CN102918063B - 抗-cd40抗体 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及新的人源化拮抗性抗-CD40抗体，及使用该抗体的治疗及诊断方法及组合物。

Description

抗-CD40抗体
发明领域
概言之，本发明涉及用于诊断及治疗应用的人源化抗-CD40抗体。更具体而言，本发明公开了人源化抗-CD40抗体及用于治疗特征在于表达CD40的细胞的各种疾病或病症的方法。本发明还公开了包含人源化抗-CD40抗体的药物组合物及试剂盒。
背景技术
CD40为48kDaI型膜内在糖蛋白，且为肿瘤坏死因子(TNF)受体超家族的成员。多种类型的细胞上表达CD40，包括正常及肿瘤性B细胞、交错突细胞、癌瘤细胞、上皮细胞(例如角质化细胞)、成纤维细胞(例如滑膜细胞)及血小板。CD40亦存在于单核细胞、巨噬细胞、一些内皮细胞及滤泡树突细胞上。CD40在B细胞个体发育的早期表达，其在CD10及CD19出现后、且在表达CD21、CD23、CD24及出现表面免疫球蛋白M(sIgM)之前出现在B细胞前体上(Uckun等人，1990，Blood15:2449)。亦已在扁桃体及来自骨髓的浆细胞上检测到CD40(Pellat-Decounynck等人，1994，Blood84:2597)。
CD40的配体为CD40L(亦称作CD154、gp39及TRAP)，其为TNF超家族成员。CD40L为主要在活化CD4+T细胞及一小亚群CD8+T细胞上表达的跨膜蛋白(VanKootenC.及Banchereau，2000)。
CD40与CD40L的相互作用诱导体液及细胞介导的免疫应答。CD40调节此配体-受体对以活化B细胞及其他抗原呈递细胞(APC)，包括树突细胞(DC)(由Toubi及Shoenfeld，2004；Kiener等人，1995综述)。业内已广泛研究了CD40对B细胞的功能。在次级淋巴样器官的生发中心中，CD40对B细胞的活化诱导增殖、分化为抗体分泌细胞及同种型(isotype)转换。体外研究已显示，CD40活化对细胞因子(IL-6、IL-10、TNF-α、LTα)的产生、黏着分子及共刺激受体(ICAM、CD23、CD80及CD86)的表达、以及B淋巴细胞表达MHCI类、MHCII类及TAP转运蛋白的提高具有直接效应(Liu等人，1996)。在大多数所述过程中，CD40与细胞因子或其他受体-配体相互作用发生协同作用。
CD40在单核细胞及DC上的信号传导导致存活延长以及细胞因子(IL-1、IL-6、IL-8、IL-10、IL-12、TNF-α及MIP-1α)的分泌。CD40在所述APC上的配基化亦导致共刺激分子(例如ICAM-1、LFA-3、CD80及CD86)上调。CD40受体的活化为使得DC可完全成熟为有效APC、从而驱动T细胞活化的一个关键信号(Banchereau及Steinman，1998)(VanKootenC.及Banchereau，2000)。
在小鼠模型中的最新研究显示，CD40在树突细胞上的信号传导在TH17细胞产生中亦具有重要作用，TH17细胞被视为例如关节炎及多发性硬化等疾病中的自身免疫介导物(Iezzi等人，2009)(Perona-Wright等人，2009)。
CD40及CD40L剔除小鼠以及激动性及拮抗性抗小鼠抗体的可用性使得可研究若干种疾病模型中CD40-CD40L的相互作用。已证实，给予阻断性抗-CD40L在若干种自身免疫模型中有益，包括自发性疾病(例如SNF1小鼠中的狼疮性肾炎或NOD小鼠中的糖尿病)或疾病的实验诱导形式(例如胶原诱导性关节炎(CIA)或实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE))(Toubi及Shoenfeld，2004)。抗-CD40LmAb可抑制小鼠中的CIA，其阻断关节炎症的发生、针对胶原的血清抗体滴度、炎症细胞浸润至滑液下组织中以及软骨及骨的侵蚀(Durie等人，1993)。对于狼疮性肾炎及EAE二者，已证实抗-CD40L亦可减轻进行性疾病，从而确认了CD40-CD40L在疾病效应期中的作用(Kalled等人，1998)；(Howard等人，1999)。
亦在CD40L缺陷型小鼠中研究CD40-CD40L相互作用在EAE发展中的作用，所述小鼠携带对髓磷脂碱性蛋白具有特异性的转基因T细胞受体。所述小鼠在经抗原初免后不会发展EAE，且CD4+T细胞保持休眠且不产生INF-γ(Grewal等人，1996)。
此外，针对CD40的抑制性抗体在例如EAE等炎性疾病模型中显示有益效应。Lamann及合作者证实，拮抗性小鼠抗人CD40mAbmu5D12及此mAb的嵌合形式可在远亲杂交狨猴中有效防止慢性脱髓鞘性EAE的临床表达(Laman等人，2002)；(Boon等人，2001)。随访研究显示，在狨猴EAE模型中，使用嵌合抗人CD40抗体的治疗性治疗降低MRI可检测炎症并延迟已存在脑部损伤的扩大(Hart等人，2005)。
在关节炎小鼠模型中测试具有激动活性的抗-CD40抗体，且获得一些矛盾性结果。如对免疫刺激剂所预期，显示激动性抗小鼠CD40mAbFGK45在CIA的DBA/1小鼠模型中可加重疾病(Tellander等人，2000)。然而，在另一慢性CIA模型FGK45中，以及另一激动性抗小鼠CD40mAb(3/23)中，二者皆表现出积极治疗效应(Mauri等人，2000)。此治疗组假定，此治疗性治疗方案中的激动性抗体通过诱导朝向Th2反应的免疫偏离及降低IFN-γ含量且升高IL-4和IL-10的含量来产生有益效应(Mauri等人，2000)。
亦已记录可通过阻断CD40/CD154相互作用来防止移植排斥。嵌合抗-CD40拮抗剂ch5D12在恒河猴肾异体移植研究中的应用表明，CD40的拮抗作用足以达成疾病缓解并将平均存活时间延长超过100天。在将ch5D12与抗CD86抗体组合且仅在开始异体移植研究时给予，之后使用环孢菌素(cyclosporine)进行延长治疗时，获得超过4年的平均存活时间，从而表明此组合可有效诱导耐受性(Haanstra等人，2005)。
因此，有众多临床前研究证实，CD40-CD40L二联体在有效的T细胞依赖性免疫应答的驱动中具有决定性作用。因此，业内公认阻断CD40信号传导为在例如RA、多发性硬化或牛皮癣等疾病中抑制致病性自身免疫应答的适宜且必需的治疗策略。然而，迄今为止，由于先前在研发中显示抗-CD40抗体具有显著副作用，故尚无CD40抗体获批用于所述病症的治疗性干预。因此，业内仍非常需要可用于干预CD40-CD40L的作用并阻断CD40信号传导的治疗药物。可通过新颖人源化抗-CD40抗体来满足此需要，所述抗体特异性结合CD40，且其所显示的抗原结合特异性、亲和性及药物代谢动力学及药效学特性使得其可用于治疗性干预基于CD40的病症。
发明概述
本发明提供人源化单克隆抗体，其中该抗体特异性结合人CD40，其在B细胞增殖中具有IC50小于1nM的拮抗活性且在高达100μg/ml的浓度不具有激动作用，且其中该抗体的特征还在于，该抗体在非人灵长类中的活体内半衰期为至少10天。
人源化单克隆抗体的特征还在于，在小于30mg/kg的剂量下，抗体在短尾猴(cynomolgusmonkeys)中的半衰期大于8天。
在示例性实施方案中，本发明的抗体包含选自SEQIDNO:1至SEQIDNO:4中任一者的重链序列及选自SEQIDNO:5至SEQIDNO:8中任一者的轻链序列。
在其他实施方案中，该抗体为人源化抗体或抗体的抗原结合片段，其具有以下中的任一者的重链可变区氨基酸序列：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:42、SEQIDNO:44、SEQIDNO:46、SEQIDNO:48、SEQIDNO:50、SEQIDNO:53、SEQIDNO:57、SEQIDNO:58、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60、SEQIDNO:61、SEQIDNO:62、SEQIDNO:63、SEQIDNO:64、SEQIDNO:65、SEQIDNO:66、SEQIDNO:67、SEQIDNO:68、SEQIDNO:69、SEQIDNO:70、SEQIDNO:71、SEQIDNO:72或SEQIDNO:73。
在其他实施方案中，该抗体为人源化抗体或抗体的抗原结合片段，其包含以下轻链可变域氨基酸序列：SEQIDNO:5至SEQIDNO:8、SEQIDNO:26、SEQIDNO:31、SEQIDNO:36、SEQIDNO:41、SEQIDNO:43、SEQIDNO:45、SEQIDNO:47、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:55、SEQIDNO:56、SEQIDNO:74、SEQIDNO:75或SEQIDNO:76。
在具体实施方案中，本文所述单克隆抗体的特征在于，其包含重链及轻链，其中重链CDR1序列选自SEQIDNO:9至SEQIDNO:11，重链CDR2序列选自SEQIDNO:12至SEQIDNO:15，且重链CDR3序列选自SEQIDNO:16至SEQIDNO:17；且其中轻链CDR1序列选自SEQIDNO:18至SEQIDNO:21，轻链CDR2序列为SEQIDNO:22至SEQIDNO:23，且轻链CDR3序列选自SEQIDNO:24至SEQIDNO:25。
在具体实施方案中，本文所述单克隆抗体的特征在于，其包含重链CDR1序列SEQIDNO:10、重链CDR2序列SEQIDNO:13及重链CDR3序列SEQIDNO:16，且其中该抗体包含轻链CDR1序列SEQIDNO:19、轻链CDR2序列SEQIDNO:22及轻链CDR3序列SEQIDNO:24。
在其他具体实施方案中，本文所述单克隆抗体的特征在于，其包含重链CDR1序列SEQIDNO:9、重链CDR2序列SEQIDNO:14及重链CDR3序列SEQIDNO:16，且其中该抗体包含轻链CDR1序列SEQIDNO:20、轻链CDR2序列SEQIDNO:22及轻链CDR3序列SEQIDNO:24。
在另一具体实施方案中，本文所述单克隆抗体的特征在于，其包含重链CDR1序列SEQIDNO:9、重链CDR2序列SEQIDNO:14及重链CDR3序列SEQIDNO:16，且其中该抗体包含轻链CDR1序列SEQIDNO:20、轻链CDR2序列SEQIDNO:22及轻链CDR3序列SEQIDNO:24。
在另一具体实施方案中，本文所述单克隆抗体的特征在于，其包含重链CDR1序列SEQIDNO:11、重链CDR2序列SEQIDNO:15及重链CDR3序列SEQIDNO:17，且其中该抗体包含轻链CDR1序列SEQIDNO:21、轻链CDR2序列SEQIDNO:23及轻链CDR3序列SEQIDNO:25。
本文亦阐述本发明优选抗体中重链的个别序列。例如，本发明涉及抗-CD40抗体，其包含SEQIDNO:1至4中任一者的重链可变域序列。该抗-CD40抗体的特征还在于，其包含SEQIDNO:5至SEQIDNO:8中任一者的轻链可变域序列。
还包括人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:27及SEQIDNO:26；SEQIDNO:28及SEQIDNO:26；SEQIDNO:29及SEQIDNO:26；SEQIDNO:30及SEQIDNO:26；SEQIDNO:32及SEQIDNO:31；SEQIDNO:33及SEQIDNO:31；SEQIDNO:34及SEQIDNO:31；SEQIDNO:35及SEQIDNO:31；SEQIDNO:37及SEQIDNO:36；SEQIDNO:38及SEQIDNO:36；SEQIDNO:39及SEQIDNO:36；SEQIDNO:40及SEQIDNO:36。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:27及SEQIDNO:26。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:28及SEQIDNO:26。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:29及SEQIDNO:26。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:30及SEQIDNO:26。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:32及SEQIDNO:31。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:33及SEQIDNO:31。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:34及SEQIDNO:31。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:35及SEQIDNO:31。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:37及SEQIDNO:36。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:38及SEQIDNO:36。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:39及SEQIDNO:36。
在另一实施方案中，本发明涉及人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:40及SEQIDNO:36。
另一实施方案涉及特异性结合人CD40的分离的抗体或抗原结合片段，其包含人源化重链可变域，该人源化重链可变域包含框架区，该框架区的氨基酸序列与人可变域重链氨基酸序列SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29或SEQIDNO:30中的框架区的氨基酸序列至少90%一致；且包含与相应的SEQIDNO:26的轻链可变域至少90%一致的轻链氨基酸序列。
另一实施方案涉及特异性结合人CD40的分离的抗体或抗原结合片段，其包含人源化重链可变域，该人源化重链可变域包含框架区，该框架区的氨基酸序列与人可变域重链氨基酸序列SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34或SEQIDNO:35中的框架区的氨基酸序列至少90%一致；且包含与相应的SEQIDNO:31的轻链可变域至少90%一致的轻链氨基酸序列。
另一方面中，本发明涉及上一段的实施方案中所述的分离的抗体或抗原结合片段，其中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:32；另一实施方案中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:33；另一实施方案中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:34；另一实施方案中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:35。
还包括特异性结合人CD40的分离的抗体或抗原结合片段，其包含人源化重链可变域，该人源化重链可变域包含框架区，该框架区的氨基酸序列与人可变域重链氨基酸序列SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39或SEQIDNO:40中的框架区的氨基酸序列至少90%一致；且包含与相应的SEQIDNO:36的对应轻链至少90%一致的轻链氨基酸序列。
另一方面中，本发明涉及上一段的实施方案中所述的分离的抗体或抗原结合片段，其中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:37；另一实施方案中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:38；另一实施方案中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:39；另一实施方案中所述重链氨基酸序列为SEQIDNO:40。
本发明的抗体的特征还在于，所述抗体在不存在CD40L时不能刺激B细胞产生细胞因子。
本发明的抗体的特征还在于，所述抗体在50%人血清存在下与人CD40结合，且结合速率(onrate)降低二倍以下。
本发明的抗体的特征还在于，该抗体在哺乳动物中在1mg/kg的浓度抑制IgM及IgG产生。
本发明的抗体可用于各种治疗性方法、预防性方法、诊断性方法及其他方法中。举例而言，本发明阐述在哺乳动物中阻断人CD40的功能的方法，其包括向该哺乳动物给予包含本发明的抗体的组合物，该抗体的量足以在该哺乳动物中阻断CD40介导的免疫应答。
本文还包括一种治疗或改善哺乳动物的移植物抗宿主病的方法，其包括向该哺乳动物给予包含本发明的抗体的组合物，该抗体的量足以在该动物中减少移植物抗宿主病的一或多个症状。
例如，自身免疫性或炎性疾病可包括(但不限于)类风湿性关节炎、多发性硬化、增生性狼疮性肾小球肾炎、炎性肠病(IBD)、牛皮癣、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、节段性回肠炎(Crohn'sDisease)及全身性红斑狼疮(SLE)、桥本氏甲状腺炎(Hashimoto'sthyroiditis)、原发性黏液水肿、甲状腺毒症/格雷夫斯病(Gravesdisease)、恶性贫血、自身免疫性萎缩性胃炎、自身免疫性心炎、艾迪生氏病(Addison'sdisease)、过早绝经、I型糖尿病、古德帕斯丘氏(Goodpastures's)综合征、重症肌无力、自身免疫性溶血性贫血、特发性白血球减少症、原发性胆汁性肝硬化、慢性活动性肝炎(HBsAg阴性)、隐源性肝硬化、Sjogren氏综合征、皮肌炎、硬皮症、混合性结缔组织疾病、盘状红斑狼疮及全身性血管炎。在示例性实施方案中，哺乳动物患有类风湿性关节炎。
本发明方法还可包括给予选自以下的第二治疗药物：TNF拮抗剂、疾病缓解抗风湿药、CTLA4拮抗剂、抗IL-6受体mAb及抗CD20mAb。
在具体实施方案中，炎性疾病或自身免疫性疾病为与表达CD40及CD20二者的细胞有关的炎性疾病或自身免疫性疾病。
在具体实施方案中，治疗涉及通过肠胃外给予途径给予抗体组合物。
在具体实施方案中，治疗涉及以静脉内或皮下方式给予抗体组合物。
本发明其他方法包括在人患者中抑制B细胞产生抗体，其包括向该人患者给予有效量的本发明的抗-CD40抗体。
更具体而言，人患者患有与表达CD40的细胞有关的炎性疾病或自身免疫性疾病。
在示例性实施方案中，人患者患有选自自身免疫性或炎性疾病的自身免疫性疾病，该自身免疫性或炎性疾病选自：类风湿性关节炎、多发性硬化、增生性狼疮性肾小球肾炎、炎性肠病(IBD)、牛皮癣、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、节段性回肠炎及全身性红斑狼疮(SLE)、桥本氏甲状腺炎、原发性黏液水肿、甲状腺毒症/格雷夫斯病、恶性贫血、自身免疫性萎缩性胃炎、自身免疫性心炎、艾迪生氏病、过早绝经、I型糖尿病、古德帕斯丘氏综合征、重症肌无力、自身免疫性溶血性贫血、特发性白血球减少症、原发性胆汁性肝硬化、慢性活动性肝炎(HBsAg阴性)、隐源性肝硬化、Sjogren氏综合征、皮肌炎、硬皮症、混合性结缔组织疾病、盘状红斑狼疮及全身性血管炎。
本发明另一方法涉及抑制表达人CD40抗原的细胞的生长，其包括向所述细胞给予本发明的抗体或抗原结合片段，该抗体或抗原结合片段与人细胞表面CD40抗原特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与该CD40抗原的结合抑制所述细胞的生长或分化。
还包括一种治疗患有CD40相关的病症的个体的方法，其包括向该个体给予本发明的抗体或抗原结合片段，该抗体或抗原结合片段与人CD40特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与CD40的结合抑制CD40相关的病症细胞的生长或分化。所述细胞可为(但不限于)B淋巴样干细胞(lymphoblastoidcells)、胰细胞、肺细胞、乳房细胞、卵巢细胞、结肠细胞、前列腺细胞、皮肤细胞、头颈细胞、膀胱细胞、骨细胞或肾细胞。
抑制细胞生长或分化的治疗方法可用于治疗慢性淋巴细胞性白血病、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt'slymphoma)、多发性骨髓瘤、T细胞淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤(Non-Hodgkin'sLymphoma)、霍奇金氏病(Hodgkin'sDisease)、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(Waldenstrom'smacroglobulinemia)或卡波西氏肉瘤(Kaposi'ssarcoma)。
还包括一种诱导清除外周B细胞的方法，其包括向所述细胞给予本发明的抗体或抗原结合片段，该抗体或抗原结合片段与人细胞表面CD40抗原特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与该CD40抗原的结合诱导清除所述细胞。
在具体实施方案中，将抗体或抗原结合片段给予患有免疫病症的个体。举例而言，该免疫病症为类风湿性关节炎或全身性红斑狼疮。
还包括一种治疗个体的类风湿性关节炎的方法，其包括向该个体给予本发明的抗体，其中该抗体为在该个体中阻断CD40功能的拮抗性抗体。
优选地，以在个体中有效抑制B细胞分化及抗体同种型转换的量给予该抗体。
在其他实施方案中，以在该个体的T细胞及巨噬细胞中有效抑制细胞因子和趋化因子的产生以及黏着分子的上调的量给予该抗体。优选地，以在该个体中有效抑制树突细胞活化的量给予该个体。
在其他实施方案中，该方法的特征还在于，以在该个体的非免疫细胞中可有效抑制促炎症细胞因子、趋化因子、基质金属蛋白酶、前列腺素的产生及黏着分子的下调的量给予该抗体。
在具体实施方案中，该抗体与包含给予甲氨喋呤和/或给予Enbrel/Humira的方案组合给予。
接受该疗法的个体是患有类风湿性关节炎且对单独的甲氨喋呤治疗无反应者。
在具体实施方案中，该方法包括用包含给予甲氨喋呤和/或给予Enbrel/Humira的方案治疗该个体。
本发明方法的特征还在于，用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效优于使用单独的甲氨喋呤、单独的Enbrel、Enbrel+甲氨喋呤的组合来治疗。
本发明方法的特征还在于，用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效在对甲氨喋呤无充分反应的患者中优于使用Enbrel+MTX的治疗。
在具体实施方案中，该抗体与包含抗TNF药物的方案组合给予。
在具体实施方案中，可将个体描述为患有类风湿性关节炎且对使用单独的抗TNF药物的治疗无反应者。在所述实施方案中，该方法可包含用包含以抗TNF药物以及该拮抗性抗-CD40抗体治疗的方案治疗该个体。
在具体实施方案中，用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效优于用抗TNF药物治疗。
在其他实施方案中，该方法的特征在于，用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效在对单独的抗TNF药物无充分反应的患者中优于用Orencia或Rituxan治疗。
本发明还包括药物组合物，其包含：(i)本文所述抗体或抗原结合片段；及(ii)药学上可接受的赋形剂。在所述组合物中，抗体或其抗原结合片段可有利地与第二药物(例如细胞毒性剂、PEG载体、酶或标记物)缀合。
本文还包括编码以下中的任一者的重链可变区氨基酸序列的分离的多核苷酸：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:42、SEQIDNO:44、SEQIDNO:46、SEQIDNO:48、SEQIDNO:50、SEQIDNO:53、SEQIDNO:57、SEQIDNO:58、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60、SEQIDNO:61、SEQIDNO:62、SEQIDNO:63、SEQIDNO:64、SEQIDNO:65、SEQIDNO:66、SEQIDNO:67、SEQIDNO:68、SEQIDNO:69、SEQIDNO:70、SEQIDNO:71、SEQIDNO:72或SEQIDNO:73。
本文还包括编码以下中的任一者的轻链可变区氨基酸序列的分离的多核苷酸：SEQIDNO:5至SEQIDNO:8、SEQIDNO:26、SEQIDNO:31、SEQIDNO:36、SEQIDNO:41、SEQIDNO:43、SEQIDNO:45、SEQIDNO:47、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:55、SEQIDNO:56、SEQIDNO:74、SEQIDNO:75或SEQIDNO:76。
本发明另外涉及本文所述抗体在制备在哺乳动物中阻断人CD40功能的药物中的用途，其中该药物在该哺乳动物中阻断CD40介导的免疫应答。
在一实施方案中，本发明涉及制备用于治疗或改善哺乳动物的移植物抗宿主病的药物。
在示例性实施方案中，制备该药物用于治疗选自以下的自身免疫性或炎性疾病：类风湿性关节炎、多发性硬化、增生性狼疮性肾小球肾炎、炎性肠病(IBD)、牛皮癣、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、节段性回肠炎及全身性红斑狼疮(SLE)、桥本氏甲状腺炎、原发性黏液水肿、甲状腺毒症/格雷夫斯病、恶性贫血、自身免疫性萎缩性胃炎、自身免疫性心炎、艾迪生氏病、过早绝经、I型糖尿病、古德帕斯丘氏综合征、重症肌无力、自身免疫性溶血性贫血、特发性白血球减少症、原发性胆汁性肝硬化、慢性活动性肝炎(HBsAg阴性)、隐源性肝硬化、Sjogren氏综合征、皮肌炎、硬皮症、混合性结缔组织疾病、盘状红斑狼疮及全身性血管炎。
