JP2020533016A5

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Publication number: JP2020533016A5
Application number: JP2020529100A
Authority: JP
Filing date: 2018-08-01
Publication date: 2021-09-09

Claims

第1の重鎖可変領域、
第2の重鎖可変領域、
第1の軽鎖可変領域、および
第2の軽鎖可変領域
を含む、二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1の重鎖可変領域と第1の軽鎖可変領域が互いに結合して、第1の抗原に特異的に結合する第1の抗原結合領域を形成し、かつ
第2の重鎖可変領域と第2の軽鎖可変領域が互いに結合して、第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合領域を形成し、
第1の抗原と結合するときの第1の抗原結合領域の結合親和性が、第2の抗原と結合するときの第2の抗原結合領域の結合親和性よりも少なくとも10倍高く、
第1の軽鎖可変領域と第2の軽鎖可変領域とが同一である、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
前記第1の抗原結合領域が、10⁸ M^-1よりも高い結合親和性で第1の抗原に特異的に結合する、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
第1の抗原と結合するときの第1の抗原結合領域の結合親和性が、第2の抗原と結合するときの第2の抗原結合領域の結合親和性よりも少なくとも100倍高い、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
前記第1の重鎖可変領域を含む第1の重鎖および前記第2の重鎖可変領域を含む第2の重鎖を含み、第1の重鎖および第2の重鎖が、ノブ・イントゥ・ホール(knobs into holes)法によって互いに結合している、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
第1の抗原が、がん特異抗原であり、かつ第2の抗原が、CD3である、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
第1の抗原がCD20であり、かつ第2の抗原がCD3である、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
第1の抗原が、がん特異抗原であり、かつ第2の抗原が、がん関連抗原である、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
第1の抗原がPD-L1であり、かつ第2の抗原がCD55である、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法：
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域（VHa）および第1の軽鎖可変領域（VLa）を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域（VHb）および第2の軽鎖可変領域（VLb）を含む、前記段階；
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階；
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80％より高いと判定する段階；
(d) 共通の軽鎖可変領域（VLc）を設計する段階であって、VLcが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持する、前記段階；
(e) VHaおよびVHbの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHb’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHb’を得る段階；ならびに
(f) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHb’を含む、前記段階。
段階（d）において、第2の抗原に対するVLc-VHbの結合親和性が低下し得る、請求項9に記載の方法。
さらに以下を含む、請求項9に記載の方法：
(g) 前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片を精製するための緩衝系を作る段階。
相補性決定領域（CDR）1、2、および3を含む重鎖可変領域（VH）であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域（VH）；ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域（VL）であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域（VL）
を含む、CD3に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:22〜24にそれぞれ記載され、かつ該選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:28〜30にそれぞれ記載される、
前記抗体またはその抗原結合断片。
重鎖可変領域が、SEQ ID NO：2と少なくとも90％同一である配列を含み、かつ軽鎖可変領域が、SEQ ID NO：3と少なくとも90％同一である配列を含む、請求項12に記載の抗体またはその抗原結合断片。
相補性決定領域（CDR）1、2、および3を含む重鎖可変領域（VH）であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域（VH）；ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域（VL）であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域（VL）
を含む、PD-L1に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、および3のアミノ酸配列および該選択されたVL CDR1、2、および3のアミノ酸配列が、
(1) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:41〜43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:53〜55にそれぞれ記載される；
(2) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:41〜43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:59〜61にそれぞれ記載される
のうちの一つである、
前記抗体またはその抗原結合断片。
重鎖可変領域が、SEQ ID NO：4またはSEQ ID NO：12と少なくとも90％同一である配列を含み、かつ軽鎖可変領域が、SEQ ID NO：6またはSEQ ID NO：7と少なくとも90％同一である配列を含む、請求項14に記載の抗体またはその抗原結合断片。
請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片をコードする一つまたはそれ以上の核酸を含む細胞。
第1のポリペプチドと、第2のポリペプチドと、第3のポリペプチドと、第4のポリペプチドとを含む、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1のポリペプチドが、SEQ ID NO：34、35、または36と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含み；
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO：37、38、または39と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含み；
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO：40と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含み；かつ
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO：40と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含む、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
第1のポリペプチドと、第2のポリペプチドと、第3のポリペプチドと、第4のポリペプチドとを含む、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1のポリペプチドが、SEQ ID NO：65と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含み；
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO：66と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含み；
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO：67または68と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含み；かつ
