JPH09501489A - 分析対象物の脱着およびイオン化のための方法および装置 - Google Patents

分析対象物の脱着およびイオン化のための方法および装置

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Abstract

(57)【要約】 本発明は基本的には、例えば、質量分光測定あるいはバイオセンサーなどの方法で後で行う科学的な分析用に、分析対象物の脱着およびイオン化するための方法および装置に関するものである。より具体的には、本発明は質量分光測定、特に、蛋白質や生態高分子などの巨大分子を分析するために用いられるタイプのレーザー脱着/イオン化、飛行時間質量分光測定に関するものである。量も具体的には、本発明は、完全な巨大分子を含む分析対象物を、化学基質を加えないでプローブ表面から気相(蒸気相)に選択的に捕捉および脱着させるようにするサンプルプローブの形状、サンプルプローブ組成、そしてサンプルプローブ表面化学物質に関するものである。

Description

【発明の詳細な説明】 発明の名称 分析対象物の脱着およびイオン化のための方法 および装置 発明の背景 本発明は一般的には、例えば、質量分光測定(MS)あるいはバイオセンサな どの方法による、後の科学的分析のための、分析対象物の脱着およびイオン化の ための方法および装置に関するものである。一般的に、質量分光測定による分析 は、レーザービームを含む、レーザーなどの高エネルギー源を用いた少量のサン プルの気化およびイオン化を伴っている。物質はレーザービームによって、プロ ーブ先端の表面からガスあるいは気相に気化され、このプロセス中に、個々の分 子の一部は陽子を取り込んで、イオン化される。これら正の電荷にイオン化され た分子は、次に、短い高圧電界で加速され、高真空度チェンバーに導かれ(ドリ フト)、その先で、感度の高い検出装置の表面に衝突する。飛行時間はイオン化 された分子の質量の関数であるから、イオン化と衝突との間に経過する時間は、 その分子の質量の判定に用いることができ、その分子質量は、次に特定の質量の 既知の分子が存在しているかどうかの判定に用いることができる。 レーザー脱着/イオン化、飛行時間質量分光測定(TOF)にプローブ先端に 蛋白質あるいは他の大型の生物分子を載置(present)する従来のすべての技術 は、金属製プローブ端のむき出しの表面上に置かれる酸性基質の大過剰モルの蛋 白質あるいは他の分析対象分子の結晶性固体混合物の調製を必 要としている。(サンプルプローブ端は通常金属製であり、ステンレススチール 、ニッケルメッキ材、あるいはプラチナでできている。)レーザービームによる 分析対象物分子の破壊を防ぐためには、こうした基質に分析対象物を埋め込むこ とが必要だと考えられていた。レーザービームはプローブ端上の固体混合物に衝 突し、そのエネルギーが、埋め込まれた分析対象物分子の一部と共に基質の小部 分を気化するのに用いられてしまう。こうした基質がないと、分析対象物分子は レーザーのエネルギーですぐ砕かれてしまい、最初の巨大分子の質量や特性の判 定が非常に困難であるか、あるいは不可能になってしまう。 こうした先行技術に基づく手順にはいくつかの制約があり、蛋白質やその他の 巨大生物分子分析対象物への適用を不可能にしている。第1に、非常に未精製の サンプルの場合、基質/分析対象物結晶あるいは固体混合物における過剰な外来 性物質が存在しないようにするために、部分的に分別する(あるいは、できるだ けそのサンプルを精製)ことが必要になる。大量の成分が存在していると、目標 とされる分析対象物のイオン信号(脱着、イオン化、および/あるいは検出)を 抑制してしまう可能性がある。こうした精製は時間がかかり、費用がかかり、通 常、分析対象物の回収率の低下(または完全な損失)につながり、そして、自動 化分析装置での実行は非常に困難である。 第2に、従来の技術に基づく分析のために必要とされる分 析対象物物質の量はそれ程大きくないが(通常はピコモル程度)、小児科患者で のテストなど、いくつかの状況においては、分析対象物の流体は極端に少量(マ イクロリットル)でしか利用できず、しかも、種々の異なった分析を行う必要が ある。したがって、ひとつの分析のための分析対象物/基質結晶性混合物の調製 のために必要とされる非常に少量(体積などで)のものでさえ、重要な意味を持 つ場合がある。また、プローブ端上で使用するための固体分析対象物/基質混合 物の調製で用いられる分析対象物のごく一部(数千分の一またはそれより少ない )だけが脱着あるいは質量分光測定では用いられることになる。したがって、1 )もっとずっと少ない量の分析対象物を用いれば済み、2)プローブの先端ある いは表面の予め決められた場所にひとつ、あるいは複数の分析対象物を配置し、 3)(たとえば、1回、あるいは複数回の化学的、あるいは酵素反応の前後に) 分析対象物の同じアリコットの分析を繰り返し行うことが可能で、そして4)よ り定量的な方法でテストを行うことができるようにする、従来の手順におけるど のような改良でも、多くの臨床領域で極めて有益であろう。 第3に、プローブの先端上で使用するための分析対象物/基質の固溶体の調製 に用いられる、分析対象物である蛋白質あるいは他の巨大分子は、基質にとざさ れている(埋め込まれている)ため、その後のいかなる化学的検査あるいは処置 にも適さない。また、今日まで使われた基質物質はすべて強 い酸性であるため、後の試験のために分析物質を修飾する目的で混合物に試みら れるはずの多くの化学反応に、有害な影響を及ぼす。したがって、分析対象物分 子についての、後の化学的修飾あるいは反応を、基質またはプローブ先端からそ れらの分子を除去することなく、あるいは全く「基質」なしに、導くことができ るようにする方法におけるどのような改良でも、研究者および臨床医にとって大 きな利益となるであろう。 いかなる形式の質量分光測定にせよ、完全なペプチドあるいは小さな蛋白質( わずか約15kDaまで)の分子質量測定に初めて成功したのは、高エネルギー粒子 による表面のボンバーディング(プラズマ脱着および高速原子ボンバードメント 分光測定)によってであり、この大躍進は1981年および1982年に起こった。1985 年および1986年に改良が行われたが、収率(信号の強さ)、感度、精密さ、およ び質量の精度は比較的低いままであった。分子の質量がより高いタンパグ質(約 20〜25kDa)は、まれな場合を除いて観察されず、これらの方法では平均的な分 子量(約70kDa)のタンバク質は全く観察されなかった。したがって、質量分光 測定によるほとんどのタンパク質の測定は、実現しないままであった。 1988年Hillenkampとその共同研究者らは、JVレーザー脱着飛行時間質量分光 測定を用いて、大過剰のモル数のUV吸収性酸性化学基質(ニコチン酸)の存在 下に、比較的高い分子質量のタンパク質をプローブ先端上に置くと、それらのタ ンパク質を完全な状態で脱着できることを発見した。この新しい技術を、基質補 助レーザー脱着/イオン化(MALDI)、飛行時間質量分光測定と呼ぶ。レー ザー脱着飛行時間質量分光測定(化学基質なし)が何度か用いられる状態があっ たが、タンパク質あるいは核酸のような大きな完全な生体高分子は、脱着に際し フラグメント化(破壊)されるため、それらの分子量測定にはまだ成功していな いことが注目さる。したがって、化学基質の導入する以前は、完全な巨大分子の 質量の明確な変化の検出には、レーザー脱着質量分光測定は基本的には有用では なかった。基質結晶のランダムな形成および分析対象物分子の固溶体中にランダ ムに包含することが、先行技術であることに注目すべきである。 この先行技術には多くの問題および制約がある。例えば、以前には、分析対象 物あるいは基質中に存在する混入物を洗浄除去することは難しいとされてきた。 他の問題には、分析対象物−塩イオン付加物の形成、基質中の分析対象物の最適 より低い溶解度、固体基質内の分析対象物の未知の局在性および濃度、複数の成 分が同時に存在することによるシグナル(分子イオン)抑制「毒作用」、および 選択的な分析対象物の脱着/イオン化が含まれる。しかし、KarasおよびHillenk ampを含む先の研究者らが質量分光学を用いた分析対象物検出のための種々の技 術を報告する前は、これらの先行技術は、少ない体積の均一化されたサンプル中 の分析対象物の検出における制約特に、の感度および選択性における固有の技術 的制 約があった(Hillenkamp,Bordeaux Mass Spectrometry Conference Report,pp .354−62(1988);Karas and Hillenkamp,Bordeaux Mass Spectrometry Confe rence Report,pp.416−17(1988);Karas and Hillenkamp,Analytical Chemi stry,60:2299(1988);Karas,et al.,Biomed.Environ.Mass Spectrum( 印刷中))。飛行時間質量分光測定にレーザービームを用いることは、例えば、 米国特許第4,694,167号、第4,686,366号、第4,295,046号および第5,045,694号に 示されている。これは参考文献として本明細書に組み入れる。 高分子量の生体高分子をフラグメント化することなく揮発させることに成功し たことにより、多くの種類の生物学上の巨大分子の質量分光測定による分析が可 能になった。さらに重要なことは、恐らく、生物学的な研究において決まって遭 遇する問題を解くために、質量分光測定がさらに創造的に用いられる可能性を示 したことであろう。最も新しい関心は、高速(分)高感度(サンプルの必要量は 、pモルより少ない)であり複雑な混合物を分析できるという理由から、基質補 助されたレーザー脱着/イオン化(MALDI)、飛行時間(TOF)質量分光 測定(MS)の有用性に集められている。 MALDI−TOF MSは、個々の分析対象物の質量の静的な測定/検証に 用いるために引き続き有用であるが、生体高分子の場合には、未知の構造につい て最も重要な情報を与える相違がある。したがって、構造生物学において慣例的 に用いるためには、MALDI−TOF MS技術の不利な 制約は、サンプルの調製および不活性なサンプルプローブ素子の表面上への載置 (析出)に関係し、特に、プローブ表面において、新たに調製した結晶性有機酸 基質中に分析対象物が埋め込まれること(共凝固)を必要とすることに関係があ る。プローブ素子の表面上の、結晶基質の不均一な並びの中に、分析対象物がラ ンダムに分布していると、適量より多くの質量スペクトルを収集する(例えば、 各々100ショットの多数のセット)ため、レーザー脱着法に必要とされるよりは るかに多くの分析対象物あるいはサンプルの析出を必要とする。分析対象物の残 りの部分は、通常、追加的な分析あるいは後の特徴づけのために回収されること はない。プローブ表面上での脱着には、1ないし10pモル(それより少ないこと もある)の分析対象物が必要であるにも拘らず、数個よりも少ない原子がレーザ ー脱着の間に消費されるにすぎないことが報告されてきた。したがって、105個 ないし106個の用いた分析対象物の中の、ごく一部分が必要なのであって、残り は無駄になる。 固体基質中に分析対象物を埋め込むことに伴う有力なデータの、別の重要な損 失は、プローブ表面上に残っている埋め込まれた分析対象物(例えば蛋白質ある いはDNA)について、後の化学的および(または)酵素による修飾を行う可能 性の減少あるいは完全な排除である。分析対象物の、他のアリコットあるいは、 埋め込まれた分析対象物を基質を含まずに回収する能力(回収率が低く困難)の みが、構造に関する データを得るために行われる、本発明者らが示差質量分光測定と呼ぶ方法を可能 にする。 さらに、恐らく多くの生物学者および臨床医らが、MSに慣れていること、お よび(または)その有用性に関しては懐疑的であるため、生物学の分野において はMSの適用が制約されてきた。さらに、MSは、MALDIが適応されたいく つかの例では、特にSDSポリアグリルアミドゲル電気泳動が十分な代用法であ るため、取りつきにくいか、あるいは費用がかかりすぎるとされている(例えば 、生物学的な粗溶液の分離)。さらに、MALDIは生物学雑誌および臨床雑誌 にはほとんど現れない。 発明の要約 本発明の1つの目的は、複数あるいは選択した分析対象物のガス(蒸気)相へ の、一連の吸着、脱着、およびイオン化のための、改良された方法、材料の組成 、および装置を提供することである。 別の目的は、多くの種類の化学的、物理学的、および生物学的修飾あるいは認 識反応を、受け入れることができるかまたは受け入れやすい場所においての、分 析対象物が基質溶液あるいは結晶性構造の中に分散されているのではなく、分子 認識という事象を通して、エネルギーを吸収する「基質」物質の中、または上、 または接着した表面の上に分析対象物が載置されている状況での分析対象物の脱 着およびイオン化を含む、親和性による分析対象物の検出のための方法および装 置を提供することである。 別の目的は、分析対象物質が、プローブ先端のサンプル載置表面を形成してい る基体に、化学的に結合しているか、あるいは物理的に接着するような方法およ び装置を提供することである。 別の目的は、サンプル載置表面を、エネルギー吸収性の分子を用いて修飾して 、先行技術において行われる外来性の基質分子の添加なしに、分析対象物分子の 好結果をもたらす脱着を可能にするための手段を提供することである。 別の目的は、質量の変わる分析対象物分子の脱着を容易にするために単層およ び多層の接着したエネルギー吸収分子が用いられているような種々の配置におい て、結合した(共有結合あるいは非共有結合)エネルギー吸収分子の適切な濃度 を提供することである。 別の目的は、エネルギー吸収分子、親和性指向分析対象物捕捉デバイス、光電 管などを用いて修飾した表面の、多数の組み合わせを提供することである。 別の目的は、プローブ先端あるいは他のサンプル載置表面を形成している物質 が、あらかじめ決められた分析対象物あるいは何種類かの分析対象物と選択的に 結合するよう、1つあるいはそれ以上の親和性試薬(種々の、濃度および増幅の 程度)で誘導されるような方法および装置を提供することである。 別の目的は、標的である分析対象物あるいは一団の分析対 象物に対し、親和性試薬が化学的に結合するかあるいは生物学的に接着するよう なシステムを提供することである。 別の目的は、載置している表面上に含まれている分析対象物の未使用の部分が 、化学的反応性を残しており、そのため分析対象物の一連の化学的、酵素的、あ るいは物理的処理に続いて、修飾された分析対象物の連続的な分析ができるよう に、分析対象物を脱着およびイオン化するための方法および装置を提供すること である。 別の目的は、分析対象物およびその成分の1次、2次、3次、または4次構造 を解明する目的のための、標的分析対象物の、組み合わされた化学的あるいは酵 素的修飾のための方法および装置を提供することである。 別の目的は、プロトン(H+)以外の陽イオンが、分析対象物である巨大分子 の脱着およびイオン化に用いられる、分析対象物質の脱着およびイオン化のため の方法および装置である。 従って、前述の目的を達成するため、本発明によれば、質量分光測定法による 、分析対象物サンプルの分析対象物分子の質量の測定のための装置が供せられ、 前記装置は、分光計チューブと;前記チューブの内側に真空を適用するための真 空手段と;前記チューブ内で、前記分析対象物サンプルから脱着した分析対象物 分子に加速電位を与えるための電位手段と;前記分析対象物分子の脱着およびイ オン化を促進するために表面に結合している分子と共同して、前記分析対象物サ ンプルを載置するための、前記分光計チューブに可動的に差し込み可能なサンプ ル載置手段において、前記表面分子が、エネルギー吸収分子、親和性捕捉デバイ ス、光感作性付着分子、およびそれらの組み合わせから成る群から選択したサン プル載置手段と;前記の表面に結合した分子と共に、前記サンプル載置手段の上 に置かれた分析対象物サンプルにおいて、前記質量分光測定分析に消費されなか った前記分析対象物分子の少なくとも一部が、後の化学的、生物学的、あるいは 物理的分析処置を受けやすいまま残っている分析対象物サンプルと;前記分析対 象物サンプルから前記分析対象物分子の一部を脱着およびイオン化するために、 十分なエネルギーを与えるために、前記分析対象物サンプルに向けるレーザー光 線を発生させるためのレーザー光線手段と;前記分光計チューブに結合し、イオ ン化された分析対象物の加速された分子を検出するための検出手段とから成る。 さらに、前述の目的を達成するため、本発明によれば、分析対象物分子の質量 を測定するための質量分光測定法が供せられ、その方法は以下の段階すなわち、 プローブ先端面上のサンプル載置表面を、分析対象物分子と結合するための手段 を有する親和性捕捉デバイスで誘導するステップと;前記の誘導したプローブ先 端面を、前記分析対象物分子の源にさらし、前記分析対象物分子が結合するよう にするステップと;前記分析対象物分子が結合している、誘導されたプローブ先 端を、飛行時間質量分光測定器の一方の端に置き、真空およ び電場を与えて分光測定器内に加速電位を作るステップと;前記先端より前記分 析対象物分子のイオンを脱着させるために、分光測定器内の、誘導されたプロー ブ先端面に結合している分析対象物の少なくとも一部分を、1つあるいはそれ以 上のレーザーパルスを用いて、打つステップと;前記質量分光測定器内で、飛行 時間によってイオンの質量を検出するステップと;このように検出された質量を 表示するステップとから成る。 さらに、前述の目的を達成するため、本発明によれば、レーザー脱着/イオン 化、飛行時間質量分光測定法により、分析対象物分子の質量を測定する方法が提 供せられ、この方法においては、分析対象物の脱着およびイオン化を容易にする ために、前記分析対象物と一緒にエネルギー吸収物質が使われ、その改良点は、 エネルギー吸収物質の上あるいは表面上に分析対象物分子を載置することを含み 、前記質量分光測定分析において脱着されなかった、分析対象物分子の少なくと も一部は、後の分析を化学的に受け入れられる状態のまま残る。 さらに、前述の目的を達成するため、本発明によれば、分析対象物分子の脱着 およびイオン化を容易にするための装置が提供せられ、その装置は、サンプルを 載置する表面と、表面に結合した分子とから成り、前記表面結合分子は、エネル ギー吸収分子と、親和性捕捉デバイスと、光感作性付着分子と、それらの組み合 わせとから成る群から選ばれ、前記表面 結合分子は、前記サンプル載置表面と結合し、前記分析対象物分子と結合する手 段を有する。 さらに、サンンプル載置表面上の分析対象物分子を捕捉し、後の分析のため前 記サンプル載置表面上から前記の捕捉された分析対象物分子を脱着/イオン化す るための方法が提供せられ、その方法は、前記サンプル載置表面を、親和性捕捉 デバイスあるいは前記分析対象物分子と結合するための手段を有する光感作性付 着分子を用いて誘導するステップと;前記の誘導したサンプル載置表面を、前記 分析対象物分子を含んでいるサンプルに当てるステップと;前記の誘導したサン プル載置表面上の分析対象物分子を、前記親和性捕捉デバイスあるいは光感作性 付着分子により捕捉するステップと;前記親和性捕捉デバイスあるいは光感作性 付着分子により、誘導されたサンプル載置表面に結合されると同時に、前記分析 対象物分子をエネルギー源あるいは光源にさらして前記分析対象物分子の少なく とも一部を前記表面より脱着させることから成る。 さらに、本発明によれば、分析対象物分子を分析用に載置するための、表面の 調製法が提供せられ、その方法は、前記分析対象物を支持するため、前記表面上 に基質を供するステップと;その基質を、親和性捕捉デバイスあるいは前記分析 対象物と選択的に結合する手段を有する光感作性付着分子で誘導するステップと ;前記親和性捕捉デバイスあるいは光感作性付着分子と結合した前記分析対象物 を検出する手段とか ら成る。 さらに、前記の目的を達成するため、本発明によれば、ガス相への完全な分析 対象物の脱着を促進するためのプローブが供され、それは、サンプル提示表面と ;そのサンプル提示表面に結合したエネルギー吸収分子とから成り、前記サンプ ルプローブがエネルギー源によって打たれると、前記サンプルプローブは、エネ ルギー吸収分子の上、上方、あるいは間に位置している完全な分析対象物分子の 脱着を促進する。さらに、このプローブにおけるエネルギー吸収分子は、シンナ ムアミド、シンナミル臭化物、2,5−ジヒドロキシ安息香酸、およびα−シア ノ−4−ヒドロキシケイ皮酸からなる群から選択される。 さらに、前記の目的を達成するため、本発明によれば、完全な分析対象物をガ ス相に脱着するためのサンプルプローブが提供され、それは、サンプル載置表面 と;表面に結合している分子とから成り、その表面に結合している分子は、少な くとも2つの結合部位を有する光感作性付着分子であり、少なくとも1つの部位 は、分析対象物と結合することができ、さらに、その分析対象物結合部位は光不 安定性である。 