在一些实施方案中，该药物还可包含选自以下的第二治疗药物：TNF拮抗剂、疾病缓解抗风湿药、CTLA4拮抗剂、抗IL-6受体mAb及抗CD20mAb。
可制备该药物以供用于肠胃外给予途径。可制备该药物以供静脉内或皮下使用。
另一实施方案涵盖本文所述抗体在制备在人患者中抑制B细胞产生抗体的药物中的用途。
另一实施方案涵盖本文所述抗体在制备抑制表达人CD40抗原的细胞的生长和/或分化的药物中的用途。
另一实施方案涵盖本文所述抗体在制备治疗患有CD40相关的病症的个体的药物中的用途，其中该药物中抗体或抗原结合片段与CD40的结合抑制CD40相关的病症细胞的生长或分化。
可制备该药物以供用于治疗CD40相关的病症中选自以下的细胞：B淋巴样干细胞、胰细胞、肺细胞、乳房细胞、卵巢细胞、结肠细胞、前列腺细胞、皮肤细胞、头颈细胞、膀胱细胞、骨细胞或肾细胞。
可制备该药物以供用于治疗慢性淋巴细胞性白血病、伯基特氏淋巴瘤、多发性骨髓瘤、T细胞淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、霍奇金氏病、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症或卡波西氏肉瘤。
另一实施方案包括本发明的抗体在制备诱导清除外周B细胞的药物中的用途，其中该药物中的抗体或抗原结合片段与人细胞表面CD40抗原特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与该CD40抗原的结合诱导清除所述细胞。
可制备该药物以供用于治疗患有免疫病症的个体。
可制备该药物以供用于治疗类风湿性关节炎或全身性红斑狼疮。
另一实施方案包括本发明的抗体在制备治疗个体的类风湿性关节炎的药物中的用途。
可制备该药物以供用于在该个体中抑制B细胞分化及抗体同种型转换。
可制备该药物以供用于在该个体的T细胞及巨噬细胞中抑制细胞因子及趋化因子的产生及黏着分子的上调。
可制备该药物以供用于在该个体中抑制树突细胞活化。
可制备该药物以供用于在该个体的非免疫细胞中抑制促炎症细胞因子、趋化因子、基质金属蛋白酶、前列腺素的产生及黏着分子的下调。
在某些实施方案中，将该药物制备为组合药物，以与包含给予甲氨喋呤和/或给予Enbrel/Humira的方案组合给予。
在其他实施方案中，将该药物制备为组合药物，且该药物除包含本发明的抗体外还包含抗TNF药物。
附图说明
图1：A：人源化抗体对经CD40转染的HEK-293细胞的结合曲线及相应的EC50值，通过流式细胞计数法所测量。B：抗体A、抗体B及抗体C与经CD40转染的HEK细胞的结合的比较，通过流式细胞计数法所测量。显示的为一个实验的代表性数据。
图2：人源化抗体对RAMOS细胞的结合曲线及相应的EC50值，通过流式细胞计数法所测量。显示的为一个实验的代表性数据。
图3：小鼠及人源化抗体的拮抗活性在人原代B细胞增殖分析中的测试。(A)显示的为对于每种小鼠前体抗体的代表性抗体滴定曲线及所得的IC50值。显示的为一个供体的代表性数据。(B)显示的为多种人源化抗-CD40抗体与4D11相比的拮抗作用的抑制曲线的叠加。
图4：在人原代B细胞增殖分析中人源化抗体的拮抗性(IC50)及激动性(SI=刺激指数)活性的测试结果的总结。显示多种抗-CD40抗体、4D11、G28.5及5D12以供比较。
图5：在人全血分析中测试抗体B、抗体A及抗体C对CD40诱导的CD86上调的抑制。显示4D11抗-CD40抗体以供比较。IgG1同种型对照在此分析中显示无效应。显示的为一个供体的代表性数据。
图6：在人纯化B细胞上及人全血中测试抗体B对CD40诱导的CD86上调的抑制的结果的总结。显示的为在(A)IC50及(B)IC90两点的数据。IgG1同种型对照在任一分析中皆显示无效应。表中总结了多个供体(n=4-5)的数据。
图7：在短尾猴全血分析中测试抗体B、抗体A及抗体C对CD40诱导的CD86上调的抑制。IgG1同种型对照在此分析中显示无效应。显示的为一个供体的代表性数据。
图8：在给予1mg/kg及10mg/kg的每种抗体后，抗体A(左图)及抗体B(右图)在短尾猴中的血浆浓度时间曲线。数据为每种抗体给予3个动物的归纳。
图9：来自短尾猴的CD86阳性B细胞在给予(抗体B)及(抗体A)之前及在用每种抗体处理后的3个时间点的百分比变化。抗体B(上图)及抗体A为各自以1mg/kg(左图)或10mg/kg(右图)给予3个动物。
图10：在注射1.25x106人PBMC后2周NSG小鼠中的(A)人IgG及(B)人IgM的含量。在转移人PBMC之前一天以1mg/kg的剂量用载体、同种型对照及抗体(抗体A、抗体B及抗体C)处理小鼠。
图11：各种小鼠抗人CD40抗体与人血小板的结合。
图12：抗体B与抗-CD40mAb4D11在全血中的人B细胞及血小板上进行结合对比的结果总结。
图13：野生型及剔除IgG1构建体的ADCC活性。
发明详述
现已公认CD40介导的信号传导参与多种目标病症。尽管可获得许多临床前数据显示在所述病症中的干预将在治疗上有益，但业内仍需要可用于治疗自身免疫性疾病的拮抗性抗-CD40抗体。本发明的优选实施方案涉及识别CD40的人源化抗体。在具体实施方案中，已基于某些主要小鼠抗体的序列确定了所述人源化抗体的序列。
术语“CD40”及“CD40表面抗原”是指在正常及肿瘤性B细胞表面上表达的约48kD糖蛋白，其用作参与细胞增殖及分化的信号的受体(Ledbetter等人，1987，J.Immunol.138:788-785)。已自文库分离编码CD40的cDNA分子，该文库自伯基特淋巴瘤细胞系Raji制备(Stamenkovic等人，1989，EMBOJ.8:1403)。
本文所用内源性表达CD40的细胞系特征为表面表达CD40的任何细胞，包括(但不限于)正常及肿瘤性B细胞、交错突细胞、基底上皮细胞、癌瘤细胞、巨噬细胞、内皮细胞、滤泡树突细胞、扁桃体细胞及来自骨髓的浆细胞。在一些实施方案中，CD40分子为人CD40分子。
本发明的抗体与人重组及天然CD40特异性结合。人源化单克隆抗体(其中该抗体与人CD40特异性结合)，其在B细胞增殖中具有IC50小于1nM的拮抗活性且在高达100μg/ml的浓度不具有激动作用，且其中该抗体的特征还在于，该抗体在非人灵长类中的活体内半衰期为至少10天。
优选地，抗体与CD40在CD40-Fc缀合物中以小于1nM的EC50特异性结合，且与CD40在表达CD40的细胞中以小于2.5nM的EC50特异性结合。抗体的拮抗性特性定义为其B细胞或树突细胞拮抗活性IC50小于1nM。抗体还具有较优药物代谢动力学特性，其活体内半衰期相比于其他抗-CD40抗体(例如，抗-CD40抗体4D11)有所延长。
本文所用表达CD40的细胞系特征为表面表达CD40的任何细胞，包括(但不限于)正常及肿瘤性B细胞、交错突细胞、基底上皮细胞、癌瘤细胞、巨噬细胞、内皮细胞、滤泡树突细胞、扁桃体细胞及来自骨髓的浆细胞。在一些实施方案中，CD40分子为人CD40分子。
本发明的抗体识别特异性“CD40抗原表位”及“CD40表位”。这些本文所用所述术语是指能与抗-CD40抗体具有免疫反应性的分子(例如，肽)或分子片段，且包括(例如)可由具有以下重链/轻链序列组合的任一抗体识别的CD40抗原决定簇：轻链SEQIDNO:26与重链SEQIDNO:27、28、29或30中的任一者；或轻链SEQIDNO:31与重链SEQIDNO:32、33、34或35中的任一者；或轻链SEQIDNO:36与重链SEQIDNO:37、38、39或40中的任一者。CD40抗原表位可包括在蛋白、蛋白片段、肽或类似物中。最常见表位为蛋白、短寡肽、寡肽模拟物(即，模拟CD40抗原的抗体结合特性的有机化合物)或其组合。
抗体或免疫球蛋白的一般化结构为本领域技术人员所熟知，所述分子为通常为约150,000道尔顿的异四聚糖蛋白，其由两个相同轻(L)链及两个相同重(H)链组成。每个轻链通过一个二硫键与重链共价连接而形成异二聚体，且异四聚分子为经由异二聚体中两个相同重链之间的共价二硫键来形成。尽管轻链及重链通过一个二硫键连接在一起，但两个重链之间的二硫键数可随免疫球蛋白同种型而变。每一重链及轻链亦具有规则间隔的链内二硫键。每一重链在氨基末端具有可变域(VH)，之后为三个或四个恒定域(CH1、CH2、CH3及CH4)，以及CH1与CH2之间的铰链区。每一轻链具有两个域，即氨基末端可变域(VL)及羧基末端恒定域(CL)。VL域与VH域非共价结合，而CL域一般经由二硫键与CH1域共价连接。人们相信，特定氨基酸残基在轻链可变域与重链可变域之间形成接口(Chothia等人，1985，J.Mol.Biol.186:651-663)。
在不同抗体之间，可变域内的某些域广泛不同，即具有“超变性”。所述超变域含有直接参与每一特定抗体与其特异性抗原决定簇的结合及特异性的残基。轻链可变域与重链可变域二者中的超变性均集中于三个称作互补决定区(CDR)或超变环(HVL)的区段中。CDR在以下文献中通过序列对比来定义：Kabat等人，1991，SequencesofProteinsofImmunologicalInterest，第5版，PublicHealthService，NationalInstitutesofHealth，Bethesda，MD.；而HVL根据可变域的三维结构在结构上定义，如Chothia及Lesk，1987，J.Mol.Biol.196：901-917中所述。其中该两种方法使得CDR的鉴定略有不同，结构定义是优选的。如由Kabat所定义，在轻链可变域中，CDR-L1大致位于残基24-34处，CDR-L2大致位于残基50-56处，且CDR-L3大致位于残基89-97处；在重链可变域中，CDR-H1大致位于残基31-35处，CDR-H2大致位于残基50-65处，且CDR-H3大致位于残基95-102处。重链及轻链的CDR1、CDR2、CDR3由此界定了对于给定抗体具有特异性的独特功能特性。
每一重链及轻链内的三个CDR为由框架区(FR)来间隔，框架区含有可变性通常较低的序列。自重链及轻链可变域的氨基末端至羧基末端，FR及CDR以以下顺序排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及FR4。FR的较大β-折叠构型使每一链内的CDR彼此紧邻且与另一链中的CDR紧邻。所得构象有助于抗原结合位点(参见Kabat等人，1991，NIHPubl.第91-3242号，第I卷，第647-669页)，但并非所有CDR残基皆必须直接参与抗原结合。
FR残基及Ig恒定域并不直接参与抗原结合，但有助于抗原结合和/或介导抗体效应子功能。人们认为，一些FR残基以至少三种方式对抗原结合产生显著效应：直接与表位非共价结合，与一或多个CDR残基相互作用，及影响重链及轻链之间的接口。恒定域并不直接参与抗原结合，但介导各种Ig效应子功能，例如介导抗体参与抗体依赖性细胞毒性(ADCC)、补体依赖性细胞毒性(CDC)及抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)。
可基于恒定域的氨基酸序列将脊椎动物免疫球蛋白的轻链分配至两个显著不同的种类(卡帕(κ)及兰布达(λ))中的一类。通过比较，根据恒定域的序列将哺乳动物免疫球蛋白的重链分为以下五个主要类别：IgA、IgD、IgE、IgG及IgM。将IgG及IgA进一步分为亚类(同种型)，例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。对应于不同免疫球蛋白种类的重链恒定域分别称作α、δ、ε、γ及μ。各天然免疫球蛋白种类的亚单元结构及三维构型为人所熟知。
本文所用术语“抗体”、“抗-CD40抗体”、“人源化抗-CD40抗体”及“变体人源化抗-CD40抗体”具有最广泛含义且具体涵盖单克隆抗体(包括全长单克隆抗体)、多克隆抗体、多特异性抗体(例如，双特异性抗体)及表达期望生物学活性(例如CD40结合)的抗体片段(例如可变域及抗体的其他部分)。
术语“单克隆抗体”(mAb)是指基本上均质的抗体群中的抗体，即该群中的个别抗体除可能少量存在的天然突变外均相同。单克隆抗体针对单一抗原决定簇(即“表位”)具有高度特异性。因此，修饰词“单克隆”指示基本上均质且针对相同表位的抗体群，且不应理解为需要通过任何特定方法来产生该抗体。应理解，单克隆抗体可通过业内已知的任何技术或方法来制备；包括(例如)杂交瘤方法(Kohler等人，1975，Nature256:495)，或业内已知的重组DNA方法(例如，参见美国专利第4,816,567号)，或使用噬菌体抗体文库通过以下文献中所述技术分离以重组方式产生的单克隆抗体的方法：Clackson等人，1991，Nature352：624-628；及Marks等人，1991，J.Mol.Biol.222：581-597。
嵌合抗体为由来自一个物种(例如，非人哺乳动物，例如小鼠)的抗体重链及轻链可变区及另一物种(例如，人)抗体的重链及轻链恒定区组成，且可通过以下方式来获得：连接来自第一物种(例如，小鼠)的编码抗体可变区的DNA序列与来自第二物种(例如人)的编码抗体恒定区的DNA序列，并用含有所述经连接序列的表达载体转化宿主，从而使其可产生嵌合抗体。或者，嵌合抗体中，重链和/或轻链中的一或多个区域或域亦可与来自另一免疫球蛋白种类或同种型的单克隆抗体中的对应序列相同、同源或为其变体、或来自共有序列或种系序列。嵌合抗体可包括所述抗体的片段，条件是抗体片段表现出其亲代抗体的期望生物学活性，例如与相同表位结合(例如，参见美国专利第4,816,567号；及Morrison等人，1984，Proc.Natl.Acad.Sci.USA81：6851-6855)。
术语“抗体片段”、“抗-CD40抗体片段”、“人源化抗-CD40抗体片段”、“变体人源化抗-CD40抗体片段”是指全长抗-CD40抗体的一部分，其中保留可变区或功能能力，例如特异性CD40表位结合。抗体片段的实例包括(但不限于)Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv、scFv及scFv-Fc片段、双链抗体(diabody)、线性抗体、单链抗体、微抗体(minibody)、自抗体片段形成的双链抗体及自抗体片段形成的多特异性抗体。
可用例如木瓜蛋白酶或胃蛋白酶等酶处理全长抗体以生成可用抗体片段。使用木瓜蛋白酶消化来产生两个相同的称作“Fab”片段的抗原结合抗体片段(各自具有单一抗原结合位点)及残留的“Fc”片段。Fab片段亦含有轻链恒定域及重链CH1域。胃蛋白酶处理产生F(ab')2片段，其具有两个抗原结合位点且仍能交联抗原。
Fab'片段与Fab片段的不同之处在于在CH1域的C末端存在额外残基，包括一或多个来自抗体铰链区的半胱氨酸。F(ab')2抗体片段为通过铰链区中的半胱氨酸残基连接的Fab'片段对。亦已知抗体片段的其他化学偶联。
“Fv”片段含有完整抗原识别及结合位点，该位点为由一个重链可变域与一个轻链可变域呈紧密非共价连接的二聚体组成。在此构型中，每一可变域的三个CDR相互作用，从而在该VH-VL二聚体的表面上界定抗原结合位点。该六个CDR共同赋予该抗体抗原结合特异性。
“单链Fv”或“scFv”抗体片段为包含抗体VH及VL域的单链Fv变体，其中所述域存在于单一多肽链中。单链Fv能识别并结合抗原。scFv多肽亦可任选含有位于VH域与VL域之间的多肽接头，以促进scFv形成用于抗原结合的期望三维结构(例如，参见Pluckthun，1994，InThePharmacologyofmonoclonalAntibodies，第113卷，Rosenburg及Moore编辑，Springer-Verlag，NewYork，第269-315页)。
其他已知的抗体片段包括那些包含一对串联的Fd区段(VH-CH1-VH-CH1)以形成一对抗原结合区的抗体片段。所述“线性抗体”可为双特异性或单特异性，如(例如)Zapata等人，1995，ProteinEng.8(10):1057-1062中所述。
人源化抗体或人源化抗体片段为特定类型的嵌合抗体，其包括免疫球蛋白氨基酸序列变体或其片段，其能结合预定抗原，且其包含一或多个基本上具有人免疫球蛋白氨基酸序列的FR及一或多个基本上具有非人免疫球蛋白氨基酸序列的CDR。此非人氨基酸序列通常称作“输入”序列，通常取自“输入”抗体域，尤其是可变域。通常，人源化抗体至少包括非人抗体的CDR或HVL，插入人重链或轻链可变域的FR之间。本发明阐述特定人源化抗-CD40抗体，其含有表3及4所示源自鼠类单克隆抗体的CDR插入人种系序列重链及轻链可变域的FR之间。应理解，某些鼠类FR残基可能对人源化抗体的功能重要，且因此将修饰某些人种系序列重链及轻链可变域残基，以与对应鼠类序列中的那些相同。
在另一方面中，人源化抗-CD40抗体基本上包含所有至少一个(通常两个)可变域(例如含于例如Fab、Fab'、F(ab')2、Fabc及Fv片段中者)，其中所有或基本上所有CDR对应于非人免疫球蛋白的CDR，且在本文中特别是所有CDR为本文下表1至4中所详述的鼠类序列，且所有或基本上所有FR为人免疫球蛋白共有序列或种系序列的FR。在另一方面中，人源化抗-CD40抗体亦包括免疫球蛋白(通常为人免疫球蛋白)Fc区的至少一部分。通常，抗体含有轻链以及至少重链可变域二者。若适宜，抗体亦可包括重链CH1、铰链、CH2、CH3和/或CH4区中的一或多者。
人源化抗-CD40抗体可选自任一种类免疫球蛋白(包括IgM、IgG、IgD、IgA及IgE)及任一同种型(包括IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2)。举例而言，恒定域可为补体固定的恒定域，其中期望人源化抗体表现细胞毒性活性，且同种型通常为IgG1。倘若不期望该细胞毒性活性，则恒定域可为另一同种型，例如IgG2。替代性人源化抗-CD40抗体可包含来自不止一种免疫球蛋白种类或同种型的序列，且本领域技术人员可熟练选择特定恒定域来优化所期望的效应子功能。在具体实施方案中，本发明所提供抗体为IgG1抗体，且更具体而言为剔除效应子功能的IgG1抗体。
人源化抗-CD40抗体的FR及CDR或HVL不需要与亲代序列精确对应。举例而言，可通过取代、插入或缺失来改变(例如，诱变处理)输入CDR或HVL或共有FR或种系FR序列中的一或多个残基，从而使得所得氨基酸残基与任一亲代序列中对应位置的原始残基不再相同，但抗体仍保留与CD40结合的功能。该改变通常可并非广泛改变且可为保守改变。通常，至少75%人源化抗体残基可与亲代共有FR或种系FR及输入CDR序列中的那些残基对应，更通常有至少90%、且最通常有超过95%或超过98%或超过99%的残基对应。
影响重链与轻链可变区之间的接口(“VL-VH接口”)的免疫球蛋白残基为那些影响两条链相对于彼此接近或定向的残基。某些可能参与链间相互作用的残基包括VL残基34、36、38、44、46、87、89、91、96及98以及VH残基35、37、39、45、47、91、93、95、100及103(采用Kabat等人，SequencesofProteinsofImmunologicalInterest(NationalInstitutesofHealth，Bethesda，Md.，1987)中所述的编号系统)。美国专利第6,407,213号亦论述，例如VL残基43及85以及VH残基43及60等残基亦可能参与此相互作用。尽管仅针对人IgG阐述所述残基，但其亦适用于其他物种。选择合理地预期参与链间相互作用的重要抗体残基用于共有序列中的取代。
术语“共有序列”及“共有抗体”是指在任一特定种类、同种型或亚单元结构的所有免疫球蛋白(例如人免疫球蛋白可变域)中的每一位置包含最常出现的氨基酸残基的氨基酸序列。共有序列可基于特定物种或多个物种的免疫球蛋白。“共有”序列、结构或抗体可理解为涵盖某些实施方案中所述的共有人序列，且是指在任一特定种类、同种型或亚单元结构的所有人免疫球蛋白中的每一位置包含最常出现的氨基酸残基的氨基酸序列。因此，共有序列所含有的氨基酸序列在每一位置具有存在于一或多种已知免疫球蛋白中的氨基酸，但其可能并不精确复制任一单一免疫球蛋白的整个氨基酸序列。可变区共有序列并非自任何天然产生的抗体或免疫球蛋白及其变体均可获得(Kabat等人，1991，SequencesofProteinsofImmunologicalInterest，第5版，PublicHealthService，NationalInstitutesofHealth，Bethesda，Md.)。重链及轻链共有序列及其变体的FR为人源化抗-CD40抗体的制备提供可用序列。例如，参见美国专利第6,037,454号及第6,054,297号。
人种系序列天然存在于人种群中。所述种系基因的组合产生抗体多样性。抗体轻链的种系抗体序列来自保守人种系κ或λv-基因及j-基因。类似地，重链序列来自种系v-、d-及j-基因(LeFranc，M-P及LeFranc，G，“TheImmunoglobulinFactsBook”AcademicPress，2001)。
本文所用“变体”、“抗-CD40变体”、“人源化抗-CD40变体”或“变体人源化抗-CD40”各自是指人源化抗-CD40抗体，其至少具有来自SEQIDNO:1至4中任一序列的重链可变鼠类CDR，或源自SEQIDNO:5至SEQIDNO:8中任一者所示的鼠类单克隆抗体的轻链鼠类CDR序列，及源自人共有序列的FR序列。变体包括那些在轻链或重链可变域的一者或两者中具有一或多处氨基酸变化的变体，条件是所述氨基酸变化不会实质上损害抗体与CD40的结合。本文所产生的示例性人源化抗体包括那些称为抗体A、抗体B及抗体C的抗体，且其各重链及轻链序列显示于SEQIDNO:26至SEQIDNO:40中。
“分离的”抗体为已经鉴定且已自其天然环境组分中分离和/或回收的抗体。抗体天然环境中的污染物组分为那些可干扰抗体的诊断性或治疗性应用的物质，且可为酶、激素或其他蛋白性或非蛋白性溶质。在一方面中，可将抗体纯化至以抗体重量计分离度至少大于95%。
由于抗体天然环境中的至少一种组分不会存在，故分离的抗体包括产生其的重组细胞内的原位抗体。然而，分离的抗体通常可通过至少一个纯化步骤来制备，其中移除了重组细胞物质。
术语“抗体性能”是指有助于抗体识别抗原或者抗体活体内效力的因素。抗体氨基酸序列的变化可影响例如折叠等抗体特性，且可影响例如以下的物理因素：抗体与抗原结合的初始速率(ka)、抗体与抗原的解离常数(kd)、抗体对抗原的亲和常数(Kd)、抗体构象、蛋白稳定性及抗体半衰期。
本文所用术语“表位标记的”是指抗-CD40抗体与“表位标签”融合。“表位标签”为具有足量氨基酸以为抗体产生提供表位的多肽，且其经设计以使得其不干扰人源化抗-CD40抗体的期望活性。表位标签通常具有充分独特性以使得针对该表位标签产生的抗体基本上不会与其他表位交叉反应。适宜的标签多肽一般含有至少6个氨基酸残基且通常含有约8至50个氨基酸残基或约9至30个残基。表位标签及结合表位的抗体的实例包括流感HA标签多肽及其抗体12CA5(Field等人，1988Mol.Cell.Biol.8：2159-2165)；c-myc标签及其8F9、3C7、6E10、G4、B7及9E10抗体(Evan等人，1985，Mol.Cell.Biol.5(12)：3610-3616)；及单纯疱疹病毒糖蛋白D(gD)标签及其抗体(Paborsky等人，1990，ProteinEngineering3(6)：547-553)。在某些实施方案中，表位标签为“补救受体结合表位”。本文所用术语“补救受体结合表位(salvagereceptorbindingepitope)”是指IgG分子(例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)Fc区中的表位，其负责延长IgG分子的活体内血清半衰期。
在一些实施方案中，本发明的抗体可与细胞毒性剂缀合。细胞毒性剂为抑制或阻止细胞机能和/或引起细胞破坏的任何物质。该术语意欲包括放射性同位素(例如I131、I125、Y90及Re186)、化学治疗药物及毒素(例如细菌、真菌、植物或动物源酶活性毒素)及其片段。所述细胞毒性剂可通过标准操作与本发明的人源化抗体偶联，且其可用于(例如)治疗适用抗体疗法的患者。
