TWI837403B - 化學化合物 - Google Patents
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Abstract
本發明關於具有式 (I) 之氮雜喹啉酮化合物,及其在藥物中之用途。
Description
本揭露關於抑制酶的聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)家族的經取代的氮雜喹啉酮化合物及其藥學上可接受的鹽。本揭露還關於這些化合物及其藥學上可接受的鹽,在醫學,例如在治療其中PARP1或PARP1功能的抑制具有治療意義的疾病中之用途。本揭露還關於使用根據本揭露之化合物之治療方法及生產藥物之方法。
酶的PARP家族在許多細胞過程(如複製、重組、染色質重塑和DNA損傷修復)中發揮重要作用(O’Connor MJ,Mol Cell[分子細胞](2015)60(4):547-60)。
在例如WO 2004/080976中教導了PARP抑制劑的實例及其作用機理。
PARP1和PARP2因其在DNA損傷修復中的作用而是被廣泛研究的PARP。PARP1被DNA損傷斷裂激活,並起著催化聚(ADP-核糖)(PAR)鏈添加至靶蛋白的作用。這種翻譯後修飾(稱為PAR基化(PARylation))介導了另外的DNA修復因子募集到DNA損傷中。
完成該募集任務後,PARP自動PAR基化觸發結合的PARP從DNA釋放,從而允許使用其他DNA修復蛋白以完成修復。因此,PARP與受損位點之結合、其催化活性以及最終從DNA釋放都為癌細胞應對化學治療劑和放射療法引起的DNA損傷之重要步驟(Bai P.Biology of poly(ADP-ribose)polymerases:the factotums of cell maintenance[聚(ADP-核糖)聚合酶的生物學:細胞維持之總管].Mol Cell[分子細胞]2015;58:947-58)。
PARP家族酶之抑制已被用作藉由使互補DNA修復途徑失活而選擇性殺傷癌細胞之策略。許多臨床前和臨床研究已經表明,荷BRCA1或BRCA2(參與藉由同源重組(HR)而修復雙股DNA斷裂(DSB)的關鍵腫瘤抑制蛋白)的有害改變的腫瘤細胞對DNA修復酶的PARP家族的小分子抑制劑選擇性敏感。此類腫瘤的同源重組修復(HRR)途徑不足,並且其存活取決於PARP酶之功能。儘管PARP抑制劑療法主要靶向BRCA突變的癌症,但是PARP抑制劑已在非BRCA突變型腫瘤中進行了臨床測試,這些腫瘤表現出同源重組缺陷(HRD)(Turner N,Tutt A,Ashworth A.Hallmarks of 'BRCAness' in sporadic cancers[散發性癌症中'BRCAness'的標誌].Nat Rev Cancer[癌症自然評論]2004;4:814-9)。
據信,與其他臨床PARP1/2抑制劑相比,對PARP1選擇性提高的PARP抑制劑可具有提高的功效和降低的毒性。還據信對PARP1的選擇性強抑制將導致PARP1捕獲在DNA上,這藉由使S期中的複製叉坍塌而導致DNA雙股斷裂(DSB)。還據信PARP1-DNA捕獲係選擇性殺傷具有HRD的腫瘤細胞之有效機制。
因此,對於有效且安全的PARP抑制劑存在未滿足的醫學需求。特別是對PARP1具有選擇性的PARP抑制劑。
申請人發現,本文所述之氮雜喹啉酮令人驚訝地具有PARP抑制活性,因此可用於治療其中PARP功能具有藥理學意義的疾病和病症。此外,本文所述之氮雜喹啉酮對PARP1之選擇性比其他PARP家族成員(如PARP2、PARP3、PARP5a和PARP6)出人意料地高。此外,本文所述之氮雜喹啉酮具有有利的低hERG活性。
其中:X1和X2各自獨立地選自N和C(H),X3獨立地選自N和C(R4),其中R4係H或氟,R1係C1-4烷基或C1-4氟烷基,R2獨立地選自H、鹵素、C1-4烷基、和C1-4氟烷基,並且R3係H或C1-4烷基,或其藥學上可接受的鹽
條件係:當X1係N時,則X2係C(H),並且X3係C(R4),當X2係N時,則X1=C(H),並且X3係C(R4),並且
當X3係N時,則X1和X2均為C(H)。
在一個另外的方面,提供了藥物組成物,該藥物組成物包含治療有效量之具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽,以及至少一種藥學上可接受的稀釋劑、賦形劑或惰性載體。
在一個另外的方面,提供了具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽,用於治療或預防其中PARP1的抑制係有益的疾病和病症。在實施方式中,本說明書提供了具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽,用於在治療癌症中使用。在實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌(例如胃癌和大腸直腸癌)、或肺癌。在實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌或前列腺癌。
在一個另外的方面,提供了治療其中抑制PARP1係有益的疾病或病症之方法,該方法包括向有需要的患者投與有效量之具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽。在一個實施方式中,所述疾病或病症係癌症。在實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌(例如胃癌和大腸直腸癌)、或肺癌。在實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌或前列腺癌。
在一個另外的方面,提供了具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽,用於製備用於治療其中PARP1的抑制係有益的疾病或病症之藥物。在實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌(例如胃癌和大腸直腸癌)、或肺癌。在實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌或前列腺癌。
在一個另外的方面,提供了具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽在製造用於治療其中PARP1的抑制係有益的疾病或病症之藥物中之用途。在
實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌(例如胃癌和大腸直腸癌)、或肺癌。在實施方式中,癌症係乳癌、卵巢癌、胰臟癌或前列腺癌。
在一個另外的方面,提供了具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽,用於在藥物中使用。
在一個另外的方面,具有式I之化合物呈游離鹼形式。
在一個另外的方面,提供了具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽,用作藥物。
在一個另外的方面,提供了本文揭露之實例。
藉由閱讀本說明書,本發明之另外的方面對於本領域技術者而言將是明顯的。
眾所周知,由人類ether-à-gogo相關基因(hERG)編碼的心臟離子通道之阻塞係藥物發現和開發的風險因素。hERG之阻塞會引起安全性問題,例如心律不整。有利地,具有式I之化合物具有低的hERG活性。在一個實施方式中,提供了IC50>10μM的具有式I之化合物。在一個實施方式中,提供了IC50>20μM的具有式I之化合物。
為了使脫靶效應的風險最小化,期望藥物分子具有對特定靶的選擇性。具有式I之化合物有利地具有對PARP1的選擇性超過對於PARP家族的其他
成員(包括PARP2、PARP3、PARP5a和PARP6)。有利地,具有式I之化合物對PARP1具有的選擇性超過PARP2。在一個實施方式中,提供了具有式I之化合物對PARP1的選擇性係PARP2的10倍。在一個實施方式中,提供了具有式I之化合物對PARP1的選擇性係PARP2的100倍。
另一個方面提供了具有式I之化合物在製備藥物中之用途,該藥物用作癌症療法的輔助劑或用於增強腫瘤細胞的用電離輻射或化學治療劑或基於抗體的療法(例如免疫腫瘤學或抗體-藥物偶聯物)的治療。
其他另外的方面提供了藉由抑制PARP1而改善的疾病的治療(包括向需要治療的受試者投與治療有效量之具有式I之化合物,較佳的是以藥物組成物的形式)、以及癌症的治療(包括向需要治療的受試者投與治療有效量之具有式I之化合物,較佳的是以藥物組成物的形式,與電離輻射或化學治療劑同時或依次投與)。
在另外的方面,具有式I之化合物可用於製備用於治療缺乏同源重組(HR)依賴性DNA DSB修復活性的癌症的藥物、或用於治療缺乏HR依賴性DNA DSB修復活性的癌症的患者(包括向所述患者投與治療有效量之該化合物)。
HR依賴性DNA DSB修復途徑經由同源機制修復DNA中的雙股斷裂(DSB),以重建連續的DNA螺旋(K.K.Khanna和S.P.Jackson,Nat.Genet.[自然遺傳學]27(3):247-254(2001))。HR依賴性DNA DSB修復途徑的組分包括但不限於ATM(NM_000051)、RAD51(NM_002875)、RAD51L1(NM_002877)、RAD51C(NM_002876)、RAD51L3(NM_002878)、DMC1(NM_007068)、XRCC2(NM_005431)、XRCC3(NM_005432)、RAD52(NM_002879)、RAD54L(NM_003579)、RAD54B(NM_012415)、BRCA1
(NM_007295)、BRCA2(NM_000059)、RAD50(NM_005732)、MRE11A(NM_005590)和NBS1(NM_002485)。HR依賴性DNA DSB修復途徑中關於的其他蛋白質包括調節因子例如EMSY(Hughes-Davies等人,Cell[細胞], 115,第523-535頁)。HR組分也描述於Wood等人,Science[科學], 291,1284-1289(2001)中。
缺乏HR依賴性DNA DSB修復的癌症可以包含一種或多種癌細胞、或由其組成,這些癌細胞相對於正常細胞具有降低的或消除的藉由該途徑修復DNA DSB之能力,即HR依賴性DNA DSB修復途徑的活性可在一種或多種癌細胞中降低或消除。
HR依賴性DNA DSB修復途徑的一種或多種組分的活性可以在患有缺乏HR依賴性DNA DSB修復的癌症的個體的一種或多種癌細胞中消除。HR依賴性DNA DSB修復途徑的組分在本領域中是充分表徵的(參見例如,Wood等人,Science[科學], 291,1284-1289(2001))並且包括以上列出的組分。
在一些實施方式中,癌細胞可具有BRCA1和/或BRCA2缺陷表現型,即在癌細胞中BRCA1和/或BRCA2活性被降低或消除。具有這種表現型之癌細胞可以缺乏BRCA1和/或BRCA2,即BRCA1和/或BRCA2之表現和/或活性可以在癌細胞中降低或消除,例如藉由編碼核酸中的突變或多態性之方式,或藉由編碼調節因子的基因(例如編碼BRCA2調節因子的EMSY基因)中的擴增、突變或多態性之方式(Hughes-Davies等人,Cell[細胞], 115,523-535)。
BRCA1和BRCA2係已知的腫瘤抑制因子,其野生型對偶基因在雜合子攜帶者的腫瘤中經常丟失(Jasin M.,Oncogene[癌基因], 21(58),8981-93
(2002);Tutt等人,Trends Mol Med.[分子醫學趨勢], 8(12),571-6,(2002))。BRCA1和/或BRCA2突變與乳癌的關聯在本領域中是充分表徵的(Radice,P.J.,Exp Clin Cancer Res.[實驗與臨床癌症研究], 21(3增刊),9-12(2002))。還已知編碼BRCA2結合因子的EMSY基因的擴增與乳癌和卵巢癌有關。BRCA1和/或BRCA2中突變的攜帶者罹患某些癌症(包括乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌和肺癌)的風險也較高。
在一些實施方式中,個體對於BRCA1和/或BRCA2或其調節劑中的一個或多個變異(例如突變和多態性)係雜合的。對BRCA1和BRCA2的變異之檢測係本領域眾所周知的,並且例如描述於EP 699 754,EP 705 903,Neuhausen,S.L.和Ostrander,E.A.,Genet.Test[基因檢測], 1,75-83(1992);Chappnis,P.O.和Foulkes,W.O.,Cancer Treat Res[癌症治療研究],107,29-59(2002);Janatova M.等人,Neoplasma[贅生物],50(4),246-505(2003);Jancarkova,N.,Ceska Gynekol., 68{1),11-6(2003)中。BRCA2結合因子EMSY的擴增的確定描述於Hughes-Davies等人,Cell[細胞],115,523-535中。
與癌症相關的突變和多態性可以藉由檢測變異體核酸序列的存在而在核酸水平上檢測,或者藉由檢測變異體(即突變異體或對偶基因變異體)多肽的存在而在蛋白質水平上檢測。
烷基基團和部分係直鏈的或支鏈的,例如C1-8烷基、C1-6烷基、C1-4烷基或C5-6烷基。烷基基團的實例係甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、三級丁基、正戊基、正己基、正庚基以及正辛基,如甲基或正己基。
氟烷基基團係其中一個或多個H原子被一個或多個氟原子替換的烷基基團,例如C1-8氟烷基、C1-6氟烷基、C1-4氟烷基或C5-6氟烷基。實例包括氟
甲基(CH2F-)、二氟甲基(CHF2-)、三氟甲基(CF3-)、2,2,2-三氟乙基(CF3CH2-)、1,1-二氟乙基(CH3CHF2-)、2,2-二氟乙基(CHF2CH2-)、和2-氟乙基(CH2FCH2-)。
鹵素意指氟、氯、溴、和碘。在一個實施方式中,鹵素係氟或氯。
在本說明書中,除非另外說明,否則如在此使用的術語「藥學上可接受的」係指在合理醫學判斷範圍內,適合用於與人類和動物組織接觸使用而沒有過多的毒性、刺激、過敏反應或其他問題或併發症(與合理的益處/風險比相稱)的那些化合物、材料、組成物和/或劑型。
在本說明書中,除非另外說明,否則短語「有效量」意指一種化合物或組成物足夠顯著地並且有利地改變所治療的症狀和/或病症(例如,提供陽性臨床反應)的量。用於藥物組成物中的活性成分的有效量將隨所治療的具體病症、病症的嚴重程度、治療的持續時間、同步治療的性質、所利用的一種或多種具體活性成分、所利用的一種或多種具體藥學上可接受的賦形劑/載體、以及處於主治醫生的知識和專業知識範圍內的類似因素而變化。
除非另有指示,否則如本文使用的術語「治療」係指逆轉、緩解或預防此術語所適用的障礙或病症或者此障礙或病症的一個或多個症狀,抑制其進展,延遲其進展,延遲其發作。除非另有指示,如本文使用的術語「治療」係指按照如上所定義的「治療」進行治療之行為。術語「治療」還包括受試者的輔助治療和新輔助治療。為免存疑,本文提及的「治療」包括提及治癒性、姑息性和預防性治療以及用於這種治療之藥物的投與。
具有式I之化合物可以形成穩定的藥學上可接受的酸或鹼的鹽,並且在此類情況下投與作為鹽的化合物可能是適當的。酸加成鹽的實例包括乙酸鹽、己二酸鹽、抗壞血酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽、碳酸氫鹽、硫酸氫鹽、丁酸鹽、樟腦酸鹽、樟腦磺酸鹽、膽鹼、檸檬酸鹽、環己基胺基磺酸鹽、二伸乙
基二胺、乙磺酸鹽、延胡索酸鹽、麩胺酸鹽、乙醇酸鹽、半硫酸鹽、2-羥乙基磺酸鹽、庚酸鹽、己酸鹽、鹽酸鹽、氫溴酸鹽、氫碘酸鹽、羥基馬來酸鹽、乳酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、甲磺酸鹽、葡甲胺、2-萘磺酸鹽、硝酸鹽、草酸鹽、雙羥萘酸鹽、過硫酸鹽、苯乙酸鹽、磷酸鹽、磷酸氫鹽、苦味酸鹽、新戊酸鹽、丙酸鹽、奎尼酸鹽、柳酸鹽、硬脂酸鹽、琥珀酸鹽、胺基磺酸鹽、胺基苯磺酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽(對甲苯磺酸鹽)、三氟乙酸鹽、以及十一烷酸鹽。儘管其他的鹽可以用於如分離或純化產物中,但是無毒的生理學上可接受的鹽係較佳的。
這些鹽可以藉由常規手段來形成,例如藉由在溶劑或介質中(這種鹽在該溶劑或介質中不溶)或在一種溶劑(例如在真空中除去水的溶劑)中使該產物的游離鹼形式與一種或多種適當的酸的等效物反應,或藉由冷凍乾燥,或在適合的離子交換樹脂上藉由將一種現存的鹽的陰離子交換為另一種陰離子。
具有式I之化合物可以具有超過一個手性中心,並且應理解該申請涵蓋所有個體立體異構物、鏡像異構物和非鏡像異構物及其混合物。因而,應當理解的是,在具有式I之化合物可憑藉一個或多個不對稱碳原子而以光學活性形式或外消旋形式存在的情況下,本申請包括了在其定義中任何這類具有上述活性的光學活性形式或外消旋形式。本申請涵蓋了所有這類具有此處定義的活性的立體異構物。
因此,貫穿本說明書,提及具有式I之化合物時,應理解該術語化合物包括作為PARP1抑制劑的非鏡像異構物、非鏡像異構物的混合物以及鏡像異構物。
還應理解的是某些具有式I之化合物及其藥用鹽能以溶劑化連同非溶劑化形式(例如像,水合形式和無水形式)存在。應當理解的是,在此的化合物涵蓋了所有這類溶劑化的形式。為了清楚起見,這包括化合物游離形式的溶劑化(例如,含水的)的形式以及化合物的鹽的溶劑化(例如,含水的)的形式二者。
如本文所述之式I旨在涵蓋其組成原子的所有同位素。例如,H(或氫)包括氫的任何同位素形式,包括1H、2H(D)、以及3H(T);C包括碳的任何同位素形式,包括12C、13C、以及14C;O包括氧的任何同位素形式,包括16O、17O、以及18O;N包括氮的任何同位素形式,包括13N、14N、以及15N;F包括氟的任何同位素形式,包括19F以及18F;等等。在一個方面,具有式I之化合物包括此處涵蓋的原子的同位素,其量對應於它們天然存在的豐度。然而,在某些情況下,可能希望的是富集處於一種正常情況下會以較低豐度存在的具體同位素中的一種或多種原子。例如,正常情況下1H以大於99.98%之豐度存在;然而,在一個方面,具有在此提出的任何化學式的化合物可以在H存在的一個或多個位置處富集2H或3H。在另一個方面中,當具有在此提出的任何化學式的化合物富集一種放射性同位素(例如,3H以及14C)時,該化合物可以用於藥物和/或底物組織分佈測定。應當理解的是,本申請涵蓋了所有這類同位素形式。
具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽通常會經由口服途徑以如下藥物製劑形式投與,這些藥物製劑包含活性成分或其藥學上可接受的鹽或溶劑化物、或這樣的鹽的溶劑化物,呈藥學上可接受的劑型。取決於待治療的障礙和患者,組成物可以按不同劑量投與。
以上所述之具有式I之化合物的藥物配製物可被製備用於口服投與,具體地呈片劑或膠囊形式,並且尤其關於目的在於提供靶向結腸的藥物釋
放的技術(Patel,M.M.Expert Opin.Drug Deliv.[關於藥物遞送的專家意見]2011,8(10),1247-1258)。
上以上所述之具有式I之化合物的藥物配製物可以方便地以單位劑型投與,並且可以藉由製藥領域中熟知的任何方法,例如如Remington's Pharmaceutical Sciences[雷明頓藥物科學],第17版,Mack Publishing Company,Easton,PA.[馬克出版公司,伊斯頓,賓夕法尼亞州],(1985)中所述之製備。
適於口服投與的藥物配製物可以包含一種或多種生理上可相容的載體和/或賦形劑,並且可以是呈固體或液體的形式。片劑和膠囊可以用黏合劑、填充劑、潤滑劑和/或表面活性劑(如十二烷基硫酸鈉)製備。液體組成物可以含有常規添加劑,如懸浮劑、乳化劑和/或防腐劑。液體組成物可以包封在例如明膠中以提供單位劑型。固體口服劑型包括片劑、兩件式硬殼膠囊和軟彈性明膠(SEG)膠囊。這種兩件式硬殼膠囊可以例如藉由將具有式(I)之化合物填充到明膠或羥丙基甲基纖維素(HPMC)殼中來製備。
乾殼配製物典型地包含約40%至60% w/w濃度的明膠、約20%至30%濃度的可塑劑(如甘油、山梨糖醇或丙二醇)和約30%至40%濃度的水。也可以存在其他材料,如防腐劑、染料、遮光劑和調味劑。液體填充材料包括已經溶解、增溶或分散(使用懸浮劑進行,如蜂蠟、氫化蓖麻油或聚乙二醇4000)的固體藥物或在一種媒介物或多種媒介物(如礦物油、植物油、甘油三酯、二醇、多元醇和表面活性試劑)的組合中的液體藥物。
在治療性治療人類時,具有式I之化合物或其藥學上可接受的鹽之合適的每日劑量係約0.0001-100mg/kg體重。
口服配製物係較佳的,特別是片劑或膠囊,其可以藉由本領域技術者已知的方法配製,以提供0.1mg至1000mg範圍內的活性化合物的劑量。
現在將藉由參考以下非限制性實例來進一步解釋本申請的化合物。
除非另有說明,否則使用Bruker 300MHz、400MHz或500MHz光譜儀,在27℃下獲得1H NMR光譜;化學位移以百萬分率(ppm,δ單位)表示,並參考溶劑的殘留單1H同位素體(CHCl3:7.24ppm;CHDCl2:5.32ppm;CD3S(=O)CD2H:2.49ppm)。耦合常數係以赫茲(Hz)為單位給出。分裂模式描述了明顯的多重性,並被指定為s(單峰)、d(雙峰)、t(三重峰)、q(四重奏)、m(多峰)和brs(寬峰)。LC-MS使用裝有Waters SQD質譜儀的Waters UPLC或裝有Shimadzu 2020質譜儀的Shimadzu LC-20AD LC-20XR LC-30AD進行。除非另有說明,否則報告的分子離子對應於[M+H]+;對於具有多個同位素模式的分子(Br、Cl等),除非另有說明,否則報告的值是對於最低同位素質量獲得的值。
使用以下進行快速層析法:在來自BiotageTM的SP1TM純化系統上、來自ISCO的CombiFlash®Rf或在來自賽默飛世爾公司(Thermo Fisher)的Gilson上,使用正相二氧化矽FLASH+TM(40M、25M或12M)或SNAPTM KP-Sil筒(340、100、50或10)、來自Agela的快速柱矽膠-CS柱,使用C18-快速柱的
直相快速層析法,或使用標準快速層析法。通常,所有使用的溶劑均為可商購的並且為分析級的。無水溶劑常規用於反應。在這些實例中使用的相分離器係ISOLUTE®相分離柱。使用來自先進化學發展股份有限公司(Advanced Chemistry Development,Inc.)(ACD/實驗室)的ACD/名稱12.01來命名以下命名的中間體和實例。起始材料係從商業來源獲得的或藉由文獻路線製備的。
XRPD分析使用Bruker D8繞射儀進行,該繞射儀可商購自布魯克AXS公司(Bruker AXS IncTM)(麥迪森,威斯康辛州)。該XRPD光譜藉由將用於分析的材料樣本(約10mg)安裝在單矽晶體晶片支架上(例如,布魯克矽零背景X射線繞射樣本架)並且借助於顯微鏡載片將該樣本鋪展成薄層獲得。將該樣本以30轉/分鐘旋轉(以改善計數統計)並且用由在40kV和40mA下操作的銅製長細聚焦管產生的具有1.5406埃(即,約1.54埃)的波長之X射線來照射。以θ-θ模式中在從5°至40°的2-θ的範圍內,使樣本每0.02°的2-θ增量(連續掃描模式)暴露1秒。D8的執行時間為15min。
