CN107428845A - 包括细胞穿透肽、货物和tlr肽激动剂的新型复合物 - Google Patents

包括细胞穿透肽、货物和tlr肽激动剂的新型复合物 Download PDF

Info

Publication number
CN107428845A
CN107428845A CN201680015946.2A CN201680015946A CN107428845A CN 107428845 A CN107428845 A CN 107428845A CN 201680015946 A CN201680015946 A CN 201680015946A CN 107428845 A CN107428845 A CN 107428845A
Authority
CN
China
Prior art keywords
epitope
cell
compound
antigen
amino acid
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201680015946.2A
Other languages
English (en)
Inventor
M·德若尔滋
E·贝尔诺儿
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Arles Treatment Co
Amal Therapeutics SA
Original Assignee
Arles Treatment Co
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Arles Treatment Co filed Critical Arles Treatment Co
Publication of CN107428845A publication Critical patent/CN107428845A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70517CD8
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/04Peptides having up to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • A61K38/10Peptides having 12 to 20 amino acids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/177Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/18Growth factors; Growth regulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/385Haptens or antigens, bound to carriers
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4615Dendritic cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/462Cellular immunotherapy characterized by the effect or the function of the cells
    • A61K39/4622Antigen presenting cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/46449Melanoma antigens
    • A61K39/464492Glycoprotein 100 [Gp100]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464496Fusion proteins originating from gene translocation in cancer cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/30Macromolecular organic or inorganic compounds, e.g. inorganic polyphosphates
    • A61K47/42Proteins; Polypeptides; Degradation products thereof; Derivatives thereof, e.g. albumin, gelatin or zein
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/62Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
    • A61K47/64Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/62Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
    • A61K47/64Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent
    • A61K47/6425Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent the peptide or protein in the drug conjugate being a receptor, e.g. CD4, a cell surface antigen, i.e. not a peptide ligand targeting the antigen, or a cell surface determinant, i.e. a part of the surface of a cell
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6801Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
    • A61K47/6803Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
    • A61K47/6811Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates the drug being a protein or peptide, e.g. transferrin or bleomycin
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6835Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
    • A61K47/6851Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell
    • A61K47/6865Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell the tumour determinant being from skin, nerves or brain cancer cell
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70514CD4
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K19/00Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K7/00Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/04Linear peptides containing only normal peptide links
    • C07K7/06Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K7/00Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/04Linear peptides containing only normal peptide links
    • C07K7/08Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/10Cells modified by introduction of foreign genetic material
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/515Animal cells
    • A61K2039/5154Antigen presenting cells [APCs], e.g. dendritic cells or macrophages
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/60Medicinal preparations containing antigens or antibodies characteristics by the carrier linked to the antigen
    • A61K2039/6031Proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/03Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/10Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a tag for extracellular membrane crossing, e.g. TAT or VP22
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/33Fusion polypeptide fusions for targeting to specific cell types, e.g. tissue specific targeting, targeting of a bacterial subspecies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/40Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/16011Herpesviridae
    • C12N2710/16211Lymphocryptovirus, e.g. human herpesvirus 4, Epstein-Barr Virus
    • C12N2710/16233Use of viral protein as therapeutic agent other than vaccine, e.g. apoptosis inducing or anti-inflammatory
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Inorganic Chemistry (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明提供了新型复合物,其包括a)细胞穿透肽,b)至少一种抗原或抗原表位,和c)至少一种TLR肽激动剂,其中组分a)–c)被共价连接。而且,本发明还提供了编码这样的复合物的核酸,其中复合物是肽或蛋白质。这样的核酸可以由载体包括,并且这样的载体可以由宿主细胞包括。具体地,提供了组合物,比如药物组合物和疫苗,其可以例如在预防和/或治疗疾病和/或障碍中是有用的,所述疾病和/或障碍包括癌症、血液学障碍、传染性疾病、自身免疫障碍和移植排斥。

