SK3302002A3 - Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and methods of use thereof - Google Patents

Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and methods of use thereof Download PDF

Info

Publication number
SK3302002A3
SK3302002A3 SK330-2002A SK3302002A SK3302002A3 SK 3302002 A3 SK3302002 A3 SK 3302002A3 SK 3302002 A SK3302002 A SK 3302002A SK 3302002 A3 SK3302002 A3 SK 3302002A3
Authority
SK
Slovakia
Prior art keywords
compound
formula
compound according
mmol
cycloalkyl
Prior art date
Application number
SK330-2002A
Other languages
English (en)
Inventor
Victoria M Richon
Paul A Marks
Richard A Rifkind
Ronald Breslow
Sandro Belvedere
Leland Gershell
Thomas A Miller
Original Assignee
Sloan Kettering Inst Cancer
Univ Columbia
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Sloan Kettering Inst Cancer, Univ Columbia filed Critical Sloan Kettering Inst Cancer
Publication of SK3302002A3 publication Critical patent/SK3302002A3/sk

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C235/00—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by oxygen atoms
    • C07C235/70—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by oxygen atoms having carbon atoms of carboxamide groups and doubly-bound oxygen atoms bound to the same carbon skeleton
    • C07C235/72—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by oxygen atoms having carbon atoms of carboxamide groups and doubly-bound oxygen atoms bound to the same carbon skeleton with the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D213/00—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D213/02—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D213/04—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D213/60—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D213/72—Nitrogen atoms
    • C07D213/75—Amino or imino radicals, acylated by carboxylic or carbonic acids, or by sulfur or nitrogen analogues thereof, e.g. carbamates
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/01—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C233/02—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having nitrogen atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to carbon atoms of unsubstituted hydrocarbon radicals
    • C07C233/04—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having nitrogen atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to carbon atoms of unsubstituted hydrocarbon radicals with carbon atoms of carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton
    • C07C233/07—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having nitrogen atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to carbon atoms of unsubstituted hydrocarbon radicals with carbon atoms of carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/01—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C233/12—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by halogen atoms or by nitro or nitroso groups
    • C07C233/13—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by halogen atoms or by nitro or nitroso groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C235/00—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by oxygen atoms
    • C07C235/70—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by oxygen atoms having carbon atoms of carboxamide groups and doubly-bound oxygen atoms bound to the same carbon skeleton
    • C07C235/72—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by oxygen atoms having carbon atoms of carboxamide groups and doubly-bound oxygen atoms bound to the same carbon skeleton with the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C235/74—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by oxygen atoms having carbon atoms of carboxamide groups and doubly-bound oxygen atoms bound to the same carbon skeleton with the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of a saturated carbon skeleton
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C237/00—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups
    • C07C237/02—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton
    • C07C237/04—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C237/12—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to an acyclic carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C237/00—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups
    • C07C237/02—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton
    • C07C237/22—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton having nitrogen atoms of amino groups bound to the carbon skeleton of the acid part, further acylated
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C259/00—Compounds containing carboxyl groups, an oxygen atom of a carboxyl group being replaced by a nitrogen atom, this nitrogen atom being further bound to an oxygen atom and not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C259/04—Compounds containing carboxyl groups, an oxygen atom of a carboxyl group being replaced by a nitrogen atom, this nitrogen atom being further bound to an oxygen atom and not being part of nitro or nitroso groups without replacement of the other oxygen atom of the carboxyl group, e.g. hydroxamic acids
    • C07C259/06—Compounds containing carboxyl groups, an oxygen atom of a carboxyl group being replaced by a nitrogen atom, this nitrogen atom being further bound to an oxygen atom and not being part of nitro or nitroso groups without replacement of the other oxygen atom of the carboxyl group, e.g. hydroxamic acids having carbon atoms of hydroxamic groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C271/00—Derivatives of carbamic acids, i.e. compounds containing any of the groups, the nitrogen atom not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C271/06—Esters of carbamic acids
    • C07C271/08—Esters of carbamic acids having oxygen atoms of carbamate groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C271/10—Esters of carbamic acids having oxygen atoms of carbamate groups bound to acyclic carbon atoms with the nitrogen atoms of the carbamate groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C271/22—Esters of carbamic acids having oxygen atoms of carbamate groups bound to acyclic carbon atoms with the nitrogen atoms of the carbamate groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms to carbon atoms of hydrocarbon radicals substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/01—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C311/02—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton
    • C07C311/03—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton having the nitrogen atoms of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/01—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C311/02—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton
    • C07C311/03—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton having the nitrogen atoms of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C311/06—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton having the nitrogen atoms of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms to acyclic carbon atoms of hydrocarbon radicals substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/30—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/37—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring
    • C07C311/38—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring having sulfur atoms of sulfonamide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered rings of the same carbon skeleton
    • C07C311/39—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring having sulfur atoms of sulfonamide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered rings of the same carbon skeleton having the nitrogen atom of at least one of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to an acyclic carbon atom
    • C07C311/42—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring having sulfur atoms of sulfonamide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered rings of the same carbon skeleton having the nitrogen atom of at least one of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to an acyclic carbon atom to an acyclic carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C327/00—Thiocarboxylic acids
    • C07C327/20—Esters of monothiocarboxylic acids
    • C07C327/32—Esters of monothiocarboxylic acids having sulfur atoms of esterified thiocarboxyl groups bound to carbon atoms of hydrocarbon radicals substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D213/00—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D213/02—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D213/04—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D213/60—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D213/78—Carbon atoms having three bonds to hetero atoms, with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals
    • C07D213/81—Amides; Imides
    • C07D213/82—Amides; Imides in position 3
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D215/00—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems
    • C07D215/02—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D215/16—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D215/38—Nitrogen atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D215/00—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems
    • C07D215/02—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D215/16—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D215/38—Nitrogen atoms
    • C07D215/40—Nitrogen atoms attached in position 8
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D215/00—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems
    • C07D215/02—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D215/16—Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D215/48—Carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen
    • C07D215/54—Carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen attached in position 3
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D231/00—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings
    • C07D231/02—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings
    • C07D231/10—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D231/12—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with only hydrogen atoms, hydrocarbon or substituted hydrocarbon radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D231/00—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings
    • C07D231/02—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings
    • C07D231/10—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D231/14—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D231/38—Nitrogen atoms
    • C07D231/40—Acylated on said nitrogen atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D233/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings
    • C07D233/54—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D233/56—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with only hydrogen atoms or radicals containing only hydrogen and carbon atoms, attached to ring carbon atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D233/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings
    • C07D233/54—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D233/64—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with substituted hydrocarbon radicals attached to ring carbon atoms, e.g. histidine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D249/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having three nitrogen atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D249/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having three nitrogen atoms as the only ring hetero atoms not condensed with other rings
    • C07D249/08—1,2,4-Triazoles; Hydrogenated 1,2,4-triazoles
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D277/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-thiazole or hydrogenated 1,3-thiazole rings
    • C07D277/02—Heterocyclic compounds containing 1,3-thiazole or hydrogenated 1,3-thiazole rings not condensed with other rings
    • C07D277/20—Heterocyclic compounds containing 1,3-thiazole or hydrogenated 1,3-thiazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D277/32—Heterocyclic compounds containing 1,3-thiazole or hydrogenated 1,3-thiazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D277/38—Nitrogen atoms
    • C07D277/44—Acylated amino or imino radicals
    • C07D277/46—Acylated amino or imino radicals by carboxylic acids, or sulfur or nitrogen analogues thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D333/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one sulfur atom as the only ring hetero atom
    • C07D333/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one sulfur atom as the only ring hetero atom not condensed with other rings
    • C07D333/04—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one sulfur atom as the only ring hetero atom not condensed with other rings not substituted on the ring sulphur atom
    • C07D333/26—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one sulfur atom as the only ring hetero atom not condensed with other rings not substituted on the ring sulphur atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D333/38—Carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
    • C07F9/02—Phosphorus compounds
    • C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
    • C07F9/22—Amides of acids of phosphorus
    • C07F9/24—Esteramides
    • C07F9/2454—Esteramides the amide moiety containing a substituent or a structure which is considered as characteristic
    • C07F9/2458—Esteramides the amide moiety containing a substituent or a structure which is considered as characteristic of aliphatic amines
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
    • C07F9/02—Phosphorus compounds
    • C07F9/28—Phosphorus compounds with one or more P—C bonds
    • C07F9/38—Phosphonic acids [RP(=O)(OH)2]; Thiophosphonic acids ; [RP(=X1)(X2H)2(X1, X2 are each independently O, S or Se)]
    • C07F9/44—Amides thereof
    • C07F9/4461—Amides thereof the amide moiety containing a substituent or a structure which is considered as characteristic
    • C07F9/4465—Amides thereof the amide moiety containing a substituent or a structure which is considered as characteristic of aliphatic amines
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C2601/00—Systems containing only non-condensed rings
    • C07C2601/12—Systems containing only non-condensed rings with a six-membered ring
    • C07C2601/14—The ring being saturated

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Pyridine Compounds (AREA)
  • Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
  • Hydrogenated Pyridines (AREA)
  • Quinoline Compounds (AREA)