“化学治疗药物”为可用于治疗癌症的化学化合物。化学治疗药物有多种实例可与本发明治疗性抗体缀合。所述化学治疗药物的实例包括烷化剂，例如噻替哌(thiotepa)及环磷酰胺；磺酸烷基酯，例如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶，例如苯并多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、meturedopa及uredopa；亚乙基亚胺及甲基密胺，包括六甲密胺(altretamine)、三亚乙基密胺、三亚乙基磷酰胺、三亚乙基硫化磷酰胺及三羟甲基密胺；番荔枝内酯(acetogenin)(尤其为布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone))；喜树碱(camptothecin)(包括合成类似物托泊替康(topotecan))；苔藓抑制素(bryostatin)；callystatin；CC-1065(包括其合成类似物阿多来新(adozelesin)、卡折来新(carzelesin)及比折来新(bizelesin))；cryptophycin(尤其为cryptophycin1及cryptophycin8)；多拉司他汀(dolastatin)；auristatin(包括类似物单甲基-auristatinE及单甲基-auristatinF)；多卡米星(duocarmycin)(包括合成类似物KW-2189及CBI-TMI)；艾榴素(eleutherobin)；pancratistatin；sarcodictyin；spongistatin；氮芥类，例如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷酰胺(chlorophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、异磷酰胺(ifosfamide)、双氯乙基甲胺(mechlorethamine)、盐酸氧氮芥(mechlorethamineoxidehydrochloride)、美法仑(melphalan)、新氮芥(novembichin)、苯芥胆甾醇(phenesterine)、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)和乌拉莫司汀(uracilmustard)；硝基脲类，例如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫斯汀(nimustine)和雷莫司汀(ranimnustine)；抗生素，例如烯二炔(enediyne)抗生素(例如刺孢霉素(calicheamicin)，尤其是刺孢霉素γ1I和刺孢霉素参见例如AngewChem.Intl.Ed.Engl.(1994)33:183-186)；dynemicin，包括dynemicinA；二膦酸盐，例如氯膦酸盐(clodronate)；埃斯培拉霉素(esperamicin)；新抑癌蛋白生色团(neocarzinostatinchromophore)和相关色蛋白烯二炔抗生素生色团(relatedchromoproteinenediyneantibioticchromophore)、aclacinomysin类、放线菌素(actinomycin)、authramycin、偶氮丝氨酸(azaserine)、博来霉素(bleomycin)、放线菌素C(cactinomycin)、carabicin、洋红霉素(carminomycin)、嗜癌霉素(carzinophilin)、色霉素(chromomycin)、放线菌素D(dactinomycin)、柔红霉素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮基-5-氧代-L-正亮氨酸(6-diazo-5-oxo-L-norleucine)、多柔比星(AdriamycinTM)(包括吗啉代-多柔比星(morpholino-doxorubicin)、氰基吗啉代-多柔比星(cyanomorpholino-doxorubicin)、2-吡咯啉子基-多柔比星(2-pyrrolino-doxorubicin)、去氧多柔比星(deoxydoxorubicin))、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊达比星(idarubicin)、麻西罗霉素(marcellomycin)、丝裂霉素(mitomycin)类例如丝裂霉素C(mitomycinC)、麦考酚酸(mycophenolicacid)、诺拉霉素(nogalamycin)、橄榄霉素(olivomycin)、培洛霉素(peplomycin)、泊非霉素(porfiromycin)、嘌罗霉素(puromycin)、三铁阿霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑霉素(streptonigrin)、链佐星(streptozocin)、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司(ubenimex)、新制癌菌素(zinostatin)和佐柔比星(zorubicin)；抗代谢物，例如甲氨喋呤(methotrexate)和5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)(5-FU)；叶酸类似物，例如二甲叶酸(denopterin)、甲氨喋呤、喋罗呤(pteropterin)和三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤类似物，例如氟达拉滨(fludarabine)、6-巯嘌呤(6-mercaptopurine)、硫咪嘌呤(thiamiprine)和硫鸟嘌呤(thioguanine)；嘧啶类似物，例如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-氮杂尿苷(6-azauridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、二脱氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、伊诺他滨(enocitabine)和氟尿苷(floxuridine)；雄激素，例如卡普睾酮(calusterone)、丙酸甲雄烷酮(dromostanolonepropionate)、环硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)和睾内酯(testolactone)；抗肾上腺素药(anti-adrenal)，例如氨鲁米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)和曲洛司坦(trilostane)；叶酸补充剂，例如亚叶酸(frolinicacid)；醋葡醛内酯(aceglatone)；醛磷酰胺糖苷(aldophosphamideglycoside)；氨基乙酰丙酸(aminolevulinicacid)；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；bestrabucil；比生群(bisantrene)；伊达曲杀(edatraxate)；地磷酰胺(defofamine)；秋水仙胺(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；elfornithine；依利醋铵(elliptiniumacetate)；埃坡霉素(epothilone)；依托格鲁(etoglucid)；硝酸镓(galliumnitrate)；羟基脲(hydroxyurea)；香菇多糖(lentinan)；氯尼达明(lonidainine)；美登醇(maytansinoid)类，例如美登素(maytansine)和安丝菌素(ansamitocin)；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；mopidanmol；根瘤菌剂(nitraerine)；喷司他丁(pentostatin)；蛋氨氮芥(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索蒽醌(losoxantrone)；鬼臼酸(podophyllinicacid)；2-乙基肼(2-ethylhydrazide)；丙卡巴肼(procarbazine)；雷佐生(razoxane)；根霉素(rhizoxin)；西佐喃(sizofiran)；锗螺胺(spirogermanium)；细交链孢菌酮酸(tenuazonicacid)；三亚胺醌(triaziquone)；2,2’,2”-三氯三乙胺(2,2’,2”-trichlorotriethylamine)；单端孢霉烯(trichothecene)(尤其是T-2毒素、verracurinA、杆孢菌素A(roridinA)和anguidine)；乌拉坦(urethan)；长春地辛(vindesine)；达卡巴嗪(dacarbazine)；甘露莫司汀(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴卫矛醇(mitolactol)；溴丙哌嗪(pipobroman)；gacytosine；阿糖胞苷(arabinoside)(“Ara-C”)；环磷酰胺；塞替派；紫杉烷(taxoid)，例如紫杉醇(paclitaxel)(Bristol-MyersSquibbOncology，Princeton，N.J.)及多西紫杉醇(doxetaxel)(Rhone-PoulencRorer，Antony，France)；苯丁酸氮芥；吉西他滨(gemcitabine)(GemzarTM)；6-硫鸟嘌呤；巯基嘌呤；甲氨喋呤；铂类似物，例如顺铂(cisplatin)及卡铂(carboplatin)；长春碱(vinblastine)；铂；依托泊苷(etoposide)(VP-16)；异磷酰胺；米托蒽醌；长春新碱(vincristine)；长春瑞滨(vinorelbine)(NavelbineTM)；诺安托(novantrone)；替尼泊苷(teniposide)；依达曲沙(edatrexate)；道诺霉素(daunomycin)；氨蝶呤(aminopterin)；希罗达(xeloda)；伊班膦酸盐(ibandronate)；CPT-11；拓扑异构酶抑制剂RFS2000；二氟甲基鸟氨酸(DMFO)；类视色素，例如视黄酸；卡培他滨(capecitabine)；及上述药物中任一者的药学上可接受的盐、酸或衍生物。此定义中亦包括用于调节或抑制激素对肿瘤的作用的抗激素剂，例如抗雌激素及选择性雌激素受体调节剂(SERM)，包括(例如)他莫昔芬(tamoxifen)(包括NolvadexTM)、雷洛昔芬(raloxifene)、屈洛昔芬(droloxifene)、4-羟基他莫昔芬、曲沃昔芬(trioxifene)、keoxifene、LY117018、奥那司酮(onapristone)及托瑞米芬(toremifene)(FarestonTM)；抑制芳香酶的芳香酶抑制剂，其调节肾上腺中雌激素的产生，例如4(5)-咪唑、胺鲁米特、乙酸甲地孕酮(megestrolacetate)(MegaceTM)、依西美坦(exemestane)、福美坦(formestane)、法倔唑(fadrozole)、伏氯唑(vorozole)(RivisorTM)、来曲唑(letrozole)(FemaraTM)及阿那曲唑(anastrozole)(ArimidexTM)；及抗雄激素，例如氟他胺(flutamide)、尼鲁米特(nilutamide)、比卡鲁胺(bicalutamide)、亮丙瑞林(leuprolide)及戈舍瑞林(goserelin)；及上述药物中任一者的药学上可接受的盐、酸或衍生物。所述药物中的任何一或多者可与本发明的人源化抗体缀合以提供可用于治疗各种病症的治疗药物。
亦可使抗体与前药缀合。“前药”为药物活性物质的前体或衍生物形式，其与母体药物相比对肿瘤细胞的细胞毒性较小，且能酶促活化或转化为活性更强的形式。例如，参见Wilman，1986,“ProdrugsinCancerChemotherapy”，BiochemicalSocietyTransactions，14，第375-382页，615thMeetingBelfast；及Stella等人，1985，“Prodrugs：AChemicalApproachtoTargetedDrugDelivery”，DirectedDrugDelivery，Borchardt等人(编辑)，第247-267页，HumanaPress。可用的前药包括(但不限于)含有磷酸根的前药、含有硫代磷酸根的前药、含有硫酸根的前药、含有肽的前药、经D-氨基酸修饰的前药、糖基化前药、含有β-内酰胺的前药、含有任选经取代的苯氧基乙酰胺的前药及含有任选经取代的苯基乙酰胺的前药、5-氟胞嘧啶前药及其他5-氟尿苷前药，其可转化成具有更高活性的无细胞毒性药物。可衍生为前药形式的细胞毒性药物的实例包括(但不限于)那些上文所述的化学治疗药物。
出于诊断性以及治疗性监测目的，亦可使本发明的抗体与标记(单独的标记或者标记与另外的第二药物(前药、化学治疗药物等))缀合。标记与其他第二药物不同，其是指可检测的化合物或组合物药物，且其可与本发明的人源化抗体直接或间接缀合。标记本身可被可检测(例如，放射性同位素标记或荧光标记)，或在酶标记情况下，标记可催化底物化合物或组合物发生可检测的化学变化。可制备经标记人源化抗-CD40抗体并用于各种应用中，包括体外及活体内诊断学。
可将本发明的抗体调配为脂质体制剂的一部分以实现其活体内递送。“脂质体”为由各种类型的脂质、磷脂和/或表面活性剂组成的小囊泡。脂质体可用于向哺乳动物递送化合物或调配物，例如本文所公开的人源化抗-CD40抗体，该抗体任选与一或多种药物活性药物和/或标记偶联或组合。脂质体的组分通常以双层结构排列，此与生物膜的脂质排列类似。
本发明某些方面涉及分离的核酸，其编码本发明的人源化抗体的一或多个域。“分离的”核酸分子为自至少一种污染物核酸分子鉴定并分离的核酸分子，其在抗体核酸的天然来源中通常与该污染物核酸分子相结合。分离的核酸分子与存在于天然细胞中的核酸分子不同。
在本发明各方面中，重组表达人源化抗体的一或多个域。该重组表达可采用一或多种控制序列，即在特定宿主有机体中表达可操作连接的编码序列所需的多核苷酸序列。适用于原核细胞中的控制序列包括(例如)启动子、操纵子及核糖体结合位点序列。真核控制序列包括(但不限于)启动子、聚腺苷酸化信号及增强子。所述控制序列可用于在原核及真核宿主细胞中表达及产生人源化抗-CD40抗体。
在使核酸序列与另一核酸序列具有功能性联系时，该核酸序列经“可操作连接”。举例而言，若前序列或分泌前导序列表达为参与多肽分泌的前蛋白，则该前序列或分泌前导序列与编码该多肽的核酸可操作连接；若启动子或增强子影响该序列的转录，则该启动子或增强子与该序列可操作连接；或若核糖体结合位点的定位可促进翻译，则该核糖体结合位点与该编码序列可操作连接。通常，“可操作连接”意指所连接DNA序列为邻接序列，且在分泌前导序列情形下为邻接序列且位于阅读框内。然而，增强子任选邻接。可通过在便捷的限制位点处接合来完成连接。若不存在所述位点，则可使用合成寡核苷酸衔接子或接头。
本文所用措辞“细胞”、“细胞系”及“细胞培养物”可互换使用，且所有所述名称皆包括其子代。因此，“转化体”及“转化细胞”包括原代个体细胞及其衍生的培养物而不考虑转移次数。
用于治疗目的的术语“哺乳动物”是指任何归类为哺乳动物的动物，包括人、家畜及农场动物，以及动物园动物、运动用动物或宠物，例如狗、马、猫、牛等。优选地，哺乳动物为人。
本文所用“病症”为可受益于使用本文所述人源化抗-CD40抗体治疗的任何病况。该术语包括慢性及急性病症或疾病，包括那些使哺乳动物易患所述病症的病理学病况。本文欲治疗的非限制性实例或病症包括癌症、血液恶性肿瘤、良性及恶性肿瘤、白血病及淋巴恶性肿瘤以及炎性、血管生成性、自身免疫性及免疫性病症。
术语“癌症”及“癌性”是指或描述哺乳动物中特征通常在于细胞生长失调的生理学病况。癌症的实例包括(但不限于)癌瘤、淋巴瘤、母细胞瘤、肉瘤及白血病。
本文所用术语“CD40相关的病症”或“CD40相关疾病”是指需要改良或消除表达CD40的细胞的病况。所述病况包括显示异常增殖的表达CD40的细胞或与癌性或恶性生长有关的表达CD40的细胞。更具体而言，显示异常表达CD40抗原的癌症的实例包括B淋巴样干细胞、伯基特氏淋巴瘤、多发性骨髓瘤、T细胞淋巴瘤、卡波西氏肉瘤、骨肉瘤、表皮及内皮肿瘤、胰腺癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、结肠癌、前列腺癌、头颈癌、皮肤癌(黑色素瘤)、膀胱癌及肾癌。所述病症包括(但不限于)白血病、淋巴瘤(包括B细胞淋巴瘤及非霍奇金氏淋巴瘤)、多发性骨髓瘤、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症；实体肿瘤，包括肉瘤(例如骨肉瘤、尤因氏肉瘤(Ewing'ssarcoma))、恶性黑色素瘤、腺癌(包括卵巢腺癌)、卡波西氏肉瘤/卡波西氏肿瘤及鳞状细胞癌。
CD40相关的病症亦包括免疫系统疾病及病症，例如自身免疫病症及炎症病症。所述病况包括(但不限于)类风湿性关节炎(RA)、全身性红斑狼疮(SLE)、硬皮症、Sjogren氏综合征、多发性硬化、牛皮癣、炎性肠病(例如，溃疡性结肠炎及节段性回肠炎)、肺炎症、哮喘及特发性血小板减少性紫癜(ITP)。
本文所用词组“阻止…生长”或“生长抑制性”是指抑制细胞、尤其是表达CD40抗原的肿瘤性细胞类型的生长或增殖。因此，生长抑制(例如)显著降低S期肿瘤性细胞的百分比。
术语“静脉内输注”是指在动物或人患者静脉中经大于约15分钟、一般介于约30至90分钟之间的一段时间引入药物。
术语“静脉内推注”或“静脉内推射”是指将药物给予至动物或人的静脉中，从而使机体在约15分钟或更短、一般5分钟或更短时间内接受药物。
术语“皮下给予”是指在动物或人患者的皮肤下、优选在皮肤与基底组织之间的囊内通过自药物贮器相对缓慢的持续递送来引入药物。将皮肤向上捏离或拉离基底组织可产生囊。
术语“皮下输注”是指在动物或人患者的皮肤下、优选在皮肤与基底组织之间的囊内经一段时间(包括(但不限于)30分钟或更短、或90分钟或更短)通过自药物贮器相对缓慢的持续递送来引入药物。任选地，输注可通过皮下植入药物递送泵(植入动物或人患者的皮肤下)来实施，其中该泵经预定时间段(例如30分钟、90分钟或跨越整个治疗方案的时间段)递送预定量的药物。
术语“皮下推注”是指在动物或人患者的皮肤下给予药物，其中推注药物递送短于约15分钟；在另一方面中，短于5分钟；且在另一方面中，短于60秒。在另一方面中，在皮肤与基底组织之间的囊内给予，其中该囊可通过将皮肤向上捏离或拉离基底组织来产生。
所用术语“治疗有效量”是指活性药物可缓解或改善所治疗病症的一或多种症状的量。在此情况下，其为具有有益患者结果(例如生长阻止效应)或引起细胞缺失的量。在一方面中，治疗有效量具有细胞凋亡活性，或能诱导细胞死亡。在另一方面中，治疗有效量是指已显示可有效(例如)减慢疾病进展的目标血清浓度。可取决于欲治疗病况以常用方式来测量功效。举例而言，在特征为表达CD40的细胞的肿瘤性疾病或病症中，可通过评价至疾病进展时间或测定反应率来测量功效。
本文所用“治疗”及“疗法”及类似术语意欲包括针对疾病或病症的治疗性以及预防性或抑制性措施，其产生任何临床上期望或有益的效应，包括(但不限于)减轻或缓解疾病或病症的一或多个症状、使疾病或病症消退、减慢或停止疾病或病症的进展。因此，例如，术语治疗包括在疾病或病症的症状发作之前或之后给予药物，由此预防或消除疾病或病症的一或多个体征。作为另一实例，该术语包括在疾病的临床表达后给予药物，从而抵抗该疾病的症状。此外，在发作后及在已出现临床症状后给予药物包含本文所用“治疗”或“疗法”，其中不论该治疗是否引起疾病改善，给予皆影响疾病或病症的临床参数，例如组织损伤度或转移的量或程度。另外，只要单独或与另一治疗药物组合的本发明组合物与未使用人源化CD40抗体组合物时相比减轻或改善所治疗病症的至少一个症状，不论是否减轻该病症的所有症状，该结果即应视为可有效治疗潜在病症。
所用术语“包装说明书”是指通常包括于治疗产品商业包装内的说明书，其含有关于使用所述治疗产品的适应症、用法、给予、禁忌症和/或警告的信息。
抗体
本文描述并公开了人源化抗-CD40抗体以及包含本发明一或多种人源化抗-CD40抗体的组合物及制品。本文还描述了包括人源化抗-CD40抗体的抗原结合片段的结合剂。人源化抗-CD40抗体及结合剂可阻止细胞生长，引起表达CD40的细胞缺失，或者诱导或引起针对靶细胞的细胞毒性或细胞抑制效应。人源化抗-CD40抗体及结合剂可用于治疗多种特征为表达CD40表面抗原的细胞增殖的疾病或病症。人源化抗-CD40抗体及CD40结合剂各自包括至少一个特异性识别CD40表位的部分(即，抗原结合片段)。
在初步表征中，鼠类抗体基于CD40结合表征来选择。
根据所述初始研究，选择具有以下表1中所示的重链可变区及表2中所示轻链可变区的鼠类抗体：
表1：CD40鼠类前导-VH序列
表2：CD40鼠类前导-VK序列
基于骨架同源性、CDR结构、保守标准残基(conservedcanonicalresidues)、保守接口封装残基(conservedinterfacepackingresidues)及其他参数来选择每一小鼠前导序列的人骨架序列。
对于各种鼠类所选择抗体的鼠类重链及轻链CDR分别显示于表3及表4中：
表3：重链CDR序列
上文所列示H-CDR1使用通过Chothia编号系统编号的序列(Al-Lazikani等人，(1997)JMB273,927-948)。序列的Kabats编号表示为上表CDR1及CDR2中残基的粗斜体文字且IMGT编号显示为加下划线文字。2H11、10F2及19B10中每一者的H-CDR3序列为TTSYYVGTYGY(SEQIDNO:77)且20E2的H-CDR3序列为ARQDGYRYAMDY(SEQIDNO:78)。
表4：轻链CDR序列
同样，表4中使用Chothia编号系统，且序列的Kabats编号表示为粗斜体文字且IMGT编号显示为加下划线文字。
选择与嵌合亲代Fab相比显示较佳或相等结合的Fab，将其转化为IgG。将来自20E2系列的克隆转化为两个不同IgG模式：a)IgG4DM(双重突变体(doublemutant))在Fc/铰链区具有两处突变，Ser228Pro降低一半的分子形成且Leu235Glu进一步降低FcγR结合；b)IgG1KO(剔除(knock-out)效应子功能)在Fc区具有两处突变Leu234Ala及Leu235Ala，其降低例如FcγR及补体结合等效应子功能。两种IgG模式皆阐述于文献中。实施例1更详细地阐述三种候选者的人源化。该人源化的结果是产生人源化抗体序列，其具有下文所展示的重链及轻链序列：
在一些实施方案中，抗原结合片段可经由(例如)结合CD40表面抗原来(例如)阻断增殖或阻止细胞生长或引起细胞的清除、死亡或其缺失。举例而言，在T及B细胞恶性肿瘤中，在恶性细胞暴露于引起正常淋巴细胞活化的刺激物时，经常引发抗肿瘤效应(例如，生长阻止伴随或不伴随细胞缺失或细胞凋亡)。已观察到此活化诱导的生长阻止具有经由抗原受体或共刺激受体的信号(例如，参见Ashwell等人，1987，Science237：61；Bridges等人，1987，J.Immunol.139：4242；Page及Defranco，1988，J.Immunol.140：3717；及Beckwith等人，1990，J.Natl.CancerInst.82：501)。由于抗体或可溶性配体的特异性结合，CD40刺激抑制B细胞淋巴瘤生长(例如，参见Funakoshi等人，1994，Blood83：2787-2794)。以此方式抑制恶性细胞生长且针对CD40表面抗原的药物为适宜药物的实例。
CD40特异性药物包括人源化抗-CD40抗体结合CD40的抗原结合片段(例如，人CD40或其变体)。CD40特异性药物及抗体可任选与细胞毒性或化学治疗药物缀合或融合。在人源化抗体结合CD40表面抗原并导致清除表达CD40的细胞类型的方面中，结合的特征一般在于归巢至活体内CD40表面抗原细胞。适宜的结合剂以足够高的亲和性和/或亲合力(avidity)结合CD40抗原，从而使得CD40特异性药物可通过特异性靶向表达抗原的细胞来用作治疗药物。
在一些方面中，人源化抗体使CD40配体与CD40的结合降低至少45%、至少50%、至少60%或至少75%或至少80%、或至少90%、或至少95%。
在一些实施方案中，人源化抗-CD40抗体(包括其抗原结合片段，例如重链及轻链可变域)包含源自上文所述CDR抗体A(重链序列=SEQIDNO:27；SEQIDNO:28；SEQIDNO:29或SEQIDNO:30；轻链序列=SEQIDNO:26)、抗体B(重链序列=SEQIDNO:32；SEQIDNO:33；SEQIDNO:34；或SEQIDNO:35；轻链序列=SEQIDNO:31)及抗体C(重链序列=SEQIDNO:37；SEQIDNO:38；SEQIDNO:39或SEQIDNO:40；轻链序列=SEQIDNO:36)的残基的氨基酸序列及源自人免疫球蛋白框架区的氨基酸残基。人源化抗-CD40抗体任选在共有或种系框架区包括特异性氨基酸取代。
在所述骨架位置处的特异性氨基酸残基取代，相对于通过将CDR或HVL“直接交换”至人种系框架区中形成的人源化抗体中所示者，可改良各方面抗体性能(包括结合亲和性和/或稳定性)，如下文实施例中所示。
在一些实施方案中，本发明阐述具有重链(VH)序列SEQIDNO:1至SEQIDNO:4及轻链(VL)序列SEQIDNO:5至SEQIDNO:8(参见上文表1及2)的其他单克隆抗体。所述鼠类抗体的CDR序列显示于表3及4中，将所述CDR置于人共有重链及轻链可变域的FR中可产生本发明可用的人源化抗体。
在某些具体实施方案中，本文所公开的人源化抗-CD40抗体至少包含具有上文表1至4中所示鼠类单克隆抗体CDR或HVL以及人种系重链及轻链可变域的FR的重链或轻链可变域。在示例性实施方案中，本文所产生人源化抗体为：抗体A、抗体B及抗体C，且其各重链及轻链序列显示于SEQIDNO:26至SEQIDNO:40中。
在具体实施方案中，涵盖具有以下的抗体：SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29或SEQIDNO:30中任一者的重链序列以及轻链序列SEQIDNO:26。备选抗体包括具有以下的那些：重链序列SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34或SEQIDNO:SEQIDNO:35以及轻链序列SEQIDNO:31。在其他实施方案中，提供具有以下的人源化抗体：重链序列SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39或SEQIDNO:40以及轻链序列SEQIDNO:36。
所述序列的CDR显示于表3及4中。在具体实施方案中，预计在所述示例性免疫球蛋白之间具有转换CDR区(即，例如转换用来自抗体C的类似CDR转换抗体A的一个或两个CDR)的嵌合抗体可产生可用抗体。
在某些实施方案中，人源化抗-CD40抗体为抗体片段。上文已概述各种抗体片段且已研发出多种技术来产生所述抗体片段。可经由蛋白水解消化完整抗体来获得片段(例如，参见Morimoto等人，1992，JournalofBiochemicalandBiophysicalMethods24：107-117；及Brennan等人，1985，Science229：81)。或者，可在重组宿主细胞中直接产生片段。举例而言，可直接自大肠杆菌(E.coli)回收Fab'-SH片段，并实施化学偶联以形成F(ab′)2片段(例如，参见Carter等人，1992，Bio/Technology10：163-167)。通过另一方法，可直接自重组宿主细胞培养物中分离F(ab′)2片段。本领域技术人员可了解产生抗体片段的其他技术。
某些实施方案包括人源化抗-CD40抗体的F(ab′)2片段，其包含SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29或SEQIDNO:30中任一者的重链序列以及轻链序列SEQIDNO:26。备选抗体包括具有以下的那些：重链序列SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34或SEQIDNO:35以及轻链序列SEQIDNO:31。在其他实施方案中，提供具有以下的人源化抗体：重链序列SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39或SEQIDNO:40以及轻链序列SEQIDNO:36。所述实施方案可包括包含所述F(ab')2的完整抗体。
