MX2012007358A - Plantas tolerantes a herbicidas inhibidores de las hppd. - Google Patents

Plantas tolerantes a herbicidas inhibidores de las hppd.

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MX2012007358A
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Arno Schulz
Fabien Poree
Bernd Laber
Nathalie Knittel-Ottleben
Gudrun Lange
Ruediger Hain
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Bayer Ip Gmbh
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Abstract

El presente invento se refiere a secuencias de ácidos nucleicos que codifican una hidroxifenilpiruvato dioxigenasa (EC 1.13.11.27, abreviada aquí como HPPD) obtenida a partir de bacterias que pertenecen al género Kordia, así como a las proteínas codificadas por ellas, y a un gen quimérico que comprende dicha secuencia de ácido nucleico, y al uso de dichas secuencias de ácidos nucleicos, proteínas o genes quiméricos para obtener unas plantas que son tolerantes a herbicidas inhibidores de las HPPD.

Description

PLANTAS TOLERANTES A HERBICIDAS INHIBIDORES DE LAS HPPD.
CAMPO DE LA INVENCIÓN El presente invento se refiere a unas secuencias de ácidos nucleicos que codifican una hidroxifenilpiruvato dioxigenasa (EC 1.13.11.27, abreviada aquí como HPPD), obtenidas a partir de bacterias que pertenecen al género Kordia, así como a las proteínas codificadas por ellas, y a un gen quimérico que comprende una de dichas secuencias de ácido nucleico, y al uso de dichas secuencias de ácidos nucleicos, proteínas o genes quiméricos para obtener plantas que son tolerantes a herbicidas inhibidores de las HPPD.
ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN Las HPPD's son unas enzimas que catalizan la reacción en la que un para-hidroxifenilpiruvato (abreviado aquí como HPP), que es un producto de degradación de la tirosina, es transformado en un homogentisato (abreviado aquí como HG), que es el precursor en plantas de tocoferol y plastoquinona (Crouch N.P. y colaboradores (1997) Tetrahedron, 53, 20, 6993-7010, Fritze y colaboradores, (2004), Plant Physiology 134:1388-1400). El tocoferol actúa como un antioxidante asociado con membranas. La plastoquinona, en primer lugar actúa como un agente portador de electrones entre el PSII y el complejo de citocromo b6/f y en segundo lugar es un cofactor redox para una fitoeno desaturasa, que está implicada en la biosíntesis de carotenoides.
Hasta el momento actual se anotaron más de 700 secuencias de ácidos nucleicos procedentes de diversos organismos presentes en la base de datos del NCBI como que codificaban una proteína putativa que tenía un dominio de HPPD e incluían la secuencia descrita bajo el número de acceso A9DQF2 que se da en la base de datos UniProtKB/TrEMBL así como bajo el número de acceso ZP02161490 que se da en la base de datos de proteínas del NCBI. Sin embargo, para la mayor parte de éstas, incluyendo la secuencia que corresponde al número de acceso A9DQF2/ZP02161490, no se ha probado que la proteína derivada de dicha secuencia podría tener una actividad enzimática de HPPD o bien en un ensayo in vitro o en un enfoque in planta, ni que dicha proteína de HPPD pueda conferir a los herbicidas inhibidores de las HPPD una tolerancia a herbicidas, cuando se exprese en una planta. Se han descrito en el estado de la técnica varias HPPDs y sus secuencias primarias, en particular las HPPDs de bacterias tales como Pseudomonas (Rüetschi y colaboradores, Eur. J. Biochem., 205, 459-466, 1992, documento de solicitud de patente internacional WO 96/38567), de plantas tales como Arabidopsis (documento WO 96/38567, Genebank AF047834), zanahoria (documento WO 96/38567, Genebank 87257), Avena sativa (documento WO 02/046387), trigo (documento WO 02/046387), Brachiaria platyphylla (documento WO 02/046387), Cenchrus echinatus (documento WO 02/046387), Lolium rigidum (documento WO 02/046387), Festuca arundinacea (documento WO 02/046387), Setaria faberi (documento WO 02/046387), Eleusine indica (documento WO 02/046387), Sorghum (documento WO 02/046387), Coccicoides (Genebank COITRP), de Coptis japónica (documento WO 06/132270), Chlamydomonas reinhardtii (documento de patente española ES 2275365), o de mamíferos tales como un ratón o un cerdo. Las correspondientes secuencias descritas en las referencias allí indicadas se incorporan a la presente por su referencia.
La mayor parte de las plantas sintetizan tirosina pasando por un arrogenato (Abou-Zeid y. colaboradores (1995), Applied Env Microb 41 : 1298-1302; Bonner y colaboradores, (1995), Plant Cell Physiol. 36, 1013-1022; Byng y colaboradores, (1981), Phytochemistry 6: 1289-1292; Connely y Conn (1986), Z. Naturforsch 41 c: 69-78; Gaines y colaboradores, (1982), Planta 156: 233-240). En estas plantas, el HPP se deriva solamente de la degradación de tirosina. Por otro lado, en organismos tales como la levadura Saccharomyces cerevisiae o la bacteria Escherichia coli, el HPP es un precursor de la tirosina y es sintetizado por la acción de una enzima, la prefenato deshidrogenasa (a la que en lo sucesivo se hace referencia como PDH), que convierte al prefenato en HPP (Lingens y colaboradores, (1967) European J. Biochem 1 : 363-374; Sampathkumar y Morrisson (1982), Bioch Biophys Acta 701 : 204-211). En estos organismos, la producción de HPP está por lo tanto conectada directamente con la ruta de biosíntesis de aminoácidos aromáticos (ruta de shikimato), y no con la ruta de degradación de la tirosina.
La inhibición de una HPPD conduce a un desacoplamiento de la fotosíntesis, a una deficiencia en cuanto a pigmentos accesorios que cosechan luz y, lo que es sumamente importante, a la destrucción de clorofila por radiación de UV (de ultravioletas) y por especies con oxígeno reactivas (blanqueo) debido a la falta de protección frente a la luz que es normalmente proporcionada por los carotenoides (Norris y colaboradores (1995), Plant Cell 7: 2139-2149). El blanqueo de tejidos activos fotosintéticamente conduce a una inhibición del crecimiento y a una muerte de las plantas.
Algunas moléculas que inhiben a las HPPD, y que se fijan específicamente a la enzima con el fin de inhibir la transformación del HPP en homogentisato, han probado ser unos herbicidas selectivos muy efectivos.
En el momento actual, la mayor parte de los herbicidas inhibidores de las HPPD que están disponibles comercialmente pertenecen a una de estas cuatro familias químicas: 1) las tricetonas, por ejemplo sulcotriona [es decir 2-[2-cloro-4-(metilsulfonil)benzoíl]-1 ,3-ciclohexanodiona], mesotriona [es decir 2-[4-(metilsulfonil)-2-nitrobenzoíl]-1 ,3-ciclohexanodiona]; tembotriona [es decir 2-[2-cloro-4- (metilsulfonil)-3-[(2,2,2-trifluoroetoxi)metil]benzoíl]-1 ,3-ciclohexanodiona]; tefuriltriona [es decir 2-[2-cloro-4-(metilsulfonil)-3-[[(tetrahidro-2-furanil)metoxi]metil]benzoíl]-1 ,3-ciclohexanodiona]]; biciclopirona [es decir 4-hidroxi-3-[[2-[(2-metoxietoxi)metil]-6-(trifluorometil)-3-piridinil]-carbonil]biciclo[3.2.1 ]oct-3-en-2-ona]; benzobiciclona [es decir 3-(2-cloro-4-mesilbenzoíl)-2-feniltiobiciclo[3.2.1 ]oct-2-en-4-ona] 2) los dicetonitrilos, por ejemplo 2-ciano-3-ciclopropil-1-(2-met¡lsulfon¡l-4-tr¡fluorometilfen¡l)-propano-1 ,3-diona y 2-ciano-1-[4-(metilsulfonil)-2-trifluorometilfenil]-3-(1 -metilciclopropil)propano-1 ,3-diona; 3) los isoxazoles, por ejemplo isoxaflutol [es decir (5-ciclopropil-4-isoxazolil)-[2-(metilsulfonil)-4-(trifluorometil)fenil]metanona]. En las plantas, el isoxaflutol es metabolizado rápidamente en DKN, que es un compuesto dicetonitrilo que exhibe la propiedad inhibidora de las HPPD; y 4) los pirazolinatos, por ejemplo topramezona [es decir [3-(4,5-dihidro-3-isoxazolil)-2-metil-4-(metilsulfonil)fenil](5-hidroxi-1-metil-1 H-pirazol-4-¡l)metanona], y pirasulfotol [(5-hidroxi-1 ,3-dimetilpirazol-4-il-(2-mesil-4-trifluorometilfenil)-metanona]; pirazofeno [2-[4-(2,4-diclorobenzoíl)-1 ,3-dimetilpirazol-5-iloxi]acetofenona].
Estos herbicidas inhibidores de las HPPD se pueden usar contra malezas herbáceas y/o de hoja ancha en presencia de plantas cultivadas, que presentan una tolerancia metabólica, tales como las de maíz (Zea mays), en las que ellos son degradados rápidamente (Schulz y colaboradores, (1993). FEBS letters, 318, 162-166; Mitchell y colaboradores, (2001) Pest Management Science, Vol 57, 120-128; Garda y colaboradores, (2000) Biochem., 39, 7501-7507; Pallett y colaboradores, (2001) Pest Management Science, Vol 57, 133-142). Con el fin de ampliar el alcance de estos herbicidas inhibidores de las HPDD, se han desarrollado varios esfuerzos con el fin de conferir a plantas, particularmente a plantas sin tolerancia metabólica o con una tolerancia metabólica de bajo rendimiento, un nivel de tolerancia que sea aceptable en condiciones agronómicas en el campo.
Junto con el intento de orillar y evitar la producción de homogentisato, mediada por una HPPD (documento de patente de los EE.UU. US 6.812.010), se ha realizado una sobreexpresión de la enzima sensible, de manera tal que se produzcan unas cantidades de la enzima diana en la planta que sean suficientes en relación con el herbicida (documento W096/38567). Una sobreexpresión de una HPPD dio como resultado una mejor tolerancia antes del brote para el derivado de dicetonitrilo (DKN) del isoxaflutol (IFT), pero la tolerancia no era suficiente para tener una tolerancia a un tratamiento después del brote (Matringe y colaboradores, (2005), Pest Management Science 61 : 269-276).
Una tercera estrategia consistió en mutar a la HPPD con el fin de obtener una enzima diana que, mientras que retiene sus propiedades de catalizar la transformación de HPP en homogentisato, es menos sensible a los agentes inhibidores de las HPPD que lo es la HPPD natural antes de la mutación.
Esta estrategia ha sido aplicada con éxito para la producción de plantas tolerantes a la 2-ciano-3-cicloprop¡l-1-(2-metilsulfonil-4-trifluorometilfenil)-propano-1 ,3-diona y a la 2-ciano-1-[4-(metilsulfonil)-2-trifluorometilfenil]-3-(1-metilciclopropil)propano-1 ,3-diona (documento de patente europea EP496630), que son dos herbicidas inhibidores de las HPPD que pertenecen a la familia de los dicetonitrilos (documento WO 99/24585). Las Pro215Leu, Gly336Glu, Gly336lle, y más particularmente Gly336Trp (las posiciones del aminoácido mutado se indican con referencia a la HPPD de Pseudomonas) se identificaron como unas mutaciones que son responsables de una tolerancia aumentada a un tratamiento antes del brote con estos herbicidas de dicetonitrilos, sin causar una alteración de la actividad de la enzima.
Más recientemente, se ha mostrado que la introducción de un gen de HPPD de Pseudomonas en el genoma de plastidios de tabaco y de soja es más eficaz que una transformación nuclear, confiriendo incluso tolerancia a la aplicación después del brote de isoxaflutol (Dufourmantel y colaboradores, 2007, Plant Biotechnol J.5(1):1 18-33 ).
En el documento WO 04/024928, los autores del invento han buscado aumentar la biosíntesis de prenilquinonas (por ejemplo, síntesis de plastoquinonas y tocoferoles) en las células de plantas por aumento del flujo del precursor de HPP dentro de las células de estas plantas. Esto se ha realizado conectando la síntesis de dicho precursor con la ruta de "shikimato" por sobreexpresión de una enzima PDH. Ellos han observado también que la transformación de plantas con un gen que codifica una enzima PDH hace posible aumentar la tolerancia de dichas plantas a agentes inhibidores de las HPPD.
En el documento de solicitud de patente WO 2009/144079, se describen una secuencia de ácido nucleico que codifica una hidroxifenilpiruvato dioxigenasa (HPPD) mutada en la posición 336 de la proteína de HPPD de Pseudomonas fluorescens y su uso para obtener plantas que son tolerantes a herbicidas inhibidores de las HPPD.
En el documento WO 2002/046387, se han identificado varios dominios de proteínas de HPPD que se originan a partir de plantas que pueden ser relevantes para conferir tolerancia a diversos herbicidas inhibidores de las HPPD pero no se han mostrado datos in planta ni bioquímicos que confirmen el impacto de las funciones de los dominios que se acaban de describir.
En el documento WO 2008/150473, se dio como ejemplo la combinación de dos distintos mecanismos de tolerancia - un gen de Avena sativa modificado que codifica una enzima HPPD mutante y un CYP450 de monooxigenasa de maíz (gen de nsfl ) -con el fin de obtener una tolerancia mejorada a herbicidas inhibidores de las HPPD, pero no se han descrito datos que demuestren los efectos sinérgicos basados en la combinación de ambas proteínas.
A pesar de estos éxitos obtenidos para el desarrollo de plantas que muestran tolerancia para diversos herbicidas inhibidores de las HPPD, que se han descrito más arriba, todavía es necesario desarrollar y/o mejorar la tolerancia de plantas a unos agentes inhibidores de las HPPD más nuevos o a varios diferentes de ellos, particularmente a unos agentes inhibidores de las HPPD que pertenecen a las clases de las tricetonas (p.ej., sulcotriona, mesotriona, tembotriona, benzobiciclona y biciclopirona) y de los pirazolinatos (p.ej., topramezona y pirasulfotol).
DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN El presente invento se refiere por lo tanto a la generación de plantas transgénicas que contienen un gen que codifica una proteína de HPPD obtenible u obtenida a partir de un organismo que pertenece al género de las Kordia, y a variantes o mutantes del mismo, más especialmente a un gen procedente de un organismo que pertenece a la especie Kordia algicida y variantes o mutantes del mismo, que codifica una enzima HPPD que muestra las propiedades de catalizar la conversión de un para-hidroxifenilpiruvato en un homogentisato y cuyas plantas son menos sensibles a agentes inhibidores de las HPPD que unas plantas que contienen dicho transgén que codifica una HPPD. Los genes procedentes de Kordia que codifican proteínas de HPPD fueron seleccionados como excelentes candidatos tolerantes a agentes inhibidores de las HPPD debido a sus altas divergencias en la composición de aminoácidos en unas posiciones relevantes para la tolerancia a los agentes inhibidores de las HPPD, tal como se determina de manera experimental y estructural en la proteína de HPPD en comparación con la proteína de HPPD de Arabidopsis sensible que se tomó como la molécula de referencia sensible a los agentes inhibidores de las HPPD.
En una forma de realización, este invento se refiere a una proteína de HPPD denominada aquí "la proteína de HPPD de este invento" o "la proteína de HPPD de Kordia", que es una proteína de HPPD con una identidad de su secuencia de aminoácidos de por lo menos 75 %, por lo menos 80 %, por lo menos 85 %, por lo menos 90 %, por lo menos 95 %; por lo menos 97 %; por lo menos 98 %, o por lo menos 99 % con respecto a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, particularmente con respecto a la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEQ ID Nos. 4, 5, 6 o 7, de manera preferible de la SEQ ID No. 6.
En una forma de realización adicional, el invento se refiere a una proteína de HPPD denominada aquí "la proteína de HPPD de este invento" o "la proteína de HPPD de Kordia", que es una proteína de HPPD con una identidad de su secuencia de aminoácidos de por lo menos 75 %, por lo menos 80 %, por lo menos 85 %, por lo menos 90 %, por lo menos 95 %; por lo menos 97 %; por lo menos 98 %, o por lo menos 99 % con respecto a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, particularmente con respecto a la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEQ ID Nos. 4, 5, 6, 7, de manera preferible de la SEQ ID No. 6, y en que cualquiera de los aminoácidos desde la posición 195 hasta la posición 387 de la SEQ ID No. 4 puede ser corregido por cualquier aminoácido presente en la naturaleza, de manera preferible puede ser cualquier sustitución conservativa.
En una forma de realización adicional, el invento se refiere a una proteína de HPPD denominada aquí "la proteína de HPPD de este invento" o "la proteína de HPPD de Kordia", que es una proteína de HPPD con una identidad de su secuencia de aminoácidos de por lo menos 75 %, por lo menos 80 %, por lo menos 85 %, por lo menos 90 %, por lo menos 95 %; por lo menos 97 %; por lo menos 98 %, o por lo menos 99 % con respecto a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, particularmente con respecto a la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de las SEQ ID Nos. 4, 5, 6, 7, de manera preferible de la SEQ ID No. 6, y que tiene uno o más de los siguientes aminoácidos en la posición definida por su número (que se relaciona con el número de la SEQ ID No. 4) dado entre paréntesis, es decir His(193), Ser(236), Asn(251), Gln(275), His(276), Tyr(305), Gln(340), Phe(353), Glu(355), Gly(366), y Asn(369).
En una forma de realización adicional, el invento se refiere a una proteína de HPPD denominada aquí "la proteína de HPPD de este invento" o "la proteína de HPPD de Kordia", que es una proteína de HPPD con una identidad de su secuencia de aminoácidos de por lo menos 75 %, por lo menos 80 %, por lo menos 85 %, por lo menos 90 %, por lo menos 95 %; por lo menos 97 %; por lo menos 98 %, o por lo menos 99 % con respecto a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, particularmente con respecto a la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de las SEQ ID Nos. 4, 5, 6, 7, de manera preferible de la SEQ ID No. 6, y en las respectivas posiciones dadas en la segunda columna de la Tabla (i) los aminoácidos originalmente presentes pueden ser sustituidos por cualesquiera de los aminoácidos enumerados en la columna 3 de la Tabla (i).
Tabla (i): En una forma de realización adicional, el invento se refiere a una proteína de HPPD denominada aquí "la proteína de HPPD de este invento" o "la proteína de HPPD de Kordia", que es una proteína de HPPD con una identidad de su secuencia de aminoácidos de por lo menos 75 %, por lo menos 80 %, por lo menos 85 %, por lo menos 90 %, por lo menos 95 %; por lo menos 97 %; por lo menos 98 %, o por lo menos 99 % con respecto a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, particularmente con respecto a la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de las SEQ ID Nos. 4, 5, 6, 7, de manera preferible de la SEQ ID No. 6, y en las respectivas posiciones dadas en la segunda columna de la Tabla (i¡) los aminoácidos originalmente presentes pueden ser sustituidos por cualesquiera de los aminoácidos enumerados en la columna 3 de la Tabla (i¡).
Tabla (ii): En una forma de realización adicional, el invento se refiere a una proteína de HPPD denominada aquí "la proteína de HPPD de este invento" o "la proteína de HPPD de Kordia", que es una proteína de HPPD con una identidad de su secuencia de aminoácidos de por lo menos 75 %, por lo menos 80 %, por lo menos 85 %, por lo menos 90 %, por lo menos 95 %; por lo menos 97 %; por lo menos 98 %, o por lo menos 99 % con respecto a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, particularmente con respecto a la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de las SEQ ID Nos. 4, 5, 6, 7, de manera preferible SEQ ID No. 6, y en las respectivas posiciones dadas en la segunda columna de la Tabla (iii) los aminoácidos originalmente presentes pueden ser sustituidos por cualesquiera de los aminoácidos enumerados en la columna 3 de la Tabla (iii).
Tabla (iii) El invento incluye una proteína con aminoácidos sustituidos, suprimidos o añadidos en comparación con la secuencia de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, tales como una proteína de fusión con un péptido de tránsito, o una proteína con cambios de aminoácidos en la secuencia de la SEQ ID No. 4 que retiene la función enzimática de una proteína de HPPD, y que todavía confiere una tolerancia a las HPPD cuando se expresa en plantas, de manera preferible una tolerancia a las HPPD de rango comparable con la conferida por la proteína de la SEQ ID No. 4. Esto incluye proteínas variantes o mutantes derivadas de la proteína de la SEQ ID No. 4, tales como cualquiera de las proteínas de las SEQ ID No. 5, 6 o 7, particularmente aquella mutante o variante que es menos sensible que la HPPD endógena de la planta anfitriona a un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de los/las isoxazoles, dicetonitrilos, tricetonas o pirazolinatos, de manera preferible aquella mutante o variante que confiere una tolerancia a herbicidas agronómicamente relevante a una planta anfitriona que la expresa cuando un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de los/las isoxazoles, dicetonitrilos, tricetonas y/o pirazolinatos, particularmente cualquiera tomado de mesotriona, tembotriona, isoxaflutol o biciclopirona es aplicado sobre dichas plantas, más particularmente cuando es aplicado después del brote. Esto incluye también una proteína que comprende una porción activa de la secuencia de la SEQ ID No. 4, cuya porción confiere una tolerancia a agentes inhibidores de las HPPD cuando se expresa en plantas. Esto incluye una proteína con sustancialmente la misma secuencia de aminoácidos que la secuencia de la SEQ ID No. 4, tal como una proteína con la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de las SEQ ID No. 4 hasta 7. Esto incluye proteínas aisladas como se definen seguidamente, y también unas proteínas, tales como la proteína de la SEQ ID No. 4 4, en las que ciertos aminoácidos han sido reemplazados por unos similares aminoácidos como se definen seguidamente, de manera preferible sustituciones conservativas de aminoácidos. También están incluidas en el presente contexto como proteínas de HPPD de este invento unas proteínas de HPPD que comprenden la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, pero en las que 1-20, 1-15, 1-10 o 1 , 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 o 9 aminoácidos han sido suprimidos o han sido sustituidos por otros aminoácidos, particularmente una proteína tal que retiene la actividad enzimática de las HPPD y que confiere tolerancia a herbicidas inhibidores de las HPPD cuando es expresada en una planta anfitriona. Están incluidas en el presente contexto unas proteínas de HPPD codificadas por unas secuencias de ADN homologas a las secuencias de ADN del invento como se describen seguidamente, o unas proteínas de HPPD codificadas por una secuencia de ADN que se híbrida con por lo menos una porción (de por lo menos 20-30 nucleótidos) del ADN de la SEQ ID No. 1 , o que es obtenible usando un cebador basado en la SEQ ID No. 1 , o unas proteínas de HPPD con una identidad entre secuencias de por lo menos 75 % con la SEQ ID No. 4, que son codificadas por una secuencia de ADN hallada en la secuencia del genoma de un microorganismo, tal como un microorganismo eucariótico, particularmente un protista, tal como un microorganismo del género Kordia. Está incluida en el presente contexto como una proteína de HPPD de este invento una proteína de HPPD de Kordia que confiere una tolerancia a herbicidas a unas plantas cuando es expresada en tales plantas, en las que dicha tolerancia es a un agente inhibidor de las HPPD tal como mesotriona, tembotriona, isoxaflutol o biciclopirona, particularmente dicha proteína de HPPD es una proteína de HPPD de Kordia algicida, tal como una proteína que comprende la secuencia de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387. Esto incluye las proteínas de HPPD mutantes o variantes tal como se describen adicionalmente más abajo.
El presente invento incluye y proporciona un anticuerpo capaz de fijar específicamente a una proteína sustancialmente purificada que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre el conjunto que consiste en las SEQ ID NOs: 4, 5, 6 o 7, o secuencias derivadas de la misma de acuerdo con un reemplazo de aminoácidos tal como se describe en una o más de las Tablas (i), (ii) o (iii) anteriores.
Un aspecto adicional del invento concierne a anticuerpos, moléculas monocatenarias que fijan antígenos, u otras proteínas que se fijan específicamente a una o más de las moléculas de proteínas o péptidos del invento y sus compuestos homólogos, fusiones o fragmentos.
En una forma de realización particularmente preferida, el anticuerpo se fija específicamente a una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos que se expone en las SEQ ID NOs: 4-7 o un fragmento de la misma, o secuencias derivadas de la misma de acuerdo con un reemplazo de aminoácidos tal como se describe en una o más de las Tablas (i), (ii) o (iii) anteriores.
En otra forma de realización, el anticuerpo se fija específicamente a una proteína de fusión que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos que se exponen en las SEQ ID NOs: 4-7, o un fragmento de la misma, o secuencias derivadas de la misma de acuerdo con un reemplazo de aminoácidos tal como se describe en una o más de las Tablas (i), (ii) o (iii) anteriores.
En otra forma de realización, el anticuerpo se fija específicamente a una proteína de fusión que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos que se exponen en las SEQ ID NOs: 4-7, o un fragmento de la misma, o secuencias derivadas de la misma de acuerdo con un reemplazo de aminoácidos tal como se describe en una o más de las Tablas (i), (ii) o (iii) anteriores.
Los anticuerpos del invento se pueden usar para detectar de manera cuantitativa o cualitativa las moléculas de proteínas o péptidos del invento, o para detectar modificaciones posteriores a la traducción de las proteínas. Tal como se usa en el presente contexto, se dice que un anticuerpo o péptido se "fija específicamente" a una molécula de proteína o péptido del invento si tal fijación no es inhibida competitivamente por la presencia de moléculas no relacionadas.
En otra forma de realización, este invento se refiere a un ácido nucleico o ADN de HPPD, denominado aquí "el ácido nucleico/ADN de HPPD de este invento", que es un ácido nucleico o ADN que codifica una HPPD de este invento tal como se ha definido anteriormente. Esto incluye un ADN que comprende una secuencia de nucleótidos, seleccionada entre el conjunto que consiste en la secuencia de la SEQ ID No. 1 desde la posición de nucleótido 4 hasta la posición de nucleótido 1.161 , en la secuencia de la SEQ ID No. 2 desde la posición de nucleótido 25 hasta la posición de nucleótido 1.182, o en la secuencia de la SEQ ID No. 3 desde la posición de nucleótido 4 hasta la posición de nucleótido 1.557, o que comprende una región de ADN que codifica una HPPD, o un ADN que es suficientemente complementario con otro ADN de manera tal que cuando el está en 5xSSC (1xSSC (acrónimo de single-strength sodium citrate = citrato de sodio de concentración simple) significa = 0,15 M de NaCI, 0,015 M de citrato de trisodio, 50 mM de fosfato de sodio de pH 7,6), que contiene 0,1 % de SDS (acrónimo de Sodium Dodecyl Sulfate = dodecil sulfato de sodio) seguido por un enjuague a la misma temperatura con 5xSSC que contiene 0,1 % de SDS, todavía se híbrida con una secuencia seleccionada entre el conjunto que consiste en las SEQ ID Nos 1 , 2 y 3. Cuando las secuencias de ensayo y del invento son de doble hebra, el ácido nucleico que constituye la secuencia de ensayo tiene de manera preferible una TM (temperatura de fusión) dentro de 10° C con respecto a la secuencia seleccionada entre el conjunto que consiste en las SEQ ID Nos 1, 2, y 3. En el caso de que la secuencia de ensayo y la secuencia seleccionada entre el conjunto que consiste en SEQ ID Nos. 1 , 2 y 3 sean mezcladas conjuntamente y sean desnaturalizadas simultáneamente, los valores de las TM de las secuencias están de manera preferible dentro de 5o C uno con respecto al otro. De manera más preferible, la hibridación se realiza en unas condiciones de hibridación relativamente rigurosas, tal como se definen seguidamente. En una forma de realización, una secuencia desnaturalizada de ensayo o del invento es de manera preferible unida en primer lugar a un soporte y se efectúa una hibridación durante un periodo de tiempo especificado a una temperatura comprendida entre 60 y 65° C en 5xSSC que contiene 0,1 % de SDS seguida por un enjuague del soporte a la misma temperatura pero con 0,1xSSC. Cuando la hibridación implica a un fragmento de la secuencia seleccionada entre el conjunto que consiste en las SEQ ID Nos. 1 , 2 y 3, las condiciones de hibridación pueden ser menos rigurosas, tal como resultará evidente para una persona experta.
También se incluyen aqui, como ADN de HPPD de este invento, unas secuencias de ADN que codifican una proteína de HPPD del invento, cuyas secuencias de ADN han sido adaptadas para la expresión en microorganismos o plantas, tal como por reemplazo de codones nativos por unos codones más preferidos en una célula anfitriona, o en las que ciertos sitios de restricción han sido añadidos o retirados para conseguir facilidad de clonación, o una secuencia de ADN con un cierto número de nucleótidos añadidos, reemplazados o suprimidos. Esto incluye también secuencias de ADN aisladas y ADN's o ácidos nucleicos variantes, mutantes o sintéticos, como se describen más adelante.
