KR20180132775A - Pd-1/pd-l1 및 cd80/pd-l1 단백질/단백질 상호작용의 마크로시클릭 억제제 - Google Patents

Pd-1/pd-l1 및 cd80/pd-l1 단백질/단백질 상호작용의 마크로시클릭 억제제 Download PDF

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Abstract

본 개시내용은 PD-1/PD-L1 및 PD-L1/CD80 단백질/단백질 상호작용을 억제하며, 따라서 암 및 감염성 질환을 포함한 다양한 질환의 호전에 유용한 신규 마크로시클릭 펩티드를 제공한다.
Figure pct00084

여기서 A는 결합으로부터 선택된다.

Description

PD-1/PD-L1 및 CD80/PD-L1 단백질/단백질 상호작용의 마크로시클릭 억제제
관련 출원에 대한 상호 참조
본 출원은 2016년 4월 5일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 62/318,417의 이익을 주장하는 2017년 3월 31일에 출원된 미국 특허 정식 출원 번호 15/475,227의 우선권을 주장하며, 그 전문이 본원에 참조로 포함된다.
본 개시내용은 PD-1/PD-L1 및 CD80/PD-L1 단백질/단백질 상호작용을 억제하며, 따라서 암 및 감염성 질환을 포함한 다양한 질환의 호전에 유용한 신규 마크로시클릭 펩티드를 제공한다.
단백질 프로그램화된 사멸 1 (PD-1)은 수용체의 CD28 패밀리의 억제 구성원이며, 상기 패밀리는 또한 CD28, CTLA-4, ICOS 및 BTLA를 포함한다. PD-1은 활성화 B 세포, T 세포 및 골수 세포 상에서 발현된다 (Agata et al., supra; Okazaki et al., Curr. Opin. Immunol., 14:779-782 (2002); Bennett et al., J. Immunol., 170:711-718 (2003)).
PD-1 단백질은 Ig 유전자 슈퍼패밀리의 일부인 55 kDa 유형 I 막횡단 단백질이다 (Agata et al., Int. Immunol., 8:765-772 (1996)). PD-1은 막 근위 면역수용체 티로신 억제 모티프 (ITIM) 및 막 원위 티로신-기반 스위치 모티프 (ITSM)를 함유한다 (Thomas, M.L., J. Exp. Med., 181:1953-1956 (1995); Vivier, E. et al., Immunol. Today, 18:286-291 (1997)). CTLA-4와 구조적으로 유사할지라도, PD-1은 CD80 CD86 (B7-2) 결합에 중요한 MYPPY 모티프가 결여되어 있다. PD-1에 대한 2개의 리간드, PD-L1 (B7-H1) 및 PD-L2 (b7-DC)가 확인된 바 있다. PD-1을 발현하는 T 세포의 활성화는 PD-L1 또는 PD-L2를 발현하는 세포와의 상호작용 시 하향조절되는 것으로 제시된 바 있다 (Freeman et al., J. Exp. Med., 192:1027-1034 (2000); Latchman et al., Nat. Immunol., 2:261-268 (2001); Carter et al., Eur. J. Immunol., 32:634-643 (2002)). PD-L1 및 PD-L2 둘 다는 PD-1에 결합하는 B7 단백질 패밀리 구성원이지만, 다른 CD28 패밀리 구성원에는 결합하지 않는다. PD-L1 리간드는 다양한 인간 암에서 풍부하다 (Dong et al., Nat. Med., 8:787-789 (2002)). PD-1 및 PD-L1 사이의 상호작용은 종양 침윤 림프구에서의 감소, T-세포 수용체 매개 증식에서의 감소, 및 암성 세포에 의한 면역 회피를 초래한다 (Dong et al., J. Mol. Med., 81:281-287 (2003); Blank et al., Cancer Immunol. Immunother., 54:307-314 (2005); Konishi et al., Clin. Cancer Res., 10:5094-5100 (2004)). 면역 억제는 PD-1과 PD-L1의 국부 상호작용을 억제함으로써 역전될 수 있고, 그 효과는 PD-1과 PD-L2의 상호작용이 또한 차단되는 경우에 상가적이다 (Iwai et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99:12293-12297 (2002); Brown et al., J. Immunol., 170:1257-1266 (2003)).
PD-L1은 또한 CD80과 상호작용하는 것으로 제시된 바 있다 (Butte MJ et al., Immunity;27:111-122 (2007)). 발현 면역 세포 상에서의 상호작용 PD-L1/CD80은 억제성인 것으로 제시된 바 있다. 이러한 상호작용의 차단은 이러한 억제 상호작용을 제거하는 것으로 밝혀졌다 (Paterson AM, et al., J Immunol., 187:1097-1105 (2011); Yang J, et al. J Immunol. Aug 1;187(3):1113-9 (2011)).
PD-1 발현 T 세포가 그의 리간드를 발현하는 세포와 접촉하면, 예컨대 증식, 시토카인 분비, 및 세포독성을 포함한, 항원 자극에 반응하는 기능적 활성이 감소된다. PD-1/PD-L1 또는 PD-L2 상호작용은 감염 또는 종양의 해소 동안, 또는 자기 관용성의 발생 동안의 면역 반응을 하향 조절한다 (Keir, M.E. et al., Annu. Rev. Immunol., 26:Epub (2008)). 종양 질환 또는 만성 감염 동안 발생하는 것과 같은 만성 항원 자극은 상승된 수준의 PD-1을 발현하고 만성 항원에 대한 활성에 대해 기능장애를 갖는 T 세포를 생성한다 (문헌 [Kim et al., Curr. Opin. Imm. (2010)]에서 검토됨). 이는 "T 세포 소진"으로 불린다. B 세포도 또한 PD-1/PD-리간드 억제 및 "소진"을 나타낸다.
PD-L1에 대한 항체를 사용한 PD-1/PD-L1 라이게이션의 차단은 많은 시스템 내에서 T 세포 활성화를 회복 및 증대시키는 것으로 제시된 바 있다. 진행성 암을 갖는 환자는 PD-L1에 대한 모노클로날 항체에 의한 요법으로부터 이익을 얻는다 (Brahmer et al., New Engl. J. Med. (2012)). 종양 및 만성 감염의 전임상 동물 모델은 모노클로날 항체에 의한 PD-1/PD-L1 경로의 차단이 면역 반응을 증진시킬 수 있고, 종양 거부 또는 감염의 제어를 발생시킬 수 있음을 제시한 바 있다. PD-1/PD-L1 차단을 통한 항종양 면역요법은 다수의 조직학적으로 별개의 종양에 대한 치료 면역 반응을 증대시킬 수 있다 (Dong, H. et al., "B7-H1 pathway and its role in the evasion of tumor immunity", J. Mol. Med., 81(5):281-287 (2003); Dong, H. et al., "Tumor-associated B7-H1 promotes T-cell apoptosis: a potential mechanism of immune evasion", Nat. Med., 8(8):793-800 (2002)).
PD-1/PD-L1 상호작용의 간섭은 만성 감염을 갖는 시스템 내에서 증진된 T 세포 활성을 유발한다. PD-L1의 차단은 만성 림프구성 맥락 수막염 바이러스 감염을 갖는 마우스에서 바이러스 클리어런스가 개선되게 하고 면역을 회복시켰다 (Barber, D.L. et al., "Restoring function in exhausted CD8 T cells during chronic viral infection", Nature, 439(7077):682-687 (2006)). HIV-1로 감염된 인간화 마우스는 바이러스혈증에 대한 증진된 보호 및 CD4+ T 세포의 바이러스 고갈을 제시한다 (Palmer et al., J. Immunol. (2013)). PD-L1에 대한 모노클로날 항체를 통한 PD-1/PD-L1의 차단은 HIV 환자 (Day, Nature (2006); Petrovas, J. Exp. Med. (2006); Trautman, Nature Med. (2006); D'Souza, J. Immunol. (2007); Zhang, Blood (2007); Kaufmann, Nature Imm. (2007); Kasu, J. Immunol. (2010); Porichis, Blood (2011)), HCV 환자 (Golden-Mason, J. Virol. (2007); Jeung, J. Leuk. Biol. (2007); Urbani, J. Hepatol. (2008); Nakamoto, PLoS Path. (2009); Nakamoto, Gastroenterology (2008)) 및 HBV 환자 (Boni, J. Virol. (2007); Fisicaro, Gastro. (2010); Fisicaro et al., Gastroenterology (2012); Boni et al., Gastro. (2012); Penna et al., J. Hep. (2012); Raziorrough, Hepatology (2009); Liang, World J. Gastro. (2010); Zhang, Gastro. (2008))로부터의 T 세포에 대한 시험관내 항원-특이적 기능성을 회복시킬 수 있다.
PD-L1/CD80 상호작용의 차단은 또한 면역을 자극하는 것으로 밝혀졌다 (Yang J., et al., J Immunol. Aug 1;187(3):1113-9 (2011)). PD-L1/CD80 상호작용의 차단으로부터 발생한 면역 자극은 추가의 PD-1/PD-L1 또는 PD-1/PD-L2 상호작용의 차단과의 조합을 통해 증진되는 것으로 제시된 바 있다.
면역 세포 표현형에서의 변경은 패혈성 쇼크에서 중요한 인자인 것으로 가설화된다 (Hotchkiss, et al., Nat Rev Immunol (2013)). 이들은 PD-1 및 PD-L1의 증가된 수준을 포함한다 (Guignant, et al., Crit. Care (2011)). 증가된 수준의 PD-1 및 PD-L1을 갖는 패혈성 쇼크 환자로부터의 세포는 증가된 수준의 T 세포 아폽토시스를 나타낸다. PD-L1에 대한 항체는 면역 세포 아폽토시스의 수준을 감소시킬 수 있다 (Zhang et al., Crit. Care (2011)). 게다가, PD-1 발현 결핍 마우스는 야생형 마우스보다 패혈성 쇼크 증상에 대해 보다 내성이 있다 (Yang J., et al. J Immunol. Aug 1;187(3):1113-9 (2011)). 연구는 항체를 사용한 PD-L1의 상호작용의 차단이 부적절한 면역 반응을 억제할 수 있고, 질환 징후를 호전시킬 수 있음을 밝혀낸 바 있다.
만성 항원에 대한 면역 반응을 증진시키는 것에 더하여, PD-1/PD-L1 경로의 차단은 또한 만성 감염의 맥락에서 치료 백신접종을 포함한 백신접종에 대한 반응을 증진시키는 것으로 제시된 바 있다 (Ha, S.J. et al., "Enhancing therapeutic vaccination by blocking PD-1-mediated inhibitory signals during chronic infection", J. Exp. Med., 205(3):543-555 (2008); Finnefrock, A.C. et al., "PD-1 blockade in rhesus macaques: impact on chronic infection and prophylactic vaccination", J. Immunol., 182(2):980-987 (2009); Song, M.-Y. et al., "Enhancement of vaccine-induced primary and memory CD8+ t-cell responses by soluble PD-1", J. Immunother., 34(3):297-306 (2011)).
본원에 기재된 분자는 생화학적 및 세포-기반 실험 시스템 둘 다에서, PD-L1과 PD-1의 상호작용을 차단하는 능력을 입증한다. 이들 결과는 치료 백신을 포함한, 암 또는 만성 감염에서 면역을 증진시키기 위한 치료적 투여에 대한 잠재력과 일치한다.
본원에 기재된 마크로시클릭 펩티드는 PD-L1과 PD-1 및 CD80의 상호작용을 억제할 수 있다. 이들 화합물은 PD-L1에 대한 매우 효과적인 결합, PD-L1과 PD-1 또는 CD80의 상호작용의 차단을 입증한 바 있고, 증진된 T 세포 기능적 활성을 촉진할 수 있으며, 따라서 이는 이들이 비경구, 경구, 폐, 비강, 협측 및 지속 방출 제제를 위한 후보가 되도록 한다.
제1 측면에서, 본 개시내용은 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염을 제공하고
Figure pct00001
여기서
A는 결합,
Figure pct00002
로부터 선택되고;
여기서
Figure pct00003
은 카르보닐 기에 대한 부착 지점을 나타내고
Figure pct00004
는 질소 원자에 대한 부착 지점을 나타내고;
z는 0, 1, 또는 2이고;
w는 1 또는 2이고;
n은 0 또는 1이고;
m은 1 또는 2이고;
m'는 0 또는 1이고;
p는 0, 1, 또는 2이고;
Rx는 수소, 아미노, 히드록시, 및 메틸로부터 선택되고;
R14 및 R15는 독립적으로 수소 및 메틸로부터 선택되고;
Rz는 수소 및 -C(O)NHR16으로부터 선택되고; 여기서 R16은 수소, -CHR17C(O)NH2, -CHR17C(O)NHCHR18C(O)NH2, 및 -CHR17C(O)NHCHR18C(O)NHCH2C(O)NH2로부터 선택되고; 여기서 R17은 수소 및 -CH2OH로부터 선택되고, R18은 수소 및 메틸로부터 선택되고;
Rv는 수소 또는 천연 아미노산 측쇄이고;
Figure pct00005
은 카르보닐 기에 대한 부착 지점을 나타내고
Figure pct00006
는 질소 원자에 대한 부착 지점을 나타내고;
Rc, Rf, Rh, Ri, Rm, 및 Rn은 수소이고;
Ra, Re, Rj, 및 Rk는 각각 독립적으로 수소 및 메틸로부터 선택되고;
R10은 인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 인돌릴 부분은 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 시아노, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 및 테트라졸릴C1-C3알킬로부터 선택된 1개의 기, 또는 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 아자인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 독립적으로 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 다른 기로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1-3이고 Q'는 1, 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고;
Rp 및 Rq는 독립적으로 수소 및 C1-C6알킬로부터 선택되고;
R13은 천연 아미노산 측쇄, 비천연 아미노산 측쇄, 및 -(C(R17a)2)2-X-R30; -C(R17a)2C(O)N(R16a)C(R17a)2-X'-R31; -C(R17a)2[C(O)N(R16a)C(R17a)2]w'-X-R31; -(C(R17a)(R17)C(O)NR16a)n'-H; 및 -(C(R17a)(R17)C(O)NR16a)m'-C(R17a)(R17)-CO2H로부터 선택되고;
w'는 2 또는 3이고;
n'는 1-6이고;
m'는 0-5이고;
X는 1 내지 172개의 원자의 쇄이고, 여기서 원자는 탄소 및 산소로부터 선택되고, 쇄는 그 안에 포매되는 -NHC(O)NH- 및 -C(O)NH-로부터 선택된 1, 2, 3, 또는 4개의 기를 함유할 수 있고; 여기서 쇄는 독립적으로 -CO2H, -C(O)NH2, -CH2C(O)NH2, 및 -(CH2)CO2H로부터 선택된 1 내지 6개의 기로 임의로 치환되고;
X'는 1 내지 172개의 원자의 쇄이고, 여기서 원자는 탄소 및 산소로부터 선택되고, 쇄는 그 안에 포매되는 -NHC(O)NH- 및 -C(O)NH-로부터 선택된 1, 2, 3, 또는 4개의 기를 함유할 수 있고; 여기서 쇄는 독립적으로 -CO2H, -C(O)NH2, 및 -CH2CO2H로부터 선택된 1 내지 6개의 기로 임의로 치환되고, 단 X'는 비치환된 PEG 이외의 것이고;
R30은 -CO2H, -C(O)NRwRx, 및 -CH3으로부터 선택되고, 여기서 Rw 및 Rx는 독립적으로 수소 및 C1-C6알킬로부터 선택되고, 단 X가 모두 탄소인 경우, R30은 -CH3 이외의 것이고;
R31은 -CO2H, -C(O)NRwRx, -CH3, 알렉사-5-SDP, 및 비오틴이고;
각각의 R17a는 독립적으로 수소, C1-C6알킬, -CH2OH, -CH2CO2H, -(CH2)2CO2H로부터 선택되고,
각각의 R17은 독립적으로 수소, -CH3, (CH2)zN3, -(CH2)zNH2, -X-R31, -(CH2)zCO2H, -CH2OH, CH2C≡CH, 및 -(CH2)z-트리아졸릴-X-R35로부터 선택되고, 여기서 z는 1-6이고 R35는 -CO2H, -C(O)NRwRx, CH3, 비오틴, -2-플루오로피리딘, -C(O)-(CH2)2-C(O)O-비타민 E, -C(O)O-비타민 E 및
Figure pct00007
로부터 선택되고;
단 적어도 1개의 R17은 수소, -CH3, 또는 -CH2OH 이외의 것이고;
R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R11, 및 R12는 독립적으로 천연 아미노산 측쇄 및 비천연 아미노산 측쇄로부터 선택되거나 또는 하기 기재된 바와 같이 상응하는 이웃자리 R 기와 함께 고리를 형성하고;
Re 및 Rk는 각각 상응하는 이웃자리 R 기 및 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성할 수 있고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고;
Rb는 메틸이거나, 또는 Rb 및 R2는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성하고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고;
Rd는 수소 또는 메틸이거나, 또는 Rd 및 R4는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성할 수 있고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 히드록시, 및 페닐로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고;
Rg는 수소 또는 메틸이거나, 또는 Rg 및 R7은 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성할 수 있고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 할로 기로 임의로 치환된 벤질, 벤질옥시, 시아노, 시클로헥실, 메틸, 할로, 히드록시, 메톡시 기로 임의로 치환된 이소퀴놀리닐옥시, 할로 기로 임의로 치환된 퀴놀리닐옥시, 및 테트라졸릴로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고; 여기서 피롤리딘 및 피페리딘 고리는 시클로헥실, 페닐, 또는 인돌 기에 임의로 융합되고;
RL은 메틸이거나, 또는 RL 및 R12은 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘 및 피롤리딘으로부터 선택된 고리를 형성하고, 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환된다.
제1 실시양태에서, 본 개시내용은 R13이 천연 아미노산 측쇄 또는 비천연 아미노산 측쇄인 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염을 제공한다.
제2 실시양태에서, 본 개시내용은 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염을 제공하고, 여기서
R13은 천연 아미노산 측쇄 또는 비천연 아미노산 측쇄이고;
R10은 인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 인돌릴 부분은 (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C1-C6알콕시, 시아노, 및 테트라졸릴C1-C3알킬로부터 선택된 1개의 기, 또는 C1-C6알콕시, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 아자인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 카르복시C1-C3알킬, 및 임의로 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 다른 기로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1-3이고 Q'는 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 옥소, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환된다.
제3 실시양태에서, 본 개시내용은 화학식 (I)의 화합물, 또는 그의 제약상 허용되는 염을 제공하고, 여기서
R13은 천연 아미노산 측쇄 또는 비천연 아미노산 측쇄이고;
R10은 인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 인돌릴 부분은 (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C1-C6알콕시, 시아노, 및 테트라졸릴C1-C3알킬로부터 선택된 1개의 기, 또는 C1-C6알콕시, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 아자인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 카르복시C1-C3알킬, 및 임의로 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 다른 기로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1-3이고 Q'는 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 옥소, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고;
A는
Figure pct00008
이다.
제4 실시양태에서, 본 개시내용은 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염을 제공하고, 여기서,
R13은 천연 아미노산 측쇄 또는 비천연 아미노산 측쇄이고;
R10은 인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 인돌릴 부분은 (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C1-C6알콕시, 시아노, 및 테트라졸릴C1-C3알킬로부터 선택된 1개의 기, 또는 C1-C6알콕시, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 아자인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 카르복시C1-C3알킬, 및 임의로 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 다른 기로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1-3이고 Q'는 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 옥소, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고;
A는
Figure pct00009
이고;
w는 1이고;
z는 0이고;
Rz는 -C(O)NHR16이고; 여기서 R16은 수소 및 -CHR17C(O)NH2로부터 선택되고, 여기서 R17은 수소이다.
제5 실시양태에서, 본 개시내용은 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염을 제공하고, 여기서
R13은 천연 아미노산 측쇄 또는 비천연 아미노산 측쇄이고;
R10은 인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 인돌릴 부분은 (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C1-C6알콕시, 시아노, 및 테트라졸릴C1-C3알킬로부터 선택된 1개의 기, 또는 C1-C6알콕시, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 아자인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 카르복시C1-C3알킬, 및 임의로 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 다른 기로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1-3이고 Q'는 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 옥소, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고;
A는
Figure pct00010
이고;
w는 1이고;
z는 0이고;
Rz는 -C(O)NHR16이고; 여기서 R16은 수소 및 -CHR17C(O)NH2로부터 선택되고, 여기서 R17은 수소이고;
Rd 및 R4는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피롤리딘 고리를 형성하고;
Rg 및 R7은 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피롤리딘 고리를 형성하고, 여기서 상기 고리는 1개의 히드록시 기로 임의로 치환되고;
Rk는 메틸이다.
제6 실시양태에서, 본 개시내용은 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염을 제공하고, 여기서
A는
Figure pct00011
이고;
w는 1이고;
z는 0이고;
Rz는 -C(O)NHR16이고; 여기서 R16은 수소 및 -CHR17C(O)NH2로부터 선택되고, 여기서 R17은 수소이고;
Rd 및 R4는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피롤리딘 고리를 형성하고;
Rg 및 R7은 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피롤리딘 고리를 형성하고, 여기서 상기 고리는 1개의 히드록시 기로 임의로 치환되고;
Rk는 메틸이고;
Ra, Re, 및 Rj는 수소이고;
Rb 및 R2는 각각 메틸이거나, 또는 Rb 및 R2는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피페리딘 고리를 형성하고;
RL은 메틸이고;
Rn은 수소이고;
R1은 페닐메틸이고, 여기서 페닐은 C1-C6알콕시, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1개의 기로 임의로 치환되고;
R3은 -CH2C(O)NH2 및 -CH2CO2H로부터 선택되고;
R5는 -CH2(이미다졸릴), -CH2NH2, 및 -CH2CH2CO2H로부터 선택되고;
R6은 -CH2CH(CH3)2, -(CH2)4NH2, 및 (CH2)2C(O)NH2로부터 선택되고;
R8은 -CH2(인돌릴)이고;
R9는 -(CH2)2NH2 및 CH2OH로부터 선택되고;
R10은 -CH2(인돌릴)이고, 여기서 인돌릴 부분은 -CH2C(O)NHS(O)2CH3, 시아노, 및 -CH2(테트라졸릴)로부터 선택된 1개의 기, 또는 -OCH3, -CO2H, 및 -CH2CO2H로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되거나 또는
R10은 -CH2(아자인돌릴)이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 -CH2CO2H로 치환되거나; 또는
R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1이고 Q'는 2 또는 3개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 -CH3, -CH2CO2H, 및 옥소로부터 선택된 1 또는 2개의 기로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1이고 Z'는 1개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고;
R11 및 R12는 -(CH2)3CH3이고;
R13은 메틸, -CH2CH(CH3)2, 및 -(CH2)3NHC(NH)NH2로부터 선택된다.
제2 측면에서, 본 개시내용은 면역 반응의 증진, 자극 및/또는 증가를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 면역 반응을 증진, 자극 및/또는 증가시키는 방법을 제공한다. 제2 측면의 제1 실시양태에서, 방법은 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염의 전, 후, 또는 그와 동시에 추가의 작용제를 투여하는 것을 추가로 포함한다. 제2 측면의 제2 실시양태에서, 추가의 작용제는 항미생물제, 항바이러스제, 세포독성제 및/또는 면역 반응 조절제이다. 제2 측면의 제3 실시양태에서, 추가의 작용제는 HDAC 억제제이다. 제2 측면의 제4 실시양태에서, 추가의 작용제는 TLR7 및/또는 TLR8 효능제이다.
제3 측면에서, 본 개시내용은 암 세포의 성장, 증식 또는 전이의 억제를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 암 세포의 성장, 증식 또는 전이를 억제하는 방법을 제공한다. 제3 측면의 제1 실시양태에서, 암은 흑색종, 신세포 암종, 편평 비소세포 폐암 (NSCLC), 비-편평 NSCLC, 결장직장암, 거세-저항성 전립선암, 난소암, 위암, 간세포성 암종, 췌장 암종, 두경부의 편평 세포 암종, 식도, 위장관 및 유방 암종, 및 혈액 악성종양으로부터 선택된다.
제4 측면에서, 본 개시내용은 감염성 질환의 치료를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 감염성 질환을 치료하는 방법을 제공한다. 제4 측면의 제1 실시양태에서, 감염성 질환은 바이러스에 의해 유발된다. 제4 측면의 제2 실시양태에서, 바이러스는 HIV, A형 간염, B형 간염, C형 간염, 포진 바이러스 및 인플루엔자로부터 선택된다.
제5 측면에서, 본 개시내용은 패혈성 쇼크의 치료를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 패혈성 쇼크를 치료하는 방법을 제공한다.
제6 측면에서, 본 개시내용은 대상체에게 치료 유효량의 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 PD-L1과 PD-1 및/또는 CD80의 상호작용을 차단하는 방법을 제공한다.
R 측쇄가 메틸로 치환된 고리의 부분인 화학식 (I)의 화합물에서, 메틸 기는 마크로시클릭 모 구조의 부분인 탄소를 포함한, 고리 내 임의의 치환가능한 탄소 원자 상에 위치할 수 있는 것으로 이해된다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R1 측쇄는 페닐알라닌, 티로신, 3-티엔-2-일, 4-메틸페닐알라닌, 4-클로로페닐알라닌, 3-메톡시페닐알라닌, 이소트립토판, 3-메틸페닐알라닌, 1-나프틸알라닌, 3,4-디플루오로페닐알라닌, 4-플루오로페닐알라닌, 3,4-디메톡시페닐알라닌, 3,4-디클로로페닐알라닌, 4-디플루오로메틸페닐알라닌, 2-메틸페닐알라닌, 2-나프틸알라닌, 트립토판, 4-피리디닐, 4-브로모페닐알라닌, 3-피리디닐, 4-트리플루오로메틸페닐알라닌, 4-카르복시페닐알라닌, 4-메톡시페닐알라닌, 비페닐알라닌, 및 3-클로로페닐알라닌; 및 2,4-디아미노부탄이다.
R2가 고리의 부분이 아닌 화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R2 측쇄는 알라닌, 세린 및 글리신이다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R3 측쇄는 아스파라긴, 아스파르트산, 글루탐산, 글루타민, 세린, 오르니틴, 리신, 히스티딘, 트레오닌, 류신, 알라닌, 2,3-디아미노프로판 및 2,4-디아미노부탄이다.
R4가 고리의 부분이 아닌 화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R4 측쇄는 발린, 알라닌, 이소류신 및 글리신이다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R5 측쇄는 아미노메탄, 글루탐산, 히스티딘, 아스파라긴, 2,3-디아미노프로판, 세린, 글리신, 2,4-디아미노부탄, 트레오닌, 알라닌, 리신, 아스파르트산, 알라닌 및 3-티아졸릴알라닌이다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R6 측쇄는 류신, 아스파르트산, 아스파라긴, 글루탐산, 글루타민, 세린, 리신, 3-시클로헥산, 트레오닌, 오르니틴, 2,4-디아미노부탄, 알라닌, 아르기닌 및 오르니틴 (COCH3)이다.
R7이 고리의 부분이 아닌 화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R7 측쇄는 글리신, 2,4-디아미노부탄, 세린, 리신, 아르기닌, 오르니틴, 히스티딘, 아스파라긴, 글루타민, 알라닌 및 2,4-디아미노부탄 (C(O)시클로부탄)이다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R8 측쇄는 트립토판 및 1,2- 벤즈이소티아졸리닐알라닌이다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R9 측쇄는 세린, 아미노에탄, 히스티딘, 리신, 오르니틴, 2,4-디부틸아민, 트레오닌, 글리신, 글루탐산, 발린, 2,3-디아미노프로판, 아르기닌, 아스파르트산 및 티로신이다.
화학식 (I)의 화합물에서, R10 측쇄가 고리의 임의의 치환가능한 탄소 또는 질소 원자를 통하여 부착될 수 있다는 것이 이해되어야 한다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R11 측쇄는 노르류신, 류신, 아스파라긴, 페닐알라닌, 메티오닌, 에톡시메탄, 알라닌, 트립토판, 이소류신, 페닐프로판, 글루탐산, 헥산 및 헵탄이다.
R12가 고리의 부분이 아닌 화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R12 측쇄는 노르류신, 알라닌, 에톡시메탄, 메티오닌, 세린, 페닐알라닌, 메톡시에탄, 류신, 트립토판, 이소류신, 글루탐산, 헥산, 헵탄 및 글리신이다.
화학식 (I)의 화합물에서, 바람직한 R13 측쇄는 아르기닌, 오르니틴, 알라닌, 2,4-디아미노부탄, 2,3-디아미노프로판, 류신, 아스파르트산, 글루탐산, 세린, 리신, 트레오닌, 시클로프로필메탄, 글리신, 발린, 이소류신, 히스티딘 및 2-아미노부탄이다.
본 개시내용에 따르면, 본 발명자들은 PD-L1에 특이적으로 결합하고 PD-L1과 PD-1 및 CD80의 상호작용을 억제할 수 있는 펩티드를 발견한 바 있다. 이들 마크로시클릭 펩티드는 시험관내 면역조정 효능을 나타내었으며, 따라서 이는 이들이 암 및 감염성 질환을 포함한 다양한 질환의 치료를 위한 치료 후보가 되게 한다.
용어 "특이적 결합" 또는 "특이적으로 결합한다"는 단백질 및 결합 분자, 예컨대 화합물 또는 리간드 사이의 상호작용을 지칭한다. 상호작용은 결합 분자에 의해 인식되는 단백질의 특정한 구조 (즉, 효소 결합 부위, 항원 결정기 또는 에피토프)의 존재에 의존한다. 예를 들어, 화합물이 단백질 결합 부위 "A"에 대해 특이적 결합을 갖는 경우에, 결합 부위 A를 포함한 단백질 및 단백질 결합 부위 A에 특이적으로 결합하는 표지된 펩티드를 함유하는 반응물 중 화합물의 존재는 단백질에 결합되는 표지된 펩티드의 양을 감소시킬 것이다. 대조적으로, 단백질에 대한 화합물의 비특이적 결합은 단백질로부터 표지된 펩티드의 농도-의존성 변위를 발생시키지 않는다.
본 개시내용은 본 화합물에서 발생하는 원자의 모든 동위원소를 포함하는 것으로 의도된다. 동위원소는 동일한 원자 번호를 갖지만 상이한 질량수를 갖는 원자를 포함한다. 일반적 예로서 및 비제한적으로, 수소의 동위원소는 중수소 및 삼중수소를 포함한다. 탄소의 동위원소는 13C 및 14C를 포함한다. 본 발명의 동위원소-표지된 화합물은 일반적으로 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 통상적인 기술에 의해 또는 본원에 기재된 것들과 유사한 방법에 의해, 달리 사용되는 비-표지된 시약 대신 적절한 동위원소-표지된 시약을 사용하여 제조될 수 있다. 이러한 화합물은, 예를 들어 생물학적 활성을 결정하는 데 있어서의 표준물 및 시약으로서, 다양한 잠재적 용도를 가질 수 있다. 안정한 동위원소의 경우에, 이러한 화합물은 생물학적, 약리학적 또는 약동학적 특성을 유리하게 변형시키는 잠재력을 가질 수 있다.
본원에 기재된 대상의 추가의 측면은 리간드 결합 검정의 개발을 위한 또는 생체내 흡착, 대사, 분포, 수용체 결합 또는 점유, 또는 화합물 배치를 모니터링하기 위한 방사성표지된 리간드로서의 개시된 펩티드의 용도이다. 예를 들어, 본원에 기재된 마크로시클릭 펩티드는 방사성 동위원소 125I를 사용하여 제조될 수 있고, 생성된 방사성표지된 펩티드는 결합 검정을 개발하거나 또는 대사 연구를 위해 사용될 수 있다. 대안적으로, 동일한 목적상, 본원에 기재된 마크로시클릭 펩티드는 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 방법을 사용하여 촉매 삼중수소화에 의해 방사성표지된 형태로 전환될 수 있다.
본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 또한, 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 방법을 사용하여 방사성 추적자를 첨가함으로써 PET 영상화제로서 사용될 수 있다.
바람직한 펩티드는 본원에 제공된 마크로시클릭 펩티드 중 적어도 1종을 포함하고, 이들 펩티드는 제약 조성물 및 조합물에 포함될 수 있다.
본원에 제공된 정의는, 특정 경우에 달리 제한되지 않는 한, 비제한적으로, 본 명세서 전반에 걸쳐 사용된 용어에 적용된다.
아미노산 및 펩티드 화학 기술분야의 통상의 기술자는 아미노산이 하기 일반 구조에 의해 나타내어지는 화합물을 포함한다는 것을 알고 있다.
Figure pct00012
여기서 R 및 R'는 본원에 논의된 바와 같다.
달리 나타내지 않는 한, 본원에서 단독으로 또는 또 다른 기의 부분으로서 이용된 용어 "아미노산"은, 비제한적으로, "α" 탄소로서 지칭되는 동일한 탄소에 연결된 아미노 기 및 카르복실 기를 포함하고, 여기서 R 및/또는 R'는 수소를 포함한 천연 또는 비천연 측쇄일 수 있다. "α" 탄소에서의 절대 "S" 배위는 통상적으로 "L" 또는 "천연" 배위로서 지칭된다. "R" 및 "R'"(프라임) 치환기 둘 다가 수소로 동일한 경우에, 아미노산은 글리신이며, 키랄이 아니다.
본원에 사용된 용어 "천연 아미노산 측쇄" 및 "천연 발생 아미노산 측쇄"는 통상적으로 S-배위 (즉, L-아미노산)에서의 임의의 천연 발생 아미노산 (즉, 알라닌, 아르기닌, 아스파라긴, 아스파르트산, 시스테인, 글루타민, 글루탐산, 글리신,-히스티딘, 이소류신, 류신, 리신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 세린, 트레오닌, 트립토판, 티로신, 및 발린)의 측쇄를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "비천연 아미노산 측쇄" 및 "비-천연 발생 아미노산 측쇄"는 통상적으로 R-배위 (즉, D-아미노산)에서의 임의의 천연 발생 아미노산의 측쇄 또는 하기로부터 선택된 R- 또는 S-배위 (즉, 각각 D- 또는 L-아미노산)에서의 천연 발생 아미노산 측쇄 이외의 기를 지칭한다:
C2-C7알케닐, C1-C3알콕시C1-C3알킬, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C7알킬, C1-C3알킬술파닐C1-C3알킬, 아미도C1-C3알킬, 아미노C1-C3알킬, 벤조티아졸릴C1-C3알킬, 벤조티에닐C1-C3알킬, 벤질옥시C1-C3알킬, 카르복시C1-C3알킬, C3-C14시클로알킬C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬, 디페닐메틸, 푸라닐C1-C3알킬, 이미다졸릴C1-C3알킬, 나프틸C1-C3알킬, 피리디닐C1-C3알킬, 티아졸릴C1-C3알킬, 티에닐C1-C3알킬;
아자인돌릴C1-C3알킬 (여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 독립적으로 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 치환기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환됨);
비페닐C1-C3알킬 (여기서 비페닐은 메틸 기로 임의로 치환됨);
-(CH2)nQ' (여기서 n은 1-3이고 Q'는 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, (C1-6알킬)술파미딜C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것임); 또는
-(CH2)nZ' (여기서, n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환됨);
독립적으로 C1-C4알콕시, C1-C4알킬, C1-C3알킬술포닐아미노, 아미도, 아미노, 아미노C1-C3알킬, 아미노술포닐, 카르복시, 시아노, 할로, 할로C1-C3알킬, 히드록시, -NC(NH2)2, 니트로, 및 -OP(O)(OH)2로부터 선택된 1, 2, 3, 4, 또는 5개의 기로 임의로 치환된 헤테로시클릴;
인돌릴C1-C3알킬 (여기서, 인돌릴 부분은 (C1-6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C1-C6알콕시, C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환됨);
독립적으로 C1-C4알콕시, C1-C4알킬, C1-C3알킬술포닐아미노, 아미도, 아미노, 아미노C1-C3알킬, 아미노술포닐, 카르복시, 시아노, 할로, 할로C1-C3알킬, 히드록시, -NC(NH2)2, 니트로, 및 -OP(O)(OH)2로부터 선택된 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 기로 임의로 치환된 페닐;
NRaRb(C1-C7알킬) (여기서 Ra 및 Rb는 독립적으로 수소, C2-C4알케닐옥시카르보닐, C1-C3알킬, C1-C3알킬카르보닐, C3-C6시클로알킬카르보닐, 푸라닐카르보닐, 및 페닐카르보닐로부터 선택됨. 알킬 링커가 1개 초과의 탄소를 함유하는 경우에 추가의 NRaRb 기가 쇄 상에 존재할 수 있음.)
NRcRd카르보닐C1-C3알킬 (여기서 Rc 및 Rd는 독립적으로 수소, C1-C3알킬, 및 트리페닐메틸로부터 선택됨);
페닐C1-C3알킬 (여기서 페닐 부분은 독립적으로 C1-C4알콕시, C1-C4알킬, C1-C3알킬술포닐아미노, 아미도, 아미노, 아미노C1-C3알킬, 아미노술포닐, 카르복시, 시아노, 할로, 할로C1-C3알킬, 히드록시, -NC(NH2)2, 니트로, 및 -OP(O)(OH)2로부터 선택된 1, 2, 3, 4, 또는 5개의 기로 임의로 치환됨); 및
페녹시C1-C3알킬 (여기서 페닐은 C1-C3알킬 기로 임의로 치환됨).
본원에 사용된 용어 "C2-C4알케닐"은 적어도 1개의 탄소-탄소 이중 결합을 함유하는 2 내지 4개의 탄소 원자의 직쇄 또는 분지쇄 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C2-C7알케닐"은 적어도 1개의 탄소-탄소 이중 결합을 함유하는 2 내지 7개의 탄소 원자의 직쇄 또는 분지쇄 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C2-C4알케닐옥시"는 산소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C2-C4알케닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알콕시"는 산소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C3알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C4알콕시"는 산소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C4알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C6알콕시"는 산소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C6알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알콕시C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C3알콕시 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C6알콕시카르보닐"은 카르보닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C6알콕시 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C6알콕시카르보닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알킬"은 1 내지 3개의 탄소 원자를 함유하는 직쇄 또는 분지쇄 포화 탄화수소로부터 유도된 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C4알킬"은 1 내지 4개의 탄소 원자를 함유하는 직쇄 또는 분지쇄 포화 탄화수소로부터 유도된 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C6알킬"은 1 내지 6개의 탄소 원자를 함유하는 직쇄 또는 분지쇄 포화 탄화수소로부터 유도된 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알킬카르보닐"은 카르보닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C3알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "(C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬"은 하기를 지칭하고:
Figure pct00013
;
여기서 R은 C1-C6알킬 기이고, R*는 C1-C3알킬 기이고,
Figure pct00014
는 모 분자 모이어티에 대한 부착 지점을 나타낸다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알킬술파닐"은 황 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C3알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알킬술파닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C3알킬술파닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알킬술포닐"은 술포닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C3알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C1-C3알킬술포닐아미노"는 아미노 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C1-C3알킬술포닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "아미도"는 -C(O)NH2를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "아미도C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 아미도 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "아미노"는 -NH2를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "아미노C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 아미노 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "아미노술포닐"은 술포닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 아미노 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "아릴"은 페닐 기, 또는 고리 중 하나 또는 둘 다가 페닐 기인 비시클릭 융합된 고리계를 지칭한다. 비시클릭 융합된 고리계는 4- 내지 6-원 방향족 또는 비-방향족 카르보시클릭 고리에 융합된 페닐 기로 이루어진다. 본 개시내용의 아릴 기는 기 내의 임의의 치환가능한 탄소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착될 수 있다. 아릴 기의 대표적인 예는 인다닐, 인데닐, 나프틸, 페닐 및 테트라히드로나프틸을 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 본 개시내용의 아릴 기는 독립적으로 C1-3알콕시, C1-3알킬, 시아노, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬 및 히드록시로부터 선택된 1, 2, 3, 4 또는 5개의 치환기로 임의로 치환된다.
본원에 사용된 용어 "아릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 아릴 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "아자인돌릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자에 부착된 아자인돌릴 기를 지칭한다. 아자인돌릴 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "벤조티아졸릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자에 부착된 벤조티아졸릴 기를 지칭한다. 벤조티아졸릴 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "벤조티에닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자에 부착된 벤조티에닐 기를 지칭한다. 벤조티에닐 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "벤질옥시"는 산소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 벤질 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "벤질옥시C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 벤질옥시 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "비페닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 비페닐 기를 지칭한다. 비페닐 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "카르보닐"은 -C(O)-를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "카르복시"는 -CO2H를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "카르복시C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 카르복시 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "시아노"는 -CN을 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C3-C14시클로알킬"은 3 내지 14개의 탄소 원자 및 0개의 헤테로원자를 갖는 포화 모노시클릭, 비시클릭, 또는 트리시클릭 탄화수소 고리계를 지칭한다. 비시클릭 및 트리시클릭 고리는 융합되거나, 스피로시클릭이거나, 또는 가교될 수 있다. 시클로알킬 기의 대표적인 예는 시클로프로필, 시클로펜틸, 비시클로[3.1.1]헵틸, 및 아다만틸을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
본원에 사용된 용어 "C3-C14시클로알킬C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C3-C14시클로알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C3-C14시클로알킬카르보닐"은 카르보닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C3-C14 시클로알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C3-C6시클로알킬"은 3 내지 6개의 탄소 원자 및 0개의 헤테로원자를 갖는 포화 모노시클릭, 탄화수소 고리계를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C3-C6시클로알킬C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C3-C6시클로알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "C3-C6시클로알킬카르보닐"은 카르보닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 C3-C6시클로알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "푸라닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 푸라닐 기를 지칭한다. 푸라닐 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "푸라닐카르보닐"은 카르보닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 푸라닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "할로" 및 "할로겐"은 F, Cl, Br 또는 I를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "할로C1-C3알콕시"는 1, 2 또는 3개의 할로겐 원자로 치환된 C1-C3알콕시 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "할로C1-C3알킬"은 1, 2 또는 3개의 할로겐 원자로 치환된 C1-C3알킬 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "할로메틸"은 1, 2 또는 3개의 할로겐 원자로 치환된 메틸 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "헤테로아릴"은 적어도 1개의 원자는 N, O 및 S로부터 선택되고 나머지 원자는 탄소인 방향족 5- 또는 6-원 고리를 지칭한다. 용어 "헤테로아릴"은 또한 헤테로아릴 고리가 N, O 및 S로부터 선택된 0, 1 또는 2개의 추가의 헤테로원자를 함유하는 4- 내지 6-원 방향족 또는 비-방향족 고리에 융합된 비시클릭계를 포함한다. 헤테로아릴 기는 기 내의 임의의 치환가능한 탄소 또는 질소 원자를 통하여 모 분자 모이어티에 부착된다. 헤테로아릴 기의 대표적인 예는 벤족사디아졸릴, 벤족사졸릴, 벤조푸라닐, 벤조티에닐, 푸라닐, 이미다졸릴, 인다졸릴, 인돌릴, 이속사졸릴, 이소퀴놀리닐, 이소티아졸릴, 나프티리디닐, 옥사디아졸릴, 옥사졸릴, 피리디닐, 피리다지닐, 피리미디닐, 피라지닐, 피라졸릴, 피롤릴, 퀴놀리닐, 티아졸릴, 티에노피리디닐, 티에닐, 트리아졸릴, 티아디아졸릴 및 트리아지닐을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 본 발명의 헤테로아릴 기는 독립적으로 C1-3알콕시, C1-3알킬, 시아노, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬 및 히드록시로부터 선택된 1, 2, 3, 4 또는 5개의 치환기로 임의로 치환될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "헤테로아릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 헤테로아릴 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "헤테로시클릴"은 독립적으로 질소, 산소, 및 황으로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 헤테로원자를 함유하는 5-, 6-, 또는 7-원 고리를 지칭한다. 5-원 고리는 0 내지 2개의 이중 결합을 갖고, 6- 및 7-원 고리는 0 내지 3개의 이중 결합을 갖는다. 용어 "헤테로시클릴"은 또한 헤테로시클릴 고리가 4- 내지 6-원 방향족 또는 비-방향족 카르보시클릭 고리 또는 또 다른 모노시클릭 헤테로시클릴 기에 융합된 비시클릭 기를 포함한다. 본 개시내용의 헤테로시클릴 기는 기 내의 탄소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된다. 헤테로시클릴 기의 예는 벤조티에닐, 푸릴, 이미다졸릴, 인돌리닐, 인돌릴, 이소티아졸릴, 이속사졸릴, 모르폴리닐, 옥사졸릴, 피페라지닐, 피페리디닐, 피라졸릴, 피리디닐, 피롤리디닐, 피롤로피리디닐, 피롤릴, 티아졸릴, 티에닐 및 티오모르폴리닐을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
본원에 사용된 용어 "히드록시"는 -OH를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "이미다졸릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 이미다졸릴 기를 지칭한다. 이미다졸릴 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "인돌릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 인돌릴 기를 지칭한다. 인돌릴 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "나프틸C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 나프틸 기를 지칭한다. 나프틸 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "니트로"는 -NO2를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "NRaRb"는 질소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 2개의 기, Ra 및 Rb를 지칭한다. Ra 및 Rb는 독립적으로 수소, C2-C4알케닐옥시카르보닐, C1-C3알킬카르보닐, C3-C6시클로알킬카르보닐, 푸라닐카르보닐 및 페닐카르보닐로부터 선택된다.
본원에 사용된 용어 "NRaRb(C1-C3)알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 NRaRb 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "NRcRd"는 질소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 2개의 기, Rc 및 Rd를 지칭한다. Rc 및 Rd는 독립적으로 수소, C1-C3알킬 및 트리페닐메틸로부터 선택된다.
본원에 사용된 용어 "NRcRd카르보닐"은 카르보닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 NRcRd 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "NRcRd카르보닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 NRcRd카르보닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "페녹시"는 산소 원자를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 페닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "페녹시C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 페녹시 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "페닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 페닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "페닐카르보닐"은 카르보닐 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 페닐 기를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "피리디닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 피리디닐 기를 지칭한다. 피리디닐 기는 기 내의 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "술파닐"은 -S-를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "술포닐"은 -SO2-를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "테트라졸릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 테트라졸릴 기를 지칭한다. 티아졸릴 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "티아졸릴C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 티아졸릴 기를 지칭한다. 티아졸릴 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "티에닐C1-C3알킬"은 C1-C3알킬 기를 통해 모 분자 모이어티에 부착된 티에닐 기를 지칭한다. 티에닐 기는 기 내 임의의 치환가능한 원자를 통해 알킬 모이어티에 부착될 수 있다.
용어 "치료하는"은 (i) 질환, 장애 및/또는 상태에 대한 소인이 있을 수 있지만 아직 걸린 것으로 진단되지는 않은 환자에서 질환, 장애 또는 상태가 발생하는 것을 예방하는 것; (ii) 질환, 장애 또는 상태를 억제하는 것, 즉, 그의 진행을 저지하는 것; 및 (iii) 질환, 장애 또는 상태를 완화시키는 것, 즉, 질환, 장애 및/또는 상태 및/또는 질환, 장애, 및/또는 상태와 연관된 증상의 퇴행을 유발하는 것을 지칭한다.
PD-L1에 대한 마크로시클릭 펩티드의 결합은, 예를 들어 균질 시간-분해 형광 (HTRF), 표면 플라즈몬 공명 (SPR), 등온 적정 열량측정법 (ITC), 핵 자기 공명 분광분석법 (NMR) 등과 같은 방법에 의해 측정될 수 있다. 추가로, 세포 표면 상에서 발현된 PD-L1에 대한 마크로시클릭 펩티드의 결합은 본원에 기재된 바와 같이 세포 결합 검정에서 측정될 수 있다.
본원에 기재된 치료제의 투여는, 비제한적으로, 치료 유효량의 치료제의 투여를 포함한다. 본원에 사용된 용어 "치료 유효량"은, 비제한적으로, 본원에 기재된 PD-1/PD-L1 결합 억제제의 조성물의 투여에 의해 치료가능한 상태를 치료 또는 예방하기 위한 치료제의 양을 지칭한다. 그러한 양은 검출가능한 치료 또는 예방 또는 호전 효과를 나타내는데 충분한 양이다. 효과는, 예를 들어 및 비제한적으로, 본원에 열거된 상태의 치료 또는 예방을 포함할 수 있다. 대상체에 대한 정확한 유효량은 대상체의 크기 및 건강, 치료될 상태의 성질 및 정도, 치료 의사의 권고, 투여를 위해 선택된 치료제 또는 치료제의 조합물에 의존할 것이다. 따라서, 미리 정확한 유효량을 구체화하는 것은 유용하지 않다.
또 다른 측면에서, 본 개시내용은 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 사용하여 대상체에서 종양 세포의 성장을 억제하는 방법에 관한 것이다. 본원에 입증된 바와 같이, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 PD-L1에 결합할 수 있고, PD-L1 및 PD-1 사이의 상호작용을 방해할 수 있고, PD-1과의 상호작용을 차단하는 것으로 공지되어 있는 항-PD-1 모노클로날 항체와 PD-L1의 결합에 대해 경쟁할 수 있고, CMV-특이적 T 세포 IFNγ 분비를 증진시킬 수 있고, HIV-특이적 T 세포 IFNg 분비를 증진시킬 수 있다. 그 결과, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 면역 반응을 조정하거나, 암 또는 감염성 질환과 같은 질환을 치료하거나, 보호적 자가면역 반응을 자극하거나, 또는 항원-특이적 면역 반응을 자극하는데 (예를 들어, PD-L1 차단 펩티드와 관심 항원의 공투여에 의함) 유용하다.
본 개시내용이 보다 용이하게 이해될 수 있도록, 특정 용어가 먼저 정의된다. 추가의 정의는 상세한 설명 전반에 걸쳐 제시된다.
용어 "프로그램화된 사멸 리간드 1", "프로그램화된 세포 사멸 리간드 1", "단백질 PD-L1", "PD-L1", "PDL1", "PDCDL1", "hPD-L1", "hPD-LI", "CD274" 및 "B7-H1"은 상호교환가능하게 사용되며, 인간 PD-L1의 변이체, 이소형, 종 상동체, 및 PD-L1과 적어도 1종의 공통 에피토프를 갖는 유사체를 포함한다. 완전한 PD-L1 서열은 진뱅크(GENBANK®) 수탁 번호 NP_054862 하에 발견될 수 있다.
용어 "프로그램화된 사멸 1", "프로그램화된 세포 사멸 1", "단백질 PD-1", "PD-1", "PD1", "PDCD1", "hPD-1" 및 "hPD-I"는 상호교환가능하게 사용되며, 인간 PD-1의 변이체, 이소형, 종 상동체, 및 PD-1과 적어도 1종의 공통 에피토프를 갖는 유사체를 포함한다. 완전한 PD-1 서열은 진뱅크(GenBank®) 수탁 번호 U64863 하에 발견될 수 있다.
용어 "세포독성 T 림프구-연관 항원-4", "CTLA-4", "CTLA4", "CTLA-4 항원" 및 "CD152" (예를 들어, 문헌 [Murata, Am. J. Pathol., 155:453-460 (1999)] 참조)는 상호교환가능하게 사용되며, 인간 CTLA-4의 변이체, 이소형, 종 상동체, 및 CTLA-4와 적어도 1종의 공통 에피토프를 갖는 유사체를 포함한다 (예를 들어, 문헌 [Balzano, Int. J. Cancer Suppl., 7:28-32 (1992)] 참조). 완전한 CTLA-4 핵산 서열은 진뱅크® 수탁 번호 L15006 하에 발견될 수 있다.
용어 "면역 반응"은 침입 병원체, 병원체에 감염된 세포 또는 조직, 암성 세포, 또는 자가면역 또는 병리학적 염증의 경우에 정상 인간 세포 또는 조직에 대한 선택적인 손상, 그의 파괴 또는 그의 인간 신체로부터의 제거를 유발하는, 예를 들어 림프구, 항원 제시 세포, 식세포, 과립구 및 상기 세포 또는 간에 의해 생산되는 가용성 거대분자 (마크로시클릭 펩티드, 시토카인 및 보체 포함)의 작용을 지칭한다.
본원에 사용된 "유해 사건" (AE)은 의학적 치료의 사용과 연관된 임의의 불리하고 일반적으로 의도되지 않는, 심지어 바람직하지 않은, 징후 (비정상적 실험실 발견 포함), 증상 또는 질환이다. 예를 들어, 유해 사건은 치료에 반응하는 면역계의 활성화 또는 면역계 세포 (예를 들어, T 세포)의 확장과 연관될 수 있다. 의학적 치료는 1종 이상의 연관 AE를 가질 수 있고, 각각의 AE는 동일하거나 상이한 수준의 중증도를 가질 수 있다. "유해 사건을 변경할" 수 있는 방법에 대한 언급은 상이한 치료 요법의 사용과 연관된 1종 이상의 AE의 발생률 및/또는 중증도를 감소시키는 치료 요법을 의미한다.
본원에 사용된 "과다증식성 질환"은 세포 성장이 정상 수준을 초과하여 증가된 상태를 지칭한다. 예를 들어, 과다증식성 질환 또는 장애는 악성 질환 (예를 들어, 식도암, 결장암, 담도암) 및 비-악성 질환 (예를 들어, 아테롬성동맥경화증, 양성 증식증 및 양성 전립선 비대)을 포함한다.
본원에 사용된 "약" 또는 "본질적으로 포함하는"은 관련 기술분야의 통상의 기술자에 의해 결정 시, 특정한 값에 대해 허용 오차 범위 내를 의미하고, 이는 부분적으로 값이 어떻게 측정 또는 결정되는지에 따라, 즉 측정 시스템의 한계에 의존할 것이다. 예를 들어, "약" 또는 "본질적으로 포함하는"은 관련 기술분야에서 실시할 때마다 1 또는 1 초과의 표준 편차 내에 있다는 것을 의미할 수 있다. 대안적으로, "약" 또는 "본질적으로 포함하는"은 20% 이하의 범위를 의미할 수 있다. 또한, 특히 생물학적 시스템 또는 과정과 관련하여, 용어는 값의 최대 한 자릿수 배수 또는 5-배를 의미할 수 있다. 특정한 값이 본 출원 및 청구범위에 제공되는 경우에, 달리 언급되지 않는 한, "약" 또는 "본질적으로 포함하는"의 의미는 상기 특정한 값에 대한 허용가능한 오차 범위 내에 있는 것으로 가정되어야 한다.
본원에 기재된 임의의 농도 범위, 백분율 범위, 비 범위 또는 정수 범위는 달리 나타내지 않는 한, 언급된 범위 내의 임의의 정수 값, 및 적절한 경우에, 그의 분율 (예컨대 정수의 1/10 및 1/100)을 포함하는 것으로 이해되어야 한다.
경쟁 검정
본 개시내용은 또한 참조 항-PD-L1 항체 (MDX-1105)의 결합과 적어도 약 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80%, 적어도 약 90%, 및 적어도 약 100%만큼 경쟁할 수 있는 마크로시클릭 펩티드에 관한 것이다. 이러한 마크로시클릭 펩티드는, PD-L1에 특이적으로 결합하는 것을 단서로 돌연변이체, 보존적 치환, 기능적 치환, 및 결실 형태를 포함한, 본원에 개시된 1종 이상의 마크로시클릭 펩티드와 구조적 상동성을 공유할 수 있다. 예를 들어, 마크로시클릭 펩티드가 참조 항-PD-L1 항체와 동일한 영역의 PD-L1에 실질적으로 결합하는 경우에, 마크로시클릭 펩티드는 항-PD-L1 모노클로날 항체가 결합하는 PD-L1 에피토프와 적어도 중첩되는 PD-L1의 에피토프에 결합할 것이다. 중첩 영역은 1개의 아미노산 잔기에서 수백개의 아미노산 잔기의 범위일 수 있다. 마크로시클릭 펩티드는 이어서 PD-L1에 대한 항-PD-L1 모노클로날 항체의 결합과 경쟁하고/거나 그러한 결합을 차단하며, 그에 의해 PD-L1에 대한 항-PD-L1 모노클로날 항체의 결합을 경쟁 검정에서 바람직하게는 적어도 약 50%만큼 감소시킬 것이다.
경쟁 검정 목적을 위한 참조 항체로서 사용될 수 있는 항-PD-L1 항체는 관련 기술분야에 공지되어 있다. 예를 들어, 하기 대표 항-PD-L1 항체가 사용될 수 있다: MDX-1105 (BMS); L01X-C (세로노(Serono)), L1X3 (세로노), MSB-0010718C (세로노) 및 PD-L1 프로바디 (시톰엑스(CytomX)) 및 공동-소유한 WO 2007/005874에 개시된 PD-L1 항체.
경쟁 검정 목적을 위한 참조 항체로서 사용될 수 있는 항-PD-1 항체는 관련 기술분야에 공지되어 있다. 예를 들어, 하기 대표 항-PD-1 항체가 사용될 수 있다: 니볼루맙 (BMS); 각각 공동-소유한 미국 특허 번호 8,008,449 (BMS)에 개시된 17D8, 2D3, 4H1, 4A11, 7D3 및 5F4, MK-3475 (머크(Merck), 미국 특허 번호 8,168,757에 개시됨) 및 미국 특허 번호 7,488,802에 개시된 항체.
제약 조성물
또 다른 측면에서, 본 개시내용은 제약상 허용되는 담체와 함께 제제화된, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드 중 하나 또는 그의 조합을 함유하는 조성물, 예를 들어 제약 조성물을 제공한다. 이러한 조성물은 본 개시내용의 (예를 들어, 2종 이상의 상이한) 마크로시클릭 펩티드, 또는 면역접합체 또는 이중특이적 분자 중 하나 또는 그의 조합을 포함할 수 있다. 예를 들어, 본 개시내용의 제약 조성물은 표적 항원 상의 상이한 에피토프에 결합하거나 또는 보체 활성을 갖는 마크로시클릭 펩티드 (또는 면역접합체 또는 이중특이체)의 조합을 포함할 수 있다.
본 개시내용의 제약 조성물은 또한 조합 요법으로, 즉 다른 작용제와 조합되어 투여될 수 있다. 예를 들어, 조합 요법은 적어도 1종의 다른 항염증제 또는 면역억제제와 조합된 마크로시클릭 펩티드를 포함할 수 있다. 조합 요법에 사용될 수 있는 치료제의 예는 하기 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드의 사용에 대한 섹션에서 보다 상세하게 기재된다.
본원에 사용된 "제약상 허용되는 담체"는 생리학상 상용성인 임의의 및 모든 용매, 분산 매질, 코팅, 항박테리아제 및 항진균제, 등장화제 및 흡수 지연제 등을 포함한다. 바람직하게는, 담체는 정맥내, 근육내, 피하, 비경구, 척수 또는 표피 투여 (예를 들어, 주사 또는 주입에 의함)에 적합하다. 투여 경로에 의존하여, 활성 화합물, 즉 마크로시클릭 펩티드, 면역접합체, 또는 이중특이적 분자는 화합물을 불활성화시킬 수 있는 산 및 다른 천연 조건의 작용으로부터 화합물을 보호하는 물질로 코팅될 수 있다.
본 개시내용의 제약 화합물은 1종 이상의 제약상 허용되는 염을 포함할 수 있다. "제약상 허용되는 염" 또는 "치료상 허용되는 염"은 모 화합물의 목적하는 생물학적 활성을 보유하고 임의의 목적하지 않는 독성학적 효과를 제공하지 않는 염을 지칭한다 (예를 들어, 문헌 [Berge, S.M. et al., J. Pharm. Sci., 66:1-19 (1977)] 참조). 이러한 염의 예는 산 부가염 및 염기 부가염을 포함한다. 산 부가염은 비독성 무기 산, 예컨대 염산, 질산, 인산, 황산, 브로민화수소산, 아이오딘화수소산, 아인산 등으로부터 유도된 것, 뿐만 아니라 비독성 유기 산, 예컨대 지방족 모노- 및 디카르복실산, 페닐-치환된 알칸산, 히드록시 알칸산, 방향족 산, 지방족 및 방향족 술폰산 등으로부터 유도된 것을 포함한다. 염기 부가염은 알칼리 토금속, 예컨대 나트륨, 칼륨, 마그네슘, 칼슘 등으로부터 유도된 것, 뿐만 아니라 비독성 유기 아민, 예컨대 N,N'-디벤질에틸렌디아민, N-메틸글루카민, 클로로프로카인, 콜린, 디에탄올아민, 에틸렌디아민, 프로카인 등으로부터 유도된 것을 포함한다.
본 개시내용의 제약 조성물은 또한 제약상 허용되는 항산화제를 포함할 수 있다. 제약상 허용되는 항산화제의 예는 (1)수용성 항산화제, 예컨대 아스코르브산, 시스테인 히드로클로라이드, 중황산나트륨, 메타중아황산나트륨, 아황산나트륨 등; (2)유용성 항산화제, 예컨대 아스코르빌 팔미테이트, 부틸화 히드록시아니솔 (BHA), 부틸화 히드록시톨루엔 (BHT), 레시틴, 프로필 갈레이트, 알파-토코페롤 등; 및 (3)금속 킬레이트화제, 예컨대 시트르산, 에틸렌디아민 테트라아세트산 (EDTA), 소르비톨, 타르타르산, 인산 등을 포함한다.
본 개시내용의 제약 조성물에 이용될 수 있는 적합한 수성 및 비수성 담체의 예는 물, 에탄올, 폴리올 (예컨대 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜 등), 및 그의 적합한 혼합물, 식물성 오일, 예컨대 올리브 오일, 및 주사가능한 유기 에스테르, 예컨대 에틸 올레에이트를 포함한다. 적절한 유동성은, 예를 들어 코팅 물질, 예컨대 레시틴의 사용에 의해, 분산액의 경우에는 요구되는 입자 크기의 유지에 의해, 및 계면활성제의 사용에 의해 유지될 수 있다.
이들 조성물은 또한, 아주반트, 예컨대 보존제, 습윤제, 유화제 및 분산제를 함유할 수 있다. 미생물의 존재를 방지하는 것은 상기의 멸균 절차, 및 다양한 항박테리아제 및 항진균제, 예를 들어 파라벤, 클로로부탄올, 페놀 소르브산 등을 포함시키는 것 둘 다에 의해 보장될 수 있다. 등장화제, 예컨대 당, 염화나트륨 등을 조성물 내로 포함시키는 것이 또한 바람직할 수 있다. 또한, 주사가능한 제약 형태의 지속 흡수는 흡수를 지연시키는 작용제, 예컨대 알루미늄 모노스테아레이트 및 젤라틴의 포함에 의해 발생할 수 있다.
제약상 허용되는 담체는 멸균 수용액 또는 분산액, 및 멸균 주사가능한 용액 또는 분산액의 즉석 제조를 위한 멸균 분말을 포함한다. 제약 활성 물질을 위한 이러한 매질 및 작용제의 용도가 관련 기술분야에 공지되어 있다. 임의의 통상적인 매질 또는 작용제가 활성 화합물과 비상용성이 아닌 한, 본 개시내용의 제약 조성물에서의 그의 사용이 고려된다. 보충 활성 화합물이 또한 조성물 내로 혼입될 수 있다.
치료 조성물은 전형적으로, 제조 및 저장 조건 하에 멸균이고 안정적이어야 한다. 이러한 조성물은 용액, 마이크로에멀젼, 리포솜, 또는 높은 약물 농도에 적합한 다른 정렬된 구조로서 제제화될 수 있다. 담체는, 예를 들어 물, 에탄올, 폴리올 (예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 및 액체 폴리에틸렌 글리콜 등), 및 그의 적합한 혼합물을 함유하는 용매 또는 분산 매질일 수 있다. 예를 들어, 코팅, 예컨대 레시틴을 사용하고, 분산액의 경우에 요구되는 입자 크기를 유지하고, 계면활성제를 사용함으로써, 적절한 유동성을 유지할 수 있다. 다수의 경우에 등장화제, 예를 들어 당, 폴리알콜, 예컨대 만니톨, 소르비톨, 또는 염화나트륨을 조성물 내로 포함시키는 것이 또한 바람직할 수 있다. 흡수를 지연시키는 작용제, 예컨대 모노스테아레이트 염 및 젤라틴을 조성물 중에 포함시킴으로써, 주사가능한 조성물의 지속 흡수를 달성할 수 있다.
멸균 주사가능한 용액은 필요량의 활성 화합물을 상기 열거된 성분 중 하나 또는 그의 조합과 함께 적절한 용매 중에 혼입시키고, 이어서 필요에 따라 멸균 마이크로여과하여 제조될 수 있다. 일반적으로, 분산액은 활성 화합물을 염기성 분산 매질 및 상기 열거된 것으로부터 요구되는 다른 성분을 함유하는 멸균 비히클 내에 혼입시켜 제조된다. 멸균 주사가능한 용액의 제조를 위한 멸균 분말의 경우에, 바람직한 제조 방법은 활성 성분 플러스 이전에 멸균-여과된 그의 용액으로부터의 임의의 추가의 목적하는 성분의 분말을 산출하는 진공 건조 및 냉동-건조 (동결건조)이다.
담체 물질과 조합되어 단일 투여 형태를 생성할 수 있는 활성 성분의 양은 치료될 대상체, 및 특정한 투여 방식에 의존하여 달라질 것이다. 담체 물질과 조합되어 단일 투여 형태를 생성할 수 있는 활성 성분의 양은 일반적으로 치료 효과를 생성하는 조성물의 양일 것이다. 일반적으로, 100 퍼센트 중 이와 같은 양은 제약상 허용되는 담체와의 조합에서 약 0.01 퍼센트 내지 약 99 퍼센트의 활성 성분, 바람직하게는 약 0.1 퍼센트 내지 약 70퍼센트, 가장 바람직하게는 약 1 퍼센트 내지 약 30 퍼센트의 활성 성분의 범위일 것이다.
투여 요법은 최적의 목적하는 반응 (예를 들어, 치료 반응)을 제공하도록 조정된다. 예를 들어, 단일 볼루스가 투여될 수 있거나, 여러 분할 용량이 시간의 경과에 따라 투여될 수 있거나, 또는 치료 상황의 위급성에 의해 지시되는 바와 같이 용량이 비례적으로 감소되거나 또는 증가될 수 있다. 비경구 조성물은 투여의 용이성 및 투여량의 균일성을 위해 투여 단위 형태로 제제화하는 것이 특히 유리하다. 본원에 사용된 투여 단위 형태는 치료될 대상체에 대한 단위 투여량으로서 적합화된 물리적 이산 단위를 지칭하고; 각각의 단위는 필요한 제약 담체와 함께 목적하는 치료 효과를 생성하도록 계산된 미리 결정된 양의 활성 화합물을 함유한다. 본 개시내용의 투여 단위 형태에 대한 세부사항은 (a) 활성 화합물의 고유 특징 및 달성하고자 하는 특정한 치료 효과, 및 (b) 개체에서의 감수성 처리를 위한 이러한 활성 화합물을 배합하는 관련 기술분야에서의 내재적 제한에 의해 좌우되며 그에 직접적으로 의존한다.
마크로시클릭 펩티드의 투여의 경우에, 투여량은 약 0.0001 내지 100 mg/kg, 및 보다 통상적으로 0.01 내지 5 mg/kg 숙주 체중의 범위이다. 예를 들어, 투여량은 0.3 mg/kg 체중, 1 mg/kg 체중, 3 mg/kg 체중, 5 mg/kg 체중 또는 10 mg/kg 체중일 수 있거나, 또는 1-10 mg/kg 범위 내일 수 있다. 예시적인 치료 요법은 1일에 1회, 1일에 2회, 1주에 2회, 1주에 3회, 매주, 2주마다 1회, 3주마다 1회, 4주마다 1회, 1개월 1회, 3개월마다 1회, 또는 3 내지 6개월마다 1회 투여를 수반한다. 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드에 대한 바람직한 투여 요법은 정맥내 투여를 통한 1 mg/kg 체중 또는 3 mg/kg 체중을 포함하며, 마크로사이클은 하기 투여 스케줄 중 하나를 사용하여 주어진다: (i) 6회의 투여량 동안 4주마다, 이어서 3개월마다; (ii) 3주마다; (iii) 3 mg/kg 체중으로 1회에 이어서 1 mg/kg 체중으로 3주마다.
일부 방법에서, 상이한 결합 특이성을 갖는 2종 이상의 마크로시클릭 펩티드가 동시에 투여되고, 이러한 경우에 투여되는 각각의 화합물의 투여량은 지시된 범위 내에 속한다. 화합물은 통상적으로 다수회 투여된다. 단일 투여량 사이의 간격은, 예를 들어 매주, 매월, 3개월마다 또는 매년일 수 있다. 또한, 환자에서 표적 항원에 대한 마크로시클릭 펩티드의 혈액 수준을 측정함으로써 지시되는 바와 같이 간격이 불규칙적일 수 있다. 일부 방법에서 투여량은 약 1-1000 .mu.g/ml, 일부 방법에서는 약 25-300 .mu.g/ml의 혈장 농도가 달성되도록 조정된다.
대안적으로, 덜 빈번한 투여가 요구되는 경우에 마크로시클릭 펩티드는 지속 방출 제제로서 투여될 수 있다. 투여량 및 투여 빈도는 치료가 예방적인지 또는 치료적인지의 여부에 의존하여 달라질 수 있다. 예방적 적용에서, 비교적 낮은 투여량이 비교적 덜 빈번한 간격으로 장기간에 걸쳐 투여된다. 일부 환자는 그의 여생 동안 계속 치료를 받는다. 치료 용도에서, 질환의 진행이 감소되거나 종결될 때까지, 바람직하게는 환자가 질환 증상의 부분적 또는 완전한 호전을 나타낼 때까지 상대적으로 짧은 간격의 상대적으로 높은 투여량이 때때로 요구된다. 그 후, 환자에게 예방 요법을 투여할 수 있다.
본 개시내용의 제약 조성물 중 활성 성분의 실제 투여량 수준은 환자에게 독성이지 않으면서, 특정한 환자, 조성물 및 투여 방식에 대해 목적하는 치료 반응을 달성하는데 효과적인 활성 성분의 양을 수득하도록 달라질 수 있다. 선택되는 투여량 수준은 이용되는 본 개시내용의 특정한 조성물, 또는 그의 에스테르, 염 또는 아미드의 활성, 투여 경로, 투여 시간, 이용되는 특정한 화합물의 배출 속도, 치료의 지속기간, 이용되는 특정한 조성물과 조합되어 사용되는 다른 약물, 화합물 및/또는 물질, 치료될 환자의 연령, 성별, 체중, 상태, 전반적 건강 및 과거 병력, 및 의학 기술분야에 널리 공지된 기타 인자를 포함한 다양한 약동학적 인자에 의존할 것이다.
본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드의 "치료 유효 투여량"은 바람직하게는 질환 증상 중증도의 감소, 질환 증상이 없는 기간의 빈도 및 지속기간의 증가, 또는 질환 고통으로 인한 장애 또는 불능의 예방을 생성한다. 예를들어, 종양의 치료를 위해, "치료 유효 투여량"은 비처리된 대상체에 비해 바람직하게는 적어도 약 20%만큼, 보다 바람직하게는 적어도 약 40%만큼, 보다 더 바람직하게는 적어도 약 60%만큼, 보다 더욱 더 바람직하게는 적어도 약 80%만큼 세포 성장 또는 종양 성장을 억제한다. 종양 성장 및/또는 HIV를 억제하는 화합물의 능력은 인간 종양에서의 효능 또는 바이러스 효능을 예측하는 동물 모델 시스템에서 평가될 수 있다. 대안적으로, 조성물의 이러한 특성은 숙련된 진료의에게 공지된 검정에 의해 시험관내에서 이러한 억제를 억제하는 화합물의 능력을 검사함으로써 평가될 수 있다. 치료 화합물의 치료 유효량은 대상체에서 종양 크기를 감소시키거나, 바이러스 로드를 감소시키거나, 또는 달리 증상을 호전시킬 수 있다. 관련 기술분야의 통상의 기술자는 대상체의 크기, 대상체의 증상의 중증도, 및 선택된 특정한 조성물 또는 투여 경로와 같은 인자에 기초하여 이러한 양을 결정할 수 있을 것이다.
또 다른 측면에서, 본 개시내용은 본원에 기재된 바와 같은 마크로시클릭 펩티드 및 또 다른 면역조정제를 포함하는 부분들의 제약 키트를 제공한다. 키트는 또한 추가로 과다증식성 질환 (예컨대 본원에 기재된 바와 같은 암) 및/또는 항바이러스 질환의 치료에 사용하기 위한 지침서를 포함할 수 있다.
본 개시내용의 조성물은 관련 기술분야에 공지된 다양한 방법 중 1종 이상을 사용하여 1종 이상의 투여 경로를 통해 투여될 수 있다. 통상의 기술자에 의해 인지될 바와 같이, 투여 경로 및/또는 방식은 목적하는 결과에 의존하여 달라질 것이다. 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드에 대한 바람직한 투여 경로는 정맥내, 근육내, 피내, 복강내, 피하, 척수 또는 다른 비경구 투여 경로, 예를 들어 주사 또는 주입에 의하는 것을 포함한다. 본원에 사용된 어구 "비경구 투여"는 통상적으로 주사에 의한, 경장 및 국소 투여 이외의 투여 방식을 의미하고, 비제한적으로, 정맥내, 근육내, 동맥내, 척수강내, 피막내, 안와내, 심장내, 피내, 복강내, 경기관, 피하, 각피하, 관절내, 피막하, 지주막하, 척수내, 경막외 및 흉골내 주사 및 주입을 포함한다.
대안적으로, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 비-비경구 경로, 예컨대 국소, 표피 또는 점막 투여 경로를 통해, 예를 들어 비강내로, 경구로, 질로, 직장으로, 설하로 또는 국소로 투여될 수 있다.
활성 화합물은 이식물, 경피 패치 및 마이크로캡슐화 전달 시스템을 포함한, 신속 방출에 대해 화합물을 보호할 담체, 예컨대 제어 방출 제제와 함께 제조될 수 있다. 생분해성, 생체적합성 중합체, 예컨대 에틸렌 비닐 아세테이트, 폴리무수물, 폴리글리콜산, 콜라겐, 폴리오르토에스테르 및 폴리락트산이 사용될 수 있다. 이러한 제제의 제조를 위한 많은 방법이 특허받았거나 또는 일반적으로 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지되어 있다. 예를 들어, 문헌 [Robinson, J.R., ed., Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, Marcel Dekker, Inc., New York (1978)]을 참조한다.
치료 조성물은 관련 기술분야에 공지된 의료 장치로 투여될 수 있다. 예를 들어, 바람직한 실시양태에서, 본 개시내용의 치료 조성물은 무바늘 피하 주사 장치, 예컨대 미국 특허 번호 5,399,163, 5,383,851, 5,312,335, 5,064,413, 4,941,880, 4,790,824, 또는 4,596,556에 개시된 장치를 사용하여 투여될 수 있다. 본 개시내용에 유용한 널리 공지된 이식물 및 모듈의 예는 하기를 포함한다: 제어된 속도로 의약을 분배하는 이식가능한 마이크로-주입 펌프를 개시하고 있는 미국 특허 번호 4,487,603; 피부를 통해 의약을 투여하는 치료 장치를 개시하고 있는 미국 특허 번호 4,486,194; 정확한 주입 속도로 의약을 전달하기 위한 의약 주입 펌프를 개시하고 있는 미국 특허 번호 4,447,233; 연속적 약물 전달을 위한 가변 유동식 이식가능한 주입 장치를 개시하고 있는 미국 특허 번호 4,447,224; 다중-챔버 구획을 갖는 삼투성 약물 전달 시스템을 개시하고 있는 미국 특허 번호 4,439,196; 및 삼투성 약물 전달 시스템을 개시하고 있는 미국 특허 번호 4,475,196. 이들 특허는 본원에 참조로 포함된다. 많은 다른 이러한 이식물, 전달 시스템 및 모듈이 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지되어 있다.
특정 실시양태에서, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 생체내 적절한 분포를 보장하도록 제제화될 수 있다. 예를 들어, 혈액-뇌 장벽 (BBB)은 많은 고도로 친수성인 화합물을 배제시킨다. 본 개시내용의 치료 화합물이 (원하는 경우에) BBB를 횡단하도록 보장하기 위해, 이들은 예를 들어 리포솜 내에 제제화될 수 있다. 리포솜의 제조 방법에 대해, 예를 들어, 미국 특허 번호 4,522,811, 5,374,548 및 5,399,331을 참조한다. 리포솜은 구체적 세포 또는 기관 내로 선택적으로 수송되어, 따라서 표적화 약물 전달을 증진시키는 1개 이상의 모이어티를 포함할 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Ranade, V.V., J. Clin. Pharmacol., 29:685 (1989)] 참조). 예시적인 표적화 모이어티는 폴레이트 또는 비오틴 (예를 들어, 로우 등의 미국 특허 번호 5,416,016 참조); 만노시드 (Umezawa et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 153:1038 (1988)); 마크로시클릭 펩티드 (Bloeman, P.G. et al., FEBS Lett., 357:140 (1995); Owais, M. et al., Antimicrob. Agents Chemother., 39:180 (1995)); 계면활성제 단백질 A 수용체 (Briscoe et al., Am. J. Physiol., 1233:134 (1995)); p120 (Schreier et al., J. Biol. Chem., 269:9090 (1994))을 포함하고; 또한 문헌 [Keinanen, K. et al., FEBS Lett., 346:123 (1994); Killion, J.J. et al., Immunomethods 4:273 (1994)]을 참조한다.
본 개시내용의 용도 및 방법
본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드, 조성물 및 방법은, 예를 들어 PD-L1의 검출, 또는 PD-L1의 차단에 의한 면역 반응의 증진을 수반하는 수많은 시험관내 및 생체내 유용성을 갖는다. 예를 들어, 이들 분자는 배양물 중, 시험관내 또는 생체외 세포에, 또는 인간 대상체, 예를 들어 생체내 투여되어 다양한 상황에서 면역을 증진시킬 수 있다. 따라서, 한 측면에서, 본 개시내용은 대상체에게 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 투여하여 상기 대상체에서 면역 반응이 조정되도록 하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 면역 반응을 조정하는 방법을 제공한다. 바람직하게는, 반응은 증진되거나, 자극되거나, 또는 상향-조절된다. 다른 측면에서, 마크로시클릭 펩티드는 항-시노, 항-마우스, 및/또는 항-우드척 결합 및 치료 활성을 가질 수 있다.
본원에 사용된 용어 "대상체"는 인간 및 비-인간 동물을 포함하는 것으로 의도된다. 비-인간 동물은 모든 척추동물, 예를 들어 포유동물 및 비-포유동물, 예컨대 비-인간 영장류, 양, 개, 고양이, 소, 말, 닭, 우드척, 양서류 및 파충류를 포함하지만, 포유동물, 예컨대 비-인간 영장류, 양, 개, 고양이, 소 및 말이 바람직하다. 바람직한 대상체는 면역 반응의 증진을 필요로 하는 인간 환자를 포함한다. 상기 방법은 T-세포 매개 면역 반응을 증대시킴으로써 치료될 수 있는 장애를 갖는 인간 환자를 치료하는데 특히 적합하다. 특정한 실시양태에서, 상기 방법은 생체내 암 세포의 치료에 특히 적합하다. 면역의 항원-특이적 증진을 달성하기 위해, 마크로시클릭 펩티드는 관심 항원과 함께 투여될 수 있다. PD-L1에 대한 마크로시클릭 펩티드를 또 다른 작용제와 함께 투여하는 경우에, 이 둘은 임의의 순서로 또는 동시에 투여될 수 있다.
본 개시내용은 추가로, 샘플 및 대조군 샘플을 인간, 우드척, 시노 및/또는 마우스 PD-L1에 특이적으로 결합하는 참조 마크로시클릭 펩티드와, 마크로사이클 및 인간, 우드척, 시노, 및/또는 마우스 PD-L1 사이에 복합체의 형성을 허용하는 조건 하에 접촉시키는 것을 포함하는, 샘플에서 인간, 우드척, 시노 및/또는 마우스 PD-L1 항원의 존재를 검출하거나 또는 인간, 우드척, 시노 및/또는 마우스 PD-L1 항원의 양을 측정하는 방법을 제공한다. 이어서, 복합체의 형성이 검출되고, 여기서 대조군 샘플과 비교하여 샘플 사이에 복합체 형성의 차이는 샘플 내 인간, 우드척, 시노 및/또는 마우스 PD-L1 항원의 존재를 나타낸다.
CD28, ICOS 및 CTLA-4와 비교하여 PD-L1에 대한 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드의 특이적 결합을 고려하면, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 세포의 표면 상의 PD-L1 발현을 특이적으로 검출하는데 사용될 수 있고, 더욱이, 면역친화성 정제를 통해 PD-L1을 정제하는데 사용될 수 있다.
암
마크로시클릭 펩티드에 의한 PD-1의 차단은 환자에서 암성 세포에 대한 면역 반응을 증진시킬 수 있다. PD-1에 대한 리간드인 PD-L1은 정상 인간 세포에서는 발현되지 않지만, 다양한 인간 암에서 풍부하다 (Dong et al., Nat. Med., 8:787-789 (2002)). PD-1 및 PD-L1 사이의 상호작용은 종양 침윤 림프구에서의 감소, T-세포 수용체 매개 증식에서의 감소, 및 암성 세포에 의한 면역 회피를 초래한다 (Dong et al., J. Mol. Med., 81:281-287 (2003); Blank et al., Cancer Immunol. Immunother., 54:307-314 (2005); Konishi et al., Clin. Cancer Res., 10:5094-5100 (2004)). 면역 억제는 PD-L1에 대한 PD-1의 국부 상호작용을 억제함으로써 역전될 수 있고, 그 효과는 PD-L2에 대한 PD-1의 상호작용이 또한 차단되는 경우에 부가된다 (Iwai et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 99:12293-12297 (2002); Brown et al., J. Immunol., 170:1257-1266 (2003)). 이전 연구는 T-세포 증식이 PD-L1에 대한 PD-1의 상호작용을 억제함으로써 회복될 수 있음을 제시한 바 있지만, PD-1/PD-L1 상호작용을 차단하는 것에 의한 생체내 암 종양 성장에 대한 직접적인 효과에 대한 어떠한 보고도 존재한 바 없다. 한 측면에서, 본 개시내용은 암성 종양의 성장이 억제되도록, 마크로시클릭 펩티드를 사용한 대상체의 생체내 치료에 관한 것이다. 마크로시클릭 펩티드는 암성 종양의 성장을 억제하기 위해 단독으로 사용될 수 있다. 대안적으로, 마크로시클릭 펩티드는 하기 기재된 바와 같이 다른 면역원성 작용제, 표준 암 치료, 또는 다른 마크로시클릭 펩티드와 함께 사용될 수 있다.
따라서, 한 실시양태에서, 본 개시내용은 대상체에게 치료 유효량의 마크로시클릭 펩티드를 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 종양 세포의 성장을 억제하는 방법을 제공한다.
그의 성장이 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 사용하여 억제될 수 있는 바람직한 암은 전형적으로 면역요법에 반응성인 암을 포함한다. 치료를 위해 바람직한 암의 비제한적 예는 흑색종 (예를 들어, 전이성 악성 흑색종), 신세포 암종 (예를 들어, 투명 세포 암종), 전립선암 (예를 들어, 호르몬 불응성 전립선 선암종 및 거세-저항성 전립선암), 유방암, 결장직장암 및 폐암 (예를 들어, 편평 및 비-편평 비소세포 폐암)을 포함한다. 추가적으로, 본 개시내용은 그의 성장이 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 사용하여 억제될 수 있는 불응성 또는 재발성 악성종양을 포함한다.
본 개시내용의 방법을 사용하여 치료될 수 있는 다른 암의 예는 골암, 췌장암, 피부암, 두경부암, 피부 또는 안내 악성 흑색종, 자궁암, 난소암, 결장암, 직장암, 항문부암, 위암, 고환암, 자궁암, 난관 암종, 자궁내막 암종, 자궁경부 암종, 질 암종, 외음부 암종, 호지킨병, 비-호지킨 림프종, 식도암, 소장암, 내분비계암, 갑상선암, 부갑상선암, 부신암, 연부 조직 육종, 요도암, 음경암, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 급성 림프모구성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병을 포함한 만성 또는 급성 백혈병, 소아기 고형 종양, 림프구성 림프종, 방광암, 신장암 또는 요관암, 신우 암종, 중추 신경계 (CNS)의 신생물, 원발성 CNS 림프종, 종양 혈관신생, 척수축 종양, 뇌간 신경교종, 뇌하수체 선종, 카포시 육종, 표피양암, 편평세포암, T-세포 림프종, 석면에 의해 유발된 것을 포함한 환경적으로 유발된 암, 및 상기 암의 조합을 포함한다. 본 개시내용은 또한 전이성 암, 특히 PD-L1을 발현하는 전이성 암의 치료에 유용하다 (Iwai et al., Int. Immunol., 17:133-144 (2005)). 임의로, PD-L1에 대한 마크로시클릭 펩티드는 면역원성 작용제, 예컨대 암성 세포, 정제된 종양 항원 (재조합 단백질, 펩티드 및 탄수화물 분자 포함), 세포, 및 면역 자극 시토카인 코딩 유전자로 형질감염된 세포와 조합될 수 있다 (He et al., J. Immunol., 173:4919-4928 (2004)). 사용될 수 있는 종양 백신의 비제한적 예는 흑색종 항원의 펩티드, 예컨대 gp100, MAGE 항원, Trp-2, MART1 및/또는 티로시나제의 펩티드, 또는 시토카인 GM-CSF를 발현하도록 형질감염된 종양 세포를 포함한다 (하기에 추가로 논의됨).
인간에서, 일부 종양 예컨대 흑색종은 면역원성인 것으로 제시된 바 있다. PD-L1 차단에 의해 T 세포 활성화의 역치를 상승시키는 것에 의해, 본 발명자들은 숙주에서 종양 반응을 활성화시킬 것을 예상할 수 있는 것으로 기대된다.
PD-L1 차단은 백신접종 프로토콜과 조합될 때 가장 유효할 가능성이 있다. 종양에 대한 백신접종을 위한 많은 실험적 전략이 고안된 바 있다 (문헌 [Rosenberg, S., Development of Cancer Vaccines, ASCO Educational Book Spring: 60-62 (2000); Logothetis, C., ASCO Educational Book Spring: 300-302 (2000); Khayat, D., ASCO Educational Book Spring: 414-428 (2000); Foon, K., ASCO Educational Book Spring: 730-738 (2000)] 참조; 또한 문헌 [Restifo, N. et al., Cancer Vaccines, Chapter 61, pp. 3023-3043, in DeVita, V. et al., eds., Cancer: Principles and Practice of Oncology, Fifth Edition (1997)] 참조). 이들 전략 중 하나에서, 백신은 자가 또는 동종 종양 세포를 사용하여 제조된다. 이들 세포성 백신은 GM-CSF를 발현하도록 종양 세포가 형질도입될 때 가장 효과적인 것으로 제시된 바 있다. GM-CSF는 종양 백신접종을 위한 항원 제시의 강력한 활성화제로 제시된 바 있다 (Dranoff et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 3539-3543 (1993)).
다양한 종양에서 유전자 발현 및 대규모 유전자 발현 패턴의 연구는 소위 종양 특이적 항원에 대한 정의로 이어진 바 있다 (Rosenberg, S.A., Immunity, 10:281-287 (1999)). 많은 경우에, 이들 종양 특이적 항원은 종양 및 종양이 발생한 세포에서 발현되는 분화 항원, 예를 들어 멜라닌세포 항원 gp100, MAGE 항원, 및 Trp-2이다. 보다 중요하게는, 이들 항원 중 많은 것은 숙주에서 발견되는 종양 특이적 T 세포의 표적인 것으로 제시될 수 있다. PD-L1 차단을 종양에서 발현되는 재조합 단백질 및/또는 펩티드의 수집과 함께 사용하여 이들 단백질에 대한 면역 반응을 생성할 수 있다. 이들 단백질은 자기 항원으로서 면역계에 의해 정상적으로 인식되고, 따라서 이들에 대해 관용성이다. 종양 항원은 또한, 염색체의 텔로미어의 합성에 필요하고 85% 초과의 인간 암에서 및 단지 제한된 수의 체성 조직에서 발현되는 단백질 텔로머라제를 포함할 수 있다 (Kim, N et al., Science, 266:2011-2013 (1994)). (이들 체성 조직은 다양한 수단에 의해 면역 공격으로부터 보호될 수 있음). 또한, 종양 항원은 단백질 서열을 변경하거나 또는 2개의 관련되지 않은 서열 사이의 융합 단백질 (즉, 필라델피아 염색체 내의 bcr-abl), 또는 B 세포 종양으로부터의 이디오타입을 생성하는 체세포 돌연변이로 인해 암 세포에서 발현되는 "신생-항원"일 수 있다.
다른 종양 백신은 인간 암에 연루된 바이러스 예컨대 인간 유두종 바이러스 (HPV), 간염 바이러스 (HBV 및 HCV) 및 카포시 포진 육종 바이러스 (KHSV)로부터의 단백질을 포함할 수 있다. PD-L1 차단과 함께 사용될 수 있는 또 다른 형태의 종양 특이적 항원은 종양 조직 자체로부터 단리된 정제된 열 쇼크 단백질 (HSP)이다. 이러한 열 쇼크 단백질은 종양 세포로부터의 단백질의 단편을 함유하고, 이들 HSP는 종양 면역을 도출하기 위한 항원 제시 세포로의 전달에 매우 효율적이다 (Suot, R. et al., Science, 269:1585-1588 (1995); Tamura, Y. et al., Science, 278:117-120 (1997)).
수지상 세포 (DC)는 항원-특이적 반응을 촉발하는데 사용될 수 있는 강력한 항원 제시 세포이다. DC는 생체외 생산되고, 다양한 단백질 및 펩티드 항원뿐만 아니라 종양 세포 추출물로 로딩될 수 있다 (Nestle, F. et al., Nat. Med., 4:328-332 (1998)). DC는 또한, 이들 종양 항원을 또한 발현시키기 위해 유전적 수단에 의해 형질도입될 수 있다. 또한, DC는 면역화를 위해 종양 세포에 직접 융합된 바 있다 (Kugler, A. et al., Nat. Med., 6:332-336 (2000)). 백신접종 방법으로서, DC 면역화는 보다 강력한 항종양 반응을 활성화시키기 위해 PD-L1 차단과 효과적으로 조합될 수 있다.
PD-L1 차단은 또한 표준 암 치료와 조합될 수 있다. PD-L1 차단은 화학요법과 효과적으로 조합될 수 있다. 이들 경우에, 투여되는 화학요법 시약의 투여량을 감소시키는 것이 가능할 수 있다 (Mokyr, M. et al., Cancer Res., 58:5301-5304 (1998)). 이러한 조합의 예는 흑색종의 치료를 위한 데카르바진과 조합된 마크로시클릭 펩티드이다. 이러한 조합의 또 다른 예는 흑색종의 치료를 위한 인터류킨-2 (IL-2)와 조합된 마크로시클릭 펩티드이다. PD-L1 차단 및 화학요법의 조합 사용을 뒷받침하는 과학적 근거는 대부분의 화학요법 화합물의 세포독성 작용의 결과인 세포 사멸이 항원 제시 경로에서 종양 항원의 수준을 증가시켜야 한다는 것이다. 세포 사멸을 통한 PD-L1 차단과 상승작용을 유발할 수 있는 다른 조합 요법은 방사선요법, 수술 및 호르몬 박탈이다. 각각의 이들 프로토콜은 숙주에서 종양 항원의 공급원을 생성한다. 또한, 혈관신생 억제제가 PD-L1 차단과 조합될 수 있다. 혈관신생의 억제는 숙주 항원 제시 경로 내로 종양 항원을 공급할 수 있는 종양 세포 사멸로 이어진다.
PD-L1 차단 마크로시클릭 펩티드는 또한 Fc 알파 또는 Fc 감마 수용체-발현 이펙터 세포를 종양 세포로 표적화하는 이중특이적 마크로시클릭 펩티드와 조합되어 사용될 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 번호 5,922,845 및 5,837,243 참조). 이중특이적 마크로시클릭 펩티드는 2개의 개별 항원을 표적화하는데 사용될 수 있다. 예를 들어, 항-Fc 수용체/항 종양 항원 (예를 들어, Her-2/neu) 이중특이적 마크로시클릭 펩티드가 대식세포를 종양 부위에 대해 표적화하기 위해 사용된 바 있다. 이 표적화는 종양 특이적 반응을 보다 효과적으로 활성화시킬 수 있다. 이들 반응의 T 세포 아암은 PD-L1 차단의 사용에 의해 증대될 것이다. 대안적으로, 항원은 종양 항원 및 수지상 세포 특이적 세포 표면 마커에 결합하는 이중특이적 마크로시클릭 펩티드의 사용에 의해 DC에 직접 전달될 수 있다.
종양은 매우 다양한 메카니즘에 의해 숙주 면역 감시를 피한다. 이들 메카니즘 중 많은 것은, 종양에 의해 발현되고 면역억제성인 단백질의 불활성화에 의해 극복될 수 있다. 이들은 특히, TGF-베타 (Kehrl, J. et al., J. Exp. Med., 163:1037-1050 (1986)), IL-10 (Howard, M. et al., Immunology Today, 13:198-200 (1992)), 및 Fas 리간드 (Hahne, M. et al., Science, 274:1363-1365 (1996))를 포함한다. 각각의 이들 개체에 대한 마크로시클릭 펩티드는 면역억제제의 효과를 상쇄시키고 숙주에 의한 종양 면역 반응을 유리하게 하기 위해 항-PD-L1과 조합되어 사용될 수 있다.
숙주 면역 반응성을 활성화시키기 위해 사용될 수 있는 다른 마크로시클릭 펩티드는 항-PD-L1과 조합되어 사용될 수 있다. 이들은 DC 기능 및 항원 제시를 활성화시키는 수지상 세포의 표면 상의 분자를 포함한다. 항-CD40 마크로시클릭 펩티드는 T 세포 헬퍼 활성을 효과적으로 대체할 수 있고 (Ridge, J. et al., Nature, 393:474-478 (1998)), PD-1 항체와 함께 사용될 수 있다 (Ito, N. et al., Immunobiology, 201(5):527-540 (2000)). 마크로시클릭 펩티드를 T 세포 공동자극 분자 예컨대 CTLA-4 (예를 들어, 미국 특허 번호 5,811,097), OX-40 (Weinberg, A. et al., Immunol., 164:2160-2169 (2000)), 4-1BB (Melero, I. et al., Nat. Med., 3:682-685 (1997)), 및 ICOS (Hutloff, A. et al., Nature, 397:262-266 (1999))에 대해 활성화시키는 것은 또한 증가된 수준의 T 세포 활성화를 제공할 수 있다.
골수 이식은 조혈계 기원의 다양한 종양의 치료를 위해 현재 사용된다. 이식편 대 숙주 질환은 이러한 치료의 결과이지만, 이식편 대 종양 반응으로부터 치료 이익을 획득할 수 있다. 공여자 생착 종양 특이적 T 세포의 유효성을 증가시키기 위해 PD-L1 차단이 사용될 수 있다.
또한, 항원 특이적 T 세포의 생체외 활성화 및 확장 및 종양에 대한 항원-특이적 T 세포를 자극하기 위한 이들 세포의 수용자 내로의 입양 전달을 수반하는 여러 실험적 치료 프로토콜이 존재한다 (Greenberg, R. et al., Science, 285:546-551 (1999)). 또한, 이들 방법은 감염원 예컨대 CMV에 대한 T 세포 반응을 활성화시키는데 사용될 수 있다. 마크로시클릭 펩티드의 존재 하에서의 생체외 활성화는 입양 전달된 T 세포의 빈도 및 활성을 증가시키는 것으로 예상될 수 있다.
감염성 질환
본 개시내용의 다른 방법은 특정한 독소 또는 병원체에 노출된 바 있는 환자를 치료하는데 사용된다. 따라서, 본 개시내용의 또 다른 측면은 대상체에게 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 투여하여 상기 대상체가 감염성 질환에 대해 치료되도록 하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 감염성 질환을 치료하는 방법을 제공한다.
상기 논의된 바와 같은 종양에 대한 적용과 유사하게, PD-L1 차단은 병원체, 독소 또는 자기-항원에 대한 면역 반응을 자극하기 위해 단독으로 또는 아주반트로서 백신과 조합되어 사용될 수 있다. 이 치료 접근법이 특히 유용할 수 있는 병원체의 예는 현재 효과적인 백신이 없는 병원체, 또는 통상적인 백신이 완전하게 효과적이지는 않은 병원체를 포함한다. 이들은, HIV, 간염 (A, B, 및 C), 인플루엔자, 포진, 지아르디아, 말라리아 (Butler, N.S. et al., Nature Immunology 13, 188-195 (2012); Hafalla, J.C.R., et al. PLOS Pathogens; February 2, 2012)), 리슈마니아(Leishmania), 스타필로코쿠스 아우레우스(Staphylococcus aureus), 슈도모나스 아에루기노사(Pseudomonas Aeruginosa)를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. PD-L1 차단은 감염 과정에 걸쳐 변경된 항원을 제시하는 HIV와 같은 작용제에 의해 확립된 감염에 대해 특히 유용하다. 이들 신규 에피토프는 항-인간 PD-L1 투여 시에 외래물질로서 인식되고, 따라서 PD-L1을 통한 음성 신호에 의해 약화되지 않는 강한 T 세포 반응을 유발한다.
본 개시내용의 방법에 의해 치료가능한 감염을 유발하는 병원성 바이러스의 일부 예는 HIV, 간염 (A, B 또는 C), 포진 바이러스 (예를 들어, VZV, HSV-1, HAV-6, HSV-II, 및 CMV, 엡스타인 바르(Epstein Barr) 바이러스), 아데노바이러스, 인플루엔자 바이러스, 플라비바이러스, 에코바이러스, 리노바이러스, 콕사키 바이러스, 코로나 바이러스, 호흡기 세포융합 바이러스, 볼거리 바이러스, 로타바이러스, 홍역 바이러스, 풍진 바이러스, 파르보 바이러스, 백시니아 바이러스, HTLV 바이러스, 뎅기 바이러스, 유두종바이러스, 연속종 바이러스, 폴리오바이러스, 광견병 바이러스, JC 바이러스 및 아르보바이러스 뇌염 바이러스를 포함한다.
본 개시내용의 방법에 의해 치료가능한 감염을 유발하는 병원성 박테리아의 일부 예는 클라미디아(chlamydia), 리케치아 박테리아(rickettsial bacteria), 미코박테리아(mycobacteria), 스타필로코쿠스(staphylococci), 스트렙토코쿠스(streptococci), 뉴모노코쿠스(pneumonococci), 메닝고코쿠스(meningococci) 및 코노코쿠스(conococci), 클레브시엘라(klebsiella), 프로테우스(proteus), 세라티아(serratia), 슈도모나스(pseudomonas), 레지오넬라(legionella), 디프테리아(diphtheria), 살모넬라(salmonella), 바실루스(bacilli), 콜레라(cholera), 파상풍, 보툴리눔독소증, 탄저병, 흑사병, 렙토스피라증 및 라임병 박테리아를 포함한다.
본 개시내용의 방법에 의해 치료가능한 감염을 유발하는 병원성 진균의 일부 예는 칸디다(Candida) (알비칸스(albicans), 크루세이(krusei), 글라브라타(glabrata), 트로피칼리스(tropicalis) 등), 크립토코쿠스 네오프르만스(Cryptococcus neoformans), 아스페르길루스(Aspergillus) (푸미가투스(fumigatus), 니거(niger) 등), 뮤코랄레스(Mucorales) 속 (뮤코르(mucor), 압시디아(absidia), 리조푸스(rhizophus)), 스포로트릭스 쉔크키이(Sporothrix schenckii), 블라스토미세스 더마티티디스(Blastomyces dermatitidis), 파라콕시디오이데스 브라실리엔시스(Paracoccidioides brasiliensis), 콕시디오이데스 임미티스(Coccidioides immitis) 및 히스토플라스마 캅술라툼(Histoplasma capsulatum)을 포함한다.
본 개시내용의 방법에 의해 치료가능한 감염을 유발하는 병원성 기생충의 일부 예는 엔트아메바 히스톨리티카(Entamoeba histolytica), 발란티디움 콜라이(Balantidium coli), 네글레리아포울레리(Naegleriafowleri), 아칸트아메바(Acanthamoeba) 종, 지아르디아 람비아(Giardia lambia), 크립토스포리디움(Cryptosporidium) 종, 뉴모시스티스 카리니이(Pneumocystis carinii), 플라스모디움 비박스(Plasmodium vivax), 바베시아 미크로티(Babesia microti), 트리파노소마 브루세이(Trypanosoma brucei), 트리파노소마 크루지(Trypanosoma cruzi), 리슈마니아 도노바니(Leishmania donovani), 톡소플라스마 곤디(Toxoplasma gondi) 및 니포스트롱길루스 브라실리엔시스(Nippostrongylus brasiliensis)를 포함한다.
상기 모든 방법에서, PD-L1 차단은 다른 형태의 면역요법 예컨대 시토카인 치료 (예를 들어, 인터페론, VEGF 활성 또는 VEGF-수용체를 표적화하는 작용제, GM-CSF, G-CSF, IL-2), 또는 종양 항원의 증진된 제시를 제공하는 이중특이적 항체 요법 (예를 들어, 문헌 [Holliger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993); Poljak, Structure, 2:1121-1123 (1994)] 참조)과 조합될 수 있다.
자가면역 반응
마크로시클릭 펩티드는 자가면역 반응을 유발하고 증폭시킬 수 있다. 실제로, 종양 세포 및 펩티드 백신을 사용한 항종양 반응의 유도는 많은 항종양 반응이 항-자기 반응성 (항-CTLA-4+GM-CSF-변형된 B 16 흑색종에서 관찰된 탈색소, [van Elsas et al. supra]; Trp-2 백신접종된 마우스에서의 탈색소 (Overwijk, W. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96:2982-2987 (1999)); TRAMP 종양 세포 백신 (Hurwitz, A., supra (2000)), 흑색종 펩티드 항원 백신접종에 의해 유발된 자가면역 전립선염 및 인간 임상 시험에서 관찰된 백반증 (Rosenberg, S.A. et al., J. Immunother. Emphasis Tumor Immunol., 19(1):81-84 (1996))을 수반하는 것으로 밝혀진다.
따라서, 질환 치료를 위해 이들 자기 단백질에 대한 면역 반응을 효과적으로 생성하도록 백신접종 프로토콜을 고안하기 위해 항-PD-L1 차단을 다양한 자기 단백질과 함께 사용하는 것을 고려하는 것이 가능하다. 예를 들어, 알츠하이머병은 뇌에서 아밀로이드 침착물 내에 A.베타. 펩티드의 부적절한 축적을 수반하고; 아밀로이드에 대한 항체 반응은 이들 아밀로이드 침착물을 제거할 수 있다 (Schenk et al., Nature, 400:173-177 (1999)).
알레르기 및 천식의 치료를 위한 IgE, 및 류마티스 관절염을 위한 TNF.알파와 같은 다른 자기 단백질이 또한 표적으로서 사용될 수 있다. 최종적으로, 다양한 호르몬에 대한 항체 반응이 본원에 개시된 마크로사이클의 사용에 의해 유도될 수 있다. 생식 호르몬에 대한 중화 항체 반응은 피임을 위해 사용될 수 있다. 특정한 종양의 성장을 위해 요구되는 호르몬 및 다른 가용성 인자에 대한 중화 항체 반응이 또한 가능한 백신접종 표적으로서 고려될 수 있다.
항-PD-L1 마크로사이클의 사용에 대해 상기 기재된 바와 유사한 방법은 다른 자기-항원, 예컨대 알츠하이머병에서의 A.베타.를 포함한 아밀로이드 침착물, 시토카인 예컨대 TNF.알파., 및 IgE의 부적절한 축적을 갖는 환자를 치료하기 위해 치료적 자가면역 반응의 유도를 위해 사용될 수 있다.
백신
마크로시클릭 펩티드는 관심 항원 (예를 들어, 백신)과 항-PD-1 마크로사이클의 공투여에 의해 항원-특이적 면역 반응을 자극하는데 사용될 수 있다. 따라서, 또 다른 측면에서 본 개시내용은 대상체에게 (i) 항원; 및 (ii) 항-PD-1 마크로사이클을 투여하여 상기 대상체에서 항원에 대한 면역 반응이 증진되도록 하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 항원에 대한 면역 반응을 증진시키는 방법을 제공한다. 항원은, 예를 들어 종양 항원, 바이러스 항원, 박테리아 항원, 또는 병원체로부터의 항원일 수 있다. 이러한 항원의 비제한적 예는 상기 섹션에서 논의된 것, 예컨대 상기 논의된 종양 항원 (또는 종양 백신), 또는 바이러스, 박테리아 또는 상기 기재된 다른 병원체로부터의 항원을 포함한다.
본 개시내용의 조성물 (예를 들어, 마크로시클릭 펩티드, 다중특이적 및 이중특이적 분자, 및 면역접합체)을 생체내 및 시험관내 투여하는 적합한 경로는 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고, 통상의 기술자에 의해 선택될 수 있다. 예를 들어, 조성물은 주사에 의해 (예를 들어, 정맥내 또는 피하) 투여될 수 있다. 사용된 분자의 적합한 투여량은 대상체의 연령 및 체중 및 조성물의 농도 및/또는 제제에 의존할 것이다.
이전에 기재된 바와 같이, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 1종 이상의 다른 치료제, 예를 들어 세포독성제, 방사성독성제 또는 면역억제제와 공-투여될 수 있다. 펩티드는 작용제에 연결될 수 있거나 (면역복합체로서), 작용제와 개별 투여될 수 있다. 후자의 경우에 (개별 투여), 펩티드는 작용제의 전에, 후에 또는 그와 공동으로 투여될 수 있거나, 또는 다른 공지된 요법, 예를 들어 항암 요법, 예를 들어 방사선과 공-투여될 수 있다. 이러한 치료제는 특히 그 자체로는 환자에게 독성 또는 준독성인 수준에서만 효과적인 항신생물제, 예컨대 독소루비신 (아드리아마이신), 시스플라틴 블레오마이신 술페이트, 카르무스틴, 클로람부실, 데카르바진 및 시클로포스파미드 히드록시우레아를 포함한다. 시스플라틴은 100 mg/용량으로서 4주마다 1회 정맥내로 투여되고, 아드리아마이신은 60-75 mg/ml 용량으로서 21일마다 1회 정맥내로 투여된다. 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드와 화학요법제의 공-투여는 인간 종양 세포에 세포독성 효과를 산출하는 상이한 메카니즘을 통해 작동하는 2종의 항암제를 제공한다. 이러한 공-투여는 펩티드에 비반응성이 되게 할 약물에 대한 내성의 발생 또는 종양 세포의 항원성에서의 변화로 인한 문제점을 해결할 수 있다.
본 개시내용의 조성물 (예를 들어, 마크로시클릭 펩티드, 이중특이적 또는 다중특이적 분자, 또는 면역접합체) 및 사용에 대한 지침서를 포함하는 키트가 또한 본 개시내용의 범주 내에 포함된다. 키트는 적어도 1종의 추가의 시약, 또는 1종 이상의 추가의 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드 (예를 들어, 마크로사이클과 구분되는 PD-L1 항원 내의 에피토프에 결합하는 상보적 활성을 갖는 인간 항체)를 추가로 함유할 수 있다. 키트는 전형적으로 키트의 내용물의 의도되는 용도를 지시하는 라벨을 포함한다. 용어 라벨은 키트 상에 또는 키트와 함께 공급되거나, 또는 달리 키트에 동반되는 임의의 문서 또는 기록물을 포함한다.
조합 요법
본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드와 또 다른 PD-L1 길항제 및/또는 다른 면역조정제의 조합은 과다증식성 질환에 대한 면역 반응의 증진을 위해 유용하다. 예를 들어, 이들 분자는 배양물 중, 시험관내 또는 생체외 세포에, 또는 인간 대상체, 예를 들어 생체내 투여되어 다양한 상황에서 면역을 증진시킬 수 있다. 따라서, 한 측면에서, 본 개시내용은 대상체에게 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 투여하여 상기 대상체에서 면역 반응이 조정되도록 하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 면역 반응을 조정하는 방법을 제공한다. 바람직하게는, 반응은 증진되거나, 자극되거나, 또는 상향-조절된다. 또 다른 실시양태에서, 본 개시내용은 대상체에게 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드 및 치료 용량 미만의 또 다른 면역조정제를 투여하는 것을 포함하는, 면역자극 치료제에 의한 과다증식성 질환의 치료와 연관된 유해 사건을 변경하는 방법을 제공한다.
마크로시클릭 펩티드에 의한 PD-L1의 차단은 환자에서 암성 세포에 대한 면역반응을 증진시킬 수 있다. 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 사용하여 성장을 억제시킬 수 있는 암은, 면역요법에 전형적으로 반응성인 암을 포함한다. 본 개시내용의 조합 요법에 의한 치료를 위한 암의 대표적인 예는 흑색종 (예를 들어, 전이성 악성 흑색종), 신암, 전립선암, 유방암, 결장암 및 폐암을 포함한다. 본 개시내용의 방법을 사용하여 치료될 수 있는 다른 암의 예는 골암, 췌장암, 피부암, 두경부암, 피부 또는 안내 악성 흑색종, 자궁암, 난소암, 직장암, 항문부암, 위암, 고환암, 자궁암, 난관 암종, 자궁내막 암종, 자궁경부 암종, 질 암종, 외음부 암종, 호지킨병, 비-호지킨 림프종, 식도암, 소장암, 내분비계암, 갑상선암, 부갑상선암, 부신암, 연부 조직 육종, 요도암, 음경암, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 급성 림프모구성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병을 포함한 만성 또는 급성 백혈병, 소아기 고형 종양, 림프구성 림프종, 방광암, 신장암 또는 요관암, 신우 암종, 중추 신경계 (CNS)의 신생물, 원발성 CNS 림프종, 종양 혈관신생, 척수축 종양, 뇌간 신경교종, 뇌하수체 선종, 카포시 육종, 표피양암, 편평세포암, T-세포 림프종, 석면에 의해 유발된 것을 포함한 환경적으로 유발된 암, 및 상기 암의 조합을 포함한다. 본 개시내용은 또한 전이성 암의 치료에 유용하다.
특정 실시양태에서, 본원에 논의된 적어도 1종의 마크로시클릭 펩티드를 함유하는 치료제의 조합물은 제약상 허용되는 담체 중의 단일 조성물로서 공동으로 투여될 수 있거나, 또는 개별 조성물로서 공동으로 투여될 수 있고, 여기서 각각의 작용제는 순차적으로 투여될 수 있다. 예를 들어, 제2 면역조정제 및 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 제2 면역조정제가 첫 번째로 투여되고 마크로시클릭 펩티드가 두 번째로 투여되거나, 또는 마크로시클릭 펩티드가 첫 번째로 투여되고 제2 면역조정제가 두 번째로 투여되는 것과 같이, 순차적으로 투여될 수 있다. 게다가, 하나 초과 용량의 조합 요법이 순차적으로 투여되는 경우에, 순차적 투여의 순서는 각각의 투여 시점에서 역전되거나 동일한 순서로 유지될 수 있거나, 순차적 투여가 공동 투여, 또는 그의 임의의 조합과 조합될 수 있다. 예를 들어, 제2 면역조정제 및 마크로시클릭 펩티드의 제1 투여는 공동일 수 있고, 제2 투여는 제2 면역조정제가 첫 번째 및 마크로시클릭 펩티드가 두 번째로 순차적일 수 있고, 제3 투여는 마크로시클릭 펩티드가 첫 번째 및 제2 면역조정제가 두 번째 등으로 순차적일 수 있다. 또 다른 대표적인 투여 계획은 마크로시클릭 펩티드가 첫 번째 및 제2 면역조정제가 두 번째인 순차적인 제1 투여를 수반할 수 있고, 후속 투여는 공동일 수 있다.
임의로, 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제의 조합은 면역원성 작용제, 예컨대 암성 세포, 정제된 종양 항원 (재조합 단백질, 펩티드 및 탄수화물 분자 포함), 세포, 및 면역 자극 시토카인 코딩 유전자로 형질감염된 세포와 추가로 조합될 수 있다 (He et al., J. Immunol., 173:4919-4928 (2004)). 사용될 수 있는 종양 백신의 비제한적 예는 흑색종 항원의 펩티드, 예컨대 gp100, MAGE 항원, Trp-2, MART1 및/또는 티로시나제의 펩티드, 또는 시토카인 GM-CSF를 발현하도록 형질감염된 종양 세포를 포함한다 (하기에 추가로 논의됨).
조합 PD-L1 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제는 백신접종 프로토콜과 추가로 조합될 수 있다. 종양에 대한 백신접종을 위한 많은 실험적 전략이 고안된 바 있다 (문헌 [Rosenberg, S., Development of Cancer Vaccines, ASCO Educational Book Spring: 60-62 (2000); Logothetis, C., ASCO Educational Book Spring: 300-302 (2000); Khayat, D., ASCO Educational Book Spring: 414-428 (2000); Foon, K., ASCO Educational Book Spring: 730-738 (2000)] 참조; 또한 문헌 [Restifo et al., Cancer Vaccines, Chapter 61, pp. 3023-3043 in DeVita et al., eds., Cancer: Principles and Practice of Oncology, Fifth Edition (1997)] 참조). 이들 전략 중 하나에서, 백신은 자가 또는 동종 종양 세포를 사용하여 제조된다. 이들 세포성 백신은 GM-CSF를 발현하도록 종양 세포가 형질도입될 때 가장 효과적인 것으로 제시된 바 있다. GM-CSF는 종양 백신접종을 위한 항원 제시의 강력한 활성화제로 제시된 바 있다 (Dranoff et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:3539-3543 (1993)).
다양한 종양에서 유전자 발현 및 대규모 유전자 발현 패턴의 연구는 소위 종양 특이적 항원에 대한 정의로 이어진 바 있다 (Rosenberg, Immunity, 10:281-287 (1999)). 다수의 경우에서, 이들 종양 특이적 항원은 종양 및 종양이 발생한 세포에서 발현되는 분화 항원, 예를 들어 멜라닌세포 항원 gp100, MAGE 항원, 및 Trp-2이다. 보다 중요하게는, 이들 항원 중 다수는 숙주에서 발견되는 종양 특이적 T 세포의 표적인 것으로 제시될 수 있다. 특정 실시양태에서, 조합 PD-L1 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제를 종양에서 발현되는 재조합 단백질 및/또는 펩티드의 수집과 함께 사용하여 이들 단백질에 대한 면역 반응을 생성할 수 있다. 이들 단백질은 자기-항원으로서 면역계에 의해 정상적으로 인식되고, 따라서 이들에 대해 관용성이다. 종양 항원은 또한, 염색체의 텔로미어의 합성에 필요하고 85% 초과의 인간 암에서 및 단지 제한된 수의 체성 조직에서 발현되는 단백질 텔로머라제를 포함할 수 있다 (Kim et al., Science, 266:2011-2013 (1994)). (이들 체성 조직은 다양한 수단에 의해 면역 공격으로부터 보호될 수 있음). 또한, 종양 항원은 단백질 서열을 변경하거나 또는 2개의 관련되지 않은 서열 사이의 융합 단백질 (즉, 필라델피아 염색체 내의 bcr-abl), 또는 B 세포 종양으로부터의 이디오타입을 생성하는 체세포 돌연변이로 인해 암 세포에서 발현되는 "신생-항원"일 수 있다.
다른 종양 백신은 인간 암에 연루된 바이러스, 예컨대 인간 유두종 바이러스 (HPV), 간염 바이러스 (HBV 및 HCV) 및 카포시 포진 육종 바이러스 (KHSV)로부터의 단백질을 포함할 수 있다. PD-L1 마크로시클릭 펩티드 차단과 함께 사용될 수 있는 또 다른 형태의 종양 특이적 항원은 종양 조직 자체로부터 단리된 정제된 열 쇼크 단백질 (HSP)이다. 이들 열 쇼크 단백질은 종양 세포로부터의 단백질의 단편을 함유하고, 이들 HSP는 종양 면역을 도출하기 위한 항원 제시 세포로의 전달에 매우 효율적이다 (Suot et al., Science, 269:1585-1588 (1995); Tamura et al., Science, 278:117-120 (1997)).
수지상 세포 (DC)는 항원-특이적 반응을 촉발하는데 사용될 수 있는 강력한 항원 제시 세포이다. DC는 생체외 생산되고, 다양한 단백질 및 펩티드 항원뿐만 아니라 종양 세포 추출물로 로딩될 수 있다 (Nestle et al., Nat. Med., 4:328-332 (1998)). DC는 또한, 이들 종양 항원을 또한 발현시키기 위해 유전적 수단에 의해 형질도입될 수 있다. 또한, DC는 면역화를 위해 종양 세포에 직접 융합된 바 있다 (Kugler et al., Nat. Med., 6:332-336 (2000)). 백신접종 방법으로서, DC 면역화는 보다 강력한 항종양 반응을 활성화시키기 위해 조합 항-PD-L1 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제와 효과적으로 추가로 조합될 수 있다.
조합 항-PD-L1 마크로시클릭 펩티드 및 추가의 면역조정제는 또한 표준 암 치료와 추가로 조합될 수 있다. 예를 들어, 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제의 조합은 화학요법과 효과적으로 조합될 수 있다. 이들 경우에, 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제의 조합에 의해 관찰되는 바와 같이, 본 개시내용의 조합물과 함께 투여되는 다른 화학요법 시약의 용량을 감소시키는 것이 가능할 수 있다 (Mokyr et al., Cancer Res., 58:5301-5304 (1998)). 이러한 조합의 예는 흑색종의 치료를 위한 데카르바진과 추가로 조합된 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제의 조합이다. 또 다른 예는 흑색종의 치료를 위한 인터류킨-2 (IL-2)와 추가로 조합된 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제의 조합이다. PD-L1 마크로시클릭 펩티드 및 또 다른 면역조정제와 화학요법의 조합 사용을 뒷받침하는 과학적 근거는 대부분의 화학요법 화합물의 세포독성 작용의 결과인 세포 사멸이 항원 제시 경로에서 종양 항원의 수준을 증가시켜야 한다는 것이다. 세포 사멸을 통한 조합 항-PD-L1 마크로시클릭 펩티드 및 추가의 면역조정제와 상승작용을 유발할 수 있는 다른 조합 요법은 방사선요법, 수술 또는 호르몬 박탈을 포함한다. 각각의 이들 프로토콜은 숙주에서 종양 항원의 공급원을 생성한다. 또한, 혈관신생 억제제가 조합 PD-L1 및 제2 면역조정제와 조합될 수 있다. 혈관신생의 억제는, 또한 숙주 항원 제시 경로 내로 공급되는 종양 항원의 공급원일 수 있는, 종양 세포 사멸로 이어진다.
PD-L1 및 또 다른 면역조정제의 조합은 또한 Fc.알파. 또는 Fc.감마. 수용체-발현 이펙터 세포를 종양 세포로 표적화하는 이중특이적 마크로시클릭 펩티드와 조합되어 사용될 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 번호 5,922,845 및 5,837,243 참조). 이중특이적 마크로시클릭 펩티드는 2개의 개별 항원을 표적화하는데 사용될 수 있다. 예를 들어, 항-Fc 수용체/항 종양 항원 (예를 들어, Her-2/neu) 이중특이적 마크로시클릭 펩티드가 대식세포를 종양 부위에 대해 표적화하기 위해 사용된 바 있다. 이 표적화는 종양 특이적 반응을 보다 효과적으로 활성화시킬 수 있다. 이들 반응의 T 세포 아암은 조합 PD-L1 및 제2 면역조정제의 사용에 의해 증대될 것이다. 대안적으로, 항원은 종양 항원 및 수지상 세포 특이적 세포 표면 마커에 결합하는 이중특이적 마크로시클릭 펩티드의 사용에 의해 DC에 직접 전달될 수 있다.
또 다른 예에서, 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제의 조합은 항-신생물성 마크로시클릭 작용제, 예컨대 리툭산(RITUXAN)® (리툭시맙), 헤르셉틴(HERCEPTIN)® (트라스투주맙), 벡사르(BEXXAR)® (토시투모맙), 제발린(ZEVALIN)® (이브리투모맙), 캄파트(CAMPATH)® (알렘투주맙), 림포사이드(Lymphocide) (에프라투주맙), 아바스틴(AVASTIN)® (베바시주맙) 및 타르세바(TARCEVA)® (에를로티닙) 등과 함께 사용될 수 있다. 예로서 이론에 얽매이는 것을 원하지 않으면서, 항암 항체 또는 독소에 접합된 항암 항체에 의한 치료는 암 세포 사멸 (예를 들어, 종양 세포)로 이어질 수 있고, 이는 제2 면역조정제 표적 또는 PD-L1에 의해 매개되는 면역 반응을 강화시킬 것이다. 예시적 실시양태에서, 과다증식성 질환 (예를 들어, 암 종양)의 치료는 마크로시클릭 펩티드 및 제2 면역조정제와 공동으로 또는 순차적으로 또는 그의 임의의 조합으로 조합된 항암 항체를 포함할 수 있고, 이는 숙주에 의한 항종양 면역 반응을 강화시킬 수 있다.
종양은 매우 다양한 메카니즘에 의해 숙주 면역 감시를 피한다. 이들 메카니즘 중 다수는 종양에 의해 발현되고 면역억제성인 단백질의 불활성화에 의해 극복될 수 있다. 이들은, 특히, TGF-.베타. (Kehrl, J. et al., J. Exp. Med., 163:1037-1050 (1986)), IL-10 (Howard, M. et al., Immunology Today, 13:198-200 (1992)), 및 Fas 리간드 (Hahne, M. et al., Science, 274:1363-1365 (1996))를 포함한다. 또 다른 예에서, 각각의 이들 개체에 대한 항체는 면역억제제의 효과를 상쇄시키고 숙주에 의한 항종양 면역 반응을 유리하게 하기 위해 마크로시클릭 펩티드 및 또 다른 면역조정제와 추가로 조합될 수 있다.
숙주 면역 반응성을 활성화시키기 위해 사용될 수 있는 다른 작용제는 추가로 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드와 조합되어 사용될 수 있다. 이들은 DC 기능 및 항원 제시를 활성화시키는 수지상 세포의 표면 상의 분자를 포함한다. 항-CD40 마크로시클릭 펩티드는 T 세포 헬퍼 활성을 효과적으로 대체할 수 있고 (Ridge, J. et al., Nature, 393:474-478 (1998)), 단독의 또는 항-CTLA-4 조합과 조합된 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드와 함께 사용될 수 있다 (Ito, N. et al., Immunobiology, 201(5):527-540 (2000)). 마크로시클릭 펩티드를 T 세포 공동자극 분자, 예컨대 OX-40 (Weinberg, A. et al., Immunol., 164:2160-2169 (2000)), 4-1BB (Melero, I. et al., Nat. Med., 3:682-685 (1997)), 및 ICOS (Hutloff, A. et al., Nature, 397:262-266 (1999))에 대해 활성화시키는 것은 또한 증가된 수준의 T 세포 활성화를 제공할 수 있다.
골수 이식은 조혈계 기원의 다양한 종양의 치료를 위해 현재 사용된다. 이식편 대 숙주 질환은 이러한 치료의 결과이지만, 이식편 대 종양 반응으로부터 치료 이익을 획득할 수 있다. 공여자 생착 종양 특이적 T 세포의 유효성을 증가시키기 위해 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드가 단독으로 또는 또 다른 면역조정제와 조합되어 사용될 수 있다.
또한, 항원 특이적 T 세포의 생체외 활성화 및 확장 및 종양에 대한 항원-특이적 T 세포를 자극하기 위한 이들 세포의 수용자 내로의 입양 전달을 수반하는 여러 실험적 치료 프로토콜이 존재한다 (Greenberg, R. et al., Science, 285:546-551 (1999)). 또한, 이들 방법은 감염원, 예컨대 CMV에 대한 T 세포 반응을 활성화시키는데 사용될 수 있다. 단독으로 또는 또 다른 면역조정제와 조합된 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드의 존재 하에서의 생체외 활성화는 입양 전달된 T 세포의 빈도 및 활성을 증가시키는 것으로 예상될 수 있다.
특정 실시양태에서, 본 개시내용은 대상체에게 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드를 치료 용량 미만의 또 다른 면역조정제와 조합하여 투여하는 것을 포함하는, 면역자극제에 의한 과다증식성 질환의 치료와 연관된 유해 사건을 변경하는 방법을 제공한다. 예를 들어, 본 개시내용의 방법은 환자에게 비흡수성 스테로이드를 투여함으로써 면역자극 치료 항체-유발된 결장염 또는 설사의 발생률을 감소시키는 방법을 제공한다. 면역자극 치료 항체를 제공받을 임의의 환자가 이러한 치료에 의해 유발되는 결장염 또는 설사 발생 위험이 있기 때문에, 이러한 전체 환자 집단은 본 개시내용의 방법에 따른 요법에 적합하다. 스테로이드가 염증성 장 질환 (IBD)을 치료하고 IBD의 악화를 예방하기 위해 투여된 바 있을지라도, 이는 IBD로 진단된 바 없는 환자에서 IBD를 예방하기 (그의 발생률을 감소시키기) 위해 사용된 바 없다. 스테로이드, 심지어 비흡수성 스테로이드는 그와 연관된 유의한 부작용으로 인해 예방적 용도를 좌절시킨 바 있다.
추가 실시양태에서, 단독으로 또는 또 다른 면역조정제와 조합된 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 임의의 비흡수성 스테로이드의 사용과 추가로 조합될 수 있다. 본원에 사용된 "비-흡수성 스테로이드"는 광범위한 일차 통과 대사를 나타내어, 간에서 대사 후에 스테로이드의 생체이용률이 낮은, 즉 약 20% 미만인 글루코코르티코이드이다. 본 개시내용의 한 실시양태에서, 비흡수성 스테로이드는 부데소니드이다. 부데소니드는 국부-작용 글루코코르티코스테로이드이고, 이는 경구 투여 후에 주로 간에 의해 광범위하게 대사된다. 엔토코르트(ENTOCORT)® EC (아스트라-제네카)는 회장으로 및 결장 전체로의 약물 전달을 최적화하기 위해 개발된 부데소니드의 pH- 및 시간-의존적 경구 제제이다. 엔토코르트® EC는 회장 및/또는 상행 결장을 수반한 경증 내지 중등도 크론병의 치료를 위해 미국에서 승인받았다. 크론병의 치료를 위한 엔토코르트® EC의 통상의 경구 투여량은 6 내지 9 mg/일이다. 엔토코르트® EC는 장에서 방출된 후, 소화관 점막에서 흡수되고 유지된다. 장 점막 표적 조직의 통과 시, 엔토코르트® EC는 간에서 시토크롬 P450 시스템에 의해 무시가능한 글루코코르티코이드 활성을 갖는 대사물로 광범위하게 대사된다. 따라서, 생체이용률은 낮다 (약 10%). 부데소니드의 낮은 생체이용률은 덜 광범위한 일차 통과 대사를 갖는 다른 글루코코르티코이드에 비해 개선된 치료 비를 생성한다. 부데소니드는 전신-작용 코르티코스테로이드보다 덜한 시상하부-뇌하수체 억제를 포함한 보다 적은 부작용을 야기한다. 그러나, 엔토코르트® EC의 만성 투여는 전신 글루코코르티코이드 효과 예컨대 부신피질기능항진증 및 부신 억제를 유발할 수 있다. 문헌 [Physicians' Desk Reference Supplement, 58th Edition, 608-610 (2004)]을 참조한다.
추가 실시양태에서, 비흡수성 스테로이드와 함께 PD-L1 및 또 다른 면역조정제의 조합은 살리실레이트와 추가로 조합될 수 있다. 살리실레이트는 5-ASA 작용제, 예컨대 예를 들어: 술파살라진 (아줄피딘(AZULFIDINE)®, 파마시아 & 업존); 올살라진 (디펜툼(DIPENTUM)®, 파마시아 & 업존); 발살라지드 (콜라잘(COLAZAL)®, 살릭스 파마슈티칼스, 인크.); 및 메살라민 (아사콜(ASACOL)®, 프록터 & 갬블 파마슈티칼스; 펜타사(PENTASA)®, 샤이어 유에스; 카나사(CANASA)®, 액스칸 스캔디팜, 인크.; 로와사(ROWASA)®, 솔베이)을 포함한다.
투여량 및 제제화
화학식 I의 적합한 펩티드, 또는 보다 구체적으로 본원에 기재된 마크로시클릭 펩티드는 화합물 단독으로서 또는 제약 제제의 형태로 허용되는 담체와 혼합되어 당뇨병 및 다른 관련 질환을 치료하기 위해 환자에게 투여될 수 있다. 당뇨병을 치료하는 관련 기술분야의 통상의 기술자는 이러한 치료를 필요로 하는 인간을 포함한 포유동물에 대한 화합물의 투여량 및 투여 경로를 용이하게 결정할 수 있다. 투여 경로는 경구, 경구내, 직장, 경피, 협측, 비강내, 폐, 피하, 근육내, 피내, 설하, 결장내, 안구내, 정맥내, 또는 장 투여를 포함할 수 있으나 이에 제한되지는 않는다. 화합물은 허용되는 제약 실시를 기반으로 한 투여 경로에 따라 제제화된다 (Fingl et al., in The Pharmacological Basis of Therapeutics, Chapter 1, p. 1 (1975); Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Edition, Mack Publishing Co., Easton, PA (1990)).
본원에 기재된 제약상 허용되는 펩티드 조성물은 다중 투여 형태, 예컨대 정제, 캡슐 (각각 지속 방출 또는 시한성 방출 제제를 포함함), 환제, 분말, 과립, 엘릭시르, 계내 겔, 마이크로구체, 결정질 복합체, 리포솜, 마이크로-에멀젼, 팅크제, 현탁액, 시럽, 에어로졸 스프레이 및 에멀젼으로 투여될 수 있다. 본원에 기재된 조성물은 또한, 모두 제약 기술분야의 통상의 기술자에게 널리 공지된 투여 형태를 사용하여, 경구, 정맥내 (볼루스 또는 주입), 복강내, 피하, 경피로 또는 근육내 형태로 투여될 수 있다. 조성물은 단독으로 투여될 수 있지만, 일반적으로 선택된 투여 경로 및 표준 제약 실시를 기준으로 선택된 제약 담체와 함께 투여될 것이다.
본원에 기재된 조성물에 대한 투여 요법은, 물론, 공지된 인자, 예컨대 특정한 작용제의 약역학적 특징, 및 그의 투여 방식 및 경로; 수용자의 종, 연령, 성별, 건강, 의학적 상태 및 체중; 증상의 속성 및 정도; 공동 치료의 종류; 치료 빈도; 투여 경로, 환자의 신장 및 간 기능, 및 목적하는 효과에 의존하여 달라질 것이다. 의사 또는 수의사는 질환 상태의 진행을 예방, 상쇄 또는 정지시키는데 필요한 약물의 유효량을 결정하고 처방할 수 있다.
일반적 지침에 따라, 활성 성분의 1일 경구 투여량은 표시된 효과를 위해 사용되는 경우에, 약 0.001 내지 1000 mg/kg 체중, 바람직하게는 1일에 약 0.01 내지 100 mg/kg 체중, 및 가장 바람직하게는 약 0.6 내지 20 mg/kg/일의 범위일 것이다. 정맥내로의 활성 성분의 1일 투여량은 표시된 효과를 위해 사용되는 경우에 일정한 속도의 주입 동안 분당/Kg 체중당 0.001ng 내지 100.0 ng의 범위일 것이다. 이러한 일정한 정맥내 주입은 바람직하게는 분당/Kg 체중당 0.01 ng 내지 50 ng의 속도에서, 가장 바람직하게는 분당/Kg 체중당 0.01 ng 내지 10.0 mg의 속도에서 투여될 수 있다. 본원에 기재된 조성물은 단일 1일 용량으로 투여될 수 있거나, 또는 총 1일 투여량이 1일에 2, 3, 또는 4회의 분할 용량으로 투여될 수 있다. 본원에 기재된 조성물은 또한 목적하는 바에 따라 일/주/개월의 기간에 걸쳐 약물의 지속 방출을 가능하게 할 데포 제제에 의해 투여될 수 있다.
본원에 기재된 조성물은 비강내 형태로 적합한 비강내 비히클의 국소 사용을 통해, 또는 경피 피부 패치를 사용한 경피 경로를 통해 투여될 수 있다. 경피 전달 시스템의 형태로 투여되는 경우에, 투여량 투여는, 물론, 투여 요법 전반에 걸쳐 간헐적이기보다는 연속적일 것이다.
조성물은 전형적으로, 의도된 투여 형태, 즉 경구 정제, 캡슐, 엘릭시르, 추진제의 존재 또는 부재 하에 생성된 에어로졸 스프레이 및 시럽에 대해 적합하게 선택되고 통상적인 제약 실시에 부합하는, 적합한 제약 희석제, 부형제 또는 담체 (본원에서 제약 담체로서 집합적으로 지칭됨)와의 혼합물로 투여된다.
예를 들어, 정제 또는 캡슐 형태로의 경구 투여를 위해, 활성 약물 성분은 경구, 비-독성, 제약상 허용되는 불활성 담체, 예컨대 비제한적으로, 락토스, 전분, 수크로스, 글루코스, 메틸 셀룰로스, 스테아르산마그네슘, 인산이칼슘, 황산칼슘, 만니톨 및 소르비톨과 조합될 수 있고; 액체 형태로의 경구 투여를 위해, 경구 약물 성분은 임의의 경구, 비-독성, 제약상 허용되는 불활성 담체, 예컨대, 비제한적으로, 에탄올, 글리세롤, 및 물과 조합될 수 있다. 더욱이, 원하거나 필요한 경우에, 적합한 결합제, 윤활제, 붕해제 및 착색제가 또한 혼합물에 혼입될 수 있다. 적합한 결합제는 전분, 젤라틴, 천연 당, 예컨대, 비제한적으로, 글루코스 또는 베타-락토스, 옥수수 감미제, 천연 및 합성 검, 예컨대 아카시아, 트라가칸트 또는 알긴산나트륨, 카르복시메틸셀룰로스, 폴리에틸렌 글리콜 및 왁스를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 이들 투여 형태에 사용되는 윤활제는 올레산나트륨, 스테아르산나트륨, 스테아르산마그네슘, 벤조산나트륨, 아세트산나트륨 및 염화나트륨을 포함한다. 붕해제는 전분, 메틸 셀룰로스, 한천, 벤토나이트 및 크산탄 검을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
본원에 기재된 조성물은 또한 혼합 미셀 또는 리포솜 전달 시스템, 예컨대 소형 단층 소포, 대형 단층 소포 및 다층 소포 형태로 투여될 수 있다. 리포솜은 다양한 인지질, 예컨대 콜레스테롤, 스테아릴아민 또는 포스파티딜콜린으로부터 형성될 수 있다. 투과 증진제가 약물 흡수를 증진시키기 위해 첨가될 수 있다.
전구약물이 제약의 수많은 바람직한 특성 (즉, 용해도, 생체이용률, 제조성 등)을 증진시키는 것으로 공지되어있기 때문에, 본원에 기재된 화합물은 전구약물 형태로 전달될 수 있다. 따라서, 본원에 기재된 대상은 본원에 청구된 화합물의 전구약물, 그의 전달 방법, 및 그를 함유하는 조성물을 포괄하는 것으로 의도된다.
본원에 기재된 조성물은 또한 표적화가능한 약물 담체로서 가용성 중합체와 커플링될 수 있다. 이러한 중합체는 폴리비닐-피롤리돈, 피란 공중합체, 폴리히드록시프로필-메타크릴아미드-페놀, 폴리히드록시에틸아스파르트아미드페놀, 또는 팔미토일 잔기로 치환된 폴리에틸렌옥시드-폴리리신을 포함할 수 있다. 게다가, 본원에 기재된 조성물은 약물의 제어 방출을 달성하는데 유용한 생분해성 중합체 부류, 예를 들어 폴리락트산, 폴리글리콜산, 폴리락트산 및 폴리글리콜산의 공중합체, 폴리엡실론 카프로락톤, 폴리히드록시 부티르산, 폴리오르토에스테르, 폴리아세탈, 폴리디히드로피란, 폴리시아노아실레이트, 및 히드로겔의 가교 또는 양친매성 블록 공중합체와 조합될 수 있다.
투여에 적합한 투여 형태 (제약 조성물)는 투여 단위당 약 0.01 밀리그램 내지 약 500 밀리그램의 활성 성분을 함유할 수 있다. 이들 제약 조성물에서, 활성 성분은 통상적으로 조성물의 총 중량을 기준으로 약 0.5-95 중량%의 양으로 존재할 것이다.
젤라틴 캡슐은 활성 성분 및 분말화 담체, 예컨대 락토스, 전분, 셀룰로스 유도체, 스테아르산마그네슘, 및 스테아르산을 함유할 수 있다. 유사한 희석제를 사용하여 압축 정제를 제조할 수 있다. 정제 및 캡슐 둘 다를 지속 방출 제품으로서 제조하여, 기간에 걸쳐 의약의 연속 방출을 제공할 수 있다. 압축 정제는, 임의의 불쾌한 맛을 차폐하고 대기로부터 정제를 보호하기 위해 당 코팅 또는 필름 코팅될 수 있거나, 또는 위장관에서의 선택적 붕해를 위해 장용 코팅될 수 있다.
경구 투여용 액체 투여 형태는 환자 수용을 증가시키기 위해 착색제 및 향미제를 함유할 수 있다.
일반적으로, 물, 적합한 오일, 염수, 수성 덱스트로스 (글루코스) 및 관련 당 용액, 및 글리콜, 예컨대 프로필렌 글리콜 또는 폴리에틸렌 글리콜이 비경구 용액에 적합한 담체이다. 비경구 투여용 용액은 바람직하게는 활성 성분의 수용성 염, 적합한 안정화제, 및 필요한 경우에, 완충제 물질을 함유한다. 단독의 또는 조합된 항산화제, 예컨대 중아황산나트륨, 아황산나트륨 또는 아스코르브산은 적합한 안정화제이다. 시트르산 및 그의 염 및 나트륨 EDTA가 또한 사용된다. 또한, 비경구 용액은 보존제 예컨대 벤즈알코늄 클로라이드, 메틸- 또는 프로필-파라벤 및 클로로부탄올을 함유할 수 있다.
적합한 제약 담체는 이러한 분야에서 표준 참조 교재 [Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Nineteenth Edition, Mack Publishing Company (1995)]에 기재되어 있다.
본원에 기재된 화합물의 투여를 위한 대표적인 유용한 제약 투여 형태는 하기와 같이 예시될 수 있다:
캡슐
다수의 단위 캡슐은 표준 2-피스 경질 젤라틴 캡슐을 분말화 활성 성분 100 밀리그램, 락토스 150 밀리그램, 셀룰로스 50 밀리그램 및 스테아르산마그네슘 6 밀리그램으로 충전시킴으로써 제조될 수 있다.
연질 젤라틴 캡슐
소화성 오일, 예컨대 대두 오일, 목화씨 오일 또는 올리브 오일 중 활성 성분의 혼합물을 제조하고, 정변위펌프의 수단에 의해 젤라틴 내에 주입하여 활성 성분 100 밀리그램을 함유하는 연질 젤라틴 캡슐을 형성할 수 있다. 캡슐은 세척 및 건조되어야 한다.
정제
정제는 통상적인 절차에 의해, 투여 단위가 예를 들어 활성 성분 100 밀리그램, 콜로이드성 이산화규소 0.2 밀리그램, 스테아르산마그네슘 5 밀리그램, 미세결정질 셀룰로스 275 밀리그램, 전분 11 밀리그램 및 락토스 98.8 밀리그램이도록 제조될 수 있다. 적절한 코팅을 적용하여 식미성을 증가시키거나 흡수를 지연시킬 수 있다.
주사제
본원에 기재된 펩티드 조성물의 주사가능한 제제는 규제 기관에 의해 승인된 것들과 같은 부형제의 사용을 필요로 할 수 있거나 그렇지 않을 수 있다. 이들 부형제는, 용매 및 공-용매, 가용화제, 유화제 또는 증점제, 킬레이트화제, 항산화제 및 환원제, 항미생물 보존제, 완충제 및 pH 조정제, 벌킹제, 보호제, 및 장성 조정제 및 특수 첨가제를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 주사가능한 제제는 멸균, 발열원 무함유이어야 하고, 용액의 경우에, 미립자 물질 무함유이어야 한다.
주사에 의한 투여에 적합한 비경구 조성물은 예를 들어, 1.5 중량%의 활성 성분을, 공-용매 또는 다른 부형제를 함유할 수 있거나 그렇지 않을 수 있는 제약상 허용되는 완충제 중에서 교반함으로써 제조될 수 있다. 용액은 염화나트륨에 의해 등장성이 되어야 하고 멸균되어야 한다.
현탁액
수성 현탁액은 경구 및/또는 비경구 투여를 위해, 예를 들어 각각 5 mL가 미분된 활성 성분 100 mg, 소듐 카르복시메틸 셀룰로스 20 mg, 벤조산나트륨 5 mg, 소르비톨 용액, U.S.P. 1.0 g, 및 바닐린 또는 다른 식미성 향미제 0.025 mL를 함유하도록 제조될 수 있다.
생분해성 마이크로입자
주사에 의한 투여에 적합한 지속-방출 비경구 조성물은, 예를 들어 적합한 생분해성 중합체를 용매에 용해시키고, 중합체 용액에 활성제를 첨가하여 혼입시키고, 매트릭스로부터 용매를 제거하며, 그에 의해 활성제가 매트릭스 전반에 분포된 중합체 매트릭스를 형성함으로써 제조될 수 있다.
특히 하기 예시적 실시예를 포함한 본 출원에 사용되는 약어는 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 널리 공지되어 있다. 사용된 약어의 일부는 하기와 같다: HOBt는 히드록시벤조트리아졸이고; HOAt는 1-히드록시-7-아자벤조트리아졸이고; DIC는 N,N'-디이소프로필카르보디이미드이고; BOP는 벤조트리아졸-1-일옥시 트리스(디메틸아미노)포스포늄 헥사플루오로포스페이트이고; PyBOP는 벤조트리아졸-1-일-옥시트리피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트이고; HCTU는 1H-벤조트리아졸륨 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-5클로로-,헥사플루오로포스페이트(1-),3-옥시드이고; HATU는 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트이고; TFA는 트리플루오로아세트산이고; TIS는 트리이소프로필실란이고; DMSO는 디메틸술폭시드이고; MeCN 또는 ACN 또는 AcCN은 아세토니트릴이고; DMF는 N,N-디메틸포름아미드이고; DCM은 디클로로메탄이고; DIPEA 또는 DIEA는 디이소프로필에틸아민이고; Et2O는 디에틸 에테르이고; MeOH는 메탄올이고; rt는 실온이고; h는 시간이고; min은 분이고; iPr은 이소프로필이다.
펩티드 합성
본원에서 본 개시내용의 기재는 화학 결합의 법칙 및 원칙과 일치하도록 해석되어야 한다. 본 개시내용에 의해 포괄된 화합물은 제약 작용제로서 사용하기에 적합하게 안정한 것들인 것으로 이해되어야 한다. 관련 기술분야의 통상의 기술자는 화학 결합의 일반적 원칙 및 안정성을 기준으로 하여 어떤 화합물이 안정하고 안정하지 않을 것인지를 인지할 것이다.
본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드의 화학적 합성은 단계적 고체 상 합성, 펩티드 단편의 입체형태적-보조 재라이게이션을 통한 반합성, 클로닝 또는 합성 펩티드 절편의 효소적 라이게이션, 및 화학적 라이게이션을 포함한 다양한 기술분야 인지 방법을 사용하여 수행될 수 있다. 본원에 기재된 마크로시클릭 펩티드 및 그의 유사체를 합성하기 위한 바람직한 방법은 다양한 고체-상 기술 예컨대 문헌 [Chan, W.C. et al., eds., Fmoc Solid Phase Synthesis, Oxford University Press, Oxford (2000); Barany, G. et al., The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, Vol. 2: "Special Methods in Peptide Synthesis, Part A", pp. 3-284, Gross, E. et al., eds., Academic Press, New York (1980); 및 Stewart, J.M. et al., Solid-Phase Peptide Synthesis, 2nd Edition, Pierce Chemical Co., Rockford, IL (1984)]에 기재된 것들을 사용하는 화학적 합성이다. 바람직한 전략은 아미노산 측쇄의 일시적 보호를 위한 tert-부틸 기와 조합된 α-아미노 기의 일시적 보호를 위한 Fmoc (9-플루오레닐메틸 메틸-옥시카르보닐) 기를 기초로 한다 (예를 들어 문헌 [Atherton, E. et al., "The Fluorenylmethoxycarbonyl Amino Protecting Group", in The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, Vol. 9: "Special Methods in Peptide Synthesis, Part C", pp. 1-38, Undenfriend, S. et al., eds., Academic Press, San Diego (1987)]을 참조함).
펩티드는 불용성 중합체 지지체 (또한 "수지"로서 지칭됨) 상에서 펩티드의 C-말단으로부터 시작하여 단계적 방식으로 합성될 수 있다. 합성은 아미드 또는 에스테르 연결의 형성을 통해 펩티드의 C-말단 아미노산을 수지에 부가하는 것에 의해 개시된다. 이는 각각 C-말단 아미드 또는 카르복실산으로서 생성되는 펩티드의 결과적인 방출을 가능하게 한다.
합성에 사용되는 C-말단 아미노산 및 모든 다른 아미노산은 그의 α-아미노 기, 및 α-아미노 보호기가 합성 동안 선택적으로 제거될 수 있도록 차별적으로 보호된 측쇄 관능기 (존재하는 경우에)를 가질 것이 요구된다. 아미노산의 커플링은 활성 에스테르로서의 그의 카르복실 기의 활성화, 및 수지에 부가된 N-말단 아미노산의 차단되지 않은 α-아미노 기와의 그의 반응에 의해 수행된다. 전체 펩티드 서열이 어셈블리될 때까지, α-아미노기 탈보호 및 커플링 순서는 반복된다. 이어서, 펩티드는 통상적으로 부반응을 제한하는 적절한 스캐빈저의 존재 하에 측쇄 관능기의 병행 탈보호와 함께 수지로부터 방출된다. 생성된 펩티드는 최종적으로 역상 HPLC에 의해 정제된다.
최종 펩티드에 대한 전구체로서 요구되는 펩티딜-수지의 합성은 상업적으로 입수가능한 가교 폴리스티렌 중합체 수지 (노바바이오켐, 캘리포니아주 샌디에고; 어플라이드 바이오시스템즈, 캘리포니아주 포스터 시티)를 이용한다. 바람직한 고체 지지체는, C-말단 카르복스아미드의 경우에 4-(2',4'-디메톡시페닐-Fmoc-아미노메틸)-페녹시아세틸-p-메틸 벤즈히드릴아민 수지 (링크 아미드 MBHA 수지); 9-Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시-메리필드 수지 (시버 아미드 수지); 4-(9-Fmoc)아미노메틸-3,5-디메톡시페녹시)발레릴-아미노메틸-메리필드 수지 (PAL 수지)이다. 제1 및 후속 아미노산의 커플링은 각각 DIC/HOBt, HBTU/HOBt, BOP, PyBOP, 또는 DIC/6-Cl-HOBt, HCTU, DIC/HOAt 또는 HATU로부터 생성된 HOBt, 6-Cl-HOBt 또는 HOAt 활성 에스테르를 사용하여 달성될 수 있다. 바람직한 고체 지지체는 보호된 펩티드 단편의 경우에 2-클로로트리틸 클로라이드 수지 및 9-Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시-메리필드 수지 (시버 아미드 수지)이다. 2-클로로트리틸 클로라이드 수지 상에의 제1 아미노산의 로딩은 Fmoc-보호된 아미노산을 수지와 디클로로메탄 및 DIEA 중에서 반응시킴으로써 최적으로 달성된다. 필요한 경우에, 소량의 DMF를 첨가하여 아미노산의 용해를 용이하게 할 수 있다.
본원에 기재된 펩티드 유사체의 합성은 단일 또는 다중-채널 펩티드 합성기, 예컨대 CEM 리버티 마이크로웨이브 합성기, 또는 프로테인 테크놀로지스, 인크. 프렐류드 (6 채널) 또는 심포니 (12 채널) 합성기를 사용함으로써 수행될 수 있다.
각각의 펩티드를 위한 펩티딜-수지 전구체는 임의의 표준 절차를 사용하여 절단 및 보호될 수 있다 (예를 들어, 문헌 [King, D.S. et al., Int. J. Peptide Protein Res., 36:255-266 (1990)] 참조). 바람직한 방법은 물, 및 스캐빈저로서 TIS의 존재 하에 TFA를 사용하는 것이다. 전형적으로, 펩티딜-수지를 TFA/물/TIS (94:3:3, v:v:v; 1 mL/100 mg 펩티딜 수지) 중에서 2-6시간 동안 실온에서 교반한다. 이어서 소비된 수지를 여과하고, TFA 용액을 감압 하에 농축 또는 건조시킨다. 생성된 조 펩티드를 침전시키고 Et2O로 세척하거나, 또는 정제용 HPLC에 의한 정제를 위해 DMSO 또는 50% 수성 아세트산에 직접 재용해시킨다.
목적하는 순도를 갖는 펩티드는, 예를 들어, 워터스 모델 4000 또는 시마즈 모델 LC-8A 액체 크로마토그래프 상에서 정제용 HPLC를 사용하는 정제에 의해 수득될 수 있다. 조 펩티드의 용액을 YMC S5 ODS (20X 100 mm) 칼럼에 주입하고, 둘 다 0.1% TFA로 완충된 물 중 MeCN의 선형 구배로 14-20 mL/분의 유량을 사용하여 220 nm에서 UV 흡광도에 의해 용출액을 모니터링하면서 용리시킨다. 정제된 펩티드의 구조는 전자-스프레이 MS 분석에 의해 확인될 수 있다.
하기 분석 프로토콜 및 합성 방법은 실시예 1253 내지 1288에 관한 것이다:
분석 데이터:
질량 분광측정법: "ESI-MS(+)"는 양이온 모드로 수행된 전기분무 이온화 질량 분광측정법을 의미하고; "ESI-MS(-)"는 음이온 모드로 수행된 전기분무 이온화 질량 분광측정법을 의미하고; "ESI-HRMS(+)"는 양이온 모드로 수행된 고해상도 전기분무 이온화 질량 분광측정법을 의미하고; "ESI-HRMS(-)"는 음이온 모드로 수행된 고해상도 전기분무 이온화 질량 분광측정법을 의미한다. 검출된 질량은 "m/z" 단위 지정에 따라 보고된다. 1000 초과의 정확한 질량을 갖는 화합물은 종종 이중-하전 또는 삼중-하전 이온으로 검출되었다.
분석 LCMS 조건 A:
칼럼: BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 물, 0.05% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.05% TFA 함유; 온도: 50℃; 구배: 2분에 걸쳐 2% B에서 98% B, 이어서 98% B에서 0.5분 유지; 유량: 0.8 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 B:
칼럼: BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 0.05% TFA 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 0.05% TFA 함유; 온도: 50℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 0.75-분 유지; 유량: 1.11 mL/분.
분석 LCMS 조건 C:
칼럼: BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 물, 0.2% 포름산 및 0.01% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.2% 포름산 0.01% TFA 함유; 온도: 50℃; 구배: 2분에 걸쳐 2% B에서 80% B, 0.1분에 걸쳐 80% B에서 98% B 이어서 98% B에서 0.5분 유지; 유량: 0.8 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 D:
칼럼: 워터스 액퀴티 UPLC BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 온도: 50℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 0.75-분 유지; 유량: 1.11 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 E:
칼럼: 워터스 액퀴티 UPLC BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 50℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 0.75-분 유지; 유량: 1.11 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 F:
칼럼: 워터스 엑스브리지 C18, 2.1 x 50 mm; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 온도: 35℃; 구배: 4분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 1-분 유지; 유량: 4 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 G:
피니간 LTQ 질량 분광계; 칼럼: 페노메넥스 주피터 C4, 1 x 50 mm; 이동상 A: 물 중 1% 포름산; 이동상 B: 아세토니트릴 중 0.1% 포름산; 온도: 30℃; 구배: 1% B, 1분 유지; 3분에 걸쳐 1-95% B, 이어서 95% B에서 3-분 유지; 유량: 0.15 mL/분.
분석 LCMS 조건 H:
칼럼: 워터스 BEH C18, 2.0 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 온도: 50℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 0.5-분 유지; 유량: 1.0 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 I:
칼럼: 워터스 BEH C18, 2.0 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 온도: 50℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 0.5-분 유지; 유량: 0.5 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 A:
칼럼: YMC 팩 ODS-AQ 3um 150x4.6mm 이동상 A: 물, 0.1% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% TFA 함유; 온도: 60℃; 구배: 25분에 걸쳐 35% B에서 80% B; 유량: 1 mL/분; 검출: 217 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 B:
칼럼: YMC 팩 ODS-AQ 3um 150x4.6mm 이동상 A: 물, 0.1% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% TFA 함유; 온도: 60℃; 구배: 25분에 걸쳐 25% B에서 75% B; 유량: 1 mL/분; 검출: 217 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 C:
칼럼: YMC 팩 ODS-AQ 3um 150x4.6mm 이동상 A: 물, 0.1% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% TFA 함유; 온도: 60℃; 구배: 25분에 걸쳐 20% B에서 70% B; 유량: 1 mL/분; 검출: 217 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 D:
칼럼: YMC 팩 ODS-AQ 3um 150x4.6mm 이동상 A: 물, 0.1% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% TFA 함유; 온도: 60℃; 구배: 25분에 걸쳐 15% B에서 65% B; 유량: 1 mL/분; 검출: 217 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 E:
칼럼: YMC 팩 ODS-AQ 3um 150x4.6mm 이동상 A: 물, 0.1% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% TFA 함유; 온도: 60℃; 구배: 20분에 걸쳐 25% B에서 60% B; 유량: 1.25 mL/분; 검출: 217 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 F:
칼럼: YMC 팩 ODS-AQ 3um 150x4.6mm 이동상 A: 물, 0.1% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% TFA 함유; 온도: 60℃; 구배: 20분에 걸쳐 25% B에서 65% B; 유량: 1.25 mL/분; 검출: 217 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 G
칼럼: 선파이어 C18 3.5um, 3.0x150mm; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 0.05% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 0.05% 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 50℃; 구배: 12분에 걸쳐 10-100% B, 이어서 100% B에서 3-분 유지; 유량: 1 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 H
칼럼: 엑스브리지 페닐 3.5x150um, 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 0.05% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 0.05% 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 50℃; 구배: 12분에 걸쳐 10-100% B, 이어서 100% B에서 3-분 유지; 유량: 1 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 HPLC 조건 I:
칼럼: 페노메넥스 루나 5u C18(2) 150 x 4.6 mm; 이동상 A: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유, 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유, 구배 20분에 걸쳐 5-100% B, 이어서 100% B에서 5분 유지; 유량 1mL/분, 검출: 220 nm에서의 UV
분석 HPLC 조건 J:
칼럼: 페노메넥스 루나 5u C18(2) 150 x 4.6 mm; 이동상 A: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유, 이동상 B: 아세토니트릴, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유, 구배 20분에 걸쳐 10-100% B, 이어서 100% B에서 5분 유지; 유량 1mL/분, 검출: 220 nm에서의 UV
일반적 절차:
프렐류드 방법 A:
모든 조작을 프렐류드 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 언급되지 않는 한 하단 프릿이 장착된 10 또는 45 mL 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. 튜브를 튜브의 하단 및 상단 둘 다를 통해 프렐류드 펩티드 합성기에 연결하였다. DMF 및 DCM을 튜브의 상단을 통해 첨가할 수 있었으며, 이를 튜브의 측면으로 동등하게 세척해 내었다. 나머지 시약을 튜브의 하단을 통해 첨가하고, 프릿을 통해 통과시켜 수지를 접촉시켰다. 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 교반"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 펄스를 기재하며; 펄스는 대략 5초 동안 지속되고, 30초마다 발생한다. 아미노산 용액은 일반적으로 제조로부터 3주 이후에는 사용하지 않았다. DMF = 디메틸포름아미드; DIC = N,N'-디이소프로필카르보디이미드; HOAt = 1-히드록시 7-아자벤조트리아졸; 시버 = Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시, 여기서 "3-일옥시"는 폴리스티렌 수지에 대한 연결의 위치 및 유형을 기재한다. 사용되는 수지는 시버 링커 (질소에서 Fmoc-보호됨); 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.71 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Ala-OH; Fmoc-Arg(Pbf)-OH; Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Bzt-OH; Fmoc-Cys(Trt)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Ile-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-Met-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Phe-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Sar-OH; Fmoc-Ser(tBu)-OH; Fmoc-Thr(tBu)-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH; Fmoc-Val-OH
"프렐류드 방법 A"의 절차는 0.100 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 시버-메리필드 수지 대략 140 mg에 해당한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 아미노산 커플링 전에, 모든 펩티드 합성 순서를 "수지-팽윤 절차"로서 하기 기재된 수지-팽윤 절차로 시작하였다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "단일-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 Fmoc-N-메틸 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "2급 아민-커플링 절차"를 사용하였다. 펩티드의 N-말단에 대한 클로로아세틸 기의 커플링은 하기 상세화된 "클로로아세틸 클로라이드 커플링 절차" 또는 "클로로아세트산 커플링 절차"에 의해 기재되어 있다.
수지-팽윤 절차:
40 mL 폴리프로필렌 고체-상 반응 용기에 메리필드:시버 수지 (140 mg, 0.100 mmol)를 첨가하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (5.0 mL) 및 DCM (5.0 mL)을 첨가하고, 그 후에 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 10분 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 배출하였다.
단일-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각 세척에서, 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 및 HOAt의 용액 (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량)에 이어서 DIC (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 60분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각 세척에서, 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각 세척에서, 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
2급 아민-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 및 HOAt의 용액 (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 5 당량)에 이어서 DIC (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 5 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 300분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
클로로아세틸 클로라이드 커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 DMF 중 DIPEA (4.0 mmol, 0.699 mL, 40 당량), 및 클로로아세틸 클로라이드 (2.0 mmol, 0.160 mL, 20 당량)의 용액 3.0 mL를 첨가하였다. 혼합물을 12 내지 18시간 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 용기의 상단에 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 용기의 상단에 DCM (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 배출하였다.
프렐류드 방법 B:
모든 조작을 프렐류드 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 하단 프릿이 장착된 10 또는 45 mL 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. DMF 및 DCM을 튜브의 상단을 통해 첨가할 수 있었으며, 이를 튜브의 측면으로 동등하게 세척해 내었다. 나머지 시약을 튜브의 하단을 통해 첨가하고, 프릿을 통해 통과시켜 수지를 접촉시켰다. 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 교반"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 펄스를 기재하며; 펄스는 대략 5초 동안 지속되고, 30초마다 발생한다. 아미노산 용액은 일반적으로 제조로부터 3주 이후에는 사용하지 않았다. DMF = 디메틸포름아미드; HCTU = 2-(6-클로로-1-H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄; DIPEA = 디이소프로필에틸아민; 시버 = Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시, 여기서 "3-일옥시"는 폴리스티렌 수지에 대한 연결의 위치 및 유형을 기재한다. 사용되는 수지는 시버 링커 (질소에서 Fmoc-보호됨); 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.71 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Ala-OH; Fmoc-Arg(Pbf)-OH; Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Bzt-OH; Fmoc-Cys(Trt)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Ile-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-Met-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Phe-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Sar-OH; Fmoc-Ser(tBu)-OH; Fmoc-Thr(tBu)-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH; Fmoc-Val-OH
"프렐류드 방법 B"의 절차는 0.100 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 시버-메리필드 수지 대략 140 mg에 해당한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 아미노산 커플링 전에, 모든 펩티드 합성 순서를 "수지-팽윤 절차"로서 하기 기재된 수지-팽윤 절차로 시작하였다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "단일-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "2급 아민-커플링 절차"를 사용하였다. 펩티드의 N-말단에 대한 클로로아세틸 기의 커플링은 하기 상세화된 "클로로아세틸 클로라이드 커플링 절차" 또는 "클로로아세트산 커플링 절차"에 의해 기재되어 있다.
수지-팽윤 절차:
40 mL 폴리프로필렌 고체-상 반응 용기에 메리필드:시버 수지 (140 mg, 0.100 mmol)를 첨가하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척(팽윤)하였다: 반응 용기에 DMF (5.0 mL) 및 DCM (5.0 mL)을 첨가하고, 그 후에 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 10분 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 배출하였다.
단일-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량)에 이어서 HCTU (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 2.5 mL, 20 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
이중-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량)에 이어서 HCTU (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 2.5 mL, 20 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)로 연속적으로 3회 세척하고 생성된 혼합물을 60초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량)에 이어서 HCTU (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 2.5 mL, 20 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
2급 아민-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 10 당량)에 이어서 HCTU (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 10 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.5 mL, 12 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 12시간 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
클로로아세틸 클로라이드 커플링 절차 A:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 DMF 중 DIPEA (4.0 mmol, 0.699 mL, 40 당량), 및 클로로아세틸 클로라이드 (2.0 mmol, 0.160 mL, 20 당량)의 용액 3.0 mL를 첨가하였다. 혼합물을 12 내지 18시간 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, CH2Cl2 (2.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후 용액을 프릿을 통해 배출하였다.
클로로아세트산 커플링 절차 B:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 DMF (2.0 mL), 클로로아세트산 (1.2 mmol, 113 mg, 12 당량), 및 N,N'-디이소프로필카르보디이미드 (1.2 mmol, 0.187 mL, 12 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 12 내지 18시간 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, CH2Cl2 (2.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다.
프렐류드 방법 C:
모든 조작을 프렐류드 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 언급되지 않는 한 하단 프릿이 장착된 10 또는 45 mL 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. 튜브를 튜브의 하단 및 상단 둘 다를 통해 프렐류드 펩티드 합성기에 연결하였다. DMF 및 DCM을 튜브의 상단을 통해 첨가할 수 있었으며, 이를 튜브의 측면으로 동등하게 세척해 내었다. 나머지 시약을 튜브의 하단을 통해 첨가하고, 프릿을 통해 통과시켜 수지를 접촉시켰다. 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 교반"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 펄스를 기재하며; 펄스는 대략 5초 동안 지속되고, 30초마다 발생한다. 아미노산 용액은 일반적으로 제조로부터 3주 이후에는 사용하지 않았다. HATU 용액은 제조예 5일 이내에 사용하였다. DMF = 디메틸포름아미드; HCTU = 2-(6-클로로-1-H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄; HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트; DIPEA = 디이소프로필에틸아민; 시버 = Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시, 여기서 "3-일옥시"는 폴리스티렌 수지에 대한 연결의 위치 및 유형을 기재한다. 사용되는 수지는 시버 링커 (질소에서 Fmoc-보호됨); 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.71 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Ala-OH; Fmoc-Arg(Pbf)-OH; Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Bzt-OH; Fmoc-Cys(Trt)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Ile-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-Met-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Phe-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Sar-OH; Fmoc-Ser(tBu)-OH; Fmoc-Thr(tBu)-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH; Fmoc-Val-OH
"프렐류드 방법 C"의 절차는 0.100 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 시버-메리필드 수지 대략 140 mg에 해당한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 아미노산 커플링 전에, 모든 펩티드 합성 순서를 "수지-팽윤 절차"로서 하기 기재된 수지-팽윤 절차로 시작하였다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "단일-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "2급 아민-커플링 절차"를 사용하였다. 수지의 최종 세척은 하기 기재된 "최종 세척 절차"를 사용하였다.
수지-팽윤 절차:
40 mL 폴리프로필렌 고체-상 반응 용기에 메리필드:시버 수지 (140 mg, 0.100 mmol)를 첨가하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척(팽윤)하였다: 반응 용기에 DMF (5.0 mL) 및 DCM (5.0 mL)을 첨가하고, 그 후에 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 10분 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다.
단일-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 5.0 mL, 10 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 2.5 mL, 20 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 60분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
2급 아민-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 5회 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 1.5 mL, 12 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 300분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 1.5 mL, 12 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 300분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
통상의 아미노산-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 0.5 내지 2.5 mL, 1 내지 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 0.5 내지 2.5 mL, 1 내지 5 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.5 내지 1.5 mL, 4 내지 12 당량)를 첨가하였다.
혼합물을 60분 내지 600분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
최종 세척액 절차:
수지를 하기와 같이 연속적으로 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 2회 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DCM (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
클로로아세트산 커플링 절차:
수동 단계를 나타내었다. 이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 5분 동안 진탕시키고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 DMF (2.0 mL), 클로로아세트산 (1.2 mmol, 113 mg, 12 당량), 및 N,N'-디이소프로필카르보디이미드 (1.2 mmol, 0.187 mL, 12 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 12 내지 18시간 동안 진탕시키고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 교반한 후, 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, CH2Cl2 (4.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초동안 주기적으로 교반한 후 프릿을 통해 배출하였다.
프렐류드 방법 D:
모든 조작을 프렐류드 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 언급되지 않는 한 하단 프릿이 장착된 10 또는 45 mL 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. 튜브를 튜브의 하단 및 상단 둘 다를 통해 프렐류드 펩티드 합성기에 연결하였다. DMF 및 DCM을 튜브의 상단을 통해 첨가할 수 있었으며, 이를 튜브의 측면으로 동등하게 세척해 내었다. 나머지 시약을 튜브의 하단을 통해 첨가하고, 프릿을 통해 통과시켜 수지를 접촉시켰다. 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 교반"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 펄스를 기재하며; 펄스는 대략 5초 동안 지속되고, 30초마다 발생한다. 아미노산 용액은 일반적으로 제조로부터 3주 이후에는 사용하지 않았다. HATU 용액은 제조예 5일 이내에 사용하였다. DMF = 디메틸포름아미드; HCTU = 2-(6-클로로-1-H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄; HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트; DIPEA = 디이소프로필에틸아민; 시버 = Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시, 여기서 "3-일옥시"는 폴리스티렌 수지에 대한 연결의 위치 및 유형을 기재한다. 사용되는 수지는 시버 링커 (질소에서 Fmoc-보호됨); 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.71 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Ala-OH; Fmoc-Arg(Pbf)-OH; Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Bzt-OH; Fmoc-Cys(Trt)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Ile-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-Met-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Phe-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Sar-OH; Fmoc-Ser(tBu)-OH; Fmoc-Thr(tBu)-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH; Fmoc-Val-OH
"프렐류드 방법 D"의 절차는 0.100 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 시버-메리필드 수지 대략 140 mg에 해당한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 아미노산 커플링 전에, 모든 펩티드 합성 순서를 "수지-팽윤 절차"로서 하기 기재된 수지-팽윤 절차로 시작하였다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "단일-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "2급 아민-커플링 절차"를 사용하였다. 수지의 최종 세척은 하기 기재된 "최종 세척 절차"를 사용하였다.
수지-팽윤 절차:
40 mL 폴리프로필렌 고체-상 반응 용기에 메리필드:시버 수지 (140 mg, 0.100 mmol)를 첨가하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척(팽윤)하였다: 반응 용기에 DMF (5.0 mL) 및 DCM (5.0 mL)을 첨가하고, 그 후에 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 10분 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다.
단일-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 2.5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 2.5 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.75 mL, 5 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
2급 아민-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 2.5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 2.5 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.75 mL, 5 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 2.5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 2.5 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.75 mL, 5 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
최종 세척액 절차:
수지를 하기와 같이 연속적으로 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 2회 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DCM (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
클로로아세트산 커플링 절차:
수동 단계를 나타낸다. 이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 5분 동안 진탕시키고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (4.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 DMF (2.0 mL), 클로로아세트산 (1.2 mmol, 113 mg, 12 당량), 및 N,N'-디이소프로필카르보디이미드 (1.2 mmol, 0.187 mL, 12 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 12 내지 18시간 동안 진탕시키고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 교반한 후, 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, CH2Cl2 (4.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후 프릿을 통해 배출하였다.
CEM 방법 A:
모든 조작을 CEM 리버티 마이크로웨이브 펩티드 합성기 (CEM 코포레이션) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 언급되지 않는 한 CEM 디스커버리 마이크로웨이브 유닛에 하단 프릿이 장착된 30 또는 125 mL 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. 튜브를 튜브의 하단 및 상단 둘 다를 통해 CEM 리버티 합성기에 연결하였다. DMF 및 DCM을 튜브의 상단 및 하단에 첨가할 수 있었으며, 이를 튜브의 측면으로 동등하게 세척해 내었다. 수지를 상단으로부터 옮기는 동안을 제외하고 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 버블링"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 버블링을 기재한다. 아미노산 용액은 일반적으로 제조로부터 3주 이후에는 사용하지 않았다. HATU 용액은 제조예 5일 이내에 사용하였다. DMF = 디메틸포름아미드; HCTU = 2-(6-클로로-1-H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄; HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트; DIPEA = 디이소프로필에틸아민; 시버 = Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시, 여기서 "3-일옥시"는 폴리스티렌 수지에 대한 연결의 위치 및 유형을 기재한다. 사용되는 수지는 시버 링커 (질소에서 Fmoc-보호됨); 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.71 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 다른 통상의 수지 예컨대 링크, 클로로트리틸, 또는 다른 산 감수성 링커를 합성에 사용할 수 있으며, 시버 아미드 수지가 달리 언급되지 않는 한 구체적 실시예에서 사용된다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Ala-OH; Fmoc-Arg(Pbf)-OH; Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Bzt-OH; Fmoc-Cys(Trt)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Ile-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-Met-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Orn(Boc)-OH; Fmoc-Phe-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Sar-OH; Fmoc-Ser(tBu)-OH; Fmoc-Thr(tBu)-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH; Fmoc-Val-OH
"CEM 방법 A"의 절차는 0.100 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 시버-메리필드 수지 대략 140 mg에 해당한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 아미노산 커플링 전에, 모든 펩티드 합성 순서를 "수지-팽윤 절차"로서 하기 기재된 수지-팽윤 절차로 시작하였다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "단일-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "2급 아민-커플링 절차"를 사용하였다. 펩티드의 N-말단에 대한 클로로아세틸 기의 커플링은 상기 상세화된 "클로로아세틸 클로라이드 커플링 절차" 또는 "클로로아세트산 커플링 절차"에 의해 기재되어 있다.
수지-팽윤 절차:
50 mL 폴리프로필렌 원추형 튜브에 메리필드:시버 수지 (140 mg, 0.100 mmol)를 첨가하였다. 이어서, DMF (7 mL)를 튜브에 첨가하고, 이어서 DCM (7 mL)을 첨가하였다. 이어서, 수지를 용기의 상단에서 반응 용기로 옮겼다. 절차를 추가적으로 2회 반복하였다. DMF (7 mL)를 첨가하고, 이어서 DCM (7 mL)을 첨가하였다. 수지를 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 15분 동안 팽윤되도록 한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다.
표준 커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF의 용액 (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF의 용액 (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량), HATU (DMF 중 0.5M, 1.0 mL, 5 당량), 및 DIPEA (NMP 중 2M, 0.5 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 커플링되는 Fmoc-Cys(Trt)-OH 및 Fmoc-His(Trt)-OH을 제외하고 모든 아미노산에 대해 75℃에서 5분 동안 N2 버블링에 의해 혼합하고, 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 65℃에서 2분 동안 주기적으로 버블링하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
이중-커플 커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF의 용액 (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF의 용액 (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량), HATU (DMF 중 0.5M, 1.0 mL, 5 당량), 및 DIPEA (NMP 중 2M, 0.5 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 커플링되는 Fmoc-Cys(Trt)-OH 및 Fmoc-His(Trt)-OH을 제외하고 모든 아미노산에 대해 75℃에서 5분 동안 N2 버블링에 의해 혼합하고, 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량), HATU (DMF 중 0.5M, 1.0 mL, 5 당량), 및 DIPEA (NMP 중 2M, 0.5 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 커플링되는 Fmoc-Cys(Trt)-OH 및 Fmoc-His(Trt)-OH을 제외하고 모든 아미노산에 대해 75℃에서 5분 동안 N2 버블링에 의해 혼합하고, 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 65℃에서 2분 동안 주기적으로 버블링하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
2급 아민 커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 DMF (7 mL) 중 5% 피페라진 및 0.1 M HOBt의 용액을 첨가하였다. 혼합물을 75℃에서 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 배출하였다. 이 절차를 1회 더 반복하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량), HCTU (DMF 중 0.5M, 1.0 mL, 5 당량), 및 DIPEA (NMP 중 2M, 0.5 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 모든 아미노산 (Fmoc-Cys(Trt)-OH 및 Fmoc-His(Trt)-OH의 경우는 50℃)에 대해 75℃에서 5분 동안에 이어서 가열 없이 6시간 동안 N2 버블링하였다. 배출 후에, 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 65℃에서 2분 동안 주기적으로 버블링하고 이어서 용액을 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
통상의 아미노산-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF의 용액 (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF의 용액 (20:80 v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 HATU (2.5 당량 내지 10 당량)를 함유하는 아미노산 용액 (1.25 mL 내지 5 mL, 2.5 당량 내지 10 당량), 및 최종적으로 DIPEA (NMP 중 2M, 0.5 mL 내지 1 mL, 20 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃ 내지 75℃에서 5분 내지 2시간 동안 N2 버블링에 의해 혼합하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 반응 용기에 아세트산 무수물:DIEA:DMF의 용액 (10:1:89 v/v/v, 5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 65℃에서 2분 동안 주기적으로 버블링하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척, 이어서 하단으로부터의 DMF (7 mL) 세척 및 최종적으로 상단으로부터의 DMF (7 mL) 세척. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
심포니 방법 A:
모든 조작을 심포니 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 달리 언급되지 않는 한 하단 프릿이 장착된 심포니 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. 튜브를 튜브의 하단 및 상단 둘 다를 통해 심포니 펩티드 합성기에 연결하였다. 모든 용매, DMF, DCM, 아미노산 및 시약을 튜브의 하단을 통해 첨가하고, 프릿을 통해 통과시켜 수지를 접촉시켰다. 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 교반"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 펄스를 기재하며; 펄스는 대략 5초 동안 지속되고, 15초마다 발생한다. 아미노산 용액은 일반적으로 제조로부터 3주 이후에는 사용하지 않았다. HATU 용액은 제조예 5일 이내에 사용하였다. DMF = 디메틸포름아미드; HCTU = 2-(6-클로로-1-H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄; HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트; NMM= n-메틸 모르폴린; DIPEA = 디이소프로필에틸아민; 시버 = Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시, 여기서 "3-일옥시"는 폴리스티렌 수지에 대한 연결의 위치 및 유형을 기재한다. 사용되는 수지는 시버 링커 (질소에서 Fmoc-보호됨); 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.71 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 다른 통상의 산 감수성 수지 예컨대 링크 또는 관능화 클로로 트리틸 수지가 또한 합성에 사용될 수 있다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Ala-OH; Fmoc-Arg(Pbf)-OH; Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Bzt-OH; Fmoc-Cys(Trt)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Ile-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-Met-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Phe-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Sar-OH; Fmoc-Ser(tBu)-OH; Fmoc-Thr(tBu)-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH; Fmoc-Val-OH
"심포니 방법 A"의 절차는 0.050 mmol 규모 상에서 수행되는 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 시버-메리필드 수지의 대략 70 mg에 해당한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.050 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 아미노산 커플링 전에, 모든 펩티드 합성 순서를 "팽윤 절차"로서 하기 기재된 수지-팽윤 절차로 시작하였다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "표준-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 "이중-커플링"을 사용하고, 통상의 아미노산을 하기 기재된 아미노산 "블랭크 커플링"의 수동 블랭크 부가를 통해 커플링하였다.
팽윤 절차:
심포니 폴리프로필렌 고체-상 반응 용기에 메리필드:시버 수지 (70 mg, 0.050 mmol)를 첨가하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척(팽윤)하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고, 그 후에 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 10분 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 하단을 통해 첨가된 DMF (6.25 mL)로 세척하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
표준-커플링 절차:
수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 하단을 통해 첨가된 DMF (6.25 mL)로 세척하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
2급 아민-커플링 절차:
수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 300분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 하단을 통해 첨가된 DMF (6.25 mL)로 세척하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 300분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
통상의 아미노산-커플링 절차:
수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 합성을 반응 용기에 통상의 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)을 수동으로 첨가하기 위해 심포니 소프트웨어에 의해 중지하고 이어서 자동화를 재시작하여: HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 300분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 하단을 통해 첨가된 DMF (2.5 mL)로 하기와 같이 6회 세척하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 Ac2O/DIPEA/DMF (v/v/v 1:1:3 2.5 mL)을 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
심포니 방법 B:
모든 조작을 심포니 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 달리 언급되지 않는 한 하단 프릿이 장착된 심포니 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. 튜브를 튜브의 하단 및 상단 둘 다를 통해 심포니 펩티드 합성기에 연결하였다. 모든 용매, DMF, DCM, 아미노산 및 시약을 튜브의 하단을 통해 첨가하고, 프릿을 통해 통과시켜 수지를 접촉시켰다. 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 교반"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 펄스를 기재하며; 펄스는 대략 5초 동안 지속되고, 15초마다 발생한다. 아미노산 용액은 일반적으로 제조로부터 3주 이후에는 사용하지 않았다. HATU 용액은 제조예 5일 이내에 사용하였다. DMF = 디메틸포름아미드; HCTU = 2-(6-클로로-1-H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄; HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트; NMM= n-메틸 모르폴린; DIPEA = 디이소프로필에틸아민; 시버 = Fmoc-아미노-크산텐-3-일옥시, 여기서 "3-일옥시"는 폴리스티렌 수지에 대한 연결의 위치 및 유형을 기재한다. 사용되는 수지는 시버 링커 (질소에서 Fmoc-보호됨); 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.71 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 다른 통상의 산 감수성 수지 예컨대 링크 또는 관능화 클로로 트리틸 수지가 또한 합성에 사용될 수 있다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Ala-OH; Fmoc-Arg(Pbf)-OH; Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Bzt-OH; Fmoc-Cys(Trt)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Ile-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-Met-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Phe-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Sar-OH; Fmoc-Ser(tBu)-OH; Fmoc-Thr(tBu)-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH; Fmoc-Val-OH
"심포니 방법 B"의 절차는 0.050 mmol 규모 상에서 수행되는 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 시버-메리필드 수지의 대략 70 mg에 해당한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.050 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 아미노산 커플링 전에, 모든 펩티드 합성 순서를 "팽윤 절차"로서 하기 기재된 수지-팽윤 절차로 시작하였다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "표준-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 "2급 아민-커플링 절차 B"를 사용하고, 통상의 아미노산을 하기 기재된 아미노산 "통상의 아미노산-커플링 절차"의 수동 블랭크 첨가를 통해 커플링하고, 클로로아세틸 무수물을 하기 기재된 "최종 캡핑 절차"를 사용하여 서열의 최종 위치에 첨가하였다.
팽윤 절차:
심포니 폴리프로필렌 고체-상 반응 용기에 메리필드:시버 수지 (70 mg, 0.050 mmol)를 첨가하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척(팽윤)하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고, 그 후에 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 10분 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 하단을 통해 첨가된 DMF (6.25 mL)로 세척하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 그 후에 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반하고 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
표준-커플링 절차:
수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 Ac2O/DIPEA/DMF (v/v/v 1:1:3 2.5 mL)을 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
2급 아민-커플링 절차:
수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 하단을 통해 첨가된 DMF (6.25 mL)로 세척하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 Ac2O/DIPEA/DMF (v/v/v 1:1:3 2.5 mL)을 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
통상의 아미노산-커플링 절차:
수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 시스템을 통상의 아미노산의 반응 용기에의 수동 첨가 (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량)를 위해 시스템에 의해 중지시킨 다음, 자동화를 재시작하여 반응 용기에 HATU (DMF 중 0.2M, 1.25 mL, 5 당량), 및 최종적으로 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 6회 세척하였다: DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 Ac2O/DIPEA/DMF (v/v/v 1:1:3 2.5 mL)을 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
최종 캡핑 절차:
수지를 하기와 같이 3회 세척하였다: 반응 용기에 DMF (2.5 mL)를 첨가하고 혼합물을 반응 용기의 하단으로부터 N2 버블링과 함께 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용매를 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 2.5분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)에 이어서 클로로아세트산 무수물 (DMF 중 0.4M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 용기의 하단을 통해 첨가된 DMF (6.25 mL)로 세척하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 NMM (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)에 이어서 클로로아세트산 무수물 (DMF 중 0.4M, 1.25 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 6회 세척하였다: DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 Ac2O/DIPEA/DMF (v/v/v 1:1:3 2.5 mL)을 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DCM (2.5 mL)를 용기의 하단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 이어서, 생성된 수지를 10분 동안 질소 스트림으로 건조시켰다.
전반적 탈보호 방법 A:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "전반적 탈보호 방법 A"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. "탈보호 용액"을 트리플루오로아세트산:물:트리이소프로필실란:디티오트레이톨 (92.5:2.5:2.5:2.5 v:v:v:w)을 사용하여 제조하였다. 수지를 반응 용기로부터 제거하고, 프릿이 장착된 25 mL 시린지로 옮겼다. 시린지에 "탈보호 용액" (5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 85분 동안 진탕기에서 혼합하였다. 용액을 여과하고, 농축시키고, 디에틸 에테르 (30 mL)로 희석하였다. 침전된 고체를 3분 동안 원심분리하였다. 상청액 용액을 경사분리하고, 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 재현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 고진공 하에 건조시켰다. 조 펩티드를 백색 내지 회백색 고체로서 수득하였다.
전반적 탈보호 방법 B:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "전반적 탈보호 방법 B"의 절차는 0.04 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.04 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. "탈보호 용액"을 트리플루오로아세트산:트리이소프로필실란 (96:4; v:v)을 사용하여 제조하였다. 수지를 반응 용기로부터 제거하고, 프릿이 장착된 10 mL 시린지로 옮겼다. 시린지에 "탈보호 용액" (2.0-3.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 1시간 또는 1.5시간 동안 진탕기에서 혼합하였다. 용액을 여과하고, 탈보호 용액 (0.5 mL)으로 세척하고, 농축시키고, 디에틸 에테르 (30 mL)로 희석하였다. 침전된 고체를 3분 동안 원심분리하였다. 상청액 용액을 경사분리하고, 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 재현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 고진공 하에 건조시켰다. 조 펩티드를 백색 내지 회백색 고체로서 수득하였다.
전반적 탈보호 방법 C:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "전반적 탈보호 방법 C"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. "탈보호 용액"을 트리플루오로아세트산:트리이소프로필실란:디티오트레이톨 (95:2.5:2.5 v:v:w)을 사용하여 제조하였다. 수지를 반응 용기로부터 제거하고, 바이오-라드 튜브로 옮겼다. 바이오-라드 튜브에 "탈보호 용액" (4.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 60분 동안 진탕기에서 혼합하였다. 용액을 여과하고, 디에틸 에테르 (30 mL) 중에 희석하였다. 침전된 고체를 3분 동안 원심분리하였다. 상청액 용액을 경사분리하고, 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 재현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 고진공 하에 건조시켰다. 조 펩티드를 백색 내지 회백색 고체로서 수득하였다.
전반적 탈보호 방법 D:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "전반적 탈보호 방법 B"의 절차는 0.100 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. "탈보호 용액"을 트리플루오로아세트산:트리이소프로필실란:디티오트레이톨 (94:3:3 v:v:w)을 사용하여 제조하였다. 수지를 반응 용기로부터 제거하고, 프릿이 장착된 25 mL 시린지로 옮겼다. 시린지에 "탈보호 용액" (5.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 진탕기에서 5분 동안 혼합하였다. 용액을 여과하고, 디에틸 에테르 (30 mL) 중에 희석하였다. 침전된 고체를 3분 동안 원심분리하였다. 상청액 용액을 경사분리하고, 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 재현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 고진공 하에 건조시켰다. 조 펩티드를 백색 내지 회백색 고체로서 수득하였다.
전반적 탈보호 방법 E:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "전반적 탈보호 방법 E"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 Fmoc Gly-ClTrt 링커의 양에 의해 결정된다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. "탈보호 용액"을 트리플루오로아세트산:트리이소프로필실란:디티오트레이톨 (95:2.5:2.5 v:v:w)을 사용하여 제조하였다. 수지를 반응 용기로부터 제거하고, 바이오-라드 튜브로 옮겼다. 바이오-라드 튜브에 "탈보호 용액" (2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 진탕기에서 혼합하였다. 용액을 여과하고, 원심분리 튜브에 수집하였다. 바이오-라드 튜브에 "탈보호 용액" (2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 진탕기에서 혼합하였다. 용액을 여과하고, 원심분리 튜브에 수집하였다. 바이오-라드 튜브에 "탈보호 용액" (2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 진탕기에서 혼합하였다. 용액을 여과하고, 원심분리 튜브에 수집하였다. 원심분리 튜브 중 용액을 60분 동안 정치되도록 하였다. 이어서, 수집된 용액을 디에틸 에테르 (30 mL)로 희석하고, 침전물이 형성되었다. 침전된 고체를 3분 동안 원심분리하였다. 상청액 용액을 경사분리하고, 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 재현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 고진공 하에 건조시켰다. 조 펩티드를 백색 내지 회백색 고체로서 수득하였다.
전반적 탈보호 방법 F:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "전반적 탈보호 방법 F"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 결합된 링크 링커의 양에 의해 결정된다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. "탈보호 용액"을 트리플루오로아세트산:트리이소프로필실란:디티오트레이톨 (95:2.5:2.5 v:v:w)을 사용하여 제조하였다. 수지를 반응 용기로부터 제거하고, 6 ml 바이오-라드 튜브로 옮겼다. 바이오-라드에 "탈보호 용액" (4.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 90분 동안 진탕기에서 혼합하였다. 용액을 여과하고, 디에틸 에테르 (30 mL) 중에 희석하였다. 침전된 고체를 3분 동안 원심분리하였다. 상청액 용액을 경사분리하고, 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 재현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 디에틸 에테르 (25 mL) 중에 현탁시켰다. 현탁액을 3분 동안 원심분리하였다. 상청액을 경사분리하고, 나머지 고체를 고진공 하에 건조시켰다. 조 펩티드를 백색 내지 회백색 고체로서 수득하였다.
고리화 방법 A
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "고리화 방법 A"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 펩티드를 생성하기 위해 사용된 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 절차에 사용된 펩티드의 양의 직접 결정을 기초로 하지 않는다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 조 펩티드 고체를 아세토니트릴:수성 8M 구아니딘/50mM 트리스 (1:3) (pH 8.6) (7 mL:18 mL 또는 유사한 비율)의 용액 중에 용해시키고, 이어서 용액을, 필요한 경우에, 수성 NaOH (1.0M)를 사용하여 pH = 8.5-9.0으로 조정하였다. 이어서, 용액을 진탕기를 12 내지 18시간 동안 사용하여 혼합하였다. 반응 용액을 농축시킨 다음, 잔류물을 아세토니트릴:물 중에 용해시켰다. 이 용액을 역상 HPLC 정제에 적용하여 목적 시클릭 펩티드를 수득하였다.
고리화 방법 C:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "고리화 방법 C"의 절차는 0.100 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 펩티드를 생성하는데 사용된 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 절차에 사용된 펩티드의 양의 직접 결정을 기초로 하지 않는다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 조 펩티드 고체를 아세토니트릴:수성 0.1M 중탄산암모늄 완충제 (11 mL:24 mL 또는 유사한 비율)의 용액 중에 용해시키고, 이어서 용액을 수성 NaOH (1.0M)를 사용하여 pH = 8.5-9.0으로 조심스럽게 조정하였다. 이어서, 용액을 진탕기를 12 내지 18시간 동안 사용하여 혼합하였다. 반응 용액을 농축시킨 다음, 잔류물을 아세토니트릴:물 중에 용해시켰다. 이 용액을 역상 HPLC 정제에 적용하여 목적 시클릭 펩티드를 수득하였다.
고리화 방법 D:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "고리화 방법 D"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 펩티드를 생성하기 위해 사용된 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 절차에 사용된 펩티드의 양의 직접 결정을 기초로 하지 않는다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 조 펩티드 고체를 아세토니트릴:수성 0.1M 중탄산암모늄 완충제 (11 mL:24 mL)의 용액 중에 용해시키고, 이어서 용액을 수성 NaOH (1.0M)를 사용하여 조심스럽게 pH = 8.5-9.0으로 조정하였다. 이어서, 용액을 12 내지 18시간 동안 교반 하에 혼합하였다. 반응 용액을 농축시킨 다음, 잔류물을 아세토니트릴:물 중에 용해시켰다. 이 용액을 역상 HPLC 정제에 적용하여 목적 시클릭 펩티드를 수득하였다.
고리화 방법 E:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "고리화 방법 E"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 펩티드를 생성하기 위해 사용된 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 절차에 사용된 펩티드의 양의 직접 결정을 기초로 하지 않는다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 조 펩티드 고체를 수성 6M 구아니딘 HCl 완충제의 용액 (15 mL) 중에 용해시키고, 이어서 용액을 교반 하에 12 내지 18시간 동안 혼합하였다. 반응 용액을 농축시키고, DMSO 15 mL를 잔류물에 첨가하여 슬러리를 수득하였으며, 이를 여과하였다. 이 여과된 용액을 역상 HPLC 정제로 처리하여 목적 시클릭 펩티드를 수득하였다.
수동 커플링 절차 A:
이전 단계로부터의 수지가 들은 바이오-라드 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 5분 동안 주기적으로 진탕시킨 다음, 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 5회 세척하였다: 각 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 진탕시킨 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 전형적 아미노산 (1.2-10 당량) (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량)에 이어서 전형적 HATU (1.210 당량) (DMF 중 0.2M, 2.5 mL, 5 당량), 및 최종적으로 전형적 DIPEA (2.4- 20 당량) (DMF 중 0.8M, 1.25 mL, 10 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 60분 내지 18시간 동안 진탕시킨 다음, 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각 세척에 대해, DMF (4.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 60초 동안 진탕시킨 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다.
수지 상 N-메틸화 방법 A. (Turner, R. A.; Hauksson, N. E.; Gipe, J. H.; Lokey, R. S. Org. Lett. 2013, 15(19), 5012-5015):
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "수지 상 N-메틸화 방법 A"의 절차는 0.100 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 펩티드를 생성하기 위해 사용된 수지에 결합된 시버 링커의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 절차에 사용된 펩티드의 양의 직접 결정을 기초로 하지 않는다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다.
수지를 25 mL 프릿화 시린지로 옮겼다. 수지에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 5.0 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 진탕시킨 다음, 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 DMF (4.0 mL)로 3회 세척하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 4.0 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 진탕시킨 다음, 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 연속적으로 DMF (4.0 mL)로 3회 및 DCM (4.0 mL)으로 3회 세척하였다. 수지를 DMF (2.0 mL) 및 에틸 트리플루오로아세테이트 (0.119 ml, 1.00 mmol), 1,8-디아자비시클로[5.4.0]운데스-7-엔 (0.181 ml, 1.20 mmol) 중에 현탁시켰다. 혼합물을 진탕기에 60분 동안 두었다. 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 연속적으로 DMF (4.0 mL)로 3회 및 DCM (4.0 mL)으로 3회 세척하였다.
수지를 건조 THF (2.0 mL)로 3회 세척하여 임의의 잔류수를 제거하였다. 오븐 건조된 4.0 mL 바이알에 THF (1.0 mL) 및 건조 4 Å 분자체 (20 mg) 상의 트리페닐포스핀 (131 mg, 0.500 mmol)을 첨가하였다. 용액을 수지로 옮기고, 디이소프로필 아조디카르복실레이트 (0.097 mL, 0.5 mmol)를 천천히 첨가하였다. 수지를 15분 동안 교반하였다. 용액을 프릿을 통해 배출하고, 수지를 건조 THF (2.0 mL)로 3회 세척하여 임의의 잔류수를 제거하였다. 오븐 건조된 4.0 mL 바이알에 THF (1.0 mL), 건조 4 Å 분자체 (20 mg) 상의 트리페닐포스핀 (131 mg, 0.500 mmol)을 첨가하였다. 용액을 수지로 옮기고, 디이소프로필 아조디카르복실레이트 (0.097 mL, 0.5 mmol)를 천천히 첨가하였다. 수지를 15분 동안 교반하였다. 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 연속적으로 DMF (4.0 mL)로 3회 및 DCM (4.0 mL)으로 3회 세척하였다. 수지를 에탄올 (1.0 mL) 및 THF (1.0 mL) 중에 현탁시키고, 수소화붕소나트륨 (37.8 mg, 1.000 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 교반하고, 배출하였다. 수지를 연속적으로 DMF (4.0 mL)로 3회 및 DCM (4.0 mL)으로 3회 세척하였다.
마이크로절단 A:
< 10 mg인 작은 수지 샘플에 실온에서 2 방울의 TIS 및 1 mL의 트리플루오로아세트산을 첨가하고, 실온에서 진탕시켰다. 1시간 후에, 작은 분취물을 제거하고 0.5 mL 아세토니트릴로 희석하고, 여과하고, LC-MS에 의한 분석을 수득하였다.
실시예 0001의 제조
Figure pct00015
실시예 0001을 하기 기재된 하기 합성 순서를 사용하여 하나의 링크 아미드 수지를 제조하였다.
"심포니 방법 B: 수지-팽윤 절차",
Fmoc-글리신-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-시스틴(Trt)-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-아르기닌(Pfp)-OH: "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차",
Fmoc-N-메틸 노르류신: "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차",
Fmoc-N-메틸 노르류신: "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차",
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(이소퀴놀린-7-일)프로판산: "수동 커플링 절차 A",
Fmoc-세린(OtBu)-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-트립토판(Boc)-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-트랜스-히드록시프롤린(tBu)-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-류신-OH: "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차",
Fmoc-히스티딘-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-프롤린-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-아스파라긴-OH: "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차",
Fmoc-N-메틸-알라닌-OH: "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차",
Fmoc-티로신(OtBu)-OH: "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차",
"심포니 방법 B: 최종 캡핑 절차",
"전반적 탈보호 방법 D"
"고리화 방법 D".
조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건 하에 정제하였다: 칼럼: 워터스 엑스브리지 C18, 19 x 250 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 25분에 걸쳐 10-65% B, 이어서 B 100%에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건 하에 추가로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 250 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 25분에 걸쳐 0-50% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 1.2 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 93%이다. 분석 LCMS 조건 D: 체류 시간 = 1.32분; ESI-MS(+) m/z 961.8 (M+2H). 분석 LCMS 조건 E: 체류 시간 = 1.10분; ESI-MS(+) m/z 961.7 (M+2H). ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 962.9380(M+2H); 실측치: 962.9370(M+2H)
실시예 1254의 제조
Figure pct00016
실시예 1254를 하기 일반적 절차로 이루어진 실시예 0001의 제조에 대해 기재된 일반적 합성 순서에 따라 제조하였다: "심포니 방법 B: 수지-팽윤 절차", "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차", "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차", "수동 커플링 절차 A "심포니 방법 B: 최종 캡핑 절차", "전반적 탈보호 방법 D", 및 "고리화 방법 D". 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 워터스 엑스브리지 C18, 19 x 250 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 25분에 걸쳐 0-50% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 3.1 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 99%이다. 분석 LCMS 조건 D: 체류 시간 = 1.39분; ESI-MS(+) m/z 961.8 (M+2H). 분석 LCMS 조건 E: 체류 시간 = 1.13분; ESI-MS(+) m/z 962.5 (M+2H).
실시예 1271의 제조
Figure pct00017
실시예 1271을 하기 일반적 절차로 이루어진 실시예 0001의 제조에 대해 기재된 일반적 합성 순서에 따라 제조하였다: "심포니 방법 B: 수지-팽윤 절차", "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차", "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차", "수동 커플링 절차 A", "심포니 방법 B: 최종 캡핑 절차", "전반적 탈보호 방법 F", 및 "고리화 방법 D". 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 40-80% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 14.8 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다. 분석 LCMS 조건 H: 체류 시간 = 1.48분; ESI-MS(+) m/z 926.9 (M+2H). 분석 LCMS 조건 I: 체류 시간 = 2.96분; ESI-MS(+) m/z 926.9 (M+2H). ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 926.4354(M+2H); 실측치: 926.4331(M+2H).
실시예 1284의 제조
Figure pct00018
실시예 1284를 하기 일반적 절차로 이루어진 실시예 0001의 제조에 대해 기재된 일반적 합성 순서에 따라 제조하였다: "심포니 방법 B: 수지-팽윤 절차", "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차", "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차", "수동 커플링 절차 A", "심포니 방법 B: 최종 캡핑 절차", "전반적 탈보호 방법 F", 및 "고리화 방법 D". 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 40-80% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 0.9 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 90%이다. 분석 LCMS 조건 H: 체류 시간 = 1.53분; ESI-MS(+) m/z 934.3 (M+2H) 분석 LCMS 조건 I: 체류 시간 = 2.57분; ESI-MS(+) m/z 933.7 (M+2H) ESI-HRMS(+) m/z:계산치: 932.9330(M+2H); 실측치: 932.9313 (M+2H).
실시예 1286의 제조
Figure pct00019
실시예 1286을 하기 일반적 절차로 이루어진 실시예 0001의 제조에 대해 기재된 일반적 합성 순서에 따라 제조하였다: "심포니 방법 B: 수지-팽윤 절차", "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차", "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차", "수동 커플링 절차 A", "심포니 방법 B: 최종 캡핑 절차", "전반적 탈보호 방법 F", 및 "고리화 방법 D". 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 5-45% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 1.8 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 97%이다. 분석 LCMS 조건 H: 체류 시간 = 1.45분; ESI-MS(+) m/z 921.5 (M+2H). 분석 LCMS 조건 I: 체류 시간 = 2.59분; ESI-MS(+) m/z 921.4 (M+2H). ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 920.9330 (M+2H); 실측치: 920.9320 (M+2H).
실시예 1287의 제조
Figure pct00020
실시예 1287을 하기 일반적 절차로 이루어진 실시예 0001의 제조에 대해 기재된 일반적 합성 순서에 따라 제조하였다: "심포니 방법 B: 수지-팽윤 절차", "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차", "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차", "수동 커플링 절차 A", "심포니 방법 B: 최종 캡핑 절차", "전반적 탈보호 방법 F", 및 "고리화 방법 D". 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 45-85% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 0.7 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 81%이다. 분석 LCMS 조건 H: 체류 시간 = 1.66분; ESI-MS(+) m/z 942.7 (M+2H) 분석 LCMS 조건 I: 체류 시간 = 2.80분; ESI-MS(+) m/z 943.6 (M+2H).
실시예 1288의 제조
Figure pct00021
실시예 1288을 하기 일반적 절차로 이루어진 실시예 0001의 제조에 대해 기재된 일반적 합성 순서에 따라 제조하였다: "심포니 방법 B: 수지-팽윤 절차", "심포니 방법 B: 표준-커플링 절차", "심포니 방법 B: 2급 아민-커플링 절차", "심포니 방법 B: 통상의 아미노산-커플링 절차", "심포니 방법 B: 최종 캡핑 절차", "전반적 탈보호 방법 F", 및 "고리화 방법 D". 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 40-80% B, 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 14.0 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다. 분석 LCMS 조건 H: 체류 시간 = 1.45분; ESI-MS(+) m/z 928.2 (M+2H). 분석 LCMS 조건 I: 체류 시간 = 2.07분; ESI-MS(+) m/z 928.2 (M+2H). ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 927.9409(M+2H) 실측치: 927.9381 (M+2H).
하기 분석 프로토콜 및 합성 방법은 실시예 1001 내지 10505에 관한 것이다.
분석 LCMS 조건 A:
칼럼: 워터스 BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 물, 0.05% TFA 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.05% TFA 함유; 온도: 40℃; 구배: 2분에 걸쳐 2% B에서 98% B, 이어서 98% B에서 0.5분 유지; 유량: 0.8 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 B:
칼럼: 페노메넥스 루나 C18 2.0 X 30mm 3-μm 입자; 이동상 A: 물, 0.05% 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 아세토니트릴, 0.05% 아세트산암모늄 함유; 온도: 40℃; 구배: 2분에 걸쳐 0% B에서 100% B, 이어서 100% B에서 1분 유지; 유량: 1.0 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 C:
칼럼: 워터스 BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B, 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 D:
칼럼: 워터스 CSH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B, 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
분석 LCMS 조건 E:
칼럼: 워터스 CSH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 0.05% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 0.05% 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV.
일반적 절차:
프렐류드 방법 A:
모든 조작을 프렐류드 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스) 상에서 자동화 하에 수행하였다. 모든 절차를 언급되지 않는 한 하단 프릿이 장착된 10 mL 폴리프로필렌 튜브에서 수행하였다. 튜브를 튜브의 하단 및 상단 둘 다를 통해 프렐류드 펩티드 합성기에 연결하였다. DMF 및 DCM을 튜브의 상단을 통해 첨가할 수 있었으며, 이를 튜브의 측면으로 동등하게 세척해 내었다. 나머지 시약을 튜브의 하단을 통해 첨가하고, 프릿을 통해 통과시켜 수지를 접촉시켰다. 모든 용액을 튜브의 하단을 통해 제거하였다. "주기적 교반"은 하단 프릿을 통한 N2 기체의 짧은 펄스를 기재하며; 펄스는 대략 5초 동안 지속되고, 30초마다 발생한다. 아미노산 용액은 제조로부터 2주 이후에는 사용하지 않았다. HATU 용액은 제조 5일 이내에 사용하였다. DMF = 디메틸포름아미드; HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트; DIPEA = 디이소프로필에틸아민; 사용되는 수지는 링크 링커로 관능화되고; 100-200 메쉬, 1% DVB, 0.53 mmol/g 로딩을 갖는 메리필드 중합체 (폴리스티렌)이다. 사용되는 통상의 아미노산은 하기에 열거되어 있으며, 측쇄 보호기는 괄호 안에 제시되어 있다.
Fmoc-Asn(Trt)-OH; Fmoc-Asp(OtBu)-OH; Fmoc-Dab(Boc)-OH; Fmoc-Dap(Boc)-OH; Fmoc-Gln(Trt)-OH; Fmoc-Gly-OH; Fmoc-His(Trt)-OH; Fmoc-Hyp(tBu)-OH; Fmoc-Leu-OH; Fmoc-Lys(Boc)-OH; Fmoc-Nle-OH; Fmoc-[N-Me]Ala-OH; Fmoc-[N-Me]Nle-OH; Fmoc-Pro-OH; Fmoc-Trp(Boc)-OH; Fmoc-Tyr(tBu)-OH
"프렐류드 방법 A"의 절차는 0.050 mmol 규모로 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 초기 수지 로딩 단계에 사용된 아미노산의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 상기 기재된 링크 아미드-메리필드 수지 96 mg을 사용한다. 모든 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.050 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 1급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "단일-커플링 절차"를 사용하였다. 2급 아민 N-말단에 대한 아미노산의 커플링은 하기 기재된 "이중-커플링 절차"를 사용하였다. 펩티드의 N-말단에 대한 클로로아세트산의 커플링은 하기 상세화된 "클로로아세트산 커플링 절차"에 의해 기재되어 있다.
수지-팽윤 절차:
3회 반복: 수지가 들은 반응 용기에 DMF (1.0 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다.
단일-커플링 절차:
수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 1.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 1.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (1.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 0.5 mL, 2 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 0.5 mL, 2 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.3 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (1.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 DMF 중 아세트산 무수물의 용액 (1M, 0.8 mL)에 이어서 DIPEA (0.8M, 0.3 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (1.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
단일-커플링 절차 - 30분:
이 방법은 DIPEA의 첨가 후에 혼합물을 15분 대신 30분 동안 주기적으로 교반하는 것 외에는 "단일-커플링 절차"와 동일하다.
이중-커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 1.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 1.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (1.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 0.5 mL, 2 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 0.5 mL, 2 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.3 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (1.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 0.5 mL, 2 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 0.5 mL, 2 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.3 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (1.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 DMF (1M, 0.8 mL) 중 아세트산 무수물의 용액에 이어서 DIPEA (0.8M, 0.3 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (1.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
클로로아세트산 커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 1.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 1.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 3분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 6회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (1.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 클로로아세트산 (0.2M, 0.5 mL), HATU (0.2M, 0.5 mL, 2 당량)에 이어서 DIPEA (DMF 중 0.8M, 0.3 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, CH2Cl2 (2.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 N2 스트림 하에 8분 동안 두었다.
심포니 방법 A:
모든 절차에 대해 심포니 X 펩티드 합성기 (프로테인 테크놀로지스)를 프렐류드 펩티드 합성기 대신 사용하고, 모든 시약을 반응 용기의 상단을 통해 첨가하였다. 심포니 X 합성기는 1.0 mmol 또는 그 초과의 규모의 반응을 수행한다. 그러므로, 하기 절차는 1.0 mmol 규모 상의 합성을 기재한다.
수지-팽윤 절차:
3회 반복: 수지가 들은 반응 용기에 DMF (2.0 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다.
단일-커플링 절차:
수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (2.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.0 mL, 2 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.0 mL, 2 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.4M, 1.0 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (2.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물의 용액 (2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
단일-커플링 절차 - 30분:
이 방법은 DIPEA의 첨가 후에 혼합물을 15분 대신 30분 동안 주기적으로 교반하는 것 외에는 "단일-커플링 절차"와 동일하다.
이중-커플링 절차:
수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (2.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.0 mL, 2 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.0 mL, 2 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.4M, 1.0 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 2회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.0 mL)를 용기의 상부을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아미노산 (DMF 중 0.2M, 1.0 mL, 2 당량)에 이어서 HATU (DMF 중 0.2M, 1.0 mL, 2 당량), 및 최종적으로 DIPEA (DMF 중 0.4M, 1.0 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 반응 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (2.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 아세트산 무수물의 용액 (2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.0 mL)를 용기의 상단을 통해 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 직접 후속 단계에 사용하였다.
클로로아세틸 클로라이드 커플링 절차:
이전 단계로부터의 수지가 들은 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 피페리딘:DMF (20:80 v/v, 2.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 4분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, 반응 용기의 상단을 통해 DMF (2.0 mL)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 30초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 반응 용기에 클로로아세트산 (0.2M, 1.0 mL), HATU (0.2M, 1.0 mL, 2 당량)에 이어서 DIPEA (DMF 중 0.4M, 1.0 mL, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 주기적으로 교반하고 이어서 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 3회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, DMF (2.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 수지를 하기와 같이 연속적으로 4회 세척하였다: 각각의 세척에 대해, CH2Cl2 (2.0 mL)를 용기의 상단에 첨가하고, 생성된 혼합물을 90초 동안 주기적으로 교반한 후에 용액을 프릿을 통해 배출하였다. 생성된 수지를 N2 스트림 하에 5분 동안 두었다.
전반적 탈보호 방법 A:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "전반적 탈보호 방법 A"의 절차는 0.050 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 수지에 이론적으로 결합된 초기 로딩된 아미노산의 규모에 의해 결정된다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.050 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. "탈보호 용액"을 40 mL 유리 바이알 중에서 트리플루오로아세트산 (22 mL), 물 (1.25 mL), DTT (250 mg) 및 트리이소프로필실란 (0.5 mL)을 합함으로써 제조했다. 수지를 반응 용기로부터 제거하고, 4 mL 유리 바이알로 옮겼다. 바이알에 수지에 이어서 "탈보호 용액" (1.0 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 진탕기에서 격렬히 혼합하였다 (40분 동안 대략 500 RPM). 혼합물을 0.2 마이크로미터 시린지 필터를 통해 여과하고, 고체를 TFA (1.0 mL)으로 추출하였다. 합한 여과물을 충전한 24 mL 시험 튜브에 Et2O (15 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 격렬히 혼합하였으며, 이 때 상당한 양의 백색 고체가 침전하였다. 혼합물을 5분 동안 원심분리한 다음, 용액을 고체로부터 경사분리하고, 폐기하였다. 고체를 Et2O (20 mL) 중에 현탁시키고; 혼합물을 5분 동안 원심분리하고; 용액을 고체로부터 경사분리하고, 폐기하여 조 펩티드를 백색 내지 회백색 고체로서 수득하였다.
고리화 방법 A:
모든 조작을 달리 언급되지 않는 한 수동으로 수행하였다. "고리화 방법 A"의 절차는 0.050 mmol 규모 상에서 수행된 실험을 기재하며, 여기서 규모는 펩티드를 생성하기 위해 사용된 수지에 이론적으로 결합된 초기 사용된 아미노산의 양에 의해 결정된다. 이 규모는 절차에 사용된 펩티드의 양의 직접 결정을 기초로 하지 않는다. 절차는 기재된 부피를 규모의 배수로 조정함으로써 0.100 mmol 넘는 규모로 규모화될 수 있다. 조 펩티드 고체를 MeCN : 수성 0.2M 중탄산암모늄 (1:1) 중에 총 부피 18-22 mL로 용해시켰다. 표적 pH는 8.5-9.0이다. 이어서, 용액을 12-18시간 동안 교반하지 않고 정치되도록 하였다. 반응 용액을 가열 없이 밤새 원심 농축을 통해 수집하고 이어서, 잔류물을 DMSO:MeOH (1 mL:1 mL) 중에 용해시켰다. 이 용액을 역상 HPLC 정제에 적용하여 목적 시클릭 펩티드를 수득하였다.
일반적 합성 순서 A:
"일반적 합성 순서 A"는 본원에 기재된 시클릭 펩티드를 수득하는데 사용된 절차의 일반적 순서를 기재한다. 이러한 일반적 절차의 목적을 위해, "심포니 방법 A"의 절차는 "프렐류드 방법 A"의 절차와 상호교환가능하다. 10 mL 폴리프로필렌 고체-상 반응 용기에 링크-메리필드 수지 (96 mg)를 첨가하고, 반응 용기를 프렐류드 펩티드 합성기 상에 두었다. 이어서 아미노산 커플링의 시리즈를 수지-결합된 펩티드의 N-말단이 1급 아민인 경우에 "프렐류드 방법 A: 단일-커플링 절차", 수지-결합된 펩티드의 N-말단이 2급 아민인 경우에 "프렐류드 방법 A: 이중-커플링 절차"에 따라 프렐류드 상에서, 또는 커플링된 AA가 AA10 위치에 혼입되는 경우에 "단일-커플링 절차 - 30분"으로 순차적으로 수행하였다. "프렐류드 방법 A: 클로로아세틸 클로라이드 커플링 절차"에 따르고; 이어서 "전반적 탈보호 방법 A"에 따르고; 이어서 "고리화 방법 A"에 따랐다.
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로판산의 제조
반응식:
Figure pct00022
단계 1:
DMF (82 ml) 중 1H-인다졸-3-카르브알데히드 (3 g, 20.53 mmol) 및 탄산세슘 (7.36 g, 22.58 mmol)의 0℃ 용액에 tert-부틸 2-브로모아세테이트 (3.29 ml, 22.58 mmol)를 첨가하고 빙조를 제거하여 실온으로 가온되도록 하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 물 (500 mL)에 붓고, Et2O (200 mL)를 첨가하였다. 생성물을 Et2O 층으로 추출하였다. 이들 층을 분리하고, 수성 상을 Et2O (100 mL)로 2회 추출하였다. 합한 Et2O 층을 물에 이어서 염수로 2 x 세척하였다. 유기 층을 수집하여 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에 농축시켰다. 조 물질을 플래쉬 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 0-30% EtOAc/헥산의 구배를 사용하여 정제하였다. 생성물 분획을 수집하고, 용매를 진공 하에 제거하여 tert-부틸 2-(3-포르밀-1H-인다졸-1-일)아세테이트, 5.23 (98%)을 수득하였다. ESI-MS(+) m/z 205.1 (M+1-tBu). 1H NMR (400MHz, 클로로포름-d) δ 10.28 (s, 1H), 8.35 (d, J=8.1 Hz, 1H), 7.56 - 7.49 (m, 1H), 7.45 - 7.36 (m, 2H), 5.18 (s, 2H), 1.48 (s, 9H).
단계 2:
(±)-메틸 2-벤질옥시카르보닐아미노-2-(디메톡시포스피닐)아세테이트 (7.32 g, 22.10 mmol)를 CH2Cl2 (50 mL) 중에 용해시키고 질소 하에 교반하였다. 이 용액에 DBU (3.33 mL, 22.10 mmol)를 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 교반하고, 이어서 CH2Cl2 (50 mL) 중 tert-부틸 2-(3-포르밀-1H-인다졸-1-일)아세테이트 (5.23 g, 20.09 mmol)의 용액을 15-20분에 걸쳐 적가하였다. 실온에서 16시간 동안 교반을 계속하였다. 반응 혼합물을 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 EtOAc로 희석하고, 5% 수성 시트르산에 이어서 염수로 세척하고 이어서 무수 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고 증발시켰다. 조 물질을 플래쉬 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 0-50% EtOAc/헥산의 구배를 사용하여 정제하였다. 생성물 분획을 수집하고, 용매를 진공 하에 제거하여 메틸 (E)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)아크릴레이트, 7.4 g (79%)을 수득하였다. ESI-MS(+) m/z 466.0 (M+1). 1H NMR (400MHz, 클로로포름-d) δ 9.21 (s, 1H), 7.82 (d, J=8.3 Hz, 1H), 7.52 - 7.23 (m, 8H), 6.90 (s, 1H), 5.23 (s, 2H), 5.08 (s, 2H), 3.86 (s, 3H), 1.44 (s, 9H)
단계 3:
(Z)-메틸 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)아크릴레이트 (7.4 g, 15.90 mmol)를 파르 병에서 MeOH (80 mL) 및 벤젠 (80 mL)중에 용해시켰다. N2 기체를 15분 동안 용액을 통해 버블링하고 이어서 (+)-1,2-비스((2S,5S)-2,5-디에틸포스폴라노)벤젠(시클로옥타디엔)로듐(I) 트리플루오로메탄술포네이트 (0.115 g, 0.159 mmol)를 첨가하고 수소 분위기 (60 psi) 하에 3일 동안 두었다. 반응물을 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하고, 진공 하에 농축시켰다. 조 물질을 플래쉬 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 0-50% EtOAc/헥산의 구배를 사용하여 정제하였다. 생성물 분획을 수집하고, 용매를 진공 하에 제거하여 메틸 (S)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로파노에이트, 7.43 g, (100%)을 수득하였다. ESI-MS(+) m/z 468.0 (M+1). 1H NMR (400MHz, 클로로포름-d) δ 7.64 (d, J=8.1 Hz, 1H), 7.44 - 7.26 (m, 7H), 7.15 (t, J=7.5 Hz, 1H), 5.87 (d, J=7.8 Hz, 1H), 5.13 (s, 2H), 4.99 (s, 2H), 4.90 - 4.80 (m, 1H), 3.66 (s, 3H), 3.63 - 3.55 (m, 1H), 3.46 (dd, J=14.8, 4.8 Hz, 1H), 1.42 (s, 9H).
단계 4:
물 (39.7 ml) 중 수산화리튬 (1.142 g, 47.7 mmol)의 용액을 THF (39.7 ml) 중 (S)-메틸 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로파노에이트 (7.43 g, 15.89 mmol)의 용액에 첨가하였다. 반응물을 실온에서 30분 동안 교반하였다. EtOAc을 반응에 첨가하고, 1 N HCl을 사용하여 pH를 산성으로 만들었다. 유기 상을 수집하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 물질을 플래쉬 크로마토그래피에 의해 0.1% AcOH을 포함하는 0-10% MeOH/DCM을 사용하여 정제하였다. 생성물 분획을 수집하고, 용매를 진공 하에 제거하여 (S)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로판산, 3.9 g (54%)을 수득하였다. ESI-MS(+) m/z 454.0 (M+1). 1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ 12.73 (br. s., 1H), 7.77 (d, J=8.3 Hz, 1H), 7.56 - 7.50 (m, 2H), 7.40 - 7.24 (m, 5H), 7.14 - 7.08 (m, 1H), 5.15 (s, 2H), 5.00 - 4.89 (m, 2H), 4.42 (td, J=8.6, 5.1 Hz, 1H), 3.39 - 3.24 (m, 2H), 1.37 (s, 9H).
단계 5:
(S)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로판산 (3.88 g, 8.56 mmol)을 MeOH (80 ml)/벤젠 (20 mL) 중에 용해시키고, N2의 분위기 하에 두었다. Pd-C (0.455 g, 0.428 mmol)를 용액에 격렬한 교반 하에 첨가하였다. 반응물을 H2 기체의 분위기 하에 두고, 16시간 동안 교반하였다. 반응물을 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하고, 진공 하에 농축시켜 (S)-2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로판산, 2.74 g (100%)을 수득하였으며, 이를 단계 6에 그대로 사용하였다. ESI-MS(+) m/z 320.1 (M+H). 1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ 7.78 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.54 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.38 (ddd, J=8.3, 7.0, 1.0 Hz, 1H), 7.13 (t, J=7.2 Hz, 1H), 5.23 - 5.10 (m, 2H), 3.58 (dd, J=9.0, 4.0 Hz, 1H), 3.49 (dd, J=15.6, 4.0 Hz, 1H), 3.28 (br. s., 2H), 3.17 (dd, J=15.7, 8.9 Hz, 1H), 1.41 (s, 9H).
단계 6:
(S)-2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로판산 (2.74 g, 8.58 mmol)을 THF (34.3 ml) 중에 용해시키고, 이어서 물 (34.3 ml)을 첨가하였다. 이어서, 중탄산나트륨 (1.442 g, 17.16 mmol)을 첨가하고, 이어서 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (2.89 g, 8.58 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 대부분의 THF을 진공 하에 제거한 다음, EtOAc을 첨가하였다. 혼합물을 1 N HCl을 사용하여 pH7로 산성화시키고 EtOAc로 추출하였다. 유기 층을 수집하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켜 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로판산 (4.9 g, 105%)을 수득하였으며, 이를 그대로 사용하였다. ESI-MS(+) m/z 542.1 (M+H). 1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ 7.87 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.82 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.70 (d, J=8.3 Hz, 1H), 7.64 (t, J=8.2 Hz, 2H), 7.52 (d, J=8.3 Hz, 1H), 7.43 - 7.34 (m, 3H), 7.32 - 7.23 (m, 2H), 7.10 (t, J=7.4 Hz, 1H), 5.15 (s, 2H), 4.42 (td, J=8.8, 5.0 Hz, 1H), 4.20 - 4.11 (m, 3H), 3.42 - 3.25 (m, 2H), 1.36 (s, 9H).
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)프로판산의 제조
Figure pct00023
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)프로판산을 하기 변형을 사용하여 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-3-일)프로판산와 동일한 방법에 의해 제조하였다: 단계 1의 1H-인다졸-3-카르브알데히드 대신 1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-카르브알데히드를 출발 물질로 사용하였다. 단계 4의 메틸 에스테르의 가수분해를 실온에서 30분 동안 대신 0℃에서 20분 동안 수행하였다. ESI-MS(+) m/z 542.2 (M+H). 1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ 8.34 (dd, J=4.8, 1.3 Hz, 1H), 8.23 (d, J=7.5 Hz, 1H), 7.89 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.81 (dd, J=8.5, 1.3 Hz, 1H), 7.65 (t, J=8.4 Hz, 2H), 7.46 (s, 1H), 7.44 - 7.37 (m, 2H), 7.29 (dtd, J=10.9, 7.4, 0.9 Hz, 2H), 7.19 (dd, J=8.3, 4.5 Hz, 1H), 5.06 - 4.92 (m, 2H), 4.37 - 4.30 (m, 1H), 4.23 - 4.14 (m, 3H), 3.28 (dd, J=14.7, 4.1 Hz, 1H), 3.09 (dd, J=14.6, 9.0 Hz, 1H), 1.38 (s, 9H).
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5-메톡시-1H-인돌-3-일)프로판산의 제조
반응식:
Figure pct00024
단계 1:
DMF (34.2 ml) 중 5-메톡시-1H-인돌-3-카르브알데히드 (1.5 g, 8.56 mmol) 및 탄산세슘 (3.07 g, 9.42 mmol)의 0℃ 용액에 tert-부틸 2-브로모아세테이트 (1.373 ml, 9.42 mmol)를 첨가하고 빙조를 제거하여 실온으로 가온되도록 하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 물에 붓고, Et2O를 첨가하였다. 생성물을 Et2O 층으로 추출하였다. 이들 층을 분리하고, 수성 상을 Et2O로 2회 추출하였다. 합한 Et2O 층을 물에 이어서 염수로 2회 세척하였다. 유기 층을 수집하여 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에 농축시켜 tert-부틸 2-(3-포르밀-5-메톡시-1H-인돌-1-일)아세테이트, 2.1g (85%)을 수득하고, 이를 후속 단계에 그대로 사용하였다. ESI-MS(+) m/z 290.1 (M+H).
단계 2:
벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (1.55 g, (3.8 mmol)를 DCM (11.52 mL) 중에 용해시키고 질소 하에 교반하였다. 이 용액에 DBU (0.573 mL, 3.80 mmol)를 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 교반하고 이어서 DCM (11.52 mL) 중 tert-부틸 2-(3-포르밀-5-메톡시-1H-인돌-1-일)아세테이트 (1.0g, 3.46 mmol)의 용액을 15-20분에 걸쳐 적가하였다. 실온에서 16시간 동안 계속하였다. 반응 혼합물을 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 EtOAc로 희석하고, 5% 수성 시트르산에 이어서 염수로 세척하고 무수 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 증발시켰다. 조 물질을 플래쉬 크로마토그래피에 의해 20-70% EtOAc/헥산의 구배를 사용하여 정제하였다. 생성물 분획을 수집하고, 용매를 진공 하에 제거하여 벤질 (E)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5-메톡시-1H-인돌-3-일)아크릴레이트, 1.6 g, 80%를 수득하였다. ESI-MS(+) m/z 571.2 (M+H).
단계 3:
(Z)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5-메톡시-1H-인돌-3-일)아크릴레이트 (700 mg, 1.227 mmol)를 MeOH (12 ml) 중에 용해시키고 (+)-1,2-비스((2S,5S)-2,5-디에틸포스폴라노)벤젠(시클로옥타디엔)로듐(I) 트리플루오로메탄술포네이트 (8.86 mg, 0.012 mmol)로 처리하고, 수소 분위기 (60 psi) 하에 3일 동안 두었다. 반응물을 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하고 진공 하에 농축시켜 벤질 (S)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5-메톡시-1H-인돌-3-일)프로파노에이트, 702 mg (100%)을 수득하였으며, 이를 후속 단계에 그대로 사용하였다. ESI-MS(+) m/z 573.2 (M+H). 1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ 7.87 (d, J=7.8 Hz, 1H), 7.38 - 7.13 (m, 11H), 7.10 - 7.02 (m, 2H), 6.77 (dd, J=8.8, 2.3 Hz, 1H), 5.13 - 5.04 (m, 2H), 5.04 - 4.94 (m, 2H), 4.86 (s, 2H), 4.32 (td, J=8.3, 5.8 Hz, 1H), 3.72 (s, 3H), 1.39 (s, 9H).
단계 4:
(S)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5-메톡시-1H-인돌-3-일)프로파노에이트 (700 mg, 1.222 mmol)를 MeOH (12 ml) 중에 용해시키고, N2의 분위기 하에 두었다. Pd-C (65.0 mg, 0.061 mmol)를 격렬한 교반 하에 용액에 첨가하였다. 반응물을 H2의 분위기 하에 두고, 16시간 동안 교반하였다. 반응물을 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하고, 진공 하에 농축시켜 (S)-2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5-메톡시-1H-인돌-3-일)프로판산, 426 mg (100%)을 수득하였으며, 이를 단계 5에 그대로 사용하였다. ESI-MS(+) m/z 349.1 (M+H).
단계 5:
(S)-2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5-메톡시-1H-인돌-3-일)프로판산 (426 mg, 1.223 mmol)을 THF (5 ml) 중에 용해시키고, 이어서 물 (5.00 ml)을 첨가하였다. 이어서, 중탄산나트륨 (205 mg, 2.446 mmol)을 첨가하고, 이어서 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (412 mg, 1.223 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 대부분의 THF을 진공 하에 제거한 다음, Et2O를 첨가하였다. 유기 층을 버리고, 수성 층을 다시 Et2O로 세척하였다. 수성 상을 수집하고, 1 N HCl로 산성화시키고, EtOAc로 추출하였다. 유기 층을 수집하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켜 조 생성물을 수득하였으며, 이를 추가로 정제하지 않았다. LC/MS 및 NMR 확인을 수득하였다. ESI-MS(+) m/z 571.1 (M+H). 1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ 12.71 (br. s., 1H), 7.88 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.72 (d, J=8.3 Hz, 1H), 7.66 (t, J=8.3 Hz, 2H), 7.40 (td, J=7.1, 4.1 Hz, 2H), 7.33 - 7.23 (m, 2H), 7.17 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.13 - 7.08 (m, 2H), 6.76 (dd, J=8.8, 2.3 Hz, 1H), 4.85 (s, 2H), 4.24 - 4.14 (m, 3H), 3.76 (s, 3H), 3.14 (dd, J=14.4, 4.4 Hz, 1H), 2.99 (dd, J=14.8, 9.8 Hz, 1H), 1.38 (s, 9H).
2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)프로판산의 제조
반응식:
Figure pct00025
단계 1:
DMF (41.1 ml) 중 1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르브알데히드 (1.5 g, 10.26 mmol) 및 탄산세슘 (3.68 g, 11.29 mmol)의 0℃ 용액에 tert-부틸 2-브로모아세테이트 (1.646 ml, 11.29 mmol)를 첨가하고 빙조를 제거하여 실온으로 가온되도록 하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 물에 붓고, Et2O를 첨가하였다. 생성물을 Et2O 층으로 추출하였다. 이들 층을 분리하고, 수성 상을 Et2O로 2회 추출하였다. 합한 Et2O 층을 물에 이어서 염수로 2 x 세척하였다. 유기 층을 수집하여 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에 농축시켜 tert-부틸 2-(3-포르밀-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)아세테이트, 2.3 g (86%)를 수득하였고, 이를 후속 단계에 그대로 사용하였다. ESI-MS(+) m/z 205.1 (M+1-tBu). 1H NMR (400MHz, 클로로포름-d) δ 10.02 (s, 1H), 8.58 (dd, J=7.8, 1.5 Hz, 1H), 8.42 (dd, J=4.8, 1.5 Hz, 1H), 7.95 (s, 1H), 7.31 - 7.28 (m, 1H), 5.05 (s, 2H), 1.49 (s, 9H).
단계 2:
벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (2.348 g, 5.76 mmol)를 DCM (12 mL) 중에 용해시키고 질소 하에 교반하였다. 이 용액에 DBU (0.637 ml, 4.23 mmol)를 첨가하고, 혼합물을 10분 동안 교반하고 이어서 DCM (12 mL) 중 tert-부틸 2-(3-포르밀-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)아세테이트 (1 g, 3.84 mmol)의 용액을 적가하였다. 실온에서 16시간 동안 교반을 계속하였다. 반응 혼합물을 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 EtOAc로 희석하고, 5% 수성 시트르산, 및 염수로 세척하고 무수 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 증발시켰다. 조 물질을 플래쉬 크로마토그래피에 의해 0-10% MeOH/DCM의 구배를 사용하여 정제하였다. 생성물 분획을 수집하고, 용매를 진공 하에 제거하여 벤질 (E)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)아크릴레이트, 1.54 g (74%)을 수득하였다.
2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-3-일)프로판산의 제조
반응식:
Figure pct00026
단계 1:
DMF (26.0 ml) 중 1H-피롤로[3,2-c]피리딘-3-카르브알데히드 (0.95 g, 6.50 mmol) 및 탄산세슘 (2.330 g, 7.15 mmol)의 0℃ 용액에 tert-부틸 2-브로모아세테이트 (1.042 ml, 7.15 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 빙조를 제거하여 실온으로 가온되도록 하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 빙수 (100 mL) 및 EtOAc (50 mL) 혼합물에 부었다. 생성물을 EtOAc로 추출하였다. 층을 분리하고, 수성 상을 EtOAc (2x 50 mL)로 2회 추출하였다. 합한 EtOAc 층을 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 tert-부틸 2-(3-포르밀-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-1-일)아세테이트 1.24 g (73%)을 깨끗한 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(-): MS m/z 259.1.
단계 2:
(±)-메틸 2-벤질옥시카르보닐아미노-2-(디메톡시포스피닐)아세테이트 (1.596 g, 4.82 mmol)를 15 mL DCM 중에 용해시키고, 질소 하에 0℃에서 5분 동안 교반하였다. 이 용액에 DBU (0.726 ml, 4.82 mmol)를 첨가하고, 이어서 DCM (15mL) 용액 중 tert-부틸 2-(3-포르밀-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-1-일)아세테이트 (1.14 g, 4.38 mmol)를 10분 동안 적가하였다. 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 EtOAc로 희석하고, 5% 수성 시트르산 용액에 이어서 염수로 세척한 다음, 유기 층을 수집하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 (E)-메틸 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-3-일)아크릴레이트 1.0 g (49%)을 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 466.0.
단계 3:
메탄올 (20 mL) 중 (E)-메틸 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-3-일)아크릴레이트 (1.0 g, 2.15 mmol) 용액에 Pd/C (0.5 g)를 첨가하였다. 반응을 55 psi에서 2일 동안 수행하였다. Pd/C를 여과하고, 메탄올 및 DCM으로 세척하였다. 용매를 농축시켜 메틸 2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-3-일)프로파노에이트 0.54 g (75%)을 조 생성물로서 수득하였으며, 이를 후속 단계에 직접 사용하였다. ESI-MS(+): MS m/z 334.1.
단계 4 및 5:
THF/H2O (1:1, 10 mL) 중 메틸 2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-3-일)프로파노에이트 (0.54 g, 1.62 mmol) 용액에 LiOH (116 mg, 4.86 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 9분 동안 교반하였다. 혼합물을 1 N HCl 용액을 첨가하여 PH=7로 조정하였다. 이어서, 중탄산나트륨 (408 mg, 4.86 mmol) 및 FMOC-OSU (546 mg, 1.620 mmol)를 혼합물에 첨가하였다. 생성된 혼합물을 2시간 동안 교반하였다. 5% 시트르산을 첨가하여 PH=7로 조절하고, 수층을 에틸 아세테이트로 추출하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-c]피리딘-3-일)프로판산 250 mg (28.5%)을 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 542.2. 1H NMR (메탄올-d4) δ 9.17 (s, 1H), 8.28 (d, J=6.3 Hz, 1H), 7.82 (t, J=6.8 Hz, 3H), 7.58 (d, J=7.3 Hz, 1H), 7.62 (d, J=7.3 Hz, 1H), 7.21-7.49 (m, 6H), 7.11-7.19 (m, 1H), 4.98-5.13 (m, 2H), 4.20-4.43 (m, 3H), 4.08-4.20 (m, 1H), 3.47-3.45 (m, 2H), 1.35-1.54 (s, 9H)
2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(7-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)프로판산의 제조
반응식:
Figure pct00027
단계 1:
7H-피롤로[2,3-d]피리미딘 (6 g, 50.4 mmol) 및 헥사메틸아민테트라민 (10.59 g, 76 mmol)에 질소 하에 아세트산 (20.00 mL) 및 물 (40 mL)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 환류 하에 가열하고, 8시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 다음 고체를 여과하였다. 고체를 에테르로 3회 세척하였다. 고체를 건조시켜 7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-카르브알데히드 5.6 g (76%)을 목적 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 148.1. 1H NMR (메탄올-d4) δ: 10.00 (s, 1H), 9.43 (s, 1H), 8.91 (s, 1H), 8.40 (s, 1H).
단계 2:
DMF (147 ml) 중 7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-카르브알데히드 (5.41 g, 36.8 mmol) 및 탄산세슘 (13.18 g, 40.4 mmol)의 0℃ 용액에 tert-부틸 2-브로모아세테이트 (5.90 ml, 40.4 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 빙조를 제거하여 실온으로 가온되도록 하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 빙수 (500 mL) 및 EtOAc (300 mL) 혼합물에 부었다. 생성물을 EtOAc로 추출하였다. 층을 분리하고, 수성 상을 EtOAc (2x 150 mL)로 2회 추출하였다. 합한 EtOAc 층을 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 tert-부틸 2-(5-포르밀-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-7-일)아세테이트 6.60 g (69%)을 깨끗한 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(-): MS m/z 262.0.
단계 3:
(±)-메틸 2-벤질옥시카르보닐아미노-2-(디메톡시포스피닐)아세테이트 (9.07 g, 27.4 mmol)를 70 mL DCM 중에 용해시키고, 질소 하에 0℃에서 5분 동안 교반하였다. 이 용액에 DBU (4.17 ml, 27.4 mmol)를 첨가하고, 이어서 DCM (50mL) 중 tert-부틸 2-(5-포르밀-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-7-일)아세테이트 (6.50 g, 24.88 mmol) 용액을 10분 동안 적가하였다. 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 EtOAc로 희석하고 5% 수성 시트르산/1 N NaOH PH=4 용액에 이어서 염수로 세척하고, 유기 층을 수집하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 (E)-메틸 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(7-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)아크릴레이트 11.55 g (100%)을 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 467.0.
단계 4:
메탄올 (40 mL) 중 (E)-메틸 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(7-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)아크릴레이트 (5.3 g, 11.36 mmol)용액에 Pd/C (1.2 g)를 첨가하였다. 반응을 55 psi에서 2일 동안 수행하였다. Pd/C를 여과하고, 메탄올 및 DCM으로 세척하였다. 용매를 농축시켜 메틸 2-아미노-3-(7-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)프로파노에이트 3.0 g (79%)을 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 335.1.
단계 5 및 6:
THF/H2O (1:1, 40 mL) 중 메틸 메틸 2-아미노-3-(7-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)프로파노에이트 (2.8 g, 8.37 mmol) 용액에 LiOH (0.60 g, 25.1 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 8분 동안 교반하였다. 혼합물을 1 N HCl 용액을 첨가하여 PH=7로 조정하였다. 이어서, 중탄산나트륨 (2.11 g, 25.1 mmol) 및 FMOC-OSU (2.82 g, 8.37 mmol)를 혼합물에 첨가하였다. 생성된 혼합물을 2시간 동안 교반하였다. 5% 시트르산을 첨가하여 PH=7로 조절하고, 수층을 에틸 아세테이트로 추출하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(7-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)프로판산 1.2 g (26.4%)을 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 543.1. 1H NMR (메탄올-d4) δ: 8.75 (s, 1H), 7.79 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.60 (t, J=7.4 Hz, 1H), 7.20-7.45 (m, 7H), 4.95 (s, 2H), 4.57 (d, J=8.3 Hz, 1H), 4.23-4.38 (m, 2H), 3.36-3.46 (m, 1H), 2.70 (s, 2H), 2.34 (s, 2H), 1.35-1.50 (s, 9H)
벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}프로프-2-에노에이트의 제조
Figure pct00028
아세토니트릴 (20 mL) 중 (S)-벤질 2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)-3-히드록시프로파노에이트 (5.0 g, 17 mmol) 및 디-tert-부틸 디카르보네이트 (9.6 g, 44 mmol)의 용액에 실온에서 DMAP (0.21 g, 1.7 mmol)를 첨가하였다. 용액을 18시간 동안 교반한 다음, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디에틸 에테르 중에 용해시키고, 수성 1M 황산수소칼륨 (2X), 수성 포화 중탄산나트륨, 염수로 순차적으로 세척한 다음, MgSO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 최종 생성물 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}프로프-2-에노에이트 (6.0 g, 16mmol, 94% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 클로로포름-d) δ 7.41 - 7.37 (m, 4H), 7.35 - 7.31 (m, 1H), 6.45 - 6.34 (m, 1H), 5.70 (s, 1H), 5.26 (s, 2H), 1.43 (s, 18H).
2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)프로판산의 제조
반응식:
Figure pct00029
단계 1:
아자인돌 (2.0 g, 16.93 mmol)을 건조 디클로로메탄 (85 mL) 중 염화알루미늄 (11.29 g, 85 mmol)에 아르곤 분위기 하에 0℃에서 첨가하였다. 0℃에서 30분 후, 혼합물을 실온으로 가온하고, 에틸 클로로옥소아세테이트 (11.56 g, 85 mmol)를 적가하였다. 반응 혼합물을 밤새 격렬히 교반하고 이어서 조심스럽게 얼음을 첨가하였다. 4 N NaOH에 이어서 차가운 포화 NaHCO3 용액으로 pH를 7로 조정하였다. 생성물을 DCM으로 3회 추출하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 농축시켜 에틸 2-옥소-2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세테이트를 황색 유성 잔류물로서 수득하였다. 차가운 석유 에테르로 세척한 후에 표제 화합물을 담황색 분말 280 mg (7.6%)으로서 수득하였다. ESI-MS(-): MS m/z 217.1.
단계 2:
TFA (2 mL) 및 트리에틸실란 (0.4 mL)의 혼합물에 에틸 2-옥소-2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세테이트 (280 mg, 1.28 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 55℃에서 16시간 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 용매를 제거하고, 포화 NaHCO3을 첨가하고, 이어서 DCM을 첨가하였다. 유기 층을 수집하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 농축시켜 에틸 2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세테이트를 조 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(-): MS m/z 203.1.
단계 3:
단계 2 조 물질 에틸 2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세테이트 및 LiOH (165 mg, 6.90 mmol)를 THF/H2O (5 mL, 1:1) 중에서 1시간 동안 실온에서 교반하였다. 1 M HCl를 0℃에서 첨가하여 PH를 5로 조절하였다. 용매를 제거하고, 잔류물을 메탄올로 세척하고, 여과하고, 유기 층을 건조시키고, 농축시켜 2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세트산을 조 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 177.1.
단계 4:
DCM (7.0 mL) 및 tert-부틸 아세테이트 (3.0 mL) 중 2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세트산 (375 mg, 2.129 mmol)의 용액에 과염소산 (0.274 mL, 3.19 mmol)을 적가하였다. 생성된 용액을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 담갈색 고체를 여과하고 DCM으로 세척하였다. DCM 층을 농축시켰다. 이어서, 물 및 EtOAc을 첨가하였다. EtOAc을 사용하여 생성물을 2회 추출하였다. 유기 층을 포화 NaHCO3로 2회 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 농축시켜 tert-부틸 2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세테이트 100 mg (20%)을 생성물로서 수득하였다. 물질을 직접 후속 단계 반응에 사용하였다. ESI-MS(-): MS m/z 231.1.
단계 5:
탄산칼륨 (357 mg, 2.58 mmol)을 아세토니트릴 (5 mL) 중 tert-부틸 2-(1H-피롤로[3,2-b]피리딘-3-일)아세테이트 (100 mg, 0.431 mmol) 및 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}프로프-2-에노에이트 (162 mg, 0.431 mmol)의 용액에 첨가하였다. 반응 혼합물을 50℃로 밤새 가열하였다. 반응물을 EtOAc 및 물로 희석하였다. 유기 층을 염수로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일}프로파노에이트를 백색 고체 (100 mg, 38%)로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 610.3.
단계 6:
MeOH (5 mL) 중 단계 5로부터의 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일}프로파노에이트 (100 mg, 0.164 mmol) 및 Pd-C (4.36 mg, 4.10 μmol)의 용액을 통해 실온에서 6시간 동안 H2를 천천히 버블링하였다. 반응 혼합물을 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하고, 증발시켜 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일}프로판산 (80 mg, 94%)을 수득하였으며, 이를 후속 단계에 정제 없이 사용하였다. ESI-MS(+): MS m/z 520.4.
단계 7:
디옥산 중 4M HCl (2 mL)을 단계 6으로부터의 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일}프로판산에 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 교반한 후에 농축시켜 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)프로판산을 조 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 320.1.
단계 8:
중탄산나트륨 (67.1 mg, 0.8 mmol) 및 FMOC-OSU (53.9 mg, 0.160 mmol)를 THF/물 (4 mL, 1:1) 용액 중 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)프로판산 (51 mg, 0.16 mmol)에 첨가하였다. 생성된 혼합물을 2시간 동안 교반하였다. 5% 시트르산을 첨가하여 PH=7로 조절하고, 수층을 에틸 아세테이트로 추출하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)프로판산 10.7 mg (12%)을 생성물로서 수득하였다. ESI-MS(+): MS m/z 542.2.
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산 및 (R)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산의 제조
Figure pct00030
단계 1:
DCM (25 mL) 및 THF (2 mL) 중 2-(1H-인돌-3-일)아세트산 (500 mg, 2.85 mmol)의 용액에 tert-부틸 2,2,2-트리클로로아세트이미데이트 (2.041 mL, 11.42 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응 휘발성 물질을 증발시키고, 조 물질을 실리카 겔 (40 g 칼럼, 5-50% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 tert-부틸 2-(1H-인돌-3-일)아세테이트 (200 mg, 0.865 mmol, 30.3% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 7.55 (dt, J=8.0, 1.0 Hz, 1H), 7.36 (dt, J=8.2, 0.8 Hz, 1H), 7.15 (s, 1H), 7.12 (td, J=7.6, 1.1 Hz, 1H), 7.05 - 7.01 (m, 1H), 3.67 (d, J=0.8 Hz, 2H), 1.46 (s, 9H).
단계 2:
아세토니트릴 (15 mL) 중 tert-부틸 2-(1H-인돌-3-일)아세테이트 (0.57 g, 2.5 mmol) 및 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}프로프-2-에노에이트 (0.85 g, 2.2 mmol)의 용액에 탄산칼륨 (1.9 g, 13 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 실온에서 교반한 후, 어떠한 반응도 발생하지 않았다. 이어서, 반응물을 50℃로 24시간 동안 가열하였다. 반응물을 냉각시키고, EtOAc로 희석하고, 물로 세척하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 (40 g 칼럼, 5-40% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 벤질 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로파노에이트 (830 mg, 1.4 mmol, 61% 수율)를 투명한 오일로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 클로로포름-d) δ 7.59 (d, J=7.9 Hz, 1H), 7.41 - 7.38 (m, 6H), 7.33 - 7.30 (m, 1H), 7.19 (td, J=7.6, 1.0 Hz, 1H), 7.13 - 7.08 (m, 1H), 7.05 (s, 1H), 5.28 - 5.19 (m, 3H), 4.87 (dd, J=15.1, 4.7 Hz, 1H), 3.68 - 3.55 (m, 2H), 1.47 (s, 9H), 1.43 (s, 9H), 1.28 (s, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.69분; ESI-MS(+) m/z 631.3 (M+Na).
단계 3:
MeOH (10 mL) 중 벤질 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로파노에이트 (830 mg, 1.4 mmol) 및 Pd-C (36 mg, 0.034 mmol)의 용액을 통해 천천히 H2를 버블링하고 이어서 H2의 양압 하에 실온에서 2일 동안 두었다. 반응물을 나일론 프릿 필터를 통해 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산 (700 mg, 1.4 mmol, 100% 수율)을 투명한 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.46분; ESI-MS(+) m/z 541.3 (M+Na).
단계 4:
디옥산 중 HCl (4 M, 5.0 ml)의 0℃ 용액에 N2의 양압 하에 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산 (700 mg, 1.4 mmol)을 첨가하였다. 빙조를 제거하고, 반응물을 실온에서 30분 동안 교반하였다. 반응 휘발성 물질을 감압 하에 가열 없이 증발시켜 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산을 점착성 오일로서 HCl 염 (480 mg, 1.4 mmol, 100% 수율)으로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.91분; ESI-MS(+) m/z 262.95 (M-t-부틸).
단계 5:
아세톤 (5.00 mL) 및 물 (10 mL) 중 HCl 염 (480 mg, 1.4 mmol)으로서의 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산, 및 중탄산나트륨 (570 mg, 6.8 mmol)의 용액에 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (460 mg, 1.4 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 격렬히 교반하면서 수성 HCl (1.0 M)로 pH 5로 천천히 산성화시켰다. 반응 용액을 DCM으로 분리하였다. 유기 층을 물에 이어서 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고 감압 하에 농축시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 물질을 실리카 겔 (40g 칼럼, 20-80% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물을 백색 발포체로서 수득하였다. 정제된 물질을 키랄 분리를 위해 SFC에 적용하였다. SFC로부터의 제1 용리 피크는 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산 (90 mg, 0.166 mmol, 12.28% 수율)이다. 제2 용리 피크는 (R)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-1-일)프로판산 (88 mg, 0.16 mmol, 12% 수율)이다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.44분; ESI-MS(+) m/z 563.1 (M+Na).
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(메틸술폰아미도)-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)프로판산의 제조
Figure pct00031
단계 1:
DCM (10 mL) 중에 용해시킨 (S)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)프로파노에이트의 용액 (1.2 g, 2.2 mmol)에 TFA (10 mL)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 휘발성 물질을 증발시키고, 고진공 하에 밤새 두어 생성물 (S)-2-(3-(3-(벤질옥시)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-옥소프로필)-1H-인돌-1-일)아세트산 (1.0 g, 2.1 mmol, 93% 수율)을 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.25분; ESI-MS(+) m/z 509.2 (M+Na).
단계 2:
건조 DCM (20 mL) 중에 용해시킨 (S)-2-(3-(3-(벤질옥시)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-옥소프로필)-1H-인돌-1-일)아세트산의 용액 (1.01 g, 2.076 mmol)에 메탄술폰아미드 (0.197 g, 2.076 mmol), EDC (0.438 g, 2.284 mmol), 및 DMAP (0.279 g, 2.284 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 4일 동안 교반하였다. 용액을 수성 HCl (1 M)에 이어서 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 증발시켜 조 물질 (S)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(메틸술폰아미도)-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)프로파노에이트 (900 mg, 1.6 mmol, 77% 수율)를 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.79분; ESI-MS(+) m/z 586.1 (M+Na).
단계 3:
MeOH (20 mL) 중 (S)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(메틸술폰아미도)-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)프로파노에이트 (896 mg, 1.590 mmol) 및 Pd-C (169 mg, 0.159 mmol)의 용액을 통해 H2를 5분 동안 버블링하였다. 이어서, 반응물을 H2의 양압 하에 2시간 동안 두었다. 반응물을 N2로 버블링하고 이어서 나일론 프릿 필터를 통해 여과하였다. 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켜 생성물 (S)-2-아미노-3-(1-(2-(메틸술폰아미도)-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)프로판산 (424 mg, 1.25 mmol, 79% 수율)을 점착성 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.87분; ESI-MS(+) m/z 340 (M+H).
단계 4:
아세톤 (8.00 mL) 및 물 (8 mL) 중 (S)-2-아미노-3-(1-(2-(메틸술폰아미도)-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)프로판산 (424 mg, 1.249 mmol) 및 중탄산나트륨 (525 mg, 6.25 mmol)의 용액에 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (421 mg, 1.249 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 격렬한 교반하면서 수성 HCl (1 M)로 pH 5로 천천히 산성화시켰다. 수성 층을 25 ml EtOAc로 분리하였다. 유기 층을 물에 이어서 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고, MgSO4 상에서 건조시키고, 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켰다. 조 물질을 역상 크로마토그래피 (이동상 A: 5% 아세토니트릴, 95% 물, 10 mM 아세트산암모늄. 이동상 B: 95% 아세토니트릴, 5% 물, 10 mM 아세트산암모늄. 10%B-50%B, 20 칼럼 부피에 걸침)에 의해 정제하여 생성물 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(메틸술폰아미도)-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)프로판산 (330 mg, 0.59 mmol, 47% 수율)을 회백색 고체로서 수득하였다. 분석 조건 B: 체류 시간 = 1.14분; ESI-MS(+) m/z 561.9 (M+H).
