JP2020503250A - ピロロベンゾジアゼピン複合体 - Google Patents

ピロロベンゾジアゼピン複合体 Download PDF

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Abstract

式Iの化合物:(I)およびその複合体。

Description

本発明は、ピロロベンゾジアゼピンおよび関連する二量体(PBD)を含む複合体、ならびにこのような複合体を作製するのに使用される前駆体薬物リンカーに関する。
ピロロベンゾジアゼピン(PBD)の中には、DNAの特定配列を認識して結合する能力を有するものがあり、好適な配列はPuGPuである。最初のPBD抗腫瘍抗生物質であるアントラマイシンは、1965に発見された(Leimgruber,et al.,J.AM.Chem.Soc.,87,5793−5795(1965)、Leimgruber,et al.,J.AM.Chem.Soc.,87,5791−5793(1965))。それ以来、天然に存在するPBDがいくつか報告されており、多様な類似体を合成する10を超える合成経路が開発されている(Thurston,et al.,Chem.Rev.1994,433−465(1994))。このファミリーに属するものとして、アベイマイシン(Hochlowski,et al.,J.Antibiotics,40,145−148(1987))、チカマイシン(Konishi,et al.,J.Antibiotics,37,200−206(1984)),DC−81(Japanese Patent 58−180 487、Thurston,et al.,Chem.Brit.,26,767−772(1990)、Bose,et al.,Tetrahedron,48,751−758(1992))、マゼトラマイシン(Kuminoto,et al.,J.Antibiotics,33,665−667(1980))、ネオトラマイシンAおよびB(Takeuchi,et al.,J.Antibiotics,29,93−96(1976))、ポロトラマイシン(Tsunakawa,et al.,J.Antibiotics,41,1366−1373(1988))、プロトラカルシン(Shimizu,et al,J.Antibiotics,29,2492−2503(1982)、Langley and Thurston,J.Org.Chem.,52,91−97(1987))、シバノマイシン(DC−102)(Hara,et al.,J.Antibiotics,41,702−704(1988)、Itoh,et al.,J.Antibiotics,41,1281−1284(1988))、シビロマイシン(Leber,et al.,J.AM.Chem.Soc.,110,2992−2993(1988))、ならびにトママイシン(Arima,et al.,J.Antibiotics,25,437−444(1972))が挙げられる。PBDは、以下の一般式のものである。
Figure 2020503250
PBDは、その芳香環Aおよびピロロ環Cの両方で、置換基の個数、種類、および位置が異なるとともに、環Cの飽和度も異なる。環Bでは、N10−C11の位置が、イミン(N=C)、カルビノールアミン(NH−CH(OH))、またはカルビノールアミンメチルエーテル(NH−CH(OMe))のいずれかになっており、ここがDNAアルキル化の原因となる求電子中心である。既知の天然産物は全て、キラルなC11a位に(S)型配置を有し、このため、PBDを環Cから環Aに向かって見たときに、これらは右巻きになっている。このことが、PBDに、B型DNAの副溝との螺旋性一致(isohelicity)(イソらせん性)に適切な三次元形状を与え、その結果、結合部位でのぴったりとした一致をもたらす(Kohn,In Antibiotics III.Springer−Verlag,New York,pp.3−11(1975)、Hurley and Needham−VanDevanter,Acc.Chem.Res.,19,230−237(1986))。副溝で付加体を形成するPBDの能力により、PBDはDNAプロセシングに干渉することができ、したがって、PBDを抗腫瘍剤として使用することが可能となる。
この分子の生物活性は、2つのPBD単位をこれらのC8/C’−ヒドロキシル官能基と一緒に、可撓性アルキレンリンカーを介して結合させることによって増強され得ることが以前に開示されている(Bose,D.S.,et al.,J.Am.Chem.Soc.,114,4939−4941(1992)、Thurston,D.E.,et al.,J.Org.Chem.,61,8141−8147(1996))。PBD二量体は、配列選択性DNA損傷、例えば、生物活性の主な原因となると考えられている、回帰性の5’−Pu−GATC−Py−3’鎖間架橋を形成すると考えられている(Smellie,M.,et al.,Biochemistry,42,8232−8239(2003)、Martin,C.,et al.,Biochemistry,44,4135−4147)。
PBD二量体の一例は、SG2000(SJG−136):
Figure 2020503250
であり(Gregson,S.,et al.,J.Med.Chem.,44,737−748(2001)、Alley,M.C.,et al.,Cancer Research,64,6700−6706(2004)、Hartley,J.A.,et al.,Cancer Research,64,6693−6699(2004))、スタンドアロン薬剤、例えば、NCT02034227として臨床検査に関与しており、急性骨髄性白血病および慢性リンパ性白血病を治療する際のその使用を調査している(https://www.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT02034227を参照)。
C2アリール置換基を有する二量体PBD化合物、例えば、SG2202(ZC−207)は、WO2005/085251:
Figure 2020503250
およびWO2006/111759に開示されており、このようなPBD化合物の亜硫酸水素塩は、例えば、SG2285(ZC−423):
Figure 2020503250
である。
これらの化合物は、非常に有用な細胞毒性剤として示されている(Howard,P.W.,et al.,Bioorg.Med.Chem.(2009),doi:10.1016/j.bmcl.2009.09.012)。
WO2007/085930は、抗体などの細胞結合剤への接続のためのリンカー基を有する二量体PBD化合物を記載している。当該リンカーは、二量体の単量体PBD単位を連結する架橋において存在する。
抗体などの細胞結合剤への接続のためのリンカー基を有する二量体PBD化合物は、WO2011/130598に記載されている。これらの化合物におけるリンカーは、利用可能なN10位のうちの1つに結合されており、リンカー基における酵素の作用によって概して開裂される。非結合N10位がキャッピング基によって保護されているとき、例示されているキャッピング基は、抗体へのリンカーと同じ開裂誘因を有している。
WO2014/057074には、1つの単量体においてN10位を介して結合されていて、他方のPBD単量体がイミン形態である、2つの特定のPBD二量体複合体が記載されている。
WO2015/052322には、1つの単量体においてN10位を介して結合されていて、他方のPBD単量体がイミン形態である、特定のPBD二量体複合体が記載されている。また、1つの単量体においてN10位を介して結合されていて、他方のPBD単量体が、抗体へのリンカーと同じ開裂誘因を持つキャッピング基を有している、特定のPBD二量体複合体も記載されている。
Figure 2020503250
本発明は、リガンド単位に結合していないN10−C11基がβ−グルクロニドキャッピング基である、PBDおよび関連する二量体複合体を提供する。リガンド単位への連結単位の開裂誘因は、非グルクロニド開裂性である。
これらの複合体におけるグルクロニドキャッピング単位の使用は、複合体が標的細胞の外側で抗体から開裂されると、放出され保護されている化合物は、その親水性に起因して細胞膜に浸透できないため、不活性のままであるので、遊離である。
本発明はまた、リガンド単位に複合化するのに好適な、PBDおよび関連する二量体薬物リンカーも提供し、ここで、リガンド単位に結合されることが意図されないN10−C11基は、グルクロニドキャッピング基である。連結単位の開裂誘因は、非グルクロニドキャッピング単位である。
これらの薬物リンカーにおけるグルクロニドキャッピング単位の使用は、概して疎水性の薬物リンカーの親水性を増加させて、薬物リンカーがリガンド単位に複合化することを容易にするため、特に有利であるとされている。
本発明の第1の態様は、式Iを有する化合物:
Figure 2020503250
ならびにその塩および溶媒和物を含み、
式中:
角括弧は、NO2基が任意選択的であることを示し;
Dは、基D1またはD2のいずれかを表し:
Figure 2020503250
点線は、C2とC3との間の二重結合の任意選択的な存在を示し、
C2とC3との間に二重結合が存在するとき、R2は、
(ia)ハロ、ニトロ、シアノ、エーテル、カルボキシ、エステル、C1-7アルキル、C3-7ヘテロシクリルおよびビス−オキシ−C1-3アルキレンを含む群より選択される1つ以上の置換基によって任意選択的に置換されているC5-10アリール基、
(ib)C1-5飽和脂肪族アルキル、
(ic)C3-6飽和シクロアルキル、
(id)
Figure 2020503250
(R11、R12およびR13は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、ここで、R2基における炭素原子の合計数が多くて5である)、
(ie)
Figure 2020503250
(R15aおよびR15bの一方がHであり、他方が、ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される基である)、ならびに
(if)
Figure 2020503250
(R14は、H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニル;から選択される)、
からなる群より選択され、
C2とC3との間に単結合が存在するとき、
2は、H、OH、F、diFおよび
Figure 2020503250
から選択され、R16aおよびR16bは、H、F、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから独立して選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基は、C1-4アルキルアミドおよびC1-4アルキルエステルから選択される基によって任意選択的に置換されており;またはR16aおよびR16bの一方がHであるとき、他方はニトリルおよびC1-4アルキルエステルから選択され;
D’は、基D’1またはD’2のいずれかを表し:
Figure 2020503250
点線は、C2’とC3’との間の二重結合の任意選択的な存在を表し、
C2’とC3’との間に二重結合が存在するとき、R12は、
(iia)ハロ、ニトロ、シアノ、エーテル、カルボキシ、エステル、C1-7アルキル、C3-7ヘテロシクリルおよびビス−オキシ−C1-3アルキレンを含む群より選択される1つ以上の置換基によって任意選択的に置換されているC5-10アリール基、
(iib)C1-5飽和脂肪族アルキル、
(iic)C3-6飽和シクロアルキル、
(iid)
Figure 2020503250
(R21、R22およびR23は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、R12基における炭素数の合計が多くて5である)、
(iie)
Figure 2020503250
(R25aおよびR25bの一方がHであり、他方が、ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される)、ならびに
(iif)
Figure 2020503250
(R24は:H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される)、
からなる群より選択され、
C2’とC3’との間に単結合が存在するとき、
12は、H、OH、F、diFおよび
Figure 2020503250
から選択され、R26aおよびR26bは、H、F、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから独立して選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基は、C1-4アルキルアミドおよびC1-4アルキルエステルから選択される基によって任意選択的に置換されており、または、R26aおよびR26bの一方がHであるとき、他方はニトリルおよびC1-4アルキルエステルから選択され、
6およびR9は、H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、ニトロ、Me3Snおよびハロから独立して選択され、
ここでRおよびR’は、任意選択的に置換されているC1-12アルキル、C3-20ヘテロシクリルおよびC5-20アリール基から独立して選択され、
7は、H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、ニトロ、Me3Snおよびハロから選択され、
R”は、C3-12アルキレン基であり、かかる鎖は、1つ以上のヘテロ原子、例えば、O、S、NRN2(ここで、RN2は、HもしくはC1-4アルキルである)、および/または芳香族環、例えば、ベンゼンもしくはピリジンによって中断されていてよく、
YおよびY’は、O、S、またはNHから選択され、
6'、R7'、R9'は、それぞれ、R6、R7およびR9と同じ基から選択され、
11bは、OH、ORAから選択され、ここでRAは、C1-4アルキルであり、
Lは、
(iiia):
Figure 2020503250
(Qは、
Figure 2020503250
であり、QXは、Qが、アミノ酸残基、ジペプチド残基またはトリペプチド残基であるようになっており、
Xは、
Figure 2020503250
であり、a=0〜5、b=0〜16、c=0または1、d=0〜5であり、
Lは、リガンド単位に接続するためのリンカーである)、ならびに
(iiib):
Figure 2020503250
(RL1およびRL2は、Hおよびメチルから独立して選択され、または、これらが結合している炭素原子と一緒になって、シクロプロピレンもしくはシクロブチレン基を形成し、
eが0または1である)、
から選択される、細胞結合剤への接続のためのリンカーである。
本発明の第2の態様は、式IIの複合体を提供し、
L−(DLp (II)、
式中、Lは、リガンド単位(すなわち、標的薬剤)であり、DLは、式I’の薬物リンカー単位であり、
Figure 2020503250
式中、D、R2、R6、R7、R9、R11b、Y、R”、Y’、D’、R6'、R7'、R9'およびR12(C2とC3との間およびC2’とC3’との間のそれぞれの二重結合の存在または非存在、およびNO2基を含む)は、本発明の第1の態様に定義されている通りであり、
LLは、
(iiia):
Figure 2020503250
(QおよびXは、第1の態様に定義されている通りであり、GLLは、リガンド単位に接続されているリンカーである)、ならびに
(iiib):
Figure 2020503250
(RL1およびRL2は、第1の態様に定義されている通りである)、から選択される、細胞結合剤への接続のためのリンカーであり、
pは、1〜20の整数である。
リガンド単位は、以下により完全に記載されており、標的部分に結合する標的薬剤である。リガンド単位は、例えば、細胞成分に(細胞結合剤)、または対象となる他の標的分子に特異的に結合し得る。リガンド単位は、例えば、タンパク質、ポリペプチドもしくはペプチド、例えば、抗体、抗体の抗原結合断片、または他の結合剤、例えば、Fc融合タンパク質であり得る。
本発明の第3の態様は、増殖性疾患を治療するための医薬の製造における、本発明の第2の態様の複合体の使用を提供する。第3の態様はまた、増殖性疾患の治療に用いるための、本発明の第2の態様の複合体も提供する。第3の態様はまた、増殖性疾患を治療する方法であって、これを必要とする患者に、治療上有効量の、本発明の第2の態様の複合体を投与することを含む、上記方法も提供する。
当業者なら、候補の複合体が任意の特定細胞型について増殖性症状を治療するかどうかを、容易に決定することができる。例えば、特定化合物により提供される活性を査定するのに都合良く用いることができるアッセイを、以下の実施例で記載する。
本発明の第4の態様は、本発明の第2の態様の複合体の合成であって、本発明の第1の態様の化合物(薬物リンカー)を、リガンド単位によって複合化することを含む、上記合成を提供する。
図1は、本発明の複合体とのインキュベーションの後のSKOV3細胞の生存度に対する効果を示す。 図2は、本発明の異なる複合体とのインキュベーションの後のSKOV3細胞の生存度に対する効果を示す。 図3は、本発明の様々な複合体による処置の後のNCI−N87異種移植腫瘍の体積に対する効果を示す。 図4は、図3と同じの本発明の複合体による処置の後のJIMT−1異種移植腫瘍の体積に対する効果を示す。
定義
置換基
「任意選択的に置換されている」という句は、本明細書中で使用される場合、非置換であっても置換されていてもよい親基に関する。
他に特定されていない限り、「置換されている」という用語は、本明細書中で使用される場合、1つ以上の置換基を持つ親基に関する。「置換基」という用語は、本明細書において従来の意味で使用されており、親基に、共有結合的に結合している、場合により縮合している化学的部分を指す。多種多様の置換基が周知されており、また、種々の親基の形成およびこれらへの導入方法も周知されている。
置換基の例を、より詳細に以下に記載する。
1-12アルキル:「C1-12アルキル」という用語は、本明細書中で使用される場合、脂肪族であっても脂環式であってもよく、また、飽和であっても不飽和(例えば、部分不飽和、完全不飽和)であってもよい、1〜12個の炭素原子を有する炭化水素化合物の1つの炭素原子から1つの水素原子を除去することによって得られる一価部分に関する。「C1-4アルキル」という用語は、本明細書中で使用される場合、脂肪族であっても脂環式であってもよく、また、飽和であっても不飽和(例えば、部分不飽和、完全不飽和)であってもよい、1〜4個の炭素原子を有する炭化水素化合物の1つの炭素原子から1つの水素原子を除去することによって得られる一価部分に関する。ゆえに、「アルキル」という用語は、以下に考察されている、サブクラスのアルケニル、アルキニル、シクロアルキルなどを含む。
飽和アルキル基の例として、メチル(C1)、エチル(C2)、プロピル(C3)、ブチル(C4)、ペンチル(C5)、ヘキシル(C6)およびヘプチル(C7)が挙げられるが、これらに限定されない。
飽和直鎖アルキル基の例として、メチル(C1)、エチル(C2)、n−プロピル(C3)、n−ブチル(C4)、n−ペンチル(アミル)(C5)、n−ヘキシル(C6)およびn−ヘプチル(C7)が挙げられるが、これらに限定されない。
飽和分岐鎖アルキル基の例として、イソ−プロピル(C3)、イソ−ブチル(C4)、sec−ブチル(C4)、tert−ブチル(C4)、イソ−ペンチル(C5)、およびネオ−ペンチル(C5)が挙げられる。
2-12アルケニル:「C2-12アルケニル」という用語は、本明細書中で使用される場合、1つ以上の炭素−炭素二重結合を有するアルキル基に関する。
不飽和アルケニル基の例として、エテニル(ビニル、−CH=CH2)、1−プロペニル(−CH=CH−CH3)、2−プロペニル(アリル、−CH−CH=CH2)、イソプロペニル(1−メチルビニル、−C(CH3)=CH2)、ブテニル(C4)、ペンテニル(C5)、およびヘキセニル(C6)が挙げられるが、これらに限定されない。
2-12アルキニル:「C2-12アルキニル」という用語は、本明細書中で使用される場合、1つ以上の炭素−炭素三重結合を有するアルキル基に関する。
不飽和アルキニル基の例として、エチニル(−C≡CH)および2−プロピニル(プロパルギル、−CH2−C≡CH)が挙げられるが、これらに限定されない。
3-12シクロアルキル:「C3-12シクロアルキル」という用語は、本明細書中で使用される場合、環式炭化水素(炭素環式)化合物の1つの脂環式環原子から1つの水素原子を除去することによって得られる一価部分であって、3〜7個の環原子を含めた3〜7個の炭素原子を有する、上記部分であり、シクリル基でもあるアルキル基に関する。
シクロアルキル基の例として、以下に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない:
飽和単環式炭化水素化合物:
シクロプロパン(C3)、シクロブタン(C4)、シクロペンタン(C5)、シクロヘキサン(C6)、シクロヘプタン(C7)、メチルシクロプロパン(C4)、ジメチルシクロプロパン(C5)、メチルシクロブタン(C5)、ジメチルシクロブタン(C6)、メチルシクロペンタン(C6)、ジメチルシクロペンタン(C7)およびメチルシクロヘキサン(C7)、
不飽和単環式炭化水素化合物:
シクロプロペン(C3)、シクロブテン(C4)、シクロペンテン(C5)、シクロヘキセン(C6)、メチルシクロプロペン(C4)、ジメチルシクロプロペン(C5)、メチルシクロブテン(C5)、ジメチルシクロブテン(C6)、メチルシクロペンテン(C6)、ジメチルシクロペンテン(C7)およびメチルシクロヘキセン(C7)、ならびに
飽和多環式炭化水素化合物:
ノルカラン(C7)、ノルピナン(C7)、ノルボルナン(C7)。
3-20ヘテロシクリル:「C3-20ヘテロシクリル」という用語は、本明細書中で使用される場合、複素環式化合物の1つの環原子から1つの水素原子を除去することによって得られる一価部分であって、3〜20個の環原子を有し、このうち1〜10個が環ヘテロ原子である、上記部分に関する。好ましくは、各環が、3〜7個の環原子を有し、このうち1〜4個が環ヘテロ原子である。
この文脈において、接頭語(例えば、C3-20、C3-7、C5-6など)は、炭素原子またはヘテロ原子にかかわらず、環原子数または環原子数の範囲を示す。例えば、「C5-6ヘテロシクリル」という用語は、本明細書中で使用される場合、5または6個の環原子を有するヘテロシクリル基に関する。
単環式ヘテロシクリル基の例として、以下に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない:
1:アジリジン(C3)、アゼチジン(C4)、ピロリジン(テトラヒドロピロール)(C5)、ピロリン(例えば、3−ピロリン、2,5−ジヒドロピロール)(C5)、2H−ピロールまたは3H−ピロール(イソピロール、イソアゾール)(C5)、ピペリジン(C6)、ジヒドロピリジン(C6)、テトラヒドロピリジン(C6)、アゼピン(C7)、
1:オキシラン(C3)、オキセタン(C4)、オキソラン(テトラヒドロフラン)(C5)、オキソール(ジヒドロフラン)(C5)、オキサン(テトラヒドロピラン)(C6)、ジヒドロピラン(C6)、ピラン(C6)、オキセピン(C7)、
1:チイラン(C3)、チエタン(C4)、チオラン(テトラヒドロチオフェン)(C5)、チアン(テトラヒドロチオピラン)(C6)、チエパン(C7)、
2:ジオキソラン(C5)、ジオキサン(C6)、およびジオキセパン(C7)、
3:トリオキサン(C6)、
2:イミダゾリジン(C5)、ピラゾリシン(ジアゾリジン)(C5)、イミダゾリン(C5)、ピラゾリン(ジヒドロピラゾール)(C5)、ピペラジン(C6)、
11:テトラヒドロオキサゾール(C5)、ジヒドロオキサゾール(C5)、テトラヒドロイソオキサゾール(C5)、ジヒドロイソオキサゾール(C5)、モルホリン(C6)、テトラヒドロオキサジン(C6)、ジヒドロオキサジン(C6)、オキサジン(C6)、
11:チアゾリン(C5)、チアゾリジン(C5)、チオモルホリン(C6)、
21:オキサジアジン(C6)、
11:オキサチオール(C5)およびオキサチアン(チオキサン)(C6)、ならびに、
111:オキサチアジン(C6)。
置換されている単環式ヘテロシクリル基の例として、環式形態の単糖類、例えば、フラノース(C5)、例えば、アラビノフラノース、リキソフラノース、リボフラノース、およびキシロフラノース、ならびにピラノース(C6)、例えば、アロピラノース、アルトロピラノース、グルコピラノース、マンノピラノース、グロピラノース、イドピラノース、ガラクトピラノースおよびタロピラノースに由来するものが挙げられる。
5-20アリール:「C5-20アリール」という用語は、本明細書中で使用される場合、芳香族化合物の1つの芳香族環原子から1つの水素原子を除去することによって得られる一価部分であって、3〜20個の環原子を有する上記部分に関する。「C5-7アリール」という用語は、本明細書中で使用される場合、芳香族化合物の1つの芳香族環原子から1つの水素原子を除去することによって得られる一価部分であって、5〜7個の環原子を有する当該部分に関し、「C5-10アリール」という用語は、本明細書中で使用される場合、芳香族化合物の1つの芳香族環原子から1つの水素原子を除去することによって得られる一価部分であって、5〜10個の環原子を有する上記部分に関する。好ましくは、各環は、5〜7個の環原子を有する。
この文脈において、接頭語(例えば、C3-20、C5-7、C5-6、C5-10など)は、炭素原子またはヘテロ原子にかかわらず、環原子数または環原子数の範囲を示す。例えば、「C5-6アリール」という用語は、本明細書中で使用される場合、5または6個の環原子を有するアリール基に関する。
上記環原子は、「カルボアリール基」におけるように全て炭素原子であってよい。
カルボアリール基の例として、ベンゼン(すなわちフェニル)(C6)、ナフタレン(C10)、アズレン(C10)、アントラセン(C14)、フェナントレン(C14)、ナフタセン(C18)、およびピレン(C16)に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない。
縮合環を含み、その少なくとも1つが芳香族環であるアリール基の例として、インダン(例えば、2,3−ジヒドロ−1H−インデン)(C9)、インデン(C9)、イソインデン(C9)、テトラリン(1,2,3,4−テトラヒドロナフタレン)(C10)、アセナフテン(C12)、フルオレン(C13)、フェナレン(C13)、アセフェナントレン(C15)、およびアセアントレン(C16)に由来する基が挙げられるが、これらに限定されない。
代替的には、上記環原子は、「ヘテロアリール基」におけるように1つ以上のヘテロ原子を含んでいてよい。単環式ヘテロアリール基の例として、以下に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない:
1:ピロール(アゾール)(C5)、ピリジン(アジン)(C6)、
1:フラン(オキソール)(C5)、
1:チオフェン(チオール)(C5)、
11:オキサゾール(C5)、イソオキサゾール(C5)、イソキサジン(C6)、
21:オキサジアゾール(フラザン)(C5)、
31:オキサトリアゾール(C5)、
11:チアゾール(C5)、イソチアゾール(C5)、
2:イミダゾール(1,3−ジアゾール)(C5)、ピラゾール(1,2−ジアゾール)(C5)、ピリダジン(1,2−ジアジン)(C6)、ピリミジン(1,3−ジアジン)(C6)(例えば、シトシン、チミン、ウラシル)、ピラジン(1,4−ジアジン)(C6)、
3:トリアゾール(C5)、トリアジン(C6)、および、
4:テトラゾール(C5)。
縮合環を含むヘテロアリールの例として:
ベンゾフラン(O1)、イソベンゾフラン(O1)、インドール(N1)、イソインドール(N1)、インドリジン(N1)、インドリン(N1)、イソインドリン(N1)、プリン(N4)(例えば、アデニン、グアニン)、ベンズイミダゾール(N2)、インダゾール(N2)、ベンズオキサゾール(N11)、ベンズイソオキサゾール(N11)、ベンゾジオキソール(O2)、ベンゾフラザン(N21)、ベンゾトリアゾール(N3)、ベンゾチオフラン(S1)、ベンゾチアゾール(N11)、ベンゾチアジアゾール(N2S)に由来する(2つの縮合環を含む)C9
クロメン(O1)、イソクロメン(O1)、クロマン(O1)、イソクロマン(O1)、ベンゾジオキサン(O2)、キノリン(N1)、イソキノリン(N1)、キノリジン(N1)、ベンゾキサジン(N11)、ベンゾジアジン(N2)、ピリドピリジン(N2)、キノキサリン(N2)、キナゾリン(N2)、シンノリン(N2)、フタラジン(N2)、ナフチリジン(N2)、プテリジン(N4)に由来する(2つの縮合環を含む)C10
ベンゾジアゼピン(N2)に由来する(2つの縮合環を含む)C11
カルバゾール(N1)、ジベンゾフラン(O1)、ジベンゾチオフェン(S1)、カルボリン(N2)、ペリミジン(N2)、ピリドインドール(N2)に由来する(3つの縮合環を含む)C13、ならびに、
アクリジン(N1)、キサンテン(O1)、チオキサンテン(S1)、オキサントレン(O2)、フェノキサチイン(O11)、フェナジン(N2)、フェノキサジン(N11)、フェノチアジン(N11)、チアントレン(S2)、フェナントリジン(N1)、フェナントロリン(N2)、フェナジン(N2)に由来する(3つの縮合環を含む)C14
が挙げられるが、これらに限定されない。
単独であるか、または、別の置換基の一部であるかにかかわらず、上記基は、それ自体が、それ自体および以下に列挙するさらなる置換基から選択される1つ以上の基によって任意選択的に置換されていてよい。
ハロ:−F、−Cl、−Br、および−I。
ヒドロキシ:−OH。
エーテル:−OR、ここで、Rは、エーテル置換基、例えば、C1-7アルキル基(C1-7アルコキシ基とも称される、以下に考察されている)、C3-20ヘテロシクリル基(C3-20ヘテロシクリルオキシ基とも称される)、またはC5-20アリール基(C5-20アリールオキシ基とも称される)、好ましくはC1-7アルキル基である。
アルコキシ:−OR、ここで、Rは、アルキル基、例えば、C1-7アルキル基である。C1-7アルコキシ基の例として、−OMe(メトキシ)、−OEt(エトキシ)、−O(nPr)(n−プロポキシ)、−O(iPr)(イソプロポキシ)、−O(nBu)(n−ブトキシ)、−O(sBu)(sec−ブトキシ)、−O(iBu)(イソブトキシ)、および−O(tBu)(tert−ブトキシ)が挙げられるが、これらに限定されない。
アセタール:−CH(OR1)(OR2)、ここで、R1およびR2は、独立して、アセタール置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、もしくはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基であり、または、「環式」アセタール基の場合、R1およびR2は、これらが結合している2つの酸素原子、およびこれらが結合している炭素原子と一緒になって、4〜8個の環原子を有する複素環式環を形成している。アセタール基の例として、−CH(OMe)2、−CH(OEt)2、および−CH(OMe)(OEt)が挙げられるが、これらに限定されない。
ヘミアセタール:−CH(OH)(OR1)、ここで、R1は、ヘミアセタール置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。ヘミアセタール基の例として、−CH(OH)(OMe)および−CH(OH)(OEt)が挙げられるが、これらに限定されない。
ケタール:−CR(OR1)(OR2)、ここで、R1およびR2は、アセタールについて定義されている通りであり、Rは、水素以外のケタール置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。ケタール基の例として、−C(Me)(OMe)2、−C(Me)(OEt)2、−C(Me)(OMe)(OEt)、−C(Et)(OMe)2、−C(Et)(OEt)2、および−C(Et)(OMe)(OEt)が挙げられるが、これらに限定されない。
ヘミケタール:−CR(OH)(OR1)、ここで、R1は、ヘミアセタールについて定義されている通りであり、Rは、水素以外のヘミケタール置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。ヘミアセタール基の例として、−C(Me)(OH)(OMe)、−C(Et)(OH)(OMe)、−C(Me)(OH)(OEt)、および−C(Et)(OH)(OEt)が挙げられるが、これらに限定されない。
オキソ(ケト、−オン):=O。
チオン(チオケトン):=S。
イミノ(イミン):=NR、ここで、Rは、イミノ置換基、例えば、水素、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは水素またはC1-7アルキル基である。エステル基の例として、=NH、=NMe、=NEt、および=NPhが挙げられるが、これらに限定されない。
ホルミル(カルボアルデヒド、カルボキシアルデヒド):−C(=O)H。
アシル(ケト):−C(=O)R、ここで、Rは、アシル置換基、例えば、C1-7アルキル基(C1-7アルキルアシルもしくはC1-7アルカノイルとも称される)、C3-20ヘテロシクリル基(C3-20ヘテロシクリルアシルとも称される)、またはC5-20アリール基(C5-20アリールアシルとも称される)、好ましくはC1-7アルキル基である。アシル基の例として、−C(=O)CH3(アセチル)、−C(=O)CH2CH3(プロピオニル)、−C(=O)C(CH33(t−ブチリル)、および−C(=O)Ph(ベンゾイル、フェノン)が挙げられるが、これらに限定されない。
カルボキシ(カルボン酸):−C(=O)OH。
チオカルボキシ(チオカルボン酸):−C(=S)SH。
チオロカルボキシ(チオロカルボン酸):−C(=O)SH。
チオノカルボキシ(チオノカルボン酸):−C(=S)OH。
イミド酸:−C(=NH)OH。
ヒドロキサム酸:−C(=NOH)OH。
エステル(カルボキシラート、カルボン酸エステル、オキシカルボニル):−C(=O)OR、ここで、Rは、エステル置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。エステル基の例として、−C(=O)OCH3、−C(=O)OCH2CH3、−C(=O)OC(CH33、および−C(=O)OPhが挙げられるが、これらに限定されない。
アシルオキシ(逆エステル):−OC(=O)R、ここで、Rは、アシルオキシ置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。アシルオキシ基の例として、−OC(=O)CH3(アセトキシ)、−OC(=O)CH2CH3、−OC(=O)C(CH33、−OC(=O)Ph、および−OC(=O)CH2Phが挙げられるが、これらに限定されない。
オキシカルボイルオキシ:−OC(=O)OR、ここで、Rは、エステル置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。エステル基の例として、−OC(=O)OCH3、−OC(=O)OCH2CH3、−OC(=O)OC(CH33、および−OC(=O)OPhが挙げられるが、これらに限定されない。
アミノ:−NR12、ここで、R1およびR2は、独立して、アミノ置換基、例えば、水素、C1-7アルキル基(C1-7アルキルアミノもしくはジ−C1-7アルキルアミノとも称される)、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはHまたはC1-7アルキル基であり、あるいは、「環式」アミノ基の場合、R1およびR2は、これらが結合している窒素原子と一緒になって、4〜8個の環原子を有する複素環式環を形成している。アミノ基は、第一級(−NH2)、第二級(−NHR1)、または第三級(−NHR12)であってよく、カチオン形態では、第四級(−+NR123)であってよい。アミノ基の例として、−NH2、−NHCH3、−NHC(CH32、−N(CH32、−N(CH2CH32、および−NHPhが挙げられるが、これらに限定されない。環式アミノ基の例として、アジリジノ、アゼチジノ、ピロリジノ、ピペリジノ、ピペラジノ、モルホリノ、およびチオモルホリノが挙げられるが、これらに限定されない。
アミド(カルバモイル、カルバミル、アミノカルボニル、カルボキサミド):−C(=O)NR12、ここで、R1およびR2は、独立して、アミノ基について定義されているアミノ置換基である。アミド基の例として、−C(=O)NH2、−C(=O)NHCH3、−C(=O)N(CH32、−C(=O)NHCH2CH3、および−C(=O)N(CH2CH32、ならびに、R1およびR2が、これらが結合している窒素原子と一緒になって、例えば、ピペリジノカルボニル、モルホリノカルボニル、チオモルホリノカルボニル、およびピペラジノカルボニルにおけるように複素環式構造を形成しているアミド基が挙げられるが、これらに限定されない。
チオアミド(チオカルバミル):−C(=S)NR12、ここで、R1およびR2は、独立して、アミノ基について定義されているアミノ置換基である。アミド基の例として、−C(=S)NH2、−C(=S)NHCH3、−C(=S)N(CH32、および−C(=S)NHCH2CH3が挙げられるが、これらに限定されない。
アシルアミド(アシルアミノ):−NR1C(=O)R2、ここで、R1は、アミド置換基、例えば、水素、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは水素またはC1-7アルキル基であり、R2は、アシル置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは水素またはC1-7アルキル基である。アシルアミド基の例として、−NHC(=O)CH3、−NHC(=O)CH2CH3、および−NHC(=O)Phが挙げられるが、これらに限定されない。R1およびR2は、例えば、スクシンイミジル、マレイミジル、およびフタルイミジル:
Figure 2020503250
におけるように、一緒になって環式構造を形成していてよい。
アミノカルボニルオキシ:−OC(=O)NR12、ここで、R1およびR2は、独立して、アミノ基について定義されているアミノ置換基である。アミノカルボニルオキシ基の例として、−OC(=O)NH2、−OC(=O)NHMe、−OC(=O)NMe2、および−OC(=O)NEt2が挙げられるが、これらに限定されない。
ウレイド:−N(R1)CONR23、ここで、R2およびR3は、独立して、アミノ基について定義されているアミノ置換基であり、R1は、ウレイド置換基、例えば、水素、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは水素またはC1-7アルキル基である。ウレイド基の例として、−NHCONH2、−NHCONHMe、−NHCONHEt、−NHCONMe2、−NHCONEt2、−NMeCONH2、−NMeCONHMe、−NMeCONHEt、−NMeCONMe2、および−NMeCONEt2が挙げられるが、これらに限定されない。
グアニジノ:−NH−C(=NH)NH2
テトラゾリル:4個の窒素原子および1個の炭素原子を有する5員の芳香族環:
Figure 2020503250
イミノ:=NR、ここで、Rは、イミノ置換基、例えば、例えば、水素、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはHまたはC1-7アルキル基である。イミノ基の例として、=NH、=NMe、および=NEtが挙げられるが、これらに限定されない。
アミジン(アミジノ):−C(=NR)NR2、ここで、各Rは、アミジン置換基、例えば、水素、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはHまたはC1-7アルキル基である。アミジン基の例として、−C(=NH)NH2、−C(=NH)NMe2、および−C(=NMe)NMe2が挙げられるが、これらに限定されない。
ニトロ:−NO2
ニトロソ:−NO。
アジド:−N3
シアノ(ニトリル、カルボニトリル):−CN。
イソシアノ:−NC。
シアナト:−OCN。
イソシアナト:−NCO。
チオシアノ(チオシアナト):−SCN。
イソチオシアノ(イソチオシアナト):−NCS。
スルフヒドリル(チオール、メルカプト):−SH。
チオエーテル(スルフィド):−SR、ここで、Rは、チオエーテル置換基、例えば、C1-7アルキル基(C1-7アルキルチオ基とも称される)、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。C1-7アルキルチオ基の例として、−SCH3および−SCH2CH3が挙げられるが、これらに限定されない。
ジスルフィド:−SS−R、ここで、Rは、ジスルフィド置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基(本明細書においてC1-7アルキルジスルフィドとも称される)である。C1-7アルキルジスルフィド基の例として、−SSCH3および−SSCH2CH3が挙げられるが、これらに限定されない。
スルフィン(スルフィニル、スルホキシド):−S(=O)R、ここで、Rは、スルフィン置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。スルフィン基の例として、−S(=O)CH3および−S(=O)CH2CH3が挙げられるが、これらに限定されない。
スルホン(スルホニル):−S(=O)2R、ここで、Rは、スルホン置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは、例えば、フッ素化もしくは過フッ素化C1-7アルキル基を含めたC1-7アルキル基である。スルホン基の例として、−S(=O)2CH3(メタンスルホニル、メシル)、−S(=O)2CF3(トリフリル)、−S(=O)2CH2CH3(エシル)、−S(=O)249(ノナフリル)、−S(=O)2CH2CF3(トレシル)、−S(=O)2CH2CH2NH2(タウリル)、−S(=O)2Ph(フェニルスルホニル、ベシル)、4−メチルフェニルスルホニル(トシル)、4−クロロフェニルスルホニル(クロシル)、4−ブロモフェニルスルホニル(ブロシル)、4−ニトロフェニル(ノシル)、2−ナフタレンスルホナート(ナプシル)、および5−ジメチルアミノ−ナフタレン−1−イルスルホナート(ダンシル)が挙げられるが、これらに限定されない。
スルフィン酸(スルフィノ):−S(=O)OH、−SO2H。
スルホン酸(スルホ):−S(=O)2OH、−SO3H。
スルフィナート(スルフィン酸エステル):−S(=O)OR;ここで、Rは、スルフィナート置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。スルフィナート基の例として、−S(=O)OCH3(メトキシスルフィニル;メチルスルフィナート)および−S(=O)OCH2CH3(エトキシスルフィニル;エチルスルフィナート)が挙げられるが、これらに限定されない。
スルホナート(スルホン酸エステル):−S(=O)2OR、ここで、Rは、スルホナート置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。スルホナート基の例として、−S(=O)2OCH3(メトキシスルホニル;メチルスルホナート)および−S(=O)2OCH2CH3(エトキシスルホニル;エチルスルホナート)が挙げられるが、これらに限定されない。
スルフィニルオキシ:−OS(=O)R、ここで、Rは、スルフィニルオキシ置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。スルフィニルオキシ基の例として、−OS(=O)CH3および−OS(=O)CH2CH3が挙げられるが、これらに限定されない。
スルホニルオキシ:−OS(=O)2R、ここで、Rは、スルホニルオキシ置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。スルホニルオキシ基の例として、−OS(=O)2CH3(メシラート)および−OS(=O)2CH2CH3(エシラート)が挙げられるが、これらに限定されない。
サルフェート:−OS(=O)2OR、ここで、Rは、サルフェート置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。サルフェート基の例として、−OS(=O)2OCH3および−SO(=O)2OCH2CH3が挙げられるが、これらに限定されない。
スルファミル(スルファモイル、スルフィン酸アミド、スルフィンアミド):−S(=O)NR12、ここで、R1およびR2は、独立して、アミノ基について定義されているアミノ置換基である。スルファミル基の例として、−S(=O)NH2、−S(=O)NH(CH3)、−S(=O)N(CH32、−S(=O)NH(CH2CH3)、−S(=O)N(CH2CH32、および−S(=O)NHPhが挙げられるが、これらに限定されない。
スルホンアミド(スルフィナモイル、スルホン酸アミド、スルホンアミド):−S(=O)2NR12、ここで、R1およびR2は、独立して、アミノ基について定義されているアミノ置換基である。スルホンアミド基の例として、−S(=O)2NH2、−S(=O)2NH(CH3)、−S(=O)2N(CH32、−S(=O)2NH(CH2CH3)、−S(=O)2N(CH2CH32、および−S(=O)2NHPhが挙げられるが、これらに限定されない。
スルファミノ:−NR1S(=O)2OH、ここで、R1は、アミノ基について定義されているアミノ置換基である。スルファミノ基の例として、−NHS(=O)2OHおよび−N(CH3)S(=O)2OHが挙げられるが、これらに限定されない。
スルホンアミノ:−NR1S(=O)2R、ここで、R1は、アミノ基について定義されているアミノ置換基であり、Rは、スルホンアミノ置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。スルホンアミノ基の例として、−NHS(=O)2CH3および−N(CH3)S(=O)265が挙げられるが、これらに限定されない。
スルフィンアミノ:−NR1S(=O)R、ここで、R1は、アミノ基について定義されているアミノ置換基であり、Rは、スルフィンアミノ置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基である。スルフィンアミノ基の例として、−NHS(=O)CH3および−N(CH3)S(=O)C65が挙げられるが、これらに限定されない。
ホスフィノ(ホスフィン):−PR2、ここで、Rは、ホスフィノ置換基、例えば、−H、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは−H、C1-7アルキル基、またはC5-20アリール基である。ホスフィノ基の例として、−PH2、−P(CH32、−P(CH2CH32、−P(t−Bu)2、および−P(Ph)2が挙げられるが、これらに限定されない。
ホスホ:−P(=O)2
ホスフィニル(ホスフィンオキシド):−P(=O)R2、ここで、Rは、ホスフィニル置換基、例えば、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくはC1-7アルキル基またはC5-20アリール基である。ホスフィニル基の例として、−P(=O)(CH32、−P(=O)(CH2CH32、−P(=O)(t−Bu)2、および−P(=O)(Ph)2が挙げられるが、これらに限定されない。
ホスホン酸(ホスホノ):−P(=O)(OH)2
ホスホナート(ホスホノエステル):−P(=O)(OR)2、ここで、Rは、ホスホナート置換基、例えば、−H、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは−H、C1-7アルキル基、またはC5-20アリール基である。ホスホナート基の例として、−P(=O)(OCH32、−P(=O)(OCH2CH32、−P(=O)(O−t−Bu)2、および−P(=O)(OPh)2が挙げられるが、これらに限定されない。
リン酸(ホスホノオキシ):−OP(=O)(OH)2
ホスフェート(ホスホノオキシエステル):−OP(=O)(OR)2、ここで、Rは、ホスフェート置換基、例えば、−H、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは−H、C1-7アルキル基、またはC5-20アリール基である。ホスフェート基の例として、−OP(=O)(OCH32、−OP(=O)(OCH2CH32、−OP(=O)(O−t−Bu)2、および−OP(=O)(OPh)2が挙げられるが、これらに限定されない。
亜リン酸:−OP(OH)2
ホスファイト:−OP(OR)2、ここで、Rは、ホスファイト置換基、例えば、−H、C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは−H、C1-7アルキル基、またはC5-20アリール基である。ホスファイト基の例として、−OP(OCH32、−OP(OCH2CH32、−OP(O−t−Bu)2、および−OP(OPh)2が挙げられるが、これらに限定されない。
ホスホロアミダイト:−OP(OR1)−NR2 2、ここで、R1およびR2は、ホスホロアミダイト置換基、例えば、−H、(任意選択的に置換されている)C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは−H、C1-7アルキル基、またはC5-20アリール基である。ホスホロアミダイト基の例として、−OP(OCH2CH3)−N(CH32、−OP(OCH2CH3)−N(i−Pr)2、および−OP(OCH2CH2CN)−N(i−Pr)2が挙げられるが、これらに限定されない。
ホスホロアミダート:−OP(=O)(OR1)−NR2 2、ここで、R1およびR2は、ホスホロアミダート置換基、例えば、−H、(任意選択的に置換されている)C1-7アルキル基、C3-20ヘテロシクリル基、またはC5-20アリール基、好ましくは−H、C1-7アルキル基、またはC5-20アリール基である。ホスホロアミダート基の例として、−OP(=O)(OCH2CH3)−N(CH32、−OP(=O)(OCH2CH3)−N(i−Pr)2、および−OP(=O)(OCH2CH2CN)−N(i−Pr)2が挙げられるが、これらに限定されない。
アルキレン
3-12アルキレン:「C3-12アルキレン」という用語は、本明細書中で使用される場合、脂肪族であっても脂環式であってもよく、また、飽和、部分不飽和、または完全不飽和であってよい、3〜12個の炭素原子(他に特定されない限り)を有する炭化水素化合物の2つの水素原子であって、両方が同じ炭素原子からであるか、2つの異なる炭素原子のそれぞれからのものであるかのいずれかである当該2つの水素原子を除去することによって得られる二座部分に関する。ゆえに、「アルキレン」という用語には、以下に考察されている、サブクラスのアルケニレン、アルキニレン、シクロアルキレンなどが含まれる。
直鎖飽和C3-12アルキレン基の例として、nが3〜12の整数である−(CH2n−、例えば、−CH2CH2CH2−(プロピレン)、−CH2CH2CH2CH2−(ブチレン)、−CH2CH2CH2CH2CH2−(ペンチレン)および−CH2CH2CH2CH−2CH2CH2CH2−(ヘプチレン)が挙げられるが、これらに限定されない。
分岐鎖飽和C3-12アルキレン基の例として、−CH(CH3)CH2−、−CH(CH3)CH2CH2−、−CH(CH3)CH2CH2CH2−、−CH2CH(CH3)CH2−、−CH2CH(CH3)CH2CH2−、−CH(CH2CH3)−、−CH(CH2CH3)CH2−、および−CH2CH(CH2CH3)CH2−が挙げられるが、これらに限定されない。
直鎖部分不飽和C3-12アルキレン基(C3-12アルケニレン、およびアルキニレン基)として、−CH=CH−CH2−、−CH2−CH=CH2−、−CH=CH−CH2−CH2−、−CH=CH−CH2−CH2−CH2−、−CH=CH−CH=CH−、−CH=CH−CH=CH−CH2−、−CH=CH−CH=CH−CH2−CH2−、−CH=CH−CH2−CH=CH−、−CH=CH−CH2−CH2−CH=CH−、および−CH2−C≡C−CH2−が挙げられるが、これらに限定されない。
分岐鎖部分不飽和C3-12アルキレン基(C3-12アルケニレンおよびアルキニレン基)の例として、−C(CH3)=CH−、−C(CH3)=CH−CH2−、−CH=CH−CH(CH3)−および−C≡C−CH(CH3)−が挙げられるが、これらに限定されない。
脂環式飽和C3-12アルキレン基(C3-12シクロアルキレン)の例として、シクロペンチレン(例えば、シクロペンタ−1,3−イレン)、およびシクロヘキシレン(例えば、シクロヘキサ−1,4−イレン)が挙げられるが、これらに限定されない。
脂環式部分不飽和C3-12アルキレン基(C3-12シクロアルキレン)の例として、シクロペンテニレン(例えば、4−シクロペンテン−1,3−イレン)、シクロヘキセニレン(例えば、2−シクロヘキセン−1,4−イレン、3−シクロヘキセン−1,2−イレン、2,5−シクロヘキサジエン−1,4−イレン)が挙げられるが、これらに限定されない。
リガンド単位
リガンド単位は、任意の種類であってよく、標的分子に特異的に結合するタンパク質、ポリペプチド、ペプチドおよび非ペプチド性剤を挙げることができる。いくつかの実施形態において、リガンド単位は、タンパク質、ポリペプチドまたはペプチドであってよい。いくつかの実施形態において、リガンド単位は、環式ポリペプチドであってよい。これらのリガンド単位は、抗体、もしくは少なくとも1つの標的分子−結合部位を含有する抗体の断片、リンホカイン、ホルモン、増殖因子、または標的に特異的に結合し得る任意の他の細胞結合分子もしくは物質を含むことができる。
「特異的に結合する」および「特異的結合」という用語は、所定の分子(例えば、抗原)への抗体または他のタンパク質、ポリペプチドもしくはペプチドの結合を示す。典型的には、抗体または他の分子が、少なくとも約1×107-1の親和性で結合し、所定の分子または密接に関連する分子以外の非特異的分子(例えば、BSA、カゼイン)への結合の親和性の少なくとも2倍超である親和性で所定の分子に結合する。
リガンド単位の例として、WO2007/085930において使用について記載されている剤が挙げられ、WO2007/085930は、本明細書に援用される。
いくつかの実施形態において、リガンド単位は、細胞における細胞外標的に結合する細胞結合剤である。このような細胞結合剤は、タンパク質、ポリペプチド、ペプチドまたは非ペプチド性剤であり得る。いくつかの実施形態において、細胞結合剤は、タンパク質、ポリペプチドまたはペプチドであってよい。いくつかの実施形態において、細胞結合剤は、環式ポリペプチドであってよい。細胞結合剤はまた、抗体または抗体の抗原結合断片であってもよい。ゆえに、1つの実施形態において、本発明は、抗体-薬物複合体(ADC)を提供する。
細胞結合剤
細胞結合剤は、任意の種類のものが可能であり、ペプチドおよび非ペプチドを挙げることができる。細胞結合剤として、少なくとも1つの結合部位を有する抗体または抗体断片、リンホカイン、ホルモン、ホルモン模倣物、ビタミン、増殖因子、栄養輸送分子、または任意の他の細胞結合分子もしくは物質を挙げることができる。
ペプチド
1つの実施形態において、細胞結合剤は、4〜30、好ましくは6〜20の、連続アミノ酸残基を含む直鎖または環状ペプチドである。この実施形態において、1つの細胞結合剤が1つの単量体または二量体ピロロベンゾジアゼピン化合物と連結されていることが好ましい。
1つの実施形態において、細胞結合剤は、インテグリンανβ6と結合するペプチドを含む。このペプチドは、XYSよりもανβ6に対して選択性を有することができる。
1つの実施形態において、細胞結合剤は、A20FMDV−Cysポリペプチドを含む。A20FMDV−Cysは、配列:NAVPNLRGDLQVLAQKVARTCを有する。あるいは、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、または10のアミノ酸残基が別のアミノ酸残基に置換されているA20FMDV−Cys配列の変異型を使用することができる。そのうえさらに、ポリペプチドは、配列NAVXXXXXXXXXXXXXXXRTCを有するものでもよい。
抗体
「抗体」という用語は、本明細書中、最も広義の意味で用いられ、具体的には、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、二量体、多量体、多特異性抗体(例えば、二特異性抗体)、および抗体断片を包含するが、ただし、それらが所望の生物活性を示す限りにおいてである(Miller et al(2003)Jour.of Immunology 170:4854−4861)。抗体は、マウス抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、または他の種由来抗体が可能である。抗体とは、免疫系により産生される、特定の抗原を認識してそれに結合することができるタンパク質である。(Janeway,C.,Travers,P.,Walport,M.,Shlomchik(2001)Immuno Biology,5th Ed.,Garland Publishing,New York)。標的抗原は、一般に、複数の抗体のCDRで認識される多数の結合部位(エピトープとも呼ばれる)を有する。異なるエピトープに特異的に結合する抗体は、それぞれ異なる構造を有する。したがって、1つの抗原は、1つより多い対応する抗体を有する可能性がある。抗体として、全長免疫グロブリン分子または全長免疫グロブリン分子の免疫学的活性部分、すなわち、注目している標的の抗原に免疫学的に結合する抗原結合部位またはその一部分を有する分子が挙げられ、そのような標的として、癌細胞または自己免疫疾患に関連した自己免疫抗体を産生する細胞が挙げられるが、これらに限定されない。免疫グロブリンは、任意の型(例えばIgG、IgE、IgM、IgD、およびIgA)、クラス(例えばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2)またはサブクラスの免疫グロブリン分子が可能である。免疫グロブリンは、任意の種由来のものが可能であり、ヒト、マウス、またはウサギ起原が挙げられる。
「抗体断片」は、全長抗体の一部分、一般には全長抗体の抗原結合領域または可変領域を含む。抗体断片の例として、Fab、Fab’、F(ab’)2、およびscFv断片;二重特異性抗体;線状抗体;Fab発現ライブラリーにより産生される断片、抗イディオタイプ(抗Id)抗体、CDR(相補性決定領域)、および上記のもののいずれかの、癌細胞抗原、ウイルス抗原、または微生物抗原に免疫学的に結合するエピトープ結合断片、単鎖抗体分子;ならびに、抗体断片から形成される多特異性抗体が挙げられる。