En una forma de realización particular, el ADN de HPPD de Kordia de este invento es expresado en plantas bajo el control de un promotor que permite la expresión de genes endógenos en plantas. En una forma de realización particular adicional, junto al extremo terminal de N de la enzima de HPPD expresada de esta manera está situado un péptido de señal, tal como un péptido de tránsito, de manera preferible un péptido de tránsito de plastidio, tal como un péptido de tránsito de cloroplastos con aproximadamente 120 aminoácidos (desde aproximadamente 30 hasta aproximadamente 120 aminoácidos) de manera sumamente preferible un doble péptido de tránsito, tal como un péptido de tránsito optimizado cuya primera parte se origina de girasol (Helianthus annuus) y cuya segunda parte se origina de Zea mays (maíz) (que ha sido descrito en el documento de patente US 5.188.642) o un péptido de tránsito de plastidio de la subunidad pequeña de ribulosa biscarboxilasa/ oxigenasa de la planta (RuBisCO ssu, acrónimo de ribulose biscarboxilase / oxigenase small subunit), que cuando sea apropiado incluye unos pocos aminoácidos de la parte terminal de N de la RuBisCO ssu madura (documento EP 189 707) En una forma de realización particular adicional, este invento incluye un ADN que codifica una proteína de HPPD de este invento que se deriva o es obtenible a partir de la SEQ ID No. 1 y está optimizado para la expresión en E. coli, tal como un ADN optimizado en codones, por ejemplo un ADN que comprende la secuencia de la SEQ ID No. 2 desde la posición de nucleótido 25 hasta la posición de nucleótido 1.182 (que incluye las posiciones definidas).
En una forma de realización particular adicional, este invento incluye un ADN que codifica una proteína de HPPD de este invento que se deriva de la SEQ ID No. 1 y está optimizado para la expresión en plantas, tal como un ADN optimizado en codones, por ejemplo un ADN que comprende la secuencia de la SEQ ID No. 3 desde la posición de nucleótido 400 hasta la posición de nucleótido 1.557 (que incluye las posiciones definidas).
En una forma de realización particular adicional, la HPPD del invento, tal como la HPPD que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387, o la HPPD que comprende la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de las SEQ ID Nos. 4 hasta 7, es menos sensible que la HPPD endógena de la planta anfitriona a un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de los/las isoxazoles, dicetonitrilos, tricetonas o pirazolinatos, o a un herbicida inhibidor de las HPPD, seleccionado entre isoxaflutol, tembotriona, mesotriona, sulcotriona, pirasulfotol, topramezona, 2-ciano-3-ciclopropil-1-(2-S02CH3-4-CF3fenil)-propano-1 ,3-d¡ona y 2-ciano-3-ciclopropil-1-(2- S02CH3-4-2,3 CI2 fenil)-propano-1 ,3-diona, biciclopirona, benzobiciclona, tefuriltriona y pirazoxifeno.
En una forma de realización particular adicional, este invento incluye un ADN que codifica una proteína de HPPD de este invento que se deriva de la SEQ ID No. 1 y está optimizado para la expresión en E. coli, tal como un ADN optimizado en codones, por ejemplo un ADN que comprende la secuencia de la SEQ ID No. 2 desde la posición de nucleótido 25 hasta la posición de nucleótido 1.182 (que incluye las posiciones definidas) que codifica una HPPD menos sensible que la HPPD endógena de la planta anfitriona a por lo menos una herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de los/las isoxazoles, dicetonitrilos, tricetonas o pirazolinatos, de manera preferible a tembotriona, mesotriona, biciclopirona, tefuriltriona, isoxaflutol, dicetonitrilo, pirasulfotol, topramezona, sulcotriona, pirazolato y benzofenap.
En una forma de realización particular adicional, este invento incluye un ADN que codifica una proteína de HPPD de este invento, que está optimizado para la expresión en plantas, tal como un ADN optimizado en codones, por ejemplo un ADN que comprende la secuencia de la SEQ ID No. 3 desde la posición de nucleótido 400 hasta la posición de nucleótido 1.557 (que incluye las posiciones definidas), que codifica una HPPD menos sensible que la HPPD endógena de la planta anfitriona a por lo menos un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de los/las isoxazoles, dicetonitrilos, tricetonas o pirazolinatos, de manera preferible a tembotriona, mesotriona, biciclopirona, tefuriltriona, isoxaflutol, dicetonitrilo, pirasulfotol, topramezona, sulcotriona, pirazolato y benzofenap.
En una forma de realización particular adicional, este invento se refiere a plantas, partes de plantas, células de plantas y progenies de estas plantas que comprenden un ADN que codifica una proteína de HPPD del invento, que está optimizado para la expresión en E. coli, o está optimizado para la expresión en plantas, tal como un ADN optimizado en codones, por ejemplo un ADN que comprende la secuencia de la SEQ ID No. 2 desde la posición de nucleótido 25 hasta la posición de nucleótido 1.182 (que incluye las posiciones definidas) o de la SEQ ID No. 3 desde la posición de nucleótido 400 hasta la posición de nucleótido 1.557 (que incluye las posiciones definidas) que codifica una HPPD menos sensible que la HPPD endógena de la planta anfitriona. Tales plantas incluyen, pero no se limitan a, plantas cultivadas en el campo, frutos y hortalizas tales como cañóla, girasol, tabaco, remolacha azucarera, algodón, maíz, trigo, cebada, arroz, sorgo, tomate, mango, melocotón, manzana, pera, fresa, plátano, melón, patata, zanahoria, lechuga, col, cebolla, especies de soja, caña de azúcar, guisantes, judías, álamo, uva, frutos cítricos, alfalfa, centeno, avena, hierbas de césped y forrajeras, lino y colza de semilla oleaginosa, y plantas productoras de nueces.
En una forma de realización más particular, este invento se refiere a plantas, partes de plantas, células de plantas y progenies de estas plantas que comprenden un ADN que codifica una HPPD del invento, que está optimizado para la expresión en E. coli, u optimizado para la expresión en plantas, tal como un ADN optimizado en codones, por ejemplo un ADN que comprende la secuencia de la SEQ ID No. 2 desde la posición de nucleótido 25 hasta la posición de nucleótido 1.182 (que incluye las posiciones definidas) o de la SEQ ID No. 3 desde la posición de nucleótido 400 hasta la posición de nucleótido 1.557 (que incluye las posiciones definidas) que codifica una HPPD menos sensible que la HPPD endógena de la planta anfitriona, y en las que las plantas están seleccionadas entre el conjunto que consiste en cañóla, girasol, tabaco, remolacha azucarera, algodón, maíz, trigo, cebada, arroz, patata, especies de soja, caña de azúcar, guisantes, judías, álamo, uva, alfalfa, centeno, avena, hierbas de césped y forrajeras, lino y colza de semilla oleaginosa, y plantas productoras de nueces, incluso de manera más preferible tales plantas están seleccionadas entre el conjunto que consiste en especies de soja, arroz, remolacha azucarera, trigo, algodón, cañóla, colza de semilla oleaginosa o maíz.
En otra forma de realización particular, la proteína de HPPD del invento comprende la secuencia de la SEQ ID No. 7 y es menos sensible a un agente inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas (que se denomina agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona), tales como tembotriona, sulcotriona, mesotriona, biciclopirona, tefuriltriona, particularmente tembotriona, o de la clase de los dicetonitrilos (isoxaflutol) o de la clase de los pirazolinatos (que se denomina agente inhibidor de las HPPD del tipo de un pirazolinato), tales como pirasulfotol, pirazolato, topramezona, benzofenap, en comparación con la HPPD no mutada endógena de una planta, particularmente la planta anfitriona en la que dicha HPPD del invento es expresada o ha de ser expresada.
La actividad enzimática de las proteínas de HPPD puede ser medida por cualquier método que haga posible ya sea medir la disminución en la cantidad de los substratos de HPP o de 02, o medir la acumulación de cualquiera de los productos derivados de la reacción enzimática, es decir homogentisato o CO2. En particular, la actividad de HPPD puede ser medida por medio del método descrito en las citas de Garcia y colaboradores (1997), Biochem. J. 325, 761-769 o García y colaboradores (1999), Plant Physíol. 119, 1507-1516, que son incorporadas en el presente contexto por su referencia.
De acuerdo con el invento, un agente inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas (o agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona) significa un agente inhibidor de las HPPD que tiene un esqueleto de tricetona. Como un ejemplo de dicho agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona, se pueden citar las moléculas sulcotriona [es decir 2-[2-cloro-4-(metilsulfonil)-benzoíl]-1 ,3-ciclohexanodiona], mesotriona [es decir 2-[4-(metilsulfonil)-2-nitrobenzoíl]-1 ,3-ciclohexanodiona], y tembotriona [es decir 2-[2-cloro-4-(metilsulfon¡l)-3-[(2,2,2-trifluoroetox¡)metil]benzoíl]-1 ,3-c¡clohexanodiona], tefuriltriona [es decir 2-{2-cloro-4-mesil-3-[(RS)-tetrahidro-2-furilmetoximetil]-benzoíl}ciclohexano-1 ,3-diona], biciclopirona [es decir 4-hidroxi-3-{2-[(2-metoxietoxi)metil]-6-(trifluorometil)-3-piridilcarbonil}biciclo[3.2.1]oct-3-en-2-ona], benzobiciclona [es decir 3-(2-cloro-4-mesilbenzoíl)-2-feniltiobiciclo[3.2.1]oct-2-en-4-ona].
De acuerdo con el invento, un agente inhibidor de las HPPD de la clase de los. pirazolinatos (o agente inhibidor de las HPPD del tipo de un pirazolinato) significa un agente inhibidor de las HPPD que tiene un radical de pirazol. Como un ejemplo de tal agente inhibidor de las HPPD del tipo de un pirazolinato, se pueden citar las moléculas topramezona [es decir [3-(4,5-dihidro-3-isoxazolil)-2-metil-4-(metilsulfonil)fenil]-(5-hidroxi-1-metil-1 H-pirazol-4-il)metanona] y pirasulfotol(5-hidrox¡-1 ,3-dimetilpirazol-4-il-(2-mesil-4-trifluorometilfenil)-metanona].
El presente invento se refiere también a una secuencia de ácido nucleico, particularmente un ADN aislado, de manera preferible un gen quimérico expresable en plantas, que codifica la HPPD de Kordia del invento y secuencias adaptadas de la misma.
El presente invento se refiere también a una secuencia de ácido nucleico que codifica una enzima HPPD de este invento que retiene sus propiedades de catalizar la conversión de para-hidroxifenilpiruvato en homogentisato y que es menos sensible a los agentes inhibidores de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, tefuriltriona, biciclopirona, benzobiciclona, que la HPPD endógena no mutada de la planta, y cuya secuencia codificada de aminoácidos muestra una identidad entre secuencias con la SEQ ID No. 4 de por lo menos 75 %, 80 %, particularmente de por lo menos 85 %, de manera preferible de por lo menos 90 %, de manera más preferible de por lo menos 95 %, incluso de manera más preferible de por lo menos 98 % y de manera sumamente preferible de por lo menos 99 %.
En una forma de realización más particular, la secuencia de ácido nucleico del invento codifica una enzima HPPD que es menos sensible a un agente inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona, mesotriona, biciclopirona y tefuriltriona, de la clase de los pirazolinatos (que se denomina agente inhibidor de las HPPD del tipo de un pirazolinato), tales como pirasulfotol, pirazolato, topramezona, benzofenap, de la clase de los isoxazoles tales como isoxaflutol o de la clase de las dicetonas tales como dicetonitrilo, que la HPPD endógena de la planta anfitriona.
De acuerdo con el presente invento, se entiende que una "secuencia de ácido nucleico" es una secuencia de nucleótidos que puede ser del tipo de ADN o de ARN, de manera preferible del tipo de ADN, y en particular de doble hebra, ya sea de origen natural o sintético, en particular una secuencia de ADN en la que los codones que codifican la HPPD de acuerdo con el invento han sido optimizados de acuerdo con el organismo anfitrión en el que ella ha de ser expresada (por ejemplo, reemplazando unos codones por aquellos codones que son más preferidos o sumamente preferidos en tablas de trato con codones de dicho organismo anfitrión o el grupo al que dicho organismo anfitrión pertenece, en comparación con el organismo original o de fuente).
El concepto de "un(a) ácido nucleico/ADN/proteína aislado/a", tal como se usa en el presente contexto, se refiere a un(a) ácido nucleico/ADN/proteína que no se presenta en la naturaleza (tal como un ADN artificial o sintético con una secuencia de nucleótidos que es diferente que la del ADN que se presenta en la naturaleza, o una proteína modificada) o que ya no se encuentra en el entorno natural en el que originalmente estaba presente, por ejemplo una secuencia que codifica un ADN, asociada con un elemento regulador heterólogo (tal como una secuencia codificadora bacteriana conectada operativamente a un promotor expresable en una planta) en un gen quimérico, un ADN transferido dentro de otra célula anfitriona, tal como una célula de planta transgénica.
A la vista de una forma de realización particular del invento y de la solución posteriormente buscada, es decir una HPPD que es menos sensible a un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona, un isoxazol o un pirazolinato, la medición del nivel de tolerancia es analizada usando el método extensamente descrito en el documento WO 2009/14407 tal como se describe seguidamente, usando un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona, un isoxazol o un pirazolinato, particularmente un agente inhibidor de las HPPD, seleccionado entre tembotriona, mesotriona, pirasulfotol, topramezona, sulcotriona, biciclopirona, dicetonitrilo, benzofenap, pirazolato y tefuriltriona.
La terminología de un ADN o una proteína "que comprende" una cierta secuencia "X", tal como se usa a lo largo del texto, se refiere a un ADN o una proteína que incluye o que contiene por lo menos la secuencia "X", de manera tal que otras secuencias de nucleótidos o de aminoácidos pueden estar incluidas junto a los extremos 5' (o terminal de N) y/o 3' (o terminal de C), por ejemplo (la secuencia de nucleótidos de) una proteína marcadora seleccionable, (la secuencia de nucleótidos de) un péptido de tránsito, y/o una secuencia conductora en 5' o una secuencia de remolque en 3'. Similarmente, debería entenderse que el uso del término "comprende", "que comprende" o "comprenden" a lo largo del texto y las reivindicaciones de esta solicitud implica la inclusión de una señalada parte entera o etapa o de un señalado conjunto de partes enteras o etapas, pero no la exclusión de cualquier otra parte entera o etapa o conjunto de partes enteras o etapas.
En una forma de realización del invento, las regiones codificadoras que codifican una HPPD comprenden una secuencia de nucleótidos que codifica unas proteínas con las secuencias de aminoácidos que se exponen en las SEQ ID Nos 4, 5, 6 y 7, tales como las secuencias de nucleótidos de las SEQ ID Nos 1 , 2 y 3.
Sin embargo, resultará evidente que unas variantes de estas secuencias de nucleótidos, incluyendo inserciones, supresiones y sustituciones de las mismas, se pueden usar también con el mismo efecto. Igualmente, se pueden usar unas secuencias homologas a las secuencias de nucleótidos mencionadas, procedentes de especies diferentes de la Kordia algicida.
Unas variantes de la secuencia de nucleótidos que se ha descrito tendrán una identidad entre secuencias que será de manera preferible de por lo menos alrededor de 70 %, 80 %, 85 % o 90 % o por lo menos 95 % con unas secuencias de nucleótidos identificadas que codifican unas enzimas HPPD tales como las identificadas en la lista de secuencias.
Una proteína que tiene "sustancialmente la misma secuencia de aminoácidos" que una proteína como se describe en el invento, tal como se usa en el presente contexto, se refiere a una proteína que tiene una identidad entre secuencias de por lo menos 90 %, particularmente de por lo menos 95 %, de manera preferible de por lo menos 97 % con una proteína de acuerdo con el invento, en donde el porcentaje de identidad entre secuencias es determinado usando la matriz de calificación blosum62 en el programa GAP del paquete de Wisconsin de GCG (Madison, Wisconsin, EE.UU.) versión 10.0 (se usaron defectos de GCG). El concepto de "identidad entre secuencias", tal como se usa a lo largo de esta solicitud, cuando se relaciona con proteínas, se refiere al porcentaje de aminoácidos idénticos cuando se usa este análisis especificado. La "identidad entre secuencias", tal como se usa en el presente contexto, cuando se relaciona con secuencias de ADN, es determinada usando la matriz de calificación nwsgapADN en el programa GAP del paquete de Wisconsin de GCG (Madison, Wisconsin, EE.UU.) versión 10.0 (se usaron defectos de GCG).
Para la finalidad de este invento, la "identidad entre secuencias" de dos secuencias de nucleótidos o aminoácidos relacionadas, expresada como un porcentaje, se refiere al número de posiciones en las dos secuencias, alineadas de una manera óptima, que tienen residuos idénticos (x 100) dividido por el número de posiciones que se han comparado. Un intersticio, es decir una posición en una alineación en la que un residuo está presente en una secuencia pero no en la otra, es considerado como una posición con residuos no idénticos. La alineación de las dos secuencias es realizada por el algoritmo de Needleman y Wunsch (Needleman y Wunsch 1970). La anterior alineación de secuencias asistida por ordenador, se puede realizar convenientemente usando un programa lógico (software) clásico, tal como el GAP que es parte del paquete de Wisconsin Package Versión 10.1 (de Genetics Computer Group, Madison, Wisconsin, EE.UU.) usando la matriz de calificación por defecto con una penalización por creación de un intersticio de 50 y una penalización por prolongación de un intersticio de 3.
Unas secuencias de nucleótidos homologas con las secuencias de nucleótidos que codifican una enzima HPPD de acuerdo con el invento pueden ser identificadas por un análisis in silico (en ordenador) de datos de secuencias genómicas.
Una secuencia de nucleótidos homologa puede ser identificada y aislada también por hibridación en condiciones rigurosas usando como sondas unas secuencias de nucleótidos identificadas que codifican unas enzimas HPPD de acuerdo con el invento o partes de las mismas. Dichas partes deberán tener de manera preferible una secuencia de nucleótidos que comprenda por lo menos 40 nucleótidos consecutivos procedentes de la región de codificación de secuencias de genes que codifican las HPPD de acuerdo con el invento, procedentes de manera preferible de la región de codificación de las SEQ ID No. 1 , SEQ ID No. 2 o SEQ ID No. 3. Sin embargo, las sondas pueden comprender regiones más largas de secuencias de nucleótidos que se derivan de los ácidos nucleicos que codifican las HPPD, tales como aproximadamente 50, 60, 75, 100, 200 o 500 nucleótidos consecutivos procedentes de cualquiera de los genes de HPPD que se han mencionado. De manera preferible, la sonda debería comprender una secuencia de nucleótidos que codifique una región conservada en alto grado, que puede ser identificada por alineación de las diferentes proteínas de HPPD.
El concepto de "unas condiciones de hibridación rigurosas" tal como se usa en el presente contexto, significa que una hibridación se realizará generalmente si hay una identidad entre secuencias de por lo menos 95 % y de manera preferible por lo menos de 97 % entre la sonda y la secuencia diana. Ejemplos de condiciones rigurosas de hibridación son una incubación durante una noche en una solución que comprende 5xSSC (150 mM de NaCI, 15 mM de citrato de trisodio), 50 mM de fosfato de sodio (de pH 7,6), 5x de solución de Denhardt, 10 % de sulfato de dextrano y 20 pg/ml de un ADN portador cortado y desnaturalizado tal como un ADN de esperma de salmón, seguido por un lavado del soporte de hibridación en 0,1xSSC a aproximadamente 65 °C, de manera preferible dos veces durante alrededor de 10 minutos. Otras condiciones de hibridación y de lavado son bien conocidas y se dan como ejemplo en la cita de Sambrook y colaboradores, Molecular Cloning: A Laboratory Manual [Clonación molecular, un manual de laboratorio], Segunda edición , Cold Spring Harbor, NY (1989), particularmente el capítulo 11.
Dichas secuencias variantes se pueden obtener también mediante una amplificación de ADN usando unos oligonucleótidos específicos para genes de HPPD que codifican enzimas como cebadores, tales como, pero sin limitarse a, unos oligonucleótidos que comprenden desde aproximadamente 20 hasta aproximadamente 50 nucleótidos consecutivos seleccionados entre las secuencias de nucleótidos de las SEQ ID Nos 1 , 2, 3, o su complemento.
El invento comprende también unas enzimas de HPPD variantes que son unas secuencias de aminoácidos similares a la secuencia de aminoácidos de HPPD de la SEQ ID No. 4 en la que uno o más aminoácidos se han introducido, suprimido o sustituido. En el presente contexto, las variantes de una secuencia de aminoácidos se refieren a aquellos/as polipéptidos, enzimas o proteínas que tienen una actividad catalítica similar a la de las secuencias de aminoácidos que aquí se describen, a pesar de cualesquiera sustituciones, adiciones o supresiones de aminoácidos que se realicen en ellas. De manera preferible, la secuencia variante de aminoácidos tiene una identidad entre secuencias de por lo menos aproximadamente 80 %, o de 85 o 90 % o 95 % con la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4. También de manera preferible, un polipéptido que comprende la secuencia variante de aminoácidos tiene la actividad enzimática de las HPPD. Unos métodos para determinar la actividad enzimática de las HPPD son bien conocidos en la especialidad e incluyen unos ensayos que se describen extensamente en el documento WO 2009/144079 o en el documento WO 2002/046387.
Unas sustituciones comprenden unas alteraciones de aminoácidos en las que un aminoácido es reemplazado por un diferente residuo de aminoácido presente en la naturaleza o uno no convencional. Se pueden clasificar como "conservativas" aquellas sustituciones en las que un residuo de aminoácido contenido en una proteína de HPPD de este invento es reemplazado por otro aminoácido presente en la naturaleza que tiene un carácter similar, por ejemplo Gly<?Ala, Val<?lle«?Leu, Asp?Glu, Lys<?Arg, Asn<?Gln o Phe<?Trp«?Tyr. Pueden también ser "no conservativas" unas sustituciones comprendidas por el presente invento, en las que un residuo de aminoácido, que está presente en una proteína de HPPD de este invento, es sustituido por un aminoácido que tiene propiedades diferentes, tal como un aminoácido presente en la naturaleza procedente de un diferente grupo (por ejemplo por sustitución de un aminoácido cargado o hidrófobo por alanina). Las sustituciones de aminoácidos son típicamente de residuos singulares, pero pueden ser también de residuos múltiples, ya sea arracimados o dispersados. Las supresiones de aminoácidos serán usualmente del orden de aproximadamente 1-10 residuos de aminoácidos, mientras que las inserciones pueden ser de cualquier longitud. Las supresiones e inserciones se pueden hacer en el extremo terminal de N, en el extremo terminal de C, o pueden ser supresiones o inserciones internas. Generalmente, unas inserciones dentro de la secuencia de aminoácidos serán menores que unas fusiones en los terminales de amino o de carboxi y del orden de 1 a 4 residuos de aminoácidos. El concepto de "aminoácidos similares", tal como se usa aquí, se refiere a unos aminoácidos que tienen unas similares cadenas de aminoácidos, es decir unos aminoácidos que tienen cadenas laterales polares, no polares o prácticamente neutras. El concepto de "aminoácidos no similares", tal como se usa en el presente contexto, se refiere a unos aminoácidos que tienen diferentes cadenas laterales de aminoácidos, por ejemplo un aminoácido con una cadena lateral polar no es similar a un aminoácido con una cadena lateral no polar. Las cadenas laterales polares tienden usualmente a estar presentes sobre la superficie de una proteína cuando ellas pueden interactuar con el entorno acuoso hallado en células (aminoácidos "hidrófilos"). Por otra parte, los aminoácidos "no polares" tienden a residir dentro del centro de la proteína en donde ellos pueden interactuar con vecinos no polares similares (aminoácidos "hidrófobos"). Ejemplos de aminoácidos que tienen cadenas laterales polares son arginina, asparagina, aspartato, cisteína, glutamina, glutamato, histidina, lisina, serina y treonina (todos ellos hidrófilos, excepto la cisteína que es hidrófoba). Ejemplos de aminoácidos que tienen cadenas laterales no polares son alanina, glicina, isoleucina, leucina, metionina, fenilalanina, prolina y triptófano (todos ellos hidrófobos, excepto la glicina que es neutra).
También se abarcan por el presente invento unos anticuerpos que reconocen específicamente a una enzima HPPD de acuerdo con el invento.
El invento se refiere también al uso, en un método para transformar plantas, de un ácido nucleico que codifica una HPPD de acuerdo con el invento como un gen marcador o como una secuencia codificadora que hace posible conferir a la planta una tolerancia a herbicidas que son agentes inhibidores de las HPPD, y al uso de los agentes inhibidores de las HPPD en plantas que comprenden una secuencia de ácido nucleico que codifica una HPPD de acuerdo con el invento. En una forma de realización de este invento, en dicho uso, los agentes inhibidores de las HPPD son tricetonas o pirazolinatos, de manera preferible tembotriona, mesotriona o sulcotriona, biciclopirona y tefuriltriona. Desde luego, se entiende que esta secuencia se puede usar también en combinación con uno/una(s) otro/otra(s) marcador(es) de genes y/o secuencia(s) que codifica(n) una o más proteínas con propiedades agrícolas útiles.
En la producción comercial de plantas cultivadas, es deseable, dentro de una administración confiable de plaguicidas, eliminar plantas indeseadas (es decir "malezas") desde un campo de plantas cultivadas. Un tratamiento ideal sería uno que se podría aplicar a un campo completo, pero que eliminaría solamente las plantas indeseadas mientras que dejaría sin afectar a las plantas cultivadas. Uno de dichos sistemas de tratamiento podría implicar el uso de plantas cultivadas que son tolerantes a un herbicida de manera tal que cuando el herbicida es rociado sobre un campo de plantas cultivadas tolerantes a herbicidas, las plantas cultivadas continuarán prosperando mientras que unas malezas no tolerantes a herbicidas son aniquiladas o dañadas gravemente. Idealmente, dichos sistemas de tratamiento aprovecharán las ventajas de propiedades herbicidas variables de manera tal que una represión de malezas podría proporcionar la mejor combinación posible de flexibilidad y economía. Por ejemplo, unos herbicidas individuales tienen diferentes longevidades en el campo, y algunos herbicidas persisten y son eficaces durante un período de tiempo relativamente largo después de que ellos hayan sido aplicados a un campo, mientras que otros herbicidas son descompuestos rápidamente para dar otros compuestos distintos y/o no activos. Un sistema de tratamiento ideal podría permitir el uso de diferentes herbicidas de manera tal que los criadores podrían seleccionar a medida de los deseos la elección de herbicidas para una situación particular.
Mientras que un cierto número de plantas cultivadas tolerantes a herbicidas están actualmente disponibles comercialmente, un tema que ha surgido para muchos/as herbicidas comerciales y combinaciones de herbicidas y plantas cultivadas, consiste en que los herbicidas individuales tienen típicamente un espectro incompleto de actividades contra especies de malezas corrientes. Para la mayor parte de los herbicidas individuales que han estado usándose desde hace algún tiempo, unas poblaciones de especies de malezas y biotipos resistentes a herbicidas han resultado más prevalecientes (véanse por ejemplo, Tranel y Wright (2002) Weed Science 50: 700-712; Owen y Zelaya (2005) Pest Manag. Sci. 61 : 301-31 1). Se han descrito unas plantas transgénicas que son resistentes a más de un herbicida (véase por ejemplo, el documento W02005/012515). Sin embargo, se están demandando continuamente unas mejoras en cualquiera de los aspectos de la producción de plantas cultivadas, opciones de represión de malezas, prolongación de la represión de malezas residuales, y un mejoramiento en el rendimiento de plantas cultivadas.
La proteína o el gen de HPPD del invento se combina ventajosamente en plantas con otros genes que codifican proteínas o ARN's que confieren útiles propiedades agronómicas a dichas plantas. Entre los genes que codifican proteínas o ARN's que confieren útiles propiedades agronómicas a las plantas transformadas, se puede hacer mención de las secuencias de ADN que codifican unas proteínas que confieren tolerancia a uno o más herbicidas que, de acuerdo con su estructura química, difieren de los herbicidas inhibidores de las HPPD, y de otras que confieren tolerancia a ciertos insectos, de aquellas que confieren tolerancia a ciertas enfermedades, ADN's que codifican ARN's que proporcionan represión de nematodos o insectos.
Dichos genes se describen en particular en las solicitudes de patentes PCT publicadas WO 91/02071 y WO95/06128.
Entre las secuencias de ADN que codifican unas proteínas que confieren tolerancia a ciertos herbicidas en las células de plantas y las plantas transformadas, se puede hacer mención de un gen de bar o PAT o del gen de Streptomyces coelicolor que se ha descrito en el documento WO2009/152359, que confiere tolerancia a herbicidas de glufosinato, de un gen que codifica una apropiada EPSPS (acrónimo de Enol Pyruvyl Shikimate Phosphate Syntase, enolpiruvilshikimato fosfato sintasa) que confiere tolerancia a herbicidas que tienen una EPSPS como una diana, tales como glifosato y sus sales (documentos US 4.535.060, US 4.769.061 , US 5.094.945, US 4.940.835, US 5.188.642, US 4.971.908, US 5.145.783, US 5.310.667, US 5.312.910, US 5.627.061 , US 5.633.435), o un gen que codifica una glifosato oxidorreductasa (documento US 5.463.175).