(S)-3-(1-((1H-테트라졸-5-일)메틸)-1H-인돌-3-일)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)프로판산의 제조
Figure pct00032
단계 1:
(S)-2-(3-(3-(벤질옥시)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-옥소프로필)-1H-인돌-1-일)아세트산의 용액 (.897 g, 1.844 mmol)에 CDI (0.389 g, 2.397 mmol)를 첨가하고, 반응물을 3시간 동안 교반하였다. 이어서, 수산화암모늄 (0.287 mL, 7.37 mmol)을 첨가하고, 반응물을 추가로 3시간 동안 교반하였다. 반응물을 DCM (50 mL)으로 희석하고, 수성 HCl (1 M)로 세척하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 증발시켜 조 생성물 (S)-벤질 3-(1-(2-아미노-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)프로파노에이트 (865 mg, 1.782 mmol, 97% 수율)을 수득하였으며, 이를 후속 반응 단계에 그대로 사용하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.14분; ESI-MS(+) m/z 561.9 (M+H).
단계 2:
DMF (12 mL) 중 (S)-벤질 3-(1-(2-아미노-2-옥소에틸)-1H-인돌-3-일)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)프로파노에이트 (865 mg, 1.782 mmol)의 용액에 실온에서 2,4,6-트리클로로-1,3,5-트리아진 (164 mg, 0.891 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 추가의 1 당량의 트리아진을 첨가하고 2시간 후에 LCMS에서 생성물로의 완전한 진행을 나타냈다. 반응물을 EtOAc로 희석하고, 물로 세척하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 증발시켰다. 조 생성물을 실리카 (40 g 칼럼 10-50% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 (S)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(시아노메틸)-1H-인돌-3-일)프로파노에이트 (600 mg, 1.28 mmol, 72% 수율)을 담갈색 발포체로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.33분; ESI-MS(+) m/z 490.2 (M+Na).
단계 3:
물 (2.0 ml) 및 2-프로판올 (1.0 ml) 중 (S)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(1-(시아노메틸)-1H-인돌-3-일)프로파노에이트 (300 mg, 0.642 mmol)의 용액에 아지드화나트륨 (83 mg, 1.283 mmol) 및 아연(II) 브로마이드 (72.3 mg, 0.321 mmol)를 첨가하고, 90℃로 가열하였다. 반응물을 가열하고, 18시간 동안 교반하였다. 반응을 냉각시킨 후, 수성 HCl (1 M, 10 mL)을 첨가하고, 이어서 EtOAc (50 mL)를 첨가하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 증발시켜 조 물질 (S)-벤질 3-(1-((1H-테트라졸-5-일)메틸)-1H-인돌-3-일)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)프로파노에이트 (328 mg, 0.6 mmol, 100% 수율)를 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.23분; ESI-MS(+) m/z 533.3 (M+Na).
단계 4:
MeOH (5 mL) 중 (S)-벤질 3-(1-((1H-테트라졸-5-일)메틸)-1H-인돌-3-일)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)프로파노에이트 (160 mg, 0.31 mmol) 및 Pd-C (33 mg, 0.03 mmol)의 용액을 통해 5분 동안 H2를 버블링하였다. 이어서, 반응물을 교반하면서 H2의 양압 하에 2일 동안 두었다. 반응물을 나일론 프릿 필터를 통해 여과하고, 감압 하에 증발시켰다. 생성물 (S)-3-(1-((1H-테트라졸-5-일)메틸)-1H-인돌-3-일)-2-아미노프로판산 (89 mg, 0.311 mmol, 100% 수율)을 직접 후속 단계에 사용하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.7분; ESI-MS(+) m/z 287 (M+H).
단계 5:
아세톤 (2.0 mL) 및 물 (4.0 mL) 중 (S)-3-(1-((1H-테트라졸-5-일)메틸)-1H-인돌-3-일)-2-아미노프로판산 (89 mg, 0.31 mmol) 및 중탄산나트륨 (130 mg, 1.6 mmol)의 용액에 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (110 mg, 0.31 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 격렬한 교반 하에 수성 HCl (1 M)로 pH 5로 천천히 산성화시켰다. 반응물을 DCM으로 분리하였다. 유기 층을 물에 이어서 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고, 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 물질을 정제용 HPLC (선파이어 정제용 C18 30x100 칼럼 크기; 10-100% 95:5 CH3CN:물, 0.1% TFA 완충제 함유의 구배로 15분에 걸쳐)에 의해 정제하여 생성물 (S)-3-(1-((1H-테트라졸-5-일)메틸)-1H-인돌-3-일)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)프로판산 (104 mg, 0.205 mmol, 65.8% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 7.77 (d, J=7.4 Hz, 2H), 7.66 - 7.63 (m, 1H), 7.59 (dd, J=7.4, 3.2 Hz, 1H), 7.40 - 7.34 (m, 3H), 7.33 (d, J=8.2 Hz, 2H), 7.29 - 7.21 (m, 3H), 7.20 - 7.15 (m, 2H), 7.11 - 7.06 (m, 1H), 5.70 - 5.62 (m, 2H), 4.57 - 4.51 (m, 1H), 4.36 - 4.19 (m, 2H), 4.17 - 4.10 (m, 1H), 3.37 (dd, J=14.7, 4.9 Hz, 1H), 3.23 - 3.10 (m, 1H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.14분; ESI-MS(+) m/z 509.1 (M+H).
벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트의 제조
Figure pct00033
단계 1:
THF (50 mL) 및 MeOH (50 mL) 중 메틸 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (10 g, 30 mmol)의 용액에 수성 수산화리튬 일수화물 (18 mL, 2.0 M)을 천천히 적가하였다. 반응물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 수성 HCl (1.0 M)을 사용하여 산성화시키고, EtOAc로 추출하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 증발시켜 조 물질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세트산 (8.0 g, 25 mmol, 84% 수율)을 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.06분; ESI-MS(+) m/z 339.8 (M+Na).
단계 2:
아세토니트릴 (17 mL) 중 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세트산 (8.0 g, 25 mmol) 및 DBU (3.8 ml, 25 mmol)의 용액에 (브로모메틸)벤젠 (3.15 ml, 26.5 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 물로 희석하고, EtOAc로 추출하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 (80 g 칼럼, 0-100% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (4.5 g, 11 mmol, 44% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 클로로포름-d) δ 7.47 - 7.32 (m, 10H), 5.64 (d, J=7.9 Hz, 1H), 5.33 (d, J=12.1 Hz, 1H), 5.24 (d, J=12.1 Hz, 1H), 5.21 - 5.11 (m, 2H), 5.04 - 4.94 (m, 1H), 3.79 - 3.67 (m, 6H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.39분; ESI-MS(+) m/z 430.0 (M+Na).
2-(트리메틸실릴)에틸 2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트의 제조
Figure pct00034
단계 1:
DCM (100 mL) 중 현탁된 2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세트산 (3.44 g, 12.15 mmol)의 용액에 DMAP (0.148 g, 1.215 mmol)에 이어서 2-(트리메틸실릴)에탄올 (1.741 mL, 12.15 mmol) 및 N1-((에틸이미노)메틸렌)-N3,N3-디메틸프로판-1,3-디아민, HCl (2.79 g, 14.58 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 유기 층을 HCl (1M)에 이어서 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고, MgSO4 상에서 건조시키고, 여과하고 휘발성 물질을 증발시켜 생성물 2-(트리메틸실릴)에틸 2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (4.4 g, 11.47 mmol, 94% 수율)를 투명한 오일로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 클로로포름-d) δ 4.94 - 4.78 (m, 1H), 4.39 - 4.25 (m, 2H), 3.84 (d, J=4.9 Hz, 3H), 3.86 (d, J=5.0 Hz, 3H), 1.48 (s, 9H), 1.15 - 1.05 (m, 2H), 0.09 - 0.06 (m, 9H).
2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5,6,7,8-테트라히드로이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산의 제조
Figure pct00035
단계 1:
3-(tert-부톡시)-3-옥소프로판산 (0.7 mL, 4.6 mmol), 피리딘-2-일메탄아민 (0.48 mL, 4.6 mmol), 및 EDC의 용액 (0.98 g, 5.1 mmol)에 DMAP (0.62 g, 5.1 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에 증발시킨 다음, EtOAc로 희석하였다. 유기 층을 수성 포화 중탄산나트륨에 이어서 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 (40 g 칼럼, 0-5% MeOH:DCM)에 의해 정제하여 생성물 tert-부틸 3-옥소-3-((피리딘-2-일메틸)아미노)프로파노에이트 (830 mg, 3.3 mmol, 72% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.882분; ESI-MS(+) m/z 251.2 (M+H).
단계 2:
0℃에서 DCM (53 ml) 중 tert-부틸 3-옥소-3-((피리딘-2-일메틸)아미노)프로파노에이트 (2 g, 8.0 mmol) 및 피리딘 (3.9 ml, 48 mmol)의 용액에 POCl3 (0.90 ml, 9.6 mmol)을 첨가하고, 실온으로 가온되도록 하였다. 반응물을 1시간 동안 교반하였다. 반응 물질을 분리 깔때기로 옮기고, 수성 포화 탄산나트륨 용액으로 세척하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 증발시켜 조 생성물 tert-부틸 2-(이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)아세테이트 (1.8 g, 7.8 mmol, 97% 수율)을 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.942분; ESI-MS(+) m/z 233.2 (M+H).
단계 3:
0℃에서 DCM (29 ml) 중 DMF (0.40 ml, 5.2 mmol) 및 피리딘 (2.1 ml, 26 mmol)의 용액에 POCl3 (0.50 ml, 5.2 mmol)을 첨가하고, 5분 동안 교반하였다. 이어서, tert-부틸 2-(이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)아세테이트 (1.0 g, 4.3 mmol)를 DCM 중 용액 (5.0 mL)으로서 첨가하고, 실온으로 가온되도록 하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응물에 수성 포화 탄산나트륨 용액을 첨가하고 10분 동안 격렬하게 교반하였다. 이어서, 2상 혼합물을 분리하고, 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 조 물질을 수득하였다. 조 물질을 실리카 겔 (80g 칼럼, 20-80% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 순수 생성물 tert-부틸 2-(1-포르밀이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)아세테이트 (876 mg, 3.37 mmol, 78% 수율)를 갈색 박편상 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 9.97 (s, 1H), 8.41 (d, J=7.1 Hz, 1H), 8.25 (dt, J=9.1, 1.1 Hz, 1H), 7.47 (ddd, J=9.1, 6.7, 0.9 Hz, 1H), 7.13 (td, J=6.9, 1.1 Hz, 1H), 4.24 (s, 2H), 1.49 - 1.38 (m, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 2.1분; ESI-MS(+) m/z 261 (M+H).
단계 4:
DCM (15 mL) 중 벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (850 mg, 2.1 mmol)의 용액에 N2 분위기 하에 DBU (0.29 mL, 1.9 mmol)를 천천히 첨가하였다. 10분 후에 tert-부틸 2-(1-포르밀이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)아세테이트 (450 mg, 1.729 mmol) (2 mL DCM 중)을 반응 혼합물에 천천히 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 증발시키고, 실리카 겔 크로마토그래피 (80 g 칼럼 20-50% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 (Z)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)아크릴레이트 (800 mg, 1.5 mmol, 85% 수율)를 투명한 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.49분; ESI-MS(+) m/z 542.5 (M+H).
단계 5:
MeOH (10 mL) 중 (Z)-벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)아크릴레이트 (400 mg, 0.739 mmol)의 용액을 통해 N2을 실온에서 5분 동안 버블링하였다. 이어서, Pd-C (79 mg, 0.074 mmol)를 첨가한 다음 반응 용액을 5분 동안 H2로 버블링한 후에 교반하면서 H2의 양압 하에 2시간 동안 두었다. 반응물을 나일론 프릿 필터를 통해 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 생성물 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5,6,7,8-테트라히드로이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산 (239 mg, 0.739 mmol, 100% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 3.96 - 3.82 (m, 2H), 3.82 - 3.69 (m, 1H), 2.94 - 2.83 (m, 1H), 2.82 - 2.63 (m, 2H), 2.02 - 1.92 (m, 2H), 1.87 - 1.79 (m, 2H), 1.51 - 1.45 (m, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.747분; ESI-MS(+) m/z 324.2 (M+H).
단계 6:
아세톤 (5 mL) 및 물 (5 mL) 중 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5,6,7,8-테트라히드로이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산 (240 mg, 0.74 mmol) 및 중탄산나트륨 (310 mg, 3.7 mmol)의 용액에 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (250 mg, 0.740 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 격렬한 교반 하에 수성 HCl (1.0 M)을 사용하여 pH 5로 천천히 산성화시켰다. 반응물을 25 ml EtOAc를 사용하여 분리하였다. 유기 층을 물에 이어서 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 물질을 역상 크로마토그래피 (55 g 칼럼, 10-100% CH3CN:물, 0.1% TFA)에 의해 정제하여 생성물 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-5,6,7,8-테트라히드로이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산 (300 mg, 0.55 mmol, 74% 수율 포함)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 7.86 - 7.77 (m, 2H), 7.71 - 7.61 (m, 2H), 7.45 - 7.37 (m, 2H), 7.37 - 7.29 (m, 2H), 4.40 - 4.17 (m, 5H), 4.00 (t, J=6.0 Hz, 3H), 3.21 - 3.07 (m, 1H), 2.96 (dd, J=15.0, 8.4 Hz, 1H), 2.80 - 2.72 (m, 2H), 2.06 - 1.87 (m, 2H), 1.87 - 1.75 (m, 2H), 1.51 - 1.40 (m, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.13분; ESI-MS(+) m/z 546.4 (M+H).
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산의 제조
Figure pct00036
단계 1:
DCM (25 mL) 중 2-(트리메틸실릴)에틸 2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (4.75 g, 12.4 mmol)의 용액에 N2 분위기 하에 DBU (1.9 mL, 12.3 mmol)를 천천히 첨가하였다. 10분 후에 DCM (5 mL) 중 tert-부틸 2-(1-포르밀이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)아세테이트 (1.00 g, 3.84 mmol)를 반응 혼합물에 천천히 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응 휘발성 물질을 증발시키고, 조 물질을 실리카 겔 크로마토그래피 (80 g 칼럼 20-50% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 (Z)-2-(트리메틸실릴)에틸 3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)-2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)아크릴레이트 (1.39 g, 2.30 mmol, 70% 수율)를 투명한 오일로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 8.13 (d, J=7.1 Hz, 1H), 7.74 (dt, J=9.2, 1.1 Hz, 1H), 7.06 (s, 1H), 7.02 (ddd, J=9.3, 6.5, 0.8 Hz, 1H), 6.87 - 6.79 (m, 1H), 4.43 - 4.29 (m, 2H), 4.17 (s, 2H), 1.52 - 1.48 (m, 9H), 1.46 (s, 9H), 1.17 - 1.10 (m, 2H), 0.13 - 0.09 (m, 9H). 분석 조건 F: 체류 시간 = 2.24분; ESI-MS(+) m/z 518.4 (M+H).
단계 2:
파르 봄베에서 테트라히드로푸란 (30 ml) 중 (Z)-2-(트리메틸실릴)에틸 3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)-2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)아크릴레이트 (1.40 g, 2.69 mmol)를 (+)-1,2-비스((2s,5s)-2,5-디에틸포스폴라노)벤젠(시클로옥타디엔)로듐(i) 트리플루오로메탄술포네이트 (0.06 g, 0.081 mmol)로 처리하고 수소 분위기 (20 bar) 하에 두었다. 반응물을 72시간 동안 교반하였다. 반응 휘발성 물질을 증발시키고, 조 물질을 실리카 겔 (80 g 칼럼, 5-40% EtOAc:Hex) 상에서 정제하여 생성물 (S)-2-(트리메틸실릴)에틸 3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)-2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)프로파노에이트 (380 mg, 0.729 mmol, 27% 수율)를 담오렌지색 발포체로서 수득하였다. 분석 조건 F: 체류 시간 = 1.64분; ESI-MS(+) m/z 520.5 (M+H).
단계 3:
실온에서 THF (4 mL) 중 (S)-2-(트리메틸실릴)에틸 3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)-2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)프로파노에이트 (240 mg, 0.462 mmol)의 용액에 테트라-n-부틸암모늄 플루오라이드 (0.460 mL, 0.462 mmol)를 첨가하고, 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응 휘발성 물질을 증발시키고, EtOAc (10 mL)로 희석하였다. 이어서, 유기 층을 MgSO4 상에서 건조시키고, 나일론 프릿 필터를 통해 여과하고, 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켰다. 이어서, 잔류물을 고진공 하에 30분 동안 두어 생성물 (S)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)-2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)프로판산 (194 mg, 0.462 mmol, 100% 수율)을 암오렌지색 잔류물로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.93분; ESI-MS(+) m/z 420.2 (M+H).
단계 4:
(S)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)-2-((tert-부톡시카르보닐)아미노)프로판산 (194 mg, 0.462 mmol)이 들은 바이알에 N2의 양압 하에 HCl (1.2 mL, 디옥산 중 4M)을 첨가하고, 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응 휘발성 물질을 감압 하에 실온에서 증발시켜 생성물 (S)-2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산을 점착성 발포체로서 HCl 염 (165 mg, 0.464 mmol, 100% 수율)으로서 수득하였다. 분석 조건 F: 체류 시간 = 0.96분; ESI-MS(+) m/z 320.1 (M+H).
단계 5:
(9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (203 mg, 0.603 mmol)를 아세톤 (3 mL) 및 물 (3 mL) 중 (S)-2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산, HCl (195 mg, 0.548 mmol) 및 중탄산나트륨 (230 mg, 2.74 mmol)의 용액에 첨가하고, 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 HCl (1M)을 사용하여 pH 5-6에 도달하도록 중화시켰다. 이어서, 중화된 용액을 EtOAc 및 물로 희석하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 조 물질을 수득하였다. 조 물질을 정제용 HPLC (선파이어 정제용 C18 30x100 칼럼 크기; 10-100% 95:5 CH3CN:물, 0.1% TFA 완충제 함유의 구배로 15분에 걸쳐)에 의해 정제하여 순수 생성물 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-1-일)프로판산 (165 mg, 0.305 mmol, 55.6% 수율)을 갈색 발포체로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.09분; ESI-MS(+) m/z 542.3 (M+H).
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)프로판산의 제조
Figure pct00037
단계 1:
탈기된 DMF (100ml) 중 2-브로모피리딘 (2.50 ml, 25.3 mmol), tert-부틸 아크릴레이트 (18.4 ml, 127 mmol), 1,4-디아자비시클로[2.2.2]옥탄 (0.114 g, 1.013 mmol), 탄산칼륨 (3.50 g, 25.3 mmol), 및 테트라부틸암모늄 브로마이드 (8.16 g, 25.3 mmol)의 용액에 아세트산팔라듐 (II) (0.114 g, 0.506 mmol)을 첨가하고 압력 용기에서 120℃로 가열하고, 14시간 동안 교반하였다. 14시간 후에 반응물을 냉각시키고, 물 (100ml)에 붓고, EtOAc (100ml)로 추출하였다. 유기 층을 물; 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피 (120 g 칼럼, 5-25% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 (E)-tert-부틸 3-(피리딘-2-일)아크릴레이트 (1.5 g, 7.31 mmol, 28.9% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 클로로포름-d) δ 8.69 - 8.59 (m, 1H), 7.76 - 7.68 (m, 1H), 7.65 - 7.55 (m, 1H), 7.47 - 7.40 (m, 1H), 7.27 (ddd, J=7.6, 4.8, 1.1 Hz, 1H), 6.85 (d, J=15.8 Hz, 1H), 1.60 - 1.50 (m, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.02분; ESI-MS(+) m/z 206.1 (M+H).
단계 2:
1,4-디옥산 (35 mL) 중 (E)-tert-부틸 3-(피리딘-2-일)아크릴레이트 (1.00 g, 4.87 mmol)의 용액에 히드록실아민 (물, 3.22 g 중 50%, 48.7 mmol)에 이어서 테트라-n-부틸암모늄 술페이트 (물 0.06 g 중 50%, 0.049 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 4일 동안 교반하였다. 이어서, 반응물을 EtOAc로 희석하고, 물로 세척하였다. 이어서, 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 생성물 tert-부틸 3-(히드록시아미노)-3-(피리딘-2-일)프로파노에이트 (1.10 g, 4.62 mmol, 95% 수율)를 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 8.58 - 8.41 (m, 1H), 7.82 (td, J=7.7, 1.7 Hz, 1H), 7.52 (d, J=7.9 Hz, 1H), 7.33 (ddd, J=7.5, 5.0, 1.3 Hz, 1H), 4.43 (t, J=7.1 Hz, 1H), 2.85 - 2.67 (m, 2H), 1.38 (s, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 0.80분; ESI-MS(+) m/z 239.2 (M+H).
단계 3:
0℃로 냉각시킨 아세트산 (5 mL) 중 tert-부틸 3-(히드록시아미노)-3-(피리딘-2-일)프로파노에이트 (500 mg, 2.10 mmol)의 용액에 아연 (500 mg, 7.65 mmol)을 첨가하였다. 이어서, 반응물을 실온으로 가온하고, 3시간 동안 교반하였다. 반응 슬러리를 MeOH (5 mL)로 희석하고, 나일론 프릿 필터를 통해 여과하였다. 용매를 감압 하에 증발시킨 다음 톨루엔 (20 mL x 3)으로 공비혼합 (3회)하여 점착성 잔류물을 수득하였다. 점착성 잔류물을 고진공 하에 24시간 동안 두어 생성물 tert-부틸 3-아미노-3-(피리딘-2-일)프로파노에이트 (466 mg, 2.096 mmol, 100% 수율)를 백색 발포체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 8.63 (d, J=4.9 Hz, 1H), 8.11 - 8.05 (m, 1H), 7.65 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.60 - 7.55 (m, 1H), 4.69 (dd, J=7.7, 4.7 Hz, 1H), 3.02 - 2.83 (m, 2H), 1.48 - 1.43 (m, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.10분; ESI-MS(+) m/z 223.1 (M+H).
단계 4:
DCM (15 mL) 중 (S)-3-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-4-(알릴옥시)-4-옥소부탄산 (740 mg, 1.87 mmol)의 용액에 HATU (712 mg, 1.871 mmol)에 이어서 휘니그 염기 (1.634 mL, 9.36 mmol)를 첨가하고, 실온에서 20분 동안 교반하였다. 이어서, tert-부틸 3-아미노-3-(피리딘-2-일)프로파노에이트 (416 mg, 1.871 mmol)를 첨가하고, 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응물을 물 및 DCM으로 희석하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 증발시켜 조 물질을 수득하였다. 조 물질을 실리카 겔 (40 g 칼럼, 10-70% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 (2S)-알릴 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-4-((3-(tert-부톡시)-3-옥소-1-(피리딘-2-일)프로필)아미노)-4-옥소부타노에이트 (263 mg, 0.439 mmol, 23.43% 수율)를 담갈색 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.22분; ESI-MS(+) m/z 600.3 (M+H).
단계 5:
0℃에서 1 드램 바이알에서 DCM (3.00 mL) 중 (2S)-알릴 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-4-((3-(tert-부톡시)-3-옥소-1-(피리딘-2-일)프로필)아미노)-4-옥소부타노에이트 (263 mg, 0.439 mmol) 및 피리딘 (0.210 mL, 2.63 mmol)의 용액에 POCl3 (0.05 mL, 0.526 mmol)를 첨가하고 실온으로 가온시킨 다음, 18시간 동안 교반하였다. 18시간 동안 교반한 후, 반응물을 DCM으로 희석하고, 수성 포화 탄산나트륨 용액으로 세척하였다. 이어서, 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피 (40g 칼럼, 10-60% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물 (S)-알릴 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)프로파노에이트 (136 mg, 0.234 mmol, 53.3% 수율)를 담갈색 발포체로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.20분; ESI-MS(+) m/z 582.3 (M+H).
단계 6:
0℃에서 THF (5 mL) 중 (S)-알릴 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)프로파노에이트 (136 mg, 0.234 mmol)의 용액에 N-메틸아닐린 (0.130 mL, 1.17 mmol)에 이어서 Pd(Ph3P)4 (27.0 mg, 0.023 mmol)를 첨가하였다. 이어서, 반응물을 실온으로 가온되도록 하고, 1시간 동안 교반하였다. 반응 휘발성 물질을 증발시켜 조 물질을 수득하였다. 조 물질을 정제용 HPLC (선파이어 정제용 C18 30x100 칼럼 크기; 10-100% 95:5 CH3CN:물, 0.1% TFA 완충제 함유의 구배로 15분에 걸쳐)에 의해 정제하여 생성물 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)이미다조[1,5-a]피리딘-3-일)프로판산 (105 mg, 0.194 mmol, 83% 수율)을 백색 발포체로서 수득하였다.
2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로판산의 제조
Figure pct00038
단계 1:
아세토니트릴 (10 mL) 중 tert-부틸 2-(5-브로모-1H-인다졸-3-일)아세테이트 (500 mg, 1.6 mmol) 및 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}프로프-2-에노에이트 (640 mg, 1.7 mmol)의 용액에 탄산칼륨 (1.3 g, 9.6 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 EtOAc로 희석하고, 물로 세척하였다. 유기 층을 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 역상 크로마토그래피 (55 g 칼럼, 5-100% CH3CN:물, 01.% TFA 함유)에 의해 정제하여 벤질 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(5-브로모-3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로파노에이트 (1.12 g, 1.626 mmol, 101% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 7.98 - 7.90 (m, 1H), 7.49 (dd, J=8.9, 1.8 Hz, 1H), 7.43 - 7.33 (m, 6H), 5.49 (t, J=7.2 Hz, 1H), 5.26 (d, J=2.7 Hz, 2H), 5.04 (d, J=7.1 Hz, 2H), 3.93 - 3.82 (m, 2H), 1.48 - 1.45 (m, 9H), 1.31 - 1.27 (m, 18H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.84분; ESI-MS(+) m/z 712.2 (M+Na).
단계 2:
MeOH (20 mL) 중 벤질 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(5-브로모-3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로파노에이트 (1.0 g, 1.5 mmol) 및 Pd-C (0.16 g, 0.15 mmol)의 용액을 통해 5분 동안 H2를 버블링하였다. 이어서, 반응물을 교반하면서 H2의 양압 하에 2시간 동안 두었다. 반응물을 N2로 버블링한 다음, 슬러리를 나일론 프릿 필터를 통해 여과하였다. 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켜 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로판산 (0.76 g, 1.5 mmol, 100% 수율)을 점착성 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.63분; ESI-MS(+) m/z 542.2 (M+Na).
단계 3:
디옥산 중 HCl (5.0 ml, 4.0 M)을 2-(비스(((2-메틸-2-프로파닐)옥시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-((2-메틸-2-프로파닐)옥시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로판산 (781 mg, 1.503 mmol)에 첨가하고 0℃에서 30분 동안 교반하고 이어서 실온으로 가온하고, 30분 동안 교반하였다. 반응 휘발성 물질을 감압 하에 가열 없이 증발시켜 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로판산을 백색 고체로서 HCl 염 (540 mg, 1.5 mmol, 100% 수율)으로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.18분; ESI-MS(+) m/z 320 (M+H).
단계 4:
아세톤 (10 mL) 및 물 (10 mL) 중 HCl 염 (540 mg, 1.5 mmol)로서의 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로판산, 및 중탄산나트륨 (630 mg, 7.5 mmol)의 용액에 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (510 mg, 1.5 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 격렬한 교반 하에 수성 HCl (1.0 M)을 사용하여 pH 5로 천천히 산성화시켰다. 수성 층을 25 ml EtOAc로 분리하였다. 유기 층을 물에 이어서 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고 및 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 물질을 정제용 HPLC (10-100% CH3CN:물, 0.1% TFA 함유)에 의해 정제하여 순수 생성물 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인다졸-1-일)프로판산 (131 mg, 0.242 mmol, 16.1% 수율)을 회백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 메탄올-d4) δ 7.79 (d, J=7.4 Hz, 2H), 7.71 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.58 - 7.50 (m, 3H), 7.41 - 7.34 (m, 3H), 7.26 (q, J=7.4 Hz, 2H), 7.13 (t, J=7.5 Hz, 1H), 4.85 - 4.81 (m, 2H), 4.79 - 4.68 (m, 1H), 4.17 (dd, J=7.3, 1.7 Hz, 2H), 4.08 (d, J=7.3 Hz, 1H), 3.92 (s, 2H), 1.46 - 1.39 (m, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.75분; ESI-MS(+) m/z 542.1 (M+H).
(S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-(tert-부톡시카르보닐)-1H-인돌-3-일)프로판산 및 (R)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-(tert-부톡시카르보닐)-1H-인돌-3-일)프로판산의 제조
Figure pct00039
단계 1:
DCM (50 mL) 중 1H-인돌-2-카르복실산 (2.0 g, 12.4 mmol)의 0℃ 용액에 tert-부틸 2,2,2-트리클로로아세트이미데이트 (2.4 mL, 13.7 mmol)를 첨가하고 0℃에서 30분 동안 교반하고, 실온으로 가온하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 여과하고, 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켜 조 물질을 수득하였으며, 이를 실리카 겔 (40 g 칼럼, 5-40% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 tert-부틸 1H-인돌-2-카르복실레이트 (2.2g, 9.9 mmol, 80% 수율)를 투명한 오일로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 클로로포름-d) δ 8.90 (br. s., 1H), 7.70 (dd, J=8.0, 0.9 Hz, 1H), 7.44 (dd, J=8.4, 0.9 Hz, 1H), 7.33 (ddd, J=8.2, 7.1, 1.1 Hz, 1H), 7.19 - 7.13 (m, 2H), 1.65 (s, 9H).
단계 2:
tert-부틸 2-브로모아세테이트 (0.85 mL, 5.8 mmol) 및 tert-부틸 1H-인돌-2-카르복실레이트의 용액 (1.2 g, 5.3 mmol)에 탄산세슘 (1.9 g, 5.8 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 물로 희석하고, EtOAc로 추출하였다. 유기 층을 물에 이어서 염수로 세척하고; 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피 (40 g 칼럼 10-60% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 tert-부틸 1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(1.7g, 5.2 mmol, 97% 수율)를 담색 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.54분; ESI-MS(+) m/z 332.0 (M+H).
단계 3:
DCM (50 mL) 및 DMF (0.80 mL, 10 mmol) 중 tert-부틸 1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트 (1.7 g, 5.2 mmol)의 교반 용액에 실온에서 POCl3 (0.96 mL, 10 mmol)를 첨가하고 서서히 1시간 동안 환류하였다. 이어서, 반응물을 실온으로 냉각시켰다. 반응 휘발성 물질을 증발시키고, 조 물질을 실리카 겔 (40 g 칼럼, 5-40% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 tert-부틸 1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-3-포르밀-1H-인돌-2-카르복실레이트(1.0 g, 2.8 mmol, 54% 수율)를 담황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 클로로포름-d) δ 10.70 (s, 1H), 8.55 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.47 - 7.42 (m, 1H), 7.40 - 7.37 (m, 1H), 7.37 - 7.33 (m, 1H), 5.23 (s, 2H), 1.68 (s, 9H), 1.51 - 1.44 (m, 9H). 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.43분; ESI-MS(+) m/z 248 (M-2t-부틸 기).
단계 4:
DCM (20 mL) 중 벤질 2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-2-(디메톡시포스포릴)아세테이트 (1.2 g, 3.0 mmol)의 용액에 DBU (0.42 mL, 2.8 mmol)를 N2 분위기 하에 천천히 첨가하였다. 10분 후에 DCM (2 mL) 중 tert-부틸 1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-3-포르밀-1H-인돌-2-카르복실레이트 (900 mg, 2.5 mmol)를 반응 혼합물에 천천히 첨가하였다. 반응물을 2일 동안 교반하였다. 이어서, 반응 휘발성 물질을 증발시키고, 조 물질을 실리카 겔 (80 g 칼럼 0-25% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 (Z)-tert-부틸 3-(3-(벤질옥시)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-옥소프로프-1-엔-1-일)-1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(680 mg, 1.1 mmol, 43% 수율)를 투명한 오일로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.61분; ESI-MS(+) m/z 663.2 (M+Na).
단계 5:
MeOH (10 mL) 중 (Z)-tert-부틸 3-(3-(벤질옥시)-2-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-3-옥소프로프-1-엔-1-일)-1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트 (680 mg, 1.1 mmol) 및 Pd-C (28 mg, 0.027 mmol)의 용액을 통해 H2을 천천히 버블링하고 실온에서 2일 동안 교반하였다. 반응 슬러리를 나일론 프릿 필터를 통해 여과하고, 휘발성 물질을 증발시켜 조 생성물 2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-(tert-부톡시카르보닐)-1H-인돌-3-일)프로판산 (440 mg, 1.1 mmol, 99% 수율)을 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.04분; ESI-MS(+) m/z 419.3 (M+H).
단계 6:
아세톤 (5.00 mL) 및 물 (10 mL) 중 2-아미노-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-(tert-부톡시카르보닐)-1H-인돌-3-일)프로판산 (440 mg, 1.1 mmol) 및 중탄산나트륨 (450 mg, 5.3 mmol)의 용액에 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (358 mg, 1.061 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 18시간 동안 교반하였다. 반응물을 격렬한 교반 하에 수성 HCl (1.0 M)로 pH 5로 천천히 산성화시켰다. 이어서, 산성화된 용액을 DCM으로 분리하였다. 유기 층을 물에 이어서 염수로 세척하였다. 유기 층을 수집하고; MgSO4 상에서 건조시키고, 및 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켜 조 생성물을 수득하였다. 조 물질을 실리카 겔 (40 g 칼럼, 20-80% EtOAc:Hex)에 의해 정제하여 생성물을 백색 발포체로서 수득하였다. 물질을 추가로 SFC 키랄 정제 팀에 의해 정제하여 생성물 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-(tert-부톡시카르보닐)-1H-인돌-3-일)프로판산 (100 mg, 0.156 mmol, 14.71% 수율) 및 (R)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(1-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-(tert-부톡시카르보닐)-1H-인돌-3-일)프로판산 (98 mg, 0.153 mmol, 14.42% 수율)을 백색 발포체로서 수득하였다. 분석 조건 A: 체류 시간 = 1.53분; ESI-MS(+) m/z 663.2 (M+Na).
(R)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-((R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산의 제조
Figure pct00040
단계 1:
교반 막대가 구비된 40 mL 바이알에 (R)-tert-부틸 2-아미노프로파노에이트 모노 HCl 염 (2.0 g, 11 mmol), 1-플루오로-2-니트로벤젠 (1.553 g, 11.01 mmol), 탄산칼륨 (3.04 g, 22.0 mmol) 및 DMF (30 mL)를 충전하였다. 바이알을 70℃ 가열 블록에 18시간 동안 두었다. 반응 혼합물을 500 mL 분리 깔때기로 옮기고, 물 (100 mL)로 희석하였다. 혼합물을 EtOAc (2 x 100 mL)로 추출하였다. 합한 유기부를 물 (100 mL)에 이어서 염수 (75 mL)로 세척하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 진공 하에 농축시켰다. 생성된 잔류물을 최소량의 아세톤 중에 용해시킨 다음, 규조토 (셀라이트®) 상에서 진공 하에 농축시켰다. 생성된 분말을 실리카 겔 크로마토그래피 (40 g 칼럼, 헥산:EtOAc 100:0 → 90:10)로 처리하여 (R)-tert-부틸 2-((2-니트로페닐)아미노)프로파노에이트를 오렌지색 오일 (2.359 g, 80%)로서 수득하였다.
단계 2:
교반 막대가 구비된 100 mL r.b. 플라스크에 (R)-tert-부틸 2-((2-니트로페닐)아미노)프로파노에이트 (2.359 g, 8.86 mmol)를 충전하고 MeOH (40 mL) 및 탄소 상 팔라듐 (데구사 유형 E101 NE/W, 10% Pd 건조 기준, 약 50wt% 물, 0.471 g, 0.221 mmol)을 첨가하였다. 플라스크를 고무 격막으로 밀봉하고, 혼합물을 N2로 15분 동안 폭기한 다음, 혼합물을 H2로 5분 동안 폭기하였다. 혼합물을 H2의 풍선 압력 하에 16시간 동안 교반하였다. 혼합물을 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하고, 필터 패드를 MeOH로 추출하였다. 합한 여과물을 진공 하에 농축시키고, 생성된 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피 (25 g 인터킴 25 마이크로미터 칼럼, 헥산:EtOAc 100:0 → 50:50)로 처리하여 (R)-tert-부틸 2-((2-아미노페닐)아미노)프로파노에이트를 적색 액체 (1.100 g, 53%)로서 수득하였다. 13C-NMR (100MHz, CDCl3) δ 173.86, 135.61, 134.82, 119.89, 119.25, 116.36, 113.07, 80.95, 52.65, 27.59, 18.73.
단계 3:
교반 막대가 구비된 50 mL 플라스크에 (R)-tert-부틸 2-((2-아미노페닐)아미노)프로파노에이트 (1.100 g, 4.66 mmol)를 충전하고 THF (25 mL), DIPEA (3.00 mL, 17.5 mmol) 및 1,1'-카르보닐디이미다졸 (2.83 g, 17.5 mmol)을 각각 첨가하였다. 바이알을 밀봉하고, 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 용액을 250 mL 분리 깔때기로 옮기고 Et2O (75 mL)로 희석하고, 이어서 수성 HCl (1M, 50 mL)로 세척하였다. 유기 상을 물 (50 mL)에 이어서 염수 (50 mL)로 세척하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 규조토 (셀라이트®) 상에서 진공 하에 농축시켰다. 생성된 분말을 실리카 겔 크로마토그래피 (40g SiO2 칼럼, 헥산:EtOAc 90:10 → 50:50)로 처리하여 (R)-tert-부틸 2-(2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로파노에이트를 회백색 고체 발포체 (828.1 mg, 68%)로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 9.09 (br. s., 1H), 7.13 - 7.03 (m, 3H), 7.02 - 6.95 (m, 1H), 5.19 (q, J=7.4 Hz, 1H), 1.70 (d, J=7.4 Hz, 3H), 1.41 (s, 9H)
단계 4:
교반 막대가 구비된 40 mL 바이알에 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}프로프-2-에노에이트 (1.192 g, 3.16 mmol), (R)-tert-부틸 2-(2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로파노에이트 (828.1 mg, 3.16 mmol), 및 MeCN (15 mL)을 첨가하였다. 용액에 탄산칼륨 (2.618 g, 18.94 mmol)을 첨가하였다. 바이알을 마개를 막고, 60℃ 가열 블록에서 교반하면서 2시간 동안 두었다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 진공 하에 농축시켰다. 생성된 잔류물을 아세톤 중에 용해시킨 다음, 규조토 (셀라이트®) 상에서 진공 하에 농축시켰다. 생성된 분말을 SiO2 크로마토그래피 (80 g 실리카 겔 칼럼, 헥산:EtOAc 100:0 → 50:50)로 처리하여 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[(2R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로파노에이트를 무색 고체 발포체 (1:1 비의 부분입체이성질체, 1.841 g, 91%)로서 수득하였다.
단계 5:
교반 막대가 구비된 100 mL r.b. 플라스크에 MeOH (20 mL) 중 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[(2R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로파노에이트 (920.3 mg, 1.439 mmol)를 충전하고 탄소 상 팔라듐 (데구사 유형 E101 NE/W, 10% Pd 건조 기준, 약 50wt% 물, 153 mg, 0.072 mmol)을 첨가하였다. 플라스크를 고무 격막으로 막았다. 용액을 N2로 15분 동안 폭기한 다음, 용액을 H2로 5분 동안 폭기하였다. 이어서, 시스템을 H2의 풍선 압력 하에 혼합물을 1.5시간 동안 교반하였다. 용액을 N2로 15분 동안 폭기한 다음, 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하였다. 필터 케이크를 MeOH로 추출하고, 합한 여과물을 진공 하에 농축시켜 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[(2R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로판산을 무색 고체 발포체 (1:1 비율의 부분입체이성질체, 791 mg, 100%)로서 수득하였다.
단계 6:
100 mL r.b. 플라스크에 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[(2R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로판산 (0.791 g, 1.44 mmol)을 충전하고 0℃ 조를 사용하여 냉각시키고 플라스크에 디옥산 중 HCl (5 mL, 4 M, 20 mmol)의 0℃ 용액을 첨가하였다. 용액을 0℃에서 1시간 동안 교반하고 진공 하에 농축시키고 분석하여 목적 생성물로의 부분 전환을 발견하였다. 고체가 들은 100 mL r.b. 플라스크를 0℃ 조로 복귀시키고 플라스크에 디옥산 중 HCl의 0℃ 용액 (5 mL, 4 M, 20 mmol)을 첨가하였다. 용액을 0℃에서 1.5시간 동안 교반한 다음, 진공 하에 농축시켜 조 2-아미노-3-(3-((R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산 HLC 염을 백색 고체로서 수득하였으며, 이를 후속 단계에 그의 전체로 사용하였다.
