JP7328267B2 - Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質 - Google Patents

Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質 Download PDF

Info

Publication number
JP7328267B2
JP7328267B2 JP2021016190A JP2021016190A JP7328267B2 JP 7328267 B2 JP7328267 B2 JP 7328267B2 JP 2021016190 A JP2021016190 A JP 2021016190A JP 2021016190 A JP2021016190 A JP 2021016190A JP 7328267 B2 JP7328267 B2 JP 7328267B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
seq
amino acid
sequence
cdr
acid sequence
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
JP2021016190A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2021072847A (ja
Inventor
ヂ-ヨン・ヤン
ゲイリー・ジェイ・ナベル
リン・シュ
ロニー・ウェイ
ファーウェイ・チウ
ヨッヘン・ベーニンガ
ヨッヘン・クルイプ
エアコーレ・ラオ
ディルク・ヴルフ・ロイシュナー
クリスティアン・バイル
クリスティアン・ランゲ
マーク・コナーズ
ジョン・アール・マスコラ
リチャード・エー・クープ
ジン・ホアン
ニコル・エー・ドリア-ローズ
トンキン・チョウ
ピーター・ディー・クォン
トゥ・ヤン・クォン
アマレンドラ・ペグー
マンガイアーカラシィ・アソカン
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Sanofi SA
Original Assignee
Sanofi SA
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Sanofi SA filed Critical Sanofi SA
Publication of JP2021072847A publication Critical patent/JP2021072847A/ja
Priority to JP2023061823A priority Critical patent/JP2023085476A/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP7328267B2 publication Critical patent/JP7328267B2/ja
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/46Hybrid immunoglobulins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • A61K39/42Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum viral
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6835Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
    • A61K47/6881Cluster-antibody conjugates, i.e. the modifying agent consists of a plurality of antibodies covalently linked to each other or of different antigen-binding fragments covalently linked to each other
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/18Antivirals for RNA viruses for HIV
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/08Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
    • C07K16/10Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses from RNA viruses
    • C07K16/1036Retroviridae, e.g. leukemia viruses
    • C07K16/1045Lentiviridae, e.g. HIV, FIV, SIV
    • C07K16/1063Lentiviridae, e.g. HIV, FIV, SIV env, e.g. gp41, gp110/120, gp160, V3, PND, CD4 binding site
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/46Hybrid immunoglobulins
    • C07K16/468Immunoglobulins having two or more different antigen binding sites, e.g. multifunctional antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/31Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency multispecific
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/92Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/94Stability, e.g. half-life, pH, temperature or enzyme-resistance