Description

Nová trieda cytodiferencujúcich prostriedkov a inhibítorov históndeacetylázy a spôsoby ich použitia
Táto prihláška sa odvoláva na predbežnú prihlášku USA č. 60/208,688 podanú 1.6.2000 a predbežnú prihlášku USA č. 60/152,755 podanú 8.9.1999.
V rámci tejto prihlášky sú odkazy na rôzne publikácie uvedené arabskými číslami v zátvorkách. Plné citácie týchto publikácií možno nájsť na konci špecifikácie hneď pred nárokmi. Tieto publikácie sa celé týmto zahŕňajú odkazom do tejto prihlášky, aby sa úplnejšie opísal doterajší stav techniky, ktorej sa týka tento vynález.
Doterajší stav techniky
Rakovina je porucha, pri ktorej populácia buniek v rôznych stupňoch prestane reagovať na kontrolné mechanizmy, ktoré normálne riadia proliferáciu a diferenciáciu. Nedávnym prístupom k terapii rakoviny bolo pokúsiť sa o indukciu terminálnej diferenciácie neoplastických buniek (1). V modeloch bunkových kultúr bola udávaná diferenciácia expozíciou buniek voči radu stimulov vrátane cyklického AMP a kyseliny retinoovej (2, 3), aklarubicínu a ďalších antracyklínov (4).
Existujú rozsiahle dôkazy, že neoplastická transformácia nemusí nutne zničiť potenciál rakovinových buniek diferencovať sa (1, 5, 6). Existuje mnoho príkladov nádorových buniek, ktoré nereagujú na normálne regulátory proliferácie a zdá sa, že sú blokované v expresii svojho diferenciačného programu, ale predsa ich možno indukovať, aby sa diferencovali a prestali sa replikovať. Rad prostriedkov vrátane niektorých pomerne jednoduchých polárnych zlúčenín (5, 7 9), derivátov vitamínu D a kyseliny retinoovej (10-12), steroidných hormónov (13), rastových faktorov (6, 14), proteáz (15, 16), nádorových promótorov (17, 18) a inhibítorov syntézy DNA alebo RNA (4, 19-24) môže indukovať rôzne transformované bunkové línie a primárne ľudské nádorové explantáty, aby vykazovali diferencovanejšie charakteristiky.
Skoršie štúdie niektorých z autorov tohto vynálezu identifikovali sériu polárnych zlúčenín, ktoré boli účinnými induktormi diferenciácie v rade transformovaných bunkových línií (8,9).
Jedným z takých účinných induktorov bola hybridná polárno-nepolárna zlúčenina Ν,Ν'-hexametylénbisacetamid (HMBA) (9), ďalším bola suberoylanilid hydroxámová kyselina (SAHA) (39, 50). Použitie týchto zlúčenín na indukovanie buniek myšej erytroleukémie (MEL), aby prešli erytroidnou diferenciáciu s potlačením onkogénnosti, sa ukázalo ako užitočný model na študovanie induktorom sprostredkovanej diferenciácie transformovaných buniek (5, 7-9).
Terminálna erytroidná diferenciácia buniek MEL indukovaná pomocou HMBA je viacstupňový proces. Po pridaní HMBA k bunkám MEL (745A-DS19) v kultúre nasleduje latentné obdobie 10 až 12 hodín, kým sa zistí komitment terminálnej diferenciácie.
Komitment je definovaný ako schopnosť buniek vykazovať terminálnu diferenciáciu napriek odstráneniu induktora (25). Pri pokračujúcom pôsobení HMBA nastáva progresívny recruitment buniek na diferenciáciu. Autori tejto prihlášky publikovali, že bunkové línie MEL zodolnené voči relatívne nízkym hladinám vinkristínu sa stali výrazne citlivejšími na indukčné pôsobenie HMBA a možno ich indukovať na diferenciáciu s krátkou alebo žiadnou latentnou dobou (26).
HMBA dokáže indukovať fenotypické zmeny konzistentné s diferenciáciou v celom rade bunkových línií (5). Charakteristiky liečivom indukovaného účinku boli rozsiahlo študované v bunkovom systéme myšej erytroleukémie (5, 25, 27, 28). Indukcia diferenciácie buniek MEL je časovo aj koncentračné závislá. Minimálna koncentrácia potrebná na preukázanie účinku in vitro u väčšiny kmeňov je 2 až 3mM; minimálne trvanie kontinuálnej expozície vo všeobecnosti vyžadovanej na indukciu diferenciácie v podstatnej časti (>20 %) populácie bez pokračujúcej expozície voči liečivu je približne 36 hodín.
Existujú dôkazy, že proteínkináza C je zapojená do dráhy induktorom sprostredkovanej diferenciácie (29). In vitro štúdie poskytli základ na hodnotenie potenciálu HMBA ako cytodiferenciačného prostriedku pri liečbe ľudských rakovín (30). Bolo dokončených niekoľko klinických štúdií fázy I s HMBA (31 - 36). Klinické štúdie tiež ukázali, že táto zlúčenina môže indukovať terapeutickú odozvu u pacientov s rakovinou (35, 36). Tieto klinické štúdie fázy I však tiež ukázali, že potenciálna účinnosť HMBA je obmedzená čiastočne dávkovo závislou toxicitou, ktorá bráni dosiahnutiu optimálnych krvných hladín, a potrebou intravenózneho podávania veľkých množstiev tohto prostriedku počas dlhých období. Preto niektorí z autorov predloženého vynálezu obrátili pozornosť na syntézu zlúčenín, ktoré sú potentnejšie a prípadne menej toxické ako HMBA (37).
Nedávno sa ukázalo, že trieda zlúčenín, ktoré indukujú diferenciáciu, inhibuje históndeacetylázy. Ukázalo sa, že niekoľko experimentálnych protinádorových zlúčenín, napríklad trichostatín A (TSA), trapoxín, suberoylanilid hydroxámová kyselina (SAHA) a fenylbutyrát pôsobia aspoň čiastočne inhibíciou históndeacetyláz (38, 39, 42). Okrem toho sa ukázalo, že dialylsulfid a príbuzné molekuly (43), oxamflatín, (44), MS-27-275, syntetický derivát benzamidu, (45) butyrátové deriváty (46), FR901228 (47), depudecin (48) a bishydroxamid kyseliny m-karboxyškoricovej (39) inhibujú históndeacetylázy. In vitro tieto zlúčeniny môžu inhibovať rast fíbroblastových buniek zastavením bunkového cyklu vo fázach G1 a G2 (49 - 52) a môžu viesť k terminálnej diferenciácii a strate transformačného potenciálu radu transformovaných bunkových línií (49 - 51). In vivo je fenylbutyrát účinný pri liečbe akútnej promyelocytickej leukémie v spojení s kyselinou retinoovou (53).
SAHA je účinná pri zabraňovaní tvorby prsníkových nádorov u potkanov a nádorov pľúc u myší (54, 55).
Patent USA č. 5,369,108 (41) vydaný niektorým z autorov predloženej prihlášky vynálezu publikuje zlúčeniny užitočné pri selektívnej indukcii terminálnej diferenciácie neoplastických buniek, ktoré zlúčeniny majú dve polárne koncové skupiny oddelené pružným reťazcom metylénových skupín, kde jedna alebo obe polárne koncové skupiny sú veľkými hydrofóbnymi skupinami. Uvádza sa, že také zlúčeniny sú aktívnejšie ako HMBA a zlúčeniny príbuzné HMBA.
Patent USA č. 5,369,108 však neuvádza, že ďalšia veľká hydrofóbna skupina na tom istom konci molekuly ako prvá hydrofóbna skupina ďalej zvyšuje diferenciačnú aktivitu asi 10O-násobne v enzymatickom teste a asi 50- krát v teste bunkovej diferenciácie.
Táto nová trieda zlúčenín podľa predloženého vynálezu môže byť užitočná na selektívnu indukciu terminálnej diferenciácie neoplastických buniek a preto môže pomáhať pri liečbe nádorov u pacientov.
Podstata vynálezu
Predložený vynález poskytuje zlúčeninu vzorca:
O
kde R1 a R2 sú rovnaké alebo rôzne a obe sú hydrofóbnym zoskupením; kde R3 je hydroxámová kyselina, hydroxylamino, hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; a n je celé číslo od 3 do 10, alebo jej farmaceutický prijateľnú soľ.
Predložený vynález poskytuje aj zlúčeninu vzorca:
R2 kde R1 a R2 je substituovaný alebo nesubstituovaný aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridín; kde R3 je hydroxámová kyselina, hydroxylamino, hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; kde R4 je vodík, halogén, fenyl alebo cykloalkyl; kde A môže byť rovnaké alebo rôzne a predstavuje amidové zoskupenie, , -0-, -S-, -NR5- alebo -CH2-, kde R5 je substituovaný alebo nesubstituovaný C,-C5 alkyl; a kde n je celé číslo od 3 do 10, alebo jej farmaceutický prijateľnú soľ.
Predložený vynález poskytuje aj spôsob selektívnej indukcie terminálnej diferenciácie neoplastických buniek a tým inhibicie proliferácie takých buniek, ktorý zahŕňa kontaktovanie buniek za vhodných podmienok s účinným množstvom vyššie uvedenej zlúčeniny.
Prehľad obrázkov na výkresoch
Obrázok 1. Účinok zlúčeniny 1 podľa predloženého vynálezu na diferenciáciu buniek MEĽ
Obrázok 2. Účinok zlúčeniny 1 podľa predloženého vynálezu na aktivitu históndeacetylázy 1.
Obrázok 3. Účinok zlúčeniny 2 podľa predloženého vynálezu na diferenciáciu buniek MEL.
Obrázok 4. Účinok zlúčeniny 3 podľa predloženého vynálezu na diferenciáciu buniek MEL.
Obrázok 5. Účinok zlúčeniny 3 podľa predloženého vynálezu na aktivitu históndeacetylázy 1.
Obrázok 6. Účinok zlúčeniny 4 podľa predloženého vynálezu na diferenciáciu buniek MEL.
Obrázok 7. Účinok zlúčeniny 4 podľa predloženého vynálezu na aktivitu históndeacetylázy 1.
Obrázok 8. Fotoafinitná značka (3H-498) sa viaže priamo na HDAC 1.
Obrázok 9. SAHA spôsobuje akumuláciu acetylovaných histónov H3 a H4 v xenoimplantáte nádoru CWR22 u myši.
Obrázok 10. SAHA spôsobuje akumuláciu acetylovaných histónov H3 a H4 v jednojadrových bunkách periférnej krvi u pacientov. SAHA sa podávala IV infúziou 3 x denne. Vzorky sa izolovali pred infúziou, po nej a 2 hodiny po infúzii.
Obrázky 11a - 11f. Ukazujú účinok vybraných zlúčenín na afinitne vyčistený ľudským epitopom značkovaný (Flag) HDAC1.
Podrobný popis vynálezu
Predložený vynález poskytuje zlúčeninu vzorca:
O .t .(CH2)n R3
R1^
R2 o kde R1 a R2 sú rovnaké alebo rôzne a obe sú hydrofóbnym zoskupením; kde R3 je hydroxámová kyselina, hydroxy lamino, hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; a n je celé číslo od 3 do 10; alebo farmaceutický prijateľnú soľ tejto zlúčeniny.
Vo vyššie uvedenej zlúčenine je R1 aj R2 naviazané priamo alebo cez mostík a je to substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
Kde je použitý mostík, môže ním byť amidové zoskupenie, -0-, -S-, -NH-, alebo -CH2-.
Podľa tohto vynálezu môže n byť 3 -10, s výhodou 3 - 8, s väčšou výhodou 3 - 7, s ešte väčšou výhodou 4, 5 alebo 6 a s najväčšou výhodou 5.
Podľa ďalšieho uskutočnenia vynálezu má zlúčenina vzorec:
NH kde R4 je substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl. R2 môže byť -amid-R5, kde R5 je substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
Podľa ďalšieho uskutočnenia vynálezu má zlúčenina vzorec:
kde R1 a R2 je substituovaný alebo nesubstituovaný aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridín; kde R3 je hydroxámová kyselina, hydroxylamino, hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; kde R4 je vodík, halogén, fenyl alebo cykloalkyl; kde A môže byť rovnaké alebo rôzne a predstavuje amidové zoskupenie, , -0-, -S-, -NR5- alebo -CH2-, kde R5 je substituovaný alebo nesubstituovaný C,-C5 alkyl; a kde n je celé číslo od 3 do 10, alebo jej farmaceutický prijateľnú soľ.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
ΝΗΟΗ
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
O
Rt
NHOH
R2
O
kde R1 aj R2 je substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, t-butyl, aryloxy, arylalkyloxy, alebo pyridín; a kde n je celé číslo od 3 do 8.
Aryl alebo cykloalkyl môže byť substituovaný nasledujúcimi substituentmi: metyl, kyano, nitro, trifluórmetyl, amino, aminokarbonyl, metylkyano, chlór, fluór, bróm, jód, 2,3-difluór, 2,4-difluór, 2,5-difluór, 3,4-difluór, 3,5-difluór, 2,6-difluór, 1,2,3-trifluór, 2,3,6-trifluór, 2,4,6-trifluór, 3,4,5-trifluór, 2,3,5,6-tetrafluór, 2,3,4,5,6pentafluór, azido, hexyl, t-butyl, fenyl, karboxyl, hydroxyl, metoxy, fenyloxy, benzyloxy, fenylaminooxy, fenylaminokarbonyl, metyoxykarbonyl, metylaminokarbonyl, dimetylamino, dimetylaminokarbonyl alebo hydroxylaminokarbonyl.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomer.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
ο
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
'(θΗ2)η> ,ΝΗΟΗ
ŇH .Ο Ο ,Ν alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
O alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
alebo jej enantiomér.
Vynález zahŕňa aj enantioméry a soli vyššie uvedených zlúčenín
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
Ο
R5
kde R1 a R2 sú rovnaké alebo rôzne a obe sú hydrofóbnym zoskupením; kde R5 je -C(O)-NHOH (hydroxámová kyselina), -C(O)-CF3 (trifluóracetyl), -NH-P(O)OHCH3, -SO2NH2 (sulfónamid), -SH (tiol), -C(O)-R6, kde R6 je hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; a n je celé číslo od 3 do 10, alebo jej farmaceutický prijateľná soľ.
Vo vyššie uvedenej zlúčenine môže byť R1 aj R2 naviazané priamo alebo cez mostík a je to substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
Mostíkom môže byť amidové zoskupenie, -0-, -S-, -NH-, alebo -CH2-.
Podľa ďalšieho uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
R2
HN
R7 kde R7 je substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
Vo vyššie uvedenej zlúčenine R2 môže byť sulfónamid-R6 alebo -amid-R8, kde R8 je substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
R2 môže byť -NH-C(O)-Y, -NH-SOZ-Y, kde Y je vybrané zo skupiny, ktorú tvoria:
R7 môže byť vybrané zo skupiny pozostávajúcej z nasledujúcich:
Ο
R2 kde R1 a R2 sú rovnaké alebo rôzne a obe sú hydrofóbnym zoskupením; kde R5 je -C(O)-NHOH (hydroxámová kyselina), -C(O)-CF3 (trifluóracetyl), -NH-P(O)OHCH3, -SO2NH2 (sulfónamid), -SH (tiol), -C(O)-R6, kde R6 je hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; a kde L je mostík, ktorý zahŕňa -(CH2)-, -C(O)-, -S-, -0-, -(CH=CH)-, -fenylalebo -cykloalkyl-, alebo akúkoľvek ich kombináciu, alebo jej farmaceutický prijateľná soľ.
L môže byť aj mostík, ktorý zahŕňa -(CH2)n-, -C(0)-, -S-, -0-, -(CH=CH)m-, -fenyl- alebo -cykloalkyl-, alebo akúkoľvek ich kombináciu, kde n je celé číslo od 3 do 10 a m je celé číslo od O do 10.
Vo vyššie uvedenej zlúčenine n môže byť 4 až 7 a m je O až 7. n je s výhodou 5 alebo 6; n je s najväčšou výhodou 6. m je s výhodou 1 až 6, s väčšou výhodou je m 2 až 5 a s najväčšou výhodou je m 3 alebo 4.
Vo tejto zlúčenine môže byť R1 aj R2 naviazané priamo alebo cez mostík a je to substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
Mostíkom môže byť amidové zoskupenie, -0-, -S-, -NH-, alebo -CHZ-.
Vynález zahŕňa aj enantioméry, soli a prekurzory tu uvedených zlúčenín.
Podľa ďalšieho uskutočnenia môže mať zlúčenina vzorec:
R7
kde L je mostík vybraný zo skupiny, ktorú tvorí -(CH2)-, -(CH=CH)-, -fenyl-, -cykloalkyl- alebo akákoľvek ich kombinácia, kde R7 aj R8 sú nezávisle substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
Vo výhodnom uskutočnení je mostík L zoskupením
Podľa ďalšieho výhodného uskutočnenia má zlúčenina vzorec:
/X,
x
Ktorúkoľvek z uvedených zlúčenín možno formulovať do farmaceutickej kompozície spolu s farmaceutický prijateľným nosičom.
Ktorékoľvek zo zlúčenín možno tiež skonvertovať na farmaceutický prijateľnú soľ zlúčeniny pomocou známych farmakologických techník.
Možno tiež vytvoriť prekurzor ktorejkoľvek zo zlúčenín pomocou známych farmakologických techník.
Ktorúkoľvek zo zlúčenín možno použiť v metóde indukovania diferenciácie nádorových buniek v nádore, kedy sa bunky kontaktujú s účinným množstvom zlúčeniny tak, aby sa ňou nádorové bunky diferencovali.
Ktorékoľvek zo zlúčenín možno tiež použiť v spôsobe inhibície aktivity históndeacetylázy, ktorý zahŕňa kontaktovanie históndeacetylázy s účinným množstvom zlúčeniny tak, aby sa ňou inhibovala aktivita históndeacetylázy.
Tento vynález popri vyššie uvedených zlúčeninách má ďalej zahŕňať použitie homológov a analógov takých zlúčenín. V tomto kontexte sú homológy molekuly s podstatnými štruktúrnymi podobnosťami s vyššie opísanými zlúčeninami a analógy sú molekuly s podstatnými biologickými podobnosťami bez ohľadu na štruktúrne podobnosti.
Podľa ďalšieho uskutočnenia predložený vynález poskytuje farmaceutickú kompozíciu obsahujúcu farmaceutický účinné množstvo ktorejkoľvek z vyššie uvedených zlúčenín a farmaceutický prijateľný nosič.
Podľa ďalšieho uskutočnenia predložený vynález poskytuje aj spôsob selektívnej indukcie zástavy rastu, terminálnej diferenciácie a/alebo apoptózy neoplastických buniek a tým inhibície proliferácie takých buniek, ktorý zahŕňa kontaktovanie buniek za vhodných podmienok s účinným množstvom ktorejkoľvek z vyššie uvedených zlúčenín.
Kontaktovanie by sa malo uskutočňovať kontinuálne počas dlhšieho času, t.j. aspoň 48 hodín, s výhodou približne 4 - 5 dní alebo dlhšie.
Spôsob možno praktizovať in vivo alebo in vitro. Ak sa spôsob praktizuje in vitro, kontaktovanie možno uskutočniť inkubovaním buniek so zlúčeninou. Koncentrácia zlúčeniny v kontakte s bunkami by mala byť od približne 1 nM do približne 25 mM, s výhodou od približne 20 nM do približne 25 mM, s väčšou výhodou od približne 40 nM do 100 μΜ, s ešte väčšou výhodou od približne 40 nM do približne 200 nM. Koncentrácia závisí od konkrétnej zlúčeniny a stavu neoplastických buniek.
Tento spôsob môže zahŕňať aj ošetrenie buniek protinádorovým prostriedkom tak, aby sa stali odolnými voči protinádorovému prostriedku, a následne kontaktovanie získaných rezistentných buniek za vhodných podmienok s účinným množstvom ktorejkoľvek z vyššie uvedených zlúčenín účinným na selektívnu indukciu terminálnej diferenciácie týchto buniek.
Predložený vynález poskytuje aj spôsob liečby pacienta s nádorom vyznačujúcim sa proliferáciou neoplastických buniek, ktorý zahŕňa podanie účinného množstva ktorejkoľvek z vyššie uvedených zlúčenín pacientovi, účinného na selektívne indukovanie zástavy rastu, terminálnej diferenciácie a/alebo apoptózy takých neoplastických buniek a tým inhibovanie ich proliferácie.
Spôsob podľa predloženého vynálezu je určený na liečbu ľudských pacientov s nádormi. Je však tiež pravdepodobné, že tento spôsob by bol účinný aj pri liečbe nádorov u iných cicavcov. Pojem nádor má zahŕňať akúkoľvek rakovinu spôsobenú proliferáciou neoplastických buniek, napríklad rakovinu prostaty, rakovinu pľúc, akútnu leukémiu, mnohonásobný myelórn, karcinóm mechúra, karcinóm obličiek, kracinóm prsníka, kolorektálny karcinóm, neuroblastóm alebo melanóm.
Cesty podania pre zlúčeninu podľa predloženého vynálezu zahŕňajú akékoľvek konvenčné a fyziologicky prijateľné cesty, napríklad orálne, pulmonárne, parenterálne (intramuskulárne, intraperitoneálne, intravenózne (IV) alebo subkutánne injekcie), inhaláciu (jemným práškovým prípravkom alebo jemným aerosólom), transdermálne, nazálne, vaginálne, rektálne alebo podjazykové cesty podania a možno ich formulovať do liekových foriem vhodných pre každú cestu podania.
Predložený vynález poskytuje aj farmaceutickú kompozíciu obsahujúcu farmaceutický prijateľný nosič, napríklad sterilnú vodu neobsahujúcu pyrogény, a terapeuticky prijateľné množstvo ktorejkoľvek z vyššie uvedených zlúčenín. Účinným množstvom je s výhodou množstvo účinné na selektívnu indukciu terminálnej diferenciácie vhodných neoplastických buniek a menšie ako množstvo, ktoré spôsobuje u pacienta toxicitu.
Predložený vynález poskytuje vyššie uvedenú farmaceutickú kompozíciu v kombinácii s protinádorovým prostriedkom, hormónom, steroidom alebo retinoidom.
Protinádorovým prostriedkom môže byť jeden z početných chemoterapeutických prostriedkov, napríklad alkylačné činidlo, antimetabolit, hormonálny prostriedok, antibiotikum, kolchicín, vinkový alkaloid, L-asparagináza, prokarbazín, hydroxymočovina, mitotán, nitrózomočoviny alebo imidazolkarboxamid. Vhodnými prostriedkami sú tie, ktoré podporujú depolarizáciu tubulínu.
Protinádorovým prostriedkom je s výhodou kolchicín alebo vinkový alkaloid; výhodné sú najmä vinblastín a vinkristín.
