JPWO2008081701A1 - Hla−a*1101拘束性wt1ペプチド、およびそれを含む医薬組成物 - Google Patents

Hla−a*1101拘束性wt1ペプチド、およびそれを含む医薬組成物 Download PDF

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Abstract

本発明は、HLA−A*1101拘束性WT1ペプチド、詳細には、WT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むペプチドであって、HLA−A*1101分子と結合能を有し、かつCTL誘導能を有するペプチド、および少なくとも1個のシステイン残基を含むWT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含む2個のペプチド単量体が、ジスルフィド結合により互いに結合しているペプチド二量体であって、HLA−A*1101分子と結合能を有し、かつCTL誘導能を有する、ペプチド二量体に関する。さらに本発明は、該ペプチドをコードするポリヌクレオチド、それらを含む癌治療および/または予防用医薬組成物などに関するものである。

Description

本発明は、HLA−A1101拘束性WT1ペプチド、詳細には、WT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むペプチドであって、HLA−A1101分子と結合能を有し、かつCTL誘導能を有するペプチド、および少なくとも1個のシステイン残基を含むWT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含む2個のペプチド単量体が、ジスルフィド結合により互いに結合しているペプチド二量体であって、HLA−A1101分子と結合能を有し、かつCTL誘導能を有する、ペプチド二量体に関する。さらに本発明は、該ペプチドをコードするポリヌクレオチド、それらを含む癌治療および/または予防用医薬組成物などに関するものである。
WT1遺伝子(Wilms' tumor 1 gene)は、小児の腎癌であるウイルムス腫瘍の責任遺伝子として同定された遺伝子であり(非特許文献1および2)、ジンクフィンガー構造を有する転写因子である。当初、WT1遺伝子は癌抑制遺伝子であるとされたが、その後の研究(非特許文献3、4、5および6)により、造血器腫瘍や固形癌においてはむしろ癌遺伝子として働くことが示された。
WT1遺伝子が多くの悪性腫瘍において高発現していることから、変異のない自己タンパク質であるWT1遺伝子産物の生体内における免疫原性の有無が検証されてきた。その結果、腫瘍細胞で高発現しているWT1遺伝子由来のタンパク質は細胞内プロセッシングにより断片化され、生じたペプチドがMHCクラスI分子と複合体を形成して細胞表面に提示されること、およびかかる複合体を認識するCTLがWT1ペプチドワクチネーションにより誘導され得ることが明らかとなった(非特許文献7、8および9)。さらに、WT1ペプチドまたはWT1 cDNAで免疫されたマウスは、移植されたWT1遺伝子発現腫瘍細胞を高い確率で拒絶するが(非特許文献7および10)、WT1遺伝子を生理的に発現している正常組織は誘導されたCTLによって傷害されないことも示された(非特許文献7)。ヒト細胞を用いたインビトロの実験において、ヒトMHCクラスI分子の1つであるHLA−A0201分子高結合性Db126ペプチドおよびWH187ペプチド(配列番号:1におけるアミノ酸187−195、SLGEQQYSV)を用いてHLA−A0201を持つヒト末梢血単核球を刺激すると、WT1特異的CTLが誘導され、誘導されたCTLは内因性にWT1遺伝子を高発現している腫瘍細胞に対し特異的な傷害活性を有すること、およびかかるCTLの傷害活性はHLA−A2拘束性であることが示された(非特許文献11)。HLA−Aアリールのうち、日本人に最も多いHLA−A2402に適合するWT1ペプチド(WT1235;配列番号:1におけるアミノ酸235−243、CMTWNQMNL)を用いたヒト細胞でのインビトロの実験において、WT1特異的CTL(TAK−1)が誘導され(非特許文献12)、誘導されたCTLは、一部WT1遺伝子を生理的に発現している正常造血幹細胞のコロニー形成能を抑制しないことが示された(非特許文献12および13)。これらの報告から、マウスだけでなくヒトにおいてもWT1特異的CTLの誘導が可能であり、かかるCTLがWT1遺伝子を高発現する腫瘍細胞に対しては傷害活性を有するが、WT1遺伝子を生理的に発現する正常細胞には傷害活性を有さない可能性が強く示唆された(非特許文献7、10、11、12および13)。
WT1遺伝子産物は核内タンパク質として存在し、細胞質内でプロテアソームによってプロセッシングを受け、ペプチドに断片化される。断片化されたペプチドは、TAP(transporter associated with antigen processing)分子によって小胞体内腔へと導かれ、MHCクラスI分子と複合体を形成し、細胞表面に提示される。CTL前駆細胞がTCRを介してWT1ペプチド−MHCクラスI分子複合体を認識することによって、WT1特異的CTLが誘導され、MHCクラスI分子を介してWT1遺伝子産物を提示する腫瘍細胞に対して細胞傷害作用を発揮する(非特許文献7、8および9)。そうすると、WT1遺伝子産物を標的とした癌免疫療法において用いられるWT1ペプチドは、少なくとも生体内でMHCクラスI分子に結合する形態となる必要がある。しかし、MHCクラスI分子には多様性があり、それぞれのMHCクラスI分子に結合するWT1ペプチドのアミノ酸配列は異なるため、MHCクラスIの型別に適合するペプチドを用意する必要がある。しかしながら、現在分かっているHLA分子に拘束性のWT1ペプチドは、HLA−A2402分子、HLA−A0201分子、HLA−A2601分子、HLA−A3303分子拘束性のもののみである(それぞれ、特許文献1、非特許文献11、特許文献2、および特許文献3)。従って、HLA−A1101拘束性WT1ペプチドを見出す必要があった。
国際公開2003/106682号公報 国際公開2005/095598号公報 特願2006−45287 Daniel A. Haber et al., Cell. 1990 Jun 29;61(7):1257-69. Call KM et al., Cell. 1990 Feb 9;60(3):509-20. Menke AL et al., Int Rev Cytol. 1998;181:151-212. Review. Yamagami T et al., Blood. 1996 Apr 1;87(7):2878-84. Inoue K et al., Blood. 1998 Apr 15;91(8):2969-76. Tsuboi A et al., Leuk Res. 1999 May;23(5):499-505. Oka Y et al., J Immunol. 2000 Feb 15;164(4):1873-80. Melief CJ et al., Immunol Rev. 1995 Jun;145:167-77. Ritz J, J Clin Oncol. 1994 Feb;12(2):237-8. Tsuboi A et al., J Clin Immunol. 2000 May;20(3):195-202. Oka Y et al., Immunogenetics. 2000 Feb;51(2):99-107. Ohminami H et al., Blood. 2000 Jan 1;95(1):286-93. Gao L et al., Blood. 2000 Apr 1;95(7):2198-203.