단계 7:
물 (12 mL) 및 아세톤 (6 mL) 중 2-아미노-3-(3-((R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산 (1.439 mmol)의 용액에 중탄산나트륨 (604 mg, 7.20 mmol)에 이어서 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (485 mg, 1.44 mmol)를 첨가하였다. 용액을 밤새 교반하였다 (18시간). 반응 혼합물을 규조토 (셀라이트®) 상에서 진공 하에 농축시키고 생성된 분말을 C18 크로마토그래피 (칼럼 = 55g 인터킴 퓨리플래쉬 C18-HP 30 마이크로미터; 용매 A = 물 중 0.1% TFA; 용매 B = 아세토니트릴 중 0.1% TFA; 구배 = 15 칼럼 부피에 걸쳐 15% B에서 80% B)로 처리하였다. 생성물-함유 분획을 합하고, 진공 하에 농축시켜 휘발성 물질을 제거하고, 수용액을 수득하여 EtOAc를 사용하여 이를 125 mL 분리 깔때기로 옮겼다. 혼합물을 추가로 염수 (10 mL)로 희석하였다. 혼합물을 EtOAc (2 x 50 mL)로 추출하였다. 합한 유기부를 염수 (25 mL)로 세척하고; MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고; 이어서 진공 하에 농축시켜 부분입체이성질체의 혼합물로서의 생성물, 468.2 mg, 황색 고체 발포체를 수득하였다. 이 물질의 부분을 하기와 같은 SFC 정제로 처리하였다: 칼럼 = 키랄팩 AD-H 정제용 칼럼, 30 x 250mm, 5μm; 이동상 = CO2 중 20% MeOH, 150bar; 온도 = 35℃; 유량 = 19분 동안 70.0 mL/분; UV 모니터링 @ 220nm; 주입 = 2:1 MeOH:CHCl3 중 ~30mg/mL 용액 0.25ml (스태킹 주입에 의해 정제된 ~246mg). 7.63분에서의 피크를 수집하여 (S)-2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-((R)-1-(tert-부톡시)-1-옥소프로판-2-일)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산을 수득하였다. 1H NMR (400MHz, CD3OD) δ 7.78 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.57 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.37 (t, J=7.4 Hz, 2H), 7.32 - 7.22 (m, 3H), 7.13 - 7.03 (m, 3H), 5.09 (q, J=7.3 Hz, 1H), 4.68 (d, J=4.3 Hz, 1H), 4.47 - 4.38 (m, 1H), 4.27 (dd, J=14.7, 8.9 Hz, 1H), 4.17 - 4.11 (m, 2H), 4.10 - 4.03 (m, 1H), 1.59 (d, J=7.3 Hz, 3H), 1.36 (s, 9H).
2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산의 제조
Figure pct00041
단계 1:
슐렝크 어댑터가 구비된 건조 250 mL r.b. 플라스크에 N2 분위기 하에 두고 DMF (60 mL), 1H-벤조[d]이미다졸-2-올 (6.93 g, 51.7 mmol) 및 tert-부틸 2-브로모아세테이트 (9.6 g, 49.2 mmol)를 첨가하였다. 용액을 0℃로 냉각시켰다. 용액에 수소화나트륨 (오일 중 60% w/w 분산액, 2.264 g, 56.6 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 0℃ (t=0)에서 1시간 동안 교반하였다. 용액에 포화 수성 NaHCO3 (60 mL)을 첨가하였다. 혼합물은 매우 농후해져 교반이 불가능하게 되었다. 혼합물을 잠깐 실온으로 가온하고 이어서 혼합물을 물 (250 mL)을 사용하여 1L 분리 깔때기로 옮겼다. 혼합물을 EtOAc (400 mL)로 추출하고, 유기 상을 MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고, 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 최소량의 아세톤 중에 용해시킨 다음, 규조토 (셀라이트®) 상에서 진공 하에 농축시켰다. 이 분말을 SiO2 크로마토그래피 (헥산:EtOAc 100:0 → 0:100, 생성물은 용리된 제2 주요 피크임)로 처리하여 tert-부틸 2-(2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)아세테이트를 연황색 고체 (3.301 g, 27%)로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.60 (br. s., 1H), 7.12 - 7.04 (m, 3H), 6.92 - 6.86 (m, 1H), 4.53 (s, 2H), 1.47 (s, 9H).
단계 2:
교반 막대가 구비된 40 mL 바이알에 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}프로프-2-에노에이트 (1.382 g, 3.66 mmol), tert-부틸 2-(2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)아세테이트 (1.00 g, 4.03 mmol), 및 MeCN (18 mL)을 첨가하였다. 용액에 탄산칼륨 (3.04 g, 22.0 mmol)을 첨가하였다. 바이알을 마개를 막고, 교반하면서 50℃ 가열 블록에 2시간 동안 두었다. 반응 혼합물을 규조토 (셀라이트®)를 통해 여과하고, 필터 케이크를 MeCN (20 mL)으로 추출하였다. 여과물을 진공 하에 농축시키고, 잔류물을 최소량의 아세톤 중에 용해시킨 다음, 규조토 (셀라이트®) 상에서 진공 하에 농축시켰다. 생성된 분말을 SiO2 크로마토그래피 (80 g 실리카 겔 칼럼, 헥산:EtOAc 100:0 → 50:50)로 처리하여 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로파노에이트를 황색 오일 (2.167 g, 95% 수율)로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.38 - 7.29 (m, 5H), 7.06 - 7.01 (m, 2H), 7.00 - 6.95 (m, 1H), 6.85 - 6.80 (m, 1H), 5.47 (dd, J=9.8, 4.3 Hz, 1H), 5.22 (s, 2H), 4.66 - 4.49 (m, 3H), 4.40 (d, J=17.7 Hz, 1H), 1.44 (s, 9H), 1.31 (s, 18H).
단계 3:
교반 막대가 구비된 100 mL r.b. 플라스크에 메탄올 (20 mL) 중 벤질 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로파노에이트 (1.083 g, 1.731 mmol)를 충전하고 탄소 상 팔라듐 (데구사 유형 E101 NE/W, 10% Pd 건조 기준, 약 50wt% 물, 0.184 g, 0.087 mmol)을 첨가하였다. 플라스크를 고무 격막으로 막았다. 용액을 N2로 15분 동안 폭기한 다음, 용액을 H2로 5분 동안 폭기하였다. 이어서, 시스템을 H2의 풍선 압력 하에 두고 혼합물을 2시간 동안 교반하였다. 용액을 N2로 15분 동안 폭기한 다음, 용액에 규조토 (셀라이트®)를 첨가하였다. 혼합물을 여과하고, 필터 케이크를 메탄올로 추출하였다. 여과물을 진공 하에 농축시켜 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로판산 (917.7 mg, 99%)을 수득하였다.
단계 4:
100 mL r.b. 플라스크에 2-{비스[(tert-부톡시)카르보닐]아미노}-3-{3-[2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸]-2-옥소-2,3-디히드로-1H-1,3-벤조디아졸-1-일}프로판산 (917.7 mg, 1.713 mmol)을 충전하고 0℃ 조를 사용하여 냉각시키고 디옥산 중 HCl의 0℃ 용액 (5 mL, 4 M, 20 mmol)을 첨가하였다. 용액을 0℃에서 1시간 동안 교반한 다음, 진공 하에 농축시켰다. 디클로로에탄 (50 mL)으로 공증발시켜 미량의 용매를 제거하여 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산 HCl 염을 무색 고체 (710.8 mg)로서 수득하였다. 이 물질의 전체를 단계 6에 사용하였다.
단계 5:
물 (12 mL) 및 아세톤 (6 mL) 중 2-아미노-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산 모노 HCl 염 (1.713 mmol)의 용액에 중탄산나트륨 (720 mg, 8.57 mmol)에 이어서 (9H-플루오렌-9-일)메틸 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 카르보네이트 (578 mg, 1.71 mmol)를 첨가하였다. 용액을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응 용액을 규조토 (셀라이트®) 상에서 진공 하에 농축시키고 생성된 고체를 C18 크로마토그래피 (인터킴 C18 55g 30 마이크로미터 칼럼, 구배 = 10 CV에 걸쳐 물:MeCN 50:50 내지 물:MeCN 0:100, 5 CV에 대해 100% MeCN에서 유지)로 처리하였다. 합한 생성물 분획을 진공 하에 농축시켜 수성 상을 수득하였으며, 이를 이어서 EtOAc (2 x 100 mL)로 추출하였다. 합한 유기 상을 MgSO4 상에서 건조시키고; 여과하고; 진공 하에 농축시켜 2-((((9H-플루오렌-9-일)메톡시)카르보닐)아미노)-3-(3-(2-(tert-부톡시)-2-옥소에틸)-2-옥소-2,3-디히드로-1H-벤조[d]이미다졸-1-일)프로판산을 백색 고체 (2단계에 걸쳐 483.2 mg, 22%)로서 수득하였다. 1H NMR (500MHz, 아세톤-d6) δ 7.84 (d, J=7.6 Hz, 2H), 7.71 - 7.61 (m, 2H), 7.40 (t, J=7.4 Hz, 2H), 7.34 - 7.26 (m, 3H), 7.12 - 7.00 (m, 4H), 4.72 (td, J=8.0, 4.8 Hz, 1H), 4.63 - 4.54 (m, 2H), 4.47 - 4.36 (m, 2H), 4.25 - 4.21 (m, 2H), 4.20 - 4.14 (m, 1H), 1.43 (s, 9H).
실시예 1001의 제조
Figure pct00042
실시예 1001을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 45-85% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 8.5 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.59분; ESI-MS(+) m/z 983.1 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.32분; ESI-MS(+) m/z 983.0 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 982.4750 실측치: 982.4796.
실시예 1002의 제조
Figure pct00043
실시예 1002을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 40-80% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 15-55% B 이어서 100% B에서 3-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 2.1 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.45분; ESI-MS(+) m/z 1003.2 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.17분; ESI-MS(+) m/z 1004.1 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 1003.5145 실측치: 1003.5111
실시예 1003의 제조
Figure pct00044
실시예 1003을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 7.0 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 96%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.76분; ESI-MS(+) m/z 1979.0 (M+H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.63분; ESI-MS(+) m/z 991.2 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 990.4633 실측치: 990.4601.
실시예 1004의 제조
Figure pct00045
실시예 1004를 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 12-52% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 7.3 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.33분; ESI-MS(+) m/z 996.6 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.62분; ESI-MS(+) m/z 996.5 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 996.4733 실측치: 996.4698.
실시예 1005의 제조
Figure pct00046
실시예 1005를 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 15-55% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 12-52% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 7.0 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 98%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.82분; ESI-MS(+) m/z 999.1 (M+2H).
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.67분; ESI-MS(+) m/z 999.6 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 998.4486 실측치: 998.4448.
실시예 1006의 제조
Figure pct00047
실시예 1006을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 12-52% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 4.8 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 99%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.72분; ESI-MS(+) m/z 1016.6 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.62분; ESI-MS(+) m/z 1015.9 (M+2H)
실시예 1007의 제조
Figure pct00048
실시예 1007을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 워터스 엑스브리지 c-18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 6.6 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 96%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.58분; ESI-MS(+) m/z 1022.5 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.56분; ESI-MS(+) m/z 1022.3 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 1021.9788 실측치: 1021.9747.
실시예 1008의 제조
Figure pct00049
실시예 1008을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 12-52% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 12-52% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 3.5 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 98%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.75분; ESI-MS(+) m/z 1024.8 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.98분; ESI-MS(+) m/z 1024.7 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 1023.9540 실측치: 1023.9506.
실시예 1009의 제조
Figure pct00050
실시예 1009를 하기 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 1.8 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 96%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.58분; ESI-MS(+) m/z 947.1 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.44분; ESI-MS(+) m/z 946.4 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 946.4980 실측치: 946.4946.
실시예 1010의 제조
Figure pct00051
실시예 1010을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 15-55% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 35분에 걸쳐 5-45% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 2.0 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 93%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.54분; ESI-MS(+) m/z 1015.6 (M+2H).
실시예 1011의 제조
Figure pct00052
실시예 1011을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 15-55% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-100% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 2.0 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 94%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.52분; ESI-MS(+) m/z 989.7 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.43분; ESI-MS(+) m/z 1975.9 (M-H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 989.4655 실측치: 989.4619.
실시예 1012의 제조
Figure pct00053
실시예 1012을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 2-42% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 9.8 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 97%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.56분; ESI-MS(+) m/z 944.5 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.38분; ESI-MS(+) m/z 944.6 (M+2H).
실시예 1013의 제조
Figure pct00054
실시예 1013을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 50-90% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 22.5 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 98%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.63분; ESI-MS(+) m/z 966.0 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.53분; ESI-MS(+) m/z 967.2 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 965.9796 실측치: 965.9790.
실시예 1014의 제조
Figure pct00055
실시예 1014를 하기 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 3-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 3.3 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 96%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.59분; ESI-MS(+) m/z 960.6 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.39분; ESI-MS(+) m/z 959.2 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 959.4879 실측치: 959.4848.
실시예 1015의 제조
Figure pct00056
실시예 1015를 하기 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 43.1 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 96%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.56분; ESI-MS(+) m/z 1901.9 (M-H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.31분; ESI-MS(+) m/z 952.3 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 952.4798 실측치: 952.4758
실시예 1016의 제조
Figure pct00057
실시예 1016을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 10.3 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 98%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.52분; ESI-MS(+) m/z 945.1 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.36분; ESI-MS(+) m/z 945.0 (M+2H).
실시예 1017의 제조
Figure pct00058
실시예 1017을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 6.9 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 97%이다. 2회의 분석용 LC/MS 주입을 사용하여 최종 순도를 결정하였다. 주입 1 조건: 칼럼: 워터스 BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV. 주입 2 조건: 칼럼: 워터스 CSH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0-100% B, 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서 UV
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.56분; ESI-MS(+) m/z 945.1 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.23분; ESI-MS(+) m/z 944.4 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 944.4824 실측치: 944.4783.
실시예 1018의 제조
Figure pct00059
실시예 1018을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 45-85% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 14.8 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.54분; ESI-MS(+) m/z 925.0 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.38분; ESI-MS(+) m/z 925.2 (M+2H)
ESI-HRMS(+) m/z: 계산치: 924.4611 실측치: 924.4596.
실시예 1019의 제조
Figure pct00060
실시예 1019를 하기 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 15-55% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 3.6 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 97%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.46분; ESI-MS(+) m/z 687.3 (M+3H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.17분; ESI-MS(+) m/z 687.4 (M+3H).
실시예 1020의 제조
Figure pct00061
실시예 1020을 하기 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자이동상 A: 5:95 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 메탄올: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 45-85% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 8.5 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.56분; ESI-MS(+) m/z 956.2 (M+2H)
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.31분; ESI-MS(+) m/z 957.1 (M+2H).
실시예 10001의 제조
Figure pct00062
실시예 10001을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 실시예 10001의 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 분석 LCMS 조건 C: 칼럼: 워터스 BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV. 분석 LCMS 조건 D: 칼럼: 워터스 CSH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 26.9 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 93%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.40분; ESI-MS(+) m/z 944.60 (M+2H).
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.12분; ESI-MS(+) m/z 944.80 (M+2H).
실시예 10002의 제조
Figure pct00063
실시예 10002을 "일반적 합성 순서 A" 에 따라 제조하였다. 실시예 10002의 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 분석 LCMS 조건 C: 칼럼: 워터스 BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV. 분석 LCMS 조건 D: 칼럼: 워터스 CSH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 22.6 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 98%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.44분; ESI-MS(+) m/z 945.30 (M+2H).
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.15분; ESI-MS(+) m/z 945.25 (M+2H).
실시예 10003의 제조
Figure pct00064
실시예 10003을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 실시예 10003의 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 분석 LCMS 조건 C: 칼럼: 워터스 BEH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴:물, 10 mM 아세트산암모늄; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV. 분석 LCMS 조건 D: 칼럼: 워터스 CSH C18, 2.1 x 50 mm, 1.7-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 트리플루오로아세트산 함유; 온도: 70℃; 구배: 3분에 걸쳐 0%B, 0-100% B 이어서 100% B에서 2.0-분 유지; 유량: 0.75 mL/분; 검출: 220 nm에서의 UV. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 1.2 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 94%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.48분; ESI-MS(+) m/z 944.70 (M+2H).
분석 조건 D: 체류 시간 = 1.26분; ESI-MS(+) m/z 944.45 (M+2H).
실시예 10500의 제조
Figure pct00065
실시예 10500을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 15분에 걸쳐 10-70% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 20.0 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 91%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.66분; ESI-MS(+) m/z 944.3 (M+2H)
분석 조건 E: 체류 시간 = 1.40분; ESI-MS(+) m/z 944.2 (M+2H).
실시예 10501의 제조
Figure pct00066
실시예 10501을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 15분에 걸쳐 0-70% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 21.1 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 92%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.70분; ESI-MS(+) m/z 916.0 (M+2H)
분석 조건 E: 체류 시간 = 1.37분; ESI-MS(+) m/z 916.0 (M+2H).
실시예 10502의 제조
Figure pct00067
실시예 10502을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 15분에 걸쳐 10-70% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 1.4 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 94%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.30분; ESI-MS(+) m/z 916.2 (M+2H)
분석 조건 E: 체류 시간 = 1.16분; ESI-MS(+) m/z 916.1 (M+2H.
실시예 10503의 제조
Figure pct00068
실시예 10503을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 23.1 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 96%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.61분; ESI-MS(+) m/z 930.1 (M+2H)
분석 조건 E: 체류 시간 = 1.37분; ESI-MS(+) m/z 930.1 (M+2H).
실시예 10504의 제조
Figure pct00069
실시예 10504를 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 40분에 걸쳐 2-42% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 5-45% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 10분에 걸쳐 10-100% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 6.5 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 97%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.57분; ESI-MS(+) m/z 916.0 (M+2H)
분석 조건 E: 체류 시간 = 1.32분; ESI-MS(+) m/z 915.9 (M+2H).
실시예 10505의 제조
Figure pct00070
실시예 10505를 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 40분에 걸쳐 2-42% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 5-45% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 15분에 걸쳐 10-100% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 7.4 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 96%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.53분; ESI-MS(+) m/z 944.1 (M+2H)
분석 조건 E: 체류 시간 = 1.29분; ESI-MS(+) m/z 944.4 (M+2H).
실시예 10506의 제조
Figure pct00071
실시예 10506을 "일반적 합성 순서 A"에 따라 제조하였다. 조 물질을 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건을 사용하여 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 30분에 걸쳐 8-48% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 10-50% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 워터스 CSH C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 0.1% 트리플루오로아세트산 함유; 구배: 30분에 걸쳐 5-45% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 물질을 추가로 정제용 LC/MS에 의해 하기 조건으로 정제하였다: 칼럼: 엑스브리지 C18, 19 x 200 mm, 5-μm 입자; 이동상 A: 5:95 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 이동상 B: 95:5 아세토니트릴: 물, 10-mM 아세트산암모늄 함유; 구배: 10분에 걸쳐 10-100% B 이어서 100% B에서 5-분 유지; 유량: 20 mL/분. 목적 생성물을 함유하는 분획을 합하고, 원심 증발을 통해 건조시켰다. 생성물의 수율은 9.3 mg이고, LCMS 분석에 의한 그의 추정 순도는 100%이다.
분석 조건 C: 체류 시간 = 1.57분; ESI-MS(+) m/z 959.2 (M+2H)
분석 조건 E: 체류 시간 = 1.35분; ESI-MS(+) m/z 959.3 (M+2H).
균질 시간-분해 형광 (HTRF) 결합 검정을 사용하여 PD-L1에 대한 PD-1의 결합에 대해 경쟁하는 마크로시클릭 펩티드의 능력을 시험하는 방법
PD-1/PD-L1 균질 시간-분해 형광 (HTRF) 결합 검정을 사용하여 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드가 PD-L1에 결합하는 능력을 조사하였다.
방법
가용성 PD-L1에 대한 가용성 PD-1의 결합의 균질 시간-분해 형광 (HTRF) 검정. 가용성 PD-1 및 가용성 PD-L1은 막횡단-관통 영역이 제거되고 이종 서열, 구체적으로 인간 이뮤노글로불린 G 서열 (Ig)의 Fc 부분 또는 헥사히스티딘 에피토프 태그 (His)에 융합된 카르복실-말단 절단을 갖는 단백질을 지칭한다. 모든 결합 연구는 0.1% (w/v) 소 혈청 알부민 및 0.05% (v/v) 트윈-20으로 보충된 dPBS로 이루어진 HTRF 검정 완충제 중에서 수행하였다. PD-1-Ig/PD-L1-His 결합 검정을 위해, 억제제를 검정 완충제 4 μl 중 PD-L1-His (10 nM 최종)와 함께 15분 동안 사전-인큐베이션하고, 이어서 검정 완충제 1 μl 중 PD-1-Ig (20 nM 최종)을 첨가하고, 추가로 15분 동안 인큐베이션하였다. 인간, 시노몰구스 마카크, 마우스, 또는 다른 종으로부터의 PD-L1 융합 단백질을 사용하였다. HTRF 검출은 유로퓸 크립테이트-표지된 항-Ig 모노클로날 항체 (1 nM 최종) 및 알로피코시아닌 (APC) 표지된 항-His 모노클로날 항체 (20 nM 최종)를 사용하여 달성하였다. 항체를 HTRF 검출 완충제 중에 희석하고, 5 μl을 결합 반응물의 상단에 분배하였다. 반응이 30분 동안 평형이 되도록 하고, 엔비전 형광계를 사용하여 신호 (665nm/620nm 비)를 수득하였다. PD-1-Ig/PD-L2-His (각각 20 및 5 nM), CD80-His/PD-L1-Ig (각각 100 및 10 nM) 및 CD80-His/CTLA4-Ig (각각 10 및 5 nM) 사이의 추가의 결합 검정을 확립하였다.
비오티닐화 화합물 번호 71 및 인간 PD-L1-His 사이의 결합/경쟁 연구를 하기와 같이 수행하였다. 마크로시클릭 펩티드 억제제를 검정 완충제 4 μl 중 PD-L1-His (10 nM 최종)와 함께 60분 동안 사전-인큐베이션한 다음, 검정 완충제 1 μl 중 비오티닐화 화합물 번호 71 (0.5 nM 최종)을 첨가하였다. 결합이 30분 동안 평형이 되도록 하고, 이어서 HTRF 완충제 5 μl 중 유로퓸 크립테이트 표지된 스트렙타비딘 (2.5 pM 최종) 및 APC-표지된 항-His (20 nM 최종)를 첨가하였다. 반응이 30분 동안 평형이 되도록 하고, 엔비전 형광계를 사용하여 신호 (665nm/620nm 비)를 수득하였다.
재조합 단백질. C-말단 인간 Ig 에피토프 태그 [hPD-1 (25-167)-3S-IG]를 갖는 카르복실-말단절단된 인간 PD-1 (아미노산 25-167) 및 C-말단 His 에피토프 태그 [hPD-L1(19-239)-담배 엽맥 반점형성 바이러스 프로테아제 절단 부위 (TVMV)-His]를 갖는 인간 PD-L1 (아미노산 18-239)을 HEK293T 세포 내에서 발현시키고, 재조합 단백질 A 친화성 크로마토그래피 및 크기 배제 크로마토그래피에 의해 순차적으로 정제하였다. 인간 PD-L2-His (시노 바이올로지칼스), CD80-His (시노 바이올로지칼스), CTLA4-Ig (알앤디 시스템즈)은 모두 상업적 공급원을 통해 획득하였다.
재조합 인간 PD-1-Ig의 서열
Figure pct00072
재조합 인간 PD-L1-TVMV-His (PD-L1-His)의 서열
Figure pct00073
결과는 표 1에 제시된다. 제시된 바와 같이, 본 개시내용의 마크로시클릭 펩티드는 PD-L1-TVMV-His (PD-L1-His)에 대한 PD-1-Ig 결합 활성의 강력한 억제를 입증하였다. 범위는 하기와 같다: A = >1 μM; B = 0.10 - 0.99 μM; C = 0.01 - 0.099 μM; D = 0.001 - 0.0099 μM.
표 1
Figure pct00074
Figure pct00075
본 개시내용이 상기 예시적인 실시예에 제한되지 않고, 그의 본질적인 속성에서 벗어나지 않으면서 다른 구체적 형태로 구현될 수 있음이 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 명백할 것이다. 따라서, 실시예는 모든 면에서 제한적인 것이 아니라 예시적인 것으로 고려되며, 상기 실시예보다는 첨부된 청구범위를 참조하고, 따라서 청구범위의 등가의 의미 및 범위 내에 속하는 모든 변화가 그 안에 포괄되도록 의도되는 것이 바람직하다.
SEQUENCE LISTING <110> Bristol-Myers Squibb Company <120> IMMUNOMODULATORS <130> 12735-WO-PCT <150> US 62/318,417 <151> 2016-04-05 <150> US 15/475,227 <151> 2017-03-31 <160> 2 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 384 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Leu Asp Ser Pro Asp Arg Pro Trp Asn Pro Pro Thr Phe Ser Pro Ala 1 5 10 15 Leu Leu Val Val Thr Glu Gly Asp Asn Ala Thr Phe Thr Cys Ser Phe 20 25 30 Ser Asn Thr Ser Glu Ser Phe Val Leu Asn Trp Tyr Arg Met Ser Pro 35 40 45 Ser Asn Gln Thr Asp Lys Leu Ala Ala Phe Pro Glu Asp Arg Ser Gln 50 55 60 Pro Gly Gln Asp Cys Arg Phe Arg Val Thr Gln Leu Pro Asn Gly Arg 65 70 75 80 Asp Phe His Met Ser Val Val Arg Ala Arg Arg Asn Asp Ser Gly Thr 85 90 95 Tyr Leu Cys Gly Ala Ile Ser Leu Ala Pro Lys Ala Gln Ile Lys Glu 100 105 110 Ser Leu Arg Ala Glu Leu Arg Val Thr Glu Arg Arg Ala Glu Val Pro 115 120 125 Thr Ala His Pro Ser Pro Ser Pro Arg Pro Ala Gly Gln Phe Gln Gly 130 135 140 Ser Pro Gly Gly Gly Gly Gly Arg Glu Pro Lys Ser Ser Asp Lys Thr 145 150 155 160 His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Ser Ser 165 170 175 Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg 180 185 190 Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro 195 200 205 Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala 210 215 220 Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val 225 230 235 240 Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr 245 250 255 Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr 260 265 270 Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu 275 280 285 Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys 290 295 300 Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser 305 310 315 320 Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp 325 330 335 Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser 340 345 350 Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala 355 360 365 Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 370 375 380 <210> 2 <211> 237 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Phe Thr Val Thr Val Pro Lys Asp Leu Tyr Val Val Glu Tyr Gly Ser 1 5 10 15 Asn Met Thr Ile Glu Cys Lys Phe Pro Val Glu Lys Gln Leu Asp Leu 20 25 30 Ala Ala Leu Ile Val Tyr Trp Glu Met Glu Asp Lys Asn Ile Ile Gln 35 40 45 Phe Val His Gly Glu Glu Asp Leu Lys Val Gln His Ser Ser Tyr Arg 50 55 60 Gln Arg Ala Arg Leu Leu Lys Asp Gln Leu Ser Leu Gly Asn Ala Ala 65 70 75 80 Leu Gln Ile Thr Asp Val Lys Leu Gln Asp Ala Gly Val Tyr Arg Cys 85 90 95 Met Ile Ser Tyr Gly Gly Ala Asp Tyr Lys Arg Ile Thr Val Lys Val 100 105 110 Asn Ala Pro Tyr Asn Lys Ile Asn Gln Arg Ile Leu Val Val Asp Pro 115 120 125 Val Thr Ser Glu His Glu Leu Thr Cys Gln Ala Glu Gly Tyr Pro Lys 130 135 140 Ala Glu Val Ile Trp Thr Ser Ser Asp His Gln Val Leu Ser Gly Lys 145 150 155 160 Thr Thr Thr Thr Asn Ser Lys Arg Glu Glu Lys Leu Phe Asn Val Thr 165 170 175 Ser Thr Leu Arg Ile Asn Thr Thr Thr Asn Glu Ile Phe Tyr Cys Thr 180 185 190 Phe Arg Arg Leu Asp Pro Glu Glu Asn His Thr Ala Glu Leu Val Ile 195 200 205 Pro Glu Leu Pro Leu Ala His Pro Pro Asn Glu Arg Thr Gly Ser Ser 210 215 220 Glu Thr Val Arg Phe Gln Gly His His His His His His 225 230 235

Claims (15)

  1. 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염.
    Figure pct00076

    여기서
    A는 결합,
    Figure pct00077

    로부터 선택되고;
    여기서
    Figure pct00078
    은 카르보닐 기에 대한 부착 지점을 나타내고
    Figure pct00079
    는 질소 원자에 대한 부착 지점을 나타내고;
    z는 0, 1, 또는 2이고;
    w는 1 또는 2이고;
    n은 0 또는 1이고;
    m은 1 또는 2이고;
    m'는 0 또는 1이고;
    p는 0, 1, 또는 2이고;
    Rx는 수소, 아미노, 히드록시, 및 메틸로부터 선택되고;
    R14 및 R15는 독립적으로 수소 및 메틸로부터 선택되고;
    Rz는 수소 및 -C(O)NHR16으로부터 선택되고; 여기서 R16은 수소, -CHR17C(O)NH2, -CHR17C(O)NHCHR18C(O)NH2, 및 -CHR17C(O)NHCHR18C(O)NHCH2C(O)NH2로부터 선택되고; 여기서 R17은 수소 및 -CH2OH로부터 선택되고, R18은 수소 및 메틸로부터 선택되고;
    Rv는 수소 또는 천연 아미노산 측쇄이고;
    Figure pct00080
    은 카르보닐 기에 대한 부착 지점을 나타내고
    Figure pct00081
    는 질소 원자에 대한 부착 지점을 나타내고;
    Rc, Rf, Rh, Ri, Rm, 및 Rn은 수소이고;
    Ra, Re, Rj, 및 Rk는 각각 독립적으로 수소 및 메틸로부터 선택되고;
    R10은 인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 인돌릴 부분은 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 시아노, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 및 테트라졸릴C1-C3알킬로부터 선택된 1개의 기, 또는 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
    R10은 아자인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 독립적으로 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 다른 기로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
    R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1-3이고 Q'는 1, 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
    R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알콕시카르보닐, C1-C6알콕시카르보닐C1-C3알킬, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, C3-C6시클로알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C3-C6시클로알킬C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 할로, 할로C1-C3알콕시, 할로C1-C3알킬, 헤테로아릴S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 헤테로아릴C1-C3알킬S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 히드록시, -NRpRq, (NRpRq)C1-C3알킬, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고;
    Rp 및 Rq는 독립적으로 수소 및 C1-C6알킬로부터 선택되고;
    R13은 천연 아미노산 측쇄, 비천연 아미노산 측쇄, 및 -(C(R17a)2)2-X-R30; -C(R17a)2C(O)N(R16a)C(R17a)2-X'-R31; -C(R17a)2[C(O)N(R16a)C(R17a)2]w'-X-R31; -(C(R17a)(R17)C(O)NR16a)n'-H; 및 -(C(R17a)(R17)C(O)NR16a)m'-C(R17a)(R17)-CO2H로부터 선택되고;
    w'는 2 또는 3이고;
    n'는 1-6이고;
    m'는 0-5이고;
    X는 1 내지 172개의 원자의 쇄이고, 여기서 원자는 탄소 및 산소로부터 선택되고, 쇄는 그 안에 포매되는 -NHC(O)NH- 및 -C(O)NH-로부터 선택된 1, 2, 3, 또는 4개의 기를 함유할 수 있고; 여기서 쇄는 독립적으로 -CO2H, -C(O)NH2, -CH2C(O)NH2, 및 -(CH2)CO2H로부터 선택된 1 내지 6개의 기로 임의로 치환되고;
    X'는 1 내지 172개의 원자의 쇄이고, 여기서 원자는 탄소 및 산소로부터 선택되고, 쇄는 그 안에 포매되는 -NHC(O)NH- 및 -C(O)NH-로부터 선택된 1, 2, 3, 또는 4개의 기를 함유할 수 있고; 여기서 쇄는 독립적으로 -CO2H, -C(O)NH2, 및 -CH2CO2H로부터 선택된 1 내지 6개의 기로 임의로 치환되고, 단 X'는 비치환된 PEG 이외의 것이고;
    R30은 -CO2H, -C(O)NRwRx, 및 -CH3으로부터 선택되고, 여기서 Rw 및 Rx는 독립적으로 수소 및 C1-C6알킬로부터 선택되고, 단 X가 모두 탄소인 경우, R30은 -CH3 이외의 것이고;
    R31은 -CO2H, -C(O)NRwRx, -CH3, 알렉사-5-SDP, 및 비오틴이고;
    각각의 R17a는 독립적으로 수소, C1-C6알킬, -CH2OH, -CH2CO2H, -(CH2)2CO2H로부터 선택되고,
    각각의 R17은 독립적으로 수소, -CH3, (CH2)zN3, -(CH2)zNH2, -X-R31, -(CH2)zCO2H, -CH2OH, CH2C≡CH, 및 -(CH2)z-트리아졸릴-X-R35로부터 선택되고, 여기서 z는 1-6이고 R35는 -CO2H, -C(O)NRwRx, CH3, 비오틴, -2-플루오로피리딘, -C(O)-(CH2)2-C(O)O-비타민 E, -C(O)O-비타민 E 및
    Figure pct00082

    로부터 선택되고;
    단 적어도 1개의 R17은 수소, -CH3, 또는 -CH2OH 이외의 것이고;
    R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R11, 및 R12는 독립적으로 천연 아미노산 측쇄 및 비천연 아미노산 측쇄로부터 선택되거나 또는 하기 기재된 바와 같이 상응하는 이웃자리 R 기와 함께 고리를 형성하고;
    Re 및 Rk는 각각 상응하는 이웃자리 R 기 및 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성할 수 있고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고;
    Rb는 메틸이거나, 또는 Rb 및 R2는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성하고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고;
    Rd는 수소 또는 메틸이거나, 또는 Rd 및 R4는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성할 수 있고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 히드록시, 및 페닐로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고;
    Rg는 수소 또는 메틸이거나, 또는 Rg 및 R7은 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘, 피롤리딘, 모르폴린, 피페리딘, 피페라진, 및 테트라히드로티아졸로부터 선택된 고리를 형성할 수 있고; 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 할로 기로 임의로 치환된 벤질, 벤질옥시, 시아노, 시클로헥실, 메틸, 할로, 히드록시, 메톡시 기로 임의로 치환된 이소퀴놀리닐옥시, 할로 기로 임의로 치환된 퀴놀리닐옥시, 및 테트라졸릴로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환되고; 여기서 피롤리딘 및 피페리딘 고리는 시클로헥실, 페닐, 또는 인돌 기에 임의로 융합되고;
    RL은 메틸이거나, 또는 RL 및 R12은 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 아제티딘 및 피롤리딘으로부터 선택된 고리를 형성하고, 여기서 각각의 고리는 독립적으로 아미노, 시아노, 메틸, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1 내지 4개의 기로 임의로 치환된다.
  2. 제1항에 있어서, R13은 천연 아미노산 측쇄 또는 비천연 아미노산 측쇄인 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염.
  3. 제2항에 있어서,
    R10은 인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 인돌릴 부분은 (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, C1-C6알콕시, 시아노, 및 테트라졸릴C1-C3알킬로부터 선택된 1개의 기, 또는 C1-C6알콕시, C1-C3알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
    R10은 아자인돌릴C1-C3알킬이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 카르복시C1-C3알킬, 및 임의로 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1 또는 2개의 다른 기로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되거나; 또는
    R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1-3이고 Q'는 2, 3, 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 옥소, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
    R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1-3이고, Z'는 1, 2, 3 또는 4개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 C1-C6알콕시, C1-C6알킬, (C1-C6알킬)S(O)2NHC(O)C1-C3알킬, 카르복시, 카르복시C1-C3알킬, 시아노, 할로, 히드록시, 테트라졸릴, 테트라졸릴C1-C3알킬, 및 페닐로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 임의로 치환되고, 여기서 페닐은 독립적으로 C1-C3알콕시, C1-C3알킬, 및 할로로부터 선택된 1, 2, 또는 3개의 기로 추가로 임의로 치환된 것인
    화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염.
  4. 제3항에 있어서,
    A는
    Figure pct00083
    인 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염.
  5. 제4항에 있어서,
    w는 1이고;
    z는 0이고;
    Rz는 -C(O)NHR16이고; 여기서 R16은 수소 및 -CHR17C(O)NH2로부터 선택되고, 여기서 R17은 수소인
    화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염.
  6. 제5항에 있어서,
    Rd 및 R4는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피롤리딘 고리를 형성하고;
    Rg 및 R7은 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피롤리딘 고리를 형성하고, 여기서 상기 고리는 1개의 히드록시 기로 임의로 치환되고;
    Rk는 메틸인
    화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염.
  7. 제6항에 있어서,
    Ra, Re, 및 Rj는 수소이고;
    Rb 및 R2는 각각 메틸이거나, 또는 Rb 및 R2는 이들이 부착되어 있는 원자와 함께 피페리딘 고리를 형성하고;
    RL은 메틸이고;
    Rn은 수소이고;
    R1은 페닐메틸이고, 여기서 페닐은 C1-C6알콕시, 할로, 및 히드록시로부터 선택된 1개의 기로 임의로 치환되고;
    R3은 -CH2C(O)NH2 및 -CH2CO2H로부터 선택되고;
    R5는 -CH2(이미다졸릴), -CH2NH2, 및 -CH2CH2CO2H로부터 선택되고;
    R6은 -CH2CH(CH3)2, -(CH2)4NH2, 및 (CH2)2C(O)NH2로부터 선택되고;
    R8은 -CH2(인돌릴)이고;
    R9는 -(CH2)2NH2 및 CH2OH로부터 선택되고;
    R10은 -CH2(인돌릴)이고, 여기서 인돌릴 부분은 -CH2C(O)NHS(O)2CH3, 시아노, 및 -CH2(테트라졸릴)로부터 선택된 1개의 기, 또는 -OCH3, -CO2H, 및 -CH2CO2H로부터 선택된 2개의 기로 임의로 치환되거나 또는
    R10은 -CH2(아자인돌릴)이고, 여기서 아자인돌릴C1-C3알킬의 아자인돌릴 부분은 -CH2CO2H로 치환되거나; 또는
    R10은 -(CH2)nQ'이고, 여기서 n은 1이고 Q'는 2 또는 3개의 질소 원자를 함유하는 5, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고, 여기서 상기 고리계는 -CH3, -CH2CO2H, 및 옥소로부터 선택된 1 또는 2개의 기로 임의로 치환되고; 단 Q'는 아자인돌릴 또는 인돌릴 이외의 것이거나; 또는
    R10은 -(CH2)nZ'이고, 여기서 n은 1이고 Z'는 1개의 질소 원자를 함유하는 6, 6-융합된 포화 또는 불포화 고리계이고;
    R11 및 R12는 -(CH2)3CH3이고;
    R13은 메틸, -CH2CH(CH3)2, 및 -(CH2)3NHC(NH)NH2로부터 선택된 것인
    화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염.
  8. 실시예 0001, 실시예 1254, 실시예 1271, 실시예 1284, 실시예 1286, 실시예 1287, 실시예 1288, 실시예 1001, 실시예 1002, 실시예 1003, 실시예 1004, 실시예 1005, 실시예 1006, 실시예 1007, 실시예 1009, 실시예 1010, 실시예 1011, 실시예 1012, 실시예 1013, 실시예 1014, 실시예 1015, 실시예 1016, 실시예 1017, 실시예 1018, 실시예 1019, 실시예 1020, 실시예 10001, 실시예 10002, 실시예 10003, 실시예 10500, 실시예 10501, 실시예 10502, 실시예 10503, 실시예 10504, 실시예 10505, 및 실시예 10506로부터 선택된 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염.
  9. 면역 반응의 증진, 자극 및/또는 증가를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 제1항의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 면역 반응을 증진, 자극 및/또는 증가시키는 방법.
  10. 암 세포의 성장, 증식 또는 전이의 억제를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 제1항의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 암 세포의 성장, 증식 또는 전이를 억제하는 방법.
  11. 제10항에 있어서, 암이 흑색종, 신세포 암종, 편평 비소세포 폐암 (NSCLC), 비-편평 NSCLC, 결장직장암, 거세-저항성 전립선암, 난소암, 위암, 간세포성 암종, 췌장 암종, 두경부의 편평 세포 암종, 식도, 위장관 및 유방의 암종 및 혈액 악성종양으로부터 선택된 것인 방법.
  12. 감염성 질환의 치료를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 제1항의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 감염성 질환을 치료하는 방법.
  13. 제12항에 있어서, 감염성 질환이 바이러스에 의해 유발된 것인 방법.
  14. 패혈성 쇼크의 치료를 필요로 하는 대상체에게 치료 유효량의 제1항의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 상기 대상체에서 패혈성 쇼크를 치료하는 방법.
  15. 대상체에게 치료 유효량의 제1항의 화합물 또는 그의 치료상 허용되는 염을 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 PD-L1과 PD-1 및/또는 CD80의 상호작용을 차단하는 방법.
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