V uskutočneniach, kde je protinárodovým prostriedkom vinkristín, sa podáva také množstvo, ktoré urobí bunky rezistentnými voči vinkristínu pri koncentrácii približne 5 mg/ml. Podávanie prostriedku sa uskutočňuje v zásade podľa vyššie uvedeného opisu pre podávanie ktorejkoľvek zo zlúčenín. Prostriedok sa s výhodou podáva počas najmenej 3 až 5 dní. Podávanie ktorejkoľvek z vyššie uvedených zlúčenín sa uskutočňuje podľa skôr uvedeného opisu.
Farmaceutickú kompozíciu možno podávať denne v 2 - 6 hodinových infúziách počas obdobia 3 až 21 dní, napríklad denne v 4-hodinovej infúzii počas obdobia 5 dní.
Tento vynález bude lepšie pochopiteľný na základe experimentálnej časti, ktorá nasleduje. Odborníkovi v danej oblasti však bude zrejmé, že konkrétne metódy a výsledky tu diskutované len ilustrujú vynález, ktorý je komplexnejšie opísaný v nárokoch, ktoré nasledujú za experimentálnou časťou.
Experimentálna časť
Príklady 1-5 ukazujú syntézu substituovaných L-a-aminosuberových hydroxámových kyselín podľa predloženého vynálezu a príklady 6 a 7 ukazujú účinky zlúčenín 1 - 5 na diferenciáciu buniek MEL a aktivitu históndeacetylázy.
Príklad 1 - syntéza zlúčeniny 1
N-Boc-a>-metyl-(L)-a-aminosuberát, Boc-Asu(OMe), bol pripravený podľa publikovaného postupu (40). („Boe“ = t-butoxykarbonyl; „Asu = a-aminosuberát (alebo kyselina a-aminosuberová))
Dicyklohexylamínová soľ N-Cbz-o-t-butyl-(L)-a-aminosuberátu bola zakúpená od firmy Research Plus, Bayonne, NJ.
N-Boc-o-metyl-(L)-a-aminosuberátanilid, Boc-Asu(OMe)-NHPh.
N-Boc-o-metyl-(L)-a-aminosuberát (493 mg, 1,63 mmol) sa rozpustil pod Ar v 7 ml suchého CH2CI2. Pridal sa EDC (470 mg, 2,45 mmol) a po ňom anilín (230 μΙ, 2,52 mmol). Roztok sa miešal pri laboratórnej teplote 2 h 30 min, potom sa premyl zriedenou HCl (pH 2,4, 2x5 ml), nasýteným NaHCO3 (10 ml) a HZO (2x10 ml). Produkt sa vyčistil stĺpcovou chromatografiou (silikagél, hexány:AcOEt 3,5:1). Izolovaný výťažok bol 366 mg (60 %).
1H-NMR a hmotnostné spektrá boli konzistentné s produktom.
N~Benzoyl-co-metyl-(L)-a-aminosuberátanilid, PhCOHN-Asu(OMe)-NHPh.
O
(I2)
Na 90 mg N-Bloc-ro-metyl-(L)-a-aminosuberátanilidu (0,238 mmol) sa pôsobilo 3,2 ml 25 % kyseliny trifluóroctovej (TFA) v CH2CI2 počas 30 min.
Rozpúšťadlo sa odstránilo a zvyšok sa nechal stáť za vysokého vákua 12 hodín. Rozpustil sa pod Ar v 3 ml suchého CH2CI2 a benzotriazol-1-yloxy-trispyrolidinofosfónium hexafluórfosfáte (PyBOP) (149 mg, 0,286 mmol), kyseline benzoovej (44 mg, 0,357 mmol) a diizopropyletylamíne (114 μΙ, 0,655 mmol). Roztok sa miešal pri teplote miestnosti 1 hodinu. Produkt sa vyčistil stĺpcovou chromatografiou (silikagél, hexány:AcOEt 3:1 - 2:1) a získal sa vo forme bielej tuhej látky: 75 mg, 82 %.
1H-NMR a hmotnostné spektrá boli konzistentné s produktom.
Uvedená reakcia syntézy bola úspešne uskutočnená aj pomocou 1-(3dimetylaminopropyl)-3-etylkarbodiimid hydrochloridu (EDC) ako činidla.
N-Benzoyl-(L)-a-aminosuberoylanilid, PhCONH-Asu(OH)-NHPh.
(I3) mg (0,196 mmol) N-benzoyl-aminosuberátanilidu sa miešalo 6 hodín pri 0 °C v 1 M NaOH:THF:MeOH 1:1:1. Po úplnom vymiznutí východiskovej látky sa roztok neutralizoval (1M HCl) a extrahoval AcOEt. Organická fáza sa oddelila a vysušila. Odstránením rozpúšťadla sa získal produkt vo forme bielej tuhej látky: 67 mg, 93 %.
1 H-NMR a hmotnostné spektrá boli konzistentné s produktom.
N-Benzoyl-(L)-a-aminosuberoylanilid-<o-hydroxámová kyselina, PhCONHAsu(NHOH)-NHPh:
O
(1)
Do suspenzie 26 mg N-benzoyl-co-metyl-(L)-a-aminosuberátanilidu (I2) v 1 ml suchého CH2CI2 sa pridalo 58 mg H2NOTBDPS (HzNO-t-butyldifenylsilyl) a potom 22 mg EDC.
Reakčná zmes sa miešala pri teplote miestnosti 4 hodiny. Intemnediát chránená hydroxámová kyselina - sa vyčistila stĺpcovou chromatografiou (silikagél, CH2CI2:MeOH 100:0-98-2). Chrániaca skupina sa odstránila pôsobením 5 % TFA v CH2CI2 v priebehu 1 h 30 min. Produkt sa vyzrážal zo zmesi acetónu a pentánu.
1H-NMR (d6-DMSO, 500 MHz) δ = 10, 29 (s, 1H), 8, 53 (d, 1H), 7, 90 (d, 2H), 7,60 (d, 2H), 7,53 (m, 1H), 7,46 (t, 2H), 7,28 (t, 2H), 7,03 (t, 2H), 4,53 (q, 1H), 1,92 (t, 2H), 1,78 (m, 2H), 1,50 -1,25 (m, 6H).
ESI-MS: 384 (M+1), 406 (M+Na), 422 (M+K)
Príklad 2 - syntéza zlúčeniny 2
N-Nikotinoyl-(L)-a-aminosuberoylanilid-cú-hydroxámová kyselina, C5H4NCOAsu(NHOH)-NHPh:
O
(2)
Bola pripravená z N-Boc-ro-metyl-L-a-aminosuberátu podľa rovnakého postupu ako benzoylový analóg. Výťažky a chromatografické správanie boli porovnateľné.
1H-NMR (d6-DMSO, 500 MHZ) δ = 10,30 (s, 1H), 10,10 (s, 1H), 9,05 (m, 1H), 8,80 (m, 1H), 8,71 (m, 1H), 8,24 (m, 1H), 7,60 (m, 2H), 7,30 (m, 2H), 7,04 (m, 1H), 4,56 (m, 1 H), 1,93 (t, 2H), 1,79 2H), 1,55-1,30 (m, 6H). ESI-MS: 385 (M+1), 407 (M+Na).
Príklad 3 - syntéza zlúčeniny 3
Kyselina N-benzyloxykarbonyl-©-t-butyl-(L)-aminosuberová, N-Cbz-(L)-Asu(OtBu)OH.
O
04)
N-Cbz-(L)-Asu(OtBii)-OH, dicyklohexylamínová soľ, (100 mg, 0,178 mmol) sa rozdelila medzi 1 M HCI (5 ml) a EtOAc (10 ml). Organická vrstva sa oddelila a vodná vrstva sa premyla EtOAc (3x3 ml). Organické frakcie sa spojili, premyli roztokom NaCI (1x2 ml) a vysušili sa (MgSOJ. Zmes sa prefiltrovala a nakoncentrovala na bezfarebný film (67 mg, 0,176 mmol, 99 %). Táto zlúčenina sa použila bezprostredne v nasledujúcom kroku.
N-benzyloxykarbonyl-o-t-butyl-(L)-a-aminosuberátanilid, N-Cbz-(L)-Asu(OtBu)NHPh.
(15)
N-Cbz-(L)-Asu(OtBu)-OH (67 mg, 0,176 mmol) sa rozpustil v suchom CH2CI2 (2,5 ml). Pridal sa anilín (17 μΙ, 0,187 mmol), PyBOP (97 mg, 0,187 mmol) a iPr2NEt (46 μΙ, 0,266 mmol) a zmes sa miešala 2 hodiny. Podľa TLC sa reakcia skončila. Zmes sa zriedila EtOAc (5 ml) a vodou (5 ml) a vrstvy sa oddelili. Vodná vrstva sa premyla EtOAc (3x3 ml) a organické frakcie sa spojili. Tento roztok sa premyl 1 M HCI (1x2 ml) a roztokom NaCl (1x2 ml), vysušil (MgSO4), prefiltroval a nakoncentroval na olej. Ten sa pretlačil cez vrstvu silikagélu (30 % EtOAc/hexány), aby sa odstránili nečistoty, čím sa získala požadovaná zlúčenina (76 mg, 0,167 mmol, 94 %).
1H NMR (CDCI3, 400 MHz, žiadny TMS) δ 8,20 (br s, 1H), 7,47 (d, 2H), 7,32 (m, SH), 7,28 (t, 2H), 7,08 (t, 1H), 5,39 (d, 1H), 5,10 (m, 2H), 4,26 (m, 1H), 2,18 (t, 2H), 1,93 (m, 1H), 1,67 (m, 1H), 1,55 (m, 3H), 1,42 (s, 9H), 1,36 (m, 3H) ’N-benzyloxykarbonyl-(L)-a-aminosuberátanilid, N-Cbz-(L)-Asu(OH)-NHPh.
O
(16)
N-Cbz-(L)-Asu(OtBu)-anilid (76 mg, 0,167 mmol) sa rozpustil v suchom CH2CI2 (5 ml) apo kvapkách sa pridal TFA (0,5 ml). Podľa TLC bola reakcia skončená po 3 hodinách. Zmes sa nakoncentrovala za zníženého tlaku, čím sa získala titulná zlúčenina (80 mg surového produktu). Táto zlúčenina sa použila v nasledujúcom kroku bez ďalšieho čistenia.
1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 11,93 (br s, 1H), 9,99 (br s, 1H), 7,57 (m, 3H), 7,34 (m, 5H), 7,29 (t, 2H), 7,03 (t, 1H), 5,02 (m, 2H), 4,11 (m, 1H), 2,17 (t, 2H), 1,61 (m, 2H), 1,46 (m, 2H), 1,27 (m, 4H).
N-benzyloxykarbonyl-(L)-a-aminosuberátanilid ω-hydroxámová kyselina, N-Cbz-(L)Asu(NH-OH)-NHPh.
ŇH ° o
/\ (3)
N-Cbz-(L)-Asu(OH)-anilide (80 mg, surový produkt) a O-t-butyldifenylsilylhydroxylamín (60 mg, 0,221 mmol) sa rozpustili v CH2CI2 (4 ml). Do tejto zmesi sa pridal PyBOP (125 mg, 0,241 mmol) a iPr2NEt (52 μΙ, 0,302 mmol) a zmes sa miešala cez noc. TLC indikovala skončenie reakcie. Zmes sa nakoncentrovala za zníženého tlaku a potom sa pretlačila cez vrstvu silikagélu (50% EtOAc/hexány), aby sa odstránili nečistoty. Odparením prchavých zložiek sa získalo 107 mg látky, ktorá sa potom rozpustila v suchom CH2CI2 (5 ml) a pridal sa TFA (0,25 ml). Monitorovanie pomocou TLC indikovalo skončenie reakcie po 1,5 h. Zmes sa nakoncentrovala za zníženého tlaku, aby sa odstránili všetky prchavé zložky. Zvyšok sa rozpustil v EtOAc (3 ml) a pomaly sa pridali hexány, čím sa vyzrážal biely gél. Supernatant sa odstránil a zrazenina sa premyla hexánmi (3x2 ml). Táto látka sa odparila dosucha za zníženého tlaku, čím sa získala titulná zlúčenina (40 mg, 0,097 mmol, 59 %).
Ή NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 10,32 (s, 1H), 10,00 (s, 1H), 8,64 (br s, 1H), 7,57 (m, 3H), 7,37 (m, 5H), 7,30 (t, 2H), 7,04 (t, 1H), 5,02 (m, 2H), 4,12 (m, 1H), 1,93 (t, 2H), 1,62 (m, 2H) 1,45 (m, 2H), 1,29 (m, 4H); ESI-MS 414 (M+l).
Príklad 4 - syntéza zlúčeniny 4
N-benzyloxykarbonyl-(L)-a-aminosuberoyl-8-chinolínamid-®-hydroxámová kyselina.
O
(4)
Pripravená podobne ako zlúčenina 3.
1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 10-45 (s, 1 H), 10,31 (s, 1H), 8,85 (dd, 1H), 8,63 (dd, 1H), 8,42 (dd, 1H), 8,13 (dd, 1H), 8,68 (m, 2H), 7,60 (t, 1H), 7,37 (m, 2H), 7,28 (m, 2H), 5,10 (m, 2H), 4,24 (m, 1H), 1,93 (t, 2H), 1,85 (m, 1H), 1,70 (m, 1H), 1,50 (m, 2H), 1,42 (m, 2H), 1,30 (m, 2H); ESI-MS 465 (M+1).
Príklad 5 - syntéza zlúčeniny 5
N-Benzoyl-(L)-a-aminosuberoyl-8-chinolínamid-ro-hydroxámová kyselina:
(5)
Vzorka N-Cbz-ro-t-butyl L-a-aminosuberoyl-8-chinolínamidu (90 mg, 0,178 mmol) sa získala z predchádzajúcej syntézy. Skupina Cbz sa odstránila hydrogenáciou v MeOH na 5 % Pd na C. Získaný voľný amín sa spojil s kyselinou benzoovou pomocou EDC v suchom CH2CI2 (69% v dvoch krokoch). Po odstránení chrániacej skupiny pomocou TFA z t-butylesteru sa zvyčajnou syntézou s H2NOTBDPS nasledovanou odstránením chrániacej skupiny získala požadovaná hydroxámová kyselina.
1H-NMR (d6-DMSO, 500 MHz) δ = 10,55 (s, 1H), 10,30 (s, 1H), 9,03 (m, 1H), 8,78 (m, 1H), 8,62 (m, 1H), 8,40 (m, 1HO, 7,97 (m, 2H), 7,67-7,46 (m, 6H), 4,66 (m, 1 H), 1,94 (t, 2H), 1,87 (m, 1H), 1,80-1,20 (m, 7H). ESI-MS: 435 (M+1).
Príklad 6 - syntéza zlúčeniny s invertovanou amidovou skupinou.
Zlúčenina nasledujúceho vzorca:
ΝΗΟΗ
Ο
/
Ο
R2 sa syntetizuje z malónesteru:
II ch2 c
R pôsobením bázy a potom pridaním:
O
II
X-CH2—(CH2)n-i-C-OR' kde X je halogén, za vzniku:
O
R.
R z ktorého sa R odstráni reakciou s amínom a karbodiimidovým činidlom za vzniku:
R\
HN CH—(CH2)n—C-OR'
HN'
R z ktorého sa R' odstráni a skonvertuje sa na hydroxámovú kyselinu (NHOH) ako v predchádzajúcich príkladoch.
V predchádzajúcej schéme môže byť R t-butyl, odstráni sa kyselinou trifluóroctovou; R1 môže byť metyl, odstráni sa bázou alebo Lil; a každé R môže byť rovnaké alebo rôzne v závislosti od použitého činidla.
Príklad 7 - účinok zlúčeniny 1 (N-Benzoyl-(L)-a-aminosuberoylanilid-a>hydroxámová kyselina, PhCONH-Asu(NHOH)-NHPh) na diferenciáciu buniek MEL a aktivitu históndeacetylázy
Diferenciácia buniek myšej erytroleukémie (MEL).
Test diferenciácie buniek MEL sa použil na vyhodnotenie schopnosti zlúčeniny 1 indukovať terminálnu diferenciáciu. Bunky MEL (deliace sa logaritmický) sa kultivovali s indikovanými koncentráciami zlúčeniny 1. Po 5dňovom kultivačnom období sa určil rast buniek pomocou Coulterovho počítača a diferenciácia sa určila mikroskopicky pomocou benzidínovej skúšky na určenie akumulácie hemoglobínového proteínu podľa jednotlivých buniek.
Pozorovalo sa, ako je znázornené na obrázku 1, že zlúčenina 1 (200 nM) je schopná indukovať diferenciáciu buniek MEL
Enzymatická aktivita históndeacetylázy (HDAC).
Účinok zlúčeniny 1 na afinitne vyčistenú ľudskú, epitopom značenú (Flag)
HDAC1 sa testoval inkubáciou enzýmového prípravku za neprítomnosti substrátu na ľade počas 20 minút s indikovanými množstvami zlúčeniny 1. Pridal sa substrát (pHjacetylom označený histón odvodený z buniek myšej erytroleukémie) a vzorky sa inkubovali 20 min pri 37 °C v celkovom objeme 30 μΙ. Reakcie sa potom zastavili a uvoľnený acetát sa extrahoval a množstvo uvoľnenej rádioaktivity sa určilo scintilačným počítaním.
Ako je ukázané na obrázku 2, pozorovalo sa, že zlúčenina 1 je potentným inhibítorom enzymatickej aktivity HDAC1 (IDM = 1 nM).
Príklad 8 - účinok zlúčeniny 2 (N-nikotinoyl-(L)-a-aminosuberoylanilid-cohydroxámová kyselina, C5H4NCO-Asu(NHOH)-NHPh) na diferenciáciu buniek MEL
Diferenciácia buniek myšej erytroleukémie (MEL):
Test diferenciácie buniek MEL sa použil na vyhodnotenie schopnosti zlúčeniny 2 indukovať terminálnu diferenciáciu. Bunky MEL (deliace sa logaritmický) sa kultivovali s indikovanými koncentráciami zlúčeniny 2. Po 5dňovom kultivačnom období sa určila diferenciácia mikroskopicky pomocou benzidínovej skúšky na určenie akumulácie hemoglobínového proteinu na báze jednotlivých buniek.
Pozorovalo sa, ako je znázornené na obrázku 3, že zlúčenina 2 (800 nM) je schopná indukovať diferenciáciu buniek MEL
Príklad 9 - účinok zlúčeniny 3 (N-benzyloxykarbonyl-(L)-a-aminosuberátanilid ωhydroxámová kyselina, N-Cbz-(L)-Asu(NH-OH)-NHPh) na diferenciáciu buniek MEL a aktivitu históndeacetylázy
Diferenciácia buniek myšej erytroleukémie (MEL):
Test diferenciácie buniek MEL sa použil na vyhodnotenie schopnosti zlúčeniny 3 indukovať terminálnu diferenciáciu. Bunky MEL (deliace sa logaritmický) sa kultivovali s indikovanými koncentráciami zlúčeniny 3. Po 5dňovom kultivačnom období sa určila diferenciácia mikroskopicky pomocou benzidínovej skúšky na určenie akumulácie hemoglobínového proteinu na báze jednotlivých buniek.
Pozorovalo sa, ako je znázornené na obrázku 4, že zlúčenina 3 (400 nM) je schopná indukovať diferenciáciu buniek MEL.
Enzymatická aktivita históndeacetylázy (HDAC):
Účinok zlúčeniny 3 na afinitne vyčistenú ľudskú, epitopom značenú (Flag) HDAC1 sa testoval inkubáciou enzýmového prípravku za neprítomnosti substrátu na ľade počas 20 minút s indikovanými množstvami HPC. Pridal sa substrát (pHJacetylom označený histón odvodený z buniek myšej erytroleukémie) a vzorky sa inkubovali 20 min pri 370 °C v celkovom objeme 30 μΙ. Reakcie sa potom zastavili a uvoľnený acetát sa extrahoval a množstvo uvoľnenej rádioaktivity sa určilo scintilačným počítaním.
Ako je ukázané na obrázku 5, pozorovalo sa, že zlúčenina 3 je potentným inhibítorom enzymatickej aktivity HDAC1 (ID60 ~ 100 nM).
Príklad 10 - účinok zlúčeniny 4 (N-benzyloxykarbonyl-(L)-a-aminoxuberoyl-8chinolínamid-cD-hydroxámovej kyseliny) na diferenciáciu buniek MEL a aktivitu históndeacetylázy
Diferenciácia buniek myšej erytroleukémie (MEL):
Test diferenciácie buniek MEL sa použil na vyhodnotenie schopnosti zlúčeniny 4 indukovať terminálnu diferenciáciu. Bunky MEL (deliace sa logaritmický) sa kultivovali s indikovanými koncentráciami zlúčeniny 4. Po 5dňovom kultivačnom období sa určila diferenciácia mikroskopicky pomocou benzidínovej skúšky na určenie akumulácie hemoglobínového proteínu na báze jednotlivých buniek.
Pozorovalo sa, ako je znázornené na obrázku 6, že zlúčenina 4 (40 nM) je schopná indukovať diferenciáciu buniek MEL
Enzymatická aktivita históndeacetylázy (HDAC):
Účinok zlúčeniny 4 na afinitne vyčistenú ľudskú, epitopom značenú (Flag) HDAC1 sa testoval inkubáciou enzýmového prípravku za neprítomnosti substrátu na ľade počas 20 minút s indikovanými množstvami HPC. Pridal sa substrát (pHjacetylom označený histón odvodený z buniek myšej erytroleukémie) a vzorky sa inkubovali 20 min pri 370 °C v celkovom objeme 30 μΙ.
Reakcie sa potom zastavili a uvoľnený acetát sa extrahoval a množstvo uvoľnenej rádioaktivity sa určilo scintilačným počítaním.
Ako je ukázané na obrázku 7, pozorovalo sa, že zlúčenina 4 je potentným inhibítorom enzymatickej aktivity HDAC1 (IDgo < 10 nM).
SAHA inhibuje aktivitu afinitne vyčistenej HDAC1 a HDAC3 (39). Kryštalografické štúdie so SAHA a proteínom príbuzným HDAC ukázali, že SAHA inhibuje HDAC priamou interakciou s katalytickým miestom (66). Ďalšie štúdie ukazujú, že tríciom označený fotoafinitný analóg SAHA (3H-498), ktorý obsahuje azidovú skupinu (67), sa viaže priamo na HDAC1 (obrázok 8). Tieto výsledky indikujú, že táto trieda zlúčenín na báze hydroxámovej kyseliny inhibuje aktivitu HDAC priamou interakciou s proteínom HDAC.
SAHA spôsobuje akumuláciu acetylovaných histónov H3 a H4 in vivo. In vivo účinok SAHA bol študovaný pomocou xenotransplantátu ľudskej prostaty CWR22 na myšiach (68). SAHA (50 mg/kg/deň) spôsobila 97 % zníženie stredného konečného objemu nádoru v porovnaní s kontrolou bez akejkoľvek zjavnej toxicity. Podávanie SAHA v tejto dávke spôsobilo zvýšenie acetylovaných histónov H3 a H4 v nádorovom xenotransplantáte (obrázok 9).
SAHA je aktuálne v klinických skúškach fázy I na pacientoch s tuhými nádormi. SAHA spôsobuje akumuláciu acetylovaných histónov H3 a H4 v jednojadrových bunkách periférnej krvi izolovaných z pacientov pod liečbou (obrázok 10).
Tabuľka 1 ukazuje sumarizáciu výsledkov príkladov 7-10, testovaných zlúčenín 1 - 4 a tiež porovnáva výsledky s výsledkami získanými pri použití SAHA.
Tabuľka 1. Sumarizácia výsledkov testov zlúčenín 1 - 4 a porovnanie s výsledkami SAHA
Diferenciácia MEL Inhibícia HDAC
Zlúčenina Interval Opt. % B+ Interval id50
1 0,1 až 50 μΜ 200 nM 44% 0,0001 až 100 μΜ 1 nM
2 0,2 až 12,5 μΜ 800 nM 27% TBT
3 0,1 až 50 μΜ 400 n M 16% 0,01 až 100 μΜ 100 nM
4 0,01 až 50 μΜ 40 nM 8% 0,01 až 100 μΜ <10 nM
SAHA 2500 nM 68% 0,01 βζ100μΜ 200 nM
Príklad 12 - modifikované inhibítory HDAC
V ďalších štúdiách sme zistili, že zlúčeniny 6 a 7 zobrazené nižšie sú veľmi účinnými inhibítormi enzýmu HDAC. Zlúčenina 6 mala ID50 2,5 nM a zlúčenina 7 mala ID50 50 nM. To je v kontraste s ID^ pre SAHA v hodnote 1 μΜ, ktorá je oveľa vyššia. Všimnite si, že 1 μΜ ID50 pre SAHA ako inhibítor HDAC je toho istého poriadku ako jej 2,5 μΜ optimálna dávka pre cytodiferenciáciu buniek MEL, ale táto blízka podobnosť neplatí pre všetky skúmané zlúčeniny. V niektorých prípadoch veľmi účinné inhibítory HDAC sú menej účinné ako cytodiferenciátory, pravdepodobne preto, lebo tieto liečivá sa metabolizujú v bunkových testoch. Tiež všetky bunkové typy nie sú rovnaké a niektoré zlúčeniny sú oveľa lepšie proti ľudským nádorovým bunkám, napríklad HT-29, ako proti bunkám MEL. Inhibicia buniek HDAC je teda len predbežným indikátorom.
(6)
Príklad 13 - vývoj zlúčenín bez časti hydroxámovej kyseliny
Pri vyššie uvedených zlúčeninách, ktoré sú hydroxámovými kyselinami, sme zistili, že pomerne rýchlo podliehajú enzymatickej hydrolýze na karboxylové kyseliny, takže ich biologické doby existencie sú krátke. Zaujímali sme sa o vývoj zlúčenín, ktoré by mohli byť in vivo stabilnejšie. Vyvinuli sme preto inhibítory HDAC, ktoré nie sú hydroxámovými kyselinami a ktoré možno použiť ako cytodiferenciačné prostriedky s dlhšími biologickými dobami života. Navyše sme zistili, že novovyvinuté zlúčeniny majú lepšiu selektivitu voči HDAC ako napríklad SAHA.
Vyvinuli sme zlúčeniny, ktoré majú dvojité väzby, podobne ako Trichostatín A (TSA), aby sme videli, či výsledné zlúčeniny budú mať ešte vyššiu účinnosť. A tiež reťazec v TSA pozostáva len z piatich uhlíkov, nie zo šiestich ako SAHA. V prípravku Oxamflatin je reťazec štyroch uhlíkov obsahujúci dvojitú väzbu a etinylový mostík medzí hydroxámovou kyselinou a prvým fenylovým kruhom a Oxamflatin je údajne účinným inhibítorom HDAC. Niektoré z týchto črt sme zabudovali do našich zlúčenín - vrátane tých, ktoré nie sú hydroxámovými kyselinami.
Publikované sú aj jednoduché kombinatorické metódy na skríning radu takých zlúčenín na účinnosť a selektívnosť vzhľadom na inhibíciu HDAC.
Navyše keďže existuje mnoho významných enzýmov, ktoré obsahujú zinočnatý ión, hydroxámové kyseliny a možno aj niektoré iné skupiny koordinujúce kovy sa tiež môžu viazať na zinočnatý katión a iné kovy.
Žh2-Lyzín^ // \
cf3 (θ)
HO-.
/ '->Zn2ÍC-O' \ \
cf3
F3C(9)
HON-C—OH \
CF3
H2
-C CO2' \ /
CH ch2 \
(10)
Ph (11)