Description

包括细胞穿透肽、货物和TLR肽激动剂的新型复合物
技术领域
本发明涉及接种疫苗,具体地涉及癌症疫苗的领域。
发明背景
免疫系统可以识别和在一定程度上消除肿瘤细胞,然而,该抗肿瘤应答通常具有低幅度并且是低效的。利用治疗性接种疫苗促进该弱的抗肿瘤应答已经是癌症疗法的长期追求目标。调节免疫系统以增强免疫应答因而已经成为肿瘤学中有希望的治疗方法,这是由于它可以与标准的护理治疗联合。
临床试验中有希望的临床前数据和进展,包括最近FDA批准的Sipuleucel-T疫苗和抗CTLA-4抗体,显示主动免疫接种对于某些癌症类型是安全的和可行的治疗形式。已经使用不同的方法——其包括修饰的肿瘤细胞疫苗、肽疫苗、重组病毒载体、DNA、蛋白质、或树突细胞疫苗——报道了肿瘤特异性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)介导的免疫应答的诱导。然而,由CTL介导的抗肿瘤免疫仅仅偶然地与肿瘤消退相关联并且仅仅少数项目已经到达III期临床阶段。
总的来说,癌症疫苗迄今为止显示了非常有限的临床功效。事实上,在2011年末,在30,000项正在进行的癌症疫苗临床试验之中,仅仅报道了19项III期试验(全球数据,2012)。在它们之中,存在用于乳腺癌的肽疫苗NeuVax、用于非小细胞肺癌(NSCLC)和乳腺癌的基于脂质体的疫苗Stimuvax、用于NSCLC的基于牛痘的疫苗TG4010和用于NSCLC的含佐剂(adjuvanted)脂质体GSK1572932A。这四种癌症疫苗基于不同的技术并且具有如下共同之处:它们靶向一种单一抗原。
治疗性癌症疫苗可以被划分为两种主要的类别:个性化(自体)和标准化疫苗,并且取决于技术平台被进一步分类。当前的个性化疫苗包括肿瘤溶胞产物疫苗以及基于树突细胞的疫苗(下文称为基于细胞的)。对于后者,抗原负载可以在使用肿瘤溶胞产物的脉冲,或利用从肿瘤提取的RNA的转染的情况下发生。在该情况下,抗原是肿瘤特异的或相关的,但是没有明确限定。利用肽脉冲或使用蛋白质比如用于改造疫苗的前列腺酸性磷酸酶(PAP),树突细胞也可以负载有限定的抗原。然而,这些基于细胞的疗法的制造过程是耗时的和劳动密集的,同时难以达到和维持质量标准。免疫监测产生进一步的复杂性。而且,与限定的和标准化的疫苗不同,大多数自体癌症疫苗不允许控制使用的抗原的特性或数量。
与基于细胞的疗法(APC、T细胞、CAR、溶胞产物)形成对比,亚单位疫苗(蛋白质或肽)允许标准化疫苗发展出更容易的生产和显著更好的批次间重现性,其可以被施用给大范围的患者。另外,抗原被完全限定,其允许更好的免疫监测和降低疫苗组分的有害作用的风险。
在临床前和临床研发中评价的不同方法包括短肽疫苗(Slingluff CL,Jr.Thepresent and future of peptide vaccines for cancer:single or multiple,long orshort,alone or in combination?Cancer journal 2011;17(5):343-50)、长肽疫苗(Melief CJ,van der Burg SH.Immunotherapy of established(pre)malignant diseaseby synthetic long peptide vaccines.Nature reviews Cancer2008;8(5):351-60)和蛋白质。与长肽和蛋白疫苗形成对比,短肽疫苗具有非常短的半衰期和可能对免疫应答具有消极后果。
对于基于蛋白质的疫苗,在转移性黑素瘤(Kruit WH,Suciu S,Dreno B,MortierL,Robert C,Chiarion-Sileni V,et al.Selection of immunostimulant AS15foractive immunization with MAGE-A3protein:results of a randomized phase IIstudy of the European Organisation for Research and Treatment of CancerMelanoma Group in Metastatic Melanoma.Journal of clinical oncology:officialjournal of the American Society of Clinical Oncology 2013;31(19):2413-20)和非小细胞肺癌(NSLC)(Vansteenkiste J,Zielinski M,Linder A,Dahabreh J,Gonzalez EE,Malinowski W,et al.Adjuvant MAGE-A3immunotherapy in resected non-small-celllung cancer:phase II randomized study results.Journal of clinical oncology:official journal of the American Society of Clinical Oncology 2013;31(19):2396-403)中有希望的II期数据后,已经在满腔热情地等待利用基于重组融合蛋白的疫苗靶向MAGE-A3的结果。然而,在2013年,黑素瘤中的III期DERMA试验(NCT00796445)没有满足其第一个协同主要终点(co-primary endpoint),接着在2014年停止NSCL中的III期MAGRIT研究(NCT00480025)。不管这些非常令人失望的临床结果,基于蛋白质的疫苗不可否认地存在许多优点。
治疗性癌症疫苗被施用给癌症患者以增强它们的免疫系统识别和杀伤肿瘤细胞的能力。治疗性癌症疫苗的主要目标是生成特异于肿瘤细胞的杀伤T细胞(还称为细胞毒性T淋巴细胞)。为了该目标和为了实现有效的免疫应答,疫苗必须包含称为抗原的分子,其也可以存在于肿瘤中并且需要被递送至抗原呈递细胞(APC),尤其是树突细胞(DC),以允许引发癌症免疫。DC将这些肿瘤抗原加工为在细胞表面表达的MHC I类或MHC II类分子上呈递至T细胞的小肽。然后由T细胞识别并且从而诱导它们的刺激的肽被称为表位。通过MHC I类或MHC II类分子的呈递允许活化两种类别的T细胞,分别是CD8+细胞毒性T淋巴细胞(CTL)和CD4+辅助T(Th)细胞。此外,为了成为完全活化的,除抗原识别之外,T细胞还需要第二信号——共刺激信号,其是抗原非特异性的并且由在APC和T细胞的表面上表达的共刺激分子之间的相互作用提供。因此,高效的治疗性癌症疫苗的两种主要的要求是肿瘤抗原的特异性和将它们高效地递送至DC的能力。
总之,肿瘤特异性免疫应答的诱导因而需要三个主要的步骤:(i)抗原必须被递送至树突细胞,所述树突细胞将把抗原加工为表位,(ii)树突细胞应当接收合适的激活信号,和(iii)活化的负载肿瘤抗原的树突细胞必须在淋巴器官中生成T-细胞介导的免疫应答。
由于肿瘤细胞可以通过下调个体抗原的表达逃避免疫系统(被动免疫逃避),多表位抗原递送提供了优势。事实上,基于蛋白质的疫苗允许多表位抗原递送至抗原呈递细胞(APC)比如树突细胞(DC),而没有限制于单一MHC等位基因的限制。另一个优势是最近在负载有蛋白质的树突细胞中描述的持久的表位呈递(van Montfoort N,Camps MG,Khan S,Filippov DV,Weterings JJ,Griffith JM,et al.Antigen storage compartments inmature dendritic cells facilitate prolonged cytotoxic T lymphocyte cross-priming capacity.Proceedings of the National Academy of Sciences of theUnited States of America 2009;106(16):6730-5)。另外,蛋白质需要由DC摄取和加工以实现它们的组成表位(constituent epitope)的MHC限制的呈递。如在使用短肽——其不具有这样严格的加工要求——接种疫苗后已经显示的,这减小诱导外周耐受的风险(ToesRE,Offringa R,Blom RJ,Melief CJ,Kast WM.Peptide vaccination can lead toenhanced tumor growth through specific T-cell tolerance induction.Proceedingsof the National Academy of Sciences of the United States of America 1996;93(15):7855-60)。
然而,大部分可溶性蛋白质通常在内溶酶体(endolysosome)中降解和在MHC I类分子上不良地交叉呈递,并且因此对CD8+T细胞应答具有差的免疫原性(Rosalia RA,Quakkelaar ED,Redeker A,Khan S,Camps M,Drijfhout JW,et al.Dendritic cellsprocess synthetic long peptides better than whole protein,improving antigenpresentation and T-cell activation.European journal of immunology 2013;43(10):2554-65)。而且,虽然成熟的DC在引发和诱发T-细胞应答中比不成熟的DC更有效(Apetoh L,Locher C,Ghiringhelli F,Kroemer G,Zitvogel L.Harnessing dendriticcells in cancer.Semin Immunol.2011;23:42–49),但是它们失去了高效地处理外源性抗原,具体地MHC II类限制的抗原的能力(Banchereau J,Steinman RM.Dendritic cellsand the control of immunity.Nature.1998;392:245–252)。结果,作为疫苗的肽-脉冲的DC具有多种限制。例如,肽降解、快速的MHC I类转换、和肽在DC/肽的制备和注射期间从MHCI类分子解离可能导致DC表面上MHC I类/肽复合物的短的半衰期,其导致弱的T-细胞应答。
为了改进基于蛋白质的疫苗递送的功效,已经提出将细胞穿透肽用于把癌症肽(cancer peptide)细胞内递送入DC(Wang RF,Wang HY.Enhancement of antitumorimmunity by prolonging antigen presentation on dendritic cells.NatBiotechnol.2002;20:149–156)。细胞穿透肽(CPP)是8至40个残基的肽,其具有穿过细胞膜并且进入大部分细胞类型的能力(Copolovici DM,Langel K,Eriste E,Langel U.Cell-penetrating peptides:design,synthesis,and applications.ACS nano 2014;8(3):1972-94,Milletti F.Cell-penetrating peptides:classes,origin,and currentlandscape.Drug Discov Today 2012)。可选地,它们还称为蛋白质转导结构域(PTD),其反映如在天然蛋白质中出现的它们的起源。已经从蛋白质鉴定出几种有效的CPP,包括人免疫缺陷病毒的Tat蛋白、单纯疱疹病毒的VP22蛋白、和成纤维细胞生长因子(BerryCC.Intracellular delivery of nanoparticles via the HIV-1tatpeptide.Nanomedicine.2008;3:357–365;Deshayes S,Morris MC,Divita G,HeitzF.Cell-penetrating peptides:Tools for intracellular delivery oftherapeutics.Cell Mol Life Sci.2005;62:1839–1849;Edenhofer F.Proteintransduction revisited:Novel insights into the mechanism underlyingintracellular delivery of proteins.Curr Pharm Des.2008;14:3628–3636;Gupta B,Levchenko TS,Torchilin VP.Intracellular delivery of large molecules and smallparticles by cell-penetrating proteins and peptides.Adv Drug Deliv Rev.2005;57:637–651;Torchilin VP.Recent approaches to intracellular delivery of drugsand DNA and organelle targeting.Annu Rev Biomed Eng.2006;8:343–375)。发现由DC/TAT-TRP2诱发的T-细胞活性比由DC/TRP2诱导的高3至10倍(Wang HY,Fu T,Wang G,GangZ,Donna MPL,Yang JC,Restifo NP,Hwu P,Wang RF.Induction of CD4+T cell-dependent antitumor immunity by TAT-mediated tumor antigen delivery intodendritic cells.J Clin Invest.2002a;109:1463–1470)。
而且,亚单位疫苗(肽或蛋白质)具有差的免疫原性。因此在治疗性癌症疫苗的背景下,有效的佐剂被强制性添加至疫苗,以便增加DC上共刺激分子的水平并且因此增大免疫系统对靶抗原的应答。佐剂通过模拟由免疫系统天然识别的保守微生物组分完成该任务。它们包括细菌细胞壁的组分脂多糖(LPS),和核酸比如双链RNA(dsRNA)、单链DNA(ssDNA)、和包含非甲基化的CpG二核苷酸的DNA。它们的存在连同疫苗可以极大地增加对抗原的先天免疫应答。另外,该佐剂应当促进使用CTL和极化的Th1类型(type polarizedTh1)的适应性免疫应答,而不是导致抗体产生的体液免疫应答。已经评价了不同的佐剂,其中有限数目已经获得监管批准用于人用途。这些包括美国中的明矾、MPL(单磷酰脂质A)和ASO4(明矾和MPL),和欧洲中的MF59(水包油乳剂)、ASO4、脂质体(Lim,Y.T.,Vaccineadjuvant materials for cancer immunotherapy and control of infectiousdisease.Clin Exp Vaccine Res,2015.4(1):p.54-8)。
最近,Toll样受体(TLR)配体正在成为有希望的佐剂类别(Baxevanis,C.N.,I.F.Voutsas,and O.E.Tsitsilonis,Toll-like receptor agonists:current statusand future perspective on their utility as adjuvants in improving anticancervaccination strategies.Immunotherapy,2013.5(5):p.497-511)。癌症疫苗研究的显著发展因而是对于疫苗制剂包括多种TLR激动剂,其包括TLR-3(聚肌苷酸胞苷酸)、TLR-4(单磷酰脂质A;MPL)、TLR-5(鞭毛蛋白)、TLR-7(咪喹莫特)和TLR-9(CpG)(Duthie MS,WindishHP,Fox CB,Reed SG.Use of defined TLR ligands as adjuvants within humanvaccines.Immunol Rev.2011;239:178–196)。在TLR刺激后,由免疫细胞产生的信号传导和细胞因子的类型控制CD4+T-细胞分化为Th1、Th2、Th17和Treg细胞。大部分基于TLR的佐剂对免疫细胞比如DC和T细胞的刺激产生促炎细胞因子并且促进Th1和CD8+T应答(Manicassamy S,Pulendran B.Modulation of adaptive immunity with Toll-likereceptors.Semin Immunol.2009;21:185–193)。
将疫苗缀合至TLR配体是相对于非缀合的疫苗提供多种优势的引人注目的方法,所述优势包括(i)由表达TLR的免疫细胞优先摄取、(ii)更高的免疫应答和(iii)降低的诱导外周耐受的风险。事实上,负载有抗原的所有抗原呈递细胞将被同时活化。不同的组探究了该方法,其中多种TLR配体主要被化学连接至肽或蛋白疫苗(Zom GG,Khan S,FilippovDV,Ossendorp F.TLR ligand-peptide conjugate vaccines:toward clinicalapplication.Adv Immunol.2012;114:177-201)。由于与肽的化学连接容易进行,缀合疫苗的最积极研究的TLR配体是TLR2激动剂Pam2Cys和Pam3Cys(Fujita,Y.and H.Taguchi,Overview and outlook of Toll-like receptor ligand-antigen conjugatevaccines.Ther Deliv,2012.3(6):p.749-60)。
然而,迄今为止,大多数癌症疫苗试验已经显示了有限的功效。一种解释是缺少如下疗法:其可以同时(i)刺激多表位细胞毒性T细胞-介导的免疫,(ii)诱导Th细胞和(iii)促进免疫记忆。这三个参数对生成有效的、持久的抗肿瘤免疫必不可少。事实上,特异于不同表位的CTL将允许异形肿瘤块内更多癌细胞的破坏,和避免抗原-丢失变体的向外生长(肿瘤免疫逃避)。Th细胞涉及持久的细胞免疫的维持,并且通过Th细胞的肿瘤浸润对CD8+CTL的募集和功能也是必不可少的步骤。免疫记忆对防护肿瘤复发必不可少。
发明内容
鉴于上面,本发明的目标是克服上面概述的当前的癌症疫苗的缺点,并且提供用于癌症免疫疗法应用的新型复合物,其代表具有改进的抗肿瘤活性的更有效的疫苗,特别是癌症疫苗。
该目标借助在下面和所附权利要求中陈述的主题实现。
虽然在下面详细描述了本发明,但是要理解本发明不限于本文描述的特定的方法、方案和试剂,因为这些可以改变。还要理解本文使用的术语不意欲限制本发明的范围,其将仅仅由所附权利要求限制。除非另外限定,本文使用的所有技术和科学术语具有与本领域普通技术人员一般理解的相同的含义。
在下列中,将描述本发明的要素。这些要素在具体的实施方式的情况下被列出,然而,应当理解它们可以以任何方式和以任何数目组合以产生另外的实施方式。不同描述的实例和优选的实施方式不应当解释为将本发明限于仅仅明确描述的实施方式。本说明书应当理解为支持和涵盖将明确描述的实施方式与任何数目的公开的和/或优选的要素组合的实施方式。另外,除非上下文另外指出,本申请中所有描述的要素的任何排列和组合应当被认为被本申请的说明书公开。
贯穿本说明书和所附的权利要求书,除非上下文另外需要,术语“包括(comprise)”和变型比如“包括(comprises)”和“包括(comprising)”将被理解暗示包括陈述的组成、整数或步骤但不排除任何其它未陈述的组成、整数或步骤。术语“由…组成(consist of)”是术语“包括”的特定的实施方式,其中排除任何其它未陈述的组成、整数或步骤。在本发明的上下文中,术语“包括”涵盖术语“由…组成”。术语“包括”因而涵盖“包含(including)”以及“由…组成(consisting)”,例如,“包括”X的组合物可以唯一地由X组成或可以包括额外的一些,例如,X+Y。
除非本文另外指示或由上下文明确地否认,在描述本发明的上下文中(尤其是在权利要求的上下文中)使用的术语“一个(a)”和“一种(an)”和“该(所述,the)”和类似的指代物被解释为覆盖单数和复数二者。本文的值范围的叙述仅仅意欲充当分别提及落入该范围的每个独立值的速记方法。除非本文另外指示,每个个体值被并入说明书,如同其在本文被分别叙述一样。本说明书中的语言均不应当被解释为指示对实践本发明必不可少的任何未要求保护的要素。
词语“基本上地”不排除“完全地”,例如,“基本上不含”Y的组合物可以完全不含Y。必要时,词语“基本上地”可以从本发明的限定省略。
关于数值x的术语“大约”意思是x±10%。
根据本发明的复合物
在第一方面,本发明提供了复合物,其包括:
a)细胞穿透肽;
b)至少一种抗原或抗原表位;和
c)至少一种TLR肽激动剂,
其中组分a)–c),即细胞穿透肽、至少一种抗原或抗原表位和至少一种TLR肽激动剂被共价连接。
根据本发明的这样的复合物提供了同时(i)刺激多表位细胞毒性T细胞-介导的免疫,(ii)诱导Th细胞和(iii)促进免疫记忆。从而,根据本发明的复合物提供有效的疫苗,具体地具有改进的抗肿瘤活性。
优选地,根据本发明的复合物是多肽或蛋白质,具体地重组多肽或重组蛋白,优选地重组融合蛋白或重组融合多肽。如本文使用的术语“重组”意思是它(在此:多肽或蛋白质)非天然存在。因此,根据本发明的复合物——其是重组多肽或重组蛋白——通常包括组分a)至c),其中组分a)至c)具有不同的起源,即不以该组合天然存在。
在本发明的上下文中,即贯穿本申请,术语“肽”、“多肽”、“蛋白质”和这些术语的变型分别指的是肽、寡肽、低聚物或包括融合蛋白的蛋白质,其包括优选地通过正常的肽键或可选地通过修饰的肽键——比如例如在等排的肽(isosteric peptide)的情况下——彼此接合的至少两个氨基酸。肽、多肽或蛋白质可以由L-氨基酸和/或D-氨基酸组成。优选地,肽、多肽或蛋白质由L-氨基酸(完全地)组成或由D-氨基酸(完全地)组成,从而形成“逆反(retro-inverso)肽序列”。术语“逆反(肽)序列”指的是线性肽序列的异构体,其中序列的方向被逆转并且每个氨基酸残基的手性被反转(参见例如Jameson et al.,Nature,368,744-746(1994);Brady et al.,Nature,368,692-693(1994))。具体地,术语“肽”、“多肽”、“蛋白质”还包括“模拟肽(peptidomimetics)”,其被定义为包含非肽结构元件的肽类似物,该肽能够模拟或拮抗天然亲本肽的生物学作用(一种或多种)。模拟肽缺乏经典的肽特性比如酶促地易剪切的肽键。具体地,除这些氨基酸之外,肽、多肽或蛋白质还可以包括由除遗传密码限定的20种氨基酸之外的氨基酸,或其可以由除遗传密码限定的20种氨基酸之外的氨基酸组成。具体地,本发明的上下文中的肽、多肽或蛋白质可以同样地由通过自然过程——比如翻译后的成熟过程——或通过化学过程修饰的氨基酸组成,其对本领域技术人员是熟知的。这样的修饰在文献中被彻底地详细描述。这些修饰可以在多肽中的任何地方出现:在肽骨架中、在氨基酸链中或甚至在羧基或氨基末端处。具体地,肽或多肽可以在泛素化之后是分支的或可以在分支或不分支的情况下是环状的。该类型的修饰可以是本领域技术人员熟知的天然或合成翻译后加工的结果。具体地,本发明的上下文中的术语“肽”、“多肽”、“蛋白质”还包括修饰的肽、多肽和蛋白质。例如,肽、多肽或蛋白质修饰可以包括乙酰化、酰化、ADP-核糖基化、酰胺化、核苷酸或核苷酸衍生物的共价固定、脂质或脂质衍生物的共价固定、磷脂酰肌醇的共价固定、共价或非共价交联、环化、二硫键形成、脱甲基化、包括聚乙二醇化的糖基化、羟基化、碘化、甲基化、豆蔻酰化、氧化、蛋白水解过程、磷酸化、异戊烯化、外消旋化、seneloylation、硫酸化、氨基酸加成比如精氨酰化或泛素化。这样的修饰在文献中被彻底地详细描述(Proteins Structure and Molecular Properties(1993)2nd Ed.,T.E.Creighton,New York;Post-translational Covalent Modifications ofProteins(1983)B.C.Johnson,Ed.,Academic Press,New York;Seifter et al.(1990)Analysis for protein modifications and nonprotein cofactors,Meth.Enzymol.182:626-646and Rattan et al.,(1992)Protein Synthesis:Post-translationalModifications and Aging,Ann NY Acad Sci,663:48-62)。因此,术语“肽”、“多肽”、“蛋白质”优选地包括例如脂肽、脂蛋白、糖肽、糖蛋白等。
然而,在特别优选的实施方式中,根据本发明的复合物是“经典的”肽、多肽或蛋白质,由此“经典的”肽、多肽或蛋白质通常由选自遗传密码限定的20种氨基酸的氨基酸组成,其彼此通过正常的肽键连接。
如果根据本发明的复合物是多肽或蛋白质,优选的是它包括至少50、至少60、至少70,优选地至少80、至少90,更优选地至少100、至少110,甚至更优选地至少120、至少130,特别优选地至少140,或最优选地至少150个氨基酸残基。
组分a)–细胞穿透肽
CPP允许高效地递送,即转运和负载,具体地至少一种抗原或抗原表位进入抗原呈递细胞(APC),具体地进入树突细胞(DC),并且因而至树突细胞的抗原加工机器。
术语“细胞穿透肽”(“CPP”)通常被用于表示短肽,其能够转运不同类型的货物分子穿过质膜,并且因而促进多种分子货物(从纳米颗粒至小的化学分子和DNA的大片段)的细胞摄取。连接至细胞穿透肽的货物分子的“细胞内化”通常意思是转运货物分子穿过质膜,并且因而使货物分子进入细胞。取决于具体情况,货物分子可以然后在细胞质中被释放,定向于细胞内细胞器,或进一步在细胞表面处呈递。根据本发明的细胞穿透肽或包括所述细胞穿透肽的复合物的细胞穿透能力或内化可以通过本领域技术人员已知的标准方法检查,包括流式细胞术或活细胞和固定细胞的荧光显微镜检查、转导有所述肽或复合物的细胞的免疫组织化学、和蛋白质印迹。
细胞穿透肽通常具有包含高相对丰度的带正电荷的氨基酸比如赖氨酸或精氨酸的氨基酸组合物或具有包含交替模式的极性/带电氨基酸和非极性疏水氨基酸的序列。这两种类型的结构分别被称为聚阳离子的或两亲的。细胞穿透肽具有不同的大小、氨基酸序列和电荷,但是所有CPP具有共同的特性,即易位质膜和促进将多种分子货物递送至细胞质或细胞的细胞器的能力。现在,CPP易位的理论区分三种主要的进入机制:在膜中直接渗透、内吞作用-介导的进入、和通过形成临时结构的易位。CPP转导是正在进行的研究区域。细胞穿透肽已经在医学中发现众多应用,作为药物递送剂——在包括癌症的不同疾病的治疗中——和病毒抑制剂,以及用于细胞标记和成像的造影剂。
通常,细胞穿透肽(CPP)是8至50个残基的肽,其具有穿过细胞膜并且进入大部分细胞类型的能力。可选地,它们还称为蛋白质转导结构域(PTD),其反映如在天然蛋白质中存在的它们的起源。Frankel与Pabo和Green与Lowenstein同时描述了来自人免疫缺陷病毒1(HIV-TAT)的反式激活转录激活因子渗透入细胞的能力(Frankel,A.D.and C.O.Pabo,Cellular uptake of the tat protein from human immunodeficiency virus.Cell,1988.55(6):p.1189-93)。在1991年,描述了将来自黑腹果蝇的触角足同源域(DNA-结合结构域)转导入神经细胞(Joliot,A.,et al.,Antennapedia homeobox peptide regulatesneural morphogenesis.Proc Natl Acad Sci U S A,1991.88(5):p.1864-8)。在1994年,命名为穿膜肽(Penetratin)的第一个16mer-肽CPP——其具有氨基酸序列RQIKIYFQNRRMKWKK(SEQ ID NO:1)——表征自触角足的同源域的第三螺旋(Derossi,D.,etal.,The third helix of the Antennapedia homeodomain translocates throughbiological membranes.J Biol Chem,1994.269(14):p.10444-50),接着在1998年,鉴定了蛋白质转导需要的TAT的最小结构域,其具有氨基酸序列YGRKKRRQRRR(SEQ ID NO:2)(Vives,E.,P.Brodin,and B.Lebleu,Atruncated HIV-1Tat protein basic domainrapidly translocates through the plasma membrane and accumulates in the cellnucleus.J Biol Chem,1997.272(25):p.16010-7)。在过去二十年内,从不同的起源描述了数十种肽,其包括病毒蛋白,例如VP22(Elliott,G.and P.O'Hare,Intercellulartrafficking and protein delivery by a herpesvirus structural protein.Cell,1997.88(2):p.223-33)和ZEBRA(Rothe,R.,et al.,Characterization of the cell-penetrating properties of the Epstein-Barr virus ZEBRAtrans-activator.J BiolChem,2010.285(26):p.20224-33),或来自毒液,例如蜂毒肽(Dempsey,C.E.,The actionsof melittin on membranes.Biochim Biophys Acta,1990.1031(2):p.143-61)、黄蜂毒素(mastoporan)(Konno,K.,et al.,Structure and biological activities of eumeninemastoparan-AF(EMP-AF),a new mast cell degranulating peptide in the venom ofthe solitary wasp(Anterhynchium flavomarginatum micado).Toxicon,2000.38(11):p.1505-15)、maurocalcin(Esteve,E.,et al.,Transduction of the scorpion toxinmaurocalcine into cells.Evidence that the toxin crosses the plasma membrane.JBiol Chem,2005.280(13):p.12833-9)、响尾蛇胺(Nascimento,F.D.,et al.,Crotaminemediates gene delivery into cells through the binding to heparan sulfateproteoglycans.J Biol Chem,2007.282(29):p.21349-60)或抗菌肽(buforin)(Kobayashi,S.,et al.,Membrane translocation mechanism of the antimicrobialpeptide buforin 2.Biochemistry,2004.43(49):p.15610-6)。合成CPP也被设计,包括聚精氨酸(R8、R9、R10和R12)(Futaki,S.,et al.,Arginine-rich peptides.An abundantsource of membrane-permeable peptides having potential as carriers forintracellular protein delivery.J Biol Chem,2001.276(8):p.5836-40)或转运素(transportan)(Pooga,M.,et al.,Cell penetration by transportan.FASEB J,1998.12(1):p.67-77)。任何上面描述的CPP可以在根据本发明的复合物中用作细胞穿透肽,即组分a)。具体地,根据本发明的复合物中的组分a),即CPP,可以包括TAT的最小结构,其具有氨基酸序列YGRKKRRQRRR(SEQ ID NO:2)。具体地,根据本发明的复合物中的组分a),即CPP,可以包括穿膜肽,其具有氨基酸序列RQIKIYFQNRRMKWKK(SEQ ID NO:1)。
还在综述:Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,andcurrent landscape.Drug Discov Today17(15-16):850-60,2012中公开了多种CPP,其可以在根据本发明的复合物中用作细胞穿透肽,即组分a)。换句话说,在Milletti,F.,2012,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug DiscovToday 17(15-16):850-60中公开的CPP可以在根据本发明的复合物中用作细胞穿透肽,即组分组分a)。具体地,这包括阳离子CPP、两亲的CPP、和疏水性CPP以及衍生自类肝素-、RNA-和DNA-结合蛋白的CPP(参阅Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today17(15-16):850-60,2012的表1)、衍生自信号肽的CPP(参阅Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and currentlandscape.Drug Discov Today17(15-16):850-60,2012的表2)、衍生自抗菌肽的CPP(参阅Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and currentlandscape.Drug Discov Today17(15-16):850-60,2012的表3)、衍生自病毒蛋白的CPP(参阅Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and currentlandscape.Drug Discov Today17(15-16):850-60,2012的表4)、衍生自多种天然蛋白质的CPP(参阅Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and currentlandscape.Drug Discov Today17(15-16):850-60,2012的表5)、和设计的CPP与衍生自肽文库的CPP(参阅Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,andcurrent landscape.Drug Discov Today17(15-16):850-60,2012的表6)。
优选地,由根据本发明的复合物包括的细胞穿透肽
i)具有总计5至50个氨基酸,优选地总计10至45个氨基酸,更优选地总计15至45个氨基酸的所述肽的氨基酸序列的长度;和/或
ii)具有包括ZEBRA的最小结构域的片段或这样的片段的序列变体的氨基酸序列,所述最小结构域从根据SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列的残基170延伸至残基220,其中,任选地,1、2、3、4或5个氨基酸已经被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力。
从而,优选的是由根据本发明的复合物包括的细胞穿透肽
i)具有总计5至50个氨基酸,优选地总计10至45个氨基酸,更优选地总计15至45个氨基酸的所述肽的氨基酸序列的长度;和
ii)具有包括ZEBRA的最小结构域的片段或这样的片段的序列变体的氨基酸序列,所述最小结构域从根据SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列的残基170延伸至残基220,其中,任选地,1、2、3、4或5个氨基酸已经被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力。
这样优选的CPP在WO 2014/041505中被公开。
术语“ZEBRA”(也称为Zta、Z、EB1或BZLF1)通常意思是爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)的碱性-亮氨酸拉链(bZIP)转录激活子。展示细胞穿透性质的ZEBRA的最小结构域已经被鉴定为横跨ZEBRA的残基170至残基220。ZEBRA的氨基酸序列在NCBI登录号YP_401673下被公开并且包括在SEQ ID NO:3中表示的245个氨基酸:
MMDPNSTSEDVKFTPDPYQVPFVQAFDQATRVYQDLGGPSQAPLPCVLWPVLPEPLPQGQLTAYHVSTAPTGSWFSAPQPAPENAYQAYAAPQLFPVSDITQNQQTNQAGGEAPQPGDNSTVQTAAAVVFACPGANQGQQLADIGVPQPAPVAAPARRTRKPQQPESLEECDSELEIKRYKNRVASRKCRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPDVLHEDLLNF(SEQ ID NO:3-ZEBRA氨基酸序列(来自爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)的天然序列)(YP_401673))
最近,源自病毒蛋白ZEBRA的CPP被描述通过如下二者转导蛋白质货物穿过生物膜:(i)直接易位和(ii)脂膜筏-介导的内吞作用(Rothe R,Liguori L,Villegas-MendezA,Marques B,Grunwald D,Drouet E,et al.Characterization of the cell-penetrating properties of the Epstein-Barr virus ZEBRAtrans-activator.TheJournal of biological chemistry2010;285(26):20224-33)。本发明人假设这两种进入机制应当促进MHC I和II类限制的货物抗原分别至CD8+和CD4+T细胞的呈递二者。因此,这样的CPP可以将多表位肽递送至树突细胞(DC),并且随后促进CTL与Th细胞活化和抗肿瘤功能。这样的CPP可以因而将根据本发明的复合物高效地递送抗原呈递细胞(APC),并且导致多表位MHC I和II类限制的呈递。
在本发明的上下文中,术语“MHC I类”表示两种主要类别的主要组织相容性复合体分子中的一种。MHC I类(也记为“MHC I”)分子在身体的每个有核细胞上被发现。MHC I类的功能是向细胞毒性细胞(CTL)展示表位。在人中,MHC I类分子由两条多肽链组成,α-和β2-微球蛋白(b2m)。仅仅α链是多态性的并且由HLA基因编码,而b2m亚基不是多态性的并且由β-2微球蛋白基因编码。在本发明的上下文中,术语“MHC II类”表示另一种主要类别的主要组织相容性复合体分子。MHC II类(也记为“MHC II”)分子仅仅在少数特定细胞类型上被发现,包括巨噬细胞、树突细胞和B细胞,其全部是专用的抗原呈递细胞(APC)。
优选地,如上面描述的ZEBRA的最小结构域的片段的序列变体与如上面描述的ZEBRA的最小结构域的片段共享——具体地在整个长度内——至少70%,至少75%,优选地至少80%,更优选地至少85%,甚至更优选地至少90%,特别优选地至少95%,最优选地至少99%氨基酸序列同一性,而不丧失细胞穿透肽的细胞穿透能力。具体地,如上面描述的ZEBRA的最小结构域的“片段”优选地被理解为其截断的序列,即如下氨基酸序列:其与天然序列的氨基酸序列比较是N-端、C-端和/或序列内截断的。而且,这样的ZEBRA的最小结构域的“片段”具有优选地总计5至50个氨基酸,优选地总计10至45个氨基酸,更优选地总计15至45个氨基酸的长度。
因此,如在本发明的上下文中使用的术语“序列变体”,即贯穿本申请,指的是参考序列中的任何改变。术语“序列变体”包括核苷酸序列变体和氨基酸序列变体。优选地,参考序列是任何在“序列和SEQ ID编号的表格”(序列表)中列出的序列,即SEQ ID NO:1至SEQID NO:79。优选地,序列变体与参考序列共享——具体地在序列的整个长度内——至少70%,至少75%,优选地至少80%,更优选地至少85%,甚至更优选地至少90%,特别优选地至少95%,最优选地至少99%序列同一性,由此,如下面所描述计算序列同一性。具体地,序列变体保留参考序列的特定功能。如下面所描述计算序列同一性。具体地,氨基酸序列变体具有改变的序列,其中参考序列中的一个或多个氨基酸被缺失或置换,或一个或多个氨基酸被插入参考氨基酸序列的序列。作为改变的结果,氨基酸序列变体具有与参考序列至少70%,至少75%,优选地至少80%,更优选地至少85%,甚至更优选地至少90%,特别优选地至少95%,最优选地至少99%同一的氨基酸序列。例如,至少90%同一的变体序列具有参考序列的每100个氨基酸不多于10个改变,即缺失、插入或置换的任意组合。
在本发明的上下文中,与本发明的查询氨基酸序列“共享”至少例如95%的“序列同一性”的氨基酸序列意指主题氨基酸序列的序列与查询序列同一,除了主题氨基酸序列可以包括查询氨基酸序列的每100个氨基酸多至五个氨基酸改变。换句话说,为了获得与查询氨基酸序列具有至少95%序列同一性的序列的氨基酸序列,主题序列中多至5%(100个中的5个)的氨基酸残基可以被插入或置换为另一种氨基酸或被缺失,优选地在上面的变体或片段的限定内。当然,其也类似地适用于核酸序列。
对于不准确对应的(氨基酸或核酸)序列,可以测定第一序列关于第二序列的“%同一性”。一般而言,待比较的这两个序列被比对以给出序列之间的最大相关性。这可以包括在一个或两个序列中插入“缺口”,以增强对齐程度。%同一性然后可以在比较的序列中的每个的全长内(所谓的全局比对)——其特别适合相同或相似长度的序列,或在较短的限定长度(所谓的局部比对)内——其更适合不相等长度的序列——进行测定。
用于比较两个或更多个序列的同一性和同源性的方法是本领域熟知的。两个序列同一的百分数可以例如使用数学算法测定。可以使用的数学算法的优选的,但是非限制的实例是Karlin et al.(1993),PNAS USA,90:5873-5877的算法。这样的算法被整合在BLAST家族的程序,例如BLAST或NBLAST程序(还参见Altschul et al.,1990,J.Mol.Biol.215,403-410或Altschul et al.(1997),Nucleic Acids Res,25:3389-3402)(可通过万维网站ncbi.nlm.nih.gov处的NCBI的主页访问)和FASTA(Pearson(1990),Methods Enzymol.183,63-98;Pearson and Lipman(1988),Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 85,2444-2448.)中。可以通过这些程序鉴定以一定程度与其它序列同一的序列。另外,Wisconsin序列分析程序包,版本9.1(Devereux et al.,1984,Nucleic Acids Res.,387-395)中可获得的程序,例如程序BESTFIT和GAP,可以被用于测定两个多核苷酸之间的%同一性和两个多肽序列之间的%同一性与%同源性或同一性。BESTFIT使用(Smith and Waterman(1981),J.Mol.Biol.147,195-197.)的“局部同源性”算法并且发现了两个序列之间相似性最好的单一区域。
更优选地,在MHC I类和/或MHC II类分子的上下文中,如上面描述的根据本发明的细胞穿透肽的片段或其变体进一步保留所述肽的在细胞——比如抗原呈递细胞——的表面处呈递货物分子比如抗原或抗原表位的能力。在MHC I类和/或MHC II类分子的上下文中,细胞穿透肽或包括所述细胞穿透肽的复合物在细胞的表面处呈递货物分子比如抗原或抗原表位的能力可以通过本领域技术人员已知的标准方法检查,包括刺激增殖的能力和/或对这些表位具有特异性的MHC-限制的CD4+或CD8+T细胞的功能。
优选的细胞穿透肽,其
i)具有总计5至50个氨基酸,优选地总计10至45个氨基酸,更优选地总计15至45个氨基酸的所述肽的氨基酸序列的长度;和/或
ii)具有包括ZEBRA的最小结构域的片段或这样的片段的变体的氨基酸序列,所述最小结构域从根据SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列的残基170延伸至残基220,其中,任选地,1、2、3、4或5个氨基酸已经被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力
优选地包括如下氨基酸序列,其具有至少一个与参考序列比较保守置换的氨基酸,意思是给定的氨基酸残基被替换为具有类似的生理化学特性的残基。
通常,在参考氨基酸序列中存在的一个或多个氨基酸的置换应当保守地完成。保守置换的实例包括将一种脂肪族残基置换为另一种,比如将Ile、VaI、Leu或Ala置换为另一种,或将一种极性残基置换为另一种,比如Lys和Arg;Glu和Asp;或Gln和Asn之间。其它这样的保守置换,例如,具有类似的疏水性质的整个区域的置换是熟知的(Kyte andDoolittle,1982,J.Mol.Biol.157(1):105-132)。在本发明的上下文中,将一种或多种L-氨基酸置换为一种或多种D-氨基酸被认为是保守置换。示例性氨基酸置换被呈现在下面的表1中:
原始残基 置换的实例
Ala(A) Val、Leu、Ile、Gly
Arg(R) His、Lys
Asn(N) Gln
Asp(D) Glu
Cys(C) Ser
Gln(Q) Asn
Glu(E) Asp
Gly(G) Pro、Ala
His(H) Lys、Arg
Ile(I) Leu、Val、Met、Ala、Phe
Leu(L) Ile、Val、Met、Ala、Phe
Lys(K) Arg、His
Met(M) Leu、Ile、Phe
Phe(F) Leu、Val、Ile、Tyr、Trp、Met
Pro(P) Ala、Gly
Ser(S) Thr
Thr(T) Ser
Trp(W) Tyr、Phe
Tyr(Y) Trp、Phe
原始残基 置换的实例
Val(V) Ile、Met、Leu、Phe、Ala
(表1)
特别优选地,优选的细胞穿透肽,其
i)具有总计5至50个氨基酸,优选地总计10至45个氨基酸,更优选地总计15至45个氨基酸的所述肽的氨基酸序列的长度;和/或
ii)具有包括ZEBRA的最小结构域的片段或这样的片段的变体的氨基酸序列,所述最小结构域从根据SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列的残基170延伸至残基220,其中,任选地,1、2、3、4或5个氨基酸已经被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力
相对于SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列,在第189位的等价位置处,包括Cys(C)被置换为Ser(S)。
从而,优选的是这样优选的细胞穿透肽具有包括根据下列通式(I)的序列的氨基酸序列:
X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11SX13X14X15X16X17
其中0、1、2、3、4或5个氨基酸被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力,其中
X1是K、R或H,优选地X1是K或R;
X2是R、K或H,优选地X2是R或K;
X3是Y、W或F,优选地X3是Y、W或F;
X4是K、R或H,优选地X4是K或R;
X5是N或Q;
X6是R、K或H,优选地X6是R或K;
X7是V、I、M、L、F或A,优选地X7是V、I、M或L;
X8是A、V、L、I或G,优选地X8是A或G;
X9是S或T;
X10是R、K或H,优选地X10是R或K;
X11是K、R或H,优选地X11是K或R;
X13是R、K或H,优选地X13是R或K;
X14是A、V、L、I或G,优选地X14是A或G;
X15是K、R或H,优选地X15是K或R;
X16是F、L、V、I、Y、W或M,优选地X16是F、Y或W;和
X17是K、R或H,优选地X17是K或R.
优选地,这样的肽、多肽或蛋白质由L-氨基酸(完全地)组成或由D-氨基酸(完全地)组成,从而形成“逆反肽序列”。术语“逆反(肽)序列”指的是线性肽序列的异构体,其中序列的方向被逆转并且每个氨基酸残基的手性被反转(参见例如Jameson et al.,Nature,368,744-746(1994);Brady et al.,Nature,368,692-693(1994))。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X1是K。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X2是R。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X3是Y。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X4是K。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X5是N。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X6是R。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X7是V。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X8是A。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X9是S。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X10是R。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X11是K。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X13是R。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X14是A。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X15是K。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X16是F。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中X17是K。
在具体的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽通过通式(I)如上面一般地限定,其中相对于通式(I)在与第12位等价的位置处的氨基酸是Ser(S)。
还特别优选的是优选的细胞穿透肽,其
i)具有总计5至50个氨基酸,优选地总计10至45个氨基酸,更优选地总计15至45个氨基酸的所述肽的氨基酸序列的长度;和/或
ii)具有包括ZEBRA的最小结构域的片段或这样的片段的变体的氨基酸序列,所述最小结构域从根据SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列的残基170延伸至残基220,其中,任选地,1、2、3、4或5个氨基酸已经被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力
包括或由如下氨基酸序列或其序列变体组成而不丧失所述肽的细胞穿透能力,所述氨基酸序列选自根据SEQ ID NO:4-13的氨基酸序列,优选地序列变体具有0、1、2、3、4或5个被置换、缺失、和/或添加的氨基酸而不丧失所述肽的细胞穿透能力。
CPP1(Z11):
KRYKNRVASRKCRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMC
(SEQ ID NO:4)
CPP2(Z12):
KRYKNRVASRKCRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLK
(SEQ ID NO:5)
CPP3(Z13):
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLK
(SEQ ID NO:6)
CPP4(Z14):
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAK
(SEQ ID NO:7)
CPP5(Z15):
KRYKNRVASRKSRAKFK
(SEQ ID NO:8)
CPP6(Z16):
QHYREVAAAKSSEND
(SEQ ID NO:9)
CPP7(Z17):
QLLQHYREVAAAK
(SEQ ID NO:10)
CPP8(Z18):
REVAAAKSS END RLRLLLK
(SEQ ID NO:11)
CPP9(Z19):
KRYKNRVA
(SEQ ID NO:12)
CPP10(Z20):
VASRKSRAKFK
(SEQ ID NO:13)
从而,特别优选的是具有如下氨基酸序列或其序列变体而不丧失所述肽的细胞穿透能力的细胞穿透肽,所述氨基酸序列包括或由根据SEQ ID NO:6(CPP3/Z13)、SEQ ID NO:7(CPP4/Z14)、SEQ ID NO:8(CPP5/Z15)或SEQ ID NO:11(CPP8/Z18)的氨基酸序列组成,优选地序列变体具有0、1、2、3、4或5个被置换、缺失、和/或添加的氨基酸而不丧失所述肽的细胞穿透能力。而且,更优选的是具有如下氨基酸序列或其序列变体而不丧失所述肽的细胞穿透能力的细胞穿透肽,所述氨基酸序列包括或由根据SEQ ID NO:6(CPP3/Z13)或SEQ IDNO:7(CPP4/Z14)的氨基酸序列组成,优选地序列变体具有0、1、2、3、4或5个被置换、缺失、和/或添加的氨基酸而不丧失所述肽的细胞穿透能力。而且,最优选的是具有如下氨基酸序列或其序列变体而不丧失所述肽的细胞穿透能力的细胞穿透肽,所述氨基酸序列包括或由根据SEQ ID NO:6(CPP3/Z13)的氨基酸序列组成,优选地序列变体具有0、1、2、3、4或5个被置换、缺失、和/或添加的氨基酸而不丧失所述肽的细胞穿透能力。
在一个优选的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽具有包括或由SEQ ID NO:6(CPP3/Z13)组成的氨基酸序列。
在另一个优选的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽具有包括或由SEQ ID NO:7(CPP4/Z14)组成的氨基酸序列。
在另一个优选的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽具有包括或由SEQ ID NO:8(CPP5/Z15)组成的氨基酸序列。
在另一个优选的实施方式中,根据本发明的细胞穿透肽具有包括或由SEQ ID NO:11(CPP8/Z18)组成的氨基酸序列。
本领域技术人员将理解本发明的细胞穿透肽的基本氨基酸序列可以进一步被翻译后修饰,比如通过糖基化或磷酸化,而不背离本发明。
在进一步的实施方式中,除如上面描述的其氨基酸序列之外,根据本发明的细胞穿透肽任选地进一步包括如下的任一种或任意组合:
(i)核定位信号(NLS)。这样的信号对技术人员是熟知的并且在Nair et al.(2003,Nucleic Acids Res.31(1):397–399)中被描述
(ii)靶向肽,其包括肿瘤导向肽比如在Kapoor et al.(2012,PLoS ONE 7(4):e35187)中描述的和在http://crdd.osdd.net/raghava/tumorhope/general.php?中列出的那些
优选地,根据本发明的细胞穿透肽连接至抗原或抗原表位并且促进所述抗原或抗原表位的细胞内化。
根据本发明的复合物可以包括一种单一的细胞穿透肽或多于一种细胞穿透肽。优选地,根据本发明的复合物包括不多于五种细胞穿透肽,更优选地根据本发明的复合物包括不多于四种细胞穿透肽,甚至更优选地根据本发明的复合物包括不多于三种细胞穿透肽,特别优选地根据本发明的复合物包括不多于两种细胞穿透肽和最优选地根据本发明的复合物包括一种单一的细胞穿透肽。
组分b)–抗原/抗原表位
根据本发明的复合物包括作为的组分b)的至少一种抗原或抗原表位。
如本文使用的,“抗原”是充当适应性免疫应答的受体的靶标——具体地作为抗体、T细胞受体、和/或B细胞受体的靶标——的任何结构物质。又称为“抗原决定簇”的“表位”是由免疫系统——具体地由抗体、T细胞受体、和/或B细胞受体——识别的抗原的部分(或片段)。因而,一种抗原具有至少一个表位,即单一抗原具有一个或多个表位。在本发明的上下文中,术语“表位”主要用于表示T细胞表位,其被呈递在抗原呈递细胞的表面上,在其中它们被结合至主要组织相容性复合体(MHC)。由MHC I类分子呈递的T细胞表位通常但不唯一地是长度为8和11个氨基酸之间的肽,而MHC II类分子呈现更长的肽,其长度通常但不唯一地在12和25个氨基酸之间。
优选地,在根据本发明的复合物中,至少一种抗原或抗原表位选自:(i)肽、多肽或蛋白质,(ii)多糖,(iii)脂质,(iv)脂蛋白或脂肽,(v)糖脂,(vi)核酸,和(vii)小分子药物或毒素。因而,至少一种抗原或抗原表位可以是肽、蛋白质、多糖、脂质,包括脂蛋白和糖脂的其组合、核酸(例如DNA、siRNA、shRNA、反义寡核苷酸、陷阱DNA、质粒)、或小分子药物(例如环孢菌素A、紫杉醇、阿霉素、甲氨蝶呤、5-氨基乙酰丙酸)、或其任意组合,具体地如果多于一种抗原或抗原表位由本发明的复合物所包括。
理解至少一种抗原或抗原表位可以包括例如至少一种,即一种或多种连接在一起的肽、多肽或蛋白质和/或至少一种,即一种或多种核酸,例如其中每一种编码一种肽或多肽。同样,至少一种抗原或抗原表位可以是包括脂蛋白和糖脂的蛋白质、脂质和/或多糖的组合。因而,具体地如果根据本发明的复合物包括多于一种抗原或抗原表位,它可以包括多于一种肽、多肽或蛋白质,多于一种多糖,多于一种脂质,多于一种脂蛋白,多于一种糖脂,多于一种核酸,多于一种小分子药物或毒素,或其组合。
优选地,根据本发明的复合物包括至少一种抗原或抗原表位,其包括来自癌症/肿瘤相关抗原、癌症/肿瘤特异性抗原、和/或病原体的抗原蛋白——其包括病毒、细菌、真菌、原生动物和多细胞寄生虫抗原蛋白——的一种或多种表位。
更优选地,至少一种抗原或抗原表位包括或由(i)至少一种病原体表位和/或(ii)至少一种癌症/肿瘤表位,具体地至少一种肿瘤表位组成。最优选地,至少一种抗原或抗原表位包括或由至少一种癌症/肿瘤表位,具体地至少一种肿瘤表位组成。
特别优选的是,根据本发明的复合物包括仅仅这样的抗原(一种或多种)或抗原表位(一种或多种),其是癌症/肿瘤相关抗原(一种或多种)、癌症/肿瘤特异性抗原(一种或多种)和/或癌症/肿瘤表位(一种或多种);具体地,其是肿瘤相关抗原(一种或多种)、肿瘤特异性抗原(一种或多种)、和/或肿瘤表位(一种或多种)。
如本文使用的,“癌症表位”意思是来自癌症相关抗原或来自癌症特异性抗原的表位。因此,“肿瘤表位”意思是来自肿瘤相关抗原或来自肿瘤特异性抗原的表位,这样的表位通常特异(或关联)于某一类型的癌症/肿瘤。例如,癌症/肿瘤表位包括胶质瘤表位。具体地,癌症/肿瘤相关(同样癌症/肿瘤有关)抗原是由癌症/肿瘤细胞和正常细胞二者表达的抗原。因此,那些抗原通常从出生(或甚至之前)就存在。因此,存在免疫系统发展出对那些抗原的自身耐受的可能。相比之下,癌症/肿瘤特异性抗原是由癌症/肿瘤细胞特异性表达的抗原,但是不由正常细胞表达。具体地,癌症/肿瘤特异性抗原包括新抗原,一般而言,新抗原是如下抗原:其在之前不存在并且因而对免疫系统是“新”的。新抗原通常是由于体细胞突变。在癌症/肿瘤的背景下,癌症/肿瘤特异性新抗原通常在发展出癌症/肿瘤前不存在,并且癌症/肿瘤特异性新抗原通常由癌性细胞/肿瘤细胞中的体细胞基因突变编码。由于新抗原对免疫系统是新的,那些抗原的自身耐受的风险与癌症/肿瘤相关抗原比较相当低。然而,每种癌症的一组肿瘤特异性突变似乎是独特的。因此,在本发明的上下文中,优选的是这样的癌症/肿瘤特异性抗原,具体地新抗原,通过技术人员已知的方法——例如,癌症基因组测序——在诊断患有癌症的对象中被鉴定。在鉴定后,各自的癌症/肿瘤特异性新抗原和/或癌症/肿瘤特异性新抗原表位被用于根据本发明的复合物。
优选地,根据本发明的复合物包括一种或多种癌症/肿瘤相关表位和/或一种或多种癌症/肿瘤相关抗原(但是优选地没有癌症/肿瘤特异性表位)。还优选的是根据本发明的复合物包括一种或多种癌症/肿瘤特异性表位和/或一种或多种癌症/肿瘤特异性抗原(但是优选地没有癌症/肿瘤相关表位)。根据本发明的复合物还可以优选地包括(i)一种或多种癌症/肿瘤相关表位和/或一种或多种癌症/肿瘤相关抗原和(ii)一种或多种癌症/肿瘤特异性表位和/或一种或多种癌症/肿瘤特异性抗原二者。
合适的癌症/肿瘤表位可以例如从癌症/肿瘤表位数据库检索,例如从van derBruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumor antigens.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。癌症/肿瘤表位的实例包括例如TRP2-来源的表位、糖蛋白100(gp100)黑素瘤抗原-来源的表位、糖蛋白70(gp70)抗原-来源的表位、存活蛋白表位、IEa表位、IL13rα2、Epha2(A型肝配蛋白受体2)、其免疫原性片段、和这样的抗原和/或片段的融合。另外,癌症/肿瘤表位的实例包括新抗原的表位,比如,例如,来自由Yadav et al.Nature.2014Nov 27;515(7528):572-6描述的MC-38肿瘤细胞系的新抗原。如上面描述的,新抗原是正常人基因组中完全不存在的抗原。与未突变的自身抗原比较,新抗原具有与肿瘤对照的相关性,这是由于对于这些抗原可获得的T细胞池的质量不受中心T细胞耐受影响。具体地,新抗原可以基于个体肿瘤基因组。潜在的新抗原可以通过技术人员已知的方法预测,比如鉴定(癌症)基因组的蛋白编码部分内的突变的癌症基因组测序或深度测序技术。
根据本发明的复合物中有用的癌症/肿瘤相关,具体地肿瘤有关,或组织特异性抗原的具体实例包括但不限于下列抗原:前列腺:前列腺特异性抗原(PSA)、前列腺特异性膜抗原(PSMA)、PAP、PSCA(PNAS 95(4)1735-1740 1998)、前列腺粘蛋白抗原(PMA)(Beckettand Wright,1995,Int.J.Cancer 62:703-710)、前列腺酶、Her-2neu、SPAS-1;黑素瘤:TRP-2、酪氨酸酶、Melan A/Mart-1、gplOO、BAGE、GAGE、GM2神经节苷脂;胸:Her2-neu、驱动蛋白2、TATA元件调节因子1、肿瘤蛋白D52、MAGE D、ING2、HIP-55、TGF-1抗凋亡因子、HOM-Mel-40/SSX2、上皮抗原(LEA 135)、DF31MUC1抗原(Apostolopoulos et al.,1996Immunol.Cell.Biol.74:457-464;Pandey et al.,1995,Cancer Res.55:4000-4003);睾丸:MAGE-1、HOM-Mel-40/SSX2、NY-ESO-1;结肠直肠:EGFR、CEA;肺:MAGE D、EGFR;卵巢:Her-2neu;膀胱:移行细胞癌(TCC)(Jones et al.,1997,Anticancer Res.17:685-687),几种癌症:Epha2、Epha4、PCDGF、HAAH、间皮素;EPCAM;NY-ESO-1、糖蛋白MUC1和NIUC10粘蛋白p5(尤其是突变版本)、EGFR;混合性肿瘤:癌症相关血清抗原(CASA)和癌症抗原125(CA125)(Kierkegaard et al.,1995,Gynecol.Oncol.59:251-254)、上皮糖蛋白40(EGP40)(Kievit et al.,1997,Int.J.Cancer 71:237-245)、鳞状细胞癌抗原(SCC)(Lozza etal.,1997Anticancer Res.17:525-529)、组织蛋白酶E(Mota et al.,1997,Am.JPathol.150:1223-1229)、黑素瘤中的酪氨酸酶(Fishman et al.,1997Cancer 79:1461-1464)、脑海绵状血管瘤的细胞核抗原(PCNA)(Notelet et al.,1997Surg.Neurol.47:364-370)、乳头状甲状腺癌中的35kD肿瘤相关自身抗原(Lucas et al.,1996AnticancerRes.16:2493-2496)、CDC27(包括蛋白质的突变形式)、抗原丙糖磷酸异构酶、707-AP、A60分枝杆菌抗原(Macs et al.,1996,J.Cancer Res.Clin.Oncol.122:296-300)、膜联蛋白II、AFP、ART-4、BAGE、β-连环蛋白/m、BCL-2、bcr-abl、bcr-abl p190、bcr-abl p210、BRCA-1、BRCA-2、CA 19-9(Tolliver and O'Brien,1997,South Med.J.90:89-90;Tsuruta at al.,1997Urol.Int.58:20-24)、CAMEL、CAP-1、CASP-8、CDC27/m、CDK-4/m、CEA(Huang et al.,Exper Rev.Vaccines(2002)1:49-63)、CT9、CT10、Cyp-B、Dek-cain、DAM-6(MAGE-B2)、DAM-10(MAGE-B1)、EphA2(Zantek et al.,Cell Growth Differ.(1999)10:629-38;Carles-Kinch et al.,Cancer Res.(2002)62:2840-7)、EphA4(Cheng at al.,2002,CytokineGrowth Factor Rev.13:75-85)、肿瘤相关Thomsen-Friedenreich抗原(Dahlenborg etal.,1997,Int.J Cancer 70:63-71)、ELF2M、ETV6-AML1、G250、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7B、GAGE-8、GnT-V、gp100(Zajac et al.,1997,Int.JCancer 71:491-496)、HAGE、HER2/neu、HLA-A*0201-R170I、HPV-E7、HSP70-2M、HST-2、hTERT、hTRT、iCE、凋亡抑制剂(例如,存活蛋白)、KH-1腺癌抗原(Deshpande andDanishefsky,1997,Nature 387:164-166)、KIAA0205、K-ras、LAGE、LAGE-1、LDLR/FUT、MAGE-1、MAGE-2、MAGE-3、MAGE-6、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-B5、MAGE-B6、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE D、MART-1、MART-1/Melan-A(Kawakami and Rosenberg,1997,Int.Rev.Immunol.14:173-192)、MC1R、MDM-2、肌球蛋白/m、MUC1、MUC2、MUM-1、MUM-2、MUM-3、新-polyA聚合酶、NA88-A、NY-ESO-1、NY-ESO-1a(CAG-3)、PAGE-4、PAP、蛋白酶3(Molldrem et al.,Blood(1996)88:2450-7;Molldrem et al.,Blood(1997)90:2529-34)、P15、p190、Pm1/RARα、PRAME、PSA、PSM、PSMA、RAGE、RAS、RCAS1、RU1、RU2、SAGE、SART-1、SART-2、SART-3、SP17、SPAS-1、TEL/AML1、TPI/m、酪氨酸酶、TARP、TRP-1(gp75)、TRP-2、TRP-2/INT2、WT-1、和可选地源自NY-ESO-1与LAGE-1基因的翻译的NY-ESO-ORF2与CAMEL蛋白。众多其它癌症抗原是本领域熟知的。
优选地,癌症/肿瘤抗原或癌症/肿瘤表位是重组癌症/肿瘤抗原或重组癌症/肿瘤表位。这样的重组癌症/肿瘤抗原或重组癌症/肿瘤表位可以通过在天然癌症/肿瘤抗原或天然癌症/肿瘤表位的总氨基酸序列中引入改变(添加、缺失或置换)特定氨基酸的突变来设计。突变的引入不过多地改变癌症/肿瘤抗原或癌症/肿瘤表位,使得其不能跨越哺乳动物对象,和优选地人或狗对象而普遍地适用,但是对它的改变足够使得所得的氨基酸序列打破耐受或被认为是外源抗原,以便产生免疫应答。另一种方式可以是产生共有的重组癌症/肿瘤抗原或癌症/肿瘤表位,其与其对应的天然癌症/肿瘤抗原或天然癌症/肿瘤表位具有至少85%和高至99%氨基酸序列同一性;优选地至少90%和高至98%序列同一性;更优选地至少93%和高至98%序列同一性;或甚至更优选地至少95%和高至98%序列同一性。在一些情况下,重组癌症/肿瘤抗原或重组癌症/肿瘤表位与其对应的天然癌症/肿瘤抗原或癌症/肿瘤表位具有95%、96%、97%、98%或99%氨基酸序列同一性。天然癌症/肿瘤抗原是通常与特定的癌症或癌症肿瘤相关联的抗原。取决于癌症/肿瘤抗原,癌症/肿瘤抗原的共有序列可以跨越哺乳动物物种或在物种的亚型内或跨越病毒株或血清型。一些癌症/肿瘤抗原不从癌症/肿瘤抗原的野生型氨基酸序列极大地改变。上述方法可以被组合,使得最终重组癌症/肿瘤抗原或癌症/肿瘤表位具有如上面讨论的与天然癌症抗原氨基酸序列的百分比相似性。然而,优选地,如上面描述的癌症/肿瘤抗原的表位的氨基酸序列不是突变的,并且因而与参考表位序列同一。
如本文使用的“病原体表位”意思是来自病原体——其包括病毒、细菌、真菌、原生动物和多细胞寄生虫——的抗原蛋白、抗原多糖、抗原脂质、抗原脂蛋白或抗原糖脂的表位。来自病原体的抗原蛋白、多糖、脂质、脂蛋白或糖脂因此分别包括来自导致疾病——其可以是接种疫苗的靶标——的病原体的蛋白质、多糖、脂质、脂蛋白和糖脂,所述疾病包括,例如,阿米巴病、炭疽、布路里溃疡(溃疡分枝杆菌)、杯状病毒相关腹泻、弯曲杆菌腹泻、宫颈癌(人乳头瘤病毒)、沙眼衣原体相关生殖器疾病、霍乱、克里米亚-刚果出血热、登革热、白喉、埃博拉出血热、产肠毒素大肠杆菌(ETEC)腹泻、胃部癌(gastric cancer)(幽门螺杆菌)、淋病、A组链球菌相关疾病、B组链球菌相关疾病、B型流感嗜血杆菌肺炎和侵袭性疾病、甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎、戊型肝炎腹泻、2型单纯疱疹生殖器溃疡、HIV/AIDS、钩虫病、流感、日本脑炎、拉沙热、利什曼病、钩端螺旋体病(leptospirosi)、肝癌(乙型肝炎)、肝癌(丙型肝炎)、莱姆病、疟疾、马尔堡出血热、麻疹、腮腺炎、鼻咽癌(爱泼斯坦-巴尔病毒)、脑膜炎双球菌脑膜炎、副流感相关肺炎、百日咳、瘟疫、脊髓灰质炎、狂犬病、呼吸道合胞病毒(RSV)肺炎、裂谷热、轮状病毒腹泻、风疹、裂体吸虫病、严重急性呼吸综合征(SARS)、志贺氏菌病、天花、金黄色葡萄球菌相关疾病、胃癌(stomach cancer)(幽门螺杆菌)、肺炎链球菌和侵袭性疾病、破伤风、蜱源脑炎、沙眼、结核、土拉菌病、伤寒、西尼罗病毒相关疾病、黄热病。
优选地,在MHC I类和/或MHC II类背景下和/或在CD1背景下,至少一种抗原或抗原表位将在细胞表面处呈递,而在MHC I类和/或MHC II类背景下,细胞表面处的呈递是优选的。短语“在MHC I类背景下的表位呈递”具体指的是位于细胞表面处的MHC I类分子的沟中的CD8+表位。短语“在MHC II类背景下的表位呈递”具体指的是位于细胞表面处的MHC II类分子的沟中的CD4+表位。短语“在CD1背景下的表位呈递”具体指的是位于细胞表面处的分化群(cluster of differentiation)1分子的沟中的脂质表位。
有利地,根据本发明的复合物包括细胞穿透肽和至少一种抗原或抗原表位,并且允许在MHC I类和MHC II类背景下在抗原呈递细胞的细胞表面处转运和呈递所述表位,并且因而在接种疫苗和免疫疗法中是有用的。
优选地,根据本发明的复合物包括至少一种抗原或抗原表位,其是至少一种CD4+表位和/或至少一种CD8+表位。
如本文使用的,术语“CD4+表位”或“CD4+-限制的表位”表示由CD4+T细胞识别的表位,所述表位具体地由位于MHC II类分子的沟中的抗原片段组成。在根据本发明的复合物中包括的单个CD4+表位优选地由大约12-25个氨基酸组成。它还可以由例如大约8-25个氨基酸或大约6-100个氨基酸组成。
如本文使用的,术语“CD8+表位”或“CD8+-限制的表位”表示由CD8+T细胞识别的表位,所述表位具体地由位于MHC I类分子的沟中的抗原片段组成。在根据本发明的复合物中包括的单个CD8+表位优选地由大约8-11个氨基酸组成。它还可以由例如大约8-15个氨基酸或大约6-100个氨基酸组成。
优选地,至少一种抗原可以包括或至少一种抗原表位可以由对应于癌症/肿瘤相关抗原、癌症/肿瘤特异性抗原、或病原体的抗原蛋白的抗原决定簇(一种或多种)的CD4+表位和/或CD8+表位组成。更优选地,至少一种抗原可以包括或至少一种抗原表位可以由对应于癌症/肿瘤相关抗原或癌症/肿瘤特异性抗原的抗原决定簇(一种或多种)的CD4+表位和/或CD8+表位组成。最优选地,至少一种抗原可以包括或至少一种抗原表位可以由对应于肿瘤相关抗原或肿瘤特异性抗原的抗原决定簇(一种或多种)的CD4+表位和/或CD8+表位组成。
还优选的是根据本发明的复合物包括至少两种抗原或抗原表位,其中至少一种抗原或抗原表位包括或由CD4+表位组成并且至少一种抗原或抗原表位包括或由CD8+表位组成。现在确定了Th细胞(CD4+)在DC许可(licensing)和在CTL(CD8+)在肿瘤位点处的募集与维持二者中的抗肿瘤免疫应答中发挥核心作用。因此,根据本发明的复合物——其包括至少两种抗原或抗原表位,其中至少一种抗原或抗原表位包括或由CD4+表位组成并且至少一种抗原或抗原表位包括或由CD8+表位组成——提供了综合免疫应答,其允许同时引发CTL和Th细胞并且因而对针对仅仅一种CD8+表位或仅仅一种CD4+表位的免疫是优选的。例如,根据本发明的复合物可以优选地包括Eα-CD4+表位和gp100-CD8+表位。
优选地,根据本发明的复合物包括至少两种抗原或抗原表位,其中至少两种抗原或抗原表位包括或由至少两种,例如2、3、4、5、6、7、8、9或更多种CD4+表位和/或至少两种,例如2、3、4、5、6、7、8、9或更多种CD8+表位组成。从而,至少两种抗原或抗原表位优选地是不同的抗原或抗原表位,更优选地至少两种抗原或抗原表位彼此不同但是与相同种类的肿瘤相关。多抗原疫苗将(i)避免抗原-丢失变体的向外生长,(ii)靶向异形肿瘤块内不同的肿瘤细胞和(iii)规避患者间肿瘤可变性。因而,根据本发明的复合物特别优选地包括至少四个抗原或抗原表位,具体地具有至少两种CD8+表位和至少两种CD4+表位。这样的根据本发明的复合物诱导多表位CD8CTL和CD4Th细胞协同地作用以抵抗肿瘤细胞和促进高效的抗肿瘤免疫。Th细胞还涉及持久的细胞免疫的维持,其在接种疫苗后被监测。这样的根据本发明的复合物诱导多克隆、多表位免疫应答和多功能CD8+与CD4+T细胞,并且因而诱导有效的抗肿瘤活性。
优选地,根据本发明的复合物包括至少两种抗原或抗原表位,更优选地根据本发明的复合物包括至少三种抗原或抗原表位,甚至更优选地根据本发明的复合物包括至少四种抗原或抗原表位,特别优选地根据本发明的复合物包括至少五种抗原或抗原表位并且最优选地根据本发明的复合物包括至少六种抗原或抗原表位。由根据本发明的复合物包括的抗原或抗原表位可以是相同或不同的,优选地由根据本发明的复合物包括的抗原或抗原表位彼此不同。优选地,根据本发明的复合物包括至少一种CD4+表位和至少一种CD8+表位。
优选地,根据本发明的复合物包括多于一种CD4+表位,例如来自相同抗原或不同抗原的两种或更多种CD4+表位,并且优选地没有CD8+表位。还优选的是根据本发明的复合物包括多于一种CD8+表位,例如来自相同抗原或不同抗原的两种或更多种CD8+表位,并且优选地没有CD4+表位。然而,最优选地,根据本发明的复合物包括(i)至少一种CD4+表位,例如来自相同抗原或不同抗原的两种或更多种CD4+表位,和(ii)至少一种CD8+表位,例如来自相同抗原或不同抗原的两种或更多种CD8+表位。
例如,根据本发明的复合物可以优选地包括gp100-CD8+表位、Eα-CD4+表位,以及进一步的CD4+表位和进一步的CD8+表位。甚至更优选地,根据本发明的复合物可以包括包含gp100-CD8+表位和Eα-CD4+表位的多肽和蛋白质。例如,由根据本发明的复合物包括的这样的多肽和蛋白质包括或由根据SEQ ID NO:14的氨基酸序列或如上面限定的其序列变体组成:
ESLKIS QAVHAAHAEI NEAGREVVGV GALKVPRNQD WLGVPRFAKF ASFEAQGALANIAVDKANLD VEQLESIINF EKLTEWTGS
SEQ ID NO:14(包括OVA-CD4+、gp100-CD8+、Eα-CD4+和OVA-CD8+表位的MAD5-货物)
例如,根据本发明的复合物还可以包括gp70-CD8+表位和/或gp70-CD4+表位。具体地,根据本发明的复合物可以包括包含gp70-CD8+表位和/或gp70-CD4+表位的多肽或蛋白质。例如,由根据本发明的复合物包括的这样的多肽和蛋白质包括或由根据SEQ ID NO:43的氨基酸序列或如上面限定的其序列变体组成:
