HU224055B1 - Eljárás aszparaginsav és/vagy glutaminsav családba tartozó aminosavak mikrobiális termeltetésére, és hatóanyagok az eljárásban történő alkalmazásra - Google Patents
Eljárás aszparaginsav és/vagy glutaminsav családba tartozó aminosavak mikrobiális termeltetésére, és hatóanyagok az eljárásban történő alkalmazásra Download PDFInfo
- Publication number
- HU224055B1 HU224055B1 HU0004381A HUP0004381A HU224055B1 HU 224055 B1 HU224055 B1 HU 224055B1 HU 0004381 A HU0004381 A HU 0004381A HU P0004381 A HUP0004381 A HU P0004381A HU 224055 B1 HU224055 B1 HU 224055B1
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- gene
- pyruvate carboxylase
- amino acid
- carboxylase gene
- leu
- Prior art date
Links
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 57
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 33
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 title claims abstract description 31
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims abstract description 26
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 title claims abstract description 5
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 title abstract description 35
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 title description 10
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 title description 2
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 title 1
- 229930195712 glutamate Natural products 0.000 title 1
- 108010053763 Pyruvate Carboxylase Proteins 0.000 claims abstract description 83
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 53
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims abstract description 49
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 claims abstract description 36
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 29
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims abstract description 26
- 102100039895 Pyruvate carboxylase, mitochondrial Human genes 0.000 claims abstract description 21
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims abstract description 19
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 18
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims abstract description 16
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims abstract description 14
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims abstract description 14
- UKAUYVFTDYCKQA-VKHMYHEASA-N L-homoserine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCO UKAUYVFTDYCKQA-VKHMYHEASA-N 0.000 claims abstract description 12
- UKAUYVFTDYCKQA-UHFFFAOYSA-N -2-Amino-4-hydroxybutanoic acid Natural products OC(=O)C(N)CCO UKAUYVFTDYCKQA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 9
- CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N Aspartic acid Chemical compound OC(=O)C(N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 8
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 claims abstract description 8
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 8
- 230000008569 process Effects 0.000 claims abstract description 8
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 21
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 21
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 19
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 17
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 14
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 14
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 14
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 14
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 13
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims description 13
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 claims description 11
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 9
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 7
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 claims description 7
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 5
- 230000019525 primary metabolic process Effects 0.000 claims description 5
- 230000002074 deregulated effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 claims description 3
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 claims description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 3
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 claims description 2
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 claims description 2
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 claims description 2
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 claims description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 claims description 2
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 claims 1
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 abstract description 15
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 abstract description 15
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N L-arginine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N 0.000 abstract description 10
- WPLOVIFNBMNBPD-ATHMIXSHSA-N subtilin Chemical compound CC1SCC(NC2=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NC(=C)C(=O)NC(CCCCN)C(O)=O)CSC(C)C2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C1NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C1NC(=O)C(=C/C)/NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)CNC(=O)C(NC(=O)C(NC(=O)C2NC(=O)CNC(=O)C3CCCN3C(=O)C(NC(=O)C3NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(=C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CCCCN)NC(=O)C(N)CC=4C5=CC=CC=C5NC=4)CSC3)C(C)SC2)C(C)C)C(C)SC1)CC1=CC=CC=C1 WPLOVIFNBMNBPD-ATHMIXSHSA-N 0.000 abstract description 4
- 229930064664 L-arginine Natural products 0.000 abstract description 3
- 235000014852 L-arginine Nutrition 0.000 abstract description 3
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 abstract description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 29
- 241000186226 Corynebacterium glutamicum Species 0.000 description 25
- 101150096049 pyc gene Proteins 0.000 description 22
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 17
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 13
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 11
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 10
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 10
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 10
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 10
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 10
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 10
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 9
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 8
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 7
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 7
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 6
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 6
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M Lactate Chemical compound CC(O)C([O-])=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 5
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 5
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 5
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000019766 L-Lysine Nutrition 0.000 description 4
- 108091000041 Phosphoenolpyruvate Carboxylase Proteins 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 description 4
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 4
- KHPXUQMNIQBQEV-UHFFFAOYSA-N oxaloacetic acid Chemical compound OC(=O)CC(=O)C(O)=O KHPXUQMNIQBQEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 4
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 4
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 4
- 108010054576 Deoxyribonuclease EcoRI Proteins 0.000 description 3
- SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N Digoxigenin Natural products C1CC(C2C(C3(C)CCC(O)CC3CC2)CC2O)(O)C2(C)C1C1=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 108700005075 Regulator Genes Proteins 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 3
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 3
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 3
- QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N digitoxigenin Natural products CC12CCC(C3(CCC(O)CC3CC3)C)C3C11OC1CC2C1=CC(=O)OC1 QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N digoxigenin Chemical compound C1([C@@H]2[C@@]3([C@@](CC2)(O)[C@H]2[C@@H]([C@@]4(C)CC[C@H](O)C[C@H]4CC2)C[C@H]3O)C)=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N 0.000 description 3
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 3
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 3
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 3
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 description 3
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 2
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- ATVYZJGOZLVXDK-IUCAKERBSA-N Glu-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O ATVYZJGOZLVXDK-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N Gly-Asp-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- IDAHFEPYTJJZFD-PEFMBERDSA-N Ile-Asp-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N IDAHFEPYTJJZFD-PEFMBERDSA-N 0.000 description 2
- NSPNUMNLZNOPAQ-SJWGOKEGSA-N Ile-Tyr-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N NSPNUMNLZNOPAQ-SJWGOKEGSA-N 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N L-Aspartic acid Natural products OC(=O)[C@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N 0.000 description 2
- 229930182844 L-isoleucine Natural products 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N Lys-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 description 2
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N Pro-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N acetyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N 0.000 description 2
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 2
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 2
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 2
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 2
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 108010020755 prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 230000008844 regulatory mechanism Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 238000009281 ultraviolet germicidal irradiation Methods 0.000 description 2
- QMOQBVOBWVNSNO-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[(2-azaniumylacetyl)amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetate Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O QMOQBVOBWVNSNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000256118 Aedes aegypti Species 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N Arg-Arg-Glu Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JGDGLDNAQJJGJI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JGDGLDNAQJJGJI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IIABBYGHLYWVOS-FXQIFTODSA-N Arg-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O IIABBYGHLYWVOS-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XVLLUZMFSAYKJV-GUBZILKMSA-N Arg-Asp-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XVLLUZMFSAYKJV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- RCAUJZASOAFTAJ-FXQIFTODSA-N Arg-Asp-Cys Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)CN=C(N)N RCAUJZASOAFTAJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N Arg-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- YSUVMPICYVWRBX-VEVYYDQMSA-N Arg-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O YSUVMPICYVWRBX-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- PNQWAUXQDBIJDY-GUBZILKMSA-N Arg-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PNQWAUXQDBIJDY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- SKTGPBFTMNLIHQ-KKUMJFAQSA-N Arg-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SKTGPBFTMNLIHQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- OOIMKQRCPJBGPD-XUXIUFHCSA-N Arg-Ile-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OOIMKQRCPJBGPD-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- GSUFZRURORXYTM-STQMWFEESA-N Arg-Phe-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 GSUFZRURORXYTM-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- OVQJAKFLFTZDNC-GUBZILKMSA-N Arg-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OVQJAKFLFTZDNC-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- AWMAZIIEFPFHCP-RCWTZXSCSA-N Arg-Pro-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AWMAZIIEFPFHCP-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- ISJWBVIYRBAXEB-CIUDSAMLSA-N Arg-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ISJWBVIYRBAXEB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ZJBUILVYSXQNSW-YTWAJWBKSA-N Arg-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O ZJBUILVYSXQNSW-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 1
- ISVACHFCVRKIDG-SRVKXCTJSA-N Arg-Val-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O ISVACHFCVRKIDG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NPDLYUOYAGBHFB-WDSKDSINSA-N Asn-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N NPDLYUOYAGBHFB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N Asn-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N Asn-Gly-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N Asn-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- VCJCPARXDBEGNE-GUBZILKMSA-N Asn-Pro-Pro Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 VCJCPARXDBEGNE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- AXXCUABIFZPKPM-BQBZGAKWSA-N Asp-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O AXXCUABIFZPKPM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HMQDRBKQMLRCCG-GMOBBJLQSA-N Asp-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HMQDRBKQMLRCCG-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- MRQQMVZUHXUPEV-IHRRRGAJSA-N Asp-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O MRQQMVZUHXUPEV-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- WCFCYFDBMNFSPA-ACZMJKKPSA-N Asp-Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O WCFCYFDBMNFSPA-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- QXHVOUSPVAWEMX-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QXHVOUSPVAWEMX-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N Asp-Glu-Lys Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- PZXPWHFYZXTFBI-YUMQZZPRSA-N Asp-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PZXPWHFYZXTFBI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UBPMOJLRVMGTOQ-GARJFASQSA-N Asp-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O UBPMOJLRVMGTOQ-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- IVPNEDNYYYFAGI-GARJFASQSA-N Asp-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N IVPNEDNYYYFAGI-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- ORRJQLIATJDMQM-HJGDQZAQSA-N Asp-Leu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O ORRJQLIATJDMQM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N Asp-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N Asp-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C(O)=O HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- GWIJZUVQVDJHDI-AVGNSLFASA-N Asp-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GWIJZUVQVDJHDI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N Asp-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- BWJZSLQJNBSUPM-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BWJZSLQJNBSUPM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SXLCDCZHNCLFGZ-BPUTZDHNSA-N Asp-Pro-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O SXLCDCZHNCLFGZ-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N Asp-Val-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- 102100021277 Beta-secretase 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710150190 Beta-secretase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101100512078 Caenorhabditis elegans lys-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100505161 Caenorhabditis elegans mel-32 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100246536 Caenorhabditis elegans pyc-1 gene Proteins 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108091028732 Concatemer Proteins 0.000 description 1
- 241000671338 Corynebacterium glutamicum R Species 0.000 description 1
- RGTVXXNMOGHRAY-WDSKDSINSA-N Cys-Arg Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N RGTVXXNMOGHRAY-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- LHLSSZYQFUNWRZ-NAKRPEOUSA-N Cys-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LHLSSZYQFUNWRZ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- GEEXORWTBTUOHC-FXQIFTODSA-N Cys-Arg-Ser Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)CN=C(N)N GEEXORWTBTUOHC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 108020003215 DNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- CKRUHITYRFNUKW-WDSKDSINSA-N Glu-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O CKRUHITYRFNUKW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- NTBDVNJIWCKURJ-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NTBDVNJIWCKURJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- YLJHCWNDBKKOEB-IHRRRGAJSA-N Glu-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O YLJHCWNDBKKOEB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N Glu-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- PXXGVUVQWQGGIG-YUMQZZPRSA-N Glu-Gly-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PXXGVUVQWQGGIG-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ZSWGJYOZWBHROQ-RWRJDSDZSA-N Glu-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZSWGJYOZWBHROQ-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- INGJLBQKTRJLFO-UKJIMTQDSA-N Glu-Ile-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O INGJLBQKTRJLFO-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 1
- VGBSZQSKQRMLHD-MNXVOIDGSA-N Glu-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O VGBSZQSKQRMLHD-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- NPMSEUWUMOSEFM-CIUDSAMLSA-N Glu-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N NPMSEUWUMOSEFM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N Glu-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N Glu-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- RFTVTKBHDXCEEX-WDSKDSINSA-N Glu-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RFTVTKBHDXCEEX-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N Glu-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- VIPDPMHGICREIS-GVXVVHGQSA-N Glu-Val-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VIPDPMHGICREIS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N Gly-Ala-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC([O-])=O UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- XUDLUKYPXQDCRX-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Asn Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XUDLUKYPXQDCRX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N Gly-Arg-Pro Natural products NCC(=O)NC(CCNC(=N)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DUYYPIRFTLOAJQ-YUMQZZPRSA-N Gly-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)CN DUYYPIRFTLOAJQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- LLXVQPKEQQCISF-YUMQZZPRSA-N Gly-Asp-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)CN LLXVQPKEQQCISF-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- MHHUEAIBJZWDBH-YUMQZZPRSA-N Gly-Asp-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)CN MHHUEAIBJZWDBH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- STVHDEHTKFXBJQ-LAEOZQHASA-N Gly-Glu-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O STVHDEHTKFXBJQ-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- UPADCCSMVOQAGF-LBPRGKRZSA-N Gly-Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)CNC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 UPADCCSMVOQAGF-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- BBTCXWTXOXUNFX-IUCAKERBSA-N Gly-Met-Arg Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O BBTCXWTXOXUNFX-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ABPRMMYHROQBLY-NKWVEPMBSA-N Gly-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN)C(=O)O ABPRMMYHROQBLY-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 1
- TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N Gly-Thr-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 1
- HQSKKSLNLSTONK-JTQLQIEISA-N Gly-Tyr-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 HQSKKSLNLSTONK-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N Gly-Val-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- DNVDEMWIYLVIQU-RCOVLWMOSA-N Gly-Val-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O DNVDEMWIYLVIQU-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZPVJJPAIUZLSNE-DCAQKATOSA-N His-Arg-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZPVJJPAIUZLSNE-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HQKADFMLECZIQJ-HVTMNAMFSA-N His-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N HQKADFMLECZIQJ-HVTMNAMFSA-N 0.000 description 1
- LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N His-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- IDXZDKMBEXLFMB-HGNGGELXSA-N His-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 IDXZDKMBEXLFMB-HGNGGELXSA-N 0.000 description 1
- LBQAHBIVXQSBIR-HVTMNAMFSA-N His-Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N LBQAHBIVXQSBIR-HVTMNAMFSA-N 0.000 description 1
- VFBZWZXKCVBTJR-SRVKXCTJSA-N His-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N VFBZWZXKCVBTJR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RLAOTFTXBFQJDV-KKUMJFAQSA-N His-Phe-Asp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)C1=CN=CN1 RLAOTFTXBFQJDV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- FCPSGEVYIVXPPO-QTKMDUPCSA-N His-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FCPSGEVYIVXPPO-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- IXQGOKWTQPCIQM-YJRXYDGGSA-N His-Thr-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)O IXQGOKWTQPCIQM-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 1
- 101001078093 Homo sapiens Reticulocalbin-1 Proteins 0.000 description 1
- WECYRWOMWSCWNX-XUXIUFHCSA-N Ile-Arg-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WECYRWOMWSCWNX-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- DMHGKBGOUAJRHU-RVMXOQNASA-N Ile-Arg-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N DMHGKBGOUAJRHU-RVMXOQNASA-N 0.000 description 1
- DMHGKBGOUAJRHU-UHFFFAOYSA-N Ile-Arg-Pro Natural products CCC(C)C(N)C(=O)NC(CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCCC1C(O)=O DMHGKBGOUAJRHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QSPLUJGYOPZINY-ZPFDUUQYSA-N Ile-Asp-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N QSPLUJGYOPZINY-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- KTGFOCFYOZQVRJ-ZKWXMUAHSA-N Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O KTGFOCFYOZQVRJ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- DFFTXLCCDFYRKD-MBLNEYKQSA-N Ile-Gly-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N DFFTXLCCDFYRKD-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- UAQSZXGJGLHMNV-XEGUGMAKSA-N Ile-Gly-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N UAQSZXGJGLHMNV-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- YNMQUIVKEFRCPH-QSFUFRPTSA-N Ile-Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)O)N YNMQUIVKEFRCPH-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- RMNMUUCYTMLWNA-ZPFDUUQYSA-N Ile-Lys-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N RMNMUUCYTMLWNA-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- XQLGNKLSPYCRMZ-HJWJTTGWSA-N Ile-Phe-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N XQLGNKLSPYCRMZ-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- OWSWUWDMSNXTNE-GMOBBJLQSA-N Ile-Pro-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N OWSWUWDMSNXTNE-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- ZNOBVZFCHNHKHA-KBIXCLLPSA-N Ile-Ser-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N ZNOBVZFCHNHKHA-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- NJGXXYLPDMMFJB-XUXIUFHCSA-N Ile-Val-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N NJGXXYLPDMMFJB-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-UHFFFAOYSA-N L-Methionine Natural products CSCCC(N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N L-arginyl-L-glutamic acid Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 229930195722 L-methionine Natural products 0.000 description 1
- 150000008547 L-phenylalanines Chemical class 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N Leu-Ala-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N Leu-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N Leu-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IGUOAYLTQJLPPD-DCAQKATOSA-N Leu-Asn-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IGUOAYLTQJLPPD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N Leu-Asp-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- MMEDVBWCMGRKKC-GARJFASQSA-N Leu-Asp-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N MMEDVBWCMGRKKC-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N Leu-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- IWTBYNQNAPECCS-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IWTBYNQNAPECCS-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N Leu-Glu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N Leu-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N Leu-Gly-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- CSFVADKICPDRRF-KKUMJFAQSA-N Leu-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)CC1=CN=CN1 CSFVADKICPDRRF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- VVQJGYPTIYOFBR-IHRRRGAJSA-N Leu-Lys-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N VVQJGYPTIYOFBR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N Leu-Lys-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- UHNQRAFSEBGZFZ-YESZJQIVSA-N Leu-Phe-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N UHNQRAFSEBGZFZ-YESZJQIVSA-N 0.000 description 1
- XXXXOVFBXRERQL-ULQDDVLXSA-N Leu-Pro-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XXXXOVFBXRERQL-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- KZZCOWMDDXDKSS-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KZZCOWMDDXDKSS-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N Leu-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VJGQRELPQWNURN-JYJNAYRXSA-N Leu-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VJGQRELPQWNURN-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 239000006142 Luria-Bertani Agar Substances 0.000 description 1
- IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- DRCILAJNUJKAHC-SRVKXCTJSA-N Lys-Glu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O DRCILAJNUJKAHC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UETQMSASAVBGJY-QWRGUYRKSA-N Lys-Gly-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 UETQMSASAVBGJY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- JZMGVXLDOQOKAH-UWVGGRQHSA-N Lys-Gly-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O JZMGVXLDOQOKAH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- QQPSCXKFDSORFT-IHRRRGAJSA-N Lys-Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QQPSCXKFDSORFT-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZCWWVXAXWUAEPZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Met-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZCWWVXAXWUAEPZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IPSDPDAOSAEWCN-RHYQMDGZSA-N Lys-Met-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IPSDPDAOSAEWCN-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- LOGFVTREOLYCPF-RHYQMDGZSA-N Lys-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCCN LOGFVTREOLYCPF-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- IEVXCWPVBYCJRZ-IXOXFDKPSA-N Lys-Thr-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IEVXCWPVBYCJRZ-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- BDFHWFUAQLIMJO-KXNHARMFSA-N Lys-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O BDFHWFUAQLIMJO-KXNHARMFSA-N 0.000 description 1
- RMKJOQSYLQQRFN-KKUMJFAQSA-N Lys-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RMKJOQSYLQQRFN-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- WDTLNWHPIPCMMP-AVGNSLFASA-N Met-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WDTLNWHPIPCMMP-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZAJNRWKGHWGPDQ-SDDRHHMPSA-N Met-Arg-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N ZAJNRWKGHWGPDQ-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- HZVXPUHLTZRQEL-UWVGGRQHSA-N Met-Leu-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O HZVXPUHLTZRQEL-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- MPCKIRSXNKACRF-GUBZILKMSA-N Met-Pro-Asn Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O MPCKIRSXNKACRF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- VHWOBXIWBDWZHK-IHRRRGAJSA-N Phe-Arg-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 VHWOBXIWBDWZHK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- JEBWZLWTRPZQRX-QWRGUYRKSA-N Phe-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O JEBWZLWTRPZQRX-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- MJQFZGOIVBDIMZ-WHOFXGATSA-N Phe-Ile-Gly Chemical compound N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)O MJQFZGOIVBDIMZ-WHOFXGATSA-N 0.000 description 1
- MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N Phe-Leu-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- INHMISZWLJZQGH-ULQDDVLXSA-N Phe-Leu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 INHMISZWLJZQGH-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- PEFJUUYFEGBXFA-BZSNNMDCSA-N Phe-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 PEFJUUYFEGBXFA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- GCFNFKNPCMBHNT-IRXDYDNUSA-N Phe-Tyr-Gly Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)NCC(=O)O)N GCFNFKNPCMBHNT-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- RGMLUHANLDVMPB-ULQDDVLXSA-N Phe-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N RGMLUHANLDVMPB-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- BNBBNGZZKQUWCD-IUCAKERBSA-N Pro-Arg-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 BNBBNGZZKQUWCD-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- GRIRJQGZZJVANI-CYDGBPFRSA-N Pro-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GRIRJQGZZJVANI-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- OBVCYFIHIIYIQF-CIUDSAMLSA-N Pro-Asn-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OBVCYFIHIIYIQF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ILMLVTGTUJPQFP-FXQIFTODSA-N Pro-Asp-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ILMLVTGTUJPQFP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XUSDDSLCRPUKLP-QXEWZRGKSA-N Pro-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 XUSDDSLCRPUKLP-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- FRKBNXCFJBPJOL-GUBZILKMSA-N Pro-Glu-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FRKBNXCFJBPJOL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LGSANCBHSMDFDY-GARJFASQSA-N Pro-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O LGSANCBHSMDFDY-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- FKYKZHOKDOPHSA-DCAQKATOSA-N Pro-Leu-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FKYKZHOKDOPHSA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N Pro-Leu-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N Pro-Thr-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N Pro-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 1
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M Pyruvate Chemical compound CC(=O)C([O-])=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100025335 Reticulocalbin-1 Human genes 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- YUSRGTQIPCJNHQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YUSRGTQIPCJNHQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CO VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HDBOEVPDIDDEPC-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HDBOEVPDIDDEPC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XNXRTQZTFVMJIJ-DCAQKATOSA-N Ser-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XNXRTQZTFVMJIJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PJIQEIFXZPCWOJ-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PJIQEIFXZPCWOJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N Ser-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- QNBVFKZSSRYNFX-CUJWVEQBSA-N Ser-Thr-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O QNBVFKZSSRYNFX-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- ZSDXEKUKQAKZFE-XAVMHZPKSA-N Ser-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O ZSDXEKUKQAKZFE-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 1
- 241000607715 Serratia marcescens Species 0.000 description 1
- CTONFVDJYCAMQM-IUKAMOBKSA-N Thr-Asn-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N CTONFVDJYCAMQM-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- BNGDYRRHRGOPHX-IFFSRLJSSA-N Thr-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O)C(O)=O BNGDYRRHRGOPHX-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- ZTPXSEUVYNNZRB-CDMKHQONSA-N Thr-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O ZTPXSEUVYNNZRB-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- KBBRNEDOYWMIJP-KYNKHSRBSA-N Thr-Gly-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N)O KBBRNEDOYWMIJP-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 1
- MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N Thr-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N Thr-Pro-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- KERCOYANYUPLHJ-XGEHTFHBSA-N Thr-Pro-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O KERCOYANYUPLHJ-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- IQPWNQRRAJHOKV-KATARQTJSA-N Thr-Ser-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IQPWNQRRAJHOKV-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N Thr-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N 0.000 description 1
- WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N Thr-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 1
- XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N Thr-Tyr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 1
- DIHPMRTXPYMDJZ-KAOXEZKKSA-N Thr-Tyr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N)O DIHPMRTXPYMDJZ-KAOXEZKKSA-N 0.000 description 1
- BKIOKSLLAAZYTC-KKHAAJSZSA-N Thr-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BKIOKSLLAAZYTC-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- KPMIQCXJDVKWKO-IFFSRLJSSA-N Thr-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KPMIQCXJDVKWKO-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N Thr-Val-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N Thr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- 102000014701 Transketolase Human genes 0.000 description 1
- 108010043652 Transketolase Proteins 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- JVTHMUDOKPQBOT-NSHDSACASA-N Trp-Gly-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O)=CNC2=C1 JVTHMUDOKPQBOT-NSHDSACASA-N 0.000 description 1
- IIJWXEUNETVJPV-IHRRRGAJSA-N Tyr-Arg-Ser Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)O IIJWXEUNETVJPV-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- BSCBBPKDVOZICB-KKUMJFAQSA-N Tyr-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BSCBBPKDVOZICB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XJPXTYLVMUZGNW-IHRRRGAJSA-N Tyr-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XJPXTYLVMUZGNW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XTOCLOATLKOZAU-JBACZVJFSA-N Tyr-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N XTOCLOATLKOZAU-JBACZVJFSA-N 0.000 description 1
- JAQGKXUEKGKTKX-HOTGVXAUSA-N Tyr-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 JAQGKXUEKGKTKX-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 1
- CVUDMNSZAIZFAE-TUAOUCFPSA-N Val-Arg-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N CVUDMNSZAIZFAE-TUAOUCFPSA-N 0.000 description 1
- CVUDMNSZAIZFAE-UHFFFAOYSA-N Val-Arg-Pro Natural products NC(N)=NCCCC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O CVUDMNSZAIZFAE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZMDCGGKHRKNWKD-LAEOZQHASA-N Val-Asn-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N ZMDCGGKHRKNWKD-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- YDPFWRVQHFWBKI-GVXVVHGQSA-N Val-Glu-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N YDPFWRVQHFWBKI-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- BZMIYHIJVVJPCK-QSFUFRPTSA-N Val-Ile-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N BZMIYHIJVVJPCK-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N Val-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- HPANGHISDXDUQY-ULQDDVLXSA-N Val-Lys-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N HPANGHISDXDUQY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- FMQGYTMERWBMSI-HJWJTTGWSA-N Val-Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](C(C)C)N FMQGYTMERWBMSI-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- LTTQCQRTSHJPPL-ZKWXMUAHSA-N Val-Ser-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N LTTQCQRTSHJPPL-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N Val-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- DLRZGNXCXUGIDG-KKHAAJSZSA-N Val-Thr-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O DLRZGNXCXUGIDG-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- SSKKGOWRPNIVDW-AVGNSLFASA-N Val-Val-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N SSKKGOWRPNIVDW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 229940100228 acetyl coenzyme a Drugs 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010009111 arginyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010069926 arginyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008687 biosynthesis inhibition Effects 0.000 description 1
- 230000001486 biosynthesis of amino acids Effects 0.000 description 1
- 238000013452 biotechnological production Methods 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000012869 ethanol precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 239000006052 feed supplement Substances 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 239000012847 fine chemical Substances 0.000 description 1
- 102000034356 gene-regulatory proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091006104 gene-regulatory proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- -1 glutamic acid amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 108010013768 glutamyl-aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N glyclproline Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 108010072405 glycyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010001064 glycyl-glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010050475 glycyl-leucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010027338 isoleucylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical compound CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 108010064486 phenylalanyl-leucyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010084572 phenylalanyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- LFGREXWGYUGZLY-UHFFFAOYSA-N phosphoryl Chemical group [P]=O LFGREXWGYUGZLY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 108010014614 prolyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010025826 prolyl-leucyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010079317 prolyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 102000037983 regulatory factors Human genes 0.000 description 1
- 108091008025 regulatory factors Proteins 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- IFGCUJZIWBUILZ-UHFFFAOYSA-N sodium 2-[[2-[[hydroxy-(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxyphosphoryl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound [Na+].C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NP(O)(=O)OC1OC(C)C(O)C(O)C1O IFGCUJZIWBUILZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 108010072986 threonyl-seryl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000004102 tricarboxylic acid cycle Effects 0.000 description 1
- 150000003628 tricarboxylic acids Chemical group 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 1
- 108010058119 tryptophyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 201000008827 tuberculosis Diseases 0.000 description 1
- 239000007160 ty medium Substances 0.000 description 1
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/93—Ligases (6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/06—Alanine; Leucine; Isoleucine; Serine; Homoserine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/08—Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/14—Glutamic acid; Glutamine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/20—Aspartic acid; Asparagine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y604/00—Ligases forming carbon-carbon bonds (6.4)
- C12Y604/01—Ligases forming carbon-carbon bonds (6.4.1)
- C12Y604/01001—Pyruvate carboxylase (6.4.1.1)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
A találmány tárgya eljárás aszparaginsav- és/vagy glutaminsavcsaládbatartozó aminosavak mikrobiális termeltetésére. A találmány tárgyátképezi továbbá egy piruvát-karboxiláz-gén, a piruvát-karboxiláz-génttartalmazó génkonstrukció, a találmány szerinti gént vagygénkonstrukciót hordozó vektor, a találmány szerinti vektorttartalmazó, transzformált sejtek, valamint a találmány szerintipiruvát-karboxiláz-gén alkalmazása az aszparaginsav- és/vagyglutaminsavcsaládba tartozó aminosavak mikroorganizmusok általitermelésének fokozására. A találmány szerinti megoldás előnyösenalkalmazható L-lizin, L-treonin, L-homoszerin, L-glutaminsav és/vagyL- arginin fokozott mennyiségben történő termelésére.
