CN110279853A - 包含聚合载体货物复合物和至少一种蛋白或肽抗原的药物组合物 - Google Patents

包含聚合载体货物复合物和至少一种蛋白或肽抗原的药物组合物 Download PDF

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帕特里克·鲍姆霍夫
托马斯·克兰普斯
索渥克·福斯
卡尔-约瑟夫·卡伦
马里奥啦·福廷-姆莱泽科
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Abstract

本发明涉及一种药物组合物,其包括(例如,用作佐剂)聚合载体货物复合物,包含作为载体的由二硫键交联的阳离子组分形成的聚合载体;和作为货物的至少一种核酸分子,以及至少一种抗原,所述抗原选自下述:来自与传染病相关的病原体的抗原;与变态反应或变应性疾病相关的抗原;与自身免疫病相关的抗原;或与癌症或肿瘤疾病相关的抗原,或在每种情形中是所述抗原的片段、变体和/或衍生物。所述药物组合物允许有效诱导针对所述抗原的适应性免疫应答。本发明还提供试剂盒以及所述药物组合物或试剂盒作为疫苗的应用,特别是用于治疗传染病、变态反应、自身免疫病和肿瘤或癌症疾病的疫苗的应用。

Description

包含聚合载体货物复合物和至少一种蛋白或肽抗原的药物组 合物
本申请是申请日为2013年01月31日、申请号为201380007095.3、发明名称为“包含聚合载体货物复合物和至少一种蛋白或肽抗原的药物组合物”的中国发明专利申请的分案申请。
技术领域
本发明涉及一种包含聚合载体货物复合物和至少一种抗原的药物组合物。所述聚合载体货物复合物优选包含载体和货物,其中所述载体是二硫键交联的阳离子组分,所述货物是至少一种核酸分子。所述至少一种抗原优选地选自来自与传染病相关的病原体的抗原,与变态反应(allergy)或变应性疾病相关的抗原,与自身免疫病(autoimmune disease)相关的抗原,或与癌症或肿瘤疾病相关的抗原,或在每种情形中是所述抗原的片段、变体和/或衍生物。所述本发明的药物组合物可以是,例如,疫苗,其中所述聚合载体货物复合物可以作用为佐剂以支持针对所述抗原的免疫应答。因此,所述药物组合物允许有效的诱导针对其中所包含的至少一种抗原的适应性免疫应答,特别是Th1-转变的免疫应答(Th1-shifted immune response)。
本发明还提供包含本发明的药物组合物的组分的试剂盒或部件的试剂盒,以及本发明的药物组合物或本发明的试剂盒或部件的试剂盒作为特别是用于治疗传染病、变态反应、自身免疫病和肿瘤或癌症疾病的疫苗的应用。此外,本发明提供:(a)聚合载体货物复合物,其与至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物组合用于治疗;和(b)至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物,其与聚合载体货物复合物组合用于治疗,在(a)和(b)的每种情形中,特别是用于治疗传染病、变态反应、自身免疫病以及肿瘤或癌症疾病。
背景技术
目前有许多疾病需要施用佐剂以提供先天性免疫应答,从而支持适应性免疫应答,特别是在接种的情形中。这些疾病中的一些而不必要是全部另外或备选地需要施用基于肽、蛋白和核酸的药物,例如,将核酸转染到细胞或组织中。这些要求通常表示此类疾病的治疗的不同方面,并且典型地难以以一种方法解决。结果,现有技术通常通过不同的方法处理所述的各个方面。
在上述情形中,通常认为接种是最有效且成本有效的预防或治疗疾病的方法之一。然而,疫苗开发中的一些问题已经证明是难以解决的:对于非常年轻和非常年老的人,疫苗常常无效;许多疫苗需要给予多次,并且它们所赋予的保护随时间减弱,需要加强施用,并且,对于一些疾病,如HIV,亟需开发有效的疫苗。如通常所接受的,如果其能够激发更强且更持久的免疫应答,则这些疫苗中的多种将被允许或改善。
由此,开发新的有效且安全的下述药物组合物代表主要的有挑战性问题,所述药物组合物包含用于接种目的的佐剂,其通过起始或加强平行的先天性免疫应答而支持适应性免疫应答的诱导和维持。
佐剂通常定义为能够增加和/或调节抗原的固有免疫原性的化合物。为了减少不利的副作用,与先前的全细胞或基于病毒的疫苗相比,新的疫苗具有通常导致更低的免疫原性的更加限定的组成。因此,需要佐剂来辅助新的疫苗诱导强有力而且持久的免疫应答,还有需要更少的抗原和更少注射次数的另外的益处。现在,清楚的是,适应性免疫应答主要依赖于注射或接种后由先天免疫细胞感知到的初始危险信号的水平和特异性(Guy,B.(2007),Nat Rev Microbiol(自然微生物学综述)5(7):505-17.)。特别是对于新一代疫苗候选物,其日益包含高度纯化的重组蛋白,并且尽管非常安全,但是免疫原性差,有效的佐剂日益变成必需的。
不幸的是,迄今为止仅有少数得到许可的佐剂是可以用的。最突出的是白矾(Alum),已知其是安全的,但是也代表着一种非常弱的佐剂。已经开发了多种其他的佐剂,例如,包括施用病原体、CpG-核苷酸等。然而,由于必须考虑和解决许多新的和刚出现的问题,这些新的或“已确定的”佐剂中大部分仍然不满足上述要求。这些问题特别包括新的和再次出现的传染病、重复的施用、流行性感冒的威胁等等。
此外,通常更难以开发新的疫苗靶标,并且,-由于其特异性定制的免疫应答-需要更有力的佐剂才能够成功。此外,仍然存在显著数量的重要的病原体,我们目前甚至没有有效的针对其的疫苗。这成为非常有挑战性的远景靶标。为了能够进行针对所述靶标的疫苗开发,将需要包含佐剂和所述靶标的更强效的药物组合物。因此,在此类组合物中的新的佐剂将需要提供一些优点,包括更加异源性的抗体应答,覆盖病原体的多样性,诱导强效功能性抗体应答,确保病原体杀伤或中和以及更有效的T细胞应答的诱导,用于直接或间接的病原体杀伤,特别是诱导作为Th1免疫应答的一部分的细胞毒性T细胞。另外,佐剂可能有必要获得更实用的效果,包括抗原剂量减少和克服组合疫苗中的抗原竞争。并且,针对老年群体的背景,其日益对传染病敏感,新的佐剂必须克服免疫应答随年龄的自然减弱(O′Hagan,D.T.和E.De Gregorio(2009),Drug Discov Today(现代药物发现)14(11-12):541-51.)。
O’Hagan(2009;同上)的综述总结了亟需新的有效的佐剂的一些原因,例如,需要疫苗中更低的抗原剂量,增加免疫应答的广度和异源性活性的必要性,允许复杂的组合疫苗,并且克服抗原竞争,克服在一些群体组(诸如老年人、幼儿和婴儿、患有慢性疾病和免疫受损的患者)中的有限的免疫应答,增加效应T细胞应答和抗体滴度,更快速地诱导保护性反应,并且还通过增强记忆B和T细胞应答而延长反应的持续时间。
综上所述,需要包含免疫刺激剂或佐剂的新的有效的且安全的药物组合物,其优选有效地诱导先天性免疫应答,特别是诱导抗病毒细胞因子IFN-α;并且其还有效地支持适应性免疫应答;安全,即不与任意长期的作用相关;其是充分耐受的;其可通过简单的合成途径获得;其表现出低成本的储存条件(特别是可行的冷冻干燥);其需要简单且廉价的组分;其是可生物降解的;其与多种不同种类的疫苗抗原相容;其能够同时递送抗原和免疫增强剂,等等。
如上文已经解释的,佐剂或免疫刺激剂通常通过其诱导先天性免疫应答的能力起作用。在大部分生物体中,先天性免疫系统形成宿主防御的主要系统,并且包括屏障,诸如体液和化学屏障(例如,包括炎症),补体系统和细胞屏障。先天性免疫系统典型地基于称为模式识别受体(pattern recognition receptors)的少量的受体。它们识别区分外源生物体与宿主细胞的保守的分子模式,所述外源生物体如病毒、细菌、真菌和寄生虫。此类病原体-相关的分子模式(PAMP)包括病毒核酸、细菌和真菌壁的组分、鞭毛蛋白及其他。详细研究的第一模式识别受体(PAMP受体)家族是Toll样受体(TLR)家族。TLRs是识别胞外环境的配体或内体腔的配体的跨膜蛋白。配体结合后,它们通过胞质衔接蛋白转导信号,这导致引发宿主防御反应并且使抗微生物肽、促炎症趋化因子和细胞因子、抗病毒细胞因子等的产生(例如,参见Meylan,E.,J.Tschopp,等人,(2006),Nature(自然)442(7098):39-44)。其他相关的免疫系统组分包括,例如,内体TLRs,胞质受体,I型干扰素和胞质受体。因此,所述免疫刺激剂或佐剂在本文中优选定义为先天性免疫应答的诱导剂,其激活模式识别受体(PAMP受体)。由此,激发信号级联,例如,其可以导致支持先天性免疫应答的细胞因子(例如,IFN-α)的释放。因此,优选地,免疫刺激剂或佐剂的特征是结合此类受体并且激活此类PAMP受体。理想地,所述试剂或佐剂另外通过例如转换免疫应答而支持适应性免疫应答,以使优选种类的Th细胞被激活。取决于要治疗的疾病或病症,向基于Th1的免疫应答的转换可能是优选的,或者在其他情形中,向Th2免疫应答的转换可能是优选的。
在现有技术中,存在一些有希望的佐剂候选物,其至少满足上文限定的需要的特征中的一些而不是全部特征。
例如,在上述开发的新的佐剂中,一些核酸,如CpG DNA寡核苷酸或isRNA(免疫刺激RNA),由于它们允许治疗性或预防性诱导先天性免疫应答而被证明是用于新的免疫刺激剂或佐剂的有希望的候选物。能够理解,基于所述核酸的佐剂通常必须被有效地递送至作用位点以允许诱导有效的先天性免疫应答,而没有不必要的佐剂活性损失,并且在一些情形中,不需要增加施用体积超过系统耐受的水平。
解决这一问题的一种方法可以是用免疫刺激性核酸转染作为先天免疫系统的一部分的细胞(例如,树突细胞、类浆细胞树突细胞(pDCs)),所述免疫刺激性核酸是PAMP受体(例如,Toll-样受体(TLRs))的配体,并且因此可以通过所述核酸配体导致免疫刺激。其他方法可以是直接转染基于核酸的佐剂。然而,所有这些方法都典型地被低效率的核酸递送减弱,并且因此减少佐剂活性,特别是在局部施用时。
然而,迄今为止,所述基于核酸的佐剂方法的一个主要的缺点是其有限的穿过哺乳动物细胞质膜的能力,这导致差的细胞进入和不足的治疗功效。迄今为止,这种障碍成为基于核酸转染的应用(例如,生物医药开发以及因此的多种生物药剂的商业成功)的主要挑战(例如,参见Foerg,C.& Merkle,H.P.,J Pharm Sci(制药科学杂志)97,144-62(2008))。
迄今为止,已经在体外转染目的的情形中和在基因治疗方法的情形中研究了将核酸或基因转染到细胞或组织中。然而,目前尚没有基于所述基因递送技术、有效且安全的佐剂可用,特别是没有得到许可的佐剂。这可能是由于在基于核酸的佐剂的情形中通常与要解决的稳定性问题组合的对佐剂的复杂的要求。
然而,将核酸或基因转染至细胞或组织中用于引发(先天性和/或适应性)免疫应答似乎提供了一种提供新的佐剂的有希望的方法。
然而,这些方法中的多种利用将核酸或基因转染到细胞或组织中,而没有诱导先天性免疫应答的目的。甚至存在一些基因治疗法,其必须严格地避免诱导先天性免疫应答。甚至在少见的情形中,其中进行接种以利用核酸的施用来诱导适应性抗原特异性免疫应答,例如,在使用DNA或mRNA编码的抗原进行的肿瘤接种中,适应性免疫应答的诱导典型地作为针对所编码的抗原的主动免疫而不是作为伴随的佐剂治疗而进行,并且因此可能需要另外施用单独的佐剂来诱导先天性免疫应答。
即使本领域已知多种转染方法,将核酸或基因转移或插入到个体细胞中仍然成为目前的主要挑战,并且还没有得到令人满意地解决。为了解决这一复杂的问题,在近十年中开发了多种方法。这些包括通过磷酸钙、阳离子脂质、阳离子聚合物和脂质体转染。其他转染方法是电穿孔和病毒转导。
然而,如技术人员知晓的,用于转移或插入核酸或基因的系统必须满足用于体内应用的一些要求,其包括以高功能性有效的向个体系统中的核酸递送,保护所核酸抵抗普遍存在的核酸酶,在细胞中释放所述核酸,没有安全性顾虑,以能够规模化的商业可接受的形式可行性制备以及在低成本条件下的储存稳定性(例如,可行的冷冻干燥)。这些要求应该添加到佐剂的复杂要求中,特别是当其是上文列出的核酸的形式时。
目前可用的用于转移或插入核酸或基因的一些成功的策略依赖于病毒载体的使用,诸如腺病毒、腺伴随病毒、反转录病毒和疱疹病毒。病毒载体能够以高效和长期基因表达的可能性介导基因转移。然而,在基因治疗临床试验中揭示的急性免疫应答(“细胞因子爆发”)、免疫原性和插入诱变已经引起了关于一些常用的病毒载体的严重的安全性担忧。
对转移或插入核酸或基因的问题的另一种解决方案可以使用非病毒载体进行。尽管非病毒载体不如病毒载体有效,但是已经开发了多种非病毒载体以提供更安全的备选方案。已经使用物理(不用载体的核酸递送)和化学方法(基于合成的载体的核酸递送)研究了非病毒核酸递送的方法。物理方法通常包括针头注射、电穿孔、基因枪、超声和流体动力学递送,利用穿透细胞膜并且促进胞内基因转移的物理力进行。化学方法典型地使用合成的或天然存在的化合物(例如,阳离子脂质、阳离子聚合物、脂质-聚合物杂合系统)作为载体将核实递送至细胞内。尽管在基础科学和各种非病毒核酸递送系统的应用中已经取得了显著的进展,但是大部分非病毒方法仍然不如病毒载体有效,尤其是用于体内基因递送时(例如,参见Gao,X.,Kim,K.& Liu,D.,AAPS J 9,E92-104(2007))。
如上文定义的此类转染剂典型地已经仅在体外反应中得到成功地应用。然而,对于核酸在体内的应用,必须满足其他的需要。例如,关于团聚,核酸与转染剂之间的复合物在生理盐溶液中必须是稳定的。此外,由于载体本身不应该在个体中诱导适应性免疫应答,因此,所述复合物典型地必须不与宿主的补体系统的各部分反应,并且,由此本身必须不是免疫原性的。另外,所述复合物应该保护核酸不受普遍存在的核酸酶的早期胞外降解。
在本领域中,有多种转染剂可用,尤其是阳离子脂质,其在细胞培养物中表现出极好的转染活性。然而,这些转染剂中的大部分在血清存在时表现不好,仅有一些在体内有活性。当脂复合物(lipoplexes)暴露于血液、黏液、上皮细胞衬液或组织基质中存在的极大量的带负电荷且通常是两亲性的蛋白时,在尺寸、表面电荷和脂质组成上发生显著的变化。当在体内施用时,脂复合物(lipoplexes)倾向于与带负电荷的血液组分相互作用,并且形成聚集物,所述聚集物可能被吸附到循环的红血细胞的表面上,截留在稠的黏液层中,或者在微脉管系统中形成栓塞,阻止其到达远端位置的意欲的靶细胞。在它们被引入到血液循环中后,有一些甚至进行溶解(例如,参见Gao,X.,Kim,K.& Liu,D.,AAPS J 9,E92-104(2007))。
一种更有希望的方法使用阳离子聚合物。由于它们能够紧密地复合并且缩合带负电荷的核酸,因此,阳离子聚合物被证明对核酸转染是有效的。因此,已经研究了多种阳离子聚合物作为体外和体内基因递送的载体。这些包括聚乙烯亚胺(PEI),聚酰胺型胺类(polyamidoamine)和聚丙胺树状聚体,聚丙烯胺,阳离子葡聚糖,壳聚糖,阳离子蛋白和阳离子肽。尽管大部分阳离子聚合物共有将DNA缩合成小颗粒的功能并且通过经由与细胞表面上阴离子位点的电荷-电荷相互作用的内吞作用促进细胞摄入,但是它们的转染活性和毒性显著不同。
在本领域中仅在一种方法中,Fotin-Mleczek等人(WO 2009/030481)证明了与短的阳离子肽复合的RNA的免疫刺激作用。这些制剂似乎在免疫活性细胞中有效地诱导细胞因子的产生。不幸的是,Fotin-Mleczek等人没有评估这些复合物对优选的抗病毒细胞因子IFN-α的诱导作用。另外,这些复合物被证明在冷冻干燥过程中是不稳定的。
在上述情形中,阳离子聚合物随分子量增加表现出更好的转染效率。然而,增加的分子量还导致阳离子聚合物的增加的毒性。在上述这种情形中,(高分子量的)PEI可能是活性最强和研究最多的用于核酸转染的聚合物,特别是用于基因递送目的的聚合物。不幸的是,由于其不能生物降解的性质和毒性,其表现出相同的缺点。此外,即使由高分子量聚合物形成的人工合成多聚复合物(polyplexes)在生理条件下表现出改善的稳定性,但是数据表明此类聚合物可能妨碍载体解开(unpacking)。为了克服这种不利的影响,Read等人(参见Read,M.L.等人,J Gene Med.(基因医学杂志)5,232-245(2003);和Read,M.L.等人,Nucleic Acids Res(核酸研究)33,e86(2005))基于通过肽Cys-Lys10-Cys的氧化缩聚反应制备的线性可还原的聚阳离子(RPC)开发了一种新型的合成载体。所述肽Cys-Lys10-Cys能够被胞内环境切割,从而促使核酸释放。在这种情形中,Read等人(2003,同上)能够证明由这些RPCs形成的人工合成多聚体通过还原条件去稳定,能够允许DNA和mRNA的有效释放。然而,检验体外转染效率,Read等人(2003,同上)还观察到N/P(氮原子比磷原子)比率为2并不令人满意,需要更高的N/P比率才能提高转染效率。另外,Read等人(2003,同上)观察到另外需要氯喹或阳离子脂质DOTAP将转染效率提高至足够的水平。结果,Read等人(2005,同上)在具有已知的内体缓冲能力的RPCs中包括组氨酸残基,并且表明此类富含组氨酸的RPCs可以被细胞内还原环境切割。这种方法能够允许在不需要内体裂解剂氯喹的条件下进行宽泛范围核酸的有效的胞质递送,所述核酸包括质粒DNA、mRNA和siRNA分子。
不幸的是,Read等人(2003,同上)和Read等人(2005,同上)都没有评价RPCs是否可以直接用于体内应用。在他们在2005年的研究中,转染在不存在血清的条件下进行,以避免可能由于血清蛋白与限制细胞摄入的人工合成多聚体的结合导致的对组氨酸残基增强基因转运的能力的掩蔽。然而,初步的实验表明富含组氨酸的RPC人工合成多聚体的转染特性可以受到血清蛋白存在的影响,在10%FCS中观察到GFP-阳性细胞减少50%。对于体内应用,Read等人(2005,同上)提议用亲水性聚合物聚-[N-(2羟基-丙基)甲基丙烯酰胺]进行修饰。不幸的是,他们没有防止人工合成多聚体的聚集和聚阳离子复合物与血清蛋白的结合。此外,由于阳离子聚合物大量过剩(其特征在于高N/P比率),当复合核酸时,形成强阳离子复合物。由此,由于它们强烈的盐诱导凝集的倾向和与血清内容物的相互作用(调理作用(opsonization)),所述复合物仅在体内有有限的应用。另外,当用于基因治疗目的时,这些(带正电荷的)复合物可能激发补体活化。还证明这些基于带正电荷RPC的复合物在局部施用到皮肤中后表现出差的核酸货物翻译。
以与Read等人相似的方法,McKenzie等人(McKenzie,D.L.,K.Y.Kwok,等人,(2000),J Biol Chem(生物化学杂志)275(14):9970-7和McKenzie,D.L.,E.Smiley,等人,(2000),Bioconjug Chem(生物缀合物化学)11(6):901-9)通过将多个半胱氨酸插入到短的合成肽中而开发了交联的肽作为基因递送剂。在他们的研究中,他们检验了与DNA的最佳复合物形成,并且结果,他们能够证明,对于充分形成的肽DNA缩合物,需要至少为2的N/P比率。因此,只有带正电荷的复合物似乎表现出最佳的DNA缩合作用。与这些数据相比,由于在之前的研究中已经表明正电性DNA缩合物的静脉内应用导致快速的调理作用和到肺和肝的非特异性生物分布(Collard,W.T.,Evers,D.L.,McKenzie,D.L.,和Rice,K.G.(2000),Carbohydr.Res.323,176-184),他们提议开发带负电荷的复合物用于体内基因递送。因此,McKenzie等人(2000;同上)提议用聚乙二醇和靶向配体衍生所述载体。应该注意,McKenzie等人(2000,同上)的方法是专利(US 6,770,740 B1)的另一个主题,该专利具体公开了编码核酸、反义核酸和核酶的转染。
因此,核酸的体内应用似乎仍然是最有挑战性的问题之一,原因在于带有阴离子电荷的血浆蛋白可以非特异性结合带正电荷的复合物并且快速除去它们,例如,通过网状内皮系统除去。通过阳离子复合物进行的调理作用和补体系统的激活是可能参与降低体内施用的阳离子复合物的效力的另外的生理现象。这特别适用于施用基于核酸的药物,例如,将核酸转染到细胞或组织中,特别是当旨在进行编码的蛋白或肽的表达或转染的核酸的RNA的转录时。
综上所述,现有技术没有提供允许建立有效且安全的药物组合物的可行性的方式或方法,所述药物组合物包含用于接种目的的佐剂,特别是当需要Th1-转变的免疫应答时。
发明内容
因此,本发明的目的是提供解决这些问题中的一种或多种的此类手段或方法。
本发明潜在的目的通过本发明的主题得以解决,优选通过后附权利要求的主题得以解决。
为了清楚和易读的目的,提供下述定义。其中公开的任何技术特征可以是本发明的每一个实施方案的一部分。另外的定义和解释可以提供在本公开内容的上下文中。
核酸:术语核酸典型地意指任意的DNA-或RNA-分子,并且与多核苷酸同义使用。此外,本文定义的核酸的修饰或衍生物清楚地包含在通用术语“核酸”中,例如,PNA也包含在术语“核酸”中。
单顺反子RNA:单顺反子RNA可以典型地是RNA,优选为mRNA,其只编码一个开放阅读框。在这种情形中,一个开放阅读框是可以翻译成肽或蛋白的数个核苷酸三联体(triplet)(密码子)的序列。
双/多顺反子RNA:RNA,优选mRNA,典型地可以具有两个(双顺反子)或更多个(多顺反子)开放阅读框(ORF)。在这种情形中,一个开放阅读框是可以翻译成肽或蛋白的数个核苷酸三联体(密码子)的序列。
5’-帽结构:5′帽典型地是添加在RNA分子的5’末端的修饰的核苷酸,特别是鸟嘌呤核苷酸。优选地,5’-帽使用5′-5′-三磷酸酯键添加。
多聚(C)序列:多聚(C)序列典型地是一段长的胞嘧啶核苷酸的序列,典型地约10至约200个胞苷核苷酸,优选约10至约100个胞苷核苷酸,更优选地约10至约70个胞苷核苷酸或甚至更优选地约20至约50个或甚至约20至约30个胞苷核苷酸。多聚(C)序列可以优选地位于核酸所包含的编码区的3’。
多聚(A)尾:多聚(A)尾也称为“3′-多聚(A)尾”,典型地是添加在RNA的3’端的一段多至约400个腺苷核苷酸的长的腺嘌呤核苷酸序列,例如,约25至约400个,优选约50至约400个,更优选约50至约300个,甚至更优选约50至约250个,最优选约60至约250个腺苷核苷酸。
稳定的核酸:稳定的核酸典型地可以基本上抵抗体内降解(例如,被外切或内切核酸酶降解)和/或离体降解(例如,通过疫苗施用之前的制备过程,例如,在制备要施用的疫苗溶液的过程中)。例如,mRNA的稳定可以通过提供5’-帽结构、多聚(A)尾、多聚(C)尾或任意其他的UTR修饰而实现。其还可以通过核酸的主链修饰或G/C含量的修饰而实现。在本发明的情形中可以考虑多种其他方法。
核酸修饰(修饰的核酸):核酸分子的修饰典型地可以包含主链修饰、糖修饰或碱基修饰。与本发明相联系的主链修饰典型地是这样的修饰,即,核酸分子中所包含的核苷酸的主链的磷酸可以进行化学修饰。与本发明相联系的糖修饰典型地可以是所述核酸的核苷酸的糖的化学修饰。此外,与本发明相联系的碱基修饰典型地可以是所述核酸分子的核苷酸的碱基结构部分的化学修饰。因此,修饰的核酸在本文中也可以定义为可以包含核苷酸类似物的核酸分子。此外,核酸分子的修饰可以包含脂质修饰。所述脂质-修饰的核酸典型地可以包含本文定义的核酸。所述脂质-修饰的核酸分子典型地可以进一步包含与所述核酸分子共价连接的至少一个接头,和与各个接头共价连接的至少一个脂质。备选地,所述脂质-修饰的核酸分子可以包含如本文定义的至少一种核酸分子和与所述核酸分子共价连接(不用接头)的至少一个(双功能)脂质。根据第三备选方案,所述脂质-修饰的核酸分子可以包含如本文定义的核酸分子,与所述核酸分子共价连接的至少一个接头和与各个接头共价连接的至少一个脂质,以及还有与所述核酸分子共价连接(不用接头)的至少一个(双功能)脂质。
核酸的修饰还可以包含核酸分子编码区的G/C含量的改变,尤其是当所述核酸分子以mRNA形式存在时。在该情形中,特别优选的是,与其特定的野生型编码序列(即,未修饰的mRNA)编码区的G/C含量相比,核酸分子编码区的G/C含量增加。与特定野生型mRNA的编码氨基酸序列相比,所述核酸序列的编码氨基酸序列优选不被改变核酸分子的G/C-含量的改变,尤其是当所述核酸分子以mRNA形式存在或编码mRNA时,是基于这样的事实,即,要被翻译的任意mRNA区的序列对于该mRNA的有效翻译是重要的。因此,各种核苷酸的组成和序列是重要的。特别地,与具有增加的A(腺苷)/U(尿嘧啶)含量的序列相比,具有增加的G(鸟苷)/C(胞嘧啶)含量的序列更稳定。因此,与其野生型编码序列或mRNA相比,所述编码序列或mRNA的密码子由此是改变的,但是保留翻译的氨基酸序列,以使其包含增加量的G/C核苷酸。关于几种密码子编码同一种氨基酸(所谓的遗传密码的简并性)的事实,可以确定对稳定性最有利的密码子(所谓的替代密码子使用(alternative codon usage))。优选地,与野生型mRNA编码区的G/C含量相比,所述核酸分子编码区的G/C含量,特别是当所述核酸以mRNA形式存在或编码mRNA时,增加至少7%,更优选增加至少15%,特别优选地增加至少20%。根据具体的实施方案,在编码本文定义的蛋白或肽或其片段、其变体和/或衍生物的区域中或野生型mRNA序列的全部序列或编码序列中至少5%,10%,20%,30%,40%,50%,60%,更优选至少70%,甚至更优选至少80%且最优选至少90%,95%或甚至100%的可取代的密码子被取代,由此增加所述序列的G/C含量。在这一情形中,与野生型序列相比,特别优选的是增加所述核酸分子的G/C含量,特别是当所述核酸以mRNA形式存在或编码mRNA时,增加至最大(即,100%可取代的密码子),特别是在编码蛋白的区域中。此外,核酸的修饰,特别是当所述核酸以mRNA形式存在或编码mRNA时,是基于这样的发现,即,翻译效率还取决于tRNAs在细胞中存在的不同频率。tRNAs在细胞中存在的频率,以及由此在所述细胞中的密码子应用,取决于所述细胞所来源的物种。因此,酵母细胞通常表现出与哺乳动物细胞(如人细胞)不同的密码子应用。由此,如果在核酸分子中存在增加程度的所谓的“稀少密码子”(关于各自的表达系统而言),特别是当所述核酸以mRNA形式存在或编码mRNA时,与其中存在编码相对“常见的”tRNAs的密码子的情形相比,相应的修饰的核酸分子以显著更少的程度翻译。因此,特别是如果修饰的核酸分子以mRNA形式存在或编码mRNA时,与野生型mRNA或编码序列的对应区域相比,所述修饰的核酸的编码区优选被修饰,以使编码在细胞中相对稀少的tRNA的野生型序列的至少一个密码子交换为编码在细胞中相对常见且携带与所述相对稀少的tRNA相同的氨基酸的tRNA的密码子。通过这种修饰,修饰核酸分子的序列,特别是当所述核酸以mRNA形式存在或编码mRNA时,被改变,以插入关于常见的tRNAs是可用的密码子。换言之,通过这种修饰,在每种情形中,编码在细胞中相对稀少的tRNA的野生型序列的所有密码子可以交换为编码在细胞中相对常见且在每种情形中与所述相对稀少的tRNA携带相同的氨基酸的tRNA的密码子。哪些tRNAs在细胞中相对常见,相比之下,哪些tRNAs相对稀少,对于本领域技术人员是已知的;例如,参考Akashi,Curr.Opin.Genet.Dev.(现代遗传发育观点)2001,11(6):660-666。特别优选的是编码用于本发明的蛋白的核酸序列针对人密码子应用进行密码子优化。特别优选为特定氨基酸使用最常见的tRNA的密码子,例如,Gly密码子,其利用在(人)细胞中最常见的tRNA。在这种情形中,特别优选的是,在不改变由核酸分子的编码区所编码的蛋白序列的前提下,将修饰的核酸分子中(尤其是当所述核酸以mRNA的形式存在或编码mRNA时)增加的(特别是最大化的)序列G/C含量与“常见”密码子联系起来。这种优选的实施方案允许提供特别有效翻译的和稳定的(修饰的)核酸,尤其是当所述核酸以mRNA的形式存在或编码mRNA时。
核酸分子的衍生物:核酸分子的衍生物在本文中可以典型地理解为修饰的核酸,如上文定义。
核苷酸类似物:核苷酸类似物典型地是结构上与天然存在的核苷酸相似(类似)的核苷酸,其包含磷酸主链修饰、糖修饰或核碱基(nucleobase)修饰。
UTR修饰:UTR修饰典型地是核酸分子、特别是编码核酸分子的5’和/或3’区的修饰。其中,“UTR”典型地意指“不翻译区”。例如,UTR可以含有、包含稳定序列(UTR修饰)或由稳定序列(UTR修饰)组成。这些在5’和/或3’不翻译区的稳定序列可以具有增加所述核酸在细胞溶胶中的半衰期的作用。这些稳定序列可以与在病毒、细菌和真核生物中天然存在的序列具有100%的序列同一性,但是也可以是部分或完全合成的。可以提及(α-)珠蛋白基因(例如,来自智人(Homo sapiens)或光滑爪蟾(Xenopus laevis))的不翻译序列(UTR)作为可以用于稳定的核酸的稳定序列的实例。稳定序列的另一个实例具有通式:(C/U)CCANxCCC(U/A)PyxUC(C/U)CC,其包含在编码(α-)珠蛋白、(I)型-胶原蛋白、15-脂氧合酶或编码酪氨酸羟化酶的非常稳定的RNA的3’UTR中(参见Holcik等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(美国国家科学院学报)1997,94:2410-2414)。所述稳定序列当然能够单独使用或与另一种组合使用并且还与本领域技术人员已知的其他稳定序列组合使用。在本发明的情形中,UTR修饰优选地意指通过添加或交换5’-和/或3’-UTR,优选地通过添加或交换稳定5’-和/或3’-UTR对编码核酸(诸如基因或mRNA)的修饰,例如,如上文所述。
核酸合成:如本文定义的按照本发明使用的核酸分子可以使用本领域已知的任意方法制备,包括合成方法,诸如例如固相合成、以及体外方法,诸如体外转录反应。
为了制备核酸分子,尤其是当所述核酸以mRNA形式存在时,例如,可以在体外转录相应的DNA分子。该DNA基质优选地包含合适的启动子,例如T7或SP6启动子,以用于体外转录,其后跟随着编码待制备的核酸分子(例如mRNA)的理想核苷酸序列和体外转录的终止信号。形成至少一种目的RNA基质的DNA分子可以通过发酵增殖和随后分离为可以在细菌内复制的质粒的一部分来制备。可以作为适合于本发明提及的质粒是例如质粒pT7Ts(GenBank编号U26404;Lai等人,Development(发育)1995,121:2349-2360),系列,例如(GenBank编号X65300;来自Promega)和pSP64(GenBank编号X65327);还参考:Mezei和Storts,Purification of PCR Products(PCR产物的纯化),在:Griffin和Griffin(编),PCR Technology:Current Innovation(PCR技术:当前改革)中,CRC Press(CRC出版社),Boca Raton,FL,2001。
蛋白:蛋白典型地由一种或多种折叠成3维形式的、促进生物功能的多肽组成。
肽:肽典型地是通过肽键连接的短的氨基酸单体聚合物。其典型地包含少于50个单体单位。然而,术语肽不排除具有多于50个单体单位的分子。长肽也称为多肽,典型地具有50-600个单体单位,更具体地是50-300个单体单位。此外,“肽”在本文中还定义为包括任意的肽基分子,包括肽类似物。
肽类似物:肽类似物典型地可以包含可以用于本发明目的的天然或非天然存在的氨基酸。例如,其可以包含选自氨基酸的等构物或手性类似物(D-氨基酸或L-氨基酸)的氨基酸。另外,所述类似物可以包含优选地选自下述的一个或多个氨基酸:羟脯氨酸,β-丙氨酸,2,3-二氨基丙酸,α-氨基异丁酸,N-甲基甘氨酸(肌氨酸),鸟氨酸,瓜氨酸,叔丁基丙氨酸,叔丁基甘氨酸,N-甲基异亮氨酸,苯基甘氨酸,丙氨酸环己酯,正亮氨酸,萘基丙氨酸,吡啶基丙氨酸,3-苯并噻吩基丙氨酸4-氯苯丙氨酸,2-氟苯丙氨酸,3-氟苯丙氨酸,4-氟苯丙氨酸,青霉胺,1,2,3,4-四氢-tic异喹啉-3-羧酸[β]-2-噻吩基丙氨酸,蛋氨酸亚砜,高精氨酸,N-乙酰基赖氨酸,2,4-二氨基丁酸,对氨基酸苯丙氨酸,N-甲基缬氨酸,高半胱氨酸,高丝氨酸,ε-氨基己酸,δ-氨基戊酸,2,3-二氨基丁酸。本文定义的肽类似物可以进一步包含修饰的肽。该术语具体包括本领域技术人员已知的肽主链修饰(即,酰胺键模拟物)。所述修饰包括酰胺氮、α-碳、酰胺羰基的修饰,酰胺键的完全替换,延伸,缺失或主链交联。一些肽主链修饰是已知的,包括Ψ[CH2S],ΨCH2NH],Ψ[CSNH2],Ψ[NHCO],Ψ[COCH2]和Ψ[(E)或(Z)CH=CH]。在上述所用的术语中,Ψ表示不存在酰胺键。替代酰胺基的结构表示在括号中。其他修饰包括,例如,N-烷基(或芳基)取代(Ψ[CONR]),或主链交联以构建内酰胺类和其他环式结构,C端羟甲基修饰,O-修饰的修饰(例如,C端羟甲基二苄醚),N端修饰,包括取代的酰胺类诸如alkylaniides和酰肼。
肽合成:肽、肽类似物或其衍生物优选地使用本领域技术人员已知的化学方法合成。例如,使用已知的固相、液相或肽缩合或它们的任意组合的技术来制备合成的肽,并且可以包含天然的和/或非天然的氨基酸。通常,化学合成方法包括向生成的肽链顺序添加一个或多个氨基酸。通常,第一个氨基酸的氨基或羧基用适当的保护基团保护。然后,被保护的或衍生的氨基酸可以连接到惰性固体支持物上或者用在溶液中,通过在允许形成酰胺键的条件下加入序列中具有被适当地保护的互补(氨基或羧基)基团的下一个氨基酸。然后,从新加入的氨基酸残基去除保护基团,然后加入下一个氨基酸(被适当地保护的),等等。在已经以正确的顺序连接需要的氨基酸后,顺序地或同时去除任何剩余的保护基团(以及任何固体支持物,如果使用固相合成技术的话),以得到最终的多肽。这些方法适于合成用于本发明目的的肽(如肽类似物)或其衍生物。典型的保护基团包括叔丁氧基羰基(Boc),9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)苯甲氧基羰基(Cbz);对甲苯磺酰基(Tx);2,4-二硝基苯基;苄基(BzI);联苯基异丙基氧基羧基-羰基,叔戊氧基羰基(t-amyloxycarbonyl),异冰片基氧基羰基,邻-溴苯甲氧基羰基,环己基,异丙基,乙酰基,邻-硝基苯磺酰基等。典型的固体支持物是交联的聚合物支持物。这些可以包括二乙烯基苯交联的苯乙烯系聚合物,例如,二乙烯基苯羟甲基苯乙烯共聚物,二乙烯基苯-氯甲基苯乙烯共聚物和二乙烯基苯-二苯甲基氨基聚苯乙烯共聚物。
重组肽或蛋白制备:可以使用重组蛋白或肽制备来制备肽或蛋白或其衍生物。为了促进重组肽或蛋白的制备,优选分离或合成至少一种编码其的核酸。典型地,使用已知的方法,诸如例如,扩增(例如,使用PCR),来分离编码所述重组蛋白或肽的核酸,或使用一种或多种限制性酶从来自生物体的核酸分离或者从核酸文库分离。为了通过重组方式表达蛋白或肽,将编码蛋白/肽的核酸置于与能够在无细胞系统或细胞系统中调节表达的启动子或其他调控序列的可操作性连接中。例如,将包含编码肽或蛋白的序列的核酸置于与适当的启动子的可操作性连接中,并且在适当的细胞中和在充分用于发生表达的条件下保持一段时间。用于体外表达、无细胞表达或基于细胞的表达的典型的表达载体已有记载并且是技术人员公知的。在这种情形中,无细胞表达系统可以包括大肠杆菌(E.coli)S30级分,兔网状细胞裂解物和麦芽提取物,并且细胞系统可以选自细菌(例如,大肠杆菌)、昆虫、植物或哺乳动物细胞(例如,293,COS,CHO,1OT细胞,293T细胞)。
分泌信号肽:所述信号肽是这样的序列,其典型地展现约15至30个氨基酸的长度并且优选地位于所编码的肽的N端,但并不限于此。本文定义的信号肽优选地允许蛋白或肽转运到限定的细胞区室中,优选地转运到细胞表面、内质网(ER)或内体-溶酶体区室。
载体/聚合载体:在本发明的情形中的载体典型地可以是促进另一种化合物的转运和/或复合的化合物。聚合载体典型地是由聚合物形成的载体。在本发明的情形中的载体优选适合作为核酸分子的载体,例如,用于调节在生理学可接受的液体中的溶解、核酸分子或载体的转运和细胞摄入。因此,在本发明的情形中的载体可以是可以适合用于核酸分子或载体的储库和递送的组分。例如,所述载体可以是阳离子或聚阳离子载体或可以作为转染剂或复合剂的化合物。在这一情形中特别优选的载体或聚合载体是阳离子或聚阳离子化合物,包括鱼精蛋白,核仁蛋白,精胺或亚精胺,或其它阳离子肽或蛋白质,诸如聚-L-赖氨酸(PLL),聚-精氨酸,碱性多肽,细胞渗透肽(CPPs),包括HIV结合肽,HIV-1 Tat(HIV),Tat-衍生的肽,穿膜肽,VP22衍生的或类似的肽,HSV VP22(单纯疱疹(Herpes simplex)),MAP,KALA或蛋白转导结构域(PTDs),PpT620,富含脯氨酸的肽,富含精氨酸的肽,富含赖氨酸的肽,一种或多种MPG-肽,Pep-1,L-寡聚体,降钙素肽,触角足衍生肽(特别地来自果蝇触角足(Drosophila antennapedia)),pAntp,pIsl,FGF,乳铁蛋白,Transportan,Buforin-2,Bac715-24,SynB,SynB(1),pVEC,hCT-衍生的肽,SAP或组蛋白。在本发明的情形中,所述阳离子或聚阳离子载体优选是阳离子或聚阳离子肽或蛋白,其优选地包含或另外经过修饰而包含至少一个能够形成二硫键的结构部分,优选是-SH结构部分。
阳离子组分:术语“阳离子组分”典型地是指带电荷的分子,在典型地约1-9的pH值,优选等于或低于9(例如5-9),等于或低于8(例如5-8)、等于或低于7(例如5-7)的pH值,最优选在生理pH值,例如,约7.3-7.4,所述分子带正电荷(阳离子)。因此,本发明所述的阳离子肽、蛋白或聚合物在生理条件下、特别是在体内细胞的生理盐条件下带正电荷。带负电荷的或中性氨基酸阳离子肽或蛋白包含比带负电荷的或中性氨基酸更多数量的阳离子氨基酸,例如,更多数量的Arg,His,Lys或Orn。在优选的实施方案中,本发明的情形中的阳离子肽或蛋白包含比其他残基更多数量的阳离子氨基酸,例如,更多数量的Arg,His,Lys或Orn。定义“阳离子”还可以是指“聚阳离子”组分。
优选在生理条件下,例如,在约5.5-7.5的pH,优选在约6.0-7.4的pH,诸如约7.0,在约25℃-40℃的温度,优选在约35-38℃的温度,诸如约37℃,在例如约130-160mM,优选约137mM-150mM的生理盐浓度,诸如约137mM,确定或评估化合物、复合物或组分的电荷,诸如本文定义的阳离子组分或聚合载体货物复合物(A)的电荷。用于确定或评估本文定义的化合物、复合物或组分的电荷的特别优选的条件是在25℃100%Ringer乳酸盐溶液中存在的条件。
ζ电位:“ζ电位”是广泛用于颗粒电表面电荷的参数。其典型地通过经由电场使带电颗粒移动而确定。在本发明的情形中,ζ电位是用于表征颗粒(例如,本发明所述的药物组合物的复合物(A))的电荷的优选参数。因此,在本发明的情形中,优选通过由使用Zetasizer纳米仪器(Zetasizer Nano instrument,Malvern Instruments,Malvern,UK)在25℃和173°的散射角进行的激光多普勒电泳法确定ζ电位来确定颗粒的电荷。给定颗粒的表面电荷还取决于所用的基质(例如,含有盐的缓冲液)的离子强度和溶液的pH。因此,给定复合物(A)在一定电荷比率(N/P)的实际ζ电位在不同的用于注射的缓冲液中可能略微不同。为了测量,优选地将所述颗粒,诸如本发明所述的药物组合物的复合物(A)悬浮在Ringer乳酸盐溶液中。因此,本发明要求带负电荷的复合物(A)在给定注射缓冲液的条件下,优选在Ringer乳酸盐溶液的条件下的应用,所述应用由其ζ电位评估。本发明所述的Ringer乳酸盐溶液优选地含有130mmol/L钠离子,109mmol/L氯离子,28mmol/L乳酸盐,4mmol/L钾离子和1.5mmol/L钙离子。所述钠、氯、钾和乳酸盐典型地来自NaCl(氯化钠),NaC3H5O3(乳酸钠),CaCl2(氯化钙)和KCl(氯化钾)。Ringer乳酸盐溶液的重量克分子渗透浓度(osmolarity)为273mOsm/L,并且pH调整至6.5。
药物有效量:在本发明的情形中,药物有效量典型地理解为足以诱导免疫应答的量。
免疫系统:免疫系统可以保护生物体,例如,保护生物体免受感染。如果病原体突破生物体的物理屏障并且进入该生物体,则先天性免疫系统提供即时的但非特异性的应答。如果病原体避开该先天性应答,脊椎动物具有第二层保护,即适应性免疫系统。此处,免疫系统在感染过程中改变其应答以改善其对病原体的识别。然后,该改善的应答在病原体被消除后以免疫记忆的形式保留,并且允许适应性免疫系统在每次遇到该病原体时建立更快且更强的攻击。根据此,免疫系统包括先天性和适应性免疫系统。这两部分的每一个包含所谓的体液和细胞成分。
免疫应答:免疫应答典型地可以是适应性免疫系统针对特定抗原的特异性反应(所谓的特异性或适应性免疫应答)或是先天性免疫系统的非特异性反应(所谓的非特异性或先天性免疫应答)。本质上,本发明与适应性免疫系统的特异性反应(适应性免疫应答)相关。然而,这种特异性反应可以得到另外的非特异性反应(先天性免疫应答)的支持。因此,本发明还涉及用于同时刺激先天性和适应性免疫系统以激发有效的适应性免疫应答的化合物或组合物。
适应性免疫应答:适应性免疫应答典型地理解为是抗原特异性的。抗原特异性允许产生针对特定抗原、抗原表达系统、病原体或病原体感染的细胞定制的反应。在体内由“记忆细胞”保留建立这些定制的反应的能力。如果病原体感染机体超过一次,则这些特异性记忆细胞通常迅速将其消灭。在这一情形中,适应性免疫应答的第一步是抗原呈递细胞对幼稚抗原特异性T细胞或能够诱导抗原特异性免疫应答的不同的免疫细胞的激活。这发生在幼稚T细胞通常从中流过的淋巴组织和器官中。可以作为抗原呈递细胞的细胞类型特别是树突细胞、巨噬细胞和B细胞。这些细胞中的每一种在激发免疫应答中具有不同的功能。树突细胞通过吞噬作用和大胞饮吸收抗原并且通过与例如外源抗原接触而被刺激以迁移到局部淋巴组织,它们在该处分化成成熟的树突细胞。巨噬细胞摄取微粒抗原,诸如细菌,并且被传染物或其他适当的刺激诱导来表达MHC分子。B细胞特有的通过其受体结合可溶性蛋白抗原并使其内在化的能力对于诱导T细胞也是重要的。在MHC分子上呈递抗原导致T细胞的激活,这诱导其增殖并且分化成武装效应T细胞。效应T细胞最重要的功能是通过CD8+细胞毒性T细胞杀死感染的细胞以及通过Th1细胞激活巨噬细胞,二者共同组成细胞介导的免疫性,以及通过Th2和Th1细胞激活B细胞,从而产生不同种类的抗体,由此驱动体液免疫应答。T细胞通过其T细胞受体识别抗原,所述T细胞受体不直接识别和结合抗原,相反而是识别与在其他细胞表面上的MHC分子结合的例如病原体来源的蛋白抗原的短肽片段。
适应性免疫系统:适应性免疫系统典型地由消除或防止病原性生长的高度专门化的、系统性细胞和过程组成。所述适应性免疫应答提供具有识别并记忆特定病原体(以产生免疫性)并且在每次遇到所述病原体时建立更强的攻击的能力的脊椎动物免疫系统。由于体细胞高度突变(加速的体细胞突变过程)和V(D)J重组(抗原受体基因片段的不可逆的遗传重组),该系统是高度适应性的。这种机制允许少量的基因产生巨大数量的不同的抗原受体,然后其在每种个体淋巴细胞上独特地表达。由于基因重排导致每种细胞的DNA中的不可逆的改变,则该细胞的所有后代(子代)都将遗传编码相同受体特异性的基因,包括记忆B细胞和记忆T细胞,它们是长久的特异性免疫性的关键细胞。免疫网络理论是关于适应性免疫系统如何工作的理论,其是基于T细胞、B细胞受体的可变区与由T细胞和B细胞产生具有可变区域的分子的可变区之间的相互作用。
先天性免疫系统:典型地,先天性免疫系统(也称为非特异性免疫系统)理解为包括以非特异性方式保护宿主防御其他生物体的感染的细胞和机制。这意指先天性系统的细胞以一般方式识别病原体并且针对其反应,但是与适应性免疫系统不同,其不赋予宿主长久的或保护性的免疫性。例如,先天性免疫系统可以被病原体-相关的分子模式(PAMP)受体(例如,Toll-样受体(TLRs))的配体或其他辅助性物质激活,所述其他辅助性物质如脂多糖,TNF-α,CD40配体或细胞因子,单核因子,淋巴用脑子,白介素或趋化因子,IL-1,IL-2,IL-3,IL-4,IL-5,IL-6,IL-7,IL-8,IL-9,IL-10,IL-12,IL-13,IL-14,IL-15,IL-16,IL-17,IL-18,IL-19,IL-20,IL-21,IL-22,IL-23,IL-24,IL-25,IL-26,IL-27,IL-28,IL-29,IL-30,IL-31,IL-32,IL-33,IFN-α,IFN-β,IFN-γ,GM-CSF,G-CSF,M-CSF,LT-β,TNF-α,生长因子和hGH,人Toll-样受体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10的配体,鼠Toll-样受体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10、TLR11、TLR12或TLR13的配体,NOD-样受体的配体,RIG-I样受体的配体,免疫刺激性核酸,免疫刺激性RNA(isRNA),CpG-DNA,抗菌剂或抗病毒剂。典型地,先天性免疫系统的反应包括通过产生化学因子招募免疫细胞至感染部位,所述化学因子包括专门的化学调节剂,称为细胞因子;激活补体级联;通过专门的白血细胞识别并且去除器官、组织、血液和淋巴中存在的外源物质;通过已知为抗原呈递的过程激活适应性免疫系统;和/或作用为针对传染物的物理和化学屏障。
细胞免疫性/细胞免疫应答:细胞免疫性典型地涉及巨噬细胞、天然杀伤细胞(NK)、抗原特异性细胞毒性T淋巴细胞的激活以及响应抗原的各种细胞因子的释放。在更一般的方式中,细胞免疫性不涉及抗体而是涉及免疫系统细胞的激活。例如,细胞免疫应答特征在于,激活抗原特异性细胞毒性T淋巴细胞,其能够在其表面上展示抗原表位的机体细胞(如病毒感染的细胞、具有细胞内细菌的细胞)和展示肿瘤抗原的癌细胞;激活巨噬细胞和天然杀伤细胞,允许它们破坏病原体;并且刺激细胞分泌影响适应性免疫应答和先天性免疫应答所涉及的其他细胞的功能的多种细胞因子。
体液免疫性/体液免疫应答:体液免疫性典型地是指抗体产生和可能伴随其的辅助过程。例如,体液免疫应答可以典型地特征在于,Th2激活和细胞因子产生,生发中心形成和同种异型转换,亲和力成熟和记忆细胞产生。体液免疫性还典型地可以指抗体的效应子功能,其包括病原体和毒素中和作用,经典补体激活和吞噬作用及病原体消除的调理促进。
抗原:根据本发明,术语“抗原”典型地是指可以由免疫系统识别并能够,例如通过形成抗体作为适应性免疫应答的一部分的抗原特异性T-细胞来触发抗原特异性免疫反应的物质。典型地,抗原是蛋白或肽,并且还可以是糖、脂质、核酸等结构。在这一情形中,适应性免疫应答的第一步是通过抗原呈递细胞激活幼稚抗原特异性T细胞。这发生在幼稚T细胞通常从中流过的淋巴组织和器官中。可以起抗原呈递细胞作用的三种细胞类型是树突细胞、巨噬细胞和B细胞。这些细胞中的每种在引起免疫应答中具有不同功能。组织树突细胞通过吞噬作用和大胞饮吸收抗原并受感染刺激移动到局部淋巴组织,它们在该处分化为成熟树突细胞。巨噬细胞摄取微粒抗原诸如细菌并受传染物诱导表达MHC II类分子。B细胞经由其受体结合并内在化可溶性蛋白抗原的独特能力对于诱导T细胞可能是重要的。通过在MHC分子上呈递抗原,导致T细胞的活化,这诱导其增殖和分化为武装效应T细胞。效应T细胞的最重要功能是通过CD8+细胞毒性T细胞杀死被感染的细胞和通过TH1细胞激活巨噬细胞,它们共同组成细胞介导的免疫性,和通过TH2和TH1细胞二者激活B细胞以产生不同类型的抗体,由此驱动体液免疫应答。T细胞通过其T细胞受体识别抗原,所述T细胞受体不直接识别和结合抗原,相反而是识别与在其他细胞表面上的MHC分子结合的例如病原体蛋白抗原的短肽片段。
T细胞属于两种具有不同效应子功能的主要类型。这两类通过细胞表面蛋白CD4和CD8的表达来区分。这两种T细胞类型的不同之处在于它们识别的MHC分子类型。存在两种MHC分子类型-MHC I类和MHC II类分子-其区别在于它们的结构和在身体组织上的表达模式。CD4+T细胞结合MHC II类分子且CD8+T细胞结合MHC I类分子。MHC I类和MHC II类分子在细胞之间具有不同的分布,这反映识别它们的T细胞的不同效应子功能。MHC I类分子将来自病原体,常见地,来自病毒的肽呈递到CD8+T细胞,其分化为细胞毒性T细胞,所述细胞毒性T细胞特化为杀死它们特异性识别的任何细胞。几乎所有细胞都表达MHC I类分子,尽管组成型表达的水平从一种细胞类型到下一种而变化。但是不仅来自病毒的致病性肽由MHCI类分子呈递,而且自身-抗原样肿瘤抗原也由它们呈递。MHC I类分子结合来自在细胞溶胶中降解和在内质网中运输的蛋白的肽。由此,受病毒或其他胞质病原体感染的细胞表面上的MHC I类分子展示来自这些病原体的肽。识别MHC I类:肽复合物的CD8+T细胞被特化为杀死展示外源肽的任何细胞并因此除去受病毒和其他胞质病原体感染的细胞体。识别MHC II类分子的CD4+T细胞(CD4+辅助性T细胞)的主要功能是激活免疫系统的其他效应细胞。因此MHC II类分子通常存在于参与免疫应答的B淋巴细胞、树突细胞和巨噬细胞上,而不在其他组织细胞上。例如,激活巨噬细胞,从而杀死它们包埋的小泡内病原体,并且激活B细胞,从而分泌针对外源分子的免疫球蛋白。抑制MHC II类分子与内质网中的肽结合,并且由此MHCII类分子结合来自在内体中降解的蛋白的肽。它们可以捕获来自已经进入巨噬细胞小泡系统的病原体的肽,或来自通过未成熟树突细胞或B细胞免疫球蛋白受体内在化的抗原的肽。在巨噬细胞和树突细胞小泡内部大量积聚的病原体倾向于刺激TH1细胞的分化,而胞外抗原倾向于刺激TH2细胞生成。TH1细胞激活巨噬细胞的杀微生物性质并诱导B细胞产生IgG抗体,所述IgG抗体非常有效地调理胞外病原体,从而被吞噬细胞摄取,而TH2细胞通过激活幼稚B细胞分泌IgM而起始体液应答,并诱导弱调理抗体诸如IgG1和IgG3(小鼠)和IgG2和IgG4(人)以及IgA和IgE(小鼠和人)的生成。
疫苗:疫苗典型地理解为提供至少一种抗原或抗原功能的预防性或治疗性物质。所述抗原或抗原功能可以刺激机体的适应性免疫系统提供适应性免疫应答。
免疫刺激剂:术语“免疫刺激剂”典型地理解为不包括激发适应性/细胞毒性免疫应答(例如,“体液”或“细胞”免疫应答,换言之,激发特征在于针对被免疫活性细胞识别为外源的抗原的结构特性的特异性的反应)的试剂,诸如例如抗原(无论何种化学结构的)。相反,“免疫刺激剂”典型地理解为意指这样的试剂/化合物/复合物,其本身不引发任意适应性/细胞毒性免疫应答,但是其可以特殊地以非特异性方式增强所述适应性/细胞毒性免疫应答,例如,通过激活“PAMP”受体并且由此引发支持实际的适应性/细胞毒性免疫应答的细胞因子的释放而增强。由此,短语“免疫刺激剂”典型地排除由本身激发适应性和/或细胞毒性免疫应答(本身直接或间接地赋予免疫性)的试剂(例如抗原)的任意免疫刺激。
佐剂:术语“佐剂”典型地理解为不包括本身赋予免疫性的试剂。因此,佐剂典型地可以本身不赋予免疫性,但是以多种方式辅助免疫系统以增强抗原-特异性的免疫应答,例如,通过促使抗原向免疫系统的呈递而增强。由此,例如,佐剂可以优选地调节抗原特异性免疫应答,例如,通过将主要的基于Th1的抗原特异性应答转换为更多基于Th2的抗原特异性应答或反之亦然进行调节。因此,术语“免疫刺激剂”和“佐剂”在本发明的情形中典型地理解为意指这样的试剂、化合物或复合物,其本身不赋予免疫性,但是特殊地以非特异性方式(与抗原特异性免疫应答相反)通过各种作用支持免疫应答,其通过非特异性方式,例如细胞因子表达/分泌、改善的抗原呈递、转换免疫应答的分支(arm)的性质等而调节抗原特异性(适应性细胞和/或体液免疫应答)。因此,术语“佐剂”或“免疫刺激剂”典型地排除本身激发免疫性的任意试剂。
免疫刺激性RNA:在本发明的情形中,免疫刺激性RNA(isRNA)可以典型地是本身能够诱导天性免疫应答的RNA。其通常不具有开放阅读框,并且由此不提供肽-抗原而是激发先天性免疫应答,例如,通过与特定种类的病原体相关的分子模式(PAMP)受体(例如,Toll-样受体(TLR)或其他适当的受体)结合而激发。然而,具有开放阅读框并且编码肽/蛋白(例如,抗原功能)的mRNAs当然也可以诱导先天性免疫应答。
序列的片段:序列的片段典型地是例如核酸序列或氨基酸序列的全长序列的较短的部分。因此,序列的片段典型地由与全长序列内相对应的一条片段或相对应的多条片段相同的序列组成。在本发明的情形中,优选的序列片段由连续的实体(诸如核苷酸或氨基酸)的片段组成,其对应于所述片段所来源于的分子中的连续的实体片段,其代表所述片段所来源于的完整(即,全长)分子的至少5%、优选至少20%、优选至少30%、更优选至少40%、更优选至少50%、甚至更优选至少60%、甚至更优选至少70%并且最优选至少80%。因此,例如,蛋白或肽抗原的片段优选地对应于所述片段所来源的蛋白或肽抗原中的连续的实体片段,其代表所述片段所来源于的完整(即,全长)蛋白或肽抗原的至少5%、优选至少20%、优选至少30%、更优选至少40%、更优选至少50%、甚至更优选至少60%、甚至更优选至少70%并且最优选至少80%。特别优选的是序列的片段是功能片段,即,所述片段完成由所述片段所来源于的序列所完成的一种或多种功能。例如,蛋白或肽抗原的片段优选地展现出所述片段所来源于的蛋白或肽抗原的至少一种抗原功能(例如,能够激发针对所述蛋白或肽抗原中的至少一种抗原决定簇的特异性的免疫反应)。
蛋白的片段:在本发明的情形中,蛋白或肽的“片段”,即,氨基酸序列片段,可以典型地包括本文所定义的蛋白或肽的序列,关于其氨基酸序列(或其编码核酸分子),与原始(天然)蛋白(或其编码核酸分子)相比,其在N端、C端和/或序列内部被截短。因此,所述截短可以发生在氨基酸水平上或者相应地发生在核酸水平上。故而,关于本文定义的所述片段的序列同一性可以优选地指本文定义的完整的蛋白或肽或指所述蛋白或肽的完整的(编码)核酸分子。
同样地,在本发明的情形中,核酸序列的“片段”可以包括本文定义的核酸的序列,关于其核酸分子,与原始(天然的)核酸分子相比,其是5’-、3’-和/或序列内截短的。因此,关于本文定义的所述片段的序列同一性可以优选地指本文定义的完整的核酸。
在本发明的情形中,优选的蛋白或肽的片段还可以包括本文定义的蛋白或肽的序列,其具有约6-约20个或甚至更多个氨基酸的长度,例如,通过I类MHC分子加工和呈递的片段,优选具有约8-约10个氨基酸的长度,例如,8,9,或10个氨基酸(或甚至6,7,11,或12个氨基酸),或通过II类MHC分子加工和呈递的片段,优选具有约13个以上氨基酸的长度,例如,13,14,15,16,17,18,19,20个或甚至更多个氨基酸,其中这些片段可以选自氨基酸序列的任意部分。这些优选的片段典型地以由所述肽片段和MHC分子组成的复合物的形式被T细胞识别,即,所述片段典型地不以其天然形式被识别。蛋白或肽的片段可以包括那些蛋白或肽的至少一个表位。此外,蛋白的结构域,如胞外结构域、胞内结构域或跨膜结构域以及蛋白的缩短或截短版本,也可以理解为蛋白的片段。
表位:(还称为“抗原决定簇”):在本发明的情形中,蛋白的T细胞表位或部分可以包括优选具有约6至约20个或甚至更多个氨基酸的长度的片段,例如,由I类MHC分子加工和呈递的片段,优选具有约8-约10个氨基酸的长度,例如,8,9,或10个氨基酸(或甚至11,或12个氨基酸),或通过II类MHC分子加工和呈递的片段,优选具有约13个以上氨基酸的长度,例如,13,14,15,16,17,18,19,20个或甚至更多个氨基酸,其中这些片段可以选自氨基酸序列的任意部分。这些片段典型地以由所述肽片段和MHC分子组成的复合物的形式被T细胞识别,即,所述片段典型地不以其天然形式被识别,即,所述片段典型地不以其天然形式被识别。
B细胞表位典型地是位于本文定义的(天然)蛋白或肽抗原外表面上的片段,优选地具有5至15个氨基酸,更优选地具有5至12个氨基酸,甚至更优选地具有6至9个氨基酸,其可以被抗体识别,即,以其天然形式被抗体识别。
蛋白或肽的此类表位还可以选自本文提及的所述蛋白或肽的变体中的任一种。在这一情形中,抗原决定簇可以是构象或不连续的表位,其由本文定义的蛋白或肽的片段构成,所述片段在本文定义的蛋白或肽的氨基酸序列上是不连续的,但是在三维结构上聚在一起;或者是由单一多肽链组成的连续或线性的表位。
变体:实体的变体,诸如序列的变体,例如,核苷酸或氨基酸序列的变体,是指修饰的实体,诸如修饰的序列,例如,修饰的核苷酸或氨基酸序列。例如,与变体所来源的序列相比,序列的变体可以展现出一个或多个核苷酸或氨基酸缺失、插入、添加和/或取代。优选地,在本发明的情形中,序列的变体与所述变体所来源的序列至少40%、优选至少50%、更优选至少60%、更优选至少70%、甚至更优选至少80%、甚至更优选至少90%、最优选至少95%相同。因此,在本发明的情形中,肽或蛋白抗原的变体优选与所述变体所来源的蛋白或肽抗原的序列至少40%、优选至少50%、更优选至少60%、更优选至少70%、甚至更优选至少80%、甚至更优选至少90%、最优选至少95%相同。优选地,所述变体是功能性变体,即,所述变体实现所述变体所来源的序列所实现的一种或多种功能。例如,蛋白或肽抗原的变体优选地展现出所述变体所来源的蛋白或肽抗原的至少一种抗原功能(例如,能够引发针对所述蛋白或肽抗原中的至少一种抗原决定簇的特异性的免疫反应)。
可以产生本发明的情形中所定义的蛋白或肽的“变体”,其具有与原始序列在一个或多个突变处不同的氨基酸序列,所述突变诸如一个或多个取代的、插入的和/或缺失的氨基酸。优选地,与全长天然蛋白相比,这些片段和/或变体具有相同的生物功能或特定的活性,例如,其抗原特性。例如,本发明的情形中所定义的蛋白或肽的“变体”与其天然序列(即,未突变的生理序列)相比可以包含保守氨基酸取代。这些氨基酸序列及其编码核苷酸序列特别都在本文定义的术语变体的涵盖下。其中来源于同一类的氨基酸彼此交换的取代称为保守取代。具体地,这些是具有脂族侧链、带正电荷或负电荷的侧链、在侧链中有芳香基团的氨基酸或是这样的氨基酸,即所述氨基酸的侧链可以参与氢键,例如,具有羟基官能的侧链。这意味着,例如,具有极性侧链的氨基酸被具有相似极性侧链的另一种氨基酸替代,或者例如,以疏水侧链为特征的氨基酸被另一种具有类似的疏水侧链的氨基酸取代(例如,丝氨酸(苏氨酸)被苏氨酸(丝氨酸)取代,或亮氨酸(异亮氨酸)被异亮氨酸(亮氨酸)取代)。特别地,插入和取代可能在不引起三维结构改变或不影响结合区的那些序列位置。例如,使用CD光谱(圆二色谱)可以容易地确定插入或缺失对三维结构的改变(Urry,1985,Absorption,Circular Dichroism and ORD of Polypeptides(多肽的吸光度、圆二色性和ORD),在:Modern Physical Methods in Biochemistry(生物化学中的现代物理方法),Neuberger等人,(编),Elsevier,Amsterdam)。
另外,蛋白或肽的变体可以包含本文定义的肽类似物。此外,本文定义的可以由核酸分子编码的蛋白或肽的变体还可以包含那些序列,其中所述核酸的核苷酸按照遗传密码的简并性交换而不导致蛋白或肽相应的氨基酸序列改变,即,所述氨基酸序列或其至少部分在上述意义内的一个或多个突变处与原始序列没有区别。
序列同一性:为了确定两个序列相同的百分数,所述序列例如,本文定义的核酸序列或氨基酸序列,诸如由所述聚合载体货物复合物的核酸序列编码的氨基酸序列或本文定义的抗原的核酸序列或氨基酸序列,货物核酸序列或氨基酸序列本身,可以比对所述序列,以随后彼此比较。因此,例如,第一序列的位置可以与第二序列的相应位置进行比较。如果第一序列中的位置被与第二序列中某位置相同的成分占据,则这两个序列在该位置是相同的。如果这不是这样的情形,则所述序列在该位置是不同的。如果与第一序列相比,在第二序列中存在插入,则可以在第一序列中插入缺口以允许进一步的比对。如果与第一序列相比,在第二序列中存在缺失,则可以在第二序列中插入缺口以允许进一步的比对。然后,两个序列相同的百分数是相同位置的数目除以位置总数(包括仅在一个序列中占据的那些位置)的函数。两个序列相同的百分数可以使用数学算法确定。可以使用的一种优选的但非限制性的数学算法的实例是Karlin等人,(1993),PNAS USA,90:5873-5877或Altschul等人,(1997),Nucleic Acids Res.(核酸研究),25:3389-3402的算法。这样的算法整合在BLAST程序中。通过该程序能够鉴定与本发明的序列在某种程度上相同的序列。蛋白或肽的“变体”可以与所述蛋白或肽的10,20,30,50,75或100个氨基酸的片段、优选与其全长序列具有例如至少70%,75%,80%,85%,90%,95%,98%或99%的氨基酸同一性。类似地,核酸序列的“变体”可以与所述核酸序列的10,20,30,50,75或100个核苷酸的片段、优选与其全长序列具有例如至少70%,75%,80%,85%,90%,95%,98%或99%的核苷酸同一性。
蛋白或肽的衍生物:蛋白或肽的衍生物典型地理解为来源于来源于另一种分子(如所述肽或蛋白)的分子。肽或蛋白的“衍生物”还包括包含用在本发明中的肽或蛋白。例如,融合网包含标记,诸如例如,表位,例如,FLAG表位或V5表位或HA表位。例如,所述表位是FLAG表位。诸如标签有效用于例如纯化融合蛋白。术语肽或蛋白的“衍生物”还包括衍生的肽或蛋白,诸如例如,被修饰而包含除氨基酸外的一个或多个化学结构部分的肽或蛋白。所述化学结构部分可以与所述肽或蛋白共价连接,例如,通过氨基端氨基酸残基、羧基端氨基酸残基或在内部氨基酸残基处共价连接。所述修饰包括在所述肽或蛋白中的反应性结构部分上添加保护性基团或帽基团,添加可检测的标记,和其他没有不利地破坏所述肽或蛋白化合物的活性的改变。例如,衍生物可以包含PEG结构部分、放射性核素、有色胶乳等。衍生物通常具有或展现出改善的特征,例如,相对于增强的蛋白酶抗性和/或更长的半衰期和/或在人或动物体的细胞或组织之间增强的转运性和/或减少的副作用和/或增强的亲和性或免疫原性。WO2010/003193描述了多种提供肽或蛋白衍生物的方法,其可以单独使用或使用本领域普通技术人员已知的标准程序组合使用,包括通过例如PEG化、HES化或糖基化衍生蛋白或肽。
按照第一方面,本发明潜在的一个或多个目的通过药物组合物解决,所述药物组合物包含:
(A)聚合载体货物复合物,其包含:
a)包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,其优选由二硫化物交联的阳离子组分形成;和
b)至少一种核酸分子,
(B)至少一种抗原,所述抗原选自由下述组成的组:
(i)来自与传染病相关的病原体的抗原;
(ii)与变态反应或变应性疾病相关的抗原;
(iii)与自身免疫病相关的抗原;和
(iv)与癌症或肿瘤疾病相关的抗原,
或所述抗原的片段、变体和/或衍生物。
优选地,组分(B)不与组分(A)共价连接,特别不是通过二硫键连接。因此,组分(B)优选地不与所述聚合载体和/或所述至少一种核酸分子共价连接,诸如通过二硫键连接。优选地,所述至少一种抗原不与所述聚合载体货物复合物共价连接,特别是不与所述聚合载体货物复合物的聚合载体共价连接。例如,优选地,所述至少一种抗原,诸如蛋白或肽抗原,不与所述聚合载体货物复合物,诸如与所述聚合载体通过二硫键共价连接。然而,在一个实施方案中,其中组分(A)和组分(B)通过二硫键连接,所述连接优选地不通过交联剂实现,诸如不通过3,6-二氧杂-1,8-辛二硫醇(DODT)交联剂实现。此外,在一个实施方案中,其中组分(A)和组分(B)通过二硫键连接,组分(B)优选不是卵清蛋白或卵清蛋白的片段。
不与聚合载体共价连接的组分(B)(例如,蛋白抗原)的优点在于抗原(例如,所述蛋白抗原)的结构不被破坏并且将保留其免疫原性。如果所述抗原(例如,蛋白抗原)与所述聚合载体共价连接(例如,通过二硫键连接),则所述抗原的三级结构可能被改变,或者甚至被变性,这可能破坏构象表位的结构并且可能使得所述蛋白免疫原性变低或没有免疫原性。由免疫系统识别的表位可以是由连续的氨基酸片段组成的线性表位或具有特异性的由来自蛋白不同部分的氨基酸组成的三维形状的构象表位。
此外,优选地,聚合载体,特别是聚合载体的阳离子组分,与所述聚合载体货物复合物的所述至少一种核酸分子不是共价连接,但是优选地通过除共价键之外的其他键缔合,诸如通过离子键和/或范德华键缔合。因此,优选的是,在所述聚合载体货物复合物中,仅阳离子组分彼此共价连接,但是核酸分子与聚合载体非共价缔合。
此外,在优选的实施方案中,组分(A)和(B)不一起形成胶束结构,特别地,所述聚合载体优选地不形成胶束结构。
在本发明所有方面的特定的实施方案中,所述聚合载体货物复合物用作佐剂。例如,其用作佐剂和/或具有佐剂特性,这可以由普通技术人员容易地利用常规方法(包括本文所述的方法)确定。
本发明的药物组合物包含(例如,作为佐剂)至少一种聚合载体货物复合物作为第一成分,其包含:
a)包含(作为载体)二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,其优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,和
b)(作为货物)至少一种核酸分子。
包含在本发明的药物组合物中的聚合载体货物复合物允许提供用于接种目的的更有效的和/或更安全的佐剂。有利地,所述聚合载体货物复合物适于体内递送核酸,特别是用于压缩和稳定用于核酸转染目的的核酸,诸如展现出上文所讨论的高分子量聚合物的一种或多种减少的不利的副作用,诸如低生物降解性或高毒性、团聚性、低体内转染活性等。所述聚合载体货物复合物还提供改善的体内核酸转运,特别是通过皮内或肌内途径的转运,包括血清稳定性、盐稳定性、摄入效率、减少的补体活化、核酸释放等。所述聚合载体货物复合物还可以通过起始或加强平行的先天性免疫应答而支持适应性免疫应答的诱导和维持。另外地,所述聚合载体货物复合物可以展现出改善的储存稳定性,特别是在冻干过程中。
如上文定义的聚合载体货物复合物包含由二硫化物交联的阳离子组分形成的聚合载体作为一种组分。术语“阳离子组分”典型地是指带电荷的分子,其在约1-9的pH值,优选等于或低于9,等于或低于8、等于或低于7的pH值,最优选在生理pH值,例如约7.3-7.4,是带正电荷的(阳离子)。因此,本发明所述的阳离子肽、蛋白或聚合物在生理条件下,特别是在细胞体内的生理盐条件下带正电荷。定义“阳离子”还可以是指“聚阳离子”组分。