「モノクローナル抗体」という用語は、本明細書中使用される場合、実質的に同種の抗体の集団、すなわち集団を構成する個々の抗体が、天然に生じる可能性のある変異を除いて同一であり、そのような変異が存在したとしても少数である集団から得られる抗体を示す。モノクローナル抗体は、特異性が高く、単独の抗原部位に向けられている。そのうえさらに、ポリクローナル抗体製剤が、異なる決定基(エピトープ)に向けられた異なる抗体を含むのとは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原の単独の決定基に向けられている。モノクローナル抗体は、その特異性に加えて、他の抗体が混入することなく合成できるという利点を有する。「モノクローナル」という修飾語は、抗体が、実質的に同種の抗体集団から得られたものであるという特徴を示すものであって、抗体の産生が何か特定の方法による必要があることを意図しない。例えば、本発明に従って使用されるモノクローナル抗体は、Kohlerらが最初に記載したハイブリドーマ方法(1975)(Nature 256:495)により作られたものであってもよいし、組換えDNA法(US4816567を参照)により作られたものであってもよい。モノクローナル抗体は、また、Clackson et al(1991)Nature,352:624−628、 Marks et al(1991)J.Mol.Biol.,222:581−597に記載された技法を用いてファージ抗体ライブラリーから単離されてもよいし、完全ヒト免疫グロブリン系を保有する遺伝子導入マウスから単離されてもよい(Lonberg(2008)Curr.Opinion 20(4):450−459)。
モノクローナル抗体として、本明細書中、具体的には「キメラ」抗体が挙げられる。「キメラ」抗体では、所望の生物活性を示す限りにおいて、重鎖および/または軽鎖の一部分が、特定種由来の抗体、または特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体の相当する配列と同一または相同であるが、鎖の残りの部分は、別の種由来の抗体、または別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体、ならびにそのような抗体の断片の相当する配列と同一または相同である(US4816567、およびMorrison et al(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851−6855)。キメラ抗体として、「霊長類化」抗体が挙げられ、この抗体は、非ヒト霊長類(例えば旧世界ザルまたは類人猿)に由来する可変ドメイン抗原結合配列およびヒトの定常部配列を含む。
「無傷の抗体」は、本明細書中、VLドメインおよびVHドメイン、ならびに軽鎖定常ドメイン(CL)および重鎖定常ドメイン、CH1、CH2、およびCH3を含む抗体である。定常ドメインは、天然配列定常ドメイン(例えばヒト天然配列定常ドメイン)またはそのアミノ酸配列変異型が可能である。無傷の抗体は、1つ以上の「エフェクター機能」を有することができ、エフェクター機能とは、抗体のFc領域(天然配列Fc領域またはアミノ酸配列変異型Fc領域)に起因する生物学的活性を示す。抗体エフェクター機能の例として、C1q結合、補体依存性細胞毒性、Fc受容体結合、抗体依存性細胞傷害(ADCC)、食作用;および細胞表面受容体(B細胞受容体およびBCRなど)の下方制御が挙げられる。
無傷の抗体は、その抗体の重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に従って、異なる「クラス」に配属させることができる。無傷の抗体には、主要な5つのクラス:IgA、IgD、IgE、IgG、およびIgMがあり、これらのクラスのいくつかは、さらに「サブクラス」(アイソタイプ)に分割することができる(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、およびIgA2)。異なる抗体のクラスにそれぞれ応じた重鎖定常ドメインは、それぞれ、α、δ、ε、γ、およびμと呼ばれる。それぞれのクラスの免疫グロブリンについてのサブユニット構造および三次元立体配置は、周知である。
ヒト化
非ヒト抗体または抗体断片のin vivo免疫原性を低下させる技法として、「ヒト化」と呼ばれるものが挙げられる。
「ヒト化抗体」は、ヒト抗体の修飾された可変領域の少なくとも一部分を含むポリペプチドを示し、この可変領域の一部分、好ましくは無傷のヒト可変ドメインより著しくに小さい一部分が、非ヒト種由来の相当する配列で置換されており、かつこの修飾された可変領域は、別のタンパク質の少なくとも別の部分、好ましくはヒト抗体の定常部と連結している。「ヒト化抗体」という表現は、1つ以上の相補性決定領域(「CDR」)アミノ酸残基および/または1つ以上のフレームワーク領域(「FW」または「FR」)アミノ酸残基が齧歯類または他の非ヒト抗体の類似部位由来アミノ酸残基で置換されているヒト抗体を含む。「ヒト化抗体」という表現は、実質的にヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有するFRおよび実質的に非ヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有するCDRを含む免疫グロブリンアミノ酸配列変異型またはその断片も含む。
「ヒト化」型の非ヒト(例えば、マウス)抗体は、非ヒト免疫グロブリン由来の最小配列を含有するキメラ抗体である。すなわち、見方を変えると、ヒト化抗体とは、ヒト配列の代わりに非ヒト(例えばマウス)抗体から選択された配列も含有するヒト抗体である。ヒト化抗体は、保存的アミノ酸置換、すなわち抗体の結合および/または生物学的活性を大きく変えることのない同種または異なる種由来の非天然の残基を含むことができる。そのような抗体は、非ヒト免疫グロブリン由来の最小配列を含有するキメラ抗体である。
様々なヒト化技法が存在し、そのような技法として、「CDRグラフト法」、「選択誘導法」、「脱免疫化」、「表面再構成(resurfacing)(「ベニヤ修飾(veneering)」としても知られる)、「複合抗体」、「ヒトストリング含有量最適化(Human String Content Optimisation)」、およびフレームワーク混合が挙げられる。
CDRグラフト法
この技法では、ヒト化抗体は、レシピエント抗体の相補性決定領域(CDR)由来の残基が、所望の性質を有する、マウス、ラット、ラクダ、ウシ、ヤギ、またはウサギなどの非ヒト種(ドナー抗体)のCDR由来の残基で置換されているヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である(実際には、非ヒトCDRが、ヒトフレームワークに「移植」されている)。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域(FR)残基が、相当する非ヒト残基で置換されている(これは、例えば、特定のFR残基が抗原結合に対して大きな効果を有する場合などにそうなる可能性がある)。
そのうえさらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体にも、導入されるCDRまたはフレームワーク配列にも見られない残基を含むことができる。こうした修飾を行うことで、抗体の性能をさらに洗練させて最大化することができる。したがって、一般に、ヒト化抗体は、全部で少なくとも1つ、および1つの態様において2つの可変領域を含むことになり、この抗体において、全てまたは全ての超可変ループは非ヒト免疫グロブリンのものに相当し、および全てまたは実質的に全てのFR領域はヒト免疫グロブリン配列のものである。ヒト化抗体はまた、随意に、ヒト免疫グロブリンの、免疫グロブリン定常部(Fc)の少なくとも一部分または全部を含むことができる。
選択誘導法
この方法は、特定のエピトープに対して特異的な所定の非ヒト抗体のVHまたはVLドメインをヒトVHまたはVLライブラリーと組み合わせることからなり、特異的ヒトVドメインは、注目している抗原に対して選択される。次いで、この選択されたヒトVHを、VLライブラリーと組み合わせて、完全なヒトVH×VLの組み合わせを作成する。この方法は、Nature Biotechnology(N.Y.)12,(1994)899−903に記載されている。
複合抗体
この方法では、ヒト抗体由来のアミノ酸配列の2つ以上のセグメントを、最終抗体分子内にひとまとめにする。最終抗体分子は、複数のヒトVHおよびVL配列セグメントを、ヒトT細胞エピトープを制限または回避する組み合わせで、最終複合抗体V領域内にひとまとめにすることにより、構築される。必要な場合は、T細胞エピトープに寄与するまたはこれをコードするV領域を、T細胞エピトープを回避する代替セグメントで交換することにより、T細胞エピトープを制限または回避する。この方法は、US2008/0206239A1に記載される。
脱免疫化
この方法は、ヒト(または他の二次種)T細胞エピトープを、治療用抗体(または他の分子)のV領域から除去することを含む。治療用抗体V領域配列を、例えば、MHC結合モチーフのデータベース(www.wehi.edu.auがホストである「モチーフ」データベースなど)と比較することで、MHCクラスII結合モチーフの存在について分析する。あるいは、MHCクラスII結合モチーフは、Altuviaらにより記載される方法(J.Mol.Biol.249 244−250(1995))などのコンピューターによるスレッド化法を用いて同定することができる。これらの方法では、V領域配列由来の連続重複ペプチドを、それらのMHCクラスIIタンパク質との結合エネルギーについて試験する。次いで、このデータを、連続して存在するペプチドと関連する他の配列特性についての情報(両親媒性、ロスバードモチーフ(Rothbard motif)、ならびにカテプシンBおよび他のプロセシング酵素による切断部位など)とまとめることができる。
いったん可能性のある二次種(例えばヒト)T細胞エピトープが同定されたら、1つ以上のアミノ酸を変更することで、それらを除去する。修飾されるアミノ酸は、通常、T細胞エピトープ自体内にあるが、タンパク質の一次または二次構造に関してエピトープと隣接するものでもよい(したがって、一次構造では隣接していなくてもよい)。最も典型的には、変更は、置換によるものであるが、状況によっては、アミノ酸の付加または欠失の方が適切なこともある。
全ての変更は、十分に確立された方法(部位特異的突然変異誘発など)を用いて、組換え宿主で発現させることにより、最終分子を調製することができるように、組換えDNA技法により達成することができる。しかしながら、タンパク質化学反応または任意の他の分子変更手段の利用も可能である。
表面再構成
この方法は、以下を含む:
(a)非ヒト(例えば齧歯類)抗体(またはその断片)の可変領域の三次元モデルを構築することにより、非ヒト抗体可変領域の高次立体構造を決定する、
(b)十分な数の非ヒトおよびヒト抗体の可変領域重鎖および軽鎖でのX線結晶構造解析に基づく構造から、相対的到達性分布を用いて、配列アラインメントを作成して、重鎖および軽鎖のフレームワーク位置の組を得る(この組において、アラインメント位置は、十分な数の非ヒト抗体重鎖および軽鎖の98%において同一である)、
(c)ステップ(b)で作成したフレームワーク位置の組を用いて、ヒト化しようとする非ヒト抗体について、重鎖および軽鎖の表面露出アミノ酸残基の組を定義する、
(d)ヒト抗体アミノ酸配列から、ステップ(c)で定義した表面露出アミノ酸残基の組との相同性が最も高い重鎖および軽鎖の表面露出アミノ酸残基の組を同定する(この場合、ヒト抗体由来の重鎖および軽鎖は、天然に対をなすまたはなさない)、
(e)ヒト化しようとする非ヒト抗体のアミノ酸配列において、ステップ(c)で定義した表面露出アミノ酸残基の組を、ステップ(d)で同定した重鎖および軽鎖の表面露出アミノ酸残基の組と置換する、
(f)ステップ(e)で指定される置換により得られる非ヒト抗体の可変領域の三次元モデルを構築する、
(g)ステップ(a)およびステップ(f)で構築した三次元モデルを比較することにより、ヒト化しようとする非ヒト抗体の相補性決定領域のいずれかの残基のいずれかの原子から5オングストローム内にあるいずれかのアミノ酸残基を、ステップ(c)またはステップ(d)で同定した組から同定する、および
(h)ステップ(g)で同定したいずれかの残基を、ヒトアミノ酸残基から元々の非ヒトアミノ酸残基に交換し、それにより、表面露出アミノ酸残基の非ヒト抗体ヒト化の組を確定させる、ただし、ステップ(a)は、必ずしも最初に行う必要はないが、ステップ(g)の前に行わなければならない。
超ヒト化
この方法は、非ヒト配列を、機能的ヒト生殖系列遺伝子レパートリーと比較する。これらのヒト遺伝子の中から、非ヒト配列と同一または密接に関連する正準構造をコードするものを選択する。選択したこれらのヒト遺伝子の中から、CDR内で最も高い相同性を持つものをFRドナーとして選択する。最後に、非ヒトCDRをこれらのヒトFRに移植する。この方法は、WO2005/079479A2に記載されている。
ヒトストリング含有量最適化
この方法は、非ヒト(例えばマウス)配列を、ヒト生殖系列遺伝子のレパートリーと比較し、差異を、ヒトストリング含有量(HSC)として点数付けする。HSCは、潜在的MHC/T細胞エピトープのレベルで配列を定量する。次いで、標的配列を、全体的な相同性尺度を用いるのではなく、標的配列のHSCを最大にするようにヒト化することで、複数の多様なヒト化変異型を作成する(Molecular Immunology,44,(2007)1986−1998に記載されている)。
フレームワークシャフリング
非ヒト抗体のCDRを、全ての既知の重鎖および軽鎖のヒト生殖系列遺伝子フレームワークを包含するcDNAプールと、インフレームで融合させる。次いで、ヒト化抗体を、例えば、ファージ提示型抗体ライブラリーをパニングすることで選択する。この方法は、Methods 36,43−60(2005)に記載されている。
細胞結合剤の例として、WO2007/085930に使用が記載されている作用剤が挙げられる。WO2007/085930は、本明細書に援用される。
本発明の実施形態で使用される腫瘍関連抗原および同族の抗体を、以下に列挙する。
腫瘍(Tumor)関連抗原および同族の抗体
(1)BMPR1B(骨形成タンパク質タンパク質受容体IB型)
ヌクレオチド
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相互参照
ten Dijke,P.,et al Science 264(5155):101−104(1994)、Oncogene 14(11):1377−1382(1997))、WO2004/063362(請求項2)、WO2003/042661(請求項12)、US2003/134790−A1(38−39頁)、WO2002/102235(請求項13、296頁)、WO2003/055443(91−92頁)、WO2002/99122(実施例2、528−530頁)、WO2003/029421(請求項6)、WO2003/024392(請求項2、図112)、WO2002/98358(請求項1、183頁)、WO2002/54940(100−101頁)、WO2002/59377(349−350頁)、WO2002/30268(請求項27、376頁)、WO2001/48204(実施例、図4)、NP_001194骨形成タンパク質タンパク質受容体、IB型/pid=NP_001194.1.、MIM:603248、AY065994
(2)E16(LAT1、SLC7A5)
ヌクレオチド
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相互参照
Biochem.Biophys.Res.Commun.255(2),283−288(1999),Nature 395(6699):288−291(1998)、Gaugitsch、H.W.,et al(1992)J.Biol.Chem.267(16):11267−11273)、WO2004/048938(実施例2)、WO2004/032842(実施例IV)、WO2003/042661(請求項12)、WO2003/016475(請求項1)、WO2002/78524(実施例2)、WO2002/99074(請求項19、127−129頁)、WO2002/86443(請求項27、222、393頁)、WO2003/003906(請求項10、293頁)、WO2002/64798(請求項33、93−95頁)、WO2000/14228(請求項5、133−136頁)、US2003/224454(図3)、WO2003/025138(請求項12、150頁)、NP_003477溶質輸送体ファミリー7(カチオン性アミノ酸輸送体、y+システム)、メンバー5/pid=NP_003477.3−ホモ・サピエンス、MIM:600182、、NM_015923。
(3)STEAP1(前立腺の6回膜貫通型上皮抗原)
ヌクレオチド
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Cancer Res.61(15),5857−5860(2001),Hubert,R.S.,et al(1999)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.96(25):14523−14528)
WO2004/065577(請求項6)、WO2004/027049(図1L)、EP1394274(実施例11)、WO2004/016225(請求項2)、WO2003/042661(請求項12)、US2003/157089(実施例5)、US2003/185830(実施例5)、US2003/064397(図2)、WO2002/89747(実施例5、618−619頁)、WO2003/022995(実施例9、図13A、実施例53、173頁、実施例2、図2A)、前立腺の6回膜貫通型上皮抗原、MIM:604415。
(4)0772P(CA125、MUC16)
ヌクレオチド
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J.Biol.Chem.276(29):27371−27375(2001))、WO2004/045553(請求項14)、WO2002/92836(請求項6、図12)、WO2002/83866(請求項15、116−121頁)、US2003/124140(実施例16)、GI:34501467。
(5)MPF(MPF、MSLN、SMR、巨核球増強因子、メソテリン)
ヌクレオチド
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Yamaguchi,N.,et al Biol.Chem.269(2),805−808(1994),Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.96:11531−11536(1999),Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.93(1):136−140(1996),J.Biol.Chem.270(37):21984−21990(1995))、WO2003/101283(請求項14)、WO2002/102235(請求項13、287−288頁)、WO2002/101075(請求項4、308−309頁)、WO2002/71928(320−321頁)、WO94/10312(52−57頁)、IM:601051。
(6)Napi3b(NAPI−3B、NPTIIb、SLC34A2、溶質輸送体ファミリー34(リン酸ナトリウム)、メンバー2、II型ナトリウム依存性リン酸輸送体3b)
ヌクレオチド
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J.Biol.Chem.277(22):19665−19672(2002),Genomics 62(2):281−284(1999)、Feild、J.A.,et al(1999)Biochem.Biophys.Res.Commun.258(3):578−582)、WO2004/022778(請求項2)、EP1394274(実施例11)、WO2002/102235(請求項13、326頁)、EP0875569(請求項1、17−19頁)、WO2001/57188(請求項20、329頁)、WO2004/032842(実施例IV)、WO2001/75177(請求項24、139−140頁)、MIM:604217。
(7)Sema 5b(FLJ10372、KIAA1445、Mm.42015、SEMA5B、SEMAG、セマフォリン5b Hlog、semaドメイン、7回トロンボスポンジン反復配列(seven thrombospondin repeats)(1型および1型様)、膜貫通ドメイン(TM)、および短細胞質ドメイン、(セマフォリン)5B)
ヌクレオチド
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Nagase T.,et al(2000)DNA Res.7(2):143−150)、WO2004/000997(請求項1)、WO2003/003984(請求項1)、WO2002/06339(請求項1、50頁)、WO2001/88133(請求項1、41−43頁、48−58頁)、WO2003/054152(請求項20)、WO2003/101400(請求項11)、受入番号:Q9P283、Genew、HGNC:10737。
(8)PSCA hlg(2700050C12Rik、C530008O16Rik、RIKEN cDNA 2700050C12、RIKEN cDNA 2700050C12遺伝子)
ヌクレオチド
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Ross et al(2002)Cancer Res.62:2546−2553、US2003/129192(請求項2)、US2004/044180(請求項12)、US2004/044179(請求項11)、US2003/096961(請求項11)、US2003/232056(実施例5)、WO2003/105758 16(請求項12)、US2003/206918(実施例5)、EP1347046(請求項1)、WO2003/025148(請求項20)、GI:37182378。
(9)ETBR(エンドセリンB型受容体)
ヌクレオチド
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Nakamuta M.,et al BioChem.Biophys.Res.Commun.177,34−39,1991、Ogawa Y.,et al BioChem.Biophys.Res.Commun.178,248−255,1991、Arai H.,et al Jpn.Circ.J.56,1303−1307,1992、Arai H.,et al J.Biol.Chem.268,3463−3470,1993、Sakamoto A.,Yanagisawa M.,et al BioChem.Biophys.Res.Commun.178,656−663,1991、Elshourbagy N.A.,et al J.Biol.Chem.268,3873−3879,1993、Haendler B.,et al J.Cardiovasc.Pharmacol.20,s1−S4,1992、Tsutsumi M.,et al Gene 228,43−49,1999、Strausberg R.L.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.99,16899−16903,2002、Bourgeois C.,et al J.Clin.Endocrinol.Metab.82,3116−3123,1997、Okamoto Y.,et al Biol.Chem.272,21589−21596,1997、Verheij J.B.,et alAM.J.Med.Genet.108,223−225,2002、Hofstra R.M.W.,et al Eur.J.Hum.Genet.5,180−185,1997、Puffenberger E.G.,et al Cell 79,1257−1266,1994、Attie T.,et al,Hum.Mol.Genet.4,2407−2409,1995、Auricchio A.,et al Hum.Mol.Genet.5:351−354,1996、AMiel J.,et al Hum.Mol.Genet.5,355−357,1996、Hofstra R.M.W.,et al Nat.Genet.12,445−447,1996、Svensson P.J.,et al Hum.Genet.103,145−148,1998、Fuchs S.,et al Mol.Med.7,115−124,2001、Pingault V.,et al(2002)Hum.Genet.111,198−206、WO2004/045516(請求項1)、WO2004/048938(実施例2)、WO2004/040000(請求項151)、WO2003/087768(請求項1)、WO2003/016475(請求項1)、WO2003/016475(請求項1)、WO2002/61087(図1)、WO2003/016494(図6)、WO2003/025138(請求項12、144頁)、WO2001/98351(請求項1、124−125頁)、EP 0522868(請求項8、図2)、WO2001/77172(請求項1、297−299頁)、US2003/109676、US6518404(図3)、US5773223(請求項1a、31−34欄)、WO2004/001004。
(10)MSG783(RNF124、仮想タンパク質FLJ20315)
ヌクレオチド
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WO2003/104275(請求項1)、WO2004/046342(実施例2)、WO2003/042661(請求項12)、WO2003/083074(請求項14、61頁)、WO2003/018621(請求項1)、WO2003/024392(請求項2、図93)、WO2001/66689(実施例6)、LocusID:54894。
(11)STEAP2(HGNC_8639、IPCA−1、PCANAP1、STAMP1、STEAP2、STMP、前立腺癌関連遺伝子1、前立腺癌関連タンパク質1、前立腺の6回膜貫通型上皮抗原2、6回膜貫通型前立腺タンパク質)
ヌクレオチド
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Lab.Invest.82(11):1573−1582(2002))、WO2003/087306、US2003/064397(請求項1、図1)、WO2002/72596(請求項13、54−55頁)、WO2001/72962(請求項1、図4B)、WO2003/104270(請求項11)、WO2003/104270(請求項16)、US2004/005598(請求項22)、WO2003/042661(請求項12)、US2003/060612(請求項12、図10)、WO2002/26822(請求項23、図2)、WO2002/16429(請求項12、図10)、GI:22655488。
(12)TrpM4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオン5チャンネル、サブファミリーM、メンバー4)
ヌクレオチド
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Xu,X.Z.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.98(19):10692−10697(2001),Cell 109(3):397−407(2002),J.Biol.Chem.278(33):30813−30820(2003))、US2003/143557(請求項4)、WO2000/40614(請求項14、100−103頁)、WO2002/10382(請求項1、図9A)、WO2003/042661(請求項12)、WO2002/30268(請求項27、391頁)、US2003/219806(請求項4)、WO2001/62794(請求項14、図1A−D)、MIM:606936。
(13)CRIPTO(CR、CR1、CRGF、CRIPTO、TDGF1、奇形腫由来増殖因子)
ヌクレオチド
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Ciccodicola,A.,et al EMBO J.8(7):1987−1991(1989),AM.J.Hum.Genet.49(3):555−565(1991))、US2003/224411(請求項1)、WO2003/083041(実施例1)、WO2003/034984(請求項12)、WO2002/88170(請求項2、52−53頁)、WO2003/024392(請求項2、図58)、WO2002/16413(請求項1、94−95、105頁)、WO2002/22808(請求項2、図1)、US5854399(実施例2、17−18欄)、US5792616(図2)、MIM:187395。
(14)CD21(CR2(補体受容体2)またはC3DR(C3d/エプスタイン・バーウイルス受容体)またはHs.73792)
ヌクレオチド
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Fujisaku et al(1989)J.Biol.Chem.264(4):2118−2125)、Weis J.J.,et al J.Exp.Med.167,1047−1066,1988、Moore M.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.84,9194−9198,1987、Barel M.,et al Mol.Immunol.35,1025−1031,1998、Weis J.J.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.83,5639−5643,1986、Sinha S.K.,et al(1993)J.Immunol.150,5311−5320、WO2004/045520(実施例4)、US2004/005538(実施例1)、WO2003/062401(請求項9)、WO2004/045520(実施例4)、WO91/02536(図9.1−9.9)、WO2004/020595(請求項1)、受入番号:P20023、Q13866、Q14212、EMBL、M26004、AAA35786.1。
(15)CD79b(CD79B、CD79β、IGb(免疫グロブリン関連β)、B29)
ヌクレオチド
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相互参照
Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(2003)100(7):4126−4131、Blood(2002)100(9):3068−3076、Muller et al(1992)Eur.J.Immunol.22(6):1621−1625)、WO2004/016225(請求項2、図140)、WO2003/087768、US2004/101874(請求項1、102頁)、WO2003/062401(請求項9)、WO2002/78524(実施例2)、US2002/150573(請求項5、15頁)、US5644033、WO2003/048202(請求項1、306頁および309頁)、WO99/58658、US6534482(請求項13、図17A/B)、WO2000/55351(請求項11、1145−1146頁)、MIM:147245。
(16)FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAP1A(SH2ドメイン含有ホスファターゼアンカータンパク質 5 1a)、SPAP1B、SPAP1C)
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2012年6月30日、12:30AM
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相互参照
AY358130)、Genome Res.13(10):2265−2270(2003),Immunogenetics 54(2):87−95(2002),Blood 99(8):2662−2669(2002),Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.98(17):9772−9777(2001),Xu,M.J.,et al(2001)BioChem.Biophys.Res.Commun.280(3):768−775、WO2004/016225(請求項2)、WO2003/077836、WO2001/38490(請求項5、図18D−1−18D−2)、WO2003/097803(請求項12)、WO2003/089624(請求項25)、MIM:606509。
(17)HER2(ErbB2)
ヌクレオチド
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相互参照
Coussens L.,et al Science(1985)230(4730):1132−1139)、Yamamoto T.,et al Nature 319,230−234,1986、Semba K.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.82,6497−6501,1985、Swiercz J.M.,et al J.Cell Biol.165,869−880,2004、Kuhns J.J.,et al J.Biol.Chem.274,36422−36427,1999、Cho H.−S.,et al Nature 421,756−760,2003、Ehsani A.,et al(1993)Genomics 15,426−429、WO2004/048938(実施例2)、WO2004/027049(図1I)、WO2004/009622、WO2003/081210、WO2003/089904(請求項9)、WO2003/016475(請求項1)、US2003/118592、WO2003/008537(請求項1)、WO2003/055439(請求項29、図1A−B)、WO2003/025228(請求項37、図5C)、WO2002/22636(実施例13、頁/95−107)、WO2002/12341(請求項68、図7)、WO2002/13847(71−74頁)、WO2002/14503(114−117頁)、WO2001/53463(請求項2、41−46頁)、WO2001/41787(15頁)、WO2000/44899(請求項52、図7)、WO2000/20579(請求項3、図2)、US5869445(請求項3、31−38欄)、WO9630514(請求項2、56−61頁)、EP 1439393(請求項7)、WO2004/043361(請求項7)、WO2004/022709、WO2001/00244(実施例3、図4)、受入番号:P04626、EMBL、M11767、AAA35808.1.EMBL、M11761、AAA35808.1
抗体
Abbott:US20110177095
例えば、配列番号3(CDR−H1)、配列番号4(CDR−H2)、配列番号5(CDR−H3)、配列番号104および/または配列番号6(CDR−L1)、配列番号7(CDR−L2)、および配列番号8(CDR−L3)のアミノ酸配列を有するCDRに対して、全体で少なくとも80%の配列相同性を有するCDRを含む抗体、ここで、抗HER2抗体または抗HER2結合断片は、配列番号1のVHおよび配列番号2のVLを有する抗体と比較して免疫原生が低下している。
Biogen:US20100119511
例えば、ATCC受入番号:PTA−10355、PTA−10356、PTA−10357、PTA−10358
例えば、BIIB71F10(配列番号11、13)、BIIB69A09(配列番号15、17);BIIB67F10(配列番号19、21);BIIB67F11(配列番号23、25)、BIIB66A12(配列番号27、29)、BIIB66C01(配列番号31、33)、BIIB65C10(配列番号35、37)、BIIB65H09(配列番号39、41)、およびBIIB65B03(配列番号43、45)からなる群より選択される抗体由来の6つのCDR全てを含むHER2に、またはこれらCDRと同一であるかまたはこれらCDRからの改変が2つ以下であるCDRを含むHER2に結合する精製抗体分子。
ハーセプチン(Genentech)−US6,054,297、ATCC受入番号CRL−10463(Genentech)
ペルツズマブ(Genentech)
US20110117097
例えば、配列番号15および16、配列番号17および18、配列番号23および24およびATCC受入番号HB−12215、HB−12216、CRL10463、HB−12697を参照。
US20090285837
US20090202546
例えば、ATCC受入番号:HB−12215、HB−12216、CRL10463、HB−12698。
US20060088523
−例えば、ATCC受入番号:HB−12215、HB−12216
−例えば、それぞれ配列番号3および4の可変軽アミノ酸配列および可変重アミノ酸配列を含む抗体。
−例えば、配列番号15および23から選択される軽鎖アミノ酸配列、ならびに配列番号16および24から選択される重鎖アミノ酸配列を含む抗体
US20060018899
−例えば、ATCC受入番号:(7C2)HB−12215、(7F3)HB−12216、(4D5)CRL−10463、(2C4)HB−12697。
−例えば、配列番号23のアミノ酸配列を含む抗体、またはその、脱アミドおよび/または酸化変異体。
US2011/0159014
−例えば、配列番号1”の超可変領域を含む軽鎖可変ドメインを有する抗体。
−例えば、配列番号2の超可変領域を含む重鎖可変ドメインを有する抗体。
US20090187007
・Glycotope:TrasGEX抗体http://www.glycotope.com/pipeline
例えば、International Joint Cancer Institute and Changhai Hospital Cancer Cent:HMTI−FcAb −Gao J.,et al BMB Rep.2009 Oct 31;42(10):636−41を参照。
・Symphogen:US20110217305
・Union Stem Cell & Gene Engineering,China −Liu HQ.,et al Xi Bao Yu Fen Zi Mian Yi Xue Za Zhi.2010 May;26(5):456−8。
(18)NCA(CEACAM6)
ヌクレオチド
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ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:48AM
相互参照
Barnett T.,et al Genomics 3,59−66,1988、Tawaragi Y.,et al BioChem.Biophys.Res.Commun.150,89−96,1988、Strausberg R.L.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.99:16899−16903,2002、WO2004/063709、EP 1439393(請求項7)、WO2004/044178(実施例4)、WO2004/031238、WO2003/042661(請求項12)、WO2002/78524(実施例2)、WO2002/86443(請求項27、427頁)、WO2002/60317(請求項2)、受入番号:P40199、Q14920、EMBL、M29541、AAA59915.1.EMBL、M18728。
(19)MDP(DPEP1)
ヌクレオチド
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ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2012年3月6日、01:00PM
相互参照
Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.99(26):16899−16903(2002))、WO2003/016475(請求項1)、WO2002/64798(請求項33、85−87頁)、JP05003790(図6−8)、WO99/46284(図9)、MIM:179780。
(20)IL20R−α(IL20Ra、ZCYTOR7)
ヌクレオチド
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ポリペプチド
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相互参照
Clark H.F.,et al Genome Res.13,2265−2270,2003、Mungall A.J.,et al Nature 425,805−811,2003、Blumberg H.,et al Cell 104,9−19,2001、Dumoutier L.,et al J.Immunol.167,3545−3549,2001、Parrish−Novak J.,et al J.Biol.Chem.277,47517−47523,2002、Pletnev S.,et al(2003)Biochemistry 42:12617−12624、Sheikh F.,et al(2004)J.Immunol.172,2006−2010、EP 1394274(実施例11)、US2004/005320(実施例5)、WO2003/029262(74−75頁)、WO2003/002717(請求項2、63頁)、WO2002/22153(45−47頁)、US2002/042366(20−21頁)、WO2001/46261(57−59頁)、WO2001/46232(63−65頁)、WO98/37193(請求項1、55−59頁)、受入番号:Q9UHF4、Q6UWA9、Q96SH8、EMBL、AF184971、AAF01320.1。
(21)ブレビカン(BCAN、BEHAB)
ヌクレオチド
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ポリペプチド
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Genbankバージョン番号AAG23135.1 GI:10798903
Genbankレコード更新日:2010年3月11日、12:58AM
相互参照
Gary S.C.,et al Gene 256,139−147,2000、Clark H.F.,et al Genome Res.13,2265−2270,2003、Strausberg R.L.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.99,16899−16903,2002、US2003/186372(請求項11)、US2003/186373(請求項11)、US2003/119131(請求項1、図52)、US2003/119122(請求項1、図52)、US2003/119126(請求項1)、US2003/119121(請求項1、図52)、US2003/119129(請求項1)、US2003/119130(請求項1)、US2003/119128(請求項1、図52)、US2003/119125(請求項1)、WO2003/016475(請求項1)、WO2002/02634(請求項1)。
(22)EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2012年9月8日、 04:43PM
相互参照
Chan,J.and Watt,V.M.,Oncogene 6(6),1057−1061(1991),Oncogene 10(5):897−905(1995),Annu.Rev.Neurosci.21:309−345(1998),Int.Rev.Cytol.196:177−244(2000))、WO2003042661(請求項12)、WO200053216(請求項1、41頁)、WO2004065576(請求項1)、WO2004020583(請求項9)、WO2003004529(128−132頁)、WO200053216(請求項1、42頁)、MIM:600997。
(23)ASLG659(B7h)
ヌクレオチド
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相互参照
US2004/0101899(請求項2)、WO2003104399(請求項11)、WO2004000221(図3)、US2003/165504(請求項1)、US2003/124140(実施例2)、US2003/065143(図60)、WO2002/102235(請求項13、299頁)、US2003/091580(実施例2)、WO2002/10187(請求項6、図10)、WO2001/94641(請求項12、図7b)、WO2002/02624(請求項13、図1A−1B)、US2002/034749(請求項54、45−46頁)、WO2002/06317(実施例2、320−321頁、請求項34、321−322頁)、WO2002/71928(468−469頁)、WO2002/02587(実施例1、図1)、WO2001/40269(実施例3、190−192頁)、WO2000/36107(実施例2、205−207頁)、WO2004/053079(請求項12)、WO2003/004989(請求項1)、WO2002/71928(233−234頁、452−453頁)、WO01/16318。
(24)PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AJ297436
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ポリペプチド
Genbank受入番号CAB97347
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Genbankレコード更新日:2011年2月1日、11:25AM
相互参照
Reiter R.E.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.95,1735−1740,1998、Gu Z.,et al Oncogene 19,1288−1296,2000、BioChem.Biophys.Res.Commun.(2000)275(3):783−788、WO2004/022709、EP 1394274(実施例11)、US2004/018553(請求項17)、WO2003/008537(請求項1)、WO2002/81646(請求項1、164頁)、WO2003/003906(請求項10、288頁)、WO2001/40309(実施例1、図17)、US2001/055751(実施例1、図1b)、WO2000/32752(請求項18、図1)、WO98/51805(請求項17、97頁)、WO98/51824(請求項10、94頁)、WO98/40403(請求項2、図1B)、受入番号:O43653、EMBL、AF043498、AAC39607.1。
(25)GEDA
ヌクレオチド
Genbank受入番号AY260763
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相互参照
AP14954脂肪腫HMGIC融合パートナー様(partnerlike)タンパク質/pid=AAP14954.1−ホモ・サピエンス(ヒト)、WO2003/054152(請求項20)、WO2003/000842(請求項1)、WO2003/023013(実施例3、請求項20)、US2003/194704(請求項45)、GI:30102449。
(26)BAFF−R(B細胞活性化因子受容体、BLyS受容体3、BR3)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AF116456
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ポリペプチド
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相互参照
BAFF受容体/pid=NP_443177.1−ホモ・サピエンス:Thompson,J.S.,et al Science 293(5537),2108−2111(2001)、WO2004/058309、WO2004/011611、WO2003/045422(実施例、32−33頁)、WO2003/014294(請求項35、図6B)、WO2003/035846(請求項70、615−616頁)、WO2002/94852(136−137欄)、WO2002/38766(請求項3、133頁)、WO2002/24909(実施例3、図3)、MIM:606269、NP_443177.1、NM_052945_1、AF132600。
(27)CD22(B細胞受容体CD22−Bアイソフォーム、BL−CAM、Lyb−8、Lyb8、SIGLEC−2、FLJ22814)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AK026467
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ポリペプチド
Genbank受入番号BAB15489
Genbankバージョン番号BAB15489.1 GI:10439338
Genbankレコード更新日:2006年9月11日、11:24PM
相互参照
Wilson et al(1991)J.Exp.Med.173:137−146、WO2003/072036(請求項1、図1)、IM:107266、NP_001762.1、NM_001771_1。
(27a)CD22(CD22分子)
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:09AM
ポリペプチド
Genbank受入番号CAA36988
Genbankバージョン番号CAA36988.1 GI:29779
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:09AM
相互参照
Stamenkovic I.et al.,Nature 345(6270),74−77(1990)
他の情報
公式記号:CD22
他の略称:SIGLEC−2、SIGLEC2
他の名称:B細胞受容体CD22、Bリンパ球細胞接着分子、BL−CAM、CD22抗原、T細胞表面抗原Leu−14、シアル酸結合Ig様レクチン2、シアル酸結合Ig様レクチン2
抗体
・G5/44(イノツズマブ):DiJoseph JF.,et al Cancer Immunol Immunother.2005 Jan、54(1):11−24。
・エプラツズマブ −Goldenberg DM.,et al Expert Rev Anticancer Ther.6(10):1341−53,2006。
(28)CD79a(CD79A、CD79α)、免疫グロブリン関連α、B細胞特異的タンパク質(Igβ(CD79B)と共有結合で相互作用し、表面でIgM分子と複合体を形成し、B細胞分化に関与するシグナルを伝達する)、pI:4.84、MW:25028、TM:2[P]、遺伝子染色体:19q13.2)。
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_001783
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ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2012年6月26日、01:48PM
相互参照
WO2003/088808、US2003/0228319、WO2003/062401(請求項9)、US2002/150573(請求項4、13−14頁)、WO99/58658(請求項13、図16)、WO92/07574(図1)、US5644033、Ha et al(1992)J.Immunol.148(5):1526−1531、Muller et al(1992)Eur .J.Immunol.22:1621−1625、Hashimoto et al(1994)Immunogenetics 40(4):287−295、Preud’homme et al(1992)Clin.Exp.Immunol.90(1):141−146、Yu et al(1992)J.Immunol.148(2)633−637、Sakaguchi et al(1988)EMBO J.7(11):3457−3464。
(29)CXCR5(バーキットリンパ腫受容体1、CXCL13ケモカインにより活性化されるGタンパク質共役受容体、このGタンパク質共役受容体は、リンパ球遊走および体液性防御において機能し、HIV−2感染、ならびに恐らくはAIDS、リンパ腫、骨髄腫、および白血病の発症において役割を果たす)。372aa、pl:8.54、MW:41959、TM:7[P]、遺伝子染色体:11q23.3、
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_001716
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Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:49PM
相互参照
WO2004/040000、WO2004/015426、US2003/105292(実施例2)、US6555339(実施例2)、WO2002/61087(図1)、WO2001/57188(請求項20、269頁)、WO2001/72830(12−13頁)、WO2000/22129(実施例1、152−153頁、実施例2、254−256頁)、WO99/28468(請求項1、38頁)、US5440021(実施例2、49−52欄)、WO94/28931(56−58頁)、WO92/17497(請求項7、図5)、Dobner et al(1992)Eur.J.Immunol.22:2795−2799、Barella et al(1995)BioChem.J.309:773−779。
(30)HLA−DOB(ペプチドに結合して、そのペプチドをCD4+Tリンパ球に提供するMHCクラスII分子のβサブユニット(Ia抗原))、273aa、pI:6.56、MW:30820、TM:1[P]、遺伝子染色体:6p21.3)
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2012年9月8日、 04:46PM
ポリペプチド
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Genbankバージョン番号NP_002111.1 GI:4504403
Genbankレコード更新日:2012年9月8日、 04:46PM
相互参照
Tonnelle et al(1985)EMBO J.4(11):2839−2847、Jonsson et al(1989)Immunogenetics 29(6):411−413、Beck et al(1992)J.Mol.Biol.228:433−441、Strausberg et al(2002)Proc.Natl.Acad.Sci USA 99:16899−16903、Servenius et al(1987)J.Biol.Chem.262:8759−8766、Beck et al(1996)J.Mol.Biol.255:1−13、Naruse et al(2002)Tissue Antigens 59:512−519、WO99/58658(請求項13、図15)、US6153408(35−38欄)、US5976551(168−170欄)、US6011146(145−146欄)、Kasahara et al(1989)Immunogenetics 30(1):66−68、Larhammar et al(1985)J.Biol.Chem.260(26):14111−14119
(31)P2X5(プリン作動性受容体P2Xリガンド開口型イオンチャンネル5、細胞外ATPにより開口するイオンチャンネルであり、このチャンネルは、シナプス伝達および神経新生に関与している可能性があり、この不全が突発性排尿筋不安定という病態生理の一因である可能性がある)、422aa)、pI:7.63、MW:47206、TM:1[P]、遺伝子染色体:17p13.3)。
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2012年6月27日、12:41AM
ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2012年6月27日、12:41AM
相互参照
Le et al(1997)FEBS Lett.418(1−2):195−199、WO2004/047749、WO2003/072035(請求項10)、Touchman et al(2000)Genome Res.10:165−173、WO2002/22660(請求項20)、WO2003/093444(請求項1)、WO2003/087768(請求項1)、WO2003/029277(82頁)
(32)CD72(B細胞分化抗原CD72、Lyb−2);359aa、pI:8.66、MW:40225、TM:15[P]、遺伝子染色体:9p13.3)。
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2012年6月26日、01:43PM
ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2012年6月26日、01:43PM
相互参照
WO2004042346(請求項65)、WO2003/026493(51−52頁、57−58頁)、WO2000/75655(105−106頁)、Von Hoegen et al(1990)J.Immunol.144(12):4870−4877、Strausberg et al(2002)Proc.Natl.Acad .Sci USA 99:16899−16903。
(33)LY64(リンパ球抗原64(RP105)、ロイシンに富む反復配列(LRR)ファミリーのI型膜タンパク質であり、B細胞活性化およびアポトーシスを制御し、この機能喪失は、全身性エリトマトーデスの患者で疾患活性の上昇を伴う)。661aa、pI:6.20、MW:74147、TM:1[P]、遺伝子染色体:5q12)。
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2012年9月2日、01:50PM
ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2012年9月2日、01:50PM
相互参照
US2002/193567、WO97/07198(請求項11、39−42頁)、Miura et al(1996)Genomics 38(3):299−304、Miura et al(1998)Blood 92:2815−2822、WO2003/083047、WO97/44452(請求項8、57−61頁)、WO2000/12130(24−26頁)。
(34)FcRH1(Fc受容体様タンパク質1、免疫グロブリンFcドメインの推定受容体であり、C2型Ig様ドメインおよびITAMドメインを含有し、Bリンパ球分化において役割を果たす可能性がある);429aa、pI:5.28、MW:46925 TM:1[P]、遺伝子染色体:1q21−1q22)
ヌクレオチド
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Genbankレコード更新日:2012年9月2日、01:43PM
ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2012年9月2日、01:43PM
相互参照
WO2003/077836、WO2001/38490(請求項6、図18E−1〜18−E−2)、Davis et al(2001)Proc.Natl.Acad.Sci USA 98(17):9772−9777、WO2003/089624(請求項8)、EP 1347046(請求項1)、WO2003/089624(請求項7)。