在一些实施方案中，该抗体或抗体片段包括介导效应子功能的恒定区。恒定区可提供针对表达CD40的靶细胞的抗体依赖性细胞毒性(ADCC)、抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)和/或补体依赖性细胞毒性(CDC)反应。效应子域可为(例如)Ig分子的Fc区。通常，CD40结合剂募集和/或活化细胞毒性白血细胞(例如，天然杀伤(NK)细胞、吞噬细胞(例如，巨噬细胞)和/或血清补体组分)。
抗体的效应子域可来自任何适宜的脊椎动物物种及同种型。来自不同动物物种的同种型介导效应子功能的能力不同。举例而言，人免疫球蛋白介导CDC及ADCC/ADCP的能力一般分别具有以下次序：IgM≈IgG1≈IgG3>IgG2>IgG4及IgG1≈IgG3>IgG2/IgM/IgG4。鼠类免疫球蛋白一般介导CDC及ADCC/ADCP一般分别具有以下次序：鼠类IgM≈IgG3>>IgG2b>IgG2a>>IgG1及IgG2b>IgG2a>IgG1>>IgG3。在另一实施例中，鼠类IgG2a介导ADCC，而鼠类IgG2a及IgM二者介导CDC。
抗体修饰
人源化抗-CD40抗体及药物可包括对人源化抗-CD40抗体或其抗原结合片段的修饰。举例而言，可期望在效应子功能方面修饰抗体，以增强抗体在治疗癌症中的效力。一种所述修饰为将半胱氨酸残基引入Fc区中，由此使得在此区域中可形成链间二硫键。由此生成的同二聚抗体可具有经改良的内在化能力和/或增强的补体介导细胞杀伤和/或抗体依赖性细胞毒性(ADCC)。例如，参见Caron等人，1992，J.ExpMed.176：1191-1195；及Shopes，1992，J.Immunol.148：2918-2922。亦可使用异双功能性交联剂来制备具有增强的抗肿瘤活性的同二聚抗体，如Wolff等人，1993，CancerResearch53：2560-2565中所述。或者，抗体可经改造以含有双重Fc区，从而增强抗体的补体溶胞及ADCC能力。参见Stevenson等人，1989，Anti-CancerDrugDesign3：219-230。
已通过修改抗体Fc区的糖基化模式来生成支持ADCC的能力经改良的抗体。这是可能的，因为抗体在CH2域中天冬酰胺残基N297处的糖基化参与ADCC必需的IgG与Fcγ受体之间的相互作用。已经改造宿主细胞系以表达糖基化改变(例如增加平分型(bisecting)N-乙酰葡萄糖胺或减少岩藻糖)的抗体。减少岩藻糖比增加平分型N-乙酰葡萄糖胺的存在更大程度地增强ADCC活性。另外，低岩藻糖抗体的ADCC增强与FcγRIIIaV/F多态性无关。
修饰抗体Fc区中的氨基酸序列为增强ADCC的糖基化改造的备选方案。已通过广泛的突变分析来确定Fcγ受体在人IgG1上的结合位点。此导致生成具有Fc突变的人源化IgG1抗体，所述突变提高对FcγRIIIa的结合亲和性并增强体外ADCC。另外，已获得结合特性具有多种不同变更的Fc变体，所述特性例如与特异性FcγR受体的结合增强且与其他FcγR受体的结合不变或减小。
另一方面包括免疫缀合物，其包含与细胞毒性剂缀合的人源化抗体或其片段，该细胞毒性剂为例如化学治疗药物、毒素(例如，细菌、真菌、植物或动物来源的酶活性毒素或其片段)或放射性同位素(即，放射性缀合物)。
上文已阐述可用于产生所述免疫缀合物的化学治疗药物。可用于形成可用免疫缀合物的酶促活性毒素及其片段包括白喉A链、白喉毒素的非结合活性片段、外毒素A链(来自铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa))、蓖麻毒素A链、相思豆毒蛋白A链、蒴莲根毒素A链、α-八叠球菌、油桐(Aleuritesfordii)蛋白、石竹素蛋白、美洲商陆(Phytolacaamericana)蛋白(PAPI、PAPII及PAP-S)、苦瓜(Momordicacharantia)抑制剂、泻果素(curcin)、巴豆毒蛋白、肥皂草(Sapaonariaofficinalis)抑制剂、白树毒素、mitogellin、局限曲菌素、酚霉素、依诺霉素(enomycin)、单端孢霉烯等。多种放射性核素可用于产生放射性缀合物的人源化抗-CD40抗体。实例包括212Bi、131I、131In、90Y及186Re。
人源化抗-CD40抗体与细胞毒性剂或化学治疗剂的缀合物可通过已知方法使用多种双功能蛋白偶联剂制得，所述偶联剂例如3-(2-吡啶基二巯基)丙酸N-琥珀酰亚胺酯(SPDP)、亚胺基硫杂环戊烷(IT)、亚胺酸酯的双功能衍生物(例如己二酸二甲酯HCL)、活性酯(例如辛二酸二琥珀酰亚胺酯)、醛(例如戊二醛)、双叠氮基化合物(例如双(对-叠氮基苯甲酰基)己二胺)、双重氮衍生物(例如双(对重氮苯甲酰基)-乙二胺)、二异氰酸酯(例如甲苯2,6-二异氰酸酯)及双活性氟化合物(例如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。举例而言，蓖麻毒素免疫毒素可如Vitetta等人，1987，Science238：1098中所述来制备。经碳-14标记的1-异硫氰酰苄基-3-甲基二亚乙基三胺五乙酸(MX-DTPA)为放射性核苷酸与抗体缀合的示例性螯合剂。缀合物亦可使用可裂解接头来形成。
在另一实施方案中，可将抗体与“受体”(例如抗生蛋白链菌素)缀合以供用于肿瘤预靶向。在此操作中，将抗体-受体缀合物给予患者，之后使用清除剂自循环移除未结合缀合物，且随后给予选择性结合受体的“配体”(例如，抗生物素蛋白)，该配体与细胞毒性剂(例如，放射性核素)缀合。
亦可将本文所公开人源化抗-CD40抗体调配为免疫脂质体。含有抗体的脂质体通过业内已知的方法来制备，例如以下文献中所阐述：Epstein等人，1985，Proc.Natl.Acad.Sci.USA82：3688；Hwang等人，1980，Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:4030；及美国专利第4,485,045号及第4,544,545号。循环时间延长的脂质体公开于(例如)美国专利第5,013,556号中。
尤其有用的脂质体可使用包含磷脂酰胆碱、胆固醇及PEG衍生的磷脂酰乙醇胺(PEG-PE)的脂质组合物通过反相蒸发法来生成。经由具有指定孔径的滤膜挤出脂质体以获得具有期望直径的脂质体。可经由二硫化物互换反应使本文所公开抗体的Fab'片段与脂质体组合，如Martin等人，1982，J.Biol.Chem.257：286-288中所述。化学治疗药物(例如多柔比星)任选含于脂质体内。例如，参见Gabizon等人，1989，J.NationalCancerInst.81(19):1484。
本文阐述并公开的抗体亦可通过使抗体与活化前药的酶缀合来用于ADEPT(抗体导向的酶前药疗法)操作，该酶将前药(例如，肽基化学治疗药物)转化为活性抗癌药物。例如，参见WO81/01145、WO88/07378及美国专利第4,975,278号。可用于ADEPT的免疫缀合物中的酶组分为能作用于前药而将其转化为活性更强的细胞毒性形式的酶。可用于ADEPT的具体酶包括(但不限于)：碱性磷酸酶，其用于将含磷酸酯前药转化为游离药物；芳基硫酸酯酶，其用于将含硫酸酯前药转化为游离药物；胞嘧啶脱胺酶，其用于将非毒性5-氟胞嘧啶转化为抗癌药物5-氟尿嘧啶；蛋白酶，例如沙雷菌(Serratia)蛋白酶、嗜热菌蛋白酶、枯草杆菌蛋白酶、羧肽酶及组织蛋白酶(例如组织蛋白酶B及L)，其用于将含肽前药转化为游离药物；D-丙氨酰羧肽酶，其用于转化含有D-氨基酸取代基的前药；碳水化合物裂解酶，例如β-半乳糖苷酶及神经氨酸酶，其用于将糖基化前药转化为游离药物；β-内酰胺酶，其用于将经β-内酰胺衍生的药物转化为游离药物；及青霉素酰胺酶，例如青霉素V酰胺酶或青霉素G酰胺酶，其用于分别将胺氮上经苯氧基乙酰基或苯基乙酰基衍生的药物转化为游离药物。或者，可使用具有酶活性的抗体(“抗体酶”)来将前药转化为游离活性药物(例如，参见Massey，1987，Nature328：457-458)。可通过已知方法来制备抗体-抗体酶缀合物以供将抗体酶递送至肿瘤细胞群，例如，通过使酶与上述人源化抗-CD40抗体/异双功能性交联试剂共价结合来制备。或者，可使用重组DNA技术构造融合蛋白，其包含本文所公开抗体的至少抗原结合区及与之相连的上述酶的至少功能活性部分(例如，参见Neuberger等人，1984，Nature312：604-608)。
在某些实施方案中，可期望使用人源化抗-CD40抗体片段而非完整抗体以(例如)促进肿瘤渗透。可期望修饰抗体片段以延长其血清半衰期。此可通过(例如)将补救受体结合表位纳入抗体片段中来达成。在一种方法中，可改变(例如使之突变)抗体片段中的适宜区域，或可通过(例如)DNA或肽合成将表位纳入肽标签中，随后使该标签在末端或在中部与抗体片段融合。例如，参见WO96/32478。
在其他实施方案中，亦包括人源化抗-CD40抗体的共价修饰。共价修饰包括对以下基团的修饰：半胱氨酰基残基、组氨酰基残基、赖氨酰基及氨基末端残基、精氨酰基残基、酪氨酰基残基、羧基侧基团(天冬氨酰基或谷氨酰基)、谷氨酰氨酰基及天冬酰氨酰基残基或丝氨酰基或苏氨酰基残基。另一共价修饰类型涉及使糖苷与抗体化学或酶促偶联。若适用，所述修饰可通过化学合成或通过抗体的酶促或化学裂解来制备。可通过使抗体的靶向氨基酸残基与能与所选侧链或氨基-或羧基-末端残基反应的有机衍生剂反应来将抗体的其他共价修饰类型引入分子中。
抗体上存在的任何碳水化合物部分的移除可以以化学或酶促方式来完成。化学去糖基化阐述于以下文献中：Hakimuddin等人，1987，Arch.Biochem.Biophys.259：52及Edge等人，1981，Anal.Biochem.，118：131。抗体上碳水化合物部分的酶促裂解可通过使用多种内切糖苷酶及外切糖苷酶来达成，如Thotakura等人，1987，Meth.Enzymol138：350中所述。
可用的共价修饰的另一类型包含使抗体与多种非蛋白性聚合物(例如聚乙二醇、聚丙二醇或聚氧化烯)中的一者以以下文献中的一或多者所述的方式连接：美国专利第4,640,835号、美国专利第4,496,689号、美国专利第4,301,144号、美国专利第4,670,417号、美国专利第4,791,192号及美国专利第4,179,337号。
人源化及氨基酸序列变体
抗-CD40抗体的氨基酸序列变体可通过将适宜核苷酸变化引入抗-CD40抗体DNA中或通过肽合成来制备。所述变体包括(例如)本文实施例中抗-CD40抗体氨基酸序列内残基的缺失和/或插入和/或取代。实施缺失、插入及取代的任一组合以获得最终构建体，条件是最终构建体具有期望特征。氨基酸变化亦可改变人源化或变体抗-CD40抗体的翻译后过程，例如改变糖基化位点的数目或位置。
可用于鉴定抗-CD40抗体中优选诱变位置的某些残基或区域的方法称作“丙氨酸扫描诱变”，如Cunningham及Wells(Science，244：1081-1085(1989))中所述。此处，鉴定了残基或目标残基群(例如带电荷残基，例如arg、asp、his、lys及glu)且其经中性或带负电荷氨基酸(通常为丙氨酸)取代以影响氨基酸与CD40抗原的相互作用。然后通过在取代位点或针对取代位点引入另外或其他变体来改良那些显示对取代具有功能敏感性的氨基酸位置。因此，在预先确定引入氨基酸序列变异的位点时，突变本身的性质无需预先确定。举例而言，为分析给定位点处突变的性能，在目标密码子或区域处实施丙氨酸扫描诱变或随机诱变并针对期望活性筛选所表达的抗-CD40抗体变体。
氨基酸序列插入包括氨基-和/或羧基末端融合(长度介于一个残基至含有上百或更多残基的多肽的范围内)以及单一或多个氨基酸残基的序列内插入。末端插入的实例包括与表位标签融合的抗-CD40抗体。抗-CD40抗体分子的其他插入性变体包括酶或可提高抗体血清半衰期的多肽与抗-CD40抗体N-或C-末端的融合。
另一类型的变体系氨基酸取代变体。所述变体在抗-CD40抗体分子中移除至少一个氨基酸残基并在该位置处插入不同残基。用于取代诱变的最受关注的位点包括超变区，但亦涵盖FR改变。保守取代显示于表5的“优选取代”标题下。若所述取代引起生物活性改变，则可引入更重要的改变(命名为“示例性取代”，或如下文参照氨基酸种类所进一步阐述)，并筛选产物。
表5
在蛋白化学中，一般公认抗体的生物学特性可通过选择维持以下特性的效应显著不同的取代来达成：(a)取代区域中多肽骨架的结构，例如呈折叠或螺旋构象，(b)分子在靶位点处的电荷或疏水性，或(c)侧链体积。根据常见侧链特性将天然残基分为以下各类：
(1)疏水性：正亮氨酸、met、ala、val、leu、ile；
(2)中性亲水性：cys、ser、thr；
(3)酸性：asp、glu；
(4)碱性：asn、gin、his、lys、arg；
(5)影响链取向的残基：gly、pro；及
(6)芳香族：trp、tyr、phe。
非保守性取代使得需要将所述种类之一的成员交换为另一种类。
亦可取代(一般用丝氨酸取代)维持人源化或变体抗-CD40抗体的适当构象时未涉及的任何半胱氨酸残基，从而提高分子的氧化稳定性，预防异常交联，或提供与细胞毒性或细胞抑制化合物的已确认的经合点。相反，可将半胱氨酸键添加至抗体以提高其稳定性(尤其在抗体为例如Fv片段等抗体片段时)。
一类取代型变体涉及取代亲代抗体(例如人源化或人抗体)中的一或多个超变区残基。通常，所选用于进一步研发的所得变体可相对于产生所述变体的亲代抗体具有改良的生物特性。产生所述取代型变体的便捷方法为使用噬菌体展示实施的亲和性成熟。简言之，使若干超变区位点(例如6至7个位点)突变以在每一位点产生所有可能的氨基酸取代。由此产生的抗体变体以单价方式以与每一颗粒内所封装的M13基因III产物的融合形式自丝状噬菌体颗粒展示出来。然后针对生物学活性(例如结合亲和性)来筛选噬菌体展示的变体。为确定修饰的候选超变区位点，可实施丙氨酸扫描诱变以确定显著促进抗原结合的超变区残基。或者或另外，有利的是分析抗原-抗体复合物的晶体结构以确定抗体与人CD40之间的接触点。所述接触残基及附近残基为本文所述技术的候选取代残基。产生所述变体后，立即如本文所述对变体组进行筛选，且可选择在一或多个相关分析中具有优良特性的抗体以供进一步研发。
抗体的另一类氨基酸变体改变抗体的原始糖基化模式。“改变”意指缺失一或多个存在于抗体中的碳水化合物部分和/或添加一或多个抗体中不存在的糖基化位点。
在一些实施方案中，可期望修饰本发明的抗体以添加糖基化位点。抗体的糖基化通常为N-连接或O-连接。N-连接是指碳水化合物部分连接至天冬酰氨酸残基侧链。三肽序列天冬酰氨酸-X-丝氨酸及天冬酰氨酸-X-苏氨酸(其中X为除脯氨酸外的任何氨基酸)为碳水化合物部分经酶连接至天冬酰氨酸侧链的识别序列。因此，多肽中存在所述三肽序列中的任一者均可产生潜在糖基化位点。O-连接糖基化是指糖N-乙酰半乳糖胺、半乳糖或木糖之一连接至羟基氨基酸，最常见为丝氨酸或苏氨酸，但亦可使用5-羟脯氨酸或5-羟赖氨酸。因此，为糖基化特定蛋白(例如抗体)，改造该蛋白的氨基酸序列以含有上述三肽序列中的一或多者(对于N-连接糖基化位点)。亦可通过一或多个丝氨酸或苏氨酸残基添加或取代于原始抗体序列中来改变(对于O-连接糖基化位点)。
编码抗-CD40抗体氨基酸序列变体的核酸分子为由业内已知的多种方法制备。所述方法包括(但不限于)自天然来源分离(在天然氨基酸序列变体情况下)或通过抗-CD40抗体的预先制备的变体或非变体形式实施寡核苷酸介导(或定点)诱变、PCR诱变及盒式诱变制备。
多核苷酸、载体、宿主细胞及重组方法
其他实施方案涵盖包含编码人源化抗-CD40抗体的序列的分离的多核苷酸、包含该多核苷酸的载体及宿主细胞，以及产生人源化抗体的重组技术。分离的多核苷酸可编码抗-CD40抗体的任何期望形式，包括例如全长单克隆抗体、Fab、Fab'、F(ab')2及Fv片段、双链抗体(diabodies)、线性抗体、单链抗体分子及自抗体片段形成的多特异性抗体。
一些实施方案包括包含编码抗体或抗体片段的序列的分离的多核苷酸，该抗体或抗体片段具有以下中的任一者的重链可变区氨基酸序列：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39或SEQIDNO:40。一些实施方案包括包含编码抗体或抗体片段的序列的分离的多核苷酸，该抗体或抗体片段具有轻链可变域氨基酸序列SEQIDNO:26、SEQIDNO:31或SEQIDNO:36。
在一方面中，分离的多核苷酸序列编码抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:27及SEQIDNO:26；SEQIDNO:28及SEQIDNO:26；SEQIDNO:29及SEQIDNO:26；SEQIDNO:30及SEQIDNO:26；SEQIDNO:32及SEQIDNO:31；SEQIDNO:33及SEQIDNO:31；SEQIDNO:34及SEQIDNO:31；SEQIDNO:35及SEQIDNO:31；SEQIDNO:37及SEQIDNO:36；SEQIDNO:38及SEQIDNO:36；SEQIDNO:39及SEQIDNO:36；SEQIDNO:40及SEQIDNO:36。
包含编码人源化抗-CD40抗体或其片段或链的序列的多核苷酸可与一或多个业内已知的调节或控制序列融合，且可含于业内已知的适宜的表达载体或宿主细胞中。编码重链或轻链可变域的每一多核苷酸分子皆可独立地与编码恒定域(例如人恒定域)的多核苷酸序列融合，从而使得能产生完整抗体。或者，可使多核苷酸或其部分融合在一起，从而提供产生单链抗体的模板。
对于重组产生，将编码抗体的多核苷酸插入可复制载体中以供克隆(扩增DNA)或表达。可使用多种适合表达重组抗体的载体。载体组分一般包括(但不限于)以下中的一或多者：信号序列、复制起点、一或多个标记基因、增强子组件、启动子及转录终止序列。
人源化抗-CD40抗体亦可以融合多肽形式产生，其中抗体与异源多肽融合，例如信号序列或在成熟蛋白或多肽的氨基末端具有特异性裂解位点的其他多肽。所选异源性信号序列通常为宿主细胞可识别及加工(即，通过信号肽酶裂解)的序列。对于不能识别并加工人源化抗-CD40抗体信号序列的原核宿主细胞而言，信号序列可由原核信号序列取代。信号序列可为(例如)碱性磷酸酶、青霉素酶、脂蛋白、耐热肠毒素II前导序列等。对于酵母分泌，可用(例如)以下信号来取代天然信号序列：得自酵母转化酶α-因子的前导序列(包括酵母菌属(Saccharomyces)及克鲁维酵母属(Kluyveromyces)α-因子前导序列)、酸性磷酸酶、白色念珠菌(C.albicans)葡糖淀粉酶或WO90/13646中所述的信号。在哺乳动物细胞中，可使用哺乳动物信号序列以及病毒分泌前导序列(例如单纯疱疹病毒gD信号)。该前体区的DNA在阅读框中与编码人源化抗-CD40抗体的DNA接合。
表达及克隆载体含有使载体能在一或多个所选宿主细胞中复制的核酸序列。通常，在克隆载体中，此序列为使载体能独立于宿主染色体DNA而复制者，且其包括复制起点或自主复制序列。用于多种细菌、酵母及病毒的所述序列为业内所熟知。来自质粒pBR322的复制起点适用于大多数革兰氏(Gram)阴性细菌，2-υ质粒起点适用于酵母，且多种病毒起点(SV40、多瘤、腺病毒、VSV及BPV)可用于在哺乳动物细胞中克隆载体。通常，哺乳动物表达载体不需要复制起点组分(通常可仅使用SV40起点，这是因为其含有早期启动子)。
表达及克隆载体可含有编码可选择标记物的基因以有助于对表达的鉴定。典型可选择标记基因编码如下蛋白：赋予对抗生素或其他毒素(例如，氨苄西林(ampicillin)、新霉素、甲氨蝶呤或四环素)的抗性；或者，为营养缺陷的补体；或在其他备选方案中供应复合培养基中不存在的特定营养素，例如编码杆菌(Bacilli)的D-丙氨酸消旋酶的基因。
选择方案的一个实施例利用药物来阻止宿主细胞的生长。那些经异源基因成功转化的细胞产生赋予抗药性的蛋白，且因此可在该选择方案中存活。该显性选择的实施例使用药物新霉素、霉酚酸及潮霉素。哺乳动物细胞的常用可选择标记物为那些使得能鉴定可吸收编码人源化抗-CD40抗体的核酸的细胞的标记物，例如DHFR(二氢叶酸还原酶)、胸苷激酶、金属硫蛋白-I及-II(例如灵长类动物金属硫蛋白基因)、腺苷脱胺酶、鸟氨酸脱羧酶等。首先通过在含有甲氨蝶呤(Mtx)(DHFR的竞争性拮抗剂)的培养基中培养所有转化体来鉴定经DHFR选择基因转化的细胞。在采用野生型DHFR时，适宜的宿主细胞为DHFR活性缺陷的中国仓鼠卵巢(CHO)细胞系(例如DG44)。
或者，经编码抗-CD40抗体、野生型DHFR蛋白及另一可选择标记物(例如氨基葡萄糖苷3'-磷酸转移酶(APH))的DNA序列转化或共转化的宿主细胞(尤其是含有内源性DHFR的野生型宿主)可通过在含有针对所述可选择标记物的选择剂(例如氨基糖苷抗生素，例如卡那霉素(kanamycin)、新霉素或G418)的培养基中使细胞生长来进行选择。例如，参见美国专利第4,965,199号。
倘若使用酵母细胞作为宿主细胞来实施重组产生，则可使用存在于酵母质粒YRp7中的TRP1基因(Stinchcomb等人，1979，Nature282：39)作为可选择标记物。TRP1基因为缺少在色氨酸中生长的能力的酵母突变体菌株(例如，ATCC第44076号或PEP4-1)提供选择标记物(Jones，1977，Genetics85:12)。则酵母宿主细胞基因组中trp1损伤的存在可提供有效环境以通过在不存在色氨酸时生长来检测转化。类似地，Leu2p缺陷型酵母菌株(例如ATCC20,622或38,626)通过具有LEU2基因的已知质粒来补足。
另外，可使用得自1.6μm环形质粒pKD1的载体来转化克鲁维酵母。或者，已报导用于大规模产生重组牛凝乳酶的表达系统可用于乳酸克鲁维酵母(K.lactis.)(VandenBerg，1990，Bio/Technology8:135)。亦已公开通过克鲁维酵母属的工业菌株分泌成熟重组人血清白蛋白的稳定多拷贝表达载体(Fleer等人，1991，Bio/Technology9:968-975)。
表达及克隆载体通常含有宿主有机体可识别且与编码抗-CD40抗体或其多肽链的核酸分子可操作连接的启动子。适用于原核宿主的启动子包括phoA启动子、β-内酰胺酶及乳糖启动子系统、碱性磷酸酶、色氨酸(trp)启动子系统及杂合启动子(例如tac启动子)。其他已知的细菌启动子亦适宜。用于细菌系统的启动子亦可含有与编码人源化抗-CD40抗体的DNA可操作连接的Shine-Dalgamo(S.D.)序列。
已知多种真核启动子序列。事实上，所有真核基因皆具有富AT区，其位于转录起始位点上游约25至30个碱基处。在许多基因的转录起始点上游70至80个碱基处发现的另一序列为CNCAAT区，其中N可为任一核苷酸。在大多数真核基因的3'端处为AATAAA序列，其可能向编码序列的3'端添加聚A尾的信号。所有所述序列皆以适宜方式插入真核表达载体中。
适用于酵母宿主的启动序列的实例包括以下酶的启动子：3-磷酸甘油酸酯激酶或其他糖酵解酶，例如烯醇化酶、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、己糖激酶、丙酮酸脱羧酶、磷酸果糖激酶、葡萄糖-6-磷酸异构酶、3-磷酸甘油酸变位酶、丙酮酸激酶、磷酸丙糖异构酶、磷酸葡萄糖异构酶及葡糖激酶。
诱导型启动子的另一优点为通过生长条件来控制转录。所述启动子包括以下酶的酵母启动子区：醇脱氢酶2、异细胞色素C、酸性磷酸酶、与氮代谢相关的衍生物酶、金属硫蛋白、甘油醛-3-磷酸脱氢酶及负责麦芽糖及半乳糖利用的酶。用于酵母表达的适宜载体及启动子进一步阐述于EP73,657中。酵母增强子亦可有利地与酵母启动子一起使用。
在哺乳动物宿主细胞中自载体转录人源化抗-CD40抗体受(例如)自以下获得的启动子控制：病毒基因组，例如多瘤、鸡痘病毒、腺病毒(例如腺病毒2)、牛乳头瘤病毒、禽肉瘤病毒、细胞巨化病毒、逆转录病毒、肝炎B病毒及猿猴病毒40(SV40)；异源性哺乳动物启动子，例如肌动蛋白启动子或免疫球蛋白启动子；热休克启动子，条件是所述启动子与宿主细胞系统兼容。
SV40病毒的早期及晚期启动子为便捷地以SV40限制性片段形式获得，其亦含有SV40病毒复制起点。人细胞巨化病毒的立即早期启动子为便捷地以HindIIIE限制性片段形式获得。使用牛乳头瘤病毒作为载体在哺乳动物宿主中表达DNA的系统公开于美国专利第4,419,446号中。此系统的修改形式阐述于美国专利第4,601,978号中。亦可参见Reyes等人，1982，Nature297:598-601，其公开在来自单纯疱疹病毒的胸苷激酶启动子控制下在小鼠细胞中表达人p-干扰素cDNA。或者，可使用劳斯肉瘤病毒(roussarcomavirus)长末端重复序列作为启动子。
可用于重组表达载体的另一可用组件为增强子序列，其用于提高高等真核生物中编码人源化抗-CD40抗体的DNA的转录。现已知多种增强子序列来自哺乳动物基因(例如珠蛋白、弹性蛋白酶、白蛋白、α-胎蛋白及胰岛素)。然而，通常使用来自真核细胞病毒的增强子。实例包括位于复制起点迟侧(lateside)上的SV40增强子(bp100-270)、细胞巨化病毒早期启动子增强子、位于复制起点迟侧上的多瘤增强子及腺病毒增强子。关于活化真核启动子的增强组件的描述亦可参见Yaniv，1982，Nature297:17-18。可将增强子剪接至载体中人源化抗-CD40抗体编码序列的5'或3'位置处，但优选位于启动子的5'位点。
用于真核宿主细胞(酵母、真菌、昆虫、植物、动物、人细胞或来自其他多细胞有机体的有核细胞)中的表达载体亦可含有终止转录及稳定mRNA所需的序列。所述序列一般可自真核生物或病毒DNA或cDNA的5'及偶而其3′非翻译区获得。所述区域含有在编码抗-CD40抗体的mRNA的非翻译部分中转录为聚腺苷酸化片段的核苷酸区段。一种可用的转录终止组分为牛生长激素聚腺苷酸化区。参见WO94/11026及其中所公开的表达载体。在一些实施方案中，人源化抗-CD40抗体可使用CHEF系统来表达。(例如，参见美国专利第5,888,809号，其公开内容为以引用方式并入本文中。)