さらに、前記の目的を達成するため、本発明によれば、完全な分析対象物のガ ス相への脱着を促進するための、サンプルプローブが供され、それは、サンプル 提示表面と;以下の2つのいずれか、すなわち前記サンプル提示表面に結合して いる、親和性捕捉デバイス、エネルギー吸収分子、および光 感作性付着分子とから成る群より選択した、少なくとも2つの異なる分子であり 、分析対象物が前記サンプルプローブと結合すると、そのサンプルプローブが、 エネルギー源により打たれる際に分析対象物のガス相への移行を促進するという ものと、前記サンプル提示表面に結合している少なくとも2つの異なる親和性捕 捉デバイスであり、前記サンプルプローブがエネルギー源により打たれると、そ のサンプルプローブが、前記分析対象物分子と結合している親和性捕捉デバイス に依存して異なる速度で、ガス相への分析対象物の移行を促進するというものと のいずれかから成る。 さらに、前記の目的を達成するため、本発明によれば、完全な分析対象物のガ ス相への脱着を促進するためのサンプルプローブが供され、それは、サンプル提 示表面と;表面に結合している分子において、その表面に結合している分子が、 エネルギー吸収分子として、さらに親和性捕捉デバイスとしても機能することが できる分子か;あるいは、表面に結合している分子において、その表面に結合し ている分子が、少なくとも2つの異なる結合部位を有しており、少なくとも1つ の結合部位がサンプル提示表面に結合しており、さらに、少なくとも1つの部位 が分析対象物と結合することができ、分析対象物結合部位が光不安定性である分 子のいずれかから成る。 さらに、本発明によれば、分析対象物の質量を測定するための質量分光測定法 が供せられ、その方法は以下の段階、す なわち、プローブ先端面上のサンプル提示表面を光感作性付着分子(PAM)に より誘導して、前記PAMが少なくとも2つの結合部位を有し、1つの結合部位 が、サンプル載置表面と結合し、そして少なくとも1つの結合部位が、分析対象 物分子と結合することができるようにするステップと;前記の誘導されたプロー ブ先端面を、前記分析対象物分子源に当て、そこに分析対象物分子が結合できる ようにすることと;前記分析対象物が結合している誘導されたプローブ先端を、 飛行時間質量分光計の一方の端に設置し、真空および電場を与えて分光計内に加 速電位を作るステップと;分光計内の前記の誘導されたプローブ先端面に結合し た分析対象物分子の少なくとも一部を、1つあるいはそれ以上のレーザーパルス でたたいて、前記先端より分析対象物分子のイオンを脱着させるステップと;前 記質量分光計内での飛行時間によって、イオンの質量を検出することと;それら の検出された質量を表示することから成る。 さらに、レーザー脱着/イオン化、飛行時間質量分光測定法による分析対象物 分子の質量の測定法において、分析対象物分子の脱着およびイオン化を容易にす るために、前記分析対象物分子と共に光感作性付着分子(PAM)を用いる測定 法が供せられ、その改良点は、PAMの上あるいは表面上に分析対象物を載置し て、前記質量分光測定分析において脱着されなかった分析対象物の少なくとも1 部を、後の分析法のために化学的な変化を受けやすい状態に残すことを含む。 さらに、本発明により、完全な分析対象物分子のガス相への差動脱着を促進す るための、サンプルプローブが提供せられ、それは、サンプル提示表面と;その サンプル提示表面に結合する2つの異なる光感作性分子とから成り、前記サンプ ルプローブがエネルギー源によってたたかれると、前記サンプルプローブが、前 記分析対象物分子に結合している光感作性付着分子に依存して異なる速度で、分 析対象物分子のガス相への移行を促進する。 さらに、本発明により、完全な分析対象物のガス相への脱着を促進する、サン プルプローブが提供せられ、それは、サンプル提示表面と;そのサンプル提示表 面に結合している光感作性付着分子とから成り、前記サンプルプローブがエネル ギー源によってたたかれると、前記サンプルプローブが、完全な分析対象物分子 のガス相への移行を促進する。 さらに、本発明によれば、生体高分子の配列決定のための方法が提供せられ、 それは以下の段階すなわち、エネルギー吸収分子、親和性捕捉デバイス、光感作 性付着分子、およびそれらの組み合わせから成る群より選択した、表面の選択分 子を有するサンプル提示表面を含んでいるプローブ先端に、生体高分子分析対象 物を結合するステップと;質量分光測定分析において生体高分子分析対象物を脱 着し、前記生体高分子の少なくとも1部が、プローブ先端から脱着されないよう にすることと、プローブ先端にまだ結合している生体高分子分析対象物を修飾し ている、脱着の結果を分析することと; 生体高分子が配列決定されるまで、脱着、分析、および修飾の段階を繰り返すこ とから成る。 以下の明細書を読み、その1部を成し本発明の現在の好ましい実施例の実例を 開示のために示している、添付図面を参照することにより、他の目的ならびにさ らなる目的、特色、および利益が明らかになり、本発明が理解しやすくなるであ ろう。 図面の簡単な説明 本発明の前述の目的ならびにそれ以外の目的と有用性は、以下の明細書および 添付図面から明らかになるであろう。図1A(上図)は、中和したエネルギー吸 収分子(シナピニン酸、pH6.2)の存在下に脱着した、3つのペプチド(ヒトの 、ヒスチジンに富む糖タンパク質の金属結合ドメイン(GHHPH)2G(12 06Da),(GHHPH)5G(2904Da)およびヒトエストロゲン受容体2量 化ドメイン(D473−L525)(6168.4Da))の質量スペクトルを示す。図1B (下図)は、中性のエネルギー吸収分子の存在下における、これらのペプチドの その場所における連続的な金属(Cu)結合を示す。 図2A(上図)は、中和したエネエルギー吸収分子(シナピニン酸、pH6.5) の存在下に脱着した、ヒトカゼインリンペプチド(5P,2488Da)の、質量ス ペクトルを示す。図2B(上から2番目の図)は、リンペプチドからリン酸基を 除くための、その場所における連続的な5分間のアルカリ性 フォスファターゼによる消化を示す。図2C(上から3番目の図)は、先行技術 に述べたように、酸性のエネルギー吸収分子(2,5ジヒドロキシ安息香酸、pH 2)の存在下に、さらにその場所におけるフォスファターゼ分解を行った後の、 リンペプチドの質量スペクトルを示す。 図3は、中和したエネルギー吸収分子(シナピン酸、pH6.2)の存在下に、カ ルボキシペプチダーゼPによりその場所で消化する前(下図)および後(上図) の(GHHPH)5Gペプチド(2904Da)の混成質量スペクトルを示す。 図4は、固体ガラス、ポリプロピレンで被覆したステンレス鋼、ポリスチレン で被覆したステンレス鋼、およびナイロンプローブエレメントから脱着したペプ チド混合物の、混成基質補助レーザー脱着質量スペクトルを示す。SEAC 図5Aは、IDA−Cu(II)表面によって吸着されないペプチド溶液中の、精 子刺激因子(933Da)およびニューロテンシン(1655Da)(およびそれらの 複数のNa付加物)の、質量スペクトルを示す。図5Bは、IDA−Cu(II)表 面に選択的に吸着されたNa−付加物ピークを加えた、アンジオテンシンI(12 96.5Da)の、質量スペクトルを示す。図5Cおよび図6Cは、IDA−Cu(I I)上に吸着され、水で洗浄した後の、同じアンジオテンシンIの質量スペクトル を示す。図6Dは、親和力で吸着したアンジオテンシンIによる、その場所での 連続的な銅の結合(1個および2個のCu)を 示す。図6Eは、親和吸着したアンジオテンシンIの、その場所での連続的なト リプシン消化を示す。 図7は、IDA−Cu(II)表面に親和性吸着した、ミオグロビン(4ないし8 fモル)の質量スペクトルを示す。 図8(上図)は、粗混合物から、TED−Fe(III)表面に親和性吸着した、 複数のリン酸化した形の合成カゼインペプチド(1934Da)の質量スペクトルを 示す。その場所の連続したアルカリ性フォスファターゼによる消化の後、もとの リン酸化されていない形だけが残った(下図)。 図9Aは、幼児用処方における全タンパク質の、質量スペクトルを示す。図9 Bは、TED−Fe(III)表面に親和性吸着した、幼児用処方におけるリンペプ チドの質量スペクトルを示す。図9Cは、幼児用処方を与えた後に採取した、胎 児の胃吸引物中の、全タンパク質の質量スペクトルを示す。図9Dは、TED− Fe(III)表面に親和性吸着した、胃吸引物中のリンペプチドの、質量スペクト ルを示す。 図10Aは、N−グリカナーゼによる消化の前後の、IDA−Cu(II)表面に吸 着された、ヒトおよびウシの、ヒスチジンに富む糖タンパク質の混成質量スペク トルを示す。質量の変化は、各糖タンパク質からの炭水化物の除去を意味する。 図10Bは、グリコシル化した2種類のタンパク質(上図、ヒトタンパク質;下か ら2番目の図、ウシタンパク質の)からの、トリプシンで消化したペプチドの混 成質量スペクトルおよび、トリプシンで消化した2種のペプチド(上から2番目 の図、ヒトタンパク質;下図、ウシタンパク質、1,2の数字は、結合したCu の数を表す)の、その場所におけるCu(II)との結合を示す。図10Cは、かかる Cu(II)結合ペプチド(下図)が、ジエチルピロカルボン酸エステルにより特異 的に修飾されて4N−カルベトキシ−ヒスチジル付加物(上図、1〜4)を形成 する、少なくとも4つのHis残基を有することを示す。図10Dは、ウシのヒスチ ジンに富む糖タンパタ質における、主要なCu−結合ペプチドの、C−末端の部 分的な配列を示す。 図11(下図)は、ヒツジ抗ウサギIgG常磁性表面に親和性吸着した、ウサギ 抗ヒトラクトフェリン免疫グロブリンのみ(対照)の質量スペクトルを示す。上 図は、ヒツジ抗ウサギIgG常磁性表面に親和性吸着した、ヒトラクトフェリン とウサギ抗ヒトラクトフェリン免疫グロブリンとの複合体の質量スペクトルを示 す。 図12は、胎児尿から抗ヒトラクトフェリン免疫グロブリンナイロン表面に親和 性吸着した、ヒトラタトフェリンの質量スペクトルを示す。 図13は、1nモル/mlのラクトフェリンを含んでいる、全胎児尿の同等の質量 スペクトルを示す。 図14(下図)は、精製したウシのヒスチジンに富む糖タンパク質の質量スペク トルを示す。上図は、ウシ初乳から、ウシのヒスチジンに富むタンパク質に対す る免疫グロブリン表面に親和性吸着した、ウシのヒスチジンに富む糖タンパク質 およびフラグメントの質量スペクトルを示す。 図15は、異種の抗濾胞刺激ホルモン抗体によって認識される、濾胞刺激ホルモ ンのペプチドの、混成質量スペクトルを示す。 図16は、直径0.5mmのプローブエレメント上に置かれた、1本鎖DNAアガロ ースの単一のビーズの上に親和性吸着された、ヒトラグトフェリンの質量スペク トルを示す。 図17は、胎児尿から1本鎖DNA表面に親和性吸着した、ヒトラクトフェリン の質量スペクトルを示す。 図18Aは、ヒト十二指腸吸引物中の全タンパク質(下図)と、この吸引物から 大豆トリプシンインヒビター表面に親和性吸着したトリプシン(上図)との、混 成質量スペクトルを示す。図18Bは、この吸引物1ulから大豆トリプシンインヒ ビターナイロン表面に親和性吸着したトリプシンの質量スペクトルを示す。 図19Aは、ヒト尿からストレプタビジン(Streptavidin)表面に親和性吸着し た、ビオチニル化したインシュリンの質量スペクトルを示す。図19Bは、ヒト血 漿からストレプタビジン表面に親和性吸着した、ビオチニル化したインシュリン の質量スペクトルを示す。 図20(上図)は、ヒト血清中の全タンパク質の質量スペクトルを示す。図20( 下図)は、ヒト血清からシバクロン−ブルー(Cibacron-blue)表面に親和性吸 着した血清アルブミンの質量スペクトルを示す。SEND 図21は、表面結合桂皮酸アミドの分子構造を示し、Rは架橋剤を加えた表面を 表す。 図22(上図)は、表面結合桂皮酸アミドから脱着したペプチド混合物の質量ス ペクトルを示す。図20B(下図)は、遊離の桂皮酸アミドを用いた同じペプチド 混合物の質量スペクトルを示す。 図23は、表面結合桂皮酸ブロマイドの分子構造を示し、Rは架橋剤を加えた表 面を示す。 図24(上図)は、表面結合桂皮酸ブロマイドから脱着した、ペプチド混合物の 質量スペクトルを示す。図22B(下図)は、遊離の桂皮酸ブロマイドを用いた同 じペプチド混合物の質量スペクトルを示す。 図25は、表面結合MAP−ヒドロキシ安息香酸の分子構造を示し、Rは架橋剤 を加えた表面を表す。 図26(上図)は、表面結合MAPのみから脱着したペプチド混合物の質量スペ クトルを示す。図26(下図)は、表面結合MAP−ジヒドロキシ安息香酸から脱 着したペプチド混合物の質量スペクトルを示す。 図27Aは、表面結合α−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸から脱着したミオグロ ビンの質量スペクトル(1,200〜50,000m/z領域)を示す。図25Bは、低い質量 領域(0〜1200m/z)における、同質量スペクトルを示す。 図28は、グルタールアルデヒドによる活性化によって、ポリアグリルアミドあ るいはナイロンまたはアクリル表面に結合した、エネルギー吸収分子の分子構造 を示す。 図29は、ジビニルスルホンによる活性化によって、ポリアクリルアミドあるい はナイロンまたはアグリル表面に結合した、エネルギー吸収分子の分子構造を示 す。 図30は、ジシクロヘキシルカルボジイミドによる活性化によってポリアクリル アミドあるいはナイロンまたはアクリル表面に結合した、エネルギー吸収分子の 分子構造を示す。 図31は、ジシクロヘキシルカルボジイミドによる活性化によって、複数の抗原 ペプチドをつけたポリアクリルアミドあるいはナイロンまたはアクリル表面に結 合した、エネルギー吸収分子の分子構造を示す。 図32は、イミノジアセテート(IDA)−Cu(II)表面に結合したチオサリチ ル酸の分子構造を示す。 図33は、チオサリチル酸−IDA−Cu(II)表面から脱着した、ヒトエストロ ゲン受容体の2量化ドメイの質量スペクトルを示す。 図34は、DEAE表面に結合したα−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸の分子構 造を示す。 図35は、シナピン酸−DEAE表面から脱着した、ヒトエストロゲン受容体の 2量化ドメインの質量スペクトルを示す。 図36は、ポリスチレン表面に結合したα−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸の分 子構造を示す。SEPAR 図37は、光分解結合により表面に固定化した、ヒスチジンに富む糖タンパク質 の金属結合ドメインの、C−末端の配列分析を示す。 発明の詳細な説明 ここに開示されている発明に対しては、発明の精神を逸脱しないで、種々の置 換や修正が可能であることは、当業者には明らかであろう。 プローブ素子に特定の分析対象物の捕捉および収容に積極的に関与することが できるようにする表面を有する新しいMSプローブ素子組成物の開発は、最近、 親和性質量分光測定(AMS)と呼ばれる領域で、いくつかの可能性を明らかに してきている、要約的に言うと、いくつかのタイプの新しいMSプローブ素子が 親和性捕捉用強化表面(Surfaces Enhancedfor Affinity Capture:SEAC) を用いて設計されている(Hutchens and Yip,Rapid Commun Mass Spectrom,7 :576−580(1993))。現在までのところ、SEACプローブ素子は蛋白質の表 面構造および生物固有分子認識について知られていることを活用して、種々のタ イプの生体高分子、特に蛋白質の検索に用いられて、成功を収めている。 構造生物学における進歩は、充分な程度の感度での生体高分子配列情報を入手 することができないことから、引き続き一定限度にとどまっている。本発明の方 法および装置を用い ることによって、AMSがこのような制約を打破する可能性を提供することを実 証した。MSプローブ素子表面(つまり、SEAC)上の不動態化親和性捕捉装 置は、そのプローブ表面に対する分析対象物の位置および親和性(特異性)を判 定するので、その後で行われる分析的AMSプロセスがいくつかの理由から一層 効率的になる。第一に、プローブ素子上での分析対象物の位置を予め決めること ができる。したがって、その後の脱着プロセスは入射レーザービームによるプロ ーブ表面マトリックスフィールドのランダムサーチにはもはや依存しなくてすむ 。第2に、分析対象物検出の感度(および動的範囲)が、複雑な構造物の場合に しばしば観察される分子イオン化抑制効果のために増大される。第3に、最初の レーザーによって誘発される脱着プロセスによって実際に消費されない分析対象 物を後で行われる分析のために引き続き利用することができる。分析対象物の脱 着を速やかに行うために外来性基質(matrix)を用いた場合、ほとんどの場合で 、引き続き使用する分析対象物をロスすることなく、それを取り除くことができ る。残った分析対象物は、その場所で(つまり、プローブ素子上で)、化学的お よび/または酵素的に直接修飾することができる。質量の違いを判定するために MSで再度分析した場合、特殊な構造上の詳細が明らかになる。非常に少量の分 析対象物(1000兆分の1モル以下)しか消費しないで、構造に関する情報を引き 出すために、分析/修飾のプロセス全体を何回も繰り返すことができる。今日ま でに 行われたAMSに基づく蛋白質構造分析としては、N−およびC−両方の端末配 列分析、および加リン酸化、脱リン酸化、グリコシル化、システイン残基反応、 部位固有化学修飾(ヒスチジン残基など)、および配位子結合など、いくつかの タイプの配列固有の翻訳後修飾の確認などを含んでいる。 生体高分子配列を判定したり、個々の生体高分子の構造の解明のためには、機 能的分子上会合の構造的決定因子を理解する能力が必要になる。高次(たとえば 、四元)構造物の構造的決定因子を調べる可能性も、AMSが提供する。本発明 を用いることによって、従来の生化学分析手順では簡単には行なかったような共 有結合によらない分子認識イベントを、プローブ素子表面の直接、あるいは間接 的につながれた巨大分子分析対象物との分子的会合の評価によって直接調べるこ とができる。 ここで用いられている『分析対象物』(analyte)とは原子および/または分 子を意味し、その錯体および断片イオンを含み、生物巨大分子の場合、蛋白質、 ペプチド、DNA,RNA、炭水化物、ステロイド、および脂質などを含む。生 命プロセスの構造あるいはその調節に関与している点で調査の対象となる重要な 生化学分子のほとんどは、非常に大型である(通常、H2Oの数千倍)。 ここで用いられている『分子イオン』とは、通常、1つあるいはそれ以上の陽 子(H+)を付加したり、あるいは失うことによる、荷電あるいはイオン化され た状態の分子を意味 している。 ここで用いられている『分子断片化』あるいは『断片イオン』は、例えば、レ ーザー誘発脱着(特に付加された基質(matrix)が存在しない条件で)中に発生 する分析対象物分子の破壊された断片を意味している。 ここで用いられている『固体相』とは、例えば、プローブ素子表面上で固体状 態にあることを意味している。 ここで用いられている『ガス』あるいは『蒸気相』とは、気体状態(真空中質 量分光測定の場合)の分子を意味している。 ここで用いられいてる『分析対象物脱着/イオン化』という用語は分析対象物 の固体相からイオンなどの気相への変移を意味している。なお、レーザー脱着に よる大型の、完全な分子イオンの脱着/イオン化が成功したのは比較的最近のこ とで(1988年)、適切な基質(ニコチン酸)が偶然発見されたことは突破口にな った。 ここで用いられいてる『気相分子イオン』とは、気相状態にあるイオンのこと を意味している。なお、蛋白質など分子量が大きなイオン(標準的な重量=陽子 1個の60,000〜70,000倍)は通常気化しない(つまり、それらは通常気相あるい は蒸気相の状態には入らない)。しかしながら、本発明による手順においては、 蛋白質などの分子量が大きなイオンでも気相あるいは蒸気相に入ることができる 。 MALDIに関連して用いられている『基質』(matrix) とはいくつかの、小型で、光吸収性のある化学物質(例えばニコチン酸、あるい はシナピン酸)を意味しており、プローブ素子上で乾燥した場合に、結晶性の、 基質に埋め込まれた分析対象物分子が(レーザー照射によって)良好に脱着され 、固体相(結晶)から気相あるいは蒸気相にイオン化され、完全な分子イオンと して加速されるような方法で分析対象物と共に溶液内に混合される。MALDI プロセスをうまく行わせるためには、分析対象物を新たに作成された化学的基質 と混合させ(例えば、基質:分析対象物の10,000:1の割合で)、質量分光測定 分析を行う直前に、不活性なプローブ素子の表面において空気で乾燥させる。飽 和に近い濃度で存在している基質がモル数で何倍も多いので、分析対象物の結晶 形成および捕捉が簡単に行われる。 