JP2023538773A - 改善された溶解性を有するプロテアーゼバリアント - Google Patents

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Abstract

本発明は、プロテアーゼバリアント、前記バリアントをコードするポリヌクレオチド、核酸構築物及び前記ポリヌクレオチドを含む発現ベクター、前記バリアントを発現する宿主細胞、バリアントを得る方法、前記バリアントを含む洗剤組成物、並びに前記バリアント又は前記洗剤組成物の使用に関する。【選択図】なし

Description

配列表の参照
本出願には、参照により本明細書に組み込まれるコンピューター可読形式の配列表が含まれる。
本発明は、プロテアーゼバリアント、前記バリアントをコードするポリヌクレオチド、核酸構築物及び前記ポリヌクレオチドを含む発現ベクター、前記バリアントを発現する宿主細胞、バリアントを得る方法、前記バリアントを含む洗剤組成物、並びに前記バリアント又は前記洗剤組成物の使用に関する。
洗剤産業において、酵素は、数十年間洗浄配合物において実装されてきた。そのような配合物において使用される酵素としては、プロテアーゼ、リパーゼ、アミラーゼ、セルラーゼ、マンノシダーゼ及び他の酵素又はその混合物が挙げられる。商業的には、最も重要な酵素は、プロテアーゼである。
例えば、洗濯及び食器洗浄洗剤のための商業的に使用されるプロテアーゼにおいて、天然に存在する野生型プロテアーゼのタンパク質操作されたバリアントがますます増加している。さらに、より良好な洗浄性能、熱安定性、保管安定性又は触媒活性などの改善をもたらす親プロテアーゼに対して改変を有する他のプロテアーゼバリアントが当該技術分野で記載されている。
しかしながら、プロテアーゼのさらなる改善は様々な要因によって有利になされる。例えば、温度及びｐＨなどの洗浄条件は、経時的に変化する傾向があり、世界の様々な国又は地域においても異なっており、多くの汚れは依然として、従来の洗浄条件下で完全に除去することが困難である。
プロテアーゼに関する別の課題は、それらの溶解性である。低い溶解性のプロテアーゼは、発酵及び下流の処理の間に結晶化する可能性が高いため、プロテアーゼの溶解性は、これらの酵素を生成するときの重要な要因である。高い溶解性を有するプロテアーゼは、
より高い濃度で処理され、プロテアーゼを精製するプロセスをより安価に、迅速に且つより持続可能にすることができる。
本発明は、改善された溶解性を有するプロテアーゼを提供することによってこの課題に対処する。
本発明は、改善された溶解性を有するプロテアーゼバリアントを提供する。本発明のプロテアーゼバリアントは、配列番号１の２１５位に対応する位置で正に荷電したアミノ酸又は極性アミノ酸を含む。
したがって、第１の態様において、本発明は、親プロテアーゼのプロテアーゼバリアントに関し、バリアントは、配列番号１と少なくとも少なくとも８０％であるが、１００％未満の配列同一性を有し、
バリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含み；
バリアントは、Ｘ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を含み；
バリアントは、プロテアーゼ活性を有し；且つ
位置番号は、配列番号２の付番に基づく。
第２の態様において、本発明は、第１の態様のプロテアーゼバリアントをコードするポリヌクレオチドに関する。
第３の態様において、本発明は、第２の態様のポリヌクレオチドを含む核酸構築物又は発現ベクターに関する。
第４の態様において、本発明は、第１の態様によるプロテアーゼバリアントを発現する宿主細胞に関する。
第５の態様において、本発明は、請求項１～１５のいずれかによるプロテアーゼバリアントを得る方法であって、
（ａ）親プロテアーゼにＸ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を導入すること；及びＸ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を導入すること（バリアントは、プロテアーゼ活性を有する）；並びに
（ｂ）バリアントを回収すること
を含む方法に関する。
第６の態様において、本発明は、第１の態様によるプロテアーゼバリアントを含む洗剤組成に関する。
第７の態様において、本発明は、クリーニングプロセス、好ましくは、洗濯又は自動食器洗浄（ＡＤＷ）などの硬質表面クリーニングにおける第１の態様によるプロテアーゼバリアント又は第６の態様による洗剤組成物の使用に関する。
国際公開第１９８９／０６２７９号パンフレットの表１に基づく配列番号１と配列番号２の間のアラインメントを示し、配列番号２の位置に対応する位置番号は容易に決定され得る。
定義
プロテアーゼ：用語「プロテアーゼ」は、ペプチド結合を加水分解する酵素を意味する。それは、ＥＣ３．４酵素群（その１３種のサブクラスの各々を含む（ｈｔｔｐ：／／ｅｎ．ｗｉｋｉｐｅｄｉａ．ｏｒｇ／ｗｉｋｉ／Ｃａｔｅｇｏｒｙ：ＥＣ＿３．４））に属する任意の酵素を含む。ＥＣ番号は、ＮＣ－ＩＵＢＭＢ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣａｌｉｆｏｒｎｉａからのＥｎｚｙｍｅ Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ １９９２を指し、それぞれＥｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１９９４，２２３，１－５；Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１９９５，２３２，１－６；Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１９９６，２３７，１－５；Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１９９７，２５０，１－６；及びＥｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１９９９，２６４，６１０－６５０において公開された補足１～５を含む。用語「サブチラーゼ」は、Ｓｉｅｚｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．４（１９９１）７１９－７３７及びＳｉｅｚｅｎ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ ６（１９９７）５０１－５２３によるセリンプロテアーゼのサブグループを指す。セリンプロテアーゼ又はセリンペプチダーゼは、基質と共有結合性の付加体を形成する活性部位においてセリンを有することを特徴とするプロテアーゼのサブグループである。さらに、サブチラーゼ（及びセリンプロテアーゼ）は、セリン以外の２つの活性部位アミノ酸残基、すなわち、ヒスチジン及びアスパラギン酸残基を有することによって特徴付けられる。サブチラーゼは、６つの下位区分、すなわち、サブチリシンファミリー、テルミターゼファミリー、プロテイナーゼＫファミリー、ランチビオティックなペプチダーゼファミリー、ケキシンファミリー、及びピロリシンファミリーに分類され得る。用語「プロテアーゼ活性」は、タンパク分解活性（ＥＣ３．４）を意味する。本発明のプロテアーゼバリアントは、エンドペプチダーゼ（ＥＣ３．４．２１）である。本発明の目的のために、プロテアーゼ活性は、下の実施例に記載されるプロテアーゼ活性アッセイに従って決定される。
ｃＤＮＡ：「ｃＤＮＡ」という用語は、真核細胞又は原核細胞から得られた成熟してスプライシングされたｍＲＮＡ分子からの逆転写により調製され得るＤＮＡ分子を意味する。ｃＤＮＡは、対応するゲノムＤＮＡ中に存在し得るイントロン配列を欠いている。最初の一次ＲＮＡ転写物は、成熟してスプライシングされたｍＲＮＡとして現れる前にスプライシングを含む一連の工程により処理されているｍＲＮＡの前駆体である。
コード配列：「コード配列」という用語は、バリアントのアミノ酸配列を直接的に指定するポリヌクレオチドを意味する。コード配列の境界は、一般的に、ＡＴＧ、ＧＴＧ、又はＴＴＧなどの開始コドンで始まり且つＴＡＡ、ＴＡＧ、又はＴＧＡなどの終止コドンで終わるオープンリーディングフレームにより決定される。コード配列は、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、合成ＤＮＡ又はこれらの組み合わせであり得る。
制御配列：「制御配列」という用語は、本発明のバリアントをコードするポリヌクレオチドの発現に必要となる核酸配列を意味する。それぞれの制御配列は、バリアントをコードするポリヌクレオチドに対して天然（すなわち、同一の遺伝子に由来する）若しくは外来性（すなわち、異なる遺伝子に由来する）のものであってよいか、又は互いに天然若しくは外来性のものであってよい。そのような制御配列としては、リーダー、ポリアデニル化配列、プロペプチド配列、プロモーター、シグナルペプチド配列、及び転写ターミネーターが挙げられるが、これらに限定されない。少なくとも、制御配列としては、プロモーター並びに転写停止シグナル及び翻訳停止シグナルが挙げられる。制御配列には、バリアントをコードするポリヌクレオチドのコード領域と制御配列の連結を容易にする特異的な制限部位を導入するためのリンカーが設けられていてもよい。
発現：用語「発現」は、バリアントの産生に関与するあらゆる工程（例えば、限定されないが、転写、転写後修飾、翻訳、翻訳後修飾、及び分泌）を含む。
発現ベクター：用語「発現ベクター」は、バリアントをコードするポリヌクレオチドを含む直鎖状又は環状のＤＮＡ分子であって、その発現をもたらす制御配列に作動可能に連結されている直鎖状又は環状のＤＮＡ分子を意味する。
断片：用語「断片」は、成熟したポリペプチドのアミノ及び／又はカルボキシル末端に存在しない１つ以上の（例えば、いくつかの）アミノ酸を有するポリペプチドを意味しており；この断片は、プロテアーゼ活性を有する。
融合ポリペプチド：用語「融合ポリペプチド」は、１つのポリペプチドが本発明のバリアントのＮ末端又はＣ末端で融合されるポリペプチドである。融合ポリペプチドは、別のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを本発明のポリヌクレオチドに融合させることにより生成される。融合ポリペプチドを生成する技術は、当該技術分野で知られており、ポリペプチドをコードするコード配列を、それらがインフレームであり、且つ融合ポリペプチドの発現が同じプロモーター及びターミネーターの制御下にあるように結合することを含む。融合ポリペプチドはまた、融合ポリペプチドが翻訳後に作製されるインテイン技術を使用して構築され得る（Ｃｏｏｐｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９３，ＥＭＢＯ Ｊ．１２：２５７５－２５８３；Ｄａｗｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９４，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６６：７７６－７７９）。融合ポリペプチドはさらに、２つのポリペプチド間の切断部位を含むことができる。融合タンパク質が分泌されると、この部位が切断されて２つのポリペプチドが遊離する。開裂部位の例としては、下記で開示されている部位が挙げられるが、これらに限定されない：Ｍａｒｔｉｎ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｊ．Ｉｎｄ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３：５６８－５７６；Ｓｖｅｔｉｎａ ｅｔ ａｌ．，２０００，Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．７６：２４５－２５１；Ｒａｓｍｕｓｓｅｎ－Ｗｉｌｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．６３：３４８８－３４９３；Ｗａｒｄ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １３：４９８－５０３；及びＣｏｎｔｒｅｒａｓ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：３７８－３８１；Ｅａｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９８６，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ２５：５０５－５１２；Ｃｏｌｌｉｎｓ－Ｒａｃｉｅ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １３：９８２－９８７；Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，Ｆｕｎｃｔｉｏｎ，ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ６：２４０－２４８；及びＳｔｅｖｅｎｓ，２００３，Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｗｏｒｌｄ ４：３５－４８。
宿主細胞：用語「宿主細胞」は、本発明のポリヌクレオチドを含む核酸構築物又は発現ベクターによる形質転換、トランスフェクション、トランスダクションなどを受けやすい任意の細胞型を意味する。「宿主細胞」という用語は、複製中に生じる変異に起因して親細胞と同一ではない、親細胞のあらゆる子孫を包含する。
ハイブリッドポリペプチド：用語「ハイブリッドポリペプチド」は、２種以上のポリペプチド由来のドメイン、例えば、あるポリペプチド由来の結合モジュール及び別のポリペプチド由来の触媒ドメインを含むポリペプチドを意味する。ドメインは、Ｎ末端又はＣ末端で融合され得る。
改善された特性：用語「改善された特性」は、親と比較して改善されているバリアントと関連する特徴を意味する。そのような改善された特性としては、触媒効率、触媒速度、化学的安定性、酸化安定性、ｐＨ活性、ｐＨ安定性、ポリエステル分解活性、ポリエステル特異性、タンパク質分解安定性、溶解性、比活性、保管条件下での安定性、基質結合、基質切断、基質特異性、基質安定性、表面特性、熱活性、及び熱安定性が挙げられるが、これらに限定されない。
一態様では、本発明のバリアントは、改善された溶解性を有する。特に、本発明のバリアントは、例えば、発酵中のプロテアーゼ結晶形成の低減、及び／又はプロテアーゼ結晶溶解性の増大（又は換言すると、改善されたプロテアーゼ結晶再可溶化）を示す。プロテアーゼ結晶形成及びプロテアーゼ結晶溶解性は、下の実施例１に記載される手順に従って決定され得る。プロテアーゼ結晶溶解性はまた、プロテアーゼ結晶溶解の速度として決定され得る。この方法を使用して、プロテアーゼは、水性緩衝液中でその濃度を増大させること（例えば、回転濃縮機を介して）及び結晶化に好適な条件に達するまで塩濃度を増大させ、ｐＨ値を調整することによって結晶化させられる。結晶化の後、プロテアーゼ結晶溶解性は、結晶の溶解速度を測定することによって決定され得る。
一態様では、本発明のバリアントは、同等又は改善された溶解性を有する。プロテアーゼ活性は、下の実施例に記載されるプロテアーゼ活性アッセイに従って決定される。
単離された：用語「単離された」は、例えば、限定されないが、他のタンパク質、核酸、細胞などを含む天然に見出されるとおりに自然に会合される少なくとも１つの他の材料又は構成成分から分離されているポリペプチド、核酸、細胞、又は他の指定の材料若しくは構成成分を意味する。単離されたポリペプチドとしては、分泌されたポリペプチドを含有する培養ブロスが挙げられるが、これに限定されない。
成熟したポリペプチド：用語「成熟したポリペプチド」は、Ｎ末端プロセシング（例えば、シグナルペプチドの除去）後のその成熟した形態のポリペプチドを意味する。
変異体：用語「変異体」は、バリアントをコードするポリヌクレオチドを意味する。
核酸構築物：用語「核酸構築物」は、天然に存在する遺伝子から単離した、又は普通では自然界に存在することのない方法で核酸のセグメントを含有するように改変させた、又は１つ以上の制御配列を含む合成物である、一本鎖又は二本鎖のいずれかの核酸分子を意味する。
作動可能に連結された：用語「作動可能に連結された」は、制御配列がコード配列の発現を指示するように制御配列がポリヌクレオチドのコード配列に対して適切な位置に配置されている構成を意味する。
親又は親プロテアーゼ：用語「親」又は「親プロテアーゼ」は、本発明の酵素バリアントを生成するように改変がなされるプロテアーゼを意味する。親は、天然に存在する（野生型）ポリペプチド又はそのバリアント若しくは断片であり得る。
ポリマー：用語「ポリマー」は、構造が共有結合性の化学結合によって連結される複数の単量体（反復単位）で構成される化学的化合物又は化合物の混合物を意味する。本発明の文脈において、ポリマーという用語は、単一の種類の反復単位（すなわち、ホモポリマー）又は異なる反復単位の混合物（すなわち、コポリマー又はヘテロポリマー）で構成される天然又は合成ポリマーを含む。本発明によれば、用語「オリゴマー」は、ポリマーに対する参照において使用されるとき、２～約２０個の単量体を含有する分子を意味する。
精製された：「精製された」という用語は、当該技術分野においてよく知られた分析技術によって測定したときに、他の構成成分を実質的に含まない核酸又はポリペプチドを意味する（例えば、精製されたポリペプチド又は核酸は、電気泳動ゲル中で、クロマトグラフ溶出液中で、及び／又は密度勾配遠心分離を施した媒体中で分離したバンドを形成し得る）。精製された核酸又はポリペプチドは、少なくとも約５０％純粋であり、通常は、少なくとも約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％、約９９．５％、約９９．６％、約９９．７％、約９９．８％以上純粋である（例えば、モル基準の重量パーセント）。関連する意味では、精製又は濃縮手法を適用した後に分子の濃度が実質的に増加した場合、組成物は分子が濃縮されている。「濃縮された」という用語は、出発組成物よりも高い相対濃度又は絶対濃度で組成物中に存在する化合物、ポリペプチド、細胞、核酸、アミノ酸、又は他の特定の材料若しくは構成成分を指す。
組み換え：「組み換え」という用語は、細胞、核酸、タンパク質又はベクターに関して使用する場合、天然の状態から改変されていることを意味する。したがって、例えば、組み換え細胞は、細胞の天然形態内に見られない（非組み換え型）遺伝子を発現するか、又は自然界に見られるものと異なるレベル若しくは異なる条件下で天然の遺伝子を発現する。組み換え核酸は、１つ以上のヌクレオチドで天然配列とは異なっており、及び／又は異種配列、例えば、発現ベクターの異種プロモーターに作動可能に連結されている。組み換えタンパク質は、１つ以上のアミノ酸で天然配列とは異なっていてもよく、及び／又は異種配列と融合している。ポリペプチドをコードする核酸を含むベクターは、組み換えベクターである。「組み換え」という用語は、「遺伝子改変された」及び「遺伝子導入」と同義である。
配列同一性：２つのアミノ酸配列の間又は２つのヌクレオチド配列の間の関連性は、「配列同一性」というパラメータにより説明される。
本発明の目的のために、２つのアミノ酸配列間の配列相同性は、好ましくはバージョン６．６．０以降のＥＭＢＯＳＳパッケージ（ＥＭＢＯＳＳ；Ｔｈｅ Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｏｐｅｎ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｓｕｉｔｅ，Ｒｉｃｅ ｅｔ ａｌ．，２０００，Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ．１６；２７６－２７７）のＮｅｅｄｌｅプログラムに実装されているような、ニードルマン－ブンシュアルゴリズム（Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ ａｎｄ Ｗｕｎｓｃｈ，１９７０，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３－４５３）を使用して「最長の同一性（ｌｏｎｇｅｓｔ ｉｄｅｎｔｉｔｙ）」の出力として決定される。使用されるパラメータは、１０のギャップオープンペナルティ、０．５のギャップ伸長ペナルティ、及びＥＢＬＯＳＵＭ６２（ＢＬＯＳＵＭ６２のＥＭＢＯＳＳバージョン）置換マトリックスである。Ｎｅｅｄｌｅプログラムが最長の同一性を報告するために、ｎｏｂｒｉｅｆオプションをコマンドラインに指定しなければならない。「最長同一性」と表示されたＮｅｅｄｌｅ出力は、次のように計算される。
（同一残基×１００）／（アラインメントの長さ－アラインメント中のギャップの合計数）
本発明の目的のために、２つのポリヌクレオチド配列間の配列同一性は、好ましくはバージョン６．６．０以降のＥＭＢＯＳＳパッケージ（ＥＭＢＯＳＳ：Ｔｈｅ Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｏｐｅｎ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｓｕｉｔｅ，Ｒｉｃｅ ｅｔ ａｌ．，２０００、前掲）のＮｅｅｄｌｅプログラムに実装されているようなニードルマン－ブンシュアルゴリズム（Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ ａｎｄ Ｗｕｎｓｃｈ，１９７０，前掲）を使用して「最長の同一性」の出力として決定される。使用されるパラメータは、ギャップ開始ペナルティが１０、ギャップ伸長ペナルティが０．５、及びＥＤＮＡＦＵＬＬ（ＮＣＢＩ ＮＵＣ４．４のＥＭＢＯＳＳバージョン）置換行列である。Ｎｅｅｄｌｅプログラムが最長の同一性を報告するために、ｎｏｂｒｉｅｆオプションをコマンドラインに指定しなければならない。「最長の同一性」と標識されたＮｅｅｄｌｅの出力は、以下のとおりに計算される：
（同一デオキシリボヌクレオチド×１００）／（アラインメントの長さ－アラインメント中のギャップの総数）。
バリアント及びプロテアーゼバリアント：用語「バリアント」及び「プロテアーゼバリアント」は、親と比較して１つ以上の（例えば、いくつかの）位置で置換、挿入、及び／又は欠失を含むプロテアーゼ活性を有するポリペプチドを意味する。置換とは、ある位置のアミノ酸の異なるアミノ酸による置き換えを意味し；欠失とは、ある位置のアミノ酸の除去を意味し；また、挿入とは、ある位置のアミノ酸に隣接し、その直後に続いて１アミノ酸を付加することを意味する。本発明の目的のために、プロテアーゼ活性は、下の実施例に記載される手順に従って決定される。
野生型：アミノ酸配列又は核酸配列に関する用語「野生型」は、アミノ酸配列又は核酸配列が天然の配列又は天然に存在する配列であることを意味する。本明細書で使用する場合、用語「天然に存在する」は、天然に見出されるもの（例えば、タンパク質、アミノ酸、又は核酸配列）を指す。逆に、用語「天然に存在しない」は、天然に見出されないもの（例えば、研究室で生成された組み換え核酸及びタンパク質配列又は野生型配列の改変）を指す。
プロテアーゼバリアントの命名に関する従来法
本発明の目的のために、配列番号２のポリペプチドを使用して、本発明のバリアントにおける対応するアミノ酸残基番号を決定する。本発明のバリアントのアミノ酸配列は配列番号２とアラインメントされ、そのアラインメントに基づき、アミノ酸位置番号は、本発明のバリアントにおけるいずれかのアミノ酸残基に対応する。
配列番号１、３、４、５及び６に関して本明細書で使用される付番は、配列番号２の付番に基づく。したがって、配列番号１、３、４、５及び６に関して、アミノ酸残基は、配列番号２における対応するアミノ酸残基に基づいて付番される。具体的には、付番は、国際公開第１９８９／０６２７９号パンフレットの表１におけるアラインメントに基づき、サブチラーゼＢＰＮ’（ＢＡＳＢＰＮ）配列（表の配列ｃ）の成熟したポリペプチド及びＳａｖｉｎａｓｅ（登録商標）（ＢＬＳＡＶＩ）（表の配列ａ）としても知られるバチルス・クラウジイ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｌａｕｓｉｉ）由来のサブチリシン３０９の成熟したポリペプチドを含む５種のプロテアーゼのアラインメントを示す。当業者は、サブチリシン３０９及び特許文献における他のプロテアーゼのために使用される位置番号が、このアラインメントによるＢＰＮ’の対応する位置番号に基づく場合が多いことを知ることになる。
添付の図１は、参照の目的のために提供され、国際公開第１９８９／０６２７９号パンフレットの表１に基づく配列番号１と配列番号２の間のアラインメントを示し、配列番号２の位置に対応する位置番号は容易に決定され得る。
別のプロテアーゼ中の対応するアミノ酸残基の同定を、それぞれのデフォルトパラメータを使用していくつかのコンピュータプログラムを使用して、複数のポリペプチド配列のアラインメントにより決定することができ、このプログラムとして下記が挙げられるが、これらに限定されない：ＭＵＳＣＬＥ（対数予測による複数配列比較；バージョン３．５以降；Ｅｄｇａｒ，２００４，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３２：１７９２－１７９７）、ＭＡＦＦＴ（バージョン６．８５７以降；Ｋａｔｏｈ ａｎｄ Ｋｕｍａ，２００２，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３０：３０５９－３０６６；Ｋａｔｏｈ ｅｔ ａｌ．，２００５，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３３：５１１－５１８；Ｋａｔｏｈ ａｎｄ Ｔｏｈ，２００７，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ２３：３７２－３７４；Ｋａｔｏｈ ｅｔ ａｌ．，２００９，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ５３７：３９－６４；Ｋａｔｏｈ ａｎｄ Ｔｏｈ，２０１０，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ２６：１８９９－１９００）、及びＣｌｕｓｔａｌＷを採用するＥＭＢＯＳＳ ＥＭＭＡ（１．８３以降；Ｔｈｏｍｐｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９４，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２２：４６７３－４６８０）。
本発明のバリアントの説明では、言及を容易にするために、下記で説明する命名法が適応される。認められているＩＵＰＡＣ一文字又は三文字アミノ酸略語が採用される。
置換：アミノ酸置換の場合、下記の命名法が使用される：元のアミノ酸、位置、置換アミノ酸。したがって、２２６位でのスレオニンのアラニンへの置換は、「Ｔｈｒ２２６Ａｌａ」又は「Ｔ２２６Ａ」と指定される。複数の置換は、加算記号（「＋」）によって隔てられ、例えば、「Ｇｌｙ２０５Ａｒｇ＋Ｓｅｒ４１１Ｐｈｅ」又は「Ｇ２０５Ｒ＋Ｓ４１１Ｆ」は、２０５位のグリシン（Ｇ）をアルギニン（Ｒ）で、及び４１１位のセリン（Ｓ）をフェニルアラニン（Ｆ）でそれぞれ置換することを表す。或いは、複数の置換は、コンマ（「，」）によって隔てられてもよく、例えば、「Ｇｌｙ２０５Ａｒｇ，Ｓｅｒ４１１Ｐｈｅ」又は「Ｇ２０５Ｒ，Ｓ４１１Ｆ」である。
欠失：アミノ酸欠失の場合、下記の命名法が使用される：元のアミノ酸、位置、＊。したがって、１９５位のグリシンの欠失は、「Ｇｌｙ１９５＊」又は「Ｇ１９５＊」と指定される。複数の欠失は、加算記号（「＋」）によって隔てられ、例えば、「Ｇｌｙ１９５＊＋Ｓｅｒ４１１＊」又は「Ｇ１９５＊＋Ｓ４１１＊」である。或いは、複数の欠失は、カンマ（「，」）によって隔てられ得、例えば、「Ｇｌｙ１９５＊，Ｓｅｒ４１１＊」又は「Ｇ１９５＊、Ｓ４１１＊」である。
挿入：アミノ酸挿入の場合、下記の命名法が使用される：元のアミノ酸、位置、元のアミノ酸、挿入アミノ酸。したがって、１９５位でのグリシンの後のリジンの挿入は、「Ｇｌｙ１９５ＧｌｙＬｙｓ」又は「Ｇ１９５ＧＫ」と指定される。複数のアミノ酸の挿入は、［元のアミノ酸、位置、元のアミノ酸、挿入アミノ酸＃１、挿入アミノ酸＃２など］と指定される。例えば、１９５位のグリシンの後のリシン及びアラニンの挿入は、「Ｇｌｙ１９５ＧｌｙＬｙｓＡｌａ」又は「Ｇ１９５ＧＫＡ」と示される。
そのような場合、挿入されたアミノ酸残基は、この挿入されたアミノ酸残基に先行するアミノ酸残基の位置番号への小文字の追加により付番される。上記の例では、配列は下記のようになる。
複数の改変：複数の改変を含むバリアントは、追加の印（「＋」）によって隔てられ、例えば、「Ａｒｇ１７０Ｔｙｒ＋Ｇｌｙ１９５Ｇｌｕ」又は「Ｒ１７０Ｙ＋Ｇｌｙ１９５Ｅ」は、それぞれ１７０位及び１９５位のアルギニン及びグリシンのチロシン及びグルタミン酸による置換を表す。或いは、複数の改変は、コンマ（「，」）によって隔てられてもよく、例えば、「Ａｒｇ１７０Ｔｙｒ，Ｇｌｙ１９５Ｇｌｕ」又は「Ｒ１７０Ｙ，Ｇ１９５Ｅ」である。
異なる改変：ある位置で異なる改変が導入され得る場合、異なる改変がカンマによって隔てられ、例えば、「Ａｒｇ１７０Ｔｙｒ，Ｇｌｕ」は、１７０位でのアルギニンのチロシン又はグルタミン酸への置換を表す。そのため、「Ｔｙｒ１６７Ｇｌｙ，Ａｌａ＋Ａｒｇ１７０Ｇｌｙ，Ａｌａ」は、下記のバリアントを指定する：
「Ｔｙｒ１６７Ｇｌｙ＋Ａｒｇ１７０Ｇｌｙ」、「Ｔｙｒ１６７Ｇｌｙ＋Ａｒｇ１７０Ａｌａ」、「Ｔｙｒ１６７Ａｌａ＋Ａｒｇ１７０Ｇｌｙ」、及び「Ｔｙｒ１６７Ａｌａ＋Ａｒｇ１７０Ａｌａ」。
配列の概要
配列番号１は、Ｓａｖｉｎａｓｅ（登録商標）プロテアーゼのアミノ酸配列である。
配列番号２は、ＢＰＮ’プロテアーゼのアミノ酸配列である。
配列番号３は、配列番号１のバリアントのアミノ酸配列である。
配列番号４は、配列番号１のバリアントのアミノ酸配列である。
配列番号５は、配列番号１のバリアントのアミノ酸配列である。
配列番号６は、配列番号１のバリアントのアミノ酸配列である。
本発明の詳細な説明
本発明は、改善された溶解性を有する新規のプロテアーゼを提供する。本発明のプロテアーゼバリアントは、配列番号１の２１５位（すなわち、配列番号１の位置Ａ２１５）に対応する位置で正に荷電したアミノ酸又は極性アミノ酸を含む。この位置での正に荷電したアミノ酸又は極性アミノ酸の導入は、下の実施例に記載されるとおり、改善された溶解性、特に、プロテアーゼ結晶形成の低減及びプロテアーゼ結晶溶解性の増大をもたらす。
プロテアーゼバリアント
本発明は、親プロテアーゼのプロテアーゼバリアントに関し、バリアントは、配列番号１と少なくとも少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％であるが、１００％未満の配列同一性を有し、バリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含み、バリアントは、Ｘ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、又はそれ以上のさらなる改変、好ましくは、置換を含み、バリアントは、プロテアーゼ活性を有し、且つ位置番号は、配列番号２の付番に基づく。
ある実施形態では、第１の置換は、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択され；好ましくは、第１の置換は、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される。
ある実施形態では、第１の置換は、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択され；好ましくは、第１の置換は、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択され；最も好ましくは、第１の置換は、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される。
ある実施形態では、バリアントは、Ｘ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、又はそれ以上のさらなる改変、好ましくは、置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９Ｅ、Ｉ３５ＩＤ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ａ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１６０Ｓ、Ｇ１９５Ｅ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｋ２３５Ｌ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、又はそれ以上のさらなる改変、好ましくは、置換を含む。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、
ａ）Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０３Ａ、Ｇ１６０Ｓ、及びＶ２０５Ｉ；
ｂ）Ｉ３５ＩＤ、Ｎ７６Ｄ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１９５Ｅ、Ｋ２３５Ｌ；
ｃ）Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅ；並びに
ｄ）Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅ
からなる群から選択される置換の群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、又は５個のさらなる改変、好ましくは、置換を含む。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０３Ａ、Ｇ１６０Ｓ、及びＶ２０５Ｉからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、又は７個のさらなる置換を含む。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｉ３５ＩＤ、Ｎ７６Ｄ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１９５Ｅ、及びＫ２３５Ｌからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、又は５個のさらなる改変、好ましくは、置換を含む。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、又は１３個のさらなる置換を含む。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、又は９個のさらなる置換を含む。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換；好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換；最も好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有する配列番号１を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換；好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換；最も好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有する配列番号３を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換；好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換；最も好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有する配列番号４を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換；好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換；最も好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有する配列番号５を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換；好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換；最も好ましくは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有する配列番号６を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
上記の置換に加えて、バリアントはさらに、１つ以上の他の位置で置換を含んでもよい。
アミノ酸の変化は、タンパク質の折り畳み及び／又は活性に著しく影響を及ぼさない保存的アミノ酸置換又は挿入；典型的には１～３０アミノ酸の小規模な欠失；アミノ末端メチオニン残基などの小規模なアミノ末端又はカルボキシル末端伸長；最大２０～２５残基の小さいリンカーペプチド；又は正味の電荷又は別の機能を変えることにより精製を容易にする、ポリヒスチジン配列、抗原エピトープ又は結合ドメインなどの小規模な伸長である軽微なものであり得る。
保存的置換の例は、塩基性アミノ酸（アルギニン、リジン及びヒスチジン）、酸性アミノ酸（グルタミン酸及びアスパラギン酸）、極性アミノ酸（グルタミン及びアスパラギン）、疎水性アミノ酸（ロイシン、イソロイシン及びバリン）、芳香族アミノ酸（フェニルアラニン、トリプトファン及びチロシン）並びに小さいアミノ酸（グリシン、アラニン、セリン、トレオニン及びメチオニン）の群に含まれる。概して比活性を変えないアミノ酸置換は、当該技術分野で知られており、例えば、Ｈ．Ｎｅｕｒａｔｈ ａｎｄ Ｒ．Ｌ．Ｈｉｌｌ，１９７９，Ｉｎ，Ｔｈｅ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋに記載されている。一般的な置換としては、Ａｌａ／Ｓｅｒ、Ｖａｌ／Ｉｌｅ、Ａｓｐ／Ｇｌｕ、Ｔｈｒ／Ｓｅｒ、Ａｌａ／Ｇｌｙ、Ａｌａ／Ｔｈｒ、Ｓｅｒ／Ａｓｎ、Ａｌａ／Ｖａｌ、Ｓｅｒ／Ｇｌｙ、Ｔｙｒ／Ｐｈｅ、Ａｌａ／Ｐｒｏ、Ｌｙｓ／Ａｒｇ、Ａｓｐ／Ａｓｎ、Ｌｅｕ／Ｉｌｅ、Ｌｅｕ／Ｖａｌ、Ａｌａ／Ｇｌｕ、及びＡｓｐ／Ｇｌｙである。
或いは、アミノ酸変化は、ポリペプチドの物理化学的特性が変えられるような性質のものである。例えば、アミノ酸変化は、ポリペプチドの熱安定性を改善する場合があり、基質特異性を変える場合があり、至適ｐＨを変える場合などがある。
ポリペプチドにおいて必須のアミノ酸は、部位特異的変異誘発又はアラニンスキャニング変異誘発などの当該技術分野で知られる手順に従って同定され得る（Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍ ａｎｄ Ｗｅｌｌｓ，１９８９，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：１０８１－１０８５）。後者の技術では、分子の活性に極めて重要なアミノ酸残基を同定するために、分子内のあらゆる残基に単一のアラニン変異を導入して、結果として生じる変異体分子を活性について試験する。また、Ｈｉｌｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９６，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７１：４６９９－４７０８も参照されたい。酵素の活性部位又は他の生物学的相互作用は、推定される接触部位アミノ酸の変異との組み合わせにより、核磁気共嗚、結晶構造解析、電子回折又は光親和性標識などの技術によって測定される構造の物理的分析によって判定することもできる。例えば、ｄｅ Ｖｏｓ ｅｔ ａｌ．，１９９２，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５５：３０６－３１２；Ｓｍｉｔｈ ｅｔ ａｌ．，１９９２，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２４：８９９－９０４；Ｗｌｏｄａｖｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９２，ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ．３０９：５９－６４を参照されたい。必須アミノ酸の同一性はまた、関連ポリペプチドとのアラインメントから推測され得る。
本発明のバリアントは、改善された溶解性を有する。特に、本発明のバリアントは、下の実施例１に記載されるとおり、例えば、バリアントを発現する宿主細胞の発酵中のプロテアーゼ結晶形成の低減、並びにそのようなプロテアーゼ結晶の溶解性の増大を呈する。改善された溶解性は、当業者に知られる様々な方法を使用する際に決定され得る。好ましくは、改善された溶解性は、下の実施例１に従ってプロテアーゼ結晶形成の低減又はプロテアーゼ結晶溶解性の増大として決定される。
一実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有しない他の点で同一であるプロテアーゼと比較して改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有さず且つＸ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を有しない同一のプロテアーゼと比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、１０～３０℃で、好ましくは、１５～２５℃で、より好ましくは、約２０℃で、最も好ましくは、２０℃で改善された溶解性を有する。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、ｐＨ３～９で、好ましくは、ｐＨ４～８で、より好ましくは、ｐＨ４～６で、さらにより好ましくは、ｐＨ４～５で、最も好ましくは、ｐＨ４．５で改善された溶解性を有する。
好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、１５～２５℃及びｐＨ４～６で改善された溶解性を有する。好ましくは、プロテアーゼバリアントは、２０℃及びｐＨ４～５で改善された溶解性を有する。
一実施形態では、プロテアーゼバリアントは、配列番号１と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。
一実施形態では、プロテアーゼバリアントは、配列番号３と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。
一実施形態では、プロテアーゼバリアントは、配列番号４と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。
一実施形態では、プロテアーゼバリアントは、配列番号５と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。
一実施形態では、プロテアーゼバリアントは、配列番号６と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。
改善された溶解性に加えて、本発明のバリアントは、親と比較して１つ以上の改善された特性を有し得る。１つ以上の改善された特性は、触媒効率、触媒速度、化学的安定性、酸化安定性、ｐＨ活性、ｐＨ安定性、タンパク質分解安定性、比活性、保管条件下での安定性、基質結合、基質切断、基質特異性、基質安定性、表面特性、熱活性、及び熱安定性からなる群から選択され得る。
本発明のバリアントは、プロテアーゼ活性、好ましくは、同等又は改善されたプロテアーゼ活性を有する。一実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換を有しない他の点で同一であるプロテアーゼと比較して改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、プロテアーゼバリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を有さず且つＸ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を有しない同一のプロテアーゼと比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％改善されたプロテアーゼ活性を有する。
一実施形態では、バリアントは、配列番号１のプロテアーゼ活性と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。
一実施形態では、バリアントは、配列番号３のプロテアーゼ活性と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。
一実施形態では、バリアントは、配列番号４のプロテアーゼ活性と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。
一実施形態では、バリアントは、配列番号５のプロテアーゼ活性と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。
一実施形態では、バリアントは、配列番号６のプロテアーゼ活性と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。
一態様では、本発明は、配列番号１と少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％であるが、１００％未満の配列同一性を有するポリペプチド、好ましくは、単離された又は精製されたポリペプチドに関し、バリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される置換を含み、バリアントは、プロテアーゼ活性を有し、且つ位置番号は、配列番号２の付番に基づく。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ１２５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される置換を含む。一実施形態では、バリアントは、配列番号１と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。一実施形態では、バリアントは、配列番号１と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、１０～３０℃で、好ましくは、１５～２５℃で、より好ましくは、約２０℃で、最も好ましくは、２０℃で改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、ｐＨ３～９で、好ましくは、ｐＨ４～８で、より好ましくは、ｐＨ４～６で、さらにより好ましくは、ｐＨ４～５で、最も好ましくは、ｐＨ４．５で改善された安定性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｋを有する配列番号１を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｒを有する配列番号１を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｑを有する配列番号１を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｎを有する配列番号１を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｓを有する配列番号１を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｔを有する配列番号１を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、本発明は、配列番号３と少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％であるが、１００％未満の配列同一性を有するポリペプチド、好ましくは、単離された又は精製されたポリペプチドに関し、バリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含み、バリアントは、Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０３Ａ、Ｇ１６０Ｓ、及びＶ２０５Ｉからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、又は７個のさらなる置換を含み、バリアントは、プロテアーゼ活性を有し、且つ位置番号は、配列番号２の付番に基づく。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ１２５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。一実施形態では、バリアントは、配列番号３と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。一実施形態では、バリアントは、配列番号３と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、１０～３０℃で、好ましくは、１５～２５℃で、より好ましくは、約２０℃で、最も好ましくは、２０℃で改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、ｐＨ３～９で、好ましくは、ｐＨ４～８で、より好ましくは、ｐＨ４～６で、さらにより好ましくは、ｐＨ４～５で、最も好ましくは、ｐＨ４．５で改善された安定性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｋを有する配列番号３を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｒを有する配列番号３を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｑを有する配列番号３を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｎを有する配列番号３を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｓを有する配列番号３を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｔを有する配列番号３を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、本発明は、配列番号４と少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％であるが、１００％未満の配列同一性を有するポリペプチド、好ましくは、単離された又は精製されたポリペプチドに関し、バリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含み、バリアントは、Ｉ３５ＩＤ、Ｎ７６Ｄ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１９５Ｅ、及びＫ２３５Ｌからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、又は５個のさらなる置換を含み、バリアントは、プロテアーゼ活性を有し、且つ位置番号は、配列番号２の付番に基づく。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ１２５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。一実施形態では、バリアントは、配列番号４と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。一実施形態では、バリアントは、配列番号４と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、１０～３０℃で、好ましくは、１５～２５℃で、より好ましくは、約２０℃で、最も好ましくは、２０℃で改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、ｐＨ３～９で、好ましくは、ｐＨ４～８で、より好ましくは、ｐＨ４～６で、さらにより好ましくは、ｐＨ４～５で、最も好ましくは、ｐＨ４．５で改善された安定性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｋを有する配列番号４を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｒを有する配列番号４を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｑを有する配列番号４を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｎを有する配列番号４を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｓを有する配列番号４を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｔを有する配列番号４を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、本発明は、配列番号５と少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％であるが、１００％未満の配列同一性を有するポリペプチド、好ましくは、単離された又は精製されたポリペプチドに関し、バリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含み、バリアントは、Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、又は１３個のさらなる置換を含み、バリアントは、プロテアーゼ活性を有し、且つ位置番号は、配列番号２の付番に基づく。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ１２５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。一実施形態では、バリアントは、配列番号５と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。一実施形態では、バリアントは、配列番号５と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、１０～３０℃で、好ましくは、１５～２５℃で、より好ましくは、約２０℃で、最も好ましくは、２０℃で改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、ｐＨ３～９で、好ましくは、ｐＨ４～８で、より好ましくは、ｐＨ４～６で、さらにより好ましくは、ｐＨ４～５で、最も好ましくは、ｐＨ４．５で改善された安定性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｋを有する配列番号５を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｒを有する配列番号５を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｑを有する配列番号５を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｎを有する配列番号５を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｓを有する配列番号５を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｔを有する配列番号５を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、本発明は、配列番号６と少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％であるが、１００％未満の配列同一性を有するポリペプチド、好ましくは、単離された又は精製されたポリペプチドに関し、バリアントは、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含み、バリアントは、Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅからなる群から選択される少なくとも３個、例えば、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、又は９個のさらなる置換を含み、バリアントは、プロテアーゼ活性を有し、且つ位置番号は、配列番号２の付番に基づく。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ１２５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。好ましい実施形態では、バリアントは、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含む。一実施形態では、バリアントは、配列番号６と比較して、同等又は例えば、少なくとも１００％、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善されたプロテアーゼ活性を有する。一実施形態では、バリアントは、配列番号６と比較して、少なくとも５％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上の改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、１０～３０℃で、好ましくは、１５～２５℃で、より好ましくは、約２０℃で、最も好ましくは、２０℃で改善された溶解性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、ｐＨ３～９で、好ましくは、ｐＨ４～８で、より好ましくは、ｐＨ４～６で、さらにより好ましくは、ｐＨ４～５で、最も好ましくは、ｐＨ４．５で改善された安定性を有する。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｋを有する配列番号６を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｒを有する配列番号６を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｑを有する配列番号６を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｎを有する配列番号６を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｓを有する配列番号６を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。好ましい実施形態では、バリアントは、置換Ａ２１５Ｔを有する配列番号６を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
親プロテアーゼ
本発明のプロテアーゼバリアントは、任意の親プロテアーゼに基づき得る。親は、天然に存在する（野生型）ポリペプチド又はそのバリアント若しくは断片であり得る。
一態様では、親プロテアーゼは、少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列番号１のポリペプチドに対する配列同一性を有し、且つプロテアーゼ活性を有する。ある実施形態では、親のアミノ酸配列は、配列番号１のポリペプチドから最大２０個のアミノ酸、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個だけ異なる。ある実施形態では、親は、配列番号１のアミノ酸配列を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、親プロテアーゼは、少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列番号３のポリペプチドに対する配列同一性を有し、且つプロテアーゼ活性を有する。ある実施形態では、親のアミノ酸配列は、配列番号３のポリペプチドから最大２０個のアミノ酸、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個だけ異なる。ある実施形態では、親は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、親プロテアーゼは、少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列番号４のポリペプチドに対する配列同一性を有し、且つプロテアーゼ活性を有する。ある実施形態では、親のアミノ酸配列は、配列番号４のポリペプチドから最大２０個のアミノ酸、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個だけ異なる。ある実施形態では、親は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、親プロテアーゼは、少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列番号５のポリペプチドに対する配列同一性を有し、且つプロテアーゼ活性を有する。ある実施形態では、親のアミノ酸配列は、配列番号５のポリペプチドから最大２０個のアミノ酸、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個だけ異なる。ある実施形態では、親は、配列番号５のアミノ酸配列を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
一態様では、親プロテアーゼは、少なくとも８０％、例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列番号６のポリペプチドに対する配列同一性を有し、且つプロテアーゼ活性を有する。ある実施形態では、親のアミノ酸配列は、配列番号６のポリペプチドから最大２０個のアミノ酸、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個だけ異なる。ある実施形態では、親は、配列番号６のアミノ酸配列を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる。
親ポリペプチドは、一方のポリペプチドの領域がもう一方のポリペプチドの領域のＮ末端又はＣ末端で融合されているハイブリッドポリペプチドであり得る。
親は、別のポリペプチドが本発明のポリペプチドのＮ末端又はＣ末端で融合されている融合ポリペプチド又は切断可能な融合ポリペプチドであり得る。融合ポリペプチドは、別のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを本発明のポリヌクレオチドに融合させることにより生成される。融合ポリペプチドを生成する技術は、当該技術分野で知られており、ポリペプチドをコードするコード配列を、それらがインフレームであり、且つ融合ポリペプチドの発現が同じプロモーター及びターミネーターの制御下にあるように結合することを含む。融合ポリペプチドはまた、融合ポリペプチドが翻訳後に作製されるインテイン技術を使用して構築され得る（Ｃｏｏｐｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９３，ＥＭＢＯ Ｊ．１２：２５７５－２５８３；Ｄａｗｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９４，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６６：７７６－７７９）。
融合ポリペプチドはさらに、２つのポリペプチド間の切断部位を含むことができる。融合タンパク質が分泌されると、この部位が切断されて２つのポリペプチドが遊離する。開裂部位の例としては、下記で開示されている部位が挙げられるが、これらに限定されない：Ｍａｒｔｉｎ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｊ．Ｉｎｄ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３：５６８－５７６；Ｓｖｅｔｉｎａ ｅｔ ａｌ．，２０００，Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．７６：２４５－２５１；Ｒａｓｍｕｓｓｅｎ－Ｗｉｌｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．６３：３４８８－３４９３；Ｗａｒｄ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １３：４９８－５０３；及びＣｏｎｔｒｅｒａｓ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：３７８－３８１；Ｅａｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９８６，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ２５：５０５－５１２；Ｃｏｌｌｉｎｓ－Ｒａｃｉｅ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １３：９８２－９８７；Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，Ｆｕｎｃｔｉｏｎ，ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ６：２４０－２４８；及びＳｔｅｖｅｎｓ，２００３，Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｗｏｒｌｄ ４：３５－４８。
親は、任意の属の微生物から得てもよい。本発明の目的のために、「から得られる」という用語は、所与の供給源に関連して本明細書で使用される場合、ポリヌクレオチドによりコードされる親が、供給源により産生されているか又は供給源からのポリヌクレオチドが挿入されている株により産生されていることと意味する。一態様では、親は細胞外に分泌される。
親は、細菌のプロテアーゼであり得る。例えば、親は、バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ゲオバチルス属（Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ラクトコッカス属（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）、オセアノバチルス属（Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、スタフィロコッカス属（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、若しくはストレプトマイセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）のプロテアーゼなどのグラム陽性細菌性ポリペプチド、又はカンピロバクター属（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）、フラボバクテリウム属（Ｆｌａｖｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ヘリコバクター属（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ）、イリオバクター属（Ｉｌｙｏｂａｃｔｅｒ）、ナイセリア属（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ）、シュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、サルモネラ属（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）、若しくはウレアプラズマ属（Ｕｒｅａｐｌａｓｍａ）のプロテアーゼなどのグラム陰性細菌性ポリペプチドであり得る。
一態様では、親は、バチルス・アルカロフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｌｋａｌｏｐｈｉｌｕｓ）、バチルス・アミロリケファシエンス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、バチルス・ブレビ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｒｅｖｉｓ）、バチルス・サーキュランス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｉｒｃｕｌａｎｓ）、バチルス・クラウジイ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｌａｕｓｉｉ）、バチルス・コアグランス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏａｇｕｌａｎｓ）、バチルス・フィルムス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｉｒｍｕｓ）、バチルス・ロータス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌａｕｔｕｓ）、バチルス・レンタス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｓ）、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バチルス・メガテリウム（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）、バチルス・プミルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｕｍｉｌｕｓ）、バチルス・ステアロサーモフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）又はバチルス・チューリンゲンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）のプロテアーゼである。
別の態様では、親は、ストレプトコッカス・エキシミリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉｓｉｍｉｌｉｓ）、ストレプトコッカス・ピオゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｙｏｇｅｎｅｓ）、ストレプトコッカス・ウベリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｕｂｅｒｉｓ）、又はストレプトコッカス・エクイ亜種ズーエピデミカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉ ｓｕｂｓｐ．Ｚｏｏｅｐｉｄｅｍｉｃｕｓ）のプロテアーゼである。
別の態様では、親は、ストレプトマイセス・アクロモゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ａｃｈｒｏｍｏｇｅｎｅｓ）、ストレプトマイセス・アベルミティリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ａｖｅｒｍｉｔｉｌｉｓ）、ストレプトマイセス・セリカラー（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｃｏｅｌｉｃｏｌｏｒ）、ストレプトマイセス・グリセウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｇｒｉｓｅｕｓ）、又はストレプトマイセス・リビダンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｌｉｖｉｄａｎｓ）のプロテアーゼである。
前述の種に関して、本発明は、完全及び不完全な状態の両方並びにそれらが知られている種の名称にかかわらず、他の分類学上の均等物、例えば、アナモルフを包含することが理解されるであろう。当業者は、適切な均等物の同一性を容易に認識するであろう。
これらの種の株は、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）、Ｄｅｕｔｓｃｈｅ Ｓａｍｍｌｕｎｇ ｖｏｎ Ｍｉｋｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｅｎ ｕｎｄ Ｚｅｌｌｋｕｌｔｕｒｅｎ ＧｍｂＨ（ＤＳＭＺ）、Ｃｅｎｔｒａａｌｂｕｒｅａｕ Ｖｏｏｒ Ｓｃｈｉｍｍｅｌｃｕｌｔｕｒｅｓ（ＣＢＳ）及びＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ Ｐａｔｅｎｔ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ、Ｎｏｒｔｈｅｒｎ Ｒｅｇｉｏｎａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｅｎｔｅｒ（ＮＲＲＬ）などのいくつかのカルチャーコレクションにおいて公的に容易に利用可能である。
親は、上記のプローブを用いて、自然界（例えば、土壌、堆肥、水など）から単離される微生物又は天然の物質（例えば、土壌、堆肥、水など）から直接得られるＤＮＡ試料を含む他の供給源から同定され且つ得られてもよい。自然の生育地から微生物及びＤＮＡを直接単離するための手法は、当該技術分野においてよく知られている。次に、親をコードするポリヌクレオチドを、別の微生物のゲノムＤＮＡ若しくはｃＤＮＡライブラリー又は混合ＤＮＡ試料を同様にスクリーニングすることによって得てもよい。１つ又は複数のプローブを用いて親をコードするポリヌクレオチドを検出してから、当業者に知られる技術を利用することにより、ポリヌクレオチドを単離又はクローン化することができる（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，１９８９を参照されたい）。
プロテアーゼバリアントの作製
本発明はまた、プロテアーゼバリアントを得るための方法であって、
（ａ）親プロテアーゼにＸ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を導入すること；及びＸ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を導入すること（バリアントは、プロテアーゼ活性を有する）；並びに
（ｂ）バリアントを回収すること
を含む方法に関する。
一実施形態では、第１の置換は、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択され；好ましくは、第１の置換は、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される。
一実施形態では、第１の置換は、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択され；好ましくは、第１の置換は、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択され；最も好ましくは、第１の置換は、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される。
一実施形態では、少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換は、Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９Ｅ、Ｉ３５ＩＤ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ａ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１６０Ｓ、Ｇ１９５Ｅ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｋ２３５Ｌ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅからなる群から選択される。
一実施形態では、少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換は、
ａ）Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０３Ａ、Ｇ１６０Ｓ、及びＶ２０５Ｉ；
ｂ）Ｉ３５ＩＤ、Ｎ７６Ｄ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１９５Ｅ、Ｋ２３５Ｌ；
ｃ）Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅ；並びに
ｄ）Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅ
からなる群の１つから選択される。
バリアントは、部位特異的変異誘発、合成的遺伝子構築、半合成的遺伝子構築、ランダム変異誘発、シャッフリングなどの当該技術分野で知られる任意の変異誘発手順を使用して調製され得る。
部位特異的変異誘発は、１つ以上の変異が親をコードするポリヌクレオチドにおける１つ以上の定義された部位で導入される手法である。
部位特異的変異誘発は、所望の変異を含有するオリゴヌクレオチドプライマーの使用を含むＰＣＲによってインビトロで達成され得る。部位特異的変異誘発は、親をコードするポリヌクレオチドを含むプラスミド中の部位での制限酵素による開裂、及びその後のこのポリヌクレオチド中の変異を含むオリゴヌクレオチドのライゲーションを含むカセット変異誘発によってもインビトロで実施され得る。通常、プラスミド及びオリゴヌクレオチドを消化する制限酵素は同一であり、プラスミド及びインサートの付着末端が互いにライゲートされ得る。例えば、Ｓｃｈｅｒｅｒ ａｎｄ Ｄａｖｉｓ，１９７９，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７６：４９４９－４９５５；及びＢａｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９０，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１８：７３４９－４９６６を参照されたい。
部位特異的変異誘発はまた、当該技術分野で知られる方法によってインビボで達成され得る。例えば、米国特許出願公開第２００４／０１７１１５４号明細書；Ｓｔｏｒｉｃｉ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１９：７７３－７７６；Ｋｒｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．４：２８５－２９０；及びＣａｌｉｓｓａｎｏ ａｎｄ Ｍａｃｉｎｏ，１９９６，Ｆｕｎｇａｌ Ｇｅｎｅｔ．Ｎｅｗｓｌｅｔｔ．４３：１５－１６を参照されたい。
任意の部位特異的変異誘発手順が、本発明において使用され得る。バリアントを調製するために使用され得る利用可能なキットが多数市販されている。
合成遺伝子構築法は、目的のポリペプチドをコードするために設計されたポリヌクレオチド分子のインビトロ合成を必要とする。遺伝子合成を、Ｔｉａｎら（２００４，Ｎａｔｕｒｅ ４３２：１０５０－１０５４）により説明されている多重マイクロチップベース技術、及びオリゴヌクレオチドが合成されて光プログラム可能なマイクロ流体チップ上で組み立てられる同様の技術等の多くの技術を利用して実施し得る。
単一又は複数のアミノ酸の置換、欠失、及び／又は挿入は、既知の変異誘発、組み換え及び／又はシャッフリングの方法、続いてＲｅｉｄｈａａｒ－Ｏｌｓｏｎ ａｎｄ Ｓａｕｅｒ，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４１：５３－５７；Ｂｏｗｉｅ ａｎｄ Ｓａｕｅｒ，１９８９，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６；２１５２－２１５６；国際公開第９５／１７４１３号パンフレット；又は国際公開第９５／２２６２５号パンフレットに開示されているものなどの関連するスクリーニング手順を使用してなされ、試験され得る。使用され得る他の方法としては、エラープローンＰＣＲ、ファージディスプレイ（例えば、Ｌｏｗｍａｎ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ３０；１０８３２－１０８３７；米国特許第５，２２３，４０９号明細書；国際公開第９２／０６２０４号パンフレット）及び領域特異的変異誘発（Ｄｅｒｂｙｓｈｉｒｅ ｅｔ ａｌ．，１９８６，Ｇｅｎｅ ４６；１４５；Ｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８８，ＤＮＡ ７；１２７）が挙げられる。
変異誘発／シャッフリング方法は、宿主細胞によって発現されるクローン化された変異誘発ポリペプチドの活性を検出するためのハイスループットの自動化されたスクリーニング方法と組み合わされ得る（Ｎｅｓｓ ｅｔ ａｌ．，１９９９，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １７：８９３－８９６）。活性ポリペプチドをコードする変異が誘発されたＤＮＡ分子を宿主細胞から回収し、当該技術分野における標準的な方法を使用して容易に配列決定することができる。この方法により、ポリペプチド中の個々のアミノ酸残基の重要性の迅速な決定が可能になる。
半合成的遺伝子構築は、合成的遺伝子構築、及び／又は部位特異的変異誘発、及び／又はランダム変異誘発、及び／又はシャッフリングの態様を組み合わせることによって達成される。半合成構築は、ＰＣＲ技術と組み合わされた、合成されるポリヌクレオチド断片を利用するプロセスに代表される。したがって、遺伝子の規定された領域は、新規に合成されてもよいが、他の領域は、部位特異的変異誘発プライマーを使用して増幅されてもよく、さらに他の領域は、エラープローンＰＣＲ又は非エラープローンＰＣＲ増幅にかけられてもよい。次に、ポリヌクレオチド部分配列は、シャッフリングされてもよい。
ポリヌクレオチド
本発明はまた、本発明のバリアントをコードする単離されたポリヌクレオチドに関する。
ポリヌクレオチドを単離するか又はクローン化するために使用される技術は、当該技術分野で知られ、ゲノムＤＮＡ若しくはｃＤＮＡ、又はその組み合わせからの単離を含む。ゲノムＤＮＡからのポリヌクレオチドのクローン化は、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）又は共有された構造的特徴を有するクローン化されたＤＮＡ断片を検出するための発現ライブラリーの抗体スクリーニングを使用することによって達成され得る。例えば、Ｉｎｎｉｓ ｅｔ ａｌ．，１９９０，ＰＣＲ：Ａ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋを参照されたい。リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、ライゲーション活性化転写（ＬＡＴ）及びポリヌクレオチドに基づく増幅（ＮＡＳＢＡ）などの他の核酸増幅手順が使用されてもよい。
核酸構築物
本発明はまた、本発明のバリアントをコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物であって、ポリヌクレオチドが、制御配列と適合する条件下で好適な宿主細胞においてコード配列の発現を誘導する１つ以上の制御配列に作動可能に連結されている核酸構築物に関する。
ポリヌクレオチドは、バリアントの発現をもたらす様々な方法において操作され得る。ベクターに挿入する前に、発現ベクターに応じてポリヌクレオチドを操作することが望ましいか、又は必要であり得る。組み換えＤＮＡ法を利用した、ポリヌクレオチドを改変するための技法は、当該技術分野においてよく知られている。
制御配列は、プロモーター（本発明のバリアントをコードするポリヌクレオチドの発現のために宿主細胞によって認識されるポリヌクレオチド）であってもよい。プロモーターは、変異体の発現を媒介する転写制御配列を含んでいる。プロモーターは、変異体、短縮型及びハイブリッドプロモーターを含む、宿主細胞において転写活性を示す任意のポリヌクレオチドであってもよく、宿主と同種又は異種のいずれかの細胞外又は細胞内ポリペプチドをコードする遺伝子から得てもよい。
細菌性宿主細胞内で本発明の核酸構築物の転写を誘導する好適なプロモーターの例は、バチルス・アミロリケファシエンス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）のα－アミラーゼ遺伝子（ａｍｙＱ）、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）のα－アミラーゼ遺伝子（ａｍｙＬ）、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）のペニシリナーゼ遺伝子（ｐｅｎＰ）、バチルス・ステアロサーモフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）のマルトース生成アミラーゼ遺伝子（ａｍｙＭ）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）のレバンスクラーゼ遺伝子（ｓａｃＢ）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）のｘｙｌＡ及びｘｙｌＢ遺伝子、バチルス・チューリンゲンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）のｃｒｙＩＩＩＡ遺伝子（Ａｇａｉｓｓｅ ａｎｄ Ｌｅｒｅｃｌｕｓ，１９９４，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ １３；９７－１０７）、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）のＬａｃオペロン、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）のｔｒｃプロモーター（Ｅｇｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｇｅｎｅ ６９；３０１－３１５）、ストレプトマイセス・セリカラー（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｃｏｅｌｉｃｏｌｏｒ）のアガラーゼ遺伝子（ｄａｇＡ）、及び原核生物のβ－ラクタマーゼ遺伝子（Ｖｉｌｌａ－Ｋａｍａｒｏｆｆ ｅｔ ａｌ．，１９７８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７５：３７２７－３７３１）から得られるプロモーター、並びにｔａｃプロモーター（ＤｅＢｏｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８０：２１－２５）である。さらなるプロモーターは、Ｇｉｌｂｅｒｔ ｅｔ ａｌ．，１９８０，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ａｍｅｒｉｃａｎ ２４２：７４－９４中の”Ｕｓｅｆｕｌ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｆｒｏｍ ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ｂａｃｔｅｒｉａ”；及びＳａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，１９８９に記載される。国際公開第９９／４３８３５号パンフレットでは、タンデムプロモーターの例が開示されている。
糸状真菌宿主細胞において本発明の核酸構築物の転写を誘導するための好適なプロモーターの例は、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）のアセトアミダーゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）の中性アルファ－アミラーゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）の酸安定性アルファ－アミラーゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）又はアスペルギルス・アワモリ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ａｗａｍｏｒｉ）のグルコアミラーゼ（ｇｌａＡ）、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のＴＡＫＡアミラーゼ、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のアルカリプロテアーゼ、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のトリオースリン酸イソメラーゼ、フザリウム・オキシスポラム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）のトリプシン様プロテアーゼ（国際公開第９６／００７８７号パンフレット）、フザリウム・ベネナタム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｅｎｅｎａｔｕｍ）アミログルコシダーゼ（国際公開第００／５６９００号パンフレット）、フザリウム・ベネナタム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｅｎｅｎａｔｕｍ）のダリア（Ｄａｒｉａ）（国際公開第００／５６９００号パンフレット）、フザリウム・ベネナタム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｅｎｅｎａｔｕｍ）のクイン（Ｑｕｉｎｎ）（国際公開第００／５６９００号パンフレット）、リゾムコール・ミーヘイ（Ｒｈｉｚｏｍｕｃｏｒ ｍｉｅｈｅｉ）のリパーゼ、リゾムコール・ミーヘイ（Ｒｈｉｚｏｍｕｃｏｒ ｍｉｅｈｅｉ）のアスパラギン酸プロテイナーゼ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のベータ－グルコシダーゼ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のセロビオヒドロラーゼＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のセロビオヒドロラーゼＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＩＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＶ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のキシラナーゼＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のキシラナーゼＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のキシラナーゼＩＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のベータ－キシロシダーゼ、及びトリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）の翻訳伸長因子から得られるプロモーター、並びにＮＡ２－ｔｐｉプロモーター（非翻訳リーダーがアスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）のトリオースリン酸イソメラーゼ遺伝子由来の非翻訳リーダーによって置き換えられたアスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）の中性アルファ－アミラーゼ遺伝子に由来する改変プロモーターであり；非限定的な例としては、非翻訳リーダーが、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）又はアスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のトリオースリン酸イソメラーゼ遺伝子由来の非翻訳リーダーによって置き換えられたアスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）の中性アルファ－アミラーゼ遺伝子に由来する改変プロモーターが挙げられる）；並びにその変異体、短縮型及びハイブリッドプロモーターが挙げられる。他のプロモーターは、米国特許第６，０１１，１４７号明細書に記載される。
酵母宿主において、有用なプロモーターは、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のエノラーゼ（ＥＮＯ－１）、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のガラクトキナーゼ（ＧＡＬ１）、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のアルコール脱水素酵素／グリセルアルデヒド－３－リン酸脱水素酵素（ＡＤＨ１、ＡＤＨ２／ＧＡＰ）、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のトリオースリン酸イソメラーゼ（ＴＰＩ）、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のメタロチオネイン（ＣＵＰ１）及びサッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）の３－ホスホグリセリン酸キナーゼに関する遺伝子から得られる。酵母宿主細胞のための他の有用なプロモーターは、Ｒｏｍａｎｏｓ ｅｔ ａｌ．，１９９２，Ｙｅａｓｔ ８：４２３－４８８によって記載される。
制御配列はまた、転写を終了するために宿主細胞によって認識される転写ターミネーターであってもよい。ターミネーターは、バリアントをコードするポリヌクレオチドの３’末端に作動可能に連結される。宿主細胞中で機能的な任意のターミネーターが本発明において使用され得る。
細菌性宿主細胞のための好ましいターミネーターは、バチルス・クラウジイ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｌａｕｓｉｉ）のアルカリ性プロテアーゼ（ａｐｒＨ）、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）のα－アミラーゼ（ａｍｙＬ）、及び大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）のリボソームＲＮＡ（ｒｒｎＢ）の遺伝子から得られる。
糸状真菌宿主細胞のために好ましいターミネーターは、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）のアセトアミダーゼ、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）のアントラニル酸シンターゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）のグルコアミラーゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）のアルファ－グルコシダーゼ、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のＴＡＫＡアミラーゼ、フザリウム・オキシスポルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）のトリプシン様プロテアーゼ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のベータ－グルコシダーゼ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のセロビオヒドロラーゼＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のセロビオヒドロラーゼＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＩＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のエンドグルカナーゼＶ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のキシラナーゼＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のキシラナーゼＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のキシラナーゼＩＩＩ、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のベータ－キシロシダーゼ及びトリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）の翻訳伸長因子に関する遺伝子から得られる。
酵母宿主のための好ましいターミネーターは、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のエノラーゼ、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のシトクロムＣ（ＣＹＣ１）及びサッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のグリセルアルデヒド－３－リン酸脱水素酵素に関する遺伝子から得られる。酵母宿主細胞のための他の有用なターミネーターは、Ｒｏｍａｎｏｓ ｅｔ ａｌ．，１９９２、上掲によって記載される。
制御配列は、プロモーターの下流及び遺伝子の発現を増大させる遺伝子のコード配列の上流のｍＲＮＡ安定化領域でもあり得る。
好適なｍＲＮＡ安定化領域の例は、バチルス・チューリンゲンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）のｃｒｙＩＩＩＡ遺伝子（国際公開第９４／２５６１２号パンフレット）及びバチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）ＳＰ８２遺伝子（Ｈｕｅ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ １７７：３４６５－３４７１）から得られる。
制御配列は、宿主細胞による翻訳に重要であるｍＲＮＡのリーダー非翻訳領域でもあり得る。リーダーは、バリアントをコードするポリヌクレオチドの５’末端に作動可能に連結される。宿主細胞内で機能的な任意のリーダーを使用してもよい。
糸状真菌宿主細胞のために好ましいリーダーは、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のＴＡＫＡアミラーゼ及びアスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）のトリオースリン酸イソメラーゼに関する遺伝子から得られる。
酵母宿主細胞のための好適なリーダーは、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のエノラーゼ（ＥＮＯ－１）、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）の３－ホスホグリセリン酸キナーゼ、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のα因子及びサッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のアルコール脱水素酵素／グリセルアルデヒド－３－リン酸脱水素酵素（ＡＤＨ２／ＧＡＰ）に関する遺伝子から得られる。
制御配列はまた、ポリヌクレオチドの３’末端に作動可能に連結された配列であり、転写されるとき、宿主細胞によってシグナルとして認識され、転写されたｍＲＮＡにポリアデノシン残基を付加するポリアデニル化配列であり得る。宿主細胞内で機能的な任意のポリアデニル化配列を使用してもよい。
糸状真菌宿主細胞のための好ましいポリアデニル化配列は、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）のアントラニル酸シンターゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）のグルコアミラーゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）のα－グルコシダーゼ、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のＴＡＫＡアミラーゼ、及びフザリウム・オキシスポラム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）のトリプシン様プロテアーゼの遺伝子から得られる。
酵母菌宿主細胞のための有用なポリアデニル化配列は、Ｇｕｏ ａｎｄ Ｓｈｅｒｍａｎ，１９９５，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｂｉｏｌ．１５：５９８３－５９９０によって記載される。
制御配列はまた、バリアントのＮ末端に連結されるシグナルペプチドをコードし、且つバリアントを細胞の分泌経路に導くシグナルペプチドコード領域であり得る。ポリヌクレオチドのコード配列の５’末端は、バリアントをコードするコード配列のセグメントと共に、翻訳読み枠において本来連結されるシグナルペプチドコード配列を本質的に含有し得る。或いは、コード配列の５’末端は、コード配列に対して外来であるシグナルペプチドコード配列を含み得る。外来シグナルペプチドコード配列は、コード配列がシグナルペプチドコード配列を天然に含有しない場合に必要とされる場合がある。或いは、外来シグナルペプチドコード配列により、バリアントの分泌を増強するために天然のシグナルペプチドコード配列を単に置き換えてもよい。しかしながら、発現されたバリアントを宿主細胞の分泌経路に導く任意のシグナルペプチドコード配列が使用され得る。
細菌宿主細胞のための効果的なシグナルペプチドコード配列は、バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）ＮＣＩＢ １１８３７マルトース生成アミラーゼ、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）のサブチリシン、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）のベータ－ラクタマーゼ、バチルス・ステアロサーモフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）のアルファ－アミラーゼ、バチルス・ステアロサーモフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）の中性プロテアーゼ（ｎｐｒＴ、ｎｐｒＳ、ｎｐｒＭ）及びバチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）のｐｒｓＡに関する遺伝子から得られるシグナルペプチドコード配列である。さらなるシグナルペプチドは、Ｓｉｍｏｎｅｎ ａｎｄ Ｐａｌｖａ，１９９３，Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ ５７：１０９－１３７によって記載される。
糸状真菌宿主細胞のための効果的なシグナルペプチドコード配列は、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）の中性アミラーゼ、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）のグルコアミラーゼ、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のＴＡＫＡアミラーゼ、フミコラ・インソレンス（Ｈｕｍｉｃｏｌａ ｉｎｓｏｌｅｎｓ）のセルラーゼ、フミコラ・インソレンス（Ｈｕｍｉｃｏｌａ ｉｎｓｏｌｅｎｓ）のエンドグルカナーゼＶ、フミコラ・ラヌギノーサ（Ｈｕｍｉｃｏｌａ ｌａｎｕｇｉｎｏｓａ）のリパーゼ及びリゾムコール・ミーヘイ（Ｒｈｉｚｏｍｕｃｏｒ ｍｉｅｈｅｉ）のアスパラギン酸プロテイナーゼに関する遺伝子から得られるシグナルペプチドコード配列である。