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO：67または68と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含む、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
がんを患っている対象を治療するための医薬組成物であって、請求項1に記載の二重特異性抗体もしくはその抗原結合断片を含む組成物の治療的に有効な量を含む、前記医薬組成物。
前記対象が、固形腫瘍、黒色腫、膵臓癌、血液悪性腫瘍、非ホジキンリンパ腫、リンパ腫、または慢性リンパ性白血病を有する、請求項19に記載の医薬組成物。
第1のポリペプチドと、第2のポリペプチドと、第3のポリペプチドと、第4のポリペプチドとを含む、CD20およびCD3に結合する二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1のポリペプチドが、相補性決定領域（CDR）1、2、および3を含む第1の重鎖可変領域（VH1）を含み、VH1 CDR1領域がSEQ ID NO：16と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH1 CDR2領域がSEQ ID NO：17と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH1 CDR3領域がSEQ ID NO：18と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；
第2のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第2の重鎖可変領域（VH2）を含み、VH2 CDR1領域がSEQ ID NO：22と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH2 CDR2領域がSEQ ID NO：23と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH2 CDR3領域がSEQ ID NO：24と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；
第3のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第1の軽鎖可変領域（VL1）を含み、VL1 CDR1領域がSEQ ID NO：28と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL1 CDR2領域がSEQ ID NO：29と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL1 CDR3領域がSEQ ID NO：30と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；かつ
第4のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第2の軽鎖可変領域（VL2）を含み、VL2 CDR1領域がSEQ ID NO：28と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL2 CDR2領域がSEQ ID NO：29と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL2 CDR3領域がSEQ ID NO：30と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含む、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
SEQ ID NO：2と少なくとも97%同一である配列を含む重鎖可変領域（VH）を含む免疫グロブリン重鎖またはその断片をコードする核酸であって、
該VHが、軽鎖可変領域（VL）と対にされる場合はCD3と結合する、
前記核酸。
第1のポリペプチドと、第2のポリペプチドと、第3のポリペプチドと、第4のポリペプチドとを含む、PD-L1およびCD55に結合する二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1のポリペプチドが、相補性決定領域（CDR）1、2、および3を含む第1の重鎖可変領域（VH1）を含み、VH1 CDR1領域がSEQ ID NO：41と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH1 CDR2領域がSEQ ID NO：42と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH1 CDR3領域がSEQ ID NO：43と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；
第2のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第2の重鎖可変領域（VH2）を含み、VH2 CDR1領域がSEQ ID NO：47と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH2 CDR2領域がSEQ ID NO：48と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH2 CDR3領域がSEQ ID NO：49と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；
第3のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第1の軽鎖可変領域（VL1）を含み、VL1 CDR1領域がSEQ ID NO：53と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL1 CDR2領域がSEQ ID NO：54と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL1 CDR3領域がSEQ ID NO：55と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；かつ
第4のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第2の軽鎖可変領域（VL2）を含み、VL2 CDR1領域がSEQ ID NO：53と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL2 CDR2領域がSEQ ID NO：54と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL2 CDR3領域がSEQ ID NO：55と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含む、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
第1のポリペプチドと、第2のポリペプチドと、第3のポリペプチドと、第4のポリペプチドとを含む、PD-L1およびCD55に結合する二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1のポリペプチドが、相補性決定領域（CDR）1、2、および3を含む第1の重鎖可変領域（VH1）を含み、VH1 CDR1領域がSEQ ID NO：41と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH1 CDR2領域がSEQ ID NO：42と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH1 CDR3領域がSEQ ID NO：43と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；
第2のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第2の重鎖可変領域（VH2）を含み、VH2 CDR1領域がSEQ ID NO：47と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH2 CDR2領域がSEQ ID NO：48と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VH2 CDR3領域がSEQ ID NO：49と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；
第3のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第1の軽鎖可変領域（VL1）を含み、VL1 CDR1領域がSEQ ID NO：59と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL1 CDR2領域がSEQ ID NO：60と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL1 CDR3領域がSEQ ID NO：61と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み；かつ
第4のポリペプチドが、CDR1、2、および3を含む第2の軽鎖可変領域（VL2）を含み、VL2 CDR1領域がSEQ ID NO：59と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL2 CDR2領域がSEQ ID NO：60と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含み、VL2 CDR3領域がSEQ ID NO：61と少なくとも80％同一であるアミノ酸配列を含む、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。