Kedže cieľom pre HDAC je acetyllyzínový vedľajší reťazec histónu, robíme zlúčeniny, v ktorých sú prítomné analógy tranzitných stavov substrátu. Syntetizujeme napríklad zlúčeniny ako SAHA, kde je skupina hydroxámovej kyseliny -CO-NHOH nahradená trifluóracetylovou skupinou, -CO-CF3. Získaná zlúčenina 8 bude ľahko tvoriť hydrát a tak sa viazať na zinočnatý katión v HDAC napodobňujúc 9 tranzitný stav 10 pre deacetyláciu. Toto súvisí s prácou, ktorú publikoval Lipscomb [56] o viazaní na karboxypeptidázu A substrátového analógu obsahujúceho skupinu CF3-CO-CH2 namiesto normálneho amidu. Hydrát ketónu sa koordinoval na zinočnatý katión ako napodobnenie tranzitného stavu pre katalyzovanú hydrolýzu amidového substrátu. Naša syntéza konkrétneho príkladu vo fluórketónovej sérii je zobrazená v nižšie uvedenej schéme:
TBDPS
O O t-Bu-CO2
TBDPS
1) TBAF
-►
2) Swernova oxidácia
CO2-t-Bu
F3C-TMS
TBAF t-Bu-CC>2
CO2-t-Bu
1) TFA, CH2CI2
2) Ph-NH2 EDCI
Ph-HN-OC
CO-NH-Ph
Dess-Martinova -► oxidácia
Ph-HN-OC
(12)
CO-NH-Ph CF3
Po alkylácii malónesteru sa pripraví aldehyd a skonvertuje sa na trifluórmetylkarbinol Ruppertsovým činidlom [57, 58]. Pripravia sa malón-bis-anilidy a karbinol sa oxiduje na ketón 12 Dess-Martinovým činidlom [59]. Iné prístupy boli vyskúšané neúspešne. Konkrétne pokusy o konverziu derivátu karboxylovej kyseliny priamo na trifluórmetylketón nevyšli.
Zlúčenina 12 bola testovaná s HDAC a zistilo sa, že je inhibítorom tohto enzýmu. Syntézu sme preto adaptovali aj na prípravu analógov 12 s nenasýtenou časťou atď. v reťazci a ďalšími skupinami na ľavom konci molekuly.
Príklad 14 - vývoj zlúčenín, kde je skupina hydroxámovej kyseliny nahradená NHP(O)OH-CH3
Analóg SAHA, v ktorom je skupina CH2-CO-NHOH nahradená NH-P(O)OHCH3, možno syntetizovať podľa všeobecnej schémy zobrazenej nižšie. Výsledná zlúčenina 13 sa viaže na zinočnatý katión v HDAC tak, ako sa príbuzná skupina viaže na zinočnatý katión karboxypeptidázy vanalógoch, napríklad tých, ktoré pripravil Bartlett [60].
Η
Ο
Η
ΝΗ2
CH3-PO(OMe)-CI
-►
Ο
LiOH
-►
Ο
Klasickým inhibítorom zinočnatého enzýmu karbónanhydrázy je sulfónamid, ktorého anión sa viaže na zinočnatý katión [61]. Teda zlúčenina 14, analóg SAHA so sulfónamidovou skupinou, sa syntetizuje podľa nižšie uvedeného. V poslednom kroku nechávame zreagovať karboxylsulfónbischlorid s anilínom a amoniakom. Keďže chlorid karboxylovej kyseliny reaguje rýchlejšie, používame sekvenciu anilín, potom amoniak, ale sekvencia sa môže aj obrátiť, alebo zmes možno separovať, ak majú tieto dve zložky podobnú reaktivitu.
V priebehu syntézy 14 používame tiol 15 ľahko pripravený z príslušnej halogénkyseliny. Tioly sú tiež inhibítory zinočnatých enzýmov ako karboxypeptidáza A a príbuzné peptidázy, napríklad angiotenzín konvertujúci enzým (Angiotensin Converting Enzýme - ACE), takže konvertujeme 15 na 16 ako inhibítor HDAC. Podobnú syntézu možno použiť na pripojenie skupiny NH-P(O)OHCH3 na iné zlúčeniny, najmä zlúčeniny 6 a 7.
CIOC.
,SO2CI
1) PhNH2/Et3N
Ph-NH-CO.
Ph-NH-OC
2) NH3 ,SO2NH2 (14)
Príklad 15 - menenie mostíka medzi skupinou viažucou zinočnatý katión a hydrofóbnymi viažucimi skupinami
Na základe výsledkov s Oxamflatinom sa zdá, že fenylový kruh môže byť súčasťou reťazca medzi skupinou viažucou zinočnatý katión a ľavou časťou molekuly podľa obrázka, najmä keď je fenylový kruh metasubstituovaný. Poskytujeme teda syntézu na zabudovanie takých metasubstituovaných reťazcov do ďalších našich zlúčenín. Konštruujeme zlúčeniny 17 a 18. Tieto jednoduché syntézy, ktoré nie sú zobrazené podrobne, vyžadujú len to, aby sa namiesto hydroxámovej kyseliny pripojenej na fenylový kruh pripravili arylamidy zlúčeniny 17 a 18.
HN—OH (17)
Možno syntetizovať aj ďalšie zlúčeniny, napríklad 19 a 20, ktoré zahŕňajú trifluórmetylketónovú skupinu zlúčeniny 12, o ktorej vieme, že je účinná pri viazaní zinočnatých katiónov v HDAC. Syntézy zahŕňajú prípravu zlúčenín 21 a 22 a potom pridanie CF3 za vzniku karbinolu, po čom nasleduje oxidácia ako v syntéze 12. Jednoduchá syntéza zahŕňa Hečkovo spojenie zlúčenín 23 a 24 s etylakrylátom a konverziu esteru na aldehydy 21 a 22 redukciou na karbinol a potom reoxidáciu.
Všetky doposiaľ uvedené reťazce obsahujú len atómy uhlíka, ale tioéterické mostíky môžu byť prijateľné a dokonca užitočné a zjednodušujú syntézu. Takto možno pripraviť sulfónamidy ako 25 a 26 príbuzné s 19 a 20 z príslušného tiofenolu a brómmetylsulfónamidu. Podobnú syntézu možno použiť na prípravu príslušných fosfónamidátov 27 a 28, ak sa táto trieda ukáže ako užitočná v inhibícii HDAC a cytodiferenciácii. V tomto prípade sa (N-chránená) m-aminobenzoová kyselina použije na acyláciu arylamínov a potom sa fosforyluje anilínová skupina.
V
\ (
o
nh2
(25)
\ t V
v
(25)
Príklad 16 - menenie ľavej strany molekuly nesúcej hydrofóbne skupiny
V rámci zmeny hydrofóbnych skupín sme syntetizovali zlúčeninu 29 ako intermediát, na ktorý možno pôsobiť rôznymi amínmi za vzniku zlúčenín 30. Odstránením chrániacej skupiny zo skupiny hydroxámovej kyseliny sa získa všeobecná trieda 31. Syntézu predstavuje nižšie uvedená schéma.
OMe-<
>·
V syntéze sa O-chránený hydroxylamín acyluje kyselinou brómhexánovou a zlúčenina potom alkyluje bis-pentafluórester kyseliny malónovej. Získaná látka 29 potom reaguje s rôznymi amínmi a chrániaca skupina sa odstráni pomocou kyseliny.
S touto zlúčeninou ako východiskovou látkou sme syntetizovali príbuzné knižnice nesúce ďalšie skupiny viažuce zinočnatý katión. Napríklad alkylácia malonátu zlúčeninou 32 nám umožňuje pripraviť fosfonamidátovú knižnicu a zlúčenina 33 nám umožní pripraviť CF3-CO knižnicu. Podobným spôsobom možno pripraviť sulfónamidovú knižnicu, ak skôr opísaná práca indikuje, že ide o sľubnú skupinu viažucu zinočnaté katióny pre HDAC. Samozrejme po alkylácii malonátu a aminolýze zlúčenina z 32 bude demetylovaná, zatiaľ čo zlúčenina z 33 bude oxidovaná.
H
To tiež umožňuje pracovať na štruktúre zlúčeniny 6, derivátu kyseliny aminosuberovej. Ako je opísané, toto bol jeden z najúčinnejších inhibítorov HDAC, ktorý sme skúmali. Túto zlúčeninu sme pripravili pomocou enzymatickej hydrolýzy, aby sme dosiahli optické rozdelenie a selektivitu medzi dvoma karbometoxyskupinami látky 34, aby sme mohli skonvertovať jednu z nich na aminochinolínamid látky 6, pričom sa dusík chránil ako karbobenzoxyskupina. Na konci syntézy sme skonvertovali vzdialenú karbometoxyskupinu na hydroxamát. 6 je však intermediát, ktorý možno použiť aj na prípravu iných derivátov. Karbobenzoxyskupinu zo 6 možno odstrániť a amín 35 možno acetylovať radom karboxylových kyselín, čím sa pripraví knižnica 36, alebo chloridmi sulfónových kyselín, čím sa pripravia príslušné sulfónamidy.
O
MeO^^O
1. chymotrypsín
2. aminoacyláza
3. chémia
-►
O (34)
(6)
(35)
(36)
Syntetizujeme aj inú knižnicu amidov 37 príbuznú so 6 a potom ju rozširujeme knižnicou iných amidov 38 acyláciou aminoskupiny po odstránení chrániacej skupiny. Syntetizujeme aj skupinu zlúčenín 39, v ktorej po odstránení karbobenzoxyskupiny látky 37 pripravujeme knižnicu sulfónamidov pomocou rôznych sulfonylchloridov. Pri všetkých krokoch môže byť skupina hydroxámovej kyseliny chránená.
(38)
X
(39)
Predchádzajúce syntetické schémy možno použiť na generovanie zlúčeniny s veľkým počtom variácií. Niektoré substituenty, ktoré môžu viesť k zlúčeninám s potenciálne dobrou afinitou voči HDAC alebo majúcim dobrú diferenciačnú aktivitu, sú nasledujúce:
Niektoré amíny, ktoré možno zabudovať namiesto anilínu do SAHA alebo ako X do zlúčenín 37 a 38:
NH2
Niektoré karboxylové a sulfónové kyseliny, ktoré možno zabudovať ako skupinu YCO do zlúčeniny 38 alebo 39:
CO co CO
SO2
SO2
Príklad 17 - syntéza na základe vyššie uvedených schém
Činidlá a východiskové látky boli získané od komerčných dodávateľov a použili sa bez ďalšieho čistenia, pokiaľ nie je uvedené inak. Pri reakciách citlivých na vlhkosť sa rozpúšťadlá čerstvo predestilovali pred použitím: tetrahydrofurán sa predestiloval pod argónom z kovového sodíka s využitím benzofenónu ako indikátora; dichlórmetán a acetonitril sa predestilovali z práškového hydridu vápenatého. Bezvodý benzén, bezvodý DIEA a bezvodý pyridín sa odoberali striekačkou z uzavretej fľaše zakúpenej od firmy Aldrich. terc-Butanol sa pred použitím vysušil nad 4A molekulovými sitami. Hydrid sodný bol zakúpený ako 60 % disperzia v minerálnom oleji. Anilín, diizopropylamín, N-metylanilín a benzylalkohol boli pred použitím čerstvo predestilované. Deuterované rozpúšťadlá boli získané od Cambridge Isotope Laboratories. Reakcie citlivé na vzduch a/alebo vlhkosť boli uskutočnené pod atmosférou suchého argónu v skle vysušenom v peci alebo plameňom vybavenom tesným gumeným šeptom. Striekačky a ihly sa pred použitím vysušili v peci. Reakcie pri 0 °C sa uskutočnili v kúpeli s ľadom a vodou. Reakcie pri -78 °C sa uskutočnili v kúpeli suchého ľadu a acetónu.
Chromatografia
Analytická tenkovrstvová chromatografia (TLC) sa uskutočňovala na sklenených platničkách pokrytých silikagélom 60 F-254, hrúbka 0,25 mm, vyrábané firmou EM Science, Nemecko. Eluované zlúčeniny boli zviditeľnené jedným alebo viacerými z nasledujúcich: krátkovlnné ultrafialové svetlo, pary l2, roztok KMnO4 alebo FeCI3. Preparatívna TLC sa uskutočnila na hotových platničkách Whatman s hrúbkou silikagélu buď 500 pm alebo 1000 pm. Stĺpcová flash chromatografia sa uskutočnila na médiu Merck Kieselgel 60, 230 - 400 mesh.
Prístroje
NMR spektrá sa merali na spektrometroch Bruker DPX300 a DRX400; 1H sa pozorovalo pri 300 a 400 MHz a 19F pri 376 MHz. Chemické posuny sú udávané ako hodnoty δ v ppm relatívne voči piku zvyškového rozpúšťadla. Hmotnostné spektrá boli získané na prístroji Nermag R-10-1 pre chemickoionizačné (Cl) alebo elektrónovoionizačné (El) spektrá a na prístroji Jeol JMS LCmate pre elektrosprejovo-ionizačné (ESI+) spektrá. Cl spektrá sa merali buď s amoniakom (NH3) alebo metánom (CH4) ako ionizačným plynom.
8-t-butyl-1-metyl ester kyseliny (E,E)-7-t-Butoxykarbonyl-okta-2,4-diéndiovej - (40)
Do miešaného roztoku NaH (60 % disperzia, 234 mg, 5,85 mmol) v THF (35 ml) pri 0 °C sa po kvapkách pridal di-t-butylmalonát (1,20 ml, 5,37 mmol). Pozoroval sa vývoj plynu a roztok sa nechal ohriať na teplotu prostredia a miešal sa 6 hodín. Roztok metyl 6-bróm-2,4-hexadienoátu (62) (1,00 g, 4,88 mmol) v THF (20 ml) sa pripravil v osobitnej banke a miešal sa vo vodnom kúpeli. Do tohto roztoku sa po kvapkách kanylovala malonátová zmes a reakcia sa nechala bežať cez noc. Reakcia sa ukončila pridaním nasýteného NH4CI (5 ml), potom sa pridala H2O (10 ml) a zmes sa extrahovala Et2O (3x15 ml). Organické frakcie sa spojili, premyli H2O (1 x 10 ml), potom roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Po odparení za zníženého tlaku nasledovala flash chromatografia (0 20 % EtOAc/hexány), čím sa získala látka 40 vo forme číreho bezfarebného oleja (850 mg, 2,49 mmol, 51 %). TLC R, 0,66 (20 % EtOAc/hexány); ’H-NMR (CDCI3, 400 MHz) δ 7,26 (dd, 1H), 6,26 (dd, 1H), 6,10 (m, 1H), 5,82 (d, 1H), 3,78 (s, 3H), 3,12 (t, 1H), 2,64 (t, 2H), 1,41 (s, 18H).
1-metylester kyseliny (E,E)-7-karboxy-okta-2,4-diéndiovej (41)
HO'
Do miešaného roztoku látky 40 (200 mg, 0,59 mmol) v CH2CI2 (10 ml) sa pridal TFA (1 ml). Reakcia sa nechala bežať cez noc. Prchavé zložky sa odstránili za zníženého tlaku, čím sa získala látka 41 vo forme bielej tuhej látky (112 mg, 0,49 mmol, 83 %). Ή-NMR (CD3OD, 400 MHz) δ 7,11 (dd, 1H), 6,33 (dd, 1H), 6,16 (m, 1H), 5,81 (d, 1H), 3,76 (s, 3H), 3,15 (t, 1H), 2,70 (t, 2H).
Fenylamid kyseliny 4-penténovej (42)
H
0
Do miešaného roztoku oxalylchloridu (2,0 M v CH2CI2, 11,5 ml, 23,1 mmol) v CH2CI2 (100 ml) a DMF (1 kvapka) pri 0 °C sa pridala kyselina 4-penténová (2,25 ml, 22,0 mmol). Zmes sa nechala ohriať na teplotu prostredia. Keď ustal vývoj plynu, zmes sa vrátila na 0 °C po kvapkách sa pridal roztok anilínu (2,00 ml, 22,0 mmol) a TEA (6,72 ml, 26,3 mmol) v CH2CI2 (5 ml). Po ohriatí na teplotu prostredia sa reakcia nechala bežať 3 hodiny. Zmes sa nakoncentrovala za zníženého tlaku a potom sa rozdelila medzi HCI (1 N, 10 ml) a EtOAc (30 ml) a vrstvy sa oddelili. Vodná časť sa extrahovala EtOAc (3 x 15 ml) a organické vrstvy sa spojili, premyli roztokom NaCI, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získala žltkastá tuhá látka, ktorá sa rekryštalizovala s toluénom, čím sa získala látka 42 vo forme bielych kryštálov (1,97 g, 11,24 mmol, 51 %). TLC R, 0,68 (50 % EtOAc/hexány); Ή-NMR (300 MHz, CDCI3) 7,49 (d, 2H), 7,29 (t, 2H), 7,08 (t, 1H), 5,88 (m, 1H), 5,10 (dd, 2 H), 4,42 (brs, 4 H).
8-t-butyl 1-metyl ester kyseliny (E,E)-okta-2,4-diéndiovej (43)
Do miešaného roztoku diizopropylamínu (2,06 ml, 14,7 mmol) v THF (25 ml) pri -78 °C sa pridalo n-BuLi (2,0 M v hexánoch, 6,2 ml, 12,4 mmol) a roztok sa nechal miešať 20 min pri tejto teplote. Potom sa po kvapkách pridal roztok fosfonátu 43a (63) (2,66 g, 11,3 mmol) v THF (4 ml), pričom roztok nadobudol tmavožltú farbu. Po 20 min pri -78 °C sa zmes ohriala na 0 °C a po kvapkách sa pridal roztok aldehydu 43b (64) (1,78 g, 11,3 mmol) v THF (4 ml). Po pridaní sa roztok nechal ohriať na teplotu prostredia a miešal sa cez noc. Zriedil sa Et2O (30 ml) a premyl H2O (3x10 ml). Vodné extrakty sa spojili a extrahovali Et2O (2 x ml), organické fázy sa spojili, premyli roztokom NaCI, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Po odparení za zníženého tlaku nasledovala flash chromatografia (10 - 20% EtOAc/hexány), čím sa získala látka 43 vo forme číreho oleja (1,54 g, 57 %). TLC Rf 0,56 (20 % EtOAc/hexány); 1H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 7,22 (dd, 1H), 6,19 (dd, 1H), 6,08 (m, 1 H), 5,77 (d, 1H), 2,42 (m, 2H), 2,32 (t, 2H), 1,42 (s, 9H).
Metylester kyseliny (E,E)-7-fenylkarbamoyl-hepta-2,4-diénovej (44)
Do miešaného roztoku diesteru 43 (1,00 g, 4,61 mmol) v CH2CI2 (40 ml) sa pridal TFA (4,0 ml) a reakcia sa nechala bežať 6 hodín. Zmes sa nakoncentrovala za zníženého tlaku. Získala sa biela tuhá látka pozostávajúca zo surovej kyseliny (710 mg, 3,85 mmol). Táto kyselina (400 mg, 2,17 mmol) sa rozpustila v CH2CI2 (20 ml) a do tohto miešaného roztoku sa pridal DMAP (13 mg), anilín (218 μΙ, 2,39 mmol) a EDC (500 mg, 2,61 mmol). Po 1,5 h sa zmes zriedila EtOAc a premyla H2O. Vrstvy sa oddelili a vodná fáza sa extrahovala EtOAc (3 x 15 ml). Organické frakcie sa spojili, premyli HCI (1 N, 1 x 5 ml) a roztokom NaCI, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získala hnedá tuhá látka. Táto sa rozpustila v minime CH2CI2 a pretlačila sa cez vrstvu silikagélu (20 30 % EtOAc/hexány, 200 ml), aby sa odstránili nečistoty. Eluent sa nakoncentroval na svetlohnedý olej, ktorý sa rozpustil v malom množstve CH2CI2 a z ktorého sa vyzrážali kryštály pridaním zmesi hexánov a dietyléteru. Matičný roztok sa odsal, kryštály sa premyli éterom, kvapalná frakcia sa nakoncentrovala a tento postup sa opakoval niekoľkokrát, kým sa nakoniec získala látka 44 vo forme belavých kryštálov (324 mg, 1,25 mmol, 58 %). TLC Rf 0,44 (50 % EtOAc/hexány); 1H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 7,47 (d, 1 H), 7,30 (t, 2 H), 7,24 (m, 1 H), 7,09 (t, 1 H), 6,24 (dd, 1H), 6,14 (m, 1H), 5,81 (d, 1H), 3,72 (s, 3H), 2,60 (m, 2H), 2,47 (t, 2H).
Metylester kyseliny (E,E)-7-(metyl-fenyl-karbamoyl)-hepta-2,4-diénovej (45)
Intermediát - surová kyselina z prvého kroku prípravy 44 (200 mg, 1,09 mmol) a N-metylanílín (130 μΙ, 1,19 mmol) sa rozpustili v CH2CI2 (10 ml) a miešali sa. Pridali sa EDC (271 mg, 1,41 mmol) a DMAP (5 mg) a reakcia sa nechala bežať cez noc. Zmes sa rozdelila medzi H2O a EtOAc a vrstvy sa oddelili. Vodná vrstva sa extrahovala EtOAc (3 x 10 ml), organické vrstvy sa spojili, premyli HCI (1 N, 1 x 5 ml), roztokom NaCI, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Odparením za zníženého tlaku sa získala čistá látka 45 vo forme hnedého oleja (286 mg, 1,05 mmol, 96 %). TLC Rt 0,81 (5 % MeOH/CH2CI2); 1H-NMR (300 MHz, CDCI3) δ 7,40 (t, 2H), 7,35 (t, 1H), 7,20 (d, 2H), 7,15 (dd, 1H), 6,20 (m, 2H), 5,76 (d, 1H), 3,70 (s, 3H), 3,24 (s, 3H), 2,42 (m, 2H), 2,18 (t, 2H).
Kyselina (E,E)-7-fenylkarbamoyl-hepta-2,4-diénová (46)
Ester 45 (260 mg, 45 mmol) sa rozpustil v MeOH (7,5 ml). Pridal sa roztok
LiOH.H2O (200 mg, 4,76 mmol) v H2O (2,5 ml) a zmes sa miešala 6 hodín.
Reakčná zmes sa okyslila HCI (1 N) do pH 2 a potom sa extrahovala EtOAc (3x10 ml). Organické frakcie sa spojili, premyli H20 a roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Odparením za zníženého tlaku sa získal čistý produkt 46 vo forme hnedej tuhej látky (200 mg, 0,77 mmol, 81%). TLC R, 0,13 (40% EtOAC/hexány); 1H-NMR (300 MHz, CD3OD) δ 7,47 (t, 2H), 7,41 (d, 1H), 7,28 (d, 2H), 7,19 (dd, 1H), 6,18 (dd, 1H), 6,05 (m, 1H), 3,27 (s, 3H), 3,40 (m, 2H), 2,22 (t, 2H).
1-Hydroxyamid 8-fenylamid kyseliny (E,E)-okta-2,4-diéndiovej (47)
Kyselina 46 (200 mg, 0,77 mmol) a TBDPSO-NH2 (220 mg, 0,81 mmol) sa rozpustili v CH2CI2 (8 ml). Do tohto miešaného roztoku sa pridali EDC (178 mg, 0,93 mmol) a DMAP (5 mg) a reakcia sa nechala bežať cez noc. Zmes sa nakoncentrovala a potom sa prefiltrovala cez vrstvu silikagélu (EtOAc). Odparením za zníženého tlaku sa získal svetlohnedý olej (383 mg, 0,75 mmol, 97%). Chránený hydroxamát (270 mg, 0,53 mmol) sa rozpustil v CH2CI2 (10 ml) a pridal sa TFA (0,5 ml). Roztok sa miešal 2 hodiny a pozorovala sa nová škvrna na TLC, ktorá sa vyfarbovala pomocou FeCI3. Roztok sa nakoncentroval za zníženého tlaku a pridal sa dietyléter, čím sa oddelila fáza, ktorá priľnula k stenám banky. Kvapalná fáza sa odtiahla, zvyšok sa rozotrel s EtOAc, kvapalina sa odstránila a odparením prchavých zložiek zo zvyšku sa získala látka 47 vo forme hnedej gumy (23 mg, 0,084 mmol, 16 %). TLC R, 0,22 (5 % MeOH/CH2CI2); 1H-NMR (400 MHz, CD3OD) δ 7,50 (t, 2H), 7,40 (t, 1H), 2,27 (d, 2H), 7,08 (m, 1H), 6,11 (m, 1H), 5,97 (m, 1H), 5,80 (m, 1H), 3,23 (s, 3H), 3,39 (m, 2H), 2,21 (t, 2H).
Hydroxyamid fenylamid kyseliny oktándiovej (48)
Titulná zlúčenina 48 sa získala ako hnedá guma (9 mg) sériou krokov analogických ako v príprave látky 47. TLC R, 0,20 (5% MeOH/CHaCIJ; 1H-NMR (400 MHz, CD3OD) δ 7,51 (t, 2H), 7,41 (t, 1H), 7,30 (d, 2H), 3,29 (s, 3H), 2,11 (m, 4H), 1,58 (m, 4H), 1,22 (m, 4H).
Benzylamid kyseliny oktándiovej (49)
O
Do miešaného roztoku suberoylchloridu (1,00 ml, 5,55 mmol) v THF (40 ml) pri 0 °C sa po kvapkách pridal roztok benzylamínu (0, 61 ml, 5,55 mmol) a DIEA (1,45 ml, 8,33 mmol) v THF (10 ml). Zmes sa nechala ohriať na teplotu miestnosti a miešala sa 1 hodinu. Potom sa pridala HCI (10 ml, 1 N) a zmes sa miešala 0,5 h. Obsah sa zriedil EtOAc (30 ml) a vrstvy sa oddelili. Vodná časť sa extrahovala EtOAc (3 x 10 ml), organické vrstvy sa spojili, premyli roztokom NaCI (5 ml) a vysušili sa nad MgSO4. Filtráciou a nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získala látka 49 vo forme belavej tuhej látky. 1H-NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 11,98 (br s, 1H), 9,80 (t, 1H), 7,32 (m, 2H), 7,23 (m, 3H), 4,25 (d, 2H), 2,19 (t, 2H), 2,12 (t, 2H), 1,50 (m, 4H), 1,25 (m, 4H).
Benzylamid hydroxyamid kyseliny oktándiovej (50)
Táto zlúčenina bola pripravená z látky 49 cez svoj chránený hydroxamát, ako bolo opísané pri predchádzajúcich zlúčeninách. Získala sa látka 50 vo forme bielej tuhej látky. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10,30 (s, 1H), 8,27 (t, 1H), 7,28 (m, 2H), 7,23 (m, 3H), 5,65 (d, 2H), 2,11 (t, 2H), 1,91 (t, 2H), 1,46 (m, 4H), 1,23 (m, 4H).
