KR20090048057A - 벤조에이안트라센 노출 여부 확인용 바이오마커 및 이를이용한 확인 방법 - Google Patents

벤조에이안트라센 노출 여부 확인용 바이오마커 및 이를이용한 확인 방법 Download PDF

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Abstract

본 발명은 다환 방향족 탄화수소류 중의 하나인 벤조에이안트라센(benzo[a]anthracene)에 대한 노출 여부 확인용 바이오마커 및 이를 이용한 확인 방법에 관한 것으로, 구체적으로 벤조에이안트라센에 의해 특이적으로 유전자 발현이 증가 또는 감소하는 바이오마커 및 이를 이용한 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법에 관한 것이며, 본 발명의 바이오마커는 DNA 마이크로어레이 칩을 통하여 선별된 반응 유전자들을 바이오마커로 이용하여 환경 시료에서 벤조에이안트라센의 오염을 모니터링 및 판정하는데 유용하게 사용될 수 있으며, 벤조에이안트라센에 의해 유발되는 독성 작용 기작을 규명하는 도구로 이용될 수 있다.
벤조에이안트라센, 다환 방향족 탄화수소, 바이오마커, 마이크로 어레이

Description

벤조에이안트라센 노출 여부 확인용 바이오마커 및 이를 이용한 확인 방법{Biomarker for identification of exposure to benzo[a]anthracene and the method of identification using thereof}
본 발명은 벤조에이안트라센(benzo[a]anthracene)에 대한 노출 여부 확인용 바이오마커 및 이를 이용한 확인 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 벤조에이안트라센에 의해 유전자 발현이 증가 또는 감소하는 바이오마커 및 이를 이용한 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법에 관한 것이다.
다환 방향족 탄화수소류 중에서 벤조에이안트라센은 화재로부터 불완전 연소에 의해 자연적으로 발생하거나, 트럭, 선반 등에서 연소된 기체로부터 발생하거나, 토탄 침전물에서 발견된다. 벤조에이안트라센은 상업적으로 생산되는 물질은 아니지만 주로 연구목적으로 생산되어진다.
벤조에이안트라센은 휘발성이 없어서 토양 중 이동성이 아주 미미하며, 토양중 반감기는 750일 정도이다. 물 표면에서의 휘발성도 거의 없어서, 주로 저질과 부유물질에 흡착되어지고, 수중에서의 가수분해반응은 일어나지 않으며 수생생물 중 생물농축이 매우 높은 것으로 알려져 있다. 대기 중에서는 입자 상태로만 존재하여 주로 물리적인 방법으로 제거되어질 수 있다. 또한 태양광에 강하게 흡착하여 환경 중에서 직접적인 광분해반응이 일어난다. 국내 식품 중 다환방향족 탄화수소류의 오염도 조사연구에서 전국 9개 도시에서 유통되는 육류, 육류 가공품 및 유지류의 벤조에이안트라센의 함량을 조사한 결과 훈연제품, 가금류 식품, 육류에서 0.022~0.046 ㎍/㎏으로 검출되었고(김명철 등, 식품의약품안전청 2001년도 내분비계 장애물질 연구보고서, 2001), 식용유지에서 평균 0.16 ㎍/㎏으로 조사되었(이종옥 등, 식품의약품안전청 연구보고서 제6권, 790, 2002).
동물실험에서 벤조에이안트라센은 경구를 통해 흡수되며 피부흡수는 느리고 공기 중 흡입에 의한 흡수는 그리 연구되지 않았다고 알려져 있다. 흡수된 벤조에이안트라센은 대부분 변으로 분비되며 배출되도록 포접화합물로 대사된다. 벤조에이안트라센은 베이 리젼(bay region)의 반응성이 있는 다이올-에폭사이드 유도체로 대사되어 유전독성 및 발암성을 일으킨다고 알려져 있다(ASTDR 1990).
다환방향족 탄화수소류의 발암성 정도와 유전자 발현 변화에 대한 연구는 일부 보고되고 있지만, 대표적인 다환방향족 탄화수소류로 알려진 벤조에이파이렌(Benzo[a]pyrene)에 대한 연구에 거의 국한되어 있다. 이처럼 벤조에이안트라센의 인간에 대한 발암 가능성에도 불구하고 인체에서의 위해도 평가 데이터가 충분하지 않고, 노출에 대한 검색 방법 역시 GC-MS(Gas Chromatography-Mass Spectrometer) 또는 HPLC(High Performance Liquid Chromatography) 등의 고전적인 방법에 국한되어 있다. GC-MS 또는 HPLC 방법 등을 이용하면 정량은 가능하나 분석을 위한 적정 조건을 설정하여야 하며 고가의 장비 등이 필요하다. 그러므로 보다 빠르고 간편한 스크리닝(screening) 방법, 예를 들면 프라이머(primer)를 이용하는 실시간(real-time) PCR(Real-time reverse transcript polymerase chain reaction)또는 DNA 마이크로어레이 칩 등으로 신속한 위해성 평가를 통해 인체에서의 독성작용을 탐색할 수 있는 분자적 지표를 발굴하고 활용하여 벤조에이안트라센의 노출에 대한 적절한 대책 및 관리를 수행하는 것이 중요한 과제라 하겠다.
포유류 6종, 미생물 292종 등 여러 종의 게놈(genome) 염기서열 프로젝트가 완성되어 NCBI(National Center for Biotechnology Information)에 보고되었다. 이렇게 얻어진 막대한 양의 데이터를 기본으로 유전자의 기능을 연구하기 위하여 게놈-와이드 익스프레션(genome-wide expression) 연구가 이루어지고 있다. 한 번의 실험으로 수천 개의 유전자의 발현을 분석하기 위하여 DNA 마이크로어레이(microarray) 분석을 수행한다(Schena, M., et al., Proc . Natl . Acad . Sci . USA 93: 10614-10619, 1996).
마이크로어레이는 cDNA(complementary DNA)나 20 - 25 염기쌍(base pair) 길이의 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide)들의 세트를 유리에 집적화한 것이다. cDNA 마이크로어레이는 학교 내의 연구실 또는 Agilent, Genomic Solutions 등의 회사에서 칩 위에 cDNA 수집물을 기계적으로 고정화 하거나 잉크젯(ink jetting) 방법을 이용하여 생산하고 있다(Sellheyer K. et. al., J. Am . Acad . Dermatol. 51:681-692, 2004). 올리고뉴클레오티드 마이크로어레이는 Affymetrix사에서 사진 식각 공정(photolithography)을 이용하여 칩 위에서 직접 합성하는 방법에 의해 만들어 지고 있으며, Agillent사 등에는 합성된 올리고뉴클레오티드를 고정화하는 방법으로 생산하고 있다(Sellheyer, K. et. al., J. Am . Acad . Dermatol. 51:681-692, 2004).
유전자의 발현을 분석을 위해서는 조직 등 시료에서 RNA를 얻어 DNA 마이크로어레이에 있는 올리고뉴클레오티드와 교잡반응을 수행한다. 얻어진 RNA는 형광이나 동위원소로 표지화하며 cDNA로 전환시킨다. 올리고 마이크로어레이는 주로 두개의 다른 형광(예: Cye3 및 Cye5)으로 대조군과 실험군을 각각 표지화하여 같은 칩 상에서 동시에 교잡 반응을 수행한 후 광학적으로 이미지를 스캔하여 형광의 세기를 얻고 그 결과를 분석한다. 두개의 형광 세기의 비율에 따라 유전자의 발현 여부를 결정한다(Somasundaram, K. et al., Genomics Proteomics I:1-10, 2002).
최근 DNA 마크로어레이 기술을 이용한 첨단 기법인 독성 유전체학(Toxicogenomics) 연구 등과 접목하여 대량(high throughput)으로 의약품 및 신의약 후보물질은 물론 대표적인 환경오염물질을 비롯해 모든 화학물질에 의한 특정 조직이나 세포주에서 발현되는 유전자들의 발현 패턴의 분석, 양적 분석이 가능해졌다. 이에 따라 특정 세포 내에서 특정 유전자의 발현 빈도를 분석함으로써 약물의 부작용 및 환경오염 물질의 유해작용과 관련된 유전자의 발굴이 가능하며, 이를 통하여 환경오염물질의 유해작용과 약물의 작용 및 부작용에 따른 분자적 메커니즘을 이해하게 될 것이며 나아가 독성 및 부작용을 유발하는 물질의 검색 및 이 가능하게 될 것이다.
이에 본 발명자들은 인간 유전자 4만 4천개가 집적된 올리고마이크로어레이를 이용하여 벤조에이안트라센의 유전자 발현 프로파일을 인간 간암 세포인 HepG2 세포주에서 관찰 및 분석함으로써 벤조에이안트라센에 의해 과발현 또는 저발현 되는 유전자를 발굴하여 벤조에이안트라센을 검출할 수 있는 바이오마커 및 이를 이용한 노출 여부를 확인하는 방법을 확립하여 본 발명을 완성하였다.
본 발명의 목적은 벤조에이안트라센의 노출에 의해 과발현 또는 저발현되는 바이오마커 및 상기 바이오마커를 이용한 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 벤조에이안트라센(benzo[a]anthracene)의 노출에 의해 발현 변화를 일으키는 것을 특징으로 하는벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 바이오마커를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 바이오마커 유전자 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 올리고뉴클레오티드 또는 이의 상보가닥 분자가 집적된 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 DNA 마이크로어레이 칩을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 바이오마커를 이용한 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법을 제공한다.
아울러, 본 발명은 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 검색 키트를 제공한다.
본 발명의 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 바이오마커 및 이를 이용한 확인 방법은 DNA 마이크로어레이 칩을 통하여 선별된 반응 유전자들을 바이오마커로 이용하여 벤조에이안트라센의 모니터링 및 위해성을 판정하는데 유용하며, 벤조에이안트라센에 의해 야기되는 독성 작용 기작을 규명하는 도구로 이용할 수 있다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명은 벤조에이안트라센의 노출에 의해 발현 변화를 일으키는 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 바이오마커를 제공한다.
상기 바이오마커는 2배 이상 발현이 증가 또는 감소한 유전자로써, 세포 증식(cell proliferation), 수용체 결합(receptor binding), 세포-세포 신호전달(cell-cell signaling), 효소 조절자 활성(enzyme regulator activity), 세포사멸(cell death), 면역반응(immune response), 신호전달(signal transduction), 세포분화(cell differentiation), 사이토카인-사이토카인 수용체 상호작용(cytokine-cytokine receptor interaction), toll-like 수용체 신호전달 경로(toll-like receptor signaling pathway), Cytochrome P450에 의한 생체이물 대사(Metaboism of xenobiotics by cytochrome P450), 항원 프로세싱과 제시(antigen processing and presentation), 유기산대사(organic acid metabolism), 지질대사(lipid metabolism), 칼슘이온 결합(calcium ion binding), 갭 결합(Gap junction), MAPK 신호전달 경로(MAPK signaling pathway), 액틴 세포골격의 조절(regulation of actin cytoskeleton), 키나아제 활성(kinase activity), 스테로이드 생합성(biosynthesis of steroids), 세포분화(cell division), 구조분자 활성(structural molecule activity), DNA복구(DNA repair), 세포 주기(cell cycle), 수용체 활성(receptor activity), 축색 가이던스(Axon guidance), 보체 및 응고 캐스케이드(Complement and coagulation cascades), 전사조절(Transcription regulation), 징크-핑거(Zinc-finger), 이온수송(ion transport) 등의 관련 유전자로 구성되어 있다.
본 발명은 하기와 같이 구성된 군에서 선택되어지는 것을 특징으로 하는 바이오마커를 제공한다:
유전자 등록번호(Genebank) AK074652(SERTAD1, SERTA domain containing 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC042390(VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) BX647402(SAS, Tetraspanin 31), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000678(ADRA1D, Adrenergic, alpha-1D-, receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005438(FOSL1, FOS-like antigen 1), 유전자 등록번호(Genebank) Y11307(CYR61, Cysteine-rich, angiogenic inducer,61), 유전자 등록번호(Genebank) AB208949(LRDD, Leucine-rich repeats and death domain containing), 유전자 등록번호(Genebank) AK129833(TFPI2, Tissue factor pathway inhibitor 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC063835(VGF, VGF nerve growth factor inducible), 유전자 등록번호(Genebank) BF569086(NK4, Interleukin 32), 유전자 등록번호(Genebank) BM923753(TFF1, Trefoil factor 1(breast cancer, estrogen-inducible sequence expressed in)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004864(GDF15, Growth differentiation factor 15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005242(F2RL1, Coagulation factor II(thrombin) receptor-like 1), 유전자 등록번호(Genebank) AB210045(KIF5A, 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NM_005441(CHAF1B, Chromatin assembly factor 1,subunit B(p60)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005515(HLXB9,Homeo box HB9), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006163(NFE2, Nuclear factor(erythroid-derived 2), 45kDa), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006195(PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006454(MXD4, MAX dimerization protein 4), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015832(MBD2, Methyl-CpG binding domain protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_017409(HOXC10, Homeo box C10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022114(PRDM16, PR domain containing 16), 유전자 등록번호(Genebank) NM_024680(FLJ23311, E2F transcription factor 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_152989(SOX5, SRY(sex determining region Y)-box 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198159(MITF, Microphthalmia-associated transcription factor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_202002(FOXM1, Forkhead box M1), 유전자 등록번호(Genebank) AK001720(FLJ10858,Nei endonuclease VIII-like 3(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) AK024233(ZDHHC11,Zinc finger, DHHC-type containing 11), 유전자 등록번호(Genebank) AL543755(VAV3, Vav 3 oncogene), 유전자 등록번호(Genebank) BC033086(TCF19, Transcription factor 19(SC1)), 유전자 등록번호(Genebank) BC092512(MYRIP, Myosin VIIA and Rab interacting protein), 유전자 등록번호(Genebank) BC098585(TCEA2, Transcription elongation factor A(SII),2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001822(CHN1, Chimerin(chimaerin) 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003250(THRA, Thyroid hormone receptor, alpha(erythroblastic leukemia viral(v-erb-a) oncogene homolog, avian)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006892(DNMT3B, DNA(cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020062(SLC2A4RG, SLC2A4 regulator), 유전자 등록번호(Genebank) AF331525(SLC26A9, Solute carrier family 26,member 9), 유전자 등록번호(Genebank) AJ441078(ATP10D, ATPase,Class V,type 10D), 유전자 등록번호(Genebank) AY043484(SCN1A, Sodium channel, voltage-gated, type I, alpha), 유전자 등록번호(Genebank) BC048332(SLC5A9, Solute carrier family 5(sodium/glucose cotransporter), member 9), 유전자 등록번호(Genebank) BC100014(SLC11A2, Solute carrier family 11(proton-coupled divalent metal ion transporters, member 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6), 유전자 등록번호(Genebank) NM_139177(SLC39A11, Solute carrier family 39(metal ion transporter), member 11), 유전자 등록번호(Genebank) NM_153320(SLC22A7, Solute carrier family 22(organic anion transporter), member 7), 유전자 등록번호(Genebank) AB037805(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) AK000643(ASB9, Ankyrin repeat and SOCS box-containing 9), 유전자 등록번호(Genebank) AK055221(FBXO5, F-box protein 5), 유전자 등록번호(Genebank) AK074377(UHRF1, Chromosome 19 open reading frame 31), 유전자 등록번호(Genebank) AY007723(MAL2, Mal, T-cell differentiation protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC026283(APOH,Apolipoprotein H(beta-2-glycoprotein I)), 유전자 등록번호(Genebank) BI762502(GSTA2, Glutathione S-transferase A2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000277(PAH, Phenylalanine hydroxylase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001809(CENPA, Centromere protein A,17kDa), 유전자 등록번호(Genebank) CR933728(CDC2, Cell division cycle 2, G1 to S and G2 to M), 유전 자 등록번호(Genebank) CR749293(PLG, Plasminogen), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004523(KIF11, Kinesin family member 11), 유전자 등록번호(Genebank) U65410(MAD2L1, MAD2 mitotic arrest deficient-like 1(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_145061(C13orf3, Chromosome 13 open reading frame 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_138555(KIF23, Kinesin family member 23), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014750(DLG7, Discs, large homolog 7(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BX640965(SLC22A3, Solute carrier family 22(extraneuronal monoamine transporter), member 3), 유전자 등록번호(Genebank) AK122685(GLUD1, Glutamate dehydrogenase 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000251(MSH2, MutS homolog 2,colon cancer,nonpolyposis type 1(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) BC008366(DDC,Dopa decarboxylase(aromatic L-amino acid decarboxylase)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016343(CENPF,Centromere protein F,350/400ka(mitosin)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003318(TTK, TTK protein kinase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001025248(DUT, DUTP pyrophosphatase), 유전자 등록번호(Genebank) BC022255(Spc25, Spindle pole body component 25 homolog(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001801(CDO1, Cysteine dioxygenase,type I), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001790(CDC25C, Cell division cycle 25C), 유전자 등록번호(Genebank) NM_013277(RACGAP1, Rac GTPase activating protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC021267(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BM464538(C5orf13, Chromosome 5 open reading frame 13), 유전자 등록번호(Genebank) AB208919(FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1(fms-related tyrosine kinase 2, Pfeiffer syndrome)), 유전자 등록번호(Genebank) AY367065(ASPM, Asp(abnormal spindle)-like,microcephaly associated(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004701(CCNB2, Cyclin B2), 유전자 등록번호(Genebank) BC032677(UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2C), 유전자 등록번호(Genebank) AK122825(HMGB1, High-mobility group box 1), 유전자 등록번호(Genebank) AV741806(Homo sapiens high-mobility group box 1(HMGB1), mRNA[NM_002128], Transcribed locus, moderately similar to NP_990233.1 high mobility group 1 protein[Gallus gallus]), 유전자 등록번호(Genebank) BC015110(HHEX, Hematopoietically expressed homeobox).