XRPD 2θ值可在合理範圍內變化,例如在±0.2°的範圍內變化,並且當由於各種各樣原因(包括例如較佳的方向)對基本上相同的晶體形式進行測量時XRPD強度可能變化。XRPD的原理被描述於出版物中,例如Giacovazzo,C.等人(1995)Fundamentals of Crystallography[晶體的基本原理],Oxford University Press[牛津大學出版社];Jenkins,R.和Snyder,R.L.(1996)Introduction to X-Ray Powder Diffractometry[X射線粉末繞射的介紹],John Wiley & Sons[約翰威利父子公司],紐約;Klug,H.P.和Alexander,L.E.(1974)X-ray Diffraction Procedures[X射線繞射程序],,John Wiley & Sons[約翰威利父子公司],紐約。
對於根據標準方法製備的樣本,使用可獲得自TA INSTRUMENTS®(紐卡斯爾,德拉瓦州)的Q SERIESTM Q1000 DSC熱量計進行DSC分析。將樣本(大約2mg)稱量到鋁樣本盤中並且轉移到該DSC中。將該儀器用氮氣以50mL/min吹掃並且使用10℃/分鐘的動態加熱速率收集在22℃與300℃之間的數據。將熱數據使用標準軟體(例如,來自TA INSTRUMENTS®的通用v.4.5A)進行分析。
使用了以下縮寫:AcOH=乙酸;aq=水性;BAST=雙(2-甲氧基乙基)胺基三氟化硫;Boc2O=二碳酸二三級丁酯;Boc=三級丁氧基羰基;CDCl3=氘代氯仿;CD3OD=氘代甲醇;CH3NO2=硝基甲烷;DCE=1,2-二氯乙烷;DCM=二氯甲烷;DEA=二乙胺;DEAD=偶氮二甲酸二乙酯;戴斯-馬丁高碘烷=1,1,1-三(乙醯基氧基)-1,1-二氫-1,2-苯碘醯-3-(1H)-酮;DIPEA=N,N-二異丙基乙胺;DMAP=2,6-二甲基胺基吡啶;DMF=N,N-二甲基甲醯胺;DMSO=二甲基亞碸;DMSO-d6=氘代二甲亞碸;DPPA=疊氮磷酸二苯酯;dppf=1,1'-雙(聯苯基膦基)二茂鐵;DIAD=二-異丙基(E)-二氮烯-1,2-二甲酸酯;DSC=差示掃描量熱法;DTAD=二-三級丁基(E)-二氮烯-1,2-二甲酸酯;ee=鏡像異構物過量;eq.=當量;ESI=電灑電離;Et2O=二乙醚;EtOAc或EA=乙酸乙酯;EtOH=乙醇;FA=甲酸;格拉布斯(Grubbs)催化劑(1,3-二三甲苯基咪唑啉-2-亞基)(三環己基膦)二氯化釕;h=小時;HATU=(二甲基胺基)-N,N-二甲基(3-氧化-1H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶基)甲亞胺離子六氟磷酸鹽;HCl=鹽酸;H2O2=過氧化氫;HP=高壓;IPA=異丙醇;LC=液相層析;LiClO4=過氯酸鋰;Mmol=毫莫耳;mCPBA=間氯過氧苯甲酸;MeOH=甲醇;min=分鐘;MeCN或CH3CN=乙腈;MeNO2=硝基甲烷;MS=質譜;NMP=N-甲基-2-吡咯啶酮;NMR=核磁共振;Pd/C=鈀碳;Pd2dba3=三(二苯亞甲基丙酮)二鈀(0);
PdCl2(dppf)=1,1'-雙(二-三級丁基膦基)二茂鐵二氯化鈀;PE=石油醚;PPh3=三苯基膦;rt=室溫;Rt或RT=保留時間;Ruphos Pd G3=(2-二環己基膦基-2',6'-二異丙氧基-1,1'-聯苯基)[2-(2'-胺基-1,1'聯苯基)]鈀(II)甲磺酸酯;sat=飽和的;SFC=超臨界流體層析法;T3P=2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧雜三磷雜環己烷2,4,6-三氧化物;TBTU=2-(1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基異脲鎓四氟硼酸鹽;TFA=三氟乙酸;THF=四氫呋喃;TLC=薄層層析法;TMS=三甲基矽基;Xantphos=4,5-雙(聯苯基膦基)-9,9-二甲基;CBr4=四溴化碳;HCl=鹽酸;HBr=氫溴酸;Cs2CO3=碳酸銫;MgSO4=硫酸鎂;NaHCO3=碳酸氫鈉;DDQ=2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌;SOCl2=亞硫醯氯;DIBAL-H=氫化二異丁基鋁;NH4HCO3=碳酸氫銨;BINAP=2,2'-雙(聯苯基膦基)-1,1'-聯萘基。
在0℃下,將丁醯氯(0.143mL,1.37mmol)滴加至4-胺基-6-溴-吡啶-3-甲醛(中間體1 250mg,1.24mmol)、DIPEA(1.086mL,6.22mmol)和DMAP(30.4mg,0.25mmol)在CH2Cl2(5mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在rt下攪拌4h。添加超過2eq之丁醯氯並將反應繼續另外的24h。將反應用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將有機層經硫酸鈉乾燥並濃縮以給出粗產物。添
加1.5mL MeOH並將固體(產物)過濾出,用1mL MeOH洗滌以給出呈白色固體的7-溴-3-乙基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體2,167mg,53.1%)。
1H NMR(DMSO-d6)1.17(3H,t),2.45-2.50(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),7.35(1H,s),7.82(1H,s),8.63(1H,s),12.09(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=252
將PdCl2(dppf)(37.6mg,0.05mmol)添加至7-溴-3-乙基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體2,130mg,0.51mmol)、4,4,5,5-四甲基-2-乙烯基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷(0.105mL,0.62mmol)和K2CO3(213mg,1.54mmol)在1,4-二(4mL)/水(1.333mL)中的攪拌混合物中,並將所得混合物在90℃下攪拌1h。將該反應混合物用水稀釋,並且用乙酸乙酯萃取。將有機層合併,經硫酸鈉乾燥並濃縮以給出粗產物。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至20% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈黃色固體的3-乙基-7-乙烯基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體3,93mg,90%)。
1H NMR(DMSO-d6)1.18(3H,t),2.53(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),5.49(1H,dd),6.27(1H,dd),6.84(1H,dd),7.15(1H,s),7.81(1H,s),8.78(1H,s),12.00(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=201
將在H2O中的四氧化鋨(0.024mL,3.00μmol)添加至3-乙基-7-乙烯基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體3,30mg,0.15mmol)、2,6-二甲基吡啶(0.035mL,0.30mmol)和過碘酸鈉(128mg,0.60mmol)在THF(1mL)/水(0.200mL)中的溶液中並在rt下攪拌過夜。將反應用水稀釋並用乙酸乙酯萃取並將濾液濃縮至乾燥。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的
0%至15% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈淡黃色泡沫的3-乙基-2-側氧基-1H-1,6-啶-7-甲醛(中間體4,24.00mg,79%)。
1H NMR(DMSO-d6)1.20(3H,t),2.55-2.62(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),7.73(1H,s),7.95(1H,s),9.03(1H,s),10.00(1H,s),12.32(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=203
在0℃下,將硼氫化鈉(61.4mg,1.62mmol)緩慢添加至3-乙基-2-側氧基-1H-1,6-啶-7-甲醛(中間體4,82mg,0.41mmol)在甲醇(2mL)中的攪拌溶液中,並將所得混合物在室溫下攪拌1h。在真空下除去甲醇並將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至35% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈淺黃色固體的3-乙基-7-(羥基甲基)-1H-1,6-啶-2-酮(中間體5,68.0mg,82%)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.18(3H,t),2.52-2.55(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),4.59(2H,br s),5.52(1H,br s),7.33(1H,s),7.80(1H,s),8.71(1H,s),12.01(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=205
在0℃下,將CBr4(928mg,2.80mmol)添加至3-乙基-7-(羥基甲基)-1H-1,6-啶-2-酮(中間體5,381mg,1.87mmol)和三苯膦(734mg,2.80mmol)在CH2Cl2(18.656ml)中的攪拌溶液中,並將所得溶液在0℃下攪拌2小時。將反應濃縮,並將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至15% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈白色固體的7-(溴甲基)-3-乙基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體6,386mg,77%)(含有三苯基膦氧化物,難於分離)。將此化合物未經進一步純化用於下一步驟。
m/z(ES+)[M]+=267
在20℃下,將DIPEA(0.059mL,0.34mmol)添加至7-(溴甲基)-3-乙基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體6,30mg,0.11mmol)和N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體13,42.8mg,0.15mmol)在乙腈(1mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在70℃下攪拌2小時。將溶劑在真空下除去並將所得粗材料藉由逆相層析法(RediSep Rf Gold® C18,水中0%至90%乙腈,0.1% NH4OH作為添加劑)進行進一步純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈淺黃色固體的5-[4-[(3-乙基-2-側氧基-1H-1,6-啶-7-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例1,23.60mg,51.7%)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.18(3H,br t),2.54(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),2.67(4H,br s),2.79(3H,br d),3.38(4H,br s),3.75(2H,br s),7.34(1H,s),7.42(1H,br dd),7.77-7.88(2H,m),8.29(1H,br d),8.40(1H,br d),8.75(1H,s),11.60-12.11(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=407
在20℃下,將DIPEA(0.082mL,0.47mmol)添加至7-(溴甲基)-3-乙基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體6,25mg,0.09mmol)和6-氟-N-甲基-5-哌-1-
基-吡啶-2-甲醯胺HCl(中間體23,28.3mg,0.10mmol)在乙腈(2mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在70℃下攪拌2小時。將溶劑在真空下除去。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至20% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈淺黃色固體的5-[4-[(3-乙基-2-側氧基-1H-1,6-啶-7-基)甲基]哌-1-基]-6-氟-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例2,17.00mg,42.8%)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.18(3H,t),2.52-2.55(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),2.64(4H,br s),2.77(3H,d),3.20(4H,br s),3.70(2H,s),7.32(1H,s),7.59(1H,dd),7.80(1H,s),7.86(1H,d),8.31-8.49(1H,m),8.73(1H,s),11.93(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=425
在20℃下,將DIPEA(0.082mL,0.47mmol)添加至7-(溴甲基)-3-乙基-1H-1,6-啶-2-酮(中間體6,25mg,0.09mmol)和6-氯-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體47,33.7mg,0.10mmol)在乙腈(2mL)中的攪拌溶液中,並將所得溶液在70℃下攪拌2小時。將溶劑在真空下除去。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至20% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈白色固體的6-氯-5-[4-[(3-乙基-2-側氧基-1H-1,6-啶-7-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例3,19.20mg,46.5%)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.18(3H,t),2.53(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),2.66(4H,br s),2.80(3H,d),3.15(4H,br s),3.72(2H,s),7.33(1H,s),7.68(1H,d),7.81(1H,s),7.95(1H,d),8.43(1H,br d),8.74(1H,s),11.93(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=441。
將乙基6-甲基-5-硝基-吡啶-3-甲酸酯(中間體7,10g,47.58mmol)和二氧化硒(7.92g,71.36mmol)在1,4-二(50mL)中的混合物在110℃下攪拌20h。將反應混合物冷卻至室溫,通過矽藻土墊過濾並將矽藻土用乙酸乙酯洗滌。將合併的濾液濃縮,並將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至70%乙酸乙酯)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈棕色油狀物的乙基6-甲醯基-5-硝基-吡啶-3-甲酸酯(中間體8,9.70g,91%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.48(3H,t),4.54(2H,q),8.81(1H,d),9.51(1H,d),10.32(1H,s);m/z(ES+)[M]+=224。
在0℃下用加料漏斗向氫化鈉(9.63g,240.89mmol)(60%,在礦物油中)在無水THF(100mL)中的攪拌溶液中滴加乙基2-(二乙氧基磷醯基)丁酸酯(60.8g,240.89mmol)以給出灰色的混合物。將所得混合物在0℃下攪拌10min並經10分鐘加溫至室溫並在40℃下攪拌持續5分鐘。將反應混合物冷卻
至-78℃,並然後向該冷卻的反應混合物中緩慢添加乙基6-甲醯基-5-硝基-吡啶-3-甲酸酯(中間體8,22.5g,100.37mmol)在100ml THF中的溶液。將混合物用飽和NH4Cl溶液淬滅,用乙酸乙酯萃取。將合併的有機層經Na2SO4乾燥,過濾並濃縮以給出粗產物。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至50%乙酸乙酯)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈黃色油狀物的乙基6-[(E)-2-乙氧基羰基丁-1-烯基]-5-硝基-吡啶-3-甲酸酯(中間體9,24.30g,75%)(E/Z異構物的1:1混合物)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.13(3H,t),1.18(3H,t),1.23(3H,t),1.37(3H,t),1.45(6H,q),2.57(2H,qd),2.66(2H,q),4.11-4.24(2H,m),4.32(2H,q),4.45-4.56(4H,m),7.08(1H,s),7.85(1H,s),8.86(2H,dd),9.26(1H,d),9.43(1H,d);m/z(ES+)[M]+=322
將乙基6-[(E)-2-乙氧基羰基丁-1-烯基]-5-硝基-吡啶-3-甲酸酯(E/Z異構物的1:1混合物)(中間體9,3.75g,11.63mmol)、Pd/C(1.857g,1.75mmol)(10%)在乙醇(30mL)中的混合物脫氣,用H2(氣囊)充滿,並將反應在室溫下在H2氣氛攪拌過夜。將混合物通過矽藻土床過濾並將矽藻土床用乙醇洗滌。濃縮後,將在二(15ml)中的4M HCl添加至將所得殘餘物並將混合物在室溫下攪拌30min。將混合物用乙醚稀釋並將固體過濾出,用二乙醚洗滌,並在真空下乾燥以得到呈白色固體的乙基7-乙基-6-側氧基-7,8-二氫-5H-1,5-啶-3-甲酸酯(中間體10,2.260g,78%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)0.94(3H,t),1.33(3H,t),1.41-1.51(1H,m),1.69-1.81(1H,m),2.41-2.48(1H,m),2.94(1H,dd),3.20(1H,dd),4.35(2H,t),7.67(1H,d),8.61(1H,d),10.32(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=249。
將乙基7-乙基-6-側氧基-7,8-二氫-5H-1,5-啶-3-甲酸酯(中間體10,2.26g,9.10mmol)溶解於1,4-二(40mL)中,添加DDQ(2.273g,10.01mmol)並將混合物在回流下攪拌3h。在減壓下除去溶劑,添加飽和NaHCO3溶液並將殘餘物在室溫下攪拌1hr。將固體過濾出,用水隨後10ml二乙醚洗滌。將所得固體在真空下乾燥得到呈淡棕色固體的乙基7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-甲酸酯(中間體11,1.738g,78%)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.14-1.28(3H,m),1.35(3H,t),2.58(2H,q),4.38(2H,q),7.83(1H,s),8.17(1H,s),8.90(1H,s),12.05(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=247。
在0℃下經45分鐘的時間段在氮下,將氫化鋁鋰(2M,在THF(29.2mL,58.47mmol)中)滴加至在四氫呋喃(150mL)中的乙基7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-甲酸酯(中間體11,7.2g,29.24mmol)中。將所得混合物在0℃下攪拌1.5小時。將反應混合物藉由滴加1M aq HCl(29mL)淬滅。將反應混合物濃縮並將固體用水(約150ml)和29ml 1M HCl溶液稀釋給出黃色懸浮液。藉由過濾收集固體,用水、二乙醚洗滌並乾燥以產生呈黃色固體的粗產物(被一些無機鹽污染)。將此固體懸浮於甲醇和DCM的混合物(2:1)(400ml)中並加熱至回流。將固體濾出。將此固體重懸於甲醇/DCM混合物中並重複此程序5次以從此混合物中除去大部分產物。然後將合併的濾液濃縮直至約100ml,並將固體藉由過濾收集,用乙醚洗滌,在真空下乾燥以產生呈黃色固體的3-乙基-7-(羥基甲基)-1H-1,5-啶-2-酮(中間體12,4.35g,72.8%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.18(3H,t),2.52-2.56(2H,m),4.61(2H,d),5.44(1H,t),7.61(1H,s),7.74(1H,s),8.37(1H,s),11.87(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=205.3
在0℃下,將亞硫醯氯(6.41mL,88.14mmol)滴加至3-乙基-7-(羥基甲基)-1,5-啶-2(1H)-酮(中間體12,3g,14.69mmol)和N,N-二甲基甲醯胺(0.114mL,1.47mmol)在CH2Cl2(60mL)中的懸浮液中並將所得溶液在室溫下攪拌6小時。將混合物濃縮至乾燥以給出粗製7-(氯甲基)-3-乙基-1H-1,5-啶-2-酮(中間體17)。