酵母菌宿主細胞のための有用なシグナルペプチドは、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のα因子、及びサッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のインベルターゼの遺伝子から得られる。他の有用なシグナルペプチドコード配列は、Ｒｏｍａｎｏｓ ｅｔ ａｌ．，１９９２、上掲によって記載される。
制御配列はまた、バリアントのＮ末端に位置するプロペプチドをコードするポリペプチドコード配列であり得る。得られるポリペプチドは、プロ酵素又はプロポリペプチド（又は場合によっては酵素前駆体）として知られる。プロポリペプチドは、一般的に不活性であり、このプロポリペプチドからのプロペプチドの触媒的又は自己触媒的な開裂により、活性バリアントに変換され得る。プロペプチドコード配列は、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）のアルカリプロテアーゼ（ａｐｒＥ）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）の中性プロテアーゼ（ｎｐｒＴ）、ミセリオフトラ・サーモフィラ（Ｍｙｃｅｌｉｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ）のラッカーゼ（国際公開第９５／３３８３６号パンフレット）、リゾムコール・ミーヘイ（Ｒｈｉｚｏｍｕｃｏｒ ｍｉｅｈｅｉ）のアスパラギン酸プロテイナーゼ、及びサッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）のα因子の遺伝子から得られてもよい。
シグナルペプチド及びプロペプチド配列の両方が存在する場合、プロペプチド配列は、バリアントのＮ末端の隣に位置し、シグナルペプチド配列は、プロペプチド配列のＮ末端の隣に位置する。
宿主細胞の増殖に対してバリアントの発現を制御する制御配列を加えることが望ましい場合もある。制御配列の例は、制御化合物の存在を含む化学的刺激又は物理的刺激に反応して遺伝子の発現をオン又はオフにするものである。原核生物系での制御配列としては、ｌａｃオペレーター系、ｔａｃオペレーター系、及びｔｒｐオペレーター系が挙げられる。酵母では、ＡＤＨ２系又はＧＡＬ１系が使用され得る。糸状真菌では、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）のグルコアミラーゼプロモーター、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のＴＡＫＡアルファ－アミラーゼプロモーター及びアスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のグルコアミラーゼプロモーター、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のセロビオヒドロラーゼＩプロモーター及びトリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）のセロビオヒドロラーゼＩＩプロモーターが使用され得る。制御配列の他の例は、遺伝子増幅を可能にするものである。真核生物系では、これらの制御配列として、メトトレキサートの存在下で増幅されるジヒドロ葉酸レダクターゼ遺伝子、及び重金属により増幅されるメタロチオネイン遺伝子が挙げられる。これらの場合、バリアントをコードするポリヌクレオチドは、制御配列に作動可能に連結されているであろう。
発現ベクター
本発明はまた、本発明のバリアントをコードするポリヌクレオチド、プロモーター、並びに転写及び翻訳終止シグナルを含む組み換え発現ベクターに関する。１つ以上の都合のよい制限部位を含み、そのような部位でバリアントをコードするポリヌクレオチドを挿入又は置換することを可能にし得る組み換え発現ベクターを作製するために、様々なヌクレオチド及び制御配列を共に連結してもよい。或いは、発現に適切なベクターにポリヌクレオチド又はポリヌクレオチドを含む核酸構築物を挿入することによってポリヌクレオチドを発現させてもよい。発現ベクターを作製する際に、コード配列が発現に適切な制御配列に作動可能に連結されるように、コード配列をベクター内に配置する。
組み換え発現ベクターは、組み換えＤＮＡ手順を好都合に施すことができ、ポリヌクレオチドの発現をもたらすことが可能な任意のベクター（例えば、プラスミド又はウイルス）であり得る。このベクターの選択は、典型的には、このベクターと、このベクターが導入される宿主細胞との適合性に依存することになる。このベクターは、直鎖状又は閉環状のプラスミドであり得る。
ベクターは、自己複製ベクター、すなわち、その複製が染色体複製とは独立した染色体外のエレメントとして存在するベクター、例えば、プラスミド、染色体外エレメント、微小染色体、又は人工染色体であり得る。このベクターは、確実に自己複製するための任意の手段を含み得る。代わりに、このベクターは、宿主細胞に導入された場合にゲノムに組み込まれ、組み込まれている染色体と一緒に複製されるものであり得る。さらに、宿主細胞のゲノムに導入される全ＤＮＡ又はトランスポゾンを一緒に含む単一のベクター若しくはプラスミド又は２つ以上のベクター若しくはプラスミドが使用され得る。
ベクターは、好ましくは、形質転換されたか、トランスフェクトされたか、形質導入されたか、又は同類の細胞の容易な選択を可能にする１つ以上の選択マーカーを含有する。選択マーカーは、遺伝子であって、その産物が、殺生物剤又はウイルス抵抗性、重金属に対する抵抗性、栄養要求体に対する原栄養性、及び同類のものをもたらす、遺伝子である。
細菌性選択マーカーの例には、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）若しくはバチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）のｄａｌ遺伝子、又はアンピシリン耐性、クロラムフェニコール耐性、カナマイシン耐性、ネオマイシン耐性、スペクチノマイシン耐性、又はテトラサイクリン耐性などの抗生物質耐性を付与するマーカーがある。酵母宿主細胞のための好適なマーカーとしては、ＡＤＥ２、ＨＩＳ３、ＬＥＵ２、ＬＹＳ２、ＭＥＴ３、ＴＲＰ１、及びＵＲＡ３が挙げられるが、これらに限定されない。糸状真菌宿主細胞における使用のための選択マーカーとしては、ａｄｅＡ（ホスホリボシルアミノイミダゾール－スクシノカルボキサミドシンターゼ）、ａｄｅＢ（ホスホリボシル－アミノイミダゾールシンターゼ）、ａｍｄＳ（アセトアミダーゼ）、ａｒｇＢ（オルニチンカルバモイルトランスフェラーゼ）、ｂａｒ（ホスフィノスリシンアセチルトランスフェラーゼ）、ｈｐｈ（ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ）、ｎｉａＤ（硝酸レダクターゼ）、ｐｙｒＧ（オロチジン－５’－リン酸デカルボキシラーゼ）、ｓＣ（硫酸アデニリルトランスフェラーゼ）、及びｔｒｐＣ（アントラニル酸シンターゼ）、並びにそれらの均等物が挙げられるが、これらに限定されない。アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）細胞中での使用に好ましいのは、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）又はアスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）のａｍｄＳ遺伝子及びｐｙｒＧ遺伝子並びにストレプトマイセス・ハイグロスコピクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｈｙｇｒｏｓｃｏｐｉｃｕｓ）ｂａｒ遺伝子である。トリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）細胞における使用に好ましいのは、ａｄｅＡ、ａｄｅＢ、ａｍｄＳ、ｈｐｈ、及びｐｙｒＧ遺伝子である。
選択マーカーは、国際公開第２０１０／０３９８８９号パンフレットに記載される二重の選択マーカー系であり得る。一態様では、二重の選択マーカーは、ｈｐｈ－ｔｋの二重の選択マーカー系である。
ベクターは、好ましくは、宿主細胞のゲノムへのベクターの組み込み又はゲノムと独立して細胞内でのベクターの自己複製を可能にするエレメントを含有する。
宿主細胞ゲノム中への組み込みに関して、ベクターは、相同又は非相同組み換えによるゲノム中への組み込みのために、バリアントをコードするポリヌクレオチドの配列又はベクターの任意の他のエレメントに依拠し得る。代わりに、ベクターは、染色体中の正確な位置での宿主細胞のゲノムへの相同組み換えによる組み込みを指示するための追加のポリヌクレオチドを含む場合がある。正確な位置での組み込みの可能性を高めるために、組み込みエレメントは、十分な数の核酸（例えば、１００～１０，０００個の塩基対、４００～１０，０００個の塩基対、及び８００～１０，０００個の塩基対）を含有するべきであり、この核酸は、相同組み換えの可能性を高めるために、対応する標的配列に対する配列同一性が高い。組み込みエレメントは、宿主細胞のゲノム中の標的配列と相同である任意の配列であり得る。さらに、組み込みエレメントは、ポリヌクレオチドをコードしていなくてもよいし、コードしていてもよい。一方、ベクターは、非相同組み換えにより宿主細胞のゲノムに組み込まれ得る。
自律的な複製の場合、ベクターは、問題の宿主細胞中でベクターが自律的に複製することを可能にする複製起点をさらに含み得る。複製起点は、細胞中で機能する自律的な複製を媒介する任意のプラスミド複製開始点であり得る。「複製起点」又は「プラスミド複製開始点」という用語は、プラスミド又はベクターがインビボで複製することを可能にするポリヌクレオチドを意味する。
細菌性複製起点の例には、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）で複製可能なｐＢＲ３２２、ｐＵＣ１９、ｐＡＣＹＣ１７７、及びｐＡＣＹＣ１８４プラスミド、並びにバチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）で複製可能なｐＵＢ１１０、ｐＥ１９４、ｐＴＡ１０６０、及びｐＡＭβ１プラスミドの複製起点がある。
酵母菌宿主細胞に使用される複製起点の例には、２ミクロンの複製起点であるＡＲＳ１、ＡＲＳ４、ＡＲＳ１及びＣＥＮ３の組み合わせ、並びにＡＲＳ４及びＣＥＮ６の組み合わせがある。
糸状真菌細胞において有用な複製起点の例には、ＡＭＡ１及びＡＮＳ１がある（Ｇｅｍｓ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｇｅｎｅ ９８；６１－６７；Ｃｕｌｌｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８７，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１５：９１６３－９１７５；国際公開第００／２４８８３号パンフレット）。ＡＭＡ１遺伝子の単離並びにこの遺伝子を含むプラスミド又はベクターの構築は、国際公開第００／２４８８３号パンフレットで開示されている方法に従って達成され得る。
本発明のポリヌクレオチドの２つ以上のコピーを宿主細胞内に挿入して、バリアントの生成を増加させ得る。ポリヌクレオチドのコピー数を増大させることは、配列の少なくとも１つのさらなるコピーを宿主細胞ゲノムに組み込むことによって、又はポリヌクレオチドに増幅可能な選択マーカー遺伝子を含めることによって達成することができ、適切な選択剤の存在下で細胞を培養することにより、増幅されたコピーの選択マーカー遺伝子を含む細胞、したがってさらなるコピーのポリヌクレオチドを含む細胞を選択することができる。
上記のエレメントを連結して本発明の組み換え発現ベクターを構築するために使用される手順は、当業者によく知られている（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，１９８９）。
宿主細胞
本発明はまた、組み換え宿主細胞であって、本発明のバリアントの生成を誘導する１つ以上の制御配列に作動可能に連結されている本発明のバリアントをコードするポリヌクレオチドを含む組み換え宿主細胞に関する。ポリヌクレオチドを含む構築物又はベクターは、構築物又はベクターが染色体組み込み体として又は先に記載される自己複製染色体外ベクターとして維持されるように宿主細胞中に導入される。「宿主細胞」という用語は、親細胞の任意の子孫であって、複製中に生じた変異に起因して親細胞と同一ではない子孫を包含する。宿主細胞の選択は、バリアントをコードする遺伝子及びその供給源に大きく依存することになる。
宿主細胞は、バリアントの組み換え産生において有用な任意の細胞、例えば、原核生物又は真核生物であり得る。
原核生物の宿主細胞は、任意のグラム陽性細菌又はグラム陰性細菌であり得る。グラム陽性細菌としては、バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ゲオバチルス属（Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ラクトコッカス属（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）、オセアノバチルス属（Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、スタフィロコッカス属（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、及びストレプトマイセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）が挙げられるが、これらに限定されない。グラム陰性細菌としては、カンピロバクター属（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）、フラボバクテリウム属（Ｆｌａｖｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ヘリコバクター属（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ）、イリオバクター属（Ｉｌｙｏｂａｃｔｅｒ）、ナイセリア属（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ）、シュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、サルモネラ属（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）、及びウレアプラズマ属（Ｕｒｅａｐｌａｓｍａ）が挙げられるが、これらに限定されない。
細菌宿主細胞は、限定されるものではないが、バチルス・アルカロフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｌｋａｌｏｐｈｉｌｕｓ）、バチルス・アミロリケファシエンス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、バチルス・ブレビス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｒｅｖｉｓ）、バチルス・サーキュランス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｉｒｃｕｌａｎｓ）、バチルス・クラウジイ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｌａｕｓｉｉ）、バチルス・コアグランス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏａｇｕｌａｎｓ）、バチルス・ファーマス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｉｒｍｕｓ）、バチルス・ロータス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌａｕｔｕｓ）、バチルス・レンタス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｓ）、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バチルス・メガテリウム（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）、バチルス・プミルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｕｍｉｌｕｓ）、バチルス・ステアロサーモフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）及びバチルス・チューリンゲンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）の細胞を含む任意のバチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）細胞であり得る。好ましくは、細菌宿主細胞は、バチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）細胞である。
細菌宿主細胞は、限定されるものではないが、ストレプトコッカス・エキシミリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉｓｉｍｉｌｉｓ）、ストレプトコッカス・ピオゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｙｏｇｅｎｅｓ）、ストレプトコッカス・ウベリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｕｂｅｒｉｓ）及びストレプトコッカス・エクイ亜種ズーエピデミカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉ ｓｕｂｓｐ．Ｚｏｏｅｐｉｄｅｍｉｃｕｓ）の細胞を含む任意のストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）細胞でもあり得る。
細菌宿主細胞は、限定されるものではないが、ストレプトマイセス・アクロモゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ａｃｈｒｏｍｏｇｅｎｅｓ）、ストレプトマイセス・アベルミティリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ａｖｅｒｍｉｔｉｌｉｓ）、ストレプトマイセス・セリカラー（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｃｏｅｌｉｃｏｌｏｒ）、ストレプトマイセス・グリセウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｇｒｉｓｅｕｓ）、及びストレプトマイセス・リビダンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｌｉｖｉｄａｎｓ）の細胞を含む任意のストレプトマイセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）細胞でもあり得る。
バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）細胞へのＤＮＡの導入は、プロトプラスト形質転換（例えば、Ｃｈａｎｇ ａｎｄ Ｃｏｈｅｎ，１９７９，Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．１６８：１１１－１１５を参照されたい）、コンピテント細胞形質転換（例えば、Ｙｏｕｎｇ ａｎｄ Ｓｐｉｚｉｚｅｎ，１９６１，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．８１：８２３－８２９、又はＤｕｂｎａｕ ａｎｄ Ｄａｖｉｄｏｆｆ－Ａｂｅｌｓｏｎ，１９７１，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．５６：２０９－２２１を参照されたい）、エレクトロポレーション（例えば、Ｓｈｉｇｅｋａｗａ ａｎｄ Ｄｏｗｅｒ，１９８８，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ６：７４２－７５１を参照されたい）、又はコンジュゲーション（例えば、Ｋｏｅｈｌｅｒ ａｎｄ Ｔｈｏｒｎｅ，１９８７，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１６９：５２７１－５２７８を参照されたい）によって達成され得る。大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）へのＤＮＡの導入は、プロトプラスト形質転換（例えば、Ｈａｎａｈａｎ，１９８３，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１６６：５５７－５８０を参照されたい）、又はエレクトロポレーション（例えば、Ｄｏｗｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１６：６１２７－６１４５を参照されたい）によって達成され得る。ストレプトマイセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）細胞へのＤＮＡの導入は、プロトプラスト形質転換、エレクトロポレーション（例えば、Ｇｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，２００４，Ｆｏｌｉａ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．（Ｐｒａｈａ）４９：３９９－４０５を参照されたい）、コンジュゲーション（例えば、Ｍａｚｏｄｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１７１：３５８３－３５８５を参照されたい）、又は形質導入（例えば、Ｂｕｒｋｅ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９８：６２８９－６２９４を参照されたい）によって達成され得る。シュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）細胞へのＤＮＡの導入は、エレクトロポレーション（例えば、Ｃｈｏｉ ｅｔ ａｌ．，２００６，Ｊ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ６４：３９１－３９７を参照されたい）、又はコンジュゲーション（例えば、Ｐｉｎｅｄｏ ａｎｄ Ｓｍｅｔｓ，２００５，Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．７１：５１－５７を参照されたい）によって達成され得る。ストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）細胞へのＤＮＡの導入は、自然形質転換能（例えば、Ｐｅｒｒｙ ａｎｄ Ｋｕｒａｍｉｔｓｕ，１９８１，Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．３２：１２９５－１２９７を参照されたい）、プロトプラスト形質転換（例えば、Ｃａｔｔ ａｎｄ Ｊｏｌｌｉｃｋ，１９９１，Ｍｉｃｒｏｂｉｏｓ ６８：１８９－２０７を参照されたい）、エレクトロポレーション（例えば、Ｂｕｃｋｌｅｙ ｅｔ ａｌ．，１９９９，Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．６５：３８００－３８０４を参照されたい）、又はコンジュゲーション（例えば、Ｃｌｅｗｅｌｌ，１９８１，Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．４５：４０９－４３６を参照されたい）によって達成され得る。しかしながら、宿主細胞にＤＮＡを導入するための当該技術分野で知られる任意の方法が使用され得る。
宿主細胞はまた、哺乳動物、昆虫、植物、又は真菌細胞などの真核生物であり得る。
宿主細胞は、真菌細胞であり得る。本明細書で使用する場合、「真菌」としては、子嚢菌門（Ａｓｃｏｍｙｃｏｔａ）、担子菌門（Ｂａｓｉｄｉｏｍｙｃｏｔａ）、ツボカビ門（Ｃｈｙｔｒｉｄｉｏｍｙｃｏｔａ）、及び接合菌門（Ｚｙｇｏｍｙｃｏｔａ）、並びに卵菌（Ｏｏｍｙｃｏｔａ）及び全ての栄養胞子形成菌（Ｈａｗｋｓｗｏｒｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎ，Ａｉｎｓｗｏｒｔｈ ａｎｄ Ｂｉｓｂｙ’ｓ Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ ｏｆ Ｔｈｅ Ｆｕｎｇｉ，８ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９５，ＣＡＢ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＵＫで定義される）が挙げられる。
真菌宿主細胞は、酵母細胞であり得る。本明細書で使用する場合、「酵母」としては、有子嚢胞子酵母（エンドミセス目（Ｅｎｄｏｍｙｃｅｔａｌｅｓ））、担子菌酵母、及び不完全菌類（不完全酵母菌綱（Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｔｅｓ））に属する酵母が挙げられる。酵母の分類は将来変更される場合があるため、本発明の目的上、酵母は、Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ ｏｆ Ｙｅａｓｔ（Ｓｋｉｎｎｅｒ，Ｐａｓｓｍｏｒｅ，ａｎｄ Ｄａｖｅｎｐｏｒｔ，ｅｄｉｔｏｒｓ，Ｓｏｃ．Ａｐｐ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ Ｓｅｒｉｅｓ Ｎｏ．９，１９８０）に記載されるとおりに定義されるものとする。
酵母宿主細胞は、カンジダ属（Ｃａｎｄｉｄａ）、ハンゼヌラ属（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ）、クルイベロマイセス属（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）、ピキア属（Ｐｉｃｈｉａ）、サッカロマイセス属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、シゾサッカロマイセス属（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）又はヤロウイア属（Ｙａｒｒｏｗｉａ）の細胞、例えば、クルイベロマイセス・ラクティス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｌａｃｔｉｓ）、サッカロマイセス・カールスベルゲンシス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃａｒｌｓｂｅｒｇｅｎｓｉｓ）、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、サッカロマイセス・ディアスタティカス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｄｉａｓｔａｔｉｃｕｓ）、サッカロマイセス・ドウグラシー（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｄｏｕｇｌａｓｉｉ）、サッカロマイセス・クルイベリ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｋｌｕｙｖｅｒｉ）、サッカロマイセス・ノルベンシス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｎｏｒｂｅｎｓｉｓ）、サッカロマイセス・オビホルミス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｏｖｉｆｏｒｍｉｓ）又はヤロウイア・リポリティカ（Ｙａｒｒｏｗｉａ ｌｉｐｏｌｙｔｉｃａ）の細胞であり得る。
真菌宿主細胞は、糸状真菌細胞であり得る。「糸状真菌」は、真菌類及び卵菌類の亜門の全ての糸状形態を含む（Ｈａｗｋｓｗｏｒｔｈ ｅｔ ａｌ．，１９９５、上記参照で定義されている）。糸状真菌は、一般的に、キチン、セルロース、グルカン、キトサン、マンナン、及び他の複雑な多糖で構成されている菌糸体の壁を特徴としている。栄養生長は菌糸伸長によるものであり、炭素異化は偏性好気性である。対照的に、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）などの酵母による栄養生長は単細胞葉状体の出芽によるものであり、炭素異化は発酵性であり得る。
糸状真菌宿主細胞は、アクレモニウム属（Ａｃｒｅｍｏｎｉｕｍ）、アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、アウレオバシジウム属（Ａｕｒｅｏｂａｓｉｄｉｕｍ）、ヤケイロタケ属（Ｂｊｅｒｋａｎｄｅｒａ）、セリポリオプシス属（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ）、クリソスポリウム属（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ）、コプリナス属（Ｃｏｐｒｉｎｕｓ）、カワラタケ属（Ｃｏｒｉｏｌｕｓ）、クリプトコッカス属（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、フィリバシジウム属（Ｆｉｌｉｂａｓｉｄｉｕｍ）、フザリウム属（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）、フミコラ属（Ｈｕｍｉｃｏｌａ）、マグナポルテ属（Ｍａｇｎａｐｏｒｔｈｅ）、ムコール属（Ｍｕｃｏｒ）、ミセリオフトラ属（Ｍｙｃｅｌｉｏｐｈｔｈｏｒａ）、ネオカリマスティクス属（Ｎｅｏｃａｌｌｉｍａｓｔｉｘ）、ニューロスポラ属（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ）、ペシロマイセス属（Ｐａｅｃｉｌｏｍｙｃｅｓ）、ペニシリウム属（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、ファネロカエテ属（Ｐｈａｎｅｒｏｃｈａｅｔｅ）、フレビア属（Ｐｈｌｅｂｉａ）、ピロミセス属（Ｐｉｒｏｍｙｃｅｓ）、ヒラタケ属（Ｐｌｅｕｒｏｔｕｓ）、シゾフィラム属（Ｓｃｈｉｚｏｐｈｙｌｌｕｍ）、タラロマイセス属（Ｔａｌａｒｏｍｙｃｅｓ）、サーモアスカス属（Ｔｈｅｒｍｏａｓｃｕｓ）、チエラビア属（Ｔｈｉｅｌａｖｉａ）、トリポクラディウム属（Ｔｏｌｙｐｏｃｌａｄｉｕｍ）、ホウロクタケ属（Ｔｒａｍｅｔｅｓ）又はトリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）の細胞であり得る。
例えば、糸状真菌宿主細胞は、アスペルギルス・アワモリ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ａｗａｍｏｒｉ）、アスペルギルス・フォエティダス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｏｅｔｉｄｕｓ）、アスペルギルス・フミガーツス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）、アスペルギルス・ジャポニカス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｊａｐｏｎｉｃｕｓ）、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）、ヤケイロタケ（Ｂｊｅｒｋａｎｄｅｒａ ａｄｕｓｔａ）、セリポリオプシス・アネイリナ（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ａｎｅｉｒｉｎａ）、セリポリオプシス・カレギエア（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ｃａｒｅｇｉｅａ）、セリポリオプシス・ギルベッセンス（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ｇｉｌｖｅｓｃｅｎｓ）、セリポリオプシス・パノンシンタ（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ｐａｎｎｏｃｉｎｔａ）、セリポリオプシス・リブロサ（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ｒｉｖｕｌｏｓａ）、セリポリオプシス・サブルファ（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ｓｕｂｒｕｆａ）、セリポリオプシス・サベルミスポラ（Ｃｅｒｉｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ｓｕｂｖｅｒｍｉｓｐｏｒａ）、クリソスポリウム・イノプス（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｉｎｏｐｓ）、クリソスポリウム・ケラチノフィラム（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｋｅｒａｔｉｎｏｐｈｉｌｕｍ）、クリソスポリウム・ルクノウェンス（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｌｕｃｋｎｏｗｅｎｓｅ）、クリソスポリウム・メルダリウム（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｍｅｒｄａｒｉｕｍ）、クリソスポリウム・パニコラ（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｐａｎｎｉｃｏｌａ）、クリソスポリウム・クイーンズランジカム（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｑｕｅｅｎｓｌａｎｄｉｃｕｍ）、クリソスポリウム・トロピカム（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｔｒｏｐｉｃｕｍ）、クリソスポリウム・ゾナタム（Ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ ｚｏｎａｔｕｍ）、コプリナス・シネレウス（Ｃｏｐｒｉｎｕｓ ｃｉｎｅｒｅｕｓ）、コリオラス・ハースタス（Ｃｏｒｉｏｌｕｓ ｈｉｒｓｕｔｕｓ）、フザリウム・バクトリジオイデス（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｂａｃｔｒｉｄｉｏｉｄｅｓ）、フザリウム・セレアリス（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｃｅｒｅａｌｉｓ）、フザリウム・クロックウェレンズ（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｃｒｏｏｋｗｅｌｌｅｎｓｅ）、フザリウム・クルモラム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｃｕｌｍｏｒｕｍ）、フザリウム・グラミネアラム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ）、フザリウム・グラミナム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｕｍ）、フザリウム・ヘテロスポラム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｈｅｔｅｒｏｓｐｏｒｕｍ）、フザリウム・ネグンジ（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｎｅｇｕｎｄｉ）、フザリウム・オキシスポラム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、フザリウム・レチクラタム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｒｅｔｉｃｕｌａｔｕｍ）、フザリウム・ロゼウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｒｏｓｅｕｍ）、フザリウム・サムブシヌム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓａｍｂｕｃｉｎｕｍ）、フザリウム・サルコクロウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓａｒｃｏｃｈｒｏｕｍ）、フザリウム・スポロトリキオイデス（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｏｒｏｔｒｉｃｈｉｏｉｄｅｓ）、フザリウム・スルフレウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｕｌｐｈｕｒｅｕｍ）、フザリウム・トルロサム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｓｕｍ）、フザリウム・トリコセシオイデス（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｔｒｉｃｈｏｔｈｅｃｉｏｉｄｅｓ）、フザリウム・ベネナタム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｅｎｅｎａｔｕｍ）、フミコラ・インソレンス（Ｈｕｍｉｃｏｌａ ｉｎｓｏｌｅｎｓ）、フミコラ・ラヌギノーサ（Ｈｕｍｉｃｏｌａ ｌａｎｕｇｉｎｏｓａ）、ムコール・ミーヘイ（Ｍｕｃｏｒ ｍｉｅｈｅｉ）、ミセリオフトラ・サーモフィラ（Ｍｙｃｅｌｉｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ）、ネウロスポラ・クラサ（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ ｃｒａｓｓａ）、ペニシリウム・プルプロゲナム（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ ｐｕｒｐｕｒｏｇｅｎｕｍ）、ファネロカエテ・クリソスポリウム（Ｐｈａｎｅｒｏｃｈａｅｔｅ ｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ）、フレビア・ラジアータ（Ｐｈｌｅｂｉａ ｒａｄｉａｔａ）、プレウロツス・エリンギ（Ｐｌｅｕｒｏｔｕｓ ｅｒｙｎｇｉｉ）、チエラビア・テレストリス（Ｔｈｉｅｌａｖｉａ ｔｅｒｒｅｓｔｒｉｓ）、トラメテス・ビロサ（Ｔｒａｍｅｔｅｓ ｖｉｌｌｏｓａ）、トラメテス・ベルシカラー（Ｔｒａｍｅｔｅｓ ｖｅｒｓｉｃｏｌｏｒ）、トリコデルマ・ハルジアナム（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｈａｒｚｉａｎｕｍ）、トリコデルマ・コニンギ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｋｏｎｉｎｇｉｉ）、トリコデルマ・ロンギブラキアタム（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｌｏｎｇｉｂｒａｃｈｉａｔｕｍ）、トリコデルマ・リーゼイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）又はトリコデルマ・ビリデ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｖｉｒｉｄｅ）の細胞であり得る。
真菌細胞は、それ自体知られている方法において、プロトプラストの形成、プロトプラストの形質転換及び細胞壁の再生を含むプロセスにより形質転換され得る。アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）及びトリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）宿主細胞の形質転換のための好適な手順は、欧州特許第２３８０２３号明細書、Ｙｅｌｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９８４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８１：１４７０－１４７４、及びＣｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ６：１４１９－１４２２に記載されている。フザリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）種の形質転換のための好適な方法は、Ｍａｌａｒｄｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｇｅｎｅ ７８：１４７－１５６、及び国際公開第９６／００７８７号パンフレットにより記載される。酵母は、Ｂｅｃｋｅｒ ａｎｄ Ｇｕａｒｅｎｔｅ，Ｉｎ Ａｂｅｌｓｏｎ，Ｊ．Ｎ．ａｎｄ Ｓｉｍｏｎ，Ｍ．Ｉ．，ｅｄｉｔｏｒｓ，Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｙｅａｓｔ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌｕｍｅ １９４，ｐｐ １８２－１８７，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ；Ｉｔｏ ｅｔ ａｌ．，１９８３，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１５３：１６３；及びＨｉｎｎｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９７８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７５：１９２０により記載される手順を使用して形質転換され得る。
生成方法
本発明は、バリアントを生成する方法であって、（ａ）このバリアントの生成の助けとなる条件下で本発明の組み換え宿主細胞を培養すること；及び任意選択により（ｂ）バリアントを回収することを含む方法にも関する。
組み換え宿主細胞は、当該技術分野において知られる方法を使用してバリアントの生成に好適な栄養培地中で培養される。例えば、細胞は、好適な培地中において並びにバリアントの発現及び／又は単離が可能になる条件下で実験用又は工業用発酵槽におけるフラスコ振盪培養、又は小規模若しくは大規模発酵（連続、バッチ、フェドバッチ、又は固体状態の発酵を含む）により培養され得る。この培養を、当該技術分野で知られる手順を使用して、炭素源及び窒素源並びに無機塩を含む好適な栄養培地中で行う。好適な培地は、商業的供給業者から入手可能であるか、又は公開されている組成（例えば、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎのカタログで公開されている組成）に従って調製され得る。バリアントが栄養培地に分泌される場合、バリアントは、培地から直接的に回収することができる。バリアントが分泌されない場合、それは、細胞可溶化物から回収することができる。
バリアントは、バリアントに特異的である当該技術分野において知られる方法を用いて検出され得る。これらの検出法としては、特異抗体の使用、酵素生成物の形成、又は酵素基質の消失が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、酵素アッセイを使用して、このバリアントの活性を決定してもよい。
バリアントは、当該技術分野において知られる方法を使用して回収され得る。例えば、バリアントは、採取、遠心分離、濾過、抽出、噴霧乾燥、蒸発又は沈殿を含むが、これらに限定されない従来の手順によって栄養培地から回収され得る。一態様では、全発酵ブロスが回収される。
バリアントは、実質的に純粋なバリアントを得るための、クロマトグラフィー（例えば、イオン交換、親和性、疎水性、クロマトフォーカシング及びサイズ排除）、電気泳動法（例えば、分取等電点電気泳動）、溶解度の相違（例えば、硫酸アンモニウム沈殿）、ＳＤＳ－ＰＡＧＥ又は抽出（例えば、Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，Ｊａｎｓｏｎ ａｎｄ Ｒｙｄｅｎ，ｅｄｉｔｏｒｓ，ＶＣＨ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８９を参照されたい）を含むが、これらに限定されない、当該技術分野において知られる様々な手順によって精製され得る。
代替的な態様では、バリアントは回収されず、むしろバリアントを発現する本発明の宿主細胞がバリアントの供給源として使用される。
発酵ブロス配合物又は細胞組成物
本発明は、本発明のバリアントを含む発酵ブロス配合物又は細胞組成物にも関する。発酵ブロス産物はさらに、例えば、細胞（本発明のバリアントをコードする遺伝子を含有する宿主細胞であって、目的のバリアントの産生に使用される宿主細胞を含む）、細胞片、バイオマス、発酵培地及び／又は発酵産物などの発酵プロセスで用いられる追加の成分を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、有機酸、死細胞及び／又は細胞片、並びに培養培地を含有する死滅した細胞の全ブロスである。
用語「発酵ブロス」は、本明細書で使用する場合、回収及び／又は精製を全く行わないか又は最小限にのみ行う細胞発酵により産生される調製物を指す。例えば、発酵ブロスは、微生物培養物が飽和まで増殖させられ、タンパク質合成（例えば、宿主細胞による酵素の発現）及び細胞培養培地への分泌を可能にする炭素制限条件下でインキュベートされるときに生成される。発酵ブロスは、発酵の終了時に得られる発酵材料の未分画内容物又は分画内容物を含有し得る。通常、発酵ブロスは分画されず、微生物細胞（例えば、糸状真菌細胞）が、例えば、遠心分離により除去された後に存在する使用済みの培養培地及び細胞片を含む。いくつかの実施形態では、発酵ブロスは、使用済みの細胞培養培地、細胞外酵素、並びに生存可能な及び／又は生存不可能な微生物細胞を含有する。
ある実施形態では、発酵ブロス配合物及び細胞組成物は、少なくとも１つの１～５炭素の有機酸及び／又はその塩を含む第１の有機酸構成成分並びに少なくとも１つの６炭素以上の有機酸及び／又はその塩を含む第２の有機酸構成成分を含む。特定の実施形態では、第１の有機酸構成成分は、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、その塩又は前述の２つ以上の混合物であり、第２の有機酸構成成分は、安息香酸、シクロヘキサンカルボン酸、４－メチル吉草酸、フェニル酢酸、その塩又は前述の２つ以上の混合物である。
一態様では、組成物は、１つ又は複数の有機酸を含有し、且つ任意選択により死細胞及び／又は細胞片をさらに含有する。一実施形態では、死細胞及び／又は細胞片は、死滅した細胞の全ブロスから除去されて、これらの構成成分を含まない組成物が提供される。
発酵ブロス配合物又は細胞組成物は、限定されないが、ソルビトール、塩化ナトリウム、ソルビン酸カリウム及び当該技術分野において知られる他のものを含む保存剤及び／又は抗菌剤（例えば、静菌剤）をさらに含み得る。
死滅した細胞の全ブロス又は組成物は、発酵の終了時に得られる発酵材料の未分画内容物を含有し得る。通常、死滅した細胞の全ブロス又は組成物は、微生物細胞（例えば、糸状真菌細胞）が、飽和まで増殖させられ、タンパク質合成を可能にする炭素制限条件下でインキュベートされた後に存在する使用済みの培養培地及び細胞片を含有する。いくつかの実施形態では、死滅した細胞の全ブロス又は組成物は、使用済みの細胞培養培地、細胞外酵素、及び死滅した糸状真菌細胞を含有する。いくつかの実施形態では、死滅した細胞の全ブロス又は組成物中に存在する微生物細胞は、当該技術分野で知られる方法を使用して透過処理され、且つ／又は溶解され得る。
本明細書に記載されるとおりの全ブロス又は細胞組成物は通常、液体であるが、死細胞、細胞片、培養培地構成成分及び／又は不溶性酵素などの不溶性構成成分を含有し得る。いくつかの実施形態では、不溶性構成成分は、清澄化された液体組成物を提供するために除去され得る。
本発明の全ブロス配合物及び細胞組成物は、国際公開第９０／１５８６１号パンフレット又は国際公開第２０１０／０９６６７３号パンフレットに記載される方法によって作製され得る。
洗剤組成物
本発明はまた、本発明のプロテアーゼバリアントを含む組成物、例えば、洗剤又はクリーニング組成物に関する。
本発明はまた、本発明のプロテアーゼバリアントを含み且つ１種以上の洗剤構成成分及び／又は１種以上の追加の酵素をさらに含む組成物に関する。好ましい実施形態では、組成物は、１種以上の洗剤構成成分、特に、１種以上の天然に存在しない洗剤構成成分を含む洗剤組成物である。
本発明はまた、本発明のプロテアーゼバリアントを含み且つアミラーゼ、カタラーゼ、セルラーゼ（例えば、エンドグルカナーゼ）、クチナーゼ、ハロペルオキシゲナーゼ、リパーゼ、マンナナーゼ、ペクチナーゼ、ペクチンリアーゼ、ペルオキシダーゼ、プロテアーゼ、キサンタナーゼ、リケナーゼ及びキシログルカナーゼ、又はこれらの任意の混合物からなる群から選択される１種以上の追加の酵素をさらに含む組成物に関する。
洗剤組成物は、例えば、バー、均質錠剤、２層以上を有する錠剤、１つ以上のコンパートメントを有するパウチ、定型的若しくは緻密な粉末、顆粒、ペースト、ゲル、又は定型的、緻密な若しくは濃縮された液体の形態であってもよい。好ましい実施形態では、洗剤組成物は、液体又はゲル、特に、液体洗濯洗剤の形態である。
本発明はまた、洗濯又は食器洗浄などの硬質表面クリーニングなどのクリーニングプロセスにおける本発明の組成物の使用に関する。
洗剤組成物の追加の構成成分の選択は、当業者の技術の範囲内であり、下記の例示的な非限定的な構成成分を含む従来の成分を含む。構成成分の選択は、布地ケアのために、クリーニングされる布地の種類、汚れの種類及び／又は程度、クリーニングが行われる温度、並びに洗剤製品の配合の検討を含み得る。
特定の実施形態では、洗剤組成物は、本発明のプロテアーゼバリアント並びに界面活性剤、ヒドロトロープ、ビルダー、コビルダー、キレーター又はキレート剤、漂白系又は漂白構成成分、ポリマー、布地色調剤、布地柔軟仕上げ剤、起泡促進剤、起泡抑制剤、分散剤、移染防止剤、蛍光増白剤、芳香剤、光学的光沢剤、殺菌剤、殺真菌剤、汚れ懸濁剤、汚れ遊離ポリマー、再付着防止剤、酵素阻害剤又は安定剤、酵素活性化剤、抗酸化剤、及び可溶化剤などの１種以上の天然に存在しない洗剤構成成分を含む。
一実施形態では、本発明のプロテアーゼバリアントは、洗浄液の１リットル当たり０．０１～２００ｍｇの酵素タンパク質、好ましくは、洗浄液の１リットル当たり０．０５～５０ｍｇの酵素タンパク質、特に、洗浄液の１リットル当たり０．１～１０ｍｇの酵素タンパク質に対応する量で洗剤組成物に加えられ得る。
自動食器洗浄（ＡＤＷ）組成物は、例えば、組成物の重量で０．５～１０％などの０．１～１５％などの０．０１％～２０％などの０．００１％～３０％の酵素タンパク質を含み得る。
洗濯のための顆粒組成物は、例えば、組成物の重量で０．０５％～５％などの０．０１％～１０％などの０．００１％～２０％の酵素タンパク質を含み得る。
洗濯のための液体組成物は、例えば、組成物の重量で０．１％～５％などの０．００１％～７％などの０．０００１％～１０％の酵素タンパク質を含み得る。
本発明のプロテアーゼバリアントなどの酵素は、従来の安定化剤、例えば、プロピレングリコール若しくはグリセロールなどのポリオール、糖若しくは糖アルコール、乳酸、ホウ酸、又はホウ酸誘導体、例えば、芳香族ホウ酸エステル、又は４－ホルミルフェニルボロン酸などのフェニルボロン酸誘導体を使用して安定化されてもよく、組成物は、例えば、国際公開第１９９２／１９７０９号パンフレット及び国際公開第１９９２／１９７０８号パンフレットに記載されるとおりに配合され得るか又は本発明によるバリアントは、国際公開第２００５／１０５８２６号パンフレット及び国際公開第２００９／１１８３７５号パンフレットに記載されるものなどのペプチドアルデヒド又はケトンを使用して安定化され得る。
本発明のプロテアーゼバリアントは、
ａ）洗剤１リットル当たり少なくとも０．０１ｍｇの活性プロテアーゼバリアント、
ｂ）２ｗｔ％～６０ｗｔ％の少なくとも１種の界面活性剤
ｃ）５ｗｔ％～５０ｗｔ％の少なくとも１種のビルダー
を含む液体洗濯組成物などの液体洗濯組成物中で配合され得る。
洗剤組成物は、洗濯のための顆粒洗剤中に配合され得る。そのような洗剤は、
ａ）組成物の１グラム当たり少なくとも０．０１ｍｇの活性プロテアーゼバリアント
ｂ）アニオン性界面活性剤、好ましくは、５ｗｔ％～５０ｗｔ％
ｃ）非イオン性界面活性剤、好ましくは、１ｗｔ％～８ｗｔ％
ｄ）炭酸塩、ゼオライト、リン酸ビルダー、カルシウム捕捉ビルダー又は錯化剤などのビルダー、好ましくは、５ｗｔ％～４０ｗｔ％
を含み得る。
下記の構成成分は、特定の機能性に従って一般的な見出しにより分類されているが、これは、当業者に理解されるように、構成成分が追加の機能性を含み得るため、限定として解釈されるべきではない。
界面活性剤
洗剤組成物は、アニオン性及び／若しくはカチオン性及び／若しくは非イオン性及び／若しくは半極性及び／若しくは双性イオン性、又はこれらの混合物であり得る１種以上の界面活性剤を含んでもよい。特定の実施形態において、洗剤組成物は、１種以上の非イオン性界面活性剤及び１種以上のアニオン性界面活性剤の混合物を含む。界面活性剤は通常、約１％～約４０％、又は約３％～約２０％、又は約３％～約１０％などの約０．１重量％～６０重量％のレベルで存在する。界面活性剤は所望のクリーニング用途に基づいて選択され、当該技術分野において知られる任意の従来の界面活性剤を含む。洗剤における使用のために当該技術分野で知られる任意の界面活性剤が利用され得る。界面活性剤は、洗剤における表面張力を低下させ、クリーニングされている汚れを浮き上がらせ、分散させ、続いて洗い流す。
含まれる場合、洗剤は通常、約１％～約４０重量％のアニオン性界面活性剤を含有し、例えば、約５％～約１５％、又は約２０％～約２５％を含む約５％～約３０％のアニオン性界面活性剤を含有することになる。アニオン性界面活性剤の非限定的な例としては、硫酸塩及びスルホン酸塩、特に、直鎖アルキルベンゼンスルホネート（ＬＡＳ）、ＬＡＳの異性体、分岐アルキルベンゼンスルホネート（ＢＡＢＳ）、フェニルアルカンスルホネート、アルファ－オレフィンスルホネート（ＡＯＳ）、オレフィンスルホネート、アルケンスルホネート、アルカン－２，３－ジイルビス（硫酸塩）、ヒドロキシアルカンスルホネート及びジスルホネート、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）などのアルキルスルフェート（ＡＳ）、脂肪族アルコールスルフェート（ＦＡＳ）、第１級アルコールスルフェート（ＰＡＳ）、アルコールエーテルスルフェート（アルコールエトキシスルフェート又は脂肪族アルコールエーテルスルフェートとしても知られるＡＥＳ又はＡＥＯＳ又はＦＥＳ）、第２級アルカンスルホネート（ＳＡＳ）、パラフィンスルホネート（ＰＳ）、エステルスルホネート、スルホン化脂肪酸グリセロールエステル、メチルエステルスルホネート（ＭＥＳ）を含むα－スルホ脂肪酸メチルエステル（α－ＳＦＭｅ又はＳＥＳ）、アルキル－又はアルケニルコハク酸、ドデセニル／テトラデセニルコハク酸（ＤＴＳＡ）、アミノ酸の脂肪酸誘導体、スルホコハク酸又は石鹸のジエステル及びモノエステル、並びにこれらの組み合わせが挙げられる。
含まれる場合、洗剤は通常、０重量％～約１０重量％のカチオン性界面活性剤を含有することになる。カチオン性界面活性剤の非限定的な例としては、アルキルジメチルエタノール第４級アミン（ＡＤＭＥＡＱ）、臭化セチルトリメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、塩化ジメチルジステアリルアンモニウム（ＤＳＤＭＡＣ）、及びアルキルベンジルジメチルアンモニウム、アルキル第４級アンモニウム化合物、アルコキシル化第４級アンモニウム（ＡＱＡ）化合物、並びにこれらの組み合わせが挙げられる。
含まれる場合、洗剤は通常、約０．２重量％～約４０重量％の非イオン性界面活性剤、例えば、約０．５％～約３０％、特に、約１％～約２０％、約３％～約１０％、例えば、約３％～約５％、又は約８％～約１２％を含有することになる。非イオン性界面活性剤の非限定的な例としては、アルコールエトキシレート（ＡＥ又はＡＥＯ）、アルコールプロポキシレート、プロポキシル化脂肪族アルコール（ＰＦＡ）、アルコキシル化脂肪酸アルキルエステル、例えばエトキシル化脂肪酸アルキルエステル及び／又はプロポキシル化脂肪酸アルキルエステル、アルキルフェノールエトキシレート（ＡＰＥ）、ノニルフェノールエトキシレート（ＮＰＥ）、アルキルポリグリコシド（ＡＰＧ）、アルコキシル化アミン、脂肪酸モノエタノールアミド（ＦＡＭ）、脂肪酸ジエタノールアミド（ＦＡＤＡ）、エトキシル化脂肪酸モノエタノールアミド（ＥＦＡＭ）、プロポキシル化脂肪酸モノエタノールアミド（ＰＦＡＭ）、ポリヒドロキシアルキル脂肪酸アミド、又はグルコサミンのＮ－アシルＮ－アルキル誘導体（グルコサミド、ＧＡ又は脂肪酸グルカミド、ＦＡＧＡ）、並びに商標名ＳＰＡＮ及びＴＷＥＥＮの下で入手可能な製品、並びにこれらの組み合わせが挙げられる。
含まれる場合、洗剤は通常、約０重量％～約１０重量％の半極性界面活性剤を含有することになる。半極性界面活性剤の非限定的な例としては、アルキルジメチルアミンオキシド、Ｎ－（ココアルキル）－Ｎ，Ｎ－ジメチルアミンオキシド及びＮ－（牛脂－アルキル）－Ｎ，Ｎ－ビス（２－ヒドロキシエチル）アミンオキシドなどのアミンオキシド（ＡＯ）、脂肪酸アルカノールアミド及びエトキシ化脂肪酸アルカノールアミド、並びにこれらの組み合わせが挙げられる。
含まれる場合、洗剤は通常、約０重量％～約１０重量％の双性イオン性界面活性剤を含有することになる。双性イオン性界面活性剤の非限定的な例としては、ベタイン、アルキルジメチルベタイン、スルホベタイン、及びこれらの組み合わせが挙げられる。
ビルダー及びコビルダー
洗剤組成物は、約０～６５重量％、例えば、約５％～約４５％の洗剤ビルダー若しくはコビルダー、又はこれらの混合物を含有し得る。食器洗浄洗剤では、ビルダーのレベルは通常、４０～６５％、特に５０～６５％である。ビルダー及びキレーターは、例えば、液体から金属イオンを除去することによって洗浄水を軟化する。ビルダー及び／又はコビルダーは、特に、Ｃａ及びＭｇとの水溶性錯体を形成するキレート化剤であり得る。洗濯洗剤における使用のための当該技術分野知られる任意のビルダー及び／又はコビルダーが利用され得る。ビルダーの非限定的な例としては、ゼオライト、ジホスフェート（ピロホスフェート）、トリホスフェート、例えば三リン酸ナトリウム（ＳＴＰ又はＳＴＰＰ）、カーボネート、例えば、炭酸ナトリウム、可溶性シリケート、例えばメタケイ酸ナトリウム、層状シリケート類（例えば、Ｈｏｅｃｈｓｔ製のＳＫＳ－６）、エタノールアミン、例えば２－アミノエタン－１－オール（ＭＥＡ）、ジエタノールアミン（ＤＥＡ、イミノジエタノールとしても知られる）、トリエタノールアミン（ＴＥＡ、２，２’，２’’－ニトリロトリエタノールとしても知られる）、及びカルボキシメチルイヌリン（ＣＭＩ）、並びにこれらの組み合わせが挙げられる。
洗剤組成物はまた、０～２０重量％、例えば、約５％～約１０％の洗剤コビルダー、又はこれらの混合物を含有し得る。洗剤組成物は、コビルダーを単独で又はビルダー例えばゼオライトビルダーと組み合わせて含み得る。コビルダーの非限定的な例としては、ポリアクリレートのホモポリマー又はそのコポリマー、例えば、ポリ（アクリル酸）（ＰＡＡ）又はコポリ（アクリル酸／マレイン酸）（ＰＡＡ／ＰＭＡ）が挙げられる。さらなる非限定的な例としては、シトレート、キレート化剤、例えば、アミノカルボキシレート、アミノポリカルボキシレート、及びホスホネート、並びにアルキル又はアルケニルコハク酸が挙げられる。追加の具体例としては、２，２’，２’’－ニトリロ三酢酸（ＮＴＡ）、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）、イミノジコハク酸（ＩＤＳ）、エチレンジアミン－Ｎ，Ｎ’－ジコハク酸（ＥＤＤＳ）、メチルグリシン二酢酸（ＭＧＤＡ）、グルタミン酸－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＧＬＤＡ）、１－ヒドロキシエタン－１，１－ジホスホン酸（ＨＥＤＰ）、エチレンジアミンテトラ（メチレンホスホン酸）（ＥＤＴＭＰＡ）、ジエチレントリアミンペンタキス（メチレンホスホン酸）（ＤＴＰＭＰＡ又はＤＴＭＰＡ）、Ｎ－（２－ヒドロキシエチル）イミノ二酢酸（ＥＤＧ）、アスパラギン酸－Ｎ－一酢酸（ＡＳＭＡ）、アスパラギン酸－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＡＳＤＡ）、アスパラギン酸－Ｎ－モノプロピオン酸（ＡＳＭＰ）、イミノジコハク酸（ＩＤＡ）、Ｎ－（２－スルホメチル）－アスパラギン酸（ＳＭＡＳ）、Ｎ－（２－スルホエチル）アスパラギン酸（ＳＥＡＳ）、Ｎ－（２－スルホメチル）－グルタミン酸（ＳＭＧＬ）、Ｎ－（２－スルホエチル）グルタミン酸（ＳＥＧＬ）、Ｎ－メチルイミノ二酢酸（ＭＩＤＡ）、α－アラニン－Ｎ，Ｎ－二酢酸（α－ＡＬＤＡ）、セリン－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＳＥＤＡ）、イソセリン－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＩＳＤＡ）、フェニルアラニン－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＰＨＤＡ）、アントラニル酸－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＡＮＤＡ）、スルファニル酸－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＳＬＤＡ）、タウリン－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＴＵＤＡ）、及びスルホメチル－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＳＭＤＡ）、Ｎ－（２－ヒドロキシエチル）－エチリデンジアミン－Ｎ，Ｎ’，Ｎ’’－三酢酸（ＨＥＤＴＡ）、ジエタノールグリシン（ＤＥＧ）、ジエチレントリアミンペンタ（メチレンホスホン酸）（ＤＴＰＭＰ）、アミノトリス（メチレンホスホン酸）（ＡＴＭＰ）、並びにこれらの組み合わせ及び塩が挙げられる。さらなる例示的ビルダー及び／又はコビルダーは、例えば、国際公開第２００９／１０２８５４号パンフレット、及び米国特許第５，９７７，０５３号明細書に記載されている。
本発明のプロテアーゼバリアントはまた、
ａ）本発明による少なくとも０．０１ｍｇの活性プロテアーゼバリアント、及び
ｂ）好ましくは、クエン酸、メチルグリシン－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＭＧＤＡ）及び／又はグルタミン酸－Ｎ，Ｎ－二酢酸（ＧＬＤＡ）並びにこれらの混合物から選択される１０～５０ｗｔ％のビルダー、並びに
ｃ）少なくとも１種の漂白構成成分
を含む食器洗浄組成物、好ましくは、自動食器洗浄組成物（ＡＤＷ）中に配合され得る。
漂白系
洗剤は、０～５０重量％、例えば、約０．１％～約２５％の漂白系を含有し得る。漂白系は、多くの場合酸化により変色を除去し、多くの漂白剤は、強力な殺菌特性も有し、消毒及び滅菌のために使用される。洗濯洗剤における使用のための当該技術分野で知られる任意の漂白系が利用され得る。好適な漂白系構成成分としては、漂白触媒、光脱色剤、漂白活性化剤、過炭酸ナトリウムなどの過酸化水素の供給源、及び過ホウ酸ナトリウム、予め形成された過酸及びその混合物が挙げられる。好適な予め形成された過酸としては、ペルオキシカルボン酸及び塩、過炭酸及び塩、過イミド酸及び塩、ペルオキシモノ硫酸及び塩、例えば、オキソン（Ｒ）、並びにその混合物が挙げられるが、これらに限定されない。漂白系の非限定的な例としては、ペルオキシド系漂白系が挙げられ、過酸形成漂白活性化剤と組み合わせて、例えば、過ホウ酸のナトリウム塩（通常、一又は四水和物）、過炭酸塩、過硫酸塩、過リン酸塩、過ケイ酸塩などのアルカリ金属塩を含む無機塩を含み得る。
漂白活性化剤という用語は、本明細書では、過酸化水素のような過酸素漂白と反応して過酸を形成する化合物を意味する。そのように形成される過酸は、活性化された漂白をなす。本明細書で使用されることになる好適な漂白活性化剤としては、エステル、アミド、イミド又は無水物のクラスに属するものが挙げられる。好適な例は、テトラアセチルエチレンジアミン（ＴＡＥＤ）、４－［（３，５，５－トリメチルヘキサノイル）オキシ］ベンゼンスルホン酸ナトリウム（ＩＳＯＮＯＢＳ）、ジペルオキシドデカン酸、４－（ドデカノイルオキシ）ベンゼンスルホン酸塩（ＬＯＢＳ）、４－（デカノイルオキシ）ベンゼンスルホン酸塩、４－（デカノイルオキシ）安息香酸塩（ＤＯＢＳ）、４－（ノナノイルオキシ）－ベンゼンスルホン酸塩（ＮＯＢＳ）、及び／又は国際公開第９８／１７７６７号パンフレットに開示されるものである。目的の漂白活性化剤の特定のファミリーが欧州特許第６２４１５４号明細書に開示されており、そのファミリーの中でも、クエン酸アセチルトリエチル（ＡＴＣ）が特に好ましい。ＡＴＣ又は短鎖トリグリセリド様トリアセチンは、それが最終的にクエン酸及びアルコールに分解するため環境に優しいという利点を有する。さらに、クエン酸アセチルトリエチル及びトリアセチンは、貯蔵に際して生成物の良好な加水分解安定性を有しており、これは効果的な漂白活性化剤である。最終的に、ＡＴＣは、洗濯添加剤に良好なビルダー能を提供する。或いは、漂白系は、例えば、アミド、イミド、又はスルホン型のペルオキシ酸を含み得る。漂白系はまた、６－（フタリミド）ペルオキシヘキサン酸（ＰＡＰ）などの過酸を含み得る。漂白系はまた、漂白触媒又は漂白促進剤を含み得る。
本発明の組成物に使用され得る漂白触媒のいくつかの非限定的な例として、シュウ酸マンガン、酢酸マンガン、マンガン－コラーゲン、コバルト－アミン触媒及びマンガントリアザシクロノナン（ＭｎＴＡＣＮ）触媒が挙げられ；特に好ましいのは、１，４，７－トリメチル－１，４，７－トリアザシクロノナン（Ｍｅ３－ＴＡＣＮ）又は１，２，４，７－テトラメチル－１，４，７－トリアザシクロノナン（Ｍｅ４－ＴＡＣＮ）とマンガンとの錯体、特に、二核マンガン錯体［（Ｍｅ３－ＴＡＣＮ）Ｍｎ（Ｏ）３Ｍｎ（Ｍｅ３－ＴＡＣＮ）］（ＰＦ６）２、及び［２，２’，２’’－ニトリロトリス（エタン－１，２－ジイラザニリリデン－κＮ－メタニリリデン）トリフェノラト－κ３Ｏ］マンガン（ＩＩＩ）などのＭｅ３－ＴＡＣＮである。漂白触媒はまた、鉄又はコバルト錯体などの他の金属化合物であってもよい。
いくつかの実施形態では、漂白構成成分は、以下の式を有する有機触媒からなる群から選択される有機触媒であり得る：
（ｉｉｉ）及びこれらの混合物（式中、各Ｒ１は、独立して、９～２４個の炭素を含有する分岐アルキル基又は１１～２４個の炭素を含有する直鎖アルキル基であり、好ましくは、各Ｒ１は、独立して、９～１８個の炭素を含有する分岐アルキル基又は１１～１８個の炭素を含有する直鎖アルキル基であり、より好ましくは、各Ｒ１は、独立して、２－プロピルヘプチル、２－ブチルオクチル、２－ペンチルノニル、２－ヘキシルデシル、ｎ－ドデシル、ｎ－テトラデシル、ｎ－ヘキサデシル、ｎ－オクタデシル、イソ－ノニル、イソ－デシル、イソ－トリデシル及びイソ－ペンタデシルからなる群から選択される）。他の例示的な漂白系は、例えば、国際公開第２００７／０８７２５８号パンフレット、国際公開第２００７／０８７２４４号パンフレット、国際公開第２００７／０８７２５９号パンフレット及び国際公開第２００７／０８７２４２号パンフレットに記載される。好適な光漂白剤は、例えば、スルホン化亜鉛フタロシアニンであってもよい。
ヒドロトロープ
ヒドロトロープは、水溶液（又は非極性環境中の反対の極性の物質）中で疎水性化合物を可溶化する化合物である。通常、ヒドロトロープは、親水性及び疎水性両方の特徴（界面活性剤から知られるとおりの、いわゆる両親媒性特性）を有するが、ヒドロトロープの分子構造は通常、自然発生的な自己凝集を好まず、例えば、Ｈｏｄｇｄｏｎ ａｎｄ Ｋａｌｅｒ、２００７，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｃｏｌｌｏｉｄ＆Ｉｎｔｅｒｆａｃｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ １２：１２１－１２８による、概説を参照されたい。ヒドロトロープは、ミセル相、ラメラ相又は他の明確なメソ相を形成する界面活性剤及び脂質に関して見出されるとおり、自己凝集が起こる臨界濃度を示さない。実際に、多くのヒドロトロープは、濃度が増大するにつれて凝集体のサイズが大きくなる持続型凝集プロセスを示す。しかしながら、多くのヒドロトロープは、水、油、界面活性剤、及びポリマーの混合物を含む、極性及び非極性の物質を含有する系の相挙動、安定性、及びコロイド特性を変化させる。ヒドロトロープは、製薬、パーソナルケア、及び食品から技術用途に至る産業全体で、古典的に使用される。洗剤組成物中のヒドロトロープの使用は、相分離又は高粘度などの望まれない現象を誘発することなく、（水を除去することによって液体洗剤を濃縮するプロセスの場合のように）例えば、界面活性剤のより濃縮された配合物を可能にする。
洗剤は、０～５重量％、例えば、約０．５～約５％、又は約３％～約５％のヒドロトロープを含有し得る。洗剤における使用のための当該技術分野で知られる任意のヒドロトロープが利用され得る。ヒドロトロープの非限定的な例としては、ベンゼンスルホン酸ナトリウム、ｐ－トルエンスルホン酸ナトリウム（ＳＴＳ）、キシレンスルホン酸ナトリウム（ＳＸＳ）、クメンスルホン酸ナトリウム（ＳＣＳ）、シメンスルホン酸ナトリウム、アミン酸化物、アルコール及びポリグリコールエーテル、ナトリウムヒドロキシナフトエート、ヒドロキシナフタレンスルホン酸ナトリウム、硫酸ナトリウムエチルヘキシル、並びにこれらの組み合わせが挙げられる。
ポリマー
洗剤は、０～１０重量％、例えば、０．５～５％、２～５％、０．５～２％又は０．２～１％のポリマーを含有し得る。洗剤における使用のために当該技術分野で知られる任意のポリマーを利用してもよい。ポリマーは、上記のコビルダーとして機能するものでもよいし、或いは、再付着防止、繊維保護、汚れ遊離、移染防止、油脂のクリーニング及び／又は消泡性を付与するものであってもよい。一部のポリマーは、上記の特性の２つ以上及び／又は下記のモチーフの２つ以上を有し得る。例示的ポリマーとしては、（カルボキシメチル）セルロース（ＣＭＣ）、ポリ（ビニルアルコール）（ＰＶＡ）、ポリ（ビニルピロリドン）（ＰＶＰ）、ポリ（エチレングリコール）又はポリ（エチレンオキシド）（ＰＥＧ）、エトキシル化ポリ（エチレンイミン）、カルボキシメチルイヌリン（ＣＭＩ）、及びＰＡＡ、ＰＡＡ／ＰＭＡ、ポリアスパラギン酸及びメタクリル酸ラウリル／アクリル酸コポリマーなどのポリカルボキシレート、疎水的に改変されたＣＭＣ（ＨＭ－ＣＭＣ）及びシリコーン、テレフタル酸とオリゴマーグリコールのコポリマー、ポリ（エチレンテレフタレート）とポリ（オキシエチレンテレフタレート）のコポリマー（ＰＥＴ－ＰＯＥＴ）、ＰＶＰ、ポリ（ビニルイミダゾール）（ＰＶＩ）、ポリ（ビニルピリジン－Ｎ－オキシド）（ＰＶＰＯ若しくはＰＶＰＮＯ）及びポリビニルピロリドン－ビニルイミダゾール（ＰＶＰＶＩ）が挙げられる。さらに例示的なポリマーとしては、スルホン化ポリカルボキシレート、ポリエチレンオキシド及びポリプロピレンオキシド（ＰＥＯ－ＰＰＯ）並びにジクオタニウムエトキシスルフェートが挙げられる。その他の例示的ポリマーは、例えば、国際公開第２００６／１３０５７５号パンフレットに開示されている。また、上記ポリマーの塩も検討される。
布地色調剤
本発明の洗剤組成物はまた、染料又は顔料などの布地色調剤を含んでもよく、これが洗剤組成物に配合される場合、洗剤組成物を含む洗浄液と布地が接触するときに布地上に沈積することができ、これによって、可視光の吸収／反射による布地の色合いを改変する。蛍光増白剤は、少なくとも一部の可視光を放射する。対照的に、布地色調剤は、可視光スペクトルの少なくとも一部を吸収するため、表面の色合いを改変する。好適な布地色調剤としては、染料及び染料－粘土コンジュゲートが挙げられ、顔料を含んでもよい。好適な染料としては、小分子染料及びポリマー染料が挙げられる。好適な小分子染料としては、例えば、国際公開第２００５／００３２７４号パンフレット、国際公開第２００５／００３２７５号パンフレット、国際公開第２００５／００３２７６号パンフレット及び欧州特許第１８７６２２６号明細書（参照により本明細書に組み込まれる）に記載されているとおり、ダイレクトブルー（Ｄｉｒｅｃｔ Ｂｌｕｅ）、ダイレクトレッド（Ｄｉｒｅｃｔ Ｒｅｄ）、ダイレクトバイオレット（Ｄｉｒｅｃｔ Ｖｉｏｌｅｔ）、アシッドブルー（Ａｃｉｄ Ｂｌｕｅ）、アシッドレッド（Ａｃｉｄ Ｒｅｄ）、アシッドバイオレット（Ａｃｉｄ Ｖｉｏｌｅｔ）、ベーシックブルー（Ｂａｓｉｃ Ｂｌｕｅ）、ベーシックバイオレット（Ｂａｓｉｃ Ｖｉｏｌｅｔ）及びベーシックレッド（Ｂａｓｉｃ Ｒｅｄ）のカラーインデックス（Ｃ．Ｉ．）分類に分類される染料からなる群から選択される小分子染料、又はそれらの混合物が挙げられる。洗剤組成物は、好ましくは、約０．００００３ｗｔ％～約０．２ｗｔ％、約０．００００８ｗｔ％～約０．０５ｗｔ％、或いは約０．０００１ｗｔ％～約０．０４ｗｔ％の布地色調剤を含む。本組成物は、０．０００１ｗｔ％～約０．２ｗｔ％の布地色調剤を含んでもよく、これは、組成物が、単位用量パウチの形態である場合、特に好ましいことがある。好適な色調剤については、例えば、国際公開第２００７／０８７２５７号パンフレット及び国際公開第２００７／０８７２４３号パンフレットにも開示されている。
追加の酵素
洗剤組成物は、アミラーゼ、アラビナーゼ、カルボヒドラーゼ、セルラーゼ（例えば、エンドグルカナーゼ）、クチナーゼ、デオキシリボヌクレアーゼ、ガラクタナーゼ、ハロペルオキシゲナーゼ、リパーゼ、マンナナーゼ、オキシダーゼ、例えば、ラクターゼ及び／又はペルオキシダーゼ、ペクチナーゼ、ペクチンリアーゼ、さらなるプロテアーゼ、キシラナーゼ、キサンタナーゼ、キシログルカナーゼ又はオキシドレダクターゼなどの１種以上の追加の酵素を含み得る。
組成物が、１種以上の追加の酵素を含むとき、追加の酵素は、好ましくは、アミラーゼ及び／又はリパーゼ、特に、アミラーゼである。
選択された酵素の特性は、選択された洗剤と適合すべきである（例えば、至適ｐＨ、他の酵素成分及び非酵素成分との適合性など）。
プロテアーゼ：
組成物は、本発明のプロテアーゼバリアントに加えて、細菌、真菌、植物、ウイルス又は動物起源のものを含む１種以上の追加のプロテアーゼを含み得る。細菌起源のプロテアーゼが好ましい。プロテアーゼは、セリンプロテアーゼ又はメタロプロテアーゼなどのアルカリプロテアーゼであってもよい。セリンプロテアーゼは、例えば、トリプシンなどのＳ１ファミリー、又はサブチリシンなどのＳ８ファミリーであってもよい。メタロプロテアーゼは、例えば、Ｍ４ファミリー由来のサーモリシン又はＭ５、Ｍ７若しくはＭ８ファミリー由来のものなどの別のメタロプロテアーゼであってもよい。
メタロプロテアーゼの例は、バチルス・アミロリケファシエンス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）由来のものなど、国際公開第２００７／０４４９９３号パンフレット（Ｇｅｎｅｎｃｏｒ Ｉｎｔ．）に記載されるとおりの中性メタロプロテアーゼである。
好適な市販のプロテアーゼ酵素としては、商標名Ａｌｃａｌａｓｅ（登録商標）、Ｄｕｒａｌａｓｅ（商標）、Ｄｕｒａｚｙｍ（商標）、Ｒｅｌａｓｅ（登録商標）、Ｒｅｌａｓｅ（登録商標）Ｕｌｔｒａ、Ｓａｖｉｎａｓｅ（登録商標）、Ｓａｖｉｎａｓｅ（登録商標）Ｕｌｔｒａ、Ｐｒｉｍａｓｅ（登録商標）、Ｐｏｌａｒｚｙｍｅ（登録商標）、Ｋａｎｎａｓｅ（登録商標）、Ｌｉｑｕａｎａｓｅ（登録商標）、Ｌｉｑｕａｎａｓｅ（登録商標）Ｕｌｔｒａ、Ｏｖｏｚｙｍｅ（登録商標）、Ｃｏｒｏｎａｓｅ（登録商標）、Ｃｏｒｏｎａｓｅ（登録商標）Ｕｌｔｒａ、Ｂｌａｚｅ（登録商標）、Ｂｌａｚｅ Ｅｖｉｔｙ（登録商標）１００Ｔ、Ｂｌａｚｅ Ｅｖｉｔｙ（登録商標）１２５Ｔ、Ｂｌａｚｅ Ｅｖｉｔｙ（登録商標）１５０Ｔ、Ｎｅｕｔｒａｓｅ（登録商標）、Ｅｖｅｒｌａｓｅ（登録商標）、Ｅｓｐｅｒａｓｅ（登録商標）、Ｐｒｏｇｒｅｓｓ（登録商標）Ｕｎｏ及びＰｒｏｇｒｅｓｓ（登録商標）Ｅｘｃｅｌ（Ｎｏｖｏｚｙｍｅｓ Ａ／Ｓ）の下で販売されるもの、商標名Ｍａｘａｔａｓｅ（登録商標）、Ｍａｘａｃａｌ（登録商標）、Ｍａｘａｐｅｍ（登録商標）、Ｐｕｒａｆｅｃｔ（登録商標）、Ｐｕｒａｆｅｃｔ（登録商標）Ｏｘ、Ｐｕｒａｆｅｃｔ（登録商標）ＯｘＰ、Ｐｕｒａｆｅｃｔ Ｐｒｉｍｅ（登録商標）、Ｐｕｒａｍａｘ（登録商標）、ＦＮ２（登録商標）、ＦＮ３（登録商標）、ＦＮ４（登録商標）、Ｅｘｃｅｌｌａｓｅ（登録商標）、Ｅｘｃｅｌｌｅｎｚ Ｐ１０００（商標）、Ｅｘｃｅｌｌｅｎｚ Ｐ１２５０（商標）、Ｅｒａｓｅｒ（登録商標）、Ｐｒｅｆｅｒｅｎｚ（登録商標）Ｐ１００、Ｐｒｅｆｅｒｅｎｚ（登録商標）Ｐ１１０、Ｅｆｆｅｃｔｅｎｚ Ｐ１０００（商標）、Ｅｆｆｅｃｔｅｎｚ Ｐ１０５０（商標）、Ｅｆｆｅｃｔｅｎｚ Ｐ２０００（商標）、Ｐｕｒａｆａｓｔ（登録商標）、Ｐｒｏｐｅｒａｓｅ（登録商標）、Ｏｐｔｉｃｌｅａｎ（登録商標）及びＯｐｔｉｍａｓｅ（登録商標）（Ｄａｎｉｓｃｏ／ＤｕＰｏｎｔ）、Ａｘａｐｅｍ（商標）（Ｇｉｓｔ－Ｂｒｏｃａｓｅｓ Ｎ．Ｖ．）の下で販売されるもの、ＢＬＡＰ（米国特許第５３５２６０４号明細書の図２９に示される配列）及びこれに関するバリアント（Ｈｅｎｋｅｌ ＡＧ）並びにＫａｏからのＫＡＰ（バチルス・アルカロフィル（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｌｋａｌｏｐｈｉｌｕｓ）サブチリシン）が挙げられる。
リパーゼ及びクチナーゼ
好適なリパーゼ及びクチナーゼとしては、細菌又は真菌起源のものが挙げられる。化学的に修飾された変異体酵素又はタンパク質を操作した変異体酵素が含まれる。 例としては、欧州特許第２５８０６８号明細書及び欧州特許第３０５２１６号明細書に記載されている、テルモマイセス属（Ｔｈｅｒｍｏｍｙｃｅｓ）由来、例えば、Ｔ．ラヌギノスス（Ｔ．ｌａｎｕｇｉｎｏｓｕｓ）（以前はフミコラ・ラヌギノーサ（Ｈｕｍｉｃｏｌａ ｌａｎｕｇｉｎｏｓａ）と命名されていた）由来のリパーゼ、例えば、Ｈ．インソレンス（Ｈ．ｉｎｓｏｌｅｎｓ）といったフミコラ属（Ｈｕｍｉｃｏｌａ）由来のクチナーゼ（国際公開第９６／１３５８０号パンフレット）、例えば、Ｐ．アルカリゲネス（Ｐ．ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ）又はＰ．シュードアルカリゲネス（Ｐ．ｐｓｅｕｄｏａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ）（欧州特許第２１８２７２号明細書）、Ｐ．セパシア（Ｐ．ｃｅｐａｃｉａ）（欧州特許第３３１３７６号明細書）、Ｐ．ｓｐ．株ＳＤ７０５（国際公開第９５／０６７２０号パンフレット及び国際公開第９６／２７００２号パンフレット）、Ｐ．ウィスコンシネンシス（Ｐ．ｗｉｓｃｏｎｓｉｎｅｎｓｉｓ）（国際公開第９６／１２０１２号パンフレット）といったシュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）（これらの一部は、現在、バークホルデリア属（Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ）と改名されている）の株由来のリパーゼ、ＧＤＳＬタイプのストレプトマイセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）リパーゼ（国際公開第２０１０／０６５４５５号パンフレット）、イネいもち病菌（Ｍａｇｎａｐｏｒｔｈｅ ｇｒｉｓｅａ）（国際公開第２０１０／１０７５６０号パンフレット）由来のクチナーゼ、シュードモナス・メンドシナ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｍｅｎｄｏｃｉｎａ）由来のクチナーゼ（米国特許第５，３８９，５３６号明細書）、サーモビフィダ・フスカ（Ｔｈｅｒｍｏｂｉｆｉｄａ ｆｕｓｃａ）由来のリパーゼ（国際公開第２０１１／０８４４１２号パンフレット）、ジェオバシラス・ステアロサーモフィラス（Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）リパーゼ（国際公開第２０１１／０８４４１７号パンフレット）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）由来のリパーゼ（国際公開第２０１１／０８４５９９号パンフレット）、並びにストレプトマイセス・グリセウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｇｒｉｓｅｕｓ）（国際公開第２０１１／１５０１５７号パンフレット）及びＳ．プリスチナエスピラリス（Ｓ．ｐｒｉｓｔｉｎａｅｓｐｉｒａｌｉｓ）（国際公開第２０１２／１３７１４７号パンフレット）由来のリパーゼが挙げられる。
他の例は、欧州特許第４０７２２５号明細書、国際公開第９２／０５２４９号パンフレット、国際公開第９４／０１５４１号パンフレット、国際公開第９４／２５５７８号パンフレット、国際公開第９５／１４７８３号パンフレット、国際公開第９５／３０７４４号パンフレット、国際公開第９５／３５３８１号パンフレット、国際公開第９５／２２６１５号パンフレット、国際公開第９６／００２９２号パンフレット、国際公開第９７／０４０７９号パンフレット、国際公開第９７／０７２０２号パンフレット、国際公開第００／３４４５０号パンフレット、国際公開第００／６００６３号パンフレット、国際公開第０１／９２５０２号パンフレット、国際公開第２００７／８７５０８号パンフレット及び国際公開第２００９／１０９５００号パンフレットに記載されるものなどのリパーゼバリアントである。
好ましい市販されているリパーゼ製品としては、Ｌｉｐｏｌａｓｅ（商標）、Ｌｉｐｅｘ（商標）；Ｌｉｐｏｌｅｘ（商標）及びＬｉｐｏｃｌｅａｎ（商標）（Ｎｏｖｏｚｙｍｅｓ Ａ／Ｓ）、Ｌｕｍａｆａｓｔ（当初はＧｅｎｅｎｃｏｒから）及びＬｉｐｏｍａｘ（当初はＧｉｓｔ－Ｂｒｏｃａｄｅｓから）が挙げられる。
さらに他の例は、アシルトランスフェラーゼ又はペルヒドロラーゼと呼ばれこともあるリパーゼ、例えば、カンジダ・アンタークティカ（Ｃａｎｄｉｄａ ａｎｔａｒｃｔｉｃａ）リパーゼＡとの相同性を有するアシルトランスフェラーゼ（国際公開第２０１０／１１１１４３号パンフレット）、マイコバクテリウム・スメグマチス（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）由来のアシルトランスフェラーゼ（国際公開第２００５／０５６７８２号パンフレット）、ＣＥ ７ファミリー由来のペルヒドロラーゼ（国際公開第２００９／０６７２７９号パンフレット）、並びにＭ．スメグマチス（Ｍ．ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）ペルヒドロラーゼのバリアント、特に、Ｈｕｎｔｓｍａｎ Ｔｅｘｔｉｌｅ Ｅｆｆｅｃｔｓ Ｐｔｅ Ｌｔｄ製の製品Ｇｅｎｔｌｅ Ｐｏｗｅｒ Ｂｌｅａｃｈに使用されているＳ５４Ｖバリアント（国際公開第２０１０／１０００２８号パンフレット）である。
アミラーゼ
本発明のプロテアーゼバリアントとともに使用され得る好適なアミラーゼは、アルファ－アミラーゼ又はグルコアミラーゼであってもよく、細菌又は真菌起源のものであってもよい。化学的に修飾された変異体又はタンパク質を操作した変異体が含まれる。アミラーゼとしては、例えば、バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、例えば英国特許第１，２９６，８３９号明細書にさらに詳細に記載されているバチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）の特殊な系統から得られるα－アミラーゼが挙げられる。
好適なアミラーゼとしては、国際公開第９５／１０６０３号パンフレットにおける配列番号２を有するアミラーゼ又はその配列番号３と９０％の配列同一性を有するバリアントが挙げられる。好ましいバリアントは、国際公開第９４／０２５９７号パンフレット、国際公開第９４／１８３１４号パンフレット、国際公開第９７／４３４２４号パンフレット及び国際公開第９９／１９４６７号パンフレットの配列番号４に記載され、例えば、以下の位置の１つ以上における置換を有するバリアントである：１５、２３、１０５、１０６、１２４、１２８、１３３、１５４、１５６、１７８、１７９、１８１、１８８、１９０、１９７、２０１、２０２、２０７、２０８、２０９、２１１、２４３、２６４、３０４、３０５、３９１、４０８、及び４４４。
異なる好適なアミラーゼとしては、国際公開第２００２／１０３５５号パンフレットにおける配列番号６を有するアミラーゼ又はその配列番号６と９０％の配列同一性を有するそのバリアントが挙げられる。配列番号６の好ましいバリアントは、１８１及び１８２位における欠失及び１９３位における置換を有するものである。
好適な他のアミラーゼは、国際公開第２００６／０６６５９４号パンフレットの配列番号６に示されるＢ．アミロリケファシエンス（Ｂ．ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）に由来するアルファ－アミラーゼの残基１～３３及び国際公開第２００６／０６６５９４号パンフレットの配列番号４に示されるＢ．リケニフォルミス（Ｂ．ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）のアルファ－アミラーゼの残基３６～４８３を含むハイブリッドアルファ－アミラーゼ又はそれと９０％の配列同一性を有するバリアントである。このハイブリッドアルファ－アミラーゼの好ましいバリアントは、以下の位置の１つ以上において置換、欠失又は挿入を有するものである：Ｇ４８、Ｔ４９、Ｇ１０７、Ｈ１５６、Ａ１８１、Ｎ１９０、Ｍ１９７、Ｉ２０１、Ａ２０９及びＱ２６４。国際公開第２００６／０６６５９４号パンフレットの配列番号６に示されるＢ．アミロリケファシエンス（Ｂ．ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）に由来するアルファ－アミラーゼの残基１～３３及び配列番号４の残基３６～４８３を含むハイブリッドアルファ－アミラーゼの最も好ましいバリアントは、置換：
Ｍ１９７Ｔ；
Ｈ１５６Ｙ＋Ａ１８１Ｔ＋Ｎ１９０Ｆ＋Ａ２０９Ｖ＋Ｑ２６４Ｓ；又は
Ｇ４８Ａ＋Ｔ４９Ｉ＋Ｇ１０７Ａ＋Ｈ１５６Ｙ＋Ａ１８１Ｔ＋Ｎ１９０Ｆ＋Ｉ２０１Ｆ＋Ａ２０９Ｖ＋Ｑ２６４Ｓ
を有するものである。
他の好適なアミラーゼは、国際公開第９９／１９４６７号パンフレットにおける配列番号６の配列を有するアミラーゼ又は配列番号６と９０％の配列同一性を有するそのバリアントである。配列番号６の好ましいバリアントは、以下の位置の１つ以上において置換、欠失又は挿入を有するものである：Ｒ１８１、Ｇ１８２、Ｈ１８３、Ｇ１８４、Ｎ１９５、Ｉ２０６、Ｅ２１２、Ｅ２１６及びＫ２６９。特に好ましいアミラーゼは、Ｒ１８１位及びＧ１８２位、又はＨ１８３位及びＧ１８４位に欠失を有するものである。
使用され得る追加のアミラーゼは、国際公開第９６／２３８７３号パンフレットの配列番号１、配列番号３、配列番号２若しくは配列番号７を有するもの又は配列番号１、配列番号２、配列番号３若しくは配列番号７と９０％の配列同一性を有するそのバリアントである。配列番号１、配列番号２、配列番号３又は配列番号７の好ましいバリアントは、付番のために国際公開第９６／２３８７３号パンフレットの配列番号２を使用する、以下の位置の１つ以上において置換、欠失又は挿入を有するものである：１４０、１８１、１８２、１８３、１８４、１９５、２０６、２１２、２４３、２６０、２６９、３０４及び４７６。より好ましいバリアントは、１８１、１８２、１８３及び１８４から選択される２つの位置、例えば、１８１及び１８２、１８２及び１８３、又は１８３位及び１８４位に欠失を有するものである。配列番号１、配列番号２又は配列番号７の最も好ましいアミラーゼバリアントは、１８３位及び１８４位における欠失並びに１４０位、１９５位、２０６位、２４３位、２６０位、３０４位及び４７６位の１つ以上における置換を有するものである。
使用され得る他のアミラーゼは、国際公開第２００８／１５３８１５号パンフレットの配列番号２、国際公開第０１／６６７１２号パンフレットの配列番号１０を有するアミラーゼ又は国際公開第２００８／１５３８１５号パンフレットの配列番号２と９０％の配列同一性若しくは国際公開第０１／６６７１２号パンフレットの配列番号１０と９０％の配列同一性を有するそのバリアントである。国際公開第０１／６６７１２号パンフレットの配列番号１０の好ましいバリアントは、以下の位置の１つ以上における置換、欠失又は挿入を有するものである：１７６、１７７、１７８、１７９、１９０、２０１、２０７、２１１及び２６４。
さらなる好適なアミラーゼは、国際公開第２００９／０６１３８０号パンフレットの配列番号２を有するアミラーゼ又はその配列番号２と９０％の配列同一性を有するバリアントである。配列番号２の好ましいバリアントは、Ｃ末端の短縮化及び／又は以下の位置の１つ以上において置換、欠失又は挿入を有するものである：Ｑ８７、Ｑ９８、Ｓ１２５、Ｎ１２８、Ｔ１３１、Ｔ１６５、Ｋ１７８、Ｒ１８０、Ｓ１８１、Ｔ１８２、Ｇ１８３、Ｍ２０１、Ｆ２０２、Ｎ２２５、Ｓ２４３、Ｎ２７２、Ｎ２８２、Ｙ３０５、Ｒ３０９、Ｄ３１９、Ｑ３２０、Ｑ３５９、Ｋ４４４及びＧ４７５。配列番号２のより好ましいバリアントは、以下の位置：Ｑ８７Ｅ，Ｒ、Ｑ９８Ｒ、Ｓ１２５Ａ、Ｎ１２８Ｃ、Ｔ１３１Ｉ、Ｔ１６５Ｉ、Ｋ１７８Ｌ、Ｔ１８２Ｇ、Ｍ２０１Ｌ、Ｆ２０２Ｙ、Ｎ２２５Ｅ，Ｒ、Ｎ２７２Ｅ，Ｒ、Ｓ２４３Ｑ，Ａ，Ｅ，Ｄ、Ｙ３０５Ｒ、Ｒ３０９Ａ、Ｑ３２０Ｒ、Ｑ３５９Ｅ、Ｋ４４４Ｅ及びＧ４７５Ｋの１つ以上における置換、並びに／又はＲ１８０位及び／若しくはＳ１８１位又はＴ１８２位及び／若しくはＧ１８３位における欠失を有するものである。配列番号２の最も好ましいアミラーゼバリアントは、置換：
Ｎ１２８Ｃ＋Ｋ１７８Ｌ＋Ｔ１８２Ｇ＋Ｙ３０５Ｒ＋Ｇ４７５Ｋ；
Ｎ１２８Ｃ＋Ｋ１７８Ｌ＋Ｔ１８２Ｇ＋Ｆ２０２Ｙ＋Ｙ３０５Ｒ＋Ｄ３１９Ｔ＋Ｇ４７５Ｋ；
Ｓ１２５Ａ＋Ｎ１２８Ｃ＋Ｋ１７８Ｌ＋Ｔ１８２Ｇ＋Ｙ３０５Ｒ＋Ｇ４７５Ｋ；又は
Ｓ１２５Ａ＋Ｎ１２８Ｃ＋Ｔ１３１Ｉ＋Ｔ１６５Ｉ＋Ｋ１７８Ｌ＋Ｔ１８２Ｇ＋Ｙ３０５Ｒ＋Ｇ４７５Ｋ
を有するものであり、
バリアントは、Ｃ末端が短縮化されており、任意選択により、２４３位の置換並びに／又は１８０位及び／若しくは１８１位の欠失をさらに含む。
さらなる好適なアミラーゼは、国際公開第２０１３／１８４５７７号パンフレットの配列番号１を有するアミラーゼ又はその配列番号１と９０％の配列同一性を有するバリアントである。配列番号１の好ましいバリアントは、以下の位置の１つ以上において置換、欠失又は挿入を有するものである：Ｋ１７６、Ｒ１７８、Ｇ１７９、Ｔ１８０、Ｇ１８１、Ｅ１８７、Ｎ１９２、Ｍ１９９、Ｉ２０３、Ｓ２４１、Ｒ４５８、Ｔ４５９、Ｄ４６０、Ｇ４７６及びＧ４７７。配列番号１の最も好ましいバリアントは、以下の位置：Ｋ１７６Ｌ、Ｅ１８７Ｐ、Ｎ１９２ＦＹＨ、Ｍ１９９Ｌ、Ｉ２０３ＹＦ、Ｓ２４１ＱＡＤＮ、Ｒ４５８Ｎ、Ｔ４５９Ｓ、Ｄ４６０Ｔ、Ｇ４７６Ｋ及びＧ４７７Ｋの１つ以上における置換、並びに／又は位置Ｒ１７８及び／若しくはＳ１７９又はＴ１８０及び／若しくはＧ１８１における欠失を有するものである。配列番号１の最も好ましいアミラーゼバリアントは、置換：
Ｅ１８７Ｐ＋Ｉ２０３Ｙ＋Ｇ４７６Ｋ
Ｅ１８７Ｐ＋Ｉ２０３Ｙ＋Ｒ４５８Ｎ＋Ｔ４５９Ｓ＋Ｄ４６０Ｔ＋Ｇ４７６Ｋを含み、
且つ任意選択により、２４１位での置換並びに／又は１７８位及び／若しくは１７９位での欠失をさらに含む。
さらなる好適なアミラーゼは、国際公開第２０１０／１０４６７５号パンフレットの配列番号１を有するアミラーゼ又はその配列番号１と９０％の配列同一性を有するバリアントである。配列番号１の好ましいバリアントは、以下の位置の１つ以上において置換、欠失又は挿入を有するものである：Ｎ２１、Ｄ９７、Ｖ１２８ Ｋ１７７、Ｒ１７９、Ｓ１８０、Ｉ１８１、Ｇ１８２、Ｍ２００、Ｌ２０４、Ｅ２４２、Ｇ４７７及びＧ４７８。
配列番号１の最も好ましいバリアントは、以下の位置：Ｎ２１Ｄ、Ｄ９７Ｎ、Ｖ１２８Ｉ Ｋ１７７Ｌ、Ｍ２００Ｌ、Ｌ２０４ＹＦ、Ｅ２４２ＱＡ、Ｇ４７７Ｋ及びＧ４７８Ｋの１つ以上における置換並びに／又は位置Ｒ１７９及び／若しくはＳ１８０又はＩ１８１及び／若しくはＧ１８２における欠失を有するものである。配列番号１の最も好ましいアミラーゼバリアントは、置換Ｎ２１Ｄ＋Ｄ９７Ｎ＋Ｖ１２８Ｉを含み、且つ任意選択により、２００位の置換並びに／又は１８０位及び／若しくは１８１位の欠失をさらに含む。
他の好適なアミラーゼは、国際公開第０１／６６７１２号パンフレットの配列番号１２を有するアルファ－アミラーゼ又は配列番号１２と少なくとも９０％の配列同一性を有するバリアントである。好ましいアミラーゼバリアントは、国際公開第０１／６６７１２号パンフレットにおける配列番号１２の以下の位置の１つ以上における置換、欠失又は挿入を有するものである：Ｒ２８、Ｒ１１８、Ｎ１７４；Ｒ１８１、Ｇ１８２、Ｄ１８３、Ｇ１８４、Ｇ１８６、Ｗ１８９、Ｎ１９５、Ｍ２０２、Ｙ２９８、Ｎ２９９、Ｋ３０２、Ｓ３０３、Ｎ３０６、Ｒ３１０、Ｎ３１４；Ｒ３２０、Ｈ３２４、Ｅ３４５、Ｙ３９６、Ｒ４００、Ｗ４３９、Ｒ４４４、Ｎ４４５、Ｋ４４６、Ｑ４４９、Ｒ４５８、Ｎ４７１、Ｎ４８４。特定の好ましいアミラーゼとしては、Ｄ１８３及びＧ１８４の欠失を有し、且つ置換Ｒ１１８Ｋ、Ｎ１９５Ｆ、Ｒ３２０Ｋ及びＲ４５８Ｋを有するバリアント、並びに群：Ｍ９、Ｇ１４９、Ｇ１８２、Ｇ１８６、Ｍ２０２、Ｔ２５７、Ｙ２９５、Ｎ２９９、Ｍ３２３、Ｅ３４５及びＡ３３９から選択される１つ以上の位置における置換をさらに有するバリアント、これら全ての位置において置換をさらに有する最も好ましいバリアントが挙げられる。
他の例は、国際公開第２０１１／０９８５３１号パンフレット、国際公開第２０１３／００１０７８号パンフレット及び国際公開第２０１３／００１０８７号パンフレットにおいて記載されるものなどのアミラーゼバリアントである。市販されているアミラーゼとしては、Ｄｕｒａｍｙｌ（商標）、Ｔｅｒｍａｍｙｌ（商標）、Ｆｕｎｇａｍｙｌ（商標）、Ｓｔａｉｎｚｙｍｅ（商標）、Ｓｔａｉｎｚｙｍｅ Ｐｌｕｓ（商標）、Ｎａｔａｌａｓｅ（商標）、Ｌｉｑｕｏｚｙｍｅ Ｘ、ＢＡＮ（商標）、Ａｍｐｌｉｆｙ（登録商標）及びＡｍｐｌｉｆｙ（登録商標）Ｐｒｉｍｅ（Ｎｏｖｏｚｙｍｅｓ Ａ／Ｓ製）、並びにＲａｐｉｄａｓｅ（商標）、Ｐｕｒａｓｔａｒ（商標）／Ｅｆｆｅｃｔｅｎｚ（商標）、Ｐｏｗｅｒａｓｅ、Ｐｒｅｆｅｒｅｎｚ Ｓ１０００、Ｐｒｅｆｅｒｅｎｚ Ｓ１１０、Ｐｒｅｆｅｒｅｎｚ Ｓ１１０（Ｇｅｎｅｎｃｏｒ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｃ．／ＤｕＰｏｎｔ製）が挙げられる。
１つの好ましいアミラーゼは、改変Ｈ１＊＋Ｎ５４Ｓ＋Ｖ５６Ｔ＋Ｋ７２Ｒ＋Ｇ１０９Ａ＋Ｆ１１３Ｑ＋Ｒ１１６Ｑ＋Ｗ１６７Ｆ＋Ｑ１７２Ｇ＋Ａ１７４Ｓ＋Ｇ１８２＊＋Ｄ１８３＊＋Ｇ１８４Ｔ＋Ｎ１９５Ｆ＋Ｖ２０６Ｌ＋Ｋ３９１Ａ＋Ｐ４７３Ｒ＋Ｇ４７６Ｋを有する国際公開第２０１６／１８０７４８号パンフレットにおける配列番号１３を有するアミラーゼのバリアントである。
別の好ましいアミラーゼは、改変Ｄ１８３＊＋Ｇ１８４＊＋Ｗ１４０Ｙ＋Ｎ１９５Ｆ＋Ｖ２０６Ｙ＋Ｙ２４３Ｆ＋Ｅ２６０Ｇ＋Ｇ３０４Ｒ＋Ｇ４７６Ｋを有する国際公開第２０１３／００１０７８号パンフレットにおける配列番号１を有するアミラーゼのバリアントである。
別の好ましいアミラーゼは、改変Ｈ１＊＋Ｇ７Ａ＋Ｇ１０９Ａ＋Ｗ１４０Ｙ＋Ｇ１８２＊＋Ｄ１８３＊＋Ｎ１９５Ｆ＋Ｖ２０６Ｙ＋Ｙ２４３Ｆ＋Ｅ２６０Ｇ＋Ｎ２８０Ｓ＋Ｇ３０４Ｒ＋Ｅ３９１Ａ＋Ｇ４７６Ｋを有する国際公開第２０１８／１４１７０７号パンフレットにおける配列番号１を有するアミラーゼのバリアントである。
さらなる好ましいアミラーゼは、改変Ｌ２０２Ｍ ＋Ｔ２４６Ｖを有する国際公開第２０１７／１９１１６０号パンフレットにおける配列番号１を有するアミラーゼのバリアントである。
デオキシリボヌクレアーゼ（ＤＮａｓｅ）
好適なデオキシリボヌクレアーゼ（ＤＮａｓｅ）は、ＤＮＡ骨格におけるホスホジエステル結合の加水切断を触媒し、それによりＤＮＡを分解するいずれかの酵素である。細菌から得ることができるＤＮａｓｅが好ましく、特に、バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）の種から得ることができるＤＮａｓｅが好ましく；特に、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）又はバチルス・リケニフォルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）から得ることができるＤＮａｓｅが好ましい。そのようなＤＮａｓｅの例は、国際公開２０１１／０９８５７９号パンフレット及び国際公開第２０１４／０８７０１１号パンフレットに記載される。
オキシドレダクターゼ
一実施形態では、組成物は、還元－酸化反応を触媒する酵素であるオキシドレダクターゼを含み得る。好ましいオキシドレダクターゼは、スーパーオキシドジスムターゼである。
ペルオキシダーゼ／オキシダーゼ
好適なペルオキシダーゼ／オキシダーゼとしては、植物、細菌又は真菌起源のものが挙げられる。化学的に修飾された変異体又はタンパク質を操作した変異体が含まれる。有用なペルオキシダーゼの例としては、コプリナス属（Ｃｏｐｒｉｎｕｓ）由来、例えば、国際公開第９３／２４６１８号パンフレット、国際公開第９５／１０６０２号パンフレット、及び国際公開第９８／１５２５７号パンフレットに記載されるものとしてのＣ．シネレウス（Ｃ．ｃｉｎｅｒｅｕｓ）由来のペルオキシダーゼ、及びそのバリアントが挙げられる。
市販のペルオキシダーゼとしては、Ｇｕａｒｄｚｙｍｅ（登録商標）（Ｎｏｖｏｚｙｍｅｓ Ａ／Ｓ）が挙げられる。
補助材料
洗濯洗剤における使用のための当該技術分野で知られる任意の洗剤構成成分もまた利用され得る。他の任意選択の洗剤構成成分としては、単独で又は組み合わせた抗腐食剤、収縮防止剤、再汚染防止剤、しわ防止剤、殺菌剤、結合剤、腐食防止剤、崩壊剤／崩壊薬剤、染料、酵素安定化剤（ホウ酸、ホウ酸塩、ＣＭＣ、及び／又はプロピレングリコールなどのポリオール）、粘土を含む布地柔軟仕上げ剤、充填剤／加工助剤、蛍光増白剤／光学的光沢剤、起泡促進剤、泡（石鹸泡）調節剤、香料、汚れ懸濁剤、柔軟剤、起泡抑制剤、黄褐色阻害剤、及びウィッキング剤が挙げられる。洗濯洗剤における使用のための当該技術分野で知られる任意の成分が利用され得る。そのような成分の選択は、十分に当業者の技術の範囲内である。
分散剤：本発明の洗剤組成物はまた、分散剤も含有することができる。特に、粉末洗剤は、分散剤を含んでもよい。好適な水溶性有機材料としては、ホモ－若しくはコポリマー酸又はそれらの塩が挙げられ、ここで、ポリカルボン酸は、２個以下の炭素原子によって相互に分離された少なくとも２つのカルボキシル基を含む。好適な分散剤は、例えば、Ｐｏｗｄｅｒｅｄ Ｄｅｔｅｒｇｅｎｔｓ，Ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｓｅｒｉｅｓ ｖｏｌｕｍｅ ７１，Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，１９９７に記載されている。
移染防止剤：本発明の洗剤組成物はまた、１種以上の移染防止剤を含んでもよい。好適な高分子移染防止剤としては、これらに限定されないが、ポリビニルピロリドンポリマー、ポリアミンＮ－オキシドポリマー、Ｎ－ビニルピロリドン及びＮ－ビニルイミダゾールのコポリマー、ポリビニルオキサゾリドン及びポリビニルイミダゾール又はこれらの混合物が挙げられる。主題の組成物中に存在する場合、移染防止剤は、組成物の約０．０００１重量％～約１０重量％、約０．０１重量％～約５重量％のレベルで、又は約０．１重量％～約３重量％のレベルでも存在し得る。
蛍光増白剤：本発明の洗剤組成物はまた、蛍光増白剤又は光学的光沢剤などのクリーニングされる物品に色合いを付与し得る追加の構成成分を含有するのが好ましい。存在する場合、光沢剤は、約０．０１％～約０５％のレベルであることが好ましい。洗濯洗剤組成物での使用に好適な任意の蛍光増白剤が、本発明の組成物において使用されてもよい。最も一般的に用いられる蛍光増白剤は、ジアミノスチルベン－スルホン酸誘導体、ジアリールピラゾリン誘導体及びビスフェニル－ジスチリル誘導体のクラスに属するものである。ジアミノスチルベン－スルホン酸誘導体タイプの蛍光増白剤の例としては、４，４’－ビス－（２－ジエタノールアミノ－４－アニリノ－ｓ－トリアジン－６－イルアミノ）スチルベン－２，２’－ジスルホネート；４，４’－ビス－（２，４－ジアニリノ－ｓ－トリアジン－６－イルアミノ）スチルベン－２．２’－ジスルホネート；４，４’－ビス－（２－アニリノ－４（Ｎ－メチル－Ｎ－２－ヒドロキシ－エチルアミノ）－ｓ－トリアジン－６－イルアミノ）スチルベン－２，２’－ジスルホネート、４，４’－ビス－（４－フェニル－２，１，３－トリアゾール－２－イル）スチルベン－２，２’－ジスルホネート；４，４’－ビス－（２－アニリノ－４（１－メチル－２－ヒドロキシ－エチルアミノ）－ｓ－トリアジン－６－イルアミノ）スチルベン－２，２’－ジスルホネート及び２－（スチルビル－４’’－ナフト－１．，２’：４，５）－１，２，３－トリアゾール－２’’－スルホネートのナトリウム塩が挙げられる。好ましい蛍光増白剤は、Ｃｉｂａ－Ｇｅｉｇｙ ＡＧ，Ｂａｓｅｌ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄから市販されているＴｉｎｏｐａｌ ＤＭＳ及びＴｉｎｏｐａｌ ＣＢＳである。Ｔｉｎｏｐａｌ ＤＭＳは、４，４’－ビス－（２－モルホリノ－４－アニリノ－ｓ－トリアジン－６－イルアミノ）スチルベンジスルホネートの二ナトリウム塩である。Ｔｉｎｏｐａｌ ＣＢＳは、２，２’－ビス－（フェニル－スチリル）ジスルホネートの二ナトリウム塩である。また、好ましい蛍光増白剤は、Ｐａｒａｍｏｕｎｔ Ｍｉｎｅｒａｌｓ ａｎｄ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ，Ｍｕｍｂａｉ，Ｉｎｄｉａ製の市販のＰａｒａｗｈｉｔｅ ＫＸである。本発明における使用に好適な他の蛍光剤としては、１－３－ジアリールピラゾリン及び７－アルキルアミノクマリンが挙げられる。好適な蛍光光沢剤のレベルは、約０．０１、０．０５、約０．１、或いは約０．２ｗｔ％の下限レベルから、０．５又はさらには０．７５ｗｔ％の上限レベルまでを含む。
汚れ遊離ポリマー：本発明の洗剤組成物はまた、綿及びポリエステル系布地などの布地からの汚れの除去、特にポリエステル系布地からの疎水性汚れの除去を補助する１種以上の汚れ遊離ポリマーを含んでもよい。汚れ遊離ポリマーは、例えば、非イオン性又はアニオン性テレフタレート系ポリマー、ポリビニルカプロラクタム及び関連するコポリマー、ビニルグラフトコポリマー、ポリエステルポリアミドであってもよく、例えば、Ｃｈａｐｔｅｒ ７，Ｐｏｗｄｅｒｅｄ Ｄｅｔｅｒｇｅｎｔｓ，Ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ ｓｃｉｅｎｃｅ ｓｅｒｉｅｓ ｖｏｌｕｍｅ ７１，Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．を参照されたい。別のタイプの汚れ遊離ポリマーは、コア構造と、このコア構造に結合した複数のアルコキシレート基とを含む両親媒性アルコキシル化油脂クリーニングポリマーである。コア構造は、国際公開第２００９／０８７５２３号パンフレット（本明細書において参照により組み込まれる）に詳述されているとおり、ポリアルキレンイミン構造又はポリアルカノールアミン構造を含み得る。さらに、ランダムグラフトコポリマーは、好適な汚れ遊離ポリマーである。好適なグラフトコポリマーは、国際公開第２００７／１３８０５４号パンフレット、国際公開第２００６／１０８８５６号パンフレット及び国際公開第２００６／１１３３１４号パンフレット（本明細書において参照により組み込まれる）において、より詳細に記載されている。他の汚れ遊離ポリマーは、欧州特許第１８６７８０８号明細書又は国際公開第０３／０４０２７９号パンフレット（共に本明細書において参照により組み込まれる）に記載されているものなどの変性セルロース誘導体などの特に置換セルロース系構造といった置換多糖類構造である。好適なセルロース系ポリマーとしては、セルロース、セルロースエーテル、セルロースエステル、セルロースアミド及びこれらの混合物が挙げられる。好適なセルロース系ポリマーとしては、アニオン性変性セルロース、非イオン性変性セルロース、カチオン性変性セルロース、双性イオン性変性セルロース、及びこれらの混合物が挙げられる。好適なセルロース系ポリマーとしては、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、エチルセルロース、ヒドロキシルエチルセルロース、ヒドロキシルプロピルメチルセルロース、エステルカルボキシメチルセルロース及びこれらの混合物が挙げられる。
再付着防止剤：本発明の洗剤組成物としてはまた、カルボキシメチルセルロース（ＣＭＣ）、ポリビニルアルコール（ＰＶＡ）、ポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）、ポリオキシエチレン及び／又はポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、アクリル酸のホモポリマー、アクリル酸とマレイン酸とのコポリマー、並びにエトキシル化ポリエチレンイミンなどの１種以上の再付着防止剤を含んでもよい。前述の汚れ遊離ポリマーの下で、上記セルロース系ポリマーは、再付着防止剤としても機能し得る。
他の好適な補助材料としては、収縮防止剤、しわ防止剤、殺菌剤、結合剤、キャリア、染料、酵素安定化剤、布地用柔軟剤、充填剤、起泡調節剤、香料、顔料、制泡剤、溶剤、並びに液体洗剤用構造化剤、及び／又は構造弾性化剤が挙げられる。
洗剤製品の配合
洗剤酵素、すなわち、本発明のプロテアーゼバリアント及び任意選択により１種以上の追加の酵素は、１種以上の酵素を含有する別々の添加剤を添加すること、又はこれらの酵素の全てを含む組み合わせた添加剤を添加することによって洗剤組成物中に含まれ得る。１種以上の酵素を含む洗剤添加剤は、例えば、顆粒、液体、スラリーなどとして配合され得る。好ましい洗剤添加剤配合物としては、顆粒、特に、非飛散性顆粒、液体、特に、安定化された液体、又はスラリーが挙げられる。
本発明の洗剤組成物は、例えば、バー、均質錠剤、２層以上を有する錠剤、１つ以上のコンパートメントを有するパウチ、定型的若しくは緻密な粉末、顆粒、ペースト、ゲル、又は定型的、緻密な若しくは濃縮された液体など、任意の好都合な形態であってもよい。層（同じ又は異なる相）、パウチ、及び機械式投与ユニットのための形態などのいくつかの洗剤配合物形態がある。
パウチは、単一又は複数のコンパートメントとして構成することができる。これは、組成物を保持するのに好適な任意の形態、形状及び材料であってもよく、例えば、水との接触前に、パウチから組成物が放出できないようにする。パウチは、内容物を封入する水溶性フィルムから作られる。内体積は、パウチのコンパートメントに分割することができる。好ましいフィルムは、ポリマー材料、好ましくは、フィルム又はシートに形成されるポリマーである。好ましいポリマー、コポリマー又はその誘導体は、ポリアクリレート、及び水溶性アクリレートコポリマー、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、ナトリウムデキストリン、エチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、マルトデキストリン、ポリメタクリレート、最も好ましくは、ポリビニルアルコールコポリマー及び、ヒドロキシプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）から選択される。好ましくは、フィルム中のポリマー、例えば、ＰＶＡのレベルは、少なくとも約６０％である。好ましい平均分子量は通常、約２０，０００～約１５０，０００となる。フィルムはまた、加水分解により分解可能で、水溶性のポリマーブレンド、例えば、ポリラクチド及びポリビニルアルコール（Ｃｈｒｉｓ Ｃｒａｆｔ Ｉｎ．Ｐｒｏｄ．ｏｆ Ｇａｒｙ，Ｉｎｄｉａｎａ，ＵＳから販売される商品名Ｍ８６３０で知られる）と、グリセロール、エチレングリセロール、プロピレングリコール、ソルビトール及びこれらの混合物のような可塑剤などを含むブレンド組成物であってもよい。パウチは、水溶性フィルムによって分離された固体洗濯洗剤組成物若しくは一部分の構成成分及び／又は液体クリーニング組成物若しくは一部分の構成成分を含むことができる。液体構成成分用のコンパートメントは、固体を含有するコンパートメントとは、組成が異なり得る。（例えば、米国特許出願公開第２００９／００１１９７０号明細書参照）。
洗剤成分は、水溶解性パウチ内のコンパートメントによって又は錠剤の様々な層で、互いに物理的に分離することができる。これにより、構成成分間の好ましくない貯蔵時の相互作用を回避することができる。コンパートメントの各々の様々な溶解プロファイルによって、洗浄溶液中の選択した構成成分の溶解遅延を起こすことも可能である。
単位用量ではない液体又はゲル洗剤は水溶性であってもよく、通常、少なくとも２０重量％、及び最大９５％の水、例えば、最大約７０％、最大約６５％、最大約５５％、最大約４５％、又は最大約３５％水を含有する。濃縮された液体洗剤は、より低い水含量を有してもよく、例えば、約３０％以下又は約２０％以下、例えば、約２％～約１５％などの約１％～約２０％の範囲である。限定されないが、アルカノール、アミン、ジオール、エーテル及びポリオールなどの他のタイプの液体が、水溶性液体又はゲルに含まれてもよい。水溶性液体又はゲル洗剤は、０～３０％の有機溶剤を含有し得る。液体又はゲル洗剤は、非水溶性であってもよい。
液体洗剤組成物は、例えば、約ｐＨ７、約ｐＨ８又は約ｐＨ９などの約６～約１０の中程度のｐＨを有するように配合され得るか、又はそれらは、例えば、約ｐＨ１０、約ｐＨ１１又は約ｐＨ１２などの約１０～約１２のより高いｐＨを有するように配合され得る。
別段の指示がない限り、用語「液体」は、本明細書で使用する場合、あらゆる種類の液体洗剤組成物、例えば、濃縮された液体、ゲル、又は例えば、１つ以上のコンパートメントを有するパウチの液体若しくはゲル部分を包含するものとして理解されるべきである。
洗濯石鹸バー
本発明の酵素は、洗濯石鹸バーに添加されてもよく、手洗いの洗濯物、布地及び／又は織物のために使用されてもよい。洗濯石鹸バーという用語は、洗濯バー、石鹸バー、コンボバー、合成洗剤バー及び洗剤バーを含む。バーの種類は通常、それらが含有する界面活性剤の種類によって異なり、洗濯石鹸バーという用語は、脂肪酸由来の石鹸及び／又は合成石鹸を含有するものを含む。洗濯石鹸バーは、固体であり、したがって、室温で液体、ゲル又は粉末ではない物理的形態を有する。
洗濯石鹸バーは、１種以上の追加の酵素、ペプチドアルデヒド（又はハイドロサルファイト付加物若しくはヘミアセタール付加物）などのプロテアーゼ阻害剤、ホウ酸、ホウ酸塩、ホウ砂及び／若しくは４－ホルミルフェニルボロン酸などのフェニルボロン酸誘導体、１種以上の石鹸又は合成界面活性剤、グリセリンなどのポリオール、脂肪酸などのｐＨ制御化合物、クエン酸、酢酸及び／若しくはギ酸、並びに／又は一価カチオン及び有機アニオンの塩を含有してもよく、一価カチオンは、例えば、Ｎａ＋、Ｋ＋又はＮＨ４ ＋であってもよく、有機アニオンは、例えば、ギ酸塩、酢酸塩、クエン酸塩、又は乳酸塩であってもよく、その結果、一価カチオン及び有機アニオンの塩は、例えば、ギ酸ナトリウムであってもよい。
洗濯石鹸バーはまた、ＥＤＴＡ及びＨＥＤＰなどの錯化剤、芳香剤及び／又は異なる種類の充填剤、界面活性剤、例えば、アニオン性合成界面活性剤、ビルダー、ポリマー性汚れ遊離剤、洗剤キレーター、安定化剤、充填剤、色素、着色剤、移染防止剤、アルコキシル化ポリカーボネート、起泡抑制剤、構造化剤、結合剤、浸出剤、漂白活性化剤、粘土汚れ除去剤、再付着防止剤、ポリマー性分散剤、光沢剤、布地用柔軟剤、芳香剤及び／又は当該技術分野で知られる他の化合物を含有し得る。
洗濯石鹸バーは、撹拌機、圧縮機、例えば、二段階真空圧縮機、押し出し機、切断機、ロゴ押印機、冷却トンネル及び包装機などであるがこれらに限定されない従来の洗濯石鹸バー作製装置において加工され得る。石鹸、本発明の酵素、任意選択により１種以上の追加の酵素、プロテアーゼ阻害剤、並びに一価カチオン及び有機アニオンの塩を含有する事前に混合されたものが調製されてもよく、続いて混合物はプロッディングされる。酵素及び任意選択の追加の酵素は、例えば、液体形態においてプロテアーゼ阻害剤と同時に添加され得る。混合工程及びプロッディング工程に加えて、プロセスはさらに、粉砕、圧出、切断、押印、冷却及び／又は包装の工程を含み得る。
顆粒状洗剤配合物
酵素含有コア及び任意選択により１種以上の被覆剤を含む顆粒の形態の酵素は、顆粒状（粉末）洗剤において一般的に使用される。コアを調製するための様々な方法は、当該技術分野でよく知られており、例えば、ａ）液体酵素含有溶液の噴霧乾燥、ｂ）例えば、流動層装置を使用する予め形成された不活性コア粒子の周囲に層としてコーティングされた酵素を有する層状製品の生成、ｃ）予め形成されたコアの表面上及び／又は表面中への酵素の吸収、ｄ）酵素含有ペーストの押し出し、ｅ）溶融したワックス中での酵素含有粉末の懸濁及び金属粒生成物をもたらす噴霧、ｆ）酵素含有液体を顆粒化構成成分の乾燥粉末組成物に添加することによる撹拌機顆粒化、ｇ）大きい粒子、ペレットなどの粉砕又は破砕による酵素含有コアのサイズ縮小、並びにｈ）流動層顆粒化を含む。酵素含有コアは、例えば、飼料又は酵素産業において顆粒を乾燥させるための流動層ドライヤー又は他の既知の方法を使用して乾燥されて、典型的には０．１～１０％ｗ／ｗ水の含水量をもたらし得る。
酵素含有コアは、任意選択により、保管安定性を改善し且つ／又は粉塵形成を低減するコーティングとともに提供される。洗剤のための酵素顆粒のために使用される場合が多いコーティングの１つの種類は、塩コーティングであり、典型的には、無機塩コーティングであり、例えば、流動層を使用して塩の溶液として塗布され得る。使用され得る他のコーティング材料は、例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、メチルヒドロキシ－プロピルセルロース（ＭＨＰＣ）及びポリビニルアルコール（ＰＶＡ）である。顆粒は、２つ以上のコーティング、例えば、塩コーティングに続いて、ＰＥＧ、ＭＨＰＣ又はＰＶＡなどの材料の追加のコーティングを含有し得る。
酵素顆粒及びその生成に対するさらなる情報については、国際公開第２０１３／００７５９４号パンフレット並びに例えば、国際公開第２００９／０９２６９９号パンフレット、欧州特許第１７０５２４１号明細書、欧州特許第１３８２６６８号明細書、国際公開第２００７／００１２６２号パンフレット、米国特許第６，４７２，３６４号明細書、国際公開第２００４／０７４４１９号パンフレット及び国際公開第２００９／１０２８５４号パンフレットを参照されたい。
使用及びクリーニング方法
本発明はまた、家庭洗濯物の洗浄及び工業的な洗濯洗浄などの布地及び織物の洗濯において本発明によるプロテアーゼバリアント又はその組成物を使用するための方法に関する。
本発明はまた、床、テーブル、壁、屋根などの硬質表面、並びに車（車洗浄）及び食器（食器洗浄）などの硬質の物体の表面のクリーニングにおいて本発明によるバリアント又はその組成物を使用するための方法に関する。
本発明のプロテアーゼバリアントが加えられ、それにより洗剤組成物の構成成分になり得る。したがって、本発明の一態様は、洗濯及び／又は硬質表面クリーニングなどのクリーニングプロセスにおけるプロテアーゼバリアントの使用に関する。
本発明の洗剤組成物は、例えば、手による又は機械的洗濯洗剤組成物として、例えば、汚れた布地の前処理に好適な洗濯添加剤組成物、及びすすぎ添加布地用柔軟剤組成物として配合され得るか、或いは一般に家庭の硬質表面クリーニング操作に使用するための洗剤組成物として配合され得るか、或いは手による又は機械的食器洗浄操作のために配合され得る。
クリーニングプロセス又は織物ケアのプロセスは、例えば、洗濯プロセス、食器洗浄プロセス又は浴室タイル、床、テーブルトップ、排水管、皮膚及び洗面器などの硬質表面のクリーニングであり得る。洗濯プロセスは、例えば、家庭での洗濯であり得るが、工業的洗濯である場合もある。さらに、本発明は、布地及び／又は衣服の洗濯のためのプロセスに関し、そのプロセスは、布地を、洗剤組成物及び少なくとも１種の本発明のプロテアーゼバリアントを含有する洗浄溶液で処理することを含む。クリーニングプロセス又は織物ケアのプロセスは、例えば、機械洗浄又は手作業で実行され得る。洗浄溶液は、例えば、洗剤組成物を含有する水性洗浄溶液であり得る。
近年、石油化学製品に由来する洗剤中の構成成分を、洗浄性能を損なわずに酵素及びポリペプチドなどの再生可能な生物学的構成成分で置き換えることへの関心が高まっている。洗剤組成物の構成成分が変化するとき、従来の洗剤組成物と比較して同様の又は改善された洗浄性能を達成するために、プロテアーゼ、リパーゼ及びアミラーゼなどの以前より使用される洗剤酵素と比較して、新規の酵素活性又は代替及び／若しくは改善された特性を有する新規の酵素が必要とされ得る。
本発明はさらに、タンパク質性の汚れを除去するプロセスにおける本発明のプロテアーゼバリアントの使用に関する。タンパク質性の汚れは、食物の汚れ、例えば、離乳食、ココア、卵若しくは牛乳、又は皮脂、血液、インク若しくは草などの他の汚れ、又はその組み合わせなどの汚れであり得る。
洗浄方法
本発明は、布地、食器類又は硬質表面を本発明のプロテアーゼバリアントを含む洗剤組成物でクリーニングする方法に関する。
クリーニングの方法は、物体を、その物体をクリーニングするのに好適な条件下で本発明のプロテアーゼバリアントを含む洗剤組成物と接触させることを含む。好ましい実施形態では、洗剤組成物は、洗濯又は食器洗浄プロセスにおいて使用される。
別の実施形態は、布地又は食器類から汚れを除去するための方法であって、布地又は食器類を、その物体をクリーニングするのに好適な条件下で本発明のプロテアーゼを含む組成物と接触させることを含む方法に関する。本発明のクリーニングの方法において、クリーニングされている物体は、織物又は食器類若しくは床、テーブル、壁などの硬質表面などの任意の好適な物体であり得る。
本発明のプロテアーゼバリアントの１種以上を使用して布地（例えば、織物を糊抜きするため）を処理する組成物及び方法も企図される。プロテアーゼは、当該技術分野でよく知られる任意の布地処理方法において使用され得る（例えば、米国特許第６，０７７，３１６号明細書を参照のこと）。例えば、一態様では、布地の手触り及び外観は、布地を溶液中のプロテアーゼと接触させることを含む方法によって改善される。一態様では、布地は、加圧下の溶液で処理される。
本発明の洗剤組成物は、洗濯及び食器洗浄を含む硬質表面適用における使用に適している。したがって、本発明は、布地を洗濯するか又は食器類を洗浄するための方法であって、クリーニングされることになる布地／食器類を本発明による洗剤組成物を含む溶液と接触させることを含む方法を含む。布地は、通常の消費者の使用条件において洗濯することができる任意の布地を含み得る。食器類は、陶器、洋食器類、陶磁器類、メラミンなどのプラスチック、金属、磁器、ガラス及びアクリル樹脂などの任意の食器類を含み得る。溶液は、好ましくは、約５．５～約１１．５のｐＨを有する。組成物は、溶液中において約１００ｐｐｍ、好ましくは、５００ｐｐｍ～約１５，０００ｐｐｍの濃度で利用され得る。水温は通常、約１０℃、約１５℃、約２０℃、約２５℃、約３０℃、約３５℃、約４０℃、約４５℃、約５０℃、約５５℃、約６０℃、約６５℃、約７０℃、約７５℃、約８０℃、約８５℃及び約９０℃を含む約５℃～約９５℃の範囲である。水と布地の比は通常、約１：１～約３０：１である。
本発明の洗剤組成物の酵素は、従来の安定化剤及びプロテアーゼ阻害剤、例えば、プロピレングリコール若しくはグリセロールなどのポリオール、糖若しくは糖アルコール、ＮａＣｌ；ＫＣｌなどの異なる塩；乳酸、ギ酸、ホウ酸、若しくはホウ酸誘導体、例えば、芳香族ホウ酸エステル、若しくは４－ホルミルフェニルボロン酸などのフェニルボロン酸誘導体、若しくはジ－、トリ－若しくはテトラペプチドアルデヒド若しくはアルデヒド類似体などのペプチドアルデヒド（形態Ｂ１－Ｂ０－Ｒ、式中、Ｒは、Ｈ、ＣＨ３、ＣＸ３、ＣＨＸ２、又はＣＨ２Ｘ（Ｘ＝ハロゲン）であり、Ｂ０は、単一のアミノ酸残基（好ましくは、任意選択により置換された脂肪族又は芳香族側鎖を有する）であり；且つＢ１は、１つ以上のアミノ酸残基（好ましくは、１、２又は３つ）からなり、任意選択により、Ｎ末端保護基を含むか、又は国際公開第２００９／１１８３７５号パンフレット、国際公開第９８／１３４５９号パンフレットに記載されるとおりのものである）又はＲＡＳＩ、ＢＡＳＩ、ＷＡＳＩ（コメ、オオムギ及びコムギの二機能性アルファ－アミラーゼ／サブチリシン阻害剤）若しくはＣＩ２若しくはＳＳＩなどのタンパク質型のプロテアーゼ阻害剤を使用して安定化され得る。組成物は、例えば、国際公開第９２／１９７０９号パンフレット、国際公開第９２／１９７０８号パンフレット及び米国特許第６，４７２，３６４号明細書に記載されるとおりに配合され得る。いくつかの実施形態では、本明細書で利用される酵素は、酵素に対してそのようなイオンをもたらす最終組成物中の亜鉛（ＩＩ）、カルシウム（ＩＩ）及び／又はマグネシウム（ＩＩ）イオン、並びに他の金属イオン（例えば、バリウム（ＩＩ）、スカンジウム（ＩＩ）、鉄（ＩＩ）、マンガン（ＩＩ）、アルミニウム（ＩＩＩ）、スズ（ＩＩ）、コバルト（ＩＩ）、銅（ＩＩ）、ニッケル（ＩＩ）、及びオキソバナジウム（ＩＶ））の水溶性供給源の存在によって安定化される。
本明細書で提供される洗剤組成物は通常、水性クリーニング操作における使用の間、洗浄水が、約５．０～約１１．５、又は約６．０～約１０．５などの約５．０～約１２．５のｐＨを有するように配合される。いくつかの実施形態では、顆粒又は液体洗濯製品は、約６～約８のｐＨを有するように配合される。推奨される使用レベルでｐＨを制御するための手法としては、緩衝液、アルカリ、酸などの使用が挙げられ、当業者によく知られている。
本発明は、以下の実施例によりさらに記載され、これらは、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。
ポリペプチドの調製及び精製
変異及び発現カセットのバチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）への導入は、当該技術分野で知られる標準的な方法によって実施された。全てのＤＮＡ操作は、当業者に知られる標準的な方法を使用するＰＣＲ（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ，２００１によって記載されるとおり）によって実施された。プロテアーゼポリペプチドをコードする組み換えＢ．サブチリス（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ）構築物が、抗生物質選択下での複合培地（ＴＢｇｌｙ）中に播種され、３７℃で２４時間培養された。富栄養培地（ＰＳ－１：１００ｇ／Ｌ スクロース（Ｄａｎｉｓｃｏ ｃａｔ．ｎｏ．１０９－０４２９）、４０ｇ／Ｌ 外皮ダイズ（ダイズ豆粉）、１０ｇ／Ｌ Ｎａ２ＨＰＯ４ １２Ｈ２Ｏ（Ｍｅｒｃｋ ｃａｔ．ｎｏ．１０６５７９）、０．１ｍｌ／Ｌ Ｄｏｗｆａｘ６３Ｎ１０（Ｄｏｗ）を含有する振盪フラスコに、１：１００の比において一晩培養物で播種された。振盪フラスコ培養は、２７０ｒｐｍで振盪させながら３０℃で４日間実施された。
培養上清の精製は、以下のとおりに実施された：培養ブロスは、２６，０００ｘｇで２０分間遠心分離され、上清は、沈殿物から注意深く捨てられる。上清は、宿主細胞の残りを除去するためにＮａｌｇｅｎｅ ０．２μｍ濾過ユニットに通して濾過される。０．２μｍの濾液におけるｐＨは、３Ｍ トリス塩基でｐＨ８に調整され、ｐＨ調整された濾液は、２０ｍＭ トリス／ＨＣｌ、１ｍＭ ＣａＣｌ２、ｐＨ８．０中で平衡化されたＭＥＰ Ｈｙｐｅｒｃｅｌカラム（Ｐａｌｌ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）にアプライされる。平衡化緩衝液でカラムを洗浄した後、カラムは、２０ｍＭ ＣＨ３ＣＯＯＨ／ＮａＯＨ、１ｍＭ ＣａＣｌ２、ｐＨ４．５で段階的に溶出される。カラムからの画分は、ｐＨ９でＳｕｃ－ＡＡＰＦ－ｐＮＡアッセイを使用してプロテアーゼ活性について分析され、ピーク画分がプールされる。ＭＥＰ ＨｙｐｅｒｃｅｌカラムからのプールのｐＨは、２０％（ｖ／ｖ）ＣＨ３ＣＯＯＨ又は３Ｍ トリス塩基でｐＨ６に調整され、ｐＨ調整されたプールは、２０ｍＭ ＭＥＳ／ＮａＯＨ、２ｍＭ ＣａＣｌ２、ｐＨ６．０と同じ伝導率まで脱イオン水で希釈される。希釈されたプールは、２０ｍＭ ＭＥＳ／ＮａＯＨ、２ｍＭ ＣａＣｌ２、ｐＨ６．０で平衡化されたＳＰ－Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ（登録商標）Ｆａｓｔ Ｆｌｏｗカラム（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）にアプライされる。平衡化緩衝液でカラムを洗浄した後、プロテアーゼバリアントが、５カラム体積にわたって同じ緩衝液中の線形ＮａＣｌ勾配（０→０．５Ｍ）で溶出される。カラムからの画分は、ｐＨ９でＳｕｃ－ＡＡＰＦ－ｐＮＡアッセイを使用してプロテアーゼ活性について分析され、活性画分がＳＤＳ－ＰＡＧＥによって分析される。１つのバンドのみがクーマシー染色ＳＤＳ－ＰＡＧＥゲル上で観察される画分が、精製された調製物としてプールされ、さらなる実験のために使用される。
プロテアーゼ活性アッセイ
タンパク質分解活性は、Ｓｕｃ－ＡＡＰＦ－ｐＮＡ基質を利用する方法によって決定され得る。Ｓｕｃ－ＡＡＰＦ－ｐＮＡは、Ｎ－スクシニル－アラニン－アラニン－プロリン－フェニルアラニン－ｐ－ニトロアニリドの略称であり、エンドプロテアーゼによって切断され得るブロックペプチドである。タンパク質分解性の切断の後、黄色の遊離ｐＮＡ分子が遊離され、波長４０５ｎｍで可視分光光度法によって測定され得る。Ｓｕｃ－ＡＡＰＦ－ＰＮＡ基質は、Ｂａｃｈｅｍ（カタログ番号Ｌ１４００、ＤＭＳＯ中に溶解）によって製造される。
分析されることになるプロテアーゼ試料は、残りの活性緩衝液（１００ｍＭ トリス、ｐＨ８．６）中で希釈される。アッセイは、３０μｌの希釈された酵素試料を９６ウェルマイクロタイタープレートに移し、７０μｌの基質標準溶液（１００ｍＭ トリス中の０．７２ｍｇ／ｍｌ、ｐＨ８．６）を添加することによって実施される。溶液を室温で混合し、ＯＤ ４０５ｎｍで５分間、２０秒毎に吸収が測定される。
時間依存的な吸収曲線の勾配（１分当たりの吸光度）は、条件の所与の設定下で対象のプロテアーゼの活性に正比例する。プロテアーゼ試料は、勾配が線形であるレベルに希釈されるべきである。
実施例１．プロテアーゼバリアントの改善された溶解性
定義：
発酵ブロス：
● ＡＣＢ＝発酵ブロスにおける完全なプロテアーゼ活性（結晶化プロテアーゼを含む）。
● ＡＣＢ ＳＵＰ＝発酵ブロスにおける溶解されたプロテアーゼ活性。
● ＡＣＢ ＰＥＬ＝発酵ブロスにおけるペレットプロテアーゼ活性（結晶化プロテアーゼを含む）。
● ＡＩＮＩＴ＝発酵ブロスにおける溶解されたプロテアーゼ活性のパーセンテージ。
プロテアーゼ結晶溶解：
● ＡＦＵＬＬ＝希釈された発酵ブロスにおける完全なプロテアーゼ活性（結晶化プロテアーゼを含む）。
● ＡＥＸＰ＝発酵ブロス及び希釈因子のプロテアーゼ活性に基づく希釈された発酵ブロスの予想される完全なプロテアーゼ活性：
● ＡＳＵＰ＝希釈された発酵ブロスにおける溶解されたプロテアーゼ活性。
● ＡＣＯＲＲ＝発酵ブロスにおける測定された活性と希釈された発酵ブロスにおける予想される完全なプロテアーゼ活性の間のパーセントの差：
● ＡＤＩＳＳ＝希釈された発酵ブロスにおけるプロテアーゼの溶解された画分のパーセント：
材料及び方法：
発酵ブロスにおける初期の溶解されたプロテアーゼ活性
配列番号１のＡ２１５位に対応する位置で置換を有する及び有しないプロテアーゼバリアントを発現する宿主細胞からの発酵ブロスが収集され、プロテアーゼ結晶について分析された。プロテアーゼ結晶の存在は、Ａｃｔａ Ｃｒｙｓｔにおいて記載されるとおりに光学顕微鏡（Ｏｌｙｍｐｕｓ ＢＸ５１）及び粉末Ｘ線回折（ＸＲＰＤ、ＰＡＮａｌｙｔｉｃａｌ Ｅｍｐｙｒｅａｎ）によって確認された。（Ｆｒａｎｋａｅｒ，Ｃ．Ｇ．，ｅｔ．ａｌ．（２０１４）．Ａｃｔａ Ｃｒｙｓｔ．Ｄ７０，１１１５－１１２３）。
結晶溶解性／形成は、発酵ブロスにおける初期の溶解されたプロテアーゼ活性（ＡＩＮＩＴ）として溶解されたプロテアーゼ活性（結晶化されていないプロテアーゼ画分）を調査することによって評価された。以下の試料が回収された：
● ＡＣＢ：完全な発酵ブロス試料（結晶化されたプロテアーゼを含む）
● ＡＣＢ ＳＵＰ：上清試料（溶解されたプロテアーゼ）
● ＡＣＢ ＰＥＬ：結晶化されたプロテアーゼを含有する培養ブロスからのペレット試料。
ＡＣＢ ＳＵＰ及びＡＣＢ ＰＥＬは、高速遠心分離（５分、１０．０００ｘＲＣＦ、２０℃）によってサンプリングされ、分画された。その後、試料は、上記のプロテアーゼ活性アッセイによって分析された。ＡＣＢ及びＡＣＢ ＳＵＰにおけるプロテアーゼ活性を使用して、
によりＡＩＮＩＴを計算した。
ＡＩＮＩＴは、発酵ブロスにおける溶解されたプロテアーゼ活性のパーセンテージである。活性ＡＣＢ ＰＥＬ試料が、プロテアーゼ活性のマスバランスを評価するための対照として使用された。最終的に、プロテアーゼ＋Ａ２１５Ｘバリアントに関するＡＩＮＩＴは、Ａ２１５Ｘ置換（すなわち、プロテアーゼ－Ａ２１５Ｘ）を有しない同じプロテアーゼに関してＡＩＮＩＴに標準化されて、倍率増加として与えられる発酵ブロスにおける初期の溶解されたプロテアーゼ活性における差をもたらした：
Ａ２１５Ｘは、プロテアーゼバリアントにおける配列番号１のＡ２１５位に対応する位置で導入される特定の置換（例えば、Ａ２１５Ｋ）を意味する。
プロテアーゼ結晶溶解：
配列番号１のＡ２１５位に対応する位置で置換を有する及び有しないプロテアーゼバリアントの結晶溶解を評価するために、発酵ブロスを、Ｈ２Ｏで５倍希釈し、ｐＨレベルを、酢酸（２０％）でｐＨ４．５に調整し、伝導率を、ＣａＣｌ２（３４％）で９ｍＳ／ｃｍに調整した。溶解は、２０℃の一定温度及び十分な混合で実行された。
溶解の直後に、実験が開始された。合計で１５分及び６０分の後、完全なプロテアーゼ活性試料（ＡＦＵＬＬ）及び上清プロテアーゼ活性試料（ＡＳＵＰ）が回収された。ＡＳＵＰ試料は、高速遠心分離（５分、１０．０００ｘＲＣＦ、２０℃）によってサンプリングされ、上清が捨てられた。その後、全ての試料が、上記のプロテアーゼ活性アッセイによって分析された。
発酵ブロスにおける結晶溶解の評価のために、予想される完全なプロテアーゼ活性（ＡＥＸＰ）が、発酵ブロス及び希釈因子のプロテアーゼ活性に基づいて計算された：
溶解実験中に回収されたＡＦＵＬＬ試料を使用して、ＡＣＢとＡＦＵＬＬの間の差、すなわち、発酵ブロスにおける測定された活性と発酵ブロスにおける予想される完全なプロテアーゼ活性の間の差を計算することによってＡＥＸＰを検証した：
（ＡＣＯＲＲは、パーセンテージとして与えられる）。
結晶溶解は、６０分目に溶解されたプロテアーゼ（ＡＤＩＳＳ）の画分を計算することによって評価された：
最終的に、プロテアーゼ＋Ａ２１５Ｘに関するＡＤＩＳＳは、Ａ２１５Ｘ置換を有しない同じプロテアーゼに関してＡＤＩＳＳに標準化されて、倍率増加として与えられる発酵ブロスにおけるプロテアーゼ結晶溶解の差をもたらした：
（ＡＤＩＳＳ＿Ｔ６０は、６０分目のＡＤＩＳＳの値を意味する）。
結果：
表１は、培養ブロスにおけるＡ２１５Ｘバリアントの初期の溶解されたプロテアーゼ活性を示す。このように、Ａ２１５Ｋ置換は、５つの試験されたプロテアーゼにわたって発酵ブロスにおいて測定された初期の溶解されたプロテアーゼ活性で２．９～１５．６倍の増加をもたらした。加えて、置換Ａ２１５Ｑ及びＡ２１５Ｎは、初期の溶解活性において、それぞれ５．１倍及び２．４倍の増加をもたらした。Ａ２１５Ｔ置換は、よりわずかな効果を有して、１．１倍の増加をもたらし、初期の溶解された活性に対する効果は、Ａ２１５Ｓバリアントに関して観察されなかった。これらのデータは、プロテアーゼ結晶形成の程度は、Ａ２１５Ｘ置換の導入によって低減されることを示す。
表２は、Ａ２１５Ｘバリアントの６０分後の溶解されたプロテアーゼ活性を示す。このように、Ａ２１５Ｋ置換は、試験された５つ全てのプロテアーゼに関する溶解されたプロテアーゼ活性における１．１～６．０倍の増加をもたらした。置換Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｔ、及びＡ２１５Ｓは、結晶溶解性における１．６～４．３倍の増加をもたらした。Ａ２１５Ｓ置換は、プロテアーゼ結晶形成の程度に影響を及ぼさなかったが（表１を参照のこと）、この置換は、６０後の溶解された活性において１．７倍の増加をもたらした。したがって、これらのデータは、プロテアーゼ結晶の溶解性が、Ａ２１５Ｘ置換の導入によって増大されることを示す。
本明細書に記載され、且つ特許請求される本発明は、開示される本明細書の特定の態様による範囲に限定されるべきではなく、なぜなら、これらの態様は、本発明のいくつかの態様の例示であることが意図されているためである。いずれの均等物の態様も、本発明の範囲内であることが意図される。実際に、本明細書中に示され、記載されるものに加えた本発明の様々な変更形態が、上記から当業者に明らかになるであろう。そのような変更形態はまた、添付の特許請求の範囲内に含まれるように意図される。矛盾がある場合、定義を含む本開示が優先されることになる。

Claims (23)

  1. 親プロテアーゼのプロテアーゼバリアントであって、前記バリアントが、配列番号１と少なくとも少なくとも８０％であるが、１００％未満の配列同一性を有し、
    前記バリアントが、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を含み；
    前記バリアントが、Ｘ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を含み；
    前記バリアントが、プロテアーゼ活性を有し；且つ
    位置番号が、配列番号２の付番に基づく、プロテアーゼバリアント。
  2. 前記第１の置換が、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択され；好ましくは、前記第１の置換が、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される、請求項１に記載のプロテアーゼバリアント。
  3. 前記第１の置換が、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｒ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択され；好ましくは、前記第１の置換が、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、Ａ２１５Ｓ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択され；最も好ましくは、前記第１の置換が、Ａ２１５Ｋ、Ａ２１５Ｑ、Ａ２１５Ｎ、及びＡ２１５Ｔからなる群から選択される、請求項１に記載のプロテアーゼバリアント。
  4. 前記少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換が、Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９Ｅ、Ｉ３５ＩＤ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ａ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１６０Ｓ、Ｇ１９５Ｅ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｋ２３５Ｌ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅからなる群から選択される、請求項１に記載のプロテアーゼバリアント。
  5. 前記少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換が、
    ａ）Ｓ３Ｔ、Ｖ４Ｉ、Ｓ９９Ｄ、Ｓ１０１Ｅ、Ｓ１０３Ａ、Ｇ１６０Ｓ、及びＶ２０５Ｉ；
    ｂ）Ｉ３５ＩＤ、Ｎ７６Ｄ、Ｈ１２０Ｄ、Ｇ１９５Ｅ、Ｋ２３５Ｌ；
    ｃ）Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｓ９９Ｆ、Ｓ１０１Ｌ、Ｓ１０３Ｔ、Ｖ１０４Ｉ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅ；並びに
    ｄ）Ｓ９Ｅ、Ｎ４３Ｒ、Ｎ７６Ｄ、Ｖ２０５Ｉ、Ｑ２０６Ｌ、Ｙ２０９Ｗ、Ｓ２５９Ｄ、Ｎ２６１Ｗ、及びＬ２６２Ｅ
    からなる群の１つから選択される、請求項４に記載のプロテアーゼバリアント。
  6. 前記親プロテアーゼと比較して改善された溶解性を有し；好ましくは、前記溶解性が、前記親プロテアーゼと比較して少なくとも４％、例えば、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１２５％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又はそれ以上改善される、請求項１～５のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント。
  7. 前記親プロテアーゼが、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される前記第１の置換を有さず且つＸ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される前記少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を有しないが他の点で同一であるプロテアーゼである、請求項６に記載のプロテアーゼバリアント。
  8. 前記バリアントが、配列番号１、配列番号３、配列番号４、配列番号５、及び／又は配列番号６と比較して改善された溶解性を有する、請求項６に記載のプロテアーゼバリアント。
  9. 前記プロテアーゼバリアントが、１０～３０℃、好ましくは、１５～２５℃、最も好ましくは、２０℃で改善された溶解性を有する、請求項６～８のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント。
  10. 前記プロテアーゼバリアントが、ｐＨ３～９で、好ましくは、ｐＨ４～８で、より好ましくは、ｐＨ４～６で、さらにより好ましくは、ｐＨ４～５で、最も好ましくは、ｐＨ４．５で改善された溶解性を有する、請求項６～９のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント。
  11. 前記プロテアーゼバリアントが、１５～２５℃及びｐＨ４～６、好ましくは、２０℃及びｐＨ４～５で改善された溶解性を有する、請求項９～１０のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント。
  12. 改善された溶解性が、実施例１によるプロテアーゼ結晶形成の低減及び／又はプロテアーゼ結晶溶解性の増大として決定される、請求項６～１１のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント。
