JP2021512317A - スマート分子分析システムのワークフローにおける使用のための機器、デバイス、および消耗品 - Google Patents
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本出願は、2018年1月30日出願の米国特許法第119条(e)項に基づく米国仮出願第62/624,080号の利益を主張する。上述した出願の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
Claims (110)
- 分子分析を実行するためのシステムであって、
反応プレートRFIDタグを含む反応プレート、および/または、
試薬容器RFIDタグを含む試薬容器と、
前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが、前記分子分析のワークフローのための情報を蓄積、および/または共有することと、を含むシステム。 - 前記分子分析が、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)である、請求項1に記載のシステム。
- 前記PCRが、qPCR、epPCR、RT−PCR、およびPCRを伴うPLAからなる群から選択される、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応プレートが、少なくとも1つの反応場を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応プレートが、複数の反応場を含む、請求項4に記載のシステム。
- 各反応場が、第1の試薬を含み、前記第1の試薬が、異なる反応場で同じ、または異なる、請求項5に記載のシステム。
- 前記試薬容器が、第2の試薬を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応プレート、および/または前記試薬容器が、温度センサーをさらに含み、前記温度センサーが、前記反応プレートRFID、および/または前記試薬容器RFIDタグに連結され、前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが各々、それぞれ前記反応プレート、および/または前記試薬容器のための温度履歴を蓄積することが可能である、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応プレート、および/または前記試薬容器が、光センサーをさらに含み、前記光センサーが、前記反応プレートRFID、および/または前記試薬容器RFIDタグに連結され、前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが各々、それぞれ前記反応プレート、および/または前記試薬容器のための露光履歴を蓄積することが可能である、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応プレート、および/または前記試薬容器が、動きセンサーをさらに含み、前記動きセンサーが、前記反応プレートRFID、および/または前記試薬容器RFIDタグに連結され、前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが各々、それぞれ前記反応プレート、および/または前記試薬容器のための動き検出履歴を蓄積することが可能である、請求項1に記載のシステム。
- さらに、
各反応場が、第1の試薬を含むことと、
前記反応プレートRFIDタグが、各反応場、および各反応場によって含まれている対応する前記第1の試薬の識別子を含むことと、を含む、請求項5に記載のシステム。 - 前記第1の試薬が、少なくとも1つのプライマー、および/または少なくとも1つのプローブを含む、請求項6に記載のシステム。
- 各反応場の前記第1の試薬中の前記少なくとも1つのプライマー、および/または前記少なくとも1つのプローブが、同じ、または異なる、請求項12に記載のシステム。
- 前記試薬容器が、第2の試薬を含む、請求項6に記載のシステム。
- さらに、
前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレートの特性に関するデータをコード化すること、および/または、
前記試薬容器RFIDタグが、前記試薬容器の特性に関するデータをコード化することを含む、請求項1に記載のシステム。 - さらに、
前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグから前記ワークフローのための前記情報を読み取るように動作可能であるRFIDリーダーを含む機器を含む、請求項1に記載のシステム。 - 前記機器が、前記反応プレートのための分析プロトコルを含む、前記分子分析のためのワークフローのための情報をダウンロードするように、ネットワークサーバーシステム、および/またはクラウドネットワークにアクセスするように動作可能であるロジックを含み、かつ/または前記機器が、前記ワークフローのための前記情報に基づいて、前記分子分析のための視覚的、および/または口頭でのガイドを提供するように動作可能であるロジックを含む、請求項16に記載のシステム。
- 前記分析プロトコルが、前記反応プレートへの液体移送のための命令を含む、請求項17に記載のシステム。
- 前記機器が、RFIDライターと、前記反応プレートへの液体移送の前記反応プレートRFIDタグ上の記録を記録するように、および/または前記試薬容器からの前記液体移送の前記試薬容器RFIDタグ上の記録を記録するように、前記RFIDライター上で動作可能であるロジックとをさらに含む、請求項16に記載のシステム。