Description
A találmány tárgya eljárás az aszparaginsav- és glutaminsavcsaládba tartozó aminosavak mikrobiális termeltetésére. A találmány tárgyát képezi továbbá egy piruvát-karboxiláz-gén, a piruvát-karboxiláz-gént tartalmazó génkonstrukció, a találmány szerinti gént vagy génkonstrukciót hordozó vektor, a találmány szerinti vektort tartalmazó, transzformált sejtek, valamint a találmány szerinti piruvát-karboxiláz-gén alkalmazása az aszparaginsav- és/vagy glutaminsavcsaládba tartozó aminosavak mikroorganizmusok általi termelésének fokozására.
A találmány szerinti megoldás előnyösen alkalmazható L-lizin, L-treonin, L-homoszerin, L-glutaminsav és/vagy L-arginin fokozott mennyiségben történő termelésére.
Az aminosavak gazdasági jelentősége széles körű, mivel számos alkalmazási területen használatosak. Például az L-lizin, L-treonin, L-metionin és L-triptofán takarmánykiegészítőként; az L-glutaminsav a gyógyszeriparban az L-izoleucin és L-tirozin gátlására szolgáló adalék anyagként; az L-arginin és L-izoleucin gyógyszerekként, míg az L-glutaminsav, L-aszparaginsav és L-fenil-alanin finomvegyipari vegyszerek szintézisének kiindulási anyagaiként alkalmazható.
E különböző aminosavak előállításának egyik előnyös eljárása a mikroorganizmusok alkalmazásával történő biotechnikai termeltetés, mivel ezen a módon a megfelelő aminosavak biológiailag hatásos és optikailag aktív alakjaihoz jutunk, továbbá egyszerű és olcsó nyersanyagok alkalmazhatók. Mikroorganizmusként például Corynebacterium glutamicum és alfajai [ssp. Flavum és ssp. Lactofermentum; Liebl és munkatársai: Int. J. System Bacteriol. 41, 255 (1991)], valamint az E. coli és rokon baktériumok alkalmazhatók. Ezek a baktériumok normális esetben is termelik a szóban forgó aminosavakat, de csak saját fejlődésükhöz szükséges mennyiségben, így felesleges aminosavak nem termelődnek, s nem is izolálhatok. Ennek oka, hogy a sejtekben az aminosavak bioszintézise többféle szabályozás alatt áll. Léteznek különféle eljárások az aminosavak termelésének fokozására, melyek a szabályozási mechanizmusok kikerülésén alapulnak. Az ilyen eljárások során például olyan aminosavanalógokat iktatnak be, amelyek kikapcsolják a bioszintézis hatásos vezérlését. Például alkalmaztak egy olyan eljárást, amely rezisztens az L-tirozin és L-fenil-alanin analógjaira (JP 19037/1976; JP 39517/1978). Feltártak továbbá egy olyan eljárást, amelyben a szabályozómechanizmus gátlására az L-lizin vagy L-fenil-alanin analógjaira rezisztens baktériumokat alkalmaztak (EP 0 205 849; GB 2 152 509).
Rekombináns DNS-technika alkalmazásával létrehoztak olyan mikroorganizmusokat, amelyekben feedback-gátlásra nem érzékeny kulcsenzimet kódoló gént expresszáltattak, s így érték el a bioszintézis vezérlésének gátlását. Például ismeretes olyan rekombináns, L-lizint termelő baktérium, amely plazmid által kódolt, feedback-rezisztens aszparaginsav-kinázt tartalmaz (EP 0 381 527). Feltártak továbbá olyan rekombináns, L-fenil-alanint termelő baktériumot, amely feedback-rezisztens prefenát-dehidrogenázt tartalmaz (JP 123475/1986;
EP 0 488 424).
Olyan gének túlzott mértékben történő expresszáltatásával, amelyek aminosavszintézisben szerepet játszó enzimekként nem feedback-érzékeny enzimeket kódolnak, fokozott aminosavtermelés érhető el. Például a lizintermelés a dihidropikolinátszlntézis fokozásával növelhető (EP 0 197 335), míg a treonin-dehidratáz fokozott mennyiségben történő szintézisével megnövelt izoleucintermelés érhető el (EP 0 436 886).
Az aminosavtermelés fokozásának további kutatásai során a központi anyagcsere elsődleges celluláris anyagcseretermékeinek javított hozzáférhetőségére összpontosítottak. Ismeretes, hogy a transzketoláz - rekombináns technikák alkalmazásával végzett - túltermeltetése az L-triptofán, L-tirozin vagy L-fenil-alanin nagyobb mennyiségű termelődését eredményezheti (EP 0 600 463). Ezenfelül, Corynebacteriumban a foszfoenol-piruvát-karboxiláz aktivitásának csökkentése az aromás gyűrűt tartalmazó aminosavak javított termelékenységét eredményezi (EP 0 3331 145), ugyanakkor, Corynebacteriumban a foszfoenol-piruvát-karboxiláz aktivitásának fokozása az aszparaginsavcsaládba tartozó aminosavak feldúsulásához vezet (EP 0 358 940).
Szaporítási - és különösen aminosavtermelés! feltételek között a trikarbonsavciklust folyamatosan és hatékonyan négy szénatomos (C4) vegyületekkel kell ellátni (például az aminosavbioszintézisből kilépő köztes termékek helyettesítése céljából oxálecetsavval). Egészen a legutóbbi időkig úgy vélték, hogy Corynebacteriumban a foszfoenol-piruvát-karboxiláz felelős ezekért az úgynevezett anaplerotikus funkciókért [Kinoshita: „Biology of Industrial Microorganisms”, szerk.: Benjámin, Cummings Publishing Company, London (1985); Liebl: „The Prokaryotes II”, Springer Verlag N. Y. (1991); Vallino és Stephanopoulos: Biotechnoi. Bíoeng. 41, 633 (1993)].
Felismertük, hogy a foszfoenol-piruvát-karboxilázra negatív mutánsok valamennyi tápközegen azonos mértékben szaporodnak, mint a megfelelő kiindulási törzsek [Peters-Wendisch és munkatársai: FEMS Microbiol. Lett. 112, 269 (1993); Gubler és munkatársai: Appl. Microbiol. Biotechnoi. 40, 857 (1994)]. Ezek az eredmények azt jelzik, hogy a foszfoenol-piruvát-karboxiláz a baktériumokban a szaporodást illetően nem kulcsfontosságú, és nem (vagy csak kevéssé) játszik szerepet az anaplerotikus reakciókban. Ezen túlmenően, az eredmények arra utalnak, hogy Corynebacteriumban egy másik - a szaporodáshoz szükséges oxálecetsav szintéziséért felelős - enzimet kell biztosítani. Az utóbbi időben Corynebacterium glutamicum permeabilizált sejtjeiben piruvát-karboxiláz-aktivitást mutattak ki [Peters-Wendisch és munkatársai: Microbiology 143, 1095 (1997)]. Ez az enzim AMP-vel, ADP-vel és acetil-koenzim-A-val hatékonyan gátolható, s szénforrásként alkalmazott laktát jelenlétében fokozott mennyiségben termelődik. Mivel azt a következtetést vonhatjuk le, hogy ez az enzim a trikarbonsavciklus kielégítő lejátszódásáért felelős, várható, hogy a génexpresszió vagy az enzimatikus aktivitás fokozódá2
HU 224 055 Β1 sa az aszparaginsavcsaládba tartozó aminosavak termelődésében nem eredményez növekedést, vagy csak csekély növekedést eredményez. Ezenfelül, azt vártuk, hogy a piruvát-karboxiláz-gén-expresszió vagy enzimaktivitás fokozódása más családokba tartozó aminosavak termelődésére sem gyakorol hatást.
Meglepő módon azt találtuk, hogy a piruvát-karboxiláz aktivitásának - az enzim genetikai módosításával és/vagy a piruvát-karboxilázt kódoló gén expressziójának fokozásával történő - növelésével fokozható az aszparaginsav- és/vagy glutaminsavcsaládba tartozó aminosavak mikrobiális termelése. Felismertük, hogy elsősorban azok a törzsek, amelyek növelt kópiaszámú piruvát-karboxiláz-gént tartalmaznak, a tenyésztő tápközegbe kb. 50%-kal több lizint, 40%-kal több treonint és 150%-kal több homoszerint képesek kiválasztani. Felismertük továbbá, hogy a glutaminsavtermelődés, meglepő módon, szintén jelentős mértékben fokozódott (vő. 6. példa, 4. táblázat).
A piruvát-karboxiláz - enzimaktivitás fokozása céljából végzett - genetikai módosítása előnyösen az endogén gén mutagenezisével hajtható végre. Az ilyen mutációk klasszikus eljárások (mint például UV-besugárzás vagy mutációt kiváltó vegyszerek) alkalmazásával, illetve géntechnológiai eljárásokkal (például delécióval, inszercióval és/vagy szubsztitúcióval) valósíthatók meg.
A piruvát-karboxiláz-gén expressziója a gén kópiaszámának növelésével és/vagy a gén expresszióját pozitív irányban módosító szabályozófaktorok erősítésével fokozható. A szabályozóelemek erősítése - előnyösen transzkripciós szinten - elsősorban a transzkripciós szignálok javításával érhető el, ami, például a struktúrgén előtt álló promoter szekvenciájának (hatékonyságának elősegítése céljából végzett) változtatásával vagy a promoter hatékonyabb promoterekkel történő teljes helyettesítésével valósítható meg. A transzkripció mértékének fokozása a piruvát-karboxiláz-génnel összefüggő szabályozógén megfelelő módosításával is elérhető. Ehhez a szabályozógén szekvenciáját például mutációval úgy módosítjuk, hogy egy szabályozóprotein piruvát-karboxiláz-génhez történő kötődésének hatékonyságát megváltoztassuk, s ezáltal a DNStranszkripciót, s következésképpen a génexpressziót fokozzuk. A piruvát-karboxiláz-génhez úgynevezett erősítőszekvencia is kapcsolható, amely az RNS-polimeráz és a DNS közötti javított kölcsönhatás eredményeként a piruvát-karboxiláz-gén szintén fokozott mértékű expresszióját eredményezi. Mindazonáltal, az expresszió erősítése transzlációs szinten is megvalósítható, melynek során például az mRNS stabilitását növeljük.
A piruvát-karboxiláz-gén kópiaszámának növelése érdekében a gént génkonstrukcióba vagy vektorba foglaljuk. A génkonstrukció elsősorban piruvát-karboxiláz-génhez kapcsolódó szabályozószekvenciákat (előnyösen a gén expresszióját erősítő szekvenciákat) tartalmaz. A piruvát-karboxiláz-gén génkonstrukcióba történő foglalása céljából a gént megfelelő Corynebacterium-változatból izoláljuk, és aminosavtermelő mikroorganizmus (elsősorban Corynebacterium, Escherichia coli vagy Serratia marcescens) törzsébe transzformáljuk. A találmány szerinti eljárások kivitelezése szempontjából elsősorban a C. glutamicumböl, C. glutamicum ssp. flavumból vagy ssp. Iactofermentumbó\ származó gének alkalmasak. A gén izolálása és ismert vektorokkal végzett in vitro rekombinálását követően [I. például Simon és munkatársai: Bio/Technology 1, 784 (1983); Eikmanns és munkatársai: Gene 102, 93 (1991)] az aminosavtermelő törzs transzformációját elektroporációval [I. Liebl és munkatársai: FEMS Microbiology Letters 65, 299 (1991)] vagy konjugációval [Schafer és munkatársai: J. Bacteriol. 172, 1663 (1990)] hajtjuk végre.
Gazdatörzsként előnyösen olyan aminosavtermelő törzseket alkalmazunk, amelyekben a megfelelő aminosav szintézise szabályozásmentesített, és/vagy amely a megfelelő aminosavat illetően fokozott exportszállítási aktivitást mutat. Ezen túlmenően, azok a törzsek előnyösek, amelyek a központi anyagcsere
- megfelelő aminosavak szintézisében szerepet játszó - anyagcseretermékeiből fokozott mennyiséget tartalmaznak, és/vagy amelyek a központi anyagcsere
- megfelelő aminosavak szintézisében szerepet nem játszó - anyagcseretermékeiből csökkent mennyiséget tartalmaznak, különösen azok az anyagcseretermékek, amelyek tolerálják a kompetitív reakciókat; vagyis azok a törzsek előnyösek, amelyekben a megfelelő aminosav bioszintézises reakcióútjával kompetitív reakcióutak csökkent aktivitással működnek. Ilyenformán, az L-aszparaginsav-p-metil-észterre (AME) rezisztens törzsként elsősorban olyan korineform mikroorganizmustörzs alkalmas, amelyben a citrát-szintetáz-aktivitás csökkent mértékű (EP 0 551 614).
A piruvát-karboxiláz-gén izolálást követően a 2. azonosító számú szekvenciaként bemutatott aminosavszekvenciát kódoló nukleotidszekvenciát, annak allélváltozatát, az 1. azonosító számú szekvencia 165-3587. nukleotidjait tartalmazó szekvenciát vagy lényegében azonos hatású nukleotidszekvenciát tartalmaz. Ezen túlmenően, a gén az 1. azonosító számú szekvencia 20-109. nukleotidjaiból álló promotert vagy azzal lényegében azonos hatású DNS-szekvenciát is tartalmaz. Az allélváltozatok, illetve az azonos hatású DNS-szekvenciák elsősorban olyan funkcionális származékok, amelyek megfelelő - delécióval, inszercióval és/vagy szubsztitúcióval módosított - nukleotidszekvenciát tartalmaznak, melynek eredményeként az enzim aktivitása változatlan marad vagy fokozódik. A találmány szerinti eljárásban előnyösen ilyen piruvát-karboxiláz-gént alkalmazunk.
Az adott esetben promoterrel és szabályozógénnel kapcsolt piruvát-karboxiláz-gén előtt és/vagy után egy vagy több DNS-szekvencia állhat; az ilyen struktúrákat génkonstrukciónak nevezzük.
A piruvát-karboxiláz-gén előtt előnyösen tac-promoter (laclQ-Gen) helyezkedik elő, amelyhez specifikus szabályozószekvenciák kapcsolódnak.
A piruvát-karboxiláz-gén klónozásával a gént tartalmazó plazmidokat kapunk, amelyek segítségével a gén aminosavtermelő törzsbe transzformálható. A transz3
HU 224 055 Β1 formációval kapott sejtek előnyösen transzformált Corynebacterium-sejtnek felelnek meg, amelyek a gént replikációra alkalmas alakban (vagyis a kromoszómán több kópiában) tartalmazzák, miáltal a gén kópiái rekombinációval a genom és/vagy egy plazmid vagy vektor tetszőleges helyeibe épülnek be.