t-Butylester kyseliny (7S)-7-benzyloxykarbonylamino-7-fenylkarbamoylheptánovej (51)
zX
Dicyklohexylamínová soľ 8-t-butylesteru kyseliny N-CbZ-L-2-aminosuberovej (100 mg, 0,18 mmol) sa rozpustila v HCI (5 ml, 1 N) a extrahovala sa EtOAc (3x10 ml). Extrakty sa spojili, premyli roztokom chloridu sodného a vysušili sa nad MgSO4. Odparením sa získala voľná kyselina vo forme bielej tuhej látky (68 mg, 0,179 mmol). Tá sa rozpustila v CH2CI2 (2,5 ml), do ktorého sa pridal anilín (17 μΙ,
0,19 mmol), DIEA (46 μΙ, 0,27 mmol) a nakoniec Py-BOP (97 mg, 0,19 mmol). Roztok sa miešal 1 h, nakoncentroval sa a zvyšok sa rozdelil medzi H2O (5 ml) a EtOAc (10 ml). Vrstvy sa oddelili a vodná fáza sa extrahovala EtOAc (3x10 ml). Extrakty sa spojili, premyli HCI (1 N) a roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získal tuhý zvyšok, ktorý sa prefiltroval cez vrstvu silikagélu (30 % EtOAc/hexány). Skombinovaný eluent sa odparil, čím sa získala zlúčenina 51 vo forme bielej tuhej látky (76 mg, 0,167 mmol, 94 %). TLC R, 0.38 (30 % EtOAc/hexanes); 1H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 8,21 (s, 1H), 7,48 (d, 2H), 7,32 (m, 5 H), 7,28 (t, 2H), 7,08 (t, 1H), 5,39 (br d, 1H), 5,10 (m, 2H), 4,26 (brdd, 1H), 2,07 (t, 2H), 1,92 (m, 1 H), 1,66 (m, 1 H), 1,55 (m, 2 H), 1,42 (s, 9 H), 1,38 (m, 4 H).
Kyselina (7S)-7-benzyloxykarbonylamino-7-fenylkarbamoylheptánová (52)
Do roztoku esteru 51 (76 mg, 0,167 mmol) v CH2CI2 (5 ml) sa pridal TFA (0,5 ml) a reakčný roztok sa miešal 5 hodín. Roztok sa nakoncentroval za zníženého tlaku, čím sa získal surový produkt 52 vo forme bielej tuhej látky (80 mg), ktorá sa použila v ďalšom kroku bez čistenia. TLC R, 0,32 (5% MeOH/CH2CI2); 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11,93 (br s, 1H), 9,99 (s, 1H), 7,58 (d, 2H), 7,55 (d, 1H), 7,35 (m, 4H), 7,29 (t, 2H), 7,03 (t, 1H), 5,02 (m, 2H), 4,11 (br dd, 1H), 2,17 (t, 2H), 1,59,,(m, 2H), 1,48 (m, 2H), 1,22 (m, 4H).
Benzylester kyseliny (1S)-(6-hydroxykarbamoyl-1fenylkarbamoylhexyl)karbamidovej (53)
ΓΊ
Do roztoku surovej kyseliny 52 (80 mg) a TBDPSO-NH2 (60 mg, 0,221 mmol) v CH2CI2 sa pridal DIEA (52 μΙ, 0,302 mmol) a potom Py-BOP (125 mg, 0,241 mmol). The solution was stirred for 3 h, then concentrated under reduced pressure. The residue was passed through a plug of silica gel (50% EtOAc/hexanes) and the collected eluent evaporated. A white foam (107 mg, 0.164 mmol, 82 %) was obtained, this was dissolved in CH2CI2 (5 ml) and TFA (0.25 ml) was added and the solution stirred for 2 h. A new spot that stained with FeCI3 was indicated by TLC analysis. The mixture was concentrated under reduced pressure, and the residue was solvated in a minimum of EtOAc and the product precipítated with hexanes. The resulting white gel was rinsed with hexanes and dried under vacuum, to give 53 as a white solid (40 mg, 0.097 mmol, 58 % over three steps). Ή-NMR (400 MHz, DMSO-C'6) 5 10. 31 (s, 1H), 9. 99 (s, 1H), 7.59 (d, 2H), 7.56 (d, 1H), 7.37 (m, 4H), 7. 2 9 (t, 2H), 7. 02 (t, 1H), 5. 02 (m, 2H), 4. 11 (dt, 1H), 1.90 (t, 2H), 1. 61 (m, 2H), 1.47 (m, 2H), 1.30 (m, 4H). MS (ESI+) calcd for C22H27NO, 413, found 414 [M+H]+.
t-Butylester kyseliny (7S)-7-benzyloxykarbonylamino-7-(chinolin-8-ylkarbamoyl)heptánovej (54)
Γί
Titulná zlúčenina sa pripravila z dicyklohexylamínovej soli 8-t-butylesteru kyseliny N-CbZ-L-2-aminosuberovej podobným spôsobom ako látka 51. Flash chromatografiou (0 - 1 % MeOH/CH2CI2) sa získal produkt 54 vo forme svetlohnedej tuhej látky (70 mg, 0,138 mmol, 82%). TLC R, 0,42 (2% MeOH/CH2CI2); 1H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 10,19 (s, 1H), 8,77 (dd, 1H), 8,71 (dd, 1 H), 8,15 (dd, 1H), 7,52 (m, 2H), 7,45 (m, 1H), 7,33 (m, 4H), 5,50 (br d, 1H), 5,15 (m, 2H), 4,51 (br dd, 1H), 2,17 (t, 2H), 2,00 (m, 1H), 1,79 (m, 1H), 1,56 (m, 2H), 1,45'(m, 2H), 1,40 (s, 9H), 1,38 (m, 2H).
Kyselina (7S)-7-benzyloxykarbonylamino-7-(chinolin-8-ylkarbamoyl)heptánová (55) x\
Pripravená z látky 54 podobne ako látka 52. Získaná vo forme hnedej tuhej látky (72 mg, 0,129 mmol). TLC Rf 0,16 (50 % EtOAc/hexány); 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11,92 (br s, 1H), 10,46 (s, 1H), 8,49 (dd, 1H), 8,63 (dd, 1H), 8,42 (dd, 1H), 8,10 (d, 1H), 7,68 (dd, 1H), 7,58 (t, 1H), 7,36 (m, 2H), 7,28 (m, 2H), 5,09 (m, 2H), 4,22 (m, 1H), 2,19 (t, 2H), 1,83 (m, 1H), 1,67 (m, 1H), 1,48 (m, 2H), 1,39 (m, 2 H), 1,28 (m, 2 H)
Benzylester kyseliny (1 S)-[6-hydroxykarbamoyl-1-(chinolin-8ylkarbamoyl)hexyl]karbamidovej (56)
Pripravená z látky 55 podobne ako látka 53. Látka 56 sa získala vo forme bielej tuhej látky (15 mg, 0,032 mmol, 44 %). 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10,46 (s, 1H), 10,31 (s, 1H), 8,85 (dd, 1H), 8,63 (dd, 1H), 8,42 (dd, 1H), 8,12 (d, 1H), 8,66 (m, 2H), 7,58 (t, 1H), 7,37 (m, 2H), 7,28 (m, 2H), 7,20-6,90 (1H), 5,10 (m, 2H), 4,10 (m, 1H), 1,92 (t, 2H), 1,82 (m, 1H), 1,68 (m, 1H), 1,49 (m, 2H), 1,40 (m, 2H), 1,26 (m, 2H). MS (ESI+) vypočítané pre C25H28N4O5 464, nájdené 465 [M+H]+.
Metylester kyseliny (7S)-(cyklohexánkarbonylamino)-7-fenylkarbamoylheptánovej (57)
γΊ
Do roztoku látky 5 (81 mg, 0,214 mmol) v CH2CI2 (10 ml) sa pridal TFA (0,5 ml) a roztok sa miešal 2 hodiny. Zmes sa nakoncentrovala za zníženého tlaku. Do roztoku tohto amínu (62 mg, 0,223 mmol) a kyseliny cyklohexánkarboxylovej (31 μΙ, 0,245 mmol) v CH2CI2 (4 ml) sa pridal Py-BOP (140 mg, 0,268 mmol) a DIEA (58 μΙ, 0,335 mmol). Roztok sa miešal 2 h, nakoncentroval sa za zníženého tlaku a produkt sa vyčistil flash chromatografiou (40 % EtOAc/hexány). Po odparení sa získal surový produkt 57 vo forme bielej tuhej látky (95 mg) obsahujúcej malé množstvo nezreagovanej kyseliny cyklohexánkarboxylovej. Tento materiál sa použil v nasledujúcom kroku bez ďalšieho čistenia. TLC Rf 0,58 (50 % EtOAc/hexány); 1HNMR (400 MHz, CDCI3) δ 8,58 (s, 1H), 7,50 (d, 2H), 7,28 (t, 2H), 7,07 (t, 1H), 6,14 (d, 1H), 4,56 (dt, 1H), 3,64 (s, 3H), 2,28 (t, 2H), 2,13 (tt, 1H), 1,94 (m, 1H), 1,85 (m, 2H), 1,76 (m, 2H), 1,64 (m, 4H), 1,41 (m, 5 H), 1,22 (m, 4H).
Kyselina (7S)-(cyklohexánkarbonylamino)-7-fenylkarbamoylheptánová (58)
ΓΊ
Do roztoku esteru 57 (95 mg) v MeOH (2,5 ml) pri 0 °C sa pridal roztok NaOH (1 M, 2,5 ml). Po pridaní sa vytvorila biela zrazenina, ktorá sa znova rozpustila pridaním THF (2,5 ml). Po 3 hodinách sa pridal ďalší NaOH (1 M, 1,0 ml) a teplota sa udržiavala na 0 °C. Po úplnom vymiznutí východiskovej látky podľa TLC analýzy sa reakčná zmes okyslila HCl (1 N), čím sa získala biela zrazenina. Supernatant sa odtiahol a tuhá látka sa odsala. Spojené roztoky sa extrahovali EtOAc (3x5 ml) a extrakty sa spojili, premyli roztokom NaCl, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získala biela tuhá látka, ktorá sa skombinovala s filtračným koláčom a vysušila za zníženého tlaku, čím sa získala karboxylová kyselina 58 (75 mg, 0,200 mmol, 90 %).1 H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11,95 (s, 1H), 9,98 (s, 1H), 7,90 (d, 1H), 7,58 (d, 1H), 7,28 (t, 2H), 7,02 (t, 1H), 4,33 (dt, 1H), 2,22 (tt, 1H), 2,17 (t, 2H), 1,67 (m, 6H), 1, 6 0 (m, 2 H), 1, 4 6 (m, 2 H), 1,22 (m, 9 H).
8-Hydroxyamid 1-fenylamid kyseliny (2S)-2-(cyklohexánkarbonylamino)oktándiovej (59)
kx
Kyselina 58 (70 mg, 0,187 mmol), TBDPSO-NH2 (61 mg, 0,224 mmol) a DMAP (5 mg) sa rozpustili v CH2CI2 (4 ml) a pridal sa EDC (47 mg, 0,243 mmol). Roztok sa miešal cez noc. Po nakoncentrovaní za zníženého tlaku sa materiál vyčistil flash chromatografiou (50 % EtOAc/hexány). Odparením spojených frakcií produktu sa získala biela pena (80 mg, 0,131 mmol, 70%). Do roztoku tohto chráneného hydroxamátu v CH2CI2 (2 ml) a THF (3 ml) sa pridal TFA (0,25 ml) a zmes sa miešala 1,5 h. Na TLC sa pozorovala nová škvrna, ktorá sa okamžite vyfarbovala pomocou FeCI3. Roztok sa nakoncentroval a všetky prchavé zložky sa odstránili za zníženého tlaku. Zvyšok sa rozotrel s EtOAc a získala sa biela and gélovitá zrazenina, ktorá sa preniesla do plastovej skúmavky s EtOAc (5 ml). Skúmavka sa centrifugovala, aby sa vytvorila peleta, supernatant sa zlial a pridal sa EtOAc (10 ml). Peleta sa resuspendovala pod ultrazvukom, znova sa centrifúgovala, supernatant sa zlikvidoval a zvyšok sa vysušil za zníženého tlaku. Získala sa biela tuhá látka 59 (18 mg, 0,046 mmol, 35%). 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10,31 (s, 1H), 9,97 (s, 1H), 7,8 9 (d, 1H), 7,57 (d, 2H), 7,28 (t, 2H), 7,02 (t, 1H), 4,33 (dt, 1H), 2,22 (t, 2H), 1,91 (t, 2H), 1,61 (m, 6H), 1,68 (m, 2H), 1,45 (m, 2H), 1,21 (9H).
Hydroxyamid chinolin-8-ylamid kyseliny oktándiovej (60)
Táto zlúčenina sa pripravila z monometylesteru kyseliny suberovej podobne ako 48 použitím 8-aminochinolínu. Surový zvyšok získaný po odstránení chrániacej skupiny chráneného hydroxamátu pomocou TFA sa rozpustil v malom objeme EtOAc a vyzrážal sa hexánmi, čím sa získal produkt 60 vo forme bielej tuhej látky (18 mg, 0,057 mmol, 21 % z karboxylovej kyseliny). 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10,31 (s, 1H), 10,02 (s, 1H), 8,92 (dd, 1H), 8,61 (dd, 1H), 8,40 (dd, 1H), 7,65 (dd, 1H), 7,63 (dd, 1H), 7,56 (t, 1H), 2,56 (t, 1H), 1,93 (t, 1H), 1,63 (m, 2H), 1,49 (m, 2H), 1,2 8 (m, 4 H) MS (ESI+) vypočítané pre C17H21N3O3 315, nájdené 316 [M+H]+.
1-t-Butylester 8-etylester kyseliny 2-t-butoxykarbonyloktándiovej (61)
Do miešanej suspenzie NaH (60 % disperzia, 197 mg, 4,913 mmol) v THF (25 ml) pri 0 °C sa pridal di-t-butylmalonát (1,00 ml, 4,466 mmol) a zmes sa nechala ohriať na teplotu prostredia. Po 1 hodine vývoj plynu ustal a po kvapkách sa pridal etyl 6-brómhexanoát (0,88 ml, 4,913 mmol). Reakcia sa refluxovala cez noc. Reakcia sa opatrne ukončila pridaním H2O (10 ml) a zriedila sa EtOAc. Po oddelení vrstiev sa vodná fáza sa extrahovala EtOAc (3x10 ml). Extrakty sa spojili, premyli H2O, roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získal žltý olej, ktorý sa prefiltroval cez vrstvu silikagélu (10% EtOAc/hexány). Odparením sa získal svetložltý sirup 61 (1,52 g, 4,24 mmol, 95 %). TLC R, 0,44 (10 % EtOAc/hexány); ’H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 4,10 (q, 2H), 3,08 (t, 1H), 2,26 (t, 2H), 1,76 (m, 2H), 1,60 (m, 2H), 1,43 (s, 18H), 1,32 (m, 4H), 1,23 (m, 3H).
8-etylester kyseliny 2-karboxyoktándiovej (62)
Do roztoku triesteru 61 (500 mg, 1,395 mmol) v CH2CI2 (20 ml) sa pridal TFA (2,0 ml) a reakčná zmes sa miešala cez noc. Prchavé zložky sa odparili za zníženého tlaku a zvyšok sa opakovane rozpustil v CH2CI2 a odparil, aby sa odstránili všetky stopy TFA. Získala sa tuhá látka 62 (327 mg; 1,33 mmol) a použila sa priamo v nasledujúcom kroku bez ďalšieho čistenia. 1H-NMR (400 MHz, DMSOde) δ 12,62 (br s, 2H), 4,03 (q, 2H), 3,16 (t, 1H), 2,25 (t, 2H), 1,67 (m, 2H), 1,49 (m, 2H), 1,25 (m, 4 H), 1,16 (t, 3 H).
Etylester kyseliny 7,7-bis-(chinolin-8-ylkarbamoyl)heptánovej (65)
O
Dikyselina 62 (150 mg, 0,609 mmol), 8-aminochinolín (211 mg, 1,462 mmol) a DMAP (5 mg) sa rozpustili v THF (6 ml). Do tohto roztoku sa pridal EDC (350 mg,
1,827 mmol) a reakcia sa nechala bežať cez noc. Zmes sa nakoncentrovala za zníženého tlaku a produkt sa vyčistil flash chromatografiou (40 % EtOAc/hexány). Odparením spojených frakcií produktu sa získal produkt 63 vo forme svetlohnedej tuhej látky (100 mg, 0,201 mmol, 14%). 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10,85 (s, 2H), 8,92 (dd, 2H), 8,64 (dd, 2H), 8,40 (dd, 2H), 7,68 (dd, 2H), 7,62 (dd, 2H), 7,57 (t, 2H), 4,35 (t, 1H), 3,98 (q, 2H), 2,24 (t, 2H), 2,00 (m, 2H), 1,51 (m, 2H), 1,37 (m, 4H),1,12(t, 3H).
Kyselina 7,7-bis-(chinolin-8-ylkarbamoyl)heptánová (64)
Do roztoku esteru 63 (94 mg, 0,212 mmol) v MeOH (3 ml) a THF (1 ml) sa pridal roztok LiOH.H2O (44 mg, 1,062 mmol) v H2O (1 ml) a zmes sa miešala 5 hodín. Po okyslení HCI (1 N) na pH 7 sa pridal EtOAc (10 ml) a vrstvy sa oddelili. Spojené roztoky sa extrahovali EtOAc (3x5 ml) a extrakty sa spojili, premyli nasýteným NH4CI (3 ml), H2O (3 ml), roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získal produkt 64 vo forme bielej tuhej látky (94 mg, 0,200 mmol, 94 %). TLC R, 0,21 (50 % EtOAc/hexány); 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11,88 (s, 1H), 10,85 (s, 2H), 8,93 (dd, 2H), 8,6S (dd, 2H), 8,40 (dd, 2H), 7,69 (dd, 2H), 7,63 (dd, 2H), 7,58 (t, 2H), 4,35 (t, 1H), 2,16 (t, 2H), 2,00 (m, 2H), 1,49 (m, 2H), 1,38 (m, 4H).
8-Hydroxyamid 1-chinolin-8-ylamid kyseliny 2-(chinolin-8-ylkarbamoyl)-oktándiovej (65)
Kyselina 64 (94 mg, 0,200 mmol), TBDPSO-NH2 (74 mg, 0,272 mmol) a DMAP (5 mg) sa rozpustili v CH2CI2 (4 ml) a pridal sa EDC (57 mg, 0,295 mmol). Roztok sa miešal cez noc a nakoncentroval sa za zníženého tlaku. Vyčistením flash chromatografiou (30 - 50 % EtOAc/hexány) a odparením spojených frakcií produktu sa získala biela pena. Do roztoku tohto chráneného hydroxamátu v CH2CI2 (4 ml) sa pridal TFA (0,2 ml) a roztok sa miešal 4 hodiny. TLC indikovala úplné spotrebovanie východiskovej látky a novú škvrnu, ktorá sa vyfarbovala pomocou FeCl3. Roztok sa nakoncentroval za zníženého tlaku a zvyšok sa rozpustil v minime EtOAc. Pridaním hexánov sa získala biela zrazenina, z ktorej sa odstránil matičný roztok. Po premytí hexánmi sa zvyšok vysušil za zníženého tlaku, čím sa získal produkt 65 vo forme bielej tuhej látky (30 mg, 0,061 mmol, 22 % z karboxylovej kyseliny). 1H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 10-85 (s, 2H), 10,30 (s, 1H), 8,93 (dd, 2H), 8,65 (dd, 2H), 8,40 (dd, 2H), 7,69 (dd, 2H), 7,63 (dd, 2H), 7,58 (t, 2H), 4,35 (t, 1H), 1,99 (m, 2H), 1,92 (t, 2H), 1,48 (m, 2H), 1,35 (m, 4H). MS (ESI+) vypočítané pre C27H27N5O4 485, nájdené 486 [M+H]+.
8-Hydroxyamid chinolin-3-ylamid kyseliny 2-(chinolin-8-ylkarbamoyl)oktándiovej (68)
Titulná zlúčenina sa pripravila z dikyseliny 62 analogicky ako 65. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10,60 (s, 1H), 10,34 (s, 1H), 8,95 (dd, 2H), 8,74 (s, 2H), 7,93 (dd, 2H), 7,64 (dd, 2H), 7,56 (dd, 2H), 3,71 (t, 1H), 1,96 (m, 4H), 1,51 (m, 2H), 1,34 (m, 4H).
Fenylamid kyseliny 6-brómhexánovej (76)
Do roztoku 6-brómhexanoylchloridu (1,00 ml, 6,53 mmol) v THF (35 ml) pri 0 °C sa po kvapkách pridal roztok anilínu (0,60 ml, 6,53 mmol) a TEA (1,09 ml, 7,84 mmol) v THF (5 ml). Reakčná zmes sa nechala ohriať na teplotu miestnosti a miešala sa 2 hodiny. Zmes sa prefiltrovala, tuhý podiel sa premyl EtOAc a filtrát sa zredukoval za zníženého tlaku. Zvyšok sa rozdelil medzi H2O (15 ml) a EtOAc (20 ml) a vrstvy sa oddelili. Vodná časť sa extrahovala EtOAc (3 x 10 ml) a organické vrstvy sa spojili, premyli HCI (1 N), roztokom NaCI, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získal hnedý olej, ktorý sa prefiltroval cez vrstvu silikagélu (30 % EtOAc/hexány) za pomoci podtlaku. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získal produkt 67 vo forme tuhej látky (1,55 g, 5,74 mmol, 88 %). TLC R, 0,36 (25 % EtOAc/hexány); 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9,85 (s, 1H), 7,57 (d, 2H), 7,27 (t, 2H), 7,01 (t, 1H), 3,53 (t, 2H), 2,30 (t, 2H), 1,81 (t, 2H), 1,63 (m, 2H), 1,42 (m, 2H); MS (ESI+) vypočítané pre C12H16BrNO 268+270, nájdené 269+271 [M+H]+.
S-(5-fenylkarbamoyl-pentyl) ester kyseliny tiooctovej (68)
O
Bromid 67 (200 mg, 0,74 mmol), tiooctan draselný (110 mg, 0,96 mmol) a jodid sodný (10 mg) sa skombinovali v THF (6 ml) a intenzívne miešaná zmes sa uviedla do refluxu cez noc. Reakčná zmes sa nakoncentrovala a prefiltrovala sa cez vrstvu silikagélu (20 % EtOAc/hexány, 200 ml) za pomoci podtlaku. Odparením za zníženého tlaku sa získal produkt 68 vo forme oranžovej kryštalickej tuhej látky (190 mg, 0,72 mmol, 97 %). TLC Rf 0,22 (25 % EtOAc/hexány); 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9,83 (s, 1H), 7,56 (d, 2H), 7,27 (t, 2H), 7,00 (t, 1H), 2,82 (t, 2H), 2,30 (s, 3H), 2,28 (t, 2H), 1,57 (m, 2H), 1,52 (m, 2H), 1,35 (m, 2H).
Kyselina 6-metánsulfonylaminohexánová (69)
H
Kyselina 6-aminohexánová (904 mg, 6,89 mmol) a NaOH (415 mg, 10,34 mmol) sa rozpustili v H2O (30 ml) a ochladili sa na 0 - 5 °C. Po kvapkách sa pridal metánsulfonylchlorid (0,586 ml, 7,58 mmol) a reakčná zmes sa miešala 2 h, potom sa ohriala na teplotu prostredia a miešala sa ďalšie 2 hodiny. Zmes sa okyslila pomocou HCI (1 N) a extrahovala sa EtOAc (3x15 ml). Extrakty sa spojili, premyli H2O, roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Odparením za zníženého tlaku sa získal produkt 69 vo forme bielej kryštalickej tuhej látky (207 mg, 0,99 mmol, 14%). ’H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11,95 (s, 1H), 6,91 (t, 1H), 2,90 (dt, 2H), 2,87 (s, 3H), 2,20 (t, 2H), 2,48 (m, 2H), 2,43 (m, 2H), 1,27 (m, 2H).
Fenylamid kyseliny 6-metánsulfonylaminohexánovej (70)
Do roztoku kyseliny 69 (100 mg, 0,48 mmol), anilínu (60 μΙ, 0,66 mmol) a DMAP (5 mg) v THF (5 ml) sa pridal EDC (119 mg, 0,57 mmol). Reakčná zmes sa miešala cez noc a rozdelila sa medzi H2O (10 ml) a EtOAc (15 ml). Vrstvy sa oddelili a vodná fáza sa extrahovala EtOAc (3x10 ml). Organické frakcie sa spojili, premyli nasýteným NH4CI (5 ml), potom roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získal produkt 70 vo forme bielej kryštalickej tuhej látky (130 mg, 0,46 mmol, 95%). ’H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9,84 (s, 1H), 7,57 (d, 2H), 7,26 (t, 2H), 7,00 (t, 1H), 6,92 (t, 1H), 2,91 (dt, 2H), 2,85 (s, 3H), 1,58 (m, 2H), 1,47 (m, 2H), 1,31 (m, 2H).
Metylester kyseliny 9,9,9-trifluór-8-oxononánovej (71)
O
O
Do roztoku monometylesteru kyseliny suberovej (1,00 g, 5,31 mmol) v THF (15 ml) sa pridal oxalylchlorid (2 ml) a po ňom DMF (1 kvapka). Roztok sa miešal 2 hodiny a nakoncentroval sa za zníženého tlaku. Prchavé zložky sa odstránili za vysokého vákua cez noc, čím sa získal žltý olej (1,08 g, 5,22 mmol, 98 %). Tento surový chlorid kyseliny sa potom transformoval na trifluórmetylketón metódou z literatúry nasledovne. (65) Do roztoku chloridu kyseliny (1,08 g, 5,22 mmol) v CH2CI2 (45 ml) pri 0 °C sa pridal trifluóracetanhydrid (4,64 ml, 32,81 mmol) a pyridín (3,54 ml, 43,74 mmol). Zmes sa nechala ohriať na teplotu miestnosti a miešala sa 2 hodinu. Po návrate na 0 °C sa opatrne pridala ľadovo studená H2O (20 ml). Pridala sa ďalšia H2O (100 ml) a vrstvy sa oddelili. Vodná fáza sa extrahovala CH2CI2 (2 x 30 ml) a organické vrstvy sa spojili, premyli roztokom NaCI, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Odparením za zníženého tlaku sa získal hnedý olej, ktorý sa vyčistil flash chromatografiou (2 - 4 % MeOH/CH2CI2), čím sa získal produkt 71 vo forme číreho oleja (641 mg, 2,67 mmol, 49 %). TLC Rf 0,24 (2 % MeOH/CH2CI2); 1H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 3,67 (s, 3H), 2,71 (t, 2H), 2,31 (t, 2H), 1,65 (m, 4H), 1,35 (m, 4H).
Fenylamid kyseliny 9,9,9-trifluór-8-oxononánovej (72)