- 前記記録が、前記液体移送の反応容量を含む、請求項19に記載のシステム。
- 前記機器が、前記液体移送が適用されている、前記反応プレートの反応場を記録するように、前記RFIDライター上で動作可能であるロジックをさらに含む、請求項19に記載のシステム。
- 前記機器が、前記液体移送が前記反応プレートに、および/または前記試薬容器から適用されている日付、および/または時間を記録するように前記RFIDライター上で動作可能であるロジックをさらに含む、請求項19に記載のシステム。
- さらに、
前記機器が、前記反応プレート上の第1の試薬を前記試薬容器によって蓄積されている第2の試薬と混合するための命令を提供するように、前記反応プレートRFIDタグおよび前記試薬容器RFIDタグによって蓄積されている情報を適用するように動作可能であるロジックを含むことを含む、請求項16に記載のシステム。 - 前記命令が、前記第1の試薬を含む前記反応プレート上の前記反応場と、前記第2の試薬を前記反応場に適用するための液体移送命令とを含む、請求項23に記載のシステム。
- 前記液体移送命令が、前記第2の試薬の反応容量を含む、請求項24に記載のシステム。
- 前記機器が、前記ワークフローの分析プロトコルのために、前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグを読み取るように動作可能であるロジックを含む、請求項16に記載のシステム。
- 前記分析プロトコルが、試薬を前記反応プレートに、および/または前記試薬容器から適用するための液体移送命令を含む、請求項26に記載のシステム。
- 前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレート上の反応場に含まれている第1の試薬の識別子を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応場に含まれている前記第1の試薬が、少なくとも1つのプライマー対を含む、請求項12に記載のシステム。
- 前記反応場に含まれている前記第1の試薬が、少なくとも1つのプローブを含み、前記プローブが、蛍光体部分および消光剤部分を含む、任意選択的に5´ヌクレアーゼプローブである、請求項12に記載のシステム。
- 前記反応プレートRFIDタグが、前記分子分析の前記ワークフローにおける次の反応プレートの識別子を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応プレートが、前記反応プレートRFIDタグに連結されている温度センサーをさらに含み、前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレートの温度履歴を蓄積する、請求項1に記載のシステム。
- 前記反応プレートが、前記反応プレートRFIDタグに連結されている光センサーをさらに含み、前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレートの露光履歴を蓄積する、請求項1に記載のシステム。
- 前記第1の試薬が、ドライスポットされている、請求項6に記載のシステム。
- 前記第1の試薬が、事前にスポットされている、請求項6に記載のシステム。
- 分子分析を実行するためのシステムであって、
第1の試薬を含んでいる少なくとも1つの反応場を含む反応プレートと、
前記反応プレートが、反応プレートRFIDタグを含むことと、
前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレートの特性に関するデータをコード化することと、
前記反応プレートRFIDタグを読み取って前記反応プレートの前記特性を取得するように動作可能であるRFIDリーダーを含む機器と、
前記機器が、前記分子分析のためのワークフローで第2の試薬と相互作用するために、前記反応プレートの前記特性を適用するように動作可能であるロジックを含むことと、を含むシステム。 - さらに、
第2の試薬および試薬容器RFIDタグを含む少なくとも1つの試薬容器と、
前記試薬容器RFIDタグが、前記第2の試薬の特性に関するデータをコード化することと、を含む、請求項36に記載のシステム。 - 前記反応プレートが、(i)前記反応プレートRFIDタグに連結されている光センサーであって、前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレートのための露光履歴を蓄積する、光センサー、(ii)前記反応プレートRFIDタグに連結されている温度センサーであって、前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレートのための温度履歴を蓄積する、温度センサー、および(iii)前記反応プレートRFIDタグに連結されている動きセンサーであって、前記反応プレートRFIDタグが、前記反応プレートのための動き検出履歴を蓄積する、動きセンサー、から選択される1つ以上をさらに含む、請求項36に記載のシステム。
- 前記試薬容器(複数可)が、(i)前記試薬容器(複数可)RFIDタグ(複数可)に連結されている光センサーであって、前記試薬容器(複数可)RFIDタグ(複数可)が、前記試薬容器(複数可)のための露光履歴を蓄積する、光センサー、(ii)前記試薬容器(複数可)RFIDタグ(複数可)に連結されている温度センサーであって、前記試薬容器(複数可)RFIDタグ(複数可)が、前記試薬容器(複数可)の温度履歴を蓄積する、温度センサー、および(iii)前記試薬容器(複数可)RFIDタグ(複数可)に連結されている動きセンサーであって、前記試薬容器(複数可)RFIDタグ(複数可)が、前記試薬容器のための動き検出履歴を蓄積する、動きセンサー、から選択される1つ以上をさらに含む、請求項37に記載のシステム。