(35)IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2、B細胞発達およびリンパ腫形成で役割を担っている可能性がある推定免疫受容体である。転位置による遺伝子の調節解除が、ある種のB細胞悪性腫瘍で生じる)。977aa、pI:6.88、MW:106468、TM:1[P]遺伝子染色体:1q21)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AF343662
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Genbankレコード更新日:2010年3月11日、01:16AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAK31325
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Genbankレコード更新日:2010年3月11日、01:16AM
相互参照
AF343663、AF343664、AF343665、AF369794、AF397453、AK090423、AK090475、AL834187、AY358085、マウス:AK089756、AY158090、AY506558、NP_112571.1、WO2003/024392(請求項2、図97)、Nakayama et al(2000)BioChem.Biophys.Res.Commun.277(1):124−127、WO2003/077836、WO2001/38490(請求項3、図18B−1〜18B−2)。
(36)TENB2(TMEFF2、トモレギュリン(tomoregulin)、TPEF、HPP1、TR、推定膜貫通プロテオグリカン、増殖因子およびフォリスタチンのEGF/ヘレグリンファミリーと関連)。374aa)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AF179274
Genbankバージョン番号AF179274.2 GI:12280939
Genbankレコード更新日:2010年3月11日、01:05AM
ポリペプチド
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Genbankレコード更新日:2010年3月11日、01:05AM
相互参照
NCBI Accession:AAD55776、AAF91397、AAG49451、NCBI RefSeq:NP_057276、NCBI Gene:23671、OMIM:605734、SwissProt Q9UIK5、AY358907、CAF85723、CQ782436、WO2004/074320、JP 2004113151、WO2003/042661、WO2003/009814、EP 1295944(69−70頁)、WO2002/30268(329頁)、WO2001/90304、US2004/249130、US2004/022727、WO2004/063355、US2004/197325、US2003/232350、US2004/005563、US2003/124579、Horie et al(2000)Genomics 67:146−152、Uchida et al(1999)BioChem.Biophys.Res.Commun.266:593−602、Liang et al(2000)Cancer Res.60:4907−12、Glynne−Jones et al(2001)Int J Cancer.Oct 15、94(2):178−84。
(37)PSMA−FOLH1(葉酸ヒドロラーゼ(前立腺特異的膜抗原)1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M99487
Genbankバージョン番号M99487.1 GI:190663
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:48AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA60209
Genbankバージョン番号AAA60209.1 GI:190664
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:48AM
相互参照
Israeli R.S.,et al Cancer Res.53(2),227−230(1993)
他の情報
公式記号:FOLH1
他の略称:GIG27、FGCP、FOLH、GCP2、GCPII、NAALAD1、NAALAdase、PSM、PSMA、mGCP
他の名称:N−アセチル化α結合酸性ジペプチダーゼ1、N−アセチル化α結合酸性ジペプチダーゼI、NAALADアーゼI、細胞増殖阻害遺伝子27タンパク質、ホリルポリ−γ−グルタミン酸カルボキシペプチダーゼ、グルタミン酸カルボキシラーゼII、グルタミン酸カルボキシペプチダーゼ2、グルタミン酸カルボキシペプチダーゼII、膜グルタミン酸カルボキシペプチダーゼ、前立腺特異的膜抗原バリアントF、プテロイルポリ−γ−グルタミン酸カルボキシペプチダーゼ
抗体
US7,666,425:
以下のATCC参照を有するハイブリドーマにより産生される抗体:ATCC受入番号HB−12101、ATCC受入番号HB−12109、ATCC受入番号HB−12127、およびATCC受入番号HB−12126。
Proscan:8H12、3E11、17G1、29B4、30C1、および20F2からなる群より選択されるモノクローナル抗体(US7,811,564、Moffett S.,et al Hybridoma(Larchmt).2007 Dec;26(6):363−72)。
Cytogen:モノクローナル抗体7E11−C5(ATCC受入番号HB10494)および9H10−A4(ATCC受入番号HB11430)−US5,763,202
GlycoMimetics:NUH2−ATCC受入番号HB9762(US7,135,301)
Human Genome Science:HPRAJ70−ATCC受入番号97131(US6,824,993)、アメリカ培養細胞系統保存機関(「ATCC」)寄託番号97131で寄託されているcDNAクローン(HPRAJ70)によりコードされるアミノ酸配列
Medarex:フコシル残基が欠けている抗PSMA抗体−US7,875,278
マウス抗PSMA抗体として、3F5.4G6、3D7.1.1、4E10−1.14、3E11、4D8、3E6、3C9、2C7、1G3、3C4、3C6、4D4、1G9、5C8B9、3G6、4C8B9、およびモノクローナル抗体が挙げられる。3F5.4G6、3D7.1.1、4E10−1.14、3E11、4D8、3E6、3C9、2C7、1G3、3C4、3C6、4D4、1G9、5C8B9、3G6、または4C8B9を分泌するハイブリドーマが、公的に寄託されており、US6,159,508に記載されている。関連するハイブリドーマが、公的に寄託されており、US6,107,090に記載されている。その上、J591をヒト化したものをはじめとするヒト化抗PSMA抗体が、PCT公報のWO 02/098897でさらに詳細に記載されている。
他のマウス抗ヒトPSMA抗体も当該分野で記載されており、例えば、mAb107−1A4(Wang,S.et al.(2001)Int.J.Cancer 92:871−876)およびmAb 2C9(Kato,K.et al.(2003)Int.J.Urol.10:439−444)などがある。
ヒト抗PSMAモノクローナル抗体の例として、4A3抗体、7F12抗体、8C12抗体、8A11抗体、16F9抗体、2A10抗体、2C6抗体、2F5抗体、および1C3抗体が挙げられ、これらの抗体は、PCT公報のWO01/09192およびWO 03/064606およびU.S.Provisional Application Ser.No.60/654,125、表題「Human Monoclonal Antibodies to Prostate Specific Membrane Antigen(PSMA)」、2005年2月18日出願に最初に記載されたとおりに単離および構造特性決定されている。4A3、7F12、8C12、8A11、16F9、2A10、2C6、2F5、および1C3のVHアミノ酸配列を、それぞれ配列番号1〜9に示す。4A3、7F12、8C12、8A11、16F9、2A10、2C6、2F5、および1C3のVLアミノ酸配列を、それぞれ配列番号10〜18に示す。
他のヒト抗PSMA抗体として、PCT公報のWO 03/034903およびUS2004/0033229に記載の抗体が挙げられる。
NW Biotherapeutics:3F5.4G6(ATCC受入番号HB12060)、3D7−1.I.(ATCC受入番号HB12309)、4E10−1.14(ATCC受入番号HB12310)、3E11(ATCC HB12488)、4D8(ATCC HB12487)、3E6(ATCC HB12486)、3C9(ATCC HB12484)、2C7(ATCC HB12490)、1G3(ATCC HB12489)、3C4(ATCC HB12494)、3C6(ATCC HB12491)、4D4(ATCC HB12493)、1G9(ATCC HB12495)、5C8B9(ATCC HB12492)、および3G6(ATCC HB12485)からなる群より選択されるハイブリドーマ細胞株−US 6,150,508を参照
PSMA Development Company/Progenics/Cytogen−Seattle Genetics:mAb3.9(ATCC受入番号PTA−3258という番号で寄託されているハイブリドーマにより産生される)またはmAb10.3(ATCC受入番号PTA−3347という番号で寄託されているハイブリドーマにより産生される)−US 7,850,971
PSMA Development Company−PSMA抗体の組成物(US 20080286284、表1)
この出願は、US10/395,894、2003年3月21日出願、(US7,850,971)の分割出願である
University Hospital Freiburg、Germany−mAb3/A12、mAb3/E7、およびmAb3/F11(Wolf P.,et al Prostate.2010 Apr 1;70(5):562−9)。
(38)SST(ソマトスタチン受容体;注、5つのサブタイプが存在する)
(38.1)SSTR2(ソマトスタチン受容体2)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_001050
Genbankバージョン番号NM_001050.2 GI:44890054
Genbankレコード更新日:2012年8月19日、01:37PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_001041
Genbankバージョン番号NP_001041.1 GI:4557859
Genbankレコード更新日:2012年8月19日、01:37PM
相互参照
Yamada Y.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.89(1),251−255(1992)、Susini C.,et al Ann Oncol.2006 Dec、17(12):1733−42
他の情報
公式記号:SSTR2
他の名称:SRIF−1、SS2R、ソマトスタチン受容体2型
(38.2)SSTR5(ソマトスタチン受容体5)
ヌクレオチド
Genbank受入番号D16827
Genbankバージョン番号D16827.1 GI:487683
Genbankレコード更新日:2006年8月1日、12:45PM
ポリペプチド
Genbank受入番号BAA04107
Genbankバージョン番号BAA04107.1 GI:487684
Genbankレコード更新日:2006年8月1日、12:45PM
相互参照
Yamada,Y.,et al BioChem.Biophys.Res.Commun.195(2),844−852(1993)
他の情報
公式記号:SSTR5
他の略称:SS−5−R
他の名称:ソマトスタチン受容体サブタイプ5、ソマトスタチン受容体5型
(38.3)SSTR1
(38.4)SSTR3
(38.5)SSTR4
AvB6−両方のサブユニット(39+40)
(39)ITGAV(インテグリン、αV)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M14648 J02826 M18365
Genbankバージョン番号M14648.1 GI:340306
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:56AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA36808
Genbankバージョン番号AAA36808.1 GI:340307
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:56AM
相互参照
Suzuki S.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.83(22),8614−8618(1986)
他の情報
公式記号:ITGAV
他の略称:CD51、MSK8、VNRA、VTNR
他の名称:モノクローナル抗体L230により同定される抗原、インテグリンα−V、インテグリンαVβ3、インテグリン、αV(ビトロネクチン受容体、αポリペプチド、抗原CD51)、ビトロネクチン受容体サブユニットα
(40)ITGB6(インテグリン、β6)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_000888
Genbankバージョン番号NM_000888.3 GI:9966771
Genbankレコード更新日:2012年6月27日、12:46AM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_000879
Genbankバージョン番号NP_000879.2 GI:9625002
Genbankレコード更新日:2012年6月27日、12:46AM
相互参照
Sheppard D.J.,et al Biol.Chem.265(20),11502−11507(1990)
他の情報
公式記号:ITGB6
他の名称:インテグリンβ−6
抗体
Biogen:US7,943,742−ハイブリドーマクローン6.3G9および6.8G6が、それぞれ、ATCC受入番号ATCC PTA−3649および−3645で寄託された。
Biogen:US7,465,449−いくつかの実施形態において、この抗体は、ハイブリドーマ6.1A8、6.3G9、6.8G6、6.2B1、6.2B10、6.2A1、6.2E5、7.1G10、7.7G5、または7.1C5により産生される抗体と同じ重鎖および軽鎖ポリペプチド配列を含む。
Centocor(J&J):US7,550,142;US7,163,681
例えば、US7,550,142の、配列番号7および配列番号8に示すアミノ酸配列を含むヒト重鎖およびヒト軽鎖可変領域を有する抗体。
Seattle Genetics:15H3(Ryan MC.,et al Cancer Res April 15,2012;72(8 Supplement):4630)
(41)CEACAM5(癌胎児抗原関連細胞接着分子5)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M17303
Genbankバージョン番号M17303.1 GI:178676
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAB59513
Genbankバージョン番号AAB59513.1 GI:178677
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47AM
相互参照
Beauchemin N.,et al Mol.Cell.Biol.7(9),3221−3230(1987)
他の情報
公式記号:CEACAM5
他の略称:CD66e、CEA
他の名称:胎便抗原100
抗体
AstraZeneca−MedImmune:US20100330103;US20080057063;
US20020142359
−例えば、以下の配列を持つ相補性決定領域(CDR)を有する抗体:重鎖CDR1−DNYMH、CDR2−WIDPENGDTEYAPKFRG、CDR3−LIYAGYLAMD Y、および軽鎖CDR1−SASSSVTYMH、CDR2−STSNLAS、CDR3−QQRSTYPLT。
−欧州培養細胞保存機関(ECACC)寄託番号96022936で寄託されているハイブリドーマ806.077。
・Research Corporation Technologies,Inc.:US5,047,507
・Bayer Corporation:US6,013,772
・BioAlliance:US7,982,017;US7,674,605
・US7,674,605
−配列番号1のアミノ酸配列に由来する重鎖可変領域配列、および配列番号2のアミノ酸配列に由来する軽鎖可変領域配列を含む抗体。
−配列番号5のアミノ酸配列に由来する重鎖可変領域配列、および配列番号6のアミノ酸配列に由来する軽鎖可変領域配列を含む抗体。
・Celltech Therapeutics Limited:US5,877,293
・The Dow Chemical Company:US5,472,693、US6,417,337、US6,333,405
US5,472,693−例えば、ATCC番号CRL−11215
US6,417,337−例えば、ATCC CRL−12208
US6,333,405−例えば、ATCC CRL−12208
・Immunomedics,Inc:US7,534,431;US7,230,084、US7,300,644、US6,730,300、
US20110189085
−軽鎖可変領域のCDRを有する抗体は、以下を含む:CDR1はKASQDVGTSVA(配列番号20)を含み、CDR2はWTSTRHT(配列番号21)を含み、およびCDR3はQQYSLYRS(配列番号22)を含む。およびこの抗CEA抗体の重鎖可変領域のCDRは、以下を含む:CDR1はTYWMS(配列番号23)を含み、CDR2はEIHPDSSTINYAPSLKD(配列番号24)を含み、およびCDR3はLYFGFPWFAY(配列番号25)を含む。
US20100221175、US20090092598、US20070202044、US20110064653、US20090185974;US20080069775。
(42)MET(met癌原遺伝子;肝細胞増殖因子受容体)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M35073
Genbankバージョン番号M35073.1 GI:187553
Genbankレコード更新日:2012年3月6日、11:12AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA59589
Genbankバージョン番号AAA59589.1 GI:553531
Genbankレコード更新日:2012年3月6日、11:12AM
相互参照
Dean M.,et al Nature 318(6044),385−388(1985)
他の情報
公式記号:MET
他の略称:AUTS9、HGFR、RCCP2、c−Met
他の名称:HGF受容体、HGF/SF受容体、SF受容体、肝細胞増殖因子受容体、met癌原遺伝子チロシンキナーゼ、癌原遺伝子c−Met、散乱因子受容体、チロシン−タンパク質キナーゼMet
抗体
・Abgenix/Pfizer:US20100040629
例えば、アメリカ培養細胞系統保存機関(ATCC)受入番号PTA−5026を有するハイブリドーマ13.3.2により産生される抗体、ATCC受入番号PTA−5027を有するハイブリドーマ9.1.2により産生される抗体、ATCC受入番号PTA−5028を有するハイブリドーマ8.70.2により産生される抗体、またはATCC受入番号PTA−5029を有するハイブリドーマ6.90.3により産生される抗体。
・Amgen/Pfizer:US20050054019
例えば、配列番号2の配列中、X2がグルタミン酸であり、およびX4がセリンであるアミノ酸配列を有する重鎖、ならびに配列番号4の配列中、X8がアラニンであるアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、シグナル配列を含まない、抗体;配列番号6に記載のアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号8に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、シグナル配列を含まない、抗体;配列番号10に記載のアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号12に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、シグナル配列を含まない、抗体;または、配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号16に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、シグナル配列を含まない、抗体。
・Agouron Pharmaceuticals(現Pfizer):US20060035907
・Eli Lilly:US20100129369
・Genentech:US5,686,292、US20100028337、US20100016241、US20070129301、US20070098707、US20070092520、US20060270594、US20060134104、US20060035278、US20050233960、US20050037431
US5,686,292−例えば、ATCC HB−11894およびATCC HB−11895
US20100016241−例えば、ATCC HB−11894(ハイブリドーマ1A3.3.13)またはHB−11895(ハイブリドーマ5D5.11.6)
・National Defense Medical Center、Taiwan:Lu RM.,et al Biomaterials.2011 Apr;32(12):3265−74。
・Novartis:US20090175860
−例えば、重鎖4687のCDR1、CDR2、およびCDR3の配列(重鎖4687のCDR1、CDR2、およびCDR3の配列は、それぞれ、配列番号58の26〜35番、50〜65番、および98〜102番残基である)、ならびに軽鎖5097のCDR1、CDR2、およびCDR3の配列(軽鎖5097のCDR1、CDR2、およびCDR3の配列は、配列番号37の24〜39番、55〜61番、および94〜100番残基である)を含む抗体。
・Pharmacia Corporation:US20040166544
・Pierre Fabre:US20110239316、US20110097262、US20100115639
・Sumsung:US20110129481−例えば、受入番号KCLRF−BP−00219または受入番号KCLRF−BP−00223を有するハイブリドーマ細胞から産生されるモノクローナル抗体。
・Samsung:US20110104176−例えば、受入番号:KCLRF−BP−00220を有するハイブリドーマ細胞から産生される抗体。
・トリノ大学医学部:DN−30 Pacchiana G.,et al J Biol Chem.2010 Nov 12;285(46):36149−57
・Van Andel Research Institute:Jiao Y.,et al Mol Biotechnol.2005 Sep;31(1):41−54。
(43)MUC1(ムチン1、細胞表面関連)
ヌクレオチド
Genbank受入番号J05581
Genbankバージョン番号J05581.1 GI:188869
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:48AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA59876
Genbankバージョン番号AAA59876.1 GI:188870
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:48AM
相互参照
Gendler S.J.,et al J.Biol.Chem.265(25),15286−15293(1990)
他の情報
公式記号:MUC1
他の略称:RP11−263K19.2、CD227、EMA、H23AG、KL−6、MAM6、MUC−1、MUC−1/SEC、MUC−1/X、MUC1/ZD、PEM、PEMT、PUM
他の名称:DF3抗原、H23抗原、肺癌関連抗原DF3、癌関連ムチン、エピシアリン、krebs von den Lungen−6;ムチン1(膜貫通)、ムチン−1;ピーナッツ反応性尿ムチン、多型上皮ムチン、腫瘍関連上皮ムチン、腫瘍関連上皮膜抗原、腫瘍関連ムチン
抗体
・AltaRex−Quest Pharma Tech:US6,716,966−例えば、ATCC番号PTA−975のハイブリドーマにより産生されるAlt−1抗体。
・AltaRex−Quest Pharma Tech:US7,147,850
・CRT:5E5 −Sorensen AL.,et al Glycobiology vol.16 no.2 pp.96−107,2006、HMFG2 −Burchell J.,et al Cancer Res.,47,5476−5482(1987)、WO2015/159076を参照。
・Glycotope GT−MAB:GT−MAB2.5−GEX(Webサイト:http://www.glycotope.com/pipeline/pankomab−gex)
・Immunogen:US7,202,346
-例えば、抗体MJ−170:ハイブリドーマ細胞株MJ−170 ATCC受入番号PTA−5286、モノクローナル抗体MJ−171:ハイブリドーマ細胞株MJ−171 ATCC受入番号PTA−5287、モノクローナル抗体MJ−172:ハイブリドーマ細胞株MJ−172 ATCC受入番号PTA−5288、またはモノクローナル抗体MJ−173:ハイブリドーマ細胞株MJ−173 ATCC受入番号PTA−5302
・Immunomedics:US6,653,104
・Ramot Tel Aviv Uni:US7,897,351
・リージェンツ大学(CA):US7,183,388、US20040005647、US20030077676。
・Roche GlycArt:US8,021,856
・ロシア国立癌研究センター:Imuteran −Ivanov PK.,et al Biotechnol J.2007 Jul;2(7):863−70
・ブラウンシュバイク技術大学:(IIB6、HT186−B7、HT186−D11、HT186−G2、HT200−3A−C1、HT220−M−D1、HT220−M−G8)−Thie H.,et al PLoS One.2011 Jan 14;6(1):e15921
(44)CA9(炭酸脱水酵素IX)
ヌクレオチド
Genbank受入番号X66839
Genbankバージョン番号X66839.1 GI:1000701
Genbankレコード更新日:2月2日,2011年、10:15AM
ポリペプチド
Genbank受入番号CAA47315
Genbankバージョン番号CAA47315.1 GI:1000702
Genbankレコード更新日:2月2日,2011年、10:15AM
相互参照
Pastorek J.,et al Oncogene 9(10),2877−2888(1994)
他の情報
公式記号:CA9
他の略称:CAIX、MN
他の名称:CA−IX、P54/58N、RCC関連抗原G250、RCC関連タンパク質G250、炭酸デヒドラターゼIX、炭酸脱水酵素9、カルボニックデヒドラターゼ、膜抗原MN、pMW1、腎細胞癌関連抗原G250
抗体
・Abgenix/Amgen:US20040018198
・Affibody:抗CAIX Affibody分子
(http://www.affibody.com/en/Product−Portfolio/Pipeline/)
・Bayer:US7,462,696
・Bayer/Morphosys:3ee9 mAb−Petrul HM.,et al Mol Cancer Ther.2012 Feb;11(2):340−9
・ハーバード大学医学大学院:抗体G10、G36、G37、G39、G45、G57、G106、G119、G6、G27、G40、およびG125。Xu C.,et al PLoS One.2010 Mar 10;5(3):e9625
・スロバキア科学アカデミーウイルス学研究所(Bayer)−US5,955,075
-例えば、M75(ATCC受入番号HB11128)またはMN12(ATCC受入番号HB11647)
・スロバキア科学アカデミーウイルス学研究所:US7,816,493
-例えば、ハイブリドーマVU−M75から分泌されるM75モノクローナル抗体(ハイブリドーマVU−M75は、アメリカ培養細胞系統保存機関にATCC番号HB11128で寄託された);ハイブリドーマV/10−VUから分泌されるV/10モノクローナル抗体(ハイブリドーマV/10−VUは、ベルギー微生物保存機関(BCCM)の国際寄託当局に、受入番号LMBP 6009CBで寄託され、ゲント大学(ゲント、ベルギー)にある分子生物学研究所プラスミドコレクション(Laboratorium voor Moleculaire Bioloqie−Plasmidencollectie)(LMBP)に加えられた)。
・スロバキア科学アカデミーウイルス学研究所:US20080177046、US20080176310、US20080176258、US20050031623
・Novartis:US20090252738
・Wilex:US7,691,375−例えば、ハイブリドーマ細胞株DSM ASC 2526により産生される抗体。
・Wilex:US20110123537;Rencarex:Kennett RH.,et al Curr Opin Mol Ther.2003 Feb;5(1):70−5
・Xencor:US20090162382
(45)EGFRvIII(上皮増殖因子受容体(EGFR)、転写物変異型3)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_201283
Genbankバージョン番号NM_201283.1 GI:41327733
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:47PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_958440
Genbankバージョン番号NP_958440.1 GI:41327734
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:47PM
相互参照
Batra SK.,et al Cell Growth Differ 1995;6:1251−1259。
抗体:
・US7,628,986およびUS7,736,644(Amgen)
−例えば、配列番号142および変異型からなる群より選択される重鎖可変領域アミノ酸配列&配列番号144および変異型からなる群より選択される軽鎖可変領域アミノ酸配列。
・US20100111979(Amgen)
例えば、以下を含む重鎖アミノ酸配列を含む抗体:
抗体13.1.2(配列番号138)、131(配列番号2)、170(配列番号4)、150(配列番号5)、095(配列番号7)、250(配列番号9)、139(配列番号10)、211(配列番号12)、124(配列番号13)、318(配列番号15)、342(配列番号16)、および333(配列番号17)のCDR1領域についてのアミノ酸配列からなる群より選択される配列からなるCDR1、
抗体13.1.2(配列番号138)、131(配列番号2)、170(配列番号4)、150(配列番号5)、095(配列番号7)、250(配列番号9)、139(配列番号10)、211(配列番号12)、124(配列番号13)、318(配列番号15)、342(配列番号16)、および333(配列番号17)のCDR2領域についてのアミノ酸配列からなる群より選択される配列からなるCDR2、ならびに
抗体13.1.2(配列番号138)、131(配列番号2)、170(配列番号4)、150(配列番号5)、095(配列番号7)、250(配列番号9)、139(配列番号10)、211(配列番号12)、124(配列番号13)、318(配列番号15)、342(配列番号16)、および333(配列番号17)のCDR3領域についてのアミノ酸配列からなる群より選択される配列からなるCDR3。
・US20090240038(Amgen)
例えば、以下からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%相同であるアミノ酸配列を含む少なくとも1本の重鎖または軽鎖ポリペプチドを有する抗体:配列番号2、配列番号19、配列番号142、配列番号144、およびそれらの任意の組み合わせ。
・US20090175887(Amgen)
例えば、抗体13.1.2(配列番号138)、131(配列番号2)、170(配列番号4)、150(配列番号5)、095(配列番号7)、250(配列番号9)、139(配列番号10)、211(配列番号12)、124(配列番号13)、318(配列番号15)、342(配列番号16)、および333(配列番号17)の重鎖アミノ酸配列からなる群より選択される重鎖アミノ酸配列を有する抗体。
・US20090156790(Amgen)
例えば、重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドを有する抗体であって、重鎖ポリペプチドまたは軽鎖ポリペプチドの少なくとも1本は、以下からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%相同であるアミノ酸配列を含む:配列番号2、配列番号19、配列番号142、配列番号144、およびそれらの任意の組み合わせ。
・US20090155282、US20050059087、およびUS20050053608(Amgen)
例えば、抗体13.1.2(配列番号138)、131(配列番号2)、170(配列番号4)、150(配列番号5)、095(配列番号7)、250(配列番号9)、139(配列番号10)、211(配列番号12)、124(配列番号13)、318(配列番号15)、342(配列番号16)、および333(配列番号17)の重鎖アミノ酸配列からなる群より選択される抗体重鎖アミノ酸配列。
・MR1−1(US7,129,332;Duke)
例えば、配列番号18の配列を有し、CDR3VHにS98P−T99Y、およびCDR3VLにF92Wの置換がある、変異型抗体。
・L8A4、H10、Y10(Wikstrand CJ.,et al Cancer Res.1995 Jul 15、55(14):3140−8;Duke)
・US20090311803(ハーバード大学)
例えば、抗体重鎖可変領域について配列番号9、および軽鎖可変領域アミノ酸配列について配列番号3
・US20070274991(EMD72000、マツズマブとしても知られる、ハーバード大学)
例えば、軽鎖および重鎖について、それぞれ、配列番号3および9
・US6,129,915(Schering)
例えば、配列番号1、2、3、4、5、および6。
・mAb CH12 −Wang H.,et al FASEB J.2012 Jan、26(1):73−80(上海市腫瘤研究所)。
・RAbDMvIII −Gupta P.,et al BMC Biotechnol.2010 Oct 7、10:72(スタンフォード大学医療センター)。
・mAb Ua30 −Ohman L.,et al Tumour Biol.2002 Mar−Apr、23(2):61−9(ウプサラ大学)。
・Han DG.,et al Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao.2010 Jan、30(1):25−9(西安交通大学)。
(46)CD33(CD33分子)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M_23197
Genbankバージョン番号NM_23197.1 GI:180097
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA51948
Genbankバージョン番号AAA51948.1 GI:188098
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47AM
相互参照
Simmons D.,et al J.Immunol.141(8),2797−2800(1988)
他の情報
公式記号:CD33
他の略称:SIGLEC−3、SIGLEC3、p67
他の名称:CD33抗原(gp67)、gp67、骨髄細胞表面抗原CD33、シアル酸結合Ig様レクチン3、シアル酸結合Ig様レクチン
抗体
・H195(リンツズマブ)−Raza A.,et al Leuk Lymphoma.2009 Aug;50(8):1336−44、US6,759,045(Seattle Genetics/Immunomedics)
・mAb OKT9:Sutherland,D.R.et al.Proc Natl Acad Sci USA 78(7):4515−4519(1981),Schneider,C.,et al J Biol Chem 257,8516−8522(1982)
mAb E6:Hoogenboom,H.R.,et al J Immunol 144,3211−3217(1990)
・US6,590,088(Human Genome Sciences)
例えば、配列番号1および配列番号2ならびにATCC受入番号97521
・US7,557,189(Immunogen)
例えば、配列番号1〜3のアミノ酸配列を有する3つのCDRを含む重鎖可変領域ならびに配列番号4〜6のアミノ酸配列を有する3つのCDRを含む軽鎖可変領域を含む、抗体またはその断片。
(47)CD19(CD19分子)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_001178098
Genbankバージョン番号NM_001178098.1 GI:296010920
Genbankレコード更新日:2012年9月10日、12:43AM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_001171569
Genbankバージョン番号NP_001171569.1 GI:296010921
Genbankレコード更新日:2012年9月10日、12:43AM
相互参照
Tedder TF.,et al J.Immunol.143(2):712−7(1989)
他の情報
公式記号:CD19
他の略称:B4、CVID3
他の名称:Bリンパ球抗原CD19、Bリンパ球表面抗原B4、T細胞表面抗原Leu−12、分化抗原CD19:
抗体
・Immunogen:HuB4 −Al−Katib AM.,et al Clin Cancer Res.2009 Jun 15;15(12):4038−45。
・4G7:Kugler M.,et al Protein Eng Des Sel.2009 Mar;22(3):135−47
例えば、Knappik,A.et al.J Mol Biol 2000 Feb;296(1):57−86の図3に記載の配列
・AstraZeneca/MedImmune:MEDI−551−Herbst R.,et al J Pharmacol Exp Ther.2010 Oct;335(1):213−22
・Glenmark Pharmaceuticals:GBR−401−Hou S.,et al Mol Cancer Ther November 2011 10(Meeting Abstract Supplement)C164
・US7,109,304(Immunomedics)
例えば、hA19Vk(配列番号7)の配列およびhA19VH(配列番号10)の配列を含む抗体
・US7,902,338(Immunomedics)
例えば、配列番号16(KASQSVDYDGDSYLN)のCDR1、配列番号17(DASNLVS)のCDR2、および配列番号18(QQSTEDPWT)のCDR3という軽鎖相補性決定領域CDR配列、ならびに配列番号19(SYWMN)のCDR1、配列番号20(QIWPGDGDTNYNGKFKG)のCDR2、および配列番号21(RETTTVGRYYYAMDY)のCDR3という重鎖CDR配列を含むとともに、ヒト抗体フレームワーク(FR)および定常部配列を含み、1つ以上のフレームワーク領域アミノ酸残基は親マウス抗体の相当するフレームワーク領域配列で置換されており、この置換されるFR残基は、重鎖可変領域のKabat残基91でのフェニルアラニンに対するセリン置換を含む、抗体または抗原結合断片。
・Medarex:MDX−1342 −CardarelliPM.,et al Cancer Immunol Immunother.2010 Feb;59(2):257−65。
・MorphoSys/Xencor:MOR−208/XmAb−5574 −Zalevsky J.,et al Blood.2009 Apr 16;113(16):3735−43
・US7,968,687(Seattle Genetics)
配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号24のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、抗体または抗原結合断片。
・4G7 chim −Lang P.,et al Blood.2004 May 15;103(10):3982−5(テュービンゲン大学)
例えば、US20120082664の図6および配列番号80
・浙江大学医学院:2E8−Zhang J.,et al J Drug Target.2010 Nov;18(9):675−8
(48)IL2RA(インターロイキン2受容体、α)、NCBI参照配列:NM_000417.2)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_000417
Genbankバージョン番号NM_000417.2 GI:269973860
Genbankレコード更新日:2012年9月9日、04:59PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_000408
Genbankバージョン番号NP_000408.1 GI:4557667
Genbankレコード更新日:2012年9月9日、04:59PM
相互参照
Kuziel W.A.,et al J.Invest.Dermatol.94(6 SUPPL)、27S−32S(1990)
他の情報
公式記号:IL2RA
他の略称:RP11−536K7.1、CD25、IDDM10、IL2R、TCGFR
他の名称:FIL−2受容体サブユニットα、IL−2−RA、IL−2Rサブユニットα、IL2−RA、TAC抗原、インターロイキン−2受容体サブユニットα、p55
抗体
・US6,383,487(Novartis/UCL:バキシリシマブ(Baxilisimab)[シムレクト])
・US6,521,230(Novartis/UCL:バキシリシマブ(Baxilisimab)[シムレクト])
例えば、抗原結合部位を有する抗体であって、この抗体は、配列番号7中のアミノ酸配列を有するCDR1、配列番号8中のアミノ酸配列を有するCDR2、および配列番号9中のアミノ酸配列を有するCDR3を含む少なくとも1つのドメインを含む、または全体で1つの配列としてこれらのCDR1、CDR2、およびCDR3は、全体で1つの配列として配列番号7、8、および9と少なくとも90%相同であるアミノ酸配列を含む。
・ダクリズマブ−Rech AJ.,et al Ann N Y Acad Sci.2009 Sep;1174:99−106(Roche)
(49)AXL(AXL受容体チロシンキナーゼ)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M76125
Genbankバージョン番号M76125.1 GI:292869
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:53AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA61243
Genbankバージョン番号AAA61243.1 GI:29870
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:53AM
相互参照
O’Bryan J.P.,et al Mol.Cell.Biol.11(10),5016−5031(1991);Bergsagel P.L.,et al J.Immunol.148(2),590−596(1992)
他の情報
公式記号:AXL
他の略称:JTK11、UFO
他の名称:AXL癌遺伝子、AXLトランスフォーミング配列/遺伝子;癌遺伝子AXL;チロシン−タンパク質キナーゼ受容体UFO
抗体
・YW327.6S2 −Ye X.,et al Oncogene.2010 Sep 23;29(38):5254−64。(Genentech)
・BergenBio:BGB324(http://www.bergenbio.com/BGB324)
(50)CD30−TNFRSF8(腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー8)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M83554
Genbankバージョン番号M83554.1 GI:180095
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:53AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA51947
Genbankバージョン番号AAA51947.1 GI:180096
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:53AM
相互参照
Durkop H.,et al Cell 68(3),421−427(1992)
他の情報
公式記号:TNFRSF8
他の略称:CD30、D1S166E、Ki−1
他の名称:CD30L受容体、Ki−1抗原;サイトカイン受容体CD30、リンパ球活性化抗原CD30、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー8
(51)BCMA(B細胞成熟抗原)−TNFRSF17(腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー17)
ヌクレオチド
Genbank受入番号Z29574
Genbankバージョン番号Z29574.1 GI:471244
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:40AM
ポリペプチド
Genbank受入番号CAA82690
Genbankバージョン番号CAA82690.1 GI:471245
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:40AM
相互参照
Laabi Y.,et al Nucleic Acids Res.22(7),1147−1154(1994)
他の情報
公式記号:TNFRSF17
他の略称:BCM、BCMA、CD269
他の名称:B細胞成熟抗原;B細胞成熟因子;B細胞成熟タンパク質;腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー17
(52)CT Ags−CTA(癌精巣抗原)
相互参照
Fratta E.,et al.Mol Oncol.2011 Apr;5(2):164−82、Lim SH.,at al Am J Blood Res.2012;2(1):29−35。
(53)CD174(ルイス式Y)−FUT3(フコシルトランスフェラーゼ3(ガラクトシド3(4)−L−フコシルトランスフェラーゼ、ルイス式血液型群)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM000149
Genbankバージョン番号NM000149.3 GI:148277008
Genbankレコード更新日:2012年6月26日、04:49PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_000140
Genbankバージョン番号NP_000140.1 GI:4503809
Genbankレコード更新日:2012年6月26日、04:49PM
相互参照
Kukowska−Latallo,J.F.,et al Genes Dev.4(8),1288−1303(1990)
他の情報
公式記号:FUT3
他の略称:CD174、FT3B、FucT−III、LE、Les
他の名称:ルイスFT、α−(1,3/1,4)−フコシルトランスフェラーゼ、ルイス式血液型α−4−フコシルトランスフェラーゼ、フコシルトランスフェラーゼIII;ガラクトシド3(4)−L−フコシルトランスフェラーゼ
(54)CLEC14A(C型レクチンドメインファミリー14、メンバーA、Genbank受入番号NM175060)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM175060
Genbankバージョン番号NM175060.2 GI:371123930
Genbankレコード更新日:2012年4月1日、03:34PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_778230
Genbankバージョン番号NP_778230.1 GI:28269707
Genbankレコード更新日:2012年4月1日、03:34PM
他の情報
公式記号:CLEC14A
他の略称:UNQ236/PRO269、C14orf27、CEG1、EGFR−5
他の名称:C型レクチンドメインファミリー14、メンバーA、ClECTおよびEGF様ドメイン含有タンパク質、上皮増殖因子受容体5
(55)GRP78−HSPA5(熱ショック70kDaタンパク質5(グルコース制御タンパク質、78kDa)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM005347
Genbankバージョン番号NM005347.4 GI:305855105
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:42PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_005338
Genbankバージョン番号NP_005338.1 GI:16507237
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:42PM
相互参照
Ting J.,et al DNA 7(4),275−286(1988)
他の情報
公式記号:HSPA5
他の略称:BIP、GRP78、MIF2
他の名称:78kDaグルコース制御タンパク質、小胞体内腔Ca(2+)結合タンパク質grp78、免疫グロブリン重鎖結合タンパク質
(56)CD70(CD70分子)L08096
ヌクレオチド
Genbank受入番号L08096
Genbankバージョン番号L08096.1 GI:307127
Genbankレコード更新日:2012年6月23日、08:54AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA36175
Genbankバージョン番号AAA36175.1 GI:307128
Genbankレコード更新日:2012年6月23日、08:54AM
相互参照
Goodwin R.G.,et al Cell 73(3),447−456(1993)
他の情報
公式記号:CD70
他の略称:CD27L、CD27LG、TNFSF7
他の名称:CD27リガンド、CD27−L;CD70抗原、Ki−24抗原、表面抗原CD70、腫瘍壊死因子(リガンド)スーパーファミリー、メンバー7、腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリーメンバー7
抗体
・CD70に対するMDX−1411(Medarex)
・h1F6(Oflazoglu,E.,et al,Clin Cancer Res.2008 Oct 1;14(19):6171−80;Seattle Genetics)
例えば、US20060083736の配列番号1、2、11、および12、ならびに図1を参照。
(57)幹細胞特異的抗原。例えば、以下:
・5T4(以下のエントリー(63)を参照)
・CD25(上記エントリー(48)を参照)
・CD32
○ポリペプチド
■Genbank受入番号ABK42161
■Genbankバージョン番号ABK42161.1 GI:117616286
■Genbankレコード更新日:2007年7月25日、03:00PM
■LGR5/GPR49
○ヌクレオチド
■Genbank受入番号NM_003667
■Genbankバージョン番号NM_003667.2 GI:24475886
■Genbankレコード更新日:2007年7月22日、03:38PM
○ポリペプチド
■Genbank受入番号NP_003658
■Genbankバージョン番号NP_003658.1 GI:4504379
■Genbankレコード更新日:2007年7月22日、03:38PM
■プロミニン(Prominin)/CD133
○ヌクレオチド
■Genbank受入番号NM_006017
■Genbankバージョン番号NM_006017.2 GI:224994187
■Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:47PM
○ポリペプチド
■Genbank受入番号NP_006008
■Genbankバージョン番号NP_006008.1 GI:5174387
■・Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:47PM
(58)ASG−5
相互参照
(Smith L.M.,et.al AACR 2010 Annual Meeting(abstract #2590);Gudas J.M.,et.al.AACR 2010 Annual Meeting(abstract #4393)
抗体
・抗AGS−5抗体:M6.131(Smith,L.M.,et.al AACR 2010 Annual Meeting(abstract #2590)
(59)ENPP3(エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ3)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AF005632
Genbankバージョン番号AF005632.2 GI:4432589
Genbankレコード更新日:2010年3月10日、09:41PM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAC51813
Genbankバージョン番号AAC51813.1 GI:2465540
Genbankレコード更新日:2010年3月10日、09:41PM
相互参照
Jin−Hua P.,et al Genomics 45(2),412−415(1997)
他の情報
公式記号:ENPP3
他の略称:RP5−988G15.3、B10、CD203c、NPP3、PD−IBETA、PDNP3
他の名称:E−NPP3、dJ1005H11.3(ホスホジエステラーゼI/ヌクレオチドピロホスファターゼ3)、dJ914N13.3(ホスホジエステラーゼI/ヌクレオチドピロホスファターゼ3)、エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼファミリーメンバー3、gp130RB13−6、ホスホジエステラーゼIβ、ホスホジエステラーゼI/ヌクレオチドピロホスファターゼ3、ホスホジエステラーゼ−Iβ
(60)PRR4(プロリンリッチ4(涙腺))
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_007244
Genbankバージョン番号NM_007244.2 GI:154448885
Genbankレコード更新日:2012年6月28日、12:39PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_009175
Genbankバージョン番号NP_009175.2 GI:154448886
Genbankレコード更新日:2012年6月28日、12:39PM
相互参照
Dickinson D.P.,et al Invest.Ophthalmol.Vis.Sci.36(10),2020−2031(1995)
他の情報
公式記号:PRR4
他の略称:LPRP、PROL4
他の名称:涙腺プロリンリッチタンパク質、鼻咽頭癌関連プロリンリッチタンパク質4、プロリンリッチポリペプチド4、プロリンリッチタンパク質4
(61)GCC−GUCY2C(グアニル酸シクラーゼ2C(熱安定性エンテロトキシン受容体)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_004963
Genbankバージョン番号NM_004963.3 GI:222080082
Genbankレコード更新日:2012年、9月2日、01:50PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_004954
Genbankバージョン番号NP_004954.2 GI:222080083
Genbankレコード更新日:2012年、9月2日、01:50PM
相互参照
De Sauvage F.J.,et al J.Biol.Chem.266(27),17912−17918(1991)、Singh S.,et al BioChem.Biophys.Res.Commun.179(3),1455−1463(1991)
他の情報
公式記号:GUCY2C
他の略称:DIAR6、GUC2C、MUCIL、STAR
他の名称:GC−C、STA受容体、グアニリルシクラーゼC、hSTAR、熱安定性エンテロトキシン受容体、腸管グアニル酸シクラーゼ(intestinal guanylate cyclase)
(62)Liv−1−SLC39A6(溶質担体ファミリー39(亜鉛輸送体)、メンバー6)
ヌクレオチド
Genbank受入番号U41060
Genbankバージョン番号U41060.2 GI:12711792
Genbankレコード更新日:Nov 30,2009 04:35PM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA96258