Description

関連出願の相互参照
本願は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる、2015年10月25日に出願した米国仮出願第62/246,113号、2016年2月24日に出願した欧州特許出願第EP16305211.1号、2016年4月13日に出願した米国仮出願第62/322,029号、および2016年5月3日に出願した米国仮出願62/331,169号の優先権を主張するものである。
本発明は、米国保健福祉省、国立衛生研究所との共同研究開発契約(NIAID #2014-0038)を履行することで生じたものである。米国政府は、本発明に一定の権利を有する。
ASCIIテキストファイルでの配列表の提出
ASCIIテキストファイルでの以下の提出内容は、その全体が参照により本明細書に組み入れられている:コンピュータ可読形式(CRF)の配列表(ファイル名:183952027041SEQLIST.txt、記録日:2016年10月19日、サイズ:1,064KB)。
本開示は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合タンパク質であって、該結合タンパク質を形成する第1のポリペプチド対は、交差配向を有する二重可変ドメインを有し、該結合タンパク質を形成する第2のポリペプチド対は、単一の可変ドメインを有する、前記結合タンパク質に関する。本開示は、三重特異性および/または三価結合タンパク質を作製する方法、ならびにHIV/AIDSの処置および/または予防のためのそのような結合タンパク質の使用にも関する。
中和抗体でHIV/AIDSを処置する上での課題の1つは、HIV-1ウイルスの高い変異率に起因する潜在的ブレイクスルー感染症である。加えて、HIV-1感染後の初期数週間におけるウイルス学的事象は、現在利用可能な併用抗レトロウイルス療法(cART)では依然として治らない生涯にわたる慢性感染症の発端となる。これは、少なくとも一部は、cARTにもかかわらず存在し続ける潜伏感染細胞を含む、ウイルス保有宿主の早期確立に起因し、したがって、処置が中断されると再発性感染症に至る。幅広さおよび力価が改善された、新たに発見された抗HIV-1中和抗体は、HIV/AIDS処置および予防のより多くの選択肢を提供することができるが、ブレイクスルー感染症は、依然として当分野の大きな問題である。
一実施形態では、本開示は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを
含み;該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一実施形態では、本開示は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該ア
ミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質160からなる群から選択される。一部の実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、単一HIV標的タンパク質上の3つの異なるエピトープに特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、第1のHIV標的タンパク質上の2つの異なるエピトープおよび第2のHIV標的タンパク質上の1つのエピトープに特異的に結合することができ、前記第1および第2のHIV標的タンパク質は異なるものである。一部の実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、3つの異なる抗原標的に特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質の機能を阻害することができる。一部の実施形態では、VL1は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL2は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。一部の実施形態では、VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
一部の実施形態では、VL3は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。一部の実施形態では、VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VH1は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:
254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VH2は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VH3は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:500の配列を含むCDR-L1、配列番号:501の配列を含むCDR-L2、および配列番号:274の配列を含むCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:266の配列を含むCDR-L1、配列番号:267の配列を含むCDR-L2、および配列番号:268の配列を含むCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:254の配列を含むCDR-H1、配列番号:255の配列を含むCDR-H2、および配列番号:256の配列を含むCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:248の配列を含むCDR-H1、配列番号:497の配列を含むCDR-H2、および配列番号:250の配列を含むCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:518の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:519の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:512の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:504の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CD
R-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:506の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:502の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL2は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL3は、配列番号:512の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VH1は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH2は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH3は、配列番号:502の配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:500の配列を含むCDR-L1、配列番号:501の配列を含むCDR-L2、および配列番号:274の配列を含むCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:254の配列を含むCDR-H1、配列番号:255の配列を含むCDR-H2、および配列番号:256の配列を含むCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む。
一部の実施形態では、VL1は、配列番号:518の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:519の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:504の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:506の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL2は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VH1は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH2は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:500の配列を含むCDR-L1、配列番号:501の配列を含むCDR-L2、および配列番号:274の配列を含むCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:254の配列を含むCDR-H1、配列番号:255の配列を含むCDR-H2、および配列番号:256の配列を含むCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:519の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:518の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含
む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:506の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:504の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL2は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VH1は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH2は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である。一部の実施形態では、L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である。一部の実施形態では、Lは、Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む。
一実施形態では、本開示は、3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:2、4、10、12、18、20、26、28、34、36、42、44、50、52、58、60、66、68、74、76、82、84、90、92、98、100、106、108、114、116、122、124、130、132、138、140、146、148、154、156、162、164、170、172、178、180、186、188、194、196、202、204、210、212、218、220、226、228、233、235、241、243のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインで
あるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~283のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:1、3、9、11、17、10、25、27、33、35、41、43、49、51、57、59、65、67、73、75、81、83、89、91、97、99、105、107、113、115、121、123、129、131、137、139、145、147、153、155、161、163、169、171、177、179、185、187、193、195、201、203、209、211、217、219、225、227、232、234、240、242のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~265のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一実施形態では、本開示は、3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:2、4、10、12、18、20、26、28、34、36、42、44、50、52、58、60、66、68、74、76、82、84、90、92、98、100、106、108、114、116、122、124、130、132、138、140、146、148、154、156、162、164、170、172、178、180、186、188、194、196、202、204、210、212、218、220、226、228、233、235、241、243のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~283のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:1、3、9、11、17、10、25、27、33、35、41、43、49、51、57、59、65、67、73、75、81、83、89、91、97、99、105、107、113、115、121、123、129、131、137、139、145、147、153、155、161、163、169、171、177、179、185、187、193、195、201、203、209、211、217、219、225、227、232、234、240、242のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~265のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一部の実施形態では、L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である。一部の実施形態では、L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である。一部の実施形態では、Lは、Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む。
一実施形態では、本開示は、3つの異なるHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を有し、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を有し、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を有し、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を有し、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、L、およびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記三重特異性および/または三価結合タンパク質を提供する。
一実施形態では、本開示は、3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1--C [I]
により表される構造を有し、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を有し、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を有し、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を有し、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、L、およびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:2、4、10、12、18、20、26、28、34、36、42、44、50、52、58、60、66、68、74、76、82、84、90、92、98、100、106、108、114、116、122、124、130、132、138、140、146、148、154、156、162、164、170、172、178、180、186、188、194、196、202、204、210、212、218、220、226、228、233、235、241、243のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~283のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:1、3、9、11、17、10、25、27、33、35、41、43、49、51、57、59、65、67、73、75、81、83、89、91、97、99、105、107、113、115、121、123、129、131、137、139、145、147、153、155、161、163、169、171、177、179、185、187、193、195、201、203、209、211、217、219、225、227、232、234、240、242のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~265のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
別の実施形態では、本開示は、第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖および第4のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって:
(a)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:4のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:4のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:3のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:3のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:1のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:1のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:2のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:2のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(b)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:12のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:12のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:11のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:11のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:9のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:9のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:10のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:10のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(c)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:20のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:20のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:19のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:19のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:17のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:17のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:18のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:18のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(d)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:28のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:28のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:27のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:27のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:25のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:25のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:26のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:26のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(e)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:36のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:36のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:35のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:35のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:33のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:33のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:34のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:34のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(f)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:44のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:44のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:43のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:43のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:41のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:41のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:42のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:42のアミノ酸配列と少なくとも95%同一で
あるアミノ酸配列を含む;
(g)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:52のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:52のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:51のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:51のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:49のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:49のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:50のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:50のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(h)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:60のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:60のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:59のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:59のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:57のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:57のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:58のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:58のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(i)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:68のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:68のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:67のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:67のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:65のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:65のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:66のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:66のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(j)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:76のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:76のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:75のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:75のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:73のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:73のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:74のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:74のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(k)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:84のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:84のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:83のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:83のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:81のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:81のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:82のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:82のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(l)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:92のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:92のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:91のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:91のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:89のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:89のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:90のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:90のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(m)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:100のアミノ酸配列を含むか、または配
列番号:100のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:99のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:99のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:97のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:97のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:98のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:98のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(n)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:108のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:108のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:107のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:107のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:105のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:105のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:106のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:106のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(o)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:116のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:116のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:115のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:115のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:113のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:113のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:114のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:114のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(p)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:124のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:124のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:123のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:123のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:121のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:121のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:122のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:122のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(q)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:132のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:132のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:131のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:131のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:129のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:129のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:130のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:130のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(r)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:140のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:140のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:139のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:139のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:137のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:137のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:138のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:138のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(s)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:148のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:148のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:147のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:14
7のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:145のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:145のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:146のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:146のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(t)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:156のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:156のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:155のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:155のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:153のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:153のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:154のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:154のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(u)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:164のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:164のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:163のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:163のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:161のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:161のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:162のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:162のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(v)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:172のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:172のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:171のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:171のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:169のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:169のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:170のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:170のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(w)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:180のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:180のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:179のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:179のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:177のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:177のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:178のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:178のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(x)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:188のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:188のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:187のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:187のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:185のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:185のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:186のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:186のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(y)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:196のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:196のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:195のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:195のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:193のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:193のアミノ酸
配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:194のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:194のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(z)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:204のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:204のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:203のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:203のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:201のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:201のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:202のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:202のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(aa)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:212のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:212のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:211のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:211のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:209のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:209のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:210のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:210のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(bb)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:220のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:220のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:219のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:219のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:217のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:217のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:218のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:218のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(cc)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:228のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:228のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:227のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:227のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:225のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:225のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:226のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:226のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(dd)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:235のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:235のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:234のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:234のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:232のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:232のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:233のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:233のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;または
(ee)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:243のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:243のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:242のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:242のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:240のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:240のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:241のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:241のアミノ酸配列と少な
くとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
一実施形態では、本開示は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み;
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み;
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み;
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み;
式中、
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置
換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一実施形態では、本開示は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み;
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み;
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み;
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み;
式中、
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメイ
ンは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質160からなる群から選択される。一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質は、CD3またはCD28である。一部の実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、HIV標的タンパク質および単一T細胞標的タンパク質上の2つの異なるエピトープに特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、HIV標的タンパク質および2つの異なるT細胞標的タンパク質に特異的に結合することができる。一部の実施態様では、結合タンパク質は、三重特異性であり、T細胞標的タンパク質および単一HIV標的タンパク質上の2つの異なるエピトープに特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、T細胞標的タンパク質および2つの異なるHIV標的タンパク質に特異的に結合することができる。一部の実施形態では、第1および第2のポリペプチド鎖は、2つのT細胞標的タンパク質を特異的に標的にする2つの抗原結合部位を形成し、第3および第4のポリペプチド鎖は、HIV標的タンパク質に特異的に結合する抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、VL1は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ;配列番号:488、489、および490に記載の配列をそれぞれ;配列番号:491、492、および493に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:494、495、および496に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL2は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ;配列番号:488、489、および490に記載の配列をそれぞれ;配列番号:491、492、および493に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:494、495、および496に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、51
7、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
一部の実施形態では、VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL3は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ;配列番号:488、489、および490に記載の配列をそれぞれ;配列番号:491、492、および493に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:494、495、および496に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。一部の実施形態では、VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VH1は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ;配列番号:479、480、および481に記載の配列をそれぞれ;配列番号:482、483、および484に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:485、486、および487に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VH2は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ;配列番号:479、480、および481に記載の配列をそれぞれ;配列番号:482、483、および484に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:485、486、および487に記載の配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメ
インを含む。一部の実施形態では、VH3は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ;配列番号:479、480、および481に記載の配列をそれぞれ;配列番号:482、483、および484に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:485、486、および487に記載の配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:488の配列を含むCDR-L1、配列番号:489の配列を含むCDR-L2、および配列番号:490の配列を含むCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:479の配列を含むCDR-H1、配列番号:480の配列を含むCDR-H2、および配列番号:481の配列を含むCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:522の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:524の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:509の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:511の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。
一部の実施形態では、VL1は、配列番号:522の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL2は、配列番号:524の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VH1は、配列番号:509の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH2は、配列番号:511の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:488の配列を含むCDR-L1、配列番号:489の配列を含むCDR-L2、および配列番号:490の配列を含むCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:479の配列を含むCDR-H1、配列番号:480の配列を含むCDR-H2、および配列番号:481
の配列を含むCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:524の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:522の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:511の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:509の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:524の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL2は、配列番号:522の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VL3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;VH1は、配列番号:511の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH2は、配列番号:509の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;VH3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である。一部の実施形態では、L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である。一部の実施形態では、Lは、Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:配列番号:299)である。
一実施形態では、本開示は、3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:303、305、3
11、313、319、321、327、329、335、337、343、345、351、353、359、361、367、369、375、377、383、385、391、393、399、401、407、409、415、417、423、425、431、433、439、441、447、449、455、457、463、465、471、473のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~271、275~277、488~496のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:302、304、310、312、318、320、326、328、334、336、342、344、350、352、358、360、366、368、374、376、382、384、390、392、398、400、406、408、414、416、422、424、430、432、438、440、446、448、454、456、462、464、470、472のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~253、257~259、479~487のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを
含み;該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一実施形態では、本開示は、3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:303、305、311、313、319、321、327、329、335、337、343、345、351、353、359、361、367、369、375、377、383、385、391、393、399、401、407、409、415、417、423、425、431、433、439、441、447、449、455、457、463、465、471、473のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~271、275~277、488~496のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:302、304、310、312、318、320、326、328、334、336、342、344、350、352、358、360、366、368、374、376、382、384、390、392、398、400、406、408、414、416、422、424、4
30、432、438、440、446、448、454、456、462、464、470、472のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~253、257~259、479~487のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。
一部の実施形態では、L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である。一部の実施形態では、L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である。一部の実施形態では、Lは、Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:配列番号:299)である。
一実施形態では、本開示は、3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1--C [I]
により表される構造を有し、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を有し、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を有し、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を有し、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、L、およびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:303、305、311、313、319、321、327、329、335、337、343、345、351、353、359、361、367、369、375、377、383、385、391、393、399、401、407、409、415、417、423、425、431、433、439、441、447、449、455、457、463、465、471、473のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~271、275~277、488~496のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:302、304、310、312、318、320、326、328、334、336、342、344、350、352、358、360、366、368、374、376、382、384、390、392、398、400、406、408、414、416、422、424、430、432、438、440、446、448、454、456、462、464、470、472のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~253、257~259、479~487のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
別の実施形態では、本開示は、第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖および第4のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
(a)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:305のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:305のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:304のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:304のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:302のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:302のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:303のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:303のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(b)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:313のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:313のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:312のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:312のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:310のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:310のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:311のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:311のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(c)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:321のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:321のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:320のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:32
0のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:318のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:318のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:319のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:319のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(d)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:329のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:329のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:328のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:328のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:326のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:326のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:327のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:327のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(e)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:337のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:337のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:336のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:336のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:334のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:334のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:335のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:335のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(f)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:345のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:345のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:344のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:344のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:342のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:342のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:343のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:343のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(g)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:353のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:353のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:352のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:352のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:350のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:350のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:351のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:351のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(h)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:361のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:361のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:360のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:360のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:358のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:358のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:359のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:359のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(i)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:369のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:369のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:368のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:368のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:366のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:366のアミノ酸
配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:367のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:367のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(j)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:377のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:377のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:376のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:376のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:374のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:374のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:375のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:375のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(k)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:385のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:385のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:384のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:384のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:382のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:382のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:383のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:383のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(l)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:393のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:393のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:392のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:392のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:390のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:390のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:391のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:391のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(m)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:401のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:401のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:400のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:400のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:398のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:398のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:399のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:399のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(n)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:409のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:409のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:408のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:408のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:406のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:406のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:407のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:407のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(p)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:417のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:417のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:416のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:416のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:414のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:414のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:415のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:415のアミノ酸配列と少なく
