JP6553509B2 - ウイルス様粒子の精製 - Google Patents
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Description
[0001] 本出願は、2012年6月22日出願の米国仮特許出願第61/663,218号、及び2013年3月15日出願の米国仮特許出願第61/794,086号に対する優先権を主張し、それぞれの全内容は参照により全体が本明細書に組み込まれる。
[0108]Sf9培養
[0109] Sf9昆虫細胞のルーチン的培養を、27℃及び周囲空気飽和のフラスコ中で実施した。Sf9細胞を、バキュロウイルスの増大及びVLPの産生のために複数継代にわたって培養した。自動細胞カウンタ(T4 Celloメータ、Nexcelom Bioscience)を使用して、Sf9培養のルーチン的集計を実施した。
[0111] 組み換え型バキュロウイルスは、製造業者の指示に従いCellfectinを使用して、転写ベクタ及び線状バキュロウイルスDNAを付着Sf9昆虫細胞に同時導入し、その後にプラークを精製して、バキュロウイルス増大の追加のラウンドを実行することによって生成した。次に、低速遠心分離によって得られた上清の分画として、組み換え型バキュロウイルスを回収した。その結果の組み換え型バキュロウイルスを調整して、最終的に10%(v/v)のDMSOにし、アリコーティングして−80℃で保存した。VLPを産生するための冷凍バキュロウイルスの増大は、以上で概略するように実施した。
[0113] ノロウイルスVLPの産生は、使い捨てのWaveバイオリアクタと使用して実施した。バイオリアクタで産生するには、Sf-900 II無血清媒質を無菌的にWaveバイオリアクタへと移動し、培養を接種した。適切な細胞密度に到達したら、組み換え型バキュロウイルスを無菌的にバイオリアクタ培養に添加し、以上で概略した条件で発現培養をインキュベートする。バイオリアクタの培養は通常、生細胞密度に基づいて感染後4〜6日で回収した。
[0116] 回収のために、HClを添加し、次に攪拌しながら周囲温度で2時間インキュベートすることによって、バイオリアクタ培養をpH3.0に調整した。次に、イミダゾールを添加し、次に低速遠心分離によって浄化することによって、培養をpH5.0(ノーウォーク)又はpH6.0(コンセンサス)に調整した。バイオリアクタの最終浄化は、遠心分離後の上清を濾過することによって実施した。その結果の回収材料(馴化培地)は、次にユニット操作の前に周囲室温で24時間以内保存、又は4℃で1週間以内保存した。
[0119] Sartobind Sカプセルを使用して、ノロウイルスVLPのカチオン交換(CE)捕捉クロマトグラフィを実施した。精製するために、カプセルを酢酸塩(pH5.0)で平衡化し、馴化培地(≦1.5gVLP合計)を装填した。次に、280nm(A280)での流通吸収が200mAU未満になるまで、カプセルを酢酸塩(pH5.0)で洗浄した。次に、カプセルを酢酸塩(pH5.0)、1%のTriton X-100、0.2%のリン酸トリブチルで飽和させ、洗浄した。このオンカラム溶媒/洗浄剤処理の後、A280<50mAUになるまで、100mL/分の酢酸塩(pH5.0)でカプセルを洗浄した。酢酸塩(pH5.0)及びNaClでノロウイルスVLPの溶出を実施した。VLP溶出分画を使い捨ての瓶又はバイオプロセス用袋に採取した。
[0122] ノーウォークVLPのヒドロキシアパタイト(HA)捕捉クロマトグラフィは、総容積250mLのCHTセラミックヒドロキシアパタイトカラム(BioRad)を使用して実施した。精製するために、カプセルをMES(pH6.0)で平衡化し、馴化培地(≦250mgVLP合計)を装填した。次に、280nm(A280)での流通吸収が200mAU未満になるまで、カプセルをMES(pH6.0)で洗浄した。次に、カプセルをMES(pH6.0)、1%のTriton X-100、0.2%のリン酸トリブチルで飽和させ、洗浄した。このオンカラム溶媒/洗浄剤処理の後、A280<50mAUになるまで、70mL/分のMES(pH6.0)でカプセルを洗浄した。ノロウイルスVLPの溶出は、100mMのリン酸ナトリウム(pH6.8)で洗浄し、VLPの溶出は400mMのリン酸ナトリウム(pH6.8)で洗浄して実施した。VLP溶出分画を使い捨ての瓶又はバイオプロセス用袋に採取した。