1) 상기 바이오마커 중에서 벤조에이안트라센의 노출에 의해 발현이 증가하는 바이오마커 유전자는 하기와 같다:
유전자 등록번호(Genebank) AK074652(SERTAD1, SERTA domain containing 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC042390(VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) BX647402(SAS, Tetraspanin 31), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000678(ADRA1D, Adrenergic,alpha-1D-, receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005438(FOSL1, FOS-like antigen 1), 유전자 등록번호(Genebank) Y11307(CYR61, Cysteine- rich,angiogenic inducer,61), 유전자 등록번호(Genebank) AB208949(LRDD, Leucine-rich repeats and death domain containing), 유전자 등록번호(Genebank) AK129833(TFPI2, Tissue factor pathway inhibitor 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC063835(VGF, VGF nerve growth factor inducible), 유전자 등록번호(Genebank) BF569086(NK4, Interleukin 32), 유전자 등록번호(Genebank) BM923753(TFF1, Trefoil factor 1(breast cancer,estrogen-inducible sequence expressed in)), 유전자 등록번호(Genebank)NM_004864(GDF15, Growth differentiation factor 15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005242(F2RL1, Coagulation factor II(thrombin) receptor-like 1), 유전자 등록번호(Genebank) AB210045(KIF5A, Kinesin family member 5A), 유전자 등록번호(Genebank) D86962(GRB10, Growth factor receptor-bound protein 10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000582(SPP1, Secreted phosphoprotein 1(osteopontin,bone sialoprotein I,early T-lymphocyte activation 1)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001657(AREG, Amphiregulin(schwannoma-derived growth factor)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006200(PCSK5, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006350(FST, Follistatin), 유전자 등록번호(Genebank) AF070599(PPP1R11, Protein phosphatase 1, regulatory(inhibitor) subunit 11), 유전자 등록번호(Genebank) AK095888(CD109, CD109 antigen(Gov platelet alloantigens)), 유전자 등록번호(Genebank) BC007251(ARHGAP5, Rho GTPase activating protein 5), 유전자 등록번호(Genebank) BC033823(P58; HP58; PRKRI; P58IPK, DnaJ(Hsp40) homolog, subfamily C, member 3), 유전자 등록번호(Genebank) BX640597(SERPINB5, Serpin peptidase inhibitor, clade B(ovalbumin), member 5), 유전자 등록번호(Genebank) BX647459(SERPINE2, Serpin peptidase inhibitor, clade(nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 2), 유전자 등록번호(Genebank) BX649164(PAI; PAI1; PAI-1; PLANH1, serpin peptidase inhibitor, clade E(nexin, plasminogen activator inhibitor type 1),member 1), 유전자 등록번호(Genebank) CD520285(CSTA, Cystatin A(stefin A)), 유전자 등록번호(Genebank) CR622682(ANXA2, Annexin A2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001175(ARHGDIB, Rho GDP dissociation inhibitor(GDI) beta), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003122(SPINK1, Serine peptidase inhibitor, Kazal type 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003955(SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004877(GMFG, Glia maturation factor,gamma), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015071(ARHGAP26, Rho GTPase activating protein 26), 유전자 등록번호(Genebank) NM_025195(TRIB1, Tribbles homolog 1(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_078487(CDKN2B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2B(p15, inhibits CDK4)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198833(SERPINB8, Serpin peptidase inhibitor, clade(ovalbumin),member 8), 유전자 등록번호(Genebank) BC012609(SERPINB2, Serpin peptidase inhibitor, clade B(ovalbumin) ,member 2), 유전자 등록번호(Genebank) BF690887(BCL2A1, BCL2-related protein A1), 유전자 등록번호(Genebank) BM556279(EMP3, Epithelial membrane protein 3), 유전자 등록번호(Genebank) BX647822(FOSL2, FOS-like antigen 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001165(BIRC3, Baculoviral IAP repeat-containing 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002305(LGALS1, Lectin, galactoside-binding, soluble, 1(galectin 1)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003311(PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain, amily A, member 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003897(IER3, Immediate early response 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_078467(CDKN1A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1A(p21,Cip1)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198951(TGM2, Transglutaminase 2(C polypeptide, protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase)), 유전자 등록번호(Genebank) AF031469(MR1, Major histocompatibility complex, class I-related), 유전자 등록번호(Genebank) AL832451(DKFZp451C2311, guanylate binding protein 2,interferon-inducible), 유전자 등록번호(Genebank) BG564326(SAA4, Serum amyloid A4,constitutive), 유전자 등록번호(Genebank) CR936755(GBP3, Guanylate binding protein 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000022(ADA, Adenosine deaminase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005238(ETS1, V-ets erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1(avian)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006404(PROCR, Protein C receptor, endothelial(EPCR)), 유전자 등록번호(Genebank) AK094474(RHOC, Ras homolog gene family, member C), 유전자 등록번호(Genebank) AK095384(PDE4C, Phosphodiesterase 4C,cAMP-specific(phosphodiesterase E1 dunce homolog, Drosophila)), 유전자 등록번 호(Genebank) AK096685(TGFBRAP1, Transforming growth factor, beta receptor associated protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK124869(LOC400745, Hypothetical protein LOC149194), 유전자 등록번호(Genebank) BC006523(SGK2, Serum/glucocorticoid regulated kinase 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC027965(GPR109A, G protein-coupled receptor 109A), 유전자 등록번호(Genebank) BC033097(HBEGF, Heparin-binding EGF-like growth factor), 유전자 등록번호(Genebank) BC033829(AKAP12, A kinase(PRKA) anchor protein(gravin) 12), 유전자 등록번호(Genebank) BC034282(PPP2CA, Protein phosphatase 2(formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform), 유전자 등록번호(Genebank) BC042060(OR7E47P, Olfactory receptor, family 7, subfamily E,member 47 pseudogene), 유전자 등록번호(Genebank) BG036385(RAMP1, Receptor(calcitonin) activity modifying protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) BU587578(RGS10, Regulator of G-protein signalling 10), 유전자 등록번호(Genebank) CR601067(PLAUR, Plasminogen activator, urokinase receptor), 유전자 등록번호(Genebank) CR602522(EDN1, Endothelin 1), 유전자 등록번호(Genebank) CR936799(FHL2, Four and a half LIM domains 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001005196(OR8B4, Olfactory receptor, family 8, subfamily B, member 4), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002867(RAB3B, RAB3B, member RAS oncogene family), 유전자 등록번호(Genebank) NM_013255(MKLN1, Muskelin 1, intracellular mediator containing kelch motifs), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014391(ANKRD1, Ankyrin repeat domain 1(cardiac muscle)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_021990(GABRE, Gamma-aminobutyric acid(GABA) A receptor, epsilon), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022648(TNS, Tensin 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_080927(DCBLD2, Discoidin, CUB and LCCL domain containing 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_177403(RAB7B, RAB7B, member RAS oncogene family), 유전자 등록번호(Genebank) XM_497958(OR7E85P, Olfactory receptor, family 7, subfamily E,member 85 pseudogene), 유전자 등록번호(Genebank) Y10529(Homo sapiens olfactory receptor, family 7, subfamily E, member 24(OR7E24) on chromosome 19 [NR_002146],Putative olfactory receptor(clone ht2)), 유전자 등록번호(Genebank) AF003837(JAG1, Jagged 1(Alagille syndrome)), 유전자 등록번호(Genebank) BM913048(TIMP1, TIMP metallopeptidase inhibitor 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000732(CD3D, CD3D antigen, delta polypeptide(TiT3 complex)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001013398(IGFBP3, Insulin-like growth factor binding protein 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002478(MYOD1, Myogenic differentiation 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003873(NRP1, Neuropilin 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005170(ASCL2, Achaete-scute complex-like 2(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_007129(ZIC2, Zic family member 2(odd-paired homolog, Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) AB209361(FAS, Fas(TNF receptor superfamily, member 6)), 유전자 등록번호(Genebank) AF520785(TNFSF15, Tumor necrosis factor(ligand) superfamily, member 15), 유전자 등록번호(Genebank) BC071710(IL2RG, Interleukin 2 receptor,gamma(severe combined immunodeficiency)), 유전자 등록번호(Genebank) CR591007(CCL3, Chemokine(C-C motif) ligand 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000418(IL4R, Interleukin 4 receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000565(IL6R, Interleukin 6 receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000641(IL11, Interleukin 11), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002309(LIF, Hypothetical protein MGC20647), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004167(CCL14, Chemokine(C-C motif) ligand 15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_172212(CSF1, Colony stimulating factor 1(macrophage)), 유전자 등록번호(Genebank) AB020807(TLR6, Toll-like receptor 6), 유전자 등록번호(Genebank) BM918324(LY96, Lymphocyte antigen 96), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003263(TLR1, Toll-like receptor 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC011409(UGT1A6, UDP glucuronosyltransferase 1 family, polypeptide A9), 유전자 등록번호(Genebank) 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B4 12-hydroxydehydrogenase), 유전자 등록번호(Genebank) BC034763(FDXR, Ferredoxin reductase), 유전자 등록번호(Genebank) BC094756(CRA, Myotubularin related protein 11), 유전자 등록번호(Genebank) BG567934(APOM, Apolipoprotein M), 유전자 등록번호(Genebank) BQ939577(AKR1C3, Aldo-keto reductase family 1, member C3(3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase, type II)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000860(HPGD, Hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15-(NAD)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004278(PIGL, Phosphatidylinositol glycan,class L), 유전자 등록번호(Genebank) NM_203380(ACSL5, Acyl-CoA synthetase long-chain family member 5), 유전자 등록번호(Genebank) AB033060(PDCD6, Aryl-hydrocarbon receptor repressor), 유전자 등록번호(Genebank) AK124751(CAPN2, Calpain 2,(m/II) large subunit), 유전자 등록번호(Genebank) BC028354(PLSCR4, Phospholipid scramblase 4), 유전자 등록번호(Genebank) BG571732(S100P, S100 calcium binding protein P), 유전자 등록번호(Genebank) BQ683841(S100A11, S100 calcium binding protein A11(calgizzarin)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006471(MRCL3, Myosin regulatory light chain 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Thymosin,beta 10), 유전자 등록번호(Genebank) BU945318(Homo sapiens metallothionein 2A(MT2A), mRNA [NM_005953], Hypothetical gene supported by X97260; BC070289), 유전자 등록번 호(Genebank) H18681(C20orf139, Sulfiredoxin 1 homolog(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001007271(DUSP13, Dual specificity phosphatase 13), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001013632(LOC343521, Similar to hypothetical protein 4833401D15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022153(PP2135, Chromosome 10 open reading frame 54), 유전자 등록번호(Genebank) NM_203403(C9orf150, Chromosome 9 open reading frame 150), 유전자 등록번호(Genebank) NM_031286(SH3BGRL3, SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_147780(CTSB, Cathepsin B), 유전자 등록번호(Genebank) W84524(TM4SF5, Transmembrane 4 L six family member 5), 유전자 등록번호(Genebank) AB209586(MAPK13, Mitogen-activated protein kinase 13), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003330(TXNRD1, Thioredoxin reductase 1), 유전자 등록번호(Genebank) CR608156(HIST1H2AC, Histone 1,H2ac), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005979(S100A13,S100 calcium binding protein A13), 유전자 등록번호(Genebank) AK092512(SLC16A5, Solute carrier family 16(monocarboxylic acid transporters),member 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001983(ERCC1, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1(includes overlapping antisense sequence)), 유전자 등록번호(Genebank) BM904612(S100A6,S100 calcium binding protein A6(calcyclin)), 유전자 등록번호(Genebank) BX537968(LOC51149, Hypothetical LOC51149), 유전자 등록번호(Genebank) AA627222(LGALS1, Lectin, galactoside-binding, soluble, 1(galectin 1)), 유전자 등록번호(Genebank) CR612719(GADD45A, Growth arrest and DNA-damage-inducible,alpha), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001421(ELF4, E74-like factor 4(ets domain transcription factor)), 유전자 등록번호(Genebank) AK126182(KIAA1949, KIAA1949), 유전자 등록번호(Genebank) BX436525(HIST1H2BH, Histone 1, H2bh), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001769(CD9, CD9 antigen(p24)), 유전자 등록번호(Genebank) BX647290(HIST1H2BO, Histone 1, H2bo), 유전자 등록번호(Genebank) BC101655(HIST1H2BI, Histone 1, H2bi).