Entre las secuencias de ADN que codifican una apropiada EPSPS que confiere tolerancia a los herbicidas que tienen una EPSPS como una diana, se hará mención más particularmente del gen que codifica una EPSPS de planta, en particular una EPSPS de maíz, particularmente una EPSPS de maíz que comprende dos mutaciones, particularmente una mutación en la posición de aminoácido 102 y una mutación en la posición de aminoácido 106 (documento WO 2004/074443), y que se describe en la solicitud de patente del documento US 6566587, que se denomina en lo sucesivo EPSPS de maíz doble muíante o 2mEPSPS, o del gen que codifica una EPSPS aislada a partir de Agrobacterium y que es descrito por las SEQ ID No. 2 y SEQ ID No. 3 del documento de patente US 5.633.435, que también se denomina CP4.
Entre las secuencias de ADN que codifican una apropiada EPSPS que confiere tolerancia a los herbicidas que tienen una EPSPS como una diana, se hará mención más particularmente del gen que codifica una EPSPS GRG23 procedente de Arthrobacter globiformis, pero también de las mutantes GRG23 ACE1 , GRG23 ACE2, o GRG23 ACE3, particularmente de las mutantes o variantes de GRG23 tal como se describen en el documento WO2008/100353, tales como la GRG23(ace3)R173K de la SEQ ID No. 29 en el documento WO2008/100353.
En el caso de las secuencias de ADN que codifican una EPSPS, y más particularmente que codifican los anteriores genes, la secuencia que codifica estas enzimas es precedida ventajosamente por una secuencia que codifica un péptido de tránsito, en particular el "péptido de tránsito optimizado" que se describe en el documento de patente US 5.510.471 o 5.633.448.
En el documento WO 2007/024782, se describen unas plantas que son tolerantes a glifosato y por lo menos a un agente inhibidor de ALS (acetolactato sintasa). Más específicamente, se describen unas plantas que contienen genes que codifican un polipéptido GAT (Glifosato - N-Acetil Transferasa) y un polipéptido que confiere resistencia a agentes inhibidores de ALS.
En el documento de patente US 6.855.533, se describieron plantas transgénicas de tabaco que contenían genes de ALS/AHAS mutados de Arabidopsis.
En el documento de patente US 6.153.401 , se describen unas plantas que contienen genes que codifican 2,4-D monooxigenasas que confieren tolerancia al 2,4-D (ácido 2,4-diclorofenoxiacético) por metabolización.
En los documentos US 2008/01 19361 y US 2008/0120739, se describen unas plantas que contienen genes que codifican dicamba monooxigenasas que confieren tolerancia a dicamba (ácido 3,6-dicloro-2-metoxibenzoico) por metabolización.
Todos los rasgos de tolerancia a herbicidas, que antes se mencionan, pueden ser combinados con los que desarrollan una tolerancia a las HPPD que son materia objetivo de este invento.
Entre las secuencias de ADN que codifican unas proteínas que conciernen a propiedades de tolerancia a insectos, se hará mención más particularmente a las proteínas Bt ampliamente descritas en la bibliografía y bien conocidas para los expertos en la especialidad. Se hará mención también a unas proteínas extraídas a partir de bacterias tales como Photorhabdus (documentos WO 97/17432 & WO 98/08932).
Entre dichas secuencias de ADN que codifican proteínas de interés que confieren nuevas propiedades de tolerancia a insectos, se hará mención más particularmente a las proteínas Bt Cry o VIP, ampliamente descritas en la bibliografía y bien conocidas por los expertos en la especialidad. Éstas incluyen la proteína CryI F o híbridos derivados de una proteína CryI F (por ejemplo, las proteínas híbridas Cry1A-Cry1 F que se describen en los documentos US 6.326.169; US 6.281.016; US 6.218.188, o fragmentos tóxicos de las mismas), las proteínas del tipo CryIA o fragmentos tóxicos de las mismas, de manera preferible la proteína CryIAc o híbridos derivados de la proteína CryIAc (por ejemplo, la proteína híbrida Cry1Ab-Cry1Ac que se describe en el documento US 5.880.275) o la proteína CryIAb o Bt2 o fragmentos insecticidas de la misma tal como se describen en el documento EP451878, las proteínas Cry2Ae, Cry2Af o Cry2Ag tal como se describen en el documento WO02/057664 o fragmentos tóxicos de la misma, la proteína Cry1A.105 que se describe en el documento WO 2007/140256 (SEQ ID No. 7) o un fragmento tóxico de la misma, la proteína VIP3Aa19 con el número de acceso al NCBI ABG20428, la proteína VIP3Aa20 con el número de acceso al NCBI ABG20429 (SEQ ID No. 2 en el documento WO 2007/142840), las proteínas VIP3A producidas en los sucesos en algodón COT202 o COT203 (documentos WO 2005/054479 y WO 2005/054480, respectivamente), las proteínas Cry que se describen en el documento WO01/47952, la proteína VIP3Aa o un fragmento tóxico de la misma, tal como se describen en la cita de Estruch y colaboradores (1996), Proc Nati Acad Sci USA. 28;93(1 1):5389-94 y en el documento US 6.291.156, las proteínas insecticidas procedentes de Xenorhabdus (como se describen en el documento WO98/50427), de Serratia (particularmente procedentes de S. entomophila) o de cepas de especies de Photorhabdus, tales como las proteínas Te procedentes de Photorhabdus tal como se describen en el documento WO98/08932 (por ejemplo, en las citas de Waterfieid y colaboradores, 2001 , Appl Environ Microbiol. 67(11):5017-24; y de Ffrench-Constant y Bowen, 2000, Cell Mol Life Sci.; 57(5):828-33). También se incluyen en el presente contexto cualesquiera variantes o mutantes de cualquiera de estas proteínas que difieren en algunos (1-10, de manera preferible 1-5) aminoácidos con respecto de cualquiera de las anteriores secuencias, particularmente la secuencia de su fragmento tóxico, o que están fusionadas con un péptido de tránsito, tal como un péptido de tránsito de plastidio, u otra/o proteína o péptido.
El presente invento se refiere también a un gen quimérico (o cásete de expresión) que comprende una secuencia codificadora así como los elementos reguladores heterólogos en las posiciones 5' y/o 3', por lo menos en la posición 5', que son capaces de funcionar dentro de un organismo anfitrión, en particular de células de plantas o plantas, con la secuencia de codificación que contiene por lo menos una secuencia de ácido nucleico que codifica una HPPD como antes se ha definido.
En una forma de realización particular, el presente invento se refiere a un gen quimérico como antes se ha descrito, en el que el organismo anfitrión se selecciona entre bacterias, levaduras, Pichia, hongos, baculovirus, células in vitro, protoplastos, células de plantas, plantas, partes de plantas, y semillas de estas plantas.
En otra forma de realización particular, el presente invento se refiere a un gen quimérico tal como se ha descrito con anterioridad, en que el gen quimérico contiene, en la posición 5' de la secuencia de ácido nucleico que codifica una HPPD de acuerdo con el invento, una secuencia de ácido nucleico que codifica un péptido de tránsito de planta, estando dispuesta esta secuencia entre la región de promotor y la secuencia que codifica la HPPD de acuerdo con el invento, de manera tal que se permite la expresión de una proteína de fusión de un péptido de tránsito y una HPPD.
En otra adicional forma de realización particular, el presente invento se refiere al uso de herbicidas inhibidores de las HPPD en plantas, partes de plantas, o semillas de plantas que comprenden un gen tolerante a las HPPD de acuerdo con el invento, o al uso de herbicidas inhibidores de las HPPD en una tierra en la que dichas plantas, partes de plantas o semillas han de crecer o se han de sembrar, ya sea a solas o en combinación con uno o más otros herbicidas conocidos que actúan en una materia diferente a la de los inhibidores de las HPPD. En una forma de realización más particular, el herbicida inhibidor de las HPPD, que se emplea, es seleccionado entre el conjunto que se compone de una tricetona (que se denomina agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona), tal como tembotriona, sulcotriona, mesotriona, biciclopirona, tefuriltriona, particularmente tembotriona, de la clase de una dicetona tal como dicetonitrilo, de la clase de un isoxazol tal como isoxaflutol, o de la clase de un pirazolinato (que se denomina agente inhibidor de las HPPD del tipo de un pirazolinato), tal como pirasulfotol, pirazolato, topramezona, benzofenap; incluso más específicamente, el presente invento se refiere a la aplicación de tembotriona, mesotriona, dicetonitrilo, biciclopirona, tefuriltriona, benzofenap, pirasulfotol, pirazolato y sulcotriona a dichas plantas, partes de plantas o semillas de plantas que son tolerantes a agentes inhibidores de las HPPD.
Como una secuencia reguladora que funciona como un promotor en células de plantas y en plantas, se puede hacer uso de cualquier secuencia de promotor de un gen que sea expresado de modo natural en plantas, en particular de un promotor que sea expresado especialmente en las hojas de plantas, tal como por ejemplo de promotores "constitutivos" de origen bacteriano, vírico o de planta, o de promotores "dependientes de la luz", tales como el de un gen de la subunidad pequeña de ribulosa biscarboxilasa/oxigenasa de plantas (RuBisCO) o de cualquier apropiado gen conocido expresable por promotores, que se pueda usar. Entre los promotores de origen vegetal, se hará mención a los promotores de histona como se describen en el documento EP 0 507 698 A1 , al promotor de actina de arroz (documento US 5.641.876), o a un promotor de ubiquitina de planta (documento US 5.510.474). Entre los promotores de un gen de virus de planta, se hará mención a los del virus del mosaico de la coliflor (CaMV 19S o 35S, Sanders y colaboradores (1987), Nucleic Acids Res. 15(4): 1543-58.), los del circovirus (documento de patente australiana AU 689 311) o los del virus de mosaico de vena de Cassava (CsVMV, US 7.053.205).
En una forma de realización de este invento, se puede usar una secuencia de promotor específica para particulares regiones o tejidos de plantas con el fin de expresar las proteínas de HPPD del invento, tales como promotores específicos para semillas (Datla, R. y colaboradores, 1997, Biotechnology Ann. Rev. 3, 269-296), especialmente el promotor de napina (documento EP 255 378 A1), el promotor de faseolina, el promotor de glutenina, el promotor de heliantinina (documento WO 92/17580), el promotor de albúmina (documento WO 98/45460), el promotor de oleosina (documento WO 98/45461), el promotor de SAT1 o el promotor de SAT3 (documento PCT/US98/06978).
Se puede hacer uso también de un promotor inducible escogido ventajosamente entre los promotores de fenilalanina amoníaco liasa (PAL), de la HMG-CoA reductasa (HMG), de quitinasa, de glucanasa, del inhibidor de proteinasa (Pl), del gen de la familia de PR1 , de nopalina sintasa (nos) y de vspB (documento US 5 670 349, Tabla 3), el promotor de HMG2 (documento US 5 670 349), el promotor de beta-galactosidasa de manzana (ABG1) y el promotor de aminociclopropano carboxilato sintasa de manzana (ACC sintasa) (documento WO 98/45445).
De acuerdo con el invento, se puede hacer uso también, en combinación con el promotor, de otras secuencias reguladoras, que están situadas entre el promotor y la secuencia codificadora, tales como unos activadores de la transcripción ("intensificadores" en inglés "enhancers"), por ejemplo el activador de la traducción del virus del mosaico del tabaco (TMV), que se ha descrito en el documento de solicitud WO 87/07644, o del virus de la corrosión del tabaco (TEV) que se ha descrito por Carrington & Freed 1990, J. Virol. 64: 1590-1597, por ejemplo, o intrones tales como el intrón adhl de maíz o el intrón 1 de actina de arroz.
En otra forma de realización particular adicional, el gen del invento está presente en plantas en múltiples, de manera preferible dos copias, estando cada una de éstas controlada por un diferente promotor expresable en plantas. i En otra forma de realización particular adicional, el gen quimérico del invento puede ser combinado con cualquier otro gen quimérico adicional para una proteína de HPPD, de manera preferible estos diferentes genes son controlados por diferentes elementos reguladores que son activos en plantas.
En otra forma de realización particular adicional, el gen quimérico del invento puede ser combinado con un gen de monooxigenasa de Maíz CYP450 que esté bajo el control de un promotor expresable en plantas, idéntico o diferente.
Como una secuencia terminadora de regulación o de poliadenilación, se puede hacer uso de cualquier correspondiente secuencia de origen: bacteriano, tal como por ejemplo la del terminador nos de Agrobacterium tumefaciens, de origen vírico, tal como por ejemplo la del terminador de CaMV 35S, o de origen vegetal, tal como por ejemplo la de un terminador de histona tal como se describe en la solicitud de patente europea publicada EP 0 633 317 A1.
El término "gen" tal como se usa en el presente contexto, se refiere a una región que codifica un ADN, flanqueada por secuencias reguladoras en 5' y/o 3', que permiten que sea transcrito un ARN que puede ser traducido en una proteína, que comprende típicamente por lo menos una región de promotor. Un "gen quimérico", cuando se refiere a un ADN que codifica una HPPD de este invento, se refiere a una secuencia de un ADN que codifica una HPPD que tiene unas secuencias reguladoras en 5' y/o 3' diferentes de las secuencias reguladoras en 5' y/o 3' bacterianas presentes en la naturaleza que impulsan y dirigen la expresión de la proteína de HPPD en su célula anfitriona natural (que también se citan como "promotor heterólogo" o "secuencias reguladoras heterólogas").
Los términos "ADN/proteína que comprende la secuencia X" y "ADN/proteína con la secuencia que comprende la secuencia X", tal como se usan en el presente contexto, se refieren a un ADN o a una proteína que incluye o que contiene por lo menos la secuencia X en su secuencia de nucleótidos o de aminoácidos, de manera tal que otras secuencias de nucleótidos o de aminoácidos pueden ser incluidas junto al extremo 5' (o terminal de N) y/o 3' (o terminal de C), p.ej., un péptido de tránsito o de señal terminal de N. El término "que comprende", tal como se usa en el presente contexto, es una modalidad de lenguaje de extremo abierto en el significado de "incluir", lo que significa que otros elementos distintos de los citados específicamente pueden también estar presentes. El término "que consiste en", tal como se usa en el presente contexto, es una modalidad de lenguaje de extremo cerrado, es decir que solamente están presentes los elementos que se citan específicamente. El término "ADN que codifica una proteína que comprende la secuencia X", tal como se usa en el presente contexto, se refiere a un ADN que comprende una secuencia codificadora, que después de una transcripción y de una traducción, da como resultado una proteína que contiene por lo menos una secuencia de aminoácidos X. Un ADN que codifica una proteína no necesita ser un ADN presente en la naturaleza, y puede ser un ADN semisintético, plenamente sintético o artificial y puede incluir intrones y regiones flanqueadoras en 5' y/o 3'. El término "secuencia de nucleótidos", tal como se usa aquí, se refiere a la secuencia de una molécula de ADN o ARN, que puede estar en una forma de una sola hebra (monocatenaria) o de doble hebra (bicatenaria).
Las proteínas de HPPD de acuerdo con el invento pueden ser equipadas con un péptido de señal de acuerdo con procesos bien conocidos en la especialidad, véase, p. ej., la solicitud de patente PCT publicada WO 96/10083, o pueden ser reemplazadas por otro péptido, tales como un péptido de tránsito de cloroplastos (por ejemplo, Van Den Broeck y colaboradores, 1985, Nature 313, 358, o un péptido de tránsito de cloroplastos modificado del documento de patente US 5.510.471) que causa un transporte de la proteína a los cloroplastos, por un péptido de señal secretorio o por un péptido que dirige a la proteína a la diana de otros plastidios, mitocondrios, los ER, u otros orgánulos, o puede ser reemplazado por un aminoácido metionina o por un dipéptido de metionina-alanina. Unas secuencias de señal para la dirección hacia orgánulos intracelulares o para la secreción fuera de la célula de planta o hacia la pared de la célula, se hallan en proteínas dirigidas a dianas o segregadas de modo natural, de manera preferible las descritas por Klósgen y colaboradores (1989, Mol. Gen. Genet. 217, 155-161), Klósgen y Weil (1991 , Mol. Gen. Genet. 225, 297-304), Neuhaus & Rogers (1998, Plant Mol. Biol. 38, 127-144), Bih y colaboradores (1999, J. Biol. Chem. 274, 22884-22894), Morris y colaboradores (1999, Bioc em. Biophys. Res. Commun. 255, 328-333), Hesse y colaboradores (1989, EMBO J. 8 2453-2461), Tavladoraki y colaboradores (1998, FEBS Lett. 426, 62-66), Terashima y colaboradores (1999, Appl. Microbiol. Biotechnol. 52, 516-523), Park y colaboradores (1997, J. Biol. Chem. 272, 6876-6881), Shcherban y colaboradores (1995, Proc. Nati. Acad. Sci USA 92, 9245-9249), todas cuyas citas son incorporadas en el presente contexto por su referencia, particularmente las secuencias de péptidos de señal procedentes de proteínas dirigidas a dianas o segregadas de maíz, algodón, soja o arroz. Una secuencia de ADN que codifica dicho péptido de señal de planta puede ser introducida en el gen quimérico que codifica la proteína de HPPD para la expresión en plantas.
A menos que se señale otra cosa distinta en los ejemplos, todos los procesos para producir y manipular un ADN recombinante se llevan a cabo por los procedimientos clásicos descritos en Sambrook y colaboradores, Molecular Cloning - A Laboratory Manual, Segunda edición, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY (1989), y en los volúmenes 1 y 2 de Ausubel y colaboradores (1994) Current Protocols en Molecular Biology [Protocolos actuales en biología molecular], Current Protocols, USA. Materiales y métodos clásicos para el trabajo en biología molecular se describen en Plant Molecular Biology Labfax (1993) por R.R.D. Croy, publicado conjuntamente por BIOS Scientific Publications Ltd (UK) y Blackwell Scientific Publications (UK). Procesos para la tecnología de PCR (acrónimo de Polymerase Chain Reaction = reacción en cadena de la polimerasa) se pueden hallar en "PCR protocols: a guide to methods and aplications" [Protocolos de PCR: una guía para métodos y aplicaciones], compilado por M.A. Innis, D.H. Gelfand, J.J. Sninsky y T.J. White (Academic Press, Inc., 1990).
Los términos "tolerancia", "tolerante" o "menos sensible" se usan intercambiablemente y significan los niveles relativos de tolerancia inherente de la HPPD escrutados de acuerdo con un fenotipo indicador visible de la cepa o de la planta transformada con un ácido nucleico que comprende el gen que codifica la respectiva proteína de HPPD en la presencia de diferentes concentraciones de los diversos agentes inhibidores de las HPPD. Unas respuestas a dosis y unos desplazamientos relativos en las respuestas a dosis asociadas con estos fenotipos indicadores (formación de color pardo, inhibición del crecimiento, blanqueo, efecto herbicida, etc) se expresan convenientemente en términos, por ejemplo, de valores de la GR50 (concentración para una reducción de 50 % del crecimiento) o de la MIC (concentración inhibidora mínima) en que unos aumentos en los valores corresponden a unos aumentos en la tolerancia inherente de la HPPD expresada, de la manera normal basada en un daño causado a plantas, síntomas de blanqueo meristemático, etc., en una gama de diferentes concentraciones de herbicidas. Estos datos pueden ser expresados en términos de, por ejemplo, valores de la GR50 derivados de las curvas de dosis/respuesta que tienen "una dosis" representada gráficamente en el eje de las x y "un porcentaje de destrucción", "un efecto herbicida", "números de plantas verdes que brotan", etc., representados gráficamente en el eje de las y, en que unos valores de GR50 aumentados corresponden a unos niveles aumentados de tolerancia inherente de la HPPD expresada. Los herbicidas pueden ser aplicados de manera apropiada antes del brote o después del brote.
De manera similar, el nivel de tolerancia del ácido nucleico o del gen que codifica una proteína de HPPD de acuerdo con el invento o la proteína de HPPD del invento, es escrutado mediante una transgénesis, una regeneración, una crianza y un ensayo por rociada de una planta de ensayo tal como una de tabaco, o una planta cultivada tal como una de soja o algodón, y de acuerdo con estos resultados, dichas plantas son por lo menos 2-4x (veces) más tolerantes a agentes inhibidores de la HPPD, tales como tembotriona, mesotriona, dicetonitrilo y/o biciclopirona, que unas plantas que no contienen ningún gen exógeno que codifique una proteína de HPPD, o que unas plantas que contienen un gen que codifica un ADN de HPPD de Arabidopsis thaliana, bajo el control del mismo promotor que el del ADN de HPPD del invento.
Se entiende que un "organismo anfitrión" o "anfitrión" es cualquier organismo heterólogo unicelular o multicelular dentro del que se puede introducir el ácido nucleico o el gen quimérico de acuerdo con el invento con la finalidad de producir una HPPD de acuerdo con el invento. Estos organismos son, en particular, bacterias, por ejemplo de E. coli, levaduras, en particular de los géneros Saccharomyces o Kluyveromyces, Pichia, hongos, en particular Aspergillus, un baculovirus o, de manera preferible, células de plantas y plantas.
Se entiende que una "célula de planta", de acuerdo con el invento, es cualquier célula que se deriva de, o se halla en, una planta, y que es capaz de formar, o es una parte de, tejidos no diferenciados, tales como callos, tejidos diferenciados tales como embriones, partes de plantas, plantas o semillas. Esto incluye protoplastos y polen, células de plantas cultivadas o protoplastos que han crecido in vitro, y células de plantas que se pueden regenerar para dar una planta completa.
Se entiende que una "planta", de acuerdo con el invento, es cualquier organismo multicelular diferenciado que es capaz de una fotosíntesis, en particular un organismo monocotiledóneo o dicotiledóneo, más especialmente plantas cultivadas que están destinadas o no están destinadas a la nutrición de animales o seres humanos, tales como maíz o maíz en grano, trigo, plantas de Brassica spp. tales como las de Brassica napus o Brassica júncea, especies de soja, arroz, caña de azúcar, raíz de remolacha, tabaco, algodón, plantas de hortalizas tales como las de pepino, puerro, zanahoria, tomate, lechuga, pimientos, melón, sandía, etc. El término "plantas transgénicas", tal como se usa en el presente contexto, se refiere a unas plantas que comprenden un gen ajeno o heterólogo introducido establemente en su genoma.
En una forma de realización, el invento se refiere a la transformación de plantas. Cualquier secuencia de promotor de un gen que es expresado de modo natural en plantas, o cualquier híbrido o combinación de elementos promotores de genes expresados de modo natural en plantas, incluyendo promotores de Agrobacterium o de virus de plantas, o cualquier promotor que sea apropiado para controlar la transcripción de un gen de tolerancia a herbicidas en plantas, se puede usar como la secuencia de promotor en las plantas del invento (denominado "promotor expresable en plantas" en el presente contexto). Ejemplos de dichos promotores expresables en plantas se han descrito anteriormente. En una forma de realización de este invento, dichos promotores expresables en plantas están engarzados operativamente a una secuencia codificadora que codifica una proteína de HPPD del invento para formar un gen quimérico de HPPD de este invento.
De acuerdo con el invento, es también posible usar, en combinación con la secuencia reguladora de promotor, otras secuencias reguladoras que están situadas entre el promotor y la secuencia codificadora, tales como secuencias de intrones, o activadores de la transcripción (intensificadores). Ejemplos de dichas apropiadas secuencias reguladoras se han descrito anteriormente.
Cualquier correspondiente secuencia de origen bacteriano o vírico, tal como el terminador nos procedente de Agrobacterium tumefaciens, o de origen vegetal, tal como un terminador de histona tal como se describe en el documento de solicitud EP 0 633 317 A1 , se puede usar como secuencia reguladora de terminación de la transcripción (y de la poliadenilación).
En una forma de realización particular del invento, una secuencia de ácido nucleico que codifica un péptido de tránsito se emplea en 5' (corriente arriba) de la secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD exógena de acuerdo con el invento, estando dispuesta esta secuencia de péptido de tránsito entre la región de promotor y la secuencia que codifica la HPPD exógena, de manera tal que se permite la expresión de una proteína de fusión de un péptido de tránsito y de la HPPD, tal como la proteína de las SEQ ID No. 6 o SEQ ID No. 7. El péptido de tránsito hace posible dirigir a las HPPD dentro de los plastidios, más especialmente de los cloroplastos, siendo disociada la proteína de fusión entre el péptido de tránsito y la proteína de HPPD del invento cuando esta última entra en el plastidio. El péptido de tránsito puede ser un único péptido, tal como un péptido de tránsito de EPSPS (que se describe en el documento de patente US 5.188.642) o un péptido de tránsito de la subunidad pequeña de ribulosa biscarboxilasa/oxigenasa de plantas (RuBisCO ssu) que, cuando sea apropiado, incluye unos pocos aminoácidos de la parte terminal de N de la RuBisCO ssu madura (documento EP 189 707 A1), o bien puede ser una fusión de varios péptidos de tránsito tales como un péptido de tránsito que comprende un primer péptido de tránsito de una planta que está fusionado con una parte de la secuencia terminal de N de una proteína madura que tiene una localización en plastidio, siendo esta parte a su vez fusionada con un segundo péptido de tránsito de una planta, tal como se describe en el documento de patente EP 508 909 A1, y, más especialmente, el péptido de tránsito optimizado que comprende un péptido de tránsito de la RuBisCO ssu de girasol fusionado con 22 aminoácidos del extremo terminal de N de la RuBisCO ssu de maíz, a su vez fusionado con el péptido de tránsito de la RuBisCO ssu de maíz, tal como se describe, con su secuencia codificadora, en el documento de patente EP 508 909 A1. El presente invento se refiere también a la proteína de fusión de un péptido de tránsito y una HPPD y a un ácido nucleico o un gen quimérico expresable en plantas que codifica dicha proteína de fusión, en que los dos elementos de esta proteína de fusión son tal como se han descrito anteriormente.
El presente invento se refiere también a un vector de clonación, de transformación y/o de expresión, cuyo vector contiene por lo menos un gen quimérico tal como se ha definido anteriormente. Además del anterior gen quimérico, este vector puede contener un origen de replicación. Este vector puede ser un plásmido o una porción de un plásmido, un cósmido, o un bacteriófago o un virus que ha sido transformado por introducción del gen quimérico de acuerdo con el invento. Unos vectores de transformación son bien conocidos para la persona experta y han sido ampliamente descritos en la bibliografía. El vector de transformación que se puede usar, en particular, para transformar células de plantas o plantas puede ser un virus, que se puede emplear para transformar células de plantas o plantas y que adicionalmente contiene sus propios elementos de replicación y expresión. De acuerdo con el invento, el vector para transformar células de plantas o plantas es de manera preferible un plásmido tal como un plásmido Ti desarmado de Agrobacterium.
El presente invento se refiere también a los organismos anfitriones, en particular a las células de plantas, semillas o plantas que comprenden un gen quimérico, el cual comprende a su vez una secuencia que codifica una proteína de HPPD del invento, tal como una proteína que codifica la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID Nos 4, 5, 6 ó 7, tal como se ha definido anteriormente, y al uso de las plantas o semillas del invento en un campo para hacer crecer una planta cultivada y cosechar un producto de planta, por ejemplo especies de soja, granos de arroz, trigo, cebada o maíz o cápsulas de algodón, en que, en una forma de realización, dicho uso implica la aplicación de un herbicida inhibidor de las HPPD a dichas plantas para reprimir malezas. En una forma de realización de este invento, en dicho uso los agentes inhibidores de las HPPD son tricetonas o pirazolinatos, de manera preferible tembotriona, mesotriona, topramezona o sulcotriona, biciclopirona, pirasulfotol, pirazolato, benzofenap y tefuriltriona, particularmente tembotriona.
Por lo tanto, el presente invento se refiere a un organismo anfitrión, en particular a una célula de planta, una semilla o una planta, que está caracterizado/a porque contiene por lo menos un gen quimérico de la HPPD tal como antes se ha descrito, o por lo menos una secuencia de ácido nucleico de HPPD tal como antes se ha descrito.
En una forma particular de realización, el presente invento se refiere a una célula de planta o a una planta, que está caracterizada porque ella contiene por lo menos una secuencia de ácido nucleico que codifica una proteína de HPPD de este invento, que retiene sus propiedades de catalizar la conversión de un para-hidroxifenilpiruvato en un homogentisato y que hace a la planta más tolerante que las plantas de la misma especie que no comprenden dicha proteína de HPPD del presente invento, particularmente a tricetonas, o a pirazolinatos, de manera preferible a tembotriona, mesotriona, topramezona o sulcotriona, biciclopirona, pirasulfotol, pirazolato, benzofenap y tefuriltriona, particularmente a tembotriona, y tales plantas que contienen la HPPD del invento tienen una tolerancia agronómicamente aceptable a un herbicida inhibidor de las HPPD, particularmente a tricetonas, o a pirazolinatos, de manera preferible a tembotriona, mesotriona, topramezona o sulcotriona, biciclopirona, pirasulfotol, pirazolato, benzofenap y tefuriltriona, particularmente a tembotriona.