VTYHSPSYAYHQFERRAILNRLVQFIKDRI
SEQ ID NO:43(包括gp70-CD8+和gp70-CD4+表位的Mad8-货物)
例如,根据本发明的复合物可以优选地包括至少一种存活蛋白表位,比如存活蛋白CD8+表位和/或存活蛋白CD4+表位。更优选地,根据本发明的复合物可以包括包含存活蛋白CD8+表位和/或存活蛋白CD4+表位的多肽或蛋白质。更优选地,根据本发明的复合物可以包括包含多于一种存活蛋白CD8+表位和/或多于一种存活蛋白CD4+表位——比如两种不同的存活蛋白CD8+表位——的多肽或蛋白质。例如,由根据本发明的复合物包括的这样的多肽和蛋白质包括或由根据SEQ ID NO:44的氨基酸序列或如上面限定的其序列变体组成:
NYRIATFKNWPFLEDCAMEELTVSEFLKLDRQR
SEQ ID NO:44(包括存活蛋白CD8+表位1和存活蛋白CD8+表位2的Mad11-货物)
例如,根据本发明的复合物可以优选地包括来自新抗原的表位。甚至更优选地,根据本发明的复合物可以包括包含来自新抗原——比如由Yadav et al.Nature.2014Nov27;515(7528):572-6鉴定的来自MC-38肿瘤细胞系的新抗原——的表位的多肽或蛋白质。例如,由根据本发明的复合物包括的这样的多肽和蛋白质包括或由根据SEQ ID NO:42的氨基酸序列或如上面限定的其序列变体组成:
HLELASMTNMELMSSIV
SEQ ID NO:42(包括来自如由Yadav et al.Nature.2014Nov 27;515(7528):572-6描述的新抗原的Mad9-货物)。
例如,根据本发明的复合物可以优选地包括多于一种,例如两种或三种,来自新抗原的表位。甚至更优选地,根据本发明的复合物可以包括包含多于一种例如两种或三种来自新抗原——比如由Yadav et al.Nature.2014Nov 27;515(7528):572-6鉴定的来自MC-38肿瘤细胞系的新抗原——的表位的多肽或蛋白质。例如,由根据本发明的复合物包括的这样的多肽和蛋白质包括或由根据SEQ ID NO:63的氨基酸序列或如上面限定的其序列变体组成:
LFRAAQLANDVVLQIMEHLELASMTNMELMSSIVVISASIIVFNLLELEG
SEQ ID NO:63(包括来自如由Yadav et al.Nature.2014Nov 27;515(7528):572-6描述的新抗原的Mad12-货物)。
优选地,由根据本发明的复合物包括的至少一种抗原或抗原表位是肽、多肽或蛋白质。在本发明中有用的肽、多肽或蛋白质性质的抗原或抗原表位的实例包括其癌症/肿瘤抗原或抗原表位;其变应性抗原或抗原表位;其自身免疫性自身抗原或抗原表位;其病原体抗原或抗原表位;和来自病毒的其抗原或抗原表位,所述病毒优选地来自巨细胞病毒(CMV)、天花病毒(orthopox variola virus)、类天花病毒(orthopox alastrim virus)、副痘病毒(parapox ovis virus)、传染性软疣痘病毒、1型单纯疱疹病毒、2型单纯疱疹病毒、乙型疱疹病毒、水痘-带状疱疹病毒、伪狂犬病毒、人巨细胞病毒(human cytomegalyvirus)、6型人疱疹病毒、7型人疱疹病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、8型人疱疹病毒、乙型肝炎病毒、基孔肯雅病毒、奥尼翁-尼翁病毒、风疹病毒、丙型肝炎病毒、C型GB病毒、西尼罗病毒、登革热病毒、黄热病病毒、跳跃病病毒、圣路易斯脑炎病毒、日本乙型脑炎病毒、波瓦生病毒、FSME病毒、SARS、SARS相关冠状病毒、人冠状病毒229E、人冠状病毒Oc43、环曲病毒属(Torovirus)、人I型嗜T细胞病毒、人II型嗜T细胞病毒、HIV(AIDS)——即人1型免疫缺陷病毒或人2型免疫缺陷病毒、流感病毒、拉沙病毒、淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒、塔卡里伯病毒、胡宁病毒、马秋博病毒、波尔那病病毒、布尼亚病毒、加利福尼亚脑炎病毒、裂谷热病毒、白蛉热病毒、托斯卡纳病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、哈扎拉病毒、喀山病毒、汉坦病毒、汉城病毒(Seoul virus)、希望山病毒(Prospect Hill virus)、普马拉病毒(Puumalavirus)、多布拉伐病毒(Dobrava Belgrade virus)、图拉病毒(Tula virus)、辛诺柏病毒(sin nombre virus)、维多利亚湖马尔堡病毒(Lake Victoria Marburg virus)、埃博拉病毒扎伊尔株、埃博拉病毒苏丹株、埃博拉病毒科特迪瓦株、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、副流感病毒、疟原虫(镰状疟原虫、间日疟原虫、卵形疟原虫、三日疟原虫、诺尔斯疟原虫)、马尔堡病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒、呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒(humanmetapneumovirus)、水泡性口膜炎印第安纳水泡病毒、狂犬病病毒、莫科拉病毒、杜文黑基病毒、1+2型欧洲蝙蝠狂犬病毒、澳大利亚蝙蝠狂犬病毒、腺病毒A-F、人乳头瘤病毒、6型尖锐湿疣病毒、11型尖锐湿疣病毒、多瘤病毒、2型腺病毒伴随病毒、轮状病毒、环状病毒、包括水痘-带状疱疹(varizella zoster)的水痘等;或来自利什曼虫、锥虫、阿米巴虫(amibe)、细菌等的抗原或抗原表位;或可以选自上面的抗原或抗原表位的表位或变体。优选地,如上面限定的抗原的表位以及变体展示与如上面显示或描述的抗原或抗原序列之一大约10%,具体地至少10%、大约20%,具体地至少20%、大约30%,具体地至少30%、大约40%,具体地至少40%、大约50%,具体地至少50%、大约60%,具体地至少60%、大约70%,具体地至少70%、大约80%,具体地至少80%、大约90%,具体地至少90%、至少95%或至少98%的序列同源性或同一性。在该上下文中,表位和变体的限定类似地如限定的适用。
肽、多肽或蛋白质的分类中的抗原或抗原表位的实例包括多种胶质瘤表位的组合,比如在Novellino et al.(2005,Cancer Immunol Immunother,54(3):187-207)、Vigneron et al.(2013,Cancer Immun.13:15)中描述的那些。然而,根据本发明的单一复合物还可以包括仅仅一个子集,即所有所述胶质瘤表位中的一种或多种。在这样的情况下,优选地,根据本发明的不同复合物包括所有所述胶质瘤表位的不同子集,使得例如包括根据本发明的这样的不同复合物的根据本发明的疫苗包括所有所述胶质瘤表位,但是其分布在不同的复合物中。
而且,根据本发明的复合物还可以包括至少一种抗原或抗原表位,其中所述抗原或抗原表位是多糖、脂质、脂蛋白、和/或糖脂,具体地多糖、脂质、脂蛋白、和/或糖脂表位,其可以是,例如,如在此限定的病原体表位。
具体地,根据本发明的复合物可以包括至少一种抗原或抗原表位,其中所述抗原或抗原表位是多糖、脂质、脂蛋白、和/或糖脂的,包括病毒、细菌、真菌、原生动物和多细胞寄生虫抗原或抗原表位。
优选地,所述表位将在MHC I类和/或MHC II类背景下在细胞表面处呈递。
优选地,所述脂质表位将在CD1(分化群1)背景下在细胞表面处呈递。
根据本发明的复合物还可以包括至少一种抗原或抗原表位,其中所述抗原或抗原表位是小分子药物或毒素。
在本发明中有用的小分子药物或毒素的分类中的货物分子的实例包括环孢菌素A、紫杉醇、阿霉素、甲氨蝶呤、5-氨基乙酰丙酸、白喉毒素、舒尼替尼和在De wit Amer(2010,Neuro Oncol,12(3):304-16)中综述的那些分子。
根据本发明的复合物包括至少一种抗原或抗原表位,优选地根据本发明的复合物包括多于一种抗原或抗原表位,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种抗原或抗原表位,更优选地根据本发明的复合物包括(至少)两种或三种抗原或抗原表位,甚至更优选地根据本发明的复合物包括(至少)四种或五种抗原或抗原表位。
如果多于一种抗原或抗原表位由根据本发明的复合物包括,理解所述抗原或抗原表位也具体地在根据本发明的复合物中共价连接,例如至另一种抗原或抗原表位和/或至组分a),即细胞穿透肽,和/或至组分c),即TLR肽激动剂。
由根据本发明的复合物包括的多种抗原或抗原表位可以相同或不同。优选地,由根据本发明的复合物包括的多种抗原或抗原表位彼此不同,因而提供了多抗原和/或多表位复合物。
而且,优选的是多于一种抗原或抗原表位,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种抗原或抗原表位,在根据本发明的复合物中被连续地定位。具体地,这意思是由复合物包括的所有抗原和/或抗原表位以一段定位,其既不被组分a),即细胞穿透肽中断,也不被组分c),即TLR肽激动剂中断。而是,组分a)和组分c)在复合物中定位,例如在这样的一段所有抗原和/或抗原表位之前或之后。然而,以这样的方式连续定位的抗原和/或抗原表位可以彼此连接,例如通过如下面描述的间隔区或连接体,其既不是组分a),即细胞穿透肽,也不是组分c),即TLR肽激动剂。
然而,可选地,多种抗原和/或抗原表位还可以以任何其它方式在根据本发明的复合物中定位,例如组分a)和/或组分c)在两种或更多种抗原和/或抗原表位之间定位,即一种或多种抗原和/或抗原表位在组分a)和组分c)之间定位(或反之亦然),和任选地,一种或多种抗原和/或抗原表位在组分a)和/或组分c)的各自另一端处定位。
要理解与相同种类的疾病——具体地相同种类的肿瘤——相关的大量不同的抗原或抗原表位可以有利地由根据本发明的单一复合物包括。可选地,与相同种类的疾病——具体地相同种类的肿瘤——相关的大量不同的抗原或抗原表位可以分布至不同抗原或抗原表位的子集,具体地在某一种类的疾病——例如肿瘤——的背景下彼此互补的子集,其由根据本发明的不同复合物包括,由此这样的包括不同子集的不同复合物可以有利地同时施用,例如在单一疫苗中,至需要其的对象。
优选地,根据本发明的复合物包括至少一种肿瘤表位,其是选自如下的抗原的表位:EpCAM、HER-2/neu、MUC-1、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、IL13Rα2、CMV、EGFRvIII、EphA2、gp100、hTert、TRP-2、YKL-40、短小蛋白聚糖、神经配蛋白4和PTPRz1。更优选地,根据本发明的复合物包括选自如下的至少一种肿瘤抗原:EpCAM、HER-2/neu、MUC-1、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、IL13Rα2、CMV、EGFRvIII、EphA2、gp100、hTert、TRP-2、YKL-40、短小蛋白聚糖、神经配蛋白4和PTPRz1或其片段、或肿瘤抗原的序列变体或其片段的序列变体。还优选的是根据本发明的复合物包括至少一种肿瘤表位,其是选自由Reardon,D.A.,et al.,An update on vaccine therapyand other immunotherapeutic approaches for glioblastoma.Expert Rev Vaccines,2013.12(6):p.597-615公开的胶质瘤抗原的抗原的表位。
如本文使用的,抗原的“片段”包括抗原的至少10个连续的氨基酸,优选地抗原的至少15个连续的氨基酸,更优选地抗原的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地抗原的至少25个连续的氨基酸和最优选地抗原的至少30个连续的氨基酸。“序列变体”如上面限定,即序列变体具有与参考序列至少70%,至少75%,优选地至少80%,更优选地至少85%,甚至更优选地至少90%,特别优选地至少95%,最优选地至少99%同一的(氨基酸)序列。“功能性”序列变体在抗原/抗原片段/表位的背景下意思是(例如由抗原(片段)包括的)表位(一种或多种)的功能不被损害或丧失。然而,优选地,(例如由本文描述的癌症/肿瘤抗原(片段)包括的)表位(一种或多种)的氨基酸序列不被突变并且因而与参考表位序列同一。
如上面描述的,那些抗原的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumor antigen.Cancer Immun2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
EpCAM
Ep-Camis是介导细胞粘附的糖蛋白。EpCAM的氨基酸序列在下列中显示:
MAPPQVLAFGLLLAAATATFAAAQEECVCENYKLAVNCFVNNNRQCQCTSVGAQNTVICSKLAAKCLVMKAEMNGSKLGRRAKPEGALQNNDGLYDPDCDESGLFKAKQCNGTSMCWCVNTAGVRRTDKDTEITCSERVRTYWIIIELKHKAREKPYDSKSLRTALQKEITTRYQLDPKFITSILYENNVITIDLVQNSSQKTQNDVDIADVAYYFEKDVKGESLFHSKKMDLTVNGEQLDLDPGQTLIYYVDEKAPEFSMQGLKAGVIAVIVVVVIAVVAGIVVLVISRKKRMAKYEKAEIKEMGEMHRELNA
[SEQ ID NO:47]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:47的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。
EpCAM的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的EpCAM表位包括下列表位(下列中显示的表位序列是上面的EpCAM序列的片段,并且因而在上面加下划线的EpCAM序列中显示;下列表位序列可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
GLKAGVIAV
[SEQ ID NO:48]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:48的氨基酸序列。
HER-2/neu
Her-2属于EGFR(表皮生长因子受体)家族。许多HLA-A表位是技术人员已知的。HER2的氨基酸序列在下列中显示:
MELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV
[SEQ ID NO:70]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:70的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,Her-2的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
粘蛋白-1(MUC-1)
MUC-1是作用于细胞粘附的人上皮粘蛋白。MUC-1的氨基酸序列在下列中显示:
MTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDNRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAATSANL
[SEQ ID NO:49]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:49的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。
MUC-1的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的MUC-1表位包括下列表位(下列中显示的表位序列是上面的MUC-1序列的片段,并且因而在上面加下划线的MUC-1序列中显示;下列表位序列中的每个可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
GSTAPPVHN
[SEQ ID NO:50]
TAPPAHGVTS
[SEQ ID NO:51]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:50的氨基酸序列和/或根据SEQ ID NO:51的氨基酸序列。
TOMM34
TOMM34参与将前体蛋白输入线粒体。其许多表位是技术人员已知的。
RNF 43
RNF43是环指(RING)型E3泛素连接酶并且预测包含跨膜结构域、蛋白酶相关结构域、胞外域、和胞质环指域。RNF43被认为负调控Wnt信号传导,并且RNF43的表达导致卷曲受体(frizzled receptor)的泛素化的增加,它们的亚细胞分布的改变,导致这些受体的降低的表面水平。其许多表位是技术人员已知的。
KOC1
KOC1,也称为胰岛素样生长因子2mRNA-结合蛋白3(IGF2BP3),是mRNA结合蛋白。然而,不可获得表达数据。
血管内皮生长因子(VEGF)/血管内皮生长因子受体(VEGFR)
血管内皮生长因子(VEGF),最初称为血管通透因子(VPF),是刺激血管发生和血管新生的由细胞产生的信号蛋白。它是当血液循环不足时恢复给组织的供氧的系统的一部分。VEGF的正常功能是在胚胎发育期间产生新血管,在损伤后产生新血管,在锻炼之后产生肌肉,和产生新血管(侧支循环)以绕过阻塞的血管。存在VEGF的受体(VEGFR)的三种主要亚型,即VEGFR1、VEGFR2和VEGFR3。
人绒毛膜促性腺激素的β亚基(βhCG)
人绒毛膜促性腺激素(hCG)是在植入之后由胚胎产生的激素。一些癌性肿瘤产生该激素;因此,当患者未怀孕时测量的升高的水平可以导致癌症诊断。hCG是异二聚体的,其具有与促黄体激素(LH)、促卵泡激素(FSH)、促甲状腺激素(TSH)相同的α(阿尔法)亚基,和hCG独有的β(贝塔)亚基。hCG促性腺激素的β-亚基(β-hCG)包含145个氨基酸并且由六个高度同源基因编码。
存活蛋白
存活蛋白,还称为包含杆状病毒凋亡抑制因子重复的蛋白(baculoviralinhibitor of apoptosis repeat)5或BIRC5,是凋亡抑制因子(IAP)家族的成员。存活蛋白起作用以抑制胱天蛋白酶活化,从而导致凋亡或程序性细胞死亡的负调控。存活蛋白的氨基酸序列在下列中显示:
MGAPTLPPAWQPFLKDHRISTFKNWPFLEGCACTPERMAEAGFIHCPTENEPDLAQCFFCFKELEGWEPDDDPIEEHKKHSSGCAFLSVKKQFEELTLGEFLKLDRERAKNKIAKETNNKKKEFEETAKKVRRAIEQLAAMD
[SEQ ID NO:52]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:52的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。
存活蛋白的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的存活蛋白表位包括下列表位(下列中显示的表位序列是上面的存活蛋白序列的片段,并且因而在上面加下划线的存活蛋白序列中显示;下列表位序列可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
RISTFKNWPF
[SEQ ID NO:53]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:53的氨基酸序列。
癌胚抗原(CEA)
CEA是细胞内粘附糖蛋白。CEA在胎儿发育期间通常在胃肠组织中产生,但是产生在出生前停止。因此,在健康成人的血液中,CEA通常仅仅在非常低的水平下存在。CEA的氨基酸序列在下列中显示:
MESPSAPPHRWCIPWQRLLLTASLLTFWNPPTTAKLTIESTPFNVAEGKEVLLLVHNLPQHLFGYSWYKGERVDGNRQIIGYVIGTQQATPGPAYSGREIIYPNASLLIQNIIQNDTGFYTLHVIKSDLVNEEATGQFRVYPELPKPSISSNNSKPVEDKDAVAFTCEPETQDATYLWWVNNQSLPVSPRLQLSNGNRTLTLFNVTRNDTASYKCETQNPVSARRSDSVILNVLYGPDAPTISPLNTSYRSGENLNLSCHAASNPPAQYSWFVNGTFQQSTQELFIPNITVNNSGSYTCQAHNSDTGLNRTTVTTITVYAEPPKPFITSNNSNPVEDEDAVALTCEPEIQNTTYLWWVNNQSLPVSPRLQLSNDNRTLTLLSVTRNDVGPYECGIQNKLSVDHSDPVILNVLYGPDDPTISPSYTYYRPGVNLSLSCHAASNPPAQYSWLIDGNIQQHTQELFISNITEKNSGLYTCQANNSASGHSRTTVKTITVSAELPKPSISSNNSKPVEDKDAVAFTCEPEAQNTTYLWWVNGQSLPVSPRLQLSNGNRTLTLFNVTRNDARAYVCGIQNSVSANRSDPVTLDVLYGPDTPIISPPDSSYLSG ANLNLSCHSASNPSPQYSWRINGIPQQHTQVLFIAKITPNNNGTYACFVSNLATGRNNSIVKSITVSASGTSPGLSAGATVGIMIGVLVGVAL
[SEQ ID NO:54]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:54的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。
CEA的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的CEA表位包括下列表位(下列中显示的表位序列是上面的CEA序列的片段,并且因而在上面加下划线的CEA序列中显示;下列表位序列中的每个可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
YLSGANLNLS
[SEQ ID NO:55]
SWRINGIPQQ
[SEQ ID NO:56]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:55的氨基酸序列和/或根据SEQ ID NO:56的氨基酸序列。
转化生长因子β受体2(TGFβR2)
TGFβ受体是单次跨膜(single pass)丝氨酸/苏氨酸激酶受体。它们以若干不同同种型存在。TGFβR2是跨膜蛋白,其具有蛋白激酶结构域,与另一种受体蛋白形成异二聚体复合物,并且结合TGF-β。该受体/配体复合物使蛋白质磷酸化,其然后进入细胞核并且调控与细胞增殖相关的基因的子集的转录。
P53
P53是在防止基因组突变中发挥作用的肿瘤阻抑蛋白。P53具有许多抗癌功能的机制,并且在凋亡、基因组稳定和抑制血管发生中发挥作用。在其抗癌作用中,p53通过多种机制作用:当DNA已经遭受损伤时它可以激活DNA修复蛋白;在DNA损伤识别上,它可以通过将细胞周期保持在G1/S调控点来停滞生长;和它可以引发凋亡。
Kirsten Ras(KRas)
GTPase Kras还称为V-Ki-ras2Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同系物和KRAS,在正常组织信号传导中发挥关键功能,并且KRAS基因的突变在许多癌症的发展中是关键步骤。与ras亚家族的其它成员一样,KRAS蛋白是GTPase并且在许多信号传导途径中是早期参与者。KRAS通常被束缚至细胞膜,这是因为其C-端上异戊二烯基团的存在。KRas的氨基酸序列在下列中显示:
MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSEDVPMVLVGNKCDLPSRTVDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQRVEDAFYTLVREIRQYRLKKISKEEKTPGCVKIKKCIIM
[SEQ ID NO:57]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:57的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。
Kirsten Ras的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的Kirsten Ras表位包括下列表位(下列中显示的表位序列是上面的Kirsten Ras序列的片段,并且因而在上面加下划线的Kirsten Ras序列中显示;下列表位序列可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
VVVGAGGVG
[SEQ ID NO:58]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:58的氨基酸序列。
O-连接的N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)转移酶(OGT)
OGT(O-连接的N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)转移酶、O-GlcNAc转移酶、OGTase、O-连接的N-乙酰葡萄糖氨基转移酶、尿苷二磷酸-N-乙酰葡糖胺:多肽β-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶、蛋白质O-连接的β-N-乙酰葡糖胺转移酶)是系统名为“UDP-N-乙酰-D-葡糖胺:蛋白质-O-β-N-乙酰-D-氨基葡萄糖转移酶”的酶。OGT催化将O-糖苷键中的单个N-乙酰葡糖胺添加至细胞内蛋白质的丝氨酸或苏氨酸残基。OGT是人体内众多生物学功能的一部分。OGT通过如下参与肌细胞和脂肪细胞中胰岛素的抗性:抑制AKT1的苏氨酸308磷酸化,增加IRS1磷酸化的速率(在丝氨酸307和丝氨酸632/635处),减少胰岛素信号传导,和使胰岛素信号的组分糖基化。另外,OGT在添加N-乙酰葡糖胺的情况下催化丝氨酸和苏氨酸残基的细胞内糖基化。研究显示OGT等位基因对胚胎发生是至关重要的,和OGT对细胞内糖基化和胚胎干细胞活力是必需的。OGT还催化修饰转录因子和RNA聚合酶II的翻译后修饰,然而该修饰的具体功能大部分是未知的。
胱天蛋白酶5(CASP5)
胱天蛋白酶5是蛋白水解地切割天冬氨酸残基处的其它蛋白质的酶,并且属于称为胱天蛋白酶的半胱氨酸蛋白酶的家族。它是炎性胱天蛋白酶,连同胱天蛋白酶1、胱天蛋白酶4和鼠胱天蛋白酶4同系物胱天蛋白酶11,并且在免疫系统中发挥作用。
结肠直肠肿瘤相关抗原-1(COA-1)
COA-1在2003年由Maccalli等(Maccalli,C.,et al.,Identification of acolorectal tumor-asspciated antigen(COA-1)recognized by CD4(+)Tlymphocytes.Cancer Res,2003.63(20):p.6735-43)鉴定为由结肠直肠和黑素瘤细胞强烈表达(不可获得数据)。它的突变可以干扰肿瘤和正常细胞的区分识别。
黑素瘤相关抗原(MAGE)
除雄性生殖细胞和——对于它们中的一些——胎盘之外,MAGE(黑素瘤相关抗原)基因家族的哺乳动物成员最初被描述为在正常成人组织中完全沉默。相比之下,这些基因在多种肿瘤中表达。因此,根据本发明的复合物优选地包括MAGE-家族的抗原(“MAGE”抗原)或其表位。在MAGE家族中,具体地MAGE-A3和MAGE-D4是优选的,并且MAGE-A3是特别优选的。MAGE-A3在健康细胞中的正常功能未知。MAGE-A3是肿瘤特异性蛋白,并且已经在许多肿瘤上被鉴定。MAGE-A3的氨基酸序列在下列中显示:
MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPDPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAELVHFLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKAFSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFATCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILGDPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHISYPPLHEWVLREGEE
[SEQ ID NO:59]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:59的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。
MAGE-A3的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的MAGE-A3表位包括下列表位(下列中显示的表位序列是上面的MAGE-A3序列的片段,并且因而在上面加下划线的MAGE-A3序列中显示;下列表位序列可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
KVAELVHFL
[SEQ ID NO:60]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:60的氨基酸序列。
由T-细胞识别的鳞状细胞癌抗原(SART)
在SART家族内,SART-3是最优选的。因而,根据本发明的复合物优选地包括SART-家族的抗原(“SART”抗原)或其表位;根据本发明的复合物更优选地包括SART-3或其表位。由T-细胞识别的鳞状细胞癌抗原3具备能够诱导癌症患者中的HLA-A24-限制和肿瘤特异性细胞毒性T淋巴细胞的肿瘤表位。SART-3被认为参与mRNA剪接的调控。
IL13Rα2
IL13Rα2以非常高的亲和力结合白介素13(IL-13)(并且因此可以将其隔绝)但是不允许IL-4结合。它充当IL-13和IL-4二者的负调节因子,然而该机制仍未确定。IL13Rα2的氨基酸序列在下列中显示:
MAFVCLAIGCLYTFLISTTFGCTSSSDTEIKVNPPQDFEIVDPGYLGYLYLQWQPPLSLDHFKECTVEYELKYRNIGSETWKTIITKNLHYKDGFDLNKGIEAKIHTLLPWQCTNGSEVQSSWAETTYWISPQGIPETKVQDMDCVYYNWQYLLCSWKPGIGVLLDTNYNLFYWYEGLDHALQCVDYIKADGQNIGCRFPYLEASDYKDFYICVNGSSENKPIRSSYFTFQLQNIVKPLPPVYLTFTRESSCEIKLKWSIPLGPIPARCFDYEIEIREDDTTLVTATVENETYTLKTTNETRQLCFVVRSKVNIYCSDDGIWSEWSDKQCWEGEDLSKKTLLRFWLPFGFILILVIFVTGLLLRKPNTYPKMIPEFFCDT
[SEQ ID NO:61]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:61的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。
IL13Rα2的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的IL13Rα2表位包括下列表位(下列中显示的表位序列是上面的IL13Rα2序列的片段,并且因而在上面加下划线的IL13Rα2序列中显示;下列表位序列可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
LPFGFIL
[SEQ ID NO:62]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:62的氨基酸序列。
CMV
人巨细胞病毒(CMV),疱疹病毒家族的成员,在通常未被识别的感染后在体内持续终生。CMV在严重免疫妥协的患者中是最频繁的机会性CNS感染。死后CMV核酸可以在多于20%的未患有CNS疾病的个体的CNS中被检测到,其确认了CMV对CNS细胞的趋向性并且指示CMV可以在CNS中持续终生而不造成(明显的)伤害。然而,CMV蛋白和寡核苷酸的表达在高百分数的胶质瘤中也被鉴定(Cobbs CS,Harkins L,Samanta M,et al.Humancytomegalovirus infection and expression in human malignant glioma.CancerRes.2002;62:3347–3350)。
优选的CMV抗原是如在WO 2009/155535中描述的那些,比如多肽或其免疫原性片段,其选自衣壳多肽、内膜多肽、和包膜多肽;优选地选自长独特磷蛋白83(phosphoproteinunique long 83)(ppUL83;a/k/a pp65)、糖蛋白UL55(gpUL55;a/k/a gB)、UL123即刻早期1(IEl)蛋白、UL122IE2蛋白、ULl I lA(a/k/a mtrll)、US28、ppUL32、ppUL65、ppUL80a、ppUL82、ppUL98a、ppUL99、gpUL4(a/k/a gp48)、gpULlβ、gpUL18(a/k/a MHC)、gpUL75(a/k/agH)、gpULlOO、gpULHO(a/k/a gM)、gpUL115(a/k/a gL)、pUL46、pUL48、pUL56、pUL86(a/k/aMCP)、短独特糖蛋白10(glycoprotein unique short 10)(gpUSIO)、gpUSl 1、糖蛋白复合物II(gcll)、gp65和gp93。优选地,CMV抗原是多肽或其免疫原性片段,其由对应于由GENBANK登录号BK000394.2或Xl 7403.1显示的CMV毒株的基因编码。而且,WO 2009/155535还描述了优选的CMV表位比如包括由Trivedi et al.,Blood,105:2793(2005)和美国专利申请公布号2005/0019344所描述的氨基酸序列的肽和在WO 2009/155535中描述的其它CMV表位。
EGFRvIII
表皮生长因子受体(EGFR;ErbB-1;人中的HER1)是细胞外蛋白配体的表皮生长因子家族(EGF-家族)的成员的细胞表面受体。EGFRvIII是EGFR的突变形式,其已知在肿瘤发生中发挥突出作用。即,EGFRvIII是组成型活化的酪氨酸激酶,其源自EGFR中的缺失突变。EGFRvIII由成胶质细胞瘤细胞大量地过表达(Saikali,S.,et al.,Expression of ninetumour antigens in a series of human glioblastoma multiforme:interest ofEGFRvIII,IL-13Rα2,gp100and TRP-2for immunotherapy.J Neurooncol,2007.81(2):p.139-48),其获得不受控的生长、存活、侵袭、和募集新肿瘤血管的增强的能力。
EGFRvIII的几种表位是技术人员已知的。优选地由根据本发明的复合物包括的优选的EGFRvIII表位包括下列表位(下列表位序列可以指的是一种表位或多于一种(重叠)表位):
LEEKKGNYVVTDHC
[SEQ ID NO:71]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:71的氨基酸序列。
EphA2
Ephrin和它们的受体(ephrin受体,“Eph”)属于参与在中枢神经系统的胚胎发育期间发生的关键过程——其包括轴突映射(axon mapping)、细胞迁移和血管新生——的蛋白质的亚家族。最近的发现表明Eph/ephrin由胶质瘤细胞过表达并且它们的信号传导影响胶质瘤细胞生长、迁移和侵袭(Nakada,M.,Y.Hayashi,and J.Hamada,Role of Eph/ephrintyrosine kinase in malignant glioma.Neuro Oncol,2011.13(11):p.1163-70)。已经鉴定了16种ephrin受体(Eph)。基于它们的细胞外结构域序列的相似性和它们结合ephrin-A与ephrin-B配体的亲和力,ephrin受体被分为两组。EPH受体A2(ephrin A型受体2)结合ephrin-A配体。
EphA2的氨基酸序列在下列中显示:
MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMNDMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDIVYSVTCEQCWPESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSGLVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
[SEQ ID NO:72]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:72的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,EphA2的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
Gp100
糖蛋白100、gp100或黑素细胞蛋白PMEL的长度是661个氨基酸并且是在黑素体中富集的I型跨膜糖蛋白,所述黑素体是黑素细胞中的产黑素细胞器。Gp100参与黑素体成熟。gp100蛋白是黑素瘤抗原,即肿瘤相关抗原。gp100的氨基酸序列在下列中显示:
MDLVLKRCLLHLAVIGALLAVGATKVPRNQDWLGVSRQLRTKAWNRQLYPEWTEAQRLDCWRGGQVSLKVSNDGPTLIGANASFSIALNFPGSQKVLPDGQVIWVNNTIINGSQVWGGQPVYPQETDDACIFPDGGPCPSGSWSQKRSFVYVWKTWGQYWQVLGGPVSGLSIGTGRAMLGTHTMEVTVYHRRGSRSYVPLAHSSSAFTITDQVPFSVSVSQLRALDGGNKHFLRNQPLTFALQLHDPSGYLAEADLSYTWDFGDSSGTLISRALVVTHTYLEPGPVTAQVVLQAAIPLTSCGSSPVPGTTDGHRPTAEAPNTTAGQVPTTEVVGTTPGQAPTAEPSGTTSVQVPTTEVISTAPVQMPTAESTGMTPEKVPVSEVMGTTLAEMSTPEATGMTPAEVSIVVLSGTTAAQVTTTEWVETTARELPIPEPEGPDASSIMSTESITGSLGPLLDGTATLRLVKRQVPLDCVLYRYGSFSVTLDIVQGIESAEILQAVPSGEGDAFELTVSCQGGLPKEACMEISSPGCQPPAQRLCQPVLPSPACQLVLHQILKGGSGTYCLNVSLADTNSLAVVSTQLIMPGQEAGLGQVPLIVGILLVLMAVVLASLIYRRRLMKQDFSVPQLPHSSSHWLRLPRIFCSCPIGENSPLLSGQQV
[SEQ ID NO:73]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:73的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,gp100的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
hTert
端粒逆转录酶(缩写为TERT或人中的hTERT)是酶端粒酶的催化亚基,其连同端粒酶RNA组分(TERC)包括端粒酶复合物的最重要的单元。端粒酶是RNA依赖性聚合酶的独特亚群的一部分。端粒酶延长DNA链中的端粒,从而允许将另外变为有丝分裂期后的和经历凋亡的衰老细胞超过Hayflick极限和变为潜在地无限增殖,通常如同癌性细胞的情况一样。hTert的氨基酸序列在下列中显示:
MPRAPRCRAVRSLLRSHYREVLPLATFVRRLGPQGWRLVQRGDPAAFRALVAQCLVCVPWDARPPPAAPSFRQVSCLKELVARVLQRLCERGAKNVLAFGFALLDGARGGPPEAFTTSVRSYLPNTVTDALRGSGAWGLLLRRVGDDVLVHLLARCALFVLVAPSCAYQVCGPPLYQLGAATQARPPPHASGPRRRLGCERAWNHSVREAGVPLGLPAPGARRRGGSASRSLPLPKRPRRGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVDVTGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
[SEQ ID NO:74]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:74的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,hTert的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
TRP-2
酪氨酸酶有关蛋白2(TRP-2,也称为“L-多巴色素互变异构酶”)是黑素原生成酶。TRP-2调控控制黑素生物聚合物中羧基化亚基的比例的开关(switch)。因而,TRP-2是参与黑素产生的黑素体蛋白。它也在成胶质细胞瘤细胞中过表达。TRP-2的氨基酸序列在下列中显示:
MSPLWWGFLLSCLGCKILPGAQGQFPRVCMTVDSLVNKECCPRLGAESANVCGSQQGRGQCTEVRADTRPWSGPYILRNQDDRELWPRKFFHRTCKCTGNFAGYNCGDCKFGWTGPNCERKKPPVIRQNIHSLSPQEREQFLGALDLAKKRVHPDYVITTQHWVGLLGPNGTQPQFANCSVYDFFVWLHYYSVRDTLLGGFFPWLKVYYYRFVIGLRVWQWEVISCKLIKRATTRQP
[SEQ ID NO:75]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:75的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,TRP-2的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
YKL-40
YKL-40(也称为人软骨糖蛋白-39(HC gp-39)和几丁质酶-3-样蛋白1(CHI3L1))是分泌的糖蛋白和家族18糖基水解酶的成员。名称YKL-40源自在分泌形式上存在的三个N-端氨基酸和其分子质量。YKL-40由多种细胞类型分泌,包括软骨细胞、滑膜细胞、巨噬细胞和一些类型的癌细胞。YKL-40的氨基酸序列在下列中显示:
MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFANISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKEAQPGKKQLLLSAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRFSNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGTLAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWALDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
[SEQ ID NO:76]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:76的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,YKL-40的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
短小蛋白聚糖
短小蛋白聚糖核心蛋白是在人中由BCAN基因编码的蛋白质。短小蛋白聚糖是lectican蛋白家族的成员。短小蛋白聚糖被定位于脑中的神经元的表面。在黑素细胞中,BCAN基因表达可以由MITF调控。短小蛋白聚糖的氨基酸序列在下列中显示:
MAQLFLPLLAALVLAQAPAALADVLEGDSSEDRAFRVRIAGDAPLQGVLGGALTIPCHVHYLRPPPSRRAVLGSPRVKWTFLSRGREAEVLVARGVRVKVNEAYRFRVALPAYPASLTDVSLALSELRPNDSGIYRCEVQHGIDDSSDAVEVKVKGVVFLYREGSARYAFSFSGAQEACARIGAHIATPEQLYAAYLGGYEQCDAGWLSDQTVRYPIQTPREACYGDMDGFPGVRNYGVVDPDDLYDVYCYAEDLNGELFLGDPPEKLTLEEARAYCQERGAEIATTGQLYAAWDGGLDHCSPGWLADGSVRYPIVTPSQRCGGGLPGVKTLFLFPNQTGFPNKHSRFNVYCFRDSAQPSAIPEASNPASNPASDGLEAIVTVTETLEELQLPQEATESESRGAIYSIPIMEDGGGGSSTPEDPAEAPRTLLEFETQSMVPPTGFSEEEGKALEEEEKYEDEEEKEEEEEEEEVEDEALWAWPSELSSPGPEASLPTEPAAQEESLSQAPARAVLQPGASPLPDGESEASRPPRVHGPPTETLPTPRERNLASPSPSTLVEAREVGEATGGPELSGVPRGESEETGSSEGAPSLLPATRAPEGTRELEAPSEDNSGRTAPAGTSVQAQPVLPTDSASRGGVAVVPASGDCVPSPCHNGGTCLEEEEGVRCLCLPGYGGDLCDVGLRFCNPGWDAFQGACYKHFSTRRSWEEAETQCRMYGAHLASISTPEEQDFINNRYREYQWIGLNDRTIEGDFLWSDGVPLLYENWNPGQPDSYFLSGENCVVMVWHDQGQWSDVPCNYHLSYTCKMGLVSCGPPPELPLAQVFGRPRLRYEVDTVLRYRCREGLAQRNLPLIRCQENGRWEAPQISCVPRRPARALHPEEDPEGRQGRLLGRWKALLIPPSSPMPGP
[SEQ ID NO:77]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:77的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,短小蛋白聚糖的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,StroobantV,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
神经配蛋白4
神经配蛋白(NLGN)——I型膜蛋白——是突触后膜上的细胞粘附蛋白,其调节神经元之间突触的形成和维持。神经配蛋白充当β-轴突蛋白的配体,其是在突触前定位的细胞粘附蛋白。神经配蛋白还通过规定突触功能影响神经网络的性质,并且它们通过募集和稳定关键的突触组分调节信号传导。随着细胞成熟,神经配蛋白与其它突触后蛋白相互作用以在突触后密集区中定位神经递质受体和通道。神经配蛋白4的氨基酸序列在下列中显示:
MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRTPLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLLHDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTNDIAHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNTLTGMQPLHTFNTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV
[SEQ ID NO:78]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:78的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,神经配蛋白4的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,StroobantV,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
PTPRz1
也称为phosphacan的受体型酪氨酸-蛋白磷酸酶ζ是单次跨膜I型膜蛋白,其具有两个胞质酪氨酸-蛋白磷酸酶结构域、一个α-碳酸酐酶结构域和一个纤连蛋白III型结构域,并且属于受体酪氨酸磷酸酶家族。蛋白质和转录物二者在成胶质细胞瘤细胞中过表达,促进它们的趋触性迁移。PTPRz1的氨基酸序列在下列中显示:
MRILKRFLACIQLLCVCRLDWANGYYRQQRKLVEEIGWSYTGALNQKNWGKKYPTCNSPKQSPINIDEDLTQVNVNLKKLKFQGWDKTSLENTFIHNTGKTVEINLTNDYRVSGGVSEMVFKASKITFHWGKCNMSSDGSEHSLEGQKFPLEMQIYCFDADRFSSFEEAVKGKGKLRALSILFEVGTEENLDFKAIIDGVESVSRFGKQAALDPFILLNLLPNSTDKYYIYNGSLTSPPCTDTVDWIVFKDTVSISESQLAVFCEVLTMQQSGYVMLMDYLQNNFREQQYKFSRQVFSSYTGKEEIHEAVCSSEPENVQADPENYTSLLVTWERPRVVYDTMIEKFAVLYQQLDGEDQTKHEFLTDGYQDLGAILNNLLPNMSYVLQIVAICTNGLYGKYSDQLIVDMPTDNPELDLFPELIGTEEIIKEEEEGKDIEEGAIVNPGRDSATNQIRKKEPQISTTTHYNRIGTKYNEAKTNRSPTRGSEFSGKGDVPNTSLNSTSQPVTKLATEKDISLTSQTVTELPPHTVEGTSASLNDGSKTVLRSPHMNLSGTAESLNTVSITEYEEESLLTSFKLDTGAEDSSGSSPATSAIPFISENISQGYIFSSENPETITYDVLIPESARNASEDSTSSGSEESLKDPSMEGNVWFPSSTDITAQPDVGSGRESFLQTNYTEIRVDESEKTTKSFSAGPVMSQGPSVTDLEMPHYSTFAYFPTEVTPHAFTPSSRQQDLVSTVNVVYSQTTQPVYNGETPLQPSYSSEVFPLVTPLLLDNQILNTTPAASSSDSALHATPVFPSVDVSFESILSSYDGAPLLPFSSASFSSELFRHLHTVSQILPQVTSATESDKVPLHASLPVAGGDLLLEPSLAQYSDVLSTTHAASETLEFGSESGVLYKTLMFSQVEPPSSDAMMHARSSGPEPSYALSDNEGSQHIFTVSYSSAIPVHDSVGVTYQGSLFSGPSHIPIPKSSLITPTASLLQPTHALSGDGEWSGASSDSEFLLPDTDGLTALNISSPVSVAEFTYTTSVFGDDNKALSKSEIIYGNETELQIPSFNEMVYPSESTVMPNMYDNVNKLNASLQETSVSISSTKGMFPGSLAHTTTKVFDHEISQVPENNFSVQPTHTVSQASGDTSLKPVLSANSEPASSDPASSEMLSPSTQLLFYETSASFSTEVLLQPSFQASDVDTLLKTVLPAVPSDPILVETPKVDKISSTMLHLIVSNSASSENMLHSTSVPVFDVSPTSHMHSASLQGLTISYASEKYEPVLLKSESSHQVVPSLYSNDELFQTANLEINQAHPPKGRHVFATPVLSIDEPLNTLINKLIHSDEILTSTKSSVTGKVFAGIPTVASDTFVSTDHSVPIGNGHVAITAVSPHRDGSVTSTKLLFPSKATSELSHSAKSDAGLVGGGEDGDTDDDGDDDDDDRGSDGLSIHKCMSCSSYRESQEKVMNDSDTHENSLMDQNNPISYSLSENSEEDNRVTSVSSDSQTGMDRSPGKSPSANGLSQKHNDGKEENDIQTGSALLPLSPESKAWAVLTSDEESGSGQGTSDSLNENETSTDFSFADTNEKDADGILAAGDSEITPGFPQSPTSSVTSENSEVFHVSEAEASNSSHESRIGLAEGLESEKKAVIPLVIVSALTFICLVVLVGILIYWRKCFQTAHFYLEDSTSPRVISTPPTPIFPISDDVGAIPIKHFPKHVADLHASSGFTEEFETLKEFYQEVQSCTVDLGITADSSNHPDNKHKNRYINIVAYDHSRVKLAQLAEKDGKLTDYINANYVDGYNRPKAYIAAQGPLKSTAEDFWRMIWEHNVEVIVMITNLVEKGRRKCDQYWPADGSEEYGNFLVTQKSVQVLAYYTVRNFTLRNTKIKKGSQKGRPSGRVVTQYHYTQWPDMGVPEYSLPVLTFVRKAAYAKRHAVGPVVVHCSAGVGRTGTYIVLDSMLQQIQHEGTVNIFGFLKHIRSQRNYLVQTEEQYVFIHDTLVEAILSKETEVLDSHIHAYVNALLIPGPAGKTKLEKQFQLLSQSNIQQSDYSAALKQCNREKNRTSSIIPVERSRVGISSLSGEGTDYINASYMGYYQSNEFIITQHPLLHTIKDFWRMIWDHNAQLVVMIPDGQNMAEDEFVYWPNKDEPINCESFKVTLMAEEHKCLSNEEKLIIQDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWPNPDSPISKTFELISVIKEEAANRDGPMIVHDEHGGVTAGTFCALTTLMHQLEKENSVDVYQVAKMINLMRPGVFADIEQYQFLYKVILSLVSTRQEENPSTSLDSNGAALPDGNIAESLESLV
[SEQ ID NO:79]
因此,根据本发明的优选的复合物包括根据SEQ ID NO:79的氨基酸序列或如本文描述的其片段或变体。如上面描述的,PTPRz1的合适的癌症/肿瘤表位从文献中是已知的,或可以通过使用癌症/肿瘤表位数据库鉴定,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumorantigen.Cancer Immun2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,其中由CD4+或CD8+T细胞识别的人肿瘤抗原基于它们的表达图式被分类为四种主要组,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
优选地,根据本发明的复合物包括至少一种肿瘤表位,其是选自如下的抗原的表位:EpCAM、MUC-1、存活蛋白、CEA、KRas、MAGE-A3、IL13Rα2、EGFRvIII、EphA2、Her2/neu、TRP-2、短小蛋白聚糖、神经配蛋白4和PTPRz1,比如根据SEQ ID NO 48、50、51、53、55、56、58、60、62和71中任一种的表位;更优选地至少一种肿瘤表位是选自如下的抗原的表位:EpCAM、MUC-1、存活蛋白、CEA、KRas、MAGE-A3、EGFRvIII、EphA2、IL-13Rα2、TRP-2和短小蛋白聚糖,比如根据SEQ ID NO 48、50、51、53、55、56、58、60、62和71中任一种的表位;并且甚至更优选地至少一种肿瘤表位是选自如下的抗原的表位:EpCAM、MUC-1、存活蛋白g、CEA、EGFRvIII、EphA2和短小蛋白聚糖,比如根据SEQ ID NO 48、50、51、53、55、56和71中任一种的表位。
还优选的是根据本发明的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-MUC-1的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:50的表位和/或根据SEQ ID NO:51的表位)或其功能性序列变体;
-存活蛋白的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:53的表位)或其功能性序列变体;
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或表位根据SEQ IDNO:56)或其功能性序列变体;
-KRas的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:58的表位)或其功能性序列变体;
-MAGE-A3的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:60的表位)或其功能性序列变体;
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-Her2/neu的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-神经配蛋白4的一种或多种表位或其功能性序列变体;和/或
-PTPRz1的一种或多种表位或其功能性序列变体。
如上面描述的,那些抗原的进一步的表位(除示例的表位之外)可以从癌症/肿瘤表位数据库容易地检索到,例如从van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van denEynde B.Peptide database:T cell-defined tumor antigen.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/,或从数据库“Tantigen”(TANTIGEN版本1.0,2009年12月1日;由Dana-Farber癌症研究所癌症疫苗中心的生物信息核心实验室研发;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)。
“序列变体”如上面限定,即序列变体具有与参考序列至少70%,至少75%,优选地至少80%,更优选地至少85%,甚至更优选地至少90%,特别优选地至少95%,最优选地至少99%同一的(氨基酸)序列。“功能性”序列变体在表位的背景下意思是作为表位的功能不被损害或丧失。然而,优选地,如本文描述的癌症/肿瘤抗原的表位的氨基酸序列不被突变并且因而与参考表位序列同一。
还优选的是根据本发明的复合物包括
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的EpCAM的片段;
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的MUC-1的片段;
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的CEA的片段;
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的KRas的片段;和/或
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的MAGE-A3的片段
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的EGFRvIII的片段;
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的EphA2的片段(比如根据SEQ ID NO:72的多肽的片段);
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的Her2/neu的片段(比如根据SEQ IDNO:70的多肽的片段);
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的IL-13Rα2的片段(比如根据SEQ IDNO:61的多肽的片段);
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的存活蛋白的片段(比如根据SEQ IDNO:52的多肽的片段);
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的TRP-2的片段(比如根据SEQ ID NO:75的多肽的片段);
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的短小蛋白聚糖的片段(比如根据SEQID NO:77的多肽的片段);
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的神经配蛋白4的片段(比如根据SEQID NO:78的多肽的片段);和/或
-包括一种或多种表位或其功能性序列变体的PTPRz1的片段(比如根据SEQ IDNO:79的多肽的片段)。
如本文使用的,抗原的“片段”包括抗原的至少10个连续的氨基酸,优选地抗原的至少15个连续的氨基酸,更优选地抗原的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地抗原的至少25个连续的氨基酸和最优选地抗原的至少30个连续的氨基酸。因此,EpCAM的片段包括EpCAM(SEQ ID NO:47)的至少10个连续的氨基酸,优选地EpCAM(SEQ ID NO:47)的至少15个连续的氨基酸,更优选地EpCAM(SEQ ID NO:47)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地EpCAM(SEQ ID NO:47)的至少25个连续的氨基酸和最优选地EpCAM(SEQ ID NO:47)的至少30个连续的氨基酸;MUC-1的片段包括MUC-1(SEQ ID NO:49)的至少10个连续的氨基酸,优选地MUC-1(SEQ ID NO:49)的至少15个连续的氨基酸,更优选地MUC-1(SEQ ID NO:49)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地MUC-1(SEQ ID NO:49)的至少25个连续的氨基酸和最优选地MUC-1(SEQ ID NO:49)的至少30个连续的氨基酸;存活蛋白的片段包括存活蛋白(SEQ ID NO:52)的至少10个连续的氨基酸,优选地存活蛋白(SEQ ID NO:52)的至少15个连续的氨基酸,更优选地存活蛋白(SEQ ID NO:52)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地存活蛋白(SEQ ID NO:52)的至少25个连续的氨基酸和最优选地存活蛋白(SEQ ID NO:52)的至少30个连续的氨基酸;CEA的片段包括CEA(SEQ ID NO:54)的至少10个连续的氨基酸,优选地CEA(SEQ ID NO:54)的至少15个连续的氨基酸,更优选地CEA(SEQ ID NO:54)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地CEA(SEQ ID NO:54)的至少25个连续的氨基酸和最优选地CEA(SEQ ID NO:54)的至少30个连续的氨基酸;Kras的片段包括KRas(SEQ ID NO:57)的至少10个连续的氨基酸,优选地KRas(SEQ ID NO:57)的至少15个连续的氨基酸,更优选地KRas(SEQ ID NO:57)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地KRas(SEQ ID NO:57)的至少25个连续的氨基酸和最优选地KRas(SEQ ID NO:57)的至少30个连续的氨基酸;MAGE-A3的片段包括MAGE-A3(SEQ ID NO:59)的至少10个连续的氨基酸,优选地MAGE-A3(SEQ ID NO:59)的至少15个连续的氨基酸,更优选地MAGE-A3(SEQ ID NO:59)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地MAGE-A3(SEQ ID NO:59)的至少25个连续的氨基酸和最优选地MAGE-A3(SEQ ID NO:59)的至少30个连续的氨基酸;EGFRvIII的片段包括EGFRvIII的至少10个连续的氨基酸,优选地EGFRvIII的至少15个连续的氨基酸,更优选地EGFRvIII的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地EGFRvIII的至少25个连续的氨基酸,和最优选地EGFRvIII的至少30个连续的氨基酸;EphA2的片段包括EphA2(SEQ ID NO:72)的至少10个连续的氨基酸,优选地EphA2(SEQ ID NO:72)的至少15个连续的氨基酸,更优选地EphA2(SEQ ID NO:72)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地EphA2(SEQ ID NO:72)的至少25个连续的氨基酸和最优选地EphA2(SEQ ID NO:72)的至少30个连续的氨基酸;Her2/neu的片段包括Her2/neu(SEQ ID NO:70)的至少10个连续的氨基酸,优选地Her2/neu(SEQ ID NO:70)的至少15个连续的氨基酸,更优选地Her2/neu(SEQ ID NO:70)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地Her2/neu(SEQ ID NO:70)的至少25个连续的氨基酸和最优选地Her2/neu(SEQ ID NO:70)的至少30个连续的氨基酸;IL-13Rα2的片段包括IL-13Rα2(SEQ ID NO:61)的至少10个连续的氨基酸,优选地IL-13Rα2(SEQ ID NO:61)的至少15个连续的氨基酸,更优选地IL-13Rα2(SEQ ID NO:61)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地IL-13Rα2(SEQ ID NO:61)的至少25个连续的氨基酸和最优选地IL-13Rα2(SEQ ID NO:61)的至少30个连续的氨基酸;TRP-2的片段包括TRP-2(SEQ ID NO:75)的至少10个连续的氨基酸,优选地TRP-2(SEQ ID NO:75)的至少15个连续的氨基酸,更优选地TRP-2(SEQ ID NO:75)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地TRP-2(SEQ ID NO:75)的至少25个连续的氨基酸和最优选地TRP-2(SEQ ID NO:75)的至少30个连续的氨基酸;短小蛋白聚糖的片段包括短小蛋白聚糖(SEQ ID NO:77)的至少10个连续的氨基酸,优选地短小蛋白聚糖(SEQ ID NO:77)的至少15个连续的氨基酸,更优选地短小蛋白聚糖(SEQ ID NO:77)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地短小蛋白聚糖(SEQ ID NO:77)的至少25个连续的氨基酸和最优选地短小蛋白聚糖(SEQ ID NO:77)的至少30个连续的氨基酸;神经配蛋白4的片段包括神经配蛋白4(SEQ ID NO:78)的至少10个连续的氨基酸,优选地神经配蛋白4(SEQ ID NO:78)的至少15个连续的氨基酸,更优选地神经配蛋白4(SEQ ID NO:78)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地神经配蛋白4(SEQID NO:78)的至少25个连续的氨基酸和最优选地神经配蛋白4(SEQ ID NO:78)的至少30个连续的氨基酸;和PTPRz1的片段包括PTPRz1(SEQ ID NO:79)的至少10个连续的氨基酸,优选地PTPRz1(SEQ ID NO:79)的至少15个连续的氨基酸,更优选地PTPRz1(SEQ ID NO:79)的至少20个连续的氨基酸,甚至更优选地PTPRz1(SEQ ID NO:79)的至少25个连续的氨基酸和最优选地PTPRz1(SEQ ID NO:79)的至少30个连续的氨基酸。
这样的片段的功能性序列变体具有与参考序列至少70%,至少75%,优选地至少80%,更优选地至少85%,甚至更优选地至少90%,特别优选地至少95%,最优选地至少99%同一的(氨基酸)序列,并且由片段包括的至少一种——优选地所有——表位的表位功能被维持。
优选地,这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体;和
-MAGE-A3的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:60的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还优选的是这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-MUC-1的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:50的表位和/或根据SEQ ID NO:51的表位)或其功能性序列变体;
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体;和
-MAGE-A3的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:60的表位)或其功能性序列变体.
这样的复合物优选地不包括HER-2、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还优选的是这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-MUC-1的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:50的表位和/或根据SEQ ID NO:51的表位)或其功能性序列变体;
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体;和
-KRas的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:58的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、TGFβR2、p53、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还优选的是这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-存活蛋白的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:53的表位)或其功能性序列变体;
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体;和
-MAGE-A3的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:60的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还优选的是这样的复合物包括
-MUC-1的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:50的表位和/或根据SEQ ID NO:51的表位)或其功能性序列变体;
-存活蛋白的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:53的表位)或其功能性序列变体;和
-MAGE-A3的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:60的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EpCAM、HER-2、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART或IL13Rα2中的任何表位。
更优选地,这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-MUC-1的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:50的表位和/或根据SEQ ID NO:51的表位)或其功能性序列变体;
-存活蛋白的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:53的表位)或其功能性序列变体;和/或
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART或IL13Rα2中的任何表位。
特别优选地,这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-MUC-1的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:50的表位和/或根据SEQ ID NO:51的表位)或其功能性序列变体;
-存活蛋白的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:53的表位)或其功能性序列变体;和
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还特别优选的是这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;
-MUC-1的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:50的表位和/或根据SEQ ID NO:51的表位)或其功能性序列变体;和
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还特别优选的是这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体;和
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还特别优选的是这样的复合物包括
-EpCAM的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:48的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART或IL13Rα2中的任何表位。
还特别优选的是这样的复合物包括
-CEA的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:55的表位和/或根据SEQ ID NO:56的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EpCAM、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF 43、KOC1、VEGFR、βhCG、存活蛋白、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART或IL13Rα2中的任何表位。
优选地,这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和/或
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
更优选地,这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EphA2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括IL-13Rα2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括TRP-2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括短小蛋白聚糖、IL-13Rα2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括IL-13Rα2、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EphA2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EphA2、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EphA2、IL-13Rα2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、IL-13Rα2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、EphA2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;和
