決定基切除、抗原決定基提取、抗原之化學修飾(參見Prot. Sci. 9 (2000) 487-496)及交叉阻斷(參見「抗體(Antibodies)」,Harlow及Lane (Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harb., NY))。 基於抗原結構之抗體譜(Antigen Structure-based Antibody Profiling;ASAP),亦稱為修飾輔助譜(Modification-Assisted Profiling;MAP),允許基於特異性結合至LAG3之多種單株抗體中之每一抗體與經化學修飾或經酶修飾之抗原表面的結合譜來對該多種單株抗體進行分組(參見例如US 2004/0101920)。每一組中之抗體結合至相同抗原決定基,該抗原決定基可為與另一組所表示之抗原決定基完全不同或部分重疊的獨特抗原決定基。 又,競爭性結合可用於容易地判定抗體與參考抗LAG3抗體結合至LAG3之相同抗原決定基抑或抗體與參考抗LAG3抗體競爭結合。舉例而言,與參考抗LAG3抗體「結合至相同抗原決定基之抗體」係指一種抗體,其在競爭分析中阻斷參考抗LAG3抗體與其抗原之結合達50%或更多,且反言之,參考抗體在競爭分析中阻斷抗體與其抗原之結合達50%或更多。又,舉例而言,為判定抗體是否與參考抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基,允許參考抗體在飽和條件下結合至LAG3。在移除多餘的參考抗LAG3抗體之後,評定所討論之抗LAG3抗體與LAG3結合之能力。若在飽和結合參考抗LAG3抗體之後抗LAG3抗體能夠結合至LAG3,則可以得出結論,所討論之抗LAG3抗體與參考抗LAG3抗體結合至不同的抗原決定基。但是,若在飽和結合參考抗LAG3抗體之後所討論之抗LAG3抗體不能夠結合至LAG3,則所討論之抗LAG3抗體可結合至與參考抗LAG3抗體所結合之抗原決定基相同的抗原決定基。為了確認所討論之抗體結合至相同抗原決定基抑或恰好由於空間原因而結合受阻,可使用常規實驗(例如,使用ELISA之肽突變及結合分析、RIA、表面電漿子共振、流動式細胞量測術或本領域中可用的任何其他定量或定性抗體結合分析)。此分析應在兩種設定中進行,亦即在兩種抗體為飽和抗體的情況下進行。在兩種設定中下,若僅第一(飽和)抗體能夠結合至LAG3,則可得出結論,所討論之抗LAG3抗體與參考抗LAG3抗體競爭結合至LAG3。 在一些實施例中,如在競爭性結合分析中所量測,若1倍、5倍、10倍、20倍或100倍過量的一種抗體抑制另一種抗體之結合達至少50%、至少75%、至少90%或甚至99%或更多,則認為兩種抗體結合至相同的或重疊的抗原決定基(參見例如Junghans等人,Cancer Res. 50 (1990) 1495-1502)。 在一些實施例中,若抗原中基本所有的減少或消除一種抗體之結合的胺基酸突變亦減少或消除另一種抗體之結合,則認為兩種抗體結合至相同抗原決定基。若僅一個子集的減少或消除一種抗體之結合的胺基酸突變減少或消除另一種抗體之結合,則認為兩種抗體具有「重疊的抗原決定基」。 術語「嵌合」抗體係指重鏈及/或輕鏈之一部分衍生自特定來源或物種,而重鏈及/或輕鏈之其餘部分衍生自不同來源或物種之抗體。 抗體之「類別」係指其重鏈所具有之恆定結構域或恆定區的類型。存在五種主要抗體類別:IgA、IgD、IgE、IgG及IgM,且此等抗體中之若干者可進一步分成亞類(同型),例如IgG1 、IgG2 、IgG3 、IgG4 、IgA1 及IgA2 。在某些實施例中,抗體具有IgG4同型,其中鉸鏈區中具有S228P突變以改良IgG4抗體之穩定性。對應於不同類別免疫球蛋白之重鏈恆定結構域分別稱作α、δ、ε、γ及μ。 如本文所用,術語「細胞毒性劑」係指抑制或妨礙細胞功能及/或引起細胞死亡或破壞之物質。細胞毒性劑包括(但不限於)放射性同位素(例如,At211 、I131 、I125 、Y90 、Re186 、Re188 、Sm153 、Bi212 、P32 、Pb212 及Lu之放射性同位素);化學治療劑或藥物(例如,甲胺喋呤(methotrexate)、阿德力黴素(adriamicin)、長春花生物鹼(長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、依託泊苷(etoposide))、小紅莓(doxorubicin)、美法侖(melphalan)、絲裂黴素C (mitomycin C)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、道諾黴素(daunorubicin)或其他插入劑);生長抑制劑;酶及其片段,諸如溶核酶;抗生素;毒素,諸如小分子毒素或細菌、真菌、植物或動物來源之酶促活性毒素,包括其片段及/或變異體;及以下所揭示之各種抗腫瘤劑或抗癌劑。 「效應功能」係指可歸因於抗體之Fc區之生物活性,其因抗體同型而異。抗體效應功能之實例包括:C1q結合及補體依賴性細胞毒性(CDC);Fc受體結合;抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC);吞噬作用;細胞表面受體(例如B細胞受體)之減量調節;及B細胞活化。 藥劑(例如醫藥調配物)之「有效量」係指在必要劑量及時間段下有效獲得所要治療或預防結果的量。 在本文中,術語「Fc區」用於定義含有恆定區之至少一部分的免疫球蛋白重鏈之C端區。該術語包括天然序列Fc區及變異Fc區。在一個實施例中,人類IgG重鏈Fc區自Cys226或自Pro230延伸至重鏈之羧基端。然而,Fc區之C端離胺酸(Lys447)可存在或可不存在。在一個實施例中,如本文所描述之抗Lag3抗體具有IgG1同型,且包含SEQ ID NO:51或SEQ ID NO:52之恆定重鏈結構域。在一個實施例中,其額外包含C端離胺酸(Lys447)。在一個實施例中,如本文所描述之抗Lag3抗體具有IgG4同型,且包含SEQ ID NO:53之恆定重鏈結構域。在一個實施例中,其額外包含C端離胺酸(Lys447)。除非本文另外說明,否則Fc區或恆定區中之胺基酸殘基之編號係依據EU編號系統,亦稱為EU索引,如Kabat等人之Sequences of Proteins of Immunological Interest (第5版,美國公共衛生署,美國國家衛生研究院,Bethesda,MD,1991)中所描述。 「構架」或「FR」係指除高變區(HVR)殘基以外的可變結構域殘基。可變結構域之FR一般由四個FR結構域組成:FR1、FR2、FR3及FR4。因此,HVR及FR序列一般以以下序列出現在VH (或VL)中:FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。 術語「全長抗體」、「完整抗體」及「全抗體」在本文中可互換使用,以指代結構實質上類似於天然抗體結構或具有含有如本文所定義之Fc區之重鏈的抗體。 術語「宿主細胞」、「宿主細胞株」及「宿主細胞培養物」可互換使用且係指已引入外源核酸之細胞,包括此類細胞之子代。宿主細胞包括「轉型體」及「轉型細胞」,其包括初級轉型細胞及自其衍生之子代(不考慮傳代次數)。子代之核酸含量與母細胞可能不完全相同,而是可能含有突變。本文包括針對原始轉型細胞篩檢或選擇具有相同功能或生物活性之突變子代。 「人類抗體」為胺基酸序列對應於由人類或人類細胞產生或來源於利用人類抗體譜系或其他人類抗體編碼序列之非人類來源之抗體的胺基酸序列之抗體。人類抗體之此定義特別排除包含非人類抗原結合殘基之人類化抗體。在某些實施例中,人類抗體來源於非人類轉殖基因哺乳動物,例如小鼠、大鼠或兔。在某些實施例中,人類抗體來源於融合瘤細胞株。 「人類共同構架」為表示所選人類免疫球蛋白VL或VH構架序列中最常出現之胺基酸殘基的構架。一般而言,人類免疫球蛋白VL或VH序列係選自可變結構域序列之子組。一般而言,序列子組為如Kabat等人之Sequences of Proteins of Immunological Interest (第五版,NIH Publication 91-3242,Bethesda MD (1991),第1至3卷)中之子組。在一個實施例中,對於VL,子組為如Kabat等人之前述文獻中之子組κI。在一實施例中,對於VH,子組為如Kabat等人之前述文獻中之子組III。 「人類化」抗體係指包含來自非人類HVR之胺基酸殘基及來自人類FR之胺基酸殘基之嵌合抗體。在某些實施例中,人類化抗體將包含至少一個且通常兩個可變結構域之實質上全部,其中全部或實質上全部HVR (例如CDR)皆對應於非人類抗體之HVR,且全部或實質上全部FR皆對應於人類抗體之FR。人類化抗體視情況可包含來源於人類抗體之抗體恆定區的至少一部分。抗體(例如非人類抗體)之「人類化形式」係指已經歷人類化之抗體。 如本文所用,術語「高變區」或「HVR」係指抗體可變結構域中序列高變(「互補決定區」或「CDR」)及/或形成結構上定義環(「高變環」)及/或含有抗原接觸殘基(「抗原觸點」)之各個區域。一般而言,抗體包含六個HVR:三個在VH (H1、H2、H3)中,且三個在VL (L1、L2、L3)中。本文之例示性HVR包括: (a)出現在胺基酸殘基26-32 (L1)、50-52 (L2)、91-96 (L3)、26-32 (H1)、53-55 (H2)及96-101 (H3)處之高變環(Chothia及Lesk,J . Mol . Biol . 196:901-917 (1987)); (b)出現在胺基酸殘基24-34 (L1)、50-56 (L2)、89-97 (L3)、31-35b (H1)、50-65 (H2)及95-102 (H3)處之CDR (Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest ,第5版,公共衛生署,美國國家衛生研究院,Bethesda,MD (1991)); (c)存在於胺基酸殘基27c-36 (L1)、46-55 (L2)、89-96 (L3)、30-35b (H1)、47-58 (H2)及93-101 (H3)處之抗原觸點(MacCallum等人,J . Mol . Biol . 262: 732-745 (1996));及 (d) (a)、(b)及/或(c)之組合,包括HVR胺基酸殘基46-56 (L2)、47-56 (L2)、48-56 (L2)、49-56 (L2)、26-35 (H1)、26-35b (H1)、49-65 (H2)、93-102 (H3)及94-102 (H3)。 在一個實施例中,HVR殘基包含下文胺基酸序列描述中識別之彼等殘基。 除非另外指示,否則在本文中,根據Kabat等人之前述文獻對可變結構域中之HVR殘基及其他殘基(例如FR殘基)進行編號。 「免疫結合劑」係與一或多個異源分子(包括(但不限於)細胞毒性劑)結合之抗體。 「個體(individual/subject)」為哺乳動物。哺乳動物包括(但不限於)家養動物(例如牛、羊、貓、狗及馬)、靈長類動物(例如人類及非人類靈長類動物,諸如猴)、兔及嚙齒動物(例如小鼠及大鼠)。在某些實施例中,該個體(individual/subject)為人類。 「經分離之」抗體為已與其天然環境之組分分離的抗體。在一些實施例中,抗體純化至大於95%或99%之純度,如藉由例如電泳(例如SDS-PAGE、等電聚焦(IEF)、毛細電泳法)或層析(例如離子交換或逆相HPLC)所測定。關於評估抗體純度之方法的綜述,參見例如Flatman等人之J . Chromatogr . B 848:79-87 (2007)。 「經分離之」核酸係指已與其天然環境之組分分離的核酸分子。分離核酸包括通常含有核酸分子之細胞中所含的核酸分子,但該核酸分子存在於染色體外或在不同於其天然染色體位置之染色體位置處。 「編碼抗LAG3抗體之分離核酸」係指編碼抗體重鏈及輕鏈(或其片段)之一或多個核酸分子,包括單一載體或不同載體中之此類核酸分子及存在於宿主細胞中之一或多個位置處之此類核酸分子。 如本文所用之術語「單株抗體」係指自實質上均質之抗體群體獲得之抗體,亦即包含該群體之個別抗體相同及/或結合相同抗原決定基,可能的變異抗體除外,該等變異抗體例如含有天然存在之突變的變異抗體或在單株抗體製劑之生產期間產生的變異抗體,此類變異體通常少量存在。相比於典型地包括針對不同決定子(抗原決定基)之不同抗體的多株抗體製劑,單株抗體製劑中之各單株抗體係針對抗原上之單一決定子。因此,修飾語「單株」指示抗體之特性為自實質上均質之抗體群體獲得,且不應解釋為需要藉由任何特定方法產生該抗體。舉例而言,根據本發明使用之單株抗體可藉由多種技術製得,包括(但不限於)融合瘤方法、重組DNA方法、噬菌體呈現方法及利用含有所有或部分人類免疫球蛋白基因座之轉殖基因動物的方法、本文所描述的製得單株抗體之此類方法及其他例示性方法。 「裸抗體(naked antibody)」係指未與異源部分(例如,細胞毒性部分)或放射性標記結合之抗體。裸抗體可以醫藥調配物形式存在。 「天然抗體」係指具有不同結構之天然存在之免疫球蛋白分子。舉例而言,天然IgG抗體為約150,000道爾頓(dalton)之異四聚體糖蛋白,其由二硫鍵鍵結之兩條相同輕鏈及兩條相同重鏈構成。自N端至C端,各重鏈具有可變區(VH),亦稱為可變重鏈結構域或重鏈可變結構域,接著為三個恆定結構域(CH1、CH2及CH3)。類似地,自N端至C端,各輕鏈具有可變區(VL),亦稱為可變輕鏈結構域或輕鏈可變結構域,接著為恆定輕鏈(CL)結構域。抗體之輕鏈可基於其恆定結構域之胺基酸序列歸為兩種類型中之一種,稱為卡帕(kappa) (κ)及拉姆達(lambda) (λ)。 術語「藥品說明書」用以指通常包括於治療性產品之商業包裝中的說明,其含有關於與使用此類治療性產品有關之適應症、用法、劑量、投與、組合療法、禁忌及/或警告的資訊。 相對於參考多肽序列之「胺基酸序列一致性百分比(%)」經定義為在比對序列及引入空位(必要時)以得到最大序列一致性百分比之後,候選序列中與參考多肽序列中之胺基酸殘基相同之胺基酸殘基的百分比。出於測定胺基酸序列一致性百分比之目的的比對可以此項技術中之技能範圍內的各種方式達成,例如使用公開可獲得的電腦軟體,諸如BLAST、BLAST-2、Clustal W、Megalign (DNASTAR)軟體或FASTA程式套裝。熟習此項技術者可判定用於比對序列之適當參數,包括在所比較序列之全長內達成最大比對所需的任何演算法。然而,出於本文之目的,胺基酸序列一致性%值係使用FASTA套裝36.3.8c版或更近版中之ggsearch程式、使用BLOSUM50比較矩陣而產生。FASTA程式套裝的作者為W. R. Pearson及D. J. Lipman (1988),「Improved Tools for Biological Sequence Analysis」,PNAS 85:2444-2448;W. R. Pearson (1996)「Effective protein sequence comparison」 Meth. Enzymol. 266:227-258;及Pearson等人(1997) Genomics 46:24-36,且公開獲自http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_down.shtml。或者,可以使用在http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/index.cgi可存取的公共伺服器來比較序列,使用ggsearch (全域蛋白質:蛋白質)程式及預設選項(BLOSUM50;開端:-10;ext:-2;Ktup = 2)以確保進行全域比對而非局域比對。輸出比對標題中示出胺基酸一致性百分比。 術語「醫藥調配物」係指呈准許其中所含活性成分之生物活性有效之形式的製劑,且其不含對調配物將投與之個體具有不可接受毒性之其他組分。 「醫藥學上可接受之載劑」係指醫藥調配物中之除活性成分外之對個體無毒的成分。醫藥學上可接受之載劑包括(但不限於)緩衝液、賦形劑、穩定劑或防腐劑。 如本文所用,「治療(treatment)」(及其語法變化形式,諸如「治療(treat)」或「治療(treating)」)係指臨床介入以試圖改變所治療個體之自然病程,且可以為實現預防或在臨床病理學病程中進行。所需治療作用包括(但不限於)預防疾病發生或復發,緩解症狀,減輕疾病之任何直接或間接病理性結果,預防轉移,減緩疾病進展速率,改善或緩和疾病病況及緩解或改良預後。在一些實施例中,本發明之抗體用於延遲疾病發生或減慢疾病進展。 術語「可變區」或「可變結構域」係指抗體重鏈或輕鏈中參與抗體與抗原之結合的結構域。天然抗體之重鏈及輕鏈(分別為VH及VL)之可變結構域通常具有類似的結構,其中各結構域包含四個保守性構架區(FR)及三個高變區(HVR)。(參見例如Kindt等人,Kuby Immunology ,第6版,W.H. Freeman and Co.,第91頁(2007))。單一VH或VL結構域可足以賦予抗原結合特異性。此外,可使用來自結合抗原之抗體的VH或VL結構域來分離結合特定抗原之抗體,以分別篩選互補VL或VH結構域之庫。參見例如Portolano等人,J . Immunol . 150:880-887 (1993);Clarkson等人,Nature 352:624-628 (1991)。 如本文所用,術語「載體」係指能夠傳播其所連接之另一核酸的核酸分子。該術語包括呈自我複製核酸結構之載體以及併入已引入其之宿主細胞之基因組中的載體。某些載體能夠導引其可操作地連接之核酸的表現。此類載體在本文中稱為「表現載體」。 I.組合物及方法 在一個態樣中,本發明提供結合至LAG3之分離抗體。 在某些實施例中,提供結合至人類LAG3之抗體。本發明之抗體適用於例如診斷或治療癌症,治療免疫相關疾病(諸如腫瘤免疫)或延緩其進展,或刺激免疫反應或功能(諸如T細胞活性);或適用作免疫刺激劑/或刺激顆粒酶B (GrzB)、干擾素-γ (IFN-γ)及或介白素2 (IL-2)分泌/釋放。 A.例示性抗LAG3抗體 在某些實施例中,提供一種抗LAG3,其中該抗體: i)與包含具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列之VH及具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列之VL的抗LAG3抗體(包含aLAG3(0414)之VH及VL)競爭結合至LAG3,及/或 ii)結合至人類及食蟹獼猴LAG3;及/或 iii)抑制在人類A375腫瘤細胞上表現之MHC-II之結合;及/或 iv)促進混合淋巴細胞反應(mMLR)分析中之顆粒酶B或IL-2釋放(如實例3中所示)。 在一個態樣中,本發明提供一種抗LAG3抗體,其包含選自以下之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個HVR:(a)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。 在一個態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3。在一個實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3。在另一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H3;及包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。在又一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3;及包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2。在又一實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。在一個實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明之抗體包含:(a) VH結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2,及(c)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含:(a)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含選自SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。 在以上實施例中之任一者中,抗LAG3抗體為人類的或經人類化。在一個實施例中,抗LAG3抗體包含如以上實施例中任一者中之HVR且進一步包含接受體人類構架,例如人類免疫球蛋白構架或人類共同構架。 在另一態樣中,抗LAG3抗體包含與SEQ ID NO:7之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的重鏈可變結構域(VH)序列。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VH序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:7中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:7中之VH序列,包括該序列之轉譯後修飾。