在本文载体中克隆或表达DNA的适宜的宿主细胞为上述原核细胞、酵母细胞或高等真核细胞。适用于此目的的原核生物包括真细菌，例如革兰氏阴性或革兰氏阳性有机体，例如：肠杆菌科(Enterobacteriaceae)，例如埃希氏菌属(Escherichia)(例如大肠杆菌)、肠杆菌属(Enterobacter)、欧文氏菌属(Erwinia)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、变形杆菌属(Proteus)、沙门氏菌属(Salmonella)(例如鼠伤寒沙门氏菌(Salmonellatyphimurium))、沙雷菌属(例如黏质沙雷氏菌(Serratiamarcescans))及志贺氏菌属(Shigella)，以及杆菌属(例如枯草芽孢杆菌(B.subtilis)及地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)(例如于1989年4月12日出版的DD266,710中所公开的地衣芽孢杆菌41P))、假单胞菌属(Pseudomonas)(例如铜绿假单胞菌)及链霉菌属(Streptomyces)。优选的大肠杆菌克隆宿主为大肠杆菌294(ATCC31,446)，但其他菌株(例如大肠杆菌B、大肠杆菌X1776(ATCC31,537)及大肠杆菌W3110(ATCC27,325))亦适合。所述实施例为例示性而非限制性。
除原核生物外，例如丝状真菌或酵母等真核微生物亦为人源化抗-CD40抗体编码载体的适宜的克隆或表达宿主。酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)或常见的面包酵母(baker'syeast)为最常用的低等真核宿主微生物。然而，一般可使用多种其他属、种及菌株且可用于本文中，例如裂殖酵母菌(Schizosaccharomycespombe)；克鲁维酵母属宿主，例如乳酸克鲁维酵母、脆壁克鲁维酵母(K.fragilis)(ATCC12,424)、保加利亚克鲁维酵母(K.bulgaricus)(ATCC16,045)、威克克鲁维酵母(K.wickeramii)(ATCC24,178)、瓦尔特克鲁维酵母(K.waltii)(ATCC56,500)、果蝇克鲁维酵母(K.drosophilarum)(ATCC36,906)、耐热克鲁维酵母(K.thermotolerans)及马科斯克鲁维酵母(K.marxianus)；耶氏酵母属(yarrowia)(EP402,226)；巴斯德毕赤酵母菌(Pichiapastoris)(EP183,070)；念珠菌属(Candida)；里氏木霉菌(Trichodermareesia)(EP244,234)；粗糙链孢霉菌(Neurosporacrassa)；许旺酵母属(Schwanniomyces)，例如西方许旺酵母(Schwanniomycesoccidentalis)；及丝状真菌，例如链孢霉属(Neurospora)、青霉属(Penicillium)、弯颈霉属(Tolypocladium)及曲霉菌属(Aspergillus)宿主(例如构巢曲霉(A.nidulans)及黑曲霉(A.niger))。
表达糖基化人源化抗-CD40抗体的适宜宿主细胞得自多细胞有机体。无脊椎动物细胞的实例包括植物及昆虫细胞，包括(例如)多种杆状病毒株及变体及来自例如以下宿主的相应许可的昆虫宿主细胞：草地贪夜蛾(Spodopterafrugiperda)(毛虫)、埃及伊蚊(Aedesaegypti)(蚊子)、白纹伊蚊(Aedesalbopictus)(蚊子)、黑腹果蝇(Drosophilamelanogaster)(果蝇)及家蚕(Bombyxmori)(蚕)。多种转染用病毒株可自公开途径获得，例如苜蓿银纹夜蛾(Autographacalifornica)NPV的L-1变体及家蚕NPV的Bm-5株，且所述病毒尤其可用于转染草地贪夜蛾细胞。
亦可采用棉花、玉米、马铃薯、大豆、矮牵牛花、西红柿及烟草的植物细胞培养物作为宿主。
在另一方面中，人源化抗-CD40的表达为在脊椎动物细胞中实施。脊椎动物细胞在培养(组织培养)中的繁殖已成为常规操作且技术随处可得。可用哺乳动物宿主细胞系的实施例为经SV40转化的猴肾CV1为(COS-7，ATCCCRL1651)、人胚肾系(293系或经亚克隆以供在悬浮培养中生长的293细胞，Graham等人，1977，J.GenVirol.36：59)、幼仓鼠肾细胞(BHK，ATCCCCL10)、中国仓鼠卵巢细胞/-DHFR1(CHO，Urlaub等人，1980，Proc.Natl.Acad.Sci.USA77：4216；例如DG44)、小鼠睾丸支持细胞(TM4，Mather，1980，Biol.Reprod.23:243-251)、猴肾细胞(CV1ATCCCCL70)、非洲绿猴肾细胞(VERO-76，ATCCCRL-1587)、人宫颈癌细胞(HELA，ATCCCCL2)、犬肾细胞(MDCK，ATCCCCL34)、水牛鼠肝细胞(BRL3A，ATCCCRL1442)、人肺细胞(W138，ATCCCCL75)、人肝细胞(HepG2，HB8065)、小鼠乳房肿瘤(MMT060562，ATCCCCL51)、TR1细胞(Mather等人，1982，AnnalsN.Y.Acad.Sci.383：44-68)、MRC5细胞、FS4细胞及人肝细胞瘤系(HepG2)。
用上述用于产生人源化抗-CD40抗体的表达或克隆载体来转化宿主细胞，并在常用营养培养基中培养，所述营养培养基经修改以适于诱导启动子、选择转化体或扩增编码期望序列的基因。
可在多种培养基中培养用于产生本文所述人源化抗-CD40抗体的宿主细胞。市售培养基适用于培养宿主细胞，例如Ham'sF10(Sigma-Aldrich公司，St.Louis，Mo.)、最小必需培养基((MEM)，Sigma-Aldrich公司)、RPMI-1640(Sigma-Aldrich公司)及达尔伯克氏改良的伊格尔氏培养基(Dulbecco'sModifiedEagle'sMedium)((DMEM)，Sigma-Aldrich公司)。另外，可使用以下文献中的一或多者阐述的任一培养基来作为宿主细胞的培养基：Ham等人，1979，Meth.Enz.58：44；Barnes等人，1980，Anal.Biochem.102：255；美国专利第4,767,704号、美国专利第4,657,866号、美国专利第4,927,762号、美国专利第4,560,655号、美国专利第5,122,469号、WO90/103430及WO87/00195。所述培养基中的任一者可根据需要补加有激素和/或其他生长因子(例如胰岛素、转铁蛋白或表皮生长因子)、盐(例如氯化钠、钙盐、镁盐及磷酸盐)、缓冲液(例如HEPES)、核苷酸(例如腺苷及胸苷)、抗生素(例如庆大霉素)、痕量元素(定义为通常以微摩尔范围的最终浓度存在的无机化合物)及葡萄糖或等效能源。亦可以包括本领域技术人员已知的适当浓度的其他补加物。例如温度、pH等培养条件为那些先前用于所选表达用宿主细胞的条件，且对本领域技术人员而言是显而易见的。
在使用重组技术时，抗体可在细胞内、在壁膜间隙中产生，或直接分泌至培养基中。若在细胞内产生抗体，则作为第一步骤可使细胞破裂以释放蛋白。可通过离心或超滤移除微粒碎片，即宿主细胞或溶解片段。Carter等人，1992，Bio/Technology10:163-167阐述分离分泌至大肠杆菌壁膜间隙中的抗体的操作。简言之，在乙酸钠(pH3.5)、EDTA及苯甲磺酰氟(PMSF)存在下经约30分钟使细胞糊剂解冻。可通过离心移除细胞碎片。倘若抗体分泌至培养基中，则通常首先使用市售蛋白浓缩滤器(例如Amicon或MilliporePellicon超滤单元)浓缩来自所述表达系统的上清液。在任一前述步骤中可包括例如PMSF等蛋白酶抑制剂以抑制蛋白水解，且可包括抗生素以防止外来污染物生长。可使用多种方法自宿主细胞分离抗体。
可使用(例如)羟基磷灰石色谱、凝胶电泳、透析及亲和色谱来纯化自细胞制备的抗体组合物，其中亲和色谱为常用纯化技术。蛋白A作为亲和配体的适合性取决于存在于抗体中的任一免疫球蛋白Fc域的物种及同种型。蛋白A可用于纯化基于人γ1、γ2或γ4重链的抗体(例如，参见Lindmark等人，1983J.Immunol.Meth.62：1-13)。推荐蛋白G用于所有小鼠同种型及人γ3(例如，参见Guss等人，1986EMBOJ.5：1567-1575)。亲和配体所附接的基质最经常为琼脂糖，但亦可使用其他基质。机械上稳定的基质(例如可控多孔玻璃或聚(苯乙烯二乙烯基)苯)使得可达成较使用琼脂糖更快的流速及更短的处理时间。倘若抗体包含CH3域，则BakerbondABXTM树脂(J.T.Baker，Phillipsburg，N.J.)可用于纯化。取决于欲回收的抗体，亦可使用其他蛋白纯化技术，例如离子交换柱分级分离、乙醇沉淀、反相HPLC、硅胶色谱、肝素SEPHAROSETM色谱、阴离子或阳离子交换树脂(例如聚天冬氨酸柱)色谱、色谱聚焦、SDS-PAGE及硫酸铵沉淀。
在任何初步纯化步骤后，可使用pH介于约2.5至4.5之间的洗脱缓冲液对包含目标抗体及污染物的混合物实施低pH疏水相互作用色谱，其通常在低盐浓度(例如，约0-0.25M盐)下实施。
亦包括如本文所定义在低、中及高严格性条件下与表示为编码抗体或抗体片段的分离的多核苷酸序列的核苷酸序列的全部或一部分(例如，编码可变区的部分)杂交的核酸，该抗体或抗体片段具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:27及SEQIDNO:26；SEQIDNO:28及SEQIDNO:26；SEQIDNO:29及SEQIDNO:26；SEQIDNO:30及SEQIDNO:26；SEQIDNO:32及SEQIDNO:31；SEQIDNO:33及SEQIDNO:31；SEQIDNO:34及SEQIDNO:31；SEQIDNO:35及SEQIDNO:31；SEQIDNO:37及SEQIDNO:36；SEQIDNO:38及SEQIDNO:36；SEQIDNO:39及SEQIDNO:36；SEQIDNO:40及SEQIDNO:36。杂交核酸的杂交部分通常长至少15个(例如，20个、25个、30个或50个)核苷酸。杂交核酸的杂交部分与编码抗-CD40多肽(例如，重链或轻链可变区)或其补体的核酸的一部分或全部的序列至少80%(例如至少90%、至少95%或至少98%)一致。本文所述类型的杂交核酸可用作(例如)克隆探针、引物(例如PCR引物)或诊断探针。
一些实施方案包括包含编码抗体或抗体片段的序列的分离的多核苷酸，该抗体或抗体片段具有与以下任一者的氨基酸序列至少80%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致的重链可变区氨基酸序列：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39或SEQIDNO:40。一些实施方案包括包含编码抗体或抗体片段的序列的分离的多核苷酸，该抗体或抗体片段具有与以下任一者的氨基酸序列至少80%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致的轻链可变域氨基酸序列：SEQIDNO:5至8、SEQIDNO:26、SEQIDNO:31或SEQIDNO:36。
在一方面中，分离的多核苷酸序列编码具有重链可变域及轻链可变区的抗体或抗体片段，该重链可变域及轻链可变区各自包括与分别具有包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区的抗体或抗体片段的氨基酸序列至少80%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致的氨基酸序列：SEQIDNO:27及SEQIDNO:26；SEQIDNO:28及SEQIDNO:26；SEQIDNO:29及SEQIDNO:26；SEQIDNO:30及SEQIDNO:26；SEQIDNO:32及SEQIDNO:31；SEQIDNO:33及SEQIDNO:31；SEQIDNO:34及SEQIDNO:31；SEQIDNO:35及SEQIDNO:31；SEQIDNO:37及SEQIDNO:36；SEQIDNO:38及SEQIDNO:36；SEQIDNO:39及SEQIDNO:36；SEQIDNO:40及SEQIDNO:36。
在另一方面中，本发明涉及上一段的实施方案中所述的多核苷酸，其中所编码的抗体或抗体片段包括与分别具有包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区的抗体或抗体片段的氨基酸序列至少80%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致的氨基酸序列：在一个实施方案中所述序列分别为SEQIDNO:27和SEQIDNO:26；另一实施方案中分别为SEQIDNO:28和SEQIDNO:26；另一实施方案中分别为SEQIDNO:29和SEQIDNO:26；另一实施方案中分别为SEQIDNO:30和SEQIDNO:26；另一实施方案中分别为SEQIDNO:32和SEQIDNO:31；另一实施方案中分别为SEQIDNO:33和SEQIDNO:31；另一实施方案中分别为SEQIDNO:34和SEQIDNO:31；另一实施方案中分别为SEQIDNO:35和SEQIDNO:31；另一实施方案中分别为SEQIDNO:37和SEQIDNO:36；另一实施方案中分别为SEQIDNO:38和SEQIDNO:36；另一实施方案中分别为SEQIDNO:39和SEQIDNO:36；且另一实施方案中分别为SEQIDNO:40和SEQIDNO:36。
本文所用术语“一致”或“一致性百分比”在两个或更多个核酸或多肽序列的上下文中是指两个或更多个序列或子序列在进行对比及对齐(以获得最大对应性)时相同或有指定百分比的核苷酸或氨基酸残基相同。为测定一致性百分比，将序列对齐以达成最佳对比目的(例如，可在第一氨基酸或核酸序列中引入空位以与第二氨基酸或核酸序列达成最佳对齐)。然后对比对应氨基酸位置或核苷酸位置处的氨基酸残基或核苷酸。若第一序列中的位置与第二序列中的对应位置由相同氨基酸残基或核苷酸占据，则所述分子在该位置处一致。两个序列之间的一致性百分比为所述序列所共有的一致性位置数目的函数(即，一致性%=一致性位置数/总位置数(例如，重叠位置数)x100)。在一些实施方案中，所对比两个序列在合适时(例如，不包括延伸出所对比序列外的额外序列)于序列内引入空位后长度相同。举例而言，在对比可变区序列时，不考虑前导序列和/或恒定域序列。在两个序列之间的序列对比中，“对应”CDR是指两个序列中相同位置处的CDR(例如，每一序列的CDR-H1)。
两个序列之间一致性百分比或相似性百分比的测定可使用数学算法来完成。用于对比两个序列的数学算法的优选非限制性实例为Karlin及Altschul的算法(1990，Proc.Natl.Acad.Sci.USA87：2264-2268)，其根据Karlin及Altschul，1993，Proc.Natl.Acad.Sci.USA90：5873-5877加以修改。此一算法已纳入Altschul等人的NBLAST及XBLAST程序中(1990，J.Mol.Biol.215：403-410)。BLAST核苷酸搜索可用NBLAST程序(分数=100，字长=12)来实施，从而获得与编码目标蛋白的核酸同源的核苷酸序列。BLAST蛋白搜索可用XBLAST程序(分数=50，字长=3)来实施，从而获得与目标蛋白同源的氨基酸序列。出于对比目的，为获得加空位对齐，可如Altschul等人，1997，NucleicAcidsRes.25：3389-3402中所述来利用GappedBLAST。或者，可使用PSI-Blast来实施迭代搜索，其检测分子之间的远距离联系(同一文献)。在利用BLAST、GappedBLAST及PSI-Blast程序时，可使用各程序(例如，XBLAST及NBLAST)的预设参数。用于对比序列的另一优选非限制性实例为Myers及Miller的算法(CABIOS(1989))。此一算法已纳入ALIGN程序(2.0版)中，其为GCG序列对齐软件包的一部分。在利用对齐程序来对比氨基酸序列时，可使用PAM120加权残差表、等于12的空位长度罚分及等于4的空位罚分。用于序列分析的其他算法为业内已知且包括ADVANCE及ADAM，如Torellis及Robotti，1994，Comput.Appl.Biosci.10：3-5中所述；及FASTA，如Pearson及Lipman，1988，Proc.Natl.Acad.Sci.USA85：2444-8中所述。在FASTA内，ktup为设定灵敏度及搜索速度的控制选项。若ktup=2，则通过检查对齐残基对来发现所对比两个序列中的相似区域；若ktup=1，则检查单一对齐氨基酸。对于蛋白序列，可将ktup设定为2或1，或对于DNA序列设定为1至6。若未指定ktup，则对于蛋白默认值为2且对于DNA默认值为6。或者，蛋白序列对齐可使用CLUSTALW算法来实施，如Higgins等人，1996，MethodsEnzymol.266:383-402所述。
非治疗性应用
本文所述抗体可用作亲和纯化剂。在此方法中，使用业内熟知方法将抗体固定在例如蛋白A树脂等固相上。使固定抗体与含有欲纯化CD40蛋白(或其片段)的样品接触，且随后用适宜溶剂洗涤载体，从而可移除样品中除与固定抗体结合的CD40蛋白以外的基本上所有物质。最后，用另一适宜溶剂洗涤载体，从而可自抗体释放CD40蛋白。
人源化抗-CD40抗体亦可用于诊断性分析中以检测和/或量化CD40蛋白，例如在特定细胞、组织或血清中检测CD40表达。
在一些实施方案中，例如处于诊断性目的，可有利地用可检测部分标记抗体。可使用多种可检测标记，包括放射性同位素、荧光标记、酶底物标记等。可使用多种已知技术使标记与抗体间接缀合。举例而言，可使抗体与生物素缀合，且可使上文所述三大类标记中的任一种与抗生物素蛋白缀合，或反之亦然。生物素选择性地与抗生物素蛋白结合，且该标记由此可以以该间接方式与抗体缀合。或者，为达成标记与抗体的间接缀合，可使抗体与较小半抗原(例如地高辛(digoxin))缀合且使一种不同类型的上述标记与抗半抗原抗体(例如，抗地高辛抗体)缀合。由此，可达成标记与抗体的间接缀合。
示例性放射性同位素标记包括35S、14C、125I、3H及131I。使用(例如)以下文献中所述的技术可用放射性同位素标记抗体：CurrentProtocolsinImmunology，第1及2卷，1991，Coligen等人编辑，Wiley-Interscience，NewYork，N.Y.，Pubs。可通过(例如)闪烁计数来测量放射性。
示例性荧光标记包括得自以下的标记：稀土螯合物(铕螯合物)或荧光素及其衍生物、罗丹明(rhodamine)及其衍生物、丹磺酰(dansyl)、丽丝胺(Lissamine)、藻红蛋白及得克萨斯红(TexasRed)。可经由已知技术使荧光标记与抗体缀合，例如CurrentProtocolsinImmunology(上述文献)中所公开的那些。可使用荧光计来量化荧光。
业内已知多种经充分表征的酶-底物标记(例如，综述参见美国专利第4,275,149号)。酶一般催化发色底物发生可使用各种技术测量的化学改变。举例而言，改变可为可以以分光光度计法测量的底物颜色变化。或者，酶可改变底物的荧光或化学发光。量化荧光变化的技术如上文所述。化学发光底物可通过化学反应经电子激发，随后可发射可使用(例如)化学发光计测量的光线或向荧光受体提供能量。
酶标记的实例包括萤光素酶(例如萤火虫萤光素酶及细菌萤光素酶，美国专利第4,737,456号)、萤光素、2,3-二氢酞嗪二酮、苹果酸脱氢酶、脲酶、过氧化物酶(例如辣根过氧化物酶(HRPO))、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、葡糖淀粉酶、溶菌酶、糖氧化酶(例如葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶)、杂环氧化酶(例如尿酸酶及黄嘌呤氧化酶)、乳过氧化物酶、微过氧化物酶等。缀合酶与抗体的技术阐述于(例如)以下文献中：O'Sullivan等人，1981，MethodsforthePreparationofEnzyme-AntibodyConjugatesforuseinEnzymeImmunoassay，MethodsinEnzym.(J.Langone及H.VanVunakis编辑)，Academicpress，N.Y.，73：147-166。
酶-底物组合的实例包括(例如)：辣根过氧化物酶(HRPO)与作为底物的过氧化氢酶，其中过氧化氢酶氧化染料前体(例如邻苯二胺(OPD)或3,3',5,5'-四甲基联苯胺盐酸盐(TMB))；碱性磷酸酶(AP)与作为发色底物的磷酸对硝基苯酯；及β-D-半乳糖苷酶(β-D-Gal)与发色底物(例如对硝基苯基-β-D-半乳糖苷酶或荧光底物4-甲基伞形酮-β-D-半乳糖苷酶)。
本领域技术人员可了解多种其他酶-底物组合。所述组合的一般综述参见美国专利第4,275,149号及美国专利第4,318,980号。
在另一实施方案中，使用未标记人源化抗-CD40抗体且用结合该人源化抗-CD40抗体的经标记抗体来检测。
本文所述抗体可用于任一已知分析方法中，例如竞争性结合分析、直接及间接夹心(sandwich)分析及免疫沉淀分析。例如，参见Zola，MonoclonalAntibodies：AManualofTechniques，第147-158页(CRCPress公司，1987)。
诊断试剂盒
人源化抗-CD40抗体可用于诊断试剂盒中，即预定量试剂与实施诊断分析的说明书的经包装组合。倘若用酶标记抗体，则试剂盒可包括酶所需底物及辅因子(例如提供可检测发色团或荧光团的底物前体)。另外，可包括其他添加剂，例如稳定剂、缓冲剂(例如封阻缓冲剂或溶胞缓冲剂)等。各种试剂的相对量可大幅变化以使所述试剂在溶液中的浓度可显著优化分析的灵敏度。试剂可以干粉形式(通常经冻干)提供，其包括在溶解后可使试剂溶液具有适宜浓度的赋形剂。
治疗用途
在另一实施方案中，本文所公开人源化抗-CD40抗体可用于治疗如本文所述各种与CD40的表达有关的病症。
人源化抗-CD40抗体或药物通过任何适宜方式来给予，包括肠胃外、皮下、腹膜内、肺内及鼻内，且若需要局部免疫抑制治疗，则实施病灶内给予(包括灌注或以其他方式使移植物在移植前与抗体接触)。人源化抗-CD40抗体或药物可以(例如)输注或推注形式来给予。肠胃外输注包括肌内、静脉内、动脉内、腹膜内或皮下给予。另外，人源化抗-CD40抗体通过脉冲输注适当给予，尤其是以抗体的递减剂量来给予。在一方面中，通过注射来实施给药，最优选通过静脉内或皮下注射来给药，这部分地取决于给予是短期给予还是长期给予。
在预防或治疗疾病时，抗体的适宜剂量可取决于多种因素，例如如上文所定义欲治疗疾病的类型、疾病的严重程度及病程、给予抗体的目的是预防性还是治疗性、先前治疗、患者临床史及对抗体的反应，以及主治医师的决定。抗体一次性给予或经一系列治疗以适当方式给予患者。
取决于疾病类型及严重程度，不论(例如)通过一或多次分开给予还是通过连续输注来给予，向患者给予的抗体初始候选剂量为约1μg/kg至20mg/kg(例如0.1-15mg/kg)。取决于上文所提及的因素，典型日剂量可介于约1μg/kg至100mg/kg或更高范围内。对于经数天或更长时间重复给予，取决于病况，持续治疗直至疾病症状出现所期望的抑制。然而，可使用其他剂量方案。此疗法的进展可通过常用技术及分析容易地监测。示例性剂量方案公开于WO94/04188中。
本文所用术语“抑制”在与“改善”及“减轻”相同的背景中意指减少疾病的一或多个特征。
可以与良好医疗实践一致的方式对抗体组合物进行调配、配量及给予。在此上下文中需考虑的因素包括所治疗的特定病症、所治疗的特定哺乳动物、个体患者的临床病况、病因、药物的递送位点、给予方法、给予时间安排及从业医师所知的其他因素。欲给予抗体的“治疗有效量”可取决于所述因素，且为预防、改善或治疗与CD40表达有关的病症所需的最小量。
抗体不必(但任选)与一或多种当前用于预防或治疗所述病症的药物一起调配。所述其他药物的有效量取决于人源化抗-CD40抗体存在于调配物中的量、病症或治疗的类型及上述其他因素。所述其他药物通常以与上文所用相同的剂量及给予途径来使用或为上文所用剂量的约1%至99%。
CD40相关的病症
抗-CD40抗体或药物可用于治疗或预防表达CD40的癌症或特征为(例如)因免疫细胞(例如，淋巴细胞或树突细胞)的不当活化而表达CD40的免疫病症。该CD40的表达可归因于(例如)CD40蛋白在细胞表面上的含量升高和/或所表达CD40的抗原性有所改变。根据本文所述方法对免疫病症的治疗或预防通过向需要该治疗或预防的个体给予有效量的抗-CD40抗体或药物来达成，该抗体藉此(i)与表达CD40且与该疾病状态相关的活化的免疫细胞结合，且(ii)对该活化的免疫细胞产生细胞毒性、细胞抑制性或免疫抑制性效应。
特征为免疫细胞的不当活化且可通过本文所述方法来治疗或预防的免疫疾病可根据(例如)该病症的基础超敏反应的类型来分类。所述反应通常可分为四类：过敏性反应、细胞毒性(细胞溶解性)反应、免疫复合物反应或细胞介导的免疫(CMI)反应(亦称作迟发型超敏(DTH)反应)。(例如，参见FundamentalImmunology(WilliamE.Paul编辑，RavenPress，N.Y.，第3版，1993)。)
所述免疫疾病的具体实例包括以下疾病：类风湿性关节炎、自身免疫性脱髓鞘疾病(例如，多发性硬化、过敏性脑脊髓炎)、内分泌性眼病、葡萄膜视网膜炎、全身性红斑狼疮、重症肌无力、格雷夫斯氏病(Grave'sdisease)、肾小球肾炎、自身免疫性血液病、炎性肠病(例如，节段性回肠炎或溃疡性结肠炎)、过敏反应、过敏性反应、Sjogren氏综合征、I型糖尿病、原发性胆汁性肝硬化、韦格纳氏肉芽肿病(Wegener'sgranulomatosis)、纤维肌痛、多发性肌炎、皮肌炎、炎症肌炎、多发性内分泌不足、施密特氏综合征(Schmidt'ssyndrome)、自身免疫性葡萄膜炎、艾迪生氏病、肾上腺炎、甲状腺炎、桥本氏甲状腺炎、自身免疫性甲状腺病、恶性贫血、胃萎缩、慢性肝炎、类狼疮性肝炎、动脉粥样硬化、亚急性皮肤红斑狼疮、甲状旁腺功能减退、德雷斯勒氏综合征(Dressler'ssyndrome)、自身免疫性血小板减少症、特发性血小板减少性紫癜、溶血性贫血、寻常天疱疮、天疱疮、疱疹样皮炎、斑秃、类天疱疮、硬皮症、进行性全身性硬化症、CREST综合征(钙质沉着症、雷诺现象(Raynaud'sphenomenon)、食管活动不良、指端硬化及毛细管扩张)、雄性及雌性自身免疫性不育、强直性脊柱炎、溃疡性结肠炎、混合性结缔组织病、结节性多动脉炎、全身性坏死性血管炎、特应性皮炎、特应性鼻炎、古德帕斯丘氏综合征(Goodpasture'ssyndrome)、恰加斯氏病(Chagas'disease)、肉样瘤病、风湿热、哮喘、复发性流产、抗磷脂综合征、农民肺(farmer'slung)、多形红斑、心脏切开术后综合征、柯兴综合征(Cushing'ssyndrome)、自身免疫性慢性活动性肝炎、养鸟人肺、中毒性表皮坏死溶解症、阿尔波特氏综合征(Alport'ssyndrome)、肺泡炎、过敏性肺泡炎、纤维化肺泡炎、间质性肺病、结节性红斑、坏疽性脓皮病、输血反应、高安动脉炎(Takayasu'sarteritis)、风湿性多肌痛、颞动脉炎、血吸虫病、巨细胞动脉炎、蛔虫病、曲霉菌病、阿司匹林三联症(Sampter'ssyndrome)、湿疹、淋巴瘤样肉芽肿病、贝切特氏病(Behcet'sdisease)、卡普兰综合征(Caplan'ssyndrome)、川崎病(Kawasaki'sdisease)、登革热(dengue)、脑脊髓炎、心内膜炎、心内膜心肌纤维化症、眼内炎、持久性隆起性红斑、牛皮癣、胎儿成红细胞增多症、嗜酸细胞性筋膜炎、输血后紫癜综合征(Shulman'ssyndrome)、费尔蒂综合征(Felty'ssyndrome)、丝虫病、睫状体炎、慢性睫状体炎、异色睫状体炎、福克斯睫状体炎(Fuch'scyclitis)、IgA肾病、亨-舍二氏紫癜(Henoch-Schonleinpurpura)、移植物抗宿主病、移植排斥、心肌病、肌无力综合征(Eaton-Lambertsyndrome)、复发性多软骨炎、冷球蛋白血症、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症(Waldenstrom'smacroglobulemia)、埃文斯综合征(Evan'ssyndrome)、急性呼吸窘迫综合征、肺炎症、骨质疏松、迟发型超敏反应及自身免疫性性腺衰竭。