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括IL-13Rα2、短小蛋白聚糖、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;和
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EphA2、短小蛋白聚糖、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;和
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
这样的复合物优选地不包括EphA2、IL-13Rα2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EphA2、IL-13Rα2、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、TRP-2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、IL-13Rα2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、IL-13Rα2、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、EphA2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、EphA2、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体;和
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、EphA2、IL-13Rα2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EGFRvIII的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:71的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EphA2、TRP-2、短小蛋白聚糖、IL-13Rα2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-EphA2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、IL-13Rα2、TRP-2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-IL-13Rα2的一种或多种表位(比如根据SEQ ID NO:62的表位)或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、EphA2、TRP-2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-TRP-2的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、EphA2、IL-13Rα2、短小蛋白聚糖、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
还更优选的是这样的复合物包括
-短小蛋白聚糖的一种或多种表位或其功能性序列变体。
这样的复合物优选地不包括EGFRvIII、EphA2、IL-13Rα2、TRP-2、CMV、gp100、Her2/neu、存活蛋白、hTert、MAGE-A1、MAGE-A3、YKL-40、神经配蛋白4或PTPRz1中的任何表位。
组分c)–TLR肽激动剂
在根据本发明的复合物中,TLR肽激动剂允许疫苗对树突细胞的增加的靶向连同自身佐剂性(self-adjuvancity)。通过同时刺激内化、代谢和展示抗原(一种或多种)的抗原呈递细胞,具体地树突细胞,根据本发明的复合物中TLR肽激动剂与CPP和根据本发明的至少一种抗原或抗原表位的物理连接提供了增强的免疫应答。
如在本发明的上下文中使用的,“TLR肽激动剂”是Toll样受体(TLR)的激动剂,即它结合至TLR并且活化TLR,具体地产生生物应答。而且,TLR肽激动剂是如上面限定的肽、多肽或蛋白质。优选地,TLR肽激动剂包括10至150个氨基酸,更优选地15至130个氨基酸,甚至更优选地2至120个氨基酸,特别优选地25至110个氨基酸,和最优选地30至100个氨基酸。
Toll样受体(TLR)是表征为细胞外、跨膜和胞质结构域的跨膜蛋白。包含富含亮氨酸的重复序列(LRR)——其具有马蹄样形状——的细胞外结构域参与识别源自不同微生物的常见分子模式。Toll样受体包括TLR1-10。能够活化TLR受体和其修饰物与衍生物的化合物在本领域中良好地被记录。TLR1可以由细菌脂蛋白和其乙酰化形式活化,TLR2可以另外由革兰氏阳性菌糖脂、LPS、LP A、LTA、菌毛、外膜蛋白、来自细菌或来自宿主的热激蛋白、和分枝杆菌脂阿拉伯甘露聚糖(lipoarabinomannan)活化。TLR3可以由dsRNA——具体地病毒起源的——或由化学化合物聚(LC)活化。TLR4可以由革兰氏阴性LPS、LTA、来自宿主或来自细菌起源的热激蛋白、病毒外壳或包膜蛋白、紫杉酚或其衍生物、包含透明质酸的寡糖和纤连蛋白活化。TLR5可以使用细菌鞭毛或鞭毛蛋白活化。TLR6可以由分枝杆菌脂蛋白和B群链球菌热不稳定的可溶性因子(GBS-F)或葡萄球菌调控蛋白(modulin)活化。TLR7可以由咪唑喹啉活化。TLR9可以由非甲基化的CpG DNA或染色质-IgG复合物活化。
优选地,由根据本发明的复合物包括的TLR肽激动剂是TLR1、2、4、5、6和/或10的激动剂。TLR在细胞表面上(TLR1、2、4、5、6和10)或在细胞内细胞器比如内体的膜上(TLR3、4、7、8和9)表达。内体受体的天然配体结果是基于核酸的分子(除TLR4以外)。细胞表面表达的TLR1、2、4、5、6和10识别细胞外微生物的分子模式(Monie,T.P.,Bryant,C.E.,et al.2009:Activating immunity:Lessons from the TLRs and NLRs.Trends Biochem.Sci.34(11),553–561)。TLR在几种细胞类型上表达,但是几乎所有TLR在DC上表达,其使得这些特定细胞感测所有可能的病原体和危险信号。
然而,TLR2、4和5在DC的表面处组成型地表达。因此,由根据本发明的复合物包括的TLR肽激动剂更优选地是TLR2、TLR4和/或TLR5的肽激动剂。甚至更优选地,TLR肽激动剂是TLR2肽激动剂和/或TLR4肽激动剂。特别优选地,TLR肽激动剂是TLR4肽激动剂。最优选地,TLR肽激动剂是一种TLR肽激动剂,其是TLR2和TLR4二者激动剂。TLR2可以检测各种源自细菌、病毒、寄生虫和真菌的配体。配体特异性通常通过TLR2与其它TLR比如TLR1、6或10,或非TLR分子比如树突状细胞相关性C型植物血凝素1(dectin-1)、CD14或CD36的相互作用测定。与TLR1的异二聚体的形成使得TLR2能够鉴定来自(分枝杆菌)细菌起源的三酰基脂蛋白或脂肽,比如Pam3CSK4和肽聚糖(PGA;Gay,N.J.,and Gangloff,M.(2007):Structure andfunction of Toll receptors and their ligands.Annu.Rev.Biochem.76,141–165;Spohn,R.,Buwitt-Beckmann,U.,et al.(2004):Synthetic lipopeptide adjuvants andToll-like receptor 2—Structure-activity relationships.Vaccine 22(19),2494–2499)。TLR2和6的异二聚化使得能够检测二酰基脂肽和酵母聚糖。脂多糖(LPS)和其衍生物是TLR4的配体并且鞭毛蛋白是TLR5的配体(Bryant,C.E.,Spring,D.R.,et al.(2010).Themolecular basis of the host response tolipopolysaccharide.Nat.Rev.Microbiol.8(1),8–14)。
TLR2与大范围和在结构上多样范围的配体相互作用,所述配体包括由细菌和真菌表达的分子。已经鉴定了多种TLR2激动剂,包括天然和合成脂肽(例如发酵支原体巨噬细胞活化脂肽(MALP-2))、肽聚糖(PG比如来自金黄色葡萄菌的那些)、来自多种细菌菌株的脂多糖(LPS)、多糖(例如酵母聚糖)、来自革兰氏阳性菌的糖基磷脂酰肌醇锚定的结构(例如来自分枝杆菌的脂磷壁酸(LTA)和脂阿拉伯甘露聚糖和来自结核分枝杆菌的脂甘露聚糖)。某些病毒决定簇也可以经由TLR2引发(Barbalat R,Lau L,Locksley RM,Barton GM.Toll-like receptor 2on inflammatory monocytes induces type I interferon inresponse to viral but not bacterial ligands.Nat Immunol.2009:10(11):1200–7)。细菌脂肽是细胞壁的结构组分。它们由酰化的s-甘油酰半胱氨酸部分组成,肽可以经由半胱氨酸残基与其缀合。为细菌脂肽的TLR2激动剂的实例包括MALP-2和其合成类似物二-棕榈酰-S-甘油酰半胱氨酸(Pam2Cys)或三-棕榈酰-S-甘油酰半胱氨酸(Pam3Cys)。
各种配体与TLR4相互作用,其包括来自明尼苏达沙门氏菌R595的单磷酰脂质A(MPLA)、脂多糖(LPS)、甘露聚糖(白色念珠菌)、糖肌醇磷脂(glycoinositolphospholipid)(锥虫)、病毒包膜蛋白(RSV和MMTV)和包括纤维蛋白原与热激蛋白的内源性抗原。TLR4的这样的激动剂例如在Akira S,Uematsu S,Takeuchi O.Pathogen recognition and innateimmunity.Cell。Feb 24;2006:124(4):783–801或在Kumar H,Kawai T,Akira S.Toll-likereceptor and innate immunity.Biochem Biophys Res Commun.Oct 30;2009 388(4):621–5中描述。在革兰氏阳性菌的外膜中发现的LPS是最广泛研究的TLR4配体。合适的LPS来源的TLR4激动剂肽例如在WO 2013/120073(A1)中描述。
TLR5通过由几乎所有能动菌表达的鞭毛蛋白分子的区域引发。因而,鞭毛蛋白、或衍生自鞭毛蛋白的肽或蛋白质和/或鞭毛蛋白的变体或片段也适合作为由根据本发明的复合物包括的TLR肽激动剂。
TLR肽激动剂的实例因而包括TLR2脂肽激动剂MALP-2、Pam2Cys和Pam3Cys或其修饰物,TLR4激动剂LPS的不同形式,例如脑膜炎双球菌野生型L3-LPS和突变体五-酰化的LpxL1-LPS,和TLR5激动剂鞭毛蛋白。
然而,优选的是由根据本发明的复合物包括的TLR肽激动剂既不是脂肽也不是脂蛋白,既不是糖肽也不是糖蛋白,更优选地,由根据本发明的复合物包括的TLR肽激动剂是如上面限定的经典的肽、多肽或蛋白质。
优选的TLR2肽激动剂是膜联蛋白II或其免疫调节片段,其在WO 2012/048190A1和美国专利申请13/0331546中详细地描述,具体地包括根据WO 2012/048190A1的SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:7的氨基酸序列或其片段或变体的TLR2肽激动剂是优选的。
从而,包括或由根据SEQ ID NO:15的氨基酸序列或如上面描述的其序列变体组成的TLR2肽激动剂作为由根据本发明的复合物包括的组分c)——即作为至少一种TLR肽激动剂——是特别优选的。
STVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
SEQ ID NO:15(TLR2肽激动剂Anaxa)
关于TLR4,TLR肽激动剂是特别优选的,其相当于结合至TLR4的基序,具体地(i)模拟天然LPS配体的肽(RS01:Gln-Glu-Ile-Asn-Ser-Ser-Tyr和RS09:Ala-Pro-Pro-His-Ala-Leu-Ser)和(ii)纤连蛋白来源的肽。细胞糖蛋白纤连蛋白(FN)具有通过三个外显子的可变剪接从单基因生成的多种同种型。这些同种型中的一种是与TLR4相互作用的额外结构域A(EDA)。
进一步合适的TLR肽激动剂包括纤连蛋白EDA结构域或其片段或变体。这样的合适的纤连蛋白EDA结构域或其片段或变体在EP 1 913 954 B1、EP 2 476 440 A1、US 2009/0220532 A1和WO 2011/101332 A1中被公开。从而,包括或由根据SEQ ID NO:45的氨基酸序列或如上面描述的其序列变体组成的TLR4肽激动剂作为由根据本发明的复合物包括的组分c)——即作为至少一种TLR肽激动剂——是特别优选的。
NIDRPKGLAFTDVDVDSIKIAWESPQGQVSRYRVTYSSPEDGIRELFPAPDGEDDTAELQGLRPGSEYTVSVVALHDDMESQPLIGIQST
SEQ ID NO:45(TLR4肽激动剂EDA)
此外,高迁移率族蛋白(high-mobility group box 1protein)(HMGB1)和其肽片段被认为是TLR4激动剂。这样的HMGB1来源的肽例如在US 2011/0236406A1中被公开。
根据本发明的复合物包括至少一种TLR肽激动剂,优选地根据本发明的复合物包括多于一种TLR肽激动剂,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种TLR肽激动剂,更优选地根据本发明的复合物包括(至少)两种或三种TLR肽激动剂,甚至更优选地根据本发明的复合物包括(至少)四种或五种TLR肽激动剂。如果根据本发明的复合物包括多于一种TLR肽激动剂,要理解所述TLR肽激动剂也具体地在根据本发明的复合物中共价连接,例如至另一种TLR肽激动剂和/或至组分a),即细胞穿透肽,和/或至组分b),即抗原或抗原表位。
在特别优选的实施方式中,根据本发明的复合物包括一种单一TLR肽激动剂。特别地,在特别优选的实施方式中,根据本发明的复合物包括一种单一TLR肽激动剂,并且不包括除所描述的一种单一TLR肽激动剂以外的具有TLR激动剂性质的进一步的组分。
由根据本发明的复合物包括的多种TLR肽激动剂可以是相同或不同的。优选地,由根据本发明的复合物包括的多种TLR肽激动剂彼此不同。
而且,优选的是多于一种抗原或抗原表位,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10种抗原或抗原表位,或更多的TLR肽激动剂,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10种TLR激动剂在根据本发明的复合物中被连续地定位。具体地,这意思是由复合物包括的所有TLR肽激动剂以一段定位,其既不被组分a),即细胞穿透肽中断,也不被组分b),即至少一种抗原或抗原表位中断。而是,组分a)和组分b)在复合物中定位,例如在这样的一段所有TLR肽激动剂之前或之后。然而,以这样的方式连续定位的TLR肽激动剂可以彼此连接,例如通过如下面描述的间隔区或连接体,其既不是组分a),即细胞穿透肽,也不是组分b),即至少一种抗原或抗原表位。
然而,可选地,多种TLR肽激动剂还可以以任何其它方式在根据本发明的复合物中定位,例如组分a)和/或组分b)在两种或更多种TLR肽激动剂之间定位,即一种或多种TLR肽激动剂在组分a)和组分b)之间定位(或反之亦然),和任选地,一种或多种TLR肽激动剂在组分a)和/或组分b)的各自另一端处定位。
要理解活化相同或不同TLR受体的大量不同的TLR肽激动剂可以有利地由根据本发明的复合物包括。可选地,活化相同或不同TLR受体的大量不同的TLR肽激动剂可以分布至活化相同或不同TLR受体的不同TLR肽激动剂的子集,其由包括根据本发明的不同复合物包括,由此这样的包括不同子集的不同复合物可以有利地同时施用,例如在单一疫苗中,至需要其的对象。
组分a)、b)和c)在根据本发明的复合物中的连接
在根据本发明的复合物中,组分a)、b)和c)被共价连接,即根据本发明的复合物三种组分a)、b)和c)中的两种之间的连接是共价连接。优选地,根据本发明的复合物三种组分a)、b)和c)中的两种彼此共价连接(即“第一”和“第二”组分),并且三种组分a)、b)和c)中的第三组分被共价连接至三种组分a)、b)和c)中的第一组分或三种组分a)、b)和c)中的第二组分。从而,优选地形成线性分子。然而,还可以想得到的是三种组分a)、b)和c)中的每种被共价连接至三种组分a)、b)和c)中的两种其它组分。
如在本发明的上下文中使用的,“共价连接”(也是共价键)指的是涉及共享原子之间的电子对的化学键。“共价连接”(也是共价键)具体地涉及当原子共享电子时它们之间的吸引力和排斥力的稳定平衡。对于许多分子,电子的共享允许每个原子达到等价的完整外壳(full outer shell),其相当于稳定的电子构型。共价键合包括许多种类的相互作用,包括例如σ-键合、π-键合、金属与金属键合、抓氢相互作用(agostic interaction)、和三中心两电子键。因此,根据本发明的复合物还可以被称为“化合物”,具体地它可以被称为“分子”。
优选地,在根据本发明的复合物中,组分a)、b)和c)以本领域已知的任何合适的方式比如交联方法通过化学偶联被共价连接。然而,注意力被吸引到如下事实:许多已知的化学交联方法是非特异性的,即,它们不将偶联点引导至组分a)、b)和c)上的任何特定位点。因而,非特异性交联剂的使用可能攻击功能性位点或空间阻断活性位点,致使根据本发明的复合物的融合组分在生物学上失活。技术人员的知识提及通过使用适当的保护基团阻断潜在反应基团。可选地,可以采用强力的和通用的肟和腙接合技术的用途,其是可以应用于组分a)、b)和c)的交联的化学选择性实体。该连接技术例如由Rose et al.(1994),JACS116,30描述。
偶联特异性可以通过直接化学合偶联至在组分a)、b)和/或c)中仅发现一次或数次的官能团而增加,该官能团将被交联至组分a)、b)和c)中的另一种。作为实例,如果仅一个半胱氨酸残基存在于根据本发明的复合物的某一组分a)、b)或c)中,可以使用半胱氨酸硫醇基。同样,例如,如果某一组分a)、b)或c)不包含赖氨酸残基,特异于伯胺的交联试剂对各自组分的氨基端将是选择性的。可选地,交联还可以经由安置在肽的N-端处的谷氨酸残基的侧链实施,以便酰胺键可以通过其侧链生成。因此,将谷氨酸残基连接至某一组分a)、b)或c)的N-端可以是有利的。然而,如果半胱氨酸残基将被引入某一组分a)、b)或c),在其N-或C-端处或附近引入是优选的。通过将一种或多种额外的氨基酸——例如尤其是半胱氨酸残基——添加至易位序列或通过置换被包括在各自的组分中的易位序列(一种或多种)的至少一种残基,基于某一组分a)、b)或c)的修饰,常规方法对这样的氨基酸序列改变是可用的。假如半胱氨酸侧链被用于偶联目的,某一组分a)、b)或c)优选地具有一个半胱氨酸残基。任何第二个半胱氨酸残基应当优选地被避免,并且当它们在由根据本发明的复合物包括的各自的组分中出现时可以任选地被替换。当半胱氨酸残基在某一组分a)、b)或c)的原始序列中被替换时,通常期望最小化在各自的组分的肽折叠中产生的变化。当替代物在化学上和空间上类似于半胱氨酸时,折叠的变化被最小化。因此,丝氨酸作为半胱氨酸的替代物是优选的。
三种组分a)、b)和c)中的两种的偶联可以经由偶联剂或缀合剂(conjugatingagent)完成,包括标准的肽合成偶联试剂比如HOBt、HBTU、DICI、TBTU。存在可以利用的几种分子间交联剂,参见例如,Means and Feeney,Chemical Modification of Proteins,Holden-Day,1974,pp.39-43。在这些试剂之中,例如是,N-琥珀酰亚胺基3-(2-吡啶基二硫)丙酸酯(SPDP)或N,N'-(1,3-亚苯基)双马来酰亚胺;N,N'-乙烯-双-(碘乙酰胺)或具有6至11个碳的亚甲基桥的其它这样的试剂;和1,5-二氟-2,4-二硝基苯。对此目的有用的其它交联剂包括:p,p'-二氟-m,m'-二硝基二苯砜;二甲基己二酸二甲酯;苯酚-1,4-二磺酰氯;六亚甲基二异氰酸酯或二异硫氰酸酯、或苯偶氮基-对-二异氰酸酯;戊二醛和双重氮基联苯胺(disdiazobenzidine)。交联剂可以是同型双官能的,即,具有经历相同反应的两个官能团。优选的同型双官能交联剂是双马来酰亚胺基己烷(BMH)。BMH包含两个马来酰亚胺官能团,其与包含巯基的化合物在温和条件(pH 6.5-7.7)下特异性地反应。两个马来酰亚胺基团通过烃链相连。因此,BMH对包含半胱氨酸残基的蛋白质(或多肽)的不可逆的交联是有用的。交联剂也可以是异型双官能的。异型双官能交联剂具有两个不同的官能团,例如胺-反应基团和硫醇-反应基团,其将分别交联具有游离的胺和硫醇的两种蛋白质。异型双官能交联剂的实例是琥珀酰亚胺基-4-(N-马来酰亚胺基甲基)-环己烷-1-羧酸酯(SMCC)、间-马来酰亚胺基苯甲酰-N-羟基琥珀酰亚胺酯(MBS)、和琥珀酰亚胺4-(对-马来酰亚胺基苯基)丁酸酯(SMPB)——MBS的链延长类似物。这些交联剂的琥珀酰亚胺基与伯胺反应,并且硫醇-反应性马来酰亚胺与半胱氨酸残基的硫醇形成共价键。因为交联剂通常在水中具有低溶解度,亲水部分,比如磺酸基团,可以被添加至交联剂以改进其水溶性。硫代-MBS和硫代-SMCC是出于水溶性被改性的交联剂的实例。许多交联剂产生在细胞条件下大体上不可切割的缀合物。因此,一些交联剂包含共价键,比如二硫键,其在细胞条件下是可切割的。例如,Traut试剂二硫双(丙酸琥珀酰亚胺酯)(DSP)、和N-琥珀酰亚胺基3-(2-吡啶基二硫)丙酸酯(SPDP)是熟知的可切割的交联剂。可切割的交联剂的使用允许由根据本发明的复合物包括的细胞穿透肽、至少一种抗原或抗原表位和至少一种TLR肽激动剂在被递送入靶细胞后彼此分离。出于此目的,直接的二硫连接也可以是有用的。化学交联还可以包括使用间隔臂。间隔臂提供了分子间灵活性或调节缀合部分之间的分子间距离并且从而可以帮助保留生物学活性。间隔臂可以是蛋白质(或多肽)部分——其包括间隔氨基酸,例如脯氨酸——的形式。可选地,间隔臂可以是交联剂的一部分,比如在“长链SPDP”中(Pierce Chem.Co.,Rockford,Ill.,目录号21651H)。众多交联剂,包括上面讨论的交联剂,是商业上可获得的。它们的使用的详细说明容易从供应商获得。在由根据本发明的复合物包括的组分a)、b)和c)的连接的上下文中有用的关于蛋白质交联和缀合物制备的更详细的信息可以获得自:Wong,Chemistry of Protein Conjugation and Cross-Linking,CRC Press(1991)。
用于肽或蛋白质交联的交联剂包括例如(i)胺对胺交联剂,例如同型双官能胺特异性蛋白质交联试剂,其基于用于伯胺的选择性缀合的NHS-酯和亚氨酸酯反应基团;在短的、长的、可切割的、不可逆的、可透过膜的、和细胞表面的种类中可获得;(ii)巯基对碳水化合物交联剂,例如基于用于缀合和形成共价交联的马来酰亚胺和酰肼反应基团的交联试剂;(iii)巯基对巯基交联剂,例如同型双官能巯基特异性交联试剂,其基于用于选择性共价缀合蛋白质和肽硫醇(还原的半胱氨酸)以形成稳定的硫醚键的马来酰亚胺或吡啶基二硫醇反应基团;(iv)光敏交联剂,例如芳基叠氮化物、二吖丙啶(diazirine)、和其它光敏(光活化的)化学异型双官能交联试剂,其经由两步活化缀合受体-配体相互作用复合物中涉及的蛋白质、核酸和其它分子结构;(v)胺对巯基交联剂,例如用于蛋白质和其它分子的伯胺(赖氨酸)和巯基(半胱氨酸)基团之间的缀合的异型双官能蛋白质交联试剂;在不同长度和类型的间隔臂的情况下是可获得的;和(vi)胺对胺交联剂,例如羧基对胺交联剂,例如碳二亚胺交联试剂、DCC和EDC(EDAC)——其用于将羧基(谷氨酸、天冬氨酸,C-端)缀合至伯胺(赖氨酸,N-端),以及N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)——其用于稳定活化用于胺缀合的羧化物。
一般而言,可以在根据本发明的复合物中使用的交联剂的实例包括N-(α-马来酰亚胺基乙酰氧基)-琥珀酰亚胺酯、N-5-叠氮基-2-硝基苄氧基-琥珀酰亚胺、1,4-双-马来酰亚胺基丁烷、1,4-双-马来酰亚胺基(maleimmidyl)-2,3-二羟基-丁烷、双-马来酰亚胺基己烷、双-马来酰亚胺基乙烷、N-(β-马来酰亚胺基丙酸)酰肼*TFA、N-(β-马来酰亚胺基丙氧基)琥珀酰亚胺酯、1,8-双-马来酰亚胺基二乙二醇、1,11-双-马来酰亚胺基三乙二醇、双(磺基琥珀酰亚胺基)辛二酸酯、双(磺基琥珀酰亚胺基)戊二酸酯-d0、双(磺基琥珀酰亚胺基)2,2,4,4-戊二酸酯-d4、双(磺基琥珀酰亚胺基)辛二酸酯-d0、双(磺基琥珀酰亚胺基)2,2,7,7-辛二酸酯-d4、双(NHS)PEG5、双(NHS)PEG9、双(2-[琥珀酰亚胺氧羰基氧]乙基)砜、N,N-二环己基碳二亚胺、1-5-二氟-2,4-二硝基苯、二甲基己二酸二甲酯*2HCI、二甲基庚二亚氨酸酯*2HCI、二甲基辛二亚氨酸酯*2HCl、二琥珀酰亚胺基戊二酸酯、二硫双(丙酸琥珀酰亚胺酯)(Lomant试剂)、二琥珀酰亚胺基辛二酸酯、二琥珀酰亚胺基酒石酸酯、二甲基3,3'-二硫双丙酰亚氨酸酯(propionimidate)*2HCI、二硫双-马来酰亚胺基乙烷、3,3'-二硫双(丙酸磺基琥珀酰亚胺酯)、1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐、乙二醇双(琥珀酸琥珀酰亚胺酯)、N-ε-马来酰亚胺基己酸、N-(ε-马来酰亚胺基己酸)酰肼、N-(ε-马来酰亚胺基己酰基氧)琥珀酰亚胺酯、N-(γ-马来酰亚胺基丁酰基氧)琥珀酰亚胺酯、N-(κ-马来酰亚胺基十一酸)酰肼、NHS-LC-二吖丙啶、琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1-羧基-(6-酰氨基己酸酯、琥珀酰亚胺基6-(3'-[2-吡啶基二硫]丙酰氨基)己酸酯、L-光反应(Photo)-亮氨酸、L-光反应-甲硫氨酸、间-马来酰亚胺基苯甲酰-N-羟基琥珀酰亚胺酯、4-(4-N-马来酰亚胺基苯基)-丁酸酰肼*HCI、2-[N2-(4-叠氮基-2,3,5,6-四氟苯甲酰)-N6-(6-生物素酰氨基己酰基)-L-赖氨酰基]甲基硫代硫酸乙酯、2-{N2-[N6-(4-叠氮基-2,3,5,6-四氟苯甲酰)-N6-(6-生物素酰氨基己酰基)-L-赖氨酰基]}甲基硫代硫酸乙酯、N-羟基琥珀酰亚胺、N-羟基琥珀酰亚胺酯乙烷叠氮化物、N-羟基琥珀酰亚胺酯四氧杂十五烷(tetraoxapentadecane)叠氮化物、N-羟基琥珀酰亚胺酯十二氧杂三十九烷叠氮化物、NHS-膦、3-(2-吡啶基二硫)丙酰基酰肼、2-吡啶基二硫醇-四氧杂十四烷-N-羟基琥珀酰亚胺、2-吡啶基二硫醇-四氧杂十四烷三十八烷-N-羟基琥珀酰亚胺、N-(对-马来酰亚胺基苯基)异氰酸酯、琥珀酰亚胺基(succinimdyl)3-(溴乙酰氨基)丙酸酯、NHS-二吖丙啶、NHS-SS-二吖丙啶、N-琥珀酰亚胺基碘乙酸酯、N-琥珀酰亚胺基(4-碘乙酰基)氨基苯甲酸酯、琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基-甲基)环己烷-1-羧酸酯、NHS-PEG2-马来酰亚胺(maliemide)、NHS-PEG4-马来酰亚胺、NHS-PEG6-马来酰亚胺、NHS-PEG8-马来酰亚胺、NHS-PEG12-马来酰亚胺、NHS-PEG24-马来酰亚胺、琥珀酰亚胺基4-(对-马来酰亚胺基-苯基)丁酸酯、琥珀酰亚胺基-6-(β-马来酰亚胺基丙酰氨基)己酸酯、4-琥珀酰亚胺基氧羰基-甲基-α-(2-吡啶基二硫)甲苯、琥珀酰亚胺基-(4-补骨脂素-8-基氧)丁酸酯、N-琥珀酰亚胺基3-(2-吡啶基二硫)丙酸酯、乙二醇双(磺基-琥珀酰亚胺基琥珀酸酯)、N-(ε-马来酰亚胺基己酰基氧)磺基琥珀酰亚胺酯、N-(γ-马来酰亚胺基丁酰基氧)磺基琥珀酰亚胺酯、N-(κ-马来酰亚胺基十一酰基氧)磺基琥珀酰亚胺酯、磺基-NHS-LC-二吖丙啶、磺基琥珀酰亚胺基6-(3'-[2-吡啶基二硫]丙酰氨基)己酸酯、间-马来酰亚胺基苯甲酰-N-羟基磺基琥珀酰亚胺酯、N-羟基琥珀酰亚胺、磺基-NHS-膦、磺基琥珀酰亚胺基6-(4'-叠氮基-2'-硝基苯基氨基)己酸酯、磺基-NHS-(2-6-[生物素酰氨基]-2-(对-叠氮基苯甲酰氨基(bezamido))、磺基-NHS-二吖丙啶、磺基-NHS-SS-二吖丙啶、磺基琥珀酰亚胺基(4-碘-乙酰基)氨基苯甲酸酯、磺基琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1-羧酸酯、磺基琥珀酰亚胺基4-(对-马来酰亚胺基苯基)丁酸酯、三-(2-马来酰亚胺基乙基)胺(三官能的)、和三-(琥珀酰亚胺基(succimimidyl)氨基三乙酸酯(tricetate))(三官能的)。
根据本发明的复合物三种组分a)、b)和c)中的两种之间的连接可以是直接的或间接的,即两种组分直接地接合或它们可以通过复合物的另外的组分连接,例如间隔区或连接体。
如果待连接的组分具有反应性氨基或羰基,直接连接可以优选地通过酰胺桥实现。更具体地,如果待连接的组分是肽、多肽或蛋白质,肽键是优选的。这样的肽键可以使用涉及待连接的两种组分(一种组分的N-末端和另一种组分的C-末端)的化学合成形成,或可以经由两种组分的完整肽序列的蛋白质合成直接形成,其中两种(蛋白质或肽)组分优选地以一步合成。这样的蛋白质合成方法包括,例如,而不被限制于此,液相肽合成方法或固体肽合成方法,例如根据Merrifield的固体肽合成方法、t-Boc固相肽合成、Fmoc固相肽合成、基于BOP(苯并三唑-1-基-氧-三-(二甲基氨基)-磷六氟磷酸盐)的固相肽合成等。可选地,酯或醚连接是优选的。
而且,具体地,如果待连接的组分是肽、多肽或蛋白质,连接可以经由侧链发生,例如通过二硫桥。其它化学性质的进一步的组分,例如至少一种抗原或抗原表位——如果它不具有肽性质,可以被同样地附加至肽性质的组分,例如细胞穿透肽、至少一种TLR肽激动剂、和至少一种抗原或抗原表位——如果它具有肽性质。经由侧链的连接将优选地基于侧链氨基、硫醇基团或羟基,例如经由酰胺或酯或醚连接。另一种组分的肽主链与肽侧链的连接还可以经由异构肽键。异构肽键是不在蛋白质的主链上存在的酰胺键。键在一个肽或蛋白质的羧基端和另一个(靶)肽或蛋白质上赖氨酸残基的氨基之间形成。
根据本发明的复合物可以任选地包括间隔区或连接体,其是非免疫学部分,其优选地是可切割的,并且其连接组分a)与b)和/或组分a)与c)、和/或组分b)与c),和/或连接连续的抗原或抗原表位,和/或连接连续的TLR肽激动剂,和/或连接连续的细胞穿透肽,和/或其可以被安置在组分b)和/或c)的C-端部分处。除连接组分之外,连接体或间隔区可以优选地提供进一步的功能,并且优选地是可切割的,更优选地在靶细胞内天然地可切割的,例如通过酶促切割。然而,具体地,这样的进一步的功能不包括任何免疫学功能。进一步的功能的实例,具体地关于融合蛋白中的连接体,可以在Chen X.et al.,2013:Fusion ProteinLinkers:Property,Design and Functionality.Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357–1369中被发现,其中例如还公开了体内可切割的连接体。而且,Chen X.et al.,2013:FusionProtein Linkers:Property,Design and Functionality.Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357–1369还公开了多种连接体,例如柔性连接体和刚性连接体,和连接体设计工具和数据库,其在根据本发明的复合物中可以是有用的或用于设计在根据本发明的复合物中使用的连接体。
所述间隔区可以是肽的或非肽的,优选地间隔区是肽的。优选地,肽间隔区由大约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸,更优选地大约1、2、3、4或5个氨基酸组成。肽间隔区的氨基酸序列可以与组分a)、b)或c)中任一种的N-端或C-端侧翼区的氨基酸序列同一。可选地,肽间隔区可以由非天然氨基酸序列组成,比如由蛋白酶的已知切割位点的所述天然侧翼区或序列的保守氨基酸置换引起的氨基酸序列,所述蛋白酶的已知切割位点比如肠激酶靶位点(氨基酸序列:DDDK,SEQ ID NO:16)、因子Xa靶位点(氨基酸序列:IEDGR,SEQ ID NO:17)、凝血酶靶位点(氨基酸序列:LVPRGS,SEQ ID NO:18)、蛋白酶TEV靶位点(氨基酸序列:ENLYFQG,SEQ ID NO:19)、PreScission蛋白酶靶位点(氨基酸序列LEVLFQGP,SEQ ID NO:20)、聚阳离子氨基酸——例如聚K、弗林蛋白酶——靶位点(氨基酸序列RX(R/K)R,SEQ IDNO:21)。在具体的实施方式中,肽间隔区不包含任何Cys(C)残基。在优选的实施方式中,连接体序列包含至少20%,更优选地至少40%并且甚至更优选地至少50%Gly或β-丙氨酸残基,例如GlyGlyGlyGlyGly(SEQ ID NO:22)、GlyGlyGlyGly(SEQ ID NO:23)、GlyGlyGly、CysGlyGly或GlyGlyCys等。适当的连接体序列可以容易地选择并且由本领域技术人员制备。它们可以由D和/或L氨基酸构成。肽间隔区的进一步的实例包括氨基酸序列EQLE(SEQID NO:24)或TEWT(SEQ ID NO:25)或其任何保守置换。
非肽间隔区可以包括或可以是酯、硫酯和二硫化物。
具体地,根据本发明的复合物可以包括间隔区或连接体,具体地肽间隔区,其被安置在组分a)与b)之间和/或组分a)与c)之间、和/或组分b)与c)之间。该肽间隔区可以由本领域技术人员选择,使得一旦包括细胞穿透肽和货物分子的复合物已经被内化,它可以被细胞机器切割。
当复合物包括几种抗原或抗原表位时或当复合物包括几种TLR肽激动剂时,本领域技术人员将清楚本发明的复合物中包括的抗原或抗原表位中的每种和/或TLR肽激动剂中的每种可以彼此直接连接或经由间隔区或连接体——比如,例如,由几个氨基酸组成的肽间隔区——被连接。可选地,当根据本发明的复合物包括几种抗原或抗原表位时或当复合物包括几种TLR肽激动剂时,也可能的是由本发明的复合物包括的一些抗原或抗原表位和/或一些TLR肽激动剂彼此直接连接,并且一些其它抗原或抗原表位和/或一些其它TLR肽激动剂经由间隔区或连接体——比如由几个氨基酸组成的肽间隔区——被连接。
例如,本发明的复合物中包括的两个连续的抗原或抗原表位或两个连续的TLR肽激动剂通过间隔区——其分别由所述抗原或抗原表位或所述TLR肽激动剂的天然侧翼区组成——彼此连接。例如,用于将第一抗原/抗原表位或第一TLR肽激动剂分别连接至第二抗原/抗原表位或第二TLR肽激动剂的间隔区可以由多至大约8个氨基酸组成,其对应于第一抗原/抗原表位或第一TLR肽激动剂的N-端或C-端侧翼区的多至大约4个氨基酸,接着是第二抗原/抗原表位或第二TLR肽激动剂的N-端或C-端侧翼区的多至大约4个氨基酸。在本发明的说明中,用于将第一抗原/抗原表位或第一TLR肽激动剂(“抗原/表位/TLR肽激动剂1”)连接至第二表位(“抗原/表位/TLR肽激动剂2”)的间隔区由大约8个氨基酸组成,其对应于如下范围内的任何可能的组合:抗原/表位/TLR肽激动剂1的0个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的8个侧翼氨基酸,至抗原/表位/TLR肽激动剂1的8个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的0个侧翼氨基酸,即包括抗原/表位/TLR肽激动剂1的1个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的7个侧翼氨基酸、抗原/表位/TLR肽激动剂1的2个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的6个侧翼氨基酸、抗原/表位/TLR肽激动剂1的3个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的5个侧翼氨基酸、抗原/表位/TLR肽激动剂1的4个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的4个侧翼氨基酸、抗原/表位/TLR肽激动剂1的5个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的3个侧翼氨基酸、抗原/表位/TLR肽激动剂1的6个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的2个侧翼氨基酸、抗原/表位/TLR肽激动剂1的7个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的1个侧翼氨基酸、抗原/表位/TLR肽激动剂1的8个侧翼氨基酸和抗原/表位/TLR肽激动剂2的0个侧翼氨基酸。要理解总计8个氨基酸——其组成连接两个连续的抗原/表位/TLR肽激动剂的间隔区——不是绝对值并且间隔区还可以由总计例如3个氨基酸、4个氨基酸、5个氨基酸、6个氨基酸、7个氨基酸、9个氨基酸或10个氨基酸构成。类似地,在间隔区具有少于或多于8个氨基酸的情况下,如上面提及的等价组合也是本发明的说明。
在本发明的另一个具体的说明中,用于将第一抗原/抗原表位或第一TLR肽激动剂(“抗原/表位/TLR肽激动剂1”)分别连接至第二抗原/抗原表位或第二TLR肽激动剂(“抗原/表位/TLR肽激动剂2”)的间隔区由例如1、2、3、4或5个氨基酸组成。更具体地,所述间隔区的氨基酸序列可以对应于抗原/表位/TLR肽激动剂1或抗原/表位/TLR肽激动剂2的N-端或C-端侧翼区的4个氨基酸。如上面描述的间隔区还可以被安置在根据本发明的复合物中包括的最后一个抗原/表位/TLR肽激动剂的C-端部分处。
用于连接三种组分a)、b)和c)中的两种的技术在文献中良好地记录并且可以取决于至少一种抗原或抗原表位的性质。例如,三种组分a)、b)和c)中的两种之间的连接可以经由可切割的二硫化物连接通过总体逐步固相合成或液相或固相片段偶联,稳定的酰胺、噻唑烷、肟和肼连接,二硫化物连接,稳定的硫代马来酰亚胺连接,肽键(包括融合蛋白的氨基酸之间的肽键),或静电或疏水相互作用实现。
优选地,由根据本发明的复合物包括的至少一种抗原或抗原表位以及由根据本发明的复合物包括的任何任选的间隔区或连接体具有肽性质。更优选地,根据本发明的复合物的所有组分,例如细胞穿透肽,至少一种抗原或抗原表位——其是肽、多肽或蛋白质,至少一种TLR肽激动剂和任何任选的肽连接体或间隔区在根据本发明的复合物中通过肽键被连接。最优选地,根据本发明的复合物因而是肽、多肽或蛋白质,比如融合蛋白,例如重组融合蛋白。
在该上下文中,包括或由根据SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQID NO:41、SEQ ID NO:46或SEQ ID NO:69的氨基酸序列组成的复合物或包括或由与SEQ IDNO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:37、SEQ IDNO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46或SEQ ID NO:69中任一种共享至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少98%序列同一性的氨基酸序列组成的复合物是优选的;包括或由根据SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ IDNO:41或SEQ ID NO:69的氨基酸序列组成的复合物或包括或由与SEQ ID NO:27、SEQ IDNO:28、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41或SEQID NO:69中任一种共享至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%or至少98%序列同一性的氨基酸序列组成的复合物是更优选的;包括或由根据SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41或SEQID NO:69的氨基酸序列组成的复合物或包括或由与SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:37、SEQ IDNO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41或SEQ ID NO:69中任一种共享至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少98%序列同一性的氨基酸序列组成的复合物是甚至更优选的;并且包括或由根据SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41或SEQ ID NO:69的氨基酸序列组成的复合物或包括或由与SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41或SEQ ID NO:69中任一种共享至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少98%序列同一性的氨基酸序列组成的复合物是特别优选的。
SEQ ID NO:26:
SEQ ID NO:27:
SEQ ID NO:28:
SEQ ID NO:33:
SEQ ID NO:34:
SEQ ID NO:37:
SEQ ID NO:38:
SEQ ID NO:39:
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKVTYHSPSYAYHQFERRAILNRLVQFIKDRISVVQALVLTSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTN FDAE
SEQ ID NO:40:
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKNYRIATFKNWPFLEDCAMEELTVSEFLKLDRQRSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
SEQ ID NO:41:
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKHLELASMTNMELMSSIVSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
SEQ ID NO:46:
RKKRRQRRRRVKRISQAVHAAHAEINEAGRRVKRKVPRNQDWLRVKRASFEAQGALANIAVDKARVKRSIINFEKLRVKRSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
SEQ ID NO:69:
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKLFRAAQLANDVVLQIMEHLELASMTNMELMSSIVVISASIIVFNLLELEGSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
组分a)、b)和c)在根据本发明的复合物中的布置
组分a)、b)和c)可以以任何方式布置在根据本发明的复合物中。
具体地,如果多于一种细胞穿透肽和/或多于一种抗原或抗原表位和/或多于一种TLR肽激动剂由根据本发明的复合物包括,则多于一种细胞穿透肽可以以非连续方式定位,即至少一种抗原或抗原表位(组分b))和/或至少一种TLR肽激动剂(组分c))可以中断一段连续定位的细胞穿透肽和/或细胞穿透肽可以以交替方式与组分b)和/或与组分c)定位。类似地,多于一种抗原或抗原表位可以以非连续方式定位,即至少一种细胞穿透肽(组分a))和/或至少一种TLR肽激动剂(组分c))可以中断一段连续定位的抗原或抗原表位和/或抗原或抗原表位可以以交替方式与组分a)和/或与组分c)定位。类似地,多于一种TLR肽激动剂可以以非连续方式定位,即至少一种细胞穿透肽(组分a))和/或至少一种抗原或抗原表位(组分b))可以中断一段连续定位的TLR肽激动剂和/或TLR肽激动剂可以以交替方式与组分a)和/或与组分b)定位。
然而,优选的是多于一种细胞穿透肽以连续方式在根据本发明的复合物中定位和/或多于一种抗原或抗原表位以连续方式在根据本发明的复合物中定位和/或多于一种TLR肽激动剂以连续方式在根据本发明的复合物中定位。具体地,这意思是由复合物包括的某一组分的所有单个单元,即所有细胞穿透肽、所有抗原或抗原表位或所有TLR肽激动剂,以一段定位,其不被其它两种组分中的任一种中断。而是,其它两种组分在复合物中定位,例如在这样的一段所述某一组分的所有单个单元之前或之后。然而,以这样的方式连续定位的所述某一组分的单个单元可以彼此连接,例如通过如本文描述的间隔区或连接体,其不是其它两种组分。
特别优选的是组分a)、b)和c)中的每种以连续方式定位。
在结构上,每种组分a)、b)和c)通常包括单个主链和至少一个侧链。如在本发明的上下文中使用的,术语“主链”(也是“骨架链”)指的是分子中共价键原子的主要的连续的链。例如,在肽、多肽和蛋白质中,主链(骨架)通常包括通过肽键连接的组成氨基酸的α-碳原子和氮原子。骨架不包括侧链。如在本发明的上下文中使用的,术语“侧链”(也是“悬垂链(pendant chain)”)指的是附加至被称为“主链”或骨架的分子的核心部分的化学基团。例如,在肽、多肽和蛋白质中,侧链通常代表附加至骨架的α-碳原子的组成氨基酸的(主要)部分。
在根据本发明的复合物中,组分a)、b)和c)可以经由如本文描述的连接体或间隔区共价连接或它们可以被直接共价连接。独立于间隔区或连接体是否被用于共价连接,原则上存在三种组分中的两种如何在根据本发明的复合物中彼此连接的四个选项,即:
(i)经由主链/主链连接、
(ii)经由主链/侧链连接、
(iii)经由侧链/主链连接或
(iv)经由侧链/侧链连接。
优选地,所有三种组分a)、b)和c)经由主链/主链连接被连接,因而具体地导致根据本发明的复合物的主链包括一种或多种细胞穿透肽的主链、一种或多种抗原或抗原表位的主链、和一种或多种TLR肽激动剂的主链。换句话说,一种或多种细胞穿透肽的主链、一种或多种抗原或抗原表位的主链、和一种或多种TLR肽激动剂的主链任选地连同进一步的组分,例如连接体(一个或多个)、间隔区(一个或多个)等组成根据本发明的复合物的主链。因此,组分a)、b)和c)的下列布置是优选的,具体地如果至少一种抗原或抗原表位是肽、多肽或蛋白质,由此所述优选的布置以复合物的主链的N-端→C-端方向在下面显示,并且其中所有三种组分a)、b)和c)经由主链/主链连接被连接,并且可以任选地通过连接体、间隔区或其它额外的组分连接:
(α)组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–组分c)(至少一种TLR肽激动剂);
(β)组分c)(至少一种TLR肽激动剂)–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位);
(γ)组分a)(细胞穿透肽)–组分c)(至少一种TLR肽激动剂)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位);
(δ)组分c)(至少一种TLR肽激动剂)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–组分a)(细胞穿透肽);
(ε)组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–组分a)(细胞穿透肽)–组分c)(至少一种TLR肽激动剂);或
(ζ)组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–组分c)(至少一种TLR肽激动剂)–组分a)(细胞穿透肽)。
具体地,如果所有三种组分a)、b)和c)经由主链/主链连接被连接,优选的是至少一种抗原或抗原表位在细胞穿透肽的C-端定位,由此细胞穿透肽和至少一种抗原或抗原表位任选地通过进一步的组分——例如连接体、间隔区——或通过至少一种TLR肽激动剂连接。因此,这对应于来自上面显示的布置的布置(α)、(β)和(γ),即从上面的布置,布置(α)、(β)和(γ)是更优选的。
甚至更优选地,至少一种抗原或抗原表位在细胞穿透肽的C-端定位,由此细胞穿透肽和至少一种抗原或抗原表位任选地通过进一步的组分——例如连接体、间隔区——但是不通过至少一种TLR肽激动剂连接。因此,这对应于来自上面显示的布置的布置(α)和(β),即从上面的布置,布置(α)和(β)是甚至更优选的。特别优选地,根据本发明的复合物是重组多肽或重组蛋白,并且组分a)至c)以如下顺序以所述复合物的主链的N-端→C-端方向定位:
(α)组分a)–组分b)–组分c);或
(β)组分c)–组分a)–组分b),
其中组分可以通过进一步的组分连接,具体地通过连接体或间隔区。
特别优选的是布置(α),其中至少一种TLR激动剂包括或由至少一种TLR2激动剂组成,例如:
(α1)组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂;
(α2)组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂,一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂和一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂;
(α3)组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂和一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂;或
(α4)组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂和一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂。
可选地,在这样的包括TLR2肽激动剂的布置中,额外的TLR肽激动剂还可以被布置在复合物中的其它位置处,例如:
(α5)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂;
(α6)一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂;或
(α7)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂和一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂。
特别优选的是布置(β),其中至少一种TLR激动剂包括或由至少一种TLR4激动剂组成,例如:
(β1)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位);
(β2)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂,一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂和一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位);
(β3)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂和一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位);或
(β4)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂和一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)。
可选地,在这样的包括TLR4肽激动剂的布置中,额外的TLR肽激动剂还可以被布置在复合物中的其它位置处,例如:
(β5)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂;
(β6)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂;或
(β7)一种或多种TLR4肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR4肽激动剂–组分a)(细胞穿透肽)–组分b)(至少一种抗原或抗原表位)–一种或多种TLR2肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR2肽激动剂和一种或多种TLR5肽激动剂,例如1、2、3、4或5种TLR5肽激动剂。
可选地,三种组分a)、b)和c)中的仅仅两种在根据本发明的复合物中经由主链/主链连接被连接。
例如组分a)和b)经由主链/主链连接被连接,因而导致复合物中组分a)和b)的下列布置,其以复合物的主链的N-端→C-端方向显示,由此组分a)和b)可以任选地通过进一步的组分——例如连接体、间隔区等——连接:
(1)细胞穿透肽(a)–抗原/抗原表位(b);或
(2)抗原/抗原表位(b)–细胞穿透肽(a)。
在这样的情况下,组分c),即至少一种TLR肽激动剂,可以然后经由主链/侧链连接,经由侧链/主链连接或经由侧链/侧链连接被布置至细胞穿透肽(a)或抗原/抗原表位(b)或——如果存在的话——另外的组分如间隔区或连接体,其可以例如在细胞穿透肽(a)和抗原/抗原表位(b)之间定位。这包括下列布置:
(i)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至组分a),即至少一种TLR肽激动剂的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至细胞穿透肽的侧链;
(ii)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至组分a),即至少一种TLR肽激动剂的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至细胞穿透肽的主链;
(iii)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至组分a),即至少一种TLR肽激动剂的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至细胞穿透肽的侧链;
(iv)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至组分b),即至少一种TLR肽激动剂的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种抗原或抗原表位的侧链;
(v)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至组分b),即至少一种TLR肽激动剂的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种抗原或抗原表位的主链;
(vi)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至组分b),即至少一种TLR肽激动剂的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种抗原或抗原表位的侧链;
(vii)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至在组分a)和组分b)之间定位的连接体或间隔区,即至少一种TLR肽激动剂的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分a)和组分b)之间定位的连接体或间隔区的侧链;
(viii)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至在组分a)和组分b)之间定位的连接体或间隔区,即至少一种TLR肽激动剂的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分a)和组分b)之间定位的连接体或间隔区的主链;或
(xi)组分c)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至在组分a)和组分b)之间定位的连接体或间隔区,即至少一种TLR肽激动剂的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分a)和组分b)之间定位的连接体或间隔区的侧链。
例如组分b)和c)经由主链/主链连接被连接,因而导致复合物中组分b)和c)的下列布置,其以复合物的主链的N-端→C-端方向显示,由此组分b)和c)可以任选地通过进一步的组分——例如连接体、间隔区等——连接:
(3)抗原/抗原表位(b)–TLR肽激动剂(c);或
(4)TLR肽激动剂(c)–抗原/抗原表位(b)。
在这样的情况下,组分a),即细胞穿透肽,可以然后经由主链/侧链连接,经由侧链/主链连接或经由侧链/侧链连接被布置至抗原/抗原表位(b)或TLR肽激动剂(c)或——如果存在的话——另外的组分如间隔区或连接体,其可以例如在抗原/抗原表位(b)和TLR肽激动剂(c)之间定位。这包括下列布置:
(x)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至组分b),即细胞穿透肽的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种抗原或抗原表位的侧链;
(xi)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至组分b),即细胞穿透肽的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种抗原或抗原表位的主链;
(xii)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至组分b),即细胞穿透肽的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种抗原或抗原表位的侧链;
(xiii)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至组分c),即细胞穿透肽的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种TLR肽激动剂的侧链;
(xiv)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至组分c),即细胞穿透肽的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种TLR肽激动剂的主链;
(xv)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至组分c),即细胞穿透肽的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种TLR肽激动剂的侧链;
(xvi)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至在组分b)和组分c)之间定位的连接体或间隔区,即细胞穿透肽的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分b)和组分c)之间定位的连接体或间隔区的侧链;
(xvii)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至在组分b)和组分c)之间定位的连接体或间隔区,即细胞穿透肽的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分b)和组分c)之间定位的连接体或间隔区的主链;或
(xviii)组分a)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至在组分b)和组分c)之间定位的连接体或间隔区,即细胞穿透肽的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分b)和组分c)之间定位的连接体或间隔区的侧链。
例如组分a)和c)经由主链/主链连接被连接,因而导致复合物中组分a)和b)的下列布置,其以复合物的主链的N-端→C-端方向显示,由此组分a)和c)可以任选地通过进一步的组分——例如连接体、间隔区等——连接:
(5)细胞穿透肽(a)–TLR肽激动剂(c);或
(6)TLR肽激动剂(c)–细胞穿透肽(a)。
在这样的情况下,组分b),即至少一种抗原或抗原表位,可以然后经由主链/侧链连接,经由侧链/主链连接或经由侧链/侧链连接被布置至细胞穿透肽(a)或TLR肽激动剂(c)或——如果存在的话——另外的组分如间隔区或连接体,其可以例如在细胞穿透肽(a)和TLR肽激动剂(c)之间定位。这包括下列布置:
(xix)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至组分a),即至少一种抗原或抗原表位的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至细胞穿透肽的侧链;
(xx)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至组分a),即至少一种抗原或抗原表位的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至细胞穿透肽的主链;
(xxi)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至组分a),即至少一种抗原或抗原表位的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至细胞穿透肽的侧链;
(xxii)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至组分c),即至少一种抗原或抗原表位的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种TLR肽激动剂的侧链;
(xxiii)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至组分c),即至少一种抗原或抗原表位的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种TLR肽激动剂的主链;
(xxiv)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至组分c),即至少一种抗原或抗原表位的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至至少一种TLR肽激动剂的侧链;
(xxv)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由主链/侧链连接至在组分a)和组分c)之间定位的连接体或间隔区,即至少一种抗原或抗原表位的主链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分a)和组分c)之间定位的连接体或间隔区的侧链;
(xxvi)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/主链连接至在组分a)和组分c)之间定位的连接体或间隔区,即至少一种抗原或抗原表位的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分a)和组分c)之间定位的连接体或间隔区的主链;或
(xxvii)组分b)可以被连接–任选地经由间隔区或连接体–经由侧链/侧链连接至在组分a)和组分c)之间定位的连接体或间隔区,即至少一种抗原或抗原表位的侧链被共价连接–任选地经由间隔区或连接体–至在组分a)和组分c)之间定位的连接体或间隔区的侧链。
可选地,可以想到的是在根据本发明的复合物中,所有三种组分a)、b)和c)经由主链/侧链连接,经由侧链/主链连接或经由侧链/侧链连接被布置,任选地通过额外的组分——例如间隔区或连接体——被连接。
编码根据本发明的肽和蛋白质复合物的核酸
在另一方面,本发明提供了编码根据本发明的复合物的核酸,其中复合物是多肽或蛋白质。具体地,本发明提供了编码如上面限定的根据本发明的复合物的多核苷酸。
在该上下文中,核酸优选地包括单链、双链或部分双链核酸,优选地选自基因组DNA、cDNA、RNA、siRNA、反义DNA、反义RNA、核酶、具有或不具有表达元件的互补RNA/DNA序列、小基因、基因片段、调控元件、启动子、和其组合。
优选地,本发明涉及编码复合物的核酸,复合物具体地是多肽或蛋白质,所述复合物包括细胞穿透肽,至少一种抗原或抗原表位——其是多肽或蛋白质,和至少一种TLR肽激动剂,其中细胞穿透肽、至少一种抗原或抗原表位、和至少一种TLR肽激动剂被共价连接,任选地使用如本文描述的肽间隔区(一个或多个)或连接体(一个或多个)。如果多于一种抗原或抗原表位——其是多肽或蛋白质——由所述复合物包括,则多于一种抗原或抗原表位也被共价连接,任选地使用如本文描述的肽间隔区(一个或多个)或连接体(一个或多个)。类似地,如果多于一种TLR肽激动剂由所述复合物包括,则多于一种TLR肽激动剂也被共价连接,任选地使用如本文描述的肽间隔区(一个或多个)或连接体(一个或多个)。
特别优选地,根据本发明的核酸编码为(重组)融合蛋白的复合物,其包括(a)如上面描述的细胞穿透肽,(b)至少一种、优选地至少两种、更优选地至少三种、甚至更优选地至少四种、特别优选地至少五种、最优选地至少六种如上面描述的抗原或抗原表位,其优选地以上面描述的连续方式布置,和(c)如上面描述的至少一种TLR激动剂。
根据本发明的细胞穿透肽和复合物的产生和纯化
根据进一步的方面,本发明提供了载体,具体地重组载体,其包括如上面描述的根据本发明的核酸。
如在本发明的上下文中使用的,术语“载体”指的是核酸分子,优选地人工核酸分子,即不天然存在的核酸分子。在本发明的上下文中,载体适于并入或携带期望的核酸序列。这样的载体可以是储存载体、表达载体、克隆载体、转移载体等。储存载体是允许核酸分子的便利储存的载体。因而,载体可以包括例如对应于根据本发明的期望的抗体或其抗体片段的序列。表达载体可以用于产生表达产物比如RNA,例如mRNA、或肽、多肽或蛋白质。例如,表达载体可以包括转录载体的序列段必需的序列,比如启动子序列。克隆载体通常是包含克隆位点——其可以用于将核酸序列并入载体——的载体。克隆载体可以是,例如,质粒载体或噬菌体载体。转移载体可以是适于将核酸分子转移入细胞或生物体的载体,例如,病毒载体。在本发明的上下文中,载体可以是,例如,RNA载体或DNA载体。优选地,载体是DNA分子。例如,本申请的意义上的载体包括克隆位点,选择标志物,比如抗生素抗性因子,和适于增殖载体的序列,比如复制起点。优选地,本申请的上下文中的载体是质粒载体。优选地,本申请的上下文中的载体是表达载体。
转化有根据本发明的载体的细胞也被包括在本发明的范围内。这样的细胞的实例包括但不限于细菌细胞,例如大肠杆菌,和真核细胞,例如,酵母细胞、动物细胞或植物细胞。在一个实施方式中,细胞是哺乳动物,例如,人、CHO、HEK293T、PER.C6、NS0、黑素瘤或杂交瘤细胞。因此,本发明还涉及表达根据本发明的抗体或其抗原结合片段;或包括根据本发明载体的细胞。
具体地,细胞可以转染有根据本发明的载体,优选地表达载体。术语“转染”指的是将核酸分子比如DNA或RNA(例如mRNA)分子导入细胞,优选地导入真核细胞。在本发明的上下文中,术语“转染”涵盖技术人员已知用于将核酸分子导入细胞的任何方法,优选地导入真核细胞,比如导入哺乳动物细胞。这样的方法涵盖,例如,电穿孔,脂转染,例如基于阳离子脂质和/或脂质体,磷酸钙沉淀,基于纳米颗粒的转染,基于病毒的转染,或基于阳离子聚合物比如DEAE-葡聚糖或聚乙烯亚胺的转染等。优选地,导入是非病毒性的。
可以使用众多表达系统,其非限制性地包括染色体、附加体和衍生的病毒。更具体地,根据本发明的载体,具体地使用的重组载体,可以源自细菌质粒,转座子,酵母附加体,插入元件,酵母染色体元件,病毒比如杆状病毒、乳头瘤病毒比如SV40、牛痘病毒、腺病毒、狐狸痘病毒、伪狂犬病毒、逆转录病毒。
例如,这样的载体,具体地重组载体,可以同样地是粘粒或噬粒衍生物。核苷酸序列,具体地根据本发明的核酸,可以通过本领域技术人员熟知的方法插入重组表达载体中,所述方法比如,例如,在MOLECULAR CLONING:A LABORATORY MANUAL,Sambrook et al.,4thEd.,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,2001中描述的那些。
载体,具体地重组载体,还可以包括控制——具体地根据本发明的核酸的——表达调控的核苷酸序列,以及允许——具体地根据本发明的核酸的——表达、转录和翻译的核苷酸序列。通常,根据使用的宿主细胞选择这些序列。
因而,例如,适当的分泌信号可以被整合在根据本发明的载体中,具体地重组载体中,使得由根据本发明的核酸编码的多肽或蛋白质将例如朝向内质网的腔,朝向壁膜间隙,在膜上或朝向细胞外环境被定向。适当的分泌信号的选择可以促进随后的蛋白质纯化。
在又另一个方面,本发明提供了包括根据本发明的载体——具体地重组载体——的宿主细胞。
可以根据本领域技术人员熟知的方法实施将根据本发明的载体——具体地重组载体——导入宿主细胞,比如在BASIC METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY,Davis et al.,2nd ed.,McGraw-Hill Professional Publishing,1995和MOLECULAR CLONING:ALABORATORY MANUAL(同上)中描述的那些,例如,其包括如上面描述的转染,例如通过磷酸钙,通过DEAE葡聚糖,或通过阳离子脂质;显微注射、电穿孔、转导或感染。
宿主细胞可以是,例如,细菌细胞比如大肠杆菌,真菌的细胞比如酵母细胞和曲霉、链霉的细胞,昆虫细胞,和/或任何细胞系,例如中国仓鼠卵巢细胞(CHO)、C127小鼠细胞系、叙利亚仓鼠细胞的BHK细胞系、人胚胎肾293(HEK 293)细胞。优选地,根据本发明的宿主细胞是哺乳动物,例如,人、CHO、HEK293T、PER.C6、NS0、骨髓瘤或杂交瘤细胞。树突细胞和树突细胞系作为宿主细胞是特别优选的。通常,培养基的选择具体地取决于细胞类型和/或细胞系的选择,由此技术人员知道合适的培养基,其适于选择的细胞类型和/或细胞系。
在根据本发明的载体和/或核酸的基础上,宿主细胞可以被,例如,用于表达多肽或蛋白质,具体地根据本发明的复合物。在通过标准方法纯化后,表达的多肽或蛋白质,具体地根据本发明的复合物,可以用于如下文描述的方法。
因此,本发明还提供了用于制备根据本发明的复合物的方法,具体地,其中复合物是多肽或蛋白质。所述方法包括如下的步骤:
(i)在培养基中培养如上面描述的宿主细胞;和
(ii)从培养基分离根据本发明的复合物或在宿主细胞溶胞后从宿主细胞溶胞产物分离根据本发明的复合物。
因而,通过根据本发明的这样的方法获得的复合物优选地是如本文描述的根据本发明的复合物。
对于蛋白质提取,可以使用商购的试剂盒和/或试剂,例如来自Novagen的BugBusterTM
优选地,用于制备如上面描述的根据本发明的复合物的方法进一步包括下列步骤:
(iii)溶解根据本发明的复合物,例如通过重悬在包含尿素或盐酸胍(GuHCl)的溶液中,
其中步骤(iii)接着如上面描述的步骤(ii)。
而且,优选的是用于制备如上面描述的根据本发明的复合物的方法进一步包括下列步骤:
(iv)纯化根据本发明的复合物,优选地通过一步亲和色谱,
其中步骤(iv)接着如上面描述的步骤(ii)或——如果存在的话——步骤(iii)。
此外,根据本发明的复合物还可以通过合成化学方法,例如通过固相肽合成制备。
那些肽或蛋白质的纯化可以借助本领域已知用于蛋白质/肽纯化的任何技术实施。示例性技术包括离子交换色谱、疏水相互作用色谱、和免疫亲和方法。
因而,本发明还提供了用于制备根据本发明的复合物的方法,其包括如下的步骤:
(i)化学地合成所述复合物;和
(ii)纯化所述复合物。
优选地,在用于制备根据本发明的复合物的方法中,在步骤(i)中化学合成的和在步骤(ii)中纯化的复合物包括细胞穿透肽的如本文描述的氨基酸序列,TLR肽激动剂的如本文描述的氨基酸序列,和任选地——如果至少一种抗原和/或抗原表位是肽或蛋白质——抗原或抗原表位的如本文描述的氨基酸序列。
可选地,本发明还提供了用于制备根据本发明的复合物的方法,其中
(i)细胞穿透肽、至少一种抗原或抗原片段和/或至少一种TLR肽激动剂被单独地合成;
(i)任选地,细胞穿透肽、至少一种抗原或抗原片段和/或至少一种TLR肽激动剂被纯化;和
(i)细胞穿透肽、至少一种抗原或抗原片段和/或至少一种TLR肽激动剂如上面描述被共价连接,任选地通过间隔区或连接体或通过如上面描述的交联剂。
负载有根据本发明的复合物的细胞
在又另一方面,本发明涉及负载有根据本发明的复合物的细胞。例如,负载有根据本发明的复合物的细胞是来自待治疗的对象的细胞,具体地来自待治疗的对象的分离的细胞,即从待治疗的对象分离的细胞。
如在本发明的上下文中使用的,术语“对象”具体地指的是哺乳动物。例如,本发明预期的哺乳动物包括人、灵长类、家养动物比如牛、羊、猪、马、实验室啮齿动物等。更优选地,术语“对象”指的是人对象。
如在本发明的上下文中使用的,“治疗(treatment)”和“治疗(treating)”等一般意思是获得期望的药理学和生理学效果。效果在防止或部分地防止疾病、其症状或病况的方面可以是预防性的和/或在部分或完全治愈疾病、归因于疾病的病况、症状或副作用的方面可以是治疗性的。如本文使用的术语“治疗”覆盖哺乳动物——具体地人——中的疾病的任何治疗并且包括:(a)预防疾病在如下对象中发生:其可能易患该疾病但是该疾病的发作还没有发生和/或疾病在该对象中还没有被诊断,例如预防性早期无症状干预;(b)抑制疾病,即,停滞或减慢其发展;或(c)减轻疾病,即,引起疾病和/或其症状或病况中的至少一种的至少部分消退比如改善或补救损害。具体地,根据本发明的方法、用途、制剂和组合物在治疗癌症或传染性疾病中和/或在预防癌症在患有早期癌症的对象中演化为晚期或转移阶段中是有用的,从而改善癌症的分期。当应用于癌症时,预防疾病或障碍包括预防癌症在个体——其被鉴定为在发展所述癌症的风险下,例如由于所述癌症在个体的亲属圈子中曾经发生——中的出现或发展,和预防促进肿瘤的病原体的感染,比如,例如,爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)、人乳头瘤病毒(HPV)、乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)、8型人疱疹病毒(HHV8)、1型人T-细胞白血病病毒(HTLV-1)、梅克尔细胞多瘤病毒(MCV)和幽门螺杆菌。术语“预防/治疗”癌症还覆盖了稳定或延迟个体中已经诊断的癌症。“稳定”的意思是在患有早期癌症的对象中防止癌症演化为晚期或转移阶段。
优选地,负载有根据本发明的复合物的细胞是抗原呈递细胞(APC)。优选地,抗原呈递细胞选自树突细胞(DC)、巨噬细胞和B-细胞。树突细胞,具体地从待治疗的对象分离的树突细胞(常规的和/或浆细胞样的),是更优选的。
从对象分离抗原呈递细胞——具体地树突细胞——的方法是技术人员已知的。它们包括从骨髓、脐带血或外周血采集单核细胞或造血干细胞。它们还包括使用胚胎干(ES)细胞和诱导多能干细胞(iPS)。抗原呈递细胞,具体地树突细胞或它们的前体,可以通过如下方法被富集:其包括淘析和基于磁珠的分离,其可以涉及富集CD14+前体细胞。
将根据本发明的复合物负载入细胞——优选地上面提及的抗原呈递细胞,更优选地树突细胞——并且在给对象施用前进一步制备这样的细胞的方法是本领域技术人员已知的。例如,制备树突细胞可以包括使用细胞因子——其可以包括例如GM-CSF和IL-4——的它们的培养或分化。树突细胞系还可以被采用。将本发明的复合物负载入细胞,优选地APC,更优选地树突细胞,可以包含在培养物中共培育本发明的复合物与细胞,其利用由根据本发明的复合物包括的细胞穿透肽的固有性质(即其内化能力)。因而被负载以诱导高效成熟的细胞——例如树突细胞——的进一步的培养可以包括添加细胞因子,其包括IL-1β,IL-6,TNFα,PGE2,IFNα,和佐剂——其可以包括聚-IC、聚-ICLC(即羧甲基纤维素、聚肌苷酸-聚胞苷酸和聚-L-赖氨酸双链RNA的合成复合物),和进一步的TLR激动剂和NLR(核苷酸-结合寡聚化结构域样受体)激动剂。
根据进一步的方面,本发明还涉及使用于细胞疗法的细胞成像,比如干细胞,树突细胞,T细胞或自然杀伤细胞,其中细胞负载有根据本发明的复合物,其可以进一步包括显像剂。
本发明还提供了用于制备负载有如上面描述的根据本发明的复合物的细胞——具体地抗原呈递细胞——的方法,所述方法包括如下的步骤:
(i)使用本发明的复合物转导或转染所述细胞;
(ii)在培养基中培养所述细胞;和
(iii)从培养基分离所述细胞。
优选地,细胞负载有根据本发明的复合物,其中复合物是多肽或蛋白质。
优选地,在MHC I类背景和/或在MHC II类背景下,负载有根据本发明的复合物(一种或多种)的细胞在细胞表面处呈递由所述复合物包括的至少一种抗原或抗原表位。
根据本发明的组合物和药盒(kits)
根据另一方面,本发明提供了组合物,其包括选自如下的至少一种组分:
(i)如上面描述的根据本发明的复合物,