Genbankバージョン番号AAA96258.2 GI:12711793
Genbankレコード更新日:Nov 30,2009 04:35PM
相互参照
Taylor KM.,et al Biochim Biophys Acta.2003 Apr 1;1611(1−2):16−30
他の情報
公式記号:SLC39A6
他の略称:LIV−1
他の名称:LIV−1タンパク質、エストロゲン制御型、ZIP−6、エストロゲン制御タンパク質LIV−1、溶質輸送体ファミリー39(金属イオン輸送体)、メンバー6、溶質輸送体ファミリー39メンバー6、亜鉛輸送体ZIP6、zrt−およびIrt−様タンパク質6
(63)5T4、トロホブラスト糖タンパク質、TPBG−TPBG(トロホブラスト糖タンパク質)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AJ012159
Genbankバージョン番号AJ012159.1 GI:3805946
Genbankレコード更新日:2011年2月1日、10:27AM
ポリペプチド
Genbank受入番号CAA09930
Genbankバージョン番号CAA09930.1 GI:3805947
Genbankレコード更新日:2011年2月1日、10:27AM
相互参照
King K.W.,et al Biochim.Biophys.Acta 1445(3),257−270(1999)
他の情報
・公式記号:TPBG
・他の略称:5T4、5T4AG、M6P1
・他の名称:5T4癌胎児性抗原、5T4癌胎児性トロホブラスト糖タンパク質、5T4癌トロホブラスト(oncotrophoblast)糖タンパク質
・WO2015/155345を参照。
(64)CD56−NCMA1(神経細胞接着分子1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_000615
Genbankバージョン番号NM_000615.6 GI:336285433
Genbankレコード更新日:2012年9月23日、02:32PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_000606
Genbankバージョン番号NP_000606.3 GI:94420689
Genbankレコード更新日:2012年9月23日、02:32PM
相互参照
Dickson,G.,et al,Cell 50(7),1119−1130(1987)
他の情報
公式記号:NCAM1
他の略称:CD56、MSK39、NCAM
他の名称:モノクローナル抗体5.1H11により認識される抗原、神経細胞接着分子、NCAM
抗体
Immunogen:HuN901(Smith SV.,et al Curr Opin Mol Ther.2005 Aug;7(4):394−401)
例えば、マウスN901抗体をヒト化したものを参照。Roguska,M.A.,et al.Proc Natl Acad Sci USA Feb 1994;91:969−973の図1bおよび図1eを参照。
(65)CanAg(腫瘍関連抗原CA242)
相互参照
Haglund C.,et al Br J Cancer 60:845−851,1989;Baeckstrom D.,et al J Biol Chem 266:21537−21547,1991
抗体
huC242(Tolcher AW et al.,J Clin Oncol.2003 Jan 15;21(2):211−22、Immunogen)
例えば、US20080138898A1の配列番号1および2を参照
(66)FOLR1(葉酸受容体1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号J05013
Genbankバージョン番号J05013.1 GI:182417
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA35823
Genbankバージョン番号AAA35823.1 GI:182418
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47AM
相互参照
Elwood P.C.,et al J.Biol.Chem.264(25)、14893−14901(1989)
他の情報
公式記号:FOLR1
他の略称:FBP、FOLR
他の名称:FR−α、KB細胞FBP、成人葉酸結合タンパク質、葉酸結合タンパク質、葉酸受容体α、葉酸受容体、成人型、卵巣腫瘍関連抗原MOv18
抗体
M9346A−Whiteman KR.,et al Cancer Res April 15,2012;72(8 Supplement):4628(Immunogen)
(67)GPNMB(糖タンパク質(膜貫通型)nmb)
ヌクレオチド
Genbank受入番号X76534
Genbankバージョン番号X76534.1 GI:666042
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:10AM
ポリペプチド
Genbank受入番号CAA54044
Genbankバージョン番号CAA54044.1 GI:666043
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:10AM
相互参照
Weterman M.A.,et al Int.J.Cancer 60(1),73−81(1995)
他の情報
公式記号:GPNMB
他の略称:UNQ1725/PRO9925、HGFIN、NMB
他の名称:糖タンパク質NMB、糖タンパク質nmb様タンパク質、オステオアクチビン、膜貫通糖タンパク質HGFIN、膜貫通糖タンパク質NMB
抗体
Celldex Therapeutics:CR011(Tse KF.,et al Clin Cancer Res.2006 Feb 15;12(4):1373−82)
例えば、EP 1827492の配列番号22、24、26、31、33、および35を参照
(68)TIM−1−HAVCR1(A型肝炎ウイルス細胞受容体1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AF043724
Genbankバージョン番号AF043724.1 GI:2827453
Genbankレコード更新日:2010年3月10日、06:24PM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAC39862
Genbankバージョン番号AAC39862.1 GI:2827454
Genbankレコード更新日:2010年3月10日、06:24PM
相互参照
Feigelstock D.,et al J.Virol.72(8),6621−6628(1998)
他の情報
公式記号:HAVCR1
他の略称:HAVCR、HAVCR−1、KIM−1、KIM1、TIM、TIM−1、TIM1、TIMD−1、TIMD1
他の名称:T細胞免疫グロブリンドメインおよびムチンドメインタンパク質1、T細胞膜タンパク質1、腎臓損傷分子1
(69)RG−1/前立腺腫瘍標的ミンディン−ミンディン/RG−1
相互参照
Parry R.,et al Cancer Res.2005 Sep 15;65(18):8397−405
(70)B7−H4−VTCN1(V−setドメイン含有T細胞活性化インヒビター1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号BX648021
Genbankバージョン番号BX648021.1 GI:34367180
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、08:40AM
相互参照
Sica GL.,et al Immunity.2003 Jun;18(6):849−61
他の情報
公式記号:VTCN1
他の略称:RP11−229A19.4、B7−H4、B7H4、B7S1、B7X、B7h.5、PRO1291、VCTN1
他の名称:B7ファミリーメンバー、H4、B7スーパーファミリーメンバー1、T細胞同時刺激分子B7x、T細胞同時刺激分子B7x、V−setドメイン含有T細胞活性化インヒビター1、免疫同時刺激タンパク質B7−H4
(71)PTK7(PTK7タンパク質チロシンキナーゼ7)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AF447176
Genbankバージョン番号AF447176.1 GI:17432420
Genbankレコード更新日:2008年11月28日、01:51PM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAL39062
Genbankバージョン番号AAL39062.1 GI:17432421
Genbankレコード更新日:2008年11月28日、01:51PM
相互参照
Park S.K.,et al J.BioChem.119(2),235−239(1996)
他の情報
公式記号:PTK7
他の略称:CCK−4、CCK4
他の名称:結腸癌キナーゼ4、不活性チロシン−タンパク質キナーゼ7、偽チロシンキナーゼ受容体(pseudo tyrosine kinase receptor)7、チロシン−タンパク質キナーゼ様7
(72)CD37(CD37分子)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_001040031
Genbankバージョン番号NM_001040031.1 GI:91807109
Genbankレコード更新日:2012年7月29日、02:08PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_001035120
Genbankバージョン番号NP_001035120.1 GI:91807110
Genbankレコード更新日:2012年7月29日、02:08PM
相互参照
Schwartz−Albiez R.,et al J.Immunol.140(3),905−914(1988)
他の情報
公式記号:CD37
他の略称:GP52−40、TSPAN26
他の名称:CD37抗原、細胞分化抗原37、白血球抗原CD37、白血球表面抗原CD37、テトラスパニン−26、tspan−26
抗体
Boehringer Ingelheim:mAb 37.1(Heider KH.,et al Blood.2011 Oct 13;118(15):4159−68)
Trubion:CD37−SMIP(G28−1 scFv−Ig)((Zhao X.,et al Blood.2007;110:2569−2577)
例えば、US20110171208A1の配列番号253を参照
Immunogen:K7153A(Deckert J.,et al Cancer Res April 15,2012;72(8 Supplement):4625)
(73)CD138−SDC1(シンデカン1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AJ551176
Genbankバージョン番号AJ551176.1 GI:29243141
Genbankレコード更新日:2011年2月1日、12:09PM
ポリペプチド
Genbank受入番号CAD80245
Genbankバージョン番号CAD80245.1 GI:29243142
Genbankレコード更新日:2011年2月1日、12:09PM
相互参照
O’Connell FP.,et al AM J Clin Pathol.2004 Feb;121(2):254−63
他の情報
公式記号:SDC1
他の略称:CD138、SDC、SYND1、シンデカン
他の名称:CD138抗原、ヘパラン硫酸プロテオグリカン線維芽細胞増殖因子受容体、シンデカンプロテオグリカン1、シンデカン−1
抗体
Biotest:キメラ化MAb(nBT062)−(Jagannath S.,et al Poster ASH#3060,2010;WIPO特許出願WO/2010/128087)
例えば、US20090232810の配列番号1および2を参照
Immunogen:B−B4(Tassone P.,et al Blood 104_3688−3696)
例えば、US20090175863A1の配列番号1および2を参照
(74)CD74(CD74分子、主要組織適合遺伝子複合体、クラスIIインバリアント鎖)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_004355
Genbankバージョン番号NM_004355.1 GI:343403784
Genbankレコード更新日:2012年9月23日、02:30PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_004346
Genbankバージョン番号NP_004346.1 GI:10835071
Genbankレコード更新日:2012年9月23日、02:30PM
相互参照
Kudo,J.,et al Nucleic Acids Res.13(24),8827−8841(1985)
他の情報
公式記号:CD74
他の略称:DHLAG、HLADG、II、Ia−GAMMA
他の名称:CD74抗原(主要組織適合遺伝子複合体の不変ポリペプチド、クラスII抗原関連)、HLAクラスII組織適合性抗原γ鎖、HLA−DR抗原関連インバリアント鎖、HLA−DR−γ、Ia−関連インバリアント鎖、MHC HLA−DRγ鎖、クラスII抗原のγ鎖、p33
抗体
Immunomedics:hLL1(ミラツズマブ)−Berkova Z.,et al Expert Opin Investig Drugs.2010 Jan;19(1):141−9)
例えば、US20040115193の配列番号19、20、21、22、23、および24を参照
Genmab:HuMax−CD74(ウェブサイトを参照)
(75)クローディン−CL(クローディン)
相互参照
Offner S.,et al Cancer Immunol Immunother.2005 May;54(5):431−45,Suzuki H.,et al Ann N Y Acad Sci.2012 Jul;1258:65−70)
ヒトでは、このファミリーの中の24のメンバーが記載されている−文献中の参照を参照。
(76)EGFR(上皮増殖因子受容体)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_005228
Genbankバージョン番号NM_005228.3 GI:41927737
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:47PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_005219
Genbankバージョン番号NP_005219.2 GI:29725609
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:47PM
相互参照
Dhomen NS.,et al Crit Rev Oncog.2012;17(1):31−50
他の情報
公式記号:EGFR
他の略称:ERBB、ERBB1、HER1、PIG61、mENA
他の名称:トリ赤芽球性白血病ウイルス性(v−erb−b)癌遺伝子ホモログ、細胞増殖抑制タンパク質40、細胞増殖誘導タンパク質61、癌原遺伝子c−ErbB−1、受容体チロシン−タンパク質キナーゼerbB−1
抗体
BMS:セツキシマブ(アービタックス)−Broadbridge VT.,et al Expert Rev Anticancer Ther.2012 May;12(5):555−65。
例えば、US6217866、ATTC寄託番号9764を参照。
Amgen:パニツムマブ(ベクティビックス)−Argiles G.,et al Future Oncol.2012 Apr;8(4):373−89
例えば、US6235883の配列番号23〜38を参照。
Genmab:ザルツムマブ −Rivera F.,et al Expert Opin Biol Ther.2009 May;9(5):667−74。
YM Biosciences:ニモツズマブ(Nimotuzumab)−Ramakrishnan MS.,et al MAbs.2009 Jan−Feb;1(1):41−8。
例えば、US5891996の配列番号27〜34を参照。
(77)Her3(ErbB3)−ERBB3(v−erb−b2赤芽球性白血病ウイルス性癌遺伝子ホモログ3(トリ))
ヌクレオチド
Genbank受入番号M34309
Genbankバージョン番号M34309.1 GI:183990
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47PM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA35979
Genbankバージョン番号AAA35979.1 GI:306841
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:47PM
相互参照
Plowman,G.D.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.87(13),4905−4909(1990)
他の情報
公式記号:ERBB3
他の略称:ErbB−3、HER3、LCCS2、MDA−BF−1、c−erbB−3、c−erbB3、erbB3−S、p180−ErbB3、p45−sErbB3、p85−sErbB3
他の名称:癌原遺伝子様タンパク質c−ErbB−3、受容体チロシン−タンパク質キナーゼerbB−3、チロシンキナーゼ型細胞表面受容体HER3
抗体
Merimack Pharma:MM−121(Schoeberl B.,et al Cancer Res.2010 Mar 15;70(6):2485−2494)
例えば、US2011028129の配列番号1、2、3、4、5、6、7、および8を参照。
(78)RON−MST1R(マクロファージ刺激1受容体(c−met関連チロシンキナーゼ))
ヌクレオチド
Genbank受入番号X70040
Genbankバージョン番号X70040.1 GI:36109
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:17PM
ポリペプチド
Genbank受入番号CCA49634
Genbankバージョン番号CCA49634.1 GI:36110
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:17PM
相互参照
Ronsin C.,et al Oncogene 8(5),1195−1202(1993)
他の情報
公式記号:MST1R
他の略称:CD136、CDw136、PTK8、RON
他の名称:MSP受容体、MST1R変異型RON30、MST1R変異型RON62、PTK8タンパク質チロシンキナーゼ8、RON変異型E2E3、c−met関連チロシンキナーゼ、マクロファージ刺激タンパク質受容体、p185−Ron、可溶性RON変異型1、可溶性RON変異型2、可溶性RON変異型3、可溶性RON変異型4
(79)EPHA2(EPH受容体A2)
ヌクレオチド
Genbank受入番号BC037166
Genbankバージョン番号BC037166.2 GI:33879863
Genbankレコード更新日:2012年3月6日、01:59PM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAH37166
Genbankバージョン番号AAH37166.1 GI:22713539
Genbankレコード更新日:2012年3月6日、01:59PM
相互参照
Strausberg R.L.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.99(26),16899−16903(2002)
他の情報
公式記号:EPHA2
他の略称:ARCC2、CTPA、CTPP1、ECK
他の名称:エフリンA型受容体2、上皮細胞受容体タンパク質チロシンキナーゼ、可溶性EPHA2変異型1、チロシン−タンパク質キナーゼ受容体ECK
抗体
Medimmune:1C1(Lee JW.,et al Clin Cancer Res.2010 May 1;16(9):2562−2570)
例えば、US20090304721A1の図7および図8を参照。
(80)CD20−MS4A1(膜貫通の4つのドメイン(membrane−spanning 4−domains)、サブファミリーA、メンバー1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M27394
Genbankバージョン番号M27394.1 GI:179307
Genbankレコード更新日:2009年11月30日、11:16AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA35581
Genbankバージョン番号AAA35581.1 GI:179308
Genbankレコード更新日:2009年11月30日、11:16AM
相互参照
Tedder T.F.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85(1),208−212(1988)
他の情報
公式記号:MS4A1
他の略称:B1、Bp35、CD20、CVID5、LEU−16、MS4A2、S7
他の名称:Bリンパ球抗原CD20、Bリンパ球細胞表面抗原B1、CD20抗原、CD20受容体、白血球表面抗原Leu−16
抗体
Genentech/Roche:リツキシマブ−Abdulla NE.,et al BioDrugs.2012 Apr 1;26(2):71−82。
例えば、US5736137、ATCC寄託番号HB−69119を参照。
GSK/Genmab:オファツムマブ−Nightingale G.,et al Ann Pharmacother.2011 Oct;45(10):1248−55。
例えば、US20090169550A1の配列番号2、4、および5を参照。
Immunomedics:ベルツズマブ−Goldenberg DM.,et al Leuk Lymphoma.2010 May;51(5):747−55。
例えば、US7919273B2の配列番号1、2、3、4、5、および6を参照。
(81)テネイシンC−TNC(テネイシンC)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_002160
Genbankバージョン番号NM_002160.3 GI:340745336
Genbankレコード更新日:2012年9月23日、02:33PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_002151
Genbankバージョン番号NP_002151.2 GI:153946395
Genbankレコード更新日:2012年9月23日、02:33PM
相互参照
Nies D.E.,et al J.Biol.Chem.266(5),2818−2823(1991)、Siri A.,et al Nucleic Acids Res.19(3),525−531(1991)
他の情報
公式記号:TNC
他の略称:150−225、GMEM、GP、HXB、JI、TN、TN−C
他の名称:GP150−225、サイトタクチン、神経膠腫関連細胞外基質抗原、ヘキサブラキオン(テネイシン)、筋腱間抗原、ニューロネクチン(neuronectin)、テネイシン、テネイシン−Cアイソフォーム14/AD1/16
抗体
Philogen:G11(von Lukowicz T.,et al J Nucl Med.2007 Apr;48(4):582−7)およびF16(Pedretti M.,et al Lung Cancer.2009 Apr;64(1):28−33)
例えば、US7968685の配列番号29、35、45、および47を参照。
(82)FAP(線維芽細胞活性化タンパク質、α)
ヌクレオチド
Genbank受入番号U09278
Genbankバージョン番号U09278.1 GI:1888315
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、09:22AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAB49652
Genbankバージョン番号AAB49652.1 GI:1888316
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、09:22AM
相互参照
Scanlan,M.J.,et al Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.91(12),5657−5661(1994)
他の情報
公式記号:FAP
他の略称:DPPIV、FAPA
他の名称:170kDa黒色腫膜結合ゼラチナーゼ、膜内在性セリンプロテアーゼ、セプラーゼ
(83)DKK−1(Dickkopf1ホモログ(アフリカツメガエル))
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_012242
Genbankバージョン番号NM_012242.2 GI:61676924
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:48PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_036374
Genbankバージョン番号NP_036374.1 GI:7110719
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:48PM
相互参照
Fedi P.et al J.Biol.Chem.274(27),19465−19472(1999)
他の情報
公式記号:DKK1
他の略称:UNQ492/PRO1008、DKK−1、SK
他の名称:dickkopf関連タンパク質−1、dickkopf−1様、dickkopf−様タンパク質1、dickkopf−関連タンパク質1、hDkk−1
抗体
・Novartis:BHQ880(Fulciniti M.,et al Blood.2009 Jul 9;114(2):371−379)
例えば、US20120052070A1の配列番号100および108を参照。
(84)CD52(CD52分子)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_001803
Genbankバージョン番号NM_001803.2 GI:68342029
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:48PM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_001794
Genbankバージョン番号NP_001794.2 GI:68342030
Genbankレコード更新日:2012年9月30日、01:48PM
相互参照
Xia M.Q.,et al Eur.J.Immunol .21(7),1677−1684(1991)
他の情報
公式記号:CD52
他の略称:CDW52
他の名称:CAMPATH−1抗原、CD52抗原(CAMPATH−1抗原)、CDW52抗原(CAMPATH−1抗原)、ケンブリッジ病理学(cambridge pathology)1抗原、精巣上体分泌タンパク質E5、he5;ヒト精巣上体特異的タンパク質5
抗体
アレムツズマブ(Campath)−Skoetz N.,et al Cochrane Database Syst Rev.2012 Feb 15;2:CD008078。
例えば、Drugbank受入番号DB00087(BIOD00109、BTD00109)を参照
(85)CS1−SLAMF7(SLAMファミリーメンバー7)
ヌクレオチド
Genbank受入番号NM_021181
Genbankバージョン番号NM_021181.3 GI:1993571
Genbankレコード更新日:2012年6月29日、11:24AM
ポリペプチド
Genbank受入番号NP_067004
Genbankバージョン番号NP_067004.3 GI:19923572
Genbankレコード更新日:2012年6月29日、11:24AM
相互参照
Boles K.S.,et al Immunogenetics 52(3−4),302−307(2001)
他の情報
公式記号:SLAMF7
他の略称:UNQ576/PRO1138、19A、CD319、CRACC、CS1
他の名称:19A24タンパク質、CD2サブセット1、CD2様受容体活性化細胞傷害性細胞、CD2様受容体活性化細胞傷害性細胞、膜タンパク質FOAP−12、新規LY9(リンパ球抗原9)様タンパク質、タンパク質19A
抗体
BMS:エロツズマブ/HuLuc63(Benson DM.,et al J Clin Oncol.2012 Jun 1;30(16):2013−2015)
例えば、US20110206701の配列番号9、10、11、12、13、14、15、および16を参照。
(86)エンドグリン−ENG(エンドグリン)
ヌクレオチド
Genbank受入番号AF035753
Genbankバージョン番号AF035753.1 GI:3452260
Genbankレコード更新日:2010年3月10日、06:36PM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAC32802
Genbankバージョン番号AAC32802.1 GI:3452261
Genbankレコード更新日:2010年3月10日、06:36PM
相互参照
Rius C.,et al Blood 92(12),4677−4690(1998)
公式記号:ENG
他の情報
他の略称:RP11−228B15.2、CD105、END、HHT1、ORW、ORW1
他の名称:CD105抗原
(87)アネキシンA1−ANXA1(アネキシンA1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号X05908
Genbankバージョン番号X05908.1 GI:34387
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:02AM
ポリペプチド
Genbank受入番号CCA29338
Genbankバージョン番号CCA29338.1 GI:34388
Genbankレコード更新日:2011年2月2日、10:02AM
相互参照
Wallner B.P.,et al Nature 320(6057),77−81(1986)
他の情報
公式記号:ANXA1
他の略称:RP11−71A24.1、ANX1、LPC1
他の名称:アネキシンI(リポコルチンI)、アネキシン−1、カルパクチンII、カルパクチン−2、クロモビンディン(chromobindin)−9、リポコルチンI、p35、ホスホリパーゼA2抑制タンパク質
(88)V−CAM(CD106)−VCAM1(血管細胞接着分子1)
ヌクレオチド
Genbank受入番号M60335
Genbankバージョン番号M60335.1 GI:340193
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:56AM
ポリペプチド
Genbank受入番号AAA61269
Genbankバージョン番号AAA61269.1 GI:340194
Genbankレコード更新日:2010年6月23日、08:56AM
相互参照
Hession C.,et al J.Biol.Chem.266(11),6682−6685(1991)
他の情報
公式記号VCAM1
他の略称:CD106、INCAM−100
他の名称:CD106抗原;血管細胞接着タンパク質1
抗体配列
抗インテグリンαvβ6
RHAB6.2
QVQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGFAFTDSYMHWVRQAPGQGLEWMGWIDPENGDTEYAPKFQGRFVFSLDTSVSTAYLQISSLKAEDTAVYYCTRGTPTAVPNLRGDLQVLAQKVAGPYPFDYWGQGTLVTVSS
RHCB6.2
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFIDSYMHWVRQAPGQRLEWMGWIDPENGDTEYAPKFQGRVTITTDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGTPTAVPNLRGDLQVLAQKVAGPYPFDYWGQGTLVTVSS
RHF
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNFIDSYMHWVRQAPGQRLEWMGWIDPENGDTEYAPKFQGRVTFTTDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCNEGTPTGPYYFDYWGQGTLVTVSS
RHFB6
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNFIDSYMHWVRQAPGQRLEWMGWIDPENGDTEYAPKFQGRVTFTTDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCNEGTPTAVPNLRGDLQVLAQKVAGPYYFDYWGQGTLVTVSS
RHAY100bP
QVQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGFAFTDSYMHWVRQAPGQGLEWMGWIDPENGDTEYAPKFQGRFVFSLDTSVSTAYLQISSLKAEDTAVYYCTRGTPTGPYPFDYWGQGTLVTVSS
RKF
ENVLTQSPGTLSLSPGERATLSCSASSSVSYMHWFQQKPGQAPRLLIYSTSNLASGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
RKFL36L50
ENVLTQSPGTLSLSPGERATLSCSASSSVSYMHWLQQKPGQAPRLLIYLTSNLASGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
RKC
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCSASSSVSYMHWFQQKPGQAPRLLIYSTSNLASGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
抗CD33
CD33 Hum195 VH
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTDYNMHWVRQAPGQGLEWIGYIYPYNGGTGYNQKFKSKATITADESTNTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGRPAMDYWGQGTLVTVSS
CD33 Hum195 VK
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASESVDNYGISFMNWFQQKPGKAPKLLIYAASNQGSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPDDFATYYCQQSKEVPWTFGQGTKVEIK
抗CD19
CD19 B4表面再構成VH
QVQLVQPGAEVVKPGASVKLSCKTSGYTFTSNWMHWVKQRPGQGLEWIGEIDPSDSYTNYNQNFKGKAKLTVDKSTSTAYMEVSSLRSDDTAVYYCARGSNPYYYAMDYWGQGTSVTVSS
CD19 B4表面再構成VK
EIVLTQSPAIMSASPGERVTMTCSASSGVNYMHWYQQKPGTSPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEPEDAATYYCHQRGSYTFGGGTKLEIK
抗Her2
ハーセプチンVH鎖
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS
ハーセプチンVL鎖
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK
抗CD25
シムレクトVK(バシリキシマブとしても既知)
QIVSTQSPAIMSASPGEKVTMTCSASSSRSYMQWYQQKPGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCHQRSSYTFGGGTKLEIK
シムレクトVH
QLQQSGTVLARPGASVKMSCKASGYSFTRYWMHWIKQRPGQGLEWIGAIYPGNSDTSYNQKFEGKAKLTAVTSASTAYMELSSLTHEDSAVYYCSRDYGYYFDFWGQGTTLTVSS
抗PSMA
脱免疫化VH’1
EVQLVQSGPEVKKPGATVKISCKTSGYTFTEYTIHWVKQAPGKGLEWIGNINPNNGGTTYNQKFEDKATLTVDKSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCAAGWNFDYWGQGTLLTVSS
脱免疫化VK’1
DIQMTQSPSSLSTSVGDRVTLTCKASQDVGTAVDWYQQKPGPSPKLLIYWASTRHTGIPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFADYYCQQYNSYPLTFGPGTKVDIK
脱免疫化VH1’5
EVKLVESGGGLVQPGGSMKLSCVASGFTFSNYWMNWVRQAPGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVTISRDDSKSIVYLQMNNLRAEDTGVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
脱免疫化VH2’5
EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCVASGFTFSNYWMNWVRQAPGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVTISRDDSKSIVYLQMNNLRAEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
脱免疫化VH3’5
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCVASGFTFSNYWMNWVRQAPGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVTISRDDSKSIVYLQMNNLRAEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
脱免疫化VH4’5
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCVASGFTFSNYWMNWVRQAPGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRFTISRDDSKSIVYLQMNNLRAEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
脱免疫化VK1’5
NIVMTQFPSSMSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPDQSPKMLIYGASNRFTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSLQTEDLADYYCGQSYTFPYTFGQGTKLEMK
脱免疫化VK2’5
NIVMTQFPSSMSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPDQSPKMLIYGASNRFTGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDLADYYCGQSYTFPYTFGQGTKLEIK
脱免疫化VK3’5
NIQMTQFPSAMSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPDQSPKMLIYGASNRFTGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDLADYYCGQSYTFPYTFGQGTKLEIK
脱免疫化VK4’5
NIQMTQFPSAMSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPDQSPKMLIYGASNRFTGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDEADYYCGQSYTFPYTFGQGTKLEIK
脱免疫化VK DI’5
NIVMTQFPKSMSASAGERMTLTCKASENVGTYVSWYQQKPTQSPKMLIYGASNRFTGVPDRFSGSGSGTDFILTISSVQAEDLVDYYCGQSYTFPYTFGGGTKLEMK
脱免疫化VH DI’5
EVKLEESGGGLVQPGGSMKISCVASGFTFSNYWMNWVRQSPEKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVIISRDDSKSSVYLQMNSLRAEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RHA’5
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSNYWMNWVRQASGKGLEWVGEIRSQSNNFATHYAESVKGRFTISRDDSKNTAYLQMNSLKTEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RHB’5
EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSNYWMNWVRQASGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVIISRDDSKNTVYLQMNSLRTEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RHC’5
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSNYWMNWVRQASGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVIISRDDSKNTVYLQMNSLRTEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RHD’5
EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSNYWMNWVRQASGKGLEWVGEIRSQSNNFATHYAESVKGRVIISRDDSKNTVYLQMNSLRTEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RHE’5
EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSNYWMNWVRQASGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRFTISRDDSKNTVYLQMNSLRTEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RHF’5
EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSNYWMNWVRQASGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVIISRDDSKNTAYLQMNSLRTEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RHG’5
EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSNYWMNWVRQASGKGLEWVAEIRSQSNNFATHYAESVKGRVIISRDDSKNTAYLQMNSLRTEDTAVYYCTRRWNNFWGQGTTVTVSS
ヒト化RKA’5
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPGTAPKLLIYGASNRFTGVPSRFSGSGSATDFTLTINNLQPEDFATYYCGQSYTFPYTFGQGTKVEIK
ヒト化RKB’5
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPGTAPKLLIYGASNRFTGVPSRFSGSGSATDFTLTINNLQPEDFATYYCGQSYTFPYTFGQGTKVEIK
ヒト化RKC’5
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPGTAPKMLIYGASNRFTGVPSRFSGSGSATDFTLTINNLQPEDFATYYCGQSYTFPYTFGQGTKVEIK
ヒト化RKD’5
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPGTAPKMLIYGASNRFTGVPSRFSGSGSATDFTLTINNLQPEDFATYYCGQSYTFPYTFGQGTKVEIK
ヒト化RKE’5
NIVMTQSPSSVSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPGTAPKLLIYGASNRFTGVPDRFTGSGSATDFILTINNLQPEDFATYYCGQSYTFPYTFGQGTKVEIK
ヒト化RKF’5
NIVMTQSPSSVSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPGTAPKMLIYGASNRFTGVPSRFSGSGSATDFILTINNLQPEDFATYYCGQSYTFPYTFGQGTKVEIK
ヒト化RKG’5
NIVMTQSPSSVSASVGDRVTITCKASENVGTYVSWYQQKPGTAPKMLIYGASNRFTGVPDRFTGSGSATDFTLTINNLQPEDFATYYCGQSYTFPYTFGQGTKVEIK
親抗体は、アルブミン結合ペプチド(ABP)配列を含む融合タンパク質であることも可能である(Dennis et al.(2002)“Albumin Binding As A General Strategy For Improving The Pharmacokinetics Of Proteins” J Biol Chem.277:35035−35043、WO01/45746)。本発明の抗体は、以下に教示されるABP配列を持つ融合タンパク質を含み、それらは全て本明細書中、参照として援用される:(i)Dennis et al(2002)J Biol Chem.277:35035−35043の表IIIおよび表IV、35038頁、(ii)US2004/0001827の[0076]、および(iii)WO01/45746の12−13頁。
1つの実施形態において、抗体は、腫瘍関連抗原ανβ6に特異的な標的に対して産生されている。
細胞結合剤は、例えば、細胞結合剤の検出または精製を助けるために、複合体として組み込まれる前に、または複合体の一部分としてのいずれかで標識化することができる。標識として、ビオチン標識が可能である。別の実施形態において、細胞結合剤は、放射性同位体で標識することができる。
リガンド単位へのリンカー単位の接続
リガンド単位は、ジスルフィド結合を通してリンカー単位に接続される。
1つの実施形態において、リガンド単位と薬物リンカーとの間の接続は、リガンド単位のシステイン残基のチオール基と、薬物リンカー単位のマレイミド基との間で形成される。
リガンド単位のシステイン残基は、接続を形成するためのリンカー単位の官能基との反応に利用可能であり得る。他の実施形態において、例えば、リガンド単位が抗体であるとき、抗体のチオール基は、鎖間ジスルフィド結合に関与し得る。これらの鎖間結合は、例えば、リンカー単位の官能基との反応の前に、DTTによる抗体の処理によって、遊離チオール基に変換され得る。
いくつかの実施形態において、システイン残基が、抗体の重鎖または軽鎖に導入される。抗体の重鎖または軽鎖における、置換によるシステイン挿入の位置として、公開されている米国特許出願第2007−0092940号および国際特許公開公報WO2008070593に記載されているものが挙げられ、これらの文献は、本明細書に援用される。
治療方法
本発明の化合物は、治療方法で使用することができる。治療方法も提供され、本方法は、治療を必要としている治療対象に、治療上有効量の式IIの複合体を投与することを含む。「治療上有効量」という用語は、患者で有益性を示すのに十分な量である。そのような有益性とは、少なくとも1種の症状の少なくとも改善であってもよい。実際に投与される量ならびに投与の速度および時間経過は、治療されようとしているものの性質および重篤度に依存するだろう。治療の処方(例えば、投薬量の決定)は、一般医および他の医師の責任能力の範囲内である。
複合体は、治療しようとする症状に応じて、単独で投与することも、または他の治療と、同時または順次で併用投与することもできる。治療および療法の例として、化学療法(例えば薬物をはじめとする活性作用剤の投与)、手術、および放射線療法が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明による、および本発明に従って使用するための、医薬組成物(薬学的組成物)は、活性成分、すなわち式Iの複合体の他に、当業者に周知である薬学的に許容可能な賦形剤、担体、緩衝剤、安定剤、または他の材料を含むことができる。そのような材料は、無毒でなければならず、かつ活性成分の効力に干渉してはならない。担体または他の材料の詳細な性質は、投与経路に依存するだろう。投与経路は、経口であってもよいし、注射、例えば皮膚注射、皮下注射、または静脈内注射によるものでもよい。
経口投与用の医薬組成物(薬学的組成物)は、錠剤、カプセル剤、粉剤、または液状の形状が可能である。錠剤は、固形担体またはアジュバントを含むことができる。液状医薬組成物(液状薬学的組成物)は、一般に、液状担体、例えば、水、石油、動物油もしくは植物油、鉱物油、または合成油を含む。生理食塩水、ブドウ糖もしくは他の糖溶液、またはグリコール、例えばエチレングリコール、プロピレングリコール、またはポリエチレングリコールも含めることができる。カプセル剤は、固形担体、例えばゼラチンを含むことができる。
静脈内注射、皮膚注射、または皮下注射、あるいは患部への注射用として、活性成分は、非経口で許容可能な水溶液の形をとることができ、この水溶液は、発熱物質を含まず、かつ適切なpH、等張力、および安定性を有する。当業者なら、例えば、等張性ビヒクル(塩化ナトリウム注射液、リンゲル注射液、乳酸リンゲル注射液など)を用いて適切な溶液を調製することが容易にできる。保存剤、安定剤、緩衝液、抗酸化剤、および/または他の添加剤も、必要に応じて、含ませることができる。
複合体は、増殖性疾患および自己免疫疾患を治療するのに使用され得る。「増殖性疾患」という用語は、過剰細胞または異常細胞の望ましくないまたは制御不能の細胞増殖に関係し、そのような増殖は、in vitroかin vivoにおける、望ましくない、例えば腫瘍形成または過形成性の増殖である。
増殖性症状の例として、良性、前悪性、および悪性の細胞増殖が挙げられるが、これらに限定されず、そのような細胞増殖として、新生物および腫瘍(例えば、組織球腫、神経膠腫、星状細胞腫、骨腫)、がん(例えば、肺癌、小細胞肺癌、胃腸癌、腸癌、大腸癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、精巣癌、肝臓癌、腎臓癌、膀胱癌、膵臓癌、脳癌、肉腫、骨肉腫、カポジ肉腫、黒色腫)、白血病、乾癬、骨疾患、線維増殖性障害(例えば、結合組織のもの)、および粥状動脈硬化が挙げられるが、これらに限定されない。対象となる他のがんとして、血液系、悪性腫瘍、例えば、白血病およびリンパ腫、例えば、非ホジキンリンパ腫、ならびにサブタイプ、例えば、DLBCL、辺縁帯、マントル層および小胞、ホジキンリンパ腫、AML、ならびにBまたはT細胞由来の他のがんが挙げられるが、これらに限定されない。
自己免疫疾患の例として以下が挙げられる:関節リウマチ、自己免疫脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、アレルギー性脳脊髄炎)、乾癬性関節炎、内分泌性眼障害、ぶどう膜網膜炎、全身性紅斑性狼瘡、重症筋無力症、グレーブス病、糸球体腎炎、自己免疫肝臓障害、炎症性腸疾患(例えば、クローン病)、アナフィラキシー、アレルギー反応、シェーグレン症候群、I型糖尿病、原発性胆汁性肝硬変、ウェゲナー肉芽腫症、線維筋痛、多発性筋炎、皮膚筋炎、多発性内分泌腺不全、シュミット症候群、自己免疫性ブドウ膜炎、アジソン病、副腎炎、甲状腺炎、橋本甲状腺炎、自己免疫性甲状腺疾患、悪性貧血、胃の萎縮症、慢性肝炎、ルポイド肝炎、粥状動脈硬化、亜急性皮膚エリテマトーデス、副甲状腺機能低下症、ドレスラー症候群、自己免疫性血小板減少症、突発性血小板減少性紫斑病、溶血性貧血、尋常性天疱瘡、天疱瘡、疱疹状皮膚炎、円形脱毛症、類天疱瘡、強皮症、進行性全身性硬化症、CREST症候群(石灰沈着症、レイノー現象、食道運動障害、手指硬化症、および毛細血管拡張症)、男性および女性の自己免疫性不妊症、強直性脊椎炎、潰瘍性大腸炎、混合性結合組織病、結節性多発動脈炎、全身性壊死性血管炎、アトピー性皮膚炎、アトピー性鼻炎、グッドパスチャー症候群、シャーガス病、サルコイドーシス、リウマチ熱、喘息、再発性流産、抗リン脂質症候群、農夫肺、多形性紅斑、心術後症候群、クッシング症候群、自己免疫性慢性活動性肝炎、愛鳥家肺、中毒性表皮壊死症、アルポート症候群、肺胞炎、アレルギー性肺胞炎、線維化性肺胞炎、間質性肺疾患、結節性紅斑、壊疽性膿皮症、輸血反応、高安動脈炎、リウマチ性多発性筋痛、側頭動脈炎、住血吸虫症、巨細胞性動脈炎、回虫症、アスペルギルス症、サムター症候群、湿疹、リンパ腫様肉芽腫症、ベーチェット病、キャプラン症候群、川崎病、デング熱、脳脊髄炎、心内膜炎、心内膜心筋線維症、眼内炎、持久性隆起性紅斑、乾癬、胎児赤芽球症、好酸球性筋膜炎、シュルマン症候群、フェルティ症候群、フィラリア症、毛様体炎、慢性毛様体炎、異慢性毛様体炎、フックス毛様体炎、IgA腎症、ヘノッホ−シェーンライン紫斑病、移植片対宿主病、移植拒絶反応、心筋症、イートン−ランバート症候群、再発性多発性軟骨炎、クリオグロブリン血症、ワルデンストレームマクログロブリン血症、エバンス症候群、および自己免疫性腺機能不全。
いくつかの実施形態において、自己免疫疾患は、Bリンパ球の障害(例えば、全身性紅斑性狼瘡、グッドパスチャー症候群、関節リウマチ、およびI型糖尿病)、Th1リンパ球の障害(例えば、関節リウマチ、多発性硬化症、乾癬、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、グレーブス病、原発性胆汁性肝硬変、ウェゲナー肉芽腫症、結核、もしくは移植片対宿主病)、またはTh2リンパ球の障害(例えば、アトピー性皮膚炎、全身性紅斑性狼瘡、アトピー性喘息、鼻結膜炎、アレルギー性鼻炎、オーメン症候群、全身性硬化症、もしくは慢性移植片対宿主病)である。一般に、樹状細胞が関与する障害は、Th1リンパ球またはTh2リンパ球の障害を含む。いくつかの実施形態において、自己免疫性疾患は、T細胞媒介免疫障害である。
いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.01〜約10mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.01〜約5mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.05〜約5mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.1〜約5mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.1〜約4mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.05〜約3mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.1〜約3mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態において、投与される複合体の量は、用量あたり約0.1〜約2mg/kgの範囲である。
薬物積載量
薬物積載量(p)は、細胞結合剤(例えば抗体)あたりのPBD薬物の平均数である。本発明の化合物がシステインと結合している場合、薬物積載量は、細胞結合剤あたり1〜8つの薬物(D)の範囲が可能である、すなわち1、2、3、4、5、6、7、および8つの薬物部分が細胞結合剤と共有結合している。複合体の組成として、1〜8つの範囲の薬物と複合している細胞結合剤(例えば抗体)を集めたものが含まれる。本発明の化合物がリシンと結合している場合、薬物積載量は、細胞結合剤あたり1〜80つの薬物(D)の範囲が可能であるが、上限を40、20、10、または8とするのが好適であり得る。複合体の組成として、1〜80、1〜40、1〜20、1〜10、または1〜8の範囲の薬物と複合している細胞結合剤(例えば抗体)を集めたものが含まれる。
複合化反応からADCを調製する場合の抗体当たりの薬物の平均数は、UV、逆相HPLC、HIC、質量分析法、ELISAアッセイ、および電気泳動などの従来法で特性決定することができる。pに関するADCの定量的分布も測定することができる。ELISAにより、ADCの特定の調製物におけるpの平均値を測定することができる(Hamblett et al(2004)Clin.Cancer Res.10:7063−7070、Sanderson et al(2005)Clin.Cancer Res.11:843−852)。しかしながら、p(薬物)値の分布を、抗体抗原結合およびELISAの検出限界により識別することはできない。同じく、抗体薬物複合体を検出するためのELISAアッセイは、薬物部分が抗体のどこに結合しているのか、例えば重鎖または軽鎖断片なのか、あるいは特定のアミノ酸残基なのかを明らかにはしない。場合によっては、pがある特定の値である均一なADCを、薬物積載量が異なるADCから分離、精製、および特性決定することは、逆相HPLCまたは電気泳動などの手段により達成できる。そのような技法は、他の型の複合体にも応用可能である。
