CN106103452B - 皮质抑素类似物及其合成和用途 - Google Patents
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Abstract
本文提供了式(A)、(B)、(C)、(D)和(E)的化合物及其药学上可接受的盐、季胺盐和N‑氧化物,和其药物组合物。式(A)、(B)、(C)、(D)和(E)的化合物考虑用作治疗广泛的病症的治疗剂,例如,但不限于与血管生成和与CDK8和/或CDK19激酶活性相关的病症。进一步提供了使用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物抑制CDK8和/或CDK19激酶活性的方法、调节β‑连环蛋白途径的方法、调节STAT1活性的方法、调节TGFβ/BMP途径的方法、调节细胞中HIF‑1‑α活性的方法和提高BIM表达以诱导细胞凋亡的方法。进一步提供了CDK8和CDK19点突变体及其使用方法。
Description
相关申请
本申请根据35U.S.C.§119(e)要求2013年12月24日提交的美国临时专利申请U.S.S.N.61/920,674、2014年2月3日提交的美国临时专利申请U.S.S.N.61/935,240和2014年5月15日提交的美国临时专利申请U.S.S.N.61/993,329的优先权,其各自的全部内容通过引用并入本文中。
背景技术
皮质抑素是一组抗血管生成的甾体生物碱,其在2006年首次从海绵Corticiumsimplex中分离。参见,例如,Aoki等,JACS(2006)128:3148-9。从分离日至今,这些天然产物已经经历了许多研究,特别是开发全合成体和新的非天然生物活性类似物。参见,例如,Aoki等,Bioorganic&Medicinal Chemistry(2007)15:6758-62.Mousseau等,Cell Host&Microbe(2012)12:97-108;Chen等,Organic&Biomolecular Chemistry(2010)8:2900;Hardin等,European Journal of Organic Chemistry(2010)19:3553。因此,在开发新的皮质抑素类似物及其制备方法方面存在着积极的兴趣。
发明内容
本文提供了式(A)、(B)和(C)的新的皮质抑素类似物及其药学上可接受的盐、季胺盐和N-氧化物,其如方案1中所描述的部分地通过式(B)的酮的还原胺化以提供式(A)的胺化产物而合成,任选地经由式(C)的亚胺中间体。
进一步提供了通过式(B)的酮的还原以提供式(D)的式C3-羟基化合物而制备的新皮质抑素类似物。还进一步提供了式(E)的化合物,其通过式(D)化合物的置换制备。这样的化合物也可以在合适的条件下用胺处理时转化为式(A)的化合物。
令人惊异地发现,式(A)的β异构体,称为式(A-1),在抑制CDK8激酶活性和AML细胞的增殖方面与皮质抑素A等效或更有效,且还发现式(A)的对应的α异构体,称为式(A-2),也非常有效。此外,已经发现式(B)的化合物对于培养中的AML细胞系的生长及细胞中的CDK8激酶活性是有活性的。
进一步提供了包含式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的皮质抑素类似物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物和药学上可接受的赋形剂的药物组合物。进一步提供了使用和治疗方法。
方案1.
因此,如本文中进一步描述的,在一个方面,提供了制备式(A)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物的方法,该方法包括使式(B)的化合物或其药学上可接受的盐(条件是RB1和RB2不连接形成氧代基团)与式HNR1R2的胺或其盐在还原胺化条件下接触。
在另一个方面,提供了制备式(D)的化合物或其药学上可接受的盐的方法,该方法包括使式(B)的化合物或其药学上可接受的盐与还原剂接触以提供式(D)的化合物。
在另一个方面,提供了制备式(E)的化合物或其药学上可接受的盐的方法,该方法包括使式(D)的化合物或其药学上可接受的盐与式RO-LG的化合物(其中LG是离去基团)接触以提供式(E)的化合物。
在另一个方面,提供了制备式(A)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物的方法,该方法包括使式(E)的化合物(其中RO是C(=ORA))或其药学上可接受的盐与式NHR1R2的化合物接触以提供式(A)的化合物。
在另一个方面,提供了包含式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物的药物组合物。
在另一个方面,提供了治疗与血管生成相关的病症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物。在某些实施方式中,所述病症是糖尿病病症、炎性病症、黄斑变性、肥胖症、动脉粥样硬化或增殖性障碍。
在又一方面,提供了治疗与CDK8和/或CDK19激酶活性相关的病症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物。在某些实施方式中,所述病症是增殖性障碍。在某些实施方式中,增殖性障碍是癌症。在某些实施方式中,癌症是造血系统癌症。在某些实施方式中,造血系统癌症是淋巴瘤。在某些实施方式中,造血系统癌症是白血病。在某些实施方式中,造血系统癌症是多发性骨髓瘤。在某些实施方式中,白血病是急性髓细胞性白血病(AML)。在某些实施方式中,增殖性障碍是骨髓增殖性肿瘤。在某些实施方式中,骨髓增殖性肿瘤是原发性骨髓纤维化(PMF)。在某些实施方式中,癌症是实体肿瘤。
在又一方面,提供了抑制细胞中的CDK8和/或CDK19激酶活性的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物与细胞接触。
在又一方面,提供了调节细胞中的β-连环蛋白途径的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物与细胞接触。
在又一方面,提供了调节细胞中的STAT1活性的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物与细胞接触。
在又一方面,提供了调节细胞中的TGFβ/BMP途径的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物与细胞接触。
在又一方面,提供了调节细胞中的HIF-1-A(HIF-1-α)活性的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物与细胞接触。
在又一方面,提供了提高细胞中的BIM表达以诱导细胞凋亡的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物或者其药物组合物与细胞接触。
在任何前述方法中,所述方法是体外方法或体内方法。
进一步提供了CDK8或CDK19 Tpr105点突变体及其使用方法。例如,在一个方面,提供了通过使CDK8或CDK19 Trp105点突变体和皮质抑素或皮质抑素类似物接触来验证细胞中的CDK8和/或CDK19激酶活性的方法。在另一个方面,提供了CDK8 Trp105点突变体。在某些实施方式中,CDK8 Trp105点突变体的氨基酸序列与SEQ ID NO:1的氨基酸序列具有至少约80%的同源性水平。进一步提供了与SEQ ID NO:1的氨基酸序列具有至少约80%的同源性水平的蛋白质。在又一方面,提供了CDK19 Trp105点突变体。在某些实施方式中,CDK19Trp105点突变体的氨基酸序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列具有至少约80%的同源性水平。进一步提供了与SEQ ID NO:2的氨基酸序列具有至少约80%的同源性水平的蛋白质。
本发明的一种或多种实施方式的细节在附图中给出。本发明的其它特征、目的和优势从详细说明、实施例和权利要求来看是清楚的。
附图说明
图1描绘了皮质抑素A和其它已知皮质抑素的结构。
图2A-2B描绘了酮13的示例性还原胺化以提供化合物14A和14B及它们的相应N-氧化物(图2A)和化合物14B的分子结构,其中二甲胺是β型(轴向的)(图2B)。
图3A-3M描绘了本发明的示例化合物。另外的化合物进一步在本文中描述。
图4A-4B描绘了在用皮质抑素A和所示的类似物处理7天时AML细胞系MV4;11(4A)和MOLM-14(4B)增殖的剂量依赖性的抑制。细胞进行传代并在第3天添加新的化合物(平均值+/-标准误,n=3)。
图5A-5B描绘了在用所示的皮质抑素类似物处理3天或10天时AML细胞系MV4;11增殖的剂量依赖性的抑制。细胞进行传代并在第3天和第7天添加新的化合物(平均值+/-标准误,n=3)。
图6A-6B描绘了在用所示的皮质抑素类似物处理3天或10天时AML细胞系MOLM-14增殖的剂量依赖性的抑制。细胞进行传代并在第3天和第7天添加新的化合物(平均值+/-标准误,n=3)。
图7显示皮质抑素A强效和选择性地抑制细胞中的CDK8模块激酶活性。CDK8被报告为抑制干扰素γ-刺激的STAT1 S727的磷酸化。参见,例如,Bancerek等,Immunity(2013)38:250-262。HepG2细胞用皮质抑素A孵育1小时,接着加入人重组干扰素-γ(IFN-γ)1小时。细胞裂解并通过蛋白质印迹探测。如所示的,皮质抑素A强力地抑制IFN-γ刺激的STAT1pS727的增加而不改变STAT1 pY701或者总STAT1和肌动蛋白的水平。
图8A-8C显示皮质抑素A抑制源自患有多种造血系统恶性肿瘤并携带多样的致癌驱动子的患者的人细胞系的增殖。这些细胞系代表的造血系统恶性肿瘤是:AML,包括源自患骨髓增殖性肿瘤的患者的那些(MPN、UKE-1和SET-2)、T-ALL、B-ALL、CML和MM。致癌驱动子包括具有FLT3-内部串联重复(FLT3-ITD)(MOLM-14和MV4;11)和不具有FLT3-ITD(RS4;11)、JAK2V617F和BCR-ABL的MLL-融合体。还显示了JAK2V617F-表达的细胞系,其如之前描述的经历了JAK1/2抑制剂鲁索利替尼(ruxolitinib)的延长处理(SET-2per、UKE-1per)。参见,例如,Koppikar等,Nature(2012)489:155–159。如所示的,皮质抑素A也抑制在鲁索利替尼存在下持续的这些细胞的增殖。细胞进行传代并在第3天和第7天添加新的皮质抑素A(平均值+/-标准误,n=3)。
图9描绘了在用所示的皮质抑素类似物处理10天时多发性骨髓瘤细胞系MM.1S增殖的剂量依赖性的抑制。细胞进行传代并在第3天和第7天添加新的化合物(平均值+/-标准误,n=3)。
图10A-10C通过显示CDK8和CDK19等位基因赋予细胞对皮质抑素A的生长抑制的抗性(图10A)及在体外(图10B)和在细胞内(图10C)对皮质抑素A的CDK8激酶抑制的抗性证明了CDK8/CDK19介导皮质抑素A的抗增殖作用。
图11A-11B描绘了皮质抑素A的药代动力学结果。图11A:皮质抑素A在pH6的10%DMSO/磷酸盐缓冲盐水中并以10mg/kg IP施用于雄性CD-1小鼠,并收集系列血浆样品和分析皮质抑素A的存在。如所示的,在1小时时Cmax是1.4mM且计算的T1/2是6.06小时。基于这一PK研究和皮质抑素A的体外效力,预测皮质抑素A可以以每日一次至少0.16mg/kg的处理在小鼠中维持有效剂量。图11B:雄性CD-1小鼠给予20%羟丙基-β-环糊精(HPCD)中1mg/kg皮质抑素A的单次IP注射。Cmax在30分钟时是762nM且0.5-2h之间计算的T1/2是33分钟。
图12A-12G显示皮质抑素A在AML的MV4;11播散性白血病小鼠模型中是有效的。表达mCherry、萤光素酶和嘌呤霉素抗性基因的MV4;11AML细胞注射到免疫抑制的NOD-SCID-IL2Rcγnull(NSG)小鼠的尾静脉中。7天后,通过生物发光成像证明植入且小鼠用媒介(20%2-羟丙基β-环糊精)、0.05和0.16mg/kg每天一次处理15天。显示第一次处理后的时间。图12A显示各时间点具有中位生物发光的小鼠的生物发光图像,表明随时间的较低疾病负荷。图12B显示通过二元ANOVA确定的平均生物发光±s.e.m.,n=11,P<0.0001。图12C显示Kaplan-Meier存活分析(n=8,P<0.0001,对数秩检验)。图12D-12F描绘第30天的脾重量(D),且对于各组中具有第29天的最高、最低和中位生物发光的小鼠显示了脾(E)和股骨骨髓(F)中MV4;11细胞(mCherry阳性)的百分比。*,P<0.05,**,P<0.01,***,P<0.001,通过媒介vs处理的一元ANOVA确定。图12D中的点线标明健康8周龄雌性NSG小鼠的平均值的1标准差内的范围。图12G显示平均体重在用皮质抑素A处理时不降低,表明皮质抑素A处理是耐受的。平均体重±s.e.m.,n=11。
图13A-13B证明皮质抑素A在健康CD-1小鼠中是耐受的。CD-1小鼠如图12中用相同给药方案(每天一次,持续15天)处理且进行体重和全血细胞计数(CBC)。图13A,平均体重±s.e.m.,n=3。图13B,在第15天最后剂量后2小时收集的CBC数据。CBC分析未表明媒介与0.16mg kg-1之间的显著差异。RBC,红细胞(x106细胞/μl);HGB,血红蛋白(g/dl);HCT,血细胞比容(%);MCV,红细胞平均体积(fl);MCH,平均红细胞血红蛋白(pg);MCHC,红细胞血红蛋白平均浓度(g/dl);PLT,血小板(x105血小板/μl);WBC,白细胞(x103细胞/μl);LYMPH,淋巴细胞(x103细胞/μl)。
图14A-14C证明皮质抑素A显示出作为原发性骨髓纤维化(PMF)治疗中的治疗剂的前景。结果来自PMF的鼠模型中前导研究。在这一模型中,造血干细胞中的MPLW515L过表达在体内导致骨髓增生,具有明显的骨髓纤维化、脾肿大和巨核细胞增殖(参见,例如,Pikman等,PLoS Med.(2006)3:e270)。在这一模型中,小鼠移植MPLW515L-转导的骨髓。在经14天以允许植入和发生严重MPN(包括血小板增多、白细胞增多和骨髓纤维化)后,小鼠随机化以每天一次i.p.接受媒介或皮质抑素A。6个日剂量的皮质抑素A后处死每组3只小鼠显示0.31mg/kg和0.62mg/kg的显著脾重量减轻(A)。脾肿大的宏观减轻显示在(C)中。4个日处理剂量后的血细胞计数分析显示等位基因负荷(allele burden)的显著减小,如通过外周血中的GFP百分比反映的(MPLW515L突变体使用MSCV-IRES-GFP逆转录病毒表达)(B)。
图15A-15E证明皮质抑素A可调节细胞中的Wnt/β-连环蛋白(A,B)和TGF-β(C)途径且可诱导BCL2L11表达(D和E)。图15A表明皮质抑素A抑制Wnt/β-连环蛋白途径刺激的报告基因表达。在几个TCF结合位点控制下用萤光素酶报告基因稳定转染HEK-293细胞(称为SuperTOPflash)(参见,例如,Xu等,Cell 2004,116,883-895)。在用Wnt3A或10μM GSK3β抑制剂azakenpaullone处理24小时以刺激Wnt/β-连环蛋白途径时,皮质抑素A抑制萤光素酶的表达,如通过发光测量的(IC50=1.5nM),不影响HEK-293细胞活力。垂直棒=SEM,n=3。图15B表明皮质抑素A抑制AML细胞系MV4;11中推定的Wnt/β-连环蛋白反应基因。MV4;11细胞用皮质抑素A处理24h并进行基因表达分析和基因集富集分析(GSEA)。GSEA揭示皮质抑素A下调了在GSK3-β抑制时上调的一组基因。由于GSK3-β抑制可刺激β-连环蛋白驱动的转录,这些基因代表了推定的Wnt/β-连环蛋白途径。图15C表明皮质抑素A(CA)剂量依赖性地抑制TGF-β刺激的SMAD2/3磷酸化。HaCat细胞用媒介或CA处理1小时,接着用TGF-β处理1小时。细胞然后洗涤、裂解和通过蛋白质印迹进行分析。图15D和E表明皮质抑素A在MV4;11和MOLM-14细胞的24h处理时剂量依赖性地提高BCL2L11的mRNA水平。
图16A-16D描绘皮质抑素A与CDK8/细胞周期蛋白C ATP结合位点的结合。图16A描绘了2.4埃分辨率的皮质抑素A/CDK8/细胞周期蛋白C三元复合物的X-射线晶体结构。图16B描绘了显示精细形状互补性的结合口袋。图16C描绘了CDK8和皮质抑素A之间的关键接触残基。点线指示皮质抑素A的异喹啉N和CDK8的主链酰胺N-H之间的H-键。也显示了皮质抑素A的电子密度。图16C也包括CDK8中ATP(青色/橙色,来自CDK2-ATP结构)与皮质抑素A的X-射线结构(黄色)的结构对准。注意到Trp105不接触ATP。图16D描绘了Trp105和皮质抑素A的N,N-二甲基基团之间接触的放大视图。如本文中进一步描述的,Trp105突变(被Met置换)赋予对皮质抑素A的抗性。
图17A-17B.图17A描绘了皮质抑素A暴露于硅胶时皮质抑素A的C3-N-氧化物的合成,与皮质抑素A用三乙胺处理的硅胶处理相反。图17B描绘了HUVEC对皮质抑素A和皮质抑素A N-氧化物处理的敏感性并表明两种化合物是等效的。HUVEC的96小时处理后的生长抑制使用Celltiter Blue(Promega)通过荧光信号测量,以媒介(DMSO)代表最高生长和10μM阿霉素代表最大生长抑制。
图18证明皮质抑素A在JAK2V617F-驱动增殖的SET-2皮下异种移植模型中是有效的。50%基质胶中1x107SET-2细胞肿瘤细胞皮下注射到8-12周龄雌性SCID Beige小鼠的侧腹中。一旦肿瘤达到80-120mm3的平均大小,小鼠在研究期间每天用媒介或0.16mg kg-1处理,导致68%肿瘤生长抑制(n=10,P<0.001,二元ANOVA)。
图19描绘了体外肝微粒体代谢稳定性分析,证明了化合物14B的N-氧化物显示改善的稳定性。
图20描绘了体外肝微粒体分析的结果,证明化合物14B在人肝微粒体中经历C3的N-单去甲基化而为化合物24B。
图21A-21E证明化合物14B的N-氧化物和化合物14B在测试的细胞系中的等效性。细胞进行传代且新鲜的化合物在第3和7天添加(平均值+/-标准误,n=3)。
图22A-22B证明CDK19(图22A)和CDK8(图22B)的等位基因赋予MV4;11细胞对于化合物14B的N-氧化物(14BNO)导致的生长抑制的抗性,表明CDK8/CDK19介导14BNO的抗增殖效应。
图23证明化合物14B的N-氧化物(14BNO)在与合并的人肝细胞混合时具有可接受的半衰期和清除率。
图24A-24C提供了在20%羟丙基-β-环糊精中配制的化合物(14A)在给予单剂量3mg/kg IV(图24A)、3mg/kg IP(图24B)或10mg/kg口服(PO)(图24C)的雄性CD-1小鼠中的药代动力学研究的结果。在给药前,小鼠禁食过夜直到给药后4小时。在所示时间点收集血样并通过HPLC/MS/MS进行分析以评价(14A)的浓度。口服给药后的Cmax在2小时后为255ng/mL,计算的T1/2为大约5小时,且口服生物利用度为44%。IV清除率为29/ml/min/kg,Vss为11.7L/kg,和IP生物利用度为95%。
具体实施方式
定义
化学定义
特定的官能团和化学术语的定义地下面更详细地描述。化学元素按照Handbookof Chemistry and Physics,75th Ed.的内封上的元素周期表,CAS版确定,且特定的官能团通常如本文中所定义。另外,有机化学的一般原理以及特定功能性部分和反应性如OrganicChemistry,Thomas Sorrell,University Science Books,Sausalito,1999;Smith andMarch March’s Advanced Organic Chemistry,5th Edition,John Wiley&Sons,Inc.,NewYork,2001;Larock,Comprehensive Organic Transformations,VCH Publishers,Inc.,New York,1989;and Carruthers,Some Modern Methods of Organic Synthesis,3rdEdition,Cambridge University Press,Cambridge,1987中所述。
本文所述的化合物可包含一个或多个非对称中心,且因此可以各种立体异构形式存在,例如,对映异构体和/或非对映异构体。例如,本文所述的化合物可以是单个对映异构体、非对映异构体或几何异构体的形式,或可以是立体异构体的混合物的形式,包括外消旋混合物和一种或多种立体异构体富集的混合物。异构体可以通过本领域技术人员已知的方法从混合物分离,包括手性高压液相(HPLC)及手性盐的形成和结晶;或者优选的异构体可以通过不对称合成制备。参见,例如,Jacques等,Enantiomers,Racemates andResolutions(Wiley Interscience,New York,1981);Wilen等,Tetrahedron 33:2725(1977);Eliel,E.L.Stereochemistry of Carbon Compounds(McGraw-Hill,NY,1962);andWilen,S.H.Tables of Resolving Agents and Optical Resolutions p.268(E.L.Eliel,Ed.,Univ.of Notre Dame Press,Notre Dame,IN 1972)。本发明另外涵盖作为基本上不含其它异构体的单个异构体且可选地作为各种异构体的混合物的化合物。
除非另外说明,本文中描绘的结构也意图包括不同仅在于一个或多个同位素富集的原子的化合物。例如,除了氢被氘或氚替代、19F被18F替代或碳被13C-或14C-富集的碳替代外具有本结构的化合物在本公开的范围内。这样的化合物可用于例如生物分析中的分析工具或探针。
当列出值的范围时,意图涵盖该范围内的各个值和子范围。例如,“C1-6烷基”意图涵盖C1、C2、C3、C4、C5、C6、C1-6、C1-5、C1-4、C1-3、C1-2、C2-6、C2-5、C2-4、C2-3、C3-6、C3-5、C3-4、C4-6、C4-5和C5-6烷基。
如本文中使用的,术语“脂族的”指烷基、烯基、炔基和环烷基。类似地,如本文中使用的,术语“杂脂族的”指杂烷基、杂烯基、杂炔基和杂环基。
如本文中使用的,“烷基”指具有1-10个碳原子的直链或支链的饱和烃基的基团(“C1-10烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-9个碳原子(“C1-9烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-8个碳原子(“C1-8烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-7个碳原子(“C1-7烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-6个碳原子(“C1-6烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-5个碳原子(“C1-5烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-4个碳原子(“C1-4烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-3个碳原子(“C1-3烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1-2个碳原子(“C1-2烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有1个碳原子(“C1烷基”)。在一些实施方式中,烷基具有2-6个碳原子(“C2-6烷基”)。C1-6烷基的实例包括甲基(C1)、乙基(C2)、正丙基(C3)、异丙基(C3)、正丁基(C4)、叔丁基(C4)、仲丁基(C4)、异丁基(C4)、正戊基(C5)、3-戊烷基(C5)、戊基(C5)、新戊基(C5)、3-甲基-2-丁烷基(C5)、叔戊基(C5)和正己基(C6)。烷基的其它实例包括正庚基(C7)、正辛基(C8)等等。除非另外特别指明,烷基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的烷基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的烷基”)。在某些实施方式中,烷基是未取代的C1-10烷基(例如,-CH3)。在某些实施方式中,烷基是取代的C1-10烷基。
如本文中使用的,“卤代烷基”是如本文定义的取代的烷基,其中一个或多个氢原子独立地被卤素替代,例如,氟、溴、氯或碘。“全卤代烷基”是卤代烷基的亚集,且指的是其中所有氢原子独立地被卤素替代的烷基,例如,氟、溴、氯或碘。在一些实施方式中,卤代烷基部分具有1-8个碳原子(“C1-8卤代烷基”)。在一些实施方式中,卤代烷基部分具有1-6个碳原子(“C1-6卤代烷基”)。在一些实施方式中,卤代烷基部分具有1-4个碳原子(“C1-4卤代烷基”)。在一些实施方式中,卤代烷基部分具有1-3个碳原子(“C1-3卤代烷基”)。在一些实施方式中,卤代烷基部分具有1-2个碳原子(“C1-2卤代烷基”)。在一些实施方式中,所有卤代烷基氢原子被氟替代以提供全氟烷基。在一些实施方式中,所有卤代烷基氢原子被氯替代以提供“全氯烷基”。卤代烷基的实例包括-CF3、-CF2CF3、-CF2CF2CF3、-CCl3、-CFCl2、-CF2Cl等等。
如本文中使用的,“杂烷基”是指如本文定义的烷基,其进一步在母链内(即,插入在相邻碳原子之间)包括选自氧、氮或硫的至少一个杂原子(例如,1、2、3或4个杂原子)和/或在母链的一个或多个末端位置处被替代。在某些实施方式中,杂烷基是指在母链内具有1-10个碳原子和1个或多个杂原子的饱和基团(“杂C1-10烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-9个碳原子和1个或多个杂原子的饱和基团(“杂C1-9烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-8个碳原子和1个或多个杂原子的饱和基团(“杂C1-8烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-7个碳原子和1个或多个杂原子的饱和基团(“杂C1-7烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-6个碳原子和1个或多个杂原子的饱和基团(“杂C1-6烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-5个碳原子和1或2个杂原子的饱和基团(“杂C1-5烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-4个碳原子和1或2个杂原子的饱和基团(“杂C1-4烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-3个碳原子和1个杂原子的饱和基团(“杂C1-3烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有1-2个碳原子和1个杂原子的饱和基团(“杂C1-2烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是具有1个碳原子和1个杂原子的饱和基团(“杂C1烷基”)。在一些实施方式中,杂烷基是在母链内具有2-6个碳原子和1或2个杂原子的饱和基团(“杂C2-6烷基”)。除非另外特别指明,杂烷基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的杂烷基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的杂烷基”)。在某些实施方式中,杂烷基是未取代的杂C1-10烷基。在某些实施方式中,杂烷基是取代的杂C1-10烷基。
如本文中使用的,“烯基”是指具有2-10个碳原子和一个或多个碳-碳双键(例如,1、2、3或4个双键)的直链或支链烃基的基团。在一些实施方式中,烯基具有2-9个碳原子(“C2-9烯基”)。在一些实施方式中,烯基具有2-8个碳原子(“C2-8烯基”)。在一些实施方式中,烯基具有2-7个碳原子(“C2-7烯基”)。在一些实施方式中,烯基具有2-6个碳原子(“C2-6烯基”)。在一些实施方式中,烯基具有2-5个碳原子(“C2-5烯基”)。在一些实施方式中,烯基具有2-4个碳原子(“C2-4烯基”)。在一些实施方式中,烯基具有2-3个碳原子(“C2-3烯基”)。在一些实施方式中,烯基具有2个碳原子(“C2烯基”)。一个或多个碳-碳双键可以是内部的(如在2-丁烯基中)或末端的(如在1-丁烯基中)。C2-4烯基的实例包括乙烯基(C2)、1-丙烯基(C3)、2-丙烯基(C3)、1-丁烯基(C4)、2-丁烯基(C4)、丁二烯基(C4)等等。C2-6烯基的实例包括前述C2–4烯基以及戊烯基(C5)、戊二烯基(C5)、己烯基(C6)等等。烯基的其它实例包括庚烯基(C7)、辛烯基(C8)、辛三烯基(C8)等等。除非另外特别指明,烯基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的烯基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的烯基”)。在某些实施方式中,烯基是未取代的C2-10烯基。在某些实施方式中,烯基是取代的C2-10烯基。
如本文中使用的,“杂烯基”是指如本文定义的烯基,其进一步在母链内(即,插入在母链的相邻碳原子之间)包括选自氧、氮或硫的至少一个杂原子(例如,1、2、3或4个杂原子)和/或在母链的一个或多个末端位置处被替代。在某些实施方式中,杂烯基是指在母链内具有2-10个碳原子、至少一个双键和1个或多个杂原子的基团(“杂C2-10烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-9个碳原子、至少一个双键和1个或多个杂原子(“杂C2-9烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-8个碳原子、至少一个双键和1个或多个杂原子(“杂C2-8烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-7个碳原子、至少一个双键和1个或多个杂原子(“杂C2-7烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-6个碳原子、至少一个双键和1个或多个杂原子(“杂C2-6烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-5个碳原子、至少一个双键和1或2个杂原子(“杂C2-5烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-4个碳原子、至少一个双键和1或2个杂原子(“杂C2-4烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-3个碳原子、至少一个双键和1个杂原子(“杂C2-3烯基”)。在一些实施方式中,杂烯基在母链内具有2-6个碳原子、至少一个双键和1或2个杂原子(“杂C2-6烯基”)。除非另外特别指明,杂烯基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的杂烯基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的杂烯基”)。在某些实施方式中,杂烯基是未取代的杂C2-10烯基。在某些实施方式中,杂烯基是取代的杂C2-10烯基。
如本文中使用的,“炔基”是指具有2-10个碳原子和一个或多个碳-碳三键(例如,1、2、3或4个三键)的直链或支链烃基的基团(“C2-10炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2-9个碳原子(“C2-9炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2-8个碳原子(“C2-8炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2-7个碳原子(“C2-7炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2-6个碳原子(“C2-6炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2-5个碳原子(“C2-5炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2-4个碳原子(“C2-4炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2-3个碳原子(“C2-3炔基”)。在一些实施方式中,炔基具有2个碳原子(“C2炔基”)。一个或多个碳-碳三键可以是内部的(如在2-丁炔基)或末端的(如在1-丁炔基)。C2-4炔基的实例包括,但不限于乙炔基(C2)、1-丙炔基(C3)、2-丙炔基(C3)、1-丁炔基(C4)、2-丁炔基(C4)等等。C2-6烯基的实例包括前述C2-4炔基以及戊炔基(C5)、己炔基(C6)等等。炔基的其它实例包括庚炔基(C7)、辛炔基(C8)等等。除非另外特别指明,炔基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的炔基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的炔基”)。在某些实施方式中,炔基是未取代的C2-10炔基。在某些实施方式中,炔基是取代的C2-10炔基。
如本文中使用的,“杂炔基”是指如本文中定义的炔基,其进一步在母链内(即,插入在其相邻碳原子之间)包括选自氧、氮或硫的至少一个杂原子(例如,1、2、3或4个杂原子)和/或在母链的一个或多个末端位置被替代。在某些实施方式中,杂炔基是指在母链内具有2-10个碳原子、至少一个三键和1个或多个杂原子的基团(“杂C2-10炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-9个碳原子、至少一个三键和1个或多个杂原子(“杂C2-9炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-8个碳原子、至少一个三键和1个或多个杂原子(“杂C2-8炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-7个碳原子、至少一个三键和1个或多个杂原子(“杂C2-7炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-6个碳原子、至少一个三键和1个或多个杂原子(“杂C2-6炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-5个碳原子、至少一个三键和1或2个杂原子(“杂C2-5炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-4个碳原子、至少一个三键和1或2个杂原子(“杂C2-4炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-3个碳原子、至少一个三键和1个杂原子(“杂C2-3炔基”)。在一些实施方式中,杂炔基在母链内具有2-6个碳原子、至少一个三键和1或2个杂原子(“杂C2-6炔基”)。除非另外特别指明,杂炔基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的杂炔基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的杂炔基”)。在某些实施方式中,杂炔基是未取代的杂C2-10炔基。在某些实施方式中,杂炔基是取代的杂C2-10炔基。
如本文中使用的,“碳环基”或“碳环的”是指在非芳族环系统中具有3-14个环碳原子(“C3-14碳环基”)和零个杂原子的非芳族环状烃基的基团。在一些实施方式中,碳环基具有3-10个环碳原子(“C3-10碳环基”)。在一些实施方式中,碳环基具有3-9个环碳原子(“C3-9碳环基”)。在一些实施方式中,碳环基具有3-8个环碳原子(“C3-8碳环基”)。在一些实施方式中,碳环基具有3-7个环碳原子(“C3-7碳环基”)。在一些实施方式中,碳环基具有3-6个环碳原子(“C3-6碳环基”)。在一些实施方式中,碳环基具有4-6个环碳原子(“C4-6碳环基”)。在一些实施方式中,碳环基具有5-6个环碳原子(“C5-6碳环基”)。在一些实施方式中,碳环基具有5-10个环碳原子(“C5-10碳环基”)。示例性的C3-6碳环基包括,但不限于环丙基(C3)、环丙烯基(C3)、环丁基(C4)、环丁烯基(C4)、环戊基(C5)、环戊烯基(C5)、环己基(C6)、环己烯基(C6)、环己二烯基(C6)等等。示例性的C3-8碳环基包括,但不限于前述C3-6碳环基以及环庚基(C7)、环庚烯基(C7)、环庚二烯基(C7)、环庚三烯基(C7)、环辛基(C8)、环辛烯基(C8)、双环[2.2.1]庚烷基(C7)、双环[2.2.2]辛烷基(C8)等等。示例性的C3-10碳环基包括,但不限于前述C3-8碳环基以及环壬基(C9)、环壬烯基(C9)、环癸基(C10)、环癸烯基(C10)、八氢-1H-茚基(C9)、十氢萘基(C10)、螺[4.5]癸基(C10)等等。如前述实例证明的,在某些实施方式中,碳环基是单环的(“单环碳环基”)或多环的(例如,含稠合的、桥连的或螺环系统如双环系统(“双环碳环基”)或三环系统(“三环碳环基”))且可以是饱和的或可以包含一个或多个碳-碳双键或三键。“碳环基”也包括其中如以上定义的碳环基环与一个或多个芳基或杂芳基稠合的环系统,其中连接点是在碳环基环上,且在这样的情况中,碳原子数继续指碳环环系统中的碳原子数。除非另外特别指明,碳环基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的碳环基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的碳环基”)。在某些实施方式中,碳环基是未取代的C3-14碳环基。在某些实施方式中,碳环基是取代的C3-14碳环基。
在一些实施方式中,“碳环基”是具有3-10个环碳原子的单环的、饱和的碳环基(“C3-10环烷基”)。在一些实施方式中,环烷基具有3-9个环碳原子(“C3-9环烷基”)。在一些实施方式中,环烷基具有3-8个环碳原子(“C3-8环烷基”)。在一些实施方式中,环烷基具有3-6个环碳原子(“C3-6环烷基”)。在一些实施方式中,环烷基具有4-6个环碳原子(“C4-6环烷基”)。在一些实施方式中,环烷基具有5-6个环碳原子(“C5-6环烷基”)。在一些实施方式中,环烷基具有5-10个环碳原子(“C5-10环烷基”)。C5-6环烷基的实例包括环戊基(C5)和环己基(C5)。C3-6环烷基的实例包括前述C5-6环烷基以及环丙基(C3)和环丁基(C4)。C3-8环烷基的实例包括前述C3-6环烷基以及环庚基(C7)和环辛基(C8)。除非另外特别指明,环烷基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的环烷基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的环烷基”)。在某些实施方式中,环烷基是未取代的C3-10环烷基。在某些实施方式中,环烷基是取代的C3-10环烷基。
如本文中使用的,“杂环基”或“杂环的”是指具有环碳原子和1-4个环杂原子的3-至14-元非芳族环系统的基团,其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“3-14元杂环基”)。在包含一个或多个氮原子的杂环基中,连接点可以是碳或氮原子,如化学价允许的。杂环基可以是单环的(“单环杂环基”)或多环的(例如,稠合的、桥连的或螺环系统如双环系统(“双环杂环基”)或三环系统(“三环杂环基”)),且可以是饱和的或可以包含一个或多个碳-碳双键或三键。杂环基多环环系统可以在一个或两个环中包括一个或多个杂原子。“杂环基”也包括其中如以上定义的杂环基环与一个或多个碳环基稠合(其中连接点在碳环基或杂环基环上)的环系统,或其中如以上定义的杂环基环与一个或多个芳基或杂芳基稠合(其中连接点在杂环基环上)的环系统,且在这样的情况中,环成员的数目继续指明杂环基环系统中环成员的数目。除非另外指明,杂环基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的杂环基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的杂环基”)。在某些实施方式中,杂环基是未取代的3-14元杂环基。在某些实施方式中,杂环基是取代的3-14元杂环基。
在一些实施方式中,杂环基是具有环碳原子和1-4个环杂原子的5-10元非芳族环系统,其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“5-10元杂环基”)。在一些实施方式中,杂环基是具有环碳原子和1-4个环杂原子的5-8元非芳族环系统,其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“5-8元杂环基”)。在一些实施方式中,杂环基是具有环碳原子和1-4个环杂原子的5-6元非芳族环系统,其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“5-6元杂环基”)。在一些实施方式中,5-6元杂环基具有选自氮、氧和硫的1-3个环杂原子。在一些实施方式中,5-6元杂环基具有选自氮、氧和硫的1-2个环杂原子。在一些实施方式中,5-6元杂环基具有选自氮、氧和硫的1个环杂原子。
示例性的包含1个杂原子的3-元杂环基包括,但不限于氮杂环丙基、氧杂环丙基和硫杂丙基。示例性的包含1个杂原子的4-元杂环基包括,但不限于氮杂环丁基、氧杂环丁基和硫杂环丁基。示例性的包含1个杂原子的5-元杂环基包括,但不限于四氢呋喃基、二氢呋喃基、四氢噻吩基、二氢噻吩基、吡咯烷基、二氢吡咯基和吡咯基-2,5-二酮。示例性的包含2个杂原子的5-元杂环基包括,但不限于二氧杂环戊基、氧硫杂环戊基和二硫戊环基。示例性的包含3个杂原子的5-元杂环基包括,但不限于三唑啉基、噁二唑啉基和噻二唑啉基。示例性的包含1个杂原子的6-元杂环基包括,但不限于哌啶基、四氢吡喃基、二氢吡啶基和噻烷基。示例性的包含2个杂原子的6-元杂环基包括,但不限于吡嗪基、吗啉基、二噻烷基、二噁烷基。示例性的包含3个杂原子的6-元杂环基包括,但不限于triazinanyl。示例性的包含1个杂原子的7-元杂环基包括,但不限于氮杂环庚烷基、氧杂环庚烷基和硫杂环庚烷基。示例性的包含1个杂原子的8-元杂环基包括,但不限于氮杂环辛基、氧杂环辛基和硫杂环辛基。示例性的双环杂环基包括,但不限于二氢吲哚基、异吲哚啉基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并噻吩基、四氢苯并噻吩基、四氢苯并呋喃基、四氢吲哚基、四氢喹啉基、四氢异喹啉基、十氢喹啉基、十氢异喹啉基、八氢色烯基、八氢异色烯基、十氢萘啶基、十氢-1,8-萘啶基、八氢吡咯并[3,2-b]吡咯、吲哚啉基、酞亚胺基、萘酰亚胺基、色满基、色烯基、1H-苯并[e][1,4]二氮杂基、1,4,5,7-四氢吡喃并[3,4-b]吡咯基、5,6-二氢-4H-呋喃并[3,2-b]吡咯基、6,7-二氢-5H-呋喃并[3,2-b]吡喃基、5,7-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡喃基、2,3-二氢-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、2,3-二氢呋喃并[2,3-b]吡啶基、4,5,6,7-四氢-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、4,5,6,7-四氢-呋喃并[3,2-c]吡啶基、4,5,6,7-四氢噻吩并[3,2-b]吡啶基、1,2,3,4-四氢-1,6-萘啶基等等。
如本文中使用的,“芳基”是指具有芳香环系统中提供的6-14个环碳原子和零个杂原子的单环或多环的(例如,双环或三环的)4n+2芳香环系统的基团(例如,环阵列中具有共享的6、10或14个π电子)(“C6-14芳基”)。在一些实施方式中,芳基具有6个环碳原子(“C6芳基”;例如,苯基)。在一些实施方式中,芳基具有10个环碳原子(“C10芳基”;例如,萘基如1-萘基和2-萘基)。在一些实施方式中,芳基具有14个环碳原子(“C14芳基”;例如,蒽基)。“芳基”也包括其中如以上定义的芳基环与一个或多个碳环基或杂环基稠合的环系统,其中基团或连接点在芳基环上,且在这样的情况中,碳原子数继续指芳基环系统中的碳原子数。除非另外指明,芳基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的芳基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的芳基”)。在某些实施方式中,芳基是未取代的C6-14芳基。在某些实施方式中,芳基是取代的C6-14芳基。
“芳烷基”是“烷基”的子集且是指被如本文定义的芳基取代的如本文定义的烷基,其中连接点在烷基部分上。
如本文中使用的,“杂芳基”是指具有在芳香环系统中提供的环碳原子和1-4个环杂原子的5-14元单环或多环的(例如,双环、三环的)4n+2芳香环系统的基团(例如,具有6、10或14个环阵列中共享的π电子),其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“5-14元杂芳基”)。在包含一个或多个氮原子的杂芳基中,连接点可以是碳或氮原子,如化学价允许的。杂芳基多环环系统可以在一个或两个环中包括一个或多个杂原子。“杂芳基”包括其中如以上定义的杂芳基环与一个或多个碳环基或杂环基稠合的环系统,其中连接点在杂芳基环上,且在这样的情况中,环成员的数目继续指杂芳基环系统中环成员的数目。“杂芳基”也包括其中如以上定义的杂芳基环与一个或多个芳基稠合的环系统,其中连接点在芳基或杂芳基环上,且在这样的情况中,环成员的数目指稠合的多环(芳基/杂芳基)环系统中环成员的数目。其中一个环不包含杂原子的多环杂芳基(例如,吲哚基、喹啉基、咔唑基等等)连接点可以在环上,即携带杂原子的环(例如,2-吲哚基)或不包含杂原子的环(例如,5-吲哚基)。
在一些实施方式中,杂芳基是具有芳香环系统中提供的环碳原子和1-4个环杂原子的5-10元芳香环系统,其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“5-10元杂芳基”)。在一些实施方式中,杂芳基是具有芳香环系统中提供的环碳原子和1-4个环杂原子的5-8元芳香环系统,其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“5-8元杂芳基”)。在一些实施方式中,杂芳基是具有芳香环系统中提供的环碳原子和1-4个环杂原子的5-6元芳香环系统,其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫(“5-6元杂芳基”)。在一些实施方式中,5-6元杂芳基具有选自氮、氧和硫的1-3个环杂原子。在一些实施方式中,5-6元杂芳基具有选自氮、氧和硫的1-2个环杂原子。在一些实施方式中,5-6元杂芳基具有选自氮、氧和硫的1个环杂原子。除非另外指明,杂芳基的各种情况独立地是未取代的(“未取代的杂芳基”)或被一个或多个取代基取代的(“取代的杂芳基”)。在某些实施方式中,杂芳基是未取代的5-14元杂芳基。在某些实施方式中,杂芳基是取代的5-14元杂芳基。