在特定實施例中,VH包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2;及(c)包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含與SEQ ID NO:8之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的輕鏈可變結構域(VL)。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VL序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:8中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:8中之VL序列,包括該序列之轉譯後修飾。在特定實施例中,VL包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含如上文所提供之任一實施例中的VH及如上文所提供之任一實施例中的VL。在一個實施例中,抗體包含分別在SEQ ID NO:7及SEQ ID NO:8中之VH及VL序列,包括彼等序列之轉譯後修飾。 在又一態樣中,本發明提供一種抗體,其與本文提供之抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。舉例而言,在某些實施例中,提供一種抗體,其與包含SEQ ID NO:7之VH序列及SEQ ID NO:8之VL序列的抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。在某些實施例中,提供一種抗體,其結合至LAG3內之抗原決定基集群E3中之一抗原決定基(參見實例2)。 在一個態樣中,本發明提供一種抗LAG3抗體,其包含選自以下之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個HVR:(a)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3。 在一個態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3。在一個實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3。在另一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H3;及包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3。在又一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3;及包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2。在又一實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3。在一個實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明之抗體包含:(a) VH結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2,及(c)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含:(a)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含選自SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3。 在以上實施例中之任一者中,抗LAG3抗體為人類的或經人類化。在一個實施例中,抗LAG3抗體包含如以上實施例中任一者中之HVR且進一步包含接受體人類構架,例如人類免疫球蛋白構架或人類共同構架。 在另一態樣中,抗LAG3抗體包含與SEQ ID NO:15之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的重鏈可變結構域(VH)序列。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VH序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:15中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:15中之VH序列,包括該序列之轉譯後修飾。在一特定實施例中,該VH包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2;及(c)包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含與SEQ ID NO:16之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的輕鏈可變結構域(VL)。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VL序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:16中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:16中之VL序列,包括該序列之轉譯後修飾。在特定實施例中,VL包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含如上文所提供之任一實施例中的VH及如上文所提供之任一實施例中的VL。在一個實施例中,抗體包含分別在SEQ ID NO:15及SEQ ID NO:16中之VH及VL序列,包括彼等序列之轉譯後修飾。 在又一態樣中,本發明提供一種抗體,其與本文提供之抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。舉例而言,在某些實施例中,提供一種抗體,其與包含SEQ ID NO:15之VH序列及SEQ ID NO:16之VL序列的抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。在某些實施例中,提供一種抗體,其結合至LAG3內之抗原決定基集群E3中之一抗原決定基(參見實例2)。 在一個態樣中,本發明提供一種抗LAG3抗體,其包含選自以下之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個HVR:(a)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3。 在一個態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3。在一個實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3。在另一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H3;及包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3。在又一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3;及包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2。在又一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3。在一個實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明之抗體包含:(a) VH結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2,及(c)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含:(a)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含選自SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3。 在以上實施例中之任一者中,抗LAG3抗體為人類的或經人類化。在一個實施例中,抗LAG3抗體包含如以上實施例中任一者中之HVR且進一步包含接受體人類構架,例如人類免疫球蛋白構架或人類共同構架。 在另一態樣中,抗LAG3抗體包含與SEQ ID NO:23之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性之重鏈可變結構域(VH)序列。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VH序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:23中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:23中之VH序列,包括該序列之轉譯後修飾。在一特定實施例中,該VH包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2;及(c)包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含與SEQ ID NO:24之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的輕鏈可變結構域(VL)。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VL序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:24中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:24中之VL序列,包括該序列之轉譯後修飾。在特定實施例中,VL包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含如上文所提供之任一實施例中的VH及如上文所提供之任一實施例中的VL。在一個實施例中,抗體包含分別在SEQ ID NO:23及SEQ ID NO:24中之VH及VL序列,包括彼等序列之轉譯後修飾。 在又一態樣中,本發明提供一種抗體,其與本文提供之抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。舉例而言,在某些實施例中,提供一種抗體,其與包含SEQ ID NO:23之VH序列及SEQ ID NO:24之VL序列的抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。在某些實施例中,提供一種抗體,其結合至LAG3內之抗原決定基集群E3中之一抗原決定基(參見實例2)。 在一個態樣中,本發明提供一種抗LAG3抗體,其包含選自以下之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個HVR:(a)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2;及(f)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3。 在一個態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3。在一個實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3。在另一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H3;及包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3。在又一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3;及包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2。在又一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3。在一個實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明之抗體包含:(a) VH結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2,及(c)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含:(a)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含選自SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3。 在以上實施例中之任一者中,抗LAG3抗體為人類的或經人類化。在一個實施例中,抗LAG3抗體包含如以上實施例中任一者中之HVR且進一步包含接受體人類構架,例如人類免疫球蛋白構架或人類共同構架。 在另一態樣中,抗LAG3抗體包含與SEQ ID NO:31之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的重鏈可變結構域(VH)序列。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VH序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:31中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:31中之VH序列,包括該序列之轉譯後修飾。在一特定實施例中,該VH包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2;及(c)包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含與SEQ ID NO:32之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的輕鏈可變結構域(VL)。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VL序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:32中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:32中之VL序列,包括該序列之轉譯後修飾。在特定實施例中,VL包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含如上文所提供之任一實施例中的VH及如上文所提供之任一實施例中的VL。在一個實施例中,抗體包含分別在SEQ ID NO:31及SEQ ID NO:32中之VH及VL序列,包括彼等序列之轉譯後修飾。 在又一態樣中,本發明提供一種抗體,其與本文提供之抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。舉例而言,在某些實施例中,提供一種抗體,其與包含SEQ ID NO:31之VH序列及SEQ ID NO:32之VL序列的抗LAG3抗體結合至相同抗原決定基。在某些實施例中,提供一種抗體,其結合至LAG3內之抗原決定基集群E3中之一抗原決定基(參見實例2)。 在一個態樣中,本發明提供一種抗LAG3抗體,其包含選自以下之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個HVR:(a)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 在一個態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3。在一個實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3。在另一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H3;及包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。在又一實施例中,該抗體包含:包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3;及包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2。在又一實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2;以及(c)包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(a)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。在一個實施例中,該抗體包含:(a)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明之抗體包含:(a) VH結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VH HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含選自以下之至少一個、至少兩個或全部三個VL HVR序列:(i)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2,及(c)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,本發明提供一種抗體,其包含:(a)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含選自SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 在以上實施例中之任一者中,抗LAG3抗體為人類的或經人類化。在一個實施例中,抗LAG3抗體包含如以上實施例中任一者中之HVR且進一步包含接受體人類構架,例如人類免疫球蛋白構架或人類共同構架。 在另一態樣中,抗LAG3抗體包含與SEQ ID NO:39之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的重鏈可變結構域(VH)序列。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VH序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:39中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:39中之VH序列,包括該序列之轉譯後修飾。在一特定實施例中,該VH包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2;及(c)包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含與SEQ ID NO:40之胺基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的輕鏈可變結構域(VL)。在某些實施例中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之VL序列相對於參考序列含有取代(例如保守性取代)、插入或缺失,但包含彼序列之抗LAG3抗體保留結合至LAG3之能力。在某些實施例中,SEQ ID NO:40中總共1至10個胺基酸已經取代、插入及/或缺失。在某些實施例中,取代、插入或缺失發生在HVR外部之區域中(亦即在FR中)。視情況,抗LAG3抗體包含位於SEQ ID NO:40中之VL序列,包括該序列之轉譯後修飾。在特定實施例中,該VL包含選自以下之一個、兩個或三個HVR:(a)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1;(b)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2;以及(c)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 在另一態樣中,提供一種抗LAG3抗體,其中該抗體包含如上文所提供之任一實施例中的VH及如上文所提供之任一實施例中的VL。