- 前記第2の試薬の前記特性が、前記第2の試薬のための有効期限を含む、請求項37に記載のシステム。
- さらに、
前記機器が、前記試薬容器RFIDタグから前記第2の試薬の前記特性を読み取るように動作可能であるロジックを含むことと、
前記機器が、前記分子分析のための前記ワークフローにおいて前記第2の試薬を前記第1の試薬に適用するための命令を提供するように、前記第2の試薬の前記特性および前記反応プレートの前記特性を適用するように動作可能であるロジックを含むことと、を含む、請求項37に記載のシステム。 - 前記反応プレート上の前記第1の試薬を含む前記反応場を識別する前記命令、および/または前記反応場への前記第2の試薬の移送するための命令、請求項41に記載のシステム。
- 前記移送命令が、前記第2の試薬の反応容量を含む、請求項42に記載のシステム。
- 前記反応プレートの前記特性が、前記反応場における前記第1の試薬の識別子を含む、請求項36に記載のシステム。
- 前記第1の試薬が、少なくとも1つのプライマー対を含む、請求項36に記載のシステム。
- 前記第1の試薬が、少なくとも1つのプローブを含む、請求項36に記載のシステム。
- 前記反応プレートの前記特性が、前記各反応場および前記各反応場によって含まれている対応する第1の試薬を識別する、請求項36に記載のシステム。
- 前記反応場の各々の前記第1の試薬が、ドライスポット試薬である、請求項36に記載のシステム。
- 前記反応プレートの前記特性が、前記分子分析のための前記ワークフローにおける次の反応プレートの識別子を含む、請求項36に記載のシステム。
- 前記機器が、RFIDライターと、前記反応プレートへの前記第2の試薬の液体移送の前記反応プレートRFIDタグ上の記録を記録するように、前記RFIDライター上で動作可能であるロジックとを含む、請求項37に記載のシステム。
- 前記記録が、前記反応プレートに適用されている前記第2の試薬の反応容量を含む、請求項50に記載のシステム。
- 前記機器が、前記第2の試薬が適用されている、前記第2の試薬の識別子および前記反応プレートの別個の反応場を記録するように、前記RFIDライター上で動作可能であるロジックを含む、請求項50に記載のシステム。
- 前記機器が、前記第2の試薬が前記反応プレートに適用されている、日付および/または時刻を記録するように、前記RFIDライター上で動作可能であるロジックを含む、請求項50に記載のシステム。
- 前記機器が、前記分子分析のための前記ワークフローをダウンロードするように、ネットワークサーバーシステムにアクセスするように動作可能であるロジックをさらに含み、前記ワークフローが、前記反応プレートのための分析プロトコルを含む、請求項36に記載のシステム。
- 前記分析プロトコルが、前記反応プレートへの前記第2の試薬の液体移送のための命令を含む、請求項54に記載のシステム。
- 前記機器が、前記反応プレートからプロトコルのための前記反応プレートの前記特性を読み取るように動作可能であるロジックをさらに含む、請求項36に記載のシステム。
- 前記プロトコルが、前記反応プレートへの前記第2の試薬の液体移送のための命令を含む、請求項56に記載のシステム。
- 分子分析を実行するための方法であって、
反応プレート上の反応プレートRFIDタグを読み取ること、および/または、
試薬容器上の試薬容器RFIDタグを読み取ることと、
前記分子分析のためのワークフローを実施するように、前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグから読み取った情報を適用することと、を含む方法。 - さらに、
前記反応プレートRFIDタグから第1の試薬および前記第1の試薬のための反応場の識別子を読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
前記試薬容器RFIDタグから第2の試薬の識別子を読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
前記反応プレートのための温度履歴、前記反応プレートのための露光履歴、および/または前記反応プレートのための動き検出履歴を、前記反応プレートのRFIDタグから読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
前記試薬容器のための温度履歴、前記試薬容器のための露光履歴、および/または前記試薬容器のための動き検出履歴を、前記試薬容器RFIDタグから読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
前記反応プレート上の複数の反応場および前記各反応場のための対応する第1の試薬の識別子を、前記反応プレートRFIDタグから読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
前記試薬容器よって蓄積されている第2の試薬のための有効期限を、前記試薬容器RFIDタグから読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
前記反応プレートの特性に関するデータを、前記反応プレートRFIDタグから読み取ること、および/または、
前記第2の試薬の特性に関するデータを、前記試薬容器RFIDタグから読み取ることを含む、請求項60に記載の方法。 - さらに、