示例性的包含1个杂原子的5-元杂芳基包括,但不限于吡咯基、呋喃基和噻吩基。示例性的包含2个杂原子的5-元杂芳基包括,但不限于咪唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、噻唑基和异噻唑基。示例性的包含3个杂原子的5-元杂芳基包括,但不限于三唑基、噁二唑基和噻二唑基。示例性的包含4个杂原子的5-元杂芳基包括,但不限于四唑基。示例性的包含1个杂原子的6-元杂芳基包括,但不限于吡啶基。示例性的包含2个杂原子的6-元杂芳基包括,但不限于哒嗪基、嘧啶基和吡嗪基。示例性的包含3或4个杂原子的6-元杂芳基分别包括,但不限于三嗪基和四嗪基。示例性的包含1个杂原子的7-元杂芳基包括,但不限于吖庚因基、噁庚英基和噻庚英基。示例性的5,6-双环杂芳基包括,但不限于吲哚基、异吲哚基、吲唑基、苯并三唑基、苯并噻吩基、异苯并噻吩基、苯并呋喃基、苯并异呋喃基、苯并咪唑基、苯并噁唑基、苯并异噁唑基、苯并噁二唑基、苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并噻二唑基、吲嗪基和嘌呤基。示例性的6,6-双环杂芳基包括,但不限于萘啶基、蝶啶基、喹啉基、异喹啉基、噌啉基、喹喔啉基、酞嗪基和喹唑啉基。示例性的三环杂芳基包括,但不限于菲啶基、二苯并呋喃基、咔唑基、吖啶基、吩噻嗪基、吩噁嗪基和吩嗪基。
“杂芳烷基”是“烷基”的子集且是指被如本文定义的杂芳基取代的如本文定义的烷基,其中连接点在烷基部分上。
如本文中使用的,术语“部分不饱和的”是指包括至少一个双键或三键的环部分。术语“部分不饱和的”意图涵盖具有多个不饱和位点的环,但不意图包括如本文定义的芳族基团(例如,芳基或杂芳基部分)。
如本文中使用的,术语“饱和的”是指不包含双键或三键的环部分,即环包含全部单键。
基团加后缀“-ene”表示该基团是二价部分,例如,亚烷基是烷基的二价部分,亚烯基是烯基的二价部分,亚炔基是炔基的二价部分,杂亚烷基是杂烷基的二价部分,杂亚烯基是杂烯基的二价部分,杂亚炔基是杂炔基的二价部分,亚碳环基是碳环基的二价部分,亚杂环基是杂环基的二价部分,亚芳基是芳基的二价部分,且亚杂芳基是杂芳基的二价部分。
如从上文理解的,如本文定义的烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基在某些实施方式中是任选取代的。任选取代的是指可以是取代的或未取代的基团(例如,“取代的”或“未取代的”烷基、“取代的”或“未取代的”烯基、“取代的”或“未取代的”炔基、“取代的”或“未取代的”杂烷基、“取代的”或“未取代的”杂烯基、“取代的”或“未取代的”杂炔基、“取代的”或“未取代的”碳环基、“取代的”或“未取代的”杂环基、“取代的”或“未取代的”芳基或者“取代的”或“未取代的”杂芳基)。一般地,术语“取代的”意思是基团上存在的至少一个氢被允许的取代基替代,例如,在取代时产生稳定的化合物的取代基,例如,不自发发生转化(如通过重排,环化、消去或其它反应)的化合物。除非另外指出,“取代的”基团在基团的一个或多个可取代位置处具有取代基,且当任何给定结构中超过一个位置被取代时,取代基在各位置处相同或不同。本发明设想任何和所有这样的组合以获得稳定的化合物。为了本发明的目的,杂原子如氮可以具有如本文所述的氢取代基和/或任何合适的取代基,其满足杂原子的价位并导致形成稳定的部分。
示例性的取代基包括,但不限于卤素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-ORaa、-ON(Rbb)2、-N(Rbb)2、-N(Rbb)3 +X-、-N(ORcc)Rbb、-SH、-SRaa、-SSRcc、-C(=O)Raa、-CO2H、-CHO、-C(ORcc)2、-CO2Raa、-OC(=O)Raa、-OCO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-OC(=O)N(Rbb)2、-NRbbC(=O)Raa、-NRbbCO2Raa、-NRbbC(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-OC(=NRbb)Raa、-OC(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-OC(=NRbb)N(Rbb)2、-NRbbC(=NRbb)N(Rbb)2、-C(=O)NRbbSO2Raa、-NRbbSO2Raa、-SO2N(Rbb)2、-SO2Raa、-SO2ORaa、-OSO2Raa、-S(=O)Raa、-OS(=O)Raa、-Si(Raa)3、-OSi(Raa)3-C(=S)N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=S)SRaa、-SC(=S)SRaa、-SC(=O)SRaa、-OC(=O)SRaa、-SC(=O)ORaa、-SC(=O)Raa、-P(=O)2Raa、-OP(=O)2Raa、-P(=O)(Raa)2、-OP(=O)(Raa)2、-OP(=O)(ORcc)2、-P(=O)2N(Rbb)2、-OP(=O)2N(Rbb)2、-P(=O)(NRbb)2、-OP(=O)(NRbb)2、-NRbbP(=O)(ORcc)2、-NRbbP(=O)(NRbb)2、-P(Rcc)2、-P(Rcc)3、-OP(Rcc)2、-OP(Rcc)3、-B(Raa)2、-B(ORcc)2、-BRaa(ORcc)、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、杂C1-10烷基、杂C2-10烯基、杂C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rdd基团取代;
或碳原子上的两个偕位氢被基团=O、=S、=NN(Rbb)2、=NNRbbC(=O)Raa、=NNRbbC(=O)ORaa、=NNRbbS(=O)2Raa、=NRbb或=NORcc替代;
Raa的各种情况独立地选自C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、杂C1-10烷基、杂C2-10烯基、杂C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基,或者两个Raa基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rdd基团取代;
Rbb的各种情况独立地选自氢、-OH、-ORaa、-N(Rcc)2、-CN、-C(=O)Raa、-C(=O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(=NRcc)ORaa、-C(=NRcc)N(Rcc)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(=S)N(Rcc)2、-C(=O)SRcc、-C(=S)SRcc、-P(=O)2Raa、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)2N(Rcc)2、-P(=O)(NRcc)2、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、杂C1-10烷基、杂C2-10烯基、杂C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基,或者两个Rbb基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rdd基团取代;
Rcc的各种情况独立地选自氢、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、杂C1-10烷基、杂C2-10烯基、杂C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基,或者两个Rcc基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rdd基团取代;
Rdd的各种情况独立地选自卤素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-ORee、-ON(Rff)2、-N(Rff)2、-N(Rff)3 +X-、-N(ORee)Rff、-SH、–SRee、-SSRee、-C(=O)Ree、-CO2H、-CO2Ree、-OC(=O)Ree、-OCO2Ree、-C(=O)N(Rff)2、-OC(=O)N(Rff)2、-NRffC(=O)Ree、-NRffCO2Ree、-NRffC(=O)N(Rff)2、-C(=NRff)ORee、-OC(=NRff)Ree、-OC(=NRff)ORee、-C(=NRff)N(Rff)2、-OC(=NRff)N(Rff)2、-NRffC(=NRff)N(Rff)2、-NRffSO2Ree、-SO2N(Rff)2、-SO2Ree、-SO2ORee、-OSO2Ree、-S(=O)Ree、-Si(Ree)3、-OSi(Ree)3、-C(=S)N(Rff)2、-C(=O)SRee、-C(=S)SRee、-SC(=S)SRee、-P(=O)2Ree、-P(=O)(Ree)2、-OP(=O)(Ree)2、-OP(=O)(ORee)2、C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、杂C1–6烷基、杂C2-6烯基、杂C2-6炔基、C3-10碳环基、3-10元杂环基、C6-10芳基、5-10元杂芳基,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rgg基团取代或者两个偕位Rdd取代基可以接合以形成=O或=S;
Ree的各种情况独立地选自C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、杂C1-6烷基、杂C2-6烯基、杂C2-6炔基、C3-10碳环基、C6-10芳基、3-10元杂环基和3-10元杂芳基,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rgg基团取代;
Rff的各种情况独立地选自氢、C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、杂C1-6烷基、杂C2-6烯基、杂C2-6炔基、C3-10碳环基、3-10元杂环基、C6-10芳基和5-10元杂芳基,或者两个Rff基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rgg基团取代;和
Rgg的各种情况独立地是卤素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-OC1-6烷基、-ON(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)3 +X-、-NH(C1-6烷基)2 +X-、-NH2(C1-6烷基)+X-、-NH3 +X-、-N(OC1-6烷基)(C1-6烷基)、-N(OH)(C1-6烷基)、-NH(OH)、-SH、-SC1-6烷基、-SS(C1-6烷基)、-C(=O)(C1-6烷基)、-CO2H、-CO2(C1-6烷基)、-OC(=O)(C1-6烷基)、-OCO2(C1-6烷基)、-C(=O)NH2、-C(=O)N(C1-6烷基)2、-OC(=O)NH(C1-6烷基)、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)C(=O)(C1-6烷基)、-NHCO2(C1-6烷基)、-NHC(=O)N(C1-6烷基)2、-NHC(=O)NH(C1-6烷基)、-NHC(=O)NH2、-C(=NH)O(C1-6烷基)、-OC(=NH)(C1-6烷基)、-OC(=NH)OC1-6烷基、-C(=NH)N(C1-6烷基)2、-C(=NH)NH(C1-6烷基)、-C(=NH)NH2、-OC(=NH)N(C1-6烷基)2、-OC(NH)NH(C1-6烷基)、-OC(NH)NH2、-NHC(NH)N(C1-6烷基)2、-NHC(=NH)NH2、-NHSO2(C1-6烷基)、-SO2N(C1-6烷基)2、-SO2NH(C1-6烷基)、-SO2NH2、-SO2C1-6烷基、-SO2OC1-6烷基、-OSO2C1-6烷基、-SOC1-6烷基、-Si(C1-6烷基)3、-OSi(C1-6烷基)3-C(=S)N(C1-6烷基)2、C(=S)NH(C1-6烷基)、C(=S)NH2、-C(=O)S(C1-6烷基)、-C(=S)SC1-6烷基、-SC(=S)SC1-6烷基、-P(=O)2(C1-6烷基)、-P(=O)(C1-6烷基)2、-OP(=O)(C1-6烷基)2、-OP(=O)(OC1-6烷基)2、C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、杂C1-6烷基、杂C2-6烯基、杂C2-6炔基、C3-10碳环基、C6-10芳基、3-10元杂环基、5-10元杂芳基;或两个偕位Rgg取代基可以接合以形成=O或=S;其中X-是反离子。
在某些实施方式中,示例性的取代基选自卤素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-ORaa、-N(Rbb)2、-SH、-SRaa、-SSRcc、-C(=O)Raa、-CO2H、-CHO、-CO2Raa、-OC(=O)Raa、-OCO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-OC(=O)N(Rbb)2、-NRbbC(=O)Raa、-NRbbCO2Raa、-NRbbC(=O)N(Rbb)2、-C(=O)NRbbSO2Raa、-NRbbSO2Raa、-SO2N(Rbb)2、-SO2Raa、-S(=O)Raa、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、杂C1-10烷基、杂C2-10烯基、杂C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rdd基团取代。
如本文中使用的,术语“卤代”或“卤素”是指氟(氟代,-F)、氯(氯代,-Cl)、溴(溴代,-Br)或碘(碘代,-I)。
如本文中使用的,“反离子”是与带正电的季胺结合以维持电中性的带负电的基团。示例性的反离子包括卤素离子(例如,F-、Cl-、Br-、I-)、NO3 -、ClO4 -、OH-、H2PO4 -、HSO4 -、磺酸根离子(例如,甲磺酸根、三氟甲磺酸根、p-甲苯磺酸根、苯磺酸根、10-樟脑磺酸根、萘-2-磺酸盐、萘-1-磺酸-5-磺酸根、乙-1-磺酸-2-磺酸根等等)和羧酸根离子(例如,乙酸根、醋酸根、丙酸根、苯甲酸根、甘油酸根、乳酸根、酒石酸根、乙醇酸根等等)。
如本文中使用的,“离去基团”是本领域公认的术语,指在异裂键切割中与一对电子离去的分子片段,其中分子片段是阴离子或中性分子。参见,例如,Smith,MarchAdvanced Organic Chemistry 6th ed.(501-502)。示例性的离去基团包括,但不限于卤代(例如,氯、溴、碘)和-OSO2Raa,其中Raa如本文定义。基团-OSO2Raa涵盖离去基团如甲苯磺酰基、甲磺酰基和苯磺酰基,其中Raa是任选取代的烷基(例如,-CH3)或任选取代的芳基(例如,苯基、甲苯基)。
如本文中使用的,术语“羟基”或“氢氧基”是指基团-OH。再则,术语“取代的羟基”或“取代的氢氧基”是指其中直接连接于母体分子的氧原子被氢以外的基团取代的羟基,且包括选自-ORaa、-ON(Rbb)2、-OC(=O)SRaa、-OC(=O)Raa、-OCO2Raa、-OC(=O)N(Rbb)2、-OC(=NRbb)Raa、-OC(=NRbb)ORaa、-OC(=NRbb)N(Rbb)2、-OS(=O)Raa、-OSO2Raa、-OSi(Raa)3、-OP(Rcc)2、-OP(Rcc)3、-OP(=O)2Raa、-OP(=O)(Raa)2、-OP(=O)(ORcc)2、-OP(=O)2N(Rbb)2和-OP(=O)(NRbb)2的基团,其中Raa、Rbb和Rcc如本文定义。
如本文中使用的,术语“巯基”或“硫醇”是指基团-SH。再则,术语“取代的巯基”或“取代的硫醇”是指其中直接连接于母体分子的硫原子被氢以外的基团取代的巯基,且包括选自-SRaa、-S=SRcc、-SC(=S)SRaa、-SC(=O)SRaa、-SC(=O)ORaa和-SC(=O)Raa的基团,其中Raa和Rcc如本文定义。
如本文中使用的,术语“氨基”是指基团-NH2。再则,术语“取代的氨基”是指单取代的氨基或二取代的氨基,如本文定义的。在某些实施方式中,“取代的氨基”是单取代的氨基或二取代的氨基。
如本文中使用的,术语“单取代的氨基”是指其中直接连接于母体分子的氮原子被一个氢和一个氢以外的基团取代的氨基,且包括选自-NH(Rbb)、-NHC(=O)Raa、-NHCO2Raa、-NHC(=O)N(Rbb)2、-NHC(=NRbb)N(Rbb)2、-NHSO2Raa、-NHP(=O)(ORcc)2和-NHP(=O)(NRbb)2的基团,其中Raa、Rbb和Rcc如本文定义,且其中基团-NH(Rbb)的Rbb不是氢。
如本文中使用的,术语“二取代的氨基”是指其中直接连接于母体分子的氮原子被两个氢以外的基团取代的氨基,且包括选自-N(Rbb)2、-NRbbC(=O)Raa、-NRbbCO2Raa、-NRbbC(=O)N(Rbb)2、-NRbbC(=NRbb)N(Rbb)2、-NRbbSO2Raa、-NRbbP(=O)(ORcc)2和-NRbbP(=O)(NRbb)2的基团,其中Raa、Rbb和Rcc如本文定义,条件是直接连接于母体分子的氮原子未被氢取代。
如本文中使用的,术语“磺酰基”是指选自-SO2N(Rbb)2、-SO2Raa和-SO2ORaa的基团,其中Raa和Rbb如本文定义。
如本文中使用的,术语“亚硫酰基”是指基团-S(=O)Raa,其中Raa如本文定义。
如本文中使用的,术语“羰基”是指其中直接连接于母体分子的碳sp2杂化的基团,且被氧、氮或硫原子取代,例如,选自酮(-C(=O)Raa)、羧酸(-CO2H)、醛(-CHO)、酯(-CO2Raa、-C(=O)SRaa、-C(=S)SRaa)、酰胺(-C(=O)N(Rbb)2、-C(=O)NRbbSO2Raa、-C(=S)N(Rbb)2)和亚胺(-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa)、-C(=NRbb)N(Rbb)2)的基团,其中Raa和Rbb如本文定义。
如本文中使用的,术语“甲硅烷基”是指基团-Si(Raa)3,其中Raa如本文定义。
如本文中使用的,术语“氧代”是指基团=O,且术语“硫代(thiooxo)”是指基团=S。
氮原子可以取代的或未取代的,如价位允许的,且包括伯、仲、叔和季氮原子。示例性的氮原子取代基包括,但不限于氢、-OH、-ORaa、-N(Rcc)2、-CN、-C(=O)Raa、-C(=O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRcc)ORaa、-C(=NRcc)N(Rcc)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(=S)N(Rcc)2、-C(=O)SRcc、-C(=S)SRcc、-P(=O)2Raa、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)2N(Rcc)2、-P(=O)(NRcc)2、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、杂C1-10烷基、杂C2-10烯基、杂C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基,或者连接于N原子的两个Rcc基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rdd基团取代,且其中Raa、Rbb、Rcc和Rdd如以上定义。
在某些实施方式中,氮原子上存在的取代基是氮保护基(本文中也称为“氨基保护基”)。氮保护基包括,但不限于-OH、-ORaa、-N(Rcc)2、-C(=O)Raa、-C(=O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(=NRcc)Raa、-C(=NRcc)ORaa、-C(=NRcc)N(Rcc)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(=S)N(Rcc)2、-C(=O)SRcc、-C(=S)SRcc、C1-10烷基(例如,芳烷基、杂芳烷基)、C2-10烯基、C2-10炔基、杂C1-10烷基、杂C2-10烯基、杂C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基,其中各烷基、烯基、炔基、杂烷基、杂烯基、杂炔基、碳环基、杂环基、芳烷基、芳基和杂芳基独立地被0、1、2、3、4或5个Rdd基团取代,且其中Raa、Rbb、Rcc和Rdd如本文定义。氮保护基是本领域中公知的并包括Protecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene和P.G.M.Wuts,3rd edition,John Wiley&Sons,1999中详细描述的那些,其通过引用并入本文。
例如,氮保护基如酰胺基(例如,-C(=O)Raa)包括,但不限于甲酰胺、乙酰胺、氯乙酰胺、三氯乙酰胺、三氟乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、N-苯甲酰基苯丙氨酰基衍生物、苯甲酰胺、p-苯基苯甲酰胺、o-硝基苯基乙酰胺、o-硝基苯氧基乙酰胺、乙酰乙酰胺、(N’-二硫代苯甲酰氧基酰氨基)乙酰胺、3-(p-羟基苯基)丙酰胺、3-(o-硝基苯基)丙酰胺、2-甲基-2-(o-硝基苯氧基)丙酰胺、2-甲基-2-(o-苯基偶氮苯氧基)丙酰胺、4-氯代丁酰胺、3-甲基-3-硝基丁酰胺、o-硝基肉桂酰胺、N-乙酰甲硫氨酸衍生物、o-硝基苯甲酰胺和o-(苯甲酰氧基甲基)苯甲酰胺。
氮保护基如氨基甲酸酯基团(例如,-C(=O)ORaa)包括,但不限于氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、9-芴甲基氨基甲酸酯(Fmoc)、9-(2-磺基)芴甲基氨基甲酸酯、9-(2,7-二溴)芴甲基氨基甲酸酯、2,7-二叔丁基-[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲基氨基甲酸酯(DBD-Tmoc)、4-甲氧基苯甲酰甲基氨基甲酸酯(Phenoc)、2,2,2-三氯乙基氨基甲酸酯(Troc)、2-三甲基甲硅烷基乙基氨基甲酸酯(Teoc)、2-苯基乙基氨基甲酸酯(hZ)、1-(1-金刚烷基)-1-甲基乙基氨基甲酸酯(Adpoc)、1,1-二甲基-2-卤代乙基氨基甲酸酯、1,1-二甲基-2,2-二溴乙基氨基甲酸酯(DB-t-BOC)、1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙基氨基甲酸酯(TCBOC)、1-甲基-1-(4-联苯基)乙基氨基甲酸酯(Bpoc)、1-(3,5-二叔丁基苯基)-1-甲基乙基氨基甲酸酯(t-Bumeoc)、2-(2’-和4’-吡啶基)乙基氨基甲酸酯(Pyoc)、2-(N,N-二环己基甲酰胺基)乙基氨基甲酸酯、叔丁基氨基甲酸酯(BOC)、1-金刚烷基氨基甲酸酯(Adoc)、乙烯基氨基甲酸酯(Voc)、烯丙基氨基甲酸酯(Alloc)、1-异丙基烯丙基氨基甲酸酯(Ipaoc)、肉桂基氨基甲酸酯(Coc)、4-硝基肉桂基氨基甲酸酯(Noc)、8-喹啉基氨基甲酸酯、N-羟基哌啶基氨基甲酸酯、烷基二硫代氨基甲酸酯、苯甲基氨基甲酸酯(Cbz)、p-甲氧基苯甲基氨基甲酸酯(Moz)、p-硝基苯甲基氨基甲酸酯、p-溴苯甲基氨基甲酸酯、p-氯代苯甲基氨基甲酸酯、2,4-二氯代苯甲基氨基甲酸酯、4-甲基亚硫酰基苯甲基氨基甲酸酯(Msz)、9-蒽基甲基氨基甲酸酯、二苯基甲基氨基甲酸酯、2-甲基硫代乙基氨基甲酸酯、2-甲基磺酰基乙基氨基甲酸酯、2-(p-甲苯磺酰基)乙基氨基甲酸酯、[2-(1,3-二噻烷基)]甲基氨基甲酸酯(Dmoc)、4-甲基噻吩基氨基甲酸酯(Mtpc)、2,4-二甲基噻吩基氨基甲酸酯(Bmpc)、2-磷鎓基乙基氨基甲酸酯(Peoc)、2-三苯基磷鎓基异丙基氨基甲酸酯(Ppoc)、1,1-二甲基-2-氰基乙基氨基甲酸酯、m-氯-p-酰氧基苯甲基氨基甲酸酯、p-(二羟基硼基)苯甲基氨基甲酸酯、5-苯并异噁唑基甲基氨基甲酸酯、2-(三氟甲基)-6-色酮基甲基氨基甲酸酯(Tcroc)、m-硝基苯基氨基甲酸酯、3,5-二甲氧基苯甲基氨基甲酸酯、o-硝基苯甲基氨基甲酸酯、3,4-二甲氧基-6-硝基苯甲基氨基甲酸酯、苯基(o-硝基苯基)甲基氨基甲酸酯、叔戊基氨基甲酸酯、S-苯甲基硫代氨基甲酸酯、p-氰基苯甲基氨基甲酸酯、环丁基氨基甲酸酯、环己基氨基甲酸酯、环戊基氨基甲酸酯、环丙基甲基氨基甲酸酯、p-癸氧基苯甲基氨基甲酸酯、2,2-二甲氧基酰基乙烯基氨基甲酸酯、o-(N,N-二甲基甲酰胺基)苯甲基氨基甲酸酯、1,1-二甲基-3-(N,N-二甲基甲酰胺基)丙基氨基甲酸酯、1,1-二甲基丙炔基氨基甲酸酯、二(2-吡啶基)甲基氨基甲酸酯、2-呋喃基甲基氨基甲酸酯、2-碘代乙基氨基甲酸酯、异冰片基氨基甲酸酯、异丁基氨基甲酸酯、异烟腙基(isonicotinyl)氨基甲酸酯、p-(p’-甲氧基苯基偶氮基)苯甲基氨基甲酸酯、1-甲基环丁基氨基甲酸酯、1-甲基环己基氨基甲酸酯、1-甲基-1-环丙基甲基氨基甲酸酯、1-甲基-1-(3,5-二甲氧基苯基)乙基氨基甲酸酯、1-甲基-1-(p-苯偶氮基苯基)乙基氨基甲酸酯、1-甲基-1-苯基乙基氨基甲酸酯、1-甲基-1-(4-吡啶基)乙基氨基甲酸酯、苯基氨基甲酸酯、p-(苯偶氮基)苯甲基氨基甲酸酯、2,4,6-三叔丁基苯基氨基甲酸酯、4-(三甲基铵)苯甲基氨基甲酸酯和2,4,6-三甲基苄基氨基甲酸酯。
氮保护基如磺酰胺基(例如,-S(=O)2Raa)包括,但不限于p-甲苯磺酰胺(Ts)、苯磺酰胺、2,3,6,-三甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Mtr)、2,4,6-三甲氧基苯磺酰胺(Mtb)、2,6-二甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Pme)、2,3,5,6-四甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Mte)、4-甲氧基苯磺酰胺(Mbs)、2,4,6-三甲基苯磺酰胺(Mts)、2,6-二甲氧基-4-甲基苯磺酰胺(iMds)、2,2,5,7,8-五甲基色满-6-磺酰胺(Pmc)、甲磺酰胺(Ms)、β-三甲基甲硅烷基乙磺酰胺(SES)、9-蒽磺酰胺、4-(4’,8’-二甲氧基萘基甲基)苯磺酰胺(DNMBS)、苯甲基磺酰胺、三氟甲基磺酰胺和苯甲酰甲基磺酰胺。
其它氮保护基包括,但不限于吩噻嗪基-(10)-酰基衍生物、N’-p-甲苯磺酰基氨基酰基衍生物、N’-苯基氨基硫代酰基衍生物、N-苯甲酰基苯丙氨酰基衍生物、N-乙酰甲硫氨酸衍生物、4,5-二苯基-3-噁唑啉-2-酮、N-酞亚胺、N-二硫杂琥珀酰亚胺(Dts)、N-2,3-二苯基马来酰亚胺、N-2,5-二甲基吡咯、N-1,1,4,4-四甲基二甲硅烷基氮杂环戊烷加合物(STABASE)、5-取代的1,3-二甲基-1,3,5-三氮杂环己烷-2-酮、5-取代的1,3-二苯甲基-1,3,5-三氮杂环己烷-2-酮、1-取代的3,5-二硝基-4-吡啶酮、N-甲胺、N-烯丙基胺、N-[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲胺(SEM)、N-3-乙酰氧基丙胺、N-(1-异丙基-4-硝基-2-氧代-3-吡咯啉(pyroolin)-3-基)胺、季铵盐、N-苄基胺、N-二(4-甲氧基苯基)甲胺、N-5-二苯并环庚基胺、N-三苯基甲胺(Tr)、N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺(MMTr)、N-9-苯基芴基胺(PhF)、N-2,7-二氯-9-芴基亚甲胺、N-二茂铁基甲氨基(Fcm)、N-2-皮考基氨基N’-氧化物、N-1,1-二甲基硫代亚甲胺、N-苯亚甲基胺、N-p-甲氧基苯亚甲基胺、N-二苯基亚甲胺、N-[(2-吡啶基)均三甲苯基]亚甲胺、N-(N’,N’-二甲基氨基亚甲基)胺、N,N’-异亚丙基二胺、N-p-硝基苯亚甲基胺、N-亚水杨基胺、N-5-氯亚水杨基胺、N-(5-氯-2-羟基苯基)苯基亚甲胺、N-亚环己基胺(cyclohexylideneamine)、N-(5,5-二甲基-3-氧代-1-环己烯基)胺、N-硼烷衍生物、N-二苯基硼酸衍生物、N-[苯基(五酰基铬-或钨)酰基]胺、N-铜螯合物、N-锌螯合物、N-硝基胺、N-亚硝基胺、胺N-氧化物、二苯基膦酰胺(Dpp)、二甲基硫代膦酰胺(Mpt)、二苯基硫代膦酰胺(Ppt)、二烷基氨基磷酸酯、二苄基氨基磷酸酯、二苯基氨基磷酸酯、苯亚磺酰胺、o-硝基苯亚磺酰胺(Nps)、2,4-二硝基苯亚磺酰胺、五氯苯亚磺酰胺、2-硝基-4-甲氧基苯亚磺酰胺、三苯基甲基亚磺酰胺和3-硝基吡啶亚磺酰胺(Npys)。
在某些实施方式中,氧原子上存在的取代基是氧保护基团(本文中也称为“羟基保护基”)。氧保护基团包括,但不限于-Raa、-N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=O)Raa、-CO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-S(=O)Raa、-SO2Raa、-Si(Raa)3、-P(Rcc)2、-P(Rcc)3、-P(=O)2Raa、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2、-P(=O)2N(Rbb)2和-P(=O)(NRbb)2,其中Raa、Rbb和Rcc如本文定义。氧保护基团是本领域中公知的并包括Protecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene和P.G.M.Wuts,3rd edition,JohnWiley&Sons,1999中详细描述的那些,其通过引用并入本文。
示例性的氧保护基团包括,但不限于甲基、甲氧基甲基(MOM)、甲硫基甲基(MTM)、叔丁基硫代甲基、(苯基二甲基甲硅烷基)甲氧基甲基(SMOM)、苄氧基甲基(BOM)、p-甲氧基苄氧基甲基(PMBM)、(4-甲氧基苯氧基)甲基(p-AOM)、愈疮木酚甲基(GUM)、叔丁氧基甲基、4-戊烯基氧基甲基(POM)、甲硅烷氧基甲基、2-甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2,2,2-三氯乙氧基甲基、双(2-氯乙氧基)甲基、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEMOR)、四氢吡喃基(THP)、3-溴四氢吡喃基、四氢噻喃基、1-甲氧基环己基、4-甲氧基四氢吡喃基(MTHP)、4-甲氧基四氢噻喃基、4-甲氧基四氢噻喃基S,S-二氧化物、1-[(2-氯-4-甲基)苯基]-4-甲氧基哌啶-4-基(CTMP)、1,4-二氧杂环己烷-2-基、四氢呋喃基、四氢硫代呋喃基、2,3,3a,4,5,6,7,7a-八氢-7,8,8-三甲基-4,7-甲撑苯并呋喃-2-基、1-乙氧基乙基、1-(2-氯乙氧基)乙基、1-甲基-1-甲氧基乙基、1-甲基-1-苄氧基乙基、1-甲基-1-苄氧基-2-氟乙基、2,2,2-三氯乙基、2-三甲基甲硅烷基乙基、2-(苯硒基)乙基、叔丁基、烯丙基、p-氯苯基、p-甲氧基苯基、2,4-二硝基苯基、苯甲基(Bn)、p-甲氧基苯甲基、3,4-二甲氧基苯甲基、o-硝基苯甲基、p-硝基苯甲基、p-卤代苯甲基、2,6-二氯苯甲基、p-氰基苯甲基、p-苯基苯甲基、2-皮考基、4-皮考基、3-甲基-2-皮考基N-氧化物、二苯基甲基、p,p’-二硝基二苯甲基、5-二苯并环庚基、三苯基甲基、α-萘基二苯基甲基、p-甲氧基苯基二苯基甲基、二(p-甲氧基苯基)苯基甲基、三(p-甲氧基苯基)甲基、4-(4’-溴苯甲酰甲氧基苯基)二苯基甲基、4,4′,4″-三(4,5-二氯邻苯二甲酰亚胺苯基)甲基、4,4′,4″-三(乙酰丙酰氧基苯基)甲基、4,4′,4″-三(苯甲酰氧基苯基)甲基、3-(咪唑-1-基)双(4′,4″-二甲氧基苯基)甲基、1,1-双(4-甲氧基苯基)-1′-芘基甲基、9-蒽基、9-(9-苯基)呫吨基、9-(9-苯基-10-氧代)蒽基、1,3-苯并二硫戊环-2-基、苯并异噻唑基S,S-二氧化、三甲基甲硅烷基(TMS)、三乙基甲硅烷基(TES)、三异丙基甲硅烷基(TIPS)、二甲基异丙基甲硅烷基(IPDMS)、二乙基异丙基甲硅烷基(DEIPS)、二甲基乙基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)、三苯甲基甲硅烷基、三-p-二甲苯基甲硅烷基、三苯基甲硅烷基、二苯基甲基甲硅烷基(DPMS)、叔丁基甲氧基苯基甲硅烷基(TBMPS)、甲酸酯、苯甲酰基甲酸酯、乙酸酯、氯代乙酸酯、二氯代乙酸酯、三氯代乙酸酯、三氟乙酸酯、甲氧基乙酸酯、三苯基甲氧基乙酸酯、苯氧基乙酸酯、p–氯代苯氧基乙酸酯、3-苯基丙酸酯、4-氧代戊酸酯(乙酰丙酸酯)、4,4-(乙烯二硫代)戊酸酯(乙酰丙酰二硫缩醛)、pivaloate、金刚酸酯、巴豆酸酯、4-甲氧基巴豆酸酯、苯甲酸酯、p-苯基苯甲酸酯、2,4,6-三甲基苯甲酸酯(mesitoate)、碳酸甲酯、9-芴基甲基碳酸酯(Fmoc)、乙基碳酸酯、2,2,2-三氯乙基碳酸酯(Troc)、2-(三甲基甲硅烷基)乙基碳酸酯(TMSEC)、2-(苯基磺酰基)乙基碳酸酯(Psec)、2-(三苯基磷鎓基)乙基碳酸酯(Peoc)、异丁基碳酸酯、乙烯基碳酸酯、烯丙基碳酸酯、叔丁基碳酸酯(BOC)、p-硝基苯基碳酸酯、苯甲基碳酸酯、p-甲氧基苯甲基碳酸酯、3,4-二甲氧基苯甲基碳酸酯、o-硝基苯甲基碳酸酯、p-硝基苯甲基碳酸酯、S-苯甲基硫代碳酸酯、4-乙氧基-1-萘基(napththyl)碳酸酯、甲基二硫代碳酸酯、2-碘代苯甲酸酯、4-叠氮基丁酸酯、4-硝基-4-甲基戊酸酯、o-(二溴甲基)苯甲酸酯、2-甲酰基苯磺酸酯、2-(甲基硫代甲氧基)乙基、4-(甲基硫代甲氧基)丁酸基、2-(甲基硫代甲氧基甲基)苯甲酸酯、2,6-二氯-4-甲基苯氧基乙酸酯、2,6-二氯-4-(1,1,3,3-四甲基丁基)苯氧基乙酸酯、2,4-双(1,1-二甲基丙基)苯氧基乙酸酯、氯二苯基乙酸酯、异丁酸基、单琥珀酸酯(monosuccinoate)、(E)-2-甲基-2-丁烯酸酯、o-(甲氧基酰基)苯甲酸酯、α-萘甲酸酯、硝酸酯、烷基N,N,N’,N’-四甲基氨基磷酸酯(phosphorodiamidate)、烷基N-苯基氨基甲酸酯、硼酸酯、二甲基硫膦基、烷基2,4-二硝基苯基次磺酸酯、硫酸酯、甲烷磺酸酯(甲磺酸酯)、甲苯基磺酸酯和甲苯磺酸酯(Ts)。
在某些实施方式中,硫原子上存在的取代基是硫保护基(也称为“巯基保护基”)。硫保护基包括,但不限于-Raa、-N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=O)Raa、-CO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-S(=O)Raa、-SO2Raa、-Si(Raa)3、-P(Rcc)2、-P(Rcc)3、-P(=O)2Raa、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2、-P(=O)2N(Rbb)2和-P(=O)(NRbb)2,其中Raa、Rbb和Rcc如本文定义。硫保护基是本领域中公知的并包括Protecting Groups inOrganic Synthesis,T.W.Greene和P.G.M.Wuts,3rd edition,John Wiley&Sons,1999中详细描述的那些,其通过引用并入本文。
这些和其它示例性的取代基更详细地描述于详细说明、实施例和权利要求中。本发明不旨在以任何方式受取代基的上述示例性的列举限制。
其它定义
术语“药学上可接受的盐”是指在合理的医学判断范围内适合用于与人和低等动物的组织接触而无过度的毒性、刺激、变态反应等等,且与合理的利益/风险比相称的那些盐。药学上可接受的盐是本领域中公知的。例如,Berge等在J.Pharmaceutical Sciences(1977)66:1-19中详细描述了药学上可接受的盐。本发明化合物的药学上可接受的盐包括源自合适的无机和有机酸和碱的那些。药学上可接受的非毒性酸加成盐的实例是与无机酸如盐酸、氢溴酸、磷酸、硫酸和高氯酸或与有机酸如乙酸、草酸、马来酸、酒石酸、柠檬酸、琥珀酸或丙二酸形成的或者通过使用本领域中采用的其它方法如离子交换形成的氨基的盐。其它药学上可接受的盐包括己二酸盐、藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡萄糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙磺酸盐、甲酸盐、富马酸盐、葡庚酸盐、甘油磷酸盐、葡萄糖酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢碘酸盐、2-羟基-乙磺酸盐、乳糖醛酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、甲磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、扑酸盐、果胶酸盐(pectinate)、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、p-甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等等。源自合适的碱的药学上可接受的盐包括碱金属盐、碱土金属盐、铵盐和N+(C1-4烷基)4盐。代表性的碱金属或碱土金属盐包括钠、锂、钾、钙、镁等等。进一步的药学上可接受的盐适宜地包括与反离子如卤素、氢氧根、羧酸根、硫酸根、磷酸根、硝酸根、低级烷基磺酸根和芳基磺酸根形成的非毒性铵、季铵和胺阳离子。
预想对其施用的“受试者”包括,但不限于人(即,各种年龄组的男性或女性,例如,儿科受试者(例如,婴儿、儿童、少年)或成人受试者(例如,年轻成人、中年成人或老年成人))和/或其它非人动物,例如,哺乳动物[例如,灵长类动物(例如,食蟹猴、恒河猴);商业相关的哺乳动物如牛、猪、马、绵羊、山羊、猫和/或狗]、鸟(例如,商业相关的鸟类如鸡、鸭、鹅和/或火鸡)、爬行动物、两栖动物和鱼类。在某些实施方式中,非人动物是哺乳动物。非人动物可以是雄性或雌性且可以是任何发育阶段。非人动物可以是转基因动物。
如本文中使用的且除非另外特别指明的,术语“治疗”、“处理”和“疗法”包括在受试者患特定疾病、障碍或病症时发生的行为,其减轻疾病、障碍或病症的严重程度或者延迟或减缓疾病、障碍或病症的进展(“治疗性处理”),且也包括在受试者开始患特定疾病、障碍或病症之前发生的行为(“预防性处理”)。
一般地,化合物的“有效量”是指足以引起所需的生物反应的量。如本领域技术人员理解的。本发明化合物的有效量可根据如希望的生物学终点、化合物的药代动力学、所治疗的疾病、施用方式及受试者的年龄、健康和状况而变化。有效量包括治疗性和预防性处理。
如本文中使用的且除非另外特别指明的,化合物的“治疗有效量”是足以在疾病、障碍或病症的治疗中提供治疗益处或者延迟或最小化与疾病、障碍或病症相关的一种或多种症状的量。化合物的治疗有效量意思是在疾病、障碍或病症的治疗中提供治疗益处的治疗剂(单独或与其它疗法结合)的量。术语“治疗有效量”可以包括改善总体治疗、减轻或避免疾病或病症的症状或原因或者增强另一治疗剂的疗效的量。
如本文中使用的且除非另外特别指明的,化合物的“预防有效量”是足以预防疾病、障碍或病症或者与疾病、障碍或病症相关的一种或多种症状的量,或者预防其复发的量。化合物的预防有效量意思是在疾病、障碍或病症的预防中提供预防益处的治疗剂(单独或与其它疗法结合)的量。术语“预防有效量”可以包括改善总体预防或增强另一预防剂的预防效果的量。
如本文中使用的,“调节”例如是指化合物在例如细胞中(例如,在体外如细胞培养物的细胞,或者在体内如受试者的细胞中)相对于媒介提高或抑制特定生物学过程(例如,激酶活性、过表达)的能力。
如本文中使用的,“抑制”、“阻止”、“阻碍”和“抑制剂”等等例如是指化合物在例如细胞中(例如,在体外如细胞培养物的细胞,或者在体内如受试者的细胞中)相对于媒介降低、减缓、中止或阻止特定生物学过程(例如,激酶活性、过表达)的活性的能力。
如本文中使用的,“提高”或“增加”等等例如是指化合物在例如细胞中(例如,在体外如细胞培养物的细胞,或者在体内如受试者的细胞中)相对于媒介刺激特定生物学过程(例如,激酶活性)的活性的能力。
本发明特定实施方式的详细说明
如本文中一般地描述的,提供了新的皮质抑素类似物,其可以任选地经由式(C)的亚胺中间体而部分地通过式(B)的酮的还原胺化以提供式(A)的胺化产物来合成。进一步提供了式(D)和(E)的新的皮质抑素类似物。参见,例如,方案1,如上。
及其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物,
其中:
R1是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-ORA、-SRA、-N(RA)2、-C(=O)RA、-C(=O)ORA、-C(=O)N(RA)2、-S(=O)2RA或氮保护基团;
R2是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-C(=O)RA、-C(=O)ORA、-C(=O)N(RA)2、-S(=O)2RA或氮保护基团;
或者R1和R2连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基;
R3是氢或任选取代的烷基;
R4是氢、卤素、任选取代的烷基或-Si(RA)3;
R5是氢、卤素或任选取代的烷基;
命名为(a)、(b)和(c)的的各种情况代表单键或双键,条件是当命名为(c)的代表双键时,RB1和RB2之一不存在,和条件是当命名为(c)的代表单键时,RB1和RB2两者存在;
RB1和RB2的各种情况独立地是氢、-L1-RB3或-XARA,其中XA是-O-、-S-或-N(RA)-;或RB1和RB2连接以形成氧代基团,条件是RB1和RB2中至少一个不是氢;
L1是键、-C(=O)-、-C(=O)O-、-C(=O)S-、-C(=O)N(RL)-或-N(RL)-(C(RLL)2)p-,其中RL是氢、任选取代的烷基或氮保护基,RLL的各种情况独立地是氢、卤素或任选取代的烷基,和p是0、1或2;
RB3是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基,条件是当L1是键时,RB3不是氢;
RA的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、羰基、甲硅烷基、在连接于氧时的氧保护基团、在连接于硫时的硫保护基团或在连接于氮时的氮保护基团,任选地当连接于N时,两个RA基团可以连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基环,和任选地当RB1和RB2各自为-XARA时,两个RA基团可以连接以形成任选取代的杂环基环;和
RO是任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-C(=O)RA、-C(=O)ORA、-C(=O)N(RA)2或氧保护基团。
一般理解,例如,本文描述的任何式包括的任何原子可以被该原子的同位素替代,例如,氢原子(1H)可以被氘(2H,D)或氚(3H,T)原子替代,碳原子(12C)可以被其14C同位素替代,且氟原子(18F)可以被其19F同位素替代。
一般地,式(B)的还原胺化一般提供式(A)包括的α和β胺化异构体两者,本文中称为式(A-1)的β异构体和称为式(A-2)的α异构体,且β异构体通常是反应的主要产物。α异构体与其它皮质抑素天然产物共有C3立体化学结构。参见,例如,图1。此外,酮的还原一般提供式(D)涵盖的α和β还原异构体两者,本文中称为式(D-1)的β异构体和本文中称为式(D-2)的α异构体。式(D)的这些异构体的后续保护分别提供式(E-1),β异构体和式(E-2),α异构体。
皮质抑素A/CDK8/细胞周期蛋白C三元复合物的晶体结构(参见,例如,图16)揭示,皮质抑素A表现出与CDK8的ATP-结合袋的明显形状互补性且在皮质抑素A的带电N,N-二甲基铵离子和CDK8的Trp105之间存在明显的阳离子-π相互作用,其在密切接触内。CDK8和CDK19是在氨基酸105处具有Trp的仅有CDK,表明阳离子-π相互作用以及皮质抑素A和Trp105之间的疏水性接触对于皮质抑素A与CDK8的高亲和性和选择性可能是重要的。基于这一晶体结构,β异构体预期与Trp105空间冲突。
晶体结构也揭示,皮质抑素A上的A环羟基可能是对于结合必不可少的,因为它们不与CDK8形成氢键并且在皮质抑素A结合袋外远离CDK8定向。另外,皮质抑素J(其缺乏皮质抑素A上存在的羟基)在抑制HUVEC增殖方面效能仅低8倍(参见,例如,Aoki等,Bioorg.Med.Chem.(2007)15:6758-6762)且具有胺和羟基取代基两者的替代的某些合成的皮质抑素A类似物保留强效的HUVEC抗增殖活性(参见,例如,Nicolaou等,J.Am.Chem.Soc.(2009)131:10587-10597)。
但是且最令人惊异的,式(A)的β异构体(其不包含A环上的任何羟基)已发现在抑制CDK8激酶活性和AML细胞的增殖方面与皮质抑素A是等效的或更高效,且还发现对应的α异构体(其也不包含A环上的任何羟基)也是非常高效的。
还发现,式(B)的化合物对于培养中的AML细胞系的生长和细胞中的CDK8激酶活性是具有活性的。设想式(C)的亚胺(如肟,其中R1是-ORA)也是活性的。
此外,尽管缺乏带电N,N-二甲基铵离子阳离子-π相互作用,式(D)和(E)的化合物也是令人惊异地高活性的。
季胺盐和N-氧化物
在某些实施方式中,如本文中提供的,式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物可以包含季胺盐和/或N-氧化物。
如本文使用的“季胺盐”是指其中氮原子包含四个价键(例如,被可以是氢和/或非氢基团的四个基团取代)以使得氮原子是带正电的且电荷用平衡阴离子(例如,如本文定义的XC)平衡(中和)的氨基。
如本文使用的“N-氧化物”是指其中氮原子包含四个价键(例如,被可以是氢和/或非氢基团的四个基团取代,其中直接连接于氮原子的一个基团是氧阴离子(oxidyl)基团)以使得氮原子是带正电的,且其中氧阴离子平衡(中和)氮原子的正电荷的氨基。
应理解,式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)任一个可以在氨基可以定位的任何位置处包含季胺盐和/或N-氧化物基团。
特别地,式(A)的化合物可以在C3位置处包含季胺盐或N-氧化物基团(也称为“季C3-胺盐”和“C3-N-氧化物”),其包含连接于环A的氨基-NR1R2。
在某些实施方式中,C3位置处的氨基可以是式的季胺盐,例如,以提供式(A-QA)的化合物:
其中R1、R2、R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义;且
其中:
Y是任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;和