在一個實施例中,抗體包含分別在SEQ ID NO:39及SEQ ID NO:40中之VH及VL序列,包括彼等序列之轉譯後修飾。 在本發明之又一態樣中,根據以上實施例中任一者之抗LAG3抗體為單株抗體,包括嵌合抗體、人類化抗體或人類抗體。在一個實施例中,抗LAG3抗體為抗體片段,例如Fv、Fab、Fab'、scFv、雙功能抗體或F(ab')2 片段。在另一實施例中,該抗體為例如在衍生自人類IgG1 Fc區之Fc區中具有取代L234A、L235A及P329G (LALA-PG)之全長抗體。(參見例如WO 2012/130831 Al)。 在又一態樣中,根據以上實施例中之任一者之抗LAG3抗體可合併如以下部分1至7中所描述之單一或組合之特徵中任一者。 1.抗體親和力 在某些實施例中,本文所提供之抗體的解離常數(Kd) ≤ 1 μM、≤ 100 nM、≤ 10 nM、≤ 1 nM、≤ 0.1 nM、≤ 0.01 nM或≤ 0.001 nM (例如,10- 8 M或更小,例如10- 8 M至10- 13 M,例如10- 9 M至10- 13 M)。 在一個實施例中,藉由放射性標記抗原結合分析(RIA)量測Kd。在一個實施例中,用Fab版本之相關抗體及其抗原進行RIA。舉例而言,Fab對抗原之溶液結合親和力量測如下:在滴定系列之未標記抗原存在下,用最小濃度之經(125 I)標記之抗原使Fab平衡,接著用經抗Fab抗體塗佈之板捕獲所結合之抗原(參見例如Chen等人,J . Mol . Biol . 293:865-881 (1999))。為了確立分析條件,將MICROTITER® 多孔板(Thermo Scientific)用含5 μg/ml所捕獲抗Fab抗體(Cappel Labs)之50 mM碳酸鈉(pH 9.6)塗佈隔夜,且隨後在室溫(約23℃)下用含2% (w/v)牛血清白蛋白之PBS阻斷二至五小時。在非吸附板(Nunc #269620)中,將100 pM或26 pM [125 I]抗原與相關Fab之連續稀釋液混合(例如,與Presta等人之Cancer Res . 57:4593-4599 (1997)中對抗VEGF抗體Fab-12之評估一致)。隨後培育相關Fab隔夜;然而,可持續培育較長時間(例如約65小時)以確保達到平衡。此後,在室溫下將混合物轉移至捕獲盤中以用於培育(例如持續一小時)。接著移除溶液且用含0.1%聚山梨醇酯20 (TWEEN-20® )之PBS洗滌盤八次。當盤乾燥時,每孔添加150 μl之閃爍體(MICROSCINT-20TM ;Packard),且在TOPCOUNTTM γ計數器(Packard)上對盤計數十分鐘。選擇產生小於或等於20%最大結合之各Fab的濃度用於競爭性結合分析。 根據另一實施例,使用BIACORE® 表面電漿子共振分析量測Kd。舉例而言,使用BIACORE® -2000或BIACORE® -3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ)之分析係在25℃下用固定抗原CM5晶片以約10反應單位(RU)進行。在一個實施例中,根據供應商之說明書,用N -乙基-N ' -(3-二甲胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N -羥基丁二醯亞胺(NHS)來活化羧基甲基化聚葡萄糖生物感測器晶片(CM5, BIACORE, Inc.)。用10 mM乙酸鈉(pH 4.8)將抗原稀釋至5 μg/ml (約0.2 μM),隨後以每分鐘5 μl之流動速率注射以獲得大約10個反應單位(RU)之偶合蛋白質。在抗原注射後,注射1 M乙醇胺以阻斷未反應之基團。關於動力學量測,在25℃下以大約每分鐘25 μl之流動速率注射Fab於含0.05%聚山梨醇酯20 (TWEEN-20TM )界面活性劑之PBS (PBST)中之兩倍連續稀釋液(0.78 nM至500 nM)。使用簡單的一比一朗格繆爾結合模型(one-to-one Langmuir binding model) (BIACORE® 評估軟體3.2版),藉由同時擬合締合及解離感測圖譜來計算締合速率(kon)及解離速率(koff)。平衡解離常數(Kd)按比率koff/kon來計算。參見例如,Chen等人,J . Mol . Biol . 293:865-881 (1999)。若藉由上述表面電漿子共振分析測定之締合速率超過106 M-1 s-1,則締合速率可使用螢光淬滅技術量測,該技術在如光譜儀(諸如具有攪拌式光析槽之止流裝備型分光光度計(Aviv Instruments)或8000系列SLM-AMINCOTM 分光光度計(ThermoSpectronic))中所量測之濃度增加之抗原存在下,在25℃下量測含20 nM抗-抗原抗體(Fab形式)之PBS (pH 7.2)之螢光發射強度(激發= 295 nm;發射= 340 nm,16 nm帶通)之增加或減少。 2.抗體片段 在某些實施例中,本文所提供之抗體為抗體片段。術語「抗體片段」係指除完整抗體之外的分子,其包含完整抗體中保留特異性結合至抗原之能力的部分。抗體片段包括(但不限於) Fab、Fab'、Fab'-SH、F(ab')2 、Fv、單鏈Fab (scFab);單鏈可變片段(scFv)及單結構域抗體(dAbs)。關於某些抗體片段之綜述,參見Holliger及Hudson之Nature Biotechnology 23:1126-1136 (2005)。 在一個實施例中,抗體片段為Fab、Fab'、Fab'-SH或F(ab')2 片段,特定言之為Fab片段。完整抗體之木瓜蛋白酶消化產生兩個相同的抗原結合片段,稱為「Fab」片段,其各自含有重鏈及輕鏈可變結構域以及輕鏈之恆定結構域及重鏈之第一恆定結構域(CH1)。因此,術語「Fab片段」係指抗體片段,其包含有包含輕鏈之VL結構域及恆定結構域(CL)之輕鏈片段,及重鏈之VH結構域及第一恆定結構域(CH1)。Fab'片段與Fab片段之不同之處在於,在包括一或多個來自抗體鉸鏈區之半胱胺酸之重鏈CH1結構域的羧基端處添加有殘基。Fab'-SH為其中恆定結構域之半胱胺酸殘基帶有游離硫醇基之Fab'片段。胃蛋白酶處理產生F(ab')2 片段,其具有兩個抗原結合位點(兩個Fab片段)及Fc區之一部分。關於包含救助受體結合抗原決定基殘基且具有延長之活體內半衰期之Fab及F(ab')2 片段的論述,參見美國專利第5,869,046號。 在另一實施例中,抗體片段為雙功能抗體、三功能抗體或四功能抗體。雙功能抗體為其中兩個抗原結合位點可為二價或雙特異性之抗體片段。參見例如EP 404,097;WO 1993/01161;Hudson等人, Nat. Med. 9:129-134 (2003);及Hollinger等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993)。三功能抗體及四功能抗體亦描述於Hudson等人之Nat. Med. 9:129-134 (2003)中。 在又一實施例中,抗體片段為單鏈Fab片段。「單鏈Fab片段」或「scFab」係由抗體重鏈可變結構域(VH)、抗體恆定結構域1 (CH1)、抗體輕鏈可變結構域(VL)、抗體輕鏈恆定結構域(CL)及連接子組成之多肽,其中該等抗體結構域及該連接子在N端至C端方向上具有以下次序中之一者:a) VH-CH1-連接子-VL-CL;b) VL-CL-連接子-VH-CH1;c) VH-CL-連接子-VL-CH1;或d) VL-CH1-連接子-VH-CL。特定言之,該連接子係具有至少30個胺基酸,較佳地32至50個胺基酸之多肽。單鏈Fab片段經由CL結構域與CH1結構域之間的天然雙硫鍵穩定化。此外,此等單鏈Fab分子可經由插入半胱胺酸殘基(例如根據Kabat編號,可變重鏈中之位置44及可變輕鏈中之位置100)而產生鏈間二硫鍵來進一步穩定化。 在另一實施例中,抗體片段為單鏈可變片段(scFv)。「單鏈可變片段(scFv)」係具有抗體之重鏈(VH)及輕鏈(VL)之藉由連接子連接之可變區的融合蛋白質。特定言之,連接子係具有10至25個胺基酸之短多肽,且通常富含於甘胺酸中以用於靈活度以及富含於絲胺酸或蘇胺酸中以用於溶解度,且可連接VH 之N端與VL 之C端或反過來。儘管移除恆定區且引入連接子,但此蛋白質保留初始抗體之特異性。關於scFv片段之綜述,參見例如Pluckthün,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, 第113卷, Rosenburg及Moore編, (Springer-Verlag, New York), 第269-315頁(1994);亦參見WO 93/16185;及美國專利第5,571,894號及5,587,458號。 在另一實施例中,抗體片段為單結構域抗體。單結構域抗體為包含抗體之重鏈可變結構域之全部或一部分或輕鏈可變結構域之全部或一部分的抗體片段。在某些實施例中,單結構域抗體為人類單結構域抗體(Domantis, Inc., Waltham, MA;參見(例如)美國專利第6,248,516 B1號)。 抗體片段可藉由各種技術製得,包括(但不限於)蛋白水解消化完整抗體以及藉由重組宿主細胞(例如大腸桿菌(E. coli)或噬菌體)產生,如本文所述。 3.嵌合及人類化抗體 在某些實施例中,本文所提供之抗體為嵌合抗體。某些嵌合抗體描述於例如美國專利第4,816,567號以及Morrison等人之Proc . Natl . Acad . Sci . USA (81:6851-6855 (1984))中。在一個實例中,嵌合抗體包含非人類可變區(例如來源於小鼠、大鼠、倉鼠、兔或非人類靈長類動物(諸如猴)之可變區)及人類恆定區。在又一實例中,嵌合抗體為「類別轉換」抗體,其中類別或子類別已自親本抗體之類別或子類別改變。嵌合抗體包括其抗原結合片段。 在某些實施例中,嵌合抗體為人類化抗體。通常,對非人類抗體進行人類化以降低對人類之免疫原性,同時保留親本非人類抗體之特異性及親和力。一般而言,人類化抗體包含一或多個可變結構域,其中HVR (例如CDR) (或其一部分)來源於非人類抗體,且FR (或其一部分)來源於人類抗體序列。人類化抗體視情況亦將包含人類恆定區之至少一部分。在一些實施例中,人類化抗體中之一些FR殘基經來自非人類抗體(例如,HVR殘基所來源之抗體)之相應殘基取代以(例如)恢復或改良抗體特異性或親和力。 人類化抗體及其製造方法概述於例如Almagro及Fransson,Front . Biosci . 13:1619-1633 (2008)中,且進一步描述於例如以下文獻中:Riechmann等人,Nature 332:323-329 (1988);Queen等人,Proc . Nat ' l Acad . Sci . USA 86:10029-10033 (1989);US專利第5,821,337號、第7,527,791號、第6,982,321號及第7,087,409號;Kashmiri等人,Methods 36:25-34 (2005) (描述特異性決定區(SDR)移植);Padlan,Mol . Immunol . 28:489-498 (1991) (描述「表面再塑(resurfacing)」);Dall'Acqua等人,Methods 36:43-60 (2005) (描述「FR改組」);及Osbourn等人,Methods 36:61-68 (2005)及Klimka等人,Br . J . Cancer ,83:252-260 (2000) (描述FR改組之「導引選擇」方法)。 可用於人類化之人類構架區包括(但不限於):使用「最佳擬合(best-fit)」方法選擇之構架區(參見例如Sims等人,J . Immunol . 151:2296 (1993));來源於具有輕鏈或重鏈可變區之特定子組之人類抗體的共同序列之構架區(參見例如Carter等人,Proc . Natl . Acad . Sci . USA ,89:4285 (1992);及Presta等人,J . Immunol . ,151:2623 (1993));人類成熟(體細胞突變)構架區或人類生殖系構架區(參見例如Almagro及Fransson,Front . Biosci . 13:1619-1633 (2008));及來源於篩選FR文庫之構架區(參見例如Baca等人,J . Biol . Chem . 272:10678-10684 (1997)及Rosok等人,J . Biol . Chem . 271:22611-22618 (1996))。 4.人類抗體 在某些實施例中,本文所提供之抗體為人類抗體。可使用此項技術中已知之各種技術產生人類抗體。人類抗體一般描述於van Dijk及van de Winkel,Curr . Opin . Pharmacol . 5: 368-74 (2001)及Lonberg,Curr . Opin . Immunol . 20:450-459 (2008)中。 人類抗體可藉由將免疫原投與已經修飾成可回應於抗原攻毒而產生完整人類抗體或具有人類可變區之完整抗體的轉殖基因動物來製備。此類動物通常含有人類免疫球蛋白基因座的全部或一部分,其置換內源性免疫球蛋白基因座,或存在於染色體外或隨機整合至動物染色體中。在此類轉殖基因小鼠中,內源性免疫球蛋白基因座一般已失活。關於自轉殖基因動物獲得人類抗體之方法的綜述,參見Lonberg,Nat . Biotech . 23:1117-1125 (2005)。亦參見例如美國專利第6,075,181號及第6,150,584號,描述XENOMOUSETM 技術;美國專利第5,770,429號,描述HUMAB®技術;美國專利第7,041,870號,描述K-M MOUSE®技術;及美國專利申請公開案第US 2007/0061900號,描述VELOCIMOUSE®技術。由此類動物產生之完整抗體之人類可變區可進一步加以修飾,例如藉由與不同人類恆定區組合。 人類抗體亦可藉由基於融合瘤之方法製備。已描述用於產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類融合骨髓瘤細胞株。(參見例如KozborJ . Immunol . , 133: 3001 (1984);Brodeur等人,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications , 第51-63頁(Marcel Dekker, Inc., New York, 1987);及Boerner等人,J . Immunol . , 147: 86 (1991))。經由人類B細胞融合瘤技術產生的人類抗體亦描述於Li等人,Proc . Natl . Acad . Sci . USA , 103:3557-3562 (2006)中。其他方法包括例如美國專利第7,189,826號(描述自融合瘤細胞株產生單株人類IgM抗體)及Ni,Xiandai Mianyixue , 26(4):265-268 (2006) (描述人類-人類融合瘤)中所述之彼等方法。人類融合瘤技術(三源融合瘤技術(Trioma technology))亦描述於Vollmers及Brandlein,Histology and Histopathology , 20(3):927-937 (2005)以及Vollmers及Brandlein,Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology , 27(3):185-91 (2005)中。 人類抗體亦可藉由分離選自人類衍生之噬菌體呈現文庫之Fv純系可變結構域序列而產生。此類可變結構域序列接著可與所需人類恆定結構域組合。下文描述用於自抗體文庫選擇人類抗體之技術。 5.源自文庫之抗體 本發明之抗體可藉由在組合文庫中篩選具有所需一或多種活性之抗體來分離。用於篩選組合文庫之方法概述於例如Lerner等人之Nature Reviews 16:498-508 (2016)中。舉例而言,此項技術中已知多種方法用於產生噬菌體呈現文庫以及在此類文庫中篩選具有所需結合特性之抗體。此類方法概述於例如Frenzel等人之mAbs 8:1177-1194 (2016);Bazan等人之Human Vaccines and Immunotherapeutics 8:1817-1828 (2012),及Zhao等人之Critical Reviews in Biotechnology 36:276-289 (2016),以及Hoogenboom等人之Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien等人編, Human Press, Totowa, NJ, 2001),以及Marks及Bradbury之Methods in Molecular Biology 248:161-175 (Lo編, Human Press, Totowa, NJ, 2003)。 在某些噬菌體呈現方法中,VH及VL基因之譜系分別藉由聚合酶鏈反應(PCR)選殖且在噬菌體文庫中隨機重組,接著可如Winter等人之Annual Review of Immunology 12: 433-455 (1994)中所述,篩選抗原結合噬菌體。噬菌體典型地以單鏈Fv (scFv)片段或Fab片段形式呈現抗體片段。來自經免疫來源之文庫向免疫原提供高親和力抗體而無需構築融合瘤。或者,可選殖(例如自人類)原生譜系以提供針對廣泛範圍之非自體抗原以及自體抗原之單一抗體來源而無需任何免疫接種,如Griffiths等人在EMBO Journal 12: 725-734 (1993)中所描述。最後,原始文庫亦可以合成方式如下製備:自幹細胞選殖未經重排之V基因區段,且使用含有隨機序列之PCR引子編碼高度可變CDR3區及完成活體外重排,如Hoogenboom及Winter在Journal of Molecular Biology 227: 381-388 (1992)中所述。描述人類抗體噬菌體文庫的專利公開案包括例如US專利第5,750,373號、第7,985,840號、第7,785,903號及第8,679,490號以及US專利公開案第2005/0079574號、第2007/0117126號、第2007/0237764號及第2007/0292936號。 此項技術中已知之用於在組合文庫中篩選具有一或多種所需活性之抗體的方法之其他實例包括核糖體及mRNA呈現,以及用於細菌、哺乳動物細胞、昆蟲細胞或酵母細胞上之抗體呈現及選擇的方法。酵母表面呈現方法概述於例如Scholler等人之Methods in Molecular Biology 503:135-56 (2012)及Cherf等人之Methods in Molecular biology 1319:155-175 (2015)以及Zhao等人之Methods in Molecular Biology 889:73-84 (2012)中。核糖體呈現方法描述於例如He等人之Nucleic Acids Research 25:5132-5134 (1997)及Hanes等人之PNAS 94:4937-4942 (1997)中。 自人類抗體文庫分離之抗體或抗體片段在本文中視為人類抗體或人類抗體片段。 6.多特異性抗體 在某些實施例中,本文所提供之抗體為多特異性抗體,例如雙特異性抗體。多特異性抗體為具有針對至少兩個不同位點(亦即,不同抗原上之不同抗原決定基或同一抗原上之不同抗原決定基)之結合特異性的單株抗體。在某些實施例中,多特異性抗體具有三個或更多個結合特異性。在某些實施例中,結合特異性中之一者係針對LAG3,且另一(兩個或更多個)特異性係針對任何其他抗原。在某些實施例中,雙特異性抗體可結合至LAG3之兩個(或更多個)不同抗原決定基。多特異性(例如雙特異性)抗體亦可用於將細胞毒性劑或細胞定位至表現LAG3之細胞。多特異性抗體可製備為全長抗體或抗體片段。 用於製得多特異性抗體之技術包括(但不限於)對具有不同特異性之兩個免疫球蛋白重鏈-輕鏈對進行重組共表現(參見Milstein及Cuello,Nature 305: 537 (1983));以及「杵臼結構(knob-in-hole)」工程改造(參見例如美國專利第5,731,168號,及Atwell等人, J. Mol. Biol. 270:26 (1997))。多特異性抗體亦可藉由以下方式製得:工程改造靜電轉向效應以用於製得抗體Fc異二聚體分子(參見例如WO 2009/089004);交聯兩種或更多種抗體或片段(參見例如US專利第4,676,980號,及Brennan等人, Science 229: 81 (1985));使用白胺酸拉鏈來產生雙特異性抗體(參見例如Kostelny等人,J . Immunol . , 148(5):1547-1553 (1992),及WO 2011/034605);使用共同輕鏈技術以避免輕鏈錯配問題(參見例如WO 98/50431);使用「雙功能抗體」技術來製得雙特異性抗體片段(參見例如Hollinger等人, Proc . Natl . Acad . Sci . USA , 90:6444-6448 (1993));以及使用單鏈Fv (sFv)二聚體(參見例如Gruber等人, J . Immunol . , 152:5368 (1994));以及如Tutt等人J . Immunol . 147: 60 (1991)中所描述製備三特異性抗體。 經工程改造具有三個或更多個抗原結合位點之抗體(例如包括「章魚抗體(Octopus antibodies)」或DVD-Ig)亦包括在本文中(參見例如WO 2001/77342及WO 2008/024715)。具有三個或更多個抗原結合位點之多特異性抗體之其他實例可見於WO 2010/115589、WO 2010/112193、WO 2010/136172、WO2010/145792及WO 2013/026831中。雙特異性抗體或其抗原結合片段亦包括「雙重作用FAb」或「DAF」,其包含結合至LAG3以及另一不同抗原或結合至LAG3之兩個不同抗原決定基的一抗原結合位點(參見例如US 2008/0069820及WO 2015/095539)。 亦可提供非對稱形式之多特異性抗體,其中同一抗原特異性之一或多個結合臂中具有結構域互換,亦即藉由交換VH/VL結構域(參見例如WO 2009/080252及WO 2015/150447)、CH1/CL結構域(參見例如WO 2009/080253)或完整Fab臂(參見例如WO 2009/080251、WO 2016/016299,以及參見Schaefer等人, PNAS, 108 (2011) 1187-1191,及Klein等人, MAbs 8 (2016) 1010-20)。在一個實施例中,多特異性抗體包含互換Fab片段。術語「互換 Fab 片段 」或「xFab片段」或「互換型Fab片段」係指其中重鏈及輕鏈之可變區或恆定區交換之Fab片段。互換Fab片段包含由輕鏈可變區(VL)及重鏈恆定區(CH1)構成的多肽鏈以及由重鏈可變區(VH)及輕鏈恆定區(CL)構成的多肽鏈。亦可藉由將帶電或不帶電胺基酸突變引入至結構域界面中以直接校正Fab配對來工程改造非對稱Fab臂。參見例如WO 2016/172485。 多特異性抗體之各種其他分子形式係此項技術中已知的且包括在本文中(參見例如Spiess等人, Mol Immunol 67 (2015) 95-106)。 7.抗體變異體 在某些實施例中,涵蓋本文所提供之抗體之胺基酸序列變異體。舉例而言,可能需要改良抗體之結合親和力及/或其他生物特性。抗體之胺基酸序列變異體可藉由將適當修飾引入編碼該抗體之核苷酸序列中或藉由肽合成製備。此類修飾包括例如抗體之胺基酸序列內殘基之缺失及/或插入及/或取代。可製造缺失、插入及取代之任一組合以獲得最終構築體,其限制條件為最終構築體具有所需特性,例如抗原結合。 a)取代、插入及缺失變異體 在某些實施例中,提供具有一或多個胺基酸取代之抗體變異體。用於取代突變誘發之相關位點包括HVR及FR。保守性取代示於表1中標題「較佳取代」下。更多實質性變化提供於表1中標題「例示性取代」下,且如下文參考胺基酸側鏈類別進一步描述。可將胺基酸取代引入相關抗體中,且針對所需活性篩選產物,該所需活性例如保留/改良之抗原結合、降低之免疫原性或改良之ADCC或CDC。 1