前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグから前記ワークフローのための情報を読み取ること、および/または、
前記情報に基づいて、前記ワークフローのための視覚的、および/または口頭でのガイドを提供することを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
ネットワークサーバーシステムから前記分子分析の前記ワークフローをダウンロードすることであって、前記ワークフローが、前記反応プレートのための分析プロトコルを含む、ダウンロードすることを含む、請求項58に記載の方法。 - 前記分析プロトコルが、液体試薬のための命令、および/または前記反応プレートへの1つ以上の試薬の試料移送を含む、請求項67に記載の方法。
- さらに、
液体、試薬、および/または前記反応プレートへの試料移送の前記反応プレートRFIDタグ上に記録を記録するように、RFIDライターを操作することを含む、請求項58に記載の方法。 - 前記記録が、前記液体移送の反応容量を含む、請求項69に記載の方法。
- さらに、
前記液体試薬、および/または試料移送が適用されている、前記反応プレートの反応場の識別子を記録するように、前記RFIDライターを操作することを含む、請求項69に記載の方法。 - さらに、
前記液体、試薬、および/または試料の移送が前記反応プレートに適用されている、日付、および/または時刻を記録するように、前記RFIDライターを操作することを含む、請求項69に記載の方法。 - さらに、
前記分子分析のための前記ワークフローにおける第1の試薬と第2の試薬を混合するための命令に、前記反応プレートRFIDタグおよび前記試薬容器RFIDタグによって蓄積されている前記情報を適用することを含む、請求項59に記載の方法。 - 前記命令が、前記第1の試薬を含む前記反応プレート上の反応場、および液体試薬のための命令、および/または前記反応場への前記第2の試薬の試料移送を含む、請求項68に記載の方法。
- 前記命令が、前記第2の試薬の反応容量を含む、請求項74に記載の方法。
- さらに、
前記ワークフローのための分析プロトコルのための前記反応プレートRFIDタグを読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - 前記分析プロトコルが、前記反応プレートへの1つ以上の試薬の液体移送のための命令を含む、請求項76に記載の方法。
- さらに、
前記反応プレート上の反応場に含まれている試薬の識別子のために、前記反応プレートRFIDタグを読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
少なくとも1つのプライマー対の識別子のために、前記反応プレートRFIDタグを読み取ることを含む、請求項78に記載の方法。 - さらに、
少なくとも1つのプローブの識別子のために、前記反応プレートRFIDタグを読み取ることを含む、請求項78に記載の方法。 - さらに、
前記分子分析のための前記ワークフローにおける次の反応プレートの識別子のために、前記反応プレートRFIDタグを読み取ることを含む、請求項58に記載の方法。 - さらに、
前記反応プレートRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグ(複数可)に、前記反応プレート、前記試薬容器、前記第1の試薬、前記第2の試薬、および/または前記分子分析についての情報を書き込むことを含む、請求項59に記載の方法。 - 分子分析ワークフローを実行するためのスマート消耗品であって、前記スマート消耗品が、
反応ホルダーRFIDタグを含む反応ホルダーであって、前記反応ホルダーRFIDタグが、前記分子分析のためのワークフローに関する情報を送信および受信し、かつ/または蓄積する、反応ホルダー、および/または、
試薬容器RFIDタグを含む試薬容器であって、前記試薬容器RFIDタグが、前記分子分析のための前記ワークフローに関する情報を送信および受信し、かつ/または蓄積する、試薬容器、のうちの少なくとも1つを含むスマート消耗品。 - 前記反応ホルダーが、複数の反応場を含み、前記複数の反応場の1つ以上が、第1の試薬を含み、前記第1の試薬が、前記同じ反応ホルダー上の異なる反応場で、同じまたは異なる、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグが、各反応場の識別子、および各反応場のための対応する第1の試薬を含む、請求項84に記載のスマート消耗品。
- 前記第1の試薬が、ドライスポットされている、請求項84に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグが、前記反応ホルダーの特性に関するデータを蓄積し、および/または前記試薬容器RFIDタグが、前記試薬容器内の試薬の特性に関するデータを蓄積する、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが、前記ワークフローのための視覚的、および/または口頭でのガイドを提供するように、情報を蓄積する、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグが、前記反応ホルダーに適用されている試薬の記録を蓄積する、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記記録が、前記反応ホルダーに適用されている前記試薬の反応容量を含む、請求項89に記載のスマート消耗品。
- 前記記録が、前記試薬が適用されている前記反応ホルダーの前記反応場の識別子を含む、請求項89に記載のスマート消耗品。