2) 상기 바이오마커 중에서, 벤조에이안트라센의 노출에 의해 발현이 감소하는 바이오마커 유전자는 하기와 같다:
유전자 등록번호(Genebank) AB020641(PFTK1, PFTAIRE protein kinase 1), 유전자 등록번호(Genebank) AB209667(RPS6KA5, Ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 5), 유전자 등록번호(Genebank) AK093396(ULK4, Unc-51-like kinase 4(C. elegans)), 유전자 등록번호(Genebank) AK122808(STK33, Serine/threonine kinase 33), 유전자 등록번호(Genebank) AK124653(WNK3, WNK lysine deficient protein kinase 3), 유전자 등록번호(Genebank) BC010082(ETNK2, Ethanolamine kinase 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC039363(EPHA10, EPH receptor A10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001005862(ERBB2, V-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog(avian)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002758(MAP2K6, Mitogen- activated protein kinase kinase 6), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003258(TK1, Thymidine kinase 1,soluble), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005400(PRKCE, Protein kinase C,epsilon), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014215(INSRR, Insulin receptor-related receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014264(PLK4, Polo-like kinase 4(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014791(MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015148(PASK, PAS domain containing serine/threonine kinase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_018492(PBK, PDZ binding kinase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022445(TPK1, Thiamin pyrophosphokinase 1), 유전자 등록번호(Genebank), 유전자 등록번호(Genebank) XM_051017(KIAA0657, Obscurin-like 1), 유전자 등록번호(Genebank) AF059203(SOAT2, Sterol O-acyltransferase 2), 유전자 등록번호(Genebank) AF202889(APOA5, Apolipoprotein A-V), 유전자 등록번호(Genebank) AF220490(PLA2G3, Phospholipase A2,group III), 유전자 등록번호(Genebank) AF288389(GLT25D2, Glycosyltransferase 25 domain containing 2), 유전자 등록번호(Genebank) AK124635(PCSK9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9), 유전자 등록번호(Genebank) AL138578(ADPN, Adiponutrin), 유전자 등록번호(Genebank) BC000054(DHCR7, 7-dehydrocholesterol reductase), 유전자 등록번호(Genebank) BC026264(UGT2B4, UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B4), 유전자 등록번호(Genebank) BC035638(LSS,Lanosterol synthase(2,3-oxidosqualene-lanosterol cyclase)), 유전자 등록번호(Genebank) BC050292(DTX2,Deltex homolog 2(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BC051385(SREBF2,Sterol regulatory element binding transcription factor 2), 유전자 등록번호(Genebank) BI521580(APOC3, Apolipoprotein C-III), 유전자 등록번호(Genebank) BX641139(SHC3, SHC(Src homology 2 domain containing) transforming protein 3), 유전자 등록번호(Genebank) CR595353(CD74, CD74 antigen(invariant polypeptide of major histocompatibility complex,class II antigen-associated)), 유전자 등록번호(Genebank) J05428(UGT2B7, UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B7), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000102(CYP17A1, Cytochrome P450, family 17, subfamily A, polypeptide 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000236(LIPC, Lipase, hepatic), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001701(BAAT, Bile acid Coenzyme A: amino acid N-acyltransferase(glycine N-choloyltransferase)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002130(HMGCS1, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004104(FASN, Fatty acid synthase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005063(SCD, Stearoyl-CoA desaturase(delta-9-desaturase)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016373(WWOX, WW domain containing oxidoreductase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020918(GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial), 유전자 등록번호(Genebank) NM_030758(OSBP2, Oxysterol binding protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198843(SFTPB, Surfactant, pulmonary-associated protein B), 유전자 등록번호(Genebank) U36798(PDE3A, Phosphodiesterase 3A,cGMP-inhibited), 유전자 등록번호(Genebank) X91148(MTP, Microsomal triglyceride transfer protein), 유전자 등록번호(Genebank) Z28339(AKR1D1, Aldo-keto reductase family 1, member D1(delta 4-3-ketosteroid-5-beta-reductase)), 유전자 등록번호(Genebank) AB209229(MVD, Mevalonate(diphospho) decarboxylase), 유전자 등록번호(Genebank) BX648472(IDI1, Isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000859(HMGCR, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003129(SQLE, Squalene epoxidase), 유전자 등록번호(Genebank) AK091289(ZNF367, Zinc finger protein 367), 유전자 등록번호(Genebank) AY367065(ASPM, Asp(abnormal spindle)-like, microcephaly associated(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BC011000(CDCA5, Cell division cycle associated 5), 유전자 등록번호(Genebank) CR592757(BRRN1, Barren homolog 1(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001813(CENPE, Centromere protein E, 312kDa), 유전자 등록번호(Genebank) NM_152526(ALS2CR19, Amyotrophic lateral sclerosis 2(juvenile) chromosome region, candidate 19), 유전자 등록번호(Genebank) AF018081(COL18A1, Collagen, type XVIII, alpha 1), 유전자 등록번호(Genebank) AF234887(CELSR2, Cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2(flamingo homolog, Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) AK130644(SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family, member 3A1), 유전자 등록번호(Genebank) AY358094(CLDN17, Claudin 17), 유전자 등록번 호(Genebank) BC045606(NID, Nidogen 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC052951(LMNB1, Lamin B1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001844(COL2A1, Collagen, type II,alpha 1(primary osteoarthritis,spondyloepiphyseal dysplasia, congenital)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001856(COL16A1, Collagen, type XVI,alpha 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002381(MATN3, Matrilin 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005560(LAMA5, Laminin,alpha 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015059(TLN2, Talin 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015180(SYNE2, Spectrin repeat containing, nuclear envelope 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016835(MAPT, Microtubule-associated protein tau), 유전자 등록번호(Genebank) NM_021135(RPS6KA2, Ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_025074(FRAS1, Fraser syndrome 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK074077(SDK1, Sidekick homolog 1(chicken)), 유전자 등록번호(Genebank) BX248766(RAD51L1, RAD51-like 1(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) CR600021(HMGB2, High-mobility group box 2), 유전자 등록번호(Genebank) CR625391(RAD51AP1, RAD51 associated protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001067(TOP2A, Topoisomerase(DNA) II alpha 170kDa), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002875(RAD51, RAD51 homolog(RecA homolog,E. coli)(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003362(UNG, Uracil-DNA glycosylase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004111(FEN1, Flap structure-specific endonuclease 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006306(SMC1L1, SMC1 structural maintenance of chromosomes 1-like 1(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_007313(ABL1,V-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_130398(EXO1, Exonuclease 1), 유전자 등록번호(Genebank) CR604810(CCNA2, Cyclin A2), 유전자 등록번호(Genebank) D79987(ESPL1, Extra spindle poles like 1(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001759(CCND2, Cyclin D2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004526(MCM2,MCM2 minichromosome maintenance deficient 2, mitotin(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005915(MCM6, MCM6 minichromosome maintenance deficient 6(MIS5 homolog, S. pombe)(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_057749(CCNE2, Cyclin E2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_182776(MCM7, MCM7 minichromosome maintenance deficient 7(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) AB193259(ACE2, Angiotensin I converting enzyme(peptidyl-dipeptidase A) 2), 유전자 등록번호(Genebank) AB209350(PTK7, PTK7 protein tyrosine kinase 7), 유전자 등록번호(Genebank) AF279145(ANTXR1, Anthrax toxin receptor 1), 유전자 등록번호(Genebank) AF363367(IGSF4B, Immunoglobulin superfamily, member 4B), 유전자 등록번호(Genebank) AF435925(MASS1, Monogenic, audiogenic seizure susceptibility 1 homolog(mouse)), 유전자 등록번호(Genebank) AK123932(PAQR9, Progestin and adipoQ receptor family member IX), 유전자 등록번호(Genebank) AK131538(GPR133, Smoothelin), 유전자 등록번호(Genebank) BC035654(NR1H4, Nuclear receptor subfamily 1, group H,member 4), 유전자 등록번호(Genebank) BC043390(GLP2R, Glucagon-like peptide 2 receptor), 유전자 등록번호(Genebank) BC050450(LU, Lutheran blood group(Auberger b antigen included)), 유전자 등록번호(Genebank) BX391158(Homo sapiens reticulon 4 receptor(RTN4R), mRNA[NM_023004], Transcribed locus, weakly similar to NP_075380.1 reticulon 4 receptor precursor; nogo receptor; Nogo-66 receptor; UNQ330/PRO526[Homo sapiens]), 유전자 등록번호(Genebank) BX537531(FBLN5, Fibulin 5), 유전자 등록번호(Genebank) BX647179(DKFZp762F0713, Hypothetical protein DKFZp762F0713), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000683(ADRA2C, Adrenergic, alpha-2C-, 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CR749395(OVOS2, Ovostatin 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000893(KNG1, Kininogen 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002215(ITIH1, Inter-alpha(globulin) inhibitor H1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002615(SERPINF1, Serpin peptidase inhibitor, clade F(alpha-2 antiplasmin, pigment epithelium derived factor), member 1), 유전자 등록번호(Genebank) U44429(TPD52L1,Tumor protein D52-like 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK122686(IF, I factor(complement)), 유전자 등록번호(Genebank) BC022312(C4BPA,Complement component 4 binding protein, alpha), 유전자 등록번호(Genebank) CR749293(PLG, Plasminogen), 유전자 등록번호(Genebank) M75106(CPB2,Carboxypeptidase B2(plasma, carboxypeptidase U)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000066(C8B, Complement component 8,beta polypeptide), 유전자 등록번호(Genebank) AF130077(ALB, Albumin), 유전자 등록번호(Genebank) AF178930(CARD15, Caspase recruitment domain family, member 15), 유전자 등록번호(Genebank) AK098772(TUBB, Tubulin,beta), 유전자 등록번호(Genebank) BC035723(C6, Complement component 6), 유전자 등록번호(Genebank) BX647151(MYBL2, V-myb myeloblastosis viral oncogene 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CCAAT/enhancer binding protein(C/EBP), alpha), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005441(CHAF1B, Chromatin assembly factor 1, subunit B(p60)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005515(HLXB9, Homeo box HB9), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006163(NFE2, Nuclear factor(erythroid-derived 2), 45kDa), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006195(PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006454(MXD4, MAX dimerization protein 4), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015832(MBD2, Methyl-CpG binding domain protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_017409(HOXC10, Homeo box C10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022114(PRDM16, PR domain containing 16), 유전자 등록번호(Genebank) NM_024680(FLJ23311, E2F transcription factor 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_152989(SOX5, SRY(sex determining region Y)-box 5), 유전자 등록번 호(Genebank) NM_198159(MITF, Microphthalmia-associated transcription factor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_202002(FOXM1, Forkhead box M1), 유전자 등록번호(Genebank) AK001720(FLJ10858, Nei endonuclease VIII-like 3(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) AK024233(ZDHHC11, Zinc 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carrier family 11(proton-coupled divalent metal ion transporters, member 2), 유전자 등록번호(Genebank) CR936810(TF, Transferrin), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001011554(SLC13A3, Solute carrier family 13(sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001848(COL6A1, Collagen, type VI, alpha 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001853(COL9A3, Collagen, type IX, alpha 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002241(KCNJ10, Potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005629(SLC6A8, Solute carrier family 6(neurotransmitter transporter, creatine), member 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005835(SLC17A2, Solute carrier family 17(sodium phosphate), member 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006045(ATP9A, ATPase, Class II, type 9A), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020659(TTYH1, Tweety homolog 1(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020897(HCN3, Hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022154(SLC39A8, Solute carrier family 39(zinc transporter), member 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_033641(COL4A6, Collagen,type IV,alpha 6), 유전자 등록번호(Genebank) NM_139177(SLC39A11, Solute carrier family 39(metal ion transporter), member 11), 유전자 등록번호(Genebank) NM_153320(SLC22A7, Solute carrier family 22(organic anion transporter), member 7), 유전자 등록번호(Genebank) AB037805(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) AK000643(ASB9, Ankyrin repeat and SOCS box-containing 9), 유전자 등록번호(Genebank) AK055221(FBXO5, F-box protein 5), 유전자 등록번호(Genebank) AK074377(UHRF1, Chromosome 19 open reading frame 31), 유전자 등록번호(Genebank) AY007723(MAL2, Mal,T-cell differentiation protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC026283(APOH, Apolipoprotein H(beta-2-glycoprotein I)), 유전자 등록번호(Genebank) BI762502(GSTA2, Glutathione S-transferase A2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000277(PAH, Phenylalanine hydroxylase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001809(CENPA, Centromere protein A,17kDa), 유전자 등록번호(Genebank) CR933728(CDC2, Cell division cycle 2,G1 to S and G2 to M), 유전자 등록번호(Genebank) CR749293(PLG, Plasminogen), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004523(KIF11, Kinesin family member 11), 유전자 등록번호(Genebank) U65410(MAD2L1, MAD2 mitotic arrest deficient-like 1(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_145061(C13orf3, Chromosome 13 open reading frame 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_138555(KIF23, Kinesin family member 23), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014750(DLG7, Discs, large homolog 7(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BX640965(SLC22A3, Solute carrier family 22(extraneuronal monoamine transporter), member 3), 유전자 등록번호(Genebank) AK122685(GLUD1, Glutamate dehydrogenase 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000251(MSH2, MutS homolog 2,colon cancer, nonpolyposis type 1(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) BC008366(DDC, Dopa decarboxylase(aromatic L-amino acid decarboxylase)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016343(CENPF, Centromere protein F, 350/400ka(mitosin)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003318(TTK, TTK protein kinase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001025248(DUT, DUTP pyrophosphatase), 유전자 등록번호(Genebank) BC022255(Spc25, Spindle pole body component 25 homolog(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001801(CDO1, Cysteine dioxygenase,type I), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001790(CDC25C, Cell division cycle 25C), 유전자 등록번호(Genebank) NM_013277(RACGAP1, Rac GTPase activating protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC021267(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BM464538(C5orf13, Chromosome 5 open reading frame 13), 유전자 등록번호(Genebank) AB208919(FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1(fms-related tyrosine kinase 2, Pfeiffer syndrome)), 유전자 등록번호(Genebank) AY367065(ASPM, Asp(abnormal spindle)-like, microcephaly associated(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004701(CCNB2, Cyclin B2), 유전자 등록번호(Genebank) BC032677(UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2C), 유전자 등록번호(Genebank) AK122825(HMGB1, High-mobility group box 1), 유전자 등록번호(Genebank) AV741806(Homo sapiens high-mobility group box 1(HMGB1), mRNA[NM_002128], Transcribed locus, moderately similar to NP_990233.1 high mobility group 1 protein[Gallus gallus]), 유전자 등록번호(Genebank) BC015110(HHEX, Hematopoietically expressed homeobox).
본 발명자들은 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 바이오마커를 발굴하기 위하여, 벤조에이안트라센을 인간 간암 세포주(HepG2)에 처리하여 세포 독성을 확인하였다. 그 결과, 상기 벤조에이안트라센은 인간 간암 세포주에 독성을 가짐이 확인되었고(도 1 참조), 상기 실험을 바탕으로 벤조에이안트라센의 농도를 결정하였다. 이후 상기 결정된 농도로 벤조에이안트라센을 인간 간암 세포주에 처리하고, 상기 물질을 처리한 세포주에서 mRNA를 분리하여 cDNA를 합성하면서 형광물질(Cy5)로 표지하였으며, 약물을 처리하지 않은 대조군의 경우 Cy3로 표지하였다. 상기 형광표지된 cDNA를 44 k 올리고마이크로어레이 칩 Human whole genome microarray(Agilent, USA)와 혼성화하였고, 형광 이미지를 스캔하여 유전자 발현 양상의 차이를 분석하였다(도 2 참조). 분석시 Cy5/Cy3 비율이 2.0배 이상인 경우 발현 증가된 유전자로 분류하였고, 0.5배 이하인 경우 발현 감소된 유전자로 분류하였다. 분석 결과, 발현 증가된 유전자는 0.87%(44,000개의 유전자 중 379개) 발현이 감소된 유전자는 1.2%(44,000개의 유전자 중 529개)임을 확인하였다. 이때, 벤조에이안트라센에 의해 2배 이상 과발현 혹은 저발현 되는 유전자들을 분류한 기능별로 분류하면, 세포 증식(cell proliferation), 수용체 결합(receptor binding), 세포-세포 신호전달(cell-cell signaling), 효소조절자 활성(enzyme regulator activity), 세포사멸(cell death), 면역반응(immune response), 신호전달(signal transduction), 세포분화(cell differentiation), 사이토카인-사이토카인 수용체 상호작용(cytokine-cytokine receptor interaction), toll-like 수용체 신호전달 경로(toll-like receptor signaling pathway), Cytochrome P450에 의한 생체이물 대사(Metaboism of xenobiotics by cytochrome P450), 항원 프로세싱과 제시(antigen processing and presentation), 유기산대사(organic acid metabolism), 지질대사(lipid metabolism), 칼슘이온 결합(calcium ion binding), 갭 결합(Gap junction), MAPK 신호전달 경로(MAPK signaling pathway), 액틴 세포골격의 조절(regulation of actin cytoskeleton), 키나아제 활성(kinase activity), 스테로이드 생합성(biosynthesis of steroids), 세포분화(cell division), 구조분자 활성(structural molecule activity), DNA복구(DNA repair), 세포 주기(cell cycle), 수용체 활성(receptor activity), 축색 가이던스(Axon guidance), 보체 및 응고 캐스케이드(Complement and coagulation cascades), 전사조절(Transcription regulation), 징크-핑거(Zinc-finger), 이온수송(ion transport) 등의 관련 유전자들이었다(표 2 및 표 3참조). 상기 유전자들은 본 발명에서 사용한 벤조에이안트라센을 처리했을 때, 인간 간암 세포에서 독성과 관련이 있다는 보고는 없다.
또한, 본 발명은 상기 바이오마커 유전자 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 올리고뉴클레오티드 또는 그의 상보 가닥 분자가 집적된 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 DNA 마이크로어레이 칩을 제공한다.
상기 올리고 뉴클레오티드 또는 이의 상보가닥 분자는 상기 바이오마커 유전자의 18 내지 30개의 핵산을 포함하고, 바람직하게는 20 내지 25개의 핵산을 포함한다.
본 발명의 벤조에이안트라센 검색용 DNA 마이크로어레이 칩은 당업자에게 알려진 방법으로 제작할 수 있다. 상기 마이크로어레이 칩을 제작하는 방법은 하기와 같다. 상기 탐색된 바이오마커를 탐침 DNA 분자로 이용하여 DNA 칩의 기판 상에 고정화시키기 위해 파이조일렉트릭(piezoelectric) 방식을 이용한 마이크로피펫팅(micropipetting)법 또는 핀(pin) 형태의 스폿터(spotter)를 이용한 방법 등을 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 본 발명의 바람직한 실시예에서는 핀 형태의 스폿터인 마이크로어레이를 이용하였다. 상기 DNA 마이크로어레이 칩의 기판은 아미노-실란(amino-silane), 폴리-L-라이신(poly-L-lysine) 및 알데히드(aldehyde)로 이루어진 군에서 선택되는 하나의 활성기가 코팅된 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니다. 또한, 상기 기판은 슬라이드 글래스, 플라스틱, 금속, 실리콘, 나일론 막, 및 니트로셀룰로스 막(nitrocellulose membrane)으로 이루어진 군에서 선택될 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니며, 본 발명의 바람직한 실시 예에서는 아미노-실란이 코팅된 슬라이드 글래스를 이용하였다.
또한, 본 발명은 상기 바이오마커를 이용한 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법을 제공한다.