XC是平衡阴离子。
季C3-胺盐可以通过游离C3-胺与基团Y-XC的反应形成,其中Y如上定义(例如,任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基或任选取代的杂环基),且XC是如本文定义的离去基团。由此产生的反离子XC可以通过离子交换方法与另一反离子XC交换,例如,离子交换色谱。示例性的XC反离子包括,但不限于卤素离子(例如,F-、Cl-、Br-、I-)、NO3 -、ClO4 -、OH-、H2PO4 -、HSO4 -、磺酸根离子(例如,甲磺酸根、三氟甲磺酸根、p-甲苯磺酸根、苯磺酸根、10-樟脑磺酸根、萘-2-磺酸根、萘-1-磺酸-5-磺酸根、乙烷-1-磺酸-2-磺酸根等等)和羧酸根离子(例如,乙酸根、醋酸根、丙酸根、苯甲酸根、甘油酸根、乳酸根、酒石酸根、乙醇酸根等等)。在某些实施方式中,Y是任选取代的烷基(例如,甲基)。在某些实施方式中,XC是卤素离子。
在某些实施方式中,式(A-QA)的季胺盐是下式的β(A-1-QA)或α(A-2-QA)异构体:
其中R1、R2、R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义。
可选地,在某些实施方式中,C3位置处的氨基可以是式的N-氧化物,例如,以提供式(A-NO)的化合物:
其中R1、R2、R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义。
在某些实施方式中,式(A-NO)的N-氧化物是下式的β(A-1-NO)或α(A-2-NO)异构体:
其中R1、R2、R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义。
已发现,皮质抑素A的C3N-氧化物在抑制HUVEC增殖方面与皮质抑素A等效。参见,例如,图17A和17B。
进一步发现,如本文所述的式(A-1-NO)的βN-氧化物与相应的式(A-1)的游离β氨基类似物相比提高了在肝微粒体中的稳定性。参见,例如,图19,其证明与化合物14B相比提高的14B-N-氧化物的稳定性。
基团R1和R2
如本文中一般定义的,在式(A)和(C)的某些实施方式中,R1是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-ORA、-SRA、-N(RA)2、-C(=O)RA、-C(=O)ORA、-C(=O)N(RA)2、-S(=O)2RA或氮保护基团。
此外,在式(A)的某些实施方式中,R2是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-C(=O)RA、-C(=O)ORA、-C(=O)N(RA)2、-S(=O)2RA或氮保护基团。
例如,在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是氢。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2两者是氢。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2之一是氢且另一是非氢基团,例如任选取代的烷基。在式(C)的某些实施方式中,R1是氢。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的烷基,例如,任选取代的C1-6烷基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2的各种情况独立地是任选取代的烷基。在式(C)的某些实施方式中,R1是任选取代的烷基,例如,任选取代的C1-6烷基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的C1烷基、任选取代的C2烷基、任选取代的C3烷基、任选取代的C4烷基、任选取代的C5烷基或任选取代的C6烷基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的甲基(C1)、任选取代的乙基(C2)、任选取代的正丙基(C3)、任选取代的异丙基(C3)、任选取代的正丁基(C4)或任选取代的叔丁基(C4)。在某些实施方式中,R1和/或R2是被一个或多个卤素取代基(例如,氟)取代的烷基。在某些实施方式中,R1和/或R2是-CH3或-CF3。在某些实施方式中,R1和R2的各种情况独立地是-CH3或-CF3。在某些实施方式中,R1和/或R2是被一个或多个卤素(例如,氟)、氨基(-NH2)、取代的氨基、羟基(-OH)、取代的羟基、巯基(-SH)、取代的巯基或磺酰基取代基取代的烷基。在某些实施方式中,R1和/或R2是被任选取代的碳环基(例如,环丙基)或任选取代的杂环基(例如,氧杂环丁基)环取代的烷基。
例如,在某些实施方式中,R1和R2中至少一个是例如,下式的基团:
以提供式(A-f)、(A-1-f)或(A-2-f)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物,
其中R1、R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义;且
其中:
p是1、2、3、4、5或6;和
Z是-CH2XZ、-CH(XZ)2、-C(XZ)3、-ORZ、-SRZ、-N(RZ)2、-S(O)2N(RZ)2、
其中RZ的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-C(=O)RZ、-C(=O)ORZ、-C(=O)N(RZ)2、在连接于氧时的氧保护基团、在连接于硫时的硫保护基团或在连接于氮时的氮保护基团,任选地当连接于N时,两个RZ基团可以连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基环;
XZ的各种情况独立地是氟、氯、溴或碘;和
w是1和10之间的整数,包括1和10。
在某些实施方式中,R1和R2的两种情况独立地为式的基团。
在某些实施方式中,p是1。在某些实施方式中,p是2。在某些实施方式中,p是3。在某些实施方式中,w是1、2、3或4。在某些实施方式中,RZ是氢或任选取代的烷基(例如,-CH3)。在某些实施方式中,Z是-ORZ,例如,-OH或-ORZ,其中RZ是非氢基团,例如,其中RZ是任选取代的烷基如-CH3。在某些实施方式中,Z是-N(RZ)2,例如,-NH2、-NHRZ或-N(RZ)2,其中RZ是非氢基团,例如,其中RZ是任选取代的烷基如-CH3。在某些实施方式中,Z是-CH2XZ、-CH(XZ)2、-C(XZ)3,例如,其中XZ是氟。在某些实施方式中,Z是-S(O)2N(RZ)2,例如,-S(O)2NH2或-S(O)2NHCH3。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的烯基,例如,任选取代的C2-6烯基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2两者是任选取代的烯基。在式(C)的某些实施方式中,R1是任选取代的烯基,例如,任选取代的C2-6烯基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的C2烯基、任选取代的C3烯基、任选取代的C4烯基、任选取代的C5烯基或任选取代的C6烯基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的乙烯基(C2)或任选取代的烯丙基(C3)。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的炔基,例如,任选取代的C2-6炔基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2两者是任选取代的炔基。在式(C)的某些实施方式中,R1是任选取代的炔基,例如,任选取代的C2-6炔基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的C2炔基、任选取代的C3炔基、任选取代的C4炔基、任选取代的C5炔基或任选取代的C6炔基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的乙炔基(C2)或任选取代的丙炔基(C3)。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的碳环基,例如,任选取代的C3-6碳环基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2两者是任选取代的碳环基。在式(C)的某些实施方式中,R1是任选取代的碳环基,例如,任选取代的C3-6碳环基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的C3碳环基、任选取代的C4碳环基、任选取代的C5碳环基或任选取代的C6碳环基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的环丙基(C3)、任选取代的环丁基(C4)、任选取代的环戊基(C5)或任选取代的环己基(C6)。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的杂环基,例如,任选取代的3-6元杂环基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2两者是任选取代的杂环基。在式(C)的某些实施方式中,R1是任选取代的杂环基,例如,任选取代的3-6元杂环基。在某些实施方式中,R1和/或R2是任选取代的3-元杂环基(例如,任选取代的氧杂环丁基)、任选取代的4-元杂环基、任选取代的5-元杂环基或任选取代的6-元杂环基,例如,包含选自氧、硫或氮的1或2个杂原子的任选取代的6-元杂环基。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的芳基,例如,任选取代的苯基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2两者是任选取代的苯基。在式(C)的某些实施方式中,R1是任选取代的芳基,例如,任选取代的苯基。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的杂芳基,例如,任选取代的5-6元杂芳基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2两者是任选取代的杂芳基。在式(C)的某些实施方式中,R1是任选取代的杂芳基,例如,任选取代的5-6元杂芳基。
在式(A)和(C)的某些实施方式中,R1是-ORA,例如,-OH或-OCH3。在式(A)和(C)的某些实施方式中,R1是-SRA。在式(A)和(C)的某些实施方式中,R1是-N(RA)2。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是-C(=O)RA、-C(=O)ORA或-C(=O)N(RA)2。在式(C)的某些实施方式中,R1是-C(=O)RA、-C(=O)ORA或-C(=O)N(RA)2。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是氮保护基。在式(C)的某些实施方式中,R1是氮保护基。
此外,如本文中一般定义的,在式(A)的某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是-S(O)2RA。在某些实施方式中,RA是任选取代的烷基(例如,-CH3)。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2之一是-S(O)2RA且另一是任选取代的烷基(例如,-CH3)。在式(C)的某些实施方式中,R1是-S(O)2RA。
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的杂环基,例如,任选取代的3-6元杂环基。在式(A)的某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的3-元杂环基、任选取代的4-元杂环基、任选取代的5-元杂环基或任选取代的6-元杂环基。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的3-元杂环基,即任选取代的氮杂环丙烷基。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的4-元杂环基,例如,任选取代的氧杂环丁烷基。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的5-元杂环基,例如,任选取代的吡咯烷基或任选取代的咪唑烷-2,4-二酮。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的6-元杂环基,例如,任选取代的哌啶基、任选取代的四氢吡喃基、任选取代的二氢吡啶基、任选取代的噻烷基(thianyl)、任选取代的哌嗪基、任选取代的吗啉基、任选取代的二噻烷基、任选取代的二氧杂环己烷基或任选取代的triazinanyl。
例如,在某些实施方式中,R1和R2连接以形成例如下式的基团:
以提供式(A-a)、(A-1-a)或(A-2-a)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物,其中R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义;且
其中:
G是-O-、-S-、-NH-、-NR7-、-CH2-、-CH(R7)-或-C(R7)2-;
R7的各种情况独立地是卤素、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、氨基、取代的氨基、羟基、取代的羟基、巯基、取代的巯基、羰基、磺酰基、亚硫酰基或在连接于氮原子时的氮保护基团;
任选地其中两个R7基团连接以形成任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基环或氧代(=O)基团;和
n是0、1、2、3或4。
在某些实施方式中,R1和R2连接以形成例如下式的基团:
以提供式(A-b)、(A-1-b)或(A-2-b)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物,其中R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义;且
其中:
G是-O-、-S-、-NH-、-NR7-、-CH2-、-CH(R7)-或-C(R7)2-;
R7的各种情况独立地是卤素、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、氨基、取代的氨基、羟基、取代的羟基、巯基、取代的巯基、羰基、磺酰基、亚硫酰基或在连接于氮原子时的氮保护基团;
任选地其中两个R7基团连接以形成任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基环或氧代(=O)基团;和
n是0、1、2、3或4。
在某些实施方式中,R1和R2连接以形成例如下式的基团:
以提供式(A-c)、(A-1-c)、(A-2-c)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物,其中R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义;且
其中:
G是-O-、-S-、-NH-、-NR7-、-CH2-、-CH(R7)-或-C(R7)2-;
R7的各种情况独立地是卤素、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、氨基、取代的氨基、羟基、取代的羟基、巯基、取代的巯基、羰基、磺酰基、亚硫酰基或在连接于氮原子时的氮保护基团;
任选地其中两个R7基团连接以形成任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基环或氧代(=O)基团;和
n是0、1、2、3或4。
在某些实施方式中,n是0,且通过R1和R2的接合形成的环系统未被如本文定义的R7基团取代。在某些实施方式中,n是1、2、3或4,且环系统被1、2、3或4个如本文定义的R7基团取代。在某些实施方式中,n是1。在某些实施方式中,n是2。在某些实施方式中,n是3。在某些实施方式中,n是4。
在某些实施方式中,其中n不是0(即,n是1、2、3或4)且至少一个R7连接于碳原子,R7是卤素(例如,氟)、羟基、取代的羟基或羰基(例如,-CO2H)。在某些实施方式中,其中n不是0(即,n是1、2、3或4)且两个R7基团连接于相同碳原子,两个R7基团各自是卤素,例如,氟。在某些实施方式中,其中n不是0(即,n是1、2、3或4)且两个R7基团连接于相同碳原子,两个R7基团连接以形成任选取代的碳环基环或任选取代的杂环基环(例如,任选取代的氧杂环丁基环)。在某些实施方式中,其中n不是0(即,n是1、2、3或4)且两个R7基团连接于不同碳原子,两个R7基团连接以形成任选取代的碳环基环或任选取代的杂环基环。
在某些实施方式中,G是-O-。在某些实施方式中,G是-NR7-,例如,其中R7是任选取代的烷基(例如,-CH3)。在某些实施方式中,G是-CH(R7)-或-C(R7)2-,其中至少一个R7是羟基、取代的羟基或羰基(例如,-CO2H)。
在某些实施方式中,基团是
在某些实施方式中,基团是
在某些实施方式中,基团是
在式(A)的某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的杂芳基,例如,任选取代的5-元杂芳基或任选取代的6-元杂芳基。
基团RO
如本文中一般定义的,对于式(E),RO是任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-C(=O)RA、-C(=O)ORA、-C(=O)N(RA)2或氧保护基团。
在式(E)的某些实施方式中,RO是任选取代的烷基,例如,任选取代的C1-6烷基,例如,任选取代的C1烷基、任选取代的C2烷基、任选取代的C3烷基、任选取代的C4烷基、任选取代的C5烷基或任选取代的C6烷基。在某些实施方式中,RO是任选取代的甲基(C1)、任选取代的乙基(C2)、任选取代的正丙基(C3)、任选取代的异丙基(C3)、任选取代的正丁基(C4)或任选取代的叔丁基(C4)。在某些实施方式中,RO是被一个或多个卤素取代基(例如,氟)取代的烷基。在某些实施方式中,RO是-CH3或-CF3。在某些实施方式中,RO是被一个或多个卤素(例如,氟)、氨基(-NH2)、取代的氨基、羟基(-OH)、取代的羟基、巯基(-SH)、取代的巯基或磺酰基取代基取代的烷基。在某些实施方式中,RO是被任选取代的碳环基(例如,环丙基)或任选取代的杂环基(例如,氧杂环丁基)环取代的烷基。
例如,在某些实施方式中,RO是例如下式的基团:
以提供式(E-f)、(E-1-f)或(E-2-f)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物,其中R3、R4、R5、RB1和RB2如本文定义;且
其中:
p是1、2、3、4、5或6;和
Z是-CH2XZ、-CH(XZ)2、-C(XZ)3、-ORZ、-SRZ、-N(RZ)2、-S(O)2N(RZ)2、
其中RZ的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、-C(=O)RZ、-C(=O)ORZ、-C(=O)N(RZ)2、在连接于氧时的氧保护基团、在连接于硫时的硫保护基团或在连接于氮时的氮保护基团,任选地当连接于N时,两个RZ基团可以连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基环;
XZ的各种情况独立地是氟、氯、溴或碘;和
w是1和10之间的整数,包括1和10。
在某些实施方式中,p是1。在某些实施方式中,p是2。在某些实施方式中,p是3。在某些实施方式中,w是1、2、3或4。在某些实施方式中,RZ是氢或任选取代的烷基(例如,-CH3)。在某些实施方式中,Z是-ORZ,例如,-OH或-ORZ,其中RZ是非氢基团,例如,其中RZ是任选取代的烷基如-CH3。在某些实施方式中,Z是-N(RZ)2,例如,-NH2、-NHRZ或-N(RZ)2,其中RZ是非氢基团,例如,其中RZ是任选取代的烷基如-CH3。在某些实施方式中,Z是-CH2XZ、-CH(XZ)2、-C(XZ)3,例如,其中XZ是氟。在某些实施方式中,Z是-S(O)2N(RZ)2,例如,-S(O)2NH2或-S(O)2NHCH3。
在式(E)的某些实施方式中,RO是任选取代的烯基,例如,任选取代的C3-6烯基,例如,任选取代的C3烯基、任选取代的C4烯基、任选取代的C5烯基或任选取代的C6烯基。
在式(E)的某些实施方式中,RO是任选取代的炔基,例如,任选取代的C3-6炔基,例如,任选取代的C3炔基、任选取代的C4炔基、任选取代的C5炔基或任选取代的C6炔基。
在式(E)的某些实施方式中,RO是任选取代的碳环基,例如,任选取代的C3-6碳环基,例如,任选取代的C3碳环基、任选取代的C4碳环基、任选取代的C5碳环基或任选取代的C6碳环基。在某些实施方式中,RO是任选取代的环丙基(C3)、任选取代的环丁基(C4)、任选取代的环戊基(C5)或任选取代的环己基(C6)。
在式(E)的某些实施方式中,RO是任选取代的杂环基,例如,任选取代的3-6元杂环基,例如,任选取代的3-元杂环基(例如,任选取代的氧杂环丁基)、任选取代的4-元杂环基、任选取代的5-元杂环基或任选取代的6-元杂环基,例如,包含选自氧、硫或氮的1或2个杂原子的任选取代的6-元杂环基。
在式(E)的某些实施方式中,R1和R2中至少一个是任选取代的芳基,例如,任选取代的苯基。
在式(A)的某些实施方式中,RO是任选取代的杂芳基,例如,任选取代的5-6元杂芳基。
在式(E)的某些实施方式中,RO是-C(=O)RA、-C(=O)ORA或-C(=O)N(RA)2。在某些实施方式中,RA是氢或任选取代的烷基(例如,-CH3)。例如,在某些实施方式中,RO是-C(=O)CH3、-C(=O)OCH3、-C(=O)N(CH3)2或-C(=O)NHCH3。
在式(E)的某些实施方式中,RO是氧保护基团。
基团R3、R4、R5及式的键(a)、(b)和(c)
如本文中一般定义的,对于式(A)、(B)、(C)、(D)和(E),R3是氢或任选取代的烷基。
在某些实施方式中,R3是氢。这样的化合物使用如18-去甲雌酮(18-nor estrone)的原料是可能的。
在某些实施方式中,R3是任选取代的烷基,例如,甲基(-CH3)。这样的化合物通过使用如对于甲基的雌酮和四氢萘酮的原料是可能的。
如本文中一般定义的,对于式(A)、(B)、(C)、(D)和(E),R4是氢、卤素、任选取代的烷基或-Si(RA)3。
例如,在某些实施方式中,R4是氢。在某些实施方式中,R4是任选取代的烷基,例如,甲基。在某些实施方式中,R4是-Si(RA)3,例如,其中RA的各种情况独立地是任选取代的烷基或任选取代的苯基。
如本文中一般定义的,R5是氢、卤素或任选取代的烷基。在某些实施方式中,R5是氢。在某些实施方式中,R5是卤素(例如,溴、碘、氯)。在某些实施方式中,R5是任选取代的烷基,例如,甲基。
如本文中一般定义的,命名为(a)、(b)和(c)的的各种情况代表单键或双键,条件是当命名为(c)的代表双键时,RB1和RB2之一不存在,和条件是当命名为(c)的代表单键时,RB1和RB2两者存在。
在某些实施方式中,命名为(a)的键是单键。在某些实施方式中,命名为(a)的键是双键。
在某些实施方式中,命名为(b)的键是单键。在某些实施方式中,命名为(b)的键是双键。
在某些实施方式中,命名为(c)的键是单键。在某些实施方式中,命名为(c)的键是双键,且RB2不存在。
在某些实施方式中,命名为(a)的键是双键,且命名为(b)的键是双键。在这种情况中,在某些实施方式中,命名为(c)的键是双键,且RB2不存在。但是,在这种情况中,在其它实施方式中,命名为(c)的键是单键。
例如,在式(A)、(B)、(C)、(D)和(E)的某些实施方式中,其中R3是甲基,R4是氢,R5是氢,和命名为(c)的键是单键,提供了式(A-d)、(A-1-d)、(A-2-d)、(B-d)、(C-d)、(D-d)、(D-1-d)、(D-2-d)、(E-d)、(E-1-d)和(E-2-d)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、RO、RB1和RB2如本文定义。
在式(A)、(B)、(C)、(D)和(E)的其它实施方式中,其中R3是甲基,R4是氢,命名为(c)的键是双键,且RB2不存在,提供了式(A-e)、(A-1-e)、(A-2-e)、(B-e)、(C-e)、(D-e)、(D-1-e)、(D-2-e)、(E-e)、(E-1-e)、(E-2-e)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、RO、R5和RB1如本文定义。
基团RB1和RB2
如本文中一般定义的,RB1和RB2的各种情况独立地是氢、-L1-RB3或-XARA,其中XA是-O-、-S-或-N(RA)-,条件是RB1和RB2中至少一个不是氢;或RB1和RB2连接以形成氧代基团;
L1是键、-C(=O)-、-C(=O)O-、-C(=O)S-、-C(=O)N(RL)-或-N(RL)-(C(RLL)2)p-,其中RL是氢、任选取代的烷基或氮保护基,RLL的各种情况独立地是氢、卤素或任选取代的烷基,和p是0、1或2;
RB3是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基,条件是当L1是键时,RB3不是氢;
RA的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、羰基、甲硅烷基、在连接于氧时的氧保护基团、在连接于硫时的硫保护基团或在连接于氮时的氮保护基团;任选地当连接于N时,两个RA基团可以连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基环;和任选地当RB1和RB2各自是-XARA时,两个RA基团可以连接以形成任选取代的杂环基环。
在某些实施方式中,RB1和RB2的至少一种情况是-L1-RB3。在这种情况中,在某些实施方式中,RB1和RB2中另一个是氢或-XARA(例如,-ORA)。例如,在某些实施方式中,当命名为(c)的代表单键时,RB1是-L1-RB3和RB2是氢或-XARA(例如,-ORA)。在其它实施方式中,当命名为(c)的代表单键时,RB2是-L1-RB3和RB1是氢或-XARA(例如,-ORA)。可选地,在某些实施方式中,当命名为(c)的代表双键时,RB1是-L1-RB3和RB2不存在。
例如,在式(A)、(B)、(C)、(D)和(E)的某些实施方式中,其中RB1是-L1-RB3,提供了式(A-g)、(A-1-g)、(A-2-g)、(B-g)、(C-g)、(D-g)、(D-1-g)、(D-2-g)、(E-g)、(E-1-g)、(E-2-g)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、RO、R3、R4、R5、RB2、L1和RB3如本文定义。
在某些实施方式中,L1是键,和RB3是任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基。
在某些实施方式中,L1是-C(=O)-、-C(=O)O-、-C(=O)S-、-C(=O)N(RL)-或-N(RL)-(C(RLL)2)p-,其中RL是氢、任选取代的烷基或氮保护基,RLL的各种情况独立地是氢、卤素或任选取代的烷基,和RB3是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基。在某些实施方式中,L1是-C(=O)-。在某些实施方式中,L1是-C(=O)O-。在某些实施方式中,L1是-C(=O)S-。在某些实施方式中,L1是-C(=O)N(RL)-。在某些实施方式中,L1是-N(RL)-C(RLL)2-。在某些实施方式中,RL是氢或任选取代的烷基,例如,甲基。在某些实施方式中,RLL的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基(例如,甲基)或氟。在某些实施方式中,p是0。在某些实施方式中,p是1。在某些实施方式中,p是2。
在某些实施方式中,当L1是-C(=O)-、-C(=O)O-、-C(=O)S-、-C(=O)N(RL)-或-N(RL)-(C(RLL)2)p-,且RB3是氢时,提供了式-C(=O)H、-C(=O)OH、-C(=O)SH、-C(=O)N(RL)H或-N(RL)H的基团。
但是,在某些实施方式中,当L1是键或者-C(=O)-、-C(=O)O-、-C(=O)S-、-C(=O)N(RL)-或-N(RL)-(C(RLL)2)p-时,RB3是任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基。
在某些实施方式中,RB3是非环状基团,例如,RB3是任选取代的烷基、任选取代的烯基或任选取代的炔基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的烷基,例如,任选取代的C1-6烷基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的烯基,例如,任选取代的C2-6烯基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的炔基,例如,任选取代的C2-6炔基。
但是,在某些实施方式中,RB3是环状基团,例如,RB3是任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基。在某些实施方式中,RB3是非芳族环状基团,例如,在某些实施方式中,RB3是任选取代的碳环基或任选取代的杂环基。在某些实施方式中,RB3是芳族环状基团,例如,在某些实施方式中,RB3是任选取代的芳基或任选取代的杂芳基。
在某些实施方式中,RB3是任选取代的碳环基,例如,任选取代的C3-6碳环基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的C3碳环基、任选取代的C4碳环基、任选取代的C5碳环基或任选取代的C6碳环基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的环戊基(C5)或任选取代的环己基(C6)。
在某些实施方式中,RB3是与任选取代的芳基或任选取代的杂芳基环稠合的任选取代的碳环基,其中连接点是在碳环基环上。在某些实施方式中,RB3是任选取代的碳环基,例如,与任选取代的芳基或任选取代的杂芳基环稠合的任选取代的C3-6碳环基。在某些实施方式中,RB3是与任选取代的芳基或任选取代的杂芳基环稠合的任选取代的C3碳环基、任选取代的C4碳环基、任选取代的C5碳环基或任选取代的C6碳环基。在某些实施方式中,RB3是与任选取代的芳基或任选取代的杂芳基环稠合的任选取代的环戊基(C5)或任选取代的环己基(C6)。在某些实施方式中,稠合的芳基环是任选取代的苯基环。在某些实施方式中,稠合的杂芳基环是任选取代的6-元杂芳基环,例如,任选取代的吡啶基环。
在某些实施方式中,RB3是任选取代的杂环基,例如,任选取代的3-6元杂环基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的3-元杂环基、任选取代的4-元杂环基、任选取代的5-元杂环基或任选取代的6-元杂环基,例如,包含选自氧、硫或氮的1或2个杂原子。
在某些实施方式中,RB3是与任选取代的芳基或任选取代的杂芳基环稠合的任选取代的杂环基,其中连接点是在杂环基环上。在某些实施方式中,RB3是与任选取代的芳基或任选取代的杂芳基环稠合的任选取代的杂环基,例如,任选取代的3-6元杂环基。在某些实施方式中,RB3是与任选取代的芳基或任选取代的杂芳基环稠合的任选取代的3-元杂环基、任选取代的4-元杂环基、任选取代的5-元杂环基或任选取代的6-元杂环基,例如,包含选自氧、硫或氮的1或2个杂原子。在某些实施方式中,稠合的芳基环是稠合的任选取代的苯基环。在某些实施方式中,稠合的杂芳基环是6-元杂芳基环,例如,任选取代的吡啶基环。在某些实施方式中,RB3的连接点是经由氮原子。在某些实施方式中,RB3是任选取代的1,2,3,4-四氢-2,7-萘啶基环、3,4-二氢吡啶并[4,3-d]嘧啶基环、3,4-二氢吡啶并[4,3-d]嘧啶-2-酮环或3,4-二氢-2H-吡啶并[3,4-e][1,3]噁嗪-2-酮环,其中连接点是在非芳族杂环基环上。
在某些实施方式中,RB3是任选取代的芳基,例如,任选取代的C6-14芳基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的苯基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的萘基。在某些实施方式中,RB3是与任选取代的杂环基环稠合的任选取代的苯基;如任选取代的苯基四氢异喹啉基。对于包含稠合的杂环基环的任选取代的芳基环系统应理解,与母体分子的连接点是在芳基(例如,苯基)环上。
在某些实施方式中,RB3是任选取代的杂芳基,例如,任选取代的5-14元杂芳基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的5-元杂芳基或任选取代的6-元杂芳基。在某些实施方式中,RB3是任选取代的双环杂芳基,例如,任选取代的5,6-双环杂芳基或任选取代的6,6-双环杂芳基。在某些实施方式中,RB3是选自下组的任选取代的5,6-双环杂芳基或任选取代的6,6-双环杂芳基环系统:任选取代的萘啶基、任选取代的蝶啶基、任选取代的喹啉基、任选取代的异喹啉基、任选取代的噌啉基、任选取代的喹喔啉基、任选取代的酞嗪基和任选取代的喹唑啉基。在某些实施方式中,RB3的连接点是经由氮原子。
在某些实施方式中,其中RB3是任选取代的杂环基,-L1-RB3选自:
其中:
R6A的各种情况独立地是卤素、-NO2、-CN、-OR6C、-SR6C、-N(R6C)2、-C(=O)R6C、-C(=O)OR6C、-C(=O)N(R6C)2、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;
R6B的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基或连接于氮时的氮保护基;
其中R6C的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、在连接于氧时的氧保护基团、在连接于硫时的硫保护基团或在连接于氮时的氮保护基团,任选地当连接于N时,两个R6C基团可以连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基环;和
m是0或1和4之间的整数,包括1和4,
条件是L1不是-N(RL)-(C(RLL)2)p-,其中p是0。
在某些实施方式中,其中RB3是任选取代的芳基或任选取代的杂芳基,-L1-RB3选自:
其中:
R6A的各种情况独立地是卤素、-NO2、-CN、-OR6C、-SR6C、-N(R6C)2、-C(=O)R6C、-C(=O)OR6C、-C(=O)N(R6C)2、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;
R6B的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基或在连接于氮时的氮保护基;
其中R6C的各种情况独立地是氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、在连接于氧时的氧保护基团、在连接于硫时的硫保护基团或在连接于氮时的氮保护基团,任选地当连接于N时,两个R6C基团可以连接以形成任选取代的杂环基或任选取代的杂芳基环;和
m是0或1和4之间的整数,包括1和4。
在某些实施方式中,m是0。在某些实施方式中,m是1、2、3或4。在某些实施方式中,其中m是1、2、3或4,至少一个R6A是卤素(例如,氟)、-OR6C、-SR6C或-N(R6C)2。
在某些实施方式中,L1是键或-C(=O)N(RL)-,其中RL是氢或任选取代的烷基(例如,甲基),且RB3是任选取代的芳基或任选取代的杂芳基,如本文所述的。
例如,在式(A)、(B)、(C)、(D)和(E)的某些实施方式中,其中基团-L1-RB3是下式的基团:
其中L1是键,提供了式(A-h)、(A-1-h)、(A-2-h)、(B-h)或(C-h)、(D-h)、(D-1-h)、(D-2-h)、(E-h)、(E-1-h)、(E-2-h)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、R6A和m如本文定义。
例如,在式(A)、(B)和(C)的某些实施方式中,其中基团-L1-RB3是下式的基团:
其中L1是键,提供了式(A-i)、(A-1-i)、(A-2-i)、(B-i)或(C-i)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、R6A和m如本文定义。
在式(A)、(B)和(C)的某些实施方式中,其中基团-L1-RB3是下式的基团:
其中L1是键,提供了式(A-p)、(A-1-p)、(A-2-p)、(B-p)或(C-p)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、R6A和m如本文定义。
在式(A)、(B)和(C)的某些实施方式中,其中基团-L1-RB3是下式的基团:
其中L1是键,提供了式(A-q)、(A-1-q)、(A-2-q)、(B-q)或(C-q)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、R6A和m如本文定义。
在式(A)、(B)和(C)的某些实施方式中,其中基团-L1-RB3是下式的基团:
其中L1是键,提供了式(A-r)、(A-1-r)、(A-2-r)、(B-r)或(C-r)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、R6A和m如本文定义。
式(A-i)、(A-1-i)、(A-2-i)、(B-i)、(C-i)、(A-p)、(A-1-p)、(A-2-p)、(B-p)、(C-p)、(A-q)、(A-1-q)、(A-2-q)、(B-q)、(C-q)、(A-r)、(A-1-r)、(A-2-r)、(B-r)和(C-r)的化合物设计为模拟皮质抑素A的异喹啉且预想具有提高的代谢稳定性。
在式(A)、(B)和(C)的其它实施方式中,其中RB1是-L1-RB3,且L1是-C(=O)N(RL)-,提供了式(A-j)、(A-1-j)、(A-2-j)、(B-j)或(C-j)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、RL和RB3如本文定义。
在式(A)、(B)和(C)的其它实施方式中,其中RB1是-L1-RB3,且L1是-N(RL)-(C(RLL)2)p-,其中p是1,提供了式(A-n)、(A-1-n)、(A-2-n)、(B-n)或(C-n)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、RL和RB3如本文定义。
式(A-j)、(A-1-j)、(A-2-j)、(B-j)、(C-j)、(A-n)、(A-1-n)、(A-2-n)、(B-n)和(C-n)的化合物设计为模拟皮质抑素A的异喹啉且预想具有改善的药代动力学特性。特别地,本文中包括其中-L1-RB3是下式的基团的化合物:
其中L1是-C(O)N(RL)-或-N(RL)-((CRLL)2)p-,其中p是1。
可选地,在某些实施方式中,RB1和RB2的至少一种情况是-XARA。在这种情况中,在某些实施方式中,RB1和RB2中另一个是氢或-XARA(例如,-ORA)。例如,在某些实施方式中,当命名为(c)的代表单键时,RB1是-XARA(例如,-ORA)且RB2是氢或-XARA(例如,-ORA)。在其它实施方式中,当命名为(c)的代表单键时,RB2是-XARA(例如,-ORA)且RB1是氢或-XARA(例如,-ORA)。可选地,在某些实施方式中,当命名为(c)的代表双键时,RB1是-XARA(例如,-ORA,其中RA不是氢)且RB2不存在。
在某些实施方式中,RB1和RB2的两种情况均是-XARA。在这一实施方式中,在某些情况中,两个RA基团可以连接以形成任选取代的杂环基环,例如,任选取代的5-6元杂环基环。例如,在式(A)、(B)和(C)的某些实施方式中,其中RB1和RB2的两种情况均是-XARA,提供了式(A-k)、(A-1-k)、(A-2-k)及(B-k)和(C-k)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4、R5、XA和RA如本文定义。
在某些实施方式中,RB1和RB2连接以形成氧代基团(=O)。例如,在式(A)、(B)和(C)的某些实施方式中,RB1和RB2连接以形成氧代基团(=O),提供了式(A-m)、(A-1-m)、(A-2-m)、(B-m)或(C-m)的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、R3、R4和R5如本文定义。
示例性的化合物
本文进一步包括某些实施方式的各种组合。
例如,在式(A-1-h)、(A-1-i)、(A-1-p)、(A-1-q)、(A-1-r)、(A-1-j)、(A-1-n)、(A-2-h)、(D-1-h)、(D-2-h)、(E-1-h)、(E-2-h)的某些实施方式中,且其中命名为(c)的键是单键,和RB2是氢,提供了下式的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、RO、R3、R4、R5、R6A、R6B、RL、RLL和m如本文定义。在某些实施方式中,R3是甲基。在某些实施方式中,R4是氢。在某些实施方式中,R5是氢。在某些实施方式中,命名为(a)和(b)的键是双键。在某些实施方式中,R1和R2的各种情况是任选取代的烷基,例如,-CH3。在某些实施方式中,R1和R2中至少一个是式的基团,其中p和Z如本文定义。在某些实施方式中,R1和R2中至少一个是-S(=O)2RA。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的杂环基。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成下式的环: 其中R7、n和G如本文定义。在某些实施方式中,化合物是N-氧化物,例如,基团具有式在某些实施方式中,RO是任选取代的烷基,例如,-CH3或式的基团,其中Z和p如本文定义。在某些实施方式中,RO是-C(=O)RA、-C(=O)ORA或-C(=O)N(RA)2,例如,-C(=O)CH3、-C(=O)OCH3、-C(=O)N(CH3)2或-C(=O)NHCH3。
在式(A-1-h-i)、(A-1-i-i)、(A-1-p-i)、(A-1-q-i)、(A-1-r-i)、(A-1-j-i)、(A-1-n-i)、(A-2-h-i)、(D-1-h-i)、(D-2-h-i)、(E-1-h-i)和(E-2-h-i)的某些实施方式中,其中R3是甲基,R4和R5是氢,和命名为(a)和(b)的键是双键,提供了下式的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R1、R2、RO、R6A、R6A、R6B、RL、RLL和m如本文定义。在某些实施方式中,R1和R2的各种情况是任选取代的烷基,例如,-CH3。在某些实施方式中,R1和R2之一是氢,和R1和R2之一是任选取代的烷基,例如,-CH3。在某些实施方式中,R1和R2中至少一个是式的基团,其中p和Z如本文定义。在某些实施方式中,R1和R2中至少一个是-S(=O)2RA。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成任选取代的杂环基。在某些实施方式中,R1和R2连接以形成下式的环: 其中R7、n和G如本文定义。在某些实施方式中,化合物是N-氧化物,例如,基团为式在某些实施方式中,RO是任选取代的烷基(例如,-CH3)或式的基团,其中Z和p如本文定义。在某些实施方式中,RO是-C(=O)RA、-C(=O)ORA或-C(=O)N(RA)2,例如,-C(=O)CH3、-C(=O)OCH3、-C(=O)N(CH3)2或-C(=O)NHCH3。
在式(A-1-h-ii)和(A-2-h-ii)的某些实施方式中,其中R1和R2连接以形成任选取代的杂环基,提供了下式的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R7、R6A、n和m如本文定义。在某些实施方式中,G是O。在某些实施方式中,G是N-CH3。在某些实施方式中,m是0。在某些实施方式中,m是1。在某些实施方式中,n是0。在某些实施方式中,n是1。
在式(A-1-h-ii)或(A-2-h-ii)的某些实施方式中,其中R1和R2连接以形成任选取代的杂环基,提供了下式的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R7、R6A、n和m如本文定义。在某些实施方式中,G是-CH2-。在某些实施方式中,m是0。在某些实施方式中,m是1。在某些实施方式中,n是0。在某些实施方式中,n是1。
在式(A-1-h-ii)的某些实施方式中,其中R1和R2各自是-CH3,提供了下式的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R6A和m如本文定义。在某些实施方式中,m是0。在某些实施方式中,m是1。
在式(A-2-h-ii)的某些实施方式中,其中R1和R2之一是氢,和R1和R2中另一个是-CH3,提供了下式的化合物:
或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物;其中R6A和m如本文定义。在某些实施方式中,m是0。在某些实施方式中,m是1。
示例性的式(A)化合物包括,但不限于:
及其药学上可接受的盐、季胺盐和其N-氧化物,例如,下式的N-氧化物:
但是,在某些实施方式中,式(A)的化合物不是:
或其药学上可接受的盐或季胺盐,或者其N-氧化物。
示例性的式(B)化合物包括,但不限于:
及其药学上可接受的盐、季胺盐或其N-氧化物。
示例性的式(C)化合物包括,但不限于:
及其药学上可接受的盐。
示例性的式(D)化合物包括,但不限于:
及其药学上可接受的盐。
示例性的式(E)化合物包括,但不限于:
及其药学上可接受的盐。
药物组合物
在某些实施方式中,本发明提供包含式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物及药学上可接受的赋形剂的药物组合物。在某些实施方式中,化合物以有效量存在,例如,治疗有效量或预防有效量。
药学上可接受的赋形剂包括任何和所有溶剂、稀释剂或其它液体媒介、分散或悬浮助剂、表面活性剂、等渗剂、增稠剂或乳化剂、防腐剂、固体粘合剂、润滑剂等等,如适合于所希望的特定剂型。药物组合物剂的配制和/或制造中的一般考虑可以例如在Remington'sPharmaceutical Sciences,Sixteenth Edition,E.W.Martin(Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1980)和Remington:The Science and Practice of Pharmacy,21st Edition(Lippincott Williams&Wilkins,2005)中找到。