- 前記記録が、前記試薬が前記反応ホルダーに適用されている、日付および/または時刻を含む、請求項89に記載のスマート消耗品。
- 前記記録が、前記分子分析のための前記ワークフローにおける第1の試薬と第2の試薬との相互作用を含む、請求項89に記載のスマート消耗品。
- 前記相互作用が、前記第1の試薬を含む前記反応ホルダー上の別個の反応場、および前記別個の反応場への前記第2の試薬の液体移送のための命令を含む、請求項93に記載のスマート消耗品。
- 前記液体移送命令が、前記第2の試薬の反応容量を含む、請求項94に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが、前記ワークフローのための分析プロトコルを蓄積する、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記分析プロトコルが、前記反応ホルダーへの1つ以上の試薬の液体移送のための命令を含む、請求項96に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグが、前記反応ホルダー上の反応場に含まれている試薬の識別子を蓄積する、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記反応場に含まれている前記試薬が、少なくとも1つのプライマー対を含む、請求項98に記載のスマート消耗品。
- 前記反応場に含まれている前記試薬が、少なくとも1つのプローブを含む、請求項98に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが、前記分子分析のための前記ワークフローにおいて使用されている、次の反応ホルダー、および/または試薬容器の識別子を蓄積する、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーが、前記反応ホルダーRFIDタグに連結されている温度センサーであって、前記反応ホルダーRFIDタグが、前記反応ホルダーのための温度履歴を蓄積する、温度センサーと、前記反応ホルダーRFIDタグに連結されている光センサーであって、前記反応ホルダーRFIDタグが、前記反応ホルダーのための露光履歴を蓄積する、光センサー、および/または、前記反応ホルダーRFIDタグに連結されている動きセンサーであって、前記反応ホルダーRFIDタグが、前記試薬容器のための動き検出履歴を蓄積する、動きセンサー、をさらに含む、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記試薬容器が、前記試薬容器RFIDタグに連結されている温度センサーであって、前記試薬容器RFIDタグが前記試薬容器のための温度履歴を蓄積する、温度センサーと、前記試薬容器RFIDタグに連結されている光センサーであって、前記試薬容器RFIDタグが、前記試薬容器のための露光履歴を蓄積する、光センサー、および/または、前記試薬容器RFIDタグに連結されている動きセンサーであって、前記試薬容器RFIDタグが、前記反応ホルダーのための動き検出履歴を蓄積する、動きセンサー、をさらに含む、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記スマート消耗品が、バーコードをさらに含む、請求項180に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダー、および/または前記試薬容器の特性に関するデータが、
ID番号と、
有効期限と、
部品番号と、
バーコードと、
ロット番号と、
部品タイプと、
蓄積温度、および/または蓄積温度範囲と、
試薬濃度と、
前記ワークフローにおいて使用する推奨試薬濃度、および/または容量と、
液体移送サポートのための規定と、
受注番号と、
試薬名と、
アッセイ名と、
前記反応ホルダー上で使用されている試薬のためのアッセイ位置と、
アッセイIDと、
前記分子分析のための推奨または必要なプロトコルと、
試料名と、
マスターミックス名と、
インターネットリンクまたはアドレス(url)と、
反応、および/または試薬容量と、
テスト試料名と、
前記分子分析のための分析設定と、
試料タイプと、
分子分析タイプと、
機器実行プロトコルと、のうちの1つ以上を含む、請求項87に記載のスマート消耗品。 - 前記反応ホルダー、および/または前記試薬容器の特性に関するデータが、前記反応ホルダーRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグに書き換えられることができる、請求項87に記載のスマート消耗品。
- 前記温度センサー、前記光センサー、およびまたは前記動きセンサーが、前記反応ホルダーRFIDタグに、直接的または間接的に連結されている、請求項102に記載のスマート消耗品。
- 前記温度センサー、前記光センサー、およびまたは前記動きセンサーが、前記試薬容器RFIDタグに、直接的または間接的に連結されている、請求項103に記載のスマート消耗品。
- 前記反応ホルダーRFIDタグ、および/または前記試薬容器RFIDタグが、少なくとも8キロバイトの情報を蓄積する収容能力を有する、請求項83に記載のスマート消耗品。
- 前記複数の反応場が、少なくとも96の反応場、少なくとも384の反応場、少なくとも1536の反応場、少なくとも3072の反応場、または少なくとも12,288の反応場を含む、請求項84に記載のスマート消耗品。
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