본 발명은 하기와 같은 과정을 포함하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법을 제공한다:
1) 인간 체세포에 피검화합물을 처리하는 단계;
2) 단계 1)의 피검 화합물을 처리한 실험군 세포와 피검화합물을 처리하지 않은 대조군 세포에서 RNA를 분리하는 단계;
3) 단계 2)의 실험군과 대조군의 RNA를 cDNA로 합성하면서 실험군과 대조군을 각기 다른 형광물질을 표지하는 단계;
4) 단계 3)의 각기 다른 형광물질로 표지된 cDNA를 DNA 마이크로어레이칩과 혼성화시키는 단계;
5) 단계 4)의 반응한 DNA 마이크로어레이 칩을 분석하는 단계; 및
6) 단계 5)의 분석한 데이터에서 본 발명의 바이오마커의 발현 정도를 대조군과 비교하여 확인하는 단계,
상기 노출 여부를 확인하는 방법에 있어서, 단계 1)의 체세포는 인간 간암 세포주(HepG2)를 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 인간의 간 또는 간암의 세포 및 조직에서 유래한 세포라면 모두 사용 가능하다.
상기 노출 여부를 확인하는 방법에 있어서, 단계 3)의 형광물질은 Cy3, Cy5, FITC(poly L-lysine-fluorescein isothiocyanate), RITC(rhodamine-B-isothiocyanate) 및 로다민(rhodamine)으로 이루어진 군으로부터 선택되어지는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 당업자에게 알려진 형광물질은 모두 사용 가능하다.
상기 노출 여부를 확인하는 방법에 있어서, 단계 5)의 DNA 마이크로어레이 칩은 Whole Human Genome Oligo Microarray(Agilent, USA)등을 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 인간 게놈 중 본 발명에서 상기 공통적으로 과발현 또는 저발현 유전자(표 2 및 포 3 참조)가 탑재된 마이크로어레이 칩이라면 사용 가능하고, 상기 본 발명자가 제작한 DNA 마이크로어레이 칩을 사용하는 것이 가장 바람직하다. 또한, 단계 5)의 분석 방법은 GenePix 4.1 소프트웨어(Axon Instruments, USA)를 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 당업자에게 알려진 분석 소프트웨어를 사용하여도 무방하다.
또한, 본 발명은 하기와 같은 과정을 포함하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법을 제공한다:
1) 인간 체세포에 피검화합물을 처리하는 단계;
2) 단계 1)의 피검화합물을 처리한 실험군 세포와 피검화합물을 처리하지 않은 대조군 세포에서 RNA를 분리하는 단계;
3) 단계 2)의 RNA를, 본 발명의 바이오마커 유전자에 상보적이고 바이오마커 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 사용하여 실시간 RT-PCR(Real-time reverse transcript polymerase chain reaction)을 수행하는 단계; 및
4) 단계 3)의 유전자 산물을 대조군과 비교하여 발현 정도를 확인하는 단계,
상기 노출 여부를 확인하는 방법에 있어서, 단계 1)의 체세포는 인간 간암 세포주(HepG2)를 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 인간의 간 또는 간암의 세포 및 조직에서 유래한 세포라면 모두 사용 가능하다.
상기 노출 여부를 확인하는 방법에 있어서, 단계 3)의 프라이머는 본 발명에서 탐색된 바이오마커 유전자와 상보적이고, 바이오마커를 증폭할 수 있는 프라이머라면 모두 사용가능하다.
아울러, 본 발명은 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 키트를 제공한다.
본 발명은 상기 본 발명에서 제작한 DNA 마이크로어레이 칩을 포함하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 키트를 제공한다.
상기 확인용 키트에 추가적으로 인간 간세포를 포함하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 키트를 제공한다. 상기 인간 간세포는 HepG2를 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 인간의 간 또는 간암의 세포 및 조직에서 유래한 세포라면 모두 사용 가능하다.
상기 키트에 추가적으로 형광물질을 포함할 수 있으며, 상기 형광물질은 스트렙아비딘-알칼리 탈인화효소 접합물질(strepavidin-like phosphatease conjugate), 화학형광물질(chemiflurorensce) 및 화학발광물질(chemiluminescent)로 이루어진 군으로부터 선택되는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 본 발명의 바람직한 실시 예에서는 Cy3와 Cy5를 사용하였다.
상기 키트에 추가적으로 반응 시약을 포함시킬 수 있으며, 상기 반응 시약은 혼성화에 사용되는 완충용액, RNA로부터 cDNA를 합성하기 위한 역전사효소, cNTPs 및 rNTP(사전 혼합형 또는 분리 공급형), 형광 염색제의 화학적 유도제와 같은 표식시약, 세척 완충용액 등으로 구성될 수 있으나 이에 한정된 것은 아니며, 당업자에게 알려진 DNA 마이크로어레이 칩의 혼성화 반응에 필요한 반응 시약은 모두 포함시킬 수 있다.
상기 키트에 추가적으로 바이오마커 유전자에 상보적이고, 바이오마커 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 포함시킬 수 있다. 상기 프라이머는 상기 바이오마커 유전자에 상보적이며, 바이오마커 유전자를 증폭할 수 있으며 증폭산물이 100 내지 300bp가 되도록 설계된 정방향 및 역방향 프라이머쌍은 모두 사용 가능하다.
이하, 본 발명을 실시 예에 의해 상세히 설명한다.
단, 하기 실시 예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시 예에 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> 세포 배양 및 화학물질 처리
<1-1> 세포배양
인간 간암 세포주인 HepG2 세포(한국 세포주 은행)를 10% FBS가 첨가된 DMEM 배지(Gibro-BRL, USA)를 이용하여 100 ㎜ 디쉬(dish)에서 80% 정도 자랄 때까지 배양하였다. 본 발명자들은 기존의 연구와 보고를 통해 다환방향족 탄화수소류의 하나로서 발암성을 가지고 있는 물질인 벤조에이안트라센을 선정하였으며, DMSO에 용해시켰다. 매질(vehicle) 농도는 모든 실험에서 0.1% 이하였다.
<1-2> 세포 독성 실험( MTT assay ) 및 화학 물질 처리
Mossman 등(J. Immunol. Methods, 65, 55-63, 1983)의 방법으로 HepG2 세포 주를 이용한 MTT 실험을 수행하였다. 세포는 24-웰 플레이트에 4× 105/웰 세포수로 DMEM 배지(Gibro-BRL, USA)에서 DMSO에 용해된 벤조에이안트라센을 처리하고 48시간 후에 MTT(3-4,5-dimethylthiazol-2,5-diphenyltetra zolium bromide) 5 ㎎/㎖을 혼합하여 튜브에 가하여 37℃에서 3 시간 동안 배양하였다. 이 후 배지를 제거하고 형성된 포르마잔 크리스탈(formazan crystal)을 DMSO 500 ㎕에 용해하였다. 96-웰 플레이트로 옮겨 분주(aliquot)하고 흡광도 540 nm에서 O.D.값을 측정하였다.
HepG2 세포주에서 벤조에이안트라센의 세포독성을 살펴본 결과, 20% 생존율을 보이는 농도(IC20)는 36.09 uM 이었으며(도 1 참조), 상기 농도들로 결정하여 마이크로어레이 실험을 수행하였다.
< 실시예 2> 마이크로어레이 실험
<2-1> 표적 RNA의 분리 및 형광 물질 표지
6 × 106 cell/㎖ 농도로 100 mm 디쉬에 HepG2 세포를 분주한 후, 실시예 1-2에서 결정된 벤조에이안트라센의 농도를 48 시간 동안 처리하였다. 이후, 상기 처리한 세포에서 트리졸(trizol) 시약(Invitrogen life technologies, USA)을 사용하여 제조사의 방법대로 전체 RNA를 분리하고, RNeasy mini kit(Qiagen, USA)를 사용하여 정제하였다. 게놈 DNA는 RNA 정제 동안 RNase-free DNase set(Qiagen, USA)를 사용하여 제거하였다. 각 전체 RNA 시료의 양은 분광광도계로 측정하였고, 농도는 Experion(Automated Electrophoresis station, Bio-Rad) 로 확인하였다.
<2-2> 표지된 cDNA 제조
올리고 마이크로어레이 분석을 위하여 실시 예 2-1에서 수득한 벤조에이안트라센 처리군의 전체 RNA를 사용하여 cDNA를 제조하였다. 상기 수득한 전체 RNA 30 ㎍과 올리고(dT) 프라이머 2 ㎍(1 ㎍/㎕)과 혼합하고 65℃에서 10분간 반응시킨 후 바로 얼음에 넣어 어닐링(annealing)시켰다. 상기 어닐링된 RNA의 역전사(Reverse Transcript) 반응을 위해 표 1과 같이 시약을 혼합하였다.
구성 부피(㎕)
5X first strand buffer 6
dNTPs 0.6
0.1 M DDT 3
SuperScript II enzyme 3
Cy-3 or Cy-5 dUTP 2
대조군인 HepG2 세포주에서 분리한 전체 RNA는 Cy3-dUTP(녹색)로 표지화하였고, 벤조에이안트라센을 처리한 HepG2 세포주로부터 분리한 RNA는 Cy5-dUTP(적색)로 표지화하였다. 이때 두 시료는 Microcon YM-30 컬럼(Millipore, USA)을 사용하여 혼합, 정제되었다.
<2-3> 혼성화 반응
혼성화 및 세척 과정은 지노첵(주)의 지시방법에 따라 수행되었다. 혼성화는 12시간 동안 62℃ 오븐에서 수행되었다. DNA 마이크로어레이 칩으로는 44 k Whole Human Genome Oligo Microarray(Agilent, USA)를 이용하였다. 세척(2분간 2× SSC/0.1% SDS에 세척, 3분간 1× SSC, 2분간 0.2× SSC에 세척) 후 슬라이드는 3분간 800 rpm으로 원심분리하여 건조하였다.
<2-4> 형광 이미지 획득
슬라이드 상의 혼성화 이미지는 Genepix 4000B(Axon Instruments, USA)로 스캔하였다. 결합하지 않은 유전자를 세척한 칩은 레이저 광 스캐너(laser fluorescence scanner)를 사용하여 형광 이미지를 획득하였다. 이때 녹색 형광 이미지는 대조군에서, 적색 형광 이미지는 실험군에서만 특이하게 발현되는 유전자의 활성정도를 나타내게 되며, 노란색 형광 이미지는 녹색과 적색의 보색으로 두 군의 발현이 큰 차이가 없음을 의미한다. 스캔한 이미지들은 유전자 발현 비율을 얻기 위하여 GenePix 4.1 소프트웨어(Axon Instruments, USA)로 분석하였다. 이렇게 하여 얻어진 데이터로부터 벤조에이안트라센에 대한 마커 유전자를 선별하였다(도 2 참조).
그 결과, 올리고 칩 상에 존재하는 대략 4만 4천 개의 유전자 중에서 벤조에이안트라센에 의해 Cy5/Cy3의 비율이 2.0배 이상으로 유전자 발현 증가를 보이는 유전자는 0.87%(44,000개의 유전자 중 379개) 발현이 감소된 유전자는 1.2%(44,000개의 유전자 중 529개)임을 확인하였다.
이때, 벤조에이안트라센에 의해 2배 이상 과발현 혹은 저발현 되는 유전자들을 기능별로 분류한 결과, 세포 증식(cell proliferation), 수용체 결합(receptor binding), 세포-세포 신호전달(cell-cell signaling), 효소조절자 활성(enzyme regulator activity), 세포사멸(cell death), 면역반응(immune response), 신호전달(signal transduction), 세포분화(cell differentiation), 사이토카인-사이토카인 수용체 상호작용(cytokine-cytokine receptor interaction), toll-like 수용체 신호전달 경로(toll-like receptor signaling pathway), Cytochrome P450에 의한 생체이물 대사(Metaboism of xenobiotics by cytochrome P450), 항원 프로세싱과 제시(antigen processing and presentation), 유기산대사(organic acid metabolism), 지질대사(lipid metabolism), 칼슘이온 결합(calcium ion binding), 갭 결합(Gap junction), MAPK 신호전달 경로(MAPK signaling pathway), 액틴 세포골격의 조절(regulation of actin cytoskeleton), 키나아제 활성(kinase activity), 스테로이드 생합성(biosynthesis of steroids), 세포분화(cell division), 구조분자 활성(structural molecule activity), DNA복구(DNA repair), 세포 주기(cell cycle), 수용체 활성(receptor activity), 축색 가이던스(Axon guidance), 보체 및 응고 캐스케이드(Complement and coagulation cascades), 전사조절(Transcription regulation), 징크-핑거(Zinc-finger), 이온수송(ion transport)(표 2 및 3). 상기 유전자들은 본 발명에서 사용한 벤조에이안트라센을 처리 했을 때, 인간 간암 세포에서 독성과 관련이 있다는 보고는 없다.