在20℃下,將DIPEA(12.83mL,73.45mmol)添加至7-(氯甲基)-3-乙基-1H-1,5-啶-2-酮(中間體17,粗製,來自以上)、碘化鉀(0.488g,2.94mmol)和N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體13,4.31g,14.69mmol)在乙腈(50.00mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在80℃下攪拌2小時。將溶劑在真空下除去。將粗材料用水稀釋,用NaHCO3水溶液鹼化,並用乙酸乙酯萃取。將有機層經硫酸鈉乾燥並濃縮以給出粗產物。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至15% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈灰白色部分結晶固體的5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例4,3.93g,65.8%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,t),2.53-2.59(6H,m),2.79(3H,d),3.33-3.39(4H,m),3.66(2H,s),7.39(1H,dd),7.64(1H,s),7.76(1H,s),7.83(1H,d),8.27(1H,d),8.36-8.40(1H,m),8.41(1H,d),11.85(1H,s);m/z(ES+)[M]+=406。
在0℃下,將CBr4(219mg,0.66mmol)添加至3-乙基-7-(羥基甲基)-1H-1,5-啶-2-酮(中間體12,90mg,0.44mmol)和三苯膦(173mg,0.66mmol)在CH2Cl2(4mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在0℃下攪拌2小時。將反應在真空下濃縮並將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至15% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到7-(溴甲基)-3-乙基-1H-1,5-啶-2-酮(中間體14,84mg,71.4%)(含有三苯基膦氧化物,難於分離)。將此化合物未經進一步純化用於下一步驟。
m/z(ES+)[M]+=267
在20℃下,將DIPEA(0.082mL,0.47mmol)添加至7-(溴甲基)-3-乙基-1H-1,5-啶-2-酮(中間體14,25mg,0.09mmol)和6-氟-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體23,32.0mg,0.10mmol)在乙腈(2mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在70℃下攪拌2小時。將溶劑在真空下除去。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至20% MeOH)進行純
化。將產物級分在減壓下濃縮以得到淺黃色固體的5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]-6-氟-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例5,13.00mg,33%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,t),2.55(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),2.58(4H,br d),2.77(3H,d),3.19(4H,br s),3.67(2H,s),7.57(1H,dd),7.63(1H,s),7.76(1H,s),7.85(1H,d),8.32-8.49(2H,m),11.85(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=425。
在20℃下,將DIPEA(0.082mL,0.47mmol)添加至7-(溴甲基)-3-乙基-1H-1,5-啶-2-酮(中間體14,25mg,0.09mmol)和6-氯-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺(中間體48,26.2mg,0.10mmol)在乙腈(2mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在70℃下攪拌2小時。將溶劑在真空下除去。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至20% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮以得到呈淺黃色固體的6-氯-5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例6,19.80mg,48.0%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,t),2.55(2H,m,與溶劑DMSO峰重疊),2.58-2.65(4H,m),2.79(3H,d),3.13(4H,br s),3.68(2H,s),7.63(1H,d),7.67(1H,d),7.76(1H,s),7.94(1H,d),8.34-8.50(2H,m),11.85(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=441。
將在二中的HCl(4.67mL,18.67mmol)添加至三級丁基4-(6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體15,600mg,1.87mmol)在MeOH(1mL)中的攪拌溶液中,並將所得溶液在rt下攪拌18小時。將溶劑在真空下除去以給出呈淡黃色固體的甲基5-哌-1-基吡啶-2-甲酸酯2HCl(中間體16,543mg,99%)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)3.20(4H,br s),3.71(4H,br s),3.85(3H,s),7.58(1H,br d),7.99(1H,br d),8.43(1H,br s),9.73(2H,br),11.29-11.75(1H,br);m/z(ES+)[M+H]+=222
在20℃下,將DIPEA(944μl,5.40mmol)添加至7-(氯甲基)-3-乙基-1H-1,5-啶-2-酮HCl(中間體17,200mg,0.77mmol)、碘化鈉(11.57mg,0.08mmol)和甲基5-哌-1-基吡啶-2-甲酸酯2HCl(中間體16,250mg,0.85mmol)在乙腈(6774μl)的攪拌溶液中。將所得溶液在80℃下攪拌3小時。將溶劑在真空下除去,添加0.4mL飽和碳酸氫鈉溶液和1.5mL乙腈並將反應攪拌10min。過濾出固體,用2mL水隨後1mL乙腈洗滌以給出呈灰白色固體的甲基5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲酸酯(中間體18,158mg,50.2%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,br t),2.54-2.61(6H,
m),3.40(4H,br s),3.66(2H,s),3.81(3H,s),7.35(1H,br dd),7.62(1H,s),7.75(1H,s),7.88(1H,br d),8.28-8.47(2H,m),12.03(1H,br);m/z(ES+)[M+H]+=408
將甲醇中的胺(4mL,28.00mmol)添加至甲基5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲酸酯(中間體18,60mg,0.15mmol)中,並將所得溶液加熱至50℃持續24h(密封管)。將反應冷卻至室溫並將固體過濾出並用2mL甲醇洗滌以給出呈淡棕色固體的5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例7,88mg,90%)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,t),2.56(6H,m,與溶劑DMSO峰重疊),3.35(4H,br d),3.66(2H,s),7.30(1H,br s),7.40(1H,dd),7.64(1H,s),7.76(2H,s),7.85(1H,d),8.28(1H,d),8.41(1H,d),11.61-11.98(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=393。
將烘箱乾燥的燒瓶用在乙腈(60mL)中的甲基5-溴吡啶-2-甲酸酯(中間體19,6g,27.77mmol)填充。添加氟化銀(II)(14.18g,97.21mmol)
並將混合物在室溫下攪拌過夜。將反應混合物通過濾紙過濾並用DCM洗滌。將濾液濃縮以給出淡棕色固體。將殘餘物懸浮於DCM和飽和NH4Cl溶液的混合物中並將白色懸浮液過濾出。將有機層分離,並將水層用DCM(100ml x 2)萃取。將合併的有機層經Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。將所得的殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至25% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到甲基5-溴-6-氟-吡啶-2-甲酸酯(中間體20,5.98g,產率90%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)4.01(3H,s),7.93(1H,d),8.15(1H,t);m/z(ES+)[M]+=234。
在80℃下,將三級丁基哌-1-甲酸酯(13.11g,70.41mmol)、甲基5-溴-6-氟-吡啶-2-甲酸酯(中間體20,10.985g,46.94mmol)、RuphosPd-G3(2.5g,2.99mmol)和Cs2CO3(38g,116.63mmol)在1,4-二(200mL)中的混合物在N2下攪拌過夜。將混合物用水和乙酸乙酯稀釋,將各層分離。將水層用DCM(100ml x 2)萃取。將合併的有機層經Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至100% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈黃色固體的三級丁基4-(2-氟-6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體21,14.00g,88%);1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.51(9H,s),3.16-3.32(4H,m),3.58-3.72(4H,m),3.98(3H,s),7.29-7.34(1H,m),8.00(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=340。
將在甲胺(120mL,36.80mmol,33wt%,在乙醇中)中的三級丁基4-(2-氟-6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體21,12.49g,36.80mmol)在r.t下攪拌24hr(密封管)。在減壓下除去溶劑。將殘餘物溶解於DCM
中並通過矽膠床過濾並用乙酸乙酯洗滌。將濾液濃縮並在真空下乾燥以得到呈黃色固體的三級丁基4-[2-氟-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體22,12.45g,100%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.42(9H,s),2.77(3H,d),3.04-3.16(4H,m),3.43-3.56(4H,m),7.59(1H,dd),7.80-7.93(1H,m),8.41(1H,q);m/z(ES+)[M+H]+=340。
在0℃下,將HCl(4M,在二中,100ml,400.00mmol)添加至三級丁基4-[2-氟-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體22,12.5g,36.94mmol)在1,4-二(50mL)中的溶液中。將反應攪拌5h,在這期間將溫度加溫至室溫以給出黃色懸浮液。將懸浮液用乙醚稀釋,過濾出固體並用乙醚洗滌。將此固體在真空下乾燥以得到呈淡黃色固體的6-氟-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體23,11.42g,99%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ ppm 2.8(d,J=4.6Hz,3 H)3.3(br s,4 H)3.4(br d,J=4.4Hz,4 H)7.6-7.7(m,1 H)7.9(d,J=8.1Hz,1 H)8.4(br d,J=4.4Hz,1 H)9.0-9.3(m,2 H);m/z(ES+)[M+H]+=239
將Ruphos Pd G3(4.07g,4.86mmol)添加至甲基5-溴吡啶-2-甲酸酯(中間體19,30g,138.87mmol)、三級丁基哌-1-甲酸酯(27.2g,145.81mmol)、Cs2CO3(90g,277.73mmol)在1,4-二(200mL)中的脫氣的混合物中,並將混合物在110℃下在N2氣氛下攪拌6hr。然後將混合物冷卻至室溫,用水稀釋,用乙酸乙酯萃取(150ml x 3)。將合併的有機層經無水Na2SO4乾燥並過濾。向此濾液中添加3-(二伸乙基三胺基)丙基官能化的矽膠(12g,1.3mmol/g載入)並將混合物在r.t下攪拌1hr。將混合物過濾,並將濾液濃縮至約100ml。將結晶的黃色固體過濾出,用乙醚洗滌並在真空下乾燥以得到呈黃色固體的三級丁基4-(6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體15,26.36g,82mmol,59.1%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.50(9H,s),3.31-3.42(4H,m),3.56-3.68(4H,m),3.98(3H,s),8.04(1H,d),8.37(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=322。
將甲胺(100ml,1155.26mmol,40%,在水中)添加至三級丁基4-(6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體15,36g,112.02mmol)在MeOH(100mL)中的溶液中,並將反應在室溫下攪拌4h以給出白色懸浮液。將混合物濃縮,將殘餘物在飽和NH4Cl溶液與DCM之間分配,將各層分離。將水層用DCM萃取,將有機層合併,用鹽水洗滌,經Na2SO4乾燥,過濾並濃縮以給出呈黃色固體的三級丁基4-[6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體24,35.9g,100%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.49(9H,s),3.02(3H,d),3.26-3.35(4H,m),3.58-3.67(4H,m),7.23(1H,dd),7.81(1H,br d),8.07(1H,d),8.16(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=321。
將HCl(4M,在二中,150ml,600.00mmol)添加至三級丁基4-[6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體24,35.9g,112.05mmol)在MeOH(50mL)中的懸浮液中,並將所得橙色懸浮液在r.t下攪拌4hr。在減壓下除去約80ml的溶劑,並將混合物用乙醚和己烷(200ml,1/1)稀釋。將固體藉由過濾收集,用己烷洗滌,乾燥,並在真空下乾燥以得到呈黃色固體的N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl鹽(中間體13,37.0g,100%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)2.79(3H,d),3.22(4H,br s),3.53-3.67(4H,m),7.51(1H,dd),7.91(1H,d),8.33(1H,d),8.50(1H,br s),9.19-9.49(2H,m);m/z(ES+)[M+H]+=221
將碳酸氫鈉(27.0g,321.39mmol)分批添加至甲基4-氟-3-硝基苯甲酸酯(中間體25,16g,80.35mmol)、和甲基2-胺基丁酸酯HCl(14.81g,96.42mmol)在THF(100mL)中的攪拌混合物中。將反應混合物在室溫下攪拌過夜。將反應藉由添加水淬滅,用乙酸乙酯萃取。將合併的有機層用飽和NaHCO3水溶液洗滌,將有機層經MgSO4乾燥並濃縮至乾燥以給出呈亮黃色固體的甲基4-(1-甲氧基羰基丙基胺基)-3-硝基-苯甲酸酯(中間體26,22.86g,96%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)0.91(3H,t),1.75-2.12(2H,m),3.75(3H,s),3.85(3H,s),4.63-4.82(1H,m),7.15(1H,d),8.00(1H,dd),8.52-8.76(2H,m)。
將Pd/C(4.15g,3.90mmol)分批添加至甲基4-(1-甲氧基羰基丙基胺基)-3-硝基-苯甲酸酯(中間體26,23.1g,77.97mmol)在MeOH(300mL)中的攪拌溶液中,並將所得漿液在H2氣氛下在室溫下攪拌30h。將甲醇在真空下除去,添加150mL DMF並將混合物攪拌10min。將鈀催化劑在矽藻土上過濾出,用50mL DMF洗滌(材料在有機溶劑(像MeOH/DCM/EtOAc)中具有非常低的溶解度)。將濾液在Genevac中濃縮以給出呈灰色固體的甲基2-乙基-3-側氧基-2,4-二氫-1H-喹啉-6-甲酸酯(中間體27,15.80g,87%)。將材料藉由NMR分析,並不經純化直接用於下一步驟。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)0.91(3H,t),1.63-1.73(2H,m),3.75(3H,s),3.90(1H,td),6.71(1H,d),6.84(1H,s),7.33(1H,d),7.41(1H,dd),10.39(1H,s);m/z(ES+)[M]+=235。
將DDQ(15.87g,69.92mmol)添加至甲基2-乙基-3-側氧基-2,4-二氫-1H-喹啉-6-甲酸酯(中間體27,15.6g,66.59mmol)在1,4-二(150mL)中的懸浮液中。將反應混合物在室溫下攪拌過夜。將混合物緩慢添加至飽和NaHCO3水溶液(約500ml)中並在室溫下攪拌20min。將沈澱物過濾,用水(100ml)洗滌並乾燥以產生呈灰白色固體的甲基2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-甲酸酯(中間體28,11.40g,73.7%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.23(3H,t),2.83(2H,q),3.89(3H,s),7.73-7.86(2H,m),7.89(1H,d),12.45(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=233。
在0℃下經50分鐘的時間段在氮氣氛下,將氫化鋁鋰(2M,在THF(49.1mL,98.17mmol)中)滴加至甲基2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-甲酸酯
(中間體28,11.4g,49.09mmol)在四氫呋喃(350mL)中的漿液中。將所得混合物在0℃下攪拌1.5小時。在0℃下,將反應混合物緩慢傾倒入1M HCl水溶液(300mL)中。將反應混合物用乙酸乙酯(約300ml X 2)萃取隨後用DCM/甲醇(5:1)(150ml x 3)萃取。將合併的有機層濃縮至300ml中,並用乙醚(200ml)稀釋以給出懸浮液。將固體藉由過濾收集,用乙醚洗滌,在真空下乾燥以產生3-乙基-7-(羥基甲基)-1H-喹啉-2-酮(中間體29,8.00g,80%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.22(3H,t),2.80(2H,q),4.59(2H,s),5.19-5.61(1H,m),7.19(1H,dd),7.28(1H,s),7.66(1H,d),12.28(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=205。
將溴化氫(60ml,48wt%,在水中)添加至3-乙基-7-(羥基甲基)-1H-喹啉-2-酮(中間體29,7.8g,38.19mmol)(產生澄清棕色溶液)並將混合物在80℃下攪拌8hr,將反應混合物冷卻至室溫,傾倒入150mL冰水中以給出灰白色沈澱物。將固體在真空下過濾,並用水隨後二乙醚洗滌,並乾燥以給出呈米黃色固體的純度為80%的7-(溴甲基)-3-乙基-1H-喹啉-2-酮(中間體30,11.10g,84%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.20(3H,t),2.79(2H,q),4.79(2H,s),7.27-7.38(2H,m),7.69(1H,d),12.34(1H,br s);m/z(ES+)[M]+=267.0。
將三級丁基哌-1-甲酸酯(中間體31,2.57g,13.80mmol)、甲基6-溴-5-氟-吡啶-2-甲酸酯(1.9g,8.12mmol)和碳酸鉀(1.459g,10.55mmol)在DMF(20mL)中的混合物在110℃下攪拌5小時,LCMS指示完全轉化。將混合物冷卻至r.t,用DCM和水稀釋,將各層分離。將水層用DCM萃取兩次並將合併的有機層經無水Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。將所得的殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至50% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈淡黃色固體的三級丁基4-(2-溴-6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體32,2.200g,67.7%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.50(9H,s),3.05-3.20(4H,m),3.58-3.72(4H,m),3.98(3H,s),7.31(1H,d),8.06(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=400。