1. példa
Corynebacterium glutamicum piruvát-karboxiláz-génjének klónozása
Ismert piruvát-karboxiláz-gének (pyc-gének), név szerint a Saccharomyces cerevisiae pyc-génje [I. J. Bioi. Chem. 263, 11 493 (1988); Mól. Gén. Génét. 229, 307 (1991)], Mensch [Biochem. Biophys Acta 1227, 46 (1994)], Maus [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1766 (1993)], az Aedes aegypti pyc-génje [EMBL-GeneBank No. L36530] és a Mycobacterium tuberculosis pyc-génje [EMBL-GeneBank No. U00024] alapján PCR-láncindítót szintetizáltunk (MWG Biotech). Ez a láncindító az M. tuberculosis pyc-génjének 810-831. és 1015-1037. nukleotidjainak felel meg. E láncindítóval - az Innis és munkatársai által [„PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications”, Academic Press (1990)] által, nem generált homológ láncindító esetére leírt standard eljárás alkalmazásával - végzett amplifikációt követően a C. glutamicum ATCC 13 032 törzs [Microbiology 140, 1817 (1994)] kromoszomális DNS-éből egy kb. 200 bp-os fragmenst izoláltunk. A 200 bp-os méret megfelel a pyc-génnel kapcsolatos várakozásnak. A PCR-terméket Sanger és munkatársai leírása szerint [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74, 5463 (1977)], fluoreszcens jelölésű ddNTP-k és automata DNS-szekvenáló készülék (Applied Biosystems) alkalmazásával szekvenáltuk.
A C. glutamicum e DNS-fragmenséből kiindulva a következő homológ oligonukleotidokat állítottuk elő:
pyc-1:5-CGTCTTCATCGAAATGAAC-3’ pyc-2: 5’-ACGGTGGTGATCCGGCACT-3’
Az oligonukleotidot a C. glutamicum piruvát-karboxiláz-génje próbájának izolálására alkalmaztuk. A láncindítót C. glutamicum kromoszomális DNS-ével és - digoxigeninnel jelzett - nukleotidokkal együtt polimeráz-láncreakciónak vetettük alá. A reakciót a Boehringer-Mannheim által forgalmazott „PCR DIG Labeling Kits” reagenskészlet mellékelt használati útmutatója szerint végeztük, miáltal olyan, digoxigeninnel jelzett DNS-fragmenst amplifikáltunk, amely megfelel a kb. 200 bp-os várt méretnek. Az így kapott pyc-próbákat Southern-blot-hibridizációval - a C. glutamicum kromoszomális DNS-ében pyc-gént hordozó DNS-fragmens azonosítására alkalmaztuk. Ennek során C. glutamicum WT-törzs kromoszomális DNS-ének 2-5 pg-ját Hindlll-mal, Sphl-gyel, Sall-gyel, Ddral-gyel, EcoRl-gyel és BamHI-gyel emésztettük, és a kapott DNS-fragmenseket - 0,8%-os agarózgélen, 20 V feszültséggel 16 óra hosszat végzett elektroforézissel méret szerint elválasztottuk. Az agarózgélen talált DNS-fragmenseket Southern-blot-eljárással denaturáltuk [J. Mól. Bioi. 98, 503 (1975)], majd vákuumos „VacuGene Biot Apparátus” készülék alkalmazásával (Pharmacia LKB) nejlonmembránra (Nytran N13;
Schleicher és Schüll, Dassel, Svájc) másoltuk, immobilizáltuk, és a digoxigeninmarkert - alkalikus foszfatázokkal végzett NBT/X-foszfát konverzióval - detektáltuk. A következő - pyc-DNS-próbával hibridizálódott kromoszomális fragmenseket detektáltuk: 17 kb-os Hindlll-fragmens; 6,5 kb-os Sall-fragmens; 1,35 kb-os EcoRI-fragmens.
A 17 kb-os Hindlll-fragmenst izoláltuk és szubklónoztuk. Erre a célra a C. glutamicum kromoszomális DNS-ének pHC79-kozmidban készített kozmidgénbankját alkalmaztuk, amely a C. glutamicum genomját 99%-ban reprezentálja [Mól. Microbiol. 6, 317 (1992)]. E génbankkal - a Sambrook és munkatársai által leírt kalcium-kloridos eljárással [„Molecular Cloning, A Laboratory Manual”, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)] - E. coli DH5a-törzset transzformáltunk. A sejteket kb. 300 telep mennyiségben - 50 pg/ml kanamicint tartalmazó - LB-agarlemezekre szélesztettük (összesen 5000 telep). Ezt követően a kapott, transzformáit terméket Nytran-N13-membránra vittük át, majd a sejtek lúgos lízise céljából 5 percig inkubáltuk, és a DNS-t - 0,5 M NaOH és 1,5 M NaCl oldatában áztatott - Whatman-szűrőpapíron denaturáltuk, majd 1 M Tris/HCI (pH=7,5) és 1,5 M NaCl elegyében semlegesítettük.
A szűrőpapírt 2xSSC-ben inkubáltuk, majd a felszabadult DNS-t 366 nm hullámhosszúságú UV sugárzással fixáltuk a szűrőpapíron. A maradék sejttörmeléket 0,1% SDS-t tartalmazó 3xSSC-oldatban 50 °C-on végzett rázatással távolítottuk el. A szűrőpapírt ebben az alakjában alkalmaztuk a specifikus pyc-próbával történő hibridizációra [I. Southern: J. Mól. Bioi. 98, 503 (1975)].
A pyc-próbával végzett hibridizációval három transzformánst azonosítottunk, melyekből Bimbóim lúgos lízises eljárásával [Meth. Enzymol. 100, 243 (1983)] izoláltuk a kozmid-DNS-t, és azt restrikciós enzimes és Southern-blot-analízissel a Hindlll-fragmensek jelenlétére teszteltük. A pHC79-10-kozmidot, amely a 40 kb-os Hindlll-fragmenst teljes egészében tartalmazza, tovább vizsgáltuk. A Sall-gyel és EcoRI-gyel végzett hasítás után is ugyanazokat a hibridizálódott fragmenseket kaptuk, mint a kromoszomális DNS-ben, azaz egy
6.5 kb-os Sall-fragmenst és egy 1,35 kb-os EcoRI-fragmenst. A 17 kb-os Hindlll-fragmenst a kozmid restrikciós enzimes emésztésével izoláltuk, és Hindlll-mal emésztett pUC18 E. coli vektorba ligáitok. A kapott pUC-pyc-vektorban lévő fragmenseket restrikciós analízisnek vetettük alá. A fragmensek fizikai térképét az 1. ábrán mutatjuk be.
2. példa
A piruvát-karboxiláz-gén szekvenálása
A további szubklónozási lépések során a pUC-pycplazmidból - megfelelő endonukleázok alkalmazásával - 0,85 kb-os Sall/EcoRI fragmenst, 1,35 kb-os EcoRl-fragmenst, 1,6 kb-os EcoRI/EcoRI/Stul fragmenst, továbbá a 0,85 kb-os Sall/EcoRI fragmenssel átfedő
1.6 kb-os Clal-fragmenst izoláltunk. Ligálással a fragmenseket a - megfelelő endonukleázokkal emésztett 4
HU 224 055 Β1 pUC18-klónozóvektorba ligáltuk, majd a fentebb leírtak szerint szekvenáltuk [I. Sanger és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74, 5463 (1977)], a kapott nukleotidszekvenciákat analizáltuk. A nukleotidszekvenciák vizsgálatára a HUSAR-programcsomagot (Release 3.0; Germán Zone fór Cancer Research, Heidelberg) alkalmaztuk. A fragmensek szekvenciaanalízisével 3576 bp-os, folytonos nyitott leolvasási fázist azonosítottunk, amely 1140 aminosavas proteint kódol. Az aminosavszekvencia EMBL-GeneBank (Heidelberg) adataival végzett összehasonlításával valamennyi ismert piruvát-karboxilázzal sikerült hasonlóságokat kimutatni. A legnagyobb mértékű (62%-os) azonosságot a Mycobacterium tuberculosis feltételezett piruvát-karboxilázával (EMBL-GeneBank No. U00024) mutattuk ki. A hasonlóság mértéke konzervált aminosavszubsztitúciók beiktatásával 76%-ra növekedett. Más organizmusokból származó piruvát-karboxilázokkal történő összehasonlítással 46-47%-os és 64-65%-os aminosavszekvencia-hasonlóságot mutattunk ki [Gene 191, 47 (1997); J. Bacteriol. 178, 5960 (1996); Proc. Natl. Acad. Sci. USA 990, 1766 (1993); Biochem. J. 316, 631 (1996); EMBL-GeneBank: No. L36530; J. Bioi. Chem.
263,11 493 (1988); Mól. Gén. Génét. 229, 307 (1991)]. Ezen eredményekből azt a következtetést vonhatjuk le, hogy a klónozott fragmens tartalmazta a C. glutamicumböl származó piruvát-karboxiláz-gént. A gén nukleotidszekvenciáját 1, azonosító számú szekvenciaként, míg az általa kódolt aminosavszekvenciát a 2. azonosító számú szekvenciaként mutatjuk be.
3. példa
A piruvát-karboxiláz nagy mennyiségben történő termeltetése
A C. glutamicum piruvát-karboxiláz-génjének túlzott mértékben történő expresszáltatása céljából a gént pUCpyx-plazmidból 6,2 kb-os Sspl/Scal fragmensként E. coli glutamicum „swing pEKO-vektorba [Gene 102, 93 (1991)] klónoztuk, amelyet EcoRI-gyel és Pstl-gyel hasítottunk. Klenow-polimerázzal végzett kezeléssel a túlnyúló végeket tompa végekhez ligáltuk az EcoRl-hely feltöltésével vagy Pstl kapcsolásával, és a linearizált vektort a 6,2 kb-os Sspl/Scal fragmenshez ligáltuk. Az így kapott pEKOpyc-vektort E. coli DH5atörzsbe transzformáltuk, a transzformánsokból plazmid-DNS-t izoláltunk, és az inszerteket restrikciós enzimekkel végzett hasítással ellenőriztük. A DNS-t elektroporációval SP733-törzsbe juttattuk [FEMS Microbiol. Lett. 65, 299 (1989)],
Ez a törzs a restrikciónegatív C. glutamicum R127-törzs [Dechema Biotechnology Conference 4, 323 (1990] kémiai mutagenezissel létrehozott mutánsa, amelyre jellemző, hogy - egyedüli szénforrásként piruvátot és laktátot tartalmazó - minimáltápközegen nem szaporodik [Microbiology 143, 195 (1997)]. Ez a fenotípus a piruvát-karboxiláz defektusaként értelmezhető, és C. glutamicumból (azaz a pEKOpyc-plazmidot hordozó törzs) származó piruvát-karboxiláz-gén bejuttatásával komplementálható (és ellentétes az egyedüli szénforrásként laktátot tartalmazó minimáltápközegen szaporodni képes kiindulási törzs fenotípusával). Ez azt bizonyítja, hogy a gén funkcionális piruvát-karboxilázt kódolt.
A pEKOpyc-plazmidot elektroporációval vad típusú C. glutamicum törzsbe (ATCC 13 032) transzformáltuk. Az így kapott WT (pEKOpyc) törzset - piruvát-karboxiláz-aktivitásukat illetően - vad típusú ATCC 13 032 törzzsel hasonlítottuk össze. Ezt a törzset komplex tápközegben [Luria-Bertani, „Molecular Cloning, A Laboratory Manual”, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)], 0,5% laktát jelenlétében, illetve 2% laktátot és 4% glükózt tartalmazó minimáltápközegen tenyésztettük, majd Peters-Wendisch és munkatársai által leírt eljárással [Microbiology 143, 1095 (1997)] piruvát-karboxiláz-tesztet végeztünk. A teszt eredményeit az 1. táblázatban mutatjuk be. A táblázatban felsorolt adatok azt mutatják, hogy a pEKOpyc-plazmidot hordozó törzsben a piruvát-karboxiláz-aktivitás kb. négyszer nagyobb volt, mint a kiindulási törzs aktivitása.
1. táblázat
Törzs | IPTG (μρ/ΓηΙ) | Piruvát- karboxiláz (nmolperc-1· ’m9száraztömeg |
13 032 (pEKOpyc) | 0 | 75±13 |
ATCC 13 032 | 0 | 19±4 |
DG52-5 | 200 | 88±13 |
(pVWEXI pyc) | 0 | 11±2 |
DG52-5 | 200 | 5±2 |
(pVWEXI) | 0 | 6±1 |
DM368-3 | 200 | 76±10 |
(pVWEXI pyc) | 0 | 12±3 |
DM368-3 | 200 | 10+1 |
(pVWEXI) | 0 | 11±2 | |
4. példa
A lizinfelhalmozódás növelése C. glutamicum DG52-5-törzsben a piruvát-karboxiláz-gén nagy mennyiségben végzett expresszáltatásával A piruvát-karboxiláz-gén nagy mennyiségben történő expresszáltatása hatásának a lizintermelő DG52-5-törzsben [J. Gén. Microbiol. 134, 3221 (1988)] történő vizsgálata céljából a pVWEXI expressziós vektort alkalmaztuk, amely IPTG-vel indukálható génexpressziót tesz lehetővé. E vektorba a pyc-gént promoter nélkül klónoztuk. Ebből a célból először láncindító oligonukleotidokat (1. láncindító: az 1. azonosító számú szekvencia 112-133. nukleotidjai; 2. láncindító: az 1. azonosító számú szekvencia 373-355. nukleotidjai) szintetizáltunk, és a piruvát-karboxiláz-gén 261 bp-os promoter nélküli - kezdeti régióját polimeráz-láncreakcióval amplifikáltuk. A láncindítókat úgy választottuk ki, hogy az 1. láncindító Pstl-hasítási helyet, a 2. láncindító pedig BamHI-hasítási helyet építsen be a PCR-termékbe. A polimeráz-láncreakció után 274 bp-os PCR-terméket izoláltunk, majd azt konkatemerekhez ligáltuk, és Pstl-gyel és BamHI-gyel hasítottuk. A restrik5
HU 224 055 Β1 ciós terméket etanolos precipitációval betöményítettük, majd - előzetesen Pstl-gyel és BamHI-gyel hasított pVWEXI-vektorral ligáltuk. Az így kapott konstrukciót (pVWEXi-PCR) restrikciós enzimes emésztéssel teszteltük. A pyc-gén végrégióját a pEKOpyc-vektorból Rcal/Klenow/Sall kezeléssel izoláltuk, majd a BamHl/Klenow/Sall pVWEXI-PCR vektorba ligáltuk. Az így kapott konstrukciót (pVWEXI pyc) restrikciós térképezéssel vizsgáltuk. A plazmid fizikai térképét a 2. ábrán mutatjuk be.