本発明の解決課題は、HLA−A1101分子拘束性であって、WT1タンパク質由来のアミノ酸配列を含むペプチド、およびそれをコードするポリヌクレオチド、ならびにそれらを含む癌の治療および/または予防用医薬組成物などを提供することにある。
本発明者は、上記事情に鑑み鋭意研究を重ねた結果、WT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むペプチドのうちHLA−A1101分子と結合能を有するペプチドが、高い確率でWT1特異的CTLを誘導できることを見出し、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は、
(1)WT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むペプチドであって、HLA−A1101分子と結合能を有し、かつCTL誘導能を有する、ペプチド、
(2)アミノ酸配列の第9位のアミノ酸がLysまたはArgである、(1)記載のペプチド、
(3)アミノ酸配列が以下の群:
Ala Ala Gly Ser Ser Ser Ser Val Lys(配列番号:2)、
Pro Ile Leu Cys Gly Ala Gln Tyr Arg(配列番号:3)、
Arg Ser Ala Ser Glu Thr Ser Glu Lys(配列番号:4)、
Ser Ala Ser Glu Thr Ser Glu Lys Arg(配列番号:5)、
Ser His Leu Gln Met His Ser Arg Lys(配列番号:6)、
Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)、
Lys Thr Cys Gln Arg Lys Phe Ser Arg(配列番号:8)、
Ser Cys Arg Trp Pro Ser Cys Gln Lys(配列番号:9)、
Asn Met His Gln Arg Asn Met Thr Lys(配列番号:10)、
からなる群より選択される、(1)記載のペプチド、
(4)アミノ酸配列がAla Ala Gly Ser Ser Ser Ser Val Lys(配列番号:2)である、(3)記載のペプチド、
(5)少なくとも1個のシステイン残基を含むWT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含む2個のペプチド単量体が、ジスルフィド結合により互いに結合しているペプチド二量体であって、HLA−A1101分子と結合能を有し、かつCTL誘導能を有する、ペプチド二量体、
(6)ペプチド単量体のアミノ酸配列が、以下の群:
Pro Ile Leu Cys Gly Ala Gln Tyr Arg(配列番号:3)、
Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)、
Lys Thr Cys Gln Arg Lys Phe Ser Arg(配列番号:8)、
Ser Cys Arg Trp Pro Ser Cys Gln Lys(配列番号:9)、
からなる群より選択される、(5)記載のペプチド二量体、
(7)(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体を含む、癌を治療または予防するための医薬組成物、
(8)有効量の(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体をHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法、
(9)(1)記載のペプチドをコードするポリヌクレオチド、
(10)(9)記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター、
(11)(9)記載のポリヌクレオチドまたは(10)記載のベクターを含む、癌を治療または予防するための医薬組成物、
(12)有効量の(9)記載のポリヌクレオチドまたは(10)記載のベクターをHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法、
(13)(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体により誘導される、WT1特異的CTL、
(14)末梢血単核球を(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体の存在下で培養し、該末梢血単核球からWT1特異的CTLを誘導することを特徴とする、WT1特異的CTLの誘導方法、
(15)(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体を必須構成成分として含む、WT1特異的CTLを誘導するためのキット、
(16)(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体により誘導される、WT1ペプチドを提示する抗原提示細胞、
(17)未熟抗原提示細胞を(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体の存在下で培養し、該未熟抗原提示細胞からWT1ペプチドを提示する抗原提示細胞を誘導することを特徴とする、WT1ペプチドを提示する抗原提示細胞の誘導方法、
(18)(1)記載のペプチドおよび/または(5)記載のペプチド二量体を必須構成成分として含む、WT1ペプチドを提示する抗原提示細胞を誘導するためのキット、
(19)(13)記載のCTLまたは(16)記載の抗原提示細胞を用いることを特徴とする、癌の診断方法、
を提供するものである。
本発明により、HLA−A1101拘束性であって、WT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むペプチド、およびそれをコードするポリヌクレオチド、ならびにそれらを含む癌の治療および/または予防用医薬組成物などが得られるので、HLA−A1101を有する対象におけるインビボおよびインビトロでのWT1特異的CTLの誘導が可能となる。日本人におけるHLA−A1101陽性率は、約17.9%と高いことから、広範囲の対象においてWT1特異的CTLを誘導できる。