本文描述的药物组合物可以通过药物学领域中已知的任何方法来制备。一般地,这样的制备方法包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物(“活性成分”)与赋形剂和/或一种或多种其它辅助成分结合的步骤,且然后如果需要和/或希望的话,将产物成型和/或包装成所需的单剂量或多剂量单元。
药物组合物可以整批地、作为单一单位剂量和/或作为多个单一单位剂量制备、包装和/或销售。如本文中使用的,“单位剂量”是包含预定量的活性成分的药物组合物的离散量。活性成分的量一般等于施用于受试者的活性成分的剂量和/或这种剂量的方便的分数,例如,这种剂量的一半或三分之一。
本发明的药物组合物中活性成分、药学上可接受的载体和/或任何另外的成分的相对量根据治疗的受试者的身份、体形和/或状况且进一步根据组合物施用的途径而变化。举例来说,组合物可以包含0.1%和100%(w/w)之间的活性成分。
在制造所提供的药物组合物中使用的药学上可接受的赋形剂包括惰性稀释剂、分散和/或制粒剂、表面活性剂和/或乳化剂、崩解剂、粘合剂、防腐剂、缓冲剂、润滑剂和/或油。赋形剂如可可脂和栓剂蜡、着色剂、涂层剂、甜味剂、矫味剂和芳香剂也可以存在于组合物中。
示例性的稀释剂包括碳酸钙、碳酸钠、磷酸钙、磷酸二钙、硫酸钙、磷酸氢钙、磷酸钠乳糖、蔗糖、纤维素、微晶纤维素、高岭土、甘露醇、山梨醇、肌醇、氯化钠、干淀粉、玉米淀粉、糖粉等及其组合。
示例性的制粒和/或分散剂包括土豆淀粉、玉米淀粉、木薯淀粉、乙醇酸淀粉钠、粘土、藻酸、瓜尔胶、柑桔渣、琼脂、膨润土、纤维素和木制品、天然海绵、阳离子-交换树脂、碳酸钙、硅酸盐、碳酸钠、交联聚(乙烯基-吡咯烷酮)(交聚维酮)、羧甲基淀粉钠(乙醇酸淀粉钠)、羧甲基纤维素、交联羧甲基纤维素钠(交联羧甲纤维素)、甲基纤维素、预胶凝淀粉(淀粉1500)、微晶淀粉、水溶性淀粉、羧甲基纤维素钙、硅酸镁铝(Veegum)、月桂基硫酸钠、季铵化合物等及其组合。
示例性的表面活性剂和/或乳化剂包括天然乳化剂(例如,阿拉伯树脂、琼脂、藻酸、藻酸钠、黄芪胶、角叉菜(chondrux)、胆固醇、黄原胶、果胶、明胶、蛋黄、酪蛋白、羊毛脂、胆甾醇、蜡和卵磷脂)、胶质粘土(例如,膨润土[硅酸铝]和Veegum[硅酸镁铝])、长链氨基酸衍生物、高分子量醇(例如,硬脂醇、鲸蜡醇、油醇、三醋精单硬脂酸酯、乙二醇二硬脂酸酯、甘油单硬脂酸酯和丙二醇单硬脂酸酯、聚乙烯醇)、卡波姆(例如,羧基聚亚甲基、聚丙烯酸、丙烯酸聚合物和羧基乙烯基聚合物)、角叉菜胶、纤维素衍生物(例如,羧甲基纤维素钠、粉状纤维素、羟甲基纤维素、羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、甲基纤维素)、山梨聚糖脂肪酸酯(例如,聚氧乙烯山梨聚糖单月桂酸酯[Tween 20]、聚氧乙烯山梨聚糖[Tween 60]、聚氧乙烯山梨聚糖单油酸酯[Tween 80]、山梨聚糖单棕榈酸酯[Span 40]、山梨聚糖单硬脂酸酯[Span 60]、山梨聚糖三硬脂酸酯[Span 65]、甘油单油酸酯、山梨聚糖单油酸酯[Span80])、聚氧乙烯酯(例如,聚氧乙烯单硬脂酸酯[Myrj 45]、聚氧乙烯氢化蓖麻油、聚氧乙烯化蓖麻油、聚氧亚甲基硬脂酸酯和Solutol)、蔗糖脂肪酸酯、聚乙二醇脂肪酸酯(例如,Cremophor)、聚氧乙烯醚(例如,聚氧乙烯月桂基醚[Brij 30])、聚(乙烯基-吡咯烷酮)、二乙二醇单月桂酸酯、三乙醇胺油酸酯、油酸钠、油酸钾、乙基油酸酯、油酸、乙基月桂酸酯、月桂基硫酸钠、Pluronic F 68、Poloxamer 188、西曲溴铵、西吡氯铵、苯扎氯铵、多库酯钠等和/或其组合。
示例性的粘合剂包括淀粉(例如,玉米淀粉和淀粉糊)、明胶、糖(例如,蔗糖、葡萄糖、右旋糖、糊精、糖蜜、乳糖、乳糖醇、甘露醇等)、天然和合成树胶(例如,阿拉伯树脂、藻酸钠、爱尔兰藓的提取物、潘瓦尔胶、印度树胶、伊沙普尔皮粘胶(mucilage of isapolhusks)、羧甲基纤维素、甲基纤维素、乙基纤维素、羟乙基纤维素、羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、微晶纤维素、乙酸纤维素、聚(乙烯基-吡咯烷酮)、硅酸镁铝(Veegum)和落叶松聚阿拉伯半乳聚糖(larch arabogalactan))、藻酸盐、聚环氧乙烷、聚乙二醇、无机钙盐、硅酸、聚甲基丙烯酸酯、蜡、水、醇等和/或其组合。
示例性的防腐剂包括抗氧化剂、螯合剂、抗细菌防腐剂、抗真菌防腐剂、醇防腐剂、酸性防腐剂和其它防腐剂。
示例性的抗氧化剂包括α生育酚、抗坏血酸、抗坏血酸棕榈酸酯(acorbylpalmitate)、丁基化羟基茴香醚、丁基化羟基甲苯、硫代甘油、焦亚硫酸钾、丙酸、没食子酸丙酯、抗坏血酸钠、亚硫酸氢钠、焦亚硫酸钠和亚硫酸钠。
示例性的螯合剂包括乙二胺四乙酸(EDTA)及其盐和水合物(例如,依地酸钠、依地酸二钠、依地酸三钠、依地酸二钠钙、依地酸二钾等等)、柠檬酸及其盐和水合物(例如,柠檬酸一水合物)、富马酸及其盐和水合物、苹果酸及其盐和水合物、磷酸及其盐和水合物、和酒石酸及其盐和水合物。示例性的抗细菌防腐剂包括苯扎氯铵、苄索氯铵、苯甲醇、溴硝醇、溴烷铵(cetrimide)、西吡氯铵、氯己啶、氯丁醇、氯甲酚、氯二甲苯酚、甲酚、乙醇、甘油、双辛氢啶、咪脲、苯酚、苯氧乙醇、苯基乙醇、硝酸苯汞、丙二醇和硫柳汞。
示例性的抗真菌防腐剂包括尼泊金丁酯、尼泊金甲酯、尼泊金乙酯、尼泊金丙酯、苯甲酸、羟基苯甲酸、苯甲酸钾、山梨酸钾、苯甲酸钠、丙酸钠和山梨酸。
示例性的醇防腐剂包括乙醇、聚乙二醇、苯酚、酚类化合物、双酚、氯丁醇、羟基苯甲酸盐和苯基乙醇。
示例性的酸性防腐剂包括维生素A、维生素C、维生素E、β-胡萝卜素、柠檬酸、乙酸、脱氢乙酸、抗坏血酸、山梨酸和植酸。
其它防腐剂包括生育酚、生育酚乙酸酯、甲磺酸得立肟(deteroxime mesylate)、溴烷铵、丁基化羟基茴香醚(BHA)、丁基化羟基甲苯(BHT)、乙二胺、月桂基硫酸钠(SLS)、月桂基醚硫酸钠(SLES)、亚硫酸氢钠、焦亚硫酸钠、亚硫酸钾、焦亚硫酸钾、Glydant Plus、Phenonip、对羟基苯甲酸甲酯、Germall 115、Germaben II、Neolone、Kathon和Euxyl。在某些实施方式中,防腐剂是抗氧化剂。在其它实施方式中,防腐剂是螯合剂。
示例性的缓冲剂包括柠檬酸盐缓冲溶液、乙酸盐缓冲溶液、磷酸盐缓冲溶液、氯化铵、碳酸钙、氯化钙、柠檬酸钙、葡乳醛酸钙、葡庚糖酸钙、葡萄糖酸钙、D-葡萄糖酸、甘油磷酸钙、乳酸钙、丙酸、乙酰丙酸钙、戊酸、磷酸氢钙、磷酸、磷酸钙、氢氧化钙磷酸盐、乙酸钾、氯化钾、葡糖酸钾、钾混合物、磷酸氢二钾、磷酸二氢钾、磷酸钾混合物、乙酸钠、碳酸氢钠、氯化钠、柠檬酸钠、乳酸钠、磷酸氢二钠、磷酸二氢钠、磷酸钠混合物、氨丁三醇、氢氧化镁、氢氧化铝、藻酸、无热原水、等渗盐水、Ringer’s溶液、乙醇等及其组合。
示例性的润滑剂包括硬脂酸镁、硬脂酸钙、硬脂酸、二氧化硅、滑石、麦芽、山嵛酸甘油酯(glyceryl behanate)、氢化植物油、聚乙二醇、苯甲酸钠、乙酸钠、氯化钠、亮氨酸、月桂基硫酸镁、月桂基硫酸钠等及其组合。
示例性的天然油包括杏仁油、苦杏仁油、鳄梨油、巴西棕榈树油、佛手柑油、黑加仑种子油、琉璃苣油、杜松油、甘菊油、芥花籽油、蒿子油、巴西棕榈油、蓖麻油、肉桂油、可可脂、椰子油、鳕鱼肝油、咖啡油、玉米油、棉籽油、鸸鹋油、桉树油、月见草油、鱼油、亚麻籽油、香茅醇油、葫芦油、葡萄籽油、榛子油、牛膝草油、肉豆蔻酸异丙酯、荷荷巴油、奇异果油、杂薰衣草油、熏衣草油、柠檬油、山苍子油、夏威夷果仁油、锦葵油、芒果籽油、白芒花籽油、貂油、肉豆蔻油、橄榄油、橙油、罗非鱼油、棕榈油、棕榈仁油、桃仁油、花生油、罂粟籽油、南瓜籽油、菜籽油、米糠油、迷迭香油、红花油、檀香木油、山茶花油、香薄荷油(savoury)、沙棘油、芝麻油、乳木果油、硅油、大豆油、向日葵油、茶树油、蓟油、椿花油、香根草油、胡桃油和小麦胚芽油。示例性的合成油包括,但不限于硬脂酸丁酯、辛酸甘油三酯、癸酸甘油三酯、环甲硅油、二乙基癸二酸酯、二甲基硅油360、肉豆蔻酸异丙酯、矿物油、辛基十二烷醇、油醇、硅油及其组合。
用于口服和肠胃外施用的液体剂型包括药学上可接受的乳剂、微乳剂、溶液剂、混悬剂、糖浆剂和酏剂。除活性成分以外,液体剂型可以包含本领域中常用的惰性稀释剂,例如,水或其它溶剂、增溶剂和乳化剂如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苄基苯甲酸酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲酰胺、油(例如,棉籽油、花生油、玉米油、胚油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氢糠醇、聚乙二醇和山梨聚糖脂肪酸酯及其混合物。除惰性稀释剂外,口服组合物可以包含助剂如润湿剂、乳化和助悬剂、甜味剂、矫味剂及芳香剂。在用于肠胃外施用的某些实施方式中,本发明的偶联物与增溶剂如Cremophor、醇、油、改性油、二醇类、聚山梨醇酯、环糊精、聚合物、聚合物偶联物(例如,IT-101/CLRX101)及其组合混合。
可注射制剂,例如,无菌注射水性或油性混悬剂可以按照已知技术使用合适的分散剂或润湿剂和助悬剂配制。无菌可注射制剂可以是无菌注射液,非毒性的肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中的混悬液或乳液,例如,作为1,3-丁二醇中的溶液。可以使用的可接受媒介和溶剂中有水、Ringer's溶液,U.S.P.和等渗氯化钠溶液。另外,无菌的非挥发油常规地用作溶剂或悬浮介质。对于这一目的,可以使用任何温和的非挥发油,包括合成的单甘油酯或二甘油酯。另外,脂肪酸如油酸用于注射剂的制备中。
可注射制剂可以例如通过经细菌滞留过滤器(bacterial-retaining filter)过滤、或通过加入无菌固体组合物形式的灭菌剂(其可在使用前溶解或分散在无菌水或其它无菌可注射介质中)中以灭菌。
为延长活性成分的作用,通常希望的是减缓来自皮下或肌肉内注射的活性成分的吸收。这可以通过使用具有不良水溶性的晶体或无定形物质的液体悬浮液来实现。活性成分的吸收速率则取决于其溶解速率,而溶解速率又可取决于晶体大小和晶体形式。或者,通过将活性成分溶解或悬浮在油媒介中来实现肠胃外施用形式的延迟吸收。
用于直肠或阴道施用的组合物通常是栓剂,其可通过将本发明的偶联物与合适的无刺激性赋形剂或载体(例如可可脂、聚乙二醇或栓剂蜡)混合来制备,所述赋形剂或载体在环境温度下为固体,但在体温下为液体,并因此在直肠或阴道腔中熔融和释放活性成分。
口服施用的固体剂型包括胶囊剂、片剂、丸剂、散剂和颗粒剂。在这些固体剂型中,将活性成分与例如以下物质混合:至少一种惰性的药学上可接受的赋形剂或载体(如柠檬酸钠或磷酸二钙);和/或a)填充剂或增量剂,例如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇和硅酸;b)粘合剂,例如羧甲基纤维素、藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和阿拉伯树胶;c)保湿剂,例如甘油;d)崩解剂,例如琼脂、碳酸钙、土豆或木薯淀粉、藻酸、某些硅酸盐和碳酸钠;e)溶解延迟剂,例如石蜡;f)吸收加速剂,例如季铵化合物;g)润湿剂,例如鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯;h)吸附剂,例如高岭土和膨润土;以及i)润滑剂,例如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、月桂基硫酸钠,及其混合物。在胶囊剂、片剂和丸剂的情况下,剂型也可包含缓冲剂。
类似类型的固体组合物也可使用例如乳糖或奶糖以及高分子量聚乙二醇等的赋形剂而用作软填充和硬填充明胶胶囊剂中的填充剂。片剂、糖锭剂、胶囊剂、丸剂和颗粒剂的固体剂型可制备有涂层和外壳,例如肠溶包衣和药物制剂领域中众所周知的其它涂层。它们可任选地含有遮光剂并且可为只在肠道的某一部分中或优先在肠道的某一部分中(任选地以延迟方式)释放活性成分的组合物。可使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。类似类型的固体组合物也可使用例如乳糖或奶糖以及高分子量聚乙二醇等的赋形剂而用作软填充和硬填充明胶胶囊剂中的填充剂。
活性成分也可为具有一种或一种如上所述的赋形剂的微包封形式。片剂、糖锭剂、胶囊剂、丸剂和颗粒剂的固体剂型可制备有涂层和外壳,例如肠溶包衣、释放控制涂层和药物制剂领域中众所周知的其它涂层。在这些固体剂型中,活性成分可与至少一种惰性稀释剂如蔗糖、乳糖或淀粉混合。如在常规实践中,这些剂型可包含除惰性稀释剂之外的其它物质,例如压片润滑剂和其它压片助剂,诸如硬脂酸镁和微晶纤维素。在胶囊剂、片剂和丸剂的情况中,剂型可包含缓冲剂。它们可任选地含有遮光剂并且可为只在肠道的某一部分中或优先在肠道的某一部分中(任选地以延迟方式)释放活性成分的组合物。可使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。
用于局部和/或经皮施用本发明化合物的剂型可以包括软膏、糊剂、乳膏、洗剂、凝胶剂、散剂、溶液、喷雾剂、吸入剂或贴片。一般地,在无菌条件下将活性成分与药学上可接受的载体和/或可能需要的任何所需的防腐剂或缓冲剂混合。另外,本发明预想使用透皮贴片,其通常具有提供活性成分对身体的受控释放的额外益处。这样的剂型可以例如通过溶解和/或分配活性成分到适宜介质中来制备。可选地或另外地,速率可通过提供速率控制膜和/或通过在聚合物基质和/或凝胶中分配活性成分进行控制。
用于递送本文所述的皮内药物组合物的合适装置包括短针装置,如美国专利4,886,499;5,190,521;5,328,483;5,527,288;4,270,537;5,015,235;5,141,496和5,417,662中描述的那些。皮内组合物可以通过限制针进入皮肤的有效穿透长度的装置施用,如PCT公开WO 99/34850中描述的那些及其功能等同物。通过液体射流注射器和/或通过刺穿角质层并产生达到真皮的射流的针递送液体疫苗的射流注射装置是合适的。射流注射装置描述于例如美国专利5,480,381;5,599,302;5,334,144;5,993,412;5,649,912;5,569,189;5,704,911;5,383,851;5,893,397;5,466,220;5,339,163;5,312,335;5,503,627;5,064,413;5,520,639;4,596,556;4,790,824;4,941,880;4,940,460及PCT公开WO 97/37705和WO 97/13537中。使用压缩气体加速粉末形式的疫苗通过皮肤的外层到达真皮的弹道式粉末/颗粒递送装置是合适的。可选地或另外地,常规注射器可以用于皮内施用的经典曼特氏(mantoux)方法中。
适合局部施用的制剂包括,但不限于液体和/或半液体制备物如搽剂、洗剂、水包油和/或油包水乳液如乳膏、软膏和/或糊剂,和/或溶液和/或悬浮液。可局部施用的制剂可以例如包含约1%-约10%(w/w)的活性成分,虽然活性成分的浓度可以高达活性成分在溶剂中的溶解性极限。用于局部施用的制剂可进一步包含一种或多种本文所述的另外的成分。
药物组合物可以以适合于经由口腔肺部施用的制剂来制备、包装和/或销售。这种制剂可以包含含有活性成分且具有约0.5-约7纳米或约1-约6纳米范围的直径的干燥颗粒。这样的组合物方便地为干粉的形式,其用于使用包括干粉储库(可以向其导入推进剂流以分散该粉末)的装置和/或使用自推进的溶剂/粉末分配容器(如密封容器中包含溶解和/或悬浮在低沸点推进剂中的活性成分的装置)施用。这样的粉末包含其中按重量计至少98重量%的颗粒具有大于0.5纳米的直径和按数量计至少95%的颗粒具有小于7纳米的直径的颗粒。可选地,按重量计至少95%的颗粒具有大于1纳米的直径和按数量计至少90%的颗粒具有小于6纳米的直径。干粉组合物可以包括固体细粉稀释剂如糖且方便地以单位剂型提供。
低沸点推进剂一般包括在大气压下沸点低于65°F的液体推进剂。一般地,推进剂可以占组合物的50-99.9%(w/w)且活性成分可以占组合物的0.1-20%(w/w)。推进剂可以进一步包含另外的成分如液体非离子和/或固体阴离子表面活性剂和/或固体稀释剂(其可以具有与包含活性成分的颗粒相同数量级的粒径)。
配制用于肺部递送的药物组合物可以以溶液和/或悬浮液的小滴的形式提供活性成分。这样的制剂可以作为包含活性成分的水性和/或稀释醇溶液和/或悬浮液(任选无菌的)制备、包装和/或销售,且可以方便地使用任何喷雾和/或雾化装置施用。这样的制剂可以进一步包含一种或多种另外的成分,包括,但不限于矫味剂如糖精钠、挥发油、缓冲剂、表面活性剂和/或防腐剂如甲基羟基苯甲酸酯。通过这一施用途径提供的液滴可以具有约0.1-约200纳米范围的平均直径。
本文描述为可用于肺部递送的制剂可用于鼻内递送本发明的药物组合物。适合于鼻内施用的另一制剂是包含活性成分且具有约0.2-500微米的平均粒径的粗粉。这种制剂通过从保持靠近鼻孔的粉末容器经鼻道快速吸入而施用。
用于鼻施用的制剂可以例如包含大约少至0.1%(w/w)和多至100%(w/w)的活性成分,且可以包含一种或多种本文所述的另外的成分。本发明的药物组合物可以以用于口腔施用的制剂制备、包装和/或销售。这样的制剂可以例如为使用常规方法制备的片剂和/或锭剂的形式,且可以包含例如0.1-20%(w/w)的活性成分,余量包含口服可溶解和/或可降解的组合物,和任选地一种或多种本文所述的另外的成分。交替地,用于口腔施用的制剂可以包含含有活性成分的粉末和/或雾化和/或喷雾的溶液和/或悬浮液。这样的粉末化、雾化和/或喷雾的制剂在分散时可以具有约0.1-约200纳米范围的平均粒径和/或液滴尺寸,且可以进一步包含一种或多种本文所述的另外的成分。
药物组合物可以以用于眼部施用的制剂制备、包装和/或销售。这样的制剂可以例如为水性或油性液体载体中的滴眼剂的形式,其包括例如活性成分的0.1/1.0%(w/w)溶液和/或悬浮液。这样的滴剂可以进一步包含缓冲剂、盐和/或一种或多种其它的本文所述的另外的成分。可以使用的其它可眼部施用的制剂包括含有微晶体形式和/或脂质体制剂中的活性成分的那些。滴耳剂和/或滴眼剂预想在本发明的范围内。
虽然本文提供的药物组合物的说明主要针对适合施用于人的药物组合物,但本领域技术人员应理解这样的组合物一般适合施用于所有种类的动物。对适合施用于人的药物组合物进行改变以使该组合物适合施用于各种动物是很好理解的,且一般熟练的兽医学家可以利用普通试验来设计和/或进行这样的改变。药物组合物配制和/或制造中的一般考虑可以发现于例如Remington:The Science and Practice of Pharmacy 21st ed.,Lippincott Williams&Wilkins,2005中。
本发明更进一步包括医药包和/或试剂盒。所提供的医药包和/或试剂盒可以包含提供的组合物和容器(例如,小瓶、安瓿、药瓶、注射器和/或分配包装或者其它合适的容器)。在一些实施方式中,提供的试剂盒可以任选地进一步包括用于准备施用于受试者的含有用于稀释和悬浮提供的组合物的合适水性载体的第二容器。在一些实施方式中,提供的制剂容器和溶剂容器的内容物组合以形成至少一个单位剂型。
任选地,单个容器可以包括一个或多个用于容纳所提供的组合物和/或适宜的用于悬浮或稀释的水性载体的隔室。在一些实施方式中,单个容器可以适当地改变以使得该容器可以接受物理改变以允许多个隔室和/或单个隔室的组分的组合。例如,箔或塑料包可以包含通过穿孔密封分隔的两个或更多个隔室,该穿孔密封可以允许在产生破坏密封的信号时被破坏以允许两个单独隔室的内容物合并。医药包或试剂盒因此可以包含含有提供的组合物和用于悬浮的适宜溶剂和/或适宜水性载体的多隔室容器。
任选地,使用说明书另外地提供在本发明的这种试剂盒中。这种说明书一般地可以提供例如剂量和施用的指示。在其它实施方式中,说明书可以进一步提供与用于施用的特定容器和/或系统的专门说明相关的另外的细节。再进一步地,说明书可以提供与另外的疗法结合或组合使用的专门说明。
治疗方法
CDK8和CDK19,称为“中介激酶”,组装成可逆地结合中介体复合物的多蛋白复合物。中介体复合物将增强子结合的转录因子与启动子结合的RNA pol II全酶连接且其影响染色质结构以通过仍缺乏了解的机制调节转录和基因表达。最近对于来自200名AML患者的样品进行的全面的全基因组测序揭示出,明显地,在假定癌症驱动蛋白中的几乎所有突变与调节基因表达相关。参见,例如,Aerts等,Nature(2013)499:35-36;The Cancer GenomeAtlas Research Network,2013.Genomic and Epigenomic Landscapes of Adult DeNovo Acute Myeloid Leukmia.N.Engl.J.Med.368,2059-2074。因此,中介激酶的特异性抑制可能是破坏一些AML突变解除对驱动AML细胞生长的基因表达程序的控制的能力的新手段。CDK8/CDK19的特异性小分子抑制也可以证明对于治疗依赖于解除控制的基因表达的其它癌症是有益的。CDK8/细胞周期蛋白C进一步观察到在阿尔兹海默病(AD)患者的神经元和星形细胞中更高表达,且因此CDK8的特异性小分子抑制也可以证明对于治疗退行性疾病如AD是有益的。参见,例如,Hessel等,Neurobiology of Aging(2003)24:427-435,其中皮质抑素A报告为结合CDK8和CDK19。参见,例如,Cee等,Angew Chem Int Ed(2009)48:8952和US20120071477。此外,如图7、10A-10C和16A-16D显示的,皮质抑素A抑制CDK8激酶活性,部分地是因为这种结合。CDK8和CDK19具有非常相似的序列和催化结构域,表明抑制CDK8很可能也抑制CDK19。参见,例如,Ries等,Semin.Cell Dev.Biol.(2011)22:735-740。CDK8vs.CDK19的Blast比对也表明氨基酸为70%相同和82%相似。
因此,在一个方面,提供了抑制细胞中的CDK8和/或CDK19激酶活性的方法,包括将式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物与细胞接触。在某些实施方式中,该方法是体外方法。在某些实施方式中,该方法是体内方法。在另一个方面,提供了治疗与CDK8和/或CDK19激酶活性相关的病症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物。
在某些实施方式中,与CDK8和/或CDK19激酶活性相关的病症是增殖性障碍,例如,癌症。CDK8激酶活性与结肠癌关联。参见,例如,Firestein等,Nature(2008)455:547-551。
在某些实施方式中,与CDK8和/或CDK19激酶活性相关的病症是糖尿病病症,例如,糖尿病。
在某些实施方式中,与CDK8和/或CDK19激酶活性相关的病症是退行性疾病,例如,阿尔兹海默病(AD)。
CDK8与参与维持和驱动如癌症的疾病的多个信号传导途径和转录程序的调节相关联。这些途径和程序包括Wnt/β-连环蛋白途径、Notch途径、TGF-β/BMP信号传导途径、JAK-STAT途径、p53途径和缺氧反应。异常的Wnt/β-连环蛋白信号传导与白血病和许多其它癌症相关。例如,结肠癌中最常见的突变是导致Wnt/β-连环蛋白信号传导的激活、Wnt-靶基因的表达和肿瘤发生的突变。由于其在肿瘤发生中的关键作用,在鉴定Wnt/β-连环蛋白信号传导的安全、有效抑制剂方面存在着很大兴趣。参见,例如,Wang等,Science(2010)327:1650-1653.Polakis,EMBO J.(2012)31:2737-2746。
因此,在另一个方面,提供了治疗β-连环蛋白途径相关病症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物。在另一个方面,提供了调节细胞中的β-连环蛋白途径(例如,通过抑制β-连环蛋白靶基因的表达)的方法,包括将式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物与细胞接触。在某些实施方式中,该方法是体外方法。在某些实施方式中,该方法是体内方法。
如图15中所示,皮质抑素A抑制报告基因分析中β-连环蛋白激活的转录及AML细胞中推定的Wnt/β-连环蛋白靶基因的表达。多项研究已经将β-连环蛋白途径激活与肿瘤起始、维持和生长相关联。Wnt/β-连环蛋白途径的改变在乳腺癌、结肠直肠癌、肝细胞癌、成神经管细胞瘤、胰腺癌、淋巴瘤/白血病、肺癌、肾癌和Wilms’瘤中观察到。参见,例如,Saito-Diaz等,Growth Factors(2013)31:1-31。除癌症外,具有Wnt/β-连环蛋白途径过度激活的其它疾病包括高骨密度疾病和肥大性肥胖症(hypertrophic obesity)。此外,Wnt-β连环蛋白途径转录因子TCF7L2的变体与糖尿病相关。参见,例如,MacDonald等,DevelopmentalCell(2009)17,9-26。
在另一个方面,提供了治疗JAK-STAT途径相关病症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物。在另一个方面,提供了调节细胞中的STAT1活性(例如,通过抑制JAK-STAT途径中STAT1 S727的磷酸化,从而导致特定STAT1-相关基因的上调或下调)的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物与细胞接触。在某些实施方式中,该方法是体外方法。在某些实施方式中,该方法是体内方法。
如图7中所示,皮质抑素A抑制干扰素-γ刺激的STAT1磷酸化。STAT1磷酸化的抑制可以是通过防止STAT1介导的β-细胞凋亡而治疗异常炎症(包括在动脉粥样硬化中)、治疗癌症(包括MPN和白血病)及治疗糖尿病的治疗策略。IFN-γ在动脉粥样硬化病变中以高水平表达,从而通过STAT1激活导致提高的炎症,且IFN-γ激活STAT1以诱导β-细胞凋亡。参见,例如,Gysemans等,Biochem.Soc.Trans(2008)36:328。STAT1通过CDK8的磷酸化也已证明为限制NK激活和肿瘤监视。因此,CDK8激酶活性的抑制可以在直接抑制肿瘤细胞增殖之外有益地实现NK-介导的肿瘤细胞杀死。参见,例如,Putz等,CellReports(2013)4:437-444。
已经报告,核CDK如CDK8驱动SMAD转录激活及BMP和TGF-β的转换(turnover)。参见,例如,Alarcon等,Cell(2009)139:757-769。因此,在又一方面,提供了治疗TGF-β/BMP途径相关病症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物。在另一个方面,提供了调节细胞中的TGF-β/BMP途径(例如,通过抑制TGF-β/BMP途径中SMAD蛋白的CDK8/CDK19磷酸化,导致特定的SMAD蛋白相关基因的上调或下调)的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物与细胞接触。在某些实施方式中,该方法是体外方法。在某些实施方式中,该方法是体内方法。
TGF-β和BMP途径对于组织稳态是关键的,TGF-β和BMP途径活性的调节可以是包括但不限于肌营养不良(参见,例如,Ceco,FEBS J.(2013)280:4198-4209)、对于移植的免疫反应、癌症、纤维化和马方综合征(参见,例如,Akhurst and Hata,Nat Rev Drug Discov(2012)11:790-811)的病症的治疗策略。
缺氧是其中身体或身体区域缺乏充分的氧供应的状况,且可以由高空病、缺血、中风、心脏病发作、贫血、癌症和一氧化碳中毒产生。CDK8与缺氧反应的调节相关联,从而在HIF-1-A(HIF-1-α)靶基因的诱导中发挥作用。这些基因涉及到血管生成、糖酵解、代谢适应和细胞存活,这些过程对于肿瘤维持和生长是关键的。参见,例如,Galbraith等,Cell 153:1327-1339。
因此,在一个方面,提供了治疗与缺氧相关的病症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物。在另一个方面,提供了减轻缺氧损伤的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物。在又一方面,提供了调节细胞中的HIF-1-A(HIF-1-α)活性(例如,通过抑制HIF-1-α相关基因的表达)的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物与细胞接触。在某些实施方式中,该方法是体外方法。在某些实施方式中,该方法是体内方法。
在另一个方面,提供了增加细胞中的BIM表达(例如,BCLC2L11表达)以诱导细胞凋亡的方法,包括使式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物与细胞接触。在某些实施方式中,该方法是体外方法。在某些实施方式中,该方法是体内方法。BCL2L11表达在细胞中紧密调节。BCL2L11编码BIM,一种促凋亡蛋白。BCL2L11在许多癌症中下调且BIM在许多癌症中受到抑制,包括慢性髓细胞性白血病(CML)和非小细胞肺癌(NSCLC),且BCL2L11表达的抑制可以赋予对酪氨酸激酶抑制剂的抗性。参见,例如,Ng等,Nat.Med.(2012)18:521-528。
此外,皮质抑素作为一类化合物已发现具有抗血管生成(anti-antiogenic)活性。参见,例如,Aoki等,JACS(2006)128:3148-9。血管生成是从现有脉管系统生成新的毛细血管的过程。出生后,血管生成有助于器官生长,但它在成年期中受到严格调控且仅在伤口愈合过程中和在雌性繁殖期中发生。参见,例如,Klagsbrun等,MolecularAngiogenesis.Chemistry&Biology 1999,6(8),R217-R224。在正常生理条件下,血管生成通过一系列促血管生成和抗血管生成因子紧密调控,这允许在受控时间段内的血管生长。参见,例如,Ferrara,Vascular Endothelial Growth Factor as a Target forAnticancer Therapy.The Oncologist 2004,9:2-10。持久的非调控的血管生成牵涉到广泛的疾病中,包括类风湿性关节炎、黄斑变性、动脉粥样硬化、肥胖症、良性肿瘤和癌症。参见,例如,Moulton等,Angiogenesis inhibitors endostatin or TNP-470 reduceintimal neovascularization and plaque growth in apolipoprotein E-deficientmice.Circulation 1999,99,(13),1726-1732;和Hanahan等,The hallmarks ofcancer.Cell 2000,100,(1),57-70。这些病理状态按照其状态统一为“血管生成依赖性疾病”但在其它方面不相关的事实使得Folkman提出血管生成作为生物学中的“组织化原则”的概念,通过该概念可以将许多类型的看起来不相似的症状联系起来。参见Folkman,Opinion-angiogenesis:an organizing principle for drug discovery?NatureReviews Drug Discovery 2007,6(4):273-286。
因此,在又一方面,提供了治疗与血管生成相关的病症如,例如,糖尿病病症(例如,糖尿病性视网膜病)、炎性病症(例如,类风湿性关节炎)、黄斑变性、肥胖症、动脉粥样硬化或增殖性障碍的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物。
在某些实施方式中,与血管生成相关的病症是糖尿病病症或相关并发症。在某些实施方式中,提供了治疗糖尿病病症或相关并发症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物。
如本文中使用的,“糖尿病病症”是指糖尿病和前驱糖尿病。糖尿病是指其中个人由于身体不能产生足够的胰岛素或由于细胞不能对产生的胰岛素作出反应而具有高血糖的一组代谢疾病。这种高血糖产生多尿(尿频)、烦渴(口渴增加)和多食(饥饿增加)的经典症状。具有几种类型的糖尿病。I型糖尿病由于身体不能产生胰岛素而导致,且目前需要个人注射胰岛素或装胰岛素泵。2型糖尿病由于胰岛素抵抗(其中细胞不能正确地利用胰岛素的状况)而导致,有时合并有绝对胰岛素缺乏。妊娠糖尿病在之前未诊断有糖尿病的孕妇产生高血糖水平时发生。其它形式的糖尿病包括先天性糖尿病(其由于胰岛素分泌的遗传性缺陷而产生)、囊性纤维化相关糖尿病、由高剂量糖皮质激素诱导的类固醇糖尿病和几种形式的单基因糖尿病(monogenic diabetes),例如,年轻人的成年型糖尿病(例如,MODY 1、2、3、4、5、6、7、8、9或10)。前驱糖尿病表示在个人的血糖水平高于正常但未高到足以诊断糖尿病时发生的状况。
所有形式的糖尿病提高长期并发症(本文中称为糖尿病病症的“相关并发症”)的风险。它们通常在许多年后发生,但可能是在该时间之前未另外地接受诊断的人群中的早期症状。主要的长期并发症与血管的损害相关。糖尿病使心血管疾病和大血管病变如缺血性心力衰竭(心绞痛、心肌梗死)、中风和周围性血管疾病的风险加倍。糖尿病也引起微血管并发症,例如,对小血管的损害。糖尿病性视网膜病(其影响眼视网膜中的血管形成)可导致视觉症状、视弱和潜在的眼盲。糖尿病性肾病(糖尿病对肾的影响)可导致肾组织中的瘢痕形成变化、尿中少量或逐渐较大量蛋白质的损失及最终需要透析的慢性肾疾病。糖尿病性肾病是糖尿病对神经系统的影响,最通常引起足的麻木、刺痛和疼痛且也提高由于改变的感觉导致的皮肤损害的风险。与腿中的血管疾病一起,肾病造成糖尿病相关足问题的风险,例如,糖尿病足溃疡,其可能难以治疗且有时需要截肢。
如本领域技术人员理解的,在治疗糖尿病病症或并发症中,施用的化合物的有效量可以例如减少、防止或延迟以下症状中任一种的发作:降低禁食血糖水平[典型的糖尿病水平为≥7.0mmol/l(126mg/dl);典型的前驱糖尿病范围为6.1-6.9mmol/l];降低血浆葡萄糖[如在葡萄糖耐量测试中75g口服葡萄糖负荷后两小时典型的糖尿病水平为≥11.1mmol/l(200mg/dL)];减轻高血糖和临时血浆葡萄糖的症状[典型的糖尿病水平为≥11.1mmol/l(200mg/dl)];降低糖化血红蛋白(Hb A1C)水平[典型的糖尿病水平为≥6.5%]。禁食血糖水平110-125mg/dl(6.1-6.9mmol/l)的受试者被认为具有受损的禁食血糖。血糖为140mg/dL(7.8mmol/L)或更高但不超过200mg/dL(11.1mmol/L)的受试者在75g口服葡萄糖负荷后两小时被认为具有受损的葡萄糖耐受。
在某些实施方式中,相关并发症是糖尿病性视网膜病。例如,在某些实施方式中,提供了治疗糖尿病性视网膜病的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物。
在某些实施方式中,与血管生成相关的病症是黄斑变性。在某些实施方式中,提供了治疗黄斑变性的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物。
在某些实施方式中,与血管生成相关的病症是肥胖症。如本文中使用的,“肥胖症”和“肥胖”是指如世界卫生组织定义的I类肥胖症、II类肥胖症、III类肥胖症和前肥胖症(pre-obesity)(例如,“超重”)。在某些实施方式中,提供了治疗肥胖症的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物。证据表明脂肪组织扩增依赖于血管的发生。因此,抑制血管生成可以是用于限制脂肪组织的扩增以预防和治疗肥胖症的治疗策略。参见,例如,Christiaens和Lijnen,Molecularand Cellular Endocrinology(2010)318:2-9。
在某些实施方式中,与血管生成相关的病症是动脉粥样硬化。在某些实施方式中,提供了治疗动脉粥样硬化的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物。证据表明在动脉粥样硬化病变中发生新的血管生成,造成动脉粥样硬化病变的增长和破裂。因此,抑制血管生成可以是用于限制动脉粥样硬化斑块的扩增、增长和最终破裂以预防和治疗动脉粥样硬化的治疗策略。参见,例如,Ho-Tin-Noé等,Trends Cariovasc.Med.(2011)21:183-187。
在某些实施方式中,与血管生成相关的病症是增殖性障碍。在某些实施方式中,提供了治疗增殖性障碍的方法,包括向需要的受试者施用式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺或N-氧化物。
示例性的增殖性障碍包括,但不限于肿瘤(例如,实体肿瘤)、良性肿瘤、前恶性肿瘤(原位癌)和恶性肿瘤(癌症)。
示例性的癌症包括,但不限于听神经瘤、腺癌、胰腺癌、肛门癌、血管肉瘤(例如,淋巴管肉瘤、淋巴管内皮肉瘤、血管肉瘤)、阑尾癌、良性单克隆丙种球蛋白病、胆管癌(例如,肝外胆管癌)、膀胱癌、乳腺癌(例如,乳腺腺癌、乳腺乳头状癌、乳房癌、乳腺髓样癌)、脑癌(例如,脑膜瘤;神经胶质瘤,例如,星形细胞瘤、少突神经胶质瘤;成神经管细胞瘤)、支气管癌、类癌瘤、宫颈癌(例如,宫颈腺癌)、绒毛膜癌、脊索瘤、颅咽管瘤、结肠直肠癌(例如,结肠癌、直肠癌、结肠直肠腺癌)、上皮癌、室管膜瘤、内皮肉瘤(例如,Kaposi’s肉瘤、多发性特发性出血性肉瘤)、子宫内膜癌(例如,子宫癌、子宫肉瘤)、食管癌(例如,食管腺癌、Barrett’s腺癌)、Ewing’s肉瘤、眼癌(例如,眼内黑素瘤、成视网膜细胞瘤)、家族性嗜酸粒细胞增多症、胆囊癌、胃癌(例如,胃腺癌)、胃肠道间质瘤(GIST)、头颈癌(例如,头颈鳞状细胞癌、口腔癌(例如,口腔鳞状细胞癌(OSCC)、咽喉癌(例如,喉癌、咽癌、鼻咽癌、口咽癌))、造血系统癌症(例如,白血病如急性淋巴细胞性白血病(ALL)-也称为急性淋巴母细胞性白血病或急性淋巴性白血病(例如,B-细胞ALL、T-细胞ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)(例如,B-细胞AML、T-细胞AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)(例如,B-细胞CML、T-细胞CML)和慢性淋巴细胞性白血病(CLL)(例如,B-细胞CLL、T-细胞CLL);淋巴瘤如霍奇金淋巴瘤(HL)(例如,B-细胞HL、T-细胞HL)和非霍奇金淋巴瘤(NHL)(例如,B-细胞NHL如弥散性大细胞淋巴瘤(DLCL)(例如,弥散性大B-细胞淋巴瘤(DLBCL))、滤泡性淋巴瘤、慢性淋巴细胞性白血病/小淋巴细胞性淋巴瘤(CLL/SLL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、边缘区B-细胞淋巴瘤(例如,粘膜相关淋巴组织(MALT)淋巴瘤、淋巴结边缘区B-细胞淋巴瘤、脾边缘区B-细胞淋巴瘤)、原发性纵隔B-细胞淋巴瘤、Burkitt淋巴瘤、淋巴浆细胞性淋巴瘤(即,“巨球蛋白血症”)、毛细胞白血病(HCL)、免疫母细胞性大细胞淋巴瘤、前体B淋巴母细胞性淋巴瘤和原发中枢神经系统(CNS)淋巴瘤;及T-细胞NHL如前体T-淋巴母细胞性淋巴瘤/白血病、外周T-细胞淋巴瘤(PTCL)(例如,皮肤T-细胞淋巴瘤(CTCL)(例如,蕈样肉芽肿、塞扎里综合征)、血管免疫母细胞性T-细胞淋巴瘤、结外天然杀伤T-细胞淋巴瘤、肠病型T-细胞淋巴瘤、皮下脂膜炎样T-细胞淋巴瘤、间变性大细胞淋巴瘤);如上所述的一种或多种白血病/淋巴瘤的混合;及多发性骨髓瘤(MM))、重链病(例如,α链病、γ链病、μ链病)、血管母细胞瘤、炎性肌纤维母细胞瘤、免疫细胞性淀粉样变性、肾癌(例如,肾母细胞瘤,也即Wilms’瘤、肾细胞癌)、肝癌(例如,肝细胞癌(HCC)、恶性肝细胞瘤)、肺癌(例如,支气管癌、小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞肺癌(NSCLC)、肺的腺癌)、平滑肌肉瘤(LMS)、肥大细胞增多症(例如,系统性肥大细胞增多症)、骨髓增生异常综合征(MDS)、间皮瘤、骨髓增生性障碍(MPD)(例如,真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET)、特发性骨髓外化生(AMM),也称为骨髓纤维变性(MF)、慢性特发性骨髓纤维化、慢性髓细胞性白血病(CML)、慢性中性粒细胞性白血病(CNL)、嗜酸细胞增多综合征(HES))、成神经细胞瘤、神经纤维瘤(例如,1型或2型神经纤维瘤病(NF)、神经鞘瘤病)、神经内分泌癌(例如,胃肠胰腺神经内分泌瘤(GEP-NET)、类癌瘤)、骨肉瘤、卵巢癌(例如,囊腺癌、卵巢胚胎性癌、卵巢腺癌)、乳头状腺癌、胰腺癌(例如,胰腺腺癌、导管内乳头状粘液性肿瘤(IPMN)、胰岛细胞瘤)、阴茎癌(例如,阴茎和阴囊的佩吉特病)、松果体瘤、原发性神经外胚层瘤(PNT)、前列腺癌(例如,前列腺腺癌)、直肠癌、横纹肌肉瘤、唾液腺癌、皮肤癌(例如,鳞状细胞癌(SCC)、角化棘皮瘤(KA)、黑素瘤、基底细胞癌(BCC))、小肠癌(例如,阑尾癌)、软组织肉瘤(例如,恶性纤维组织细胞瘤(MFH)、脂肪肉瘤、恶性外周神经鞘瘤(MPNST)、软骨肉瘤、纤维肉瘤、粘液肉瘤)、皮脂腺癌、汗腺癌、滑膜瘤、睾丸癌(例如,精原细胞瘤、睾丸胚胎性癌)、甲状腺癌(例如,甲状腺乳头状癌、乳头状甲状腺癌(PTC)、甲状腺髓样癌)、尿道癌、阴道癌和外阴癌(例如,外阴的佩吉特病)。
在某些实施方式中,癌症与CDK8和/或CDK19激酶活性相关。
在某些实施方式中,癌症是造血系统癌症。在某些实施方式中,造血系统癌症是淋巴瘤。在某些实施方式中,造血系统癌症是白血病。在某些实施方式中,白血病是急性髓细胞性白血病(AML)。如图4、5、6和8中所示,皮质抑素A或皮质抑素A类似物在体外抑制AML细胞系的增殖,且如图12中所示,皮质抑素A在体内抑制AML发展。
在某些实施方式中,增殖性障碍是骨髓增殖性肿瘤。在某些实施方式中,骨髓增殖性肿瘤(MPN)是原发性骨髓纤维化(PMF)。如图8中所示,皮质抑素A抑制源自MPN患者的细胞系的增殖,且如图14中所示,皮质抑素A在PMF的体内模型中是有效的。
在某些实施方式中,癌症是实体肿瘤。如本文中使用的实体肿瘤是指通常不包含囊肿或液体区域的异常组织团块。不同类型的实体肿瘤以形成它们细胞类型命名。实体肿瘤类别的实例包括,但不限于肉瘤、癌瘤和淋巴瘤,如本文中以上所述。实体肿瘤的另外的实例包括,但不限于鳞状细胞癌、结肠癌、乳腺癌、前列腺癌、肺癌、肝癌、胰腺癌和黑素瘤。
式(A)、(B)、(C)、(D)或(E)的化合物及其药学上可接受的盐、季胺和N-氧化物可以配制成便于施用和剂量均一性的单位剂量形式。但是应理解,包含如本文所述的化合物的组合物的总日使用量由负责医生在合理的医学判断范围内决定。对于任何特定受试者或生物体的特定治疗有效剂量水平取决于多种因素,包括待治疗的疾病、障碍或病症及疾病的严重程度;采用的特定化合物的活性;采用的特定组合物;受试者的年龄、体重、总体健康、性别和饮食;施用时间、施用途径和采用的特定化合物的排泄率;治疗持续时间;与采用的特定化合物组合或同时使用的药物;及医药领域中公知的类似因素。
本文提供的化合物和组合物可以通过任何途径施用,包括肠(例如,口服)、肠胃外、静脉内、肌肉内、动脉内、髓内、鞘内、皮下、心室内、经皮、皮内、直肠、阴道内、腹膜内、局部(如通过粉末、软膏、乳膏和/或滴剂)、粘膜、经鼻、口腔、舌下;通过气管内滴注、支气管灌注和/或吸入;和/或作为口腔喷雾、鼻喷雾和/或气雾剂。特别设想的途径是口服施用、静脉内施用(例如,系统性静脉内注射)、经血液和/或淋巴供应的区域施用和/或直接施用于患病部位。一般地,最适宜的施用途径取决于多种因素,包括药剂的性质(例如,其在胃肠道环境中的稳定性)、受试者的状况(例如,受试者是否能够耐受口服施用)。
获得有效量所需的化合物的精确量随受试者而变化,这取决于例如受试者的种类、年龄和一般状况,副作用或障碍的严重性,特定化合物的性质,施用模式等等。所需的剂量可以一天三次、一天两次、一天一次、每两天、每三天、每周、每两周、每三周或每四周递送。在某些实施方式中,所需的剂量可以使用多次施用递送(例如,两次、三次、四次、五次、六次、七次、八次、九次、十次、十一次、十二次、十三次、十四次或更多次施用)。
在某些实施方式中,用于一天一次或多次施用于70kg成人的化合物的有效量可以包含每单位剂型约0.0001mg-约3000mg、约0.0001mg-约2000mg、约0.0001mg-约1000mg、约0.001mg-约1000mg、约0.01mg-约1000mg、约0.1mg-约1000mg、约1mg-约1000mg、约1mg-约100mg、约0.1mg-约10mg或约0.1mg-约15mg的化合物。
在某些实施方式中,化合物可以一天一次或多次以足以递送每天约0.001mg/kg-约100mg/kg,约0.01mg/kg-约50mg/kg,优选约0.1mg/kg-约40mg/kg,优选约0.5mg/kg-约30mg/kg,约0.01mg/kg-约10mg/kg,约0.1mg/kg-约10mg/kg,且更优选约0.01mg/kg-约1mg/kg受试者体重/天的剂量水平口服或肠胃外施用于成人以获得所需的治疗效果。
应理解,如本文所述的剂量范围提供向成人施用所提供的药物组合物的指导。待施用于例如儿童或青少年的量可以由执业医师或本领域技术人员确定,且可以比施用于成人的量低或相同。
还应理解,如本文所述的化合物或组合物可以与一种或多种另外的治疗活性剂组合施用。化合物或组合物可以与提高其生物利用度、降低和/或改变其代谢、抑制其排泄和/或改变其体内分布的另外的治疗活性剂组合施用。还应理解,采用的疗法可以对于相同疾病实现所需的效果(例如,化合物可以与抗炎剂、抗癌剂等组合施用)和/或它可以实现不同的效果(例如,副作用的控制,例如,通过止吐药控制的呕吐)。
化合物或组合物可以与一种或多种另外的治疗活性剂同时、在其之前或之后施用。一般地,各药剂按照对于该药剂确定的剂量和/或时间表施用。应进一步理解,在这种组合中使用的另外的治疗活性剂可以在单一组合物中一起施用或在不同组合物中单独地施用。方案中采用的特定组合考虑本发明的化合物与另外的治疗活性剂的相容性和/或待实现的希望的疗效。一般地,预期的是组合中使用的另外的治疗活性剂以不超过它们单独使用时的水平的水平使用。在一些实施方式中,组合中使用的水平低于其单独使用的水平。
示例性的另外的治疗活性剂包括,但不限于小的有机分子如药物化合物(例如,如Code of Federal Regulations(CFR)中提供的由食品和药物管理局批准的化合物)、肽、蛋白质、碳水化合物、单糖、寡糖、多糖、核蛋白、粘蛋白、脂蛋白、合成多肽或蛋白质、与蛋白质连接的小分子、糖蛋白、类固醇、核酸、DNA、RNA、核苷酸、核苷、寡核苷酸、反义寡核苷酸、脂质、激素、维生素和细胞。在某些实施方式中,另外的治疗活性剂是抗癌剂,例如,放疗和/或一种或多种化疗剂。
制备方法
再进一步提供了制备式(A)、(B)、(C)、(D)和(E)的化合物的方法。本文设想的化合物的示例性的合成提供在方案2-14中。
合成最初设想使用式(I)的化合物作为原料。雌酮(其中R3是-CH3)或去甲雌酮(其中R3是H)(I)的氧化(例如,DDQ、MnO2)提供式(III)的化合物。参见,例如,Stephan等,Steroid,1995,60,809-811。式(III)的化合物作为缩醛或缩酮被保护(例如,经由与HXARA或HXARA-RAXAH的反应,其中两个RA基团接合,其中RB1和RB2各自独立地是-XARA)以得到(IV)-A和(IV)-B的混合物(例如,1:1混合物)。设想用于保护的示例性的条件包括PTSA和乙二醇,PTSA和CH(OMe)3,PTSA和CH(OEt)3,PTSA和2,2-二甲基-1,3-丙二醇)。保护的化合物然后使用烷基化剂(例如,Me2SO4和K2CO3,EtN(i-Pr)2和TMS-重氮甲烷)烷基化(例如,甲基化)以提供(V)-A和(V)-B,其中E是任选取代的烷基。参见方案2。
方案2.