ここで使われている『エネルギー吸収分子(EAM)』とは、(SENDの場 合のように)プローブ素子の表面に置かれた場合、後で完全な分子イオンとして 加速されるようにするために、固体相(つまり、表面)から気相あるいは蒸気相 への脱着をより容易に行わせるようにするいくつかの、小さな、光吸収性化学物 質を意味している。SENDという用語との関連では、EAMという用語を用い るのが好ましい。なお、SENDプロセスによる分析対象物の脱着は、面依存プ ロセスと定義される(つまり、分析対象物が結合EAMによって構成された表面 上に配置される)。対照的に、MALDIは、現在のところ、表面全体を気相に 『投げ込む』ような 火山の爆発タイプのプロセスによって、分析対象物の脱着を速やかに行わせるも のと考えられている。さらに、一部のEAMは、MALDIプロセスで述べられ たように分析対象物分子を埋め込むために遊離化学物質として用いられた場合、 作用を発揮しない(つまり、それらは分子脱着を促進しないでの、それらは適し た基質分子とは言えない)。 ここで用いられている『プローブ素子』あるいは『サンプル提示装置』とは、 以下の様な物理的性質を有する素子を意味している:つまり、不活性で(例えば 、ステンレス鋼などの場合のように)、しかも積極的な役割を果すもの(例えば EAMを含む様に強化された表面を有するプローブ素子および/または分子捕捉 装置)。 ここで用いられいている『MALDI』とは、基質支援レーザー脱着/イオン 化のことを意味している。 ここで用いられている『TOF』とは飛行時間(Time-of-Flight)のことであ る。 ここで用いられている『MS』とは質量分光測定(Mass spectrometry)のこ とである。 ここで用いられている『MALDI−TOF MS』とは基質支援レーザー脱 着/イオン化、飛行時間質量分光測定のことを意味している。 ここで用いられている『ESI』とは、電子スプレイイオン化の略語である。 ここで用いられている『化学結合』とは、単に、ひとつの 化学物質(例えば、基質)を他の物質(例えば、不活性なプローブ素子表面)上 に置いた場合に見られる様な、明確には定義されないような一般的な性格の化学 的相互作用から、合理的で、熟慮された、そして分かっている、公知のタイプの 化学的相互作用の操作を区別する意味で用いられている。定義されているタイプ の化学結合としては、静電あるいはイオン性(+/−)結合(例えば、蛋白質表 面での正に荷電された基と負に荷電された基)、共有結合(電子の共有によって 生じる非常に強力で、『永続的な』結合)、同位共有結合(例えば,蛋白質内の 電子供与体基と銅または鉄などの遷移金属間の)、そして疎水性相互作用(例え ば、2つの非荷電基間の)などがある。 ここで用いられている『電子供与体基』とは、生化学分子内の原子(例えば、 N,S,O)が電子を『供与』したり、あるいは弱電基(例えば、銅イオンや他 の遷移金属イオン)と電子を共有したりするような場合を意味する。 本発明はレーザー脱着/イオン化用強化表面(SELDI)を有する一般的な カテゴリーのプローブ素子(サンプル提示手段)を用い、このSELDIは以下 の3つのサブ・カテゴリーがある。プローブ素子表面(サンプル提示手段)がそ の表面の直接(そのまま)付加された分析対象物の脱着/イオン化を容易に行わ せるために、『基質』(matrix)の代わりにエネルギー吸収分子(EAM)を含 むように設計されているニート脱着用強化表面(SEND)。このカテゴリー1 (SEND)は単独で、あるいは、プローブ素子表面(サンプル提示手段)が、 種々のメカニズム(ほとんどは共有結合)によって、分析対象物のそのプローブ 表面への特異的、あるいは非特異的な付着、あるいは吸着(いわゆる格納、また は連結)を容易に行わせるための、化学的に定義された、そして/または生物学 的に定義された親和性捕捉装置を含む様に設計されている親和性捕捉用強化表面 (SEAC)(カテゴリー2)との組み合わせで用いられる。カテゴリー2(S EAC)は付加された基質と共に用いられるか、あるいは、付加された基質なし でカテゴリー1(SEND)との組み合わせで用いられる。したがって、SEN DとSEACの組み合わせは、実際的には、別のカテゴリーとなる。 カテゴリー3は光の影響により付着及び放出用SEPAR強化表面を用いるも ので、この場合、プローブ素子表面(サンプル提示手段)は1つ、あるいは複数 のタイプの、共有結合を利用した収容デバイスとして化学的に定義された架橋分 子を含むように設計/修飾されている。これらの光感作付着分子(PAM)は2 価あるいはそれ以上の電荷を有しており、つまり、一方では先ずサンプル提示手 段のプローブ素子表面にPAMを永続的に付着させるように反応し、一方で、P AMの別の反応面が、分析対象物がPAM−誘導プローブ表面に接触した場合に その分析対象物を反応できるような状態にある。こうした表面(サンプル提示手 段)は、共有結合に基づくものではあるが光の照射を受けた場合に可逆的な反応 を 示す(つまり、光感作性のある)非常に強力な(つまり、安定した、共有結合に よる)分析対象物の付着および吸着(つまり、収容あるいは連結)プロセスを可 能にしてくれる。こうした表面は構造的回析を目的とする、その場所での(つま り、プローブ端上で直接)化学的および/または酵素的に修正されるための分析 対象物のレーザーを利用した脱着のためのプラットフォームを提供してくれる。 実際に照射を受ける(全体のうちの極小部分のみ)プローブ表面上の分析対象物 だけが脱着される。連結された分析対象物の残りは共有結合で結合されたままと なっており、表面からの何らかの予定外の結合解除によるロスなしで修正される 。SEPARカテゴリー(カテゴリー3)は、光への露出によって可逆的な反応 を示す分析対象物付着プロセスによって特徴づけられている。しかしながら、分 析対象物とプローブ表面の付着結合の光に依存した可逆反応が進んでも、分析対 象物が気相状態にいつでも変化するとは限らない。言い換えると、プローブ表面 への分析対象物の光感作性付着に関与する分子が、SENDに関連して述べられ たようなエネルギー吸収分子(EAM)と同じであるとは限らない。しかしなが ら、ここに重要な例外がある。本発明はSENDおよびSEPARに関して2重 の機能性を発揮するハイブリッドEAM/PAM化学物質を含んでいる。つまり 、現在SENDのために用いられている一部のEAM分子は、SENDとSEP ARプロセスの両方の媒介因子として作用するように修正することができる。同 様 に、SEACとSEPARの両方に関して2重の機能性を示す1部のハイブリッ ド親和性捕捉/PAM化学物質も提供される。本発明は1部の親和性捕捉デバイ ス、特に、生物学的に明確に定義され、SEACとSEPARプロセスの両方の 媒介因子として修正されるものを利用する。 本発明は、そうした目的のために、分析対象物の付着(連結あるいは固着)と 、その後での連結された分析対象物の光に依存した脱着をすみやかに行わせる表 面会合(あるいは表面結合)分子を利用したサンプル提示手段(すなわち、プロ ーブ素子表面)を提供するものであり、ここで、上記表面分子は、分析対象物分 子のサンプル提示手段への(共有結合を利用した付着メカニズムなどによる)結 合(収容、連結、あるいは架橋)に関与する光に対して反応性を示す(光感作性 )分子で構成されるグループから選択されることを特徴とする。さらに、その内 部で、光(例えば、ひとつ、あるいは複数のレーザーからの)の入射パルスを用 いて、後で行われる分析対象物のプローブの静止した(固体)表面からの気相( 蒸気相)への脱着に支障を来たさないような方法で、プローブ表面に結合してい る分析対象物の光感作性結合を破壊することができるように、分析対象物がひと つ、あるいは複数の光感作性結合によってサンプル提示手段の表面に結合される ことを特徴とする、サンプル提示手段(上に述べたような適切なプローブ素子物 質のうちのひとつ、あるいは複数のもので構成されている)が提供される。 SEPARサンプル提示手段(つまり、プローブ素子表面)と分析対象物(例 えば、蛋白質)との間の光感作性分子付着点のタイプと数を決定する化学的な特 異性には、分析対象物内のひとつ、あるいは複数の残基、あるいは化学構造(例 えば、蛋白質やペプチド類の場合のHis,Lys,Arg,Tyr,PheおよびCys残 基)が関係している可能性がある。言い換えると、蛋白質やペプチド類の場合、 SEPARサンプル提示手段は、複数の異なったタイプの付着点で分析対象物を 固定するためのいくつかの違ったタイプの光感作性付着分子で修正されたプロー ブ表面を含むことができる。 分析対象物とプローブ素子表面との間の光感作性付着を破壊するのに必要な光 の波長、あるいは光の強度は静止状態から気相あるいは蒸気状態への分析対象物 の脱着を速やかに行わせるために必要な光の波長や光の強度を同じ場合もあれば 、異なる場合もあるであろう。プローブ素子表面(例えば、サンプル提示手段) への分析対象物、特にペプチド、蛋白質、リボ核酸(RNA)、デオキシボ核酸 (DNA)および炭水化物(CHO)などの生体高分子の付着には、プローブ表 面と分析対象物巨大分子間の複数の付着点が関与している可能性がある。生体高 分子が複数の付着点を介して付着されると、その生体高分子の骨格の異なった点 を、化学的および/または酵素的手段によって切断、あるいは断片化され、その 結果生じる断片の多くは分離された別個の分析対象物となり、それぞれ、ひとつ 、あるいは複数の光感作性結合によってプロ ーブ表面に付着(連結)されたままであり、飛行時間質量分析装置によって同時 に行われる質量分析と同時並行的に気相状態に脱着される。 このプロセスにより、生体高分子(蛋白質、ペプチド、RNA,DNA、炭水 化物)配列決定が可能になる。 ここで用いられている『親和性』とは2つの分子間の物理的および/または化 学的吸引を意味している。一般的には、生化学的活性(つまり、情報伝達)の構 造や調節を示す目的で用いられる。通常、ひとつの生化学分子の他の生化学分子 に対する親和性は非常に特異的である。ここでは、問題の分子分析対象物が捕捉 される原理を示す目的で用いられている。SEACの場合、問題の分析対象物に 対して特徴的な親和性を示す化学物質あるいは生化学分子はプローブ素子の表面 に連結(結合)され、望ましい分析対象物を積極的に『探し』出して、選択的に それと結合する。 ここで用いられている『分子認識』とは、相互に対する自然な親和性による2 つの分子間の相互作用を意味している。 ここで用いられている『分子捕捉』とは、特異的な親和性関係が存在している 他の生化学分子を吸引、結合(捕捉)するために連結された生化学分子を用いる ことを意味する。 ここで用いられている『受動的吸着』とは、単に分析対象物を(例えば、基質 と共に)置くことを意味している。 ここで用いられている『能動的収容』とは、SEACの場合のように、活性の あるプローブ素予表面で分析対象物分子 を慎重に捕捉することを意味する。 ここで用いられている『静止状態』とは固体相と同じ意味である。ここでは、 プローブ素子表面自体、あるいは不活性プローブ素子表面との組み合わせで用い られる『外部』微粒状SENDまたはSEACデバイスを意味している。 ここで用いられる『活性表面領域』とは、望ましい反応または事象(例えば、 EAM付着または親和性捕捉)に関与すると考えられる、あるいは関与すること が分かっている表面の領域のことを意味している。この活性表面領域は全表面積 と比較すれば相当小さな割合である(これは、立体障害などの物理的な効果によ って、総面積の一部が使えない、あるいは役に立たないからである)。 ここで用いられている『配位子』とは、大型の分子(魚)に結合比較的小さな 分子(餌)を意味している。ここでは、配位子はリンカーアーム(釣り糸)を介 してプローブ素子表面に付着(化学的に結合する)。こうしたプロセスにより、 生化学分子の捕捉活動を表面(静止あるいは固体相状態)上で局所化することが 可能になる。 ここで用いられている『親和性剤』とは、分析対象物捕捉デバイス、つまり、 分析対象物を認識し、それに結合する能力を保持しつつ、(共有結合、化学的吸 着などによって)提示表面上に保持される能力を持つタイプの分子(人造、非天 然、天然、あるいは生物によるものとを含む)および/または化合物を意味して いる。 ここで用いられる『脱着』とは、分析対象物のプローブ表面からの脱離、およ び/または分析対象物の気相への移行を意味している。 ここで用いられている『イオン化』とは、分析対象物上にひとつ、あるいはそ れ以上の電子単位に等しいプラスまたはマイナスの電荷をつくりだしたり、ある いは保持したりすることを意味している。 ここで用いられている『内転』とは、分析対象物を会合した付加物質の出現を 意味しており、通常、過剰な基質(あるいは基質分解生成物)と分析対象物との 直接の反応によって起きる。 ここで用いられている『吸着』とは、上記エネルギー吸収物資、親和性剤(分 析対象物捕捉デバイス)、および/または分析対象物のプローブ(提示表面)へ の化学的な結合(共有結合および/または非共有結合)を意味する。 本発明の1つの実施例は、質量分光測定によって分析対象物サンプルの分析対 象物分子の質量を測定する装置であって、該装置は分光計チューブ、該分析対象 物サンプルから脱着された分析対象物分子への加速電位を付加するための、上記 チューブ内に配置された電位(付加)手段、該分析対象物の脱着およびイオン化 を速やかに行わせるために、表面会合分子と会合した状態で該分析対象物サンプ ルを提示するための、該分光計チューブに取り外し可能に挿入されるサンプル提 示手段で、該表面分子がエネルギー吸収分子、親和性捕捉デバ イス、光感作性付着分子、およびそれらの組み合わせで構成されるグループから 選択されることを特徴とするサンプル提示手段と、該表面会合分子と会合した状 態で該サンプル提示手段上に配置され、それによって、該質量分光測定分析で消 費されなかった該分析対象物分子の少なくとも一部が後で行なわれる化学的、生 物学的、あるいは物理的分析手順に用いることができる分析対象物サンプルと、 該分析対象物サンプルからの該分析対象物分子を脱着、イオン化するのに十分な エネルギーを付与するために該分析対象物サンプルに向けられたレーザービーム をつくりだすレーザービーム手段と、そして、加速化されたイオン化分子による 衝撃を検出するための検出手段によって構成されている。 本発明の他の実施例は、分析対象物分子の質量を測定するための質量分光測定 の方法であって、この方法は、分析対象物分子と結合するための手段を有する親 和性捕捉デバイスでプローブ端面上のサンプル提示表面を誘導するステップと; 該誘導されたプローブ端面を該分析対象物分子の供給源に露出して該分析対象物 分子をそこに結合させるステップと;そこに結合した該分析対象物分子によって 誘導されたプローブ端を飛行時間質量分光計の一端において真空にし、電場を発 生してその分光計内部に加速電位を形成するステップと、上記分光計内部の該誘 導されたプローブ端面に結合した分析対象物分子の少なくとも1部を1つ、ある いは複数のレーザーパルスで衝撃を与えて、該先端から該分析対象物分子のイオ ンを脱着させるためのステップと;該質量分光計内部でのその飛行時間によって それらイオンの質量を検出するステップと;それら検出された質量を表示するス テップとで構成されている。好ましい実施例においては、この方法はさらに脱着 /イオン化支援基質物質を親和性捕捉デバイスと組み合わせて該プローブ端に適 用するステップを含んでいる。より好ましい実施例においては、この方法はさら に、該プローブ端を該質量分光計かた取り外すステップと、脱着されなかった該 分析対象物分子の該部分の組成を変えるために、脱着されなかった該分析対象物 分子の該部分に化学的、または生物学的手順を行うステップと、該変性された分 析対象物分子と共に該プローブ端を再挿入するステップと;そして、該変性され た分析対象物分子の分子量を判定するために、後で質量分光測定を行うステップ とを含んでいる。 さらに別の実施例では、該親和性捕捉デバイスは該プローブ端の該面に化学的 に結合されたり、該プローブ端の該面に物理的に接着されたり、あるいは該分析 対象物分子に生物学的に接着するのに適合化されたりする。さらに別の実施例で は、該分析対象物分子は生体高分子であり、該親和性剤は分化されていない生体 サンプルから該生体高分子を選択的に分離するように調製されている。また、好 ましい実施例においては、該基質物質が弱酸性から強酸性のpH範囲にある。さら に好ましい実施例においては、該基質物質は6.0以上のpH値を有している。さら にまた別の実施例では、該プローブ端の 面が電気絶縁性の物質で構成されている。 本発明の別の実施例は、その内部でエネルギー吸収物質がその分析対象物分子 の脱着およびイオン化を速やかに行わせるために該分析対象物分子と組み合わせ て用いられるレーザー脱着/イオン化、飛行時間質量分析計で分析対象物分子の 質量を測定する方法であり、その改良点は、上記エネルギー吸収物質の表面上あ るいはその上方に上記分析対象物分子を提示し、該質量分光測定分析で脱着され なかった分析対象物分子の少なくとも1部が後で行われる分析手順で化学的に利 用できる点にある。 本発明のさらに別の実施例は、分析対象物分子の脱着およびイオン化を速やか に行うための装置で、該装置は、サンプル提示表面と、表面会合分子で構成され ており、その表面会合分子はエネルギー吸収物質、親和性捕捉デバイス、光感作 性付着分子、およびそれらの組み合わせで構成されるグループから選択され、該 表面会合分子は該サンプル提示表面と会合しており該分析対象物分子と結合する ための手段を有している。 好ましい実施例においては、該サンプル提示手段は、飛行時間質量分光測定分 析計に使用されるプローブ先端の表面で構成されている。さらに、この好ましい 実施例では、該サンプル提示表面に化学的に結合したり、該サンプル提示表面に 物理的に接着されたり、該分析対象物分子と化学的に結合したり、あるいは、該 分析対象物分子と生物学的に接着したり する親和性捕捉デバイス、あるいは光感作性付着分子が用いられる。さらに、こ の好ましい実施例で用いられる分析対象物分子は生体高分子であり、該親和性捕 捉デバイスあるいは光感作性付着分子は分化されていない生物学的サンプルから 該生体高分子を選択的に分離するように適応される。 さらに、この装置は、基質物質を該親和性捕捉デバイスあるいは光感作性付着 分子と会合させた状態で該サンプル提示表面上に置くようにしてもよい。より好 ましい実施例では、この基質物質は弱酸性から強酸性のpH範囲にある。最も好ま しい実施例においては、この基質物質のpH6.0以上である。加えて、好ましい実 施例では、電気絶縁性物質で形成されたサンプル提示表面が用いられる。 本発明のさらに別の実施例では、サンプル提示表面上に分析対象物分子を捕捉 し、後で分析を行うために該捕捉した分析対象物分子を該サンプル提示表面から 脱着あるいはイオン化するための、該サンプル提示表面を親和性捕捉デバイスあ るいは該分析対象物分子と結合するための手段を有する光感作性付着分子で誘導 させるステップと、該親和性捕捉デバイスあるいは光感作性付着分子で該誘導さ れたサンプル提示表面上に該分析対象物分子を捕捉するステップと、該分析対象 物分子を、該親和性捕捉手段あるいは光感作性付着分子によって該誘導されたサ ンプル提示表面に結合したままの状態で、エネルギーあるいは光源に露出させて 、該表面から少なくとも該分析対象物の1部を脱着させるステップで構成されて い る。 本発明のさらに別の実施例は分析のための分析対象物分子を提示するための表 面を作成する方法であって、この方法は該分析対象物を支持するための基板(su bstrate)を提供するステップと、親和性捕捉デバイスあるいは該分析対象物と 選択的に結合するための手段を有する光感作性付着分子によって該基板を誘導さ せるステップと、そして、該親和性捕捉デバイスあるいは光感作性付着分子を結 合した分析対象物分子を検出するための手段とで構成されている。好ましい実施 例においては、該表面に検出用の物質を付加するステップが提供される。さらに 好ましい実施例においては、こうした検出用物質は蛍光種、放射性種、あるいは 発光性種である。 別の好ましい実施例においては、該親和性捕捉デバイスあるいは光感作性付着 分子と会合した状態で脱着/イオン化支援物質を該サンプル提示表面に沈着させ るステップが含まれている。さらに好ましい実施例においては、エネルギー源は レーザーで構成されている。別の好ましい実施例においては、親和性捕捉デバイ スが用いられ、該エネルギー源はイオン源である。さらに、好ましい実施例では 、該エネルギー源に露出後も該分析対象物分子が該サンプル提示表面に結合した ままである。より好ましい実施例においては、少なくとも該誘導されたサンプル 提示表面上に結合したままの分析対象物分子の少なくとも1部を化学的、生物学 的、あるいは物理的な反応によって修飾された分析対象物分子に転換するステッ プ が含まれており、ここで、該分析対象物分子は該親和性捕捉デバイスあるいは光 感作性付着分子によって該誘導されたサンプル提示表面に結合したままであり、 そして、さらに該修飾された分析対象物分子をエネルギー源に露出して少なくと も該修飾された分析対象物分子を該表面から脱着するステップが含まれている。 