とも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(q)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:425のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:425のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:424のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:424のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:422のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:422のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:423のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:423のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(r)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:433のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:433のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:432のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:432のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:430のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:430のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:431のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:431のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(s)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:441のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:441のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:440のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:440のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:438のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:438のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:439のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:439のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(t)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:449のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:449のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:448のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:448のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:446のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:446のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:447のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:447のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(u)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:457のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:457のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:456のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:456のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:454のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:454のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:455のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:455のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(v)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:465のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:465のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:464のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:464のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:462のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:462のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:463のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:463のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;または
(w)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:473のアミノ酸配列を含むか、または配
列番号:473のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:472のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:472のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:470のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:470のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:471のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:471のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、
前記結合タンパク質を提供する。
一実施形態では、本開示は、上記実施形態のいずれかによる結合タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子を提供する。一実施形態では、本開示は、上記実施形態のいずれかによる核酸分子を含む発現ベクターを提供する。一実施形態では、本開示は、上記実施形態のいずれかによる核酸分子を含む、単離された宿主細胞を提供する。一実施形態では、本開示は、上記実施形態のいずれかによる発現ベクターを含む、単離された宿主細胞を提供する。一部の態様では、単離された宿主細胞は、哺乳動物細胞または昆虫細胞である。一実施形態では、本開示は、上記実施形態のいずれかによる結合タンパク質の第1、第2、第3、および第4のポリペプチド鎖をコードする1つまたはそれ以上のベクターを含むベクター系を提供する。一部の実施形態では、ベクター系は、結合タンパク質の第1のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第2のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターと、結合タンパク質の第3のポリペプチド鎖をコードする第3のベクターと、結合タンパク質の第4のポリペプチド鎖をコードする第4のベクターとを含む。一部の実施形態では、ベクター系は、結合タンパク質の第1および第2のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第3および第4のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターとを含む。一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のベクターは、発現ベクターである。一実施形態では、本開示は、上記実施形態のいずれかによるベクター系を含む、単離された宿主細胞を提供する。一部の実施形態では、単離された宿主細胞は、哺乳動物細胞または昆虫細胞である。一実施形態では、本開示は、結合タンパク質を産生する方法であって、a)上記実施形態のいずれかによる宿主細胞を、該宿主細胞が該結合タンパク質を発現するような条件下で培養する工程;およびb)該結合タンパク質を該宿主細胞から単離する工程を含む前記方法を提供する。
一実施形態では、本開示は、患者におけるHIV感染症を予防および/または処置する方法であって、上記実施形態のいずれかによる少なくとも1つの結合タンパク質の治療有効量を該患者に投与する工程を含む前記方法を提供する。一部の実施形態では、結合タンパク質は、標準的抗レトロウイルス療法と併用投与される。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質の投与は、1つまたはそれ以上のHIVビリオンの中和をもたらす。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質の投与は、患者における1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性HIV感染細胞の排除をもたらす。一部の実施形態では、患者はヒトである。
一実施形態では、本開示は、患者におけるHIV感染症の予防または処置のための、上記実施形態のいずれかによる結合タンパク質を提供する。一部の実施形態では、結合タンパク質は、標準的抗レトロウイルス療法と併用投与される。一部の実施形態では、結合タンパク質は、患者における1つまたはそれ以上のHIVビリオンの中和を引き起こす。一部の実施形態では、結合タンパク質は、患者における1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性HIV感染細胞の排除を引き起こす。一部の実施形態では、患者はヒトである。
本発明の特定の実施形態は、ある一定の実施形態および請求項についての下記のより詳
細な説明から明らかになるであろう。
本明細書に記載の様々な実施形態の特性の1つ、一部またはすべてを組み合わせて、本発明の他の実施形態を形成することができることは理解されるはずである。本発明のこれらおよび他の態様が当業者に明らかになるであろう。
図1A~Dは、1つまたはそれ以上の抗原上の3つの異なるエピトープに特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性結合タンパク質であって、一部の実施形態に従って、第1のポリペプチド対は、2つの抗原結合部位(VH1-VL1およびVH2-VL2を含む)を形成する交差配向を有する二重可変ドメインを有し、第2のポリペプチド対は、単一の抗原結合部位(VH3-VL3を含む)を有する、前記三重特異性結合タンパク質の模式図を示す図である。図1Aは、ノブが第1のポリペプチド対上にある「ノブ・イントゥー・ホール」修飾を含む三重特異性結合タンパク質を示す。図1Bは、ノブが第2のポリペプチド対上にある「ノブ・イントゥー・ホール」修飾を含む三重特異性結合タンパク質を示す。図1Cは、表1および2に示す結合タンパク質1~31についての、ポリペプチド鎖上の可変ドメインの配向、およびノブ/ホール配向を示す。「重鎖A」(例えば、本開示の第3のポリペプチド鎖)は、重鎖Aの可変ドメインを示す。「軽鎖A」(例えば、本開示の第4のポリペプチド鎖)は、軽鎖Aの可変ドメインを示す。「重鎖B」(例えば、本開示の第2のポリペプチド鎖)は、重鎖Bの可変ドメイン1および可変ドメイン2を示す。「軽鎖B」(例えば、本開示の第1のポリペプチド鎖)は、軽鎖Bの可変ドメイン1および可変ドメイン2を示す。図1Dは、表1および2に示す結合タンパク質32~53についての、ポリペプチド鎖上の可変ドメインの配向、およびノブ/ホール配向を示す。「重鎖A」(例えば、本開示の第3のポリペプチド鎖)は、重鎖Aの可変ドメインを示す。「軽鎖A」(例えば、本開示の第4のポリペプチド鎖)は、軽鎖Aの可変ドメインを示す。「重鎖B」(例えば、本開示の第2のポリペプチド鎖)は、重鎖Bの可変ドメイン1および可変ドメイン2を示す。「軽鎖B」(例えば、本開示の第1のポリペプチド鎖)は、軽鎖Bの可変ドメイン1および可変ドメイン2を示す。 図2A~Bは、先ずアフィニティークロマトグラフィーを使用し、次いで分取サイズ排除クロマトグラフィーを使用する、三重特異性結合タンパク質の精製を示す図である。図2Aは、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製中の三重特異性結合タンパク質の溶離プロファイルを示す。図2Bは、Superdex200サイズ排除クロマトグラフィーによる単量体タンパク質の精製を示す。 図2A~Bは、先ずアフィニティークロマトグラフィーを使用し、次いで分取サイズ排除クロマトグラフィーを使用する、三重特異性結合タンパク質の精製を示す図である。図2Aは、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製中の三重特異性結合タンパク質の溶離プロファイルを示す。図2Bは、Superdex200サイズ排除クロマトグラフィーによる単量体タンパク質の精製を示す。 図3A~Bは、先ずアフィニティークロマトグラフィーを使用し、次いで分取サイズ排除クロマトグラフィーを使用する、MPER Ab、CD4BS Ab「b」、およびV1/V2指向性Ab「a」親抗体の精製を示す図である。図3Aは、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製中の親抗体の溶離プロファイルを示す。図3Bは、Superdex200サイズ排除クロマトグラフィーによる単量体タンパク質の精製を示す。 図3A~Bは、先ずアフィニティークロマトグラフィーを使用し、次いで分取サイズ排除クロマトグラフィーを使用する、MPER Ab、CD4BS Ab「b」、およびV1/V2指向性Ab「a」親抗体の精製を示す図である。図3Aは、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製中の親抗体の溶離プロファイルを示す。図3Bは、Superdex200サイズ排除クロマトグラフィーによる単量体タンパク質の精製を示す。 図4A~Bは、二重特異性および三重特異性結合タンパク質のサイズ排除クロマトグラフィープロファイルを示す図である。図4Aは、二重特異性結合タンパク質のサイズ排除クロマトグラフィープロファイルを示す。図4Bは、三重特異性結合タンパク質のサイズ排除クロマトグラフィープロファイルを示す。 図4A-1の続き。 図4A~Bは、二重特異性および三重特異性結合タンパク質のサイズ排除クロマトグラフィープロファイルを示す図である。図4Aは、二重特異性結合タンパク質のサイズ排除クロマトグラフィープロファイルを示す。図4Bは、三重特異性結合タンパク質のサイズ排除クロマトグラフィープロファイルを示す。 図4B-1の続き。 図5は、標準的なBiacoreベースの動態アッセイにより評定したときの、HIV gp41由来ペプチド(MPER結合部位)に対する三重特異性結合タンパク質および親MPER Ab抗体の結合動態についてのBiacoreセンソグラムを示す図である。 図5-1の続き。 図6は、標準的なBiacoreベースの動態アッセイにより評定したときの、組換えHIV gp120に対する3つの三重特異性結合タンパク質および親CD4BS Ab「b」抗体の結合動態についてのBiacoreセンソグラムを示す図である。 図6-1の続き。 図7は、アカゲザルにおける静脈内(IV)注射後の示されているタンパク質についての薬物動態(PK)研究の結果を示す図である。 図8A~8Bは、一部の実施形態による、三重特異性T細胞エンゲージャーの模式図を示す図である。結合部位を点線の円により示す。 図9は、gp120のCD3(CD3EはCD3イプシロンタンパク質を表し;CD3DはCD3デルタタンパク質を表す)、CD28、および表面再構成安定化コア3(RSC3)タンパク質に対する、三重特異性結合タンパク質「結合タンパク質32」および「CD3×CD28/CD4BS Ab「b」」ならびに陰性対照(ヒトIgG)の結合特性を示す図である。 図10は、親CD4BS IgG4抗体、および陰性対照(mAbなし)と比較して、三重特異性結合タンパク質「結合タンパク質32」および「CD3×CD28/CD4BS Ab「b」」を使用するCD8 T細胞活性化を示す図である。 図11は、親CD4BS IgG4抗体、および陰性対照(mAbなし)と比較して、三重特異性結合タンパク質「結合タンパク質32」および「CD3×CD28/CD4BS Ab「b」」を使用するCD4 T細胞活性化を示す図である。 図12は、親CD4BS IgG4抗体、および陰性対照(mAbなし)と比較して、三重特異性結合タンパク質「結合タンパク質32」および「CD3×CD28/CD4BS Ab「b」」によるT細胞活性化後のCD3ダウンレギュレーションを示す図である。 図13A~Cは、潜伏感染HIV-1T細胞に対する三重特異性結合タンパク質についての蛍光標識細胞分取(FACS)ベースの細胞傷害性アッセイを示す図である。図13Aは、CEM-Bal細胞とともにインキュベートした三重特異性結合タンパク質についての結果を示す。図13Bは、ACH2細胞とともにインキュベートした三重特異性結合タンパク質についての結果を示す。図13Cは、J1.1細胞とともにインキュベートした三重特異性結合タンパク質についての結果を示す。
本開示は、1つもしくはそれ以上のヒト免疫不全ウイルス(HIV)標的タンパク質および/または1つもしくはそれ以上のT細胞受容体標的タンパク質に特異的に結合する3
つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合タンパク質であって、該結合タンパク質を形成する第1のポリペプチド対は、交差配向を有する二重可変ドメインを有し、該結合タンパク質を形成する第2のポリペプチド対は、単一可変ドメインを有する、前記三重特異性および/または三価結合タンパク質を提供する。
以下の説明は、例示的な方法、パラメータなどを示すものである。しかし、そのような説明は、本開示の範囲の限定として意図されたものではなく、それよりむしろ例示的な実施形態の説明として提供されるものであることを、認識すべきである。
定義
本開示に従って用いられる以下の用語は、別段の指示がない限り、以下の意味を有すると解されるものとする。文脈による別段の要求がない限り、単数形の用語は、複数形を包含するものとし、複数形の用語はその単数形を包含するものとする。
本明細書で使用される「ポリヌクレオチド」という用語は、長さが少なくとも10ヌクレオチドの1本鎖または2本鎖核酸ポリマーを指す。ある一定の実施形態では、ポリヌクレオチドを含むヌクレオチドは、リボヌクレオチドであってもよく、またはデオキシリボヌクレオチドであってもよく、またはどちらかのタイプのヌクレオチドの修飾形態であってもよい。そのような修飾体には、塩基修飾体、例えば、ブロモウリジン、リボース修飾体、例えば、アラビノシドおよび2’,3’-ジデオキシリボース、ならびにヌクレオチド間結合修飾体、例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレノエート、ホスホロジセレノエート、ホスホロアニロチオエート、ホスホロアニラデートおよびホスホロアミデートが含まれる。「ポリヌクレオチド」という用語は、特に、1本鎖および2本鎖形態のDNAを含む。
「単離されたポリヌクレオチド」は、ゲノム、cDNAもしくは合成起源の、またはこれらの何らかの組合せの、ポリヌクレオチドであり、該ポリヌクレオチドは:(1)単離されたポリヌクレオチドに天然に見出されるポリヌクレオチドのすべてもしくは一部分と会合していない、(2)それが天然に連結していないポリヌクレオチドに連結している、または(3)より大きい配列の一部として天然に存在しない。
「単離されたポリペプチド」は、次のものである:(1)通常見出される少なくともいくつかの他のポリペプチドがないもの、(2)同じ源からの、例えば、同じ種からの、他のポリペプチドが本質的にないもの、(3)異なる種からの細胞による発現されるもの、(4)それが天然に会合しているポリヌクレオチド、脂質、炭水化物または他の物質の少なくとも約50パーセントから分離されたもの、(5)「単離されたポリペプチド」が天然に会合しているポリペプチドの部分と(共有結合性相互作用によっても、非共有結合性相互作用によっても)会合していないもの、(6)それが天然に会合していないポリペプチドと(共有結合性または非共有結合性相互作用により)動作可能に会合しているもの、または(7)天然に存在しないもの。そのような単離されたポリペプチドは、合成起源の、ゲノムDNA、cDNA、mRNAもしくは他のRNAによりコードされていることもあり、またはこれらの任意の組合せによりコードされていることもある。好ましくは、単離されたポリペプチドには、その使用(治療的使用、診断的使用、予防的使用、研究使用または別様の使用)に干渉することになる、その天然の環境で見出されるポリペプチドまたは他の汚染物質が実質的にない。
天然起源の抗体は、四量体を概して含む。各々のそのような四量体は、2つの同一のポリペプチド鎖対で概して構成されており、各対は、1本の完全長「軽」鎖(約25kDaの分子量を概して有する)および1本の完全長「重」鎖(約50~70kDaの分子量を
概して有する)を有する。本明細書で使用される「重鎖」および「軽鎖」という用語は、標的抗原に対する特異性を付与するために十分な可変ドメイン配列を有する任意の免疫グロブリンポリペプチドを指す。軽鎖および重鎖各々のアミノ末端部分は、抗原認識を概して担当する、アミノ酸約100~110またはそれ以上の可変ドメインを概して含む。各鎖のカルボキシ末端部分は、エフェクター機能を担当する定常ドメインを概して規定する。したがって、天然起源の抗体の場合、完全長重鎖免疫グロブリンポリペプチドは、可変ドメイン(V)および3つの定常ドメイン(CH1、CH2、およびCH3)を含み、前記Vドメインは、前記ポリペプチドのアミノ末端にあり、前記CH3ドメインは、前記ポリペプチドのカルボキシル末端にあり、ならびに完全長軽鎖免疫グロブリンポリペプチドは、可変ドメイン(V)および定常ドメイン(C)を含み、前記Vドメインは、前記ポリペプチドのアミノ末端にあり、前記Cドメインは、前記ポリペプチドのカルボキシル末端にある。
ヒト軽鎖は、概して、カッパおよびラムダ軽鎖として分類され、ヒト重鎖は、概して、ミュー、デルタ、ガンマ、アルファまたはイプシロンとして分類され、IgM、IgD、IgG、IgAおよびIgEといった抗体のアイソタイプをそれぞれ規定する。IgGは、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4を含むがこれらに限定されない、いくつかのサブクラスを有する。IgMは、IgM1およびIgM2を含むがこれらに限定されないサブクラスを有する。IgAは、同様に、IgA1およびIgA2を含むがこれらに限定されないサブクラスに細分される。完全長軽鎖および重鎖内の可変および定常ドメインは、アミノ酸約12またはそれ以上の「J」領域により概して連結されており、重鎖は、アミノ酸がさらに約10個多い「D」領域も含む。例えば、あらゆる目的でその全体が参照により組み入れられる、FUNDAMENTAL IMMUNOLOGY(Paul,W.編、Raven Press、第2版、1989)も参照されたい。各軽鎖/重鎖対の可変領域は、概して、抗原結合部位を形成する。天然起源の抗体の可変ドメインは、相補性決定領域またはCDRとも呼ばれる3つの超可変領域により連結された比較的保存されるフレームワーク領域(FR)の同じ一般構造を概して示す。各対の2本の鎖からのCDRは、概して、フレームワーク領域により整列されており、これにより特異的エピトープへの結合が可能になりうる。アミノ末端からカルボキシル末端に、軽鎖および重鎖両方の可変ドメインは、概して、ドメインFR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、およびFR4を含む。
「CDRセット」という用語は、抗原に結合することができる、単一可変領域内に存在するCDR3つの1群を指す。これらのCDRの正確な境界は、異なるシステムに従って異なって定義されている。カバット(Kabatら、SEQUENCES OF PROTEINS OF IMMUNOLOGICAL INTEREST(National
Institutes of Health、Bethesda、Md.(1987)および(1991))により記載されたシステムは、抗体の任意の可変領域に適用可能な明確な残基番号付けシステムを提供するばかりでなく、3つのCDRを定義する正確な残基境界も提供する。これらのCDRは、カバットCDRと呼ばれることもある。コチアおよび共同研究者(ChothiaおよびLesk、1987、J.Mol.Biol.196:901~17;Chothiaら、1989、Nature 342:877~83)は、カバットCDR内のある一定の小部分が、アミノ酸配列レベルで大きい多様性を有するにもかかわらず、ほぼ同一のペプチド主鎖立体構造をとることを見出した。これらの小部分は、L1、L2およびL3、またはH1、H2およびH3(ここで、「L」および「H」は、軽鎖および重鎖領域をそれぞれ示す)と称された。これらの領域は、コチアCDRと呼ばれることがあり、カバットCDRと重複する境界を有する。カバットCDRと重複するCDRを定義する他の境界は、Padlan、1995、FASEB J.9:133~39;MacCallum、1996、J.Mol.Biol.262(5):732~45;およびLefranc、2003、Dev.Comp.Immunol
.27:55~77により記載されている。さらに他のCDR境界定義は、本明細書におけるシステムのものに厳格に従わないこともあるが、特定の残基もしくは残基群またはさらにはCDR全体が抗原結合に有意な影響を与えないという予測または実験的発見にかんがみて短縮または延長されることもあるにせよ、それでもなおカバットCDRと重複することになる。本明細書において使用される方法は、ある一定の実施形態はカバットまたはコチア定義CDRを使用するとはいえ、これらのシステムのいずれに従って定義されたCDRを用いてもよい。アミノ酸配列を使用する予測CDRの同定は、例えば、Antibody Engineering、第2巻、Kontermann R.,Dubel S.編、Springer-Verlag、Berlin、33~51頁(2010)のMartin,A.C.「Protein sequence and structure analysis of antibody variable domains」におけるものなど、当分野において周知である。重鎖および/または軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列を調査して、他の従来の方法により、例えば、配列超可変性領域を決定するための他の重鎖および軽鎖可変領域の公知アミノ酸配列の比較により、CDRの配列を同定することもできる。番号付けした配列を目視によりアラインメントしてもよく、またはThompson、1994、Nucleic Acids Res.22:4673~80に記載されているような一連のCLUSTALプログラムのものなどの、アラインメントプログラムを利用することによりアラインメントしてもよい。分子モデルを従来通りに利用してフレームワークおよびCDR領域を正確に描写し、かくて配列ベースのアラインメントを補正する。
本明細書で使用される「Fc」という用語は、抗体の消化の結果として生じるまたは他の手段により産生される非抗原結合断片の配列を含む分子を、単量体形態であろうと、多量体形態であろうと指し、ヒンジ領域を含有することができる。天然Fcの元々の免疫グロブリン源は、好ましくはヒト起源のものであり、いずれの免疫グロブリンであってもよいが、IgG1およびIgG2が好ましい。Fc分子は、共有結合性会合(すなわち、ジスルフィド結合)および非共有結合性会合により連結して二量体または多量体形態にすることができる単量体ポリペプチドで構成されている。天然Fc分子の単量体サブユニット間の分子間ジスルフィド結合の数は、クラス(例えば、IgG、IgA、およびIgE)またはサブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgA1、およびIgGA2)に依存して1~4の幅がある。Fcの一例は、IgGのパパイン消化の結果として生じるジスルフィド結合二量体である。本明細書で使用される「Fc」という用語は、単量体形態、二量体形態および多量体形態に通有である。
F(ab)断片は、1本の軽鎖と1本の重鎖のVおよびCH1ドメインとを概して含み、F(ab)断片のV-CH1重鎖部分は、別の重鎖ポリペプチドとジスルフィド結合を形成することができない。本明細書で使用されるF(ab)断片は、アミノ酸リンカーによって隔てられている2つの可変ドメインを含有する1本の軽鎖、およびアミノ酸リンカーにより隔てられている2つの可変ドメインと、CH1ドメインとを含有する1本の重鎖を含むこともある。
F(ab’)断片は、1本の軽鎖と、より多くの定常領域を(CH1ドメインとCH2ドメインの間に)含有する1本の重鎖の部分とを概して含み、したがって、鎖間ジスルフィド結合を2本の重鎖間で形成してF(ab’)分子を形成することができる。
本明細書で使用される「結合タンパク質」という用語は、少なくとも1つの標的抗原と特異的に結合する、非天然起源の(または組換えもしくは工学的操作)分子であって、少なくとも3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含み、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を有し、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を有し、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を有し、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を有し、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記分子を指す。
「組換え」分子は、組換え手段により製造、発現、作出または単離されたものである。
本開示の一実施形態は、1つ~3つの標的抗原に対する生物学的および免疫学的特異性を有する結合タンパク質を提供する。本開示の別の実施形態は、そのような結合タンパク質を形成するポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子を提供する。本開示の別の実施形態は、そのような結合タンパク質を形成するポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子を含む発現ベクターを提供する。本開示のさらに別の実施形態は、そのような結合タンパク質を発現する(すなわち、そのような結合タンパク質を形成するポリペプチド鎖をコードする核酸分子またはベクターを含む)宿主細胞を提供する。
本明細書で使用される「スワップ可能性」という用語は、結合タンパク質フォーマット内の可変ドメインの可換性であって、折り畳みおよび究極の結合親和性が保持される前記可換性を指す。「完全スワップ可能性」は、結合親和性の保持によって証明されるような結合タンパク質の完全な機能性を維持しながら、式Iのポリペプチド鎖または式IIのポリペプチド鎖におけるVH1およびVH2ドメインの順序、したがってVL1およびVL2ドメインの順序をスワップすること(すなわち、順序を逆にすること)ができることを指す。さらに、VおよびVという呼称は、最終フォーマットの特定のタンパク質鎖上のドメインの位置を単に指すことに留意されたい。例えば、VH1およびVH2を親抗体におけるVL1およびVL2ドメインから推論し、結合タンパク質のVH1およびVH2位置に配置することができるだろう。同様に、VL1およびVL2を親抗体におけるVH1およびVH2ドメインから推論し、結合タンパク質のVH1およびVH2位置に配置することができるだろう。それ故、VおよびVという呼称は、現在の位置を指し、親抗体における元の位置を指さない。したがって、VおよびVドメインは、「スワップ可能」である。
本明細書で使用される「抗原」または「標的抗原」または「抗原標的」という用語は、結合タンパク質が結合できる分子または分子の部分であって、さらに、抗原のエピトープと結合することができる抗体を産生するために動物において使用することができる前記分子または分子の部分を指す。標的抗原は、1つまたはそれ以上のエピトープを有することができる。結合タンパク質により認識される各標的抗原に関して、結合タンパク質は、該標的抗原を認識するインタクト抗体と競合することができる。
本明細書で使用される「HIV」という用語は、ヒト免疫不全ウイルスを意味する。本明細書で使用される「HIV感染症」という用語は、HIV I、HIV II、HIV
III(別名HTLV-II、LAV-1、LAV-2)を含むがこれらに限定されない、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)ファミリーのレトロウイルスによる、宿主、特に、ヒト宿主の感染症を一般に包含する。HIVは、本明細書では、HIVファミリーの任意の株、型、サブタイプ、クレードおよび変種を指すために使用することができる。したがって、HIV感染症を処置することは、任意のHIVファミリーのレトロウイルスの保有者である人または活動性AIDSと診断される人の処置、ならびにそのような人のAIDS関連状態の処置または予防を包含することになる。
本明細書で使用される「AIDS」という用語は、後天性免疫不全症候群を意味する。AIDSは、HIVにより引き起こされる。
「CD4bs」または「CD4結合部位」という用語は、Tヘルパー細胞、単球、マクロファージおよび樹状細胞などの免疫細胞の表面で見出される糖タンパク質であるCD4(表面抗原分類4)の結合部位を指す。
「CD3」という用語は、表面抗原分類因子3ポリペプチドであり、概してT細胞受容体(TCR)複合体の一部であるT細胞表面タンパク質である。
「CD28」は、表面抗原分類28ポリペプチドであり、T細胞活性化および生存のための共刺激シグナルをもたらすT細胞表面タンパク質である。
「糖タンパク質160」または「gp160タンパク質」という用語は、HIVのエンベロープ糖タンパク質複合体を指し、gp120およびgp41サブユニットに分割されるホモ三量体である。
「MPER」という用語は、HIVをはじめとするレトロウイルスのエンベロープタンパク質複合体のサブユニットである、糖タンパク質41(gp41)の膜近位外部領域を指す。
「グリカン」という用語は、糖タンパク質、糖脂質またはプロテオグリカンなどの複合糖質の炭水化物部分を指す。本開示結合タンパク質に関して、グリカンは、HIV-1エンベロープ糖タンパク質gp120を指す。
「T細胞エンゲージャー」という用語は、宿主の免疫系、より具体的にはT細胞の細胞傷害活性にも指向され、HIV標的タンパク質にも指向された結合タンパク質を指す。
「三量体突端部」という用語は、HIV-1エンベロープ糖タンパク質gp120の突端部を指す。
「単一特異性結合タンパク質」という用語は、1つの抗原標的と特異的に結合する結合タンパク質を指す。
「一価結合タンパク質」という用語は、1つの抗原結合部位を有する結合タンパク質を指す。
「二重特異性結合タンパク質」という用語は、2つの異なる抗原標的と特異的に結合する結合タンパク質を指す。
「二価結合タンパク質」という用語は、2つの結合部位を有する結合タンパク質を指す。
「三重特異性結合タンパク質」という用語は、3つの異なる抗原標的と特異的に結合する結合タンパク質を指す。
「三価結合タンパク質」という用語は、3つの結合部位を有する結合タンパク質を指す。特定の実施形態では、三価結合タンパク質は、1つの抗原標的と結合することができる。他の実施形態では、三価結合タンパク質は、2つの抗原標的と結合することができる。他の実施形態では、三価結合タンパク質は、3つの抗原標的と結合することができる。
「単離された」結合タンパク質は、その天然環境の成分から同定および分離および/または回収されたものである。その天然の環境の汚染成分は、結合タンパク質についての診断的または治療的使用に干渉することになる物質であり、酵素、ホルモンおよび他のタンパク質様溶質または非タンパク質様溶質を含むことができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は:(1)ローリー法により判定して抗体の95重量%超、最も好ましくは99重量%超まで、(2)スピニングカップシークエネーターの使用によりN末端もしくは内部アミノ酸配列の少なくとも15残基を得るのに十分な程度に、または(3)クマシーブルーもしくは好ましくは銀染色剤を使用する還元もしくは非還元条件下でのSDS-PAGEにより均一状態まで、精製されることになる。単離された結合タンパク質は、結合タンパク質の天然環境の少なくとも1成分が存在しないことになるので、組換え細胞内の原位置に結合タンパク質を含む。
本明細書で使用される「実質的に純粋な」または「実質的に精製されている」という用語は、存在する優勢種である(すなわち、分子ベースで、組成物中のいずれの他の個々の種よりも大量に存在する)化合物または種を指す。一部の実施形態では、実質的に精製されている画分は、前記種が、存在するすべての高分子種の(分子ベースで)少なくとも約50%を含む、組成物である。他の実施形態では、実質的に純粋な組成物は、該組成物中に存在するすべての高分子種の約80%、85%、90%、95%または99%より多くを含むことになる。さらに他の実施形態では、前記種は、組成物が単一高分子種から本質的になる、(従来の検出方法により組成物において汚染種を検出することができない)本質的均一状態まで精製される。
本明細書で使用される「中和」結合タンパク質は、それが結合する標的抗原のエフェクター機能を遮断することまたは実質的に低下させることができる分子を指す。この場合に使用される「実質的に低下させる」は、標的抗原のエフェクター機能の少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約75%、よりいっそう好ましくは少なくとも約80%、よりいっそう好ましくは少なくとも約85%、最も好ましくは少なくとも約90%低下を意味する。
「エピトープ」という用語は、免疫グロブリンまたはT細胞受容体と特異的に結合することができる任意の決定基、好ましくはポリペプチド決定基を含む。ある一定の実施形態では、エピトープ決定基は、アミノ酸、糖側鎖、ホスホリル基またはスルホニル基などの
分子の化学的に活性な表面基を含み、ある一定の実施形態では、特異的三次元構造特性および/または特異的電荷特性を有することができる。エピトープは、抗体または結合タンパク質により結合される、抗原の領域も指す。ある一定の実施形態では、結合タンパク質は、タンパク質および/または高分子の複合混合物中のその標的抗原を優先的に認識する場合、抗原に特異的に結合すると言われる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、平衡解離定数が、≦10-8Mである場合、より好ましくは、平衡解離定数が、≦10-9Mである場合、最も好ましくは、解離定数が、<10-10Mである場合、抗原に特異的に結合すると言われる。
結合タンパク質の解離定数(K)は、例えば表面プラズモン共鳴により、決定することができる。一般に、表面プラズモン共鳴分析は、BIAcoreシステム(Pharmacia Biosensor;Piscataway、NJ)を使用して表面プラズモン共鳴(SPR)によりリガンド(バイオセンサーマトリックス上の標的抗原)と分析物(溶解状態の結合タンパク質)とのリアルタイム結合相互作用を測定する。表面プラズモン分析は、分析物(バイオセンサーマトリックス上の結合タンパク質)を固定化し、リガンド(標的抗原)を提示することによって行うこともできる。本明細書で使用される「K」という用語は、特定の結合タンパク質と標的抗原との相互作用の解離定数を指す。
本明細書で使用される「特異的に結合する」という用語は、エピトープを含有する抗原と少なくとも約1×10-6M、1×10-7M、1×10-8M、1×10-9M、1×10-10M、1×10-11M、1×10-12M、もしくはそれ以上のKdで結合すること、および/または非特異的抗原に対するその親和性より少なくとも2倍大きい親和性でエピトープと結合することが、結合タンパク質またはその抗原結合断片にできることを指す。
本明細書で使用される「リンカー」という用語は、軽鎖および重鎖のドメインが折り重なって交差二重可変領域免疫グロブリンになるのに十分な移動性を与えるために、免疫グロブリンドメイン間に挿入される1つまたはそれ以上のアミノ酸残基を指す。リンカーは、配列レベルでは可変ドメイン間または可変ドメインと定常ドメインの間の移行部にそれぞれ挿入される。免疫グロブリンドメインの近似的サイズは十分解明されているので、ドメイン間の移行部を同定することができる。ドメイン移行部の正確な位置は、実験データにより立証されるような、またはモデリング技術もしくは二次構造予測技術により推測できるような、ベータシートまたはアルファヘリックスなどの二次構造エレメントを形成しないペプチドストレッチの位置の特定により、決定することができる。本明細書に記載のリンカーは、軽鎖上のVL2のC末端とVL1ドメインのN末端の間に位置するものは、Lと呼ばれ;および軽鎖上のVL1のC末端とCドメインのN末端の間に位置するものは、Lと呼ばれる。重鎖リンカーは、VH1のC末端とVH2ドメインのN末端の間に位置するものは、Lとして公知であり;およびVH2のC末端とCH1ドメインのN末端の間に位置するものは、Lとして公知である。
本明細書で使用される「ベクター」という用語は、宿主細胞にコード情報を伝達するために使用される任意の分子(例えば、核酸、プラスミド、またはウイルス)を指す。「ベクター」という用語は、核酸分子であって、該核酸分子が連結されている別の核酸を輸送することができる前記核酸分子を含む。ベクターの1つのタイプは、さらなるDNAセグメントを挿入することができる環状2本鎖DNA分子を指す「プラスミド」である。ベクターのもう1つのタイプは、さらなるDNAセグメントをウイルスゲノムに挿入することができるウイルスベクターである。ある一定のベクターは、それらが導入される宿主細胞において自己複製することができる(例えば、細菌複製起点を有する細菌ベクター、およびエピソーム哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)を宿主細胞への導入時に該宿主細胞のゲノムに組込むことができ、その結果、該ベク
ターは、宿主ゲノムとともに複製される。加えて、ある一定のベクターは、該ベクターが動作可能に連結されている遺伝子の発現を指向することができる。そのようなベクターは、本明細書では「組換え発現ベクター」(または単に「発現ベクター」)と呼ばれる。一般に、組換えDNA技術において有用な発現ベクターは、プラスミドの形態であることが多い。「プラスミド」という用語と「ベクター」という用語は、プラスミドがベクターの最もよく使用される形態であるので、本明細書では同義で使用されることがある。しかし、本開示は、等価の機能を果たす他の形態の発現ベクター、例えばウイルスベクター(例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス)を含むことを意図したものである。
本明細書で使用される「組換え宿主細胞」(または「宿主細胞」)という句は、組換え発現ベクターが導入された細胞を指す。組換え宿主細胞または宿主細胞は、特定の対象細胞のみならず、そのような細胞の子孫も指すことを意図したものである。変異または環境の影響いずれかのために後の世代においてある一定の改変が起こることがあるため、そのような子孫は、実際には親細胞と同一でないことがあるが、そのような細胞は、本明細書で使用される「宿主細胞」という用語の範囲内になお含まれる。細菌、酵母、バキュロウイルスおよび哺乳動物発現系(ならびにファージディスプレイ発現システム)をはじめとする多種多様な宿主細胞発現系を使用して、結合タンパク質を発現させることができる。適する細菌発現ベクターの一例は、pUC19である。結合タンパク質を組換え発現させるために、宿主細胞は、結合タンパク質のポリペプチド鎖をコードするDNA断片を担持する1つもしくはそれ以上の組換え発現ベクターを用いて形質転換またはトランスフェクトされ、その結果、ポリペプチド鎖は、宿主細胞において発現され、好ましくは、宿主細胞が培養される培地に分泌され、その培地から結合タンパク質が回収される。
本明細書で使用される「形質転換」という用語は、細胞の遺伝特性の変化を指し、細胞は、新たなDNAを含有するように改変されている場合、形質転換されている。例えば、細胞は、その天然状態から遺伝子改変される場合、形質転換される。形質転換後、形質転換するDNAは、細胞の染色体への物理的組込みにより該細胞のDNAと組み変わることもあり、または複製されることなくエピソームエレメントとして一時的に維持されることもあり、またはプラスミドとして独立して複製することもある。細胞は、DNAが該細胞の分裂に伴って複製された場合、安定に形質転換されていると見なされる。本明細書で使用される「トランスフェクション」という用語は、細胞による外来または外来性DNAの取り込みを指し、細胞は、外来性DNAが細胞膜内に導入されている場合、「トランスフェクト」されている。多数のトランスフェクション技術が当技術分野において周知である。そのような技術を使用して、1つまたはそれ以上の外来性DNA分子を適する宿主細胞に導入することができる。
本明細書で使用され、物体に適用される「天然起源の」という用語は、その物体が、天然に見出すことができるものであり、人間により操作されていないことを指す。例えば、生物体(ウイルスを含む)内に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドであって、天然の源から単離することができ、人間により意図的に修飾されていない前記ポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、天然起源のものである。同様に、本明細書で使用される「非天然起源の」は、天然に見出されない、または構造修飾されている、または人間により合成された物体を指す。
本明細書で使用される、20種の標準型アミノ酸およびそれらの略号は、慣例的用法に準じる。20種の標準型アミノ酸の立体異性体(例えば、D-アミノ酸);非天然アミノ
酸および類似体、例えば、α-,α-二置換アミノ酸、N-アルキルアミノ酸、乳酸および他のアミノ酸、ならびに他の非標準型アミノ酸も、結合タンパク質のポリペプチド鎖の適する成分であることがある。非標準型アミノ酸の例としては、次のものが挙げられる:
4-ヒドロキシプロリン、γ-カルボキシグルタメート、ε-N,N,N-トリメチルリシン、ε-N-アセチルリシン、O-ホスホセリン、N-アセチルセリン、N-ホルミルメチオニン、3-メチルヒスチジン、5-ヒドロキシリシン、σ-N-メチルアルギニン、ならびに他の類似のアミノ酸およびイミノ酸(例えば、4-ヒドロキシプロリン)。本明細書で使用されるポリペプチド表記法では、標準的用法および慣例に従って、左手方向がアミノ末端方向であり、右手方向がカルボキシル末端方向である。
天然起源の残基は、共通の側鎖特性に基づいて次のクラスに分けることができる:
(1)疎水性:Met、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Tyr、Pro;
(2)極性親水性;Arg、Asn、Asp、Gln、Glu、His、Lys、Ser、Thr;
(3)脂肪族:Ala、Gly、Ile、Leu、Val、Pro;
(4)脂肪族疎水性;Ala、Ile、Leu、Val、Pro;
(5)中性親水性;Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(6)酸性:Asp、Glu;
(7)塩基性:His、Lys、Arg;
(8)鎖の配向に影響を与える残基:Gly、Pro;
(9)芳香族:His、Trp、Tyr、Phe;および
(10)芳香族疎水性:Phe、Trp、Tyr。
保存的アミノ酸置換は、これらのうちの1つのクラスのメンバーと同じクラスの別のメンバーとの交換を含むことができる。非保存的置換は、これらのうちの1つのクラスのメンバーの、別のクラスからのメンバーへの交換を含むことができる。
当業者は、周知の技術を使用して結合タンパク質のポリペプチド鎖の適する変異体を決定することができるであろう。例えば、当業者は、活性にとって重要であると考えられていない領域を標的にすることにより、活性を破壊することなく変化させることができる、ポリペプチド鎖の適する領域を同定することができる。あるいは、当業者は、類似のポリペプチド間で保存される、分子の残基および部分を同定することができる。加えて、生物活性にとってまたは構造にとって重要である可能性がある領域であっても、生物活性を破壊することなく、またはポリペプチド構造に悪影響を与えることなく、保存的アミノ酸置換に付すことができる。
本明細書で使用される「患者」という用語は、ヒトおよび動物対象を含む。
本明細書で使用される「処置」または「処置する」という用語は、治療的処置と予防対策の両方を指す。処置を必要とする者には、障害に罹患している者はもちろん、障害に罹患する傾向がある者、または障害を予防すべき者も含まれる。特定の実施形態では、結合タンパク質は、HIVに感染したヒト、もしくはHIV感染症に罹患しやすいヒトを処置するために、またはHIVに感染したヒト対象におけるHIV感染症を改善するために、使用することができる。結合タンパク質は、ヒト患者におけるHIVを予防するために使用することもできる。
HIVに感染した処置されるヒトが、例えば、急性原発性感染症候群(これは、無症候性であることもあり、または発熱、倦怠感、下痢および神経症状、例えば頭痛を有するインフルエンザ様疾患を伴うこともある)、無症候性感染症(これは、循環CD4T細胞の数の漸減を伴う、長い潜伏期間である)、およびAIDS(これは、より重度のAIDS定義疾患により、および/または有効な免疫機能に対応するレベル未満への循環CD4細胞の減少により定義される)を含む、HIV感染のいくつかの進行期のいずれか1つに
ある対象を含むことは、理解されるはずである。加えて、HIV感染症を処置することまたは予防することは、例えば、HIV汚染血との接触、輸血、体液の交換、感染者との「危険な」性行為、偶発的針刺し、汚染された器具で入れ墨もしくは鍼治療の施術を受けること、または妊娠、出産中もしくはその直後の母親から乳児へのウイルスの感染による、HIVへの疑わしい過去の曝露後の、HIVによる疑わしい感染症を処置することも包含することになる。
本明細書で使用される「医薬組成物」または「治療用組成物」という用語は、患者に適切に投与されたときに所望の治療効果を誘導することができる化合物または組成物を指す。
本明細書で使用される「薬学的に許容される担体」または「生理学的に許容される担体」という用語は、結合タンパク質の送達の遂行または増進に適する1つまたはそれ以上の配合材料を指す。
1つまたはそれ以上の結合タンパク質を含む医薬組成物に関して使用されるときの「有効量」および「治療有効量」という用語は、所望の治療結果を生じさせるのに十分な量または投薬量を指す。より具体的には、治療有効量は、処置される状態に関連する臨床的に定義された病理過程の1つまたはそれ以上を、ある程度の期間、抑制するのに十分な結合タンパク質の量である。有効量は、使用されることになる特定の結合タンパク質に依存して変わることがあり、処置されることになる患者に関する様々な因子および条件、ならびに障害の重症度にも依存する。例えば、結合タンパク質をin vivoで投与すべきである場合、考慮される因子には、患者の年齢、体重および健康、ならびに前臨床動物研究で得られた用量反応曲線および毒性データなどの因子があるであろう。所与の医薬組成物の有効量または治療有効量の決定は、十分に当業者の能力の範囲内である。
本開示の一実施形態は、薬学的に許容される担体と治療有効量の結合タンパク質とを含む医薬組成物を提供する。
三重特異性および/または三価結合タンパク質
一実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上の(例えば、3つの異なる)HIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記三重特異性および/または三価結合タンパク質である。
一実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上の(例えば、3つの異なる)HIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記三重特異性および/または三価結合タンパク質である。
一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、2つの別個の抗原結合部位を形成する交差配向を有する。一部の実施形態では、VH1およびVL1は、結合対を形成し、第1の抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、VH2およびVL2は、結合対を形成し、第2の抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、第3のポリペプチドおよび第4のポリペプチドは、第3の抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、VH3およびVL3は、結合対を形成し、第3の抗原結合部位を形成する。
一部の実施形態では、VL1、L2およびVL3は、各々独立して、配列番号:2、4、10、12、18、20、26、28、34、36、42、44、50、52、58、60、66、68、74、76、82、84、90、92、98、100、106、108、114、116、122、124、130、132、138、140、146、148、154、156、162、164、170、172、178、180、186、188、194、196、202、204、210、212、218、220、226、228、233、235、241、243のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであり;VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:1、3、9、11、17、10、25、27、33、35、41、43、49、51、57、59、65、67、73、75、81、83、89、91、97、99、105、107、113、115、121、123、129、131、137、139、145、147、153、155、161、163、169、171、177、179、185、187、193、195、201、203、209、211、217、219、225、227、232、234、240、242のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインである。他の実施形態では、VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~283のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~265のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む。一部の実施形態では、VL1、L2およびVL3は、各々独立して、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖可変ドメイン配列を含む、軽鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、H2およびVH3は、各々独立して、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1、L2およびVL3は、各々独立して、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖可変ドメイン配列のCDR-L1、CDR-L2およびCDR-L3を含む軽鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、H2およびVH3は、各々独立して、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの重鎖可変ドメイン配列のCDR-H1、CDR-H2およびCDR-H3を含む重鎖可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:303、305、311、313、319、321、327、329、335、337、343、345、351、353、359、361、367、369、375、377、383、385、391、393、399、401、407、409、415、417、423、425、431、433、439、441、447、449、455、457、463、465、471、473のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであり;VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:302、304、310、312、318、320、326、328、334、336、342、344、350、352、358、360、366、368、374、376、382、384、390、392、398、400、406、408、414、416、422、424、430、432、438、440、446、448、454、456、462、464、470、472のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインである。他の実施形態では、VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~271、275~277、488~496のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~253、257~259、479~487のいずれか1つに記載のア
ミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む。
特定の実施形態では、式Iのポリペプチド鎖または式IIのポリペプチド鎖におけるVH1およびVH2ドメインの順序、したがってVL1およびVL2ドメインの順序は、スワップされる(すなわち、順序を逆にする)。
一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:4のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:4のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:3のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:3のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:1のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:1のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:2のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:2のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:12のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:12のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:11のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:11のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:9のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:9のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:10のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:10のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:20のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:20のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:19のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:19のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:17のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:17のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:18のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:18のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:28のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:28のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:27のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:27のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:25のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:25のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:26のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:26のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:36のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:36のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:35のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:35のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:33のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:33のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:34のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:34のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:44のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:44のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:43のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:43のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:41のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:41のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:42のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:42のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:52のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:52のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:51のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:51のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:49のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:49のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:50のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:50のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:60のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:60のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:59のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:59のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:57のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:57のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:58のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:58のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:68のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:68のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:67のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:67のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:65のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:65のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:66のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:66のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:76のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:76のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:75のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:75のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:73のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:73のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:74のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:74のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:84のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:84のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:83のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:83のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペ
プチド鎖は、配列番号:81のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:81のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:82のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:82のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:92のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:92のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:91のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:91のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:89のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:89のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:90のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:90のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:100のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:100のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:99のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:99のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:97のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:97のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:98のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:98のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:108のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:108のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:107のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:107のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:105のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:105のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:106のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:106のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:116のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:116のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:115のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:115のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:113のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:113のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:114のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:114のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:124のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:124のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:123のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:123のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:121のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:121のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:122のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:122のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:132のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:132のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:131のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:131のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:129のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:129のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:130のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:130のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:140のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:140のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:139のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:139のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:137のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:137のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:138のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:138のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:148のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:148のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:147のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:147のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:145のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:145のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:146のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:146のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:156のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:156のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:155のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:155のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:153のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:153のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:154のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:154のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:164のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:164のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:163のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:163のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:161のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:161のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:162のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:162のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:172のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:172のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:171のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:171のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:169のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:16
9のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:170のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:170のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:180のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:180のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:179のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:179のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:177のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:177のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:178のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:178のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:188のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:188のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:187のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:187のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:185のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:185のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:186のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:186のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:196のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:196のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:195のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:195のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:193のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:193のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:194のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:194のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:204のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:204のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:203のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:203のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:201のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:201のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:202のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:202のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:212のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:212のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:211のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:211のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:209のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:209のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:210のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:210のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:220のアミノ酸配列を含む
か、または配列番号:220のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:219のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:219のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:217のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:217のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:218のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:218のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:228のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:228のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:227のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:227のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:225のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:225のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:226のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:226のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:235のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:235のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:234のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:234のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:232のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:232のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:233のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:233のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:243のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:243のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:242のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:242のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:240のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:240のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:241のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:241のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:305のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:305のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:304のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:304のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:302のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:302のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:303のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:303のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:313のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:313のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:312のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:312のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:310のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:310のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチ
ド鎖は、配列番号:311のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:311のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:321のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:321のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:320のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:320のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:318のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:318のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:319のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:319のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:329のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:329のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:328のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:328のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:326のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:326のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:327のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:327のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:337のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:337のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:336のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:336のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:334のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:334のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:335のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:335のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:345のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:345のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:344のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:344のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:342のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:342のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:343のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:343のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:353のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:353のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:352のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:352のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:350のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:350のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:351のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:351のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:361のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:361のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列
を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:360のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:360のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:358のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:358のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:359のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:359のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:369のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:369のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:368のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:368のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:366のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:366のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:367のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:367のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:377のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:377のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:376のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:376のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:374のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:374のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:375のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:375のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:385のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:385のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:384のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:384のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:382のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:382のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:383のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:383のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:393のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:393のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:392のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:392のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:390のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:390のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:391のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:391のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:401のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:401のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:400のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:400のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:398のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:398のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:399のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:399のアミノ酸
配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:409のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:409のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:408のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:408のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:406のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:406のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:407のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:407のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:417のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:417のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:416のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:416のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:414のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:414のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:415のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:415のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:425のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:425のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:424のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:424のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:422のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:422のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:423のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:423のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:433のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:433のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:432のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:432のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:430のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:430のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:431のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:431のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:441のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:441のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:440のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:440のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:438のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:438のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:439のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:439のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:449のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:449のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:448のアミノ酸配列を含むか、または配
列番号:448のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:446のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:446のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:447のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:447のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:457のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:457のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:456のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:456のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:454のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:454のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:455のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:455のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:465のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:465のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:464のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:464のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:462のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:462のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:463のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:463のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、配列番号:473のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:473のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号:472のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:472のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号:470のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:470のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号:471のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:471のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上の(例えば、3つの)HIV標的抗原に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を有し、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3(ホール) [II]
により表される構造を有し、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3(ノブ) [III]
により表される構造を有し、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を有し、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記三重特異性および/または三価結合タンパク質である。
他の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上の(例えば、3つの)HIV標的抗原に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を有し、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3(ノブ) [II]
により表される構造を有し、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3(ホール) [III]
により表される構造を有し、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を有し、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記三重特異性および/または三価結合タンパク質である。
三重特異性結合タンパク質のさらなる例
一部の実施形態では、VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521のいずれか1つに記載の配列と少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約8
3%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む可変ドメインである。
三重特異性結合タンパク質のさらなる例
一部の実施形態では、VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508のいずれか1つに記載の配列と少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、配列番号:518、519、および512に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含み、VH1、VH2、およびVH3は、配列番号:504、506、および502に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、配列番号:518、519、および513に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含み、VH1、VH2、およびVH3は、配列番号:504、506、および503に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、配列番号:519、518、および513に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含み、VH1、VH2、およびVH3は、配列番号:506、504、および503に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、表Cに示す軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、表Cに示す重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL2は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL3は、配列番号:512の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VH1は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH2は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含
む可変ドメインであり;VH3は、配列番号:502の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL2は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VH1は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH2は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VHは、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL2は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり、VH1は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH2は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、次のものを含む可変ドメインである;(a)配列番号:266、269、275、278、281、および500からなる群から選択される配列を含むCDR-L1;(b)配列番号:267、270、276、279、282、および501からなる群から選択される配列を含むCDR-L2;ならびに/または(c)配列番号:268、271、274、277、280、および283からなる群から選択される配列を含むCDR-L3。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、表Bに示すアミノ酸配列を含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、次のものを含む可変ドメインである:(a)配列番号:248、251、254、257、263、および499からなる群から選択される配列を含むCDR-H1;(b)配列番号:252、255、258、261、264、および497からなる群から選択される配列を含むCDR-H2;ならびに/または(c)配列番号:250、253、256、259、262、265、および498からなる群から選択される配列を含むCDR-H3。一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、表Bに示すアミノ酸配列を含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり、該CDR-H1、CDR
-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および251に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VL1は、配列番号:500、501、および274の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:275、276、および277の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:266、267、および268の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:254、255、および256の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:257、258、および259の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:248、497、および250の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:500、501、および274の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:275、276、および277の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269、270、および271の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:254、255、および256の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:257、258、および259の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251、252、および253の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:275、276、および277の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:500、501、および274の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269、270、および271の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:257、258、および259の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:254、255、および256の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251、252、および253の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。
1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質を標的にするさらなる三重特異性結合タンパク質
一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上の(例えば、1つまたは2つの)HIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上の(例えば、1つまたは2つの)T細胞標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I];
により表される構造を有し;
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II];
により表される構造を有し;
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III];
により表される構造を有し;
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV];
により表される構造を有し;
式中、
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、L、およびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記ポリペプチド鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上の(例えば、1つまたは2つの)HIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上の(例えば、1つまたは2つの)T細胞標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I];
により表される構造を有し;
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II];
により表される構造を有し;
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III];
により表される構造を有し;
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV];
により表される構造を有し;
式中、
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、L、およびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成
する、
前記ポリペプチド鎖を含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、2つの別個の抗原結合部位を形成する交差配向を有する。一部の実施形態では、VH1およびVL1は、結合対を形成し、第1の抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、VH2およびVL2は、結合対を形成し、第2の抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、第3のポリペプチドおよび第4のポリペプチドは、第3の抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、VH3およびVL3は、結合対を形成し、第3の抗原結合部位を形成する。
一部の実施形態では、VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524のいずれか1つに記載の配列と少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511のいずれか1つに記載の配列と少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、配列番号:522、524、および513に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含み、VH1、VH2、およびVH3は、配列番号:509、511、および503に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含む。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、配列番号:524、522、および513に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含み、VH1、VH2、およびVH3は、配列番号:511、509、および503に記載のアミノ酸配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および51
1からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1は、配列番号:522の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL2は、配列番号:524の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VH1は、配列番号:509の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH2は、配列番号:511の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:524の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL2は、配列番号:522の配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VL3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり;VH1は、配列番号:511の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH2は、配列番号:509の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり;VH3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、次のものを含む可変ドメインである;(a)配列番号:266、269、275、278、281、488、491、494、および500からなる群から選択される配列を含むCDR-L1;(b)配列番号:267、270、276、279、282、489、492、495、および501からなる群から選択される配列を含むCDR-L2;ならびに(c)配列番号:268、271、274、277、280、283、490、493、および496からなる群から選択される配列を含むCDR-L3。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、表Bに示すアミノ酸配列を含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1、VL2、およびVL3は、各々独立して、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む可変ドメインであり、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ;配列番号:488、489、および490に記載の配列をそれぞれ;配列番号:491、492、および493に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:494、495、および496に記載の配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、次のものを含む可変ドメインである:(a)配列番号:248、251、254、257、263、479、482、485、および499からなる群から選択される配列を含むCDR-H1;(b)配列番号:252、255、258、261、264、480、483、486、および497からなる群から選択される配列を含むCDR-H2;ならびに(c)配列番号:250、253、256、259、262、265、481、484、487、お
よび498からなる群から選択される配列を含むCDR-H3。一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、表Bに示すアミノ酸配列を含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインである。一部の実施形態では、VH1、VH2、およびVH3は、各々独立して、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む可変ドメインであり、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、配列番号:248、497、および251に記載の配列をそれぞれ;配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ;配列番号:479、480、および481に記載の配列をそれぞれ;配列番号:482、483、および484に記載の配列をそれぞれ;または配列番号:485、486、および487に記載の配列をそれぞれ含む。
一部の実施形態では、VL1は、配列番号:488、489、および490の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:494、495、および496の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269、270、および271の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:479、480、および481の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:485、486、および487の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251、252、および253の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。一部の実施形態では、VL1は、配列番号:494、495、および496の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL2は、配列番号:488、489、および490の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VL3は、配列番号:269、270、および271の配列をそれぞれ含むCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;VH1は、配列番号:485、486、および487の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH2は、配列番号:479、480、および481の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;VH3は、配列番号:251、252、および253の配列をそれぞれ含むCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。
一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD3の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD3の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD28またはC
D28_2の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD3の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD3の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD3の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD3の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD3の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD3の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD3の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの6つ
のCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD3の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。
一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD3の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の軽鎖および重鎖可変配列を含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。一部の実施形態では、VL1およびVH1は、本明細書に記載の抗体CD4BS「a」、CD4BS「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2指向性「a」、V1/V2指向性「b」、またはV3指向性のものの6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、VL2およびVH2は、本明細書に記載の抗体CD3またはCD28_2の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインであり、ならびにVL3およびVH3は、本明細書に記載の抗体CD28またはCD28_2の6つのCDRを含む軽鎖および重鎖可変ドメインである。
標的タンパク質
一実施形態では、結合タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質と特異的に結合する。一部の実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、HIV-1 gp41タンパク質のMPER、HIV-1 gp120タンパク質のCD4結合部位、HIV-1 gp120タンパク質のV3ループ内のグリカン、HIV-1 gp120タンパク質またはgp160の三量体突端部と特異的に結合する。他の実施形態では、結合タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質と、およびT細胞受容体複合体を含むT細胞上の1つまたはそれ以上の標的タンパク質と、特異的に結合する。これらのT細胞エンゲージャー結合タンパク質は、T細胞を標的細胞に一時的に動員することができ、同時に、T細胞の細胞溶解活性を活性化することができる。T細胞エンゲージャー三重特異性抗体は、HIV-1保有宿主を活性化するため、および潜伏感染HIV-1T細胞を溶解するようにT細胞に再指向する/T細胞を活性化するために、使用することができる。T細胞上の標的タンパク質の例としては、なかんずくCD3およびCD28が挙げられるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、2つまたはそれ以上の単一特異性抗体(親抗体)の抗原結合ドメインを1つの抗体に組み合わせることにより、三重特異性結合タンパク質を生成することができる。参照により本開示に組み入れられる、国際公開番号WO2011/038290 A2、WO2013/086533 A1、WO2013/070776 A1、WO2012/154312 A1、およびWO2013/163427 A1を参照されたい。本開示の結合タンパク質は、例えばヒト、マウスもしくはヒト化抗体を含む、任意のヒトもしくは非ヒト抗体から得られるまたはそれに由来するドメインまたは配列を使用して、製造することができる。
本開示の一部の実施形態では、三価結合タンパク質は、3つの異なる抗原標的に結合することができる。一実施形態では、結合タンパク質は、三重特異性であり、1つの軽鎖-重鎖対は、2つの異なる抗原標的またはエピトープに結合することができ、1つの軽鎖-重鎖対は、1つの抗原標的またはエピトープに結合することができる。別の実施形態では、結合タンパク質は、gp120およびgp41サブユニットで構成されているHIVエンベロープ糖タンパク質構造上に位置する3つの異なるHIV抗原標的に結合することができる。他の実施形態では、結合タンパク質は、抗原標的のうちの1つまたはそれ以上についての機能を阻害することができる。
一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に結合する。一部の実施形態では、結合タンパク質は、単一HIV標的タンパク質上の3つの異なるエピトープに特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、第1のHIV標的タンパク質上の2つの異なるエピトープ、および第2のHIV標的タンパク質上の1つのエピトープに結合することができる。一部の実施形態では、第1および第2のHIV標的タンパク質は異なる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、3つの異なるHIV標的タンパク質に特異的に結合することができる。一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質160のうちの1つまたはそれ以上である。
一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質に結合する。一部の実施形態では、結合タンパク質は、1つのHIV標的タンパク質および単一T細胞標的タンパク質上の2つの異なるエピトープに特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、1つのHIV標的タンパク質および2つの異なるT細胞標的タンパク質(例えば、CD28およびCD3)に特異的に結合することができる。一部の実施態様では、結合タンパク質は、1つのT細胞標的タンパク質および単一HIV標的タンパク質上の2つの異なるエピトープに特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質は、1つのT細胞標的タンパク質および2つの異なるHIV標的タンパク質に特異的に結合することができる。一部の実施形態では、結合タンパク質の第1および第2のポリペプチド鎖は、2つのT細胞標的タンパク質を特異的に標的にする2つの抗原結合部位を形成し、結合タンパク質の第3および第4のポリペプチド鎖は、HIV標的タンパク質に特異的に結合する抗原結合部位を形成する。一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質160のうちの1つまたはそれ以上である。一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質は、CD3およびCD28のうちの1つまたはそれ以上である。
リンカー
一部の実施形態では、リンカーL、L、L、およびLは、無アミノ酸(長さ=0)から約100アミノ酸長、または100、50、40、30、20もしくは15アミノ酸未満もしくはそれ以下の範囲である。リンカーは、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸長であってもよい。1つの結合タンパク質中のL、L、L、およびLは、すべてが同じアミノ酸配列を有してもよく、またはすべてが異なるアミノ酸配列を有してもよい。
適するリンカーの例としては、単一グリシン(Gly)残基;ジグリシンペプチド(Gly-Gly);トリペプチド(Gly-Gly-Gly);4つのグリシン残基を有するペプチド(Gly-Gly-Gly-Gly;配列番号:285);5つのグリシン残基を有するペプチド(Gly-Gly-Gly-Gly-Gly;配列番号:286);6つのグリシン残基を有するペプチド(Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly;配列番号:287);7つのグリシン残基を有するペプチド(Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly;配列番号:288);8つのグリシン残基を有するペプチド(Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly;配列番号:289)が挙げられる。アミノ酸残基の他の組合せ、例えば、ペプチドGly-Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:290)、ペプチドGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:291)およびペプチドGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:292)を使用してもよい。他の適するリンカーとしては、単一Ser、およびVal残基;ジペプチドArg
-Thr、Gln-Pro、Ser-Ser、Thr-Lys、およびSer-Leu;Thr-Lys-Gly-Pro-Ser(配列番号:293)、Thr-Val-Ala-Ala-Pro(配列番号:294)、Gln-Pro-Lys-Ala-Ala(配列番号:295);Gln-Arg-Ile-Glu-Gly(配列番号:296);Ala-Ser-Thr-Lys-Gly-Pro-Ser(配列番号:297)、Arg-Thr-Val-Ala-Ala-Pro-Ser(配列番号:298)、Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)、およびHis-Ile-Asp-Ser-Pro-Asn-Lys(配列番号:300)が挙げられる。上に列挙した例は、いかなる点でも本開示の範囲を制限することを意図したものではなく、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、トレオニン、リシン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、グルタミン、グリシン、およびプロリンからなる群から選択される無作為に選択されたアミノ酸を含むリンカーは、結合タンパク質において適していることが明らかになった。
リンカー中のアミノ酸残基の正体および配列は、そのリンカーにおいて達成することが必要な二次構造エレメントのタイプによって変わることがある。例えば、グリシン、セリンおよびアラニンは、最大の可動性を有するリンカーにとって最良である。グリシン、プロリン、トレオニンおよびセリンの一部の組合せは、より硬い、より伸長したリンカーが必要である場合に有用である。任意のアミノ酸残基を、所望の特性に依存して必要に応じてより大きいペプチドリンカーを構築するために他のアミノ酸残基と組み合わせて、リンカーと見なすことができる。
一部の実施形態では、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍である。一部の実施形態では、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍である。一部の実施形態では、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍であり、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍である。一部の実施形態では、Lは、長さが3~12アミノ酸残基であり、Lは、長さが3~14アミノ酸残基であり、Lは、長さが1~8アミノ酸残基であり、Lは、長さが1~3アミノ酸残基である。一部の実施形態では、Lは、長さが5~10アミノ酸残基であり、Lは、長さが5~8アミノ酸残基であり、Lは、長さが1~5アミノ酸残基であり、Lは、長さが1~2アミノ酸残基である。一部の実施形態では、Lは、長さが7アミノ酸残基であり、Lは、長さが5アミノ酸残基であり、Lは、長さが1アミノ酸残基であり、Lは、長さが2アミノ酸残基である。
一部の実施形態では、L、L、L、および/またはLは、配列Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む。一部の実施形態では、Lは、配列Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む。一部の実施形態では、Lは、配列Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む。
一部の実施形態では、L、L、L、および/またはLは、配列Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)を含む。一部の実施形態では、Lは、配列Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)を含む。一部の実施形態では、Lは、配列Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)を含み、Lは、配列Thr-Lys-Gly-Pro-Ser-Arg(配列番号:526)を含み、Lは、配列Serを含み、Lは、配列Arg-Thrを含む。一部の実施形態では、Lは、配列Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)を含む。一部の実施形態では、Lは、配列Serを含み、Lは、配列Arg-Thrを含み、Lは、配列Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)を含み、Lは、配列Thr-Lys-Gly-Pro-Ser-Arg(配列番号:
526)を含む。
Fc領域および定常ドメイン
一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、CH1に連結されたFc領域をさらに含む第2のポリペプチド鎖であって、該Fc領域が免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、前記第2のポリペプチド鎖を含む。一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、CH1に連結されたFc領域をさらに含む第3のポリペプチド鎖であって、該Fc領域が免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、前記第3のポリペプチド鎖を含む。一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、CH1に連結されたFc領域をさらに含む第2のポリペプチド鎖であって、該Fc領域が免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、前記第2のポリペプチド鎖と、CH1に連結されたFc領域をさらに含む第3のポリペプチド鎖であって、該Fc領域が免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、前記第3のポリペプチド鎖とを含む。
結合タンパク質の収量を向上させるために、一部の実施形態では、例えば国際公開番号WO96/027011、Ridgwayら、1996、Protein Eng.9:617~21;およびMerchantら、1998、Nat.Biotechnol.16:677~81にいくつかの例とともに詳細に記載されている、「ノブ・イントゥー・ホール」技術により、CH3ドメインを変化させることができる。具体的には、2つのCH3ドメインの相互作用面を、これら2つのCH3ドメインを含有する両方の重鎖のヘテロ二量体化を増加させるように変化させる。2つのCH3ドメイン(2本の重鎖の2つのCH3ドメイン)の各々が「ノブ」であることができるが、他方は「ホール」である。ジスルフィド架橋の導入は、ヘテロ二量体をさらに安定させ(Merchantら、1998;Atwellら、1997、J.Mol.Biol.270:26~35)、収量を増加させる。特定の実施形態では、ノブは、単一可変ドメインを有する第2のポリペプチド対上にある。他の実施形態では、ノブは、交差配向を有する第1のポリペプチド対上にある。さらに他の実施形態では、CH3ドメインは、ノブ・イン・ホールを含まない。
一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、第2のポリペプチド鎖上に「ノブ」変異を含み、第3のポリペプチド鎖上に「ホール」変異を含む。一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、第3のポリペプチド鎖上に「ノブ」変異を含み、第2のポリペプチド鎖上に「ホール」変異を含む。一部の実施形態では、「ノブ」変異は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置での置換を含む。一部の実施形態では、アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態では、「ホール」変異は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置での置換を含む。一部の実施形態では、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2
およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。
一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、血清半減期を改善するための1つまたはそれ以上の変異を含む(例えば、Hinton,P.R.ら(2006)J.Immunol.176(1):346~56を参照されたい)。一部の実施形態では、変異は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置での置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。一部の実施形態では、結合タンパク質は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含む第2のポリペプチド鎖であって、該第1のFc領域が免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、前記第2のポリペプチド鎖と、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含む第3のポリペプチド鎖であって、該第2のFc領域が免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、前記第3のポリペプチド鎖とを含み、前記第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである。一部の実施形態では、本開示の結合タンパク質は、ノブおよびホール変異と、血清半減期を改善するための1つまたはそれ以上の変異とを含む。
一部の実施形態では、本明細書に記載の三重特異性結合タンパク質のCH1、CH2、CH3、およびCは、結合タンパク質1~53のCH1、CH2、CH3、およびC配列のいずれかを含んでもよい。
核酸
標準的組換えDNA方法を使用して、結合タンパク質を形成するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを構築し、これらのポリヌクレオチドを組換え発現ベクターに組込み、そのようなベクターを宿主細胞に導入する。例えば、Sambrookら、2001、Molecular Cloning:A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Laboratory Press 、第3版)を参照されたい。酵素反応および精製技術を、製造業者の仕様に従って行ってもよく、当技術分野において一般に果たされているように行ってもよく、または本明細書に記載の通りに行ってもよい。特定の定義を提供しない限り、本明細書に記載の分析化学、合成有機化学、医化学および製薬化学に関連して用いられる命名法、ならびにそのような化学の実験手順および技術は、当技術分野において周知の、一般に使用されているものである。同様に、従来の技術を化学合成、化学分析、薬剤調合、製剤化、送達、および患者の処置に使用することができる。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の結合タンパク質のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子に関する。一部の実施形態では、単離された核酸は、結合タンパク質をコードする核酸配列の転写を指向するための異種プロモーターに動作可能に連結されている。プロモーターは、核酸の転写を指向する核酸制御配列を指すこともある。第1の核酸配列が第2の核酸配列と機能的関係に置かれている場合、該第1の核酸配列は、該第2の核酸配列に動作可能に連結されている。例えば、プロモーターがコード配列の転写または発現に影響を与える場合、該プロモーターは、結合タンパク質の該
コード配列に動作可能に連結されている。プロモーターの例としては、ウイルス(例えば、ポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルス(例えば、アデノウイルス2)、ウシパピローマウイルス、トリ肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、B型肝炎ウイルス、サルウイルス40(SV40)など)のゲノムから得られるプロモーター、異種真核生物プロモーター類からのプロモーター(例えば、アクチンプロモーター、免疫グロブリンプロモーター、熱ショックプロモーター類からのプロモーターなど)、CAG-プロモーター(Niwaら、Gene 108(2):193~9、1991)、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)プロモーター、テトラサイクリン誘導性プロモーター(Masuiら、Nucleic Acids Res.33:e43、2005)、lac系、trp系、tac系、trc系、ファージラムダの主要オペレーターおよびプロモーター領域、3-ホスホグリセリン酸キナーゼのプロモーター、酵母酸性ホスファターゼのプロモーター、および酵母アルファ接合因子のプロモーターを挙げることができるが、これらに限定されない。本開示の結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、構成的プロモーターの制御下にあってもよく、誘導性プロモーターの制御下にあってもよく、または本明細書に記載の任意の他の適するプロモーターの制御下にあってもよく、または当業者には容易に分かるであろう他の適するプロモーターの制御下にあってもよい。
一部の実施形態において、単離された核酸は、ベクターに組込まれる。一部の実施形態において、ベクターは、発現ベクターである。発現ベクターは、発現されることになるポリヌクレオチドに動作可能に連結された1つまたはそれ以上の調節配列を含むことができる。「調節配列」という用語は、プロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御エレメント(例えば、ポリアデニル化シグナル)を含む。適するエンハンサーの例としては、哺乳動物遺伝子からのエンハンサー配列(例えば、グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α-フェトプロテイン、インスリンなど)、および真核細胞ウイルスからのエンハンサー配列(例えば、複製起点の後期側(bp100~270)のSV40エンハンサー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後期側のポリオーマエンハンサー、アデノウイルスエンハンサーなど)を挙げることができるが、これらに限定されない。適するベクターの例としては、例えば、プラスミド、コスミド、エピソーム、トランスポゾン、およびウイルスベクター(例えば、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、シンドビスウイルス、麻疹、ヘルペスウイルス、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノ随伴ウイルスベクターなど)を挙げることができる。発現ベクターは、例えば細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞および哺乳動物細胞などの、宿主細胞へのトランスフェクションに使用することができる。宿主における発現および複製が可能な生物学的な機能を持つウイルスおよびプラスミドDNAベクターは当技術分野において公知であり、目的の任意の細胞へのトランスフェクションに使用することができる。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の結合タンパク質のいずれかの第1、第2、第3および第4のポリペプチド鎖をコードする1つまたはそれ以上のベクターを含むベクター系に関する。一部の実施形態では、ベクター系は、結合タンパク質の第1のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第2のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターと、結合タンパク質の第3のポリペプチド鎖をコードする第3のベクターと、結合タンパク質の第4のポリペプチド鎖をコードする第4のベクターとを含む。一部の実施形態では、ベクター系は、結合タンパク質の第1および第2のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第3および第4のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターとを含む。一部の実施形態では、ベクター系は、結合タンパク質の第1および第3のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第2および第4のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターとを含む。一部の実施形態では、ベクター系は、結合タンパク質の第1および第4のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第2および第3のポリペプチド鎖をコードする第2のベクタ
ーとを含む。一部の実施形態では、ベクター系は、結合タンパク質の第1、第2、第3および第4のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターを含む。ベクター系の1つまたはそれ以上のベクターは、本明細書に記載のベクターのいずれであってもよい。一部の実施形態では、1つまたはそれ以上のベクターは、発現ベクターである。
宿主細胞
本開示の他の態様は、本明細書に記載の1つまたはそれ以上の単離されたポリヌクレオチド、ベクターおよび/またはベクター系を含む、宿主細胞(例えば、単離された宿主細胞)に関する。一部の実施形態では、本開示の単離された宿主細胞は、in vitroで培養される。一部の実施形態では、宿主細胞は、細菌細胞(例えば、大腸菌(E.coli)細胞)である。一部の実施形態では、宿主細胞は、酵母細胞(例えば、出芽酵母(S.cerevisiae)細胞)である。一部の実施形態では、宿主細胞は、昆虫細胞である。昆虫宿主細胞の例としては、例えば、ショウジョウバエ(Dorosophila)細胞(例えば、S2細胞)、イラクサギンウワバ(Trichoplusia ni)細胞(例えば、High Five(商標)細胞)、およびツマジロクサヨトウ(Spodoptera frugiperda)細胞(例えば、Sf21またはSf9細胞)を挙げることができる。一部の実施形態では、宿主細胞は、哺乳動物細胞である。哺乳動物宿主細胞の例としては、例えば、ヒト胎児由来腎臓細胞(例えば、浮遊培養での増殖のためにサブクローニングされた293または293細胞)、Expi293(商標)細胞、CHO細胞、ベビーハムスター腎臓細胞(例えば、BHK、ATCC CCL 10)、マウスセルトリ細胞(例えば、TM4細胞)、サル腎臓細胞(例えば、CV1 ATCC CCL 70)、アフリカミドリザル腎臓細胞(例えば、VERO-76、ATCC
CRL-1587)、ヒト子宮頸癌細胞(例えば、HELA、ATCC CCL 2)、イヌ腎臓細胞(例えば、MDCK、ATCC CCL 34)、バッファローラット肝臓細胞(例えば、BRL 3A、ATCC CRL 1442)、ヒト肺細胞(例えば、W138、ATCC CCL 75)、ヒト肝臓細胞(例えば、Hep G2、HB 8065))、マウス乳房腫瘍細胞(例えば、MMT 060562、ATCC CCL51)、TRI細胞、MRC 5細胞、FS4細胞、ヒト肝細胞癌株(例えば、Hep G2)、および骨髄腫細胞(例えば、NS0およびSp2/0細胞)を挙げることができる。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の結合タンパク質のいずれかを産生する方法に関する。一部の実施形態では、方法は、a)単離された核酸、ベクター、および/またはベクター系(例えば、本明細書に記載の単離された核酸、ベクター、および/またはベクター系のいずれか)を含む宿主細胞(例えば、本明細書に記載の宿主細胞のいずれか)を、該宿主細胞が結合タンパク質を発現する条件下で培養する工程;およびb)前記結合タンパク質を前記宿主細胞から単離する工程を含む。タンパク質を発現する条件下で宿主細胞を培養する方法は、当業者に周知である。培養した宿主細胞からタンパク質を単離する方法は、例えば、アフィニティークロマトグラフィー(例えば、プロテインAアフィニティークロマトグラフィー、続いてサイズ排除クロマトグラフィーを含む、2工程アフィニティークロマトグラフィー)による方法を含めて、当業者に周知である。
結合タンパク質の使用
結合タンパク質は、1つまたはそれ以上の標的抗原の検出および定量のための競合結合アッセイ、直接的および間接的サンドイッチアッセイならびに免疫沈降アッセイなどの、任意の公知アッセイ方法において用いることができる。結合タンパク質は、用いられるアッセイ法にふさわしい親和性で1つまたはそれ以上の標的抗原に結合することになる。
診断応用のために、ある一定の実施形態では、結合タンパク質を検出可能な部分で標識することができる。検出可能な部分は、検出可能なシグナルを直接または間接的に生じさ
せることができる、いずれのものであってもよい。例えば、検出可能な部分は、放射性同位元素、例えば、H、14C、32P、35S、125I、99Tc、111In、もしくは67Ga;蛍光もしくは化学発光化合物、例えば、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、もしくはルシフェリン;または酵素、例えば、アルカリホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、もしくはホースラディッシュペルオキシダーゼであってもよい。
結合タンパク質は、in vivo撮像にも有用である。検出可能な部分で標識された結合タンパク質を動物に、例えば血流に投与し、その宿主における標識抗体の存在および位置をアッセイすることができる。結合タンパク質は、核磁気共鳴によろうと、X線検査によろうと、または当技術分野において公知の他の検出手段によろうと、動物において検出することができる任意の部分で、標識することができる。