[0125] 精製後、ノロウイルスVLPは分析法のパネルで純度を分析し、NuPAGE勾配ゲルを使用して、SDS−PAGE分析を実施した。その結果のPAGEゲルを、Imperial Protein Stain又は着色銀で着色した。捕捉クロマトグラフィ工程中に、産生培養の低pH処理及びオンカラム溶媒/洗浄剤処理の標準的プラークアッセイで、バキュロウイルスの不活性化を評価した。
[0128] バイオリアクタ産生−VLPを産生する拡大可能な方法を開発するために、当技術分野で周知の技術を使用し、組み換え型バキュロウイルスに感染させるようにSf9培養をWaveバイオリアクタ中で増殖させた。
[0136] コンセンサスVLPの馴化培地にモデルウイルスを固定し、オンカラム溶媒/洗浄剤処理を伴う、及び伴わないカチオン交換クロマトグラフィで加工した。表3に示すように、CE工程のみではモデルウイルスの減少が最小であり、オンカラム溶媒/洗浄剤処理を含むと、高レベルの除去/不活性化が観察された。
[0138] Sf9昆虫細胞中のノロウイルスVLP産生後、バイオリアクタ産生培養は、従来の方法(低速遠心分離及び濾過)で回収した後に高レベルの生バキュロウイルス(約108pfu/mL)を含有している。表4は、低pH処理のみでは、産生培養中に見られるレベルのバキュロウイルスを完全には不活性化しないことを示す。対照的に、低pH処理及び溶媒/洗浄剤処理の組み合わせによるバキュロウイルス不活性化のレベルは、産生培養中で約10pfu/mLを超える。
[0140] バキュロウイルス発現系の産生中、コンセンサスVP1サブユニットはタンパク質分解性分割を経験することができ、その結果、発現した材料の特定の分画でN末端の切断が生じる。このタンパク質分解性フラグメントは集合してVLPになり、下流加工中に完全長VP1サブユニットで構成されたVLPと同時精製される。開発試験中に、大量バイオリアクタ産生培養の低pH処理は、N末端切断産生物を含有するVLPの集団を選択的に除去し、より均質な材料を下流加工に提供することが発見された。
[0143] バイオリアクタ産生培養の回収後、ノーウォークVLP及びコンセンサスVLPを、オンカラム溶媒/洗浄剤処理を伴うカチオン交換(CE)クロマトグラフィで加工した。VLP及びSfの宿主細胞タンパク質(HCP)の含有量を、バイオリアクタ回収材料(CEロード)及びカチオン交換溶出分画(CE溶出)の両方について評価した。これらの試験で、VLP含有量をサイズ排除クロマトグラフィで判定し、HCP含有量は、市販されているELISAキット(Cygnus Technologies、Cat: F020)を使用して判定した。表6は、プロセス分画のHCP含有量について、複数のVLPのロットで平均したデータを示し、上述したアッセイで判定して、CE工程によってHCPが有意に減少したことを示す。
[0145] ノーウォークVLP及びコンセンサスVLPの現在の製造では、バイオリアクタ産生培養を低pH処理で回収し、遠心分離/濾過で浄化する。現在の回収手順の低pH処理工程は、ウイルスの不活性化及びプロセス汚染物質の除去に使用され、遠心分離は、産生培養の一次浄化に使用される。遠心分離は、バイオリアクタ浄化の確固たる拡大可能な方法であるが(図4A参照)、一次浄化にデプス濾過を代替的に使用すると(図4B参照)、操作の容易さ及び使い捨て材料の使用可能性など幾つかの利点があり、これによってクリーニングを確認する必要がなくなる。
Claims (29)
- ヒトノロウイルスのウイルス様粒子(VLP)を精製する方法であって、
前記VLPを含有する細胞可溶化物、培養上清、又は濾液を生成するか又は得るステップであって、前記VLPが少なくともVLPの第一亜集団、及びVLPの第二亜集団を含み、前記第一亜集団が完全長VP1サブユニットを有するVLPを含み、前記第二亜集団が切断型VP1サブユニットを有するVLPを含む、ステップと、
前記可溶化物、上清、又は濾液のpHを5未満のpH値に調整して、pH調整済み溶液を生成するステップと、
濾過プロセスを使用して前記pH調整済み溶液から非VLP微粒子/凝集体、及びVLPの前記第二亜集団を除去して、精製済み溶液を生成するステップであって、前記精製済み溶液が、前記濾過プロセスにより得られるろ液であり、該精製済み溶液が、完全長VP1サブユニットを有するVLPを含むVLPの前記第一亜集団を実質的に保持し、前記切断型VP1サブユニットを有するVLPを実質的に含まない、ステップと、
を含む、方法。 - 残留汚染タンパク質に対するVLPの前記第一亜集団の比率が、少なくとも2倍増加する、請求項1に記載の方法。
- 前記pHの前記調整が、30分間と48時間の間の継続時間実行される、請求項1に記載の方法。