本発明の1つの実施例においては、完全は分析対象物を気相に脱着するサンプ ルプローブが、サンプル提示表面と、そして、該サンプル提示表面と会合したエ ネルギー吸収分子を含んでおり、該サンプルプローブは、該サンプルプローブが エネルギー源によって衝撃を与えられた時にエネルギー吸収分子上、あるいはそ の上方、あるいはその間に沈着された完全な分析対象物分子の脱着を速やかに行 わせることを特徴としている。より好ましい実施例では、エネルギー吸収分子が 、桂皮酸アミド、桂皮酸ブロマイド、2,5−ジヒドロキシ安息香酸、およびα −シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸で構成されるグループから選択される。さらに 別の好ましい実施例においては、ガラス、セラミックス、テフロン被覆磁性物質 、有機高分子物および天然の生体高分子で構成されるグループから選択される。 別の好ましい実施例においては、元のままの分析対象物の気相への脱着を促進 するサンプルプローブが含まれており、このサンプルプローブはサンプル提示表 面と、該サンプル提示表面と会合した親和性捕捉デバイスで構成されており、該 サンプルプローブがエネルギー源によって衝撃を与えられた時に、該サンプルプ ローブが元のままの分析対象物分子を気相に速やかに転移させることを特徴とし ている。好ましい実施例においては、親和性捕捉デバイスは、金属イオン、蛋白 質、ペプチド類、免疫グロブリン、核酸、炭水化物、レクチン、染料、還元剤、 およびそれらの組み合わせで構成されるグループから選択される。別の好ましい 実施例においては、サンプル提示表面はガラス、セラミックス、テフロンで被覆 した磁性物質、有機高分子物、および天然の生体高分子で構成されるグループか ら選択される。 別の実施例は完全な分析対象物を気相に脱着させるサンプルプローブを含んで おり、このサンプルプローブはサンプル提示表面、および、表面会合分子で構成 されており、該表面会合分子は少なくとも2つの結合部位を有する光感作性付着 分子であり、少なくとも、その1つの部位はサンプル提示表面と結合しており、 少なくとも1つの部位は分析対象物を結合させるために用いることができ、さら に、分析対象物結合部位は光感作性である。 別の実施例では、完全な分析対象物の気相への脱着を促進するためのサンプル プローブが設けられており、このサンプルプローブはサンプル提示表面と、親和 性捕捉デバイス、エネルギー吸収分子および該サンプル提示表面と会合した光感 作性付着分子で構成されるグループから選択される少なくとも2つの異なった分 子の混合物か、あるいは該サンプル提示 表面と会合した光感作性付着分子のいずれかで構成されており、分析対象物が該 サンプルプローブと会合される場合に、該サンプルプローブがエネルギー源によ って刺激を与えられた場合に該サンプルプローブが分析対象物の気相への転移を 促進することを特徴としており、さらにこのサンプルプローブは該分析対象物分 子と会合した親和性捕捉デバイスによって、異なった速度で分析対象物分子の気 相への転移を促進する。 好ましい実施例においては、分析対象物は、エネルギー源により刺激の後に上 記混合物から選択的に脱着される。別の好ましい実施例においては、その配列が 複数の異なった分析対象物を選択的に吸収する。 より好ましい実施例においては、本発明による装置は分析対象物の定量に用い られ、この定量においては、親和性捕捉デバイスの位置と量が吸収された分析対 象物の量を判定する。別の好ましい実施例においては、結合は選択的であっても 、あるいは非選択的であってもよい。 別の実施例で、完全な分析対象物の気相への脱着を促進するサンプルプローブ は、サンプル提示表面と、そして、エネルギー吸収分子と親和性捕捉デバイスの 両方の機能を果たすことができる表面会合分子か、あるいは、少なくとも2つの 結合分の1を有する光感作性付着分子であって、少なくとも1つの部位がサンプ ル提示表面と結合しており、そして少なくとも1つの部位が分析対象物を結合さ せるために利用でき、 そしてその分析対象物結合部位が光感作性であることを特徴としている。 本発明の異なった実施例は、質量分光測定における分析対象物分子の質量を測 定する方法を含んでおり、この方法は、光感作性付着分子(PAM)によってプ ローブ端面上のサンプル提示表面を誘導するステップで構成されており、該PA Mは少なくとも2つの結合部位を有しており、1つの結合部位はサンプル提示表 面と結合し、少なくとも1つの結合部位は分析対象物分子との結合のために利用 することができ、さらに、この方法は該誘導されたプローブ端面を該分析対象物 分子の供給源の露出させて該分析対象物分子をそこに結合させるステップと、そ こに結合した分析対象物分子によってその誘導されたプローブ端を飛行時間質量 分光計の一端に入れて、真空にし、そして電場を発生してその分光計内部に加速 電位を発生するステップと、1つ、あるいは複数のレーザーパルスで分光計内部 の該誘導されたプローブ端面に結合した分析対象物分子の少なくとも1部に刺激 を与えて該分析対象物分子のイオンを該プローブ端から脱着するステップと、該 質量分光計内部でのそれぞれの飛行時によってそのイオンの質量を検出するステ ップと、そして、その検出された質量を表示するステップとで構成される。好ま しい実施例においては、PAMと会合させた該プローブ端面に脱着/イオン化支 援基質物質を適用するステップも含まれる。より好ましい実施例においては、さ らに、該プローブ端を該質量分光計から 取り出し、脱着されなかった該分析対象物分子の該部分に化学的、生物学的、あ るいは物理的な手順を適用して、脱着されなかった該分析対象物分子の該部分の 組成を変えるステップと、該編成された分析対象物分子を載せた該プローブ端を 再度挿入するステップと、後で質量分光測定分析を行って該編成された分析対象 物分子の分子量を判定するステップとが含まれる。好ましい実施例はまた、該プ ローブ端の該面に化学的に結合したPAMも含んでおり、PAMは該分析対象物 分子と化学的に結合しており、PAMと分析対象物分子との間の該結合は光に依 存して破壊され、分析対象物分子が放出され、あるいは、該分析対象物分子は生 体高分子であり、該PAMは分化されていない生物学的サンプルから該生体高分 子を選択的に分離するのに適応されている。別の好ましい実施例では、該基質物 質は弱酸性から強酸性のpH値を有している。さらに好ましい実施例では、該基質 物質は6.0以上のpH値を有している。好ましい実施例はまた、電気的絶縁物質で 形成された該プローブ端の面を含んでいる。 さらに別の実施例ではレーザー脱着/イオン化、飛行時間質量分光測定による 分析対象物分子の質量を測定する方法が提示され、この方法において、光感作性 付着分子(PAM)がその分析対象物分子の脱着およびイオン化を促進するため に該分析対象物分子と組み合わせて用いられており、その改良点は、分析対象物 分子をPAMの表面上、あるいはその上方に提示するステップで構成され、該質 量分光測定・分析で 脱着されなかった分析対象物分子の少なくとも1部は、後で行われる分析手順の ために化学的に利用することができる。 本発明の別の実施例は完全な分析対象物の気相への差別的脱着を促進するため のサンプルプローブであり、サンプル提示表面と、そして少なくとも2つの、該 サンプル提示表面と会合した光感作性付着分子で構成されており、該サンプルプ ローブはエネルギー源により刺激を与えられ、該サンプルプローブは該分析対象 物分子と会合した光感作性付着分子に依存した異なった速度で分析対象物分子の 気相への転移を促進する。好ましい実施例においては、この光感作性付着分子は 所定の配列に並べられている。より好ましい実施例においては、これらの配列は 複数の異なった分析対象物を選択的に吸収する。 本発明のさらに好ましい実施例においては、完全な分析対象物の気相への転移 を促進するサンプルプローブが含まれており、このサンプルプローブはサンプル 提示表面と、該サンプル提示表面に会合した光感作性付着分子とで構成されてお り、サンプルプローブにエネルギー源からの刺激が与えられると、該サンプルプ ローブは完全な分析対象物分子の気相への転移を促進する。好ましい実施例にお いては、分析対象物の定量が行なわれ、光感作性付着分子の位置と量とにより、 吸着された分析対象物の量の判定が行なわれる。 別の実施例は生体高分子シーケンス決定の方法を示し、この方法は生体高分子 分析対象物を、エネルギー吸収分子、親 和性捕捉デバイス、光感作性付着分子、およびそれらの組み合わせで構成される グループから選択される表面選択分子を有するサンプル提示表面を含むプローブ 端に結合させるステップと、質量分光測定分析で生体高分子分析対象物を脱着さ せるステップとを含んでおり、このステップでは該生体高分子の少なくとも一部 がプローブ端から脱着されず、さらにこの方法は、まだプローブ端に結合してい る生体高分子分析対象物を脱着修飾した結果を分析するステップと、そして、生 体高分子が得られるまで、その脱着、分析および修飾ステップとを繰り返すステ ップを含んでいる。好ましい実施例は、蛋白質、RNA,DNAおよび炭水化物 で構成されるグループから選択される生体高分子を提示する。 以下の具体例は本発明の具体的な実施例とその材料、方法を示すものであり、 本発明を説明するものであって、発明の範囲を限定する意図はない。 本発明の実施例はレーザービームなどの飛行時間質量分光計を用いて、プロー ブ端の表面から分析対象物を気化させる。このプロセスにおいて、一部の分子は イオン化される。正荷電された分子は短い高電圧場で加速されて、電場のない飛 行チューブに入る。この飛行チューブの端部に配置された感度の高い検出装置が 、各分子がそれに衝突する度に信号を出す。当業者なら、他のモードの検出やイ オン化を用いることができることが分かるであろう。 実施例1 水溶性、中性化形態のエネルギー吸収分子 基質支援レーザー脱着飛行時間質量分光測定で用いられる先行技術に基づく基 質物質は強酸性である。本発見の1つは、完全に水性の溶剤に解かされた中性化 エネルギー吸収分子と混合されると、分析対象物が脱着されるということである 。pH6.0以上に適切に中性化することによって、この基質物質はプローブ端表面 上に配置された分析対象物分子上で実行される後の化学的、あるいは酵素的反応 を基本的には受けられるようにする。分析対象物分子の小部分だけが各脱着/質 量分光計測定で用いられるので、プローブ端上のサンプルはその場所で後で行わ れる化学的または酵素的修飾のために用いることができる。修飾後、このサンプ ルは質量分光測定によって分析される。同じプローブ端上で分析を行うことによ って、分子とその構造を含むその特性についてより正確に判定することができる 。 質量分光測定はQ−切換ネオジミウムイットリウムアルミニウムガーネット( Md−YAG)パルス化レーザー(355nm,5nsパスル)を用いる修飾Vestecモ デルVT2000、あるいはMASモデルSELD1 Researchリニアー飛行時間質 量分光計で行われる。パルス化レーザー照射によって脱着されたイオンは30keV のエネルギーに加速されて、2メートルの電場のない領域(10-8torrに維持され ている)内で遊走させられる。20ステージ個別ダイノード電子倍増管を用いて検 出 されるイオン信号は、200MS/sトランシェントレコーダー(LeCroy TR8828 D,8ビットy−軸解像度)あるいは高速信号平均化処理を行うことができるTe ktronixデジタイザ記録される前に高速予備増幅器を用いて10倍に増幅される。 最適イオン信号を達成するために、オッシロスコープ(Tektronix)でそのプロ セスをモニタリングしながら、レーザー照射はリアルタイムで調節される。デー タ削減(ピーク中心軌跡および時間の質量/電荷への変換)はパソコンによるソ フトウエアによって行われる。335nmでパルス化レーザーを発生する窒素レーザ ーを用いるAVGTOFSpec質量分光計、あるいは335nmでパルス化レーザーを 発生する窒素レーザーを用いるニリアLDI1700質量分光計を用いることもでき る。I.特異分析 1. シナピン酸(Aldrich Chemical Co.,Inc.,Milwaukee,WI)を20mg/ml(pH 3.88)水に懸濁して、トリエチルアミン(Pierce,Rockford,IL)を用いてpH6. 2〜6.5に中性化する。ヒトヒスチジンを多量に含む糖蛋白質金属結合領域(GH HPH)2G(1206Da),(GHHPH)5G(2904Da)およびヒトエストロゲン受 容体2量体化領域(D473−L525)(6168.4Da)を、プローブ端上で2μlのシ ナピン酸(20mg/ml水,pH6.2)に混合して、レーザー脱着飛行時間質量分光測定 によって分析した。5つのスペクトル(1スペクトルあたり平均100レーザーシ ョット)を得た後、プローブを検索 して,2μlの20mM Cu(SO)4を加え、質量分光測定でサンプルを再分析した 。図1A(上側の図)は、中性化エネルギー吸収分子の存在下で脱着された3つ のペプチド類の質量スペクトルを示している。図1B(下側の図)は、中性エネ ルギー吸収分子の存在下でのペプチド類の、その場所での金属結合を示している 。(GHHPH)2Gペプチドは少なくとも4つのCu(II)を結合させることがで き、(GHHPH)5Gペプチドは、少なくとも5つのCu(II)を結合させること ができ、2量体化領域は本実験条件の下で少なくとも1つのCu(II)を結合させ ることができる。pH6.5に中性化されたα−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸(20m g/ml水)によっても同様の結果が得られる。 2. ヒトβカゼインホスホペプチド(R1−K18+5P)(2488Da)の1μlの アリコットをpH6.5に中性化された桂皮酸(20mg/m1水)の1μlと混合され、レ ーザー脱着飛行時間質量分光測定によって分析する。5つのスペクトル(1スペ クトルあたり平均100レーザーショット)を得た後、プローブを除去し、中性化 されたシナピン酸と混合された残っているホスホペプチドを、0.5μlのアルカリ 性ホスホターゼ(Sigma)によってプローブ端上で直接消化し、23℃の温度下で 5分間培養した。5つのスペクトル(1スペクトルあたり平均100レーザーショ ット)を得た後、プローブを取り出し、さらに0.5μlのアルカリ性ホスホターゼ の別のアリコットを追加して残りのホスホペプチド類のさらに消化させ、23 ℃の温度で5分間培養した。このサンプルをレーザー脱着質量分光測定で再分析 する。図2A(1番上の図)は中性化されたエネルギー吸収分子の存在下で脱着 されたホスホペプチドの質量スペクトルを示している。図2B(上から2番目の 図)はホスホペプチドからホスフェート基を取り除くためのその場所でのアルカ リ性ホスホターゼの5分間の消化を示している。0P,1Pおよび3Pピークは 、上記ホスホペプチドからそれぞれ5つ、4つ、そして2つのホスフェート基を 取り除いた後の生成物を示している。図2C(上から3番目の図)は、その場所 でさらにアルカリ性ホスホターゼでさらに消化を行うと、ホスホペプチドからす べてのホスフェートが完全に除去されることを示している。対照的に、図2D( 1番下の図)は、予備的な中性化(例えば、pH3.88で桂皮酸、あるいはpH2.07で ジヒドロキシ安息香酸)を行わずにエネルギー吸収分子の存在下でアルカリ性ホ スホターゼ(0.5μl)の消化が行われた対象の実験では、23℃、10分間では非常 に限定的な消化しか行われなかった。 3. (GHHPH)5Gペプチド(2904Da)の1μlアリコットをpH6.2に中性化 されたシナピン酸(20mg/ml水)、2μlと混合し、レーザー脱着飛行時間質量分 光測定によって分析された。5つのスペクトル(1スペクトルあたり平均100レ ーザーショット)を得た後、中性化されたシナピン酸と混合された残りのペプチ ド類を1μlのカルボキシペプチダーゼP(Boehringer Mannheim Corp.Indiana polis,IN)でプロ ーブ端上で直接消化し、23℃の温度下で30分間培養した。このサンプルを質量分 光測定で分析した。図3は中性化されたエネルギー吸収分子の存在下でカルボキ シペプチダーゼPによるその場所での消化の前(下側の図)および後(上側の図 )の複合質量スペクトルを示している。質量の減少は、ペプチドのC端末からの Gly残基の除去を示している。 これら3つの実施例は水溶液内での中性化エネルギー吸収分子が、大幅なモル 過剰で付加された場合でさえ、分析対象物の構造と機能を保持する上でより生化 学的に互換性が高い(biocompatible)であることを示している。その存在は、 残っている分析対象物上での化学的、あるいは酵素的反応に対して何も干渉しな い。 実施例2 非金属プローブ素子(サンプル提示表面) 本発明のプロセスで用いられているプローブ素子(プローブ端、あるいはサン プル提示表面)は、先行技術の手順に関連して述べたように必ずしも金属、ある いは金属被覆したものでなくてもよい。サンプル提示表面は、多孔性あるいは非 多孔性物質を含む種々の物質で構成され、多孔性物質はスポンジ状、ポリマー性 、高表面積を有しており、分析対象物の吸着および提示に最適である。 ポリプロピレン、あるいはポリスチレン、あるいはポリエチレン、あるいはポ リカーボネートを火炎中で溶かして、2mm直径ステンレススチールプローブ素子 上に薄膜上に沈着さ せて、それを完全に覆うようにする。固体ガラス棒あるいは固体ナイロンフィラ メント(最大1.5mm径)あるいはポリアクリスアミドを1cm細片に分割し、ステ ンレススチールプローブサポート内に挿入される。磁性撹拌棒(1.5×8mm、テ フロン被覆したもの)をステンレススチールプローブ端サポート内に挿入する。 (GHHPH)2Gおよびヒト/エストロゲン受容体2量体領域を含んだペプチ ド混合物1μlのアリコットを、2μlのジヒドロキシ安息香酸(30%メタノール 、0.1%トリフルオロ酢酸に溶かしたもの)とこうしたプローブ素子のそれぞれ の上で混合して、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析した。図4は、絶縁 性、生化学的に互換性のある表面から脱着されることを示している。 これらの表面は化学結合(共有結合あるいは非共有結合)によって誘導される と、親和性吸着剤(親和性捕捉デバイス)、エネルギー吸収分子(結合『基質』 分子)あるいは光感作性付着分子を結合させることができる。サンプル提示表面 の形状はいろいろで(例えば、サイズ、構造、柔軟性、厚みなど)、実験(アッ セイ)のニーズ(所定のサイズのスペースを通じての生きている生物への挿入) に合わせることができる。 実施例3 親和性指向レーザー脱着 (表面強化親和性捕捉、SEAC) この実施例では、(1)1つ、あるいは複数の分析対象物 の捕捉(吸着)、(2)これら捕捉された分析対象物の作成(例えば、塩などの 汚染物質を除去するための、水や他の緩衝あるいは非緩衝溶液による洗浄、およ び極性有機溶媒、洗剤−溶剤、希釈酸、希釈塩基あるいは尿素などによる正常サ イクルの反復)、そして(3)より重要なことであるが、これら捕捉され、調製 された分析対象物を後で行う分析対象物脱着のためにプローブ表面に直接移行さ せるために設計された既存、および新しい固体相親和性剤の使用について述べる 。親和性捕捉デバイスは電気絶縁性素材(多孔性および非多孔性)、柔軟なある いは固くない素材、光学的に透明な物質(例えば、種々の密度、厚み、色および いろいろな反射率を有するガラスなど)、および、より反応性の低い素材(例え ば、アガロース、デキストラン、セルロース、スターチ、ペプチド、および蛋白 質や核酸の断片など)の上で不動態化される。質量分析のためのサンプルの選択 的脱着/提示のための好ましいプローブ端、あるいはサンプル面は(1)特定の 生体高分子あるいは他の非生物学的親和剤の共有結合による付着に適した合成ポ リマー(例えば、架橋デキストランあるいはアガロース、ナイロン、ポリエチレ ン、ポリスチレン)で被覆したステンレススチール、(2)ガラス、セラミック ス、および/または(3)プラスチック(合成ポリマー)などである。これらプ ローブ表面への親和剤の選択的不動態化に関与する化学構造には、知られている ような種類の、共有結合による、または共有結合によらない不動態化のための酸 素依存、炭素依存、硫黄依存、および/または窒素依存手段を含んでいる。I.親和性捕捉デバイスとしての表面不動態化金属イオン 1. 多孔性アガロース・ビーズ(Chelating Sepharose Fast Flow,Pharmacia B iotech Inc.,Piscataway,NJ、配位子密度22〜30μモル/mlゲル)あるいは固体 シリカゲルビーズ(Chelating TSK−SW,Toyo Soda,日本、配位子密度15 〜20μモル/mlゲル)のいずれかに対し共有結合で結合したイミノジアセテート (IDA)基によって、Cu(II)をキレート化する。