Ezt a plazmidot elektroporációval C. glutamicum DG52-5-törzsbe juttattuk be. Kontrollként a DG52-5törzset inszert nélküli pVWEXI-vektorral transzformáltuk, és összehasonlítottuk a három különböző transzformáns L-lizin precipitációját. Erre a célra [DG52-5 (pVWEXI pyc) 3,4 és (2*TY; Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989) 50 pg/liter kanamicinnel] az egyes előtenyészetekből a megfelelő fermentációs tápközeget külön-külön beoltottuk. A tápközegbe a plazmid stabilitásának fenntartása érdekében további kanamicint adtunk. Mindegyik esetben két párhuzamos tesztet végeztünk; az egyik lombikba 200 pg/ml kanamicint adtunk, míg a másik lombik IPTG-t nem tartalmazott. A tenyészeteket 30 °C-on, 48 óra hosszat, 120-as percenkénti fordulatszámmal síkkeverőn inkubáltuk, majd a tápközegben meghatároztuk a felhalmozódott lizin mennyiségét. Az aminosavkoncentrációt nagy teljesítményű folyadékkromatográfiával határoztuk meg [J. Chromat. 266, 471 (1983)].
A fermentáció eredményeit a 2. táblázatban mutatjuk be, ahol az adatok a különböző kiónokkal végzett kísérletek eredményeinek középértékei.
2. táblázat
Törzs | IPTG (pg/ml) | Lizin (mM) |
DG52-5 (pVWEXI pyc) | 200 0 | 35,4+2,6 23,6±2,9 |
DG52-5 (pVWEXI) | 200 0 | 23,3±2,9 22,1 ±4,0 |
A táblázatban bemutatott eredmények azt jelzik, hogy a piruvát-karboxiláz-gén nagy mennyiségben történő expresszáltatása a tápközegben a lizin 50%-kal nagyobb mértékű felhalmozódását eredményezi. Ilyenformán, az anaplerotikus piruvát-karboxiláz génjének alkalmazása a lizintermelés jelentős mértékű növelését teszi lehetővé.
5. példa
A treonin és homoszerin felhalmozódásának növelése C. glutamicum DM368-3-törzsben a piruvát-karboxiláz-gén nagy mennyiségben történő expresszáltatásával
A treonin tenyészeti felülúszóban - a piruvát-karboxiláz-gén nagy mennyiségben végzett expresszáltatásának következtében - történő felhalmozódását az L-lizin 4. példában leírt termeltetéséhez hasonlóan teszteltük.
A treonintermelő C. glutamicum DM368-3-törzset (Degussa AG) pVWEXI pyc-plazmiddal (kontrollként pVWEXI-plazmiddal) transzformáltuk, és a három különböző transzformánsnál külön-külön meghatároztuk a treonin felhalmozódásának mértékét. Ebből a célból komplex tápközegben (2*TY; 50 pg/liter kanamicin) DM368-3 (pVWEXI) 2-es és 3-as törzset, valamint DM368-3 (pVWEXI pyc) 1-es, 2-es és 3-as törzset tenyésztettünk, és az előnyészetekkel külön-külön fermentációs tápközeget [CGXII; J. Bacteriol. 175, 5595 (1993)] oltottunk be. A tápközegbe a plazmid stabilitásának fenntartása érdekében további kanamicint adtunk. Mindegyik esetben két párhuzamos tesztet végeztünk; az egyik lombikba 200 pg/ml kanamicint adtunk, míg a másik lombik IPTG-t nem tartalmazott. A tenyészeteket 30 °C-on, 48 óra hosszat, 120-as percenkénti fordulatszámmal síkkeverőn inkubáltuk, majd a tápközegben meghatároztuk a felhalmozódott treonin mennyiségét. Az aminosavkoncentrációt nagy teljesítményű folyadékkromatográfiával határoztuk meg [J. Chromat. 266, 471 (1983)]. A fermentáció eredményeit a 3. táblázatban mutatjuk be, ahol az adatok a különböző klónokkal végzett három kísérlet eredményeinek középértékei.
3. táblázat
Törzs | IPTG (Pg/ml) | Treonin (mM) | Homoszerin (mM) |
DM368-3 | 200 | 10,2±0,5 | 14,4±1,2 |
(pVWEXI pyc) | 0 | 7,9±1,0 | 5,6±0,2 |
DM368-3 | 200 | 8,0+0,5 | 5,8+0,7 |
(pVWEXI) | 0 | 7,5±0,8 | 6,1+1,0 |
Az eredmények azt mutatják, hogy a piruvát-karboxiláz-gén nagy mennyiségben történő expresszáltatása a tápközegben a treonin kb. 40%-kal nagyobb mértékű felhalmozódását eredményezi. Ilyenformán, az anaplerotikus piruvát-karboxiláz génjének alkalmazása az L-treonin-termelés jelentős mértékű növelését teszi lehetővé.
Ezenfelül, az aminosavkoncentráció meghatározása azt a váratlan eredményt mutatta, hogy a piruvátkarboxiláz-gént nagy mennyiségben expresszáló törzs tápközegében a homoszerin mennyisége 150%-kal több volt, mint a gént nem túlzott mennyiségben expresszáló törzs esetében (I. 3. táblázat). Ezen eredmények alapján látható, hogy a találmány szerinti eljárással a treonin és a homoszerin mennyisége egyaránt jelentős mértékben növelhető.
6. példa
A glutaminsav felhalmozódásának növelése vad típusú C. glutamicum törzsben a piruvát-karboxiláz-gén nagy mennyiségben történő expresszáltatásával
Az L-lizin, L-treonin és L-homoszerin termeléséhez hasonló módon (I. 4. és 5. példa) a tenyészeti felülúszóban vizsgáltuk a glutaminsav - piruvát-karboxiláz-gén túlzott mennyiségben végzett expresszáltatásának köszönhető - felhalmozódását is. Erre a célra, a már el6
HU 224 055 Β1 nyeit a 4. táblázatban mutatjuk be, ahol az adatok a különböző klónokkal végzett két-két kísérlet eredményeinek középértékei.
mondottaknak megfelelően, a C. glutamicum 4. példa szerinti ATCC 13 032 vad típusú törzsét pVWEXI pyc-plazmiddal (kontrollként pVWEXI-plazmiddal) transzformáltuk, és a két transzformáns tenyészeti felülúszójában meghatároztuk a glutaminsav mennyisé- 5 gét. C. glutamicum ATCC 13 032 (pVWEXIpyc) D1- és D2-törzset, illetve C. glutamicum ATCC 13 032 (pVWEXIpyc) 1-es és 2-es törzset komplex tápközegben (50 pg/liter kanamicint tartalmazó 2*TY-tápközeg) tenyésztettük, és az egyes előtenyészetekkel külön-kü- 10 lön CGXII fermentációs tápközeget [J. Bacteriol. 175,
5595 (1993)] oltottunk be. A tápközegbe a plazmid stabilitásának fenntartása érdekében további kanamicint adtunk. Mindegyik esetben két párhuzamos tesztet végeztünk; az egyik lombikba 200 pg/ml kanamicint ad- 15 tünk, míg a másik lombik IPTG-t nem tartalmazott. A tenyészeteket 30 °C-on, 48 óra hosszat, 120-as percenkénti fordulatszámmal síkkeverőn inkubáltuk, majd a tápközegben meghatároztuk a felhalmozódott glutaminsav mennyiségét. Az aminosavkoncentrációt nagy 20 teljesítményű folyadékkromatográfiával határoztuk meg [J. Chromat. 266, 471 (1983)]. A fermentáció eredmé4. táblázat
Törzs | IPTG (pg/ml) | Glutaminsav (mM) |
ATCC 13 032 | 200 | 11±2 |
ATCC 13 032 | 0 | 13±2 |
ATCC 13 032 (pVWEXIpyc) | 200 | 67+4 |
ATCC 13 032 (pVWEXIpyc) | 0 | 32±4 |
Az eredmények azt mutatják, hogy a piruvát-karboxiláz-gén túlzott mennyiségben történő expresszáltatása a tápközegben a glutaminsav kb. 500%-kal nagyobb mértékű felhalmozódását eredményezi. Ilyenformán, az anaplerotikus piruvát-karboxiláz génjének alkalmazása a glutaminsavtermelés jelentős mértékű növelését teszi lehetővé.
Szekvencialista
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI;
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 3728 bázispár
TÍPUSA: nukleotid
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCAACCGTG CTTGAAGTCG TGCAGGTCAG GGGAGTGTTG CCCGAAAACA TTGAGAGGAA 60 AACAAAAACC GATGTTTGAT TGGGGGAATC GGGGGTTACG ATACTAGGAC GCAGTGACTG 120 CTATCACCCT TGGCGGTCTC TTGTTGAAAG GAATAATTAC TCTAGTGTCG ACTCACACAT 180 CTTCAACGCT TCCAGCATTC AAAAAGATCT TGGTAGCAAA CCGCGGCGAA ATCGCGGTCC 240 GTGCTTTCCG TGCAGCACTC GAAACCGGTG CAGCCACGGT AGCTATTTAC CCCCGTGAAG 300 ATCGGGGATC ATTCCACCGC TCTTTTGCTT CTGAAGCTGT CCGCATTGGT ACCGAAGGCT 360 CACCAGTCAA GGCGTACCTG GACATCGATG AAATTATCGG TGCAGCTAAA AAAGTTAAAG 420 CAGATGCCAT TTACCCGGGA TACGGCTTCC TGTCTGAAAA TGCCCAGCTT GCCCGCGAGT 480 GTGCGGAAAA CGGCATTACT TTTATTGGCC CAACCCCAGA GGTTCTTGAT CTCACCGGTG 540 ATAAGTCTCG CGCGGTAACC GCCGCGAAGA AGGCTGGTCT GCCAGTTTTG GCGGAATCCA 600 CCCCGAGCAA AAACATCGAT GAGATCGTTA AAAGCGCTGA AGGCCAGACT TACCCCATCT 660 TTGTGAAGGC AGTTGCCGGT GGTGGCGGAC GCGGTATGCG TTTTGTTGCT TCACCTGATG 720 AGCTTCGCAA ATTAGCAACA GAAGCATCTC GTGAAGCTGA AGCGGCTTTC GGCGATGGCG 780 CGGTATATGT CGAACGTGCT GTGATTAACC CTCAGCATAT TGAAGTGCAG ATCCTTGGCG 840 ATCACACTGG AGAAGTTGTA CACCTTTATG AACGTGACTG CTCACTGCAG CGTCGTCACC 900 AAAAAGTTGT CGAAATTGCG CCAGCACAGC ATTTGGATCC AGAACTGCGT GATCGCATTT 960 GTGCGGATGC AGTAAAGTTC TGCCGCTCCA TTGGTTACCA GGGCGCGGGA ACCGTGGAAT 1020 TCTTGGTCGA TGAAAAGGGC AACCACGTCT TCATCGAAAT GAACCCACGT ATCCAGGTTG 1080 AGCACACCGT GACTGAAGAA GTCACCGAGG TGGACCTGGT GAAGGCGCAG ATGCGCTTGG 1140 CTGCTGGTGC AACCTTGAAG GAATTGGGTC TGACCCAAGA TAAGATCAAG ACCCACGGTG 1200 CAGCACTGCA GTGCCGCATC ACCACGGAAG ATCCAAACAA CGGCTTCCGC CCAGATACCG 1260 GAACTATCAC CGCGTACCGC TCACCAGGCG GAGCTGGCGT TCGTCTTGAC GGTGCAGCTC 1320 AGCTCGGTGG CGAAATCACC GCACACTTTG ACTCCATGCT GGTGAAAATG ACCTGCCGTG 1380 GTTCCGACTT TGAAACTGCT GTTGCTCGTG CACAGCGCGC GTTGGCTGAG TTCACCGTGT 1440 CTGGTGTTGC AACCAACATT GGTTTCTTGC GTGCGTTGCT GCGGGAAGAG GACTTCACTT 1500 CCAAGCGCAT CGCCACCGGA TTCATTGCCG ATCACCCGCA CCTCCTTCAG GCTCCACCTG 1560 CTGATGATGA GCAGGGACGC ATCCTGGATT ACTTGGCAGA TGTCACCGTG AACAAGCCTC 1620
HU 224 055 Β1
ATGGTGTGCG TCCAAAGGAT GTTGCAGCTC CTATCGATAA GCTGCCTAAC ATCAAGGATC 1680
TGCCACTGCC ACGCGGTTCC CGTGACCGCC TGAAGCAGCT TGGCCCAGCC GCGTTTGCTC 1740
GTGATCTCCG TGAGCAGGAC GCACTGGCAG TTACTGATAC CACCTTCCGC GATGCACACC 1800
AGTCTTTGCT TGCGACCCGA GTCCGCTCAT TCGCACTGAA GCCTGCGGCA GAGGCCGTCG 1860
CAAAGCTGAC TCCTGAGCTT TTGTCCGTGG AGGCCTGGGG CGGCGCGACC TACGATGTGG 1920
CGATGCGTTT CCTCTTTGAG GATCCGTGGG ACAGGCTCGA CGAGCTGCGC GAGGCGATGC 1980
CGAATGTAAA CATTCAGATG CTGCTTCGCG GCCGCAACAC CGTGGGATAC ACCCCGTACC 2040
CAGACTCCGT CTGCCGCGCG TTTGTTAAGG AAGCTGCCAG CTCCGGCGTG GACATCTTCC 2100
GCATCTTCGA CGCGCTTAAC GACGTCTCCC AGATGCGTCC AGCAATCGAC GCAGTCCTGG 2160