將密封的壓力容器用三級丁基4-(2-溴-6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體32,2.2g,5.50mmol)和甲胺(22ml,176.72mmol)(33w.t%,在乙醇中)填充,並將混合物在60℃下加熱2小時,LCMS指示完全轉化。將混合物濃縮,並將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至80% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈白色固體的三級丁基4-[2-溴-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體33,2.200g,100%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.50(9H,s),3.02(3H,d),3.05-3.14(4H,m),3.56-3.74(4H,m),7.36(1H,d),7.68(1H,br d),8.11(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=399。
將三級丁基4-[2-溴-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體33,200mg,0.50mmol)、三丁基(乙烯基)錫烷(0.161ml,0.55mmol)
和第二代XPhos Pd循環(19.71mg,0.03mmol)在1,4-二(5ml)中的混合物在100℃下在N2下攪拌2.5hr,LCMS指示完全轉化。將混合物用DCM稀釋,用飽和NH4Cl洗滌,將有機層乾燥(無水Na2SO4),過濾並濃縮。將所得的殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至80% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈白色固體的三級丁基4-[6-(甲基胺基甲醯基)-2-乙烯基-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體34,174mg,100%)。m/z(ES+)[M+H]+=347
將Pd/C(53.5mg,0.05mmol)(10wt%乾重,濕載入)添加至三級丁基4-[6-(甲基胺基甲醯基)-2-乙烯基-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體34,174mg,0.50mmol)在MeOH(6mL)中的溶液中。將燒瓶脫氣並用H2(氣囊)重填充。將混合物在rt下攪拌過夜。LCMS指示反應未完成。添加更多的Pd/C(53.5mg,0.05mmol),並將所得混合物在r.t下在H2氣氛下攪拌5hr。將混合物通過矽藻土墊過濾,用甲醇洗滌,將濾液濃縮至乾燥以產生呈無色殘餘物的三級丁基4-[2-乙基-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體35,172mg,98%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.37(3H,t),1.51(9H,s),2.82-2.95(6H,m),3.05(3H,d),3.57-3.73(4H,m),7.39(1H,d),7.93-8.13(2H,m);m/z(ES+)[M]+=348
將三級丁基4-[2-乙基-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體35,172mg,0.49mmol)在HCl(4M,在二中,8ml,32.00mmol)中的混合物在r.t下攪拌1hr以給出白色懸浮液。將混合物用乙醚稀釋並將固體過濾出並在真空下乾燥以給出呈淡黃色固體的6-乙基-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-
甲醯胺2HCl(中間體36,159mg,100%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.31(3H,t),2.74-2.86(5H,m),3.00-3.14(4H,m),3.24(4H,br s),7.57(1H,d),7.82(1H,d),8.43(1H,br d),9.20(2H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=249。
將DIPEA(0.203mL,1.17mmol)添加至6-乙基-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體36,75mg,0.23mmol)和7-(溴甲基)-3-乙基-1H-喹啉-2-酮(中間體30,69.3mg,0.23mmol)在乙腈(3mL)中的懸浮液中。將所得混合物在60℃下攪拌3hr,LCMS指示完全轉化。將混合物冷卻至r.t,濃縮,將殘餘物在Gilson逆相柱(用0%至95% ACN/水/0.1%TFA洗脫,運行15min,從5至9min收集)上進行純化。將含有產物的級分濃縮並然後將殘餘物溶解於甲醇和DCM中。300mg的四烷基碳酸氫銨、聚合物鍵聯(40-90目,2.5-3.5mmol/g),並將混合物在r.t下攪拌10min。然後將混合物過濾並用甲醇洗滌。將濾液濃縮,重新溶解於水/CAN的混合物中並將此混合物凍乾至乾燥以產生呈淡黃色固體的6-乙基-5-[4-[(2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例8,60.0mg,59.1%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.22(3H,t),1.30(3H,t),2.54-2.69(2H,m),2.72-2.86(7H,m),2.93(4H,br s),3.26(2H,s),3.64(2H,s),7.17-7.33(2H,m),7.52(1H,d),7.69(1H,br d),7.80(1H,d),8.40(1H,br d),12.25(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=435。
在室溫下,氟化銀(I)(176mg,1.39mmol)在DMF(2mL)中的良好攪拌的混合物中添加三甲基(三氟甲基)矽烷(0.247mL,1.67mmol)。將混合物攪拌20min,隨後向其中添加銅粉(133mg,2.09mmol)。將反應混合物攪拌4h後變為藍色(指示形成CuCF3)。將三級丁基4-(2-溴-6-甲氧基羰基-3-吡啶基)哌-1-甲酸酯(中間體33,150mg,0.38mmol)添加至混合物中,並將所得深色混合物在90℃下攪拌18hr給出棕色懸浮液。LCMS指示完全轉化。將混合物用乙酸乙酯稀釋並將過濾出固體。將濾液用水洗滌隨後用鹽水洗滌。將有機層經無水Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。將所得的殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至70% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈黃色殘餘物的三級丁基4-[6-(甲基胺基甲醯基)-2-(三氟甲基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體37,146mg,100%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.50(9H,s),2.93-3.03(4H,m),3.05(3H,d),3.55-3.69(4H,m),7.71(1H,d),7.81(1H,br d),8.33(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=389。
將三級丁基4-[6-(甲基胺基甲醯基)-2-(三氟甲基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體37,146mg,0.38mmol)在HCl(4M,在二,8ml,32.00mmol)中的混合物在r.t下攪拌2hr。LCMS指示完全轉化。將溶劑濃縮至體積2ml,將混合物用乙醚/己烷(15ml,5/1)稀釋。過濾出固體並在真空下乾燥以得到呈粉色固體的N-甲基-5-哌-1-基-6-(三氟甲基)吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體38,127mg,94%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)2.83(3H,d),3.21(8H,br s),8.09(1H,d),8.23(1H,d),8.46(1H,br d),9.08(2H,br d);m/z(ES+)[M+H]+=289。
將DIPEA(0.121mL,0.69mmol)添加至N-甲基-5-哌-1-基-6-(三氟甲基)吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體38,50mg,0.14mmol)和7-(溴甲基)-3-乙基喹啉-2(1H)-酮(中間體30,46.2mg,0.14mmol)在乙腈(3mL)中的懸浮液中,並將混合物在60℃下攪拌3hr。將混合物冷卻至r.t,濃縮,將殘餘物在Gilson逆相柱(用0%至95% ACN/水/0.1%TFA洗脫)上進行純化。將含有產物的級分在室溫下濃縮。然後將殘餘物溶解於甲醇和DCM中,隨後添加250mg的四烷基碳酸氫銨聚合物鍵聯(40-90目,2.5-3.5mmol/g)並將混合物在室溫下攪拌10min。然後將固體過濾出,用甲醇洗滌並將濾液濃縮以給出固體。然後將此固體重新溶解於水/CH3CN的混合物中並凍乾至乾燥以得到呈白色固體的5-[4-[(2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-6-(三氟甲基)吡啶-2-甲醯胺(實例9,40.0mg,60.9%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.40(3H,t),2.70(4H,br s),2.98-3.08(5H,m),3.12(4H,br s),3.72(2H,br s),7.29-7.32(1H,m),7.37(1H,
dd),7.74(1H,d),7.79-7.88(2H,m),8.33(1H,d),11.06(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=475。
將在H2O中的四氧化鋨(0.050mL,6.35μmol)添加至三級丁基4-[6-(甲基胺基甲醯基)-2-乙烯基-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體34,110mg,0.32mmol)、2,6-二甲基吡啶(0.074mL,0.64mmol)和過碘酸鈉(272mg,1.27mmol)在THF(5mL)/水(1mL)/三級丁醇(0.304mL,3.18mmol)中的溶液中,並將混合物在rt下攪拌過夜以給出黃色懸浮液。LCMS和TLC指示完全轉化。將反應用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。濃縮後,將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至100% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈黃色固體的三級丁基4-[2-甲醯基-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體39,100mg,90%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.50(9H,s),3.07(3H,d),3.14-3.29(4H,m),3.66-3.79(4H,m),7.49(1H,d),7.86(1H,br d),8.28(1H,d),10.10(1H,s).m/z(ES+)[M+H]+=349。
將在CH2Cl2(2mL)中的三級丁基4-[2-甲醯基-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體39,99mg,0.28mmol)冷卻至0℃,添加DAST(0.710mL,0.71mmol)(1M,在DCM中)並將所得混合物在室溫下攪拌3hr。TLC和LCMS指示完全轉化。將反應滴加飽和NaHCO3溶液淬滅並用DCM萃取。將合併的有機物經無水Na2SO4乾燥,過濾並濃縮以給出粗產物。將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為己烷中的0%至100% EtOAc)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈灰白色固體的三級丁基4-[2-(二氟甲基)-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體40,94mg,89%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.51(9H,s),2.89-3.03(4H,m),3.06(3H,d),3.54-3.73(4H,m),6.82-7.16(1H,m),7.64(1H,d),7.94(1H,br d),8.29(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=371。
將三級丁基4-[2-(二氟甲基)-6-(甲基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體40,92mg,0.25mmol)在1,4-二(6ml,24.00mmol)中的HCl 4M中的混合物在r.t下攪拌1.5hr,給出橙色懸浮液,將混合物用乙醚稀釋,過濾,將固體重新溶解於甲醇中,濃縮至乾燥以產生呈橙色固體的6-(二氟甲基)-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體41,56.0mg,65.7%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)2.83(3H,d),3.03-3.23(5H,m),3.30(4H,br s),7.06-7.49(1H,m),7.92(1H,d),8.13(1H,d),8.43(1H,br d),9.00(2H,br d);m/z(ES+)[M+H]+=271。
將DIPEA(0.127mL,0.73mmol)添加至6-(二氟甲基)-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體41,50mg,0.15mmol)和7-(溴甲基)-3-乙基喹啉-2(1H)-酮(中間體30,48.6mg,0.15mmol)在乙腈(3mL)中的懸浮液中。將所得混合物在60℃下攪拌3hr,LCMS指示完全轉化。將混合物濃縮,並將殘餘物在Gilson逆相柱(用0%至95% ACN/水/0.1%TFA洗脫)上進行純化。將含有產物的級分在室溫下濃縮。然後將殘餘物溶解於甲醇和DCM中,隨後添加250mg四烷基碳酸氫銨聚合物鍵聯(40-90目,2.5-3.5mmol/g),並將混合物在室溫下攪拌10min。然後將固體過濾出,用甲醇洗滌並將濾液濃縮以給出固體。將此固體然後重新溶解於水/CH3CN的混合物中,並凍乾至乾燥以得到呈黃色固體的6-(二氟甲基)-5-[4-[(2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例10,50.0mg,75%)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)1.40(3H,t),2.72(4H,br s),2.97-3.17(9H,m),3.73(2H,s),6.84-7.15(1H,m),7.32(1H,s),7.37(1H,d),7.64(1H,d),7.83(1H,d),7.95(1H,br d),8.29(1H,d),11.32-11.62(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=457。
在20mL小瓶中添加7-(溴甲基)-3-乙基喹啉-2(1H)-酮(中間體30,0.147g,0.55mmol)和N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體13,0.161g,0.55mmol)。將小瓶密封,抽空,並用N2重填充。將乙腈(3mL)和DIPEA(0.481mL,2.75mmol)添加至小瓶中並放置在預加熱至70C的加熱塊中。將反應混合物在相同的溫度下攪拌2小時並冷卻至室溫。在真空下將反應的體積減少至其初始體積的1/3,並添加NaHCO3水溶液(2mL)。將反應混合物攪拌30min,過濾並將固體用水(50mL)洗滌。將粗產物藉由快速二氧化矽層析法(使用DCM中的0%-30% MeOH)進行純化以產生呈淡黃色固體的5-[4-[(2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例11,93.0mg,41.6%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.22(3H,t),2.52-2.60(4H,m),2.73-2.85(5H,m),3.30(4H,m,overlapped with水peak),3.62(2H,s),7.22-7.31(2H,m),7.39(1H,dd),7.69(1H,d),7.83(1H,d),8.23-8.31(1H,m),8.39(1H,br d),12.13-12.36(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=407。
將7-(溴甲基)-3-乙基喹啉-2(1H)-酮(中間體30,150mg,0.56mmol)添加至在NMP(2mL)中的6-氟-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺(中間體23,60mg,0.25mmol)和DIPEA(0.270mL,1.55mmol)中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19 x 150mm;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3,0.1% NH3.H2O),流動相B:ACN;流速:20mL/min;梯度:8min內28% B至38% B;254;220nm;RT:8.02min)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的5-[4-[(2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-6-氟-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例12,9mg,42.9%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 1.33(3H,t),2.65-2.72(4H,m),2.87-2.95(5H,m),3.26-3.30(4H,m),3.71(2H,s),7.33-7.41(2H,m),7.52(1H,dd),7.76(1H,d),7.90(1H,dd);19F NMR(376MHz,CD3OD)δ -73.40;m/z(ES+)[M+H]+=425。
將甲胺在THF(20mL,40.00mmol)中的2M溶液添加至甲基5-溴-6-甲基吡啶甲酸酯(中間體42,2.0g,8.69mmol)中,並將所得混合物在80℃下攪拌18小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.1% NH4HCO3)中的5%至80% MeOH)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得
到呈淺黃色固體的5-溴-N,6-二甲基吡啶醯胺(中間體43,1.5g,75%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.65(3H,s),2.82(3H,d),7.75(1H,d),8.17(1H,d),8.57-8.76(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=229
在氮下,將5-溴-N,6-二甲基吡啶醯胺(中間體43,1.0g,4.37mmol)添加至在甲苯(20mL)中的三級丁基哌-1-甲酸酯(0.894g,4.80mmol)、BINAP(0.272g,0.44mmol)、Pd(OAc)2(0.098g,0.44mmol)和Cs2CO3(3.56g,10.91mmol)中。將所得混合物在80℃下攪拌16小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至30% MeOH)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈棕色固體的三級丁基4-(2-甲基-6-(甲基胺基甲醯基)吡啶-3-基)哌-1-甲酸酯(中間體44,1.2g,82%)。1H NMR(300MHz,CD3OD)δ 1.50(9H,s),2.58(3H,s),2.92-3.00(7H,m),3.62(4H,m),7.50(1H,d),7.88(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=335。
將三級丁基4-(2-甲基-6-(甲基胺基甲醯基)吡啶-3-基)哌-1-甲酸酯(中間體44,1.18g,3.53mmol)添加至在1,4-二(10mL,329.15mmol)中的4M HCl溶液中。將所得混合物在室溫下攪拌1小時。將沈澱物藉由過濾收集,用石油醚(5mL x 2)、Et2O(5mL x 2)洗滌,並在真空下乾燥以得到呈黃色固體的N,6-二甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體45,0.77g,81%)。1H NMR(300MHz,CD3OD)δ 2.86(3H,s),3.02(3H,s),3.42-3.54(8H,m),8.29(2H,d);m/z(ES+)[M+H]+=235。