抗体薬物複合体によっては、pは、抗体にある結合部位の個数により制限される可能性がある。例えば、抗体は、システインチオール基を1つだけ有しても、複数有してもよく、または、リンカーが結合できる十分に反応性のあるチオール基を1つだけ有しても、複数有してもよい。薬物積載量が大きくなる(例えばp>5)ほど、特定の抗体薬物複合体に、凝集、不溶性、毒性を引き起こす、または細胞透過性の喪失を引き起こす可能性ができる。
典型的には、複合化反応の間に、最大理論値より少ない個数の薬物部分を抗体と複合させる。抗体は、例えば、薬物リンカーともリンカー試薬とも反応しないリシン残基を多数含有し得る。最も反応性の高いリシン基のみが、アミン反応性リンカー試薬と反応することができる。同じく、最も反応性の高いシステインチオール基のみが、チオール反応性リンカー試薬と反応することができる。一般に、抗体は、薬物部分と連結することができる遊離反応性システインチオール基を、含んでいたとしても、多くは含まない。化合物の抗体にあるほとんどのシステインチオール残基は、ジスルフィド架橋として存在し、部分または全還元条件下で、還元剤(ジチオトレイトール(DTT)またはTCEPなど)を用いて還元しなければならない。ADCの積載量(薬物/抗体比)は、複数の異なる様式で制御することができ、そのような様式として以下が挙げられる:(i)抗体に対して薬物リンカーのモル過剰量を制限する、(ii)複合化反応時間または温度を制限する、および(iii)システインチオール修飾の部分的または制限的還元条件。
ある特定の抗体は、還元できる鎖間ジスルフィド、すなわちシステイン架橋を有する。抗体は、DTT(ジチオトレイトール)などの還元剤で処理することにより、リンカー試薬との複合化に反応するようになることができる。こうして、各システイン架橋は、理論的には、2つの反応性チオール求核剤になる。リシンと2−イミノチオラン(トラウト試薬)の反応によりアミンをチオールに変換することで、抗体にさらなる求核基を導入することができる。1つ、2つ、3つ、4つ、またはそれより多いシステイン残基を操作する(例えば、1つ以上の非天然システインアミノ酸残基を含む変異抗体を調製する)ことにより、抗体(またはその断片)に反応性チオール基を導入することができる。US7521541は、反応性システインアミノ酸の導入による抗体操作を教示する。
抗体の反応性部位にあり、鎖間または分子間ジスルフィド架橋を形成しないシステインアミノ酸は、操作することができる(Junutula,et al.,2008b Nature Biotech.,26(8):925−932、Dornan et al(2009)Blood 114(13):2721−2729、US7521541、US7723485、WO2009/052249)。操作されたシステインチオールは、チオール反応性求電子基(マレイミドまたはα−ハロアミドなど)を有する本発明のリンカー試薬または薬物リンカー試薬と反応して、システイン操作された抗体部分およびPBD薬物部分を持つADCを形成することができる。したがって、薬物部分の配置は、設計し、制御し、知ることができる。薬物積載量は、制御することができる。なぜなら、操作されたシステインチオール基は、典型的には、高収率で、チオール反応性のリンカー試薬または薬物リンカー試薬と反応するからである。IgG抗体を操作して、重鎖または軽鎖の1カ所で置換によりシステインアミノ酸を導入することにより、対称抗体に2つの新たなシステインを与える。2に近い薬物積載量が、複合化生成物ADCの近均一性とともに達成できる。
抗体の1つより多い求核または求電子基が薬物リンカー中間体、またはリンカー試薬と反応し、続いて薬物部分試薬と反応すると、得られる生成物は、抗体に結合した薬物部分に分布がある(例えば1、2、3など)ADC化合物混合物になる。重合体逆相(PLRP)および疎水的相互作用(HIC)などの液体クロマトグラフィー法は、薬物積載量の値で混合物から化合物を分離することができる。単一の薬物積載量値(p)を持つADCの調製物を単離することができるものの、そうした単一の薬物積載量値のADCであっても、依然として不均一混合物である可能性がある。なぜなら、複数の薬物部分は、リンカーを介して、抗体の異なる部位に結合する可能性があるからである。
したがって、本発明の抗体薬物複合体組成物は、抗体薬物複合化合物の混合物を含み、この混合物において、抗体は1つ以上のPBD薬物部分を有し、薬物部分は、抗体に、様々なアミノ酸残基で結合している可能性がある。
1つの実施形態において、細胞結合剤あたりの二量体ピロロベンゾジアゼピン基の平均数は、1〜20の範囲である。いくつかの実施形態において、この範囲は、1〜8、2〜8、2〜6、2〜4、および4〜8から選択される。
いくつかの実施形態において、細胞結合剤あたり1つの二量体ピロロベンゾジアゼピン基が存在する。
一般的な合成経路
PBD化合物の合成は、以下の参照文献において広く論じられており、これらの考察は、参照により本明細書に援用される:
a)WO00/12508(頁14〜30)、
b)WO2005/023814(頁3〜10)、
c)WO2004/043963(頁28〜29)、および
d)WO2005/085251(頁30〜39)。
合成経路
式Iの本発明の化合物は:
Figure 2020503250
式IIの化合物から合成され得る:
Figure 2020503250
式中、R2、R6、R7、R9、R6'、R7'、R9'、R11b、R12、Y、Y’およびR”は、式Iの化合物について定義されている通りであり、RLLは、RLの前駆体である。この方法は、RLが式IIIaのものである式Iの化合物に特に適用可能である。これらの化合物について、RLLは、典型的には、RLの部分、例えば、式IIIa’の基である:
Figure 2020503250
かかる場合において、反応は、基GLを付加することを含む。
式2の化合物は、式3の化合物を脱保護することによって作製され得る:
Figure 2020503250
式中、R2、R6、R7、R9、R6'、R7'、R9'、R11b、R12、Y、Y’およびR”は、式Iの化合物について定義されている通りであり、RLL-Protは、RLLの保護されたバージョンであり、適切なカルボキシ/ヒドロキシ保護基を表す。
式3の化合物は、式4の閉環によって作製され得る:
Figure 2020503250
ここで、閉環は、例えばスワーンによる酸化によって行われる。
式4の化合物は、2つのアミノ保護基の段階的付加によって式5の化合物から合成され得る:
Figure 2020503250
段階的付加は、1つのアミノ基の単純な保護により(例えば、Fmocにより)、続いて、他のアミノ基における所望の保護基の導入により達成され得る。これは、簡単な保護基の除去、続いての他の所望のアミノ保護基の導入に従い得る。
Lが式IIIbのものである式Iの化合物は、同様にして合成されてよいが、完全なRL基は、保護されている前駆体の使用によるよりもむしろ式5の化合物から開始して導入されてよい。
式5の化合物は、既知の方法、例えば、WO2011/130598に開示されている方法によって合成されてよい。
薬物複合体の合成
複合体は、先に記載されているように調製され得る。抗体は、Doronina et al.,Nature Biotechnology,2003,21,778−784)に記載されているように薬物リンカー化合物に複合化され得る。簡潔には、pH7.4で50mMのホウ酸ナトリウムを含有するPBSにおける抗体(4〜5mg/mL)は、37℃でトリス(カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩(TCEP)によって還元される。鎖間ジスルフィドを還元する反応の進行は、5,5’−ジチオビス(2−ニトロ安息香酸)との反応によってモニタリングされ、所望のチオール/mAbレベルが達成されるまで続行される。還元された抗体は、次いで、0℃まで冷却され、抗体チオールあたり1.5当量のマレイミド薬物−リンカーによってアルキル化される。1時間後、反応は、5当量のN−アセチルシステインの添加によってクエンチされる。クエンチされた薬物−リンカーは、PD−10カラム上でのゲル濾過によって除去される。ADCは、次いで、0.22μmシリンジフィルタを通して滅菌される。タンパク質濃度は、それぞれ280nmおよび329nmでのスペクトル分析により、280nmでの薬物吸光度の寄与を補正して決定され得る。サイズ排除クロマトグラフィーは、抗体凝集の程度を決定するのに使用され得、RP−HPLCは、残存するNACクエンチ薬物−リンカーのレベルを決定するのに使用され得る。
さらなる優先事項
以下の優先事項は、上述の本発明の全ての態様に適用されてよく、または、単一の態様に関していてよい。優先事項は、任意の組み合わせで一つに組み合わされてよい。
いくつかの実施形態において、NO2基が存在する。他の実施形態において、NO2は存在しない。
いくつかの実施形態において、R6'、R7'、R9'、およびY’は、それぞれ、R6、R7、R9、およびYと同じ基から選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、R6'、R7'、R9'、およびY’は、それぞれ、R6、R7、R9、およびYと同じである。
いくつかの実施形態において、R12は、R2と同じである。
二量体連結
いくつかの実施形態において、YおよびY’は、両方がOである。
いくつかの実施形態において、R”は、置換基を有さないC3-7アルキレン基である。これらの実施形態のいくつかにおいて、R”は、C3、C5またはC7アルキレンである。特に、R”は、C3またはC5アルキレンであってよい。
他の実施形態において、R”は、以下の式の基であり:
Figure 2020503250
式中、rは、1または2である。
6〜R9
いくつかの実施形態において、R9は、Hである。
いくつかの実施形態において、R6は、H、OH、OR、SH、NH2、ニトロおよびハロから選択され、Hまたはハロから選択され得る。これらの実施形態のいくつかにおいて、R6は、Hである。
いくつかの実施形態において、R7は、H、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、およびハロから選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、R7は、H、OHおよびORから選択され、ここで、Rは、任意選択的に置換されているC1-7アルキル、C3-10ヘテロシクリルおよびC5-10アリール基から選択される。Rは、より好ましくはC1-4アルキル基であってよく、置換されていても置換されていなくてもよい。対象となる置換基は、C5-6アリール基(例えば、フェニル)である。7位における特に好ましい置換基は、OMeおよびOCH2Phである。特定の対象となる他の置換基は、ジメチルアミノ(すなわち−NMe2)、−(OC24qOMe(qは、0〜2である)、モルホリノ、ピペリジニルおよびN−メチル−ピペラジニルを含めた窒素含有C6ヘテロシクリルである。
これらの実施形態および優先事項は、それぞれR9'、R6'およびR7'に適用される。
DおよびD’
いくつかの実施形態において、DおよびD’は、それぞれD1およびD’1である。
いくつかの実施形態において、DおよびD’は、それぞれD2およびD’2である。
2
C2とC3との間に二重結合が存在するとき、R2は、以下から選択される:
(a)ハロ、ニトロ、シアノ、エーテル、C1-7アルキル、C3-7ヘテロシクリルおよびビス−オキシ−C1-3アルキレンを含む群より選択される1つ以上の置換基によって任意選択的に置換されているC5-10アリール基、
(b)C1-5飽和脂肪族アルキル、
(c)C3-6飽和シクロアルキル、
(d)
Figure 2020503250
(R11、R12およびR13は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、ここで、R2基における炭素原子の合計数が多くて5である)、
(e)
Figure 2020503250
(R15aおよびR15bの一方がHであり、他方が:ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される基である)、ならびに
(f)
Figure 2020503250
(R14は:H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される)。
2は、C5-10アリール基であるとき、C5-7アリール基であってよい。C5-7アリール基は、フェニル基またはC5-7ヘテロアリール基、例えばフラニル、チオフェニルおよびピリジルであってよい。いくつかの実施形態において、R2は、好ましくはフェニルである。他の実施形態において、R2は、好ましくはチオフェニル、例えば、チオフェン−2−イルおよびチオフェン−3−イルである。
2は、C5-10アリール基であるとき、C8-10アリール、例えばキノリニルまたはイソキノリニル基であってよい。キノリニルまたはイソキノリニル基は、任意の利用可能な環位を通してPBDコアに結合されていてよい。例えば、キノリニルは、キノリン−2−イル、キノリン−3−イル、キノリン−4イル、キノリン−5−イル、キノリン−6−イル、キノリン−7−イルおよびキノリン−8−イルであってよい。これらのうち、キノリン−3−イルおよびキノリン−6−イルが好ましい場合がある。イソキノリニルは、イソキノリン−1−イル、イソキノリン−3−イル、イソキノリン−4イル、イソキノリン−5−イル、イソキノリン−6−イル、イソキノリン−7−イルおよびイソキノリン−8−イルであってよい。これらのうち、イソキノリン−3−イルおよびイソキノリン−6−イルが好ましい場合がある。
2は、C5-10アリール基であるとき、任意の数の置換基を持っていてよい。1〜3個の置換基を持つことが好ましく、1および2がより好ましく、単独で置換されている基が最も好ましい。置換基は、任意の位置であってよい。
2がC5-7アリール基であるとき、単一の置換基が、化合物の残りへの結合に隣接しない環原子上にあることが好ましく、すなわち、化合物の残りへの結合に対してβまたはγであることが好ましい。そのため、C5-7アリール基がフェニルであるとき、置換基は、好ましくはメタまたはパラ位にあり、より好ましくはパラ位にある。
2は、C8-10アリール基、例えばキノリニルまたはイソキノリニルであるとき、キノリンまたはイソキノリン環の任意の位置に任意の数の置換基を持っていてよい。いくつかの実施形態において、R2は、1、2または3つの置換基を持ち、これらが、近位および遠位環のいずれか、または両方(1を超える置換基があるとき)にあってよい。
2がC5-10アリール基であるときのR2置換基
2がC5-10アリール基であるときのR2上の置換基がハロであるとき、該置換基は、好ましくはFまたはCl、より好ましくはClである。
2がC5-10アリール基であるときのR2上の置換基がエーテルであるとき、該置換基は、いくつかの実施形態において、アルコキシ基、例えば、C1-7アルコキシ基(例えば、メトキシ、エトキシ)であってよく、または、いくつかの実施形態において、C5-7アリールオキシ基(例えば、フェノキシ、ピリジルオキシ、フラニルオキシ)であってよい。アルコキシ基は、それ自体が、例えばアミノ基(例えば、ジメチルアミノ)によってさらに置換されていてよい。
2がC5-10アリール基であるときのR2上の置換基がC1-7アルキルであるとき、該置換基は、好ましくはC1-4アルキル基(例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル)であってよい。
2がC5-10アリール基であるときのR2上の置換基がC3-7ヘテロシクリルであるとき、該置換基は、いくつかの実施形態において、C6の窒素含有ヘテロシクリル基、例えば、モルホリノ、チオモルホリノ、ピペリジニル、ピペラジニルであってよい。これらの基は、窒素原子を介してPBD部分の残部に結合していてよい。これらの基は、例えばC1-4アルキル基によってさらに置換されていてよい。C6の窒素含有ヘテロシクリル基がピペラジニルであるとき、上記のさらなる置換基は、第2の窒素環原子上にあってよい。
2がC5-10アリール基であるときのR2上の置換基がビス−オキシ−C1-3アルキレンであるとき、該置換基は、好ましくはビス−オキシ−メチレンまたはビス−オキシ−エチレンである。
2がC5-10アリール基であるときのR2上の置換基がエステルであるとき、該置換基は、好ましくはメチルエステルまたはエチルエステルである。
2がC5-10アリール基であるとき特に好ましい置換基として、メトキシ、エトキシ、フルオロ、クロロ、シアノ、ビス−オキシ−メチレン、メチル−ピペラジニル、モルホリノおよびメチル−チオフェニルが挙げられる。R2についての他の特に好ましい置換基は、ジメチルアミノプロピルオキシおよびカルボキシである。
2がC5-10アリール基であるとき特に好ましい置換されているR2基として、4−メトキシ−フェニル、3−メトキシフェニル、4−エトキシ−フェニル、3−エトキシ−フェニル、4−フルオロ−フェニル、4−クロロ−フェニル、3,4−ビスオキシメチレン−フェニル、4−メチルチオフェニル、4−シアノフェニル、4−フェノキシフェニル、キノリン−3−イルおよびキノリン−6−イル、イソキノリン−3−イルおよびイソキノリン−6−イル、2−チエニル、2−フラニル、メトキシナフチル、およびナフチルが挙げられるが、これらに限定されない。別の可能な置換されているR12基は、4−ニトロフェニルである。特定の対象となるR12基として、4−(4−メチルピペラジン−1−イル)フェニルおよび3,4−ビスオキシメチレン−フェニルが挙げられる。
2は、C1-5飽和脂肪族アルキルであるとき、メチル、エチル、プロピル、ブチルまたはペンチルであってよい。いくつかの実施形態において、これは、メチル、エチルまたはプロピル(n−ペンチルもしくはイソプロピル)であってよい。これらの実施形態のいくつかにおいて、これは、メチルであってよい。他の実施形態において、これは、ブチルまたはペンチルであってよく、これらは、直鎖または分岐鎖であってよい。
2は、C3-6飽和シクロアルキルであるとき、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチルまたはシクロヘキシルであってよい。いくつかの実施形態において、R2は、シクロプロピルであってよい。
2が、
Figure 2020503250
であるとき、R11、R12およびR13は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、ここで、R2基における炭素原子の合計数は、多くて5である。いくつかの実施形態において、R2基における炭素原子の合計数は、多くて4または多くて3である。
いくつかの実施形態において、R11、R12およびR13のうちの1つがHであり、他の2つの基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される。
他の実施形態において、R11、R12およびR13のうちの2つがHであり、他の基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される。
いくつかの実施形態において、Hではない基は、メチルおよびエチルから選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、Hではない基は、メチルである。
いくつかの実施形態において、R11は、Hである。
いくつかの実施形態において、R12は、Hである。
いくつかの実施形態において、R13は、Hである。
いくつかの実施形態において、R11およびR12は、Hである。
いくつかの実施形態において、R11およびR13は、Hである。
いくつかの実施形態において、R12およびR13は、Hである。
特定の対象となるR2基は:
Figure 2020503250
である。
2
Figure 2020503250
であるとき、R15aおよびR15bの一方がHであり、他方が:ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される。いくつかの実施形態において、Hではない基は、任意選択的に置換されているフェニルである。フェニルの任意選択的な置換基がハロであるとき、該置換基は、好ましくはフルオロである。いくつかの実施形態において、フェニル基は、置換されていない。
2
Figure 2020503250
であるとき、R14は:H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロメチル、メトキシから選択される基によって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される。フェニルの任意選択的な置換基がハロであるとき、該置換基は、好ましくはフルオロである。いくつかの実施形態において、フェニル基は、置換されていない。
いくつかの実施形態において、R14は、H、メチル、エチル、エテニルおよびエチニルから選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、R14は、Hおよびメチルから選択される。
C2とC3との間に単結合が存在するとき、
2は、Hもしくは
Figure 2020503250
であり、ここで、R16aおよびR16bは、H、F、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから独立して選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基は、C1-4アルキルアミドおよびC1-4アルキルエステルから選択される基によって任意選択的に置換されており、または、R16aおよびR16bの一方がHであるとき、他方は、ニトリルおよびC1-4アルキルエステルから選択される。
いくつかの実施形態において、R2は、Hである。
いくつかの実施形態において、R2
Figure 2020503250
である。
いくつかの実施形態において、R16aおよびR16bの両方がHであることが好ましい。
他の実施形態において、R16aおよびR16bの両方がメチルであることが好ましい。
さらなる実施形態において、R16aおよびR16bのうちの1つがHであり、他方が、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基が、任意選択的に置換されていることが好ましい。これらのさらなる実施形態において、Hではない基は、メチルおよびエチルから選択されることがさらに好ましい場合がある。
12
C2’とC3’との間に二重結合が存在するとき、R12は、以下から選択される:
(a)ハロ、ニトロ、シアノ、エーテル、C1-7アルキル、C3-7ヘテロシクリルおよびビス−オキシ−C1-3アルキレンを含む群より選択される1つ以上の置換基によって任意選択的に置換されているC5-10アリール基、
(b)C1-5飽和脂肪族アルキル、
(c)C3-6飽和シクロアルキル、
(d)
Figure 2020503250
(R21、R22およびR23は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、R12基における炭素数の合計が多くて5である)、
(e)
Figure 2020503250
(R25aおよびR25bの一方がHであり、他方が、ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される基である)、ならびに
(f)
Figure 2020503250
24は:H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニル。
から選択される。
12は、C5-10アリール基であるとき、C5-7アリール基であってよい。C5-7アリール基は、フェニル基またはC5-7ヘテロアリール基、例えばフラニル、チオフェニルおよびピリジルであってよい。いくつかの実施形態において、R12は、好ましくはフェニルである。他の実施形態において、R12は、好ましくはチオフェニル、例えば、チオフェン−2−イルおよびチオフェン−3−イルである。
12は、C5-10アリール基であるとき、C8-10アリール、例えばキノリニルまたはイソキノリニル基であってよい。キノリニルまたはイソキノリニル基は、任意の利用可能な環位を通してPBDコアに結合されていてよい。例えば、キノリニルは、キノリン−2−イル、キノリン−3−イル、キノリン−4−イル、キノリン−5−イル、キノリン−6−イル、キノリン−7−イルおよびキノリン−8−イルであってよい。これらのうち、キノリン−3−イルおよびキノリン−6−イルが好ましい場合がある。イソキノリニルは、イソキノリン−1−イル、イソキノリン−3−イル、イソキノリン−4イル、イソキノリン−5−イル、イソキノリン−6−イル、イソキノリン−7−イルおよびイソキノリン−8−イルであってよい。これらのうち、イソキノリン−3−イルおよびイソキノリン−6−イルが好ましい場合がある。
12は、C5-10アリール基であるとき、任意の数の置換基を持っていてよい。1〜3個の置換基を持つことが好ましく、1および2がより好ましく、単独で置換されている基が最も好ましい。置換基は、任意の位置であってよい。
12がC5-7アリール基であるとき、単一の置換基が、化合物の残りへの結合に隣接しない環原子上にあることが好ましく、すなわち、化合物の残りへの結合に対してβまたはγであることが好ましい。そのため、C5-7アリール基がフェニルであるとき、置換基は、好ましくはメタまたはパラ位にあり、より好ましくはパラ位にある。
12は、C8-10アリール基、例えばキノリニルまたはイソキノリニルであるとき、キノリンまたはイソキノリン環の任意の位置に任意の数の置換基を持っていてよい。いくつかの実施形態において、これは、1、2または3つの置換基を持ち、これらが、近位および遠位環のいずれか、または両方(1を超える置換基があるとき)にあってよい。
12がC5-10アリール基であるときのR12置換基
12がC5-10アリール基であるときのR12上の置換基がハロであるとき、該置換基は、好ましくはFまたはCl、より好ましくはClである。
12がC5-10アリール基であるときのR12上の置換基がエーテルであるとき、該置換基は、いくつかの実施形態において、アルコキシ基、例えば、C1-7アルコキシ基(例えば、メトキシ、エトキシ)であってよく、または、いくつかの実施形態において、C5-7アリールオキシ基(例えば、フェノキシ、ピリジルオキシ、フラニルオキシ)であってよい。アルコキシ基は、それ自体が、例えばアミノ基(例えば、ジメチルアミノ)によってさらに置換されていてよい。
12がC5-10アリール基であるときのR12上の置換基がC1-7アルキルであるとき、該置換基は、好ましくはC1-4アルキル基(例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル)であってよい。
12がC5-10アリール基であるときのR12上の置換基がC3-7ヘテロシクリルであるとき、該置換基は、いくつかの実施形態において、C6の窒素含有ヘテロシクリル基、例えば、モルホリノ、チオモルホリノ、ピペリジニル、ピペラジニルであってよい。これらの基は、窒素原子を介してPBD部分の残部に結合していてよい。これらの基は、例えばC1-4アルキル基によってさらに置換されていてよい。C6の窒素含有ヘテロシクリル基がピペラジニルであるとき、上記のさらなる置換基は、第2の窒素環原子上にあってよい。
12がC5-10アリール基であるときのR12上の置換基がビス−オキシ−C1-3アルキレンであるとき、該置換基は、好ましくはビス−オキシ−メチレンまたはビス−オキシ−エチレンである。
12がC5-10アリール基であるときのR12上の置換基がエステルであるとき、該置換基は、好ましくはメチルエステルまたはエチルエステルである。
12がC5-10アリール基であるとき特に好ましい置換基として、メトキシ、エトキシ、フルオロ、クロロ、シアノ、ビス−オキシ−メチレン、メチル−ピペラジニル、モルホリノおよびメチル−チオフェニルが挙げられる。R12についての他の特に好ましい置換基は、ジメチルアミノプロピルオキシおよびカルボキシである。
12がC5-10アリール基であるとき特に好ましい置換されているR12基の例として、4−メトキシ−フェニル、3−メトキシフェニル、4−エトキシ−フェニル、3−エトキシ−フェニル、4−フルオロ−フェニル、4−クロロ−フェニル、3,4−ビスオキシメチレン−フェニル、4−メチルチオフェニル、4−シアノフェニル、4−フェノキシフェニル、キノリン−3−イルおよびキノリン−6−イル、イソキノリン−3−イルおよびイソキノリン−6−イル、2−チエニル、2−フラニル、メトキシナフチル、およびナフチルが挙げられるが、これらに限定されない。別の可能な置換されているR12基は、4−ニトロフェニルである。特定の対象となるR12基として、4−(4−メチルピペラジン−1−イル)フェニルおよび3,4−ビスオキシメチレン−フェニルが挙げられる。
12は、C1-5飽和脂肪族アルキルであるとき、メチル、エチル、プロピル、ブチルまたはペンチルであってよい。いくつかの実施形態において、これは、メチル、エチルまたはプロピル(n−ペンチルもしくはイソプロピル)であってよい。これらの実施形態のいくつかにおいて、R12は、メチルであってよい。他の実施形態において、R12は、ブチルまたはペンチルであってよく、これらは、直鎖または分岐鎖であってよい。
12は、C3-6飽和シクロアルキルであるとき、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチルまたはシクロヘキシルであってよい。いくつかの実施形態において、R12は、シクロプロピルであってよい。
12が、
Figure 2020503250
であるとき、R21、R22およびR23は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、R12基における炭素数の合計が多くて5である。いくつかの実施形態において、R12基における炭素原子の合計数は、多くて4または多くて3である。
いくつかの実施形態において、R21、R22およびR23のうちの1つがHであり、他の2つの基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される。
他の実施形態において、R21、R22およびR23のうちの2つがHであり、他の基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される。
いくつかの実施形態において、Hではない基は、メチルおよびエチルから選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、Hではない基は、メチルである。
いくつかの実施形態において、R21は、Hである。
いくつかの実施形態において、R22は、Hである。
いくつかの実施形態において、R23は、Hである。
いくつかの実施形態において、R21およびR22は、Hである。
いくつかの実施形態において、R21およびR23は、Hである。
いくつかの実施形態において、R22およびR23は、Hである。
特定の対象となるR12基は:
Figure 2020503250
である。
12
Figure 2020503250
であるとき、R25aおよびR25bの一方がHであり、他方が、ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される。いくつかの実施形態において、Hではない基は、任意選択的に置換されているフェニルである。フェニルの任意選択的な置換基がハロであるとき、該置換基は、好ましくはフルオロである。いくつかの実施形態において、フェニル基は、置換されていない。
12
Figure 2020503250
であるとき、R24は、H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロメチル、メトキシから選択される基によって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される。フェニルの任意選択的な置換基がハロであるとき、該置換基は、好ましくはフルオロである。いくつかの実施形態において、フェニル基は、置換されていない。いくつかの実施形態において、R24は、H、メチル、エチル、エテニルおよびエチニルから選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、R24は、Hおよびメチルから選択される。
C2’とC3’との間に単結合が存在するとき、
12は、Hもしくは
Figure 2020503250
であり、ここで、R26aおよびR26bは、H、F、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから独立して選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基は、C1-4アルキルアミドおよびC1-4アルキルエステルから選択される基によって任意選択的に置換されており、または、R26aおよびR26bの一方がHであるとき、他方は、ニトリルおよびC1-4アルキルエステルから選択される。
いくつかの実施形態において、R12は、Hである。
いくつかの実施形態において、R12
Figure 2020503250
である。
いくつかの実施形態において、R26aおよびR26bの両方がHであることが好ましい。
他の実施形態において、R26aおよびR26bの両方がメチルであることが好ましい。
さらなる実施形態において、R26aおよびR26bのうちの1つがHであり、他方が、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基が、任意選択的に置換されていることが好ましい。これらのさらなる実施形態において、Hではない基は、メチルおよびエチルから選択されることがさらに好ましい場合がある。
11b
いくつかの実施形態において、R11bは、OHである。
いくつかの実施形態において、R11bは、ORAであり、ここでRAは、C1-4アルキルである。これらの実施形態のいくつかにおいて、RAは、メチルである。
本発明の第1の態様のいくつかの実施形態において、式Ia−1、Ia−2またはIa−3のものがあり:
Figure 2020503250
式中、R2aおよびR12aは同じであり、以下:
Figure 2020503250
から選択され、
1aは、メチルおよびベンジルから選択され、
LおよびR11bは、上記に定義されている通りである。
本発明のいくつかの実施形態において、R2およびR12は、両方が、多くて3個の炭素原子を含む。
ゆえに、C2とC3との間に二重結合が存在するこれらの実施形態において、R2は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
ゆえに、C2とC3との間に二重結合が存在しないこれらの実施形態において、R2は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
ゆえに、C2’とC3’との間に二重結合が存在するこれらの実施形態において、R12は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
ゆえに、C2’とC3’との間に二重結合が存在しないこれらの実施形態において、R12は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
これらの実施形態のいくつかにおいて、R2およびR12は、両方が、多くて2個の炭素原子を含む。
ゆえに、C2とC3との間に二重結合が存在するこれらの実施形態において、R2は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
ゆえに、C2とC3との間に二重結合が存在しないこれらの実施形態において、R2は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
ゆえに、C2’とC3’との間に二重結合が存在するこれらの実施形態において、R12は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
ゆえに、C2’とC3’との間に二重結合が存在しないこれらの実施形態において、R12は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
これらの実施形態のさらなるものにおいて、R2およびR12は、両方が、多くて1個の炭素原子を含む。
ゆえに、C2とC3との間に二重結合が存在するこれらの実施形態において、R2は、メチルであってよい。ゆえに、C2とC3との間に二重結合が存在しないこれらの実施形態において、R2は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
ゆえに、C2’とC3’との間に二重結合が存在するこれらの実施形態において、R12は、メチルであってよい。ゆえに、C2’とC3’との間に二重結合が存在しないこれらの実施形態において、R12は、以下から選択され得る:
Figure 2020503250
理論によって拘束されることを望まないが、PBD二量体のC2位における置換基が小さいとき、これらの薬物リンカーにおけるグルクロニドキャッピング単位の使用は、薬物リンカーの親水性を有意に増加させて、薬物リンカーがリガンド単位に複合化することを容易にするため、特に有利であるとされている。
これらの実施形態および優先事項は、本発明の第2の態様にも適用される。
リンカー(RL
いくつかの実施形態において、RLは、式IIIaのものである。
いくつかの実施形態において、RLLは、式IIIa’のものである。
L
Lは、以下から選択され得、式中、Arは、C5-6アリーレン基、例えば、フェニレンを表す。
Figure 2020503250
いくつかの実施形態において、GLは、GL1-1およびGL1-2から選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、GLは、GL1-1である。
LL
LLは、以下から選択され得、式中、Arは、C5-6アリーレン基、例えば、フェニレンを表す。
Figure 2020503250
いくつかの実施形態において、GLLは、GLL1-1およびGLL1-2から選択される。これらの実施形態のいくつかにおいて、GLLは、GLL1-1である。

Xは、
Figure 2020503250
であり、
式中、a=0〜5、b=0〜16、c=0または1、d=0〜5である。
aは、0、1、2、3、4または5であってよい。いくつかの実施形態において、aは、0〜3である。これらの実施形態のいくつかにおいて、aは、0または1である。さらなる実施形態において、aは、0である。
bは、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15または16であってよい。いくつかの実施形態において、bは、0〜12である。これらの実施形態のいくつかにおいて、bは、0〜8であり、0、2、4または8であってよい。
Cは、0または1であってよい。
dは、0、1、2、3、4または5であってよい。いくつかの実施形態において、dは、0〜3である。これらの実施形態のいくつかにおいて、dは、1または2である。さらなる実施形態において、dは、2である。
Xのいくつかの実施形態において、aは、0であり、cは、1であり、dは、2であり、bは、0〜8であってよい。これらの実施形態のいくつかにおいて、bは、0、4または8である。
X
1つの実施形態において、QXは、アミノ酸残基である。アミノ酸は、天然アミノ酸または非天然アミノ酸であってよい。
1つの実施形態において、QXは:Phe、Lys、Val、Ala、Cit、Leu、Ile、Arg、およびTrpから選択され、Citは、シトルリンである。
1つの実施形態において、QXは、ジペプチド残基を含む。ジペプチドにおけるアミノ酸は、天然アミノ酸および非天然アミノ酸の任意の組み合わせであってよい。いくつかの実施形態において、ジペプチドは、天然アミノ酸を含む。リンカーがカテプシン不安定リンカーであるとき、ジペプチドは、カテプシン媒介開裂の作用部位である。ジペプチドは、次いでカテプシンの認識部位となる。
1つの実施形態において、QXは、
CO−Phe−Lys−NH
CO−Val−Ala−NH
CO−Val−Lys−NH
CO−Ala−Lys−NH
CO−Val−Cit−NH
CO−Phe−Cit−NH
CO−Leu−Cit−NH
CO−Ile−Cit−NH
CO−Phe−Arg−NH、および
CO−Trp−Cit−NH
から選択され、
Citはシトルリンである。
好ましくは、QXは、
CO−Phe−Lys−NH
CO−Val−Ala−NH
CO−Val−Lys−NH
CO−Ala−Lys−NH
CO−Val−Cit−NH
から選択される。
最も好ましくは、QXは、CO−Phe−Lys−NHCO−Val−Cit−NHおよびCO−Val−Ala−NHから選択される。
対象となる他のジペプチド組み合わせとして、
CO−Gly−Gly−NH
CO−Pro−Pro−NH、および
CO−Val−Glu−NH
が挙げられる。
参照により本明細書に援用される、Dubowchik et al.,Bioconjugate Chemistry,2002,13,855−869に記載されているものを含めた他のジペプチド組み合わせが使用され得る。
いくつかの実施形態において、QXは、トリペプチド残基である。トリペプチドにおけるアミノ酸は、天然アミノ酸および非天然アミノ酸の任意の組み合わせであってよい。いくつかの実施形態において、トリペプチドは、天然アミノ酸を含む。リンカーがカテプシン不安定リンカーであるとき、トリペプチドは、カテプシン媒介開裂の作用部位である。トリペプチドは、次いでカテプシンの認識部位となる。
1つの実施形態において、適切な場合、アミノ酸側鎖が化学的に保護されている。側鎖保護基は、以下に考察されている基であってよい。保護されているアミノ酸配列は、酵素によって開裂可能である。例えば、Boc側鎖保護Lys残基を含むジペプチド配列は、カテプシンによって開裂可能である。
アミノ酸の側鎖のための保護基は、当該分野において周知であり、上記のように、Novabiochem Catalogに記載されている。
いくつかの実施形態において、RLは、式IIIbのものである。
いくつかの実施形態において、RLLは、式IIIb’のものである。
L1およびRL2は、Hおよびメチルから独立して選択され、または、これらが結合している炭素原子と一緒になって、シクロプロピレンもしくはシクロブチレン基を形成している。
いくつかの実施形態において、RL1およびRL2は、両方がHである。
いくつかの実施形態において、RL1が、Hであり、RL2が、メチルである。
いくつかの実施形態において、RL1およびRL2は、両方がメチルである。
いくつかの実施形態において、RL1およびRL2は、これらが結合している炭素原子と一緒になって、シクロプロピレン基を形成している。
いくつかの実施形態において、RL1およびRL2は、これらが結合している炭素原子と一緒になって、シクロブチレン基を形成している。
基IIIbでは、いくつかの実施形態において、eは、0である。他の実施形態において、eは、1であり、ニトロ基は、環の任意の利用可能な位置にあってよい。これらの実施形態のいくつかにおいて、オルト位にある。これらの実施形態の他のものにおいて、パラ位にある。
1つの特定の実施形態において、本発明の第1の態様は、式Idの化合物を含む。
Figure 2020503250
1つの特定の実施形態において、本発明の第2の態様は、薬物リンカー(DL)が式(Id’)のものである。
Figure 2020503250
さらなる背景
University College Londonにより英国の2014 Research Excellence Framework(REF)に提出された影響研究では(http://impact.ref.ac.uk/casestudies2/refservice.svc/GetCaseStudyPDF/35393において入手可能)、以下がコメントされた:
「SG2000よりも効能がある、SG2057およびSG2202を含めた次世代のPBD二量体が開発された。PBD二量体は、広範なヒト腫瘍細胞株に対してピコモル/サブピコモルの活性を示し、ヒト腫瘍異種移植片モデルにおいて治癒的な活性を実証している。」:
Hartley JA,et al.,DNA interstrand cross−linking and in vivo antitumor activity of the extended pyrrolo[2,1−c][1,4]benzodiazepine dimer SG2057.Invest New Drugs.2012 Jun;30(3):950−8.http://dx.doi.org/10.1007/s10637−011−9647−z(以下、“Hartley et al(2012)”)を参照、
ならびに:
「非常に強い効能を表すこのような細胞毒性分子を生成する能力は、細胞毒性剤を標的してこれを腫瘍部位で直接的に高度に放出する目的のストラテジーにおいて潜在的な役割を示唆した。抗体薬物複合体(ADC)の「弾頭」成分としての例である。完全合成PBD二量体は、ADCアプローチにおける弾頭の役割に理想的に適している。」
Hartley et al(2012)の研究論文は、その概要において、「SG2057は、そのため、SG2000より強力なin vitro活性および優れたin vivo活性を有する、高度に活性な抗腫瘍剤であり、さらなる発展を保証する」とコメントしている。
SG2057は構造:
Figure 2020503250
を有する。
弾頭としてSG2057を使用する抗体薬物複合体は、WO2011/130598に最初に開示された。例えば、この出願の請求項54は、以下の式を含む。
Figure 2020503250
式中、nは、1〜24、より好ましくは4〜8である。以下の薬物リンカーが例示された:n=4、15c;n=8、15d;n=24、15e。
この出願の請求項54はまた、以下の式も含む。
Figure 2020503250
式中、nは、1〜24、より好ましくは4〜8である。以下の薬物リンカーが例示された:n=8、58;n=24、61。
WO2011/130598はまた、これらの薬物リンカーを含む抗体−薬物複合体も、実施例110(抗Steap1−15d)、実施例114(トラスツズマブ−15d)および実施例115(トラスツズマブ−58)について開示している。
WO2013/055987は、薬物リンカー14および22ならびに抗体-薬物複合体におけるこれらの使用を開示している。
Figure 2020503250
より最近では、弾頭:
Figure 2020503250
が、薬物リンカーおよび抗体−薬物複合体において使用されている。WO2014/057074は、
Figure 2020503250
を開示している。
本発明者らは、SG2000は、SG2057よりも細胞毒性が少なくとも10倍少ない(Hartley et al 2012を参照)が、特定の抗体−薬物複合体が、少なくとも匹敵する活性を示すと思われることを驚くべきことに見出した。これらの複合体は、様々な種において、毒性研究において驚くべきことに良好な耐容性を有することが示されている。これにより、高い治療指数を示す複合体がもたらされ、ゆえに、有望な臨床候補である。
本発明のいくつかの実施形態において、C11置換基は、隣接する基に対して以下の立体化学的配置にあってよい。
Figure 2020503250
他の実施形態において、C11置換基は、隣接する基に対して以下の立体化学的配置にあってよい。
Figure 2020503250
特定の対象となる化合物として、上記例のものが挙げられる。
フラッシュクロマトグラフィーを、88%ヘキサン/EtOAcまたは99.9%DCM/MeOHのいずれかから開始して、カラムから全てのUV活性成分(214および254nmで検出)が溶出されるまで、勾配をつけた溶出を使用してBiotage Isolera1(商標)を使用して実施した。勾配は、UV活性材料の実質的な溶出が観察されたときはすぐに手動で維持した。画分は、純度について、Merck Kieselgel 60 F254シリカゲル(アルミニウムプレート上に蛍光指示薬が付いている)を用いて薄層クロマトグラフィー(TLC)により確認した。他に特に記載がないかぎり、TLCの視覚化は、UV光またはヨウ素蒸気で行った。抽出およびクロマトグラフィーの溶媒は、VWR,U.K.から購入し、精製することなく使用した。他に特に記載がないかぎり、全ての純度の高い化合物は、Sigma−AldrichまたはTCI Europeから購入した。PEG化試薬は、Stratech UKを通してQuanta biodesign USから得た。
1Hおよび13C NMRスペクトルをBruker Avance(登録商標)400分光計において得た。カップリング定数を、ヘルツ(Hz)で引用する。化学シフトを、百万分率(ppm)で、テトラメチルシランからのダウンフィールドで記録する。スピン多重度を、s(一重項)、bs(ブロード一重項)、d(二重項)、t(三重項)およびm(多重項)として記載する。
(反応モニタリングおよび純度決定のための)分析用のLC/MS条件は以下の通りであった。ポジティブモードエレクトロスプレー質量分析は、Shimadzu Nexera(登録商標)/Prominence(登録商標)LCMS−2020を使用して実施した。使用した移動相は、溶媒A(0.1%ギ酸を含むH2O)および溶媒B(0.1%ギ酸を含むCH3CN)であった。定期的な3分間実行のための勾配:初期組成の5%Bを25秒間かけて保持し、次いで5%Bから100%Bに1分35秒の期間をかけて増加させた。組成を100%Bで50秒間保持し、次いで5%Bへと5秒で戻し、そこで5秒間保持した。勾配実行の合計継続時間は3.0分であった。15分間実行のための勾配:初期組成の5%Bを1分間かけて保持し、次いで5%Bから100%Bに9分の期間をかけて増加させた。組成を100%Bで2分間保持し、次いで5%Bへと10秒で戻し、そこで2分50秒間保持した。勾配実行の合計継続時間は15.0分であった。流速は0.8mL/分(3分間実行)および0.6mL/分(15分間実行)であった。検出は254nmであった。カラム:Waters Acquity UPLC(登録商標)BEH Shield RP18 VanGuardプレカラム、130A、1.7μm、2.1mm×5mmを装備した50℃のWaters Acquity UPLC(登録商標)BEH Shield RP18 1.7μm 2.1×50mm(定期的な3分間実行)、およびWaters Acquity UPLC(登録商標)BEH Shield RP18 VanGuardプレカラム、130A、1.7μm、2.1mm×5mmを装備したACE Excel 2 C18−AR、2μ、3.0×100mm(15分間実行)。
分取HPLC条件は以下の通りであった。逆相超高速液体クロマトグラフィー(UFLC)を、Phenomenex(登録商標)Gemini NX 5μC18カラム(50℃)寸法:150×21.2mmを使用したShimazdzu Prominence(登録商標)機において行った。使用した溶出液は、溶媒A(0.1%ギ酸を含むH2O)および溶媒B(0.1%ギ酸を含むCH3CN)であった。全てのUFLC実験を以下の勾配条件で実施した:初期組成の13%Bを15分の期間をかけて60%Bに増加させ、次いで2分間かけて100%Bに増加させた。組成を100%Bで1分間保持し、次いで0.1分で13%Bに戻し、そこで1.9分間保持した。勾配実行の合計継続時間は20.0分であった。流速は20.0mL/分であり、検出は254および280nmであった。
重要な中間体の合成
(a)化合物5a
以下の化合物5a:
Figure 2020503250
を、Grinda,M.,et al.,ChemMedChem 2011(5),2137−2141(DOI:10.1002/cmdc.201100355)において(化合物10について)記載されているように合成した。
(a)(S)−2−(メトキシカルボニル)−4−メチレンピロリジニウムクロリド(I3)
Figure 2020503250
市販のプロリン誘導体(I1)をOmegachemから得た。
(i)(S)−1−tert−ブチル 2−メチル 4−メチレンピロリジン−1,2−ジカルボキシラート(I2)
カルボン酸I1(10.92g、48mmol、1.0当量)をDMF(270mL)に溶解させた撹拌溶液に、炭酸カリウム(19.92g、14mmol、3.0当量)を添加した。得られた白色懸濁液を室温で30分間撹拌し、この時点で、ヨードメタン(21.48g、9.5mL、151mmol、3.15当量)を添加した。反応混合物を室温で3日間撹拌させた。DMFを減圧ロータリーエバポレーションにより除去し、黄色残渣を得、この残渣を酢酸エチルおよび水の間で分配した。有機層を分離し、水相を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を水ブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させた。酢酸エチルを減圧ロータリーエバポレーションにより除去し、粗生成物を黄色油状物として得た。粗生成物をフラッシュクロマトグラフィー[85%n−ヘキサン/15%酢酸エチル]によって精製し、生成物を無色油状物として得た(10.74g、93%)。
(ii)(S)−2−(メトキシカルボニル)−4−メチレンピロリジニウムクロリド(I3)
4M塩酸をジオキサン(63mL、254.4mmol、4.5当量)に溶解させ、この溶液をBoc保護C環断片I2(13.67g、56.6mmol、1.0当量)に室温で添加した。泡立ちが観察されて、CO2の遊離およびBoc基の除去を示した。生成物が白色固体として沈殿し、追加のジオキサンを添加して撹拌を容易にし、反応混合物を1時間撹拌させ、次いでジエチルエーテルで希釈した。沈殿した生成物を真空濾過によって収集し、追加のジエチルエーテルで洗浄した。空気乾燥により、所望の生成物を白色粉末として得た(9.42g、94%)。
(b)((プロパン−1,3−ジイルビス(オキシ))ビス(2−アミノ−5−メトキシ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−イル)メタノン)(I11)
Figure 2020503250
(i)1’,3’−ビス[2−メトキシ−4−(メトキシカルボニル)フェノキシ]プロパン(I5)
バニリン酸メチルI4(60g、329mmol)およびPh3P(129.4g、494mmol)を無水THF(800mL)に溶解させたオーバーヘッド撹拌溶液に、アゾジカルボン酸ジイソプロピル(71.3mL、73.2g、362mmol)を、窒素雰囲気下0〜5℃(氷/アセトン)で60分間かけて滴加した。反応混合物を0〜5℃でさらに1時間撹拌させ、この時間の後、1,3−プロパンジオール(11.4mL、12.0g、158mmol)をTHF(12mL)に溶解させた溶液を20分間かけて滴加した。反応混合物を室温に昇温させ、5日間撹拌した。得られた白色沈殿物I3を真空濾過によって収集し、THFで洗浄し、一定重量になるまで真空デシケータにおいて乾燥させた。収率=54.68g(1,3−プロパンジオールを基準にして84%)。分析データ:LC/MSによれば満足できる純度3.20分(ES+)m/z(相対強度)427([M+Na]+.,10);1H NMR(400MHz,CDCl3)δδ7.64(dd,2H,J=1.8,8.3Hz),7.54(d,2H,J=1.8Hz),6.93(d,2H,J=8.5Hz),4.30(t,4H,J=6.1Hz),3.90(s,6H),3.89(s,6H),2.40(p,2H,J=6.0Hz)。
(ii)1’,3’−ビス[2−メトキシ−4−(メトキシカルボニル)−5−ニトロフェノキシ]プロパン(I6)
ビス−エステルI5(54.68g、135mmol)の、無水酢酸(650mL)中のオーバーヘッド撹拌スラリーに、固体Cu(NO32.3H2O(81.54g、337.5mmol)を0〜5℃(氷/アセトン)でゆっくりと添加した。反応混合物を0〜5℃で1時間撹拌させ、次いで室温に昇温させた。穏やかな発熱(およそ40〜50℃)が、混合物の増粘により達成され、この段階でNO2の放出が観察された。追加の無水酢酸(300mL)を添加し、反応混合物を16時間室温で撹拌させた。反応混合物を氷(約1.5L)上に注ぎ、撹拌し、室温に戻した。得られた黄色沈殿物を真空濾過によって収集し、デシケータにおいて乾燥させて、所望のビス−ニトロ化合物6を黄色固体として得た。収率=66.7g(100%)。分析データ:LC/MSによれば満足できる純度3.25分(ES+)m/z(相対強度)517([M+Na]+.,40);1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.49(s,2H),7.06(s,2H),4.32(t,4H,J=6.0Hz),3.95(s,6H),3.90(s,6H),2.45−2.40(m,2H)。参照Thurston 1996を参照。
(iii)1’,3’−ビス(4−カルボキシ−2−メトキシ−5−ニトロフェノキシ)プロパン(I7)
THF(700mL)中のメチルエステルI6(66.7g、135mmol)のスラリーを1N NaOH(700mL)によって処理し、反応混合物を室温で激しく撹拌させた。4日間の撹拌後、スラリーが暗色の溶液になり、この溶液を減圧ロータリーエバポレーションに供して、THFを除去した。得られた水性残渣を濃HClによってpH1に酸性化し、無色沈殿物I7を収集し、真空オーブン(50℃)において完全に乾燥させた。収率=54.5g(87%)。分析データ:LC/MSによれば満足できる純度2.65分(ES+)m/z(相対強度)489([M+Na]+.、30);1HNMR(400MHz,DMSO−d6)δ7.62(s,2H),7.30(s,2H),4.29(t,4H,J=6.0Hz),3.85(s,6H),2.30−2.26(m,2H)。
(iv)ジメチル 1,1’−(4,4’−(プロパン−1,3−ジイルビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロベンゾイル))(2S,2’S)−ビス(4−メチレンピロリジン−2−カルボキシラート)(I8)
触媒量の無水DMF(2.4mL)を、オキサリルクロリド(14.7g、9.8mL、115.8mmol、3当量)および二量体コアI7(18g、38.6mmol、1当量)を無水DCM(500mL)に懸濁させた撹拌懸濁液に、室温で添加した。DMFの添加後に激しい泡立ちが観察され、反応混合物を、塩化カルシウム乾燥管を装着した丸底フラスコにおいて18時間撹拌させた。得られた透明溶液を減圧蒸発させ、固体をエーテルで摩砕した。固体生成物を真空濾過によって収集し、追加のエーテルで洗浄し、40℃で1.5時間真空乾燥させた。この固体を、次いで、C環3(15.1g、84.9mmol、2.2当量)およびTEA(19.5g、27mL、119.6mmol、5当量)を脱水DCM(375mL)に懸濁させた懸濁液に分割添加し、ドライアイス/アセトニトリル浴によって−40℃から−50℃の間の温度を維持した。反応混合物を−40℃で1時間撹拌させ、次いで室温に昇温させ、この時点で、LCMSが、出発物質の完全な消費を示した。反応混合物を追加のDCMで希釈し、塩酸水溶液(1M、2×200mL)、飽和重炭酸ナトリウム(2×250mL)、水(250mL)、ブライン(250mL)で順次洗浄し、乾燥させた(MgSO4)。DCMを減圧ロータリーエバポレーションにより除去し、生成物を黄色発泡物として得た(25.72g、94%)。分析データ:RT1.59分;MS(ES+)m/z(相対強度)713([M+H]+.,100)
(v)((プロパン−1,3−ジイルビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(ヒドロキシメチル)−4−メチレンピロリジン−1−イル)メタノン)(I9)