AGACCAACAC CGCGGTAGCC GAGGTGGCTA TGGCTTATTC TGGTGATCTC TCTGATCCAA 2220
ATGAAAAGCT CTACACCCTG GATTACTACC TAAAGATGGC AGAGGAGATC GTCAAGTCTG 2280
GCGCTCACAT CTTGGCCATT AAGGATATGG CTGGTCTGCT TCGCCCAGCT GCGGTAACCA 2340
AGCTGGTCAC CGCACTGCGC CGTGAATTCG ATCTGCCAGT GCACGTGCAC ACCCACGACA 2400
CTGCGGGTGG CCAGCTGGCA ACCTACTTTG CTGCAGCTCA AGCTGGTGCA GATGCTGTTG 2460
ACGGTGCTTC CGCACCACTG TCTGGCACCA CCTCCCAGCC ATCCCTGTCT GCCATTGTTG 2520
CTGCATTCGC GCACACCCGT CGCGATACCG GTTTGAGCCT CGAGGCTGTT TCTGACCTCG 2580
AGCCGTACTG GGAAGCAGTG CGCGGACTGT ACCTGCCATT TGAGTCTGGA ACCCCAGGCC 2640
CAACCGGTCG CGTCTACCGC CACGAAATCC CAGGCGGACA GTTGTCCAAC CTGCGTGCAC 2700
AGGCCACCGC ACTGGGCCTT GCGGATCGTT TCGAACTCAT CGAAGACAAC TACGCAGCCG 2760
TTAATGAGAT GCTGGGACGC CCAACCAAGG TCACCCCATC CTCCAAGGTT GTTGGCGACC 2620
TCGCACTCCA CCTCGTTGGT GCGGGTGTGG ATCCAGCAGA CTTTGCTGCC GATCCACAAA 2680
AGTACGACAT CCCAGACTCT GTCATCGCGT TCCTGCGCGG CGAGCTTGGT AACCCTCCAG 2940
GTGGCTGGCC AGAGCCACTG CGCACCCGCG CACTGGAAGG CCGCTCCGAA GGCAAGGCAC 3000
CTCTGACGGA AGTTCCTGAG GAAGAGCAGG CGCACCTCGA CGCTGATGAT TCCAAGGAAC 3060
GTCGCAATAG CCTCAACCGC CTGCTGTTCC CGAAGCCAAC CGAAGAGTTC CTCGAGCACC 3120
GTCGCCGCTT CGGCAACACC TCTGCGCTGG ATGATCGTGA ATTCTTCTAC GGCCTGGTCG 3180
AAGGCCGCGA GACTTTGATC CGCCTGCCAG ATGTGCGCAC CCCACTGCTT GTTCGCCTGG 3240
ATGCGATCTC TGAGCCAGAC GATAAGGGTA TGCGCAATGT TGTGGCCAAC GTCAACGGCC 3300
AGATCCGCCC AATGCGTGTG CGTGACCGCT CCGTTGAGTC TGTCACCGCA ACCGCAGAAA 3360
AGGCAGATTC CTCCAACAAG GGCCATGTTG CTGCACCATT CGCTGGTGTT GTCACCGTGA 3420
CTGTTGCTGA AGGTGATGAG GTCAAGGCTG GAGATGCAGT CGCAATCATC GAGGCTATGA 3480
AGATGGAAGC AACAATCACT GCTTCTGTTG ACGGCAAAAT CGATCGCGTT GTGGTTCCTG 3540
CTGCAACGAA GGTGGAAGGT GGCGACTTGA TCGTCGTCGT TTCCTAAACC TTTCTGTAAA 3600
AAGCCCCGCG TCTTCCTCAT GGAGGAGGCG GGGCTTTTTG GGCCAAGATG GGAGATGGGT 3660
GAGTTGGATT TGGTCTGATT CGACACTTTT AAGGGCAGAG ATTTGAAGAT GGAGACCAAG 3720
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1140 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met 1 | Ser | Thr | His | Thr 5 | Ser | Ser | Thr | Leu | Pro 10 | Alá | Phe | Lys | Lys | Ile 15 | Leu |
Val | Alá | Asn | Arg 20 | Gly | Glu | Ile | Alá | Val 25 | Arg | Alá | Phe | Arg | Alá 30 | Alá | Leu |
Glu | Thr | Gly 35 | Alá | Alá | Thr | Val | Alá 40 | Ile | Tyr | Pro | Arg | Glu 45 | Asp | Arg | Gly |
Ser | Phe 50 | His | Arg | Ser | Phe | Alá 55 | Ser | Glu | Alá | Val | Arg 60 | Ile | Gly | Thr | Glu |
Gly | Ser | Pro | Val | Lys | Alá | Tyr | Leu | Asp | Ile | Asp | Glu | Ile | Ile | Gly | Alá |
70 75 80
HU 224 055 Β1
Alá Lys Lys Val Lys Alá Asp Alá Ile Tyr Pro Gly Tyr Gly Phe Leu 85 90 95
Ser Glu Asn Alá Gin Leu Alá Arg Glu Cys Alá Glu Asn Gly Ile Thr 100 105 110
Phe Ile Gly Pro Thr Pro Glu Val Leu Asp Leu Thr Gly Asp Lys Ser 115 120 125
Arg Alá Val Thr Alá Alá Lys Lys Alá Gly Leu Pre Val Leu Alá Glu 130 135 140
Ser Thr Pro Ser Lys Asn Ile Asp Glu Ile Val Lys Ser Alá Glu Gly
145 150 155 160
Gin Thr Tyr Pro Ile Phe Val Lys Alá Val Alá Gly Gly Gly Gly Arg
165 170 175
Gly Met Arg Phe Val Ma Ser Pro Asp Glu Leu Arg Lys Leu Alá Thr 180 185 190
Glu Alá Ser Arg Glu Alá Glu Alá Alá Phe Gly Asp Gly Alá Val Tyr 195 200 205
Val Glu Acg Alá Val Ile Asn Pro Gin His Ile Glu Val Gin Ile Leu 210 215 220
Gly Asp His Thr Gly Glu Val Val His Leu Tyr Glu Arg Asp Cys Ser
225 230 235 240
Leu Gin Arg Arg His Gin Lys Val Val Glu Ile Alá Pro Alá Gin His
245 250 255
Leu Asp Pro Glu Leu Arg Asp Arg Ile Cys Alá Asp Alá Val Lys Phe 260 265 270
Cys Arg Ser Ile Gly Tyr Gin Gly Alá Gly Thr Val Glu Phe Leu Val 275 280 285
Asp Glu Lys Gly Asn His Val Phe Ile Glu Met Asn Pro Arg Ile Gin 290 295 300
Val Glu His Thr Val Thr Glu Glu Val Thr Glu Val Asp Leu Val Lys
305 310 315 320
Alá Gin Met Arg Leu Alá Alá Gly Alá Thr Leu Lys Glu Leu Gly Leu
325 330 335
Thr Gin Asp Lys Ile Lys Thr His Gly Alá Alá Leu Gin Cys Arg Ile 340 345 350
Thr Thr Glu Asp Pro Asn Asn Gly Phe Arg Pro Asp Thr Gly Thr Ile 355 360 365
Thr Alá Tyr Arg Ser Pro Gly Gly Alá Gly Val Arg Leu Asp Gly Alá 370 375 380
Alá Gin Leu Gly Gly Glu Ile Thr Alá His Phe Asp Ser Met Leu Val 385 390 395 400
HU 224 055 Β1
Lys Met Thr Cys Arg 405
Gin Arg Alá Leu Alá 420
Gly Phe Leu Arg Alá 435
Ile Alá Thr Gly Phe 450
Pro Alá Asp Asp Glu 465
Thr Val Asn Lys Pro 485
Ile Asp Lys Leu Pro 500
Arg Asp Arg Leu Lys 515
Arg Glu Gin Asp Alá 530
His Gin Ser Leu Leu 545
Alá Alá Glu Alá Val 565
Alá Trp Gly Gly Alá 580
Asp Pro Trp Asp Arg 595
Asn Ile Gin Met Leu 610
Tyr Pro Asp Ser Val 625
Gly Val Asp Ile Phe 645
Met Arg Pro Alá Ile 660
Glu Val Alá Met Alá 675
Leu Tyr Thr Leu Asp 690
Ser Gly Alá His Ile 705
Gly Ser
Glu Phe
Leu Leu
Ile Alá 455
Gin Gly 470
His Gly
Asn Ile
Gin Leu
Leu Alá 535
Alá Thr 550
Alá Lys
Thr Tyr
Leu Asp
Leu Arg 615
Cys Arg 630
Arg Ile
Asp Alá
Tyr Ser
Tyr Tyr 695
Leu Alá 710
Asp Phe Glu Thr Alá 410
Thr Val Ser Gly Val 425
Arg Glu Glu Asp Phe 440
Asp His Pro His Leu 460
Arg Ile Leu Asp Tyr 475
Val Arg Pro Lys Asp 490
Lys Asp Leu Pro Leu 505
Gly Pro Alá Alá Phe 520
Val Thr Asp Thr Thr 540
Arg Val Arg Ser Phe 555
Lys Thr Pro Glu Leu 570
Asp Val Alá Met Arg 585
Glu Leu Arg Glu Alá 600
Gly Arg Asn Thr Val 620
Alá Phe Val Lys Glu 635
Phe Asp Alá Leu Asn 650
Val Leu Glu Thr Asn 665
Gly Asp Leu Ser Asp 680
Leu Lys Met Alá Glu 700
Ile Lys Asp Met Alá 715
Val Alá Arg Alá 415
Alá Thr Asn Ile 430
Thr Ser Lys Arg 445
Leu Gin Alá Pro
Leu Alá Asp Val 480
Val Alá Alá Pro 495
Pro Arg Gly Ser 510
Alá Arg Asp Leu 525
Phe Arg Asp Alá
Alá Leu Lys Pro 560
Leu Ser Val Glu 575
Phe Leu Phe Glu 590
Met Pro Asn Val 605
Gly Tyr Thr Pro
Alá Alá Ser Ser 640
Asp Val Ser Gin 655
Thr Alá Val Alá 670
Pro Asn Glu Lys 685
Glu Ile Val Lys
Gly Leu Leu Arg 720
HU 224 055 Β1
Pro Alá Alá | Val | Thr 725 | Lys | Leu | Val | Thr Alá 730 | Leu | Arg | Arg | Glu | Phe 735 | Asp |
Leu Pro Val | His | Val | His | Thr | His | Asp Thr | Alá | Gly | Gly | Gin | Leu | Alá |
740 | 745 | 750 | ||||||||||
Thr Tyr Phe | Alá | Alá | Alá | Gin | Alá | Gly Alá | Asp | Alá | Val | Asp | Gly | Alá |
755 | 760 | 765 | ||||||||||
Ser Alá Pro | Leu | Ser | Gly | Thr | Thr | Ser Gin | Pre | Ser | Leu | Ser | Alá | Ile |
770 | 775 | 780 | ||||||||||
Val Alá Alá | Phe | Alá | His | Thr | Arg | Arg Asp | Thr | Gly | Leu | Ser | Leu | Glu |
785 | 790 | 795 | 800 | |||||||||
Alá Val Ser | Asp | leu | Glu | Pro | Tyr | Trp Glu | Alá | Val | Arg | Gly | Leu | Tyr |
805 | 810 | 815 | ||||||||||
Leu Pro Phe | Glu | Ser | Gly | Thr | Pro | Gly Pro | Thr | Gly | Arg | Val | Tyr | Arg |
820 | 825 | 830 | ||||||||||
His Glu Ile | Pro | Gly | Gly | Gin | Leu | Ser Asn | Leu | Arg | Alá | Gin | Alá | Thr |
835 | 840 | 845 | ||||||||||
Alá Leu Gly | Leu | Alá | Asp | Arg | Phe | Glu Leu | Ile | Glu | Asp | Asn | Tyr | Alá |
850 | 855 | 860 | ||||||||||
Alá Val Asn | Glu | Met | Leu | Gly | Arg | Pro Thr | Lys | Val | Thr | Pro | Ser | Ser |
865 | 870 | 875 | 880 | |||||||||
Lys Val Val | Gly | Asp | Leu | Alá | Leu | His Leu | Val | Gly | Alá | Gly | Val | Asp |
885 | 890 | 895 | ||||||||||
Pro Alá Asp | Phe | Alá | Alá | Asp | Pro | Gin Lys | Tyr | Asp | Ile | Pro | Asp | Ser |
900 | 905 | 910 | ||||||||||
Val Ile Alá | Phe | Leu | Arg | Gly | Glu | Leu Gly | Asn | Pro | Pro | Gly | Gly | Trp |
915 | 920 | 925 | ||||||||||
Pro Glu Pro | Leu | Arg | Thr | Arg | Alá | Leu Glu | Gly | Arg | Ser | Glu | Gly | Lys |
930 | 935 | 940 | ||||||||||
Alá Pro Leu | Thr | Glu | Val | Pro | Glu | Glu Glu | Gin | Alá | His | Leu | Asp | Alá |
945 | 950 | 955 | 960 | |||||||||
Asp Asp Ser | Lys | Glu | Arg | Arg | Asn | Ser Leu | Asn | Arg | Leu | Leu | Phe | Pro |
965 | 970 | 975 | ||||||||||
Lys Pro Thr | Glu | Glu | Phe | Leu | Glu | His Arg | Arg | Arg | Phe | Gly | Asn | Thr |
980 | 985 | 990 | ||||||||||
Ser Alá Leu | Asp | Asp | Arg | Glu | Phe | Phe Tyr | Gly | Leu | Val | Glu | Gly | Arg |
995 | 1000 | 1005 | ||||||||||
Glu Thr Leu | Ile | Arg | Leu | Pro | Asp | Val Arg | Thr | Pro | Leu | Leu | Val | Arg |
1010 | 1015 | 1020 | ||||||||||
Leu Asp Alá | Ile | Ser | Glu | Pro | Asp | Asp Lys | Gly | Met | Arg | Asn | Val | Val |
1025 1030 1035 1040
HU 224 055 Β1
Alá | Asn | Val | Asn | Gly 1045 | Gin 1 | Ile | Arg | Pro | Met 1050 | Arg | Val | Arg | Asp | Arg 1055 | Ser |
Val | Glu | Ser | Val 1060 | Thr 1 | Alá | Thr | Alá | Glu 1065 | Lys 1 | Alá | Asp | Ser | Ser 1070 | Asn 1 | Lys |
Gly | His | Val 1075 | Alá | Alá | Pro | Phe | Alá 1080 | Gly 1 | Val | Val | Thr | Val 1085 | Thr | Val | Alá |
Glu | Gly 109C | Asp 1 | Glu | Val | Lys | Alá 1095 | Gly | Asp | Alá | Val | Alá 1100 | Ile 1 | Ile | Glu | Alá |
Met 1105 | Lys | Met | Glu | Alá | Thr 1110 | Ile 1 | Thr | Alá | Ser | Val 1115 | Asp | Gly | Lys | Ile | Asp 1120 |
Arg | Val | Val | Val | Pro 1125 | Alá | Alá | Thr | Lys | Val 1130 | Glu 1 | Gly | Gly | Asp | Leu 1135 | Ile |
Val | Val | Val | Ser |
1140
Claims (37)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK1. Eljárás aszparaginsav- és/vagy glutaminsavcsaládba tartozó aminosavak mikrobiális termeltetésére, azzal jellemezve, hogy megfelelő aminosavtermelő mikroorganizmusban az enzim genetikai módosításával és/vagy a piruvát-karboxiláz-gén expresszáltatásával fokozzuk a piruvát-karboxiláz-aktivitást.