本開示は、結合タンパク質と生体試料における標的抗原レベルの検出に有用な他の試薬とを含むキットにも関する。そのような試薬としては、検出可能な標識、ブロッキング血清、陽性および陰性対照試料、ならびに検出試薬を挙げることができる。一部の実施形態では、キットは、本明細書に記載の任意の結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、ベクター系および/または宿主細胞を含む、組成物を含む。一部の実施形態では、キットは、容器と、その容器上のまたはその容器に付随するラベルまたは添付文書とを含む。適する容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV溶液バッグなどが挙げられる。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの様々な材料から形成されたものであってよい。容器は、単独である組成物を保持するか、または状態(例えば、HIV感染症)の処置、予防および/もしくは診断に有効な別の組成物と組み合わせた組成物を保持し、滅菌取り出し口を有することができる(例えば、容器は、静脈内注射用溶液バッグであってもよく、または皮下注射針によって穴を開けることができるストッパーを有するバイアルであってもよい)。一部の実施形態では、ラベルまたは添付文書は、組成物が、選ばれた状態の予防、診断および/または処置に使用されることを示す。あるいは、または加えて、製造物品またはキットは、注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝食塩水、リンゲル溶液およびデキストロース溶液などの薬学的に許容される緩衝液を含む第2の(または第3の)容器をさらに含むことができる。それは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針およびシリンジをはじめとする、商業的観点および使用者の観点から望ましい他の材料をさらに含むことができる。
結合タンパク質を含む治療用組成物または医薬組成物は、本開示の範囲内である。そのような治療用組成物または医薬組成物は、投与方法との適合性のために選択される薬学的にまたは生理学的に許容される配合剤との混合物で、結合タンパク質または結合タンパク質・薬物複合体の治療有効量を含むことができる。
許容される配合材料は、用いられる投薬量および濃度でレシピエントに対して非毒性である。
医薬組成物は、例えば、該組成物のpH、モル浸透圧濃度、粘度、透明性、色、等張性、匂い、無菌性、安定性、溶解もしくは放出速度、吸収性または浸透性を、修飾する、維持する、または保つための配合材料を含有することができる。適する配合材料としては、アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、もしくはリシン)、抗菌剤、抗酸化剤(例えば、アスコルビン酸、亜硫酸ナトリウム、もしくは亜硫酸水素ナトリウム)、緩衝剤(例えば、ホウ酸塩、重炭酸塩、Tris-HCl、クエン酸塩、リン酸塩もしくは他の有機酸)、増量剤(例えば、マンニトールもしくはグリシン)、キレート剤(例えば、エチレンジアミン四酢酸(EDTA))、錯化剤(例えば、カフェイン、ポリビニルピロリドン、ベータ-シクロデキストリン、もしくはヒドロキシプロピ
ル-ベータ-シクロデキストリン)、充填剤、単糖類、二糖類、および他の炭水化物(例えば、グルコース、マンノース、もしくはデキストリン)、タンパク質(例えば、血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリン)、着色、着香および希釈剤、乳化剤、親水性ポリマー(例えば、ポリビニルピロリドン)、低分子量ポリペプチド、塩形成対イオン(例えば、ナトリウム)、保存薬(例えば、塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン、ソルビン酸、もしくは過酸化水素)、溶媒(例えば、グリセリン、プロピレングリコール、もしくはポリエチレングリコール)、糖アルコール(例えば、マンニトールもしくはソルビトール)、懸濁剤、界面活性剤もしくは湿潤剤(例えば、プルロニック;PEG;ソルビタンエステル;ポリソルベート、例えば、ポリソルベート20もしくはポリソルベート80;トリトン;トロメタミン;レシチン;コレステロールもしくはチロキサポール)、安定性向上剤(例えば、スクロースもしくはソルビトール)、浸透圧向上剤(例えば、ハロゲン化アルカリ金属-例えば、塩化ナトリウムもしくはカリウム-もしくはマンニトールソルビトール)、送達ビヒクル、希釈剤、賦形剤ならびに/または補助薬が挙げられるが、これらに限定されない(例えば、あらゆる目的で参照により本明細書に組み入れられている、REMINGTON’S PHARMACEUTICAL SCIENCES(第18版、A.R.Gennaro編、Mack Publishing Company 1990)、およびその後続版を参照されたい)。
最適な医薬組成物は、当業者により、例えば、所期の投与経路、送達フォーマット、および所望の投薬量に依存して決定されることになる。そのような組成物は、結合タンパク質の物理的状態、安定性、in vivo放出速度、およびin vivoクリアランス速度に影響を与ることができる。
医薬組成物における主要なビヒクルまたは担体は、本来、水性であってもよく、または非水性であってもよい。例えば、注射用の適するビヒクルまたは担体は、非経口投与用の組成物によく見られる他の材料がことによると補充されている、水、生理食塩溶液または人工脳脊髄液であってもよい。中性緩衝食塩水、または血清アルブミンと混合された食塩水は、さらなる例示的ビヒクルである。他の例示的医薬組成物は、約pH7.0~8.5のTris緩衝液、または約pH4.0~5.5の酢酸緩衝液を含み、これは、ソルビトールまたは適する代用品をさらに含むことができる。本開示の一実施形態では、結合タンパク質組成物は、所望の純度を有する選択された組成物を任意選択の配合剤と混合することにより、凍結乾燥ケーキまたは水溶液の形態で保管用に製造することができる。さらに、結合タンパク質は、スクロースなどの適切な賦形剤を使用して凍結乾燥物として製剤化することができる。
本開示の医薬組成物を非経口送達または皮下送達のために選択してもよい。あるいは、組成物を吸入、または経口でのような消化管経由の送達のために選択してもよい。そのような薬学的に許容される組成物の製造は、当技術分野の技能の範囲内である。
配合成分は、投与部位に許容される濃度で存在する。例えば、組成物を生理的pHで、またはそれよりわずかに低いpHで、概して約5~約8のpH範囲内で維持するために、緩衝剤が使用される。
非経口投与が企図される場合に使用するための治療用組成物は、薬学的に許容されるビヒクル中の所望の結合タンパク質を含む、発熱物質不含の非経口的に許容される水溶液の形態であることができる。非経口注射に特に適しているビヒクルは滅菌蒸留水であり、結合タンパク質は、該滅菌蒸留水中の滅菌、等張溶液として製剤化され、適切に保存される。さらの別の製法は、生成物の制御または持続放出をもたらし、したがって該生成物をデポー注射により送達することができる物質、例えば、注射用マイクロスフェア、生侵食性
粒子、高分子化合物(例えば、ポリ乳酸もしくはポリグリコール酸)、ビーズまたはリポソームを用いる、所望の分子の製剤化を含むことができる。ヒアルロン酸も使用することができ、これは、循環血中の期間の持続を促進する効果を有することができる。所望の分子の他の適する導入手段としては、埋め込み型薬物送達デバイスが挙げられる。
一実施形態では、医薬組成物を吸入用に製剤化することができる。例えば、結合タンパク質を吸入用のドライパウダーとして製剤化することができる。エアロゾル送達用の噴射剤を用いて、結合タンパク質吸入溶液を製剤化することもできる。さらに別の実施形態では、溶液を噴霧することができる。
ある一定の製剤を経口投与することができることも企図される。本開示の一実施形態では、この様式で投与される結合タンパク質を、錠剤およびカプセルなどの固体剤形の配合に通例使用される担体を用いて、または用いずに、製剤化することができる。例えば、バイオアベイラビリティーが最大となり、全身送達前の分解(pre-systemic
degradation)が最小となる胃腸管内での時点で製剤の活性部分を放出するように、カプセルを設計することができる。結合タンパク質の吸収を助長するためにさらなる物質を含めてもよい。希釈剤、香味料、低融点ワックス、植物油、滑沢剤、縣濁剤、錠剤崩壊剤、および結合剤も用いられることがある。
別の医薬組成物は、錠剤の製造に適している非毒性賦形剤との混合物中の結合タンパク質の有効量を含むことができる。滅菌水または別の適切なビヒクルに錠剤を溶解することにより、溶液を単位用量形態で製造することができる。適する賦形剤としては、不活性希釈剤、例えば、炭酸カルシウム、炭酸もしくは重炭酸ナトリウム、ラクトース、もしくはリン酸カルシウム;または結合剤、例えば、デンプン、ゼラチンもしくはアラビアゴム;または滑沢剤、例えば、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、もしくはタルクが挙げられるが、これらに限定されない。
本開示のさらなる医薬組成物は、持続送達または制御送達処方の結合タンパク質を含む製剤を含めて、当業者には明らかであるであろう。リポソーム担体、生侵食性微粒子または多孔性ビーズおよびデポー注射などの、様々な他の持続送達または制御送達手段を処方する技術も、当業者に公知である。持続放出製剤のさらなる例としては、造形品、例えばフィルムまたはマイクロカプセル、の形態の半透性ポリマーマトリックスが挙げられる。持続放出マトリックスは、ポリエステル、ヒドロゲル、ポリラクチド、L-グルタミン酸とL-グルタミン酸ガンマエチルエステルのコポリマー、ポリ(メタクリル酸2-ヒドロキシエチル)、エチレン酢酸ビニル、またはポリ-D(-)-3-ヒドロキシ酪酸を含むことができる。持続放出組成物は、リポソームも含むことができ、リポソームは、当技術分野において公知のいくつかの方法のいずれかにより製造することができる。
in vivoでの投与に使用されることになる医薬組成物は、概して、無菌でなければならない。これは、滅菌濾過膜による濾過によって果たすことができる。組成物を凍結乾燥させる場合、この方法を使用する滅菌を凍結乾燥および再構成の前に行ってもよく、または後に行ってもよい。非経口投与用の組成物は、凍結乾燥形態で、または溶液中で保管することができる。加えて、非経口組成物は一般に、滅菌取り出し口を有する容器、例えば、静脈内注射用の溶液バッグ、または皮下注射針によって穴を開けることができるストッパーを有するバイアルに入れられる。
医薬組成物を製剤化してしまえば、溶液、懸濁液、ゲル、エマルジョン、固体として、または脱水もしくは凍結乾燥された粉末として、滅菌バイアル内に保管することができる。そのような製剤を、すぐに使用できる形態で保管することができ、または投与前に再構成を必要とする(例えば、凍結乾燥された)形態で保管することもできる。
本開示は、単一用量投与単位を生成するためのキットも包含する。これらのキットは、各々が、乾燥されたタンパク質を有する第1の容器と水性製剤を有する第2の容器の両方を含有することができる。充填済みの1室および多室シリンジ(例えば、液剤用シリンジおよびリオシリンジ(lyosyringe))を含有するキットも、本開示の範囲内に含まれる。
治療に用いられることになる結合タンパク質医薬組成物の有効量は、例えば、治療の内容および目的に依存することになる。したがって、処置のための適切な投薬レベルが、送達される分子、結合タンパク質が使用されることになる適応症、投与経路、ならびに患者のサイズ(体重、体表、または臓器サイズ)および状態(年齢および総体的な健康)に一部は依存して変わることになることは、当業者には理解されるであろう。したがって、臨床医は、最適な治療効果が得られるように投薬の用量を設定し、投薬経路を変更することができる。
投薬頻度は、使用されることになる製剤中の結合タンパク質の薬物動態パラメータに依存することになる。概して、臨床医は、所望の効果を達成する投薬量に到達するまで組成物を投与することになる。したがって、組成物は、単一用量として投与されることもあり、ある期間にわたって2用量またはそれ以上(これらは、同量の所望の分子を含有してもよく、またはしなくてもよい)として投与されることもあり、または埋め込みデバイスもしくはカテーテルにより持続注入として投与されることもある。適切な投薬量のさらなる精密化は、当業者により常例的に行われ、彼らにより常例的に遂行される職務の範囲内である。適切な投薬量は、適切な用量反応データの使用により確認することができる。
医薬組成物の投与経路は、公知の方法と一致し、例えば、経口的にであるか;静脈内、腹腔内、脳内(実質内)、側脳室内、筋肉内、眼内、動脈内、門脈内もしくは病巣内経路による注射によるか;持続放出システムによるか;または埋め込みデバイスによる。所望される場合、組成物をボーラス注入により投与することができ、または注入によりもしくは埋め込みデバイスにより継続的に投与することができる。
所望の分子が吸着または封入された膜、スポンジまたは他の適切な材料の埋め込みにより、組成物を局所投与することもできる。埋め込みデバイスを使用する場合、デバイスを任意の適する組織もしくは臓器に埋め込むことができ、所望の分子の送達は、拡散によることもあり、時限放出ボーラスによることもあり、または連続投与によることもある。
医薬組成物は、HIV感染症を予防および/または処置するために使用することができる。医薬組成物は、単独療法として使用することができ、または標準的抗レトロウイルス療法と併用することができる。
一部の実施形態では、本開示は、患者におけるHIV感染症を予防および/または処置する方法に関する。一部の実施形態では、方法は、本明細書に記載の少なくとも1つの結合タンパク質の治療有効量を患者に投与する工程を含む。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質は、抗レトロウイルス療法(例えば、抗HIV療法)と併用で投与される。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質は、抗レトロウイルス療法の前に投与される。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質は、抗レトロウイルス療法と同時に投与される。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質は、抗レトロウイルス療法の後に投与される。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質は、当技術分野において公知の任意の標準的抗レトロウイルス療法と併用投与される。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質の投与は、1つまたはそれ以上のHIVビリオンの中和をもたらす。一部の実施形態では、少なくとも1
つの結合タンパク質の投与は、患者における1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性HIV感染細胞の排除をもたらす。一部の実施形態では、少なくとも1つの結合タンパク質の投与は、1つまたはそれ以上のHIVビリオンの中和をもたらし、患者における1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性HIV感染細胞の排除をもたらす。一部の実施形態では、患者はヒトである。
本開示を限定するものではないが、本開示の多数の実施形態を、説明のために下に記載する。
項目1:1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、前記結合タンパク質。
項目2:1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、前記結合タンパク質。
項目3:1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質60からなる群から選択される、項目1または項目2に記載の結合タンパク質。
項目4:三重特異性であり、単一HIV標的タンパク質上の3つの異なるエピトープに特異的に結合することができる、項目1または項目2に記載の結合タンパク質。
項目5:三重特異性であり、第1のHIV標的タンパク質上の2つの異なるエピトープおよび第2のHIV標的タンパク質上の1つのエピトープに特異的に結合することができ、該第1および第2のHIV標的タンパク質は異なるものである、項目1または項目2に記載の結合タンパク質。
項目6:三重特異性であり、3つの異なる抗原標的に特異的に結合することができる、項目1または項目2に記載の結合タンパク質。
項目7:1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質の機能を阻害することができる、項目1または項目2に記載の結合タンパク質。
項目8:VL1は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、
配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ
含む、項目1~7のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目9:VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む、項目1~7のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目10:VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目1~9のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目11:VL2は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、
配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ
含む、項目1~10のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目12:VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む、項目1~10のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目13:VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目1~12のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目14:VL3は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、
配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ
含む、項目1~13のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目15:VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む、項目1~13のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目16:VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、および521からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目1~15のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目17:VH1は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、
配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ
含む、項目1~16のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目18:VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、項目1~16のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目19:VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む、項目1~18のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目20:VH2は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、
配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ
含む、項目1~19のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目21:VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、項目1~19のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目22:VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む、項目1~21のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目23:VH3は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、
配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ
含む、項目1~22のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目24:VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、項目1~22のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目25:VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、および508からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む、項目1~2
4のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目26:VL1は、配列番号:500の配列を含むCDR-L1、配列番号:501の配列を含むCDR-L2、および配列番号:274の配列を含むCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:266の配列を含むCDR-L1、配列番号:267の配列を含むCDR-L2、および配列番号:268の配列を含むCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:254の配列を含むCDR-H1、配列番号:255の配列を含むCDR-H2、および配列番号:256の配列を含むCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:248の配列を含むCDR-H1、配列番号:497の配列を含むCDR-H2、および配列番号:250の配列を含むCDR-H3を含む、
項目1~25のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目27:VL1は、配列番号:518の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:519の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:512の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:504の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:506の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:502の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、
項目1~25のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目28:VL1は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L2は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L3は、配列番号:512の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
H1は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H2は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H3は、配列番号:502の配列を含む重鎖可変ドメインを含む、
項目1~27のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目29:VL1は、配列番号:500の配列を含むCDR-L1、配列番号:501の配列を含むCDR-L2、および配列番号:274の配列を含むCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:254の配列を含むCDR-H1、配列番号:255の配列を含むCDR-H2、および配列番号:256の配列を含むCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む、
項目1~25のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目30:VL1は、配列番号:518の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:519の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:504の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:506の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、
項目1~25のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目31:VL1は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L2は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
H1は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H2は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む、
項目1~25および29~30のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目32:VL1は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:500の配列を含むCDR-L1、配列番号:501の配列を含むCDR-L2、および配列番号:274の配列を含むCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:254の配列を含むCDR-H1、配列番号:255の配列を含むCDR-H2、および配列番号:256の配列を含むCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む、
項目1~25のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目33:VL1は、配列番号:519の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:518の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:506の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:504の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、
項目1~25のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目34:VL1は、配列番号:519の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L2は、配列番号:518の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
H1は、配列番号:506の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H2は、配列番号:504の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む、
項目1~25および32~33のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目35:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、項目1に記載の結合タンパク質。
項目36:第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、項目1に記載の結合タンパク質。
項目37:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目1に記載の結合タンパク質。
項目38:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目1に記載の結合タンパク質。
項目39:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;
該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN
434Sである、
項目1、37,および38のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目40:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目2に記載の結合タンパク質。
項目41:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目2に記載の結合タンパク質。
項目42:第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、項目2、40、および41のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目43:L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である、項目1または項目2に記載の結合タンパク質。
項目44:L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である、項目1または項目2に記載の結合タンパク質。
項目45:Lは、Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む、項目1~44のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目46:3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:2、4、10、12、18、20、26、28、34、36、42、44、50、52、58、60、66、68、74、76、82、84、90、92、98、100、106、108、114、116、122、124、130、132、138、140、146、148、154、156、162、164、170、172、178、180、186、188、194、196、202、204、210、212、218、220、226、228、233、235、241、243のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~283のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:1、3、9、11、17、10、25、27、33、35、41、43、49、51、57、59、65、67、73、75、81、83、89、91、97、99、105、107、113、115、121、123、129、131、137、139、145、147、153、155、161、163、169、171、177、179、185、187、193、195、201、203、209、211、217、219、225、227、232、234、240、242のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~265のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質。
項目47:3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:2、4、10、12、18、20、26、28、34、36、42、44、50、52、58、60、66、68、74、76、82、84、90、92、98、100、106、108、114、116、122、124、130、132、138、140、146、148、154、156、162、164、170、172、178、180、186、188、194、196、202、204、210、212、218、220、226、228、233、235、241、243のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~283のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:1、3、9、11、17、10、25、27、33、35、41、43、49、51、57、59、65、67、73、75、81、83、89、91、97、99、105、107、113、115、121、123、129、131、137、139、145、147、153、155、161、163、169、171、177、179、185、187、193、195、201、203、209、211、217、219、225、227、232、234、240、242のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~265のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質。
項目48:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、項目46に記載の結合タンパク質。
項目49:第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、項目46に記載の結合タンパク質。
項目50:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目46に記載の結合タンパク質。
項目51:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目46に記載の結合タンパク質。
項目52:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;
該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、
項目46、50、および51のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目53:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目47に記載の結合タンパク質。
項目54:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目47に記載の結合タンパク質。
項目55:第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、項目47、53、および54のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目56:L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である、項目46または項目47に記載の結合タンパク質。
項目57:L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である、項目46または項目47に記載の結合タンパク質。
項目58:Lは、Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む、項目46~57のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目59:第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖および第4のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって:
(a)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:4のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:4のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:3のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:3のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:1のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:1のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:2のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:2のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(b)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:12のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:12のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:11のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:11のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:9のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:9のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:10のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:10のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(c)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:20のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:20のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:19のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:19のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:17のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:17のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:18のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:18のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(d)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:28のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:28のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:27のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:27のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:25のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:25のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:26のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:26のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(e)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:36のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:36のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:35のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:35のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:33のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:33のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:34のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:34のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(f)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:44のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:44のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:43のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:43のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:41のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:41のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:42のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:42のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(g)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:52のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:52のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:51のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:51のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:49のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:49のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:50のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:50のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(h)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:60のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:60のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:59のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:59のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:57のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:57のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:58のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:58のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(i)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:68のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:68のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:67のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:67のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:65のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:65のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:66のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:66のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(j)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:76のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:76のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:75のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:75のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:73のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:73のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:74のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:74のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(k)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:84のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:84のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:83のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:83のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:81のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:81のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:82のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:82のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(l)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:92のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:92のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:91のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:91のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:89のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:89のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:90のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:90のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(m)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:100のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:100のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:99のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:99のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:97のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:97のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:98のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:98のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(n)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:108のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:108のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:107のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:107のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:105のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:105のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:106のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:106のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(o)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:116のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:116のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:115のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:115のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:113のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:113のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:114のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:114のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(p)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:124のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:124のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:123のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:123のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:121のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:121のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:122のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:122のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(q)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:132のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:132のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:131のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:131のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:129のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:129のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:130のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:130のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(r)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:140のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:140のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:139のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:139のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:137のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:137のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:138のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:138のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(s)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:148のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:148のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:147のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:147のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:145のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:145のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:146のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:146のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(t)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:156のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:156のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:155のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:155のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:153のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:153のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:154のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:154のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(u)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:164のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:164のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:163のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:163のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:161のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:161のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:162のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:162のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(v)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:172のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:172のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:171のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:171のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:169のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:169のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:170のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:170のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(w)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:180のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:180のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:179のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:179のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:177のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:177のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:178のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:178のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(x)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:188のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:188のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:187のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:187のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:185のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:185のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:186のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:186のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(y)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:196のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:196のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:195のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:195のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:193のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:193のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:194のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:194のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(z)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:204のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:204のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:203のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:203のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:201のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:201のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:202のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:202のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(aa)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:212のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:212のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:211のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:211のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:209のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:209のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:210のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:210のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(bb)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:220のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:220のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:219のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:219のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:217のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:217のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:218のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:218のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(cc)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:228のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:228のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:227のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:227のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:225のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:225のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:226のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:226のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(dd)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:235のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:235のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:234のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:234のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:232のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:232のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:233のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:233のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;または
(ee)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:243のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:243のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:242のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:242のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:240のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:240のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:241のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:241のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、
前記結合タンパク質。
項目60:1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み;
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み;
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み;
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み;
式中、
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記結合タンパク質。
項目61:1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み;
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み;
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み;
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み;
式中、
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成する、
前記結合タンパク質。
項目62:1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質160からなる群から選択される、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目63:1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質は、CD3またはCD28である、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目64:三重特異性であり、HIV標的タンパク質および単一T細胞標的タンパク質上の2つの異なるエピトープに特異的に結合することができる、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目65:三重特異性であり、HIV標的タンパク質および2つの異なるT細胞標的タンパク質に特異的に結合することができる、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目66:三重特異性であり、T細胞標的タンパク質および単一HIV標的タンパク質上の2つの異なるエピトープに特異的に結合することができる、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目67:三重特異性であり、T細胞標的タンパク質および2つの異なるHIV標的タンパク質に特異的に結合することができる、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目68:第1および第2のポリペプチド鎖は、2つのT細胞標的タンパク質を特異的に標的にする2つの抗原結合部位を形成し、第3および第4のポリペプチド鎖は、HIV
標的タンパク質に特異的に結合する抗原結合部位を形成する、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目69:VL1は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、
配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:488、489、および490に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:491、492、および493に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:494、495、および496に記載の配列をそれぞれ
含む、項目60~68のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目70:VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む、項目60~68のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目71:VL1は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目60~70のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目72:VL2は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、
配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:488、489、および490に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:491、492、および493に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:494、495、および496に記載の配列をそれぞれ
含む、項目60~71のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目73:VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む、項目60~71のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目74:VL2は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目60~73のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目75:VL3は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、該C
DR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3は、
配列番号:266、267、および268に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:269、270、および271に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:500、501、および274に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:275、276、および277に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:281、282、および283に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:278、279、および280に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:488、489、および490に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:491、492、および493に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:494、495、および496に記載の配列をそれぞれ
含む、項目60~74のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目76:VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む、項目60~74のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目77:VL3は、配列番号:512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、および524からなる群から選択される配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目60~76のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目78:VH1は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、
配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:479、480、および481に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:482、483、および484に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:485、486、および487に記載の配列をそれぞれ
含む、項目60~77のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目79:VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、項目60~77のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目80:VH1は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む、項目60~79のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目81:VH2は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、
配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:479、480、および481に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:482、483、および484に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:485、486、および487に記載の配列をそれぞれ
含む、項目60~80のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目82:VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、項目60~80のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目83:VH2は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む、項目60~82のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目84:VH3は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、該CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3は、
配列番号:248、497、および250に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:251、252、および253に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および256に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:254、255、および498に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:257、258、および259に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:263、264、および265に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:499、261、および262に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:479、480、および481に記載の配列をそれぞれ;