固体水素化ホウ素リチウム(3.18g、146mmol、3当量)を、エステルI8(34.72g、48.7mmol、1当量)を脱水THF(350mL)に溶解させた溶液に、窒素雰囲気下0℃(氷浴)において一度に加えた。反応混合物を0℃で30分間撹拌させ、次いで、室温に昇温させ、この時点で、橙色ガム状の沈殿が観察された。反応混合物を室温でさらに2時間撹拌させ、次いで氷浴で冷却し、水で処理して、黄色懸濁液を得た。塩酸(1M)を、泡立ちが停止するまで注意深く添加した。反応混合物を酢酸エチルで抽出し(×4)、合わせた有機層を水(×1)、ブライン(×1)で洗浄し、乾燥させた(MgSO4)。酢酸エチルを減圧ロータリーエバポレーションにより除去し、黄色発泡物を得た。フラッシュカラムクロマトグラフィーによる精製[勾配溶出、1%増分でDCM/MeOH0%から5%へ]により、生成物を淡黄色発泡物として得た(23.1g、72%)。分析データ:RT1.23分;MS(ES+)m/z(相対強度)657([M+H]+.、100)
(vi)((プロパン−1,3−ジイルビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−イル)メタノン)(I10)
ビス−アルコールI9(10g、15.2mmol、1当量)、t−ブチルジメチルシリルクロリド(5.97g、39.6mmol、2.6当量)およびイミダゾール(5.38g、79mmol、5.2当量)を脱水DMF(80mL)に溶解させた溶液を、室温で3時間撹拌した。反応混合物を水(500mL)に注ぎ入れ黄色沈殿物を得た。混合物をDCM(4×100mL)で抽出し、合わせた抽出物を水およびブラインで洗浄し、乾燥させ(MgSO4)、減圧蒸発させ、粘性の黄色油状物を得た。カラムクロマトグラフィーによる精製[biotage isolera、勾配をつけた溶出、ヘキサン60%/EtOAc40%からEtOAc100%、8カラム体積 100g、snap ultra(登録商標)カートリッジ]により、生成物を黄色発泡物として得た(11.8g、88%)。分析データ:RT2.20分;MS(ES+)m/z(相対強度)885([M+H]+.,100)、907([M+Na]+.,50)
(vii)((プロパン−1,3−ジイルビス(オキシ))ビス(2−アミノ−5−メトキシ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−イル)メタノン)(I11)
亜鉛粉末(31.9g、488mmol、40当量)を、1M HClと共に撹拌/超音波処理により10分間活性化した。亜鉛を濾過し、1M HCl、水(×3)およびMeOH(×2)によって洗浄した。活性化された亜鉛を、ニトロ−TBS化合物I10(10.8g、12.2mmol、1当量)をMeOH(88mL)に溶解した溶液、および5%ギ酸/MeOH溶液(440mL)に添加した。温度を37℃に上昇させると、反応混合物が黄色から無色の溶液に変化した。いったん発熱が治まったら(20分.)、LCMSにより、反応が完了したことが示された。反応混合物をセライトで濾過し、EtOAcで洗浄した。EtOAc部分を飽和重炭酸塩溶液(×4)[泡立ちに注意]、水(×1)、ブライン(×1)で洗浄し、乾燥させ(MgSO4)、減圧蒸発させて、黄色固体を得た。フラッシュカラムクロマトグラフィーによる精製[10%増分でn−ヘキサン/EtOAc50/50v/vからEtOAc100%へ]により、生成物を黄色発泡物として得た(9.5g、86%)。分析データ:RT2.12分;MS(ES+)m/z(相対強度)825([M+H]+.,60)、847([M+Na]+.,30)
(c)Alloc−Val−Ala−PABOH(I16)
Figure 2020503250
(i)Alloc−Val−OH(I13)
クロロギ酸アリル(41g、36.2mL、0.34mol、1.2当量)を、L−バリンI12(33.25g、0.28mol、1当量)および炭酸カリウム(58.9g、0.426mol、1.5当量)を水(650mL)およびTHF(650mL)に溶解した撹拌溶液に滴加した)。反応混合物を室温で18時間撹拌した。THFを減圧蒸発させ、残存溶液をジエチルエーテル(またはMTBE)(×2)で抽出した。水性部分を濃HClによってpH2まで酸性化し、DCM(×3)で抽出した。合わせた有機抽出物をブライン(×1)で洗浄し、乾燥させ(MgSO4)、減圧蒸発させ、無色油状物を得た(57.1g)。これを、精製することなく次のステップで使用した。
(ii)Alloc−Val−OSu(I14)
化合物I13(57.1g、0.28mol、1当量)およびN−ヒドロキシスクシンイミド(32.68g、0.28mol、1当量)を脱水THF(800mL)に溶解させた撹拌溶液に、ジシクロヘキシルカルボジイミド(58.6g、0.28mol、1当量)を添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌した。反応混合物を濾過した。固体をTHFで洗浄し、合わせた濾液を減圧濃縮した。油状物/固体残渣をDCMに再溶解させ、0℃で30分間放置した。懸濁液を濾過し、冷DCMで洗浄した。濾液の減圧蒸発により、スクシンイミドエステルを白色固体として得、これを精製することなく次のステップで使用した。
(iii)Alloc−Val−Ala−OH(I15)
Alloc−Val−OSu I14(11.67g、39.0mmol、1当量)をTHF(50mL)に溶解させた溶液を、H−Ala−OH(3.66g、41.08mmol、1.05当量)およびNaHCO3(3.61g、43.03mmol、1.1当量)をTHF(100mL)およびH2O(100mL)に溶解させた溶液に添加した。混合物を、室温で72時間撹拌し、THFを減圧蒸発させた。pHをクエン酸によって3〜4に調整し、白色ガム状物を沈殿させた。これを酢酸エチル(6×150mL)で抽出し、合わせた抽出物をH2O(200mL)、ブライン(200mL)で洗浄し、乾燥させ(MgSO4)、減圧蒸発させ、白色固体を得た。ジエチルエーテル(xs)で摩砕し、純粋な生成物を白色粉末として得た(7.93g、74%)。分析データ:RT2.17分;MS(ES+)m/z(相対強度)295([M+Na]+.,63)、273([M+1]+.,60)。
(iv)Alloc−Val−Ala−PABOH(I16)
EEDQ(4.79g、19.3mmol、1.05当量)を、p−アミノベンジルアルコール(2.38g、19.3mmol、1.05当量)およびAlloc−Val−Ala−OH I15(5.02g、18.4mmol、1.0当量)を脱水THF(100mL)に溶解した溶液に添加した。混合物を、室温で72時間撹拌した。溶媒を減圧蒸発させ、淡褐色固体を得た。固体にジエチルエーテル摩砕し、濾過して、過剰のジエチルエーテルで洗浄した。これにより、生成物を白色固体として得た(6.2g、89%)。分析データ:RT2.50分;MS(ES+)m/z(相対強度)400.6([M+Na]+.,50)、378.6([M+1]+.,60)。
実施例1
Figure 2020503250
Figure 2020503250
(a)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−(3−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(3)
FmocCl(1.97g、7.63mmol)を、THF(65mL)およびH2O(65mL)中のビス−アニリンI11(6.99g、8.48mmol)およびNa2CO3(2.25g、21.2mmol)の撹拌混合物に添加した。混合物を室温で16時間撹拌させ、ここで、LC/MSによる分析により、保持時間2.15分、I%=12における未反応出発物質、および保持時間2.50分、I%=45、ES+m/z1291[M+Na]+.、1269[M+H]+.におけるビス−Fmoc物質と併せて、保持時間2.34分、I%=40、ES+m/z1069[M+Na]+.、1047[M+H]+.において所望のモノFmoc生成物3が示された。層を分離し、水相をDCM(2×20mL)で抽出し、合わせた有機層をH2O(30mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 50g、100mL/分)、橙色発泡物としての純粋なモノFmoc生成物3(2.67g、FmocClを基準にして収率39%、50%ヘキサン/EtOAcで溶出)、未反応ビス−アニリン2(1.78g、100%EtOAcで溶出)、およびビス−Fmoc(3.28g、70%ヘキサン/EtOAcで溶出)を得た。
(b)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−(3−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(4)
トリホスゲン(26mg、86μmol)を、モノFmoc生成物3(250mg、0.24mmol)およびTEA(73μL、53mg、0.53mmol)を脱水DCM(10mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.39分、ES+m/z1127[M+Na]+.、1105[M+H]+.)。混合物を追加のTEA(50μL、36mg、0.36mmol)で処理し、続いて、リンカーI16(90mg、0.24mmol)を添加した。アルゴン下で4時間撹拌した後、LC/MSにより、保持時間2.34分、ES+m/z1472[M+Na]+.、1451[M+H]+.においてカルバマート4への満足できる変換が示された。混合物を、DCM(60mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(2×20mL)、H2O(20mL)、ブライン(30mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 25g、75mL/分)、純粋なカルバマート4(28%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(257mg、収率74%)。
(c)4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル(5−(3−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(5)
ジメチルアミン(16.5mLの2.0M THF溶液、33.0mmol)を、Fmoc保護化合物4(2.39g、1.65mmol)をTHF(46mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。室温で1時間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.92分におけるFmoc開裂副生成物および保持時間1.10分におけるそのDMA付加物と併せて、保持時間2.17分、ES+m/z1250[M+Na]+.、1228[M+H]+.において所望の生成物との反応の完了が示された。混合物を真空蒸発させて粗生成物を得、これをIsolera(商標)によって続いて精製して(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なアニリン5(100%EtOAcで溶出)を橙色発泡物として得た(1.87g、収率92%)。
(d)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−(3−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(6)
トリホスゲン(161mg、0.54mmol)を、アニリン5(1.85g、1.51mmol)およびピリジン(269μL、263mg、3.32mmol)を脱水DCM(20mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.21分、ES+m/z1308[M+Na]+.、1286[M+H]+.)。混合物を追加のピリジン(183μL、179mg、2.27mmol)およびラウリン酸ジブチルスズ(179μL、191mg、0.30mmol)で処理し、続いて、リンカー5a(960mg、1.51mmol)を添加した。アルゴン下で20時間撹拌した後、LC/MSにより、カルバマート6への満足できる変換が示された(保持時間2.25分、ES+m/z1915[M+Na]+.、1892[M+H]+.)。混合物を、DCM(60mL)で希釈し、飽和NH4Cl(2×20mL)、H2O(20mL)、ブライン(30mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート6(42%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(2.01g、収率70%)。
(e)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−(3−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(ヒドロキシメチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(ヒドロキシメチル)−4−メチレンピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(7)
氷酢酸(18mL)を、TBS保護化合物6(2.12g、1.12mmol)をTHF(6mL)およびH2O(6mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌させ、この時間の後、LC/MSによる分析により、保持時間1.79分、ES+m/z1663[M+H]+.、1686[M+Na]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。反応混合物をNaHCO3の冷却(0〜5℃)飽和溶液(300mL)に滴加した。中性溶液を室温に昇温させ、EtOAc(3×100mL)で抽出し、合わせた有機層をH2O(50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−アルコール7(93%DCM/MeOHで溶出)を黄色がかった発泡物として得た(1.43g、収率77%)。
(f)4−(((2S,3R,4S,5S,6S)−6−((アリルオキシ)カルボニル)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−イル)オキシ)−3−ニトロベンジル(11S,11aS)−8−(3−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)プロポキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン10(5H)−カルボキシラート(8)
45%IBX(264mg、0.43mmol)を、ビス−OH7(300mg、0.18mmol)を脱水DMSO(5mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。混合物をアルゴン雰囲気下で30℃に加熱し、反応の進行をLC/MSによってモニタリングした。24時間撹拌した後、追加のIBX(22mg、36μmol)を添加し、混合物をさらに24時間撹拌した。この時点でのLC/MSによる分析により、保持時間1.78分、ES+m/z1682[M+Na]+.において、所望の生成物に相当する単一のピークが主に示された。反応混合物を水(40mL)上に注ぎ、濾過し、沈殿物を収集し、H2O(50mL)で洗浄して、濾液を片側に保持した。残渣(沈殿物)をDCM(120mL)で洗浄し、残存する未溶解の沈殿物を飽和NaHCO3水溶液(60mL)で洗浄した。合わせた濾液を分液漏斗に移し、層を分離した。水相をDCM(2×20mL)で抽出し、合わせた有機層をNaHCO3(2×50mL)、ブライン(60mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 25g、75mL/分)、環化生成物8(94.5%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(261mg、収率87%)。
(g)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−(3−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−アミノ−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)プロポキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(9)
Pd(PPh34(18.2mg、15.7μmol)を、ピロリジン(72μL、62mg、0.87mmol)およびAlloc/アリル化合物8(261mg、0.16mmol)を脱水DCM(3mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物をアルゴン雰囲気下で撹拌させ、ここで、沈殿物が形成し始めた。室温で30分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.13分、ES+m/z1284[M+H]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をジエチルエーテルで摩砕し、続いて、さらに真空蒸発することにより、粗アミン9を固体として得、これをさらに精製または分析することなく、次のステップに供した。
(h)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−(3−(((11S,11aS)−10−(((4−((2S,5S)−37−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)−5−イソプロピル−2−メチル−4,7,35−トリオキソ−10,13,16,19,22,25,28,31−オクタオキサ−3,6,34−トリアザヘプタトリアコンタンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)プロポキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(10)
MAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(132mg、0.18mmol)を脱水DCM(7mL)に溶解させた溶液を、アミン9(202mg、0.16mmol)、ピリジン(24μL、23mg、0.3mmol)およびDMF(0.25mL)の撹拌試料に添加した。反応混合物をアルゴン下で20時間撹拌させると、時間と共に色が暗くなり始めた。LC/MSによる分析により、保持時間1.13分における未反応アミンと併せて、保持時間1.38分、ES+)m/z1857[M+H]+.、1880[M+Na]+において所望の生成物の形成が示された。追加のMAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(66mg、0.09mmol)、ピリジン(12μL、11mg、0.15mmol)およびDCM(3mL)を添加し、混合物をさらに3日間撹拌させた。この時点で、LC/MSによる分析の際、満足できる量の所望の生成物が形成されており、溶媒を真空蒸発によって除去した。粗生成物を分取HPLCによって精製して、マレイミド10を白色固体として得た(55mg、19%):LC/MS(15分間実行)、保持時間5.93分、ES+m/z1857[M+H]+.、1880[M+Na]+.1H NMR(400MHz,d6−DMSO)δ10.0(br s,2H),8.25−8.12(m,1H),7.99(t,1H、J=5.7Hz),7.87(d,1H,J=8.9Hz),7.73(br s,1H),7.62−7.48(m,3H),7.40(d,1H,J=8.7Hz),7.22−7.11(m,2H),7.06(s,2H),7.00(s,2H),6.87(s,2H),6.84−6.76(m,1H),6.68−6.52(m,2H),5.45−5.30(m,3H),5.25−5.01(m,9H),4.97−4.82(m,2H),4.42−4.34(m,1H),4.24−4.17(m,1H),4.16−3.92(m,8H),3.87−3.72(m,6H),3.60(t,4H,J=7.2Hz),3.54−3.42(m,30H),3.39−3.20(m,5H),3.18−3.12(m,2H),2.95−2.82(m,2H),2.57−2.35(m,4H),2.33(t,2H,J=7.4Hz),2.24−2.13(m,2H),2.03−1.90(m,1H),1.30(d,1H,J=7.0Hz),0.87(d,3H,J=6.7Hz),0.83(d,3H,J=6.7Hz)。
実施例2
Figure 2020503250
Figure 2020503250
(a)(S)−(2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)(4−ヒドロキシ−5−メトキシ−2−ニトロフェニル)メタノン(12)
LiOAc(2.11g、20.7mmol)を、TIPS化合物11(12g、20.7mmol)をDMF(67mL)およびH2O(3mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。黄色から赤色への色の変化が観察された。室温で2時間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.83分、ES+m/z445[M+Na]+.、423[M+H]+.において所望の生成物への完全な変換が示された。混合物をH2O(300mL)で希釈し、EtOAc(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層を10%w/vクエン酸(2×200mL)、H2O(200mL)、ブライン(200mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させ、粗生成物12を黄色固体として得た(8.74g、収率100%)。満足できる純度であったため、物質をさらに精製することなく次のステップに供した。
(b)((ペンタン−1,5−ジイルビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)メタノン)(13)
1,5−ジヨードペンタン(1.54mL、3.35g、10.4mmol)を、フェノール12(8.74g、20.7mmol)、TBAI(750mg、2.05mmol)およびK2CO3(3.15g、22.8mmol)を脱水DMF(60mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を70℃に加熱し、アルゴン雰囲気下で16時間撹拌し、この時点で、LC/MSによる分析により、保持時間2.21分、ES+m/z935[M+Na]+.、913[M+H]+.において実質的な生成物形成が示された。反応混合物を室温まで冷却させ、DMFを真空蒸発によって除去した。得られた残渣をEtOAc(200mL)に再溶解させ、水相を水(3×40mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−エーテル13(60%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(6.75g、収率71%)。
(c)((ペンタン−1,5−ジイルビス(オキシ))ビス(2−アミノ−5−メトキシ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)メタノン)(14)
亜鉛末(2.79g、42.8mmol)を1NのHCl(50mL)で処理し、室温で10分間撹拌した。混合物を次いで10分間超音波処理し、活性化亜鉛を焼結真空濾過によって収集し、次いで、1NのHCl(25mL)、H2O(20mL)、MeOH(20mL)で洗浄し、焼結フィルターパッドにおいて真空乾燥した。活性化亜鉛を、ビス−ニトロ化合物13(974mg、1.07mmol)をMeOH(15mL)に溶解させた激しく撹拌された溶液に室温で添加した。反応混合物を5%v/v HCO2HのMeOH溶液(20mL)で滴下処理した。緑色からメタリックグレーへの色の変化、および37℃への発熱が観察された。反応混合物を室温まで冷却させ、この時点で、LC/MSによる分析により、保持時間2.19分、ES+m/z875[M+Na]+.、853[M+H]+.において所望の生成物への完全な変換が示された。混合物を、セライト(登録商標)を通して濾過し、パッドをEtOAc(75mL)で洗浄した。濾液を飽和NaHCO3水溶液(3×20mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗ビス−アニリン14を暗橙色発泡物として得た(840mg、収率92%)。満足できる純度であったため、物質をさらに精製することなく次のステップに供した。
(d)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−((5−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(15)
FmocCl(1.50g、5.93mmol)を、ビス−アニリン14(6.74g、7.91mmol)およびNa2CO3(2.10g、19.8mmol)をTHF(40mL)およびH2O(40mL)に懸濁させた撹拌懸濁液に添加した。混合物を室温で16時間撹拌させ、ここで、LC/MSによる分析により、保持時間2.22分、I%=30における未反応出発物質、および保持時間2.60分、I%=36、ES+m/z1321[M+Na]+.、1298[M+H]+.におけるビス−Fmoc物質と併せて、保持時間2.41分、I%=32、ES+m/z1098[M+Na]+.、1076[M+H]+.において所望のモノFmoc生成物15が示された。混合物をH2O(50mL)およびEtOAc(50mL)の間で分配し、層を分離し、有機層をH2O(30mL)、ブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、橙色発泡物として純粋なモノFmoc生成物15(2.43g、FmocClを基準にして収率38%、58%ヘキサン/EtOAcで溶出)、未反応ビス−アニリン14(3.06g、40%ヘキサン/EtOAcで溶出)、ビス−Fmoc(2.32g、74%ヘキサン/EtOAcで溶出)を得た。
(e)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−((5−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(16)
トリホスゲン(242mg、0.81mmol)を、モノFmoc生成物15(2.43g、2.26mmol)およびTEA(692μL、502mg、4.97mmol)を脱水DCM(30mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.38分、ES+m/z1156[M+Na]+.、1133[M+H]+.)。混合物を追加のTEA(472μL、342mg、3.39mmol)で処理し、続いて、リンカーI16(852mg、2.26mmol)を添加した。アルゴン下で3.5時間撹拌した後、LC/MSにより、保持時間2.33分、ES+m/z1501[M+Na]+.、1479[M+H]+.においてカルバマート16への満足できる変換が示された。混合物を、DCM(50mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(2×20mL)、ブライン(30mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート16(46%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(2.26g、収率68%)。
(f)4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル(5−((5−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(17)
ジメチルアミン(15.0mLの2.0M THF溶液、30.6mmol)を、Fmoc保護化合物16(2.26g、1.65mmol)をTHF(20mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。室温で1時間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.79分におけるFmoc開裂副生成物および保持時間0.97分におけるそのDMA付加物と併せて、保持時間2.17分、ES+m/z1279[M+Na]+.、1257[M+H]+.において所望の生成物との反応の完了が示された。混合物を真空蒸発させて粗生成物を得、これをIsolera(商標)によって続いて精製して(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なアニリン17(18%ヘキサン/EtOAcで溶出)を橙色発泡物として得た(1.94g、収率100%)。
(g)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−((5−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(18)
トリホスゲン(165mg、0.55mmol)を、アニリン17(1.94g、1.54mmol)およびピリジン(274μL、268mg、3.39mmol)を脱水DCM(20mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.21分、ES+m/z1337[M+Na]+.、1315[M+H]+.)。混合物を追加のピリジン(187μL、183mg、2.31mmol)およびラウリン酸ジブチルスズ(179μL、191mg、0.30mmol)で処理し、続いて、リンカー5a(984mg、1.54mmol)を添加した。アルゴン下で18時間撹拌した後、LC/MSにより、保持時間2.23分、ES+m/z1942[M+Na]+.、1920[M+H]+.においてカルバマート18への満足できる変換が示された。混合物を、DCM(30mL)で希釈し、飽和NH4Cl(2×20mL)、H2O(20mL)、ブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート18(43%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(2.17g、収率74%)。
(h)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−((5−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(ヒドロキシメチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(ヒドロキシメチル)−4−メチル−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(19)
氷酢酸(18mL)を、TBS保護化合物18(2.17g、1.13mmol)をTHF(6mL)およびH2O(6mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌させ、この時間の後、LC/MSによる分析により、保持時間1.82分、ES+m/z1691[M+H]+.、1714[M+Na]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。反応混合物をNaHCO3の冷却(0〜5℃)飽和溶液(300mL)に滴加した。中性溶液を室温に昇温させ、EtOAc(3×100mL)で抽出し、合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−アルコール19(96.5%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(1.31g、収率69%)。
(i)4−(((2S,3R,4S,5S,6S)−6−((アリルオキシ)カルボニル)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−イル)オキシ)−3−ニトロベンジル(11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−11,11a−ジヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10(5H)−カルボキシラート(20)
45%IBX(269mg、0.43mmol)を、ビス−OH19(300mg、0.18mmol)を脱水DMSO(5mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。混合物をアルゴン雰囲気下で30℃に加熱し、反応の進行をLC/MSによってモニタリングした。24時間撹拌した後、追加のIBX(22mg、36μmol)を添加し、混合物をさらに24時間撹拌した。この時点でのLC/MSによる分析により、保持時間1.79分、ES+m/z1710[M+Na]+.において生成物の形成が示された。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(100mL)に滴加し、DCM(2×75mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和水性NaHCO3(2×20mL)、H2O(30mL)、ブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 25g、75mL/分)、環化生成物11(97.4%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(136mg、収率46%)。
(j)4−(((2S,3R,4S,5S,6S)−6−((アリルオキシ)カルボニル)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−イル)オキシ)−3−ニトロベンジル(11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−11,11a−ジヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10(5H)−カルボキシラート(20)の代替合成
TEMPO(6.6mg、42μmol)およびDAIB(125mg、0.39mmol)を、ビス−OH19(300mg、0.18mmol)を脱水DCM(15mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。混合物をアルゴン雰囲気下で撹拌し、反応の進行LC/MSによってモニタリングした。24時間撹拌した後、追加のTEMPO(6.6mg、42μmol)およびDAIB(25mg、78μmol)を添加し、混合物をさらに24時間撹拌した。この時点でのLC/MSによる分析により、保持時間1.79分、ES+m/z1710[M+Na]+.において生成物の形成が示された。混合物をDCM(50mL)で希釈し、飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液(40mL)、飽和NaHCO3水溶液(30mL)、ブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 25g、75mL/分)、環化生成物21(96.5%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(231mg、収率78%)。
(k)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−アミノ−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(21)
Pd(PPh34(15.8mg、13.7μmol)を、ピロリジン(63μL、54mg、0.75mmol)およびAlloc/アリル化合物20(231mg、0.14mmol)を脱水DCM(4mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物をアルゴン雰囲気下で撹拌させ、ここで、沈殿物が形成し始めた。室温で30分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.18分、ES+m/z1312[M+H]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をジエチルエーテルで摩砕し、続いて、さらに真空蒸発することにより、粗アミン12を固体として得、これをさらに精製または分析することなく、次のステップに供した。
(l)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((2S,5S)−37−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)−5−イソプロピル−2−メチル−4,7,35−トリオキソ−10,13,16,19,22,25,28,31−オクタオキサ−3,6,34−トリアザヘプタトリアコンタンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(22)
MAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(122mg、0.16mmol)を脱水DCM(5mL)に溶解させた溶液を、アミン21(180mg、0.16mmol)、ピリジン(28μL、27mg、0.34mmol)およびDMF(0.25mL)の撹拌試料に添加した。反応混合物をアルゴン下で20時間撹拌させると、時間と共に色が暗くなり始めた。LC/MSによる分析により、保持時間1.18分における未反応アミンと併せて、保持時間1.43分、ES−m/z1884[M−H]+.において所望の生成物の形成が示された。追加のMAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(66mg、0.09mmol)、ピリジン(12μL、11mg、0.15mmol)およびDCM(3mL)を添加し、混合物をさらに3日間撹拌させた。この時点で、LC/MSによる分析の際、満足できる量の所望の生成物が形成されており、溶媒を真空蒸発によって除去した。粗生成物を分取HPLCによって精製して、マレイミド22を白色固体として得た(55mg、19%):LC/MS(15分間実行)、保持時間5.82分、ES+m/z1886[M+H]+.、1908[M+Na]+.1H NMR(400MHz,d6−DMSO)δ9.98(br s,2H),8.25−8.15(m,1H),7.99(t,1H,J=5.7Hz),7.87(d,1H,J=8.7Hz),7.69(br s,1H),7.62−7.48(m,3H),7.37(d,1H,J=8.9Hz),7.21−7.09(m,2H),7.04(s,1H),7.03(s,1H),6.98(s,2H),6.79(s,1H),6.74(s,1H),6.72−6.65(m,2H),6.62−6.58(m,2H),5.63−5.50(m,2H),5.41−5.32(m,2H),5.25−5.05(m,4H),4.93−4.80(m,2H),4.41−4.32(m,1H),4.23−4.16(m,1H),4.00−3.90(m,4H),3.87−3.72(m,6H),3.70−3.60(m,2H),3.58(t,4H,J=7.2Hz),3.52−3.43(m,28H),3.39−3.20(m,5H),3.18−3.10(m,2H),2.95−2.82(m,2H),2.53−2.34(m,4H),2.31(t,2H,J=7.3Hz),1.99−1.90(m,1H),1.82−1.68(m,4H),1.73(s,6H),1.60−1.47(m,2H),1.28(d,1H,J=7.0Hz),0.85(d,3H,J=6.8Hz),0.81(d,3H,J=6.8Hz)。
実施例3
Figure 2020503250
Figure 2020503250
化合物23は、WO2014/057074における化合物46である。
(a)(5S,5’S)−(4,4’−(ペンタン−1,5−ジイルビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロベンゾイル))ビス(5−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1,3−ジイル)ビス(トリフルオロメタンスルホナート)(24)
無水2,6−ルチジン(8.90mL、8.22g、76.7mmol)を、ビス−ケトン23(5.41g、5.90mmol)を脱水DCM(200mL)に溶解させた撹拌溶液に、シリンジを介してアルゴン雰囲気下、−45℃(乾燥氷/アセトニトリル)で添加した。新しく開けたアンプルから採取した無水トリフルオロメタンスルホン酸無水物(5.96mL、10.0g、35.5mmol)を、次いで、−40℃以下に温度を維持しながらシリンジを介して添加した。反応混合物を−45℃で1時間撹拌させ、この時点で、LC/MSによる分析により、保持時間2.23分、ES+m/z1203[M+Na]+.、1181[M+H]+.において生成物への変換が示された。冷反応混合物をDCM(200mL)でただちに希釈し、水(1×200mL)、5%クエン酸溶液(2×200mL)、飽和NaHCO3水溶液(200mL)、ブライン(300mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−エノールトリフラート3(78%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(5.02g、収率72%)。
(b)((ペンタン−1,5−ジイルビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)メタノン)(25)
Pd(PPh34(196mg、0.17mmol)を、ビス−エノールトリフラート24(5.02g、4.25mmol)、4−メトキシフェニルボロン酸(1.68g、11.1mmol)、Na2CO3(1.44g、13.6mmol)、EtOH(20mL)、トルエン(40mL)および水(20mL)の撹拌混合物に添加した。反応混合物を30℃で加熱し、アルゴン雰囲気下で3時間撹拌し、この時間の後、LC/MSにより、保持時間2.23分、ES+m/z1120[M+Na]+.、1098[M+H]+.において所望の生成物への完全な変換が観察された。反応混合物をEtOAc(200mL)およびH2O(100mL)の間で分配し、水層をEtOAc(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をH2O(2×50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−C2−アリール化合物25(63%ヘキサン/EtOAc溶出)を黄色がかった発泡物として得た(3.11g、収率67%)。
(c)((ペンタン−1,5−ジイルビス(オキシ))ビス(2−アミノ−5−メトキシ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)メタノン)(26)
非活性化亜鉛(4.13g、63.1mmol)を、ビス−ニトロ化合物25(1.73g、1.58mmol)をEtOH(15mL)およびEtOAc(15mL)に溶解させた激しく撹拌された溶液に室温で添加した。反応混合物を、水(1mL)で処理し、次いで5%v/v HCO2HのMeOH溶液(19mL)で滴下処理した。緑色からメタリックグレーへの色の変化、および40℃への発熱が観察された。反応混合物を室温まで冷却させ、この時点で、LC/MSによる分析により、保持時間2.19分、ES+m/z1060[M+Na]+.、1038[M+H]+.において所望の生成物への完全な変換が示された。混合物を、セライト(登録商標)を通して濾過し、パッドをEtOAc(100mL)で洗浄した。濾液を飽和NaHCO3水溶液(3×50mL)[泡立ちに注意]、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗ビス−アニリン26を暗橙色発泡物として得た(1.56g、収率95%)。満足できる純度であったため、物質をさらに精製することなく次のステップに供した。
(d)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−((5−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(27)
FmocCl(1.22g、4.70mmol)を、ビス−アニリン26(6.50g、6.27mmol)およびNa2CO3(1.66g、15.7mmol)をTHF(32mL)およびH2O(32mL)に懸濁させた撹拌懸濁液に添加した。混合物を室温で3時間撹拌させ、ここで、LC/MSによる分析により、保持時間2.19分、I%=24における未反応出発物質、および保持時間2.47分、I%=24、ES+m/z1504[M+Na]+.、1482[M+H]+.におけるビス−Fmoc物質と併せて、保持時間2.33分、I%=51、ES+m/z1282[M+Na]+.、1260[M+H]+.において所望のモノFmoc生成物27が示された。混合物をH2O(50mL)およびEtOAc(75mL)の間で分配し、層を分離し、水相をEtOAc(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層をH2O(30mL)、ブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、橙色発泡物として純粋なモノFmoc生成物27(3.31g、FmocClを基準にして収率56%、53%ヘキサン/EtOAcで溶出)、未反応ビス−アニリン26(2.09g、40%ヘキサン/EtOAcで溶出)、およびビス−Fmoc(1.39g、68%ヘキサン/EtOAcで溶出)を得た。
(e)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−((5−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(28)
トリホスゲン(281mg、0.81mmol)を、モノFmoc生成物27(3.31g、2.63mmol)およびTEA(805μL、584mg、5.79mmol)を脱水DCM(35mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.35分、ES+m/z1340[M+Na]+.、1318[M+H]+.)。混合物を追加のTEA(549μL、398mg、3.95mmol)で処理し、続いて、リンカーI16(992mg、2.63mmol)を添加した。アルゴン下で20時間撹拌した後、LC/MSにより、保持時間2.19分、I%=28、ES+m/z1463[M+Na]+.、1441[M+H]+.におけるFmoc開裂物質29と併せて、保持時間2.33分、I%=40、ES+m/z1685[M+Na]+.において所望のカルバマート28への変換が示された。混合物をDCM(40mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(2×30mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、Fmoc開裂生成物29(1.31g、20%ヘキサン/EtOAcで溶出)と併せて、純粋なカルバマート28を黄色発泡物として得た(1.64g、収率38%、40%ヘキサン/EtOAcで溶出)。
(f)4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル(5−((5−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(29)
ジメチルアミン(9.9mLの2.0M THF溶液、19.7mmol)を、Fmoc保護化合物28(1.64g、0.99mmol)をTHF(15mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。室温で1.5時間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間0.97分における生成物DMA付加物によるFmoc開裂と併せて、保持時間2.19分、ES+m/z1463[M+Na]+.、1441[M+H]+.において所望の生成物との反応の完了が示された。混合物を真空蒸発させて粗生成物を得、これをIsolera(商標)によって続いて精製して(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なアニリン29(20%ヘキサン/EtOAcで溶出)を橙色発泡物として得た(1.36g、収率96%)。
(g)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−((5−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(30)
トリホスゲン(198mg、0.67mmol)を、アニリン29(2.67g、1.85mmol)およびピリジン(329μL、322mg、4.07mmol)を脱水DCM(25mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.22分、ES+m/z1521[M+Na]+.、1499[M+H]+.)。混合物を追加のピリジン(224μL、220mg、2.78mmol)およびラウリン酸ジブチルスズ(219μL、234mg、0.37mmol)で処理し、続いて、リンカー5a(1.18g、1.85mmol)を添加した。アルゴン下で16時間撹拌した後、LC/MSにより、イソシアナートの消費およびリンカー5aのシグナル強度の減少が示されたが、保持時間2.23分における所望の生成物に関するM2+は示されなかった。混合物をDCM(30mL)で希釈し、飽和NH4Cl(2×30mL)、ブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘキサン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート30(39%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(2.40g、収率62%)。
(h)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−((5−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(ヒドロキシメチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)ペンチル)オキシ)−2−((S)−2−(ヒドロキシメチル)−4−(4−メトキシフェニル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(31)
氷酢酸(21mL)を、TBS保護化合物30(2.40g、1.14mmol)をTHF(7mL)およびH2O(7mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を室温で16時間撹拌させ、この時間の後、LC/MSによる分析により、保持時間1.88分、ES+m/z1876[M+H]+.、1898[M+Na]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。反応混合物をNaHCO3の冷却(0〜5℃)飽和溶液(350mL)に滴加した。中性溶液を室温に昇温させ、EtOAc(200mL)で分配した。水相をEtOAc(2×50mL)で抽出し、合わせた有機層をNaHCO3(2×60mL)、ブライン(70mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−アルコール31(95.6%DCM/MeOH溶出)を黄色がかった発泡物として得た(2.07g、収率97%)。
(i)4−(((2S,3R,4S,5S,6S)−6−((アリルオキシ)カルボニル)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−イル)オキシ)−3−ニトロベンジル(11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−(4−メトキシフェニル)−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−(4−メトキシフェニル)−5−オキソ−11,11a−ジヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10(5H)−カルボキシラート(32)
Cu(NCCH34・CF3SO3(2mg、5.3μmmol)を、ビス−OH31(100mg、53μmmol)およびStahl好気的酸化TEMPO溶液(27μLの0.2M CH3CN溶液、5.3μmmol)をCH3CN(1mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を空気雰囲気(バルーン)下で3時間撹拌させ、この時点で、LC/MSによる分析により、保持時間またはES+の明らかな変化は示されなかった。追加のCu(NCCH34・CF3SO3(2mg、5.3μmmol)およびStahl好気的酸化TEMPO溶液(27μLの0.2M CH3CN溶液、5.3μmmol)を添加し、反応混合物をさらに16時間撹拌させた。再びLC/MSによって分析すると、保持時間の変化は示されなかったが、ES+により、出発物質のm/zの非存在および所望の生成物の強い存在m/z1894[M+Na]+.が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をIsolera(商標)によって精製して(DCM/MeOH、SNAP Ultra 10g、36mL/分)、環化生成物32(96.2%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(91mg、収率92%)。
(j)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−アミノ−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−(4−メトキシフェニル)−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−(4−メトキシフェニル)−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(33)
Pd(PPh34(15.0mg、12.8μmol)を、ピロリジン(59μL、50mg、0.70mmol)およびAlloc/アリル化合物32(240mg、0.13mmol)を脱水DCM(5mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物をアルゴン雰囲気下で撹拌させ、室温で30分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.31分、ES+m/z1496[M+H]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をジエチルエーテルで摩砕し、超音波処理し、続いて、さらなる真空蒸発により、粗アミン33を黄色固体として得、これを、さらに精製または分析することなく次のステップに供した。
(k)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((2S,5S)−37−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)−5−イソプロピル−2−メチル−4,7,35−トリオキソ−10,13,16,19,22,25,28,31−オクタオキサ−3,6,34−トリアザヘプタトリアコンタンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−(4−メトキシフェニル)−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−(4−メトキシフェニル)−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(34)
MAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(114mg、0.15mmol)を脱水DCM(5mL)に溶解させた溶液を、アミン33(191mg、0.13mmol)およびピリジン(26μL、25mg、0.32mmol)の撹拌試料に添加した。反応混合物をアルゴン下で20時間撹拌させると、時間と共に色が暗くなり始めた。LC/MSによる分析により、保持時間1.31分における未反応アミンと併せて、保持時間1.59分(M2+の所望のm/zは、反応モニタリングの際には検出されなかった)において所望の生成物の形成が示された。追加のMAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(114mg、0.15mmol)、ピリジン(26μL、25mg、0.32mmol)およびDCM(3mL)を添加し、混合物をさらに6日間撹拌させた。この時点で、LC/MSによる分析の際、満足できる量の所望の生成物が形成されており、溶媒を真空蒸発によって除去した。粗生成物をIsolera(商標)(DCM/MeOH、SNAP Ultra 10g、36mL/分、82%DCM/MeOHで溶出)、続いて分取HPLCによって精製して、マレイミド34を僅かに黄色の固体として得た(46mg、13%):LC/MS(15分間実行)、保持時間6.71分、ES+m/z1036[M2+.+H]、1058[M2++Na]、1046[M+Na]2+1H NMR(400MHz,d6−DMSO)δ10.02(br s,2H),8.27−8.16(m,1H),8.01(t,1H,J=5.6Hz),7.90(d,1H,J=8.6Hz),7.72(br s,1H),7.60−7.51(m,3H),7.46−7.38(m,5H),7.23−7.15(m,2H),7.11(s,1H),7.09(s,1H),6.99(s,2H),6.92(d,2H,J=8.9Hz),6.91(d,2H,J=8.9Hz),6.88−6.77(m,6H),5.70−5.60(m,2H),5.39−5.33(m,2H),5.24−5.09(m,4H),4.96−4.81(m,2H),4.42−4.34(m,1H),4.24−4.17(m,1H),4.04−3.93(m,4H),3.87−3.79(m,8H),3.77(s,6H),3.59(t,4H,J=7.3Hz),3.52−3.46(m,28H),3.40−3.26(m,7H,H2Oによって見えない)、3.19−3.11(m,2H),2.95−2.82(m,2H),2.53−2.31(m,4H),2.02−1.92(m,1H),1.86−1.73(m,4H),1.62−1.52(m,2H),1.30(d,1H,J=7.0Hz),0.87(d,3H,J=6.7Hz),0.83(d,3H,J=6.8Hz)。
実施例4
Figure 2020503250
Figure 2020503250