因此，本文所述方法涵盖治疗以下细胞的病症：B淋巴细胞(例如，全身性红斑狼疮、古德帕斯丘氏综合征、类风湿性关节炎及I型糖尿病)、Th1淋巴细胞(例如，类风湿性关节炎、多发性硬化、牛皮癣、Sjogren氏综合征(Sjorgren'ssyndrome)、桥本氏甲状腺炎、格雷夫斯氏病、原发性胆汁性肝硬化、韦格纳氏肉芽肿病、肺结核或移植物抗宿主病)或Th2淋巴细胞(例如，特应性皮炎、全身性红斑狼疮、特应性哮喘、鼻结膜炎、过敏性鼻炎、欧门氏综合征(Omenn'ssyndrome)、全身性硬化症或慢性移植物抗宿主病)。通常，涉及树突细胞的病症涉及Th1淋巴细胞或Th2淋巴细胞病症。
类风湿性关节炎(RA)为最常见的炎性自身免疫性疾病之一，其影响约1%的人群。尽管可获得有效治疗(例如MTX及抗TNF药物)，但仍存在大量未满足的医疗需要，尤其是对于那些对抗TNF疗法无充分反应的患者(约30%患者)。另外，高达50%的患者在5年内中断TNF拮抗剂治疗，这主要是由于不良事件所致，但亦由于经验证丧失治疗益处的患者的数量日益增加。因此，重要的是确立靶向RA中的炎症及关节损坏而并不仅仅依赖对TNF的直接抑制的有效疗法。极有吸引力的方法为靶向共刺激性细胞路径。共刺激中的关键受体-配体对之一为CD40/CD40L。此系统容许免疫细胞间及免疫细胞与非免疫细胞之间发生相互作用，所述相互作用在RA的发病机制中皆具有重要意义。用本发明拮抗性抗体阻断CD40在RA中可具有以下效应中的一或多者：
1)抑制B细胞分化及抗体同种型转换；
2)在T细胞及巨噬细胞中抑制细胞因子及趋化因子产生及黏着分子上调；
3)抑制树突细胞活化；及
4)在非免疫细胞(例如上皮细胞、内皮细胞及间质细胞)中抑制促炎症细胞因子、趋化因子、基质金属蛋白酶、前列腺素的产生，并下调黏着分子。
达成上述效应中的一或多者的方法明确涵盖于本文中。除RA外，本发明组合物尤其可用于治疗多发性硬化、牛皮癣(包括牛皮癣关节炎)、幼年型类风湿性关节炎、炎性肠病、全身性红斑狼疮及实体器官移植的方法中。
类风湿性关节炎(RA)为慢性全身性自身免疫性疾病，其在成年人中的患病率为约1%。该疾病持续引发显著发病率及早发性死亡(死亡主要为由于加速心脏血管疾病所致)。现已确定，关节损伤在病程中出现极早，有高达30%的患者在诊断时有放射影像证据显示骨侵蚀，且在1年后增加至60%。当前准则推荐在已确认明确诊断后3个月内用传统疾病缓解性抗风湿药(DMARD)开始治疗。DMARD可减少或预防关节损伤并保持关节功能。当前，风湿病学家选择甲氨喋呤(MTX)作为大多数患者的初始DMARD疗法。
TNF拮抗剂依那西普(etanercept)英夫利昔单抗(infliximab)阿达木单抗(adalimumab)CTLA4拮抗剂阿巴西普(abatacept)抗IL-6受体mAb托珠单抗(tocilizumab)及抗CD20mAb利妥昔单抗(rituximab)可有效治疗RA。当前准则一般推荐在发现对传统DMARD无充分反应后使用生物性DMARD来治疗活动性RA。
在患有早期侵袭性RA且先前未接受MTX治疗的患者中的最新研究显示，MTX与TNF拮抗剂的组合优于使用其中任一者的单一疗法。最惊人的结果为组合疗法具有显著放射性益处。因此，应在侵袭性疾病及侵袭性表型风险最大(例如高活动性分数、功能受损、类风湿因子(RF)或抗环瓜氨酸肽抗体(CCP)呈血清阳性、CRP升高、放射影像性侵蚀)的患者中使用MTX与TNF抑制剂的组合。然而，预期在临床实践中，TNF拮抗剂将很少用做一线疗法。美国风湿病学家在2005年4月进行的调查显示，对使用TNF拮抗剂的决定影响最大的因素为：MTX或多种DMARD的失效、医师的整体评价、功能受损及放射影像性恶化或侵蚀。当前，在美国估计有20%的RA患者接受TNF抑制剂疗法。
由于药物耐受不良及药物毒性或缺少反应，包括生物疗法在内的当前治疗对大部分RA患者无足够帮助。高达50%的患者在5年内中断TNF拮抗剂治疗，此主要为由于不良事件所致，但亦为由于经验证丧失反应的患者的数量日益增加。
在一些实施方案中，免疫病症为T细胞介导的免疫病症，例如T细胞病症，其中与病症有关的活化T细胞表达CD40。可给予抗-CD40抗体或药物以排除所述表达CD40的活化T细胞。在一具体实施方案中，给予抗-CD40抗体或药物可排除表达CD40的活化T细胞，同时抗-CD40或药物基本上未排除静止T细胞。在此上下文中，“基本上未排除”意指少于约60%或少于约70%或少于约80%的静止T细胞未排除。
本文所述抗-CD40抗体及药物亦可用于治疗或预防表达CD40的癌症。根据本文所述方法治疗或预防表达CD40的癌症，通过向需要该治疗或预防的个体给予有效量的抗-CD40抗体或药物来达成，该抗体或药物藉此(i)与表达CD40的癌细胞结合，及(ii)产生细胞毒性或细胞抑制效应以排除表达CD40的癌细胞或抑制其增殖。
可通过本文所述方法治疗或预防的表达CD40的癌症包括(例如)白血病，例如急性白血病、急性淋巴细胞性白血病、急性髓细胞性白血病(例如，成髓细胞性白血病、前髓细胞性白血病、骨髓单核细胞性白血病、单核细胞性白血病或红白血病)、慢性白血病、慢性髓细胞性(粒细胞性)白血病或慢性淋巴细胞性白血病；真性红细胞增多症；淋巴瘤(例如，霍奇金氏病或非霍奇金氏病)；多发性骨髓瘤、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症；重链病；实体肿瘤，例如肉瘤及癌瘤(例如，纤维肉瘤、黏液肉瘤、脂肪肉瘤、软骨肉瘤、成骨性肉瘤、骨肉瘤、脊索瘤、血管肉瘤、内皮肉瘤、淋巴管肉瘤、淋巴管内皮肉瘤、滑膜瘤、间皮瘤、尤因氏肿瘤(Ewing'stumor)、平滑肌肉瘤、横纹肌肉瘤、结肠癌、结肠直肠癌、胰腺癌、乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳头状癌、乳头状腺癌、囊腺癌、髓样癌、支气管癌、肾细胞癌、肝癌、胆管癌、绒毛膜癌、精原细胞瘤、胚胎性癌、维尔姆斯氏肿瘤(Wilms'tumor)、宫颈癌、子宫癌、睾丸瘤、肺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神经胶质瘤、星形细胞瘤、成神经管细胞瘤、颅咽管瘤、室管膜瘤、松果体瘤、血管母细胞瘤、听神经瘤、少突神经胶质瘤、脑膜瘤(menangioma)、黑色素瘤、神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、鼻咽癌或食管癌)。
药物组合物及其给药
可将包含CD40结合剂(例如，抗-CD40抗体)的组合物给予患有免疫病症或表达CD40的癌症或具有罹患所述疾病的风险的个体。本发明另外提供CD40结合剂(例如，抗-CD40抗体)在制备用于预防或治疗表达CD40的癌症或免疫病症的药物中的用途。本文所用术语“个体”意指可给予CD40结合剂的任何哺乳动物患者，包括(例如)人及非人哺乳动物，例如灵长类动物、啮齿类动物及狗。明确意欲使用本文所述方法治疗的个体包括人。在免疫病症或表达CD40的癌症的预防或治疗中，抗体或药物可单独或与其他组合物组合给予。
用于所述药物组合物中的优选抗体为那些包含具有以下中的任一者的重链可变区氨基酸序列的人源化抗体或抗体片段：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39或SEQIDNO:40。
一些实施方案包括包含编码抗体或抗体片段的序列的分离的多核苷酸，该抗体或抗体片段具有轻链可变域氨基酸序列SEQIDNO:26、SEQIDNO:31或SEQIDNO:36。尤其优选的人源化抗体组合物包含抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:27及SEQIDNO:26；SEQIDNO:28及SEQIDNO:26；SEQIDNO:29及SEQIDNO:26；SEQIDNO:30及SEQIDNO:26；SEQIDNO:32及SEQIDNO:31；SEQIDNO:33及SEQIDNO:31；SEQIDNO:34及SEQIDNO:31；SEQIDNO:35及SEQIDNO:31；SEQIDNO:37及SEQIDNO:36；SEQIDNO:38及SEQIDNO:36；SEQIDNO:39及SEQIDNO:36；SEQIDNO:40及SEQIDNO:36。本发明内涵盖编码以下重链序列中的任一者的分离的多核苷酸：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:42、SEQIDNO:44、SEQIDNO:46、SEQIDNO:48、SEQIDNO:53、SEQIDNO:57、SEQIDNO:58、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60、SEQIDNO:61、SEQIDNO:62、SEQIDNO:63、SEQIDNO:64、SEQIDNO:65、SEQIDNO:66、SEQIDNO:67、SEQIDNO:68、SEQIDNO:69、SEQIDNO:70、SEQIDNO:71、SEQIDNO:72或SEQIDNO:73。其他实施方案涉及编码以下序列中的任一者的轻链序列的分离的核酸：SEQIDNO:5至SEQIDNO:8、SEQIDNO:26、SEQIDNO:31、SEQIDNO:36、SEQIDNO:41、SEQIDNO:43、SEQIDNO:45、SEQIDNO:47、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:55、SEQIDNO:56、SEQIDNO:74、SEQIDNO:75或SEQIDNO:76。
在某些实施方案中，在患有中度至重度活动性RA且对单独的MTX无充分反应的患者中，倘若意欲治疗RA，则方法中可使用本发明组合物来减少体征及症状，诱发主要临床反应并降低结构性损伤的进展。当前此疗法的实例为：Enbrel/Humira(使用Humira及Enbrel的数据在两个不同患者群中获得)。可使用本发明组合物来代替Enbrel/Humira疗法或与Enbrel/Humira疗法组合以用于对单独的MTX无反应的个体。优选地，在所述实施方案中，在对甲氨喋呤无充分反应的患者中，本发明组合物的功效将优于Enbrel+MTX，如通过(例如)以下所确定：在6个月时，化合物加MTX的ACR20>85%(GS：Enbrel+MTX为71%，而安慰剂+MTX为27%，在12个月时Humira+MTX为59%，而安慰剂+MTX为24%)*。本发明组合物优良功效的其他标准可包括：与Enbrel类似，在一年时间内抑制结构性损伤的进展(对于52周后的平均改良Sharp分数，Humira+MTX为0.1，而安慰剂+MTX为2.7)*。在其他实施方案中，组合物在已对甲氨喋呤无充分反应的患者中产生优于Enbrel的“主要临床反应”，如通过以下所测量：ACR70(Humira+MTX为20%，安慰剂+MTX为4%)*。
在其他实施方案中，在患有中度至重度活动性RA且已对抗TNF药物无充分反应的患者中，可能需要本发明组合物来减少体征及症状，诱发主要临床反应并降低结构性损伤的进展。当前金标准(Goldstandard)：非抗TNF性生物疗法。优选地，在所述个体中，通过在已对抗TNF药物无充分反应的患者中的历史性比较，本发明组合物的功效不低于非抗TNF生物疗法(例如Orencia、Rituxan)：在6个月时，化合物加DMARD的ACR20>50%(GS：Orencia+DMARD为50%，而安慰剂+DMARD为20%)。在其他实施方案中，与Rituxan类似，本发明组合物在一年时间内抑制结构性损伤的进展，如通过公认X射线评分法对关节侵蚀及关节腔狭窄所评价(对于52周后的平均改良Sharp分数，Rituxan+MTX为1.0，而安慰剂+MTX为2.31)。
已知且可使用多种递送系统来给予CD40结合剂。引入方法包括(但不限于)真皮内、肌内、腹膜内、静脉内、皮下、鼻内、硬膜外及经口途径。CD40结合剂可通过(例如)输注、推注或注射来给予，且可与例如化学治疗药物等其他生物活性剂一起给予。给予可为全身性或局部给予。在优选实施方案中，通过皮下注射来给予。可在(例如)预填充注射器中制备用于所述注射的调配物，其可每隔一周给予一次。
可测定本发明的抗体的安全性特征且优选包括一或多个例如以下的特征：与常用于治疗类风湿性关节炎的其他药物(例如DMARD、类固醇、NSAID)无临床上显著的不良相互作用；因安全性或耐受性问题所致的中断率不高于Enbrel；严重感染率不高于抗TNF药物或其他常用生物药物；注射位点反应或输注反应的频率和/或严重性与Enbrel类似；在多个治疗周期后未产生抗药性或抗药性极小(低于5%)；未中和或最低程度地中和抗体；无证据显示增强了可引起活体内血栓栓塞事件的血小板聚集/活化或可引起流血的血小板/内皮功能障碍。
在具体实施方案中，CD40结合剂组合物为通过注射、借助导管、借助栓剂或借助植入体来给予，该植入体为有孔、无孔或凝胶状材料，其包括例如硅橡胶膜等膜或纤维。通常，在给予组合物时，使用抗-CD40抗体或药物不能吸附的材料。
在其他实施方案中，抗-CD40抗体或药物以控释系统来递送。在一实施方案中，可使用泵(例如，参见Langer，1990，Science249：1527-1533；Sefton，1989，CRCCrit.Ref.Biomed.Eng.14：201；Buchwald等人，1980，Surgery88：507；Saudek等人，1989，N.Engl.J.Med.321：574)。在另一实施方案中，可使用聚合材料。(例如，参见MedicalApplicationsofControlledRelease(Langer及Wise编辑，CRCPress，BocaRaton，Fla.，1974)；ControlledDrugBioavailability，DrugProductDesignandPerformance(Smolen及Ball编辑，Wiley，NewYork，1984)；Ranger及Peppas，1983，Macromol.Sci.Rev.Macromol.Chem.23：61。亦参见Levy等人，1985，Science228：190；During等人，1989，Ann.Neurol.25：351；Howard等人，1989，J.Neurosurg.71：105。)其他控释系统论述于(例如)Langer(上述文献)中。
CD40结合剂(例如，抗-CD40抗体)可以包含治疗有效量的结合剂及一或多种药学上相容的成分的药物组合物形式来给予。
在典型实施方案中，根据常规操作将药物组合物调配为适用于静脉内或皮下给予人的药物组合物。通常，注射给予用组合物为存在于无菌等渗水性缓冲液中的溶液。若需要，药物亦可包括增溶剂及局部麻醉剂(例如利诺卡因(lignocaine))以减轻注射位点的疼痛。通常，各成分单独或混合在一起以单位剂型来供应，例如，作为冻干干粉或无水浓缩物存在于例如安瓿或药囊等标明活性剂的量的密封容器中。倘若药物为通过输注来给予，则可将其分配至含有无菌药物级水或盐水的输注瓶中。倘若药物通过注射来给予，则可提供含有注射用无菌水或盐水的安瓿以使得可在给予之前混合各成分。
此外，可以以药物试剂盒形式来提供药物组合物，所述试剂盒包含(a)含有呈冻干形式的CD40结合剂(例如，抗-CD40抗体)的容器及(b)含有药学上可接受的注射用稀释剂(例如，无菌水)的第二容器。药学上可接受的稀释剂可用于重组或稀释冻干抗-CD40抗体或药物。任选地，该容器可附带有监管药物或生物产品的制备、使用或销售的政府机构所规定形式的公告，该公告显示政府机构已批准用于人给予的制备、使用或销售。
CD40结合剂(例如，抗-CD40抗体)在治疗或预防免疫病症或表达CD40的癌症中的有效量可通过标准临床技术来确定。另外，可任选采用体外分析来帮助确定最佳剂量范围。调配中所用确切剂量亦可取决于给予途径及免疫病症或表达CD40的癌症的阶段，且应根据从业医师的判断及各患者的情况来决定。可根据得自体外或动物模型测试系统的剂量反应曲线来推断有效剂量。
举例而言，抗-CD40抗体或药物的毒性及治疗功效可在细胞培养物或实验动物中通过测定ED50(在50%群体中治疗有效的剂量)的标准药物操作来测定。表现出较大治疗指数的CD40结合剂(例如，抗-CD40抗体)是优选的。倘若CD40结合剂表现出毒性副作用，则可使用将CD40结合剂靶向至受影响组织位点的递送系统以使对不表达CD40的细胞的潜在损伤降至最低，且由此减少副作用。
自细胞培养分析及动物研究获得的数据可用于调配用于人的剂量范围。CD40结合剂的剂量通常在具有极低毒性或无毒性的循环浓度(包括ED50)范围内。该剂量可在此范围内取决于所用剂型及所用给予途径而变。对于该方法中所用任一CD40结合剂而言，可首先根据细胞培养分析来估计治疗有效剂量。可在动物模型中调配剂量以达成如在细胞培养物中所测定的循环血浆浓度范围，其包括IC50(即测试化合物可达成症状半最大抑制的浓度)。该信息可用于更准确地确定人的可用剂量。血浆中含量可通过(例如)高效液相色谱、ELISA等来测量。
通常，抗-CD40抗体或CD40结合剂给予患有免疫病症或表达CD40的癌症的患者的剂量通常为约0.1mg/kg至约100mg/kg个体体重。给予个体的剂量为约0.1mg/kg至约50mg/kg个体体重、约1mg/kg至约30mg/kg、约1mg/kg至约20mg/kg、约1mg/kg至约15mg/kg、或约1mg/kg至约10mg/kg。
示例性剂量包括(但不限于)1ng/kg至100mg/kg。在一些实施方案中，剂量为约0.5mg/kg、约1mg/kg、约2mg/kg、约3mg/kg、约4mg/kg、约5mg/kg、约6mg/kg、约7mg/kg、约8mg/kg、约9mg/kg、约10mg/kg、约11mg/kg、约12mg/kg、约13mg/kg、约14mg/kg、约15mg/kg或约16mg/kg。该剂量可以例如以下的频率来给予：每日、每周一次(一周一次)、每周两次、每周三次、每周四次、每周五次、每周六次、每两周一次或每月一次、每两个月一次或每三个月一次。在具体实施方案中，剂量为约0.5mg/kg/周、约1mg/kg/周、约2mg/kg/周、约3mg/kg/周、约4mg/kg/周、约5mg/kg/周、约6mg/kg/周、约7mg/kg/周、约8mg/kg/周、约9mg/kg/周、约10mg/kg/周、约11mg/kg/周、约12mg/kg/周、约13mg/kg/周、约14mg/kg/周、约15mg/kg/周或约16mg/kg/周。在一些实施方案中，剂量介于约1mg/kg/周至约15mg/kg/周的范围内。
在一些实施方案中，包含CD40结合剂的药物组合物还可包含与该结合剂缀合或未缀合的治疗药物。抗-CD40抗体或CD40结合剂可与一或多种用于治疗或预防免疫病症或表达CD40的癌症的治疗药物组合共同给予。举例而言，组合疗法可包括细胞抑制剂、细胞毒性剂或免疫抑制剂。组合疗法亦可包括(例如)给予靶向活化淋巴细胞、树突细胞或表达CD40的癌细胞表面上除CD40以外的受体或受体复合物的药物。所述药物的实例包括第二非CD40抗体，其与活化淋巴细胞、树突细胞或表达CD40的癌细胞表面上的分子结合。另一实例包括靶向此一受体或受体复合物的配体。通常，所述抗体或配体与活化淋巴细胞、树突细胞或表达CD40的癌细胞上的细胞表面受体结合，且通过将细胞抑制或细胞毒性信号递送至活化淋巴细胞、树突细胞或表达CD40的癌细胞中来增强抗-CD40抗体的细胞毒性或细胞抑制效应。
该组合疗法给予可对疾病参数(例如，症状严重度、症状数或复发频率)产生累加或协同效应。
对于组合给予的治疗方案，在一具体实施方案中，将抗-CD40抗体或CD40结合剂与治疗药物同时给予。在另一具体实施方案中，在给予抗-CD40抗体或CD40结合剂之前或之后给予治疗药物，即在给予抗-CD40抗体或CD40结合剂之前或之后至少一小时且最长数月、例如至少一小时、5小时、12小时、1天、1周、1个月或3个月给予治疗药物。
细胞毒性剂或免疫抑制剂的可用种类包括(例如)微管蛋白抑制剂、奥瑞斯他汀(auristatin，例如MMAE或MMAF)、DNA小沟结合剂、DNA复制抑制剂、烷基化剂(例如，铂络合物，例如顺铂、单(铂)、双(铂)及三核铂络合物及卡铂)、蒽环类抗生素、抗生素、抗叶酸素、抗代谢物、化学疗法增敏剂、多卡米星、依托泊苷、氟化嘧啶、离子载体、莱克森(lexitropsin)、亚硝基脲、顺氯胺铂(platinol)、预形成化合物、嘌呤抗代谢物、嘌呤霉素、放射增敏剂、类固醇、紫杉烷、拓扑异构酶抑制剂、长春花生物碱(vincaalkaloid)等。
个别细胞毒性剂或免疫抑制剂包括(例如)雄激素、氨茴霉素(anthramycin)(AMC)、天冬酰胺酶、5-氮胞苷、硫唑嘌呤、博莱霉素、白消安、丁硫氨酸硫酸亚胺、喜树碱、卡铂、卡莫司汀(BSNU)、CC-1065、苯丁酸氮芥、顺铂、秋水仙素(colchicine)、环磷酰胺、阿糖胞苷、阿糖胞苷、松胞菌素B(cytochalasinB)、达卡巴嗪、更生霉素(原放线菌素)、柔红霉素、氨烯咪胺(decarbazine)、多西他赛(docetaxel)、多柔比星、雌激素、5-氟脱氧尿苷、5-氟尿嘧啶、短杆菌肽D(gramicidinD)、羟基脲、伊达比星、异磷酰胺、伊立替康(irinotecan)、洛莫司汀(CCNU)、双氯乙基甲胺、美法仑、6-巯基嘌呤、甲氨喋呤、光辉霉素(mithramycin)、丝裂霉素C、米托蒽醌、硝基咪唑、紫杉醇、光辉霉素(plicamycin)、丙卡巴肼(procarbizine)、链脲霉素(streptozotocin)、替尼泊苷(tenoposide)、6-硫鸟嘌呤、噻替哌、托泊替康、长春碱、长春新碱、长春瑞滨、VP-16及VM-26。
在一些典型实施方案中，治疗药物为细胞毒性剂。适宜细胞毒性剂包括(例如)多拉司他汀(例如，奥瑞斯他汀E、AFP、MMAF、MMAE、AEB或AEVB)、DNA小沟结合剂(例如，烯二炔及莱克森)、多卡米星、紫杉烷(例如，紫杉醇及多西他赛)、嘌呤霉素、长春花生物碱、CC-1065、SN-38、托泊替康、吗啉基-多柔比星、根霉素、氰基吗啉基-多柔比星、棘霉素(echinomycin)、考布他汀(combretastatin)、纺锤菌素(netropsin)、埃博霉素A及B、雌莫司汀、念珠藻素(cryptophysins)、西马多丁(cemadotin)、类美坦辛(maytansinoid)、圆皮海绵内酯(discodermolide)、艾榴素或米托蒽醌。
在一些实施方案中，细胞毒性剂为常用化学治疗药，例如多柔比星、紫杉醇、美法仑、长春花生物碱、甲氨喋呤、丝裂霉素C或依托泊苷。另外，可使例如CC-1065类似物、刺孢霉素、美坦辛、多拉司他汀10类似物、根霉素及海葵毒素(palytoxin)等有效药物与抗-CD40抗体或其药物相连。
在具体实施方案中，细胞毒性剂或细胞抑制剂为奥瑞斯他汀E(业内亦称作多拉司他汀10)或其衍生物。通常，奥瑞斯他汀E衍生物为(例如)在奥瑞斯他汀E与酮酸之间形成的酯。举例而言，可使奥瑞斯他汀E与对乙酰基苯甲酸或苯甲酰戊酸反应以分别产生AEB及AEVB。其他典型奥瑞斯他汀衍生物包括AFP、MMAF及MMAE。奥瑞斯他汀E及其衍生物的合成及结构阐述于(例如)以下文献中：美国专利申请公开案第2004-0157782A1号及第2005-0238649号；国际专利申请案第PCT/US03/24209号、国际专利申请案第PCT/US02/13435号及美国专利第6,884,869号、第6,323,315号、第6,239,104号、第6,034,065号、第5,780,588号、第5,665,860号、第5,663,149号、第5,635,483号、第5,599,902号、第5,554,725号、第5,530,097号、第5,521,284号、第5,504,191号、第5,410,024号、第5,138,036号、第5,076,973号、第4,986,988号、第4,978,744号、第4,879,278号、第4,816,444号及第4,486,414号，其公开内容为以引用方式并入本文中。
在具体实施方案中，细胞毒性剂为DNA小沟结合剂。(例如，参见美国专利第6,130,237号)。举例而言，在一些实施方案中，小沟结合剂为CBI化合物。在其他实施方案中，小沟结合剂为烯二炔(例如，刺孢霉素)。
微管蛋白抑制剂的实例包括(但不限于)紫杉烷(例如，(紫杉醇)、(多西他赛))、T67(Tularik)、长春花生物碱(例如，长春新碱、长春碱、长春地辛及长春瑞滨)及多拉司他汀(例如，奥瑞斯他汀E、AFP、MMAF、MMAE、AEB、AEVB)。其他微管蛋白抑制剂包括(例如)浆果赤霉素(baccatin)衍生物、紫杉烷类似物(例如，埃博霉素A及B)、噻氨酯哒唑(nocodazole)、秋水仙素及秋水仙胺(colcimid)、雌莫司汀、念珠藻素、西马多丁、类美坦辛、考布他汀、圆皮海绵内酯及艾榴素。
在一些实施方案中，细胞毒性剂为类美坦辛，其为另一类微管蛋白抑制剂。举例而言，在具体实施方案中，类美坦辛为美坦辛或DM-1(ImmunoGen公司；亦参见Chari等人，1992，CancerRes.52：127-131)。
在一些实施方案中，治疗药物不为放射性同位素。