Figure 107111898-A0304-0001
胺基酸可根據共有側鏈特性進行分組: (1)疏水性:正白胺酸、Met、Ala、Val、Leu、Ile; (2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln; (3)酸性:Asp、Glu; (4)鹼性:His、Lys、Arg; (5)影響鏈取向之殘基:Gly、Pro; (6)芳族:Trp、Tyr、Phe。 非保守性取代將必然伴有將此等類別中之一者之成員換成另一個類別。 一種類型之取代型變異體涉及取代親本抗體(例如人類化或人類抗體)之一或多個高變區殘基。一般而言,選用於進一步研究之所得變異體相對於親本抗體將在某些生物特性方面具有修飾(例如改良) (例如親和力提高、免疫原性降低)及/或將實質上保留親本抗體之某些生物特性。例示性取代型變異體係親和力成熟抗體,其可例如宜使用基於噬菌體呈現之親和力成熟技術(諸如本文所述之技術)產生。簡言之,使一或多個HVR殘基突變,且在噬菌體上呈現變異抗體且針對特定生物活性(例如結合親和力)進行篩選。 改變(例如取代)可在HVR中進行以例如改良抗體親和力。此類改變可在HVR「熱點」,亦即由在體細胞成熟過程期間高頻率地經歷突變之密碼子編碼的殘基(參見例如Chowdhury,Methods Mol . Biol . 207:179-196 (2008))及/或接觸抗原之殘基中進行,隨後針對結合親和力測試所得變異VH或VL。藉由構築二級文庫及自二級文庫再選擇來達成親和力成熟已描述於Hoogenboom等人Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien等人編, Human Press, Totowa, NJ, (2001))中。在親和力成熟之一些實施例中,藉由各種方法(例如,易錯PCR、鏈改組或寡核苷酸導引之突變誘發)中之任一者將多樣性引入選用於成熟之可變基因中。隨後產生二級文庫。隨後篩選該文庫以鑑別具有所需親和力之任何抗體變異體。引入多樣性之另一方法涉及HVR引導途徑,其中將若干HVR殘基(例如一次4至6個殘基)隨機分組。可特異性地鑑別抗原結合所涉及之HVR殘基,例如使用丙胺酸掃描突變誘發或建立模型。尤其通常靶向CDR-H3及CDR-L3。 在某些實施例中,取代、插入或缺失可發生在一或多個HVR內,只要此類改變不實質上降低抗體結合抗原之能力即可。舉例而言,可在HVR中進行不實質上降低結合親和力之保守性改變(例如,如本文所提供之保守性取代)。此類改變例如可在HVR中接觸抗原之殘基之外。在上文所提供之變異VH及VL序列之某些實施例中,各HVR未改變或含有不超過一個、兩個或三個胺基酸取代。 一種適用於鑑別突變誘發可靶向之抗體殘基或區域的方法稱為「丙胺酸掃描突變誘發」,如Cunningham及Wells (1989)Science , 244:1081-1085所描述。在此方法中,鑑別殘基或一組靶殘基(例如帶電殘基,諸如arg、asp、his、lys及glu)且經中性或帶負電胺基酸(例如丙胺酸或聚丙胺酸)置換以判定抗體與抗原之相互作用是否受到影響。可在對初始取代展現功能敏感性之胺基酸位置處引入其他取代。或者或另外,利用抗原-抗體複合物之晶體結構來鑑別抗體與抗原之間的接觸點。此類接觸殘基及鄰近殘基可作為取代候選物之標靶或排除在取代候選物之外。可篩選變異體以確定其是否含有所需特性。 胺基酸序列插入包括長度在一個殘基至含有一百個或更多個殘基之多肽範圍內的胺基端及/或羧基端融合,以及單個或多個胺基酸殘基之序列內插入。末端插入之實例包括具有N端甲硫胺醯基殘基之抗體。抗體分子之其他插入變異體包括抗體之N端或C端與酶(例如對於ADEPT而言)或延長抗體之血清半衰期之多肽的融合物。 b)糖基化變異體 在某些實施例中,對本文所提供之抗體進行改變以增加或降低抗體糖基化之程度。向抗體中添加糖基化位點或使抗體缺失糖基化位點可藉由改變胺基酸序列以便產生或移除一或多個糖基化位點來便利地實現。 在抗體包含Fc區之情況下,可改變連接於其上之寡醣。由哺乳動物細胞產生之天然抗體通常包含分支鏈雙觸角寡醣,其一般藉由N鍵連接於Fc區之CH2結構域的Asn297。參見例如Wright等人TIBTECH 15:26-32 (1997)。寡醣可包括各種碳水化合物,例如甘露糖、N-乙醯基葡糖胺(GlcNAc)、半乳糖及唾液酸,以及連接於雙觸角寡醣結構之「主幹」中之GlcNAc的海藻糖。在一些實施例中,可對本發明抗體中之寡醣進行修飾以便形成具有某些改良特性之抗體變異體。 在一個實施例中,提供具有非海藻糖基化寡醣之抗體變異體,亦即寡醣結構缺少(直接地或間接)連接至Fc區之海藻糖。特定言之,此類非海藻糖基化寡醣(亦稱作「去海藻糖基化」寡醣)為缺少連接至雙觸角寡醣結構之主幹中之第一GlcNAc的海藻糖殘基之N鍵聯寡醣。在一個實施例中,提供Fc區中之非海藻糖基化寡糖之比例相比於天然或親本抗體增加之抗體變異體。舉例而言,非海藻糖基化寡糖之比例可為至少約20%、至少約40%、至少約60%、至少約80%或甚至約100% (亦即不存在海藻糖基化寡糖)。非海藻糖基化寡糖之百分比為相對於如藉由MALDI-TOF質譜分析所量測之連接至Asn 297之所有寡糖(例如複合、雜交及高甘露糖結構)的總和,不含海藻糖殘基之寡糖的(平均)量,如例如WO 2006/082515中所描述。Asn297係指位於Fc區中約位置297 (Fc區殘基之EU編號)處之天冬醯胺殘基;然而,由於抗體中之輕微序列變化,Asn297亦可位於位置297上游或下游之約±3個胺基酸處,亦即位於位置294與300之間。Fc區中之非海藻糖基化寡糖之比例增加的此類抗體可改良FcγRIIIa受體結合及/或改良效應功能,特定言之改良ADCC功能。參見例如US 2003/0157108;US 2004/0093621。 能夠產生具有減少之海藻糖基化之抗體的細胞株之實例包括缺乏蛋白質海藻糖基化之Lec13 CHO細胞(Ripka等人Arch . Biochem . Biophys . 249:533-545 (1986);US 2003/0157108及WO 2004/056312,尤其在實例11處),及基因剔除細胞株,諸如α-1,6-海藻糖基轉移酶基因、FUT8 、基因剔除CHO細胞(參見例如Yamane-Ohnuki等人Biotech . Bioeng . 87:614-622 (2004);Kanda, Y.等人, Biotechnol . Bioeng . , 94(4):680-688 (2006);以及WO2003/085107),或者GDP-海藻糖合成或轉運蛋白之活性降低或消除的細胞(參見例如US2004259150、US2005031613、US2004132140、US2004110282)。 在又一實施例中,提供具有平分寡糖之抗體變異體,例如其中連接至抗體Fc區之雙觸角寡醣經GlcNAc平分。此類抗體變異體可具有降低之海藻糖基化及/或改良之ADCC功能,如上文所描述。此類抗體變異體之實例描述於例如Umana等人, Nat Biotechnol 17, 176-180 (1999);Ferrara等人, Biotechn Bioeng 93, 851-861 (2006);WO 99/54342;WO 2004/065540、WO 2003/011878中。 亦提供寡醣中之至少一個半乳糖殘基與Fc區連接之抗體變異體。此類抗體變異體可具有改良之CDC功能。此類抗體變異體描述於例如WO 1997/30087;WO 1998/58964;及WO 1999/22764中。 c) Fc區變異體 在某些實施例中,可將一或多個胺基酸修飾引入本文所提供之抗體的Fc區中,由此產生Fc區變異體。Fc區變異體可包含在一或多個胺基酸位置處包含胺基酸修飾(例如取代)之人類Fc區序列(例如,人類IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 Fc區)。 在某些實施例中,本發明涵蓋具有一些而非所有效應功能之抗體變異體,此使得該抗體成為合乎應用需要之候選物,在該等應用中,活體內抗體半衰期至關重要,而某些效應功能(諸如補體及ADCC)為不必要或有害的。可進行活體外及/或活體內細胞毒性分析以證實CDC及/或ADCC活性之降低/損耗。舉例而言,可進行Fc受體(FcR)結合分析以確保抗體缺乏FcγR結合(因此可能缺乏ADCC活性),但保留FcRn結合能力。用於介導ADCC之初級細胞NK細胞僅表現FcγRIII,而單核細胞表現FcγRI、FcγRII及FcγRIII。FcR在造血細胞上之表現概述於Ravetch及Kinet,Annu . Rev . Immunol . 9:457-492 (1991)之第464頁之表3中。用以評估相關分子之ADCC活性的活體外分析之非限制性實例描述於美國專利第5,500,362號(參見例如Hellstrom, I.等人Proc . Nat ' l Acad . Sci . USA 83:7059-7063 (1986))及Hellstrom, I等人,Proc . Nat ' l Acad . Sci . USA 82:1499-1502 (1985);第5,821,337號(參見Bruggemann, M.等人,J . Exp . Med . 166:1351-1361 (1987))中。或者,可採用非放射性分析方法,參見例如用於流動式細胞量測術之ACTI™非放射性細胞毒性分析(CellTechnology, Inc. Mountain View, CA);及CytoTox 96® 非放射性細胞毒性分析(Promega, Madison, WI)。適用於此類分析之效應細胞包括周邊血液單核細胞(PBMC)及天然殺手(NK)細胞。或者或另外,可例如在動物模型中,諸如Clynes等人,Proc Nat ' l Acad Sci USA 95:652-656 (1998)中所揭示之動物模型中活體內評估相關分子之ADCC活性。亦可進行C1q結合分析以證實抗體不能結合C1q且因此缺乏CDC活性。參見例如WO 2006/029879及WO 2005/100402中之C1q及C3c結合ELISA。為了評估補體活化,可進行CDC分析(參見例如Gazzano-Santoro等人,J . Immunol . Methods 202:163 (1996);Cragg, M.S.等人,Blood 101:1045-1052 (2003);及Cragg, M.S.及M.J. Glennie,Blood 103:2738-2743 (2004))。亦可使用此項技術中已知之方法(參見例如Petkova, S.B.等人,Int ' l . Immunol . 18(12):1759-1769 (2006);WO 2013/120929 Al)進行FcRn結合及活體內清除率/半衰期測定。 具有降低之效應功能的抗體包括Fc區殘基238、265、269、270、297、327及329中之一或多者具有取代之彼等抗體(美國專利第6,737,056號)。此類Fc突變體包括在胺基酸位置265、269、270、297及327中之兩者或多於兩者處具有取代之Fc突變體,包括殘基265及297取代為丙胺酸的所謂「DANA」Fc突變體(US專利第7,332,581號)。 描述具有提高或降低之與FcR之結合的某些抗體變異體。(參見例如美國專利第6,737,056號;WO 2004/056312,及Shields等人, J . Biol . Chem . 9(2): 6591-6604 (2001))。 在某些實施例中,抗體變異體包含具有改良ADCC之一或多個胺基酸取代的Fc區,例如在Fc區之位置298、333及/或334 (殘基之EU編號)處具有取代。 在某些實施例中,抗體變異體包含具有增加FcRn結合之一或多個胺基酸取代的Fc區,例如在Fc區之位置252及/或254及/或256 (殘基之EU編號)處具有取代。在某些實施例中,抗體變異體包含在位置252、254及256處具有胺基酸取代之Fc區。在一個實施例中,該等取代為來源於人類IgG1 Fc區之Fc區中的M252Y、S254T及T256E。 在某些實施例中,抗體變異體包含具有減少FcγR結合之胺基酸取代的Fc區,例如在Fc區之位置234及235 (殘基之EU編號)處具有取代。在一個實施例中,該等取代為L234A及L235A (LALA)。在某些實施例中,抗體變異體進一步包含來源於人類IgG1 Fc區之Fc區中的D265A及/或P329G。在一個實施例中,該等取代為來源於人類IgG1 Fc區之Fc區中的L234A、L235A及P329G (LALA-PG)。(參見例如WO 2012/130831 Al)。在另一實施例中,該等取代為來源於人類IgG1 Fc區之Fc區中的L234A、L235A及D265A (LALA-DA)。 在一些實施例中,在Fc區中進行使得C1q結合及/或補體依賴性細胞毒性(CDC)改變(亦即增加或降低)之改變操作,例如如US專利第6,194,551號、WO 99/51642及Idusogie等人J . Immunol . 164: 4178-4184 (2000)中所描述。 半衰期延長且與負責將母體IgG轉移至胎兒之新生兒Fc受體(FcRn) (Guyer等人,J . Immunol . 117:587 (1976)及Kim等人,J . Immunol . 24:249 (1994))之結合改良的抗體描述於US 2005/0014934A1 (Hinton等人)中。彼等抗體包含其中具有一或多個取代之Fc區,此改善Fc區與FcRn之結合。此類Fc變異體包括在以下Fc區殘基中之一或多者處具有取代之變異體:238、252、254、256、265、272、286、303、305、307、311、312、317、340、356、360、362、376、378、380、382、413、424或434,例如Fc區殘基434處之取代(參見例如US專利第7,371,826號;Dall'Acqua, W.F.等人J. Biol. Chem. 281 (2006) 23514-23524)。 已藉由定點突變誘發鑑別出對於小鼠Fc-小鼠FcRn相互作用至關重要的Fc區殘基(參見例如Dall'Acqua, W.F.等人J. Immunol 169 (2002) 5171-5180)。殘基I253、H310、H433、N434及H435 (根據Kabat之EU編號)參與該相互作用(Medesan, C.等人Eur. J. Immunol. 26 (1996) 2533;Firan, M.等人, Int. Immunol. 13 (2001) 993;Kim, J.K.等人, Eur. J. Immunol. 24 (1994) 542)。發現殘基I253、H310及H435對於人類Fc與鼠類FcRn之相互作用至關重要(Kim, J.K.等人, Eur. J. Immunol. 29 (1999) 2819)。對人類Fc-人類FcRn複合物之研究已顯示殘基I253、S254、H435及Y436對於相互作用至關重要(Firan, M.等人, Int. Immunol. 13 (2001) 993;Shields, R.L.等人, J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604)。在Yeung, Y.A.等人(J. Immunol. 182 (2009) 7667-7671)中,已報告並檢測殘基248至259及301至317及376至382及424至437之各種突變體。 在某些實施例中,抗體變異體包含具有減少FcRn結合之一或多個胺基酸取代的Fc區,例如在Fc區之位置253及/或310及/或435 (殘基之EU編號)處具有取代。在某些實施例中,抗體變異體包含在位置253、310及435處具有胺基酸取代之Fc區。在一個實施例中,該等取代為來源於人類IgG1 Fc區之Fc區中的I253A、H310A及H435A。參見例如Grevys, A.等人, J. Immunol. 194 (2015) 5497-5508。 在某些實施例中,抗體變異體包含具有減少FcRn結合之一或多個胺基酸取代的Fc區,例如在Fc區之位置310及/或433及/或436 (殘基之EU編號)處具有取代。在某些實施例中,抗體變異體包含在位置310、433及436處具有胺基酸取代之Fc區。在一個實施例中,該等取代為來源於人類IgG1 Fc區之Fc區中的H310A、H433A及Y436A。(參見例如WO 2014/177460 Al)。 關於Fc區變異體之其他實例,亦參見Duncan及Winter,Nature 322:738-40 (1988);美國專利第5,648,260號;美國專利第5,624,821號;及WO 94/29351。 B.重組方法及組合物 可使用例如如US 4,816,567中所描述之重組方法及組合物產生抗體。對於此等方法,提供編碼抗體之一或多個分離核酸。在天然抗體或天然抗體片段之情況下,需要兩個核酸,一個用於輕鏈或其片段且一個用於重鏈或其片段。此類核酸編碼包含抗體之VL的胺基酸序列及/或包含抗體之VH的胺基酸序列(例如抗體之輕鏈及/或重鏈)。此等核酸可以在同一表現載體上或在不同表現載體上。在具有異二聚體重鏈之雙特異性抗體的情況下,需要四個核酸,一個用於第一輕鏈,一個用於包含第一異單體Fc區多肽之第一重鏈,一個用於第二輕鏈,且一個用於包含第二異單體Fc區多肽之第二重鏈。該四個核酸可以包含在一或多個核酸分子或表現載體中。此類核酸編碼包含抗體之第一VL之胺基酸序列,及/或包含抗體之包括第一異單體Fc區之第一VH的胺基酸序列,及/或包含抗體之第二VL之胺基酸序列,及/或包含抗體之包括第二異單體Fc區之第二VH的胺基酸序列(例如抗體之第一及/或第二輕鏈及/或第一及/或第二重鏈)。此等核酸可以在同一表現載體上或在不同表現載體上,通常此等核酸係位於兩個或三個表現載體上,亦即,一個載體可以包含此等核酸中之多於一者。此等雙特異性抗體之實例為CrossMabs及T細胞雙特異性(參見例如Schaefer, W.等人, PNAS, 108 (2011) 11187-1191)。舉例而言,異單體重鏈中之一者包含所謂的「杵突變」(T366W以及視情況存在之S354C或Y349C中之一者),且另一者包含所謂的「臼突變」(T366S、L368A及Y407V以及視情況存在之Y349C或S354C) (參見例如Carter, P.等人, Immunotechnol. 