(a)4,4’−((1,3−フェニレンビス(メチレン))ビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロベンズアルデヒド)(36)
1,3−ビス(ブロモメチル)ベンゼン(5.0g、19.1mmol)を、フェノール35(7.5g、38.2mmol)、TBAI(705mg、1.91mmol)およびK2CO3(5.81g、42.0mmol)を脱水DMF(60mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を70℃に加熱し、アルゴン雰囲気下で2時間撹拌し、この時点で、LC/MSによる分析により、保持時間1.67分、ES+m/z519[M+Na]+.、497[M+H]+.において実質的な生成物形成が示された。反応混合物を室温まで冷却させ、DMFを真空蒸発によって除去した。得られた残渣を水(300mL)で希釈し、橙色沈殿物36を真空濾過によって収集し、次いでH2O、ジエチルエーテルで洗浄し、真空オーブンにおいて一定重量まで乾燥させた(9.18g、収率97%)。
(b)4,4’−((1,3−フェニレンビス(メチレン))ビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロ安息香酸)(37)
亜塩素酸ナトリウム(8.44g、92.7mmol、80%工業銘柄)およびリン酸二水素ナトリウム(一塩基性)(6.2g、51.8mmol)を水(140mL)に溶解させた溶液を、アルデヒド36(9.18g、18.5mmol)をテトラヒドロフラン(100mL)に溶解させた溶液に室温で添加した。過酸化水素(30%w/w、53mL、518mmol)を激しく撹拌させた二相性混合物にただちに滴加した。橙色から淡黄色への色の変化および懸濁液の溶解と併せて、泡立ちおよび30℃への発熱が観察された。反応混合物を氷浴において冷却し、濃塩酸によってpH2に酸性化した。反応混合物を次いでEtOAc(4×150mL)で抽出し、合わせた有機層をブライン(2×100mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗酸37を得た。固体をジエチルエーテルで摩砕し、真空オーブンにおいて一定重量まで乾燥させた(9.90g、収率>100%)。LC/MSによる十分な純度(保持時間1.56分、ES−m/z527[M+H]+.)。
(c)(((1,3−フェニレンビス(メチレン))ビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−イル)メタノン)(38)
DMF(12滴)を、ビス−ニトロ安息香酸37(9.90g、18.7mmol)および塩化オキサリル(4.9mL、7.1g、56.3mmol)を無水DCM(130mL)に懸濁させた撹拌懸濁液に添加した。最初の泡立ちの後、反応懸濁液が溶液になり、混合物を室温で16時間撹拌させた。溶媒の大部分を真空蒸発によって除去し、濃縮された溶液をジエチルエーテルで摩砕した。得られた黄色沈殿物(MeOH中でサンプリングしたLC/MSにより、保持時間1.69分、ES+m/z579[M+Na]+.においてメチルエステルが得られた)を真空濾過によって収集し、冷ジエチルエーテルで洗浄し、真空オーブンにおいて40℃で1時間乾燥させた。固体の酸塩化物を、(S)−(+)−2−ピロリジンメタノール(4.35g、4.25mL、43.0mmol)およびTEA(13.0mL、9.46g、93.5mmol)をDCM(100mL)に懸濁させた撹拌懸濁液に一部ずつ−40℃(乾燥氷/CH3CN)で添加した。1時間撹拌した後、保持時間1.44分、ES+m/z717[M+Na]+.、695[M+H]+.においてもっぱら所望の生成物のみであることによってLC/MSによって判断されるように反応が完了した。混合物をDCM(100mL)で希釈し、1N HCl(3×50mL)、飽和NaHCO3(3×40mL)、ブライン(70mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過し、溶媒を真空蒸発させて、純粋な生成物38を黄色固体として得た(12.7g、収率100%)。
(d)(((1,3−フェニレンビス(メチレン))ビス(オキシ))ビス(5−メトキシ−2−ニトロ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−イル)メタノン)(39)
TBSCl(8.27g、54.9mmol)を、ビス−アルコール38(12.7g、18.3mmol)およびイミダゾール(7.47g、110mmol)を脱水DCM(100mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。室温で1.5時間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間2.11分、ES+m/z946[M+Na]+.、924[M+H]+.において所望の生成物への完全な変換が示された。混合物をDCM(100mL)で希釈し、水(2×75mL)、ブライン(80mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過し、溶媒を真空蒸発させて、粗生成物39を黄色発泡物として得た(16.7g、収率99%)。物質は十分に純粋であり、さらに精製することなく次のステップに供した。
(e)(((1,3−フェニレンビス(メチレン))ビス(オキシ))ビス(2−アミノ−5−メトキシ−4,1−フェニレン))ビス(((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−イル)メタノン)(40)
非活性化亜鉛(18.5g、282mmol)を、ビス−ニトロ化合物39(6.50g、7.10mmol)をEtOH(65mL)およびEtOAc(65mL)に溶解させた激しく撹拌された溶液に室温で添加した。反応混合物を、水(6.5mL)で処理し、次いで、5%v/v HCO2HのEtOH溶液(130mL)で滴下処理した。緑色からメタリックグレーへの色の変化、および37℃への発熱が観察された。反応混合物を室温まで冷却させ、この時点で、LC/MSによる分析により、保持時間2.04分、ES+m/z885[M+Na]+.、863[M+H]+.において所望の生成物への完全な変換が示された。混合物を、セライト(登録商標)を通して濾過し、パッドをEtOAc(200mL)で洗浄した。濾液を飽和NaHCO3水溶液(3×100mL)[泡立ちに注意]、ブライン(150mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗ビス−アニリン40を暗橙色発泡物として得た(5.41g、収率89%)。満足できる純度であったため、物質をさらに精製することなく次のステップに供した。
(f)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−((3−((5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(41)
FmocCl(1.43g、5.50mmol)を、ビス−アニリン40(6.34g、7.35mmol)およびNa2CO3(1.95g、18.4mmol)をTHF(32mL)およびH2O(32mL)に懸濁させた撹拌懸濁液に添加した。混合物を室温で2時間撹拌させ、ここで、LC/MSによる分析により、保持時間2.03分、I%=19における未反応出発物質、および保持時間2.39分、I%=40、ES+m/z1330[M+Na]+.、1308[M+H]+.におけるビス−Fmoc物質と併せて、保持時間2.24分、I%=41、ES+m/z1108[M+Na]+.、1086[M+H]+.において所望のモノFmoc生成物41が示された。混合物をH2O(50mL)およびEtOAc(50mL)の間で分配し、層を分離し、有機層をH2O(30mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、橙色発泡物として純粋なモノFmoc生成物41(2.40g、FmocClを基準にして40%、30%ヘプタン/EtOAcで溶出)、未反応ビス−アニリン40(1.72g、100%EtOAcで溶出)、およびビス−Fmoc(1.95g、69%ヘプタン/EtOAcで溶出)を得た。
(g)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−((3−((5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(42)
トリホスゲン(236mg、0.80mmol)を、モノFmoc生成物41(2.40g、2.21mmol)およびTEA(676μL、491mg、4.86mmol)を脱水DCM(30mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.27分、ES+m/z1166[M+Na]+.、1144[M+H]+.)。混合物を追加のTEA(461μL、335mg、3.32mmol)で処理し、続いて、リンカーI16(835mg、2.21mmol)を添加した。アルゴン下で2.5時間撹拌した後、LC/MSにより、保持時間2.24分、ES+m/z1511[M+Na]+.、1489[M+H]+.においてカルバマート9への満足できる変換が示された。混合物をDCM(50mL)で希釈し、飽和水性NH4Cl(2×40mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート42(38%ヘプタン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(2.40g、収率73%)。
(h)4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル(5−((3−((5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(43)
ジメチルアミン(16.1mLの2.0M THF溶液、32.2mmol)を、Fmoc保護化合物42(2.40g、1.61mmol)をTHF(20mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。室温で1時間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.74分におけるFmoc開裂副生成物および保持時間0.95分におけるそのDMA付加物と併せて、保持時間2.07分、ES+m/z1289[M+Na]+.、1267[M+H]+.において所望の生成物との反応の完了が示された。混合物を真空蒸発させて粗生成物を得、これをIsolera(商標)によって続いて精製して(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なアニリン43(100%EtOAcで溶出)を白色発泡物として得た(1.77g、収率87%)。
(i)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−((3−((5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(44)
トリホスゲン(150mg、0.50mmol)を、アニリン43(1.77g、1.40mmol)およびピリジン(249μL、243mg、3.08mmol)を脱水DCM(20mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.11分、ES+m/z1347[M+Na]+.、1325[M+H]+.)。混合物を追加のピリジン(170μL、166mg、2.10mmol)およびラウリン酸ジブチルスズ(165μL、177mg、0.28mmol)で処理し、続いて、リンカー5a(891mg、1.40mmol)を添加した。アルゴン下で24時間撹拌した後、LC/MSにより、保持時間2.16分、ES+m/z1952[M+Na]+.、1930[M+H]+.においてカルバマート44への満足できる変換が示された。混合物を、DCM(40mL)で希釈し、飽和NH4Cl(2×35mL)、ブライン(30mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート44(32%ヘプタン/EtOAcで溶出)を白色固体として得た(2.16g、収率80%)。
(j)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−((3−((5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−2−((S)−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(45)
氷酢酸(18mL)を、TBS保護化合物44(2.16g、1.12mmol)をTHF(6mL)およびH2O(6mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を室温で5時間撹拌させ、この時間の後、LC/MSによる分析により、保持時間1.77分、ES+m/z1702[M+H]+.、1724[M+Na]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。反応混合物をNaHCO3の冷却(0〜5℃)飽和溶液(300mL)に滴加した。中性溶液を室温に昇温させ、EtOAc(3×50mL)で抽出し、合わせた有機層をブライン(60mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−アルコール45(94.8%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(1.86g、収率98%)。
(k)4−(((2S,3R,4S,5S,6S)−6−((アリルオキシ)カルボニル)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−イル)オキシ)−3−ニトロベンジル(11S,11aS)−8−((3−((((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10(5H)−カルボキシラート(46)
45%IBX(263mg、0.42mmol)を、ビス−OH45(300mg、0.18mmol)を脱水DMSO(4mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。混合物をアルゴン雰囲気下で30℃に加熱し、反応の進行をLC/MSによってモニタリングした。24時間撹拌した後、追加のIBX(2×22mg、2×36μmol)を添加し、混合物をさらに28時間撹拌させた。この時点でのLC/MSによる分析により、保持時間1.72分、ES+m/z1698[M+H]+.,1720[M+Na]+.において分解生成物の形成が示された。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(100mL)に滴加し、DCM(2×40mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 25g、75mL/分)、環化生成物46(96.5%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(219mg、収率73%)。
(l)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−((3−((((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−アミノ−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(47)
Pd(PPh34(13.0mg、11.1μmol)を、ピロリジン(51μL、43mg、0.61mmol)およびAlloc/アリル化合物46(189mg、0.11mmol)を脱水DCM(2mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物をアルゴン雰囲気下、室温で30分間撹拌させ、ここで、LC/MSによる分析により、保持時間1.13分、ES+m/z1322[M+H]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をジエチルエーテルで摩砕し、続いて、さらに真空蒸発することにより、粗アミン47を固体として得、これをさらに精製または分析することなく、次のステップに供した。
(m)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−((3−((((11S,11aS)−10−(((4−((2S,5S)−37−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)−5−イソプロピル−2−メチル−4,7,35−トリオキソ−10,13,16,19,22,25,28,31−オクタオキサ−3,6,34−トリアザヘプタトリアコンタンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)メチル)ベンジル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(48)
MAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(123mg、0.16mmol)を脱水DCM(2mL)に溶解させた溶液を、アミン47(147mg、0.11mmol)およびピリジン(22μL、22mg、0.28mmol)の撹拌試料に添加した。反応混合物をアルゴン下で20時間撹拌させると、時間と共に色が暗くなり始めた。LC/MSによる分析により、保持時間1.13分における微量の未反応アミンと併せて、保持時間1.37分、ES+m/z1896[M+H]+.、1918[M+Na]+.において所望の生成物の形成が示された。生成物および溶媒の実質的な分解を真空蒸発によって除去した。粗生成物を分取HPLCによって精製して、マレイミド48を白色固体として得た(75mg、36%):LC/MS(15分間実行)、保持時間5.48分、ES+m/z1896[M+H]+.、1918[M+Na]+.1H NMR(400MHz,d6−DMSO)δ9.92(br s,2H),8.20−8.14(m,1H),8.01(t,1H,J=5.6Hz),7.87(d,1H,J=8.7Hz),7.73(br s,1H),7.62−7.36(m,8H),7.23−7.15(m,2H),7.11(s,1H),7.09(s,1H),7.00(s,2H),6.99(s,1H),6.94(s,1H),6.62−6.51(m,2H),5.53−5.41(m,3H),5.35−5.85(m,9H),4.41−4.32(m,1H),4.23−4.16(m,1H),4.00−3.90(m,2H),3.81(s,3H),3.80(s,3H),3.61−3.58(m,4H),3.52−3.45(m,28H),3.42−3.23(m,9H),3.18−3.12(m,2H),2.50−2.35(m,2H),2.34−2.31(m,2H),2.10−1.8(m,9H),1.28(d,1H,J=7.1Hz),0.87(d,3H,J=6.7Hz),0.83(d,3H,J=6.8Hz)。
実施例5
Figure 2020503250
Figure 2020503250
(a)(9H−フルオレン−9−イル)メチル(5−(3−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(50)
FmocCl(1.58g、6.09mmol)を、THF(35mL)およびH2O(35mL)中のビス−アニリン49(6.50g、8.12mmol)およびNa2CO3(2.15g、20.3mmol)の撹拌混合物に添加した。混合物を室温で2.5時間撹拌させ、ここで、LC/MSによる分析により、保持時間1.96分、I%=19における未反応出発物質、および保持時間2.34分、I%=32、ES+m/z1270[M+Na]+.、1246[M+H]+.におけるビス−Fmoc物質と併せて、保持時間2.19分、I%=49、ES+m/z1046[M+Na]+.、1024[M+H]+.において所望のモノFmoc生成物50が示された。混合物をH2O(50mL)およびEtOAc(50mL)の間で分配した。層を分離し、水相をEtOAc(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層をH2O(30mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、橙色発泡物として純粋なモノFmoc生成物50(3.61g、FmocClを基準にして収率58%、61%ヘプタン/EtOAcで溶出)、未反応ビス−アニリン2(2.04g、100%EtOAcで溶出)、およびビス−Fmoc(1.71g、30%ヘプタン/EtOAcで溶出)を得た。
(b)4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル(5−(3−(5−((((9H−フルオレン−9−イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(51)
トリホスゲン(377mg、1.27mmol)を、モノFmoc生成物50(3.61g、3.53mmol)およびTEA(1.08mL、784mg、7.70mmol)を脱水DCM(40mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.23分、ES+m/z1104[M+Na]+.、1082[M+H]+.)。混合物を追加のTEA(737μL、535mg、5.30mmol)で処理し、続いて、リンカーI16(1.33g、3.53mmol)を添加した。アルゴン下で2.5時間撹拌した後、LC/MSにより、保持時間2.21分、ES+m/z1449[M+Na]+.、1427[M+H]+.においてカルバマート51への満足できる変換が示された。混合物をDCM(50mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(2×30mL)、H2O(30mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート51(40%ヘキサン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(3.34g、収率66%)。
(c)4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル(5−(3−(5−アミノ−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバマート(52)
ジメチルアミン(23.4mLの2.0M THF溶液、46.8mmol)を、Fmoc保護化合物51(3.34g、2.34mmol)をTHF(15mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下、室温で1時間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.72分におけるFmoc開裂副生成物および保持時間0.93分におけるそのDMA付加物と併せて、保持時間2.02分、ES+m/z1227[M+Na]+.、1205[M+H]+.において所望の生成物との反応の完了が示された。混合物を真空蒸発させて粗生成物を得、これをIsolera(商標)によって続いて精製して(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なアニリン52(100%EtOAcで溶出)を橙色発泡物として得た(2.51g、収率89%)。
(d)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−(3−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(53)
トリホスゲン(222mg、0.75mmol)を、アニリン52(2.51g、2.08mmol)およびピリジン(370μL、362mg、4.58mmol)を脱水DCM(30mL)に溶解させた撹拌溶液に室温で添加した。アルゴン下で10分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、イソシアナートへの完全な変換が示された(MeOHでサンプリングしてメチルカルバマートを得た、保持時間2.06分、ES+m/z1285[M+Na]+.、1263[M+H]+.)。混合物を追加のピリジン(252μL、247mg、3.12mmol)およびラウリン酸ジブチルスズ(247μL、263mg、0.42mmol)で処理し、続いて、リンカー5a(1.33g、2.08mmol)を添加した。アルゴン下で28時間撹拌した後、LC/MSにより、カルバマート53への満足できる変換が示された(保持時間2.12分、ES+m/z1890[M+Na]+.、1868[M+H]+.)。混合物を、DCM(40mL)で希釈し、飽和NH4Cl(3×30mL)で洗浄し、ブライン(50mL)、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(ヘプタン/EtOAc、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、純粋なカルバマート53(37%ヘプタン/EtOAcで溶出)を黄色発泡物として得た(3.12g、収率80%)。
(e)アリル(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((5−(3−(5−((((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)アミノ)−4−((S)−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボニル)−2−メトキシフェノキシ)プロポキシ)−2−((S)−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボニル)−4−メトキシフェニル)カルバモイル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボキシラート(54)
氷酢酸(24mL)を、TBS保護化合物53(3.12g、1.67mmol)をTHF(8mL)およびH2O(8mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌させ、この時間の後、LC/MSによる分析により、保持時間1.72分、ES+m/z1640[M+H]+.、1662[M+Na]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。反応混合物をNaHCO3の冷却(0〜5℃)飽和溶液(450mL)に滴加した。中性溶液を室温に昇温させ、EtOAc(3×80mL)で抽出し、合わせた有機層をブライン(80mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 100g、100mL/分)、ビス−アルコール54(96.6%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(2.05g、収率75%)。
(f)4−(((2S,3R,4S,5S,6S)−6−((アリルオキシ)カルボニル)−3,4,5−トリス(((アリルオキシ)カルボニル)オキシ)テトラヒドロ−2H−ピラン−2−イル)オキシ)−3−ニトロベンジル(11S,11aS)−8−(3−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(((アリルオキシ)カルボニル)アミノ)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)プロポキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10(5H)−カルボキシラート(55)
45%IBX(273mg、0.44mmol)を、ビス−OH(54)(300mg、0.18mmol)を脱水DMSO(4mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。混合物をアルゴン雰囲気下で30℃に加熱し、反応の進行をLC/MSによってモニタリングした。24時間撹拌した後、追加のIBX(26mg、42μmol)を添加し、混合物をさらに24時間撹拌した。この時点でのLC/MSによる分析により、保持時間1.68分、ES+m/z1658[M+Na]+.において、所望の生成物に相当する単一のピークが主に示された。反応混合物を冷却飽和NaHCO3水溶液(100mL)に滴加し、DCM(2×40mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、濾過および真空蒸発させて、粗生成物を得た。Isolera(商標)による精製により(DCM/MeOH、SNAP Ultra 25g、75mL/分)、環化生成物55(97%DCM/MeOHで溶出)を白色発泡物として得た(256mg、収率87%)。
(g)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−(3−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−アミノ−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)プロポキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(56)
Pd(PPh34(18.1mg、15.7μmol)を、ピロリジン(72μL、62mg、0.86mmol)およびAlloc/アリル化合物55(256mg、0.16mmol)を脱水DCM(2mL)に溶解させた撹拌溶液に添加した。反応混合物をアルゴン雰囲気下で撹拌させ、ここで、沈殿物が形成し始めた。室温で30分間撹拌した後、LC/MSによる分析により、保持時間1.07分、ES+m/z1260[M+H]+.において観察された所望の生成物との反応の完了が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をジエチルエーテルで摩砕し、続いて、さらに真空蒸発することにより、粗アミン56を固体として得、これをさらに精製または分析することなく、次のステップに供した。
(h)(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−(3−(((11S,11aS)−10−(((4−((2S,5S)−37−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)−5−イソプロピル−2−メチル−4,7,35−トリオキソ−10,13,16,19,22,25,28,31−オクタオキサ−3,6,34−トリアザヘプタトリアコンタンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)プロポキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(57)
MAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(140mg、0.19mmol)を脱水DCM(2mL)に溶解させた溶液を、アミン56(198mg、0.16mmol)、ピリジン(32μL、31mg、0.39mmol)およびDMF(0.25mL)の撹拌試料に添加した。反応混合物をアルゴン下で20時間撹拌させると、時間と共に色が暗くなり始めた。LC/MSによる分析により、保持時間1.07分における未反応アミンと併せて、保持時間1.31分、ES+m/z1834[M+H]+.、1857[M+Na]+において所望の生成物の形成が示された。追加のMAL−dPEG(登録商標)8−TFPエステル(70mg、0.09mmol)、ピリジン(16μL、16mg、0.2mmol)およびDCM(2mL)を添加し、混合物をさらに24時間撹拌させた。次いで溶媒の体積を真空蒸発によって50%低減させ、この時点で、LC/MSによる分析の際、満足できる量の所望の生成物が形成されており、溶媒を真空蒸発によって完全に除去した。粗生成物を分取HPLCによって精製して、マレイミド56を白色固体として得た(48mg、17%):LC/MS(15分間実行)、保持時間5.22分、ES+m/z1834[M+H]+.、1856[M+Na]+.1H NMR(400MHz,d6−DMSO)δ9.99(br s,2H),8.24−8.17(m,1H),8.01(t,1H,J=5.6Hz),7.88(d,1H,J=8.7Hz),7.74(br s,1H),7.64−7.50(m,3H),7.44−7.34(m,1H),7.23−7.13(m,2H),7.06(s,2H),7.00(s,2H),6.86(s,1H),6.79(s,1H),6.59−6.47(m,2H),5.52−5.37(m,3H),5.32−5.02(m,4H),4.98−4.84(m,2H),4.44−4.34(m,1H),4.24−4.19(m,1H),4.17−3.96(m,5H),3.92−3.84(m,1H),3.77(s,6H),3.60(t,4H,J=7.3Hz),3.54−3.45(m,29H),3.40−3.24(m,8H),3.19−3.12(m,2H),2.57−2.35(m,2H),2.34−2.30(m,2H),2.25−2.12(m,2H),2.10−1.78(m,9H),1.30(d,1H,J=6.9Hz),0.87(d,3H,J=6.7Hz),0.83(d,3H,J=6.7Hz)。
実施例6
Figure 2020503250
(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−(3−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(6−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)ヘキサンアミド)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)プロポキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチレン−5−オキソ−2,3,5,10,11,11a−ヘキサヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(58)
6−マレイミドヘキサン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(51mg、0.17mmol)を脱水DCM(2mL)に溶解させた溶液を、アミン9(141mg、0.11mmol)、ピリジン(22μL、21mg、0.33mmol)およびDMF(0.25mL)の撹拌試料に添加した。反応混合物をアルゴン下で20時間撹拌させると、時間と共に色が暗くなり始めた。LC−MSによる分析により、保持時間1.12分における微量の未反応アミンと併せて、保持時間1.42分、ES−m/z1474[M−H]-.において所望の生成物の形成が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をIsolera(商標)によって精製し(DCM/MeOH、SNAP Ultra 10g、36mL/分、80%DCM/MeOHで溶出)、90mgの富化物58を得た。分取HPLCによるさらなる精製により、マレイミド58を白色固体として得た(26mg、16%):LC−MS(15分間実行)、保持時間5.85分、ES+m/z1477[M+H]+.、1499[M+Na]+.1H NMR(400MHz,d6−DMSO)δ10.0(br s,2H),8.16(d,1H,J=7.0Hz),7.80(d,1H,J=8.6Hz),7.74(br s,1H),7.62−7.50(m,3H),7.39(d,1H,J=8.7Hz),7.22−7.11(m,2H),7.06(s,2H),7.00(s,2H),6.89(s,2H),6.84−6.78(m,1H),6.68−6.56(m,2H),5.45−5.30(m,3H),5.29−5.01(m,9H),4.98−4.85(m,2H),4.42−4.33(m,1H),4.24−3.92(m,9H),3.77(s,6H),3.44(t,2H,J=9.5Hz),3.39−3.30(m,2H),2.93−2.80(m,2H),2.57−2.35(m,2H),2.23−2.06(m,4H)2.03−1.90(m,1H),1.48(p,4H,J=7.3Hz),1.30(d,3H,J=7.0Hz),1.18(p,2H,J=7.6Hz),0.86(d,3H,J=6.7Hz),0.83(d,3H,J=6.7Hz)。
実施例7
Figure 2020503250
(2S,3S,4S,5R,6S)−6−(4−((((11S,11aS)−8−((5−(((11S,11aS)−10−(((4−((S)−2−((S)−2−(6−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)ヘキサンアミド)−3−メチルブタンアミド)プロパンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−8−イル)オキシ)ペンチル)オキシ)−11−ヒドロキシ−7−メトキシ−2−メチル−5−オキソ−5,10,11,11a−テトラヒドロ−1H−ピロロ[2,1−c][1,4]ベンゾジアゼピン−10−カルボニル)オキシ)メチル)−2−ニトロフェノキシ)−3,4,5−トリヒドロキシテトラヒドロ−2H−ピラン−2−カルボン酸(59)
6−マレイミドヘキサン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(42mg、0.14mmol)を脱水DCM(2mL)に溶解させた溶液を、アミン21(118mg、0.09mmol)およびピリジン(18μL、18mg、0.23mmol)の撹拌試料に添加した。反応混合物をアルゴン下で24時間撹拌させたところ、時間と共に色が暗くなり始めた。LC−MSによる分析により、保持時間1.15分における微量の未反応アミンと併せて、保持時間1.45分、ES−m/z1502[M−H]-.において所望の生成物の形成が示された。溶媒を真空蒸発によって除去し、得られた残渣をIsolera(商標)によって精製し(DCM/MeOH、SNAP Ultra 10g、36mL/分、66%DCM/MeOHで溶出)、76mgの富化物59を得た。分取HPLCによるさらなる精製により、マレイミド59を白色固体として得た(27mg、20%):LC−MS(15分間実行)、保持時間6.13分、ES+m/z1505[M+H]+.、1527[M+Na]+.1H NMR(400MHz,d6−DMSO)δ9.95(br s,2H),8.15(d,1H,J=6.9Hz),7.80(d,1H,J=8.7Hz),7.87(d,1H,J=8.7Hz),7.71(br s,1H),7.62−7.48(m,3H),7.39(d,1H,J=8.6Hz),7.21−7.12(m,2H),7.06(s,1H),7.05(s,1H),6.99(s,2H),6.82(s,1H),6.76(s,1H),6.72−6.65(m,2H),6.62(s,2H),5.63−5.50(m,2H),5.48−5.40(m,2H),5.31−5.08(m,6H),4.98−4.82(m,3H),4.43−4.34(m,1H),4.21−4.14(m,1H),4.03−3.86(m,4H),3.79(s×2、6H),3.72−3.61(m,2H),3.38−3.35(m,2H),2.98−2.85(m,2H),2.59−2.42(m,2H),2.23−2.06(m,2H),2.00−1.88(m,1H),1.82−1.68(m,4H),1.74(s,6H),1.61−1.41(m,8H),1.22−1.14(m,2H),1.28(d,1H,J=7.0Hz),0.86(d,3H,J=6.7Hz),0.82(d,3H,J=6.8Hz)。
実施例8−複合化
複合体トラスツズマブ−10(ConjA)
DL−ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液(80モル当量/抗体、16マイクロモル、320μL)を、抗体トラスツズマブ(30mg、200ナノモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が2.5mg/mLの12.0mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(50rpm)振とうしながら4〜5時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、室温で反応させた。還元された抗体を、スピンフィルター遠心分離を介して、PBSおよび1mM EDTAを含有する再酸化緩衝液中に緩衝液交換し、全ての過剰の還元剤を除去した。デヒドロアスコルビン酸(DHAA、20モル当量/抗体、4マイクロモル、80μL)をDMSOに溶解させた50mM溶液を添加し、再酸化混合物を1.5mg/mLの抗体濃度で穏やかに(50rpm)振とうしながら室温で16時間反応させた(またはさらなるDHAAを添加して、鎖間システインジスルフィドを再形成するシステインチオールの完全な再酸化がUHPLCによって観察されるまで反応をより長時間放置した)。再酸化混合物を次いで滅菌濾過し、PBSおよび1mM EDTAを含有する複合化緩衝液において希釈して最終抗体濃度を1.0mg/mLとした。化合物10をDMSO溶液(10モル当量/抗体、1.5mL DMSO中1マイクロモル)として、13.5mLのこの再酸化された抗体溶液(15mg、100ナノモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を室温で1.5時間混合し、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(15マイクロモル、100mMで150μL)の添加によりクエンチし、次いで、15mLのAmicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用してスピン濾過によって精製し、滅菌濾過し、分析した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150mm×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、280nmおよび330nm(化合物10に特異的)で、ConjAの還元試料をUHPLC分析すると、化合物10の単一分子に結合している非複合化軽鎖ならびに非複合化重鎖および重鎖の混合物を示し、この結果は、抗体あたりの化合物10の分子数が1.89個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjAの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は99%であることがわかる。UHPLC SEC分析により、8.5mL中1.45mg/mLの濃度の最終ConjAを得、得られたConjAの質量は12.3mgである(収率82%)。
複合体トラスツズマブ−22(ConjB)
DL−ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(80モル当量/抗体、42.7マイクロモル、853μL)、抗体トラスツズマブ(80mg、533ナノモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が4.0mg/mLの20.0mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(60rpm)振とうしながら4〜5時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、室温で反応させた。還元された抗体を、スピンフィルター遠心分離を介して、PBSおよび1mM EDTAを含有する再酸化緩衝液中に緩衝液交換し、全ての過剰の還元剤を除去した。デヒドロアスコルビン酸(DHAA、20モル当量/抗体、10.7マイクロモル、213μL)をDMSOに溶解させた50mM溶液を添加し、再酸化混合物を1.5mg/mLの抗体濃度で穏やかに(50rpm)振とうしながら室温で16時間反応させた(またはさらなるDHAAを添加して、鎖間システインジスルフィドを再形成するシステインチオールの完全な再酸化がUHPLCによって観察されるまで反応をより長時間放置した)。再酸化混合物を次いで滅菌濾過し、PBSおよび1mM EDTAを含有する複合化緩衝液において希釈して最終抗体濃度を1.0mg/mLとした。化合物22をDMSO溶液(10モル当量/抗体、2.0mL DMSO中1.33マイクロモル)として、18.0mLのこの再酸化された抗体溶液(20mg、133ナノモル)に添加した、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を室温で1.5時間混合し、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(20マイクロモル、100mMで200μL)の添加によりクエンチし、次いで、15mLのAmicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用してスピン濾過によって精製し、滅菌濾過し、分析した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150mm×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、280nmおよび330nm(化合物22に特異的)で、ConjBの還元試料をUHPLC分析すると、化合物22の単一分子に結合している非複合化軽鎖ならびに非複合化重鎖および重鎖の混合物を示し、この結果は、抗体あたりの化合物22の分子数が1.71個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjBの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は99%であることがわかる。UHPLC SEC分析により、10.3mL中1.39mg/mLの濃度の最終ConjBを得、得られたConjBの質量は14.3mgである(収率72%)。
複合体トラスツズマブ−34(ConjC)
DL−ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(80モル当量/抗体、42.7マイクロモル、853μL)、抗体トラスツズマブ(80mg、533ナノモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が4.0mg/mLの20.0mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(60rpm)振とうしながら4〜5時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、室温で反応させた。還元された抗体を、スピンフィルター遠心分離を介して、PBSおよび1mM EDTAを含有する再酸化緩衝液中に緩衝液交換し、全ての過剰の還元剤を除去した。デヒドロアスコルビン酸(DHAA、20モル当量/抗体、10.7マイクロモル、213μL)をDMSOに溶解させた50mM溶液を添加し、再酸化混合物を1.5mg/mLの抗体濃度で穏やかに(50rpm)振とうしながら室温で16時間反応させた(またはさらなるDHAAを添加して、鎖間システインジスルフィドを再形成するシステインチオールの完全な再酸化がUHPLCによって観察されるまで反応をより長時間放置した)。再酸化混合物を次いで滅菌濾過し、PBSおよび1mM EDTAを含有する複合化緩衝液において希釈して最終抗体濃度を1.0mg/mLとした。化合物34をDMSO溶液(10モル当量/抗体、2.0mL DMSO中1.33マイクロモル)として、18.0mLのこの再酸化された抗体溶液(20mg、133ナノモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を室温で1.5時間混合し、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(20マイクロモル、100mMで200μL)の添加によりクエンチし、次いで、15mLのAmicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用してスピン濾過によって精製し、そして、2.5mL/分のPBSで溶出しながら、Superdex200PGを充填したGE Healthcare HiLoad(商標)26/600カラムを使用してAKTA(商標)Start FPLCにおいてさらに精製した。ConjC単量体ピークに相当する画分をプールし、15mLのAmicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用して濃縮し、滅菌濾過し、分析した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150mm×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、280nmおよび330nm(化合物34に特異的)で、ConjCの還元試料をUHPLC分析すると、化合物34の単一分子に結合している非複合化軽鎖ならびに非複合化重鎖および重鎖の混合物を示し、この結果は、抗体あたりの化合物34の分子数が1.66という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjCの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は99%であることがわかる。UHPLC SEC分析により、10.4mL中1.36mg/mLの濃度の最終ConjCを得、得られたConjCの質量は14.1mgである(収率71%)。
複合体トラスツズマブ−10(ConjD)
DL−ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(150モル当量/抗体、40マイクロモル、800μL)、抗体トラスツズマブ(40mg、267ナノモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が2.5mg/mLの16.0mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(50rpm)振とうしながら4時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、室温で反応させた。還元された抗体溶液を、スピンフィルター遠心分離を介して、PBSおよび1mM EDTAを含有する複合化緩衝液中に緩衝液交換して(全ての過剰の還元剤を除去した)、最終抗体濃度を2.5mg/mLとした。化合物10をDMSO溶液(25モル当量/抗体、0.4mL DMSO中1.67マイクロモル)として、3.6mLのこの還元された抗体溶液(10mg、67ナノモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を室温で1.5時間混合し、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(8.33マイクロモル、100mMで83.3μL)の添加によりクエンチし、次いで、2.5mL/分のPBSで溶出しながら、Superdex200PGを充填したGE Healthcare HiLoad(商標)26/600カラムを使用してAKTA(商標)Start FPLCにおいて精製した。ConjD単量体ピークに相当する画分をプールし、15mLのAmicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用して濃縮し、滅菌濾過し、分析した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150mm×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、280nmおよび330nm(化合物10に特異的)で、ConjDの還元試料をUHPLC分析すると、化合物10の単一分子に結合している非複合化軽鎖、軽鎖の混合物、ならびに、化合物10の最大3分子に結合している非複合化重鎖および重鎖を示し、この結果は、抗体あたりの化合物10の分子数が7.47個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjDの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は99%であることがわかる。UHPLC SEC分析により、4.4mL中1.90mg/mLの濃度の最終ConjDを得、得られたConjAの質量は8.4mgである(収率84%)。
複合体トラスツズマブ−22(ConjE)
DL−ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(150モル当量/抗体、40マイクロモル、800mL)、抗体トラスツズマブ(40mg、267ナノモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が2.5mg/mLの16.0mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(50rpm)振とうしながら、4時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、室温で反応させた。還元された抗体溶液を、スピンフィルター遠心分離を介して、PBSおよび1mM EDTAを含有する複合化緩衝液中に緩衝液交換し(全ての過剰の還元剤を除去した)、最終抗体濃度を2.5mg/mLとした。化合物22をDMSO溶液(25モル当量/抗体、0.4mL DMSO中1.67マイクロモル)として、3.6mLのこの還元された抗体溶液(10mg、67ナノモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を室温で1.5時間混合し、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(8.33マイクロモル、100mMで83.3mL)の添加によりクエンチし、次いで、2.5mL/分のPBSで溶出しながら、Superdex200PGを充填したGE Healthcare HiLoad(商標)26/600カラムを使用してAKTA(商標)Start FPLCにおいて精製した。ConjE単量体ピークに相当する画分をプールし、15mLのAmicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用して濃縮し、滅菌濾過し、分析した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150mm×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、280nmおよび330nm(化合物22に特異的)で、ConjEの還元試料をUHPLC分析すると、化合物22の単一分子に結合している非複合化軽鎖、軽鎖の混合物、ならびに、化合物22の最大3分子に結合している非複合化重鎖および重鎖を示し、この結果は、抗体あたりの化合物22の分子数が7.39個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjEの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は96%であることがわかる。UHPLC SEC分析により、4.6mL中1.93mg/mLの濃度の最終ConjEを得、得られたConjEの質量は8.9mgである(収率89%)。
複合体トラスツズマブ−34(ConjF)
DL−ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(150モル当量/抗体、10マイクロモル、200μL)、抗体(10mg、66.7ナノモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が2.5mg/mLの4.0mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(50rpm)振とうしながら、4時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、室温で反応させた。還元された抗体溶液を、スピンフィルター遠心分離を介して、PBSおよび1mM EDTAを含有する複合化緩衝液中に緩衝液交換して(全ての過剰の還元剤を除去した)、最終抗体濃度を2.5mg/mLとした。化合物34をDMSO溶液(25モル当量/抗体、0.4mL DMSO中1.67マイクロモル)として、3.6mLのこの還元された抗体溶液(10mg、67ナノモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を室温で0.75時間混合し、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(8.33マイクロモル、100mMで83.3μL)の添加によりクエンチし、次いで、2.5mL/分のPBSで溶出しながら、Superdex200PGを充填したGE Healthcare HiLoad(商標)26/600カラムを使用してAKTA(商標)Start FPLCにおいて精製した。ConjFピークに相当する画分をプールし、15mLのAmicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用して濃縮し、2.5mL/分のPBSで溶出しながら、Superdex200PGを充填したGE Healthcare HiLoad(商標)26/600カラムを使用してAKTA(商標)Start FPLCにおいて再精製した。ConjFピークに相当する画分をプールし、15mLAMicon Ultracell 50kDa MWCOスピンフィルターを使用して濃縮し、滅菌濾過し、分析した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150mm×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、280nmおよび330nm(化合物34に特異的)で、ConjFの還元試料をUHPLC分析すると、化合物34の単一分子に結合している非複合化軽鎖、軽鎖の混合物、ならびに化合物34の最大3分子に結合している非複合化重鎖および重鎖を示し、この結果は、抗体あたりの化合物34の分子数が7.41個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjFの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は0%(100%二量体−三量体)であることがわかる。UHPLC SEC分析により、4.4mL中1.09mg/mLの濃度の最終ConjFを得、得られたConjFの質量は4.8mgである(収率48%)。
複合体トラスツズマブ−58(ConjG)
ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(120モル当量/抗体、32マイクロモル、50mMで0.64mL)、抗体(40mg、0.267マイクロモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が2.0mg/mLの3.7mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(60rpm)振とうしながら、4時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、+25℃で加熱した。室温に冷却後、還元された抗体を、50KDa MWCOビバスピンを用いたスピンフィルターを介して、PBS(pH7.4)および1mM EDTAを含有する再酸化緩衝液中に緩衝液交換し、全ての過剰の還元剤を除去した。デヒドロアスコルビン酸(DHAA、20モル当量/抗体、5.3マイクロモル、50mMで0.1mL)をDMSOに溶解させた50mM溶液を添加し、再酸化混合物を約2.0mg/mLの抗体濃度で穏やかに(60rpm)振とうしながら室温で16時間反応させた(または鎖間システインジスルフィドを再形成するシステインチオールの完全な再酸化がUHPLCによって観察されるまで)。再酸化混合物を4000rpmで3分間遠心分離し、次いで、0.22μmメンブレンフィルターを使用して滅菌濾過した。化合物58をDMSO溶液(11モル当量/抗体、0.9mL DMSO中1.46マイクロモル)として、9.1mLのこの再酸化された抗体溶液(20mg、0.13マイクロモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を+25℃で3時間振とうし、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(7.3マイクロモル、100mMで0.07mL)によってクエンチした。
過剰な遊離薬物を、PBS(pH7.4)を含有する緩衝液中、50kDa MWCOビバスピンを使用したスピンフィルターを介して除去した。遊離薬物の除去の程度を、無溶媒の複合体を使用してUHPLC−RPによってモニタリングした。遊離薬物の完全な除去後、ConjGを滅菌雰囲気下で0.22μm Mustangフィルターを使用して濾過し、+4℃で保存した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、214nmおよび330nm(化合物58に特異的)で、複合体の還元試料をUHPLC分析すると、化合物58の単一分子に結合している非複合化軽鎖ならびに非複合化重鎖および重鎖の混合物を示し、この結果は、抗体あたりの化合物58の分子数が1.83個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjGの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は99%超であることがわかる。UHPLC SEC分析により、8.9mL中1.34mg/mLの濃度の最終ConjGを得、得られたConjGの質量は11.9mgである(収率60%)。
複合体トラスツズマブ−59(ConjH)
抗体(30mg)を、参照により本明細書に援用されるUS2014−0037961A1に記載されている方法にしたがって、固体支持体上に負荷して還元し、再酸化し、複合化して化合物59とし、精製し、樹脂から遊離させ、25mMヒスチジン、200mMスクロース、Tween−20 0.02%(pH6.0)において製剤化した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、214nmおよび330nm(化合物59に特異的)で、複合体の還元試料をUHPLC分析すると、化合物59の単一分子に結合している非複合化軽鎖ならびに非複合化重鎖および重鎖の混合物を示し、この結果は、抗体あたりの化合物59の分子数が1.9個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjHの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は97%超であることがわかる。UHPLC SEC分析により、7.5mL中1.49mg/mLの濃度の最終ConjHを得、得られたConjHの質量は11.2mgである(収率37%)。
複合体トラスツズマブ−48(ConjI)
ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(80モル当量/抗体、21.4マイクロモル、50mMで0.43mL)、抗体(40mg、0.267マイクロモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が2.0mg/mLの3.7mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(60rpm)振とうしながら、4時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、+25℃で加熱した。室温に冷却後、還元された抗体を、50KDa MWCOビバスピンを用いたスピンフィルターを介して、PBS(pH7.4)および1mM EDTAを含有する再酸化緩衝液中に緩衝液交換し、全ての過剰の還元剤を除去した。デヒドロアスコルビン酸(DHAA、20モル当量/抗体、5.3マイクロモル、50mMで0.1mL)をDMSOに溶解させた50mM溶液を添加し、再酸化混合物を約2.0mg/mLの抗体濃度で穏やかに(60rpm)振とうしながら室温で16時間反応させた(または鎖間システインジスルフィドを再形成するシステインチオールの完全な再酸化がUHPLCによって観察されるまで)。再酸化混合物を4000rpmで3分間遠心分離し、次いで、0.22μmメンブレンフィルターを使用して滅菌濾過した。化合物48をDMSO溶液(11モル当量/抗体、1.7mL DMSO中1.46マイクロモル)として、16.8mLのこの再酸化された抗体溶液(20mg、0.13マイクロモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を+25℃で3時間振とうし、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(7.3マイクロモル、100mMで0.07mL)によってクエンチした。
過剰な遊離薬物を、PBS(pH7.4)を含有する緩衝液中、50kDa MWCOビバスピンを使用したスピンフィルターを介して除去した。遊離薬物の除去の程度を、無溶媒の複合体を使用してUHPLC−RPによってモニタリングした。遊離薬物の完全な除去後、ADCを滅菌雰囲気下で0.22μm Mustangフィルターを使用して濾過し、+4℃で保存した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、214nmおよび330nm(化合物48に特異的)で、複合体の還元試料をUHPLC分析すると、化合物48の単一分子に結合している非複合化軽鎖ならびに非複合化重鎖および重鎖の混合物を示し、この結果は、抗体あたりの化合物48の分子数が1.86個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjIの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は99%超であることがわかる。UHPLC SEC分析により、7.3mL中1.7mg/mLの濃度の最終ConjIを得、得られたConjIの質量は12.4mgである(収率62%)。
複合体トラスツズマブ−57(ConjJ)
ジチオトレイトール(DTT)をリン酸緩衝食塩水(pH7.4)(PBS)に溶解させた50mM溶液を(80モル当量/抗体、21.4マイクロモル、50mMで0.43mL)、抗体(40mg、0.267マイクロモル)を、PBSを含有する還元緩衝液および1mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)に溶解させた、最終抗体濃度が2.0mg/mLの3.7mL溶液に添加した。還元混合物を、オービタルシェーカーにおいて、穏やかに(60rpm)振とうしながら4時間(または完全な還元がUHPLCによって観察されるまで)、+25℃で加熱した。室温に冷却後、還元された抗体を、50KDa MWCOビバスピンを用いたスピンフィルターを介して、PBS(pH7.4)および1mM EDTAを含有する再酸化緩衝液中に緩衝液交換し、全ての過剰の還元剤を除去した。デヒドロアスコルビン酸(DHAA、20モル当量/抗体、5.3マイクロモル、50mMで0.1mL)をDMSOに溶解させた50mM溶液を添加し、再酸化混合物を約2.0mg/mLの抗体濃度で穏やかに(60rpm)振とうしながら室温で16時間反応させた(または鎖間システインジスルフィドを再形成するシステインチオールの完全な再酸化がUHPLCによって観察されるまで)。再酸化混合物を4000rpmで3分間遠心分離し、次いで、0.22μmメンブレンフィルターを使用して滅菌濾過した。化合物57をDMSO溶液(11モル当量/抗体、1.7mL DMSO中1.46マイクロモル)として、16.8mLのこの再酸化された抗体溶液(20mg、0.13マイクロモル)に添加して、10%(v/v)の最終DMSO濃度とした。溶液を+25℃で3時間振とうし、次いで、複合化をN−アセチルシステイン(7.3マイクロモル、100mMで0.07mL)によってクエンチした。
過剰な遊離薬物を、PBS(pH7.4)を含有する緩衝液中、50kDa MWCOビバスピンを使用したスピンフィルターを介して除去した。遊離薬物の除去の程度を、無溶媒の複合体を使用してUHPLC−RPによってモニタリングした。遊離薬物の完全な除去後、ADCを滅菌雰囲気下で0.22μm Mustangフィルターを使用して濾過し、+4℃で保存した。
Shimadzu ProminenceシステムにPhenomenex Aeris 3.6u XB−C18 150×2.1mmカラムを用い、水およびアセトニトリルの勾配を付けて溶出させ、214nmおよび330nm(化合物57に特異的)で、複合体の還元試料をUHPLC分析すると、化合物57の単一分子に結合している非複合化軽鎖ならびに非複合化重鎖および重鎖の混合物を示し、この結果は、抗体あたりの化合物57の分子数が1.87個という抗体あたり薬物比(DAR)に相当する。
Shimadzu ProminenceシステムにTosoh Bioscience TSKgel SuperSW mAb HTP 4μm 4.6×150mmカラム(4μm 3.0×20mmガードカラムを有する)を用い、0.3mL/分の、200mMリン酸カリウム(pH6.95)、250mM塩化カリウムおよび10%イソプロパノール(v/v)を含有する滅菌濾過SEC緩衝液で溶出させ、280nmでConjJの試料をUHPLC分析すると、単量体の純度は100%超であることがわかる。UHPLC SEC分析により、10.3mL中の0.86mg/mLの濃度の最終ConjJを得、得られたConjJの質量は8.9mgである(収率45%)。
実施例9
化合物10のin vitro試験
DU145(2000/ウェル、72時間アッセイ)およびMDA−MB−361(5000/ウェル、144時間アッセイ)細胞を、1ウェルあたり80μLの体積で、組織培養処理した96ウェルプレートに入れて培養し、一晩付着させた。弾頭の希釈物用に、まず、60倍の濃度の、試験対象の各用量分を、DMSO中で被験物質を希釈することによって調製した。弾頭の60倍希釈物を、次いで、細胞培養液単独または5倍のβ−グルクロニダーゼ酵素(Sigmaカタログ番号G0799−25KU)を含有する細胞培養液のいずれかにおいて5倍の濃度にさらに希釈した。被験物質+/−酵素を含有する20μLの細胞培養液を、三つ組のウェル中の細胞に添加し、最終用量曲線が、段階的な1:4の連続希釈系列において6.4nM〜61pMの範囲であった。培地に対して希釈したDMSOのみを対照として使用した。処理した細胞を37℃/5%CO2で(それぞれ特定の細胞株の確立された成長速度論に応じて)72〜144時間培養した。アッセイの最後に、CellTiter−Glo(登録商標)(CTG)Luminescent Viability Assay(Promega)を使用して相対的な細胞毒性を求めた。100μLのCTG試薬を各ウェルに添加し、プレートを、穏やかに振とうしながら室温で10分間インキュベートし、各試料の吸光度を、EnVision luminometer(Perkin Elmer)を使用して560nMで読み取った。細胞生存度(%)を以下の式によって計算した:
(処理した試料の平均発光/対照試料の平均発光)×100。
GraphPad Prismソフトウェアによりロジスティック非線形回帰分析を使用してIC50値を求めた。
Figure 2020503250
ConjAのin vitro試験
同様の方法を、MDA−MB−361(HER2 high、5000細胞/ウェル、144時間アッセイ)およびMCF−7細胞(HER2低、1500細胞/ウェル、144時間アッセイ)を用いて上記のように使用した。細胞プレーティング密度およびアッセイの継続時間を、それぞれ特定の細胞株の確立された成長速度論を基準にして求めた。培地中の被験物質を希釈することによって、5倍の濃度の、各用量の試験対象ADCを調製した。20μLのADCを、三つ組のウェル中の細胞に添加し、最終用量曲線が、1:4の連続希釈系列において3μg/mL〜11pg/mLの範囲であった。処理した細胞を37℃/5%CO2で144時間培養し、CellTiter−Glo(登録商標)(CTG)Luminescent Viability Assay(Promega)を使用して上記のように相対的な細胞毒性を求めた。
Figure 2020503250
β−グルクロニダーゼのsiRNAノックダウンによる細胞におけるConjBおよびConjCの試験
HER2−過剰発現SKOV3細胞をリバーストランスフェクションに供してノックダウンGUSB発現レベルとした。まず、RNAiMAXの4倍原液(最終濃度0.125ul/ウェル、Life Technologies)およびsiRNAオリゴの4倍原液(非標的/ネガティブsiRNA、GAPDH siRNAおよびGUSB siRNA、最終濃度100nm/ウェル、Life Technologies)をOptiMEM培地において調製した。RNAiMAX/OptiMEMのみの混合物が脂質対照として含まれた。4倍RNAiMAX溶液および4倍siRNA溶液を1対1の比で混合することにより2倍にし、RNAiMAX/siRNA混合物を放置して室温で20分間インキュベートした。インキュベーション後、1ウェルあたり40μlのRNAiMAX/siRNA混合物および脂質対照を、組織培養処理した96ウェルプレートに添加し、40μlの細胞溶液を脂質/siRNA混合物上に添加し、最終プレーティング密度が2000細胞/ウェルであった。プレートを37℃/5%CO2で72時間培養し、この時点で、20μlの、5倍濃度の各用量のConjB/ConjCを、二つ組のウェル中の細胞に添加し、最終用量曲線が、1:4の連続希釈系列において10μg/mL〜0.15ng/mLの範囲であった。ADC処理した細胞を37℃/5%CO2でさらに72時間培養し、CellTiter−Glo(登録商標)(CTG)Luminescent Viability Assay(Promega)を使用して上記のように相対的な細胞毒性を求めた。siRNAノックダウンの効能を、RNA発現レベル、およびβ−グルクロニダーゼ酵素活性の測定によって求めた。
結果を図1(ConjB)および図2(ConjC)に示す。そこでゃ以下の記号を使用する。
Figure 2020503250
Figure 2020503250
ConjCの最大殺傷がかなり高いことも注目に値する。
実施例10−in vitro試験
T75フラスコ中のサブ密集(80−90%の密集度)細胞培養からの培地を吸引し、フラスコをPBS(約20ml)で濯ぎ、空にした。トリプシン−EDTA(5ml)を添加し、フラスコを、37℃の、ガスが供給されたインキュベーターに最大約5分間戻し、次いで激しくたたいてプラスチックから細胞を取り除いて分離させた。細胞懸濁液を無菌の50mlのねじ口遠心管に移し、成長培地によって15mlの最終濃度まで希釈し、次いで遠心分離した(5分間で400g)。上清を吸引し、ペレットを10ml培地に再懸濁した。単分散細胞懸濁液を生成するのに繰り返しのピペット操作が必要となる場合がある。トリパンブルー細胞染色細胞の細胞濃度および生存度を、LUNA−II(商標)Automated Cell Counterを使用して測定する。細胞を2×105/mlに希釈し、96ウェル平底プレートに分配し(50μl/ウェル)、使用前に一晩インキュベートした。
抗体薬物複合体(ADC)(20μg/ml)の原液(1ml)を、フィルター滅菌ADCを細胞培養液中に希釈することによって作製した。ADC原液の10倍希釈液の8個のセットを、900μlの細胞培養液に100μlをシリアル転送することによって24ウェルプレートにおいて作製した。
ADC希釈液を、先に播種した50μlの細胞懸濁液を含有する、96ウェルプレートの4つの複製ウェル内に分配した(50μl/ウェル)。対照ウェルに50μlの細胞培養液を与えた。細胞およびADCを含有する96ウェルプレートを、CO2ガスが供給されたインキュベーターにおいて37℃で暴露時間インキュベートした。
インキュベーション期間の最後に、MTSアッセイで細胞生存度を測定した。MTS(Promega)を各ウェルに分配し(1ウェルあたり20μl)、CO2ガスが供給されたインキュベーターにおいて37℃で4時間インキュベートした。ウェル吸光度を490nmで測定した。生存細胞のパーセンテージを、4つの対照の未処理のウェルにおける平均吸光度(100%)と比較して、4つのADC処理したウェルにおける平均吸光度から計算した。IC50は、非線形曲線適合アルゴリズム(S字状、4PL Xは、log(濃度)である)を使用したGraphPad Prismを使用して、用量−反応データから決定した。
Figure 2020503250
Figure 2020503250
Figure 2020503250
実施例11−異種移植片試験
NCI−N87異種移植マウス
雌性重症複合免疫不全マウス(Fox Chase SCID(登録商標)、CB17/Icr−Prkdcscid/IcrIcoCrl、Charles River)は、研究の1日目で、体重(BW)範囲が16.5〜21.1グラムで10週齢であった。動物に自由飲水(逆浸透、1ppm Cl)させ、18.0%の粗タンパク質、5.0%の粗脂肪および5.0%の粗繊維からなるNIH 31Modified and Irradiated Lab Diet(登録商標)を自由摂食させた。マウスを、静圧マイクロアイソレーターにおける照射Enricho’cobs(商標)Laboratory Animal Beddingにおいて、12時間の明サイクルにて20〜22℃(68〜72°F)および40〜60%の湿度で飼育した。CR Discovery Servicesは、具体的には、拘束、畜産、外科手術、試料および流体規制、ならびに獣医医療に関するGuide for Care and Use of Laboratory Animalsの勧告を遵守している。CR Discovery Servicesの動物管理および使用プログラムは、実験動物の管理および使用に対する承認規格の遵守を保証する、Association for Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care International(AAALAC)によって公認されている。
腫瘍細胞培養
ヒトNCI−N87胃癌リンパ腫細胞を、10%ウシ胎仔血清、2mMグルタミン、100単位/mLペニシリン、100μg/mL硫酸ストレプトマイシンおよび25μg/mLゲンタマイシンを補充したRPMI−1640培地において培養した。細胞を、5%CO2および95%空気の雰囲気において37℃で加湿インキュベーターにおいて組織培養フラスコ中で増殖させた。
In Vivo移植および腫瘍成長
移植に使用したNCI−N87細胞を対数期増殖の間に摘出し、50%Matrigel(商標)(BD Biosciences)を含有するリン酸緩衝食塩水(PBS)に再懸濁した。腫瘍移植の日に、各試験マウスに、1×107細胞(0.1mL細胞懸濁液)を右側腹に皮下注射し、腫瘍成長を、100〜150mm3の標的範囲に近づいた平均サイズとしてモニタリングした。研究の1日目に指定した14日後に、マウスを、それぞれ、108〜144mm3の範囲の個々の腫瘍体積、および115mm3の群平均腫瘍体積を有する10匹の動物からなる群に、計算した腫瘍サイズに従って分類した。
腫瘍を、キャリパを使用して2次元で測定し、体積を以下の式を使用して計算した。
腫瘍体積(mm3)=(w2×l)/2
式中、腫瘍のmmでのw=幅、およびl=長さである。腫瘍重量を、1mgが腫瘍体積の1mm3と同等であると仮定して、推定してよい。
処置
処置を、確立された皮下NCI−N87腫瘍(108〜144mm3)を有する10匹のマウス(n=10)において1日目に開始した。トラスツズマブ−10(ConjA)を1日目(qd×1)に1回静脈投与した。ビヒクル処置群を効力分析の対照群とした。研究が79日目に終了するまで腫瘍を1週間に2回測定した。各マウスを、腫瘍が最終体積の800mm3に達したとき、または最終日のいずれか早く到達したときに安楽死させた。エンドポイントまでの時間(TTE)を各マウスについて計算した。
処置効果は、対照群に対する処置マウスについてのTTE中央値のパーセント増加として定義される腫瘍成長遅延(%TGD)から決定し、群間の差異は、logrank生存分析を使用してP≦0.05において統計的に有意と見なした。マウスを、完全縮小(CR)応答および部分縮小(PR)応答についてモニタリングした。
処置耐容性を、体重測定、および処置関連副作用の兆候の頻繁な観察によって査定した。処置耐容性を、体重測定、および処置関連副作用の兆候の頻繁な観察によって査定した。全てのレジメンは、許容できる耐容性であった。ビヒクル処置した対照のTTE中央値は、50.7日であり、79日研究で28.3日間(56%)の最大可能TGDを確立した。
最小有効用量は、被験物質の投与後28日で静止状態の腫瘍を得るのに必要な最小投薬量として定義した。1日目からの腫瘍体積の平均および中央値のプロットならびに変化(%)の目視検査を基準にすると、1.0mg/kgのトラスツズマブ−10(ConjA)が、最小有効用量と一致する応答に達した投薬量であると見られた。
0.3mg/kgの群の動物のうち2匹が、708mm3のMTVを有して、研究の最後に生存していた。1.0mg/kgの群の動物の動物のうち8匹が、650mm3のMTVを有して、研究の最後に生存していた。結果を図3に示す。
JIMT−1異種移植マウス
マウス
雌性重症複合免疫不全マウス(Fox Chase SCID(登録商標)、CB17/Icr−Prkdcscid/IcrIcoCrl、Charles River)は、研究の1日目で、体重(BW)範囲が15.1〜22.2で10週齢であった。
腫瘍細胞培養
JIMT−1ヒト乳癌細胞を、10%ウシ胎仔血清、100単位/mLペニシリンGナトリウム、100μg/mL硫酸ストレプトマイシン、25μg/mLゲンタマイシン、および2mMグルタミンを含有するDMEMにおいて増殖させた。細胞培養を、5%CO2および95%空気の雰囲気において37℃で加湿インキュベーターにおいて組織培養フラスコ中で維持した。
In Vivo移植および腫瘍成長
移植に使用したJIMT−1細胞を対数期増殖の間に摘出し、5×107細胞/mLの濃度で50%Matrigel(BD Biosciences):50%リン酸緩衝食塩水に再懸濁した。腫瘍移植の日に、各試験マウスに、1×107細胞(0.2mL細胞懸濁液)を右側腹に皮下注射し、腫瘍成長を、100〜150mm3の標的範囲に近づいた平均サイズとしてモニタリングした。腫瘍を、キャリパを使用して2次元で測定し、体積を以下の式を使用して計算した。
腫瘍体積(mm3)=(w2×l)/2
式中、腫瘍のmmでのw=幅、およびl=長さである。腫瘍重量を、1mgが腫瘍体積の1mm3と同等であると仮定して、推定してよい。
処置
処置を、体積範囲(88〜196mm3)、および120〜122mm3の群平均腫瘍体積を有する、確立された皮下JIMT−1腫瘍を有する10匹のマウス(n=10)において1日目に開始した。トラスツズマブ−10(ConjA)を1日目(qd×1)に1回静脈投与した。ビヒクル処置群を効力分析の対照群とした。研究が59日目に終了するまで腫瘍を1週間に2回測定した。各マウスを、腫瘍が最終体積の1000mm3に達したとき、または最終日のいずれか早く到達したときに安楽死させた。エンドポイントまでの時間(TTE)を各マウスについて計算した。
処置効果は、対照群に対する処置マウスについてのTTE中央値のパーセント増加として定義される腫瘍成長遅延(%TGD)から決定し、群間の差異は、logrank生存分析を使用してP≦0.05において統計的に有意と見なした。マウスを、完全縮小(CR)応答および部分縮小(PR)応答についてモニタリングした。
処置耐容性を、体重測定、および処置関連副作用の兆候の頻繁な観察によって査定した。全てのレジメンは、許容できる耐容性であった。ビヒクル処置した対照のTTE中央値は、48.4日であり、59研究で10.6日間(22%)の最大可能TGDを確立した。試験した全てのADCレジメンは、ビヒクル処置した対照(P<0.01)と比較して有意な生存有益性を生じた。
最小有効用量は、被験物質の投与後28日で静止状態の腫瘍を得るのに必要な最小投薬量として定義した。1日目からの腫瘍体積の平均および中央値のプロットならびに変化(%)の目視検査を基準にすると、1.0mg/kgのトラスツズマブ−10(ConjA)が、最小有効用量と一致する応答に達した投薬量であると見られた。
0.3mg/kgの群の腫瘍体積の中央値が34日目を終えてゆっくりと増加し、次いでその後に向上するという用量依存性の効果が観察された一方で、1.0mg/kgの群が、38日目を終えて変化がなく、その後に進行する腫瘍体積の中央値を示した。0.3mg/kgの群についてのTTEの中央値は、対照に対して8.5日(18%)の有意なTGD(P<0.05)に相当する56.9日であった。0.3mg/kgの群では、目的とする縮小反応が無かった。0.3mg/kgの群の動物のうち5匹が、486mm3のMTVを有して、研究の最後に生存していた。
1.0mg/kgの群についてのTTEの中央値は、対照に対して10.6日(22%)の有意なTGD(P<0.001)に相当する最大の59.0日であった。1.0mg/kgの群では、目的とする縮小反応が無かった。1.0mg/kgの群の動物のうち9匹が、446mm3のMTVを有して、「試験の最後」に生存していた。0.3および1.0mg/kgの群は、互いに有意に異なっていた(P<0.05)。
結果を図4に示す。
実施例12−毒性試験/治療指数
ラット試験:
単回投与毒性試験を使用して、トラスツズマブ−10(ConjA)の最大耐量(MTD)および安全性プロファイルを決定した。雄性Sprague Dawleyラット(ENVIGO)に、ビヒクル対照(25mMヒスチジン、200mMスクロース、pH6.0)または試験物質(ConjA)を、尾静脈を介してゆっくりとしたボーラス静脈内注射によって投与した。試験の際に評価したパラメータは、死亡率、身体検査、症状観察、体重、体重変化、臨床病理学(臨床化学、血液学、および凝固)、ならびに全体の病理学的所見を含んだ。群1〜6の全ての動物について、群6の1匹の動物では研究日(SD)25で終了させたことを除いて、研究日(SD)29で終了させた。
Figure 2020503250
対照=25mMヒスチジン−HCl、200mMスクロース、pH6.0
耐容性を、減少した絶対網状赤血球、白血球および細胞成分、ならびに肺における肉眼的および顕微鏡的病変を含めた毒性エンドポイントに基づいて決定した。≧4mg/kgの用量レベルでの主な所見は、肺の病変の組織病理学的観察であった。4mg/kgの用量では、所見は軽度であり、可逆的とされた。用量が増加するにつれて、肺の病変は重篤度が増加し、可逆的でないとされた。この所見に基づいて、ConjAの単回用量の後にラットにおける最大耐量(MTD)を6mg/kgであると決定した。
治療指数
治療指数は、ラットにおける非標的化ADCの単回の最大耐量(MTD)を、標的化ADCの最小有効用量(MED)によって除算することによって計算することができる。MEDは、(NCI−N87異種移植片では)28日でin vivoモデルにおいて静止状態の腫瘍を得るのに必要な単回用量である。
ゆえに、化合物10の複合体では、治療指数は、1.0mg/kgのMEDによって除算された6mg/kgのMTDであり(上記を参照)、6の治療指数を与える。
上に記載される文献および他の参照は全て、本明細書中に参照として援用される。

Claims (112)

  1. 式Iの化合物:
    Figure 2020503250
    であって、
    式中:
    角括弧は、NO2基が任意選択的であることを示し、
    Dは、基D1またはD2のいずれかを表し:
    Figure 2020503250
    点線は、C2とC3との間の二重結合の任意選択的な存在を示し、
    C2とC3との間に二重結合が存在するとき、R2は:
    (ia)ハロ、ニトロ、シアノ、エーテル、カルボキシ、エステル、C1-7アルキル、C3-7ヘテロシクリルおよびビス−オキシ−C1-3アルキレン;を含む群より選択される1つ以上の置換基によって任意選択的に置換されているC5-10アリール基、
    (ib)C1-5飽和脂肪族アルキル、
    (ic)C3-6飽和シクロアルキル、
    (id)
    Figure 2020503250
    (R11、R12およびR13は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、ここで、R2基における炭素原子の合計数が多くて5である)、
    (ie)
    Figure 2020503250
    (R15aおよびR15bの一方がHであり、他方が、ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニルから選択される基である)ならびに
    (if)
    Figure 2020503250
    (R14は、H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニル;から選択される)
    からなる群より選択され、
    C2とC3との間に単結合が存在するとき、
    2は、H、OH、F、diFおよび
    Figure 2020503250
    から選択され、R16aおよびR16bは、H、F、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから独立して選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基は、C1-4アルキルアミドおよびC1-4アルキルエステルから選択される基によって任意選択的に置換されており、またはR16aおよびR16bの一方がHであるとき、他方はニトリルおよびC1-4アルキルエステルから選択され、
    D’は、基D’1またはD’2のいずれかを表し:
    Figure 2020503250
    点線は、C2’とC3’との間の二重結合の任意選択的な存在を表し、
    C2’とC3’との間に二重結合が存在するとき、R12は、
    (iia)ハロ、ニトロ、シアノ、エーテル、カルボキシ、エステル、C1-7アルキル、C3-7ヘテロシクリルおよびビス−オキシ−C1-3アルキレン;を含む群より選択される1つ以上の置換基によって任意選択的に置換されているC5-10アリール基、
    (iib)C1-5飽和脂肪族アルキル、
    (iic)C3-6飽和シクロアルキル、
    (iid)
    Figure 2020503250
    (R21、R22およびR23は、それぞれが、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから独立して選択され、R12基における炭素数の合計が多くて5である)、
    (iie)
    Figure 2020503250
    (R25aおよびR25bの一方がHであり、他方が、ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニル;から選択される)、ならびに
    (iif)
    Figure 2020503250
    (R24は、H;C1-3飽和アルキル;C2-3アルケニル;C2-3アルキニル;シクロプロピル;ハロ、メチル、メトキシによって任意選択的に置換されているフェニル;ピリジル;およびチオフェニル;から選択される)
    からなる群より選択され、
    C2’とC3’との間に単結合が存在するとき、
    12は、H、OH、F、diFおよび
    Figure 2020503250
    から選択され、R26aおよびR26bは、H、F、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから独立して選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基は、C1-4アルキルアミドおよびC1-4アルキルエステルから選択される基によって任意選択的に置換されており、または、R26aおよびR26bの一方がHであり、他方はニトリルおよびC1-4アルキルエステルから選択され、
    6およびR9は、H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、ニトロ、Me3Snおよびハロから独立して選択され、
    RおよびR’は、任意選択的に置換されているC1-12アルキル、C3-20ヘテロシクリルおよびC5-20アリール基から独立して選択され、
    7は、H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、ニトロ、Me3Snおよびハロから選択され、
    R”は、C3-12アルキレン基であり、かかる鎖は、1つ以上のヘテロ原子、例えば、O、S、NRN2(ここで、RN2は、HもしくはC1-4アルキルである)、および/または芳香族環、例えば、ベンゼンもしくはピリジンによって中断されていてよく、
    YおよびY’は、O、S、またはNHから選択され、
    6'、R7'、R9'は、それぞれ、R6、R7およびR9と同じ基から選択され、
    11bは、OH、ORAから選択され、ここでRAは、C1-4アルキルであり、
    Lは:
    (iiia):
    Figure 2020503250
    (Qは、
    Figure 2020503250
    であり、QXは、Qが、アミノ酸残基、ジペプチド残基またはトリペプチド残基であるようになっており、
    Xは、
    Figure 2020503250
    であり、a=0〜5、b=0〜16、c=0または1、d=0〜5であり、
    Lは、リガンド単位に接続するためのリンカーである)、ならびに
    (iiib):
    Figure 2020503250
    (RL1およびRL2は、Hおよびメチルから独立して選択され、または、これらが結合している炭素原子と一緒になって、シクロプロピレンもしくはシクロブチレン基を形成し、
    eが0または1である)
    から選択される、細胞結合剤への接続のためのリンカーである、
    前記化合物、ならびにその塩および溶媒和物。
  2. YおよびY’の両方がOである、請求項1に記載の化合物。
  3. R”がC3-7アルキレンである、請求項1または請求項2のいずれかに記載の化合物。
  4. R”が、式:
    Figure 2020503250
    の基であり、式中、rは、1または2である、
    請求項1または請求項2のいずれかに記載の化合物。
  5. 9が、Hである、請求項1から4のいずれか1項に記載の化合物。
  6. 6が、Hである、請求項1から5のいずれか1項に記載の化合物。
  7. 7が、H、OHおよびORから選択される、請求項1から6のいずれか1項に記載の化合物。
  8. 7が、C1-4アルキルオキシ基である、請求項7に記載の化合物。
  9. DがD1であり、C2とC3との間に二重結合が存在し、R2が、C5-7アリール基である、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  10. 2が、フェニルである、請求項9に記載の化合物。
  11. DがD1であり、C2とC3との間に二重結合が存在し、R2が、C8-10アリール基である、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  12. 2が、1〜3つの置換基を持つ、請求項9から11のいずれか1項に記載の化合物。
  13. 前記置換基が、メトキシ、エトキシ、フルオロ、クロロ、シアノ、ビス−オキシ−メチレン、メチル−ピペラジニル、モルホリノおよびメチル−チオフェニルから選択される、請求項9から12のいずれか1項に記載の化合物。
  14. DがD1であり、C2とC3との間に二重結合が存在し、R2が、C1-5飽和脂肪族アルキル基である、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  15. 2が、メチル、エチルまたはプロピルである、請求項14に記載の化合物。
  16. C2とC3との間に二重結合が存在し、R2が、C3-6飽和シクロアルキル基である、請求項1から7のいずれか1項に記載の化合物。
  17. 2が、シクロプロピルである、請求項16に記載の化合物。
  18. DがD1であり、C2とC3との間に二重結合が存在し、R2が、式:
    Figure 2020503250
    の基である、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  19. 前記R2基における炭素原子の合計数が、多くて4である、請求項18に記載の化合物。
  20. 前記R12基における炭素原子の合計数が、多くて3である、請求項19に記載の化合物。
  21. 11、R12およびR13のうちの1つがHであり、他の2つの基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される、請求項18から20のいずれか1項に記載の化合物。
  22. 11、R12およびR13のうちの2つがHであり、他の基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される、請求項18から20のいずれか1項に記載の化合物。
  23. DがD1であり、C2とC3との間に二重結合が存在し、R2が、式:
    Figure 2020503250
    の基である、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  24. 2が、基:
    Figure 2020503250
    である、請求項23に記載の化合物。
  25. DがD1であり、C2とC3との間に二重結合が存在し、R2が、式:
    Figure 2020503250
    の基である、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  26. 14が、H、メチル、エチル、エテニルおよびエチニルから選択される、請求項25に記載の化合物。
  27. 14が、Hおよびメチルから選択される、請求項26に記載の化合物。
  28. DがD1であり、C2とC3との間に単結合が存在し、R2が、Hである、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  29. DがD1であり、C2とC3との間に単結合が存在し、R2が、
    Figure 2020503250
    であり、R16aおよびR16bの両方がHである、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  30. DがD1であり、C2とC3との間に単結合が存在し、R2
    Figure 2020503250
    であり、R16aおよびR16bの両方がメチルである、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  31. DがD1であり、C2とC3との間に単結合が存在し、R2
    Figure 2020503250
    であり、R16aおよびR16bのうちの1つがHであり、他方が、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基が、任意選択的に置換されている、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  32. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に二重結合が存在し、R12が、C5-7アリール基である、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  33. 12が、フェニルである、請求項32に記載の化合物。
  34. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に二重結合が存在し、R12が、C8-10アリール基である、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  35. 12が、1〜3つの置換基を持つ、請求項32から34のいずれか1項に記載の化合物。
  36. 前記置換基が、メトキシ、エトキシ、フルオロ、クロロ、シアノ、ビス−オキシ−メチレン、メチル−ピペラジニル、モルホリノおよびメチル−チオフェニルから選択される、請求項32から35のいずれか1項に記載の化合物。
  37. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に二重結合が存在し、R12が、C1-5飽和脂肪族アルキル基である、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  38. 12が、メチル、エチルまたはプロピルである、請求項37に記載の化合物。
  39. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に二重結合が存在し、R12が、C3-6飽和シクロアルキル基である、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  40. 12が、シクロプロピルである、請求項39に記載の化合物。
  41. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に二重結合が存在し、R12が、式:
    Figure 2020503250
    の基である、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  42. 前記R12基における炭素原子の合計数が、多くて4である、請求項41に記載の化合物。
  43. 前記R12基における炭素原子の合計数が、多くて3である、請求項42に記載の化合物。
  44. 21、R22およびR23のうちの1つがHであり、他の2つの基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される、請求項41から43のいずれか1項に記載の化合物。
  45. 21、R22およびR23のうちの2つがHであり、他の基が、H、C1-3飽和アルキル、C2-3アルケニル、C2-3アルキニルおよびシクロプロピルから選択される、請求項41から43のいずれか1項に記載の化合物。
  46. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に二重結合が存在し、R12が式:
    Figure 2020503250
    の基である、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  47. 12が、基:
    Figure 2020503250
    である、請求項46に記載の化合物。
  48. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に二重結合が存在し、R12が、式:
    Figure 2020503250
    の基である、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  49. 24が、H、メチル、エチル、エテニルおよびエチニルから選択される、請求項48に記載の化合物。
  50. 24が、Hおよびメチルから選択される、請求項49に記載の化合物。
  51. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に単結合が存在し、R12が、Hである、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  52. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に単結合が存在し、R12が、
    Figure 2020503250
    であり、R26aおよびR26bは、両方がHである、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  53. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に単結合が存在し、R12が、
    Figure 2020503250
    であり、R26aおよびR26bは、両方がメチルである、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  54. D’が、D’1であり、C2’とC3’との間に単結合が存在し、R12
    Figure 2020503250
    であり、R26aおよびR26bのうちの1つがHであり、他方が、C1-4飽和アルキル、C2-3アルケニルから選択され、かかるアルキルおよびアルケニル基が、任意選択的に置換されている、請求項1から31のいずれか1項に記載の化合物。
  55. 6'が、R6と同じ基から選択され、R7'が、R7と同じ基から選択され、R9'が、R9と同じ基から選択され、Y'が、Yと同じ基から選択される、請求項1から54のいずれか1項に記載の化合物。
  56. 6'が、R6と同じ基であり、R7'が、R7と同じ基であり、R9'が、R9と同じ基であり、Y'が、Yと同じ基である、請求項55に記載の化合物。
  57. 12が、R2と同じ基である、請求項1から56のいずれか1項に記載の化合物。
  58. 式Ia−1、Ia−2またはIa−3のものであり:
    Figure 2020503250
    式中、R2aおよびR12aは同じであり、以下:
    Figure 2020503250
    から選択され、
    1aは、メチルおよびベンジルから選択され、
    LおよびR11bは、請求項1に定義されている通りである、
    請求項1に記載の化合物。
  59. 2およびR12は、両方が、多くて3個の炭素原子を含む、請求項1から8のいずれか1項に記載の化合物。
  60. 2およびR12は、両方が、多くて2個の炭素原子を含む、請求項59に記載の化合物。
  61. 2およびR12は、両方が、多くて1個の炭素原子を含む、請求項60に記載の化合物。
  62. 11bが、OHである、請求項1から61のいずれか1項に記載の化合物。
  63. 11bが、ORAであり、ここでRAは、C1-4アルキルである、請求項1から61のいずれか1項に記載の化合物。
  64. Aが、メチルである、請求項63に記載の化合物。
  65. Lが、式IIIaのものであり、Qxが、Phe、Lys、Val、Ala、Cit、Leu、Ile、Arg、およびTrpから選択されるアミノ酸残基である、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  66. Lが、式IIIaのものであり、Qxが、
    CO−Phe−Lys−NH
    CO−Val−Ala−NH
    CO−Val−Lys−NH
    CO−Ala−Lys−NH
    CO−Val−Cit−NH
    CO−Phe−Cit−NH
    CO−Leu−Cit−NH
    CO−Ile−Cit−NH
    CO−Phe−Arg−NH、および
    CO−Trp−Cit−NH
    から選択されるジペプチド残基である、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  67. Xが、CO−Phe−Lys−NHCO−Val−Cit−NH、およびCO−Val−Ala−NHから選択される、請求項66に記載の化合物。
  68. Lが、式IIIaのものであり、Qxが、トリペプチド残基である、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  69. Lが、式IIIaのものであり、aが、0〜3である、請求項1から68のいずれか1項に記載の化合物。
  70. aが、0である、請求項69に記載の化合物。
  71. Lが、式IIIaのものであり、bが、0〜12である、請求項1から70のいずれか1項に記載の化合物。
  72. bが、0〜8である、請求項71に記載の化合物。
  73. Lが、式IIIaのものであり、dが、0〜3である、請求項1から72のいずれか1項に記載の化合物。
  74. dが、2である、請求項73に記載の化合物。
  75. Lが、式IIIaのものであり、aが、0であり、cが、1であり、dが、2であり、bが、0〜8である、請求項1から68のいずれか1項に記載の化合物。
  76. bが、0、4または8である、請求項75に記載の化合物。
  77. Lが、式IIIaのものであり、GLが以下から選択される、請求項1から76のいずれか1項に記載の化合物:
    Figure 2020503250
    (式中、Arは、C5-6アリーレン基を表す)。
  78. Arが、フェニレン基である、請求項77に記載の化合物。
  79. Lが、GL1-1およびGL1-2から選択される、請求項77または請求項78のいずれかに記載の化合物。
  80. Lが、GL1-1である、請求項79に記載の化合物。
  81. Lが、式IIIbのものであり、RL1およびRL2は、両方が、Hである、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  82. Lが、式IIIbのものであり、RL1が、Hであり、RL2が、メチルである、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  83. Lが、式IIIbのものであり、RL1およびRL2は、両方がメチルである、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  84. Lが、式IIIbのものであり、RL1およびRL2は、これらが結合している炭素原子と一緒になって、シクロプロピレン基を形成している、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  85. Lが、式IIIbのものであり、RL1およびRL2は、これらが結合している炭素原子と一緒になって、シクロブチレン基を形成している、請求項1から64のいずれか1項に記載の化合物。
  86. Lが、式IIIbのものであり、eが、0である、請求項1から64および81から85のいずれか1項に記載の化合物。
  87. Lが、式IIIbのものであり、eが、1である、請求項1から64および81から85のいずれか1項に記載の化合物。
  88. 前記ニトロ基がパラ位にある、請求項87に記載の化合物。
  89. 式Id:
    Figure 2020503250
    のものである、請求項1に記載の化合物。
  90. 式Iの複合体であって、
    L−(DLp (I)
    式中、Lは、リガンド単位であり、Dは、式I’の薬物リンカー単位であり、
    Figure 2020503250
    式中、D、R2、R6、R7、R9、R11b、Y、R”、Y’、D’、R6'、R7'、R9'およびR12は、C2とC3との間およびC2’とC3’との間のそれぞれの二重結合の存在または非存在を含めて、請求項1から64のいずれか1項に定義されている通りであり、
    LLは:
    (iiia):
    Figure 2020503250
    (式中、QおよびXは、請求項1および65〜76のいずれか1項に定義されている通りであり、GLLは、リガンド単位に接続されているリンカーである)、ならびに
    (iiib):
    Figure 2020503250
    (式中、RL1およびRL2は、請求項1および82〜85に定義されている通りである)、から選択される、細胞結合剤への接続のためのリンカーであり、
    pは、1〜20の整数である、
    前記複合体。
  91. LLが以下から選択される、請求項90に記載の複合体:
    Figure 2020503250
    (式中、Arは、C5-6アリーレン基を表す)。
  92. Arが、フェニレン基である、請求項91に記載の複合体。
  93. LLが、GLL1-1およびGLL1-2から選択される、請求項91または請求項92に記載の化合物。
  94. LLが、GLL1-1である、請求項92に記載の化合物。
  95. Lが、式(Id’):
    Figure 2020503250
    のものである、請求項90に記載の複合体。
  96. 前記リガンド単位は、抗体またはその活性断片である、請求項90から94のいずれか1項に記載の複合体。
  97. 前記抗体または抗体断片は、腫瘍関連抗原の抗体または抗体断片である、請求項95に記載の複合体。
  98. 前記抗体または抗体断片は、以下の(1)〜(88)から選択される1つ以上の腫瘍関連抗原または細胞表面受容体に結合する抗体である、請求項96に記載の複合体:
    (1)BMPR1B、
    (2)E16、
    (3)STEAP1、
    (4)0772P、
    (5)MPF、
    (6)Napi3b、
    (7)Sema 5b、
    (8)PSCA hlg、
    (9)ETBR、
    (10)MSG783、
    (11)STEAP2、
    (12)TrpM4、
    (13)CRIPTO、
    (14)CD21、
    (15)CD79b、
    (16)FcRH2、
    (17)HER2、
    (18)NCA、
    (19)MDP、
    (20)IL20R−α、
    (21)ブレビカン、
    (22)EphB2R、
    (23)ASLG659、
    (24)PSCA、
    (25)GEDA、
    (26)BAFF−R、
    (27)CD22、
    (28)CD79a、
    (29)CXCR5、
    (30)HLA−DOB、
    (31)P2X5、
    (32)CD72、
    (33)LY64、
    (34)FcRH1、
    (35)IRTA2、
    (36)TENB2、
    (37)PSMA−FOLH1、
    (38)SST、
    (38.1)SSTR2、
    (38.2)SSTR5、
    (38.3)SSTR1、
    (38.4)SSTR3、
    (38.5)SSTR4、
    (39)ITGAV、
    (40)ITGB6、
    (41)CEACAM5、
    (42)MET、
    (43)MUC1、
    (44)CA9、
    (45)EGFRvIII、
    (46)CD33、
    (47)CD19、
    (48)IL2RA、
    (49)AXL、
    (50)CD30−TNFRSF8、
    (51)BCMA−TNFRSF17、
    (52)CT Ags−CTA、
    (53)CD174(ルイス式Y)−FUT3、
    (54)CLEC14A、
    (55)GRP78−HSPA5、
    (56)CD70、
    (57)幹細胞特異的抗原、
    (58)ASG−5、
    (59)ENPP3、
    (60)PRR4、
    (61)GCC−GUCY2C、
    (62)Liv−1−SLC39A6、
    (63)5T4、
    (64)CD56−NCMA1、
    (65)CanAg、
    (66)FOLR1、
    (67)GPNMB、
    (68)TIM−1−HAVCR1、
    (69)RG−1/前立腺腫瘍標的ミンディン−ミンディン/RG−1、
    (70)B7−H4−VTCN1、
    (71)PTK7、
    (72)CD37、
    (73)CD138−SDC1、
    (74)CD74、
    (75)クローディン−CLs、
    (76)EGFR、
    (77)Her3、
    (78)RON−MST1R、
    (79)EPHA2、
    (80)CD20−MS4A1、
    (81)テネイシンC−TNC、
    (82)FAP、
    (83)DKK−1、
    (84)CD52、
    (85)CS1−SLAMF7、
    (86)エンドグリン−ENG、
    (87)アネキシンA1−ANXA1、
    (88)V−CAM(CD106)−VCAM1。
  99. 前記抗体または抗体断片は、システイン操作した抗体である、請求項95から97のいずれか1項に記載の複合体。
  100. pは、1〜8の整数である、請求項90から98のいずれか1項に記載の複合体。
  101. pは、1、2、3、または4である、請求項99に記載の複合体。
  102. 請求項90から100のいずれか1項に記載の複合体の混合物を含む組成物であって、複合化合物の混合物中の平均pは、約1〜約8である、前記組成物。
  103. 療法に用いるための、請求項90から100のいずれか1項に記載の複合体。
  104. 請求項90から100のいずれか1項に記載の複合体、および薬学的に許容可能な希釈剤、担体または賦形剤を含む、医薬組成物。
  105. 治療対象の増殖性疾患の治療に用いるための、請求項90から100のいずれか1項に記載の複合体または請求項103に記載の医薬組成物。
  106. 前記の治療すべき疾患は、がんである、請求項104に記載の使用のための複合体。
  107. 医療的治療方法における、請求項90から100のいずれか1項に記載の複合体、または請求項103に記載の医薬組成物の使用。
  108. 患者に、請求項103に記載の医薬組成物を投与することを含む、医療的治療方法。
  109. 前記医療的治療方法が、がんの治療のためのものである、請求項107に記載の方法。
  110. 前記患者は、前記複合体と併用して、化学療法薬が投与される、請求項108に記載の方法。
  111. 増殖性疾患の治療のための医薬の製造方法における、請求項90から100のいずれか1項に記載の複合体の使用。
  112. 増殖性疾患を有する哺乳類の治療方法であって、治療上有効量の請求項90から100のいずれか1項に記載の複合体または請求項103に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
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