(ii)如上面描述的根据本发明的核酸,
(iii)如上面描述的根据本发明的载体,
(iv)如上面描述的根据本发明的宿主细胞,和
(v)负载有如上面描述的根据本发明的复合物的细胞。
优选地,根据本发明的组合物包括如上面描述的根据本发明的复合物。
根据本发明的组合物还可以包括多于一种上面的组分(i)至(v)。例如,根据本发明的组合物可以包括(i)下的至少两种不同的复合物,(ii)下的至少两种不同的核酸,(iii)下的至少两种不同的载体,(iv)下的至少两种不同的宿主细胞,和/或(v)下的至少两种不同的细胞;例如,本发明的组合物可以包括至少两种不同的复合物(i)和/或至少两种不同的核酸(ii)。
例如,如上面描述的由组合物包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于组分a),即细胞穿透肽,在于组分b),即抗原或抗原表位或多于一种抗原或抗原表位的子集,或在于组分c),即TLR肽激动剂或多于一种TLR肽激动剂的子集;或如上面描述的由组合物包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于三种组分a)、b)和c)中的两种;或如上面描述的由组合物包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于复合物的所有三种组分a)、b)和c)。因此,如上面描述的由组合物包括的不同的核酸(ii)的不同之处可以在于它们编码这样不同的复合物;如上面描述的由组合物包括的不同的载体(iii)的不同之处可以在于它们包括这样不同的核酸;如上面描述的由组合物包括的不同的宿主细胞(iv)的不同之处可以在于它们包括这样不同的载体;并且如上面描述的由组合物包括的不同的负载有复合物的细胞(v)的不同之处可以在于它们负载有这样不同的复合物。
如在此描述的,本发明还提供了复合物或负载有所述复合物的细胞,其被用作药物,具体地被用作疫苗。具体地,根据本发明的组合物优选地是疫苗。
因而,本发明还提供了疫苗,其包括选自如下的至少一种组分:
(i)如上面描述的根据本发明的复合物,
(ii)如上面描述的根据本发明的核酸,
(iii)如上面描述的根据本发明的载体,
(iv)如上面描述的根据本发明的宿主细胞,和
(v)负载有如上面描述的根据本发明的复合物的细胞。
优选地,根据本发明的疫苗包括如上面描述的根据本发明的复合物。
从而,上面关于多于一种组分(i)至(v)的根据本发明的组合物的详细描述也适用于根据本发明的疫苗。
如在本发明的上下文中使用的,术语“疫苗”指的是生物制剂,其通常对特定的疾病——优选地癌症——提供先天性和/或适应性免疫。因而,疫苗具体地支持待治疗的对象的免疫系统的先天性和/或适应性免疫应答。例如,根据本发明的复合物的抗原或抗原表位通常导致或支持待治疗的患者中的适应性免疫应答,并且根据本发明的复合物的TLR肽激动剂可以导致或支持先天性免疫应答。
本发明的组合物,具体地本发明的疫苗,还可以包括药学上可接受的载体、佐剂、和/或媒介,如下面对本发明的药物组合物限定的。在本发明的组合物——具体地本发明的疫苗——的具体上下文中,药学上可接受的载体的选择原则上由本发明的组合物——具体地本发明的疫苗——的施用方式确定。本发明的组合物,具体地本发明的疫苗,可以例如被全身地或局部地施用。全身施用途径一般包括,例如,经皮,口服,肠胃外途径,其包括皮下、静脉内、肌肉内、动脉内、真皮内和腹腔内注射和/或鼻内施用途径。局部施用途径一般包括,例如,外用施用途径以及真皮内、经皮、皮下或肌肉内注射或病灶内、颅内、肺内、心内、结内和舌下注射。更优选地,本发明的组合物,具体地疫苗,可以通过真皮内、皮下、结内或肌肉内途径被施用。甚至更优选地,本发明的组合物,具体地疫苗,可以通过皮下、结内或肌肉内途径被施用。特别优选地,本发明的组合物,具体地疫苗,可以通过皮下或结内途径被施用。最优选地,本发明的组合物,具体地疫苗可以通过皮下途径被施用。本发明的组合物,具体地本发明的疫苗,因此优选地以液体(或有时以固体)形式配制。
待施用的本发明的组合物——具体地本发明的疫苗——的合适的量可以使用动物模型通过常规实验确定。这样的模型不暗示任何限制地包括兔、羊、小鼠、大鼠、狗和非人灵长类模型。优选的用于注射的单位剂型包括无菌水溶液、生理盐水或其混合物。这样的溶液的pH应当被调节至大约7.4。合适的用于注射的载体包括水凝胶、用于控释或延迟释放的装置、聚乳酸和胶原基质。合适的用于外用施用的药学上可接受的载体包括适于在洗剂、霜剂、凝胶等中使用的的那些。如果本发明的组合物,具体地本发明的疫苗,被口服施用,片剂、胶囊等是优选的单位剂型。用于制备单位剂型——其可以用于口服施用——的药学上可接受的载体是现有技术中熟知的。其选择将取决于次要考量比如味道、成本和可储存性,其对于本发明的目的不是决定性的,并且可以由本领域技术人员不困难地做出。
本发明的组合物,具体地本发明的疫苗,可以额外地包含一种或多种辅助物质,以便进一步增加其免疫原性。如上面描述的本发明的复合物和辅助物质——其可以被任选地包含在如上面描述的本发明的疫苗中——的协同作用从而优选地被实现。取决于多种类型的辅助物质,在这方面可以开始考虑多种机制。例如,允许树突细胞(DC)的成熟的化合物,例如脂多糖、TNF-α或CD40配体,形成第一类别的合适的辅助物质。一般而言,可能的是作为辅助物质使用以“危险信号”(LPS、GP96等)的方式影响免疫系统的任何试剂,或细胞因子比如GM-CSF,其使得由根据本发明的免疫刺激佐剂产生的免疫应答以靶向的方式被增强和/或影响。特别优选的辅助物质是细胞因子,比如单核因子、淋巴因子、白介素或趋化因子,其进一步促进先天性免疫应答,比如IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-12、IL-13、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、IL-19、IL-20、IL-21、IL-22、IL-23、IL-24、IL-25、IL-26、IL-27、IL-28、IL-29、IL-30、IL-31、IL-32、IL-33、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、LT-β或TNF-α,生长因子,比如hGH。
可以包括在本发明的疫苗中的进一步的添加剂是乳化剂,比如,例如,湿润剂,比如,例如,月桂基硫酸钠;着色剂;味道赋予剂;药物载体;片剂成型剂;稳定剂;抗氧化剂;防腐剂。
本发明的组合物,具体地本发明的疫苗,可以额外地包含任何进一步的化合物,其已知由于它对人Toll样受体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10的结合亲和力(作为配体),或由于它对鼠Toll样受体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10、TLR11、TLR12或TLR13的结合亲和力(作为配体)是免疫刺激的。
在该上下文中,可以被添加至本发明的组合物——具体地本发明的疫苗——的另一种类别的化合物可以是CpG核酸,具体地CpG-RNA或CpG-DNA。CpG-RNA或CpG-DNA可以是单链CpG-DNA(ss CpG-DNA)、双链CpG-DNA(dsDNA)、单链CpG-RNA(ss CpG-RNA)或双链CpG-RNA(ds CpG-RNA)。CpG核酸优选地是CpG-RNA的形式,更优选地单链CpG-RNA(ss CpG-RNA)的形式。CpG核酸优选地包含至少一种或多种(促有丝分裂的)胞嘧啶/鸟嘌呤二核苷酸序列(CpG基序(一种或多种))。根据第一优选的替代方案,包含在这些序列中的至少一种CpG基序,具体地CpG基序的C(胞嘧啶)和G(鸟嘌呤),是非甲基化的。任选地包含在这些序列中的所有进一步的胞嘧啶或鸟嘌呤可以是甲基化的或非甲基化。然而,根据进一步优选的替代方案,CpG基序的C(胞嘧啶)和G(鸟嘌呤)也可以甲基化形式呈现。
而且,本发明还提供了如上面描述的复合物或负载有所述复合物的细胞或如上面描述的组合物或疫苗,其用于预防和/或治疗疾病或障碍,包括例如癌症、血液学障碍、传染性疾病、自身免疫性障碍和移植排斥,由此癌症是优选的。
此外,本发明还提供了如上面描述的复合物或负载有所述复合物的细胞或如上面描述的组合物,其被用作成像或诊断组合物。
本发明还提供了药物组合物,具体地如上面描述的疫苗组合物,和用于治疗对象——优选地哺乳动物对象,和最优选地人对象——的方法,所述对象遭受疾病或障碍,具体地可以通过免疫疗法治疗的障碍比如癌症、传染性疾病、自身免疫性障碍和移植排斥。
具体地,本发明提供了药物组合物,其包括根据本发明的至少一种复合物或负载有根据本发明的复合物的至少一种细胞,和任选地药学上可接受的载体和/或媒介、或任何赋形剂、缓冲剂、稳定剂或本领域技术人员熟知的其它材料,具体地包括根据本发明的至少一种复合物或负载有根据本发明的复合物的至少一种细胞和药学上可接受的载体的药物组合物。
作为进一步的成分,本发明的药物组合物可以具体地包括药学上可接受的载体和/或媒介。在本发明的上下文中,药学上可接受的载体通常包括液体或非液体基础的本发明的药物组合物。如果本发明的药物组合物以液体形式提供,载体将通常是无热原水;等渗盐水或缓冲(水)溶液,例如磷酸盐、柠檬酸盐等缓冲溶液。特别地对于注射本发明的药物组合物,可以使用水或优选地缓冲剂,更优选地水性缓冲剂,其包含钠盐,优选地至少30mM的钠盐,钙盐,优选地至少0.05mM的钙盐,和任选地钾盐,优选地至少1mM的钾盐。根据优选的实施方式,钠、钙和任选地钾盐可以以它们的卤化物的形式出现,例如氯化物、碘化物或溴化物,以它们的氢氧化物、碳酸盐、碳酸氢盐或硫酸盐等的形式出现。不限于此,钠盐的实例包括例如NaCl、NaI、NaBr、Na2CO3、NaHCO3、Na2SO4,任选的钾盐的实例包括例如KCl、KI、KBr、K2CO3、KHCO3、K2SO4,并且钙盐的实例包括例如CaCl2、CaI2、CaBr2、CaCO3、CaSO4、Ca(OH)2。此外,上述阳离子的有机阴离子可以被包含在缓冲剂中。根据更优选的实施方式,适于如上面限定的注射目的缓冲剂可以包含选自氯化钠(NaCl)、氯化钙(CaCl2)和任选地氯化钾(KCl)的盐,其中除氯化物之外可以存在进一步的阴离子。CaCl2也可以被另一种盐如KCl替换。通常,注射缓冲剂中的盐以至少30mM氯化钠(NaCl)、至少1mM氯化钾(KCl)和至少0.05mM氯化钙(CaCl2)的浓度存在。注射缓冲剂参照具体的参考介质可以是高渗的、等渗的或低渗的,即缓冲剂参考具体的参考介质可以具有更高的、相同的或更低的盐含量,其中优选地可以使用上述的盐的这样的浓度,其不由于渗透或其它浓度效应导致细胞的损害。参考介质是例如在“体内”方法中出现的液体,比如血液、淋巴液、胞质液,或其它体液,或例如在“体外”方法中可以被用作参考介质的液体,比如常见缓冲剂或液体。这样的常见缓冲剂或液体是技术人员已知的。盐水(0.9%NaCl)和林格-乳酸溶液作为液体基础是特别优选的。
然而,一种或多种相容性固体或液体填料或稀释剂或包封化合物也可以用于本发明的药物组合物,其适于施用至待治疗的对象。如本文使用的术语“相容的”意思是本发明的药物组合物的这些组成能够以如下这样的方式与如上面限定的根据本发明的复合物混合:在典型使用条件下不发生将实质上降低本发明的药物组合物的药物效力的相互作用。药学上可接受的载体、填料和稀释剂当然必须具有足够高的纯度和足够低的毒性以使得它们适于施用至待治疗的对象。可以被用作药学上可接受的载体、填料或其组成的化合物的一些实例是糖,比如,例如,乳糖、葡萄糖和蔗糖;淀粉,比如,例如,玉米淀粉或马铃薯淀粉;纤维素和其衍生物,比如,例如,羧甲基纤维素钠、乙基纤维素、醋酸纤维素;粉末状黄蓍胶;麦芽;明胶;牛脂;固体助流剂,比如,例如,硬脂酸、硬脂酸镁;硫酸钙;植物油,比如,例如,花生油、棉籽油、芝麻油、橄榄油、玉米油和来自可可的油;多元醇,比如,例如,聚丙二醇、甘油、山梨醇、甘露醇和聚乙二醇;海藻酸。
本发明的药物组合物可以口服地、肠胃外地、通过吸入喷雾、外用地、直肠地、鼻部地、含服地、阴道地或经由植入的储器被施用。如本文使用的术语肠胃外包括皮下、静脉内、肌肉内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内、颅内、经皮、真皮内、肺内、腹腔内、心内、动脉内、结内和舌下注射或输注技术。优选地,本发明的药物组合物可以真皮内地、肌肉内地、结内地或皮下地被施用。更优选地本发明的药物组合物可以肌肉内地、结内地或皮下地被施用。甚至更优选地,本发明的药物组合物可以结内地或皮下地被施用。最优选地,本发明的药物组合物可以皮下地被施用。
优选地,本发明的药物组合物可以通过肠胃外注射被施用,更优选地通过皮下、静脉内、肌肉内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内、颅内、经皮、真皮内、肺内、腹腔内、心内、动脉内、结内和舌下注射或经由输注技术。本发明的药物组合物的无菌的可注射形式可以是水性或油性悬浮液。这些悬浮液可以使用合适的分散或湿润剂和悬浮剂根据本领域已知的技术配制。无菌的可注射制剂还可以是无毒性肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中无菌的可注射溶液或悬浮液,例如1.3-丁烷二醇中的溶液。在可接受的媒介和溶剂之中,可以采用的是水、林格溶液和等渗的氯化钠溶液。此外,无菌的非挥发油常规地被采用为溶剂或悬浮介质。出于该目的,可以采用任何无味的非挥发油,包括合成的甘油一酯或甘油二酯。脂肪酸,比如油酸和其甘油酯衍生物在可注射剂的制备中是有用的,如是天然的药学上可接受的油,比如橄榄油或蓖麻油,尤其是其聚氧乙基化(polyoxyethylated)形式。这些油溶液或悬浮液还可以包含长链醇稀释剂或分散剂,比如羧甲基纤维素或类似的分散剂,其常用于形成药学上可接受的剂型,包括乳液和悬浮液。其它常用的表面活性剂,比如吐温、Span和其它乳化剂或生物利用度增强剂——其常用于制造药学上可接受的固体、液体或其它剂型——还可以被用于配制本发明的药物组合物的目的。
对于静脉内、皮肤或皮下注射,或病痛位点处的注射,活性成分将优选地是肠胃外可接受的水溶液的形式,其是无热原的并且具有合适的pH、等渗性和稳定性。本领域相关技术人员能够使用例如等渗媒介比如氯化钠注射剂、林格注射剂、乳酸林格注射剂制备合适的溶液。可以根据需要包括防腐剂、稳定剂、缓冲剂、抗氧化剂和/或其它添加剂。无论它是多肽、肽或核酸分子,待被给予个体的根据本发明的其它药学上有用的化合物的施用优选地以“预防有效量”或“治疗有效量”(视情况而定),这足以对个体显示益处。施用的实际量和施用速率与时间进程将取决于待治疗的疾病的性质和严重度。
如上面限定的本发明的药物组合物还可以以任何口服可接受的剂型——其包括但不限于胶囊、片剂、水性悬浮液或溶液——口服地被施用。在用于口服用途的片剂的情况下,常使用的载体包括乳糖和玉米淀粉。润滑剂比如硬脂酸镁也通常被添加。对于以胶囊形式口服施用,有用的稀释剂包括乳糖和干燥的玉米淀粉。当口服用途需要水性悬浮液时,活性成分,即如上面限定的本发明的转运蛋白货物缀合分子,与乳化剂和悬浮剂组合。如果期望的话,还可以添加某些甜味剂、调味剂或着色剂。
本发明的药物组合物还可以外用地被施用,尤其是当治疗靶标包括通过外用施用容易接近的区域或器官时,例如包括皮肤或任何其它易接近的上皮组织的疾病。对于这些区域或器官中的每个,容易制备合适的外用制剂。对于外用施用,本发明的药物组合物可以以合适的药膏配制,其包含悬浮或溶解在一种或多种载体中的本发明的免疫刺激组合物,具体地如上面限定的其组分。用于外用施用的载体包括但不限于矿物油、液体矿脂、白凡士林、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蜡和水。可选地,本发明的药物组合物可以以合适的洗剂或霜剂配制。在本发明的上下文中,合适的载体包括但不限于矿物油、脱水山梨糖醇单硬脂酸酯、聚山梨酯60、鲸蜡酯蜡、鲸蜡硬脂醇、2-辛基月桂醇、苄醇和水。
在该上下文中,当使用上面的药物组合物时,治疗处方例如剂量等的决定通常在一般从业者和其它医生的职责内,并且通常考虑待治疗的障碍、个体患者的状况、递送位点、施用方法和从业者已知的其它因素。上面提及的技术和方案的实例可以在REMINGTON'SPHARMACEUTICAL SCIENCES,16th edition,Osol,A.(ed),1980中被发现。
因此,本发明的药物组合物通常包括“安全和有效量”的本发明的药物组合物——具体地如上面限定的根据本发明的复合物和/或负载有所述复合物的细胞——的组分。如本文使用的,“安全和有效量”意思是足以显著地诱导疾病或障碍的积极改变的根据本发明的复合物的量,即引发正在寻求的组织、系统、动物或人中的生物学或医学应答的根据本发明的复合物或负载有所述复合物细胞的量。有效量可以是用于减轻被治疗的疾病或病症的症状的“治疗有效量”和/或用于预防被预防的疾病或病症的症状的“预防有效量”。术语还包括足以减少疾病的进展,显著地减少或抑制肿瘤生长或感染并且从而引发正在寻求的应答的活性复合物的量(即“抑制有效量”),具体地这样的应答可以是针对由复合物包括的抗原或抗原表位的免疫应答。然而,同时,“安全和有效量”是足够小以避免严重的副作用,也就是说,允许益处和风险之间合理的关系。这些界限的确定通常在合理的医学判断的范围内。本发明的药物组合物——具体地如上面限定的根据本发明的复合物——的组分的“安全和有效量”将另外改变,其与待治疗的具体病症并且也与如下有关:待治疗的患者的年龄和身体状况、体重、一般健康、性别、饮食、施用时间、排泄速率、药物组合、如上面限定的根据本发明的复合物的特定组分a)、b)和c)的活性、病症的严重度、治疗的持续时间、伴随疗法的性质、使用的具体的药学上可接受的载体的性质、和类似的因素,其在随行医生的知识和经验内。本发明的药物组合物一般作为药物组合物或作为疫苗可以用于人并且可以用于兽医医学目的,优选地用于人医学目的。
根据本发明的药物组合物,具体地疫苗组合物,或制剂可以被施用为药物制剂,其可以以本文描述的任何形式包含根据本发明的复合物。
如在本发明的上下文中使用的术语“药物制剂”和“药物组合物”具体地指的是如下这样的形式的制剂:其允许活性成分(一种或多种)的生物活性是明确有效的并且其不包含将对所述制剂将被施用的对象有毒性的额外的组分。
在本发明的上下文中,治疗的“功效”可以基于响应于根据本发明的用途或方法的疾病过程的变化被测量。例如,癌症的治疗功效可以通过肿瘤体积的减小、和/或无进展存活时间的增加、和/或原发性癌症切除术后复发的降低的风险被测量。更具体地对于通过免疫疗法治疗的癌症,功效的评估可以通过免疫治疗剂通过新型免疫相关应答标准(irRC)——其改编自实体瘤应答评价标准(RECIST)和世界卫生组织(WHO)标准(J.Natl.Cancer Inst.2010,102(18):1388–1397)——的抗肿瘤应答的临床模式谱。传染性疾病的预防功效最终通过人群体中的流行病学研究被评估,其通常与血清中中和抗体的效价,和诱导多功能的病原体特异性T细胞应答相关联。临床前评估可以包括在使用传染性病原体攻击后对感染的抵抗。传染性疾病的治疗可以通过抑制病原体的生长或消灭病原体(并且因而,不存在检测到的病原体)被测量,其与病原体特异性抗体和/或T细胞免疫应答相关联。
根据本发明的药物组合物,具体地疫苗组合物,或制剂还可以被施用为药物制剂,其可以以本文描述的任何形式包含负载有根据本发明的复合物的抗原呈递细胞。
根据本发明的疫苗和/或组合物还可以被配制为药物组合物和其单位剂量,具体地连同如上面和下面描述的常规采用的佐剂、免疫调节材料、载体、稀释剂或赋形剂,并且是这样的形式,其可以被采用为固体,比如片剂或填充胶囊,或液体比如溶液、悬浮液、乳液、酏剂、或填充它们的胶囊,其所有均用于口服用途,或是无菌的可注射溶液的形式,其通过注射或连续输注用于肠胃外(包括皮下和真皮内)用途。
在本发明的上下文中,具体地在根据本发明的药物组合物和疫苗的上下文中,可注射的组合物通常基于可注射的无菌盐水或磷酸盐缓冲盐水或本领域已知的其它可注射的载体。这样的药物组合物和其单位剂型可以包括常规比例的成分,具有或不具有额外的活性化合物或要素(principle),并且这样的单位剂型可以包含任何合适有效量的活性成分,其与待采用的预期每日剂量范围相当。
在本发明的上下文中,合适的佐剂和/或免疫调节材料的实例包括(Corixa)、包括铝化合物的铝基矿物质(一般称为Alum)、ASO1-4、MF59、磷酸钙、脂质体、Iscom、包括其稳定形式聚-ICLC(Hiltonol)的聚肌苷酸:聚胞苷酸(聚IC)、CpG寡脱氧核苷酸、粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)、脂多糖(LPS)、Montanide、聚乳酸-乙醇酸共聚物(PLG)、鞭毛蛋白、皂树皮(Soap Bark tree)皂素(QS21)、氨基烷基葡糖酰胺化合物(例如RC529)、具有合成寡脱氧核苷酸的两组分抗菌肽(例如IC31)、咪喹莫特、瑞喹莫德、免疫刺激序列(ISS)、单磷酰脂质A(MPLA)、成纤维细胞刺激脂肽(FSL1)、和抗CD40抗体。
根据本发明的组合物,具体地药物组合物和疫苗,可以是液体制剂,其包括但不限于水性或油性悬浮液、溶液、乳液、糖浆和酏剂。组合物还可以被配制为干燥产物,以便在使用前与水或其它合适的媒介进行重构。这样的液体制剂可以包含添加剂,其包括但不限于悬浮剂、乳化剂、非水性媒介和防腐剂。悬浮剂包括但不限于山梨醇糖浆、甲基纤维素、葡萄糖/糖浆、明胶、羟基乙基纤维素、羧甲基纤维素、硬脂酸铝凝胶、和氢化的食用脂肪。乳化剂包括但不限于卵磷脂、脱水山梨糖醇单硬脂酸酯和阿拉伯树胶。防腐剂包括但不限于甲基或丙基对-羟基苯甲酸酯和山梨酸。分散或湿润剂包括但不限于聚(乙二醇)、甘油、牛血清白蛋白、
根据本发明的组合物,具体地药物组合物和疫苗,还可以被配制为贮存制剂,其可以通过植入或通过肌肉内注射被施用。
根据本发明的组合物,具体地药物组合物和疫苗,还可以是固体组合物,其可以是以常规方式配制的片剂或锭剂的形式。例如,用于口服施用的片剂和胶囊可以包含常规的赋形剂,其包括但不限于结合剂、填料、润滑剂、崩解剂和湿润剂。结合剂包括但不限于糖浆、阿拉伯树胶、明胶、山梨醇、黄蓍树、淀粉的粘液和聚乙烯吡咯烷酮。填料包括但不限于乳糖、糖、微晶纤维素、玉米淀粉、磷酸钙、和山梨醇。润滑剂包括但不限于硬脂酸镁、硬脂酸、滑石、聚乙二醇、和二氧化硅。崩解剂包括但不限于马铃薯淀粉和淀粉乙醇酸钠。湿润剂包括但不限于月桂基硫酸钠。片剂可以根据本领域熟知的方法被包衣。
根据本发明组合物,具体地药物组合物和疫苗,还可以以缓释形式或从缓释药物递送系统被施用。
而且,根据本发明组合物,具体地药物组合物和疫苗,可以被调整适于通过重复施用被递送。
在根据本发明的组合物——具体地药物组合物和疫苗——的上下文中或在它们的制剂的上下文中有用的进一步的材料以及制剂加工技术等在“Part 5of Remington’s“The Science and Practice of Pharmacy”,22nd Edition,2012,University of theSciences in Philadelphia,Lippincott Williams&Wilkins”中被陈述。
根据仍另一方面,本发明提供了制备根据本发明的药物组合物的方法,其包括混合根据本发明的复合物或负载有根据本发明的复合物的细胞——具体地抗原呈递细胞——和药学上可接受的载体的步骤。
因此,根据本发明的复合物和负载有根据本发明的复合物的细胞可以被(用于制备药物组合物和/或制备疫苗)用于预防、治疗和/或改善如本文限定的任何疾病和障碍,具体地通过免疫疗法可以治疗或预防的那些比如癌症和传染性疾病。
在另一方面,本发明提供了成像或诊断(diagnosis)组合物(“诊断(diagnostic)组合物”)。仍其它方面涉及用于递送显像剂的方法和用于诊断对象——优选地哺乳动物对象,和最优选地人对象——中的疾病或障碍的方法,所述对象怀疑遭受医学障碍,和具体地癌症、传染性疾病、自身免疫性障碍和移植排斥。
在此描述的药物组合物的制剂和施用模式也可以适于根据本发明的成像或诊断组合物。
在进一步的方面,本发明还涉及套装药盒(kit-of-parts),其包括如下的至少一种:
(i)如上面描述的根据本发明的复合物,
(ii)如上面描述的根据本发明的核酸,
(iii)如上面描述的根据本发明的载体,
(iv)如上面描述的根据本发明的宿主细胞,和
(v)负载有如上面描述的根据本发明的复合物的细胞。
具体地,本发明的套装药盒可以包括多于一种组分(i)至(v)。例如,根据本发明的套装药盒可以包括(i)下的至少两种不同的复合物,(ii)下的至少两种不同的核酸,(iii)下的至少两种不同的载体,(iv)下的至少两种不同的宿主细胞,和/或(v)下的至少两种不同的细胞;例如,本发明的套装药盒可以包括至少两种不同的复合物(i)和/或至少两种不同的核酸(ii)。
例如,如上面描述的由套装药盒包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于组分a),即细胞穿透肽,在于组分b),即抗原或抗原表位或多于一种抗原或抗原表位的子集,或在于组分c),即TLR肽激动剂或多于一种TLR肽激动剂的子集;或如上面描述的由套装药盒包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于三种组分a)、b)和c)中的两种;或如上面描述的由套装药盒包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于复合物的所有三种组分a)、b)和c)。因此,如上面描述的由套装药盒包括的不同的核酸(ii)的不同之处可以在于它们编码这样不同的复合物;如上面描述的由套装药盒包括的不同的载体(iii)的不同之处可以在于它们包括这样不同的核酸;如上面描述的由套装药盒包括的不同的宿主细胞(iv)的不同之处可以在于它们包括这样不同的载体;并且如上面描述的由套装药盒包括的不同的负载有复合物的细胞(v)的不同之处可以在于它们负载有这样不同的复合物。
套装药盒的多种组分可以被包装在一个或多个容器中。上面的组分可以以冻干或干燥形式提供或溶解在合适的缓冲剂中。药盒还可以包括额外的试剂,其包括例如防腐剂、生长介质、和/或用于储存和/或重构上面引用的组分的缓冲剂、清洗溶液等。此外,根据本发明的套装药盒可以任选地包含使用说明。
而且,本发明还提供了用于治疗、预防和/或稳定癌症或传染性疾病的接种疫苗药盒,其包括根据本发明的药物组合物或根据本发明的疫苗和所述药物组合物或所述疫苗的使用说明。
因而,本发明还提供了药盒:其包括如本文描述的根据本发明的复合物、如本文描述的根据本发明的细胞、如本文描述的根据本发明的组合物、如本文描述的根据本发明的疫苗、和/或如本文描述的根据本发明的药物组合物。
优选地,这样的药盒进一步包括包装插入物或指导散页,其指导通过使用如本文描述的根据本发明的复合物、如本文描述的根据本发明的细胞、如本文描述的根据本发明的组合物、如本文描述的根据本发明的疫苗、和/或如本文描述的根据本发明的药物组合物治疗癌症和/或血液学障碍,优选地恶性脑肿瘤或淋巴、造血和相关组织的恶性肿瘤,最优选地成胶质细胞瘤。
这样的药盒可以具体地用于医学,例如用于预防和/或治疗癌症。
此外,根据本发明的组合物和/或套装药盒可以用于成像技术和/或诊断如本文公开的疾病或障碍。
根据本发明的用途和方法
在另一方面,本发明提供了如下任一种的用途:(i)根据本发明的复合物,和/或(ii)负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞,(用于制备药物)用于预防、治疗或稳定疾病或障碍,比如通过免疫疗法可以治疗的那些,其包括癌症、传染性疾病、自身免疫性障碍、血液学疾病和移植排斥。因此,本发明提供了如下任一种:(i)根据本发明的复合物,和/或(ii)负载有根据本发明的复合物细胞,比如抗原呈递细胞,用于预防、治疗或稳定疾病或障碍,比如通过免疫疗法可以治疗的那些,其包括癌症、传染性疾病、自身免疫性障碍、血液学疾病和移植排斥。
本发明还提供了用于接种疫苗和/或免疫疗法的根据本发明的复合物,其允许在MHC I类和/或MHC II类背景下在抗原呈递细胞的细胞表面处转运和呈递由复合物包括的至少一种抗原或抗原表位。
根据另一方面,本发明提供了预防、治疗或抑制疾病或障碍的方法,疾病或障碍比如通过免疫疗法可以治疗的那些,其包括癌症、传染性疾病、自身免疫性障碍、血液学疾病和移植排斥,其中所述方法包括给所述对象施用如下任一种:(i)本发明的复合物,(ii)本发明的负载有复合物的细胞,比如抗原呈递细胞,或(iii)(i)至(ii)的药物制剂。
而且,本发明提供了用于在对象中引发或改进针对依赖于CD4+辅助T细胞和/或CD8+细胞毒性T细胞的一种或多种表位的免疫应答的方法,其中所述方法包括给所述对象施用如下的任一种:(i)根据本发明的复合物,和/或(ii)负载有所述复合物的细胞,比如抗原呈递细胞,或(iii)(i)至(ii)的药物制剂。
依赖于CD4+和/或CD8+应答的免疫应答可以通过评价炎性应答、促炎细胞因子应答测量,包括相对于施用本发明的化合物前的水平,IFN-γ、TNF-α和IL-2mRNA或蛋白质中的一种或多种的表达的增加。它还可以通过如下被测量:抗原特异性T细胞在施用本发明的化合物后的频率或绝对数目的增加、HLA-肽多聚体染色、ELISPOT试验、和延迟型超敏性测试。它还可以通过依赖于抗原特异性T辅助细胞的抗原特异性血清抗体的增加被间接地测量。
本发明还提供了用于在对象中引发或改进针对一种或多种抗原或抗原表位——其受限于多种MHC I类分子和/或多种MHC II类分子——的免疫应答的方法,其中所述方法包括给对象施用如下的任一种:(i)根据本发明的复合物,和/或(ii)负载有所述复合物的细胞,比如抗原呈递细胞,或(iii)(i)至(ii)的药物制剂。
用于在对象中引发或改进针对多种表位——其受限于多种MHC I类分子和/或多种MHC II类分子——的免疫应答的方法可以通过评价细胞因子应答测量,包括相对于施用本发明的化合物前、使用结合至抗原呈递细胞上离散的MHC I类和II类分子的个体肽体外刺激T细胞后的水平,IFN-γ、TNF-α和IL-2mRNA或蛋白质中的一种或多种的表达的增加。还可以通过使用表达不同MHC分子的抗原呈递细胞,或通过使用MHC封闭性抗体验证对不同的MHC分子的限制。它还可以通过如下被测量:抗原特异性T细胞在施用本发明的化合物后的频率或绝对数目的增加、HLA-肽多聚体染色,其使用用离散的MHC分子装配的多聚体。
优选地,在根据本发明的用于引发或改进针对一种或多种抗原或抗原表位的免疫应答的方法中,免疫应答针对肿瘤相关抗原或肿瘤特异性抗原的一种或多种表位,例如,胶质瘤表位的组合,比如在Novellino et al.(2005,Cancer Immunol Immunother,54(3):187-207)和Vigneron et al.(2013,Cancer Immun.13:15)中描述的那些。
可选地或额外地,免疫应答可以针对来自病原体的抗原蛋白的多种表位。
如本文描述的根据本发明的方法可以用于在对象中引发或改进针对一种或多种表位——其受限于MHC I类分子和/或MHC II类分子——的免疫应答。
具体地,本发明因而提供了用于在需要其的对象中治疗癌症或起始、增强或延长抗肿瘤-应答的方法,其包括给对象施用复合物,所述复合物包括:
细胞穿透肽;
至少一种抗原或抗原表位;和
至少一种TLR肽激动剂,
其中组分a)–c)被共价连接。
在这样的方法中,优选的是如本文描述的根据本发明的复合物、如本文描述的根据本发明的细胞、如本文描述的根据本发明的组合物、如本文描述的根据本发明的疫苗、和/或如本文描述的根据本发明的药物组合物被施用至对象。
优选地,对象具有癌症和/或被诊断有癌症。
另外,本发明因而提供了用于在需要其的对象中治疗癌症和/或血液学障碍——优选地恶性脑肿瘤或淋巴、造血和相关组织的恶性肿瘤,最优选地成胶质细胞瘤——的方法,其包括给对象施用复合物,所述复合物包括:
细胞穿透肽;
至少一种抗原或抗原表位;和
至少一种TLR肽激动剂,
其中组分a)–c)被共价连接。
从而,优选的是如本文描述的根据本发明的复合物、如本文描述的根据本发明的细胞、如本文描述的根据本发明的组合物、如本文描述的根据本发明的疫苗、和/或如本文描述的根据本发明的药物组合物被施用至对象。
在另一方面,本发明提供了如下的任一种分别制备用于成像技术的成像组合物或制备用于诊断疾病或障碍的诊断(diagnosis)组合物(“诊断(diagnostic)组合物”)的用途:(i)根据本发明的复合物,和/或(ii)负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞。可以使用本发明诊断的疾病或障碍包括可以通过免疫疗法治疗的那些,例如癌症、传染性疾病、自身免疫性障碍和移植排斥。具体地,可以通过使用根据本发明的诊断组合物诊断的疾病是可以通过使用如本文描述的根据本发明的复合物治疗和/或预防的疾病。根据本发明的诊断组合物包括选自如下的至少一种组分:
(i)如上面描述的根据本发明的复合物,
(ii)如上面描述的根据本发明的核酸,
(iii)如上面描述的根据本发明的载体,
(iv)如上面描述的根据本发明的宿主细胞,和
(v)负载有如上面描述的根据本发明的复合物的细胞。
优选地,根据本发明的诊断组合物包括如上面描述的根据本发明的复合物。
具体地,根据本发明的复合物、负载有根据本发明的复合物的细胞比如抗原呈递细胞、本发明的组合物、本发明的药物组合物或本发明的疫苗、或最优选地本发明的诊断组合物可以作为诊断工具用于诊断中,例如在(体内或体外)试验中,例如在免疫试验中,检测、预测、诊断、或监测提及的障碍或疾病的多种状况和疾病状态。
作为实例,(体外)试验可以通过将根据本发明的复合物、负载有根据本发明的复合物的细胞比如抗原呈递细胞、本发明的组合物、本发明的药物组合物或本发明的疫苗、或最优选地本发明的诊断组合物递送至靶细胞来进行,并且通过技术人员通常已知的生物物理学方法监测细胞应答,所述靶细胞通常选自例如培养的动物细胞、人细胞或微生物。其中通常使用的靶细胞可以是培养的细胞(体外),例如从人或动物体分离的细胞,比如从人或动物体分离的血细胞,或体内细胞,即组成活的动物或人的器官或组织的细胞,或在活的动物或人中发现的微生物。在该上下文中特别优选的是所谓的标志物或标记,其可以包含在根据本发明的复合物中,具体地,包含在根据本发明的诊断组合物中。
根据进一步的方面,本发明提供了诊断对象中的疾病或障碍的方法,其中所述方法包括给所述对象或给所述对象的离体样品施用如下的任一种:(i)本发明的复合物,(ii)负载有本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞,或(iii)(i)至(ii)的药物制剂。
根据另一方面,本发明提供了成像方法,其中所述方法包括体外、离体或体内使用如下的任一种:(i)本发明的复合物,(ii)负载有本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞,或(iii)(i)至(ii)的药物制剂。
优选地,根据本发明的用途和方法包括施用根据本发明的复合物。
而且,根据本发明的用途和方法包括施用多于一种根据本发明的复合物、细胞或药物制剂。例如,在根据本发明的用途和方法中,至少两种不同的复合物被使用或施用,其中每种复合物包括至少一种抗原或抗原表位并且所述抗原或抗原表位或(如果多于一种抗原或抗原表位由所述复合物包括)所述抗原或抗原表位的子集在两种复合物之间是不同的。
例如,如上面描述的由组合物包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于组分a),即细胞穿透肽,在于组分b),即抗原或抗原表位或多于一种抗原或抗原表位的子集,或在于组分c),即TLR肽激动剂或多于一种TLR肽激动剂的子集;或如上面描述的由组合物包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于三种组分a)、b)和c)中的两种;或如上面描述的由组合物包括的不同的复合物(i)的不同之处可以在于复合物的所有三种组分a)、b)和c)。因此,如上面描述的由组合物包括的不同的核酸(ii)的不同之处可以在于它们编码这样不同的复合物;如上面描述的由组合物包括的不同的载体(iii)的不同之处可以在于它们包括这样不同的核酸;如上面描述的由组合物包括的不同的宿主细胞(iv)的不同之处可以在于它们包括这样不同的载体;并且如上面描述的由组合物包括的不同的负载有复合物的细胞(v)的不同之处可以在于它们负载有这样不同的复合物。
而且,在根据本发明的用途和方法中,根据本发明的细胞可以是抗原呈递细胞,具体地树突细胞,更优选地来自待治疗的对象的树突细胞。
待治疗或预防的疾病
如在本发明的上下文中使用的术语“疾病”意欲与术语“障碍”和“病症”是大体上同义的,并且与其可交换地使用(如在医疗条件中),在于均反映损害正常功能的人或动物体或其部分之一的异常状况,其通常由有区别的征兆和症状显示,并且引起人或动物具有降低的寿命或生活质量。
通过使用根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗治疗和/预防的疾病包括癌症、血液学障碍、传染性疾病、自身免疫性障碍和移植排斥。从而,癌症和传染性疾病的治疗和/或预防是优选的,并且癌症的治疗和/或预防是更优选的。对于癌症,恶性脑肿瘤或淋巴、造血和相关组织的恶性肿瘤是优选的,并且成胶质细胞瘤是更优选的。
优选地,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗,可以用于(制备用于如下的药物)预防、治疗和/或减轻癌症或肿瘤疾病,其包括由缺陷性凋亡引起的疾病,优选地选自听神经神经细胞瘤,肛门癌,星形细胞瘤,基底细胞癌,贝切特综合征,膀胱癌,胚细胞瘤,骨癌,脑转移,脑肿瘤,脑癌(成胶质细胞瘤),乳腺癌(乳房癌),伯基特淋巴瘤,类癌瘤,宫颈癌,结肠癌,结肠直肠癌,子宫体癌,颅咽管癌(craniopharyngeomas),CUP综合征,子宫内膜癌,胆囊癌,生殖器肿瘤——包括泌尿生殖道的癌症,成胶质细胞瘤,胶质瘤,头/颈肿瘤,肝癌,组织细胞淋巴瘤,何杰金综合征或淋巴瘤和非何杰金淋巴瘤,脑下垂体肿瘤,肠癌——包括小肠的肿瘤和胃肠肿瘤,卡波西肉瘤,肾癌(kidney cancer),肾癌(kidneycarcinomas),喉癌(laryngeal cancer)或喉癌(larynx cancer),白血病——包括急性髓性白血病(AML)、红白血病,急性淋巴性白血病(ALL),慢性髓性白血病(CML)和慢性淋巴细胞性白血病(CLL),眼睑肿瘤,肝癌,肝转移,肺癌(lung carcinomas)(=肺癌(lungcancer)=支气管癌),小细胞肺癌和非小细胞肺癌,和肺腺癌,淋巴瘤,淋巴癌,恶性黑素瘤,乳房癌(=乳腺癌),成神经管细胞瘤,黑素瘤,脑膜瘤,蕈样真菌病,肿瘤疾病——神经细胞瘤,食管癌,食道癌(=食管癌),少突神经胶质瘤,卵巢癌(ovarian cancer)(=卵巢癌(ovarian carcinoma)),卵巢癌(ovarian carcinoma),胰腺癌(pancreatic carcinoma)(=胰腺癌(pancreatic cancer)),阴茎癌(penile cancer),阴茎癌(penis cancer),咽癌,垂体肿瘤,浆细胞瘤,前列腺癌(=前列腺肿瘤),直肠癌,直肠肿,肾癌(renal cancer),肾癌(renal carcinomas),成视网膜细胞瘤,肉瘤,Schneeberger病,皮肤癌——例如黑素瘤或非黑素瘤皮肤癌,包括基底细胞和鳞状细胞癌以及银屑病、寻常性天疱疮,软组织肿瘤,棘细胞癌,胃癌,睾丸癌,喉癌(throat cancer),胸腺瘤,甲状腺癌,舌癌,尿道癌,子宫癌,阴道癌症,多种病毒诱导的肿瘤——比如,例如,乳头瘤病毒诱导的癌(例如宫颈癌(cervical carcinoma)=宫颈癌(cervical cancer))、腺癌、疱疹病毒诱导的肿瘤(例如伯基特淋巴瘤、EBV诱导的B-细胞淋巴瘤、宫颈癌)、乙型肝炎诱导的肿瘤(肝细胞癌)、HTLV-1和HTLV-2诱导的淋巴瘤,外阴癌,疣病症或损害等。在本上下文中,术语“疗法”和“治疗性”优选地意思是在被施用至活体之后具有至少一些最低的生理作用。例如,施用“治疗性”抗肿瘤化合物之后的生理作用可以是抑制肿瘤生长,或肿瘤大小的减小,或防止肿瘤的复发。优选地,在癌症或肿瘤疾病的治疗中,抑制肿瘤的生长或减小肿瘤的大小或防止肿瘤的复发的化合物将被认为是治疗上有效的。术语“抗肿瘤药物”因此优选地意思是针对肿瘤、肿瘤疾病或癌症具有治疗作用的任何治疗剂。
癌症的实例包括脑癌、前列腺癌症、乳腺癌、卵巢癌、食管癌、肺癌(lung cancer)、肝癌、肾癌、黑素瘤、消化道癌(gut carcinoma)、肺癌(lung carcinoma)、头颈鳞状细胞癌、慢性髓性白血病、结肠直肠癌、胃部癌、子宫内膜癌、髓性白血病、肺鳞状细胞癌、急性成淋巴细胞性白血病、急性髓性白血病、膀胱肿瘤、早幼粒细胞白血病、非小细胞肺癌、肉瘤。
癌症可以是实体瘤、血癌或淋巴癌。癌症可以是良性的或转移性的。
优选地,待预防和/或治疗的癌症是胶质瘤,更优选地高度侵袭性的多形性成胶质细胞瘤(GBM)。胶质瘤是成人中原发性脑肿瘤的最常见的形式,其中多形性成胶质细胞瘤(GBM)具有最差的预后。该肿瘤因其高度侵袭性和攻击性性状而闻名。具体地,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗可以连同现有的模态(modalities)用于胶质瘤,更具体地高度侵袭性的GBM。T淋巴细胞可以主动地寻找脑中的肿瘤细胞,并且具有安全地消灭特异性肿瘤细胞而不损害周围健康组织的潜力。
而且,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗,可以用于(制备用于如下的药物)预防、治疗和/或减轻传染性疾病,优选地病毒、逆转录病毒、细菌或原生动物传染性疾病。这样的传染性疾病通常选自AIDS,炭疽,日本脑炎,细菌传染性疾病比如流产(前列腺炎症),炭疽,阑尾炎,莱姆病,肉毒杆菌中毒,弯曲杆菌(camphylobacter),沙眼衣原体(尿道的炎症、结膜炎),霍乱,白喉,腹股沟肉芽肿(donavanosis),会厌炎,斑疹伤寒热,气性坏疽,淋病,兔热病,幽门螺杆菌,百日咳,腹股沟淋巴肉芽肿(climatic bubo),骨髓炎,军团病,鸡痘,尖锐湿疹,巨细胞病毒(CMV),登革热,初夏(early summer)脑膜脑炎(ESME),埃博拉病毒,感冒,第五病,口蹄疫,I型单纯疱疹,II型单纯疱疹,带状疱疹,HSV,由寄生虫、原生动物或真菌引起的传染性疾病——比如阿米巴病、血吸虫病、南美洲锥虫病、棘球属、鱼绦虫、鱼肉中毒(拉美鱼肉毒)、狐狸绦虫、足癣、犬绦虫、念珠菌病、酵母菌斑、疥疮、皮肤利什曼病、贾第虫病(梨形鞭毛虫病)、虱、盘尾丝虫病(河盲)、真菌病、牛绦虫、裂体吸虫病、猪绦虫、弓形体病、滴虫病、锥体虫病(昏睡症)、内脏利什曼病、尿布皮炎或微型绦虫,传染性红斑,流感,卡波西肉瘤,拉沙热,利什曼病,麻风病,李斯特菌病,莱姆疏螺旋体病,疟疾,马尔堡病毒感染,麻疹,包括细菌脑膜炎的脑膜炎,传染性软疣,单核细胞增多症(mononucleosis),腮腺炎,人型支原体,新生儿败血症(绒毛膜羊膜炎),走马疳,诺瓦克病毒感染,中耳炎,副斑疹伤寒,发否侏热,瘟疫,肺炎,小儿麻痹症(脊髓灰质炎,儿童残废),假格鲁布,狂犬病,莱特尔综合征,落基山斑疹热,沙门氏菌副斑疹伤寒,沙门氏菌斑疹伤寒,SARS,猩红热,带状疱疹,肝炎,天花,软下疳,梅毒,破伤风,三日热,tripper,恙虫病,结核,斑疹伤寒,鞘炎(阴道炎),由巨细胞病毒(CMV)、天花病毒、类天花病毒、副痘病毒、传染性软疣痘病毒、1型单纯疱疹病毒、2型单纯疱疹病毒、乙型疱疹病毒、水痘-带状疱疹病毒、伪狂犬病毒、人巨细胞病毒、6型人疱疹病毒、7型人疱疹病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、8型人疱疹病毒、乙型肝炎病毒、基孔肯雅病毒、奥尼翁-尼翁病毒、风疹病毒、丙型肝炎病毒、C型GB病毒、西尼罗病毒、登革热病毒、黄热病病毒、跳跃病病毒、圣路易斯脑炎病毒、日本乙型脑炎病毒、波瓦生病毒、FSME病毒、SARS、SARS相关冠状病毒、人冠状病毒229E、人冠状病毒Oc43、环曲病毒属、人I型嗜T细胞病毒、人II型嗜T细胞病毒、HIV(AIDS)——即人1型免疫缺陷病毒或人2型免疫缺陷病毒、流感病毒、拉沙病毒、淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒、塔卡里伯病毒、胡宁病毒、马秋博病毒、波尔那病病毒、布尼亚病毒、加利福尼亚脑炎病毒、裂谷热病毒、白蛉热病毒、托斯卡纳病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、哈扎拉病毒、喀山病毒、汉坦病毒、汉城病毒、希望山病毒、普马拉病毒、多布拉伐病毒、图拉病毒、辛诺柏病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、埃博拉病毒扎伊尔株、埃博拉病毒苏丹株、埃博拉病毒科特迪瓦株、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、副流感病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒、呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒、水泡性口膜炎印第安纳水泡病毒、狂犬病病毒、莫科拉病毒、杜文黑基病毒、1+2型欧洲蝙蝠狂犬病毒、澳大利亚蝙蝠狂犬病毒、腺病毒A-F、人乳头瘤病毒、6型尖锐湿疣病毒、11型尖锐湿疣病毒、多瘤病毒、2型腺病毒伴随病毒、轮状病毒、或环状病毒引起的病毒病,包括带状水痘的水痘,和疟原虫(镰状疟原虫、间日疟原虫、卵形疟原虫、三日疟原虫、诺尔斯疟原虫),病毒传染性疾病比如AIDS,由尖锐湿疹、空心疣(hollow wart)、登革热、三日热、埃博拉病毒、感冒、初夏脑膜脑炎(FSME)、流感、带状疱疹、肝炎、I型单纯疱疹、II型单纯疱疹、带状疹疱、流感、日本脑炎、拉沙热、马尔堡病毒、疣、西尼罗热、黄热病引起的传染性疾病等。
传染性疾病的实例包括由病毒、细菌、真菌、原生动物和多细胞寄生虫引起的疾病。它们包括,例如,阿米巴病、炭疽、布路里溃疡(溃疡分枝杆菌)、杯状病毒相关腹泻、弯曲杆菌腹泻、宫颈癌(人乳头瘤病毒)、沙眼衣原体相关生殖器疾病、霍乱、克里米亚-刚果出血热、登革热、白喉、埃博拉出血热、产肠毒素大肠杆菌(ETEC)腹泻、胃癌(幽门螺杆菌)、淋病、A组链球菌相关疾病、B组链球菌相关疾病、B型流感嗜血杆菌肺炎和侵袭性疾病、甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎、戊型肝炎腹泻、2型单纯疱疹生殖器溃疡、HIV/AIDS、钩虫病、流感、日本脑炎、拉沙热、利什曼病、钩端螺旋体病、肝癌(乙型肝炎)、肝癌(丙型肝炎)、莱姆病、疟疾、马尔堡出血热、麻疹、腮腺炎、鼻咽癌(爱泼斯坦-巴尔病毒)、脑膜炎双球菌脑膜炎、副流感相关肺炎、百日咳、瘟疫、脊髓灰质炎、狂犬病、呼吸道合胞病毒(RSV)肺炎、裂谷热、轮状病毒腹泻、风疹、血吸虫病、严重急性呼吸综合征(SARS)、志贺氏菌病、天花、金黄色葡萄球菌相关疾病、胃癌(幽门螺杆菌)、肺炎链球菌和侵袭性疾病、破伤风、蜱源脑炎、沙眼、结核、土拉菌病、伤寒、西尼罗病毒相关疾病、黄热病。
而且,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗,可以用于(制备用于如下的药物)预防、治疗和/或减轻自身免疫性障碍,例如CNS的自身免疫性疾病、自身炎性疾病、乳糜泻;斯耶格伦综合征、系统性红斑狼疮等。通常,自身免疫性疾病由身体针对正常地在身体中存在的物质和组织的异常免疫应答引起(自身免疫)。这可以限制于某些器官(例如自身免疫性甲状腺炎)或可以涉及不同位置的特定组织(例如古德帕斯彻病,其可以影响肺和肾二者中的基底膜)。自身免疫性疾病可以通过对应类型的超敏性被分类:I型(即由自体血清诱导的荨麻疹)、II型、III型或IV型。
自身免疫性疾病的实例包括Blau综合征、大疱性类天疱疮、癌症、卡斯尔曼病、乳糜泄、南美洲锥虫病、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病、慢性复发性多病灶骨髓炎、慢性阻塞性肺病、丘-施二氏综合征、瘢痕性类天疱疮、寇甘综合征、冷凝集素疾病、补体成分2缺陷、接触性皮炎、颅动脉炎、CREST综合征、克罗恩病、库兴综合征、德尔肯病、疱疹样皮炎、皮肌炎、1型糖尿病、弥漫性皮肤系统性硬皮病、德雷斯勒综合征、狼疮、盘状红斑狼疮、湿疹、急性播散性脑脊髓炎(ADEM)、阿狄森病、无γ球蛋白血症、肌萎缩性侧索硬化症(也是LouGehrig病;运动神经元病)、强直性脊柱炎、抗磷脂综合征、抗合成酶综合征、特应性皮炎、自身免疫性再生障碍性贫血、自身免疫性心肌病、自身免疫性溶血性贫血、自身免疫性肝炎、自身免疫性内耳病、自身免疫性淋巴细胞增生性综合征、自身免疫性周围神经病、自身免疫性胰腺炎、自身免疫性多内分泌综合征、自身免疫性黄体酮皮炎、自身免疫性血小板减少性紫癜、自身免疫性荨麻疹、自身免疫性葡萄膜炎、巴类病/巴类同心性硬化症、贝切特病、贝格尔病、Bickerstaff脑炎、子宫内膜异位、起止点炎相关的关节炎、嗜酸性胃肠炎、后天性大疱性表皮松解、胎儿成红细胞增多症、伊凡斯综合征、骨化性纤维发育不良、纤维性肺泡炎(或特发性肺纤维化)、胃炎、肾小球性肾炎、古德帕斯彻综合征、格雷夫斯病、格-巴二氏综合征、桥本脑病、桥本甲状腺炎、妊娠类天疱疮、化脓性汗腺炎、低丙球蛋白血症、特发性血小板减少性紫癜(自身免疫性血小板减少性紫癜)、IgA肾病、眼(occular)瘢痕性类天疱疮、包涵体肌炎、类风湿性关节炎、慢性炎性风湿热、脱髓鞘性多发性神经病、结节病、复发性风湿病、间质性膀胱炎、青少年特发性精神分裂症、PANDAS(儿童关节炎,又称为青少年自身免疫性类风湿性关节炎)、施密特综合征、神经精神病性川畸病——APS的另一种形式、施尼茨勒综合征、副肿瘤性小脑肌无力综合征、白细胞破裂性血清病、扁平苔藓、斯耶格伦综合征、硬化性苔藓、痛性肌萎缩(Parsonage-Tumer)、线状IgA病、斯提尔病、寻常性天疱疮、狼疮状肝炎、自身免疫性肝炎、僵人(stiff person)综合征、恶性贫血(pemiciousanaemia)、亚急性细菌心内膜炎(SBE)、POEMS综合征、红斑狼疮、斯威特综合征、交感性眼炎、美尼尔病、系统性狼疮、原发性胆汁性肝硬变、米-费二氏(Miller-Fisher)综合征、高安动脉炎、胆管炎、进行性炎性神经病、穆-哈二氏病、银屑病、银屑病性关节炎、坏疽性脓皮病、多发性硬化症、纯红细胞再生障碍、腊斯默森脑炎、重症肌无力、横贯性脊髓炎、雷诺现象、显微镜结肠炎(microscopic colitis)、溃疡性结肠炎、肌炎、特发性炎性肠病(IBD)、视神经脊髓炎、德维克病、和神经性肌强直。
而且,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗,可以用于(制备用于如下的药物)预防、治疗和/或减轻血液学障碍,其通常是主要影响血液的障碍。从而,血液学恶性肿瘤是优选的。
血液学疾病的实例包括骨髓障碍,其包括血红蛋白病(血红蛋白分子或血红蛋白合成速率的先天性异常),例如镰状细胞病、地中海贫血、高铁血红蛋白血症;贫血(缺少红细胞或血红蛋白),例如缺铁性贫血,包括维生素B12缺乏、恶性贫血和叶酸缺乏的巨幼红细胞贫血,溶血性贫血(红细胞破坏)——其包括RBC膜的遗传障碍(比如遗传性球形红细胞症、遗传性椭圆形红细胞性贫血和先天性红细胞生成障碍性贫血)和RBC代谢的遗传障碍(比如葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏(G6PD)和丙酮酸激酶缺乏),免疫介导的溶血性贫血(直接库姆斯测试是阳性的)比如自身免疫性溶血性贫血——其包括热抗体自身免疫性溶血性贫血(比如特发性、系统性红斑狼疮(SLE)和伊凡斯综合征(抗血小板抗体和溶血性抗体))和冷抗体自身免疫性溶血性贫血(比如特发性冷凝集素综合征、传染性单核细胞增多症和阵发性冷血红蛋白尿),同种免疫性溶血性贫血——其包括新生儿溶血病(HDN)(比如Rh病(RhD)、新生儿ABO溶血病、新生儿抗Kell溶血病、新生儿Rhesus C溶血病、新生儿Rhesus E溶血病、和其它血型不相容(RhC、Rhe、Kid、Duffy、MN、P和其它)),包括青霉素(该剂量)和甲基多巴的药物诱导的免疫介导的溶血性贫血,血红蛋白病(即在其中,这些是不稳定的或结晶的血红蛋白),阵发性夜间血红蛋白尿(罕见的红细胞表面蛋白的获得性克隆障碍),对RBC的直接物理伤害——其包括微血管病性溶血性贫血和继发于人工心脏瓣膜(一个或多个),再生障碍性贫血比如范康尼贫血、戴-布二氏(Diamond-Blackfan)贫血(遗传性纯红细胞发育不全)和获得性纯红细胞发育不全;细胞数目减少,例如骨髓增生异常综合征,骨髓纤维化,中性粒细胞减少(中性粒细胞数目减少),粒细胞缺乏,格兰兹曼血小板机能不全和血小板减少(血小板数目减少)——其包括特发性血小板减少性紫癜(ITP)、血栓性血小板减少性紫癜(TTP)和肝素诱导的血小板减少(HIT);骨髓增殖性障碍(细胞数目增加),例如真性红细胞增多(一般而言,细胞数目增加)、红细胞增多(红细胞数目增加)、白细胞增多(白细胞数目增加)、血小板增多(血小板数目增加)和骨髓增殖性障碍;凝血病(出血和凝血的障碍),例如血小板增多,复发性血栓形成,播散性血管内凝血,凝血蛋白障碍——其包括血友病比如血友病A、血友病B(也称为克里斯马斯病)和血友病C,维勒布兰德病,播散性血管内凝血,蛋白S缺乏,和抗磷脂综合征,和血小板障碍——其包括血小板减少、格兰兹曼血小板机能不全和威-奥二氏(Wiskott-Aldrich)综合征。而且,血液学疾病的实例还包括血液学恶性肿瘤,其包括血液学恶性肿瘤,例如淋巴瘤——其包括何杰金病和非何杰金淋巴瘤比如伯基特淋巴瘤、间变性大细胞淋巴瘤、脾边缘区淋巴瘤、肝脾T-细胞淋巴瘤和血管成免疫细胞T-细胞淋巴瘤(AILT),骨髓瘤比如多种骨髓瘤、沃尔丹斯特伦巨球蛋白血症和浆细胞瘤,白血病比如急性淋巴细胞性白血病(ALL)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、急性髓性白血病(AML)、慢性特发性骨髓纤维化(MF)、慢性髓性白血病(CML)、T-细胞幼淋巴细胞性白血病(T-PLL)、B-细胞幼淋巴细胞性白血病(B-PLL)、慢性中性粒细胞性白血病(CNL)、毛细胞白血病(HCL)、T-细胞大颗粒淋巴细胞白血病(T-LGL)和攻击性NK-细胞白血病。而且,血液学疾病的实例还包括混杂的血液学疾病,其包括血色病,无脾,脾功能亢进比如高歇病,意义未定的单克隆丙种球蛋白病(monoclonal gammopathy of undetermined significance),噬血细胞性淋巴组织细胞增生症和Tempi综合征。而且,血液学疾病的实例还包括继发于非血液学障碍的血液学改变,其包括慢性疾病的贫血、传染性单核细胞增多症、AIDS、疟疾和利什曼病。
而且,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗,可以用于(制备用于如下的药物)预防、治疗和/或减轻移植排斥,其包括例如移植物抗宿主反应。移植排斥包括移植物的超急性排斥、急性排斥和慢性排斥。移植排斥的实例包括皮肤、肾、心、肺、胰腺、肝、血细胞、骨髓、角膜、意外切断的肢体(具体地手指、手、足)、脸、鼻、骨骼、心脏瓣膜、血管或肠移植排斥反应。
施用模式
根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗可以以如上面描述的任何方式被施用,包括口服地、肠胃外地、静脉内地、直肠地、或其组合。肠胃外施用包括但不限于静脉内、动脉内、腹膜内、皮下、真皮内和肌肉内。根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗还可以优选地经由外用、瘤内、真皮内、皮下、肌肉内、鼻内、或结内途径被施用。根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗还可以以植入物的形式被施用,其允许缓慢释放组合物以及缓慢控制的i.v.输注。例如,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗还可以被皮下地施用。
根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗的施用可以需要多个连续的注射。因而,施用可以被重复至少两次,例如一次作为初次免疫注射和后者作为加强注射。
具体地,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗可以被重复地或连续地施用。根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗可以被重复地或连续地施用持续至少1、2、3、或4周;2、3、4、5、6、8、10、或12个月;或2、3、4、或5年的时期。
而且,组成根据本发明的复合物的细胞穿透肽,组分a)、b)和c),即至少一种抗原或抗原表位和至少一种TLR肽激动剂可以被包含在单独的组合物中,其紧接着施用前混合或其被同时施用至需要其的对象。
根据一个方法,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗可以使用如上面描述的施用途径被直接地施用至患者,具体地对于药物组合物。可选地,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗可以使用离体方法被施用至患者,例如通过将如上面限定的药物组合物、疫苗或本发明的转运蛋白货物缀合分子导入细胞,优选地自体细胞,即源自待治疗的患者的细胞,和将这些细胞移植入待治疗的患者的部位,任选地在治疗之前储存和/或培养这些细胞之后。
作为单个或多个剂量被施用至个体的剂量将取决于各种因素改变,包括药代动力学性质、对象状况和特性(性别、年龄、体重、健康、大小)、症状的程度、同步治疗、治疗的频率和期望的效果。
通常,对于癌症治疗,根据本发明的复合物的治疗有效剂量是大约0.01mg至5mg/注射,具体地大约0.1mg至2mg/注射,或大约0.01nmol至1mmol/注射,具体地1nmol至1mmol/注射,优选地1μmol至1mmol/注射。
通常,对于癌症治疗,负载有根据本发明的复合物的抗原呈递细胞的治疗有效剂量是大约200,000个细胞至2,000,000个细胞/注射。
联合疗法
根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗在根据本发明的方法和用途中的施用可以单独地或与助剂——其对治疗和/或稳定待治疗或抑制的疾病或障碍是有用的——联合地实施。
例如,在治疗、预防或稳定癌症的情况下,药物组合物在根据本发明的方法和用途中的施用可以与如下物质或任何其它分子联合地实施,所述物质在针对实体瘤的常规化学疗法中使用和用于控制转移的建立,所述分子通过引发程序性细胞死亡起作用,例如选自肿瘤坏死家族成员的助剂,其包括但不限于Fas配体和肿瘤坏死因子(TNF)相关凋亡诱导(TRAIL)配体。根据进一步的实施方式,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗在根据本发明的方法和用途中的施用可以与放射疗法并行地实施。
本发明涵盖根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗的施用,其中在对治疗和/或稳定癌症和/或防止癌症复发(例如多种药物方案)有用的其它治疗方案或助剂之前、同时或之后,它以治疗有效量被施用至对象。与所述助剂同时施用的所述复合物、细胞、组合物、疫苗或药物组合物可以在相同或不同的组合物(一种或多种)中和通过相同或不同的施用途径(一种或多种)被施用。
所述其它治疗方案或助剂可以选自放射疗法、化学疗法、外科手术、靶向疗法(包括小分子、肽和单克隆抗体)、和抗血管生成疗法。抗血管生成疗法在本文被定义为施用直接地或间接地靶向肿瘤相关脉管系统的药剂。
因此,本发明提供了与至少一种助剂——其对治疗和/或稳定癌症和/或防止癌症复发是有用——联合的药物制剂,其包括本发明的复合物或本发明的细胞,具体地本发明的抗原呈递细胞,和至少一种药学上可接受的载体。
而且,根据本发明的复合物;负载有根据本发明的复合物的细胞,比如抗原呈递细胞;本发明的组合物;本发明的药物组合物或本发明的疫苗可以在外科手术后——其中实体瘤已经被去除——作为抵抗复发和/或转移的预防被施用。
而且,成像或诊断组合物在根据本发明的方法和用途中的施用可以单独地或与对成像和/或诊断疑似疾病或障碍有用的助剂联合地被实施。
对象
本发明可以被应用于遭受任何疾病或障碍的任何对象,这具体地取决于由根据本发明的复合物包括的至少一种抗原或抗原表位的特异性。具体地,所述复合物的治疗作用可以引起针对所述抗原或抗原表位的免疫应答,具体地依赖于CD4+辅助T细胞和/或CD8+细胞毒性T细胞和/或受限于MHC I类分子和/或MHC II类分子的应答。
优选地,根据本发明的对象是遭受癌症的对象,例如来自脑、结肠、头或颈的癌症,或来自宫颈癌。更优选地,根据本发明的对象是遭受包括胶质瘤的脑癌的对象。
也优选的是根据本发明的对象已经经历肿瘤的外科手术去除。
可选地,根据本发明的对象是遭受传染性疾病的对象。
本发明在范围上不受限于本文描述的具体的实施方式。事实上,除本文描述的那些之外,本发明的多种修改将根据前面的描述和附图对本领域技术人员变得显而易见。这样的修改落入所附权利要求的范围内。
本文引用的所有参考文献在此通过引用并入。
除非另外定义,本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域普通技术人员一般理解的相同的含义。虽然与本文描述的那些类似或等价的方法和材料可以用于本发明的实践或测试,但是下面描述了合适的方法和材料。本文提及的所有出版物、专利申请、专利、和其它参考文献通过引用以其全部并入。在冲突的情况下,将以包括定义的本说明书为准。此外,材料、方法和实例仅仅是说明性的并且不意欲是限制性的。
附图说明
在下列中将给出附图说明。附图意欲更详细地说明本发明。然而,它们不意欲以任何方式限制本发明的主题。
图1:针对实施例1显示了通过来自一个单一棕黄层(buffy)的人血单核细胞来源的树突细胞(DC)的活化标志物CD40的表达。DC在48h期间使用300nM的EDAZ13Mad5、Z13Mad5、Mad5或25ng/ml的LPS进行刺激。还进行每种条件的同种型染色(同种型不显示在图1中)(一个实验)。
图2:针对实施例1显示了通过来自一个单一棕黄层的人血单核细胞来源的树突细胞(DC)的活化标志物CD86的表达。DC在48h期间使用300nM的EDAZ13Mad5、Z13Mad5、Mad5或25ng/ml的LPS进行刺激。还进行每种条件的同种型染色(同种型不显示在图2中)(一个实验)。
图3:针对实施例1显示了通过来自一个单一棕黄层的人血单核细胞来源的树突细胞(DC)的活化标志物HLADR的表达。DC在48h期间使用300nM的EDAZ13Mad5、Z13Mad5、Mad5或25ng/ml的LPS进行刺激。还进行每种条件的同种型染色(同种型不显示在图3中)(一个实验)。
图4:针对实施例1显示了通过来自一个单一棕黄层的人血单核细胞来源的树突细胞(DC)的活化标志物CD83的表达。DC在48h期间使用300nM的EDAZ13Mad5、Z13Mad5、Mad5或25ng/ml的LPS进行刺激。还进行每种条件的同种型染色(同种型不显示在图4中)(一个实验)。
图5:针对实施例2显示了使用来自不同TCR转基因小鼠的骨髓来源的树突细胞(BMDC)和脾细胞的鼠体外系统中的功能性MHC I类限制的交叉呈递。为了该目的,BMDC过夜负载有300nM的EDAZ13Mad5、EDAMad5或Mad5。高效的MHC I类限制的OVACD8表位和gp100表位的呈递在4天后分别使用CFSE标记的OT1细胞和P-Mel细胞进行监测。高效的MHC II类限制的OVACD4表位的呈递在4天后使用CFSE标记的OT2细胞进行监测。作为对照,BMDC使用5μM肽脉冲1h(代表2个独立实验的一个实验)。
图6:针对实施例3显示了2nmol组的结果。C57BL/6小鼠使用2nmol的EDAMad5或EDAZ13Mad5被接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。阳性对照组使用Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)进行接种疫苗。小鼠在最后一次接种疫苗后7天被抽血并且进行五聚体染色(3-4只小鼠/组,一个实验)。
图7:针对实施例3显示了10nmol组的结果。C57BL/6小鼠使用10nmol的EDAMad5或EDAZ13Mad5被接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。阳性对照组使用Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)进行接种疫苗。小鼠在最后一次接种疫苗后7天被抽血并且进行五聚体染色(3-4只小鼠/组,一个实验)。
图8:针对实施例3显示了测试的所有组的五聚体阳性CD8+T细胞的百分数。C57BL/6小鼠使用2nmol或10nmol的EDAMad5或EDAZ13Mad5被接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。阳性对照组使用Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)进行接种疫苗。小鼠在最后一次接种疫苗后7天被抽血并且进行五聚体染色(一个实验,其中3-4只小鼠/组)。
图9:针对实施例4显示了7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);*,p<0.05EDAZ13Mad5对对照组(双向方差检验)。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射10nmol的EDAZ13Mad5、EDAMad5、Mad5或Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)被接种疫苗两次(d5和d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。
图10:针对实施例4显示了个体肿瘤生长曲线(7只个体小鼠/组)。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射10nmol的EDAZ13Mad5、EDAMad5、Mad5或Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)被接种疫苗两次(d5和d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。
图11:针对实施例4显示了(A)7只小鼠/组的存活曲线;*,p<0.05EDAZ13Mad5对对照组(时序检验)和(B)7只小鼠/组的无肿瘤进展曲线(tumor-free progressioncurve);*,p<0.05EDAZ13Mad5对对照组(时序检验)。
图12:针对实施例5显示了每个实验组的转移的数目。C57BL/6小鼠i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞并且通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射2nmol的EDAZ13Mad5、EDAMad5或Mad5或Z13Mad5+MPLA(与EDA等摩尔)或单独的MPLA被接种疫苗两次(d0和d9)。小鼠在第13天被处死并且回收肺。对每个肺进行转移灶数目的计数。**,p<0.01;****,p<0.0001(非配对T检验)。
图13:针对实施例6显示了每个实验组的转移的数目。C57BL/6小鼠通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射2nmol的EDAZ13Mad5、EDAMad5或Mad5或Z13Mad5+MPLA(与EDA等摩尔)被接种疫苗两次(d-21和d-7)。在第0天,小鼠i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞。小鼠在第14天被处死并且回收肺。对每个肺进行转移灶数目的计数。*,p<0.05;***,p<0.0001(非配对T检验)。
图14:显示了实施例8的结果。HEK-hTLR2细胞系在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用0.3μM、1μM或3μM的AnaxaZ13Mad5或Z13Mad5Anaxa进行刺激并且在37℃下培育24h。阳性对照使用500ng/ml的Pam3CSK4进行。(A)二十微升的上清液被添加至检测培养基并且在OD读取(620nm)前在37℃下培育1h。(B)定量上清液中的IL-8分泌(通过ELISA)。
图15:显示了实施例9的结果。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa或axaZ13Mad5被接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。小鼠在最后一次接种疫苗后7天被抽血并且进行五聚体染色(一个实验)。
图16:显示了实施例9的结果。C57BL/6小鼠使用2nmol Z13Mad5Anaxa或axaZ13Mad5被接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。小鼠在最后一次接种疫苗后7天被抽血并且进行五聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。*,p<0.05。
图17:针对实施例10显示了7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM)。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中皮下注射10nmol的AnaxZ13Mad5、Z13Mad5Anaxa或共注射Z13Mad5+Pam3CSK4(与Anaxa等摩尔)被接种疫苗两次(d5和d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。*,p<0.05;***,p<0.001,****,p<0.0001。
图18:针对实施例10显示了个体肿瘤生长曲线(7只个体小鼠/组)。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射10nmol的AnaxZ13Mad5、Z13Mad5Anaxa或共注射Z13Mad5+Pam3CSK4(与Anaxa等摩尔)被接种疫苗两次(d5和d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。
图19:针对实施例10显示了7只小鼠/组的存活曲线。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中皮下注射10nmol的AnaxZ13Mad5、Z13Mad5Anaxa或共注射Z13Mad5+Pam3CSK4(与Anaxa等摩尔)被接种疫苗两次(d5和d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。*,p<0.05,**,p<0.01,****,p<0.0001(时序检验)。
图20:针对实施例11显示了7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM)。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中皮下注射2nmol的Hp91Z13Mad5、EDAZ13Mad5、Z13Mad5Anaxa、Z13Mad5EDA或Z13Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)被接种疫苗两次(d5和d13)。*,p<0.05;**,p<0.01;***,p<0.001;****,p<0.0001(在第23天,双向方差检验)。
图21:针对实施例11显示了个体肿瘤生长曲线(7只个体小鼠/组)。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射2nmol的Hp91Z13Mad5、EDAZ13Mad5、Z13Mad5Anaxa、Z13Mad5EDA或Z13Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)被接种疫苗两次(d5和d13)。
图22:针对实施例11显示了所有7只小鼠/组的存活曲线。存活中位数被指示在图表上(m.s.)。*,p<0.05;**,p<0.01(时序检验)。
图23:针对实施例12显示了7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);****,p<0.0001(时序检验)。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中皮下注射0.5nmol、2nmol或10nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗两次(一次在d5并且一次在d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。
图24:针对实施例13显示了在C57BL/6小鼠的血液中检测到的SIINFEKL特异性CD8T细胞应答,所述小鼠使用0.5nmol(A)或2nmol(B)的Z13Mad5Anaxa被s.c.、i.d.或i.m.接种疫苗三次(一次在Wk0,一次在Wk2并且一次在Wk4)。血液在第二次和第三次接种疫苗后7天获得自小鼠并且进行多聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。*,p<0.05。
图25:针对实施例13显示了KLRG1表达(A)和PD-1表达(B),其在多聚体-阳性CD8T细胞上进行分析(一个实验,其中4只小鼠/组)。简略地,C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa被s.c.、i.d.或i.m.接种疫苗三次(一次在Wk0,一次在Wk2并且一次在Wk4)。血液在第二次和第三次接种疫苗后7天获得自小鼠并且进行FACS染色。
图26:针对实施例14显示了C57BL/6小鼠中的SIINFEKL特异性CD8T细胞应答,所述小鼠使用0.5nmol的Z13Mad5Anaxa被结内地接种疫苗两次(一次在Wk0并且一次在Wk2)。血液在第二次接种疫苗后7天获得自小鼠并且进行多聚体染色(3只小鼠/组)。
图27:针对实施例15显示了五聚体-阳性细胞在CD8T细胞之中的百分数(A和B;*,p<0.05)和五聚体-阳性CD8T细胞的KLRG1几何平均值(C和D)。简略地,C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa被s.c.接种疫苗3次(A和C:Wk0、Wk2和Wk4;B和D:Wk0、Wk2和Wk8)。小鼠在最后一次接种疫苗后7天被抽血并且进行五聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。
图28:针对实施例15显示了多聚体-阳性细胞在CD8T细胞之中的百分数(A和D);多聚体-阳性CD8T细胞的KLRG1几何平均值(B和E)和多聚体-阳性CD8T细胞的PD1几何平均值(C和F)。A-C,C57BL/6小鼠在第0天、第3天和第7天被接种疫苗3次并且在第7天和第14天被抽血。D-F,C57BL/6小鼠在第0天、第7天和第14天被接种疫苗3次并且在第14天和第21天被抽血。接种疫苗使用0.5nmol的Z13Mad5Anaxa被s.c.进行。多聚体染色在血液样品上进行(一个实验,其中4只小鼠/组)。
图29:针对实施例16显示了IL-6分泌,其指示在使用如图中指示的多种构建体培育BMDC后的APC活化。简略地,BMDC在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用1μM的Z13Mad5Anaxa、Mad5Anaxa、Z13Mad5、EDAZ13Mad5或EDAMad5进行刺激并且在37℃下培育24h。通过ELISA定量上清液中的IL-6分泌。2至3个独立实验的平均值±SEM。
图30:针对实施例16显示了TNF-α分泌,其指示在使用如图中指示的多种构建体培育Raw 264.7细胞后的APC活化。简略地,Raw 264.7细胞在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用1μM的Z13Mad5Anaxa、Mad5Anaxa或Z13Mad5进行刺激并且在37℃下培育24h。通过ELISA定量上清液中的TNF-α分泌。2至3个独立实验的平均值±SEM。
图31:针对实施例17显示了IL-8分泌,其指示在使用如图中指示的多种构建体培育HEK-hTLR4细胞后的TLR4结合。简略地,HEK-hTLR4细胞在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用1μM的Z13Mad5Anaxa、Mad5Anaxa、Z13Mad5、EDAZ13Mad5或EDAMad5进行刺激并且在37℃下培育24h。通过ELISA定量上清液中的IL-8分泌。2至3个独立实验的平均值±SEM。
图32:针对实施例18显示了具有半治疗(semitherapeutic)设置的肺转移模型中转移的数目。简略地,C57BL/6小鼠i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞并且通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射2nmol的EDAZ13Mad5、Z13Mad5+MPLA(与EDA等摩尔)或单独的MPLA被接种疫苗两次(d0和d9)。小鼠在第13天被处死并且回收肺。对每个肺进行转移灶数目的计数。**,p<0.01(单向方差与Tukey多重比较检验)。