在一些实施方案中，细胞毒性剂或免疫抑制剂为抗代谢物。抗代谢物可为(例如)嘌呤拮抗剂(例如，咪唑硫嘌呤或麦考酚酸吗乙酯(mycophenolatemofetil))、二氢叶酸还原酶抑制剂(例如甲氨喋呤)、阿昔洛韦(acyclovir)、丙氧鸟苷(gangcyclovir)、齐多夫定(zidovudine)、阿糖腺苷(vidarabine)、利巴韦林(ribavarin)、叠氮胸苷嘧啶、阿糖胞苷、金刚烷胺、二脱氧尿苷、碘脱氧尿苷、膦甲酸钠(poscamet)或曲氟尿苷(trifluridine)。
在其他实施方案中，细胞毒性剂或免疫抑制剂为他克莫司(tacrolimus)、环孢菌素或雷帕霉素(rapamycin)。在其他实施方案中，细胞毒性剂为阿地白介素(aldesleukin)、阿仑珠单抗(alemtuzumab)、阿利维甲酸(alitretinoin)、别嘌呤醇(allopurinol)、六甲密胺、胺磷汀(amifostine)、阿那曲唑、三氧化二砷、贝沙罗汀(bexarotene)、卡普睾酮、卡培他滨、塞来昔布(celecoxib)、克拉屈滨(cladribine)、达依泊汀α(Darbepoetinalfa)、地尼白介素2(Denileukindiftitox)、右雷佐生(dexrazoxane)、丙酸屈他雄酮、表柔比星、阿法依泊汀(Epoetinalfa)、雌莫司汀、依西美坦、非格司亭(Filgrastim)、氟尿苷、氟达拉滨、氟维司群(fulvestrant)、吉西他滨、吉姆单抗奥佐米星(gemtuzumabozogamicin)、戈舍瑞林、伊达比星、异磷酰胺、甲磺酸伊马替尼(imatinibmesylate)、干扰素α-2a、伊立替康、来曲唑、亚叶酸(leucovorin)、左旋咪唑(levamisole)、氮芥(meclorethamine)或氮芥(nitrogenmustard)、甲地孕酮、美司钠(mesna)、甲氨喋呤、甲氧沙林(methoxsalen)、丝裂霉素C、米托坦、苯丙酸诺龙(nandrolonephenpropionate)、奥普瑞白介素(oprelvekin)、奥沙利铂(oxaliplatin)、氨羟二磷酸二钠(pamidronate)、培加酶(pegademase)、培门冬酶(pegaspargase)、培非司亭(pegfilgrastim)、喷司他汀、溴丙哌嗪、光辉霉素、卟吩姆钠(porfimersodium)、丙卡巴肼、奎纳克林(quinacrine)、拉布立酶(rasburicase)、雷利度胺(revlimid)、沙格司亭(Sargramostim)、链脲霉素、他莫昔芬、替莫唑胺(temozolomide)、替尼泊苷、睾内酯、硫鸟嘌呤、托瑞米芬、托西莫单抗(Tositumomab)、曲妥珠单抗(Trastuzumab)、维甲酸(tretinoin)、尿嘧啶氮芥、戊柔比星(valrubicin)、长春碱、长春新碱、长春瑞滨及唑来磷酸(zoledronate)。
在其他实施方案中，该药物为人源化抗HER2单克隆抗体；RITUXAN(利妥昔单抗；Genentech公司，SouthSanFrancisco，Calif.)；嵌合抗CD20单克隆抗体；OVAREX(AltaRex公司，MA)；PANOREX(GlaxoWellcome，NC；鼠类IgG2a抗体)；CetuximabErbitux(ImcloneSystems公司，NY；抗EGFRIgG嵌合抗体)；Vitaxin(MedImmune公司，MD)；CampathI/H(Leukosite，MA；人源化IgG1抗体)；SmartMI95(ProteinDesignLabs公司，CA；人源化抗CD33IgG抗体)；LymphoCide(Immunomedics公司，NJ；人源化抗CD22IgG抗体)；SmartID10(ProteinDesignLabs公司，CA；人源化抗HLA-DR抗体)；Oncolym(Techniclone公司，CA；放射性标记的鼠类抗HLA-Dr10抗体)；Allomune(BioTransplant，CA；人源化抗CD2mAb)；Avastin(Genentech公司，CA；抗VEGF人源化抗体)；依帕珠单抗(Epratuzamab)(Immunomedics公司，NJ及Amgen，CA；抗CD22抗体)；及CEAcide(Immunomedics，NJ；人源化抗CEA抗体)。
其他适宜抗体包括(但不限于)针对以下抗原的抗体：CA125、CA15-3、CA19-9、L6、LewisY、LewisX、α-胎蛋白、CA242、胎盘碱性磷酸酶、前列腺特异性抗原、前列腺酸性磷酸酶、表皮生长因子、MAGE-1、MAGE-2、MAGE-3、MAGE-4、转铁蛋白受体抗体、p97、MUC1-KLH、CEA、gp100、MART1、前列腺特异性抗原、IL-2受体、CD20、CD52、CD33、CD22、人绒毛膜促性腺激素、CD38、黏蛋白、P21、MPG及Neu癌基因产物。
在一些实施方案中，治疗药物为免疫抑制剂。免疫抑制剂可为(例如)丙氧鸟苷、依那西普、他克莫司、环孢菌素、雷帕霉素、环磷酰胺、硫唑嘌呤、麦考酚酸吗乙酯或甲氨喋呤。或者，免疫抑制剂可为(例如)糖皮质激素(例如，皮质醇或醛固酮)或糖皮质激素类似物(例如，泼尼松(prednisone)或地塞米松(dexamethasone))。
适宜的环氧合酶抑制剂包括甲氯芬那酸(meclofenamicacid)、甲芬那酸(mefenamicacid)、卡洛芬(carprofen)、双氯芬酸(diclofenac)、二氟尼柳(diflunisal)、芬布芬(fenbufen)、非诺洛芬(fenoprofen)、布洛芬(ibuprofen)、吲哚美辛(indomethacin)、酮洛芬(ketoprofen)、萘丁美酮(nabumetone)、萘普生(naproxen)、舒林酸(sulindac)、替诺昔康(tenoxicam)、托美汀(tolmetin)及乙酰水杨酸。
适宜的脂氧合酶抑制剂包括氧化还原抑制剂(例如，儿茶酚丁烷衍生物、去甲二氢愈创木酸(NDGA)、马索罗酚(masoprocol)、菲尼酮(phenidone)、氯萘帕林(lanopalen)、吲唑啉酮、naphazatrom、苯并呋喃酚、烷基羟胺)及非氧化还原抑制剂(例如，羟基噻唑、甲氧基烷基噻唑、苯并吡喃及其衍生物、甲氧基四氢吡喃、乳香酸及乳香酸的乙酰化衍生物以及经环烷基取代的喹啉甲氧基苯基乙酸)及氧化还原抑制剂的前体。
其他适宜的脂氧合酶抑制剂包括抗氧化剂(例如，酚、没食子酸丙酯、类黄酮和/或含有黄酮类的天然底物、黄酮的羟基化衍生物、黄酮醇、二氢槲皮素、木犀草素、高良姜黄素(galangin)、奥洛波尔(orobol)、查耳酮(chalcone)衍生物、4,2',4'-三羟基查耳酮、邻氨基苯酚、N-羟基脲、苯并呋喃酚、依布硒啉(ebselen)及还原性含硒酶活性提高的物质)、铁螯合剂(例如，氧肟酸及其衍生物、N-羟基脲、2-苄基-1-萘酚、儿茶酚、羟胺、鼠尾草酚troloxC、儿茶酚、萘酚、柳氮磺胺吡啶、齐留通(zyleuton)、5-羟基氨基苯甲酸及4-(ω-芳基烷基)苯基链烷酸)、含咪唑化合物(例如，酮康唑(ketoconazole)及伊曲康唑(itraconazole))、吩噻嗪及苯并吡喃衍生物。
其他适宜的脂氧合酶抑制剂包括类花生酸抑制剂(所述类花生酸包括例如十八碳四烯酸、二十碳四烯酸、二十二碳五烯酸、二十碳六烯酸及二十二碳六烯酸及其酯、PGE1(前列腺素E1)、PGA2(前列腺素A2)、维前列醇(viprostol)、15-单羟基二十碳四烯酸、15-单羟基-二十碳三烯酸及15-单羟基二十碳五烯酸及白三烯B5、C5及D5)、干扰钙流动的化合物、吩噻嗪、二苯基丁胺、维拉帕米(verapamil)、岩藻糖苷(fuscoside)、姜黄素、绿原酸(chlorogenicacid)、咖啡酸、5,8,11,14-二十碳四烯酸(ETYA)、羟苯基维甲酰胺、氯萘帕林、七叶灵(esculin)、乙胺嗪、phenantroline、黄芩素(baicalein)、丙羟萘吡酸(proxicromil)、硫醚、二烯丙基硫醚及二-(1-丙烯基)硫醚。
白三烯受体拮抗剂包括骨化三醇(calcitriol)、昂唑司特(ontazolast)、BayerBay-x-1005、Ciba-GeigyCGS-25019C、依布硒啉、LeoDenmarkETH-615、LillyLY-293111、OnoONO-4057、TerumoTMK-688、BoehringerIngleheimBI-RM-270、LillyLY213024、LillyLY264086、LillyLY292728、OnoONOLB457、Pfizer105696、PerdueFrederickPF10042、Rhone-PoulencRorerRP66153、SmithKlineBeechamSB-201146、SmithKlineBeechamSB-201993、SmithKlineBeechamSB-209247、SearleSC-53228、SumitamoSM15178、AmericanHomeProductsWAY121006、BayerBay-o-8276、Warner-LambertCI-987、Warner-LambertCI-987BPC-15LY223982、LillyLY233569、LillyLY-255283、MacroNexMNX-160、MerckandCo.MK-591、MerckandCo.MK-886、OnoONO-LB-448、PurdueFrederickPF-5901、Rhone-PoulencRorerRG14893、Rhone-PoulencRorerRP66364、Rhone-PoulencRorerRP69698、ShionoogiS-2474、SearleSC-41930、SearleSC-50505、SearleSC-51146、SearleSC-52798、SmithKlineBeechamSK及F-104493、LeoDenmarkSR-2566、TanabeT-757及TeijinTEI-1338。
制品
在另一方面中，包括含有可用于治疗上述病症的材料的制品。该制品包含容器及标记。适宜容器包括(例如)瓶子、小瓶、注射器及试管。容器可自例如玻璃或塑料等多种材料形成。容器容纳可有效治疗病况的组合物且可具有无菌出入口。举例而言，容器可为静脉内溶液袋或具有皮下注射针可刺入塞子的小瓶。组合物中的活性药物为人源化抗-CD40抗体。容器上或与容器相连的标记指示，该组合物为用于治疗所选病况。制品还可包含第二容器，该第二容器包含药学上可接受的缓冲液，例如磷酸盐缓冲盐水、林格氏溶液(Ringer'ssolution)及右旋糖溶液。其还可包括根据商业及用户角度考虑所期望的其他材料，包括其他缓冲液、稀释剂、滤器、针、注射器及写有使用说明的包装说明书。
本发明进一步阐述于以下实施例中，所述实施例不欲限制本发明的范围。
实施例
实施例1：人源化抗-CD40抗体的产生
鼠类抗体20E2及2H11显示于上文表1及2中。20E2及2H11克隆的人源化已完成。制备文库，使人及鼠类残基改变为在任意给定位置处可存在一个人或鼠类残基。此文库为针对在人种系与鼠类抗体之间不同的那些氨基酸制备。仅选择保留亲代鼠类抗体功能的克隆。
以此方式，抗体a、抗体B及抗体C为源自克隆至人IgG1-KO(KO=剔除)/κ骨架中的小鼠抗体20E2(抗体A及抗体B)或2H11(抗体C)的人源化抗体。IgG1-KO在Fc区中具有两处突变Leu234Ala及Leu235Ala，从而降低FcγR及补体结合。
所述人源化的结果产生不同人源化重链及轻链可变序列，如下文所示：
SEQIDNO：41(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：42(可变重链序列)：
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SEQIDNO：43(可变轻链序列)：
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TLTISSLQAEDVAVYYCQNDYTYPLTFGGGTKVEIK
SEQIDNO：44(可变重链序列)：
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SEQIDNO：45(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：46(可变重链序列)：
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SEQIDNO：47(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：48(可变重链序列)：
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SEQIDNO：49(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：50(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：51(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：52(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：53(可变重链序列)：
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SEQIDNO：54(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：55(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：56(可变轻链序列)：
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SEQIDNO：57(可变重链序列)：
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SEQIDNO：58(可变重链序列)：
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SEQIDNO：59(可变重链序列)：
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SEQIDNO：60(可变重链序列)：
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SEQIDNO：61(可变重链序列)：
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SEQIDNO：62(可变重链序列)：
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SEQIDNO：63(可变重链序列)：
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SEQIDNO：64(可变重链序列)：
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SEQIDNO：65(可变重链序列)：
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SEQIDNO：66(可变重链序列)：
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SEQIDNO：67(可变重链序列)：
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SEQIDNO：68(可变重链序列)：
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SEQIDNO：69(可变重链序列)：
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SEQIDNO：70(可变重链序列)：
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SEQIDNO：71(可变重链序列)：
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SEQIDNO：72(可变重链序列)：
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SEQIDNO：73(可变重链序列)：
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TAYMELSSLRSEDTAVYYCTTSYYVGTYGYWGQGTTVTVSS
SEQIDNO：74(可变重链序列)1，来自抗体10F2Hum：
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QPEDFATYYCQQRTFYPYTFGGGTKVEIK
SEQIDNO：75(可变重链序列)2，来自抗体10F2Hum：
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSATSSVSYILWFQQKPGKAPKLLIYSTSNLASGVPARFSGSGSGTDFTLTISSL
QPEDFATYYCQQRTFYPYTFGGGTKVEIK
SEQIDNO：76(可变轻链序列)：
QIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSATSSVSYILWFQQKPGKAPKLWIYSTSNLASGVPARFSGSGSGTDFTLTISSL
QPEDFATYYCQQRTFYPYTFGGGTKVEIK
本发明示例性人源化抗体为那些具有下表中所示重链及轻链序列者。下表中的粗体加下划线序列为可变域，而正常无下划线序列为恒定域：
将可变区亚克隆至一个或两个不同的适宜的IgG表达载体中：
A)人IgG1-KO(剔除)/κ模式，其在Fc区中具有Leu234Ala与Leu235Ala双重突变以降低例如FcγR及补体结合等效应子功能
B)人IgG4-DM(双重突变体)/κ模式，其在铰链区中具有Ser228Pro突变以降低IgG4半分子的出现率，且具有Leu235Glu突变以进一步降低FcγR结合
纯化两个候选者(抗体A及抗体B)并通过以下标准进行评估：
-CCF外观(浊度)
-CCF的过滤特性
-r蛋白A的产率
-洗脱及中和后的浊度
-可溶聚集体(SEC)
-纯度/浓度模式(SDS)
-电荷模式(IEF)
实施例2：体外数据
抗体A、抗体B及抗体C与基于所公开序列制备的抗体4D11(Kirin/Astellas)及PG-102(PanGenetics)一起表征。抗体A、抗体B、抗体C及4D11的数据显示于下文中。PG-102显示激动活性且仅不完全抑制B细胞增殖(未显示)。表2.2.概述所得数据。在表2.2之后更详细地阐述数据。
表2.2.对抗体A、抗体B及抗体C及Kirin的4D11抗-CD40抗体的体外数据的总结
*SI，刺激指数；**比率>1意指相对于人与狗的结合有所增加。
A.人源化抗体与细胞CD40及重组CD40蛋白的结合
通过流式细胞计数法使用经人CD40转染的HEK293细胞来分析人源化抗体与细胞CD40的特异性结合。观察到抗体A、抗体B及抗体C具有浓度依赖性结合。所述抗体显示图1B中所示的类似结合曲线。本发明的抗体及Kirin抗体4D11的EC50值皆在约1nM的相同范围内，该范围最有可能为分析的灵敏度限值，这是因为在经转染细胞中含有大量CD40。人源化抗体与人Ramos细胞上的细胞CD40的特异性结合亦显示浓度依赖性结合。所述抗体显示略有不同的结合曲线(显示于图2中)及介于0.21nM至1.22nM之间的EC50值。在例如未经转染的HEK293细胞或T细胞系HSB-2等CD40阴性细胞上未检测到结合，由此确认对CD40的选择性结合(数据未显示)。
抗体A、抗体B及抗体C与人CD40-Fc蛋白结合的亲和性为经由ForteBioOctet来测量，且发现解离常数(KD)<100pM。由于抗体及CD40-Fc的二价亲合力效应使得不能精确测定低于100pM的Kd。另外，在不存在及存在50%人血清时分析与CD40-Fc的结合，且观察到血清对结合无显著影响(数据未显示)。
B.人源化抗体在B细胞活化/增殖分析中的活性
在B细胞增殖分析中测试人源化抗体的活性，其中在IL-2及IL-4存在下用重组CD40L刺激得自外周血的人B细胞。抗体A、抗体B及抗体C显示可有效抑制B细胞增殖(显示于图3A及3B中)。与BI抗体及Kirin抗体4D11的抑制曲线及IC50值作对比，表明4D11抗体在多个供体之间测试时具有较高效能(图3B及4)。当在不存在CD40L的情形下测试激动活性时，与4D11抗体类似，抗体(抗体B、抗体A及抗体C)在高达10μg/ml(67nM)的浓度下不诱导任何超过背景水平的B细胞增殖(显示于图4中)。
竞争抗体4D11似乎有效性略高，其平均IC50为约0.02nM且不存在激动性效应。三种BI抗体及4D11的数据概述于图4及上文表2.2中。在此分析中亦测试另一竞争抗体PG-102(得自克隆5D12)，其在不存在CD40L时显示刺激B细胞增殖的显著激动剂效应(图4)。因此，我们的前导候选者因缺少激动活性而可与PG-102明确区分。
在第二分析中，在人B细胞中评价抗体对CD86上调的抑制。在此情形下，可用人全血或在纯化B细胞中实施该分析，二者皆在外源CD40L存在下进行。与B细胞增殖数据一致，如通过流式细胞计数法所测量，在人全血中测试的抗体B、抗体A及抗体C显示可有效抑制CD40介导的CD86上调(显示于图5中)。抗体C在此分析中所显示效能与4D11类似，而抗体B及抗体A的效能稍弱。在纯化B细胞上或在全血中对比抗体B与4D11显示，抗体B的效能(IC50及IC90值)在纯化B细胞中与在存在其他含CD40细胞或血清时的B细胞中相比相对不变，而4D11的效能在全血条件下发生剧烈变化(显示于图6)。
在用全血样品来评价抗体B、抗体A及抗体C在短尾猴B细胞中对CD86上调的抑制时获得类似数据(显示于图7中)。如通过流式细胞计数法所测量，在短尾猴全血中测试的抗体B、抗体A及抗体C显示可有效抑制CD40介导的CD86上调。因此所述抗体皆对短尾猴CD40显示功能性交叉反应性，且对人CD40具有类似效能。
评价抗体BIgG1KOb及抗体BIgG1WT介导抗体依赖性细胞毒性的能力的活性(图13)。在此分析中，将RAMOS细胞与人PBMC以50:1的效应子:靶细胞比率一起培育。自20μg/ml逐步增加抗体BIgG1KOb及抗体BIgG1WT的量，且通过LDH的释放来监测细胞死亡程度。所显示数据来自一个代表性实验。数据显示，抗体AIgG1Wt20E2-12-RIgG1WT为ADCC的有效介导物，且含有可消除效应子功能的突变的抗体BIgG1KOb不具有ADCC活性。
实施例3：药物代谢动力学/药效学研究
A.在短尾猴中以1mg/kg或10mg/kg的单剂量静脉内给予抗体A及抗体B
将抗体A及抗体B各自以1mg/kg及10mg/kg静脉内给予雄性短尾猴(N=3/剂量)。自0-504小时(3周)收集血样，回收血清，且将样品储存在-20℃直至分析。通过上述夹心ELISA来分析样品。在两次静脉内给药后两种抗体在猴中的血清浓度-时间曲线及药物代谢动力学参数概述于图8及下文所示的表2.7.1(抗体A)及表2.7.2(抗体B)中。两种抗体皆显示剂量依赖性药物代谢动力学，表明在低剂量下，清除主要归因于与靶介导的处置，而在较高剂量下，抗体主要通过分解代谢来清除。已观察到靶向膜结合靶(例如CD19、CD20、EGFR、CD146及HER2)的其他Mab具有类似的剂量依赖性药物代谢动力学曲线。在1mg/kg及10mg/kg剂量下，抗体A的清除率分别为0.8mL/h/kg及0.1mL/h/kg。在1mg/kg及10mg/kg剂量下，抗体B的清除率分别为0.7mL/h/kg及0.1mL/h/kg。类似地，在1mg/kg及10mg/kg剂量下，抗体A的半衰期分别为1天及13天，且抗体B在相同剂量下的半衰期分别为2天及13天。尽管抗体B在较低剂量下的半衰期比相同剂量的抗体A略长，但预计此差异不能理解为在长期给予后暴露更持久。两种化合物的AUC为超比例的且两种化合物的分布容积(Vss)与血浆容积(约40mL/kg)近似，从而表现出通常在大型极性蛋白治疗中观察到的有限组织分布。总之，两种抗体的药物代谢动力学参数之间不存在显著差异。
表2.7.1：在1mg/kg及10mg/kg的单一静脉内剂量后，抗体A在雄性短尾猴(N=3/剂量)中的药物代谢动力学参数。
剂量(mg/kg) CLp(mL/hr/kg) Vss(mL/kg) AUC(μM.hr) T1/2(天) MRT(天)
1 0.8±0.03 41±6 8.0±0.3 0.9±0.2 2.1±0.2
10 0.10±0.02 42±6 660±92 12.6±0.5 17.5±0.3
表2.7.2：在1mg/kg及10mg/kg的单一静脉内剂量后，抗体B在雄性短尾猴(N=3/剂量)中的药物代谢动力学参数。
剂量(mg/kg) CLp(mL/hr/kg) Vss(mL/kg) AUC(μM.hr) T1/2(天) MRT(天)
1 0.7±0.16 40±2 10.1±2.7 1.5±0.2 2.6±0.860 -->
10 0.09±0.01 41±6 744±55 13.3±3.0 19.3±4.2
B.离体药效学研究
作为上述PK研究的一部分，分析抗-CD40抗体的药效学效应。为此，将全血样品与重组CD40L一起培育过夜并通过流式细胞计数法来测定B细胞上CD86表达的增加。在第0天(处理前)、给药后第2天、第7天及第14天分析样品。尽管CD86表达的增加相对较小(约5-20%)，但仍观察到剂量依赖性效应(显示于图9中)。在给予10mg/kg抗体A及抗体B的动物组中，在第2天、第7天及第14天完全抑制CD86诱导，这与在此剂量下的持续暴露一致。给予1mg/kg的动物在第2天显示完全抑制，在第7天显示部分抑制，且在第14天显示无抑制。低剂量组中药效学效应随时间的丧失与抗体的较快清除相关。
实施例4：毒理学相关研究：血小板上的CD40