Do roztoku esteru 71 (300 mg, 1,25 mmol) v THF (18 ml) sa pridal roztok LiOH.H2O (262 mg, 6,24 mmol) v H2O (6 ml) a suspenzia sa miešala cez noc. Zmes sa potom okyslila HCI (1 N) na pH 2 a potom sa extrahovala EtOAc (3x15 ml). Extrakty sa spojili, premyli roztokom chloridu sodného, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získala biela tuhá látka (211 mg, 0,93 mmol, 75%). Do roztoku tejto kyseliny (109 mg, 0,48 mmol), EDC (111 mg, 0,58 mmol), a DMAP (5 mg) v CH2CI2 (5 ml) sa pridal anilín (49 μΙ, 0,53 mmol) a reakcia sa nechala bežať cez noc. Roztok sa rozdelil medzi H2O (5 ml) a EtOAc (10 ml). Vrstvy sa oddelili a vodná fáza sa extrahovala EtOAc (3x5 ml). Organické frakcie sa spojili, premyli roztokom NaCI, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Odparením za zníženého tlaku sa získala tuhá látka, ktorá sa vyčistila preparatívnou TLC (30 % EtOAC/hexány) s izoláciou najmenej polárneho pásu extrakciou EtOAc. Extrakt sa nakoncentroval, čím sa získal produkt 72 vo forme žltkastej tuhej látky (92 mg, 0,31 mmol, 65 %). TLC R, 0,48 (50 % EtOAc/hexány); ’H-NMR (400 MHz, CDCI3) δ 7,51 (d, 2H), 7,32 (t, 2H), 7,10 (t, 1H), 2,72 (t, 2H),
2,36 (t, 2H), 1,72 (m, 4H), 1,40 (m, 4H); 19F NMR (? MHz, CDCI3) -78,40 (s, 3F); MS (APCI+) vypočítané pre C15H19F3NO, 301, nájdené 325 [M+Na]+.
t-Butylester kyseliny (5-fenylkarbamoylpentyl)karbamidovej (73)
O
Do roztoku kyseliny N-Boc-6-aminohexánovej (2,50 g, 10,81 mmol), EDC (2,69 g, 14,05 mmol) a DMAP (20 mg) v CH2CI2 (100 ml) sa pridal anilín (1,04 ml,
11.35 mmol) a zmes sa miešala cez noc. Roztok sa odparil za zníženého tlaku na malý objem, potom sa rozdelil medzi H2O (20 ml) a EtOAc (30 ml). Vrstvy sa oddelili a vodná fáza sa extrahovala EtOAc (3 x 15 ml). Organické frakcie sa spojili, premyli nasýteným NH4CI (5 ml), potom roztokom NaCl, vysušili sa nad MgSO4 a prefiltrovali. Nakoncentrovaním za zníženého tlaku sa získal čistý produkt 73 vo forme bielej tuhej látky (3,14 g, 10,25 mmol, 95%). TLC Rf 0,40 (50% EtOAc/hexány): 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9,81 (s, 1H), 7,56 (d, 2H), 7,26 (t, 2H), 7,00 (t, 1 H), 6,74 (t, 1 H), 2,89 (dt, 2H), 2,27 (t, 2H), 1,56 (m, 2H), 1,38 (m, 2H),
1.35 (s, 9H), 1,25 (m, 2H).
TFA soľ fenylamidu kyseliny 6-aminohexánovej (74)
H
Do roztoku karbamátu 73 (300 mg, 0,98 mmol) v CH2CI2 (15 ml) sa pridal TFA (0,75 ml) a roztok sa miešal cez noc. Úplné spotrebovanie východiskovej látky bolo potvrdené TLC. Zmes sa odparila za zníženého tlaku, aby sa odstránili všetky prchavé zložky, čím sa získala belavá tuhá látka (295 mg, 0,92 mmol, 94%). Surový produkt 74 sa použil bez ďalšieho čistenia.
Dimetylester kyseliny N-(N-fenylkarbamoyl-5-pentyl)fosforamidovej (75)
O
0
Do miešanej suspenzie amónnej soli 74 (197 mg, 0,62 mmol) a DIEA (148 μΙ, 0,85 mmol) v CH2CI2 (7 ml) pri 0 °C sa po kvapkách pridal dimetylchlórfosfát (77 μΙ, 0,72 mmol). Teplota zmesi sa nechala vystúpiť na teplotu miestnosti a zmes sa miešala cez noc. Roztok sa zriedil H2O (10 ml) a vrstvy sa oddelili. Vodná fáza sa extrahovala CH2CI2 (3 x 10 ml), organické vrstvy sa spojili, premyli nasýteným NH4CI (5 ml), roztokom NaCI, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Po nakoncentrovaní sa zvyšok vyčistil flash chromatografiou (2 - 5 % MeOH/CHaCIJ a frakcie obsahujúce polárnejší z dvoch UV-aktívnych pásov na TLC sa skombinovali a nakoncentrovali, čím sa získal produkt 75 vo forme číreho oleja (40 mg, 0,13 mmol, 20%). TLC Rf 0,23 (5% MeOH/CH2CI2); ’H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9,84 (s, 1H), 7,57 (d, 2H), 7,26 (t, 2H), 7,00 (t, 1H), 4,90 (dt, 1H), 3,51 (d, 6H), 2,71 (m, 2H), 2,28 (t, 2H), 1,56 (m, 2H), 1,40 (m, 2H), 1,29 (m, 2H).
Metyl N-(5-N-fenylkarbamoylpentyl)metylfosfonamidát (76)
O
l\Z
Do suspenzie amónnej soli 74 (155 mg, 0,48 mmol) v CH3CN (8 ml) sa pridal DIEA (0,21 ml) a metyl metylfosfonochloridát (77 mg, 0,600 mmol). Reakčná zmes sa miešala cez noc, počas čoho sa vyčírila. Roztok sa rozdelil medzi H2O (10 ml) a EtOAc (15 ml) a vrstvy sa oddelili. Vodná fáza sa extrahovala EtOAc (3 x 10 ml), organické vrstvy sa spojili, premyli nasýteným NH4CI (1x5 ml), roztokom NaCI, vysušili nad MgSO4 a prefiltrovali. Produkt sa vyčistil flash chromatografiou (3 10 % MeOH/CH2CI2) a frakcie obsahujúce polárnejšiu škvrnu sa spojili a nakoncentrovali, čím sa získala látka 76 vo forme číreho oleja (102 mg, 0,34 mmol, 71 %). TLC Rf 0,16 (5% MeOH/CH2CI2); 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9,85 (s, 1H), 7,57 (d, 2H), 7,26 (t, 2H), 7,00 (t, 1H), 4,52 (dt, 1H), 3,43 (d, 3H), 2,73 (m, 2H), 2,28 (t, 2H), 1,57 (m, 2H), 1,38 (m, 2H), 1,28 (m, 2H), 1,26 (d, 3H).
Príklad 18 - syntéza zlúčeniny 77
Dietyl 3-brómfenylmalonát
Dietyl 3-brómfenylmalonát bol pripravený podľa práce Cehnevert, R. a Desjardins, M. Can. J. Chem. 1994. 72, 3212-2317. 1H NMR (CDCI3, 300 MHz) δ
7,6 (s, 1H), 7,50 (d, 1H, J = 7,9 Hz), 7,37 (d, 1H, J = 7,9 Hz), 7,26 (t, 1H, J = 7,9 Hz), 4,58 (s, 1H), 4,22 (m, 4H), 1,29 (t, J = 10 Hz).
3-brómfenyl malonyl di(fenylamid)
Dietyl 3-brómfenyl malonát (1 g, 3,2 mmol) sa pridal do anilínu (5 ml). Reakčná zmes sa prepláchla argónom a refluxovala sa 2 hodiny. Po ochladení sa reakčná zmes zriedila 10 % HCI (20 ml) a etylacetátom (50 ml). Organická vrstva sa oddelila a nakoncentrovala, čím sa získal 3-brómfenyl malonyl di(fenylamid) vo forme bieleho prášku. (540 mg, 1,3 mmol, 42 %). 1H NMR (d6-DMSO, 300 MHz) δ 10,3 (bs, 2H),7,65 s, 1H), 7, 60 (d, 4H, J = 7, 9 Hz), 7, 54 (d, 1H, J = 7, 9Hz), 7,46 (d, 1H, J = 7,8 Hz), 7,35 (t, 1H, J = 7,8 Hz), 7,31 (t, 4H, J = 7,8 Hz), 7,06 (t, 2H, J = 7,6 Hz), 4,91 9s, 1H).
3-(malonyl di(fenylamid)) škoricová kyselina
3-brómfenyl malonyl di(fenylamid) (500 mg, 1,22 mmol), kyselina akrylová (115 mg, 1,6 mmol, 1,3 ekvivalentu), Pd(OAc)2 (2 mg), tri-o-tolyl fosfón (20 mg), tributylamín (0,6 ml) a xylény (5 ml) sa zahrievali na 120 °C počas 6 h v zatavenej nádobe. Po ochladení sa reakčná zmes zriedila 5 % HCI (10 ml) a etylacetátom (50 ml). Organická vrstva sa oddelila, prefiltrovala a pri státí sa 3-(malonyl di(fenylamid)) škoricová kyselina vyzrážala vo forme bieleho prášku (450 mg, 1,12 mmol, 92 %). 1H NMR (d6-DMSO, 300 MHz) δ 12,4 (bs, 1 H), 10,3 (bs, 2H), 7,73 (s, 1H), 7,7 - 7,5 (m, 6H), 7,52 (d, 1H, J = 7,7 Hz), 7, 4 3 (t, 1 H, J = 7,6 Hz), 7,31 (t, 4H, J = 7,5Hz), 7,06 (t, 2H, J = 7,4 Hz), 6,52 (d, 1H, J = 16 Hz), 4,95 (s, 1H). APCIMS 401 (M+1).
3-(malonyl di(fenylamid)) cinamyl hydroxámová kyselina (77)
3-(malonyl di(fenylamid) škoricová kyselina (200 mg, 0 - 5 mmol) sa rozpustila v suchom CH2CI2 (10 ml). S miešaním sa pri 0°C pridal izobutylchlórformiát (0,10 ml, 0,77 mmol) a trietylamín (0,20 ml). Po 2 hodinách pri 25 °C sa pridal O-(t-butyldifenylsilyl)hydroxylamín a zmes sa miešala ďalšie 4 hodiny. Surová reakčná zmes sa naniesla priamo na vrstvu silikagélu (15 g) a elúciou 20 % etylacetátom/hexánmi sa získala príslušná hydroxámová kyselina chránená silylom (R, = 0,58, 50% etylacteát/hexány) vo forme peny. Na tú sa pôsobilo priamo 10% kyselinou trifluóroctovou v dichlórmetáne (10 ml) počas 4 hodín. Rozpúšťadlá sa nakoncentrovali pri 50 °C na rotačnej odparke a zvyšok sa suspendoval v dietyléteri (10 ml). Filtráciou získanej zrazeniny sa získala zlúčenina 77 vo forme bieleho prášku (150 mg, 0,365 mmol, 73 %). 1H NMR (d6-DMSO, 300 MHz) δ 10,8 (bs, 0,5H), 10,2 (bs, 2H), 9,06 (bs, 0,5H), 7,7 - 7,55 (m, 5H), 7,53 7,38 (m, 4H), 7,31 (t, 4H, J = 7,7 Hz), 7,06 (t, 2H, J = 7,3 Hz), 6,50 (d, 1H, J = 16 Hz) 4,92 (s, 1H). APCI-MS 416 (M+1).
Účinok zlúčeniny 77 na diferenciáciu buniek MEL a aktivitu históndeacetylázy je zobrazený v tabuľke 2. Zlúčenina 77 zodpovedá štruktúre 683 v tabuľke 2. Ako je zrejmé z tabuľky 2, očakáva sa, že zlúčenina 77 bude vysokoúčinným cytodiferenciačným prostriedkom.
Výsledky
Všetky zlúčeniny, ktoré boli pripravené, sa otestovali. Nižšie uvedená tabuľka 2 ukazuje výsledky testovania len na podskupine zlúčenín. Tabuľka 2 je skompilovaná z experimentov podobných, ako sú experimenty opísané vo vyššie uvedených príkladoch 7-10. Testovaným zlúčeninám boli priradené štruktúrne čísla podľa tabuľky 2. Čísla štruktúr boli priradené náhodne a nekorelujú s číslami zlúčenín použitými inde v tejto publikácii.
Výsledky zobrazené v tabuľke 2 overujú všeobecnú presnosť prediktívnych princípov pre návrh zlúčenín s aktivitou bunkovej diferenciácie a inhibície HDAC diskutovanej vyššie v tejto publikácii. Na základe publikovaných princípov a syntetických schém možno jednoducho navrhnúť, pripraviť a testovať na aktivitu bunkovej diferenciácie a inhibície HDAC niekoľko ďalších zlúčenín.
Obrázky 11a-f ukazujú účinok vybraných zlúčenín na afinitne vyčistený ľudským epitopom značkovaný (Flag) HDAC1. Tento účinok bol hodnotený inkubovaním enzýmového prípravku za neprítomnosti substrátu na ľade počas 20 minút s uvedenými množstvami zlúčeniny. Pridal sa substrát (pHjacetylom označený histón odvodený z buniek myšej erytroleukémie) a vzorky sa inkubovali 20 min pri 37 °C v celkovom objeme 30 μΙ. Reakcie sa potom zastavili a uvoľnený acetát sa extrahoval a množstvo uvoľnenej rádioaktivity sa určilo scintilačným počítaním. Ide o modifikáciu testu HDAC opísaného v práci Richon et al. 1998 (39).
Tabuľka 2 - údaje o inhibícii pre vybrané zlúčeniny
Štruktúra MEL dif. HDAC inh.
Interval Opt. % B+ buniek/ml. 10' 5 Interval id50
SAHA (390) O 0,5 až 50 μΜ 2,5 μΜ 68 3,6 0,001 až 100 μΜ 200 nM
654 0,1 to 50 μΜ 200 nM 44 9 0,0001 to 100 μΜ 1 nM
-ξ. Štruktúra MEL dif. HDAC inh.
Interval Opt. % B+ buniek/ml.10' 5 Interval id50
655 ό 0,1 až 50 μΜ 400 nM 16 3,3 0,01 až 100 μΜ 100 nM
656 0,4 až 50 μΜ 0 0,01 až 100 μΜ >100 μΜ
657 0,4 až 50 μΜ 0 0,01 až 100μΜ >100 μΜ
658 čú 0,01 až 50 μΜ 40 nM 8 13 0,0001 až 100 μΜ 2,5 nM
659 ÓO 0,4 až 50 μΜ 0 0,01 až 100 μΜ 10 μΜ
660 0,2 až 12,5 μΜ 800 nM 27 0,001 až 100 μΜ 50 nM
661 όΗς^τ 0,1 až 50 μΜ 500 nM 7 0,01 až 100 μΜ 20 nM
662 0,2 až 50 μΜ 0 0,001 až 100 μΜ >100 μΜ
663 0,2 až 50 μΜ 200 nM 43 7 0,001 až 100 μΜ 100 nM
“S Štruktúra MEĽ dif. HDAC inh.
Interval Opt. % B+ buniek/ml.10' 5 Interval ID50
664 0,2 až 50 μΜ 400 nM 33 22 0,001 až 100 μΜ 50 nM
665 0,1 -50 μΜ 150 nM 24 30 0,001 až 100 μΜ 50 nM
666 ó’ 0,1 -50 μΜ 150 nM 31 28 0,001 až 100 μΜ 100 nM
667 Y1· ' to 0,02- 10 μΜ 80 nM 27 2 0,001 až 100 μΜ 50 nM
668 ίγΑ—V- 0,02 až 10 μΜ 10 μΜ 11 4,7 0,001 až 100 μΜ 100 nM
669 ó 0,8 až 50 μΜ 4 μΜ 11 16,0 0,001 až 100 μΜ 10 μΜ
670 0,4 až 50 μΜ žiadny účinok do 25 μΜ 13,0 0,001 až 100 μΜ >100 μΜ
671 c~o|^1to 0,4 až 50 μΜ 3,1 μΜ 35 12,5 0,001 až 100 μΜ 200 nM
672 H Mjcc/ 0,8 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ 100 μΜ
Č. Štruktúra MEL dif. HDAC inh.
Interval Opt. % B+ buniek/ml. 10' 5 Interval ID5o
673 H X 0,8 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ 100 μΜ
674 cAr-toAo 0,8 až 50 μΜ 0 mŕtve pri 25 μΜ 0,01 až 100 μΜ 50 μΜ
675 0,8 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,001 až 100 μΜ >100 μΜ
676 OX/x^ H 0,8 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ 100 μΜ
677 X 0,05 až 25 μΜ 1,6 μΜ 23 4,5 0,001 až 100 μΜ 5 nM
678 0 y X* 0,8 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,001 až 100 μΜ >100 μΜ
679 Á-X 0,8 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,001 až 100 μΜ >100 μΜ
680 qX™X 0,01 až 100 μΜ >100 μΜ
681 to 0,8 až 50 μΜ 3 μΜ 3 2,5 0,01 až 100 μΜ 200 ηΜ
682 Q/k^yto 0° 0,8 až 50 μΜ 50 μΜ 8 1,1 0,01 až 100 μΜ 150 μΜ
~ε. Štruktúra MEĽ dif. HDAC inh.
Interval Opt. % B+ buniek/ml.10’ 5 Interval id50
683 0,01 až 0,1 μΜ 20 nM 9 9,0 0,0001 až 100 μΜ 1 nM
684 0,4 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ 100 μΜ
685 OH C^h H/ {/NH HN \h 0,125 až 5 μΜ 1,0 μΜ 20 1,0 0,01 až 100 μΜ 150 nM
686 0 Q’J / 0,4 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ 100 μΜ
687 0,125 až 5 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ 200 nM
688 Q-^^nŤo 0,4 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ >100 μΜ
689 qVq^ 5,0 až 40 μΜ 35 μΜ 48 2,0 0,01 až 100μΜ 200 nM
690 OQ 2/Λχ-ν 5,0 až 40 μΜ 10 μΜ 38 2,5 0,01 až 100 μΜ 150 nM
C. Štruktúra MEĽ dif. HDAC inh.
Interval Opt. % B+ buniek/ml.10' 5 Interval IDS0
691 óo 1,0 až 25 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ 100 nM
692 0,03 až 5 μΜ 1 μΜ 27 18,0 0,01 až 100 μΜ 1 nM
693 0,4 až 50 μΜ 0 žiadna inhibícia 0,01 až 100 μΜ >100 μΜ
BIBLIOGRAPHY
1. Sporn, M. B., Roberts, A. B. a Driscoll, J. S. (1985) in Cancer: Principles and Practice of Oncology, eds. Hellman, S., Rosenberg, S. A. a DeVita, V. T., Jr., Ed. 2, (J. B. Lippincott, Philadelphia), P. 49.
2. Breitman, T. R., Selonick, S. E. a Collins, S. J. (1980) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 2936-2940.
3. Olsson, I. L. and Breitman, T. R. (1982) Cancer Res. 42: 3924-3927.
4. Schwartz, E. L. a Sartorelli, A. C. (1982) Cancer Res. 42: 2651-2655.
5. Marks, P. A., Sheffery, M. a Rifkind, R. A. (1987) Cancer Res. 47: 659.
6. Sachs, L. (1978) Náture (Lond.) 274: 535.
7. Friend, C., Scher, W., Holland, J. W. a Sato, T. (1971) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 68: 378-382.
8. Tanaka, M., Levy, J., Terada, M., Breslow, R., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1975) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 72:1003-1006.
9. Reuben, R. C., Wife, R. L., Breslow, R., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1976) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 73: 862-866.
10. Abe, E., Miyaura, C., Sakagami, H., Takeda, M., Konno, K., Yamazaki, T., Yoshika, S. a Suda, T. (1981) Proc. Natl, Acad, Sci. (USA) 78: 4990-4994.
11. Schwartz, E. L., Snoddy, J. R., Kreutter, D., Rasmussen, H. a Sartorelli, A. C. (1983) Proc. Am. Assoc. Cancer Res. 24:18.
12. Tanenaga, K., Hozumi, M. a Sakagami, Y. (1980) Cancer Res. 40: 914-919.
13. Lotem, J. and Sachs, L. (1975) Int. J. Cancer 15: 731-740.
14. Metcalf, D. (1985) Science, 229:16-22.
15. Scher, W., Scher, B. M. a Waxman, S. (1983) Exp. Hematol. 11: 490-498.
16. Scher, W., Scher, B. M. a Waxman, S. (1982) Biochem. & Biophys. Res. Comm. 109: 348-354.
17. Huberman, E. and Callaham, M. F. (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 76: 1293-1297.
18. Lottem, J. and Sachs, L. (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 76: 5158-5162.
19. Terada, M., Epner, E.,.Nudel, U., Salmon, J., Fibach, E., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1978) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 75: 2795-2799.
20. Morin, M. J. and Sartorelli, A. C. (1984) Cancer Res. 44: 2807-2812.
21. Schwartz, E. L., Brown, B. J., Nierenberg, M., Marsh, J. C. a Sartorelli, A. C. (1983) Cancer Res. 43: 2725-2730.
22. Sugano, H., Furusawa, M., Kawaguchi, T. a Ikawa, Y. -104- (1973) Bibl. Hematol. 39: 943-954.
23. Ebert, P. S., Wars, I. a Buell, D. N. (1976) Cancer Res. 36:1809-1813.
24. Hayashi, M., Okabe, J. a Hozumi, M. (1979) Gann 70: 235-238.
25. Fibach, E., Reuben, R. C., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1977) Cancer Res. 37; 440-444.
26. Melloni, E., Pontremoli, S., Damiani, G., Viotti, P., Weich, N., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 85: 3835-3839.
27. Reuben, R., Khanna, P. L., Gazitt, Y., Breslow, R., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1978) J. Biol. Chem. 253: 4214-4218.
28. Marks, P. A. and Rifkind, R. A. (1988) International Journal of Celí Cloning 6: 230-240.
29. Melloni, E., Pontremoli, S., Michetti, M., Sacco, 0., Cakiroglu, A. G., Jackson, J. F., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1987) Proc. Natl. Acad. Sciences (USA) 84: 5282-5286.
30. Marks, P. A. and Rifkind, R. A. (1984) Cancer 54: 2766-2769.
31. Egorin, M. J., Sigman, L. M. VanEcho, D. A., Forrest, A., Whitacre, M. Y. a Aisner, J. (1987) Cancer. Res. 47: 617-623.
32. Rowinsky, E. W., Ettinger, D. S., Grochow, L. B., Brundrett, R. B., Cates, A. E. a Donehower, R. C. (1986) J. Clin. Oncol. 4:1835-1844.
33. Rowinsky, E. L. Ettinger, D. S., McGuire, W. P., Noe, D. A., Grochow, L. B. a Donehower, R. C. (1987) Cancer Res. 47:5788-5795.
34. Callery, P. S., Egorin, M. J., Geelhaar, L. A. a Nayer, M. S. B. (1986) Cancer Res. 46: 4900-4903.
35. Young, C. W. Fanucchi, M. P., Walsh, T. B., Blatzer, L., Yaldaie, S., Stevens, Y. W., Gordon, C., Tong, W., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1988) Cancer Res. 48: 7304-7309.
36. Andreeff, M., Young, C., Clarkson, B., Fetten, J., Rifkind, R. A. a Marks, P. A. (1988) Blood 72: 186a.
37. Marks, P.A., Richon, V.M., Breslow, R., Rifkind, R.A., Life Sciences 1999, 322: 161-165.
38. Yoshida et al., 1990, J. Biol. Chem. 265:17174-17179.
39. Richon, V.M., Emiliani, S., Verdin, E., Webb, Y., Breslow, R., Rifkind, R.A. a Marks, P.A., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 95: 3003-3007 (1998).
40. Nishino, N. et. al. Chem. Pharm. Bull. 1996, 44, 212-214.
41. Patent USA č. 5,369,108, vydaný 29. novembra 1994.
42. Kijima et al., 1993, J. Biol. Chem. 268:22429-22435.
43. Lea et al., 1999, Int. J. Oncol. 2:347-352.
44. Kim et al., 1999, Oncogene 15:2461 -2470.
45. Saito et al., 1999, Proc. ATatl. Acad. Sci. 96:4592-4597.
46. Lea a Tulsyan, 1995, Anticancer Res. 15:879-883.
47. Nokajima et al., 1998, Exp. Celí Res. 241:126-133.
48. Kwon et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:3356-3361.
49. Richon et al, 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. USA -93:5705- 5708.
50. Kim et al., 1999, Oncogene 18:2461-2470.
51. Yoshida et al., 1995, Bioassays 17:423-430.
52. Yoshida & Beppu, 1988, Exp. Celí. Res. 177:122-131.
53. Warrell et al., 1998, J. Natl. Cancer Inst. 90:1621-1625.
54. Desai et al., 1999, Proc. AACR 40: abstrakt č. 2396.
55. Cohen et al., Antitumor Res., odoslané.
56. D. W. Christianson a W. N. Lipscomb, The Complex Between Carboxypeptidase A and a Possible Transition-State Analogue: Mechanistic Inferences from High-Resolution X-ray Structures of Enzyme-inhibitor Complexes, J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4998-5003.
57. G. H. S. Prakash and A. K. Yudin, Perfluoroalkylation with Organosilicon Reagents, Chem. Rev. 1997,97, 757-786.
58. J.-C. Blazejewski, E. Anselmi a M. P. Wilmshurst, Extending the Scope of Rupperťs Reagent: Trifluoromethylation of Imines, Tet. Letters 1999, 40, 5475-5478.
59. R. J. Linderman and D. M. Graves, Oxidation of Fluoroalkyl-Substituted Carbinols by the Dess-Martin Reagent, J. Org. Chem. 1989, 54, 661-668.
60. N. E. Jacobsen and P. A. Bartlett, A Phosphonamidate Dipeptide Analogue as an Inhibitor of Carboxypeptidase A, J. Am - Chem. Soc. 1981,103, 654657.
61. S. Lindskog, L. E. Henderson, K. K. Kannan, A. Liljas, P. O. Nyman a B. Strandberg, Carbonic Anhydrase, in The Enzymes, 3rd edition, P. D. Boyer, ed., 1971, zv. V, s. 587-665, pozrite s. 657.
62. Durrant, G.; Greene, R.H.; Lambeth, P.F.; Lester, M.G.; Taylor, N.R., J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 1983,-2211-2214.
63. Burden, R.S.; Crombie, L., J. Chem. Soc. (C) 1969, 2477- 2481.
64. Farquhar, D.; Cherif, A.; Bakina, E.; Nelson, J.A., J. Med. Chem., 1998, 41, 965-972.
65. Boivin, J.; El Kaim, L.; Zard, S.Z., Tet. Lett. 1992, 33,1285-1288.
66. Finnin, M.S. et al., Structures of a histone deacetylase homologue bound to the TSA and SAHA inhibitors. Náture 401,188-93 (1999).
67. Webb, Y. et al., Photoaffinity labeling and mass -108- spectrometry identity ribosomal protein S3 as a potential target for hybrid polar cytodifferentiation agents. J. Biol. Chem. 274, 14280-14287 (1997).
68. Butler, L.M. et al., Suberoylanilide hydroxamic acid (SAHA), an inhibitor of histone deacetylaser suppresses the growth of the CWR22 human prostate cancer xenograft. odoslané (2000).