ニューロテンシン(1655Da )、スペルム活性化ペプチド(933Da)、およびアンギオテンシンI(1296.5D a)を含んだ合成ペプチドの混合物を、pH7.0のTSK−SW IDA−Cu(II) (20mMリン酸ナトリウム、0.5M塩化ナトリウム)50μlを用いて、23℃の温度下 で10分間、混合した。このゲルを遠心分離によって残っているペプチド溶液から 分離し、次に、200μlリン酸ナトリウム、塩化ナトリウム緩衝液、pH7.0で3度 洗浄して、非特異的に結合したペプチド類を取り除く。最後に、このゲルを50μ lの水に懸濁させる。2μlのゲル懸濁液と非吸収ペプチド溶液のアリコットをス テンレススチールプローブ端上で1μlのシナピン酸(メタノールに溶解したも の)と混合させて、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。プローブ端 のいろいろの場所で5つのスペクトルを得た後(1スペクトルあたり平均100レ ーザーショット)、メタノールでシナピン酸を取 り除く。2μlの20mM CuSO4のアリコットを付加し、その後、1μlのシナピ ン酸と混合して、レーザー脱着飛行時間質量分光測定によって再分析する。プロ ーブ端のいろいろの場所で別の5つのスペクトルを得た後(1スペクトルあたり 平均100レーザーショット)、メタノールで除去する。IDA−Cu(II)ゲルビー ズに吸着された残りのペプチドを、pH8.0の0.1M重炭酸ナトリウム内で、トリプ シン(シグマ)1μlで、モイスト・チェンバー内で23℃の温度下で10分間消化 させる。このゲル・ビーズを水で洗浄して酵素と塩を除去した後、1μlのシナ ピン酸を加えて、そのサンプルをレーザー脱着飛行時間質量分光測定で再分析す る。図5Aは、IDA−Cu(II)によって吸収されなかった残りのペプチド溶液 内のスペルム活性化因子(933Da)およびニューロテンシン(1655Da)の分子 イオン(および多重Na−アダクト)を示している。アンギオテンシンI(1296. 5Da)に対応する有意のピークは存在しない。図5Bの質量スペクトルはIDA −Cu(II)ゲルにかなり選択的に吸収されたアンギオテンシンI+Na−アダクト ピータを示している。IDA−Cu(II)ゲルをさらに500μlの水で2度洗浄した 場合に得られる質量スペクトルは、ペアレントアンギオテンシンだけを示し、他 のアダクトピーク(図5および6図C)は示されなかった。図6Dは、アンギオ テンシンペプチドによるその場所での銅結合を示している。図6Eは、その配列 のシングルArg2位置でのアンギオテンシンのその場所でのトリプシン消 化を示す。 この実施例は、a)表面が不動態化された金属イオン上に親和性吸着された分 析対象物レーザー脱着が良好に行われること、b)一度結合すると、分析対象物 の非常に明確な質量スペクトルを得ることができるようにサンプル内の含むすべ ての汚染化合物を除去するために、種々の溶剤で洗浄することができ、c)この 親和性捕捉デバイスが明確に定義された分析対象物だけを選択すること(本例で は、IDA−Cu(II)によってペプチド混合物からアンギオテンシンが選択的に 吸収される。このペプチドは自由なN−端末と2つのヒスチジンアミノ酸残基を その配列に有しており、両方の性質とも強力なCu(II)−結合にとって必要であ るのに対して、スペルム活性化因子とニューロテンシンの両方ともN−端末は塞 がれており、その配列内にヒスチジンアミノ酸残基を有していない)、d)吸着 された分析対象物上で、その場所での化学的、あるいは酵素による配列修飾を通 じて構造および機能回析を行うことができ、しかも反応、洗浄の各ステップでサ ンプルのロスが非常に少ないこと、そしてe)表面が結合した基質(例えば、ア ンギオテンシンI)を有するプローブ素子を用いて、その場所で(例えば、人体 の胃腸内部で)特殊な酵素活性(例えば、トリプシン)をモニターすることがで きる、ことを示している。 2. ウマ心臓のミオグロビン(325pモル、16,952Da)の溶液を、pH7.0(20mM リン酸ナトリウム、0.5M塩化ナトリウム) でTSK−SW IDA−Cu(II)の50μlと23℃の温度下で10分間混合する。こ のゲルを遠心分離で溶液から分離し、500μlの緩衝液で2回、さらに、500μlの 水で2回洗浄する。これらすべての溶液中に残っているミオグロビンを分光光度 計で測定することにより、ゲルに吸収された量を計算することができる。このゲ ルを50μlの水に懸濁させて、その後、水で希釈する。希釈されたゲル50μlのア リコットを(30%メタノール、0.1%トリフルオロ酢酸)と混合し、レーザー脱 着飛行時間質量分光測定で分析する。図7はミオグロビンの検出可能な信号(平 均50レーザーショットを与えた後の信号/ノイズ比=6)が得られ、プローブ 端上に沈着したミオグロビンの量が4〜8fモルと計算されることを示している 。 この実施例は、表面上に親和性吸着された分析対象物が一層簡単に転移され、 容器や転移装置の表面への非特異的な吸着によるロスがないことを示している。 吸着された分析対象物を、レーザー脱着/イオン化、飛行時間質量分光測定によ って効率的に検出するために必要な明確に定義された表面密度あるいは局所的濃 度で、低(アット乃至フェムトモル)量でサンプル提示表面の予め決められた領 域(レーザースポットサイズより小さい)上で配列決定される。 3. ヒトβカゼインペプチド(E2−K18)をApplied Biosystem社のモデル4 30Aペプチドシンセサイザー上で、NMP−HOBtプロトコルを用いて合成す る。ホスホリル化されるべきSer残基を側鎖保護基のないペプチド鎖に結合さ せる。保護されないSerを、先ず、di−t−ブチル−N,N,−ジイソプロピル −ホスホルアミダイトを用いてホスホル化する。次に、このリン酸エステルをt −ブチルペロキサイドで酸化し、水洗し、レシンから分割する。95%トリフルオ ロ酢酸ですべての側鎖保護基を除去する。未精製ホスホペプチドをメチル t− ブチルエーテルで抽出して、乾燥する。この合成ホスホペプチドの未精製調製物 を50mM MES、pH6.5の0.15M塩化ナトリウムに溶解し、多孔性セファロース( Yip,T−TおよびHutchens,T.W.,Proteins Expression and Purification 2:355−362(1991)に従って合成されたもの)上で不動態化されたトリス( カルボキシメチル)−エチレンジアミン(TED)−Fe(III)50μl、配位子密 度65μモル/ml、と23℃の温度下で15分間混合する。このゲルを同じ緩衝液で3 回洗浄し、その後、500μlの水で1回洗浄した。ゲル1μlのアリコットをプロ ーブ端上で1μlのシナピン酸(30%メタノール、0.1%トリフルオロ酢酸)と混 合して、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。プローブ端のいろいろ なスポトで5つのスペクト(1スペクトルあたり平均100レーザーショット)を 得た後、メタノールでシナピン酸を取り除き、TED−Fe(III)上に吸着された 残りのホスホペプチドを50mM HEPES pH7.0内で、モイストチェンバー内で2 3℃の温度下で10分間、1μlのアルカリ性ホスファターゼ(硫化アルミニウム懸 濁液、Sigma)を用いて、プローブ端上で直接消化する。このゲルを水で洗浄し て酵素 および塩を除去する。シナピン酸を加えて、サンプルをレーザー脱着質量分光測 定で分析する。図8(1番上の図)はいろいろなホスホリレート化形態を有する カセインペプチド(1934Da)の分布を示す。その場所でのアルカリ性ホスファ ターゼ消化を行った後、最初の非ホスホリレート化された形態だけが残っている (下側の図)。 この実施例は、予め清浄化せずに、未精製の混合物内でのホスホペプチド合成 のクイックモニターとしてのSEACの応用の可能性を示している。その場所で のアルカリホスファターゼ消化によって、ホスホペプチドの確認を簡単に確認す ることができる。 4. プレタームインファント調製液(preterm infant formula)(SIMILA C,Meade Johnson)100μlのアリコットとこの調製液を与えた後、90分間呼吸 させたプレタームインファントの消化内容物を、0.1M MES,0.15M塩化ナト リウム内で50μlのTED−Fe(III)セファロース50μlと混合する。このゲルを 500μlの同じ緩衝液で3回洗浄し、その後、500μlの水で1回洗浄する。1μl のゲル懸濁液、プレタームインファント調製液、あるいは胃吸引物(gastric as pirate)をプローブ端上で2μlのシナピン酸(50%アセトニトリル、0.1%トリ フルオロ酢酸に溶解したもの)と混合して、レーザー脱着飛行時間質量分光測定 で分析する。図9は、胃吸引物全体の質量スペクトル(上から2番目の図)がイ ンファント調製液(1番下の図)とまったくよく似ており、1,000〜 15,000Da領域の分子量を持っていることを示している。しかしながら、これら 2つのサンプルからTED−Fe(III)によって選択的に吸着された分析対象物の 質量スペクトルはまったく違ったものであり、調製液(下から2番目の図)より 胃吸引物(1番上の図)の方により多く低分子量ホスホペプチド(TED−Fe( III)により結合したもの)が存在しているが、これは調製液内に存在するホスフ ォプロテインが胃吸引物を消化するからである。この実例は、SEACが生物学 的なサンプル内部の特定の分析対象物の分析に特に有用であることを示している 。複合サンプル内に他の汚染物質が存在している場合、ホスォペプチド類を検出 するのはより困難であるが、これはそれらが正イオンモード内でイオン化される 程度が低いからである。しかしながら、ホスフォペプチドが選択的に吸着され、 サンプル中の他のすべての成分が取り除かれると、そうした信号抑制は観察され ない。 5. ヒトおよび仔ウシのヒスチジンを多量に含んだ糖蛋白質200μlのアリコット をpH7.0でIDA−Cu(II)セファロース(Pharmacia)(20mMリン酸ナトリウム 、0.5M塩化ナトリウム)50μlと23℃の温度下で10分間混合した。このゲルを50 0μlの緩衝液で2回洗浄し、さらに500μlの水で1回洗浄する。ゲル1μlのア リコットを2μlのシナピン酸(30%メタノール、0.1%トリフルオロ酢酸に溶解 したもの)と混合し、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。プローブ 端上のいろいろな場所で5つのスペクトルを得た後(1ス ペクトルあたり平均100レーザーショット)、メタノール酸で洗浄して、シナピ ン酸を取り除く。IDA−Cu(II)ゲル上に吸着された残りの糖蛋白質を20mMリ ン酸ナトリウム、0.5M塩酸ナトリウム、3M尿素内で,pH7.0、37℃の温度下で 、モイスト・チェンバー内で1夜消化する。水で洗浄して酵素と塩を取り除いた 後、2μlのシナピン酸を加えて、サンプルを質量分光測定で分析する。5つの スペクトル(1スペクトルあたり平均100レーザーショット)を得た後、シナピ ン酸をメタノールで取り除いた。0.1M重炭酸ナトリウム内に2μlのトリプシン を溶解したアリコットを加えて、モイストチェンバー内で37℃の温度下、30分間 培養した。水洗して酵素と塩を取り除いた後、シナピン酸を加えて、質量分光測 定でサンプルを分析した。プローブ端のいろいろな場所で5つのスペクトル(1 スペクトルあたり平均100レーザーショット)を得た後、メタノールでシナピ ン酸を除去する。20mM CuSO4 2μlのアリコットを加える。その後、2μlの シナピン酸を加え、その後、質量分光測定で分析した。プローブ端のいろいろな 場所で5つのスペクトル(1スペクトルあたり平均100レーザーショット)を得 た後、メタノールでシナピン酸を取り除く。5mM HEPES,pH6.5に溶解した 2μlのジエシルピロカルボネート(Sigma)のアリコットを加え、23℃の温度下 、30分間培養した。水洗して化学物質と緩衝塩類を除去した後、2μlのシナピ ン酸を加えて、サンプルを質量分光測定で分析する。ジエチルピロカルボネー トでヒスチジン残基を修飾する代わりに、金属結合ペプチドの部分配列を得るた めには、表面上に吸着されたトリプティックダイジェスト(tryptic digest)に 1μlのカルボキシペプチダーゼY(Boehringer Mannheim)を加えて、モイスト チェンバー内で室温で5分間培養する。水で酵素と塩を洗い流した後、1μlの シナピン酸を加えて、質量分光測定で分析する。図10AはN−グリカナーゼ消化 の前と後のIDA−Cu(II)セファロース上に吸着されたヒトおよび仔ウシのヒ スチジンを多量に含む糖蛋白質の複合質量スペクトルを示している。質量変移は それぞれの糖蛋白質から炭水化物が除去されることを示している。図10Bは2つ の種の脱グリコシレート化された蛋白質からのトリプシンで消化されたペプチド 類の複合質量スペクトル(上の図はヒト蛋白質、下から図は仔ウシ蛋白質)と、 これら2つの種のトリプシン消化ペプチドのその場所でのCu(II)結合(上から 2番目の図はヒト蛋白質、1番下の図は仔ウシ蛋白質:1,2の数字は結合した 銅の数を示す)を示している。図10Cは、そうした1つのCu(II)結合ペプチド (1番下の図)が少なくとも4つのHis残基を有しており、それらがジエチルピ ロカルボネートで修飾された、4N−カルベトキシ−ヒスチジルアダクト(1〜 4、1番上の図)を形成していることを示している。図10Dは仔ウシのヒスチジ ンを多量に含む糖蛋白質内の主要Cu結合ペプチドの部分的C−端末配列を示し ている。この例は、異なった種からの金属結合領域の構造と機能を解明するため にSEACの使用が有効であることを示している。II.親和性捕捉デバイスなどの表面不動態化抗体 1. ポリグローナルウサギ抗−ヒトラクトフェリン抗体はBethyl Laboratories (Montgomery,TX)によって精製されたヒトラクトフェリンによってつくりださ れるものである。この抗体は、チオフィリック吸着および不動態化ラクトフェリ ンカラムによって親和性純化さる。磁性ビーズに共有結合で付着されたヒツジ抗 ウサギIgGを、Norway,Oslo,DynalASから入手した(均一2.8μm超磁性体ポリ スチレンビーズ、1mgビーズあたり配位子密度10μgヒツジIgG)。ヒトラクト フェリン(1nモル、59Feでラベル、81,100Da)を20mMリン酸ナトリム、0.15 M塩化ナトリウム、pH7.0で、37℃の温度下、30分間、ウサギ抗−ヒトラクトフ ェリンで培養する。その後、ダイナビーズ(6−7×108ビーズ/ml)に載せた40 μlのヒツジ抗ウサギIgGを加えて、37℃の温度で30分間培養する。このビーズ を500μlのリン酸ナトリウム緩衝液で3回洗浄し、さらに500μlの水で2回洗浄 する。この複合体に結合したヒトラグトフェリンの最終的な量は4pモルと判定 されるビーズのほぼ10分の1がテフロンで被覆した磁性プローブ端に転移され、 2μlのシナピン酸(30%メタノール、0.1%トリフルオロ酢酸に溶解したもの) と混合され、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析される。図11は抗原−1 次抗体−2次抗体複合体(上側の図)内にラクトフェリン(81,143Da)が存在 していることを示しており、一方、こ の1次抗体−2次抗体コントロール(下側の図)はウサギ抗体信号(単独荷電で 149,000Da、2重荷電で74,500Da)のみを示している。 この実施例はa)表面不動態化抗体上に親和性吸着された分析対象物でレーザ ー脱着が良好に脱着されること(1次抗体−分析対象物複合体の混合物内で分析 対象物信号が不明瞭にしか確認されない場合は、本方法においては、分析対象物 を確認するために、表面を不動態化した2次抗体、蛋白質A、蛋白質G、ストレ プタビジンなどの、1次抗体のいずれかの捕捉デバイスが用いられる);b)分 析対象物の1つがその捕捉の主要対象物との会合を通じて検出される特異性蛋白 質識別現象を通じての蛋白質発見の原理;そしてc)効率的な捕捉デバイスとし ての磁性表面の使用を示している。 2. 親和性純化されたウサギ抗−ヒトラクトフェリンをグルタルアルデヒドを介 して活性化されたナイロンプローブ素子(2mm径)の先端に共有結合を利用して 結合させる。これを350fモルのヒト・ラクトフェリンを含む1mlのプレターム インファントウリン(胎仔の尿),pH7.0に浸して、4〜8℃の温度下で15時間 撹拌する。ナイロンプローブ端を取り出して、1mlの20mMリン酸ナトリウム、0. 5M塩化ナトリウム、3Mの尿素,pH7.0で3回洗浄し、さらに1mlの水で2回洗 浄する。シナピン酸2μlのアリコット(30%メタノール、0.1%トリフルオロ酢 酸)を加えて、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。図12はヒトラク トフェリン分子イ オン(信号・ノイズ比=2.5、平均25レーザーショット)を質量スペクトルで示 したものである。図13は1nモル/mlのラクトフェリンを含んでいるプレターム インファントウリン全体の等価質量スペクトルを示すもので、尿サンプル内に他 の成分が存在している場合に引き起こされる信号抑制が非常に大きいので、図12 に関して述べたように350fモル/mlのラクトフェリンに数千倍の比率で付加して も、検出されない程である。 この実施例は、柔軟なプローブ素子の平たい表面(2次元構成)上でのSEA Cデバイスの使用を示している。このSEACデバイスは血液、涙、尿、唾液、 胃腸液、脊椎液、羊水、骨髄液、バクテリア、ウイルス、培養中の細胞、生体標 本組織、植物の組織あるいは液体、昆虫の組織や液体などの未分化の生物学的な サンプルから目的の分析対象物を分離するのに用いることができる。この特異性 のある親和性吸着ステップは複雑なサンプル内での他の成分による汚染から分析 対象物を隔離することを可能にし、特に、分析対象物の濃度が非常に低い場合( フェムトモル/ml)に信号抑制効果を克服する。 3. SEACを用いた技術による検出感度のさらなる改善を分析対象物に結合し た標識物質の増幅によって達成される。これを行う1つの方法は、酵素触媒とス トレプタビジン−ビオチンシステムとの組み合わせによって行うことができる。 実施例3.II.2.で述べたナイロンプローブ素子上で微量のラ クトフェリンを捕捉した後、ビオチニル化した抗ラクトフェリン抗体、あるいは ビオチニル化した単一鎖DNAを用いて、ラクトフェリンに特異的に結合させる 。次にストレプタビジンを加えて、ビオチニル化した標識物質に特異的に結合さ せる。最後にビオチニル化したアルカリ性ホスファターゼを加えて、ストレプタ ビジンに特異的に結合させる。こうしたビオチニル化したアルカリ性ホスファタ ーゼのいくつかが1つのストレプタビジンに結合することができるので、1次レ ベルでの増幅が行われる。第2のレベルの増幅は酵素触媒によってもたらされ、 この場合酵素は1分あたり102から103-1のターンオーバー数を達成することが できる。アルカリ性ホスファターゼ酵素活性のアッセイは、ATP,NADPH 、あるいはホスフォペプチドなどの低分子量ホスフォリル化基質を用いることに よって、簡単に行うことができる。低分子量分析対象物の重量変移を検出する効 率は、80kDa糖蛋白質の場合よりずっと高い。 4. 現段階での検出における最大の改善は、プロメラーゼ鎖反応原理に基づく増 幅によって達成される。実施例3.II.2.で述べたようにナイロンプローブ素子上 に微量のラクトフェリンを捕捉した後、ビオチニル化した抗ラクトフェリン抗体 あるいはビオチニル化した単一鎖DNAを用いてラクトフェリンに特異的に結合 させる。次に、ストレプタビジンを付加してビオチニル化した標識物質に特異的 に結合させる。最後に一片のビオチニル化した線状DNAを付加して、ステプタ ビジンに特異的に結合させる。この結合DNA標識物質が30サイクルポリメラー ゼ鎖反応手順で増幅される。各サイクルは94℃での1分間の変性ステップと、1 分間の、72℃での1次拡張反応とによって構成されている。この手順は106程度 の範囲の増幅倍率をもたらす。この増幅されたDNAを、3−OHピコリン酸を 基質として用いて、レーザー脱着質量分光測定で直接検出する。 5. ポリクローナルウサギ抗−仔ウシヒスチジン含有抗体を、Bethyl Laborator ies(Montgomery,TX)による精製仔ウシヒスチジン含有糖蛋白質に対して作成 する。この抗体をチオフェン吸着および不動態化された仔ウシヒスチジン含有糖 蛋白質カラムで親和性純化する。この精製された抗体をメーカーの指示に従って AffiGel 10(BioRad Laboratories,Hercules,CA、配位子密度15μモル/mlゲル )上で不動態化する。仔ウシの初乳200μlのアリコットを20mMリン酸ナトリウム 、pH7.0、200μlで希釈して、50μlの不動態化抗体に入れ、23℃の温度で30分間 撹拌する。