En otra forma particular de realización, el presente invento se refiere a una célula de planta o a una planta, que está caracterizada porque ella contiene por lo menos una secuencia de ácido nucleico que codifica una HPPD de este invento, que retiene sus propiedades de catalizar la conversión de un para-hidroxifenilpiruvato en un homogentisato y que es menos sensible a un agente inhibidor de las HPPD que la HPPD endógena de la planta anfitriona, tal como la HPPD procedente de Arabi opsis thaliana, particularmente la HPPD que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 11 (desde la posición de aminoácido 126 hasta la posición de aminoácido 568), o que comprende la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID No.1 1 o SEQ ID No. 12 (desde la posición de aminoácido 134 hasta la posición de aminoácido 575).
En una forma de realización particular, el presente invento se refiere a una célula o semilla de planta anfitriona, o a una planta anfitriona, que está caracterizada porque ella contiene por lo menos una secuencia de ácido nucleico que codifica una HPPD del invento tal como se ha definido en el presente contexto, en que la HPPD del invento es menos sensible que la HPPD endógena de la planta anfitriona a un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de los/las isoxazoles, dicetonitrilos, tricetonas o pirazolinatos, más especialmente tomado de isoxaflutol, tembotriona, mesotriona, sulcotriona, pirasulfotol, biciclopirona, tefuriltriona, topramezona, 2-ciano- 3-ciclopropil-1-(2-S02CH3-4-CF3fenil)propano-1 ,3-diona y 2-ciano-3-ciclopropil-1-(2-S02CI-l3-4-2,3 CI2 fenil)-propano-1 ,3-diona, incluso más particularmente de tembotriona, mesotriona, dicetonitrilo, biciclopirona, topramezona, pirazolato, benzofenap, sulcotriona, tefuriltriona, y pirasulfotol, de manera sumamente particular de tembotriona, mesotriona y biciclopirona.
En otra forma de realización particular, el presente invento se refiere a una célula de planta o a una planta, caracterizada porque ella contiene por lo menos una secuencia de ácido nucleico que codifica una HPPD del invento tal como se ha descrito con anterioridad, y además un gen quimérico que comprende un promotor expresable en plantas tal como se ha descrito más arriba, engarzado operativamente a una secuencia de ácido nucleico que codifica una enzima PDH (prefenato deshidrogenasa) (documento US 2005/ 0257283).
El presente invento se refiere también a las plantas que contienen células transformadas, en particular a las plantas que son regeneradas a partir de las células transformadas, y a plantas de progenie o semillas de las mismas, que comprenden el gen quimérico de HPPD del invento. La regeneración se puede obtener por cualquier método apropiado, siendo el método dependiente de la naturaleza de la especie, tal como se ha descrito, por ejemplo, en las referencias anteriores. Se pueden citar las siguientes patentes y solicitudes de patentes, en particular, con respecto a los métodos para transformar células de plantas y regenerar plantas: documentos US 4.459.355, US 4.536.475, US 5.464.763, US 5.177.010, US 5.187.073, EP 267.159 A1 , EP 604 662 A1, EP 672 752 A1 , US 4.945.050, US 5.036.006, US 5.100.792, US 5.371.014, US 5.478.744, US 5.179.022, US 5.565.346, US 5.484.956, US 5.508.468, US 5.538.877, US 5.554.798, US 5.489.520, US 5.510.318, US 5.204.253, US 5.405.765, EP 442 174 A1 , EP 486 233 A1 , EP 486 234 A1 , EP 539 563 A1, EP 674 725 A1, WO 91/02071 y WO 95/06128.
El presente invento se refiere también a las plantas transgénicas o a partes de las mismas, que se derivan cultivando y/o cruzando las anteriores plantas transgénicas, y a las semillas de las plantas transgénicas, que comprenden el gen quimérico de HPPD del invento.
El presente invento se refiere también a los productos finales tales como la harina o el aceite, que se obtienen a partir de las plantas, de las partes de las mismas o de las semillas del invento.
Las plantas transformadas que se pueden obtener de acuerdo con el invento pueden ser del tipo monocotiledóneo, tales como las de trigo, cebada, caña de azúcar, arroz, cebolla, y maíz o grano de maíz, o del tipo dicotiledóneo, tales como las de tabaco, especies de soja, alfalfa, Brassica spp., plantas tales como las de colza de semilla oleaginosa, algodón, remolacha azucarera, trébol, hortalizas, etc.
El invento se refiere a un método para transformar organismos anfitriones, en particular células de plantas o plantas, por integración en dichos organismos de por lo menos una secuencia de ácido nucleico o de un gen quimérico tal como antes se ha definido, en el que es posible obtener la transformación por cualesquiera medios conocidos apropiados, cuyos medios se describen ampliamente en la bibliografía especialista y, en particular, en las referencias citadas en la presente solicitud, por ejemplo por uso del vector de acuerdo con el invento.
Un método de transformación de acuerdo con este invento comprende bombardear células, protoplastos o tejidos con partículas sólidas o líquidas a las cuales se ha añadido un ADN, o que contienen un ADN. Otro método de transformación comprende usar, como el medio para transferir a la planta, un gen quimérico que es introducido en un plásmido Ti de Agrobacterium tumefaciens o un plásmido Ri de Agrobacterium rhizogenes. Se pueden usar otros métodos tales como una microoinyección o electroporación, o dirigir de otro modo la transferencia del gen usando PEG. La persona experta puede seleccionar cualquier método apropiado para transformar el organismo anfitrión que se ha de elegir, en particular la célula de planta o la planta, tal como por ejemplo, la tecnología para la transformación de soja ha sido descrita extensamente en los ejemplos 1 hasta 3 divulgados en el documento EP 1 186666 A1 , incorporado en el presente contexto por su referencia. Para el arroz, se podrían realizar una transformación mediada por Agrobacterium (Hiei y colaboradores, 1994 Plant J 6:271-282, y Hiei y colaboradores, 1997 Plant Mol Biol. 35:205-21 , incorporadas en el presente contexto por su referencia), una electroporación (documentos US 5.641.664 y US 5.679.558, incorporados en el presente contexto por su referencia), o un bombardeo (Christou y colaboradores, 1991 , Biotechnology 9:957 incorporada en el presente contexto por su referencia). Una apropiada tecnología para la transformación de plantas monocotiledóneas, y particularmente de arroz, se describe en el documento WO 92/09696, incorporado en el presente contexto por su referencia. Para el algodón, se han descrito una transformación mediada por Agrobacterium (Gould J.H. y Magallanes-Cedeno M., 1998 -Plant Molecular Biology repórter, 16:1-10 y Zapata C, 1999, Theoretical Applied Genetics, 98(2): 1432-2242 incorporadas en el presente contexto por su referencia), una transformación mediada por polibreno y/o por un tratamiento (Sawahel W.A., 2001 , - Plant Molecular Biology repórter, 19:377a-377f, incorporada en el presente contexto por su referencia).
En una forma de realización particular del invento, la HPPD del invento es dirigida hacia una diana dentro del cloroplasto. Esto se puede hacer fusionando una secuencia de ácido nucleico que codifica un péptido de tránsito con la secuencia de ácido nucleico que codifica la proteína de HPPD del invento para obtener un ácido nucleico que codifica una proteína de fusión tal como antes se ha descrito.
Alternativamente, la HPPD del invento se puede expresar directamente en los plastidios tales como los cloroplastos, usando una transformación del plastidio, tal como el genoma de cloroplastos. Un método apropiado comprende el bombardeo de células o un tejido de plantas con partículas sólidas revestidas con el ADN o con partículas líquidas que comprenden el ADN, y la integración del gen introducido que codifica la proteína del invento por recombinación homologa. Unos apropiados vectores y sistemas de selección son conocidos para la persona experta en la especialidad. Un ejemplo de medios y métodos que se pueden usar para dicha integración en el genoma de cloroplastos de plantas de tabaco se da en el documento WO 06/108830, cuyo contenido es incorporado en la presente por su referencia.
El presente invento se refiere también a un método para obtener una planta tolerante a un agente inhibidor de las HPPD, que está caracterizado porque la planta es transformada con un gen quimérico de HPPD del invento, tal como se ha descrito con anterioridad.
Por lo tanto, el presente invento se refiere también a un método para obtener una planta tolerante a un agente inhibidor de las HPPD, caracterizado porque la planta contiene un gen quimérico de HPPD del invento que comprende una secuencia codificadora así como un elemento regulador heterólogo en la posición 5' y opcionalmente en la posición 3', que son capaces de funcionar en un organismo anfitrión, que está caracterizado porque la secuencia codificadora comprende por lo menos una secuencia de ácido nucleico que define un gen que codifica una HPPD del invento, tal como se ha descrito con anterioridad.
En una forma de realización de este invento, el agente inhibidor de las HPPD en el anterior método es un herbicida del tipo de una tricetona o un pirazolinato, de manera preferible tembotriona, mesotriona, biciclopirona, tefuriltriona, pirasulfotol, pirazolato, dicetonitrilo, benzofenap o sulcotriona, particularmente tembotriona.
De acuerdo con este invento, se proporciona también un método para obtener una planta tolerante a un agente inhibidor de las HPPD tal como se ha descrito más arriba, que está caracterizado porque se obtiene una planta que comprende un primer transgén, que es un gen quimérico de HPPD del invento, y un segundo transgén, que es un gen quimérico que comprende un promotor expresable en plantas, engarzado operativamente a un ácido nucleico que codifica una enzima PDH (prefenato deshidrogenasa). Una planta que comprende dichos dos transgenes se puede obtener transformando una planta con un transgén, y luego volviendo a transformar esta planta transgénica con el segundo transgén, o transformando una planta con los dos transgenes simultáneamente (en el mismo ADN o vector o en 2 diferentes ADN's o vectores de transformación), o cruzando una planta que comprende el primer transgén con una planta que comprende el segundo transgén, tal como es bien conocido en la especialidad.
El invento se refiere también a un método para eliminar selectivamente malezas o impedir la germinación de malezas en un campo en el que se han de plantar plantas o en el que se han de sembrar semillas, o en un cultivo de plantas, por aplicación de un agente inhibidor de las HPPD a dicho campo o cultivo de plantas, en particular un herbicida inhibidor de las HPPD tal como se ha definido con anterioridad, cuyo método está caracterizado porque este herbicida inhibidor de las HPPD es aplicado a plantas que han sido transformadas de acuerdo con el invento, ya sea antes de sembrar la planta cultivada (lo que se denomina en lo sucesivo aplicación antes de plantar), antes del brote de la planta cultivada (lo que se denomina en lo sucesivo aplicación antes del brote), o después del brote de la planta cultivada (lo que se denomina en lo sucesivo aplicación después del brote).
El invento se refiere también a un método para reprimir malezas en una zona o en un campo que contiene semillas transformadas tal como se han descrito anteriormente en el presente invento, cuyo método comprende aplicar, a dicha zona del campo, una dosis de un herbicida inhibidor de la HPPD que es tóxica para dichas malezas, sin afectar significativamente a las semillas ni a las plantas que contienen el ácido nucleico de HPPD o el gen quimérico de HPPD del invento, tal como se ha descrito con anterioridad en el presente invento.
El presente invento se refiere también a un método para cultivar las plantas que han sido transformadas con un gen quimérico de acuerdo con el invento, cuyo método comprende plantar semillas que comprenden un gen quimérico del invento, en una zona de un campo que es apropiada para cultivar dichas plantas, y aplicar, si están presentes malezas, una dosis, que es tóxica para las malezas, de un herbicida cuya diana es la HPPD antes definida a dicha zona de dicho campo, sin afectar significativamente a dichas semillas transformadas ni a dichas plantas transformadas, y luego cosechar las plantas cultivadas o las partes de plantas, cuando éstas alcanzan la etapa deseada de madurez y, cuando sea apropiado, separar las semillas con respecto de las plantas cosechadas.
En los métodos anteriores, el herbicida cuya diana es la enzima de HPPD se puede aplicar de acuerdo con el invento, ya sea antes de sembrar la planta cultivada, antes de que la planta cultivada brote o después de que la planta cultivada brote.
El presente invento se refiere también a un procedimiento para obtener un aceite, particularmente un aceite de soja spp, maíz o algodón, o una harina, que comprende hacer crecer una planta cultivada, particularmente una planta cultivada de soja spp, expresar una proteína de HPPD del invento, opcionalmente tratar dicha planta cultivada con un herbicida inhibidor de las HPPD, cosechar los granos y moler los granos para producir una harina y extraer el aceite. También las semillas o los granos, ya sea enteras/os, rotas/os o trituradas/os, que comprenden el gen quimérico del invento, son parte de este invento.
Por lo tanto, el presente invento se refiere a un método para obtener un aceite o una harina, que comprende hacer crecer una planta transformada tal como antes se ha descrito, opcionalmente tratar dicha planta con un herbicida inhibidor de las HPPD, cosechar los granos y moler estos granos para producir una harina y extraer el aceite.
Se proporcionan adicionalmente en este invento los anteriores métodos que implican a un herbicida inhibidor de las HPPD seleccionado entre isoxaflutol, tembotriona, mesotriona, pirasulfotol, sulcotriona, biciclopirona, tefuriltriona, topramezona, 2-ciano- 3-ciclopropil-1-(2-metilsulfonil-4-trifluorometilfenil)-propano-1 ,3-diona y 2-ciano-1-[4-(metilsulfonil)-2-trifluorometilfenil]-3-(1-metil-ciclopropil)-propano-1 ,3-diona.
También se proporcionan en el presente contexto los anteriores métodos del invento que implican a un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionado entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona.
Dentro del significado del presente invento, se entiende que un "herbicida" es una sustancia activa como herbicida por si misma, o tal sustancia que está combinada con un aditivo que altera su eficacia tal como, por ejemplo, un agente que aumenta su actividad (un agente sinérgico) o que limita su actividad (un antídoto). Desde luego, se ha de entender que, para su aplicación en la práctica, los anteriores herbicidas son combinados, de una manera que es de por sí conocida, con los agentes coadyuvantes de formulación que habitualmente se emplean en la química agrícola.
Unos herbicidas inhibidores de las HPPD tales como los de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionados entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, tienen una actividad herbicida sobresaliente contra un amplio espectro de plantas dañinas anuales monocotiledóneas y dicotiledóneas económicamente importantes. Las sustancias activas también actúan eficientemente sobre plantas dañinas perennes que producen vástagos a partir de rizomas, cepellones, tallos leñosos u otros órganos perennes, y que son difíciles de reprimir.
El presente invento por lo tanto se refiere también a un método de reprimir plantas indeseadas o para regular el crecimiento de las plantas en cultivos de plantas que comprenden una HPPD de acuerdo con el invento, en el que uno o más herbicidas inhibidores de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionados entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, se aplica(n) a las plantas (por ejemplo plantas dañinas tales como malezas o plantas cultivadas indeseadas monocotiledóneas o dicotiledóneas), a las semillas (por ejemplo granos, semillas o propágulos vegetativos tales como tubérculos o partes de vástagos con pimpollos) o a la zona en la que crecen las plantas (por ejemplo la zona sometida a cultivación). En este contexto, un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionado entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, se puede aplicar por ejemplo antes de plantar (si fuese apropiado también por incorporación dentro de la tierra), antes del brote o después del brote. Ejemplos de representantes individuales de las malezas monocotiledóneas y dicotiledóneas que se pueden reprimir con un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionada entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, se mencionan seguidamente, sin que esta mención esté pensada como una limitación a ciertas especies solamente: Plantas dañinas monocotiledóneas de los géneros: Aegilops, Agropyron, Agrostis, Alopecurus, Apera, Avena, Brachiaria, Bromus, Cenchrus, Commelina, Cynodon, Cyperus, Dactyloctenium, Digitaria, Echinochloa, Eleocharis, Eleusine, Eragrostis, Eriochloa, Festuca, Fimbristylis, Heteranthera, Imperata, Ischaemum, Leptochloa, Lolium, Monochoria, Panicum, Paspalum, Phalaris, Phleum, Poa, Rottboellia, Sagittaria, Scirpus, Setaria, Sorghum.
Malezas dicotiledóneas de los géneros: Abutilón, Amaranthus, Ambrosia, Anoda, Anthemis, Aphanes, Artemisia, Atriplex, Bellis, Bidens, Capsella, Carduus, Cassia, Centaurea, Chenopodium, Cirsium, Convolvulus, Datura, Desmodium, Emex, Erysimum, Euphorbia, Galeopsis, Galinsoga, Galium, Hibiscus, Ipomoea, Kochia, Lamium, Lepidium, Lindernia, Matricaria, Mentha, Mercurialis, Mullugo, Myosotis, Papaver, Pharbitis, Plantago, Polygonum, Portulaca, Ranunculus, Raphanus, Rorippa, Rotala, Rumex, Salsola, Senecio, Sesbania, Sida, Sinapis, Solanum, Sonchus, Sphenoclea, Stellaria, Taraxacum, Thlaspi, Trifolium, Urtica, Verónica, Viola, Xanthium.
En plantas cultivadas transgénicas de acuerdo con el invento, que comprenden una proteína de HPPD, un ADN o un gen quimérico de acuerdo con el invento y que también pueden mostrar una o más adicionales resistencias a herbicidas contra herbicidas que difieren de los herbicidas inhibidores de las HPPD, se prefiere el uso de un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionado entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, en plantas cultivadas transgénicas económicamente importantes de plantas útiles y ornamentales, por ejemplo de cereales tales como trigo, cebada, centeno, avena, sorgo y mijo, arroz y maíz o bien plantas cultivadas de remolacha azucarera, algodón, especies de soja, colza de semilla oleaginosa, patata, tomate, guisantes y otras hortalizas.
En lo que se refiere a unas propiedades de las plantas, distintas de la tolerancia a herbicidas inhibidores de las HPPD tal como se describen en el presente invento, unas vías convencionales para la generación de nuevas plantas que, en comparación con las plantas existentes, presentan propiedades modificadas, consisten por ejemplo en métodos tradicionales de cultivación y procreación y en la generación de mutantes. Alternativamente, se pueden generar nuevas plantas con propiedades modificadas con la ayuda de métodos recombinantes (véanse, por ejemplo, los documentos EP-A-0221044 A1 y EP-A-0131624 A1 ). Se han descrito, por ejemplo, en varios casos las siguientes: modificaciones recombinantes de plantas cultivadas, para las finalidades de modificar el almidón sintetizado en las plantas (por ejemplo, los documentos WO 92/11376, WO 92/14827 y WO 91/19806), plantas cultivadas transgénicas, que son resistentes a ciertos herbicidas del tipo de glufosinato (compárense, por ejemplo los documentos EP-A-0242236, EP-A-0242246) o del tipo de glifosato (documento WO 92/00377) o del tipo de las sulfonil-ureas (documentos EP-A-0257993 y US-A-5013659), - plantas cultivadas transgénicas, por ejemplo de maíz, algodón o especies de soja, que son capaces de producir toxinas de Bacillus thuringiensis (toxinas de Bt), o híbridos o mutantes de las mismas, que hacen a las plantas resistentes contra determinadas plagas (documento EP-A-0193259), plantas cultivadas transgénicas con una composición modificada de ácidos grasos (documento WO 91/13972), plantas cultivadas modificadas genéticamente con nuevas sustancias constitutivas o metabolitos secundarios, por ejemplo nuevas fitoalexinas, que estableen una resistencia aumentada contra ciertas enfermedades (documentos EPA 309862, EPA 0464461), - plantas modificadas genéticamente con una fotorrespiración reducida, que presentan más altos rendimientos de cosechas y una más alta tolerancia frente al estrés (documento EPA 0305398), plantas cultivadas transgénicas, que producen proteínas importantes farmacéutica o diagnósticamente (en inglés "molecular pharming" = farmacología molecular), plantas cultivadas transgénicas, que se distinguen por más altos rendimientos de cosechas o por una mejor calidad, plantas cultivadas transgénicas, que se distinguen por una combinación de nuevas propiedades tal como una combinación de las nuevas propiedades arriba mencionadas (en inglés "gene stacking" = amontonamiento de genes).
Un gran número de técnicas de biología molecular, por medio de las cuales se pueden generar nuevas plantas transgénicas con propiedades modificadas, son conocidas en principio; véanse por ejemplo las citas de I. Potrykus y G. Spangenberg (coordinadores de edición) Gene Transfer to Plants, Springer Lab Manual [Transferencia de genes a plantas. Manual de laboratorio de Springer] (1995), editorial Springer Berlín, Heidelberg, o de Christou, "Trends in Plant Science" [Tendencias en la ciencia de plantas] 1 (1996) 423-431 ).
Para llevar a cabo tales manipulaciones recombinantes, es posible introducir en plásmidos unas moléculas de ácidos nucleicos, que permitan una mutagénesis o una modificación de las secuencias por recombinación de secuencias de ADN. Con la ayuda de métodos clásicos, se pueden llevar a cabo, por ejemplo, sustituciones de bases, se pueden eliminar secuencias parciales o se pueden añadir secuencias naturales o sintéticas. Para el engarce de los fragmentos de ADN unos con otros, es posible adosar adaptadores o engarzadores a los fragmentos; véanse, por ejemplo, las citas de Sambrook y colaboradores, 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual [Clonación molecular, un manual de laboratorio], 2a edición, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY; o de Winnacker "Gene und Klone" [Genes y clones], VCH Weinheim 2a edición de 1996.
La generación de células de plantas con una actividad disminuida de un producto génico se puede conseguir por ejemplo mediante la expresión de por lo menos un correspondiente ARN antisentido, de un ARN del mismo sentido para conseguir un efecto de supresión conjunta, o de una combinación de ARN's tanto de antisentido como del mismo sentido que forman una molécula de ARN silenciosa de doble hebra (ARNi), o mediante la expresión de por lo menos una ribozima correspondientemente construida, que disocia específicamente a transcritos del producto génico antes mencionado. Para hacer esto, es posible en primer lugar usar unas moléculas de ADN, que comprenden la totalidad de la secuencia codificadora de un producto génico, inclusive cualesquiera secuencias flanqueadoras que puedan estar presentes, o también unas moléculas de ADN, que comprenden solamente partes de la secuencia codificadora, siendo necesario que estas partes sean lo suficientemente largas como para establecer en las células un efecto antisentido. Es posible también usar unas secuencias de ADN que tienen un alto grado de homología con respecto a las secuencias codificadoras de un producto génico, pero que no son totalmente idénticas.
Cuando se expresan moléculas de ácidos nucleicos en plantas, la proteína obtenida puede estar localizada en cualquier compartimiento de la célula de planta. Sin embargo, con el fin de conseguir la localización en un compartimiento particular, es posible por ejemplo engarzar la región codificadora con unas secuencias de ADN, que garantizan la localización en un compartimiento específico. Tales secuencias son conocidas para un experto en la especialidad (véanse, por ejemplo, las citas de Braun y colaboradores, EMBO J. 11 (1992), 3219-3227; de Wolter y colaboradores, Proc. Nati. Acad. Sci. USA 85 (1988), 846-850; y de Sonnewald y colaboradores, Plant J. 1 (1991) 95-106). Sin embargo, las moléculas de ácidos nucleicos pueden ser expresadas también en los orgánulos de las células de plantas.
Las células de plantas transgénicas se pueden regenerar de acuerdo con técnicas conocidas para dar plantas intactas. En principio, las plantas transgénicas pueden ser plantas de cualquier especie de plantas, incluyendo plantas monocotiledóneas o dicotiledóneas.
Así, se pueden obtener unas plantas transgénicas que - además del gen quimérico de HPPD del invento - tienen propiedades modificadas como el resultado de una sobreexpresión, supresión o inhibición de genes o secuencias de genes homólogos/as (= naturales) o de una expresión de genes o secuencias de genes heterólogos/as (= ajenos).
En las plantas, células de plantas o semillas del invento, se prefiere emplear el herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionado entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, en plantas cultivadas transgénicas que son también resistentes a agentes reguladores del crecimiento tales como, por ejemplo, a 2,4-D o dicamba, o contra herbicidas que inhiben a esenciales enzimas de plantas, por ejemplo a acetolactato sintasas (ALS), EPSP sintasas, glutamina sintasas (GS) o hidroxifenilpiruvato dioxigenasas (HPPD), o contra herbicidas tomados del conjunto de las sulfonilureas, glifosato, glufosinato o benzoílisoxazoles y sustancias activas análogas.
El invento, por lo tanto, se refiere también al uso de herbicidas aplicados a estas plantas tolerantes a las HPPD de acuerdo con el invento para reprimir plantas dañinas (es decir malezas) que también se extiende a plantas cultivadas transgénicas que comprenden una segunda o más resistencia(s) a herbicidas además de la resistencia contra herbicidas inhibidores de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona; sulcotriona y mesotriona, de la clase de los/las isoxazoles tales como isoxaflutol o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionados entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona.
Los herbicidas inhibidores de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionados entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, se pueden emplear en las formulaciones habituales en la forma de polvos humectables, concentrados emulsionables, soluciones atomizables, polvos para espolvorear o granulados.
Los herbicidas inhibidores de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionados entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, se pueden formular de diversas maneras, dependiendo de los parámetros biológicos y/o físico-químicos prevalecientes. Ejemplos de posibles formulaciones son: polvos humectables (WP), polvos solubles en agua (SP), concentrados solubles en agua, concentrados emulsionares (EC), emulsiones (EW), tales como emulsiones de los tipos de aceite en agua y de agua en aceite, soluciones atomizables, concentrados para suspensión (SC), dispersiones constituidas sobre la base de aceites o de agua, soluciones miscibles con aceites, suspensiones para encapsular (CS), polvos para espolvorear (DP), productos desinfectantes de semillas, granulados para la aplicación por esparcimiento y sobre el suelo, granulados (GR) en forma de microgranulados, granulados formados por atomización, granulados revestidos y granulados formados por adsorción, granulados dispersables en agua (WG), granulados solubles en agua (SG), formulaciones ULV (de volumen ultra-bajo), microcápsulas y ceras.
Estos tipos individuales de formulaciones son conocidos en principio y se describen, por ejemplo, en las obras de: Winnacker-Küchler, "Chemische Technologie" (Tecnología química), tomo 7, editorial C. Hanser, Múnich, 4a edición de 1986; Wade van Valkenburg, "Pesticide Formulations" (Formulaciones de plaguicidas), Marcel Dekker, N.Y., 1973; K. Martens, "Spray Drying Handbook" (Manual del secado por atomización), 3a edición de 1979, G. Goodwin Ltd, Londres.
Los requeridos agentes auxiliares para formulaciones, tales como materiales inertes, agentes tensioactivos, disolventes y otros materiales aditivos, son asimismo conocidos y se describen, por ejemplo, en las obras de: Watkins, "Handbook of Insecticide Dust Diluents and Carriers" (Manual de diluyentes y vehículos para polvos finos insecticidas), 2a edición, Darland Books, Caldwell N.J.; H.v. Olphen "Introduction to Clay Colloid Chemistry" (Introducción a la química de los coloides de arcillas), 2a edición, J. Wiley & Sons, N.Y.; C. arsden, "Solvents Guide" (Guía de disolventes), 2a edición, Interscience, N.Y. 1963; "Detergente and Emulsifiers Annual" (Anual de detergentes y emulsionantes) de McCutcheon, MC Publ. Corp., Ridgewood N.J.; Sisley y Wood, "Encyclopedia of Surface Active Agents" (Enciclopedia de agentes tensioactivos), Chem. Publ. Co. Inc., N.Y. 1964; Schónfeldt, "Grenzfláchenaktive Áthylenoxidaddukte" (Aductos con óxido de etileno ¡nterfacialmente activos), Wiss. Verlagsgesell., Stuttgart 1976; Winnacker-Küchler, "Chemische Technologie" (Tecnología química), tomo 7, editorial C. Hanser Munich, 4a edición de 1986.
Sobre la base de estas formulaciones, es posible también preparar combinaciones con otras sustancias activas como plaguicidas, tales como por ejemplo insecticidas, acaricidas, herbicidas, fungicidas, y con antídotos, agentes fertilizantes y/o reguladores del crecimiento, por ejemplo en forma de una formulación acabada (en inglés ready mix) o tal como una mezcla en depósito (en inglés tank mix).
Los polvos humectables son unas formulaciones dispersables uniformemente en agua y que, junto a la sustancia activa, comprenden también agentes tensioactivos de tipos iónicos y/o no iónicos (agentes humectantes, agentes dispersantes), por ejemplo alquil-fenoles poli(oxietilados), alcoholes grasos poli(oxietilados), aminas grasas poli(oxietiladas), (alcohol graso)-poliglicol-éter-sulfatos, alcano-sulfonatos, alquil-benceno-sulfonatos, un lignosulfonato de sodio, un 2,2'-dinaftilmetano-6,6'-disulfonato de sodio, un dibutilnaftaleno-sulfonato de sodio o también un oleoíl-metil-taurato de sodio, junto a una sustancia diluyente o inerte. Para preparar los polvos humectables, las sustancias activas como herbicidas se muelen finamente, por ejemplo en equipos usuales tales como molinos de martillos, molinos de soplante y molinos de chorros de aire y, simultáneamente o a continuación, se mezclan con los agentes auxiliares para formulaciones.