벤조에이안트라센에 의해 발현이 증가하는 유전자
등록번호 유전자 약어 유전자명 중간값의 비
(a) 세포증식(cell proliferation)
AK074652 SERTAD1 SERTA domain containing 1 2.4041
BC042390 VTI1B Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B(yeast) 2.4964
BX647402 SAS Tetraspanin 31 2.0384
NM_000678 ADRA1D Adrenergic, alpha-1D-, receptor 3.0688
NM_005438 FOSL1 FOS-like antigen 1 2.7199
Y11307 CYR61 Cysteine-rich, angiogenic inducer, 61 5.2010
(b) 수용체 결합(receptor binding)
AB208949 LRDD Leucine-rich repeats and death domain containing 2.2505
AK129833 TFPI2 Tissue factor pathway inhibitor 2 3.6519
BC063835 VGF VGF nerve growth factor inducible 2.5555
BF569086 NK4 Interleukin 32 2.0342
BM923753 TFF1 Trefoil factor 1 (breast cancer, estrogen-inducible sequence expressed in) 2.4039
NM_004864 GDF15 Growth differentiation factor 15 5.1426
NM_005242 F2RL1 Coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1 2.5739
(c) 세포-세포 신호전달(cell-cell signaling)
AB210045 KIF5A Kinesin family member 5A 2.5406
D86962 GRB10 Growth factor receptor-bound protein 10 2.1279
NM_000582 SPP1 Secreted phosphoprotein 1(osteopontin, bone sialoprotein I, early T-lymphocyte activation 1) 2.8737
NM_001657 AREG Amphiregulin (schwannoma-derived growth factor) 8.0196
NM_006200 PCSK5 Proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 2.0296
NM_006350 FST Follistatin 2.5516
(d) 효소조절자 활성(enzyme regulator activity)
AF070599 PPP1R11 Protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 11 6.3421
AK095888 CD109 CD109 antigen(Gov platelet alloantigens) 4.5234
BC007251 ARHGAP5 Rho GTPase activating protein 5 2.6608
BC033823 P58; HP58; PRKRI; P58IPK DnaJ(Hsp40) homolog, subfamily C, member 3 3.1128
BX640597 SERPINB5 Serpin peptidase inhibitor, clade B(ovalbumin), member 5 2.2865
BX647459 SERPINE2 Serpin peptidase inhibitor, clade E(nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 2 2.9178
BX649164 PAI; PAI1; PAI-1; PLANH1 serpin peptidase inhibitor, clade E(nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 1 4.3989
CD520285 CSTA Cystatin A(stefin A) 2.5871
CR622682 ANXA2 Annexin A2 2.3365
NM_001175 ARHGDIB Rho GDP dissociation inhibitor(GDI) beta 2.1839
NM_003122 SPINK1 Serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 2.2116
NM_003955 SOCS3 Suppressor of cytokine signaling 3 2.5738
NM_004877 GMFG Glia maturation factor, gamma 3.8902
NM_015071 ARHGAP26 Rho GTPase activating protein 26 3.3649
NM_025195 TRIB1 Tribbles homolog 1 (Drosophila) 2.2986
NM_078487 CDKN2B Cyclin-dependent kinase inhibitor 2B(p15, inhibits CDK4) 2.8503
NM_198833 SERPINB8 Serpin peptidase inhibitor, clade B(ovalbumin), member 8 3.0128
(e) 세포사멸(cell death)
BC012609 SERPINB2 Serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 2 3.8957
BF690887 BCL2A1 BCL2-related protein A1 4.9533
BM556279 EMP3 Epithelial membrane protein 3 2.1707
BX647822 FOSL2 FOS-like antigen 2 2.0574
NM_001165 BIRC3 Baculoviral IAP repeat-containing 3 2.5694
NM_002305 LGALS1 Lectin, galactoside-binding, soluble, 1(galectin 1) 2.6751
NM_003311 PHLDA2 Pleckstrin homology-like domain, family A, member 2 3.0232
NM_003897 IER3 Immediate early response 3 4.0162
NM_078467 CDKN1A Cyclin-dependent kinase inhibitor 1A(p21, Cip1) 4.1174
NM_198951 TGM2 Transglutaminase 2(C polypeptide, protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase) 3.0897
(f) 면역 반응(immune response)
AF031469 MR1 Major histocompatibility complex, class I-related 2.0802
AL832451 DKFZp451C2311 guanylate binding protein 2, interferon-inducible 3.1078
BG564326 SAA4 Serum amyloid A4, constitutive 4.9242
CR936755 GBP3 Guanylate binding protein 3 2.3882
NM_000022 ADA Adenosine deaminase 2.1374
NM_005238 ETS1 V-ets erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1(avian) 2.6998
NM_006404 PROCR Protein C receptor,endothelial(EPCR) 4.0931
(g) 신호 전달(signal transduction)
AK094474 RHOC Ras homolog gene family, member C 2.2908
AK095384 PDE4C Phosphodiesterase 4C, cAMP-specific(phosphodiesterase E1 dunce homolog, Drosophila) 3.7213
AK096685 TGFBRAP1 Transforming growth factor, beta receptor associated protein 1 2.3246
AK124869 LOC400745 Hypothetical protein LOC149194 3.0838
BC006523 SGK2 Serum/glucocorticoid regulated kinase 2 2.2610
BC027965 GPR109A G protein-coupled receptor 109A 2.6368
BC033097 HBEGF Heparin-binding EGF-like growth factor 2.2611
BC033829 AKAP12 A kinase(PRKA) anchor protein(gravin) 12 2.7546
BC034282 PPP2CA Protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform 2.1879
BC042060 OR7E47P Olfactory receptor, family 7, subfamily E, member 47 pseudogene 2.2052
BG036385 RAMP1 Receptor(calcitonin) activity modifying protein 1 3.2320
BU587578 RGS10 Regulator of G-protein signalling 10 3.6750
CR601067 PLAUR Plasminogen activator, urokinase receptor 3.0258
CR602522 EDN1 Endothelin 1 2.0607
CR936799 FHL2 Four and a half LIM domains 2 3.4421
NM_001005196 OR8B4 Olfactory receptor, family 8, subfamily B, member 4 2.9098
NM_002867 RAB3B RAB3B, member RAS oncogene family 2.5932
NM_013255 MKLN1 Muskelin 1, intracellular mediator containing kelch motifs 2.0638
NM_014391 ANKRD1 Ankyrin repeat domain 1(cardiac muscle) 2.2318
NM_021990 GABRE Gamma-aminobutyric acid(GABA) A receptor, epsilon 2.4073
NM_022648 TNS Tensin 1 2.6217
NM_080927 DCBLD2 Discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 2.0347
NM_177403 RAB7B RAB7B, member RAS oncogene family 2.0503
XM_497958 OR7E85P Olfactory receptor, family 7, subfamily E, member 85 pseudogene 2.4439
Y10529 Homo sapiens olfactory receptor, family 7, subfamily E, member 24(OR7E24) on chromosome 19 [NR_002146] Putative olfactory receptor(clone ht2) 2.4970
(h) 세포분화(cell differentiation)
AF003837 JAG1 Jagged 1(Alagille syndrome) 2.2373
BM913048 TIMP1 TIMP metallopeptidase inhibitor 1 5.9568
NM_000732 CD3D CD3D antigen, delta polypeptide(TiT3 complex) 8.4700
NM_001013398 IGFBP3 Insulin-like growth factor binding protein 3 5.1843
NM_002478 MYOD1 Myogenic differentiation 1 2.3332
NM_003873 NRP1 Neuropilin 1 2.5431
NM_005170 ASCL2 Achaete-scute complex-like 2(Drosophila) 2.4238
NM_007129 ZIC2 Zic family member 2(odd-paired homolog, Drosophila) 2.9861
(i) 사이토카인-사이토카인 수용체 상호작용(cytokine-cytokine receptor interaction)
AB209361 FAS Fas(TNF receptor superfamily, member 6) 2.9040
AF520785 TNFSF15 Tumor necrosis factor(ligand) superfamily, member 15 3.0908
BC071710 IL2RG Interleukin 2 receptor, gamma(severe combined immunodeficiency) 2.0149
CR591007 CCL3 Chemokine(C-C motif) ligand 3 2.1758
NM_000418 IL4R Interleukin 4 receptor 2.0557
NM_000565 IL6R Interleukin 6 receptor 2.4107
NM_000641 IL11 Interleukin 11 5.1950
NM_002309 LIF Hypothetical protein MGC20647 3.4146
NM_004167 CCL14 Chemokine(C-C motif) ligand 15 3.0649
NM_172212 CSF1 Colony stimulating factor 1(macrophage) 2.4179
(j) Toll-like 수용체 신호전달 경로(Toll-like receptor signaling pathway)
AB020807 TLR6 Toll-like receptor 6 2.0480
BM918324 LY96 Lymphocyte antigen 96 3.3350
NM_003263 TLR1 Toll-like receptor 1 2.6780
(k) 사이토크롬 P450에 의한 생체이물 대사(metabolism of xenobiotics by Cytochrome P450)
BC011409 UGT1A6 UDP glucuronosyltransferase 1 family, polypeptide A9 7.6622
NM_000104 CYP1B1 Cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1 3.5798
NM_000499 CYP1A1 Cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 1 90.8710
NM_030622 CYP2S1 Cytochrome P450, family 2, subfamily S, polypeptide 1 2.2449
(l) 항원 프로세싱과 제시(antigen processing and presentation)
NM_007360 KLRK1 Killer cell lectin-like receptor subfamily K, member 1 2.4797
NM_147780 CTSB Cathepsin B 3.2580
(m) 유기산대사(organic acid metabolism)
AK172798 CPT1A Carnitine palmitoyltransferase 1A(liver) 2.1466
BC000012 GFPT2 Glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 3.6508
NM_000353 TAT Tyrosine aminotransferase 2.9399
NM_013246 CLC Cardiotrophin-like cytokine factor 1 4.7496
NM_203327 SLC23A2 Solute carrier family 23(nucleobase transporters), member 2 2.3356
(n) 지질대사(lipid metabolism)
AF524864 AKR1B10 Aldo-keto reductase family 1, member B10(aldose reductase) 2.3633
AK057762 TDH L-threonine dehydrogenase 2.2723
AK091948 LTB4DH Leukotriene B4 12-hydroxydehydrogenase 2.5584
BC034763 FDXR Ferredoxin reductase 2.5500
BC094756 CRA Myotubularin related protein 11 2.7273
BG567934 APOM Apolipoprotein M 2.0719
BQ939577 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1, member C3(3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase, type II) 2.0317
NM_000860 HPGD Hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15-(NAD) 2.3102
NM_004278 PIGL Phosphatidylinositol glycan, class L 2.2041
NM_203380 ACSL5 Acyl-CoA synthetase long-chain family member 5 2.1892
(o) 칼슘이온 결합(calcium ion binding)
AB033060 PDCD6 Aryl-hydrocarbon receptor repressor 2.2577
AK124751 CAPN2 Calpain 2,(m/II) large subunit 3.5076
BC028354 PLSCR4 Phospholipid scramblase 4 2.1592
BG571732 S100P S100 calcium binding protein P 2.8905
BQ683841 S100A11 S100 calcium binding protein A11(calgizzarin) 2.9780
NM_006471 MRCL3 Myosin regulatory light chain MRCL3 2.0074
NM_032468 ASPH Aspartate beta-hydroxylase 2.2048
NM_080388 S100A16 S100 calcium binding protein A16 2.3793
NM_201631 TGM5 Transglutaminase 5 2.1296
(p) 갭 결합(Gap junction)
AK092677 TUBB6 Tubulin, beta 6 3.5150
NM_001963 EGF Epidermal growth factor(beta-urogastrone) 2.0572
NM_005633 SOS1 Son of sevenless homolog 1(Drosophila) 3.1738
(q) MAPK 신호전달 경로(MAPK signaling pathway)
AK122902 TGFB3 Transforming growth factor, beta 3 2.0871
NM_004419 DUSP5 Dual specificity phosphatase 5 6.5254
(r) 액틴 세포골격의 조절(Regulation of actin cytoskeleton)
CR614015 CD14 CD14 antigen 3.1069
NM_005228 EGFR Epidermal growth factor receptor(erythroblastic leukemia viral(v-erb-b) oncogene homolog, avian) 2.2205
X17033 ITGA2 Integrin, alpha 2 (CD49B, alpha 2 subunit of VLA-2 receptor) 3.2473
(s) 기타(The others)
AB075871 FLJ42654 Golgi transport 1 homolog A(S. cerevisiae) 2.0455
AK095363 AQP3 Aquaporin 3 5.7494
BQ276852 TMSB10 Thymosin, beta 10 2.0170
BU945318 Homo sapiens metalloth ionein 2A(MT2A), mRNA [NM_005953] Hypothetical gene supported by X97260; BC070289 3.2617
H18681 C20orf139 Sulfiredoxin 1 homolog(S.cerevisiae) 2.3243
NM_001007271 DUSP13 Dual specificity phosphatase 13 2.7455
NM_001013632 LOC343521 Similar to hypothetical protein 4833401D15 2.7628
NM_022153 PP2135 Chromosome 10 open reading frame 54 7.0025
NM_203403 C9orf150 Chromosome 9 open reading frame 150 2.4481
NM_031286 SH3BGRL3 SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3 3.0401
NM_147780 CTSB Cathepsin B 1.9929
W84524 TM4SF5 Transmembrane 4L six family member 5 1.9251
AB209586 MAPK13 Mitogen-activated protein kinase 13 1.8811
NM_003330 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1 1.8051
CR608156 HIST1H2AC Histone 1, H2ac 1.8048
NM_005979 S100A13 S100 calcium binding protein A13 1.7849
AK092512 SLC16A5 Solute carrier family 16(monocarboxylic acid transporters), member 5 1.7968
NM_001983 ERCC1 Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1(includes overlapping antisense sequence) 1.7323
BM904612 S100A6 S100 calcium binding protein A6(calcyclin) 1.7300
BX537968 LOC51149 Hypothetical LOC51149 1.6902
AA627222 LGALS1 Lectin, galactoside-binding, soluble, 1(galectin 1) 1.6654
CR612719 GADD45A Growth arrest and DNA-damage-inducible, alpha 1.6357
NM_001421 ELF4 E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) 1.5892
AK126182 KIAA1949 KIAA1949 1.5632
BX436525 HIST1H2BH Histone 1, H2bh 1.5612
NM_001769 CD9 CD9 antigen(p24) 1.5452
BX647290 HIST1H2BO Histone 1, H2bo 1.5323
BC101655 HIST1H2BI Histone 1, H2bi 1.5282
벤조에이안트라센에 의해 발현이 감소하는 유전자
등록번호 유전자 약어 유전자 명 중간값의 비
(a) 키나아제 활성(kinase activity)
AB020641 PFTK1 PFTAIRE protein kinase 1 0.2184
AB209667 RPS6KA5 Ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 5 0.3408
AK093396 ULK4 Unc-51-like kinase 4(C. elegans) 0.2532
AK122808 STK33 Serine/threonine kinase 33 0.4673
AK124653 WNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 0.4534
BC010082 ETNK2 Ethanolamine kinase 2 0.3550
BC039363 EPHA10 EPH receptor A10 0.4556
NM_001005862 ERBB2 V-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog(avian) 0.3886
NM_002758 MAP2K6 Mitogen-activated protein kinase kinase 6 0.4747
NM_003258 TK1 Thymidine kinase 1, soluble 0.4743
NM_005400 PRKCE Protein kinase C, epsilon 0.2983
NM_014215 INSRR Insulin receptor-related receptor 0.4267
NM_014264 PLK4 Polo-like kinase 4(Drosophila) 0.4257
NM_014791 MELK Maternal embryonic leucine zipper kinase 0.4500
NM_015148 PASK PAS domain containing serine/threonine kinase 0.3574
NM_018492 PBK PDZ binding kinase 0.4355
NM_022445 TPK1 Thiamin pyrophosphokinase 1 0.2601
XM_051017 KIAA0657 Obscurin-like 1 0.4425
(b) 지질대사(lipid metabolism)
AF059203 SOAT2 Sterol O-acyltransferase 2 0.4399
AF202889 APOA5 Apolipoprotein A-V 0.2938
AF220490 PLA2G3 Phospholipase A2, group III 0.4764
AF288389 GLT25D2 Glycosyltransferase 25 domain containing 2 0.4846
AK124635 PCSK9 Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 0.1442
AL138578 ADPN Adiponutrin 0.4921
BC000054 DHCR7 7-dehydrocholesterol reductase 0.4214
BC026264 UGT2B4 UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B4 0.2892
BC035638 LSS Lanosterol synthase (2,3-oxidosqualene-lanosterol cyclase) 0.3836
BC050292 DTX2 Deltex homolog 2(Drosophila) 0.4022
BC051385 SREBF2 Sterol regulatory element binding transcription factor 2 0.4848
BI521580 APOC3 Apolipoprotein C-III 0.3418
BX641139 SHC3 SHC(Src homology 2 domain containing) transforming protein 3 0.3871