方案3提供其它示例性的途径以提供式(IV-B)的化合物,例如其中R3是-CH3。例如,式(V)-B的化合物如方案3(A)中所述在四个步骤中作为外消旋混合物从6-甲氧基-1-四氢萘酮获得。对于Grignard反应,参见,例如,Saraber等,Tetrahedron,2006,62,1726-1742。对于氢化,参见,例如,Sugahara等,Tetrahedron Lett,1996,37,7403-7406。方案3(B)显示通过手性拆分获得对映纯的Torgov’s中间体的方法。参见,例如,Bucourt等,J.Bull.Soc.Chim.Fr.(1967)561-563。方案3(C)提供了通过酶促还原帮助制备对映纯的Torgov’s中间体的另一方法。参见,例如,Gibian等,Tetrahedron Lett.(1966)7:2321-2330。
方案3.
(A)
(B)
(C)
已经具有式(IV-A)和(IV-B)的化合物,在一锅法中进行环氧化/环氧开环/环氧化反应(例如,MMPP,mCPBA)以提供式(IX-A)和(IX-B)的化合物,其在平衡下以(IX-A)作为主要化合物。参见方案4A和4B。
方案4.
(A)
(B)
式(IX-A)和(IX-B)的化合物暴露于Birch还原条件(例如,Li/NH3和t-BuOH,Na/NH3和t-BuOH)以提供脱芳烃化合物(X)。A-环的C3然后作为缩醛或缩酮被保护(例如,经由与HXARA或HXARA-RAXAH的反应,其中两个RA基团接合,且其中RB1和RB2各自独立地为-XARA)以提供化合物(XI)。示例性的保护条件包括PTSA和乙二醇,PTSA和CH(OMe)3,PTSA和CH(OEt)3及PTSA和2,2-二甲基-1,3-丙二醇。参见方案5。
方案5.
化合物(XI)通过醚化(例如,NBS、NIS,例如,其中X是Br或I)转化为式(XIII)的化合物。该化合物然后氧化(例如,SO3·Py/DMSO和三乙胺、IBX、(COCl)2/DMSO和三乙胺)以提供式(XIV)的化合物。该化合物然后用碱(例如,DBU、三乙胺)处理以提供式(XV)的化合物。该化合物然后还原(例如,NaBH4和CeCl3,三仲丁基硼氢化锂(L-selectride))以提供式(XVI)的化合物。参见方案6。
方案6.
式(XVI)的化合物然后用环丙烷化试剂(例如,ZnEt2和ClCH2I,ZnEt2和CH2I2,Zn-Cu和CH2I2)处理以提供式(XVII)的化合物。环丙烷化产物的醇被激活,其中LG1是磺酰基(例如,醇用Tf2O,MsCl处理以提供活化的醇,其中LG1是Tf或Ms)并用碱(例如,2,6-二叔丁基-4-甲基吡啶、2,6-二甲基吡啶、三乙胺)处理以提供式(XX)的化合物。参见,例如,Magnus等,Org.Lett.2009,11,3938-3941。参见方案7。
方案7.
式(XX)的化合物的D-环上的保护基然后在酸性条件(例如,PTSA和丙酮/水,TFA/水)下脱保护以提供式(XXI)的酮中间体。这一产物用式RB1-M的化合物(例如,RB1-CeCl2,RB1-Mg)(其从RB1-X(例如,RB1-Br,RB1-I)制备)处理以提供式(XXII)的化合物,其中RB1是如本文定义的非氢基团。式(XXII)的化合物被活化(例如,TFAA和吡啶,PhNCS和KH)以提供式(XXIII)的化合物。式(XXIII)的化合物的还原(例如,AIBN和Bu3SnH)提供式(XXIV)的化合物。对于步骤S14、S15和S16,参见,例如,Flyer等,Nature.Chem.2010,2,886-892.和Yamashita等,J.Org.Chem.2011,76,2408-2425。参见方案8A。
化合物(XXIV)也可以通过转化为活化的醇(其中LG2是磺酰基)(例如,醇用Tf2O,MsCl处理以提供活化的醇,其中LG2是Tf或Ms;通过三氟甲磺酰化,例如,KHMDS和PhNTf2,LiHMDS和PhNTf2,Tf2O和2,6-二叔丁基-4-甲基吡啶)接着钯催化的与RB1-M(其中M是取代的硼(例如,如-B(R′)2,其中各R′是-OR″或烷基,其中烷基和R″是烷基或可以连接以形成环))的交叉偶联以提供式(XXVI)的化合物而从(XX)制备。示例性的钯催化的交叉偶联条件包括,但不限于RB1-B(pin)、RB1-(9-BBN-H)、RB1-OBBD或RB1-B(cat)及Pd(PPh3)4和Na2CO3,或Pd(dppf)Cl2和K3PO4)(pin=频哪醇;cat=儿茶酚;OBBD=9-氧杂-10-硼杂双环[3.3.2]癸烷;9-BBN-H=9-硼杂双环[3.3.1]壬烷)。参见,例如,Nicolaou等,J.Am.Chem.Soc.2009,131,10587-10597。C16-C17双键的氢化(例如,Pd/C和H2,雷尼Ni和H2)产生式(XXIV)的化合物。参见方案8B。
方案8.
(A)
(B)
式(XXVI)或(XXIV)的任何一种化合物然后可以脱保护(例如,PTSA和丙酮/水,TFA/水,HCl)且所得的α碳可以用亲电子试剂(例如,R5-LG,其中LG是离去基团,例如,-OSO2Raa)烷基化以提供相应的烷基化产物,其中R5是非氢基团。参见方案9A和9B。
方案9.
(A)
(B)
如方案9(A)和9(B)中提供的酮化合物然后可以用式H2NR1的胺处理以形成缩合产物亚胺,如步骤S22中所示。酮化合物也可以用式HNR1R2的胺或其盐在还原胺化条件下处理以提供胺化产物,如步骤S23中所示。示例性的还原胺化条件包括,但不限于在酸性pH(例如,pH 3)下的NaCNBH3、NaCN(9BBN)H或NaBH(OAc)3。胺化产物可以进一步氧化为相应的N-氧化物,如步骤S25中所示。示例性的氧化条件包括,但不限于H2O2、mCPBA或DMDO。参见方案10A-10D。
方案10.
(A)
(B)
(C)
(D)
式(XXV)的化合物可以通过用CO和HN(RL)RB3的钯催化的羰化胺化(例如,Pd(PPh3)4和三乙胺,Pd(dppf)Cl2和三乙胺)转化为式(XXV-i)的化合物。用于以下步骤以得到式(XXV-i)、(XXV-iii)、(XXV-iv)和(XXV-v)的化合物的条件与之前描述的相同。参见方案11。
方案11.
如方案11中提供的酮化合物然后可以如之前所述的转化为相应的亚胺、胺和N-氧化物。参见方案12A和12B。
方案12.
(A)
(B)
单酮化合物(XXI)可以用HNRB4RB5(例如,1,2,3,4-四氢-[2,7]萘啶)在之前描述的条件下还原性地胺化以提供式(XXVII)的化合物。化合物(XXVII)可以如之前所述的转化为相应的亚胺、胺和N-氧化物。参见方案13。
方案13.
酮可以进一步合成地操作以提供其它的目标化合物。以式(XXIV-i)的酮为例,酮可以在还原剂存在下还原(如步骤S26中所示)以提供C-3羟基化的化合物。参见方案14。示例性的还原剂包括三仲丁基硼氢化锂、三仲丁基硼氢化钾(K-selectride)、二异丁基氢化铝(DIBALH)和氢化铝锂(LAH)。此外,各种还原剂优先生成一种C-3羟基化化合物作为超过其它异构体的主要异构体,例如,使用三仲丁基硼氢化锂,β异构体优先作为主要异构体产生,而使用氢化铝锂(LAH),α异构体优先作为主要异构体产生。
如本文中使用的,“主要异构体”是指相对于其它异构体过量产生的异构体,即大于该反应产生的两种异构体总量的50%,例如,大于反应产生的两种异构体总量的60%、70%、80%、90%或95%。
式(D)的C-3羟基化化合物然后可以活化为式(E)的化合物(例如,通过在开始反应之前与基团LG-C(=O)RA(其中LG是离去基团)的反应,或者通过在Mitsunobu反应条件下(例如,用HOC(=O)RA,二乙基偶氮羧酸酯(DEAD)或二异丙基偶氮羧酸酯(DIAD)和PPh3)用式-C(=O)RA的基团的取代原位(在反应过程中)地进行)和然后用式NHR1R2的胺处理以提供式(A)的化合物,其中以反转的C3立体化学为主要异构体(如步骤S28中所示)。或者,式(D)的C-3羟基化的化合物可以用碱和式RO-LG(其中LG是离去基团)的化合物处理以提供保护的C3-羟基化合物,其中C3-立体化学保持作为主要异构体(如步骤S27中所示)。
方案14.
因此,在一个方面,提供了制备式(A)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物的方法:
该方法包括使式(B)的化合物:
或其药学上可接受的盐与式HNR1R2的胺或其盐在还原胺化条件下接触,条件是RB1和RB2不接合以形成氧代基团。在某些实施方式中,该方法包括制备一种C3异构体作为超过其它异构体的主要异构体。例如,在某些实施方式中,该方法包括制备式(A-1)的化合物作为主要异构体。在其它实施方式中,该方法包括制备式(A-2)的化合物作为主要异构体。
在某些实施方式中,该方法进一步包括氧化式(A)的化合物以提供式(A-NO)的N-氧化物:
或其药学上可接受的盐。
在其它实施方式中,提供了制备式(D)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物的方法:
该方法包括使式(B)的化合物或其药学上可接受的盐:
与还原剂接触。在某些实施方式中,该方法包括制备一种C3异构体超过其它异构体的主要异构体。例如,在某些实施方式中,该方法包括制备式(D-1)的化合物作为主要异构体。在其它实施方式中,该方法包括制备式(D-2)的化合物作为主要异构体。
在另一个方面,提供了制备式(E)的化合物或其药学上可接受的盐的方法:
该方法包括使式(D)的化合物或其药学上可接受的盐:
与式RO-LG的化合物(其中LG是离去基团)接触以提供式(E)的化合物。
在另一个方面,提供了制备式(A)的化合物或其药学上可接受的盐、季胺盐或N-氧化物的方法:
该方法包括提供式(E)的化合物或其药学上可接受的盐:
其中RO是-C(=O)RA;并用式NHR1R2的化合物处理式(E)的化合物以提供式(A)的化合物。在某些实施方式中,式(E)的化合物(其中RO是-C(=O)RA)从用式RO-LG的化合物活化式(D)的化合物而原位产生。在某些实施方式中,式(E)的化合物是式(E-1)的化合物,且该方法产生式(A-2)的化合物作为主要异构体。在某些实施方式中,式(E)的化合物是式(E-2)的化合物,且该方法产生式(A-1)的化合物作为主要异构体。
突变体和分析方法
如本文中一般地描述的,进一步提供了新的CDK8和CDK19点突变体及其使用方法。
具有Trp105处的点突变(如Trp105Met)的CDK8和CDK19可以保持细胞和体外活性,但对于皮质抑素或皮质抑素类似物的抑制不敏感。如图10中所示,FLAG-CDK8 W105M和FLAG-CDK19 W105M表达降低MOLM-14细胞对于皮质抑素A的生长抑制的敏感性且FLAG-CDK8W105M在皮质抑素A存在下保持激酶活性。CDK8和/或CDK19 Trp105点突变体可以与皮质抑素或皮质抑素类似物一起使用以验证不同背景中的CDK8和CDK19激酶活性,包括对于不同疾病的药物靶标。另外,CDK8和/或CDK19 Trp105点突变体可以与皮质抑素或皮质抑素类似物一起使用以阐明CDK8和/或CDK19激酶底物和信号传导途径。这些点突变体可以通过过表达或敲入在细胞中表达且可以组成性或诱导性地表达。这些点突变体也可以用于筛选程序中以发现选择性地靶向CDK8和/或CDK19的新化学结构。
CDK8的野生型氨基酸序列在下面及SEQ ID NO:1中提供。Trp105加下划线。本文中可用的CDK8 Trp105点突变体包含位置105处的氨基酸置换。
MDYDFKVKLSSERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKAKRKDGKDDKDYALKQIEGTGISMSACREIALLRELKHPNVISLQKVFLSHADRKVWLLFDYAEHDLWHIIKFHRASKANKKPVQLPRGMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPYHHDQLDRIFNVMGFPADKDWEDIKKMPEHSTLMKDFRRNTYTNCSLIKYMEKHKVKPDSKAFHLLQKLLTMDPIKRITSEQAMQDPYFLEDPLPTSDVFAGCQIPYPKREFLTEEEPDDKGDKKNQQQQQGNNHTNGTGHPGNQDSSHTQGPPLKKVRVVPPTTTSGGLIMTSDYQRSNPHAAYPNPGPSTSQPQSSMGYSATSQQPPQYSHQTHRY
CDK19的野生型氨基酸序列在下面及SEQ ID NO:2中提供。Trp105加下划线。本文中可用的CDK19 Trp105点突变体包含位置105处的氨基酸置换。
MDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRKDGKDEKEYALKQIEGTGISMSACREIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSDRKVWLLFDYAEHDLWHIIKFHRASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWEDIRKMPEYPTLQKDFRRTTYANSSLIKYMEKHKVKPDSKVFLLLQKLLTMDPTKRITSEQALQDPYFQEDPLPTLDVFAGCQIPYPKREFLNEDDPEEKGDKNQQQQQNQHQQPTAPPQQAAAPPQAPPPQQNSTQTNGTAGGAGAGVGGTGAGLQHSQDSSLNQVPPNKKPRLGPSGANSGGPVMPSDYQHSSSRLNYQSSVQGSSQSQSTLGYSSSSQQSSQYHPSHQAHRY
因此,在一个方面,提供了验证细胞中CDK8和/或CDK19激酶活性的方法,其是通过使CDK8或CDK19 Trp105点突变体与如本文所述的皮质抑素或皮质抑素类似物接触而进行。在另一个方面,提供了验证细胞中的CDK8和/或CDK19激酶活性的方法,其是通过在细胞中表达CDK8或CDK19 Trp105点突变体以使细胞对如本文所述的皮质抑素或皮质抑素类似物脱敏而进行。
在另一个方面,提供了CDK8 Trp105点突变体。在某些实施方式中,CDK8 Trp105点突变体的氨基酸序列与SEQ ID NO:1的氨基酸序列具有至少约80%,例如,至少约85%、至少约90%、至少约95%或至少约97%的同一性水平。进一步提供了与SEQ ID NO:1的氨基酸序列具有至少约80%,例如,至少约85%、至少约90%、至少约95%或至少约97%的同一性水平的蛋白质。
在又一方面,提供了CDK19 Trp105点突变体。在某些实施方式中,CDK19 Trp105点突变体的氨基酸序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列具有至少约80%,例如,至少约85%、至少约90%、至少约95%或至少约97%的同一性水平。进一步提供了与SEQ ID NO:2的氨基酸序列具有至少约80%,例如,至少约85%、至少约90%、至少约95%或至少约97%的同一性水平的蛋白质。
在又一方面,提供了CDK19 Trp105点突变体。在某些实施方式中,CDK19 Trp105点突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO.2中所示。进一步提供了与SEQ ID NO.2为80%同源的蛋白质。
在一个实施方式中,可用于本文的方法中的CDK8 Trp105点突变体具有位于SEQID NO:1的CDK8多肽的位置105处的甲硫氨酸置换。在一个实施方式中,可用于本文的方法中的CDK19 Trp105点突变体具有位于SEQ ID NO:2的CDK19多肽的位置105处的甲硫氨酸置换。在前述任一实施方式中,另一氨基酸可以替代Trp105而置换,如其它天然或非天然氨基酸。天然氨基酸的非限制性实例包括异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸、丙氨酸、赖氨酸、精氨酸、苏氨酸、谷氨酸、甲硫氨酸和半胱氨酸。非天然氨基酸的非限制性实例包括乙硫氨酸或正亮氨酸。
在一个实施方式中,可用于本发明的CDK8 Trp105点突变体的氨基酸序列与SEQID NO:1的氨基酸序列具有至少约80%、至少约85%、至少约90%、至少约95%或至少约97%的同源性水平。在一个实施方式中,SEQ ID NO:1的CDK8 Trp105点突变体包含另外的一个或多个氨基酸的一个或多个置换、缺失和/或插入。在另一个实施方式中,CDK8 Trp105点突变体是SEQ ID NO:1的等位基因变体。等位基因变体代表占据相同染色体位点的基因的两种或更多种可选形式中的任一种。等位基因变异通过突变天然地发生,且可以导致群体内的多态性。基因突变可以是沉默的(编码的多肽中没有变化)或可以编码具有改变的氨基酸序列的多肽。多肽的等位基因变体是由基因的等位基因变体编码的多肽。
在一个实施方式中,CDK8 Trp105点突变体是SEQ ID NO:1或其等位基因变体的片段,其具有CDK8活性。SEQ ID NO:1的片段是从SEQ ID NO:1或其等位基因变体的氨基和/或羧基末端删除一个或多个氨基酸的CDK8 Trp105点突变体。
可用于本发明的CDK8 Trp105点突变体具有SEQ ID NO:1的CDK8多肽的至少约20%、至少约40%、至少约60%、至少约80%、至少约90%或至少约95%的CDK8激酶活性。
在一个实施方式中,可用于本发明的CDK19 Trp105点突变体的氨基酸序列与SEQID NO:2的氨基酸序列具有至少约80%、至少约85%、至少约90%、至少约95%或至少约97%的同源性水平。在一个实施方式中,SEQ ID NO:2的CDK19 Trp105点突变体包含另外的一个或多个氨基酸的一个或多个置换、缺失和/或插入。在另一个实施方式中,CDK19Trp105点突变体是SEQ ID NO:2的等位基因变体。
在一个实施方式中,CDK19 Trp105点突变体是SEQ ID NO:2或其等位基因变体的片段,其具有CDK19活性。SEQ ID NO:2的片段是从SEQ ID NO:2或其等位基因变体的氨基和/或羧基末端删除一个或多个氨基酸的CDK19 Trp105点突变体。
可用于本发明的CDK19 Trp105点突变体具有至少SEQ ID NO:2的CDK19多肽的至少约20%、至少约40%、至少约60%、至少约80%、至少约90%或至少约95%的CDK19激酶活性。
在一个实施方式中,可用于本发明的CDK8或CDK19 Trp105点突变体包含标签如肽标签(例如,标签、GST标签、人流感病毒血凝素(HA)标签、几丁质结合蛋白(CBP)标签、麦芽糖结合蛋白(MBP)标签、谷胱甘肽-S-转移酶(GST)标签、聚(His)标签、V5-标签、Myc-标签)或荧光标签(例如,eGFP标签、mCherry标签)。
还设想预测或测定受试者对皮质抑素或皮质抑素类似物的反应的方法。例如,提供了分析来自受试者的样品以确定受试者是否具有位于CDK8和/或CDK19的Trp105处的点突变的方法。在一个实施方式中,点突变是Trp105Met。一个或多个Trp105突变的存在一般指示受试者对皮质抑素或皮质抑素类似物的反应降低或无效。在一个实施方式中,如果受试者具有位于CDK8和/或CDK19的Trp105处的点突变,除皮质抑素或皮质抑素类似物之外的不同药物施用于受试者。
实施例
为了本文描述的本发明可以更完全地理解,给出了以下实施例。应理解,这些实施例仅用于说明的目的而不理解为以任何方式限制本发明。
合成方法
材料和仪器
除非另有说明,所有反应在正的氩气压下在火焰干燥的玻璃器皿中进行。快速柱色谱采用硅胶60(40-63μm,Whatman)如Still等,J.Org.Chem.1978,43,2923-2925所述进行。
商业试剂和溶剂原样使用,以下除外:四氢呋喃(THF)、二氯甲烷(CH2Cl2)用氩脱气并如Pangborn等,Organometallics 1996,15,1518-1520所述经过使用氧化铝柱的溶剂纯化系统(由Glass Contour的J.C.Meyer设计)。吡啶和三乙胺在使用前经氢化钙蒸馏。使用的硅藻土是购自J.T.Baker的545。正丁基锂溶液的摩尔浓度使用1,10-邻二氮杂菲作为指示剂通过滴定来测定(三次滴定的平均)。
1H NMR谱用Varian INOVA-600或Varian INOVA-500谱仪记录。质子化学位移以百万分(δ标度)报告并使用残留的未氘化溶剂作为内部参比进行校准(CDCl3:δ7.26(CHCl3),C6D6:δ7.15(C6D5H))。1H NMR谱的数据如下报告:化学位移(δppm)(多重性,偶合常数(Hz),积分)。多重性报告如下:s=单峰,d=二重峰,t=三重峰,q=四重峰,m=多重峰,br=宽峰,app=表观或其组合。13C NMR谱用Varian INOVA-500谱仪记录。高分辨率质谱(HRMS)从Harvard University Mass Spectrometry Laboratory获得,其中在Agilent 6210 TOFLC/MS仪器上进行电喷雾电离(ESI)质谱(MS)实验。
实施例1.含异喹啉化合物的合成
方案1-1
方案1-2.
路线1:8,9-不饱和的甲氧基亚乙基酮从6-甲氧基-1-四氢萘酮的合成(化合物1)
Grignard反应用20.0g(113mmol,1.00当量)的6-甲氧基-1-四氢萘酮进行且产物在没有通过快速色谱的纯化的情况下使用。参见,例如,Saraber等,Tetrahedron 2006,62,1726-1742。向Grignard反应产物和2-甲基-1,3-戊二烯酮(12.8g,114mmol,1.01当量)在二甲苯(140mL)中的溶液添加AcOH(64.6mL,1.13mol,10.0当量)且反应混合物升温至回流。在2h后,使反应冷却到室温并减压浓缩。添加1:1的甲苯和乙醚混合物以溶解固体残留物且混合物过滤。滤液用饱和NaHCO3溶液(200mL)和盐水顺序洗涤,在MgSO4上干燥并减压浓缩。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:1:1己烷类:EtOAc:DCM)纯化以提供Torgov’s二烯。谱数据与之前报告的一致。参见,例如,Soorukram,D.,Knochel,P.Org.Lett.2007,9,1021-1023。Torgov’s二烯基于文献已知的过程转化为8,9-不饱和的甲氧基亚乙基酮化合物1(15.0g,3个步骤47%)。参见,例如,Sugahara等,Tetrahedron Lett.1996,37,7403-7406。
路线1:8,9-不饱和的甲氧基亚乙基缩酮(化合物2)的合成
向化合物1(15.0g,53.1mmol,1.0当量)在苯(215mL)和乙二醇(72mL)中的溶液添加草酸(2.30g,12.1mmol,0.22当量)。使反应混合物升温至回流且水通过Dean-Stark仪分离。在16h后,反应冷却到室温并添加饱和NaHCO3溶液(150mL)。有机层和水层分离且水相用乙酸乙酯(2×200mL)萃取。合并的有机相用盐水(150mL)洗涤并用Na2SO4干燥。溶剂减压蒸发且残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:15:1己烷类:EtOAc)纯化以提供8,9-不饱和的甲氧基亚乙基缩酮化合物2(15.5g,89%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=7.13(d,J=8.3Hz,1H),6.73-6.67(m,2H),4.05-3.85(m,4H),3.79(s,3H),2.82-2.65(m,2H),2.52-2.45(m,2H),2.23-2.17(m,2H),2.14(ddd,J=2.2,11.6,14.0Hz,1H),1.99-1.82(m,4H),1.64(td,J=4.2,12.2Hz,1H),1.49(dq,J=6.8,11.6Hz,1H),0.86(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C21H27O3[M+H]+:327.1955,测定值327.1947。
路线1:环氧醇3和3a的合成
8,9-不饱和的亚乙基缩酮2(1.63g,5.00mmol,1.0当量)在CHCl3(50mL)中的溶液冷却到0℃并添加mCPBA(77%max,2.46g,11.0mmol,2.2当量)。反应混合物在0℃下搅拌10min并升温到室温。再50min后,顺序添加10%Na2S2O3溶液(40mL)和饱和NaHCO3溶液(40mL)。有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(3×50mL)萃取。合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:3:1→1:1己烷类:EtOAc)纯化以提供环氧醇3和3a(1.40g,75%)。3和3a在任何溶剂中平衡,主要为3。对环氧醇3进行H NMR分析。在指定(indicted)的情况下,皮质抑素类似物(12、13、14A、14B、15B、16B和17B)作为从6-甲氧基-1-四氢萘酮构建的外消旋混合物应用于生物实验。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=7.77(d,J=8.3Hz,1H),6.76(dd,J=2.0,8.3Hz,1H),6.63(d,J=2.0Hz,1H),4.78(dd,J=7.8,9.8Hz,1H),3.95-3.87(m,4H),3.78(s,3H),2.84(dt,J=5.9,14.4Hz,1H),2.49(dd,J=4.4,15.1Hz,1H),2.36-2.29(m,1H),2.26(dd,J=5.9,14.2Hz,2H),2.06(t,J=11.7Hz,1H),1.97(dd,J=7.3,12.2Hz,1H),1.94-1.88(m,2H),1.75(dt,J=5.4,14.2Hz,1H),1.63-1.53(m,1H),1.46(t,J=11.0Hz,1H),0.75(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C21H27O5[M+H]+:359.1853,测定值359.1852。
路线2:8,9和9,11-不饱和的甲氧基亚乙基缩酮化合物2和4的合成
用22.0g(81.4mmol,1.0当量)的雌酮进行DDQ氧化且产物在不通过快速色谱纯化的情况下使用。参见,例如,Stephan等,Steroid.1995,60,809-811。向9,11-不饱和的雌酮在苯(375mL)中的溶液添加乙二醇(110mL,1.99mol,24.4当量)和PTSA(3.00g,16.3mmol,0.20当量)。反应混合物升温至回流且水通过Dean-Stark仪分离。在18h后,使反应冷却到室温并施加饱和NaHCO3溶液(300mL)。水相用乙酸乙酯(2×300mL)萃取且合并的有机相用盐水(200mL)洗涤。有机相进行干燥(Na2SO4)且溶剂减压蒸发。产物在没有进一步纯化的情况下用于下一步骤。
亚乙基缩酮(8,9和9,11-不饱和的区域异构体的混合物)溶解于丙酮(420mL)中并加入K2CO3(22.5g,163mmol,2.00当量)。这之后添加Me2SO4(9.30mL,97.6mmol,1.20当量)且反应混合物升温至回流。在18h后,使反应冷却到室温并蒸发丙酮。添加2M NaOH溶液(300mL)且水相用乙酸乙酯(2×300mL)萃取。合并的有机相进行干燥(Na2SO4)且溶剂减压蒸发。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:15:1己烷类:EtOAc)纯化以提供8,9和9,11-不饱和的甲氧基亚乙基缩酮化合物2和4的混合物(16.3g,三个步骤61%,8,9-不饱和的区域异构体:9,11-不饱和的区域异构体的~4:5混合物)。
对于9,11-不饱和的异构体,仅分配可分辨的峰:1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=7.53(d,J=8.8Hz,1H),6.60(d,J=2.0Hz,1H),6.13(td,J=2.6,5.0Hz,1H),3.79(s,3H),2.59(td,J=3.2,17.6Hz,1H),2.09-2.00(m,3H),1.45-1.33(m,2H),0.90(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C21H27O3[M+H]+:327.1955,测定值327.1951。
路线2:环氧醇化合物3和3a
向8,9和9,11-不饱和的亚乙基缩酮化合物2和4的混合物(15.7g,48.1mmol,1.00当量)在二氯甲烷(700mL)中的溶液加入单过氧邻苯二甲酸镁六水合物(68.4g,111mmol,2.30当量)和水(4.8mL)。反应混合物室温下搅拌20h且然后用10%Na2S2O3(300mL)水溶液和饱和NaHCO3溶液(300mL)的混合物淬灭。有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(2×500mL)萃取。合并的有机相用盐水(300mL)洗涤并干燥(Na2SO4)。溶剂减压蒸发且残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:3:1→2:1己烷类:EtOAc)纯化以提供环氧醇3和3a(8.60g,50%)。谱数据与从8,9-不饱和的甲氧基亚乙基缩酮2构建的环氧醇3和3a一致。
二醇化合物5的合成
氨气冷凝(240mL)并在-78℃下向液氨添加Li(3.90g,565mmol,25.0当量)。在搅拌30min后,THF(110mL)中的环氧醇3和3a(8.10g,22.6mmol,1.0当量)插管并在该温度下再搅拌1.5h。在-78℃下向反应混合物加入t-BuOH(32mL)和THF(16mL)的混合物并在该温度下再搅拌20min。添加t-BuOH(92mL)和THF(38mL)的混合物,接着在-78℃下加入苯(50mL)和水(50mL),且烧瓶打开以通过移除冷却浴温和地蒸发液氨。加入水(200mL)且水相用乙酸乙酯(2×250mL)萃取。合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,干燥(Na2SO4)并减压浓缩。产物在没有进一步纯化的情况下用于下一步骤。
向Birch还原产物在THF(300mL)和乙二醇(75mL)中的溶液加入PTSA(430mg,2.26mmol,0.10当量)。反应混合物在室温下搅拌30min并加入饱和NaHCO3溶液(200mL)。有机层和水层分离且水相用乙酸乙酯(4×250mL)萃取。合并的有机相用盐水(200mL)洗涤并干燥(Na2SO4)。溶剂减压蒸发且残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:4:1己烷类:EtOAc→100%EtOAc→10:1 EtOAc:MeOH)纯化以提供二醇5(4.60g,52%)。
1H NMR(500MHz,C6D6)位移=3.67-3.42(m,9H),3.25-3.14(m,1H),2.40(dd,J=5.9,13.2Hz,1H),2.31(br.s,2H),2.23-2.09(m,2H),2.03(t,J=10.7Hz,1H),1.97-1.90(m,2H),1.89(dd,J=8.3,14.2Hz,1H),1.85-1.75(m,4H),1.66-1.50(m,4H),1.00(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C22H32NaO6[M+Na]+:415.2091,测定值415.2076。
烯酮化合物6的合成
在-10℃下向二醇5(4.05g,10.3mmol,1.00当量)在二氯甲烷(230mL)中的溶液一次性加入NBS(2.00g,11.4mmol,1.10当量)且反应混合物升温到室温。反应通过TLC监测(约30min完成)。一旦反应进行,反应混合物冷却到-40℃且加入三乙胺(17.3mL,124mmol,12.0当量)。将室温下预搅拌20min的DMSO(115mL)中的SO3·Py(16.4g,103mmol,10.0当量)在-40℃下加入到反应混合物,其随后允许缓慢升温至-10℃。4h后,加入饱和NH4Cl溶液(130mL)且反应允许升温至室温。有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(2×200mL)萃取。合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。产物在无进一步纯化的情况下使用。
氧化产物溶解于二氯甲烷(300mL)中且反应混合物冷却到-40℃,接着缓慢加入DBU(3.90mL,25.6mmol,2.50当量)。15min后,加入饱和NH4Cl溶液(130mL)且反应允许升温至室温。有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(2×200mL)萃取。合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:3:1→1:1己烷类:EtOAc)纯化以提供烯酮6(3.16g,三个步骤80%)。
1H NMR(500MHz,C6D6)位移=3.58-3.51(m,1H),3.49-3.34(m,6H),3.28-3.23(m,2H),3.19(dt,J=4.2,7.7Hz,1H),2.80(d,J=16.1Hz,1H),2.60(ddd,J=6.8,12.7,19.0Hz,1H),2.55(d,J=13.2Hz,1H),2.43(d,J=16.1Hz,1H),2.31(dd,J=1.5,13.2Hz,1H),1.98-1.88(m,2H),1.88-1.80(m,3H),1.71(ddd,J=4.2,9.6,11.6Hz,1H),1.68-1.59(m,3H),1.20(ddd,J=3.7,8.4,11.4Hz,1H),0.90(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C22H28NaO6[M+Na]+:411.1778,测定值411.1786。
烯丙醇化合物7的合成
在室温下向烯酮6(3.20g,8.32mmol,1.00当量)在MeOH(150mL)和THF(20mL)中的溶液加入CeCl3·7H2O(9.20g,24.7mmol,3.00当量)。在搅拌5min后,反应冷却到-20℃,接着加入NaBH4(623mg,16.5mmol,2.00当量)。在30min后,加入饱和NH4Cl溶液(50mL)和水(50mL),这允许升温至室温。水相用乙酸乙酯(3×200mL)萃取且合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:1DCM:MeOH)纯化以提供烯丙醇7(2.72g,85%)。
1H NMR(500MHz,C6D6)位移=4.39-4.30(m,1H),3.58-3.36(m,8H),3.22(dd,J=3.7,16.4Hz,1H),2.94(dd,J=7.1,12.5Hz,1H),2.66(d,J=13.2Hz,1H),2.49-2.41(m,1H),2.39(dd,J=2.2,12.9Hz,1H),2.07-1.99(m,1H),1.96-1.79(m,6H),1.73(br.s,3H),1.66-1.57(m,1H),1.15-1.07(m,1H),0.86(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C22H30NaO6[M+Na]+:413.1935,测定值413.1942。
环丙烷化合物8的合成
在0℃下向ClCH2I(1.98mL,27.1mmol,4.00当量)在1,2-二氯乙烷(140mL)中的溶液加入Et2Zn在乙醚(1M,13.6mL,13.6mmol,2.00当量)中的溶液。在搅拌5min后,1,2-二氯乙烷(70mL)中的烯丙醇7(2.65g,6.79mmol,1.00当量)在0℃下加入反应烧瓶中。在30min后,反应通过饱和NH4Cl溶液(100mL)淬灭并允许升温至室温。有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(2×120mL)萃取。合并的有机相用盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:2:1→1:1己烷类:EtOAc)纯化以提供环丙烷8(2.59g,93%)。
1H NMR(500MHz,C6D6)位移=3.92(dd,J=3.7,11.0Hz,1H),3.51-3.40(m,8H),2.72(dd,J=7.1,12.9Hz,1H),2.39(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),2.38(d,J=12.2Hz,1H),2.15(d,J=12.2Hz,1H),2.12(dt,J=4.9,12.2Hz,1H),2.02(ddd,J=2.9,11.2,14.6Hz,1H),1.92-1.82(m,3H),1.82-1.73(m,2H),1.69-1.54(m,5H),1.52(dd,J=6.1,12.0Hz,1H),1.49-1.44(m,1H),0.98(s,3H),0.86(d,J=2.4Hz,1H),0.15(d,J=2.9Hz,1H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C23H32NaO6[M+Na]+:427.2091,测定值427.2088。
氧杂双环[3.2.1]辛烷化合物9的合成
环丙烷8(2.45g,6.06mmol,1.00当量)和2,6-二叔丁基-4-甲基吡啶(4.40g,21.2mmol,3.50当量)用苯共沸干燥并溶解于二氯甲烷(120mL)中。添加分子筛(3.1g)且反应烧瓶冷却到0℃。逐滴加入三氟甲磺酸酐在二氯甲烷中的溶液(1M,12.1mL,12.1mmol,2.00当量)并移除冰浴以使反应烧瓶升温至室温。在2h后,反应用三乙胺(20mL)淬灭并通过硅藻土垫过滤。加入饱和NaHCO3溶液(100mL)且水相用二氯甲烷(2×120mL)萃取。合并的有机相用盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:3:1戊烷:乙醚)纯化以提供氧杂双环[3.2.1]辛烷化合物9(1.42g,60%)。也参见Magnus等,Org.Lett.2009,11,3938-3941。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=5.73(s,1H),5.29-5.26(m,1H),4.04-3.76(m,8H),2.58-2.50(m,1H),2.46(t,J=15.1Hz,1H),2.31-2.24(m,2H),2.19(t,J=11.2Hz,1H),2.09(d,J=13.2Hz,1H),1.99(dt,J=4.4,13.2Hz,1H),1.94(dd,J=2.4,13.2Hz,1H),1.91-1.84(m,1H),1.83-1.71(m,3H),1.71-1.53(m,5H),0.88(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C23H30O5[M+H]+:387.2166,测定值387.2180。
单酮化合物10的合成
向双亚乙基缩酮9(110mg,285μmol,1.0当量)在丙酮(14.6mL)和水(3.6mL)中的溶液加入PTSA(21.6mg,85.2μmol,0.30当量)且反应混合物搅拌3d。饱和NaHCO3溶液(5mL)和乙酸乙酯(25mL)顺序加入反应中。层分离且水层用乙酸乙酯(2×15mL)萃取。有机层合并,用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。所得的残留物然后通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:4:1己烷类:EtOAc)纯化以提供单酮10(79.0mg,81%)。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=5.73(s,1H),5.29-5.25(m,1H),3.98-3.90(m,4H),2.48(dd,J=8.8,19.5Hz,1H),2.46-2.40(m,1H),2.36(dd,J=5.9,12.7Hz,1H),2.34-2.25(m,2H),2.24-2.08(m,5H),2.09(d,J=13.2Hz,1H),1.95(dd,J=2.4,13.2Hz,1H),1.90-1.81(m,1H),1.79-1.70(m,2H),1.70-1.61(m,2H),0.89(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C21H27O4[M+H]+:343.1909,测定值343.1919。
1-氯代异喹啉加成化合物11的合成
反应烧瓶中的CeCl3(565mg,2.30mmol,10.0当量)在140℃下真空加热2h。烧瓶加载Ar并冷却到0℃。在30min后,加入THF(2.8mL)并在0℃下搅拌2h。然后烧瓶允许升温至室温并再搅拌16h。
1-氯-7-碘代异喹啉按照Subasinghe等,Bioorg.Med.Chem.Lett.2013,23,1063-1069中提供的方法合成。
向CeCl3/THF复合物的溶液加入THF(1.4mL)中的1-氯-7-碘代异喹啉(396mg,1.40mmol,6.00当量),接着在室温下搅拌10min,其然后允许冷却到-78℃。然后逐滴加入正丁基锂在己烷类中的溶液(1.6M,716μL,1.10mmol,5.00当量)。反应混合物在相同温度下再搅拌30min且单酮10(78.5mg,229μmol,1.00当量)在THF(1.4mL)中插管。在另外30min后,饱和NH4Cl溶液(5mL)加入搅拌的反应混合物,其然后允许升温到室温。混合物用EtOAc(5mL)稀释且层分离。水层用EtOAc(3×5mL)萃取且有机层合并,用盐水(5mL)洗涤并用Na2SO4干燥和减压浓缩。所得的残留物然后通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:2:1己烷类:EtOAc)纯化以提供1-氯代异喹啉加成物11(115mg,97%)。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.34(br.s,1H),8.24(d,J=5.9Hz,1H),7.89-7.83(m,1H),7.76(d,J=8.3Hz,1H),7.56(d,J=5.9Hz,1H),5.63(s,1H),5.16-4.99(m,1H),4.02-3.87(m,4H),2.62(ddd,J=4.4,9.8,14.2Hz,1H),2.48-2.38(m,2H),2.36-2.26(m,3H),2.26-2.19(m,1H),2.18-2.08(m,2H),1.96(dd,J=2.4,13.7Hz,1H),1.88(dd,J=5.1,17.8Hz,1H),1.82-1.70(m,2H),1.67-1.57(m,3H),1.49(d,J=17.6Hz,1H),1.20-1.08(m,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H32NaO4NCl[M+Na]+:528.1918,测定值528.1929。
异喹啉化合物12的合成
1-氯代异喹啉加成物11(115mg,227μmol,1.00当量)在二氯甲烷(20mL)中的溶液冷却到0℃。吡啶(183μL,2.30mmol,10.0当量)和DMAP(13.9mg,114μmol,0.50当量)然后顺序加入溶液中。在5min后,逐滴加入三氟乙酸酐(158μL,1.14mmol,5.00当量)并再搅拌30min,此时加入pH 7的磷酸盐缓冲液(15mL),接着使反应烧瓶升温至室温。有机层和水层分离且水层用二氯甲烷(2×15mL)萃取。有机层合并,用盐水(25mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。所得的残留物然后通过短的快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:2:1己烷类:EtOAc)纯化以提供三氟乙酸化的产物,其快速用于下一步骤。
三氟乙酸化的产物(130mg,216mmol,1.00当量)用苯共沸干燥并溶解于苯(4.3mL)中。加入AIBN(106mg,647μmol,3.00当量)且反应烧瓶通过冷冻泵冻融过程(3个循环)脱气。加入Bu3SnH(1.16mL,4.31mmol,20.0当量)且反应混合物允许升温至回流。在3h后,反应混合物冷却到室温并减压浓缩。所得的残留物然后通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:4:1→3:1→1:1己烷类:EtOAc)纯化以提供异喹啉12(67.0mg,两个步骤65%)。也参见Yamashita等,J.Org.Chem.2011,76,2408-2425。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.21(s,1H),8.46(d,J=5.9Hz,1H),7.77(s,1H),7.73(d,J=8.3Hz,1H),7.61(d,J=5.9Hz,1H),7.57(d,J=8.3Hz,1H),5.74(s,1H),5.29-5.23(m,1H),4.00-3.90(m,4H),3.11(t,J=10.0Hz,1H),2.49(dd,J=8.3,11.2Hz,1H),2.47-2.41(m,1H),2.38-2.24(m,4H),2.24-2.14(m,2H),2.12(d,J=13.2Hz,1H),2.06-1.95(m,2H),1.91(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.83(dq,J=4.9,11.7Hz,1H),1.77(td,J=2.3,12.9Hz,1H),1.72-1.59(m,3H),0.52(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H33NaNO3[M+Na]+:478.2353,测定值478.2347。
酮13的合成
向异喹啉12(19.0mg,41.7μmol,1.00当量)在丙酮(1.4mL)和水(350μL)中的溶液加入PTSA(20.9mg,83.4μmol,2.00当量)且反应混合物升温至55℃。在14.5h后,反应冷却到室温且饱和NaHCO3溶液(2mL)和乙酸乙酯(2.5mL)顺序加入反应中。层分离且水层用乙酸乙酯(2×2.5mL)萃取。有机层合并,用盐水(2mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。所得的残留物然后通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:3:2→1:2己烷类:EtOAc)纯化以提供酮13(15.0mg,87%)。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.23(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.80(s,1H),7.78(d,J=8.3Hz,1H),7.65(d,J=5.9Hz,1H),7.61(d,J=8.3Hz,1H),5.91(s,1H),5.40-5.35(m,1H),3.15(t,J=10.0Hz,1H),2.94(d,J=15.1Hz,1H),2.68(d,J=15.1Hz,1H),2.67-2.59(m,1H),2.58-2.41(m,4H),2.41-2.24(m,3H),2.24-2.10(m,2H),2.04(tt,J=4.6,13.2Hz,1H),1.96(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.86(dq,J=5.1,12.1Hz,1H),1.80-1.67(m,2H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H30NO2[M+H]+:412.2271,测定值412.2288。
方案1-3.优化的路线2
环氧醇化合物3和3a
向雌酮(180g,667mmol,1.00当量)在DMSO(2.8L)中的溶液添加KOH颗粒(85%工业级,150g,2.26mol,3.40当量)和CH3I(83.0mL,1.33mol,2.00当量)。反应混合物室温下搅拌3.5小时并在0℃下缓慢加入蒸馏水(2L)。水层用二氯甲烷(3×1.5L)萃取且合并的有机层用盐水(1.5L)洗涤。有机层在氮气流下浓缩以提供白色晶体,其用冷甲醇洗涤。180g粗混合物用于下一步骤而无需进一步纯化。三个步骤的其余部分分两批进行。
向粗混合物(100g,352mmol,1.00当量)在甲醇(750mL)和二氯甲烷(750mL)中的溶液加入NaHCO3(93.8g,1.05mmol,3.00当量)。DDQ(120g,527mmol,1.50当量)分四部分以5min的间隔加入且反应混合物搅拌2小时,然后用10%Na2S2O3水溶液(500mL)淬灭。反应烧瓶搅拌另外30min并通过硅藻土过滤,用氯仿洗涤。加入2M NaOH溶液(500mL),有机层和水层分离且水相用氯仿(3×700mL)萃取。合并的有机相用盐水(700mL)洗涤并干燥(Na2SO4)。溶剂减压蒸发且89g粗混合物用于下一步骤而无需进一步纯化。
向粗混合物(81.4g,291mmol,1.00当量)在苯(1.25L)中的溶液加入乙二醇(162mL,2.91mol,10当量)和PTSA(11.1g,58.3mmol,0.20当量)。反应混合物升温至回流且水通过Dean-Stark仪分离。在24小时后,使反应冷却到室温并施加饱和NaHCO3溶液(500mL)。水相用乙酸乙酯(3×300mL)萃取且合并的有机相用盐水(500mL)洗涤。有机相进行干燥(Na2SO4)且溶剂减压蒸发。81.4g粗产物用于下一步骤而无需进一步纯化。
向8,9和9,11-不饱和的亚乙基缩酮的混合物(81.4g,249mmol,1.00当量)在二氯甲烷(1.28L)中的溶液加入单过氧邻苯二甲酸镁六水合物(354g,573mmol,2.30当量)和水(25mL)。反应混合物在室温下搅拌16小时且然后通过硅藻土垫过滤。向滤液加入饱和NaHCO3溶液(800mL),有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(3×700mL)萃取。合并的有机相用盐水(700mL)洗涤并干燥(Na2SO4)。溶剂减压蒸发且残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:3:1→2:1己烷类:EtOAc)纯化以提供环氧醇3和3a(3:3a=8:1,来自180g的81.0g,4个步骤4%)。对环氧醇3进行1H NMR和13C NMR分析。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=7.77(d,J=8.3Hz,1H),6.76(dd,J=2.0,8.3Hz,1H),6.63(d,J=2.0Hz,1H),4.78(dd,J=7.8,9.8Hz,1H),3.95-3.87(m,4H),3.78(s,3H),2.84(dt,J=5.9,14.4Hz,1H),2.49(dd,J=4.4,15.1Hz,1H),2.36-2.29(m,1H),2.26(dd,J=5.9,14.2Hz,2H),2.06(t,J=11.7Hz,1H),1.97(dd,J=7.3,12.2Hz,1H),1.94-1.88(m,2H),1.75(dt,J=5.4,14.2Hz,1H),1.63-1.53(m,1H),1.46(t,J=11.0Hz,1H),0.75(s,3H);13C NMR(500MHz,CDCl3)位移=159.1,139.5,130.2,125.9,117.6,114.3,111.1,69.0,67.5,65.4,64.5,61.8,55.2,47.4,46.8,37.0,34.9,26.2,25.0,21.3,14.9;FTIR(cm-1)3464,2944,2885,1610,1503;HRMS(ESI)(m/z)计算值C21H27O5[M+H]+:359.1853,测定值359.1852;[α]D=-147.4°(c=0.01g/mL,在CHCl3中)。