Los concentrados emulsionables se preparan por disolución de la sustancia activa en un disolvente orgánico, por ejemplo butanol, ciclohexanona, dimetil-formamida, xileno o también compuestos aromáticos o hidrocarburos de punto de ebullición más alto o mezclas de los disolventes orgánicos, con adición de uno o varios agentes tensioactivos de tipos iónicos y/o no iónicos (agentes emulsionantes). Ejemplos de agentes emulsionantes que se pueden usar son: alquil-aril-sulfonatos de calcio tales como dodecil-benceno-sulfonato de calcio, o emulsionantes no iónicos, tales como ésteres de poliglicoles con ácidos grasos, alquil-aril-poliglicol éteres, (alcohol graso) poliglicol éteres, condensados de óxido de propileno y óxido de etileno, alquil poliéteres, ésteres de sorbitán tales como, por ejemplo, ésteres con ácidos grasos de sorbitán, o poli(oxietilen)-ésteres de sorbitán, tales como, por ejemplo, poli(oxietilen)-ésteres con ácidos grasos de sorbitán.
Los polvos para espolvorear se obtienen mediante molienda de la sustancia activa con materiales sólidos finamente divididos, por ejemplo, talco, arcillas naturales tales como caolín, bentonita y pirofilita, o tierra de diatomeas.
Los concentrados para suspensión pueden estar basados en agua o en aceites. Ellos se pueden preparar por ejemplo por molienda en húmedo mediante molinos de perlas disponibles comercialmente, si fuese apropiado con adición de agentes tensioactivos, tal como ya se han enumerado, por ejemplo, más arriba en los casos de los otros tipos de formulaciones.
Las emulsiones, por ejemplo las emulsiones del tipo de aceite en agua (EW), se pueden preparar por ejemplo mediante agitadores, molinos de coloides, y/o mezcladores estáticos mediando uso de disolventes orgánicos acuosos y si fuese apropiado, de agentes tensioactivos, tal como ellos se han mencionado ya, por ejemplo, más arriba para los otros tipos de formulaciones.
Los granulados se pueden preparar o bien por proyección de la sustancia activa sobre un material inerte granulado, capaz de adsorción, o por aplicación de concentrados de sustancias activas sobre la superficie de materiales de soporte, tales como arena, caolinitas, o un material inerte granulado con la ayuda de agentes adhesivos, por ejemplo un poli(alcohol vindico), un poli(acrilato de sodio) o también aceites minerales. También se pueden granular sustancias activas apropiadas del modo que es usual para la producción de granallas de agentes fertilizantes, si se desea en forma de una mezcla con agentes fertilizantes.
Los granulados dispersables en agua se preparan por regla general por métodos usuales, tales como desecación por atomización, granulación en lecho fluidizado, granulación en bandejas, mezcladura con agitadores de alta velocidad y extrusión sin ningún material inerte sólido.
Para preparar granulados en bandejas, granulados en lecho fluidizado, granulados en extrusor y granulados por atomización, véanse, por ejemplo, los métodos expuestos en las obras "Spray-Drying Handbook" (Manual del secado por atomización), 3a edición de 1979, G. Goodwin Ltd., Londres; J.E. Browning, "Agglomeration" (Aglomeración), Chemical and Engineering 1967, páginas 147 y siguientes; "Perry's Chemical Engineer's Handbook" (Manual del ingeniero químico de Perry), 5a edición, McGraw-Hill, Nueva York 1973, páginas 8-57, Para más detalles acerca de la formulación de agentes para la protección de plantas cultivadas, véanse, por ejemplo, las obras de G.C. Klingman, "Weed Control as a Science" (Represión de malas hierbas como una ciencia), John Wiley and Sons, Inc., Nueva York, 1961 , páginas 81-96 y de J.D. Freyer, S.A. Evans, "Weed Control Handbook" (Manual de la represión de malas hierbas), 5a edición, BlackweII Scientific Publications, Oxford, 1968, páginas 101-103.
Por regla general, las formulaciones agroquímicas comprenden de 0,1 a 99 % en peso, en particular de 0,1 a 95 % en peso, de compuestos conformes al invento. En polvos humectables, la concentración de una sustancia activa es por ejemplo, de aproximadamente 10 a 90 % en peso, estando compuesto el resto hasta 100 % en peso de los usuales constituyentes de formulaciones. En el caso de los concentrados emulsionables, la concentración de una sustancia activa puede ser de aproximadamente 1 a 90, de manera preferida de 5 a 80 % en peso. Las formulaciones en forma de polvos para espolvorear contienen de 1 a 30 % en peso de una sustancia activa, de manera preferida en la mayor parte de los casos de 5 a 20 % en peso de una sustancia activa, y las soluciones atomizables comprenden de aproximadamente 0,05 a 80, de manera preferida de 2 a 50 % en peso de una sustancia activa. En el caso de granulados dispersables en agua, el contenido de una sustancia activa depende en parte de si el compuesto activo se presenta en forma líquida o sólida, y de cuáles sean los agentes auxiliares de granulación, materiales de carga y relleno y similares, que se estén usando. En el caso de los granulados dispersables en agua, por ejemplo, el contenido de una sustancia activa está situado entre 1 y 95 % en peso, de manera preferida entre 10 y 80 % en peso.
Por añadidura, las mencionadas formulaciones de sustancias activas comprenden, si fuese apropiado, los agentes auxiliares que son convencionales en cada caso, tales como agentes adhesivos, humectantes, dispersantes, emulsionantes, penetrantes, conservantes, agentes protectores frente a las heladas o anticongelantes, disolventes, materiales de carga y relleno, materiales de soporte y colorantes, antiespumantes, inhibidores de la evaporación y agentes que influyen sobre el valor del pH y sobre la viscosidad.
Sobre la base de estas formulaciones, es también posible preparar combinaciones de un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionado entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, con otras sustancias activas como plaguicidas, tales como, por ejemplo, insecticidas, acaricidas, herbicidas, fungicidas, y con antídotos, agentes fertilizantes y/o reguladores del crecimiento, por ejemplo en forma de una formulación acabada (en inglés ready mix) o tal como una mezcla en depósito (en inglés tank mix), que se ha de aplicar a las plantas tolerantes a las HPPD de acuerdo con el invento.
Unas sustancias activas que pueden ser aplicadas a plantas tolerantes a las HPPD de acuerdo con el presente invento en combinación con un herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionado entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona en formulaciones mixtas o en una mezcla en depósito, son, por ejemplo, unas sustancias activas conocidas, que se basan en la inhibición de, por ejemplo, acetolactato sintasa, acetil-CoA carboxilasa, celulosa sintasa, enolpiruvilshikimato-3-fosfato sintasa, glutamina sintetasa, p-hidroxifenilpiruvato dioxigenasa, fitoeno desaturasa, fotosistema I, fotosistema II, protoporfirinógeno oxidasa, tal como se describen por ejemplo, en Weed Research 26 (1986) 441-445, o en el manual "The Pesticide Manual" [El manual de los plaguicidas], 14a edición, The British Crop Protection Council and the Royal Soc. of Chemistry, 2003 y la bibliografía allí citada. Conocidos agentes herbicidas o reguladores del crecimiento de las plantas, que se pueden combinar con los compuestos conformes al invento, son, por ejemplo, las siguientes sustancias activas (los compuestos son designados o bien por el nombre común (en inglés "common ñame") de acuerdo con la International Organization for Standard ization (ISO) (= Organización Internacional para Normalización) o por el nombre químico, si fuese apropiado junto con el número de código) y comprenden siempre todas las formas de uso, tales como ácidos, sales, ésteres e isómeros tales como estereoisómeros e isómeros ópticos. En este contexto, se mencionan a modo de ejemplo una forma de uso y en algunos casos también varias formas de uso: acetocloro; acibenzolar, acibenbenzolar-S-metilo, acifluorfeno, acifluorfeno-sodio, aclonifeno, alacloro, alidocloro, aloxidim, aloxidim-sodio, ametrina, amicarbazona, amidocloro, amidosulfurón, aminociclopiracloro, aminopiralida, amitrol, sulfamato de amonio, ancimidol, anilofos, asulam, atrazina, azafenidina, azimsulfurón, aziprotrina, BAH-043, BAS-140H, BAS-693H, BAS-714H, BAS-762H, BAS-776H, BAS-800H, beflubutamida, benazolina, benazolina-etilo, bencarbazona, benfluralina, benfuresato, bensulida, bensulfurón-metilo, bentazona, benzofendizona, benzobiciclona, benzofenap, benzofluoro, benzoilprop, bifenox, bilanafos, bilanafos-sodio, bispiribac, bispiribac-sodio, bromacilo, bromobutida, bromofenoxima, bromoxinilo, bromurón, buminafos, busoxinona, butacloro, butafenacilo, butamifos, butenacloro, butralina, butroxidim, butilato, cafenstrol, carbetamida, carfentrazona, carfentrazona-etilo, clometoxifeno, cloramben, clorazifop, clorazifop-butilo, clorobromurón, clorobufam, clorfenac, clorfenac-sodio, clorfenprop, cloroflurenol, cloroflurenol-metilo, cloridazona, clorimurón, clorimurón-etilo, cloromequat-cloruro, cloronitrofeno, cloroftalim, clortal-dimetilo, clorotolurón, clorosulfurón, cinidón, cinidón-etilo, cinmetilina, cinosulfurón, cletodim, clodinafop, clodinafop-propargilo, clofencet, clomazona, clomeprop, cloprop, clopiralida, cloransulam, cloransulam-metilo, cumilurón, cianamida, cianazina, ciclanilida, cicloato, ciclosulfamurón, cicloxidim, ciclurón, cihalofop, cihalofop-butilo, ciperquat, ciprazina, ciprazol, 2,4-D, 2,4-DB, daimurón/dimrón, dalapon, daminozida, dazomet, n-decanol, desmedifam, desmetrina, detosil-pirazolato (DTP), di-alato, dicamba, diclobenilo, diclorprop, diclorprop-P, diclofop, diclofop-metilo, diclofop-P-metilo, diclosulam, dietatilo, dietatilo-etilo, difenoxurón, difenzoquat, diflufenican, diflufenzopir, diflufenzopir-sodio, dimefurón, dikegulac-sodio, dimefurón, dimepiperato, dimetacloro, dimetametrina, dimetenamida, dimetenamida-P, dimetipina, dimetrasulfurón, dinitramina, dinoseb, dinoterb, difenamida, dipropetrina, diquat, diquat-dibromuro, ditiopir, diurón, DNOC, eglinazina-etilo, endotal, EPTC, esprocarb, etalfluralina, etametsulfurón-metilo, etefon, etidimurón, etiozina, etofumesato, etoxifeno, etoxifeno-etilo, etoxisulfurón, etobenzanida, F-5331 , es decir N-[2-cloro-4-fluoro-5-[4-(3-fluoro-propil)-4,5-dihidro-5-oxo-1 H-tetrazol-1-il]-fenil]-etano-sulfonamida, fenoprop, fenoxaprop, fenoxaprop-P, fenoxaprop-etilo, fenoxaprop-P-etilo, fentrazamida, fenurón, flamprop, flamprop-M-isopropilo, flamprop-M-metilo, flazasulfurón, florasulam, fluazifop, fluazifop-P, fluazifop-butilo, fluazifop-P-butilo, fluazolato, flucarbazona, flucarbazona-sodio, flucetosulfurón, flucloralina, flufenacet (tiafluamida), flufenpir, flufenpir-etilo, flumetralina, flumetsulam, flumiclorac, flumiclorac-pentilo, flumioxazina, flumipropina, fluometurón, fluorodifeno, fluoroglicofeno, fluoroglicofeno-etilo, flupoxam, flupropacilo, flupropanato, flupirsulfurón, flupirsulfurón-metil-sodio, flurenol, flurenol-butilo, fluridona, flurocloridona, fluroxipir, fluroxipir-meptilo, flurprimidol, flurtamona, flutiacet, flutiacet-metilo, flutiamida, fomesafeno, foramsulfurón, forclorofenurón, fosamina, furiloxifeno, ácido giberélico, glufosinato, L-glufosinato, L-glufosinato-amonio, glufosinato-amonio, glifosato, glifosato-isopropilamonio, H-9201 , halosafeno, halosulfurón, halosulfurón-metilo, haloxifop, haloxifop-P, haloxifop-etoxietilo, haloxifop-P-etoxietilo, haloxifop-metilo, haloxifop-P-metilo, hexazinona, HNPC-9908, HOK-201 , HW-02, imazametabenz, imazametabenz-metilo, imazamox, imazapic, imazapir, imazaquina, imazetapir, imazosulfurón, inabenfida, indanofan, ácido indol-acético (IAA), ácido 4-indol-3-il-butírico (IBA), yodosulfurón, yodosulfurón-metil-sodio, ioxinilo, isocarbamida, isopropalina, Isoproturón, isourón, isoxabeno, isoxaclortol, isoxaflutol, isoxapirifop, KUH-043, KUH-071 , karbutilato, ketospiradox, lactofeno, lenacilo, linurón, hidrazida de ácido maleico, MCPA, MCPB, MCPB-metilo, -etilo y -sodio, mecoprop, mecoprop-sodio, mecoprop-butotilo, mecoprop-P-butotilo, mecoprop-P-dimetilamonio, mecoprop-P-2-etil-hexilo, mecoprop-P-potasio, mefenacet, mefluidida, mepiquat-cloruro, mesosulfurón, mesosulfurón-metilo, metabenzotiazurón, metam, metamifop, metamitron, metazacloro, metazol, metoxifenona, metildimrón, 1-metil-ciclopropeno, isotiocianato de metilo, metobenzurón, metobenzurón, metobromurón, metolacloro, S-metolacloro, metosulam, metoxurón, metribuzina, metsulfurón, metsulfurón-metilo, molinato, monalida, monocarbamida, monocarbamida dihidrógeno sulfato, monolinurón, monosulfurón, monurón, MT 128, MT-5950, es decir N-[3-cloro-4-(1-metil-etil)-fenil]-2-metil-pentanamida, NGGC-011 , naproanilida, napropamida, naptalam, NC-310, es decir 4-(2,4-dicloro-benzoil)-1-metil-5-benciloxi-pirazol, neburón, nicosulfurón, nipiraclofeno, nitralina, nitrofeno, nitrofenolato-sodio (mezcla de isómeros), nitrofluorfeno, ácido nonanoico, norflurazona, orbencarb, ortosulfamurón, orizalina, oxadiargilo, oxadiazona, oxasulfurón, oxaziclomefona, oxifluorfeno, paclobutrazol, paraquat, paraquat dicloruro, ácido pelargónico (ácido nonanoico), pendimetalina, pendralina, penoxsulam, pentanocloro, pentoxazona, perfluidona, petoxamida, fenisofam, fenmedifam, fenmedifam-etilo, picloram, picolinafeno, pinoxaden, piperofos, pirifenop, pirifenop-butilo, pretilacloro, primisulfurón, primisulfurón-metilo, probenazol, profluazol, prociazina, prodiamina, prifluralina, profoxidim, prohexadiona, prohexadiona-calcio, prohidrojasmona, prometón, prometrina, propacloro, propanilo, propaquizafop, propazina, profam, propisocloro, propoxicarbazona, propoxicarbazona-sodio, propizamida, prosulfalina, prosulfocarb, prosulfurón, prinacloro, piraclonilo, piraflufeno, piraflufeno-etilo, pirasulfotol, pirazolinato (pirazolato), pirazosulfurón-etilo, pirazoxifeno, piribambenz, piribambenz-isopropilo, piribenzoxima, piributicarb, piridafol, piridato, piriftalida, piriminobac, piriminobac-metilo, pirimisulfano, piritiobac, piritiobac-sodio, piroxasulfona, piroxsulam, quinclorac, quinmerac, quinoclamina, quizalofop, quizalofop-etilo, quizalofop-P, quizalofop-P-etilo, quizalofop-P-tefurilo, rimsulfurón, saflufenacilo, secbumetona, setoxidim, sidurón, simazina, simetrina, SN-106279, sulfalato (CDEC), sulfentrazona, sulfometurón, sulfometurón-metilo, sulfosato (glifosato-trimesio), sulfosulfurón, SYN-523, SYP-249, SYP-298, SYP-300, tebutam, tebutiurón, tecnazeno, tepraloxidim, terbaciio, terbucarb, terbucloro, terbumetona, terbutilazina, terbutrina, TH-547, tenilcloro, tiafluamida, tiazaflurón, tiazopir, tidiazimina, tidiazurón, tiencarbazona, tiencarbazona-metilo, tifensulfurón, tifensulfurón-metilo, tiobencarb, tiocarbazilo, tralkoxidim, tri-alato, triasulfurón, triaziflam, triazofenamida, tribenurón, tribenurón-metilo, ácido tricloroacético (TCA), triclopir, tridifano, trietazina, trifloxisulfurón, trifloxisulfurón-sodio, trifluralina, triflusulfurón, triflusulfurón-metilo, trimeturón, trinexapac, trinexapac-etilo, tritosulfurón, tsitodef, uniconazol, uniconazol-P, vernolato, ZJ-0166, ZJ-0270, ZJ-0543, ZJ-0862 así como los siguientes compuestos La tasa de aplicación requerida del herbicida inhibidor de las HPPD de la clase de las tricetonas, tales como tembotriona, sulcotriona y mesotriona, o de la clase de los pirazolinatos, tales como pirasulfotol y topramezona, particularmente seleccionado entre tembotriona, sulcotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y mesotriona, más particularmente tembotriona, que se ha de aplicar a unas zonas en las que están creciendo plantas tolerantes a las HPPD de acuerdo con el presente invento, varía como una función de condiciones externas tales como la temperatura, la humedad, la naturaleza del herbicida usado y otras similares. Ella puede variar, por ejemplo, entre 0,001 y 1 ,0 y más kg/ha de sustancia activa, pero está situada de manera preferible entre 0,005 y 750 g/ha.
En el caso de aplicaciones combinadas de herbicidas inhibidores de las HPPD con unos herbicidas, que difieren de los herbicidas inhibidores de las HPPD, a las plantas tolerantes a las HPPD de acuerdo con el presente invento, estas mezclas pueden causar lesiones en las plantas cultivadas, basándose en la presencia de los herbicidas no inhibidores de las HPPD. Con el fin de reducir/eliminar dichas lesiones en las plantas cultivadas, se pueden añadir apropiados antídotos. Estos antídotos, que se emplean en cantidades activas como antídotos, reducen los efectos colaterales de los herbicidas/plaguicidas usados, por ejemplo en plantas cultivadas económicamente importantes, tales como las de cereales (trigo, cebada, centeno, maíz, arroz, mijo), alfalfa, remolacha azucarera, caña de azúcar, colza de semilla oleaginosa, algodón y especies de soja, de manera preferible las de maíz, algodón, remolacha azucarera, o especies de soja.
Los antídotos se seleccionan de manera preferible entre el conjunto que consiste en: compuestos de la fórmula (S-l) en la que los símbolos e índices tienen los siguientes significados: nA es un número natural de 0 a 5, de manera preferida de 0 a 3; RA1 es halógeno, alquilo de (C C4), alcoxi de (C1-C4), nitro o haloalquilo de (C C4); WA es un radical heterocíclico divalente sin sustituir o sustituido, tomado entre el conjunto que consiste en los heterociclos con anillos de cinco miembros, parcialmente insaturados o aromáticos con 1 a 3 heteroátomos de anillo del tipo de N ó O, estando presente en el anillo por lo menos un átomo de nitrógeno y a lo sumo un átomo de oxígeno, de manera preferida un radical tomado entre el conjunto que consiste en (WA1) hasta (WA4), mA es O o l ; RA2 es ORA3, SRA3 o NRA3RA4 o un heterociclo de 3 a 7 miembros, saturado o insaturado, que tiene por lo menos un átomo de nitrógeno y hasta 3 heteroátomos, de manera preferida tomados entre el conjunto que consiste en O y S, que está unido a través del átomo de nitrógeno con el grupo carbonilo en (S-l), y que está sin sustituir o sustituido con radicales tomados entre el conjunto que consiste en alquilo de (C C4), alcoxi de (C1-C4) y fenilo eventualmente sustituido, de manera preferida un radical de las fórmulas O RA3, NHRA3 Ó N(CH3)2, en particular de la fórmula ORA3; RA3 es hidrógeno o un radical hidrocarbilo alifático sin sustituir o sustituido, que tiene de manera preferida un total de 1 a 18 átomos de C; RA4 es hidrógeno, alquilo de (CrC6), alcoxi de (Ci-C6) o fenilo sin sustituir o sustituido; RA5 es H, alquilo de (Ci-C8), halo-alquilo de (CrCe), alcoxi de (Ci-C4)-alquilo de (d- C8), ciano o COORA9, en que RA9 es hidrógeno, alquilo de (CrC8), halo-alquilo de (Ci-C8), alcoxi de (CrC4)-alquilo de (C1-C4), hidroxi-alquilo de (C Ce), cicloalquilo de (C3-C12) o tri-alquil de (CrC4)-sililo¡ RA6, RA7, RA8 son idénticos o diferentes, y son hidrógeno, alquilo de (CrC8), halo-alquilo de (CrC8), cicloalquilo de (C3-C12), o fenilo sustituido o sin sustituir; de manera preferida: a) compuestos del tipo del ácido dicloro-fenil-pirazolina-3-carboxílico, de manera preferida compuestos tales como 1-(2,4-dicloro-fenil)-5-(etoxicarbonil)-5-metil-2-pirazolina-3-carboxilato de etilo (S1-1 ), ("mefenpir-dietilo", véase el Manual de los Plaguicidas), y compuestos afines, tal como se describen en el documento WO 91/07874; b) derivados del ácido dicloro-fenil-pirazol-carboxílico, de manera preferida compuestos tales como 1-(2,4-dicloro-fenil)-5-metil-pirazol-3-carboxilato de etilo (S1-2), 1-(2,4-dicloro-fenil)-5-isopropil-pirazol-3-carboxilato de etilo (S1-3), l-(2,4-dicloro-fenil)-5-(1 ,1-dimetil-etil)pirazol-3-carboxilato de etilo (S1-4), 1-(2,4-dicloro-fenil)-5-fenil-pirazol-3-carboxilato de etilo (S1-5) y compuestos afines, tal como se describen en los documentos EP-A-333 131 y EP-A-269 806. c) compuestos del tipo de los ácidos triazol-carboxílicos, de manera preferida compuestos tales como el fenclorazol(-éster etilo), es decir 1-(2,4-dicloro-fenil)-5-triclorometil-(1 H)-1 ,2,4-triazol-3-carboxilato de etilo (S1-6), y compuestos afines tal como se describen en los documentos EP-A-174 562 y EP-A-346 620; d) compuestos del tipo de los ácidos 5-bencil- o 5-fenil-2-isoxazolina-3-carboxílicos, o del ácido 5,5-difenil-2-isoxazolina-3-carboxílico, de modo preferido compuestos tales como 5-(2,4-dicloro-bencil)-2-isoxazolina- carboxilato de etilo (S1-7) o 5-fenil-2-isoxazolina-3-carboxilato de etilo (S1-8) y compuestos afines, tal como se describen en el documento WO 91/08202, o respectivamente 5,5-difenil-2-isoxazolina-carboxilato de etilo (S1-9) ("isoxadifeno-etilo") o 5,5-difenil-2-isoxazolina-carboxilato de n-prop¡lo (S1-10) o 5-(4-fluoro-fenil)-5-fenil-2-isoxazolina-3-carboxilato de etilo (S1-11), tal como se describen en la solicitud de patente documento WO-A-95/07897.
B) Derivados de quinolina de la fórmula (S-ll) (S-ll) en que los símbolos e índices tienen los siguientes significados: RB1 es halógeno, alquilo de (C1-C4), alcoxi de (C1-C4), nitro o halo-alquilo de (C1-C4); ?? es un número natural de 0 a 5, de manera preferida de 0 a 3; RB2 es ORB3, SRB3 O NRB3RB4 o un heterociclo de 3 a 7 miembros, saturado o insaturado, que tiene por lo menos un átomo de nitrógeno y hasta 3 heteroátomos, de manera preferida tomados entre el conjunto que consiste en O y S, que está unido a través del átomo de nitrógeno con el grupo carbonilo en (S-ll), y que está sin sustituir o sustituido con radicales tomados entre el conjunto que consiste en alquilo de (CrC4), alcoxi de (C1-C4) o fenilo eventualmente sustituido, de manera preferida un radical de las fórmulas ORB3, NHRB4 o N(CH3)2, en particular de la fórmula ORB3¡ RB3 es hidrógeno o un radical hidrocarbilo alifático sin sustituir o sustituido, que tiene de manera preferida un total de 1 a 18 átomos de C; RB4 es hidrógeno, alquilo de (C^Ce), alcoxi de (CrC6) o fenilo sin sustituir o sustituido; TB es una cadena de alcano de (C1 o C2)-diilo, que está sin sustituir o sustituida con uno o dos radicales de (Ci-C4) o con [alcoxi de (d-C3)]-carbonilo; de manera preferida: a) compuestos del tipo del ácido 8-quinolinoxi-acético (S2), de manera preferida (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de (1-metil-hexilo), (nombre común "cloquintocet-mexilo" (S2-1) (véase el Manual de los Plaguicidas), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de 1 ,3-dimetilbut-1-ilo) (S2-2), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de 4-aliloxibutilo (S2-3), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de 1-aliloxiprop-2-ilo (S2-4), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de etilo (S2-5), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de metilo (S2-6), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de alilo (S2-7), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de 2-(2-propilideniminooxi)-1 -etilo (S2-8), (5-cloro-8-quinolinoxi)-acetato de 2-oxo-propilo (S2-9) y compuestos afines, tal como se describen en los documentos EP-A-86 750, EP-A-94 349 y EP-A-191 736 ó EP-A-0492 366, y también sus hidratos y sales tal como se describen en el documento WO-A-2002/034048. b) compuestos del tipo del ácido (5-cloro-8-quinolinoxi)-malónico, de manera preferida compuestos tales como (5-cloro-8-quinolinoxí)-malonato de dietilo, (5-cloro-8-quinolinoxi)-malonato de dialilo, (5-cloro-8-quinolinoxi)-malonato de metilo y etilo, y compuestos afines, tal como se describen en el documento EP-A-0 582 198.
C) Compuestos de la fórmula (S-lll) en que los símbolos e índices tienen los siguientes significados: Rc1 es alquilo de (Ci-C^, halo-alquilo de (Ci-C4), alquenilo de (C2-C4), halo-alquenilo de (C2-C4), cicloalquilo de (C3-C7), de manera preferida diclorometilo; Re2, Re3 son idénticos o diferentes y son hidrógeno, alquilo de (C1-C4), alquenilo de (C2-C4), alquinilo de (C2-C4), halo-alquilo de (C1-C4), halo-alquenilo de (C2-C4), alquil de (C C- -carbamoíl-alquilo de (C1-C4), alquenil de (C2-C )-carbamoíl-alquilo de (Cr C4), alcoxi de (CrC4)-alquilo de (C1-C4), dioxolanil-alquilo de (C1-C4), tiazolilo, furilo, furil-alquilo, tienilo, piperidilo, fenilo sustituido o sin sustituir, o Re2 y Re3 forman en común un anillo heterocíclico sustituido o sin sustituir, de manera preferida un anillo de oxazolidina, tiazolidina, piperidina, morfolina, hexahidropirimidina o benzoxazina; de manera preferida: compuestos activos del tipo de las dicloroacetamidas, que se usan frecuentemente como antídotos para antes del brote (antídotos activos en el suelo), tales como por ejemplo "diclormida"(véase el Manual de los Plaguicidas) (= N,N-dialil-2,2-dicloro-acetamida), "R-29148" (= 3-dicloroacetil-2,2,5-trimetil-1 ,3-oxazolidona de Stauffer), "R-28725" (= 3-dicloroacetil-2,2,5-dimetil-1 ,3-oxazolidona de Stauffer), "benoxacor" (véase el Manual de los Plaguicidas) (= 4-dicloroacetil-3,4-dihidro-3-metil-2H-1 ,4-benzoxazina).
"PPG-1292" (= N-alil-N[(1 ,3-dioxolan-2-il)-metil]dicloroacetamida de PPG Industries), "DKA-24" (= N-alil-N-[(alilaminocarbonil)-metil]-dicloroacetamida de Sagro-Chem), "AD-67" o "MON 4660" (= 3-dicloroacetil-1-oxa-3-aza-espiro[4,5]decano de Nitrokemia o respectivamente Monsanto), "Ti-35" (= 1-dicloroacetil-azepano de TRI-Chemical RT) "diclonona" (diciclonona) o "BAS145138" o "LAB145138" (= 3-dicloroacetil-2,5,5-trimetil-1 ,3-diaza-biciclo[4.3.0]nonano de BASF) y "furilazol" o "MON 13900" (véase el Manual de los Plaguicidas) (= (RS)-3-dicloroacetil-5-(2-furil)-2,2-dimetil-oxazolidona) D) N-Acilsulfonamidas de la fórmula (S-IV) y sus sales en la que XD es CH RD1 es CO-NRD5RD6 O NHCO-RD7; RD2 es halógeno, halo-alquilo de (C1-C4), halo-alcoxi de (C1-C4), nitro, alquilo de (Ci-C4), alcoxi de (Ci-C4), alquil de (d-C4)-sulfon¡lo, alcoxi de (C C^-carbonilo o alquil de (C C4)-carbonilo; RD3 es hidrógeno, alquilo de (C1-C4), alquenilo de (C2-C4) o alquinilo de (C2-C4); RD4 es halógeno, nitro, alquilo de (C1-C4), halo-alquilo de (C1-C4), halo-alcoxi de (Ci-C4), cicloalquilo de (C3-C6), fenilo, alcoxi de (C1-C4), ciano, alquil de (Ci-C4)-tio, alquil de (Ci-C4)-sulfinilo, alquil de (Ci-C4)-sulfonilo, alcoxi de (Ci-C4)-carbonilo o alquil de (Ci-C4)-carbonilo; RD5 es hidrógeno, alquilo de (Ci-C6), cicloalquilo de (C3-C6), alquenilo de (C2-C6), alquinilo de (C2-C6), cicloalquenilo de (C5-C6), fenilo o heterociclilo de 3 a 6 miembros que contiene vD heteroátomos tomados entre el conjunto que consiste en nitrógeno, oxígeno y azufre, realizándose que los siete radicales mencionados en último término están sustituidos con VD sustituyentes, tomados entre el conjunto que consiste en halógeno, alcoxi de (C1-C6), halo-alcoxi de (C Ce), alquil de (Ci-C2)-sulfinilo, alquil de (CrC2)-sulfonilo, cicloalquilo de (C3-C6), alcoxi de (Ci-C4)-carbonilo, alquil de (Ci-C4)-carbonilo y fenilo y, en el caso de radicales cíclicos, también están sustituidos con alquilo de (C1-C4) y halo-alquilo de (C1-C4); RD6 es hidrógeno, alquilo de (Ci-C6), alquenilo de (C2-Ce) o alquinilo de (C2-C6), en que los tres radicales mencionados en último término están sustituidos con VD radicales tomados entre el conjunto que consiste en halógeno, hidroxi, alquilo de (C1-C4), alcoxi de (C1-C4) y alquil de (Ci-C4)-tio, o RD5 y RD6 forman en común con el átomo de nitrógeno que los lleva un anillo de pirrolidinilo o piperidinilo; RD7 es hidrógeno, alquil de (Ci-C4)-amino, di-alquil de (Ci-C )-amino, alquilo de (CrC6), cicloalquilo de (C3-C6), en que los 2 radicales mencionados en último término están sustituidos con VD sustituyentes, tomados entre el conjunto que consiste en halógeno, alcoxi de (C1-C4), halógeno-alcoxi de (C1-C6) y alquil de (Ci-C4)-tio y en el caso de radicales cíclicos, también están sustituidos con alquilo de (C1-C4) y halo-alquilo de (CrC4); np es 0, 1 o 2; ITID es 1 o 2; vD es 0, 1 , 2 o 3; de entre éstos se da la preferencia a los compuestos del tipo de las N-acil-sulfonamidas, por ejemplo de la fórmula (S-V) siguiente, que son conocidos, por ejemplo, a partir del documento WO 97/45016 en la que RD7 significa alquilo de (Ci-C6), cicloalquilo de (C3-C6), en que los 2 radicales mencionados en último término están sustituidos con vD sustituyentes, tomados entre el conjunto que consiste en halógeno, alcoxi de (C1-C4), halógeno-alcoxi de (CrC6) y alquil de (Ci-C4)-tio y, en el caso de radicales cíclicos, también están sustituidos con alquilo de (CrC4) y halo-alquilo de (C1-C4); RD4 significa halógeno, alquilo de (C1-C4), alcoxi de (C1-C4), CF3; mD significa 1 o 2; vD es 0, 1 , 2 o 3; y también acilsulfamoílbenzamidas, por ejemplo de la siguiente fórmula (S-VI), que son conocidas, por ejemplo, a partir del documento WO 99/16744, por ejemplo aquellas en que RD5 = ciclopropilo y (RD4) = 2-OMe ("ciprosulfamida", S3-1), RD5 = ciclopropilo y (RD4) = 5-CI-2-OMe (S3-2), RD5 = etilo y (RD4) = 2-OMe (S3-3), RD5 = isopropilo y (RD4) = 5-CI-2-OMe (S3-4) y RD5 = isopropilo y (RD4) = 2-OMe (S3-5); y también compuestos del tipo de las N-acilsulfamoílfenilureas de la fórmula (S-VII), que son conocidos, por ejemplo, a partir del documento EP-A-365484 en la que RD8 y RD9 independientemente uno de otro son hidrógeno, alquilo de (Ci-C8), cicioalquilo de (C3-C8), alquenilo de (C3-C6), alquinilo de (C3-C6), RD4 es halógeno, alquilo de (C1-C4), alcoxi de (C1-C4), CF3 mD es 1 o 2; de ellos en particular 1-[4-(N-2-metoxibenzoilsulfamoil)fenil]-3-metil-urea, 1-[4-(N-2-metoxibenzoílsulfamoíl)fenil]-3,3-dimetil-urea, 1-[4-(N-4,5-dimetilbenzoílsulfamoíl)fenil]-3-metil-urea, 1-[4-(N-naftoílsulfamoíl)fenil]-3,3-dimetil-urea, G) compuestos activos de la clase de los compuestos hidroxiaromáticos y de los derivados de ácidos carboxílicos aromático-alifáticos, por ejemplo 3,4,5-triacetoxi-benzoato de etilo, ácido 3,5-dimetoxi-4-hidroxi-benzoico, ácido 3,5-dihidroxi-benzoico, ácido 4-hidroxi-salicílico, ácido 4-fluoro-salicílico, 1 ,2-dihidro-2-oxo-6-trifluorometil-piridina-3-carboxamida, ácido 2-hidroxi-cinámico, 2,4-dicloro-cinámico, tal como se describen en los documentos WO 2004084631 , WO 2005015994, WO 2006007981 y WO 2005016001 ; H) compuestos activos de la clase de las 1,2-dihidroquinoxalin-2-onas, por ejemplo 1-metil-3-(2-tienil)-1 ,2-dihidroquinoxalin-2-ona, 1-metil-3-(2-tienil)-1 ,2-dihidro-quinoxalin-2-tiona, hidrocloruro de 1-(2-aminoetil)-3-(2-tienil)-1 ,2-dihidro-quinoxalin-2-ona, 1-(2-metilsulfonilaminoetil)-3-(2-tienil)-1 ,2-dihidro-quinoxalin-2-ona, tal como se describen en el documento WO 2005112630, I) compuestos activos que, además de una acción herbicida contra plantas dañinas, tienen también una acción como antídoto sobre plantas cultivadas tales como arroz, tales como por ejemplo "dimepiperato" o "MY-93" (véase el Manual de los Plaguicidas) (= piperidina-1-tio-carboxilato de S-1-metil-1-fenil-etilo), que es conocido como antídoto para arroz contra daños causados por el herbicida molinato, "daimurón" o "SK 23" (véase el Manual de los Plaguicidas) (= 1 -(1 -metil-1 -fenil-etil)-3-p-tolil-urea), que es conocido como antídoto para arroz contra daños causados por el herbicida imazosulfurón, "cumilurón" = "JC-940" (= 3-(2-clorofen¡lmetil)-1-(1 -met¡l-1-fen¡l-et¡l)urea, véase el documento de solicitud de patente japonesa JP-A-60087254), que es conocido como antídoto para arroz contra daños causados por algunos herbicidas, "metoxifenona" o "NK 049" (= 3,3'-dimetil-4-metoxi-benzofenona), que es conocido como antídoto para arroz contra daños causados por algunos herbicidas, "CSB" (= 1-bromo-4-(clorometilsulfonil)benceno) (CAS N° de Reg. 54091 -06-4 de Kumiai), que es conocido como antídoto contra daños causados por algunos herbicidas en arroz, K) compuestos de la fórmula (S-IX), como se describen en el documento WO-A-1998/38856 en que los símbolos e índices tienen los siguientes significados: RK\ RK2 independientemente uno de otro, son halógeno, alquilo de (C1-C4), alcoxi de (C1-C4), halo-alquilo de (C1-C4), alquil de (Ci-C4)-amino, di-alquil de (C1-C4)-amino, nitro; AK es COORK3 O COORK4 RK3, RK4 independientemente uno de otro, son hidrógeno, alquilo de (C1 -C4), alquenilo de (C2-C6), alquinilo de (C2-C4), cianoalquilo, halo-alquilo de (d-C4), fenilo, nitrofenilo, bencilo, halobencilo, piridinilalquilo o alquilamonio, n« 6 o 1 n«2, nK3 independientemente uno de otro, son 0, 1 o 2 de manera preferida: (difenilmetoxi)acetato de metilo (CAS N° de Reg.: 41858-19-9), compuestos de la fórmula (S-X), como se describen en el documento WO A-98/27049 en que los símbolos é índices tienen los siguientes significados: XL es CH o N, nL para el caso de que sea X = N, es un número entero de 0 hasta 4 y para el caso de que sea X = CH, es un número entero de 0 hasta 5, RL es halógeno, alquilo de (C1 -C4), halo-alquilo de (CrC4), alcoxi de (CrC4), halo-alcoxi de (Ci-C4), nitro, alquil de (CrC4)-tio, alquil de (Ci-C4)-sulfonilo, alcoxi de (Ci-C4)-carbonilo, fenilo opcionalmente sustituido, fenoxi opcionalmente sustituido, RL2 es hidrógeno o alquilo de (C1-C4), RL3 es hidrógeno, alquilo de (Ci-C8), alquenilo de (C2-C4), alquinilo de (C2-C ) o arilo, en que cada uno de los radicales que contienen carbono, antes mencionados, está sin sustituir o sustituido con uno o varios, de manera preferida hasta tres, radicales idénticos o diferentes tomados del conjunto que se compone de halógeno y alcoxi; o sus sales.
M) compuestos activos de la clase de las 3-(5-tetrazolilcarbonil)-2-quinolonas, por ejemplo 1 ,2-dihidro-4-hidroxi-1-etil-3-(5-tetrazolilcarbonil)-2-qu¡nolona (CAS N° de Reg.: 219479-18-2), 1 ,2-dihidro-4-hidroxi-1 -metil-3-(5-tetrazolil-carbonil)-2-quinolona (CAS N° de Reg.: 95855-00-8), tal como se describen en el documento WO-A-1999000020, N) Compuestos de las fórmulas (S-XI) o (S-XII) tal como se describen en los documentos WO-A-2007023719 y WO-A- 2007023764 (S-XI) (S-XI I) en las que RIM1 es halógeno, alquilo de (C1-C4), metoxi, nitro, ciano, CF3, OCF3 Y, Z independientemente uno de otro son O o S, ?? es un número entero de 0 hasta 4, RN2 es alquilo de (CrC16), alquenilo de (C2-C6), cicloalquilo de (C3-C6), arilo; bencilo, halobencilo, RN3 es hidrógeno, alquilo de (C1-C6) ; O) uno o más compuestos tomados del conjunto que consiste en: anhídrido de ácido 1 ,8-naftálico, fosforoditioato de ?,?-dietilo y S-2-etiltio-etilo (disulfotón), metilcarbamato de 4-cloro-fenilo (mefenato), fosforotioato de 0,0-dietil-O-fenilo (dietolato), ácido 4-carboxi-3,4-dihidro-2H-1 -benzopirano-4-acético (CL-304415, CAS N° de Reg.: 31541-57-8), 1 -oxa-4-azaespiro[4.5]decano-4-carboditioato de 2-propenilo (MG-838, CAS N° de Reg.: 133993-74-5), [(3-OXO-1 H-2-benzotiopiran-4(3H)-iliden)metoxi]acetato de metilo (a partir del documento WO-A-98/13361 ; CAS N° de Reg.: 205121-04-6), cianometoxiimino(fenil)acetonitrilo (ciometrinilo), 1 ,3-dioxolan-2-ilmetoxiimino(fenil)acetonitrilo (oxabetrinilo), O-1 ,3-dioxolan-2-ilmetil-oxima de 4'-cloro-2,2,2-trifluoro-acetofenona (fluxofenim), 4,6-dicloro-2-fenilpirimidina (fenclorim), 2-cloro-4-trifluorometil-1 ,3-tiazol-5-carboxilato de bencilo (flurazol), 2-diclorometil-2-metil-1 ,3-dioxolano (MG-191), incluyendo a los estereoisómeros y a las sales habituales en la agricultura.
También es posible una mezcla con otros compuestos activos conocidos, tales como fungicidas, insecticidas, acaricidas, nematicidas, repelentes de pájaros, nutrientes de plantas y agentes mejoradores de la estructura de los suelos.
Algunos de los antídotos ya son conocidos como herbicidas y, por consiguiente, además de la acción herbicida contra plantas dañinas, también actúan protegiendo a las plantas cultivadas.
Las relaciones ponderales del herbicida (la mezcla de herbicidas) al antídoto dependen en general de la tasa de aplicación del (de los) herbicida(s) y de la eficacia del antídoto en cuestión y pueden variar dentro de amplios límites, por ejemplo en el intervalo de 200:1 a 1:200, de manera preferida de 100:1 a 1:100, en particular de 20:1 a 1 :20. Los antídotos se pueden formular de una manera análoga a la de los compuestos de la fórmula (I) o sus mezclas con otros herbicidas/plaguicidas y se pueden poner a disposición y utilizar como una formulación acabada o una mezcla en depósito con los herbicidas.
La tasa de aplicación requerida del compuesto de la fórmula (I) varía dependiendo, entre otras cosas, de condiciones externas tales como la temperatura, la humedad y el tipo del herbicida usado. Ella puede variar dentro amplios límites, por ejemplo entre 0,001 y 10.000 o más g/ha de la sustancia activa; sin embargo, está situada de manera preferible entre 0,5 y 5.000 g/ha, de manera particularmente preferible entre 0,5 y 1.000 g/ha y de manera muy particularmente preferible entre 0,5 y 500 g/ha.
Cuando la planta transgénica del invento contiene uno o más otros genes para tolerancia a otros herbicidas (tal como, por ejemplo, un gen que codifica una EPSPS mutada o no mutada que confiere a la planta tolerancia a herbicidas del tipo de glifosato o un gen de pat o bar que confiere tolerancia a herbicidas del tipo de glufosinato), o cuando la planta trasnsgénica es resistente de modo natural a otro herbicida (tal como una tolerancia a sulfonilureas), el método de acuerdo con el invento puede comprender la aplicación simultánea o escalonada cronológicamente de un agente inhibidor de las HPPD en combinación con dicho(a) herbicida o combinación de herbicidas, por ejemplo herbicidas de los tipos de glifosato y/o glufosinato y/o sulfonilurea.
El invento se refiere también al uso del gen quimérico que codifica la HPPD del invento como un gen marcador durante la transformación de una especie de planta, basándose en la selección entre los antes mencionados herbicidas inhibidores de las HPPD.
El presente invento se refiere también a un método para obtener una planta resistente a un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona o un pirazolinato, caracterizado porque la planta es transformada con un gen quimérico que expresa en la planta una HPPD del invento tal como se ha definido en el presente contexto.
En una particular forma de realización, el invento se refiere a dicho método para obtener una planta resistente a un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona o un pirazolinato, caracterizado porque la HPPD del invento comprende la SEQ ID No. 4 (desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387), o un ADN sintético que codifica la HPPD del invento adaptada al trato con codones de maíz, arroz, trigo, especies de soja, caña de azúcar, cebolla, plantas de la especie Brassica, o algodón.
En otra particular forma de realización, el invento se refiere a dicho método para obtener una planta resistente a un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona, seleccionado entre tembotriona, mesotriona, dicetonitrilo, isoxaflutol, sulcotriona, tefuriltriona y biciclopirona.
En otra particular forma de realización, el invento se refiere a dicho método para obtener una planta resistente a un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona o un pirazolinato, caracterizado porque la planta también comprende un gen quimérico expresable en plantas que codifica una enzima PDH (prefenato deshidrogenasa), o una enzima con por lo menos PDH.
El invento se refiere también a un método para reprimir malezas en una zona o un campo, cuyo método comprende plantar en esta(e) zona o campo unas plantas transformadas resistentes a un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona o un pirazolinato, que se han obtenido de acuerdo con el método que se ha descrito más arriba, o unas semillas transformadas que se originan a partir de ellas, y aplicar una dosis, que es tóxica para las malezas de dicho agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona o un pirazolinato sin afectar de manera significativa a dichas semillas transformadas ni a dichas plantas transformadas.
El invento se refiere también a un método para obtener un aceite o una harina, que comprende hacer crecer una planta transformada resistente a un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona o un pirazolinato, que se ha obtenido de acuerdo con el método antes descrito, o una semilla transformada que se origina a partir de dicha planta, tratar opcionalmente dicha planta o semilla con un agente inhibidor de las HPPD del tipo de un pirazolinato, cosechar los granos y moler los granos para producir una harina y extraer el aceite.
El invento se refiere también al uso de una HPPD del invento tal como se ha descrito más arriba, caracterizado porque el agente inhibidor de las HPPD es un agente inhibidor de las HPPD del tipo de una tricetona, seleccionado entre tembotriona, mesotriona, topramezona, biciclopirona, tefuriltriona y sulcotriona.
El presente invento se refiere también a un organismo anfitrión, en particular a células de plantas o a plantas, que contienen un gen quimérico que comprende una secuencia que codifica una HPPD de acuerdo con el invento, y que también contiene un gen que es funcional en este organismo anfitrión permitiendo la sobreexpresión de una enzima prefenato deshidrogenasa (abreviada aquí como PDH).
El término "enzima PDH", tal como se usa aquí, se refiere a cualquier enzima PDH natural o mutada que exhiba la actividad de PDH de conversión del prefenato en HPP. En particular, dicha enzima PDH se puede originar a partir de cualquier tipo de organismo. Una enzima con actividad de PDH puede ser identificada por cualquier método que haga posible o bien medir la disminución en la cantidad del substrato prefenato, o medir la acumulación de un producto derivado de la reacción enzimática, es decir HPP o uno de los cofactores NADH o NADPH.
Muchos genes que codifican enzimas PDH se describen en la bibliografía y sus secuencias se pueden identificar en el sitio web http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/. Particularmente conocido es el gen que codifica la enzima PDH de la levadura Saccharomyces cerevisiae (N° de Acceso S46037) tal como se describe en la cita de Mannhaupt y colaboradores ( 989) Gene 85, 303-3 , de una bacteria del género Bacillus, en particular de la especie B. subtílis (N° de Acceso P20692) tal como se describe en la cita de Henner y colaboradores (1986) Gene 49 (1 ) 147-152, de una bacteria del género Escherichia, en particular de la especie E. coli (N° de Acceso KMECTD) tal como se describe en la cita de Hudson y colaboradores (1984) J. Mol. Biol. 180(4), 1023-1051 , o de una bacteria del género Erwinia, en particular de la especie E. herbicola (N° de Acceso S29934) tal como se describe en la cita de Xia y colaboradores (1992) J. Gen. Microbiol. 138(7), 1309-1316.
El invento se refiere además a un método para obtener un organismo anfitrión, particularmente una célula de planta o una planta, que es resistente a un agente inhibidor de la HPPD, por integración en dicho organismo de por lo menos una secuencia de ácido nucleico o un gen quimérico tal como antes se ha definido, y por transformación ulterior de ella, de manera simultánea o sucesiva, con un gen que es funcional en este organismo anfitrión permitiendo la expresión de una enzima PDH (prefenato deshidrogenasa).
En una particular forma de realización, el invento se refiere a un método para obtener un organismo anfitrión, particularmente una célula de planta o una planta, que es resistente a un agente inhibidor de la HPPD del tipo de una tricetona o un pirazolinato, particularmente tembotriona, mesotriona topramezona, biciclopirona, tefuriltriona o sulcotriona.
Medios y métodos que se podrían usar para obtener un organismo anfitrión, particularmente una célula de planta o una planta, transformado(a) tanto con un gen que permite una sobreexpresión de una enzima HPPD, y con un gen que permite una sobreexpresión de una enzima PDH, se describen extensamente en el documento WO 04/024928, cuyo contenido es incorporado por la presente por su referencia.
La referencia hecha en esta memoria descriptiva a cualquier publicación anterior (o información derivada de ella) o a cualquier materia que sea conocida, no se toma, ni se deberá tomar, como un reconocimiento o una admisión o cualquier forma de sugerencia de que dicha publicación anterior (o anterior) o materia conocida forma parte del conocimiento general común en el campo de este invento.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS FIG.1 Mapa del plásmido pSE420::FMP27e FIG.2 Mapa del ADN-T introducido dentro de las plantas de tabaco FIG.3 Mapa del ADN-T introducido en las diferentes plantas de acuerdo con los Ejemplos 5 hasta 13; Abreviaturas que tienen los siguientes significados A, B, C y G, plantas de tabaco, D, E, y F, plantas de Zea mays, H, Plantas de soja, I, Plantas de arroz y J, plantas de algodón. 35S: promotor de CaMV35S, KanR: gen que confiere resistencia al antibiótico kanamicina, nos: promotor de nopalina sintasa, Ter: terminador, H6: secuencia que codifica una marca de His TAG, OTP: péptido de tránsito optimizado, genes de BAR (resistentes a bialafos documento WO 8705629) y de PAT (fosfinotricina N-acetiltransferasa, documento EP 257542): que confieren tolerancia a bialafos, fosfinotricina o glufosinato, 2mEPSPS: gen que codifica la EPSPS (5-enolpiruvilshikimato sintasa) doble mutante (Thr102lle y Pro106Ser) procedente de Zea mays (documento US 20030027312), 2mAHAS: gen que codifica la ALS (acetolactato sintasa) doble mutante procedente de Arabidopsis (Pro197Ala y Trp574Leu); documento US 5378824, HA: promotor de histona procedente del gen de Arabidopsis, TEV: virus de corrosión del tabaco, FMP27e: gen que codifica una FMP27 optimizada para la expresión en E coli con una secuencia que codifica una marca His junto a su extremidad 5', FMP27t: gen que codifica una FMP27 optimizada para la expresión en plantas dicotiledóneas con una secuencia que codifica una marca His junto a su extremidad 5', FMP27t-h, un gen que codifica una FMP27 optimizada para la expresión en plantas dicotiledóneas, FMP27m, un gen que codifica una FMP27 optimizada para la expresión en plantas de Zea mays, LB, borde izquierdo, RB, borde derecho.
LISTA DE SECUENCIAS SEQ ID No. 1 : Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida SEQ ID No. 2: Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para E. coli, que contiene en el extremo 5' un ácido nucleico que codifica un aminoácido alanina y 6 aminoácidos histidina.
SEQ ID No. 3: Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para Nicotiana tabaccum, que contiene en el extremo 5' una secuencia de ácido nucleico que codifica un péptido de tránsito optimizado y una marca HIS.
SEQ ID No. 4: Secuencia de aminoácidos de la HPPD de Kordia algicida derivada de la SEQ ID No. 1 SEQ ID No. 5: Proteína codificada por la SEQ ID No. 2 SEQ ID No. 6: Secuencia de aminoácidos de la HPPD de Kordia algicida (SEQ ID No. 4) fusionada con un OTP (péptido de tránsito optimizado (documento WO 2009/144079)) SEQ ID No. 7: Proteína codificada por la SEQ ID No. 3 SEQ ID No. 8: Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Arabidopsis thaliana SEQ ID No. 9: Secuencia de aminoácidos de la HPPD de Arabidopsis thaliana SEQ ID No. 10 Proteína codificada por la SEQ ID No. 8 más una adicional alanina directamente corriente abajo del inicial aminoácido metionina seguido por 6 aminoácidos histidina SEQ ID No. 11 : Proteína de la SEQ ID No. 9 más la secuencia de OTP situada junto al extremo terminal de N de la proteína SEQ ID No. 12: Proteína de la SEQ ID No. 10 más la secuencia de OTP directamente situada junto al extremo terminal de N de la proteína SEQ ID No. 13 Secuencia de cebador de Xho-OTP-for SEQ ID No. 1 Secuencia de cebador de Ncol-OTP-rev SEQ ID No. 15 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas dicotiledóneas SEQ ID No. 16: Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Zea mays SEQ ID No. 17 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Brassica napus SEQ ID No. 18 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Beta vulgaris SEQ ID No. 19 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Gossypium hirsutum SEQ ID No. 20 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Glycine max SEQ ID No. 21 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Hordeum vulgare SEQ ID No. 22 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Oryza sativa SEQ ID No. 23 Secuencia de ácido nucleico que codifica la HPPD de Kordia algicida optimizada para plantas de Triticum aestivum EJEMPLOS Los diversos aspectos del invento serán comprendidos mejor con la ayuda de los ejemplos experimentales que siguen. Todos los métodos o todas las operaciones que se describen seguidamente en estos ejemplos se dan por vía de ejemplo y corresponden a una elección que se hace entre los diferentes métodos que están disponibles para llegar al mismo resultado o a uno similar. Esta elección no tiene ningún efecto sobre la calidad del resultado y, como consecuencia, cualquier método apropiado se puede usar por la persona experta para llegar al mismo resultado o a uno similar. La mayoría de los métodos para manipular fragmentos de ADN se describen en la obra "Current Protocols en Molecular Biology" Volúmenes 1 y 2, Ausubel F.M. y colaboradores, publicado por Greene Publishing Associates y Wiley Interscience (1989) o en la obra Molecular cloning, T. Maniatis, E.F. Fritsch, J. Sambrook, 1982, o en Sambrook J. y Russell D., 2001 , Molecular Cloning: a laboratory manual (Tercera edición) Ejemplo 1 Preparación de la HPPD de Kordia algicida (que se denomina FMP27e) de la SEQ ID No. 5 y de la HPPD de Arabidopsis thaliana identificada por la SEQ ID No. 10.
La secuencia codificadora de la HPPD de Arabidopsis thaliana AtHPPD (de 1.335 pb (pares de bases); Genebank AF047834; documento WO 96/38567) fue clonada inicialmente dentro del vector de expresión pQE-30 (QIAGEN, Hilden, Alemania) entre los sitios de restricción con BamHI y Hindlll. El vector obtenido fue denominado "pQE30-AtHPPD".
La secuencia original de la HPPD de Kordia algicida (de 1.164 pb) que codifica la proteína listada bajo el número de acceso A9DQF2 en UniProtKB/TrEMBL, se modificó y sintetizó usando un optimizado trato con codones de Escherichia coli K12 (operón Eurofins MWG (Ebersberg, Alemania), software (programa lógico) de GENEius) y se clonó en un vector pBluescript modificado (operón Eurofins MWG operon, Ebersberg, Alemania). En este vector, la secuencia correspondiente al MCS (acrónimo de múltiple cloning site = sitio de clonación múltiple) fue eliminada parcialmente de manera tal que quedaron solamente las secuencias correspondientes a los sitios de reconocimiento por la enzima de restricción Hindlll a ambos lados del inserto.
En el extremo 5', directamente corriente abajo del ATG se introdujo una secuencia de ácido nucleico que codifica un aminoácido alanina y una secuencia de ácido nucleico que codifica una marca HIS6 terminal de N (6x HIS, codificada por: cae cat cat cae cat cat). Corriente arriba del ATG, se añadieron dos adicionales pares de bases de citosina con el fin de obtener una secuencia correspondiente al sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Ncol y corriente abajo con respecto al codón de detención se añadieron las secuencias correspondientes al sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Xbal. El resultante vector "pBluescript-FMP27e" fue digerido con las enzimas de restricción Ncol y Xbal, la banda que no migraba en la longitud del tamaño del vector de aproximadamente 3.000 pb correspondiente al ADN fue separada sobre un gel de agarosa por electroforesis. Luego, el ADN que codifica la HPPD fue purificado usando el Estuche de Extracción con Gel MinEluteTM (Qiagen, Hilden, Alemania) y clonado dentro del vector pSE420(RI)NX (véase más adelante) previamente cortado con las mismas enzimas de restricción.
El vector de clonación y expresión pSE420(RI)NX (5.261 pb) está basado en el plásmido pSE420 producido por Invitrogen (Karlsruhe, Alemania). Las modificaciones de este vector incluyen la adición de un gen de nptll (neomicina fosfotransferasa; Sambrook y Russell, 2001 , Molecular Cloning: a laboratory manual (Tercera edición)) que confiere tolerancia al antibiótico kanamicina y al que le falta la mayoría de la súper-región de engarzador (sitio de clonación múltiple).
El plásmido posee el promotor trp-lac (trc) y el gen /aclq que proporciona el represor lac en cualquier cepa anfitriona de E coli. El represor lac se fija al operador lac (lacO) y restringe la expresión del gen diana; esta inhibición puede ser aliviada por inducción con isopropil ß-D-l-tiogalactopiranosido (IPTG).
El resultante vector fue denominado "pSE420(RI)NX-FMP27e" (véase la Figura 1 ) y fue usado para transformar células de Escherichia coli BL21 (Merck, Darmstadt, Alemania).
Para la AtHPPD (HPPD de Arabidopsis thaliana) que se usó como referencia, véase el documento WO 2009/144079.
La expresión de HPPD se llevó a cabo en E. coli K-12 BL21 que contiene pQE30-AtHPPD o pSE420(RI)NX-FMP27e. Las células se dejaron crecer hasta que la OD (acrónimo de Optical Density = densidad óptica) llegó a 0,5, luego se inició la expresión desde el promotor trp-lac (trc) por inducción con 1 mM de IPTG que se fija al represor lac y causa su disociación desde el operón lac. La expresión se llevó a cabo durante 15 h a 28 °C.
Para preparar el cultivo pre-iniciador, 2 mi del medio TB (100 pg*m 1 de carbenicilina) se inocularon con 50 µ? de una carga original de E. coli K-12 BL21 en glicerol. El cultivo pre-iniciador se incubó a 37 °C con agitación a 140 rpm (revoluciones por minuto) durante 15 h. 200 µ? del cultivo pre-iniciador se usaron para iniciar al cultivo iniciador (5 mi de suplemento TB con 100 pgT1), que se incubó durante 3 h a 37 °C.
Para preparar el cultivo principal, 400 mi del medio TB (100 pg*ml"1 de carbenicilina) se inocularon con 4 mi del cultivo iniciador. Este cultivo iniciador se incubó a 37 °C con agitación a 140 rpm hasta que se alcanzó una OD6oo de 0,5. Luego se indujo la expresión de la proteína recombinante con 400 µ? de una solución 1 M de IPTG. Las células se dejaron crecer durante una hora adicional en estas condiciones, luego la temperatura se disminuyó a 28°C y el cultivo se agitó a 140 rpm durante 15 h. Las células se cosecharon por centrifugación a 6.000 x g durante 15 min at 4 °C. Luego los sedimentos de células se almacenaron a -80 °C.
Aislamiento y purificación de His6-AtHPPD y His6-FMP27e en forma natural Lisis de células Las células fueron lisadas usando lisozima, una enzima que disocia los enlaces 1 ,4-ß entre residuos de ácido N-acetilmurámico y de N-acetil-D-glucosamina en un péptidoglicano que forma la pared celular de las bacterias. Las membranas celulares fueron luego rotas por la presión interna de la célula de bacteria. Por añadidura, el tampón de lisis contenía la Nucleasa Benzonase®, que es una endonucleasa que hidroliza a todas las formas de ADN y ARN sin dañar a las proteínas y de esta manera reduce ampliamente la viscosidad del material lisado celular. La lisis en condiciones naturales se llevó a cabo sobre hielo.
Para la purificación de proteínas marcadas con Hise se usó el Estuche de Iniciación Rápida QIAexpress® Ni-NTA Fast Start, siguiendo las instrucciones del manual de los usuarios.
Purificación de proteínas marcadas con His6 por cromatografía de afinidad de iones metálicos inmovilizados (IMAC = acrónimo de immobilized metal ion affinity chromatography) El material lisado de células despejado (10 mi), obtenido después de centrifugación de la masa de reacción de lisis se cargó sobre una Columna de Iniciación Rápida Ni-NTA Fast Start Column procedente del Estuche QIAexpress® Ni-NTA Fast Start Kit (Qiagen, Hilden, Alemania) y la purificación se llevó a cabo de acuerdo con el manual de instrucciones. La proteína marcada con His6 fue eluída con 2,5 mi del tampón de elución.
Desalinización de las soluciones de HPPD mediante filtración en gel.
Unas soluciones de HPPD, eluídas a partir de una Columna de Iniciación Rápida Ni-NTA Fast Start con 2,5 mi de un tampón de elución, fueron aplicadas a una columna Sephadex G-25 PD-10 column (GE Healthcare, Freiburg, Alemania) siguiendo las instrucciones del manual de los usuarios. Después de que la totalidad de la muestra hubo entrado en el lecho de gel, se realizó una elución con 3,5 mi de un tampón de almacenamiento.
Las soluciones de HPPD, eluidas a partir de la columna de desalinización, fueron congeladas a -80 °C en partes alícuotas de 1 mi.
Determinación de la concentración de la proteína de HPPD usando el ensayo de proteínas de Bradford.
La concentración de la proteína fue determinada usando el ensayo de Bradford normalizado (Bradford, (1976), Anal Biochem 72: 248-254).
Determinación de la pureza de las soluciones de HPPD usando una SDS-PAGE (electroforesis en gel de SDS-poli(acrilamida)) La integridad de la proteína eluída se comprobó mediante una electroforesis en gel de proteína SDS-PAGE usando el gel NuPAGE® Novex 4-12 % Bis-Tris Gels (Invitrogen, Karlsruhe, Alemania), se cargaron aproximadamente 10 g de proteína. 10 µ? del Tampón de Muestra de Laemmli se añadieron a 1-10 µ? de una solución de proteína y la mezcla se incubó a 90 °C durante 10 min. Después de una corta operación de centrifugación, toda la mezcla fue cargada dentro de una rendija de un gel de SDS previamente fijado en una cámara de gel XCell SureLock™ Novex Mini-Cell rellena con un Tampón de Elución NuPAGE® MOPS SDS Running Buffer (diluido a partir de la solución 20 x con ddH20). Luego se aplicó un voltaje de 150 V a la cámara de gel durante 1 h. Para la tinción de bandas de proteínas, el gel fue sumergido en una Solución de Tinción Coomassie Brilliant Blue R-250. Para la destinción del gel de poll(acrilamida), éste fue sumergido en una Solución de Destinción Coomassie Brilliant Blue R-250 hasta que las bandas de la proteína aparecieron de color azul sobre un gel de color blanco.
Ejemplo 2 Caracterización cinética y evaluación de la tolerancia a agentes inhibidores de las HPPD de las enzimas HPDD "SEQ ID No. 5" y "SEQ ID No. 10".
La actividad de las HPPD fue comprobada por el ensayo espectrofotométrico clásico (método descrito extensamente en el documento WO 2009/144079) Determinación de las propiedades cinéticas in vitro de las HPPD Los valores de Km, Vmax y kcat para diferentes preparaciones de enzimas HPPD y los valores de K¡, Ki=Kon, y ?.?=?0« para diferentes agentes inhibidores de las HPPD fueron determinados usando un ensayo de HPLC (cromatografía de fase líquida de alto rendimiento) para mediciones de la actividad de las HPPD. Las mezclas de ensayo contenían, en un volumen de 1 mi, 150 mM de un tampón de Tris-HCI a un pH de 7,8, 10 mM de ascorbato de sodio, 650 unidades de catalasa bovina (Sigma C30 (Sigma-Aldrich, Munich, Alemania), 34 mg de proteína/ml, 23.000 unidades/mg), y apropiadas cantidades del HPP, de la enzima HPPD purificada y de los agentes inhibidores de las HPPD. Para la determinación de los valores de Km, Vmax y kcat las concentraciones de HPP en la mezcla de ensayo se hicieron variar entre 10 y 400 µ?. Para la determinación de los valores de K¡, Ki=Kon, y K.i=K0ff se usaron 2 mM de HPP. Todos los ensayos se comenzaron mediante la adición de una enzima HPPD a la mezcla de ensayo y se detuvieron en una serie de momentos entre 0 y 240 s (segundos) por adición de 200 µ? de la mezcla de reacción a unos tubos de ensayo para reacción, que contenían 20 µ? de ácido perclórico al 10 %. La proteína precipitada se sedimentó mediante una centrifugación durante 5 minutos a 10.000 xg. 100 µ? del material sobrenadante se cargaron sobre una columna de Knauer (Berlín, Alemania) Eurospher 100-5 C18 de 250 x 4 mm, equilibrada con 10 % de metanol y 0,1 % de ácido trifluoroacético (tampón A). La columna fue eluída, también a razón de 1 ,5 ml/min, usando un lavado durante 4 minutos con el tampón A, seguido por un lavado durante 3 minutos con metanol al 95 % y por un lavado durante 2 minutos adicionales con el tampón A. La elución del HGA (ácido homogentísico) y del HPP (hidroxifenilpiruvato) se vigiló a 292 nm. El HGA se eluye en alrededor de 5 minutos y el HPP se eluye más tarde. Un conjunto patrón de concentraciones de HGA se usaron para proporcionar una curva patrón con el fin de calibrar la absorbencia a 292 nm del pico de HGA en función de la concentración de HGA.
Para las determinaciones de los valores de Km y Vmax, las velocidades iniciales de la reacción de HPPD en diferentes concentraciones del substrato se determinaron a partir de representaciones gráficas del HGA formado como una función del tiempo y se acoplaron con la ecuación de Michaelis-Menten para enzimas unirreactivas usando la sucesión de programas lógicos ID Business Solutions Ltd. (www.idbs.com) XLfit software suite. Para la determinación de los valores de K¡, Ki=Kon, y K.i=K0ff los cursos de tiempo de la reacción de HPPD con diferentes concentraciones de los inhibidores fueron acoplados con las ecuaciones para el Mecanismo A, inhibición competitiva, para inhibidores de fijación apretada (Cha, S. (1975) Tight-binding inhibitors - I. Kinetic behaviour [inhibidores de fijación apretada - I. Comportamiento cinético]. Biochemical Pharmacology 24, 2177-2185) usando la sucesión de programas lógicos ID Business Solutions Ltd. XLfit software suite Tabla 1 Caracterización cinética de las enzimas HPPD (de Arabidopsis thaliana "SEQ ID No. 10" y de Kordia algicida "SEQ ID No. 5") y su respectiva tolerancia a los agentes inhibidores de las HPPD tembotriona y dicetonitrilo.
En la Tabla 1 dada seguidamente, "Km" (la constante de Michaelis-Menten) significa el parámetro cinético que se usa para caracterizar a una enzima, y es definida como la concentración del substrato que permite una velocidad semimáxima de la reacción. La Km es definida adicionalmente como la concentración del substrato con la que la velocidad de reacción alcanza la mitad de su valor máximo (l/max/2) en que Vmax tiene el significado de ser la velocidad máxima de la reacción.
Kon=Ki es igual a la constante de velocidad de asociación de la fijación entre la enzima y el substrato y K0ff=K.i es igual a la constante de velocidad de la disociación del complejo de enzima e inhibidor. K¡ define a la constante de inhibición En la anterior Tabla 1, puede verse con claridad que mientras que los parámetros cinéticos Km y Vmax de la HPPD de bacteria "SEQ ID No. 5" y de la HPPD de planta "SEQ ID No. 10" ya mostraron diferencias significativas (6,3 µ? frente a 292 µ?) que son incluso mayores en lo concerniente al nivel de tolerancia a tembotriona (0,015 µ? frente a 33 µ?) y a dicetonitrilo (0,018 µ? frente a 15 µ?). La HPPD de bacteria "SEQ ID No. 5" era muchísimo más tolerante a los agentes inhibidores de las HPPD ensayados que la HPPD de planta "SEQ ID No. 10".
Determinación de la actividad de las HPPD en presencia de diversos agentes inhibidores de las HPPD En este contenido, el valor de piso significa el valor del logaritmo de la concentración del agente inhibidor que es necesaria para inhibir el 50 % de la actividad de una enzima en concentración molar.
Los valores de pl50 para los agentes inhibidores de las HPPD se determinaron a partir de representaciones gráficas de dosis y respuesta de la actividad de una HPPD como una función de la concentración del agente inhibidor, usando el ensayo descrito extensamente en el documento WO 2009/144079 en una concentración de HPP fijada en 2 mM y un período de tiempo de incubación fijado de 3 minutos usando la sucesión ID Business Solutions Ltd. XLfit software suite.
Tabla 2: Determinación del pl50 de enzimas HPPD (de Arabidopsis thaliana "SEQ ID No. 10" y de Kordia algicida "SEQ ID No. 5") y sus respectivas tolerancias a los diversos agentes inhibidores de la HPPD enumerados seguidamente: tembotriona, dicetonitrilo, mesotriona, biciclopirona, pirasulfotol, sulcotriona, pirazolato, tefuriltriona y benzofenap. El símbolo "»" significa que el valor era muchísimo más alto que el indicado pero no podría ser calculado con exactitud dentro del intervalo de concentraciones del agente inhibidor ensayado (2,5x10"6, 5,0x10"6, 1 ,0x10"5, 2,5x10"5, 6,3x10-5, 2,5x10" M).
Tabla 3: Determinación del porcentaje de inhibición en presencia de 5,0x10"6 M de agentes inhibidores comparado con la actividad medida en ausencia del agente inhibidor para la HPPD originada a partir de Arabidopsis thaliana (SEQ ID No. 10) y a partir de Kordia algicida (SEQ ID No. 5).
En las anteriores Tablas 2 y 3, puede verse con claridad, que la HPPD bacteriana "SEQ ID No. 5" mostró un superior nivel de tolerancia a todos los agentes inhibidores de las HPPD ensayados que la planta en todas las concentraciones de agentes inhibidores de las HPPD que el que se observó empleando la HPPD "SEQ ID No. 10" en idénticas condiciones experimentales.
Ejemplo 3: Construcción de genes quiméricos para la evaluación de la tolerancia a herbicidas inhibidores de las HPPD en plantas de tabaco.
A) Construcción de los genes quiméricos El vector pRP-RD224 (que se describe extensamente en el documento WO 2009/144079) que contiene la secuencia que codifica el OTP se usó para la fijación mediada por PCR corriente arriba de la secuencia de ácido nucleico correspondiente al sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Xhol y corriente abajo de la secuencia de ácido nucleico correspondiente al sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Ncol. El obtenido producto de la PCR fue clonado en el vector pCR®-Blunt ll-TOPO® (Invitrogen, Karlsruhe, Alemania) siguiendo las instrucciones del manual de los usuarios. El resultante vector fue denominado "pCR-TOPO-OTP". La inserción de la correcta secuencia fue confirmada por una clásica secuenciación de ADN. El ADN correspondiente al OTP fue digerido con las enzimas de restricción Ncol y Xhol, separado por apropiadas electroforesis en gel y clonado previamente dentro del plásmido pRT100 (Toepfer, (1987), Nucleic Acid Res 15:5890) y correspondientemente digerido con las enzimas de restricción Neo I y Xhol. El plásmido pRT100 contiene el promotor de CaMV35S y el terminador de CaMV35S. El resultante vector fue subsiguientemente digerido con las enzimas de restricción Ncol y Xbal. El vector pSE420(RI)NX-FMP27e (véase la Figura 1) fue sometido a las enzimas de restricción Ncol y Xbal con el fin de obtener el fragmento de ADN correspondiente a la "SEQ ID No. 2". El resultante vector fue digerido por empleo de la enzima de restricción Hindlll para subclonar la cásete CaMV35S::OTP::FMP27e::CaMV35-term (véase la Figura 2) dentro del vector binario pBin19 (Bevan (1984), Nucleic Acid Res. 12:8711-8721.) previamente digerido con la misma enzima y desfosforilado. El resultante vector fue denominado "FMP27ebv".
Los vectores pQE-30-AtHPPD se usaron para la fijación mediada por PCR de un sitio de restricción con Ncol y de una secuencia que codifica una marca Hise terminal de N para los extremos 5' y un sitio de restricción con Xbal para los extremos 3' de AtHPPD.
El producto de la PCR del gen de AtHPPD fue aislado a partir de un gel de agarosa, cortado con las enzimas de restricción Ncol y Xbal, purificado con el Estuche de Purificación por PCR MinElute™ (Qiagen, Hilden, Alemania) y clonado dentro del vector pSE420(RI)NX cortado con las mismas enzimas de restricción.
El vector generado fue denominado "pSE420(RI)NX-AtHPPD" y fue digerido con las enzimas de restricción Ncol y Xbal y clonado dentro del vector pRTIOO previamente abierto (Toepfer y colaboradores, (1987), Nucleic Acid Res 15:5890) que contiene el promotor de CaMV35S y el terminador de CaMV35S. El vector generado fue denominado "pRT100-AtHPPD".
El vector pCR-TOPO-OTP fue digerido con las enzimas de restricción Ncol y Xhol, y la banda de ADN correspondiente al OTP fue clonada dentro del vector previamente abierto pRT100-AtHPPD con las enzimas de restricción antes mencionadas. El resultante vector fue subsiguientemente digerido con la enzima de restricción Hindlll y la cásete de expresión de interés fue clonada dentro del vector binario pBin19 previamente abierto y desfosforilado. El resultante vector fue denominado "AtHPPDbv".
Los vectores binarios FMP27ebv y AtHPPDbv se usaron para transformar células competentes de Agrobacteríum tumefaciens (ATHV derivadas de EHA 01) seleccionadas sobre medios YEB suplementados con los antibióticos kanamicina y rifampicina (que se describen extensamente en el documento de solicitud de patente US005925808A).
Estas cepas de Agrobacteríum que contienen los vectores binarios de interés (FMP27ebv o AtHPPDbv) se usaron para transformar discos de hojas procedentes de plantas de tabaco Nicotiana tabacum L cv Samsun NN, que tienen aproximadamente un tamaño de 5x5 mm2, tal como se describen extensamente en la cita de Horsch y colaboradores, (1985), Science 227; 1229-1231.
Los discos de hojas fueron cultivados conjuntamente durante 2 días con células de Agrobacteríum tumefaciens que contienen o bien el vector binario FMP27ebv o el AtHPPDbv. Luego los discos de hojas fueron transferidos a un medio que permitía la regeneración de vástagos durante 6 semanas en un medio MS (de Murashige y Skoog, (1962), Physiol Plant 15(3): 473-497) suplementado con BAP (1 mg/ml; bencilaminopurina), carbenicilina (250 mg/ml), cefotaxina (250 mg/ml), kanamicina i (75 mg/ml) y tembotríona (10'6 M) Los callos regenerados fueron transferidos a un medio con el fin de inducir el desarrollo de raíces durante 6 a 12 semanas: MS (1/2), suplementado con carbenicilina (250 mg/ml), cefotaxina (250 mg/ml), kanamicina (75 mg/ml), y tembotriona (10"6 M).
Después de 6 semanas en este medio, los vástagos transformados con células de Agrobacterium tumefaciens que contienen el vector binario AtHPPDbv, fueron transferidos al mismo medio agotado con el agente inhibidor de las HPPD tembotriona.
Los resultados están recopilados en la Tabla 5 siguiente.
Durante todo el experimento, las placas que contenían los discos de hoja se colocaron dentro de una cámara de crecimiento en condiciones controladas (luz durante 16 h, noche durante 8 h, 25 °C).
Enraizamiento de callos Los callos de vástagos regenerados a partir de una célula transformada con una secuencia de ácido nucleico que codifica una HPPD que comprende la SEQ ID No. 11 (Arabidopsis thaliana) o la SEQ ID No. 7 (Kordia algicida) fueron transferidos a un medio que inducía el crecimiento de las raíces, cuyo medio fue suplementado adicionalmente con el agente inhibidor de la HPPD tembotriona durante 6 a 12 semanas. En ninguno de los sucesos que contenían la HPPD definida por la SEQ ID No. 11 (Arabidopsis thaliana) o no contenían callos transformados, se observó un crecimiento de raíces en las condiciones antes dadas. Al contrario de esto, en las condiciones idénticas, los callos que contenían la HPPD definida por la por la SEQ ID No. 7 desarrollaron manifiestamente raíces numerosas y sanas (véase la Tabla 4, siguiente).
Tabla 4 Regeneración de discos de hojas Se cortaron discos de hojas a partir de plantas que contienen las HPPD con las SEQ ID No. 11 (Arabidopsis thaliana) o SEQ ID No. 7 (Kordia algicida), seguido por una regeneración durante 6 semanas en condiciones normalizadas de cultivo en un medio MS suplementado con BAP (1 mg/ml; bencilaminopurina), carbenicilina (250 mg/ml), cefotaxina (250 mg/ml) y que comprende además uno de los agentes inhibidores dé las HPPD seguidamente enumerados en las concentraciones mencionadas (tembotriona (10"6 M), dicetonitrilo (5-10"6 M), mesotriona (10"6 M) y biciclopirona (10~6 M)), con un medio que no contiene ningún agente inhibidor de las HPPD como el testigo positivo. Al final de los experimentos se evaluó el nivel de regeneración tal como sigue: "-" significa qué los discos de hojas tenían el mismo aspecto que un disco de hoja procedente de plantas de tabaco de tipo silvestre en un medio suplementado con los agentes inhibidores antes mencionados. "++++" significa que los discos de hojas tenían un aspecto similar al de los discos de hojas procedentes de las plantas de tabaco de tipo silvestre en un medio sin ningún agente inhibidor. "+", "++", y "+++" indican que los discos de hojas regenerados fueron afectados grandemente (+), medianamente (++) y poco (+++) por la presencia de los agentes inhibidores.
Los resultados de los experimentos están recopilados en la Tabla 5.
Tabla 5: Efectos de diversos agentes inhibidores de las HPPD sobre la regeneración de un disco de hoja que se origina a partir de plantas transgénicas que comprenden un gen que codifica una HPPD obtenida a partir de Arabidopsis (SEQ ID No. 11) o a partir de Kordia algicida (SEQ ID No. 7).
Mientras que en el caso de plantas que contienen la HPPD definida por SEQ ID No. 7 (Kordia algicida) éstas muestran una regeneración igual o solo ligeramente reducida en comparación con este testigo sin tratar, las correspondientes plantas que contienen la HPPD definida por SEQ ID No. 1 1 (Arabidopsis thaliana) no muestran ninguna regeneración sino que desarrollan un fenotipo de blanqueo claramente visible en comparación con el testigo sin tratar en la presencia de todos los agentes inhibidores de HPPD ensayados.
Ejemplo 4: Pruebas en invernadero para evaluar la tolerancia a herbicidas inhibidores de las HPPD de plantas del tabaco transgénicas que expresan un gen que codifica una proteína de HPPD tolerante Preparación de linajes de plantas transgénicas que expresan enzimas HPPD o bien de Arabidopsis o de F P27. Ensayo en invernadero en cuanto a tolerancia a herbicidas.
Respuesta a tembotriona, isoxaflutol y biciclopirona Unas plantas de tabaco T0 que contenían o bien el gen procedente de Arabidopsis que codifica una HPPD o el gen FMP27e procedente de Kordia algicida que codifica una HPPD de FMP27, antes mencionados (Ejemplo 3), fueron transferidas al invernadero (28/20°C), para desarrollarse más y producir semillas. Estas semillas fueron cosechadas y colocadas sobre tierra (ED73 mezclada con arena y osmocote Pro) para germinar en el invernadero (28/20°C). Tres a cuatro semanas más tarde, unas plántulas fueron transferidas a macetas individuales que contenían la tierra antes mencionada. Dos semanas más tarde, unas plantas de un tamaño de 4-6 cm de diámetro fueron rociadas con o bien - tembotriona a razón de 100 g de ??/ha preparada a partir de una formulación WP20 (polvo humectable al 20 %) suplementada con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza, o - isoxaflutol a razón de 100 g de ??/ha preparado a partir de una formulación WP20 suplementada con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza, o - biciclopirona a razón de 100 g de: IA/ha preparada a partir de una formulación WP20 suplementada con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza, o - "formulación a ciegas" preparada a partir de una formulación WP20 sin ingrediente activo (IA) suplementada con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza, y fueron transferidas seguidamente a una cámara de crecimiento con adecuadas condiciones de luz (20.000 Lux).
Siete días después de la aplicación (DAT acrónimo de Days After The application) los síntomas en plantas transformadas fueron evaluados en comparación con la respuesta observada en las plantas de tabaco de tipo silvestre rociadas al mismo tiempo y en las mismas condiciones que las plantas de tabaco que contenían los transgenes (100 % significa que las plantas presentaron el mismo fenotipo de blanqueo que las plantas de tipo silvestre, 0 % significa que las plantas tenían el mismo aspecto que las plantas de tipo silvestre tratadas con la "formulación a ciegas", y un porcentaje intermedio representa el grado de los síntomas observados).
Tabla 6: Plantas de tabaco de tipo silvestre (A) y poblaciones de sucesos en tabaco que contienen, alternativamente, las casetes de expresión que se han descrito más arriba que tienen el promotor de CaMV 35S, la secuencia que codifica un OTP y la secuencia que codifica la HPPD de Arabidopsis (B), o el promotor de CaMV35S, la secuencia que codifica un OTP, y la secuencia FMP27e que codifica la HPPD de FMP27 (C). Las comprobaciones del daño causado por herbicidas se efectuaron a los 7 días después de la aplicación (DAT) por rociada con 100 g de ??/ha de tembotriona o isoxaflutol suplementada/o con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza. Es evidente que las plantas que contenían el gen FMP27e fueron muchísimo más tolerantes a tembotriona y isoxaflutol. Las plantas que pertenecen a las categorías (B) y (C) no han sido seleccionadas en cuanto a la presencia del respectivo transgén antes de la aplicación del herbicida. % de daño, 7 DAT, 100 g de A lA/ha De tipo silvestre de daño, 7 DAT, lA/ha % de daño, 7 DAT, 100 B IA/ha HPPDde Arabidopsis % de daño, 7 DAT, 100 g de c lA/ha FMP27e Linaje Tembotriona Isoxaflutol 121 1 0 0 121 2 0 0 121 3 0 0 121 4 0 0 121 5 5 1 121 6 5 2 121 7 5 20 121 8 10 n.d. 121 9 10 n.d. 121 10 10 n.d. 121 11 10 n.d. 121 12 10 n.d. 121 13 10 n.d. 129 1 0 0 129 2 0 0 129 3 5 0 129 4 5 0 129 5 10 1 129 6 10 1 129 7 15 1 129 8 15 2 129 9 30 2 % de daño, 7 DAT, 100 g de c lA/ha FMP27e Linaje Tembotriona Isoxaflutol 129 10 30 2 129 11 n.d. 5 129 12 n.d. 10 129 13 n.d. 10 218 1 0 0 218 2 0 0 218 3 0 0 218 4 0 0 218 5 0 0 218 6 0 0 218 7 0 0 218 8 0 0 218 9 0 0 218 10 0 1 218 11 0 1 218 12 5 1 218 13 5 2 218 14 5 3 218 15 5 5 Respuesta a biciclopirona.
Semillas de plantas de tabaco de tipo silvestre y plantas de tabaco T1 que eran portadoras del gen FMP27e procedente de Kordia algicida que codifica una HPPD fueron sembradas en un medio MS (Murashige y Skoog 964) suplementado con 50 g/l de kanamicina. Después de 4 semanas, las plántulas verdes enraizadas fueron transferidas a tierra y dejadas crecer durante 3 semanas en el invernadero tal como se ha descrito más arriba y luego rociadas con una mezcla que contiene biciclopirona (100 g de ??/ha), sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza. Las plantas fueron clasificadas en dos categorías basándose en el fenotipo desarrollado como respuesta al herbicida a los siete días después del tratamiento. La Clase I fue definida como plantas que no presentaron desde ningún daño hasta daños ligeros como respuesta al tratamiento con herbicidas (daño: 0-30 %), la Clase II fue definida como las plantas que presentaban desde fuertes daños hasta daños similares a los observados con plantas de tipo silvestre sometidas al mismo tratamiento (daño: 31-100 %). En este caso, solamente las plantas que contenían por lo menos un ADN T fueron expuestas al tratamiento con herbicida.
En general, se puede ver que las plantas que contienen un inserto de ADN T mostraban un nivel significativo suficiente de tolerancia a una exposición a una dosis en el campo del herbicida inhibidor de las HPPD biciclopirona.
Tabla 7: Las plantas que contenían la HPPD FMP27 presentaron tolerancia al herbicida inhibidor de las HPPD biciclopirona.
Puede resumirse a partir de los datos antes presentados que las plantas que expresan el gen FMP27e procedente de Kordia algicida que codifica la HPPD de FMP27, obtenidas a partir de diferentes sucesos transgénicos independientes son altamente tolerantes a varios herbicidas inhibidores de HPPD en unas dosis aplicadas en condiciones agronómicas clásicas.
Ejemplo 5: Construcción de vectores binarios para expresar diferentes variantes optimizadas de dicotiledóneas en plantas y prueba en invernadero para evaluar la tolerancia de plantas de tabaco que contienen dichas variantes.