2 (1996) 73)。在一個實施例中,提供如在本文所報告之方法中使用的編碼抗體之分離核酸。在又一實施例中,提供包含此類核酸之一或多個載體(例如表現載體)。在又一實施例中,提供包含此類核酸之宿主細胞。在一個此類實施例中,宿主細胞包含(例如已轉化有):-在由經二硫鍵鍵結之兩個相同輕鏈及兩個相同重鏈或包含其片段之VH及VL構成的抗體之情況下:(1)載體包含對包含抗體之VL的胺基酸序列及包含抗體之VH的胺基酸序列進行編碼的核酸,或(2)第一載體包含對包含抗體之VL的胺基酸序列進行編碼的核酸,且第二載體包含對包含抗體之VH的胺基酸序列進行編碼的核酸。-在具有異二聚體重鏈之雙特異性抗體的情況下:(1)第一載體包含編碼胺基酸序列之第一對核酸,該等胺基酸序列中之一者包含抗體之第一VL且另一者包含抗體之第一VH;且第二載體包含編碼胺基酸序列之第二對核酸,該等胺基酸序列中之一者包含抗體之第二VL且另一者包含抗體之第二VH,或(2)第一載體包含第一核酸,其對包含可變結構域中之一者(較佳地輕鏈可變結構域)的胺基酸序列進行編碼;第二載體包含編碼胺基酸序列之一對核酸,該等胺基酸序列中之一者包含輕鏈可變結構域且另一者包含第一重鏈可變結構域;且第三載體包含編碼胺基酸序列之一對核酸,該等胺基酸序列中之一者包含相對於第二載體中之對應另一輕鏈可變結構域且另一者包含第二重鏈可變結構域,或(3) 第一載體包含對包含抗體之第一VL的胺基酸序列進行編碼的核酸;第二載體包含對包含抗體之第一VH的胺基酸序列進行編碼的核酸;第三載體包含對包含抗體之第二VL的胺基酸序列進行編碼的核酸;且第四載體包含對包含抗體之第二VH的胺基酸序列進行編碼的核酸。在一個實施例中,宿主細胞為真核細胞,例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或淋巴細胞(例如Y0、NS0、Sp20細胞)。在一個實施例中,提供一種製造抗LAG3抗體之方法,其中該方法包含:在適合於表現該抗體的條件下,培養如上文所提供之包含編碼該抗體之核酸的宿主細胞,且視情況自該宿主細胞(或宿主細胞培養基)回收抗體。針對抗LAG3抗體之重組產生,分離例如如上文所描述的編碼抗體之核酸且將其插入至一或多個載體中以用於在宿主細胞中進一步選殖及/或表現。此類核酸可容易地使用習知程序(例如藉由使用能夠特異性地結合至編碼抗體之重鏈及輕鏈之基因的寡核苷酸探針)分離及定序,或藉由重組方法產生,或藉由化學合成獲得。適合用於選殖或表現編碼抗體之載體的宿主細胞包括本文所述之原核或真核細胞。舉例而言,抗體可於細菌中產生,在不需要糖基化及Fc效應功能時尤其如此。關於抗體片段及多肽在細菌中之表現,參見例如US 5,648,237、US 5,789,199及US 5,840,523。(亦參見Charlton, K.A., In: Methods in Molecular Biology,第248卷, Lo, B.K.C. (編), Humana Press, Totowa, NJ (2003), 第245-254頁,其描述抗體片段在大腸桿菌中之表現)在表現之後,可以可溶性溶離份自細菌細胞糊狀物分離抗體且其可進一步經純化。除原核生物外,諸如絲狀真菌或酵母之真核微生物為適用於編碼抗體之載體的選殖或表現宿主,包括糖基化路徑已經「人類化」,從而使得所產生之抗體具有部分或完全人類糖基化型態的真菌及酵母菌株。參看Gerngross, T.U., Nat. Biotech. 22 (2004) 1409-1414;及Li, H.等人, Nat. Biotech. 24 (2006) 210-215。適用於表現糖基化抗體之宿主細胞亦來源於多細胞生物體(無脊椎動物及脊椎動物)。無脊椎動物細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已鑑別出眾多可與昆蟲細胞聯合使用,尤其用於轉染草地黏蟲(Spodoptera frugiperda)細胞之桿狀病毒株。植物細胞培養物亦可用作宿主。參見例如US 5,959,177、US 6,040,498、US 6,420,548、US 7,125,978及US 6,417,429 (描述在轉殖基因植物中產生抗體之PLANTIBODIESTM技術)。脊椎動物細胞亦可用作宿主。舉例而言,適於在懸浮液中生長之哺乳動物細胞株可為適用的。適用哺乳動物宿主細胞株之其他實例為藉由SV40轉化之猴腎CV1株系(COS-7);人胚腎株系(293或293細胞,如例如Graham, F.L.等人, J. Gen Virol. 36 (1977) 59-74中所描述);幼倉鼠腎細胞(BHK);小鼠塞特利氏細胞(mouse sertoli cell) (TM4細胞,如例如Mather, J.P., Biol. Reprod. 23 (1980) 243-252中所描述);猴腎細胞(CV1);非洲綠猴腎細胞(VERO-76);人類子宮頸癌瘤細胞(HELA);犬科動物腎細胞(MDCK;布法羅大鼠(buffalo rat)肝臟細胞(BRL 3A);人類肺細胞(W138);人類肝臟細胞(Hep G2);小鼠乳房腫瘤(MMT 060562);TRI細胞,如例如Mather, J.P.等人, Annals N.Y. Acad. Sci. 383 (1982) 44-68中所描述;MRC 5細胞;以及FS4細胞。其他適用哺乳動物宿主細胞株包括中國倉鼠卵巢(CHO)細胞,包括DHFR- CHO細胞(Urlaub, G.等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77 (1980) 4216-4220);以及骨髓瘤細胞株,諸如Y0、NS0及Sp2/0。關於適合於抗體產生之某些哺乳動物宿主細胞株之綜述,參見例如Yazaki, P.及Wu, A.M., Methods in Molecular Biology, 第248卷, Lo, B.K.C. (編), Humana Press, Totowa, NJ (2004), 第255-268頁。C.分析 可藉由此項技術中已知之各種分析對本文所提供之抗LAG3抗體針對其物理/化學特性及/或生物活性進行鑑別、篩選或表徵。 1.結合分析及其他分析 在一個態樣中,例如藉由已知方法,諸如ELISA、西方墨點法(Western blot)等,測試本發明抗體之抗原結合活性。 在另一態樣中,可使用競爭分析鑑別與aLAG3 (0414)競爭結合至LAG3之抗體。在某些實施例中,此類競爭性抗體結合aLAG3 (0414)所結合之相同抗原決定基(例如線性或構形抗原決定基)。用於對抗體所結合之抗原決定基進行定位的詳細例示性方法提供於Morris (1996) 「Epitope Mapping Protocols」,Methods in Molecular Biology 第66卷(Humana Press, Totowa, NJ)中。 在例示性競爭分析中,在包含結合至LAG3之第一經標記抗體(例如aLAG3 (0414))及第二未標記抗體之溶液中培育固定LAG3,其中測試該第二未標記抗體與第一抗體競爭結合至LAG3之能力。第二抗體可存在於融合瘤上清液中。作為對照,在包含第一經標記抗體但無第二未標記抗體之溶液中培育固定LAG3。在允許第一抗體結合至LAG3之條件下進行培育之後,移除過量的未結合抗體,且量測與固定LAG3締合之標記的量。若測試樣品中與固定LAG3締合之標記的量相對於對照樣品中實質上減少,則其指示第二抗體與第一抗體競爭結合至LAG3。參見Harlow及Lane (1988)Antibodies : A Laboratory Manual 第14章(Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY)。 2.活性分析 在一個態樣中,提供用於鑑別具有生物活性之抗LAG3抗體的分析。生物活性可包括,例如,抗LAG3抗體(單獨或與抗PDL1抗體組合)對混合淋巴細胞反應(mMLR)分析中人類CD4 T細胞之細胞毒性顆粒酶B釋放及IL-2分泌的影響,或抗LAG-3抗體對人類CD4 T細胞之顆粒酶B及IFN-γ釋放之Treg抑制的影響;或抗LAG3抗體對結合至在人類A375腫瘤細胞中表現之MHC-II之LAG-3的抑制。亦提供在活體內及/或活體外具有此生物活性之抗體。 在某些實施例中,測試本發明抗體之此類生物活性。細節參見下文實例2及實例3。 D.用於診斷及偵測之方法及組合物 在某些實施例中,本文所提供之抗LAG3抗體中之任一者適用於偵測生物樣品中LAG3之存在。如本文中所使用,術語「偵測」涵蓋定量或定性偵測。在某些實施例中,生物樣品包含細胞或組織,諸如腫瘤組織。 在一個實施例中,提供一種適用於診斷或偵測方法之抗LAG3抗體。在又一態樣中,提供一種偵測生物樣品中LAG3之存在的方法。在某些實施例中,該方法包含使生物樣品與如本文所述之抗LAG3抗體在允許抗LAG3抗體結合至LAG3之條件下接觸,且偵測在抗LAG3抗體與LAG3之間是否形成複合物。此類方法可為活體外或活體內方法。在一個實施例中,使用抗LAG3抗體來選擇適於用抗LAG3抗體治療之個體,例如其中LAG3為用於患者選擇之生物標記。 可使用本發明抗體診斷之例示性病症包括不同形式之癌症,諸如慢性淋巴球性白血病(CLL)、乳癌等(亦參見下文癌症清單)。 在某些實施例中,提供經標記之抗LAG3抗體。標記包括(但不限於)直接偵測之標記或部分(諸如螢光、發色、電子緻密、化學發光及放射性標記),以及例如經由酶反應或分子相互作用間接偵測之部分(諸如酶或配位體)。例示性標記包括(但不限於)放射性同位素32 P、14 C、125 I、3 H及131 I;螢光團,諸如稀土螯合物或螢光素及其衍生物;若丹明(rhodamine)及其衍生物;丹醯基;傘酮;螢光素酶,例如螢火蟲螢光素酶及細菌螢光素酶(美國專利第4,737,456號);螢光素;2,3-二氫酞嗪二酮;辣根過氧化酶(HRP);鹼性磷酸酶;β-半乳糖苷酶;葡糖澱粉酶;溶菌酶;醣氧化酶,例如葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶及葡萄糖-6-磷酸去氫酶;雜環氧化酶,諸如尿酸酶及黃嘌呤氧化酶,其與採用過氧化氫氧化染料前驅體之酶(諸如HRP、乳過氧化酶或微過氧化酶)偶合;生物素/抗生物素蛋白;自旋標記;噬菌體標記;穩定自由基及其類似標記。 E.醫藥調配物 如本文所述之抗LAG3抗體之醫藥調配物係藉由將具有所要純度之此類抗體與一或多種視情況存在之醫藥學上可接受之載劑混合(Remington ' s Pharmaceutical Sciences 第16版, Osol, A.編(1980)),以凍乾調配物或水溶液形式來製備。醫藥學上可接受之載劑在所使用之劑量及濃度下一般係對接受者無毒性的,且包括(但不限於):緩衝液,諸如磷酸、檸檬酸及其他有機酸;抗氧化劑,包括抗壞血酸及甲硫胺酸;防腐劑(諸如氯化十八烷基二甲基苯甲基銨;氯化六羥季銨;苯紮氯銨;苄索氯銨;酚醇、丁醇或苯甲醇;對羥基苯甲酸烷酯,諸如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯;兒茶酚;間苯二酚;環己醇;3-戊醇;以及間甲酚);低分子量(少於約10個殘基)多肽;蛋白質,諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白;親水性聚合物,諸如聚乙烯吡咯啶酮;胺基酸,諸如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸;單糖、雙糖及其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合劑,諸如EDTA;糖,諸如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨醇;成鹽抗衡離子,諸如鈉;金屬錯合物(例如Zn-蛋白質錯合物);及/或非離子型界面活性劑,諸如聚乙二醇(PEG)。本文中之例示性醫藥學上可接受之載劑進一步包括間質藥物分散劑,諸如可溶性中性活性玻尿酸酶糖蛋白(sHASEGP),例如人類可溶性PH-20玻尿酸酶糖蛋白,諸如rHuPH20 (HYLENEX®, Baxter International, Inc.)。某些示例性sHASEGP (包括rHuPH20)及使用方法描述於US專利公開案第2005/0260186號及第2006/0104968號中。在一個態樣中,sHASEGP與一或多種其他葡萄糖胺聚糖酶(諸如軟骨素酶)組合。 例示性凍乾抗體調配物描述於US專利第6,267,958號中。水性抗體調配物包括US專利案第6,171,586號及WO2006/044908中所述之調配物,後一者中之調配物包括組胺酸-乙酸鹽緩衝液。 本文之調配物亦可含有多於一種為所治療之特定適應症所必需之活性成分,較佳為具有不會對彼此產生不利影響之互補活性的彼等活性成分。舉例而言,可能需要進一步提供抗PD1抗體或抗PDL1抗體或抗TIM3抗體。此類活性成分宜以有效達成預期目的之量的組合存在。 可例如藉由凝聚技術或藉由界面聚合將活性成分包覆於所製備之微囊中,例如羥甲基纖維素或明膠微囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯)微囊,分別包覆於膠狀藥物遞送系統(例如,脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子及奈米囊劑)或巨乳液中。此類技術揭示於Remington ' s Pharmaceutical Sciences 第16版, Osol, A.編(1980)中。 可製備延釋製劑。延釋製劑之適合實例包括含有抗體之固體疏水性聚合物之半滲透基質,該等基質呈成形製品形式,例如薄膜或微膠囊。 用於活體內投與之調配物通常為無菌的。無菌性可容易地藉由例如無菌過濾膜過濾來實現。 F.治療方法及組合物 本文所提供之抗LAG3抗體中之任一者可用於治療方法中。 在一個態樣中,提供一種用作藥劑之抗LAG3抗體。在其他態樣中,提供一種用於治療癌症之抗LAG3抗體。在某些實施例中,提供一種用於治療方法之抗LAG3抗體。在某些實施例中,本發明提供一種用於治療患有癌症之個體的方法之抗LAG3抗體,該方法包含向個體投與有效量之抗LAG3抗體。在一個實施例中,該抗體用於治療諸如腫瘤免疫之免疫相關疾病或延緩其進展。在一個實施例中,該抗體用於刺激免疫反應或功能,諸如T細胞活性。 在其他實施例中,本發明提供一種抗LAG3抗體,其用作免疫刺激劑/或刺激顆粒酶B (GrzB)、干擾素-γ (IFN-γ)及或介白素2 (IL-2)分泌/釋放。在某些實施例中,本發明提供一種抗LAG3抗體,其用於個體中之顆粒酶B (GrzB)、干擾素-γ (IFN-γ)及或介白素2 (IL-2)分泌/釋放之方法,該方法包含向個體投與有效之抗LAG3抗體以用於顆粒酶B (GrzB)、干擾素-γ (IFN-γ)及或介白素2 (IL-2)分泌/釋放。 根據以上實施例中之任一者的「個體」較佳為人類。在又一態樣中,本發明提供抗LAG3抗體之用途,其用於製造或製備藥劑。在一個實施例中,藥劑用於治療癌症。在又一實施例中,藥劑用於治療癌症之方法,該方法包含向患有癌症之個體投與有效量之藥劑。在又一實施例中,藥劑用於誘導癌細胞之細胞介導溶解。在又一實施例中,藥劑用於誘導患有癌症之個體內癌細胞之細胞介導溶解之方法,該方法包含向個體投與有效量之藥劑以在癌細胞中誘導細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖。根據以上實施例中任一者之「個體」可為人類。 如本文所使用,術語「癌症」可為例如肺癌、非小細胞肺(NSCL)癌、細支氣管肺泡細胞肺癌、骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭頸癌、皮膚或眼內黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門區癌、胃癌(stomach cancer)、胃癌(gastric cancer)、結腸癌、乳癌、子宮癌、輸卵管癌瘤、子宮內膜癌瘤、子宮頸癌瘤、陰道癌瘤、外陰癌瘤、霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、前列腺癌、膀胱癌、腎臟或尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌瘤、間皮瘤、肝細胞癌、膽道癌、中樞神經系統(CNS)贅瘤、脊軸腫瘤、腦幹神經膠質瘤、多形性膠質母細胞瘤、星形細胞瘤、神經鞘瘤、室管膜瘤、神經管胚細胞瘤、脊膜瘤、鱗狀細胞癌、垂體腺瘤、淋巴瘤、淋巴球性白血病,其包括以上癌症中之任一者之難治性形式或以上癌症中之一或多者之組合。在一個較佳實施例中,此癌症為乳癌、結腸直腸癌、黑色素瘤、頭頸癌、肺癌或前列腺癌。在一個較佳實施例中,此癌症為乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、肺癌或前列腺癌。在另一較佳實施例中,此癌症為乳癌、肺癌、結腸癌、卵巢癌、黑素瘤癌、膀胱癌、腎癌、腎臟癌、肝癌、頭頸癌、結腸直腸癌、胰臟癌、胃癌、食道癌、間皮瘤、前列腺癌、白血病、淋巴瘤、骨髓瘤。在一個較佳實施例中,此類癌症之進一步特徵在於LAG3表現或過度表現。 在又一態樣中,本發明提供一種用於治療癌症之方法。在一個實施例中,該方法包含向患有癌症之個體投與有效量之抗LAG3。根據以上實施例中任一者之「個體」可為人類。 在又一態樣中,本發明提供一種用於誘導患有癌症之個體內癌細胞之細胞介導溶解之方法。在一個實施例中,該方法包含向個體投與有效量的抗LAG3以誘導患有癌症之個體內癌細胞之細胞介導溶解。在一個實施例中,「個體」為人類。 在又一態樣中,本發明提供包含本文所提供之抗LAG3抗體中之任一者的醫藥調配物,例如用於上述治療方法中之任一者。在一個實施例中,醫藥調配物包含本文所提供之抗LAG3抗體中之任一者及醫藥學上可接受之載劑。 在又一態樣中,本發明提供包含本文所提供之抗LAG3抗體中之任一者的醫藥調配物,例如用於上述治療方法中之任一者。在一個實施例中,醫藥調配物包含本文所提供之抗LAG3抗體中之任一者及醫藥學上可接受之載劑。在另一實施例中,醫藥調配物包含本文所提供之抗LAG3抗體中之任一者及至少一種其他治療劑(例如下文所描述)。 本發明之抗體可單獨或與其他藥劑組合用於療法中。舉例而言,本發明抗體可與至少一種其他治療劑共投與。在某些實施例中,另一種治療劑為抗LAG3抗體或抗PDL1抗體或抗TIM3抗體。 除抗LAG3抗體之外,亦可投與化學治療劑。在一個實施例中,可與如本文所描述之抗LAG3抗體一起投與之該等其他化學治療劑包括(但不限於)抗贅生劑,其包括烷基化劑,包括:氮芥,諸如二氯甲基二乙胺、環磷醯胺、異環磷醯胺、美法侖及苯丁酸氮芥;亞硝基脲,諸如卡莫司汀(carmustine) (BCNU)、洛莫司汀(lomustine) (CCNU)及司莫司汀(semustine) (甲基-CCNU);Temodal(TM) (替莫唑胺(temozolamide)),乙烯亞胺/甲基三聚氰胺,諸如三乙烯三聚氰胺(TEM)、三乙烯、塞替派(thiophosphoramide) (噻替派(thiotepa))、六甲基三聚氰胺(HMM,六甲蜜胺);磺酸烷基酯,諸如白消安;三嗪,諸如達卡巴嗪(dacarbazine) (DTIC);抗代謝物,包括葉酸類似物,諸如甲胺喋呤及曲美沙特(trimetrexate),嘧啶類似物,諸如5-氟尿嘧啶(5FU)、氟去氧尿苷、吉西他濱(gemcitabine)、胞嘧啶阿拉伯糖苷(AraC,阿糖胞苷)、5-氮胞苷、2,2'-二氟去氧胞核,嘌呤類似物,諸如6-巰基嘌呤(6-merca.rho.topurine)、6-硫鳥嘌呤(6-thioguamne)、硫唑嘌呤、T-去氧柯福黴素(deoxycoformycin) (噴司他汀(pentostatin))、赤式羥基壬基腺嘌呤(EHNA)、氟達拉賓磷酸鹽(fludarabine phosphate)及2-氯去氧腺苷(克拉屈濱(cladribine),2-CdA);天然產物,包括抗有絲分裂藥物,諸如太平洋紫杉醇(paclitaxel),長春花生物鹼(vinca alkaloids),包括長春鹼(vinblastine) (VLB)、長春新鹼(vincristine)及長春瑞賓(vinorelbine),克癌易(taxotere)、雌氮芥(estramustine)及磷酸雌氮芥;鬼臼毒素(pipodophylotoxin),諸如依託泊苷(etoposide)及替尼泊苷(teniposide);抗生素,諸如放線菌素D、柔紅黴素(daunomycin) (紅比黴素(rubidomycin))、小紅莓、米托蒽醌(mitoxantrone)、艾達黴素(idarubicin)、博來黴素(bleomycin)、普卡黴素(plicamycin) (光神黴素(mithramycin))、絲裂黴素C及放射菌素;酶類,諸如L-天冬醯胺酶;生物反應改質劑,諸如干擾素-α、IL-2、G-CSF及GM-CSF;其他藥劑,包括鉑配位錯合物,諸如奧沙利鉑(oxaliplatin)、順鉑(cisplatin)及卡鉑(carboplatin),蒽二酮(anthracenedione),諸如米托蒽醌,經取代之尿素,諸如羥基尿素,甲肼衍生物,包括N-甲肼(MIH)及丙卡巴肼(procarbazine),腎上腺皮質抑制劑,諸如米托坦(mitotane) (o,p-DDD)及胺格魯米特(aminoglutethimide);激素及拮抗劑,包括腎上腺皮質類固醇拮抗劑,諸如強的松(prednisone)及等效物、地塞米松(dexamethasone)及胺格魯米特;Gemzar(TM) (吉西他濱),孕激素,諸如羥助孕酮己酯、甲羥助孕酮乙酯及甲地孕酮乙酯;雌激素,諸如己烯雌酚(diethylstilbestrol)及炔雌醇等效物;抗雌激素,諸如他莫昔芬(tamoxifen);雄激素,包括丙酸睪固酮及氟甲睾酮/等效物;抗雄激素,諸如氟他胺(flutamide)、促性腺激素釋放激素類似物及亮丙立德(leuprolide);以及非類固醇抗雄激素,諸如氟他胺。