二醇化合物5
在室温下向3和3a(10.0g,27.9mmol,1.00当量)在1,2-二氯乙烷(175mL)中的溶液顺序添加NaBH3CN(3.51g,55.8mmol,2.00当量)和AcOH(3.19mL,55.8mmol,2.00当量)。2.5小时后,加入饱和NaHCO3溶液(150mL)且有机层和水层分离。水相用二氯甲烷(3×150mL)萃取。合并的有机相用盐水(200mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。粗混合物用于下一步骤而无需进一步纯化。
氨气冷凝(60mL)并在-78℃下向液氨中加入Li(1.94g,279mmol,10.0当量)。在搅拌30min后,THF(10mL)和EtOH(6mL)中的粗混合物插管且反应升温至最高-40℃。1.5小时后,向反应混合物顺序加入EtOH(20mL)和EtOH:H2O=1:1(20mL),且烧瓶打开以通过移除冷却浴温和地蒸发液氨。加入水(50mL)且水相用乙醚(3×90mL)萃取。合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,干燥(Na2SO4)并减压浓缩。产物在没有进一步纯化的情况下用于下一步骤。
向Birch还原产物在THF(300mL)和乙二醇(75mL)中的溶液添加PTSA(530mg,2.79mmol,0.100当量)。反应混合物在室温下搅拌30min并加入饱和NaHCO3溶液(200mL)。有机层和水层分离且水相用氯仿(4×200mL)萃取。合并的有机相用盐水(200mL)洗涤并干燥(Na2SO4)。溶剂减压蒸发且残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:4:1己烷类:EtOAc→100%EtOAc→10:1 EtOAc:MeOH)纯化以提供二醇5(6.6g,三个步骤60%)。
1H NMR(500MHz,C6D6)位移=3.67-3.42(m,9H),3.25-3.14(m,1H),2.40(dd,J=5.9,13.2Hz,1H),2.31(br.s,2H),2.23-2.09(m,2H),2.03(t,J=10.7Hz,1H),1.97-1.90(m,2H),1.89(dd,J=8.3,14.2Hz,1H),1.85-1.75(m,4H),1.66-1.50(m,4H),1.00(s,3H);13C NMR(500MHz,CDCl3)位移=127.8,126.9,118.3,108.5,74.2,72.0,65.3,64.7,64.4,64.3,63.7,58.9,52.5,45.9,41.2,40.5,33.8,31.6,27.6,25.8,18.0,16.6;FTIR(cm-1)3417,2940,2884;HRMS(ESI)(m/z)计算值C22H32NaO6[M+Na]+:415.2091,测定值415.2076;[α]D=-13.4°(c=0.01g/mL,在CHCl3中)。
烯丙醇化合物7
在-10℃下向二醇5(4.05g,10.3mmol,1.00当量)在二氯甲烷(230mL)中的溶液一次性添加NBS(2.00g,11.4mmol,1.10当量)且反应混合物升温到室温。反应通过TLC监测(约30min完成)。一旦反应进行,反应混合物冷却到-40℃并加入三乙胺(17.3mL,124mmol,12.0当量)。在室温下预搅拌20min的DMSO(115mL)中的SO3·Py(16.4g,103mmol,10.0当量)在-40℃下添加到反应混合物,其随后允许缓慢到室温。在3小时后,添加饱和NH4Cl溶液(130mL)且反应允许升温至室温。有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(2×200mL)萃取。合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。粗混合物在没有进一步纯化的情况下使用。
粗混合物溶解于二氯甲烷(300mL)中且反应混合物冷却到-40℃,接着缓慢添加DBU(3.90mL,25.6mmol,2.50当量)。在15min后,添加饱和NH4Cl溶液(130mL)且反应允许升温至室温。有机层和水层分离且水相用二氯甲烷(2×200mL)萃取。合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。
室温下向粗混合物(3.20g,8.32mmol,1.00当量)在MeOH(150mL)和THF(20mL)中的溶液加入CeCl3·7H2O(9.20g,24.7mmol,3.00当量)。在搅拌5min后,反应冷却到-20℃,接着添加NaBH4(623mg,16.5mmol,2.00当量)。在30min后,加入饱和NH4Cl溶液(50mL)和水(50mL),其允许升温至室温。水相用乙酸乙酯(3×200mL)萃取且合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。残留物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:1DCM:MeOH)纯化以提供烯丙醇7(2.60g,4个步骤64%)。
1H NMR(500MHz,C6D6)位移=4.39-4.30(m,1H),3.58-3.36(m,8H),3.22(dd,J=3.7,16.4Hz,1H),2.94(dd,J=7.1,12.5Hz,1H),2.66(d,J=13.2Hz,1H),2.49-2.41(m,1H),2.39(dd,J=2.2,12.9Hz,1H),2.07-1.99(m,1H),1.96-1.79(m,6H),1.73(br.s,3H),1.66-1.57(m,1H),1.15-1.07(m,1H),0.86(s,3H);13C NMR(500MHz,C6D6)位移=140.6,139.1,118.7,109.5,88.3,86.2,67.1,65.4,64.6,64.2,47.9,46.5,41.3,40.9,34.7,34.2,33.9,30.0,20.4,19.8,15.6;HRMS(ESI)(m/z)计算值C22H30NaO6[M+Na]+:413.1935,测定值413.1942。
还原胺化
方法A
在室温下向酮13(1.00当量)在1,2-二氯乙烷中的溶液(0.02M)顺序添加胺(4.00当量)、AcOH(1.50当量)和NaBH3CN(3.50当量)。如果反应的胺为HCl盐的形式,则加入三乙胺(4当量)(方法AA)。一旦反应进行,加入饱和NaHCO3溶液且层分离。水层用二氯甲烷萃取。有机层合并,用盐水洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。(α-NR2:β-NR2=~1:1.2至~1:5)。
方法B
室温下向酮13(1.00当量)在1,2-二氯乙烷(0.02M)中的溶液顺序添加胺(2.00当量)、AcOH(2.00当量)和NaBH(OAc)3(2.00当量)。如果反应的胺为HCl盐的形式,则加入三乙胺(2.00当量)(方法BB)。一旦反应进行,加入饱和NaHCO3溶液且层分离。水层用二氯甲烷萃取。有机层合并,用盐水洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。(α-NR2:β-NR2=~1:1.2至~1:5)。
方法C
室温下向仲胺(1.00当量)在二氯甲烷(0.02M)中的溶液添加甲醛或乙醛(5.00当量)并搅拌1h,之后加入NaBH(OAc)3(2.00当量)。一旦反应进行,加入饱和NaHCO3溶液且层分离。水层用二氯甲烷萃取。有机层合并,用盐水洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。
方法D:偏向于α-胺的一般方法
向酮13(1.00当量)在THF和t-BuOH(4:1,0.02M)中的溶液顺序加入胺(5.00当量)和Ti(Oi-Pr)4(3.00当量),并在室温下搅拌15小时(对于Me2NH、MeNH2和NH3为4小时)。反应混合物冷却到-20℃并加入NaBH4(1.50当量)。一旦反应进行,加入饱和NaHCO3溶液且层分离。水层用EtOAc萃取。有机层合并,用盐水洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。(α-NR2:β-NR2=~1.1:1至~3.7:1)。
方法E:甲磺酰胺形成的一般方法
向胺(1.00当量)在二氯甲烷(0.013M)中的溶液添加三甲胺(4.00当量)且反应混合物冷却到-20℃。甲磺酸酐(2.50当量)作为二氯甲烷中的溶液加入并在相同温度下搅拌30min。加入2N NaOH溶液且层分离。水层用二氯甲烷萃取。有机层合并,用盐水洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。
β-二甲胺14B和α-二甲胺14A
粗混合物顺序地通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-二甲胺14B(21.5mg,65%)。ca.0.6mg的α-二甲胺14A通过HPLC(Eclipse XDB-C8柱,9.4mm×25cm;梯度=0%→35%MeCN(0.1%甲酸):H2O(0.1%甲酸),30min)从3mg的13制备。
β-二甲胺14B:1H NMR(500MHz,C6D6)位移=9.31(s,1H),8.61(d,J=5.4Hz,1H),7.43(s,1H),7.39(d,J=8.8Hz,1H),7.25(d,J=5.4Hz,1H),7.23(d,J=8.8Hz,1H),5.73(br.s,1H),5.18(s,1H),2.74(t,J=10.0Hz,1H),2.63(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.48-2.28(m,2H),2.27-2.20(m,1H),2.19-2.03(m,6H),2.00(br.s,6H),1.95-1.84(m,2H),1.83-1.66(m,5H),1.41(tt,J=5.4,13.2Hz,1H),0.45(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H37N2O[M+H]+:441.2900,测定值441.2910。
α-二甲胺14A:1H NMR(600MHz,C6D6)位移=9.26(s,1H),8.56(d,J=5.9Hz,1H),7.44-7.39(m,1H),7.36(d,J=8.2Hz,1H),7.21-7.20(m,1H),7.20(d,J=5.9Hz,1H),5.68-5.65(m,1H),5.15-5.11(m,1H),2.72-2.66(m,J=10.0Hz,1H),2.59(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.34(tt,J=2.9,12.1Hz,1H),2.16(td,J=3.2,16.0Hz,1H),2.09(s,6H),2.13-1.92(m,8H),1.85(ddd,J=5.0,9.0,13.6Hz,1H),1.73(dt,J=5.3,12.3Hz,1H),1.72-1.66(m,2H),1.60-1.57(m,1H),1.57-1.49(m,1H),1.20(dq,J=4.1,12.3Hz,1H),0.40(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H37N2O[M+H]+:441.2900,测定值441.2909。
β-吗啉15B和α-吗啉15A
β-吗啉15B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:100%EtOAc→35:1→20:1→10:1 EtOAc:MeOH)纯化以提供β-吗啉15B(21mg,66%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.3Hz,1H),7.62(d,J=5.9Hz,1H),7.59(dd,J=1.0,8.8Hz,1H),5.71(s,1H),5.24(d,J=2.9Hz,1H),3.73(br.s,4H),3.13(t,J=10.0Hz,1H),2.65-2.28(m,11H),2.23-2.11(m,3H),2.06(d,J=13.2Hz,1H),2.01(dt,J=4.4,9.0Hz,1H),1.93(dd,J=4.9,17.1Hz,1H),1.89-1.79(m,1H),1.75-1.53(m,4H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O2[M+H]+:483.3006,测定值483.3012。
β-N-甲基哌嗪16B和α-N-甲基哌嗪16A
β-N-甲基哌嗪16B:粗混合物顺序地通过快速色谱(硅胶,1st柱:洗脱剂:100%MeOH→10:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液/2nd柱:洗脱剂:20:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液))纯化以提供β-N-甲基哌嗪16B(20mg,55%)。1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.9Hz,1H),7.59(d,J=8.2Hz,1H),5.70(s,1H),5.25-5.22(m,1H),3.13(t,J=9.7Hz,1H),2.53(br.s.,1H),2.50(dd,J=8.8,11.7Hz,1H),2.41(t,J=12.9Hz,1H),2.38-2.33(m,3H),2.32(br.s,3H),2.22-2.11(m,3H),2.10-1.95(m,3H),1.95-1.89(m,2H),1.84(dq,J=5.3,11.7Hz,1H),1.79-1.50(m,11H),0.62-0.43(m,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C33H42N3O[M+H]+:496.3322,测定值496.3337。
β-氮杂环丁烷18B和α-氮杂环丁烷18A
β-氮杂环丁烷18B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:1:1 EtOAc:MeOH)纯化以提供β-氮杂环丁烷18B(2.7mg,50%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.4Hz,1H),7.59(d,J=8.3Hz,1H),5.69(s,1H),5.22(d,J=2.4Hz,1H),3.20-3.05(m,5H),2.59-2.43(m,4H),2.39-2.28(m,2H),2.23-2.12(m,2H),2.07-1.96(m,4H),1.92(dd,J=5.1,17.3Hz,1H),1.89-1.79(m,3H),1.75-1.55(m,3H),1.40(t,J=13.2Hz,1H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C31H37N2O[M+H]+:453.2906,测定值453.2916。
β-吡咯烷19B和α-吡咯烷19A
β-吡咯烷19B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:20:10:3EtOAc:己烷:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-吡咯烷19B(2.0mg,40%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.4Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.3Hz,1H),7.62(d,J=5.9Hz,1H),7.59(d,J=8.3Hz,1H),5.70(br.s.,1H),5.22(br.s.,1H),3.13(t,J=9.8Hz,1H),2.59-2.46(m,6H),2.44(br.s.,1H),2.41-2.28(m,3H),2.23-2.12(m,2H),2.11-2.00(m,2H),2.00-1.82(m,4H),1.79-1.65(m,6H),1.64-1.51(m,2H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O[M+H]+:467.3057,测定值467.3053。
β-二甲胺17,18-不饱和的异喹啉23B和α-二甲胺17,18-不饱和的异喹啉23A
β-二甲胺17,18-不饱和的异喹啉23B:粗混合物顺序地通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-二甲胺17,18-不饱和的异喹啉23B(6.5mg,74%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(br.s.,1H),8.51(d,J=5.4Hz,1H),7.94(s,1H),7.84-7.76(m,2H),7.63(d,J=5.4Hz,1H),6.27(br.s.,1H),5.97(s,1H),5.50(dd,J=2.4,4.9Hz,1H),2.98(d,J=14.6Hz,1H),2.78(dd,J=6.8,11.2Hz,1H),2.71(d,J=14.6Hz,1H),2.72-2.63(m,1H),2.61(d,J=5.4Hz,1H),2.59-2.54(m,2H),2.54-2.50(m,2H),2.50-2.42(m,2H),2.39(ddd,J=1.5,11.0,12.9Hz,1H),2.20(ddd,J=1.5,9.5,11.5Hz,1H),2.01(ddd,J=7.3,8.8,12.7Hz,1H),1.79(dt,J=7.3,11.2Hz,1H),1.18(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H35N2O[M+H]+:439.2744,测定值439.2753。
β-单甲胺24B和α-单甲胺24A
β-单甲胺24B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:10:1EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-单甲胺24B(ca.1.5mg,58%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.4Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.9Hz,1H),7.59(dd,J=1.0,8.3Hz,1H),5.72(d,J=1.0Hz,1H),5.24(dd,J=2.2,5.1Hz,1H),3.13(t,J=10.0Hz,1H),3.03-2.98(m,1H),2.57-2.50(m,1H),2.51(dd,J=8.3,11.7Hz,1H),2.44(s,3H),2.36(d,J=15.2Hz,1H),2.36-2.28(m,2H),2.26-2.13(m,2H),2.09(dd,J=3.7,16.4Hz,1H),2.07-1.99(m,2H),1.98-1.92(m,1H),1.93(dd,J=5.9,17.6Hz,1H),1.85(dq,J=4.9,11.7Hz,1H),1.82-1.76(m,1H),1.76-1.58(m,3H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C29H35N2O[M+H]+:427.2744,测定值427.2740。
β-氘代二甲胺26B和α-氘代二甲胺26A
β-氘代二甲胺26B:加入三乙胺。粗混合物顺序地通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-氘代二甲胺26B(4mg,62%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.80(s,1H),7.77(d,J=8.3Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(d,J=8.3Hz,1H),5.74(br.s.,1H),5.26(br.s.,1H),3.15(t,J=10.0Hz,1H),2.51(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.50-2.42(m,1H),2.37(d,J=17.1Hz,1H),2.38-2.26(m,2H),2.26-2.09(m,4H),2.08-1.98(m,2H),1.95(dd,J=5.1,17.3Hz,1H),1.87(dq,J=5.4,12.2Hz,1H),1.80-1.68(m,3H),1.62(br.s.,2H),0.63-0.50(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H31D6N2O[M+H]+:447.3277,测定值447.3281。
β-2-甲氧基乙基甲胺27B和α-2-甲氧基乙基甲胺27A
β-2-甲氧基乙基甲胺27B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:10:10:1己烷类:EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-2-甲氧基乙基甲胺27B(ca.1.2mg,20%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21(s,1H),8.40(d,J=5.4Hz,1H),7.99(s,1H),7.90(d,J=8.8Hz,1H),7.81(d,J=5.9Hz,1H),7.77(s,1H),5.80(s,1H),5.35-5.27(m,1H),3.60(t,J=5.4Hz,2H),3.39(s,2H),3.24(t,J=10.0Hz,1H),3.15-2.88(m,2H),2.56(br.s.,3H),2.51(dd,J=9.3,10.7Hz,1H),2.48-2.39(m,3H),2.35-2.28(m,1H),2.25-2.09(m,4H),2.02-1.84(m,7H),1.76(s,2H),0.59(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H41N2O2[M+H]+:485.3163,测定值485.3170。
β-双-2-甲氧基乙胺28B和α-双-2-甲氧基乙胺28A
β-双-2-甲氧基乙胺28B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:10:1二氯甲烷:MeOH)纯化以提供β-双-2-甲氧基乙胺28B(ca.1.1mg,19%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21(s,1H),8.39(d,J=5.9Hz,1H),7.99(s,1H),7.90(d,J=8.8Hz,1H),7.81(d,J=5.9Hz,1H),7.77(s,1H),5.74(s,1H),5.29-5.24(m,1H),3.47(t,J=6.1Hz,4H),3.36(s,6H),3.24(t,J=10.5Hz,1H),3.06-2.93(m,1H),2.78(d,J=5.9Hz,4H),2.52(dd,J=9.0,11.5Hz,1H),2.49-2.43(m,1H),2.44(d,J=17.6Hz,1H),2.40-2.35(m,1H),2.35-2.26(m,1H),2.24-2.10(m,3H),2.07-1.94(m,3H),1.91(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.85(d,J=14.6Hz,1H),1.82-1.67(m,3H),0.59(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C34H45N2O3[M+H]+:29.3425,测定值529.3434。
β-2-氟乙基甲胺29B和α-2-氟乙基甲胺29A
β-2-氟乙基甲胺29B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:20:1二氯甲烷:MeOH)纯化以提供β-2-氟乙基甲胺29B(2.7mg,51%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.80(s,1H),7.77(d,J=8.8Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(dd,J=1.0,8.3Hz,1H),5.74(br.s.,1H),5.26(br.s.,1H),4.68-4.46(m,2H),3.15(t,J=9.8Hz,1H),2.99-2.69(m,3H),2.52(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.47-2.30(m,6H),2.29-2.16(m,4H),2.16-2.00(m,3H),2.01-1.92(m,1H),1.94(dd,J=5.1,17.3Hz,1H),1.86(dq,J=5.4,12.2Hz,1H),1.79-1.64(m,3H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C31H38N2OF[M+H]+:473.2963,测定值473.2971。
β-2,2-二氟乙基甲胺30B和α-2,2-二氟乙基甲胺30A
β-2,2-二氟乙基甲胺30B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:1:1己烷类:EtOAc)纯化以提供β-2,2-二氟乙基甲胺30B(ca.1.1mg,19%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.28(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.86(s,1H),7.83(d,J=8.3Hz,1H),7.75(d,J=5.4Hz,1H),7.69(d,J=8.3Hz,1H),6.15-5.83(m,1H),5.75(s,1H),5.27(dd,J=2.4,5.4Hz,1H),3.17(t,J=10.0Hz,1H),2.91(br.s.,2H),2.52(dd,J=8.8,11.7Hz,1H),2.47(br.s,3H),2.45-2.30(m,4H),2.27-2.11(m,6H),2.11-1.99(m,2H),1.95(dd,J=5.1,17.3Hz,1H),1.88(dq,J=6.3,12.7Hz,1H),1.77-1.68(m,3H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C31H37N2OF2[M+H]+:491.2868,测定值491.2879。
β-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷31B和α-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷31A
β-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷31B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:10:10:1→10:10:2己烷类:EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷31B(3mg,50%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.81(s,1H),7.77(d,J=8.3Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.61(d,J=8.3Hz,1H),5.71(br.s.,1H),5.24(br.s.,1H),3.43(br.s.,2H),3.15(t,J=9.8Hz,1H),2.69(br.s.,2H),2.52(t,J=9.8Hz,1H),2.46(br.s.,1H),2.37(d,J=17.6Hz,1H),2.38-2.29(m,1H),2.27-2.13(m,3H),2.11-1.92(m,6H),1.87(dq,J=5.9,12.7Hz,1H),1.86-1.79(m,1H),1.78-1.60(m,8H),1.55(t,J=13.2Hz,1H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C34H41N2O[M+H]+:493.3213,测定值493.3224。
β-异丙基胺32B和α-异丙基胺32A
β-异丙基胺32B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:10:1EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-异丙基胺32B(5mg,70%)。1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.9Hz,1H),7.59(d,J=8.2Hz,1H),5.71(s,1H),5.24(d,J=2.9Hz,1H),3.24(br.s.,1H),3.13(t,J=9.7Hz,1H),2.90(br.s.,1H),2.50(dd,J=8.5,11.4Hz,2H),2.41-2.26(m,3H),2.24-2.13(m,3H),2.09(dd,J=2.9,15.3Hz,1H),2.06-1.98(m,2H),1.93(dd,J=5.3,17.6Hz,1H),1.85(dq,J=5.3,12.3Hz,1H),1.75-1.62(m,4H),1.07(br.s.,6H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C31H39N2O[M+H]+:455.3057,测定值493.3049。
β-异丙基甲胺33B
粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:20:10:3己烷类:EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-异丙基甲胺33B(4mg,78%)。1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.22(br.s.,1H),8.49(d,J=4.7Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.3Hz,1H),7.59(d,J=8.2Hz,1H),5.70(br.s.,1H),5.22(br.s.,1H),3.22(br.s.,1H),3.13(t,J=10.0Hz,1H),2.77(br.s.,1H),2.50(t,J=8.2Hz,1H),2.43(t,J=12.9Hz,1H),2.36(d,J=17.6Hz,1H),2.35-2.28(m,2H),2.22-2.14(m,2H),2.17(dt,J=4.4,9.0Hz,1H),2.11(br.s.,3H),2.08-1.99(m,2H),1.98-1.91(m,1H),1.93(dd,J=4.1,17.0Hz,1H),1.85(dq,J=5.3,12.3Hz,1H),1.69(br.s.,2H),1.59(br.s.,1H),1.56(br.s.,1H),0.96(br.s.,6H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H41N2O[M+H]+:455.3057,测定值493.3049。
β-异丙基乙胺34B
粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:100%MeOH)纯化以提供β-异丙基乙胺34B(ca.1.5mg,20%)。1H NMR(600MHz,CD3OD)位移=9.19(s,1H),8.38(d,J=5.9Hz,1H),7.97(s,1H),7.88(d,J=8.8Hz,1H),7.79(d,J=5.9Hz,1H),7.74(d,J=8.2Hz,1H),5.76(br.s.,1H),5.27(br.s.,1H),3.26-3.19(m,1H),2.91-2.66(m,3H),2.50(dd,J=9.4,11.2Hz,1H),2.48-2.36(m,3H),2.29(t,J=10.6Hz,1H),2.23-2.06(m,4H),2.00-1.86(m,5H),1.86-1.79(m,1H),1.79-1.66(m,2H),1.21-1.08(m,9H),0.57(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C33H43N2O[M+H]+:483.3370,测定值483.3382。
β-(R)-3-氟代吡咯烷35B和α-(R)-3-氟代吡咯烷35A
β-(R)-3-氟代吡咯烷35B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:47.5:47.5:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-(R)-3-氟代吡咯烷35B(2.2mg,38%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=δ9.22(s,1H),8.49(d,J=5.4Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.4Hz,1H),7.59(d,J=8.8Hz,1H),5.71(d,J=2.0Hz,1H),5.23(m,1H),5.11(m,1H),3.40(m,1H),3.13(dd,J=9.3,9.3Hz,1H),2.88-2.96(m,2H),2.66-2.77(m,1H),2.48-2.58(m,3H),2.29-2.45(m,3H),2.12-2.23(m,3H),1.99-2.09(m,5H),1.83-1.97(m,2H),1.67-1.74(m,2H),1.59(m,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H38FN2O[M+H]+:485.2968,测定值485.2915。
β-(S)-3-氟代吡咯烷36B和α-(S)-3-氟代吡咯烷36A
β-(S)-3-氟代吡咯烷36B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:47.5:47.5:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-(S)-3-氟代吡咯烷36B(2.7mg,46%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21-9.18(m,1H),8.37(d,J=5.87Hz,1H),7.98-7.96(m,1H),7.88(d,J=8.80Hz,1H),7.80-7.77(m,1H),7.74(dd,J=8.56,1.71Hz,1H),5.71(d,J=1.47Hz,1H),5.23(m,1H),5.22-5.07(m,2H),3.22(t,J=9.8Hz,1H),3.08-2.97(m,1H),2.90(td,J=8.19,5.62Hz,1H),2.70-2.64(m,1H),2.62-2.58(m,1H),2.52-2.34(m,6H),2.33-2.24(m,1H),2.23-2.03(m,3H),2.03-1.85(m,6H),1.77-1.67(m,2H),1.67-1.56(m,1H),0.57(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H38FN2O[M+H]+:485.6553,测定值485.6551。
β-3,3-二氟代吡咯烷37B和α-3,3-二氟代吡咯烷37A
β-3,3-二氟代吡咯烷37B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:80:15:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-3,3-二氟代吡咯烷37B(2.9mg,40%).1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=δ9.22(s,1H),8.49(d,J=5.4Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.3Hz,1H),7.62(d,J=5.4Hz,1H),7.59(d,J=8.8Hz,1H),5.72(d,J=2.0Hz,1H),5.25(dd,J=5.4Hz,2.0Hz,1H),3.13(dd,J=9.3Hz,9.3Hz,1H),2.86-3.03(m,2H),2.14(dd,J=6.9,6.9Hz,2H),2.58(m,1H),2.50(dd,J=11.7,8.3Hz,2H),2.13-2.44(m,6H),1.98-2.10(m,2H),1.90-1.96(m,1H),1.83-1.89(m,2H),1.66-1.74(m,2H),1.53-1.61(m,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H37F2N2O[M+H]+:503.2874,测定值503.2814。
α-3,3-二氟代吡咯烷37A:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:80:15:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供α-3,3-二氟代吡咯烷37A(来自6.0mg的2.9mg,40%)。1HNMR(500MHz,CDCl3)位移=δ9.22(s,1H),8.49(d,J=5.4Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.4Hz,1H),7.59(d,J=8.8Hz,1H),5.74(s,1H),5.28(d,J=2.4Hz,1H),3.15(dd,J=9.3Hz,9.3Hz,1H),3.01(dt,J=13.7,2.4Hz,2H),2.83(dd,J=6.8,6.8Hz,2H),2.52(dd,J=11.2,8.3Hz,2H),2.15-2.40(m,6H),2.02-2.07(m,3H),1.79-1.97(m,3H),1.72(m,3H),1.61(m,3H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H37F2N2O[M+H]+:503.2874,测定值503.2807。
β-2-氧杂-6-氮杂螺环[3.4]辛烷38B和α-2-氧杂-6-氮杂螺环[3.4]辛烷38A
β-2-氧杂-6-氮杂螺环[3.4]辛烷38B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:47.5:47.5:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-2-氧杂-6-氮杂螺环[3.4]辛烷38B(3.4mg,55%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21(s,1H),8.39(d,J=5.4Hz,1H),7.99(s,1H),7.90(d,J=8.8Hz,1H),7.81(d,J=5.9Hz,1H),7.76(dd,J=1.7,8.5Hz,1H),5.73-5.70(m,1H),5.28-5.23(m,1H),4.63(d,J=2.4Hz,4H),3.28-3.21(m,1H),2.90(dd,J=9.3,49.8Hz,2H),2.62(t,J=7.3Hz,2H),2.54-2.40(m,5H),2.36-2.27(m,2H),2.23-2.16(m,1H),2.13(s,2H),2.10-2.05(m,1H),2.02-1.88(m,6H),1.81-1.66(m,2H),1.66-1.57(m,1H),0.58(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C34H41N2O2[M+H]+:509.7015,测定值509.7013。
β-环丙胺39B和α-环丙胺39A
β-环丙胺39B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:47.5:47.5:5EtOAc:己烷类:2MNH3甲醇溶液)纯化以提供β-环丙胺39B(3.7mg,55%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21(s,1H),8.39(d,J=5.9Hz,1H),7.99(s,1H),7.90(d,J=8.8Hz,1H),7.81(d,J=5.4Hz,1H),7.76(dd,J=1.7,8.5Hz,1H),5.73(d,J=2.0Hz,1H),5.28-5.24(m,1H),3.24(t,J=20.0Hz,1H),3.18-3.12(m,1H),2.54-2.40(m,4H),2.36-2.27(m,2H),2.18(s,3H),2.05-2.00(m,2H),2.00-1.95(m,2H),1.94-1.91(m,1H),1.91-1.84(m,2H),1.77-1.66(m,3H),0.58(s,3H),0.51(d,J=4.4Hz,2H),0.39(dd,J=2.2,3.7Hz,2H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C31H37N2O[M+H]+:453.6383,测定值453.6381。
β-环丙基甲胺40B
粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:47.5:47.5:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-甲基环丙胺40B(1.1mg,85%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21(s,1H),8.39(d,J=5.4Hz,1H),8.00-7.98(m,1H),7.90(d,J=7.8Hz,1H),7.81(d,J=5.9Hz,1H),7.76(dd,J=1.5,9.3Hz,1H),5.78-5.74(m,1H),5.29-5.25(m,1H),3.26-3.24(m,1H),3.23(t,J=9.8Hz,1H),3.27-3.21(m,1H),2.88(t,J=1.0Hz,1H),2.56-2.49(m,1H),2.48-2.41(m,2H),2.37(s,3H),2.33-2.26(m,1H),2.23-2.10(m,3H),2.03(d,J=7.3Hz,2H),2.01-1.96(m,1H),1.96-1.88(m,2H),1.88-1.82(m,1H),1.79-1.68(m,2H),0.59(m,5H),0.50-0.46(m,2H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O[M+H]+:467.6649,测定值467.6645。
β-3-甲基-3-氧杂环丁胺41B和α-3-甲基-3-氧杂环丁胺41A
β-3-甲基-3-氧杂环丁胺41B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:47.5:47.5:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-3-甲基-3-氧杂环丁胺41B(4.7mg,81%)。1HNMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21(s,1H),8.39(d,J=5.4Hz,1H),7.99(s,1H),7.90(d,J=8.8Hz,1H),7.81(d,J=5.9Hz,1H),7.78-7.74(m,1H),5.75(d,J=1.5Hz,1H),5.29-5.26(m,1H),4.61(dd,J=3.4,5.9Hz,2H),4.36(dd,J=5.9,8.3Hz,2H),3.27-3.21(m,1H),3.19-3.11(m,1H),2.50(d,J=8.3Hz,4H),2.29(s,2H),2.23-2.13(m,2H),2.02-1.95(m,2H),1.94-1.87(m,3H),1.80-1.67(m,4H),1.55(br.s.,4H),0.59(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O2[M+H]+:483.6643,测定值483.6640。
β-N-甲基-1-(3-甲基-3-氧杂环丁基)甲胺42B和α-N-甲基-1-(3-甲基-3-氧杂环
丁基)甲胺42A
β-N-甲基-1-(3-甲基-3-氧杂环丁基)甲胺42B:粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:47.5:47.5:5EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-N-甲基-1-(3-甲基-3-氧杂环丁基)甲胺42B(1.5mg,24%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.22(s,1H),8.39(d,J=5.9Hz,1H),7.99(s,1H),7.90(d,J=8.3Hz,1H),7.81(d,J=5.9Hz,1H),7.76(dd,J=1.7,8.5Hz,1H),5.75-5.72(m,1H),5.31-5.27(m,1H),4.57-4.51(m,2H),4.32(dd,J=1.5,5.9Hz,2H),3.28-3.22(m,1H),2.69(s,2H),2.57-2.31(m,5H),2.30-2.15(m,4H),2.04-1.86(m,5H),1.82(t,J=24.9Hz,1H),1.77-1.69(m,1H),1.68-1.57(m,2H),1.39(d,J=2.9Hz,6H),0.58(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C34H43N2O2[M+H]+:511.7174,测定值511.7173。
β-叔丁基胺43B和α-叔丁基胺43A
β-叔丁基胺43B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:50:1EtOAc:三乙胺)纯化以提供β-叔丁基胺43B(3.4mg,60%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.49(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.3Hz,1H),7.62(d,J=5.9Hz,1H),7.59(d,J=8.3Hz,1H),5.75(d,J=2.0Hz,1H),5.29(m,1H),3.14(dd,J=10.8,10.8Hz,1H),2.52(dd,J=11.7,8.8Hz,1H),2.32–2.38(m,2H),2.13-2.26(m,5H),2.01-2.08(m,2H),1.94(dd,J=17.6,5.4Hz,1H),1.84-1.87(m,3H),1.62-1.74(m,3H),1.25(br s,9H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H41N2O[M+H]+:469.3219,测定值469.3265。
β-氮杂环丙烷78B和α-氮杂环丙烷78A
向酮13(6mg,0.0146mmol)在甲醇(0.5mL)中的溶液添加2-氯乙胺盐酸盐(5.1mg,0.0437mmol),接着加入三乙胺(0.006mL,0.0437mmol)。该混合物在室温下搅拌15分钟。加入冰醋酸(0.0025mL,0.0437mmol)且该混合物在室温下搅拌20分钟。该混合物冷却到0℃并加入氰硼氢化钠(3.2mg,0.0510mml)。反应允许经16小时升温至室温且然后用饱和氯化铵溶液(5mL)淬灭。该混合物用乙酸乙酯(3X8mL)萃取。合并的有机部分用无水硫酸镁干燥,过滤并浓缩。粗制品通过硅胶色谱(乙酸乙酯,2%三乙胺作为洗脱剂)纯化以提供所需的β-氮杂环丙烷78B(4.5mg,72%产率)。
1H NMR(500MHz,CDCl3)δ=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.87Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.80Hz,1H),7.63(d,J=5.38Hz,1H),7.59(d,J=8.80Hz,1H),5.74(d,J=1.96Hz,1H),5.25(m,1H),3.34(m,2H),3.14(dd,J=10.27,10.27Hz,1H),2.75(m,3H),2.51(dd,J=11.25,8.31,1H),2.44(m,1H),2.29-2.37(m,3H),2.12-2.27(m,3H),1.81-2.08(m,3H),1.54-1.74(m,4H),1.15(m,1H),1.05(m,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H35N2O[M+H]+:439.2749,测定值439.2721。
β-羟脯氨酸65B和α-羟脯氨酸65A
酮13在‘方法B’的条件下与羟脯氨酸甲基酯反应。粗混合物溶解于水中的THF:MeOH:1 M LiOH=3:3:1中并在55℃下搅拌1.5小时。粗混合物粗略地浓缩并施加pH 3.7的乙酸钠缓冲液,接着用氯仿萃取三次。粗混合物通过制备型TLC(洗脱剂:5:1CHCl3:MeOH)纯化以提供β-羟脯氨酸65B(3.7mg,2个步骤58%)。
1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(br.s.,1H),8.47(br.s.,1H),7.77(br.s.,1H),7.75(d,J=8.2Hz,1H),7.63(br.s.,1H),7.57(d,J=8.2Hz,1H),5.77(s,1H),5.30(br.s.,1H),4.47(br.s.,1H),4.21-4.08(m,1H),4.01-3.90(m,0H),3.55(br.s.,1H),3.19-3.11(m,1H),3.12(t,J=8.8Hz,1H),2.51-2.44(m,J=10.6,10.6Hz,1H),2.44-2.37(m,2H),2.35(d,J=17.6Hz,2H),2.31-2.14(m,6H),2.11(dd,J=6.2,13.2Hz,1H),2.06-1.96(m,2H),1.92(dd,J=4.7,17.6Hz,1H),1.87-1.68(m,3H),0.53(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C33H39N2O4[M+H]+:527.2904,测定值527.2921。