図1は、WT1251を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図2は、WT1279を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図3は、WT1312を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図4は、WT1313を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図5は、WT1338を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図6は、WT1378を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図7は、WT1386を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図8は、WT1415を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図9は、WT1436を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す。 図10は、WT1378ペプチドを用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す(a、b、cは、それぞれHLA−A1101陽性健常人ドナー1、2、3由来PBMCを用いたときの細胞傷害活性を示す)。 図11は、WT1378ペプチド二量体を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す(aおよびbは、それぞれHLA−A1101陽性健常人ドナー1および2由来PBMCを用いたときの細胞傷害活性を示す)。 図12は、改変WT1378ペプチド(G→I)を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す(a、b、cは、それぞれHLA−A1101陽性健常人ドナー1、2、3由来PBMCを用いたときの細胞傷害活性を示す)。 図13は、改変WT1378ペプチド(G→V)を用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す(a、b、cは、それぞれHLA−A1101陽性健常人ドナー1、2、3由来PBMCを用いたときの細胞傷害活性を示す)。 図14は、WT1379ペプチドを用いて誘導されたCTLの細胞傷害活性を示す(a、b、cは、それぞれHLA−A1101陽性健常人ドナー1、2、3由来PBMCを用いたときの細胞傷害活性を示す)。
本発明は、1の態様において、WT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むペプチドであって、HLA−A1101分子と結合能を有し、かつCTL誘導能を有するペプチド(本明細書において、「WT1ペプチド」ともいう)に関するものである。ヒトWT1タンパク質のアミノ酸配列を配列番号:1に示す。本発明のペプチドは、かかる配列番号:1に示されるアミノ酸配列中の連続する9個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むものである。本発明のペプチドが、後述の配列番号3、7、8および9のアミノ酸配列などのシステインを含むアミノ酸配列を含む場合、かかるアミノ酸配列中のシステインを他のアミノ酸などの別の物質(例えば、セリン、アラニン、α−アミノ酪酸)に置換して、あるいはシステインのSH基を当該技術分野で既知の保護基(例えば、カルボキシメチル基、ピリジルエチル基)で修飾することにより、安定性を上昇させてもよい。本発明のペプチドは、細胞内でプロセッシングされて、プロセッシングされたペプチドが抗原提示細胞により提示されることにより、CTLを誘導することができる癌抗原ペプチドである。
本発明は、上述の通りHLA−A1101拘束性を有するペプチドを得ることを目的とする。従って、本発明のペプチドは、HLA−A1101分子と結合能を有するものである。結合能は、当該技術分野において既知の方法により調べることができる。かかる方法として、例えば、Rankpep、BIMAS、SYFPEITHIなどのコンピューターベースの方法、HLA−A1101分子結合能を有する既知のペプチドとの競合的結合試験などがある。例えば、調べた結合能を既知のHLA−A1101拘束性ペプチドの結合能と比較し、本発明のペプチドが結合能を有するかどうかを判断することができる。本発明における結合能を有するペプチドの例は、本願明細書の実施例1に記載した方法により得られるHLA−A1101分子に対する親和性スコアが4以上のもの、好ましくは、5以上のもの、より好ましくは、6以上のものである。
本発明のペプチドは、さらに、CTL誘導能を有するものである。WT1遺伝子は、例えば、白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、悪性リンパ腫などの造血器腫瘍、胃癌、大腸癌、肺癌、乳癌、胚細胞癌、肝癌、皮膚癌、膀胱癌、前立腺癌、子宮癌、子宮頸癌、卵巣癌などの固形癌において天然型で高発現しているので、本発明のペプチドは、かかる疾患に罹患した対象において、高い確率でCTLを誘導することなどが可能である。CTL誘導能は、インビボまたはインビトロにおいてCTLを誘導することができる能力をいう。かかる誘導能は、一般的な方法、例えば、Cr遊離アッセイを用いてCTLの細胞傷害活性を調べることなどにより調べることができる。
本発明のペプチドは、アミノ酸配列の第9位のアミノ酸がLysまたはArgのものであってもよい。かかるアミノ酸を有することで、ペプチドのHLA−A1101分子との結合能が高くなると考えられる。
本発明のペプチドが含む該9個のアミノ酸からなるアミノ酸配列のうち好ましいものは、Ala Ala Gly Ser Ser Ser Ser Val Lys(配列番号:2)、Pro Ile Leu Cys Gly Ala Gln Tyr Arg(配列番号:3)、Arg Ser Ala Ser Glu Thr Ser Glu Lys(配列番号:4)、Ser Ala Ser Glu Thr Ser Glu Lys Arg(配列番号:5)、Ser His Leu Gln Met His Ser Arg Lys(配列番号:6)、Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)、Lys Thr Cys Gln Arg Lys Phe Ser Arg(配列番号:8)、Ser Cys Arg Trp Pro Ser Cys Gln Lys(配列番号:9)、またはAsn Met His Gln Arg Asn Met Thr Lys(配列番号:10)であり、最も好ましいものは、Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)である。さらに、配列番号:2〜10のいずれかにおいて、該9個のアミノ酸のうち1個ないし数個、好ましくは1個ないし5個のアミノ酸が別のアミノ酸に置換されたものであってもよい。また、該9個のアミノ酸および置換された別のアミノ酸のいずれかが、適宜修飾されたものであってもよい。但し、いずれの場合においても、本発明のペプチドがHLA−A1101分子との結合能を保持していることが条件となる。