Clonación en pBin19 de FMP27t (SEQ ID No. 3), FMP27t-h (SEQ ID No. 15) Se diseñaron un gen con un trato con codones optimizado para la expresión en plantas dicotiledóneas que codifican la proteína de HPPD FMP27, y denominado FMP27t-h (SEQ ID No. 15) y el mismo gen con unas secuencias adicionales que codifican una OTP y una marca HIS junto a su extremidad 5', denominado FMP27t (SEQ ID No. 3). La secuencia correspondiente al gen FMP27t-h fue clonada usando las enzimas de restricción Ncol y Xbal en el vector pRT100-OTP previamente descrito, que contiene un promotor y un terminador de CaMV35S. El resultante vector fue denominado pRT100-OTP-FMP27t-h. La secuencia correspondiente al FMP27t fue clonada en el vector pRT100 previamente descrito, usando las enzimas de restricción Xhol y Xbal, y el resultante vector fue denominado pRT100-OTP-FMP27t. Los fragmentos correspondientes a PromCaMV35S-OTP-FMP27t-h-TerCaMV35S y PromCaMV35S-OTP-HIS6-FMP27t-TerCaMV35S fueron subclonados en el vector pBIN19 (que se ha descrito más arriba) usando la enzima de restricción Sbfl. Los vectores binarios fueron denominados respectivamente pBin19-FMP27t-h (Fig.3C) y pBin19-FMP27t (Fig.3B) y se pueden usar, por ejemplo, para transformar plantas dicotiledóneas, tales como las plantas de tabaco que se han descrito más arriba. Luego unas plantas transformantes que han crecido suficientemente, se ensayan en cuanto a su tolerancia a herbicidas inhibidores de la HPPD, tales como tembotriona. El desarrollo de los síntomas observados como respuesta al tratamiento con herbicidas se evalúa y se compara con la respuesta de plantas del tipo silvestre en las mismas condiciones.
Transformación de plantas, y selección de T0 con 100 g de IA / TBT Como un ejemplo, unas plantas enraizadas que contienen el ADN-T PromCaMV35S-OTP-HIS6-F P27t-TerCaMV35S, fueron transferidas al invernadero en condiciones de crecimiento normalizadas. Después de un período de tiempo de aclimatación de dos semanas, las plantas T0 fueron tratadas con una mezcla que contenía 100 g de tembotriona/ha, preparada a partir de una formulación WP20 (polvo humectable al 20 %) suplementada con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza. Dos semanas después del tratamiento, fueron evaluados los síntomas debidos a la aplicación de los herbicidas. Las plantas fueron clasificadas en cuatro categorías. Las plantas tratadas evaluadas como "0" tienen el mismo aspecto que las plantas de tabaco sin tratar. Las plantas evaluadas como "1 " presentan provisionalmente un fenotipo de blanqueo provisionalmente ligero debido a la aplicación de los herbicidas. Las plantas evaluadas como "2" presentan unos síntomas de blanqueo permanentes desde ligeros hasta fuertes. Finalmente las plantas evaluadas como "3" tienen el mismo aspecto que unas plantas de tabaco de tipo silvestre sometidas al mismo tratamiento. Los resultados se recopilan en la siguiente Tabla 8.
Tabla 8: Respuesta de plantas de tabaco TO que expresan la HPPD de FMP27.
En conclusión, varias plantas de tabaco que expresan la HPPD de FMP27 son tolerantes a tembotriona.
Ejemplo 6 : Clonación de los genes FMP27e, FMP27t y FMP27m que codifican la HPPD de FMP27 en un vector para transformar plantas de Zea mays FMP27e (SEQ ID No. 2), FMP27t (SEQ ID No. 3), FMP27m-h (SEQ ID No. 18) a- FMP27e en pHoe6/Ac: Gen con un trato con codones optimizado para E. coli, más, junto a su extremidad 5', una secuencia que codifica un OTP y una secuencia que codifica una marca His.
El vector pRT100-FMP27e que contiene el gen que codifica la HPPD de FMP27, optimizado para la expresión en E. coli bajo el control del promotor de CaMV35S, fue digerido con la enzima de restricción Hindlll.
La cásete CaMV35S::OTP::FMP27e::CaMV35S-term fue clonada ulteriormente dentro del vector binario pHoe6/Ac (documento US 6.316.694) previamente digerido con la misma enzima de restricción y desfosforilado. El resultante vector fue denominado pHoe6/Ac/FMP27e. b- F P27t en pHoe6/Ac (SEQ ID No. 3): Gen con un trato con codones optimizado para plantas dicotiledóneas, más, junto a su extremidad 5', una secuencia que codifica un OTP y una secuencia que codifica una marca His.
FMP27t en pRTI OO. Una versión del gen que codifica la proteína FMP27, optimizado para la expresión en Nicotiana tobaccum, que contiene además en el extremo 5' una secuencia de ácido nucleico que codifica un optimizado péptido de tránsito y una marca His, fue encargada y denominada FMP27t. Corriente arriba con relación a esta secuencia se añadió la secuencia de reconocimiento para la enzima de restricción Xhol y corriente abajo se añadió la secuencia de reconocimiento para la enzima de restricción Xbal. Los ADN correspondientes al OTP y al FMP27t fueron digeridos con las enzimas de restricción Xhol y Xbal, separados mediante apropiadas electroforesis en gel y clonados dentro del vector pRTIOO (Toepfer, (1987), Nucleic Acid Res 15:5890) previamente digerido con las enzimas de restricción Xhol y Ncol. El plásmido pRTIOO contiene el promotor de CaMV35S y el terminador de CaMV35S. El resultante vector fue denominado pRT100-FMP27t, y digerido con la enzima de restricción Hindlll para separar el ADN correspondiente a la cásete CaMV35S::OTP::FMP27t::CaMV35S-term con respecto del resto del vector, con el fin de clonarlo dentro del vector pHoe6/Ac previamente restringido (documento US 6.316.694). El resultante vector fue denominado pHoe6/Ac/FMP27t (Fig.3). c- FMP27m en pHoe6/Ac (SEQ ID No. 16): Gen con un trato con codones optimizado para plantas monocotiledóneas más, junto a su extremidad 5', una secuencia que codifica un OTP.
FMP27m en pRT100-OTP (Ncol-Xbal) luego Hindlll La variante del gen optimizado para la expresión en plantas monocotiledóneas que codifican FMP27, denominada FMP27m, fue encargada, y corriente arriba del codón de iniciación se añadió un sitio de restricción con Ncol mientras que corriente abajo del codón de detención se añadió la secuencia de reconocimiento para la enzima de restricción Xbal. La secuencia de ADN correspondiente a FMP27m fue digerida con las enzimas de restricción Ncol y Xbal, luego separada por electroforesis en gel, y finalmente aislada a partir del gel. El fragmento de ADN aislado fue mezclado con el vector pRT100-OTP (antes mencionado) previamente digerido también con las mismas enzimas de restricción. El resultante vector fue denominado pRT100-OTP-FMP27m, que contiene la cásete de expresión CaMV35S::OTP::FMP27m::CaMV35Sterm, que fue aislada usando la enzima de restricción Hindlll y luego clonada ulteriormente dentro del vector pHOE6/Ac previamente abierto y desfosfonlado, que contiene el gen que codifica la enzima PAT (de Phosphinothricin Acetyl Transferase = fosfinotricina acetil transferasa), que confiere resistencia al herbicida glufosinato (documento US 6.316.694). El resultante plásmido fue denominado pHoe/Ac/FMP27m (Fig.3F) Transformación de maíz: Los plásmidos pHoe6/Ac (documento US 6.316.694), pHoe6/Ac/FMP27e, pHoe6/Ac/FMP27t y pHoe6/Ac/FMP27m se usaron para transformar un cultivo de maíz.
El cultivo de maíz, el aislamiento de los protoplastos, la transformación y la regeneración de plantas de maíz transgénicas fértiles se realizaron de acuerdo con la patente de los EE.UU. 6284945, "Zea mays (L.) con una capacidad de regeneración de las plantas a largo plazo y altamente eficiente que incluye un maíz transgénico fértil que tiene un gen heterólogo, y su preparación" Los callos transformados fueron seleccionados sobre un medio que contiene fosfinotricina. Luego las plantas enraizadas y regeneradas se transfirieron a tierra y se dejaron crecer y producir semillas en el invernadero en condiciones normalizadas (28/20°C). Las plantas adultas se hicieron crecer hasta la producción de semillas y las semillas se recogieron para una siembra ulterior, y las plantas suficientemente desarrolladas serán tratadas con los respectivos herbicidas inhibidores de las HPPD.
Ejemplo 7: Construcción de un vector que contiene el gen FMP27e que ha de ser expresado en plantas de arroz.
Un vector binario para la transformación de plantas de arroz es construido, por ejemplo, con el promotor de CaMV35 que impulsa y dirige la expresión del gen FMP27e, con un trato con codones optimizado para la expresión en bacterias E. coli y junto a su extremidad 5' se añadió una secuencia que codificaba una marca His, y más corriente arriba se añadió una secuencia que codificaba un OTP, seguida por el terminador de CaMV35S. Adicionalmente, el vector de transformación contiene también una cásete del gen de PAT en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de Ca V35S y seguido por terminador de CaMV35S para una selección basada en glufosinato durante el proceso de transformación (véase la Fig. 3 I). El vector binario fue denominado pTMV369. Se construye similarmente un vector binario similar pero que comprende una cásete de expresión que expresa el gen de Arabidopsis que codifica la enzima HPPD.
Ejemplo 8 : Transformación de plantas de arroz.
La transformación de arroz se consigue usando unos métodos bien conocidos en la especialidad. Dicho brevemente, la transformación de arroz mediada por Agrobacterium tumefaciens se realizó usando embriones inmaduros, procedentes del linaje de restaurador 6G4317. Dicho brevemente, unas panículas procedentes de plantas donantes se cosecharon a los 8-12 días después de la polinización. La lema de la semilla inmadura se eliminó. Las semillas fueron después de ello esterilizadas usando una solución basada en NaOCI y Tween. Las semillas fueron inducidas previamente con ácido acetilsalicílico. Luego unas células de Agrobacterium tumefaciens se cultivaronn concomitantemente con las semillas previamente inducidas en presencia de acetosiringona durante 4 días a 24 °C en la oscuridad. Después de esto, los coleóptilos procedentes de embriones se retiraronn y se lavaron, y luego se colocaronn sobre un medio suplementado con fosfinotricina durante 3 semanas a 28°C bajo un ritmo de fotoperiodo de 16 horas. Luego los callos en crecimiento fueron cortados y separados desde los embriones, y transferidos a un medio de nueva aportación que contenía triacilina, fosfinotricina, L-prolina y sulfato de cobre (II).
Para cada linaje de callo y por cada concentración de tembotriona, 3 vástagos, aislados al azar a partir de diferentes trozos de callos, se transfirieron a MS/2 con tembotriona. Por regla general, la transferencia de los vástagos desde el medio de regeneración al MS/2 se realizó 9 semanas después de que los callos hubieran sido colocados en el medio de regeneración.
Los cultivos fueron incubados a 26,5 °C (fotoperíodo de 16 h) y la evaluación de los síntomas se realizó 2 semanas más tarde.
Unas nuevas hojas en desarrollo de los vástagos transferidos han sido calificadas sobre la base del blanqueo y asignadas a categorías en 3 grupos: a) sin blanqueo b) con blanqueo intermedio c) con blanqueo completo Dentro de la categoría "blanqueo intermedio" se ha hecho una distinción entre unos vástagos que tienen nuevas hojas, que muestran solamente muy pocos síntomas de blanqueo y por lo tanto tienden a formar hojas verdes, y unos vástagos con nuevas hojas casi totalmente blanqueados.
Tabla 9: Respuesta a tembotriona en pruebas en invernadero.
Unas plántulas TO enraizadas (seleccionadas ya sea sobre fosfinotricina a solas o sobre fosfinotricina suplementada con tembotriona) fueron transferidas a tierra en el invernadero. A continuación de un período de tiempo de aclimatación, las plantas que habían crecido suficientemente se trataron con los diferentes herbicidas inhibidores de las HPPD. Como un ejemplo, las plantas TO fueron rociadas con tembotriona del tipo de formulación WP20 (a razón de 100 g de ??/ha) suplementada con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza. Siete días después de la aplicación por rociada, los síntomas debidos a la aplicación del herbicida fueron evaluados y comparados con los síntomas observados en plantas de tipo silvestre sometidas al mismo tratamiento. Las plantas fueron clasificadas en tres categorías basándose en el fenotipo desarrollado como respuesta al herbicida siete días después del tratamiento. La Clase I fue definida como las plantas que no presentaron ningún daño, la Clase II fue definida como las plantas que presentaron unos ligeros daños provisionales como respuesta al tratamiento con herbicidas (daño: 10-40 %), la Clase III fue definida como las plantas que presentaban desde fuertes daños hasta daños similares a los observados con plantas del tipo silvestre sometidas al mismo tratamiento (daño:41-100 %).
En general, puede observarse que incluso las plantas que contienen solamente un inserto de ADN T ya mostraron un nivel significativo y suficiente de tolerancia a una dosis en el campo expuesta del herbicida inhibidor de las HPPD tembotriona.
Tabla 10: En conclusión, puede observarse que las plantas de arroz que expresan la proteína FMP27 son más tolerantes a la aplicación del herbicida inhibidor de las HPPD tembotriona que las plantas de arroz del tipo silvestre.
Ejemplo 9: Construcción de vectores binarios para la transformación de soja Un vector binario para la transformación de soja es construido, por ejemplo, con el promotor CaMV35 que impulsa y dirige la expresión del gen FMP27t-h (SEQ ID No. 15), con un trato con codones optimizado para la expresión en plantas dicotiledóneas y junto a su extremidad 5' se añadió una secuencia que codificaba un OTP, y más corriente arriba una secuencia de TEV (acrónimo de Tabaco Etch Virus = virus de la corrosión del tabaco) para mejorar la estabilidad del ARNm en plantas seguida por el terminador de CaMV35S. La secuencia de nucleótidos del gen FMP27t-h se da en la SEQ ID No. 15. Adicionalmente, el vector de transformación contiene también una cásete del gen de PAT en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de CaMV35S y seguido por un terminador de CaMV35S para una selección basada en el glufosinato durante el proceso de transformación y una cásete de gen 2mEPSPS en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de histona procedente de Arabidopsis para conferir a las plantas transformadas una tolerancia al herbicida glifosato (véase la Fig. 3 H). El vector binario fue denominado pFCO116.
Ejemplo 10: Establecimiento y selección de plantas T0 de soja La transformación de soja se consigue usando métodos bien conocidos en la especialidad, tal como el que se describe usando la transformación mediada por Agrobacterium tumefaciens de explantes de mitades de semillas de soja, que ha sido descrita por Paz y colaboradores (2006, Plant cell Rep. 25:206). Los transformantes fueron identificados usando isoxaflutol como marcador de selección. Se observó la aparición de vástagos verdes, y se documentó como un indicador de la tolerancia al herbicida isoxaflutol. En total, un 1 % de los vástagos transgénicos ensayados mostraron un verdeo normal comparable al de los vástagos de soja de tipo silvestre no tratados con isoxaflutol, mientras que los vástagos de soja de tipo silvestre tratados con la misma cantidad de isoxaflutol fueron blanqueados enteramente. Esto indica que la presencia de la proteína FMP27 hace posible la tolerancia a los herbicidas inhibidores de las HPPD, tales como isoxaflutol.
Unos vastagos verdes tolerantes fueron transferidos a medios de enraizamiento o injertados. Unas plántulas enraizadas fueron transferidas al invernadero después de un período de tiempo de aclimatación.
Las plantas que contenían el transgén fueron luego rociadas con herbicidas inhibidores de las HPPD, tal como por ejemplo con tembotriona con una tasa de 100 g de ??/ha. Diez días después de la aplicación se evaluaron los síntomas debidos a la aplicación de los herbicidas y se compararon con los síntomas observados en plantas de tipo silvestre en las mismas condiciones.
Ocho sucesos que expresaban la proteína de HPPD FMP27 fueron generados a partir de los vástagos verdes citados más arriba y fueron transferidos al invernadero. A las cuatro semanas después de la aclimatación, es decir que unas plantas que estaban en una etapa de desarrollo de 3-4 internodos se trataron con 100 g de lA/ha de tembotriona preparada a partir de una formulación WP 20 suplementada con sulfato de amonio y con el éster metílico de aceite de colza. Diez días después de la aplicación, los síntomas causados por la aplicación del herbicida inhibidor de las HPPD fueron evaluados y comparados con los síntomas que se observaron en plantas de soja de tipo silvestre no transgénicas tratadas. Dos de los ocho sucesos no muestran ningún fenotipo de blanqueo y tenían el mismo aspecto que las plantas de soja de tipo silvestre no tratadas. Un suceso mostró ligeros síntomas transitorios de blanqueo pero se recuperó a los 14 días después de la aplicación de tembotriona. Los cinco restantes sucesos exhibieron el mismo blanqueo que la planta de soja de tipo silvestre no transgénica después del tratamiento con tembotriona. Todos estos datos confirman que la proteína de HPPD FMP27 confiere tolerancia a los herbicidas inhibidores de las HPPD, como la tembotriona, en plantas de soja.
Ejemplo 11 : Construcción de vectores binarios para la transformación de algodón.
Un vector binario para la transformación de algodón es construido, por ejemplo, con el promotor de Ca V35 que impulsa y dirige la expresión del gen FMP27t-h (SEQ ID No. 15), con un trato con codones optimizado para la expresión en plantas dicotiledóneas y en su extremidad 5' se añadió una secuencia que codifica un OTP, y más corriente arriba se añadió una secuencia de TEV (virus de la corrosión del tabaco) para mejorar la estabilidad del ARNm en plantas, seguida por el terminador de CaMV35. La secuencia de nucleótidos del gen FMP27t-h está dada en SEQ ID No. 15. Adicionalmente, el vector de transformación contiene también una cásete del gen de PAT en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de CaMV35S y seguida por un terminador de CaMV35S para una selección basada en glufosinato durante el proceso de transformación y una cásete de gen de 2mEPSPS en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de histona procedente de Arabidopsis para conferir a las plantas transformadas una tolerancia al herbicida glifosato (véase la Fig. 3 J). El vector binario fue denominado pTSIH25 Ejemplo 12: Establecimiento y selección de plantas T0 de algodón La transformación de algodón se consigue usando métodos bien conocidos en la especialidad, un método especialmente preferido es el que se describe en la publicación de patente PCT WO 00/71733.
Unas plantas regeneradas son transferidas al invernadero. Después de un período de tiempo de aclimatación, las plantas que han crecido suficientemente son rociadas con herbicidas inhibidores de las HPPD tales como por ejemplo tembotriona a razón de 100 g de ??/ha, suplementada con sulfato de amonio y éster metílico de aceite de colza. A los siete días después de la aplicación por rociada, los síntomas debidos al tratamiento con los herbicidas son evaluados y comparados con los síntomas observados en plantas de algodón de tipo silvestre sometidas al mismo tratamiento en las mismas condiciones.
Ejemplo 13: Construcción de vectores de transformación binarios para generar plantas tolerantes a cuatro herbicidas con distintas modalidades de acción.
Un vector binario para la transformación de plantas dicotiledóneas es construido, por ejemplo, con el promotor de CaMV35 que impulsa y dirige la expresión del gen FMP27t-h (SEQ ID No. 15), con un trato con codones optimizado para la expresión en plantas dicotiledóneas y junto a su extremidad 5' se añadió una secuencia que codifica un OTP, seguida por el terminador de CaMV35S. La secuencia de nucleótidos del gen FMP27t-h se da en la SEQ ID No. 15. Adicionalmente, el vector de transformación también contiene una cásete de gen de PAT en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de CaVM35S y seguido por un terminador de CaMV35S para conferir a la planta que expresa el gen una tolerancia a glufosinato, una cásete de gen de 2mEPSPS que codifica el EPSPS de maíz doble muíante (Thr102lle y Pro106Ser) en que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de histona procedente de Arabidopsis para conferir a las plantas transformadas una tolerancia al herbicida glufosinato, y una cásete de gen de 2mAHAS de Arabidopsis thaliana que codifica una enzima ALS tolerante (acetolactato sintasa, Pro197Ala, Trp574Leu) impulsado y dirigido por un promotor de CaMV35S con el fin de conferir a la planta que expresa este gen una tolerancia a herbicidas de las clases de sulfonilureas e imidazolinonas (véase la Fig. 3 G) Las casetes de genes son finalmente clonadas dentro del vector pHoe6/Ac (documento US 6.316.694), y el vector final es denominado pHoe6/FMP27t-h/PAT/EPSPS/AHAS, y es usado para transformar plantas dicotiledóneas a partir de métodos de la técnica anterior mediados por Agrobacterium tumefaciens. Unas plantas T0 son transferidas a tierra, y después de un período de tiempo de aclimatación, las plantas que han crecido suficientemente son rociadas sucesivamente con un herbicida de la clase de los agentes inhibidores de las HPPD, luego con glifosato, luego con glufosinato y finalmente con un herbicida de la clase de las su Ifonil ureas, por ejemplo.
Ejemplo 14: Generación de plantas transgénicas que muestran tolerancia a herbicidas con tres distintas modalidades de acción.
Un vector binario para la transformación de tabaco es construido, por ejemplo, con el promotor de CaMV35 que impulsa y dirige la expresión del gen FMP27t-h (SEQ ID No. 15), con un trato con codones optimizado para la expresión en plantas dicotiledóneas y junto a su extremidad 5' se añadió una secuencia que codifica un OTP, y más corriente arriba se añadió una secuencia de TEV (virus de la corrosión del tabaco) para mejorar la estabilidad del ARNm en plantas, seguida por el terminador de CaMV35. La secuencia de nucleótidos del gen FMP27t-h está dada en la SEQ ID No. 15. Adicionalmente, el vector de transformación contiene también una cásete del gen de PAT en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de CaMV35S y seguida por un terminador de CaMV35S para una selección basada en glufosinato durante el proceso de transformación y una cásete de gen de 2mEPSPS en la que el gen es impulsado y dirigido por un promotor de histona procedente de Arabidopsis para conferir a las plantas transformadas una tolerancia al herbicida glifosato (véase la Fig. 3 H). El vector binario fue denominado pFC0116. El anterior vector se usó para transformar discos de hojas obtenidos a partir de plantas de Nicotiana tobacum, de acuerdo con el Ejemplo 3.
Unas plantas transgénicas de tabaco fueron transferidas al invernadero y tratadas con glifosato en una tasa de 1.121 g de ??/ha. Se produjeron semillas a partir de dichas plantas de tabaco tolerantes y se cosecharon. Estas semillas se colocaron sobre tierra para germinar en el invernadero. De tres a cuatro semanas más tarde, 50 plántulas por suceso se transfirieron a macetas individuales. Dos semanas más tarde, unas plantas con un tamaño de 4-6 cm se rociaron, respectivamente, con: glufosinato-amonio 1.000 g de lA/ha glifosato ¡ 1.121 g de lA/ha tembotriona 100 g de ??/ha, o tembotriona + glifosato 100 g de IA/ha + 1.121 g de lA/ha.
Después de nueve días, se evaluaron los síntomas causados por las respectivas aplicaciones de herbicidas, tal como se recopila en la Tabla 1 1 , siguiente.
Las plantas fueron clasificadas en tres categorías basándose en el fenotipo desarrollado como respuesta al (a los) respectivo(s) herbicida(s) siete días después del tratamiento. La Clase I fue definida como las plantas que no presentaron ningún daño. La Clase II fue definida como las plantas que presentaron unos ligeros daños provisionales como respuesta al tratamiento con herbicidas (daño: 10-40 %). La Clase III fue definida como las plantas que presentaban desde fuertes daños hasta daños similares a los observados con plantas del tipo silvestre sometidas al mismo tratamiento (daño: 41-100 %). Las plantas de tabaco no transgénicas fueron aniquiladas completamente por un tratamiento que usaba uno o más de los anteriores herbicidas.
Tabla 11 : Glufosinato amonio 1.000 g de IA /ha 9 DAT Glifosato 1.121 g de 9 DAT Tembotriona 100 g de IA /ha 9 DAT Glifosato + tembotriona 1.121 g de IA /ha + 100 g de lA /ha 9 DAT Todos estos datos confirman que estas plantas que codifican varios genes de tolerancia que conciernen a herbicidas inhibidores de las HPPD, glifosato y glufosinato-amonio, confieren tolerancia a cualquiera de estos herbicidas aplicados a solas o en una combinación entre sí.
Esta es la primera vez en que unas plantas transgénicas que contienen estos tres genes de tolerancia en un único lugar (locus) exhiben una tolerancia a herbicidas a tales herbicidas en una tasa de aplicación que es de relevancia agronómica.

Claims (16)

REIVINDICACIONES
1. Un gen quimérico caracterizado porque comprende una secuencia de codificación engarzada operativamente a un promotor expresable en plantas, caracterizado porque la secuencia de codificación comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica una proteína de hidroxifenilpiruvato dioxigenasa (HPPD) de Kordia, o una proteina con una identidad entre secuencias de por lo menos 75 % con una proteína de HPPD de Kordia.
2. El gen quimérico de acuerdo con la reivindicación 1 , caracterizado porque la proteína de HPPD es una proteína de HPPD de Kordia algicida o una proteína con una identidad entre secuencias de por lo menos 75 % con una proteína HPPD de Kordia algicida.
3. Un gen quimérico de las reivindicaciones 1 ó 2, caracterizado porque un ADN que codifica dicha proteína se puede obtener a partir de un ADN de Kordia usando un cebador o una sonda de al menos 20 nucleótidos, que se híbrida con el ADN de la SEQ ID No. 1.
4 El gen quimérico de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 hasta 3, caracterizado porque codifica una proteína de HPPD que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387 o una proteína con una identidad entre secuencias de por lo menos 75 % con la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID No. 4 desde la posición de aminoácido 2 hasta la posición de aminoácido 387.
5. El gen quimérico de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 hasta 4, caracterizado porque codifica una secuencia de proteína de HPPD y comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID No. 3 desde la posición de nucleótido 400 hasta la posición de nucleótido 1.557, o un ADN que se híbrida con dicha secuencia en condiciones rigurosas de hibridación.
6. El gen quimérico de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 hasta 5, caracterizado porque comprende corriente abajo de la secuencia codificadora de HPPD, una secuencia de ácido nucleico que codifica un péptido de tránsito activo en plantas, de manera tal que una proteína de fusión del péptido de tránsito y de la HPPD es codificada por dicho gen quimérico.
7. Un vector caracterizado porque comprende por lo menos un gen quimérico tal como se reclama en cualquiera de las reivindicaciones 1 hasta 6.
8. Una célula de planta, parte de planta, planta o semilla, caracterizada porque ella comprende un gen quimérico tal como se reclama en cualquiera de las reivindicaciones 1 hasta 7.
9. La célula de planta, parte de planta, planta o semilla de la reivindicación 8, caracterizada porque comprende también un gen quimérico que codifica una enzima PDH.
10. La célula de planta, parte de planta, planta o semilla de la reivindicación 8 ó 9, caracterizada porque comprende además uno o más gen(es) quimérico(s) que confiere(n) tolerancia a reguladores del crecimiento, de manera preferida a 2,4-D o dicamba, y/o a herbicidas que inhiben a la acetolactato sintasa (ALS), a la EPSP sintasa (EPSPS) y/o a la glutamina sintasa (GS).
11. Un método para obtener una planta tolerante a un herbicida inhibidor de las HPPD, caracterizado porque un gen quimérico es introducido en dicha planta tal como se reclama en cualquiera de las reivindicaciones 1 hasta 6.
12. Un método para reprimir malezas en una zona o en un campo que contiene o ha de ser plantada(o) con plantas o semillas tal como se reclama en la reivindicación 8, 9 ó 10, cuyo método comprende aplicar, a dicha zona o a dicho campo, una dosis de un herbicida inhibidor de las HPPD que es tóxica para dichas malezas, sin afectar significativamente a las semillas ni a las plantas tal como se reclama en la reivindicación 8, 9 ó 10.
13. El método para reprimir malezas de acuerdo con la reivindicación 12, caracterizado porque el agente inhibidor de las HPPD se selecciona entre el conjunto que consiste en isoxaflutol, tembotriona, mesotriona, sulcotriona, pirasulfotol, topramezona, 2-ciano-3-ciclopropil-1-(2-S02CH3-4-CF3fenil)-propano-1 ,3-diona y 2-ciano-3-ciclopropil-1-(2-S02CH3-4-2,3 Cl2 fenil)propano-1 ,3-diona, biciclopirona, benzobiciclona, tefuriltriona, dicetonitrilo y pirazoxifeno.
14. Un método para obtener un aceite o una harina, caracterizado porque comprende hacer crecer una planta tal como se reclama en la reivindicación 8, 9 ó 10, opcionalmente tratar dicha planta con un herbicida inhibidor de las HPPD, cosechar los granos y moler los granos para producir la harina y opcionalmente extraer el aceite.
15. Uso de una HPPD de Kordia o de una HPPD con una identidad entre secuencias de por lo menos 75 % con una HPPD de Kordia para hacer a las plantas tolerantes a herbicidas inhibidores de las HPPD.
16. El uso de la reivindicación 15, en el que los herbicidas inhibidores de las HPPD se seleccionan entre el conjunto que consiste en: isoxaflutol, tembotriona, mesotriona, sulcotriona, pirasulfotol, topramezona, 2-ciano-3-ciclopropil-1-(2-S02CH3-4-CF3fenil)propano-1 ,3-diona y 2-ciano-3-ciclopropil- 1-(2-S02CH3-4-2,3 Cl2 fenil)propano-1,3-diona, biciclopirona, benzobiciclona, tefuriltriona, dicetonitrilo y pirazoxifeno.
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