- 2. Az 1. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy endogén piruvát-karboxiláz-gén mutagenezisével nagyobb piruvát-karboxiláz-aktivitású enzimet hozunk létre.
- 3. Az 1. vagy 2. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a piruvát-karboxiláz-gén expresszióját a gén kópiaszámának növelésével fokozzuk.
- 4. A 3. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a piruvát-karboxiláz-gén kópiaszámának növelése céljából a gént génkonstrukcióba foglaljuk.
- 5. A 3. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a gént olyan génkonstrukcióba foglaljuk, amely a piruvát-karboxiláz-génnel kapcsolódó szabályozószekvenciákat tartalmaz.
- 6. A 4. vagy 5. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a megfelelő aminosavtermelő mikroorganizmust a gént tartalmazó génkonstrukcióval transzformáljuk.
- 7. A 6. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a gént tartalmazó génkonstrukcióval Corynebacfer/um-nemzetségbe tartozó mikroorganizmust transzformálunk.
- 8. A 6. vagy 7. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan mikroorganizmust transzformálunk, amelyben a megfelelő aminosav szintézisében szerepet játszó enzim a szabályozás alól fel van szabadítva, és/vagy amely a megfelelő aminosavat illetően fokozott exportszállításí aktivitást mutat.
- 9. A 6-8. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan mikroorganizmust transzformálunk, amelyben a megfelelő aminosav szintézisében szerepet játszó anyagcseretermékek nagyobb mennyiségben vannak jelen.
- 10. A 6-9. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan mikroorganizmust transzformálunk, amelyben a megfelelő aminosav bioszintézises reakcióútjával kompetícióban lévő bioszintézises reakcióutak csökkent aktivitással játszódnak le.
- 11. Az 1-10. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a piruvát-karboxiláz-gént Corynebacterium-nemzetségbe tartozó mikroorganizmustörzsből izoláljuk.
- 12. Az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a génexpressziót a transzkripciós szignál erősítésével fokozzuk.
- 13. Az 1-12. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy piruvát-karboxiláz-génként a piruvát-karboxiláz-gén előtt tac-promotert tartalmazó génkonstrukciót alkalmazunk.
- 14. A 13. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan génkonstrukciót alkalmazunk, amelyben a tac-promoter szabályozószekvenciákhoz van kapcsolva.
- 15. Az 1-14. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy piruvát-karboxiláz-génként olyan gént alkalmazunk, amely a 2. azonosító számú szekvenciaként bemutatott aminosavszekvenciát kódoló nukleotidszekvenciát tartalmaz.
- 16. A 15. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy piruvát-karboxiláz-génként olyan gént alkalmazunk, amely az 1. azonosító számú szekvencia 165-3587. nukleotidjaiból álló nukleotidszekvenciát vagy azzal azonos aminosavszekvenciát kódoló DNS-szekvenciát tartalmaz.
- 17. Az 1-16. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy lizint, treonint, homoszerint, glutaminsavat és/vagy arginint állítunk elő.
- 18. Izolált piruvát-karboxiláz-gén, amely a 2. azonosító számú szekvenciaként bemutatott aminosavszekvenciát kódolja.HU 224 055 Β1
- 19. A 18. igénypont szerinti piruvát-karboxiláz-gén, amely az 1. azonosító számú szekvencia 165-3587. nukleotidjaiból álló nukleotidszekvenciát vagy azzal azonos aminosavszekvenciát kódoló DNS-szekvenciát tartalmaz.
- 20. A 18. vagy 19. igénypont szerinti piruvát-karboxiláz-gén, amelyhez az 1. azonosító számú szekvencia 20-109. nukleotídjait tartalmazó nukleotidszekvencia van kapcsolva.
- 21. A 18. vagy 19. igénypont szerinti piruvát-karboxiláz-gén, amelyhez tac-promoter van kapcsolva.
- 22. A 21. igénypont szerinti piruvát-karboxiláz-gén a promoterhez kapcsolódó szabályozószekvenciával együtt.
- 23. A 18-20. igénypont szerinti piruvát-karboxiláz-gén, a hozzákapcsolódó szabályozószekvenciákkal együtt.
- 24. Génkonstrukció, amely 18-23. igénypontok bármelyike szerinti piruvát-karboxiláz-gént tartalmaz.
- 25. Vektor, amely 18-23. igénypontok bármelyike szerinti piruvát-karboxiláz-gént vagy 24. igénypont szerinti gén konstrukciót tartalmaz.
- 26. Transzformált sejt, amely replikációra alkalmas alakban 18-23. igénypontok bármelyike szerinti piruvát-karboxiláz-gént vagy 24. igénypont szerinti génkonstrukciót tartalmaz.
- 27. A 26. igénypont szerinti transzformált sejt, amely 25. igénypont szerinti vektort tartalmaz.
- 28. A 26. vagy 27. igénypont szerinti transzformált sejt, amely a Corynebacterium-nemzetségbe tartozik.
- 29. A 26-28. igénypontok bármelyike szerinti transzformáit sejt, amelyben a megfelelő aminosav szintézisében szerepet játszó enzimek és/vagy a megfelelő aminosav szállításában szerepet játszó enzimek a szabályozás alól fel vannak szabadítva.
- 30. A 26-29. igénypontok bármelyike szerinti transzformált sejt, amely a központi anyagcsere - megfelelő aminosav szintézisében szerepet játszó - anyagcseretermékeiből fokozott mennyiséget tartalmaz.
- 31. A 26-30. igénypontok bármelyike szerinti transzformált sejt, amely a központi anyagcsere - megfelelő aminosav szintézisében szerepet nem játszó anyagcseretermékeiből csökkentett mennyiséget tartalmaz.
- 32. Piruvát-karboxiláz-gén alkalmazása aszparaginsav- és/vagy glutaminsavesaládba tartozó aminosavak mikroorganizmusokban történő termelődésének fokozására.
- 33. A 32. igénypont szerinti alkalmazás, azzal jellemezve, hogy fokozott piruvát-karboxiláz-aktivitású enzimet kódoló, mutagenizált piruvát-karboxiláz-gént alkalmazunk.
- 34. A 32. vagy 33. igénypont szerinti alkalmazás, azzal jellemezve, hogy a megfelelő aminosavat termelő mikroorganizmust piruvát-karboxiláz-gént tartalmazó génkonstrukcióval transzformáljuk.
- 35. A 34. igénypont szerinti alkalmazás, azzal jellemezve, hogy a megfelelő aminosavat termelő mikroorganizmust olyan génkonstrukcióval transzformáljuk, amely szabályozószekvenciákat is tartalmaz.
- 36. A 32-35. igénypontok bármelyike szerinti alkalmazás, azzal jellemezve, hogy Corynebacteriumból származó piruvát-karboxiláz-gént alkalmazunk.
- 37. A 32-36. igénypontok bármelyike szerinti alkalmazás, azzal jellemezve, hogy aminosavtermelő mikroorganizmusként Corynebacteriumot alkalmazunk.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19743894 | 1997-10-04 | ||
DE19831609A DE19831609B4 (de) | 1997-10-04 | 1998-07-14 | Verfahren zur Herstellung von Aminosäuren der Aspartat- und/oder Glutamatfamilie und im Verfahren einsetzbare Mittel |
PCT/EP1998/006210 WO1999018228A2 (de) | 1997-10-04 | 1998-09-30 | Verfahren zur mikrobiellen herstellung von aminosäuren der aspartat- und/oder glutamatfamilie und im verfahren einsetzbare mittel |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HUP0004381A1 HUP0004381A1 (en) | 2001-03-28 |
HUP0004381A3 HUP0004381A3 (en) | 2003-08-28 |
HU224055B1 true HU224055B1 (hu) | 2005-05-30 |
Family
ID=26040582
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU0004381A HU224055B1 (hu) | 1997-10-04 | 1998-09-30 | Eljárás aszparaginsav és/vagy glutaminsav családba tartozó aminosavak mikrobiális termeltetésére, és hatóanyagok az eljárásban történő alkalmazásra |
Country Status (15)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US7267967B1 (hu) |
EP (1) | EP1015621B1 (hu) |
JP (1) | JP2002508921A (hu) |
CN (1) | CN1323171C (hu) |
AT (1) | ATE290602T1 (hu) |
AU (1) | AU741038B2 (hu) |
BR (1) | BRPI9813021B1 (hu) |
CA (1) | CA2305577A1 (hu) |
DE (1) | DE59812638D1 (hu) |
ES (1) | ES2238773T3 (hu) |
HU (1) | HU224055B1 (hu) |
ID (1) | ID26644A (hu) |
RU (1) | RU2231552C2 (hu) |
SK (1) | SK284235B6 (hu) |
WO (1) | WO1999018228A2 (hu) |
Families Citing this family (85)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2194122B1 (en) | 1998-04-13 | 2015-12-02 | The University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Pyruvate carboxylase overexpression for enhanced production of oxaloacetate-derived biochemicals in microbial cells |
DE19931317A1 (de) * | 1999-07-07 | 2001-01-11 | Degussa | L-Lysin produzierende coryneforme Bakterien und Verfahren zur Herstellung von L-Lysin |
AU2203399A (en) * | 1998-12-23 | 2000-07-31 | Massachusetts Institute Of Technology | Pyruvate carboxylase from (corynebacterium glutamicum) |
US6171833B1 (en) | 1998-12-23 | 2001-01-09 | Massachusetts Institute Of Technology | Pyruvate carboxylase from corynebacterium glutamicum |
JP2000201692A (ja) | 1999-01-13 | 2000-07-25 | Ajinomoto Co Inc | 発酵法によるl―グルタミン酸の製造法 |
TW200734459A (en) | 1999-10-04 | 2007-09-16 | Ajinomoto Kk | Genes for heat resistant enzymes of amino acid biosynthetic pathway derived from thermophilic coryneform bacteria |
DE19947792A1 (de) * | 1999-10-05 | 2001-04-12 | Degussa | Neue für das Irp Gen codierende Nukleotidsequenzen |
US7132272B2 (en) | 1999-10-05 | 2006-11-07 | Degussa Ag | Nucleotide sequence encoding corynebacterium glutamicum leucine response regulatory protein |
RU2207376C2 (ru) * | 1999-10-14 | 2003-06-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | Способ получения l-аминокислоты методом ферментации, штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-аминокислоты (варианты) |
US6949374B2 (en) | 2000-05-04 | 2005-09-27 | Degussa Ag | FadD15 gene of Corynebacterium glutamicum, encoding an acyl-CoA synthase polypeptide |
DE10021831A1 (de) * | 2000-05-04 | 2001-11-08 | Degussa | Neue für das fadD15-Gen kodierende Nukleotidsequenzen |
DE10032350A1 (de) | 2000-07-04 | 2002-01-24 | Degussa | Neue für das mdhA-Gen kodierende Nukleotidsequenzen |
EP1307562B1 (en) * | 2000-08-10 | 2004-12-15 | Degussa AG | Nucleotide sequences which code for the lysr3 gene |
DE10039049A1 (de) | 2000-08-10 | 2002-02-21 | Degussa | Neue für das IysR3-Gen kodierende Nukleotidsequenzen |
DE10042051A1 (de) * | 2000-08-26 | 2002-03-07 | Degussa | Neue für das cstA-Gen kodierende Nukleotidsequenzen |
PL364087A1 (en) * | 2001-02-21 | 2004-12-13 | Basf Aktiengesellschaft | Method for the production of d-pantothenic acid and/or salts thereof as adjunct for animal feedstuffs |
JP2004523237A (ja) * | 2001-02-21 | 2004-08-05 | ビーエーエスエフ アクチェンゲゼルシャフト | 動物飼料添加剤としてのd−パントテン酸および/またはその塩の製造方法 |
DE10108223A1 (de) * | 2001-02-21 | 2002-10-10 | Basf Ag | Verfahren zur Herstellung von D-Pantothensäure und/oder deren Salze als Zusatz zu Tierfuttermitteln |
DE10108225A1 (de) * | 2001-02-21 | 2002-10-10 | Basf Ag | Verfahren zur Herstellung von D-Pantothensäure und/oder deren Salze als Zusatz zu Tierfuttermitteln |
EP1407035B1 (en) | 2001-07-18 | 2006-04-12 | Degussa AG | Process for the preparation of l-amino acids using strains of the enterobacteriaceae family which contain an attenuated aspa gene |
ATE434663T1 (de) | 2001-07-18 | 2009-07-15 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur herstellung von l-threonin durch enterobakteriaceae-stämmen mit verstärkter exprimierung der succ und sucd gene |
CA2456416A1 (en) * | 2001-08-06 | 2003-02-20 | Degussa Ag | Coryneform bacteria which produce chemical compounds ii |
US8278076B2 (en) | 2002-02-20 | 2012-10-02 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Microbial production of pyruvate and pyruvate derivatives |
DE10303571A1 (de) | 2003-01-30 | 2004-08-12 | Degussa Ag | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE10316109A1 (de) | 2003-04-09 | 2004-10-21 | Degussa Ag | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE102004005836A1 (de) | 2004-02-06 | 2005-09-15 | Degussa Ag | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE102004037572A1 (de) * | 2004-08-03 | 2006-02-23 | Degussa Ag | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE102005018835A1 (de) | 2005-04-22 | 2006-11-02 | Degussa Ag | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung verbesserter Stämme der Familie Enterobacteriaceae |
DE102005043979A1 (de) | 2005-09-15 | 2007-03-22 | Forschungszentrum Jülich GmbH | Verfahren zur Produktion von Aminosäuren in aminosäureproduzierenden Mikroorganismen |