將7-(溴甲基)-3-乙基喹啉-2(1H)-酮(中間體30,100mg,0.37mmol)添加至在NMP(2mL)中的N,6-二甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體45,90mg,0.33mmol)和DIPEA(0.36mL,2.05mmol)中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Prep OBD C18柱30 x 150mm,5um;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:7min內30% B至40% B;254;220nm;RT:6.43min)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的5-[4-[(2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-N,6-二甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例13,68.7mg,43.6%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 1.33(3H,t),2.55(3H,s),2.71(4H,s),2.87-2.99(5H,m),3.05(4H,t),3.73(2H,s),7.35(1H,s),7.38(1H,d),7.49(1H,d),7.77(1H,d),7.87(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=421。
將哌(1.0g,11.61mmol)添加至在MeCN(30mL)中的甲基6-氯-5-氟吡啶甲酸酯(中間體46,1.0g,5.28mmol)中。將所得混合物在80℃
下攪拌18小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.1% NH4HCO3)中的5%至60% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈紅色油狀物的甲基6-氯-5-(哌-1-基)吡啶甲酸酯(中間體47,1.28g,95%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.81-2.91(4H,m),3.04-3.08(4H,m),3.85(3H,s),7.61(1H,d),8.00(1H,d)(未顯示NH質子);m/z(ES+)[M+H]+=256。
將甲胺在THF(40mL,80.00mmol)中的2M溶液添加至甲基6-氯-5-(哌-1-基)吡啶甲酸酯(中間體47,1.26g,4.93mmol)中。將所得混合物在80℃下攪拌18小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.1% NH4HCO3)中的5%至60% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈淺黃色油狀物的6-氯-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體48,1.12g,89%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 2.79(3H,d),2.85-2.89(4H,m),2.97-3.02(4H,m),7.63(1H,d),7.94(1H,d),8.45(1H,q)(哌-未顯示NH質子);m/z(ES+)[M+H]+=255。
將7-(溴甲基)-3-乙基喹啉-2(1H)-酮(中間體30,200mg,0.75mmol)添加至在NMP(2mL)中的6-氯-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體48,100mg,0.39mmol)和DIPEA(0.358mL,2.05mmol)中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Prep OBD C18柱30×150mm 5um;流動相A:水(10MMOL/L
NH4HCO3),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:8min內30% B至40% B;254;220nm;RT:7.3min)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的6-氯-5-[4-[(2-乙基-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例14,52.6mg,30.4%)。1HNMR(400MHz,CD3OD)δ 1.33(3H,t),2.71(4H,s),2.87-2.96(5H,m),3.23(4H,s),3.73(2H,s),7.33-7.41(2H,m),7.62(1H,d),7.77(1H,d),8.00(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=441。
將4-溴苯-1,2-二胺(中間體49,0.9g,4.81mmol)添加至在甲苯(10mL)中的甲基3,3,3-三氟-2-側氧基丙酸酯(0.9g,5.77mmol)中。將所得混合物在100℃下攪拌60分鐘。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為石油醚中的0%至50% EtOAc)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的7-溴-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮和6-溴-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體50+中間體51,1.28g,45.4%)的區域異構混合物。將區域異構物的混合物分離,並且未說明1H NMR譜;m/z(ES+)[M+H]+=295。
將Pd(Ph3P)4(0.3g,0.26mmol)添加至7-溴-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮和6-溴-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體50+中間體51,1.2g,2.05mmol)和(三丁基甲錫烷基)甲醇(1.2g,3.74mmol)在1,4-二(40mL)中
的混合物中。將所得混合物在100℃下在氮下攪拌18小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.1% HCO2H)中的5%至50% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的7-(羥基甲基)-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體52,0.32g,64.0%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,)δ 4.63(2H,d),5.52(1H,t),7.30(1H,dd),7.38(1H,d),7.83(1H,d),13.05(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=245。
將33% HBr在AcOH(3mL,18.23mmol)中的溶液添加至7-(羥基甲基)-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體52,111mg,0.45mmol)中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將DIEA(0.5mL,2.86mmol)和N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體13,100mg,0.45mmol)添加至在NMP(3mL)中的上述混合物中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Prep OBD C18柱,30×150mm 5um;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:7min內22B至32B;254;220nm;RT:5.77)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的N-甲基-5-[4-[[3-側氧基-2-(三氟甲基)-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例15,44.0mg,21.71%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.55-2.62(m,4H),2.78(d,3H),3.34-3.38(t,4H),3.69(s,2H),7.34-7.44(m,3H),7.80-7.91(m,2H),
8.27(d,1H),8.36-8.41(m,1H),12.97(s,1H);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -68.36;m/z(ES+)[M+H]+=447。
將在AcOH中的33% HBr(3mL,18.23mmol)添加至7-(羥基甲基)-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體52,43.1mg,0.18mmol)中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將DIPEA(0.5mL,2.86mmol)和6-氯-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體48,45mg,0.18mmol)添加至在NMP(5mL)中的上述混合物中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Prep OBD C18柱,30×150mm 5um;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:10B至50B,在7min內;254;220nm;RT:6.75)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的6-氯-N-甲基-5-[4-[[3-側氧基-2-(三氟甲基)-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例16,22.00mg,25.9%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.56-2.64(s,4H),2.79(d,3H),3.09-3.17(m,4H),3.71(s,2H),7.36-7.42(m,2H),7.67(d,1H),7.88
(d,1H),7.94(d,1H),8.39-8.44(m,1H),12.89(s,1H);19F NMR(376MHz,DMSO)δ -68.41;m/z(ES+)[M+H]+=481。
將在AcOH中的33% HBr(3mL,55.25mmol)添加至7-(羥基甲基)-3-(三氟甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體52,102mg,0.42mmol)中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將6-氟-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體23,100mg,0.42mmol)和DIPEA(0.5mL,2.86mmol)添加至在NMP(5mL)中的上述混合物中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Prep OBD C18柱,30×150mm 5um;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在8min內15B至40B;254;220nm;RT:7.2)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的6-氟-N-甲基-5-[4-[[3-側氧基-2-(三氟甲基)-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例17,66.0mg,33.9%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.55-2.69(m,4H),2.77(d,3H),3.15-3.23(m,4H),3.69(s,2H),7.33-7.46(m,2H),7.58(dd,1H),7.78
-7.93(m,2H),8.37-8.42(m,1H),12.99(s,1H);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -68.36,-72.52;m/z(ES+)[M+H]+=465。
在0℃下,將SOCl2(17mL,232.94mmol)滴加至在MeOH(200mL)中的2-胺基戊酸(中間體53,10.0g,85.36mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌18小時。將溶劑在減壓下除去以得到呈白色固體的甲基2-胺基戊酸酯鹽酸鹽(中間體54,15.78g,110%)。1H NMR(DMSO-d6,400MHz)δ 0.88(3H,t),1.19-1.51(2H,m),1.67-1.83(2H,m),3.74(3H,s),3.89-3.93(1H,m),8.64(3H,s);m/z(ES+)[M+H]+=132。
將碳酸氫鈉(20.0g,238.08mmol)添加至在THF(160mL)中的甲基2-胺基戊酸酯鹽酸鹽(中間體54,15.57g,92.88mmol)和甲基4-氟-3-硝基苯甲酸酯(9.0g,45.19mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌18小時。在減壓下除去溶劑。將反應混合物用EtOAc(150mL)稀釋,並依次用水(100mL x 1)、飽和NaHCO3(100mL x 1)和飽和鹽水(100mL x 1)洗滌。將有機層經Na2SO4乾燥,過濾並蒸發以得到呈黃色油狀物的甲基4-(1-甲氧基-1-側氧基戊烷-2-基胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體55,14.09g,100%)。1H NMR(400MHz,
DMSO-d6)δ 0.89(3H,t),1.26-1.41(2H,m),1.84-1.94(2H,m),3.73(3H,s),3.83(3H,s),4.68-4.75(1H,m),7.12(1H,d),8.00(1H,d),8.60(1H,d),8.63(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=311。
將Pd(OH)2/C(20% wt,1.58g,2.25mmol)添加至在MeOH(300mL)中的甲基4-((1-甲氧基-1-側氧基戊烷-2-基)胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體55,14.05g,45.28mmol)中。將所得混合物在室溫下在H2下攪拌30小時。將反應混合物過濾。將沈澱物用DMF(100mL)洗滌並將濾液蒸發至乾燥以得到粗產物。將粗產物用DCM(10mL)洗滌並在真空下乾燥以得到呈白色固體的甲基3-側氧基-2-丙基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體56,9.12g,81%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 0.87(3H,t),1.32-1.46(2H,m),1.57-1.64(2H,m),3.74(3H,s),3.88-3.93(1H,m),6.70(1H,d),6.83(1H,d),7.32(1H,d),7.40(1H,dd),10.38(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=249。
將DDQ(9.42g,41.50mmol)添加至在1,4-二(200mL)中的甲基3-側氧基-2-丙基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體56,9.12g,36.73mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌18小時。將反應混合物用飽和NaHCO3(200mL)稀釋。將所得混合物在室溫下攪拌0.5小時。將沈澱物藉由過濾收集,用水(1000mL)洗滌,並在真空下乾燥以得到呈灰白色固體的甲基3-側氧基-2-丙基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體57,7.86g,87%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 0.98(3H,t),1.68-1.80(2H,m),2.75-2.83(2H,m),3.89(3H,s),7.73-7.85(2H,m),7.88(1H,d),12.45(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=247。
在0℃下,將DIBAL-H在THF(100mL,100.00mmol)中的1M溶液滴加至在THF(200mL)中的甲基3-側氧基-2-丙基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體57,7.81g,31.71mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌18小時。將反應混合物用MeOH(5mL)和飽和水性酒石酸單鉀單鈉四水合物溶液(20mL)淬滅,將有機層蒸發以得到呈白色固體的7-(羥基甲基)-3-丙基喹啉-2(1H)-酮(中間體58,1.2g,17.34%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 0.97(3H,t),1.36-1.77(2H,m),2.71-2.79(2H,m),4.59(2H,s),5.39(1H,s),7.18(1H,dd),7.27(1H,d),7.65(1H,d),12.30(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=219。
將在AcOH中的33% HBr(74.6μl,1.37mmol)添加至7-(羥基甲基)-3-丙基喹啉-2(1H)-酮(中間體58,300mg,1.37mmol)中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。將溶劑在減壓下除去以得到呈棕色固體的7-(溴甲基)-3-丙基喹啉-2(1H)-酮(中間體59,600mg,155%)(粗產物係不純的並含有AcOH和其他雜質)。將產物不經進一步純化用於下一步驟。1H NMR譜不乾淨,並且未說明;m/z(ES+)[M+H]+=282。
將DIPEA(200μL,1.15mmol)添加至在NMP(3mL)中的7-(溴甲基)-3-丙基喹啉-2(1H)-酮(中間體59,200mg,0.71mmol)和N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體13,80mg,0.36mmol)。將所得的混合物在80℃下
攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,19 x 250mm,10um;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3,0.1% NH3.H2O),流動相B:ACN;流速:20mL/min;梯度:38B至50B,在7min內;254/220nm;RT:6.20)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的N-甲基-5-[4-[(3-側氧基-2-丙基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例18,71.0mg,46.5%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 0.97(3H,t),1.66-1.80(2H,m),2.55-2.61(4H,m),2.73-2.85(5H,m),3.33-3.40(4H,m),3.62(2H,s),7.19-7.31(2H,m),7.40(1H,dd),7.68(1H,d),7.83(1H,d),8.27(1H,d),8.35-8.45(1H,m),12.26(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=421。
將DIPEA(200μL,1.15mmol)添加至在NMP(3mL)中的7-(溴甲基)-3-丙基喹啉-2(1H)-酮(中間體59,200mg,0.71mmol)和6-氯-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體48,80mg,0.31mmol)中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,19 x 250mm,10um;流動相A:水(0.1% HCO2H),流動相B:ACN;流速:20mL/min;梯度:在7min內18B至30B;254/220nm;RT:5.93)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色
固體的6-氯-N-甲基-5-[4-[(3-側氧基-2-丙基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例19,52.0mg,36.4%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 0.97(3H,t),1.66-1.79(2H,m),2.55-2.65(4H,m),2.71-2.85(5H,m),3.06-3.12(4H,m),3.64(2H,s),7.20-7.32(2H,m),7.64-7.72(2H,m),7.94(1H,d),8.40-8.50(1H,m),12.27(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=455。
將DIPEA(500μl,2.86mmol)添加至在NMP(3mL)中的7-(溴甲基)-3-丙基喹啉-2(1H)-酮(中間體59,200mg,0.71mmol)和6-氟-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺2 HCl(中間體23,100mg,0.32mmol)中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。在減壓下除去溶劑。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:SunFire C18 OBD Prep柱,100Å,5μm,19mm x 250mm;流動相A:水(0.1% HCO2H),流動相B:ACN;流速:25mL/min;梯度:在13min內10B至20B;254/220nm;RT:12.13)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的6-氟-N-甲基-5-[4-[(3-側氧基-2-丙基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例20,71.0mg,50.4%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 0.97(3H,t),1.66-1.78(2H,m),2.54-2.60(4H,m),2.71-2.83(5H,m),