上述の通り、本発明のペプチドは、WT1タンパク質由来であって、上記9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含んでいればよい。従って、本発明のペプチドは、例えば、配列番号:2〜10に示すアミノ酸配列からなるペプチドそのものであってもよく、あるいは配列番号:2〜10に示すアミノ酸配列を含む、WT1タンパク質またはその一部であってもよい。本発明のペプチドに含まれるアミノ酸の数は特に限定されないが、例えば、9〜500個、9〜300個、9〜200個、9〜100個、9〜50個、9〜30個、9〜12個などである。本発明のペプチドはまた、上記9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列のN末端および/またはC末端に、種々の物質を結合させることができる。例えば、アミノ酸、ペプチド、それらのアナログ等を結合させてもよい。本発明のペプチドにこれらの物質が結合している場合、これらの物質が例えば、生体内酵素などにより、あるいは細胞内プロセッシングなどの過程により処理され、最終的に上記9個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を生じ、HLA−A1101分子との複合体として細胞表面に提示されることにより、CTL誘導効果を得ることができる。これらの物質は、本発明のペプチドの溶解性を調節するものであってもよく、耐プロテアーゼ作用等その安定性を向上させるものであってもよく、また例えば、所定の組織・器官に特異的に本発明のペプチドをデリバリーするようなものであってもよく、あるいはまた抗原提示細胞の取込み効率を増強させる作用などを有するものであってもよい。これらの物質はまた、CTL誘導能を増大させるもの、例えば、ヘルパーペプチドなどであってもよい。
本発明のペプチドは、当該技術分野において通常用いられる方法またはそれらの変法を用いて合成することができる。かかる合成方法は、例えば、Peptide Synthesis, Interscience, New York, 1966;The Proteins, Vol 2, Academic Press Inc., New York, 1976;ペプチド合成、丸善(株),1975;ペプチド合成の基礎と実験、丸善(株),1985;医薬品の開発 続 第14巻・ペプチド合成、広川書店,1991などに記載されている。
本発明のペプチドはまた、本発明のペプチドをコードするヌクレオチド配列情報に基づき、遺伝子工学的手法を用いて製造することもできる。かかる遺伝子工学的手法は、当業者に周知のものである。
本発明は、さらなる態様において、少なくとも1個のシステイン残基を含むWT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含む2個のペプチド単量体が、ジスルフィド結合により互いに結合している、HLA−A1101分子との結合能を有し、かつCTL誘導能を有する、ペプチド二量体(本明細書において、「WT1ペプチド二量体」ともいう)に関するものである。本発明のペプチド二量体の安定性は、二量体形態をとることによりペプチド単量体と比較して増大する。本発明のペプチド二量体は、細胞内でプロセッシングされて、プロセッシングされたペプチドが抗原提示細胞により提示されることにより、CTLを誘導することができる癌抗原ペプチド二量体である。
本発明のWT1ペプチド二量体は、2個のペプチド単量体が、単量体に存在するシステイン残基間のジスルフィド結合を介して結合することにより、形成される。従って、本発明のWT1ペプチド二量体に含まれるペプチド単量体は、上述のWT1ペプチドであって、かつ少なくとも1個のシステイン残基を含むものである。本発明のWT1ペプチド二量体は、ホモ二量体であっても、ヘテロ二量体であってもよい。
本発明のWT1ペプチド二量体において、ペプチド単量体が含むアミノ酸配列のうち好ましいものは、 Pro Ile Leu Cys Gly Ala Gln Tyr Arg(配列番号:3)、Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)、Lys Thr Cys Gln Arg Lys Phe Ser Arg(配列番号:8)、またはSer Cys Arg Trp Pro Ser Cys Gln Lys(配列番号:9)であり、最も好ましいものは、Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)である。
本発明のWT1ペプチド二量体は、当該技術分野において既知の方法を用いて製造することができる。例えば、ペプチド単量体が1対のシステイン残基を含むとき、本発明のWT1ペプチド二量体は、例えば、システイン側鎖上の保護基を含む全ての保護基を除去し、次に、得られた単量体溶液をアルカリ条件下で空気酸化の対象とするか、あるいはアルカリまたは酸性条件下で酸化剤を添加することによりジスルフィド結合を形成することにより、製造され得る。酸化剤としては、例えば、ヨウ素、ジメチルスルホキシド(DMSO)、フェリシアン化カリウムなどが挙げられる。
ペプチド単量体が2個以上のシステイン残基を含むときも、本発明のWT1ペプチド二量体は前記方法により合成される。この場合、異なるタイプのジスルフィド結合に起因して、異性体が得られる。あるいは、本発明のWT1ペプチド二量体は、システイン側鎖の保護基の組み合わせを選択することにより、製造され得る。保護基の組み合わせとしては、例えば、MeBzl(メチルベンジル)基とAcm(アセトアミドメチル)基、Trt(トリチル)基とAcm基、Npys(3−ニトロ−2−ピリジルチオ)基とAcm基、S−Bu−t(S−tert−ブチル)基とAcm基の組み合わせなどが挙げられる。例えば、MeBzl基とAcm基との組み合わせの場合、WT1ペプチド二量体は、MeBzl基以外の保護基およびシステイン側鎖上の保護基以外の保護基を除去し、得られた単量体溶液を空気酸化の対象とし、保護されたシステイン残基間でジスルフィド結合を形成し、次に、ヨウ素により脱保護および酸化して、Acmで保護されていたしシステイン残基間でジスルフィド結合を形成することにより、製造され得る。
本発明は、もう1つの態様において、上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体を含む、癌を治療または予防するための医薬組成物に関するものである。WT1遺伝子は、各種の癌や腫瘍、例えば、白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、悪性リンパ腫などの造血器腫瘍、胃癌、大腸癌、肺癌、乳癌、胚細胞癌、肝癌、皮膚癌、膀胱癌、前立腺癌、子宮癌、子宮頸癌、卵巣癌などの固形癌において高発現しているため、本発明の医薬組成物を癌の治療または予防のために用いることができる。本発明の医薬組成物がHLA−A1101陽性対象に投与されると、該医薬組成物に含まれるHLA−A1101拘束性WT1ペプチドまたはWT1ペプチド二量体により、WT1特異的CTLが誘導され、かかるCTLにより対象中の癌細胞が傷害される。