CD40在人血小板上组成性表达(Henn等人，2001)及(Inwald等人，2003)，而CD40L在活化血小板的细胞表面上快速瞬时表达(Henn等人，2001)。尽管预期无FcγR结合的抗-CD40抗体不会对血小板产生效应，但重要的是直接证实确实如此。实施流式细胞计数法研究来证实抗-CD40前导候选者与人及短尾猴血小板的结合。
先前已通过流式细胞计数法证实，G28.5及mAb89抗-CD40mAb与静止人血小板结合(Henn等人，2001)。使用经FITC标记的G28.5抗体对此进行确认。制备G28.5的5倍连续稀释液且在室温以0.5μg/ml至0.32ng/ml的范围在100μl得自人(2个供体)或短尾猴(3个供体)的血小板中培育30分钟。另外，使用经APC标记的抗CD45mAb来鉴定与其他CD40+细胞类型结合的血小板以自分析排除所述细胞。在抗体染色后，洗涤血小板并用OptilyseC固定且实施流式细胞计数法。测定平均荧光强度(MFI)作为与CD45-血小板结合的抗体的量度。
对市售5c3及本发明所选抗体抗-CD40小鼠mAb实施FITC标记。确认与Ramos细胞的结合。每个抗体分子的FITC分子数介于每个抗体分子2至4个FITC范围内。制备市售及候选抗-CD40mAb的5倍连续稀释液(介于0.5μg/ml至0.32ng/ml范围内)且将其与人(3个供体)及短尾猴(2个供体)血小板在室温一起培育30分钟。
显示小鼠候选抗-CD40mAb与人血小板结合的代表性图表显示于图11中。四种候选单克隆抗体与经FITC标记的同种型对照抗体相比显示与人血小板特异性结合。10F2、2H11、19B10及20E2显示与血小板的结合相当。对于短尾猴血小板观察到类似倾向(数据未显示)。
除所述研究外，在人及短尾猴全血样品中对比直接标记的抗体B及4D11与血小板及B细胞结合的能力(显示于图12中)。在人及短尾猴血样中，4D11显示与B细胞及血小板二者的结合类似(如通过EC50所例示)。抗体B显示类似模式但结合效能远远较弱。
实施例5：在NSG小鼠模型中的活体内药理学研究
在抗体产生模型中评估人源化抗体(抗体A)的功效，其中将人PBMC注射至免疫缺陷型NSG小鼠中以产生移植物抗宿主反应。在移植物植入后最初2周时可检测到大量产生人IgM(hIgM)及IgG(hIgG)。用抗体A以5mg/kg及1mg/kg的剂量处理，在移植物植入后第2周及第3周时显著抑制hIgG及hIgM反应。以5mg/kg的单剂量评估竞争抗体(4D11)且亦显示可消除该反应。在第二研究中，以1mg/kg的单剂量测试所有抗体(抗体A、抗体B及抗体C)且显示在第2周完全抑制IgM及IgG反应(图10)。
实施例6：生物标记物分析
受体上调：CD40L诱导的受体上调可通过流式细胞计数法来测量。可用优化浓度的可溶性CD40L来刺激人全血，且CD20+受体+细胞的总体百分比可通过流式细胞计数法来测量。与评价抗体A及B的短尾猴pk研究平行，测量CD20阳性细胞上CD86表达的百分比变化(图9)。数据显示，在与抗体暴露一致的时间点抑制CD86上调。
靶向蛋白质组学：可使用CD40刺激后全血中蛋白质分泌的增加来作为潜在生物标记物。使用检测MDC/CCL22及若干种其他分泌蛋白的Luminex多重珠粒平台来确立可溶性CD40L的优化浓度及刺激时间。将以全剂量范围的抗-CD40mAb来评价来自人全血的临床样品。
受体占有率：可在基于人全血中B细胞流式细胞计数法分析的体外或离体分析中测定CD40受体占有率。将使用本发明当前候选抗体及非竞争性抗-CD40抗体5C3来量化受体占有率分析。
实施例7：人源化抗-CD40抗体的抗肿瘤活性
在一些情形下，可期望测定本发明的抗体的抗肿瘤特性。所述测定可通过分析人源化抗-CD40抗体在SCID小鼠淋巴瘤异种移植模型中的抗肿瘤活性来实施。所述SCID模型可经癌细胞注射以呈现肿瘤，例如可在开始药物治疗前13天将5x106(百万)个肿瘤细胞皮下注射至SCID小鼠(10只/组)中。每周3次(4mg/kg/剂量)腹膜内给予本发明鼠类抗-CD40抗体或对比抗体(例如，对照或其他人源化抗体)，且给予8次或5次剂量。在小鼠中监测肿瘤的出现及生长且在所选研究阶段期间(例如14天的研究阶段)每周测量肿瘤体积。优选地，结果将显示，在对照小鼠中肿瘤生长为经本发明的抗体治疗的小鼠的2、3、4、5、6、7、8、9、10倍或更多倍。优选地，在治疗阶段中，在经本发明的抗体治疗的小鼠中，肿瘤生长可忽略不计。所述数据可证实，所测试人源化抗体在该B淋巴瘤异种移植模型中可有效抑制肿瘤生长。
实施例8：通过人源化抗-CD40抗体延长存活
人源化抗-CD40抗体对带瘤小鼠(例如上述的那些)的存活的功效可在SCID小鼠淋巴瘤异种移植模型中加以分析。在抗体治疗前3天向SCID小鼠(10只/组)静脉内接种1×106(百万)个肿瘤细胞。然后用本发明的鼠类或人源化抗-CD40抗体或Ig对照治疗小鼠，其为每周两次(4mg/kg/剂量)腹膜内给予，总计5次剂量。然后每天检查小鼠笼中的死亡率以测定抗体延长患有癌症的个体的存活的功效程度。
本文引用各种参考文献，包括专利申请案、专利及科学出版物，所述参考文献的公开内容为全文以引用方式并入本文中。本文中对任何参考文献的引用或表述皆不应视为承认该参考文献可用作本发明的先前技术。
可根据以下段落中的实施方案来阐述本发明优选方面：
段落1.一种人源化单克隆抗体，其中该抗体与人CD40特异性结合，且其在B细胞增殖中具有IC50小于1nM的拮抗活性且在高达100μg/ml的浓度不具有激动作用，且其中该抗体的特征还在于，该抗体在非人灵长类中的活体内半衰期为至少10天。
段落2.如段落1的人源化单克隆抗体，其中该抗体在小于30mg/kg的剂量下在短尾猴中的半衰期大于8天。
段落3.如段落1的抗体，其中该抗体包含选自SEQIDNO:1至SEQIDNO:4中任一者的重链序列及选自SEQIDNO:5至SEQIDNO:8中任一者的轻链序列。
段落4.如段落1的抗体，其中该抗体为人源化抗体或抗体的抗原结合片段，其具有以下中的任一者的重链可变区氨基酸序列：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:42、SEQIDNO:44、SEQIDNO:46、SEQIDNO:48、SEQIDNO:50、SEQIDNO:53、SEQIDNO:57、SEQIDNO:58、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60、SEQIDNO:61、SEQIDNO:62、SEQIDNO:63、SEQIDNO:64、SEQIDNO:65、SEQIDNO:66、SEQIDNO:67、SEQIDNO:68、SEQIDNO:69、SEQIDNO:70、SEQIDNO:71、SEQIDNO:72或SEQIDNO:73。
段落5.如段落1的抗体，其中该抗体为人源化抗体或抗体的抗原结合片段，其包含以下轻链可变域氨基酸序列：SEQIDNO:5至SEQIDNO:8、SEQIDNO:26、SEQIDNO:31、SEQIDNO:36、SEQIDNO:41、SEQIDNO:43、SEQIDNO:45、SEQIDNO:47、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:55、SEQIDNO:56、SEQIDNO:74、SEQIDNO:75或SEQIDNO:76。
段落6.如段落1的单克隆抗体，其中该抗体包含重链及轻链，其中重链CDR1序列选自SEQIDNO:9至SEQIDNO:11，重链CDR2序列选自SEQIDNO:12至SEQIDNO:15，且重链CDR3序列选自SEQIDNO:16至SEQIDNO:17；且其中轻链CDR1序列选自SEQIDNO:18至SEQIDNO:21，轻链CDR2序列为SEQIDNO:22至SEQIDNO:23，且轻链CDR3序列选自SEQIDNO:24至SEQIDNO:25。
段落7.如段落1的单克隆抗体，其中该抗体包含重链CDR1序列SEQIDNO:10、重链CDR2序列SEQIDNO:13及重链CDR3序列SEQIDNO:16，且其中该抗体包含轻链CDR1序列SEQIDNO:19、轻链CDR2序列SEQIDNO:22及轻链CDR3序列SEQIDNO:24。
段落8.如段落1的单克隆抗体，其中该抗体包含重链CDR1序列SEQIDNO:9、重链CDR2序列SEQIDNO:14及重链CDR3序列SEQIDNO:16，且其中该抗体包含轻链CDR1序列SEQIDNO:20、轻链CDR2序列SEQIDNO:22及轻链CDR3序列SEQIDNO:24。
段落9.一种抗-CD40抗体，其包含SEQIDNO:1至4中任一者的重链可变域序列。
段落10.一种抗-CD40抗体，其包含SEQIDNO:5至SEQIDNO:8中任一者的轻链可变域序列。
段落12.一种人源化抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域及轻链可变区：SEQIDNO:27及SEQIDNO:26；SEQIDNO:28及SEQIDNO:26；SEQIDNO:29及SEQIDNO:26；SEQIDNO:30及SEQIDNO:26；SEQIDNO:32及SEQIDNO:31；SEQIDNO:33及SEQIDNO:31；SEQIDNO:34及SEQIDNO:31；SEQIDNO:35及SEQIDNO:31；SEQIDNO:37及SEQIDNO:36；SEQIDNO:38及SEQIDNO:36；SEQIDNO:39及SEQIDNO:36；SEQIDNO:40及SEQIDNO:36。
段落13.一种特异性结合人CD40的分离的抗体或抗原结合片段，其包含人源化重链可变域，该人源化重链可变域包含框架区，该框架区的氨基酸序列与人可变域重链氨基酸序列SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29或SEQIDNO:30中的框架区氨基酸序列至少90%一致；且包含与相应的SEQIDNO:26的轻链可变域至少90%一致的轻链氨基酸序列。
段落14.一种特异性结合人CD40的分离的抗体或抗原结合片段，其包含人源化重链可变域，该人源化重链可变域包含框架区，该框架区的氨基酸序列与人可变域重链氨基酸序列SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34或SEQIDNO:35中的框架区氨基酸序列至少90%一致；且包含与相应的SEQIDNO:31的轻链可变域至少90%一致的轻链氨基酸序列。
段落15.一种特异性结合人CD40的分离的抗体或抗原结合片段，其包含人源化重链可变域，该人源化重链可变域包含框架区，该框架区的氨基酸序列与人可变域重链氨基酸序列SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39或SEQIDNO:40中的框架区氨基酸序列至少90%一致；且包含与相应的SEQIDNO:36的对应轻链至少90%一致的轻链氨基酸序列。
段落16.如段落1的抗体，其中所述抗体在不存在CD40L时不能刺激B细胞产生细胞因子。
段落17.如段落1的抗体，其中所述抗体在50%人血清存在下与人CD40结合，且结合速率降低二倍以下。
段落18.如段落1的抗体，其中该抗体在1mg/kg的浓度抑制哺乳动物中IgM及IgG的产生。
段落19.一种在哺乳动物中阻断人CD40的功能的方法，其包括向该哺乳动物给予包含如段落1的抗体的组合物，该抗体的量足以阻断该哺乳动物中CD40介导的免疫应答。
段落20.一种治疗或改善哺乳动物的移植物抗宿主病的方法，其包括向该哺乳动物给予包含如段落1的抗体的组合物，该抗体的量足以在该动物中减少移植物抗宿主病的一或多个症状。
段落21.如段落20的方法，其中该哺乳动物患有选自以下的自身免疫性或炎性疾病：类风湿性关节炎、多发性硬化、增生性狼疮性肾小球肾炎、炎性肠病(IBD)、牛皮癣、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、节段性回肠炎及全身性红斑狼疮(SLE)、桥本氏甲状腺炎、原发性黏液水肿、甲状腺毒症/格雷夫斯病、恶性贫血、自身免疫性萎缩性胃炎、自身免疫性心炎、艾迪生氏病、过早绝经、I型糖尿病、古德帕斯丘氏综合征、重症肌无力、自身免疫性溶血性贫血、特发性白血球减少症、原发性胆汁性肝硬化、慢性活动性肝炎(HBsAg阴性)、隐源性肝硬化、Sjogren氏综合征、皮肌炎、硬皮症、混合性结缔组织疾病、盘状红斑狼疮及全身性血管炎。
段落22.如段落19的方法，其中该哺乳动物患有类风湿性关节炎。
段落23.如段落20的方法，其还包含给予选自以下的第二治疗药物：TNF拮抗剂、疾病缓解抗风湿药、CTLA4拮抗剂、抗IL-6受体mAb及抗CD20mAb。
段落24.如段落20的方法，其中该炎性疾病或自身免疫性疾病为与表达CD40及CD20二者的细胞有关的炎性疾病或自身免疫性疾病。
段落25.如段落19的方法，其中该抗-CD40抗体为通过肠胃外给予途径来给予。
段落26.如段落19的方法，其中该抗-CD40抗体为以静脉内或皮下方式来给予。
段落27.一种在人患者中抑制B细胞产生抗体的方法，其包括向该人患者给予有效量的如段落1的抗-CD40抗体。
段落28.如段落27的方法，其中该人患者患有与表达CD40的细胞有关的炎性疾病或自身免疫性疾病。
段落29.如段落27的方法，其中该人患者患有选自自身免疫性或炎性疾病的自身免疫性疾病，该自身免疫性或炎性疾病选自：类风湿性关节炎、多发性硬化、增生性狼疮性肾小球肾炎、炎性肠病(IBD)、牛皮癣、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、节段性回肠炎及全身性红斑狼疮(SLE)、桥本氏甲状腺炎、原发性黏液水肿、甲状腺毒症/格雷夫斯病、恶性贫血、自身免疫性萎缩性胃炎、自身免疫性心炎、艾迪生氏病、过早绝经、I型糖尿病、古德帕斯丘氏综合征、重症肌无力、自身免疫性溶血性贫血、特发性白血球减少症、原发性胆汁性肝硬化、慢性活动性肝炎(HBsAg阴性)、隐源性肝硬化、Sjogren氏综合征、皮肌炎、硬皮症、混合性结缔组织疾病、盘状红斑狼疮及全身性血管炎。
段落30.一种抑制表达人CD40抗原的细胞生长的方法，其包括将如段落1的抗体或抗原结合片段给予所述细胞，该抗体或抗原结合片段与人细胞表面CD40抗原特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与该CD40抗原的结合抑制所述细胞的生长或分化。
段落31.一种治疗患有CD40相关的病症的个体的方法，其包括向该个体给予如段落1的抗体或抗原结合片段，该抗体或抗原结合片段与人CD40特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与CD40的结合抑制该CD40相关的病症细胞的生长或分化。
段落32.如段落31的方法，其中该CD40相关的病症中的所述细胞为B淋巴样干细胞、胰细胞、肺细胞、乳房细胞、卵巢细胞、结肠细胞、前列腺细胞、皮肤细胞、头颈细胞、膀胱细胞、骨细胞或肾细胞。
段落33.如段落31的方法，其中该CD40相关的病症为慢性淋巴细胞性白血病、伯基特氏淋巴瘤、多发性骨髓瘤、T细胞淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、霍奇金氏病、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症或卡波西氏肉瘤。
段落34.一种诱导清除外周B细胞的方法，其包括向所述细胞给予如段落1的抗体或抗原结合片段，该抗体或抗原结合片段与人细胞表面CD40抗原特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与该CD40抗原的结合诱导清除所述细胞。
段落35.如段落34的方法，其中将该抗体或抗原结合片段给予患有免疫病症的个体。
段落36.如段落34的方法，其中该免疫病症为类风湿性关节炎或全身性红斑狼疮。
段落37.一种治疗个体的类风湿性关节炎的方法，其包括向该个体给予如段落1的抗体，其中该抗体为在该个体中阻断CD40功能的拮抗性抗体。
段落38.如段落37的方法，其中该抗体以在该个体中有效抑制B细胞分化及抗体同种型转换的量来给予。
段落39.如段落37的方法，其中该抗体以在该个体的T细胞及巨噬细胞中有效抑制细胞因子及趋化因子产生及黏着分子上调的量来给予。
段落40.如段落37的方法，其中该抗体以在该个体中有效抑制树突细胞活化的量来给予。
段落41.如段落37的方法，其中该抗体以在该个体的非免疫细胞中可有效抑制促炎症细胞因子、趋化因子、基质金属蛋白酶、前列腺素的产生及黏着分子的下调的量来给予。
段落42.如段落37的方法，其中该抗体与包含给予甲氨喋呤和/或给予Enbrel/Humira的方案组合给予。
段落43.如段落37的方法，其中该个体为患有类风湿性关节炎且对单独的甲氨喋呤治疗无反应的个体。
段落44.如段落43的方法，其中该方法包括用包含给予甲氨喋呤和/或给予Enbrel/Humira的方案来治疗该个体。
段落45.如段落37的方法，其中用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效优于使用单独的甲氨喋呤、单独的Enbrel、Enbrel+甲氨喋呤的组合来治疗。
段落46.如段落43的方法，其中在对甲氨喋呤无充分反应的患者中用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效优于使用Enbrel+MTX来治疗。
段落47.如段落37的方法，其中该抗体与包含抗TNF药物的方案组合给予。
段落48.如段落37的方法，其中该个体为患有类风湿性关节炎且对使用单独的抗TNF药物的治疗无反应的个体。
段落49.如段落48的方法，其中该方法包括用包含以抗TNF药物以及该拮抗性抗-CD40抗体治疗的方案来治疗该个体。
段落50.如段落37的方法，其中用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效优于用抗TNF药物来治疗。
段落51.如段落48的方法，其中在对单独的抗TNF药物无充分反应的患者中用该拮抗性抗-CD40抗体治疗该个体的功效优于用Orencia或Rituxan来治疗。
段落52.一种药物组合物，其包含：(i)如段落8的抗体或抗原结合片段；及(ii)药学上可接受的赋形剂。
段落53.如段落52的药物组合物，其中该抗体或其抗原结合片段与第二药物缀合。
段落54.如段落52的药物组合物，其中该第二药物为细胞毒性剂、PEG载体、酶或标记物。
段落55.一种分离的多核苷酸，其编码以下中的任一者的重链可变区氨基酸序列：SEQIDNO:1至4、SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:42、SEQIDNO:44、SEQIDNO:46、SEQIDNO:48、SEQIDNO:50、SEQIDNO:53、SEQIDNO:57、SEQIDNO:58、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60、SEQIDNO:61、SEQIDNO:62、SEQIDNO:63、SEQIDNO:64、SEQIDNO:65、SEQIDNO:66、SEQIDNO:67、SEQIDNO:68、SEQIDNO:69、SEQIDNO:70、SEQIDNO:71、SEQIDNO:72或SEQIDNO:73。
段落56.一种分离的多核苷酸，其编码以下中的任一者的轻链可变区氨基酸序列：SEQIDNO:5至SEQIDNO:8、SEQIDNO:26、SEQIDNO:31、SEQIDNO:36、SEQIDNO:41、SEQIDNO:43、SEQIDNO:45、SEQIDNO:47、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:55、SEQIDNO:56、SEQIDNO:74、SEQIDNO:75或SEQIDNO:76。
段落57.如段落1的抗体在制备在哺乳动物中阻断人CD40的功能的药物中的用途，其中该药物在该哺乳动物中阻断CD40介导的免疫应答。
段落58.如段落1的抗体在制备治疗或改善哺乳动物的移植物抗宿主病的药物中的用途。
段落59.如段落58的用途，其中该药物经制备用于治疗选自以下的自身免疫性或炎性疾病：类风湿性关节炎、多发性硬化、增生性狼疮性肾小球肾炎、炎性肠病(IBD)、牛皮癣、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、节段性回肠炎及全身性红斑狼疮(SLE)、桥本氏甲状腺炎、原发性黏液水肿、甲状腺毒症/格雷夫斯病、恶性贫血、自身免疫性萎缩性胃炎、自身免疫性心炎、艾迪生氏病、过早绝经、I型糖尿病、古德帕斯丘氏综合征、重症肌无力、自身免疫性溶血性贫血、特发性白血球减少症、原发性胆汁性肝硬化、慢性活动性肝炎(HBsAg阴性)、隐源性肝硬化、Sjogren氏综合征、皮肌炎、硬皮症、混合性结缔组织疾病、盘状红斑狼疮及全身性血管炎。
段落60.如段落58的用途，其中该药物还包含选自以下的第二治疗药物：TNF拮抗剂、疾病缓解抗风湿药、CTLA4拮抗剂、抗IL-6受体mAb及抗CD20mAb。
段落61.如段落57的用途，其中该药物经制备用于肠胃外给予途径。
段落62.如段落57的用途，其中该药物经制备以供静脉内或皮下使用。
段落63.如段落1的抗体在制备在人患者中抑制B细胞产生抗体的药物中的用途。
段落64.如段落1的抗体在制备抑制表达人CD40抗原的细胞的生长和/或分化的药物中的用途。
段落65.如段落1的抗体在制备治疗患有CD40相关的病症的个体的药物中的用途，其中该药物中该抗体或抗原结合片段与CD40的结合抑制该CD40相关的病症细胞的生长或分化。
段落66.如段落65的用途，其中该药物用于治疗CD40相关的病症中选自以下的细胞：B淋巴样干细胞、胰细胞、肺细胞、乳房细胞、卵巢细胞、结肠细胞、前列腺细胞、皮肤细胞、头颈细胞、膀胱细胞、骨细胞或肾细胞。
段落67.如段落65的用途，其中该药物用于治疗慢性淋巴细胞性白血病、伯基特氏淋巴瘤、多发性骨髓瘤、T细胞淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、霍奇金氏病、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症或卡波西氏肉瘤。
段落68.如段落1的抗体在制备诱导清除外周B细胞的药物中的用途，其中该药物中该抗体或抗原结合片段与人细胞表面CD40抗原特异性结合，其中该抗体或抗原结合片段与该CD40抗原的结合诱导清除所述细胞。
段落69.如段落68的用途，其中该药物用于治疗患有免疫病症的个体。
段落70.如段落68的用途，其中该药物用于治疗类风湿性关节炎或全身性红斑狼疮。
段落71.如段落1的抗体在制备治疗个体的类风湿性关节炎的药物中的用途。
段落72.如段落71的用途，其中该药物用于在该个体中抑制B细胞分化及抗体同种型转换。
段落73.如段落71的用途，其中该药物用于在该个体的T细胞及巨噬细胞中抑制细胞因子及趋化因子产生及黏着分子上调。
段落74.如段落71的用途，其中该药物用于在该个体中抑制树突细胞活化。
段落75.如段落71的用途，其中该药物用于在该个体的非免疫细胞中抑制促炎症细胞因子、趋化因子、基质金属蛋白酶、前列腺素的产生及下调黏着分子。
段落76.如段落71的用途，其中该药物为欲与包含给予甲氨喋呤和/或给予Enbrel/Humira的方案组合给予的组合药物。
段落77.如段落71的用途，其中该药物还包含抗TNF药物。
本文所公开教导内容的应用并不限于本文所述的具体实施方案。实际上，本领域技术人员根据本文所含教导内容及随附实施例能作出各种修改。所述修改意欲含于随附权利要求书的范畴内。

Claims (9)

1.人源化单克隆抗体或抗体片段，其具有分别包含以下氨基酸序列的重链可变域和轻链可变区：SEQIDNO:27和SEQIDNO:26；SEQIDNO:28和SEQIDNO:26；SEQIDNO:29和SEQIDNO:26；SEQIDNO:30和SEQIDNO:26；SEQIDNO:32和SEQIDNO:31；SEQIDNO:33和SEQIDNO:31；SEQIDNO:34和SEQIDNO:31；SEQIDNO:35和SEQIDNO:31。
2.特异性结合人CD40的分离的抗体或抗原结合片段，其包含
人源化重链可变域，该人源化重链可变域包含框架区，该框架区的氨基酸序列与人可变域重链氨基酸序列SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34或SEQIDNO:35中的框架区的氨基酸序列一致，且包含与相应的SEQIDNO:31的轻链可变域一致的轻链氨基酸序列。
3.权利要求1至2中任一项的抗体，其中所述抗体或所述抗体的抗原结合片段特异性结合人CD40，在B细胞增殖中具有IC50小于1nM的拮抗活性且在高达100μg/ml的浓度不具有激动作用，且其中所述抗体或所述抗体的抗原结合片段的特征还在于所述抗体或所述抗体的抗原结合片段在非人灵长类中的活体内半衰期为至少10天；且其中所述抗体或所述抗体的抗原结合片段在小于30mg/kg的剂量于短尾猴中的半衰期任选大于8天。
4.权利要求1-2中任一项的抗体在制备药物中的用途，所述药物用于在哺乳动物中阻断人CD40的功能的方法，所述方法包括向该哺乳动物给予该药物，该药物以足以阻断该哺乳动物中CD40介导的免疫应答的量包含权利要求1-2中任一项的抗体。
5.权利要求1-2中任一项的抗体在制备药物中的用途，所述药物用于治疗或改善哺乳动物的疾病或病症的方法，所述方法包括向该哺乳动物给予该药物，该药物以足以在该哺乳动物中减少所述疾病或病症的一或多个症状的量包含权利要求1-2中任一项的抗体，其中所述疾病或病症选自狼疮性肾炎和类风湿性关节炎。
6.权利要求5的用途，其还包括给予所选择的第二治疗药物。
7.权利要求5的用途，其中所述抗体通过肠胃外途径、静脉内途径或皮下途径给予。
8.药物组合物，其包含(i)权利要求1-3中任一项的抗体；和(ii)药学上可接受的赋形剂；且其中该抗体或其抗原结合片段任选与第二药物缀合。
9.一种分离的多核苷酸，其编码重链可变区氨基酸序列或轻链可变区，其中所述重链可变区氨基酸序列包括以下的任一者：SEQIDNO:27、SEQIDNO:28、SEQIDNO:29、SEQIDNO:30、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35；且轻链可变区氨基酸序列包括以下的任一者：SEQIDNO:26、SEQIDNO:31。
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