配列番号:482、483、および484に記載の配列をそれぞれ;または
配列番号:485、486、および487に記載の配列をそれぞれ
含む、項目60~83のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目85:VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、項目60~83のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目86:VH3は、配列番号:502、503、504、505、506、507、508、509、510、および511からなる群から選択される配列を含む重鎖可変ドメインを含む、項目60~85のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目87:VL1は、配列番号:488の配列を含むCDR-L1、配列番号:489の配列を含むCDR-L2、および配列番号:490の配列を含むCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:479の配列を含むCDR-H1、配列番号:480の配列を含むCDR-H2、および配列番号:481の配列を含むCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含
むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む、
項目60~86のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目88:VL1は、配列番号:522の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:524の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:509の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:511の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、
項目60~86のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目89:VL1は、配列番号:522の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L2は、配列番号:524の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
H1は、配列番号:509の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H2は、配列番号:511の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む、
項目60~88のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目90:VL1は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:488の配列を含むCDR-L1、配列番号:489の配列を含むCDR-L2、および配列番号:490の配列を含むCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:269の配列を含むCDR-L1、配列番号:270の配列を含むCDR-L2、および配列番号:271の配列を含むCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:479の配列を含むCDR-H1、配列番号:480の配列を含むCDR-H2、および配列番号:481の配列を含むCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:251の配列を含むCDR-H1、配列番号:252の配列を含むCDR-H2、および配列番号:253の配列を含むCDR-H3を含む、
項目60~86のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目91:VL1は、配列番号:524の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L2は、配列番号:522の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
L3は、配列番号:513の軽鎖可変ドメイン配列を含む軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;
H1は、配列番号:511の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H2は、配列番号:509の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR
-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み;
H3は、配列番号:503の重鎖可変ドメイン配列を含む重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む、
項目60~86のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目92:VL1は、配列番号:524の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L2は、配列番号:522の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
L3は、配列番号:513の配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;
H1は、配列番号:511の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H2は、配列番号:509の配列を含む重鎖可変ドメインを含み;
H3は、配列番号:503の配列を含む重鎖可変ドメインを含む、
項目60~86および90~91のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目93:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、項目60に記載の結合タンパク質。
項目94:第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、項目60に記載の結合タンパク質。
項目95:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目60に記載の結合タンパク質。
項目96:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目60に記載の結合タンパク質。
項目97:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖
定常ドメインを含み;
該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、
項目60、95、および96のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目98:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目61に記載の結合タンパク質。
項目99:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目61に記載の結合タンパク質。
項目100:第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、項目61、98、および99のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目101:L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目102:L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である、項目60または項目61に記載の結合タンパク質。
項目103:Lは、Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)である、項目60~102のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目104:3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:303、305、311、313、319、321、327、329、335、337、343、345、351、353、359、361、367、369、375、377、383、385、391、393、399、401、407、409、415、417、423、425、431、433、439、441、447、449、455、457、463、465、471、473のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~271、275~277、488~496のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:302、304、310、312、318、320、326、328、334、336、342、344、350、352、358、360、366、368、374、376、382、384、390、392、398、400、406、408、414、416、422、424、430、432、438、440、446、448、454、456、462、464、470、472のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~253、257~259、479~487のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質。
項目105:3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
式中:
L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLは、アミノ酸リンカーであり;
ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し;
ここで:
(a)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:303、305、311、313、319、321、327、329、335、337、343、345、351、353、359、361、367、369、375、377、383、385、391、393、399、401、407、409、415、417、423、425、431、433、439、441、447、449、455、457、463、465、471、473のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VL1、VL2およびVL3は、各々独立して、配列番号:266~271、275~277、488~496のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの軽鎖相補性決定領域を含み;
ここで:
(a)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:302、304、310、312、318、320、326、328、334、336、342、344、350、352、358、360、366、368、374、376、382、384、390、392、398、400、406、408、414、416、422、424、430、432、438、440、446、448、454、456、462、464、470、472のいずれか1つに記載のアミノ酸配列に由来する可変ドメインであるか;または
(b)VH1、VH2およびVH3は、各々独立して、配列番号:248~253、257~259、479~487のいずれか1つに記載のアミノ酸配列を含む可変ドメインの重鎖相補性決定領域を含む、
前記結合タンパク質。
項目106:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常領域を含む、項目104に記載の結合タンパク質。
項目107:第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結されたFc領域をさらに含み、該Fc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、項目104に記載の結合タンパク質。
項目108:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グ
ロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目104に記載の結合タンパク質。
項目109:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第1のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、該第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目104に記載の結合タンパク質。
項目110:第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、該第1のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、
第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、該第2のFc領域は、免疫グロブリンヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;
該第1および第2のFc領域は、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、
項目104、108、および109のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目111:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、
項目105に記載の結合タンパク質。
項目112:第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
項目105に記載の結合タンパク質。
項目113:第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、項目105、111、および112のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目114:L、L、L、またはLのうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である、項目104または項目105に記載の結合タンパク質。
項目115:L、L、L、またはLは、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である、項目104または項目105に記載の結合タンパク質。
項目116:Lは、Gly-Gln-Pro-Lys-Ala-Ala-Pro(配列番号:299)である、項目104~115のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目117:第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖および第4のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって:
(a)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:305のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:305のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:304のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:304のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:302のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:302のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:303のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:303のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(b)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:313のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:313のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:312のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:312のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:310のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:310のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:311のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:311のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(c)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:321のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:321のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:320のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:320のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:318のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:318のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:319のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:319のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(d)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:329のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:329のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:328のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:328のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:326のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:326のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:327のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:327のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(e)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:337のアミノ酸配列を含むか、または配
列番号:337のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:336のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:336のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:334のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:334のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:335のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:335のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(f)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:345のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:345のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:344のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:344のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:342のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:342のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:343のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:343のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(g)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:353のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:353のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:352のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:352のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:350のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:350のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:351のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:351のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(h)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:361のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:361のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:360のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:360のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:358のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:358のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:359のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:359のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(i)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:369のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:369のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:368のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:368のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:366のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:366のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:367のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:367のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(j)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:377のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:377のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:376のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:376のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:374のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:374のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:375のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:375のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(k)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:385のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:385のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:384のアミノ酸配列を含むか、または配
列番号:384のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:382のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:382のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:383のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:383のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(l)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:393のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:393のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:392のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:392のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:390のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:390のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:391のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:391のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(m)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:401のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:401のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:400のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:400のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:398のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:398のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:399のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:399のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(n)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:409のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:409のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:408のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:408のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:406のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:406のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:407のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:407のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(p)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:417のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:417のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:416のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:416のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:414のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:414のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:415のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:415のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(q)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:425のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:425のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:424のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:424のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:422のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:422のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:423のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:423のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(r)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:433のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:433のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:432のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:432のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:430のアミノ酸配列を含むか、または配
列番号:430のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:431のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:431のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(s)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:441のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:441のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:440のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:440のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:438のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:438のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:439のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:439のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(t)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:449のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:449のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:448のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:448のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:446のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:446のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:447のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:447のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(u)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:457のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:457のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:456のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:456のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:454のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:454のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:455のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:455のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;
(v)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:465のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:465のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:464のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:464のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:462のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:462のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:463のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:463のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む;または
(w)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:473のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:473のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチド鎖は、配列番号:472のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:472のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチド鎖は、配列番号:470のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:470のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み;
第4のポリペプチド鎖は、配列番号:471のアミノ酸配列を含むか、または配列番号:471のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、
前記結合タンパク質。
項目118:項目1~117のいずれか1項目に記載の結合タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
項目119:項目118に記載の核酸分子を含む発現ベクター。
項目120:項目118に記載の核酸分子を含む、単離された宿主細胞。
項目121:項目119に記載の発現ベクターを含む、単離された宿主細胞。
項目122:哺乳動物細胞または昆虫細胞である、項目120または項目121に記載の単離された宿主細胞。
項目123:項目1~117のいずれか1項目に記載の結合タンパク質の第1、第2、第3、および第4のポリペプチド鎖をコードする1つまたはそれ以上のベクターを含むベクター系。
項目124:結合タンパク質の第1のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第2のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターと、結合タンパク質の第3のポリペプチド鎖をコードする第3のベクターと、結合タンパク質の第4のポリペプチド鎖をコードする第4のベクターとを含む、項目123に記載のベクター系。
項目125:結合タンパク質の第1および第2のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第3および第4のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターとを含む、項目123に記載のベクター系。
項目126:1つまたはそれ以上のベクターは、発現ベクターである、項目123~125のいずれか1項目に記載のベクター系。
項目127:項目123~126のいずれか1項目に記載のベクター系を含む、単離された宿主細胞。
項目128:哺乳動物細胞または昆虫細胞である、項目127に記載の単離された宿主細胞。
項目129:結合タンパク質を産生する方法であって:
a)項目120~122および項目127~128のいずれか1項目に記載の宿主細胞を、該宿主細胞が該結合タンパク質を発現するような条件下で培養する工程;および
b)該結合タンパク質を該宿主細胞から単離する工程
を含む前記方法。
項目130:患者におけるHIV感染症を予防および/または処置する方法であって、項目1~117のいずれか1項目に記載の少なくとも1つの結合タンパク質の治療有効量を該患者に投与する工程を含む前記方法。
項目131:結合タンパク質は、標準的抗レトロウイルス療法と併用投与される、項目130に記載の方法。
項目132:少なくとも1つの結合タンパク質の投与は、1つまたはそれ以上のHIVビリオンの中和をもたらす、項目130または項目131に記載の方法。
項目133:少なくとも1つの結合タンパク質の投与は、患者における1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性HIV感染細胞の排除をもたらす、項目130~132のいずれか1項目に記載の方法。
項目134:患者はヒトである、項目130~133のいずれか1項目に記載の方法。
項目135:患者におけるHIV感染症の予防または処置のための、項目1~117のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目136:標準的抗レトロウイルス療法と併用投与される、項目135に記載の結合タンパク質。
項目137:患者における1つまたはそれ以上のHIVビリオンの中和を引き起こす、項目135または項目136に記載の結合タンパク質。
項目138:患者における1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性HIV感染細胞の排除を引き起こす、項目135~137のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
項目139:患者はヒトである、項目135~138のいずれか1項目に記載の結合タンパク質。
下記の実施例は、本開示の特定の実施形態およびそれらの様々な使用の説明に役立つものである。これらの実施例は単に説明のために示すものであり、いかなる点においても本発明の範囲を制限するものと見なすべきではない。
HIV-1 Env糖タンパク質を標的にする三重特異性結合タンパク質の産生
HIV-1エンベロープ糖タンパク質(Env/gp160)は、ウイルス粒子の表面に位置し、非共有結合で連結された膜貫通gp41とgp120の3つの複合体を含むホモ三量体で構成されている。Envは、HIVの主受容体(CD4)および共受容体(CCR5またはCXCR4)へのgp120の結合により標的細胞へのウイルス侵入、続いて、gp41の立体構造変化による助長されるウイルス/細胞膜融合の誘導を可能にし、その結果、ウイルスカプシドの侵入およびウイルスゲノムの宿主細胞への送達が起こる。加えて、Envは、感染細胞の表面で発現される。
Envは、HIV-1ビリオン上の中和抗体の唯一の標的としての役割を果たす。ウイルスEnvへの中和抗体の結合は、ウイルスの付着/侵入を阻害する。さらに、HIV-1に感染したEnv発現細胞への中和抗体の結合は、抗体依存性細胞介在性細胞傷害(ADCC)および補体依存性細胞傷害(CDC)によるそれらの破壊につながり、その結果、潜伏ウイルス保有宿主が低減される。したがって、Envを標的にする中和抗体は、魅力的な抗ウイルス療法開発分野である。しかし、HIV-1ウイルスの高い配列多様性および変異率のため、Envを標的にする中和抗体の開発は困難を伴うと判明した。所与のHIV-1株には所与の中和抗体のエピトープがない尤度が高いか、または所与のHIV-1株は、変異を進化させて前記抗体に対して耐性になっている尤度が高いからである。HIV-1を標的にする新規中和抗体を開発する場合、ウイルス株のブレイクスルーを軽減するための戦略を開発しなければならない。ここに記載の研究は、HIV Env糖タンパク質上の3つの異なるエピトープに特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチドを含む新規三重特異性結合タンパク質の開発、およびHIV-1を中和する際のこれらの新規三重特異性結合タンパク質の使用を探究するものである。
方法
結合タンパク質の産生および精製
三重特異性結合タンパク質を発現するベクターを、設計した重鎖および軽鎖遺伝子を哺
乳動物発現ベクターに挿入することにより構築した。対応する重鎖および軽鎖対合が自発的に起こり、Fc領域に工学的に作製したノブ・イン・ホール変異によりヘテロ二量体形成が促進された。
結合タンパク質をExpi293細胞において4つの発現プラスミドの共トランスフェクションにより産生した(Life Technologies、Expi293(商標)Expression System Kit、カタログ番号A14635)。2工程精製スキームを使用して結合タンパク質を精製した。先ず、結合タンパク質をプロテインAアフィニティークロマトグラフィー樹脂に捕捉し、洗浄し、次いでグリシン中、pH3.0で溶離した。次いで、溶離したタンパク質をPBSで透析し、濃縮し、濾過した。濾過した抗体を、Superdex 200 SECカラムを使用してさらに精製して、単量体結合タンパク質を得た。
結合タンパク質の親和性測定
抗HIV三重特異性結合タンパク質の結合親和性を、Biacore3000計器(GE Healthcare)を使用して表面プラズモン共鳴(SPR)により測定した。使用したアッセイ用緩衝液は、HBS-EP(GE Healthcare)であった。
Biacore計器を使用して表面プラズモン共鳴(SPR)分析により、上述のタンパク質についてのHIV-1タンパク質gp41上のMPER結合部位に対する親和性を、次のように測定した:結合タンパク質を、先ず、抗ヒトFc抗体と結合したCM5チップに捕捉し、その後、それに様々な濃度(100nM~6.25nM)のMPER結合ペプチド(アセチル-RRRNEQELLELDKWASLWNWFDITNWLWYIRRR-Ttds-Lys-(ビオチン)-NH)(配列番号:284)を毎分30μLで流し、Biacore 3000を用いる25℃で240秒間の会合および300秒間の解離の測定により結合を検出した。泳動用緩衝液はもちろん、HBS-EP緩衝液も試料希釈に使用した。3M MgClを用いて30μL毎分でチップの再生を行った。データ分析にはBIAevaluationソフトウェアv.4.1(GE Healthcare)を使用した。物質移動を伴う1:1ラングミュアモデルを使用してデータのグローバルフィッティングを行った。ソフトウェアベースの曲線フィッティング後、MPER結合ペプチドの各濃度での結合および解離速度を算出し、それを使用して各結合タンパク質についての結合親和性を得た。
HIV-1タンパク質gp120上のCD4BS結合部位に対する上述のタンパク質の親和性をSPRにより次のように測定した:組換えHIV-1 gp120(Thr27-Arg498)タンパク質(HIV-1/クレードB/C(CN54)、ARCO Biosystems(カタログ番号GP4-V15227))をCM5チップに捕捉し、その後、それに様々な濃度(100nM~6.25nM)の結合タンパク質を流し、Biacore 3000を用いる25℃で240秒間の会合および300秒間の解離の測定により結合を検出した。泳動用緩衝液はもちろん、HBS-EP緩衝液も試料希釈に使用した。3M MgClを用いて30μL毎分でチップの再生を行った。データ分析にはBIAevaluationソフトウェアv.4.1(GE Healthcare)を使用した。物質移動を伴う1:1ラングミュアモデルを使用してデータのグローバルフィッティングを行った。ソフトウェアベースの曲線フィッティング後、結合タンパク質の各濃度での結合および解離速度を算出し、それを使用して各結合タンパク質についての結合親和性を得た。
立体構造安定性および凝集アッセイ
三重特異性結合タンパク質の立体構造安定性を、融点Tおよび凝集開始温度(Tagg)を決定することにより評定した。
融点Tの測定は、示差走査蛍光定量法(DSF)により行った。試料を白色セミスカート96ウェルプレート(BIORAD)においてD-PBS緩衝液(Invitrogen)で希釈して、D-PBS中のSYPRO-Orange染色剤(Invitrogen、DMSO中の5000Xストック)の4×濃度溶液を含む0.2μg/μLの最終濃度にした。すべての測定は、MyiQ2リアルタイムPCR計器(BIORAD)を使用して2回ずつ行った。融解曲線の負の一次導関数曲線(-d(RFU)/dT)をiQ5ソフトウェアv2.1(BIORAD)で生成した。次いで、T決定およびグラフ表示のためにデータをExcelにエクスポートした。
融点Tおよび凝集開始温度(Tagg)を、Unit計器(Unchained Labs)を使用して静的光散乱(SLS)によっても測定した。各試料9μLを未希釈でマルチキュベットアレイに投入した。次いで、試料を0.3℃/分の加熱速度で20℃から95℃に加熱した。トリプトファン蛍光スペクトルの重心平均(BCM)を使用して、タンパク質融解曲線を測定し、T値を決定した。266nm静的光散乱(SLS)シグナルを使用して、凝集曲線を測定し、Tagg値を決定した。Unit分析ソフトウェアv2.1を使用してデータ分析を行った。
結果
HIV-1に対する中和抗体効力を向上させ、その上、それに付随して、高い配列多様性および/またはウイルス変異に起因するウイルスブレイクスルーの尤度を制限する、新規戦略を開発した。この戦略は、HIV Env糖タンパク質上の3つの異なるエピトープに特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチドを含む三重特異性結合タンパク質(図1)の生成を含む。各抗原結合部位は、Env糖タンパク質上の別個のエピトープを標的にする異なるHIV-1中和抗体からのVおよびVドメインを含んだ。三重特異性結合タンパク質は、2つの別個の抗原結合部位を形成する交差配向を有する二重可変ドメイン(CODV Igフォーマットと呼ぶ)を有する第1のポリペプチド対と、第3の抗原結合部位を形成する単一可変ドメインを各ペプチドが有する第2のポリペプチド対とを含有した(図1Aおよび1B)。
第1のポリペプチド対(これらのペプチドは、二重可変ドメインを有した)は、構造VL2-リンカー-VL1-リンカー-免疫グロブリン軽鎖定常ドメインを有する第1のポリペプチドと、構造VH1-リンカー-VH2-リンカー-免疫グロブリンCH1、ヒンジ、CH2およびCH3重鎖定常ドメインを有する第2のポリペプチドを含み、その結果、2つの別個の抗原結合部位:VH1-VL1およびVH2-VL2を形成する交差配向を有するポリペプチド対となった(図1Cおよび1D、軽鎖および重鎖Bを参照されたい)。第2のポリペプチド対(これらのペプチドは、各々、単一可変ドメインを有した)は、構造VH3-免疫グロブリンCH1、ヒンジ、CH2およびCH3重鎖定常ドメインを有する第1のポリペプチドと、構造VL3-免疫グロブリン軽鎖定常ドメインを有する第2のポリペプチドとを含み、その結果、第3の抗原結合部位:VH3-VL3を形成するポリペプチド対となった(図1Cおよび1D、軽鎖および重鎖Aを参照されたい)。加えて、LS変異を含むように三重特異性結合タンパク質を構築した。さらに、重鎖のヘテロ二量体化を助長するために1つの結合タンパク質中の一方のCH3ドメインがノブ変異を含み、他方のCH3ドメインがホール変異を含むように、三重特異性結合タンパク質を構築した(図1)。
三価結合タンパク質設計の上記手法を使用して、3つの三重特異性結合タンパク質(結合タンパク質2、3および24)を生成した。これらの三重特異性結合タンパク質は、HIV-1 Env糖タンパク質上の3つの別個のエピトープを標的にする次の抗体から単離したVおよびVドメインを三重特異性結合タンパク質フレームワーク上にグラフト
することにより作出した:MPER Ab(gp41上のMPERエピトープを標的にする)、CD4BS Ab「b」(gp120上のCD4結合部位を標的にする)、およびV1/V2指向性Ab「a」(gp120上のV1/V2ドメインを標的にする)。結合タンパク質2は、第1のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、2つの抗原結合部位を形成した)が、HIV-1 Env糖タンパク質エピトープMPERおよびV1/V2を標的にし、第2のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、単一抗原部位を形成した)が、HIV-1 Env糖タンパク質エピトープCD4BSを標的にするように、構築した(結合タンパク質2=MPER×V1/V2/CD4BS)。結合タンパク質3は、第1のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、2つの抗原結合部位を形成した)が、HIV-1 Env糖タンパク質エピトープV1/V2およびMPERを標的にし、第2のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、単一抗原部位を形成した)が、HIV-1
Env糖タンパク質エピトープCD4BSを標的にするように、構築した(結合タンパク質3=V1/V2×MPER/CD4BS)。結合タンパク質24は、第1のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、2つの抗原結合部位を形成した)が、HIV-1 Env糖タンパク質エピトープV1/V2およびCD4BSを標的にし、第2のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、単一抗原結合部位を形成した)が、HIV-1 Env糖タンパク質エピトープMPERを標的にするように、構築した(結合タンパク質24=V1/V2×CD4BS/MPER)。3つの三重特異性結合タンパク質、およびそれらの親抗体を、プロテインA親和性樹脂(図2Aおよび3A)、続いてサイズ排除クロマトグラフィー(図2Bおよび3B)で精製して、さらなる特性解明に適する単量体タンパク質を得た。3つすべての三重特異性結合タンパク質は、安定しており、高頻度で単量体を形成した。
異なるHIV-1 Envタンパク質エピトープ(3つではなく)2つを標的にする結合タンパク質の開発の可能性を試験するために、三重特異性結合タンパク質の作出に使用したのと同じ親抗体からの2つの異なるVおよびVドメインを使用して、上記CODV Igフォーマット(WO2012/135345を参照されたい)に基づいて二重特異性結合タンパク質を設計した。しかし、これらの特異的可変ドメインを有する二重特異性結合タンパク質は、単量体ほど十分に精製しなかったが、対応する三重特異性結合タンパク質と比較して凝集形成の有意な増加を示した(図4Aおよび4B)。
次に、精製した三重特異性タンパク質(およびそれらの親抗体)についてのpg41およびgp120上のHIV-1 Env糖タンパク質エピトープに対する結合親和性を測定した。先ず、MPER結合エピトープを使用してBiacoreアッセイによりgp41に対する結合親和性を、3つの三重特異性結合タンパク質、および親MPER抗体について測定した(図5)。MPER抗体についての結合親和性を18.7nMであると算定した。驚くべきことに、3つの三重特異性結合タンパク質すべては、MPER結合ペプチドに対して親抗体が有するより高い親和性を有し(表3)、結合タンパク質2はMPER抗体よりおおよそ3.1倍高い親和性を有した(それぞれ、6.05nM対18.7nM)。
Figure 0007328267000001
同様に、gp120上のCD4結合部位に対する結合親和性をBiacoreアッセイにより3つの三重特異性結合タンパク質、および親CD4BS抗体について測定した(図6)。3つの三重特異性結合タンパク質すべては、親抗体と比較したとき、CD4結合部位に対して同様の親和性を有した(表4)。
Figure 0007328267000002
このように、三重特異性結合タンパク質は、HIV-1 Env糖タンパク質上の被験標的エピトープの両方に結合することができた(表5)。さらに、3つすべての三重特異性結合タンパク質は、それらの親抗体の親和性とほぼ同等の親和性で、またはそれらの親抗体の親和性を超える親和性で、標的エピトープに結合した。V1/V2指向性Ab「a」の結合親和性、ならびに3つの三重特異性結合タンパク質2、3および24中のV1/V2指向性Ab「a」結合部位の結合親和性は、Biacore分析により決定することができなかった。これには、入手できない特異的gp120タンパク質抗原が必要であったからであった。
Figure 0007328267000003
三重特異性結合タンパク質および親抗体について生物物理学的特性を試験した(表6)。被験タンパク質のすべては、同様の安定性および限定された凝集体形成傾向を有した。
Figure 0007328267000004
これらの実験は、HIV-1 Env糖タンパク質上の3つの別個のエピトープを標的にする安定した単量体三重特異性結合タンパク質を構築することができ、効率的に精製することができることを示した。さらに、三重特異性結合タンパク質は、それらの標的エピトープに結合するそれらの能力を保持し、それらの親抗体と比べて同様のまたは向上した親和性を有した。最後に、三重特異性結合タンパク質は、適する生物物理学的特性を有し、対応する二重特異性結合タンパク質より有意に低い凝集を示した。
結合タンパク質の特性解明
適切な生物物理学的特性および結合能力を有する3つの三重特異性結合タンパク質(実施例1に記載の通り)の開発に成功したことから、21のさらなる三重特異性結合タンパク質を開発し、試験した。ここに記載の実験は、HIV-1をin vitroで中和する24の三重特異性結合タンパク質の能力、および多数のこれらの三重特異性結合タンパク質のin vivoでの薬物動態特性を探究するものであった。
Envシュードタイプウイルスを用いる1ラウンドの感染後、HIV-1 Tat調節ホタルルシフェラーゼ(Luc)レポーター遺伝子発現の低下の関数として中和を測定するTZM-blアッセイを使用して、中和アッセイを行った。このアッセイは、Marcella Sarzotti-Kelsoeら、J.Immunological Methods、409:131~146(2014)に記載の通りに行った。様々な抗体の中和結果を表8~10に示す。
方法
Envシュードタイプウイルスの産生
Envシュードタイプウイルスのアッセイ用ストックを、293T/17細胞において次の2つのプラスミドでの共トランスフェクションにより産生した:Env発現プラスミド、およびEnvを除く全HIV-1ゲノムを発現するプラスミド。これらのプラスミドの共トランスフェクションは、標的細胞にTat遺伝子を送達することができる感染性シュードウイルス粒子を産生するが、これらのシュードウイルスでの感染自体は、感染性ウイルス子孫を産生することができなかった。
ウイルス中和アッセイ
TZM-bl細胞(別名JC53BL-13細胞)を使用するHIV感染の中和を以前に記載された通りに行った(Marcella Sarzotti-Kelsoeら、J.Immunological Methods、409:131~146(2014)
)。簡単に言うと、EnvシュードタイプHIV-1ビリオンを使用する1ラウンドの感染をTZM-bl細胞(CXCR-4陽性ヒーラ細胞クローン)において行った。CD4およびCCR5を発現し、HIV末端反復配列制御下のホタルルシフェラーゼおよび大腸菌β-ガラクトシダーゼの統合レポーター遺伝子を含有するように、TZM-bl細胞を工学的に操作した。レポーター遺伝子発現を1サイクル感染直後にウイルスTatタンパク質(シュードタイプウイルスにより供給される)によりトランスで誘導した。ルシフェラーゼ活性を相対発光単位(RLU)として定量した。ルシフェラーゼ活性は、最初の接種材料中に存在した感染性ウイルス粒子の数に広い値範囲にわたって正比例した。様々な濃度の上述の結合タンパク質の投与後にTat調節ホタルルシフェラーゼ(Luc)レポーター遺伝子発現減少の関数として中和を測定した。中和力価は、RLUが、バックグラウンドRLUの減算後、ウイルス対照ウェルと比較して80%低下した時点での、タンパク質希釈度として同定した。高い処理能力のためにアッセイを96ウェルプレートで行い、研究全体にわたっての均一性のために十分に特性が解明された参照株を用いる。
薬物動態(PK)測定
体重3~6kgの雌インドアカゲザルを体重に従って無作為に群(1群当りアカゲザル2匹)に割り当て、上述の濃度の結合タンパク質をそれらに静脈内注射した。0日目の注射前、ならびに注射の30分、6時間、1日、2日、4日、7日、14日、21日および28日後に、動物から血液を採取した。採取した血液からの血漿において、RSC3ベースのELISAアッセイを使用して、各結合タンパク質の血清濃度を定量した。
結果
3つの別個のHIV-1 Env糖タンパク質エピトープを標的にする21のさらなる三重特異性結合タンパク質を実施例1に記載の通りに生成し、精製した。これら21のさらなる三重特異性結合タンパク質(結合タンパク質1および4~23)は、HIV-1 Env糖タンパク質上の別個のエピトープを標的にする次の抗体から単離したVおよびVドメインを三重特異性結合タンパク質フレームワーク上にグラフトすることにより作出した:抗MPER抗体MPER Ab「a」およびMPER Ab「b」(gp41上のMPERエピトープを標的にする)、抗CD4BS抗体CD4BS Ab「a」およびCD4BS Ab「b」(gp120上のCD4結合部位を標的にする)、抗V1/V2抗体V1/V2指向性Ab「a」およびV1/V2指向性Ab「b」(gp120上のV1/V2ドメインを標的にする)、ならびに抗V3抗体V3指向性Ab(gp120上のV3ループを標的にする)(表7)。
Figure 0007328267000005
様々な濃度の三重特異性結合タンパク質のうちの5つ(およびそれらの親抗体)についての208の異なるHIV-1 Envシュードタイプウイルスのパネルに対するウイルス中和能力を試験した(表8)。TZM-blルシフェラーゼレポーター遺伝子アッセイを使用して、シュードタイプHIV-1分離株の結合タンパク質媒介中和を測定した。各結合タンパク質についての阻害用量を、感染後の発光の80%低下を引き起こす希釈度(IC80)として、各シュードタイプウイルスについて算出した。驚くべきことに、被験三重特異性結合タンパク質の各々について算出したIC80幾何平均は、親抗体より低かった。これは、これらの三重特異性結合タンパク質が、それらの親中和抗体よりシュードタイプHIV-1を中和する点で強力であったことを示唆する。
Figure 0007328267000006
次に、様々な濃度の三重特異性結合タンパク質(およびそれらの親抗体)のより大きいパネルについての、10の異なるHIV-1クレードを代表する20のシュードタイプウイルスに対するウイルス中和能力を試験した(表9)。三重特異性結合タンパク質は、これら20のウイルスによる感染に対して頑強な防護を提供した(表10)。
Figure 0007328267000007
Figure 0007328267000008
最後に、三重特異性結合タンパク質および親抗体のサブセットについての薬物動態(PK)をアカゲザルにおいて試験した。簡単に言うと、タンパク質10または20mg/kgを雌アカゲザルに静脈内注射し、注射前に採取した血液試料からの血漿を用いて、および注射後(42日まで)の多数の時点で採取した血液試料からの血漿を用いて、ELISAアッセイを行った(図7)。三重特異性結合タンパク質のすべてをIV投与の少なくとも14日後に検出することができ、結合タンパク質1は、注射の少なくとも35日後に依然として検出可能であった。これは、結合タンパク質がin vivoで安定していたことを示す。
考え合わせると、このデータは、HIV-1 Env糖タンパク質上の3つの別個のエピトープを標的にする広域中和性三重特異性結合タンパク質を構築することができたことを示唆した。これらの結合タンパク質は、親中和抗体と比較して同様のまたは増加した力
価/はるかに向上した中和能力(広域性)を示した。さらに、これらの三重特異性結合タンパク質は、in vivoで良好な耐容性を示すように見えた。理論によって拘束されることを望むものではないが、HIV上の複数のエピトープを標的にする広域中和性三重特異性結合タンパク質の開発は、単一特異性または二重特異性抗体と比べて向上した抗ウイルス療法を可能にすることができる。HIVウイルス粒子は、単一特異性または二重特異性中和抗体上のそれぞれ単一または二重抗原結合部位より、中和性三重特異性結合タンパク質上の3つすべての抗原結合部位に耐性を示す可能性が低いからである。
T細胞エンゲージャーの特性解明
上で述べたように、Envは、HIV感染細胞の表面で発現される。このため、Envは、感染細胞を同定するための、ならびに潜伏ウイルス保有宿主の低減をもたらす抗体依存性細胞介在性細胞傷害(ADCC)および補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導するための、抗体標的として作用することができる。ここに記載の研究は、3つの異なる抗原(HIV-1 Env糖タンパク質、CD3およびCD28)を標的にする3つの抗原結合部位を含有する新規三重特異性結合タンパク質(「T細胞エンゲージャー」と名付けた)の開発を探究するものである。これらの新規タンパク質は、中和抗体からの抗原結合部位を含むばかりでなく、エフェクターT細胞に結合して、それらを感染標的細胞のすぐ近くに持って行き、かくてHIV感染細胞溶解を誘導する能力も有する。
方法
T細胞エンゲージャーの結合特性
ホースラディッシュペルオキシダーゼ標識抗Fabプローブを使用して、ELISAアッセイによりT細胞エンゲージャーの結合特性を測定して、gp120のCD3、CD28または表面再構成安定化コア3(RSC3)タンパク質でコーティングされたELISAプレートの表面へのT細胞エンゲージャー結合を検出した。Cambridge Biologics、MA、USAからのヒトCD3ge-hIgG4(KIH)(カタログ番号:03-01-0051);Cambridge Biologics、MA、USAからのヒトCD28-hIgG4(カタログ番号:03-01-0303)。
T細胞活性化アッセイ
CD4およびCD8 T細胞活性化を次のように測定した:磁気ビーズ(Miltenyi Biotec)を使用して、ナイーブドナー(NIH血液バンク)から得たバフィーコートから抹消血単核細胞(PBMC)を濃縮した。これらの細胞を、漸増濃度(0.01~1.0μg/mL)の結合タンパク質とブレフェルジンAの存在下で14~16時間、未感染またはHIV-1感染CEM細胞とともに共培養した。次いで、細胞をT細胞マーカー(CD3、CD4およびCD8)ならびに活性化マーカー(CD25およびCD69)の表面発現について染色し、その後、蛍光標識抗体(BD Biosciences、eBiosciences、Biolegend)を使用してサイトカイン(IFN-γ、TNF-α、およびIL-2)について細胞内染色した。LSRIIフローサイトメーターに試料を流し、Flowjoソフトウェア(Treeestar)でデータを分析することにより、各サイトカインまたは活性化マーカーを発現するCD4およびCD8
T細胞の数を決定した。
CD3ダウンレギュレーション
T細胞エンゲージャーによるT細胞活性化後のCD3ダウンレギュレーションを非競合マウス抗ヒトCD3抗体での活性化PBMCの染色により測定し、フローサイトメトリーを使用して定量した。
細胞傷害性アッセイ
CEM-BaL、ACH2、およびJ1.1細胞に対するT細胞エンゲージャーの細胞傷害性をフローサイトメトリーにより次のようにモニターした:潜伏ウイルス株(ACH2、J1.1、OM10)をNIH AIDS Reagent Programから得た。TNF-α(10ng/mL)の存在または非存在下で14~16時間、これらの細胞の培養することにより、これらの細胞の活性化を行った。アロフィコシアニン標識抗HIV Env抗体(2G12)を使用してフローサイトメトリーにより細胞表面HIVエンベロープ糖タンパク質の発現を判定することによって、活性化を測定した。CEM-IIIb、ACH2、J1.1およびOM10細胞を膜染色剤PKH-26(Sigma)で標識し、細胞傷害性アッセイにおいて標的細胞として使用した。これらの標識標的細胞をエフェクター細胞としての濃縮ヒトT細胞とともに10:1のE:T比で14~16時間、漸増量の結合タンパク質の存在下で共培養した。生/死細胞マーカー(Life technologies)での染色、そしてLSRIIフローサイトメーターに試料を流すことによる標識標的細胞集団中の死細胞数の測定、その後のFlowjoソフトウェア(Treestar)を使用する分析により、標的細胞における細胞溶解度を決定した。
結果
T細胞表面タンパク質とHIV-1上の中和エピトープの両方を標的にする抗原結合部位を有するT細胞エンゲージャーを開発する可能性を探った。2つの異なるT細胞表面受容体(CD3およびCD28)を標的にする2つの抗原結合部位と、HIV-1 Env糖タンパク質を標的にする第3の抗原結合部位とを含有する、T細胞エンゲージャーを構築した(図8Aおよび8B)。加えて、LS変異を含むようにT細胞エンゲージャーを構築した。さらに、重鎖のヘテロ二量体化を助長するために1つの結合タンパク質中の一方のCH3ドメインがノブ変異を含み、他方のCH3ドメインがホール変異を含むように、T細胞エンゲージャーを構築した(図8Aおよび8B)。
この手法を使用して、T細胞表面タンパク質とHIV-1 Env糖タンパク質(結合タンパク質32とCD3×CD28/CD4BS「b」Ab)の両方を標的にする2つのT細胞エンゲージャーを構築した。これら2つのT細胞エンゲージャーは、T細胞表面タンパク質CD3およびCD28を標的にする親抗体ならびに抗HIV-1抗体CD4BS
Ab「b」(gp120のCD4結合部位を標的にする)から単離したVおよびVドメインを三重特異性結合タンパク質フレームワーク上にグラフトすることにより作出した。結合タンパク質32は、第1のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、2つの抗原結合部位を形成した)が、T細胞表面受容体CD28およびCD3を標的にし、第2のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、単一抗原結合部位を形成した)が、HIV-1抗原CD4BSを標的にするように、構築した(結合タンパク質32=CD28×CD3/CD4BS)。CD3×CD28/CD4BS「b」Ab三重特異性結合タンパク質は、第1のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、2つの抗原結合部位を形成した)が、T細胞表面受容体CD3およびCD28を標的にし、第2のポリペプチド対(これらのポリペプチドは、単一抗原部結合位を形成した)が、HIV-1抗原CD4BSを標的にするように、構築した(表11)。
Figure 0007328267000009
2つのT細胞エンゲージャーの、それらの3つの標的抗原の各々に結合する能力を、ELISAアッセイにより試験した。T細胞エンゲージャーは、T細胞エンゲージャーの二重特異性アームにおけるいずれかの配向のCD3およびCD28抗原結合部位(すなわち、CD3×CD28/CD4BS Ab「b」についてはCD3×CD28、または結合タンパク質32についてはCD28×CD3)を用いて、CD3 T細胞表面タンパク質とCD28 T細胞表面タンパク質の両方に結合することができた。両方のT細胞エンゲージャーは、(V1、V2およびV3可変領域を欠くgp120変異体であるHIV-1
RSC3タンパク質を使用して測定して)gp120にも結合することができた(図9)。
次に、T細胞活性に対する効果を両方のT細胞エンゲージャーについて試験した。単球とT細胞エンゲージャーのインキュベーションは、T細胞エンゲージャーが頑強なCD8T細胞活性化を誘導することを明示した(図10)。同様に、T細胞エンゲージャーは、単独でのPBMCに関して、またはHIV-1感染T細胞株CEM-NKr細胞もしくはCEM-BaL細胞のいずれかとともにインキュベートしたPBMCに関して、有意なCD4T細胞活性化を誘導することができた(図11)。加えて、両方のT細胞エンゲージャーは、活性化T細胞上のCD3の細胞表面発現を低下させた(図12)。
最後に、HIV感染細胞の溶解を誘導するT細胞エンゲージャーの能力を試験した。T細胞エンゲージャー(ならびにCD3およびHIV抗原を標的にする陽性および陰性対照二重特異性結合タンパク質)をHIV-1感染T細胞株CEM-BaL細胞とともにインキュベートした。感染細胞とT細胞エンゲージャーのインキュベーションは、広範な濃度にわたって頑強な細胞溶解を誘導した(図13A)。同様に、これらのT細胞エンゲージャーのインキュベーションは、潜伏感染T細胞株ACH2細胞(図13B)、およびJ1.1細胞(図13C)の溶解を誘導した。驚くべきことに、T細胞エンゲージャーは、二重特異性結合タンパク質と比較したとき、慢性および潜伏HIV感染細胞株に対して匹敵するまたはそれより良好な細胞傷害活性を示した。
考え合わせると、本明細書に記載の新規T細胞エンゲージャーは、HIV感染細胞上のHIV-1 Env糖タンパク質gp120上のそれらの標的抗原に結合する、ならびに細胞表面に露出しているT細胞タンパク質CD3およびCD28とに結合する、それらの親抗体からの能力を保持した。T細胞エンゲージャーは、頑強なCD4およびCD8T細胞活性化を誘導し、CD3表面発現を減少させた。最後に、これらのT細胞エンゲージャーは、HIV-1感染T細胞の有意な溶解を誘導した。理論によって拘束されることを望むものではないが、これらのT細胞エンゲージャーは、HIV/AIDS患者においてT細胞エンゲージメントにより潜伏ウイルス保有宿主を低減/排除することによる、抗ウイルス療法の新規戦略を提供することができる。
本開示は、様々な実施形態を含むが、当然のことながら、変形形態および修飾形態が当
業者の心に浮かぶであろう。したがって、添付の特許請求の範囲は、本開示の範囲に入るそのような等価の変形形態すべてを包含することを意図したものである。加えて、本明細書で使用されている節の見出しは、単に構成のためのものであり、記載の主題を限定すると見なすべきでない。
本明細書に記載の各実施形態は、相反する明確な指示がない限り、任意の他の単数の実施形態または複数の実施形態と組み合わせることができる。詳細には、好ましいまたは有利であると示されている任意の特徴または実施形態は、相反する明確な指示がない限り、好ましいまたは有利であると示されている任意の他の単数の特徴もしくは複数の特徴または単数の実施形態もしくは複数の実施形態と組み合わせることができる。
本願において引用したすべての参照文献は、参照により本明細書に明確に組み入れられている。
配列
Figure 0007328267000010
Figure 0007328267000011
Figure 0007328267000012
Figure 0007328267000013
Figure 0007328267000014
Figure 0007328267000015
Figure 0007328267000016
Figure 0007328267000017
Figure 0007328267000018
Figure 0007328267000019
Figure 0007328267000020
Figure 0007328267000021
Figure 0007328267000022
Figure 0007328267000023
Figure 0007328267000024
Figure 0007328267000025
Figure 0007328267000026
Figure 0007328267000027
Figure 0007328267000028
Figure 0007328267000029
Figure 0007328267000030
Figure 0007328267000031
Figure 0007328267000032
Figure 0007328267000033
Figure 0007328267000034
Figure 0007328267000035
Figure 0007328267000036
Figure 0007328267000037
Figure 0007328267000038
Figure 0007328267000039
Figure 0007328267000040
Figure 0007328267000041
Figure 0007328267000042
Figure 0007328267000043
Figure 0007328267000044
Figure 0007328267000045
Figure 0007328267000046
Figure 0007328267000047
Figure 0007328267000048
Figure 0007328267000049
Figure 0007328267000050
Figure 0007328267000051
Figure 0007328267000052
Figure 0007328267000053
Figure 0007328267000054
Figure 0007328267000055
Figure 0007328267000056
Figure 0007328267000057
Figure 0007328267000058
Figure 0007328267000059
Figure 0007328267000060
Figure 0007328267000061
Figure 0007328267000062
Figure 0007328267000063
Figure 0007328267000064
Figure 0007328267000065
Figure 0007328267000066
Figure 0007328267000067
Figure 0007328267000068
Figure 0007328267000069
Figure 0007328267000070
Figure 0007328267000071
Figure 0007328267000072
Figure 0007328267000073
Figure 0007328267000074
Figure 0007328267000075
Figure 0007328267000076
Figure 0007328267000077
Figure 0007328267000078
Figure 0007328267000079
Figure 0007328267000080
Figure 0007328267000081
Figure 0007328267000082
Figure 0007328267000083
Figure 0007328267000084
Figure 0007328267000085
Figure 0007328267000086
Figure 0007328267000087
Figure 0007328267000088
Figure 0007328267000089
Figure 0007328267000090
Figure 0007328267000091
Figure 0007328267000092
Figure 0007328267000093
Figure 0007328267000094
Figure 0007328267000095
Figure 0007328267000096
Figure 0007328267000097
Figure 0007328267000098
Figure 0007328267000099
Figure 0007328267000100
Figure 0007328267000101
Figure 0007328267000102
Figure 0007328267000103
Figure 0007328267000104
Figure 0007328267000105
Figure 0007328267000106
Figure 0007328267000107
Figure 0007328267000108
Figure 0007328267000109
Figure 0007328267000110
Figure 0007328267000111
Figure 0007328267000112
Figure 0007328267000113
Figure 0007328267000114
Figure 0007328267000115
Figure 0007328267000116
Figure 0007328267000117
Figure 0007328267000118
Figure 0007328267000119
Figure 0007328267000120
Figure 0007328267000121
Figure 0007328267000122
Figure 0007328267000123
Figure 0007328267000124
Figure 0007328267000125
Figure 0007328267000126
Figure 0007328267000127
Figure 0007328267000128
Figure 0007328267000129
Figure 0007328267000130
Figure 0007328267000131
Figure 0007328267000132
Figure 0007328267000133
Figure 0007328267000134
Figure 0007328267000135
Figure 0007328267000136
Figure 0007328267000137
Figure 0007328267000138
Figure 0007328267000139
Figure 0007328267000140
Figure 0007328267000141
Figure 0007328267000142
Figure 0007328267000143
Figure 0007328267000144
Figure 0007328267000145
Figure 0007328267000146
Figure 0007328267000147
Figure 0007328267000148
Figure 0007328267000149
Figure 0007328267000150
Figure 0007328267000151
Figure 0007328267000152