3.14-3.25(4H,m),3.62(2H,s),7.19-7.33(2H,m),7.57(1H,dd),7.68(1H,d),7.85(1H,dd),8.37-5.43(1H,m),12.27(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -72.51;m/z(ES+)[M+H]+=439。
在0℃下,將SOCl2(17mL,232.94mmol)滴加至在MeOH(100mL)中的2-胺基丁酸(中間體60,10.0g,96.97mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌18小時。將溶劑在減壓下除去以得到呈白色固體的甲基2-胺基丁酸酯鹽酸鹽(中間體61,14.84g,100%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 0.91(3H,t),1.75-1.95(2H,m),3.73(3H,s),3.93(1H,t),8.72(3H,s);m/z(ES+)[M+H]+=118
將DIPEA(4.02mL,23.03mmol)添加至在NMP(10mL)中的甲基2,4-二氟-5-硝基苯甲酸酯(1.0g,4.61mmol)和甲基2-胺基丁酸酯鹽酸鹽(中間體61,0.707g,4.61mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌5小時。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.1% NH4HCO3)中的5%至80% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈黑色固體的甲基2-氟-4-(1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基胺基)-5-硝基苯甲酸酯(中間體62,1.2g,83%)。1H NMR(400MHz,
DMSO-d6)δ 0.88(3H,t),1.78-2.03(2H,m),3.75(3H,s),3.83(3H,s),4.73-4.80(1H,m),7.06(1H,d),8.66-8.72(2H,m);m/z(ES+)[M+H]+=315。
在氫下,將甲基2-氟-4-((1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-5-硝基苯甲酸酯(中間體62,1.15g,3.66mmol)添加至在MeOH(300mL)和乙酸乙酯(50mL)中的20wt% Pd(OH)2(500mg,0.71mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌3天。反應未完成。將反應混合物過濾。將有機層蒸發以得到呈棕色膠狀物的粗產物甲基2-乙基-7-氟-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體63,0.780g,85%)。將該粗產物未進一步純化即直接用於下一步驟。粗產物不乾淨,並且未說明1HNMR譜;m/z(ES+)[M+H]+=253。
將甲基2-乙基-7-氟-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體63,760mg,3.01mmol)添加至在DCM(20mL)中的DDQ(821mg,3.62mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌2小時。反應完成。將所得混合物在減壓下濃縮以獲得棕色固體。將NaHCO3飽和水溶液(10mL)添加至固體中並在室溫下攪拌1小時。將沈澱物過濾並用另外的NaHCO3水溶液(10mL x 5)漂洗。將固體在真空下乾燥以得到呈棕色固體的甲基2-乙基-7-氟-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體64,750mg,99%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 1.20(3 H,t),2.82(2 H,q),3.87(3 H,s),7.65(1 H,d),7.76(1 H,d),12.42(1 H,s);m/z(ES+)[M+H]+=251。
將二異丁基氫化鋁在THF(15.35mL,15.35mmol)中的1M溶液分批添加至在THF(300mL)中的甲基2-乙基-7-氟-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-
甲酸酯(中間體64,640mg,2.56mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。反應完成。在0℃下,將反應混合物用飽和酒石酸鉀鈉水溶液(20mL)和MeOH(10mL)淬滅。將所得混合物在室溫下攪拌1小時。將反應混合物過濾並用THF(50mL x 3)洗滌。將有機層蒸發至乾燥以得到粗產物。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至60% MeOH)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的3-乙基-6-氟-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體65,110mg,19.37%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 1.21(3H,t),2.80(2H,q),4.63(2H,d),5.49(1H,t),7.41(1H,d),7.49(1H,d),12.36(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=223。
將3-乙基-6-氟-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體65,50mg,0.23mmol)添加至在AcOH(2mL,12.15mmol)中的33% HBr中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。將反應混合物在真空下蒸發以得到7-(溴甲基)-3-乙基-6-氟喹啉-2(1H)-酮(粗產物)。將該產物不經進一步純化直接用於下一步驟。將DIPEA(0.196mL,1.13mmol)添加至在NMP(2mL)中的7-(溴甲基)-3-乙基-6-氟喹啉-2(1H)-酮和6-氟-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體23,70mg,0.29mmol)中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。將所得混合物藉由製備型HPLC(柱:Sunfire prep C18柱,30 x 150mm,5um;流動相A:水(0.1% HCO2H),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在8min內10B至35B;254/220nm;RT:7.37)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥
以得到呈灰白色固體的5-[4-[(2-乙基-7-氟-3-側氧基-4H-喹啉-6-基)甲基]哌-1-基]-6-氟-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例21,55.0mg,53.7%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 1.21(3H,t),2.61(4H,m),2.73-2.85(5H,m),3.18(4H,m),3.68(2H,s),7.38(1H,d),7.51-7.61(2H,m),7.84(1H,dd),8.13(0.29H,s),8.38(1H,m),12.29(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -72.53,-124.31;m/z(ES+)[M+H]+=443。
將DIPEA(8.77mL,50.22mmol)添加至在DMF(20mL)中的甲基4-氟-3-硝基苯甲酸酯(2.0g,10.04mmol)和甲基2-胺基-3-羥基丁酸酯鹽酸鹽(中間體66,2.04g,12.05mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。將反應混合物用EtOAc(100mL)稀釋,並依次用飽和NH4Cl水溶液(100mL x 1)、和鹽水(100mL x 4)洗滌。將有機層經Na2SO4乾燥,過濾並蒸發以得到呈黃色固體的所希望的產物甲基4-((3-羥基-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體67,2.9g,92%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 1.15-1.27(3H,m),3.64-3.74(3H,m),3.83(3H,s),4.08-4.44(1H,m),4.61-4.72(1H,m),5.39-5.60(1H,m),7.03-7.15(1H,m),7.90-8.03(1H,m),8.62-8.69(1H,m),8.73-8.89(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=313。
在氫下,將20% Pd(OH)2/C(0.648g,0.92mmol)添加至在MeOH(300mL)中的甲基4-((3-羥基-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體67,2.88g,9.22mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。反應完成。將該反應混合物通過矽藻土過濾。將有機層蒸發以得到呈灰色固體的甲基2-(1-羥基乙基)-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體68,2.290g,99%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 1.07(3H,m),2.81(1H,d),3.72(1H,m),3.74(3H,s),4.78(1H,d),6.70-6.86(2H,m),7.27(1H,d),7.37(1H,dd),10.38(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=251。
將DDQ(2.265g,9.98mmol)添加至在DCM(100mL)中的甲基2-(1-羥基乙基)-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體68,2.27g,9.07mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌1小時。反應完成。將反應混合物在減壓下濃縮以獲得棕色固體。將NaHCO3飽和水溶液(100mL)添加至固體並在室溫下攪拌1小時。將沈澱物過濾並用另外的NaHCO3水溶液(30mL x 3)漂洗。將固體在真空下乾燥以得到呈灰色固體的甲基2-(1-羥基乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體69,2.24g,99%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 1.40(3H,d),3.88(3H,s),4.94(1H,q),7.69(1H,dd),7.77(1H,d),7.90(1H,d)(2 protons are not shown);m/z(ES+)[M+H]+=249。
將戴斯-馬丁高碘烷(2.56g,6.04mmol)添加至在DCM(30mL)中的甲基2-(1-羥基乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體69,1.0g,4.03mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌3小時。將反應混合物蒸發以得到粗產物。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至30%
MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈淺黃色固體的甲基2-乙醯基-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體70,0.62g,62.5%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.58(3H,s),3.91(3H,s),7.84(1H,dd),7.91-8.03(2H,m),12.86(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=247。
將BAST(1.35mL,7.31mmol)添加至在DCM(20mL)中的甲基2-乙醯基-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體70,600mg,2.44mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。將反應混合物蒸發,以得到粗產物。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至30% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的甲基2-(1,1-二氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體71,174mg,26.6%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.07(3H,t),3.91(3H,s),7.84(1H,dd),7.92-7.99(2H,m),12.90(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -93.26;m/z(ES+)[M+H]+=269。
在0℃下,1M二異丁基氫化鋁在THF(2.39mL,2.39mmol)中的溶液添加至在THF(50mL)中的甲基2-(1,1-二氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體71,160mg,0.60mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。在0℃下,將反應混合物用飽和酒石酸鉀鈉水溶液(3mL)和MeOH(1mL)淬滅。將所得混合物攪拌1小時。將反應混合物過濾並用THF(10mL x 3)洗滌。將有機層蒸發以得到粗產物3-(1,1-二氟乙基)-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體72,120mg,84%)。將該產物不經進一步純化直接用於下一步驟。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.06(3H,t),4.63(2H,s),5.47(1H,s),7.26(1H,dd),7.35(1H,d),7.78(1H,d),12.75(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=241。
將3-(1,1-二氟乙基)-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體72,60mg,0.25mmol)添加至在乙酸(2mL,12.15mmol)中的33% HBr中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。將反應混合物在真空下蒸發以得到7-(溴甲基)-3-(1,1-二氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(粗產物)。將該產物不經進一步純化直接用於下一步驟。將DIPEA(0.218mL,1.25mmol)添加至在NMP(3mL)中的7-(溴甲基)-3-(1,1-二氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(粗產物)和N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體13,60mg,0.27mmol)中。將所得的混合物在80℃下攪拌1小時。將反應混合物濃縮並藉由製備型HPLC(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,30 x 150mm,5um;流動相A:水(0.05% NH3H2O),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在7min內13B至33B;254;220nm;RT:5.70)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈黃色固體的5-[4-[[2-(1,1-二氟乙基)-3-側氧基-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例22,47.8mg,43.2%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.06(3H,t),2.52-2.62(4H,m),2.78(3H,d),3.30-3.40(4H,m),3.67(2H,s),7.32-7.42(3H,m),7.80-7.86(2H,m),8.27(1H,d),8.34-8.42(1H,m),12.70(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -92.74;m/z(ES+)[M+H]+=443。
將DIPEA(8.77mL,50.22mmol)添加至在DMF(20mL)中的甲基4-氟-3-硝基苯甲酸酯(2.0g,10.04mmol)和甲基2-胺基-4,4-二氟丁酸酯鹽酸鹽(中間體73,2.0g,10.55mmol)。將所得混合物在40℃下攪拌8小時。將反應混合物用EtOAc(100mL)稀釋,並依次用飽和NH4Cl(100mL x 1)、和鹽水(100mL x 4)洗滌。將有機層經Na2SO4乾燥,過濾並蒸發以得到呈黃色固體的所希望的產物甲基4-((4,4-二氟-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體74,2.5g,74.9%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 2.50-2.76(2H,m),3.71(3H,s),3.82(3H,s),4.95(1H,q),6.22(1H,tt),7.18(1H,d),7.99(1H,dd),8.63(1H,d),8.66(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=333。
在氫下,將20% Pd(OH)2/C(0.465g,0.66mmol)添加至在MeOH(300mL)中的甲基4-((4,4-二氟-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體74,2.2g,6.62mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。將該反應混合物通過矽藻土過濾。將濾液蒸發以得到呈黃色固體的甲基2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體75,1.64g,92%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.24-2.32(2H,m),3.76(3H,s),4.10-4.18(1H,m),6.27(1H,tt),6.73(1H,d),6.89(1H,s),7.37(1H,d),7.44(1H,dd),10.58(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=271。
將DDQ(1.478g,6.51mmol)添加至在DCM(100mL)中的甲基2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體75,1.6g,5.92mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌3小時。將所得混合物在減壓下除去以獲得棕色固體。將NaHCO3飽和水溶液(100mL)添加至固體並在室溫下攪拌1小時。將沈澱物過濾並用另外的NaHCO3水溶液(30mL x 3)漂洗。將固體在真空下乾燥以得到呈灰白色固體的甲基2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體76,1.58g,99%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 3.46(2H,td),3.90(3H,s),6.57(1H,t),7.79-7.92(3H,m),12.68(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=269。
在0℃下,將二異丁基氫化鋁在THF(22.37mL,22.37mmol)中的1M溶液分批添加至在THF(100mL)中的甲基2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體76,1.0g,3.73mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。在0℃下,將反應混合物用飽和酒石酸鉀鈉水溶液(20mL)和MeOH(10mL)淬滅。將所得混合物攪拌1小時。將反應混合物過濾並用THF(30mL x 3)洗滌。將有機層蒸發以得到呈紅色固體的3-(2,2-二氟乙基)-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(0.72g,80%)(粗產物)。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至60% MeOH)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈紅色固體的3-(2,2-二氟乙基)-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體77,500mg,69.4%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 3.42(2H,td),4.61(2H,s),5.42(1H,brs),6.56(1H,tt),7.23(1H,dd),7.32(1H,d),7.71(1H,d),12.55(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=241。
將戴斯-馬丁高碘烷(530mg,1.25mmol)添加至在DCM(5mL)中的3-(2,2-二氟乙基)-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體77,200mg,0.83mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物蒸發以得到粗產物。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至30% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈黃色固體的2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲醛(中間體78,160mg,81%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 3.47(2H,td),6.58(1H,tt),7.77-7.85(2H,m),7.90-7.98(1H,m),10.09(1H,s),12.79(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=239。
將異丙氧基鈦(65.6mg,0.23mmol)添加至在THF(2mL)中的2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲醛(中間體78,55mg,0.23mmol)和N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體13,60mg,0.23mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌2分鐘。添加三乙醯氧基硼氫化鈉(196mg,0.92mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌1小時。將反應混合物用MeOH(0.1mL)淬滅。將反應混合物蒸發以得到粗產物,將該粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,30 x 150mm,5um;流動相A:水(0.05% NH3H2O),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在7min內13B至33B;254;220nm;RT:5.70)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈黃色固體的5-[4-[[2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]-N-甲
基-吡啶-2-甲醯胺(實例23,8.76mg,8.57%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.56(4H,m),2.78(3H,d),3.32-3.48(6H,m),3.64(2H,s),6.55(1H,tt),7.27-7.33(2H,m),7.39(1H,dd),7.73(1H,d),7.83(1H,d),8.26(1H,d),8.37(1H,m),12.49(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -114.29;m/z(ES+)[M+H]+=443。
將異丙氧基鈦(59.7mg,0.21mmol)添加至在THF(2mL)中的2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲醛(中間體78,50mg,0.21mmol)和6-氟-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體23,50.0mg,0.21mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌2分鐘。添加三乙醯氧基硼氫化鈉(178mg,0.84mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌1小時。反應完成。將反應混合物用MeOH(0.1mL)淬滅。將反應混合物蒸發,以得到粗產物。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:Sunfire prep C18柱,30 x 150,5um;流動相A:水(0.1% HCO2H),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在7min內2B至27B;254/220nm;RT:6.78)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈黃色固體的5-[4-[[2-(2,2-二氟乙基)-3-側氧基-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]-6-氟-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例24,21.72mg,22.13%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.54-2.61(4H,m),2.76(3H,d),3.14-3.22(4H,m),3.41(2H,td),3.64
(2H,s),6.39-6.71(1H,m),7.26-7.33(2H,m),7.57(1H,dd),7.73(1H,d),7.82-7.86(1H,m),8.13(0.16H,s),8.37(1H,m),12.49(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -72.52,-114.29;m/z(ES+)[M+H]+=461。
將DIPEA(8.77mL,50.22mmol)添加至在DMF(20mL)中的甲基4-氟-3-硝基苯甲酸酯(2.0g,10.04mmol)和甲基2-胺基-4-氟丁酸酯鹽酸鹽(中間體79,1.81g,10.55mmol)中。將所得混合物在40℃下攪拌8小時。將反應混合物用EtOAc(100mL)稀釋,並依次用飽和NH4Cl(100mL x 1)、和鹽水(100mL x 4)洗滌。將有機層經Na2SO4乾燥,過濾並蒸發以得到呈黃色固體的所希望的產物甲基4-((4-氟-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體80,2.5g,79%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 2.25-2.35(1H,m),2.35-2.45(1H,m),3.71(3H,s),3.82(3H,s),4.36-4.58(1H,m),4.56-4.74(1H,m),4.84(1H,q),7.14(1H,d),7.99(1H,dd),8.63(1H,d),8.67(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=315。
在氫下,將20% Pd(OH)2/C(0.547g,0.78mmol)添加至在MeOH(300mL)中的甲基4-((4-氟-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-3-硝基苯甲酸酯(中間體80,2.45g,7.80mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。反應完成。將該反應混合物通過矽藻土過濾。將濾液蒸發以得到呈灰色固體的甲
基2-(2-氟乙基)-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體81,1.9g,97%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ1.91-2.19(2H,m),3.75(3H,s),4.03(1H,m),4.49-4.73(2H,m),6.73(1H,d),6.91(1H,d),7.35(1H,d),7.42(1H,dd),10.46(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=253。
將DDQ(1.83g,8.07mmol)添加至在DCM(100mL)中的甲基2-(2-氟乙基)-3-側氧基-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體81,1.85g,7.33mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌3小時。將所得混合物在減壓下除去以獲得棕色固體。將NaHCO3飽和水溶液(100mL)添加至固體中,並在室溫下攪拌1小時。將沈澱物過濾並用另外的NaHCO3水溶液(30mL x 3)漂洗。將固體在真空下乾燥以得到呈灰色固體的甲基2-(2-氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體82,1.8g,98%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 3.23(2H,dt),3.89(3H,s),4.90(2H,dt),7.76-7.85(2H,m),7.88(1H,d),12.55(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=251。
在0℃下,將二異丁基氫化鋁在THF(15.99mL,15.99mmol)中的1M溶液分批添加至在THF(100mL)中的甲基2-(2-氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體82,1.0g,4.00mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。在0℃下,將反應混合物用飽和酒石酸鉀鈉水溶液(20mL)和MeOH(10mL)淬滅。將所得混合物攪拌1小時。將反應混合物過濾並用THF(30mL x 3)洗滌。將有機層蒸發以得到粗產物。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至60% MeOH)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈棕色固體的3-(2-氟乙基)-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體83,0.49
g,55.2%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 3.20(2H,dt),4.60(2H,d),4.90(2H,dt),5.41(1H,t),7.21(1H,dd),7.30(1H,d),7.68(1H,d),12.42(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=223。
將戴斯-馬丁高碘烷(229mg,0.54mmol)添加至在DCM(3mL)中的3-(2-氟乙基)-7-(羥基甲基)喹啉-2(1H)-酮(中間體83,100mg,0.45mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌2小時。將反應混合物蒸發,以得到粗產物。將粗產物藉由逆相層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至30% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈黃色固體的2-(2-氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲醛(中間體84,93mg,94%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 3.20-3.28(2H,m),4.90(2H,dt),7.74-7.80(2H,m),7.91(1H,d),10.06(1H,s),12.66(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=221。
將異丙氧基鈦(64.5mg,0.23mmol)添加至在THF(3mL)中的2-(2-氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲醛(中間體84,50mg,0.23mmol)和N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體13,50.0mg,0.23mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌2分鐘。添加三乙醯氧基硼氫化鈉(192mg,0.91mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2小時。在另一批次中重複此步驟,併合並兩批次進行純化。將合併的反應混合物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Prep OBD C18柱,30×150mm 5um;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流動相B:ACN;
流速:60mL/min;梯度:在7min內20B至35B;254/210nm;RT:6.38)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的5-[4-[[2-(2-氟乙基)-3-側氧基-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例25,4.83mg,2.54%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.53-2.59(4H,m),2.78(3H,d),3.17(1H,t),3.23(1H,t),3.32-3.38(4H,m),3.63(2H,s),4.83(1H,t),4.95(1H,t),7.25-7.32(2H,m),7.39(1H,dd),7.71(1H,d),7.83(1H,d),8.26(1H,d),8.37(1H,d),12.36(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -217.70;m/z(ES+)[M+H]+=425。
將異丙氧基鈦(90mg,0.32mmol)添加至在THF(3mL)中的2-(2-氟乙基)-3-側氧基-3,4-二氫喹啉-6-甲醛(中間體84,70mg,0.32mmol)和6-氟-N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體23,76mg,0.32mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌2分鐘。添加三乙醯氧基硼氫化鈉(269mg,1.27mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌1小時。將反應混合物用MeOH(0.1mL)淬滅。將反應混合物蒸發,以得到粗產物。將粗產物藉由製備型HPLC(柱:XBridge Prep OBD C18柱,30×150mm 5um;流動相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在8min內28B至35B;
254/210nm;RT:7)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到粗產物。將粗產物進一步藉由製備型HPLC(柱:Xselect CSH OBD柱30*150mm 5um,n;流動相A:水(0.1% HCO2H),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在7min內5B至20B;254;220nm;RT:6.83)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈黃色固體的6-氟-5-[4-[[2-(2-氟乙基)-3-側氧基-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例26,3.79mg,2.65%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.55-2.60(4H,m),2.76(3H,d),3.14-3.25(6H,m),3.63(2H,s),4.89(2H,dt),7.24-7.31(2H,m),7.57(1H,dd),7.70(1H,d),7.84(1H,d),8.24(0.174H,s),8.38(1H,d),12.37(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -72.51,-217.71;(ES+)[M+H]+=443。
將DIPEA(8.77mL,50.22mmol)添加至在DMF(20mL)中的甲基4-氟-3-硝基苯甲酸酯(2.0g,10.04mmol)和甲基2-胺基-4,4,4-三氟丁酸酯鹽酸鹽(中間體85,2.2g,10.55mmol)中。將所得混合物在50℃下攪拌10小時。將反應混合物用EtOAc(100mL)稀釋,並依次用飽和水性NH4Cl(100mL x 1)、和鹽水(100mL x 4)洗滌。將有機層經Na2SO4乾燥,過濾並蒸發以得到呈黃色固體的所希望的產物甲基3-硝基-4-((4,4,4-三氟-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)苯甲酸酯(中間體86,3.0g,85%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.99-3.28
(2H,m),3.73(3H,s),3.84(3H,s),5.18(1H,td),7.28(1H,d),8.01(1H,dd),8.65(1H,d),8.71(1H,d);m/z(ES+)[M+H]+=351。
在氫下,將20% Pd(OH)2/C(0.601g,0.86mmol)添加至在MeOH(300mL)中的甲基3-硝基-4-((4,4,4-三氟-1-甲氧基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)苯甲酸酯(中間體86,3.0g,8.57mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。將該反應混合物通過矽藻土過濾。將濾液蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的甲基3-側氧基-2-(2,2,2-三氟乙基)-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體87,2.3g,93%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.64-2.83(2H,m),3.76(3H,s),4.32-4.37(1H,m),6.78(1H,d),6.90(1H,d),7.37(1H,d),7.43(1H,dd),10.64(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=289。
將DDQ(1.975g,8.70mmol)添加至在DCM(100mL)中的甲基3-側氧基-2-(2,2,2-三氟乙基)-1,2,3,4-四氫喹啉-6-甲酸酯(中間體87,2.28g,7.91mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌3小時。將所得混合物在減壓下除去以獲得棕色固體。將NaHCO3飽和水溶液(100mL)添加至固體中,並在室溫下攪拌1小時。將沈澱物過濾並用另外的NaHCO3水溶液(30mL x 3)漂洗。將固體在真空下乾燥以得到呈棕色固體的甲基3-側氧基-2-(2,2,2-三氟乙基)-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體88,2.2g,97%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 3.88-3.98(5H,m),7.81(1H,dd),7.86-7.94(2H,m),12.75(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=287。
在0℃下,將二異丁基氫化鋁在THF(20.96mL,20.96mmol)中的1M溶液分批添加至在THF(100mL)中的甲基3-側氧基-2-(2,2,2-三氟乙基)-3,4-二氫喹啉-6-甲酸酯(中間體88,1.0g,3.49mmol)中。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。在0℃下,將反應混合物用飽和酒石酸鉀鈉水溶液(20mL)和MeOH(10mL)淬滅。將所得混合物攪拌1小時。將反應混合物過濾並用THF(30mL x 3)洗滌。將有機層蒸發以得到灰白色固體,將該固體藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為水(0.4% HCO2H)中的5%至55% MeOH)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈黃色固體的7-(羥基甲基)-3-(2,2,2-三氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(中間體89,650mg,72.2%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 3.88(2 H,q),4.62(2H,d),5.45(1H,t),7.24(1H,dd),7.33(1H,d),7.73(1H,d),12.62(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=259。
將7-(羥基甲基)-3-(2,2,2-三氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(中間體89,50mg,0.19mmol)添加至在AcOH(2mL,12.15mmol)中的33% HBr中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。將反應混合物在真空下蒸發以得到7-(溴甲基)-3-(2,2,2-三氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(粗產物)。將該產物不經進一步純化直接用於下一步驟。將DIPEA(0.169mL,0.97mmol)添加至在NMP(2mL)中的7-(溴甲基)-3-(2,2,2-三氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(粗產物)和N-甲基-5-(哌-1-基)吡啶醯胺(中間體13,50mg,0.23mmol)中,。將所得的混合物在80℃下
攪拌1小時。將反應混合物濃縮,藉由製備型HPLC(柱:Sunfire prep C18柱,30 x 150,5um;流動相A:水(0.1% HCO2H),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在7min內10B至25B;254/220nm;RT:6.57)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的N-甲基-5-[4-[[3-側氧基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例27,41.5mg,46.6%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.56(4H,m),2.78(3H,d),3.35(4H,m),3.65(2H,s),3.88(2H,q),7.29-7.42(3H,m),7.79(2H,m),8.25-8.30(1H,m),8.38(1H,m),12.60(1H,br s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -61.53;m/z(ES+)[M+H]+=461。
將7-(羥基甲基)-3-(2,2,2-三氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(中間體89,60mg,0.23mmol)添加至在AcOH(2mL,12.15mmol)中的33% HBr中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。將反應混合物在真空下蒸發以得到7-(溴甲基)-3-(2,2,2-三氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(粗產物)。將該產物不經進一步純化直接用於下一步驟。將DIPEA(0.203mL,1.16mmol)添加至在NMP(2mL)中的7-(溴甲基)-3-(2,2,2-三氟乙基)喹啉-2(1H)-酮(粗產物)和6-氟-N-甲基-5-(哌
-1-基)吡啶醯胺(中間體23,60mg,0.25mmol)中。將所得混合物在80℃下攪拌2小時。將所得混合物藉由製備型HPLC(柱:Sunfire prep C18柱,30 x 150,5um;流動相A:水(0.1% HCO2H),流動相B:ACN;流速:60mL/min;梯度:在7min內12B至30B;254/220nm;RT:6.25)進行純化。將含有所希望的化合物的級分蒸發至乾燥以得到呈灰白色固體的6-氟-N-甲基-5-[4-[[3-側氧基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4H-喹啉-6-基]甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例28,49.0mg,43.3%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 2.53-2.63(4H,m),2.76(3H,d),3.15-3.22(4H,m),3.65(2H,s),3.88(2H,q),7.28-7.35(2H,m),7.57(1H,dd),7.76(1H,d),7.84(1H,dd),8.17(0.185H,s),8.38(1H,m),12.57(1H,s);19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -61.54,-72.52;m/z(ES+)[M+H]+=479。
在20℃下,將DIPEA(330μl,1.89mmol)添加至7-(氯甲基)-3-乙基-1,5-啶-2(1H)-酮HCl(中間體17,70mg,0.27mmol)、碘化鈉(4.05mg,0.03mmol)和6-(二氟甲基)-N-甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體41,102mg,0.30mmol)在乙腈(2.4mL)中的攪拌溶液中,並將所得溶液在50℃下攪拌3小時。將溶劑在真空下除去並添加50mL水隨後3mL飽和NaHCO3。將混合物用乙酸乙酯萃取。濃縮後,將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫
梯度為DCM中的0%至30% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈淺黃色固體的6-(二氟甲基)-5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例29,52.0mg,42%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,t),2.54-2.58(2H,m),2.63(4H,br s),2.84(3H,d),3.03(4H,br t),3.68(2H,s),7.14(1H,t),7.62(1H,d),7.76(1H,s),7.86(1H,d),8.10(1H,d),8.32-8.45(2H,m),11.86(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=457。
在20℃下,將DIPEA(330μl,1.89mmol)添加至7-(氯甲基)-3-乙基-1,5-啶-2(1H)-酮HCl(中間體17,70mg,0.27mmol)、碘化鈉(4.05mg,0.03mmol)和N-甲基-5-哌-1-基-6-(三氟甲基)吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體38,107mg,0.30mmol)在乙腈(2.4mL)中的攪拌溶液中,並將所得溶液在50℃下攪拌3小時。將溶劑在真空下除去並添加50mL水隨後3mL飽和NaHCO3。將混合物用乙酸乙酯萃取。濃縮後,將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至30% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈淺黃色固體的5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-6(三氟甲基)吡啶-2-甲醯胺(實例30,58.0mg,45%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,t),2.54-2.62(6H,m),2.83(3H,d),3.04(4H,br t),
3.67(2H,s),7.62(1H,d),7.75(1H,s),8.04(1H,d),8.19(1H,d),8.31-8.48(2H,m),11.85(1H,s);m/z(ES+)[M+H]+=475。
在20℃下,將DIPEA(0.366mL,2.10mmol)添加至7-(溴甲基)-3-乙基-1,5-啶-2(1H)-酮(中間體14,80mg,0.30mmol)和N,6-二甲基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體45,101mg,0.33mmol)在乙腈(2mL)中的攪拌溶液中,並將所得溶液在70℃下攪拌3小時。將溶劑在真空下除去並添加50mL水隨後3mL飽和NaHCO3。將混合物用乙酸乙酯萃取。濃縮後,將所得殘餘物藉由快速二氧化矽層析法(洗脫梯度為DCM中的0%至30% MeOH)進行純化。將產物級分在減壓下濃縮至乾燥以得到呈淺黃色固體的5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]-N,6-二甲基-吡啶-2-甲醯胺(實例31,36.0mg,29%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.19(3H,t),2.50(3H,s),2.54-2.57(2H,m),2.57-2.64(4H,m),2.81(3H,d),2.96(4H,br s),3.68(2H,s),7.49(1H,d),7.63(1H,d),7.76(1H,s),7.80(1H,d),8.35-8.47(2H,m),11.85(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=421。
將在甲醇中的乙胺(7M,7.78mL,15.56mmol)添加至三級丁基4-(6-(甲氧基羰基)吡啶-3-基)哌-1-甲酸酯(中間體15,500mg,1.56mmol)的溶液中,並將所得溶液在50℃下攪拌18小時。將溶劑在真空下除去並將樣本進一步乾燥以得到三級丁基4-[6-(乙基胺基甲醯基)-3-吡啶基]哌-1-甲酸酯(中間體90,0.495g,95%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.11(3H,t),1.43(9H,s),3.27-3.32(6H,m),3.44-3.52(4H,m),7.42(1H,dd),7.85(1H,d),8.28(1H,d),8.44(1H,br t)。
將在二中的HCl(0.473mL,15.58mmol)緩慢添加至三級丁基4-(6-(乙基胺基甲醯基)吡啶-3-基)哌-1-甲酸酯(中間體90,521mg,1.56mmol)在甲醇(10mL)中的攪拌溶液中。將所得溶液在室溫下攪拌17小時。將反應濃縮,並將固體乾燥以給出N-乙基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體91,421mg,88%);m/z(ES+)[M+H]+=235
在20℃下,將DIPEA(0.320mL,1.83mmol)添加至7-(溴甲基)-3-乙基-1,5-啶-2(1H)-酮(中間體14,70mg,0.26mmol)、和N-乙基-5-哌-1-基-吡啶-2-甲醯胺2HCl(中間體91,89mg,0.29mmol)在乙腈(2mL)中的攪拌溶液中,並將所得溶液在70℃下攪拌3小時。將溶劑在真空下除去並添加50mL水隨後3mL飽和NaHCO3。將混合物用乙酸乙酯萃取。濃縮後,將粗產物藉由逆相層析法((柱:XbridC18),洗脫梯度為水(具有0.2% NH4OH)中的20%至50% MeCN)進行純化。將純級分蒸發至乾燥以得到呈白色固體的N-乙基-5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]吡啶-2-甲醯胺(實例32,28.0mg,25%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)1.10(3H,t),1.19(3H,t),2.52-2.55(2H,m),2.55-2.59(4H,m),3.26-3.30(2H,m),3.34(4H,br d),3.66(2H,s),7.40(1H,dd),7.63(1H,s),7.76(1H,s),7.83(1H,d),8.27(1H,d),8.36-8.46(2H,m),11.74-11.94(1H,m);m/z(ES+)[M]+=420。
在實例4中,通過在減壓下蒸發甲醇/二氯乙烷溶液獲得呈部分結晶固體的5-[4-[(7-乙基-6-側氧基-5H-1,5-啶-3-基)甲基]哌-1-基]-N-甲基-吡啶-2-甲醯胺。如此獲得的結晶材料被表徵為結晶形式A。
在結晶度較差的情況下,可以藉由在環境溫度或環境溫度下或在50℃下,將20mg粗樣本懸浮於0.20ml的水、甲醇、乙醇、丙酮、乙腈、四氫呋喃、乙酸乙酯或其他溶劑中持續1天,獲得結晶形式A。
將形式A藉由XRPD進行分析並且將結果如下列表(表1)並且在圖1中示出。
形式A的特徵在於提供使用CuKα輻射測量的以下2θ值中的至少一者:8.3、12.4、和19.4°。
藉由熱技術對形式A進行分析。DSC分析表明,形式A具有在254℃開始並且在255℃達到峰的熔點。形式A之代表性DSC軌跡圖示於圖2中。
可以採用以下測試程序來確定本文所述化合物之抑制性質。
將重組全長6HIS標記的PARP1蛋白用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋至6nM,並用等體積的2nM螢光探針(用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋)孵育四小時。探針之最終DMSO濃度保持在1%(v/v)以下。
將重組全長PARP2蛋白用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋至6nM,並用等體積的2nM螢光探針(用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋)孵育四小時。探針之最終DMSO濃度保持在1%(v/v)以下。
將重組全長PARP3蛋白用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋至100nM,並用等體積的6nM螢光探針(用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋)孵育四小時。探針之最終DMSO濃度保持在1%(v/v)以下。
將重組PARP5a結合域用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋至160nM,並用等體積的6nM螢光探針(用50
mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋)孵育四小時。探針之最終DMSO濃度保持在1%(v/v)以下。
將重組全長GST標記的PARP6蛋白用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋至160nM,並用等體積的6nM螢光探針(用50mM Tris pH 8、0.001% Triton X100、10mM MgCl2、150mM NaCl稀釋)孵育四小時。探針之最終DMSO濃度保持在1%(v/v)以下。
在存在測試化合物或溶劑對照之情況下,使用BMG Pherastar FS©測量了與蛋白質結合時探針的螢光各向異性,並確定了對各向異性之影響。計算不同測試化合物濃度之%抑制值,並將其擬合到四參數對數圖以確定IC50值。必要時,化合物K i可以使用Anal Biochem.[分析生物化學]1980年9月1日;107(1):220-39定義的Munson Rodbard方程、根據IC50值確定,並且其基於與相關PARP蛋白結合的探針的已知K D。
使用Nanion Syncropatch 768PE從穩定轉染的CHO hKv11.1細胞獲得電生理記錄(均在RT下進行)。以6個化合物板(每個在不同的濃度下)添加測試化合物、媒介物或陽性對照,以允許向細胞給予累積劑量(10mM、3.167mM、1mM、0.3167mM、0.1mM、0.03167mM)。將600ηl的化合物重懸於90μl的參比緩衝液(以mM計,NaCl 80、KCL 4、CaCl 5、MgCl 1、NMDG Cl 60、D-葡萄糖一水合物5、HEPES 10(pH 7.4 HCL,298mOsm)),最終化合物濃度為39.6μM、13.2μM、4.4μM、1.46μM、0.48μM、0.16μM。對於每次Nanion Syncropatch 768PE運行,使用Syncropatch液體處理系統進行的所有液體添加來測量在存在細胞外溶液(以mM計,NaCl 80、KCL 4、CaCl 5、MgCl 1、NMDG Cl 60、D-葡萄糖一水合物5、HEPES 10(pH 7.4 HCL、298mOsm))時每個孔中
的電流振幅。將40μL外部溶液(以mM計,HBPS、CaCl2 2、MgCl2 1(pH 7.4、NaOH))添加至384孔多孔介質電阻記錄晶片中,並將內部緩衝液(以mM計,KF 130、KCl 20、MgCl2 1、EGTA 10、HEPES 10、Escin 25(均來自西格瑪奧德里奇公司(Sigma-Aldrich);使用10M KOH使得達到pH 7.2-7.30,320mOsm)灌注至板的底部。以1e6個細胞/ml的密度將20μL的保持在約9℃的細胞分配到晶片之每個孔中,隨後添加20μL的密封增強劑(以mM計,NaCl 80、KCl 3、CaCl 10、HEPES 10、MgCl 1(pH 7.4 NaOH))。執行洗滌步驟,殘餘體積為40μL。在添加測試化合物之前,分配40μL的參比緩衝液以建立穩定的基線,並在3min後進行40μL去除步驟,重複此步驟。分配40μL的濃度1(0.16μM)化合物,「即時」記錄3min暴露,然後去除40μL。對另外5個後續化合物板重複此步驟,以生成累積曲線分析。所有數據均進行漏電扣除,2個脈衝至-80mV 100ms,100ms延遲。然後,將向外的K+電流從-90mV的保持電勢藉由電壓階躍誘發到+60mV,每個脈衝以2Hz的頻率以15s的脈衝間隔傳送。
在完全培養基中收穫密度分別為1.875E4個細胞/ml和6.25E4個細胞/ml的DLD1細胞和BRCA2(-/-)DLD1細胞,使用Multidrop Combi將它們以40μL/孔接種到384孔板(格瑞納公司(Greiner),克雷姆斯明斯特(Kremsmunster),奧地利;781090)中,然後在37℃、5% CO2下孵育過夜。第二天(第1天),使用Multidrop Combi將sytox綠(sytox green)(5ul,2uM)和皂素(10ul,0.25%儲備液)添加至第0天的板中,使用黑色膠蓋密封板,並在RT下孵育>3hr。使用裝有4x物鏡的Cell Insight(賽默飛世爾公司(Thermo Fisher))對細胞成像。使用Echo 555添加測試化合物,並將其置於保持在37℃、5% CO2下的培養箱中,並孵育4天。在第5天,向板中添加sytox綠(5ul,2uM),然後添加皂素(10ul,
0.25%儲備液),使用黑色膠蓋密封板並在RT下孵育>3hr。使用4x物鏡讀取Cell Insight上的所有細胞。藉由評估針對第0天和第5天的板的、Cell Insight輸出的總細胞數,確定Genedata中的增殖速率。
[圖1]示出了實例4(形式A)之X射線粉末繞射
[圖2]示出了實例4(形式A)之DSC軌跡
Claims (28)
- 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中R2選自二氟甲基、三氟甲基或甲基。
- 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中R2係H或鹵素。
- 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中R1係乙基,R2選自H、氯和氟,且R3係甲基。
- 一種醫物組合物,其包含如請求項1至7中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽,以及至少一種醫藥上可接受的稀釋劑、賦形劑或惰性載劑。
- 如請求項1至7中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽,用於用作藥物。
- 如請求項1至7中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽,用於在癌症的治療中使用。
- 如請求項10之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該癌症缺乏HR依賴性DNA DSB修復途徑。
- 如請求項10之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該癌症包含一種或多種癌細胞,該等癌細胞相對於正常細胞具有降低的或消除的藉由HR修復DNA DSB之能力。
- 如請求項10之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該癌細胞具有BRCA1或BRCA2缺陷表現型。
- 如請求項13之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該癌細胞缺乏BRCA1或BRCA2。
- 如請求項11之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該個體對於編碼HR依賴性DNA DSB修復途徑的組分的基因中的突變係雜合的(heterozygous)。
- 如請求項15之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該個體對於BRCA1和/或BRCA2中的突變係雜合的。
- 如請求項10之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該癌症選自乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌、和肺癌中的任一者。
- 一種如請求項1至7中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽之用途,其係用於製備治療癌症的藥物。
- 如請求項18之用途,其中該癌症缺乏HR依賴性DNA DSB修復途徑。
- 如請求項18之用途,其中該癌症包含一種或多種癌細胞,該等癌細胞相對於正常細胞具有降低的或消除的藉由HR修復DNA DSB之能力。
- 如請求項19或20之用途,其中該癌細胞具有BRCA1或BRCA2缺陷表現型。
- 如請求項21之用途,其中該癌細胞缺乏BRCA1或BRCA2。
- 如請求項19或20之用途,其中該個體對於編碼HR依賴性DNA DSB修復途徑的組分的基因中的突變係雜合的。
- 如請求項23之用途,其中該個體對於BRCA1和/或BRCA2中的突變係雜合的。
- 如請求項18至20中任一項之用途,其中該癌症選自乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌、和肺癌中的任一者。
- 如請求項1至7中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽,用於治療或預防其中PARP1的抑制係有益的疾病和病症。
- 如請求項26之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該疾病或病症係癌症。
- 如請求項27之化合物或其醫藥上可接受的鹽,其中該癌症選自乳癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、血液癌、胃腸道癌、和肺癌中的任一者。
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