本発明の医薬組成物は、有効成分としての上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体以外に、例えば、担体、賦形剤などを含んでいてもよい。本発明の医薬組成物に含まれるHLA−A1101拘束性WT1ペプチドまたはWT1ペプチド二量体は、WT1特異的CTLを誘導することから、その誘導効率を増強させるために、本発明の医薬組成物は適当なアジュバントを含むか、あるいは適当なアジュバントと共に投与されてもよい。好ましいアジュバントとしては、例えば、完全または不完全フロイントアジュバント、水酸化アルミニウムなどが挙げられるがこれらに制限されない。
本発明の医薬組成物の投与方法は、疾患の種類、対象の状態、標的部位などの条件に応じて適宜選択することができる。当該方法は、例えば、皮内投与、皮下投与、筋肉内投与、静脈内投与、経鼻投与、経口投与などが挙げられるが、これらに限らない。本発明の医薬組成物に含まれるペプチドまたはペプチド二量体の量、医薬組成物の剤形、投与回数などは、疾患の種類、対象の状態、標的部位などの条件に応じて適宜選択できるが、1回あたりのペプチド投与量は、通常、0.0001mg〜1000mg、好ましくは、0.001mg〜1000mgである。
本発明は、別の態様において、有効量の上記WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体をHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法に関するものである。治療または予防される癌は、いずれのものであってもよく、例えば、白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、悪性リンパ腫などの造血器腫瘍、胃癌、大腸癌、肺癌、乳癌、胚細胞癌、肝癌、皮膚癌、膀胱癌、前立腺癌、子宮癌、子宮頸癌、卵巣癌などの固形癌を含む。
本発明は、さらなる態様において、HLA−A1101陽性対象におけるWT1特異的CTLの存在または量を決定する方法であって、
(a)WT1ペプチドとHLA−A1101分子との複合体を該対象由来試料と反応させ;次に、
(b)該試料に含まれる該複合体を認識するCTLの存在または量を調べる、
工程を含む方法に関するものである。対象由来試料は、リンパ球が含まれている可能性があればいずれのものであってもよく、例えば、血液、リンパ液などの体液、組織などが挙げられる。WT1ペプチドとHLA−A1101分子との複合体は、例えば、ビオチンストレプトアビジン法などの当業者に既知の方法を用いて、例えば、テトラマー、ペンタマーなどの形態にされていてもよい。かかる複合体を認識するCTLの存在または量は、当業者に既知の方法により測定することができる。本発明のこの態様において、上記複合体は標識されたものであってもよい。標識としては、蛍光標識、放射性標識などの公知のものを使用することができる。標識することで、CTLの存在または量の決定が容易かつ迅速になる。
従って、本発明はまた、HLA−A1101陽性対象におけるWT1特異的CTLの存在または量を決定するための、HLA−A1101拘束性WT1ペプチドを含む組成物を提供する。
さらに、本発明は、HLA−A1101拘束性WT1ペプチドを含む、HLA−A1101陽性対象におけるWT1特異的CTLの存在または量を決定するためのキットを提供する。
本発明は、さらなる態様において、WT1ペプチドとHLA−A1101分子との複合体を用いて、WT1特異的CTLを生成する方法であって、
(a)試料と該複合体を反応させ、
(b)該試料中に含まれる該複合体を認識するCTLを得る、
工程を含む方法に関するものである。WT1ペプチドとHLA−A1101分子との複合体については上述の通りである。試料は、リンパ球が含まれている可能性があればいずれのものであってもよく、例えば、血液などの対象由来試料、細胞培養液などが挙げられる。複合体を認識するCTLの取得は、例えば、FACS、MACSなど当業者に既知の方法を用いて行うことができる。得られたWT1特異的CTLを培養し、種々の癌の治療または予防に用いることも可能になる。
従って、本発明はまた、WT1ペプチドとHLA−A1101分子との複合体を用いて、WT1特異的CTLを生成する方法により得ることのできる、WT1特異的CTLに関するものである。
本発明は、さらにもう1つの態様において上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドをコードするポリヌクレオチドに関するものである。本発明のポリヌクレオチドは、DNAであってもRNAであってもよい。本発明のポリヌクレオチドの塩基配列は、上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドのアミノ酸配列に基づき決定できる。該ポリヌクレオチドは、例えば、化学合成法などの公知のDNAまたはRNA合成方法、PCR法などにより製造することができる。
本発明は、別の態様において上記ポリヌクレオチドを含む発現ベクターに関するものである。発現ベクターの種類、上記ポリヌクレオチド配列以外で含まれる配列等は、当該発現ベクターを導入する宿主の種類、目的等に応じて適宜選択できる。本発明の発現ベクターをHLA−A1101陽性対象に投与し、生体内においてHLA−A1101拘束性WT1ペプチドを産生させ、WT1特異的CTLを誘導し、これにより対象中の造血器腫瘍細胞、固形癌細胞などを傷害することで、該造血器腫瘍、固形癌の治療または予防を行うことができる。
本発明は、さらに別の態様において上記ポリヌクレオチドまたは上記発現ベクターを含む、癌を治療または予防するための医薬組成物に関するものである。本発明のこの態様の医薬組成物の組成、投与方法等は、上述の通りである。
本発明は、別の態様において、有効量の上記ポリヌクレオチドまたは発現ベクターをHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法に関するものである。治療または予防される癌は、白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、悪性リンパ腫などの造血器腫瘍、胃癌、大腸癌、肺癌、乳癌、胚細胞癌、肝癌、皮膚癌、膀胱癌、前立腺癌、子宮癌、子宮頸癌、卵巣癌などの固形癌を含む。