Claims (19)

  1. 1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合部位を形成する4本のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって、
    第1のポリペプチド鎖は、式:
    L2-L1-VL1-L2-CL [I]
    により表される構造を含み、
    第2のポリペプチド鎖は、式:
    H1-L3-VH2-L4-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
    により表される構造を含み、
    第3のポリペプチド鎖は、式:
    H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
    により表される構造を含み、
    第4のポリペプチド鎖は、式:
    L3-CL [IV]
    により表される構造を含み、
    式中:
    L1は、第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
    L2は、第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
    L3は、第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
    H1は、第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
    H2は、第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
    H3は、第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
    Lは、免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
    H1は、免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
    H2は、免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
    H3は、免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
    ヒンジは、CH1ドメインとCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
    1、L2、L3およびL4は、アミノ酸リンカーであり;
    ここで、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、交差軽鎖-重鎖対を形成し、ここで、
    (a)V L1 は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
    L2 は、配列番号:488の配列を含むCDR-L1、配列番号:489の配列を含むCDR-L2、および配列番号:490の配列を含むCDR-L3を含み;
    L3 は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
    H1 は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
    H2 は、配列番号:479の配列を含むCDR-H1、配列番号:480の配列を含むCDR-H2、および配列番号:481の配列を含むCDR-H3を含み;
    H3 は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含む;
    (b)V L1 は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
    L2 は、配列番号:491の配列を含むCDR-L1、配列番号:492の配列を含むCDR-L2、および配列番号:493の配列を含むCDR-L3を含み;
    L3 は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
    H1 は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
    H2 は、配列番号:482の配列を含むCDR-H1、配列番号:483の配列を含むCDR-H2、および配列番号:484の配列を含むCDR-H3を含み;
    H3 は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含む;
    (c)V L1 は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
    L2 は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
    L3 は、配列番号:488の配列を含むCDR-L1、配列番号:489の配列を含むCDR-L2、および配列番号:490の配列を含むCDR-L3を含み;
    H1 は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
    H2 は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;
    H3 は、配列番号:479の配列を含むCDR-H1、配列番号:480の配列を含むCDR-H2、および配列番号:481の配列を含むCDR-H3を含む;
    (d)V L1 は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
    L2 は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
    L3 は、配列番号:488の配列を含むCDR-L1、配列番号:489の配列を含むCDR-L2、および配列番号:490の配列を含むCDR-L3を含み;
    H1 は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;
    H2 は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
    H3 は、配列番号:479の配列を含むCDR-H1、配列番号:480の配列を含むCDR-H2、および配列番号:481の配列を含むCDR-H3を含む;
    (e)V L1 は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
    L2 は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
    L3 は、配列番号:491の配列を含むCDR-L1、配列番号:492の配列を含むCDR-L2、および配列番号:493の配列を含むCDR-L3を含み;
    H1 は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
    H2 は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;
    H3 は、配列番号:482の配列を含むCDR-H1、配列番号:483の配列を含むCDR-H2、および配列番号:484の配列を含むCDR-H3を含む;または
    (f)V L1 は、配列番号:275の配列を含むCDR-L1、配列番号:276の配列を含むCDR-L2、および配列番号:277の配列を含むCDR-L3を含み;
    L2 は、配列番号:494の配列を含むCDR-L1、配列番号:495の配列を含むCDR-L2、および配列番号:496の配列を含むCDR-L3を含み;
    L3 は、配列番号:491の配列を含むCDR-L1、配列番号:492の配列を含むCDR-L2、および配列番号:493の配列を含むCDR-L3を含み;
    H1 は、配列番号:257の配列を含むCDR-H1、配列番号:258の配列を含むCDR-H2、および配列番号:259の配列を含むCDR-H3を含み;
    H2 は、配列番号:485の配列を含むCDR-H1、配列番号:486の配列を含むCDR-H2、および配列番号:487の配列を含むCDR-H3を含み;
    H3 は、配列番号:482の配列を含むCDR-H1、配列番号:483の配列を含むCDR-H2、および配列番号:484の配列を含むCDR-H3を含む、
    前記結合タンパク質。
  2. (a)V L1 は、配列番号:524の配列を含み;
    L2 は、配列番号:522の配列を含み;
    L3 は、配列番号:519の配列を含み;
    H1 は、配列番号:511の配列を含み;
    H2 は、配列番号:509の配列を含み;
    H3 は、配列番号:506の配列を含む;
    (b)V L1 は、配列番号:524の配列を含み;
    L2 は、配列番号:523の配列を含み;
    L3 は、配列番号:519の配列を含み;
    H1 は、配列番号:510の配列を含み;
    H2 は、配列番号:509の配列を含み;
    H3 は、配列番号:506の配列を含む;
    (c)V L1 は、配列番号:524の配列を含み;
    L2 は、配列番号:519の配列を含み;
    L3 は、配列番号:522の配列を含み;
    H1 は、配列番号:511の配列を含み;
    H2 は、配列番号:506の配列を含み;
    H3 は、配列番号:509の配列を含む;
    (d)V L1 は、配列番号:519の配列を含み;
    L2 は、配列番号:524の配列を含み;
    L3 は、配列番号:522の配列を含み;
    H1 は、配列番号:506の配列を含み;
    H2 は、配列番号:511の配列を含み;
    H3 は、配列番号:509の配列を含む;
    (e)V L1 は、配列番号:524の配列を含み;
    L2 は、配列番号:519の配列を含み;
    L3 は、配列番号:523の配列を含み;
    H1 は、配列番号:506の配列を含み;
    H2 は、配列番号:509の配列を含み;
    H3 は、配列番号:510の配列を含む;または
    (f)V L1 は、配列番号:519の配列を含み;
    L2 は、配列番号:524の配列を含み;
    L3 は、配列番号:523の配列を含み;
    H1 は、配列番号:506の配列を含み;
    H2 は、配列番号:511の配列を含み;
    H3 は、配列番号:510の配列を含む、
    請求項1に記載の結合タンパク質。
  3. (a)第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;
    第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、または
    (b)第2のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の349、366、368、および407位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;
    第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインは、EUインデックスによるヒトIgG1の354および366位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである、
    請求項1または請求項2に記載の結合タンパク質。
  4. 第2および第3のポリペプチド鎖のCH3ドメインはどちらも、EUインデックスによるヒトIgG1の428および434位に対応する位置にアミノ酸置換を含み、該アミノ酸置換は、M428LおよびN434Sである、請求項1または請求項2に記載の結合タンパク質。
  5. (a)L1、L2、L3、またはL4のうちの少なくとも1つは、独立して、長さが0アミノ酸である、または
    (b)L1、L2、L3、またはL4は、各々独立して、長さが少なくとも1アミノ酸である、
    請求項1または請求項2に記載の結合タンパク質。
  6. 1、L2、L3、および/またはL4は、配列Asp-Lys-Thr-His-Thr(配列番号:525)を含む、請求項に記載の結合タンパク質。
  7. 第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖および第4のポリペプチド鎖を含む結合タンパク質であって:
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:321のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:320のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:318のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:319のアミノ酸配列を含む;
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:329のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:328のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:326のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:327のアミノ酸配列を含む;
    (c)第1のポリペプチド鎖は、配列番号:417のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:416のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:414のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:415のアミノ酸配列を含む;
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:425のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:424のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:422のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:423のアミノ酸配列を含む;
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:433のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:432のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:430のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:431のアミノ酸配列を含む;
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:441のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:440のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:438のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:439のアミノ酸配列を含む;
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:449のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:448のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:446のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:447のアミノ酸配列を含む;
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:457のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:456のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:454のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:455のアミノ酸配列を含む;
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:465のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:464のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:462のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:463のアミノ酸配列を含む;または
    )第1のポリペプチド鎖は、配列番号:473のアミノ酸配列を含み
    第2のポリペプチド鎖は、配列番号:472のアミノ酸配列を含み
    第3のポリペプチド鎖は、配列番号:470のアミノ酸配列を含み
    第4のポリペプチド鎖は、配列番号:471のアミノ酸配列を含む、
    前記結合タンパク質。
  8. 請求項1~のいずれか1項に記載の結合タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
  9. 請求項に記載の核酸分子を含む発現ベクター。
  10. 請求項1~のいずれか1項に記載の結合タンパク質の第1、第2、第3、および第4のポリペプチド鎖をコードする1つまたはそれ以上のベクターを含むベクター系。
  11. 結合タンパク質の第1のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第2のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターと、結合タンパク質の第3のポリペプチド鎖をコードする第3のベクターと、結合タンパク質の第4のポリペプチド鎖をコードする第4のベクターとを含む、請求項10に記載のベクター系。
  12. 結合タンパク質の第1および第2のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターと、結合タンパク質の第3および第4のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターとを含む、請求項10に記載のベクター系。
  13. 請求項に記載の核酸分子、請求項に記載の発現ベクター、または請求項1012のいずれか1項に記載のベクター系を含む、単離された宿主細胞。
  14. 哺乳動物細胞である、請求項13に記載の単離された宿主細胞。
  15. 昆虫細胞である、請求項13に記載の単離された宿主細胞。
  16. 結合タンパク質を産生する方法であって:
    a)請求項1315のいずれか1項に記載の宿主細胞を、該宿主細胞が該結合タンパク質を発現するような条件下で培養する工程;および
    b)該結合タンパク質を該宿主細胞から単離する工程
    を含む前記方法。
  17. 治療有効量の請求項1~のいずれか1項に記載の少なくとも1つの結合タンパク質を含む、患者におけるHIV感染症を予防および/または処置する方法において使用するための医薬組成物。
  18. 標準的抗レトロウイルス療法と併用投与される、請求項17に記載の組成物。
  19. 患者がヒトである、請求項17または18に記載の組成物。
JP2021016190A 2015-10-25 2021-02-04 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質 Active JP7328267B2 (ja)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2023061823A JP2023085476A (ja) 2015-10-25 2023-04-06 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質