在这一情形中,通过二硫化物交联形成所述聚合载体货物复合物的聚合载体的基础的阳离子组分典型地选自任意适于该目的的适当的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物,特别是能够复合如本发明定义的核酸并且由此优选地缩合所述核酸的任意阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物。所述阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物优选是线性分子,然而,也可以使用支链阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物。
所述聚合载体的每个阳离子或聚阳离子蛋白、肽或聚合物包含至少一个-SH结构部分,最优选地至少一个半胱氨酸残基或任意其他展现-SH结构部分的化学基团,其在与作为本文提及的聚合载体的阳离子组分的至少另一种阳离子或聚阳离子蛋白、肽或聚合物缩合时能够形成二硫键。
所述聚合载体的每个阳离子或聚阳离子蛋白、肽或聚合物或任意其他组分优选与其相邻的组分(阳离子蛋白、肽、聚合物或其他组分)通过二硫化物交联连接。优选地,所述二硫化物交联是在所述聚合载体的至少一种阳离子或聚阳离子蛋白、肽或聚合物与至少一种其他阳离子或聚阳离子蛋白、肽或聚合物之间的(可逆的)二硫键(-S-S-)。所述二硫化物交联典型地通过所述聚合载体的组分(特别是阳离子组分)的-SH-结构部分的缩合形成。所述-SH-结构部分可以是所述聚合载体的阳离子或聚阳离子蛋白、肽或聚合物或任意其他组分在二硫化物交联之前的结构或者可以通过下文定义的修饰在二硫化物交联之前添加。在这一情形中,提供二硫键所需要的邻近所述聚合载体的一种组分的硫可以由该组分自身提供,例如,通过本文定义的-SH结构部分提供,或者可以通过相应地修饰所述组分使其展示-SH结构部分而提供。这些-SH-结构部分典型地由每种组分提供,例如,通过所述组分的半胱氨酸或任意其他(修饰的)氨基酸或化合物提供,这些携带-SH结构部分。在所述聚合载体的阳离子组分或任意其他组分是肽或蛋白的情形中,优选所述-SH结构部分由至少一个半胱氨酸残基提供。备选地,所述聚合载体的组分可以相应地用-SH结构部分修饰,优选地通过与携带-SH结构部分的化合物的化学反应进行修饰,以使所述聚合载体的每种组分都携带至少一个这样的-SH结构部分。所述携带-SH结构部分的化合物可以是,例如,所述聚合载体的组分的(另外的)半胱氨酸或任意其他(修饰的)氨基酸或化合物,它们携带-SH结构部分。所述化合物还可以是任意非氨基化合物或结构部分,诸如含有或允许向本文定义的组分中引入-SH结构部分的非氨基酸化合物或结构部分。所述非氨基化合物,例如,非氨基酸化合物,可以通过化学反应或化合物结合与本发明所述的聚合载体的组分连接,例如,通过3-硫代丙酸或2-亚氨基硫杂环戊烷(2-iminothiolane)(Traut’s试剂)的结合,通过酰胺形成(例如,羧酸、硫磺酸、胺等),通过迈克尔加成(例如,顺丁烯二酰亚胺结构部分,α,β不饱和的羰基等),通过click化学(click chemistry)(例如,叠氮化物或炔),通过烯/炔methatesis(alkene/alkine methatesis)(例如,烯或炔),亚胺或腙形成(醛或酮,肼,羟胺,胺),络合反应(抗生物素蛋白,生物素,蛋白G)或允许Sn-型取代反应的组分(例如,卤代烷,硫醇,醇,胺,肼,酰肼,硫磺酸酯,氧盐(oxyphosphonium salts)或其他可以用于连接其他组分的化学结构部分。在一些情形中,在与所述组分化学连接的过程中,所述-SH结构部分可以由保护基团掩蔽。此类保护基团在本领域中是已知的并且可以在化学偶联后去除。在每种情形中,所述-SH结构部分,例如,半胱氨酸或任意其他(修饰的)氨基酸或化合物的-SH结构部分,可以存在在所述聚合载体的组分的末端或内部的任意位置。如本文定义,所述聚合载体的每种组分,优选地所述聚合载体的每种阳离子组分典型地展现出至少一个-SH-结构部分,但是也可以包含两个、三个、四个、五个或甚至更多个-SH-结构部分。
在一个优选的实施方案中,所述聚合载体、货物核酸分子和/或抗原,诸如蛋白或肽抗原,不通过引入用于形成二硫键的新偶联位点(诸如通过引入新的-SH-结构部分)而修饰,特别是所述聚合载体、货物核酸分子和/或抗原,诸如蛋白或肽抗原,优选地不通过二硫代吡啶修饰。因此,在特别优选的实施方案中,所述聚合载体、货物核酸分子和/或抗原不包含二硫代吡啶。
在另一个优选的实施方案中,所述聚合载体不包含聚乙二醇(PEG)结构部分,特别优选地,所述聚合载体的阳离子组分优选地不包含PEG结构部分。然而,如果所述聚合载体包含PEG结构部分,则所述阳离子组分优选不是聚-L-赖氨酸。
另外,为了结合阳离子组分,可以利用-SH结构部分将其他组分连接到本文定义的聚合载体上,特别是氨基酸组分,例如,抗原表位、抗原、抗体、细胞渗透肽(例如TAT)、配体等。如果所述聚合载体除阳离子组分之外还包含其他组分,则优选地所述另外的组分不是卵清蛋白或卵清蛋白的片段,特别地,如果所述另外的组分是氨基酸组分。
如上文定义,所述聚合载体货物复合物的聚合载体由二硫化物交联的阳离子(或聚阳离子)组分形成。
按照一个第一备选方案,所述聚合载体的至少一种阳离子或(聚阳离子)组分可以选自阳离子或聚阳离子肽或蛋白。所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白优选地展现出约3至100个氨基酸的长度,优选约3至50个氨基酸的长度,更优选约3至25个氨基酸的长度,例如,约3至10;5至20;5至15;8至15,16或17;10至15,16,17,18,19,或20;或15至25个氨基酸的长度。备选地或另外地,所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白可以展现出约0.01kDa至约100kDa的分子量,包括约0.5kDa至约100kDa的分子量,优选约10kDa至约50kDa,甚至更优选约10kDa至约30kDa的分子量。在这一情形中,也明确包括本文定义的蛋白或肽的类似物和衍生物。
在所述聚合载体的阳离子组分包含阳离子或聚阳离子肽或蛋白或由阳离子或聚阳离子肽或蛋白组成的具体的情形中,所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白的特性或整个聚合载体(如果所述聚合载体由阳离子或聚阳离子肽或蛋白组成)的特性可以基于其阳离子氨基酸的含量确定,特别是基于其相对于阴离子或中性氨基酸过量的阳离子氨基酸的含量,并且由此基于其净正电荷来确定。优选地,所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白和/或所述聚合载体中阳离子氨基酸的含量为至少10%,20%,或30%,优选至少40%,更优选至少50%,60%或70%,而且优选80%,90%,或者甚至95%,96%,97%,98%,99%或100%,最优选至少30%,40%,50%,60%,70%,80%,90%,95%,96%,97%,98%,99%或100%,或者可以在约10%至90%的范围内,更优选在约15%至75%的范围内,甚至更优选在约20%至50%的范围内,例如20%,30%,40%或50%,或者在由前述数值中任意两个数值形成的范围内,条件是,则在所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白中或在整个聚合载体(如果所述聚合载体完全由阳离子或聚阳离子肽或蛋白组成)中,所有氨基酸(例如阳离子、亲脂性、亲水性、芳香族和其他氨基酸)的含量为100%。
在这一情形中,阳离子氨基酸优选是天然存在的氨基酸Arg(精氨酸),Lys(赖氨酸),His(组氨酸)和Orn(鸟氨酸)。然而,在较广泛意义上,在其侧链上携带阳离子电荷的任意(非天然)氨基酸也可以考虑用来实施本发明。然而,优选包含在生理pH条件下带正电荷的侧链的那些阳离子氨基酸。在一个更优选的实施方案中,这些氨基酸是Arg、Lys和Orn。
优选地,所述聚合载体的此类阳离子或聚阳离子肽或蛋白(其包含或另外被修饰而包含至少一个-SH结构部分)选自,但不限于此,阳离子肽或蛋白,诸如鱼精蛋白,核仁蛋白,精胺或亚精胺,寡聚-或聚-L-赖氨酸(PLL),碱性多肽,寡聚或聚-精氨酸,细胞渗透肽(CPPs),嵌合CPPs,诸如Transportan,或MPG肽,HIV-结合肽,Tat,HIV-1 Tat(HIV),Tat-衍生的肽,穿膜肽(penetratin)家族成员,例如穿膜肽,触角足-衍生的肽(特别是来自果蝇触角足(Drosophila antennapedia)),pAntp,pIsl等,抗微生物衍生的CPPs,例如Buforin-2,Bac715-24,SynB,SynB(1),pVEC,hCT-衍生的肽,SAP,MAP,KALA,PpTG20,Loligomere,FGF,乳铁蛋白,组蛋白,VP22衍生的或类似的肽,HSV,VP22(单纯疱疹(Herpes simplex)),MAP,KALA或蛋白转导结构域(PTDs,PpT620,富含脯氨酸的肽,富含精氨酸的肽,富含赖氨酸的肽,Pep-1,L-寡聚物,降钙素肽等。
备选地或另外地,所述聚合载体的此类阳离子或聚阳离子肽或蛋白(其包含或另外被修饰而包含至少一个-SH结构部分)选自,但不限于此,下述具有下述总式(I)的阳离子肽:
{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x};
其中l+m+n+o+x=3-100,并且l,m,n或o彼此独立地是选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80,81-90和91-100中的任意数字,条件是Arg(精氨酸)、Lys(赖氨酸)、His(组氨酸)和Orn(鸟氨酸)的总含量占所述寡肽全部氨基酸的至少10%;并且Xaa是选自除Arg、Lys、His或Orn之外的天然(=天然存在的)或非天然氨基酸中的任一种氨基酸;x是选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80,81-90中的任意数字,条件是Xaa的总含量不超过所述寡肽的全部氨基酸的90%。氨基酸Arg、Lys、His、Orn和Xaa中的任一种可以位于所述肽的任意位置。在这一情形中,特别优选7-30个氨基酸范围内的阳离子肽或蛋白。该式甚至更优选的肽是寡聚精氨酸,诸如例如Arg7,Arg8,Arg9,Arg12,His3Arg9,Arg9His3,His3Arg9His3,His6Arg9His6,His3Arg4His3,His6Arg4His6,TyrSer2Arg9Ser2Tyr,(ArgLysHis)4,Tyr(ArgLysHis)2Arg等。
按照一个特别优选的实施方案,所述聚合载体具有上文所示的经验总式(I)的所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白可以(但不限于此)包含下式的小组中的至少一个:
Arg7,Arg8,Arg9,Arg10,Arg11,Arg12,Arg13,Arg14,Arg15-30
Lys7,Lys8,Lys9,Lys10,Lys11,Lys12,Lys13,Lys14,Lys15-30
His7,His8,His9,His10,His11,His12,His13,His14,His15-30
Orn7,Orn8,Orn9,Orn10,Orn11,Orn12,Orn13,Orn14,Orn15-30
按照另一个特别优选的实施方案,所述聚合载体具有上文所示的经验总式(I)的所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白(其包含或另外被修饰从而包含至少一个-SH结构部分)可以优选地选自,但不限于此,至少一个下式的小组。下式(与经验式(I))不指定任意氨基酸顺序,但是意欲通过专门指明作为各种肽的组分的氨基酸(数目)而反映经验式。因此,例如,经验式Arg(7-29)Lys1意欲意指该式所涵盖的肽包含任意顺序的7-19个Arg残基和1个Lys残基。如果所述肽包含7个Arg残基和1个Lys残基,则包括所有具有7个Arg残基和1个Lys残基的变体。因此,例如,Lys残基可以位于由7个Arg残基和1个Lys残基组成的8个氨基酸长的序列中的任意位置。所述小组优选地包括:
按照另一个特别优选的实施方案,所述聚合载体具有上文所示的经验总式(I)的所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白(其包含或另外被修饰从而包含至少一个-SH结构部分)可以选自,但不限于此,由通式Arg7(也叫作R7)、Arg9(也叫作R9)、Arg12(也叫作R12)组成的小组。
按照另一个特别优选的实施方案,所述聚合载体的阳离子或聚阳离子肽或蛋白,在按照上文所示的式{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}(式(I))定义并且包含或另外被修饰从而包含至少一个-SH结构部分时,可以选自分式(Ia),但不限于此:
{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa′)x(Cys)y} 式(Ia)
其中(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;和x如本文定义,Xaa’是选自除Arg,Lys,His,Orn或Cys之外的天然(=天然存在的)或非天然氨基酸中的任意氨基酸,并且y是选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80和81-90的任意数字,条件是Arg(精氨酸)、Lys(赖氨酸)、His(组氨酸)和Orn(鸟氨酸)的总含量占所述寡肽全部氨基酸的至少10%。
这一实施方案可以适用于这样的情形,其中所述聚合载体的阳离子或聚阳离子肽或蛋白,例如,当按照上文所示的经验式(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x(式(I))定义时,包含或已经被至少一个半胱氨酸修饰以包含上述意思的-SH结构部分,使得作为阳离子组分的所述阳离子或聚阳离子肽携带至少一个半胱氨酸,其能够与所述聚合载体的其他组分形成二硫键。
按照另一个特别优选的实施方案,所述聚合载体的阳离子或聚阳离子肽或蛋白,当按照上文所示的式{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}(式(I))定义时,可以选自分式(Ib),但不限于此:
Cys1{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}Cys2 (分式(Ib))
其中经验式{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}(式(I))如本文定义,并且形成(半经验)式(I)所述的氨基酸序列的核心,并且其中Cys1和Cys2是接近或在(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x末端的半胱氨酸。示例性的实例可以包含两侧为两个Cys的任一上述序列和下述序列:
这一实施方案可以适用于这样的情形,其中所述聚合载体的阳离子或聚阳离子肽或蛋白,例如,当按照上文所示的经验式(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x(式(I))定义时,已经被至少两个半胱氨酸修饰以包含上述意思的-SH结构部分,使得所述聚合载体货物复合物作为阳离子组分的所述阳离子或聚阳离子肽携带至少两个(末端)半胱氨酸,其能够与所述聚合载体的其他组分形成二硫键。
按照第二备选方案,所述聚合载体的至少一个阳离子(或聚阳离子)组分可以选自,例如,适于这一情形的任意(非肽)阳离子或聚阳离子聚合物,条件是该(非肽)阳离子或聚阳离子聚合物展现出或被修饰从而展现出至少一个-SH-结构部分,其提供连接所述阳离子或聚阳离子聚合物与本文定义的所述聚合载体的另一种组分的二硫键。因此,同样如本文定义,所述聚合载体可以包含相同的或不同的阳离子或聚阳离子聚合物。
在所述聚合载体的阳离子组分包含(非肽)阳离子或聚阳离子聚合物的具体的情形中,所述(非肽)阳离子或聚阳离子聚合物的阳离子特性可以基于其与所述阳离子聚合物各组分的总电荷相比较的阳离子电荷含量而确定。优选地,在本文定义的(生理)pH下,所述阳离子聚合物中阳离子电荷的含量,优选净阳离子电荷(即,减去阴离子和中性电荷)为至少10%,20%,或30%,优选至少40%,更优选至少50%,60%或70%,还优选至少80%,90%,或甚至95%,96%,97%,98%,99%或100%,最优选至少30%,40%,50%,60%,70%,80%,90%,95%,96%,97%,98%,99%或100%,或者可以在约10%-90%的范围内,更优选在约30%-100%的范围内,甚至优选在约50%-100%的范围内,例如,50,60,70,80%,90%或100%,或者在由前述数值中任意两个数值形成的范围内,条件是,在整个阳离子聚合物中的总电荷含量,例如在本文定义的(生理)pH的正电荷和负电荷含量为100%。
优选地,所述聚合载体的(非肽)阳离子组分表现为阳离子或聚阳离子聚合物,典型地展现出约0.1或0.5kDa至约100kDa的分子量,优选约1kDa至约75kDa,更优选约5kDa至约50kDa,甚至更优选约5kDa至约30kDa的分子量,或者约10kDa至约50kDa,甚至更优选约10kDa至约30kDa的分子量。另外地,所述(非肽)阳离子或聚阳离子聚合物典型地展现出至少一个-SH-结构部分,其能够在与本文定义的所述聚合载体的其他阳离子组分或其他组分缩合时形成二硫键。
所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白可以通过普通技术人员已知的所有方法或通过重组肽或蛋白生产或通过本文所述的肽合成制备。
在上述情形中,所述聚合载体的(非肽)阳离子组分可以选自丙烯酸酯,改性的丙烯酸酯,如pDMAEMA(聚(丙烯酸二甲基氨基乙基甲酯)),壳聚糖,氮丙啶或2-乙基-2-唑啉(形成低聚乙烯亚胺或改性的低聚乙烯亚胺),通过二丙烯酸酯与胺类反应形成低聚β氨基酯或聚酰胺基胺(poly amido amines)而得到的聚合物,或其他聚合物,如聚酯、聚碳酸酯等。这些(非肽)阳离子或聚阳离子聚合物中的每种分子典型地展现出至少一个-SH-结构部分,其中这些至少一个-SH-结构部分可以通过化学修饰,例如使用、3-硫代丙酸或引入含有-SH-结构部分的氨基酸(如半胱氨酸或任意其他(修饰的)氨基酸)而引入到所述(非肽)阳离子或聚阳离子聚合物中。所述-SH-结构部分优选地如上文所定义的。
在所述聚合载体的情形中,通过二硫化物交联形成所述聚合载体的基础的阳离子组分可以彼此相同或不同。还特别优选的是本发明的聚合载体包含阳离子肽、蛋白或聚合物以及任选地本文定义的其他组分的混合物,它们通过本文所述的二硫键交联。在本发明的情形中,所述聚合载体的特别优选的阳离子组分是阳离子肽或蛋白。
在这一情形中,所述聚合载体货物复合物由于其可变的聚合载体有利地允许组合不同的(短)阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物或其他组分的需要的特性。例如,所述聚合载体允许有效的压缩核酸而不损失活性,以用于有效转染核酸的目的、用于辅助疗法、用于基因治疗的目的、用于基因敲降或其他策略,特别展现出在体外有效地将核酸转染到不同细胞系中以及特别的体内转染。此外,所述聚合载体以及由此所述聚合载体货物复合物对细胞无毒,提供其核酸货物的有效释放,在冻干过程中稳定并且适合作用为免疫刺激剂或佐剂。优选地,所述聚合载体货物复合物可以诱导抗病毒细胞因子IFN-α。
特别地,由二硫化物连接的阳离子组分形成的聚合载体极大地允许改变其肽或聚合物内容物,由此非常容易且快速地调控其生物物理/生物化学特性,特别是所述聚合载体的阳离子特性,例如,通过结合相同的或不同的阳离子(肽)或聚合物作为阳离子组分并且任选地向所述聚合载体中添加其他组分进行调控。尽管由非常小的无毒单体单位组成,所述聚合载体形成长的阳离子结合序列,提供核酸货物的强缩合作用和复合物稳定性。在胞质的还原条件(例如胞质GSH)下,复合物迅速降解成其(阳离子)组分,其再进一步降解(例如,降解成寡肽)。这支持核酸货物在胞质中的释放。由于在胞质中降解成小的寡肽或聚合物,没有观察到如对于高分子寡肽或聚合物已知的毒性,例如来自高分子聚精氨酸的毒性。
因此,所述聚合载体货物复合物的聚合载体可以包含选自上文定义的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或(非肽)聚合物的不同的(短)阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物,任选地以及上文定义的其他组分。
另外,优选在二硫化物交联之前,上文定义的聚合载体货物复合物的聚合载体,更优选地通过二硫化物交联形成所述聚合载体的基础的不同的(短)阳离子或聚阳离子肽或(非肽)聚合物中的至少一种,可以用至少一种其他组分进行修饰。备选地,所述聚合载体因此可以用至少一种其他组分修饰。其还可以任选地包含至少一种其他组分,所述其他组分典型地与上文定义的其他(短)阳离子或聚阳离子肽一起通过二硫化物交联而形成聚合载体二硫化物。
为了允许上文定义的阳离子或聚阳离子肽或(非肽)聚合物的修饰,所述聚合载体的每种组分(优选地已经在二硫化物交联之前)还可以包含至少一种其他官能结构部分,所述官能结构部分允许连接本文定义的所述其他的组分。所述官能结构部分可以选自允许其他组分连接的官能性,例如,本文定义的官能性,例如,通过形成酰胺(例如,羧酸、硫磺酸、胺等),通过迈克尔加成(例如,顺丁烯二酰亚胺结构部分,α,β不饱和的羰基等),通过click化学(例如,叠氮化物或炔),通过烯/炔methatesis(例如,烯或炔),亚胺或腙形成(醛或酮,肼,羟胺,胺),络合反应(抗生物素蛋白,生物素,蛋白G)或允许Sn-型取代反应的组分(例如,卤代烷,硫醇,醇,胺,肼,酰肼,硫磺酸酯,氧盐)或其他可以用于连接其他组分的化学结构部分。
按照一个特别优选的实施方案,可以包含在所述聚合载体中的或可以用来修饰形成所述聚合载体货物复合物的聚合载体的基础的不同的(短)阳离子或聚阳离子肽或(非肽)聚合物的所述其他组分是氨基酸组分(AA),例如,其可以修饰本文定义的聚合载体的生物物理/生物化学特性。按照本发明,所述氨基酸组分(AA)包含优选在约1-100个范围内、优选在约1-50个范围内的氨基酸数目,更优选选自包括1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14或15-20的数目,或者可以选自由上述数值中的任意两个形成的范围。在这一情形中,氨基酸组分(AA)的氨基酸可以彼此独立地选择。例如,如果在所述聚合载体中存在两个以上的(AA)组分,则它们可以是相同的或可以彼此不同。
所述氨基酸组分(AA)可以包含或者可以侧连含有-SH的结构部分,其允许通过二硫键将该组分(AA)引入到本文定义的聚合载体中。在所述含有-SH的结构部分表现为半胱氨酸的具体的情形中,所述氨基酸组分(AA)还可以读作-Cys-(AA)-Cys-,其中Cys表示半胱氨酸,并且提供二硫键必需的-SH-结构部分。也可以使用上文所示的用于阳离子组分或其任意组分的任一种修饰或反应而将所述含有-SH的结构部分引入到氨基酸组分(AA)中。
此外,所述氨基酸组分(AA)可以提供有两个-SH-结构部分(或者甚至更多个),例如,以式HS-(AA)-SH所示的形式,以允许通过二硫键与两个官能性结合,例如,当所述氨基酸组分(AA)用作两个其他组分之间的接头时(例如,作为两个阳离子聚合物之间的接头)。在这一情形中,在第一步中,一个-SH结构部分优选地用本领域已知的保护基团进行保护,形成式HS-(AA)-S-保护基团的氨基酸组分(AA)。然后,所述氨基酸组分(AA)可以与所述聚合载体的其他组分结合,从而通过未保护的-SH结构部分形成第一个二硫键。然后,典型地将所保护的-SH-结构部分去保护,并且结合到所述聚合载体的其他组分的另一个游离的-SH-结构部分上,从而形成第二个二硫键。
备选地,所述氨基酸组分(AA)可以提供有如上文已经关于所述聚合载体的其他组分所述的其他官能性,其允许所述氨基酸组分(AA)与所述聚合载体的任一种组分结合。
在其中所述氨基酸组分(AA)通过二硫键与所述聚合载体连接的实施方案中,优选的是,所述二硫键不通过交联剂实现,诸如不通过3,6-二氧杂-1,8-辛二硫醇(DODT)交联剂实现。
因此,所述氨基酸组分(AA)可以利用或不利用二硫键结合到所述聚合载体的其他组分上。不利用二硫键的结合可以通过任意上述反应实现,优选地通过利用本文定义的酰胺-化学(amid-chemistry)将所述氨基酸组分(AA)结合到所述聚合载体的其他组分上。如果需要或必需,氨基酸组分(AA)的另一个末端,例如,N或C端,可以用于偶联另一个组分,如配体L。为了这一目的,氨基酸组分(AA)的另一个末端优选地包含或通过修饰而包含其它官能性,例如,炔烃-种类(见上文),其可以用来通过例如click化学加合另一组分。如果配体是通过酸敏感性键结合的,则该键优选地在内体中被切割,并且所述聚合载体在其表面上呈递氨基酸组分(AA)。
所述氨基酸组分(AA)可以存在作为上文定义的聚合载体的另一种组分,例如,作为阳离子组分之间的接头,例如,作为一个阳离子肽与另一个阳离子肽之间的接头,作为一个阳离子聚合物与另一个阳离子聚合物之间的接头,作为一个阳离子肽与阳离子聚合物之间的接头,全部优选地如本文定义,或者作为所述聚合载体的另外的组分,例如通过使所述氨基酸组分(AA)与所述聚合载体或其组分结合,例如通过侧链、SH-结构部分或通过本文定义的其他结构部分结合,其中所述氨基酸组分(AA)优选地进行相应的修饰。
按照另一个且特别优选的备选方案,所述氨基酸组分(AA)可以用来修饰所述聚合载体,特别是在上文定义的聚合载体中的阳离子组分的含量。
在这一情形中,优选地,所述聚合载体中阳离子组分的含量为至少10%,20%,或30%,优选至少40%,更优选至少50%,60%或70%,还优选至少80%,90%,或甚至95%,96%,97%,98%,99%或100%,更优选至少30%,40%,50%,60%,70%,80%,90%,95%,96%,97%,98%,99%或100%,或者可以在约30%至100%的范围内,更优选在约50%至100%的范围内,甚至优选在约70%至100%的范围内,例如,70,80,90或100%,或者在由上述数值中的任意两个形成的范围内,条件是,所述聚合载体中所有组分的含量为100%。
在本发明的情形中,所述氨基酸组分(AA)可以选自下述的备选方案。
按照第一备选方案,所述氨基酸组分(AA)可以是芳香氨基酸组分(AA)。由于芳香氨基酸与核酸货物的碱基的相互作用,将芳香氨基酸或序列作为芳香氨基酸组分(AA)结合在本发明的聚合载体中能够允许所述聚合载体与核酸的不同(第二)结合,这与其通过所述聚合载体分子的阳离子电荷序列与磷酸骨架的结合相反。例如,这种相互作用可以通过插入或通过次要的或主要的沟槽结合而发生。这种类型的相互作用不倾向于被阴离子复合配偶体(例如,肝素、透明质酸)解压缩(decompaction),所述阴离子复合配偶体在体内主要存在于胞外基质中,并且对盐作用的敏感性也较差。
对于这一目的,芳香氨基酸组分(AA)中的氨基酸可以选自相同的或不同的芳香氨基酸,例如,选自Trp,Tyr或Phe。
另外,芳香氨基酸组分(AA)可以包含或可以侧连含有-SH的结构部分,其允许通过二硫键引入该组分作为上文定义的聚合载体的另一部分,例如,作为接头。所述含有-SH的结构部分可以是本文定义的适合将本文定义的一种组分偶联到本文定义的另一组分上的任意结构部分。例如,所述含有-SH的结构部分可以是半胱氨酸。
另外,芳香氨基酸组分(AA)可以包含或展现至少一个脯氨酸,其可以作为所述芳香氨基酸组分(AA)中较长的Trp、Tyr和Phe序列的结构中断剂,优选包含两个、三个或更多个脯氨酸。
按照第二备选方案,氨基酸组分(AA)可以是亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸组分(AA)。将亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸或序列作为亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸组分(AA)结合在本发明的聚合载体中允许与核酸货物的结合更加柔性。这导致更有效地压缩核酸货物,并且因此获得更好的针对核酸酶和不需要的解压缩的保护。还允许提供(长)聚合载体,其相对于完整载体展现出减少的阳离子电荷,并且在这一情形中,如果需要或必需的话,更好地调节结合特性。
对于这一目的,亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸组分(AA)中的氨基酸可以选自相同的或不同的亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸,例如,选自Thr,Ser,Asn或Gln。
另外,亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸组分(AA)可以包含或可以侧连含有-SH的结构部分,其允许通过二硫键引入该组分作为上述通式(I)的另一部分,例如,作为接头。所述含有-SH的结构部分可以是本文定义的适合将本文定义的一种组分偶联到本文定义的另一组分上的任意结构部分。例如,所述含有-SH的结构部分可以是半胱氨酸。
另外,亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸组分(AA)可以包含至少一个脯氨酸,其可以作为亲水性(且优选是不带电荷的极性)氨基酸组分(AA)中较长的Ser、Thr和Asn序列的结构中断剂,优选包含两个、三个或更多个脯氨酸。
按照第三备选方案,氨基酸组分(AA)可以是亲脂性氨基酸组分(AA)。在本发明的聚合载体中结合亲脂性氨基酸或序列作为氨基亲脂性氨基酸组分(AA)能够允许更强地压缩核酸货物和/或在形成复合物时更强地压缩所述聚合载体及其核酸货物。这特别是由于聚合载体的一条或多条聚合物链(特别是亲脂性氨基酸组分(AA)的亲脂性部分)与核酸货物的相互作用导致。这种相互作用优选地将为所述聚合载体及其核酸货物之间的复合物增加另外的稳定性。这种稳定作用在某种程度上可以比得上一类在不同聚合物链之间的非共价交联。尤其是在水性环境中,这种相互作用典型地很强,并且提供显著的影响。
对于这一目的,亲脂性氨基酸组分(AA)中的氨基酸可以选自相同的或不同的亲脂性氨基酸,例如,选自Leu,Val,Ile,Ala,Met。
另外,亲脂性氨基酸组分(AA)可以包含或可以侧连含有-SH的结构部分,其允许通过二硫键引入该组分作为上述聚合载体的另一部分,例如,作为接头。所述含有-SH的结构部分可以是本文定义的适合将本文定义的一种组分偶联到本文定义的另一组分上的任意结构部分。例如,所述含有-SH的结构部分可以是半胱氨酸。
另外,亲脂性氨基酸组分(AA)可以包含至少一个脯氨酸,其可以作为亲脂性氨基酸组分(AA)中较长的Leu、Val、Ile、Ala和Met序列的结构中断剂,优选包含两个、三个或更多个脯氨酸。
最后,按照第四备选方案,氨基酸组分(AA)可以是弱碱性氨基酸组分(AA)。在本发明的聚合载体中结合弱碱性氨基酸或序列作为弱碱性氨基酸组分(AA)可以作为质子海绵,并且促进内体逃逸(也称为内体释放)(质子海绵效应)。结合所述弱碱性氨基酸组分(AA)优选地提高转染效率。
对于这一目的,弱碱性氨基酸组分(AA)中的氨基酸可以选自相同的或不同的弱氨基酸,例如,选自组氨酸或天冬氨酸盐(aspartate)(天冬氨酸)。
另外,弱碱性氨基酸组分(AA)可以包含或可以侧连含有-SH的结构部分,其允许通过二硫键引入该组分作为上述通式(I)的另一部分,例如,作为接头。所述含有-SH的结构部分可以是本文定义的适合将本文定义的一种组分偶联到本文定义的另一组分上的任意结构部分。
另外,弱碱性氨基酸组分(AA)可以包含至少一个脯氨酸,其可以作为弱碱性氨基酸组分(AA)中较长的组氨酸或天冬氨酸盐(aspartate)(天冬氨酸)序列的结构中断剂,优选包含两个、三个或更多个脯氨酸。
按照第五备选方案,氨基酸组分(AA)可以是信号肽或信号序列、定位信号或序列、核定位信号或序列(NLS)、抗体、细胞渗透肽(例如TAT)等。优选地,所述氨基酸组分(AA)通过(可逆的)二硫键结合在所述聚合载体上或者结合在所述聚合载体的另一组分上。在这一情形中,所述信号肽或信号序列、定位信号或序列、核定位信号或序列(NLS)、抗体、细胞渗透肽(例如TAT)等另外包含至少一个-SH-结构部分。在这一情形中,信号肽、定位信号或序列或核定位信号或序列(NLS)可以用于引导本发明的聚合载体货物复合物到达特定的靶细胞(例如,肝细胞或抗原呈递细胞),并且优选地允许所述聚合载体易位(translocalization)到特定的靶标,例如,易位到细胞中,到细胞核中,到内体区室中,关于线粒体基质的序列,关于质膜的定位序列,关于高尔基体、细胞核、胞质和细胞骨架(cytosceleton)等的定位序列。所述信号肽、定位信号或序列或核定位信号可以用于转运任何本文定义的核酸,优选RNA或DNA,更优选shRNA或pDNA,例如,将其转运到细胞核中。不限于此,所述信号肽、定位信号或序列或核定位信号可以包含,例如,关于内质网的定位序列。本文定义的分泌信号肽的实例包括,但不限于此,经典或非经典MHC-分子的信号肽(例如,I和II类MHC分子的信号序列,例如,I类MHC分子HLA-A*0201的信号序列),本文定义的细胞因子或免疫球蛋白的信号肽,本文定义的免疫球蛋白或抗体的不变链的信号肽,Lamp1、Tapasin、Erp57、Calretikulin、钙联接蛋白(Calnexin)和其它膜相关蛋白或与内质网(ER)或内体-溶酶体区室相关的蛋白的信号肽。特别优选地,按照本发明可以使用I类MHC分子HLA-A*0201的信号肽。所述另外的组分可以例如结合到本文定义的聚合载体的阳离子聚合物上或任意其他组分上。优选地,该信号肽、定位信号或序列或核定位信号或序列(NLS)通过(可逆的)二硫键结合到所述聚合载体上或结合到所述聚合载体的另一组分上。对于这一目的,所述(AA)组分另外包含至少一个部分定义的-SH结构部分。与所述聚合载体的任意组分的结合还可以使用酸不稳定键实现,优选通过所述聚合载体的任意组分的侧链实现,其允许在较低pH值(例如,在本文定义的生理pH值)分开或释放所述另外的组分。
另外,按照另一备选方案,所述氨基酸组分(AA)可以是功能肽或蛋白,其可以相应地调节所述聚合载体的官能性。作为氨基酸组分(AA)的所述功能肽或蛋白优选地包括本文定义的肽或蛋白,例如,下文定义的治疗活性蛋白。按照一个备选方案,所述其他功能肽或蛋白可以包括所谓的用于转运的细胞渗透肽(CPPs)或阳离子肽。特别优选的是CPPs,其在内体中诱导pH-介导的构象变化,并且通过插入到脂质体的脂质层而导致聚合载体(其与核酸复合)从内体的释放提高。这些用于转运的细胞渗透肽(CPPs)或阳离子肽可以包括,但不限于此,鱼精蛋白,核仁蛋白,精胺或亚精胺,寡聚-或聚-L-赖氨酸(PLL),碱性多肽,寡聚或聚-精氨酸,细胞渗透肽(CPPs),嵌合CPPs,如Transportan,或MPG肽,HIV-结合肽,Tat,HIV-1 Tat(HIV),Tat-衍生的肽,穿膜肽家族成员,例如穿膜肽,触角足-衍生的肽(特别是来自果蝇触角足),pAntp,pIsl等,抗微生物-衍生的CPPs,例如Buforin-2,Bac715-24,SynB,SynB(1),pVEC,hCT-衍生的肽,SAP,MAP,KALA,PpTG20,Loligomers,FGF,乳铁蛋白,组蛋白,VP22衍生的或类似的肽,HSV,VP22(单纯疱疹),MAP,KALA或蛋白转导结构域(PTDs),PpT620,富含脯氨酸的肽,富含精氨酸的肽,富含赖氨酸的肽,Pep-1,L-寡聚体,降钙素肽等。所述氨基酸组分(AA)还可以结合到本文定义的聚合载体的任意组分上。优选地,其通过(可逆的)二硫键结合到所述聚合载体或所述聚合载体的另一组分上。对于上述目的,所述氨基酸组分(AA)优选地包含至少一个本文定义的-SH结构部分。对所述聚合载体的任意组分的结合也可以利用SH-结构部分或酸不稳定键实现,优选地通过聚合载体的任意成分的侧链实现,其允许在较低pH值(例如,在本文定义的生理pH值)下分开或释放所述另外的组分。
按照最后的备选方案,氨基酸组分(AA)可以包含可以在细胞中发挥任意有利作用的任意肽或蛋白。特别优选的是选自下列的肽或蛋白:治疗活性蛋白或肽,抗原,例如肿瘤抗原,致病性抗原(动物抗原,病毒抗原,原生动物抗原,细菌抗原,变应性抗原),自体免疫抗原,或其它抗原,变应原,抗体,免疫刺激性蛋白或肽,抗原特异性T-细胞受体,或如下文关于编码核酸定义的适于特定(治疗性)应用的任意其他的蛋白或肽。特别优选的是来自至少一种本文定义的抗原(来自与传染病相关的病原体的抗原;与变态反应或变应性疾病相关的抗原;与自身免疫病相关的抗原;或与癌症或肿瘤病相关的抗原)的肽表位。
在该情形中,所述氨基酸组分(AA)共价连接到所述聚合载体货物复合物上,特别是聚合载体上,所述氨基酸组分(AA)优选地不是卵清蛋白或卵清蛋白的片段。优选地,所述氨基酸组分不是卵清蛋白或卵清蛋白的片段。
由于所述氨基酸组分的肽性质,肽、蛋白或其片段、变体和衍生物的定义也相应地适用并且明确地包含在其中。
此外,所述(AA)组分可以通过普通技术人员已知的所有方法或通过重组肽或蛋白生产或通过本文所述的肽合成制备。
所述聚合载体可以包含上文提及的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物或其他组分(例如(AA))中的至少一种,其中任意上述备选方案可以彼此组合,并且可以在通过其-SH-结构部分的聚合缩合反应中使其聚合而形成。
按照另一个实施方案,所述聚合载体货物复合物的聚合载体或其单一组分,例如,上文提及的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物或其他组分,例如(AA),可以用配体进一步修饰,优选用碳水化合物(carbohydrate),更优选用糖,甚至更优选用甘露糖修饰。优选地,所述配体通过(可逆的)二硫键或通过迈克尔加成结合到所述聚合载体上或所述聚合载体的组分上。在配体通过二硫键结合的情形中,所述配体另外包含至少一个-SH-结构部分。这些配体可以用来引导聚合载体货物复合物到达特定的靶细胞(例如,肝细胞或抗原呈递细胞)。在这一情形中,特别优选的是甘露糖作为配体,在该情形中,树突细胞是特别用于接种或辅助目的的靶标。
按照本发明的另一个实施方案,所述聚合载体货物复合物可以包含上文定义不包含-SH结构部分的(AA)组分。这些(AA)组分可以在至少一种核酸分子的复合之前或复合过程中加入。由此,所述(AA)组分(非共价)结合到所述聚合载体货物复合物中,在通过(共价)聚合作用形成的聚合载体本身中不包含所述(AA)组分。
按照一个具体的实施方案,整个聚合载体货物复合物可以在第一步中由上文提及的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物或其他组分(例如(AA))(中的至少一种),通过其-SH-结构部分的聚合缩合以及在第二步中将核酸与所述聚合载体复合而形成。因此,所述聚合载体可以包含多个相同的或不同的上文定义的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物或其他组分(例如(AA))中的至少一种或甚至多种,数目优选由上述范围确定。
按照一个备选的具体实施方案,聚合载体货物复合物通过进行上文提及的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物或其他组分(例如(AA))中的至少一种通过其-SH-结构部分的聚合缩合反应同时将核酸货物复合在(原位制备的)聚合载体上而形成。同样地,因此,此处聚合载体还包含多个相同的或不同的上文定义的阳离子或聚阳离子肽、蛋白或聚合物或其他组分(例如(AA))中的至少一种或甚至多种,数目优选由上述范围确定。
所述聚合载体货物复合物另外包含至少一种核酸(分子)作为货物。在本发明的情形中,所述核酸分子可以是任意的核酸,例如,选自任意(单链或双链的)DNA,优选地,但不限于此,例如,基因组DNA,单链DNA分子,双链DNA分子,编码DNA,DNA引物,DNA探针,免疫刺激性DNA,(短)DNA寡核苷酸((短)寡脱氧核糖核苷酸),或者可以选自,例如,任意PNA(肽核酸)或者可以选自,例如,任意(单链或双链的)RNA,优选地,但不限于此,(短)RNA寡核苷酸((短)寡核糖核苷酸),编码RNA,信使RNA(mRNA),免疫刺激性RNA,小干扰RNA(siRNA),反义RNA,微小RNA,小核RNA(snRNA),小发夹(sh)RNA或riboswitches,核酶或适体;等等。所述聚合载体货物复合物的核酸分子也可以是核糖体RNA(rRNA),转运RNA(tRNA),信使RNA(mRNA)或病毒RNA(vRNA)。优选地,所述聚合载体货物复合物的核酸分子是RNA。更优选地,所述聚合载体货物复合物的核酸分子是(线性)单链RNA,甚至更优选地是mRNA或免疫刺激性RNA。在本发明的情形中,mRNA典型地是RNA,其由一些结构元件组成,例如,可选的5’-CAP结构,可选的5’-UTR区,位于上游的核糖体结合位点,接着是编码区,可选的3’-UTR区,其后可以接着聚-A尾(和/或聚-C尾)。mRNA可以作为单顺反子、双顺反子或甚至多顺反子RNA存在,即为携带一种、两种或更多种蛋白或肽的编码序列的RNA。在双顺反子或甚至多顺反子mRNA中的所述编码序列可以被至少一个IRES(例如,如本文定义)序列隔开。
此外,所述聚合载体货物复合物的核酸可以是单链的或双链的核酸(分子)(由于两条单链核酸(分子)的非共价缔合,其也可以视为核酸(分子))或部分双链或部分单链的核酸,其至少部分自我互补(这些部分双链的或部分单链的核酸分子二者典型地由较长的和较短的单链核酸分子形成或由两条长度大约相同的单链核酸分子形成,其中一条单链核酸分子与另一条单链核酸分子部分互补,并且二者由此在该区域中形成双链核酸分子,即,部分双链或部分单链的核酸(分子))。优选地,所述核酸(分子)可以是单链核酸分子。此外,所述核酸(分子)可以是环形或线性核酸分子,优选是线性核酸分子。
按照一个备选方案,所述聚合载体货物复合物的核酸分子可以是编码核酸,例如DNA或RNA。所述编码DNA或RNA可以是任意本文定义的DNA或RNA。优选地,所述编码DNA或RNA可以是单链的或双链的DNA或RNA,更优选地是单链的DNA或RNA,和/或环形或线性DNA或RNA,更优选地是线性DNA或RNA。甚至更优选地,所述编码DNA或RNA可以是(线性)单链DNA或RNA。最优选地,本发明所述的核酸分子可以是((线性)单链的)信使RNA(mRNA)。所述mRNA可以作为单顺反子、双顺反子或甚至多顺反子RNA存在,即为携带一种、两种或更多种蛋白或肽的编码序列的RNA。在双顺反子或甚至多顺反子mRNA中的所述编码序列可以被至少一个IRES(例如,如本文定义)序列隔开。
编码核酸:
所述聚合载体货物复合物的核酸分子可以编码蛋白或肽,其可以选自,但不限于此,例如,治疗活性蛋白或肽,包括辅助蛋白(adjuvant protein),抗原,例如肿瘤抗原,致病性抗原(例如选自动物抗原,病毒抗原,原生动物抗原,细菌抗原),变应性抗原,自体免疫抗原,或其它抗原,变应原,抗体,免疫刺激性蛋白或肽,抗原特异性T-细胞受体,或适于特定(治疗性)应用的任意其他蛋白或肽,其中可以将编码核酸转运到细胞、组织或生物体中,并且随后可以在该细胞、组织或生物体中表达该蛋白。在这一情形中,编码核酸可以另外编码本文定义的信号肽。
a)治疗活性蛋白
在本发明的情形中,治疗活性蛋白或肽可以由本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子所编码。治疗活性蛋白在本文中定义为对治愈有作用、预防性防止或治疗性治疗疾病(优选如本文定义的疾病)的蛋白,或是个体需要的蛋白。这些可以选自技术人员从现有技术中已知的任何天然的或合成设计存在的重组或分离的蛋白。不限于此,治疗活性蛋白可以包括能够刺激或抑制细胞中的信号转导的蛋白,例如,细胞因子,淋巴因子,单核因子,生长因子,受体,信号转导分子,转录因子等;抗凝剂;抗凝血酶;抗变应性蛋白;凋亡因子或凋亡相关的蛋白,治疗活性酶和与任何获得性疾病或任何遗传性疾病相联系或有利于任何获得性疾病或任何遗传性疾病的治疗的任何蛋白或肽。
治疗活性蛋白,其可以由本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子编码,也可以是辅助蛋白。在这一情形中,辅助蛋白优选理解为能够引发本文定义的先天性免疫应答的任何蛋白。优选地,所述先天性免疫应答包括模式识别受体的激活,所述受体诸如例如,选自Toll-样受体(TLR)家族的受体,包括,例如,选自人TLR1至TLR10或选自鼠Toll样受体TLR1至TLR13的Toll样受体。更优选地,所述辅助蛋白选自人辅助蛋白或选自致病性辅助蛋白,选自由下列组成的组,但不限于此,细菌蛋白,原生动物蛋白,病毒蛋白,或真菌蛋白,动物蛋白,特别是选自细菌辅助蛋白。另外,还可以使用编码参与辅助作用的人蛋白(例如,模式识别受体的配体、模式识别受体、信号转导途径的蛋白、转录因子或细胞因子)的核酸。
b)抗原
本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子可以备选地编码抗原。在本发明的情形中,由本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子编码的抗原典型地包括落入上述定义中的任何抗原、抗原性表位或抗原性肽,更优选是蛋白和肽抗原,例如,肿瘤抗原,变应性抗原,自体免疫自身抗原,致病性抗原等。特别地,由本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子编码的抗原可以是在细胞外产生的抗原,更典型地是不是来源于宿主生物体(例如,人)本身(即非自身抗原)而是来源于宿主生物体之外的宿主细胞的抗原,例如,病毒抗原,细菌抗原,真菌抗原,原生动物抗原,动物抗原,变应性抗原等。变应性抗原(变态反应抗原)典型地是在人中引起变态反应的抗原,并且可以来源于人或其它来源。另外,由本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子编码的抗原还可以是在细胞、组织或身体内产生的抗原。所述抗原包括来源于宿主生物体(例如,人)自身的抗原,例如,肿瘤抗原,自身抗原或自体抗原,诸如自体免疫自身抗原等,以及本文定义的(非自身)抗原,其最初来源于宿主生物体外的宿主细胞,但是其在身体、组织或细胞内分解或降解,例如,通过(蛋白酶)降解、代谢机制等分解或降解。在这一情形中,由包含在所述聚合载体货物复合物中的核酸货物编码的抗原如下文关于本发明的药物组合物的至少一种抗原、第二成分所述那样定义。
在这一情形中,特别优选的是由核酸货物编码的抗原或其片段、变体和/或衍生物是与本文定义的包含在本发明的药物组合物中作为第二成分的至少一种抗原相同的抗原。然而,在备选的实施方案中,由核酸货物编码的抗原或其片段、变体和/或衍生物是与本文定义的包含在本发明的药物组合物中作为第二成分的至少一种抗原不同的抗原。在抗原由核酸货物编码的具体情形中,所述核酸分子连同所述聚合载体一起作为佐剂或免疫刺激剂来诱导非特异性的先天性免疫应答,而由所述核酸货物表达的所编码的蛋白或肽抗原作为抗原来诱导抗原特异性的适应性免疫应答。
c)抗体
按照另一个备选方案,本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子可以编码抗体或抗体片段。按照本发明,所述抗体可以选自本领域已知的任何抗体,例如,任何重组生产或天然存在的抗体,特别是适用于治疗、诊断或科学目的的抗体,或已经鉴定与特定癌症疾病相关的抗体。本文中,术语“抗体”以其最广泛意义使用,并且特别涵盖单克隆和多克隆抗体(包括激动剂、拮抗剂、和阻断或中和抗体)和具有多表位特异性的抗体种类。按照本发明,术语“抗体”典型地包括本领域已知的任何抗体(例如IgM,IgD,IgG,IgA和IgE抗体),诸如天然存在的抗体,通过免疫在宿主生物体中产生的抗体,由天然存在的抗体分离和鉴定的抗体或通过免疫在宿主生物体中产生的抗体和通过本领域已知的生物分子方法重组产生的抗体,以及嵌合抗体,人抗体,人源化抗体,双特异性抗体,细胞内抗体,即在细胞中表达并且任选地定位在特定细胞区室中的抗体,以及前述抗体的片段和变体。一般地,抗体由轻链和重链组成,所述轻链和重链均具有可变结构域和恒定结构域。轻链由N-端可变结构域VL和C-端恒定结构域CL组成。相比之下,IgG抗体的重链,例如,由N-端可变结构域VH和三个恒定结构域CH1、CH2和CH3组成。
在本发明的情形中,由本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子编码的抗体可以优选地包括全长抗体,即由完全重链和完全轻链组成的抗体,如前文所述。然而,抗体的衍生物,诸如抗体片段、变体或加合物,也可以由本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子编码。抗体片段优选地选自前述(全长)抗体的Fab,Fab’,F(ab’)2,Fc,Facb,pFc’,Fd和Fv片段。一般地,抗体片段在本领域中是已知的。例如,Fab(“片段、抗原结合”)片段由每条重链和轻链的一个恒定结构域和一个可变结构域组成。两个可变结构域结合特定抗原上的表位。两条链通过二硫键连接。scFv(“单链可变片段”)片段,例如,典型地由轻链和重链的可变结构域组成。所述结构域通过人工连接键连接,通常是多肽连接,诸如由15-25个甘氨酸、脯氨酸和/或丝氨酸残基组成的肽。
在所述情形中,优选的是抗体或抗体片段的不同链由多顺反子核酸分子编码。备选地,抗体或抗体片段的不同链由数个单顺反子核酸(序列)编码。
siRNA:
按照另一个备选方案,本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子可以采用dsRNA的形式,优选是siRNA的形式。联系RNA干扰现象,特别感兴趣的是dsRNA或siRNA。体外RNA干扰(RNAi)技术基于双链RNA分子(dsRNA),其引发序列特异性的基因表达抑制(Zamore(2001)Nat.Struct.Biol.(自然结构生物学)9:746-750;Sharp(2001)Genes Dev.(基因发育)5:485-490:Hannon(2002)Nature(自然)41:244-251)。在用长dsRNA转染哺乳动物细胞时,蛋白激酶R和RNA酶L的激活导致非特异性作用,诸如例如,干扰素应答(Stark等人,(1998)Annu.Rev.Biochem.(生物化学年度综述)67:227-264;He和Katze(2002)ViralImmunol.(病毒免疫学)15:95-119)。当使用较短的,例如21-至23-mer的所谓siRNA(小干扰RNA)时,避免了这些非特异性作用,因为短于30bp的siRNA不引发非特异性作用(Elbashir等人,(2001)Nature(自然)411:494-498)。
本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子因此可以是长度为17-29、优选19-25的双链RNA(dsRNA),并且(dsRNA的核苷酸)优选与前述(治疗相关)蛋白或抗原(作为活性成分)或本文所述的任意其他蛋白的核酸序列的一部分(编码部分或非编码部分,优选编码部分)有至少90%、更优选95%、特别是100%的互补性。所述核酸分子(的一部分)在本文中可以称为“靶序列”,并且可以是本文定义的任意核酸分子,优选是基因组DNA,cDNA,RNA,例如mRNA等。90%的互补性意指,对于本文所述的dsRNA的长度,例如20个核苷酸,该dsRNA包含的不具有与靶序列相对应部分的互补性的核苷酸不多于2个。然而,按照本发明使用的双链RNA的序列优选地在其通用结构上与靶序列的一部分完全互补。在这一情形中,所述聚合载体货物复合物的核酸分子可以是具有通用结构5′-(N17-29)-3′的dsRNA,优选具有通用结构5′-(N19-25)-3′,更优选具有通用结构5′-(N19-24)-3′,或更优选具有通用结构5′-(N21-23)-3′,其中对于每种通用结构,每个N是所述靶序列的一部分的(优选不同的)核苷酸,优选选自所述靶序列部分的连续17-29个数目的核苷酸,并且以其天然顺序存在于通用结构5′-(N17-29)-3′中。原则上,所有具有17-29、优选19-25个存在于靶序列中的碱基对的长度的部分可以作为本文定义的dsRNA的制剂。同等地,用作所述聚合载体货物复合物的核酸的dsRNAs还可以针对前述(治疗相关)蛋白或抗原(作为活性成分)的不位于靶序列的编码区、特别是5′非编码区的核苷酸序列,例如,因此,针对靶序列具有调节功能的非编码区。因此,用作所述聚合载体货物复合物的核酸分子的dsRNA的靶序列可以位于靶序列的翻译区和不翻译区和/或位于前述蛋白或抗原的控制元件区。用作所述聚合载体货物复合物的核酸分子的dsRNA的靶序列还可以位于不翻译和翻译序列的重叠区;特别地,所述靶序列可以包含编码区(例如,基因组DNA、cDNA、RNA或mRNA等的编码区)起始三联体上游的至少一个核苷酸。
免疫刺激性核酸:
a)免疫刺激性CpG核酸:
按照另一个备选方案,本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子可以采用(免疫刺激性)CpG核酸的形式,特别是CpG-RNA或CpG-DNA的形式,其优选诱导先天性免疫应答。按照本发明使用的CpG-RNA或CpG-DNA可以是单链CpG-DNA(ss CpG-DNA),双链CpG-DNA(dsDNA),单链CpG-RNA(ss CpG-RNA)或双链CpG-RNA(ds CpG-RNA)。按照本发明使用的CpG核酸优选采用CpG-RNA的形式,更优选采用单链CpG-RNA(ss CpG-RNA)的形式。还优选地,所述CpG核酸具有上述长度。优选地,所述CpG基序未甲基化。在一个优选的实施方案中,所述CpG核酸不是由序列5’TCCATGACGTTCCTGACGTT-3’(SEQ ID NO:123)组成的CpG-DNA,特别当所述蛋白或肽抗原是卵清蛋白或卵清蛋白的片段时。在另一个优选的实施方案中,所述CpG核酸不是包含SEQ ID NO:123的序列。优选地,所述CpG核酸不是CpG-DNA。在本发明的一些实施方案中,所述聚合载体货物复合物不包含CpG-DNA,优选地不包含CpG核酸。在本发明的一些实施方案中,所述药物组合物不包含CpG-DNA,优选不包含CpG核酸。
b)免疫刺激性RNA(isRNA):
同样地,按照另一个备选方案,本文定义的聚合载体货物复合物的(免疫刺激性)核酸分子可以采用免疫刺激性RNA(isRNA)的形式,其优选地引发先天性免疫应答。所述免疫刺激性RNA可以是任意(双链或单链)RNA,例如编码RNA,如本文定义。优选地,所述免疫刺激性RNA可以是单链的、双链的或部分双链的RNA,更优选是单链RNA,和/或环形或线性RNA,更优选线性RNA。更优选地,所述免疫刺激性RNA可以是(线性)单链RNA。甚至更优选地,所述免疫刺激性RNA可以是(长)(线性)单链非编码RNA。在这种情形中,特别优选的是,所述isRNA在其5’-端携带三磷酸,对于体外转录的RNA是这种情形。免疫刺激性RNA还可以作为本文定义的短RNA寡核苷酸存在。本文所用的免疫刺激性RNA还可以选自任何种类的RNA分子,天然存在的或合成制备的,并且其可以诱导先天性免疫应答并且可以支持由抗原诱导的适应性免疫应答。在这种情形中,免疫应答可以以多种方式发生。关于适当的(适应性)免疫应答的基本因素是不同T细胞亚群的刺激。T淋巴细胞典型地分成两个亚群,T辅助1(Th1)细胞和T辅助2(Th2)细胞,利用其免疫系统能够破坏细胞内(Th1)和细胞外(Th2)病原体(例如,抗原)。这两种Th细胞群在它们所产生的效应子蛋白(细胞因子)的模式方面不同。因此,Th1细胞通过激活巨噬细胞和细胞毒性T细胞而辅助细胞免疫应答。在另一方面,Th2细胞通过刺激B细胞转化为浆细胞和通过形成抗体(例如,针对抗原的抗体)而促进体液免疫应答。因此,在诱导和维持适应性免疫应答方面,Th1/Th2比率非常重要。与本发明相联系的,(适应性)免疫应答的Th1/Th2比率优选向细胞应答(Th1应答)方向转变,并且由此诱导细胞免疫应答。按照一个实例,可以通过Toll样受体(TLRs)的配体激活可能支持适应性免疫应答的先天性免疫系统。TLRs是高度保守的模式识别受体(PRR)多肽家族,其识别病原体相关的分子模式(PAMPs)并且在哺乳动物的先天免疫性中起关键作用。目前,已经鉴定了至少十三个家族成员,称为TLR1-TLR13(Toll-样受体:TLR1,TLR2,TLR3,TLR4,TLR5,TLR6,TLR7,TLR8,TLR9,TLR10,TLR11,TLR12或TLR13)。此外,已经鉴定了多个特异性TLR配体。例如,发现未甲基化的细菌DNA及其合成的类似物(CpG DNA)是关于TLR9的配体(Hemmi H等人,(2000)Nature(自然)408:740-5;Bauer S等人,(2001)Proc Natl Acad Sci USA(美国国家科学院学报)98,9237-42)。此外,已经报道,关于某些TLRs的配体包括某些核酸分子,并且某些类型的RNA以序列不依赖性或序列依赖性方式是免疫刺激性的,其中这些不同的免疫刺激性RNAs可以,例如,刺激TLR3,TLR7,或TLR8,或细胞内受体,诸如RIG-I,MDA-5等。例如,Lipford等人确定某些含有G,U的寡核糖核苷酸通过TLR7和TLR8作用是免疫刺激性的(参见WO 03/086280)。相信由Lipford等人所述的免疫刺激性含有G,U的寡核糖核苷酸可来源于包括核糖体RNA、转运RNA、信使RNA和病毒RNA的RNA来源。
用作本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子的免疫刺激性RNA(isRNA)因此可以包括已知是免疫刺激性的任何RNA序列,包括但不限于此,代表和/或编码TLRs的配体的RNA序列,优选选自人家族成员TLR1-TLR10或鼠家族成员TLR1-TLR13,更优选选自(人)家族成员TLR1-TLR10,甚至更优选选自TLR7和TLR8,关于RNA的细胞内受体的配体(诸如RIG-I或MDA-5等)(参见例如.Meylan,E.,Tschopp,J.(2006).Toll-like receptors and RNAhelicases:two parallel ways to trigger antiviral responses(Toll样受体和RNA解旋酶:引发抗病毒反应的两种平行方式).Mol.Cell(分子细胞)22,561-569),或任意其它免疫刺激性RNA序列。此外,用作所述聚合载体货物复合物的核酸分子的免疫刺激性RNA分子(种类)可以包括能够引发先天性免疫应答的任何其它RNA。不限于此,所述免疫刺激性RNA可以包括核糖体RNA(rRNA),转运RNA(tRNA),信使RNA(mRNA)和病毒RNA(vRNA),优选地,所述免疫刺激性RNA是非编码的RNA。所述免疫刺激性RNA可以包括1000-5000,500-5000,5-5000,或5-1000,5-500,5-250,5-100,5-50或5-30个核苷酸的长度。
按照一个特别优选的实施方案,所述免疫刺激性核酸序列优选是优选由式(II)或(III)的核酸序列组成或包含式(II)或(III)的核酸序列的RNA:
GlXmGn,(式(II))
其中:
G是鸟苷、尿嘧啶或是鸟苷或尿嘧啶的类似物;
X是鸟苷、尿嘧啶、腺苷、胸苷、胞嘧啶或上述核苷酸的类似物;
l是1-40的整数,
其中
当l=1时,G是鸟苷或其类似物,
当l>1时,至少50%的核苷酸是鸟苷或其类似物;
m是整数且至少为3;
其中
当m=3时,X是尿嘧啶或其类似物,
当m>3时,存在至少3个连续的尿嘧啶或尿嘧啶类似物;
n是1-40的整数,
其中
当n=1时,G是鸟苷或其类似物,
当n>1时,至少50%的核苷酸是鸟苷或其类似物。
ClXmCn,(式(III))
其中:
C是胞嘧啶、尿嘧啶或是胞嘧啶或尿嘧啶的类似物;
X是鸟苷、尿嘧啶、腺苷、胸苷、胞嘧啶或上述核苷酸的类似物;
l是1-40的整数,
其中
当l=1时,C是胞嘧啶或其类似物,
当l>1时,至少50%的核苷酸是胞嘧啶或其类似物;
m是整数且至少为3;
其中
当m=3时,X是尿嘧啶或其类似物,
当m>3时,存在至少3个连续的尿嘧啶或尿嘧啶类似物;
n是1-40的整数,
其中
当n=1时,C是胞嘧啶或其类似物,
当n>1时,至少50%的核苷酸是胞嘧啶或其类似物。
可以用作所述聚合载体货物复合物的核酸货物的式(II)或(III)的核酸可以是相对短的核酸分子,典型的长度约为5-100(但是,对于特定的实施方案,也可以长于100个核苷酸,例如,至多200个核苷酸)、5-90或5-80个核苷酸,优选长度约为5-70,更优选长度约为8-60,更优选长度约为15-60个核苷酸,更优选20-60,最优选30-60个核苷酸。如果核酸货物复合物的核酸具有例如100个核苷酸的最大长度,则m典型地<=98。式(II)的核酸中核苷酸G的数目由l或n确定。l和n,彼此独立,分别是1-40的整数,其中当l或n=1时,G是鸟苷或其类似物,当l或n>1时,至少50%的核苷酸是鸟苷或其类似物。例如,不暗示任何限制,当l或n=4时,Gl或Gn可以是,例如,GUGU,GGUU,UGUG,UUGG,GUUG,GGGU,GGUG,GUGG,UGGG或GGGG等;当l或n=5时,Gl或Gn可以是,例如,GGGUU,GGUGU,GUGGU,UGGGU,UGGUG,UGUGG,UUGGG,GUGUG,GGGGU,GGGUG,GGUGG,GUGGG,UGGGG或GGGGG等;等等。在本发明式(II)的核酸中与Xm相邻的核苷酸优选不是尿嘧啶。类似地,在本发明式(III)的核酸中核苷酸C的数目由l或n确定。l和n,彼此独立,分别是1-40的整数,其中当l或n=1时,C是胞嘧啶或其类似物,当l或n>1时,至少50%的核苷酸是胞嘧啶或其类似物。例如,不暗示任何限制,当l或n=4时,Cl或Cn可以是,例如,CUCU,CCUU,UCUC,UUCC,CUUC,CCCU,CCUC,CUCC,UCCC或CCCC等;当l或n=5时,Cl或Cn可以是,例如,CCCUU,CCUCU,CUCCU,UCCCU,UCCUC,UCUCC,UUCCC,CUCUC,CCCCU,CCCUC,CCUCC,CUCCC,UCCCC或CCCCC等;等等。在本发明式(V)的核酸中与Xm相邻的核苷酸优选不是尿嘧啶。优选地,对于式(II),当l或n>1时,至少60%,70%,80%,90%或甚至100%的核苷酸是鸟苷或其类似物,如上文定义。在侧连序列Gl和/或Gn中至100%的其余的核苷酸(当鸟苷组成少于100%的核苷酸时)是尿嘧啶或其类似物,如前文定义。还优选地,l和n,彼此独立,分别是2-30的整数,更优选是2-20的整数,更优选是2-15的整数。如果有必要,l或n的下限可以变化,并且至少为1,优选至少为2,更优选至少为3,4,5,6,7,8,9或10。这一定义相应地应用于式(III)。
按照一个特别优选的实施方案,可以用作所述聚合载体货物复合物的核酸的任意式(II)或(III)的核酸可以选自由任意下述序列组成或包含任意下述序列的序列:
或选自与这些序列中的任一种具有至少60%,70%,80%,90%或甚至95%的序列同一性的序列。
按照另一个特别优选的实施方案,所述免疫刺激性核酸序列,特别是isRNA,由式(IV)或(V)的核酸组成或包含式(IV)或(V)的核酸:
(NuGlXmGnNv)a,(式(IV))
其中:
G是鸟苷(鸟嘌呤)、尿苷(尿嘧啶)或是鸟苷(鸟嘌呤)或尿苷(尿嘧啶)的类似物,优选是鸟苷(鸟嘌呤)或其类似物;
X是鸟苷(鸟嘌呤)、尿苷(尿嘧啶)、腺苷(腺嘌呤)、胸苷(胸腺嘧啶)、胞苷(胞嘧啶),或这些核苷酸(核苷)的类似物,优选是尿苷(尿嘧啶)或其类似物;
N是具有约4-50、优选约4-40、更优选约4-30或4-20个核酸的长度的核酸序列,每个N独立地选自鸟苷(鸟嘌呤)、尿苷(尿嘧啶)、腺苷(腺嘌呤)、胸苷(胸腺嘧啶)、胞苷(胞嘧啶)或这些核苷酸(核苷)的类似物;
a是1-20的整数,优选1-15,最优选1-10的整数;
l是1-40的整数,
其中,当l=1时,G是鸟苷(鸟嘌呤)或其类似物,
当l>1时,至少50%的这些核苷酸(核苷)是鸟苷(鸟嘌呤)
或其类似物;
m是整数且至少为3;
其中,当m=3时,X是尿苷(尿嘧啶)或其类似物,和
当m>3时,存在至少3个连续的尿苷(尿嘧啶)或尿苷(尿嘧啶)类似物;
n是1-40的整数,
其中,当n=1时,G是鸟苷(鸟嘌呤)或其类似物,
当n>1时,至少50%的这些核苷酸(核苷)是鸟苷(鸟嘌呤)
或其类似物;
u,v可以彼此独立为0-50的整数,
优选地其中,当u=0时,v≥1,或
当v=0时,u≥1;
其中式(IV)的核酸分子的长度为至少50个核苷酸,优选至少100个核苷酸,更优选至少150个核苷酸,甚至更优选至少200个核苷酸,且最优选至少250个核苷酸。
(NuClXmCnNv)a,(式(V))
其中:
C是胞苷(胞嘧啶)、尿苷(尿嘧啶)或是胞苷(胞嘧啶)或尿苷(尿嘧啶)的类似物,优选是胞苷(胞嘧啶)或其类似物;
X是鸟苷(鸟嘌呤)、尿苷(尿嘧啶)、腺苷(腺嘌呤)、胸苷(胸腺嘧啶)、胞苷(胞嘧啶),或前述核苷酸(核苷)的类似物,优选是尿苷(尿嘧啶)或其类似物;
N分别是彼此独立具有约4-50、优选约4-40、更优选约4-30或4-20个核酸的长度的核酸序列,每个N独立地选自鸟苷(鸟嘌呤)、尿苷(尿嘧啶)、腺苷(腺嘌呤)、胸苷(胸腺嘧啶)、胞苷(胞嘧啶)或这些核苷酸(核苷)的类似物;
a是1-20的整数,优选1-15,最优选1-10的整数;
l是1-40的整数,
其中,当l=1时,C是胞苷(胞嘧啶)或其类似物,
当l>1时,至少50%的这些核苷酸(核苷)是胞苷(胞嘧啶)或其类似物;
m是整数且至少为3;
其中,当m=3时,X是尿苷(尿嘧啶)或其类似物,
当m>3时,存在至少3个连续的尿苷(尿嘧啶)或尿苷(尿嘧啶)类似物;
n是1-40的整数,
其中,当n=1时,C是胞苷(胞嘧啶)或其类似物,
当n>1时,至少50%的这些核苷酸(核苷)是胞苷(胞嘧啶)或其类似物;