α-二甲胺14A和β-二甲胺14B
粗混合物顺序地通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供α-二甲胺14A(2.2mg,68%)。1H NMR(600MHz,C6D6)位移=9.26(s,1H),8.56(d,J=5.9Hz,1H),7.44-7.39(m,1H),7.36(d,J=8.2Hz,1H),7.21-7.20(m,1H),7.20(d,J=5.9Hz,1H),5.68-5.65(m,1H),5.15-5.11(m,1H),2.72-2.66(m,J=10.0Hz,1H),2.59(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.34(tt,J=2.9,12.1Hz,1H),2.16(td,J=3.2,16.0Hz,1H),2.09(s,6H),2.13-1.92(m,8H),1.85(ddd,J=5.0,9.0,13.6Hz,1H),1.73(dt,J=5.3,12.3Hz,1H),1.72-1.66(m,2H),1.60-1.57(m,1H),1.57-1.49(m,1H),1.20(dq,J=4.1,12.3Hz,1H),0.40(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H37N2O[M+H]+:441.2900,测定值441.2909。
α-单甲胺24A和β-单甲胺24B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:10:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供α-单甲胺24A(ca.1.2mg,37%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.81(s,1H),7.77(d,J=8.8Hz,1H),7.64(d,J=5.4Hz,1H),7.61(dd,J=1.0,8.8Hz,1H),5.76(s,1H),5.29(d,J=2.4Hz,1H),3.16(t,J=10.0Hz,1H),2.61-2.50(m,3H),2.49(s,3H),2.43-2.30(m,3H),2.30-2.15(m,4H),2.13-1.99(m,2H),1.95(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.88(dq,J=4.9,11.7Hz,1H),1.79-1.60(m,3H),1.19(dq,J=4.4,12.7Hz,1H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C29H35N2O[M+H]+:427.2744,测定值427.2759。
α-伯胺62A和β-伯胺62B
粗混合物通过制备型TLC纯化(硅胶,洗脱剂:25:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)以提供α-伯胺62A(3.7mg,38%)和β-伯胺62B(2.5mg,26%)。
α-伯胺62A: 1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.3Hz,1H),7.59(dd,J=1.2,8.2Hz,1H),5.74(s,1H),5.27(d,J=2.9Hz,1H),3.14(t,J=10.0Hz,1H),2.85(tt,J=3.2,11.7Hz,1H),2.51(dd,J=8.5,11.4Hz,1H),2.40-2.28(m,3H),2.27-2.12(m,4H),2.10-1.96(m,3H),1.93(dd,J=5.3,17.6Hz,1H),1.92-1.81(m,2H),1.76-1.62(m,2H),1.22(dtd,J=4.1,11.7,13.5Hz,1H),0.53(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H33N2O[M+H]+:413.2587,测定值413.2590。
β-伯胺62B: 1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.2Hz,1H),7.62(d,J=5.3Hz,1H),7.59(dd,J=1.5,8.5Hz,1H),5.73(d,J=1.2Hz,1H),5.25(d,J=2.9Hz,1H),3.47(td,J=3.7,7.9Hz,1H),3.13(t,J=10.0Hz,1H),2.58(dt,J=5.3,14.1Hz,1H),2.51(dd,J=8.5,11.4Hz,1H),2.39-2.21(m,5H),2.17(dq,J=5.3,9.4Hz,1H),2.13(ddd,J=2.3,4.7,15.8Hz,1H),2.10-1.99(m,2H),1.93(dd,J=5.3,17.0Hz,1H),1.86(dq,J=5.3,12.3Hz,1H),1.82(ddd,J=1.8,4.1,13.5Hz,1H),1.78-1.66(m,3H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H33N2O[M+H]+:413.2587,测定值413.2599。
α-吗啉15A和β-吗啉15B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:40:1 EtOAc:MeOH)纯化以提供α-吗啉15A(ca.1.5mg,38%)。1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.23(s,1H),8.49(d,J=5.4Hz,1H),7.80(s,1H),7.76(d,J=8.3Hz,1H),7.63(d,J=5.4Hz,1H),7.60(d,J=8.3Hz,1H),5.74(s,1H),5.29(d,J=2.9Hz,1H),3.73(br.s.,4H),3.15(t,J=10.0Hz,1H),2.60(br.s.,4H),2.52(dd,J=8.5,11.5Hz,2H),2.46-2.29(m,3H),2.29-2.13(m,4H),2.12-1.99(m,2H),1.94(dd,J=5.1,17.3Hz,1H),1.94-1.81(m,3H),1.73(td,J=8.2,12.3Hz,1H),1.70-1.63(m,1H),1.38(dq,J=4.4,12.2Hz,1H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O2[M+H]+:483.3006,测定值483.3000。
α-吡咯烷19A和β-吡咯烷19B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:20:10:3 EtOAc:己烷类:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供α-吡咯烷19A(2.5mg,55%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.2Hz,1H),7.62(d,J=5.3Hz,1H),7.59(d,J=8.8Hz,1H),5.72(s,1H),5.27(d,J=2.9Hz,1H),3.14(t,J=10.0Hz,1H),2.63(br.s.,4H),2.52(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.42-2.29(m,3H),2.28-2.15(m,5H),2.12(d,J=12.3Hz,1H),2.10-2.00(m,2H),1.93(dd,J=5.3,17.0Hz,1H),1.90-1.83(m,2H),1.80(br.s.,4H),1.72(td,J=8.8,12.9Hz,1H),1.63(br.s.,1H),1.37(dq,J=3.5,11.7Hz,1H),0.53(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O[M+H]+:467.3057,测定值467.3064。
α-氮杂环丁烷18A和β-氮杂环丁烷18B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:1:1 EtOAc:MeOH)纯化以提供α-氮杂环丁烷18A(ca.1.5mg,38%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.4Hz,1H),7.80(s,1H),7.77(d,J=8.8Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(d,J=8.8Hz,1H),5.74(s,1H),5.28(br.s.,1H),3.24(br.s.,4H),3.16(t,J=9.8Hz,1H),2.54(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.42-2.30(m,3H),2.30-2.13(m,5H),2.12-2.00(m,2H),1.95(dd,J=5.4,18.1Hz,1H),1.93-1.78(m,3H),1.74(td,J=8.3,12.2Hz,1H),1.67-1.54(m,3H),1.11(q,J=12.2Hz,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C31H37N2O[M+H]+:453.2906,测定值453.2900。
α-叔丁基胺43A和β-叔丁基胺43B
粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:10:1 CHCl3:i-PrOH)纯化以提供α-叔丁基胺43A(2.4mg,42%)和β-叔丁基胺43B(1.6mg,28%)。
α-叔丁基胺43A: 1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(br.s.,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.78(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.3Hz,1H),7.58(dd,J=1.2,8.2Hz,1H),5.73(s,1H),5.28(d,J=2.3Hz,1H),3.14(t,J=9.7Hz,1H),2.49(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.46-2.40(m,1H),2.39-2.29(m,3H),2.28-2.12(m,5H),2.08-1.99(m,1H),1.93(dd,J=5.3,17.0Hz,1H),1.83(dq,J=5.0,12.2Hz,2H),1.76-1.60(m,3H),1.55(br.s.,9H),1.26-1.18(m,1H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H41N2O[M+H]+:469.3213,测定值469.3223。
β-叔丁基胺43B: 1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.3Hz,1H),7.78(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.62(d,J=5.9Hz,1H),7.59(d,J=9.4Hz,1H),5.73(br.s.,1H),5.25(br.s.,1H),3.38-3.23(m,1H),3.13(t,J=10.0Hz,1H),2.57-2.48(m,1H),2.49(dd,J=8.5,10.9Hz,1H),2.40-2.27(m,2H),2.25-2.08(m,4H),2.07-1.98(m,2H),1.93(dd,J=5.3,17.6Hz,2H),1.84(dq,J=5.3,12.3Hz,1H),1.76-1.66(m,2H),1.65-1.47(m,3H),1.42-0.94(br.s.,9H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H41N2O[M+H]+:469.3213,测定值469.3225。
α-羟基氮杂环丁烷70A和β-羟基氮杂环丁烷70B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:2:3 EtOAc:MeOH)纯化以提供α-羟基氮杂环丁烷70A(1.2mg,30%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.4Hz,1H),7.80(s,1H),7.77(d,J=8.3Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(d,J=8.3Hz,1H),5.77(s,1H),5.32(d,J=2.4Hz,1H),4.66-4.55(m,1H),3.94(br.s.,2H),3.34(br.s.,2H),3.16(t,J=9.8Hz,1H),2.53(dd,J=8.5,11.5Hz,1H),2.41(dd,J=15.6,28.3Hz,2H),2.34(dt,J=4.9,11.2Hz,1H),2.28(t,J=11.2Hz,1H),2.25-2.14(m,3H),2.10-1.98(m,2H),1.95(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.96-1.89(m,1H),1.86(dd,J=5.4,12.2Hz,1H),1.84-1.76(m,2H),1.74(td,J=8.4,12.4Hz,1H),1.65(dt,J=7.8,10.5Hz,1H),1.40-1.27(m,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C31H37N2O2[M+H]+:469.2850,测定值469.2872。
α-羟基甲基氮杂环丁烷69A和β-羟基甲基氮杂环丁烷69B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:1:1 EtOAc:MeOH)纯化以提供α-羟基甲基氮杂环丁烷69A(2.3mg,53%)。1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.23(s,1H),8.49(d,J=5.9Hz,1H),7.80(s,1H),7.76(d,J=8.2Hz,1H),7.63(d,J=5.9Hz,1H),7.59(d,J=8.8Hz,1H),5.76(s,1H),5.30(d,J=2.9Hz,1H),3.65-3.35(m,4H),3.15(t,J=10.0Hz,1H),2.52(dd,J=8.5,11.4Hz,1H),2.40(dd,J=16.4,25.8Hz,2H),2.33(dt,J=4.1,11.7Hz,1H),2.26(t,J=11.4Hz,1H),2.24(m,3H),2.09-2.00(m,1H),1.98(br.s.,1H),1.94(dd,J=5.0,17.3Hz,1H),1.92-1.77(m,4H),1.73(td,J=8.2,12.9Hz,1H),1.67-1.59(m,1H),1.58-1.50(br.s.,3H),1.39-1.28(m,1H),0.58-0.51(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O2[M+H]+:483.3006,测定值483.3000。
α-氨基乙基磺酰胺71A和β-氨基乙基磺酰胺71B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:100%EtOAc)纯化以提供β-氨基乙基磺酰胺71B(0.7mg,15%)和α-氨基乙基磺酰胺71A(1.1mg,24%)。
β-氨基乙基磺酰胺71B: 1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.21-9.17(m,1H),8.37(d,J=5.9Hz,1H),7.97(s,1H),7.88(d,J=8.3Hz,1H),7.79(d,J=5.4Hz,1H),7.74(dd,J=1.5,8.8Hz,1H),5.74-5.69(m,1H),5.28-5.22(m,1H),3.26-3.18(m,J=9.8Hz,1H),3.14-3.00(m,4H),2.59-2.38(m,4H),2.37-2.26(m,2H),2.23-2.06(m,3H),2.03-1.86(m,5H),1.85-1.76(m,1H),1.76-1.59(m,3H),0.57(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H38N3O3S[M+H]+:520.2628,测定值520.2640。
α-氨基乙基磺酰胺71A: 1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.19(s,1H),8.37(d,J=5.9Hz,1H),7.97(s,1H),7.88(d,J=8.8Hz,1H),7.79(d,J=5.9Hz,1H),7.74(dd,J=1.7,8.6Hz,1H),5.77-5.71(m,1H),5.30-5.24(m,1H),3.29-3.24(m,2H),3.23(dd,J=9.0,11.0Hz,1H),3.13(dt,J=2.7,6.7Hz,2H),2.73(tt,J=3.1,12.0Hz,1H),2.50(dd,J=8.6,11.5Hz,1H),2.47-2.38(m,2H),2.39-2.34(m,1H),2.32(d,J=11.2Hz,1H),2.30-2.22(m,2H),2.17(dtd,J=5.9,9.3,14.7Hz,2H),2.10-2.03(m,1H),2.01(s,1H),2.00-1.92(m,1H),1.90(dd,J=6.4,17.1Hz,1H),1.72(td,J=8.3,12.3Hz,1H),1.68-1.60(m,2H),1.18(dq,J=4.4,12.2Hz,1H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H38N3O3S[M+H]+:520.2628,测定值520.2643。
α-羟基氨基甲基氧杂环丁烷72A和β-羟基氨基甲基氧杂环丁烷72B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:100%EtOAc)纯化以提供α-羟基氨基甲基氧杂环丁烷72A(1.5mg,34%)。1H NMR(500MHz,CD3OD)位移=9.19(s,1H),8.38(d,J=5.4Hz,1H),7.97(s,1H),7.88(d,J=8.3Hz,1H),7.79(d,J=5.9Hz,1H),7.74(dd,J=1.5,8.8Hz,1H),5.84-5.78(m,1H),5.35-5.30(m,1H),4.64(d,J=7.3Hz,2H),4.57(dd,J=3.7,7.1Hz,2H),3.48-3.40(m,2H),3.24(dd,J=9.0,11.0Hz,2H),2.54-2.48(m,J=8.8Hz,1H),2.48-2.40(m,3H),2.40-2.24(m,4H),2.24-2.13(m,3H),2.01-1.85(m,4H),1.80-1.64(m,2H),1.46(dq,J=4.9,12.2Hz,1H),0.57(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C32H39N2O3[M+H]+:499.2955,测定值499.2933。
β-PEG胺75B和α-PEG胺75A
β-PEG胺75B:粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:5:5:1EtOAc:二氯甲烷:2MNH3甲醇溶液)纯化以提供β-PEG胺75B(1.0mg,18%).1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.81(s,1H),7.77(d,J=8.3Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.61(dd,J=1.7,8.5Hz,1H),5.72(d,J=1.5Hz,2H),5.25(dd,J=2.2,5.1Hz,1H),3.71-3.64(m,6H),3.62(t,J=5.4Hz,2H),3.58(dd,J=3.7,5.6Hz,2H),3.41(s,3H),3.19-3.12(m,J=10.7Hz,1H),3.11(t,J=3.9Hz,1H),2.79(t,J=5.4Hz,2H),2.56(t,J=16.1Hz,1H),2.52(dd,J=8.3,11.2Hz,1H),2.42-2.29(m,3H),2.27-2.13(m,2H),2.12-2.01(m,2H),2.02(dd,J=3.7,13.9Hz,1H),1.95(br.s.,2H),1.86(dq,J=5.4,12.2Hz,1H),1.80-1.73(m,1H),1.71(dd,J=3.2,11.5Hz,1H),1.68-1.58(m,2H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C35H47N2O4[M+H]+:559.3530,测定值559.3545。
α-PEG胺75A:粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:100:5:1 EtOAc:MeOH:三乙胺)纯化以提供α-PEG胺75A(1.1mg,20%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.81(s,1H),7.77(d,J=8.8Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.61(dd,J=1.5,8.8Hz,1H),5.75(d,J=2.0Hz,1H),5.28(dd,J=2.2,5.1Hz,1H),3.70-3.65(m,7H),3.64(t,J=5.4Hz,2H),3.61-3.55(m,2H),3.41(s,3H),3.16(dd,J=9.0,10.5Hz,1H),2.87(t,J=5.1Hz,2H),2.67(t,J=11.5Hz,1H),2.54(dd,J=8.3,11.7Hz,1H),2.38(d,J=16.1Hz,3H),2.24(d,J=12.2Hz,2H),2.22-2.14(m,2H),2.11-2.02(m,2H),1.95(dd,J=5.4,16.6Hz,1H),1.88(dq,J=5.4,12.2Hz,1H),1.78-1.69(m,2H),1.68-1.62(m,1H),1.27-1.19(m,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C35H47N2O4[M+H]+:559.3530,测定值559.3542。
α-甲基磺酰胺73A
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:40:1 MeOH:二氯甲烷)纯化以提供α-甲基磺酰胺73A(2.0mg,82%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(br.s.,1H),8.51(d,J=4.9Hz,1H),7.80(s,1H),7.77(d,J=8.3Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(dd,J=1.5,8.3Hz,1H),5.78(d,J=1.5Hz,1H),5.36-5.29(m,1H),4.24(d,J=7.8Hz,1H),3.53(tdt,J=3.9,7.7,11.7Hz,1H),3.20-3.11(m,J=10.7Hz,1H),3.04(s,3H),2.51(dd,J=8.3,11.7Hz,1H),2.37(d,J=16.6Hz,3H),2.28(br.s.,2H),2.25-2.10(m,4H),2.10-2.00(m,1H),1.96(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.88(dt,J=5.4,11.7Hz,1H),1.85(t,J=12.2Hz,1H),1.80-1.66(m,2H),1.47-1.35(m,J=4.4Hz,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C29H35N2O3S[M+H]+:491.2363,测定值491.2387。
β-甲基磺酰胺73B
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:40:1 MeOH:二氯甲烷)纯化以提供β-甲基磺酰胺73B(1.7mg,90%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.80(s,1H),7.78(d,J=8.8Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(dd,J=1.5,8.3Hz,1H),5.79(d,J=1.5Hz,1H),5.35-5.30(m,1H),4.31(d,J=6.3Hz,1H),4.00(quind,J=3.6,6.7Hz,1H),3.16(dd,J=9.0,10.5Hz,1H),3.03(s,3H),2.52(dd,J=8.5,11.5Hz,1H),2.41(t,J=16.1Hz,1H),2.39(br.s.,2H),2.32-2.26(m,2H),2.26-2.14(m,3H),2.12-1.99(m,2H),1.96(dd,J=5.1,17.3Hz,2H),1.86(dq,J=5.4,12.2Hz,1H),1.83-1.72(m,3H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C29H35N2O3S[M+H]+:491.2363,测定值491.2376。
α-甲基-甲基磺酰胺76A
粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:40:1 MeOH:二氯甲烷)纯化以提供α-甲基-甲基磺酰胺76A(0.7mg,57%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.51(d,J=5.9Hz,1H),7.81(s,1H),7.78(d,J=8.3Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(dd,J=1.5,8.3Hz,1H),5.79(s,1H),5.33(dd,J=2.2,5.6Hz,1H),3.98(tt,J=3.4,12.4Hz,1H),3.16(dd,J=9.0,10.5Hz,1H),2.89(s,3H),2.80(s,3H),2.52(dd,J=8.5,11.5Hz,1H),2.44(ddd,J=2.7,4.1,16.6Hz,1H),2.36(br.s.,3H),2.28(d,J=10.7Hz,2H),2.21(dq,J=4.9,9.1Hz,1H),2.14(t,J=12.7Hz,1H),2.10-2.00(m,0H),1.97(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.93(dd,J=2.9,12.2Hz,1H),1.88(dd,J=5.4,12.2Hz,1H),1.87-1.81(m,1H),1.80-1.60(m,3H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H37N2O3S[M+H]+:505.2519,测定值505.2537。
实施例2.从异喹啉化合物10至12的另一可能路线
设计了得到异喹啉12的新路线。参见以下方案2-1。三氟甲磺酸化/Suzuki交叉偶联反应如图中所示用指定的试剂在相似的基质上实现。参见,例如,Nicolaou等.J.Am.Chem.Soc.2009,131,10587-10597。
方案2-1.
三氟甲磺酸盐20的合成
在-78℃下向单酮10(200mg,584μmol,1.00当量)在THF(4mL)中的溶液逐滴加入NaHMDS(1M,701μL,701μmol,1.20当量)。在搅拌1.5h后,THF(2.5mL)中的PhNTf2(313mg,876μmol,1.50当量)插管且反应混合物升温至最高0℃。在另外30min后,饱和NH4Cl溶液(8mL)加入到搅拌的反应混合物并用EtOAc(10mL)稀释。层分离且水层用EtOAc(2×6mL)萃取,有机层合并,用盐水(15mL)洗涤,用Na2SO4干燥,且减压浓缩。所得的残留物然后通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:8:1→5:1己烷类:EtOAc)纯化以提供三氟甲磺酸盐20(237mg,86%)。1HNMR(500MHz,CDCl3)位移=5.76(s,1H),5.67(br.s.,1H),5.32(dd,J=2.0,4.9Hz,1H),4.02-3.94(m,4H),2.67(dd,J=6.8,10.7Hz,1H),2.49(t,J=14.6Hz,1H),2.45(ddd,J=3.7,6.5,15.2Hz,1H),2.38-2.28(m,4H),2.17(ddd,J=1.5,10.7,12.7Hz,1H),2.12(d,J=13.2Hz,1H),2.10(dd,J=5.9,17.6Hz,1H),1.98(dd,J=2.7,13.4Hz,1H),1.88(ddd,J=7.6,8.9,12.8Hz,1H),1.80(tdd,J=2.4,4.8,12.7Hz,1H),1.74-1.63(m,2H),1.03(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C22H26O6F3S[M+H]+:475.1397,测定值475.1411。
从三氟甲磺酸盐20合成17,18-不饱和的异喹啉21的Suzuki交叉偶联
向三氟甲磺酸盐20(1.00当量)和异喹啉-7-硼酸(3.00当量)在1,4-二噁烷和H2O(10:1,0.02M)中的溶液添加K2CO3(3.00当量)且溶液通过惰性Ar鼓泡5min。添加Pd(dppf)Cl2·CH2Cl2(0.05当量)且反应混合物在80℃下搅拌1h。混合物允许冷却到室温并施用饱和NaHCO3溶液。混合物用EtOAc稀释且层分离。水层用EtOAc萃取且合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,且减压浓缩。
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:2:1→1:1→1:2己烷类:EtOAc)纯化以提供17,18-不饱和的异喹啉21(490mg,84%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.23(s,1H),8.49(d,J=5.4Hz,1H),7.94(s,1H),7.85-7.81(m,1H),7.80-7.75(m,1H),7.63(d,J=5.4Hz,1H),6.26(br.s.,1H),5.82(s,1H),5.40(d,J=3.4Hz,1H),4.08-3.90(m,4H),2.76(dd,J=7.1,11.0Hz,1H),2.58(dt,J=5.4,17.6Hz,1H),2.56-2.40(m,3H),2.40-2.28(m,4H),2.16(d,J=13.2Hz,1H),2.02(dd,J=2.0,13.2Hz,1H),1.94(td,J=8.8,13.2Hz,1H),1.81(td,J=2.0,12.7Hz,1H),1.76-1.67(m,2H),1.18(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H32NO3[M+H]+:454.2377,测定值454.2366。
异喹啉12从17,18-不饱和的异喹啉21的合成
向17,18-不饱和的异喹啉21(400mg,877μmol,1.0当量)在THF(36mL)中的溶液添加10wt%Pd/C(280mg,263μmol,0.30当量)并安装H2球囊。在3h后,反应混合物通过硅藻土垫过滤并用0.2M NH3甲醇溶液(40mL)洗涤,减压浓缩。残留物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:1→1:2己烷类:EtOAc)纯化以提供异喹啉12(325mg,80%)。谱数据与从1-氯代异喹啉加成物11构建的异喹啉12一致。
实施例3.异喹啉类似物的合成
方案3-1.
方案3-2.
方案3-3.
方案3-4.
从三氟甲磺酸盐20至17,18-不饱和的5-吲唑56的Suzuki交叉偶联
向三氟甲磺酸盐20(1.00当量)和吲唑-5-硼酸酯(3.00当量)在1,4-二噁烷和H2O(10:1,0.02M)中的溶液加入K2CO3(3.00当量)且溶液通过惰性Ar鼓泡5min。添加Pd(dppf)Cl2·CH2Cl2(0.05当量)且反应混合物在80℃下搅拌1h。混合物允许冷却到室温并施加饱和NaHCO3溶液。混合物用EtOAc稀释且层分离。水层用EtOAc萃取且合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,且减压浓缩。
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:3→1:1 EtOAc:己烷类)纯化以提供17,18-不饱和的6-吲唑56(13mg,70%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.04(s,1H),7.67(d,J=10.0Hz,1H),7.49(s,1H),7.27(d,J=10.0Hz,1H),6.12(br.s.,1H),5.78(br.s.,1H),5.36(t,J=5.0Hz,1H),3.99(m,4H),2.72(m,1H),2.53-2.44(m,3H),2.40(br.d.,J=10.0Hz,1H),2.36-2.25(m,4H),2.14(d,J=10.0Hz,1H),2.00(dd,J=10.0,5.0Hz,1H),1.93-1.87(m,1H),1.79(m,1H),1.72-1.66(m,2H),1.10(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H31N2O3[M+H]+:443.5573,测定值443.5571。
从三氟甲磺酸盐20至17,18-不饱和的6-吲唑59的Suzuki交叉偶联
向三氟甲磺酸盐20(1.00当量)和吲唑-6-硼酸酯(3.00当量)在1,4-二噁烷和H2O(10:1,0.02M)中的溶液加入K2CO3(3.00当量)且溶液通过惰性Ar鼓泡5min。添加Pd(dppf)Cl2·CH2Cl2(0.05当量)且反应混合物在80℃下搅拌1h。混合物允许冷却到室温并施加饱和NaHCO3溶液。混合物用EtOA稀释和层分离。水层用EtOAc萃取且合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,且减压浓缩。
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:4→3:1 EtOAc:己烷类)纯化以提供17,18-不饱和的5-吲唑59(5.9mg,65%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=10.04(br s,1H),8.05(s,1H),7.75(s,1H),7.46(ABq,JAB=8.8Hz,Δν=33.5Hz,2H),6.02(s,1H),5.79(s,1H),5.38(dd,J=3.4,3.4Hz,1H),3.94-4.01(m,4H),2.73(dd,J=10.7,6.8Hz,1H),2.44-2.53(m,3H),2.40(d,12.2Hz,1H),2.28-2.36(m,3H),2.15(d,J=13.2Hz,1H),2.03(parobs d,J=11.2Hz,1H),2.01(par obs dd,J=13.2,2.4Hz,1H),1.91(dt,J=12.21,9.3Hz,1H),1.77-1.82(m,1H),1.66-1.73(m,2H),1.10(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H31N2O3[M+H]+:443.2335,测定值443.4956。
β-二甲胺氨基甲基吡啶46B和α-二甲胺氨基甲基吡啶46A
β-二甲胺氨基甲基吡啶46B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:10:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-二甲胺氨基甲基吡啶46B(5mg,55%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.58(s,1H),8.51(dd,J=1.5,4.9Hz,1H),7.71(td,J=2.0,7.8Hz,1H),7.26(dd,J=4.9,7.8Hz,1H),5.71(s,1H),5.24(dd,J=2.4,4.4Hz,1H),3.88-3.80(m,2H),2.81(t,J=9.0Hz,1H),2.45(dt,J=6.3,13.7Hz,1H),2.46-2.37(m,1H),2.30(br.s.,6H),2.26-2.19(m,3H),2.17-2.07(m,5H),1.92(dd,J=2.9,13.7Hz,2H),1.79(dddd,J=4.9,8.3,10.3,13.2Hz,1H),1.74-1.59(m,4H),1.39(ddt,J=4.4,9.8,12.7Hz,1H),0.80(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C27H38N3O[M+H]+:420.3009,测定值420.2999。
β-二甲胺17,18-不饱和的酰胺吡啶49B和α-二甲胺17,18-不饱和的酰胺吡啶49A
方法A
β-二甲胺17,18-不饱和的酰胺吡啶49B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:8:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-二甲胺17,18-不饱和的酰胺吡啶49B(2.1mg,44%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.58(d,J=2.4Hz,1H),8.36(dd,J=1.0,4.9Hz,1H),8.23(td,J=2.0,8.3Hz,1H),7.49(s,1H),7.29(dd,J=4.9,8.8Hz,1H),6.57(br.s.,1H),5.73(s,1H),5.33(dd,J=2.0,5.4Hz,1H),2.66-2.56(m,2H),2.54(dd,J=3.2,6.6Hz,1H),2.51-2.32(m,5H),2.28(br.s.,6H),2.20(ddd,J=1.2,11.0,12.7Hz,1H),2.10(td,J=6.4,13.1Hz,2H),1.97-1.89(m,3H),1.76(dt,J=7.8,11.2Hz,1H),1.66-1.55(m,1H),1.14(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C27H34N3O2[M+H]+:432.2646,测定值432.2649。
β-二甲胺17,18-不饱和的酞嗪55B和α-二甲胺17,18-不饱和的酞嗪55A
β-二甲胺17,18-不饱和的酞嗪55B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:9:1EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-二甲胺17,18-不饱和的酞嗪55B(5.5mg,73%)。1HNMR(500MHz,CDCl3)位移=9.50(s,2H),7.97-8.03(m,1H),7.89(d,J=4.39Hz,2H),6.34-6.39(m,1H),5.77-5.83(m,1H),5.32-5.43(m,1H),2.72(dd,J=11.23,6.84Hz,1H),2.38-2.50(m,4H),2.47(br.m.,6H),2.24-2.30(m,3H),2.09-2.20(m,2H),2.03(d,J=10.25Hz,2H),1.88-1.99(m,2H),1.75-1.86(m,2H),1.17(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H33N3O[M+H]+:440.5998,测定值440.5995。
β-二甲胺17,18-不饱和的6-吲唑58B和α-二甲胺17,18-不饱和的6-吲唑58A
β-二甲胺17,18-不饱和的6-吲唑58B:粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:9:1EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-二甲胺17,18-不饱和的6-吲唑58B(3.9mg,73%)。1HNMR(500MHz,CDCl3)位移=8.03(s,1H),7.67(d,J=8.30Hz,1H),7.49(s,1H),7.25-7.28(m,1H),6.12(t,J=2.44Hz,1H),5.75(s,1H),5.33(t,J=3.42Hz,1H),3.22-3.38(m,1H),2.71(dd,J=11.23,6.84Hz,1H),2.44-2.50(m,4H),2.41(br.m.,6H),2.22-2.31(m,3H),2.09-2.20(m,2H),2.04(d,J=2.93Hz,2H),1.78(td,J=11.35,7.08Hz,2H),1.52-1.64(m,1H),1.07-1.15(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H33N3O[M+H]+:428.5891,测定值428.5889。
β-二甲胺17,18-不饱和的5-吲唑61B和α-二甲胺17,18-不饱和的5-吲唑61A
β-二甲胺17,18-不饱和的5-吲唑61B:粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:9:1 EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供β-二甲胺17,18-不饱和的5-吲唑61B(2.5mg,70%).1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.05(s,1H),7.75(s,1H),7.47(ABq,JAB=8.8Hz,Δν=33.5Hz,2H),6.02(dd,J=2.0,2.0Hz,1H),5.74(s,1H),5.33(dd,J=3.4,3.4Hz,1H),2.72(dd,J=11.2,6.8Hz,1H),2.43-2.48(m,5H),2.37-2.41(m,2H),2.26-2.35(m,8H),2.11(m,2H),2.04(d,J=6.8Hz,1H),1.88–1.98(m,3H),1.77(m,1H),1.10(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H34N3O[M+H]+:428.2702,测定值428.2653。
β-二甲胺酰胺吡啶50B的合成
向β-二甲胺17,18-不饱和的酰胺吡啶49B(ca.1.2mg)在MeOH(300μL)中的溶液添加Mg(ca.1mg)并在室温下搅拌48h。反应混合物添加H2O(700μL)并用EtOAc(700μL)稀释。水相用EtOAc(2×0.5mL)萃取且合并的有机相用盐水(0.5mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。残留物通过HPLC(Eclipse XDB-C8柱,9.4mm×25cm;梯度=0%→35%MeCN(0.1%甲酸):H2O(0.1%甲酸),30min)纯化以提供β-二甲胺酰胺吡啶50B(ca.0.3mg,25%)。由于太小的量,仅分配诊断峰。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.56(br.s,1H),8.37(d,J=3.4Hz,1H),8.21(d,J=8.3Hz,1H),7.09(br.s.,1H),5.81(s,1H),5.39-5.33(m,1H),2.78(br.s.,6H),0.83(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C27H35N3O2[M+H]+:434.2802,测定值434.2815。
酞嗪6-三氟甲磺酸盐51的合成
向6-酞嗪醇(phthalazinol)(588.4mg,4.26mmol,1.0当量)在CHCl3中的溶液添加N-苯基-双(三氟甲磺酰亚胺)(1.73g,4.83mmol,1.2当量)、Et3N(0.9mL,6.04mmol,1.5当量)和DMAP(cat.)。混合物升温到60℃并搅拌3h。反应冷却到室温并用饱和NaHCO3和CH2Cl2淬灭,且层分离。水层用CH2Cl2萃取。有机层合并,用Na2SO4干燥并减压浓缩。粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:9:1二氯甲烷:MeOH)纯化以提供酞嗪6-三氟甲磺酸酯51(995mg,90%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.68(d,J=3.91Hz,2H)8.19(d,J=8.79Hz,1H)7.96(br.s.,1H)7.84-7.89(m,1H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C9H6F3N2O3S[M+H]+:279.2157,测定值279.2152。
酞嗪6-三甲基锡52的合成
向酞嗪6-三氟甲磺酸酯52(992mg,3.57mmol,1.0当量)在C6H6中的溶液添加LiCl(907mg,21.59mmol,6.0当量)、Pd(PPh3)4(412mg,0.3565mmol,0.1当量)和(Me3Sn)2(0.78mL,3.743mmol,1.05当量)。溶液在超声处理器中用氩气鼓泡10min且混合物升温到105℃和搅拌1h。反应冷却到rt,用乙酸乙酯稀释并在硅藻土上过滤。有机部分用饱和NaHCO3洗涤和用Na2SO4干燥,且然后减压浓缩。粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:1EtOAc:己烷类)纯化以提供酞嗪6-三甲基锡52(656mg,63%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.54(d,J=4.39Hz,2H)8.12(br.s.,1H)8.08(d,J=7.81Hz,1H)7.92(d,J=7.81Hz,1H)0.43(s,9H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C11H15N2Sn[M+H]+:293.9602,测定值293.9601。
17,18-不饱和的酞嗪53的合成
向三氟甲磺酸盐20(20mg,42.15μmol,1.0当量)在DMSO中的溶液添加(三甲基锡烷基)酞嗪52(31mg,105.40μmol,2.0当量)、CuCl(42mg,421.50μmol,10.0当量)和LiCl(18mg,421.50μmol,10.0当量)。混合物通过冻融方法脱氧四次并加入Pd(PPh3)(5mg,4.22μmol,0.1当量)。混合物加热到60℃并搅拌1h。反应用5%NH4OH和乙酸乙酯淬灭且层分离。水层用乙酸乙酯萃取。有机层合并,用盐水洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。粗混合物通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:1:4→1:1→3:1 EtOAc:己烷类)纯化以提供17,18-不饱和的酞嗪53(16.3mg,85%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.51(d,J=5.0Hz,2H)8.02(d,J=5.0Hz,1H),7.91(s,1H),7.90(d,J=5.0Hz,1H),6.37(br.s.,1H),5.80(br.s.,1H),5.37(br.m.,1H),3.98(m,4H),2.75(m,1H),2.59-2.52(m,2H),2.50-2.42(m,3H),2.37-2.26(m,3H),2.14(d,J=15.0Hz,1H),2.00(dd,J=15.0,2.5Hz,1H),1.93(m,1H),1.79(m,1H),1.72-1.66(m,2H),1.16(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C29H31N2O3[M+H]+:455.5680,测定值455.5679。
17,18-不饱和的酰胺吡啶47的合成
向三氟甲磺酸盐20(20mg,42.1μmol,1.0当量)和3-氨基吡啶(19.8mg,210μmol,5.0当量)在DMF(1mL)中的溶液添加三乙胺(12μL,84.3μmol,2.0当量)和Pd(dppf)Cl2·CH2Cl2(1.72mg,2.10μmol,0.05当量)。反应烧瓶安装CO气囊且溶液在室温下吹扫5min。然后,反应混合物加热到最高85℃并搅拌4h。混合物允许冷却到室温并加入EtOAc(3mL)和H2O。层分离且水层用EtOAc(3×2mL)萃取,且合并的有机层用盐水(3mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:10:10:1→10:10:2己烷类:EtOAc:MeOH)纯化以提供17,18-不饱和的酰胺吡啶47(17mg,89%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.57(d,J=2.4Hz,1H),8.33(dd,J=1.2,4.6Hz,1H),8.20(d,J=8.3Hz,1H),7.70(s,1H),7.26(dd,J=4.9,7.8Hz,1H),6.55(br.s.,1H),5.77(s,1H),5.36(d,J=2.9Hz,1H),4.03-3.89(m,4H),2.63-2.56(m,2H),2.52(ddd,J=2.9,7.3,17.1Hz,1H),2.52-2.37(m,3H),2.36-2.27(m,2H),2.20(t,J=12.2Hz,1H),2.12(d,J=13.2Hz,1H),1.97(dd,J=2.2,12.9Hz,1H),1.89(td,J=8.8,13.2Hz,1H),1.78(tdd,J=2.4,4.8,12.8Hz,1H),1.71-1.62(m,2H),1.11(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C27H31N2O4[M+H]+:447.2278,测定值447.2289。