CR595353 CD74 CD74 antigen(invariant polypeptide of major histocompatibility complex, class II antigen-associated) 0.4563
J05428 UGT2B7 UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B7 0.4792
NM_000102 CYP17A1 Cytochrome P450, family 17, subfamily A, polypeptide 1 0.3571
NM_000236 LIPC Lipase, hepatic 0.4844
NM_001701 BAAT Bile acid Coenzyme A: amino acid N-acyltransferase (glycine N-choloyltransferase) 0.2617
NM_002130 HMGCS1 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) 0.3051
NM_004104 FASN Fatty acid synthase 0.3904
NM_005063 SCD Stearoyl-CoA desaturase(delta-9-desaturase) 0.2804
NM_016373 WWOX WW domain containing oxidoreductase 0.1704
NM_020918 GPAM Glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial 0.3033
NM_030758 OSBP2 Oxysterol binding protein 2 0.1297
NM_198843 SFTPB Surfactant, pulmonary-associated protein B 0.3450
U36798 PDE3A Phosphodiesterase 3A, cGMP-inhibited 0.4198
X91148 MTP Microsomal triglyceride transfer protein 0.4662
Z28339 AKR1D1 Aldo-keto reductase family 1, member D1(delta 4-3-ketosteroid-5-beta-reductase) 0.2378
(c) 스테로이드 생합성(Biosynthesis of steroids)
AB209229 MVD Mevalonate(diphospho) decarboxylase 0.3516
BX648472 IDI1 Isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1 0.4918
NM_000859 HMGCR 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase 0.4188
NM_003129 SQLE Squalene epoxidase 0.4368
(d) 세포분화(cell division)
AK091289 ZNF367 Zinc finger protein 367 0.4515
AY367065 ASPM Asp(abnormal spindle)-like, microcephaly associated(Drosophila) 0.4809
BC011000 CDCA5 Cell division cycle associated 5 0.4286
CR592757 BRRN1 Barren homolog 1(Drosophila) 0.4934
NM_001813 CENPE Centromere protein E, 312kDa 0.4076
NM_152526 ALS2CR19 Amyotrophic lateral sclerosis 2(juvenile) chromosome region, candidate 19 0.1275
(e) 구조분자 활성(structural molecule activity)
AF018081 COL18A1 Collagen, type XVIII, alpha 1 0.4286
AF234887 CELSR2 Cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (flamingo homolog, Drosophila) 0.3328
AK130644 SLCO3A1 Solute carrier organic anion transporter family, member 3A1 0.4058
AY358094 CLDN17 Claudin 17 0.3772
BC045606 NID Nidogen 1 0.4665
BC052951 LMNB1 Lamin B1 0.4652
NM_001844 COL2A1 Collagen, type II, alpha 1(primary osteoarthritis, spondyloepiphyseal dysplasia, congenital) 0.1224
NM_001856 COL16A1 Collagen, type XVI, alpha 1 0.4297
NM_002381 MATN3 Matrilin 3 0.4365
NM_005560 LAMA5 Laminin, alpha 5 0.4884
NM_015059 TLN2 Talin 2 0.4192
NM_015180 SYNE2 Spectrin repeat containing, nuclear envelope 2 0.4186
NM_016835 MAPT Microtubule-associated protein tau 0.3529
NM_021135 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 2 0.4616
NM_025074 FRAS1 Fraser syndrome 1 0.4416
(f) DNA 복구(DNA repair)
AK074077 SDK1 Sidekick homolog 1(chicken) 0.4906
BX248766 RAD51L1 RAD51-like 1(S. cerevisiae) 0.4052
CR600021 HMGB2 High-mobility group box 2 0.4561
CR625391 RAD51AP1 RAD51 associated protein 1 0.4609
NM_001067 TOP2A Topoisomerase(DNA) II alpha 170kDa 0.4911
NM_002875 RAD51 RAD51 homolog(RecA homolog, E. coli)(S. cerevisiae) 0.4690
NM_003362 UNG Uracil-DNA glycosylase 0.4527
NM_004111 FEN1 Flap structure-specific endonuclease 1 0.4139
NM_006306 SMC1L1 SMC1 structural maintenance of chromosomes 1-like 1(yeast) 0.4994
NM_007313 ABL1 V-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 1 0.4814
NM_130398 EXO1 Exonuclease 1 0.4202
(g) 세포주기(Cell cycle)
CR604810 CCNA2 Cyclin A2 0.4195
D79987 ESPL1 Extra spindle poles like 1(S. cerevisiae) 0.4411
NM_001759 CCND2 Cyclin D2 0.3389
NM_004526 MCM2 MCM2 minichromosome maintenance deficient 2, mitotin(S. cerevisiae) 0.3805
NM_005915 MCM6 MCM6 minichromosome maintenance deficient 6(MIS5 homolog, S. pombe)(S. cerevisiae) 0.3744
NM_057749 CCNE2 Cyclin E2 0.4850
NM_182776 MCM7 MCM7 minichromosome maintenance deficient 7(S. cerevisiae) 0.4034
(h) 수용체 활성(receptor activity)
AB193259 ACE2 Angiotensin I converting enzyme (peptidyl-dipeptidase A) 2 0.3735
AB209350 PTK7 PTK7 protein tyrosine kinase 7 0.4774
AF279145 ANTXR1 Anthrax toxin receptor 1 0.2654
AF363367 IGSF4B Immunoglobulin superfamily, member 4B 0.4360
AF435925 MASS1 Monogenic, audiogenic seizure susceptibility 1 homolog(mouse) 0.1766
AK123932 PAQR9 Progestin and adipoQ receptor family member IX 0.4509
AK131538 GPR133 Smoothelin 0.4547
BC035654 NR1H4 Nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4 0.3891
BC043390 GLP2R Glucagon-like peptide 2 receptor 0.2394
BC050450 LU Lutheran blood group(Auberger b antigen included) 0.4006
BX391158 Homo sapiens reticulon 4 receptor(RTN4R), mRNA[NM_023004] Transcribed locus, weakly similar to NP_075380.1 reticulon 4 receptor precursor; nogo receptor; Nogo-66 receptor; UNQ330/PRO526 [Homo sapiens] 0.3155
BX537531 FBLN5 Fibulin 5 0.1757
BX647179 DKFZp762F0713 Hypothetical protein DKFZp762F0713 0.4986
NM_000683 ADRA2C Adrenergic, alpha-2C-, receptor 0.3441
NM_001003679 LEPR Leptin receptor 0.2626
NM_001049 SSTR1 Somatostatin receptor 1 0.3374
NM_002847 PTPRN2 Protein tyrosine phosphatase, receptor type, N polypeptide 2 0.1895
NM_005631 SMO Smoothened homolog(Drosophila) 0.4707
NM_020242 KNSL7 Kinesin family member 15 0.3960
NM_080744 SRCRB4D Scavenger receptor cysteine rich domain containing, group B(4 domains) 0.3198
(i) 축색 가이던스(Axon guidance)
AB002438 SEMA6A Sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain,(semaphorin) 6A 0.4820
AB210030 SEMA4D Sema domain, immunoglobulin domain(Ig), transmembrane domain(TM) and short cytoplasmic domain,(semaphorin) 4D 0.4211
CR616314 MRPL43 Mitochondrial ribosomal protein L43 0.4965
NM_005232 EPHA1 EPH receptor A1 0.4730
NM_006080 SEMA3A Sema domain, immunoglobulin domain(Ig), short basic domain, secreted,(semaphorin) 3A 0.3019
NM_032108 SEMA6B Sema domain, transmembrane domain(TM), and cytoplasmic domain,(semaphorin) 6B 0.4813
(j) 효소조절자 활성(enzyme regulator activity)
AB051503 CENTB5 Centaurin, beta 5 0.4764
AF086413 MCF2L MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 0.4747
AF323119 NFE2L2 Nuclear factor(erythroid-derived 2)-like 2 0.4936
AK075356 WFIKKN1 WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 1 0.3118
AK127255 SNX26 Sorting nexin 26 0.4084
AK223503 CASP1 Caspase 1, apoptosis-related cysteine peptidase(interleukin 1, beta, convertase) 0.3674
BC048198 AHSG Alpha-2-HS-glycoprotein 0.4304
BI819219 SCGB1A1 Secretoglobin, family 1A, member 1(uteroglobin) 0.4403
BX248009 SERPINA4 Serpin peptidase inhibitor, clade A(alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 4 0.4183
BX648170 RALGPS1 Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 0.3966
CR749395 OVOS2 Ovostatin 2 0.4822
NM_000893 KNG1 Kininogen 1 0.3105
NM_002215 ITIH1 Inter-alpha(globulin) inhibitor H1 0.3356
NM_002615 SERPINF1 Serpin peptidase inhibitor, clade F(alpha-2 antiplasmin, pigment epithelium derived factor), member 1 0.4545
U44429 TPD52L1 Tumor protein D52-like 1 0.4224
(k) 보체 및 응고 캐스케이드(Complement and coagulation cascades)
AK122686 IF I factor(complement) 0.4802
BC022312 C4BPA Complement component 4 binding protein, alpha 0.4047
CR749293 PLG Plasminogen 0.3099
M75106 CPB2 Carboxypeptidase B2(plasma, carboxypeptidase U) 0.3864
NM_000066 C8B Complement component 8, beta polypeptide 0.3773
(l) 세포사멸(Cell death)
AF130077 ALB Albumin 0.4285
AF178930 CARD15 Caspase recruitment domain family, member 15 0.4050
AK098772 TUBB Tubulin, beta 0.4114
BC035723 C6 Complement component 6 0.3232
BX647151 MYBL2 V-myb myeloblastosis viral oncogene homolog(avian)-like 2 0.3318
NM_148957 TNFRSF19 Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 19 0.4626
(m) 전사조절(transcription regulation)
AB209378 TBX2 T-box 2 0.4203
AF241528 HOXD1 Homeo box D1 0.4424
AK025758 NFATC2 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 0.4400
AK095154 AES Amino-terminal enhancer of split 0.2775
AK126074 DPF3 D4, zinc and double PHD fingers, family 3 0.3823
AY198414 PRDM1 PR domain containing 1, with ZNF domain 0.4163
BC005812 DLX4 Distal-less homeobox 4 0.3794
BC040991 TFDP2 Transcription factor Dp-2(E2F dimerization partner 2) 0.4922
BC042297 UBTF Upstream binding transcription factor, RNA polymerase I 0.3645
CR625990 PC4 SUB1 homolog(S. cerevisiae) 0.4609
NM_003200 TCF3 Transcription factor 3(E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47) 0.4443
NM_004364 CEBPA CCAAT/enhancer binding protein(C/EBP), alpha 0.3443
NM_005441 CHAF1B Chromatin assembly factor 1, subunit B(p60) 0.4606
NM_005515 HLXB9 Homeo box HB9 0.4882
NM_006163 NFE2 Nuclear factor(erythroid-derived 2), 45kDa 0.3312
NM_006195 PBX3 Pre-B-cell leukemia transcription factor 3 0.4780
NM_006454 MXD4 MAX dimerization protein 4 0.4397
NM_015832 MBD2 Methyl-CpG binding domain protein 2 0.3038
NM_017409 HOXC10 Homeo box C10 0.4927
NM_022114 PRDM16 PR domain containing 16 0.4551
NM_024680 FLJ23311 E2F transcription factor 8 0.4926
NM_152989 SOX5 SRY(sex determining region Y)-box 5 0.4881
NM_198159 MITF Microphthalmia-associated transcription factor 0.4307
NM_202002 FOXM1 Forkhead box M1 0.4441
(n) 징크-핑거(zinc-finger)
AK001720 FLJ10858 Nei endonuclease VIII-like 3(E. coli) 0.4147
AK024233 ZDHHC11 Zinc finger, DHHC-type containing 11 0.4641
AL543755 VAV3 Vav 3 oncogene 0.4778
BC033086 TCF19 Transcription factor 19(SC1) 0.3499
BC092512 MYRIP Myosin VIIA and Rab interacting protein 0.4377
BC098585 TCEA2 Transcription elongation factor A(SII), 2 0.4574
NM_001822 CHN1 Chimerin(chimaerin) 1 0.4937
NM_003250 THRA Thyroid hormone receptor, alpha(erythroblastic leukemia viral(v-erb-a) oncogene homolog, avian) 0.4860
NM_006892 DNMT3B DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta 0.4844
NM_020062 SLC2A4RG SLC2A4 regulator 0.4969
(o) 이온수송(ion transport)
AF331525 SLC26A9 Solute carrier family 26, member 9 0.4406
AJ441078 ATP10D ATPase, Class V, type 10D 0.4209
AY043484 SCN1A Sodium channel, voltage-gated, type I, alpha 0.4425
BC048332 SLC5A9 Solute carrier family 5(sodium/glucose cotransporter), member 9 0.4771
BC100014 SLC11A2 Solute carrier family 11(proton-coupled divalent metal ion transporters), member 2 0.4714
CR936810 TF Transferrin 0.3951
NM_001011554 SLC13A3 Solute carrier family 13(sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3 0.2835
NM_001848 COL6A1 Collagen, type VI, alpha 1 0.4436
NM_001853 COL9A3 Collagen, type IX, alpha 3 0.4121
NM_002241 KCNJ10 Potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 0.4994
NM_005629 SLC6A8 Solute carrier family 6(neurotransmitter transporter, creatine), member 8 0.3738
NM_005835 SLC17A2 Solute carrier family 17(sodium phosphate), member 2 0.3875
NM_006045 ATP9A ATPase, Class II, type 9A 0.4600
NM_020659 TTYH1 Tweety homolog 1(Drosophila) 0.2430
NM_020897 HCN3 Hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 3 0.4397
NM_022154 SLC39A8 Solute carrier family 39(zinc transporter), member 8 0.3765
NM_033641 COL4A6 Collagen, type IV, alpha 6 0.4547
NM_139177 SLC39A11 Solute carrier family 39(metal ion transporter), member 11 0.4992
NM_153320 SLC22A7 Solute carrier family 22(organic anion transporter), member 7 0.3575
(p) 기타(The others)
AB037805 KLHL14 Kelch-like 14(Drosophila) 0.4752
AK000643 ASB9 Ankyrin repeat and SOCS box-containing 9 0.4408
AK055221 FBXO5 F-box protein 5 0.4347
AK074377 UHRF1 Chromosome 19 open reading frame 31 0.3337
AY007723 MAL2 Mal, T-cell differentiation protein 2 0.4618
BC026283 APOH Apolipoprotein H(beta-2-glycoprotein I) 0.4356
BI762502 GSTA2 Glutathione S-transferase A2 0.3948
NM_000277 PAH Phenylalanine hydroxylase 0.3809
NM_001809 CENPA Centromere protein A, 17kDa 0.4446
CR933728 CDC2 Cell division cycle 2, G1 to S and G2 to M 0.5087
CR749293 PLG Plasminogen 0.5093
NM_004523 KIF11 Kinesin family member 11 0.5096
U65410 MAD2L1 MAD2 mitotic arrest deficient-like 1(yeast) 0.5103
NM_145061 C13orf3 Chromosome 13 open reading frame 3 0.5206
NM_138555 KIF23 Kinesin family member 23 0.5246
NM_014750 DLG7 Discs, large homolog 7(Drosophila) 0.5254
BX640965 SLC22A3 Solute carrier family 22(extraneuronal monoamine transporter), member 3 0.5275
AK122685 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1 0.5331
NM_000251 MSH2 MutS homolog 2, colon cancer, nonpolyposis type 1(E. coli) 0.5381
BC008366 DDC Dopa decarboxylase(aromatic L-amino acid decarboxylase) 0.5453
NM_016343 CENPF Centromere protein F, 350/400ka(mitosin) 0.5468
NM_003318 TTK TTK protein kinase 0.5501
NM_001025248 DUT DUTP pyrophosphatase 0.5579
BC022255 Spc25 Spindle pole body component 25 homolog(S. cerevisiae) 0.5743
NM_001801 CDO1 Cysteine dioxygenase, type I 0.5853
NM_001790 CDC25C Cell division cycle 25C 0.5918
NM_013277 RACGAP1 Rac GTPase activating protein 1 0.5931
BC021267 KLHL14 Kelch-like 14(Drosophila) 0.5937
BM464538 C5orf13 Chromosome 5 open reading frame 13 0.6014
AB208919 FGFR1 Fibroblast growth factor receptor 1(fms-related tyrosine kinase 2, Pfeiffer syndrome) 0.6020
AY367065 ASPM Asp(abnormal spindle)-like, microcephaly associated(Drosophila) 0.6155
NM_004701 CCNB2 Cyclin B2 0.6320
BC032677 UBE2C Ubiquitin-conjugating enzyme E2C 0.6357
AK122825 HMGB1 High-mobility group box 1 0.6359
AV741806 Homo sapiens high-mobilit y group box 1(HMGB1), mRNA [NM_002128] Transcribed locus, moderately similar to NP_990233.1 high mobility group 1 protein [Gallus gallus] 0.6368
BC015110 HHEX Hematopoietically expressed homeobox 0.6512
도 1은 벤조에이안트라센(benzo[a]anthracene)의 인간 간암 세포주에서의 세포 독성을 나타내는 그래프이고,
도 2는 마이크로어레이 칩을 이용한 벤조에이안트라센을 처리한 인간 간암 세포주의 유전자 발현 양상을 분석한 결과를 나타내는 그림이다.