このゲルを500μlの20mMリン酸ナトリウム、0.5M塩化ナトリウム、 3Mの尿素、pH7.0で3回洗浄し、次に500μlの水で二回洗浄する。洗浄された ゲル1μlのアリコットを2μlのシナピン酸(30%メタノール、0.1%トリフル オロ酢酸に溶解したもの)とプローブ端上で混合して、レーザー脱着飛行時間質 量分光測定で分析する。図14は、精製された仔ウシのヒスチジンを多量に含む糖 蛋白質の質量スペクトル(下側の図)と、仔ウシ初乳から得た蛋 白質の親和性(下側の図)を示している。この結果は、完全な、ヒスチジンを多 量に含む糖蛋白質と、仔ウシ初乳内の主要な原始的断片の存在を示している。 この実施例は、少量の生物液内での新しい蛋白質の検出および特徴付けにおけ る手軽で単純な手法としてSEACを用いた場合の有効性を示している。この結 果はポリアクリルアミドゲル電気泳動の非常に手間のかかる免疫ブロッティング で得られるた初期の知見を裏づけるものである。 6. SEAC手法を用いることによって、抗体の完全なマッピングを簡単に行う ことができる。抗ヒト・卵胞刺激ホルモンの3つの供給源(Chemicon Internati onal,Temecula,CaからのベータFSHに対して特異性を発揮するポリクロー ナル、Serotec,Indianapolis,INからのベータ3エピトープに特異性を示すモ ノクローナル、Biodesign,Kennebunk,MEからのモノクローナル)をメーターの 指示に従ってAffiGel 10上で不動態化した。これらの不動態化した抗体のすべて について、卵巣刺激ホルモンの2つの異なった製剤(Chemicon社からの半精製製 剤、およびAccurate Chemical and Scientific Corp.からの粗精製製剤)で培 養することによって、卵巣刺激ホルモンと特異的に結合するかどうかをテストし 、その後、シナピン酸の存在下で質量分光測定によって分析する。次に、ヒトF SH(Chemicon)の半精製製剤をトリプシンで消化して、個別のアリコット(7 ul)をホスフェート緩衝食塩水中で、これらの不動態化された抗体(10ul 1: 1ゲル懸濁液) と、4℃の温度下で、2時間反応させる。 リン酸緩衝食塩水および水で洗浄した後、吸着された蛋白質を、シナピン酸の 存在下でレーザー脱着質量分光測定で分析する。図15は異なった抗体によって認 識された卵巣刺激ホルモンのペプチドの複合質量スペクトルを示す。これら2つ のモノクローナル抗体は異なったエピトープを明瞭に識別するのに対して、ポリ クローナルは両方のモノクローナルによって識別されたものに共通のエピトープ だけを識別する。III.親和性捕捉デバイスとしての表面不動態化核酸 1. 4%アガロースビーズ上で不動態化された単一鎖DNAをGIBCCBRL (Gaithersburg,MD 配位子密度0.5〜1.0mg DNA/mlゲル)から入手する。12 5 I−ヒトラクトフエリン(49nモルに相当)のアリコットを100μlの不動態化 単一鎖DNAと20mM HEPES,pH7.0内で、室温下、10分間混合する。このゲ ルを500μlのHEPES緩衝液で五回洗浄し、その後等量の水に懸濁させる。ビ ーズ1個あたりに結合するラクトフェリンの量は、放射活性の判定、および単位 体積あたりのビーズの数を数えることによって62fモルと推定される。0.5mm直 径のプローブ端上にいろいろの数のビーズ(1〜12)を置いて、0.2μlのシナピ ン酸(30%メタノール、0.1%トリフルオロ酢酸に溶解したもの)と混合し、レ ーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。図16は、単一鎖DNAアガロース のひとつのビーズに親和性吸着されたラクトフェリンの質量スペクトルを示して いる。これは、その ひとつのビーズから得られた全部で5つのスペクトル(1スペクトルあたり平均 100レーザーショット)の代表的なスペクトルである。 この実施例は、表面を不動態化された核酸などの生体高分子に親和性吸着され た分析対象物上で、レーザー脱着が良好に行われることを示している。ヒトラク トフェリンとDNAとの間の相互作用の特異性は、すでに文献で紹介され、微量 のラクトフェリンをプレタームインファントウリン(preterminfant urine)か ら捕捉する目的で広く用いられている。このケースでは、ラクトフェリン親和性 捕捉デバイスを伝達する効率と、レーザー脱着の感度をうまく組み合わせること によって、質量分光測定の検出感度が大幅に向上することを示している。 2. 30pモルの59Fe−ヒトラクトフェリンを含んでいる出産前胎仔の尿の1ml のアリコットを0.1M HEPES、pH7.4中で、20μlの単一鎖DANアガロース と23℃の温度下、15分間混合した。このゲルを500μlのHEPES緩衝液で2回 洗浄し、その後、500μlの水で2回洗浄する。このゲルを等量の水に懸濁させ、 この懸濁液1μl(放射活性で判定して吸着ラクトフェリンは350fモル以上含ん でいない)を1μlのシナピン酸(30%メタノール,0.1%トリフルオロ酢酸に溶 解したもの)とプローブ端上で混合して、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で 分析する。図17は、親和性捕捉デバイスとしての表面不動態化DNAで尿から抽 出したラクトフ エリンの質量スペクトルを示している。 この例は、DNA捕捉デバイスでの、生物液内の微量の高分子量分析対象物の 検出における効率と感度を示している。IV.親和性捕捉デバイスとしての表面不動態化したいろいろの生体高分子 1. 大豆トリプシン抑制因子(Sigma)をAffiGel 10(BioRad)上でメーカーの 指示にしたがって不動態化させる。100μlのヒト十二指腸吸引物アリコットを50 μlのpH7.0の表面不動態化大豆トリプシン抑制因子(20mMリン酸ナトリウム、0. 5M塩化ナトリウム)50μlと23℃の温度下で15分間混合する。次にこのゲルを50 0μlのリン酸緩衝液で3回洗浄し、さらに500μlの水で2回洗浄する。ゲル懸濁 液あるいは最初の十二指腸吸引物1μlのアリコットを2μlのシナピン酸(50% アセトニトリル、0.1%トリフルオロ酢酸に溶解したもの)と混合し、レーザー 脱着飛行時間質量分光測定で分析する。図18Aは総十二指腸吸引物の複合質量ス ペクトル(下側の図)と表面不動態化大豆トリプシン抑制因子に吸着された蛋白 質の質量スペクトル(下側)とを示している。親和性捕捉されたサンプルの主要 なピークはトリプシンを示している。同様の結果はa)グルタルアルデヒドを介 して大豆トリプシン抑制因子に結合されたナイロンプローブ素子の先端か、b) グルタルアルデヒドかジビニルスルフォンを介して大豆トリプシン抑制因子に結 合したポリアクリルアミドによって被覆されたアクリルプローブの先端に置かれ たわずか1μlの十二 指腸液でも得ることができる(図18B)。 これらの結果は、a)生物液内での特定の分析対象物の検出および特徴付けに おける非不明瞭性と,b)その場所での、診断の目的で柔軟性のある(例えばナ イロン)プローブ素子をエンドスコープを通じて直接人体に挿入することができ ること、を示している。 2. ダイナビーズ(均一で、2.8μm、超磁性、ポリスチレンビーズ)をDynal,A S,Oslo,Norwayから入手する。150μlのヒト血漿あるいは18pモルのビオチニ ル化インシュリン(Sigma)を含む尿のアリコットをpH7.0のストレプタビジンダ イナビーズの20μl懸濁液(20mMリン酸ナトリウム,0.5M塩化ナトリウム)と、 23℃の温度下で10分間混合した。このビーズを3M尿を含む500μlの緩衝液で3 回洗浄した後、500μlの水で1回洗浄する。ビーズ懸濁液0.5μlのアリコットを 2μlのシナピン酸(30%メタノール、0.1%トリフルオロ酢酸と混合し、レーザ ー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。図19Aは尿から親和性吸着されたビオ チニル化インシュリンの質量スペクトルを示している。複数のピークはひとつか ら3つのビオチン基で惹起されたインシュリンを示している。図19Bは血漿から 親和性吸着されたビオチニル化されたインシリンの質量スペクトルを示している 。 この実施例は、ビオチン−ストレプタビジン結合を介して親和性吸着された分 析対象物上でレーザー脱着が行われることを示している。ビオチンとアビジン( Ka=1015-1)と の強固な結合から、このシステムは、その場所で化学あるいは酵素による修飾が 行われるプローブ表面上での蛋白質および核酸に対する理想的なSEACデバイ スとして機能する。 3. ヒト/エストロゲン受容体DNA−結合領域(84残基)をバグテリア内で表 現する。プラスミド表現ベタターpT7 ERDBD(J.Schwabe,MRC Laboratory of Molecular Biology,Cambridge,UK)を大腸菌BL21(DE3)plyS細胞 (Novagene)に移行させる。DNA結合領域の表現は1mMイソプロピルチオガラ クトシド(GIBCOBRL)で誘発され、3時間の誘発後、バクテリアを収穫 した。誘発されたバクテリア全体を基質支援レーザー脱着/イオン化質量分光測 定で分析して、DNA−結合領域が合成される主要なペプチドであることを確認 した。ペプチドをバクテリア性リゼートから逆相HPLCで純化し、AffiGel 10 (BioRad)上で不動態化する。エストロゲン反応要素を含む30−bpDNA配列を Genosys(Houston,TX)で合成する。表面親和性吸着したapo−,Zn−およびC u−結合形態のDNA−結合領域と配列特異性核酸(エストロゲン反応要素)と の相互作用に関して、3−ヒドロキシピコリン酸を基質として用いることによっ て調査する。 この実施例は、蛋白質表面の機能性領域がSEACにおいて捕捉デバイスとし て利用できることを示している。各蛋白質表面領域の構造と機能上の金属結合の 影響を調べることができる。 4. 表面(例えば、Con A−セファロース、小麦胚レクチ ン−セファロース、Pharmacia)上で不動態化されたレクチンの異なったアリコ ットを用いてヒトのグリコペプチドおよび仔ウシのヒスチジンを多量に含んだ糖 蛋白質トリプティックダイジェストを結合させた。緩衝液と水で洗浄して未結合 のペプチド類を取り除いた後、FUCcase I,MA Nase I,HEXase I, NANase IIIおよびPKGase(Glyko,Inc,Novato,CA)を用いてその場所で 配列酵素消化を行った。このサンプルをレーザー脱着飛行時間質量分光測定で分 析して、これら2つの蛋白質内の糖蛋白質の炭水化物組成について調べる。この 実施例は、糖蛋白質を連結するためのSEACの利用、そしてその場所で配列決 定できる炭水化物成分を示している。V.親和性捕捉デバイスとしての表面不動態化染料 シバクロンブル−3GA−agarose(タイプ3000、4%ビーズ化アガロース、 配位子密度2〜5μモル/mlゲル)をSigmaから入手する。ヒト血漿の200μl のアリコットを50μlの表面不動態化シバクロンプルー、pH7.0(20mMリン酸ナト リウム、0.5M塩化ナトリウム)と、23℃の温度下、10分間混合した。このゲル を500μlの緩衝液で3回洗浄し、500μlの水で2回洗浄する。1μlのゲル懸濁 液のアリコットを2μlのシナピン酸(50%アセトニトリル、0.1%トリフルオロ 酢酸に溶解したもの)と混合し、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する 。図20は表面不動態化シバクロンブルーによる血清サンプルからのヒト血漿アル ブミン(2重電荷 イオン[M+2H]2+,32,000m/z、単一電荷イオン[M+H]+,64,000m/z、 2量体イオン、2[M+H]+,128,000m/z)の選択的脱着を示している。テス トされた他の不動態化染料としては、リアクティブレッド120−アガロース、リ アクティブブルーアガロース、リアクティブグリーンアガロース、リアクティブ イェロウ・アガロース(すべてSigma社製)などで、それぞれヒト血漿からの異 なった血漿を選択する。 実施例4 表面強化ニート脱着(SEND) この実施例は分析対象物の脱着およびイオン化の方法を示し、この方法におい ては分析対象物は基質結晶構造中に分散しているのではなく、エネルギー吸収分 子の付着表面内部、あるいはその上、あるいはその上方の、いろいろな化学的、 物理的、および生物学的修飾や認識反応への反応を示す位置に存在する。表面は 適切な密度の(共有結合により、あるいはそれによらないで)、エネルギー吸収 の単層あるいは複数の層を用いていろいろな質量の分析対象物分子の脱着を速や かに行わせるように、いろいろな形状で結合しているエネルギー吸収分子により 誘導される。 以下の実施例(グループI〜IV)は、SENDとSEACとの組み合わせを示 しており、これらの実施例においては、脱着(結合された)エネルギー吸収分子 は分析対象物分子の捕捉を促進するための親和性吸着剤としての役割も果たして いる。I.表面への共有結合によって結合したエネルギー吸収分子 1. 桂皮酸アミド(Aldrich)(先行技術ではレーザー波長355nmで基質としての 役割は果たさない)をプロパノール:0.5M炭酸ナトリウム(3:1)に溶解し て、ジビニルスルホン(Fluka,Ronkonkoma,NY)活性化セファローズ(Pharmac ia)と23℃の温度下で2時間混合した。過剰のエネルギー吸収分子はイソプロパ ノールで洗浄除去する。この分子構造を図21に示す。結合、あるいは遊離分子2 μlのアリコットをプローブ端上に置いて、0.1%トリフルオロ酢酸に溶かしたヒ トエストロゲン受容体2量体化領域1μlをその上に加え、レーザー脱着飛行時間 質量分光測定で分析した。これらの結果はペプチドイオン信号が結合エネルギー 吸収分子表面(図20、上側)上でのみ検出されること、そして遊離分子は有効で ないこと(図20、下側)を示している。 2. 桂皮酸ブロマイド(Aldrich)(先行技術ではレーザー波長355nmで基質とし て機能しない)をイソプロパノール:0.5M炭酸ナトリウムに溶かして(3:1 )、ジビニルスルホン(Fluka)活性化セファロースと23℃の温度下、15時間混 合した。過剰なエネルギー吸収分子をイソプロパノールで洗浄除去する。その分 子構造を図23に示す。結合、あるいは遊離分子2μlのアリコットをプローブ端 上に置いて、0.1%トリフルオロ酢酸に溶かしたペプチド混合物1μlをその上に 加え、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。そ の結果は、ペプチドイオン信号は結合したエネルギー吸収分子の表面でだけ検出 され(図24、1番上)、遊離分子は有効ではない(図24、下側)を示している。 3. ジヒドロキシ安息香酸をジシグロヘキシルカルボジイミドで活性化させ、Fm oc−MAP8側鎖樹脂(Applied Biosystem,Forster,City,CA)と23℃の温度 下で15時間混合する。過剰なエネルギー吸収分子はメタノールで洗浄除去する。 この分子構造を図25に示す。結合エネルギー吸収分子を含む、および含まないM AP8側鎖樹脂1μlのアリコットをプローブ端上に置いて、0.1%トリフルオロ 酢酸に溶かしたペプチド混合物1μlを上に加え、レーザー脱着飛行時間質量分 光測定で分析する。その結果は、ペプチドイオン信号が結合エネルギー吸収分子 を持った表面上でのみ検出されること(図26、1番下)、エネルギー吸収分子を 含まないコントロール表面は有効ではないことを示す(図24、1番上)。 4. α−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸をメタノールに溶かし、AffiGel 10ある いはAffiGel 15(BioRad)と種々のpH値で、23℃の温度下、2〜24時間混合した 。過剰なエネルギー吸収分子をメタノールで洗浄除去する。結合した分子2μl のアリコットをプローブ端上に置いて、1μlのペプチド混合物、あるいはミオ グロビン、あるいはトリプシン、あるいは炭酸アンヒドラーゼを上に加え、レー ザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。この結果は、ミオグロビンイオン信 号が結合エネルギー吸収分子を有する表面でのみ検出され (図27A)、汚染性低質量イオン信号はほとんど観察されない(図27B)を 示している。 5. 40%ポリアタリルアミド溶液を調製して、望ましい形のプローブ端内に入れ る。このゲルをサイズで観察できる程の縮小が認められなくなるまで、空気で乾 燥させる。この先端を9%グルタルアルデヒド/緩衝液(v/v)溶液に浸し、 緩やかに振りながら37℃の温度で2時間培養する。培養後、緩衝液を用いて過剰 なグルタルアルデヒドを洗い流す。活性化された先端を飽和緩衝エネルギー吸収 分子溶液に加えて、(約)37℃の温度下で、(約)24時間、穏やかな振動を加え ながら培養する。有機溶剤を用いて、それを必要とする状況でエネルギー吸収分 子を可溶化する。この先端を緩衝液で洗浄し、9%エタノールアミン/水(v/ v)溶液に入れて、25℃の温度で、緩やかな振動を加えながら30分間培養する。 次に、先端を緩衝液で洗浄してシアノボロハイドライドナトリウム/緩衝液5mg /mL溶液に加え、25℃の温度下で30分間培養する。最後に、先端を緩衝液で十分 に洗浄し、使用時まで保存する。同じ反応を、2分間の超音波処理で6N HC lによる加水分解で作成したナイロン端上で行い、その後、水と緩衝液で十分に 洗浄する。同じ反応を20%NaOH内に7日間浸し、毎日30〜60分間超音波処理 を行って活性化させたアクリル端上で行い、その後洗浄した。この実験で推定さ れる表面の一般的な分子構造を図28に示す。 6. 40%ポリアクリルアミド溶液を調製し、望ましい形のプ ローブ端に入れる。このゲルを、観察されるようなサイズの縮小が認められなく なるまで、空気で乾燥させる。pH値が8.8の0.5M炭酸ナトリウムを洗浄用緩衝液 として作成する。上に作成したプローブ端をジビニルスルホン(Fluka)の溶液 および緩衝液を10:1で混合した溶液に入れ、24時間培養する。このプローブ端 を緩衝液で洗浄して、pH8のエネルギー吸収分子緩衝溶液内に入れ、2時間培養 する。同じ反応を超音波処理を加えながら6N HClでの加水分解で作成した ナイロン端上で実行し、その後で水と緩衝液で十分に洗浄する。同じ反応を20% NaOH内に7日間浸して、毎日30〜60分間超音波処理を加えて活性化させたア クリル端上で行い、その後、洗浄した。この実験で推定される表面の一般的な分 子構造を図29に示す。 7. 40%ポリアクリルアミド溶液を調製して、望ましい形のプローブ端に入れる 。このゲルを、観察できるようなサイズの縮小が認められなくなるまで空気で乾 燥させる。ジクロロメタン/NMP(2:1)内に100mg/mLで溶解したエネルギ ー吸収分子と、1Mジクロロヘキシルカルボジイミド/NMP溶液を、それぞれ 1:2(EAM:DCC)の比率で混合する。EAM/DCC溶液を次に25℃の 温度で1時間、撹拌しながら培養する。培養後、白い沈殿物が観察される。この 白い沈殿物をか焼させたガラスフィルターでろ過する。このフィルターの透過フ ローはDCC活性化EAMである。次に、この先端をDCC活性化EAM溶液に 入れて、25℃の温度で (約)2時間培養する。この先端を最終的に、アセトン、ジクロロメタン、メタ ノール、NMP、およびヘキサンなどの種々の溶剤で洗浄する。同じ反応を超音 波処理を加えながら6N HClで2分間加水分解することによって調製された ナイロン端上で実行し、その後、水と緩衝液で洗浄する。同じ反応を20%NaO Hに7日間浸し、毎日30〜60分間超音波処理を加えて作成したアクリル端上で行 い、その後洗浄する。この表面の一般的な分子構造を図30に示す。 8. 40%ポリアグリルアミド溶液を調製し、望ましい形のプローブ端に入れる。 このゲルを観察できる程のサイズの縮小が認められなくなるまで、空気で乾燥さ れる。ジクロロメタン/NMP(2:1)に溶かしたN−α−Fmoc−L−Lysi neの100mg/mLと1M DCC/NMP溶液を1:2(リシン:DCC)の比率で 混合する。このリシン/DCC溶液を25℃の温度下で、撹拌しながら1時間培養 する。培養後、白い沈殿物が観察され、か焼したガラスファイバーでろ過する。 透過フローはDCC活性化リシンである。このプローブ端をDCC活性化リシン 溶液に入れて、25℃の温度下、2時間(程度)培養する。このプローブ端を次に 5mLピペリジンに入れて、25℃の温度で、おだやかな振動を加えながら45分間培 養する。DCC活性化リシンをこのプローブ端を用いて、望ましいリシン側鎖が できるまで、連続して反応させる。ジクロロメタン/NMP(それぞれ2:1) 内に100mg/mLで溶かしたEAM溶液と1M DCC/NMP溶液を1:2の比率 ( EAM:DCC)で混合する。