Applications Claiming Priority (9)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562246113P 2015-10-25 2015-10-25
US62/246,113 2015-10-25
EP16305211.1 2016-02-24
EP16305211 2016-02-24
US201662322029P 2016-04-13 2016-04-13
US62/322,029 2016-04-13
US201662331169P 2016-05-03 2016-05-03
US62/331,169 2016-05-03
JP2018521308A JP7169190B2 (ja) 2015-10-25 2016-10-24 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2018521308A Division JP7169190B2 (ja) 2015-10-25 2016-10-24 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2023061823A Division JP2023085476A (ja) 2015-10-25 2023-04-06 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2021072847A JP2021072847A (ja) 2021-05-13
JP7328267B2 true JP7328267B2 (ja) 2023-08-16

Family

ID=55588187

Family Applications (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2018521308A Active JP7169190B2 (ja) 2015-10-25 2016-10-24 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質
JP2021016190A Active JP7328267B2 (ja) 2015-10-25 2021-02-04 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質
JP2023061823A Pending JP2023085476A (ja) 2015-10-25 2023-04-06 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2018521308A Active JP7169190B2 (ja) 2015-10-25 2016-10-24 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2023061823A Pending JP2023085476A (ja) 2015-10-25 2023-04-06 Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質

Country Status (31)

Country Link
US (3) US20190054182A1 (ja)
EP (2) EP3819310A1 (ja)
JP (3) JP7169190B2 (ja)
KR (1) KR20180063336A (ja)
CN (4) CN116789841A (ja)
AR (1) AR106466A1 (ja)
AU (2) AU2016347058B2 (ja)
BR (1) BR112018008011A2 (ja)
CA (1) CA3002664A1 (ja)
CL (1) CL2018001065A1 (ja)
CO (1) CO2018005337A2 (ja)
CR (1) CR20180288A (ja)
DO (1) DOP2018000102A (ja)
EA (1) EA201891028A1 (ja)
ES (1) ES2894304T3 (ja)
HK (1) HK1253385A1 (ja)
HR (1) HRP20211528T1 (ja)
HU (1) HUE056608T2 (ja)
IL (2) IL301140A (ja)
MA (1) MA42641A1 (ja)
MX (2) MX2018005048A (ja)
MY (1) MY192278A (ja)
PE (1) PE20181167A1 (ja)
PH (1) PH12018500873A1 (ja)
PL (1) PL3365366T3 (ja)
RS (1) RS62437B1 (ja)
SG (1) SG11201803324VA (ja)
SI (1) SI3365366T1 (ja)
TW (2) TWI750139B (ja)
UY (1) UY36965A (ja)
WO (1) WO2017074878A1 (ja)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3052132B1 (en) 2013-09-30 2020-07-29 Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. Antibody therapies for human immunodeficiency virus (hiv)
CN106459186B (zh) * 2014-02-28 2021-02-02 美国卫生和人力服务部 针对hiv-1 v1v2 env区域的广谱中和性单克隆抗体
PE20181167A1 (es) 2015-10-25 2018-07-19 Sanofi Sa Proteinas de union triespecificas y/o trivalentes para la prevencion o el tratamiento de la infeccion por vih
WO2017079479A1 (en) * 2015-11-03 2017-05-11 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Neutralizing antibodies to hiv-1 gp41 and their use
SG11201808911SA (en) 2016-04-13 2018-11-29 Sanofi Sa Trispecific and/or trivalent binding proteins
FI3443006T3 (fi) * 2016-04-13 2023-10-23 Sanofi Sa Trispesifisiä ja/tai kolmiarvoisia sitojaproteiineja
WO2017189964A2 (en) 2016-04-29 2017-11-02 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions for the treatment of disease
EP3448874A4 (en) 2016-04-29 2020-04-22 Voyager Therapeutics, Inc. COMPOSITIONS FOR TREATING A DISEASE
JP7304288B2 (ja) 2017-02-17 2023-07-06 サノフイ ジストログリカンおよびラミニン2に対する特異性を有する多特異性結合性分子
US10626169B2 (en) 2017-02-17 2020-04-21 Sanofi Multispecific binding molecules having specificity to dystroglycan and laminin-2
CN110831965B (zh) 2017-06-21 2023-03-07 吉利德科学公司 靶向hiv gp120和cd3的多特异性抗体
EP4249068A3 (en) * 2017-10-10 2023-11-22 Sanofi Anti-cd38 antibodies and combinations with anti-cd3 and anti-cd28 antibodies
CN111819196B (zh) * 2017-12-21 2022-10-28 纽约市哥伦比亚大学理事会 双特异性hiv-1中和抗体
AU2019206648A1 (en) 2018-01-12 2020-07-16 Genzyme Corporation Methods for the quantitation of polypeptides
US11845788B2 (en) 2018-05-22 2023-12-19 Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. Antibody therapies for human immunodeficiency virus (HIV)
BR112021006558A2 (pt) 2018-10-09 2021-07-13 Sanofi proteínas de ligação triespecíficas anti-cd38, anti-cd28 e anti-cd3 e métodos de uso para o tratamento de infecção viral
WO2020106713A1 (en) * 2018-11-21 2020-05-28 Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. Antibody therapies for human immunodeficiency virus (hiv)
SG11202111012QA (en) 2019-04-09 2021-11-29 Sanofi Sa Trispecific binding proteins, methods, and uses thereof
US11613576B2 (en) 2019-04-09 2023-03-28 Sanofi Trispecific binding proteins, methods, and uses thereof
TW202104274A (zh) 2019-04-09 2021-02-01 法商賽諾菲公司 用於治療hiv感染之三特異性及/或三價結合蛋白
JP2022553716A (ja) 2019-10-25 2022-12-26 サノフイ 多特異性結合タンパク質において鎖誤対合を分析する方法
WO2021203103A2 (en) * 2020-04-03 2021-10-07 Somasekar Seshagiri Ace2 receptor polymorphisms and varying susceptibility to sars-cov-2, methods for diagnosis and treatment
KR20230054456A (ko) * 2020-08-25 2023-04-24 길리애드 사이언시즈, 인코포레이티드 Hiv를 표적으로 하는 다중특이적 항원 결합 분자 및 이의 사용 방법
TW202334204A (zh) * 2021-12-21 2023-09-01 美商莫德斯醫療公司 條件性活化之抗原結合多肽複合物及其使用方法

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013163427A1 (en) 2012-04-25 2013-10-31 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health & Human Services Antibodies to treat hiv-1 infection

Family Cites Families (52)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA1338518C (en) 1987-09-23 1996-08-13 Joyce M. Zarling Antibody heteroconjugates for the killing of hiv-infected cells
US5731168A (en) 1995-03-01 1998-03-24 Genentech, Inc. Method for making heteromultimeric polypeptides
ATE375365T1 (de) 1998-04-02 2007-10-15 Genentech Inc Antikörper varianten und fragmente davon
AU2002241922B2 (en) 2001-01-17 2007-10-25 Aptevo Research And Development Llc Binding domain-immunoglobulin fusion proteins
CN1294148C (zh) 2001-04-11 2007-01-10 中国科学院遗传与发育生物学研究所 环状单链三特异抗体
US7700097B2 (en) 2003-06-27 2010-04-20 Biogen Idec Ma Inc. Purification and preferential synthesis of binding molecules
US9200061B2 (en) 2004-02-06 2015-12-01 Morpho Sys AG Generation and profiling of fully human HuCAL gold®-derived therapeutic antibodies specific for human CD3i
CN100376599C (zh) 2004-04-01 2008-03-26 北京安波特基因工程技术有限公司 基因工程重组抗cea抗cd3抗cd28线性单链三特异抗体
EP2014680A1 (en) * 2007-07-10 2009-01-14 Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Recombinant, single-chain, trivalent tri-specific or bi-specific antibody derivatives
EP2050764A1 (en) 2007-10-15 2009-04-22 sanofi-aventis Novel polyvalent bispecific antibody format and uses thereof
CA2726087A1 (en) 2008-06-03 2009-12-10 Tariq Ghayur Dual variable domain immunoglobulins and uses thereof
WO2011038290A2 (en) 2009-09-25 2011-03-31 The U. S. A., As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to hiv-1 and their use
DK2580243T3 (da) 2010-06-09 2020-01-13 Genmab As Antibodies against human cd38
WO2012065055A2 (en) 2010-11-12 2012-05-18 The Rockefeller University Fusion proteins for hiv therapy
JOP20210044A1 (ar) 2010-12-30 2017-06-16 Takeda Pharmaceuticals Co الأجسام المضادة لـ cd38
TWI622597B (zh) * 2011-03-28 2018-05-01 賽諾菲公司 具有交叉結合區定向之雙重可變區類抗體結合蛋白
WO2012154312A1 (en) 2011-05-09 2012-11-15 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health & Human Services Neutralizing antibodies to hiv-1 and their use
CN103842383B (zh) 2011-05-16 2017-11-03 健能隆医药技术(上海)有限公司 多特异性fab融合蛋白及其使用方法
WO2012158948A1 (en) * 2011-05-17 2012-11-22 The Rockefeller University Human immunodeficiency virus neutralizing antibodies adn methods of use thereof
BR112014010823B1 (pt) 2011-11-07 2021-02-17 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services anticorpos que se ligam a gp41 e neutralizam o vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (hiv-1), seus usos, molécula de ácido nucleico, vetor de expressão, composição, kit, bem como métodos de detecção de infecção pelo hiv-1 e de teste de imunógeno potencial
EP2776061B1 (en) * 2011-11-07 2019-08-14 MedImmune, LLC Multispecific and multivalent binding proteins and uses thereof
CN108676091B (zh) 2011-12-08 2022-04-01 美国政府(由卫生和人类服务部的部长所代表) Hiv-1的中和抗体及其用途
JOP20200236A1 (ar) 2012-09-21 2017-06-16 Regeneron Pharma الأجسام المضادة لمضاد cd3 وجزيئات ربط الأنتيجين ثنائية التحديد التي تربط cd3 وcd20 واستخداماتها
AU2013322710A1 (en) * 2012-09-25 2015-04-16 Glenmark Pharmaceuticals S.A. Purification of hetero-dimeric immunoglobulins
US9951106B2 (en) 2012-12-04 2018-04-24 University Of Maryland, Baltimore Recombinant fusion protein comprising HIV gp120 linked to an enhancing CD4 binding site mAb
KR20210088741A (ko) 2012-12-13 2021-07-14 더 트러스티스 오브 더 유니버시티 오브 펜실베니아 Dna 항체 작제물 및 그 이용 방법
US20140213772A1 (en) 2012-12-28 2014-07-31 Abbvie, Inc. Cross-over dual variable domain immunoglobulin constructs
US10487155B2 (en) 2013-01-14 2019-11-26 Xencor, Inc. Heterodimeric proteins
EP2948475A2 (en) 2013-01-23 2015-12-02 AbbVie Inc. Methods and compositions for modulating an immune response
MY192312A (en) * 2013-02-26 2022-08-17 Roche Glycart Ag Bispecific t cell activating antigen binding molecules
EP2970457A2 (en) 2013-03-15 2016-01-20 AbbVie Inc. Dual specific binding proteins directed against tnf
US20140302037A1 (en) 2013-03-15 2014-10-09 Amgen Inc. BISPECIFIC-Fc MOLECULES
AU2014296059B2 (en) 2013-08-02 2020-12-10 The Regents Of The University Of California Engineering antiviral T cell immunity through stem cells and chimeric antigen receptors
PE20160724A1 (es) 2013-11-04 2016-08-04 Glenmark Pharmaceuticals Sa Produccion de inmunoglobulinas heterodimericas de redireccionamiento de celulas t
EP3954713A3 (en) 2014-03-28 2022-03-30 Xencor, Inc. Bispecific antibodies that bind to cd38 and cd3
US10961506B2 (en) 2014-09-04 2021-03-30 Stemcell Technologies Inc. Soluble antibody complexes for T cell or NK cell activation and expansion
ES2824167T3 (es) 2015-01-23 2021-05-11 Sanofi Sa Anticuerpos anti-CD3, anticuerpos anti-CD123 y anticuerpos biespecíficos que se unen específicamente a CD3 y/o CD123
JP6936736B2 (ja) 2015-05-20 2021-09-22 クアンタム−エスアイ インコーポレイテッドQuantum−Si Incorporated 時間分解発光を使用して核酸の配列を決定するための方法
US10654943B2 (en) 2015-06-02 2020-05-19 The Rockefeller University Tri-specific antibodies for HIV therapy
MX2018003463A (es) 2015-09-22 2018-09-06 Univ Pennsylvania Método de redireccionamiento de células t para tratar la infección por virus de inmunodeficiencia humana (vih).
PE20181167A1 (es) 2015-10-25 2018-07-19 Sanofi Sa Proteinas de union triespecificas y/o trivalentes para la prevencion o el tratamiento de la infeccion por vih
CN105837688B (zh) 2015-11-20 2019-02-26 北京大学深圳研究生院 单域抗体及其编码基因,免疫毒素及其编码基因、制备方法、表达载体、应用,及宿主细胞
SG11201804787UA (en) 2015-12-15 2018-07-30 Gilead Sciences Inc Human immunodeficiency virus neutralizing antibodies
SG11201808911SA (en) 2016-04-13 2018-11-29 Sanofi Sa Trispecific and/or trivalent binding proteins
FI3443006T3 (fi) 2016-04-13 2023-10-23 Sanofi Sa Trispesifisiä ja/tai kolmiarvoisia sitojaproteiineja
EP3575319A4 (en) 2016-12-30 2021-03-10 Shanghai Sinobio Biotech Co., Ltd. BIFUNCTIONAL MOLECULE AND USE OF IT
JP7304288B2 (ja) 2017-02-17 2023-07-06 サノフイ ジストログリカンおよびラミニン2に対する特異性を有する多特異性結合性分子
US10626169B2 (en) 2017-02-17 2020-04-21 Sanofi Multispecific binding molecules having specificity to dystroglycan and laminin-2
EP3601334A4 (en) 2017-03-27 2021-03-31 The Wistar Institute Of Anatomy And Biology DNA ANTIBODY CONSTRUCTS FOR USE AGAINST HIV
EP4249068A3 (en) 2017-10-10 2023-11-22 Sanofi Anti-cd38 antibodies and combinations with anti-cd3 and anti-cd28 antibodies
BR112021006558A2 (pt) 2018-10-09 2021-07-13 Sanofi proteínas de ligação triespecíficas anti-cd38, anti-cd28 e anti-cd3 e métodos de uso para o tratamento de infecção viral
US11613576B2 (en) 2019-04-09 2023-03-28 Sanofi Trispecific binding proteins, methods, and uses thereof

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013163427A1 (en) 2012-04-25 2013-10-31 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health & Human Services Antibodies to treat hiv-1 infection

Also Published As

Publication number Publication date
MY192278A (en) 2022-08-16
MX2018005048A (es) 2018-09-06
RS62437B1 (sr) 2021-11-30
BR112018008011A2 (pt) 2018-10-30
CA3002664A1 (en) 2017-05-04
DOP2018000102A (es) 2018-11-30
MX2022014631A (es) 2023-01-11
US11129905B2 (en) 2021-09-28
UY36965A (es) 2017-05-31
IL258822B1 (en) 2023-04-01
CN116789841A (zh) 2023-09-22
JP2018537966A (ja) 2018-12-27
US20220226495A1 (en) 2022-07-21
JP2021072847A (ja) 2021-05-13
US20200054765A1 (en) 2020-02-20
JP7169190B2 (ja) 2022-11-10
WO2017074878A8 (en) 2018-05-24
ES2894304T3 (es) 2022-02-14
EP3365366B1 (en) 2021-07-14
SG11201803324VA (en) 2018-05-30
TW202219064A (zh) 2022-05-16
CO2018005337A2 (es) 2018-07-10
PL3365366T3 (pl) 2022-01-31
SI3365366T1 (sl) 2022-02-28
JP2023085476A (ja) 2023-06-20
KR20180063336A (ko) 2018-06-11
IL258822A (en) 2018-06-28
EA201891028A1 (ru) 2019-02-28
MA42641A1 (fr) 2019-03-29
IL301140A (en) 2023-05-01
CL2018001065A1 (es) 2018-11-23
CN109311966B (zh) 2023-03-10
US20190054182A1 (en) 2019-02-21
AU2016347058B2 (en) 2023-11-09
AR106466A1 (es) 2018-01-17
WO2017074878A1 (en) 2017-05-04
PE20181167A1 (es) 2018-07-19
EP3819310A1 (en) 2021-05-12
TWI750139B (zh) 2021-12-21
TW201730210A (zh) 2017-09-01
HRP20211528T1 (hr) 2021-12-24
HK1253385A1 (zh) 2019-06-14
EP3365366A1 (en) 2018-08-29
AU2016347058A1 (en) 2018-06-14
CN109311966A (zh) 2019-02-05
PH12018500873A1 (en) 2018-11-12
CN116675776A (zh) 2023-09-01
US11779651B2 (en) 2023-10-10
HUE056608T2 (hu) 2022-02-28
AU2024200395A1 (en) 2024-04-11
CR20180288A (es) 2018-09-11
CN117069855A (zh) 2023-11-17
IL258822B2 (en) 2023-08-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7328267B2 (ja) Hiv感染症の予防または処置のための三重特異性および/または三価結合タンパク質
JP7462621B2 (ja) 三重特異性抗cd38、抗cd28、および抗cd3結合タンパク質ならびにウイルス感染を処置するための使用方法
US11613576B2 (en) Trispecific binding proteins, methods, and uses thereof
WO2023143445A1 (zh) 用于治疗hbv感染及相关疾病的表位肽及抗体
RU2812910C2 (ru) Антитела к cd38 и комбинации с антителами к cd3 и cd28
CA3136147A1 (en) Trispecific and/or trivalent binding proteins using the cross-over-dual-variable domain (codv) format for treatment of hiv infection
EA040589B1 (ru) Триспецифические и/или тривалентные связывающие белки для предупреждения или лечения инфекции, вызываемой hiv
WO2024073572A2 (en) Fusions with cd8 antigen binding molecules for treating chronic viral infection
TW202104261A (zh) 三特異性結合蛋白、方法及其用途

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20210303

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20210303

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20210305

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20220208

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20220506

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20220708

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20220808

A02 Decision of refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02

Effective date: 20221206

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20230406

C60 Trial request (containing other claim documents, opposition documents)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C60

Effective date: 20230406

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20230407

A911 Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911

Effective date: 20230519

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20230711

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20230803

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 7328267

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150