- 前記VLPが、酸安定性VLPを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記除去が、デプス濾過及びその後の追加的濾過によってpH調整済み溶液を浄化して、前記精製済み溶液を生成するステップを含む、請求項1に記載の方法。
- 残留汚染核酸の少なくとも98%が、前記精製の結果として、前記可溶化物、上清、又は濾液から除去される、請求項1に記載の方法。
- 1つ又は複数のクロマトグラフィプロセスを使用して、前記精製済み溶液からVLPの第一亜集団を分離するステップをさらに含み、各クロマトグラフィプロセスが、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィ、疎水性相互作用クロマトグラフィ、サイズ排除クロマトグラフィ、イオン交換クロマトグラフィ、混合モードクロマトグラフィ、及びアフィニティクロマトグラフィから個別に選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記精製済み溶液をクロマトグラフィ材料と接触させるステップであって、前記VLPが前記クロマトグラフィ材料に結合する、ステップと、
溶媒及び/又は洗浄剤で前記クロマトグラフィ材料を処理するステップと、
前記処理の後、前記クロマトグラフィ材料から前記VLPの前記第一亜集団を溶出させるステップと、
をさらに含む、請求項1に記載の方法。 - 前記溶媒及び/又は洗浄剤が、TnBP、オクチルフェノール、エチレンオキシド凝縮液、モノオレイン酸ポリオキシエチレンソルビタン、及びコール酸ナトリウム、Triton X−100、及びリン酸トリブチルのうち1つ又は複数を含む、請求項8に記載の方法。
- 前記VLPが、ノロウイルス遺伝子群I型VLP、ノロウイルス遺伝子群II型VLP、ノロウイルス遺伝子群IV型VLP、キメラノロウイルスVLP、及びサポウイルスVLPのうち1つ又は複数である、請求項8に記載の方法。
- 残留汚染タンパク質に対する前記VLPの比率が、前記可溶化物、上清又は濾液と比較して少なくとも10倍増加する、請求項8に記載の方法。
- 前記精製の結果、残留汚染タンパク質の少なくとも50%が、前記可溶化物、上清又は濾液から除去される、請求項8に記載の方法。
- 前記精製中に失われる前記VLPが50%以下である、請求項8に記載の方法。
- 各クロマトグラフィプロセスが、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィ、疎水性相互作用クロマトグラフィ、サイズ排除クロマトグラフィ、イオン交換クロマトグラフィ、混合モードクロマトグラフィ、膜式クロマトグラフィ、及びアフィニティクロマトグラフィから個別に選択される、請求項8に記載の方法。
- 前記VLPが、細菌細胞、昆虫細胞、酵母細胞、植物、又は哺乳類細胞中で産生される、請求項8に記載の方法。
- ヒトノロウイルスのウイルス様粒子(VLP)を精製する方法であって、
前記VLPを含有する細胞可溶化物、培養上清、又は濾液を生成するか又は得るステップであって、前記VLPが少なくともVLPの第一亜集団、及びVLPの第二亜集団を含み、前記第一亜集団が完全長VP1サブユニットを有するVLPを含み、前記第二亜集団が切断型VP1サブユニットを有するVLPを含む、ステップと、
前記可溶化物、上清又は濾液のpHを5未満のpH値に調整して、pH調整済み溶液を生成するステップと、
前記pH調整済み溶液から非VLP微粒子/凝集体、及びVLPの前記第二亜集団を除去するステップと、を含み、前記除去するステップが、デプス濾過プロセスによって前記pH調整済み溶液を浄化して、デプス濾過済み精製済み溶液を生成するステップであって、前記デプス濾過済み精製済み溶液が前記デプス濾過プロセスにより得られるろ液であり、該デプス濾過済み精製済み溶液が、完全長VP1サブユニットを有するVLPを含むVLPの前記第一亜集団を実質的に保持し、前記切断型VP1サブユニットを有するVLPを実質的に含まない、ステップとを含む、方法。 - 前記デプス濾過プロセスが、前記pH調整済み溶液を1つ又は複数のデプスフィルタと接触させるステップを含み、前記デプスフィルタの少なくとも1つが、珪藻土デプスフィルタである、請求項16に記載の方法。
- 前記可溶化物、上清又は濾液と比較して、残留汚染核酸の少なくとも95%が、前記pH調整済み溶液から除去される、請求項16に記載の方法。
- 前記可溶化物、上清又は濾液と比較して、前記pH調整済み溶液からの前記VLPの回収率が少なくとも75%である、請求項16に記載の方法。
- 前記分離が、1つ又は複数のクロマトグラフィプロセスを使用して、前記デプス濾過済み精製済み溶液からVLPの前記第一亜集団を分離するステップをさらに含み、各クロマトグラフィプロセスが、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィ、疎水性相互作用クロマトグラフィ、サイズ排除クロマトグラフィ、アニオン交換クロマトグラフィ、カチオン交換クロマトグラフィ、混合モードクロマトグラフィ、及びアフィニティクロマトグラフィから個別に選択される、請求項16に記載の方法。
- 前記VLPが、ノロウイルス遺伝子群I型VLP、ノロウイルス遺伝子群II型VLP、ノロウイルス遺伝子群IV型VLP、キメラノロウイルスVLP、及びサポウイルスVLPのうち1つ又は複数である、請求項16に記載の方法。
- 前記VLPが、ノロウイルス遺伝子群I型VLPであり、前記第一亜集団が、完全長VP1サブユニットを有するノロウイルスVLPを含み、前記第二亜集団が、切断型VP1サブユニットを有するノロウイルスVLPを含む、請求項21に記載の方法。
- 前記VLPが、細菌細胞、昆虫細胞、酵母細胞、植物、又は哺乳類細胞中で産生される、請求項16に記載の方法。
- ヒトノロウイルスのVLPの精製済み集団を含む溶液を製造する方法であって、
前記VLPを含有する細胞可溶化物、培養上清、又は細胞培養物の濾液を生成するか又は得るステップであって、前記VLPが少なくとも完全長VP1サブユニットを有するVLPと切断型VP1サブユニットを有するVLPを含む、ステップと、
前記可溶化物、上清、又は濾液のpHを5未満のpH値に調整して、pH調整済み溶液を生成するステップと、
濾過プロセスを使用して前記pH調整済み溶液から切断型VP1サブユニットを有するVLPを除去して、精製済み溶液を生成するステップであって、前記精製済み溶液が、前記濾過プロセスにより得られるろ液であり、前記精製済み溶液が、少なくとも50%の完全長VP1サブユニットを有するVLPを含有し、10%未満の切断型VP1サブユニットを有するVLPを含有する、ステップと、
を含む、方法。 - ヒトノロウイルスのVLPの精製済み集団を製造する方法であって、
1つ又は複数のクロマトグラフィプロセスを使用して、請求項24に記載の方法により製造された溶液からVLPの精製済み集団を分離して、完全長VP1サブユニットを有するVLPの精製済み集団を生成するステップを含む、方法。 - 生きたウイルスを含有し、前記生きたウイルスによって生成されたヒトノロウイルスVLPをさらに含有する溶液であって、前記VLPが少なくとも完全長VP1サブユニットを有するVLPを含むVLPの第一亜集団、及び切断型VP1サブユニットを有するVLPを含むVLPの第二亜集団を含む、溶液中において、前記生きたウイルスを除去及び/又は不活性化する方法であって、
前記生きたウイルスを含有する前記溶液のpHを5未満のpH値に調整して、pH調整済み溶液を生成するステップと、
濾過プロセスを使用して前記pH調整済み溶液から非VLP微粒子/凝集体、及びVLPの前記第二亜集団を除去して、精製済み溶液を生成するステップであって、前記精製済み溶液が、前記濾過プロセスにより得られるろ液であり、該精製済み溶液が、完全長VP1サブユニットを有するVLPを含むVLPの前記第一亜集団を実質的に保持し、前記切断型VP1サブユニットを有するVLPを実質的に含まない、ステップと、を含む、方法。 - 前記pH調整済み溶液中の前記生きたウイルスのレベルが少なくとも104倍減少する、請求項26に記載の方法。
- 少なくとも1つのクロマトグラフィプロセスを使用して、前記精製済み溶液を精製するステップとをさらに含み、前記少なくとも1つのクロマトグラフィプロセスが、
前記pH調整済み溶液をクロマトグラフィ材料と接触させるステップであって、前記VLPは前記クロマトグラフィ材料に結合する、ステップと
前記クロマトグラフィ材料を溶媒及び/又は洗浄剤で処理するステップと、
前記処理の後、前記クロマトグラフィ材料から前記VLPを溶出して、溶出液を生成するステップとを含み、
前記溶出液中の前記生きたウイルスのレベルが、前記生きたウイルスを含有する前記溶液と比較して少なくとも102倍減少する、請求項26に記載の方法。 - 前記溶出液中の前記生きたウイルスのレベルが、前記生きたウイルスを含有する前記溶液と比較して少なくとも103倍減少する、請求項28に記載の方法。
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