このEAM/DCC溶液を25℃の温度下で、緩や かな振動を加えながら1時間培養する。培養後、白い沈殿物が観察され、か焼し たグラスファイバーでろ過する。透過フローはDCC活性化EAMである。この EAMはDCCと反応する酸機能基を有する。このプローブ端をDCC活性化E AM溶液に入れて、25℃の温度で2時間(程度)、緩やかな振動を加えながら培 養する。最後に、このプローブ端を、使用前に過剰なジクロロメタン、NMP、 およびメタノールで洗浄する。同じ反応を超音波処理を加えながら6N HCl で2分間加水分解することによって調製されたタイロン端で実行し、その後、水 と緩衝液で洗浄する。同じ反応を20%NaOH内に7日間浸し、1日30〜60分間 超音波処理を加えて活性化したアクリル端上でも行い、その後、洗浄する。この 実験で推定される表面の一般的な化学構造を図31に示す。II.表面への配位共有結合結合によって結合されたエネルギー吸収分子 1. チオサリチル酸(Aldrich)を水、または50%メタノール水溶液、あるいは メタノールに溶解する。これらの溶液はそのまま用いるか、あるいはそれら溶液 のpHを炭酸水素ナトリウムあるいは水酸化アンモニウムまたはトリエチルアミン で6.5に調整してから用いる。Cu(II)イオンをイミノジアセテート(IDA)( Chelating Sepharose Fast Flow,Pharmacia)あるいはトリス(カルボキシメチ ル)エチレネ イドアミン(TED)(YipおよびHutches,1991によって述べられているように 合成)のいずれかでキレート化する。このエネルギー吸収分子の溶液をIDA− Cu(II)ゲルと4℃から23℃の温度下で5分間〜15時間の範囲で混合する。過剰 のエネルギー吸収分子は水か、50%メタノール水溶液か、あるいはメタノールで 洗浄除去する。この実験で推定される表面の分子構造を図32に示す。結合エネル ギー吸収分子1μlのアリコットをプローブ端上に置いて、1μlのペプチド混合 物、あるいはエストロゲン受容体2量体化領域、またミオグロビンを0.1%トリ フルオロ酢酸に溶かしたものを上に加え、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で 分析する。図33はこの表面から脱着されるエストロゲン受容体2量体化領域の代 表的な質量スペクトルを示す。 2. EAM表面の上に置かれたサンプルで、配列決定のためのその場所での反応 を簡単に行うことができる。プローブ表面上のIDA−Cu(II)に配位共有結合 しているチオサリチル酸をセクション2.1に示すような方法で調製する。(GHH PH)3Gペプチド1μlのアリコットをこの表面上に置いて、レーザー脱着飛行 時間質量分光測定で分析する。いくつかのスペクトル(1スペクトルあたり平均 50レーザーショット)を得た後、サンプルを取り出す。カルボキシペプチダー ゼY(Boehringer Mannheim)2μlのアリコットを表面の直接加えて、モイスト チェンバー内で5分〜1時間、37℃の温度下で培養される。0.1%トリフルオロ 酢酸1μlによってそ の場所での酵素消化を終わらせ、サンプルを質量分光測定で再分析する。 3. 配列決定のその場所での反応の別の実施例はトリプシン消化を行い、その後 でC−端末配列決定を行う方法である。プローブ表面上でIDA−Cu(II)に配 位共有結合結合したチオサリチル酸をセクション2.1.に述べた方法で調製する。 エストロゲン受容体2量体化領域(6168.4Da)1μlのアリコットをこの表面上 に置いて、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。いくつかのスペクト ル(1スペクトルあたり平均20レーザーショット)を得た後、サンプルを取り出 す。0.1M重炭酸ナトリウムに溶かしたトリプシン(Sigma)2μlのアルコット を表面に付加して、37℃の温度で15分間培養する。0.1%トリフルオロ酢酸1μl を加えてその場所での消化を終わらせ、質量分光測定で再分析する。いくつかの スペクトル(1スペクトルあたり平均20レーザーショット)を得た後、サンプル を取り出す。カルボキシペプチダーゼY(Boehringer Mannheim)2μlのアリコ ットを直接表面に加えて、モイストチェンバー内で37℃の温度で1時間培養する 。0.1%トリフルオロ酢酸を加えてその場所での酵素消化を終わらせ、その後、 サンプルを質量分光測定で再分析する。III.表面にイオン結合で結合したエネルギー吸収 シナピン酸、またはα−シアノ−4−ヒドロキシシナピン酸を水に懸濁させ、 pHを希釈した水酸化ナトリウムで6.6に調節する。テンタクルDEAD Fractog al(EM Separations, Gibbstown,NJ)を20mM HEPES,pH6.0で洗浄して、吸引乾燥させる。エネ ルギー吸収分子溶液をこのDEAEゲルと23℃の温度下で15時間混合させる。こ のゲルを、過剰なエネルギー吸収分子が取り除かれるまで水で洗浄する。この実 験から推定される表面の分子構造を図34に示す。結合されたエネルギー吸収分子 0.5μlのアリコットをプローブ端上に置いて、0.1%トリフルオロ酢酸に溶かし た1μlのエストロゲン受容体2量体化領域あるいはミオグロビンを上に加えて 、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。図35AおよびBはその質量ス ペクトルを示す。IV.表面への疎水性/ファンデルワールス結合によって結合されたエネルギー吸 1. α−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸を50%メタノール水溶液およびジメチル スルホキシドに溶解する。これをアミノメチル化されたポリスチレンと23℃の温 度で15時間混合する。過剰なエネルギー吸収分子を50%メタノール水溶液で洗浄 除去する。この実験で推定される分子構造を図36に示す。結合したエネルギー吸 収分子1μlのアリコットをプローブ端上に置いて、1μlのペプチドを上に加え 、レーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。 実施例5 光感作性付着および放出のために強化された表面 (SEPAR) DNA,RNAおよび蛋白質などの生体高分子の構造と特 性を決定する個別構成ブロック(モノマー)の線形的な集団が知られているが、 これらは、レーザー脱着/イオン化、飛行時間(TOF)質量分光測定(MS) による部分的に消化された(例えば、化学的あるいは酵素による)生体高分子の 個別的な質量判定を伴う方法で(全体にせよ、その1部にせよ)配列決定される 。 生体高分子を先ず1つ、あるいは複数の共有結合による光感作性(つまり、光 に対して感受性のある)結合を介してSELDIプローブ素子に結合したとする 。次に、その生体高分子の端末のいろいろな数の個別ユニット(モノマー)を酵 素あるいは化学反応により分割する(つまり、取り出す)。プローブ素子表面に 残る分析対象物は質量が生体高分子のグループ(ポピュレーション)で構成され ており、その端末モノマーユニットはそれぞれ一部が失われている。修飾された 生体高分子の、小さな、しかし十分な生体高分子がレーザー光によってプローブ 素子から結合解除(連結解除)される、つまり、260nmと365nmの間の波長の紫外 線で光感作性結合が分割される。結合解除された生体高分子は飛行時間質量分光 測定によって脱着/イオン化される。I.生体高分子のSELDI表面への結合 3つの成分が関連している。1)アミンまたはカルボキシル基のいずれか、あ るいはその両方に反応するように活性化された表面;2)光感作性化合物、一般 的に一般式がR1−N=N−R2のアゾ化合物、例えば、5−(4−アミノフェ ニルアゾ)サリチル酸(Aldrich)、アゾジカルボンアミド(Aldrich)、あるい はその他の活性水素反応性化学物質などの光感作性などを作り出すメカニズムの 使用;3)蛋白質、核酸、炭水化物などの生体高分子。 光感作性化合物を先ず最初に活性化された表面に付着する必要がある。例えば 、アゾジカルボンアミドとアミンに対して反応性を示す表面に付着させたり、ア ミンまたはカルボキシルに対して反応性を示す表面に対してアミノフェニルアゾ サリチル酸を付着させるというようにである。次に、従来用いられている多くの 化学物質、例えば、アミンに反応性を示す化学物質−臭化シアノゲン、N−ヒド ロキシ桂皮酸イミドエステル、FMP活性体、EDC−媒介、ジビニルスルホン ;ヒドロキシル基に反応性を示す化学物質−エポキシ活性体、ジビニルスルホン ;スルフィドリル基に対して反応性を示す−ヨードアセチル活性体、マレイミド 、ジビニルスルホン、エポキシ活性体;カルボニル基に反応性を示す化学物質− ヒドラジド、還元性アミン化;活性水素に反応性を示す化学物質−同時に光感作 性結合もつくりだすジアゾニウム、などの1つを用いて、光感作性化合物あるい は生体高分子を活性化させる。最後に、この生体高分子を1つ、あるいは複数の 結合を介して光感作性化合物に付着させる。過剰な化学物質は、イオン化力が強 くpHの低い、水性あるいは有機溶媒を用いて、何回か操作を繰り返して、洗浄除 去する。II.構造上の統合性を検証するための質量分光測定による分析 260nm〜365nmのUVレーザーは光分解結合を切断することができる。脱共役生 体高分子を、MALDI TOFにより脱着/イオン化する(当業者には、SE ND,SEACおよびSEPARも使用できることが周知である)。III.生体高分子のその場所における配列決定 このことは、酵素的あるいは化学的方法による、周知の連続的な分解のいずれ かの方法によって行われ、例えば、タンパク質のN−末端はアミノペプチダーゼ により、タンパグ質のC−末端はカルボキシペプチダーゼにより、タンパク質の N−末端はエドマン分解により、核酸はエキソヌクレアーゼにより、またはサン ガー法により、炭水化物はノイラミニダーゼ、マンナーゼ、フカーゼ、ガラクト シダーゼ、グルコシダーゼ、O−グリカナーゼ、またはN−グリカナーゼにより 配列決定される。過剰の試薬ならびに反応生成物を洗浄除去した後、複数の光分 解結合によって表面上は繋ぎ止められている、失われた末端モノマーの数が異な る一団の、質量の定義された生体高分子から成る分析対象物を、MALDI T OF MSにより分析する(当業者には、SEND,SEACおよびSEPAR も使用できることは周知である)。 酵素的手法あるいは化学的手法を用いた複数の内部配列の決定には、例えば、 エンドヌクレアーゼあるいは臭化シアンを用いた蛋白質の分解と、それに続くN −および(または) C−末端の連続的な分解、エンドヌクレアーゼを用いた核酸の分解とそれに続く エキソヌクレアーゼあるいは化学的手法よる連続的な分解、エンドグリコシダー ゼHあるいはエンドグリコシダーゼFを用いた多糖類鎖の分解とそれに続く特異 的な酵素を用いた分解がある。過剰の試薬ならびに反応生成物を洗浄除去した後 、表面上に残っている、失われた末端モノマーの数が異なる複数の集団の、質量 の定義された生体高分子から成る分析対象物を、MALDI TOF MS(当 業者に周知)により分析する。IV.配列決定の特異例 この原理の実物による説明を、26残基のペプチドの配列決定により提供する。 GHHPHGHHPHGHHPHGHHPHGHHPHGHHPHG このペプチド(CHHPH)5Gは、ヒスチジンに富む糖蛋白質(HRG)と して知られている80kDaの蛋白質の、完全な配列の中の金属結合ドメインである 。 カップリング剤として表面にアリルアミン基をもつガラスビーズ(sigma)を 、冷却した0.3M HClで洗浄し、懸濁する。50mg/mLのNaNO2水溶液のアリ コットを、ビーズに対して1:5(v/v)の比で(NaNO2:HCl)加え 、穏やかに振とうしながら4℃で15分間インキュベートする。インキュベーショ ンの後、0.3M HClおよび50mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH8.0)で洗浄する 。配列決定されるべきペプチドを、リン酸ナトリウム(pH8.0)中のビーズに加 え、 穏やかに振とうしながら4℃で24時間インキュベートする。ペプチドを結合した ビーズを、リン酸ナトリウム緩衝液で洗浄し、高濃度の塩(例えば1.0M)、希 酸、および有機溶媒(例えば、メタノール)を含むリン酸ナトリウム緩衝液を用 いて、MALDI−TOF質量分光測定(当業者には、SEND,SEAC、お よびSEPARもまた使用できることが周知である)か、または220nmの吸光度 により、ペプチドの徴候が上清に全く検出されなくなるまで洗浄する。ビーズの アリコット1μlをプローブ先端上に置き、1μL、のシナピン酸(50%メタノー ル/0.1%トルフルオロ酢酸に溶かした)をビーズに混合し、このサンプルをレー ザー脱着飛行時間質量分光測定により分析した。幾つかのスペクトル(各々平均 50個のレーザーショット)を得た後、表面上に残っているペプチドをメタノール で洗浄してシナピン酸を除き、カルボキシペプチダーゼ(Boehringer Mannheim )を用いて、モイストチャンバー内で23℃で消化する。次に、消化されたペプチ ドをリン酸緩衝塩類溶液(PBS)(pH8.0)で洗浄する。シナピン酸の1μLの アリコットを表面に加え、レーザー脱着飛行時間質量分光測定により再び分析し た。GHHPHGの配列の、C−末端分析の結果を図35に示す。このペプチドの 、新生配列が観察される。この配列は、2つのピークの間の質量の差から推断さ れる。 第2の実施例は、光分解結合によって表面上に共有結合された、複数のペプチ ドの同時の配列決定である。ヒトのエス トロゲン受容体の2量ドメイン(6168.4Da)を複数の光分解結合により表面上 に繋ぎ止める。このペプチドは、その配列中に3つのメチオニン残基を持ってお り、臭化シアンにより特異的に分解され、2170.58Da(D1−M18),3118.77 Da(A19−M45)および535.62Da(S46−M50)および397.62Da(E51−L5 3)の質量のペプチドを生じる。これらのペプチドはすべて、光分解結合により 表面上に結合されている。次に、これらの各ペプチドを、完全に他から識別され る新生配列を生じさせるため、カルボキシペプチダーゼYによりその場所で消化 する。 蛋白質の構造決定のためのもう1つのアプローチは、複数の光分解結合によっ て表面上に結合された蛋白質の、トリプシン消化によって生じる複数のペプチド の、N−末端の同時の配列決定である。インシュリンB鎖を、複数の光分解結合 により表面上に繋ぎ止める。このペプチドは、その配列の中に2つのリジン/ア ルギニン残基を持っており、それはトリプシンによって特異的に切断されて、25 85.9Da(F1−R22)と859.0Da(G23−K29)の質量のペプチドを生じ、こ れらはいずれもいる。次いで、これらの各々にその場所で、アミノペプチダーゼ 消化あるいはエドマン分解の複数のサイクルのいずれかを施し、他から識別され る新生配列を生じさせる。 核酸のカップリングおよび配列決定も同様の方法で行われる。カップリング剤 として、表面にアリルアミン基を持つガ ラスビーズ(Sigma)を0.3M HClで洗浄し、懸濁する。このビーズに、50mg/ mLのNaNO2水溶液を、1:5(v/v)の比で(NaNO2:HCl)加え、 4℃で15分間穏やかに振とうしながらインキュベートする。インキュベーション の後、冷却した0.3M HClおよび50mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH8.0)でビ ーズを洗浄する。配列決定されるべきDNA(例えば、エストロゲン受容体認識 要素、30塩基対のオリゴヌグレオチド)を、リン酸ナトリウム緩衝液(pH8.0 )中にてビーズに加え、4℃で24時間穏やかに振とうしながらインキュベート する。DNAを結合したビーズをリン酸ナトリウム緩衝液で洗浄し、高濃度の塩 (例えば、1.0M),希酸、および有機溶媒(例えば、メタノール)を加えたリ ン酸ナトリウム緩衝液を用いて、MALDI−TOF質量分光測定(当業者には 、SEND,SEACおよびSEPARもまた使用できることが周知である)あ るいは260nmの吸光度によって、上清にDNAの徴候が全く検出されなくなるま で洗浄する。次に、1μLのビーズのアリコットをプローブ先端上に置き、この ビーズにlμLのアリコットの、3−ヒドロキシピコリン酸(50%メタノール/0 .1%トルフルオロ酢酸に溶かした)を混合し、このサンプルをレーザー脱着飛行 時間質量分光測定で分析する。幾つかの質量スペクトル(各々平均50個のレーザ ショット)を得た後、表面に結合している残ったDNAを、メタノールを用いて 洗浄して3−ヒドロキシピコリン酸を除き、モイストチャンバー内で、エキソヌ クレアーゼ(Boehringer Mannheim)を用い、23℃で消化する。次に、表面上の 消化したDNAをリン酸緩衝塩類溶液(PBS)pH8.0で洗浄して、過剰の試薬 および反応生成物を除く。3−ヒドロキシピコリン酸の1μLのアリコットを表 面に加え、レーザー脱着飛行時間質量分光測定により再び分析した。DNAの新 生の配列を生じる。その配列は、2つのピークの間の質量の差により推断される 。 炭水化物鎖は、過ヨウ素酸塩により酸化され、活性化されて、表面上の光分解 性化合物に特異的に結合する。この繋ぎ止められた炭水化物について、ノイラミ ニダーゼ、マンナーゼ、フカーゼ、ガラクトシダーゼ、グルコシダーゼ、O−、 またはN−グリカナーゼのような特異的な酵素を用いた配列決定を行い、レーザ ー脱着飛行時間分光計測定により決定した。5−(4−アミノフェニルアゾ)サ リチル酸(Aldric)を、細孔状ガラスビーズ上のアリルアミンのような、カルボ キシル反応性表面に結合させる。ヒトおよびウシのヒスチジンに富む糖タンパク 質の炭水化物小部分を低濃度の(0.2M)ナトリウム過ヨウ酸塩水溶液を用い、2 3℃で90分間酸化する。過剰の試薬を水で洗浄除去する。この蛋白質を、リン酸 緩衝液、pH8.0中で、細孔状ガラスビーズ上に結合した5−(4−アミノフェニ ルアゾ)サリチル酸に加える。次に、シアノポロハイドライドナトリウム(0.6m g/100μl)を加え、23℃で18時間撹拌する。水、1M NaClで広範囲に洗浄 し、さらに水で再び洗浄して過剰な試薬および未反応のタンパク 質を除去する。このビーズの1μLのアリコツトをプローブ先端に置き、1μlの シナピン酸(50%メタノール/0.1%トルフルオロ酢酸に溶かした)をビーズに 加え、このサンプルをレーザー脱着飛行時間質量分光測定により分析する。表面 上に結合している残りの蛋白質をメタノールで洗浄してシナピン酸を除去し、リ ン酸緩衝液(pH8.0)中で、2μlのトリプシンと共に37℃で30分間インキュベー トする。糖ペプチドの結合した表面を、リン酸緩衝塩類溶液および水を用いて完 全に洗浄し、過剰の試薬および未結合のペプチドを除去する。このビーズに、シ ナピン酸の1μLのアリコットを混合し、このサンプルをレーザー脱着飛行時間 質量分光測定で分析する。幾つかの質量スペクトル(各々平均50個のレーザショ ット)を得た後、プローブ表面に残っている糖ペプチド質をメタノールで洗浄し てシナピニン酸を除去し、N−アセチルノイラミニダーゼ(NANase III,Gly ko,50mMリン酸ナトリウム、pH6.0、37℃1時間)、マンノシダーゼ(MANase I,Glyko,50mMリン酸ナトリウム、pH6.0、37℃18時間)、フコシダーゼ(F UCase I,Glyko,50mMリン酸ナトリウム、pH5.0、37℃18時間)、N−アセチ ルグルコサミニダーゼ(HEXasc I,Glyko,50mMリン酸ナトリウム、pH5.0、 37℃4時間)、O−グリコシダーゼ(Glyko,50mMリン酸ナトリウム、pH5.0、37 ℃18時間)、N−グリカナーゼ(PNGaseF,Glyko,100mMリン酸、pH8.6、37 ℃18時間)を用い、連続的に、あるいは組み合わせて消化する。最後に、表面上 でフラグメント化された糖ペプチドをリン酸緩衝塩類溶液および水で洗浄し、試 薬および反応生成物を除去する。この表面に、シナピン酸の1μLのアリコット を加え、再びレーザー脱着飛行時間質量分光測定で分析する。糖ペプチドの新生 配列が得られる。この配列は、2つのピークの間の質量の差から推断される。 この明細書に述べたすべての特許ならびに刊行物は、本発明に関する当業者の レベルを示すものである。すべての特許ならびに刊行物は、この文中においては 、個々の刊行物が各々特異的かつ別個に引用文献に取り入れられていたのと同じ 程度に引用文献に取り入れられている。 当業者には本発明が、その目的を達成し、述べられた目的物ならびに利益、お よび固有の目的物ならびに利益を得るために、うまく適合していることが容易に 認められるであろう。ここに述べたオリゴヌクレオチド、化合物、方法、手順お よび技術は、必然的に好ましい実施例を代表するものであって、見本となること を意図しており、発明の範囲を限定するものではない。当業者らには変更ならび に他の使用法が生じるであろうが、それらは本発明の精神に含まれるものであり 、添付した請求項の範囲により定義されるものである。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AT,AU,BB,BG,BR,BY, CA,CH,CN,CZ,DE,DK,ES,FI,G B,HU,JP,KP,KR,KZ,LK,LU,LV ,MG,MN,MW,NL,NO,NZ,PL,PT, RO,RU,SD,SE,SK,UA,US,UZ,V N