亦可使靶向表觀遺傳機構之療法與抗原結合蛋白組合,該等療法包括(但不限於)組蛋白脫乙醯基酶抑制劑、去甲基劑(例如維達紮(Vidaza))及轉錄抑制解除(ATRA)療法。在一個實施例中,化學治療劑選自由以下組成之群:紫杉烷(taxane) (如太平洋紫杉醇(紫杉醇(Taxol))、多西他賽(docetaxel) (克癌易)、經改質太平洋紫杉醇(例如阿布拉生(Abraxane)及歐帕西(Opaxio))、小紅莓、舒尼替尼(sunitinib) (舒癌特(Sutent))、索拉非尼(sorafenib) (雷沙瓦(Nexavar))及其他多重激酶抑制劑奧沙利鉑、順鉑及卡鉑、依託泊苷、吉西他濱及長春鹼。在一個實施例中,化學治療劑選自由以下組成之群:紫杉烷(如紫杉醇(太平洋紫杉醇)、多西他賽(克癌易)、經改質太平洋紫杉醇(例如阿布拉生及歐帕西)。在一個實施例中,額外化學治療劑選自5-氟尿嘧啶(5-FU)、甲醯四氫葉酸(leucovorin)、伊立替康(irinotecan)或奧沙利鉑。在一個實施例中,化學治療劑為5-氟尿嘧啶、甲醯四氫葉酸及伊立替康(FOLFIRI)。在一個實施例中,化學治療劑為5-氟尿嘧啶及奧沙利鉑(FOLFOX)。 上述該等組合療法涵蓋組合投藥(其中兩種或多於兩種治療劑包括在同一或不同調配物中)及獨立投藥,在此情況下,本發明抗體之投與可在投與一或多種其他治療劑之前、同時及/或之後進行。在一個實施例中,抗LAG3抗體之投與及另一治療劑之投與彼此在約一個月內;或在約一週、兩週或三週內;或在約一天、兩天、三天、四天、五天或六天內進行。本發明之抗體亦可與放射療法組合使用。 本發明之抗體(及任何其他治療劑)可藉由任何適合方式投與,包括非經腸、肺內及鼻內投與及(必要時針對局部治療)病灶內投與。非經腸輸注包括肌肉內、靜脈內、動脈內、腹膜內或皮下投與。部分視投藥之短期或長期性而定,可藉由任何適當途徑(例如藉由注射,諸如靜脈內或皮下注射)給藥。本文中涵蓋各種給藥時程,包括(但不限於)單次投藥或在不同時間點的多次投藥、快速投藥及脈衝式輸注。 本發明之抗體將以與良好醫療實踐一致之方式調配、給藥及投與。在此情形下考慮之因素包括所治療之特定病症、所治療之特定哺乳動物、個別患者之臨床病狀、病症起因、藥劑遞送位點、投與方法、投與時程及醫學從業者已知之其他因素。抗體並非必須而是視情況與一或多種當前用於預防或治療所述病症之藥劑一起調配。此類其他藥劑之有效量視存在於調配物中之抗體的量、病症或治療之類型及上文所論述之其他因素而定。此等藥劑一般以相同劑量且以如本文所描述之投與途徑使用,或以本文所描述之劑量之約1%至99%使用,或以任何劑量且以憑經驗/臨床上確定為適當之任何途徑使用。 為預防或治療疾病,本發明抗體之適當劑量(當單獨或與一或多種其他額外治療劑組合使用時)將視以下而定:待治療疾病之類型、抗體類型、疾病之嚴重度及病程、出於預防抑或治療目的投與抗體、先前療法、患者之臨床病史及對抗體之反應以及主治醫師之判斷。一次性或歷經一系列治療向患者適當地投與抗體。視疾病之類型及嚴重度而定,約1 µg/kg至15 mg/kg (例如0.1 mg/kg至10 mg/kg)之抗體可為向患者進行投與之初始候選劑量,例如藉由一或多次獨立投與抑或藉由連續輸注。視上文所提及之因素而定,一種典型的日劑量可在約1 μg/kg至100 mg/kg之範圍內或大於100 mg/kg。對於歷經數日或更長時間之重複投藥,視病狀而定,治療通常將持續至疾病症狀之所需抑制發生為止。抗體之一種例示性劑量將在約0.05 mg/kg至約10 mg/kg之範圍內。因此,可向患者投與約0.5 mg/kg、2.0 mg/kg、4.0 mg/kg或10 mg/kg (或其任何組合)之一或多種劑量。此類劑量可間歇性地投與,例如每週或每三週投與(例如,使得患者接受約兩倍至約二十倍或例如約六倍劑量之抗體)。可投與初始較高起始劑量,接著可投與一或多種較低劑量。例示性給藥方案包含投與。然而,其他給藥方案可為適用的。此療法之進程易於藉由習知技術及分析來監測。 應瞭解,替代抗LAG3抗體或除抗LAG3抗體之外,可使用本發明之免疫結合劑進行上述調配或治療方法中之任一者。 G.製品 在本發明之另一態樣中,提供含有適用於治療、預防及/或診斷上文所描述之病症之製品。製品包含容器及容器上或容器隨附之標籤或藥品說明書。適合的容器包括例如瓶子、小瓶、注射器、IV溶液袋等。容器可由各種材料形成,諸如玻璃或塑膠。容器容納組合物本身或組合物與可有效治療、預防及/或診斷病況之另一組合物之組合,且可具有無菌接取口(例如容器可為具有可由皮下注射針刺穿之塞子的靜脈內溶液袋或小瓶)。組合物中之至少一種活性劑為本發明之抗體。標記或藥品說明書指示組合物用於治療所選病狀。此外,製品可包含(a)其中含有組合物之第一容器,其中該組合物包含本發明之抗體;及(b)其中含有組合物之第二容器,其中該組合物包含另一種細胞毒性劑或其他治療劑。本發明之此實施例中之製品可進一步包含指示組合物可用於治療特定病況之藥品說明書。或者或另外,製品可進一步包含第二(或第三)容器,其包含醫藥學上可接受之緩衝液,諸如抑菌性注射用水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液(Ringer's solution)及右旋糖溶液。其可進一步包括就商業及使用者觀點而言所需之其他物質,包括其他緩衝液、稀釋劑、過濾器、針及注射器。 胺基酸序列及核酸序列之描述SEQ ID NO: 1 重鏈HVR-H1,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 2 重鏈HVR-H2,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 3 重鏈HVR-H3,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 4 輕鏈HVR-L1,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 5 輕鏈HVR-L2,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 6 輕鏈HVR-L3,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 7 重鏈可變結構域VH,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 8 輕鏈可變結構域VL,aLAG3(0414) SEQ ID NO: 9 重鏈HVR-H1,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 10 重鏈HVR-H2,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 11 重鏈HVR-H3,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 12 輕鏈HVR-L1,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 13 輕鏈HVR-L2,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 14 輕鏈HVR-L3,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 15 重鏈可變結構域VH,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 16 輕鏈可變結構域VL,aLAG3(0403) SEQ ID NO: 17 重鏈HVR-H1,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 18 重鏈HVR-H2,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 19 重鏈HVR-H3,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 20 輕鏈HVR-L1,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 21 輕鏈HVR-L2,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 22 輕鏈HVR-L3,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 23 重鏈可變結構域VH,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 24 輕鏈可變結構域VL,aLAG3(0411) SEQ ID NO: 25 重鏈HVR-H1,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 26 重鏈HVR-H2,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 27 重鏈HVR-H3,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 28 輕鏈HVR-L1,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 29 輕鏈HVR-L2,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 30 輕鏈HVR-L3,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 31 重鏈可變結構域VH,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 32 輕鏈可變結構域VL,aLAG3(0417) SEQ ID NO: 33 重鏈HVR-H1,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 34 重鏈HVR-H2,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 35 重鏈HVR-H3,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 36 輕鏈HVR-L1,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 37 輕鏈HVR-L2,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 38 輕鏈HVR-L3,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 39 重鏈可變結構域VH,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 40 輕鏈可變結構域VL,aLAG3(0416) SEQ ID NO: 41 重鏈可變結構域VH,BMS-986016 (WO2014/008218及US2016/0326248) SEQ ID NO: 42 輕鏈可變結構域VL BMS-986016 (WO2014/008218及US2016/0326248) SEQ ID NO: 43 重鏈可變結構域VH,MDX25F7 (25F7) (US2011/0150892及WO2014/008218) SEQ ID NO: 44 輕鏈可變結構域VL,MDX25F7 (25F7) (US2011/0150892及WO2014/008218) SEQ ID NO: 45 重鏈可變結構域VH,人類化BAP050 (LAG525) (US2015/0259420) SEQ ID NO: 46 輕鏈可變結構域VL,人類化BAP050 (LAG525) (US2015/0259420) SEQ ID NO: 47 重鏈可變結構域VH,MDX26H10 (26H10) (US 2011/0150892) SEQ ID NO: 48 輕鏈可變結構域VL,MDX26H10 (26H10) (US 2011/0150892) SEQ ID NO: 49 人類κ輕鏈恆定區 SEQ ID NO: 50 人類λ輕鏈恆定區 SEQ ID NO: 51 源自IgG1之人類重鏈恆定區 SEQ ID NO: 52 具有突變L234A、L235A及P329G之源自IgG1之人類重鏈恆定區 SEQ ID NO: 53 源自IgG4之人類重鏈恆定區 SEQ ID NO: 54 例示性人類LAG3序列(不含信號序列) SEQ ID NO: 55 人類LAG3細胞外結構域(ECD) SEQ ID NO: 56 引子rbHC.up SEQ ID NO: 57 引子rbHCf.do SEQ ID NO: 58 引子BcPCR_FHLC_leader.fw SEQ ID NO: 59 引子BcPCR_huCkappa.rev 在下文中,列出包括抗LAG3抗體aLAG3(0403)至aLAG3(0417)之經標記HVR (粗體、下劃線字母表示之HVR)的VH及VL結構域之胺基酸序列:
Figure 02_image001
Figure 02_image003
Figure 02_image005
在下文中,列出本發明之特定實施例:1.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含 A) (a)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3;或 B) (a)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3;或 C) (a)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3;或 D) (a)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3;或 E) (a)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1;(b)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2;(c)包含SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;(d)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1;(e)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2;以及(f)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 2. 一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含 A) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3;或 B) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3;或 C) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3;或 D) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3;或 E) (a) VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b) VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 3.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體 i)包含相比於SEQ ID NO:7之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:8之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域; ii)包含相比於SEQ ID NO:15之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:16之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域; iii)包含相比於SEQ ID NO:23之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:24之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域; iv)包含相比於SEQ ID NO:31之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:32之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域;或 v)包含相比於SEQ ID NO:39之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:40之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域。 4.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含 A) (a)相比於SEQ ID NO:7之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:8之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域;其中該VH結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;且(b)該VL結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3;或 B) (a)相比於SEQ ID NO:15之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:16之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域;其中該VH結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:9之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:10之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:11之胺基酸序列之HVR-H3;且(b)該VH結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:14之胺基酸序列之HVR-L3;或 C) (a)相比於SEQ ID NO:23之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:24之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域;其中該VH結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:17之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:18之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:19之胺基酸序列之HVR-H3;且(b)該VL結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:20之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:21之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:22之胺基酸序列之HVR-L3;或 D) (a)相比於SEQ ID NO:31之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:32之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域;其中該VH結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:25之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:26之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:27之胺基酸序列之HVR-H3;且(b)該VL結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:28之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:29之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:30之胺基酸序列之HVR-L3;或 E) (a)相比於SEQ ID NO:39之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VH結構域以及相比於SEQ ID NO:40之序列具有95%、96%、97%或98%胺基酸序列一致性之VL結構域;其中該VH結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:33之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:34之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:35之胺基酸序列之HVR-H3;且(b)該VL結構域包含:(i)包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:37之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列之HVR-L3。 