图33:针对实施例19显示了具有半治疗设置的肺转移模型中转移的数目。简略地,C57BL/6小鼠i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞并且通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa、Mad5Anaxa或Z13Mad5+Pam3CSK4(与Anaxa等摩尔)或单独的MPLA被接种疫苗两次(d0和d9)。小鼠在第21天被处死并且回收肺。对每个肺进行转移灶数目的计数。*,p<0.05;**,p<0.01(非配对t检验)。
图34:针对实施例20显示了SIINFEKL特异性CD8T细胞在Quad-Gl261成胶质细胞瘤模型中的定量。简略地,C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa被接种疫苗两次(d7和d21)。在第28天,SIINFEKL特异性CDS T细胞通过多聚体染色在血液中和在BIL中被定量(5-8只小鼠/组)。
图35:针对实施例20显示了细胞因子分泌。简略地,C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa被接种疫苗两次(d7和d21)。BIL被分离并且在进行细胞因子的细胞内染色前在存在布雷菲德菌素A的情况下使用负载或未负载SllNFEKL肽的成熟的BMDC在6h期间进行培养。分泌细胞因子的CD8T细胞的%(5-8只小鼠/组)。
图36:针对实施例21显示了Z13Mad5Anaxa对Quad-Gl261成胶质细胞瘤模型中的存活的作用。简略地,C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗三次(d7、d21和d35)。小鼠每天称重并且当重量减少达到大于15%时被处死。
图37:针对实施例22显示了Z13Mad5Anaxa对预防设置中的皮下EG7-OVA肿瘤模型中的肿瘤生长和存活的作用。简略地,C57BL/6小鼠通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗两次(d-21和d-7),并且然后在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞。使用卡尺测量肿瘤大小。(A)7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);****,p<0.0001(在第30天,双向方差检验)。(B)7只小鼠/组的存活曲线。存活中位数被指示在图表上(m.s.)。***,p<0.001(时序检验)。
图38:针对实施例23显示了Z13Mad5Anaxa对确立的肿瘤上的治疗设置中的皮下B16-OVA肿瘤模型中的肿瘤生长和存活的作用。简略地,C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有1×105个B16-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗两次(d14和d21)。(A)7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);*,p<0.05(在第32天,双向方差检验)。(B)7只小鼠/组的存活曲线。存活中位数被指示在图表上(m.s.)。
图39:针对实施例24显示了Z13Mad5Anaxa中的CPP对皮下EG7-OVA肿瘤模型中的肿瘤生长和存活的作用。简略地,C57BL/6小鼠在第0天在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且然后通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa或Mad5Anaxa被接种疫苗两次(d5和d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。(A)7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);****,p<0.0001。(B)7只小鼠/组的存活曲线。存活中位数被指示在图表上(m.s.)。**,p<0.01;***,p<0.001。
图40:针对实施例25显示了具有不同CPP的复合物对免疫应答的作用。C57BL/6小鼠使用2nmol(A)或0.5nmol(B)的Z13Mad5Anaxa、Z14Mad5Anaxa或Z18Mad5Anaxa被s.c.接种疫苗五次(Wk0、Wk2、Wk4、Wk6和Wk8)。小鼠在第2次、第3次、第4次和第5次接种疫苗后7天被抽血并且进行多聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。*,除在Z18Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的Vac2后之外,在每个时间点处的接种疫苗的小鼠对稚小鼠之间p<0.05。
图41:针对实施例26显示了具有不同CPP的复合物对脾(A)、引流淋巴结(B)和骨髓(C)中的CD8T细胞的作用。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa被s.c.接种疫苗五次(Wk0、Wk2、Wk4、Wk6和Wk8)。在第5次接种疫苗后九天,小鼠被处死,回收器官并且进行多聚体染色。
图42:针对实施例26显示了具有不同CPP的复合物对脾中的T细胞的作用(CD8T细胞应答(A)和CD4T细胞应答(B))。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa被s.c.接种疫苗五次(Wk0、Wk2、Wk4、Wk6和Wk8)。(A)在第5次接种疫苗后九天,对使用SIINFEKL OVACD8肽刺激的脾细胞进行酶联免疫斑点测定。(B)在第5次接种疫苗后九天,对使用OVACD4肽刺激的脾细胞进行酶联免疫斑点测定。
图43:针对实施例26显示了具有不同CPP的复合物对CD8T细胞效应子功能的作用。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa被s.c.接种疫苗五次(Wk0、Wk2、Wk4、Wk6和Wk8)。在第5次接种疫苗后九天,对使用SIINFEKL OVACD8肽刺激的脾细胞进行细胞内染色。
图44:针对实施例27显示了具有不同CPP的复合物对肿瘤生长(A)和存活率(B)的作用。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa被接种疫苗两次(d5和d13)。(A)7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);*,p<0.05;****,p<0.0001(在第28天,双向方差检验)。(B)7只小鼠/组的存活曲线。存活中位数被指示在图表上(m.s.)。*,p<0.05;**,p<0.01;***,p<0.001(时序检验)。
图45:针对实施例28显示了具有不同CPP的复合物对免疫应答的作用。C57BL/6小鼠使用2nmol(A)或0.5nmol(B)的EDAZ13Mad5、EDAZ14Mad5或EDAZ18Mad5被s.c.接种疫苗三次(Wk0、Wk2和Wk4)。小鼠在第3次接种疫苗后7天被抽血并且进行多聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。*,p<0.05。
图46:针对实施例29显示了EDAZ14Mad5对肿瘤生长(A)和存活率(B)的作用。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中s.c.注射2nmol的EDAZ14Mad5被接种疫苗两次(d5和d13)。左图:7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);**,p<0.01(在第27天,双向方差检验)。右图:7只小鼠/组的存活曲线。存活中位数被指示在图表上(m.s.)。
图47:针对实施例30显示了SIINFEKL特异性CD8T细胞在Quad-Gl261成胶质细胞瘤模型中的定量。简略地,C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa被接种疫苗两次(d7和d21)。在第28天,SIINFEKL特异性CD8T细胞通过多聚体染色在血液中和在BIL中被定量(7-16只小鼠/组)。
图48:针对实施例30显示了细胞因子分泌。简略地,C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa被接种疫苗两次(d7和21)。BIL被分离并且在进行细胞因子的细胞内染色前在存在布雷菲德菌素A的情况下使用负载或未负载SllNFEKL肽的成熟的BMDC在6h期间进行培养。分泌细胞因子的CD8T细胞的%(7-16只小鼠/组)。
图49:针对实施例31显示了Z13Mad8Anaxa对脾中的T细胞的作用(CD8T细胞应答(A)和CD4T细胞应答(B))。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad8Anaxa被s.c.接种疫苗四次(Wk0、Wk2、Wk4和Wk6)。(A)在第4次接种疫苗后一周,对使用gp70CD8肽刺激的脾细胞进行酶联免疫斑点测定。(B)在第4次接种疫苗后一周,对使用gp70CD4肽肽刺激的脾细胞进行酶联免疫斑点测定。
图50:针对实施例32显示了Z13Mad11Anaxa对B16肺转移模型中转移的数目(A)和对脾中的T细胞应答(B)的作用。C57BL/6小鼠使用1nmol的Z13Mad11Anaxa被s.c.接种疫苗两次(第0天、第10天)。
图51:针对实施例33显示了Z13Mad9Anaxa对脾中的T细胞的作用(CD8T细胞应答)。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad9Anaxa被s.c.接种疫苗四次(Wk0、Wk2、Wk4和Wk6)。在第4次接种疫苗后一周,对使用adpgk肽刺激的脾细胞进行酶联免疫斑点测定。
图52:针对实施例34显示了具有不同CPP的复合物对免疫应答的作用。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa或TatFMad5Anaxa被s.c.接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。小鼠在第2次接种疫苗后7天被抽血并且进行多聚体染色(一个实验,其中8只小鼠/组)。
图53:针对实施例35显示了SIINFEKL特异性CD8T细胞在稚小鼠中的定量。简略地,C57BL/6小鼠通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa(“Z13Mad5Anaxa”组)或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa(“Z13Mad5+Anaxa”组)被接种疫苗一次(第0天)。SIINFEKL特异性CD8T细胞通过多聚体染色在血液中被定量(4-8只小鼠/组)。
图54:针对实施例36显示了Z13Mad12Anaxa对血液中的T细胞的作用(CD8T细胞应答)。C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad12Anaxa被s.c.接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。在第2次接种疫苗后一周,在血细胞上进行新抗原reps1的多聚体染色。
图55:针对实施例37显示了通过来自一个单一棕黄层的人血单核细胞来源的树突细胞(DC)的活化标志物HLA-DR、CD83、CD80和CD86(从左至右)的表达。DC在48h期间使用300nM的Z13Mad5Anaxa(下图)或Z13Mad5(上图)进行刺激。还如显示的进行每种条件的同种型染色。
具体实施方式
实施例
在下列中,呈现了说明本发明的多种实施方式和方面的具体的实施例。然而,本发明在范围上不受限于本文描述的具体的实施方式。给出下列制剂和实施例以使得本领域技术人员能够更清楚地理解和实践本发明。然而,本发明在范围上不受限于示例性实施方式,其仅仅意欲作为本发明的单个方面的说明,并且功能上等价的方法在本发明的范围内。事实上,除本文描述的那些之外,本发明的多种修改将根据前面的描述、附图和下面的实施例对本领域技术人员变得显而易见。所有这样的修改均落入所附权利要求的范围内。
实施例1:体外人树突细胞成熟
该研究的目标是调查根据本发明的复合物诱导树突细胞的成熟的能力。在本研究中,根据本发明的复合物是融合蛋白,其包括细胞穿透肽“Z13”,蛋白质“MAD5”——其由来自多种抗原的不同的CD8+和CD4+表位组成,和TLR4肽激动剂“EDA”。因此,设计了在N-端位置处具有EDA肽的融合蛋白和不具有Z13或EDA或二者的不同的对照缀合蛋白(controlconjugated proteins)。
即,下列构建体被设计,由此在氨基酸序列中,细胞穿透肽“Z13”加下划线地显示并且TLR肽激动剂“EDA”以斜体显示:
EDAZ13Mad5
序列:
[SEQ ID NO:26]
分子量:25’057Da
特性:
-Mad5货物包含OVACD4、gp100CD8、EαCD4和OVACD8表位
-包含EDA TLR激动剂(Lasarte,J.J.,et al.,The extra domain A fromfibronectin targets antigens to TLR4-expressing cells and induces cytotoxic Tcell responses in vivo.J Immunol,2007.178(2):p.748-56)
-储存缓冲剂:50mM Tris-HCl,150mM NaCl,10%甘油,2mM DTT,1M L-精氨酸,pH8
-内毒素水平:<0.01EU/μg
Z13Mad5
序列:
[SEQ ID NO:29]
分子量:15’196Da
特性:
-Mad5货物包含OVACD4、gp100CD8、EαCD4和OVACD8表位
-储存缓冲剂:50mM Tris-HCl,150mM NaCl,10%甘油,2mM DTT,1M L-精氨酸,pH9
-内毒素水平:
ο第1批:0.32EU/mg
ο第2批:0.44EU/mg
Mad5
序列:
[SEQ ID NO:30]
分子量:10’154.6Da
特性:
-Mad5货物包含OVACD4、gp100CD8、EαCD4和OVACD8表位
-储存缓冲剂:50mM Tris-HCl,150mM NaCl,10%甘油,2mM DTT,0.5M L-精氨酸,pH 8
-内毒素水平:0.069EU/mg
调查EDAZ13Mad5、Z13Mad5和Mad5蛋白诱导人树突细胞(DC)成熟的能力。在使用300nM的蛋白质在48h期间培育后,通过FACS在人DC上评估活化标志物表达(CD86、CD40、CD83和HLA-DR)(图1-4)。每种蛋白质的具体的缓冲剂被用作阴性对照。
CD40的结果显示在图1中,CD86的结果显示在图2中,HLADR的结果显示在图3中,并且CD83的结果显示在图4中。EDAZ13Mad5诱导通过CD86、HLADR和CD83的上调显示的人DC的成熟,而Z13Mad5和Mad5蛋白不能够活化人DC。这些结果指示蛋白质的EDA部分负责人DC上活化标志物的上调。
实施例2:体外表位呈递(MHC I)
该研究的目标是使用来自不同TCR转基因小鼠的骨髓来源的树突细胞(BMDC)和脾细胞评估鼠体外系统中的功能性MHC I类限制的交叉呈递。为了该目的,使用构建体EDAZ13Mad5与Mad5(在上面的实施例1中描述的)和构建体EDAMad5:
EDAMad5
序列
[SEQ ID NO:31]
分子量:20’017Da
特性:
-Mad5货物包含OVACD4、gp100CD8、EαCD4和OVACD8表位
-包含EDA TLR激动剂
-储存缓冲剂:50mM Tris-HCl,150mM NaCl,10%甘油,2mM DTT,0.5M L-精氨酸,pH 8
-内毒素水平:1.8EU/mg
BMDC过夜负载有300nM的包含OVACD8、OVACD4和gp100表位的EDAMad5,EDAZ13Mad5和Mad5蛋白。这些MHC I限制的OVACD8和gp100表位的加工和呈递通过分别测量来自OT-1T细胞受体(TCR)转基因小鼠的稚OVA257-264特异性CD8+T细胞和来自P-mel T细胞TCR转基因小鼠的gp100特异性CD8+T细胞的体外增殖进行监测。因此,高效的MHC I类限制的OVACD8表位和gp100表位的呈递在4天后分别使用CFSE标记的OT1细胞和P-Mel细胞进行监测。MHC II限制的OVACD4表位的加工和呈递通过测量来自OT-2T细胞受体(TCR)转基因小鼠的稚OVA323-339特异性CD4+T细胞的体外增殖进行监测。因此,高效的MHC II类类限制的OVACD4表位的呈递在4天后使用CFSE标记的OT2细胞进行监测。作为对照,BMDC使用5μM肽脉冲1h(代表2个独立实验的一个实验)。
结果显示在图5中。观察到所有评估的基于Mad5的蛋白质的类似的交叉呈递和加工能力。
实施例3:CD8T细胞免疫应答
为了调查EDA缀合蛋白在诱导多克隆CD8+T细胞应答中的功效,C57BL/6小鼠通过皮下注射2nmol或10nmol的构建体EDAZ13Mad5或EDAMad5(在实施例1和2中描述的)被接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。阳性对照组使用Mad5和TLR4激动剂MPLA(与EDA等摩尔)被接种疫苗。两种剂量被评估:2nmol的构建体(图6)和10nmol的构建体(图7)。每组使用3-4只小鼠。
在最后一次接种疫苗后七天,小鼠被抽血并且进行五聚体染色以监测血液中的OVA特异性免疫应答。在图8中,对于测试的所有组和两种剂量显示五聚体阳性CD8+T细胞的百分数。
有趣地,这些数据显示了与2nmol比较,免疫应答在10nmol下更低。在两种剂量下,2nmol和10nmol,与EDAMad5组形成对比,在EDAZ13Mad5组中更一致地观察到疫苗介导的免疫应答。而且,当TLR4激动剂与疫苗缀合时,存在增加的免疫应答。
实施例4:对基准EG.7-OVA肿瘤模型中肿瘤生长的疫苗功效
为了评价EDA构建体蛋白对肿瘤生长控制的作用,选择EG.7-OVA胸腺瘤细胞的s.c.模型。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞。在肿瘤植入后,小鼠在第5天和第13天使用10nmol的下列构建体(关于构建体描述参阅实施例1和2)之一在右胁中被s.c.接种疫苗:EDAZ13Mad5、EDAMad5、Mad5、或Mad5和MPLA(与EDA等摩尔)。使用卡尺测量肿瘤大小。
图9显示了7只小鼠/组的肿瘤生长(平均值±SEM);*,p<0.05EDAZ13Mad5对对照组(双向方差检验)。图10显示了个体肿瘤生长曲线(7只个体小鼠/组)。图11A显示了7只小鼠/组的存活曲线;*,p<0.05EDAZ13Mad5对对照组(时序检验)。图11B显示了7只小鼠/组的无肿瘤进展曲线;*,p<0.05EDAZ13Mad5对对照组(时序检验)。
结果显示了在治疗设置中,EDAZ13Mad5是与对照组比较显著地控制肿瘤生长的仅有的蛋白质疫苗,其具有显著更好的无肿瘤进展曲线和存活曲线。
结果因此表明构建体蛋白EDAZ13Mad5是用于控制治疗设置中的肿瘤生长的高度有效的疫苗。
实施例5:对黑素瘤转移模型中肿瘤生长的疫苗功效
为了使用半治疗设置中的B16-OVA肿瘤细胞评估肺转移模型中的功效,使用不同的构建体蛋白:EDAMad5、EDAZ13Mad5、Z13Mad5+MPLA(关于构建体的设计参阅实施例1和2)、和单独的MPLA。C57BL/6小鼠i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞,并且同时(d0)在右胁中通过皮下注射施用2nmol的疫苗(EDAMad5、EDAZ13Mad5、Z13Mad5+MPLA、单独的MPLA)。九天后,小鼠使用相同的剂量被第二次接种疫苗。进一步的对照组使用2nmol的Z13Mad5和TLR4激动剂MPLA(与EDA等摩尔)或单独的MPLA被接种疫苗。小鼠在第13天被处死并且回收肺。对每个肺进行转移灶数目的计数。结果在图12中显示。
结果显示了缀合物EDAZ13Mad5与Z13Mad5+MPLA一样有效地抑制肺中的肿瘤转移。另外,EDA-Mad5比EDAZ13Mad5更低效,其指示Z13在疫苗功效中的关键作用。
实施例6:对黑素瘤转移模型-预防设置中肿瘤生长的疫苗功效
另外,不同的构建体蛋白EDAMad5、EDAZ13Mad5、和Z13Mad5+MPLA(关于构建体的设计参阅实施例1和2)的功效在预防设置中的肺转移模型中被评估。在植入肿瘤细胞(d-21和d-7)前21和7天,C57BL/6小鼠通过在右胁中的皮下(s.c.)皮下注射2nmol的EDAZ13Mad5、EDAMad5或Z13Mad5+MPLA(与EDA等摩尔)被接种疫苗。在第0天,小鼠被i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞。小鼠在第14天被处死并且回收肺小鼠。结果显示在图13中。
实施例7:包括TLR2肽激动剂的进一步的构建体的设计
在此,根据本发明的复合物又是融合蛋白,其包括细胞穿透肽“Z13”,蛋白质“MAD5”——其由来自多种抗原的不同的CD8+和CD4+表位组成,和TLR2肽激动剂“Anaxa”。因此,设计了在C-端或N-端位置处具有Anaxa肽的融合蛋白。
即,下列构建体被设计,由此在氨基酸序列中,细胞穿透肽“Z13”加下划线地显示并且TLR肽激动剂“Anaxa”以斜体显示
AnaxaZ13Mad5
序列:
[SEQ ID NO:27]
分子量:18973Da
特性:
-Mad5货物包含OVACD4、gp100CD8、EαCD4和OVACD8表位
-包含膜联蛋白的35-mer肽
-储存缓冲剂:50mM Tris-HCl,150mM NaCl,10%甘油,2mM DTT,0.5M L-精氨酸,pH 8
-内毒素水平:5.17EU/mg
Z13Mad5Anaxa
序列:
[SEQ ID NO:28]
分子量:18973Da
特性:
-Mad5货物包含OVACD4、gp100CD8、EαCD4和OVACD8表位
-包含膜联蛋白的35-mer肽
-储存缓冲剂:50mM Tris-HCl,150mM NaCl,10%甘油,2mM DTT,0.5M L-精氨酸,pH 8
-内毒素水平:3.1EU/mg
实施例8:TLR2结合(HEK-hTLR2细胞系)
该研究的目标是评估Z13Mad5Anaxa和AnaxaZ13Mad5构建体蛋白(关于这些构建体蛋白的涉及参阅实施例7)是否能够结合作为激动剂的TLR2。HEK-BlueTM hTLR2在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用0.3μM、1μM或3μM的AnaxaZ13Mad5或Z13Mad5Anaxa进行刺激并且在37℃下培育24h。阳性对照使用500ng/ml的Pam3CSK4、TLR2激动剂进行。
为了监测NF-κB/AP1的活化,二十微升的上清液被添加至检测培养基并且在OD读取(620nm)前在37℃下培育1h。结果显示在图14A中。
通过ELISA定量上清液中IL-8的分泌。结果显示在图14B中。
结果(图14A、B)显示了Z13Mad5Anaxa和AnaxaZ13Mad5能够类似地以剂量依赖方式结合至TLR2。
实施例9:特异性CD8+T细胞的体内诱导
为了调查实施例7的Anaxa缀合蛋白在诱导CD8+T细胞应答中的功效,C57BL/6小鼠通过皮下注射2nmol的AnaxaZ13Mad5或2nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。在最后一次接种疫苗后七天,小鼠被抽血并且监测血液中的OVA特异性免疫应答,进行五聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。结果显示在图15和16中。
这些数据指示Z13Mad5Anaxa疫苗和AnaxaZ13Mad5构建体二者均引发强烈的免疫应答。
实施例10:对肿瘤生长的治疗作用
为了评价在实施例7中设计的Anaxa缀合构建体蛋白对肿瘤生长控制的作用,使用基准肿瘤模型,即s.c.植入EG.7-OVA胸腺瘤细胞。
C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞。在肿瘤植入后,三组每组7只小鼠在第5天和第13天通过皮下注射10nmol的AnaxZ13Mad5(第1组),Z13Mad5Anaxa(第2组)或Z13Mad5和Pam3CSK4(与Anaxa等摩尔;第3组)在右胁中被s.c.接种疫苗。为了比较对与外部佐剂混合的蛋白质的作用,对照组使用Z13Mad5和Pam3CSK4(与Anaxa等摩尔)被接种疫苗。使用卡尺测量肿瘤大小。结果显示在图17–19中。
在治疗方案中,Z13Mad5Anaxa和AnaxaZ13Mad5与对照组比较是用于控制肿瘤生长的更好的蛋白质疫苗,即Z13Mad5和Pam3CSK的共注射显示了显著更好的存活曲线。具体地,与和Pam3CSK4单独施用的Z13Mad5相比,Z13Mad5Anaxa和AnaxaZ13Mad5展现了显著更高的功效。结果因此表明构建体蛋白Z13Mad5Anaxa和AnaxaZ13Mad5是有希望的缀合疫苗,其用于控制治疗设置中的肿瘤生长。
实施例11:对肿瘤生长的治疗作用——比较使用不同TLR激动剂的构建体
该研究的目标是比较缀合至不同TLR激动剂的不同构建体蛋白疫苗——即实施例1和7的EDAZ13Mad5和Z13Mad5Anaxa——对肿瘤生长控制的功效。为了该目的,如先前在实施例10中描述中的,C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105EG.7-OVA胸腺瘤细胞。小鼠(7只个体小鼠/组)在第5天和第13天使用2nmol的EDAZ13Mad5、Z13Mad5Anaxa或共注射的Z13Mad5+MPLA(与EDA等摩尔)在右胁中被s.c.接种疫苗。
结果显示在图20、21和22中。在该实验设置中,Z13Mad5Anaxa、EDAZ13Mad5和Z13Mad5+MPLA能够类似地显著控制肿瘤生长。而且,这些数据指示在该实验设置中,Z13Mad5Anaxa是显著控制肿瘤生长的最好的构建体并且EDAZ13Mad5轻微优于Z13Mad5+MPLA。
实施例12:Z13Mad5Anaxa对肿瘤生长控制的剂量效应
为了鉴定缀合疫苗的最佳剂量,评估三种不同剂量(0.5nmol、2nmol和10nmol)的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)的控制肿瘤生长的能力。在如先前在实施例10中描述的EG.7-OVA胸腺瘤细胞的s.c.模型中评价Z13Mad5Anaxa构建体的剂量效应。在肿瘤植入后,小鼠在0.5、2或10nmol的Z13Mad5Anaxa下在治疗设置中被接种疫苗两次(在肿瘤植入后第5天和第13天)。
C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中皮下注射0.5nmol、2nmol或10nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗两次(d5和d13)。使用卡尺测量肿瘤大小。
7只小鼠/组的肿瘤生长在图23中被描绘。那些数据显示0.5和2nmol的剂量至少与10nmol在用于控制肿瘤生长上一样有效。
实施例13:Z13Mad5Anaxa的不同施用途径的作用
该研究基于先前展现Z13Mad5Anaxa缀合疫苗的功效的实施例(参阅实施例7),如上面显示的,所述疫苗能够引发特异性免疫应答并且对控制皮下肿瘤模型EG7中的肿瘤生长是有效的。
为了调查皮下、肌肉内和真皮内施用途径的作用,比较通过皮下、肌肉内和真皮内注射引发的免疫应答。使用来自Pantec Biosolutions的装置进行真皮内注射。
小鼠使用0.5或2nmol的Z13Mad5Anaxa每两周被接种疫苗三次(Wk0、Wk2和Wk4)(参阅实施例7)。为了靶向几种淋巴结,第1次和第3次接种疫苗在右胁中进行而第2次在左胁中完成。在第2次和第3次接种疫苗后1周在血液中分析SIINFEKL特异性CD8+T细胞应答。图24显示了在每次接种疫苗后在C57BL/6小鼠——其使用0.5nmol(图24A)或2nmol(图24B)的Z13Mad5Anaxa被s.c.、i.d.或i.m.接种疫苗三次(Wk0、Wk2和Wk4)——的血液中检测到的SIINFEKL特异性CD8T细胞应答。血液在第2次和第3次接种疫苗后7天获得自小鼠并且进行多聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。
结果指示在测试的两种剂量(0.5和2nmol)下,(i)测试的所有施用途径引发SIINFEKL特异性CD8免疫应答和(ii)皮下接种疫苗引发最强的SIINFEKL特异性CD8免疫应答。对于皮下施用,最大应答在第2次接种疫苗后达到并且在第3次接种疫苗后仍被维持。与皮下接种疫苗比较,通过真皮内和肌肉内接种疫苗引发的第2次接种疫苗后的SIINFEKL特异性CD8免疫应答更低并且在第3次接种疫苗后不增强。
接着,分别通过分析KLRG 1(杀伤细胞凝集素样受体亚家族G成员1)和PD-1评价SIINFEKL特异性CD8T细胞的效应子功能和耗减状态。
为了该目的,C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)被s.c.、i.d.或i.m.接种疫苗三次(Wk0、Wk2和Wk4)。血液在第2次和第3次接种疫苗后7天获得自小鼠并且进行FACS染色。在多聚体-阳性CD8T细胞上分析KLRG1和PD-1表达(一个实验,其中4只小鼠/组)。结果显示在图25中。
这些数据指示KLRG 1的表达在皮下接种疫苗后在SIINFEKL特异性CD8T细胞上强烈地增加。在i.d.或i.m.接种疫苗后,观察到的作用更低。KLRG 1-阳性细胞在SIINFEKL特异性CD8T细胞之中的百分数在s.c.接种疫苗后也被提高(数据未显示)。
与KLRG 1形成对比,对于皮下和肌肉内接种疫苗途径,PD-1表达随着时间和接种疫苗降低。这表明SIINFEKL特异性CD8T细胞没有被耗减。PD1-阳性细胞在SIINFEKL特异性CD8T细胞之中的百分数在s.c.和i.m.接种疫苗后也被减小(数据未显示)。值得注意的是当小鼠皮下地被接种疫苗时,PD-1表达在第2次接种疫苗后更高,其反映了特异性T细胞的早期活化状态(Keir,M.E.,et al.,PD-1and its ligands in tolerance andimmunity.Annu Rev Immunol,2008.26:p.677-704)。
还分析晚期耗减(late exhaustion)标志物Tim-3的表达。所有组均观察到非常低的表达。
总之,结果指示皮下接种疫苗与肌肉内或真皮内注射比较引发最佳的特异性CD8免疫应答。
实施例14:结内施用途径
基于先前的实验(实施例13),另外调查结内施用途径。为了该目的,调查通过结内注射Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)引发的免疫应答。
出于该目的,小鼠首先皮下地注射伊文思蓝,以便使得容易地可视化用于注射的淋巴结,并且结内地注射而不需要侵入性外科手术,例如在Jewell,C.M.,S.C.Lopez,andD.J.Irvine,In situ engineering of the lymph node microenvironment viaintranodal injection of adjuvant-releasing polymer particles.ProcNatl AcadSci US A,2011。108(38):p.15745-50中描述的。
C57BL/6小鼠使用0.5nmol的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)被每两周结内地接种疫苗两次(Wk0和Wk2)。第1次接种疫苗在右腹股沟淋巴结中进行,而第二次接种疫苗在左腹股沟淋巴结中完成。血液在第2次接种疫苗后7天获得自小鼠并且进行多聚体染色(3只小鼠/组)。换句话说,在第2次接种疫苗后一周分析血液中的SIINFEKL特异性CD8+T细胞应答。图26显示了SIINFEKL特异性CD8T细胞应答。那些数据指示结内注射也引发SIINFEKL特异性CD8T细胞。
实施例15:接种疫苗方案
接种疫苗方案评价工作起始于如下目标:鉴定使用如上面描述的相同的Z13Mad5Anaxa构建体(参阅实施例7)的第三次接种疫苗的影响。考虑到先前的结果选择皮下途径。
在实验中,前两次接种疫苗在wk0和Wk2进行而且第3次接种疫苗在wk4(图27A)或在wk8(图27B)进行。因而,C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa被s.c.接种疫苗三次(图27A和C:Wk0、Wk2和Wk4并且图27B和D:Wk0、Wk2和Wk8)。血液在最后一次接种疫苗后7天获得自小鼠并且进行五聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。因此,在第2次和第3次接种疫苗后1周分析SIINFEKL特异性CD8+T细胞应答(图27A和B)。此外,通过分析KLRG 1在特异性CD8T细胞上的表达评价SIINFEKL特异性T细胞的效应子功能(图27C和D)。
数据指示与对照比较,SIINFEKL特异性CD8T细胞的百分数在测试的所有时间点(Vac2和Vac3)以及在两种接种疫苗方案(图27A和B)中均显著增加。
有趣地,在Wk4的第三次接种疫苗使得最突出地增加SIINFEKL特异性CD8T细胞的百分数(图27A)。相同的细胞还通过较高的KLRG 1表达展现了改进的效应子功能(图27C)。相比之下,在Wk8进行的第三次接种疫苗的情况下,在SIINFEKL特异性免疫应答和在KLRG1表达中不能观察到从第二次至第三次接种疫苗的改进。
总之,这些结果指示CD8免疫应答可以通过缩短第二次和第三次接种疫苗之间的延迟增加。
考虑到较早的第三次接种疫苗似乎增加免疫应答,在接下来的研究中调查接种疫苗的两种短的方案:
i)第0天、第3天和第7天三次接种疫苗,和
ii)第0天、第7天和第14天三次接种疫苗。
再次,使用C57BL/6小鼠并且使用0.5nmol的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)进行s.c.接种疫苗。在第2次和第3次接种疫苗后一周获得的血液样品上进行多聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。
因而,在第2次和第3次接种疫苗后一周分析SIINFEKL特异性CD8+T细胞应答(图28A和D)。此外,通过分析KLRG 1在特异性CD8T细胞上的表达评价SIINFEKL特异性T细胞的效应子功能(图28B和28E),并且通过分析特异性T细胞的PD-1表达评价耗减状态(图28C和28F)。
数据指示——类似于关于上面描述的接种疫苗方案的第一个研究——与对照比较,SIINFEKL特异性CD8T细胞的百分数在测试的所有时间点(Vac2和Vac3)以及在两种接种疫苗方案(图27A和B)中均增加(图28A和B)。
然而,与方案wk0-wk2-wk4比较,在第0天、第3天和第7天使用接种疫苗的方案不引发这样高的SIINFEKL特异性CD8T细胞免疫应答。就在第0天、第7天和第14天使用接种疫苗的方案而言,引发的SIINFEKL特异性CD8T细胞免疫应答与先前的方案(d0-d3-d7)比较更好,但是在第3次接种疫苗后不被维持。
总之,接种疫苗方案数据集指示Wk0-Wk2-Wk4接种疫苗方案是用于以高效应子功能诱导有效的OVA特异性CD8免疫应答的最好的接种疫苗方案。
实施例16:TLR激动剂-CPP缀合构建体活化鼠抗原呈递细胞(APC)的能力
为了调查CPP组分和TLR激动剂组分二者在根据本发明的复合物中的作用,再次使用如上面描述的融合蛋白(参阅实施例1、2和7)。
此外,设计进一步的“对照肽”,其也是融合蛋白并且其包括蛋白质“MAD5”——其由来自多种抗原的不同的CD8+和CD4+表位组成,和TLR2肽激动剂“Anaxa”(即没有细胞穿透肽)。因此,下列对照构建体被另外地设计:
Mad5Anaxa
序列:
[SEQ ID NO:32]
分子量:13933Da
特性:
-Mad5货物包含OVACD4、gp100CD8、EαCD4和OVACD8表位
-在C-端位置中包含膜联蛋白的35-mer肽
-储存缓冲剂:50mM Tris-HCl,150mM NaCl,10%甘油,2mM DTT,0.5M L-精氨酸,pH 8
-内毒素水平:第1批–12.15EU/mg
该研究的目的是与缺少细胞穿透肽组分Z13(Mad5Anaxa,参阅上面;EDAMad5,参阅实施例2)或TLR激动剂(Z13Mad5,参阅实施例1)的参考复合物比较,评价根据本发明的两种示例性复合物——即EDAZ13Mad5(参阅实施例1)和Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)——促进抗原呈递细胞活化的能力。
为了该目的,在骨髓来源的树突细胞(BMDC)——其表达除TLR7以外的所有TLR——中评估上面提及的构建体促进抗原呈递细胞(APC)活化的能力。
BMDC在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用1μM的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)、Mad5Anaxa(参阅上面)、Z13Mad5(参阅实施例1)、EDAZ13Mad5(参阅实施例1)或EDAMad5(参阅实施例2)进行刺激并且在37℃下培育24h。
通过监测IL-6在BMDC的培养物上清液中的分泌调查APC活化。通过ELISA定量上清液中的IL-6分泌。
结果显示在图29中。这些数据清楚地显示Z13Mad5Anaxa能够活化BMDC,然而当细胞在存在Z13Mad5或Mad5Anaxa的情况下培养时没有观察到这样的活化。这表明不仅TLR激动剂(Anaxa或EDA)对巨噬细胞和树突细胞的活化至关重要,而且CPP也是必需的。而且存在CPP但没有TLR激动剂是不充分的,但是事实上,CPP和TLR激动剂二者对巨噬细胞和树突细胞的活化至关重要。
那些结果通过使用另一种细胞系被确认,即在Raw 264.7小鼠巨噬细胞细胞系中,其表达除TLR5以外的所有TLR(Applequist,S.E.,R.P.Wallin,and H.G.Ljunggren,Variable expression of Toll-like receptor in murine innate and adaptiveimmune cell lines.Int Immunol,2002.14(9):p.1065-74)。
Raw 264.7细胞在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用1μM的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)、Mad5Anaxa(参阅上面)或Z13Mad5(参阅实施例1)进行刺激并且在37℃下培育24h。
在Raw 264.7细胞中,通过监测TNF-α在Raw 264.7的培养物上清液中的分泌调查APC活化。通过ELISA定量上清液中的TNF-α分泌。结果显示在图30中。
认为CPP可以促进分子进入细胞,其允许细胞内TLR的更好的靶向。
总之,数据揭示了CPP和TLR激动剂二者在缀合构建体内活化APC的关键作用。该作用可能由于帮助构建体进入细胞,因此导致细胞内TLR的最佳靶向。
实施例17:缀合构建体结合人TLR4的能力
最近显示Anaxa肽借助通过TLR2的信号传导拥有佐剂活性(WO 2012/048190A1),然而EDA肽是TLR4的天然配体(Okamura,Y.,et al.,The extradomain A of fibronectinactivates Toll-like receptor 4.J Biol Chem,2001.276(13):p.10229-33)。
而且,如在上面的实施例8和图14中显示的,根据本发明的复合物——其包括Anaxa肽作为TLR激动剂,例如Z13Mad5Anaxa——能够结合至是人TLR2并且促进HEK-hTLR2细胞的IL-8分泌(参阅实施例8,图14)。
在本研究中,评价根据本发明复合物——其包括Anaxa肽作为TLR激动剂或EDA肽作为TLR激动剂——结合至人TLR4的能力。为了该目的,转染有人TLR4(HEK-hTLR4)的HEK细胞在培养基中被接种在平的96-孔板中,其使用1μM的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)、Mad5Anaxa(参阅上面)、Z13Mad5(参阅实施例1)、EDAZ13Mad5(参阅实施例1)或EDAMad5(参阅实施例2)进行刺激并且在37℃下培育24h。通过ELISA定量上清液中的IL-8分泌。
结果显示在图31中。如预期的,使用EDAZ13Mad5培育HEK-hTLR4导致显著的IL-8分泌,其指示EDAZ13Mad5结合至TLR4。与在实施例16中获得的结果一致,EDAMad5(不具有CPP)的IL-8分泌与EDAZ13Mad5比较显著更低,其显示了存在CPP的作用。不包括TLR激动剂的Z13Mad5构建体显示没有IL-8分泌,其指示——如预期的——缺少结合至TLR4。
有趣地,使用构建体Z13Mad5Anaxa培育HEK-hTLR4导致最明显的IL-8分泌,其指示Z13Mad5Anaxa结合至TLR4。这是令人吃惊的,因为Anaxa先前被猜测是TLR2激动剂。另外,不具有CPP的相同的构建体(Mad5Anaxa)导致显著更低的IL-8分泌,其确认了在实施例16中获得的结果。
总之,这些数据(i)确认了在实施例16中获得的结果,(ii)确认了EDA的确是TLR4激动剂,并且(iii)令人吃惊地显示Anaxa肽也是TLR4激动剂(除是TLR2激动剂之外,参阅实施例8和图14)。
实施例18:对肺转移模型-半治疗设置中肿瘤生长的疫苗功效:TLR激动剂EDA
该研究基于实施例6,其显示了根据本发明的复合物——即EDAZ13Mad5——在预防设置中的黑素瘤肺转移模型中的功效(参阅图13)。
在本研究中,使用相同的肺转移模型以及构建体蛋白EDAZ13Mad5和Z13Mad5+MPLA(关于构建体的设计参阅实施例1和2)。然而,在半治疗设置中,C57BL/6小鼠在植入肿瘤细胞的同时(d0)被接种疫苗,并且在植入后九天(d9)进行第二次接种疫苗。通过在右肋中的皮下(s.c.)皮下注射2nmol的EDAZ13Mad5、Z13Mad5+MPLA(与EDA等摩尔)或MPLA进行接种疫苗。在第0天,小鼠i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞并且通过在右肋中皮下(s.c.)皮下注射2nmol的EDAZ13Mad5、Z13Mad5+MPLA(与EDA等摩尔)或单独的MPLA被接种疫苗两次(d0和d9)。小鼠在第13天被处死并且回收肺。结果显示在图32中。
结果显示EDAZ13Mad5在抑制黑素瘤转移的生长方面比Z13Mad5+MPLA轻微地更有效。此外,在仅使用MPLA注射的小鼠中没有观察到佐剂作用。
在预防和半治疗设置中,EDAZ13Mad5和Z13Mad5+MPLA二者显著地抑制黑素瘤转移在肺中的生长。
实施例19:对肺转移模型-半治疗设置中肿瘤生长的疫苗功效:TLR激动剂Anaxa
该研究基于具有相同模型(半治疗设置)和实验方案的实施例18。然而,调查了根据本发明复合物——其包括“Anaxa”肽作为TLR激动剂,而不是实施例18中的EDA TLR激动剂——的功效。
为了该目的,C57BL/6小鼠i.v.植入有1×105个B16-OVA黑素瘤肿瘤细胞并且通过在右肋中的皮下(s.c.)皮下注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa、Mad5Anaxa或Z13Mad5+Pam3CSK4(与Anaxa等摩尔)被接种疫苗两次(d0和d9)。小鼠在第21天被处死并且回收肺。对每个肺进行转移灶数目的计数。结果显示在图33中。
结果显示Z13Mad5Anaxa在抑制黑素瘤转移的生长方面明显地比Z13Mad5+Pam3CSK4更有效。相比之下,Mad5Anaxa不能够控制肺中的转移生长,其再次强调CPP的重要性。
总之,B16-OVA肺转移实验显示Z13Mad5Anaxa在抑制肺中的黑素瘤转移的生长中是高度有效的。
实施例20:成胶质细胞瘤模型中的疫苗功效
在该研究中,使用了另一种癌症模型,即成胶质细胞瘤模型。胶质瘤是成人中原发性脑肿瘤的最常见的形式,其中多形性成胶质细胞瘤(GBM)是最致命的。该肿瘤因其高度侵袭性和攻击性性状而闻名。当前,针对GBM的最佳治疗是包含外科手术、化学疗法和放射疗法的联合,其具有仅仅14.6个月的中位数存活期。对改进胶质瘤患者的预后的新的治疗模态存在急迫的、未满足的医疗需要。T-细胞介导的免疫疗法是连同现有的模态用于胶质瘤的在概念上吸引人的治疗选项,具体地高度侵袭性GBM。
Gl261胶质瘤是致癌物诱导的小鼠胶质瘤模型。该模型代表在免疫活性动物中研发的极少数脑肿瘤模型之一,其具有与人GBM类似的生长特性(Newcomb,E.and D.Zagzag,The murine GL261glioma experimental model to assessnovel brain tumortreatments,in CNS Cancer Models,Markers,Prognostic,Factors,Targets,andTherapeutic Approaches,E.G.Van Meir,Editor.2009,Humana Press:Atlanta.p.227-241;Jacobs,V.L.,et al.,Current review of in vivo GBM rodent models:emphasison the CNS-1tumour model.ASN Neuro,2011.3(3):p.e00063)。低数目的颅内移植的Gl261细胞在C57BL/6小鼠中形成颅内肿瘤(Zhu,X.,et al.,Poly-/CLC promotes theinfiltration of effector T cells into intracranial gliomas via induction ofCXCL10in IFN-αand IFN-γdependent manners.Cancer Immunol lmmunother,2010.59(9):p.1401-9;Zhu,X.,et al.,Toll like receptor-3ligand poly-/CLC promotes theefficacy of peripheral vaccinations with tumor antigen-derived peptideepitopes in murine CNS tumour models.J Transl Med,2007.5:p.10)。细胞是中等免疫原性的:它们能够在肿瘤位点处引发肿瘤特异性免疫应答。然而,肿瘤特异性免疫细胞不能够实现完全肿瘤清除。
最近,M.Ollin通过使Gl261细胞系转染有“Quad盒”——其表达由H-2b I类或II分子呈递的四种肽:人gp10025-33、鸡OVA257-264、鸡OVA323-339和小鼠I-Eα52-68——生成了新的Gl261模型(Ohlfest,J.R.,et al.,Vaccine injectionsite matters:qualitative andquantitative defects in CDB T cells primed as a function of proximity to thetumor in a murine glioma model.JImmunol,2013.190(2):p.613-20)。Quad-Gl261细胞系还稳定地表达萤光素酶,其使得通过生物发光随访肿瘤生长。
该研究的目标是评估根据本发明的复合物在Quad-Gl261成胶质细胞瘤模型中的功效。
在上面描述的成胶质细胞瘤模型中评价根据本发明的复合物——即Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)——的作用。因此在荷载Gl261-Quad肿瘤的小鼠——其使用Z13Mad5Anaxa疫苗被接种疫苗两次(Wk1和Wk3)——中分析肿瘤位点处的T细胞归巢。使用单独施用的Z13Mad5和Anaxa(与Z13Mad5Anaxa等摩尔)接种疫苗的组被用作对照。简略地,C57BL/6小鼠i.c.植入(颅内地)有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa(第1组)或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa(第2组)被接种疫苗两次(在植入之后d7和d21)。在Wk4,分析血液和脑浸润淋巴细胞(BIL),由此在d28,SIINFEKL特异性CD8T细胞通过多聚体染色在血液中和在BIL中被定量(5-8只小鼠/组)。结果显示在图34中。
一般而言,低频率的SIINFEKL特异性CD8T细胞在血液中被定量。然而,在Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的血液中观察到较高百分数的SIINFEKL特异性CD8T细胞。在所有组中,在BIL中存在明显较强的SIINFEKL特异性CD8T细胞的积聚。
在使用Z13Mad5Anaxa两次接种疫苗后,SIINFEKL特异性细胞CD8+T细胞在BIL中的频率比使用Z13Mad5+Anaxa(12%)高2倍(24%)。
接着,评估细胞因子分泌。为了该目的,C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa被接种疫苗两次(d7和21)。BIL被分离并且在进行细胞因子细胞内染色前在存在布雷菲德菌素A的情况下使用负载或未负载SllNFEKL肽的成熟的BMDC在6h期间进行培养。结果显示在图35中。
不管异质性,对于来自使用Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的脑浸润CD8T细胞观察到高水平的细胞因子分泌。这些结果展现了Z13Mad5Anaxa疫苗能够以有效的效应子功能在荷瘤小鼠的脑中引发较强的SIINFEKL特异性CD8T细胞免疫应答。
获得的结果指示Z13Mad5Anaxa对引发高的脑浸润SIINFEKL特异性CD8免疫应答是有效的。Z13Mad5Anaxa能够促进脑中的抗原特异性CD8T细胞的细胞因子分泌。
实施例21:对Gl261-Quad成胶质细胞瘤模型中存活的疫苗功效
在独立实验中,监测对照和Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的存活。治疗设置是在i.c.肿瘤植入之后在第7天、第21天和第35天使用2nmol的Z13Mad5Anaxa的三次连续的接种疫苗。
C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗三次(d7、d21和d35)。小鼠每天称重并且当重量减少达到大于15%时被处死。结果显示在图36中。
结果显示Z13Mad5Anaxa治疗性接种疫苗比对照组更有效,其具有延长10天的中位数存活。
实施例22:对皮下肿瘤模型-预防设置的疫苗功效
该研究基于在实施例10——如在图17–19中显示的——中获得的结果。
为了评价在实施例7中设计的Anaxa缀合构建体蛋白对肿瘤生长控制的作用,使用基准肿瘤模型,即s.c.植入EG.7-OVA胸腺瘤细胞。与实施例10形成对比,其中接种疫苗在第5天和第13天进行,在本研究中评价预防设置,其中小鼠在肿瘤植入前21和7天被接种疫苗。
C57BL/6小鼠通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗两次(d-21和d-7),并且然后在第0天在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞。使用卡尺测量肿瘤大小。
结果以肿瘤体积(图37A)和存活率(图37B)显示在图37中。数据显示使用Z13Mad5Anaxa的预防性接种疫苗对控制肿瘤生长和存活率是高度有效的。与对照小鼠比较,肿瘤的体积在使用Z13Mad5Anaxa处理的小鼠中高度显著减小。与对照小鼠比较,存活率在使用Z13Mad5Anaxa处理的小鼠中高度显著增加。
实施例23:在具有确定的肿瘤的皮下肿瘤模型-治疗设置中的疫苗功效
该研究基于在实施例10——如在图17–19中显示的——中和在图37中显示的实施例22中获得的结果。该研究的目标是评价Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)对确定的肿瘤的作用。
出于该目的,使用B16-OVA黑素瘤细胞的s.c.模型。在该模型中,肿瘤细胞缓慢地扩散,因此允许更大的接种疫苗时间窗口。
一旦肿瘤被确定并且可视,进行使用0.5nmol的低剂量的Z13Mad5Anaxa的第一次接种疫苗,即在肿瘤细胞植入后第14天。第二次接种疫苗在第21天完成。
因而,C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有1×105个B16-OVA肿瘤细胞并且通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa被接种疫苗两次(d14和d21)。监测肿瘤生长和存活曲线。结果显示在图38中。
结果指示Z13Mad5Anaxa有效地控制确定的和可视的肿瘤的生长。而且,与对照比较,确定的和可视的肿瘤存活率在使用Z13Mad5Anaxa治疗的小鼠中增加。
实施例24:皮下肿瘤模型-治疗设置中的疫苗功效:CPP的作用
评价了对应于在实施例10中描述的研究的该研究的方案,不同在于额外的组“Mad5Anaxa”(参阅实施例16)。
简略地,使用基准肿瘤模,即s.c.植入EG.7-OVA胸腺瘤细胞。C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞。在肿瘤植入后,每个7只小鼠的组在第5天和第13天在右胁中通过皮下注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa(第1组)或Mad5Anaxa(第2组)被s.c.接种疫苗并且与对照组比较。使用卡尺测量肿瘤大小。结果显示在图39中。
结果显示与对照小鼠和使用Mad5Anaxa——即没有CPP的构建体——处理的小鼠二者比较,使用Z13Mad5Anaxa处理的小鼠显示了显著减小的肿瘤体积和显著增加的存活率。这些结果指示CPP的存在导致显著减小的肿瘤体积和显著增加的存活率,即导致增加的接种疫苗效率。因此,结果指示——连同在实施例10中获得的结果——CPP和TLR激动剂的存在对肿瘤生长和存活率发挥协同效应。
实施例25:比较使用具有不同细胞穿透肽的复合物的免疫应答的动力学
为了调查不同的CPP在根据本发明的复合物中的作用,使用如上面描述的融合蛋白Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)。
此外,设计了进一步的融合蛋白,其包括不同于Z13的CPP——即Z14(SEQ ID NO:7)或Z18(SEQ ID NO:11)。那些融合蛋白还包括蛋白质“MAD5”——其由来多种抗原的不同的CD8+和CD4+表位组成,和TLR2肽激动剂“Anaxa”。因此,下列构建体被另外地设计:Z14Mad5Anaxa
序列:
(SEQ ID NO:33)
Z18Mad5Anaxa
序列:
(SEQ ID NO:34)
C57BL/6小鼠被分配为八个不同的组(4只小鼠/组):接受2nmol的Z13Mad5Anaxa、Z14Mad5Anaxa或Z18Mad5Anaxa的三组和各自的对照和接受0.5nmol的Z13Mad5Anaxa、Z14Mad5Anaxa或Z18Mad5Anaxa的三组和各自的对照。小鼠被s.c.接种疫苗五次(第0周、第2周、第4周、第6周和第8周)。小鼠在第2次、第3次、第4次和第5次接种疫苗后7天被抽血并且进行多聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。
结果显示在图40中。与对照组比较,使用Z13Mad5Anaxa、Z14Mad5Anaxa或Z18Mad5Anaxa接种疫苗的所有组显示了多聚体-阳性细胞的增加的百分数(除Z18Mad5Anaxa的第二次接种疫苗以外)。这些结果指示具有不同细胞穿透肽的根据本发明的复合物能够在不同的剂量下引发免疫应答。
实施例26:比较使用具有不同细胞穿透肽的复合物的T细胞免疫应答
为了更详细地调查CD8T细胞免疫应答,C57BL/6小鼠被分配为三个不同的组(3–4只小鼠/组):幼稚的、Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa。
Z13Mad5Anaxa组和Z14Mad5Anaxa组的C57BL/6小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7)或Z14Mad5Anaxa(参阅实施例25)被s.c.接种疫苗五次(第0周、第2周、第4周、第6周和第8周)。在第5次接种疫苗后九天,小鼠被处死,回收器官,并且进行多聚体染色以鉴定SIINFEKL特异性CD8T细胞在脾、骨髓和引流淋巴结(腹股沟的和腋窝的)中的百分数。
结果显示在图41中。使用Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠显示了多聚体-阳性细胞的类似的增加,具体地在脾和骨髓中,以及在引流淋巴结中的轻微增加。
为了进一步调查在使用具有不同CPP的复合物的接种疫苗后的CD8T细胞效应子功能,在如上面描述的相同的小鼠的组中,在第5次接种疫苗后九天,在使用SIINFEKL OVACD8肽(SEQ ID NO:35)刺激的脾细胞上进行酶联免疫斑点测定,以便定量产生IFN-γ的细胞。
结果显示在图42A中。与稚小鼠比较,使用Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠显示了产生IFN-γ的细胞的显著增加。与稚小鼠比较,使用Z14Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠也显示了产生IFN-γ的细胞的增加,然而,增加不是显著的,其可能是由于低的小鼠数目(Z14Mad5Anaxa组中3只小鼠)。
为了调查在使用具有不同CPP的复合物的接种疫苗后的CD4T细胞应答,在如上面描述的相同的小鼠的组中,在第5次接种疫苗后九天,在使用OVACD4肽(SEQ ID NO:36)刺激的脾细胞上进行酶联免疫斑点测定,以便定量产生IFN-γ的细胞。
结果显示在图42B中。与稚小鼠比较,使用Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠显示了产生IFN-γ的细胞的高度显著增加。与稚小鼠比较,使用Z14Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠也显示了产生IFN-γ的细胞的增加,然而,增加不是显著的,其可能是由于低的小鼠数目(Z14Mad5Anaxa组中3只小鼠)。
此外,在上面描述的小鼠的组中,在使用SIINFEKL OVACD8肽(SEQ ID NO:35)刺激的脾细胞上进行细胞内染色以鉴定CD107a+IFN-γ+TNF-α+细胞。结果显示在图43中。使用Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠显示了CD107a+IFN-γ+TNF-α+细胞的类似的增加。
实施例27:比较具有不同细胞穿透肽的复合物对EG.7-OVA s.c.模型中的肿瘤生 长和存活的作用
为了调查具有不同细胞穿透肽的复合物对肿瘤生长和存活的作用,使用EG.7-OVAs.c.模型。在d0,C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且被分配为三个不同的组(幼稚的、Z13Mad5Anaxa和Z14Mad5Anaxa)。小鼠在肿瘤植入后d5和d13通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa被接种疫苗两次。
结果显示在图44中。使用Z13Mad5Anaxa或Z14Mad5Anaxa接种疫苗导致与对照小鼠(图44A)比较显著减小的肿瘤体积以及与对照小鼠(图44B)比较显著增加的存活率。那些结果指示两种复合物Z13Mad5Anaxa和Z14Mad5Anaxa能够显著地减小肿瘤生长和显著地延长存活。
实施例28:比较在使用具有不同细胞穿透肽的复合物的接种疫苗后的免疫应答
在该实验中,通过使用具有TLR激动剂“EDA”的复合物调查不同的CPP在根据本发明的复合物中的作用。因此,使用如上面描述的融合蛋白EDAZ13Mad5(参阅实施例1)。
此外,设计了进一步的融合蛋白,其包括不同于Z13的CPP——即Z14(SEQ ID NO:7)或Z18(SEQ ID NO:11)。那些融合蛋白还包括蛋白质“MAD5”——其由来多种抗原的不同的CD8+和CD4+表位组成,和TLR4肽激动剂“EDA”。因此,下列构建体被另外地设计:EDAZ14Mad5
序列:
(SEQ ID NO:37)
EDAZ18Mad5
序列:
(SEQ ID NO:38)
C57BL/6小鼠被分配为八个不同的组(4只小鼠/组):接受2nmol的EDAZ13Mad5、EDAZ14Mad5或EDAZ18Mad5的三组和各自的对照和接受0.5nmol的EDAZ13Mad5、EDAZ14Mad5或EDAZ18Mad5的三组和各自的对照。小鼠被s.c.接种疫苗三次(第0周、第2周和第4周)。小鼠在第2次和第3次接种疫苗后7天被抽血并且进行多聚体染色(一个实验,其中4只小鼠/组)。
结果显示在图45中。与对照组比较,使用EDAZ13Mad5,EDAZ14Mad5或EDAZ18Mad5接种疫苗的所有组显示了多聚体-阳性细胞的增加的百分数。这些结果指示具有不同细胞穿透肽的根据本发明的复合物能够在不同的剂量下引发免疫应答。
实施例29:EDAZ14Mad5对EG.7-OVA s.c.模型中的肿瘤生长和存活的作用
为了调查EDAZ14Mad5对肿瘤生长和存活的作用,使用EG.7-OVA s.c.模型(关于在相同模型中的作用参阅实施例4和图9–11)。
在d0,C57BL/6小鼠在左胁中s.c.植入有3×105个EG7-OVA肿瘤细胞并且被分配为两个不同的组(幼稚的和EDAZ14Mad5)。小鼠在肿瘤植入后d5和d13通过在右胁中s.c.注射0.5nmol的EDAZ14Mad5被接种疫苗两次。
结果显示在图46中。与EDAZ13Mad5类似(参阅实施例4,图9–11),使用EDAZ14Mad5接种疫苗导致与对照小鼠(图46A)比较显著减小的肿瘤体积以及与对照小鼠(图46B)比较显著增加的存活率。那些结果指示EDAZ14Mad5能够显著地减小肿瘤生长和显著地延长存活——其与EDAZ13Mad5类似(参阅实施例4,图9–11)。
实施例30:Z13Mad5Anaxa融合构建体与Z13Mad5和Anaxa比较在成胶质细胞瘤模型 中更优越的功效
为了调查根据本发明的复合物的功效,选择成胶质细胞瘤模型(参阅实施例20)。即,Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7;SEQ ID NO:28)被施用至一组小鼠,而Z13Mad5(SEQ IDNO:29)和Anaxa(SEQ ID NO:15)被施用(二者在一起)至另一组小鼠。
在使用2nmol Z13Mad5Anaxa疫苗接种疫苗两次——即肿瘤植入(第0天)后第7天和第21天——的荷载Gl261-Quad肿瘤的小鼠(7–16只小鼠/组)中分析肿瘤位点处的T细胞归巢。使用Z13Mad5和Anaxa(与Z13Mad5Anaxa等摩尔)二者接种疫苗的组被用作对照。简略地,C57BL/6小鼠i.c.植入(颅内地)有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa(第1组)或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa(第2组)被接种疫苗两次(在植入之后d7和d21)。在d28,分析血液和脑浸润淋巴细胞(BIL),由此SIINFEKL特异性CD8T细胞在d28通过多聚体染色在血液中和在BIL中被定量(7–16只小鼠/组)。
结果显示在图47中。与使用Z13Mad5和Anaxa二者接种疫苗的小鼠比较,在Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的血液中观察到SIINFEKL特异性CD8T细胞的显著更高的百分数(图47A)。类似地,与使用Z13Mad5和Anaxa单独接种疫苗的小鼠比较,在Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的BIL中观察到SIINFEKL特异性CD8T细胞的更强的积聚(图47B,p=0.0539)。
接着,评估细胞因子分泌。为了该目的,C57BL/6小鼠i.c.植入有5×105个Gl261-Quad肿瘤细胞并且通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa被接种疫苗两次(d7和d21)。BIL被分离并且在进行细胞因子细胞内染色前在存在布雷菲德菌素A的情况下使用负载或未负载SllNFEKL肽(SEQ ID NO:35)的成熟的BMDC在6h期间进行培养。
结果显示在图48中。一般而言,对于来自使用Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的脑浸润CD8T细胞观察到高水平的细胞因子分泌。具体地,与使用Z13Mad5和Anaxa单独接种疫苗的小鼠比较,对于来自使用Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的脑浸润CD8T细胞观察到总IFN-γ和IFN-γ与TNF-α一起显著更高分分泌。
总之,这些结果展现了Z13Mad5Anaxa疫苗(与单独施用的Z13Mad5和Anaxa比较)能够以有效的效应子功能在荷瘤小鼠的脑中引发更强的SIINFEKL特异性CD8T细胞免疫应答。
获得的结果指示Z13Mad5Anaxa对引发高的脑浸润SIINFEKL特异性CD8免疫应答是有效的。Z13Mad5Anaxa能够促进脑中抗原特异性CD8T细胞的细胞因子的分泌。
实施例31:另一种抗原货物在根据本发明的复合物中的作用
为了调查不同的抗原货物(“Mad8”)的作用,设计了包括细胞穿透肽、不同的抗原和TLR肽激动剂的另一种复合物(“Z13Mad8Anaxa”)。Z13Mad8Anaxa不同于抗原货物中的Z13Mad5Anaxa(在实施例7中描述的)。具体地,“Z13Mad8Anaxa”是包括细胞穿透肽“Z13”,抗原货物“MAD8”——其包括糖蛋白70的CD8和CD4表位,和TLR肽激动剂“Anaxa”的融合蛋白。在下列中,Z13Mad8Anaxa的氨基酸序列以加下划线地显示的细胞穿透肽“Z13”和以斜体显示的TLR肽激动剂“Anaxa”显示:
KRYKNRVASR KSRAKFKQLL QHYREVAAAK SSENDRLRLLLKVTYHSPSYAY HQFERRAILNRLVQFIKDRI SVVQALVLTS TVHEILCKLS LEGDHSTPPS AYGSVKPYTN FDAE
(SEQ ID NO:39)
稚Balb/c小鼠(4只小鼠/组)使用2nmol的Z13Mad8Anaxa被s.c.接种疫苗四次(第0周、第2周、第4周和第6周)。
为了调查在接种疫苗后的CD4T细胞应答,在第4次接种疫苗后一周,小鼠被死;回收器官并且在使用gp70CD4肽(SEQ ID NO:64)或gp70CD8肽(SEQ ID NO:65)刺激的脾细胞上进行离体酶联免疫斑点测定,以便定量产生IFN-γ的表位特异性CD4和CD8T细胞。
结果显示在图49中。与稚小鼠比较,使用Z13Mad8Anaxa接种疫苗的小鼠显示了产生IFN-γ的细胞的显著增加。这些数据显示Z13Mad8Anaxa疫苗能够引发有效的表位特异性CD8和CD4T细胞免疫应答,并且因而根据本发明的复合物能够引发自身抗原免疫应答。
实施例32:另一种抗原货物在根据本发明的复合物中的作用
为了调查进一步的不同抗原货物(“Mad11”)的作用,设计了包括细胞穿透肽、不同的抗原和TLR肽激动剂的另一种复合物(“Z13Mad11Anaxa”)。Z13Mad11Anaxa不同于抗原货物中的Z13Mad5Anaxa(在实施例7中描述的)。具体地,“Z13Mad11Anaxa”是包括细胞穿透肽“Z13”,抗原货物“MAD11”——其包括如在Derouazi M,Wang Y,Marlu R,et al.Optimalepitope composition after antigen screening using a live bacterial deliveryvector:Application to TRP-2.Bioengineered Bugs.2010;1(1):51-60.doi:10.4161/bbug.1.1.9482中描述的存活蛋白(surviving)的两种CD8表位,和TLR肽激动剂“Anaxa”的融合蛋白。在下列中,Z13Mad11Anaxa的氨基酸序列以加下划线地显示的细胞穿透肽“Z13”和以斜体显示的TLR肽激动剂“Anaxa”显示:
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKNYRIATFKNWPFLEDCAMEELTVSEFL KLDRQRSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
(SEQ ID NO:40)
稚C57BL/6小鼠(5只小鼠/组)被i.v.植入有1×105个B16黑素瘤肿瘤细胞并且通过皮下注射1nmol的Z13Mad11Anaxa被接种疫苗两次(d0和d10)。在第18天,小鼠被处死,回收器官并且在使用存活蛋白肽存活蛋白20-28(SEQ ID NO:67)和存活蛋白97-104(SEQ IDNO:68)刺激的脾细胞上进行离体酶联免疫斑点测定,以便定量产生IFN-γ的存活蛋白特异性T细胞。
结果显示在图50中。与稚小鼠比较,使用Z13Mad11Anaxa接种疫苗的小鼠显示了更少的转移(图50A)。而且,在使用Z13Mad11Anaxa接种疫苗的小鼠的脾中观察到产生IFN-γ的存活蛋白特异性T细胞的显著更高的数目(图49B)。
获得的结果显示Z13Mad11Anaxa对减少转移的数目是有效的,并且Z13Mad11Anaxa能够促进脾中抗原特异性CD8T细胞的细胞因子的分泌。
实施例33:另一种抗原货物在根据本发明的复合物中的作用
为了调查进一步的不同抗原货物(“Mad9”)的作用,设计了包括细胞穿透肽、不同的抗原和TLR肽激动剂的另一种复合物(“Z13Mad9Anaxa”)。Z13Mad9Anaxa不同于抗原货物中的Z13Mad5Anaxa(在实施例7中描述的)。具体地,“Z13Mad9Anaxa”是包括细胞穿透肽“Z13”,抗原货物“Mad9”——其包括来自MC-38肿瘤细胞系的如由Yadav etal.Nature.2014Nov 27;515(7528):572-6鉴定的新抗原,和TLR肽激动剂“Anaxa”的融合蛋白。在下列中,Z13Mad9Anaxa的氨基酸序列以加下划线地显示的细胞穿透肽“Z13”和以斜体显示的TLR肽激动剂“Anaxa”显示:
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKHLELASMTNMELMSSIVSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
(SEQ ID NO:41)
稚C57BL/6小鼠(4只小鼠/组)使用2nmol的Z13Mad9Anaxa被s.c.接种疫苗四次(第0周、第2周、第4周和第6周)。为了调查在接种疫苗后的CD8T细胞应答,在第4次接种疫苗后一周,小鼠被处死,回收器官并且在使用adpgk肽(SEQ ID NO:66)刺激的7天体外再刺激后在脾细胞上进行酶联免疫斑点测定,以便定量产生IFN-γ的表位特异性CD8T细胞。
结果显示在图51中。与稚小鼠比较,使用Z13Mad9Anaxa接种疫苗的小鼠显示了效应物新抗原特异性CD8T细胞的显著增加。
实施例34:比较在使用具有不同细胞穿透肽的复合物的接种疫苗后的免疫应答
在该实验中,通过使用具有TLR激动剂“Anaxa”的复合物调查不同的CPP在根据本发明的复合物中的作用。因此,使用如上面描述的融合蛋白Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7,SEQ ID NO:28)。
此外,设计了进一步的融合蛋白,其包括结合至如在Lu et al.,Multiepitopetrojan antigen peptide vaccines for the induction of antitumor CTL and Thimmune responses J.Immunol.,172(2004),pp.4575–4582中描述的融合连接体的TATCPP。
该融合蛋白还包括蛋白质“MAD5”——其由来多种抗原的不同的CD8+和CD4+表位组成,和TLR4肽激动剂“Anaxa”。因此,下列构建体被另外地设计:
TatFMad5Anaxa
序列:
RKKRRQRRRRVKRISQAVHAAHAEINEAGRRVKRKVPRNQDWLRVKRASFEAQGALANIAVDKARVKRSIINFEKLRVKRSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
(SEQ ID NO:46)
C57BL/6小鼠被分配为三个不同的组(8只小鼠/组):接受2nmol的Z13Mad5Anaxa的一组,接受2nmol的TatFMad5Anaxa的一组和各自的对照。小鼠使用2nmol的Z13Mad5Anaxa或2nmol的TatFMad5Anaxa被s.c.接种疫苗两次(第0周和第2周)。小鼠在第2次接种疫苗后7天被抽血并且进行多聚体染色(8只小鼠/组)。
结果显示在图52中。与对照组比较,使用Z13Mad5Anaxa或TatFMad5Anaxa接种疫苗的小鼠显示了多聚体-阳性细胞的增加的百分数。这些结果指示具有不同细胞穿透肽的根据本发明的复合物能够在不同的剂量下引发免疫应答。然而,源自ZEBRA(Z13)的CPP优于TAT CPP。
实施例35:Z13Mad5Anaxa融合构建体与Z13Mad5和Anaxa比较在稚小鼠中更优越的 功效
接着,在稚小鼠中调查根据本发明的复合物的功效。即,Z13Mad5Anaxa(参阅实施例7;SEQ ID NO:28)被施用至一组小鼠,而Z13Mad5(SEQ ID NO:29)和Anaxa(SEQ ID NO:15)被施用(二者在一起)至另一组小鼠。
Z13Mad5Anaxa组和Z13Mad5+Anaxa组的C57BL/6小鼠通过s.c.注射2nmol的Z13Mad5Anaxa(第1组)或2nmol的Z13Mad5和2nmol的Anaxa(第2组)被接种疫苗一次(第0周)。在第14天,分析血液,由此SIINFEKL特异性CD8T细胞通过多聚体染色在血液中被定量(4–8只小鼠/组)。
结果显示在图53中。与使用Z13Mad5和Anaxa单独接种疫苗的小鼠比较,在Z13Mad5Anaxa接种疫苗的小鼠的血液中观察到SIINFEKL特异性CD8T细胞的显著更高的百分数(图53)。
总之,这些结果展现了Z13Mad5Anaxa疫苗(与单独施用的Z13Mad5和Anaxa比较)能够在外周中引发更强的SIINFEKL特异性CD8T细胞免疫应答。
实施例36:另一种抗原货物在根据本发明的复合物中的作用
为了调查进一步的不同抗原货物(“Mad12”)的作用,设计了包括细胞穿透肽、不同的抗原和TLR肽激动剂的另一种复合物(“Z13Mad12Anaxa”)。Z13Mad12Anaxa不同于抗原货物中的Z13Mad5Anaxa(在实施例7中描述的)。具体地,“Z13Mad12Anaxa”是包括细胞穿透肽“Z13”,抗原货物“MAD12”——其包括来自MC-38肿瘤细胞系的如由Yadav etal.Nature.2014Nov 27;515(7528):572-6鉴定的三种新抗原,和TLR肽激动剂“Anaxa”的融合蛋白。在下列中显示了Z13Mad12Anaxa的氨基酸序列:
KRYKNRVASRKSRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKLFRAAQLANDVVLQIMEHLELASMTNMELMSSIVVISASIIVFNLLELEGSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKPYTNFDAE
(SEQ ID NO:69)
稚C57BL/6小鼠(4只小鼠/组)使用2nmol的Z13Mad12Anaxa被s.c.接种疫苗两次(第0周、第2周)。为了调查在接种疫苗后的CD8T细胞应答,在第2次接种疫苗后一周,分析血液,由此新抗原reps1特异性CD8T细胞通过多聚体染色在血液中被定量(4只小鼠/组)。
结果显示在图54中。与稚小鼠比较,使用Z13Mad12Anaxa接种疫苗的小鼠显示了效应物新抗原特异性CD8T细胞的显著增加。
实施例37:体外人树突细胞成熟
该研究的目标是调查与缺少TLR肽激动剂的复合物(“Z13Mad5”,SEQ ID NO:29,参阅实施例1)比较,根据本发明使用的复合物(“Z13Mad5Anaxa”,SEQ ID NO:28,参阅实施例7)诱导树突细胞的成熟的能力。
调查Z13Mad5Anax多肽和Z13Mad5多肽诱导人树突细胞(DC)成熟的能力。在使用300nM的蛋白质过夜培育后,通过FACS在人DC上评估活化标志物表达(CD86、CD80、CD83和HLA-DR)(图55)。每种蛋白质的相同的缓冲剂体积被用作阴性对照。
结果显示在图55中。Z13Mad5Anaxa诱导通过CD86、HLADR和CD83的上调显示的人DC的成熟,而Z13Mad5不能够活化人DC。这些结果指示蛋白质的Anaxa部分负责人DC上活化标志物的上调。
序列和SEQ ID编号的表格(序列表):