Claims (14)

  1. 하기의 군으로부터 선택되는 유전자를 포함하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 바이오마커:
    유전자 등록번호(Genebank) AK074652(SERTAD1, SERTA domain containing 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC042390(VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) BX647402(SAS, Tetraspanin 31), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000678(ADRA1D, Adrenergic, alpha-1D-, receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005438(FOSL1, FOS-like antigen 1), 유전자 등록번호(Genebank) Y11307(CYR61, Cysteine-rich, angiogenic inducer,61), 유전자 등록번호(Genebank) AB208949(LRDD, Leucine-rich repeats and death domain containing), 유전자 등록번호(Genebank) AK129833(TFPI2, Tissue factor pathway inhibitor 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC063835(VGF, VGF nerve growth factor inducible), 유전자 등록번호(Genebank) BF569086(NK4, Interleukin 32), 유전자 등록번호(Genebank) BM923753(TFF1, Trefoil factor 1(breast cancer, estrogen-inducible sequence expressed in)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004864(GDF15, Growth differentiation factor 15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005242(F2RL1, Coagulation factor II(thrombin) receptor-like 1), 유전자 등록번호(Genebank) AB210045(KIF5A, Kinesin family member 5A), 유전자 등록번호(Genebank) D86962(GRB10,Growth factor receptor- bound protein 10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000582(SPP1,Secreted phosphoprotein 1(osteopontin, bone sialoprotein I,early T-lymphocyte activation 1)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001657(AREG, Amphiregulin(schwannoma-derived growth factor)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006200(PCSK5, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006350(FST,Follistatin), 유전자 등록번호(Genebank) AF070599(PPP1R11, Protein phosphatase 1,regulatory(inhibitor) subunit 11), 유전자 등록번호(Genebank) AK095888(CD109, CD109 antigen(Gov platelet alloantigens)), 유전자 등록번호(Genebank) BC007251(ARHGAP5, Rho GTPase activating protein 5), 유전자 등록번호(Genebank) BC033823(P58; HP58; PRKRI; P58IPK, DnaJ(Hsp40) homolog, subfamily C,member 3), 유전자 등록번호(Genebank) BX640597(SERPINB5, Serpin peptidase inhibitor, clade B(ovalbumin), member 5), 유전자 등록번호(Genebank) BX647459(SERPINE2, Serpin peptidase inhibitor,clade(nexin, plasminogen activator 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domain, transmembrane domain(TM),and cytoplasmic domain(semaphorin) 6B), 유전자 등록번호(Genebank) AB051503(CENTB5, Centaurin,beta 5), 유전자 등록번호(Genebank) AF086413(MCF2L, MCF.2 cell line derived transforming sequence-like), 유전자 등록번호(Genebank) AF323119(NFE2L2, Nuclear factor(erythroid-derived 2)-like 2), 유전자 등록번호(Genebank) AK075356(WFIKKN1, WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK127255(SNX26, Sorting nexin 26), 유전자 등록번호(Genebank) AK223503(CASP1, Caspase 1,apoptosis-related cysteine peptidase(interleukin 1,beta, convertase)), 유전자 등록번호(Genebank) BC048198(AHSG, Alpha-2-HS-glycoprotein), 유전자 등록번호(Genebank) BI819219(SCGB1A1, Secretoglobin,family 1A,member 1(uteroglobin)), 유전자 등록번호(Genebank) BX248009(SERPINA4, Serpin peptidase inhibitor, clade A(alpha-1 antiproteinase, antitrypsin),member 4), 유전자 등록번호(Genebank) BX648170(RALGPS1, Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1), 유전자 등록번호(Genebank) CR749395(OVOS2, Ovostatin 2), 유전자 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protein(C/EBP), alpha), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005441(CHAF1B, Chromatin assembly factor 1,subunit B(p60)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005515(HLXB9,Homeo box HB9), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006163(NFE2, Nuclear factor(erythroid-derived 2), 45kDa), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006195(PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3), 유전자 등록번 호(Genebank) NM_006454(MXD4, MAX dimerization protein 4), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015832(MBD2, Methyl-CpG binding domain protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_017409(HOXC10, Homeo box C10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022114(PRDM16, PR domain containing 16), 유전자 등록번호(Genebank) NM_024680(FLJ23311, E2F transcription factor 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_152989(SOX5, SRY(sex determining region Y)-box 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198159(MITF, Microphthalmia-associated transcription factor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_202002(FOXM1, Forkhead box M1), 유전자 등록번호(Genebank) AK001720(FLJ10858,Nei endonuclease VIII-like 3(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) AK024233(ZDHHC11,Zinc finger, DHHC-type containing 11), 유전자 등록번호(Genebank) AL543755(VAV3, Vav 3 oncogene), 유전자 등록번호(Genebank) BC033086(TCF19, Transcription factor 19(SC1)), 유전자 등록번호(Genebank) BC092512(MYRIP, Myosin VIIA and Rab interacting protein), 유전자 등록번호(Genebank) BC098585(TCEA2, Transcription elongation factor A(SII),2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001822(CHN1, Chimerin(chimaerin) 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003250(THRA, Thyroid hormone receptor, alpha(erythroblastic leukemia viral(v-erb-a) oncogene homolog, avian)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006892(DNMT3B, DNA(cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020062(SLC2A4RG, SLC2A4 regulator), 유전자 등록번호(Genebank) AF331525(SLC26A9, Solute carrier family 26,member 9), 유전자 등록번 호(Genebank) AJ441078(ATP10D, ATPase,Class V,type 10D), 유전자 등록번호(Genebank) AY043484(SCN1A, Sodium channel, voltage-gated, type I, alpha), 유전자 등록번호(Genebank) BC048332(SLC5A9, Solute carrier family 5(sodium/glucose cotransporter), member 9), 유전자 등록번호(Genebank) BC100014(SLC11A2, Solute carrier family 11(proton-coupled divalent metal ion transporters, member 2), 유전자 등록번호(Genebank) CR936810(TF, Transferrin), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001011554(SLC13A3, Solute carrier family 13(sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001848(COL6A1, Collagen, type VI, alpha 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001853(COL9A3, Collagen, type IX, alpha 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002241(KCNJ10, Potassium inwardly-rectifying channel,subfamily J, member 10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005629(SLC6A8, Solute carrier family 6(neurotransmitter transporter, creatine),member 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005835(SLC17A2, Solute carrier family 17(sodium phosphate), member 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006045(ATP9A, ATPase,Class II, type 9A), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020659(TTYH1, Tweety homolog 1(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020897(HCN3, Hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022154(SLC39A8, Solute carrier family 39(zinc transporter), member 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_033641(COL4A6, Collagen,type IV,alpha 6), 유전자 등록번호(Genebank) NM_139177(SLC39A11, Solute carrier family 39(metal ion transporter), member 11), 유전자 등록번호(Genebank) NM_153320(SLC22A7, Solute carrier family 22(organic anion transporter), member 7), 유전자 등록번호(Genebank) AB037805(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) AK000643(ASB9, Ankyrin repeat and SOCS box-containing 9), 유전자 등록번호(Genebank) AK055221(FBXO5, F-box protein 5), 유전자 등록번호(Genebank) AK074377(UHRF1, Chromosome 19 open reading frame 31), 유전자 등록번호(Genebank) AY007723(MAL2, Mal, T-cell differentiation protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC026283(APOH,Apolipoprotein H(beta-2-glycoprotein I)), 유전자 등록번호(Genebank) BI762502(GSTA2, Glutathione S-transferase A2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000277(PAH, Phenylalanine hydroxylase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001809(CENPA, Centromere protein A,17kDa), 유전자 등록번호(Genebank) CR933728(CDC2, Cell division cycle 2, G1 to S and G2 to M), 유전자 등록번호(Genebank) CR749293(PLG, Plasminogen), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004523(KIF11, Kinesin family member 11), 유전자 등록번호(Genebank) U65410(MAD2L1, MAD2 mitotic arrest deficient-like 1(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_145061(C13orf3, Chromosome 13 open reading frame 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_138555(KIF23, Kinesin family member 23), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014750(DLG7, Discs, large homolog 7(Drosophila)), 유전자 등록 번호(Genebank) BX640965(SLC22A3, Solute carrier family 22(extraneuronal monoamine transporter), member 3), 유전자 등록번호(Genebank) AK122685(GLUD1, Glutamate dehydrogenase 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000251(MSH2, MutS homolog 2,colon cancer,nonpolyposis type 1(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) BC008366(DDC,Dopa decarboxylase(aromatic L-amino acid decarboxylase)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016343(CENPF,Centromere protein F,350/400ka(mitosin)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003318(TTK, TTK protein kinase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001025248(DUT, DUTP pyrophosphatase), 유전자 등록번호(Genebank) BC022255(Spc25, Spindle pole body component 25 homolog(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001801(CDO1, Cysteine dioxygenase,type I), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001790(CDC25C, Cell division cycle 25C), 유전자 등록번호(Genebank) NM_013277(RACGAP1, Rac GTPase activating protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC021267(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BM464538(C5orf13, Chromosome 5 open reading frame 13), 유전자 등록번호(Genebank) AB208919(FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1(fms-related tyrosine kinase 2, Pfeiffer syndrome)), 유전자 등록번호(Genebank) AY367065(ASPM, Asp(abnormal spindle)-like,microcephaly associated(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004701(CCNB2, Cyclin B2), 유전자 등록번호(Genebank) BC032677(UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2C), 유전자 등록번호(Genebank) AK122825(HMGB1, High-mobility group box 1), 유전자 등록번호(Genebank) AV741806(Homo sapiens high-mobility group box 1(HMGB1), mRNA[NM_002128], Transcribed locus, moderately similar to NP_990233.1 high mobility group 1 protein[Gallus gallus]), 유전자 등록번호(Genebank) BC015110(HHEX, Hematopoietically expressed homeobox).
  2. 제 1항에 있어서, 하기 유전자가 벤조에이안트라센의 노출에 의해 발현이 증가하는 것을 특징으로 하는 바이오마커:
    유전자 등록번호(Genebank) AK074652(SERTAD1, SERTA domain containing 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC042390(VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) BX647402(SAS, Tetraspanin 31), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000678(ADRA1D, Adrenergic,alpha-1D-, receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005438(FOSL1, FOS-like antigen 1), 유전자 등록번호(Genebank) Y11307(CYR61, Cysteine-rich,angiogenic inducer,61), 유전자 등록번호(Genebank) AB208949(LRDD, Leucine-rich repeats and death domain containing), 유전자 등록번호(Genebank) AK129833(TFPI2, Tissue factor pathway inhibitor 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC063835(VGF, VGF nerve growth factor inducible), 유전자 등록번호(Genebank) BF569086(NK4, Interleukin 32), 유전자 등록번호(Genebank) BM923753(TFF1, Trefoil factor 1(breast cancer,estrogen-inducible sequence expressed in)), 유전자 등록번호(Genebank)NM_004864(GDF15, Growth differentiation factor 15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005242(F2RL1, Coagulation factor II(thrombin) receptor-like 1), 유전자 등록번호(Genebank) AB210045(KIF5A, Kinesin family member 5A), 유전자 등록번호(Genebank) D86962(GRB10, Growth factor receptor-bound protein 10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000582(SPP1, Secreted phosphoprotein 1(osteopontin,bone sialoprotein I,early T-lymphocyte activation 1)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001657(AREG, Amphiregulin(schwannoma-derived growth factor)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006200(PCSK5, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006350(FST, Follistatin), 유전자 등록번호(Genebank) AF070599(PPP1R11, Protein phosphatase 1, regulatory(inhibitor) subunit 11), 유전자 등록번호(Genebank) AK095888(CD109, CD109 antigen(Gov platelet alloantigens)), 유전자 등록번호(Genebank) BC007251(ARHGAP5, Rho GTPase activating protein 5), 유전자 등록번호(Genebank) BC033823(P58; HP58; PRKRI; P58IPK, DnaJ(Hsp40) homolog, subfamily C, member 3), 유전자 등록번호(Genebank) BX640597(SERPINB5, Serpin peptidase inhibitor, clade B(ovalbumin), member 5), 유전자 등록번호(Genebank) BX647459(SERPINE2, Serpin peptidase inhibitor, clade(nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 2), 유전자 등록번호(Genebank) BX649164(PAI; PAI1; PAI-1; PLANH1, serpin peptidase inhibitor, clade E(nexin, plasminogen activator inhibitor type 1),member 1), 유전자 등록번호(Genebank) CD520285(CSTA, Cystatin A(stefin A)), 유전자 등록번호(Genebank) CR622682(ANXA2, Annexin A2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001175(ARHGDIB, Rho GDP dissociation inhibitor(GDI) beta), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003122(SPINK1, Serine peptidase inhibitor, Kazal type 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003955(SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004877(GMFG, Glia maturation factor,gamma), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015071(ARHGAP26, Rho GTPase activating protein 26), 유전자 등록번호(Genebank) NM_025195(TRIB1, Tribbles homolog 1(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_078487(CDKN2B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2B(p15, inhibits CDK4)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198833(SERPINB8, Serpin peptidase inhibitor, clade(ovalbumin),member 8), 유전자 등록번호(Genebank) BC012609(SERPINB2, Serpin peptidase inhibitor, clade B(ovalbumin) ,member 2), 유전자 등록번호(Genebank) BF690887(BCL2A1, BCL2-related protein A1), 유전자 등록번호(Genebank) BM556279(EMP3, Epithelial membrane protein 3), 유전자 등록번호(Genebank) BX647822(FOSL2, FOS-like antigen 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001165(BIRC3, Baculoviral IAP repeat-containing 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002305(LGALS1, Lectin, galactoside-binding, soluble, 1(galectin 1)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003311(PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain, amily A, member 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003897(IER3, Immediate early response 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_078467(CDKN1A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1A(p21,Cip1)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198951(TGM2, Transglutaminase 2(C polypeptide, protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase)), 유전자 등록번호(Genebank) AF031469(MR1, Major histocompatibility complex, class I-related), 유전자 등록번호(Genebank) AL832451(DKFZp451C2311, guanylate binding protein 2,interferon-inducible), 유전자 등록번호(Genebank) BG564326(SAA4, Serum amyloid A4,constitutive), 유전자 등록번호(Genebank) CR936755(GBP3, Guanylate binding protein 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000022(ADA, Adenosine deaminase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005238(ETS1, V-ets erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1(avian)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006404(PROCR, Protein C receptor, endothelial(EPCR)), 유전자 등록번호(Genebank) AK094474(RHOC, Ras homolog gene family, member C), 유전자 등록번호(Genebank) AK095384(PDE4C, Phosphodiesterase 4C,cAMP-specific(phosphodiesterase E1 dunce homolog, Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) AK096685(TGFBRAP1, Transforming growth factor, beta receptor associated protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK124869(LOC400745, Hypothetical protein LOC149194), 유전자 등록번호(Genebank) BC006523(SGK2, Serum/glucocorticoid regulated kinase 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC027965(GPR109A, G protein-coupled receptor 109A), 유전자 등록번호(Genebank) BC033097(HBEGF, Heparin-binding EGF-like growth factor), 유전자 등록번호(Genebank) BC033829(AKAP12, A kinase(PRKA) anchor protein(gravin) 12), 유전자 등록번호(Genebank) BC034282(PPP2CA, Protein phosphatase 2(formerly 2A), catalytic 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Thymosin,beta 10), 유전자 등록번호(Genebank) BU945318(Homo sapiens metallothionein 2A(MT2A), mRNA [NM_005953], Hypothetical gene supported by X97260; BC070289), 유전자 등록번호(Genebank) H18681(C20orf139, Sulfiredoxin 1 homolog(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001007271(DUSP13, Dual specificity phosphatase 13), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001013632(LOC343521, Similar to hypothetical protein 4833401D15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022153(PP2135, Chromosome 10 open reading frame 54), 유전자 등록번호(Genebank) NM_203403(C9orf150, Chromosome 9 open reading frame 150), 유전자 등록번호(Genebank) NM_031286(SH3BGRL3, SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_147780(CTSB, Cathepsin B), 유전자 등록번호(Genebank) W84524(TM4SF5, Transmembrane 4 L six family member 5), 유전자 등록번호(Genebank) AB209586(MAPK13, Mitogen-activated protein kinase 13), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003330(TXNRD1, Thioredoxin reductase 1), 유전자 등록번호(Genebank) CR608156(HIST1H2AC, Histone 1,H2ac), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005979(S100A13,S100 calcium binding protein A13), 유전자 등록번호(Genebank) AK092512(SLC16A5, Solute carrier family 16(monocarboxylic acid transporters),member 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001983(ERCC1, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1(includes overlapping antisense sequence)), 유전자 등록번호(Genebank) BM904612(S100A6,S100 calcium binding protein A6(calcyclin)), 유전자 등록번호(Genebank) BX537968(LOC51149, Hypothetical LOC51149), 유전자 등록번호(Genebank) AA627222(LGALS1, Lectin, galactoside-binding, soluble, 1(galectin 1)), 유전자 등록번호(Genebank) CR612719(GADD45A, Growth arrest and DNA-damage-inducible,alpha), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001421(ELF4, E74-like factor 4(ets domain transcription factor)), 유전자 등록번호(Genebank) AK126182(KIAA1949, KIAA1949), 유전자 등록번호(Genebank) BX436525(HIST1H2BH, Histone 1, H2bh), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001769(CD9, CD9 antigen(p24)), 유전자 등록번호(Genebank) BX647290(HIST1H2BO, Histone 1, H2bo), 유전자 등록번호(Genebank) BC101655(HIST1H2BI, Histone 1, H2bi).