  13. 同等又は改善されたプロテアーゼ活性を有し；好ましくは、前記プロテアーゼ活性が、前記親プロテアーゼと比較して少なくとも１００％、例えば、少なくとも１０１％、少なくとも１０２％、少なくとも１０３％、少なくとも１０４％、少なくとも１０５％、少なくとも１１０％、少なくとも１２０％、少なくとも１３０％、少なくとも１４０％、少なくとも１５０％、少なくとも１７５％、少なくとも２００％、少なくとも２５０％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％である、請求項１～１２のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント。
  14. 前記親プロテアーゼが、Ｘ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される前記第１の置換を有さず且つＸ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される前記少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を有しないが他の点で同一であるプロテアーゼである、請求項１３に記載のプロテアーゼバリアント。
  15. 前記バリアントが、配列番号１、配列番号３、配列番号４、配列番号５、及び／又は配列番号６と比較して同等又は改善されたプロテアーゼ活性を有する、請求項１３～１４のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント。
  16. 請求項１～１５のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアントをコードするポリヌクレオチド。
  17. 請求項１６に記載のポリヌクレオチドを含む核酸構築物又は発現ベクター。
  18. 請求項１～１５のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアントを発現する宿主細胞。
  19. 請求項１～１５のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアントを得るための方法であって、
    （ａ）親プロテアーゼにＸ２１５Ｋ、Ｘ２１５Ｒ、Ｘ２１５Ｑ、Ｘ１２５Ｎ、Ｘ２１５Ｓ、及びＸ２１５Ｔからなる群から選択される第１の置換を導入すること；及びＸ３Ｔ（例えば、Ｓ３Ｔ）、Ｘ４Ｉ（例えば、Ｖ４Ｉ）、Ｘ９Ｅ（例えば、Ｓ９Ｅ）、Ｉ３５ＩＤ、Ｘ４３Ｒ（例えば、Ｎ４３Ｒ）、Ｘ７６Ｄ（例えば、Ｎ７６Ｄ）、Ｘ９９Ｄ（例えば、Ｓ９９Ｄ、Ｘ９９Ｆ（例えば、Ｓ９９Ｆ）、Ｘ１０１Ｅ（例えば、Ｓ１０１Ｅ）、Ｘ１０１Ｌ（例えば、Ｓ１０１Ｌ）、Ｘ１０３Ａ（例えば、Ｓ１０３Ａ）、Ｘ１０３Ｔ（例えば、Ｓ１０３Ｔ）、Ｘ１０４Ｉ（例えば、Ｖ１０４Ｉ）、Ｘ１２０Ｄ（例えば、Ｈ１２０Ｄ）、Ｘ１６０Ｓ（例えば、Ｇ１６０Ｓ）、Ｘ１９５Ｅ（例えば、Ｇ１９５Ｅ）、Ｘ２０５Ｉ（例えば、Ｖ２０５Ｉ）、Ｘ２０６Ｌ（例えば、Ｑ２０６Ｌ）、Ｘ２０９Ｗ（例えば、Ｙ２０９Ｗ）、Ｘ２３５Ｌ（例えば、Ｋ２３５Ｌ）、Ｘ２５９Ｄ（例えば、Ｓ２５９Ｄ）、Ｘ２６１Ｗ（例えば、Ｎ２６１Ｗ）、及びＸ２６２Ｅ（例えば、Ｌ２６２Ｅ）からなる群から選択される少なくとも３個のさらなる改変、好ましくは、置換を導入することであって、前記バリアントは、プロテアーゼ活性を有する、導入すること；並びに
    （ｂ）前記バリアントを回収すること
    を含む方法。
  20. 請求項１～１５のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント及び１種以上の洗剤構成成分を含む洗剤組成物。
  21. 前記組成物が、バー、均質錠剤、２層以上を有する錠剤、１つ以上のコンパートメントを有するパウチ、定型的若しくは緻密な粉末、顆粒、ペースト、ゲル、又は定型的、緻密な若しくは濃縮された液体の形態である、請求項２０に記載の洗剤組成物。
  22. 前記組成物が、液体の形態である、請求項２０に記載の洗剤組成物。
  23. クリーニングプロセス、好ましくは、洗濯又は食器洗浄、例えば、自動食器洗浄などの硬質表面クリーニングにおける請求項１～１５のいずれか一項に記載のプロテアーゼバリアント又は請求項２０～２２のいずれか一項に記載の洗剤組成物の使用。
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Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2023225459A2 (en) 2022-05-14 2023-11-23 Novozymes A/S Compositions and methods for preventing, treating, supressing and/or eliminating phytopathogenic infestations and infections
WO2024050346A1 (en) * 2022-09-02 2024-03-07 Danisco Us Inc. Detergent compositions and methods related thereto

Family Cites Families (124)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB1296839A (ja) 1969-05-29 1972-11-22
US4933287A (en) 1985-08-09 1990-06-12 Gist-Brocades N.V. Novel lipolytic enzymes and their use in detergent compositions
DK122686D0 (da) 1986-03-17 1986-03-17 Novo Industri As Fremstilling af proteiner
US5989870A (en) 1986-04-30 1999-11-23 Rohm Enzyme Finland Oy Method for cloning active promoters
DE3750450T2 (de) 1986-08-29 1995-01-05 Novo Industri As Enzymhaltiger Reinigungsmittelzusatz.
US5389536A (en) 1986-11-19 1995-02-14 Genencor, Inc. Lipase from Pseudomonas mendocina having cutinase activity
EP0305216B1 (en) 1987-08-28 1995-08-02 Novo Nordisk A/S Recombinant Humicola lipase and process for the production of recombinant humicola lipases
DK6488D0 (da) 1988-01-07 1988-01-07 Novo Industri As Enzymer
JP3079276B2 (ja) 1988-02-28 2000-08-21 天野製薬株式会社 組換え体ｄｎａ、それを含むシュードモナス属菌及びそれを用いたリパーゼの製造法
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
WO1990015861A1 (en) 1989-06-13 1990-12-27 Genencor International, Inc. A method for killing cells without cell lysis
GB8915658D0 (en) 1989-07-07 1989-08-23 Unilever Plc Enzymes,their production and use
DE69033388T2 (de) 1989-08-25 2000-05-11 Henkel Research Corp Alkalisches proteolytisches enzym und verfahren zur herstellung
KR930702514A (ko) 1990-09-13 1993-09-09 안네 제케르 리파제 변체
IL99552A0 (en) 1990-09-28 1992-08-18 Ixsys Inc Compositions containing procaryotic cells,a kit for the preparation of vectors useful for the coexpression of two or more dna sequences and methods for the use thereof
EP0511456A1 (en) 1991-04-30 1992-11-04 The Procter & Gamble Company Liquid detergents with aromatic borate ester to inhibit proteolytic enzyme
BR9205959A (pt) 1991-04-30 1994-07-26 Procter & Gamble Detergentes líquidos reforçados com complexo bórico-poliol para inibir enzima proteolítica
BR9206918A (pt) 1991-12-13 1995-11-21 Procter & Gamble Esteres de citrato acilado usados como precursores de perácido
DK72992D0 (da) 1992-06-01 1992-06-01 Novo Nordisk As Enzym
DK88892D0 (da) 1992-07-06 1992-07-06 Novo Nordisk As Forbindelse
WO1994002597A1 (en) 1992-07-23 1994-02-03 Novo Nordisk A/S MUTANT α-AMYLASE, DETERGENT, DISH WASHING AGENT, AND LIQUEFACTION AGENT
DK0689589T4 (da) 1993-02-11 2010-01-04 Genencor Int Oxidativ stabil alfa-amylase
KR950702240A (ko) 1993-04-27 1995-06-19 한스 발터 라벤 세제로의 이용을 위한 새로운 리파제 변형체
FR2704860B1 (fr) 1993-05-05 1995-07-13 Pasteur Institut Sequences de nucleotides du locus cryiiia pour le controle de l'expression de sequences d'adn dans un hote cellulaire.
JP2859520B2 (ja) 1993-08-30 1999-02-17 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ リパーゼ及びそれを生産する微生物及びリパーゼ製造方法及びリパーゼ含有洗剤組成物
JPH09503916A (ja) 1993-10-08 1997-04-22 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ アミラーゼ変異体
JPH09503664A (ja) 1993-10-13 1997-04-15 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ Ｈ▲下２▼ｏ▲下２▼安定ペルオキシダーゼ変異体
JPH07143883A (ja) 1993-11-24 1995-06-06 Showa Denko Kk リパーゼ遺伝子及び変異体リパーゼ
DE4343591A1 (de) 1993-12-21 1995-06-22 Evotec Biosystems Gmbh Verfahren zum evolutiven Design und Synthese funktionaler Polymere auf der Basis von Formenelementen und Formencodes
US5605793A (en) 1994-02-17 1997-02-25 Affymax Technologies N.V. Methods for in vitro recombination
CN1077598C (zh) 1994-02-22 2002-01-09 诺沃奇梅兹有限公司 制备脂解酶变异体的方法
US6599730B1 (en) * 1994-05-02 2003-07-29 Procter & Gamble Company Subtilisin 309 variants having decreased adsorption and increased hydrolysis
DK0755442T3 (da) 1994-05-04 2003-04-14 Genencor Int Lipaser med forbedret resistens over for overfladeaktive midler
BR9507817A (pt) 1994-06-03 1997-09-16 Novo Nordisk Biotech Inc Construção de dna enzima vetor recombinante célula hospedeira recombinante lacase de ascomicete ou deuteromicete processos para obter uma enzima de lacase para melhorar o rendimento de enzima recombinante para polimerizar um substrato de lignina ou lignossulfato em soluç o para despolimerizar in situ a pasta kraft para oxidar corantes ou precursores de corantes para pintar cabelo e para polimerizar ou oxidar um composto fenólico ou anilina composição de corante e recipiente contendo a mesma
WO1995035381A1 (en) 1994-06-20 1995-12-28 Unilever N.V. Modified pseudomonas lipases and their use
AU2884695A (en) 1994-06-23 1996-01-19 Unilever Plc Modified pseudomonas lipases and their use
ATE294871T1 (de) 1994-06-30 2005-05-15 Novozymes Biotech Inc Nicht-toxisches, nicht-toxigenes, nicht- pathogenes fusarium expressionssystem und darin zu verwendende promotoren und terminatoren
BE1008998A3 (fr) 1994-10-14 1996-10-01 Solvay Lipase, microorganisme la produisant, procede de preparation de cette lipase et utilisations de celle-ci.
CN1167503A (zh) 1994-10-26 1997-12-10 诺沃挪第克公司 一种具有脂解活性的酶
AR000862A1 (es) 1995-02-03 1997-08-06 Novozymes As Variantes de una ó-amilasa madre, un metodo para producir la misma, una estructura de adn y un vector de expresion, una celula transformada por dichaestructura de adn y vector, un aditivo para detergente, composicion detergente, una composicion para lavado de ropa y una composicion para la eliminacion del
JPH08228778A (ja) 1995-02-27 1996-09-10 Showa Denko Kk 新規なリパーゼ遺伝子及びそれを用いたリパーゼの製造方法
CN1193346A (zh) 1995-07-14 1998-09-16 诺沃挪第克公司 一种具有脂解活性的修饰酶
WO1997007202A1 (en) 1995-08-11 1997-02-27 Novo Nordisk A/S Novel lipolytic enzymes
AU6513096A (en) 1995-07-19 1997-02-18 Novo Nordisk A/S Treatment of fabrics
DE19528059A1 (de) 1995-07-31 1997-02-06 Bayer Ag Wasch- und Reinigungsmittel mit Iminodisuccinaten
US5763385A (en) 1996-05-14 1998-06-09 Genencor International, Inc. Modified α-amylases having altered calcium binding properties
CN1238001A (zh) 1996-09-24 1999-12-08 普罗格特-甘布尔公司 含有蛋白水解酶、肽醛和钙离子的液体洗涤剂
CN1232384A (zh) 1996-10-08 1999-10-20 诺沃挪第克公司 作为染料前体的二氨基苯甲酸衍生物
HUP0000117A2 (hu) 1996-10-18 2000-06-28 The Procter And Gamble Company Mosószerkészítmények
EP1023439B1 (en) 1997-10-13 2009-02-18 Novozymes A/S alpha-AMYLASE MUTANTS
US5955310A (en) 1998-02-26 1999-09-21 Novo Nordisk Biotech, Inc. Methods for producing a polypeptide in a bacillus cell
WO2000034450A1 (en) 1998-12-04 2000-06-15 Novozymes A/S Cutinase variants
US6472364B1 (en) 1998-10-13 2002-10-29 The Procter & Gamble Company Detergent compositions or components
JP5043254B2 (ja) 1998-10-26 2012-10-10 ノボザイムス アクティーゼルスカブ 糸状面細胞内の問題のｄｎａライブラリーの作製及びスクリーニング
JP4620253B2 (ja) 1999-03-22 2011-01-26 ノボザイムス，インコーポレイティド 菌類細胞中で遺伝子を発現させるためのプロモーター
WO2000060063A1 (en) 1999-03-31 2000-10-12 Novozymes A/S Lipase variant
EP2221365A1 (en) 2000-03-08 2010-08-25 Novozymes A/S Variants with altered properties
ATE302845T1 (de) 2000-06-02 2005-09-15 Novozymes As Cutinase-varianten
JP4855632B2 (ja) 2000-08-01 2012-01-18 ノボザイムス アクティーゼルスカブ 変更された性質を有するα−アミラーゼ突然変異体
JP2005500841A (ja) 2001-07-27 2005-01-13 アメリカ合衆国 オリゴヌクレオチドを用いるインビボ部位指定変異誘発のためのシステム
GB0127036D0 (en) 2001-11-09 2002-01-02 Unilever Plc Polymers for laundry applications
ATE439422T1 (de) 2002-06-11 2009-08-15 Unilever Nv Waschmitteltabletten
EP1923455A3 (en) 2003-02-18 2009-01-21 Novozymes A/S Detergent compositions
WO2005003275A1 (en) 2003-06-18 2005-01-13 Unilever Plc Laundry treatment compositions
GB0314210D0 (en) 2003-06-18 2003-07-23 Unilever Plc Laundry treatment compositions
GB0314211D0 (en) 2003-06-18 2003-07-23 Unilever Plc Laundry treatment compositions
EP2664670B1 (en) 2003-12-03 2015-05-06 Danisco US Inc. Perhydrolase
WO2005105826A1 (ja) 2004-04-28 2005-11-10 Zaidan Hojin Biseibutsu Kagaku Kenkyu Kai チロペプチンａ類縁体
MX2007007494A (es) 2004-12-23 2007-08-15 Novozymes As Variantes de alfa-amilasa.
DE602006002151D1 (de) 2005-03-23 2008-09-25 Unilever Nv Körperförmige Wasch- oder Reinigungsmittelzusammensetzungen
EP1869155B1 (en) 2005-04-15 2010-09-29 The Procter & Gamble Company Liquid laundry detergent compositions with modified polyethyleneimine polymers and lipase enzyme
ES2354269T3 (es) 2005-04-15 2011-03-11 Basf Se Polialquileminas anfifílicas alcoxiladas solubles en agua con un bloque interno de óxido de polietileno y un bloque externo de óxido de polipropileno.
CN101184835A (zh) 2005-05-31 2008-05-21 宝洁公司 包含聚合物的洗涤剂组合物及其使用
BRPI0520369A2 (pt) 2005-06-17 2009-05-05 Procter & Gamble catalisador orgánico com compatibilidade intensificada de enzima
DK1934340T3 (da) 2005-10-12 2014-06-16 Danisco Us Inc Anvendelse og fremstilling af en opbevaringsstabil neutral metalloprotease
US8518675B2 (en) 2005-12-13 2013-08-27 E. I. Du Pont De Nemours And Company Production of peracids using an enzyme having perhydrolysis activity
US20070191247A1 (en) 2006-01-23 2007-08-16 The Procter & Gamble Company Detergent compositions
EP2251404A1 (en) 2006-01-23 2010-11-17 The Procter & Gamble Company Enzyme and fabric hueing agent containing compositions
ES2629334T3 (es) 2006-01-23 2017-08-08 Novozymes A/S Variantes de lipasa
US7786067B2 (en) 2006-01-23 2010-08-31 The Procter & Gamble Company Composition comprising a lipase and a bleach catalyst
AR059155A1 (es) 2006-01-23 2008-03-12 Procter & Gamble Composiciones que comprenden enzimas y fotoblanqueadores
WO2007087258A2 (en) 2006-01-23 2007-08-02 The Procter & Gamble Company A composition comprising a lipase and a bleach catalyst
WO2007087243A2 (en) 2006-01-23 2007-08-02 The Procter & Gamble Company Detergent compositions
BRPI0712159B1 (pt) 2006-05-31 2018-04-24 Basf Se Polímero de enxerto anfifílico, e, processo para preparar polímeros de enxerto
DE202006009003U1 (de) 2006-06-06 2007-10-25 BROSE SCHLIEßSYSTEME GMBH & CO. KG Kraftfahrzeugschloß
DE602006020852D1 (de) 2006-07-07 2011-05-05 Procter & Gamble Waschmittelzusammensetzungen
WO2008153815A2 (en) 2007-05-30 2008-12-18 Danisco Us, Inc., Genencor Division Variants of an alpha-amylase with improved production levels in fermentation processes
EP2014756B1 (en) 2007-07-02 2011-03-30 The Procter & Gamble Company Laundry multi-compartment pouch composition
AU2008325250B2 (en) 2007-11-05 2013-06-13 Danisco Us Inc. Variants of Bacillus sp. TS-23 alpha-amylase with altered properties
RU2470069C2 (ru) 2008-01-04 2012-12-20 Дзе Проктер Энд Гэмбл Компани Композиция средства для стирки, содержащая гликозилгидролазу
PT2245129E (pt) 2008-01-24 2012-07-30 Unilever Nv Composições de detergente para máquinas de lavar loiça
US20090209447A1 (en) 2008-02-15 2009-08-20 Michelle Meek Cleaning compositions
WO2009109500A1 (en) 2008-02-29 2009-09-11 Novozymes A/S Polypeptides having lipase activity and polynucleotides encoding same
US9181296B2 (en) 2008-03-26 2015-11-10 Novozymes A/S Stabilized liquid enzyme compositions
WO2010039889A2 (en) 2008-09-30 2010-04-08 Novozymes, Inc. Methods for using positively and negatively selectable genes in a filamentous fungal cell
EP2367923A2 (en) 2008-12-01 2011-09-28 Danisco US Inc. Enzymes with lipase activity
EP2398889B1 (en) 2009-02-20 2018-04-25 Danisco US Inc. Fermentation broth formulations
CN102333914A (zh) 2009-03-06 2012-01-25 亨斯迈先进材料（瑞士）有限公司 酶催化的纺织物漂白-增白方法
CN102341495A (zh) 2009-03-10 2012-02-01 丹尼斯科美国公司 巨大芽孢杆菌菌株DSM90相关的α-淀粉酶及其使用方法
US20120028318A1 (en) 2009-03-18 2012-02-02 Danisco Us Inc. Fungal cutinase from magnaporthe grisea
BRPI1013425A2 (pt) 2009-03-23 2015-09-01 Danisco Us Inc Aciltransferases relacionadas com cal a e métodos de uso das mesmas
CN102762222B (zh) * 2009-12-09 2015-11-25 丹尼斯科美国公司 包含蛋白酶变体的组合物和方法
CN102712878A (zh) 2009-12-21 2012-10-03 丹尼斯科美国公司 含有枯草芽孢杆菌脂肪酶的洗涤剂组合物及其使用方法
CN102712880A (zh) 2009-12-21 2012-10-03 丹尼斯科美国公司 含有嗜热脂肪地芽孢杆菌脂肪酶的洗涤剂组合物及其使用方法
JP2013515139A (ja) 2009-12-21 2013-05-02 ダニスコ・ユーエス・インク サーモビフィダ・フスカのリパーゼを含む洗剤組成物、及びその使用方法
WO2011098531A1 (en) 2010-02-10 2011-08-18 Novozymes A/S Variants and compositions comprising variants with high stability in presence of a chelating agent
GB2477914B (en) 2010-02-12 2012-01-04 Univ Newcastle Compounds and methods for biofilm disruption and prevention
WO2011150157A2 (en) 2010-05-28 2011-12-01 Danisco Us Inc. Detergent compositions containing streptomyces griseus lipase and methods of use thereof
CA2830579A1 (en) 2011-04-08 2012-10-11 Danisco Us Inc. Compositions
AU2012277721B2 (en) 2011-06-30 2017-06-22 Novozymes A/S Alpha-amylase variants
DK3543333T3 (da) 2011-06-30 2022-02-14 Novozymes As Fremgangsmåde til screening af alfa-amylaser
WO2013007594A1 (en) 2011-07-12 2013-01-17 Novozymes A/S Storage-stable enzyme granules
US20150141316A1 (en) 2012-06-08 2015-05-21 Danisco Us Inc. Variant alpha amylases with enhanced activity on starch polymers
US10323217B2 (en) 2012-12-07 2019-06-18 Novozymes A/S Detergent composition comprising enzymes and washing method for preventing adhesion of bacteria
CN107075493B (zh) 2014-12-04 2020-09-01 诺维信公司 枯草杆菌酶变体以及编码它们的多核苷酸
US10260024B2 (en) * 2014-12-04 2019-04-16 Novozymes A/S Liquid cleaning compositions comprising protease variants
WO2016146540A1 (en) * 2015-03-13 2016-09-22 Carbios New polypeptide having a polyester degrading activity and uses thereof
BR112017023975A2 (pt) 2015-05-08 2018-07-24 Novozymes As variantes de alfa-amilase e polinucleotídeos codificando as mesmas
JP6997082B2 (ja) * 2015-10-28 2022-02-03 ノボザイムス アクティーゼルスカブ プロテアーゼおよびアミラーゼ変異体を含む洗剤組成物
WO2017089093A1 (en) * 2015-11-25 2017-06-01 Unilever N.V. A liquid detergent composition
WO2017191160A1 (en) 2016-05-03 2017-11-09 Novozymes A/S Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding the same
WO2018109183A1 (en) 2016-12-16 2018-06-21 Carbios Improved plastic degrading proteases
CN110382694A (zh) 2017-02-01 2019-10-25 诺维信公司 α-淀粉酶变体
US11549105B2 (en) 2017-12-21 2023-01-10 Carbios Proteases and uses thereof

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