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.質量分光測定によって分析対象物サンプルの分析対象物分子の質量を測定す る装置において、 分光計チューブと; 該チューブの内部を真空にする真空手段と; 該分析対象物サンプルから脱着された分析対象物分子に加速電位を付加する ための、該チューブ内に配置された電位付加手段と; 該分析対象物分子の脱着およびイオン化を速やかに行わせるために表面会合 分子と会合した該分析対象物サンプルを提示するための、該分光計チューブ内に 取り外し可能に挿入され、該表面分子がエネルギー吸収分子、親和性捕捉デバイ ス、光感作性付着分子、およびそれらの結合物で構成されるグループから選択さ れることを特徴とするサンプル提示手段と; 表面会合分子と会合した状態で該サンプル提示手段上に置かれ、それによっ て、該質量分光測定分析で消費されない少なくとも該分析対象物分子の一部が、 後で行われる化学的、生物学的、あるいは物理的分析手順に利用できるようにし ている分析対象物サンプルと; 該分析対象物サンプルから該分析対象物分子を脱着、イオン化するために、 十分なエネルギーを付与するために該分析対象物サンプルに向けられたレーザー ビームを発生するためのレーザービーム手段と;そして加速され たイオン化分析対象物分子の衝撃を検出するための、該分光計チューブと組み合 わせられた検出手段とによって構成される装置。 2.分析対象物分子の質量を質量分光測定するための方法において、 分析対象物分子と結合するための手段を有する親和性捕捉デバイスでプロー ブ端表面にサンプル提示表面を誘導するステップと; 該誘導されたプローブ端表面を、該分析対象物分子をそこに結合させるため に該分析対象物分子に露出させるステップと; そこに結合した該分析対象物分子と共に該誘導されたプローブ端を飛行時間 質量分光計の一端に置いて、真空化し、電場を発生させてその分光計内部に加速 電位を形成させるステップと; 該先端からの該分析対象物分子のイオンを脱着するために、ひとつ、あるい は複数のレーザーパルスで上記分光計内部で、該誘導されたプローブ端面に結合 した上記分析対象物分子の少なくとも一部に衝撃を与えるステップと; 該質量分光計内部での飛行時間によってそれらイオンの質量を検出するステ ップと;そして それら検出された質量を表示するステップ とで構成された方法。 3.上記方法において、さらに、脱着およびイオン化補助マトリックス材料を、 該親和性捕捉デバイスと会合する該プローブ端面に適用するステップで構成され た請求項2記載の方法。 4.上記方法において、さらに、該質量分光計から該プローブ端面を除去するス テップと; 脱着されていない該分析対象物分子の該一部に化学的、生物学的手順を行い 、脱着されていない該分析対象物分子の該一部の組成を変更するステップと; 該変更された分析対象物分子により該プローブ端面を再挿入するステップと ;そして 続いて質量分光測定分析を行い、該変更された分析対象物分子の分子量を判 定するステップ とで構成された請求項3記載の方法。 5.上記方法において、該親和性捕捉デバイスが該プローブ端の該面に化学的に 結合されることを特徴とする請求項2記載の方法。 6.上記方法において、該親和性捕捉デバイスが該プローブ端の該面に物理的に 接合されることを特徴とする請求項2記載の方法。 7.上記方法において、該親和性捕捉デバイスが、該分析対象物分子に化学的に 結合するために改良されることを特徴とする請求項2記載の方法。 8.上記方法において、該親和性捕捉デバイスが、該分析 対象物分子に生物学的に接合するために収良されることを特徴とする請求項2記 載の方法。 9.上記方法において、該分析対象物分子が生分子で、該親和性試薬が、分化さ れていない生物学的サンプルから該生分子を選択的に分離するために改良される ことを特徴とする請求項2記載の方法。 10.上記方法において、該マトリックス材料が、弱酸性から強塩基性pHの範囲に あることを特徴とする請求項3記載の方法。 11.上記方法において、該マトリックス材料が、6.0以上のpHを有することを特 徴とする請求項3記載の方法。 12.上記方法において、該プローブ端の該面が、電気的に絶縁された材料で形成 されることを特徴とする請求項2記載の方法。 13.上記分析対象物分子の脱着およびイオン化を速やかに行わせるために、エネ ルギー吸収物質を該分析対象物分子と組み合わせて用いるレーザー脱着/イオン 化、飛行時間質量分光計によって分析対象物の質量を測定する方法において、 上記エネルギー吸収物質の表面上、あるいはその上方に上記分析対象物分子 を提示し、その場合、該質量分光測定分析で脱着されない少なくとも上記分析対 象物分子の1部が後で行われる分析手順で化学的に利用できることを特徴とする 改良。 14.分析対象物分子の脱着およびイオン化を速やかに行わせるための装置におい て、 サンプル提示面と; エネルギー吸収分子、親和性捕捉デバイス、光感作性付着分子、およびそれ らの組み合わせで構成されるグループから選択される表面会合分子で、該サンプ ル提示表面と会合しており、該分析対象物分子と結合するための手段を有してい る表面会合分子 とで構成される装置。 15.上記装置において、該サンプル提示表面が、飛行時間質量分光測定アナライ ザーに使用されるプローブ端の表面で構成されていることを特徴とする請求項14 記載の装置。 16.上記装置において、該親和性捕捉デバイスまたは光感作性付着分子が該サン プル提示表面に化学的に結合することを特徴とする請求項14記載の装置。 17.上記装置において、該親和性捕捉デバイスが該サンプル提示表面に物理的に 接合することを特徴とする請求項14記載の装置。 18.上記装置において、該親和性捕捉デバイスまたは光感作性付着分子が該分析 対象物分子に化学的に結合することを特徴とする請求項14記載の装置。 19.上記装置において、該親和性捕捉デバイスが該分析対象物分子に生物学的に 接合することを特徴とする請求項 14記載の装置。 20.上記装置において、該分析対象物分子が生分子で、該親和性捕捉デバイスま たは光感作性付着分子が、分化されていない生体サンプルから該生分子を選択的 に分離するために改良されることを特徴とする請求項14記載の装置。 21.上記装置が、さらに、該親和性捕捉デバイスまたは光感作性付着分子と会合 した状態でサンプル提示表面に置かれたマトリックス材料によって構成されるこ とを特徴とする請求項14記載の装置。 22.上記装置において、該マトリックス材料が弱酸性から強塩基性pHの範囲にあ ることを特徴とする請求項21記載の装置。 23.上記方法において、該マトリックス材料が、6.0以上のpHを有することを特 徴とする請求項21記載の方法。 24.上記方法において、該サンプル提示表面が、電気的に絶縁された材料で形成 されることを特徴とする請求項14記載の方法。 25.サンプル提示表面上に分析対象物分子を捕捉し、後で行なわれる分析のため に該サンプル提示表面から該捕捉された分析対象物分子を脱着/イオン化させる 方法において、該分析対象物分子と結合するための手段を有する親和性捕捉装置 あるいは光感作性付着分子で該サンプル提示表面を誘導させるステップと; 該誘導されたサンプル提示表面を該分析対象物分子を含んでいるサンプルに 露出するステップと; 該親和性捕捉デバイス、あるいは光感作性付着分子によって該誘導されたサ ンプル提示表面上に該分析対象物分子を捕捉するステップと;そして 該分析対象物分子を、該親和性捕捉デバイスあるいは光感作性付着分子によ って該誘導されたサンプル提示表面に結合されたままの状態で、エネルギーまた は光源に露出させて、少なくとも該分析対象物分子の1部を該表面から脱着させ るステップ とで構成される方法。 26.分析のために分析対象物分子を提示する表面を作成する方法において、該分 析対象物を支持する該表面上に基板を配置するステップと; 該分析対象物と選択的に結合するための手段を有する親和性捕捉デバイスま たは光感作性付着分子によって、該基板を誘導するステップと;そして 該親和性捕捉デバイスまたは光感作性付着分子と結合した該分析対象物分子 を検出する手段とで構成される方法。 27.上記方法において、検出材料を該表面に適用するステップを追加して構成さ れることを特徴とする請求項26記載の方法。 28.上記方法において、そのような材料が蛍光性の種によ り構成されていることを特徴とする請求項27記載の方法。 29.上記方法において、そのような検出材料が酵素性の種により構成されている ことを特徴とする請求項27記載の方法。 30.上記方法が、そのような検出材料が放射性の種により構成されている点をさ らに有していることを特徴とする請求項27記載の方法。 31.上記方法が、そのような検出材料が発光性の種により構成されている点をさ らに有していることを特徴とする請求項27記載の方法。 32.上記方法が、該親和性捕捉デバイスまたは光感作性付着分子に結合する状態 で該サンプル提示表面に脱着/イオン化補助材料を置くステップをさらに有する ことを特徴とする請求項27記載の方法。 33.上記方法において、該エネルギー源がレーザーにより構成されていることを 特徴とする請求項25記載の方法。 34.上記方法において、親和性捕捉デバイスが使われ、また該エネルギー源がイ オン源により構成されていることを特徴とする請求項25記載の方法。 35.上記方法において、該分析対象物分子の一部が、該サンプル提示表面を該エ ネルギー源に露出させた後で、該サンプル提示表面に結合されるようにすること を特徴とする請求項25記載の方法。 36.上記方法が、さらに、該誘導されたサンプル提示表面 に結合させようとする分析対象物分子の少なくとも一部を、化学的、生物学的、 または物理的反応によって、改良された分析対象物分子に変換し、該分析対象物 分子が、該親和性捕捉デバイスまたは光感作性付着分子によって該誘導されたサ ンプル提示表面に結合されるようにするステップと;そして 該改良された分析対象物分子の少なくとも一部を該表面から脱着させるため に、該改良された分析対象物分子をエネルギー源に露出させるステップ とで構成されることを特徴とする請求項35記載の方法。 37.完全な分析対象物をガス状に脱着することを促すサンプルプローブが、 サンプル提示表面と;そして サンプル提示表面と会合するエネルギー吸収分子 とで構成され、該サンプルプローブがエネルギー源に影響されるときに、該サ ンプルプローブが、エネルギー吸収分子上、その上方、またはその間に位置する 完全な分析対象物分子の脱着を促すサンプルプローブ。 38.上記サンプルプローブにおいて、エネルギー吸収分子が、桂皮酸、桂皮酸ブ ロマイド、2,5−ジヒドロキシ安息香酸、そして、α−シアノ−4−ヒドロキ シ桂皮酸で構成されるグループから選ばれることを特徴とする請求項37記載のサ ンプルプローブ。 39.上記サンプルプローブにおいて、上記サンプル提示表 面が、有機重合体や自然生体高分子などの、ガラスと、セラミック、テフロン被 覆された磁気材料とで構成されるグループから選ばれることを特徴とする請求項 37記載のサンプルプローブ。 40.完全な分析対象物をガス状に脱着することを促すサンプルプローブが、 サンプル提示表面と;そして 該サンプル・プローブがエネルギー源に影響されるときに、該サンプルプロ ーブが、完全な分析対象物分子がガス状に変化することを促す、サンプル提示表 面と会合するエネルギー吸収分子 とで構成されるサンプルプローブ。 41.上記サンプルプローブにおいて、上記親和性捕捉デバイスが、金属イオン、 蛋白質と、ペプチド、免疫グロブリン、核酸、炭水化物、レシチン、染料、還元 剤およびそれらの結合物とで構成されたグループから選ばれることを特徴とする 請求項40記載のサンプルプローブ。 42.上記サンプルプローブにおいて、上記サンプル提示表面が、有機重合体や自 然生体高分子などの、ガラスと、セラミック、テフロン被覆された磁気材料とで 構成されるグループから選ばれることを特徴とする請求項40記載のサンプルプロ ーブ。 43.完全な分析対象物の脱着をガス状へ促すためのサンプルプローブが、 サンプル提示表面と;そして 親和性捕捉デバイスと、エネルギー吸収分子と、該サンプル提示表面と会合 した光感作性付着分子とで構成されるグループから選ばれた少なくとも2つの異 なる分子とで構成され、分析対象物が該サンプルプローブと会合するときに、し かも該サンプルプローブがエネルギー源に影響されるときは、該サンプルプロー ブが分析対象物のガス状への変化を促すサンプルプローブ。 44.上記サンプルプローブにおいて、上記分析対象物が、エネルギー源によって 影響された後の混合物から選択的に脱着することを特徴とする請求項43記載のサ ンプルプローブ。 45.完全な分析対象物の、ガス状への分化、脱着を促すためのサンプルプローブ が、 サンプル提示表面と;そして サンプル提示表面と会合する少なくとも2つの異なる親和性捕捉デバイスと で構成され、該サンプルプローブがエネルギー源に影響されるときに、該サンプ ルプローブが、該分析対象物分子と会合する親和性捕捉デバイスによって異なる 量で、分析対象物分子のガス状への変化を促すサンプルプローブ。 46.上記サンプルプローブにおいて、上記親和性捕捉デバイスが所定の配列で並 べられていることを特徴とする請求項45記載のサンプルプローブ。 47.上記サンプルプローブにおいて、上記配列が複数の異なる分析対象物を吸収 することを特徴とする請求項46記載のサンプルプローブ。 48.分析対象物の量を計るためのサンプルプローブを有する上記装置において、 親和性捕捉デバイスの位置と量が、吸収された分析対象物の量を決定することを 特徴とする請求項40記載の装置。 49.上記装置において、その結合が選択的であることを特徴とする請求項2,14 ,21記載の装置。 50.上記装置において、その結合が非選択的であることを特徴とする請求項2, 14,21記載の装置。 51.上記方法において、その結合が選択的であることを特徴とする請求項3,4 ,25記載の方法。 52.上記方法において、その結合が非選択的であることを特徴とする請求項3, 4,25記載の方法。 53.上記サンプルプローブにおいて、その結合が非選択的であることを特徴とす る請求項40,41,43または45記載の方法。 54.上記サンプルプローブにおいて、その結合が選択的であることを特徴とする 請求項40,41,43または45記載の方法。 55.完全な分析対象物のガス状への脱着を促すためのサンプルプローブが、 サンプル提示表面と;そして 表面会合分子とで構成され、該表面会合分子が、エネルギー吸収分子機能と 親和性捕捉デバイス機能と両方機能することが可能なサンプルプローブ。 56.完全な分析対象物のガス状への脱着を促すためのサンプルプローブが、 サンプル提示表面と;そして 該表面会合分子が少なくとも2つの結合部位を有し、少なくとも1つの結合 部位はサンプル提示表面に結合し、少なくとも1つの結合部位は分析対象物と結 合することが可能であり、また上記分析対象物結合部位が光感作性である表面会 合分子 とで構成されるサンプルプローブ。 57.分析対象物分子の質量を測定するための質量分光測定方法において、 光感作性付着分子(PAM)が少なくとも2つの結合部位を有し、1つの結 合部位が上記サンプル提示表面と結合し、少なくとも1つの結合部位が分析対象 物分子と結合可能であるPAMを有するプローブ端面上にサンプル提示表面を誘 導するステップと; 該誘導されたプローブ端面を、該分析対象物分子をそこに結合させるために 該分析対象物分子に露出させるステップと; そこに結合した該分析対象物分子と共に上記誘導されたプローブ端面を飛行 時間質量分光計の一端に置いて、 真空化し、電場を発生させてその分光計内部に加速電位を形成させるステップと ; 該先端からの分析対象物分子のイオンを脱着するために、ひとつ、あるいは 複数のレーザーパルスで上記分光計内部で、該誘導されたプローブ端面に結合し た上記分析対象物分子の少なくとも1部に衝撃を与えるステップと; 該質量分光内部での飛行時間によってそれらイオンの質量を検出するステッ プと;そして それら検出された質量を表示するステップ とで構成された方法。 58.上記方法において、さらに、脱着/イオン化補助マトリックス材料を、該P AMと会合した該プローブ端面に適用するステップを有することを特徴とする請 求項57記載の方法。 59.上記方法において、さらに、 該質量分光計から該プローブ端面を取り除くステップと; 脱着していない該分析対象物分子の該1部上で、化学的、生物学的、または 物理的な手順を行い、脱着していない該分析対象物分子の該一部の組成を変更す るステップと; 上記の上で該変更された分析対象物分子を有する該プローブ端面を再挿入す るステップと;そして 続いて質量分光測定分析を行い、該変更された分析対象物分子の分子量を決 定するステップ とで構成される方法。 60.上記方法において、該PAMが該プローブ端の該面に化学的に結合すること を特徴とする請求項57記載の方法。 61.上記方法において、該PAMが該分析対象物分子に化学的に結合し、また上 記PAMと上記分析対象物分子との間の該結合が壊れ、上記分析対象物分子が光 によって放出されることを特徴とする請求項57記載の方法。 62.上記方法において、該分析対象物分子が生分子で、また該PAMが分化され ていない生物学的サンプルから該生分子を選択的に分離するために改良されるこ とを特徴とする請求項57記載の方法。 63.上記方法において、該マトリックス材料が弱酸性から強塩基pHの範囲にある ことを特徴とする請求項58記載の方法。 64.上記方法において、該マトリックス材料が6.0以上のpHを有することを特徴 とする請求項58記載の方法。 65.上記方法において、該プローブ端の該面が電気的に絶縁された材料で形成さ れることを特徴とする請求項57記載の方法。 66.上記分析対象物分子の脱着およびイオン化を速やかに行わせるために、光感 作性付着分子(PAM)が該分析対象物分子と組み合わせて用いるレーザー脱着 /イオン 化、飛行時間質量分光測定によって分析対象物分子の質量を測定する方法におい て、 上記PAMの表面上、あるいはその情報に上記分析対象物分子を提示し、そ の場合、該質量分光測定分析で脱着されない少なくとも上記分析対象物分子の1 部が後で行われる分析手順で化学的に利用できることを特徴とする改良。 67.完全な分析対象物のガス状への分化脱着を促すためのサンプル・プローブが 、 サンプル提示表面と; 該サンプル提示表面と会合した少なくとも2つの異なる光感作性付着分子と で構成され、該サンプルプローブがエネルギー源に影響されるとき、該分析対象 物分子と会合した光感作性付着分子により異なる量で、該サンプルプローブが分 析対象物分子のガス状への変更を促すサンプルプローブ。 68.上記サンプルプローブにおいて、上記光感作性付着分子が所定の配列で並ん でいることを特徴とする請求項67記載のサンプルプローブ。 69.上記サンプルブロープにおいて、上記配列が、複数の異なる分析対象物を選 択的に吸収することを特徴とする請求項68記載のサンプルプローブ。 70.完全な分析対象物のガス状への脱着を促すためのサンプルプローブが、 サンプル提示表面と;そして 該サンプル提示表面と会合した該光感作性付着分子とで構成され、該サンプ ルプローブがエネルギー源に影響されるとき、該サンプルプローブが完全な分析 対象物分子のガス状への変化を促すサンプルプローブ。 71.分析対象物の量を計るための上記装置において、光感作性付着分子の位置と 量が、吸収された分析対象物の量を決定する装置。 72.生体高分子の配列決定のための方法が、 エネルギー吸収分子と、親和性捕捉デバイスと、光感作性付着分子と、それ らの結合物とで構成されるグループから選ばれた表面選択分子を有するサンプル 提示表面を持つプローブ端面に、生体高分子分析対象物を結合するステップと; 質量分光測定分析において、生体高分子の少なくとも1部がプローブ端から 脱着しない生体高分子分析対象物を脱着するステップと; 上記プローブ端にまだ結合している上記生体高分子・分析対象物を変更して 脱着した結果を分析するステップと;そして 分析、修飾のステップを繰り返すことが 上記生体高分子の配列が決定されるまで、脱着、分析修飾を繰り返すステッ プ で構成される方法。 73.上記方法において、上記生体高分子が、蛋白質と、RNAと、DNAと、炭 水化物とで構成されるグループから選ばれることを特徴とする請求項72記載の方 法。
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