本発明は、別の態様において、上記発現ベクターを含有する細胞に関するものである。本発明の細胞は、例えば、大腸菌、酵母、昆虫細胞、動物細胞などの宿主細胞を上記発現ベクターを用いて形質転換することにより製造することができる。宿主細胞への発現ベクターの導入方法は、種々の方法を適宜選択して用いることができる。形質転換した細胞を培養し、産生されたWT1ペプチドを回収・精製することにより、本発明のペプチドを製造することもできる。
本発明は、さらなる態様において、上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体により誘導される、WT1特異的CTLに関するものである。本発明のCTLは、WT1ペプチドとHLA−A1101分子との複合体を認識する。従って、本発明のCTLを用いて、HLA−A1101陽性、かつWT1高発現腫瘍細胞を特異的に傷害することができる。
本発明は、別の態様において、WT1特異的CTLをHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法に関するものである。WT1特異的CTLの投与方法は、疾患の種類、対象の状態、標的部位などの条件に応じて適宜選択することができる。当該方法は、例えば、静脈内投与、皮内投与、皮下投与、筋肉内投与、経鼻投与、経口投与などが挙げられるが、これらに限らない。
本発明は、別の態様において、末梢血単核球を上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体の存在下で培養し、該末梢血単核球からWT1特異的CTLを誘導することを特徴とする、WT1特異的CTLの誘導方法に関するものである。末梢血単核球が由来する対象は、HLA−A1101陽性であればいずれであってもよい。末梢血単核球をHLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体の存在下で培養することで、末梢血単核球中のCTL前駆細胞からWT1特異的CTLが誘導される。本発明により得られたWT1特異的CTLをHLA−A1101陽性対象に投与することで、対象の造血器腫瘍、固形癌を治療または予防することができる。
本発明は、さらに別の態様において、HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体を必須構成成分として含む、WT1特異的CTLを誘導するためのキットに関するものである。好ましくは、該キットは上記WT1特異的CTLの誘導方法に用いられる。本発明のキットは、上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体のほかに、例えば、末梢血単核球の取得手段、アジュバント、反応容器等を含んでいてもよい。一般的には、キットには取扱説明書を添付する。本発明のキットを用いて、WT1特異的CTLを効率よく誘導できる。
本発明は、さらなる態様において、上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体により誘導される、WT1ペプチドをHLA−A1101分子を介して提示する抗原提示細胞(樹状細胞など)に関するものである。本発明の抗原提示細胞を用いることで、上記WT1特異的CTLが効率よく誘導される。
本発明は、別の態様において、上記WT1ペプチドをHLA−A1101分子を介して提示する抗原提示細胞をHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法に関するものである。抗原提示細胞の投与方法は、疾患の種類、対象の状態、標的部位などの条件に応じて適宜選択することができる。当該方法は、例えば、静脈内投与、皮内投与、皮下投与、筋肉内投与、経鼻投与、経口投与などが挙げられるが、これらに限らない。
本発明は、別の態様において、未熟抗原提示細胞を上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体の存在下で培養し、該未熟抗原提示細胞からWT1ペプチドをHLA−A1101分子を介して提示する抗原提示細胞を誘導することを特徴とする、WT1ペプチドをHLA−A1101分子を介して提示する抗原提示細胞の誘導方法に関するものである。未熟抗原提示細胞は、未熟樹状細胞などの成熟して抗原提示細胞となり得る細胞をいう。未熟抗原提示細胞が由来する対象は、HLA−A1101陽性であればいずれのものであってもよい。未熟抗原提示細胞は、例えば、末梢血単核球などに含まれているため、かかる細胞を上記WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体の存在下で培養してもよい。
本発明は、さらに別の態様において、上記HLA−A1101拘束性WT1ペプチドおよび/またはWT1ペプチド二量体を必須構成成分として含む、WT1ペプチドをHLA−A1101分子を介して提示する抗原提示細胞を誘導するためのキットに関するものである。好ましくは、該キットは上記抗原提示細胞の誘導方法に用いられる。本発明のキットに含まれるその他の構成成分等は上述の通りである。本発明のキットを用いて、WT1ペプチドをHLA−A1101分子を介して提示する抗原提示細胞を効率よく誘導できる。
本発明は、別の態様において、HLA−A1101拘束性WT1ペプチドまたは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドに対する抗体に関するものである。本発明の抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体のいずれであってもよい。
本発明は、さらなる態様において、上記WT1特異的CTL、WT1ペプチドをHLA−A1101分子を介して提示する抗原提示細胞、またはHLA−A拘束性WT1ペプチドまたは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドに対する抗体を用いることを特徴とする、癌の診断方法に関するものである。好ましくは、WT1特異的CTLが本発明の診断方法に用いられる。例えば、上記CTL、抗原提示細胞または抗体をHLA−A1101陽性対象由来の試料とインキュベーションする、あるいはHLA−A1101陽性対象に投与し、次に該CTL、抗原提示細胞または抗体の例えば、位置、部位、量等を決定することで、癌の診断が可能となる。上記CTL、抗原提示細胞または抗体は、標識されたものであってもよい。かかる標識を付すことで、本発明の診断方法を効率よく行うことができる。
以下に実施例を示して本発明を具体的かつ詳細に説明するが、実施例は本発明を限定するものと解してはならない。
WT1ペプチドの選択