Claims (54)

  1. Zlúčenina vzorca:
    R2 (CH2)n.
    R3
  2. 2.
    2.
  3. 3.
    3.
  4. 4.
    4.
    kde R1 a R2 sú rovnaké alebo rôzne a sú každé hydrofóbnou skupinou;
    kde R3 je hydroxámová kyselina, hydroxylamino, hydroxyl, amino, alkylamino, alebo alkyloxy; a n je celé číslo od 3 do 10, alebo jej farmaceutický prijateľná soľ.
    Zlúčenina podľa nároku 1, kde R1 aj R2 je naviazané priamo alebo cez mostík a je to substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
    Zlúčenina podľa nároku 2, kde mostíkom je amidové zoskupenie, -0-, -S-, NH- alebo -CH2-.
    Zlúčenina podľa nároku 1 majúca vzorec:
    R4.
    NH
    R3 kde R4 je substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
  5. 5. Zlúčenina podľa nároku 4, kde R2 je -amid-R5, kde R5 je substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
  6. 6. Zlúčenina vzorca:
    kde R1 a R2 je substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl;
    kde R3 je hydroxámová kyselina, hydroxylamino, hydroxyl, amino, alkylamino, alebo alkyloxy;
    kde R4 je vodík, halogén, fenyl alebo cykloalkyl;
    kde A môže byť rovnaké alebo rôzne a predstavuje amidové zoskupenie, -0-, -S-, -NR5-, alebo -CH2-, kde R5 je substituovaný alebo nesubstituovaný C,-C5 alkyl; a kde n je celé číslo od 3 do 10, alebo jej farmaceutický prijateľná soľ.
  7. 7. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
  8. 8. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
  9. 9. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    R2
    O kde R1 aj R2 je substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, t-butyl, aryloxy, arylalkyloxy, alebo pyridín; a kde n je celé číslo od 3 do 8.
  10. 10. Zlúčenina podľa nároku 9, kde aryl alebo cykloalkyl je substituovaný nasledujúcimi substituentmi: metyl, kyano, nitro, trifluórmetyl, amino, aminokarbonyl, metylkyano, chlór, fluór, bróm, jód, 2,3-difluór, 2,4-difluór, 2,5difluór, 3,4-difluór, 3,5-difluór, 2,6-difluór, 1,2,3-trifluór, 2,3,6-trifluór, 2,4,6trifluór, 3,4,5-trifluór, 2,3,5,6-tetrafluór, 2,3,4,5,6-pentafluór, azido, hexyl, tbutyl, fenyl, karboxyl, hydroxyl, metoxy, fenyloxy, benzyloxy, fenylaminooxy, fenylaminokarbonyl, metyoxykarbonyl, metylaminokarbonyl, dimetylamino, dimetylaminokarbonyl, alebo hydroxylaminokarbonyl.
  11. 11. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    NH .0 O alebo jej enantiomér.
  12. 12. Zlúčenina podľa nároku 11, kde n = 5.
  13. 13. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    alebo jej enantiomér.
  14. 14. Zlúčenina podľa nároku 13, kde n = 5.
  15. 15. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    O
    NH ° alebo jej enantiomér.
  16. 16. Zlúčenina podľa nároku 15, kde n = 5.
  17. 17. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    alebo jej enantiomér.
  18. 18. Zlúčenina podľa nároku 17, kde n = 5.
  19. 19. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    '(CH2k .NHOH ,N alebo jej enantiomér.
  20. 20. Zlúčenina podľa nároku 19, kde n = 5.
  21. 21. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    alebo jej enantiomér.
  22. 22. Zlúčenina podľa nároku 21, kde n = 5.
  23. 23. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    ^x x/ alebo jej enantiomér.
  24. 24. Zlúčenina podľa nároku 23, kde n = 5.
  25. 25. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    100 alebo jej enantiomér.
  26. 26. Zlúčenina podľa nároku 25, kde n = 5.
  27. 27. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    alebo jej enantiomér.
  28. 28. Zlúčenina podľa nároku 27, kde n = 5.
    101
  29. 29. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    alebo jej enantiomér.
  30. 30. Zlúčenina podľa nároku 29, kde n = 5.
  31. 31. Zlúčenina podľa nároku 6 majúca vzorec:
    alebo jej enantiomér.
  32. 32. Zlúčenina podľa nároku 31, kde n = 5.
    102
  33. 33. Farmaceutická kompozícia, vyznačujúca sa tým, že obsahuje farmaceutický účinné množstvo zlúčeniny podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 - 9 a farmaceutický prijateľný nosič.
  34. 34. Spôsob selektívnej indukcie terminálnej diferenciácie neoplastických buniek a tým inhibície proliferácie takých buniek, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa kontaktovanie buniek za vhodných podmienok s účinným množstvom zlúčeniny podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 9.
  35. 35. Spôsob liečby pacienta s nádorom charakteristickým proliferáciou neoplastických buniek, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa podanie účinného množstva zlúčeniny podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1-9 pacientovi.
  36. 36. Zlúčenina vzorca:
    O .L ^CH2)n
    R1^ ^R5
    R2 kde R1 a R2 sú rovnaké alebo rôzne a sú každé hydrofóbnou skupinou;
    kde R5 je -C(O)-NHOH (hydroxámová kyselina), -C(O)-CF3 (trifluóracetyl), NH-P(O)OH-CH3, -SO2NH2 (sulfónamid), -SH (tiol), -C(O)-R6, kde R6 je hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; a n je celé číslo od 3 do 10, alebo jej farmaceutický prijateľná soľ.
  37. 37. Zlúčenina podľa nároku 36, kde R1 aj R2 je naviazané priamo alebo cez mostík a je to substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkyiamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
  38. 38. Zlúčenina podľa nároku 37, kde mostíkom je amidové zoskupenie, -0-, -S-, NH- alebo -CH2-.
    103
  39. 39. Zlúčenina podľa nároku 36 majúca vzorec:
    -(CH2)n
    R4
    R7 kde R7 je substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, älkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
  40. 40. Zlúčenina podľa nároku 39, kde R2 je -sulfónamid-R8 alebo -amid-R8, kde R8 je substituovaná alebo nesubstituovaná skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, älkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
  41. 41. Zlúčenina podľa nároku 39, kde R2 je -NH-C(O)-Y, -NH-SO2-Y, kde Y je vybrané zo skupiny pozostávajúcej z nasledujúcich:
    N
    104
  42. 42. Zlúčenina podlá nároku 39, kde R7 je vybrané zo skupiny, ktorú tvorí:
    r *\
    105 r \
  43. 43. Zlúčenina vzorca:
    kde R1 a R2 sú rovnaké alebo rôzne a sú každé hydrofóbnou skupinou;
    kde R5 je -C(O)-NHOH (hydroxámová kyselina), -C(O)-CF3 (trifluóracetyl), NH-P(O)OH-CH3, -SO2NH2 (sulfónamid), -SH (tiol), -C(O)-R6, kde R6 je hydroxyl, amino, alkylamino alebo alkyloxy; a kde L je mostík, ktorý zahŕňa -(CHJ-, -C(O)-, -S-, -0-, -(CH=CH)-, -fenylalebo -cykloalkyl-, alebo akúkoľvek ich kombináciu, alebo jej farmaceutický prijateľná soľ.
  44. 44. Zlúčenina podľa nároku 43, kde n je od 4 do 7 a m je od 1 do 3.
  45. 45. Zlúčenina podľa nároku 43, kde R1 aj R2 je naviazané priamo alebo cez mostík aje to substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6-amín,
    106 tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
  46. 46. Zlúčenina podľa nároku 43, kde mostíkom je amidové zoskupenie, -0-, -S-, NH- alebo -CH2-.
  47. 47. Zlúčenina podľa nároku 43 majúca vzorec:
    kde L je mostík vybraný zo skupiny, ktorú tvorí -(CHJ-, -(CH=CH)-, -fenyl-, -cykloalkyl- alebo akákoľvek ich kombinácia, kde R7 aj R8 sú nezávisle substituovaná alebo nesubstituované skupina aryl, cykloalkyl, cykloalkylamino, naftalenyl, pyridínamino, piperidino, 9-purín-6amín, tiazolamino, hydroxyl, rozvetvený alebo lineárny alkyl, alkenyl, alkyloxy, aryloxy, arylalkyloxy alebo pyridinyl.
  48. 48. Zlúčenina podľa nároku 47, kde mostík L zahŕňa zoskupenie
  49. 49. Zlúčenina podľa nároku 43 majúca vzorec:
    107
    XX χχ
    XX
  50. 50. Farmaceutická kompozícia, vyznačujúca sa tým, že obsahuje zlúčeninu podľa nároku 1,36 alebo 43 a farmaceutický prijateľný nosič.
  51. 51. Farmaceutický prijateľná soľ zlúčeniny podľa nároku 1,36 alebo 43.
  52. 52. Prekurzor zlúčeniny podľa nároku 1,36 alebo 43.
  53. 53. Spôsob indukovania diferenciácie nádorových buniek v nádore, vyznačujúci sa tým, že bunky sa kontaktujú s účinným množstvom zlúčeniny podľa nároku 1, 36 alebo 43 tak, aby sa ňou nádorové bunky diferencovali.
  54. 54. Spôsob inhibicie aktivity históndeacetylázy, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa kontaktovanie históndeacetylázy s účinným množstvom zlúčeniny podľa nároku 1,36 alebo 43 tak, aby sa ňou inhibovala aktivita históndeacetylázy.
SK330-2002A 1999-09-08 2000-08-24 Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and methods of use thereof SK3302002A3 (en)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US15275599P 1999-09-08 1999-09-08
US20868800P 2000-06-01 2000-06-01
PCT/US2000/023232 WO2001018171A2 (en) 1999-09-08 2000-08-24 Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and methods of use thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
SK3302002A3 true SK3302002A3 (en) 2002-07-02