u,v可以彼此独立为0-50的整数,
优选地其中,当u=0时,v≥1,或
当v=0时,u≥1;
其中本发明式(V)的核酸分子的长度为至少50个核苷酸,优选至少100个核苷酸,更优选至少150个核苷酸,甚至更优选至少200个核苷酸,且最优选至少250个核苷酸。
对于式(V),上述关于元件N(即Nu和Nv)和X(Xm),特别是上文定义的核心结构,以及关于整数a,l,m,n,u和v给出的任一定义,类似地相应地适用于式(IV)的元件,其中式(V)中,核心结构由ClXmCn限定。边缘元件Nu和Nv的定义与上文关于Nu和Nv给出的定义相同。
按照一个更特别优选的实施方案,本发明式(IV)的核酸分子可以包含,例如,任一下述序列,优选地由任一下述序列组成:
或与上文定义的任一序列具有至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%、最优选至少95%的同一性的核酸序列。
按照另一个更特别优选的实施方案,式(V)的核酸分子包含,例如,任一下述序列,优选地由任一下述序列组成:
或与上文定义的任一序列具有至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%、最优选至少95%的同一性的核酸序列。
在另一个优选的实施方案中,本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子还可以以修饰的核酸的形式存在。
按照第一实施方案,本文定义的聚合载体货物复合物的核酸分子可以作为“稳定的核酸”提供,优选作为稳定的RNA或DNA提供,更优选作为基本上耐受体内降解(例如,通过核酸外切酶或核酸内切酶降解)的RNA提供。
按照另一个实施方案,本文定义的聚合载体货物复合物的核酸货物可以如本文定义那样修饰,和/或稳定,特别是当所述核酸分子采用编码核酸的形式,例如,mRNA,通过改变所述核酸分子(特别是mRNA,优选其如本文定义的编码区)的G/C含量进行。
在本文用作本文定义的聚合载体货物复合物中包含的货物的核酸分子可以使用本领域已知的任一种方法,包括本文定义的核酸合成方法制备。
此外,本发明明确包括包含在所述聚合载体货物复合物中作为核酸货物的本文定义的核酸分子的变体和片段。
在本发明的情形中,特别优选的核酸货物分子是这样的核酸分子,其包含下述,优选地由下述组成:SEQ ID NO.105或122的核酸序列或与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%、最优选至少95%相同的序列。
在所述聚合载体货物复合物中,本文定义的聚合载体的阳离子组分和核酸货物典型地以约1-10000的聚合物比核酸的摩尔比率提供,优选以约5-5000的摩尔比率,更优选以约10-2500的摩尔比率,甚至更优选以约25-2000的摩尔比率,并且最优选以约25-1000的摩尔比率提供。
此外,在所述聚合载体货物复合物中,本文定义的聚合载体的阳离子组分和核酸货物优选以至少0.1,0.2,0.3,0.4,0.5,0.75,1,1.5或2的N/P-比率提供。优选地,所述N/P-比率在约0.1,0.3,0.4,0.5,0.75,1.0,1.5或2-20的范围内,更优选在约0.2(0.5或0.75或1.0)至12的范围内,更优选以约0.4(0.75或1.0)至10的N/P-比率,甚至更优选地以约0.4(0.75或1.0)至5的N/P比率。最优选地,所述N/P比率为0.1-0.9的比率。在这一情形中,所述N/P比率因此是所述聚合载体的阳离子(侧链)组分或所述聚合载体的离子电荷。具体地,如果所述阳离子组分的阳离子特性是由氮(例如,氨基酸侧链的氮)产生,则考虑到所述聚合载体的阳离子组分中的(侧链)氮原子贡献正电荷,并且核酸磷酸骨架的磷酸贡献负电荷,N/P比率表示所述核苷酸骨架中的碱性氮原子与磷酸残基的比率。通常,一个磷酸提供一个负电荷,例如,货物核酸分子中的一个核苷酸提供一个负电荷。实施例中给出了公式,N/P-比率定义为整个本发明的聚合载体货物复合物的氮/磷酸比率(N/P-比率)。这典型地示例所述聚合载体中阳离子成分的含量/量,并且表征在本发明的聚合载体货物复合物中结合或复合的核酸的含量/量。其可以基于下述计算,例如,1μg RNA典型地包含约3nmol磷酸残基,条件是RNA展现出碱基的统计学分布。另外,取决于分子量及其(阳离子)氨基酸的数目,1nmol肽典型地包含约x nmol氮残基。
在这一情形中,对于体外应用(例如,在从患者提取的细胞在体外用本发明的药物组合物治疗并且随后施用给所述患者的情形中),优选的是,在所述聚合载体货物复合物中,本文定义的聚合载体的阳离子组分和核酸货物以至少约1,优选约1-20范围内的N/P-比率提供。
对于本发明的药物组合物的体内应用,优选至少0.1(0.2,0.3,0.4,0.5,0.6)的N/P比率,优选约0.1(0.2,0.3,0.4.,0.5,或0.6)至1.5范围内的N/P比率。甚至更优选的是0.1或0.2至0.9的N/P比率范围或0.5至0.9的N/P比率范围。
在意欲诱导IFN-α的具体情形中,优选至少0.1(0.2,0.3,0.4,0.5或0.6)的N/P比率或0.1至1的N/P比率范围,或更优选0.1或0.2至0.9的N/P比率范围或0.5至0.9的N/P比率范围。另外,如果意欲诱导TNFα,特别优选1-20的N/P比率。
N/P比率显著地影响产生的聚合载体货物复合物的表面电荷。因此,优选地,对于体外应用,产生的聚合载体货物复合物是带正电荷的,对于体内应用是带负电荷或中性的。产生的聚合载体货物复合物的表面电荷可以表示为ζ电位,其可以使用Zetasizer Nano(Malvern Instruments,Malvern,UK)通过多普勒电泳方法测量。通常,低于1的N/P比率产生负的ζ电位,高于1的N/P比率产生正的ζ电位(在典型的测量误差范围内)。
在一些实施方案中,聚合载体货物复合物的表面电荷,优选ζ电位,是正的,即,高于0mV,诸如高于1mV,高于2mV,高于4mV,高于5mV或高于10mV。在备选的实施方案中,聚合载体货物复合物的表面电荷,优选ζ电位,是负的,即,低于0mV,诸如低于-1mV,低于-2mV,低于-4mV,低于-5mV或低于-10mV,诸如约-1mV至-50mV,约-2mV至-40mV或约-5mV至-30mV。
所述聚合载体货物复合物用于本发明时,诸如用作佐剂时,优选地能够引发非抗原特异性的(先天性)免疫反应(由先天性免疫系统提供),优选以免疫刺激方式引发。通常可以以多种方式引起免疫反应。关于适当的免疫应答的重要因素是不同T细胞亚群的刺激。T淋巴细胞典型地分成两个亚群,T辅助1(Th1)细胞和T辅助2(Th2)细胞,利用其免疫系统能够破坏细胞内(Th1)和细胞外(Th2)病原体(例如,抗原)。这两种Th细胞群在它们所产生的效应子蛋白(细胞因子)的模式方面不同。因此,Th1细胞通过激活巨噬细胞和细胞毒性T细胞而辅助细胞免疫应答。在另一方面,Th2细胞通过刺激B细胞转化为浆细胞和通过形成抗体(例如,针对抗原的抗体)而促进体液免疫应答。因此,Th1/Th2比率在免疫应答中非常重要。与本发明相联系的,在细胞应答(也就是说,Th1应答)方向上,免疫应答的Th1/Th2比率优选被免疫刺激剂替代,特别是被所述聚合载体货物复合物替代,并且由此诱导主要的细胞免疫应答。如上文所述,所述聚合载体货物复合物可以诱导非特异性的先天性免疫应答,其可能允许支持由所述抗原引发的特异性的适应性免疫应答。
确定本发明的药物组合物中的组分的(先天性)免疫刺激或辅助能力:
为了确定免疫刺激剂或佐剂(特别是用于本发明的聚合载体货物复合物)的免疫刺激能力,一些方法在本领域中是已知的并且可以使用。例如,体外方法有利地利用化合物诱导细胞因子的能力,其(专门地或至少典型地)是先天性免疫系统的一部分,并且由此(作为免疫系统的另一个分支)典型地改善由抗原引起的抗原特异性免疫应答的诱导。对于这一目的,例如,可以从血液样品分离PBMCs,并且用特定的免疫刺激剂或佐剂刺激。温育后,通过ELISA确定典型地作为先天性免疫系统的一部分(并且不是抗原特异性的免疫系统)的需要的细胞因子的分泌(例如,作为激活PAMP受体的反应)。这些选择的细胞因子在本领域中可以用作在体内诱导先天性免疫应答的决定子。在这一情形中,优选地测量TNF-α和IFN-α的分泌以确定由化合物或复合物激发的非特异性(先天性免疫应答)。特别地,IFN-α在病毒感染后的非特异性免疫应答的诱导过程中起重要作用,并且可以用作诱导Th1-转换的适应性免疫应答的指示剂,在治疗癌症或肿瘤疾病的情形中这是特别优选的。因此,特别优选的是,在筛选测定中检测的免疫刺激性化合物或复合物诱导例如IFN-α的分泌。然后,可以应用所述化合物或复合物,例如在接种治疗法中用作免疫刺激剂(引发非特异性(先天性)免疫应答)。
IFN-α是I型干扰素家族的一部分。I型干扰素(IFN)是主要支持抗病毒免疫应答的多向性细胞因子。除了激活天然杀伤(NK)和T细胞之外,其还诱导感染病毒的细胞的凋亡和针对病毒感染的细胞抗性。I型干扰素对大量的细胞因子和趋化因子有影响,即,其影响单核细胞成熟、归巢(homing)、效应子功能和凋亡。典型地,IFN-α的主要作用是诱导致敏状态(其影响其他调控剂(包括细胞因子)的产生和调节)。例如,IFN-αβ信号传导上调树突细胞(DCs)和T细胞的IFN-αγ产生,并且因此有利于诱导并维持Th1细胞。当使用蛋白或肽疫苗时,由于这些疫苗通常诱导基于Th2的免疫应答,其由此防止或减少细胞毒性T细胞的诱导,因此,向Th1免疫应答方向转换免疫应答可能变得特别重要。
因此,优选的是,在本发明的情形中用作佐剂的化合物或复合物可以优选地具有将由抗原引起的抗原特异性的免疫应答转换为基于Th1的免疫应答的特性。通常通过确定一些亚型的抗原特异性抗体的诱导和抗原特异性细胞毒性CD8+T细胞的诱导来测量由抗原诱导的免疫应答的方向。在这一情形中,亚型抗体IgG1表示基于Th2的免疫应答的诱导,并且亚型抗体IgG2a的诱导和细胞毒性T细胞的诱导表示基于Th1的免疫应答的诱导。抗原特异性抗体的诱导典型地通过ELISA测量疫苗的血液中的抗体滴度来确定。抗原特异性细胞毒性T细胞的诱导典型地通过ELISPOT测量用抗原特异性肽刺激后脾细胞中的IFN-γ分泌来确定。在这一情形中,IFN-γ分泌的诱导提供脾中存在抗原特异性T细胞的证据,并且其可以特异性地攻击在其表面上呈递I类MHC分子上的抗原表位的细胞。
为了确定佐剂的有利特性,典型地进行体内接种。由此可能研究所述佐剂或免疫刺激性化合物或复合物是否改善由所述疫苗引起的抗原特异性的免疫应答,并且此外,其能否在需要的方向上转换抗原特异性的免疫应答以展示佐剂特性。具体地,在诱导抗肿瘤免疫应答时,相信Th1-转换的免疫应答的诱导,特别是细胞毒性T细胞的诱导起主要作用,原因在于相信抗原特异性细胞毒性T细胞的诱导表示成功的肿瘤斗争不可缺少的先决条件。
因此,筛选、检测和/或研究展现出作为佐剂的特性的化合物或复合物的方法在本领域中是公知的,并且可以容易地进行应用,例如,通过ELISA检测测量由所检测的化合物/复合物激发的免疫应答。
在另一个方面,本发明涉及制备本发明的药物组合物的方法,所述方法包括下述步骤:(i)提供本文任意地方定义的至少一种聚合载体货物复合物;(ii)提供本文任意地方定义的抗原;和(iii)组合所述聚合载体货物复合物与所述抗原。(iii)的组合步骤可以在施用给患者之前立即发生(诸如在所述施用之前约1,5,15,30或60分钟,直至72小时),或者可以在制备所述药物组合物的过程中发生。相应的普通技术人员(例如,医生或健康专家、或供应商)应该知晓适用于所述组合步骤的常规方法。
在本发明的情形中,制备本文定义的聚合载体货物复合物的方法可以包括下述步骤:
a)提供至少一种本文定义的阳离子蛋白或肽和/或至少一种阳离子或聚阳离子聚合物以及任选地至少一种本文定义的氨基酸组分(AA),每种分别包含至少一个-SH结构部分,
b)提供至少一种本文定义的核酸分子,优选地以上文提及的比率提供,
c)将在步骤a)和b)中提供的组分混合,优选在本文定义的碱性或中性环境中,优选地在氧气或本文定义的其他起始剂(starter)的存在下,优选在本文定义的pH、温度和时间混合,由此缩合并且由此通过二硫键将步骤a)中提供的阳离子组分彼此聚合在一起(在聚合缩合反应或缩聚反应中),从而获得所述聚合载体,并且将步骤b)中提供的核酸分子与步骤a)中提供的阳离子组分复合在一起,
d)任选地纯化按照步骤c)得到的聚合载体货物复合物,优选使用本文所述的方法纯化,
e)任选地将按照步骤c)或d)得到的聚合载体货物复合物冻干。
本文所述的制备聚合载体货物复合物的方法在步骤c)中可以包含通过离析物(例如,本文定义的阳离子肽或聚合物以及任选地其他氨基酸组分(AA))的-SH结构部分的多步缩合聚合或缩聚反应。与核酸分子的复合或静电结合同时发生的缩合聚合或缩聚反应优选地产生聚合载体货物复合物,其中所述聚合载体是缩合聚合物,其中各单一组分通过二硫键连接。
如本文在制备聚合载体货物复合物的方法的步骤a)中所述,提供本文定义的至少一种阳离子或聚阳离子蛋白或肽和/或本文定义的至少一种阳离子或聚阳离子聚合物,优选以上文所示的比率提供。在步骤c)中这些组分与步骤b)中提供的核酸分子混合,优选在本文定义的碱性或中性环境中,优选在氧气或本文定义的其他起始剂的存在下,优选在本文定义的pH、温度和时间混合,由此缩合并由此通过二硫键将这些组分彼此聚合(在聚合缩合或缩聚反应中),从而获得与本文定义的核酸分子复合的聚合载体。
按照一个备选方案,在所述制备聚合载体货物复合物的方的步骤a)中,提供本文定义的至少一种阳离子或聚阳离子蛋白或肽和/或至少一种阳离子或聚阳离子聚合物,并且任选地在步骤a)中提供本文定义的至少一种氨基酸组分(AA),并且在添加步骤b)的核酸之前但是使用步骤c)的列出的相同的聚合条件,用于聚合缩合或缩聚以及复合反应。然后,在步骤c)中将聚合的聚合载体与步骤b)的核酸混合。优选地,所述组分全部以上文所示的比率提供,并且优选地在本文定义的碱性或中性环境下,优选在氧气或本文定义的其他起始剂的存在下,优选在本文定义的pH、温度和时间混合。当混合并起始反应时,所述组分缩合并由此通过二硫键彼此聚合(在聚合缩合或缩聚反应中),从而获得与本文定义的核酸分子复合的聚合载体。
在上述两个备选方案中,在上文所示的缩合聚合反应中可以选择不同的聚合载体,特别是不同的肽和/或不同的聚合物。在这一情形中,聚合载体的不同组分的选择典型地依赖于最终聚合载体的需要的特性和最终聚合载体的需要的阳离子强度。因此,在步骤a)的上述备选方案中,阳离子组分的含量可以被进一步“稀释”或改变,例如,通过引入本文定义的氨基酸组分(AA),优选以上文定义的比率引入。由此,可以获得修饰的聚合载体,其中典型在本文定义的限度内保留未修饰的聚合载体的阳离子特征。因此,最终聚合载体的特性可以按需要通过在步骤a)中插入本文定义的氨基酸组分(AA)用组分(AA)的特性进行调整。
在步骤c)中,所述至少一种本文定义的阳离子或聚阳离子蛋白或肽和/或至少一种本文定义的阳离子或聚阳离子聚合物,以及任选地至少一种氨基酸组分(AA)和所述至少一种本文定义的核酸,优选地包含在本发明的制备本发明的聚合载体货物复合物的方法的步骤a)中的碱性或中性环境中。所述碱性或中性环形典型地表现出约5至约10的pH范围,优选约6至约9的pH范围,更优选约7至约8的pH范围,例如,约6.5,7,7.5,8,8.5或9或选自这些或上述数值中任意两个数值的任意范围。
此外,步骤c)中溶液的温度优选地在约5℃至约60℃的范围内,更优选在约15℃至约40℃的范围内,甚至更优选在约20℃至约30℃的范围内,最优选在约20℃至约25℃的范围内,例如约25℃。
在本文所述的制备聚合载体货物复合物的方法的步骤c)中,可以适当地使用缓冲液。优选的缓冲液可以包括,但不限于,优选的选自碳酸缓冲液、硼酸缓冲液、N-二(羟乙基)甘氨酸缓冲液、CHES缓冲液、CAPS缓冲液、含有乙醇胺的缓冲液、HEPES、MOPS缓冲液、磷酸缓冲液、PIPES缓冲液、Tris缓冲液、三(羟甲基)甲基甘氨酸缓冲液、TAPS缓冲液和/或TES缓冲液作为缓冲剂。特别优选的是碳酸缓冲液。
当混合所述组分时,优选在氧气的存在下,优选在本文定义的碱性或中性环境的存在下,开始缩合聚合或缩聚反应和至少一种核酸分子的复合。对于这一目的,步骤c)的混合优选地暴露于氧气或者可以使用其他起始剂起始,例如,使用催化量的氧化剂,例如DMSO等起始。当起始本文定义的至少一种阳离子或聚阳离子蛋白或肽和/或至少一种阳离子或聚阳离子聚合物以及任选地至少一种氨基酸组分(AA)缩合并由此通过二硫键彼此聚合(聚合缩合或缩聚反应)。在该反应步骤a)中,优选地,使用具有至少一个反应性-SH结构部分的单体,即,本文定义的至少一种阳离子或聚阳离子蛋白或肽和/或至少一种阳离子或聚阳离子聚合物以及任选地至少一种氨基酸组分(AA),每种组分展现出至少一个本文定义的游离的-SH-结构部分,例如,在它们的末端,产生线性聚合物。然而,可以使用具有多于一个、优选两个游离的-SH-结构部分的组分,其可以产生分支聚合物。与聚合反应同时地,所述阳离子聚合物与所述至少一种核酸分子结合并且由此与其复合。
按照一个备选方案,所述聚合载体货物复合物另外可以用本文定义的组分(AA)修饰。
按照第一个实例,在步骤a)中提供阳离子组分之前,组分(AA)(例如,配体)通过本文定义的任意官能性(例如-SH结构部分)连接到阳离子组分上。该组分(AA)或(例如配体)优选地在这些组分的一个末端连接到所述阳离子组分上。如果连接是通过-SH键进行的,则所述阳离子组分优选地提供有两个(或甚至更多个)-SH-结构部分。组分(AA)或(例如配体)优选地携带仅一个-SH结构部分。在这一情形中,在第一步,所述阳离子组分的一个-SH结构部分优选地用本领域已知的保护基团进行保护。然后,所述阳离子组分可以与组分L结合以通过未保护的-SH结构部分形成第一个二硫键。然后,典型地将所述阳离子组分的保护的-SH-结构部分去保护以用于进一步的反应。
备选地,上文提及的组分(AA)或(例如配体)可以在步骤c)中用于与上述步骤a)中提供的阳离子组分偶联,例如,通过二硫键而不封闭游离的-SH结构部分。但是在这一情形中,技术人员已知的或本文定义的所有方法都可以用来将组分(AA)连接到所述阳离子组分或所述聚合载体上。
备选地,在步骤c)后,组分(AA)或(例如配体)可以通过本文定义的任意官能性(例如,-SH结构部分)结合到所述聚合载体货物复合物上。在这一情形中,优选的是,所述组分(AA)(例如配体)通过所述聚合载体组分的游离的-SH结构部分结合。
按照本文所述的制备聚合载体货物复合物的方法的步骤c),至少一种本文定义的核酸分子与步骤b)中提供的阳离子组分混合,优选地以上文提及的比率混合。典型地,在所述聚合载体货物复合物中,本文定义的阳离子组分以及所述至少一种核酸分子以约5至10000的阳离子聚合物比核酸的摩尔比率提供,优选以约5至5000的摩尔比率,更优选以约10至2500的摩尔比率,甚至更优选以约10至1000的摩尔比率提供。N/P比率优选地如上文所示。在这一情形中,特别优选的是选择N/P比率,由此避免体内凝聚和毒性。
在具体的实施方案中,可以在步骤c)中加入上文定义的不包含-SH结构部分的(AA)组分,由此其不通过(末端)-SH结构部分的聚合而结合到所述聚合载体货物复合物中。由此,这些(AA)组分典型地不是共价连接,并且非共价地包含在所述复合物中作为其他组分。在这一情形中特别优选的是结合至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物,以蛋白或肽提供作为所述聚合载体货物复合物的(AA)组分。当AA是卵清蛋白或卵清蛋白的片段时,该实施方案是特别优选的。因此,在一个特别优选的实施方案中,如果AA是卵清蛋白或其片段,则AA不与所述聚合载体货物复合物共价连接,例如,AA不通过二硫键与所述聚合载体货物复合物共价连接。
按照本文所述的制备聚合载体货物复合物的方法的另一个步骤d),任选地纯化按照步骤c)获得的聚合载体货物复合物。串行可以通过使用色谱方法,诸如HPLC、FPLC、GPS、透析等进行。
按照本文所述的制备聚合载体货物复合物的方法的另一个步骤e),任选地将按照步骤c)或d)得到的聚合载体货物复合物冻干。对于这一目的,可以向按照c)或d)得到的聚合载体货物复合物中加入任意适当的冷冻保护剂或低温防护剂(lyoprotectant)。
制备本文定义的聚合载体货物复合物的方法特别适合由于具体选择其聚合载体的组分而改变所需要的聚合载体货物复合物的化学特性,由此避免体内凝聚和毒性。
本发明的药物组合物包含至少一种抗原作为第二成分,所述抗原选自:来自与传染病相关的病原体的抗原;与变态反应或变应性疾病相关的抗原;与自身免疫病相关的抗原;或与癌症或肿瘤疾病相关的抗原,或在每种情形中是所述抗原的片段、变体和/或衍生物。
所述至少一种抗原可以提供为蛋白或肽、编码所述至少因子后抗原的核酸、或抗原性细胞、抗原性细胞片段、细胞级分;包含所述至少一种抗原的细胞壁成分改性、减毒或灭活的(例如,化学灭活或通过辐照灭活)病原体(病毒、细菌等)。
在特定的实施方案中,包含在所述药物组合物中作为第二成分的所述抗原是肽或蛋白抗原,或是所述肽或蛋白抗原的片段、变体和/或衍生物。
a)来自与传染病相关的病原体的抗原:
来自与传染病相关的病原体的抗原是来源于与诱导传染病相关的病原体。在特定的实施方案中,所述抗原是肽或蛋白抗原,或是所述肽或蛋白抗原的片段、变体和/或衍生物,和/或包含在下述中,提供为下述和/或来源于下述:灭活的或减毒的所述病原体(例如,灭活的或减毒的所述病原体的制剂)(例如,病毒,诸如本文所述的任一种病毒)。在这一情形中,所述(例如肽或蛋白)抗原可以包含在、提供为和/或来源于减毒的或灭活的与传染病相关的病原体(例如,减毒的或灭活的与传染病相关的病原体的制剂)(例如,病毒,诸如本文所述的任一种病毒)。
在本发明所有方面的备选实施方案中,用于本发明的抗原(例如肽或蛋白抗原)不是包含在灭活的或减毒的病毒(诸如本文所述的任一种,或本文所述的任一种病原体)(例如,灭活的或减毒的病毒的制剂)中的抗原;和/或是不提供为灭活的或减毒的所述病毒或病原体(例如,灭活的或减毒的所述病毒或病原体的制剂)的抗原;和/或是不来源于灭活的或减毒的所述病毒或病原体(例如,灭活的或减毒的所述病毒或病原体的制剂)的抗原。例如,用在本发明任一方面中的抗原可以是或者可以提供为分离的和/或纯化的蛋白或肽抗原。普通技术人员应该理解,分离的(和/或纯化的)抗原包括这样的抗原,所述抗原存在于(或提供在)具有少于约40%,30%,20%,10%,5%,2%或1%不需要的或特定的其他组分(诸如其他蛋白/肽或杂质)的(起始)组合物中。
在具体的实施方案中,用于本发明的(例如蛋白或肽)抗原是重组抗原,例如,使用重组生产制备的抗原,诸如使用本文所述的那些方法制备的抗原。在备选的实施方案中,用于本发明的(例如蛋白或肽)抗原是合成的抗原,例如,使用肽合成制备的抗原,诸如使用本文所述的那些方法制备的抗原。
来自与传染病相关的病原体的抗原选自来自下述病原体的抗原:鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii),无形体属(Anaplasma genus),Anaplasmaphagocytophilum,猫钩虫(Ancylostoma braziliense),十二指肠钩虫(Ancylostomaduodenale),溶血隐秘杆菌(Arcanobacterium haemolyticum),人蛔虫(Ascarislumbricoides),曲霉菌属(Aspergillus genus),星状病毒科(Astroviridae),巴贝虫属(Babesia genus),炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis),蜡状芽孢杆菌(Bacilluscereus),汉赛巴尔通体(Bartonella henselae),BK病毒,人芽囊原虫(Blastocystishominis),皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis),百日咳博德特菌(Bordetellapertussis),伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi),疏螺旋体属(Borrelia genus),疏螺旋体属物种(Borrelia spp),布鲁杆菌属(Brucella genus),马来丝虫(Brugia malayi),布尼亚病毒科家族(Bunyaviridae family),洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderiacepacia)和其他伯克霍尔德氏菌属种(Burkholderia species),鼻疽伯克霍尔德氏菌(Burkholderia mallei),类鼻疽伯克霍尔德氏菌(Burkholderia pseudomallei),嵌杯病毒科家族(Caliciviridae family),弯曲杆菌属(Campylobacter genus),白色念珠菌(Candida albicans),念珠菌属物种(Candida spp),沙眼衣原体(Chlamydiatrachomatis),肺炎衣原体(Chlamydophila pneumoniae),鹦鹉衣原体(Chlamydophilapsittaci),CJD朊病毒,华支睾吸虫(Clonorchis sinensis),肉毒梭菌(Clostridiumbotulinum),艰难梭菌(Clostridium difficile),产气荚膜梭菌(Clostridiumperfringens),产气荚膜梭菌,梭菌属物种(Clostridium spp),破伤风梭菌(Clostridiumtetani),球孢菌属物种(Coccidioides spp),冠状病毒(coronaviruses),白喉棒杆菌(Corynebacterium diphtheriae),伯内特考克斯体(Coxiella burnetii),克里米亚-刚果出血热病毒(Crimean-Congo hemorrhagic fever virus),新型隐球菌(Cryptococcusneoformans),隐孢子虫属(Cryptosporidium genus),巨细胞病毒(Cytomegalovirus),登革热病毒(Dengue viruses)(DEN-1,DEN-2,DEN-3和DEN-4),脆弱双核阿米巴(Dientamoebafragilis),埃博拉病毒(Ebolavirus,EBOV),棘球属(Echinococcus genus),恰菲埃里希氏体(Ehrlichia chaffeensis),尤氏埃里希氏体(Ehrlichia ewingii),埃里希氏体属(Ehrlichia genus),溶组织内阿米巴(Entamoeba histolytica),肠球菌属(Enterococcusgenus),肠道病毒属(Enterovirus genus),肠道病毒(Enteroviruses),主要柯萨奇病毒A病毒(mainly Coxsackie A virus)和肠道病毒属71(EV71),表皮癣菌属物种(Epidermophyton spp),埃巴病毒(Epstein-Barr Virus,EBV),大肠杆菌(Escherichiacoli)O157:H7,O111和O104:H4,肝片形吸虫(Fasciola hepatica)和巨大片形吸虫(Fasciola gigantica),FFI朊病毒,丝虫目超家族(Filarioidea superfamily),黄病毒属(Flaviviruses),土拉热弗朗西丝菌(Francisella tularensis),梭杆菌属(Fusobacterium genus),白地霉(Geotrichum candidum),肠贾第虫(Giardiaintestinalis),颚口线虫属(Gnathostoma spp),GSS朊病毒,瓜纳瑞托病毒(Guanaritovirus),杜克雷嗜血杆菌(Haemophilus ducreyi),流感嗜血菌(Haemophilusinfluenzae),幽门螺杆菌(Helicobacter pylori),亨尼病毒属(Henipavirus)(亨德拉病毒(Hendra virus)尼派病毒(Nipah virus)),甲型肝炎病毒(Hepatitis A Virus),乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus),丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus),丁型肝炎病毒(Hepatitis D Virus),戊型肝炎病毒(Hepatitis E Virus),单纯疱疹病毒(Herpessimplex virus)1和2(HSV-1和HSV-2),荚膜组织胞浆菌(Histoplasma capsulatum),HIV(人免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus)),威尼克何德霉(Hortaeawerneckii),人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV),人疱疹病毒6(HHV-6)和人疱疹病毒7(HHV-7),人变性肺病毒(Human metapneumovirus,hMPV),人乳头瘤病毒(Humanpapillomavirus,HPV),人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIV),日本脑炎病毒(Japanese encephalitis virus),JC病毒,胡宁病毒(Junin virus),金氏金氏菌(Kingella kingae),肉芽肿杆菌(Klebsiella granulomatis),库鲁朊病毒(Kuru prion),拉沙病毒(Lassa virus),嗜肺军团病杆菌(Legionella pneumophila),利什曼原虫属(Leishmania genus),钩端螺旋体属(Leptospira genus),单核细胞增生利斯特菌(Listeria monocytogenes),淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(Lymphocyticchoriomeningitis virus,LCMV),Machupo病毒,马拉色霉菌属物种(Malassezia spp),马尔堡病毒(Marburg virus),麻疹病毒(Measles virus),横川吸虫(Metagonimusyokagawai),微孢子虫门(Microsporidia phylum),传染性软疣病毒(Molluscumcontagiosum virus,MCV),腮腺炎病毒(Mumps virus),麻风分枝杆菌(Mycobacteriumleprae)和Mycobacterium lepromatosis,结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis),溃疡分枝杆菌(Mycobacterium ulcerans),肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae),福氏耐格里原虫(Naegleria fowleri),美洲板口线虫(Necator americanus),淋病奈瑟球菌(Neisseria gonorrhoeae),脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis),星状诺卡尔菌(Nocardia asteroides),诺卡尔菌属物种(Nocardia spp),旋盘尾丝虫(Onchocercavolvulus),恙虫热立克次体(Orientia tsutsugamushi),正粘病毒科家族(Orthomyxoviridae family),巴西副球孢子菌(Paracoccidioides brasiliensis),并殖吸虫属物种(Paragonimus spp),卫斯特曼并殖吸虫(Paragonimus westermani),细小病毒属(Parvovirus)B19,巴斯德菌属(Pasteurella genus),疟原虫属(Plasmodium genus),杰氏肺囊虫(Pneumocystis jirovecii),脊髓灰质炎病毒(Poliovirus),狂犬病病毒(Rabiesvirus),呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV),鼻病毒属(Rhinovirus),鼻病毒(rhinoviruses),痘立克次体(Rickettsia akari),立克次体属(Rickettsiagenus),普氏立克次体(Rickettsia prowazekii),立氏立克次体(Rickettsiarickettsii),斑疹伤寒立克次体(Rickettsia typhi),立夫特山谷热病毒(Rift Valleyfever virus),轮状病毒属(Rotavirus),风疹病毒(Rubella virus),Sabia病毒,沙门菌属(Salmonella genus),疥螨(Sarcoptes scabiei),SARS冠状病毒属(SARS coronavirus),血吸虫属(Schistosoma genus),志贺菌属(Shigella genus),辛诺瓦病毒(Sin Nombrevirus),汉坦病毒属(Hantavirus),申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii),葡萄球菌属(Staphylococcus genus),葡萄球菌属,无乳链球菌(Streptococcus agalactiae),肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae),酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes),粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis),绦虫属(Taenia genus),猪肉绦虫(Taenia solium),蜱传脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV),犬弓蛔线虫(Toxocara canis)或猫弓蛔虫(Toxocara cati),鼠弓形虫(Toxoplasma gondii),苍白密螺旋体(Treponemapallidum),旋毛线虫(Trichinella spiralis),阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis),发癣菌属物种(Trichophyton spp),鞭形鞭虫(Trichuris trichiura),布鲁斯锥虫(Trypanosoma brucei),克鲁斯锥虫(Trypanosoma cruzi),尿素分解尿素支原体(Ureaplasma urealyticum),水痘-带状疱疹病毒(Varicella zoster virus,VZV),水痘-带状疱疹病毒(VZV),主要痘症(Variola major)或次要痘症(Variola minor),vCJD朊病毒,委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus),霍乱弧菌(Vibriocholerae),西尼罗病毒(West Nile virus),西方马脑炎病毒(Western equineencephalitis virus),班氏吴策线虫(Wuchereria bancrofti),黄热病毒(Yellow fevervirus),小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica),鼠疫耶尔森菌(Yersiniapestis)和假结核病耶尔森菌(Yersinia pseudotuberculosis)。
在这一情形中,特别优选的是来自选自狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌的病原体的抗原。
此外,来自与传染病相关的病原体的抗原可以选自下述抗原:外膜蛋白A OmpA,生物膜相关的蛋白Bap,转运蛋白MucK(鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii),不动杆菌感染(Acinetobacter infections));可变表面糖蛋白VSG,微管相关的蛋白MAPP15,反式唾液酸酶TSA(布鲁斯锥虫(Trypanosoma brucei),非洲昏睡病(African sleepingsickness)(非洲锥虫病(African trypanosomiasis)));HIV p24抗原,HIV包膜蛋白(Gp120,Gp41,Gp160),聚蛋白GAG,阴性因子蛋白Nef,转录Tat的反式激活剂(HIV(人免疫缺陷病毒),AIDS(获得性免疫缺陷综合征(Acquired immunodeficiency syndrome));半乳糖抑制性粘附蛋白GIAP,29kDa抗原Eh29,Gal/GalNAc凝集素,蛋白CRT,125kDa免疫显性抗原,蛋白M17,粘附素ADH112,蛋白STIRP(溶组织内阿米巴,阿米巴疾病(Amoebiasis));主要表面蛋白1-5(MSP1a,MSP1b,MSP2,MSP3,MSP4,MSP5),IV型分泌系统蛋白(VirB2,VirB7,VirB11,VirD4)(微粒孢子虫属(Anaplasma genus),微粒孢子虫病(Anaplasmosis));保护性抗原PA,水肿因子EF,致死因子LF,S-层同源蛋白SLH(炭疽芽孢杆菌,炭疽(Anthrax));acranolysin,磷脂酶D,胶原蛋白结合蛋白CbpA(溶血隐秘杆菌(Arcanobacteriumhaemolyticum),溶血隐秘杆菌感染);核壳蛋白NP,糖蛋白前体GPC,糖蛋白GP1,糖蛋白GP2(胡宁病毒,阿根廷出血热(Argentine hemorrhagic fever));壳多糖-蛋白层蛋白,14kDa表面抗原A14,主要精子蛋白MSP,MSP聚合-组织蛋白MPOP,MSP纤维蛋白2MFP2,MSP聚合-激活激酶MPAK,ABA-1-样蛋白ALB,蛋白ABA-1,皮菌素CUT-1(人蛔虫,蛔虫病(Ascariasis));41kDa变应原Asp v13,变应原Asp f3,主要分生孢子棒状表面蛋白A(major conidialsurface protein rodlet A),蛋白酶Pep1p,GPI-锚定蛋白Gel1p,GPI-锚定蛋白Crf1p(曲霉菌属,曲霉菌病(Aspergillosis));家族VP26蛋白,VP29蛋白(星状病毒科(Astroviridae),星状病毒属感染(Astrovirus infection));棒状体相关蛋白1 RAP-1,裂殖子表面抗原MSA-1,MSA-2(a1,a2,b,c),12D3,11C5,21B4,P29,变体红细胞表面抗原VESA1,顶膜抗原1 AMA-1(巴贝虫属(Babesia genus),巴贝虫病(Babesiosis));溶血素,肠毒素C,PXO1-51,葡糖酸氧化酶,ABC-转运蛋白,青霉素-结合蛋白,锌转运蛋白家族蛋白,假尿苷合酶Rsu,质粒复制蛋白RepX,寡内肽酶F,原噬菌体膜蛋白,蛋白HemK,鞭毛抗原H,28.5-kDa细胞表面抗原(蜡状芽孢杆菌,蜡状芽孢杆菌感染);大T抗原LT,小T抗原,衣壳蛋白VP1,衣壳蛋白VP2(BK病毒,BK病毒感染);29kDa-蛋白,胱天蛋白酶-3-样抗原,糖蛋白(人芽囊原虫,人芽囊原虫感染);酵母表面粘附素WI-1(皮炎芽生菌(Blastomycesdermatitidis),芽生菌病(Blastomycosis));核蛋白N,聚合酶L,基质蛋白Z,糖蛋白GP(Machupo病毒,玻利维亚出血热(Bolivian hemorrhagic fever));外表面蛋白A OspA,外表面蛋白OspB,外表面蛋白OspC,核心蛋白多糖结合蛋白A DbpA,核心蛋白多糖结合蛋白BDbpB,鞭毛丝41kDa核心蛋白Fla,碱性膜蛋白A前体BmpA(免疫显性抗原P39),外表面22kDa脂蛋白前体(抗原IPLA7),可变表面脂蛋白vlsE(疏螺旋体属,疏螺旋体感染);肉毒菌毒素神经毒素BoNT/A1,BoNT/A2,BoNT/A3,BoNT/B,BoNT/C,BoNT/D,BoNT/E,BoNT/F,BoNT/G,重组肉毒菌毒素F Hc结构域FHc(肉毒梭菌,肉毒中毒(Botulism)(和婴儿肉毒中毒(Infantbotulism)));核壳蛋白,糖蛋白前体(Sabia病毒,巴西出血热(Brazilian hemorrhagicfever));铜/锌超氧化物歧化酶SodC,细菌铁蛋白Bfr,50S核糖体蛋白RplL,含有OmpA-样跨膜结构域的蛋白Omp31,免疫原性39-kDa蛋白M5 P39,锌ABC转运蛋白周质锌-结合蛋白znuA,周质免疫原性蛋白Bp26,30S核糖体蛋白S12 RpsL,甘油醛-3-磷酸脱氢酶Gap,25kDa外膜免疫原性蛋白前体Omp25,侵入性蛋白B lalB,触发因子Tig,分子伴侣DnaK,推定的肽基-脯氨酰顺反异构酶SurA,脂蛋白Omp19,外膜蛋白MotY Omp16,保守的外膜蛋白D15,苹果酸脱氢酶Mdh,IV型分泌系统的组分(T4SS)VirJ,未知功能的脂蛋白BAB1_0187(布鲁杆菌属(Brucella genus),布鲁杆菌病(Brucellosis));ABC转运蛋白家族成员(LolC,OppA和PotF),推定的脂蛋白释放系统跨膜蛋白LolC/E,鞭毛蛋白FliC,伯克霍尔德氏菌胞内运动性A BimA,细菌延伸因子-Tu EF-Tu,17kDa OmpA-样蛋白,boaA编码蛋白,boaB编码蛋白(洋葱伯克霍尔德氏菌和其他伯克霍尔德氏菌物种,伯克霍尔德氏菌感染);分枝酰-转移酶Ag85A,热休克蛋白Hsp65,蛋白TB10.4,19kDa抗原,蛋白PstS3,热休克蛋白Hsp70(溃疡分枝杆菌,布路里溃疡(Buruli ulcer));诺如病毒(norovirus)主要和次要病毒衣壳蛋白VP1和VP2,基因组聚蛋白,札幌病毒衣壳蛋白VP1,蛋白Vp3,基因组聚蛋白(嵌杯病毒科家族,杯状病毒感染(Calicivirus infection)(诺如病毒和札幌病毒(Sapovirus));主要外膜蛋白PorA,鞭毛蛋白FlaA,表面抗原GjaA,纤连蛋白结合蛋白CadF,天冬氨酸/谷氨酸-结合ABC转运蛋白Peb1A,蛋白FspA1,蛋白FspA2(弯曲杆菌属(Campylobacter genus),弯曲菌病(Campylobacteriosis));糖酵解酶烯醇化酶,分泌的天冬氨酰蛋白酶SAP1-10,糖磷脂酰肌醇(GPI)-连接的细胞壁蛋白,蛋白Hyr1,补体受体3-相关的蛋白CR3-RP,粘附素Als3p,热休克蛋白90kDa hsp90,细胞表面疏水性蛋白CSH(通常是白色念珠菌(Candida albicans)和其他念珠菌属物种,念珠菌病(Candidiasis));17-kDa抗原,蛋白P26,三聚体自发转运蛋白粘附素TAAs,巴尔通体属(Bartonella)粘附素A BadA,可变表达的外膜蛋白Vomps,蛋白Pap3,蛋白HbpA,包膜相关的蛋白酶HtrA,蛋白OMP89,蛋白GroEL,蛋白LalB,蛋白OMP43,二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶SucB(汉赛巴尔通体(Bartonella henselae),猫抓病(Cat-scratch disease));无鞭毛体表面蛋白-2,无鞭毛体-特异性表面蛋白SSP4,梭菌蛋白酶(cruzipain),反式唾液酸酶TS,锥鞭毛体表面糖蛋白TSA-1,补体调控蛋白CRP-10,蛋白G4,蛋白G2,paraxonemal杆状蛋白PAR2,副鞭毛体杆状组分Par1,粘蛋白-相关的表面蛋白MPSP(克鲁斯锥虫,Chagas病(美国锥虫病(American trypanosomiasis)));包膜糖蛋白(gB,gC,gE,gH,gI,gK,gL)(水痘-带状疱疹病毒(VZV),水痘(Chickenpox));主要外膜蛋白MOMP,可能的外膜蛋白PMPC,外膜复合物蛋白B OmcB,热休克蛋白Hsp60 HSP10,蛋白IncA,来自III型分泌系统的蛋白,核糖核苷酸还原酶小链蛋白NrdB,质粒蛋白Pgp3,衣原体外蛋白NCopN,抗原CT521,抗原CT425,抗原CT043,抗原TC0052,抗原TC0189,抗原TC0582,抗原TC0660,抗原TC0726,抗原TC0816,抗原TC0828(沙眼衣原体,衣原体属(Chlamydia));低钙响应蛋白E LCrE,衣原体外蛋白N CopN,丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶PknD,酰基-载体-蛋白S-丙二酰转移酶FabD,单链DNA-结合蛋白Ssb,主要外膜蛋白MOMP,外膜蛋白2 Omp2,多形膜蛋白家族(Pmp1,Pmp2,Pmp3,Pmp4,Pmp5,Pmp6,Pmp7,Pmp8,Pmp9,Pmp10,Pmp11,Pmp12,Pmp13,Pmp14,Pmp15,Pmp16,Pmp17,Pmp18,Pmp19,Pmp20,Pmp21)(肺炎衣原体,肺炎衣原体感染);霍乱毒素B CTB,毒素共同调节的菌毛蛋白A TcpA,毒素共同调节的菌毛蛋白TcpF,毒素共同调节的菌毛生物合成蛋白F TcpF,霍乱肠毒素亚基A,霍乱肠毒素亚基B,热稳定性肠毒素ST,甘露糖敏感性血细胞凝集素MSHA,外膜蛋白U Porin ompU,Poring B蛋白,多形膜蛋白-D(霍乱弧菌,霍乱);丙酰-CoA羧化酶PCC,14-3-3蛋白,抑制素,半胱氨酸蛋白酶,谷胱甘肽转移酶,钙结合微丝蛋白,组织蛋白酶L蛋白酶CatL,间层蛋白20.8kDa TP20.8,间层蛋白31.8kDa TP31.8,溶血磷脂酸磷酸酶LPAP,(华支睾吸虫(Clonorchis sinensis),华支睾吸虫病(Clonorchiasis));表面层蛋白SLPs,谷氨酸脱氢酶抗原GDH,毒素A,毒素B,半胱氨酸蛋白酶Cwp84,半胱氨酸蛋白酶Cwp13,半胱氨酸蛋白酶Cwp19,细胞壁蛋白CwpV,鞭毛蛋白FliC,鞭毛蛋白FliD(艰难梭菌,艰难梭菌感染);鼻病毒属:衣壳蛋白VP1,VP2,VP3,VP4;冠状病毒:sprike蛋白S,包膜蛋白E,膜蛋白M,核壳蛋白N(通常是鼻病毒和冠状病毒,感冒(急性病毒鼻咽炎(Acute viral rhinopharyngitis);急性鼻卡他(Acute coryza)));朊病毒蛋白Prp(CJD朊病毒,克-雅病(Creutzfeldt-Jakob disease,CJD));包膜蛋白Gc,包膜蛋白Gn,核壳蛋白(克里米亚-刚果出血热病毒,克里米亚-刚果出血热(Crimean-Congohemorrhagic fever,CCHF));毒力相关的DEAD-盒RNA解旋酶VAD1,半乳糖木甘露聚糖(galactoxylomannan)-蛋白GalXM,glucuronoxylomannan GXM,甘露糖蛋白MP(新型隐球菌,隐球菌病(Cryptococcosis));酸性核糖体蛋白P2 CpP2,粘蛋白抗原Muc1,Muc2,Muc3Muc4,Muc5,Muc6,Muc7,表面粘附蛋白CP20,表面粘附蛋白CP23,表面蛋白CP12,表面蛋白CP21,表面蛋白CP40,表面蛋白CP60,表面蛋白CP15,表面相关的糖肽gp40,表面相关的糖肽gp15,卵囊壁蛋白AB,抑制蛋白PRF,腺苷三磷酸双磷酸酶(隐孢子虫属(Cryptosporidiumgenus),隐孢子虫病(Cryptosporidiosis));脂肪酸和视黄醇结合蛋白-1FAR-1,金属蛋白酶的组织抑制剂TIMP(TMP),半胱氨酸蛋白酶ACEY-1,半胱氨酸蛋白酶ACCP-1,表面抗原Ac-16,分泌的蛋白2 ASP-2,金属蛋白酶1 MTP-1,天冬氨酰蛋白酶抑制剂API-1,表面相关的抗原SAA-1,成年人特异性分泌的因子Xa丝氨酸蛋白酶抑制剂抗凝剂AP,组织蛋白酶D-样天冬氨酸蛋白酶ARR-1(通常是猫钩虫;多种其他寄生虫,皮肤幼虫移行症(Cutaneous larvamigrans,CLM));组织蛋白酶L-样蛋白酶,53/25-kDa抗原,8kDa家族成员,具有边缘胰蛋白酶样活性的囊虫(cysticercus)蛋白TsAg5,六钩蚴蛋白TSOL18,六钩蚴蛋白TSOL45-1A,乳酸脱氢酶A LDHA,乳酸脱氢酶B LDHB(猪肉绦虫,囊虫病(Cysticercosis));pp65抗原,膜蛋白pp15,邻近衣壳的间层蛋白pp150,蛋白M45,DNA聚合酶UL54,解旋酶UL105,糖蛋白gM,糖蛋白gN,糖蛋白H,糖蛋白B gB,蛋白UL83,蛋白UL94,蛋白UL99(巨细胞病毒,巨细胞病毒感染);衣壳蛋白C,前膜蛋白prM,膜蛋白M,包膜蛋白E(结构域I,结构域II,结构域II),蛋白NS1,蛋白NS2A,蛋白NS2B,蛋白NS3,蛋白NS4A,蛋白2K,蛋白NS4B,蛋白NS5(登革热病毒(DEN-1,DEN-2,DEN-3和DEN-4)-黄病毒属,登革热);39kDa蛋白(脆弱双核阿米巴,双核阿米巴病(Dientamoebiasis));白喉毒素前体Tox,白喉毒素DT,菌毛蛋白特异性分拣酶SrtA,轴菌毛蛋白SpaA,tip pilin蛋白SpaC,次要菌毛蛋白SpaB,表面相关的蛋白DIP1281(白喉棒杆菌(Corynebacterium diphtheriae),白喉(Diphtheria));糖蛋白GP,核蛋白NP,次要基质蛋白VP24,主要基质蛋白VP40,转录激活剂VP30,聚合酶辅因子VP35,RNA聚合酶L(埃博拉病毒(Ebolavirus,EBOV),埃博拉病毒出血热(Ebola hemorrhagic fever));朊病毒蛋白(vCJD朊病毒,变异克-雅病(variant Creutzfeldt-Jakob disease,vCJD,nvCJD));UvrABC系统蛋白B,蛋白Flp1,蛋白Flp2,蛋白Flp3,蛋白TadA,血红蛋白受体HgbA,外膜蛋白TdhA,蛋白CpsRA,调节剂CpxR,蛋白SapA,18kDa抗原,外膜蛋白NcaA,蛋白LspA,蛋白LspA1,蛋白LspA2,蛋白LspB,外膜组分DsrA,凝集素DltA,脂蛋白Hlp,主要外膜蛋白OMP,外膜蛋白OmpA2(杜克雷嗜血杆菌(Haemophilus ducreyi),软下疳(Chancroid));天冬氨酰蛋白酶1Pep1,磷脂酶B PLB,α-甘露糖苷酶1 AMN1,葡聚糖基转移酶(glucanosyltransferase)GEL1,脲酶URE,过氧化物酶体基质蛋白Pmp1,富含脯氨酸的抗原Pra,人T-细胞反应性蛋白TcrP(粗球孢子菌(Coccidioides immitis)和Coccidioides posadasii,球孢菌病(Coccidioidomycosis));变应原Tri r 2,热休克蛋白60 Hsp60,真菌肌动蛋白Act,抗原Tri r2,抗原Tri r4,抗原Tri t1,蛋白IV,甘油-3-磷酸脱氢酶Gpd1,渗透感受器(osmosensor)HwSh01A,渗透感受器HwSho1B,组氨酸激酶HwHhk7B,变应原Mala s 1,变应原Mala s 11,硫氧还蛋白Trx Mala s 13,变应原Mala f,变应原Mala s(通常是发癣菌属物种(Trichophyton spp),表皮癣菌属物种(Epidermophyton spp.),马拉色霉菌属物种(Malassezia spp.),威尼克何德霉(Hortaea werneckii,皮癣病(Dermatophytosis));蛋白EG95,蛋白EG10,蛋白EG18,蛋白EgA31,蛋白EM18,抗原EPC1,抗原B,抗原5,蛋白P29,蛋白14-3-3,8-kDa蛋白,亲肌肉抗原(myophilin),热休克蛋白20 HSP20,糖蛋白GP-89,脂肪酸结合蛋白FAPB(棘球属(Echinococcus genus),棘球蚴病(Echinococcosis));主要表面蛋白2 MSP2,主要表面蛋白4 MSP4,MSP变体SGV1,MSP变体SGV2,外膜蛋白OMP,外膜蛋白19OMP-19,主要抗原性蛋白MAP1,主要抗原性蛋白MAP1-2,主要抗原性蛋白MAP1B,主要抗原性蛋白MAP1-3,Erum2510编码蛋白,蛋白GroEL,蛋白GroES,30-kDA主要外膜蛋白,GE 100-kDa蛋白,GE 130-kDa蛋白,GE 160-kDa蛋白(埃里希体属(Ehrlichia genus),埃里希体病(Ehrlichiosis));分泌的抗原SagA,sagA-样蛋白SalA和SalB,胶原蛋白粘附素Scm,表面蛋白Fms1(EbpA(fm),Fms5(EbpB(fm),Fms9(EpbC(fm)和Fms10,蛋白EbpC(fm),96kDa免疫保护性糖蛋白G1(肠球菌属(Enterococcus genus),肠球菌感染);基因组聚蛋白,聚合酶3D,病毒衣壳蛋白VP1,病毒衣壳蛋白VP2,病毒衣壳蛋白VP3,病毒衣壳蛋白VP4,蛋白酶2A,蛋白酶3C(肠道病毒属(Enterovirus genus),肠道病毒感染);外膜蛋白OM,60kDa外膜蛋白,细胞表面抗原OmpA,细胞表面抗原OmpB(sca5),134kDa外膜蛋白,31kDa外膜蛋白,29.5kDa外膜蛋白,细胞表面蛋白SCA4,细胞表面蛋白Adr1(RP827),细胞表面蛋白Adr2(RP828),细胞表面蛋白SCA1,侵入性蛋白invA,细胞侵入性蛋白fts,分泌蛋白sec 0家族,毒力蛋白virB,tlyA,tlyC,微小菌素-样蛋白Plp,蛋白质前体易位酶SecA,120-kDa表面蛋白抗原SPA,138kD复合物抗原,主要100-kD蛋白(蛋白I),胞质内蛋白D,保护性表面蛋白抗原SPA(普氏立克次体,流行性斑疹伤寒(Epidemic typhus));埃巴核抗原(EBNA-1,EBNA-2,EBNA-3A,EBNA-3B,EBNA-3C,EBNA-leader protein(EBNA-LP)),latent membrane蛋白(LMP-1,LMP-2A,LMP-2B),早期抗原EBV-EA,膜抗原EBV-MA,病毒衣壳抗原EBV-VCA,碱性核酸酶EBV-AN,糖蛋白H,糖蛋白gp350,糖蛋白gp110,糖蛋白gp42,糖蛋白gHgL,糖蛋白gB(埃巴病毒(EBV),埃巴病毒感染性单核细胞增多症(Epstein-Barr Virus Infectious Mononucleosis));衣壳蛋白VP2,衣壳蛋白VP1,主要蛋白NS1(细小病毒属(Parvovirus)B19,传染性红斑(Erythema infectiosum)(第五病));pp65抗原,糖蛋白105,主要衣壳蛋白,包膜糖蛋白H,蛋白U51(人疱疹病毒6(HHV-6)和人疱疹病毒7(HHV-7),幼儿急疹(Exanthem subitum));硫氧还-谷胱甘肽蛋白还原酶TGR,组织蛋白酶L1和L2,Kunitz-型蛋白KTM,亮氨酸氨基肽酶LAP,半胱氨酸蛋白酶Fas2,皂化蛋白-样蛋白-2SAP-2,硫氧还蛋白过氧化物酶TPx,Prx-1,Prx-2,组织蛋白酶1半胱氨酸蛋白酶CL3,蛋白酶组织蛋白酶L CL1,磷酸甘油激酶PGK,27-kDa分泌蛋白,60kDa蛋白HSP35α,谷胱甘肽转移酶GST,28.5kDa间层抗原28.5kDa TA,组织蛋白酶B3蛋白酶CatB3,I型半胱氨酸蛋白酶抑制剂stefin-1,组织蛋白酶L5,组织蛋白酶L1g和组织蛋白酶B,脂肪酸结合蛋白FABP,亮氨酸氨基肽酶LAP(肝片形吸虫(Fasciolahepatica)和巨大片形吸虫(Fasciola gigantica),片形吸虫病(Fasciolosis));朊病毒蛋白(FFI朊病毒,家族致命性失眠症(Fatal familial insomnia,FFI));毒液变应原同系物样蛋白VAL-1,冗余幼虫转录物ALT-1,冗余幼虫转录物ALT-2,硫氧还蛋白过氧化物酶TPX,黄蜂变应原同源物VAH,硫氧还蛋白过氧化物酶2 TPX-2,抗原性蛋白SXP(肽N,N1,N2,和N3),活化相关的蛋白-1 ASP-1,硫氧还蛋白TRX,谷氨酰胺转移酶BmTGA,谷胱甘肽-S-转移酶GST,肌球蛋白,黄蜂变应原同源物VAH,175kDa胶原酶,甘油醛-3-磷酸脱氢酶GAPDH,表皮胶原Col-4,分泌的幼虫酸性蛋白SLAPs,壳多糖酶CHI-1,麦芽糖结合蛋白MBP,糖酵解酶果糖-1,6-二磷酸醛缩酶Fba,原肌球蛋白TMY-1,线虫特异性基因产物OvB20,癌半胱氨酸蛋白酶抑制剂(onchocystatin)CPI-2,Cox-2(丝虫目超家族(Filarioidea superfamily),丝虫病(Filariasis));磷脂酶C PLC,热不稳定肠毒素B,Iota毒素组分Ib,蛋白CPE1281,丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶,延伸因子G EF-G,产气荚膜梭菌细胞溶素O Pfo,甘油醛-3-磷酸脱氢酶GapC,果糖-二磷酸醛缩酶Alf2,产气荚膜梭菌肠毒素CPE,α毒素AT,α类毒素ATd,ε-类毒素ETd,蛋白HP,大细胞毒素TpeL,内-β-N-乙酰氨基葡糖苷酶Naglu,磷酸甘油酸变位酶Pgm(产气荚膜梭菌,产气荚膜梭菌引起的食物中毒);白细胞毒素lktA,粘附素FadA,外膜蛋白RadD,高分子量精氨酸-结合蛋白(梭杆菌属(Fusobacterium genus),梭杆菌感染(Fusobacterium infection));磷脂酶C PLC,热不稳定肠毒素B,Iota毒素组分Ib,蛋白CPE1281,丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶,延伸因子G EF-G,产气荚膜梭菌细胞溶素O Pfo,甘油醛-3-磷酸脱氢酶GapC,果糖-二磷酸醛缩酶Alf2,产气荚膜梭菌肠毒素CPE,α毒素AT,α类毒素ATd,ε-类毒素ETd,蛋白HP,大细胞毒素TpeL,内-β-N-乙酰氨基葡糖苷酶Naglu,磷酸甘油酸变位酶Pgm(通常为产气荚膜梭菌;其他梭菌属物种,气性坏疽(Gas gangrene)(气性坏疽(Clostridial myonecrosis)));脂酶A,脂酶B,过氧化物酶Dec1(念珠地丝菌(Geotrichum candidum),地丝菌病(Geotrichosis));朊病毒蛋白(GSS朊病毒,格-施-沙综合征(Gerstmann-Scheinker syndrome,GSS));cyst壁蛋白CWP1,CWP2,CWP3,变体表面蛋白VSP,VSP1,VSP2,VSP3,VSP4,VSP5,VSP6,56kDa抗原,丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶PFOR,醇脱氢酶E ADHE,α-贾地虫蛋白,α8-贾地虫蛋白,α1-贾地虫蛋白,β-贾地虫蛋白,半胱氨酸蛋白酶,谷胱甘肽-S-转移酶GST,精氨酸脱亚氨基酶ADI,果糖-1,6-二磷酸醛缩酶FBA,贾地虫滋养体抗原(Giardia trophozoite antigens)GTA(GTA1,GTA2),鸟氨酸羧基转移酶OCT,纹状纤维组装样蛋白(striated fiber-asseblin-like protein)SALP,尿苷磷酰基-样蛋白UPL,α-微管蛋白,β-微管蛋白(肠贾第虫(Giardia intestinalis),贾第虫病(Giardiasis));ABC转运蛋白家族成员(LolC,OppA和PotF),推定的脂蛋白释放系统跨膜蛋白LolC/E,鞭毛蛋白FliC,伯克霍尔德氏菌胞内运动性A BimA,细菌延伸因子-Tu EF-Tu,17kDa OmpA-样蛋白,boaA编码蛋白(鼻疽伯克霍尔德氏菌,马鼻疽(Glanders));环孢素A受体CyP,24kDa三期幼虫蛋白GS24,排泄-分泌产物ESPs(40,80,120和208kDa)(棘颚口线虫(Gnathostoma spinigerum)和刚棘颚口虫(Gnathostoma hispidum),颚口线虫病(Gnathostomiasis));菌毛蛋白,次要菌毛蛋白相关的亚基pilC,主要菌毛蛋白亚基和变体pilE,pilS,相变异蛋白porA,孔蛋白B PorB,蛋白TraD,奈瑟菌属(Neisserial)外膜抗原H.8,70kDa抗原,主要外膜蛋白PI,外膜蛋白PlA和PlB,W抗原,表面蛋白A NspA,转铁蛋白结合蛋白TbpA,转铁蛋白结合蛋白TbpB,PBP2,mtrR编码蛋白,ponA编码蛋白,膜通透酶FbpBC,FbpABC蛋白系统,LbpAB蛋白,外膜蛋白Opa,外膜转运蛋白FetA,铁抑制调节剂MpeR(淋病奈瑟球菌(Neisseria gonorrhoeae),淋病(Gonorrhea));外膜蛋白A OmpA,外膜蛋白C OmpC,外膜蛋白K17 OmpK17(肉芽肿杆菌(Klebsiella granulomatis),腹股沟肉芽肿(Granulomainguinale,Donovanosis));纤连蛋白结合蛋白Sfb,纤连蛋白/纤连蛋白结合蛋白FBP54,纤连蛋白结合蛋白FbaA,1型M蛋白Emm1,6型M蛋白Emm6,免疫球蛋白-结合蛋白35 Sib35,表面蛋白R28 Spr28,超氧化物歧化酶SOD,C5a肽酶ScpA,抗原I/II AgI/II,粘附素AspA,G-相关的α2-巨球蛋白-结合蛋白GRAB,表面纤维状蛋白M5(酿脓链球菌(Streptococcuspyogenes),A组链球菌感染);C蛋白β抗原,精氨酸脱亚氨基酶蛋白,粘附素BibA,105kDA蛋白BPS,表面抗原c,表面抗原R,表面抗原X,胰蛋白酶抗性蛋白R1,胰蛋白酶抗性蛋白R3,胰蛋白酶抗性蛋白R4,表面免疫原性蛋白Sip,表面蛋白Rib,富含亮氨酸的重复蛋白LrrG,富含丝氨酸的重复蛋白Srr-2,C蛋白α-抗原Bca,β抗原Bag,表面抗原ε,α-样蛋白ALP1,α-样蛋白ALP5表面抗原δ,α-样蛋白ALP2,α-样蛋白ALP3,α-样蛋白ALP4,Cβ蛋白Bac(无乳链球菌(Streptococcus agalactiae),B组链球菌感染);转铁蛋白结合蛋白2 Tbp2,磷酸酶P4,外膜蛋白P6,肽多糖-相关的脂蛋白Pal,蛋白D,蛋白E,粘附和穿透蛋白Hap,外膜蛋白26Omp26,外膜蛋白P5(Fimbrin),外膜蛋白D15,外膜蛋白OmpP2,5′-核苷酸酶NucA,外膜蛋白P1,外膜蛋白P2,外膜脂蛋白Pcp,脂蛋白E,外膜蛋白P4,岩藻酮糖激酶Fuck,[Cu,Zn]-超氧化物歧化酶SodC,蛋白酶HtrA,蛋白O145,α-半乳糖苷基神经酰胺(流感嗜血菌(Haemophilus influenzae),流感嗜血菌感染);聚合酶3D,病毒衣壳蛋白VP1,病毒衣壳蛋白VP2,病毒衣壳蛋白VP3,病毒衣壳蛋白VP4,蛋白酶2A,蛋白酶3C(肠道病毒属(Enteroviruses),主要是柯萨奇病毒A(Coxsackie A virus)和肠道病毒71(EV71),手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD));RNA聚合酶L,蛋白L,糖蛋白Gn,糖蛋白Gc,核壳蛋白S,包膜糖蛋白G1,核蛋白NP,蛋白N,聚蛋白M(辛诺瓦病毒(Sin Nombre virus),汉坦病毒属(Hantavirus),汉坦病毒肺综合征(Hantavirus Pulmonary Syndrome,HPS));热休克蛋白HspA,热休克蛋白HspB,柠檬酸合酶GltA,蛋白UreB,热休克蛋白Hsp60,嗜中性白血病活化蛋白NAP,过氧化氢酶KatA,空泡形成细胞毒素VacA,尿素酶αUreA,尿素酶βUreb,蛋白Cpn10,蛋白groES,热休克蛋白Hsp10,蛋白MopB,细胞毒素相关的10kDa蛋白CAG,36kDa抗原,β-内酰胺酶HcpA,β-内酰胺酶HcpB(幽门螺杆菌(Helicobacter pylori),幽门螺杆菌感染);完整的膜蛋白,凝集倾向的蛋白,O-抗原,毒素-抗原Stx2B,毒素-抗原Stx1B,粘附-抗原片段Int28,蛋白EspA,蛋白EspB,亲密素,蛋白Tir,蛋白IntC300,蛋白Eae(大肠杆菌(Escherichia coli)O157:H7,O111和O104:H4,溶血尿毒症综合征(Hemolytic-uremicsyndrome,HUS);RNA聚合酶L,蛋白L,糖蛋白Gn,糖蛋白Gc,核壳蛋白S,包膜糖蛋白G1,核蛋白NP,蛋白N,聚蛋白M(布尼亚病毒科(Bunyaviridae)家族,伴有肾综合征的出血热(Hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS);糖蛋白G,基质蛋白M,核蛋白N,融合蛋白F,聚合酶L,蛋白W,蛋白C,磷蛋白p,非结构蛋白V(亨尼病毒属(亨德拉病毒尼派病毒),亨尼病毒感染);聚蛋白,糖蛋白Gp2,甲型肝炎表面抗原HBAg,蛋白2A,病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3,病毒蛋白VP4,蛋白P1B,蛋白P2A,蛋白P3AB,蛋白P3D(甲型肝炎病毒,甲型肝炎);乙型肝炎表面抗原HBsAg,乙型肝炎核心抗原HbcAg,聚合酶,蛋白Hbx,preS2中表面蛋白,表面蛋白L,大S蛋白,病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3,病毒蛋白VP4(乙型肝炎病毒,乙型肝炎);包膜糖蛋白E1 gp32 gp35,包膜糖蛋白E2 NS1 gp68 gp70,衣壳蛋白C,核心蛋白核,聚蛋白,病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3,病毒蛋白VP4,抗原G,蛋白NS3,蛋白NS5A,(丙型肝炎病毒,丙型肝炎);病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3,病毒蛋白VP4,大肝炎δ抗原,小肝炎δ抗原(丁型肝炎病毒,丁型肝炎);病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3,病毒蛋白VP4,衣壳蛋白E2(戊型肝炎病毒,戊型肝炎);糖蛋白L UL1,尿嘧啶-DNA转葡糖基酶UL2,蛋白UL3,蛋白UL4,DNA复制蛋白UL5,门蛋白(portal protein)UL6,病毒体成熟蛋白UL7,DNA解旋酶UL8,复制起点-结合蛋白UL9,糖蛋白M UL10,蛋白UL11,碱性核酸外切酶UL12,丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶UL13,间层蛋白(tegument protein)UL14,末端酶UL15,间层蛋白UL16,蛋白UL17,衣壳蛋白VP23 UL18,主要衣壳蛋白VP5 UL19,膜蛋白UL20,间层蛋白UL21,糖蛋白H(UL22),胸苷激酶UL23,蛋白UL24,蛋白UL25,衣壳蛋白P40(UL26,VP24,VP22A),g糖蛋白B(UL27),ICP18.5蛋白(UL28),主要DNA-结合蛋白ICP8(UL29),DNA聚合酶UL30,核基质蛋白UL31,包膜糖蛋白UL32,蛋白UL33,内核膜蛋白UL34,衣壳蛋白VP26(UL35),大间层蛋白UL36,衣壳组装蛋白UL37,VP19C蛋白(UL38),核糖核苷酸还原酶(大亚基)UL39,核糖核苷酸还原酶(小亚基)UL40,间层蛋白/病毒体宿主关闭VHS蛋白(UL41),DNA聚合酶持续合成因子UL42,膜蛋白UL43,糖蛋白C(UL44),膜蛋白UL45,间层蛋白VP11/12(UL46),间层蛋白VP13/14(UL47),病毒体成熟蛋白VP16(UL48,α-TIF),包膜蛋白UL49,dUTP二磷酸酶UL50,间层蛋白UL51,DNA解旋酶/引物酶复合蛋白UL52,糖蛋白K(UL53),转录调节蛋白IE63(ICP27,UL54),蛋白UL55,蛋白UL56,病毒复制蛋白ICP22(IE68,US1),蛋白US2,丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶US3,糖蛋白G(US4),g糖蛋白J(US5),糖蛋白D(US6),糖蛋白I(US7),糖蛋白E(US8),间层蛋白US9,衣壳/间层蛋白US10,Vmw21蛋白(US11),ICP47蛋白(IE12,US12),主要转录激活剂ICP4(IE175,RS1),E3泛素连接酶ICP0(IE110),潜伏相关的蛋白1 LRP1,潜伏相关的蛋白2 LRP2,神经毒力因子RL1(ICP34.5),潜伏相关的转录物LAT(单纯疱疹病毒1和2(HSV-1和HSV-2),单纯疱疹(Herpes simplex));热休克蛋白Hsp60,细胞表面蛋白H1C,IV型二肽基肽酶DppIV,M抗原,70kDa蛋白,17kDa组蛋白样蛋白(荚膜组织胞浆菌,组织胞浆菌病(Histoplasmosis));脂肪酸和视黄醇结合蛋白-1FAR-1,金属蛋白酶组织抑制剂TIMP(TMP),半胱氨酸蛋白酶ACEY-1,半胱氨酸蛋白酶ACCP-1,表面抗原Ac-16,分泌的蛋白2 ASP-2,金属蛋白酶1 MTP-1,天冬氨酰蛋白酶抑制剂API-1,表面相关的抗原SAA-1,表面相关的抗原SAA-2,成年人特异性分泌的因子Xa,丝氨酸蛋白酶抑制剂抗凝血剂AP,组织蛋白酶D-样天冬氨酸蛋白酶ARR-1,谷胱甘肽S-转移酶GST,天冬氨酸蛋白酶APR-1,乙酰胆碱酯酶AChE(十二指肠钩虫(Ancylostoma duodenale)和美洲板口线虫(Necator americanus),钩虫感染(Hookworm infection));蛋白NS1,蛋白NP1,蛋白VP1,蛋白VP2,蛋白VP3(人博卡病毒(HBoV),人博卡病毒感染);主要表面蛋白2 MSP2,主要表面蛋白4 MSP4,MSP变体SGV1,MSP变体SGV2,外膜蛋白OMP,外膜蛋白19 OMP-19,主要抗原性蛋白MAP1,主要抗原性蛋白MAP1-2,主要抗原性蛋白MAP1B,主要抗原性蛋白MAP1-3,Erum2510编码蛋白,蛋白GroEL,蛋白GroES,30-kDA主要外膜蛋白,GE 100-kDa蛋白,GE130-kDa蛋白,GE 160-kDa蛋白(尤氏埃里希氏体(Ehrlichia ewingii),人尤氏埃里希体病(Human ewingii ehrlichiosis));主要表面蛋白1-5(MSP1a,MSP1b,MSP2,MSP3,MSP4,MSP5),IV型分泌系统(secreotion system)蛋白VirB2,VirB7,VirB11,VirD4(嗜吞噬细胞无形体(Anaplasma phagocytophilum),人粒细胞边虫病(Human granulocyticanaplasmosis,HGA));蛋白NS1,小疏水蛋白NS2,SH蛋白,融合蛋白F,糖蛋白G,基质蛋白M,基质蛋白M2-1,基质蛋白M2-2,phospho蛋白P,核蛋白N,聚合酶L(人变性肺病毒(Humanmetapneumovirus,hMPV),人变性肺病毒感染);主要表面蛋白2 MSP2,主要表面蛋白4MSP4,MSP变体SGV1,MSP变体SGV2,外膜蛋白OMP,外膜蛋白19 OMP-19,主要抗原性蛋白MAP1,主要抗原性蛋白MAP1-2,主要抗原性蛋白MAP1B,主要抗原性蛋白MAP1-3,Erum2510编码蛋白,蛋白GroEL,蛋白GroES,30-kDA主要外膜蛋白,GE 100-kDa蛋白,GE 130-kDa蛋白,GE 160-kDa蛋白(恰菲埃里希氏体,人单核细胞埃里希氏体病(Human monocyticehrlichiosis));复制蛋白E1,调节蛋白E2,蛋白E3,蛋白E4,蛋白E5,蛋白E6,蛋白E7,蛋白E8,主要衣壳蛋白L1,次要衣壳蛋白L2(人乳头瘤病毒(HPV),人乳头瘤病毒(HPV)感染);融合蛋白F,血凝素-神经酰胺酶HN,糖蛋白G,基质蛋白M,磷蛋白P,核蛋白N,聚合酶L(人副流感病毒(HPIV),人副流感病毒感染);″血凝素HA,神经酰胺酶NA,核蛋白NP,基质蛋白M1,基质蛋白M2,蛋白NS1,聚合酶复合物PA,PB1,PB2,核输出蛋白NEP;;″(正粘病毒科(Orthomyxoviridae)家族,流感(flu));基因组聚蛋白,蛋白E,蛋白M,衣壳蛋白C(日本脑炎病毒,日本脑炎);RTX毒素,IV型菌毛,主要菌毛亚基PilA,调节转录因子PilS和PilR,蛋白σ54,外膜蛋白(金氏金氏菌,金氏金氏菌感染);朊病毒蛋白(库鲁朊病毒,库鲁病(Kuru));核蛋白N,聚合酶L,基质蛋白Z,糖蛋白GP(拉沙病毒(Lassa virus),拉沙热(Lassa fever));肽多糖-相关的脂蛋白PAL,60kDa伴侣蛋白Cpn60(groEL,HspB),IV型菌毛蛋白PilE,外膜蛋白MIP,主要外膜蛋白MompS,锌金属蛋白酶MSP(嗜肺军团病杆菌,军团杆菌病(Legionellosis)(军团病(Legionnaires′disease),庞蒂亚克热(Pontiac fever)));P4核酸酶,蛋白WD,核糖核苷酸还原酶M2,表面膜糖蛋白Pg46,半胱氨酸蛋白酶CP,葡萄糖-调节的蛋白78 GRP-78,阶段特异性S抗原-样蛋白A2,ATP酶F1,β-微管蛋白,热休克蛋白70Hsp70,KMP-11,糖蛋白GP63,蛋白BT1,核苷水解酶NH,细胞表面蛋白B1,核糖体蛋白P1-样蛋白P1,固醇24-c-甲基转移酶SMT,LACK蛋白,组蛋白H1,SPB1蛋白,硫醇特异性抗氧化剂TSA,蛋白抗原STl1,信号肽酶SP,组蛋白H2B,表面抗原PSA-2,半胱氨酸蛋白酶b Cpb(利什曼原虫属(Leishmania genus),利什曼病(Leishmaniasis));主要膜蛋白I,富含丝氨酸的抗原-45kDa,10kDa caperonin GroES,HSP kDa抗原,氨基-氧代壬酸酯合酶AONS,蛋白重组酶ARecA,乙酰基-/丙酰基-辅酶A羧化酶α,丙氨酸消旋酶,60kDa伴侣蛋白2,ESAT-6-样蛋白EcxB(L-ESAT-6),蛋白Lsr2,蛋白ML0276,肝素-结合血凝素HBHA,热休克蛋白65 Hsp65,mycP1或ML0041编码蛋白,htrA2或ML0176编码蛋白,htrA4或ML2659编码蛋白,gcp或ML0379编码蛋白,clpC或ML0235编码蛋白(麻风分枝杆菌(Mycobacterium leprae)和Mycobacterium lepromatosis,麻风(Leprosy));外膜蛋白LipL32,膜蛋白LIC10258,膜蛋白LP30,膜蛋白LIC12238,Ompa-样蛋白Lsa66,表面蛋白LigA,表面蛋白LigB,主要外膜蛋白OmpL1,外膜蛋白LipL41,蛋白LigAni,表面蛋白LcpA,粘附蛋白LipL53,外膜蛋白UpL32,表面蛋白Lsa63,鞭毛蛋白FlaB1,膜脂蛋白LipL21,膜蛋白pL40,钩端螺旋体表面粘附素Lsa27,外膜蛋白OmpL36,外膜蛋白OmpL37,外膜蛋白OmpL47,外膜蛋白OmpL54,酰基转移酶LpxA(钩端螺旋体属(Leptospira genus),钩端螺旋体病(Leptospirosis));李斯特菌溶菌素(listeriolysin)O前体Hly(LLO),侵入相关的蛋白Iap(P60),李斯特菌溶菌素调节蛋白PrfA,锌金属蛋白酶Mpl,磷脂酰肌醇-特异性磷脂酶C PLC(PlcA,PlcB),O-乙酰基转移酶Oat,ABC-转运蛋白通透酶Im.G_1771,粘附蛋白LAP,LAP受体Hsp60,粘附素LapB,溶血素李斯特菌溶菌素O LLO,蛋白ActA,内化蛋白A InlA,蛋白lnlB(单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes),李斯特菌病(Listeriosis));外表面蛋白A OspA,外表面蛋白OspB,外表面蛋白OspC,核心蛋白聚糖结合蛋白A DbpA,核心蛋白聚糖结合蛋白B DbpB,鞭毛丝41kDa核心蛋白Fla,碱性膜蛋白A BmpA(免疫显性抗原P39),外表面22kDa脂蛋白前体(抗原IPLA7),可变的表面脂蛋白vlsE(通常是伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi)和其他疏螺旋体属(Borrelia)物种,莱姆病(Lyme disease)(莱姆包柔氏体螺旋病(Lymeborreliosis)));毒液变应原同系物-样蛋白VAL-1,冗余幼虫转录物ALT-1,冗余幼虫转录物ALT-2,硫氧还蛋白过氧化物酶TPX,黄蜂变应原同源物VAH,硫氧还蛋白过氧化物酶2TPX-2,抗原性蛋白SXP(肽N,N1,N2和N3),活化相关的蛋白-1 ASP-1,硫氧还蛋白TRX,谷氨酰胺转移酶BmTGA,谷胱甘肽-S-转移酶GST,肌球蛋白,黄蜂变应原同源物VAH,175kDa胶原酶,甘油醛-3-磷酸脱氢酶GAPDH,表皮胶原Col-4,分泌的幼虫酸性蛋白SLAPs,壳多糖酶CHI-1,麦芽糖结合蛋白MBP,糖酵解酶果糖-1,6-二磷酸醛缩酶Fba,原肌球蛋白TMY-1,线虫特异性基因产物OvB20,癌半胱氨酸蛋白酶抑制剂CPI-2,蛋白Cox-2(班氏吴策线虫(Wuchereria bancrofti)和马来丝虫(Brugia malayi),淋巴性丝虫病(Lymphaticfilariasis)(象皮肿(Elephantiasis)));糖蛋白GP,基质蛋白Z,聚合酶L,核蛋白N(淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(Lymphocytic choriomeningitis virus,LCMV),淋巴细胞性脉络丛脑膜炎(Lymphocytic choriomeningitis));凝血酶敏感蛋白-相关的无名蛋白TRAP,SSP2子孢子表面蛋白2,顶膜抗原1 AMA1,棒状体膜抗原RMA1,酸性碱性重复抗原ABRA,细胞-traversal蛋白PF,蛋白Pvs25,裂殖子表面蛋白1 MSP-1,裂殖子表面蛋白2 MSP-2,环感染的红细胞表面抗原RESALiver阶段抗原3 LSA-3,蛋白Eba-175,丝氨酸重复抗原5 SERA-5,环子孢子蛋白CS,裂殖子表面蛋白3 MSP3,裂殖子表面蛋白8MSP8,烯醇化酶PF10,肝细胞红细胞蛋白17kDa HEP17,红细胞膜蛋白1 EMP1,蛋白Kβ裂殖子表面蛋白4/5 MSP4/5热休克蛋白Hsp90,富含谷氨酸的蛋白GLURP,裂殖子表面蛋白4 MSP-4,蛋白STARP,环子孢子蛋白-相关的抗原前体CRA(疟原虫属(Plasmodium genus),疟疾(Malaria));核蛋白N,膜相关的蛋白VP24,次要核蛋白VP30,聚合酶辅因子VP35,聚合酶L,基质蛋白VP40,包膜糖蛋白GP(马尔堡病毒(Marburg virus),马尔堡出血热(Marburg hemorrhagic fever,MHF));蛋白C,基质蛋白M,磷蛋白P,非结构蛋白V,血凝素糖蛋白H,聚合酶L,核蛋白N,融合蛋白F(麻疹病毒(Measles virus),麻疹(Measles));ABC转运蛋白家族成员(LolC,OppA和PotF),推定的脂蛋白释放系统跨膜蛋白LolC/E,鞭毛蛋白FliC,伯克霍尔德氏菌胞内运动性A BimA,细菌延伸因子-Tu EF-Tu,17kDa OmpA-样蛋白,boaA编码蛋白,boaB编码蛋白(鼻疽伯克霍尔德氏菌,类鼻疽(Melioidosis)(惠特莫尔病(Whitmore′s disease)));菌毛蛋白,次要菌毛相关的亚基pilC,主要菌毛亚基和变体pilE,pilS,相变异蛋白porA,孔蛋白B PorB,蛋白TraD,奈瑟菌属外膜抗原H.8,70kDa抗原,主要外膜蛋白PI,外膜蛋白蛋白PlA和PlB,W抗原,表面蛋白ANspA,转铁蛋白结合蛋白TbpA,转铁蛋白结合蛋白TbpB,PBP2,mtrR编码蛋白,ponA编码蛋白,膜通透酶FbpBC,FbpABC蛋白系统,LbpAB蛋白,外膜蛋白Opa,外膜转运蛋白FetA,铁抑制调节剂MpeR,因子H-结合蛋白fHbp,粘附素NadA,蛋白NhbA,抑制剂FarR(脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis),脑膜炎球菌病(Meningococcal disease));66kDa蛋白,22kDa蛋白(通常是横川吸虫(Metagonimus yokagawai),后殖吸虫病(Metagonimiasis));极性管蛋白(吞微孢子属(Glugea)中34,75和170kDa,在脑炎微孢子虫属(Encephalitozoon)中35,55和150kDa),驱动蛋白-相关的蛋白,RNA聚合酶II最大的亚基,相似或完整的膜蛋白YIPA,抗沉默蛋白1,热休克转录因子HSF,蛋白激酶,胸苷激酶,NOP-2样核仁蛋白(微孢子门(Microsporidia phylum),微孢子虫病(Microsporidiosis));CASP8和FADD-样凋亡调节剂,谷胱甘肽过氧化酶GPX1,RNA解旋酶NPH-II NPH2,聚(A)聚合酶催化亚基PAPL,主要包膜蛋白P43K,早期转录因子70kDa亚基VETFS,早期转录因子82kDa亚基VETFL,G1-型金属内肽酶,核苷三磷酸酶I NPH1,复制蛋白A28-样MC134L,RNA聚合酶7kDa亚基RPO7(传染性软疣病毒(Molluscum contagiosum virus,MCV)),触染性软疣(Molluscumcontagiosum,MC));基质蛋白M,磷蛋白P/V,小疏水蛋白SH,核蛋白N,蛋白V,融合糖蛋白F,血凝素-神经氨酸酶HN,RNA聚合酶L(腮腺炎病毒(Mumps virus),流行性腮腺炎(Mumps));外膜蛋白OM,细胞表面抗原OmpA,细胞表面抗原OmpB(sca5),细胞表面蛋白SCA4,细胞表面蛋白SCA1,胞质内的蛋白D,晶状表面层蛋白SLP,保护性表面蛋白抗原SPA(斑疹伤寒立克次体(Rickettsia typhi),鼠型斑疹伤寒(Murine typhus)(地方性斑疹伤寒(Endemictyphus)));粘附素P1,粘附P30,蛋白p116,蛋白P40,细胞骨架蛋白HMW1,细胞骨架蛋白HMW2,细胞骨架蛋白HMW3,MPN152编码蛋白,MPN426编码蛋白,MPN456编码蛋白,MPN-500编码蛋白(肺炎支原体,支原体肺炎(Mycoplasma pneumonia));NocA,铁依赖性调节蛋白,VapA,VapD,VapF,VapG,酪蛋白水解蛋白酶,丝端-相关的43-kDa蛋白,蛋白P24,蛋白P61,15-kDa蛋白,56-kDa蛋白(通常是星状诺卡尔菌(Nocardia asteroides)和其他诺卡尔菌属(Nocardia)物种,诺卡菌病(Nocardiosis));毒液变应原同系物-样蛋白VAL-1,冗余幼虫转录物ALT-1,冗余幼虫转录物ALT-2,硫氧还蛋白过氧化物酶TPX,黄蜂变应原同源物VAH,硫氧还蛋白过氧化物酶2 TPX-2,抗原性蛋白SXP(肽N,N1,N2和N3),活化相关的蛋白-1 ASP-1,硫氧还蛋白TRX,谷氨酰胺转移酶BmTGA,谷胱甘肽-S-转移酶GST,肌球蛋白,黄蜂变应原同源物VAH,175kDa胶原酶,甘油醛-3-磷酸脱氢酶GAPDH,表皮胶原Col-4,分泌的幼虫酸性蛋白SLAPs,壳多糖酶CHI-1,麦芽糖结合蛋白MBP,糖酵解酶果糖-1,6-二磷酸醛缩酶Fba,原肌球蛋白TMY-1,线虫特异性基因产物OvB20,癌半胱氨酸蛋白酶抑制剂CPI-2,Cox-2(旋盘尾丝虫(Onchocerca volvulus),盘尾丝虫病(Onchocerciasis)(河盲(Riverblindness)));43kDa分泌的糖蛋白,糖蛋白gp0,糖蛋白gp75,抗原Pb27,抗原Pb40,热休克蛋白Hsp65,热休克蛋白Hsp70,热休克蛋白Hsp90,蛋白P10,磷酸丙糖异构酶TPI,N-乙酰基-葡糖胺-结合凝集素Paracoccin,28kDa蛋白Pb28(巴西副球孢子菌(Paracoccidioidesbrasiliensis),副球孢子菌病(Paracoccidioidomycosis)(南美芽生菌病(SouthAmerican blastomycosis)));28-kDa梭菌蛋白酶-样半胱氨酸蛋白酶Pw28CCP(通常是卫斯特曼并殖吸虫(Paragonimus westermani)和其他并殖吸虫属(Paragonimus)物种,并殖吸虫病(Paragonimiasis));外膜蛋白OmpH,外膜蛋白Omp28,蛋白PM1539,蛋白PM0355,蛋白PM1417,修复蛋白MutL,蛋白BcbC,蛋白(prtein)PM0305,甲酸脱氢酶-N,蛋白PM0698,蛋白PM1422,DNA旋转酶,脂蛋白PlpE,粘附蛋白Cp39,血红素获得系统受体HasR,39kDa荚膜蛋白,铁调节的OMP IROMP,外膜蛋白OmpA87,伞毛蛋白Ptf,伞毛亚基蛋白PtfA,转铁蛋白结合蛋白Tbpl,酯酶MesA,多杀巴斯德菌(Pasteurella multocida)毒素PMT,粘附蛋白Cp39(巴斯德菌属(Pasteurella genus),巴斯德菌病(Pasteurellosis));″丝状血凝素FhaB,腺苷酸环化酶CyaA,百日咳毒素亚基4前体PtxD,百日咳杆菌粘附素前体Prn,毒素亚基1 PtxA,蛋白Cpn60,蛋白brkA,百日咳毒素亚基2前体PtxB,百日咳毒素亚基3前体PtxC,百日咳毒素亚基5前体PtxE,百日咳杆菌粘附素Prn,蛋白Fim2,蛋白Fim3;″(百日咳博德特菌(Bordetella pertussis),百日咳(Pertussis,Whooping cough));″F1荚膜抗原,毒力相关的V抗原,分泌的效应子蛋白LcrV,V抗原,外膜蛋白酶Pla,分泌的效应子蛋白YopD,推定的分泌的蛋白-酪氨酸磷酸酶YopH,针状复合物主要亚基YscF,蛋白激酶YopO,推定的自发转运蛋白YapF,内膜ABC-转运蛋白YbtQ(Irp7),推定的糖结合蛋白YPO0612,热休克蛋白90HtpG,推定的硫酸酯酶蛋白YdeN,外膜脂蛋白载体蛋白LolA,分泌伴侣蛋白YerA,推定的脂蛋白YPO0420,溶血素活化剂蛋白HpmB,鼠疫菌素/耶尔森菌素外膜受体Psn,分泌的效应子蛋白YopE,分泌的效应子蛋白YopF,分泌的效应子蛋白YopK,外膜蛋白YopN,外膜蛋白YopM,凝固酶/纤维蛋白溶酶前体Pla;″(鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis),鼠疫(Plague));蛋白PhpA,表面粘附素PsaA,肺炎链球菌溶血素Ply,ATP-依赖性蛋白酶Clp,硫辛酸-蛋白连接酶LplA,细胞壁表面锚定蛋白psrP,分拣酶SrtA,谷氨酰基-tRNA合酶GltX,胆碱结合蛋白A CbpA,肺炎球菌表面蛋白A PspA,肺炎球菌表面蛋白C PspC,6-磷酸葡糖酸脱氢酶Gnd,铁结合蛋白PiaA,胞壁质水解酶LytB,proteon LytC,蛋白酶A1(肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae),肺炎球菌感染(Pneumococcal infection));主要表面蛋白B,kexin-样蛋白酶KEX1,蛋白A12,55kDa抗原P55,主要表面糖蛋白Msg(杰氏肺囊虫,肺囊虫肺炎(Pneumocystis pneumonia,PCP));基因组聚蛋白,聚合酶3D,病毒衣壳蛋白VP1,病毒衣壳蛋白VP2,病毒衣壳蛋白VP3,病毒衣壳蛋白VP4,蛋白酶2A,蛋白酶3C(脊髓灰质炎病毒(Poliovirus),脊髓灰质炎(Poliomyelitis));蛋白Nfa1,毒蜥外泌肽-3,分泌性脂酶,组织蛋白酶B-样蛋白酶,半胱氨酸蛋白酶,组织蛋白酶,过氧化物氧还蛋白,蛋白Cry1Ac(通常是福氏耐格里原虫(Naegleria fowleri),原发性阿米巴脑膜脑炎(Primary amoebicmeningoencephalitis,PAM));未知蛋白(agnoprotein),大T抗原,小T抗原,主要衣壳蛋白VP1,次要衣壳蛋白Vp2(JC病毒,进行性多病灶脑白质病(Progressive multifocalleukoencephalopathy));低钙响应性蛋白E LCrE,衣原体外蛋白N CopN,丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶PknD,酰基-载体-蛋白S-丙二酰转移酶FabD,单链DNA-结合蛋白Ssb,主要外膜蛋白MOMP,外膜蛋白2 Omp2,多形膜蛋白家族(Pmp1,Pmp2,Pmp3,Pmp4,Pmp5,Pmp6,Pmp7,Pmp8,Pmp9,Pmp10,Pmp11,Pmp12,Pmp13,Pmp14,Pmp15,Pmp16,Pmp17,Pmp18,Pmp19,Pmp20,Pmp21)(鹦鹉衣原体(Chlamydophila psittaci),鹦鹉热(Psittacosis));外膜蛋白P1,热休克蛋白B HspB,肽ABC转运蛋白,GTP-结合蛋白,蛋白IcmB,核糖核酸酶R,磷酸酶SixA,蛋白DsbD,外膜蛋白TolC,DNA-结合蛋白PhoB,ATPase DotB,热休克蛋白B HspB,膜蛋白Com1,28kDa蛋白,DNA-3-甲基腺嘌呤糖苷酶I,p外膜蛋白OmpH,外膜蛋白AdaA,甘氨酸裂解系统T-蛋白(伯内特考克斯体(Coxiella burnetii),Q热(Q fever));核蛋白N,大结构蛋白L,磷蛋白P,基质蛋白M,糖蛋白G(狂犬病病毒,狂犬病(Rabies));融合蛋白F,核蛋白N,基质蛋白M,基质蛋白M2-1,基质蛋白M2-2,磷蛋白P,小疏水蛋白SH,主要表面糖蛋白G,聚合酶L,非结构蛋白1NS1,非结构蛋白2 NS2(呼吸道合胞病毒(RSV),呼吸道合胞病毒感染);基因组聚蛋白,聚合酶3D,病毒衣壳蛋白VP1,病毒衣壳蛋白VP2,病毒衣壳蛋白VP3,病毒衣壳蛋白VP4,蛋白酶2A,蛋白酶3C(鼻病毒属(Rhinovirus),鼻病毒感染);外膜蛋白OM,细胞表面抗原OmpA,细胞表面抗原OmpB(sca5),细胞表面蛋白SCA4,细胞表面蛋白SCA1,蛋白PS120,胞质内蛋白D,保护性表面蛋白抗原SPA(立克次体属(Rickettsia genus),立克次体感染(Rickettsialinfection));外膜蛋白OM,细胞表面抗原OmpA,细胞表面抗原OmpB(sca5),细胞表面蛋白SCA4,细胞表面蛋白SCA1,胞质内蛋白D(螨立克次体(Rickettsia akari),立克次体痘(Rickettsialpox));包膜糖蛋白GP,聚合酶L,核蛋白N,非结构蛋白NSS(立夫特山谷热病毒(Rift Valley fever virus),立夫特山谷热(Rift Valley fever,RVF));外膜蛋白OM,细胞表面抗原OmpA,细胞表面抗原OmpB(sca5),细胞表面蛋白SCA4,细胞表面蛋白SCA1,胞质内蛋白D(立氏立克次体(Rickettsia rickettsii),洛矶山斑疹热(Rocky mountainspotted fever,RMSF));″非结构蛋白6 NS6,非结构蛋白2 NS2,中间体衣壳蛋白VP6,内部衣壳蛋白VP2,非结构蛋白3 NS3,RNA-定向的RNA聚合酶L,蛋白VP3,非结构蛋白1 NS1,非结构蛋白5 NS5,外衣壳糖蛋白VP7,非结构糖蛋白4 NS4,外衣壳蛋白VP4;″(轮状病毒属(Rotavirus),轮状病毒感染(Rotavirus infection));聚蛋白P200,糖蛋白E1,糖蛋白E2,蛋白NS2,衣壳蛋白C(风疹病毒(Rubella virus),风疹(Rubella));伴侣蛋白GroEL(MopA),磷酸肌醇磷酸酶SopB,热休克蛋白HslU,伴侣蛋白DnaJ,蛋白TviB,蛋白IroN,鞭毛蛋白FliC,侵入蛋白SipC,糖蛋白gp43,外膜蛋白LamB,外膜蛋白PagC,外膜蛋白TolC,外膜蛋白NmpC,外膜蛋白FadL,转运蛋白SadA,转移酶WgaP,效应子蛋白SifA,SteC,SseL,SseJ和SseF(沙门菌属(Salmonella genus),沙门菌病(Salmonellosis));″蛋白14,非结构蛋白NS7b,非结构蛋白NS8a,蛋白9b,蛋白3a,核蛋白N,非结构蛋白NS3b,非结构蛋白NS6,蛋白7a,非结构蛋白NS8b,膜蛋白M,包膜小膜蛋白EsM,复制酶聚蛋白1a,spike糖蛋白S,复制酶聚蛋白1ab;″(SARS冠状病毒,SARS(严重急性呼吸综合征(Severe Acute RespiratorySyndrome)));丝氨酸蛋白酶,非典型疥螨属(Sarcoptes)抗原1 ASA1,谷胱甘肽S-转移酶GST,半胱氨酸蛋白酶,丝氨酸蛋白酶,脱脂载脂蛋白(疥螨(Sarcoptes scabiei),疥疮(Scabies));谷胱甘肽S-转移酶GST,副肌球蛋白,血红蛋白酶SM32,主要卵抗原,14kDa脂肪酸-结合蛋白Sm14,主要幼虫表面抗原P37,22,6kDa间层抗原,钙激活中性蛋白酶CANP,三磷酸异构酶Tim,表面蛋白9B,外衣壳蛋白VP2,23kDa完整的膜蛋白Sm23,Cu/Zn-超氧化物歧化酶,糖蛋白Gp,肌球蛋白(血吸虫属(Schistosoma genus),血吸虫病(Schistosomiasis)(裂体吸虫病(Bilharziosis)));60kDa伴侣蛋白,56kDa型-特异性抗原,丙酮酸磷酸二激酶,4-羟基苯酸酯辛异戊二烯基转移酶(恙虫热立克次体(Orientia tsutsugamushi),恙虫热斑疹伤寒(Scrub typhus));脱氢酶GuaB,侵入蛋白Spa32,侵染素IpaA,侵染素IpaB,侵染素IpaC,侵染素IpaD,侵染素IpaH,侵染素IpaJ(志贺菌属(Shigella genus),细菌性痢疾(Shigellosis)(杆菌性痢疾(Bacillary dysentery)));蛋白P53,病毒体蛋白US10同系物,转录调节剂IE63,转录反式激活剂IE62,蛋白酶P33,α反式-结合因子74kDa蛋白,脱氧尿苷5′-三磷酸核苷酸水解酶,转录反式激活剂IE4,膜蛋白UL43同系物,核磷蛋白UL3同系物,核蛋白UL4同系物,复制起点-结合蛋白,膜蛋白2,磷蛋白32,蛋白57,DNA聚合酶持续合成因子,门蛋白54,DNA引物酶,间层蛋白UL14同系物,间层蛋白UL21同系物,间层蛋白UL55同系物,三分末端酶亚基(tripartite terminase subunit)UL33同系物,三分末端酶亚基UL15同系物,衣壳-结合蛋白44,病毒体-包装蛋白43(水痘-带状疱疹病毒(VZV),带状疱疹(Shingles,Herpes zoster));截短的3-β羟基-5-烯类固醇脱氢酶同系物,病毒体膜蛋白A13,蛋白A19,蛋白A31,截短的蛋白A35同系物,蛋白A37.5同系物,蛋白A47,蛋白A49,蛋白A51,脑信号蛋白-样蛋白A43,丝氨酸蛋白酶抑制剂1,丝氨酸蛋白酶抑制剂2,丝氨酸蛋白酶抑制剂3,蛋白A6,蛋白B15,蛋白C1,蛋白C5,蛋白C6,蛋白F7,蛋白F8,蛋白F9,蛋白F11,蛋白F14,蛋白F15,蛋白F16(主要痘症或次要痘症,天花(Smallpox)(痘症(Variola)));粘附素/糖蛋白gp70,蛋白酶(申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii),孢子丝菌病(Sporotrichosis));血红素-铁结合蛋白IsdB,胶原粘附素Cna,聚集因子A ClfA,蛋白MecA,纤连蛋白-结合蛋白A FnbA,A型肠毒素EntA,B型肠毒素EntB,C型肠毒素EntC1,C型肠毒素EntC2,D型肠毒素EntD,E型肠毒素EntE,中毒性休克综合征毒素-1 TSST-1,葡激酶(Staphylokinase),青霉素结合蛋白2a PBP2a(MecA),分泌抗原SssA(葡萄球菌属(Staphylococcus genus),葡萄球菌食物中毒(Staphylococcal food poisoning));血红素-铁结合蛋白蛋白IsdB,胶原粘附素Cna,聚集因子A ClfA,蛋白MecA,纤连蛋白-结合蛋白蛋白A FnbA,A型肠毒素EntA,B型肠毒素EntB,C型肠毒素EntC1,C型肠毒素EntC2,D型肠毒素EntD,E型肠毒素EntE,中毒性休克综合征毒素-1 TSST-1,葡激酶,青霉素结合蛋白2aPBP2a(MecA),分泌抗原SssA(葡萄球菌属,葡萄球菌感染(Staphylococcal infection));抗原Ss-IR,抗原NIE,strongylastacin,Na+-K+ATP酶Sseat-6,原肌球蛋白SsTmy-1,蛋白LEC-5,41kDa a抗原P5,41-kDa幼虫蛋白,31-kDa幼虫蛋白,28-kDa幼虫蛋白(粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis),类圆线虫病(Strongyloidiasis));甘油磷酸二酯磷酸二酯酶GlpQ(Gpd),外膜蛋白TmpB,蛋白Tp92,抗原TpF1,重复蛋白Tpr,重复蛋白F TprF,重复蛋白G TprG,重复蛋白I TprI,重复蛋白J TprJ,重复蛋白K TprK,密螺旋体膜蛋白A TmpA,脂蛋白,15kDa Tpp15,47kDa膜抗原,小铁蛋白TpF1,粘附素Tp0751,脂蛋白TP0136,蛋白TpN17,蛋白TpN47,外膜蛋白TP0136,外膜蛋白TP0155,外膜蛋白TP0326,外膜蛋白TP0483,外膜蛋白TP0956(苍白密螺旋体(Treponema pallidum),梅毒(Syphilis));组织蛋白酶L-样蛋白酶,53/25-kDa抗原,8kDa家族成员,具有边缘胰蛋白酶-样活性的囊尾蚴蛋白TsAg5,六钩蚴蛋白TSOL18,六钩蚴蛋白TSOL45-1A,乳酸脱氢酶A LDHA,乳酸脱氢酶B LDHB(绦虫属(Taenia genus),绦虫病(Taeniasis));破伤风毒素TetX,破伤风毒素C TTC,140kDa S层蛋白,黄素蛋白β-亚基CT3,磷脂酶(卵磷脂酶),磷载体蛋白HPr(破伤风梭菌(Clostridiumtetani),破伤风(Tetanus)(牙关紧闭症(Lockjaw)));基因组聚蛋白,蛋白E,蛋白M,衣壳蛋白C(蜱传脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV),蜱传脑炎(Tick-borneencephalitis));58-kDa抗原,68-kDa抗原,弓蛔虫属(Toxocara)幼虫排泄-分泌抗原TES,32-kDa糖蛋白,糖蛋白TES-70,糖蛋白GP31,排泄-分泌抗原TcES-57,肠周流体抗原Pe,可溶性提取物抗原Ex,排泄/分泌幼虫抗原ES,抗原TES-120,聚蛋白变应原TBA-1,组织蛋白酶L-样半胱氨酸蛋白酶c-cpl-1,26-kDa蛋白(犬弓蛔线虫(Toxocara canis)或猫弓蛔虫(Toxocara cati),弓蛔虫病(Toxocariasis)(眼幼虫移行症(Ocular Larva Migrans,OLM)和内脏幼虫移行症(Visceral Larva Migrans,VLM)));微丝蛋白(MIC1,MIC2,MIC3,MIC4,MIC5,MIC6,MIC7,MIC8),棒状蛋白Rop2,棒状蛋白(Rop1,Rop2,Rop3,Rop4,Rop5,Rop6,Rop7,Rop16,Rjop17),蛋白SR1,表面抗原P22,主要抗原p24,主要表面抗原p30,致密颗粒蛋白(GRA1,GRA2,GRA3,GRA4,GRA5,GRA6,GRA7,GRA8,GRA9,GRA10),28kDa抗原,表面抗原SAG1,SAG2相关的抗原,核苷-三磷酸酶1,核苷-三磷酸酶2,蛋白Stt3,含有HesB-样结构域的蛋白,菱形样蛋白酶5,toxomepsin 1(鼠弓形虫(Toxoplasma gondii),弓形虫病(Toxoplasmosis));43kDa分泌的糖蛋白酶,53kDa分泌的糖蛋白酶,副肌球蛋白,抗原Ts21,抗原Ts87,抗原p46000,TSL-1抗原,小窝蛋白-1 CAV-1,49kDa新生幼虫抗原,前列腺血清酸性磷酸酶同源物,丝氨酸蛋白酶,丝氨酸蛋白酶抑制剂,45-kDa糖蛋白Gp45(旋毛线虫(Trichinella spiralis),旋毛虫病(Trichinellosis));Myb-样转录因子(Myb1,Myb2,Myb3),粘附蛋白AP23,粘附蛋白AP33,粘附素蛋白AP33-3,粘附素AP51,粘附素AP65,粘附蛋白AP65-1,α-辅肌动蛋白,驱动蛋白-相关的蛋白,teneurin,62kDa蛋白酶,枯草杆菌蛋白酶-样丝氨酸蛋白酶SUB1,半胱氨酸蛋白酶基因3 CP3,α-烯醇化酶Eno1,半胱氨酸蛋白酶CP30,热休克蛋白(Hsp70,Hsp60),免疫原性蛋白P270,(阴道毛滴虫(Trichomonasvaginalis),滴虫病(Trichomoniasis));β-微管蛋白,47-kDa蛋白,分泌性白细胞-样蛋白酶-1 SLP-1,50-kDa蛋白TT50,17kDa抗原,43/47kDa蛋白(鞭形鞭虫(Trichuristrichiura),鞭虫病(Trichuriasis)(鞭虫感染(Whipworm infection)));蛋白ESAT-6(EsxA),10kDa滤出物抗原EsxB,分泌的抗原85-B FBPB,纤连蛋白-结合蛋白A FbpA(Ag85A),丝氨酸蛋白酶PepA,PPE家族蛋白PPE18,纤连蛋白-结合蛋白D FbpD,免疫原性蛋白MPT64,分泌的蛋白MPT51,过氧化氢酶-过氧化物酶-过氧亚硝酸酶(peroxynitritase)TKATG,周质磷酸-结合脂蛋白PSTS3(PBP-3,Phos-1),铁调节的肝素结合血凝素Hbha,PPE家族蛋白PPE14,PPE家族蛋白PPE68,蛋白Mtb72F,蛋白Apa,免疫原性蛋白MPT63,周质磷酸-结合脂蛋白PSTS1(PBP-1),分子伴侣DnaK,细胞表面脂蛋白Mpt83,脂蛋白P23,磷酸转运系统通透酶蛋白pstA,14kDa抗原,纤连蛋白-结合蛋白C FbpC1,丙氨酸脱氢酶TB43,谷氨酰胺合酶1,ESX-1蛋白,蛋白CFP10,TB10.4蛋白,蛋白MPT83,蛋白MTB12,蛋白MTB8,Rpf-样蛋白,蛋白MTB32,蛋白MTB39,晶体蛋白,热休克蛋白HSP65,蛋白PST-S(通常是结核分枝杆菌,肺结核(Tuberculosis));外膜蛋白FobA,外膜蛋白FobB,胞内生长基因座lglC1,胞内生长基因座IglC2,氨基转移酶Wbtl,伴侣蛋白GroEL,17kDa主要膜蛋白TUL4,脂蛋白LpnA,壳多糖酶家族18蛋白,异柠檬酸脱氢酶,Nif3家族蛋白,IV型菌毛糖基化蛋白,外膜蛋白tolC,FAD结合家族蛋白,type IV菌毛多聚体外膜蛋白,二组分传感器蛋白KdpD,伴侣蛋白DnaK,蛋白TolQ(土拉热弗朗西丝菌(Francisella tularensis),土拉菌病(Tularemia));″MB抗原,尿素酶,蛋白GyrA,蛋白GyrB,蛋白ParC,蛋白ParE,脂质相关的膜蛋白LAMP,胸苷激酶TK,磷脂酶PL-A1,磷脂酶PL-A2,磷脂酶PL-C,表面表达的96-kDa抗原;″(尿素分解尿素支原体(Ureaplasma urealyticum),尿素分解尿素支原体感染);非结构聚蛋白,结构聚蛋白,衣壳蛋白CP,蛋白E1,蛋白E2,蛋白E3,蛋白酶P1,蛋白酶P2,蛋白酶P3(委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus),委内瑞拉马脑炎(Venezuelan equineencephalitis));糖蛋白GP,基质蛋白Z,聚合酶L,核蛋白N(瓜纳瑞托病毒(Guanaritovirus),委内瑞拉出血热(Venezuelan hemorrhagic fever));聚蛋白,蛋白E,蛋白M,衣壳蛋白C,蛋白酶NS3,蛋白NS1,蛋白NS2A,蛋白AS2B,brotein NS4A,蛋白NS4B,蛋白NS5(西尼罗河病毒(West Nile virus),西尼罗热(West Nile Fever));衣壳蛋白CP,蛋白E1,蛋白E2,蛋白E3,蛋白酶P2(西方马脑炎病毒(Western equine encephalitis virus),西方马脑炎(Western equine encephalitis));基因组聚蛋白,蛋白E,蛋白M,衣壳蛋白C,蛋白酶NS3,蛋白NS1,蛋白NS2A,蛋白AS2B,蛋白NS4A,蛋白NS4B,蛋白NS5(黄热病毒(Yellow fevervirus),黄热病(Yellow fever));推定的Yop靶向蛋白YobB,效应子蛋白YopD,效应子蛋白YopE,蛋白YopH,效应子蛋白YopJ,蛋白易位蛋白YopK,效应子蛋白YopT,蛋白YpkA,鞭毛生物合成蛋白FlbA,肽酶M48,钾流出系统KefA,转录调节剂RovA,粘附素Ifp,易位蛋白LcrV,蛋白PcrV,侵染素Inv,外膜蛋白OmpF-样孔蛋白,粘附素YadA,蛋白激酶C,磷脂酶C1,蛋白PsaA,甘露糖基转移酶-样蛋白WbyK,蛋白YscU,抗原YPMa(假结核病耶尔森菌(Yersiniapseudotuberculosis),假结核病耶尔森菌感染);效应子蛋白YopB,60kDa伴侣蛋白,蛋白WbcP,酪氨酸-蛋白磷酸酶YopH,蛋白YopQ,肠毒素,半乳糖苷通透酶,还原酶NrdE,蛋白YasN,侵染素Inv,粘附素YadA,外膜孔蛋白F OmpF,蛋白UspA1,蛋白EibA,蛋白Hia,细胞表面蛋白Ail,伴侣蛋白SycD,蛋白LcrD,蛋白LcrG,蛋白LcrV,蛋白SycE,蛋白YopE,调节剂蛋白TyeA,蛋白YopM,蛋白YopN,蛋白YopO,蛋白YopT,蛋白YopD,蛋白酶ClpP,蛋白MyfA,蛋白FilA和蛋白PsaA(小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica),耶尔森菌病(Yersiniosis))。
(括号中的是所述抗原是/来源于的特定的病原体以及所述抗原与之相关的传染病)
在本发明所述的具体的实施方案中,特别优选下述与传染病相关的病原体的抗原:
·在狂犬病病毒的每种情形中:核蛋白(N),磷蛋白(P),基质蛋白(M),糖蛋白(G),和病毒RNA聚合酶(L);
·在乙型肝炎病毒的每种情形中:乙型肝炎表面抗原(HBsAg),乙型肝炎核心抗原(HbcAg),乙型肝炎病毒DNA聚合酶,HBx蛋白,preS2中表面蛋白,大S蛋白,病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3和病毒蛋白VP4;
·在人乳头瘤病毒(hPV)的每种情形中:E1蛋白,E2蛋白,E3蛋白,E4蛋白,E5蛋白,E6蛋白,E7蛋白,E8蛋白,L1蛋白和L2蛋白;
·在炭疽芽孢杆菌的每种情形中:保护性抗原(PA),水肿因子(EF),致死因子(LF)和S-层同源蛋白(SLH);
·在呼吸道合胞病毒(RSV)的每种情形中:融合(F)蛋白,核壳(N)蛋白,磷蛋白(P),基质(M)蛋白,糖蛋白(G),大蛋白(L;RNA聚合酶),非结构蛋白1(NS1),非结构蛋白2(NS2),小疏水(SH)蛋白,延伸因子M2-1和转录调节蛋白M2-2;
·在单纯疱疹病毒(HSV)的每种情形中:糖蛋白L(UL1),尿嘧啶-DNA糖基化酶UL2,UL3蛋白,UL4蛋白,DNA复制蛋白UL5,门蛋白UL6,病毒体成熟蛋白UL7,DNA解旋酶UL8,复制起点-结合蛋白UL9,糖蛋白M(UL10),UL11蛋白,碱性核酸外切酶UL12,丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶UL13,间层蛋白UL14,末端酶(UL15),间层蛋白UL16,UL17蛋白,衣壳蛋白VP23(UL18),主要衣壳蛋白VP5(UL19),膜蛋白UL20,间层蛋白UL21,糖蛋白H(UL22),胸苷激酶UL23,UL24蛋白,UL25蛋白,衣壳蛋白P40(UL26,VP24,VP22A),糖蛋白B(UL27),ICP18.5蛋白(UL28),主要DNA-结合蛋白ICP8(UL29),DNA聚合酶UL30,核基质蛋白UL31,包膜糖蛋白UL32,UL33蛋白,内核膜蛋白UL34,衣壳蛋白VP26(UL35),大间层蛋白UL36,衣壳组装蛋白UL37,VP19C蛋白(UL38),核糖核苷酸还原酶(大亚基)UL39,核糖核苷酸还原酶(小亚基)UL40,间层蛋白/病毒体宿主关闭VHS蛋白(UL41),DNA聚合酶持续合成因子UL42,膜蛋白UL43,糖蛋白C(UL44),膜蛋白UL45,间层蛋白VP11/12(UL46),间层蛋白VP13/14(UL47),病毒体成熟蛋白VP16(UL48,α-TIF),包膜蛋白UL49,dUTP二磷酸酶UL50,间层蛋白UL51,DNA解旋酶/引物酶复合蛋白UL52,糖蛋白K(UL53),转录调控蛋白IE63(ICP27,UL54),UL55蛋白,UL56蛋白,病毒复制蛋白ICP22(IE68,US1),US2蛋白,丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶US3,糖蛋白G(US4),糖蛋白J(US5),糖蛋白D(US6),糖蛋白I(US7),糖蛋白E(US8),间层蛋白US9,衣壳/间层蛋白US10,Vmw21蛋白(US11),ICP47蛋白(IE12,US12),主要转录激活因子ICP4(IE175,RS1),E3泛素连接酶ICP0(IE110),潜伏相关的蛋白1(LRP1),潜伏相关的蛋白2(LRP2),神经毒力因子RL1(ICP34.5),和潜伏相关的转录物(LAT);或
·在结核分枝杆菌的每种情形中:ESAT-6蛋白,ESX-1蛋白,CFP10蛋白,TB10.4蛋白,MPT63蛋白,MPT64蛋白,MPT83蛋白,MTB12蛋白,MTB8蛋白,AG85A蛋白,AG85B蛋白,Rpf-样蛋白,KATG蛋白,PPE18蛋白,MTB32蛋白,MTB39蛋白,晶体蛋白,HSP65蛋白,PST-S蛋白,和HBHA蛋白,10kDa滤出物抗原EsxB,丝氨酸蛋白酶PepA,纤连蛋白-结合蛋白D FbpD,分泌的蛋白MPT51,周质磷酸-结合脂蛋白PSTS1(PBP-1),周质磷酸-结合脂蛋白PSTS3(PBP-3,Phos-1),PPE家族蛋白PPE14,PPE家族蛋白PPE68,蛋白MTB72F,分子伴侣DnaK,细胞表面脂蛋白MPT83,脂蛋白P23,磷酸转运系统通透酶蛋白PstA,14kDa抗原,纤连蛋白-结合蛋白CFbpC1,丙氨酸脱氢酶TB43和谷氨酰胺合酶1。
b)与变态反应或变应性疾病相关的抗原(变应原性抗原或变应原):
按照另一个备选方案,另一种类的抗原包括变应原性抗原。所述变应原性抗原可以选自来源于不同来源的抗原,例如,来源于动物、植物、真菌、细菌等的抗原。在该情形中,变应原的来源包括,例如,草,花粉,霉,药物或多种环境引发剂等。变应原性抗原典型地术语不同种类的化合物,诸如核酸及其片段,蛋白或肽及其片段,碳水化合物,多糖,糖,脂质,磷脂等。在本发明的情形中特别感兴趣的是蛋白或肽抗原及其片段或表位,或核酸及其片段,特别是编码所述蛋白或肽抗原及其片段或表位的核酸及其片段。
在备选的实施方案中,所述抗原是肽或蛋白抗原,或所述肽或蛋白抗原的片段、变体和/或衍生物,诸如包含在由所述来源提取的制剂中的肽或蛋白抗原。在备选的实施方案中,用于本发明的肽或蛋白抗原不是包含在由所述来源提取的制剂中的抗原,和/或是不是从由所述来源提取的制剂中获得的抗原。
与变态反应或变应性疾病相关的抗原(变应原)优选来源于选自由下述组成的列表的来源:
毛囊蠕螨物种(Acarus spp)(Aca s 1,Aca s 10,Aca s 10.0101,Aca s 13,Acas 13.0101,Aca s 2,Aca s 3,Aca s 7,Aca s 8),刺鲅物种(Acanthocybium spp)(Aca so1),棘唇线虫属物种(Acanthocheilonema spp)(Aca v 3,Aca v 3.0101),毛虾物种(Acetes spp)(Ace ja 1),猕猴桃属物种(Actinidia spp)(Act a 1,Act c 1,Act c 10,Act c 10.0101,Act c 2,Act c 4,Act c 5,Act c 5.0101,Act c 8,Act c 8.0101,Act c壳多糖酶,Act d 1,Act d 1.0101,Act d 10,Act d 10.0101,Act d 10.0201,Act d 11,Act d 11.0101,Act d 2,Act d 2.0101,Act d 3,Act d 3.0101,Act d 3.02,Act d 4,Act d 4.0101,Act d 5,Act d 5.0101,Act d 6,Act d 6.0101,Act d 7,Act d 7.0101,Act d 8,Act d 8.0101,Act d 9,Act d 9.0101,Act d壳多糖酶,Act e 1,Act e 5),长管蚜物种(Acyrthosiphon spp)(Acy pi 7,Acy pi 7.0101,Acy pi 7.0102),西番莲科物种(Adenia spp)(Ade v RIP),伊蚊属物种(Aedes spp)(Aed a 1,Aed a 1.0101,Aed a 2,Aed a 2.0101,Aed a 3,Aed a 3.0101,Aed a 4,Aed a 7,Aed a 7.0101,Aed a 7.0102,Aed a 7.0103,Aed a 7.0104,Aed a 7.0105,Aed a 7.0106,Aed a 7.0107,Aed a7.0108,Aed a 7.0109,Aed a 7.0110,Aed a 7.0111,Aed al 1,Aed al 3,Aed al 37kD,Aed v 37kD,Aed v 63kD),山羊草属物种(Aegilops spp)(Aeg ta 28,Aeg ta α_麦醇溶蛋白,Aeg um 28,Aeg un 28),烟鲈属物种(Aethaloperca spp)(Aet ro 1),冰草属物种(Agropyron spp)(Agr c 7),剪股草属物种(Agrostis spp)(Agr ca 1,Agr ca 5,Agr g1,Agr g 4,Agr s 5),土壤杆菌属物种(Agrobacterium spp)(Agr sp CP4 EPSPS),大熊猫属物种(Ailuropoda spp)(Ail me卵黄高磷蛋白,Ail me TCTP),Aix spp(Aix ga 1,Aixsp 1),食粉螨物种(Aleuroglyphus spp)(Ale o 1,Ale o 10,Ale o 10.0101,Ale o10.0102,Ale o 13,Ale o 14,Ale o 2,Ale o 20,Ale o 3,Ale o 5,Ale o 7,Ale o 8,Ale o 9),葱属物种(Allium spp)(All a 3,All a Alliin裂解酶,All c 3,All c 30kD,All c 4,All c Alliin裂解酶,All p Alliin裂解酶,All s Alliin裂解酶),赤杨物种(Alnus spp)(Aln g 1,Aln g 1.0101,Aln g 1/Bet v 1/Cor a 1 TPC7,Aln g 1/Bet v1/Cor a 1 TPC9,Aln g 2,Aln g 4,Aln g 4.0101),埃及雁物种(Alopochen spp)(Alo ae1),看麦娘属物种(Alopecurus spp)(Alo p 1,Alo p 5),链格孢属物种(Alternaria spp)(Alt a 1,Alt a 1.0101,Alt a 1.0102,Alt a 10,Alt a 10.0101,Alt a 12,Alt a12.0101,Alt a 13,Alt a 13.0101,Alt a 2,Alt a 3,Alt a 3.0101,Alt a 4,Alt a4.0101,Alt a 5,Alt a 5.0101,Alt a 6,Alt a 6.0101,Alt a 7,Alt a 7.0101,Alt a70kD,Alt a 8,Alt a 8.0101,Alt a 9,Alt a MnSOD,Alt a NTF2,Alt a TCTP,Alt ar 1,Alt arg 1,Alt b 1,Alt bl 1,Alt br 1,Alt c 1,Alt ca 1,Alt ce 1,Alt ch 1,Alt ci1,Alt co 1,Alt cr 1,Alt ct 1,Alt cu 1,Alt cy 1,Alt d 1,Alt du 1,Alt e 1,Altet 1,Alt eu 1,Alt ga 1,Alt gr 1,Alt j 1,Alt l 1,Alt lo 1,Alt m 1,Alt me 1,Altmi 1,Alt mo 1,Alt o 1,Alt p 1,Alt ph 1,Alt po 1,Alt ps 1,Alt r 1,Alt s 1,Altse 1,Alt sm 1,Alt so 1,Alt su 1,Alt t 1,Alt te 1,Alt to 1),苋属物种(Amaranthus spp)(Ama r 2,Ama r 2.0101,Ama v 2,Ama v 2.0101,Ama v 2.0201),Ambrosia spp(Amb a 1,Amb a 1.0101,Amb a 1.0201,Amb a 1.0202,Amb a 1.0301,Amba 1.0302,Amb a 1.0303,Amb a 1.0304,Amb a 1.0305,Amb a 1.0401,Amb a 1.0402,Amba 1.0501,Amb a 1.0502,Amb a 10,Amb a 10.0101,Amb a 3,Amb a 3.0101,Amb a 4,Amba 4.0101,Amb a 5,Amb a 5.0101,Amb a 6,Amb a 6.0101,Amb a 7,Amb a 7.0101,Amb a8,Amb a 8.0101,Amb a 8.0102,Amb a 9,Amb a 9.0101,Amb a 9.0102,Amb a CPI,Amb p1,Amb p 5,Amb p 5.0101,Amb p 5.0201,Amb t 5,Amb t 5.0101,Amb t 8),Ammotheaspp(Amm h 7,Amm h 7.0101),毛蚶物种(Anadara spp)(Ana br 1),菠萝物种(Ananasspp)(Ana c 1,Ana c 1.0101,Ana c 2,Ana c 2.0101,Ana c 2.0101(MUXF3)),河鸭属物种(Anas spp)(Ana ca 1),狼鳚物种(Anarhichas spp)(Ana l 1),腰果属物种(Anacardium spp)(Ana o 1,Ana o 1.0101,Ana o 1.0102,Ana o 2,Ana o 2.0101,Ana o3,Ana o 3.0101),河鸭属物种(Ana p 1,Ana p 2,Ana p 3),鳗鲡属物种(Anguilla spp)(Ang a 1,Ang j 1),异尖属物种(Anisakis spp)(Ani s 1,Ani s 1.0101,Ani s 10,Anis 10.0101,Ani s 11,Ani s 11.0101,Ani s 12,Ani s 12.0101,Ani s 2,Ani s 2.0101,Ani s 24kD,Ani s 3,Ani s 3.0101,Ani s 4,Ani s 4.0101,Ani s 5,Ani s 5.0101,Anis 6,Ani s 6.0101,Ani s 7,Ani s 7.0101,Ani s 8,Ani s 8.0101,Ani s 9,Ani s9.0101,Ani s CCOS3,Ani s细胞色素B,Ani s FBPP,Ani s NADHDS4L,Ani s NARaS,Ani sPEPB,Ani s肌钙蛋白),番荔枝属物种(Annona spp)(Ann c壳多糖酶),按蚊属物种(Anopheles spp)(Ano da 17,Ano da 17.0101,Ano da 27,Ano da 27.0101,Ano da 7,Ano da 7.0101,Ano g 7,Ano g 7.0101),雁属物种(Anser spp)(Ans a 1,Ans a 2,Ans a3,Ans in 1),黄花茅物种(Anthoxanthum spp)(Ant o 1,Ant o 1.0101,Ant o 12,Ant o13,Ant o 2,Ant o 4,Ant o 5,Ant o 6,Ant o 7),蜜蜂属物种(Apis spp)(Api c 1,Apic 1.0101,Api c 10,Api c 2,Api c 4,Api d 1,Api d 1.0101,Api d 4,Api fl 4),芹菜物种(Apium spp)(Api g 1,Api g 1.0101,Api g 1.0201,Api g 2,Api g 2.0101,Api g3,Api g 3.0101,Api g 4,Api g 4.0101,Api g 5,Api g 5.0101,Api g 6,Api g6.0101),蜜蜂属物种(Apis spp)(Api m 1,Api m 1.0101,Api m 10,Api m 10.0101,Apim 11,Api m 11.0101,Api m 11.0201,Api m 13kD,Api m 2,Api m 2.0101,Api m 3,Apim 3.0101,Api m 4,Api m 4.0101,Api m 5,Api m 5.0101,Api m 6,Api m 6.0101,Api m7,Api m 7.0101,Api m 8,Api m 8.0101,Api m 9,Api m 9.0101,Api m A1-A2,Api mA1-A2-A3,Api m Apalbumin 1,Api m Apalbumin 2,Api me 1,Api me 4),花生属物种(Arachis spp)(Ara d 2,Ara d 6,Ara f 3,Ara f 4,Ara h 1,Ara h 1.0101,Ara h 10,Ara h 10.0101,Ara h 10.0102,Ara h 11,Ara h 11.0101,Ara h 2,Ara h 2.0101,Ara h2.0102,Ara h 2.0201,Ara h 2.0202,Ara h 3,Ara h 3.0101,Ara h 4,Ara h 4.0101,Ara h 5,Ara h 5.0101,Ara h 6,Ara h 6.0101,Ara h 7,Ara h 7.0101,Ara h 7.0201,Ara h 7.0202,Ara h 8,Ara h 8.0101,Ara h 8.0201,Ara h 9,Ara h 9.0101,Ara h9.0201,Ara h凝集素,Ara h油质蛋白18kD,Ara i 2,Ara i 6),拟南芥属物种(Arabidopsis spp)(Ara t 3,Ara t 8,Ara t GLP),羊鲷物种(Archosargus spp)(Arc pr1),Archaeopotamobius spp(Arc s 8,Arc s 8.0101),女王扇贝物种(Aequipecten spp)(Arg i 1),锐缘蜱属物种(Argas spp)(Arg r 1,Arg r 1.0101),拟海鲶属物种(Ariopsisspp)(Ari fe 1),辣根属物种(Armoracia spp)(Arm r HRP),Arrhenatherum spp(Arr e1,Arr e 5),蒿属物种(Artemisia spp)(Art a 1,Art ap 1),卤虫物种(Artemia spp)(Art fr 1,Art fr 1.0101,Art fr 5,Art fr 5.0101),节杆菌属物种(Arthrobacterspp)(Art gl CO),头癣菌物种(Achorion spp)(Art gy 7),木菠萝属物种(Artocarpusspp)(Art h 17kD,Art h 4),节螺藻属物种(Arthrospira spp)(Art pl β_藻青蛋白),蒿属物种(Artemisia spp)(Art v 1,Art v 1.0101,Art v 1.0102,Art v 1.0103,Art v1.0104,Art v 1.0105,Art v 1.0106,Art v 1.0107,Art v 2,Art v 2.0101,Art v 3,Art v 3.0101,Art v 3.0201,Art v 3.0202,Art v 3.0301,Art v 4,Art v 4.0101,Artv 4.0201,Art v 47kD,Art v 5,Art v 5.0101,Art v 6,Art v 6.0101,Art v 60kD),皮肤分节真菌物种(Arthroderma spp)(Art va 4),蛔虫属物种(Ascaris spp)(Asc l 3,Ascl 3.0101,Asc l 3.0102,Asc l 34kD,Asc s 1,Asc s 1.0101,Asc s 3,Asc s 3.0101,Asc s GST),曲霉菌属物种(Aspergillus spp)(Asp aw葡糖淀粉酶,Asp c 22,Asp f 1,Asp f 1.0101,Asp f 10,Asp f 10.0101,Asp f 11,Asp f 11.0101,Asp f 12,Asp f12.0101,Asp f 13,Asp f 13.0101,Asp f 15,Asp f 15.0101,Asp f 16,Asp f 16.0101,Asp f 17,Asp f 17.0101,Asp f 18,Asp f 18.0101,Asp f2,Asp f 2.0101,Asp f 22,Asp f 22.0101,Asp f 23,Asp f 23.0101,Asp f 27,Asp f 27.0101,Asp f 28,Asp f28.0101,Asp f 29,Asp f 29.0101,Asp f 3,Asp f 3.0101,Asp f 34,Asp f 34.0101,Asp f 4,Asp f 4.0101,Asp f 5,Asp f 5.0101,Asp f 56kD,Asp f 6,Asp f 6.0101,Aspf 7,Asp f 7.0101,Asp f 8,Asp f 8.0101,Asp f 9,Asp f 9.0101,Asp f AfCalAp,Aspf AT_V,Asp f过氧化氢酶,Asp f脱乙酰壳多糖酶,Asp f CP,Asp f DPPV,Asp f FDH,Aspf γ_肌动蛋白,Asp f葡糖苷酶,Asp f GPI,Asp f GST,Asp f GT,Asp f IAO,Asp fIPMI,Asp f LPL1,Asp f LPL3,Asp f甘露糖苷酶,Asp f MDH,Asp f PL,Asp f PUP,Asp fRPS3,Asp f SXR,Asp fl 13,Asp fl 13.0101,Asp fl 18,Asp fl 2,Asp fl 21,Asp fl3,Asp fl 4,Asp fl 7,Asp fl 8,Asp fl 9,Asp me Seaprose,Asp n 14,Asp n 14.0101,Asp n 18,Asp n 18.0101,Asp n 25,Asp n 25.0101,Asp n 30,Asp n葡糖淀粉酶,Asp n半纤维素酶,Asp n果胶酶,Asp o 13,Asp o 13.0101,Asp o 21,Asp o 21.0101,Asp o 3,Asp o 4,Asp o 7,Asp o 8,Asp o 乳糖酶,Asp o脂肪酶,Asp oc 13,Asp r 1,Asp sa AP,Asp sp葡糖淀粉酶,Asp sp葡糖氧化酶,Asp sp PL,Asp sp PME,Asp sy 13,Asp v 13,Aspv 13.0101,Asp v过氧化氢酶A,Asp v烯醇化酶,Asp v GAPDH,Asp v MDH,Asp v SXR),天门冬属物种(Asparagus spp)(Aspa o 1,Aspa o 1.01,Aspa o 1.02,Aspa o 17kD,Aspa o4),曲霉菌属物种(Aspe ni 2,Aspe ni 3,Aspe ni 4,Aspe ni 7,Aspe ni 8,Aspe ni 9),燕麦属物种(Avena spp)(Ave s 1,Ave s 12,Ave s 13,Ave s 2,Ave s 4,Ave s 5,Ave s7),Babylonia spp(Bab ja 1),芽孢杆菌属物种(Bacillus spp)(Bac al枯草杆菌蛋白酶,Bac cl枯草杆菌蛋白酶,Bac l枯草杆菌蛋白酶,Bac li aA,Bac li枯草杆菌蛋白酶),果实蝇属物种(Bactrocera spp)(Bac ol 27,Bac ol 27.0101),芽孢杆菌属物种(Bac sp aA1,Bac sp aA3,Bac sp脱羧酶,Bac st amyM,Bac su枯草杆菌蛋白酶,Bac t Cry1Ab,Bac tCry1Fa,Bac t Cry3Bb1,Bac t Cry9c),海鲿物种(Bagre spp)(Bag ma 1),鳞鲀物种(Balistes spp)(Bal ca 1),藤壶属物种(Balanus spp)(Bal r 1,Bal r 1.0101),白僵菌属物种(Beauveria spp)(Bea b Ald,Bea b Enol,Bea b f2,Bea b Hex),巴西坚果树物种(Bertholletia spp)(Ber e 1,Ber e 1.0101,Ber e 2,Ber e 2.0101),金眼鲷属物种(Beryx spp)(Ber sp 1),桦木属物种(Betula spp)(Bet ab 1,Bet al 1,Bet ch 1,Betco 1,Bet da 1,Bet gr 1,Bet hu 1,Bet le 1,Bet me 1,Bet n 1,Bet p 1,Bet pa 1,Bet po 1,Bet pu 1,Bet pu 2,Bet pu 4,Bet pu 6,Bet pu 7,Bet sc 1,Bet ut 1,Bet v1,Bet v 1 B1-B1-B1,Bet v 1 fv Mal 4x,Bet v 1.0101,Bet v 1.0102,Bet v 1.0103,Bet v 1.0201,Bet v 1.0301,Bet v 1.0401,Bet v 1.0402,Bet v 1.0501,Bet v1.0601,Bet v 1.0602,Bet v 1.0701,Bet v 1.0801,Bet v 1.0901,Bet v 1.1001,Bet v1.1101,Bet v 1.1201,Bet v 1.1301,Bet v 1.1401,Bet v 1.1402,Bet v 1.1501,Bet v1.1502,Bet v 1.1601,Bet v 1.1701,Bet v 1.1801,Bet v 1.1901,Bet v 1.2001,Bet v1.2101,Bet v 1.2201,Bet v 1.2301,Bet v 1.2401,Bet v 1.2501,Bet v 1.2601,Bet v1.2701,Bet v 1.2801,Bet v 1.2901,Bet v 1.3001,Bet v 1.3101,Bet v 2,Bet v2.0101,Bet v 3,Bet v 3.0101,Bet v 4,Bet v 4.0101,Bet v 6,Bet v 6.0101,Bet