RANKPEP(http://bio.dfci.harvard.edu/Tools/rankpep.html)を用いて、WT1タンパク質(配列番号:1)由来のペプチドから、HLA−A1101分子との結合能の高いWT1251、WT1279、WT1312、WT1313、WT1338、WT1378、WT1386、WT1415、およびWT1436を選択した。これらのペプチドのアミノ酸配列、配列番号:1におけるアミノ酸番号、HLA−A1101分子に対する親和性スコアを表1に示す。
Figure 2008081701
B−LCL細胞の調製
HLA−A1101陽性健常人ドナーより採取した末梢血からFicoll-Hypaque gradient density centrifugation法により末梢血単核球(PBMC)を分離した。次に、PBMCを24ウェル細胞培養用プレートに10% FCS含有RPMI 1640培地中約1×10個の密度で播種し、B95−8細胞(EBウイルス産生細胞)の培養上清を添加して、37℃、5% COで約1ヶ月間培養した。EBウイルスにより形質転換された、B細胞系腫瘍細胞であるB−LCL細胞を得た。得られたB−LCL細胞がWT1遺伝子を発現していないことを確認した。B−LCL細胞を20μg/ml WT1251、WT1279、WT1312、WT1313、WT1338、WT1378、WT1386、WT1415、またはWT1436と共に2時間インキュベーションすることでパルスし、次に、放射線80Gyを照射させた。得られたB−LCL細胞(以下、WT1ペプチドでパルスしたB−LCL細胞という)を抗原提示細胞として以下の実験に用いた。
WT1特異的CTLの誘導
自己のPBMC3×10個を、24ウェル細胞培養用プレートにて20μg/ml WT1251、WT1279、WT1312、WT1313、WT1338、WT1378、WT1386、WT1415、またはWT1436を含む完全培地(45% RPMI、45% AMI−V培地、および10% ヒトAB血清)中、37℃、5% COで1週間培養し、応答細胞を得た。得られた応答細胞 2×10個を、同じWT1ペプチドでパルスしたB−LCL細胞 1×10個と完全培地中で1週間共培養した(1回目刺激)。PBMCをWT1ペプチドでパルスしたB−LCL細胞とさらに3回共培養し(2〜4回目刺激)、その際20IU/ml(最終濃度)IL2を、次の条件;2回目刺激:刺激開始の3日後から1日置き計2回;3回目および4回目刺激:刺激開始の翌日から1日置き計3回添加した。得られた細胞を、Negative Selection Columns Gravity Feed Kit(StemSp)を用いてCD8陽性T細胞が約80%となるよう濃縮し、次に、WT1ペプチドでパルスしたB−LCL細胞と共培養した(5回目刺激)。最終刺激の5日後のCD8陽性T細胞(CTL)を細胞傷害活性の測定のために用いた。
CTLの細胞傷害活性
CTLの細胞傷害活性を51Cr遊離試験を用いて測定した。CTL細胞(以下、エフェクター細胞ともいう)を、あらかじめ51Crを取り込ませた標的細胞と1:1ないし30:1の比率(E/T比)となるよう培地 200μlに調製し、96ウェル細胞培養用プレート中、37℃、5% COで4時間培養した。標的細胞として、CTL誘導に用いたWT1ペプチドと同じペプチドでパルスしたB−LCL細胞(BLCL−P)、およびWT1ペプチドをパルスしていないB−LCL細胞(BLCL−NP)を用いた。培養後、遠心して上清を回収し、液体シンチレーションカウンターを用いて、上清中に遊離した51Cr量を測定した。細胞傷害活性(%)を次の式:
(試料上清中の51Cr遊離量−自然発生51Cr遊離量)/(最大51Cr遊離量−自然発生51Cr遊離量)×100
(自然発生51Cr遊離量は、51Crを取り込ませた標的細胞のみを同様の条件で培養したときの51Cr遊離量であり、最大51Cr遊離量は、51Crを取り込ませた標的細胞を1% トリトンX−100を用いて全細胞を溶解させたときの51Cr遊離量である)
を用いて決定した。結果を図1〜9に示す。図中、縦軸は特異的溶解(%)を示し、横軸はE/T比を示す。また、BLCL−Pを実線、BLCL−NPを点線で示す。WT1251、WT1279、WT1312、WT1313、WT1338、WT1378、WT1386、WT1415、およびWT1436を用いて誘導されたCTLは、BLCL−NP細胞と比較して、WT1ペプチドをHLA−A1101分子との複合体として提示しているBLCL−P細胞を特異的に傷害することが確認できた。以下で、WT1251、WT1279、WT1313、WT1338、およびWT1386を用いて誘導されたCTLについてさらなる実験を行った。
CTLの内因性WT1遺伝子発現細胞に対する細胞傷害活性
WT1251、WT1279、WT1313、WT1338、およびWT1386を用いて誘導されたCTLのWT1発現B−LCLに対する細胞傷害活性を上述の方法を用いて決定した。WT1発現細胞は、ヒトWT1遺伝子を導入したB−LCL細胞であって、細胞内でWT1タンパク質を発現し、プロセスされて約9個のアミノ酸からなるペプチドをHLA−A1101分子上に発現する細胞をいう。結果を図1、2、4、5、および7に示す。図中、WT1発現B−LCLを破線で示す。WT1251、WT1279、WT1313、WT1338、およびWT1386を用いて誘導されたCTLが、WT1遺伝子を内因性に発現している細胞に対しても傷害活性を有することが確認できた。
WT1ペプチド二量体の製造
WT1378ペプチド単量体227.5mg、N−メチルグルカミン(NMG)227.5mgおよび水23mlの混合物を室温で約2日間攪拌することにより、空気酸化した。得られた混合液に酢酸ナトリウム2gを水5mlに溶解した水溶液を加え約20分間、室温にて攪拌した。水200mlとアセトニトリル約200mlを添加し、桐山ロート(ろ紙 No.5C)でろ過し、水(約50ml×3回)で洗浄した。残渣に水約200mlを添加し、凍結乾燥を行い、粗ペプチドWT1378二量体158mgを得た。
粗WT1ペプチド二量体の精製
粗WT1ペプチド378二量体158mgをDMSO 9mlに溶解し、HPLC(島津製作所製 LC8AD型)にセットした、1液(HO/1% AcOH)で平衡化したODS C18カラム(5cm Φ×50cm L,YMC社製)にHPLCポンプを用いて注入した。カラムを約30分間そのままにし、0%〜40%の濃度勾配の2液(CHCN/1% AcOH)で360分間かけて溶出した。220nmでのUV吸収をモニターしながら、自動分画装置を用いて、WT1ペプチド二量体を含む分画を回収した。回収した分画を合わせ、HPLC(日立製 L−4000型)にセットした、17%の2液で平衡化したODS C18カラム(4.6mm Φ×25cm L,YMC社製)に注入し、0%〜47%の濃度勾配の2液で30分かけて溶出し、保持時間20.51分の精製WT1378ペプチド二量体46.6mgを得た。
FAB.MS 2365.0(理論値 2342.70)Na F=0.25%
WT1ペプチド二量体によるCTL誘導
得られたWT1378ペプチド二量体、WT1378ペプチド、改変WT1378ペプチド(G→I)(配列番号:11)および改変WT1378ペプチド(G→V)(配列番号:12)、WT1379ペプチド(配列番号:13,国際公開第2002/28414号において開示)のCTL誘導能を、上述の方法により、HLA−A1101陽性健常人ドナー1〜3由来のPBMCを用いて調べた。結果を図10〜14に示す。図中、縦軸は特異的溶解(%)を示し、横軸はE/T比を示す。また、BLCL−Pを実線、BLCL−NPを点線で示す。WT1378ペプチド二量体がCTL誘導能を有することが確認できた。また、WT1タンパク質のアミノ酸配列において、WT1378ペプチドと1アミノ酸ずつ異なるWT1379ペプチドのCTL誘導能は、WT1378ペプチドと比較して極めて低く、本発明のWT1ペプチドが既知のWT1ペプチドと比較して格別顕著なCTL誘導能を有することがわかった。
本発明により、HLA−A1101拘束性WT1ペプチド、該ペプチドをコードするポリヌクレオチド、およびそれらを含む医薬組成物等が提供されるので、医薬品等の分野、例えば、WT1遺伝子を高発現している種々の造血器腫瘍、固形癌の予防薬、または治療薬の開発、製造分野において利用可能である。
SEQ ID NO: 11: Modified WT1 peptide
SEQ ID NO: 12: Modified WT1 peptide

Claims (19)

  1. WT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含むペプチドであって、HLA−A1101分子との結合能を有し、かつCTL誘導能を有する、ペプチド。
  2. アミノ酸配列の第9位のアミノ酸がLysまたはArgである、請求項1記載のペプチド。
  3. アミノ酸配列が以下の群:
    Ala Ala Gly Ser Ser Ser Ser Val Lys(配列番号:2)、
    Pro Ile Leu Cys Gly Ala Gln Tyr Arg(配列番号:3)、
    Arg Ser Ala Ser Glu Thr Ser Glu Lys(配列番号:4)、
    Ser Ala Ser Glu Thr Ser Glu Lys Arg(配列番号:5)、
    Ser His Leu Gln Met His Ser Arg Lys(配列番号:6)、
    Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)、
    Lys Thr Cys Gln Arg Lys Phe Ser Arg(配列番号:8)、
    Ser Cys Arg Trp Pro Ser Cys Gln Lys(配列番号:9)、
    Asn Met His Gln Arg Asn Met Thr Lys(配列番号:10)、からなる群より選択される、請求項1記載のペプチド。
  4. アミノ酸配列がAla Ala Gly Ser Ser Ser Ser Val Lys(配列番号:2)である、請求項3記載のペプチド。
  5. 少なくとも1個のシステイン残基を含むWT1タンパク質由来の9個の連続するアミノ酸からなるアミノ酸配列を含む2個のペプチド単量体が、ジスルフィド結合により互いに結合しているペプチド二量体であって、HLA−A1101分子との結合能を有し、かつCTL誘導能を有する、ペプチド二量体。
  6. ペプチド単量体のアミノ酸配列が、以下の群:
    Pro Ile Leu Cys Gly Ala Gln Tyr Arg(配列番号:3)、
    Thr Gly Val Lys Pro Phe Gln Cys Lys(配列番号:7)、
    Lys Thr Cys Gln Arg Lys Phe Ser Arg(配列番号:8)、
    Ser Cys Arg Trp Pro Ser Cys Gln Lys(配列番号:9)、
    からなる群より選択される、請求項5記載のペプチド二量体。
  7. 請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体を含む、癌を治療または予防するための医薬組成物。
  8. 有効量の請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体をHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法。
  9. 請求項1記載のペプチドをコードするポリヌクレオチド。
  10. 請求項9記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
  11. 請求項9記載のポリヌクレオチドまたは請求項10記載のベクターを含む、癌を治療または予防するための医薬組成物。
  12. 有効量の請求項9記載のポリヌクレオチドまたは請求項10記載のベクターをHLA−A1101陽性対象に投与することを特徴とする、癌を治療または予防するための方法。
  13. 請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体により誘導される、WT1特異的CTL。
  14. 末梢血単核球を請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体の存在下で培養し、該末梢血単核球からWT1特異的CTLを誘導することを特徴とする、WT1特異的CTLの誘導方法。
  15. 請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体を必須構成成分として含む、WT1特異的CTLを誘導するためのキット。
  16. 請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体により誘導される、WT1ペプチドを提示する抗原提示細胞。
  17. 未熟抗原提示細胞を請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体の存在下で培養し、該未熟抗原提示細胞からWT1ペプチドを提示する抗原提示細胞を誘導することを特徴とする、WT1ペプチドを提示する抗原提示細胞の誘導方法。
  18. 請求項1記載のペプチドおよび/または請求項5記載のペプチド二量体を必須構成成分として含む、WT1ペプチドを提示する抗原提示細胞を誘導するためのキット。
  19. 請求項13記載のCTLまたは請求項16記載の抗原提示細胞を用いることを特徴とする、癌の診断方法。
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