  3. 제 1항에 있어서, 하기 유전자가 벤조에이안트라센의 노출에 의해 발현이 감소하는 것을 특징으로 하는 바이오마커:
    유전자 등록번호(Genebank) AB020641(PFTK1, PFTAIRE protein kinase 1), 유전자 등록번호(Genebank) AB209667(RPS6KA5, Ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 5), 유전자 등록번호(Genebank) AK093396(ULK4, Unc-51-like kinase 4(C. elegans)), 유전자 등록번호(Genebank) AK122808(STK33, Serine/threonine kinase 33), 유전자 등록번호(Genebank) AK124653(WNK3, WNK lysine deficient protein kinase 3), 유전자 등록번호(Genebank) BC010082(ETNK2, Ethanolamine kinase 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC039363(EPHA10, EPH receptor A10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001005862(ERBB2, V-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog(avian)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002758(MAP2K6, Mitogen-activated protein kinase kinase 6), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003258(TK1, Thymidine kinase 1,soluble), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005400(PRKCE, Protein kinase C,epsilon), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014215(INSRR, Insulin receptor-related receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014264(PLK4, Polo-like kinase 4(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) 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Stearoyl-CoA desaturase(delta-9-desaturase)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016373(WWOX, WW domain containing oxidoreductase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020918(GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial), 유전자 등록번호(Genebank) NM_030758(OSBP2, Oxysterol binding protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198843(SFTPB, Surfactant, pulmonary-associated protein B), 유전자 등록번호(Genebank) U36798(PDE3A, Phosphodiesterase 3A,cGMP-inhibited), 유전자 등록번호(Genebank) X91148(MTP, Microsomal triglyceride transfer protein), 유전자 등록번 호(Genebank) Z28339(AKR1D1, Aldo-keto reductase family 1, member D1(delta 4-3-ketosteroid-5-beta-reductase)), 유전자 등록번호(Genebank) AB209229(MVD, Mevalonate(diphospho) decarboxylase), 유전자 등록번호(Genebank) BX648472(IDI1, Isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000859(HMGCR, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003129(SQLE, Squalene epoxidase), 유전자 등록번호(Genebank) AK091289(ZNF367, Zinc finger protein 367), 유전자 등록번호(Genebank) 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type XVI,alpha 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002381(MATN3, Matrilin 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005560(LAMA5, Laminin,alpha 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015059(TLN2, Talin 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015180(SYNE2, Spectrin repeat containing, nuclear envelope 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016835(MAPT, Microtubule-associated protein tau), 유전자 등록번호(Genebank) NM_021135(RPS6KA2, Ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_025074(FRAS1, Fraser syndrome 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK074077(SDK1, Sidekick homolog 1(chicken)), 유전자 등록번호(Genebank) BX248766(RAD51L1, RAD51-like 1(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) CR600021(HMGB2, High-mobility group box 2), 유전자 등록번호(Genebank) CR625391(RAD51AP1, RAD51 associated protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001067(TOP2A, Topoisomerase(DNA) II alpha 170kDa), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002875(RAD51, RAD51 homolog(RecA homolog,E. coli)(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003362(UNG, Uracil-DNA glycosylase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004111(FEN1, Flap structure-specific endonuclease 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006306(SMC1L1, SMC1 structural maintenance of chromosomes 1-like 1(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_007313(ABL1,V-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_130398(EXO1, Exonuclease 1), 유전자 등록번호(Genebank) CR604810(CCNA2, Cyclin A2), 유전자 등록번호(Genebank) D79987(ESPL1, Extra spindle poles like 1(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001759(CCND2, Cyclin D2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004526(MCM2,MCM2 minichromosome maintenance deficient 2, mitotin(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005915(MCM6, MCM6 minichromosome maintenance deficient 6(MIS5 homolog, S. pombe)(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_057749(CCNE2, Cyclin E2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_182776(MCM7, MCM7 minichromosome maintenance deficient 7(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) AB193259(ACE2, Angiotensin I converting enzyme(peptidyl-dipeptidase A) 2), 유전자 등록번호(Genebank) AB209350(PTK7, PTK7 protein tyrosine kinase 7), 유전자 등록번호(Genebank) 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alpha-2C-, receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001003679(LEPR, Leptin receptor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001049(SSTR1, Somatostatin receptor 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002847(PTPRN2, Protein tyrosine phosphatase, receptor type, N polypeptide 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005631(SMO, Smoothened homolog(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020242(KNSL7, Kinesin family member 15), 유전자 등록번호(Genebank) NM_080744(SRCRB4D, Scavenger receptor cysteine rich domain containing, group B(4 domains)), 유전자 등록번호(Genebank) AB002438(SEMA6A, Sema domain, transmembrane domain(TM), and cytoplasmic domain(semaphorin) 6A), 유전자 등록번호(Genebank) AB210030(SEMA4D,Sema domain, immunoglobulin domain(Ig), transmembrane domain(TM) and short cytoplasmic domain,(semaphorin) 4D), 유전자 등록번호(Genebank) CR616314(MRPL43, Mitochondrial ribosomal protein L43), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005232(EPHA1, EPH receptor A1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006080(SEMA3A, Sema domain, immunoglobulin domain(Ig), short basic domain, secreted(semaphorin) 3A), 유전자 등록번호(Genebank) NM_032108(SEMA6B, Sema domain, transmembrane domain(TM), and cytoplasmic domain(semaphorin) 6B), 유전자 등록번호(Genebank) AB051503(CENTB5, Centaurin,beta 5), 유전자 등록번호(Genebank) AF086413(MCF2L, MCF.2 cell line derived transforming sequence-like), 유전자 등록번호(Genebank) AF323119(NFE2L2, Nuclear factor(erythroid-derived 2)-like 2), 유전자 등록번호(Genebank) AK075356(WFIKKN1, WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK127255(SNX26, Sorting nexin 26), 유전자 등록번호(Genebank) AK223503(CASP1, Caspase 1, apoptosis-related cysteine peptidase(interleukin 1, beta, convertase)), 유전자 등록번호(Genebank) BC048198(AHSG, Alpha-2-HS-glycoprotein), 유전자 등록번호(Genebank) BI819219(SCGB1A1, Secretoglobin, family 1A, member 1(uteroglobin)), 유전자 등록번호(Genebank) BX248009(SERPINA4, Serpin peptidase inhibitor, clade A(alpha-1 antiproteinase,antitrypsin), member 4), 유전자 등록번호(Genebank) BX648170(RALGPS1, Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1), 유전자 등록번호(Genebank) CR749395(OVOS2, Ovostatin 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000893(KNG1, Kininogen 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002215(ITIH1, Inter-alpha(globulin) inhibitor H1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002615(SERPINF1, Serpin peptidase inhibitor, clade F(alpha-2 antiplasmin, pigment epithelium derived factor), member 1), 유전자 등록번호(Genebank) U44429(TPD52L1,Tumor protein D52-like 1), 유전자 등록번호(Genebank) AK122686(IF, I factor(complement)), 유전자 등록번호(Genebank) BC022312(C4BPA,Complement component 4 binding protein, alpha), 유전자 등록번호(Genebank) CR749293(PLG, Plasminogen), 유전자 등록번호(Genebank) M75106(CPB2,Carboxypeptidase B2(plasma, carboxypeptidase U)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000066(C8B, Complement component 8,beta polypeptide), 유전자 등록번호(Genebank) AF130077(ALB, Albumin), 유전자 등록번호(Genebank) AF178930(CARD15, Caspase recruitment domain family, member 15), 유전자 등록번호(Genebank) AK098772(TUBB, Tubulin,beta), 유전자 등록번호(Genebank) BC035723(C6, Complement component 6), 유전자 등록번호(Genebank) BX647151(MYBL2, V-myb myeloblastosis viral oncogene homolog(avian)-like 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_148957(TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 19), 유전자 등록번호(Genebank) AB209378(TBX2, T-box 2), 유전자 등록번호(Genebank) AF241528(HOXD1, Homeo box D1), 유전자 등록번호(Genebank) AK025758(NFATC2, Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2), 유전자 등록번호(Genebank) AK095154(AES, Amino-terminal enhancer of split), 유전자 등록번호(Genebank) AK126074(DPF3, D4, zinc and double PHD fingers, family 3), 유전자 등록번호(Genebank) AY198414(PRDM1, PR domain containing 1, with ZNF domain), 유전자 등록번호(Genebank) BC005812(DLX4, Distal-less homeobox 4), 유전자 등록번호(Genebank) BC040991(TFDP2, Transcription factor Dp-2(E2F dimerization partner 2)), 유전자 등록번호(Genebank) BC042297(UBTF, Upstream binding transcription factor, RNA polymerase I), 유전자 등록번호(Genebank) CR625990(PC4,SUB1 homolog(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003200(TCF3, Transcription factor 3(E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004364(CEBPA, CCAAT/enhancer binding protein(C/EBP), alpha), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005441(CHAF1B, Chromatin assembly factor 1, subunit B(p60)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005515(HLXB9, Homeo box HB9), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006163(NFE2, Nuclear factor(erythroid-derived 2), 45kDa), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006195(PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006454(MXD4, MAX dimerization protein 4), 유전자 등록번호(Genebank) NM_015832(MBD2, Methyl-CpG binding domain protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_017409(HOXC10, Homeo box C10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022114(PRDM16, PR domain containing 16), 유전자 등록번호(Genebank) NM_024680(FLJ23311, E2F transcription factor 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_152989(SOX5, SRY(sex determining region Y)-box 5), 유전자 등록번호(Genebank) NM_198159(MITF, Microphthalmia-associated transcription factor), 유전자 등록번호(Genebank) NM_202002(FOXM1, Forkhead box M1), 유전자 등록번 호(Genebank) AK001720(FLJ10858, Nei endonuclease VIII-like 3(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) AK024233(ZDHHC11, Zinc finger,DHHC-type containing 11), 유전자 등록번호(Genebank) AL543755(VAV3, Vav 3 oncogene), 유전자 등록번호(Genebank) BC033086(TCF19, Transcription factor 19(SC1)), 유전자 등록번호(Genebank) BC092512(MYRIP, Myosin VIIA and Rab interacting protein), 유전자 등록번호(Genebank) BC098585(TCEA2, Transcription elongation factor A(SII),2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001822(CHN1, Chimerin(chimaerin) 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003250(THRA, Thyroid hormone receptor, alpha(erythroblastic leukemia viral(v-erb-a) oncogene homolog, avian)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006892(DNMT3B, DNA(cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020062(SLC2A4RG, SLC2A4 regulator), 유전자 등록번호(Genebank) AF331525(SLC26A9, Solute carrier family 26,member 9), 유전자 등록번호(Genebank) AJ441078(ATP10D, ATPase,Class V,type 10D), 유전자 등록번호(Genebank) AY043484(SCN1A, Sodium channel, voltage-gated, type I, alpha), 유전자 등록번호(Genebank) BC048332(SLC5A9, Solute carrier family 5(sodium/glucose cotransporter), member 9), 유전자 등록번호(Genebank) BC100014(SLC11A2, Solute carrier family 11(proton-coupled divalent metal ion transporters, member 2), 유전자 등록번호(Genebank) CR936810(TF, Transferrin), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001011554(SLC13A3, Solute carrier family 13(sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3), 유전자 등록번 호(Genebank) NM_001848(COL6A1, Collagen, type VI, alpha 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001853(COL9A3, Collagen, type IX, alpha 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_002241(KCNJ10, Potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005629(SLC6A8, Solute carrier family 6(neurotransmitter transporter, creatine), member 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_005835(SLC17A2, Solute carrier family 17(sodium phosphate), member 2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_006045(ATP9A, ATPase, Class II, type 9A), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020659(TTYH1, Tweety homolog 1(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_020897(HCN3, Hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_022154(SLC39A8, Solute carrier family 39(zinc transporter), member 8), 유전자 등록번호(Genebank) NM_033641(COL4A6, Collagen,type IV,alpha 6), 유전자 등록번호(Genebank) NM_139177(SLC39A11, Solute carrier family 39(metal ion transporter), member 11), 유전자 등록번호(Genebank) NM_153320(SLC22A7, Solute carrier family 22(organic anion transporter), member 7), 유전자 등록번호(Genebank) AB037805(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) AK000643(ASB9, Ankyrin repeat and SOCS box-containing 9), 유전자 등록번호(Genebank) AK055221(FBXO5, F-box protein 5), 유전자 등록번호(Genebank) AK074377(UHRF1, Chromosome 19 open reading frame 31), 유전자 등록번호(Genebank) AY007723(MAL2, Mal,T-cell differentiation protein 2), 유전자 등록번호(Genebank) BC026283(APOH, Apolipoprotein H(beta-2-glycoprotein I)), 유전자 등록번호(Genebank) BI762502(GSTA2, Glutathione S-transferase A2), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000277(PAH, Phenylalanine hydroxylase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001809(CENPA, Centromere protein A,17kDa), 유전자 등록번호(Genebank) CR933728(CDC2, Cell division cycle 2,G1 to S and G2 to M), 유전자 등록번호(Genebank) CR749293(PLG, Plasminogen), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004523(KIF11, Kinesin family member 11), 유전자 등록번호(Genebank) U65410(MAD2L1, MAD2 mitotic arrest deficient-like 1(yeast)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_145061(C13orf3, Chromosome 13 open reading frame 3), 유전자 등록번호(Genebank) NM_138555(KIF23, Kinesin family member 23), 유전자 등록번호(Genebank) NM_014750(DLG7, Discs, large homolog 7(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BX640965(SLC22A3, Solute carrier family 22(extraneuronal monoamine transporter), member 3), 유전자 등록번호(Genebank) AK122685(GLUD1, Glutamate dehydrogenase 1), 유전자 등록번호(Genebank) NM_000251(MSH2, MutS homolog 2,colon cancer, nonpolyposis type 1(E. coli)), 유전자 등록번호(Genebank) BC008366(DDC, Dopa decarboxylase(aromatic L-amino acid decarboxylase)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_016343(CENPF, Centromere protein F, 350/400ka(mitosin)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_003318(TTK, TTK protein kinase), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001025248(DUT, DUTP pyrophosphatase), 유전자 등록번호(Genebank) BC022255(Spc25, Spindle pole body component 25 homolog(S. cerevisiae)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001801(CDO1, Cysteine dioxygenase,type I), 유전자 등록번호(Genebank) NM_001790(CDC25C, Cell division cycle 25C), 유전자 등록번호(Genebank) NM_013277(RACGAP1, Rac GTPase activating protein 1), 유전자 등록번호(Genebank) BC021267(KLHL14, Kelch-like 14(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) BM464538(C5orf13, Chromosome 5 open reading frame 13), 유전자 등록번호(Genebank) AB208919(FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1(fms-related tyrosine kinase 2, Pfeiffer syndrome)), 유전자 등록번호(Genebank) AY367065(ASPM, Asp(abnormal spindle)-like, microcephaly associated(Drosophila)), 유전자 등록번호(Genebank) NM_004701(CCNB2, Cyclin B2), 유전자 등록번호(Genebank) BC032677(UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2C), 유전자 등록번호(Genebank) AK122825(HMGB1, High-mobility group box 1), 유전자 등록번호(Genebank) AV741806(Homo sapiens high-mobility group box 1(HMGB1), mRNA[NM_002128], Transcribed locus, moderately similar to NP_990233.1 high mobility group 1 protein[Gallus gallus]), 유전자 등록번호(Genebank) BC015110(HHEX, Hematopoietically expressed homeobox).
  4. 제 1항의 바이오마커 유전자 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 올리고뉴클 레오티드 또는 그의 상보가닥 분자가 집적된 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 DNA 마이크로어레이 칩.
  5. 1) 인간 체세포에 피검화합물을 처리하는 단계;
    2) 단계 1)의 피검화합물을 처리한 실험군 세포와 피검화합물을 처리하지 않은 대조군 세포에서 RNA를 분리하는 단계;
    3) 단계 2)의 실험군 및 대조군의 RNA를 cDNA로 합성하면서 실험군과 대조군을 각기 다른 형광물질로 표지하는 단계;
    4) 단계 3)의 각기 다른 형광물질로 표지된 cDNA를 제 5항의 DNA 마이크로어레이칩과 혼성화시키는 단계;
    5) 단계 4)의 반응한 DNA 마이크로어레이칩을 분석하는 단계; 및
    6) 단계 5)의 분석한 데이터에서 제 1항의 바이오마커의 발현 정도를 대조군과 비교하여 확인하는 단계를 포함하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법.
  6. 제 5항에 있어서, 단계 1)의 인간 체세포는 인간의 간 또는 간암의 세포 및 조직에서 유래한 세포인 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법.
  7. 제 6항에 있어서, 상기 인간 간암 세포는 HepG2인 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법.
  8. 제 5항에 있어서, 단계 3)의 형광물질은 Cy3, Cy5, FITC(poly L-lysine-fluorescein isothiocyanate), RITC(rhodamine-B-isothiocyanate) 및 로다민(rhodamine)으로 이루어진 군으로부터 선택하여 사용하는 것을 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법.
  9. 1) 인간 체세포에 피검화합물을 처리하는 단계;
    2) 단계 1)의 피검화합물을 처리한 실험군 세포와 피검화합물을 처리하지 않은 대조군 세포에서 RNA를 분리하는 단계;
    3) 단계 2)의 RNA를, 제 1항의 바이오마커 유전자에 상보적이고 바이오마커 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 사용하여 실시간 RT-PCR(Real-time reverse transcript polymerase chain reaction)을 수행하는 단계; 및
    4) 단계 3)의 유전자 산물을 대조군과 비교하여 발현 정도를 확인하는 단계를 포함하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법.
  10. 제 9항에 있어서, 단계 1)의 인간 체세포는 간 또는 간암의 세포 및 조직에서 유래한 세포인 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법.
  11. 제 10항에 있어서, 상기 인간 간암 세포는 HepG2인 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부를 확인하는 방법.
  12. 제 4항의 DNA 마이크로어레이 칩을 포함하는 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 키트.
  13. 제 12항에 있어서, 인간 간 세포 또는 간암 세포를 추가적으로 포함하는 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 키트.
  14. 제 12항에 있어서, 제 1항의 바이오마커 유전자에 상보적이고 바이오마커 유 전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 추가적으로 포함하는 것을 특징으로 하는 벤조에이안트라센에 대한 노출 여부 확인용 키트.
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