JP2009118740A (ja) | 2006-03-03 | 2009-06-04 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
DE102006032634A1 (de) | 2006-07-13 | 2008-01-17 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren |
EP2066782A4 (en) * | 2006-09-15 | 2010-02-03 | Cj Cheiljedang Corp | CORYNEBACTERIA WITH IMPROVED L-LYSINE PRODUCTIVITY AND METHOD FOR THE PREPARATION OF L-LYSINE THEREWITH |
JP2010041920A (ja) | 2006-12-19 | 2010-02-25 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
KR100830826B1 (ko) | 2007-01-24 | 2008-05-19 | 씨제이제일제당 (주) | 코리네박테리아를 이용하여 글리세롤을 포함한탄소원으로부터 발효산물을 생산하는 방법 |
JP2010088301A (ja) | 2007-02-01 | 2010-04-22 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP2010110216A (ja) | 2007-02-20 | 2010-05-20 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸または核酸の製造方法 |
DE102007051024A1 (de) | 2007-03-05 | 2008-09-11 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
EP1975241A1 (de) | 2007-03-29 | 2008-10-01 | Evonik Degussa GmbH | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
JP2010226956A (ja) * | 2007-07-23 | 2010-10-14 | Ajinomoto Co Inc | L−リジンの製造法 |
EP2192170B1 (en) | 2007-09-04 | 2017-02-15 | Ajinomoto Co., Inc. | Amino acid-producing microorganism and method of producing amino acid |
DE102007044134A1 (de) | 2007-09-15 | 2009-03-19 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE102007052270A1 (de) | 2007-11-02 | 2009-05-07 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
EP2060636A1 (de) | 2007-11-14 | 2009-05-20 | Evonik Degussa GmbH | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
JP2011067095A (ja) | 2008-01-10 | 2011-04-07 | Ajinomoto Co Inc | 発酵法による目的物質の製造法 |
CN102348806A (zh) | 2008-01-23 | 2012-02-08 | 味之素株式会社 | L-氨基酸的生产方法 |
EP2098597A1 (de) | 2008-03-04 | 2009-09-09 | Evonik Degussa GmbH | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
US8932861B2 (en) | 2008-04-10 | 2015-01-13 | Cj Cheiljedang Corporation | Transformation vector comprising transposon, microorganisms transformed with the vector, and method for producing L-lysine using the microorganism |
KR101126041B1 (ko) | 2008-04-10 | 2012-03-19 | 씨제이제일제당 (주) | 트랜스포존을 이용한 형질전환용 벡터, 상기 벡터로형질전환된 미생물 및 이를 이용한 l-라이신 생산방법 |
DE102008001874A1 (de) | 2008-05-20 | 2009-11-26 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren |
DE102008002309A1 (de) | 2008-06-09 | 2009-12-10 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE102008044768A1 (de) | 2008-08-28 | 2010-03-04 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Herstellung von organisch-chemischen Verbindungen unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
CN102177246B (zh) | 2008-09-08 | 2015-02-11 | 味之素株式会社 | 生产l-氨基酸的微生物和l-氨基酸的生产方法 |
JP2012029565A (ja) | 2008-11-27 | 2012-02-16 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
EP2267145A1 (de) | 2009-06-24 | 2010-12-29 | Evonik Degussa GmbH | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von verbesserten Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
WO2011013707A1 (ja) | 2009-07-29 | 2011-02-03 | 味の素株式会社 | L-アミノ酸の製造法 |
JP2012223092A (ja) | 2009-08-28 | 2012-11-15 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP2013013329A (ja) | 2009-11-06 | 2013-01-24 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
MX2012009816A (es) | 2010-02-25 | 2012-12-10 | Council Scient Ind Res | Procesos para la produccion de arginina utilizando corynebacterium glutamicum atcc 21831 o corynebacterium glutamicum atcc 21493 en un medio de fermentacion que comprende bagazo de mandioca o semilla del fruto de panapen como una fuente de carbono. |
KR101145943B1 (ko) | 2010-03-11 | 2012-05-15 | 씨제이제일제당 (주) | L-아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법 |
JP5796282B2 (ja) * | 2010-08-31 | 2015-10-21 | 東レ株式会社 | コリネ型細菌による化学品の製造方法 |
RU2496867C2 (ru) * | 2011-04-25 | 2013-10-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | Способ получения l-аминокислоты семейства глутамата с использованием коринеформной бактерии |
EP2540834A1 (en) | 2011-06-29 | 2013-01-02 | Metabolic Explorer | Method for the preparation of 1,3-propanediol |
CN105483145B (zh) * | 2011-12-21 | 2021-04-06 | Cj第一制糖株式会社 | 利用具有产生l-赖氨酸能力的微生物产生l-赖氨酸的方法 |
JP5831669B2 (ja) | 2013-05-13 | 2015-12-09 | 味の素株式会社 | L−アミノ酸の製造法 |
EA201591846A1 (ru) * | 2013-05-17 | 2016-08-31 | Ксилеко, Инк. | Обработка биомассы |
JP2016165225A (ja) | 2013-07-09 | 2016-09-15 | 味の素株式会社 | 有用物質の製造方法 |
JP2016192903A (ja) | 2013-09-17 | 2016-11-17 | 味の素株式会社 | 海藻由来バイオマスからのl−アミノ酸の製造方法 |
ES2761596T3 (es) | 2013-10-02 | 2020-05-20 | Ajinomoto Kk | Aparato de control de amoniaco y método de control de amoniaco |
JP6459962B2 (ja) | 2013-10-21 | 2019-01-30 | 味の素株式会社 | L−アミノ酸の製造法 |
JP6519476B2 (ja) | 2013-10-23 | 2019-05-29 | 味の素株式会社 | 目的物質の製造法 |
CN105505969A (zh) * | 2014-09-26 | 2016-04-20 | 中国科学院天津工业生物技术研究所 | 一种提高l-苏氨酸转化率的方法及其应用 |
JP6623690B2 (ja) | 2015-10-30 | 2019-12-25 | 味の素株式会社 | グルタミン酸系l−アミノ酸の製造法 |
JP7066977B2 (ja) | 2017-04-03 | 2022-05-16 | 味の素株式会社 | L-アミノ酸の製造法 |
DE102017004751A1 (de) | 2017-05-18 | 2018-11-22 | Forschungszentrum Jülich GmbH | Pyruvatcarboxylase und für die Pyruvatcarboxylase kodierende DNA, Plasmid enthaltend die DNA, sowie Mikroorganismus zur Produktion und verfahren zur Herstellung von Produkten, deren Bioynthese Oxalacetat als Vorstufe beeinhaltet und Chromosom |
EP3467099A1 (en) | 2017-10-05 | 2019-04-10 | Evonik Degussa GmbH | Method for the fermentative production of l-amino acids |
EP3608409A1 (en) | 2018-08-09 | 2020-02-12 | Evonik Operations GmbH | Process for preparing l amino acids using improved strains of the enterobacteriaceae family |
EP3847270A1 (en) | 2018-09-07 | 2021-07-14 | Archer Daniels Midland Company | Engineered strains of corynebacteria |
RU2019128538A (ru) | 2018-09-26 | 2021-03-11 | Эвоник Оперейшенс ГмбХ | Способ ферментативного получения l-лизина |
WO2020071538A1 (en) | 2018-10-05 | 2020-04-09 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing target substance by bacterial fermentation |
CN113755492B (zh) * | 2020-07-20 | 2023-05-30 | 中国科学院天津工业生物技术研究所 | 丙酮酸羧化酶基因启动子的突变体及其应用 |
JPWO2022092018A1 (hu) | 2020-10-28 | 2022-05-05 | ||
WO2023222510A1 (en) | 2022-05-18 | 2023-11-23 | Evonik Operations Gmbh | Biotechnological production of desferrioxamines and analogs thereof |
WO2023222515A1 (en) | 2022-05-18 | 2023-11-23 | Evonik Operations Gmbh | Biotechnological production of bisucaberins, desferrioxamines and analogs thereof |
WO2023222505A1 (en) | 2022-05-18 | 2023-11-23 | Evonik Operations Gmbh | Biotechnological production of monomers of bisucaberins, desferrioxamines and analogs thereof |
US20240117393A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-11 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing l-amino acid |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB2223754B (en) | 1988-09-12 | 1992-07-22 | Degussa | Dna encoding phosphoenolpyruvate carboxylase |
DE4201085A1 (de) | 1992-01-17 | 1993-07-22 | Degussa | Verfahren zur erhoehung der leistungsfaehigkeit l-lysin ausscheidender coryneformer bakterien |
HU219600B (hu) * | 1993-08-24 | 2001-05-28 | Ajinomoto Co., Inc. | Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, ennek génje, valamint eljárás aminosav előállítására |
US5939307A (en) * | 1996-07-30 | 1999-08-17 | The Archer-Daniels-Midland Company | Strains of Escherichia coli, methods of preparing the same and use thereof in fermentation processes for l-threonine production |
DE60030400T2 (de) * | 1999-07-09 | 2007-09-13 | Degussa Gmbh | Für den opac-gen kodierende nukleotidsequenzen |
DE19941478A1 (de) * | 1999-09-01 | 2001-03-08 | Degussa | Neue für das thrE-Gen codierende Nukleotidsequenzen und Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Threonin mit coryneformen Bakterien |
DE19959329A1 (de) * | 1999-12-09 | 2001-06-13 | Degussa | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer Bakterien |
DE10154102A1 (de) * | 2001-11-02 | 2003-05-15 | Degussa | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
-
1998
- 1998-09-30 SK SK4812000A patent/SK284235B6/sk unknown
- 1998-09-30 CN CNB988098385A patent/CN1323171C/zh not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-30 BR BRPI9813021A patent/BRPI9813021B1/pt active IP Right Grant
- 1998-09-30 JP JP2000515022A patent/JP2002508921A/ja active Pending
- 1998-09-30 ID IDW20000634A patent/ID26644A/id unknown
- 1998-09-30 US US09/529,043 patent/US7267967B1/en not_active Expired - Fee Related
- 1998-09-30 RU RU2000111541/13A patent/RU2231552C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1998-09-30 DE DE59812638T patent/DE59812638D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-30 AT AT98954301T patent/ATE290602T1/de not_active IP Right Cessation
- 1998-09-30 WO PCT/EP1998/006210 patent/WO1999018228A2/de active IP Right Grant
- 1998-09-30 EP EP98954301A patent/EP1015621B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-30 HU HU0004381A patent/HU224055B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1998-09-30 CA CA002305577A patent/CA2305577A1/en not_active Abandoned
- 1998-09-30 AU AU11482/99A patent/AU741038B2/en not_active Ceased
- 1998-09-30 ES ES98954301T patent/ES2238773T3/es not_active Expired - Lifetime
-
2007
- 2007-04-05 US US11/732,869 patent/US20070202571A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
SK284235B6 (en) | 2004-11-03 |
ES2238773T3 (es) | 2005-09-01 |
CN1275167A (zh) | 2000-11-29 |
CN1323171C (zh) | 2007-06-27 |
DE59812638D1 (de) | 2005-04-14 |
ID26644A (id) | 2001-01-25 |
EP1015621A2 (de) | 2000-07-05 |
US20070202571A1 (en) | 2007-08-30 |
AU1148299A (en) | 1999-04-27 |
EP1015621B1 (de) | 2005-03-09 |
HUP0004381A1 (en) | 2001-03-28 |
RU2231552C2 (ru) | 2004-06-27 |
BRPI9813021B1 (pt) | 2016-04-05 |
CA2305577A1 (en) | 1999-04-15 |
HUP0004381A3 (en) | 2003-08-28 |
AU741038B2 (en) | 2001-11-22 |
WO1999018228A2 (de) | 1999-04-15 |
ATE290602T1 (de) | 2005-03-15 |
BR9813021A (pt) | 2000-08-15 |
SK4812000A3 (en) | 2000-09-12 |
WO1999018228A3 (de) | 1999-05-20 |
JP2002508921A (ja) | 2002-03-26 |
US7267967B1 (en) | 2007-09-11 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
HU224055B1 (hu) | Eljárás aszparaginsav és/vagy glutaminsav családba tartozó aminosavak mikrobiális termeltetésére, és hatóanyagok az eljárásban történő alkalmazásra | |
KR100526316B1 (ko) | 아스파테이트 및 글루타메이트계열 아미노산의 미생물적제조방법과 이 방법에 사용되는 작용제 | |
KR100337959B1 (ko) | 돌연변이체포스포에놀피루베이트카복실라제,이의유전자및아미노산의제조방법 | |
KR100976072B1 (ko) | 에스세리키아속 세균을 사용하는 l-트레오닌의 제조방법 | |
US10526586B2 (en) | Pyruvate dehydrogenase variants, a microorganism comprising the same and a method for producing L-amino acid using the same | |
RU2761871C1 (ru) | Новый экспортер L-триптофана и способ продуцирования L-триптофана с его использованием | |
GB2223754A (en) | Dna coding for phosphoenolpyruvate carboxylase | |
US8535915B2 (en) | Promoter, and a production method for L-lysine using the same | |
JP2001136991A (ja) | 発酵法によるl−アミノ酸の製造法 | |
US10253339B2 (en) | Gluconate repressor variant, microorganism containing the same producing L-lysine, and method for producing L-lysine | |
WO1995023224A1 (fr) | Nouveau gene tire de corynebacterium et son utilisation | |
KR20020073153A (ko) | L-아미노산의 제조법 및 신규 유전자 | |
JP2001190290A (ja) | 遺伝子sucCおよびsucDをコードする新規のヌクレオチド配列 | |
JP2009507505A (ja) | 微生物を使用するアミノ酸産生法 | |
US10597686B2 (en) | Polypeptide having the activity of exporting O-acetyl-homoserine | |
KR102126951B1 (ko) | 디하이드로디피콜린산 리덕타제 변이형 폴리펩티드 및 이를 이용한 l-쓰레오닌 생산방법 | |
KR100830860B1 (ko) | 메틸로필루스 메틸로트로푸스로부터 유도된 신규한 효소및 이를 암호화하는 유전자 | |
CN114630903B (zh) | 内消旋-二氨基庚二酸脱氢酶的修饰多肽及使用其生产l-苏氨酸的方法 | |
KR20220101509A (ko) | GlxR 단백질 변이체 또는 이를 이용한 쓰레오닌 생산방법 | |
EP2397545B1 (en) | Method for producing amino acid | |
MXPA00003224A (en) | Method for microbial production of amino acids of the aspartate and/or glutamate family and agents which can be used in said method |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
HFG4 | Patent granted, date of granting |
Effective date: 20050311 |
|
MM4A | Lapse of definitive patent protection due to non-payment of fees |