Family

ID=26849835

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SK330-2002A SK3302002A3 (en) 1999-09-08 2000-08-24 Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and methods of use thereof

Country Status (19)

Country Link
US (5) US6511990B1 (sk)
EP (1) EP1231919B1 (sk)
JP (1) JP2003509343A (sk)
KR (1) KR20020059393A (sk)
CN (1) CN1378450A (sk)
AU (1) AU6932700A (sk)
BR (1) BR0014254A (sk)
CA (1) CA2383999A1 (sk)
EA (2) EA007649B1 (sk)
HU (1) HUP0202707A3 (sk)
IL (1) IL148497A0 (sk)
MX (1) MXPA02002505A (sk)
NZ (1) NZ517613A (sk)
PL (1) PL200861B1 (sk)
SK (1) SK3302002A3 (sk)
TR (1) TR200201052T2 (sk)
UA (1) UA74345C2 (sk)
WO (1) WO2001018171A2 (sk)
YU (1) YU22402A (sk)

Families Citing this family (157)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6822267B1 (en) * 1997-08-20 2004-11-23 Advantest Corporation Signal transmission circuit, CMOS semiconductor device, and circuit board
EP1169031A1 (en) * 1999-04-09 2002-01-09 British Biotech Pharmaceuticals Limited Antimicrobial agents
HUP0202707A3 (en) 1999-09-08 2003-11-28 Univ Columbia Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and pharmaceutical compositions containing them and use thereof
CA2391952C (en) * 1999-11-23 2012-01-31 Methylgene Inc. Inhibitors of histone deacetylase
PE20020354A1 (es) 2000-09-01 2002-06-12 Novartis Ag Compuestos de hidroxamato como inhibidores de histona-desacetilasa (hda)
JP2004509941A (ja) 2000-09-29 2004-04-02 プロリフィクス　リミテッド Ｈｄａｃインヒビターとしてのアミド結合を含むカルバミン酸化合物
GB0023983D0 (en) 2000-09-29 2000-11-15 Prolifix Ltd Therapeutic compounds
JP4975941B2 (ja) 2000-09-29 2012-07-11 トポターゲット ユーケー リミテッド （ｅ）−ｎ−ヒドロキシ−３−（３−スルファモイル−フェニル）アクリルアミド化合物及びその治療用途
US7312247B2 (en) * 2001-03-27 2007-12-25 Errant Gene Therapeutics, Llc Histone deacetylase inhibitors
US8026280B2 (en) * 2001-03-27 2011-09-27 Errant Gene Therapeutics, Llc Histone deacetylase inhibitors
US7842727B2 (en) * 2001-03-27 2010-11-30 Errant Gene Therapeutics, Llc Histone deacetylase inhibitors
WO2002102984A2 (en) 2001-06-14 2002-12-27 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Hdac9 polypeptides and polynucleotides and uses thereof
ES2371630T3 (es) 2001-08-21 2012-01-05 Astellas Pharma Inc. Uso medicinal de un inhibidor de histona desacetilasa y método para evaluar su efecto antitumoral.
WO2003032921A2 (en) 2001-10-16 2003-04-24 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Treatment of neurodegenerative diseases and cancer of the brain
AU2002348474A1 (en) 2001-10-18 2003-04-28 The Salk Institute For Biological Studies Methods of using deacetylase inhibitors to promote cell differentiation and regeneration
US20050288227A1 (en) * 2002-02-15 2005-12-29 Marks Paul A Use of thioredoxin measurements for diagnostics and treatments
EP1482962A4 (en) * 2002-02-15 2009-12-23 Sloan Kettering Inst Cancer METHOD OF TREATING THIOREDOXIN-MEDIATED DISEASES (TRX)
US7148257B2 (en) 2002-03-04 2006-12-12 Merck Hdac Research, Llc Methods of treating mesothelioma with suberoylanilide hydroxamic acid
US20040132825A1 (en) * 2002-03-04 2004-07-08 Bacopoulos Nicholas G. Methods of treating cancer with HDAC inhibitors
RU2320331C2 (ru) * 2002-03-04 2008-03-27 МЕРК ЭйчДиЭйСи Рисерч, ЛЛС. Способ индукции конечной дифференцировки
US20060276547A1 (en) * 2002-03-04 2006-12-07 Bacopoulos Nicholas G Methods of treating cancer with HDAC inhibitors
US20070060614A1 (en) * 2002-03-04 2007-03-15 Bacopoulos Nicholas G Methods of treating cancer with hdac inhibitors
US7456219B2 (en) * 2002-03-04 2008-11-25 Merck Hdac Research, Llc Polymorphs of suberoylanilide hydroxamic acid
AU2003220119A1 (en) 2002-03-07 2003-09-22 University Of Delaware Methods, compositions, and kits for enhancing oligonucleotide-mediated nucleic acid sequence alteration using compositions comprising a histone deacetylase inhibitor, lambda phage beta protein, or hydroxyurea
EP1501489A4 (en) * 2002-04-15 2007-11-21 Sloan Kettering Inst Cancer COMBINATION THERAPY FOR THE TREATMENT OF CANCER
EP1511477A4 (en) * 2002-05-22 2008-04-09 Errant Gene Therapeutics Llc HISTONE DEACETYLASE INHIBITORS BASED ON ALPHA-KETO-EPOXYDE COMPOUNDS
TW559390U (en) * 2002-08-27 2003-10-21 Molex Inc Electrical connector
US7154002B1 (en) 2002-10-08 2006-12-26 Takeda San Diego, Inc. Histone deacetylase inhibitors
US7250514B1 (en) 2002-10-21 2007-07-31 Takeda San Diego, Inc. Histone deacetylase inhibitors
RU2352337C2 (ru) * 2002-11-12 2009-04-20 Алькон, Инк. Ингибиторы гистондеацетилазы для лечения офтальмологических неоваскулярных нарушений и заболеваний
WO2004046104A2 (en) * 2002-11-20 2004-06-03 Errant Gene Therapeutics, Llc Treatment of lung cells with histone deacetylase inhibitors
US7244751B2 (en) 2003-02-14 2007-07-17 Shenzhen Chipscreen Biosciences Ltd. Histone deacetylase inhibitors of novel benzamide derivatives with potent differentiation and anti-proliferation activity
US7381825B2 (en) * 2003-03-17 2008-06-03 Takeda San Diego, Inc. Histone deacetylase inhibitors
WO2004089293A2 (en) 2003-04-01 2004-10-21 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Hydroxamic acid compounds and methods of use thereof
US20070123580A1 (en) * 2003-05-21 2007-05-31 Atadja Peter W Combination of histone deacetylase inhibitors with chemotherapeutic agents
WO2005007091A2 (en) * 2003-07-07 2005-01-27 Georgetown University Histone deacetylase inhibitors and methods of use thereof
US7842835B2 (en) * 2003-07-07 2010-11-30 Georgetown University Histone deacetylase inhibitors and methods of use thereof
EP1663194B1 (en) 2003-08-26 2010-03-31 Merck HDAC Research, LLC Use of SAHA for treating mesothelioma
EP2226072A1 (en) 2003-08-29 2010-09-08 Aton Pharma, Inc. Combinations of suberoylanilide hydroxamic acid and antimetbolic agents for treating cancer
CA2542096A1 (en) * 2003-10-09 2005-04-21 Aton Pharma, Inc. Thiophene and benzothiophene hydroxamic acid derivatives
WO2005053609A2 (en) * 2003-11-26 2005-06-16 Guilford Pharmaceuticals Inc. Methods of nad+-dependent deacetylase inhibitors
US20090023718A1 (en) * 2003-11-26 2009-01-22 Aton Pharma, Inc. Diamine and Iminodiacetic Acid Hydroxamic Acid Derivatives
EP1694640A4 (en) * 2003-11-28 2007-01-10 Univ Queensland ANTI CANCER AGENTS
US20080057529A1 (en) * 2003-12-18 2008-03-06 Michele Pallaoro Method for Identifying Histone Deacetylase Inhibitors
WO2005066151A2 (en) * 2003-12-19 2005-07-21 Takeda San Diego, Inc. Histone deacetylase inhibitors
WO2005065681A1 (en) * 2003-12-19 2005-07-21 Takeda San Diego, Inc. N- hydroxy-3-(3-(1h-imidazol-2-yl)-phenyl)-acrylamide derivatives and related compounds as histone deacetylase (hdac) inhibitors for the treatment of cancer
WO2005070020A2 (en) * 2004-01-23 2005-08-04 The Regents Of The University Of Colorado Gefitinib sensitivity-related gene expression and products and methods related thereto
US20080113874A1 (en) * 2004-01-23 2008-05-15 The Regents Of The University Of Colorado Gefitinib sensitivity-related gene expression and products and methods related thereto
CN101010298A (zh) * 2004-04-05 2007-08-01 默克Hdac研究有限责任公司 组蛋白脱乙酰酶抑制剂前药
ES2677562T3 (es) * 2004-05-27 2018-08-03 The Regents Of The University Of Colorado Métodos para la predicción del resultado clínico para inhibidores del receptor del factor de crecimiento epidérmico para pacientes de cáncer
JP2008505971A (ja) * 2004-07-12 2008-02-28 メルク　エンド　カムパニー　インコーポレーテッド ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤
AU2005261501A1 (en) * 2004-07-12 2006-01-19 Istituto Di Ricerche Di Biologia Molecolare P Angeletti Spa Amide derivatives as inhibitors of histone deacetylase
AU2005271842A1 (en) * 2004-07-12 2006-02-16 Merck Sharp & Dohme Corp. Histone deacetylase inhibitors
AU2005261487A1 (en) * 2004-07-12 2006-01-19 Istituto Di Ricerche Di Biologia Molecolare P. Angeletti S.P.A. Amide derivatives as inhibitors of histone deacetylase
CA2574035A1 (en) * 2004-07-19 2006-02-23 Sandro Belvedere Histone deacetylase inhibitors
KR20070057822A (ko) * 2004-08-09 2007-06-07 아스텔라스세이야쿠 가부시키가이샤 히스톤 디아세틸라제 (ｈｄａｃ) 억제제 활성을 갖는히드록시아미드 화합물
JP2008510821A (ja) * 2004-08-25 2008-04-10 メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド ヒストンデアセチラーゼ阻害剤
KR100584811B1 (ko) 2004-10-21 2006-05-30 한국화학연구원 히스톤 디아세틸라제 저해활성을 갖는ｎ,ｎ-다이메틸아미노페닐 옥타노산 하이드록시아마이드유도체 및 이의 제조방법
US20070021612A1 (en) * 2004-11-04 2007-01-25 University Of Notre Dame Du Lac Processes and compounds for preparing histone deacetylase inhibitors and intermediates thereof
US7235688B1 (en) 2004-11-04 2007-06-26 University Of Notre Dame Du Lac Process for preparing histone deacetylase inhibitors and intermediates thereof
EP1817020A4 (en) * 2004-11-08 2012-11-21 Errant Gene Therapeutics Inc INHIBITORS OF HISTONATE ACETYLASE
WO2006066133A2 (en) * 2004-12-16 2006-06-22 Takeda San Diego, Inc. Histone deacetylase inhibitors
WO2006094068A2 (en) 2005-03-01 2006-09-08 The Regents Of The University Of Michigan Hdac inhibitors that promote brm expression and brm related diagnostics
BRPI0608039A2 (pt) * 2005-03-11 2009-06-16 Univ Colorado células cancerìgenas sensìveis aos inibidores da histona deacetilase
US20090182019A1 (en) * 2005-04-18 2009-07-16 The Johns Hopkins University Histone deacetylase inhibitors
JP2008536924A (ja) 2005-04-20 2008-09-11 メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド ベンゾチオフェンヒドロキサミン酸のカーバメート、ウレア、アミドおよびスルホンアミド置換誘導体
EP1874295A4 (en) * 2005-04-20 2009-08-12 Merck & Co Inc benzothiophene
EP1874755A4 (en) * 2005-04-20 2010-04-28 Merck Sharp & Dohme BENZOTHIOPHENE-hydroxamic acid derivatives
GB0509225D0 (en) 2005-05-05 2005-06-15 Chroma Therapeutics Ltd Inhibitors of enzymatic activity
GB0509223D0 (en) 2005-05-05 2005-06-15 Chroma Therapeutics Ltd Enzyme inhibitors
GB0509226D0 (en) * 2005-05-05 2005-06-15 Chroma Therapeutics Ltd Enzyme and receptor modulation
PL1877098T3 (pl) * 2005-05-05 2013-09-30 Glaxosmithkline Ip Dev Ltd Koniugaty estru alfa-aminokwasu z lekiem ulegające hydrolizie z udziałem karboksyloesterazy
WO2006122319A2 (en) * 2005-05-11 2006-11-16 Takeda San Diego, Inc. Histone deacetylase inhibitors
TWI365068B (en) 2005-05-20 2012-06-01 Merck Sharp & Dohme Formulations of suberoylanilide hydroxamic acid and methods for producing same
US8158825B2 (en) * 2005-06-24 2012-04-17 Merck Sharp & Dohme Corp. Modified malonate derivatives
BRPI0613429A2 (pt) * 2005-07-14 2009-02-10 Takeda San Diego Inc inibidores de histona desacetilase
GB0518237D0 (en) * 2005-09-07 2005-10-19 Angeletti P Ist Richerche Bio Therapeutic compounds
KR100696139B1 (ko) * 2005-11-01 2007-03-20 한국화학연구원 히스톤 디아세틸라제 저해활성을 갖는 알킬카바모일나프탈렌일옥시 옥테노일 하이드록시아마이드 유도체 및그의 제조방법
US8026260B2 (en) 2005-11-03 2011-09-27 Merck Sharp & Dohme Corp. Histone deacetylase inhibitors with aryl-pyrazolyl-motifs
WO2007055942A2 (en) * 2005-11-03 2007-05-18 Merck & Co., Inc. Substituted nicotinamide compounds
US20070117815A1 (en) * 2005-11-04 2007-05-24 James Pluda Method of treating cancers with SAHA and pemetrexed
CN101300015A (zh) * 2005-11-04 2008-11-05 默克公司 使用n-辛二酰苯胺异羟肟酸和厄洛替尼治疗癌症的方法
WO2007058927A1 (en) * 2005-11-11 2007-05-24 The Scripps Research Institute Histone deacetylase inhibitors as therapeutics for neurological diseases
AR057579A1 (es) * 2005-11-23 2007-12-05 Merck & Co Inc Compuestos espirociclicos como inhibidores de histona de acetilasa (hdac)
MX2008008470A (es) * 2005-12-27 2008-09-26 Univ Pais Vasco Nuevos derivados pirrolicos con actividad inhibidora de desacetilasa de histonas.
US20090012075A1 (en) * 2006-01-12 2009-01-08 Miller Thomas A Fluorinated Arylamide Derivatives
EP1973405A4 (en) * 2006-01-12 2011-06-01 Merck Sharp & Dohme HYDROXYALKYMARYLAMIDE DERIVATIVES
JP2009525955A (ja) * 2006-01-13 2009-07-16 タケダ サン ディエゴ インコーポレイテッド ヒストンデアセチラーゼ阻害剤
WO2007091703A1 (en) * 2006-02-07 2007-08-16 Astellas Pharma Inc. N-hydroxyacrylamide compounds
BRPI0707826B1 (pt) 2006-02-14 2022-04-19 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compostos inibidores de histona desacetilase, composição farmacêutica e uso dos referidos compostos
GB0603041D0 (en) * 2006-02-15 2006-03-29 Angeletti P Ist Richerche Bio Therapeutic compounds
JP2009528354A (ja) * 2006-02-28 2009-08-06 メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド ヒストン脱アセチル化酵素のインヒビター
WO2007113644A2 (en) * 2006-04-05 2007-10-11 Orchid Research Laboratories Limited New hdac inhibitors
WO2008013589A2 (en) 2006-04-24 2008-01-31 Gloucester Pharmaceuticals Treatment of ras-expressing tumors
US8119685B2 (en) * 2006-04-26 2012-02-21 Merck Sharp & Dohme Corp. Disubstituted aniline compounds
EP2023924B1 (en) * 2006-05-18 2016-08-03 Merck Sharp & Dohme Corp. Aryl-fused spirocyclic compounds
US8957027B2 (en) * 2006-06-08 2015-02-17 Celgene Corporation Deacetylase inhibitor therapy
AU2007275743A1 (en) * 2006-07-20 2008-01-24 Merck Sharp & Dohme Corp. Phosphorus derivatives as histone deacetylase inhibitors
WO2008027837A2 (en) * 2006-08-28 2008-03-06 The Regents Of The University Of California Small molecule potentiator of hormonal therapy for breast cancer
WO2008033466A2 (en) * 2006-09-14 2008-03-20 Combinatorx (Singapore) Pre. Ltd. Compositions and methods for treatment of viral diseases
EP2079462A4 (en) 2006-09-28 2009-12-02 Merck & Co Inc PHARMACEUTICAL COMPOSITIONS OF HDAC INHIBITORS AND CHEMABLE COMPOUNDS, AND CHELATED HDAC INHIBITOR METAL COMPLEXES
GB0619753D0 (en) 2006-10-06 2006-11-15 Chroma Therapeutics Ltd Enzyme inhibitors
GB0620823D0 (en) * 2006-10-19 2006-11-29 Univ London Histone deacetylase inhibitors
BRPI0622100A2 (pt) 2006-10-30 2011-12-27 Chroma Therapeutics Ltd hidroxamatos como inibidores de desacetilase de histona
JP2010509221A (ja) * 2006-11-03 2010-03-25 ユニバーシテイ・オブ・メリーランド，ボルテイモア 多発性骨髄腫を治療するためにｓａｈａおよびボルテゾミブを使用する方法
WO2008083288A2 (en) 2006-12-29 2008-07-10 Gloucester Pharmaceuticals Purifiction of romidepsin
CN103788108B (zh) 2007-02-06 2017-04-12 利克斯特生物技术公司 氧杂双环庚烷和氧杂双环庚烯，它们的制备及用途
WO2008097654A1 (en) * 2007-02-08 2008-08-14 Merck & Co., Inc. Methods of using saha for treating hiv infection
GB2445630B (en) * 2007-03-12 2008-11-12 Cvon Innovations Ltd Dynamic message allocation system and method
BRPI0809000A2 (pt) * 2007-03-13 2014-11-11 Sigma Tau Ind Farmaceuti Compostos de amido e a sua utilização como agentes antitumorais
US20080288310A1 (en) * 2007-05-16 2008-11-20 Cvon Innovation Services Oy Methodologies and systems for mobile marketing and advertising
CA2726734C (en) 2007-06-06 2014-10-07 University Of Maryland, Baltimore Hdac inhibitor ms-275 and aromatase inhibitors for the treatment of cancer
US8389553B2 (en) * 2007-06-27 2013-03-05 Merck Sharp & Dohme Corp. 4-carboxybenzylamino derivatives as histone deacetylase inhibitors
US8461189B2 (en) * 2007-06-27 2013-06-11 Merck Sharp & Dohme Corp. Pyridyl derivatives as histone deacetylase inhibitors
WO2009045440A1 (en) 2007-10-01 2009-04-09 Lixte Biotechnology Holdings, Inc. Hdac inhibitors
WO2009067543A2 (en) * 2007-11-19 2009-05-28 The Regents Of The University Of Colorado Treatment of histone deacetylase mediated disorders
US20110044952A1 (en) * 2007-11-27 2011-02-24 Ottawa Health Research Institute Amplification of cancer-specific oncolytic viral infection by histone deacetylase inhibitors
CA2709383A1 (en) 2007-12-14 2009-06-25 Milton L. Brown Histone deacetylase inhibitors
US7863315B2 (en) 2008-01-15 2011-01-04 Shenzhen Chipscreen Biosciences, Ltd. 2-indolinone derivatives as selective histone deacetylase inhibitors
US8158656B2 (en) 2008-05-16 2012-04-17 Shenzhen Chipscreen Biosciences Ltd. 2-indolinone derivatives as multi-target protein kinase inhibitors and histone deacetylase inhibitors
US8178577B2 (en) 2008-05-21 2012-05-15 Shenzhen Chipscreen Biosciences Ltd. Tricyclic derivatives as potent and selective histone deacetylase inhibitors
AU2009277086B2 (en) 2008-08-01 2015-12-10 Lixte Biotechnology, Inc. Neuroprotective agents for the prevention and treatment of neurodegenerative diseases
US8227473B2 (en) 2008-08-01 2012-07-24 Lixte Biotechnology, Inc. Oxabicycloheptanes and oxabicycloheptenes, their preparation and use
US10354229B2 (en) * 2008-08-04 2019-07-16 Mcafee, Llc Method and system for centralized contact management
WO2010028193A1 (en) * 2008-09-03 2010-03-11 Repligen Corporation Compounds including pimelic acid derivatives as hdac inhibitors
GB0903480D0 (en) 2009-02-27 2009-04-08 Chroma Therapeutics Ltd Enzyme Inhibitors
US8211901B2 (en) 2009-05-22 2012-07-03 Shenzhen Chipscreen Biosciences Ltd. Naphthamide derivatives as multi-target protein kinase inhibitors and histone deacetylase inhibitors
CN101906076B (zh) 2009-06-04 2013-03-13 深圳微芯生物科技有限责任公司 作为蛋白激酶抑制剂和组蛋白去乙酰化酶抑制剂的萘酰胺衍生物、其制备方法及应用
CN102020588B (zh) * 2009-09-16 2014-01-29 深圳微芯生物科技有限责任公司 具有组蛋白去乙酰化酶抑制活性的三环化合物、其制备方法及应用
DK2562155T3 (da) * 2010-04-20 2019-06-24 Fujifilm Toyama Chemical Co Ltd Hydroxaminsyrederivat
AU2011255281A1 (en) * 2010-05-21 2013-01-10 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Selective HDAC inhibitors
RU2607634C2 (ru) 2010-07-12 2017-01-10 Селджин Корпорейшн Твердые формы ромидепсина и их применение
CN101894348B (zh) * 2010-07-20 2014-04-09 中兴通讯股份有限公司 一种自扩展的联机交易系统及其实现方法
US8859502B2 (en) 2010-09-13 2014-10-14 Celgene Corporation Therapy for MLL-rearranged leukemia
CN102775368B (zh) * 2011-05-10 2016-08-17 上海驺虞医药科技有限公司 一类噻唑类化合物及其制备方法和用途
US8921533B2 (en) 2011-07-25 2014-12-30 Chromatin Technologies Glycosylated valproic acid analogs and uses thereof
UA111231C2 (uk) 2011-09-19 2016-04-11 Сігма-Тау Індустріє Фармасьютіке Ріуніте С.П.А. Тіопохідні лактамів як високоактивні інгібітори hdac та їх застосування як лікарського засобу
US9499479B2 (en) 2011-10-03 2016-11-22 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Molecules that selectively inhibit histone deacetylase 6 relative to histone deacetylase 1
US9044408B2 (en) * 2011-10-31 2015-06-02 Avon Products, Inc. Cosmetic use of N-heteroarylbisamide analogs and related compounds
US9334475B2 (en) 2012-04-06 2016-05-10 Kyoto University Method for inducing erythropoietin-producing cell
AU2013202506B2 (en) 2012-09-07 2015-06-18 Celgene Corporation Resistance biomarkers for hdac inhibitors
AU2013202507B9 (en) 2012-11-14 2015-08-13 Celgene Corporation Inhibition of drug resistant cancer cells
AU2014251087B2 (en) 2013-04-09 2019-05-02 Lixte Biotechnology, Inc. Formulations of oxabicycloheptanes and oxabicycloheptenes
US9890136B2 (en) 2013-12-23 2018-02-13 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Selective HDAC6 inhibitors
NZ630311A (en) 2013-12-27 2016-03-31 Celgene Corp Romidepsin formulations and uses thereof
WO2015184260A2 (en) 2014-05-30 2015-12-03 The Johns Hopkins University Methods for treating mendelian disorders of the epigenetic machinery
WO2017017108A1 (en) 2015-07-28 2017-02-02 Vilmorin & Cie Method for producing haploid, dihaploid and doubled haploid plants by isolated microspore culture
TWI794171B (zh) 2016-05-11 2023-03-01 美商滬亞生物國際有限公司 Ｈｄａｃ抑制劑與ｐｄ-ｌ１抑制劑之組合治療
WO2019036607A1 (en) * 2017-08-17 2019-02-21 The University Of Toledo IMIDAZOLE ANTICANCER AGENTS AND DERIVATIVES THEREOF, AND METHODS OF MAKING THEM AND METHODS OF USE THEREOF
EP3461480A1 (en) 2017-09-27 2019-04-03 Onxeo Combination of a dna damage response cell cycle checkpoint inhibitors and belinostat for treating cancer
EP3461488A1 (en) 2017-09-27 2019-04-03 Onxeo Combination of a dbait molecule and a hdac inhibitor for treating cancer
CN107698464A (zh) * 2017-10-12 2018-02-16 江苏师范大学 具有组蛋白去乙酰化酶抑制作用的贝利司他结构类似物及其应用
CN107822916A (zh) * 2017-11-14 2018-03-23 江苏师范大学 一种美白活性成分
IL279755B1 (en) 2018-07-11 2024-06-01 Rubedo Life Sciences Inc Senolytic preparations and their uses
WO2021148581A1 (en) 2020-01-22 2021-07-29 Onxeo Novel dbait molecule and its use
WO2023041805A1 (en) 2021-09-20 2023-03-23 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for improving the efficacy of hdac inhibitor therapy and predicting the response to treatment with hdac inhibitor
WO2023194441A1 (en) 2022-04-05 2023-10-12 Istituto Nazionale Tumori Irccs - Fondazione G. Pascale Combination of hdac inhibitors and statins for use in the treatment of pancreatic cancer

Family Cites Families (41)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US2895991A (en) 1959-07-21 New chloromethylated amlides
US2346665A (en) 1940-05-08 1944-04-18 Du Pont Acid
US2279560A (en) 1940-05-08 1942-04-14 Du Pont Viscous hydrocarbon oil
US3450673A (en) 1965-09-07 1969-06-17 Ashland Oil Inc Polyurethane compositions from diaminimides
DE1272540B (de) 1965-11-11 1968-07-11 Bayer Ag Verfahren zur Polymerisation von Diisocyanaten mit aliphatischen NCO-Gruppen
US3632783A (en) 1969-05-27 1972-01-04 Hall Co C P Treatment of mosquito bites employing certain tetraalkyl diamides
CH567388A5 (sk) * 1972-04-18 1975-10-15 Lundqvist Harald
US4056524A (en) 1974-04-09 1977-11-01 Stauffer Chemical Company Bis-substituted succinamides and their utility as herbicides
US3875301A (en) 1974-04-30 1975-04-01 Interx Research Corp Useful tetraalkyl diamides in the treatment of poison ivy
NL7607987A (nl) 1975-08-08 1977-02-10 Merck & Co Inc Werkwijze voor het bereiden van peptiden.
JPS52108027A (en) 1976-03-09 1977-09-10 Rikagaku Kenkyusho Anticarcinogen
JPS5819669B2 (ja) * 1978-10-28 1983-04-19 白井松新薬株式会社 新規生理活性ペプチド化合物及びその製造法
IT1123574B (it) 1979-09-10 1986-04-30 Anic Spa Processo per la produzione di diesterediammidi
US4442305A (en) 1981-08-24 1984-04-10 The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy Polycatecholamide chelating agents
US4480125A (en) 1981-11-16 1984-10-30 Polaroid Corporation Itaconamide compounds and method of preparation
US4935450A (en) 1982-09-17 1990-06-19 Therapeutical Systems Corporation Cancer therapy system for effecting oncolysis of malignant neoplasms
EP0137640A1 (en) * 1983-08-15 1985-04-17 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Chain extended analogues of methotrexate and aminopterin
US4537781A (en) 1983-09-16 1985-08-27 Research Corporation Pharmaceutically useful malonamides
US5900237A (en) * 1983-11-29 1999-05-04 Igen International, Inc. Catalytic antibodies which hydrolyze primary amides and methods for eliciting such antibodies
EP0169645A1 (en) * 1984-06-27 1986-01-29 Johnson Matthey Public Limited Company Platinum co-ordination compounds
US4611053A (en) 1985-02-15 1986-09-09 Sasa Michiyuki Mitch Polyhydroxamide polymer
JPS61205221A (ja) 1985-03-08 1986-09-11 Univ Osaka ニトリルとアミンからのアミドの製造方法
PH24782A (en) * 1985-10-24 1990-10-30 Sankyo Co Composition containing a penem or carbapenem antibiotic and the use of the same
US4863967A (en) 1986-06-16 1989-09-05 Research Corporation N,N-diaminophthalamides
US4882346A (en) 1987-06-16 1989-11-21 The United States Of America As Reprsented By The Department Of Health And Human Services Chemical differentiating agents
JP2777193B2 (ja) * 1988-10-24 1998-07-16 生化学工業株式会社 ペプチドの製造方法
US5055608A (en) 1988-11-14 1991-10-08 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Novel potent inducers of thermal differentiation and method of use thereof
US5330744A (en) 1988-11-14 1994-07-19 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Method for increasing sensitivity to chemically induced terminal differentiation
US5175191A (en) 1988-11-14 1992-12-29 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Potent inducers of terminal differentiation and methods of use thereof
AU643248B2 (en) * 1989-11-14 1993-11-11 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Novel potent inducers of terminal differentiation and method of use thereof
FR2665159B1 (fr) 1990-07-24 1992-11-13 Rhone Poulenc Sante Nouveaux derives de la pyridine et de la quinoleine, leur preparation et les compositions pharmaceutiques qui les contiennent.
ZA924811B (en) 1991-06-28 1993-12-29 Endorecherche Inc Controlled release systems and low dose androgens
US5369108A (en) * 1991-10-04 1994-11-29 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Potent inducers of terminal differentiation and methods of use thereof
US5700811A (en) 1991-10-04 1997-12-23 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Potent inducers of terminal differentiation and method of use thereof
EP1010705A4 (en) * 1997-09-02 2004-09-15 Sumitomo Pharma NEW CYCLIC TETRAPEPTIDE DERIVATIVES AND THEIR MEDICAL USE
HUP0202707A3 (en) * 1999-09-08 2003-11-28 Univ Columbia Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and pharmaceutical compositions containing them and use thereof
WO2003032921A2 (en) * 2001-10-16 2003-04-24 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Treatment of neurodegenerative diseases and cancer of the brain
EP1482962A4 (en) * 2002-02-15 2009-12-23 Sloan Kettering Inst Cancer METHOD OF TREATING THIOREDOXIN-MEDIATED DISEASES (TRX)
US7148257B2 (en) * 2002-03-04 2006-12-12 Merck Hdac Research, Llc Methods of treating mesothelioma with suberoylanilide hydroxamic acid
EP1501489A4 (en) * 2002-04-15 2007-11-21 Sloan Kettering Inst Cancer COMBINATION THERAPY FOR THE TREATMENT OF CANCER
US20040008968A1 (en) * 2002-07-09 2004-01-15 L3 Optics, Inc. Photosensitive optical glass

Also Published As

Publication number Publication date
KR20020059393A (ko) 2002-07-12
EP1231919A4 (en) 2005-02-23
US7126001B2 (en) 2006-10-24
IL148497A0 (en) 2002-09-12
WO2001018171A2 (en) 2001-03-15
EP1231919A2 (en) 2002-08-21
CN1378450A (zh) 2002-11-06
NZ517613A (en) 2004-01-30
AU6932700A (en) 2001-04-10
US7345174B2 (en) 2008-03-18
US20070010536A1 (en) 2007-01-11
EA200601252A1 (ru) 2006-10-27
PL200861B1 (pl) 2009-02-27
US20060241129A1 (en) 2006-10-26
WO2001018171A3 (en) 2002-06-27
PL364175A1 (en) 2004-12-13
YU22402A (sh) 2006-01-16
UA74345C2 (uk) 2005-12-15
HUP0202707A3 (en) 2003-11-28
US20070010669A1 (en) 2007-01-11
JP2003509343A (ja) 2003-03-11
BR0014254A (pt) 2002-08-27
US6511990B1 (en) 2003-01-28
TR200201052T2 (tr) 2003-01-21
EA200200333A1 (ru) 2002-10-31
MXPA02002505A (es) 2004-09-10
EA007649B1 (ru) 2006-12-29
US20040002506A1 (en) 2004-01-01
CA2383999A1 (en) 2001-03-15
EP1231919B1 (en) 2015-09-30
HUP0202707A2 (hu) 2002-12-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
SK3302002A3 (en) Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and methods of use thereof
RU2128643C1 (ru) Новые соединения как потенциальные индукторы терминальной дифференциации клеток опухоли и фармацевтическая композиция на их основе
CA2190765C (en) Novel potent inducers of terminal differentiation and methods of use thereof
ES2367369T3 (es) Inhibidores de enzimas.
Wada et al. α-Keto amides as inhibitors of histone deacetylase
US7923579B2 (en) Tricyclic hydroxamate and benzamide derivatives, compositions and methods
Marks et al. Polar/apolar chemical inducers of differentiation of transformed cells: strategies to improve therapeutic potential.
US20110212943A1 (en) Novel bridged cyclic compounds as histone deacetylase inhibitors
WO2005055928A2 (en) Zn2+ -chelating motif-tethered short -chain fatty acids as a novel class of histone deacetylase inhibitors
KR19990036271A (ko) 콜라겐 과다생산과 연관된 질환의 치료에 이용되는 ｃ-프로테나제 저해물질
JP2009051845A (ja) Ｈｄａｃ阻害剤としてのスルホンアミド結合を含むカルバミン酸化合物
HU225107B1 (en) N-(2-aryl-propionyl)-sulfonamids, their use and pharmaceutical preparations containing them
Chen et al. Studies of benzamide‐and thiol‐based histone deacetylase inhibitors in models of oxidative‐stress‐induced neuronal death: identification of some HDAC3‐selective inhibitors
JP4223003B2 (ja) 選択的モノアミンオキシダーゼｂインヒビターとしてのｎ−アシルアミノベンゼン誘導体
CA2688267A1 (en) Amino acid derivatives as calcium channel blockers
CA2289094A1 (en) New cysteine derivatives, processes for their production, and pharmaceuticals containing them
EP1402887A1 (en) New compounds for the inhibition of undesired cell proliferation and use thereof
Aronimo et al. Synthesis, molecular docking and antimalarial activity of phenylalanine-glycine dipeptide bearing sulphonamide moiety
AU2005205805B2 (en) Novel class of cytodifferentiating agents and histone deacetylase inhibitors, and methods of use thereof
US20070197577A1 (en) Inhibitors of anthrax lethal factor
US20060252813A1 (en) Apparatus for curing a composite laminate
US20100160392A1 (en) Histone deacetylase inhibitors
JPH0558978A (ja) カフエー酸アミド誘導体及びそれを含む医薬組成物
Mohammad et al. Synthesis, Characterization and in vitro evaluation of the anticancer activity of new HA–based HDAC inhibitors containing amino acids and analides as a surface recognition moieties
JP2007503472A (ja) 病気治療用のヒストン脱アセチル化酵素阻害剤としてのカルボニル化合物

Legal Events

Date Code Title Description
FC9A Refused patent application