实施例4.用于酮合成的一般方法
在0℃下向缩酮在THF中的溶液添加6N HCl(THF:6N HCl=1:1,0.05M)。混合物升温到室温并搅拌1h。反应用6N NaOH和乙酸乙酯淬灭且层分离。水层用乙酸乙酯萃取。有机层合并,用Na2SO4干燥并减压浓缩。
酮45的合成
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:15:1二氯甲烷:MeOH)纯化以提供酮45(8.5mg,95%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.60(s,1H),8.52(d,J=3.9Hz,1H),7.74(br.s.,1H),7.28(dd,J=4.4,8.3Hz,1H),5.91(s,1H),5.37(dd,J=2.7,4.6Hz,1H),3.88(d,J=13.7Hz,1H),3.84(d,J=13.7Hz,1H),2.91(d,J=14.6Hz,1H),2.82(t,J=9.0Hz,1H),2.65(d,J=15.1Hz,1H),2.64(dd,J=10.3,14.6Hz,1H),2.59-2.41(m,3H),2.32-2.20(m,3H),2.19-2.07(m,3H),1.85-1.72(m,2H),1.72-1.61(m,2H),1.44(br.s.,1H),0.82(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C25H31N2O2[M+H]+:391.2380,测定值391.2366。
酮54的合成
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:1 EtOAc:己烷类)纯化以提供酮54(8.7mg,80%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.54(d,J=10.0Hz,2H)8.04(d,J=10.0Hz,1H),7.93(br.s.,2H),6.40(br.s.,1H),5.95(br.s.,1H),5.47(br.m.,1H),2.95(d,J=10.0Hz,1H),2.77(m,1H),2.71-2.62(m,2H),2.59-2.44(m,7H),2.34(t,J=10.0Hz,1H),2.19(t,J=10.0Hz,1H),2.00(m,1H),1.78(m,1H),1.18(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C27H27N2O2[M+H]+:411.5155,测定值411.5152。
酮57的合成
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:1 EtOAc:己烷类)纯化以提供酮57(13.7mg,72%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.04(br.s.,1H),7.68(d,J=10.0Hz,1H),7.48(br.s.,1H),7.27(d,J=10.0Hz,1H),6.13(br.s.,1H),5.93(br.s.,1H),5.45(br.t.,J=5Hz,1H),2.97(d,J=15.0Hz,1H),2.76-2.64(m,3H),2.53-2.43(m,6H),2.40-2.34(m,2H),2.17(t,J=10.0Hz,1H),1.98(m,1H),1.77(m,1H),1.11(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C26H27N2O2[M+H]+:399.5048,测定值399.5047。
酮60的合成
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:1→3:1 EtOAc:己烷类,用2%三乙胺缓冲)纯化以提供酮60(3.3mg,68%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.93-10.27(br s,1H),8.06(s,1H),7.75(s,1H),7.47(ABq,JAB=8.8Hz,Δν=29.5Hz,2H),6.03(dd,J=2.0,2.0Hz,1H),5.94(s,1H),5.47(dd,J=3.9,3.9Hz,1H),2.97(d,J=15.1Hz,1H),2.63-2.76(m,3H),2.53-2.59(m,1H),2.44-2.50(m,5H),2.35-2.42(m,2H),2.17(dd,J=9.3,9.3Hz,1H),1.95-2.01(m,1H),1.74-1.80(m,1H),1.11(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C26H27N2O2[M+H]+:399.2073,测定值399.2043。
酮22的合成
对于该方法,参见‘酮13的合成’。所得的残留物然后通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:3:2→1:2己烷类:EtOAc)纯化以提供酮22(8.2mg,61%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(br.s.,1H),8.51(d,J=5.4Hz,1H),7.94(s,1H),7.84-7.76(m,2H),7.63(d,J=5.4Hz,1H),6.27(br.s.,1H),5.97(s,1H),5.50(dd,J=2.4,4.9Hz,1H),2.98(d,J=14.6Hz,1H),2.78(dd,J=6.8,11.2Hz,1H),2.71(d,J=14.6Hz,1H),2.72-2.63(m,1H),2.61(d,J=5.4Hz,1H),2.59-2.54(m,2H),2.54-2.50(m,2H),2.50-2.42(m,2H),2.39(ddd,J=1.5,11.0,12.9Hz,1H),2.20(ddd,J=1.5,9.5,11.5Hz,1H),2.01(ddd,J=7.3,8.8,12.7Hz,1H),1.79(dt,J=7.3,11.2Hz,1H),1.18(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H28NO2[M+H]+:410.2115,测定值410.2111。
酮48的合成
对于该方法,参见‘酮13的合成’。所得的残留物然后通过快速色谱(硅胶,洗脱剂:20:10:3己烷类:EtOAc:2M NH3甲醇溶液)纯化以提供酮48(5.0mg,74%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=8.60(d,J=2.0Hz,1H),8.37(dd,J=1.0,4.9Hz,1H),8.24-8.20(m,1H),7.55(s,1H),7.30(dd,J=4.9,8.3Hz,1H),6.57(br.s.,1H),5.94(s,1H),5.48(dd,J=2.2,5.1Hz,1H),2.95(d,J=15.1Hz,1H),2.69(d,J=14.6Hz,1H),2.68(d,J=12.7Hz,1H),2.66-2.61(m,2H),2.61-2.53(m,2H),2.52-2.44(m,3H),2.41(d,J=18.1Hz,1H),2.29(ddd,J=1.5,11.1,12.8Hz,1H),2.22-2.15(m,J=1.5,9.4,11.1Hz,1H),1.98(ddd,J=7.6,9.0,12.7Hz,1H),1.76(dt,J=7.3,11.2Hz,1H),1.14(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C25H27N2O3[M+H]+:403.2016,测定值403.2023。
实施例5.用于合成N-氧化物的一般方法
在室温下向胺(1.00当量)在甲醇中的溶液(0.028M)添加H2O2(32.0当量)。在25h后,添加饱和NaHCO3溶液,用二氯甲烷稀释,且层分离。水层用二氯甲烷萃取。有机层合并,用盐水洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩。
14B-N-氧化物(14BNO)的合成
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:90:9:1→80:18:2氯仿:甲醇:5N NH4OH水溶液)纯化以提供N-氧化物14BNO(23.5mg,95%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.21(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.77(s,1H),7.75(d,J=8.3Hz,1H),7.61(d,J=5.9Hz,1H),7.57(dd,J=1.0,8.8Hz,1H),5.76(s,1H),5.28(d,J=2.9Hz,1H),3.44-3.36(m,1H),3.22(s,3H),3.12(t,J=10.8Hz,1H),3.10(d,J=1.0Hz,3H),2.47(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),2.44-2.29(m,5H),2.28-2.13(m,4H),2.09(ddd,J=1.5,9.3,11.2Hz,1H),2.06-1.97(m,2H),1.94(dd,J=5.1,17.4Hz,1H),1.85(dq,J=5.4,12.2Hz,1H),1.83-1.76(m,1H),1.72(td,J=9.3,12.2Hz,1H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H37N2O2[M+H]+:457.2850,测定值457.2842。
14A-N-氧化物(14ANO)的合成
粗混合物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:90:9:1→80:18:2氯仿:甲醇:5N NH4OH水溶液)纯化以提供N-氧化物14ANO(3.6mg,77%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.80(s,1H),7.77(d,J=8.8Hz,1H),7.64(d,J=5.9Hz,1H),7.60(d,J=8.8Hz,1H),5.81(s,1H),5.36(d,J=2.9Hz,1H),3.46(t,J=12.4Hz,1H),3.24(s,3H),3.18(s,3H),3.16(t,J=9.8Hz,1H),2.64(dd,J=3.2,7.1Hz,1H),2.59-2.47(m,3H),2.43-2.28(m,4H),2.28-2.15(m,2H),2.09-1.99(m,2H),1.97(dd,J=5.1,12.4Hz,1H),1.88(dq,J=5.4,12.2Hz,1H),1.81-1.71(m,2H),1.51(dq,J=4.1,12.3Hz,1H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H37N2O2[M+H]+:457.2850,测定值457.2846。
皮质抑素A N-氧化物的形成
皮质抑素A N-氧化物:向皮质抑素A(2mg)在乙酸乙酯(1mL)中的溶液添加Aldrich硅胶DavisilTM(200目)(200mg)且这一溶液暴露于空气搅拌1小时。硅胶过滤且滤液浓缩以得到粗皮质抑素A N-氧化物,其通过SiO2色谱(洗脱剂:50%甲醇/乙酸乙酯)进一步纯化以提供皮质抑素A N-氧化物(1.8mg,90%产率)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ9.22(s,1H),8.50(d,J=5.8Hz,1H),7.78(s,1H),7.76(d,J=8.8Hz,1H),7.63(d,J=5.9Hz,1H),7.58(d,J=8.8Hz,1H),6.28(s,1H),5.49(m,1H),4.15(d,J=9.3Hz,1H),3.83(t,J=9.8,9.8Hz,1H),3.31-3.36(m,1H),3.26(s,3H),3.19(s,3H),3.16(dd,J=9.3,9.3Hz,1H),2.50(dd,J=11.7,8.8Hz,1H),2.14-2.40(m,5H),1.97-2.07(m,3H),1.81-1.90(m,2H),1.68-1.75(m,1H),1.49-1.65(m,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H37N2O4[M+H]+:489.2753,测定值489.5928。
实施例6.C3-醇和取代的类似物的合成
β-醇17B的合成
β-醇17B:酮13(2.00mg,4.85μmol,1.0当量)在THF(350μL)中的溶液冷却到-78℃并加入三仲丁基硼氢化锂在THF(1M,9.71μL,9.71μmol,2.0当量)中的溶液。在1h后,加入饱和NH4Cl溶液(400μL)和乙酸乙酯(300μL),其允许升温至室温。水相用乙酸乙酯(3×1mL)萃取且合并的有机相用盐水(1mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。残留物通过制备型TLC(洗脱剂:1:1己烷类:EtOAc)纯化以提供β-醇17B(ca.1.2mg,60%)。
1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.26(br.s,1H),8.49(br.s,1H),7.82(s,1H),7.78(d,J=8.2Hz,1H),7.69(br.s,1H),7.63(d,J=7.6Hz,1H),5.75(s,1H),5.26(br.s,1H),4.36(br.s,1H),3.15(t,J=9.7Hz,1H),2.63(t,J=13.5Hz,1H),2.51(dd,J=9.1,10.9Hz,1H),2.42-2.28(m,2H),2.24(t,J=10.6Hz,1H),2.21-2.12(m,2H),2.12-1.97(m,3H),1.93(dd,J=5.0,17.3Hz,2H),1.90-1.80(m,2H),1.79-1.58(m,3H),0.54(s,2H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H32NO2[M+H]+:414.2428,测定值414.2436。
α-醇17A
酮13(9.6mg,23.3μmol,1.00当量)在THF(750μL)中的溶液冷却到-78℃且加入LAH在二乙基醚(1.0M,35.0μL,35.0μmol,1.50当量)中的溶液。在10min后,添加饱和NH4Cl溶液(500μL)和乙酸乙酯(500μL),其允许升温至室温。水相用乙酸乙酯(3×1mL)萃取且合并的有机相用盐水(1mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。残留物通过快速柱色谱(硅胶,洗脱剂:1:1→1:5己烷类:EtOAc→100%EtOAc)纯化以提供α-醇17A(8.5mg,88%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.47(d,J=5.3Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.2Hz,1H),7.63(d,J=5.9Hz,1H),7.59(dd,J=1.2,8.8Hz,1H),5.75(s,1H),5.28(d,J=2.3Hz,1H),3.78(tt,J=4.0,11.3Hz,1H),3.14(t,J=10.0Hz,1H),2.51(dd,J=8.5,11.4Hz,1H),2.40-2.33(m,2H),2.32(dt,J=4.7,12.3Hz,1H),2.28-1.98(m,7H),1.93(dd,J=5.0,17.3Hz,1H),1.90-1.81(m,2H),1.74-1.62(m,2H),1.40(dtd,J=5.9,11.6,13.8Hz,1H),0.53(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H32NO2[M+H]+:414.2428,测定值414.2437。
α-甲基醚64A
在室温下向α-醇17A(2.0mg,4.83μmol,1.00当量)在DMF(300μL)中的溶液添加60wt%NaH(1.0mg,24.1μmol,5.00当量)并预搅拌30min。温度允许降低到-10℃并加入MeI(2.0μL,29.0μmol,6.00当量)。在2.5小时后,加入2M NaOH溶液(200μL)和乙酸乙酯(500μL),其允许升温至室温。水相用乙酸乙酯(3×1mL)萃取且合并的有机相用盐水(1mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。残留物通过制备型TLC(洗脱剂:1:2己烷类:EtOAc)纯化以提供α-甲基醚64A(ca.1.2mg,58%)。1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.75(d,J=8.8Hz,1H),7.63(d,J=5.9Hz,1H),7.59(dd,J=1.5,8.5Hz,1H),5.74(s,1H),5.28(d,J=2.9Hz,1H),3.39(s,3H),3.29(tt,J=3.5,11.4Hz,1H),3.14(t,J=10.0Hz,1H),2.52(dd,J=8.5,11.4Hz,1H),2.42-2.29(m,3H),2.25(t,J=11.7Hz,1H),2.24-2.08(m,5H),2.06(td,J=4.1,12.9Hz,1H),1.93(dd,J=5.3,17.0Hz,1H),1.86(dq,J=5.3,12.3Hz,1H),1.79(t,J=12.0Hz,1H),1.75-1.61(m,2H),1.32(dtd,J=4.7,11.5,14.0Hz,1H),0.53(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H32NO2[M+H]+:428.2584,测定值428.2573。
β-甲基醚64B
反应条件与α-甲基醚64A的合成相同。残留物通过制备型TLC(洗脱剂:1:2己烷类:EtOAc)纯化以提供C3β-甲基醚64B(1.2mg,58%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.22(s,1H),8.48(d,J=5.9Hz,1H),7.79(s,1H),7.76(d,J=8.8Hz,1H),7.63(d,J=5.9Hz,1H),7.60(dd,J=1.5,8.3Hz,1H),5.74-5.70(m,1H),5.25(dd,J=2.2,5.1Hz,1H),3.75-3.69(m,1H),3.35(s,3H),3.18-3.10(m,J=9.3Hz,1H),2.51(dd,J=8.5,11.5Hz,1H),2.52-2.44(m,1H),2.40-2.26(m,4H),2.17(s,3H),2.14-2.08(m,1H),2.07-1.96(m,2H),1.96-1.90(m,2H),1.86(dq,J=4.9,12.0Hz,1H),1.76-1.61(m,1H),1.55-1.45(m,1H),0.54(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H32NO2[M+H]+:428.2584,测定值428.2599。
α-单甲基氨基甲酸酯68A
向α-醇17A(3.5mg,8.5μmol,1.00当量)在CH3CN(350μL)中的溶液添加CDI(2.1mg,12.7μmol,1.50当量)且反应混合物回流4小时。粗混合物减压浓缩并用于下一反应而无需进一步纯化。
室温下向粗混合物在DCM(300μL)中的溶液添加THF中的MeNH2(2M,50μL)并搅拌14小时。粗混合物减压浓缩并通过制备型TLC(洗脱剂:1:1己烷类:EtOAc)纯化以提供C3α-单甲基氨基甲酸酯68A(2.4mg,2个步骤60%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)位移=9.28(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.87(s,1H),7.83(d,J=8.8Hz,1H),7.75(d,J=5.9Hz,1H),7.69(d,J=8.8Hz,1H),5.77(s,1H),5.30(dd,J=2.2,4.6Hz,1H),4.76(t,J=11.7Hz,1H),4.61(br.s.,1H),3.17(t,J=10.0Hz,1H),2.82(d,J=4.4Hz,3H),2.53(dd,J=8.5,11.5Hz,1H),2.38(d,J=17.1Hz,2H),2.32(dd,J=3.7,11.5Hz,1H),2.30-2.14(m,5H),2.13-2.01(m,2H),1.95(dd,J=5.1,17.3Hz,1H),1.94-1.82(m,2H),1.78-1.67(m,2H),1.43(dq,J=4.9,12.7Hz,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C30H35N2O3[M+H]+:471.2642,测定值471.2631。
α-甲氧基乙醚63A
室温下向α-醇17A(2.0mg,4.83μmol,1.00当量)在DMF(300μL)中的溶液添加60wt%NaH(1.0mg,24.1μmol,5.00当量)并在加入MeO(CH2)2Br(1.6μL,16.6μmol,3.00当量)之前预搅拌30min。在36小时后,添加2M NaOH溶液(200μL)和乙酸乙酯(500μL)。水相用乙酸乙酯(3×1mL)萃取且合并的有机相用盐水(1mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。残留物通过制备型TLC(洗脱剂:2:5己烷类:EtOAc)纯化以提供C3α-甲氧基乙醚63A(ca.0.7mg,27%)。1H NMR(600MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.9Hz,1H),7.81(s,1H),7.77(d,J=8.3Hz,1H),7.65(d,J=5.9Hz,1H),7.61(d,J=8.8Hz,1H),5.75(s,1H),5.29(d,J=2.4Hz,1H),3.74-3.63(m,2H),3.61-3.51(m,2H),3.44(tt,J=3.9,11.7Hz,1H),3.44-3.39(s,3H),3.16(t,J=9.8Hz,1H),2.54(dd,J=8.5,11.5Hz,1H),2.43-2.30(m,3H),2.30-2.17(m,4H),2.17-2.02(m,3H),1.95(dd,J=5.1,17.3Hz,1H),1.92-1.82(m,2H),1.78-1.62(m,J=8.3Hz,2H),1.41(dtd,J=4.1,11.9,13.5Hz,1H),0.55(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C28H32NO2[M+H]+:472.2846,测定值472.2850。
实施例7.从醇合成胺
α-二甲基乙内酰脲74A
向β-醇17B(5.0mg,12.3μmol,1.0当量)在THF(400μL)中的溶液添加二甲基乙内酰脲(7.8mg,61.6μmol,5.0当量)和PPh3(9.7mg,36.9μmol,3.0当量)。反应混合物冷却到0℃并DEAD(16.1μL的40wt%甲苯溶液,36.9μmol,3.0当量)。反应升温至最高50℃并搅拌17h。在冷却反应混合物至室温后,加入1N NaOH溶液(300μL),且水相用乙酸乙酯(3×0.5mL)萃取和合并的有机相用盐水(1mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。粗混合物通过制备型TLC(硅胶,洗脱剂:40:1 MeOH:二氯甲烷)纯化以提供α-二甲基乙内酰脲74A(0.9mg,14%)。1HNMR(500MHz,CDCl3)位移=9.24(s,1H),8.50(d,J=5.4Hz,1H),7.81(s,1H),7.77(d,J=8.8Hz,1H),7.64(d,J=5.4Hz,1H),7.61(dd,J=1.5,8.8Hz,1H),5.79(d,J=1.5Hz,1H),5.32(dd,J=2.7,5.1Hz,1H),5.18(s,1H),4.10(tdd,J=3.2,11.3,13.1Hz,1H),3.16(dd,J=9.3,10.7Hz,1H),2.86(t,J=12.7Hz,1H),2.54(dd,J=8.3,11.7Hz,1H),2.45(dd,J=2.9,14.6Hz,1H),2.30(br.s.,6H),2.19(tq,J=4.4,9.0Hz,1H),2.09-2.00(m,1H),1.96(dd,J=5.4,17.6Hz,1H),1.92-1.80(m,2H),1.80-1.64(m,3H),1.42(d,J=4.9Hz,6H),0.56(s,3H)。HRMS(ESI)(m/z)计算值C33H38N3O3[M+H]+:524.2908,测定值524.2892。
生物学方法
细胞培养物和细胞系
MV4;11、RS4;11、HL-60、K562、L-Wnt3A和L细胞从ATCC获得。HEL、NB4、KG1、UKE-1、UKE-1per、SET-2和SET-2per细胞由Ross Levine(MSKCC)提供。MOLM-14由Scott Armstrong(Boston Children’s Hospital)提供。MV4;11-mCLP细胞由Andrew Kung(Dana FarberCancer Institute)提供。HEK293STF细胞由Jeremy Nathans(Johns Hopkins UniversitySchool of Medicine)提供。所有细胞维持在设定于37℃,5%CO2的加湿培养箱中。MV4;11、RS4;11、K562、HEL、NB4、MOLM-14和KG1细胞在具有10%FBS、100U ml-1青霉素和100μg ml-1链霉素的RPMI-1640中生长。HaCaT和HEK293STF细胞在具有10%FBS、100U ml-1青霉素和100μg ml-1链霉素的DMEM中生长,对于HEK293STF细胞具有200μg ml-1G418。L-Wnt3A和L细胞在具有10%FBS、100U ml-1青霉素、100μg ml-1链霉素和400μg ml-1G418(仅对于L-Wnt3A)的DMEM中生长。SET-2细胞在具有20%FBS、100U ml-1青霉素和100μg ml-1链霉素的RPMI-1640中生长。HL-60在具有20%FBS、100U ml-1青霉素和100μg ml-1链霉素的IMDM中生长。UKE-1细胞在具有10%FBS、10%马血清、100U ml-1青霉素、100μg ml-1链霉素和1μM氢化可的松的RPMI-1640中生长。SET-2per和UKE-1per细胞分别在0.7μM和1μM鲁索利替尼的存在下维持。人脐静脉内皮细胞(HUVEC)从Life Technologies获得并在具有低血清生长补充剂的M200培养基(LSGS,Life Technologies)中培养。
试剂
用于测试的化合物制备为100%DMSO原液并在-80℃下储存于氩气氛下。盐酸阿霉素、抗-FLAG(F1804)和抗-肌动蛋白(A5060)抗体从Sigma-Aldrich获得。抗-Smad 2/3(8565)、抗-Stat1(9172)、抗-磷酸-Stat1 Tyr701(9171)和抗-磷酸-Stat1 Ser727(9177)抗体获自Cell Signaling Technologies。抗-磷酸-Smad 2/3 T220/T179获自Rockland,IFNγ获自Life Technologies和TGFβ1获自R&D Systems。Wnt3A条件化培养基和L-细胞条件化培养基如所述的通过ATCC获得。
质粒、诱变、包装和转导
5’-FLAG标记的CDK8从添加了EcoRI(5’)和XbaI(3’)限制性位点并通过粘端连接(EcoRI和XbaI)克隆到慢病毒表达载体pLVX-EF1α-IRES-mCherry(Clonetech)中和转化到E.coli(One Shot Stbl3,Invitrogen)中的pBabe.puro.CDK8.flag(Addgene,原始来源Firestein等,Nature(2008)455,547-551)PCR扩增。5’-FLAG标记的CDK19从添加了SpeI(5’)和XbaI(3’)限制性位点并通过粘端连接克隆到慢病毒表达载体pLVX-EF1α-IRES-ZsGreen1(Clonetech)中和转化到E.coli(One Shot Stbl3,Invitrogen)中的F-CDK8L(Addgene,原始来源Conaway等,FEBS Letters(2005)579,904-908)PCR扩增。点突变通过全质粒PCR(QuikChange II XL Site-Directed Mutagenesis Kit,Agilent)引入。5’-FLAG标记的CDK8或CDK19突变体随后使用EF1α正向和IRES反向引物(参见表1)进行PCR扩增,并分别克隆到pLVX-EF1α-IRES-mCherry或pLVX-EF1α-IRES-ZsGreen1中,和转化到E.coli(OneShot Stbl3,Invitrogen)中。用于克隆CDK8和CDK19及将W105M点突变引用到各蛋白质中的引物提供在表1中。
慢病毒表达载体由University ofMassachusetts RNAi Core Facility通过用包装载体psPAX2(Addgene)和包膜载体(envelope vector)pMD2.G(Addgene)共转染293T细胞进行包装。转染后48h,收集病毒上清液,通过0.45μm过滤器(Millipore)并用于转导(对于293T细胞MOI 2)。转导根据制造商的说明使用RetroNectin(Clontech)进行。简言之,无菌24-孔板包被无菌PBS中的500μL 20μg/ml RetroNectin并储存在4℃下过夜。第二天,吸取RetroNectin溶液且板在室温下用无菌PBS中的2%BSA封闭30min。板然后用PBS洗涤1x并加入300-500μL病毒上清液,板然后以2000xg离心1.5hr,在45min后变向180°。板然后在设定于37℃,5%CO2的加湿培养箱中孵育2h。然后除去病毒上清液并将500μL的200,000细胞/ml添加到各孔。在板孵育1-3天后,细胞扩增并通过FACS分离表达荧光蛋白质的细胞。
为确定CDK8和CDK19是否介导皮质抑素A或皮质抑素A类似物的抗增殖效应,鉴别了赋予细胞对皮质抑素A的生长抑制的抗性的两种中介激酶的等位基因。利用我们的晶体结构的指导,CDK8Trp105选择用于对Met的突变,因为分子建模表明其破坏CDK8与皮质抑素A的结合而不破坏与ATP的结合。已发现过表达FLAG-CDK8 W105M或FLAG-CDK19 W105M的MOLM-14细胞对于皮质抑素A(>50-倍,图10A)和14BNO(>50-倍,图22)的生长抑制高度脱敏。此外,CDK8 W105M是具有催化能力的但在体外(图10B)或在细胞中(图10C)对皮质抑素A的激酶抑制敏感性低得多,因此证明这些突变通过降低对皮质抑素A而非ATP的亲和力而发挥作用(图10B)。总的说来,这些结果提供了CDK8和CDK19冗余地发挥作用以介导皮质抑素A的抗增殖作用的明确证明。对于图10A和22,细胞传代且在第3天添加新的化合物(平均值+/-标准误,n=3)。对于图10B,FLAG-CDK8和FLAG-CDK8 W105M从过表达各蛋白质并在所示浓度的皮质抑素A存在下经历激酶反应的MOLM-14细胞分离。对于图10C,表达等同水平的FLAG-CDK8或FLAG-CDK8 W105M的MOLM-14细胞用所示浓度的皮质抑素A处理1小时,接着用IFN-γ处理1hr。然后收集细胞,裂解,并通过蛋白质印迹进行分析。
细胞生长分析
HUVEC一式三份以75μL中1,000细胞/孔的浓度接种在96-孔板中。24h后,化合物在培养基中系列地稀释并作为25μL中的4x溶液(最终0.1%DMSO用于分析)递送到细胞。化合物添加后96h,CellTiter-Blue(Promega)添加到孔中,板在37℃下孵育90min,且使用SPECTRAmax M3检测荧光(555nm激发;580nm发射)。IC50通过使用GraphPad Prism 5.0将数据与四参数剂量-反应曲线拟合来测定。
对于所有其它细胞系,化合物在培养基中系列稀释并一式三份分配在96-孔板中(最终0.1%DMSO用于分析),接着以5,000-30,000细胞/孔范围的密度添加指数生长的细胞。细胞也接种到含有媒介(0.1%DMSO)的另外2个对照孔中。在3天后,对照孔之一中活细胞的数目通过血细胞计数器或MOXI Z(Orflo)计数,且对于所有孔等同量的细胞用新鲜媒介/化合物拆分,使得对照孔的最终接种密度为5,000-30,000细胞/孔,匹配该孔中的最初接种密度。这一过程在第7天和第10天重复。%生长计算为%生长=100X(孔中总的估计细胞数–第0天起始细胞数)/(总平均媒介估计细胞数–第0天起始细胞数)。为确定各孔中的估计细胞数,对照孔中计数的细胞对于8-点稀释系列进行3-倍稀释,并一式两份转移到384-孔板,每孔20μL。所有其它孔中的细胞4-倍稀释并一式两份转移到384-孔板,每孔20μL。20μL的CellTiter-Glo(Promega)随后添加到所有孔并使用SPECTRAmax M3检测发光。对照孔稀释系列拟合于线性回归并用作用于计算各孔的估计细胞数的标准。对于第7和10天,总估计细胞数代表拆分调节的理论细胞数。
体外CDK8激酶分析
体外激酶分析如前所述进行(参见,例如,Knuesel等,Mol.Cell.Biol.(2009)29,650-661)。FLAG-CDK8和FLAG-CDK8 W105M从MOLM-14细胞过表达并纯化。
X-射线晶体结构
与CDK8/细胞周期蛋白C结合的皮质抑素A(CA)的X-射线晶体结构通过ProterosBiostructures GmbH获得。CDK8/细胞周期蛋白C的表达和纯化如前所述进行(参见,例如,Schneider等,J.Mol.Biol.(2011)412,251-266)。衍射数据在SWISS LIGHT SOURCE(SLS,Villigen,Switzerland)收集。结构解析并优化到的最终分辨率。数据使用程序XDS和XSCALE处理。确定和分析结构所需的相位信息通过用之前解析的CDK8/CycC的结构作为研究模型的分子置换获得。随后的模型构建和优化用软件包CCP4和COOT进行。对于自由R-因子(交叉验证最终模型的正确性的手段)的计算,约3.4%的测量的反射从优化程序排除。TLS优化(使用REFMAC5,CCP4)已经完成,其导致较低R-因子和较高质量的电子密度图。配体参数化和对应文库文件的生成用CORINA完成。水模型用"Find waters"-COOT的算法通过将水分子置于以3.0描画的Fo-Fc图谱的峰中接着用REFMAC5优化和用COOT的验证工具检查所有水而构建。可疑水的列表的标准为:大于的B-因子,小于1.2σ的2Fo-Fc图,小于或大于的至最近接触的距离。可疑水分子及活性位点中的那些(距抑制剂的距离小于)人工检查。在Fo-Fc图(在-3.0σ下描画)的负峰中侧链的占有率设定为零,且随后如果在下一优化循环后存在正峰则设定为0.5。最终模型的拉马钱德兰图显示最有利区域中所有残基的93.2%,另外允许区域中的6.6%,和一般允许区域中的0.2%。在不允许区域中没有发现残基。数据收集、处理和优化表如下。括号中的值指的是最高分辨率箱。
为了解皮质抑素A如何抑制CDK8,我们解析了分辨率的皮质抑素A/CDK8/细胞周期蛋白C三元复合物的X-射线晶体结构(图16A)。皮质抑素A结合在CDK8的ATP-结合位点中并在皮质抑素A的异喹啉氮和位于铰链区中的Ala100的主链酰胺N–H之间与CDK8形成单一H-键(虚线,图16C)。皮质抑素A和CDK8之间的其余接触是疏水性的,使得皮质抑素A表现出与ATP-结合位点的明显形状互补性(图16B)。特别地,皮质抑素A的C13角甲基和C5-C9乙烷桥完美地填充由His106、Ala155、Trp105和Asp103的侧链形成的疏水性腔(图16C)。其它CDK不具有相似的疏水性腔以容纳皮质抑素A的C13-甲基和C5-C9乙烷桥,或许解释了皮质抑素A对于CDK8/CDK19的异常的选择性。
在皮质抑素A的带电C3-N,N-二甲基铵离子和CDK8的Trp105之间也存在明显的阳离子-π相互作用,其在密切接触内。CDK8和CDK19是在氨基酸105处具有Trp的仅有CDK,表明皮质抑素A和Trp105之间的阳离子-π相互作用以及疏水性接触对于皮质抑素A与CDK8的高亲和力和选择性可能是重要的。Trp105和皮质抑素A的N,N-二甲基铵离子之间接触的近距视图显示于图16D中。在皮质抑素A的N,N-二甲胺的一个甲基和Trp105之间存在直接接触,这对于阳离子-π相互作用是极好的。
非常令人惊异的是,14B在细胞生长抑制中及CDK8激酶抑制中与皮质抑素A同样有效或更有效(效力高大约2-倍),因为C3胺现在是轴向的且可能预期与Trp105冲突。
蛋白质印迹
对于STAT1研究,MOLM-14细胞用媒介(0.1%DMSO)或化合物处理1h,接着加入IFNγ(Life Technologies,PHC4031)1h。细胞然后收集,用冷PBS洗涤两次并在液氮中急冻。对于所有蛋白质印迹,全细胞裂解产物在具有磷酸酶和蛋白酶抑制剂添加剂(Sigma-Aldrich,P8340,P0044,P5762)的RIPA缓冲液(Sigma-Aldrich,R0278)中制备,且蛋白质浓度通过BCA分析(Thermo Scientific,23225)测定。RIPA提取物通过使聚丙烯酰胺凝胶电泳(Life Technologies,NuPAGE)变性并使用Mini Trans-Blot系统(BioRad)转移到PVDF膜(Millipore)来解析。膜如抗体制造商推荐的探测且蛋白质使用辣根过氧化酶偶联的二抗通过化学发光进行检测。对于SMAD2/3研究,HaCaT细胞如对于STAT1所述通过添加TGFβ1(R&D Systems)代替IFNγ来处理。
报告体分析
指数生长的HEK293STF一式三份以75μL中5,000细胞/孔的密度接种到96-孔板中。对于用氮杂坎帕罗酮的试验,在24h后,皮质抑素A在含有40μM氮杂坎帕罗酮的培养基中系列稀释并作为25μL中的4x溶液(0.2%DMSO和最终10μM氮杂坎帕罗酮用于分析)递送到细胞。各板上另外的三重对照孔具有培养基而无细胞或具有细胞而无氮杂坎帕罗酮。对于采用Wnt3A条件化培养基的试验,在24h后,化合物在作为1x溶液(最终0.1%DMSO)的Wnt3A条件化培养基中系列地稀释。老培养基从细胞移除并用化合物/Wnt3A-培养基替换。各板上另外的三重对照孔具有培养基而无细胞或用L-条件化培养基(无Wnt3A)处理的细胞。在24h后,随后连续地进行CellTiter-Fluor和Steady-Glo分析(Promega)以分别测定各孔中的存活率和发光(在SPECTRAmax M3,Molecular Devices上进行测量)。曲线在Prism 5(GraphPad Software,Inc.)中形成,将非线性回归拟合于S形-反应曲线(可变斜率)。
基因表达
指数生长的MOLM-14、MV4;11和K562细胞在1mL的培养基中以500,000-800,000细胞/mL的密度接种在12-孔板中,接着在三重孔中添加媒介(0.1%DMSO)或者10nM皮质抑素A(“CA10”)用于MOLM-14和MV4;11细胞及25nM皮质抑素A用于K562细胞。在24h后,细胞用冷PBS洗涤2x,急冻,且RNA通过RNeasy Plus Microkit(Qiagen)或TRIzol(LifeTechnologies)分离。RNA通过Dana Farber Cancer Institute Microarray CoreFacility处理并与Human U133 Plus 2.0微阵列(Affymetrix)杂交。微阵列使用affyQCReport Bioconductor包(参见,例如,Gentleman等,Genome Biol(2004)5:R80;RDevelopment Core Team,R:A Language and Environment for StatisticalComputing.Vienna,Austria.ISBN 3-900051-07-0)进行质控。令人满意的阵列使用affyBioconductor包的rma函数针对背景进行校正、标准化和log2-转化(参见,例如,Rafael等,Nucleic Acids Research(2003)31:e15;Bolstad等,Bioinformatics(2003)19:185-193;Irizarry等,Biostatistics(2003)4:249-264)。使用affy包的mas5calls函数进行Present/Absent调用。在>20%的样品中存在且四分位数间距为>log2(1.2)的探针组保留用于进一步分析。按照细胞类型的批校正(MOLM-14vs.MV4;11)利用ComBat进行(参见,例如,Johnson等,Biostatistics(2007)8:118-127)。我们使用GenePattern基于欧氏距离进行样品的无监督层次聚类。在CA10-处理的样品vs.DMSO对照样品中显著上调或下调至少1.5-倍的探针组使用limma Bioconductor包鉴别(参见,例如,Smyth,G.K.(2005).Limma:linear models for microarray data.在'Bioinformatics and Computational BiologySolution using R and Bioconductor'中.R.Gentleman,V.Carey,S.Dudoit,R.Irizarry,W.Huber(eds),Springer,New York,2005)。我们设定<0.05的p值,通过Benjamini-Hochberg方法(参见,例如,Benjamini,Y.&Hochberg,Y.J.R.Stat.Soc.,B(1995)57:289-300)进行多重假设检验的校正作为我们的显著性截止值。基因集富集分析(Gene SetEnrichment Analysis)(参见,例如,Subramanian等,Proc Natl Acad Sci U S A.(2005)102:15545-50)在使用log2值的T-检验作为量度进行。印记包括从Broad's MSigDB下载的审核的基因集(C2)以及从文献内部审核的印记。
体内研究
对于皮质抑素A(CA)的药代动力学研究,来自CD-1小鼠的血液样品在以10mg kg-1(图11A)和1mg/kg(图11B)i.p.施用皮质抑素A后的指定时间收集并通过HPLC/MS/MS分析以评估皮质抑素A的浓度。
对于(14A)的药代动力学研究,(14A)配制在20%羟丙基-β-环糊精(HPCD)中且雄性CD-1小鼠以3mg/kg i.p.和静脉内(i.v.)及10mg/kg口服(p.o.)给予单剂量的14A。在给药前,小鼠禁食过夜直到给药后4小时。血样在指定时间点收集并通过HPLC/MS/MS分析以评估(14A)的浓度。参见图24。从这些研究,得到以下观察:(1)化合物(14A)在雄性CD-1小鼠中具有29mL/min/kg的IV清除率,其仅是该物种中肝血流的1/3并表明(14A)具有良好的稳定性;(2)Vss较大(大约11.7L/kg),因此(14A)具有良好的组织分布;(3)口服生物利用度发现为大约44%;(4)口服给药后的Cmax为255ng/mL;(5)口服给药后的t1/2为大约5小时(口服C24谷浓度为14.2ng/mL);且(5)IP生物利用度为95%。
使用MV4;11异种移植物模型的效能研究如前所述进行。参见,例如,Etchin等,Leukemia(2013)27,66-74。简言之,2百万MV4;11mCLP细胞通过尾静脉注射引入7-周龄雌性NOD-SCID-IL2Rcγnull(NSG)小鼠(The Jackson Laboratory)中。肿瘤负荷使用IVISSpectrum系统(Caliper Life Sciences)通过生物发光成像(BLI)进行评价。注射后7天,通过BLI证明白血病的建立且小鼠分成治疗组以接受媒介(20%羟丙基-β-环糊精)或皮质抑素A(0.05和0.16mg kg-1)和每天一次处理,共15天。在处理开始日后的30天,处死每组3只小鼠,并使用Hemavet 950F仪(Drew Scientific)获得血细胞计数且收集脾、股骨和外周血细胞和通过流式细胞术(LSR Fortessa,BD Biosciences)分析。小鼠和一部分脾也保存在Bouin氏液中用于组织病理学分析。小鼠切片,石蜡包埋并用苏木精和曙红染色。药物处理小鼠的存活随治疗开始的时间测量直到垂死状态。存活率益处通过Kaplan–Meier分析评价。对于皮质抑素A的安全性试验(图13),雌性CD-1小鼠每天一次用媒介(20%羟丙基-β-环糊精)或皮质抑素A(0.16mg kg-1)处理共15天,且每天称重。最后给药后2h,处死小鼠,获得血细胞计数,分析血液化学并用Bouin氏液固定小鼠用于组织病理学分析。使用原发性骨髓纤维化的鼠模型(MPLW515L小鼠)的效能研究如前所述进行(参见,例如,Marubayashi等,J.Clin,Invest.(2010)120,3578-3593),每天一次给予媒介(20%羟丙基-β-环糊精)或皮质抑素A。对于使用SET-2皮下异种移植物模型的效能研究,50%基质胶中的1x107SET-2细胞肿瘤细胞皮下注射到8-12周龄雌性SCID Beige小鼠的侧腹中。一旦肿瘤达到80-120mm3的平均尺寸,小鼠在研究的持续时间内每天用媒介或0.16mg kg-1处理。
肝微粒体代谢稳定性分析
测试化合物以1微摩尔在37℃下在NADPH再生系统存在下与0.5mg/ml微粒体蛋白的从多个供体合并的肝微粒体一起孵育。在0、5、10、20、30和60分钟,样品移除,并与含内标的冷乙腈混合。在蛋白质分离后,样品使用分析物与内标的峰面积比率通过LC/MS/MS分析测试化合物的消失。从该值,计算微粒体清除率。使用的物种是人、Sprague Dawley大鼠、比格犬和CD-1小鼠。
人肝细胞稳定性分析
测试化合物一式两份在37℃下与冷冻保存的肝细胞一起孵育。细胞解冻;计数活细胞,并按照供应商的指示进行平衡。在37℃下伴随温和搅拌的30min平衡后,测试化合物添加到细胞中以得到所需的1μM的最终浓度。细胞悬液如上在37℃下孵育。在所示的时间,样品移除并与等体积的冰冷停止液(含内标的乙腈)混合。停止的反应在冰上孵育至少十分钟,并添加另外体积的水。样品离心以除去沉淀的蛋白质,且上清液通过LC/MS/MS分析以定量剩余的母体。数据通过除以零时浓度值转化为%剩余。数据与一阶衰减模型拟合以确定半衰期。从log(ln)峰面积针对时间的曲线图,确定线的斜率。随后,半衰期和内在清除率使用以下公式计算:清除速率常数(k)=(-斜率);半衰期(T1/2)min=0.693/k;内在清除率(CLint)(ml/min/百万细胞)=(Vx0.693)/T1/2;V=孵育体积ml/细胞数。
体外数据
*缺乏抑制K562增殖的活性是类似物中靶(on-target)且匹配CA的选择性抗增殖活性的证据。
**>1,000nM,第7天。
其它实施方式
在权利要求中,冠词如“一”、“一个”和“该”可以指一个或多于一个,除非有相反的说明或从上下文另外证明。在一个或多个组成员之间包括“或”的权利要求或描述被认为满足一个、多于一个或所有组成员存在于、用于或另外地与给定产物或过程相关的情况,除非有相反的说明或从上下文另外证明。本发明包括其中恰好组的一个成员存在于、用于或另外地与给定产物或过程相关的实施方式。本发明包括其中多于一个或所有组成员存在于、用于或另外地与给定产物或过程相关的实施方式。
此外,本发明涵盖其中来自一个或多个列举的权利要求的一个或多个限定、元素、分句和描述性项目引入另一权利要求中的所有变型、组合和排列。例如,从属于另一权利要求的任何权利要求可以修改为包括在从属于同一基础权利要求的任何其它权利要求中存在的一个或多个限定。在元素作为列表给出时,例如,以Markush组的形式,元素的各亚组也被公开,且任何元素可以从组中移除。应当理解,一般地,在本发明或本发明的方面称为包含特定元素和/或特征的情况中,本发明的某些实施方式或本发明的方面由这样的元素和/或特征组成或者基本上由其组成。为简单的目的,那些实施方式在本文中未以这样的语言具体地陈述。还应注意,术语“包含”和“含有”旨在是开放式的且允许包括另外的元素或步骤。
在给出范围的情况下,终点包括在内。此外,除非另外说明或从上下文及本领域技术人员的理解另外证明,表示为范围的值可以在本发明的不同实施方式中假定所陈述范围内的任何特定值或子范围,达到该范围下限的单位的十分之一,除非上下文明确指示另外的情况。
本申请引用各种授权的专利、公开的专利申请、期刊文章和其它公开出版物,其全部通过引用并入本文。如果在任何并入的参考文献与本申请之间存在冲突,以本申请为准。另外,落入现有技术中的本发明的任何特定实施方式可以从任何一个或多个权利要求明确地排除。因为这样的实施方式视为是本领域技术人员已知的,它们可以被排除,即使该排除未在本文中明确地给出。本发明的任何特定实施方式可以出于任何理由从任何权利要求排除,无论是否与现有技术的存在相关。
本领域技术人员将认识到或能够仅使用常规试验确定本文所述的特定实施方式的许多等同物。本文所述的当前实施方式的范围不意图限于以上说明书,而是如所附权利要求中展示。本领域技术人员可理解,可以对这一说明进行各种变化和改进而不脱离如以下权利要求中限定的本发明的精神或范围。
Claims (12)
1.下式的化合物或其药学上可接受的盐:
2.如权利要求1所述的化合物,其中所述药学上可接受的盐是季胺盐。
3.如权利要求1所述的化合物,其中所述化合物是:
4.如权利要求1所述的化合物,其中所述化合物是:
5.一种药物组合物,包含与药学上可接受的赋形剂结合的根据权利要求1-4任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。
6.根据权利要求1-4任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐在制备通过抑制CDK8和/或CDK19激酶活性治疗受试者的医学病症的药物中的用途。
7.如权利要求6所述的用途,其中所述病症是糖尿病病症、炎性病症、黄斑变性、肥胖症、动脉粥样硬化、与血管生成相关的病症或增殖性障碍。
8.如权利要求6所述的用途,其中所述病症是增殖性障碍,且所述增殖性障碍是原发性骨髓纤维化(PMF)。
9.如权利要求6所述的用途,其中所述病症是癌症。
10.如权利要求9所述的用途,其中所述癌症是实体肿瘤或造血系统癌症。
11.如权利要求9所述的用途,其中所述癌症是造血系统癌症,且所述造血系统癌症选自多发性骨髓瘤、淋巴瘤和急性髓细胞性白血病(AML)。
12.如权利要求6-11所述的用途,其中所述受试者是人。
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