5.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體 i)包含SEQ ID NO:7之VH序列及SEQ ID NO:8之VL序列; ii)包含SEQ ID NO:15之VH序列及SEQ ID NO:16之VL序列; iii)包含SEQ ID NO:23之VH序列及SEQ ID NO:24之VL序列; iv)包含SEQ ID NO:31之VH序列及SEQ ID NO:32之VL序列;或 v)包含SEQ ID NO:39之VH序列及SEQ ID NO:40之VL序列。 6.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含SEQ ID NO:7之VH序列及SEQ ID NO:8之VL序列。 7.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含SEQ ID NO:15之VH序列及SEQ ID NO:16之VL序列。 8.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含SEQ ID NO:23之VH序列及SEQ ID NO:24之VL序列。 9.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含SEQ ID NO:31之VH序列及SEQ ID NO:32之VL序列。 10.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體包含SEQ ID NO:39之VH序列及SEQ ID NO:40之VL序列。 11.根據前述實施例中之任一者的抗LAG3抗體,其中該抗體由以下特性中之一或多者獨立表徵:該抗LAG3抗體 i)與包含具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列之VH及具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列之VL的抗LAG3抗體競爭結合至LAG3,及/或 ii)結合至人類及食蟹獼猴LAG3;及/或 iii)抑制在人類A375腫瘤細胞上表現之MHC-II之結合;及/或 iv)促進混合淋巴細胞反應(mMLR)分析中之顆粒酶B或IL-2釋放(如實例3中所示)。 12.一種結合至人類LAG3之分離抗體,其中該抗體: i)與包含具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列之VH及具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列之VL的抗LAG3抗體競爭結合至LAG3,及/或 ii)結合至人類及食蟹獼猴LAG3;及/或 iii)抑制在人類A375腫瘤細胞上表現之MHC-II之結合;及/或 iv)促進混合淋巴細胞反應(mMLR)分析中之顆粒酶B或IL-2釋放(如實例3中所示)。 13.如前述實施例中之任一者的抗體,其為單株抗體。 14. 根據前述實施例中之任一者的抗體,其為人類、人類化或嵌合抗體。 15.根據前述實施例中之任一者的抗體,其為結合至LAG3之抗體片段。 16.根據前述實施例中之任一者的抗體,其為全長IgG1抗體。 17.根據前述實施例中之任一者的抗體,其為具有突變L234A、L235A及P329G (根據Kabat之EU索引編號)之全長IgG1抗體。 18.一種分離核酸,其編碼如前述實施例中之任一者的抗體。 19.一種宿主細胞,其包含如實施例18之核酸。 20.一種產生抗體之方法,其包含培養如實施例19之宿主細胞,以使得產生該抗體。 21.如實施例20之方法,其進一步包含自該宿主細胞回收該抗體。 22.一種醫藥調配物,其包含根據實施例1至17中之任一者的抗體及醫藥學上可接受之載劑。 23.根據實施例1至17中之任一者的抗體,其用作藥劑。 24.根據實施例1至17中之任一者的抗體,其用於治療癌症。 25.一種根據實施例1至17中之任一者之抗體的用途,其用於製造藥劑。 26.如實施例25之用途,其中該藥劑係用於治療癌症。 27.一種治療患有癌症之個體之方法,該方法包含向該個體投與有效量的如實施例1之抗體。 28.一種治療諸如腫瘤免疫之免疫相關疾病或延緩其進展的方法,該方法包含向該個體投與有效量的如實施例1之抗體。 29.一種刺激諸如T細胞活性之免疫反應或功能的方法,該方法包含向該個體投與有效量的如實施例1之抗體。 III.實例 下文為本發明之方法及組合物之實例。應理解,鑒於上文所提供之一般說明,可實踐各種其他實施例。 雖然前述本發明已藉助於說明及實例較詳細地描述以用於清楚理解之目的,但描述及實例不應解釋為限制本發明之範疇。本文中所引用之所有專利及科學文獻之揭示內容均以全文引用之方式明確併入本文中。 實例1: 抗LAG3抗體之產生兔之免疫接種 用表現LAG3之質體DNA對表現人類化抗體譜系之Roche專有的轉殖基因兔進行免疫接種。 使用編碼全長人類LAG3之質體表現載體(15352 _ pIntronA _ fl - hLag3 _ DNA - IMS ),藉由皮內施加400 μg載體DNA,隨後電穿孔(5個750 V/cm之方形脈衝,持續時間10 ms,時間間隔1 s)對一組3隻兔進行基因免疫接種。兔在第0、14、28、49、70、98及126天接受7次連續免疫接種。在第35、77、105及133天獲取血液(估計總血量之10%)。製備血清,藉由ELISA測定其效價(參見下文),並分離出末梢單核細胞,使用該等單核細胞作為下文B細胞選殖程序中抗原特異性B細胞之來源。測定血清效價 (ELISA) 將100微升/孔於PBS中2 μg/ml之人類重組LAG3蛋白質固定於96孔NUNC Maxisorp培養盤上,隨後:用200微升/孔含2% Crotein C之PBS阻斷該培養盤;一式兩份,以100微升/孔施加抗血清於含0.5% Crotein C之PBS中的連續稀釋液;用100微升/孔分別在含0.5% Crotein C之PBS中稀釋的(1)偶聯HRP之驢抗兔IgG抗體(Jackson Immunoresearch/Dianova 711-036-152;1/16 000),或(2)偶聯HRP之兔抗人類IgG抗體(Pierce/Thermo Scientific 31423;1/5000),或(3)生物素化山羊抗人類κ抗體(Southern Biotech/Biozol 2063-08,1/5 000)及抗生蛋白鏈菌素-HRP偵測。對於所有步驟,將培養盤在37℃下培育1小時。在所有步驟之間,用含0.05% Tween 20之PBS洗滌培養盤3次。藉由以100微升/孔添加BM Blue POD可溶性底物(Roche)來顯現信號;且藉由以100微升/孔添加1 M HCl來終止。以690 nm作為參考,在450 nm下讀出吸光度。將效價定義為產生半數最大信號之抗血清之稀釋度。分離兔周邊血液單核細胞 (PBMC) 自免疫接種之轉殖基因兔獲取血液樣品。用1× PBS (PAA, Pasching, Austria)將含EDTA之全血稀釋至兩倍,隨後使用哺乳動物淋巴細胞(Cedarlane Laboratories, Burlington, Ontario, Canada)根據製造商之說明書來進行密度離心。用1× PBS洗滌PBMC兩次。EL - 4 B5 培養基 使用補充有10% FCS (Hyclone, Logan, UT, USA)、2 mM麩醯胺酸、1%青黴素/鏈黴素溶液(PAA, Pasching, Austria)、2 mM丙酮酸鈉、10 mM HEPES (PAN Biotech, Aidenbach, Germany)及0.05 mM b-巰基乙醇(Gibco, Paisley, Scotland)之RPMI 1640 (Pan Biotech, Aidenbach, Germany)。用蛋白質抗原塗佈培養盤 在4℃下,在碳酸鹽緩衝液(0.1 M碳酸氫鈉、34 mM碳酸氫二鈉,pH 9.55)中用偶聯至人類Fc部分之人類LAG3 ECD (2 µg/ml)塗佈無菌細胞培養6孔培養盤隔夜。在使用之前將培養盤在無菌PBS中洗滌三次。細胞耗竭 (a)使用覆蓋有匯合之CHO細胞單層的無菌6孔培養盤(細胞培養級)經由非特異性黏附及非特異性結合淋巴細胞使巨噬細胞/單核細胞耗竭。 (b)使用空白無菌6孔培養盤(細胞培養級)經由非特異性黏附使巨噬細胞及單核細胞以及其他細胞耗竭。 一半PBMC樣品用於(a)且一半用於(b)。 至多用4 ml培養基及多至6×106個來自免疫兔之PBMC填充各孔且使其在37℃下於培育箱中結合1小時。上清液中之細胞(周邊血液淋巴細胞(PBL))用於抗原淘選(panning)步驟。富集針對 LAG3 抗原之 B 細胞 蛋白質抗原 用來自使用空白6孔培養盤之耗竭步驟的多達6 × 10e6個PBL/4 ml培養基接種塗佈有LAG3-ECD-huFc蛋白質之6孔組織培養盤,並在培育箱中於37℃下使其結合1小時。藉由用1× PBS仔細洗滌該等孔1至2次來移除非黏附細胞。在37℃下於培育箱中藉由胰蛋白酶使殘餘黏性細胞剝離,持續10分鐘。用EL-4 B5培養基停止胰蛋白酶作用。將細胞保持在冰上直至免疫螢光染色為止。 細胞表面抗原 用來自使用CHO覆蓋之6孔培養盤之耗竭步驟的多達6 × 106個PBL/4 ml培養基接種覆蓋有單層人類LAG3陽性CHO細胞之6孔組織培養盤,並在培育箱中於37℃下使其結合1小時。藉由用1× PBS仔細洗滌該等孔1至2次來移除非黏附細胞。在37℃下於培育箱中藉由胰蛋白酶使殘餘黏性細胞剝離,持續10分鐘。用EL-4 B5培養基停止胰蛋白酶作用。將細胞保持在冰上直至免疫螢光染色為止。 免疫螢光染色及流動式細胞量測術 使用抗IgG FITC (AbD Serotec, Düsseldorf, Germany)及抗huCk PE (Dianova, Hamburg, Germany)抗體進行單細胞分選。對於表面染色,將來自耗竭及富集步驟之細胞與抗IgG FITC及抗huCk PE抗體一起在PBS中培育,且在暗處在4℃下培育45分鐘。在染色之後,用冰冷的PBS雙倍洗滌PBMC。最後,使PBMC再懸浮於冰冷的PBS中且立即經歷FACS分析。在FACS分析之前,添加濃度為5 μg/ml之碘化丙錠(BD Pharmingen, San Diego, CA, USA)以辨別死細胞及活細胞。 配備有電腦之Becton Dickinson FACSAria及FACSDiva軟體(BD Biosciences, USA)用於單細胞分選。B 細胞 培養 藉由Seeber等人(S Seeber等人PLoS One 9 (2), e86184. 2014年二月04日)描述之方法進行兔B細胞之培養。簡言之,在培育箱中,在37℃下於96孔培養盤中用200微升/孔含有Pansorbin細胞(1:100000) (Calbiochem (Merck), Darmstadt, Deutschland)、5%兔胸腺細胞上清液(MicroCoat, Bernried, Germany)及γ輻射之鼠類EL-4 B5胸腺瘤細胞(5 × 10e5個細胞/孔)之EL-4 B5培養基培育單次分選之兔B細胞7天。移出B細胞培養之上清液進行篩選,且立即收集殘留細胞並在-80℃下於100 μl RLT緩衝液(Qiagen, Hilden, Germany)中冷凍。 分離LAG3抗體之V結構域V 結構域之 PCR 擴增 使用NucleoSpin 8/96 RNA套組(Macherey&Nagel;740709.4,740698),根據製造商之方案由B細胞溶解產物(再懸浮於RLT緩衝液-Qiagen目錄號79216中)製備總RNA。用60 µl不含RNA酶之水溶離RNA。根據製造商之說明書,使用Superscript III First-Strand Synthesis SuperMix (Invitrogen;18080-400)及寡聚dT引子,使用6 µl RNA藉由逆轉錄酶反應產生cDNA。所有步驟均在Hamilton ML Star系統上進行。使用4 µl cDNA,用AccuPrime Supermix (Invitrogen;12344-040)以50 µl最終體積針對重鏈使用引子rbHC.up及rbHC.do且針對輕鏈使用BcPCR_FHLC_leader.fw及BcPCR_huCkappa.rev來擴增免疫球蛋白重鏈及輕鏈可變區(VH及VL) (表1.1)。所有正向引子均對信號肽(分別VH及VL之信號肽)具有特異性,而反向引子對恆定區(分別VH及VL之恆定區)具有特異性。RbVH之PCR條件如下:在94℃下熱起動5分鐘;進行35個在94℃下20s、在70℃下20s、在68℃下45s之循環,且在68℃下最終延長7分鐘。HuVL之PCR條件如下:在94℃下熱起動5分鐘;進行40個在94℃下20s、在52℃下20s、在68℃下45s之循環,且在68℃下最終延長7分鐘。 表1.1
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將50 µl PCR溶液中之8 µl裝載於48 E-Gel 2% (Invitrogen G8008-02)上。根據製造商之方案,使用NucleoSpin Extract II套組(Macherey&Nagel;740609250)清潔陽性PCR反應,且在50 μl溶離緩衝液中將其溶離。所有清潔步驟均在Hamilton ML Starlet系統上進行。兔單株二價抗體之重組表現 對於兔單株二價抗體之重組表現,藉由懸垂選殖方法(overhang cloning method) (RS Haun等人, Biotechniques (1992) 13, 515-518;MZ Li等人, Nature Methods (2007) 4, 251-256)將編碼VH或VL之PCR產物以cDNA形式選殖至表現載體中。表現載體含有由以下各者組成之表現卡匣:包括內含子A之5' CMV啟動子,及3' BGH聚腺苷醯化序列。除表現卡匣之外,質體含有pUC18衍生之複製起點及β-內醯胺酶基因,其為大腸桿菌中之質體擴增賦予安比西林抗性。使用基礎質體之三種變異體:一種質體含有設計成接受VH區之兔IgG恆定區,同時含有用於接受VL區之人類κ LC恆定區。 藉由PCR,使用重疊引子來擴增編碼κ或γ恆定區及VL/VH插入序列的線性化表現質體。 經純化之PCR產物用T4 DNA-聚合酶培育,此產生單股懸垂物。藉由添加dCTP停止反應。 在下一步驟中,將質體及插入序列合併且與recA一起培育,其誘發位點特異性重組。將重組質體轉化至大腸桿菌中。次日,藉由質體製備、限制分析及DNA-定序選取生長菌落且測試恰當的重組質體。 關於抗體表現,暫時將經分離之HC及LC質體共同轉染至HEK293細胞中且1週後收集上清液。 實例2: 特徵化抗LAG3抗體 2 不同抗 LAG3 抗體之特徵的概述
Figure 107111898-A0304-0003
用於人類 Lag3 ELISA 用25微升/孔蛋白質濃度為800 ng/ml之重組人類LAG-3 Fc嵌合體蛋白質(R&D系統,2319-L3)塗佈Nunc maxisorp培養盤(Nunc 464718),並在4℃下培育隔夜或在室溫下培育1小時。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,在室溫下將各孔與90 µl阻斷緩衝液(PBS + 2% BSA + 0.05% Tween 20)一起培育1小時。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,添加25 µl濃度為1-9 µg/ml (1:3稀釋於OSEP緩衝液中)之抗Lag3樣品並在室溫下培育1小時。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,添加25微升/孔1:2000稀釋的山羊抗人類Ig κ鏈抗體-HRP偶聯物(Milipore,AP502P)並在室溫下培育1小時。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,添加25微升/孔的TMB底物(Roche,11835033001)並培育2至10分鐘。量測在Tecan Safire 2儀器上在370/492 nm下進行。細胞表面 Lag3 結合 ELISA 將25微升/孔之Lag3細胞(表現Lag3之重組CHO細胞,10000個細胞/孔)接種於組織培養物處理之384孔培養盤(Corning,3701)中並在37℃下培育一天或兩天。次日,在移除培養基之後,添加25 µl抗Lag3樣品(1:3稀釋於OSEP緩衝液中,起始濃度為6至40 nM)並在4℃下培育2小時。洗滌(1×90 µl,PBST)之後,藉由添加30微升/孔的戊二醛達到0.05%最終濃度(Sigma目錄號:G5882),在室溫下保持10分鐘來固定細胞。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,添加25微升/孔1:1000稀釋的山羊抗人類Ig κ鏈抗體-HRP偶聯物(Milipore,AP502P)並在室溫下培育1小時。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,添加25微升/孔的TMB底物(Roche,11835033001)並培育6至10分鐘。量測在Tecan Safire 2儀器上在370/492 nm下進行。 LAG3 抗體之 SPR ( Biacore ) 表徵 已使用基於表面電漿子共振(SPR)之分析來測定25℃下單價Fab片段形式之抗Lag3抗體與人類Fc標記之人類Lag3細胞外結構域(ECD)之間的結合的動力參數。 因此,C1生物感測器晶片之兩個流槽係在Biacore T200中,藉由使用『固定嚮導(immobilization wizard)』將在pH 4.5之乙酸鹽緩衝液中稀釋至25 µg/ml的中性抗生物素蛋白固定至其上而製備。由此得到約1900 RU之固定量。接著,使用20 µg/ml於操作緩衝液(HBS-EP+,GE Healthcare)中之稀釋液,使CaptureSelect™生物素抗IgG-Fc (人類)偶聯物結合至中性抗生物素蛋白。 該方法本身由每個週期四條命令組成。第一命令:捕捉約46 RU之huLag3-Fc (20s,10 µl/min)。第二命令:以30 µl/min之流速注入樣品,保持120s,隨後為1200s之長時間解離。第三及第四命令:藉由注入pH 1.5之甘胺酸-HCl,保持30秒,實現再生。 接著,使用先前所描述之方法量測各抗體Fab片段之連續稀釋液(3.13 nM至200 nM,在操作緩衝液中兩倍稀釋)及其他空白週期。由於捕捉量無法完全再現,故接著利用Biacore T200評估軟體,藉由將利用Rmax擬合參數集之1:1朗格繆爾(langmuir)擬合應用於『局部』來獲得動力學值。結果顯示於表2中。 已使用基於表面電漿子共振(SPR)之分析來測定25℃下呈二價形式之aLag3結合劑與人類Lag3細胞外結構域(ECD)之間的相互作用的表觀親和力。 因此,Biacore生物感測器晶片係在Biacore T200中,利用標準胺偶合條件,藉由固定最小值約800 RU之P329G點突變特異性抗體而製備。 隨後,在各循環中,捕捉樣品抗體,且將huLag3 ECD濃度系列(總共包括四個濃度)中之一個濃度應用於系統持續200s,接著為1200s之長時間解離。接著使生物感測器晶片再生。 使用藉由Ridgeview Diagnostics TraceDrawer軟體提供之『相互作用圖』來評估所得實驗資料,以計算各樣品之個別表觀、仿射結合比重。 結果顯示於表2中。抗原決定基定位 使用基於表面電漿子共振(SPR)之分析進行抗原決定基分組。因此,使aLag3結合劑在Biacore T200儀器上結合至huLag3。接著,評估其他結合劑與先前形成之aLag3結合劑-huLag3複合物之可接近性。 使用SA CAP套組(GE Healthcare)進行此分析。若未另外描述,則該分析係根據SA CAP套組手冊進行。 該操作僅包括一種循環類型。在雜交之後,使生物素化、huFc標記之huLag3之10 nM稀釋液以10 µl/min之流動速率結合至感測器晶片上之抗生蛋白鏈菌素,保持20秒。接著,以30 µl/min之流動速率注射在操作緩衝液中稀釋之第一份200 nM樣品,持續180秒,隨後立即在相同條件下注射第二份樣品。隨後使表面再生。 接著將樣品分配至具有類似競爭模式之不同抗原決定基組。基於使用6.1 RU之臨限值進行第二次注射之相對反應進行第一次粗略分類,該臨限值剛好高於當注射結合劑作為第一及第二樣品時所觀察到的最高值。所有值及決定最後均藉由目視檢查感測器圖譜進行驗證。 結果示於表2中。鑑別出三個主要抗原決定基模式(E1、E2及E3)。由於aLag3-0416與人類化BAP 050同屬相同組但彼此不完全抑制,故將其分配至亞組E2b及E2c。 來自tg兔之抗Lag3抗體與重組食蟹獼猴Lag3陽性HEK細胞之結合 除使用在表面上重組表現人類Lag3之HEK細胞進行結合分析外,亦評估與食蟹獼猴Lag3陽性HEK細胞之結合。對於此實驗,將預先用食蟹獼猴LAG-3短暫轉染之冷凍HEK293F細胞解凍,離心且再懸浮於PBS/2% FBS中。將1.5×105 個細胞/孔接種至96孔培養盤中。添加抗Lag3抗體達10 µg/ml之最終標準濃度。為進行參考並作為對照,在該實驗中製備並量測自體螢光及陽性對照(Medarex 25F7)以及同型對照(來自Sigma之huIgG1,目錄號#I5154,資料未示出 )抗體。將HEK細胞與指定抗體一起在冰上培育45分鐘,用200 µl含有2% FBS之冰冷PBS緩衝液洗滌兩次,隨後添加二次抗體(APC標記之山羊抗人類IgG-κ,Invitrogen,目錄號#MH10515) (1:50稀釋於FACS-Puffer中/孔)並在冰上另外培育30分鐘。再用200 µl冰冷的PBS/2% FBS緩衝液洗滌細胞兩次,隨後使樣品最終再懸浮於150 µl FACS緩衝液中,並在FACS CANTO-II HTS模組上量測結合。結果 下表中顯示不同抗Lag3抗體與表現cynoLAG3之HEK293細胞之結合及交叉反應性,結合係以陽性細胞百分比或信號強度之幾何平均值給出:
Figure 107111898-A0304-0004
來自tg兔之抗Lag3抗體與表現Lag3之(活化) 食蟹獼猴PBMC/T細胞之結合 在結合至重組Lag3蛋白質及哺乳動物細胞上重組表現之Lag3之後,評估/確定與活化食蟹獼猴T細胞上表現之Lag3的結合。 藉由FACS分析確定新產生之抗Lag3抗體(來源於Roche之轉殖基因兔)與食蟹T細胞或PBMC之細胞表面上表現之Lag3的結合特性。儘管Lag3不在天然T細胞上表現,但其在T細胞活化及/或耗竭時上調。因此,由新鮮食蟹獼猴血液製備食蟹獼猴周邊血液單核細胞(PBMC)且接著藉由CD3/CD28預處理(1 µg/ml) 2至3天使其活化。隨後分析活化細胞中之Lag3表現:簡言之,在冰上用最終濃度為10 μg/ml之指定抗Lag3抗體及各別對照抗體對1-3×105 個活化細胞染色30-60分鐘。經由螢光染料偶聯之抗人類IgG或抗兔IgG二次抗體偵測經結合抗Lag3抗體。染色之後,用PBS/2% FCS洗滌細胞兩次並在FACS Fortessa (BD)上進行分析。結果 下表概括在活化食蟹獼猴PBMC內Lag3陽性細胞之百分比:
Figure 107111898-A0304-0005
所有兔抗Lag3抗體均展示與活化食蟹獼猴T細胞上Lag3+ 細胞之大量結合。由此,相較於人類抗Lag3參考抗體(例如MDX25F7、BMS-986016),所有新產生的抗體均顯示陽性細胞之百分比增加。抑制 LAG - 3 人類 A375 腫瘤細胞上表現之 MHC - II 結合 ( 藉由 ELISA 測定 ) 將25微升/孔之A375細胞(10000個細胞/孔)接種於組織培養物處理之384孔培養盤(Corning,3701)中並在37℃下培育隔夜。將抗Lag3抗體與在細胞培養基中以3 µg/ml抗體濃度起始1:3稀釋之生物素化Lag3 (250 ng/ml)一起預培育1小時。在自接種有細胞之孔中移除培養基之後,將25 µl抗體-Lag3預培育混合物轉移至孔中並在4℃下培育2小時。洗滌(1×90 µl,PBST)之後,藉由添加30微升/孔的戊二醛達到0.05%最終濃度(Sigma目錄號:G5882),在室溫下保持10分鐘來固定細胞。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,添加25微升/孔1:2000或1:8000稀釋之聚HRP40-抗生蛋白鏈菌素(Fitzgerald,65R-S104PHRPx)並在室溫下培育1小時。洗滌(3×90微升/孔,用PBST緩衝液洗滌)之後,添加25微升/孔的TMB底物(Roche,11835033001)並培育2至10分鐘。量測在Tecan Safire 2儀器上在370/492 nm下進行。抑制 LAG - 3 人類 A375 腫瘤細胞上表現之 MHC - II 結合 ( 藉由 FACS 分析測定 ) 分析原理 為研究抗Lag3抗體之拮抗功能,進行MHCII:Lag3競爭分析。在與抗Lag3抗體預培育或不預培育的情況下,用內部產生之生物素化Lag3:Fc融合蛋白對MHCII+ 人類A375細胞染色。本分析係以FACS競爭實驗研究:在補充有EBSS (PAN,目錄號#P04-00509)、10% FBS、2 mM L-麩醯胺酸、1×NEAA及1×丙酮酸鈉之EM伊格爾氏培養基(EM Eagle's medium)中培養A375細胞(ATCC,#CRL-1619)達2-3代。所有抗體均在FACS緩衝液中以25 µl稀釋至20 µg/ml最終濃度(在96孔U形底培養盤中)。將25µl內部產生之生物素化重組LAG-3:Fc融合蛋白添加至培養基或抗Lag3抗體或對照物中達到10 µg/ml最終濃度並在室溫下預培育30分鐘。用PBS洗滌A375細胞並在PBS中調整至3×106 個細胞/毫升。在96孔V形底培養盤中每孔接種100 µl。對各培養盤離心並移除上清液。接著,將預培育之LAG-3:Fc融合蛋白/抗體混合物(50微升/孔)添加至細胞中並在室溫下培育1小時。之後,用200 µl FACS緩衝液洗滌細胞。為偵測結合至細胞MHCII之生物素化Lag3:Fc蛋白質,使用每份樣品3 µl之APC偶聯山羊抗生物素抗體(Miltenyi Biotec,目錄號#130-090-856)並另外培育10-15分鐘。染色之後,再次洗滌細胞,且接著將其用150 µl FACS緩衝液(PBS/2% FBS)轉移至U形底培養盤上,並在FACS Canto-II上使用HTS模組進行分析。 兩種抗Lag3抗體(純系25F7及26H10;Medarex)充當陽性對照且適當時人類IgG1 (Sigma,目錄號#I5154)充當同型對照。使用的所有抗體之最終濃度均為10 µg/ml。結果 下表中顯示FACS分析之結果,展示Lag3蛋白質與細胞上MHC-II之結合的抑制百分比(以結合信號相對於在無阻斷抗體存在下之最大值的降低計算):
Figure 107111898-A0304-0006
該等資料支持所有測試抗體與Lag3之功能相互作用以及細胞相互作用之阻斷。 在標準LAG3阻斷Bio/報告分析中新穎抗Lag3抗體之中和效能 為了測試新穎抗Lag3抗體在活體外恢復受抑制之T細胞反應中的中和效能,使用市售的報告系統。此系統由Lag3+ NFAT Jurkat效應細胞(Promega,目錄號#CS194801)、MHC-II+ Raji細胞(ATCC,#CLL-86)及超級抗原組成。簡言之,該報告系統係基於三個步驟:(1)超級抗原誘導之NFAT細胞活化;(2)由MHCII (Raji細胞)與Lag3+ NFAT Jurkat效應細胞之間的抑制相互作用介導之活化信號抑制;及(3)恢復Lag3拮抗性/中和性aVH-Fc融合構築體之NFAT活化信號。 對於此實驗,如提供商所描述,培養Raji及Lag-3+ Jurkat/NFAT-luc2效應T細胞。在白色平底96孔培養盤(Costar,目錄號#3917)中,在分析培養基(RPMI 1640 (PAN Biotech,目錄號#P04-18047)、1% FCS)中製備若干抗Lag3及參考抗體之連續稀釋液(40 pg/ml-50 µg/ml)。將1×105 個Lag3+ NFAT-Jurkat細胞/孔添加至抗體溶液中。此步驟之後,將2.5×104 個Raji細胞/孔添加至Jurakt細胞/抗體混合物以及50 ng/ml最終濃度之SED超級抗原(Toxin technology,目錄號DT303)中。在37℃及5% CO2 下培育六小時之後,使Bio-Glo底物(Promega,#G7940)升溫至室溫並每孔添加75 µl,培育5-10分鐘,隨後根據該套組之製造商的建議,在Tecan Infinite讀取器上量測總體發光。 表中顯示當SED刺激時不同抗Lag3抗體對MHCII/Lag3介導之NFAT螢光素酶信號抑制的恢復作用(以EC50值提供):
Figure 107111898-A0304-0007
n.t.:此實驗中未測試之分子 實例3:不同分析中之生物活性:不同抗LAG3抗體(單獨或與抗PD1抗體組合)之影響 3 不同抗 LAG3 抗體 ( 單獨或與抗 PD1 抗體組合 ) 之生物活性概述
Figure 107111898-A0304-0008
PD-1及LAG-3阻斷對與同種異體成熟樹突狀細胞共培養之人類CD4 T細胞之細胞毒性顆粒酶B釋放及IL-2分泌之影響 為篩選在同種異體背景中抗LAG-3阻斷抗體與抗PD-1之組合,開發出一種分析,其中在單核細胞來源之同種異體成熟樹突狀細胞(mDC)存在下共培養新鮮純化之CD4 T細胞5天。提前一週經由塑性黏附自新鮮PBMC分離單核細胞,繼之以移除非黏附細胞。接著藉由在含有GM-CSF (50 ng/ml)及IL-4 (100 ng/ml)之培養基中培養其5天來自單核細胞產生未成熟DC。為誘導iDC成熟,添加TNF-α、IL-1β及IL-6 (各50 ng/ml)至培養基中,另外保持2天。隨後藉由經由流動式細胞量測術(LSRFortessa,BD Biosciences)量測主要組織相容複合體II類(MHCII)、CD80、CD83及CD86之其表面表現來評估DC成熟。 在最小混合淋巴細胞反應(mMLR)當天,經由微珠套組(Miltenyi Biotec)自獲自不相關供體之108個PBMC富集CD4 T細胞。培養之前,用5 µM之羧基螢光素琥珀醯亞胺酯(CFSE)標記CD4 T細胞。接著,在存在或不存在10 μg/ml濃度的單獨或與嵌合抗LAG-3抗體(aLAG3(0403)至aLAG(0418)) ((0403)至(0418))或參考抗體(人類化BAP050 (LAG525)及BMS 986016)組合之阻斷抗PD-1抗體aPD1(0376) (= PD1-0103-0312,來自PCT申請案PCT/EP2016/073248之)下,將105 個CD4 T細胞與成熟同種異體DC (5:1)一起塗鋪於96孔培養盤中。DP47係在Fc部分中具有LALA突變以避免由FcγR識別之非結合人類IgG且用作陰性對照。 五天後收集細胞培養物上清液,稍後用以藉由ELISA (R&D系統)來量測IL-2含量,且在存在Golgi Plug (佈雷菲爾德菌素A (Brefeldin A))及Golgi Stop (莫能菌素(Monensin))之情況下在37℃下另外靜置細胞5小時。隨後洗滌細胞,在表面上用抗人類CD4抗體及存活/死亡可固定染料Aqua (Invitrogen)染色,之後用固定/電燙緩衝液(BD Bioscience)固定/滲透。針對顆粒酶B (BD Bioscience)及IFN-γ (eBioscience)進行細胞內染色。結果顯示於圖1A及圖1B中。 PD-1及LAG-3阻斷對與B細胞-淋巴母細胞細胞株(ARH77)共培養之人類CD4 T細胞之細胞毒性顆粒酶B釋放的影響。 在功能研究中,將CD4 T細胞與腫瘤細胞株ARH77,即PDL-1之表現量低於mDC之B細胞淋巴母細胞樣細胞株共培養,以更好地表徵LAG-3拮抗作用對PD-1阻斷之作用。其餘實驗設置及讀出相對於mMLR保持不變。圖2中,抗LAG-3抗體(aLAG3(0414)及aLAG3(0416),基於在mMLR中共分泌IL-2及顆粒酶B之能力選擇)與抗PD-1抗體之組合顯示CD4 T細胞之顆粒酶B分泌相較於單獨參考抗LAG-3抗體((人類化BAP050 (LAG525)及BMS 986016)) (P <0.05)及抗PD-1 (P <0.01)有顯著增加。 PD-1及LAG-3阻斷對與經輻射之同種異體PBMC共培養的人類CD4 T細胞之顆粒酶B及IFN-γ釋放之Treg抑制的影響。 在涉及調控T細胞(Treg)抑制分析之功能研究中,經由微珠套組(Miltenyi Biotec)將來自同一供體之PBMC分成兩份樣品:一份在CD4 T細胞中富集且另一份在Treg中富集,定義為CD4+ CD25 CD127 T細胞。在純化該兩個細胞群後,用5 μM羧基螢光素琥珀醯亞胺酯(CFSE)標記CD4 T細胞,而Treg用5 μM細胞-軌跡-紫色(Cell-Trace-Violet;CTV)標記以便能在隨後的FACS中對其進行區分。 接著,在存在或不存在10 μg/ml濃度之抗LAG-3抗體(aLAG3(0414)及aLAG3(0416)或參考抗LAG-3抗體(人類化BAP050 (LAG525)及BMS 986016)與抗PD-1抗體之組合下,在96孔培養盤中以1:1比例共培養CD4 T細胞(105 )及Treg (105 )以及來自不相關供體的經輻射PBMC (105 )。作為用以估計Treg對CD4 T細胞效應功能之抑制量值的對照,亦在無Treg存在下共培養CD4 T細胞(105 )與經輻射PBMC (105 )。 五天後收集細胞培養物上清液,稍後用以藉由ELISA (R&D系統)來量測IFN-γ含量,且在存在Golgi Plug (佈雷菲爾德菌素A)及Golgi Stop (莫能菌素)之情況下在37℃下另外靜置細胞5小時。隨後洗滌細胞,在表面上用抗人類CD4抗體及存活/死亡可固定染料Aqua (Invitrogen)染色,之後用固定/電燙緩衝液(BD Bioscience)固定/滲透。針對顆粒酶B (BD Bioscience)及IFN-γ (eBioscience)進行細胞內染色。結果顯示於圖3A及圖3B中。 如由顆粒酶B之分泌量明顯高於在單獨抗PD-1存在下(P <0.05)或在無檢查點抑制劑存在下(P <0.001)之Tconv所證實,抗LAG-3抗體(aLAG3(0414)及aLAG3(0416)與抗PD-1抗體aPD1 (0376)之組合(= PD1-0103-0312,來自PCT申請案PCT/EP2016/073248)使Tconv脫離調控T細胞之緊密控制。參考抗LAG-3抗體(人類化BAP050 (LAG525)及BMS 986016)與抗PD-1之組合不能自Treg抑制明顯恢復Tconv效應功能。關於IFN-g獲得類似結果,即使僅用4位供體,差異無法達到統計顯著性。 PD-1及LAG-3阻斷對在用免疫原性黑素瘤抗原肽池回憶之後由來自黑素瘤患者PBMC之CD4 T細胞之顆粒酶B及IFN-γ分泌的影響。 先前已描述,黑素瘤患者之PBMC含有可偵測頻率之腫瘤抗原特異性T細胞。因此,出於POC目的,針對用免疫原性黑素瘤相關抗原肽池再刺激隔夜之黑素瘤患者PBMC測試抗LAG-3抗體(0414)加抗PD-1相對於單獨抗PD-1。 在室溫下,在存在或不存在飽和濃度(10 μg/ml)之單獨抗PD-1 (0376)、抗PD-1與抗LAG-3 (aLAG3(0414) = (0414),10 μg/ml)抗體之組合下培育來自黑素瘤患者之105 至106 個PBMC。接著,在蛋白質轉運抑制劑Golgi Plug (佈雷菲爾德菌素A)及Golgi Stop (莫能菌素)存在下,用一組免疫原性腫瘤相關抗原,如MAGEA1、MAGEA3、MAGEA4、Melan-A/MART-1、NYESO-1、黑色素細胞蛋白質Pmel 17 gp100、酪胺酸酶、酪胺酸酶相關蛋白質2再刺激T細胞隔夜。 隨後洗滌細胞,在表面上用抗人類CD4抗體及存活/死亡可固定染料Aqua (Invitrogen)染色,之後用固定/電燙緩衝液(BD Bioscience)固定/滲透。針對顆粒酶B (BD Bioscience)及IFN-γ (eBioscience)進行細胞內染色。 抗LAG-3抗體與抗PD-1抗體(P <0.01及P <0.001)之組合明顯增強腫瘤抗原特定性T細胞效應功能(亦即顆粒酶B及IFN-γ分泌) (P <0.01及P <0.0001),而單獨PD-1阻斷並未顯示任何效應(資料未示出)。 類似地,熟習此項技術者可將實例3下之上述細胞培養物/動物研究擴展至人類治療方法。
1 抗LAG-3抗體對與同種異體成熟樹突狀細胞共培養之人類CD4 T細胞之細胞毒性顆粒酶B釋放及IL-2分泌之影響 圖1A:顆粒酶B分泌 圖1B:IL-2分泌 2 抗LAG-3抗體對與B細胞-淋巴母細胞細胞株(ARH77)共培養之人類CD4 T細胞之細胞毒性顆粒酶B釋放的影響。 3 抗LAG-3抗體對與經輻射同種異體PBMC共培養之人類CD4 T細胞之顆粒酶B及IFN-γ釋放之Treg抑制的影響。 圖3A:顆粒酶B釋放 圖3B:IFN-γ釋放
<110> 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司(F.HOFFMANN-LA ROCHEAG)
<120> 抗LAG3抗體
<140> TW107111898
<141> 2018-04-03
<150> EP17164917.1
<151> 2017-04-05
<160> 59
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 5
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1
Figure 107111898-A0305-02-0106-2
<210> 2
<211> 17
<212> PRT
<213> 智人
<400> 2
Figure 107111898-A0305-02-0106-1
<210> 3
<211> 12
<212> PRT
<213> 智人
<400> 3
Figure 107111898-A0305-02-0106-3
<210> 4
<211> 11
<212> PRT
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Claims (12)

  1. 一種分離之抗體,其結合至人類LAG3,其中該抗體包含(a)VH結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之HVR-H1,(ii)包含SEQ ID NO:2之胺基酸序列之HVR-H2,及(iii)包含選自SEQ ID NO:3之胺基酸序列之HVR-H3;以及(b)VL結構域,其包含:(i)包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之HVR-L1,(ii)包含SEQ ID NO:5之胺基酸序列之HVR-L2,及(iii)包含SEQ ID NO:6之胺基酸序列之HVR-L3。
  2. 一種分離之抗體,其結合至人類LAG3,其中該抗體包含SEQ ID NO:7之VH序列及SEQ ID NO:8之VL序列。
  3. 如請求項1或2之抗體,其為具有突變L234A、L235A及P329G(根據Kabat之EU索引編號)之全長IgG1抗體。
  4. 一種分離之核酸,其編碼如請求項1至3中任一項之抗體。
  5. 一種宿主細胞,其包含如請求項4之核酸。
  6. 一種產生抗體之方法,其包含培養如請求項5之宿主細胞,以產生該抗體。
  7. 如請求項6之方法,其進一步包含自該宿主細胞回收該抗體。
  8. 一種醫藥調配物,其包含如請求項1至3中任一項之抗體及醫藥學上可接受之載劑。
  9. 如請求項1或2之抗體,其用於治療癌症。
  10. 如請求項1或2之抗體,其用作藥劑。
  11. 一種如請求項1至3中任一項之抗體的用途,其用於製造藥劑。
  12. 如請求項11之用途,其中該藥劑係用於治療癌症。
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