Claims (45)

1.复合物,其包括:
a)细胞穿透肽;
b)至少一种抗原或抗原表位;和
c)至少一种TLR肽激动剂,
其中所述组分a)–c)被共价连接。
2.根据权利要求1所述的复合物,其中所述复合物是重组多肽或重组蛋白。
3.根据权利要求1或2所述的复合物,其中所述细胞穿透肽
(i)具有总计5至50个氨基酸,优选地总计10至45个氨基酸,更优选地总计15至45个氨基酸的所述肽的氨基酸序列的长度;和/或
(ii)具有包括ZEBRA的最小结构域的片段或其变体的氨基酸序列,所述最小结构域从根据SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列的残基170延伸至残基220,其中,任选地,1、2、3、4或5个氨基酸已经被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力。
4.根据权利要求3所述的复合物,其中所述细胞穿透肽具有在根据SEQ ID NO:3的ZEBRA氨基酸序列的第189位的等价位置处包括Ser(S)的氨基酸序列。
5.根据权利要求3或4所述的复合物,其中所述细胞穿透肽具有氨基酸序列,所述氨基酸序列包括:
(i)根据下列通式(I)的序列:
X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11SX13X14X15X16X17
其中0、1、2、3、4或5个氨基酸被置换、缺失、和/或添加而不丧失所述肽的细胞穿透能力,其中
X1是K、R或H,优选地X1是K或R;
X2是R、K或H,优选地X2是R或K;
X3是Y、W或F,优选地X3是Y、W或F;
X4是K、R或H,优选地X4是K或R;
X5是N或Q;
X6是R、K或H,优选地X6是R或K;
X7是V、I、M、L、F或A,优选地X7是V、I、M或L;
X8是A、V、L、I或G,优选地X8是A或G;
X9是S或T;
X10是R、K或H,优选地X10是R或K;
X11是K、R或H,优选地X11是K或R;
X13是R、K或H,优选地X13是R或K;
X14是A、V、L、I或G,优选地X14是A或G;
X15是K、R或H,优选地X15是K或R;
X16是F、L、V、I、Y、W或M,优选地X16是F、Y或W;和
X17是K、R或H,优选地X17是K或R。
6.根据权利要求3或4所述的复合物,其中所述细胞穿透肽具有氨基酸序列,所述氨基酸序列包括如下氨基酸序列:选自根据SEQ ID NO:4–13的氨基酸序列,或其序列变体而不丧失所述肽的细胞穿透能力,具体地其序列变体共享至少70%序列同一性,优选地至少80%序列同一性和更优选地至少90%序列同一性而不丧失所述肽的细胞穿透能力。
7.根据权利要求6所述的复合物,其中所述细胞穿透肽具有氨基酸序列,所述氨基酸序列包括或由如下组成:根据SEQ ID NO:6(CPP3/Z13)、SEQ ID NO:7(CPP4/Z14)、SEQ ID NO:8(CPP5/Z15)或SEQ ID NO:11(CPP8/Z18)的氨基酸序列,或其序列变体而不丧失所述肽的细胞穿透能力,具体地其序列变体共享至少70%序列同一性,优选地至少80%序列同一性和更优选地至少90%序列同一性而不丧失所述肽的细胞穿透能力。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的复合物,其中所述至少一种抗原或抗原表位选自:(i)肽、多肽、或蛋白质,(ii)多糖,(iii)脂质,(iv)脂蛋白,(v)糖脂,(vi)核酸,和(vii)小分子药物或毒素。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的复合物,其中所述至少一种抗原或抗原表位包括或由至少一种病原体表位和/或至少一种肿瘤表位组成,优选地所述至少一种抗原或抗原表位包括或由至少一种肿瘤表位组成。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的复合物,其中所述至少一种抗原或抗原表位是至少一种CD4+表位和/或至少一种CD8+表位。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的复合物,其中所述至少一种抗原或抗原表位是肽、多肽或蛋白质。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的复合物,其中所述复合物包括多于一种抗原或抗原表位,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种抗原或抗原表位。
13.根据权利要求12所述的复合物,其中所述多于一种抗原或抗原表位,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种抗原或抗原表位,在所述复合物中被连续地定位。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的复合物,其中所述至少一种TLR肽激动剂是TLR2、TLR4和/或TLR5肽激动剂,优选地TLR2肽激动剂和/或TLR4肽激动剂。
15.根据权利要求14所述的复合物,其中所述至少一种TLR肽激动剂包括或由根据SEQID NO:15的氨基酸序列或其序列变体组成,具体地其序列变体共享至少70%序列同一性,优选地至少80%序列同一性和更优选地至少90%序列同一性而不丧失所述肽的TLR激动剂能力。
16.根据权利要求1至15中任一项所述的复合物,其中所述复合物包括多于一种TLR肽激动剂,具体地2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种TLR肽激动剂。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的复合物,其中所述至少一种抗原或抗原表位在所述细胞穿透肽的C-端定位,由此所述细胞穿透肽和所述至少一种抗原或抗原表位任选地通过进一步的组分,例如连接体、间隔区,或通过所述至少一种TLR肽激动剂连接。
18.根据权利要求17所述的复合物,其中所述至少一种抗原或抗原表位在所述细胞穿透肽的C-端定位,由此所述细胞穿透肽和所述至少一种抗原或抗原表位任选地通过进一步的组分,例如连接体、间隔区,但不通过所述至少一种TLR肽激动剂连接。
19.根据权利要求2至18中任一项所述的复合物,其中所述复合物是重组多肽或重组蛋白,并且所述组分a)至c)按如下顺序以所述复合物的主链的N-端→C-端方向定位:
(α)组分a)–组分b)–组分c);或
(β)组分c)–组分a)–组分b),
其中所述组分可以通过进一步的组分,具体地通过连接体或间隔区连接。
20.核酸,其编码根据权利要求1至19中任一项所述的复合物,其中所述复合物是多肽或蛋白质。
21.载体,其包括根据权利要求20所述的核酸。
22.宿主细胞,其包括根据权利要求21所述的载体。
23.制备复合物的方法,所述复合物是多肽或蛋白质,所述方法包括在培养基中培养根据权利要求22所述的宿主细胞,和从所述培养基分离所述复合物或在宿主细胞溶胞后从所述宿主细胞溶胞产物分离所述复合物。
24.根据权利要求23所述的制备复合物的方法,其中获得根据权利要求1至19中任一项所述的复合物。
25.细胞,其负载有根据权利要求1至19中任一项所述的复合物。
26.根据权利要求25所述的细胞,其中所述细胞是抗原呈递细胞,优选地树突细胞。
27.组合物,其包括如下的至少一种:
(i)根据权利要求6至19中任一项所述的复合物;
(ii)根据权利要求20所述的核酸;
(ii)根据权利要求21所述的载体;
(iv)根据权利要求22所述的宿主细胞;或
(v)根据权利要求25或26所述的负载有复合物的细胞。
28.疫苗,其包括如下的至少一种:
(i)根据权利要求6至19中任一项所述的复合物;
(ii)根据权利要求20所述的核酸;
(iii)根据权利要求21所述的载体;
(iv)根据权利要求22所述的宿主细胞;或
(v)根据权利要求25或26所述的负载有复合物的细胞。
29.药物组合物,其包括根据权利要求1至19中任一项所述的至少一种复合物或根据权利要求25或26所述的至少一种细胞,和药学上可接受的载体。
30.根据权利要求29所述的药物组合物,其中所述组合物包括至少两种不同的复合物。
31.根据权利要求1至19中任一项所述的复合物,其被用作药物。
32.根据权利要求1至19中任一项所述的复合物,其使用在预防和/或治疗疾病和/或障碍中,所述疾病和/或障碍包括癌症、血液学障碍、传染性疾病、自身免疫性障碍和移植排斥。
33.根据权利要求32使用的复合物,其中待预防和/或治疗的疾病是癌症和/或血液学障碍,优选地恶性脑肿瘤或淋巴、造血和相关组织的恶性肿瘤,最优选地成胶质细胞瘤。
34.根据权利要求25或26所述的细胞,其使用在预防和/或治疗疾病和/或障碍中,所述疾病和/或障碍包括癌症、血液学障碍、传染性疾病、自身免疫性障碍和移植排斥。
35.根据权利要求34使用的细胞,其中待预防和/或治疗的疾病是癌症和/或血液学障碍,优选地恶性脑肿瘤或淋巴、造血和相关组织的恶性肿瘤,最优选地成胶质细胞瘤。
36.诊断组合物,其包括根据权利要求1至19中任一项所述的复合物。
37.药盒,其包括根据权利要求1至19中任一项所述的复合物,根据权利要求25或26所述的细胞,根据权利要求27所述的组合物,根据权利要求28所述的疫苗,和/或根据权利要求29或30所述的药物组合物。
38.根据权利要求37所述的药盒,其中所述药盒进一步包括包装插入物或指导散页,其指导通过使用根据权利要求1至19中任一项所述的复合物,根据权利要求25或26所述的细胞,根据权利要求27所述的组合物,根据权利要求28所述的疫苗,和/或根据权利要求29或30所述的药物组合物治疗癌症和/或血液学障碍,优选地恶性脑肿瘤或淋巴、造血和相关组织的恶性肿瘤,最优选地成胶质细胞瘤。
39.根据权利要求37或38所述的药盒,其使用在医学中。
40.根据权利要求37至39中任一项所述的药盒,其使用在预防和/或治疗癌症中。
41.用于在需要其的对象中治疗癌症或起始、增强或延长抗肿瘤-应答的方法,其包括给对象施用复合物,所述复合物包括:
a)细胞穿透肽;
b)至少一种抗原或抗原表位;和
c)至少一种TLR肽激动剂,
其中所述组分a)–c)被共价连接。
42.权利要求41所述的方法,其中根据权利要求1至19中任一项所述的复合物,根据权利要求25或26所述的细胞,根据权利要求27所述的组合物,根据权利要求28所述的疫苗,和/或根据权利要求29或30所述的药物组合物被施用给所述对象。
43.权利要求41或42所述的方法,其中所述对象具有癌症。
44.用于在需要其的对象中治疗癌症和/或血液学障碍,优选地恶性脑肿瘤或淋巴、造血和相关组织的恶性肿瘤,最优选地成胶质细胞瘤的方法,其包括给对象施用复合物,所述复合物包括:
a)细胞穿透肽;
b)至少一种抗原或抗原表位;和
c)至少一种TLR肽激动剂,
其中所述组分a)–c)被共价连接。
45.权利要求44所述的方法,其中根据权利要求1至19中任一项所述的复合物,根据权利要求25或26所述的细胞,根据权利要求27所述的组合物,根据权利要求28所述的疫苗,和/或根据权利要求29或30所述的药物组合物被施用给所述对象。
CN201680015946.2A 2015-03-16 2016-03-16 包括细胞穿透肽、货物和tlr肽激动剂的新型复合物 Pending CN107428845A (zh)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EPPCT/EP2015/000580 2015-03-16
EP2015000580 2015-03-16
EPPCT/EP2015/002244 2015-11-09
EP2015002244 2015-11-09
PCT/EP2016/000471 WO2016146260A1 (en) 2015-03-16 2016-03-16 A novel complex comprising a cell penetrating peptide, a cargo and a tlr peptide agonist