v6.0102,Bet v 7,Bet v 7.0101,Bet v 8,Bet v葡聚糖酶),Beta spp(Beta v 1,Beta v1.0101,Beta v 2,Beta v 2.0101),蜚蠊物种(Blattella spp)(Bla g 1,Bla g 1.0101,Bla g 1.0102,Bla g 1.0103,Bla g 1.0201,Bla g 1.0202,Bla g 2,Bla g 2.0101,Blag 2.0201,Bla g 36kD,Bla g 4,Bla g 4.0101,Bla g 4.0201,Bla g 5,Bla g 5.0101,Bla g 5.0201,Bla g 6,Bla g 6.0101,Bla g 6.0201,Bla g 6.0301,Bla g 7,Bla g7.0101,Bla g 8,Bla g 8.0101,Bla g 9,Bla g烯醇化酶,Bla g GSTD1,Bla g RACK1,Blag TPI,Bla g胰蛋白酶,Bla g卵黄生成素),蠊属物种(Blatta spp)(Bla o 1,Bla o 7),无爪螨属物种(Blomia spp)(Blo t 1,Blo t 1.0101,Blo t 1.0201,Blo t 10,Blo t10.0101,Blo t 10.0102,Blo t 11,Blo t 11.0101,Blo t 12,Blo t 12.0101,Blo t12.0102,Blo t 13,Blo t 13.0101,Blo t 14,Blo t 15,Blo t 18,Blo t 19,Blo t19.0101,Blo t 2,Blo t 2.0101,Blo t 2.0102,Blo t 2.0103,Blo t 20,Blo t 21,Blot 21.0101,Blo t 3,Blo t 3.0101,Blo t 4,Blo t 4.0101,Blo t 5,Blo t 5.0101,Blot 6,Blo t 6.0101,Blo t 7,Blo t 8,Blo t 9,Blo t HSP70),熊蜂属物种(Bombus spp)(Bom ar 4,Bom hy 4,Bom p 1,Bom p 1.0101,Bom p 2,Bom p 3,Bom p 4,Bom p 4.0101,Bom t 1,Bom t 1.0101,Bom t 4,Bom t 4.0101),蚕娥物种(Bombyx spp)(Bomb m 1,Bombm 1.0101,Bomb m 7,Bomb m 7.0101,Bomb m 7.0102,Bomb m 7.0103,Bomb m 7.0104,Bomb m 7.0105,Bomb m 7.0106),牛蜱属物种(Boophilus spp)(Boo m 1,Boo m 7,Boo m7.0101),牛属物种(Bos spp)(Bos d 2,Bos d 2.0101,Bos d 2.0102,Bos d 2.0103,Bosd 3,Bos d 3.0101,Bos d 4,Bos d 4.0101,Bos d 5,Bos d 5.0101,Bos d 5.0102,Bos d6,Bos d 6(MDA),Bos d 6.0101,Bos d 7,Bos d 7.0101,Bos d 8,Bos d 8 αS1,Bos d 8αS2,Bos d 8β,Bos d 8κ,Bos d α2I,Bos d α2I.0101,Bos d凝乳酶,Bos d纤维蛋白,Bosd明胶,Bos d HG,Bos d胰岛素,Bos d乳铁蛋白,Bos d乳过氧化物酶,Bos d肌红蛋白,Bosd OBP,Bos d OSCP,Bos d卵黄高磷蛋白,Bos d PLA2,Bos d PRVB,Bos d凝血酶,Bos dTI,Bos gr ALA,Bos gr肌红蛋白),洞蛇属物种(Bothrops spp)(Bot as 1,Bot at 1),格兰马草属物种(Bouteloua spp)(Bou g 1),Biting spp(Bov ov 1),乌鲂物种(Brama spp)(Bra du 1),芸苔属物种(Brassica spp)(Bra j 1,Bra j 1.0101,Bra n 1,Bra n1.0101,Bra n 4,Bra n 7,Bra n 8,Bra n PG,Bra ni 8,Bra o 3,Bra o 3.0101,Bra r1,Bra r 1.0101,Bra r 2,Bra r 2.0101,Bra r 3,Bra r 4,Bra r 7),雀麦属物种(Bromus spp)(Bro a 1,Bro a 4),单鳍鳕物种(Brosme spp)(Bro br 1),雀麦属物种(Broi 1,Bro i 5,Bro i 7),布鲁丝虫属物种(Brugia spp)(Bru m 3,Bru m 3.0101,Bru mBm33),印度水牛物种(Bubalus spp)(Bub b ALA,Bub b BLG,Bub b酪蛋白,Bub b酪蛋白αS1,Bub b酪蛋白αS2,Bub b酪蛋白β,Bub b酪蛋白κ),新杆状线虫物种(Caenorhabditisspp)(Cae b 3,Cae b 3.0101,Cae br 3,Cae br 3.0101,Cae e 3,Cae e 3.0101,Cae e3.0102,Cae re 13,Cae re 13.0101),木豆属物种(Cajanus spp)(Caj c 1),鱼虱属物种(Caligus spp)(Cal cl 1,Cal cl 1.0101,Cal cl 1.0102),省藤属物种(Calamus spp)(Cal le 1),蓝蟹杆状病毒物种(Callinectes spp)(Cal s 2),骆驼属物种(Camelus spp)(Cam d ALA,Cam d酪蛋白,Cam d酪蛋白αS1,Cam d酪蛋白αS2,Cam d酪蛋白β,Cam d酪蛋白κ),弓背蚁属物种(Camponotus spp)(Cam fl 7,Cam fl 7.0101),犬属物种(Canis spp)(Can f 1,Can f 1.0101,Can f 2,Can f 2.0101,Can f 3,Can f 3.0101,Can f 4,Can f4.0101,Can f 5,Can f 5.0101,Can f 6,Can f 6.0101,Can f Feld1-样,Can f Homs2-样,Can f卵黄高磷蛋白,Can f TCTP),疣鳞鲀物种(Canthidermis spp)(Can ma 1),癌症物种(Cancer spp)(Can mg 2,Can p 1),大麻属物种(Cannabis spp)(Can s 3),念珠菌属物种(Candida spp)(Cand a 1,Cand a 1.0101,Cand a 3,Cand a 3.0101,Cand a CAAP,Cand a CyP,Cand a烯醇化酶,Cand a FPA,Cand a MnSOD,Cand a PGK,Cand b 2,Cand b2.0101,Cand b FDH,Cand r脂肪酶),辣椒属物种(Capsicum spp)(Cap a 1,Cap a1.0101,Cap a 17kD,Cap a 2,Cap a 2.0101,Cap a 30kD,Cap a葡聚糖酶,Cap ch 17kD),麦杆虫属物种(Caprella spp)(Cap e 1),山羊属物种(Capra spp)(Cap h ALA,Cap hBLG,Cap h酪蛋白,Cap h酪蛋白αS1,Cap h酪蛋白αS2,Cap h酪蛋白β,Cap h酪蛋白κ,Cap hGSA),Capitulum spp(Cap m 1),鲫属物种(Carassius spp)(Car au 1),鹅耳枥属物种(Carpinus spp)(Car b 1,Car b 1.0101,Car b 1.0102,Car b 1.0103,Car b 1.0104,Car b 1.0105,Car b 1.0106,Car b 1.0107,Car b 1.0108,Car b 1.0109,Car b1.0110,Car b 1.0111,Car b 1.0112,Car b 1.0113,Car b 1.0201,Car b 1.0301,Car b1.0302,Car b 2,Car b 4),鲹鱼亚属物种(Caranx spp)(Car cr 1),山核桃物种(Caryaspp)(Car i 1,Car i 1.0101,Car i 2,Car i 4,Car i 4.0101),欧洲蟹杆状病毒物种(Carcinus spp)(Car ma 2),鱼尾椰属物种(Caryota spp)(Car mi 2),番木瓜属物种(Carica spp)(Car p 1,Car p壳多糖酶,Car p糜木瓜酶,Car p内蛋白酶),栗属物种(Castanea spp)(Cas c 24kD,Cas s 1,Cas s 1.0101,Cas s 1.0102,Cas s 1.0103,Cass 2,Cas s 5,Cas s 5.0101,Cas s 8,Cas s 8.0101,Cas s 9,Cas s 9.0101),长春花属物种(Catharanthus spp)(Cat r 1,Cat r 1.0101,Cat r 17kD,Cat r 2),柄方头鱼物种(Caulolatilus spp)(Cau ch 1),天竺鼠物种(Cavia spp)(Cav p 1,Cav p 1.0101,Cav p2,Cav p 2.0101,Cav p 3,Cav p 3.0101,Cav p明胶,Cav p GSA),锯旨鮨物种(Centropristis spp)(Cen s 1),斑点九棘鲈物种(Cephalopholis spp)(Cep so 1),蟳物种(Charybdis spp)(Cha f 1,Cha f 1.0101),大西洋白鲳物种(Chaetodipterus spp)(Cha fa 1),红桧物种(Chamaecyparis spp)(Cha o 1,Cha o 1.0101,Cha o 2,Cha o2.0101),藜属物种(Chenopodium spp)(Che a 1,Che a 1.0101,Che a 2,Che a 2.0101,Che a 3,Che a 3.0101),摇蚊属物种(Chironomus spp)(Chi k 1,Chi k 10,Chi k10.0101),毛丝鼠属物种(Chinchilla spp)(Chi l 21kD_a,Chi l 21kD_b),蟹物种(Chionoecetes spp)(Chi o 1,Chi o 1.0101,Chi o 2,Chi o 4,Chi o 6,Chi o α_肌动蛋白,Chi o SERCA),摇蚊属物种(Chironomus spp)(Chi t 1,Chi t 1.0101,Chi t1.0201,Chi t 2,Chi t 2.0101,Chi t 2.0102,Chi t 3,Chi t 3.0101,Chi t 4,Chi t4.0101,Chi t 5,Chi t 5.0101,Chi t 6,Chi t 6.0101,Chi t 6.0201,Chi t 7,Chi t7.0101,Chi t 8,Chi t 8.0101,Chi t 9,Chi t 9.0101),扇贝物种(Chlamys spp)(Chl n1),草雁属物种(Chloephaga spp)(Chl pi 1),Chortoglyphus spp(Cho a 10),Chrysomela spp(Chr tr 7,Chr tr 7.0101),鹰觜豆物种(Cicer spp)(Cic a 2S白蛋白,Cic a白蛋白),菊苣属物种(Cichorium spp)(Cic i 1),臭虫属物种(Cimex spp)(Cim lNitrophorin),柑桔物种(Citrus spp)(Cit l 1,Cit l 3,Cit l 3.0101),西瓜属物种(Citrullus spp)(Cit la 2,Cit la MDH,Cit la TPI),柑桔物种(Cit r 3,Cit r3.0101,Cit s 1,Cit s 1.0101,Cit s 2,Cit s 2.0101,Cit s 3,Cit s 3.0101,Cit s3.0102,Cit s IFR),分枝孢子菌属物种(Cladosporium spp)(Cla c 14,Cla c 14.0101,Cla c 9,Cla c 9.0101,Cla h 1,Cla h 10,Cla h 10.0101,Cla h 12,Cla h 12.010l,Cla h 2,Cla h 2.0101,Cla h 42kD,Cla h 5,Cla h 5.010l,Cla h 6,Cla h 6.0101,Clah 7,Cla h 7.0101,Cla h 8,Cla h 8 CSP,Cla h 8.0101,Cla h 9,Cla h 9.0101,Cla habH,Cla h GST,Cla h HCh1,Cla h HSP70,Cla h NTF2,Cla h TCTP),梭菌属物种(Clostridium spp)(Clo hi胶原酶,Clo t类毒素),鲱属物种(Clupea spp)(Clu h 1,Cluh 1.0101,Clu h 1.0201,Clu h 1.0301),椰子树物种(Cocos spp)(Coc n 2,Coc n 4,Cocn 5),球孢菌属物种(Coccidioides spp)(Coc po 8),咖啡豆物种(Coffea spp)(Cof a 1,Cof a 1.0101),鸽属物种(Columba spp)(Col l PSA),鬼伞属物种(Coprinus spp)(Cop c1,Cop c 1.0101,Cop c 2,Cop c 2.0101,Cop c 3,Cop c 3.0101,Cop c 4,Cop c 5,Copc 5.0101,Cop c 6,Cop c 7,Cop c 7.0101),榛属物种(Corylus spp)(Cor a 1,Cor a1.0101,Cor a 1.0102,Cor a 1.0103,Cor a 1.0104,Cor a 1.0201,Cor a 1.0301,Cor a1.0401,Cor a 1.0402,Cor a 1.0403,Cor a 1.0404,Cor a 10,Cor a 10.0101,Cor a11,Cor a 11.0101,Cor a 12,Cor a 12.0101,Cor a 13,Cor a 13.0101,Cor a 14,Cor a14.0101,Cor a 2,Cor a 2.0101,Cor a 2.0102,Cor a 8,Cor a 8.0101,Cor a 9,Cor a9.0101),棒杆菌属物种(Corynebacterium spp)(Cor d类毒素),榛属物种(Cor he 1),其鲯物种(Coryphaena spp)(Cor hi 1),芫荽物种(Coriandrum spp)(Cor s 1,Cor s 11kD,Cor s 2),栒子属物种(Cotoneaster spp)(Cot l 3),褐虾物种(Crangon spp)(Cra c 1,Cra c 1.0101,Cra c 2,Cra c 2.0101,Cra c 4,Cra c 4.0101,Cra c 5,Cra c 5.0101,Cra c 6,Cra c 6.0101,Cra c 8,Cra c 8.0101),巨牡蛎属物种(Crassostrea spp)(Crag 1),原仓鼠属物种(Cricetus spp)(Cri c HSA),Crivellia spp(Cri pa 1),番红花物种(Crocus spp)(Cro s 1,Cro s 1.0101,Cro s 2,Cro s 2.0101,Cro s 3,Cro s 3.01,Cros 3.02),柳杉属物种(Cryptomeria spp)(Cry j 1,Cry j 1.0101,Cry j 1.0102,Cry j1.0103,Cry j 2,Cry j 2.0101,Cry j 2.0102,Cry j 3,Cry j 3.1,Cry j 3.2,Cry j3.3,Cry j 3.4,Cry j 3.5,Cry j 3.6,Cry j 3.7,Cry j 3.8,Cry j 4,Cry j AP,Cry j壳多糖酶,Cry j CPA9,Cry j IFR,Cry j LTP,Cry j P1-P2),隐丛壳属物种(Cryphonectria spp)(Cry p AP),栉头蚤属物种(Ctenocephalides spp)(Cte f 1,Cte f1.0101,Cte f 2,Cte f 2.0101,Cte f 3,Cte f 3.0101),Ctenopharyngodon spp(Cte id1),香瓜属物种(Cucumis spp)(Cuc m 1,Cuc m 1.0101,Cuc m 2,Cuc m 2.0101,Cuc m 3,Cuc m 3.0101,Cuc m Lec17,Cuc m MDH),南瓜属物种(Cucurbita spp)(Cuc ma 18kD,Cucma 2,Cuc p 2,Cuc p AscO),香瓜属物种(Cuc s 2),库蠓属物种(Culicoides spp)(Cul n1,Cul n 10,Cul n 11,Cul n 2,Cul n 3,Cul n 4,Cul n 5,Cul n 6,Cul n 7,Cul n 8,Cul n 9,Cul n HSP70),库蚊属物种(Culex spp)(Cul q 28kD,Cul q 35kD,Cul q 7,Culq 7.0101,Cul q 7.0102),库蠓属物种(Cul so 1),孜然芹物种(Cuminum spp)(Cum c 1,Cum c 2),柏属物种(Cupressus spp)(Cup a 1,Cup a 1.0101,Cup a 1.02,Cup a 2,Cupa 3,Cup a 4,Cup a 4.0101,Cup s 1,Cup s 1.0101,Cup s 1.0102,Cup s 1.0103,Cup s1.0104,Cup s 1.0105,Cup s 3,Cup s 3.0101,Cup s 3.0102,Cup s 3.0103,Cup s 8),旋孢腔菌物种(Cochliobolus spp)(Cur l 1,Cur l 1.0101,Cur 1 2,Cur l 2.0101,Curl 3,Cur l 3.0101,Cur l 4,Cur l 4.0101,Cur l ADH,Cur l GST,Cur l MnSOD,Cur lOryzin,Cur l Trx,Cur l ZPS1),蓝翅雁属物种(Cyanochen spp)(Cya cy 1),犬牙石首鱼属物种(Cynoscion spp)(Cyn ar 1),洋狗尾草属物种(Cynosurus spp)(Cyn cr 1,Cyn cr5),狗牙根属物种(Cynodon spp)(Cyn d 1,Cyn d 1.0101,Cyn d 1.0102,Cyn d 1.0103,Cyn d 1.0104,Cyn d 1.0105,Cyn d 1.0106,Cyn d 1.0107,Cyn d 1.0201,Cyn d1.0202,Cyn d 1.0203,Cyn d 1.0204,Cyn d 10,Cyn d 11,Cyn d 12,Cyn d 12.0101,Cynd 13,Cyn d 15,Cyn d 15.0101,Cyn d 2,Cyn d 22,Cyn d 22.0101,Cyn d 23,Cyn d23.0101,Cyn d 24,Cyn d 24.0101,Cyn d 4,Cyn d 5,Cyn d 6,Cyn d 7,Cyn d 7.0101),犬牙石首鱼属物种(Cyn ne 1),草原犬属物种(Cynomys spp)(Cyn sp脂质运载蛋白),鲤物种(Cyprinus spp)(Cyp c 1,Cyp c 1.01,Cyp c 1.02),大蒲蛇属物种(Daboia spp)(Dabru 1),鸭茅属物种(Dactylis spp)(Dac g 1,Dac g 1.01,Dac g 1.0101,Dac g 1.02,Dacg 12,Dac g 13,Dac g 2,Dac g 2.0101,Dac g 3,Dac g 3.0101,Dac g 4,Dac g 4.0101,Dac g 5,Dac g 5.0101,Dac g 7),Dama spp(Dam d CSA),鮐物种(Danio spp)(Dan re 1,Dan re 2,Dan re α2I,Dan re CK),魟物种(Dasyatis spp)(Das ak 1,Das am 1,Das sa1),胡萝卜属物种(Daucus spp)(Dau c 1,Dau c 1.0101,Dau c 1.0102,Dau c 1.0103,Dau c 1.0104,Dau c 1.0105,Dau c 1.0201,Dau c 1.0301,Dau c 3,Dau c 4,Dau c4.0101,Dau c CyP),圆森物种(Decapterus spp)(Dec ru 1),Dendronephthya spp(Den n1,Den n 1.0101),Dermatophagoides spp(Der f 1,Der f 1.0101,Der f 1.0102,Der f1.0103,Der f 1.0104,Der f 1.0105,Der f 1.0106,Der f 1.0107,Der f 1.0108,Der f1.0109,Der f 1.0110,Der f 10,Der f 10.0101,Der f 10.0102,Der f 11,Der f11.0101,Der f 13,Der f 13.0101,Der f 14,Der f 14.0101,Der f 15,Der f 15.0101,Der f 16,Der f 16.0101,Der f 17,Der f 17.0101,Der f 18,Der f 18.0101,Der f 2,Der f 2.0101,Der f 2.0102,Der f 2.0103,Der f 2.0104,Der f 2.0105,Der f2.0106,Der f 2.0107,Der f 2.0108,Der f 2.0109,Der f 2.0110,Der f 2.0111,Der f2.0112,Der f 2.0113,Der f 2.0114,Der f 2.0115,Der f 2.0116,Der f 2.0117,Der f20,Der f 21,Der f 22,Der f 22.0101,Der f 3,Der f 3.0101,Der f 4,Der f 5,Der f6,Der f 6.0101,Der f 7,Der f 7.0101,Der f 8,Der f 9,Der f HSP70),皮刺螨属物种(Dermanyssus spp)(Der g 10,Der g 10.0101),Dermatophagoides spp(Der m 1,Der m1.0101,Der p 1,Der p 1.0101,Der p 1.0102,Der p 1.0103,Der p 1.0104,Der p1.0105,Der p 1.0106,Der p 1.0107,Der p 1.0108,Der p 1.0109,Der p 1.0110,Der p1.0111,Der p 1.0112,Der p 1.0113,Der p 1.0114,Der p 1.0115,Der p 1.0116,Der p1.0117,Der p 1.0118,Der p 1.0119,Der p 1.0120,Der p 1.0121,Der p 1.0122,Der p1.0123,Der p 1.0124,Der p 10,Der p 10.0101,Der p 10.0102,Der p 10.0103,Der p11,Der p 11.0101,Der p 13,Der p 14,Der p 14.0101,Der p 15,Der p 18,Der p 2,Der p 2.0101,Der p 2.0102,Der p 2.0103,Der p 2.0104,Der p 2.0105,Der p2.0106,Der p 2.0107,Der p 2.0108,Der p 2.0109,Der p 2.0110,Der p 2.0111,Der p2.0112,Der p 2.0113,Der p 2.0114,Der p 2.0115,Der p 20,Der p 20.0101,Der p21,Der p 21.0101,Der p 23,Der p 23.0101,Der p 3,Der p 3.0101,Der p 4,Der p4.0101,Der p 5,Der p 5.0101,Der p 5.0102,Der p 6,Der p 6.0101,Der p 7,Der p7.0101,Der p 8,Der p 8.0101,Der p 9,Der p 9.0101,Der p 9.0102,Der p P1-P2,Derp P2-P1,Der s 1,Der s 2,Der s 3),石竹物种(Dianthus spp)(Dia c RIP),芒萁属物种(Dicranopteris spp)(Dic l 2S白蛋白),柿属物种(Diospyros spp)(Dio k 17kD,Dio k4,Dio k IFR),薯蓣属物种(Dioscorea spp)(Dio p TSP),重牙鲷物种(Diplodus spp)(Dip ho 1),盐草属物种(Distichlis spp)(Dis s 1,Dis s 7),海鲫鱼物种(Ditremaspp)(Dit te 1),长黄胡蜂属物种(Dolichovespula spp)(Dol a 1,Dol a 2,Dol a 5,Dola 5.0101),扁豆属物种(Dolichos spp)(Dol b凝集素),长黄胡蜂属物种(Dol m 1,Dol m1.0101,Dol m 1.02,Dol m 2,Dol m 2.0101,Dol m 5,Dol m 5.0101,Dol m 5.02),果蝇属物种(Drosophila spp)(Dro an 7,Dro an 7.0101,Dro er 7,Dro er 7.0101,Dro er7.0102,Dro gr 7,Dro gr 7.0101,Dro gr 7.0102,Dro m 7,Dro m 7.0101,Dro m7.0102,Dro m 7.0103,Dro m 7.0104,Dro m 7.0105,Dro m 7.0106,Dro m 7.0107,Dro m7.0108,Dro m 7.0109,Dro m 7.0110,Dro m 7.0111,Dro m 7.0112,Dro m 7.0113,Dro m9,Dro m MnSOD,Dro mo 7,Dro mo 7.0101,Dro pp 7,Dro pp 7.0101,Dro se 7,Dro se7.0101,Dro si 7,Dro si 7.0101,Dro si 7.0102,Dro vi 7,Dro vi 7.0101,Dro wi 7,Dro wi 7.0101,Dro y 7,Dro y 7.0101,Dro y 7.0102,Dro y 7.0103),蓝蓟属物种(Echium spp)(Ech p细胞色素C),棕榈物种(Elaeis spp)(Ela g 2,Ela g Bd31kD),Elopsspp(Elo sa 1),埃里格孢属物种(Embellisia spp)(Emb a 1,Emb i 1,Emb nz 1,Emb t1),鳀物种(Engraulis spp)(Eng e 1),Enteroctopus spp(Ent d 1),石斑鱼属物种(Epinephelus spp)(Epi bl 1,Epi co 1,Epi fl 1,Epi mc 1,Epi mo 1),附球菌属物种(Epicoccum spp)(Epi p 1,Epi p 1.0101,Epi p 12kD,Epi p GST),石斑鱼属物种(Epipo 1,Epi un 1),木贼属物种(Equisetum spp)(Equ a 17kD),马属物种(Equus spp)(Equas 4,Equ as DSA,Equ bu 4,Equ c 1,Equ c 1.0101,Equ c 2,Equ c 2.0101,Equ c2.0102,Equ c 3,Equ c 3.0101,Equ c 4,Equ c 4.0101,Equ c 5,Equ c 5.0101,Equ cALA,Equ c BLG,Equ c酪蛋白,Equ c酪蛋白β,Equ c酪蛋白κ,Equ c PRVB,Equ he 4,Equ zZSA),Erimacrus spp(Eri i 1,Eri i 1.0101,Eri i 1.0102),方蟹物种(Eriocheir spp)(Eri s 1,Eri s 1.0101,Eri s 2),欧文氏菌属物种(Erwinia spp)(Erw ch门冬酰胺酶),埃希氏菌属物种(Escherichia spp)(Esc c门冬酰胺酶,Esc c βGAL),狗鱼属物种(Esoxspp)(Eso l 1),鳞虾物种(Euphausia spp)(Eup p 1,Eup p 1.0101),磷虾物种(Euphasiaspp)(Eup s 1,Eup s 1.0101),嗜霉螨属物种(Euroglyphus spp)(Eur m 1,Eur m1.0101,Eur m 1.0102,Eur m 1.0103,Eur m 10,Eur m 14,Eur m 14.0101,Eur m 2,Eurm 2.0101,Eur m 2.0102,Eur m 3,Eur m 3.0101,Eur m 4,Eur m 4.0101),长棘鲷物种(Evynnis spp)(Evy j 1),荞麦属物种(Fagopyrum spp)(Fag e 1,Fag e 1.0101,Fag e10kD,Fag e 19kD,Fag e 2,Fag e 2.0101,Fag e TI),山毛榉属物种(Fagus spp)(Fag s1,Fag s 1.0101,Fag s 2,Fag s 4),荞麦属物种(Fag t 1,Fag t 10kD,Fag t 2,Fag t2.0101),猫属物种(Felis spp)(Fel d 1,Fel d 1.0101,Fel d 2,Fel d 2.0101,Fel d3,Fel d 3.0101,Fel d 4,Fel d 4.0101,Fel d 5,Fel d 5.0101,Fel d 6,Fel d6.0101,Fel d 7,Fel d 7.0101,Fel d 8,Fel d 8.0101,Fel d IgG),明对虾物种(Fenneropenaeus spp)(Fen c 1,Fen c 2,Fen me 1,Fen me 1.0101),羊茅属物种(Festuca spp)(Fes e 1,Fes e 13,Fes e 4,Fes e 5,Fes e 7,Fes p 1,Fes p 13,Fes p4,Fes p 4.0101,Fes p 5,Fes r 1,Fes r 5),榕属物种(Ficus spp)(Fic c 17kD,Fic c4,Fic c无花果酶),茴香属物种(Foeniculum spp)(Foe v 1,Foe v 2),连翘属物种(Forsythia spp)(For s 1),铗蠓属物种(Forcipomyia spp)(For t 1,For t 1.0101,Fort 2,For t 2.0101,For t 7,For t FPA,For t肌球蛋白,For t TPI),草莓属物种(Fragaria spp)(Fra a 1,Fra a 1.0101,Fra a 3,Fra a 3.0101,Fra a 3.0102,Fra a3.0201,Fra a 3.0202,Fra a 3.0203,Fra a 3.0204,Fra a 3.0301,Fra a 4,Fra a4.0101,Fra c 1),梣属物种(Fraxinus spp)(Fra e 1,Fra e 1.0101,Fra e 1.0102,Frae 1.0201,Fra e 12,Fra e 2,Fra e 3,Fra e 9),草莓属物种(Fra v 1),镰刀菌属物种(Fusarium spp)(Fus c 1,Fus c 1.0101,Fus c 2,Fus c 2.0101,Fus c 3,Fus s 1,Fuss 45kD,Fus sp Lipase),鳕属物种(Gadus spp)(Gad c 1,Gad c 1.0101,Gad c APDH,Gadm 1,Gad m 1.0101,Gad m 1.0102,Gad m 1.0201,Gad m 1.0202,Gad m 45kD,Gad m明胶,Gad ma 1),鸡形目物种(Gallus spp)(Gal d 1,Gal d 1.0101,Gal d 2,Gal d 2.0101,Gal d 3,Gal d 3.0101,Gal d 4,Gal d 4.0101,Gal d 5,Gal d 5.0101,Gal d 6,Gal d6.0101,Gal d Apo I,Gal d Apo VI,Gal d GPI,Gal d HG,Gal d IgY,Gal d L-PGDS,Gald卵粘蛋白,Gal d卵黄高磷蛋白,Gal d PRVB,Gal la 4),Galleria spp(Gal m 18kD,Galm 24kD),Gallus spp(Gal so 4),Gammarus spp(Gam s TM),白树属物种(Gelonium spp)(Gel m RIP),Geothelphusa spp(Geo de 1),舌蝇属物种(Glossina spp)(Glo m 5,Glo m5.0101,Glo m 7,Glo m 7.0101,Glo m 7.0102,Glo m 7.0103),甘氨酸物种(Glycinespp)(Gly a Bd30K,Gly ar Bd30K,Gly ca Bd30K,Gly cl Bd30K,Gly cu Bd30K,Gly cyBd30K),食甜螨属物种(Glycyphagus spp)(Gly d 10,Gly d 10.0101,Gly d 13,Gly d 2,Gly d 2.0101,Gly d 2.0201,Gly d 2.03,Gly d 2/Lep d 2 L1,Gly d 2/Lep d 2 L2,Gly d 2/Lep d 2 L3,Gly d 2/Lep d 2 L4,Gly d 2/Lep d 2 R1,Gly d 2/Lep d 2R2,Gly d 2/Lep d 2 R3,Gly d 2/Lep d 2 R4,Gly d 2/Lep d 2 R5,Gly d 20,Gly d 3,Glyd 5,Gly d 5.01,Gly d 5.02,Gly d 7,Gly d 8),甘氨酸物种(Gly f Bd30K,Gly lBd30K,Gly m 1,Gly m 1.0101,Gly m 1.0102,Gly m 2,Gly m 2.0101,Gly m 2S白蛋白,Gly m 3,Gly m 3.0101,Gly m 3.0102,Gly m 39kD,Gly m 4,Gly m 4.0101,Gly m 5,Glym 5.0101,Gly m 5.0201,Gly m 5.0301,Gly m 5.0302,Gly m 50kD,Gly m 6,Gly m6.0101,Gly m 6.0201,Gly m 6.0301,Gly m 6.0401,Gly m 6.0501,Gly m 68kD,Gly m凝集素,Gly m Bd28K,Gly m Bd30K,Gly m Bd60K,Gly m CPI,Gly m EAP,Gly m TI,Gly miBd30K,Gly s Bd30K,Gly t Bd30K,Gly to Bd30K),棉属物种(Gossypium spp)(Gos h豌豆球蛋白),嗜血菌属物种(Haemophilus spp)(Hae in P6),血蜱属物种(Haemaphysalisspp)(Hae l 7,Hae l 7.0101,Hae q 7,Hae q 7.0101),鲍属物种(Haliotis spp)(Hal a1,Hal d 1,Hal di 1,Hal di PM,Hal m 1,Hal m 1.0101,Hal r 1,Hal r 49kD,Hal ru1),瓢虫物种(Harmonia spp)(Har a 1,Har a 1.0101,Har a 2,Har a 2.0101),掠猛蚁属物种(Harpegnathos spp)(Har sa 7,Har sa 7.0101,Har sa 7.0102),向日葵属物种(Helianthus spp)(Hel a 1,Hel a 1.0101,Hel a 2,Hel a 2.0101,Hel a 2S白蛋白,Hela 3,Hel a 3.0101,Hel a 4),Helix spp(Hel ap 1,Hel as 1,Hel as 1.0101),螺旋线虫物种(Heligmosomoides spp)(Hel p 3,Hel p 3.0101),向日葵属物种(Hel tu 1),血鮨物种(Hemanthias spp)(Hem le 1),香螺科物种(Hemifusus spp)(Hem t 1),异皮线虫属物种(Heterodera spp)(Het g 3,Het g 3.0101),橡胶树属物种(Hevea spp)(Hev b 1,Hevb 1.0101,Hev b 10,Hev b 10.0101,Hev b 10.0102,Hev b 10.0103,Hev b 11,Hev b11.0101,Hev b 11.0102,Hev b 12,Hev b 12.0101,Hev b 13,Hev b 13.0101,Hev b 14,Hev b 14.0101,Hev b 2,Hev b 2.0101,Hev b 3,Hev b 3.0101,Hev b 4,Hev b 4.0101,Hev b 5,Hev b 5.0101,Hev b 6,Hev b 6.01,Hev b 6.02,Hev b 6.0202,Hev b 6.03,Hev b 7,Hev b 7.01,Hev b 7.02,Hev b 7.D2,Hev b 7.S2,Hev b 8,Hev b 8.0101,Hevb 8.0102,Hev b 8.0201,Hev b 8.0202,Hev b 8.0203,Hev b 8.0204,Hev b 9,Hev b9.0101,Hev b柠檬酸结合蛋白,Hev b GAPDH,Hev b HSP80,Hev b IFR,Hev b蛋白酶体亚基,Hev b旋转异构酶(Rotamase),Hev b SPI,Hev b Trx,Hev b UDPGP),六线鱼物种(Hexagrammos spp)(Hex ot 1),庸鲽物种(Hippoglossus spp)(Hip h 1),拟庸鲽物种(Hippoglossoides spp)(Hip pl 1),庸鲽物种(Hip st 1),水蛭物种(Hirudo spp)(Hirme水蛭素),绒毛草属物种(Holcus spp)(Hol l 1,Hol l 1.0101,Hol l 1.0102,Hol l 2,Hol l 4,Hol l 5,Hol l 5.0101,Hol l 5.0201),Holocnemus spp(Hol pl 9,Hol pl血蓝蛋白),螯龙虾物种(Homarus spp)(Hom a 1,Hom a 1.0101,Hom a 1.0102,Hom a 1.0103,Hom a 3,Hom a 3.0101,Hom a 4,Hom a 6,Hom a 6.0101,Hom g 1,Hom g 2),智人物种(Homo spp)(Hom s 1,Hom s 1.0101,Hom s 2,Hom s 2.0101,Hom s 3,Hom s 3.0101,Homs 4,Hom s 4.0101,Hom s 5,Hom s 5.0101,Hom s AAT,Hom s ACTH,Hom s阿达木单抗(Adalimumab),Hom s ALA,Hom s α_肌动蛋白,Hom s α-半乳糖苷酶,Hom s APDH,Hom s芳基硫酸酯酶B,Hom s酪蛋白,Hom s CyP A,Hom s CyP B,Hom s CyP C,Hom s DSF70,Hom sDSG3,Hom s eIF6,Hom s依那西普(Etanercept),Hom s Factor IX,Hom s因子VII,Hom s因子VIII,Hom s G-CSF,Hom s葡糖脑苷脂酶,Hom s葡萄糖苷酶,Hom s HLA-DR-α,Hom sHSA,Hom s艾杜糖醛酸酶,Hom s艾杜硫酸酯酶(Idursulfase),Hom s IgA,Hom s胰岛素,Hom s乳铁蛋白,Hom s层粘连蛋白γ_2,Hom s MnSOD,Hom s缩宫素,Hom s P2,Hom s卵黄高磷蛋白,Hom s抑制蛋白(Profilin),Hom s PSA,Hom s RP1,Hom s TCTP,Hom s TL,Homs TPA,Hom s TPO,Hom s转醛醇酶,Hom s Trx,Hom s微管蛋白-α,Hom s/Mus m巴利昔单抗(Basiliximab),Hom s/Mus m西妥昔单抗(Cetuximab),Hom s/Mus m Cetuximab(Gal-Gal),Hom s/Mus m英利昔单抗(Infliximab),Hom s/Mus m那他珠单抗(Natalizumab),Homs/Mus m奥马珠单抗(Omalizumab),Hom s/Mus m帕利珠单抗(Palivizumab),Hom s/Mus m利妥昔单抗(Rituximab),Hom s/Mus m托珠单抗(Tocilizumab),Hom s/Mus m曲妥珠单抗(Trastuzumab)),Hoplostethus spp(Hop a 1),大麦属物种(Hordeum spp)(Hor v 1,Horv 12,Hor v 12.0101,Hor v 13,Hor v 14,Hor v 15,Hor v 15.0101,Hor v 16,Hor v16.0101,Hor v 17,Hor v 17.0101,Hor v 18kD,Hor v 2,Hor v 21,Hor v 21.0101,Horv 28,Hor v 33,Hor v 4,Hor v 5,Hor v 5.0101,Hor v BDAI,Hor v BTI),腐质霉属物种(Humicola spp)(Hum in纤维素酶),律草属物种(Humulus spp)(Hum j 1,Hum j 1.0101,Hum j 10kD,Hum j 2),鳇属物种(Huso spp)(Hus h 1),Hylocereus spp(Hyl un LTP),膜头鳕属物种(Hymenocephalus spp)(Hym st 1),黑栉鲳物种(Hyperoglyphe spp)(Hyp by1),鲢属物种(Hypophthalmichthys spp)(Hyp mo 1),鲢属物种(Hyp no 1),鮰属物种(Ictalurus spp)(Ict fu 1,Ict p 1),Imperata spp(Imp c 4,Imp c 5,Imp c VIIIe1),硬蜱属物种(Ixodes spp)(Ixo r 2,Ixo sc 7,Ixo sc 7.0101),Jasus spp(Jas la 1,Jasla 1.0101,Jas la 1.0102),胡桃物种(Juglans spp)(Jug ca 1,Jug ca 2,Jug ci 1,Jugci 2,Jug n 1,Jug n 1.0101,Jug n 2,Jug n 2.0101,Jug r 1,Jug r 1.0101,Jug r 2,Jug r 2.0101,Jug r 3,Jug r 3.0101,Jug r 4,Jug r 4.0101,Jug r 5),刺柏属物种(Juniperus spp)(Jun a 1,Jun a 1.0101,Jun a 1.0102,Jun a 2,Jun a 2.0101,Jun a3,Jun a 3.0101,Jun c 1,Jun o 1,Jun o 4,Jun o 4.0101,Jun r 3,Jun r 3.1,Jun r3.2,Jun v 1,Jun v 1.0101,Jun v 1.0102,Jun v 3,Jun v 3.0101,Jun v 3.0102,Jun v4),鲣属物种(Katsuwonus spp)(Kat p 1),鮀物种(Kyphosus spp)(Kyp se 1),Lachnolaimus spp(Lac ma 1),饭匙倩属物种(Lachesis spp)(Lac mu 1),莴苣属物种(Lactuca spp)(Lac s 1,Lac s 1.0101),兔头鲀物种(Lagocephalus spp)(Lag la 1),鸥属物种(Larus spp)(Lar a 1,Lar a 2,Lar a 3),黄鱼属物种(Larimichthys spp)(Larpo 1),Lates spp(Lat c 1),鲈属物种(Lateolabrax spp)(Lat ja 1),山黧豆属物种(Lathyrus spp)(Lat oc凝集素),石首鱼物种(Leiostomus spp)(Lei xa 1),Lens spp(Len c 1,Len c 1.0101,Len c 1.0102,Len c 1.0103,Len c 2,Len c 2.0101,Len c 3,Len c 3.0101,Len c Agglutinin),Leopardus spp(Leo p 1),Lepidoglyphus spp(Lep d10,Lep d 10.0101,Lep d 12,Lep d 13,Lep d 13.0101,Lep d 2,Lep d 2.0101,Lep d2.0102,Lep d 2.0201,Lep d 2.0202,Lep d 3,Lep d 39kD,Lep d 5,Lep d 5.0101,Lepd 5.0102,Lep d 5.0103,Lep d 7,Lep d 7.0101,Lep d 8,Lep dα微管蛋白),太阳鱼物种(Lepomis spp)(Lep gi 1),Leptomelanosoma spp(Lep i 1),太阳鱼物种(Lep ma 1),衣鱼物种(Lepisma spp)(Lep s 1,Lep s 1.0101,Lep s 1.0102),疮痂鱼虱属物种(Lepeophtheirus spp)(Lep sa 1,Lep sa 1.0101,Lep sa 1.0102,Lep sa 1.0103),薮猫属物种(Leptailurus spp)(Lep se 1),雅鲆属物种(Lepidorhombus spp)(Lep w 1,Lep w1.0101),Lethocerus spp(Let in 7,Let in 7.0101,Let in 7.0102),雅罗鱼物种(Leuciscus spp)(Leu ce 1),Lewia spp(Lew in 1),女贞属物种(Ligustrum spp)(Lig v1,Lig v 1.0101,Lig v 1.0102,Lig v 2),百合属物种(Lilium spp)(Lil l 2,Lil lPG),刺泥鲽物种(Limanda spp)(Lim fe 1),Limnonectes spp(Lim m 1),鲎属物种(Limulus spp)(Lim p 1,Lim p 1.0101,Lim p 2,Lim p LPA),书虱属物种(Liposcelisspp)(Lip b 1,Lip b 1.0101),荔枝树物种(Litchi spp)(Lit c 1,Lit c 1.0101,Lit cIFR,Lit c TPI),Lithobates spp(Lit ca 1),白虾物种(Litopenaeus spp)(Lit se 1,Lit v 1,Lit v 1.0101,Lit v 2,Lit v 2.0101,Lit v 3,Lit v 3.0101,Lit v 4,Lit v4.0101),Filiaria spp(Loa lo 3,Loa lo 3.0101),松鲷物种(Lobotes spp)(Lob su 1),Locusta spp(Loc m 7,Loc m 7.0101),枪乌贼属物种(Loligo spp)(Lol b 1,Lol e 1),黑麦草属物种(Lolium spp)(Lol m 2,Lol m 5,Lol p 1,Lol p 1.0101,Lol p 1.0102,Lol p 1.0103,Lol p 10,Lol p 11,Lol p 11.0101,Lol p 12,Lol p 13,Lol p 2,Lol p2.0101,Lol p 3,Lol p 3.0101,Lol p 4,Lol p 4.0101,Lol p 5,Lol p 5.0101,Lol p5.0102,Lol p 7,Lol p CyP,Lol p FT,Lol p豆球蛋白),Lonomia spp(Lon o 7,Lon o7.0101),秋沙鸭物种(Lophodytes spp)(Lop cu 1),Lophonetta spp(Lop sp 1),羽扇豆属物种(Lupinus spp)(Lup a 1,Lup a α_蓝豆蛋白,Lup a δ_蓝豆蛋白,Lup a γ_蓝豆蛋白,Lup an 1,Lup an 1.0101,Lup an α_蓝豆蛋白,Lup anδ_蓝豆蛋白,Lup anγ_蓝豆蛋白,Lup l 17kD),笛鲷物种(Lutjanus spp)(Lut a 1,Lut c 1,Lut cy 1,Lut gr 1,Lutgu 1,Lut jo 1),獭蛤属物种(Lutraria spp)(Lut p 1),笛鲷物种(Lut pu 1,Lut sy 1),番茄属物种(Lycopersicon spp)(Lyc e 1,Lyc e 1.0101,Lyc e 11S球蛋白,Lyc e 2,Lyce 2.0101,Lyc e 2.0102,Lyc e 3,Lyc e 3.0101,Lyc e 4,Lyc e 4.0101,Lyc e ARP60S,Lyc e壳多糖酶,Lyc e葡聚糖酶,Lyc e过氧化物酶,Lyc e PG,Lyc e PME,Lyc e PR23,Lyce豌豆球蛋白),绵粉蚧属物种(Maconellicoccus spp)(Mac h 7,Mac h 7.0101),鳕物种(Macruronus spp)(Mac ma 1,Mac n 1),桑橙属物种(Maclura spp)(Mac po 17kD),沼虾物种(Macrobrachium spp)(Mac ro 1,Mac ro 1.0101,Mac ro 血蓝蛋白),大袋鼠属物种(Macropus spp)(Macr s明胶),苹果属物种(Malus spp)(Mal d 1,Mal d 1.0101,Mal d1.0102,Mal d 1.0103,Mal d 1.0104,Mal d 1.0105,Mal d 1.0106,Mal d 1.0107,Mal d1.0108,Mal d 1.0109,Mal d 1.0201,Mal d 1.0202,Mal d 1.0203,Mal d 1.0204,Mal d1.0205,Mal d 1.0206,Mal d 1.0207,Mal d 1.0208,Mal d 1.0301,Mal d 1.0302,Mal d1.0303,Mal d 1.0304,Mal d 1.0401,Mal d 1.0402,Mal d 1.0403,Mal d 2,Mal d2.0101,Mal d 3,Mal d 3.0101,Mal d 3.0102,Mal d 3.0201,Mal d 3.0202,Mal d3.0203,Mal d 4,Mal d 4.0101,Mal d 4.0102,Mal d 4.0201,Mal d 4.0202,Mal d4.0301,Mal d 4.0302),Malpighia spp(Mal g 4,Mal g橡胶素),苹果属物种(Mal p 1),马拉色霉菌属物种(Malassezia spp)(Mala f 2,Mala f 2.0101,Mala f 3,Mala f3.0101,Mala f 4,Mala f 4.0101,Mala g 10,Mala s 1,Mala s 1.0101,Mala s 10,Malas 10.0101,Mala s 11,Mala s 11.0101,Mala s 12,Mala s 12.0101,Mala s 13,Mala s13.0101,Mala s 5,Mala s 5.0101,Mala s 6,Mala s 6.0101,Mala s 7,Mala s 7.0101,Mala s 8,Mala s 8.0101,Mala s 9,Mala s 9.0101),木薯物种(Manihot spp)(Man e 5,Man e 5.0101,Man e FPA,Man e GAPDH),芒果属物种(Mangifera spp)(Man i 1,Man i14kD,Man i 2,Man i 3,Man i 3.01,Man i 3.02,Man i壳多糖酶),沼虾物种(Marsupenaeus spp)(Mar j 1,Mar j 1.0101,Mar j 2,Mar j 4),母菊属物种(Matricaria spp)(Mat c 17kD),纺织娘物种(Mecopoda spp)(Mec e 7),鲂属物种(Megalobrama spp)(Meg am 2,Meg am CK),Megathura spp(Meg c血蓝蛋白),大海鲢属物种(Megalops spp)(Meg sp 1),黑线鳕物种(Melanogrammus spp)(Mel a 1),吐绶鸡物种(Meleagris spp)(Mel g 1,Mel g 2,Mel g 3,Mel g PRVB,Mel g TSA),宽沟对虾物种(Melicertus spp)(Mel l 1),无鳔石首鱼物种(Menticirrhus spp)(Men am 1),山靛属物种(Mercurialis spp)(Mer a 1,Mer a 1.0101),无须鳕物种(Merluccius spp)(Mer ap1,Mer au 1,Mer bi 1,Mer ca 1,Mer ga 1,Mer hu 1),牙鳕属物种(Merlangius spp)(Mer me 1),无须鳕物种(Mer mr 1,Mer pa 1,Mer po 1,Mer pr 1,Mer se 1),沙鼠属物种(Meriones spp)(Mer un 23kD),黑僵菌物种(Metarhizium spp)(Met a 30),Metapenaeopsis spp(Met ba 1),新对虾物种(Metapenaeus spp)(Met e 1,Met e1.0101,Met e 2),水杉物种(Metasequoia spp)(Met gl 2),新对虾物种(Metapenaeusspp)(Met j 1,Met j 2),新海螯虾属物种(Metanephrops spp)(Met ja 1),Metapenaeopsis spp(Met la 1),新海螯虾属物种(Metanephrops spp)(Met t 2),蓝鳕属物种(Micromesistius spp)(Mic po 1),Micropogonias spp(Mic un 1),类栉孔扇贝属物种(Mimachlamys spp)(Mim n 1),苦瓜属物种(Momordica spp)(Mom c RIP),Morus spp(Mor a 17kD,Mor a 4),狼鲈属物种(Morone spp)(Mor am 1),桑属物种(Morus spp)(Morn 3,Mor n 3.0101),狼鲈属物种(Mor sa 1,Mor sc 1),鲻物种(Mugil spp)(Mug c 1),鳗鳞鳕属物种(Muraenolepis spp)(Mur mi 1),芭蕉属物种(Musa spp)(Mus a 1,Mus a1.0101,Mus a 2,Mus a 2.0101,Mus a 3,Mus a 3.0101,Mus a 4,Mus a 4.0101,Mus a5,Mus a 5.0101,Mus a 5.0102),小鼠属物种(Mus spp)(Mus m 1,Mus m 1.0101,Mus m1.0102,Mus m 2,Mus m明胶,Mus m IgG,Mus m MSA,Mus m莫罗单抗(Muromonab),Mus m卵黄高磷蛋白),鼬属物种(Mustela spp)(Mus p 17kD),芭蕉属物种(Musa spp)(Mus xp 1,Mus xp 2,Mus xp 5),鼻鲈物种(Mycteroperca spp)(Myc bo 1,Myc mi 1,Myc ph 1),毁丝霉属物种(Myceliophthora spp)(Myc sp Laccase),斗牛犬蚁属物种(Myrmecia spp)(Myr p 1,Myr p 1.0101,Myr p 2,Myr p 2.0101,Myr p 2.0102,Myr p 3,Myr p3.0101),贻贝属物种(Mytilus spp)(Myt e 1,Myt g 1,Myt g PM),蚜科物种(Myzus spp)(Myz p 7,Myz p 7.0101),Nemorhedus spp(Nae go Hya),板口线虫属物种(Necator spp)(Nec a钙网蛋白(Calreticulin)),金线鱼科物种(Nemipterus spp)(Nem vi 1),新缝匠菌物种(Neosartorya spp)(Neo fi 1,Neo fi 22),绿翅雁物种(Neochen spp)(Neo ju 1),新园蛛物种(Neoscona spp)(Neo n 7,Neo n 7.0101),韶子属物种(Nephelium spp)(Nep1 GAPDH),Nephrops spp(Nep n 1,Nep n DF9),香螺属物种(Neptunea spp)(Nep po 1,Nep po 1.0101),烟草属物种(Nicotiana spp)(Nic t 8,Nic t逆渗透蛋白,Nic t绒毛蛋白),Nimbya spp(Nim c 1,Nim s 1),日本圆线虫属物种(Nippostrongylus spp)(Nip bAg1),夜行猴物种(Nycticebus spp)(Nyc c 1),章鱼属物种(Octopus spp)(Oct f 1,Octl 1,Oct v 1,Oct v 1.0101,Oct v PM),敏尾笛鲷属物种(Ocyurus spp)(Ocy ch 1),洋橄榄属物种(Olea spp)(Ole e 1,Ole e 1.0101,Ole e 1.0102,Ole e 1.0103,Ole e1.0104,Ole e 1.0105,Ole e 1.0106,Ole e 1.0107,Ole e 10,Ole e 10.0101,Ole e11,Ole e 11.0101,Ole e 11.0102,Ole e 12,Ole e 13,Ole e 2,Ole e 2.0101,Ole e3,Ole e 3.0101,Ole e 36kD,Ole e 4,Ole e 4.0101,Ole e 5,Ole e 5.0101,Ole e 6,Ole e 6.0101,Ole e 7,Ole e 7.0101,Ole e 8,Ole e 8.0101,Ole e 9,Ole e 9.0101),柔鱼属物种(Ommastrephes spp)(Omm b 1,Omm b 1.0101),大麻哈鱼属物种(Oncorhynchus spp)(Onc ke 1,Onc ke 18 kD,Onc ke α2I,Onc ke卵黄生成素,Onc m 1,Onc m 1.0101,Onc m 1.0201,Onc m α2I,Onc m鱼精蛋白,Onc m卵黄生成素,Onc ma 1,Onc ma FPA,Onc ma FSA,Onc ma TPI,Onc n 1),盘尾丝虫属物种(Onchocerca spp)(Onco 3,Onc o 3.0101),大麻哈鱼属物种(Onc ts 1),盘尾丝虫属物种(Onc v 3,Onc v3.0101),口虾蛄属物种(Oratosquilla spp)(Ora o 1,Ora o 1.0101),Oreochromis spp(Ore a 1,Ore mo 1,Ore mo 2,Ore mo FPA,Ore mo SCAF7145,Ore ni 1,Ore ni 18kD,Ore ni 45kD),禽刺螨属物种(Ornithonyssus spp)(Orn sy 10,Orn sy 10.0101,Orn sy10.0102),兔鼠物种(Oryctolagus spp)(Ory c 1,Ory c 1.0101,Ory c 2,Ory c酪蛋白,Ory c卵黄高磷蛋白,Ory c RSA),Oryza spp(Ory s 1,Ory s 1.0101,Ory s 11,Ory s12,Ory s 12.0101,Ory s 13,Ory s 14,Ory s 17kD,Ory s 19kD,Ory s 2,Ory s 23,Orys 3,Ory s 7,Ory s aA_TI,Ory s GLP52,Ory s GLP63,Ory s乙二醛酶I,Ory s NRA),铁木属物种(Ostrya spp)(Ost c 1,Ost c 1.0101),绵羊物种(Ovis spp)(Ovi a ALA,Ovi aBLG,Ovi a酪蛋白,Ovi a酪蛋白αS1,Ovi a酪蛋白αS2,Ovi a酪蛋白β,Ovi a酪蛋白κ,Ovi a卵黄高磷蛋白,Ovi a SSA),Pachycondyla spp(Pac c 3),赤鲷物种(Pagrus spp)(Pag m1,Pag pa 1),鲳物种(Pampus spp)(Pam ar 1,Pam c 1),Pandalus spp(Pan b 1,Pan b1.0101),巨鲶属物种(Pangasius spp)(Pan bo 1),Pandalus spp(Pan e 1,Pan e1.0101,Pan e 4),龙虾物种(Panulirus spp)(Pan h 1,Pan hy 1),巨鲶属物种(Pangasius spp)(Pan hy 18kD,Pan hy 45kD),龙虾物种(Pan j 1),豹属物种(Pantheraspp)(Pan l 1,Pan o 1,Pan p 1),龙虾物种(Pan s 1,Pan s 1.0101),豹属物种(Pan t1),Pan spp(Pan tr TCTP),罂粟属物种(Papaver spp)(Pap s 17kD,Pap s 2,Pap s34kD),Papilio spp(Pap xu 7,Pap xu 7.0101,Pap xu 7.0102),牙鲆物种(Paralichthysspp)(Par a 1),河鲶物种(Parasilurus spp)(Par as 1,Par c 1),Paralithodes spp(Par c 1.0101,Par c 1.0102,Par f 1),银胶菊物种(Parthenium spp)(Par h 1),Parietaria spp(Par j 1,Par j 1.0101,Par j 1.0102,Par j 1.0103,Par j 1.0201,Par j 2,Par j 2.0101,Par j 2.0102,Par j 3,Par j 3.0101,Par j 3.0102,Par j 4,Par j 4.0101,Par j J1-J2),牙鲆物种(Par le 1),Parietaria spp(Par m 1,Par o 1,Par o 1.0101),牙鲆物种(Par ol 1,Par ol α2I),Parahucho spp(Par pe卵黄生成素),西番莲属物种(Passiflora spp)(Pas e壳多糖酶,Pas e橡胶素),雀稗属物种(Paspalumspp)(Pas n 1,Pas n 1.0101,Pas n 13),Patinopecten spp(Pat y 1),虱属物种(Pediculus spp)(Ped h 7,Ped h 7.0101),对虾属物种(Penaeus spp)(Pen a 1,Pen a1.0101,Pen a 1.0102,Pen a 1.0102(103-117),Pen a 1.0102(109-123),Pen a 1.0102(1-15),Pen a 1.0102(115-129),Pen a 1.0102(121-135),Pen a 1.0102(127-141),Pena 1.0102(13-27),Pen a 1.0102(133-147),Pen a 1.0102(139-153),Pen a 1.0102(145-159)),Farfantepenaeus spp(Pen a 1.0102(151-165)),对虾属物种(Pen a 1.0102(157-171),Pen a 1.0102(163-177),Pen a 1.0102(169-183),Pen a 1.0102(175-189),Pen a1.0102(181-195),Pen a 1.0102(187-201),Pen a 1.0102(193-207),Pen a 1.0102(19-33),Pen a 1.0102(199-213),Pen a 1.0102(205-219),Pen a 1.0102(211-225),Pen a1.0102(217-231),Pen a 1.0102(223-237),Pen a 1.0102(229-243)),Farfantepenaeusspp(Pen a 1.0102(235-249)),对虾属物种(Pen a 1.0102(241-255),Pen a 1.0102(247-261),Pen a 1.0102(253-267),Pen a 1.0102(25-39),Pen a 1.0102(259-273),Pen a1.0102(265-279),Pen a 1.0102(270-284),Pen a 1.0102(31-45),Pen a 1.0102(37-51),Pen a 1.0102 (43-57),Pen a 1.0102(49-63)),Farfantepenaeus spp(Pen a1.0102(55-69)),对虾属物种(Pen a 1.0102(61-75),Pen a 1.0102(67-81),Pen a1.0102(7-21),Pen a 1.0102(73-87),Pen a 1.0102(79-93),Pen a 1.0102(85-99),Pena 1.0102(91-105),Pen a 1.0102(97-111),Pen a 1.0103),青霉属物种(Penicilliumspp)(Pen b 13,Pen b 13.0101,Pen b 26,Pen b 26.0101,Pen c 1,Pen c 13,Pen c13.0101,Pen c 18,Pen c 19,Pen c 19.0101,Pen c 2,Pen c 22,Pen c 22.0101,Pen c24,Pen c 24.0101,Pen c 3,Pen c 3.0101,Pen c 30,Pen c 30.0101,Pen c 32,Pen c32.0101,Pen c MnSOD,Pen ch 13,Pen ch 13.0101,Pen ch 18,Pen ch 18.0101,Pen ch20,Pen ch 20.0101,Pen ch 31,Pen ch 31.0101,Pen ch 33,Pen ch 33.0101,Pen ch35,Pen ch 35.0101,Pen ch MnSOD),对虾属物种(Pen i 1,Pen i 1.0101,Pen m 1,Pen m1.0101,Pen m 1.0102,Pen m 2,Pen m 2.0101,Pen m 3,Pen m 3.0101,Pen m 4,Pen m4.0101,Pen m 6,Pen m 6.0101),青霉属物种(Pen o 18,Pen o 18.0101),对虾属物种(Pena o 1,Pena o 1.0101),大蠊属物种(Periplaneta spp)(Per a 1,Per a 1.0101,Pera 1.0102,Per a 1.0103,Per a 1.0104,Per a 1.0105,Per a 1.0201,Per a 10,Per a10.0101,Per a 2,Per a 3,Per a 3.0101,Per a 3.0201,Per a 3.0202,Per a 3.0203,Per a 4,Per a 5,Per a 6,Per a 6.0101,Per a 7,Per a 7.0101,Per a 7.0102,Per a7.0103,Per a 9,Per a 9.0101,Per a组织蛋白酶,Per a FABP,Per a胰蛋白酶,Per f 1,Per f 7,Per f7.0101),贻贝物种(Perna spp)(Per v 1),鳄梨属物种(Persea spp)(Persa 1,Pers a 1.0101,Pers a 4),香芹菜属物种(Petroselinum spp)(Pet c 1,Pet c 2,Pet c 3),金丝雀草物种(Phalaris spp)(Pha a 1,Pha a 1.0101,Pha a 5,Pha a5.0101,Pha a 5.02,Pha a 5.03,Pha a 5.04),菜豆属物种(Phaseolus spp)(Pha v 3,Pha v 3.0101,Pha v 3.0201,Pha v aAI,Pha v aAI.0101,Pha v壳多糖酶,Pha v PHA,Pha v菜豆球蛋白),Phleum spp(Phl p 1,Phl p 1.0101,Phl p 1.0102,Phl p 11,Phl p11.0101,Phl p 12,Phl p 12.0101,Phl p 12.0102,Phl p 12.0103,Phl p 13,Phl p13.0101,Phl p 2,Phl p 2.0101,Phl p 3,Phl p 3.0101,Phl p 3.0102,Phl p 4,Phl p4.0101,Phl p 4.0102,Phl p 4.0201,Phl p 4.0202,Phl p 4.0203,Phl p 4.0204,Phl p5,Phl p 5.0101,Phl p 5.0102,Phl p 5.0103,Phl p 5.0104,Phl p 5.0105,Phl p5.0106,Phl p 5.0107,Phl p 5.0108,Phl p 5.0109,Phl p 5.0201,Phl p 5.0202,Phl p5.0203,Phl p 5.0204,Phl p 5.0205,Phl p 5.0206,Phl p 5.0207,Phl p 6,Phl p6.0101,Phl p 6.0102,Phl p 7,Phl p 7.0101,Phl p P1-P2-P5-P6,Phl p P2-P6,Phl pP5-P1,Phl p P6-P2),凤凰物种(Phoenix spp)(Pho d 2,Pho d 2.0101,Pho d 40kD,Phod 90kD),毛足鼠属物种(Phodopus spp)(Pho s 21kD),茎点霉属物种(Phoma spp)(Pho t1),芦苇属物种(Phragmites spp)(Phr a 1,Phr a 12,Phr a 13,Phr a 4,Phr a 5),商陆属物种(Phytolacca spp)(Phy a RIP),茴芹属物种(Pimpinella spp)(Pim a 1,Pim a2),Pinna spp(Pin a 1),胡椒属物种(Piper spp)(Pip n 14kD,Pip n 28kD),豌豆物种(Pisum spp)(Pis s 1,Pis s 1.0101,Pis s 1.0102,Pis s 2,Pis s 2.0101,Pis s 5,Pis s凝集素,Pis s白蛋白),黄连木属物种(Pistacia spp)(Pis v 1,Pis v 1.0101,Pisv 2,Pis v 2.0101,Pis v 2.0201,Pis v 3,Pis v 3.0101,Pis v 4,Pis v 4.0101,Pis v5,Pis v 5.0101),悬铃木属物种(Platanus spp)(Pla a 1,Pla a 1.0101,Pla a 2,Pla a2.0101,Pla a 3,Pla a 3.0101,Pla a 8),川鲽属物种(Platichthys spp)(Pla f 1),车前属物种(Plantago spp)(Pla l 1,Pla l 1.0101,Pla l 1.0102,Pla l 1.0103,Pla l细胞色素C),悬铃木属物种(Platanus spp)(Pla oc 1,Pla or 1,Pla or 1.0101,Pla or 2,Pla or 2.0101,Pla or 3,Pla or 3.0101,Pla or 4,Pla or CyP,Pla r 1),鳃棘鲈属物种(Plectropomus spp)(Ple ar 1),格孢腔菌属物种(Pleospora spp)(Ple h 1),鳃棘鲈属物种(Plectropomus spp)(Ple le 1),Plodia spp(Plo i 1,Plo i 1.0101,Plo i 2,Plo i 2.0101),Poa spp(Poa p 1,Poa p 1.0101,Poa p 10,Poa p 12,Poa p 13,Poa p2,Poa p 4,Poa p 5,Poa p 5.0101,Poa p 6,Poa p 7),马蜂属物种(Polistes spp)(Pola 1,Pol a 1.0101,Pol a 2,Pol a 2.0101,Pol a 5,Pol a 5.0101,Pol d 1,Pol d1.0101,Pol d 1.0102,Pol d 1.0103,Pol d 1.0104,Pol d 4,Pol d 4.0101,Pol d 5,Pol d 5.0101,Pol e 1,Pol e 1.0101,Pol e 2,Pol e 4,Pol e 4.0101,Pol e 5,Pol e5.0101,Pol f 5,Pol f 5.0101,Pol g 1,Pol g 1.0101,Pol g 2,Pol g 4,Pol g 5,Polg 5.0101,Pol he MLT,Pol m 5,Pol m 5.0101),多足摇蚊物种(Polypedilum spp)(Pol n1),Pollicipes spp(Pol po 1),青鳕物种(Pollachius spp)(Pol vi 1),Polybia spp(Poly p 1,Poly p 1.0101,Poly p 2,Poly p 5,Poly s 5,Poly s 5.0101),Pomatomusspp(Pom sa 1),猩猩物种(Pongo spp)(Pon ab HSA),Pontastacus spp(Pon l 4,Pon l4.0101,Pon l 7,Pon l 7.0101),梭子蟹属物种(Portunus spp)(Por s 1,Por s 1.0101,Por s 1.0102,Por tr 1,Por tr 1.0101),Protortonia spp(Pro ca 38kD),Procumbarusspp(Pro cl 1,Pro cl 1.0101,Pro cl 21kD),牡豆树属物种(Prosopis spp)(Pro j20kD),李属物种(Prunus spp)(Pru ar 1,Pru ar 1.0101,Pru ar 3,Pru ar 3.0101,Pruav 1,Pru av 1.0101,Pru av 1.0201,Pru av 1.0202,Pru av 1.0203,Pru av 2,Pru av2.0101,Pru av 3,Pru av 3.0101,Pru av 4,Pru av 4.0101,Pru c 1,Pru d 1,Pru d 2,Pru d 3,Pru d 3.0101,Pru d 4,Pru du 1,Pru du 2,Pru du 2S白蛋白,Pru du 3,Prudu 3.0101,Pru du 4,Pru du 4.0101,Pru du 4.0102,Pru du 5,Pru du 5.0101,Pru du6,Pru du 6.0101,Pru du 6.0201,Pru du Conglutin,Pru p 1,Pru p 1.0101,Pru p 2,Pru p 2.0101,Pru p 2.0201,Pru p 2.0301,Pru p 3,Pru p 3.0101,Pru p 3.0102,Prup 4,Pru p 4.0101,Pru p 4.0201,Pru sa 3),裸盖菇属物种(Psilocybe spp)(Psi c 1,Psi c 1.0101,Psi c 2,Psi c 2.0101),痒螨属物种(Psoroptes spp)(Pso o 1,Pso o10,Pso o 10.0101,Pso o 11,Pso o 13,Pso o 14,Pso o 2,Pso o 21,Pso o 3,Pso o 5,Pso o 7),美洲狮物种(Puma spp)(Pum c 1),石榴科物种(Punica spp)(Pun g 3),犁属物种(Pyrus spp)(Pyr c 1,Pyr c 1.0101,Pyr c 3,Pyr c 3.0101,Pyr c 4,Pyr c 4.0101,Pyr c 5,Pyr c 5.0101,Pyr py 2),栎树物种(Quercus spp)(Que a 1,Que a 1.0101,Quea 1.0201,Que a 1.0301,Que a 1.0401,Que a 2,Que a 4),军曹鱼物种(Rachycentronspp)(Rac ca 1),蛙物种(Rana spp)(Ran e 1,Ran e 1.0101,Ran e 2,Ran e 2.0101),旭蟹属物种(Ranina spp)(Ran ra 1),驯鹿属物种(Rangifer spp)(Ran t BLG),鼠属物种(Rattus spp)(Rat n 1,Rat n 1.0101,Rat n酪蛋白,Rat n明胶,Rat n IgG,Rat n卵黄高磷蛋白,Rat n RSA,Rat n转铁蛋白),根毛霉物种(Rhizomucor spp)(Rhi m AP),根霉菌属物种(Rhizopus spp)(Rhi nv Lipase,Rhi o Lipase),朱红笛鲷物种(Rhomboplites spp)(Rho au 1),红酵母属物种(Rhodotorula spp)(Rho m 1,Rho m 1.0101,Rho m 2,Rho m2.0101),蓖麻属物种(Ricinus spp)(Ric c 1,Ric c 1.0101,Ric c 2,Ric c 3,Ric c 8,Ric c RIP),花溪鱂物种(Rivulus spp)(Riv ma 1),洋槐属物种(Robinia spp)(Rob p 2,Rob p 4,Rob p葡聚糖酶),蔷薇属物种(Rosa spp)(Ros r 3),王棕属物种(Roystoneaspp)(Roy e 2),悬钩子属物种(Rubus spp)(Rub i 1,Rub i 1.0101,Rub i 3,Rub i3.0101,Rub i壳多糖酶,Rub i CyP),酵母菌属物种(Saccharomyces spp)(Sac c羧肽酶Y,Sac c CyP,Sac c Enolase,Sac c葡糖苷酶,Sac c转化酶,Sac c MnSOD,Sac c P2,Sac c抑制蛋白),红点鲑属物种(Salvelinus spp)(Sal f 1),猪毛菜属物种(Salsola spp)(Salk 1,Sal k 1.0101,Sal k 1.0201,Sal k 1.0301,Sal k 1.0302,Sal k 2,Sal k 2.0101,Sal k 3,Sal k 3.0101,Sal k 4,Sal k 4.0101,Sal k 4.0201,Sal k 5,Sal k 5.0101),红点鲑属物种(Salvelinus spp)(Sal le卵黄生成素),鲑物种(Salmo spp)(Sal s 1,Sals 1.0101,Sal s 1.0201,Sal s 2,Sal s 2.0101,Sal s明胶),接骨木属物种(Sambucusspp)(Sam n 1),Sander spp(San lu 1),肥皂草属物种(Saponaria spp)(Sap o RIP),拟沙丁鱼属物种(Sardinops spp)(Sar m 1),Sarkidiomis spp(Sar ml 1),沙丁鱼物种(Sardina spp)(Sar p 1),疥螨属物种(Sarcoptes spp)(Sar s 1,Sar s 14,Sar s 3,Sars GST,Sar s PM),拟沙丁鱼属物种(Sardinops spp)(Sar sa 1,Sar sa 1.0101),血吸虫属物种(Schistosoma spp)(Sch j GST,Sch j PM,Sch j Sj22,Sch j Sj67,Sch ma Sm20,Sch ma Sm21,Sch ma Sm22,Sch ma Sm31),Sciaenops spp(Sci oc 1),鲭属物种(Scomberspp)(Sco a 1),Scombermorus spp(Sco ca 1),马鲛物种(Scomberomorus spp)(Sco g1),鲭属物种(Sco j 1,Sco ma 1,Sco s 1),蜈蚣物种(Scolopendra spp)(Sco y 7,Sco y7.0101),Scylla spp(Scy o 1,Scy o 1.0101,Scy o 2,Scy pa 1,Scy pa 2,Scy s 1,Scys 1.0101,Scy s 2),平鲉物种(Sebastes spp)(Seb fa 1,Seb in 1,Seb m 1,Seb m1.0101,Seb m 1.0201),黑麦属物种(Secale spp)(Sec c 1,Sec c 12,Sec c 13,Sec c2,Sec c 20,Sec c 20.0101,Sec c 20.0201,Sec c 28,Sec c 3,Sec c 4,Sec c 4.0101,Sec c 4.0201,Sec c 5,Sec c 5.0101,Sec c aA_TI,Sec c aA_TI.0101),千里光属物种(Senecio spp)(Sen j MDH,Sen j PL),乌贼物种(Sepia spp)(Sep e 1,Sep e 1.0101),Sepioteuthis spp(Sep l 1,Sep l 1.0101),乌贼物种(Sep m 1),鰤物种(Seriola spp)(Ser d 1,Ser la 1),樱虾物种(Sergestes spp)(Ser lu 1),鰤物种(Ser q 1,Ser ri1),芝麻物种(Sesamum spp)(Ses i 1,Ses i 1.0101,Ses i 2,Ses i 2.0101,Ses i 3,Ses i 3.0101,Ses i 4,Ses i 4.0101,Ses i 5,Ses i 5.0101,Ses i 6,Ses i 6.0101,Ses i 7,Ses i 7.0101,Ses i 8),志贺菌属物种(Shigella spp)(Shi bo GST,Shi dyGST),蚋属物种(Simulia spp)(Sim vi 1,Sim vi 2,Sim vi 3,Sim vi 4,Sim vi 70kD),芥属物种(Sinapis spp)(Sin a 1,Sin a 1.0101,Sin a 1.0104,Sin a 1.0105,Sin a1.0106,Sin a 1.0107,Sin a 1.0108,Sin a 2,Sin a 2.0101,Sin a 3,Sin a 3.0101,Sin a 4,Sin a 4.0101),缢蛏物种(Sinonovacula spp)(Sin c 1,Sin c 1.0101),火蚁属物种(Solenopsis spp)(Sol g 2,Sol g 2.0101,Sol g 3,Sol g 3.0101,Sol g 4,Sol g4.0101,Sol g 4.0201,Sol i 1,Sol i 1.0101,Sol i 2,Sol i 2.0101,Sol i 3,Sol i3.0101,Sol i 4,Sol i 4.0101),Solenocera spp(Sol me 1),火蚁属物种(Sol r 1,Solr 2,Sol r 2.0101,Sol r 3,Sol r 3.0101,Sol s 2,Sol s 2.0101,Sol s 3,Sol s3.0101,Sol s 4),欧洲鳎物种(Solea spp)(Sol so 1,Sol so TPI),茄属物种(Solanumspp)(Sola t 1,Sola t 1.0101,Sola t 2,Sola t 2.0101,Sola t 3,Sola t 3.0101,Sola t 3.0102,Sola t 4,Sola t 4.0101,Sola t 8,Sola t葡聚糖酶),高粱物种(Sorghum spp)(Sor b 1,Sor h 1,Sor h 1.0101,Sor h 12,Sor h 7),鲷属物种(Sparusspp)(Spa a 1),双髻鲨物种(Sphyrna spp)(Sph ti 1),螺旋藻物种(Spirulina spp)(Spimx β_藻青蛋白),菠菜属物种(Spinacia spp)(Spi o 2,Spi o RuBisCO),虾蛄物种(Squilla spp)(Squ ac 1,Squ ac 1.0101,Squ o 1,Squ o 1.0101),葡萄球菌属物种(Staphylococcus spp)(Sta a FBP,Sta a SEA,Sta a SEB,Sta a SEC,Sta a SED,Sta aSEE,Sta a TSST),葡萄状穗霉属物种(Stachybotrys spp)(Sta c 3,Sta c 3.0101,Sta c纤维素酶,Sta c溶血素,Sta c SchS34,Sta c Stachyrase A),匍柄霉属物种(Stemphylium spp)(Ste b 1,Ste c 1,Ste v 1),小公鱼属物种(Stolephorus spp)(Stoi 1),鸵鸟物种(Struthio spp)(Str c 1,Str c 2,Str c 3),链球菌属物种(Streptococcus spp)(Str dy链激酶),链霉菌属物种(Streptomyces spp)(Str g链霉蛋白酶(Pronase)),链球菌属物种(Str pn PspC),Strongylocentrotus spp(Str pu 18kD,Str pu卵黄生成素),链球菌属物种(Str py SPEA,Str py SPEC,Str py 链激酶),类圆线虫属物种(Strongyloides spp)(Str st 45kD),链霉菌属物种(Str v PAT),海鞘物种(Styela spp)(Sty p 1),Suidasia spp(Sui m 1,Sui m 13,Sui m 2,Sui m 3,Sui m 5,Sui m 5.01,Sui m 5.02,Sui m 5.03,Sui m 6,Sui m 7,Sui m 8,Sui m 9),Sus spp(Suss ACTH,Sus s ALA,Sus s淀粉酶,Sus s BLG,Sus s酪蛋白,Sus s酪蛋白αS1,Sus s酪蛋白αS2,Sus s酪蛋白β,Sus s酪蛋白κ,Sus s明胶,Sus s HG,Sus s胰岛素,Sus s脂肪酶,Suss胃蛋白酶,Sus s卵黄高磷蛋白,Sus s PRVB,Sus s PSA,Sus s TCTP),Syntelopodeumaspp(Syn y 7,Syn y 7.0101),紫丁香属物种(Syringa spp)(Syr v 1,Syr v 1.0101,Syrv 1.0102,Syr v 1.0103,Syr v 2,Syr v 3,Syr v 3.0101),虻虫物种(Tabanus spp)(Taby 1,Tab y 1.0101,Tab y 2,Tab y 2.0101,Tab y 5,Tab y 5.0101),雌麻鸭物种(Tadorna spp)(Tad ra 1),踝节菌属物种(Talaromyces spp)(Tal st 22,Tal st 3,Talst 8),蒲公英物种(Taraxacum spp)(Tar o 18kD),落羽松属物种(Taxodium spp)(Tax d2),Tegenaria spp(Teg d血蓝蛋白),背带线虫属物种(Teladorsagia spp)(Tel ci 3),异舟蛾属物种(Thaumetopoea spp)(Tha p 1,Tha p 1.0101,Tha p 2,Tha p 2.0101),明太鱼物种(Theragra spp)(The c 1),嗜热真菌属物种(Thermomyces spp)(The 1脂肪酶,Thesp脂肪酶,The sp木聚糖酶),金枪鱼物种(Thunnus spp)(Thu a 1,Thu a 1.0101,Thu a胶原,Thu al 1,Thu at 1,Thu o 1,Thu o胶原),金钟柏属物种(Thuja spp)(Thu oc 3,Thup 1),金枪鱼物种(Thu t 1,Thu to 1),Thyrsites spp(Thy at 1),Thyrophygus spp(Thyy 7,Thy y 7.0101),褶柔鱼属物种(Todarodes spp)(Tod p 1,Tod p 1.0101,Tod p1.0102),Toxoptera spp(Tox c 7,Tox c 7.0101),弓蛔虫属物种(Toxocara spp)(Tox caTES 120,Tox ca TES26,Tox ca TES30),弓形虫属物种(Toxoplasma spp)(Tox g HSP70),Trachypenaeus spp(Tra c 1),鲳鲹属物种(Trachinotus spp)(Tra ca 1),竹荚鱼物种(Trachurus spp)(Tra j 1,Tra j明胶,Tra tr明胶),小麦属物种(Triticum spp)(Tri a1,Tri a 10kD,Tri a 12,Tri a 12.0101,Tri a 12.0102,Tri a 12.0103,Tri a12.0104,Tri a 13,Tri a 14,Tri a 14.0101,Tri a 14.0201,Tri a 15,Tri a 15.0101,Tri a 18,Tri a 18.0101,Tri a 19,Tri a 19.0101,Tri a 2,Tri a 21,Tri a 21.0101,Tri a 23kd,Tri a 25,Tri a 25.0101,Tri a 26,Tri a 26.0101,Tri a 27,Tri a27.0101,Tri a 28,Tri a 28.0101,Tri a 29,Tri a 29.0101,Tri a 29.0201,Tri a 3,Tri a 30,Tri a 30.0101,Tri a 31,Tri a 31.0101,Tri a 32,Tri a 32.0101,Tri a33,Tri a 33.0101,Tri a 34,Tri a 34.0101,Tri a 35,Tri a 35.0101,Tri a 36,Tri a36.0101,Tri a 37,Tri a 37.0101,Tri a 4,Tri a 4.0101,Tri a 4.0201,Tri a 5,Tria 7,Tri a aA_SI,Tri a α_麦醇溶蛋白,Tri a bA,Tri a Bd36K,Tri a β_麦醇溶蛋白,Tri a壳多糖酶,Tri a CM16,Tri a DH,Tri a内壳多糖酶(Endochitinase),Tri a γ_麦醇溶蛋白,Tri a Germin,Tri a麦醇溶蛋白,Tri a GST,Tri a LMW Glu,Tri a LMW-GSB16,Tri a LMW-GS P42,Tri a LMW-GS P73,Tri a LTP2,Tri aω2_麦醇溶蛋白,Tri a过氧化物酶,Tri a过氧化物酶1,Tri a SPI,Tri a TLP,Tri a麦芽凝集素,Tri a XI),Tritirachium spp(Tri al蛋白水解酶K),拟谷盗属物种(Tribolium spp)(Tri ca 17,Trica 17.0101,Tri ca 7,Tri ca 7.0101),毛圆线虫属物种(Trichostrongylus spp)(Trico 3,Tri co 3.0101),发癣菌属物种(Trichophyton spp)(Tri eq 4),葫芦巴属物种(Trigonella spp)(Tri fg 1,Tri fg 2,Tri fg 3,Tri fg 4),栝楼属物种(Trichosanthes spp)(Tri k RIP),带鱼物种(Trichiurus spp)(Tri le 1),小麦属物种(Triticum spp)(Tri m过氧化物酶),发癣菌属物种(Trichophyton spp)(Tri me 2,Trime 4),三毛草属物种(Trisetum spp)(Tri p 1,Tri p 5),毛线虫属物种(Trichinellaspp)(Tri ps 3,Tri ps 3.0101),发癣菌属物种(Tri r 2,Tri r 2.0101,Tri r 4,Tri r4.0101),木霉属物种(Trichoderma spp)(Tri rs纤维素酶),小麦属物种(Tri s 14),发癣菌属物种(Tri sc 2,Tri sc 4,Tri so 2),Trichinella spp(Tri sp 3,Tri sp 3.0101,Tri sp 3.0102,Tri sp 3.0103,Tri sp 3.0104,Tri sp 3.0105,Tri sp 3.0106),发癣菌属物种(Tri t 1,Tri t 1.0101,Tri t 4,Tri t 4.0101),小麦属物种(Tri td 14,Tri tdaA_TI),木霉属物种(Tri v Cellulase),发癣菌属物种(Tri ve 4),锥猎蝽属物种(Triatoma spp)(Tria p 1,Tria p 1.0101),三鳞茎皮属物种(Triplochiton spp)(Trips 1),Turbo spp(Tur c 1,Tur c PM),食酪螨属物种(Tyrophagus spp)(Tyr p 1,Tyr p10,Tyr p 10.0101,Tyr p 10.0102,Tyr p 13,Tyr p 13.0101,Tyr p 2,Tyr p 2.0101,Tyr p 24,Tyr p 24.0101,Tyr p 3,Tyr p 3.0101,Tyr p 4,Tyr p 5,Tyr p 5.01,Tyr p5.02,Tyr p 5.03,Tyr p 7,Tyr p α微管蛋白),单格孢属物种(Ulocladium spp)(Ulo a1,Ulo at 1,Ulo b 1,Ulo c 1,Ulo co 1,Ulo cu 1,Ulo mu 1,Ulo ob 1,Ulo se 1,Ulosu 1,Ulo tu 1),雪豹属物种(Uncia spp)(Unc u 1),长鳍鳕物种(Urophycis spp)(Urote 1),越桔属物种(Vaccinium spp)(Vac m 3),瓦螨属物种(Varroa spp)(Var j 13kD),Venerupis spp(Ven ph 1,Ven ph 1.0101),黄胡蜂属物种(Vespula spp)(Ves f 1,Ves f2,Ves f 5,Ves f 5.0101,Ves g 1,Ves g 2,Ves g 5,Ves g 5.0101,Ves m 1,Ves m1.0101,Ves m 2,Ves m 2.0101,Ves m 5,Ves m 5.0101,Ves m MLT,Ves p 1,Ves p 2,Ves p 5,Ves p 5.0101,Ves s 1,Ves s 1.0101,Ves s 2,Ves s 5,Ves s 5.0101,Ves v1,Ves v 1.0101,Ves v 2,Ves v 2.0101,Ves v 2.0201,Ves v 3,Ves v 3.0101,Ves v5,Ves v 5.0101,Ves v 5-Pol a 5,Ves vi 5,Ves vi 5.0101),胡蜂属物种(Vespa spp)(Vesp c 1,Vesp c 1.0101,Vesp c 2,Vesp c 5,Vesp c 5.0101,Vesp c 5.0102,Vesp m1,Vesp m 1.0101,Vesp m 5,Vesp m 5.0101,Vesp ma 1,Vesp ma 2,Vesp ma 5,Vesp maMLT,Vesp v MLT),豇豆物种(Vigna spp)(Vig r 1,Vig r 1.0101,Vig r 17kD,Vig r 5,Vig r 8S球蛋白,Vig r白蛋白,Vig r p-伴大豆球蛋白),葡萄属物种(Vitis spp)(Vit v1,Vit v 1.0101,Vit v 4,Vit v 5,Vit v葡聚糖酶,Vit v TLP),旗鱼属物种(Xiphiasspp)(Xip g 1,Xip g 1.0101,Xip g 25kD),玉蜀黍属物种(Zea spp)(Zea m 1,Zea m1.0101,Zea m 11,Zea m 12,Zea m 12.0101,Zea m 12.0102,Zea m 12.0103,Zea m12.0104,Zea m 12.0105,Zea m 13,Zea m 14,Zea m 14.0101,Zea m 14.0102,Zea m 2,Zea m 20S,Zea m 22,Zea m 25,Zea m 25.0101,Zea m 27kD Zein,Zea m 3,Zea m 4,Zeam 5,Zea m 50kD Zein,Zea m 7,Zea m壳多糖酶,Zea m G1,Zea m G2,Zea m PAO,Zea mZm13),Zeus spp(Zeu fa 1),枣属物种(Ziziphus spp)(Ziz m 1,Ziz m 1.0101),鮈物种(Zoarces spp)(Zoa a ISP III),霸王属物种(Zygophyllum spp)(Zyg f 2)。
在这一情形中,括号中的术语表示来自特定来源的特别优选的变应原。
最优选地,与变态反应或变应性疾病相关的抗原优选地来源于选自由下述组成的列表的来源:草花粉(grass pollen)(例如,裸麦(rye)的花粉),树花粉(tree pollen)(例如,榛树(hazel)、桦树(birch)、桤木(alder)、岑树(ash)的花粉),花的花粉,草本花粉(例如,艾蒿的花粉),粉尘螨(例如,Der f 1,Der p 1,Eur m 1,Der m 1 Der f 2,Der p 2,Eur m 2,Tyr p 2,Lep d 2),霉菌(例如,支顶孢属(Acremonium)、曲霉菌属(Aspergillus)、分枝孢子菌属(Cladosporium)、镰刀菌属(Fusarium)、毛霉菌属(Mucor)、青霉属(Penicillium)、根霉菌属(Rhizopus)、葡萄状穗霉属(Stachybotrys)、木霉属(Trichoderma)或链格孢属(Alternaria)的变应原),动物(例如,猫的Fel d1,Fel d 2,Feld3或Fel d4),食物(例如,鱼(例如,鲈鱼(bass),鳕(cod),比目鱼(flounder))的变应原,海产食品(例如,螃蟹(crab),龙虾(lobster),龟(shrimps)),鸡蛋,小麦,坚果(例如,花生,杏仁,腰果,核桃),大豆,牛奶等)和昆虫毒液(例如,来自黄蜂、蜜蜂、大黄蜂、蚂蚁、蚊子或虱类的毒液的变应原)。
c)与自身免疫病相关的抗原:
与自身免疫病相关的抗原优选地选自与自身免疫病相关的自身抗原,所述自身免疫病选自:艾迪生病(Addison disease)(自身免疫性肾上腺炎(autoimmuneadrenalitis),Morbus Addison),斑秃(alopecia areata),艾迪生贫血(Addison’sanemia)(Morbus Biermer),自身免疫性溶血性贫血(autoimmune hemolytic anemia,AIHA),冷型自身免疫性溶血性贫血(autoimmune hemolytic anemia(AIHA)of the coldtype)(冷型血凝素病(cold hemagglutinine disease),冷型自身免疫性溶血性贫血(coldautoimmune hemolytic anemia(AIHA))(冷凝集素疾病(cold agglutinin disease)),(CHAD)),暖型自身免疫性溶血性贫血(autoimmune hemolytic anemia(AIHA)of the warmtype)(暖型AIHA,暖型自身免疫性溶血性贫血(warm autoimmune haemolytic anemia(AIHA))),自身免疫性溶血性多-兰贫血(autoimmune hemolytic Donath-Landsteineranemia)(阵发性冷性血红蛋白尿症(paroxysmal cold hemoglobinuria)),抗磷脂综合征(antiphospholipid syndrome,APS),动脉粥样硬化(atherosclerosis),自身免疫性关节炎(autoimmune arthritis),颞动脉炎(arteriitis temporalis),高安动脉炎(Takayasuarteriitis)(高安病(Takayasu’s disease),主动脉弓病(aortic arch disease)),颞动脉炎(temporal arteriitis)/巨细胞动脉炎(giant cell arteriitis),自身免疫性慢性胃炎(autoimmune chronic gastritis),自身免疫性不育(autoimmune infertility),自身免疫性内耳病(autoimmune inner ear disease,AIED),巴赛多病(Basedow′s disease)(Morbus Basedow),别赫捷列夫病(Bechterew’s disease)(Morbus Bechterew,强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis),关节强硬性脊椎炎(spondylitis ankylosans)),贝赫切特综合征(Behcet′s syndrome)(Morbus Behcet),肠病(bowel disease),包括自身免疫性炎性肠病(autoimmune inflammatory bowel disease)(包括溃疡性结肠炎(colitisulcerosa)(克罗恩病(Morbus Crohn,Crohn′s disease)),心肌症(cardiomyopathy),特别是自身免疫性心肌症(autoimmune cardiomyopathy),特发性扩张型心肌病(idiopathicdilated cardiomyopathy,DCM),腹部口炎性腹泻皮炎(celiac sprue dermatitis)(谷蛋白介导的肠病(gluten mediated enteropathia)),慢性疲劳性免疫功能障碍综合征(chronic fatigue immune dysfunction syndrome,CFIDS),慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病(chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy,CIDP),慢性多关节炎(chronic polyarthritis),丘-施综合征(Churg-Strauss syndrome),瘢痕性类天疱疮(cicatricial pemphigoid),耳蜗前庭综合征(Cogan syndrome),CREST综合征(具有皮肤钙质沉着症(Calcinosis cutis),雷诺现象(Raynaud phenomenon),食管运动障碍(motility disorders of the esophagus),sklerodaktylia和teleangiectasia的综合征),克罗恩病(Crohn’s disease)(Morbus Crohn,溃疡性结肠炎(colitis ulcerosa)),在皮肤用药性自身免疫病过程中的疱疹样皮炎(dermatitis herpetiformis),皮肌炎(dermatomyositis),糖尿病(Diabetes),1型糖尿病(Diabetes mellitus Type 1)(I型糖尿病,胰岛素依赖性糖尿病(insuline dependent Diabetes mellitus)),2型糖尿病(II型糖尿病),特发性混合性冷球蛋白血症(essential mixed cryoglobulinemia),特发性混合性冷球蛋白血症,纤维肌痛(fibromyalgia),纤维肌炎(fibromyositis),肺出血肾炎综合征(Goodpasture syndrome)(抗肺出血肾炎综合征介导的肾小球肾炎(anti-GBM mediatedglomerulonephritis)),移植物抗宿主病(graft versus host disease),吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barré syndrome)(GBM,多神经根神经炎(Polyradikuloneuritis)),血液性自身免疫病(haematologic autoimmune diseases),桥本甲状腺炎(Hashimotothyroiditis),血友病(haemophilia),获得性血友病(acquired hemophilia),肝炎(hepatitis),自身免疫性肝炎(autoimmune hepatitis),特别是自身免疫性形式的慢性肝炎(autoimmune forms of chronic hepatitis),特发性肺纤维化(idiopathic pulmonaryfibrosis,IPF),特发性血小板减少性紫癜(idiopathic thrombocytopenic purpura),免疫性-血小板减少性紫癜(Immuno-thrombocytopenic purpura)(Morbus Werlhof;ITP),IgA肾病(IgA nephropathy),不育(infertility),自身免疫性不育,幼年型类风湿关节炎(juvenile rheumatoid arthritis)(Morbus Still,斯蒂尔综合征(Still syndrome)),兰伯特-伊顿综合征(Lambert-Eaton syndrome),扁平苔癣(lichen planus),硬化苔藓(lichen sclerosus),红斑狼疮(lupus erythematosus),系统性红斑狼疮(systemiclupus erythematosus,SLE),红斑狼疮(盘形),莱姆关节炎(Lyme arthritis)(莱姆病(Lyme disease),疏螺旋体关节炎(borrelia arthritis)),梅尼埃病(Ménierè’sdisease)(Morbus Ménierè);混合性结缔组织病(mixed connective tissue disease,MCTD),多发性硬化(multiple sclerosis)(MS,弥散性脑脊髓炎(encephalomyelitisdisseminate),夏科病(Charcot’s disease)),重症肌无力(Myasthenia gravis)(肌无力(myasthenia),MG),肌炎(myosits),多发性肌炎(polymyositis),神经性自身免疫病(neural autoimmune diseases),神经性皮炎(neurodermitis),寻常天疱疮(pemphigusvulgaris),大疱性类天疱疮(bullous pemphigoid),瘢痕形成性类天疱疮(scar formingpemphigoid);结节性多发性动脉炎(polyarteriitis nodosa)(结节性动脉周炎(periarteiitis nodosa)),多软骨炎(polychondritis)(全软骨炎(panchondritis)),多腺性(自身免疫性)综合征(polyglandular(autoimmune)syndrome)(PGA综合征,Schmidt综合征(Schmidt’s syndrome)),风湿性多肌痛(Polymyalgia rheumatica),原发性丙种球蛋白缺乏血症(primary agammaglobulinemia),原发性胆汁性肝硬化(primary biliarycirrhosis PBC),原发性自身免疫性胆管炎(primary autoimmune cholangitis)),进行性系统性硬化(progressive systemic sclerosis,PSS),银屑病(Psoriasis),寻常性银屑病(Psoriasis vulgaris),雷诺现象(Raynaud′s phenomena),莱特尔综合征(Reiter′ssyndrome)(Morbus Reiter,尿道结合滑膜综合征(urethral conjunctive synovialsyndrome))),类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis)(RA,慢性多关节炎(chronicpolyarthritis),关节的类风湿病(rheumatic disease of the joints),风湿热(rheumatic fever)),结节病(sarcoidosis)(Morbus Boeck,Besnier-Boeck-Schaumann病(Besnier-Boeck-Schaumann disease)),僵体综合征(stiff-man syndrome),硬皮病(Sclerodermia),硬皮病(Scleroderma),舍格伦综合征(syndrome),交感性眼炎(sympathetic ophtalmia);短暂性谷蛋白耐受不良(Transient gluten intolerance),移植器官排斥(transplanted organ rejection),葡萄膜炎(uveitis),自身免疫性葡萄膜炎(autoimmune uveiitis),血管炎(Vasculitis),白癜风(Vitiligo),(白斑病(leucoderma),花斑皮肤(piebold skin)),和韦格纳病(Wegner’s disease)(MorbusWegner,韦格纳肉芽肿病(Wegner’s granulomatosis))。
在这一情形中特别优选的是选自下述的自身抗原:
·在与多发性硬化(MS)相关的每种情形中:髓鞘碱蛋白(MBP),蛋白脂蛋白(PLP),和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG);
·在与I型糖尿病相关的每种情形中:CD44,前胰岛素原,胰岛素原,胰岛素,谷氨酸脱羧酶(GAD65),酪氨酸磷酸酶-样胰岛素瘤抗原2(IA2),锌转运蛋白((ZnT8),和热休克蛋白60(HSP60);
·与自身免疫性葡萄膜炎相关的光感受器间类视黄醇-结合蛋白(IRBP);
·在与重症肌无力相关的每种情形中:乙酰胆碱受体AchR和胰岛素样生长因子-1受体(IGF-1R);
·来自与风湿热相关的β-溶血链球菌的M蛋白(假自身抗原);
·与关节炎相关的巨噬细胞迁移抑制因子;
·在与舍格伦综合征相关的每种情形中:Ro/La RNP复合物,α-和β-胞衬蛋白,胰岛细胞自身抗原,聚(ADP)核糖聚合酶(PARP),NuMA,NOR-90,Ro60自身抗原和p27抗原;
·在与红斑狼疮相关的每种情形中:Ro60自身抗原,低密度脂蛋白,U-1小核核糖核蛋白复合物的Sm抗原(B/B′,D1,D2,D3,E,F,G),和RNP核糖核蛋白;
·在与动脉粥样硬化相关的每种情形中:oxLDL,β(2)GPI,HSP60/65和oxLDL/β(2)GPI;
·与特发性扩张型心肌病(DCM)相关的心脏β(1)-肾上腺素能受体;
·与肌炎相关的组氨酰-tRNA合酶(HisRS);
·与硬皮病相关的拓扑异构酶I。
此外,在其他实施方案中,所述抗原与相应的自身免疫病相关,如例如由参与所述自身免疫病(诸如本文所述的任意自身免疫病)中的自身免疫应答的免疫细胞所表达的例如IL-17、热休克蛋白和/或任意独特型致病性T细胞或趋化因子受体。
d)与癌症或肿瘤疾病相关的抗原(“肿瘤抗原”):
在这一情形中,“肿瘤抗御”是优选位于(肿瘤)细胞表面上的抗原。肿瘤抗原还可以选自与正常细胞相比在肿瘤细胞中过量表达的蛋白。此外,肿瘤抗原还包括在这样的细胞中表达的抗原,所述细胞自身不(或初始自身不)退化而是与假定的肿瘤相关。此处也包括与供应肿瘤血管或其(再)形成相关的抗原,特别是与新血管形成相关的那些抗原,例如,生长因子,诸如VEGF,bFGF等。与肿瘤相关的抗原还包括来自典型地嵌入肿瘤的细胞或组织的抗原。此外,一些物质(通常是蛋白或肽)在(已知或未知)患有癌症疾病的患者中表达,并且其在所述患者的体液中以增加的浓度存在。这些物质也称为“肿瘤抗原”,然而,在诱导免疫应答的物质的严格意义上,它们不是抗原。这类肿瘤抗原可以进一步分为肿瘤-特异性抗原(TSAs)和肿瘤-相关的-抗原(TAAs)。TSAs可以仅由肿瘤细胞呈递而从不由正常的“健康”细胞呈递。它们典型地由肿瘤特异性突变产生。更普遍的TAAs通常由肿瘤和健康细胞二者呈递。这些抗原被细胞毒性T细胞识别,并且抗原-呈递细胞可以被细胞毒性T细胞破坏。另外,肿瘤抗原还可以以例如突变的受体的形式存在于肿瘤表面上。在上述情形中,它们可以被抗体识别。特别优选的肿瘤抗原选自由下述组成的组:5T4,707-AP,9D7,AFP,AlbZIPHPG1,α-5-β-1-整联蛋白,α-5-β-6-整联蛋白,α-辅肌动蛋白-4/m,α-甲基酰基-辅酶A消旋酶,ART-4,ARTC1/m,B7H4,BAGE-1,BCL-2,bcr/abl,β-连环蛋白/m,BING-4,BRCA1/m,BRCA2/m,CA 15-3/CA 27-29,CA 19-9,CA72-4,CA125,钙网蛋白,CAMEL,CASP-8/m,组织蛋白酶B,组织蛋白酶L,CD19,CD20,CD22,CD25,CDE30,CD33,CD4,CD52,CD55,CD56,CD80,CDC27/m,CDK4/m,CDKN2A/m,CEA,CLCA2,CML28,CML66,COA-1/m,毛状蛋白(coactosin)-样蛋白,collage XXIII,COX-2,CT-9/BRD6,Cten,细胞周期蛋白B1,细胞周期蛋白D1,cyp-B,CYPB1,DAM-10,DAM-6,DEK-CAN,EFTUD2/m,EGFR,ELF2/m,EMMPRIN,EpCam,EphA2,EphA3,ErbB3,ETV6-AML1,EZH2,FGF-5,FN,Frau-1,G250,GAGE-1,GAGE-2,GAGE-3,GAGE-4,GAGE-5,GAGE-6,GAGE7b,GAGE-8,GDEP,GnT-V,gp100,GPC3,GPNMB/m,HAGE,HAST-2,hepsin,Her2/neu,HERV-K-MEL,HLA-A*0201-R17I,HLA-A11/m,HLA-A2/m,HNE,同源异型框NKX3.1,HOM-TES-14/SCP-1,HOM-TES-85,HPV-E6,HPV-E7,HSP70-2M,HST-2,hTERT,iCE,IGF-1R,IL-13Ra2,IL-2R,IL-5,不成熟的层粘连蛋白受体,激肽释放酶-2,激肽释放酶-4,Ki67,KIAA0205,KIAA0205/m,KK-LC-1,K-Ras/m,LAGE-A1,LDLR-FUT,MAGE-A1,MAGE-A2,MAGE-A3,MAGE-A4,MAGE-A6,MAGE-A9,MAGE-A10,MAGE-A12,MAGE-B1,MAGE-B2,MAGE-B3,MAGE-B4,MAGE-B5,MAGE-B6,MAGE-B10,MAGE-B16,MAGE-B17,MAGE-C1,MAGE-C2,MAGE-C3,MAGE-D1,MAGE-D2,MAGE-D4,MAGE-E1,MAGE-E2,MAGE-F1,MAGE-H1,MAGEL2,乳珠蛋白(mammaglobin)A,MART-1/melan-A,MART-2,MART-2/m,基质蛋白22,MC1R,M-CSF,ME1/m,间皮素,MG50/PXDN,MMP11,MN/CA IX-抗原,MRP-3,MUC-1,MUC-2,MUM-1/m,MUM-2/m,MUM-3/m,I类肌球蛋白/m,NA88-A,N-乙酰葡糖氨基转移酶-V,Neo-PAP,Neo-PAP/m,NFYC/m,NGEP,NMP22,NPM/ALK,N-Ras/m,NSE,NY-ESO-1,NY-ESO-B,OA1,OFA-iLRP,OGT,OGT/m,OS-9,OS-9/m,骨钙素,骨桥蛋白,p15,p190小bcr-abl,p53,p53/m,PAGE-4,PAI-1,PAI-2,PAP,PART-1,PATE,PDEF,Pim-1-激酶,Pin-1,Pml/PARα,POTE,PRAME,PRDX5/m,prostein,蛋白酶-3,PSA,PSCA,PSGR,PSM,PSMA,PTPRK/m,RAGE-1,RBAF600/m,RHAMM/CD168,RU1,RU2,S-100,SAGE,SART-1,SART-2,SART-3,SCC,SIRT2/m,Sp17,SSX-1,SSX-2/HOM-MEL-40,SSX-4,STAMP-1,STEAP,生存素,生存素-2B,SYT-SSX-1,SYT-SSX-2,TA-90,TAG-72,TARP,TEL-AML1,TGFβ,TGFβRII,TGM-4,TPI/m,TRAG-3,TRG,TRP-1,TRP-2/6b,TRP/INT2,TRP-p8,酪氨酸酶,UPA,VEGF,VEGFR1,VEGFR-2/FLK-1,和WT1。所述肿瘤抗原优选地可以选自由下述组成的组:p53,CA125,EGFR,Her2/neu,hTERT,PAP,MAGE-A1,MAGE-A3,间皮素,MUC-1,NY-ESO-1,GP100,MART-1,酪氨酸酶,PSA,PSCA,PSMAVEGF,VEGFR1,VEGFR2,Ras,CEA或WT1,并且更优选地选自PAP,NY-ESO-1,MAGE-A3,WT1和MUC-1。
在这一情形中,并且对于本发明所有方面的某些实施方案,与癌症或肿瘤疾病相关的抗原不包括:(x)独特型免疫球蛋白(独特型抗体或独特型B细胞受体);或(y)独特型T细胞受体,并且任选地不是此类抗原的片段、变体和/或衍生物。
此外,所述至少一种抗原,如果在某些实施方案中被提供为蛋白或肽抗原,其不是模式抗原卵清蛋白或卵清蛋白的片段,诸如卵清蛋白衍生的肽SIINFEKL(SEQ ID NO:116)。
本发明的药物组合物中的至少一种抗原可以提供为蛋白或肽,或可以由核酸编码,例如,由DNA(例如,质粒DNA或病毒DNA)或RNA(例如,mRNA或病毒RNA)编码。优选地,所述至少一种抗原提供为蛋白或肽,或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物。在某些实施方案中,所述蛋白或肽抗原(或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物)包含在、提供为或来源于确定的样品,例如,具有已知数量的组分或组分的组成的样品。例如,在每种情形中,所述蛋白或肽抗原不包含在;或不提供为;或不来源于其他组分(例如,未限定的其他组分)的混合物,诸如作为灭活的或减毒的病毒或病原体(诸如,在每种情形中,本文所述的任一种)的制剂的混合物。例如,用于本发明任一方面的抗原可以是,或可以提供为,分离的和/或纯化的蛋白或肽抗原。如普通技术人员应该理解的,分离的(和/或纯化的)抗原包括这样的抗原,所述抗原存在于(或提供在)具有少于约40%,30%,20%,10%,5%,2%或1%不需要的或指定的其他组分(诸如其他蛋白/肽或杂质)的(起始)组合物中。
例如,蛋白或肽抗原可以按下述制备。
上述蛋白或肽抗原,可以使用重组生产方法制备,诸如本文所述的那些方法,或者例如在普通技术人员已知的分子生物学方法的辅助下进行。适当地,所述抗原可以描述为“重组蛋白抗原”和/或“重组肽抗原”。
备选地,上述蛋白或肽(例如,片段、结构域、表位或蛋白抗原和/或肽类似物)可以使用肽合成方法制备,诸如本文所述的那些方法,或例如使用普通技术人员已知的其他方法制备。适当地,所述抗原可以描述为“合成的蛋白抗原”和/或“合成的肽抗原”。
在所述至少一种抗原被提供为蛋白或肽抗原(或其片段、变体和/或衍生物)的情形中,在第一备选方案中,所述肽或蛋白抗原可以提供在本发明的药物组合物中的单独的组分中。在所述至少一种蛋白或肽抗原不是所述聚合载体货物复合物的一部分的情形中,或者换言之,在该情形中,所述聚合载体货物复合物不包含所述至少一种抗原。在第二备选方案中,所述至少一种蛋白或肽抗原可以提供为聚合载体货物复合物的组分。在该情形中,所述肽或蛋白抗原可以在本文所述的制备聚合载体货物复合物的方法的聚合步骤c)中加入到所述聚合载体货物复合物中。由此,所述肽或蛋白抗原整合到所述聚合载体货物复合物中。在该情形中,特别优选的是所述肽或蛋白抗原携带至少一个SH-结构部分用以与所述聚合载体货物复合物中的聚合载体的其他组分聚合。此外,在另一个备选方案中,蛋白或肽抗原提供为所述聚合载体货物复合物的聚合载体的组分,并且至少一种另外的蛋白或肽抗原(相同或不同)提供在本发明的药物组合物的分开的组分中,其不是所述聚合载体货物复合物的一部分。
另外,所述至少一种抗原(或其片段、变体和/或衍生物)可以以编码所述至少一种抗原(或其片段、变体和/或衍生物)的核酸的形式提供在本发明的药物组合物中。
在这一情形中,编码所述至少一种抗原(或其片段、变体和/或衍生物)的核酸可以如上文公开那样定义为包含在用作本发明的药物组合物中的佐剂的聚合载体货物复合物中核酸货物。因此,也明确包括本文定义的核酸的片段、变体、衍生物和修饰。
所述至少一种抗原(或其片段、变体和/或衍生物),如果已编码所述至少一种抗原(或其片段、变体和/或衍生物)的核酸的形式提供在本发明的药物组合物中,可以用技术人员已知的所有用于核酸合成的方法制备。特别优选的是本文所定义的核酸合成方法。
此外,在该情形中,存在两种备选方案。第一备选方案提供编码作为所述聚合载体货物复合物的一部分(例如,核酸货物分子)的所述至少抗原的核酸,第二备选方案提供编码作为本发明的药物组合物的分开的组分的所述至少一种抗原的核酸。因此,在该情形中,编码所述至少一种抗原的核酸不是所述聚合载体货物复合物的一部分。
在本发明的另一个实施方案中,由核酸编码的所述至少一种抗原(或其片段、变体和/或衍生物)可以提供作为(佐剂)聚合载体货物复合物的一部分(例如,作为编码所述至少一种抗原的核酸货物),并且另外地,由核酸编码的抗原可以提供在不是所述聚合载体货物复合物的一部分的分开的组分中。
本发明还提供下述备选方案,至少一种抗原提供为核酸(作为聚合载体货物复合物的一部分或不作为其一部分),并且所述至少一种另外的抗原提供为蛋白或肽抗原(作为聚合载体货物复合物的一部分或不作为其一部分)。
作为另一个实施方案,所述至少一种抗原,如果提供为蛋白或肽或提供为编码所述至少一种抗原的核酸,可以进一步包含或编码本文定义的信号肽。
药物组合物可以包含至少一种另外的药物活性组分作为另一种成分。在该方面中的药物活性成分是具有治疗作用的化合物,所述治疗作用治愈、减轻或预防特定的适应证,优选是肿瘤或癌症疾病、自身免疫病、变态反应或传染病。所述化合物包括,不暗示任何限制,肽或肽,优选如本文定义,核酸,优选如本文定义,(治疗活性的)低分子量有机或无机化合物(分子量小于5000,优选小于1000),糖,抗原或抗体,优选如本文定义,现有技术已知的治疗剂,抗原性细胞,抗原性细胞片段,细胞级分;细胞壁成分(例如,多糖),修饰的、减毒的或去活性的(例如,化学去活性或通过辐照)病原体(病毒、细菌等),佐剂,优选如本文定义,等等。
此外,本发明的药物组合物可以包含药用载体和/或赋形剂。在本发明的情形中,药用载体典型地包括药物组合物的液体或非液体基础。如果所述药物组合物以液体形式提供,则所述载体典型地是不含致热原的水;等渗的盐水或缓冲的(水性)溶液,例如,磷酸、柠檬酸等缓冲的溶液。参考特定的参比介质,注射缓冲液可以是高渗的、等渗的或低渗的,即,参考特定的参比介质,缓冲液可以具有更高、相等的或更低的盐含量,其中,优选可以使用前述盐的所述浓度,其不引起由于渗透性或其他浓度作用导致的细胞损害。参比介质是,例如,在“体内”方法中存在的液体,诸如血液、淋巴、细胞质液体,或其他体液,或提供可以在“体外”方法用作参比介质的液体,诸如常规的缓冲液或液体。所述常规的缓冲液或液体是技术人员已知的。
然而,一种或多种相容的固体或液体填充剂或稀释剂或包封化合物也可以用于药物组合物,其适于施用给待治疗的患者。术语“相容的”用作本文中意指药物组合物的这些组成成分能够与本文定义的聚合载体货物复合物以这样的方式混合,所述方式是指不发生将基本上减少所述药物组合物在典型应用条件下的药物有效性的相互作用。药用载体、填充剂和稀释剂当然必须具有充分高的纯度和充分地的毒性,足以使得其适于施用给待治疗的人。可以用作药用载体、填充剂或其组成成分的一些化合物的实例是糖,诸如,例如,乳糖,葡萄糖和蔗糖;淀粉,诸如例如,玉米淀粉或马铃薯淀粉;纤维素及其衍生物,诸如例如,羧甲基纤维素钠,乙基纤维素,乙酸纤维素;粉末状黄蓍胶;麦芽;明胶;动物脂;固体助流剂,诸如例如,硬脂酸,硬脂酸镁;硫酸钙;植物油,诸如,例如,花生油,棉籽油,芝麻油,橄榄油,玉米油和可可油(oil from theobroma);多元醇,诸如,例如,聚丙二醇,甘油,山梨醇,甘露醇和聚乙二醇;褐藻酸。
按照一个具体的实施方案,本发明的药物组合物可以包含(另外的)佐剂。在该情形中,佐剂可以理解为适于起始或增加先天性免疫系统的免疫应答(即,非特异性免疫应答)的任意化合物。换言之,当施用时,所述药物组合物典型地引发由任选地包含在其中的佐剂引起的先天性免疫应答。所述佐剂可以选自技术人员已知并且适于本情形的的任一种佐剂,即,支持在哺乳动物中诱导先天性免疫应答。
本发明的药物组合物可以口服、肠胃外、通过吸入喷雾、局部、直肠、鼻腔、口腔、阴道或经由植入型储库(implanted reservoir)施用。术语肠胃外用于本文中时包括皮下、静脉内、肌内、关节内、结节内、滑液内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内、颅内、经皮、皮内、肺内、腹膜内、心内、动脉内和舌下注射或灌输技术。
优选地,本发明的药物组合物通过肠胃外注射,更优选通过皮下、静脉内、肌内、关节内、结节内、滑液内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内、颅内、经皮、皮内、肺内、腹膜内、心内、动脉内和舌下注射或经由灌输技术施用。特别优选的是皮内、皮下和肌内注射。药物组合物的无菌可注射形式可以是水性或油质混悬液。这些混悬液可以根据本领域中已知的技术,使用适合的分散剂或湿润剂和悬浮剂来配制。所述无菌可注射制剂还可以是处于无毒可肠胃外用稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液或混悬液,例如如处于1,3-丁二醇中的溶液。可以使用的可用赋形剂和溶剂为水、林格氏溶液和等渗氯化钠溶液。另外,无菌不挥发性油常规用作溶剂或悬浮介质。为了该目的,可以使用任何温和的不挥发性油,包括合成的单甘油酯或双甘油酯。脂肪酸,诸如油酸及其甘油酯衍生物有效用于制备注射剂,天然的药用油,诸如橄榄油或蓖麻油,特别是处于其聚氧乙烯化形式时也有效用于制备注射剂。这些油溶液或混悬液还可以包含长链醇稀释剂或分散剂,诸如羧甲基纤维素或常规用于配制药用剂型(包括乳剂和混悬液)的类似分散剂。其他常用的表面活性剂,诸如Tweens,Spans和常规用于制备药用固体、液体、或其剂型的其他乳化剂或生物适用性增强剂也可以用于配制所述药物组合物的目的。
如上定义的本发明的药物组合物还可以以任何口服可接受的剂型,包括但不仅限于,胶囊剂、片剂、水性混悬液或溶液口服施用。在用于口服使用的片剂的情形中,常用的载体包括乳糖和玉米淀粉。还典型地添加润滑剂,诸如硬脂酸镁。对于以胶囊剂形式口服施用,有效的稀释剂包括乳糖和干玉米淀粉。当需要水性混悬液来口服使用时,活性成分,即所述聚合载体货物复合物,与乳化剂和混悬剂组合。如果需要,还可以添加某些甜味剂、调味剂或着色剂。
本发明的药物组合物还可以局部施用,特别是当治疗靶标包括容易通过局部施用接近的区域或器官,例如包括皮肤或任何其他可接近的上皮组织的疾病时。合适的局部制剂对于这些区域或器官的每一个容易地制备。为了局部施用,药物组合物可以以合适的膏剂来配制,所述膏剂包含悬浮或溶解在一种或多种载体中的聚合载体货物复合物。用于局部施用的载体包括,但不仅限于,矿物油,液体石蜡、白软石蜡、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蜡和水。备选地,药物组合物可以以合适的洗剂或乳膏剂来配制。在本发明的上下文中,合适的载体包括,但不仅限于,矿物油、脱水山梨醇单硬脂酸酯、聚山梨醇酯60、十六烷基酯蜡、鲸蜡硬脂醇、2-辛基十二醇、苯甲醇和水。
本发明的药物组合物典型地包含“安全且有效量”的药物组合物的组分,特别是本文定义的聚合载体货物复合物或核酸本身。用于本文中时,“安全且有效量”意指足以显著诱导如本文中定义的疾病或病症的正向改善的所述聚合载体货物复合物的量。然而,同时,“安全且有效量”足够小到避免严重的副作用,并且允许合理的优势和风险之间的关系。这些限制的决定典型地属于合理的医学判断范围之内。所述药物组合物的组分,特别是本文定义的聚合载体货物复合物或至少一种抗原的“安全且有效的量”,在本文中还应该关于具体的待治疗病症以及还随着待治疗患者的年龄和身体状态、体重、一般健康、性别、饮食、施药时间、排泄速度、药物组合、所述聚合载体货物复合物或所述抗原的活性、病症的严重性、治疗的持续时间、附随治疗的性质、所用的具体的药用载体、和类似因素,在陪同医生的知识和经验范围内而变化。药物组合物可以用于人类医学并还可以用于兽医目的,优选用于人类医学目的,其作为一般的药物组合物或作为疫苗使用。
本发明的药物组合物可以另外包含一种或多种辅助物质,从而进一步增加其免疫原性或免疫刺激能力(如果需要的话)。由此优选地获得本文定义的(佐剂)聚合载体货物复合物和可以另外包含在本发明的药物组合物中的辅助物质的协同作用。根据辅助物质的不同类型,就此可以考虑多种机制。例如,允许树突细胞(DCs)成熟的化合物,例如脂多糖,TNF-α或CD40配体,形成第一类合适的辅助物质。一般地,可以使用以“危险信号”(LPS,GP96,等)或细胞因子,如GM-CFS的方式影响免疫系统的任何试剂作为辅助物质,其允许免疫应答以靶向方式得以增强和/或被影响。特别优选的辅助物质是细胞因子,诸如单核因子,淋巴因子,白介素或趋化因子,其进一步促进先天性免疫应答,诸如IL-1,IL-2,IL-3,IL-4,IL-5,IL-6,IL-7,IL-8,IL-9,IL-10,IL-12,IL-13,IL-14,IL-15,IL-16,IL-17,IL-18,IL-19,IL-20,IL-21,IL-22,IL-23,IL-24,IL-25,IL-26,IL-27,IL-28,IL-29,IL-30,IL-31,IL-32,IL-33,INF-α,IFN-β,INF-γ,GM-CSF,G-CSF,M-CSF,LT-β或TNF-α,生长因子,诸如hGH。
可以包含在本发明的药物组合物中的另外的添加剂是乳化剂,如,例如,湿润剂,如,例如,十二烷基硫酸钠;着色剂;赋味剂,药物载体;片剂形成剂;稳定剂;抗氧化剂;防腐剂。
本发明的药物组合物还可以另外包含任何其他化合物,所述化合物已知由于其与人Toll样受体TLR1,TLR2,TLR3,TLR4,TLR5,TLR6,TLR7,TLR8,TLR9,TLR10的结合亲和性(作为配体),或由于其与鼠Toll样受体TLR1,TLR2,TLR3,TLR4,TLR5,TLR6,TLR7,TLR8,TLR9,TLR10,TLR11,TLR12或TLR13的结合亲和性(作为配体)而具有免疫刺激性。
本发明的药物组合物还可以另外或备选地包含免疫刺激性RNA,即,来源于免疫刺激性RNA的RNA,其引发或增强(先天性)免疫应答。优选地,所述免疫刺激性RNA可以通常如前文所定义。
在该情形中,可以加入到本发明的药物组合物中的另一类化合物可以是CpG核酸,特别是CpG-RNA或CpG-DNA。CpG-RNA或CpG-DNA可以是单链CpG-DNA(ss CpG-DNA),双链CpG-DNA(dsDNA),单链CpG-RNA(ss CpG-RNA)或双链CpG-RNA(ds CpG-RNA)。所述CpG核酸优选地以CpG-RNA的形式,更优选地以单链CpG-RNA(ss CpG-RNA)的形式存在。所述CpG核酸优选地包含至少一个或多个(促有丝分裂)的胞嘧啶/鸟嘌呤二核苷酸序列(CpG基序)。根据第一个优选的备选方案,包含在这些序列中的至少一种CpG基序,即CpG基序的C(胞嘧啶)和G(鸟嘌呤)是未甲基化的。任选地包含在这些序列中的所有其它胞嘧啶或鸟嘌呤可以是甲基化或未甲基化的。然而,根据另一个优选的备选方案,CpG基序的C(胞嘧啶)和G(鸟嘌呤)也可以以甲基化形式存在。
在本发明的情形中,包含在本发明的药物组合物中的聚合载体货物复合物中的核酸货物优选如上文定义。更优选地,所述聚合载体货物复合物(优选地包含在所述药物组合物中)的核酸,典型地是本文定义的免疫刺激性核酸,例如,CpG-DNA或免疫刺激性RNA(isRNA),优选isRNA。备选地或另外地,所述聚合载体货物复合物(优选地包含在所述药物组合物中)的核酸,是本文定义的编码核酸序列,优选是cDNA或mRNA,更优选地编码优选地如本文定义的佐剂蛋白。在这一情形中,所述聚合载体货物复合物,典型地在待治疗的患者中起始先天性免疫应答。
在这一情形的具体的实施方案中,优选的是佐剂蛋白是所述聚合载体货物复合物的组分,并且优选地是所述聚合载体的组分。
按照另一方面,本发明还提供试剂盒,特别是部件的试剂盒,其包含单独的各组分或与任选地其他成分组合的各组分,并且包含下述(作为第一组分):
(A)聚合载体货物复合物,所述聚合载体货物复合物包含:
a)(作为载体的)包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成;和
b)(作为货物的)至少一种核酸分子。
和下述(作为第二组分):
(B)至少一种抗原,所述抗原选自:
(i)来自与传染病相关的病原体的抗原;
(ii)与变态反应或变应性疾病相关的抗原;
(iii)与自身免疫病相关的抗原;和
(iv)与癌症或肿瘤疾病相关的抗原,其中在一些实施方案中,所述与癌症或肿瘤疾病相关的抗原是除包含下述的抗原之外的另一种抗原:(x)独特型免疫球蛋白(例如,独特型抗体或独特型B细胞受体);或(y)至少一种独特型T细胞受体,
或所述抗原的片段、变体和/或衍生物,
在本文任何地方定义的每种情形中,以及在任选地具有关于所述聚合载体货物复合物和所述至少一种抗原的施用和剂量的技术使用说明书,所述试剂盒,优选部件的试剂盒,例如可以应用于本文定义的任意应用或用途。所述试剂盒,当以部件的试剂盒存在时,还可以在所述试剂盒的不同部件中包含本发明的药物组合物的每种组分。
在本发明的试剂盒的特定实施方案中,所述抗原是包含在疫苗中。
本发明还提供本发明的药物组合物(例如,佐剂化的疫苗)或本文任意地方定义的包含其的试剂盒或部件的试剂盒的一些应用和用途。
在这一情形中,本发明还提供转染和/或治疗细胞、组织或生物体的方法,由此应用或施用本发明的药物组合物特别用于治疗目的。在这一情形中,典型地在制备本发明的药物组合物之后,本发明的药物组合物优选施用给细胞、组织或生物体,优选使用本文所述的任何施用模式施用。用于转染和/或治疗细胞的方法可以在体外、体内或离体进行。
此外,本发明提供在本文任意地方定义的每种情形中的药物组合物或试剂盒或部件的试剂盒在治疗中和/或作为药物,优选作为疫苗诸如佐剂化的疫苗的应用。
此外,在本发明所有方面的特定实施方案中,所述至少一种抗原不是选自:(x)独特型免疫球蛋白(独特型抗体或独特型B细胞受体);或(y)至少一种独特型T细胞受体;并且任选地不是此类抗原的片段、变体和/或衍生物。
在本发明的这一方面中,在本文任意地方定义的每种情形中,特别优选的是本发明的药物组合物或如本文定义的包含其的试剂盒或部件的试剂盒在治疗传染病、变态反应或变应性疾病、自身免疫病和癌症或肿瘤疾病中的应用。
在这一情形中,传染病优选是病毒、细菌或原生动物传染病。所述传染病,优选(病毒、细菌或原生动物)传染病,典型地选自由下述组成的列表:不动杆菌属(Acinetobacter)感染,非洲昏睡病(African sleeping sickness)(非洲锥虫病(Africantrypanosomiasis)),AIDS(获得性免疫缺陷综合症(Acquired immunodeficiencysyndrome)),阿米巴疾病(Amoebiasis),微粒孢子虫病(Anaplasmosis),炭疽(Anthrax),阑尾炎(Appendicitis),溶血隐秘杆菌(Arcanobacterium haemolyticum)感染,阿根廷出血热(Argentine hemorrhagic fever),蛔虫病(Ascariasis),曲霉菌病(Aspergillosis),星状病毒属(Astrovirus)感染,足癣(Athlete′s foot),巴贝虫病(Babesiosis),蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)感染,细菌性脑膜炎(Bacterial meningitis),细菌性肺炎(Bacterial pneumonia),细菌性阴道病(Bacterial vaginosis,BV),拟杆菌属(Bacteroides)感染,小袋虫病(Balantidiasis),贝利蛔线虫属(Baylisascaris)感染,血吸虫病(Bilharziosis),BK病毒感染,黑色毛结节菌病(Black piedra),人芽囊原虫(Blastocystis hominis)感染,芽生菌病(Blastomycosis),玻利维亚出血热(Bolivianhemorrhagic fever),疏螺旋体属(Borrelia)感染(疏螺旋体病(Borreliosis)),肉毒中毒(Botulism)(以及婴儿型肉毒中毒(Infant botulism)),牛绦虫(Bovine tapeworm),巴西出血热(Brazilian hemorrhagic fever),布鲁杆菌病(Brucellosis),伯克霍尔德氏菌(Burkholderia)感染,布路里溃疡(Buruli ulcer),杯状病毒(Calicivirus)感染(诺如病毒和Sapovirus),弯曲菌病(Campylobacteriosis),念珠菌病(Candidiasis)(Candidosis),犬绦虫(Canine tapeworm)感染,猫抓病(Cat-scratch disease),Chagas病(美洲锥虫病(American trypanosomiasis)),软下疳(Chancroid),水痘(Chickenpox),衣原体(Chlamydia)感染,沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)感染,肺炎衣原体(Chlamydophila pneumoniae)感染,霍乱(Cholera),着色真菌病(Chromoblastomycosis),腹股沟淋巴肉芽肿(Climatic bubo),华支睾吸虫病(Clonorchiasis),艰难梭菌(Clostridium difficile)感染,球孢菌病(Coccidioidomycosis),感冒(Cold),科罗拉多蜱传热(Colorado tick fever,CTF),普通感冒(Common cold)(急性病毒性鼻咽炎(Acuteviral rhinopharyngitis);急性鼻炎(Acute coryza)),尖锐湿疣(Condylomaacuminata),结膜炎(Conjunctivitis),克-雅病(Creutzfeldt-Jakob disease,CJD),克里米亚-刚果出血热(Crimean-Congo hemorrhagic fever,CCHF),隐球菌病(Cryptococcosis),隐孢子虫病(Cryptosporidiosis),皮肤幼虫移行症(Cutaneous larvamigrans,CLM),皮肤利什曼虫病(Cutaneous Leishmaniosis),环孢子虫感染(Cyclosporiasis),囊虫病(Cysticercosis),巨细胞病毒(Cytomegalovirus)感染,登革热(Dengue fever),脚气(Dermatophytosis),双核阿米巴病(Dientamoebiasis),白喉(Diphtheria),裂头绦虫病(Diphyllobothriasis),Donavanosis,龙线虫病(Dracunculiasis),早夏季脑膜脑炎(Early summer meningoencephalitis,FSME),埃博拉病毒出血热(Ebola hemorrhagic fever),棘球蚴病(Echinococcosis),埃里希体病(Ehrlichiosis),蛲虫病(Enterobiasis)(蛲虫(Pinworm)感染),肠球菌(Enterococcus)感染,肠道病毒(Enterovirus)感染,流行性斑疹伤寒(Epidemic typhus),会厌炎(Epiglottitis),埃巴病毒传染性单核细胞增多症(Epstein-Barr Virus InfectiousMononucleosis),传染性红斑(Erythema infectiosum)(第五大病),幼儿急疹(Exanthemsubitum),姜片虫病(Fasciolopsiasis),片形吸虫病(Fasciolosis),家族致命性失眠症(Fatal familial insomnia,FFI),第五大病,丝虫病(Filariasis),鱼肉中毒(Fishpoisoning)(鱼肉和蚌肉毒(Ciguatera)),鱼绦虫(Fish tapeworm),流感(Flu),产气荚膜梭菌引起的食物中毒(Food poisoning by Clostridium perfringens),狐狸绦虫(Foxtapeworm),自由生活阿米巴感染(Free-living amebic infection),梭杆菌(Fusobacterium)感染,气性坏疽(Gas gangrene),地丝菌病(Geotrichosis),格-施-沙综合征(Gerstmann-Scheinker syndrome,GSS),贾第虫病(Giardiasis),马鼻疽(Glanders),颚口线虫病(Gnathostomiasis),淋病(Gonorrhea),腹股沟肉芽肿(Granulomainguinale)(腹股沟肉芽肿(Donovanosis)),A组链球菌感染,B组链球菌感染,流感嗜血菌(Haemophilus influenzae)感染,手足口病(Hand foot and mouth disease,HFMD),汉坦病毒肺综合征(Hantavirus Pulmonary Syndrome,HPS),幽门螺杆菌(Helicobacterpylori)感染,溶血尿毒症综合征(Hemolytic-uremic syndrome,HUS),肾综合征出血热(Hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS),亨尼病毒(Henipavirus)感染,甲型肝炎(Hepatitis A),乙型肝炎(Hepatitis B),丙型肝炎(Hepatitis C),丁型肝炎(Hepatitis D),戊型肝炎(Hepatitis E),单纯疱疹(Herpes simplex),I型单纯疱疹,II型单纯疱疹,带状疱疹(Herpes zoster),组织胞浆菌病(Histoplasmosis),空心疣(Hollowwarts),钩虫(Hookworm)感染,人博卡病毒感染,人ewingii埃里希体病(Human ewingiiehrlichiosis),人粒细胞微粒孢子虫病(Human granulocytic anaplasmosis,HGA),人变性肺病毒(metapneumovirus)感染,人单核细胞埃里希体病(Human monocyticehrlichiosis),人乳头瘤病毒(HPV)感染,人副流感病毒感染,膜壳绦虫病(Hymenolepiasis),流感(Influenza),等孢子球虫病(Isosporiasis),日本脑炎(Japaneseencephalitis),川崎病(Kawasaki disease),角膜炎(Keratitis),金氏金氏杆菌(Kingella kingae)感染,库鲁病(Kuru),兰伯鞭毛虫病(Lambliasis)(贾第虫病(Giardiasis)),拉沙热(Lassa fever),军团杆菌病(Legionellosis)(军团病(Legionnaires′disease),庞蒂亚克热(Pontiac fever)),利什曼病(Leishmaniasis),麻风(Leprosy),钩端螺旋体病(Leptospirosis),虱(Lice),李斯特菌病(Listeriosis),莱姆包柔氏体螺旋病(Lyme borreliosis),莱姆病(Lyme disease),淋巴性丝虫病(Lymphaticfilariasis)(象皮肿(Elephantiasis)),淋巴细胞性脉络丛脑膜炎(Lymphocyticchoriomeningitis),疟疾(Malaria),马尔堡出血热(Marburg hemorrhagic fever,MHF),马尔堡病毒(Marburg virus),麻疹(Measles),类鼻疽(Melioidosis)(惠特莫尔病(Whitmore′s disease)),脑膜炎(Meningitis),脑膜炎球菌病(Meningococcal disease),后殖吸虫病(Metagonimiasis),微孢子虫病(Microsporidiosis),微小绦虫(Miniaturetapeworm),流产(Miscarriage)(前列腺炎症(prostate inflammation)),触染性软疣(Molluscum contagiosum,MC),单核细胞增多症(Mononucleosis),流行性腮腺炎(Mumps),鼠型斑疹伤寒(Murine typbus)(地方性斑疹伤寒(Endemic typhus)),马杜拉分枝菌病(Mycetoma),支原体人型(Mycoplasma hominis),支原体肺炎(Mycoplasma pneumonia),蝇蛆病(Myiasis),尿布皮炎(Nappy/diaper dermatitis),新生儿结膜炎(Neonatalconjunctivitis)(新生儿眼炎(Ophthalmia neonatorum)),新生儿脓毒症(Neonatalsepsis)(绒毛膜羊膜炎(Chorioamnionitis)),诺卡菌病(Nocardiosis),坏疽性口炎(Noma),诺沃克病毒(Norwalk virus)感染,盘尾丝虫病(Onchocerciasis)(河盲(Riverblindness)),骨髓炎(Osteomyelitis),中耳炎(Otitis media),副球孢子菌病(Paracoccidioidomycosis)(南美芽生菌病(South American blastomycosis)),并殖吸虫病(Paragonimiasis),副伤寒(Paratyphus),巴斯德菌病(Pasteurellosis),头虱病(Pediculosis capitis)(头虱(Head lice)),体虱病(Pediculosis corporis)(体虱(Bodylice)),阴虱病(Pediculosis pubis)(阴虱(Pubic lice),螃蟹虱(Crab lice)),盆腔炎性疾病(Pelvic inflammatory disease,PID),百日咳(Pertussis)(Whooping cough),传染性单核细胞增多症(Pfeiffer′s glandular fever),鼠疫(Plague),肺炎球菌(Pneumococcal)感染,肺囊虫肺炎(Pneumocystis pneumonia,PCP),肺炎(Pneumonia),小儿麻痹症(Polio)(儿童期残废(childhood lameness)),脊髓灰质炎(Poliomyelitis),猪绦虫(Porcine tapeworm),Prevotella感染,原发性阿米巴脑膜脑炎(Primary amoebicmeningoencephalitis,PAM),进行性多病灶脑白质病(Progressive multifocalleukoencephalopathy),假格鲁布(Pseudo-croup),鹦鹉热(Psittacosis),Q热(Q fever),兔热病(Rabbit fever),狂犬病(Rabies),鼠咬热(Rat-bite fever),莱特尔综合征(Reiter′s syndrome),呼吸道合胞病毒感染(RSV),鼻孢子菌病(Rhinosporidiosis),鼻病毒(Rhinovirus)感染,立克次体(Rickettsial)感染,立克次体痘(Rickettsialpox),裂谷热(Rift Valley fever,RVF),洛矶山斑疹热(Rocky mountain spotted fever,RMSF),轮状病毒(Rotavirus)感染,风疹(Rubella),副伤寒沙门氏菌(Salmonella paratyphus),伤寒沙门氏菌(Salmonella typhus),沙门菌病(Salmonellosis),SARS(严重急性呼吸综合征(Severe Acute Respiratory Syndrome)),疥疮(Scabies),猩红热(Scarlet fever),血吸虫病(Schistosomiasis)(裂体吸虫病(Bilharziosis)),恙虫热斑疹伤寒(Scrub typhus,Sepsis),细菌性痢疾(Shigellosis)(杆菌性痢疾(Bacillary dysentery)),带状疱疹(Shingles),天花(Smallpox)(痘症(Variola)),软下疳(Soft chancre),孢子丝菌病(Sporotrichosis),葡萄球菌食物中毒(Staphylococcal food poisoning),葡萄球菌(Staphylococcal)感染,类圆线虫病(Strongyloidiasis),梅毒(Syphilis),绦虫病(Taeniasis),破伤风(Tetanus),三日热(Three-day fever),蜱传脑炎(Tick-borneencephalitis),须癣(Tinea barbae)(触染性须疮(Barber′s itch)),头癣(Tineacapitis)(头皮癣(Ringworm of the Scalp)),体癣(Tinea corporis)(体癣(Ringworm ofthe Body)),股癣(Tinea cruris)(股部表皮癣菌病(Jock itch)),手癣(Tinea manuum)(手癣(Ringworm of the Hand)),掌黑癣(Tinea nigra),脚癣(Tinea pedis)(脚癣(Athlete’s foot)),甲癣(Tinea unguium)(甲癣(Onychomycosis)),花斑癣(Tineaversicolor)(花斑糠疹(Pityriasis versicolor)),弓蛔虫病(Toxocariasis)(眼幼虫移行症(Ocular Larva Migrans,OLM)和内脏幼虫移行症(Visceral Larva Migrans,VLM)),弓形虫病(Toxoplasmosis),旋毛虫病(Trichinellosis),滴虫病(Trichomoniasis),鞭虫病(Trichuriasis)(鞭虫(Whipworm)感染),Tripper,锥虫病(Trypanosomiasis)(非洲锥虫病(sleeping sickness)),恙虫病(Tsutsugamushi disease),肺结核(Tuberculosis),土拉菌病(Tularemia),斑疹伤寒(Typhus),斑疹伤寒热(Typhus fever),尿素分解尿素支原体(Ureaplasma urealyticum)感染,阴道炎(Vaginitis)(阴道炎(Colpitis)),变异克-雅病(Variant Creutzfeldt-Jakob disease,vCJD,nvCJD),委内瑞拉马脑炎(Venezuelanequine encephalitis),委内瑞拉出血热(Venezuelan hemorrhagic fever),病毒性肺炎(Viral pneumonia),内脏利什曼虫病(Visceral Leishmaniosis),疣(Warts),西尼罗热(West Nile Fever),西方马脑炎(Western equine encephalitis),白色毛结节菌病(White piedra)(白癣(Tinea blanca)),百日咳(Whooping cough),酵母真菌斑点(Yeastfungus spots),黄热(Yellow fever),假结核病耶尔森菌(Yersiniapseudotuberculosis)感染,耶尔森菌病(Yersiniosis)和接合菌病(Zygomycosis)。
变态反应或变应性疾病优选地选自花粉变态反应(pollen allergy)(针对草花粉、树花粉(例如,榛树、桦树、桤木、岑树的花粉)、花粉、草本花粉(例如,艾蒿的花粉)的变态反应),粉尘螨变态反应,霉菌变态反应(例如针对支顶孢属(Acremonium)、曲霉菌属(Aspergillus)、分枝孢子菌属(Cladosporium)、镰刀菌属(Fusarium)、毛霉菌属(Mucor)、青霉属(Penicillium)、根霉菌属(Rhizopus)、葡萄状穗霉属(Stachybotrys)、木霉属(Trichoderma)或链格孢属(Alternaria)的变态反应),宠物变态反应(针对动物的变态反应;例如,针对猫、狗、马的变态反应),食物变态反应(例如,针对鱼(例如,鲈鱼,鳕,比目鱼)、海产食品(例如,螃蟹,龙虾,龟)、鸡蛋、小麦、坚果(例如,花生,杏仁,腰果,核桃)、大豆、牛奶等的变态反应)或昆虫叮咬变态反应(针对昆虫毒液,例如,黄蜂、蜜蜂、大黄蜂、蚂蚁、蚊子或虱类的毒液的变态反应)。
按照另一个具体的实施方案,本文所定义的疾病包括下文定义的自身免疫病.自身免疫病优选地选自:艾迪生病(艾迪生病,Morbus Addison),斑秃,艾迪生贫血(MorbusBiermer),自身免疫性溶血性贫血(AIHA),冷型自身免疫性溶血性贫血(AIHA)(冷型血凝素病,冷型自身免疫性溶血性贫血(AIHA)(冷凝集素疾病),(CHAD)),暖型自身免疫性溶血性贫血(AIHA)(暖型AIHA,暖型自身免疫性溶血性贫血(AIHA)),自身免疫性溶血性多-兰贫血(自身免疫性溶血性多-兰贫血),抗磷脂综合征(APS),动脉粥样硬化,自身免疫性关节炎,颞动脉炎,高安动脉炎(高安病,主动脉弓病),颞动脉炎/巨细胞动脉炎,自身免疫性慢性胃炎,自身免疫性不育,自身免疫性内耳病(AIED),巴赛多病(Morbus Basedow),别赫捷列夫病(Morbus Bechterew,强直性脊柱炎,关节强硬性脊椎炎),贝赫切特综合征(MorbusBehcet),肠病,包括自身免疫性炎性肠病(包括溃疡性结肠炎(colitis ulcerosa)(克罗恩病(Morbus Crohn,Crohn′s disease)),心肌症,特别是自身免疫性心肌症,特发性扩张型心肌病(DCM),腹部口炎性腹泻皮炎(谷蛋白介导的肠病),慢性疲劳性免疫功能障碍综合征(CFIDS),慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病(CIDP),慢性多关节炎,慢性多关节炎,瘢痕性类天疱疮,耳蜗前庭综合征,CREST综合征(具有皮肤钙质沉着症、雷诺现象、食管运动障碍、sklerodaktylia和teleangiectasia的综合征),克罗恩病(Crohn’s disease)(MorbusCrohn,溃疡性结肠炎(colitis ulcerosa)),在皮肤用药性自身免疫病过程中的疱疹样皮炎,皮肌炎,糖尿病,1型糖尿病(I型糖尿病,胰岛素依赖性糖尿病),2型糖尿病(II型糖尿病),特发性混合性冷球蛋白血症,特发性混合性冷球蛋白血症,纤维肌痛,纤维肌炎,肺出血肾炎综合征(抗肺出血肾炎综合征介导的肾小球肾炎),移植物抗宿主病,吉兰-巴雷综合征(GBM,多神经根神经炎),血液性自身免疫病,桥本甲状腺炎,血友病,获得性血友病,肝炎,自身免疫性肝炎,特别是自身免疫性形式的慢性肝炎,特发性肺纤维化(IPF),特发性血小板减少性紫癜,免疫性-血小板减少性紫癜(Morbus Werlhof;ITP),IgA肾病,不育,自身免疫性不育,幼年型类风湿关节炎(Morbus Still,斯蒂尔综合征),兰伯特-伊顿综合征,扁平苔癣,硬化苔藓,红斑狼疮,系统性红斑狼疮(SLE),系统性红斑狼疮,莱姆关节炎(莱姆病,疏螺旋体关节炎),梅尼埃病(Morbus Ménierè);混合性结缔组织病(MCTD),多发性硬化(MS,弥散性脑脊髓炎,夏科病),重症肌无力(肌无力,MG),肌炎,多发性肌炎,神经性自身免疫病,神经性皮炎,寻常天疱疮,大疱性类天疱疮,瘢痕形成性类天疱疮;结节性多发性动脉炎(结节性动脉周炎),多软骨炎(全软骨炎),多腺性(自身免疫性)综合征(PGA综合征,Schmidt’s综合征),风湿性多肌痛,原发性丙种球蛋白缺乏血症,原发性胆汁性肝硬化PBC,原发性自身免疫性胆管炎),原发性自身免疫性胆管炎(PSS),银屑病,寻常性银屑病,雷诺现象,莱特尔综合征(Morbus Reiter,尿道结合滑膜综合征),类风湿性关节炎(RA,慢性多关节炎,关节的类风湿病,风湿热),结节病(Morbus Boeck,Besnier-Boeck-Schaumann病),僵体综合征,硬皮病(Sclerodermia),硬皮病,舍格伦综合征,交感性眼炎;短暂性谷蛋白耐受不良,移植器官排斥,葡萄膜炎,自身免疫性葡萄膜炎,血管炎,白癜风,(白斑病,花斑皮肤)和韦格纳病(Morbus Wegner,韦格纳肉芽肿病(Wegner’s granulomatosis))。
此外,癌症或肿瘤疾病优选地选自:黑素瘤(melanomas),恶性黑素瘤(malignantmelanomas),结肠癌(colon carcinomas),淋巴瘤(lymphomas),肉瘤(sarcomas),胚细胞瘤(blastomas),肾癌(renal carcinomas),胃肠瘤(gastrointestinal tumors),神经胶质瘤(gliomas),前列腺肿瘤(prostate tumors),膀胱癌(bladder cancer),直肠瘤(rectaltumors),胃癌(stomach cancer),食管癌(oesophageal cancer),胰腺癌(pancreaticcancer),肝癌(liver cancer),肝癌(mammary carcinomas=breast cancer),子宫癌(uterine cancer),宫颈癌(cervical cancer),急性髓性白血病(acute myeloidleukaemia,AML),急性淋巴样白血病(acute lymphoid leukaemia,ALL),慢性髓性白血病(chronic myeloid leukaemia,CML),慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocyticleukaemia,CLL),肝细胞瘤(hepatomas),多种病毒诱导的肿瘤(various virus-inducedtumors)诸如例如乳头瘤病毒诱导的癌(papilloma virus-induced carcinomas)(例如宫颈癌(cervical carcinoma=cervical cancer)),腺癌(adenocarcinomas),疱疹病毒诱导的肿瘤(herpes virus-induced tumors)(例如,伯基特淋巴瘤(Burkitt′s lymphoma),EB病毒诱导的B细胞淋巴瘤(EBV-induced B-cell lymphoma)),EB病毒诱导的B细胞淋巴瘤(heptatitis B-induced tumors)(肝细胞癌(hepatocell carcinomas)),HTLV-1-和HTLV-2-诱导的淋巴瘤,听觉神经瘤(acoustic neuroma),肺癌(lung carcinomas=lung cancer=bronchial carcinoma),小细胞肺癌(small-cell lung carcinomas),喉癌(pharyngealcancer),肛门癌(anal carcinoma),成胶质细胞瘤(glioblastoma),直肠癌(rectalcarcinoma),星形细胞瘤(astrocytoma),脑瘤(brain tumors),成视网膜细胞瘤(retinoblastoma),基底细胞癌(basalioma),脑转移(brain metastases),成神经管细胞瘤(medulloblastomas),阴道癌(vaginal cancer),胰腺癌(pancreatic cancer),睾丸癌(testicular cancer),霍奇金综合征(Hodgkin′s syndrome),脑膜瘤(meningiomas),Schneeberger病,垂体瘤(hypophysis tumor),蕈样霉菌病(Mycosis fungoides),类癌瘤(carcinoids),神经鞘瘤(neurinoma),spinalioma,伯基特淋巴瘤(Burkitt′s lymphoma),喉癌(laryngeal cancer),肾癌(renal cancer),胸腺瘤(thymoma),体癌(corpuscarcinoma),骨癌(bone cancer),非霍奇金细胞淋巴瘤(non-Hodgkin′s lymphomas),尿道癌(urethral cancer),CUP综合征,头/颈肿瘤(head/neck tumors),少突神经胶质瘤(oligodendroglioma),外阴癌(vulval cancer),肠癌(intestinal cancer),结肠癌(colon carcinoma),食管癌(oesophageal carcinoma=oesophageal cancer),疣累及(wart involvement),小肠瘤(tumors of the small intestine),颅咽管瘤(craniopharyngeomas),卵巢癌(ovarian carcinoma),生殖器瘤(genital tumors),卵巢癌(ovarian cancer=ovarian carcinoma),胰腺癌(pancreatic carcinoma=pancreaticcancer),子宫内膜癌(endometrial carcinoma),肝转移(liver metastases),阴茎癌(penile cancer),舌癌(tongue cancer),胆囊癌(gall bladder cancer),白血病(leukaemia),浆细胞瘤(plasmocytoma),眼睑瘤(lid tumor),前列腺癌(prostatecancer)(=前列腺肿瘤(prostate tumors))等。
在另一个方面,本发明提供本文任意地方定义的聚合载体货物复合物,诸如包含下述的一种聚合载体货物复合物:
a)(作为载体的)包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成;和
b)(作为货物的)至少一种核酸分子,
在本文任意地方定义的每种情形中,特别是在上文定义的传染病、变态反应或变应性疾病、自身免疫病以及癌症或肿瘤疾病的治疗中,其与至少一种抗原,优选蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物组合用在治疗中。
另外,在本文任意地方定义的每种情形中,本发明提供至少一种抗原,优选蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物与本文任意地方定义的聚合载体货物复合物组合用在治疗中,所述聚合载体货物复合物诸如包含下述的一种聚合载体货物复合物:
a)(作为载体的)包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成;和
b)(作为货物的)至少一种核酸分子,
特别用在上文定义的传染病、变态反应或变应性疾病、自身免疫病以及癌症或肿瘤疾病的治疗中
在本发明的所述方面的特定实施方案中,所述抗原包含在疫苗中,诸如商购疫苗中。
在这种情形中,“组合”意指不同的组分(所述传染病、变态反应或变应性疾病、自身免疫病以及癌症或肿瘤疾病的治疗中和所述至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物)可以一起提供在相同的组合物中,或者可以单独配制在不同的组合物中,即,包含或表示本文所定义的聚合载体货物复合物的一种组合物,和包含本文定义的所述至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物的另一种组合物。如果提供在不同的组合物中,则所述聚合载体货物复合物与所述至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物可以在时间上分开施用(以时间错开的方式)和/或可以在不同的给药位点和/或通过不同的给药途径施用。这意味着所述聚合载体货物复合物可以,例如在所述至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物之前、与之同时或在其之后施用,或者反之亦然。随后的施用包括用于治疗的每种组分彼此在约48小时、24小时、12小时、8小时、6小时、4小时、2小时、1小时、30分钟、15分钟或5分钟内施用。
在另一方面,本发明提供药物包装,其包括:
(A)聚合载体货物复合物,所述聚合载体货物复合物包含:
a)(作为载体的)包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成;和
b)(作为货物的)至少一种核酸分子,
如本文任意地方所定义的,
(B)描述所述聚合载体货物复合物与本文任意地方所定义的至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物组合用于治疗的应用的使用说明书。
所述药物包装还可以包含本文任意地方所定义的至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物。
此外,在另外的实施方案中,本发明提供药物包装,其包括:
(A)在本文任意地方定义的每种情形中,至少一种抗原或其片段、变体和/或衍生物;
(B)描述所述抗原或其片段、变体和/或衍生物与本文任意地方所定义的聚合载体货物复合物组合用于治疗的应用的使用说明书。
所述药物包装还可以包含聚合载体货物复合物,所述聚合载体货物复合物包含下述:
a)(作为载体的)包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成;和
b)(作为货物的)至少一种核酸分子,
如本文任意地方定义的。
在这一情形中,本发明还提供包含在上文定义的药物包装中的组分在治疗特定疾病(适应证)中的应用,所述特定的疾病(适应证)选自上文定义的传染病、变态反应或变应性疾病、自身免疫病或癌症或肿瘤疾病。相应的疾病可以是本文任意地方所述的一种疾病。
在本发明中,如果没有另外指明,则在适当情形中,备选方案和实施方案的不同特征可以彼此组合。
综上所述,在一个优选的实施方案中,本发明涉及包含下述的药物组合物:
聚合载体货物复合物,和
至少一种蛋白或肽抗原,
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及
药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子,
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及
药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及
药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:来自与传染病相关的病原体的抗原,
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
更优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
更优选来自选自狂犬病病毒、乙型肝炎病毒、人乳头瘤病毒(hPV)的病原体的抗原;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及
药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
更优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
甚至更优选来自狂犬病病毒的抗原,更优选选自下述的来自狂犬病病毒的抗原:核蛋白(N),磷蛋白(P),基质蛋白(M),糖蛋白(G)和病毒RNA聚合酶(L);
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及
药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ IDNOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
更优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
甚至更优选来自乙型肝炎病毒的抗原,最优选选自下述的来自乙型肝炎病毒的抗原:乙型肝炎表面抗原(HBsAg),乙型肝炎核心抗原(HbcAg),乙型肝炎病毒DNA聚合酶,HBx蛋白,preS2中表面蛋白,大S蛋白,病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3和病毒蛋白VP4;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及
药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
更优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
甚至更优选来自流感病毒的抗原,更优选选自下述的来自流感病毒的抗原:流感病毒的血凝素(HA),神经氨酸酶(NA),核蛋白(NP),M1蛋白,M2蛋白,NS1蛋白,NS2蛋白(NEP蛋白:核输出蛋白),PA蛋白,PB1蛋白(聚合酶碱性1蛋白),PB1-F2蛋白和PB2蛋白;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
更优选来自人乳头瘤病毒(hPV)的抗原,甚至更优选选自下述的来自人乳头瘤病毒(hPV)的抗原:E1蛋白,E2蛋白,E3蛋白,E4蛋白,E5蛋白,E6蛋白,E7蛋白,E8蛋白,L1蛋白和L2蛋白;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
更优选来自炭疽芽孢杆菌的抗原,甚至更优选选自下述的来自炭疽芽孢杆菌的抗原:保护性抗原(PA),水肿因子(EF),致死性因子(LF)和S-层同源蛋白(SLH);
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
更优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
甚至更优选来自呼吸道合胞病毒(RSV)的抗原,
更优选选自下述的来自呼吸道合胞病毒(RSV)的抗原:融合(F)蛋白,核壳(N)蛋白,磷蛋白(P),基质(M)蛋白,糖蛋白(G),大蛋白(L;RNA聚合酶),非结构蛋白1(NS1),非结构蛋白2(NS2),小疏水(SH)蛋白,延伸因子M2-1和转录调节蛋白M2-2;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
更优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
甚至更优选来自单纯疱疹病毒(HSV)的抗原,
更优选选自下述的来自单纯疱疹病毒(HSV)的抗原:糖蛋白L(UL1),尿嘧啶-DNA糖基化酶UL2,UL3蛋白,UL4蛋白,DNA复制蛋白UL5,门蛋白UL6,病毒体成熟蛋白UL7,DNA解旋酶UL8,复制起点-结合蛋白UL9,糖蛋白M(UL10),UL11蛋白,碱性核酸外切酶UL12,碱性核酸外切酶UL13,间层蛋白UL14,末端酶(UL15),间层蛋白UL16,UL17蛋白,衣壳蛋白VP23(UL18),主要衣壳蛋白VP5(UL19),膜蛋白UL20,间层蛋白UL21,糖蛋白H(UL22),胸苷激酶UL23,UL24蛋白,UL25蛋白,衣壳蛋白P40(UL26,VP24,VP22A),糖蛋白B(UL27),ICP18.5蛋白(UL28),主要DNA-结合蛋白ICP8(UL29),DNA聚合酶UL30,核基质蛋白UL31,包膜糖蛋白UL32,UL33蛋白,内核膜蛋白UL34,衣壳蛋白VP26(UL35),大间层蛋白UL36,衣壳组装蛋白UL37,VP19C蛋白(UL38),核糖核苷酸还原酶(大亚基)UL39,核糖核苷酸还原酶(小亚基)UL40,间层蛋白/病毒体宿主关闭VHS蛋白(UL41),DNA聚合酶持续合成因子UL42,膜蛋白UL43,糖蛋白C(UL44),膜蛋白UL45,间层蛋白VP11/12(UL46),间层蛋白VP13/14(UL47),病毒体成熟蛋白VP16(UL48,α-TIF),包膜蛋白UL49,dUTP二磷酸酶UL50,间层蛋白UL51,DNA解旋酶/引物酶复合蛋白UL52,糖蛋白K(UL53),转录调控蛋白IE63(ICP27,UL54),UL55蛋白,UL56蛋白,病毒复制蛋白ICP22(IE68,US1),US2蛋白,丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶US3,糖蛋白G(US4),糖蛋白J(US5),糖蛋白D(US6),糖蛋白I(US7),糖蛋白E(US8),间层蛋白US9,衣壳/间层蛋白US10,Vmw21蛋白(US11),ICP47蛋白(IE12,US12),主要转录激活因子ICP4(IE175,RS1),E3泛素连接酶ICP0(IE110),潜伏相关的蛋白1(LRP1),潜伏相关的蛋白2(LRP2),神经毒力因子RL1(ICP34.5)和潜伏相关的转录物(LAT);
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选来自与传染病相关的病原体的抗原,
更优选来自选自下述的病原体的抗原:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌,呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌,
甚至更优选来自结核分枝杆菌的抗原,
最优选选自下述的来自结核分枝杆菌的抗原:
ESAT-6蛋白,ESX-1蛋白,CFP10蛋白,TB10.4蛋白,MPT63蛋白,MPT64蛋白,MPT83蛋白,MTB12蛋白,MTB8蛋白,AG85A蛋白,AG85B蛋白,Rpf-样蛋白,KATG蛋白,PPE18蛋白,MTB32蛋白,MTB39蛋白,晶体蛋白,HSP65蛋白,PST-S蛋白,HBHA蛋白,10kDa滤出物抗原EsxB,丝氨酸蛋白酶PepA,纤连蛋白-结合蛋白DFbpD,分泌的蛋白MPT51,周质磷酸-结合脂蛋白PSTS1(PBP-1),周质磷酸-结合脂蛋白PSTS3(PBP-3,Phos-1),PPE家族蛋白PPE14,PPE家族蛋白PPE68,蛋白MTB72F,分子伴侣DnaK,细胞表面脂蛋白MPT83,脂蛋白P23,磷酸转运系统通透酶蛋白PstA,14kDa抗原,纤连蛋白-结合蛋白CFbpC1,丙氨酸脱氢酶TB43和谷氨酰胺合酶1;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少 80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选与变态反应或变应性疾病相关并且来源于下述由下述组成的列表的来源的蛋白或肽抗原:草花粉,树花粉,花的花粉,草本花粉,粉尘螨,霉菌,动物,食物和昆虫毒液,优选树花粉,花的花粉,草本花粉,粉尘螨,食物和昆虫毒液,最优选上文列出的变应原,
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选由二硫化物交联的阳离子组分形成的聚合载体,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选与自身免疫病相关的抗原,更优选与下述相关的抗原:多发性硬化(MS);I型糖尿病;自身免疫性葡萄膜炎(autoimmune uveitis);重症肌无力;风湿热;关节炎;舍格伦综合征;红斑狼疮;动脉粥样硬化;特发性扩张型心肌病(DCM);肌炎或硬皮病,
甚至更优选是选自包括下述的组的抗原:
髓鞘碱蛋白(MBP),蛋白脂蛋白(PLP)和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG),CD44,前胰岛素原,胰岛素原,胰岛素,谷氨酸脱羧酶(GAD65),酪氨酸磷酸酶-样胰岛素瘤抗原2(IA2),锌转运蛋白((ZnT8),和热休克蛋白60(HSP60),光感受器间类视黄醇-结合蛋白(IRBP),乙酰胆碱受体AchR乙酰胆碱受体-1受体(IGF-1R),来自β-溶血链球菌的M蛋白(假自身抗原),巨噬细胞迁移抑制因子,Ro/La RNP复合物,α-和β-胞衬蛋白,胰岛细胞自身抗原,聚(ADP)核糖聚合酶(PARP),NuMA,NOR-90,Ro60自身抗原,和p27抗原,Ro60自身抗原,低密度脂蛋白,U-1小核核糖核蛋白复合物的Sm抗原(B/B′,D1,D2,D3,E,F,G),和RNP核糖核蛋白,oxLDL,β(2)GPI,HSP60/65,和oxLDL/β(2)GPI,心脏β(1)-肾上腺素能受体,组氨酰-tRNA合酶(HisRS),拓扑异构酶I,IL-17;或热休克蛋白;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
假定所述抗原与自身免疫病相关,如果所述抗原是淋巴细胞(优选B细胞或T细胞)的免疫球蛋白独特型或T细胞受体独特型,在其可以是进一步优选的。如果它们错误编程而识别并且抗击机体的自身表位,则所述淋巴细胞,例如B细胞或T细胞,可能负责体细胞(诸如例如胰腺β-细胞)的破坏。在这一情形中,免疫球蛋白独特型可以理解为这样的肽或蛋白,所述肽或蛋白具有由特定类型的B细胞表达的免疫球蛋白的可变区的特定分子形状。所述独特型可以用作引发针对这种特定类型的B细胞(例如,针对恶性B细胞)的免疫应答的抗原。T细胞受体独特型可以理解为这样的肽或蛋白,所述肽或蛋白具有由特定类型的T细胞表达的T细胞受体的可变区的特性分子形状。所述独特型可以用作引发针对该中特定类型的T细胞(例如,针对恶性T细胞)的免疫应答。例如,本发明的药物组合物可以用于针对所述错误编程的淋巴细胞的接种。例如,通过用本发明的药物组合物破坏攻击自身机体的机能不良的淋巴细胞以及随后的接种可以进行对患有自发免疫病(诸如例如,糖尿病,克罗恩病,多发性硬化等)的患者的治疗。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及药物组合物,所述药物组合物包含:
聚合载体货物复合物和
至少一种蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物;
其中所述聚合载体货物复合物包含:
聚合载体,
优选是包含二硫化物交联的阳离子组分的聚合载体,优选地由二硫化物交联的阳离子组分形成,
更优选是上文定义的式(I)(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,最优选是如上文定义的其分式(IA)或(IB)的一种或多种肽,
和至少一种核酸分子,
优选包含下述核酸序列的核酸分子,优选由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为上文定义的式(II)GlXmGn,式(III)ClXmCn,式(IV)(NuGlXmGnNv)a或式(V)(NuClXmCnNv)a所述,诸如包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种或是与SEQ ID NOs.15-108和122中的任一种至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,例如,包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列为SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%,并且最优选至少95%相同的序列,
或编码抗原的核酸分子,更优选编码与所述至少一种蛋白或肽抗原是相同抗原的抗原的核酸分子;
并且其中所述蛋白或肽抗原
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物选自:
来自与传染病相关的病原体的抗原,
与变态反应或变应性疾病相关的抗原,
与自身免疫病相关的抗原,
与癌症或肿瘤疾病相关的抗原;
优选与癌症或肿瘤疾病相关的抗原,更优选选自下述的抗原:p53,CA125,EGFR,Her2/neu,hTERT,PAP,MAGE-A1,MAGE-A3,间皮素,MUC-1,NY-ESO-1,GP100,MART-1,酪氨酸酶,PSA,PSCA,PSMA VEGF,VEGFR1,VEGFR2,Ras,CEA和WT1;
并且优选地,其中所述蛋白或肽抗原和/或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物不包含在所述聚合载体货物复合物中。
在这些实施方案的每一个中,所述聚合载体货物复合物优选用作佐剂,其中,更优选地,所述至少一种核酸分子是如本文定义的免疫刺激性核酸,甚至更优选地所述至少一种核酸分子是RNA,最优选地是免疫刺激性RNA(isRNA)。在本发明的情形中特别优选的核酸货物是包含下述核酸序列或由下述核酸序列组成的核酸分子,所述核酸序列是SEQ IDNO.105或122或是与SEQ ID NO.105或122至少60%、优选至少70%、优选至少80%、更优选至少90%、并且最优选至少95%相同的核酸序列。
此外,在这些实施方案的每一个中,所述聚合载体货物复合物可以是这样的聚合载体货物复合物,其中包含在所述聚合载体货物复合物中的所述聚合载体和所述核酸分子货物的阳离子组分以0.1-20范围内、或0.1-5范围内、或0.1-1范围内、或0.5-0.9范围内的N/P比率提供。
在一些实施方案中,假定所述聚合载体货物复合物包含聚合载体(优选由二硫化物交联的阳离子组分形成的聚合载体)和至少一种核酸分子,则可能优选的是,所述药物组合物不是这样的组合物:所述组合物包含由二硫化物交联的阳离子肽CR12C作为载体和isRNA722A(SEQ ID No.105)或isRNA722B(SEQ ID No.122)作为核酸货物与蛋白疫苗卵清蛋白(OVA蛋白)形成的聚合载体货物复合物。
在一些实施方案中,假定所述聚合载体货物复合物包含聚合载体(优选由二硫化物交联的阳离子组分形成的聚合载体)和至少一种核酸分子,则可能优选的是,所述药物组合物不是这样的组合物:所述组合物包含由二硫化物交联的阳离子肽CR12C作为载体和isRNA722A(SEQ ID No.105)或isRNA722B(SEQ ID No.122)作为核酸货物与卵清蛋白-特异性肽疫苗SIINFEKL形成的聚合载体货物复合物。
因此,在一些实施方案中,可能优选的是,所述药物组合物不是这样的组合物:所述组合物包含由二硫化物交联的阳离子肽CR12C(SEQ ID No.6)作为载体和isRNA722A(SEQID No.105)或isRNA722B(SEQ ID No.122)作为核酸货物与是卵清蛋白(OVA蛋白)(SEQ IDNo.117)的抗原形成的聚合载体货物复合物。
在一些实施方案中,假定所述药物组合物包含这样的聚合载体货物复合物,所述聚合载体货物复合物包含由二硫化物交联的阳离子组分形成的聚合载体和至少一种核酸分子,则可能更优选的是,所述至少一种抗原不是与癌症或肿瘤疾病(特别是淋巴瘤或淋巴瘤相关的疾病)相关的抗原,其中所述抗原是淋巴血细胞的免疫球蛋白独特型或淋巴血细胞的T细胞受体独特型或者所述免疫球蛋白独特型或T细胞受体独特型的片段、变体和/或衍生物。
在这一情形中,免疫球蛋白独特型可以理解为是具有由特定类型的B细胞表达的免疫球蛋白的可变区的特定分子形状的肽或蛋白。所述独特型可以用作引发针对该种特定类型的B细胞(例如,针对恶性B细胞)的免疫应答的抗原。T细胞受体独特型可以理解为具有由特定类型的T细胞表达的T细胞受体的可变区的特定分子形状的肽或蛋白。所述独特型可以用作引发针对该种特定类型的T细胞(例如,针对恶性T细胞)的免疫应答的抗原。
在一些实施方案中,假定所述药物组合物包含这样的聚合载体货物复合物,所述聚合载体货物复合物包含由二硫化物交联的阳离子组分形成的聚合载体和至少一种核酸分子,则可能优选的是,所述至少一种与癌症或肿瘤疾病相关的抗原不是与淋巴瘤、优选不是B细胞淋巴瘤、T细胞淋巴瘤或非霍奇金淋巴瘤相关的抗原。
在一些实施方案中,假定所述药物组合物包含这样的聚合载体货物复合物,所述聚合载体货物复合物包含由二硫化物交联的阳离子组分形成的聚合载体和至少一种核酸分子,则可能优选的是,所述至少一种与癌症或肿瘤疾病相关的抗原不是来源于恶性细胞、优选不是来源于恶性B细胞或恶性T细胞的抗原。
在一些其他实施方案中,可能优选的是,所述药物组合物可以不包含除组分A)和B)之外的其他组分,优选没有其他mRNA组分(除了由组分A包含之外),优选地所述药物组合物可以完全不包含任何mRNA。
在一些其他实施方案中,假定所述药物组合物包含mRNA(除了组分A的核酸之外的mRNA),则可能优选的是,所述mRNA可以不是编码B)所述的肽或抗原的mRNA,进一步优选的是,所述mRNA可以不是编码卵清蛋白、PSMA、荧光素酶或STEAP的mRNA。
在一些其他实施方案中,假定所述药物组合物包含mRNA(除了组分A的核酸之外的mRNA),特别是编码B)所述的肽或抗原的mRNA,和/或编码卵清蛋白、PSMA、荧光素酶或STEAP的mRNA,则可能优选的是,所述mRNA可以不与鱼精蛋白复合,优选不以2∶1或4∶1或2∶1与4∶1之间的比率复合。
在一些其他实施方案中,可以优选的是,所述药物组合物可以不用于治疗胰腺癌或非小细胞肺癌。
在一些其他实施方案中,假定所述药物组合物包含mRNA(除组分A的核酸之外的mRNA),则可以优选的是,所述mRNA可以不是游离的mRNA。
在一些其他实施方案中,假定所述药物组合物包含mRNA(除组分A的核酸之外的mRNA),则可以优选的是,所述mRNA可以不与鱼精蛋白复合。
在一些其他实施方案中,假定所述药物组合物包含游离的mRNA,则可以优选的是,所述mRNA可以不编码治疗活性的蛋白,并且可以不编码抗体,并且可以不编码抗原。
在一些其他实施方案中,可以优选的是,关于本发明的药物组合物的组分A),a)可以不是鱼精蛋白。
在一些其他实施方案中,可以优选的是,关于本发明的药物组合物的组分A),所述载体蛋白可以不是鱼精蛋白。
在一些其他实施方案中,假定组分A)的a)是鱼精蛋白,则可以优选的是,相对于组分A)的b),a)不是以1∶2或1∶4或1∶2与1∶4之间的比率存在。
在一些其他实施方案中,假定组分A)的载体蛋白是鱼精蛋白,则可以优选的是,相对于组分A)的核酸,所述载体蛋白不是以1∶2或1∶4的比率存在。
在一些其他实施方案中,可以优选的是,关于组分A),所述核酸不是mRNA。
在一些其他实施方案中,假定组分A)的核酸是mRNA,则可以优选的是,所述mRNA不编码卵清蛋白、PSMA、荧光素酶或STEAP。
在一些其他实施方案中,鉴定组分A)的核酸(即b))是mRNA,则可以优选的是,所述mRNA不是游离的mRNA,而是专一地与a)的载体蛋白复合。
在一些其他实施方案中,组分(B)不是卵清蛋白或卵清蛋白的片段。优选地,本发明所述的药物组合物、试剂盒或药物包装不包含卵清蛋白或卵清蛋白的片段或者编码卵清蛋白或卵清蛋白的片段的核酸序列。
附图说明
以下附图意欲进一步图示本发明。它们不意欲将本发明的主题限制于此。
图1:使用Zetasizer Nano(Malvern仪器(Malvern Instruments),Malvern,UK)通过动态光散射显示由二硫化物交联的阳离子肽CR12C和CR7C作为载体形成的聚合载体货物复合物在冻干后与作为载体的未聚合的阳离子肽(R12和R7)相比较的原始相关性曲线。用新鲜制备的复合物和用冻干后重构的复合物测量流体动力学直径。肽∶RNA的质量比率为1∶2。因此,其可以显示,包含通过二硫键引起聚合载体的聚合的含有半胱氨酸的肽作为阳离子的聚合载体货物复合物尺寸没有变化,与此相比,由未聚合的肽形成的复合物尺寸增加并且因此在冻干步骤过程中是不不稳定的。因此,具有聚合的肽作为聚合载体的复合物表现出冻干的有利特性。
图2:显示由二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的R722以不同的w/w比率形成的聚合载体货物复合物的ζ电位。可以看出,当该w/w比率从过量的肽至1∶1的比率(肽/RNA)变化时,ζ电位从正到负变化。
图3A:显示在用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的CpG 2216以1∶2.5(w/w)(CR12C/CpG 2216)的质量比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中的hIFNa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hIFNa细胞因子释放的增加。
图3B:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的CpG 2216以1∶2.5(w/w)(CR12C/CpG 2216)的质量比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中的hTNFa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物没有引起hPBMCs中hTNFa细胞因子释放的增加。
图4A:显示在用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的编码荧光素酶的mRNA R491以1∶2(w/w)(CR12C/R491)的质量比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中的hIFNa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hIFNa细胞因子释放的增加。
图4B:显示在用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的编码荧光素酶的mRNA R491以1∶2(w/w)(CR12C/R491)的质量比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中的hTNFa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hTNFa细胞因子释放的增加。
图5A:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的短的富含GU的RNA寡核苷酸(短的富含GU)以1∶2.5(w/w)(CR12C/短的富含GU)的质量比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hIFNa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hIFNa细胞因子释放的增加。
图5B:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的短的富含GU的RNA寡核苷酸(短的富含GU)以1∶2.5(w/w)(CR12C/短的富含GU)的质量比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hTNFa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hTNFa细胞因子释放的增加。
图6A:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR7C与作为核酸货物的长的非编码富含GU的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hIFNa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与由未聚合的肽R7形成的货物复合物(R7/R722)相比,所述聚合载体货物复合物(CR7C/R722)引起hPBMCs中hIFNa细胞因子释放的增加。
图6B:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR7C与作为核酸货物的长的非编码富含GU的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hTNFa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与由未聚合的肽R7形成的货物复合物(R7/R722)相比,所述聚合载体货物复合物(CR7C/R722)仅引起hPBMCs中hTNFa细胞因子释放的微弱增加。
图7A:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR9C与作为核酸货物的长的非编码富含GU的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hIFNa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与由未聚合的肽R9形成的货物复合物(R9/R722)相比,本发明的聚合载体货物复合物(CR9C/R722)引起hPBMCs中hIFNa细胞因子释放的增加。
图7B:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR9C与作为核酸货物的长的非编码富含GU的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hTNFa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与由未聚合的肽R9形成的货物复合物(R9/R722)相比,所述聚合载体货物复合物(CR9C/R722)没有引起hPBMCs中hTNFa细胞因子释放的增加。
图8A:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722以不同w/w比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hIFNa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hIFNa细胞因子释放的增加。
图8B:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722以不同w/w比率形成的聚合载体货物复合物刺激后在hPBMCs中hTNFa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hTNFa细胞因子释放的增加。
图9A:显示用由阳离子肽CH6R4H6C,CH3R4H3C和CHK7HC与作为核酸货物的isRNAR722以不同的N/P比率形成的聚合载体复合物刺激后hPBMCs中的hIFNa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hIFNa细胞因子释放的增加。
图9B:显示用由二硫化物交联的阳离子肽CH6R4H6C,CH3R4H3C和CHK7HC与作为核酸货物的isRNA R722以不同的N/P比率形成的聚合载体复合物刺激后hPBMCs中的hTNFa细胞因子(体外)分泌。可以看出,与单独的核酸货物或单独的阳离子肽相比,所述聚合载体货物复合物引起hPBMCs中hTNFa细胞因子释放的增加。特别地,具有高于或等于1的N/P比率的聚合货物复合物引起TNFα分泌。
图10:显示向蛋白抗原卵清蛋白(OVA蛋白)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂在肿瘤刺激实验中的(体内)作用。
对于这一目的,每组7只雌性C57BL/6小鼠在两周内用与45μg CR12C/R722(1∶2;w/w)组合的μg 5μg卵清蛋白接种三次。不注射聚合货物复合物的小鼠用于比较。
可以看出,与单独的蛋白抗原相比,所述聚合载体货物复合物极大地减小肿瘤生长的速率,所述单独的蛋白抗原与缓冲液对照相比对肿瘤生长没有影响。
图11:显示向蛋白抗原卵清蛋白(OVA蛋白)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对诱导卵清蛋白-特异性IgG2a抗体的(体内)作用。
对于这一目的,每组5只雌性C57BL/6小鼠在两周内用与45μg CR12C/R722(1∶2;w/w)组合的5μg卵清蛋白接种三次。不注射聚合货物复合物的小鼠用于比较。
可以看出,所述聚合载体货物复合物强烈增加B细胞应答,这证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是关于对Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图12:显示向蛋白抗原卵清蛋白(OVA蛋白)或卵清蛋白-特异性的肽抗原SIINFEKL中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对诱导卵清蛋白-特异性细胞毒性T细胞的(体内)作用。
对于这一目的,每组5只雌性C57BL/6小鼠在两周内用与45μg CR12C/R722(1∶2;w/w)组合的5μg卵清蛋白或50μg SIINFEKEL肽接种三次。不注射聚合货物复合物的小鼠用于比较。
可以看出,与用单独的蛋白或肽接触相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加卵清蛋白-特异性的细胞毒性T细胞的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是关于对Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图13:显示向疫苗(包含灭活的狂犬病病毒)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对狂犬病特异性IgG抗体的诱导(由OD 405nm表示)的(体内)作用。对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.1,0.01,和0.001倍人剂量的和30μg R722与8.1μgCR12C(3.7∶1w/w)。免疫后21天,采集血液样品并且分析针对狂犬病病毒的总的IgG抗体。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加狂犬病特异性IgG抗体的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性。
图14:显示向疫苗或HDC(包含灭活的狂犬病病毒)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对狂犬病特异性细胞毒性T细胞的诱导(由ELISPOT测定中斑点数目表示)的(体内)作用。
对于这一目的,5只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.01倍人剂量的或HDC和30μg R722与8.1μg CR12C(3.7∶1 w/w)。免疫后5天将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。
可以看出,与用单独的或HDC接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加狂犬病特异性细胞毒性T细胞的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是关于对Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图15:显示向疫苗(包含灭活的狂犬病病毒)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对狂犬病特异性IgG抗体的诱导的(体内)作用。此外,其显示所述聚合载体货物复合物对具有针对所述抗原的高亲和力的抗体的诱导作用(由%结合的IgG表示)的影响。
对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.01倍的人剂量的和30μgR722与8.1μg CR12C(3.7∶1 w/w)。免疫后7和21天,采集血液样品,并且分析针对狂犬病病毒的总IgG抗体。为了检验所产生的抗体针对狂犬病病毒的亲和力,在进行ELISA过程中,用增加浓度的尿素洗涤所结合的抗体。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加具有针对所述抗原的高亲和力的狂犬病特异性IgG抗体的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于具有高亲和力的抗体的诱导作用。
图16:显示向疫苗HDC(包含灭活的狂犬病病毒)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对狂犬病病毒中和抗体的诱导作用(由IU/ml表示)的(体内)影响。对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.01倍人剂量的HDC和30μg R722与15μg CR12C(2∶1 w/w)。免疫后21天,采集血液样品,并且分析病毒中和。
可以看出,与用单独的HDC接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加中和抗体的滴度,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性。
图17:显示向猪流感疫苗(包含灭活的H1N1流感病毒)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对H1N1流感特异性IgG2a抗体诱导作用的(体内)影响。
对于这一目的,5只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.1μg和30μg R722与15μg CR12C(2∶1 w/w)。免疫后14天,采集血液样品并且分析针对H1N1流感病毒的IgG2a抗体的诱导(表示为OD 405nm)。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加流感病毒特异性IgG2a抗体的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图18:显示向A(H1N1)pdm09流感疫苗(包含灭活的A(H1N1)pdm09流感病毒)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对A(H1N1)pdm09流感病毒特异性细胞毒性T细胞的诱导作用(由ELISPOT测定中的斑点数目表示)的(体内)影响。
对于这一目的,5只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.1μg和15μg R722与7.5μg CR12C(2∶1 w/w)。免疫后6天将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加A(H1N1)pdm09-特异性细胞毒性T细胞的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图19:显示向季节性流感疫苗(包含灭活的WHO推荐的季节性流感病毒毒株)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对流感特异性IgG2a抗体的诱导作用(由OD 405nm表示)的(体内)影响。
对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.1μg和30μg R722与15μg CR12C(2∶1 w/w)。免疫后28天采集血液样品并且分析针对流感病毒的IgG2a抗体。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加流感病毒特异性IgG2a抗体的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图20:显示向乙型肝炎疫苗(包含重组的乙型肝炎表面抗原(HBsAg))中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物作为佐剂对HBsAG特异性抗体的诱导作用(由荧光表示)的(体内)影响。
对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.5μg和6.25μg R722与1.7μg CR12C(3.7∶1 w/w)。免疫后28天采集血液样品并且分析针对HBsAGg的IgG2a抗体。可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加HBsAg-特异性IgG2a抗体的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图21:显示向人乳头瘤病毒16(HPV16)来源的肽中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对HPV16 E7特异性细胞毒性T细胞的诱导作用(由ELISPOT测定中的斑点数目表示)的(体内)影响。
对于这一目的,5只雌性C57BL/6小鼠肌内注射100μg HPV16 E7来源的肽E7aa43-77和50μg R722与25μg CR12C(2∶1 w/w)。免疫后8天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。可以看出,与用单独的所述肽接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加HPV16 E7-特异性细胞毒性T细胞的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图22:显示向人乳头瘤病毒16(HPV16)来源的肽中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对HPV16 E7特异性细胞毒性T细胞的诱导作用(由ELISPOT测定中的斑点数目表示)的(体内)影响。
对于这一目的,5只雌性C57BL/6小鼠肌内注射100μg HPV16 E7来源的肽E7aa43-77和50μg R722与25μg CR12C(2∶1 w/w)。此外,小鼠注射另外包含所述抗原性肽E7aa43-77的聚合载体货物复合物。免疫后七天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。
可以看出,与用单独的所述肽接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加HPV16E7-特异性细胞毒性T细胞的诱导。此外,结果表明在所述聚合载体货物复合物中包含所述抗原性肽进一步改善HPV16 E7-特异性细胞毒性T细胞的诱导。因此,该实验也证明了所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图23:显示向人NY-ESO-1蛋白中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对NY-ESO-1特异性细胞毒性T细胞的诱导作用(由ELISPOT测定中的斑点数目表示)的(体内)影响。
对于这一目的,5只雌性C57BL/6小鼠在15天内肌内注射两次5μg NY-ESO-1蛋白和30μg R722与15μg CR12C(2∶1 w/w)。最后一次免疫后7天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。
可以看出,与用单独的所述蛋白接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加NY-ESO-1-特异性细胞毒性T细胞的诱导。此外,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于Th1-转变的免疫应答的诱导作用。
图24:显示向疫苗(包含灭活的狂犬病病毒)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对针对致死性病毒攻击感染的保护作用的增强的(体内)影响。
对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.001倍人剂量的和3μgR722与0.81μg CR12C(3.7∶1 w/w)。免疫后37天,使用25-倍LD50(致死剂量50%)的攻击病毒毒株(CVS)的狂犬病病毒的致死剂量感染小鼠。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加小鼠针对致死性狂犬病病毒感染的存活,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性。
图25:显示在肿瘤攻击实验中向人乳头瘤病毒16(HPV16)来源的长链肽E7aa43-77中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂的(体内)作用。
对于这一目的,每组8只C57BL/6小鼠在第1天用1x105个表达HPV E6和E7蛋白的TC-1细胞攻击。在肿瘤攻击后第7天(中值肿瘤体积31-48mm3)开始接种。小鼠用与50μgCR12C/R722(1∶2;w/w)组合的5μg或50μg E7肽皮内接种5次(在第8,12,15,19和22天)。对于比较,小鼠仅注射聚合货物复合物。
可以看出,与单独的聚合载体货物复合物相比,与HPV-16来源的E7肽E7aa43-77组合的聚合载体货物复合物甚至减少肿瘤的生长。
图26:显示在肿瘤攻击实验中向人乳头瘤病毒16(HPV16)来源的E7肽E7aa43-77中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂的(体内)作用。
对于这一目的,每组8只C57BL/6小鼠在第1天用1x105个TC-1细胞攻击。在肿瘤攻击后第7天(中值肿瘤体积31-48mm3)开始接种。小鼠用与50μg CR12C/R722(1∶2;w/w)组合的5μg或50μg E7肽E7aa43-77皮内接种5次(在第8,12,15,19和22天)。对于比较,小鼠仅注射E7肽或聚合货物复合物。注射PBS作为阴性对照。
可以看出,与单独的E7肽或50聚合载体货物复合物相比,与HPV-16来源的E7肽组合的聚合载体货物复合物强烈增强荷瘤小鼠的存活(对于50μg E7肽+50μg聚合载体货物复合物,平均存活时间为44.5天;对于5μg E7肽+50μg聚合载体货物复合物,平均存活时间为22天)。
图27:显示在肿瘤攻击实验中向人乳头瘤病毒16(HPV16)来源的E7肽E7aa43-77中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂的(体内)作用。
对于这一目的,如该图中所示,每组13只C57BL/6小鼠用由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物和E7肽每周皮内接种一次共接种四周。在第四次接种后八周,将5只小鼠/组处死,分离脾细胞,并且通过实施例13所述的HPV-五聚体染色和流式细胞计数确定抗原-特异性CD8+T细胞的频率。
可以看出,与用50μg单独的E7肽接种的小鼠相比,与HPV-16来源的E7肽E7aa43-77组合的聚合载体货物复合物导致抗原特异性CD8+T细胞的统计学显著增加(对于5μg E7肽,p=0.0007,对于50μg E7肽,p=0.0002;通过不配对t-检验评估组间统计学差异)。因此,与HPV-16来源的E7肽组合的聚合载体货物复合物的组合诱导有力的记忆CD8+T细胞应答。
图28:显示在肿瘤攻击实验中向人乳头瘤病毒16(HPV16)来源的E7肽E7aa43-77中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂的(体内)作用。
对于这一目的,如该表所示,每组13只C57BL/6小鼠用由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物和所述E7肽每周皮内接种一次,共接种四周。第四次接种后八周,用1x105个TC-1肿瘤细胞攻击8只小鼠/组,并且监测肿瘤体积。
可以看出,与HPV-16来源的E7肽E7aa43-77组合的聚合载体货物复合物导致显著的肿瘤生长延迟(对于5μg E7肽+50μg的50μg聚合载体货物复合物,4例完全反应;对于50μgE7肽+50μg的50μg聚合载体货物复合物,7例完全反应)。因此,与HPV-16来源的E7肽组合的聚合载体货物复合物的组合诱导有力的记忆CD8+T细胞应答。
图29:显示向季节性流感疫苗(包含灭活的WHO推荐的季节性流感病毒毒株)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对流感特异性血凝素抑制(HI)滴度的诱导(由HI滴度表示)的(体内)作用。
对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射0.45μg或0.045μg与5μgR722+1.35μg CR12C(3.7∶1,w/w)。免疫后21天,采集血液样品,并且确定血清中的HI滴度。HI滴度广泛用作流感疫苗功效的替代参数,HI滴度≥1∶40通常定义为在人中的保护性界限。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加甲型流感H1N1-特异性HI滴度(A)和H3N2-特异性HI滴度(B)的诱导作用,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性。
图30:显示向季节性流感疫苗(包含灭活的WHO推荐的季节性流感病毒毒株)中加入由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C与作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物用作佐剂对流感特异性IgG2a抗体的诱导作用(由IgG2a滴度表示)的(体内)影响。
对于这一目的,8只雌性BALB/c小鼠肌内注射4.5μg或0.045μg与5μgR722+1.35μg CR12C(3.7∶1 w/w)。免疫后21天,采集血液样品并且分子针对甲型流感H1N1病毒的IgG2a抗体。
可以看出,与用单独的接种相比,所述聚合载体货物复合物强烈增加甲型流感H1N1-特异性IgG2a抗体的诱导,这进一步证明所述聚合载体货物复合物的有益的佐剂特性,特别是对于季节性流感疫苗的剂量减少(dose-sparing)。
具体实施方式
实施例
下述实施例意欲进一步举例说明本发明。它们不意欲将本发明的主题限制于此。
1.试剂:
作为聚合载体的阳离子组分的阳离子肽:
R7:Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg(Arg7)(SEQ ID NO.109)
CR7C:Cys-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Cys(CysArg7Cys)(SEQ ID NO.1)
R9:Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg(Arg9)(SEQ ID NO.110)
R12:Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg(Arg12)(SEQ IDNO.111)
CR9C:Cys-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Cys(Cys-Arg9-Cys)(SEQ IDNO.2)
CR12C:Cys-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-Cys(Cys-Arg12-Cys)(SEQ ID NO.6)
作为聚合载体货物复合物的货物的核酸:
R1180:编码荧光素酶的mRNA(SEQ ID NO.112)
R722A:长的非编码的富含isGU的RNA(SEQ ID NO.105)
R722B:长的非编码的富含isGU的RNA(SEQ ID NO.122)
R491:编码荧光素酶的mRNA(SEQ ID NO.113)
CpG 2216:CpG寡核苷酸
短的富含GU:富含GU的RNA寡核苷酸
已经使用序列R722A和/或R722B进行表明核酸货物R722的应用的实验。
抗原和表位:
卵清蛋白-来源的肽SIINFEKL(SEQ ID NO.116)
卵清蛋白:
2.核酸序列的制备:
对于本实施例,制备实施例1所示的核酸序列,并且用于形成聚合的聚合载体货物复合物或用于未聚合的载体货物复合物用于比较。这些聚合载体货物复合物用于体外和体内处理(transaction)、用于体外免疫刺激和用于颗粒表征。
按照第一制备方案,制备编码相对应的RNA序列R1180,R722和R491序列的DNA序列。相对应的RNAs的序列显示在序列表中(SEQ ID NOs:112,105和113)。
短的富含GU的序列和CpG 2216寡核苷酸序列利用亚磷酰胺化学通过自动化固相合成制备。所述序列显示在序列表中(SEQ ID NOs:115和114)。
体外转录:
在体外用T7-聚合酶(T7-Opti mRNA试剂盒,CureVac,Tübingen,德国)按照供应商的使用说明转录按照实施例2制备的关于R1180,R722和R491的各个DNA质粒。随后,使用(CureVac,Tübingen,德国)纯化mRNA。
3.聚合载体货物复合物的合成:
将实施例1中上文定义的核酸序列与实施例1中定义的阳离子组分混合。因此,所示量的核酸序列以所示的质量比率与各种阳离子组分混合,由此形成复合物。如果按照本发明使用聚合阳离子组分,则阳离子组分的聚合与核酸货物的复合同时发生。然后,用水将得到的溶液调节至终体积50μl,并且在室温温育30分钟。实验中所用的不同的阳离子组分/核酸比率显示在表1中。
表1
N/P比率=是聚合载体的阳离子组分或聚合载体本身的离子电荷的量度。在所述阳离子组分的阳离子特性由氮原子提供的情形中,考虑到氮原子赋予正电荷,核酸的磷酸骨架的磷酸根赋予负电荷,则N/P比率是碱性氮原子与磷酸根残基的比率。
N/P优选地通过下式计算:
例如,应用SEQ ID NO:122所示的RNA R722,其分子量为186kDa。因此,1μg R722RNA等于5.38 pmol RNA。
4.hPBMCs中的细胞因子刺激:
用Ficoll梯度分离来自健康供体外周血的HPBMC细胞,并随后用1×PBS(磷酸缓冲盐水)洗涤。然后,将细胞接种在96-孔微量滴定板中(200x103个/孔)。将hPBMC细胞在X-VIVO 15培养基(BioWhittaker)中用10μl来自实施例3的含有指示量的核酸的聚合载体货物复合物温育24小时。免疫刺激性作用通过检测hPBMCs的细胞因子的产生(肿瘤坏死因子α和干扰素α)而测量。因此,将ELISA微量滴定板(Nunc Maxisorb)用结合缓冲液(0.02%NaN3,15mM Na2CO3,15mM NaHCO3,pH 9.7)温育过夜(o/n),所述结合缓冲液另外含有特定的细胞因子抗体。然后,将细胞用含有1%BSA(牛血清白蛋白)的1×PBS封闭。加入细胞上清,并且在37℃温育4小时。随后,将该微量滴定板用含有0.05%吐温-20的1×PBS洗涤,并且然后用生物素标记的二级抗体(BD Pharmingen,Heidelberg,德国)温育。向该板中加入链霉抗生物素蛋白-偶联的辣根过氧化物酶。然后,将板再次用含有0.05%吐温-20的1×PBS洗涤,并且加入ABTS(2,2′-连氮基-双(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸(2,2′-azino-bis(3-ethyl-benzthiazoline-6-sulfonic acid))作为底物。使用Tecan的Sunrise ELISA-读数仪(Crailsheim,德国),利用用重组细胞因子(BD Pharmingen,Heidelberg,德国)获得的标准曲线,通过测量在405nm的吸光度(OD 405)而测量细胞因子的量。相应的结果显示在图3-9中。
5.ζ电位测量:
使用Zetasizer Nano(Malvern仪器,Malvern,UK),通过激光多普勒电泳法评估所述聚合载体货物复合物的ζ电位。测量在25℃在进行,并且使用173°的散射角。结果显示在图2中。
6.复合物在冻干后的稳定性
使用Zetasizer Nano(Malvern仪器,Malvern,UK),按照供应商的使用说明,通过动态光散射测量上述制备的聚合载体货物复合物的流体动力学直径。测量在25℃在通过累积量方法(cumulant method)分析的缓冲剂中进行,从而获得该聚合载体货物复合物的流体动力学直径和多样性指数。聚合载体货物复合物如实施例3所示形成,并且使用刚制备的复合物和冻干后重建的复合物来测量流体动力学直径。相应的实验结果显示在图1中。
7.免疫实验:
a)用卵清蛋白或SIINFEKL免疫:
对于免疫,将疫苗卵清蛋白(OVA)(5μg)或卵清蛋白-特异性肽SIINFEKL(50μg)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以2∶1 w/w的比率)(30μg R722/15μg CR12C)组合,并且皮内注射到雌性C57BL/6小鼠中(对于肿瘤攻击,每组7只小鼠,对于免疫应答检测,每组5只小鼠)。接种在2周内重复2次。仅注射抗原的小鼠用来比较。
b)用狂犬病疫苗免疫:
对于免疫,将疫苗或HDC(均包含灭活的狂犬病病毒)(0.1,0.01和0.001倍人剂量)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以3.7∶1 w/w的比率)(30μg R722/8.1μg CR12C)组合,并且肌内注射到雌性Balb/c小鼠(每组5或8只;如所示)中。仅注射或HDC的小鼠用于比较。
c)用流感A(H1N1)pdm09(猪流感)疫苗免疫:
对于免疫,将疫苗(二者均包含灭活的A(H1N1)pdm09流感病毒)(0.1μg/剂量)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以2∶1 w/w的比率)(对于是15μg R722/7.5μg CR12C,对于是30μg R722/15μg CR12C)组合,并且肌内注射到雌性Balb/c小鼠(每组5只)中。仅注射的小鼠用于比较。
d)用季节性流感疫苗免疫:
对于免疫,将季节性流感疫苗(包含灭活的WHO推荐的流感病毒毒株;季节性2009/2010)(0.1μg/剂量)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以2∶1 w/w的比率)(30μg R722/15μg CR12C)组合,并且肌内注射到雌性Balb/c小鼠(每组8只)中。仅注射的小鼠用于比较。
e)用乙型肝炎疫苗免疫:
对于免疫,将乙型肝炎疫苗(包含重组的乙型肝炎表面抗原)(0.5μg/剂量)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以3.7∶1 w/w的比率)(6.25μg R722/1.7μgCR12C)组合,并且肌内注射到雌性Balb/c小鼠(每组8只)中。仅注射的小鼠用于比较。
f)用人乳头瘤病毒16(HPV16)E7-来源的肽免疫:
对于免疫,将HPV16-来源的肽E7 aa43-77(100μg/剂量)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以2∶1 w/w的比率)(50μg R722/25μg CR12C)组合,并且肌内注射到雌性C57BL/6小鼠(每组5只小鼠)中。仅注射肽的小鼠用于比较。
在另一个实验中(图22),在上文所述的制备聚合载体货物复合物的方法的聚合步骤c)过程中,将HPV-来源的肽E7 aa43-77(100μg/剂量)与聚合货物复合物R722/CR12C(以2∶1 w/w的比率)(50μg R722/25μg CR12C)组合。因此所述HPV-来源的肽是所述聚合载体货物复合物的一部分,并且表示为E7 aa43-77/R722/CR12C。对于在该另外的实验中的比较,小鼠注射单独的肽(E7 aa43-77)和包含作为抗原的E7 aa43-77肽和作为佐剂的所述聚合载体货物复合物的本发明的药物组合物,其中所述聚合载体货物复合物不包含抗原(E7 aa43-77+R722/CR12C)。
g)用NY-ESO-1蛋白免疫:
对于免疫,将肿瘤抗原NY-ESO-1蛋白(5μg/剂量)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以2∶1 w/w的比率)(30μg R722 15μg CR12C)组合,并且在15天内肌内注射2次注射到雌性C57BL/6小鼠(每组5只)中。仅注射蛋白的小鼠用于比较。
8.检测抗原-特异性免疫应答(B-细胞免疫应答):
a)检测针对卵清蛋白的抗体:
通过检测抗原特异性抗体进行抗原特异性免疫应答(B细胞免疫应答)的检测。因此,在最后一次接种后5天,从接种的小鼠采集血液样品,并且制备血清。将MaxiSorb平板(Nalgene Nunc International)用原鸡(Gallus gallus)卵清蛋白包被。用含有0.05%吐温-20和1%BSA的1×PBS封闭后,将平板用稀释的小鼠血清温育。然后加入生物素-偶联的二级抗体(抗-小鼠-IgG2a,Pharmingen)。洗涤后,将平板用辣根过氧化物酶-链霉抗生物素蛋白温育,然后测量ABTS底物(2,2’-连氮基-双(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸)的转化。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗体诱导的结果显示在图11中。
b)检测针对狂犬病病毒的抗体:
通过检测狂犬病病毒特异性总IgG抗体进行抗原特异性免疫应答(B细胞免疫应答)的检测。因此,在接种后7和21天,从接种的小鼠采集血液样品,并且制备血清。将MaxiSorb平板(Nalgene Nunc International)用含有灭活的病毒的商购狂犬病疫苗(HDC;1∶10000)包被。在用含有0.05%吐温-20和1%BSA的1×PBS封闭后,将平板用稀释的小鼠血清温育。然后加入辣根过氧化物酶-偶联的二级抗体(抗-小鼠-IgG,Pharmingen)。洗涤后,将平板用ABTS显色,然后,测量ABTS底物(2,2’-连氮基-双(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸)的转化。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗体诱导的结果显示在图13中。
c)确定针对狂犬病病毒的抗体的亲和力:
针对狂犬病病毒的总IgG抗体的检测如b)所公开进行,不同之处在于小鼠血清仅以1∶40的稀释度进行检测。此外,在用小鼠血清温育后,将平板用增加浓度的尿素(6,7和8M尿素)洗涤。通过用尿素洗涤,仅可以检测具有针对所述抗原的高亲和力的抗体。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗体诱导的结果显示在图15中。
d)检测针对A(H1N1)pdm09流感病毒(猪流感)的抗体:
通过检测A(H1N1)pdm09流感病毒特异性IgG2a抗体进行抗原特异性免疫应答(B细胞免疫应答)的检测。因此,在接种后14天从接种的采集血液样品,并且制备血清。用流感A/California/7/09 A(H1N1)pdm09灭活的病毒(NIBSC,UK)(以1μg/ml)包被MaxiSorb平板(Nalgene Nunc International)。在用含有0.05%吐温-20和1%BSA的1×PBS封闭后,将平板用稀释的小鼠血清温育。然后加入生物素-偶联的二级抗体(抗-小鼠-IgG2a,Pharmingen)。洗涤后,将平板用辣根过氧化物酶-链霉抗生物素蛋白温育,然后测量ABTS底物(2,2’-连氮基-双(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸)的转化,从而确定IgG2a抗体的诱导。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗体诱导的结果显示在图17中。
e)检测针对季节性流感病毒毒株的抗体:
通过检测流感病毒特异性IgG2a抗体进行抗原特异性免疫应答(B细胞免疫应答)的检测。因此,在接种后28天从接种的小鼠采集血液样品,并且制备血清。将MaxiSorb平板(Nalgene Nunc International)用含有相同的病毒流感抗原作为用于接种的流感疫苗的Influvac(5μg/ml)包被。在用含有0.05%吐温-20和1%BSA的1×PBS封闭后,将平板用稀释的小鼠血清温育。然后加入辣根过氧化物酶-偶联的二级抗体(抗-小鼠-IgG2a,Pharmingen)。洗涤后,将平板用辣根过氧化物酶-链霉抗生物素蛋白温育,然后测量ABTS底物(2,2’-连氮基-双(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸)的转化,从而确定IgG2a抗体的诱导。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗体诱导的结果显示在图19中。
f)检测针对乙型肝炎表面抗原(HBsAg)的抗体:
通过检测HBsAG特异性IgG2a抗体进行抗原特异性免疫应答(B细胞免疫应答)的检测。因此,在接种后28天从接种的小鼠采集血液样品,并且制备血清。将MaxiSorb平板(Nalgene Nunc International)用重组乙型肝炎表面抗原(HBsAG)(Aldevron,USA)(1μg/ml)包被。在用含有0.05%吐温-20和1%BSA的1×PBS封闭后,将平板用稀释的小鼠血清温育。然后加入生物素-偶联的二级抗体(抗-小鼠-IgG2a,Pharmingen)。洗涤后,将平板用辣根过氧化物酶-链霉抗生物素蛋白温育,然后测量ABTS底物(2,2’-连氮基-双(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸)的转化,从而确定IgG2a抗体的诱导。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗体诱导的结果显示在图20中。
9.通过ELISPOT检测抗原特异性细胞免疫应答:
a)检测针对卵清蛋白的细胞毒性T细胞应答:
在最后一次接种后5天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。为了检测INFγ,将包被多筛选平板(Millipore)用包含针对INFγ的抗体(BD Pharmingen,Heidelberg,德国)的包被缓冲液(0.1M碳酸盐-碳酸氢盐缓冲液,pH 9.6,10.59g/l Na2CO3,8.4g/lNaHCO3)温育过夜。次日,加入1x106个细胞/孔,并且用1μg/孔的相关肽(卵清蛋白的SIINFEKL);不相关的肽(连接蛋白=对照肽)或不含肽的缓冲液再刺激。然后,将细胞在37℃温育24小时。次日,将该平板PBS洗涤3次,用水洗涤一次,用PBS/0.05%吐温-20洗涤一次,然后用生物素-偶联的二级抗体在4℃温育11-24小时。然后,将平板用PBS/0.05%吐温-20洗涤,并用与封闭缓冲液中的链霉抗生物素蛋白偶联的碱性磷酸酶在室温温育2小时。用PBS/0.05%吐温-20洗涤后,向平板中加入底物(5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸/硝基蓝四唑液体底物系统,购自Sigma Aldrich,Taufkirchen,德国),并且可以可视性检测底物的转化。然后通过用水洗涤平板而终止反应。然后通过ELISPOT平板读数仪对干燥的平板读数。为了显现斑点水平,通过减去背景而校正数值。在用本发明的药物组合物接种时的这种特异性细胞毒性T细胞的诱导的结果显示在图12中。
b)检测针对狂犬病病毒的细胞毒性T细胞应答:
在接种后5天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。为了检测INFγ,将包被多筛选平板(Millipore)用包含针对INFγ的抗体(BD Pharmingen,Heidelberg,德国)的包被缓冲液(0.1M碳酸盐-碳酸氢盐缓冲液,pH 9.6,10.59g/l Na2CO3,8.4g/l NaHCO3)温育过夜。次日,加入5x105个细胞/孔,并且用灭活的狂犬病病毒(1∶100或HDC 1∶100)或不含肽(BSA)的缓冲液再刺激。然后,将细胞在37℃温育24小时。次日,将该平板PBS洗涤3次,用水洗涤5分钟,用PBS/0.05%吐温-20洗涤一次,然后用生物素-偶联的二级抗体在4℃温育11-24小时。然后,将平板用PBS/0.05%吐温-20洗涤,并用与封闭缓冲液中的链霉抗生物素蛋白偶联的碱性磷酸酶在室温温育2小时。用PBS/0.05%吐温-20洗涤后,向平板中加入底物(5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸/硝基蓝四唑液体底物系统,购自Sigma Aldrich,Taufkirchen,德国),并且可以可视性检测底物的转化。然后通过用水洗涤平板而终止反应。然后通过ELISPOT平板读数仪对干燥的平板读数。为了显现斑点水平,通过减去背景而校正数值。在用本发明的药物组合物接种时的这种特异性细胞毒性T细胞的诱导的结果显示在图14中。
c)检测针对猪流感(A(H1N1)pdm09)的细胞毒性T细胞应答:
在接种后6天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。为了检测INFγ,将包被多筛选平板(Millipore)用包含针对INFγ的抗体(BD Pharmingen,Heidelberg,德国)的包被缓冲液(0.1M碳酸盐-碳酸氢盐缓冲液,pH 9.6,10.59g/l Na2CO3,8.4g/l NaHCO3)温育过夜。次日,加入5x105个细胞/孔,并且用流感A/California/7/09 A(H1N1)pdm09灭活的病毒(NIBSC,UK)(10μg/ml?)或不含肽(BSA)的缓冲液再刺激。然后,将细胞在37℃温育24小时。次日,将该平板PBS洗涤3次,用水洗涤5分钟,用PBS/0.05%吐温-20洗涤一次,然后用生物素-偶联的二级抗体在4℃温育11-24小时。然后,将平板用PBS/0.05%吐温-20洗涤,并用与封闭缓冲液中的链霉抗生物素蛋白偶联的碱性磷酸酶在室温温育2小时。用PBS/0.05%吐温-20洗涤后,向平板中加入底物(5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸/硝基蓝四唑液体底物系统,购自Sigma Aldrich,Taufkirchen,德国),并且可以可视性检测底物的转化。然后通过用水洗涤平板而终止反应。然后通过ELISPOT平板读数仪对干燥的平板读数。为了显现斑点水平,通过减去背景而校正数值。在用本发明的药物组合物接种时的这种特异性细胞毒性T细胞的诱导的结果显示在图18中。
d)检测针对人乳头瘤病毒16(HPV16)的E7蛋白的细胞毒性T细胞应答:
在接种后8天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。为了检测INFγ,将包被多筛选平板(Millipore)用包含针对INFγ的抗体(BD Pharmingen,Heidelberg,德国)的包被缓冲液(0.1M碳酸盐-碳酸氢盐缓冲液,pH 9.6,10.59g/l Na2CO3,8.4g/l NaHCO3)温育过夜。次日,加入5x105个细胞/孔,并且用不同的E7来源的肽(E7 aa43-77,E748-57,E7 aa49-57)(1μg/ml)、不相关的肽(LacZ肽H-2 Ld)或不含肽的缓冲液(DMSO)再刺激。然后,将细胞在37℃温育24小时。次日,将该平板PBS洗涤3次,用水洗涤5分钟,用PBS/0.05%吐温-20洗涤一次,然后用生物素-偶联的二级抗体在4℃温育11-24小时。然后,将平板用PBS/0.05%吐温-20洗涤,并用与封闭缓冲液中的链霉抗生物素蛋白偶联的碱性磷酸酶在室温温育2小时。用PBS/0.05%吐温-20洗涤后,向平板中加入底物(5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸/硝基蓝四唑液体底物系统,购自Sigma Aldrich,Taufkirchen,德国),并且可以可视性检测底物的转化。然后通过用水洗涤平板而终止反应。然后通过ELISPOT平板读数仪对干燥的平板读数。为了显现斑点水平,通过减去背景而校正数值。在用包含来自与传染病相关的病原体的肽抗原的本发明的药物组合物接种时的这种特异性细胞毒性T细胞的诱导的结果,对于所述E7aa43-77肽抗原不包含在所述聚合货物复合物中的结果显示在图21中,另外,对于所述E7aa43-77肽抗原包含在聚合货物复合物中时的结果显示在图22中。
e)检测针对肿瘤抗原NY-ESO-1的细胞毒性T细胞应答:
在接种后7天,将小鼠处死,取出脾脏并且分离脾细胞。为了检测INFγ,将包被多筛选平板(Millipore)用包含针对INFγ的抗体(BD Pharmingen,Heidelberg,德国)的包被缓冲液(0.1M碳酸盐-碳酸氢盐缓冲液,pH 9.6,10.59g/l Na2CO3,8.4g/l NaHCO3)温育过夜。次日,加入1x106个细胞/孔,并且用包含预测的MHC I和MHC II表位的NY-ESO-1的表位文库再刺激。然后,将细胞在37℃温育24小时。次日,将该平板PBS洗涤3次,用水洗涤一次,用PBS/0.05%吐温-20洗涤一次,然后用生物素-偶联的二级抗体在4℃温育11-24小时。然后,将平板用PBS/0.05%吐温-20洗涤,并用与封闭缓冲液中的链霉抗生物素蛋白偶联的碱性磷酸酶在室温温育2小时。用PBS/0.05%吐温-20洗涤后,向平板中加入底物(5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸/硝基蓝四唑液体底物系统,购自Sigma Aldrich,Taufkirchen,德国),并且可以可视性检测底物的转化。然后通过用水洗涤平板而终止反应。然后通过ELISPOT平板读数仪对干燥的平板读数。为了显现斑点水平,通过减去背景而校正数值。在用包含至少一种肿瘤抗原的本发明的药物组合物接种时的这种特异性细胞毒性T细胞的诱导的结果显示在图23中。
10.肿瘤攻击:
在最后一次接种后一周,在接种的小鼠中皮下植入1x106个E.G7-OVA细胞(稳定表达卵清蛋白的肿瘤细胞)。通过使用测径器在3维上测量肿瘤尺寸而监测肿瘤生长。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗肿瘤应答的诱导的结果显示在图10中。
11.病毒中和检测:
通过病毒中和测定的平均值进行病毒中和抗体应答(特异性B细胞免疫应答)的检测。一次,在接种后21天,从接种的小鼠采集血液样品,并且制备血清。这些血清用于荧光抗体病毒中和(FAVN)检测,该检测使用细胞培养适合的狂犬病病毒的攻击病毒毒株(CVS),该攻击病毒毒株由OIE(世界动物保健组织)推荐并且最先记述在Cliquet F.,Aubert M.&Sagne L.(1998);J.Immunol.Methods(免疫学方法杂志),212,79-87中。简言之,以连续两倍稀释一式四份作为一式四份样品检测热灭活的血清中和50μl的体积中CVS的100TCID50(组织培养物感染剂量的50%)的潜力。因此,将血清稀释液与病毒在37℃(在潮湿的培养箱中,具有5%CO2)温育1小时,然后加入胰蛋白酶酶解的BHK-21细胞(4x105个细胞/ml;50μl/孔)。将感染的细胞培养物在潮湿的培养箱中在37℃和5%CO2培养48小时。在室温用80%丙酮固定细胞后用FITC抗-狂犬病缀合物分析细胞的感染。平板用PBS洗涤两次,并且去除过量的PBS。关于狂犬病病毒的存在,将细胞培养物评分为正或负。在血清处理的孔中评分为负的细胞表示狂犬病病毒的中和。每次FAVN检测包括WHO或OIE标准血清(阳性参比血清),其作为测定标准化的参比。参照标准血清计算测试血清的中和活性,并且表示为国际单位/ml(IU/ml)。本实验的结果显示在图16中。
12.小鼠的狂犬病病毒攻击感染:
在用0.001倍人剂量的和3μg R722与0.81μg CR12C(3.7∶1 w/w)单次肌内免疫小鼠后37天,用25-倍LD50的狂犬病病毒CVS毒株颅内(i.c.)感染本实验中的所有小鼠。监测小鼠特定的狂犬病症状和体重发展。本实验的结果显示在图24中。
13.用TC-1细胞进行肿瘤刺激(在治疗设置中测量肿瘤生长和动物存活):
在第1天,用表达HPV E6和E7蛋白的1x105个TC-1细胞攻击每组八只C57BL/6小鼠。在肿瘤攻击后第7天(中值肿瘤体积为31-48mm3)开始接种。小鼠用与50μg CR12C/R722(1∶2;w/w)组合的5μg或50μg E7肽皮内接种5次(在第8,12,15,19和22天)。为了比较,小鼠注射单独的聚合货物复合物。
与单独的聚合载体货物复合物相比,与HPV-16来源的E7肽E7aa43-77组合的聚合载体货物复合物甚至减少肿瘤的生长(图25)。
与单独的E7肽或50聚合载体货物复合物相比,与HPV-16来源的E7肽组合的聚合载体货物复合物强烈增强荷瘤小鼠的存活(对于50μg E7肽+50μg聚合载体货物复合物,平均存活时间为44.5天;对于5μg E7肽+50μg聚合载体货物复合物,平均存活时间为22天)。
14.用TC-1细胞进行肿瘤攻击(诱导T细胞记忆应答):
每组十三只C57BL/6小鼠每周用由作为载体的二硫化物交联的阳离子肽CR12C和作为核酸货物的isRNA R722形成的聚合载体货物复合物以及E7肽皮内接种一次,共接种四周(在第0,7,14和21天接种)。
在第四次接种后八周,将5只小鼠/组处死,分离脾细胞,并且按照实施例15所述通过HPV-五聚体染色和流式细胞计数确定抗原-特异性CD8+T细胞的频率。
与用单独的50μg E7肽接种的小鼠相比,与HPV-16来源的E7肽E7aa43-77组合的聚合载体货物复合物导致抗原特异性CD8+T细胞的统计学显著的增加(对于5μg E7肽,p=0.0007,对于50μg E7肽,p=0.0002;组间统计学差异通过未配对的t-检验评估)。因此,与HPV-16来源的E7肽组合的聚合载体货物复合物的组合诱导有力的记忆CD8+T细胞应答(图27)。
第四次接种后八周,用1x105个TC-1肿瘤细胞攻击8只小鼠/组,并且监测肿瘤生长。
与HPV-16来源的E7肽E7aa43-77组合的聚合载体货物复合物导致显著的肿瘤生长延迟(对于5μg E7肽+50μg的50μg聚合载体货物复合物,4例完全反应;对于50μg E7肽+50μg的50μg聚合载体货物复合物,7例完全反应)。因此,与HPV-16来源的E7肽组合的聚合载体货物复合物的组合诱导有力的记忆CD8+T细胞应答(图28)。
15.通过五聚体染色检测抗原特异性细胞免疫应答:
将刚分离的脾细胞接种在96孔平板(2x106个细胞/孔)中,并且用Fc-Block(1∶100,抗-CD16/CD32;BD Biosciences)染色。20分子温育后,加入H-2Db-RAHYNIVTF-五聚体(HPV 16 E7 49-57)-五聚体-PE(10μl/孔),并且将细胞在4℃再温育30分钟。洗涤后,细胞用下述抗体染色:CD19-FITC(1∶200),CD8-PerCP-Cy5.5(1∶200),KLRG1-PECy7(1∶200),CD44-APC(1∶100),CD127-eFluor450(1∶100)(eBioscience)和CD3-APC-Cy7(1∶200)(BDBiosciences)。使用Aqua Dye来区分活细胞/死细胞(Invitrogen)。用Canto II流式细胞仪(Beckton Dickinson)收集细胞。使用FlowJo软件(Tree Star,Inc.)分析流式细胞计数数据。使用GraphPad Prism软件,版本5.01进行统计学分析。利用Welch’s校正通过未配对的t检验评估组间统计学差异。
16.用季节性流感免疫病检测抗体:
对于免疫,将季节性流感疫苗(包含灭活的WHO推荐的流感病毒毒株;季节性2011/2012)(4.5,0.45和0.045μg)与作为佐剂的聚合货物复合物R722/CR12C(以3.7∶1 w/w的比率)(5μg R722/1.35μg CR12C)组合,并且肌内注射到雌性Balb/c小鼠(每组8只小鼠)中。仅注射的小鼠用于比较。
通过检测流感病毒血凝素抑制(HI)滴度进行抗原特异性免疫应答(B细胞免疫应答)的检测。因此,在接种后21天从接种的小鼠采集血液样品,并且将血清加热灭活,用高岭土温育,并预先吸附到鸡红血细胞上。对于HI测定,将50μl 2倍稀释的预先处理的血清用灭活的流感A/California/7/2009 H1N1或流感A/Victoria/210/2009 H3N2(both NIBSC)温育,并且加入50μl 0.5%鸡红血细胞。在用本发明的药物组合物接种时的这种HI滴度的诱导的结果显示在图29中。
通过检测流感病毒特异性IgG2a抗体进行抗原特异性免疫应答(B细胞免疫应答)的检测。因此,在接种后21天采集血液样品,并且制备血清。将MaxiSorb平板(Nalgene NuncInternational)用灭活的流感A/California/7/2009 H1N1(NIBSC,Potters Bar,UK)以1μg/ml进行包被。在用含有0.05%吐温-20和1%BSA的1xPBS封闭后,将平板用稀释的小鼠血清温育。然后,加入生物素-偶联的二级抗体(抗-小鼠-IgG2a,Pharmingen)。洗涤后,将平板用辣根过氧化物酶-链霉抗生物素蛋白温育,然后测量ABTS底物(2,2′-连氮基-双(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸)的转化,从而确定IgG2a抗体的诱导。在用本发明的药物组合物接种时的这种抗体诱导的结果显示在图30中。

Claims (22)

1.一种药物组合物,其包含:
(A)聚合载体货物复合物,所述聚合载体货物复合物包含:
a)作为载体的聚合载体,其包含二硫化物交联的阳离子组分,优选由二硫化物交联的阳离子组分形成;和
b)作为货物的至少一种核酸分子,
(B)至少一种蛋白或肽抗原,其选自由下述组成的组:
(i)来自与传染病相关的病原体的抗原;
(ii)与变态反应或变应性疾病相关的抗原;
(iii)与自身免疫病相关的抗原;和
(iv)与癌症或肿瘤疾病相关的抗原,
或所述蛋白或肽抗原的片段、变体和/或衍生物。
2.权利要求1的药物组合物,其中组分(B)不与组分(A)共价连接。
3.权利要求1或2的药物组合物,其中所述蛋白或肽抗原来自选自由下述组成的列表的病原体:狂犬病病毒,乙型肝炎病毒,人乳头瘤病毒(hPV),炭疽芽孢杆菌(Bacillusanthracis),呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),流感病毒和结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)。
4.权利要求1-3中任一项的药物组合物,其中所述蛋白或肽抗原选自由下述组成的列表:
●流感病毒的:血凝素(HA),神经氨酸酶(NA),核蛋白(NP),M1蛋白,M2蛋白,NS1蛋白,NS2蛋白(NEP蛋白:核输出蛋白),PA蛋白,PB1蛋白(聚合酶碱性1蛋白),PB1-F2蛋白和PB2蛋白;
●在狂犬病病毒的每种情形中:核蛋白(N),磷蛋白(P),基质蛋白(M),糖蛋白(G),和病毒RNA聚合酶(L);
●在乙型肝炎病毒的每种情形中:乙型肝炎表面抗原(HBsAg),乙型肝炎核心抗原(HbcAg),乙型肝炎病毒DNA聚合酶,HBx蛋白,preS2中表面蛋白,大S蛋白,病毒蛋白VP1,病毒蛋白VP2,病毒蛋白VP3和病毒蛋白VP4;
●在人乳头瘤病毒(hPV)的每种情形中:E1蛋白,E2蛋白,E3蛋白,E4蛋白,E5蛋白,E6蛋白,E7蛋白,E8蛋白,L1蛋白和L2蛋白;
●在炭疽芽孢杆菌的每种情形中:保护性抗原(PA),水肿因子(EF),致死因子(LF)和S-层同源蛋白(SLH);
●在呼吸道合胞病毒(RSV)的每种情形中:融合(F)蛋白,核壳(N)蛋白,磷蛋白(P),基质(M)蛋白,糖蛋白(G),大蛋白(L;RNA聚合酶),非结构蛋白1(NS1),非结构蛋白2(NS2),小疏水(SH)蛋白,延伸因子M2-1和转录调节蛋白M2-2;
●在单纯疱疹病毒(HSV)的每种情形中:糖蛋白L(UL1),尿嘧啶-DNA糖基化酶UL2,UL3蛋白,UL4蛋白,DNA复制蛋白UL5,门蛋白UL6,病毒体成熟蛋白UL7,DNA解旋酶UL8,复制起点-结合蛋白UL9,糖蛋白M(UL10),UL11蛋白,碱性核酸外切酶UL12,丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶UL13,间层蛋白UL14,末端酶(UL15),间层蛋白UL16,UL17蛋白,衣壳蛋白VP23(UL18),主要衣壳蛋白VP5(UL19),膜蛋白UL20,间层蛋白UL21,糖蛋白H(UL22),胸苷激酶UL23,UL24蛋白,UL25蛋白,衣壳蛋白P40(UL26,VP24,VP22A),糖蛋白B(UL27),ICP18.5蛋白(UL28),主要DNA-结合蛋白ICP8(UL29),DNA聚合酶UL30,核基质蛋白UL31,包膜糖蛋白UL32,UL33蛋白,内核膜蛋白UL34,衣壳蛋白VP26(UL35),大间层蛋白UL36,衣壳组装蛋白UL37,VP19C蛋白(UL38),核糖核苷酸还原酶(大亚基)UL39,核糖核苷酸还原酶(小亚基)UL40,间层蛋白/病毒体宿主关闭VHS蛋白(UL41),DNA聚合酶持续合成因子UL42,膜蛋白UI43,糖蛋白C(UL44),膜蛋白UL45,间层蛋白VP11/12(UL46),间层蛋白VP13/14(UI47),病毒体成熟蛋白VP16(UL48,α-TIF),包膜蛋白UL49,dUTP二磷酸酶UL50,间层蛋白UL51,DNA解旋酶/引物酶复合蛋白UL52,糖蛋白K(UL53),转录调节蛋白IE63(ICP27,UL54),UL55蛋白,UL56蛋白,病毒复制蛋白ICP22(IE68,US1),US2蛋白,丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶US3,糖蛋白G(US4),糖蛋白J(US5),糖蛋白D(US6),糖蛋白I(US7),糖蛋白E(US8),间层蛋白US9,衣壳/间层蛋白US10,Vmw21蛋白(US11),ICP47蛋白(IE12,US12),主要转录激活因子ICP4(IE175,RS1),E3泛素连接酶ICP0(IE110),潜伏相关的蛋白1(LRP1),潜伏相关的蛋白2(LRP2),神经毒力因子RL1(ICP34.5),和潜伏相关的转录物(LAT);或
●在结核分枝杆菌的每种情形中:ESAT-6蛋白,ESX-1蛋白,CFP10蛋白,TB10.4蛋白,MPT63蛋白,MPT64蛋白,MPT83蛋白,MTB12蛋白,MTB8蛋白,AG85A蛋白,AG85B蛋白,Rpf-样蛋白,KATG蛋白,PPE18蛋白,MTB32蛋白,MTB39蛋白,晶体蛋白,HSP65蛋白,PST-S蛋白,和HBHA蛋白,10kDa滤出物抗原EsxB,丝氨酸蛋白酶PepA,纤连蛋白-结合蛋白D FbpD,分泌的蛋白MPT51,周质磷酸-结合脂蛋白PSTS1(PBP-1),周质磷酸-结合脂蛋白PSTS3(PBP-3,Phos-1),PPE家族蛋白PPE14,PPE家族蛋白PPE68,蛋白MTB72F,分子伴侣DnaK,细胞表面脂蛋白MPT83,脂蛋白P23,磷酸转运系统通透酶蛋白PstA,14kDa抗原,纤连蛋白-结合蛋白CFbpC1,丙氨酸脱氢酶TB43和谷氨酰胺合酶1。
5.权利要求1或2的药物组合物,其中所述蛋白或肽抗原与变态反应或变应性疾病相关,并且来源于选自由下述组成的列表的来源:草花粉,树花粉,花的花粉,草本花粉,粉尘螨,霉菌,动物,食物和昆虫毒液。
6.权利要求1或2的药物组合物,其中所述蛋白或肽抗原与自身免疫病相关,并且选自由下述组成的列表:
●在与多发性硬化(MS)相关的每种情形中:髓鞘碱蛋白(MBP),蛋白脂蛋白(PLP),和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG);
●在与I型糖尿病相关的每种情形中:CD44,前胰岛素原,胰岛素原,胰岛素,谷氨酸脱羧酶(GAD65),酪氨酸磷酸酶-样胰岛素瘤抗原2(IA2),锌转运蛋白((ZnT8),和热休克蛋白60(HSP60);
●与自身免疫性葡萄膜炎相关的光感受器间类视黄醇-结合蛋白(IRBP);
●在与重症肌无力相关的每种情形中:乙酰胆碱受体AchR和胰岛素样生长因子-1受体(IGF-1R);
●来自与风湿热相关的β-溶血链球菌(streptocci)的M蛋白(假自身抗原);
●与关节炎相关的巨噬细胞迁移抑制因子;
●在与舍格伦综合征相关的每种情形中:Ro/La RNP复合物,α-和β-胞衬蛋白,胰岛细胞自身抗原,聚(ADP)核糖聚合酶(PARP),NuMA,NOR-90,Ro60自身抗原和p27抗原;
●在与红斑狼疮相关的每种情形中:Ro60自身抗原,低密度脂蛋白,U-1小核核糖核蛋白复合物的Sm抗原(B/B′,D1,D2,D3,E,F,G),和RNP核糖核蛋白;
●在与动脉粥样硬化相关的每种情形中:oxLDL,β(2)GPI,HSP60/65和oxLDL/β(2)GPI;
●与特发性扩张型心肌病(DCM)相关的心脏β(1)-肾上腺素能受体;
●与肌炎相关的组氨酰-tRNA合酶(HisRS);
●与硬皮病相关的拓扑异构酶I;
●IL-17;或
热休克蛋白。
7.权利要求1或2的药物组合物,其中所述蛋白或肽抗原与癌症或肿瘤疾病相关,并且选自由下述组成的列表:p53,CA125,EGFR,Her2/neu,hTERT,PAP,MAGE-A1,MAGE-A3,间皮素,MUC-1,NY-ESO-1,GP100,MART-1,酪氨酸酶,PSA,PSCA,PSMA VEGF,VEGFR1,VEGFR2,Ras,CEA和WT1。
8.权利要求1-7中任一项的药物组合物,其中所述聚合载体货物复合物用作佐剂。
9.权利要求1-8中任一项的药物组合物,其中所述核酸分子货物是免疫刺激性核酸。
10.权利要求1-9中任一项的药物组合物,其中所述核酸分子货物是RNA;优选其中所述核酸分子货物是免疫刺激性RNA(isRNA)。
11.权利要求1-10中任一项的药物组合物,其中包含在所述聚合载体货物复合物中的所述聚合载体的阳离子组分与所述核酸分子货物以0.1-20范围内、或0.1-5范围内、或0.1-1范围内或0.5-0.9范围内的N/P比率提供。
12.权利要求1-11中任一项的药物组合物,其中包含在所述聚合载体货物复合物中的所述聚合载体的阳离子组分是阳离子肽。
13.权利要求12的药物组合物,其中所述阳离子肽选自下述式(I)的肽:
(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x
其中
l+m+n+o+x=3-100,并且
l,m,n或o=彼此独立地选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80,81-90和91-100中的任意数字,条件是Arg,Lys,His和Orn的总含量占所述阳离子肽全部氨基酸的至少10%;并且Xaa是选自除Arg、Lys、His或Orn之外的天然(=天然存在的)或非天然氨基酸中的任一种氨基酸;和
x=选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80,81-90中的任意数字,条件是Xaa的总含量不超过所述阳离子肽的全部氨基酸的90%,
或所述阳离子肽选自下述分式(IIIa)的肽:
{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa’)x(Cys)y}
或所述阳离子肽选自下述分式(Ib)的肽:
Cys1{(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}Cys2
其中(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;x如上文定义;Xaa’是选自除Arg,Lys,His,Orn或Cys之外的天然(=天然存在的)或非天然氨基酸中的任意氨基酸,并且y是选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80和81-90的任意数字,条件是Arg(精氨酸)、Lys(赖氨酸)、His(组氨酸)和Orn(鸟氨酸)的总含量占寡肽全部氨基酸的至少10%,并且其中Cys1和Cys2是接近(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orrn)o;(Xaa)x的半胱氨酸或在(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x末端的半胱氨酸。
14.权利要求1-13中任一项的药物组合物,其中所述聚合载体货物复合物不包括所述蛋白或肽抗原。
15.试剂盒或部件的试剂盒,其包含:
a)权利要求1、2或权利要求8-14中任一项所限定的聚合载体货物复合物;和
b)权利要求1-7中任一项所限定的至少一种蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物。
16.权利要求1-14中任一项的药物组合物,或权利要求15的试剂盒或部件的试剂盒,其用作疫苗。
17.权利要求1、2或权利要求8-14中任一项所限定的聚合载体货物复合物,其与权利要求1-7中任一项所限定的至少一种蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物组合用于治疗。
18.权利要求1-7中任一项所限定的蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物,其与权利要求1、2或权利要求8-14中任一项所限定的聚合载体货物复合物组合用于治疗。
19.权利要求17的聚合载体货物复合物,其用于治疗下述;或权利要求18的蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物,其用于治疗下述:
(i)传染病;
(ii)变态反应或变应性疾病;
(iii)自身免疫病;或
(iv)癌症或肿瘤疾病。
20.一种药物包装,其包括:
(A)权利要求1、2或权利要求8-14中任一项所限定的聚合载体货物复合物;和
(B)描述所述聚合载体货物复合物与权利要求1-7中任一项所限定的至少一种蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物组合用于治疗的应用的使用说明书。
21.一种药物包装,其包括:
(A)权利要求1-7中任一项所限定的至少一种蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物;和
(B)描述所述蛋白或肽抗原或其片段、变体和/或衍生物与权利要求1、2或权利要求8-14中任一项所限定的聚合载体货物复合物组合用于治疗的应用的使用说明书。
22.权利要求20或21的药物包装,其中所述使用说明书还描述在下述疾病的治疗中的应用:
(i)传染病;
(ii)变态反应或变应性疾病;
(iii)自身免疫病;或
(iv)癌症或肿瘤疾病。
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