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN107428845A true CN107428845A (zh) 2017-12-01

Family

ID=55066559

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201680015946.2A Pending CN107428845A (zh) 2015-03-16 2016-03-16 包括细胞穿透肽、货物和tlr肽激动剂的新型复合物

Country Status (25)

Country Link
US (7) US20180133327A1 (zh)
EP (4) EP3270954A1 (zh)
JP (5) JP6862369B2 (zh)
KR (2) KR102386172B1 (zh)
CN (1) CN107428845A (zh)
AU (5) AU2016232657B9 (zh)
BR (1) BR112017015906A2 (zh)
CA (3) CA2973757A1 (zh)
CL (1) CL2017002345A1 (zh)
CY (1) CY1122953T1 (zh)
DK (3) DK3270957T3 (zh)
EA (1) EA038049B1 (zh)
ES (2) ES2781454T3 (zh)
HR (1) HRP20200491T1 (zh)
HU (2) HUE048808T2 (zh)
IL (2) IL253416B (zh)
LT (1) LT3270955T (zh)
MX (1) MX2017011796A (zh)
NZ (1) NZ733762A (zh)
PH (1) PH12017501287A1 (zh)
PL (3) PL3693009T3 (zh)
PT (2) PT3270957T (zh)
RS (1) RS60089B1 (zh)
SI (1) SI3270955T1 (zh)
WO (5) WO2016146143A1 (zh)

Cited By (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109859795A (zh) * 2019-02-20 2019-06-07 成都分迪科技有限公司 泛素化降解目标蛋白质的数据库
CN109963585A (zh) * 2016-09-21 2019-07-02 阿尔勒治疗公司 包括细胞穿透肽、多表位和tlr肽激动剂的用于治疗癌症的融合物
CN113166216A (zh) * 2018-12-19 2021-07-23 韩国化学研究院 源自人lrrc24蛋白的跨膜结构域
CN113557035A (zh) * 2019-01-12 2021-10-26 卫理公会医院 自组装肽纳米颗粒和其用途
CN113817677A (zh) * 2021-09-29 2021-12-21 四川大学 泛酸或其衍生物与α-D-葡萄糖-1,6-二磷酸或其衍生物在促进DC迁移中的用途
TWI812706B (zh) * 2018-05-02 2023-08-21 國立大學法人新潟大學 肽以及其使用

Families Citing this family (43)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2016146143A1 (en) * 2015-03-16 2016-09-22 Amal Therapeutics Sa Cell penetrating peptides and complexes comprising the same
WO2017106332A1 (en) 2015-12-14 2017-06-22 X4 Pharmaceuticals, Inc. Methods for treating cancer
CN109069426B (zh) 2015-12-14 2021-10-29 X4 制药有限公司 治疗癌症的方法
DK3393468T3 (da) 2015-12-22 2022-12-19 X4 Pharmaceuticals Inc Fremgangsmåder til behandling af en immundefektsygdom
JP2019510785A (ja) 2016-04-08 2019-04-18 エックス4 ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 癌を処置する方法
ES2870920T3 (es) 2016-06-21 2021-10-28 X4 Pharmaceuticals Inc Inhibidores de CXCR4 y usos de los mismos
JP7084624B2 (ja) 2016-06-21 2022-06-15 エックス4 ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド Cxcr4阻害剤およびその使用
US11332470B2 (en) 2016-06-21 2022-05-17 X4 Pharmaceuticals, Inc. CXCR4 inhibitors and uses thereof
EP3522915A2 (en) 2016-10-07 2019-08-14 Enterome S.A. Immunogenic compounds for cancer therapy
CN110049774A (zh) 2016-10-07 2019-07-23 恩特罗姆公司 肿瘤相关抗原表位的小型生物群序列变体
EP3522916A2 (en) * 2016-10-07 2019-08-14 Enterome S.A. Immunogenic compounds for cancer therapy
WO2018071824A1 (en) * 2016-10-13 2018-04-19 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compositions and methods for predicting response and resistance to ctla4 blockade in melanoma using a gene expression signature
KR101875055B1 (ko) * 2016-10-19 2018-07-06 연세대학교 원주산학협력단 융합 단백질 및 그의 용도
KR102007203B1 (ko) * 2016-10-20 2019-08-05 연세대학교 원주산학협력단 융합 단백질 및 그의 용도
EP3532505A4 (en) * 2016-10-25 2019-12-25 Urogen Pharma Ltd. BODY CAVES IMMUNODULATING TREATMENTS
US11433128B2 (en) * 2017-04-07 2022-09-06 Tianxin Wang Cell surface anchoring antigen conjugates to treat cancer
WO2018197926A1 (en) * 2017-04-26 2018-11-01 Robert Penchovsky Methods for creating novel antibacterial agents using chimeric antisense oligonucleotides
US20200138804A1 (en) * 2017-06-21 2020-05-07 X4 Pharmaceuticals, Inc. Methods for treating cancer
WO2019134018A1 (en) * 2018-01-05 2019-07-11 Telethon Kids Institute Vaccine conjugates and uses thereof
WO2019160780A1 (en) * 2018-02-16 2019-08-22 Wang tian xin Methods and agents to treat tumor cells and cancer
EP3773689B1 (en) * 2018-04-11 2022-11-09 Enterome S.A. Antigenic peptides for prevention and treatment of cancer
EP3566718A1 (en) 2018-05-07 2019-11-13 Universitätsmedizin der Johannes Gutenberg-Universität Mainz A pharmazeutical combination (treg depleting agent, checkpoint inhibitor, tlr9 agonist) for use in the treatment of cancer
US10548889B1 (en) 2018-08-31 2020-02-04 X4 Pharmaceuticals, Inc. Compositions of CXCR4 inhibitors and methods of preparation and use
EP3876956A4 (en) * 2018-11-08 2022-12-28 The Regents of The University of California SYSTEMS AND METHODS FOR TARGETING CANCER CELLS
US11274150B2 (en) 2018-11-16 2022-03-15 Bristol-Myers Squibb Company Anti-human natural killer cell inhibitory receptor group 2A protein (NKG2A) antibodies
WO2020130548A1 (ko) * 2018-12-19 2020-06-25 한국화학연구원 인간 쥐피에이티씨에치4 단백질 유래 세포막 투과 도메인
WO2020130547A1 (ko) * 2018-12-19 2020-06-25 한국화학연구원 인간 엘알알씨24 단백질 유래 세포막 투과 도메인
WO2020130546A1 (ko) * 2018-12-19 2020-06-25 한국화학연구원 인간 씨엘케이2 단백질 유래 세포막 투과 도메인
US20220184087A1 (en) * 2019-03-28 2022-06-16 The Penn State Research Foundation Methods and compositions relating to treatment of cancer
US11339190B2 (en) 2020-04-21 2022-05-24 Rush University Medical Center Peptides for the treatment of covid-19
US11667678B2 (en) 2019-04-21 2023-06-06 Rush University Medical Center Peptides for the treatment of COVID-19
KR102484312B1 (ko) * 2020-05-14 2023-01-02 한국화학연구원 고효능 사스 코로나바이러스 2 항원 및 이를 포함하는 백신 조성물
CR20220586A (es) 2020-05-19 2023-01-09 Boehringer Ingelheim Int Moléculas de fijación para el tratamiento de cáncer
WO2021246666A1 (ko) * 2020-06-04 2021-12-09 가톨릭대학교 산학협력단 플라젤린으로부터 유도된 tlr5 작용제를 유효성분으로 포함하는 항암제 조성물
EP4171619A2 (en) * 2020-06-26 2023-05-03 National Breast Cancer Coalition Breast cancer vaccine
AU2021341521A1 (en) 2020-09-14 2023-03-30 Boehringer Ingelheim International Gmbh Heterologous prime boost vaccine
KR102556731B1 (ko) * 2020-09-29 2023-07-21 주식회사 젠센 단백질 수송 도메인, 이를 포함하는 융합 화합물 및 이 융합 화합물을 포함하는 약학 조성물
WO2022079175A1 (en) * 2020-10-14 2022-04-21 Boehringer Ingelheim International Gmbh Combination of a sting agonist and a complex comprising a cell penetrating peptide, a cargo and a tlr peptide agonist
TW202231283A (zh) * 2020-10-19 2022-08-16 美商G1治療公司 用於治療轉移性大腸直腸癌之經改良之基於氟尿嘧啶之多藥劑化學治療
WO2023059687A1 (en) * 2021-10-06 2023-04-13 Whispergenics, Inc. Triple drug combination (metformin, simvastatin, digoxin) for targeted treatment of cancers
US20240033336A1 (en) 2022-03-16 2024-02-01 Boehringer Ingelheim International Gmbh Tumor antigens, compounds comprising the tumor antigens and uses thereof
WO2023200796A1 (en) * 2022-04-13 2023-10-19 The Regents Of The University Of California Immune cell inhibition by immune checkpoint engagers
FR3143031A1 (fr) * 2022-12-08 2024-06-14 Université Grenoble Alpes Nouveaux peptides et leur utilisation en tant que transporteurs pour l’internalisation de molécules d’intérêt dans des cellules cibles

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012048190A1 (en) * 2010-10-08 2012-04-12 Regents Of The University Of Minnesota Annexin ii compositions and methods
EP2476440A1 (en) * 2009-09-11 2012-07-18 Proyecto de Biomedicina Cima, S.L. Therapeutic compositions for the treatment of hpv-induced diseases
WO2013120073A1 (en) * 2012-02-09 2013-08-15 Av Therapeutics, Inc. Synthetic toll-like receptor-4 (tlr-4) agonist peptides
WO2014041505A1 (en) * 2012-09-13 2014-03-20 Universite De Geneve Cell penetrating peptides

Family Cites Families (50)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5851795A (en) 1991-06-27 1998-12-22 Bristol-Myers Squibb Company Soluble CTLA4 molecules and uses thereof
US6051227A (en) 1995-07-25 2000-04-18 The Regents Of The University Of California, Office Of Technology Transfer Blockade of T lymphocyte down-regulation associated with CTLA-4 signaling
US5811097A (en) 1995-07-25 1998-09-22 The Regents Of The University Of California Blockade of T lymphocyte down-regulation associated with CTLA-4 signaling
US5855887A (en) 1995-07-25 1999-01-05 The Regents Of The University Of California Blockade of lymphocyte down-regulation associated with CTLA-4 signaling
WO1998042752A1 (en) 1997-03-21 1998-10-01 Brigham And Women's Hospital Inc. Immunotherapeutic ctla-4 binding peptides
US7109003B2 (en) 1998-12-23 2006-09-19 Abgenix, Inc. Methods for expressing and recovering human monoclonal antibodies to CTLA-4
EE05627B1 (et) 1998-12-23 2013-02-15 Pfizer Inc. CTLA-4 vastased inimese monoklonaalsed antikehad
CZ302706B6 (cs) 1998-12-23 2011-09-14 Pfizer Inc. Lidská monoklonální protilátka, farmaceutická kompozice tuto protilátku obsahující, bunecná linie produkující tuto protilátku, izolovaná molekula kódující težký nebo lehký retezec uvedené protilátky, hostitelská bunka obsahující tuto izolovanou molek
US7605238B2 (en) 1999-08-24 2009-10-20 Medarex, Inc. Human CTLA-4 antibodies and their uses
MXPA02001911A (es) 1999-08-24 2003-07-21 Medarex Inc Anticuerpos ctla-4 humanos y sus usos.
JP2003520828A (ja) 2000-01-27 2003-07-08 ジェネティクス インスティテュート,エルエルシー Ctla4(cd152)に対する抗体、これを含む結合体、およびその使用
AUPR593101A0 (en) 2001-06-26 2001-07-19 Council Of The Queensland Institute Of Medical Research, The Cytomegalovirus t cell epitopes
WO2004035607A2 (en) 2002-10-17 2004-04-29 Genmab A/S Human monoclonal antibodies against cd20
JP2007519612A (ja) 2003-10-15 2007-07-19 イスティチュート スペリオーレ ディ サニータ 結腸直腸癌抗原
US20080305120A1 (en) 2004-06-17 2008-12-11 Medimmune, Inc. Immunogenic Compositions Comprising Hmgb 1 Polypeptides
JP5112863B2 (ja) 2004-07-01 2013-01-09 ノヴォ ノルディスク アー/エス ヒト抗−kir抗体
AU2006209951B2 (en) * 2005-02-04 2011-04-14 Survac Aps Survivin peptide vaccine
ES2291071B1 (es) 2005-06-13 2009-03-16 Proyecto De Biomedicina Cima, S.L. Agentes y metodos basados en el uso del dominio eda de la fibronectina.
EP1987839A1 (en) 2007-04-30 2008-11-05 I.N.S.E.R.M. Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale Cytotoxic anti-LAG-3 monoclonal antibody and its use in the treatment or prevention of organ transplant rejection and autoimmune disease
AU2008266951B2 (en) 2007-06-18 2013-12-12 Merck Sharp & Dohme B.V. Antibodies to human programmed death receptor PD-1
SI2183361T1 (sl) * 2007-07-27 2015-09-30 Immatics Biotechnologies Gmbh Nova imunoterapija proti nevronalnim in možganskim tumorjem
EP2178896A1 (en) * 2007-07-31 2010-04-28 The Johns Hopkins University Polypeptide-nucleic acid conjugate for immunoprophylaxis or immunotherapy for neoplastic or infectious disorders
EP2044949A1 (en) 2007-10-05 2009-04-08 Immutep Use of recombinant lag-3 or the derivatives thereof for eliciting monocyte immune response
CN102046198A (zh) * 2008-04-25 2011-05-04 系统生物学研究所 鞭毛蛋白多肽疫苗
US8425898B2 (en) 2008-06-20 2013-04-23 Duke University Compositions, methods, and kits for eliciting an immune response
AR072999A1 (es) 2008-08-11 2010-10-06 Medarex Inc Anticuerpos humanos que se unen al gen 3 de activacion linfocitaria (lag-3) y los usos de estos
CN108997498A (zh) 2008-12-09 2018-12-14 霍夫曼-拉罗奇有限公司 抗-pd-l1抗体及它们用于增强t细胞功能的用途
EP2459594A1 (en) 2009-07-31 2012-06-06 N.V. Organon Fully human antibodies to btla
AU2010286351A1 (en) 2009-08-31 2012-03-15 Amplimmune, Inc. B7-H4 fusion proteins and methods of use thereof
WO2011036211A1 (en) * 2009-09-23 2011-03-31 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) Polypeptides and nucleic acids for treating erbb2-dependent cancers
EP3279215B1 (en) 2009-11-24 2020-02-12 MedImmune Limited Targeted binding agents against b7-h1
WO2011101332A1 (en) 2010-02-16 2011-08-25 Proyecto De Biomedicina Cima, S.L. Compositions based on the fibronectin extracellular domain a for the treatment of melanoma
US8802091B2 (en) 2010-03-04 2014-08-12 Macrogenics, Inc. Antibodies reactive with B7-H3 and uses thereof
CN103402539B (zh) * 2010-09-14 2016-02-24 科学与工业研究委员会 一种用于产生对抗病原体的持久免疫和保护的合成免疫原
KR101760464B1 (ko) * 2010-10-13 2017-07-24 사회복지법인 삼성생명공익재단 교모세포종의 진단 또는 예후 예측용 바이오 마커 및 그 용도
US9187534B2 (en) * 2011-03-11 2015-11-17 Universite De Geneve Multi-epitopic vaccine
US8795678B2 (en) * 2011-05-13 2014-08-05 Academia Sinica TLR-2 agonists and methods of use thereof
US8841418B2 (en) 2011-07-01 2014-09-23 Cellerant Therapeutics, Inc. Antibodies that specifically bind to TIM3
US8819679B2 (en) 2011-07-28 2014-08-26 International Business Machines Corporation Methods and systems for on-boarding applications to a cloud
WO2013025779A1 (en) 2011-08-15 2013-02-21 Amplimmune, Inc. Anti-b7-h4 antibodies and their uses
US9422351B2 (en) 2011-11-03 2016-08-23 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Isolated B7-H4 specific compositions and methods of use thereof
CN104168922A (zh) * 2011-11-16 2014-11-26 安姆根有限公司 治疗表皮生长因子缺失突变体viii相关疾病的方法
WO2014165101A1 (en) * 2013-03-13 2014-10-09 California Stem Cell, Inc. Individualized high purity colon carcinoma stem cells, methods and use of the same
WO2014070663A1 (en) * 2012-10-29 2014-05-08 Anderson David E Compositions and methods for diagnosis and treatment of malignant gliomas
EP3066105A4 (en) * 2013-11-06 2017-10-11 Solstice Biologics, Ltd. Polynucleotide constructs having disulfide groups
EP3068428B1 (en) * 2013-11-13 2022-08-17 Regents of the University of Minnesota Annexin ii variant compositions and methods
PE20161344A1 (es) * 2014-01-02 2016-12-23 Memorial Sloan Kettering Cancer Center Determinantes de respuesta del cancer a la inmunoterapia
US20170114341A1 (en) * 2014-06-06 2017-04-27 Solstice Biologics, Ltd. Polynucleotide constructs having bioreversible and non-bioreversible groups
WO2016146143A1 (en) * 2015-03-16 2016-09-22 Amal Therapeutics Sa Cell penetrating peptides and complexes comprising the same
US20190175748A1 (en) * 2016-03-16 2019-06-13 Amal Therapeutics Sa Combination of an immune checkpoint modulator and a complex comprising a cell penetrating peptide, a cargo and a tlr peptide agonist for use in medicine

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2476440A1 (en) * 2009-09-11 2012-07-18 Proyecto de Biomedicina Cima, S.L. Therapeutic compositions for the treatment of hpv-induced diseases
WO2012048190A1 (en) * 2010-10-08 2012-04-12 Regents Of The University Of Minnesota Annexin ii compositions and methods
WO2013120073A1 (en) * 2012-02-09 2013-08-15 Av Therapeutics, Inc. Synthetic toll-like receptor-4 (tlr-4) agonist peptides
WO2014041505A1 (en) * 2012-09-13 2014-03-20 Universite De Geneve Cell penetrating peptides

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
TIMO BUHL: "Internalization routes of cell-penetrating melanoma antigen peptides into human dendritic cells", 《EXPERIMENTAL DERMATOLOGY》 *
TONG TONG ZHANGA: "LAH4 enhances CD8+ T cell immunity of protein/peptide-based vaccines", 《VACCINE》 *
周洋: "疫苗佐剂最新研究进展", 《中国新药杂志》 *

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109963585A (zh) * 2016-09-21 2019-07-02 阿尔勒治疗公司 包括细胞穿透肽、多表位和tlr肽激动剂的用于治疗癌症的融合物
TWI812706B (zh) * 2018-05-02 2023-08-21 國立大學法人新潟大學 肽以及其使用
CN113166216A (zh) * 2018-12-19 2021-07-23 韩国化学研究院 源自人lrrc24蛋白的跨膜结构域
CN113557035A (zh) * 2019-01-12 2021-10-26 卫理公会医院 自组装肽纳米颗粒和其用途
CN109859795A (zh) * 2019-02-20 2019-06-07 成都分迪科技有限公司 泛素化降解目标蛋白质的数据库
CN113817677A (zh) * 2021-09-29 2021-12-21 四川大学 泛酸或其衍生物与α-D-葡萄糖-1,6-二磷酸或其衍生物在促进DC迁移中的用途
CN113817677B (zh) * 2021-09-29 2023-08-18 四川大学 泛酸或其衍生物与α-D-葡萄糖-1,6-二磷酸或其衍生物在促进DC迁移中的用途

Also Published As

Publication number Publication date
US20220031850A1 (en) 2022-02-03
LT3270955T (lt) 2020-05-11
EP3270957B1 (en) 2020-01-08
AU2021218097A1 (en) 2021-09-09
NZ733762A (en) 2023-09-29
PT3270955T (pt) 2020-04-09
JP2018509936A (ja) 2018-04-12
MX2017011796A (es) 2018-04-11
PL3693009T3 (pl) 2024-06-10
JP6862369B2 (ja) 2021-04-21
AU2021218097B2 (en) 2023-01-19
DK3270955T3 (da) 2020-03-16
AU2016232656A1 (en) 2017-08-10
SI3270955T1 (sl) 2020-08-31
HUE048807T2 (hu) 2020-08-28
AU2016232659B2 (en) 2021-07-01
RS60089B1 (sr) 2020-05-29
JP6993240B2 (ja) 2022-02-15
EA201792045A1 (ru) 2018-03-30
KR102386172B1 (ko) 2022-04-12
CA2973757A1 (en) 2016-09-22
PT3270957T (pt) 2020-04-21
AU2021282506A1 (en) 2022-01-06
KR20170128516A (ko) 2017-11-22
CL2017002345A1 (es) 2018-05-18
EP3270955B1 (en) 2020-01-08
AU2016232657A1 (en) 2017-08-10
AU2016232657B2 (en) 2021-07-29
JP2021119182A (ja) 2021-08-12
EP3270955A1 (en) 2018-01-24
AU2016232659A1 (en) 2017-08-10
US20220175933A1 (en) 2022-06-09
WO2016146259A1 (en) 2016-09-22
JP2018509935A (ja) 2018-04-12
WO2016146261A1 (en) 2016-09-22
EP3270957A1 (en) 2018-01-24
IL285273A (en) 2021-09-30
KR102212451B1 (ko) 2021-02-04
ES2781455T3 (es) 2020-09-02
AU2016232657B9 (en) 2021-12-02
JP6882207B2 (ja) 2021-06-02
US20180133339A1 (en) 2018-05-17
ES2781454T3 (es) 2020-09-02
JP7190528B2 (ja) 2022-12-15
US20180133295A1 (en) 2018-05-17
PL3270957T3 (pl) 2020-07-27
CA2973770A1 (en) 2016-09-22
JP2021104038A (ja) 2021-07-26
WO2016146143A1 (en) 2016-09-22
DK3693009T3 (da) 2024-04-29
AU2021282506B2 (en) 2023-02-16
WO2016146260A1 (en) 2016-09-22
EP3693009A1 (en) 2020-08-12
US20220040314A1 (en) 2022-02-10
JP2018510215A (ja) 2018-04-12
IL253416A0 (en) 2017-09-28
CA2973747A1 (en) 2016-09-22
HRP20200491T1 (hr) 2020-06-26
HUE048808T2 (hu) 2020-08-28
JP7179896B2 (ja) 2022-11-29
PH12017501287A1 (en) 2018-02-05
CY1122953T1 (el) 2021-10-29
US20180133338A1 (en) 2018-05-17
WO2016146262A1 (en) 2016-09-22
IL285273B (en) 2022-06-01
US20180133327A1 (en) 2018-05-17
EP3270954A1 (en) 2018-01-24
KR20210013670A (ko) 2021-02-04
BR112017015906A2 (pt) 2018-04-10
DK3270957T3 (da) 2020-03-30
IL253416B (en) 2021-08-31
EA038049B1 (ru) 2021-06-29
EP3693009B1 (en) 2024-02-21
PL3270955T3 (pl) 2020-07-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107428845A (zh) 包括细胞穿透肽、货物和tlr肽激动剂的新型复合物
CN109963585A (zh) 包括细胞穿透肽、多表位和tlr肽激动剂的用于治疗癌症的融合物
CN104736553A (zh) 细胞穿透肽
RU2807135C2 (ru) Слитая конструкция, содержащая проникающий в клетку пептид, полиэпитоп и пептидный агонист tlr, предназначенная для лечения рака

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination