JP2020500530A - 合成免疫受容体およびその使用方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2016年12月2日出願の米国仮出願第62/429,619号および2016年12月2日出願の米国仮出願第62/429,597号の合衆国法典第35編第119条に基づく優先権を主張し、これらの仮出願の開示は、参照により本出願に組み込まれる。
本出願には、2017年12月2日に作製され、IBM−PC、MS Windows OSでマシンフォーマットされた、77,085,242バイトのデータを有する「Sequence_ST25.txt」と言う題の配列表が添付されている。当該配列表は、あらゆる目的のためにその全体が参照により本出願に組み込まれる。
770の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号769〜770の核酸配列に少なくとも70%同一の配列であって、TCRδ鎖と二量体化可能な配列を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、(vi)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、配列番号771〜772の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号771〜772の核酸配列に少なくとも70%同一の配列であって、TCRγ鎖と二量体化可能な配列を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、(iv)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、配列番号766〜768の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号766〜768の核酸配列に少なくとも70%同一の配列であって、TCRβ1またはTCRβ2鎖と二量体化可能な配列を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、1つ以上の疾患関連抗原に結合する上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD19;CD123;CD22;CD30;CD171;CS−1(CD2サブセット1、CRACC、SLAMF7、CD319、および19A24とも呼ばれる);C型レクチン様分子1(CLL−1またはCLECL1);CD33;上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRviii);ガングリオシドG2(GD2);ガングリオシドGD3(aNeu5Ac(2−8)aNeu5Ac(2−3)bDGalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA);Tn抗原((Tn Ag)または(GalNAcα―Ser/Thr);前立腺特異的膜抗原(PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1);FMS様チロシンキナーゼ3(FLT3);腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72);CD38;CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化CD43エピトープ、非造血器癌で発現するグリコシル化CD43エピトープ;癌胎児性抗原(CEA);上皮細胞接着分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);インターロイキン13受容体サブユニットアルファ2(IL−13Ra2またはCD213A2);メソテリン;インターロイキン11受容体α(IL−11Ra);前立腺幹細胞抗原(PSCA);プロテアーゼセリン21(テスティシンまたはPRSS21);血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2);ルイス(Y)抗原;CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR―β);ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4);CD20;葉酸受容体α;受容体チロシンプロテインキナーゼERBB2(Her2/neu);ムチン1、細胞表面関連(MUC1);上皮細胞増殖因子受容体(EGFR);神経細胞接着分子(NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性フォスファターゼ(PAP);伸長因子2変異(ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質α(FAP);インスリン様増殖因子1受容体(IGF−1受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX);プロテアソーム(プロソーム、マクロパイン)サブユニット、β型9(LMP2);糖タンパク質100(gp100);易切断領域(BCR)およびアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ1(Abl)から成る癌遺伝子融合タンパク質(bcr−abl);チロシナーゼ;エフリンA型受容体2(EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子(sLe);ガングリオシドGM3(aNeu5Ac(2−3)bClalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);トランスグルタミナーゼ5(TGS5);高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA);O−アセチル―GD2ガングリオシド(OAcGD2);葉酸受容体β;腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248);腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R);クローディン6(CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR);Gタンパク質共役受容体クラスCグループ5メンバーD(GPRC5D);染色体Xオープンリーディングフレーム61(CXORF61);CD97;CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ(ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的1(PLAC1);グロボHグリコセラミドの六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY−BR−1);ウロプラキン2(UPK2);A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1);アドレナリン受容体β3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3);Gタンパク質共役受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6コンプレックス遺伝子座K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2);TCRγ代替リーディングフレームタンパク質(TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1);癌/精巣抗原1(NY−ES0−1);癌/精巣抗原2(LAGE−1a);黒色腫関連抗原1(MAGE−A1);染色体12pに位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6−AML);精子タンパク質17(SPA17);X抗原ファミリーメンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体2(Tie2);黒色腫癌精巣抗原1(MAD−CT−1);黒色腫癌精巣抗原2(MAD−CT−2);Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質p53(p53);p53変異体;プロステイン;サバイビン(surviving);テロメラーゼ;前立腺癌腫抗原1(PCT A−1またはガレクチン8)、T細胞によって認識される黒色腫抗原1(MelanAまたはMARTI);ラット肉腫(Ras)変異体;ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座切断点;アポトーシスの黒色腫阻害物質(ML−IAP);ERG(膜貫通型プロテアーゼ、セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子);NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV(NA17);ペアードボックスタンパク質Pax−3(PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリンB1;v−myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性癌遺伝子の神経芽細胞腫由来のホモログ(MYCN);RasホモログファミリーメンバーC(RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP−2);チトクロームP4501B1(CYP1B1);CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様(BORISすなわちBrother of the Regulator of Imprinted Sites)、T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3(SART3);ペアードボックスタンパク質Pax−5(PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32(OY−TES1);リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK);Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP−4);滑膜肉腫、X切断点2(SSX2);糖化最終産物の受容体(RAGE−1);腎臓ユビキタス1(RU1);腎臓ユビキタス2(RU2);レグマイン;ヒト乳頭腫ウイルスE6(HPV E6);ヒト乳頭腫ウイルスE7(HPV E7);腸由来カルボキシルエステラーゼ;熱ショックタンパク質70−2変異体(mut hsp 70−2);CD79a;CD79b;CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1):IgA受容体のFc断片(FCARまたはCD89);白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2);CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF);C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A);骨髄間質細胞抗原2(BST2);EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2);リンパ球抗原75(LY75);グリピカン3(GPC3);Fc受容体様5(FCRL5);および免疫グロブリンλ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、ビオチン、c−MYCエピトープタグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRα4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原)フコシルGM1、PTK7、gpNMB、CDH1−CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b−IGL11、ALK TCRγδ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、Tn ag、CSPG4−HMW−MAA、Timl−/HVCR1、CSF2RA(GM−CSFRα)、TGFβR2、VEGFR2/KDR、ルイスAg、TCRβ鎖、TCRβ2鎖、TCRγ鎖、TCRδ鎖、FITC、黄体化ホルモン受容体(LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性性腺刺激ホルモン受容体(CGHR)、CCR4、GD3、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1−Tax、CMVpp65、EBV−EBNA3c、インフルエンザAヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、KSHV−K8.1タンパク質、KSHV−gHタンパク質、デスモグレイン3(Dsg3)に対する自己抗体、デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体、HLA、HLA―A、HLA―A2、HLA―B、HLA―C、HLA―DP、HLA−DM、HLA−DOA、HLA−DOB,HLA―DQ、HLA―DR、HLA―G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、クローディン18.2(CLD18A2またはCLDN18A.2)、P糖タンパク質、STEAP1、LIV1、NECTIN−4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素イオンチャネル、およびTNT抗体によって認識される抗原から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、抗体、抗体断片、scFv、Fv、Fab、(Fab’)2、単一ドメイン抗体(SDAB)、vHまたはvLドメイン、ラクダ科動物由来vHHドメイン、非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、例えば、DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、オボディーズ、リピボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質、受容体、またはリガンドを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、(i)配列番号226〜400または10203〜10321のいずれかの配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであって、抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる重鎖可変領域(vH)と、(ii)配列番号16〜191または10085〜10202のいずれかの配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであって、抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる軽鎖可変領域(vL)と、(iii)配列番号488〜657、10346〜10400、または18098〜18160のいずれかの配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであって、抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる単鎖可変断片(scFv)と、(iv)配列番号421〜445または10322〜10337のいずれかの配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであって、抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされるラクダ科動物VHHドメインと、(v)配列番号439〜443のいずれかの配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであって、抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる非免疫グロブリンスカフォールドと、(vi)配列番号456〜468のいずれかの配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであって、抗原に結合するポリペプチドを
コードするポリヌクレオチドによりコードされる受容体と、(vii)配列番号476〜486または10402〜
10404のいずれかの配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであって、抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされるリガンドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号13999〜14879または14880のいずれか1つに記載の選択標的抗原のための1つ以上の軽鎖相補性決定領域、および/または配列番号14881〜15761または15762のいずれか1つに記載の選択標的抗原のための1つ以上の軽鎖相補性決定領域を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2307〜2482または12042〜12159のいずれか1つに記載の配列を有する可変軽鎖(vL)ドメイン、および/または10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2506〜2680または12160〜12278のいずれか1つに記載の配列を有する可変重鎖(vH)ドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2701〜2725または12279〜12294のいずれか1つに記載の選択抗原のための1つ以上のラクダ科動物vHH相補性決定領域を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2728〜2732または12296〜12301のいずれか1つに記載のアミノ酸を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を含む非免疫グロブリン抗原結合ドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2307〜2482または12042〜12159のいずれか1つの配列を有する可変軽鎖(vL)ドメインの1つ以上の軽鎖相補性決定領域と、配列番号2506〜2680または12160〜12278のいずれか1つの配列を有する可変重鎖(vH)ドメインの1つ以上の重鎖相補性決定領域とを含むscFvドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2770〜2939、12303〜12357、および18162〜18224から成る群であって、各々10までの保存的アミノ酸置換体を有する群から選択された配列を含むscFv断片を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る1つ以上の受容体を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2758〜2768または12359〜12361のうちいずれかの配列から成る1つ以上のリガンドを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD16A、NKG2D、CD4、PD1、デスモグレイン3(Dsg3)、またはCD4−DC−SIGNの細胞外ドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、hTPO、mTPO、CGHα鎖、CGHβ鎖、FHβ鎖、LHβ鎖、TSHβ鎖、APRIL、またはそれらの組み合わせのうち1つ以上の細胞外ドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれか1つの配列を含み、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)と、a)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれかに記載されている任意のラクダ科動物vHH、またはb)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、またはc)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、またはd)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインとを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか記載のラクダ科動物vHHと、a)配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれかの配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)、またはb)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、またはc)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、またはd)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインと、を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、リンカー領域によりTCR定常領域の各々に任意に接続されており、前記リンカー領域の核酸は、配列番号2981〜2992およびそれらの任意の組み合わせから成る群から選択されるアミノ酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列をコードするか、あるいはリンカーは、配列番号701〜714から成る群から選択される核酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列によってコードされている。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、それを取得した抗体よりも少なくとも5倍少ない標的抗原への結合親和性を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、SIRをコードするポリヌクレオチドは、各鎖のN末端に存在し配列番号1〜9および10から成る群から選択される配列を有するリーダー配列またはシグナルペプチドを更に有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、少なくとも1つのポリヌクレオチドは2つのSIRをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記ポリヌクレオチドは、切断可能リンカーをコードするヌクレオチド配列によって結合された2つのSIRをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーは、自己切断による切断可能リンカーである。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、切断可能リンカーは、2Aリンカー、2A様リンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーは、T2Aリンカー、P2A、F2A、E2Aリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーは、配列番号780〜785のうち任意の1つ以上の配列を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチド配列の前には、任意に、フーリン切断部位、フーリン様切断部位、またはそれらの機能的等価物をコードするヌクレオチド配列が位置する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーに先行するフーリン切断部位は、配列番号788〜790のうち任意の1つ以上の配列を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチド配列の前には、可撓性リンカーをコードするヌクレオチド配列が位置する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーに先行する可撓性リンカーは、Ser−Glyリンカー、Ser−Gly−Ser−Glyリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち1つ以上をコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーに先行する可撓性リンカーは、配列番号786〜787の配列を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、順番が、フーリン切断部位、可撓性リンカー、切断可能リンカーとなるよう、上記フーリン切断部位をコードするポリヌクレオチド配列の後ろに可撓性リンカーをコードするポリヌクレオチドが位置し、その後ろに切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチドが位置する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチドは、第二SIRをコードしたリーダー配列(シグナルペプチド)をコードする配列の前に存在する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記SIRは、選択抗原のために、多様な結合親和性を有するように設計可能である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記SIRはアクセサリーモジュールを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記アクセサリーモジュールはCD3zドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記TCR定常鎖は、(viii)配列番号12401、12402、12403、12408、または12409と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列と、(ix)配列番号12421、12422、12423、12427、または12428と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列と、(x)(viii)および(ix)の2つのTCR定常鎖の二量体組み合わせと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインはCD19と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2318〜2324、12060〜12068、12108、12127、および12156のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる相補性決定領域(CDR)と、配列番号2517〜2523、12178〜12186、1227、12246、および12275のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる相補性決定領域(CDR)と、配列番号12288に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、配列番号2770〜2774、12325、12308、18162〜18170、および12354のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3135〜3235、3250〜3346、3396、3401〜3403、3406、3429〜3432、3435〜3439、3540、3855〜3859、12431〜12489、12491〜
12493、12495〜12530、12534、13195〜13203、
13250、13267、13289、13429〜13437、13483、13501、および13523から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD20と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2325〜2326、12069〜12077、および12078のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2524〜2525、12187〜12195、および12196のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号12289または12290に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、配列番号2787〜2788、18177〜18186、および18187のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3263、3348、3456〜3457、3876〜3877、12464〜12465、12477〜12482、12492、12534、13204〜13213、13438〜13446、および13447から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD22と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2327〜2329、12122〜12126、および12132のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2526〜2528、12241〜12245、および12251のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2789〜2791、12320〜12330、および18188のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドにおいて、配列番号3332,3433、3458〜3460、3878〜3880、12483、12485、12488〜12490、13241〜13245、13268、13475〜13479、および13502から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、BCMAと結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2310〜2313、12046〜12048、12118〜12119、12139〜12145、および12146のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2509〜2512、12164〜12166、12237〜12238、12258〜12264、および12265のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号12279〜12281、12283〜12285、12287、12291〜12292、12293、または12294に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、配列番号2780〜2783、12237〜12344、18174〜18175、および18176のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3445〜3449、3866〜3869、12463、12533、12535〜12536、13181〜13183、13261〜13262、13277〜13284、13415〜13417、13495〜13496、13511〜13517、および13518から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、MPLと結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2414〜2421、12120、12128、および12129のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2611〜2618、12239、12247、および12248のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2871〜2878、12326〜12327、および12318のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記配列番号3347、3373、3427〜3428、3495、3556〜3562、3979〜3985、4025、12454、12456、12458、12462、12532、13259、13265〜13266、13493、13499、および13500から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CS1と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2355〜2358、12090〜12094、および12095のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2553〜2555、12209〜12213、および12214のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2817〜2819、18211〜18215、および18216のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドにおいて、配列番号3376、3487、3489、3907〜3909、12455、12457、12459、12461、12476、13226〜13231、13460〜13464、および13465から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD33と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2336〜2337、12079〜12084、および12085のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2535〜2536、12197〜12202、および12203のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2795〜2796、18189〜18193、および18194のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3464〜3465、3884〜3885、12460、12473、12479、13214〜13220、13448〜13453、および13454から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD123と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2315、2472、12049〜12058、および12059のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2514、2670、12167〜12176、および12177のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2716または2717に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、配列番号2801、2929、18196〜18205、および18206のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3266〜3267、3366〜3368、3375、3378、3405、3409、3434、3470、3492〜3497、3617、3890、3912〜3913、4041、12480、13184〜13194、13418〜13427、および13428から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、葉酸受容体1と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2373に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2570に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2833に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3511および3928から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、メソテリンと結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2413、12154、および12155のうちのいずれか1つに少なくとも
98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2609〜2610、12273、および12274のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2713〜2714または2725に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、配列番号2870、2899、12352、および12353のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドにおいて、配列番号3414、3419、3554、3585、3976、4008、13287〜13288、13521、および13522から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、IL13Ra2と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2399および2400のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2595および2596のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2858および2859のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドにおいて、配列番号3541〜3542、3542、3963、および3964から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD138と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2316に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2515に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2802に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記組換えポリヌクレオチドにおいて、配列番号3268、3374、3404、3471、および3891から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、TCRgdと結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2449に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2646に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2907に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3594および4017から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、TCRB1と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2445および2446のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2642および2643のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2903および2904のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3590〜3591、4013、および4014から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、TCRB2と結合する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2447および2448のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2644および2645のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、またはポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、配列番号2905および2906のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、から成る群から選択される。上記組換えポリヌクレオチドは、配列番号3353〜3364、3592〜3593、4015、および4016から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする。
3023から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体α鎖(Cα)である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記TCRの定常領域は、配列番号3024〜3044から成る群から選択される配列、または配列番号3024〜3044から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体β鎖(Cβ)である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記TCRの定常領域は、配列番号3049〜3050から成る群から選択される配列、または配列番号3049〜3050から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体γ鎖(Cγ)である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記TCRの定常領域は、配列番号3051〜3052から成る群から選択される配列、または配列番号3051〜3052から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体δ鎖(Cδ)である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記TCRの定常領域は、配列番号3046〜3048から成る群から選択される配列、または配列番号3046〜3048から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するプレTCR受容体α鎖(前Cα)である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の疾患関連抗原に結合する1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD19;CD123;CD22;CD30;CD171;CS−1(CD2サブセット1、CRACC、SLAMF7、CD319、および19A24とも呼ばれる);C型レクチン様分子1(CLL−1またはCLECL1);CD33;上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRviii);ガングリオシドG2(GD2);ガングリオシドGD3(aNeu5Ac(2−8)aNeu5Ac(2−3)bDGalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA);Tn抗原((Tn Ag)または(GalNAcα―Ser/Thr);前立腺特異的膜抗原(PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1);FMS様チロシンキナーゼ3(FLT3);腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72);CD38;CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化CD43エピトープ、非造血器癌で発現するグリコシル化CD43エピトープ;癌胎児性抗原(CEA);上皮細胞接着分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);インターロイキン13受容体サブユニットアルファ2(IL−13Ra2またはCD213A2);メソテリン;インターロイキン11受容体α(IL−11Ra);前立腺幹細胞抗原(PSCA);プロテアーゼセリン21(テスティシンまたはPRSS21);血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2);ルイス(Y)抗原;CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR―β);ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4);CD20;葉酸受容体α;受容体チロシンプロテインキナーゼERBB2(Her2/neu);ムチン1、細胞表面関連(MUC1);上皮細胞増殖因子受容体(EGFR);神経細胞接着分子(NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性フォスファターゼ(PAP);伸長因子2変異(ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質α(FAP);インスリン様増殖因子1受容体(IGF−1受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX);プロテアソーム(プロソーム、マクロパイン)サブユニット、β型9(LMP2);糖タンパク質100(gp100);易切断領域(BCR)およびアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ1(Abl)から成る癌遺伝子融合タンパク質(bcr−abl);チロシナーゼ;エフリンA型受容体2(EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子(sLe);ガングリオシドGM3(aNeu5Ac(2−3)bClalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);トランスグルタミナーゼ5(TGS5);高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA);O−アセチル―GD2ガングリオシド(OAcGD2);葉酸受容体β;腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248);腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R);クローディン6(CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR);Gタンパク質共役受容体クラスCグループ5メンバーD(GPRC5D);染色体Xオープンリーディングフレーム61(CXORF61);CD97;CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ(ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的1(PLAC1);グロボHグリコセラミドの六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY−BR−1);ウロプラキン2(UPK2);A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1);アドレナリン受容体β3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3);Gタンパク質共役受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6コンプレックス遺伝子座K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2);TCRγ代替リーディングフレームタンパク質(TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1);癌/精巣抗原1(NY−ES0−1);癌/精巣抗原2(LAGE−1a);黒色腫関連抗原1(MAGE−A1);染色体12pに位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6−AML);精子タンパク質17(SPA17);X抗原ファミリーメンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体2(Tie2);黒色腫癌精巣抗原1(MAD−CT−1);黒色腫癌精巣抗原2(MAD−CT−2);Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質p53(p53);p53変異体;プロステイン;サバイビン;テロメラーゼ;前立腺癌腫抗原1(PCT A−1またはガレクチン8)、T細胞によって認識される黒色腫抗原1(MelanAまたはMARTI);ラット肉腫(Ras)変異体;ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座切断点;アポトーシスの黒色腫阻害物質(ML−IAP);ERG(膜貫通型プロテアーゼ、セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子);NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV(NA17);ペアードボックスタンパク質Pax−3(PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリンB1;v−myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性癌遺伝子の神経芽細胞腫由来のホモログ(MYCN);RasホモログファミリーメンバーC(RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP−2);チトクロームP4501B1(CYP1B1);CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様(BORISすなわちBrother of the Regulator of Imprinted Sites)、T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3(SART3);ペアードボックスタンパク質Pax−5(PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32(OY−TES1);リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK);Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP−4);滑膜肉腫、X切断点2(SSX2);糖化最終産物の受容体(RAGE−1);腎臓ユビキタス1(RU1);腎臓ユビキタス2(RU2);レグマイン;ヒト乳頭腫ウイルスE6(HPV E6);ヒト乳頭腫ウイルスE7(HPV E7);腸由来カルボキシルエステラーゼ;熱ショックタンパク質70−2変異体(mut hsp 70−2);CD79a;CD79b;CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1):IgA受容体のFc断片(FCARまたはCD89);白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2);CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF);C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A);骨髄間質細胞抗原2(BST2);EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2);リンパ球抗原75(LY75);グリピカン3(GPC3);Fc受容体様5(FCRL5);および免疫グロブリンλ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、ビオチン、c−MYCエピトープタグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原)フコシルGM1、PTK7、gpNMB、CDH1−CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b−IGL11、ALK TCRγδ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、Tn ag、CSPG4−HMW−MAA、Timl−/HVCR1、CSF2RA(GM−CSFRα)、TGFβR2、VEGFR2/KDR、ルイスAg、TCRβ鎖、TCRβ2鎖、TCRγ鎖、TCRδ鎖、FITC、黄体化ホルモン受容体(LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性性腺刺激ホルモン受容体(CGHR)、CCR4、GD3、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1−Tax、CMVpp65、EBV−EBNA3c、インフルエンザAヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、KSHV−K8.1タンパク質、KSHV−gHタンパク質、デスモグレイン3(Dsg3)に対する自己抗体、デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体、HLA、HLA―A、HLA―A2、HLA―B、HLA―C、HLA―DP、HLA−DM、HLA−DOA、HLA−DOB,HLA―DQ、HLA―DR、HLA―G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、クローディン18.2(CLD18A2またはCLDN18A.2)、P糖タンパク質、STEAP1、LIV1、NECTIN−4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素イオンチャネル、およびTNT抗体によって認識される抗原から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、抗体、抗体断片、scFv、Fv、Fab、(Fab’)2、単一ドメイン抗体(SDAB)、vHまたはvLドメイン、ラクダ科動物由来vHHドメイン、非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、例えば、DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、オボディーズ、リピボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質、受容体、またはリガンドを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、(i)配列番号2506〜2680または12160〜12278のいずれかに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする重鎖可変領域(vH)と、(ii)配列番号2307〜2482または12042〜12159のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする軽鎖可変領域(vL)と、(iii)配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする単鎖可変断片(scFv)と、(iv)配列番
号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも
98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードするラクダ科動物VHHと、(v)配列番号439〜443のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列によりコードされ、同種に結合するポリペプチドをコードする非免疫グロブリンスカフォールドと、(vi)配列番号2736〜2748のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする受容体と、(vii)配列番号2758〜2768または12359〜12361のうちのいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、同種に結合するポリペプチドをコードするリガンドと、から成る群から選択される。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号13999〜14879または14880のいずれかに記載の、選択標的抗原のための1つ以上の軽鎖相補性決定領域、および/または配列番号14881〜15761または15762のいずれかに記載の、選択標的抗原のための1つ以上の重鎖相補性決定領域を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2307〜2482または12042〜12159のうちいずれか1つの配列を含む可変軽鎖(vL)ドメイン、および/または10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2506〜2680または12160〜12278のうちいずれか1つの配列を含む可変重鎖(vH)ドメインを有する。上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のいずれかに記載の、選択された抗原のための1つ以上のラクダ科動物vHH相補性決定領域を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2728〜2732または12296〜12301のいずれかに記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を含む非免疫グロブリン抗原結合ドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2307〜2482または12042〜12159のうちのいずれか1つの配列を有する可変軽鎖(vL)ドメインのうち1つ以上の軽鎖相補性決定領域と、配列番号2506〜2680または12160〜12278のうちのいずれか1つの配列を有する可変重鎖(vH)ドメインのうち1つ以上の重鎖相補性決定領域とを含むscFvドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、各々10までの保存アミノ酸置換体を有する、配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224から成る群から選択される配列を含むscFv断片を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る1つ以上の受容体を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361のうちいずれかの配列を含む1つ以上のリガンドを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD16A、NKG2D、CD4、PD1、デスモグレイン3(Dsg3)、またはCD4−DC−SIGNの細胞外ドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、hTPO、mTPO、CGHα鎖、CGHβ鎖、FHβ鎖、TSHβ鎖、APRIL、またはそれらの組み合わせのうち1つ以上の細胞外ドメインを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれかの配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)と、a)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか記載のラクダ科動物vHH、またはb)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、またはc)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、またはd)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインとを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか記載のラクダ科動物vHHと、a)配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれかの配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)、またはb)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、またはc)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、またはd)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインとを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、リンカー領域により前記TCR定常領域の各々に任意に接続されており、前記リンカー領域の核酸は、配列番号2981〜3003およびそれらの任意の組み合わせから成る群から選択されるアミノ酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列をコードするか、あるいは前記リンカーは、配列番号701〜725から成る群から選択される核酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列によってコードされている。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、それを取得した抗体よりも少なくとも5倍少ない標的抗原への結合親和性を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記SIRをコードするポリヌクレオチドは、各鎖のN末端に存在し配列番号1〜9および10から成る群から選択される配列を有するリーダー配列またはシグナルペプチドを更に有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記SIRはSIRヘテロ二量体を有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記ポリペプチドは、切断可能リンカーによって結合される2つのSIRを有する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーは、自己切断による切断可能リンカーである。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーは、2Aリンカー、2A様リンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記切断可能リンカーは、T2Aリンカー、P2A、F2A、E2Aリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である。更なる実施形態において、上記切断可能リンカーは、配列番号780〜785のうち任意の1つ以上の配列を有する。前述のいずれかの実施形態において、上記切断可能リンカーの前には、任意に、フーリン切断部位、フーリン様切断部位、またはそれらの機能的等価物が位置する。更なる実施形態において、上記切断可能リンカーに先行する前記フーリン切断部位は、配列番号788〜790のうち任意の1つ以上の配列を有する。更なる実施形態において、上記切断可能リンカーの前には可撓性リンカーが位置する。更なる実施形態において、上記切断可能リンカーに先行する前記可撓性リンカーは、Ser−Glyリンカー、Ser−Gly−Ser−Glyリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち1つ以上をコードする。上記切断可能リンカーに先行する前記可撓性リンカーは、配列番号786〜787の配列を有する。更なる実施形態において、順番が、フーリン切断部位、可撓性リンカー、切断可能リンカーとなるよう、上記フーリン切断部位の後ろに可撓性リンカーが位置し、その後ろに切断可能リンカーが位置する。前述のいずれかに関する別のまたは更なる実施形態において、上記SIRは、選択抗原のために、多様な結合親和性を有するように設計される。
ベクターを用いて導入される。
SIRを設計するための適切な標的が、文献または遺伝子発現データベースの検索に基づいて選択される。一般的に、SIRの適切な標的は、通常の健康な細胞と比べて、病気を引き起こす細胞または病気関連細胞でより多く発現される。
SIRの候補標的抗原が特定されたら、SIRの抗原結合ドメインが文献で入手可能な情報に基づいて設計される。一般的に、SIRの抗原結合ドメインは、通常、抗体、抗体断片、scFv、またはラクダ科動物のvHHドメインに基づいている。抗体の重鎖(vH)および軽鎖(vL)の可変鎖、ラクダ科動物vHHドメイン、並びに種々の受容体およびリガンドの配列は、配列決定により、あるいは公的に利用可能なデータベースにより入手可能であり、異なる実施例で示されるように、本明細書記載の方法を用いて、SIRの合成に使用可能である。SIRの抗原結合ドメインを含む配列は、公的に利用可能なソフトウェア(例えば、ThermoFisherまたはIDT)および商用ベンダー(例えば、IDT)を用いて、コドン最適化され、人工的に合成される。その結果得られる断片はPCR増幅され、標準の分子生物学の技術を用いて、異なるSIR骨格構造を有する異なるベクターでクローン化される。一般的に、SIRコンストラクトは、通常、レンチウイルスベクターでクローン化される。SIRコンストラクトの配列は、自動配列決定を用いて確認される。
免疫エフェクター細胞でのSIRの発現および結合活性を試験するため、SIRの抗原標的の細胞外ドメインが、短いGly−Serリンカーを通して、ルシフェラーゼ(例えば、NLuc、GLuc、MLuc7、TurboLuc16、またはPaLuc)と融合される。例えば、CD19の細胞外ドメインは、Gly−Serリンカーを通して、フレーム単位でNLucと融合される。融合タンパク質はN末端シグナル配列を有している。その結果得られるコンストラクトは293FT細胞に一時的にトランスフェクションされ、分泌融合タンパク質を含む上澄み液は48〜72時間後に回収される。
SIRの活性を試験するための適切な細胞株を特定するため、SIRの抗原結合ドメインは、短いGly−Serリンカーを通して、ルシフェラーゼ(例えば、NLuc、GLuc、MLuc7、TurboLuc16、またはPaLuc)とも融合される。例えば、SIRがCD19を標的にするFMC63モノクロナール抗体に基づいている場合、FMC63のscFv断片(vL−Gly−Ser−Linker−vH)は、Gly−Serリンカーを通して、フレーム単位でNLucと融合される。融合タンパク質はN末端シグナル配列を有している。その結果得られるコンストラクトは293FT細胞に一時的にトランスフェクションされ、分泌融合タンパク質を含む上澄み液は48〜72時間後に回収される。高レベルのSIR標的を発現する(従ってSIRの活性を試験するのに使用可能な)細胞株を特定するため、ABD−NLuc融合タンパク質への結合に関して、細胞株のパネルが試験される。表Aは、本開示のSIRの活性をアッセイするのに使用可能な異なる抗原標的を発現する細胞株の例示的リストを提供する。SIRの標的を発現する細胞株は、代替方法、例えば、文献検索、商業的に入手可能な抗体による免疫染色、または公的に利用可能な遺伝子発現データベースを用いて特定してもよい。
対照ベクターおよびSIR発現Jurkat−NFAT−GFPまたはT細胞が(上述のような)標的抗原NLuc融合タンパク質で染色され、標的抗原に結合する能力がNLuc活性を測定することにより分析される。例えば、CD19を標的とするFMC63ベースSIRを発現するJurkat−NFAT−GFP細胞は、Jurkat−NFAT−GFP細胞または親Jurkat−NFAT−GFP細胞を発現する対照ベクターと比較して、CD19−NLuc融合タンパク質への結合が増大している。
(上述の)標的抗原を発現する細胞株と一緒に4〜24時間共培養された対照ベクターおよびSIR発現Jurkat−NFAT−GFPおよび標的抗原に結合する能力が、フローサイトメトリーを用いてGFP発現の誘導を測定することにより分析される。細胞の上澄み液が回収され、サイトカイン(例えば、IL2)の誘導が分析される。
対照ベクターおよびSIR発現Jurkat−NFAT−GFPまたはT細胞が、標的細胞株と一緒に4〜96時間共培養され、上澄み液が、ELISAを用いて、サイトカイン(例えば、IL2、IFNγ、TNFαなど)発現の誘導に関して検査される。
非感染T細胞、または対照ベクターまたはSIRを発現する細胞は、ルシフェラーゼ(GLuc、NLuc、Turboluc26など)の非分泌形態を発現する標的細胞株と4〜96時間共培養され、細胞溶解の誘導が、PCT/US17/52344記載の方法でルシフェラーゼ活性を測定することにより検査される。細胞毒活性の代替測定方法(例えば、51Cr放出アッセイまたはLDH放出アッセイ)も同様に使用できる。SIRを発現するT細胞の活性も、免疫不全マウスにおける適切な異種移植片を用いてインビボで分析できる。
1.pLENTI−EF1−FMC63vL−V5−[mTCRb−WT]−F−P2A−FMC63−vH−Myc−[mTCRa−WT]−F−F2A−Pac−F06。 このコンストラクトは、対応するヒト鎖の代わりにマウスTCRβ(TCRb)の定常領域(C領域)およびマウスTCRαを有している点を除き、pLENTI−EF1−FMC63vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−Pac−F02コンストラクトに類似している。
2.pLENTI−EF1−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−FMC63−vH−Myc−[TCR−ca−T48C−opt1]−F−F2A−PAC−L05(050515−L05)。このコンストラクトは、以下の点で、pLenti−EF1−FMC63vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−Pac−F02と異なっている。
a.TCRbおよびTCRa鎖の定常領域をコードするヌクレオチド配列は、SIRの発現を増大させるため、コドン最適化された。
b.導入されたTCR鎖と内因性TCR鎖との誤対合を減少させるため、追加のシステイン残基が各鎖に加えられ、追加の鎖間ジスルフィド結合の形成を促進した。従って、TCRb配列はSer57からシステインへの変異を有しており、TCRaはトレオニン48からシステインへの変異を有している。
3.pLENTI−EF1−FMC63−vL−V5−[TCRb−KACIAH]−F−P2A−FMC63−vH−Myc−[TCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC−D06(081415−D06)。このコンストラクトは、以下の点で、pLENTI−EF1−FMC63vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−Pac−F02と異なっている。
a.TCRbおよびTCRa鎖の定常領域をコードするヌクレオチド配列は、SIRの発現を増大させるため、コドン最適化された。
b. 導入されたTCR鎖と内因性TCR鎖との誤対合を減少させるため、追加のシステイン残基が各鎖に加えられ、追加の鎖間ジスルフィド結合の形成を促進した。従って、TCRb配列はSer57からシステインへの変異を有しており、TCRaはトレオニン48からシステインへの変異を有している。
c.マウスTCRはヒトの対応物よりも発現が優れていることが証明されており、ヒトTCRのマウス化は発現を改善することが証明されている。このコンストラクトにおいては、ヒトTCRβ(TCRb)定常領域の5つのアミノ酸が対応するマウスのアミノ酸で置き換えられている。斯かるマウスのアミノ酸は、K−18、A−22、I−133、A−136、およびH−139であった。加えて、ヒトTCRα(TCRa)定常鎖が、4つのアミノ酸、すなわちセリン(S−91)、アスパラギン酸(D−92)、バリン(V−93)、およびプロリン(P−94)を含むマウスTCRα(TCRa)定常鎖の領域で置き換えられている(配列番号3010)。
レンチウイルスは、実質的に前出されたように(Matta, Hozayev, Tomar, Chugh & Chaudhary, 2003)、293FT細胞におけるリン酸カルシウムベースのトランスフェクションによって作製された。293FT細胞は、10%FCS4mML−グルタミン、0.1mM MEM非必須アミノ酸、および1mM MEMピルビン酸ナトリウムを含むDMEM(DMEM−10と呼ばれる)で繁殖させた。レンチウイルスを作製するため、トランスフェクションの日に約80コンフルエントとなるように、10cm組織培養プレートのDMEM−10培地10mLで、抗生物質なしに、293FTを培養した。次の日、異なる遺伝子をコードするレンチウイルス発現プラスミド10μg、PSPAX2プラスミド7.5μg、およびPLP/VSVGプラスミド2μgを用いて、リン酸カルシウムトランスフェクション法により、細胞にトランスフェクションを行った。トランスフェクションの約15〜16時間後、培地9mLを除去し、新鮮な培地5mLで置き換えた。トランスフェクションの約48時間後、5mLの上澄み液を回収(第一回収)し、5mLの新鮮な培地で置き換えた。トランスフェクションの約72時間後、全ての培地を回収した(第二回収、通常約6mL)。回収された上澄み液はプールされ、細胞残骸物および非接着性細胞を除去するため、1000rpmで1分間遠心分離を行った。無細胞上澄み液は、0.45μmのシリンジフィルターで濾過した。ある場合には、上澄み液は、4℃で2時間、18500rpmの超遠心で更に濃縮した。ウイルスペレットを最初の容積の1/10のXVIVO培地に再懸濁した。ウイルスは新鮮なまま標的細胞を感染させるのに使用するか、あるいは−80℃でアリコート中に冷凍保存された。
ロサンジェルスの小児病院の血液銀行から、健康な匿名の成人ドナー由来のバッフィーコート細胞を取得し、それを使用して、フィコールハイパック比重遠心法により、末梢血単核細胞(PBMC)を単離した。PBMCはそのまま使用された、あるいはCD3磁気マイクロビーズ(Miltenyi Biotech)を用い、製造元の指示に従ってT細胞を単離するのに使用された。PBMCまたは単離されたT細胞は、10ng/mLのCD3抗体、10ng/mLのCD28抗体、および100IU組換えヒトIL−2で補充されたXVIVO培地(Lonza)に再懸濁された。細胞は、5%のCO2加湿型培養器で、37℃で培養された。細胞は、レンチウイルスベクターを感染させる前、1日間、上記培地で活性化させた。一般的に、一次細胞(例えば、T細胞)は、朝、スピン感染(8μg/mLのPolybrene(登録)(Sigma、カタログ番号H9268)の存在下でXVIVO培地に再懸濁させた濃縮ウイルス300μLを用いて、37℃で90分間、1800rpmで行われた)を用いて感染させた。培地は夕方取り替え、感染は更に2日間(合計3感染)繰り返えされた。3度目の感染後、細胞はペレット化され、10ng/mLのCD3抗体、10ng/mLのCD28抗体、および100IU組換えヒトIL−2を含む新鮮なXVIVO培地に再懸濁され、(指示されている場合は)それぞれの抗生物質で補充され、別の規定がない限り、選択用の細胞培養フラスコに配置された。細胞は、薬剤選択がない場合には上記培地で10〜15日間、薬剤選択が使用された場合には20〜30日間、培養された。EGFPを発現するレンチウイルスで細胞を感染させる場合、細胞は薬剤選択なしに増殖させるか、あるいは流動選別により、EGFP発現細胞の濃縮が行われた。癌細胞株の感染に関しては、約500,000の細胞を2mLの非濃縮ウイルス上澄み液(Polybrene(登録)(Sigma、カタログ番号H9268)を含む合計容積3mL)で感染させた。翌朝、細胞をペレット化し、それぞれの抗生物質を含む培地に再懸濁し、それを選択用の細胞培養フラスコに配置した。
エレクトロポレーションのため、5x106のJurkat細胞を90gで10分間遠心分離し、10μLの緩衝液に再懸濁し、プラスミドをコードするsleeping beauty20μgおよびSB100Xトランスポザーゼプラスミドと混合する。エレクトロポレーション緩衝液およびキュベットは、LonzaのAmaxa Cell Line Nucleofector Kit V(VCA−1003)から提供された。再懸濁された細胞はキュベットへ移され、プログラムX−001を用いてエレクトロポレートされた。エレクトロポレーション後、細胞は室温で10分間、キュベット内で培養され、次に20%FBSで補充され予め温められたRPMI培地1mLがキュベット内の細胞に添加された。細胞は、予め温められた培地1mLを各ウェルに含む6ウェルプレートへ移され、37℃で終夜培養された。翌日、細胞は遠心分離され、sleeping beauty−SIR発現Jurkat細胞を選択するため、10%FBSおよび250ng/mLピューロマイシンで補充されたRPMIで培地を置き換えた。
ジギトニンはSigma(カタログ番号D141)から購入され、100mg/mLの原液がDMSO中で調製された。1mg/mLの希釈原液がPBS中で調製された。細胞溶解に使用されたジギトニンの最終濃度は、別の規定がない限り、30μg/mLであった。
ヒトIL2が、R&D Systems(Minneapolis, MN)のIL2−ELISAキットを用いて、製造元の推薦に従い、24〜96時間特定の標的細胞株と共培養されたSIR発現Jurkat−NFAT−GFPエフェクター細胞またはT細胞の細胞培養上澄み液で測定された。
マウス抗ヒトc−MycAPC共役モノクロナール抗体(カタログ番号IC3696A)をR&D Systems(Minneapolis, MN)から得た。ビオチニル化ProteinLは、GeneScript(Piscataway, NJ)から購入し、リン酸緩衝生理食塩水中1mg/mLで再構成され、4℃で保存された。ストレプトアビジンAPC(SA1005)はThermoFisher Scientificから購入した。
細胞死を測定するため、PCT/US17/52344に記載(「A Non−Radioactive Cytotoxity Assay」)されている、GlucまたはNLucの異所性細胞質ゾル発現に基づく新しいアッセイが用いられた。この方法は、標的細胞内のレポーターの発現に関係しており、該レポーターは健康な細胞内では優先的に維持されるが、死んだ細胞または死にかかっている細胞からは放出される、あるいは死んだ細胞または死にかかっている細胞でその活性が優先的に測定可能である。本アッセイのための好ましいレポーターは、1)カイアシ類(例えば、Gaussia princeps、Pleuromamma abdominalis、Metridia pacifica、Metridia curticauda、Metridia asymmetrica、Metridia okhotensis、Metridia longa、Lucicutia ovaliformis、Heterorhabdus tanneri、およびPleuromamma scutullata)からのルシフェラーゼの非分泌型、2)深海エビ由来の改変ルシフェラーゼレポーター(例えば、NanoLuc)である。斯かるいくつかのレポーターベクターの配列が、配列番号881〜配列番号887に提供される。上記ベクターはレトロウイルスおよびレンチウイルスの作製に使用され、当該ウイルスは、適切な抗生物質で選択後、Gluc、NLuc,TurboLuc、またはMLuc7を安定的に発現するいくつかの標的細胞株のポリクロナール母集団を作製するのに使用された。特別の規定がない限り、異なるルシフェラーゼ(Gluc、NLuc,NLuc7、またはTurboLuc16)を安定的に発現する標的細胞は、384ウェルプレートの標的細胞を増殖させるのに使用される培地で、三つ組で培養された。懸濁液中に繁殖する標的細胞は、一般的に、ウェル当たり2〜3x104の濃度で培養され、付着単層として増殖する標的細胞は、ウェル当たり1〜2x104の濃度で培養された。特別の規定がない限り、標的細胞は、遺伝子組換えT細胞(すなわち、SIRまたはCARを発現する細胞)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比が1対1から10対1の範囲で、4時間から96時間、共培養された。標的細胞が付着細胞(例えば、HeLa細胞)として増殖する場合、T細胞を加える前に、斯かる細胞がウェルの底に付着するようにした。T細胞仲介による標的細胞の溶解誘導は、ルシフェラーゼ活性の増大により分析された(天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することによる、Bio Tek Synergyプレートリーダーでの測定)。
天然のセレンテラジン(CTZ、Nanaolight、カタログ番号#303)の100X原液を、冷凍CT粉末1mgを100%メタノール1.1mL(時間経過によるCTZの酸化を回避するため、6NのHCL30μLで補充)に溶解することにより調製した。CTZアッセイ緩衝液を調製するため、CTZの100X原液が、PBS中で0.5X濃度に希釈された。特別の規定がない限り、(上記で調製された)CTZアッセイ緩衝液全量15μLが、ルシフェラーゼの非分泌型を発現する細胞を約50〜60mL容量の培地に含む384ウェルホワイトプレート(Greiner、384ウェルホワイトプレートカタログ番号781075)の各ウェルに添加され、Bio Tek Synergy H4プレートリーダーを用いて、エンドポイントモードで、プレートの蛍光が読み取られた。96ウェルプレートに関しては、細胞は200μLの培地で培養され、約50μLの0.5X CTZアッセイ緩衝液が添加された。特別の規定がない限り、Gluc、TurboLuc16、およびMLuc7の活性のアッセイには、0.5X CTZアッセイ緩衝液が用いられた。CTZアッセイ緩衝液(0.125X濃度へ希釈)は、いくつかの実施形態において(以下を参照)、NLuc活性の測定にも使用された。特別の規定がない限り、一般的に、添加された0.5X CTZアッセイ緩衝液の容積は、細胞を含むウェルの液体の容積の約1/4であるが、0.5X CTZアッセイ緩衝液が1対1の容量の細胞を含む培地に添加された場合もアッセイは成功した。培地だけ(Med)を含むウェル、および標的細胞がSIRコンストラクトで感染されていないT細胞(T−UI)と一緒に培養された場合のウェル内のGluc活性が、(該当する場合)対照として使用された。
SIRおよびその標的抗原の発現を検出するため、ルシフェラーゼベースのレポーターアッセイが、PCT/US2017/025602(「A Highly Sensitive And Specific Luciferase Based Reporter Assay for Antigen Detection」)に記載されるように用いられた。CD19もMPL(トロンボポエチンまたはTPO−Rとしても知られる)も、造血細胞で発現するが、異なる系統の細胞では異なる発現を示す。FMC63は、ヒトCD19を特異的に認識する、良く特徴付けられたマウスモノクロナール抗体である。同様に、161はヒトMPLを認識するモノクロナール抗体である。我々は、FMC63vLおよびvH断片の既知の配列に基づいて、FMC63短鎖Fv(scFv)を作製した。FMC63scFvをコードするcDNAは、5’から3’末端にかけて、ヒトCD8分子由来のシグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列、FMC63vL断片、(Gly4Ser)x3リンカー、およびFMC63−vH断片から成る。次に、FMC63scFv断片をコードするcDNAが、GLy−Gly−Ser−Glyリンカーを通して、AcV5タッグNLucをコードするcDNAへ融合されてFMC63−GGSG−NLucが生成され、次に、その生成物はヒトEF1αプロモーターの下流のレンチウイルスベクターpLenti−EF1にクローン化され、コンストラクトPlenti−EF1a−FMC63(vL−vH)−GGSG−NLuc−AcV5−U09(配列番号880)が生成される。挿入断片の配列は、配列番号4516である。同様に、161−GGSG−NLucをコードするコンストラクトが、MPLに対する161モノクロナール抗体のvLおよびvH断片を用いて作製された。挿入断片の核酸配列は、配列番号4517に提供される。Plenti−EF1−FMC63−GGSG−NLuc−AcV5およびPlenti−EF1−161−GGSG−NLuc−AcV5プラスミドが、リン酸カルシウム共沈法により、293FT細胞へトランスフェクションされた。トランスフェクションの約20時間後、細胞培養媒体をXVIVO培地で置き換えた。分泌されたFMC63−GGSG−NLuc−AcV5および161−GGSG−NLuc−AcV5タンパク質を含む調整培地を48〜72時間後に回収した。
養子細胞療法分野で頻繁に生じる問題は、キメラ抗原受容体およびSIRを発現する細胞を検出可能な高感度で特異的なアッセイの欠如である。タンパク質Tによる染色は、CARおよびSIRを含むscFvの細胞表面発現の検出には使用できるが、標的抗原とCARおよびSIRとの相互作用を測定することはできない。C19およびMPLを標的とするCARの結合親和性を検出するため、PCT/US2017/025602(参照として、その全体が本明細書に援用される)記載の極めて高感度なルシフェラーゼレポーターベースの抗原検出アッセイが使用された。シグナルペプチドを含むヒトCD19およびヒトMPLの細胞外ドメインが、フレーム単位で、GLy−Gly−Ser−Glyリンカー、NLuc(分泌シグナルなし)、およびAcV5エピトープタグをコードするヌクレオチド配列と融合された。CD19コンストラクトの場合、シグナルペプチドと細胞外ドメインの最初の部分との間にFLAGタグが挿入された。カセット全体がヒトEF1αプロモーターの下流のレンチウイルスベクターpLenti−EF1にクローン化され、コンストラクトpLenti−EF1−CD19−GGSG−NLuc−AcV5およびpLenti−EF1−MPL−GGSG−NLuc−AcV5がそれぞれ作製された。挿入断片の核酸配列は、それぞれ配列番号4518および4519に提供される。該コンストラクトは、リン酸カルシウム共沈法により293FT細胞にトランスフェクションされた。トランスフェクションの約20時間後、細胞培養培地を新鮮な培地で置き換えた。48〜72時間後、分泌されたFlag−CD19−GGSG−NLuc−AcV5およびMPL−GGSG−NLuc−AcV5がタンパク質を含む調整培地が回収された。
異なるMPL CARコンストラクトを発現するJurkatT細胞または対照CAR(4C3)が、MPL−GGSG−NLuc−AcV5およびCD19−GGSG−NLuc−AcV5上澄み液と一緒に培養され、十分な洗浄後、実質的に前述の例に記載されたやり方で、NLuc活性が分析された。その結果は図10に示してあり、異なるMPL CARコンストラクトを発現するJurkat細胞とMPL−GGSG−NLuc−AcV5融合タンパク質との間の結合レベルが異なっていることを示している。斯かる相違は、異なるコンストラクトの発現レベルの違い、および/またはそれぞれのscFvとMPLとの結合親和性の違いを反映している。
CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞に、CD19を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスを感染させた。MPLを標的にするSIRをコードするレンチウイルスベクター(161−SIR−U01)は陰性対照として使用した。感染後、細胞は、別の規定がない限り、10ng/mL可溶性抗CD3、10ng/mL可溶性抗CD28、および100IU組換えヒトIL−2を含むXVIVO培地で増殖させ、ピューロマイシンで選択した。異なるSIRコンストラクトを発現するT細胞は、CD19−GGSG−NLuc−AcV5上澄み液と一緒に培養し、十分な洗浄後、実質的に前述の例に記載されたやり方で、NLuc活性が分析された。データは、CD19−GGSG−NLuc−AcV5が異なるSIRを発現するT細胞に結合することを示している。野生型ヒトTCRαおよびヒトTCRβ2ヌクレオチド配列によってコードされたTCRαおよびTCRβ定常領域を含む、CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(080815−F02)(配列番号922)を発現するT細胞は、陰性対照SIR161−SIR−U01(NLuc平均値=1580)を発現するT細胞と比較して、CD19−GGSG−NLuc−AcV5との有意の結合は一切示さなかった(NLuc平均値=1190)。対照的に、コドン最適化マウスTCRαおよびマウスTCRβヌクレオチド配列でコードされたTCRαおよびTCRβ定常領域を含む、CD8SP−FMC63−vL−V5−[mTCRb−opt]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[mTCRa−opt]−F−F2A−PAC(080815−B06)(配列番号953)は、CD19−GGSG−NLuc−AcV5との有意の結合を示した(NLuc平均値=5359)。CD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(050515−L05)(配列番号900)を発現するT細胞は、CD19−GGSG−NLuc−AcV5との強力な結合を示した(NLuc平均値=19178)。このコンストラクトは、コドン最適化ヒトTCRαおよびヒトTCRβヌクレオチド配列でコードされたTCRαおよびTCRβ定常領域を含んでおり、TCRβ定常鎖にS57C変異、TCRα定常鎖にT48C変異を有している。CD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(050515−L05)(配列番号900)SIRも、FMC63−vL領域とTCRβ鎖との間にV5エピトープタグを有し、FMC63−vH領域とTCRα鎖との間にMycタグを有している。CD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−CD19Bu12−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(070215−M03)(配列番号1021)SIRを発現するT細胞は、CD19−GGSG−NLuc−AcV5と更に強力な結合を示した(NLuc平均値=39575)。このコンストラクトは、ヒトCD19に対するヒト化モノクロナール抗体であるhCD19−Bu12抗体由来のvLおよびvH断片を有すると言う点を除いて、FMC63ベースの050515−L05に類似している。CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)を発現するT細胞は、CD19−GGSG−NLuc−AcV5と最も強力な結合を示した(NLuc平均値=107077)。このコンストラクトは、コドン最適化ヒトTCRαおよびヒトTCRβヌクレオチド配列でコードされたTCRα(TCRa)およびTCRβ(TCRb)定常領域を含んでおり、TCRβ定常鎖にS57C変異、TCRα定常鎖にT48C変異を有している。FMC63−SIR−D06コンストラクトも、FMC63−vL領域とTCRβ鎖との間にV5エピトープタグを有し、FMC63−vH領域とTCRα鎖との間にMycタグを有している。最後に、このコンストラクトにおいて、TCRαおよびTCRβ定常鎖はマウス化されている。従って、ヒトTCR−b定常領域の5つのアミノ酸が、対応するマウスのアミノ酸で置き換えられている。斯かるアミノ酸は、K−18、A−22、I−133、A−136、およびH−139である。加えて、4つのアミノ酸、すなわち、セリン(S−90)、アスパラギン酸(D−91)、バリン(V−93)、およびプロリン(P−94)を含むマウスTCRa定常鎖の領域が、ヒトTCRa定常鎖を置き換えていた。
CD19を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。細胞内でhGLucを安定的に発現するRAJI細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞溶解の誘発は、天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することにより、Bio Tek Synergyプレートリーダーを用いて測定したGLuc活性増大により分析した。CD−19特異的なSIR CD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(050515−L05)(配列番号900)およびCD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−CD19Bu12−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(070215−M03)(配列番号1021)を発現するT細胞と共培養した後に、MPLを標的とする対照SIR CD8SP−MPL−161−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt1]−F−P2A−MPL−161−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(040315−U02)(配列番号1112)を発現するT細胞と比較すると、GLuc活性の増大すなわち標的細胞の溶解をデータは示している。ジギトニン処理を使用して、最大細胞死を示した。コンストラクト(040315−U02)(配列番号1112)、(050515−L05)(配列番号900)、(070215−M03)(配列番号1021)へ接触させた後ジギトニン処理を行ったRAJI細胞の平均GLuc値は、それぞれ119、3042、2547、および3869であった。
CD19を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた、あるいは非感染状態(T−UI)に放置した。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現するRAJI細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞溶解の誘発は、天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することにより、Bio Tek Synergyプレートリーダーを用いて測定したGLuc活性増大により分析した。培地だけ(Med)を含むウェル、および任意のSIRコンストラクトで感染させていないT細胞(T−UI)と一緒に標的細胞を培養したウェル内のGluc活性が、この実験および指示された以後の実験で対照として使用された。CD−19特異的なSIR CD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(050515−L05)(配列番号900)、CD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−WT]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(091015−Y08)(配列番号926)、およびCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)を発現するT細胞と共培養した後に、MPLを標的とする対照SIR CD8SP−MPL−161−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt1]−F−P2A−MPL−161−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(040315−U02)(配列番号1112)を発現するT細胞、または非感染T細胞(T−UI)と比較すると、GLuc活性の増大すなわち標的細胞の溶解をデータは示している。(091015−Y08)(配列番号926)コンストラクトの結果は、機能性二重鎖SIRを作製するにあたりTCRβの定常鎖と共発現させた場合、前TCRα−del48定常鎖断片はTCRα定常鎖領域に置き換えられることを示している。Medは媒体だけを示しており、T−UIはいずれのSIRコンストラクトでも感染されていないT細胞を意味している。
CD19抗原に向けられたCD19Bu12およびFMC63モノクロナール抗体由来のscFvがTCRb定常鎖に融合されており、相補性TCRaが発現されていないSIRコンストラクトを作製した。コンストラクトCD8SP−CD19Bu12−vL−Gly−Ser−Linker−CD19Bu12−vH−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−PAC(051216−D08)(配列番号1022)において、(CD19Bu12−vL−Gly−Ser−Linker−CD19Bu12−vHとして示される)CD19Bu12のscFv断片が、V5リンカーを通して、野生型ヌクレオチド配列を含むTCRb定常鎖に結合された。コンストラクトCD8SP−FMC63−vL−Gly−Ser−Linker−FMC63−vH−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−PAC(051216−G01)(配列番号912)において、(FMC63−vL−Gly−Ser−Linker−FMC63−vHに示される)FMC63のscFv断片が、V5リンカーを通して、コドン最適化ヌクレオチド配列を含みS57C変異を有するTCRb定常鎖に結合された。コンストラクトCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−FMC63−vL−Gly−Ser−Linker−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(082815−G07)(配列番号1620)において、FMC63のscFv断片が、MYCリンカーを通して、コドン最適化ヌクレオチド配列を含みCSDVP変異を有するTCRb定常鎖に結合されたが、その場合、該TCRaは、V5リンカーを通してコドン最適化ヌクレオチド配列を含みKACIAH変異を有するTCRb定常鎖と共発現された。コンストラクトCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)およびCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−K13−FLAG−F−T2A−PAC(051216−K04)(配列番号918)は、FMC63由来のvLおよびvH断片がそれぞれhTCRb−KACIAHおよびhTCRa−CSDVPに結合した二重鎖コンストラクトである。
CD19を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現するRAJI細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞溶解の誘発は、天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することにより、Bio Tek Synergyプレートリーダーを用いて測定したGLuc活性増大により分析した。抗原結合ドメインがTCRb定常鎖に結合し相補性TCRa定常鎖を欠損するSIRコンストラクト(051216−D08)(配列番号1022)、(051216−F03)(配列番号1023)、および(051216−G01)(配列番号912)SIRを発現するT細胞は、非感染T細胞(T−UI)または培地だけを含むウェルと比較すると、RAJI細胞の溶解を誘発できないことをデータは示している。
CD19を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。TCRβ2鎖を標的にするコンストラクト(CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TCRB2−CP01−E05−vL−Gly−Ser−Linker−TCRB2−CP01−E05−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(030816−C05)(配列番号1781))が、陰性対照として用いられた。(コンストラクト022216−A04および031416−A18に関しては)細胞は選択されず、(他のコンストラクトに関しては)ピューロマイシンで選択され、増殖された。細胞は、RAJI−Gluc細胞の溶解能力について試験された。結果は、非感染T細胞(T−UI)または培地だけを含むウェルと比較すると、全てのコンストラクトを発現するT細胞によって標的細胞溶解が効果的に行われることを示している。特に、効果的な抗原細胞溶解は、コンストラクト(031616−B05)(配列番号1019)、(031616−C05)(配列番号1020)、(021816−N02)(配列番号1016)によって観察されるが、その場合、CD19Bu12scFv断片はTCRb定常鎖に結合しており、空のhTCRa定常鎖と共発現する。効果的な抗原細胞溶解は、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−2−CD19MM−vL−Gly−Ser−Linker−CD19MM−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(031616−A05)(配列番号1623)でも観察されるが、この場合、CD19MMscFvはMycリンカーを通してhTCRa−CSDVP定常鎖に結合しており、V5リンカーを有する空のhTCRb−KACIAH定常鎖と共発現する。効果的な抗原細胞溶解は、CD8SP−CD19Bu12−scFv−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−scFv−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(020216−B07)(配列番号1026)でも観察されるが、この場合、CD19Bu12scFvはhTCRb−KACIAH鎖に結合しており、FMC63scFvはhTCRa−CSDVPに結合しており、従って、2つの異なるscFv断片を含む機能性SIRが構築できることが証明された。最後に、効果的な抗原細胞溶解は、コンストラクトCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−K13−FLAG−F−T2A−CNB30(022216−A04)(配列番号920)およびCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−P2A−CD3z−41BB−T2A−CNB30(031416−A18)(配列番号998)でも観察されるが、その場合、FMC63由来のvLおよびvH断片は、それぞれhTCRb−KACIAHおよびhTCRa−CSDVP定常鎖と結合している。しかし、斯かるコンストラクトは、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルスがコードするウイルスFLICE阻害タンパク質(vFLIP)K13および融合タンパク質CD3z−41BBをそれぞれ共発現する。K13タンパク質は、細胞タンパク質NEMOに結合することにより、NF−κB経路を選択的に活性化することが知られており、CD3z−41BB融合タンパク質は、TCR複合体のCD3z鎖に結合する共刺激分子41BBの細胞質ゾル信号伝達ドメインを含む。共刺激シグナルを提供することにより、CD3z−41BB融合タンパク質はSIR発現細胞の活性化および増殖を向上させ、機能性を高め、長期的維持を改善する。022216−A04および031416−A18コンストラクトも、カルシニューリン阻害剤への耐性を与えるカルシニューリンB鎖のCNB30変異体、例えばFK506(タクロリムス)を発現する。
CD19を標的にする異なるSIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで細胞を感染させ、RAJI−GLuc細胞に対する細胞毒性を試験した。野生型ヌクレオチド配列でコードされたTCRβおよびTCRα定常鎖(すなわち、それぞれ配列番号746および配列番号731)を含む、CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(080815−F02)(配列番号922)SIRコンストラクトは、MPLを標的とする陰性対照コンストラクトCD8SP−MPL−161−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt1]−F−P2A−MPL−161−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(040315−U02)(配列番号1112)と比較して、有意の標的細胞溶解は誘発しないことをデータは示している。対照的に、全ての他のコンストラクト(例えば、(050515−L05)(配列番号900)、(070215−M03)(配列番号1021)、(081415)(配列番号992)、(080815−B06)(配列番号953)、(082815−G07)(配列番号1620)、および(082815−E05)(配列番号1622))はGLuc活動を上昇させ、標的細胞の溶解を示した。(082815−G07)(配列番号1620)および(082815−E05)(配列番号1622)コンストラクトは、hTCRb−KACIAH(配列番号748)をhTCRa−CSDVP(配列番号732)定常鎖断片と一緒に発現する(その場合、各鎖にFMC63およびCD19Bu12scFvがそれぞれ融合している)。抗原結合ドメインがTCRa定常鎖に融合しているSIRは、空の相補性TCRb定常鎖と共発現させれば、効果的な標的細胞溶解を誘発できる。斯かるSIRにおける空のTCRb定常鎖は、抗原結合ドメインを有するTCRa定常鎖の細胞表面発現を促進するのであろう。
RAJI−GLuc細胞を、CD19を標的にする異なるSIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。上記方法により、SIR細胞仲介による標的細胞の溶解誘発を分析した。、野生型ヌクレオチド配列でコードされたTCRbおよびTCRa定常鎖を含むCD19Bu12ベースのCD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−CD19Bu12−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(021916−Q03)(配列番号1038)SIRコンストラクトは、陰性対照コンストラクト111815−O05または非感染T細胞と比較して、有意の標的細胞溶解を誘発しないことをデータが示していたが、これはヒト一次T細胞における021916−Q03SIRコンストラクトの発現が乏しかったからであろう。従って、CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(080815−F02)(配列番号922)コンストラクトの場合同様、TCRaおよびTCRb鎖の野生型ヌクレオチド配列に基づく別のSIRも、標的細胞株に対して有意の細胞毒性を誘発できなかった。
CD19を標的にする異なるSIRをコードするレンチウイルスで、ヒト末梢血T細胞を感染させ、RAJI−GLuc細胞を用いて、エフェクター対標的(E対T)比1対1で96時間、細胞毒性を試験した。野生型ヌクレオチド配列でコードされたTCRbおよびTCRa定常鎖を含むCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(080815−F02)(配列番号922)SIRコンストラクトは、陰性対照コンストラクト040315−U02と比較して、有意の標的細胞溶解を誘発しないことをデータは示しているが、これはヒト一次T細胞における上記(すなわち、080815−F02)の発現が乏しかったからであろう。対照的に、全ての他のコンストラクト(例えば、050515−L05、070215−M03、081415−D06、080815−B06、082815−G07、および082815−E05)はGLuc活動を上昇させ、標的細胞の溶解を示した。082815−G07および082815−E05コンストラクトは、TCRb定常鎖(KACIAHバージョン)をTCRa(CSDVP)断片と一緒に発現する(その場合、各鎖にFMC63およびCD19Bu12scFvがそれぞれ融合している)。従って、TCRa定常鎖に融合した抗原結合ドメインに基づくSIRは、空の相補性TCRb定常鎖と共発現させれば、効果的な標的細胞溶解を誘発できる。従って、OAHSIRは、単鎖SIR(SCSIR)よりも効果的である。これは、恐らく、T細胞上の効果的な発現には、TCRaおよびTCRbが相補性鎖を必要とするからであろう。
RAJI−GLuc細胞を、CD19を標的にする異なるSIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養し、その後GLuc活性を測定した。CD8SP−FMC63−vL−Myc−[hTCRa−T48−opt1]−F−F2A−FMC63−vH−V5−[hTCRb−C57C−opt1]−F−P2A−PAC(100515−E03)(配列番号902)コンストラクト(FMC63−vLはhTCRa−T48−opt1定常鎖と結合し、FMC63−vHはhTCRb−C57C−opt1定常鎖と結合している)を発現するT細胞は、非感染T細胞、あるいはCD4またはKSHVタンパク質を標的にする陰性対照CARを発現するT細胞と比較して、標的細胞の効果的な溶解を誘発できることをデータが示している。同様に、CD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(050515−L05)(配列番号900)およびCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(100815−B04)(配列番号951)コンストラクトを発現するT細胞(FMC63−vL鎖はTCRb−S57C−opt1またはhTCRb−S57C−opt定常鎖と結合し、FMC63−vH鎖はTCRa−T48C−opt1またはhTCRa−T48C−opt定常鎖と結合する)は、効果的な標的細胞溶解を誘発した。最後に、IgHSP−FMC63−vH−[hTCRb−C57C−opt]−F−P2A−CD8SP−FMC63−vL−MYC−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−Pac(101415−M05)(配列番号901)コンストラクトを発現するT細胞(FMC63−vH鎖はhTCRb−C57C−opt定常鎖と結合し、FMC63−vL鎖はhTCRa−T48C−opt定常鎖と結合する)も、標的細胞の効果的な溶解を誘発できる。従って、二重鎖SIRコンストラクトにおいては、抗体のvL断片はTCRaまたはTCRb定常鎖と結合し、vH断片は相補性TCRbまたはTCRa定常鎖と結合できる。加えて、二重鎖SIRコンストラクトにおいては、両方の機能性ポリペプチド単位(FPU)が同じベクターから発現されるが、FPUを含むTCRbまたはTCRa鎖が第一(または5’)FPUであり得る。
RAJI−GLuc細胞を、CD19およびCD20を標的にする異なるSIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養し、その後GLuc活性を測定した。非感染T細胞または培地(Med)だけを含むウェルと比較して、CD8SP−CD20−2F2−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD20−2F2−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(100615−D05)(配列番号1221)SIRを発現するT細胞によって標的細胞溶解が効果的に誘発されることをデータが示している。CD19を標的とするSIRコンストラクトCD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(050515−L05)(配列番号900)およびCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(100815−L05)(配列番号951)においても、僅かな細胞毒性が観察された。
CD20を標的にするSIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させたが、この場合、ヒトCD20(2F2)に対するモノクロナール抗体のvLおよびvH断片が、コドン最適化イヌTCRaおよびTCRb定常鎖に結合されている。E対T比10対1で4時間共培養後、RAJI−GLuc細胞に対する細胞毒性が試験された。非感染T細胞との比較で、TCRbおよびTCRaに基づくCD8SP−CD20−2F2−vL−[イヌTCRb−opt]−F−P2A−CD20−2F2−vH[イヌTCRa−opt]−F−F2A−PAC(051716−E02)(配列番号1113)を発現するT細胞によって標的細胞溶解が効果的に誘発されることをデータが示している。
CD8SP−Lym1−vL[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−Lym1−vH−[hTCRa−opt2−Del]−F−F2A−PAC(012716−B01)(配列番号1185)SIRをコードするレンチウイルスで、ヒトT細胞を感染させ、ピューロマイシンを用いた選択後、Kasumi−1−GLuc細胞に対して、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間、細胞毒性の試験を行った(対照は非感染T細胞(T−UI)である)。細胞毒性はGLuc活性の増大で求められた。(012716−B01)(配列番号1185)SIRを発現するT細胞による標的細胞溶解の効果的な誘発をデータが示しており、Gluc活性は、非感染T細胞またが培地だけを含むウェルと比較して、約9倍増大した。
Lym1およびLym2を標的とするSIRを発現するT細胞が、E対T比10対1で共培養後の4時間目に、RAJI−GLuc細胞に対して試験された。CD8SP−Lym1−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−Lym1−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(021216−H02)(配列番号1314)およびCD8SP−Lym2−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−Lym2−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(100615−B07)(配列番号1315)SIRの両方により、標的細胞溶解が効果的に誘発されることをGluc細胞毒性アッセイのデータが示しており、Gluc値は、T細胞を発現する対照SIR(配列番号4639)、非感染T細胞、または培地だけと比較して、それぞれ約20倍超および10倍超高かった。082815−P08は、CD19Bu12scFvを発現しCD19抗原を標的にする従来のCARである。野生型ヌクレオチド配列でコードされるTCRbおよびTCRaを含むCD19Bu12ベース(021916−Q03)(配列番号1038)SIRコンストラクトを発現するT細胞は、この場合も、有意の標的細胞溶解を誘発することができなかった。
CS1(SLAMF7)を標的にするSIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択され、E対T比10対1で4時間、L363−GLucおよびU266−GLuc細胞に対して細胞毒性が試験された。Gluc細胞毒性アッセイにより、非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較し、CD8SP−CS1−huLuc90−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−huLuc90−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(012716−A02)(配列番号1254)SIRを発現するT細胞により、L363−GLucおよびU266−GLuc溶解の効果的な誘発が示された(Gluc値で約15倍超および10倍の増加)。
CS1(SLAMF7)およびBCMAを標的にするSIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択され、E対T比10対1で4時間、L363−GLucおよびU266−GLuc細胞に対して細胞毒性が試験された。Gluc細胞毒性アッセイにより、非感染T細胞、対照SIRであるCD8SP−KSHV−4C3−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−4C3−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(111815−O05)(配列番号4639)を発現するT細胞、または培地だけを含むウェルと比較し、CD8SP−BCMA−huC12A3−L3H3−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−BCMA−huC12A3−L3H3−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(011116−A07)(配列番号1212)およびCD8SP−CS1−huLuc90−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−huLuc90−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(012716−A02)(配列番号1254)SIRを発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発することが示された。LAMP1を標的にするSIRであるCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−LAMP1−Mb4−vL−Gly−Ser−Linker−LAMP1−Mb4−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050216−A02)(配列番号1732)並びにcMetおよびHer3を標的にする二重特異的CAR041316−F06を発現するT細胞によっても、僅かないし中程度の標的細胞溶解が観察された。
CD138、CS1、GPRC5D、およびWT1を標的にするSIRコンストラクトを発現するT細胞をピューロマイシンで選択し、GLucを安定的に発現するU266およびL363細胞に対して、E対T比2対1で72時間試験した。Gluc細胞毒性アッセイにより、非感染T細胞または培地(Med)だけを含むウェルと比較して、CD8SP−CD138−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD138−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(100815−A05)(配列番号1236)SIRを発現するT細胞が標的細胞溶解を効果的に誘発することが示された。野生型TCRaおよびTCRbを含むSIRであるCD8SP−CD138−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−SP−CD138−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(021916−R04)(配列番号1139)は、U266細胞において最低限しか効果的ではなく、L363細胞においては全く効果的ではなかった。単鎖のSIRであるCD8SP−CD138−vL−Gly−Ser−Linker−CD138−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(030316−G03)(配列番号1169)(CD138scFvがhTCRa−CSDVP定常鎖に結合している)はU266細胞にだけ効果的であった。LAMP1に対する抗体のvL断片およびGPRC5Dに対する抗体のvH断片を有する二重特異的コンストラクトLAMP1−humab1−2−vL−V5−[TCRb−KACIAH]−F−P2A−GPRC5D−ET150−18−vH−MYC−[TCRa−CSDVP]−F−F2A−Pac−E05(092916−E05−VN)(配列番号1163)も、両方の細胞タイプで効果的に細胞毒性を誘発した。最後に、特にU266細胞において、CS1およびWT1を標的にするコンストラクトで僅かないし中程度の細胞毒性が観察された。CS1(配列番号1674、1253)およびWT1(配列番号1804、1805)に対するコンストラクトの制限された細胞毒性は、本実験における低いE対T率の使用に起因するのかも知れない。
CLL1を標的にするSIRであるCD8SP−CLL1−M26−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−CLL1−M26−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(012616−A05)(配列番号4790)コンストラクトを発現するT細胞をピューロマイシンで選択し、HL60−GLuc細胞に対して、E対T比10対1で4時間試験した。Gluc細胞毒性アッセイにより、非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較して、(012616−A05)(配列番号4790)SIRを発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発することが示された。
CLEC5AおよびCLL1に対するSIRを発現するT細胞について、実験を繰り返した。非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CLEC5A−8H8F5−vL−Gly−Ser−Linker−CLEC5A−8H8F5−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(42816−E05)(配列番号1666)、CD8SP−CLL1−M26−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−CLL1−M26−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(012616−A05)(配列番号4790)、およびCD8SP−CLL1−M32−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CLL1−M32−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(021216−I03)(配列番号1250)SIRを発現するT細胞が、HL60−GLuc細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。GLuc値は、3つのSIRを発現するT細胞で処理された細胞において、それぞれ約9倍、4倍、および7倍高かった。
異なるSIRを発現するT細胞をE対T比10対1でTHP−GLuc細胞と一緒に4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較して、それぞれCSF2RA、LAMP1、およびCLL1を標的にするCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CSF2RA−Ab1−vL−Gly−Ser−Linker−CSF2RA−Ab1−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050216−B02)(配列番号1676)、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−LAMP1−Mb4−vL−Gly−Ser−Linker−LAMP1−Mb4−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050216−F05)(配列番号1732)、およびCD8SP−CLL1−M32−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CLL1−M32−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(021216−I03)(配列番号1250)SIRを発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。
CSF2RAを標的にするSIRを発現するT細胞をE対T比10対1でMolm13−GLuc細胞と一緒に4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。 非感染T細胞、KSHVタンパク質(111815−O05)を標的にするSIRを発現するT細胞、または培地だけを含むウェルと比較して、CSF2RAを標的にするSIRであるCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CSF2RA−Ab1−vL−Gly−Ser−Linker−CSF2RA−Ab1−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050216−B02)(配列番号1676)を発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。
TSHRおよびTnAgを標的にする異なるSIRを発現するT細胞をE対T比10対1でJurkat−GLucおよびPEER1−Gluc細胞と一緒に4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。非感染T細胞、陰性対照SIR(111815−O05、042816−H07、031516−J07)を発現するT細胞、または培地だけを含むウェルと比較して、TSHRおよびTnAgを標的にするSIRであるCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TSHR−KB1−vL−Gly−Ser−Linker−TSHR−KB1−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(042916−E03)(配列番号1795)およびCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TnAg−vL−Gly−Ser−Linker−TnAg−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050216−A04)(配列番号1788)を発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。
TnAgを標的にするSIRを発現するT細胞をE対T比10対1でJurkat−GLucおよびPEER1−Gluc細胞と一緒に4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較して、TnAgを標的にするSIRであるCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TnAg−vL−Gly−Ser−Linker−TnAg−vH−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(080816−H06)(配列番号2003)を発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。
MPLを標的にするSIRを発現するT細胞をE対T比10対1でHEL−GLuc細胞と一緒に4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較して、MPLを標的にするSIRであるCD8SP−MPL−175−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−175−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(042116−G01)(配列番号4862)を発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのを実験が示した。
FLT3を標的にするSIRを発現するT細胞をE対T比10対1でRS:411−GLuc細胞と一緒に4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。非感染T細胞、陰性対照SIR(111815−O05)を発現するT細胞、または培地だけを含むウェルと比較して、FLT3を標的にするSIRであるCD8SP−FLT3−NC7−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−FLT3−NC7−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050316−C01)(配列番号1273)を発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのをデータが示した。
(GGGGS−GGGGD−Mycリンカーを通してhTCR−CSDVP定常鎖にリンクされている)NKG2Dの細胞外ドメイン並びにFLT3およびCSF2RAを標的にするSIRを発現するヒト末梢血T細胞をE対T比10対1でMV411−GLuc細胞と一緒に4時間培養した。非感染T細胞、陰性対照SIR(CD8SP−KSHV−4C3−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−4C3−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(111815−O05)(配列番号4639))を発現するT細胞、または培地だけを含むウェルと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−NKG2D−(GGGGS−GGGGD)−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(042916−A06)(配列番号1755)、CD8SP−FLT3−NC7−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FLT3−NC7−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050316−C01)(配列番号1273)、およびCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CSF2RA−Ab1−vL−Gly−Ser−Linker−CSF2RA−Ab1−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(050216−B02)(配列番号1676)SIRを発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのをGluc細胞毒性アッセイが示した。
SIRは、特定のHLA抗原との関係で認識できる細胞内ペプチドに対して作製可能である。CD30またはWT1を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。WT1SIRは、HLA−A2分子と一緒にWT1由来のペプチド(RMFPNAPYL)を認識する。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現するU266(WT1+/HLA−A2+)およびL−363(WT1+/HLA−A2+)細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIRであるCD8SP−WT1−Ab1−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−WT1−Ab1−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(012816−G01)(配列番号4709)を発現するT細胞は最小限の効果しか示さなかったが、SIRであるCD8SP−WT1−Ab5−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−WT1−Ab5−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(111815−C04)(配列番号4710)を発現するT細胞は、非感染T細胞(T−UI)と比較して、標的細胞を効果的に殺すことをGluc細胞毒性アッセイが示した。加えて、CD30を標的にするSIRであるCD8SP−CD30−Ac10−vL−V5−[hTCRb−LACIAH]−F−P2A−SP−CD30−Ac10−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(010716−K01)(配列番号1227)は、CD30発現標的細胞を効果的に殺した。
CD33およびCD179bを標的にするSIRを発現するT細胞を、E対T比10対1でHL60−GlucおよびMolm13−Gluc細胞と一緒に4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。それぞれCD33およびCD179bを標的にするSIRであるCD8SP−CD33−AF5−vL−V5−[TCRβ−KACIAH]−F−P2A−SP−CD33−AF5vH−MYC−[TCRα−CSDVP]−F−F2A−Pac(052416−K05)(配列番号1229)およびCD179b−vL−V5−[TCRβ−KACIAH]−F−P2A−SP−CD179b−vH−MYC−[TCRα−CSDVP]−F−F2A−Pac(063016−Y06)(配列番号1237)を発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのをデータが示した。
CD33を標的にするSIRを発現するT細胞を、HL60−Gluc細胞と一緒にE対T比10対1で4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。CD33を標的にするSIRであるCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CD33−huMyc9−vL−Gly−Ser−Linker−CD33−huMyc9−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(090116−C02)(配列番号1650)、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CD33−AF5−vL−Gly−Ser−Linker−CD33−AF5−vH−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(083116−E02)(配列番号1864)、およびCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CD33−huMyc9−vL−Gly−Ser−Linker−CD33−huMyc9−vH−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(083116−C06)(配列番号1860)を発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのを実験が示した。
CXCR4を標的にする表示二重特異的SIRコンストラクトCD8SP−CXCR4−1−vHH−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−MYC−[hTCRa−CSDV]−F−F2A−PAC(101415−V01)(配列番号1171)を発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。SIRコンストラクトは、CD19に対するFMC63抗体のvH断片も発現した。細胞は、HL60−GLuc細胞と一緒に、E対T比5対1で4時間培養し、Glucアッセイを用いて細胞毒性を測定した。非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較して、CXCR4を標的にするSIRを発現するT細胞が、標的細胞溶解を効果的に誘発するのを実験が示した。
IL11Raを標的にするSIRを発現するT細胞を、THP−1−Gluc細胞と一緒にE対T比10対1で4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−IL11Ra−8E2−Ts107−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−IL11Ra−8E2−Ts107−vH−Myc−[hTCRa−CSDV]−F−F2A−PAC(050516−R06)(配列番号1304)SIRを発現するT細胞が、Bv173標的細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。
ヒトIgGに高い親和性を有するCD16A変異体v158Aを発現するSIRコンストラクトCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP2−CD16A−v158−v2−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(020416−A08)(配列番号1186)を発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。陰性対照として、KSHVタンパク質に対するA4C3SIRが使用された。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGlucを安定的に発現するRAJI細胞を、リツキシマブ(1μg/mL)の不在および存在下で、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発を、天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することにより、Bio Tek Synergyプレートリーダーを用いて測定したGluc活性増大により分析した。結果は、CD16A−v158SIRコンストラクトにより効果的な標的細胞溶解が生じることを示していたが、それはリツキシマブの存在下のみであった。従って、CD16A−v158SIRは、任意のモノクロナール抗体と一緒に使用可能な汎用SIRとして機能でき、異なる抗原標的に対して個々のSIRを作製する必要がなくなる。
CD123およびMPL(161)の両方を標的とするSIRコンストラクトIgHSP−CD123−2−vHH−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−CD8SP−MPL−161−HL−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(022516−M08)(配列番号4591)を発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGlucを安定的に発現するBv173およびHEL標的細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間培養した。二重特異的SIRが、標的抗体または抗体を発現する標的細胞溶解を効果的に誘発するのをGluc細胞毒性アッセイが示した。
CD123を標的にするSIRを発現するT細胞を、L428−Gluc細胞と一緒にE対T比10対1で4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−CD123−CSL362−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD123−CSL362−vH−Myc−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(041416−K04)(配列番号1445)SIRを発現するT細胞が、L428標的細胞溶解を効果的に誘発するのを実験が示した。
CD123を標的にするSIRを発現するT細胞を、Bv173−Gluc細胞と一緒にE対T比10対1で4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけ(Med)と比較して、IgHSP−CD123−2−vHH−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD123−1−vHH−Myc−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(041416−V03)(配列番号1467)SIRを発現するT細胞が、Bv173標的細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。このSIRは、hTCRb−KACIAHおよび前TCRa−Del48定常鎖断片にそれぞれ結合した2つの異なるラクダ科動物vHH(CD132−2およびCD132−1)を含んでいる。2つの異なる抗原結合ドメインを含むSIRが機能的に活性であることを、この結果は示している。
CD796およびCD138を標的にするSIRを発現するT細胞を、RAJI−GlucおよびL363−GLuc細胞と一緒にE対T比10対1で4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。非感染T細胞または培地だけを含むウェルと比較して、それぞれCD79bおよびCD138を標的にするCD8SP−CD79b−2F2−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−CD79b−2F2−vH−Myc−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(041216−H05)(配列番号1130)およびCD8SP−CD138−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD138−vH−Myc−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(040416−I03)(配列番号1446)SIRを発現するT細胞が、Bv173標的細胞溶解を効果的に誘発するのを結果が示した。
TCRB1(TCRβ1)定常鎖を標的にするCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TCRB1−CP01−E09−vL−Gly−Ser−Linker−TCRB1−CP01−E09−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(030816−D04)(配列番号1778)およびCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TCRB1−Jovil−vL−Gly−Ser−Linker−TCRB1−Jovil−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(030816−B07)(配列番号1779)SIR、並びにCD30を標的にするCD8SP−CD30−Ac10−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD30−Ac10−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(063016−K02)(配列番号1227)SIRを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現するJurkat細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGluc活性の増大で分析した。CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TCRB1−Jovil−vL−Gly−Ser−Linker−TCRB1−Jovil−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(030816−B07)(配列番号1779)およびCD8SP−CD30−Ac10−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD30−Ac10−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(063016−K02)(配列番号1227)は効果的な標的細胞溶解を誘発したが、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TCRB1−CP01−E09−vL−Gly−Ser−Linker−TCRB1−CP01−E09−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(030816−D04)(配列番号1778)は同じほど効果的ではなかったことを結果が示した。
最初の実験において、TCRβ2に向けられたSIRを発現するT細胞は、細胞毒性アッセイにおいて機能的に不活性であった。これは、斯かるSIRのTCRβ定常鎖はTCRβ2鎖由来であり、従って、斯かるSIR発現T細胞は自殺または兄弟殺し(すなわち、近隣のSIR発現細胞を殺し)したからであろう。斯かる問題を回避するため、TCRβ2を標的にするSIRは、TCRβ1に基づいたTCRβ1−op4定常鎖(配列番号752およびアミノ酸配列番号3032)を用いて作製された。TCRB2(TCRβ2)定常鎖を標的にする表示SIR(CD8SP−TCRB2−D05−vL−[hTCRb−opt4]−F−P2A−SP−TCRB2−D05−vH−MYC−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−Pac−K06(072816−K06)(配列番号1129)およびCD8SP−TCRB2−CP01−E05−vL−[hTCRb−opt4]−F−P2A−SP−TCRB2−CP01−E05−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(072816−L06)(配列番号1128))コンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。標的細胞株に関しては、PSMAを標的にするSIRを含むTCRB2定常鎖を安定的に発現するJurkat細胞を使用した。更に、Jurkat細胞は、TurboLucのシグナルペプチド欠損バージョンをレポーターとして共発現した。Jurkat細胞は、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発を、天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することにより、Bio Tek Synergyプレートリーダーを用いて測定したTurboLuc活性増大により分析した。結果は、非感染T細胞(T−UI)または培地だけと比較した場合、CD8SP−TCRB2−D05−vL−[hTCRb−opt4]−F−P2A−SP−TCRB2−D05−vH−MYC−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−Pac−K06(072816−K06)(配列番号1129)およびCD8SP−TCRB2−CP01−E05−vL−[hTCRb−opt4]−F−P2A−SP−TCRB2−CP01−E05−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(072816−L06)(配列番号1128)SIRの両方を発現するT細胞が、標的細胞の効果的な溶解を誘発した(TurboLuc活性の増大として示された)。
FR1を標的にする表示SIRコンストラクト(CD8SP−FR1−huMov19−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FR1−huMov19−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(102915−P07)(配列番号1276))を発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現するSKOV3、PC3、およびLNCAP細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGluc活性の増大により分析した。非感染T細胞(T−UI)と比較して、CD8SP−FR1−huMov19−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FR1−huMov19−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(102915−P07)(配列番号1276)を発現するT細胞が、SKOV3およびPC3細胞死を効果的に誘発することを結果が示している。Epcam1およびL1CAMを標的とするSIRを発現するT細胞も、SKOV3およびPC3細胞株において、非感染T細胞と比較して、細胞死を僅かに誘発した。
表示SIRコンストラクト(CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TERT−3G3−T865−vL−Gly−Ser−Linker−TERT−3G3−T865−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(021216−L07)(配列番号1784)、CD8SP−TERT−3G3−T865−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−TERT−3G3−T865−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(050316−A01)(配列番号4902)、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−MART1−CAG10−vL−Gly−Ser−Linker−MART1−CAG10−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(021216−N03)(配列番号1739)、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−Muc1−D6−M3B8−vL−Gly−Ser−Linker−Muc1−D6−M3B8−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(021616−B05)(配列番号1751)、CD8SP−MUC1−D6−M3A1−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−MUC1−D6−M3A1−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(050316−B01)(配列番号4870)、CD8SP−NYESO−T1−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−NYESO−T2−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(040416−D01)(配列番号4877)、CD8SP−gp100−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−gp100−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(031516−B03)(配列番号4828)、およびCD8SP−Tyros−B2−vL−[hTCRb−opt2]−F−P2A−SP−Tyros−B2−vH−[hTCRa−opt2]−F−F2A−PAC(032816−B03)(配列番号4915))を発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。TERT、MART1、MUC1、gp100、チロシナーゼ、およびNYESOを標的にするSIRは、上述のHLA−A2分子と一緒に、斯かる細胞内タンパク質由来のペプチドを認識する。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現する表示標的(HLA−A2)細胞を、SIRを発現するT細胞と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発はGluc活性の増大により分析した。TERT、MART1、MUC1、gp100、チロシナーゼ、およびNYESOを標的にするSIRは、斯かる細胞内抗原を発現するKLA−A2陽性標的細胞株の溶解を示す。加えて、GD3を標的とするSIRであるCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−GD3−KM−641−vL−Gly−Ser−Linker−GD3−KM−641−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(042816−A04)(配列番号1697)を発現するT細胞は、GD3を発現するMEL624標的細胞の溶解を示す。
EGFRを標的にするSIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現するHeLa細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比5対1で24時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGLuc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−セツキシマブ−vL−Gly−Ser−Linker−セツキシマブ−vH−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(062916−G04)(配列番号1880)を発現するT細胞が、HeLa標的細胞の溶解を効果的に誘発することを結果が示した。
CD324を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離したヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGLucを安定的に発現するMDA−MB−231細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比5対1で24時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGLuc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−CD324−SC10−6−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD324−SC10−6−vH−Myc4−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(071516−L04)(配列番号1239)SIRを発現するT細胞が、CD324標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
CD276およびIL13Ra2を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、T細胞を感染させた。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。U87−MG−GLuc細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGLuc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−CD276−17−vL−Gly−Ser−Linker−CD276−17−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(042816−C03)(配列番号1658)SIRを発現するT細胞が、標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
GD2を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、T細胞を感染させた。細胞をピューロマイシンで選択し、増殖させた。Glucを安定的に発現するSKMEL−31およびSKMEL−37細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で4時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGLuc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−GD2−hu3F8−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−GD2−hu3F8−vH−Myc−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(041816−E01)(配列番号1489)SIRを発現するT細胞が、標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
L1CAMを標的にするSIRを発現するT細胞を、SKOV3−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−MYC−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−CD8SP−L1CAM−9−3−Hu3−V5−[hTCRb−T57C−opt1]−F−P2A−PAC(080316−T02)(配列番号1136)SIRを発現するT細胞が、SKOV3標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
CDH6を標的にするSIRを発現するT細胞を、SKOV3−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−CDH6−NOV712−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CDH6−NOV712−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(062816−U01)(配列番号1242)およびCD8SP−CDH6−NOV710−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CDH6−NOV710−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(063016−T05)(配列番号1241)SIRを発現するT細胞が、SKOV3標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
TROP2を標的にするSIRを発現するT細胞を、PC3−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−TROP2−ARA47−HV3KV3−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−TROP2−ARA47−HV3KV3−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(062816−S01)(配列番号1367)SIRを発現するT細胞が、PC3標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
GFRA4を標的にするSIRを発現するT細胞を、TT−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−GFRa4−P4−10−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−GFRa4−P4−10−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(062816−W05)(配列番号1282)SIRを発現するT細胞が、PC3標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
MPLを標的にするSIRを発現するT細胞を、HEL−92.1.7−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞、CD8SP−FMC63−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(050515−L05)(配列番号900)SIRを発現するT細胞、または培地だけと比較して、CD8SP−MPL−161−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt1]−F−P2A−MPL−161−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(040315−U02)(配列番号1112)SIRを発現するT細胞が、HEL−92.1.7標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
MPLを標的にするSIRを発現するT細胞を、HEL−92.1.7−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で4時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞、CD8SP−FMC63(vL−vH)−Myc−BBz−T2A−PAC(112014−A13)(配列番号4501)CARを発現するT細胞、または培地だけと比較して、CD8SP−MPL−161−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt1]−F−P2A−MPL−161−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(040315−U02)(配列番号1112)SIRを発現するT細胞が、HEL−92.1.7標的細胞の溶解を効果的に誘発することを結果が示した。単鎖SIRであるCD8SP−MPL−161−vL−Ser−Gly−Linker−MPL−161−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt1]−F−T2A−PAC(040915−X03)(配列番号1192)およびCD8SP−MPL−161−vL−Ser−Gly−Linker−MPL−161−vH−V5−[hTCRb−S57C−opt1]−T2A−PAC(032415−E07)(配列番号1193)を発現するT細胞をHEL−92.1.7標的細胞と共培養する場合も、標的細胞の溶解誘発が観察された、最後に、単鎖SIRであるCD8SP−MPL−161−vL−Ser−Gly−Linker−MPL−161−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt1]−F−T2A−PAC(040915−X03)(配列番号1192)は、Jurkat−MPL細胞の溶解を誘発した。本開示の異なるscFvが変異TCRα鎖に結合した他の例示的単鎖SIRは、DNA配列番号7519〜7715および16694〜16809、並びにPRT配列番号8161〜8357および16928〜17043に示される。斯かる単鎖SIRは、好ましくは内因性TCRα鎖が減少している、または排除されている細胞で、相補性外因性TCRβ鎖なしに発現される。本開示の異なるscFvが変異TCRβ鎖に結合した単鎖SIRは、DNA配列番号7733〜7929および16811〜16926、並びにPRT配列番号8375〜8571および17045〜17160に示される。斯かる単鎖SIRは、好ましくは内因性TCRβ1およびTCRβ2鎖が減少している、または排除されている細胞で、相補性外因性TCRα鎖なしに発現される。
TSLPRを標的にするSIRを発現するT細胞を、Jurkat−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−TSLPR−vL−Gly−Ser−Linker−TSLPR−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(091216−C03)(配列番号1797)SIRを発現するT細胞が、Jurkat標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
SSEA4を標的にするSIRを発現するT細胞を、HEL−92.1.7−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞と比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−SSEA4−vL−Gly−Ser−Linker−SSEA4−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(091516−I06)(配列番号1776)およびCD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−SSEA4−vL−Gly−Ser−Linker−SSEA4−vH−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(091516−K06)(配列番号1991)SIRを発現するT細胞が、SSEA4標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
CDH7を標的にするSIRを発現するT細胞を、LoVo−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−CDH17−PTA001A4−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CDH17−PTA001A4−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(062816−X02)(配列番号1243)SIRを発現するT細胞が、LoVo標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
メソテリンを標的にするSIRを発現するT細胞を、SKOV3−GLuc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−メソテリン−m912−vL−Gly−Ser−Linker−m912−vH−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(090616−E04)(配列番号1956)SIRを発現するT細胞が、SKOV3標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
FSHRを標的にするSIRコンストラクトを発現するレトロウイルスでT細胞を感染させた。SIRの抗原結合ドメインは、Gly−Serリンカーを通してCGHa(絨毛性ゴナドトロピンホルモンアルファ鎖)に結合するFSHb(卵胞刺激ホルモンベータ鎖)を含む。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGlucを安定的に発現するMDAMB−231細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比10対1で24時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGluc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−FSHb−Gly−Ser−Linker−CGHa−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(091516−N06)(配列番号1909)SIRを発現するT細胞が、MDAMB−231標的細胞の溶解を効果的に誘発することを結果が示した。更に、結果は、抗原結合ドメインがヘテロ二量体サイトカインを含むSIRが機能的に活性であることも示している。
LHRを標的にするSIRコンストラクトを発現するレトロウイルスでT細胞を感染させた。このSIRの抗原結合ドメインは、Gly−Serリンカーを通してCGHa(絨毛性ゴナドトロピンホルモンアルファ鎖)に結合するLHb(黄体化ホルモンベータ鎖)を含む。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。hGlucを安定的に発現するMCF7細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比2対1で24時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGluc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−LHb−Gly−Ser−Linker−CGHa−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(091616−R03)(配列番号1735)SIRを発現するT細胞が、MDAMB−231標的細胞の溶解を僅かに誘発することを結果が示した。更に、結果は、抗原結合ドメインがヘテロ二量体サイトカインを含むSIRが機能的に活性であることも示している。
DLL3を標的にするSIRを発現するT細胞を、SKMEL31−GlucおよびSKMEL37−Gluc細胞と一緒に、E対T比10対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−DLL3−hSC16−13−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−DLL3−hSC16−13−vH−Myc4−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(071516−N04)(配列番号1263)SIRを発現するT細胞が、SKMEL31およびSKMEL37標的細胞の溶解を効果的に誘発することをデータが示した。
EGFRvIII細胞を標的にするSIRを発現するレトロウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。レトロウイルスベクター(MSCV−EGFRvIII)およびhGlucを発現させるレトロウイルスベクターで感染させることにより、EGFRvIIIおよびhGlucを発現するようにHeLa細胞を改変した。HeLa−EGFRvIII−hGluc細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比2対1で24時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGLuc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD8SP−EGFRvIII−2173−vH−Gly−Ser−Linker−EGFRvIII−2173−vH−Myc4−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC(090616−D03)(配列番号1902)SIRを発現するT細胞が、標的細胞の溶解を誘発することを実験が示した。
EGFRを標的にするSIRを発現するT細胞を、Hela−Gluc細胞と一緒に、E対T比2対1で24時間培養し、Gluc細胞毒性アッセイを用いて試験した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−セツキシマブ−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−セツキシマブ−vH−Myc4−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(071516−H04)(配列番号1245)SIRを発現するT細胞が、EGFR標的細胞の溶解を誘発することをデータが示した。
HIV1エンベロープ糖タンパク質を標的にする表示SIRを発現するレトロウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択し、増殖させた。HIV1エンベロープ糖タンパク質を発現し、hGLucを安定的に発現するように改変されたHL2/3細胞を、SIRを発現するT細胞または非感染細胞(T−UI)と一緒に、エフェクター対標的(E対T)比2対1で24時間共培養した。SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGLuc活性の増大により分析した。T−UI細胞または培地だけと比較して、CD8SP−HIV1−3BNC117−vL−MYC2−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−HIV1−3BNC117−vH−Myc4−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(091616−Y01−RP)(配列番号1297)SIRを発現するT細胞が、HIV1エンベロープ標的細胞の溶解を誘発することを結果が示した。
BST1を標的にする配列番号11333〜11335を有するSIRを発現するようにT細胞を改変し、E対T比10対1で24時間共培養後、Molm13−Gluc細胞に対する細胞毒性を試験した。細胞毒性はGlucアッセイで測定した。BST1標的SIR細胞は、有意の細胞死(GLuc活性の増大により測定)を示した。
IL1RAPを標的にする配列番号18242、18248、および18254を有するSIRを発現するようにT細胞を改変し、E対T比10対1で24時間共培養後、Molm13−Gluc細胞に対する細胞毒性を試験した。細胞毒性はGlucアッセイで測定した。IL1RAP標的SIR細胞は、有意の細胞死(GLuc活性の増大により測定)を示した。
Miltenyi製のT−Reg単離キット(130−091−301)を用い、製造元の推薦に従って、T−Reg細胞を単離した。T−Reg細胞は、ラパマイシン100ng/mLTで補充したT細胞培養培地で培養した。全T細胞およびT−Reg細胞を表示CARおよびSIRレンチウイルスで感染させた。細胞はラパマイシン400ng/mLで選択した。CD19を標的にするCARおよびSIRを発現するTおよびT−Reg細胞を、単独で、またはE対T比10対1の組み合わせで、RAJI−GLuc細胞と一緒に4時間共培養し、天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することにより細胞毒性を測定した。結果は、CD19を標的にするSIRを発現するT−Reg細胞が、SIRを発現するT細胞の細胞毒性活性を部分的に阻害できることを示している。
NFAT結合部位を有するIL−2プロモーターがGFP遺伝子の上流にクローン化されるように、Jurkat−NFAT−GFP細胞が改変される。斯かる細胞は、TCRおよびCARを通した信号伝達を研究するのに使用されている。レンチウイルス仲介の遺伝子導入、その後のピューロマイシンによる選択により、異なるSIRがJurkat NFAT−GFP細胞で安定的に発現された。SIRを発現するJurkat−NFAT−GFP細胞が、E対T比約1対2で4時間から18時間、標的細胞と一緒に共培養された。SIRとその標的抗原との間の相互作用によりNFAT経路の活性化が行われると、GFP発現が誘発される。従って、SIRを発現するJurkat−NFAT−GFP細胞は、SIRの受容体を発現する標的細胞株と相互作用する場合に、増加レベルのGFP発現を示す。
特定の抗原に対するSIRであって、更に大きい多様性を有するSIRを生成するため、異なる抗体由来の抗原結合ドメインを用いて、CD19を標的にするいくつかのSIRが作製された。斯かるSIRは、TCR鎖、リンカー、および抗原結合ドメインのフォーマットが異なっている。対応するCAR(すなわち、SIRと同じ抗原結合ドメインを含むCAR)も作製された。異なるSIRおよびCARは、安定的にJurkat−NFAT−GFP細胞に形質導入され、RAJI細胞との終夜の共培養後、CD19−GGSG−NLuc−AcV5との結合能力およびNFATシグナル伝達の活性化能力が比較された。表9Cは、標的細胞へ接触させた後のCD19結合能力およびNFATシグナル伝達の活性化能力に関して、異なるCD19抗原結合ドメインを含む異なるSIRおよびCAR間における有意な多様性を示している。TCRαおよびTCRβ鎖の野生型ヌクレオチド配列を含むBu12抗体ベースのSIRであるCD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−CD19Bu12−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(配列番号1038)は、CD19結合も極めて僅かであり、NFAT信号伝達も最低であった。CD19結合能力およびNFATシグナル伝達の活性化能力の点で、異なるSIR間で大きな違いがあるが、斯かる2つのパラメーターは、異なる抗原結合ドメインを含むSIR間で比較した場合、直接の相互関連はなかった。従って、配列番号11240で示されるSIRは、配列番号10815および11245で示されるSIRと比較して、約10倍高いCD19−NLuc−AcV5結合を示したが、NFATシグナル伝達の活性化能力は低かった。斯かる結果は、多様な特性を有するSIRのプールを発現する免疫エフェクター細胞を作製する能力(多様な養子免疫応答を生成するための能力)を示している。更に多様な免疫応答を生成するため、SIRを発現する免疫エフェクター細胞をCARおよび他のキメラ免疫受容体を発現する免疫細胞と組み合わせてもよい。
SIRであるCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(010616−C01)(配列番号1200)およびCARであるCD8SP−FMC63(vL−vH)−Myc−BBz−T2A−PAC(112014−A13)(配列番号4501)を発現するJurkat−NFAT−GFP細胞を、RAJI細胞へ終夜接触後、NFAT誘発GFP発現を誘発するため、親Jurkat−NFAT−GFP細胞と一緒に試験した。SIR(配列番号1200)およびCAR(配列番号4501)を発現するT細胞は、親細胞と比較して、同等および有意に高いGFP生産を誘発することが示された(これは、SIRおよびCARの両方によるNFAT信号伝達の効果的な誘発を示している)。細胞は、その後、CD19−GGSG−NLuc結合アッセイを用いた抗原結合に関して、三つ組で試験された。親Jurkat細胞との平均NLuc結合活性は93であるが、SIR(配列番号1200)およびCAR(配列番号4501)を発現するJurkat細胞は、それぞれ平均NLuc値16422および186567を示す。従って、SIR(配列番号1200)を発現するJurkat細胞は、対応するCAR(配列番号4501)にほぼ等しいNFAT信号伝達活性を有しているが、両者を標的抗原に接触させた場合、約10倍低い抗原結合親和性を示す。
T細胞表面におけるCARの発現増大は、自己凝集、持続的な信号伝達、および細胞の早期枯渇を導くことが知られている。CD19を標的にするBu12ベースのSIR(CD8SP−CD19Bu12−(vL−vH)−Myc−BBz−T2A−PAC(配列番号4503))および同等のCAR(CD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−CD19Bu12−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(070215−M03)(配列番号1021))をコードするレンチウイルスで、ヒト末梢T細胞を感染させた。細胞はピューロマイシンで選択し、繁殖させた。SIRおよびCARを発現するT細胞は、RAJI−GLuc細胞に対して効果的な細胞毒性を示した。T細胞は、Mycタグに対する抗体での染色、並びにビオチニル化ProteinL、その後のAPC共役ストレプトアビジンProteinLでの染色を用いて、SIRおよびCARの細胞表面発現に関しても調べた。図16は、いずれかの方法で測定された場合、SIR(配列番号1021)を発現するT細胞が、対応するCAR(配列番号4503)を発現するT細胞と比較して、有意に低い細胞表面発現を有することを示している。
CAR(CD8SP−FMC63−vL−Gly−Ser−Linker−FMC63−vH−Myc−CD8TM−BBz(配列番号9659))および対応するSIR(CD8SP−FMC63−vL−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−SP−FMC63−vH−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−PAC(配列番号10596))を発現するように、T細胞が改変された。細胞はNalm6およびBV173標的細胞と一緒に37℃で24時間共培養され、TNFα生産の誘発がELISAで測定された。CAR発現T細胞は、SIR−T細胞と比較して、TNFα生産が何倍も増大した。SIR−TおよびCAR−T細胞の両方が、標的細胞株に対して有意な細胞毒性を誘発することが示された。
上記の実験では、SIRの2つの機能性ポリペプチド単位(FPU)が単一のベクターを用いて発現された。次は、SIRの2つのFPUが2つの異なるベクターを用いて発現できるか否かが試験された。SIRレンチウイルスコンストラクト050216−T02および050216−S08は、SIR断片CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−PAC(CD19モノクロナール抗体FMC63由来のvL断片が、V5リンカーを通して、KACIAH変異を有するhTCRbの定常鎖に結合している)をコードする配列番号913に対応するSIR配列を含んでいる。このSIRFPUはF−P2A切断可能リンカーを通してPAC(ピューロマイシン耐性)遺伝子に結合している。050216−T02用のベクターはpLenti−EFα−DWPRE(配列番号871)であり、050216−S08用のベクターはpLenti−EFα(配列番号870)である。SIRレンチウイルスコンストラクト041916−A02および041916−B03は、SIR断片CD8SP−FMC63−vH−MYC−[TCRα−CSDVP]−F−F2A−BlastR(CD19モノクロナール抗体FMC63由来のvH断片が、MYCリンカーを通して、CSDVP変異を有するhTCRaの定常鎖に結合している)をコードする配列番号997に対応するSIR配列を含んでいる。このSIRFPUはF−F2A切断可能リンカーを通してブラストサイジン耐性遺伝子に結合している。041916−A02用のベクターはpLenti−EFα−DWPRE(配列番号871)であり、041916−B03用のベクターはpLenti−EFα(配列番号870)である。Jurkat−NFAT−GFP細胞を050216−S08で感染させ、ピューロマイシンで選択した。Jurkat−NFAT−GFP細胞は、041916−A02および041916−B03コンストラクトでも感染させ、ブラストサイジンで選択した。最後に、Jurkat−NFAT−GFP細胞を050216−S08で感染させ、ピューロマイシンで選択し、041916−A02または041916−B03コンストラクトで感染させ、ブラストサイジンで選択することにより、SIRの両方のFPUを発現する細胞を選択した。単一感染または二重感染の細胞を、NLuc結合アッセイを用いて、CD19−GGSG−NLucへの結合に関して試験した。その結果、コンストラクト050216−S08(配列番号913)、041916−A02(配列番号997)、または041916−B03(配列番号997)コンストラクトだけでは、CD19−GGSG−NLucとの有意な結合を示さないことが分かった。対照的に、コンストラクト050216−S08プラス041916−A02(配列番号997)並びに050216−S08(配列番号913)プラス041916−B03(配列番号997)で感染させたJurkat−NFAT−GFP細胞は、CD19−GGSG−NLucへの強力な結合を示した。コンストラクト050216−S08(配列番号913)プラス041916−A02(配列番号997)並びに050216−S08(配列番号913)プラス041916−B03(配列番号997で感染させたJurkat−NFAT−GFP細胞は、RAJI標的細胞と共培養した場合、GFP発現の強力な誘発を示したが、コンストラクトを単独で感染させたJurkat−NFAT−GFP細胞はそうならなかった。これらの結果は、SIRの2つのFPUが異なるベクターを用いて発現可能であること、並びに二重に感染した細胞で機能性受容体を作製するようにアセンブル可能であることを示している。V5リンカーを通して、TCRb鎖(hTCRb−S57C−opt)へ結合している本開示の異なるvL断片を発現する例示的SIRコンストラクトは、DNA配列番号8803〜8978および17162〜17277、並びにPRT配列番号9231〜9406および17396〜17511に示してある。Mycリンカーを通して、TCRa鎖(hTCRa−T84C−opt)へ結合している本開示の異なるvH断片を発現する対応する例示的SIRコンストラクトは、DNA配列番号9017〜9191および17279〜17394、並びにPRT配列番号9445〜9619および17513〜17628に示してある。
いくつかのSIR挿入体をNheIおよびSalI酵素で消化することによりレンチウイルスベクターから切り出し、AvrIIおよびSalIで消化したレトロウイルスベクターMSCV−Bgl2−AvrII−Bam−EcoR1−Xho−BstB1−Mlu−Sal−ClaI.I03(配列番号872)にサブクローン化した。挿入体のクローンID、配列番号、および名前は、以下の表11に示される。
いくつかのSIR挿入体をAgeIおよびXbaI酵素で消化することによりレンチウイルスベクターから切り出し、AgeIおよびXbaIで消化したSleeping BeautyトランスポゾンベクターpSBi−Pur(配列番号874)にサブクローン化した。その結果得られたコンストラクトは、トランスポザーゼをコードするベクターpCMV/SB10(Addgene、プラスミド#24551)と一緒に、Jurkat−NFAT−GFP細胞にトランスフェクションされた。細胞は上記のようにピューロマイシンで選択し、増殖された。以下のに示されるように、コンストラクトpSBbi−Puro-FMC63vL−V5−[TCRb−KACIAH]−F−P2A−FMC63vH−MYC−[TCRa−CSDVP]−F−F2A(010616−B01)(配列番号875)でトランスフェクションされたJurkat−NFAT−GFP細胞は、対応するRAJI標的細胞株と共培養するとGFP誘発を示した。斯かる結果は、本開示のSIRを発現するのにSleeping Beautyトランスポゾンが使用可能であることを示している。
SIRをコードするRNAを生成するIVTは、本質的に記載通り(Zhao Yら、MOLECULAR THERAPY Vol. 13,No. 1,2006)に行われる。IVTRNAを生成するのに、mMESSAGE mMACHINE High Yield Capped RNA Transcription Kit(Invitrogen)が利用される。IVTRNAはRNeasy Mini Kit(Qiagen, Inc., Valencia, CA, USA)を用いて精製され、精製されたRNAは1〜0.5μg/mLでRNaseフリーの水に溶出される。無刺激PBMCのエレクトロポレーションのため、細胞(0.1mL)は、CD19を標的にするSIR(CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(102615−C08)(配列番号1200))をコードするRNA5μgでエレクトロポレートされた。細胞およびキュベットは、エレクトロポレーション前に5分間氷上に置くことにより予め冷却される。その後、0.05〜0.2mLの細胞がIVTRNA(または表示に従って)の2μg/1x106T細胞と混合され、ECM830 Electro Square Wave Porator (Harverd Apparatus BTX)を用いて、2mmのキュベット内でエレクトロポレートされる。エレクトロポレーションの直後、細胞は300IU/mLのIL−2と一緒に、新鮮なCMに移される。SIRをコードするIVTRNAに転写された細胞は、48〜72時間後に分析される。SIRをトランスフェクションされた細胞は、CD19−GGS−NLuc融合タンパク質への結合を増大させ、RAJI−GLuc標的細胞の溶解を促進する。
CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−WT]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−WT]−F−F2A−PAC(080815−F02)(配列番号922)、CD8SP−FMC63−vL−V5−[mTCRb−opt]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[mTCRa−opt]−F−F2A−PAC(080815−B06)(配列番号953)、およびCD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)SIRコンストラクト、並びにGuassiaルシフェラーゼの非分泌形態をコードするGluc−PAC−G07対照コンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。約半分の細胞をピューロマイシンで選択し、残りの半分をピューロマイシン選択なしに繁殖させた。NSGマウス(Jackson Lab)に、用量175cGyで致死量以下の照射を行った。照射の約24時間後(第2日目)、マウスには、尾静脈を通して2.5x104RAJI細胞を注射した。3日目、マウスは(各群につきn=5)、表示SIRをコードするレンチウイルスまたはGluc−PAC−G07コンストラクトを感染させた5百万のT細胞(50%ピューロマイシン選択+50%非選択)で処理された。対照マウス(n=5)にはT細胞処理は行わなかった(あるいは非感染T細胞で処理した)。マウスは、対照群の全マウスが死滅するまで1日置きにヒトIL2(400IU腹腔内)を投与された。表12は、各群のマウスの生存を示す。TCRbおよびTCRa定常鎖の両方が野生型ヌクレオチド配列でコードされているFMCベースのSIR(080815−F02)には、延命効果は見られなかったが、コドン最適化マウスTCRbおよびTCRa定常鎖配列を含むSIRコンストラクト(080815−B06)(配列番号953)には延命効果が与えられた。同様に、コドン最適化ヒトTCRbおよびTCRa定常鎖配列を含むSIRコンストラクト(081415−D06)(配列番号992)にも延命効果が与えられた。
癌免疫療法のために、いくつかのヒト細胞ベースの人工抗原提示細胞が記載されている。CAR+およびSIR+のエクスビボ増殖のための1つのアプローチは、標的腫瘍関連抗原(TAA)を発現する照射人工抗原提示細胞(aAPC)の使用に関する。しかし、このアプローチでは、aAPCは、各個別のTAAを発現するように改変されなければならない。この問題を解決するため、汎用抗原提示細胞が開発された。ProteinLは、嫌気性細菌種ぺプトストレプトコッカス・マグナス(Peptostreptococcus magnus)のいくつかの株が発現する免疫グロブリン(Ig)軽鎖結合タンパク質である。ProteinLはκ軽鎖vLドメインの枠組構造領域に結合し、抗原結合ドメインには干渉しない。aAPC上で個々のTAAを発現させるアプローチの代替として、ProteinLが、特異性とは独立に、CAR+TおよびSIR+T細胞を活性化できるか否かを決定するための実験を行った。最初の実験において、ProteinL磁気ビーズがGFP発現を誘発するか否かを決定するため、異なるCARおよびSIRコンストラクトを発現するJurkat−NFAT−GFP細胞の共培養を試験した。Pierce ProteinL磁気ビーズ(カタログ番号88849、濃度10mg/mL)をThermoFisherから購入し、PBSで1対10に希釈した。約10μLの希釈ビーズをU底96ウェルプレートの各ウェルに添加した。Jurkat−NFAT−GFP親細胞、またはCD8SP−FMC63(vL−vH)−Myc−BBz−T2A−PAC(112014−A13)(配列番号4501)を発現するJurkat−NFAT−GFP細胞をウェルに添加し、ビーズと一緒に18時間共培養した。GFP発現誘発をフローサイトメトリーで調べた。以下の図18は、CD8SP−FMC63(vL−vH)−Myc−BBz−T2A−PAC(112014−A13)(配列番号4501)を発現するJurkat−NFAT−GFP細胞とProteinLビーズとの共培養により、GFP発現が僅かに誘発されることを示している。
ヒトCD8、41BB共刺激ドメイン、およびCD3z鎖のヒンジ領域および膜貫通領域と融合してProteinLの異なる領域を発現する、レンチウイルスキメラ抗原受容体(CAR)を生成した。ヒト細胞での最適発現のため、ProteinLのヌクレオチド配列をコドン最適化した。本発明目的では、ProteinLの機能にとって、41BB共刺激ドメインおよびCD3z鎖は本質的ではないので、この点は注意の必要がある。ProteinLの細胞表面輸送を可能にするため、ベクターはヒトCD8またはIgH由来のN末端シグナルペプチドも有していた。ベクターの完全な核酸およびアミノ酸配列が、配列番号888および配列番号889に提供される。
末梢血単核細胞(1千万細胞)をFicoll−Hypaque分離を用いて取得する。細胞は遠心分離し、4℃で1時間、細胞ペレットを200μLのヒトAB血清でブロックする。細胞は、1%FCSを含む冷却PBSで洗浄し、4℃で1時間、3つの抗体、すなわちUIC2(200μg/mL、Santa Cruz Biotechnology,SC−73354)、MRK16、およびP−糖タンパク質(Pgp)に向けられた4E3で染色する。各抗体は、アッセイの感度を高めるため、0.5μg/100万細胞の濃度で使用される。1%FCS含有PBSで十分に洗浄後、細胞を5μL(2.5μg)のFITC共役ヤギF(ab)2抗マウスIgG(H+L)ヒト吸収抗体(Southern Biotechnology、カタログ番号1032−02)で染色する。2回洗浄後、4℃で1時間、細胞をPE共役ヒトCD3抗体で標識する。細胞を洗浄し、フローサイトメトリーで分析する。CD3陽性Tリンパ球をPgp+veとPgp−ve分画に分ける。各分画の細胞を、CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)、または陰性対照SIRであるCD8SP−KSHV−4C3−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−4C3−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(111815−O05)(配列番号4639)をコードするレンチウイルスベクターで感染させる。NSGマウス(Jackson Lab)に、用量175cGyで致死量以下の照射を行う。照射の約24時間後(第2日目)、マウスには、尾静脈を通して2.5x104RAJI細胞を注射される。3日目、マウスは(各群につきn=6)、表示SIRをコードするレンチウイルスを感染させた5百万のリンパ球で処理される。対照マウス(n=6)にはT細胞を与えない、または非感染T細胞を与える。マウスには、1日置きにヒトIL2が与えられる。CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)SIRで感染させたPgp−veT細胞を与えられたマウス、あるいは陰性対照SであるCD8SP−KSHV−4C3−vL−V5−[hTCRb−S57C−opt]−F−P2A−SP−4C3−vH−Myc−[hTCRa−T48C−opt]−F−F2A−PAC(111815−O05)(配列番号4639)で感染させたPgp+veまたはPgp−veT細胞を与えられたマウスと比較して、CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)SIRで感染させたPgp+veT細胞を与えられたマウスは長く生存した。CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)SIRで感染させたPgp+veT細胞を与えられたマウスの長期生存は、SIR−T細胞の長期インビボ継続と相関する。上記実験は、参照として本明細書に援用される国際特許出願第PCT/US2017/042248号記載の他の方法(MACS(磁気活性化細胞選別)、およびTH9402への露出、その後の露光を含む)を用いて、Pgp発現Tリンパ球を濃縮することにより反復される。ここでも、CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(081415−D06)(配列番号992)SIRで感染させたPgp+veT細胞を与えられたマウスは長く生存し、SIR−T細胞の長期インビボ継続と相関する。
SIRであるCD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[TCRb−S57C−opt1]−F−P2A−SP−CD19Bu12−vH−Myc−[TCRa−T48C−opt1]−F−F2A−PAC(070215−M03)(配列番号1021))およびCD8SP−CD20−2F2−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−CD20−2F2−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(100615−D05)(配列番号1221)を発現するT細胞を、37℃で約30分、100nMのダサチニブと一緒に予備培養した、あるいは無処理状態に置いた。当該薬品処理および無処理T細胞をホワイト384細胞プレートで培養した。GLucを安定的に発現するRAJIを、30K細胞/ウェルの濃度でT細胞を含むウェルに加え、E対T比を5対1とした。最終濃度を100nMに維持するため、ダサチニブをウェルに加えた。4〜24時間の共培養後、天然のセレンテラジン(Nanaolight)を含む0.5xCTZアッセイ緩衝液を直接注入することにより、SIR−T細胞仲介による標的細胞の溶解誘発をGLuc活性の増大で分析した。結果は、100nMのダサチニブによりSIR誘発細胞死が有意に阻害されることを示した。ダサチニブ処理は、SIR−T細胞と標的細胞株との共培養後、IFNγおよびTNFα生産を有意に抑制することが判明した。SIR−T細胞による細胞毒性およびサイトカイン生産を阻害するダサチニブの能力を結果が示している。ダサチニブはFDA承認の薬剤であり、血液脳関門を通過できるので、SIR−T細胞により誘発される毒性(神経毒性を含む)の制御並びに患者へ投与後のSIR−T細胞活性の制御に使用可能である。
CD19を標的にする表示SIRコンストラクトを発現するレンチウイルスで、CD3磁気ビーズを用いて単離されたヒト末梢血T細胞を感染させた。細胞は無選択状態で、またはピューロマイシンで選択し、上述の標準プロトコールにより、CD3/CD28ビーズを用いて、重複P13K/mTOR阻害剤PF−04691502(0.10μM〜0.5μM)の存在下または不在下に繁殖させた。NSGマウス(Jackson Lab)に、用量175cGyで致死量以下の照射を行った。照射の24時間後(第2日目)、マウスには、尾静脈を通して、2.5x104RaJI細胞を注射した。3日目、マウス(各群につき、n=5)は5百万のT細胞で処置されたが、T細胞は表示SIRをコードするレンチウイルスで予め感染させ、PF−04691502の存在下または不在下に繁殖させた。対照マウス(n=5)には、5百万の非感染T細胞が注射された。マウスには、対照群の全マウスが死滅するまで、1日置きにヒトIL2(400IU腹腔内)が与えられた。P13K/AKTの存在下に繁殖させた(050515−L05)(配列番号900)SIR−Tを与えたマウスの生存中央値は、P13K/AKTの存在下に繁殖させたSIR−Tを与えたマウスよりも高い。
ルシフェラーゼを発現するDaudi細胞が、NSGマウス(Jackson Laboratory)に腹腔内注射される(腹腔内、0.3x106細胞/マウス)。マウスの一部には、リツキシマブ(150mg)が腹腔内注射される。CD8SP−MYC−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−SP−CD16A−V158−ECD−v2−V5−[hTCRb−S57C−opt1]−F−P2A−PAC(配列番号2069)SIRを発現するヒトT細胞(1x107)が、Daudi接種の4日後に注射される。対照マウスには、リツキシマブの代わりに組織培養培地が与えられる。リツキシマブは週1回ずつ4週間与えられるが、Tリンパ球の注射はそれ以上ない。全てのマウスに、週2回ずつ4週間、IL−2が1,000〜2,000IU腹腔内注射される。リツキシマブおよびSIR−T細胞が与えられるマウスは腫瘍の成長が低減する。
表7A〜7Hに掲載されたCD19を標的にするSIRのプールが、TRAC gRNA(配列番号896)および業界周知の技術を用いて、T細胞のTRAC座を標的とする。T細胞は末梢血由来であってよい。代替実施形態では、T細胞は、業界で周知の技術を用いて、iPSCまたは造血器幹細胞由来の単一クローンであってもよい。SIRのプールを発現するT細胞は、1〜21日間、インビトロでRAJI細胞と共培養される。SIR−T細胞プールの分取部分が標的細胞との培養前に回収され、更に共培養後、様々な日に回収される。試料は、標的細胞へ接触させた後、異なるSIRの相対頻度を決定するため、次世代シーケンシングへ回される。標的細胞との共培養後、増殖応答の改善されたSIRを決定するのに、バイオインフォ―マティクス分析が使用される。インビボでT細胞上の増殖可能性の高いSIR、および/またはインビボで長期継続するSIR,および/または腫瘍に負けた動物と比較して生存動物における頻度(初期T細胞母集団の頻度に対して標準化された頻度)の高いSIRを決定するのに、本質的に同様のアプローチが使用される。本開示の代替実施形態において、ヒトの臨床サンプルにおいても、異なる特性および/または結果(限定されないが、改善された長期生存率、サイトカイン放出症候群の低い発生頻度、低い神経毒性、および/または改善された長期継続性)に関連するSIRを同定するのに、本質的に同様のアプローチが使用される。斯かるSIRは、その後、異なる病状および異なる患者を治療するための多様な特性を有する多様なSIRのサブプール(同じまたは異なる抗原結合ドメインを標的にするSIRを含む)を開発するのに、単独で、または種々の組み合わせで使用できる。別の実施形態では、SIR−T細胞は標的細胞株に接触させ、その後、フローサイトメトリーで決定される細胞内IFNγの程度に基づいて、異なるセットに分類される。低/高IFNγ母集団における異なるSIRの頻度は、次世代シーケンシングにより決定され、対照SIR−T細胞母集団(すなわち、標的細胞株に接触していないSIR−T細胞、またはSIRの標的を発現しない細胞に接触したSIR−T細胞)の頻度に対して標準化される。斯かる分析に基づいて、異なるレベルのINFα生産に関連しているSIRが決定される。同様なアプローチが、任意の望ましい特性または属性(限定されないが、低いTNFα生産、枯渇マーカーの低い発現、最終分化のマーカーの低い発現、および/または細胞毒性のマーカーの高い発現などが含まれる)、あるいはそれらの組み合わせを有するSIRをスクリーニングまたは選別するのに使用される。
本研究は前述の実施例の記載同様に行われるが、マウスには、SIR−T細胞の注入後1日目に始まって、用量200ng/マウスの外因性組換えヒトIL−7を腹腔内に三回投与され、対照マウスには正常な生理食塩水が投与される点が異なっている。
本研究は前述の実施例の記載同様に行われるが、配列番号893(Plenti−EF1α−CD8SP−FMC63−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−FMC63−vH−Myc−[前TCRa−Del48]−F−F2A−PAC−shRNA−BRD4−DWPRE)(BRD4に対するH1プロモーター駆動shRNAを共発現する)に示されるSIRコンストラクトを発現するT細胞が使用される点が異なっている。BRD4−shRNAを共発現するshRNAコンストラクト(すなわち配列番号893)を与えられるマウスは、SIR−T細胞の継続性が長く、生存期間も長期である。
本開示のSIR−T細胞は養子細胞療法に使用できる。例えば、再発した急性リンパ性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病(CLL)、または高リスクの中悪性度B細胞リンパ腫の患者は、CD19を標的にする養子免疫伝達される自家SIR−T細胞を用いて免疫療法を受けてもよい。各患者から集められた白血球アフェレシス産物に関しては、Miltenyi BiotecのCliniMACS Prodigy(登録)Systemを使用し、製造元の推薦に従って、CD3陽性Tリンパ球の選別が行われる。Tリンパ球は、Pgp抗体で染色後の流動選別、Pgp抗体で染色後のMACS、またはTH9402への露出プラス露光後の光力学的選別を用いて、Pgp陽性T細胞のための濃縮が任意に行われる。細胞は臨床グレードのCD19−SIRウイルス(例えば、CD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD19Bu12−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−GMCSF−SP−tEGFR()(配列番号1087))を形質導入され、次に、閉鎖系でSIR−T細胞の選別および増殖が行われる。その結果得られた細胞産物が品質管理試験(無菌試験、腫瘍特異的な細胞毒性試験を含む)を受けた後、凍結保存される。その間、白血球アフェレシスの後、研究参加者は、リンパ球枯渇化学療法(30mg/m2/日フルダラビン+500mg/m2/日シクロホスファミドx3日)を開始する。リンパ球枯渇レジメンの完了後1日目に、以前に保存されているSIR−T細胞産物が運搬され、解凍され、患者のベッドサイドで注入される。研究参加者には、静注されたSIR形質導入リンパ球、次に高用量(720,000IU/kg)のIL−2(Aldesleukin, Prometheus, San Diego, CA)が8時間毎に許容量まで投与される。SIR―T産物の用量は、研究プロトコールに従って、1x104SIR+veCD3細胞/kgから5x109SIRveCD3細胞/kgまで様々である。SIR−T産物は、単回注入で投与されてもよいし、分割注入で投与されてもよい。研究参加者は、T細胞注入の少なくとも30分前に、15mg/kgのアセタミノフェン(経口)(最高650mg)および0.5〜1mg/kgのジフェンヒドラミン(静注)(最高用量50mg)で前投薬されてもよい。研究参加者は、ヒトIL−2を毎日任意に注射されてもよい。次に、臨床および実験の相関追跡試験が医師の自由裁量により行われてもよく、その中には、C19発現ALL/リンパ腫細胞および/または養子免疫伝達T細胞に関する定量的RT−PCR研究、FDG−PETおよび/またはCTスキャン、病気特異的な病理学的評価のための骨髄検査、リンパ管生検、および/またはFDAのBiologic Response Modifiers Advisory Committeeが設定したガイドラインに基づき遺伝子導入に適用される長期フォローアップなどが含まれてもよい。本開示のSIRを発現するように改変された同種免疫細胞(例えば、T細胞)を用いて他の病気を治療するのにも、本質的に同様なアプローチ(すなわち、病気を引き起こす細胞または病気関連の細胞で発現する抗原(複数も可)を、SIRが標的にするアプローチ)が使用できる。
多くの異なる病気、例えば、感染症(例えば、HIV1、EBV、CMV、HTLV1など)、変性性疾患(例えば、アルツハイマー病)、自己免疫疾患(例えば、尋常性天疱瘡)、アレルギー疾患(例えば、慢性突発性蕁麻疹)、および複数の癌を罹患する患者が、多様な病気を引き起こす抗原または病気関連抗原を標的にする養子免疫伝達同種SIR−T細胞による免疫療法に関する、IRB承認第1相臨床試験に登録される。異なる病気用のSIRが、病気を引き起こす細胞または病気関連細胞における標的抗原の既知の発現に基づいて選択される。可能ならば、病気を引き起こす細胞または病気関連細胞におけるSIRの標的の発現は、ABD−GGS−NLuc融合タンパク質(SIRの抗原結合ドメインが、可撓性リンカーを通して、NLucタンパク質の非分泌形態に融合している)との結合により確認される。あるいは、病気を引き起こす細胞または病気関連細胞におけるSIRの標的の発現は、商業的に入手可能な抗体を用いる免疫組織化学またはフローサイトメトリーを用いて確認される。T細胞は、白血球アフェレシスを用いて回収され、適切なSIRをコードするレンチウイルスベクターで形質導入され、閉鎖系においてCD3/CD28ビーズを用いてエクスビボで繁殖させる。その結果得られた細胞産物が品質管理試験(無菌試験、腫瘍特異的な細胞毒性試験を含む)を受けた後、凍結保存される。その間、研究参加者は、リンパ球枯渇化学療法(30mg/m2/日フルダラビン+500mg/m2/日シクロホスファミドx3日)を開始する。リンパ球枯渇レジメンの完了後1日目に、研究参加者には、静注された形質導入リンパ球、次に高用量(720,000IU/kg)のIL−2(Aldesleukin, Prometheus, San Diego, CA)が8時間毎に許容量まで投与される。以前に保存されているSIR−T細胞産物が運搬され、解凍され、患者のベッドサイドで注入される。SIR―T産物の用量は、研究プロトコールに従って、1x104SIR+veCD3細胞/kgから5x109SIRveCD3細胞/kgまで様々である。SIR−T産物は、単回注入で投与されてもよいし、分割注入で投与されてもよい。研究参加者は、T細胞注入の少なくとも30分前に、15mg/kgのアセタミノフェン(経口)(最高650mg)および0.5〜1mg/kgのジフェンヒドラミン(静注)(最高用量50mg)で前投薬されてもよい。研究参加者は、ヒトIL−2を毎日任意に注射されてもよい。次に、臨床および実験の相関追跡試験が医師の自由裁量により行われてもよい。
研究は前述の実施例の記載同様に行われるが、SIR−T細胞の注入後1日目に始まって、研究参加者には、mTOR阻害剤、例えばアロステリック阻害剤(例えば、RAD001)を標的トラフ値が0.1〜3ng/mLを提供する用量で投与する点が異なっている(この場合、トラフ値とは、次の用量直前における血漿中の薬剤濃度、または2つの用量間の最低薬剤濃度を意味する)。
研究は前述の実施例の記載同様に行われるが、SIR−T細胞の注入後1日目に始まって、研究参加者には、140mg/d〜420mg/dの用量でイブルチニブを経口投与する点が異なっている。イブルチニブを投与される研究参加者は、イブルチニブなしでSIR−T細胞を投与される参加者と比較して、重篤なサイトカイン放出症候群の発生数が少ない。
同種骨髄移植を受けた患者で、再発した急性リンパ性白血病または高リスクの中悪性度B細胞リンパ腫の患者は、養子免疫伝達同種SIR−T細胞の免疫療法を受けてもよい。ドナー(同種移植に使用されるのと同じドナー)から回収された白血球アフェレシス産物に関しては、Miltenyi BiotecのCliniMACS Prodigy(登録)Systemを使用し、製造元の推薦に従って、CD3陽性Tリンパ球の選別が行われる。Tリンパ球は、Pgp抗体で染色後の流動選別、Pgp抗体で染色後のMACS、またはTH9402への露出プラス露光後の光力学的選別を用いて、Pgp陽性T細胞のための濃縮が任意に行われる。細胞は、CD3およびCD28磁気ビーズベースの人工抗原提示細胞を用いて活性化され、臨床グレードのCD19−SIRウイルス(例えば、CD8SP−CD19Bu12−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−CD19Bu12−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−icasapase9(配列番号1080))で形質導入される。細胞は、閉鎖系で9〜12日増殖される。その結果得られた細胞産物が品質管理試験(無菌試験、腫瘍特異的な細胞毒性試験を含む)を受けた後、凍結保存される。その間、研究参加者は、リンパ球枯渇化学療法(30mg/m2/日フルダラビン+500mg/m2/日シクロホスファミドx3日)を開始する。リンパ球枯渇レジメンの完了後1日目に、研究参加者には、静注された形質導入リンパ球、次に高用量(720,000IU/kg)のIL−2(Aldesleukin, Prometheus, San Diego, CA)が8時間毎に許容量まで投与される。SIR−T細胞産物が運搬され、解凍され、患者のベッドサイドで注入される。SIR―T産物の用量は、研究プロトコールに従って、1x104SIR+veCD3細胞/kgから5x109SIRveCD3細胞/kgまで様々であってよい。SIR産物は、単回注入で投与されてもよいし、分割注入で投与されてもよい。研究参加者は、SIR−T細胞注入の少なくとも30分前に、15mg/kgのアセタミノフェン(経口)(最高650mg)および0.5〜1mg/kgのジフェンヒドラミン(静注)(最高用量50mg)で前投薬されてもよい。次に、臨床および実験の相関追跡試験が医師の自由裁量により行われてもよく、その中には、C19発現ALL/リンパ腫細胞および/または養子免疫伝達T細胞に関する定量的RT−PCR研究、FDG−PETおよび/またはCTスキャン、病気特異的な病理学的評価のための骨髄検査、リンパ管生検、および/またはFDAのBiologic Response Modifiers Advisory Committeeが設定したガイドラインに基づき遺伝子導入に適用される長期フォローアップなどが含まれてもよい。免疫抑制剤の使用も医師の自由裁量に任される。本開示のSIRを発現するように改変された同種免疫細胞(例えば、T細胞)を用いて他の病気を治療するのにも、本質的に同様なアプローチ(すなわち、病気を引き起こす細胞または病気関連の細胞で発現する抗原(複数も可))を、SIRが標的にするアプローチ)が使用できる。
SIR−T細胞は、静注に加えて、高濃度のSIR−T細胞を病気関連の局部または器官に提供するため、動注されてもよい。以下の実施例では、本アプローチは、葉酸受容体アルファ(FR1)を発現する消化器系癌の肝臓転移を患う患者の場合に使用される。他の腫瘍抗原を標的にするSIR−T細胞の動注にも、本質的に同様なアプローチが使用できる。
SIR−Tは、実質的にKoneru Mら(Journal of Translational Medicine; 2015; 13:102)記載のように、腹腔内投与してもよい。以下の例において、斯かるアプローチが、葉酸受容体アルファ(FR1)を発現する卵巣癌により腹膜の病変を患っている患者の場合に使用される。他の腫瘍抗原を標的にするSIR−T細胞の腹腔内注射にも、本質的に同様なアプローチが使用できる。
更に、SIR−T細胞は、実質的にBrown CEら、Clin Cancer Res, 2015年9月15日;21(18):4062−4072に記載される方法で、腫瘍内に投与されてもよい。以下の実施例では、本アプローチは、IL13Ra2を発現する再発性膠芽細胞腫(GBM)の患者の場合に使用される。他の腫瘍抗原を標的にするSIR−T細胞の腫瘍内注射にも、本質的に同様なアプローチが使用できる。
骨髄または幹細胞移植前の癌細胞の末梢血幹細胞調製物をパージするのに、SIR−T細胞が使用できる。以下の例では、SIR−T細胞を発現するCD8SP−HuLuc64−vL−V5−[hTCRb−KACIAH]−F−P2A−SP−HuLuc64−vH−Myc−[hTCRa−CSDVP]−F−F2A−PAC(092916−E07)(配列番号1253)が、多発性骨髄腫の患者から得た骨髄または末梢血幹細胞を、自家幹細胞(または骨髄)移植前にパージするのに使用される。
尋常性天疱瘡の患者が、Dsg3細胞外ドメインを含むSIRの安全性および効果を試験する臨床試験に登録されるであろう。患者は、治療抵抗性の尋常性天疱瘡の診断後、登録されるであろうが、その時点で、末梢血単核細胞(PBMC)の回収のため、白血球アフェレシスを受けるであろう。斯かる細胞は、上述の実施例に記載されるように対応するレンチウイルスベクターで感染後、SIR(CD8SP−MYC−[hTCRa−T48C−opt1]−F−F2A−SP−Dsg3−ECD−V5−[hTCRb−S57C]−F−P2A−PAC(配列番号1144))を発現するようにT細胞を改変するのに使用されるであろう。あるいは、SIR−T細胞は、レトロウイルスベクターで感染後、またはsleaping beautyトランスポゾンを用いて、またはIVT mRNAのトランスフェクションにより作製されるであろう。その後、遊離試験済み治療用SIR−T細胞は、冷凍され、後の使用のために保存される。患者には、SIR修飾T細胞で治療を開始する2〜4日前に、リンパ球枯渇性シクロホスファミド(750mg/m2静注)化学療法の単一用量が与えられる。形質導入されたT細胞は、注入前に、数、純度、生育可能性、および無菌性の品質試験が行われる。SIR―T産物の用量は、研究プロトコールに従って、1x104SIR+veCD3細胞/kgから5x109SIRveCD3細胞/kgまで様々であってよい。SIR産物は、単回注入で投与されてもよいし、分割注入で投与されてもよい。研究参加者は、SIR−T細胞注入の少なくとも30分前に、15mg/kgのアセタミノフェン(経口)(最高650mg)および0.5〜1mg/kgのジフェンヒドラミン(静注)(最高用量50mg)で前投薬されてもよい。次に、臨床および実験の相関追跡試験が医師の自由裁量により行われてもよい。
Claims (198)
- 少なくとも1つの合成免疫受容体(SIR)をコードする少なくとも1つの組換えポリヌクレオチドであって、
前記少なくとも1つのSIRは、
(a)T細胞受容体(TCR)定常鎖であって、
(i)配列番号3010と少なくとも98%同一であり且つ48、61、91、92、93および/または94の位置に1つ以上の変異を有するアミノ酸配列であって、任意選択のアクセサリーモジュールを含んでもよいアミノ酸配列、
(ii)配列番号3024と少なくとも98%同一であり且つ18、22、57、79、133、136および/または139の位置に1つ以上の変異を有するアミノ酸配列であって、任意選択のアクセサリーモジュールを含んでもよいアミノ酸配列、
(iii)配列番号3025と少なくとも98%同一であり且つ18、22、57、79、133、136および/または139の位置に1つ以上の変異を有するアミノ酸配列であって、任意選択のアクセサリーモジュールを含んでもよいアミノ酸配列、
(iv)配列番号3046、3047または3048と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列であって、任意選択のアクセサリーモジュールを含んでもよいアミノ酸配列、
(v)配列番号3049と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列であって、任意選択のアクセサリーモジュールを含んでもよいアミノ酸配列、
(vi)配列番号3051または3052と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列であって、任意選択のアクセサリーモジュールを含んでもよいアミノ酸配列、ならびに
(vii)(i)と(ii)、(i)と(iii)、(iv)と(ii)、(iv)と(iii)、および(v)と(vi)、から選択される2つのTCR定常鎖の二量体の組み合わせ、
から成る群から選択されるアミノ酸配列を有するT細胞受容体定常鎖と、
(b)任意選択のリンカーと、
(c)(a)に連結された1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインであって、
(1)抗体、
(2)抗体断片(例えば、Fv、Fab、(Fab’)2)、
(3)抗体の重鎖可変領域(vHドメイン)またはその断片、
(4)抗体の軽鎖可変領域(vLドメイン)またはその断片、
(5)単鎖可変断片(scFv)またはその断片、
(6)単一ドメイン抗体(SDAB)またはその断片、
(7)ラクダ科動物由来VHHドメインまたはその断片、
(8)抗体の単量体可変領域、
(9)DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、オーボディ、リピボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質またはそれらの断片等の、非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、
(10)受容体またはその断片、
(11)リガンドまたはその断片、
(12)二重特異性の抗体、二重特異性の抗体断片、二重特異性のscFV、二重特異性のvHH、二重特異性のSDAB、二重特異性の非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、二重特異性の受容体、または二重特異性のリガンド、および
(13)自己抗原またはその断片、
から成る群から選択される1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインと、
を含み、
(a)(i)〜(a)(iii)の変異体および(a)(vii)の二量体は、前記抗原結合ドメインの標的抗原に対する多様な結合親和性をもたらし、前記親和性は、同じ結合ドメインを有するcTCRの結合親和性よりも少なくとも5%大きく、前記合成免疫受容体は、リンパ球で発現した場合に、リンパ球の表面上の1つ以上の連続鎖で、前記抗原結合ドメインおよび前記T細胞受容体定常鎖の両方を発現し、その結果、前記発現した抗原結合ドメインがその抗原に結合した際に、リンパ球が、活性化、増殖、サイトカインを分泌および/または標的細胞の死滅を調整(誘発または抑制)するようにトリガーされ且つMHC拘束性およびMHC非拘束性の抗体タイプ特異性を有する、
組換えポリヌクレオチド。 - (a)(vii)のTCR定常鎖を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチドであって、前記非天然TCR結合ドメインは、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の重鎖および軽鎖またはそれらの断片の可変領域であって、発現した場合に、前記抗体の重鎖および軽鎖またはそれらの断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗体の重鎖および軽鎖またはそれらの断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、可変領域と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの単鎖可変断片(scFv)であって、発現した場合に、前記scFvの1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記scFvのもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの単鎖可変断片(scFv)と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの抗体断片であって、発現した場合に、前記抗体断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗体断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの抗体断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの単一ドメイン抗体(SDAB)断片であって、発現した場合に、前記SDAB断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記SDAB断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの単一ドメイン抗体(SDAB)断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つのラクダ科動物由来vHHドメインであって、発現した場合に、前記vHHドメインの1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記vHHドメインのもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つのラクダ科動物由来vHHドメインと、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドであって、発現した場合に、前記非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドの1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドドメインのもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドと、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの受容体またはその断片であって、発現した場合に、前記受容体またはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記受容体またはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの受容体またはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つのリガンドまたはその断片であって、発現した場合に、前記リガンドまたはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記リガンドまたはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つのリガンドまたはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの構造的に異なる抗原結合断片であって、発現した場合に、前記抗原結合断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗原結合断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの構造的に異なる抗原結合断片と、
−2つの結合断片であって、そのいずれかまたは両方が二重特異性または多重特異性であり、発現した場合に、前記抗原結合断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗原結合断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの結合断片と、
−2つの自己抗原またはその断片であって、発現した場合に、前記自己抗原またはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記自己抗原またはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つの自己抗原またはその断片と、
−2つのvLまたはその断片であって、発現した場合に、前記vLまたはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記vLまたはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つのvLまたはその断片と、
−2つのvHまたはその断片であって、発現した場合に、前記vHまたはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記vHまたはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、2つのvHまたはその断片と、
から成る群から選択される、組換えポリヌクレオチド。 - (a)(iv)のTCR定常鎖を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチドであって、前記非天然TCR結合ドメインは、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の重鎖(vH)の可変領域またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の軽鎖(vL)の可変領域またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的な単鎖可変断片(scFv)またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体断片(例えば、Fv、Fab、(Fab’)2)と、
−所定の標的抗原に特異的な単一ドメイン(SDAB)断片と、
−所定の標的抗原に特異的なラクダ科動物由来vHHドメインと、
−所定の標的抗原に特異的な非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドと、
−所定の標的抗原に特異的な受容体またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的なリガンドまたはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な、二重特異性の抗体、二重特異性の抗体断片、二重特異性のscFV、二重特異性のvHH、二重特異性のSDAB、二重特異性の非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、二重特異性の受容体、または二重特異性のリガンドと、
−自己抗原またはその断片と、
から成る群から選択される、組換えポリヌクレオチド。 - (i)、(ii)、(iii)、(iv)、(v)または(vi)をコードするポリヌクレオチドを含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチドであって、前記非天然TCR結合ドメインは、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の重鎖(vH)の可変領域と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の軽鎖(vL)の可変領域と、
−所定の標的抗原に特異的な単鎖可変断片(scFv)と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体断片(例えば、Fv、Fab、(Fab’)2)と、
−所定の標的抗原に特異的な単一ドメイン(SDAB)断片と、
−所定の標的抗原に特異的なラクダ科動物由来vHHドメインと、
−所定の標的抗原に特異的な非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドと、
−所定の標的抗原に特異的な受容体またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的なリガンドまたはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な、二重特異性の抗体、二重特異性の抗体断片、二重特異性のscFV、二重特異性のvHH、二重特異性のSDAB、二重特異性の非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、二重特異性の受容体、または二重特異性のリガンドと、
−自己抗原またはその断片と、
から成る群から選択される、組換えポリヌクレオチド。 - 前記TCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドがコドン最適化配列である、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- (a)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、TCR定常鎖の発現および/または対形成を向上させる変異であって内因性T細胞受容体鎖との対形成を減少させる変異を含むTCR定常鎖(複数可)をコードする、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- (a)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、配列番号730〜743の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号730〜743の核酸配列と少なくとも70%同一の配列であって、TCRβ1鎖またはTCRβ2鎖と二量体化可能な配列を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- (b)または(c)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、配列番号744〜765の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号744〜765の核酸配列と少なくとも70%同一の配列であって、TCRα鎖と二量体化可能な配列を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- (v)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、配列番号769〜770の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号769〜770の核酸配列と少なくとも70%同一の配列であって、TCRδ鎖と対形成可能な配列を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- (vi)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、配列番号771〜772の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号771〜772の核酸配列と少なくとも70%同一の配列であって、TCRγ鎖と二量体化可能な配列を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- (iv)のTCR定常鎖をコードするポリヌクレオチドは、配列番号766〜768の核酸配列の1〜40修飾の核酸配列または配列番号766〜768の核酸配列と少なくとも70%同一の配列であって、TCRβ1鎖またはTCRβ2鎖と二量体化可能な配列を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD19;CD123;CD22;CD30;CD171;CS−1(CD2サブセット1、CRACC、SLAMF7、CD319、および19A24とも呼ばれる);C型レクチン様分子1(CLL−1またはCLECL1);CD33;上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRviii);ガングリオシドG2(GD2);ガングリオシドGD3(aNeu5Ac(2−8)aNeu5Ac(2−3)bDGalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA);Tn抗原((Tn Ag)または(GalNAcα―Ser/Thr);前立腺特異的膜抗原(PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1);FMS様チロシンキナーゼ3(FLT3);腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72);CD38;CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化CD43エピトープ、非造血器癌で発現するグリコシル化CD43エピトープ;癌胎児性抗原(CEA);上皮細胞接着分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);インターロイキン13受容体サブユニットアルファ2(IL−13Ra2またはCD213A2);メソテリン;インターロイキン11受容体α(IL−11Ra);前立腺幹細胞抗原(PSCA);プロテアーゼセリン21(テスティシンまたはPRSS21);血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2);ルイス(Y)抗原;CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR―β);ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4);CD20;葉酸受容体α;受容体チロシンプロテインキナーゼERBB2(Her2/neu);ムチン1、細胞表面関連(MUC1);上皮細胞増殖因子受容体(EGFR);神経細胞接着分子(NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性フォスファターゼ(PAP);伸長因子2変異(ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質α(FAP);インスリン様増殖因子1受容体(IGF−1受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX);プロテアソーム(プロソーム、マクロパイン)サブユニット、β型9(LMP2);糖タンパク質100(gp100);易切断領域(BCR)およびアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ1(Abl)から成る癌遺伝子融合タンパク質(bcr−abl);チロシナーゼ;エフリンA型受容体2(EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子(sLe);ガングリオシドGM3(aNeu5Ac(2−3)bClalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);トランスグルタミナーゼ5(TGS5);高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA);O−アセチル―GD2ガングリオシド(OAcGD2);葉酸受容体β;腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248);腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R);クローディン6(CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR);Gタンパク質共役受容体クラスCグループ5メンバーD(GPRC5D);染色体Xオープンリーディングフレーム61(CXORF61);CD97;CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ(ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的1(PLAC1);グロボHグリコセラミドの六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY−BR−1);ウロプラキン2(UPK2);A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1);アドレナリン受容体β3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3);Gタンパク質共役受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6コンプレックス遺伝子座K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2);TCRγ代替リーディングフレームタンパク質(TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1);癌/精巣抗原1(NY−ES0−1);癌/精巣抗原2(LAGE−1a);黒色腫関連抗原1(MAGE−A1);染色体12pに位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6−AML);精子タンパク質17(SPA17);X抗原ファミリーメンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体2(Tie2);黒色腫癌精巣抗原1(MAD−CT−1);黒色腫癌精巣抗原2(MAD−CT−2);Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質p53(p53);p53変異体;プロステイン;サバイビン;テロメラーゼ;前立腺癌腫抗原1(PCT A−1またはガレクチン8)、T細胞によって認識される黒色腫抗原1(MelanAまたはMARTI);ラット肉腫(Ras)変異体;ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座切断点;アポトーシスの黒色腫阻害物質(ML−IAP);ERG(膜貫通型プロテアーゼ、セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子);NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV(NA17);ペアードボックスタンパク質Pax−3(PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリンB1;v−myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性癌遺伝子の神経芽細胞腫由来のホモログ(MYCN);RasホモログファミリーメンバーC(RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP−2);チトクロームP450 1B1(CYP1B1);CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様(BORISすなわちBrother of the Regulator of Imprinted Sites)、T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3抗原3(SART3);ペアードボックスタンパク質Pax−5(PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32(OY−TES1);リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK);Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP−4);滑膜肉腫、X切断点2(SSX2);糖化最終産物の受容体(RAGE−1);腎臓ユビキタス1(RU1);腎臓ユビキタス2(RU2);レグマイン;ヒト乳頭腫ウイルスE6(HPV E6);ヒト乳頭腫ウイルスE7(HPV E7);腸由来カルボキシルエステラーゼ;熱ショックタンパク質70−2変異体(mut hsp 70−2);CD79a;CD79b;CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1):IgA受容体のFc断片(FCARまたはCD89);白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2);CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF);C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A);骨髄間質細胞抗原2(BST2);EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2);リンパ球抗原75(LY75);グリピカン3(GPC3);Fc受容体様5(FCRL5);および免疫グロブリンλ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、ビオチン、c−MYCエピトープタグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原)フコシルGM1、PTK7、gpNMB、CDH1−CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b−IGL11、ALK TCRγ−δ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、Tn ag、CSPG4−HMW−MAA、Timl−/HVCR1、CSF2RA(GM−CSFRα)、TGFβR2、VEGFR2/KDR、ルイスAg、TCRβ鎖、TCRβ2鎖、TCRγ鎖、TCRδ鎖、FITC、黄体化ホルモン受容体(LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性性腺刺激ホルモン受容体(CGHR)、CCR4、GD3、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1−Tax、CMVpp65、EBV−EBNA3c、インフルエンザAヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、KSHV−K8.1タンパク質、KSHV−gHタンパク質、デスモグレイン3(Dsg3)に対する自己抗体、デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体、HLA、HLA―A、HLA―A2、HLA―B、HLA―C、HLA―DP、HLA−DM、HLA−DOA、HLA−DOB,HLA―DQ、HLA―DR、HLA―G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、クローディン18.2(CLD18A2またはCLDN18A.2)、P−糖タンパク質、STEAP1、LIV1、NECTIN−4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素イオンチャネル、およびTNT抗体によって認識される抗原、から成る群から選択される疾患関連抗原のうちの1つ以上に結合する、請求項1に記載の組み換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、抗体;抗体断片;scFv:;Fv;Fab;(Fab’)2;単一ドメイン抗体(SDAB);vHドメインもしくはvLドメイン;ラクダ科動物由来vHHドメイン;DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、オーボディ、リピボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質のような非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド;受容体;またはリガンドを含む、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
(i)配列番号226〜400または10203〜10321のうちのいずれか1つの配列またはそれと少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであってその抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる重鎖可変領域(vH)と、
(ii)配列番号16〜191または10085〜10202のうちのいずれか1つの配列またはそれと少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであってその抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる軽鎖可変領域(vL)と、
(iii)配列番号488〜657、10346〜10400または18098〜18160のうちのいずれか1つの配列またはそれと少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであってその抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる単鎖可変断片(scFv)と、
(iv)配列番号421〜445または10322〜10337のうちのいずれか1つの配列またはそれと少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであってその抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされるラクダ科動物VHHドメインと、
(v)配列番号439〜443のうちのいずれか1つの配列またはそれと少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであってその抗原に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる非免疫グロブリンスカフォールドと、
(vi)配列番号456〜468のうちのいずれか1つの配列またはそれと少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであってそのコグネイトに結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされる受容体と、
(vii)配列番号476〜486または10402〜10404のうちのいずれか1つの配列またはそれと少なくとも98%同一の配列を有するポリヌクレオチドであってそのコグネイトに結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによりコードされるリガンドと、
から成る群から選択される、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号13999〜14879または14880のいずれかに記載される、選択された標的抗原のための軽鎖相補性決定領域のうちの1つ以上、および/または配列番号14881〜15761または15762のいずれかに記載される、選択された標的抗原のための重鎖相補性決定領域のうちの1つ以上、を含む、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2307〜2482または12042〜12159のいずれか1つに記載の配列を有する可変軽鎖(vL)ドメイン、および/または10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2506〜2680または12160〜12278のいずれか1つに記載の配列を有する可変重鎖(vH)ドメインを有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2701〜2725または12279〜12294のいずれか1つに記載の選択抗原のための1つ以上のラクダ科動物vHH相補性決定領域を有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2728〜2732または12296〜12301のいずれか1つに記載のアミノ酸を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を含む非免疫グロブリン抗原結合ドメインを有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2307〜2482または12042〜12159のいずれか1つの配列を有する可変軽鎖(vL)ドメインの1つ以上の軽鎖相補性決定領域と、配列番号2506〜2680または12160〜12278のいずれか1つの配列を有する可変重鎖(vH)ドメインの1つ以上の重鎖相補性決定領域とを含むscFvドメインを有する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2770〜2939、12303〜12357、および18162〜18224から成る群であって、各々10までの保存的アミノ酸置換体を有する群から選択された配列を含むscFv断片を有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る1つ以上の受容体を有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有する配列番号2758〜2768または12359〜12361のうちいずれかの配列から成る1つ以上のリガンドを有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD16A、NKG2D、CD4、PD1、デスモグレイン3(Dsg3)、またはCD4−DC−SIGNの細胞外ドメインを有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、hTPO、mTPO、CGHα鎖、CGHβ鎖、FHβ鎖、LHβ鎖、TSHβ鎖、APRIL、またはそれらの組み合わせのうち1つ以上の細胞外ドメインを有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれか1つの配列を含み、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)と、
a)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれかに記載されている任意のラクダ科動物vHH、または
b)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、または
c)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、または
d)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインと、
を有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか記載のラクダ科動物vHHと、
a)配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれかの配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)、または
b)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、または
c)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、または
d)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインと、
を有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、リンカー領域により前記TCR定常領域の各々に任意に接続されており、前記リンカー領域の核酸は、配列番号2981〜3003およびそれらの任意の組み合わせから成る群から選択されるアミノ酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列をコードする、あるいは前記リンカーは、配列番号701〜725から成る群から選択される核酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列によってコードされている、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、それを取得した抗体よりも少なくとも5倍少ない標的抗原への結合親和性を有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記SIRをコードする前記ポリヌクレオチドは、各鎖のN末端に存在し配列番号1〜9および10から成る群から選択される配列を有するリーダー配列またはシグナルペプチドを更に有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 少なくとも1つのポリヌクレオチドは2つのSIRをコードする、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記ポリヌクレオチドは、切断可能リンカーをコードするヌクレオチド配列によって結合された2つのSIRをコードする、請求項30に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーは、自己切断による切断可能リンカーである、請求項31に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーは、2Aリンカー、2A様リンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である、請求項31に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーは、T2Aリンカー、P2A、F2A、E2Aリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である、請求項31に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーは、配列番号780〜785のうち任意の1つ以上の配列を有する、請求項31に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチド配列の前には、任意に、フーリン切断部位、フーリン様切断部位、またはそれらの機能的等価物をコードするヌクレオチド配列が位置する、請求項31に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーに先行する前記フーリン切断部位は、配列番号788〜790のうち任意の1つ以上の配列を有する、請求項36に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーをコードする前記ポリヌクレオチド配列の前には、可撓性リンカーをコードするヌクレオチド配列が位置する、請求項31〜37のいずれか一項に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーに先行する前記可撓性リンカーは、Ser−Glyリンカー、Ser−Gly−Ser−Glyリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち1つ以上をコードする、請求項38に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーに先行する前記可撓性リンカーは、配列番号786〜787の配列を有する、請求項39に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 順番が、フーリン切断部位、可撓性リンカー、切断可能リンカーとなるよう、前記フーリン切断部位をコードする前記ポリヌクレオチド配列の後ろに前記可撓性リンカーをコードするポリヌクレオチドが位置し、その後ろに前記切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチドが位置する、請求項38に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチドは、第二SIRをコードしたリーダー配列(シグナルペプチド)をコードする配列の前に存在する、請求項31に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記SIRは、選択抗原のために、多様な結合親和性を有するように設計可能である、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記SIRはアクセサリーモジュールを有する、組換えポリヌクレオチド。
- 請求項44記載の組換えポリヌクレオチドにおいて、前記アクセサリーモジュールはCD3zドメインを有する、請求項1に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記TCR定常鎖は、
(viii)配列番号12401、12402、12403、12408、または12409と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列と、
(ix)配列番号12421、12422、12423、12427、または12428と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列と、
(x)(viii)および(ix)の2つのTCR定常鎖の二量体組み合わせと、
から成る群から選択される、請求項45に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD19と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2318〜2324、12060〜12068、12108、12127、および12156のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2517〜2523、12178〜12186、1227、12246、および12275のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号12288に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
−配列番号2770〜2774、12325、12308、18162〜18170、および12354のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項47に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3135〜3235、3250〜3346、3396、3401〜3403、3406、3429〜3432、3435〜3439、3540、3855〜3859、12431〜12489、12491〜12493、12495〜12530、12534、13195〜13203、13250、13267、13289、13429〜13437、13483、13501、および13523から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項47に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD20と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2325〜2326、12069〜12077、および12078のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2524〜2525、12187〜12195、および12196のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号12289または12290に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
−配列番号2787〜2788、18177〜18186、および18187のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項50に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3263、3348、3456〜3457、3876〜3877、12464〜12465、12477〜12482、12492、12534、13204〜13213、13438〜13446、および13447から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項50に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD22と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2327〜2329、12122〜12126、および12132のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2526〜2528、12241〜12245、および12251のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2789〜2791、12320〜12330、および18188のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項53に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3332,3433、3458〜3460、3878〜3880、12483、12485、12488〜12490、13241〜13245、13268、13475〜13479、および13502から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項53に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、BCMAと結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2310〜2313、12046〜12048、12118〜12119、12139〜12145、および12146のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2509〜2512、12164〜12166、12237〜12238、12258〜12264、および12265のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号12279〜12281、12283〜12285、12287、12291〜12292、12293、または12294に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
−配列番号2780〜2783、12237〜12344、18174〜18175、および18176のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項56に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3445〜3449、3866〜3869、12463、12533、12535〜12536、13181〜13183、13261〜13262、13277〜13284、13415〜13417、13495〜13496、13511〜13517、および13518から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項56に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、MPLと結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2414〜2421、12120、12128、および12129のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2611〜2618、12239、12247、および12248のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2871〜2878、12326〜12327、および12318のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項59に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3347、3373、3427〜3428、3495、3556〜3562、3979〜3985、4025、12454、12456、12458、12462、12532、13259、13265〜13266、13493、13499、および13500から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項59に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CS1と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2355〜2358、12090〜12094、および12095のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2553〜2555、12209〜12213、および12214のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2817〜2819、18211〜18215、および18216のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項62に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3376、3487、3489、3907〜3909、12455、12457、12459、12461、12476、13226〜13231、13460〜13464、および13465から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項62に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD33と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2336〜2337、12079〜12084、および12085のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2535〜2536、12197〜12202、および12203のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2795〜2796、18189〜18193、および18194のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項65に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3464〜3465、3884〜3885、12460、12473、12479、13214〜13220、13448〜13453、および13454から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項65に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD123と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2315、2472、12049〜12058、および12059のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2514、2670、12167〜12176、および12177のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2716または2717に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
−配列番号2801、2929、18196〜18205、および18206のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項68に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3266〜3267、3366〜3368、3375、3378、3405、3409、3434、3470、3492〜3497、3617、3890、3912〜3913、4041、12480、13184〜13194、13418〜13427、および13428から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項68に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、葉酸受容体1と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2373に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2570に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2833に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項71に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3511および3928から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項71に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、メソテリンと結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2413、12154、および12155のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2609〜2610、12273、および12274のうちのいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2713〜2714または2725に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
−配列番号2870、2899、12352、および12353のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項74に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3414、3419、3554、3585、3976、4008、13287〜13288、13521、および13522から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項74に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、IL13Ra2と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2399および2400のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2595および2596のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2858および2859のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項77に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3541〜3542、3963、および3964から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項77に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD138と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2316に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2515に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2802に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項80に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3268、3374、3404、3471、および3891から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項80に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、TCRgdと結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2449に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2646に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2907に少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項83に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3594および4017から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項83に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、TCRB1と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2445および2446のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2642および2643のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2903および2904のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項86に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3590〜3591、4013、および4014から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項86に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、TCRB2と結合する、請求項12に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
−配列番号2447および2448のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2644および2645のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチド、または前記ポリペプチドのいずれかに含まれる任意の相補性決定領域(CDR)と、
−配列番号2905および2906のうちいずれか1つに少なくとも98%同一である配列を有するポリペプチドと、
から成る群から選択される、請求項89に記載の組換えポリヌクレオチド。 - 配列番号3353〜3364、3592〜3593、4015、および4016から成る群から選択される配列を有するポリペプチドをコードする、請求項89に記載の組換えポリヌクレオチド。
- 治療コントロールと共発現する請求項1記載の組換えポリヌクレオチドを有する組換え発現システムであって、
前記治療コントロールは、切断型上皮増殖因子受容体(tEGFR)、切断型切断型上皮増殖因子受容体viii(tEGFRviii)、切断型CD30(tCD30)、切断型BCMA(tBCMA)、切断型CD19(tCD19),CD34、チミジンキナーゼ、シトシンデアミナーゼ、ニトロレダクターゼ、キサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ、ヒトカスパーゼ8、ヒトカスパーゼ9、誘導型カスパーゼ9(icaspase9)、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、リナマラーゼ/リナマリングルコースオキシダーゼ、デオキシヌクレオシドキナーゼ、ホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)/インドール−3−酢酸(IAA)、γグルタミルシステインシンターゼ、CD20/αCD20、CD34/チミジンキナーゼキメラ、dox依存カスパーゼ2、変異チミジンキナーゼ(HSV−TKSR39)、AP1903/Fasシステム、キメラサイトカイン受容体(CCR)、選択マーカー、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、
組換え発現システム。 - 前記tEGFRおよびtEGFRviiiは、EGFR特異的siRNA、低分子化合物、抗EGFR抗体またはその断片、およびそれらの組み合わせのうち任意の1つ以上に結合する、請求項92に記載の組換え発現システム。
- 前記tCD30は、CD30特異的siRNA、低分子化合物、抗CD30抗体またはその断片、およびそれらの組み合わせのうち任意の1つ以上に結合する、請求項92に記載の組換え発現システム。
- 前記tCD19は、CD19特異的siRNA、低分子化合物、抗CD19抗体またはその断片、およびそれらの組み合わせのうち任意の1つ以上に結合する、請求項92に記載の組換え発現システム。
- 前記CD34は、CD34特異的siRNA、低分子化合物、抗CD34抗体またはその断片、およびそれらの組み合わせのうち任意の1つ以上に結合する、請求項92に記載の組換え発現システム。
- 前記選択マーカーは、ジヒドロキシ葉酸受容体、変異DHFR、メチル化DNAタンパク質システインメチルトランスフェラーゼ、イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼII(IMDHP2)、ピューロマイシンアセチルトランスフェラーゼ(PAC)、ブラスティシジン耐性遺伝子、変異カルシニューリンa/b(Can/b)、CNa12、CNb30、およびそれらの組み合わせのうち任意の1つ以上に結合する、請求項92に記載の組換え発現システム。
- 前記CCRは、(i)IL−7サイトカインリンカーIL7Ra、(ii)IL2Rβの細胞質ドメインのうち、IL−7Ra膜貫通ドメインのIL−RaIL−7サイトカインリンカー細胞外ドメイン、(iii)IL−7サイトカインリンカーIL2Rβ、および(iv)それらの組み合わせのうち任意の1つ以上を有する、請求項92に記載の組換え発現システム。
- アクセサリーモジュールと共に共発現する請求項1記載の組換えポリヌクレオチドを有する組換え発現システムであって、
前記アクセサリーモジュールは、41BBL、CD40L、K13、MC159、cFLIP−L/MRITα、cFLIP−p22、HTLV1 Tax、HTLV2 Tax、HTLV2 Tax2―RS変異体、FKBPx−K13、FKBPx−HTLV2−Tax、FKBPx−HTLV2−Tax―RS、IL6R−304−vHH−Alb8−vHH、IL12f、PD1−4H1 scFV、PD1−5C4 scFV、PD1−4H1−Alb8−vHH、PD1−5C4−Alb8−vHH、CTLA4イピリムマブscFV、CTLA4イピリムマブAlb8−vHH、IL6−19A−scFV、IL6−19A−scFV−Alb8−vHH、sHVEM、sHVEM−Alb8−vHH、hTERT、Fx06、CD3z、CD3z−GGGS−41BB、CD3−BBz、CD3−CD28z、CD3−CD28−Lck融合タンパク質、shRNA標的Brd4、キメラ抗原受容体(CAR)、hTERT、ヘパリナーゼ、CAR、阻害CAR、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、
組換え発現システム。 - 前記SIRをコードする前記組換えポリヌクレオチド、1つ以上の治療コントロール、および/または1つ以上のアクセサリーモジュールは、切断可能リンカーをコードするヌクレオチド配列によって結合される、請求項92または99に記載の組換え発現システム。
- 前記切断可能リンカーは、自己切断による切断可能リンカーである、請求項100に記載の組換え発現システム。
- 前記切断可能リンカーをコードするポリヌクレオチド配列の前には、フーリン切断部位、フーリン様切断部位、またはそれらの機能的等価物をコードするヌクレオチド配列が位置する、請求項101に記載の組換え発現システム。
- 前記切断可能リンカーをコードする前記ポリヌクレオチド配列の前には、任意に、可撓性リンカーをコードするヌクレオチド配列が位置する、請求項100に記載の組換え発現システム。
- 請求項1の組換えポリヌクレオチドを有する少なくとも1つのベクターであって、
DNAベクター、RNAベクター、プラスミド、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、レトロウイルスベクター、バキュロウイルスベクター、sleeping beautyトランスポゾンベクター、およびpiggybacトランスポゾンベクターから成る群から選択される、
ベクター。 - 前記ベクターのバックボーンは、配列番号870〜875および876から成る群から選択される配列を有する、請求項104に記載のベクター。
- EF−1プロモーター、CMV IE遺伝子プロモーター、EF−1aプロモーター、ユビキチンCプロモーター、MSCV LTRプロモーター、およびホスホグリセレートキナーゼ(PGK)プロモーターから選択されるプロモーターを有する、請求項104に記載のベクター。
- 前記EF−1プロモーターは、配列番号877の配列またはそれと80〜99%同一である配列を有する、請求項106に記載のベクター。
- 前記ベクターは、インビトロ転写ベクターであるか、またはポリ(A)テールまたは3’UTRを更に有するベクターである、請求項104に記載のベクター。
- 請求項1の少なくとも1つの組換えポリヌクレオチドによってコードされている少なくとも1つのポリペプチド。
- 請求項1記載の少なくとも1つの組換えポリヌクレオチドを発現する組換え細胞。
- 単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体であって、
(a)T細胞受容体(TCR)定常鎖であって、
(i)配列番号3010と少なくとも98%同一であり、48、61、91、92、93、および/または94の位置に1つ以上の変異を有し、任意のアクセサリーモジュールを有していてもよいアミノ酸配列と、
(ii)配列番号3024と少なくとも98%同一であり、18、22、57、79、133、136、および/または139の位置に1つ以上の変異を有し、任意のアクセサリーモジュールを有していてもよいアミノ酸配列と、
(iii)配列番号3025と少なくとも98%同一であり、18、22、57、79、133、136、および/または139の位置に1つ以上の変異を有し、任意のアクセサリーモジュールを有していてもよいアミノ酸配列と、
(iv)配列番号3046、3047、または3048と少なくとも98%同一であり、任意のアクセサリーモジュールを有していてもよいアミノ酸配列と、
(v)配列番号3049と少なくとも98%同一であり、任意のアクセサリーモジュールを有していてもよいアミノ酸配列と、
(vi)配列番号3051または3052と少なくとも98%同一であり、任意のアクセサリーモジュールを有していてもよいアミノ酸配列と、
(vii)(i)および(ii)、(i)および(iii)、(iv)および(ii)、(iv)および(iii)、(v)および(vi)から選択される2つのTCR定常鎖の二量体組み合わせと、
から成る群から選択されたアミノ酸配列を有するT細胞受容体定常鎖と、
(b)任意のリンカーと、
(c)(a)に結合された1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインであって、
(1)抗体と、
(2)抗体断片(例えば、Fv、Fab、(Fab’)2)と、
(3)抗体の重鎖可変領域(vHドメイン)またはその断片と、
(4)抗体の軽鎖可変領域(vLドメイン)またはその断片と、
(5)単鎖可変断片(scFv)またはその断片と、
(6)単一ドメイン抗体(SDAB)またはその断片と、
(7)ラクダ科動物由来VHHドメインまたはその断片と、
(8)抗体の単量体可変領域と、
(9)DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、オボディーズ、リピボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質、またはそれらの断片等の、非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドと、
(10)受容体またはその断片と、
(11)リガンドまたはその断片と、
(12)二重特異性の抗体、二重特異性の抗体断片、二重特異性のscFV、二重特異性のvHH、二重特異性のSDAB、二重特異性の非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、二重特異性の受容体、または二重特異性のリガンドと、
(13)自己抗原またはその断片と、
から成る群から選択される非天然TCR抗原結合ドメインとを含み、
(a)(i)〜(a)(iii)の変異体は、抗原結合ドメインの標的抗原に多様な結合親和性を有し、前記合成免疫受容体は、リンパ球で発現した場合に、リンパ球の表面上の1つ以上の連続鎖で、前記抗原結合ドメインおよび前記T細胞受容体定常鎖の両方を発現し、前記発現した抗原結合ドメインがその抗原に結合した際に、サイトカインを活性化、増殖、および分泌するようにトリガーされ、および/または前記標的細胞の死滅を調整(誘発または抑制)し、MHC拘束性およびMHC非拘束性の抗体タイプ特異性を有する、
単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - (a)(vii)のTCR定常鎖を有し、前記非天然TCR結合ドメインは、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の重鎖および軽鎖またはその断片の可変領域であって、発現した場合に、前記抗体の重鎖および軽鎖またはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗体の重鎖および軽鎖またはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、可変領域と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの単鎖可変断片(scFv)であって、発現した場合に、前記scFvの1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記scFvのもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、単鎖可変断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの抗体断片であって、発現した場合に、前記抗体断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗体断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、抗体断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの単一ドメイン抗体(SDAB)断片であって、発現した場合に、前記SDAB断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記SDAB断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、単一ドメイン抗体断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つのラクダ科動物由来vHHドメインであって、発現した場合に、前記vHHドメインの1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記vHHドメインのもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、vHHドメインと、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドであって、発現した場合に、前記非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドの1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドドメインのもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドと、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの受容体またはその断片であって、発現した場合に、前記受容体またはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記受容体またはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、受容体またはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つのリガンドまたはその断片であって、発現した場合に、前記リガンドまたはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記リガンドまたはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、受容体またはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な2つの構造的に異なる抗原結合断片であって、発現した場合に、前記抗原結合断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗原結合断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、構造的に異なる抗原結合断片と、
−2つの結合断片であって、そのいずれかまたは両方が二重特異性または多重特異性であり、発現した場合に、前記抗原結合断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記抗原結合断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、結合断片と、
−2つの自己抗原またはその断片であって、発現した場合に、前記自己抗原またはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記自己抗原またはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、受容体またはその断片と、
−2つのvLまたはその断片であって、発現した場合に、前記vLまたはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記vLまたはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、受容体またはその断片と、
−2つのvHまたはその断片であって、発現した場合に、前記vHまたはその断片の1つは、前記T細胞定常領域の(a)(vii)の前記2つの鎖のうちの一つに付いており、前記vHまたはその断片のもう1つは、前記T細胞定常領域の前記2つの鎖のうちのもう一つに付いている、受容体またはその断片と、
から成る群から選択される、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - (a)(iv)のTCR定常鎖を有しており、前記非天然TCR結合ドメインは、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の重鎖(vH)の可変領域またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の軽鎖(vL)の可変領域またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的な単鎖可変断片(scFv)またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体断片(例えば、Fv、Fab、(Fab’)2)と、
−所定の標的抗原に特異的な単一ドメイン(SDAB)断片と、
−所定の標的抗原に特異的なラクダ科動物由来vHHドメインと、
−所定の標的抗原に特異的な非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドと、
−所定の標的抗原に特異的な受容体またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的なリガンドまたはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な、二重特異性の抗体、二重特異性の抗体断片、二重特異性のscFV、二重特異性のvHH、二重特異性のSDAB、二重特異性の非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、二重特異性の受容体、または二重特異性のリガンドと、
−自己抗原またはその断片と、
から成る群から選択される、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - (i)、(ii)、(iii)、(iv)、(v)、または(vi)のTCR定常ドメインを有しており、前記非天然TCR結合ドメインは、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の重鎖(vH)の可変領域と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体の軽鎖(vL)の可変領域と、
−所定の標的抗原に特異的な単鎖可変断片(scFv)と、
−所定の標的抗原に特異的な抗体断片(例えば、Fv、Fab、(Fab’)2)と、
−所定の標的抗原に特異的な単一ドメイン(SDAB)断片と、
−所定の標的抗原に特異的なラクダ科動物由来vHHドメインと、
−所定の標的抗原に特異的な非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドと、
−所定の標的抗原に特異的な受容体またはその断片と、
−所定の標的抗原に特異的なリガンドまたはその断片と、
−1つ以上の所定の標的抗原に特異的な、二重特異性の抗体、二重特異性の抗体断片、二重特異性のscFV、二重特異性のvHH、二重特異性のSDAB、二重特異性の非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、二重特異性の受容体、または二重特異性のリガンドと、
−自己抗原またはその断片と、
から成る群から選択される、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - 前記TCR定常鎖(複数も可)は、TCR定常鎖の発現および/または対形成を促進する変異であって、内因性T細胞受容体鎖との対形成を減少させる変異を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記TCRの定常領域は、配列番号3010〜3023から成る群から選択される配列、または配列番号3010〜3023から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体α鎖(Cα)である、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記TCRの定常領域は、配列番号3024〜3044から成る群から選択される配列、または配列番号3024〜3044から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体β鎖(Cβ)である、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記TCRの定常領域は、配列番号3049〜3050から成る群から選択される配列、または配列番号3049〜3050から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体γ鎖(Cγ)である、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記TCRの定常領域は、配列番号3051〜3052から成る群から選択される配列、または配列番号3051〜3052から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するTCR受容体δ鎖(Cδ)である、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記TCRの定常領域は、配列番号3046〜3048から成る群から選択される配列、または配列番号3046〜3048から成る群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも98%同一の配列に対して1〜40のアミノ酸置換体または変異体を含むアミノ酸配列を有するプレTCR受容体α鎖(前Cα)である、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 1つ以上の疾患関連抗原に結合する前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD19;CD123;CD22;CD30;CD171;CS−1(CD2サブセット1、CRACC、SLAMF7、CD319、および19A24とも呼ばれる);C型レクチン様分子1(CLL−1またはCLECL1);CD33;上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRviii);ガングリオシドG2(GD2);ガングリオシドGD3(aNeu5Ac(2−8)aNeu5Ac(2−3)bDGalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA);Tn抗原((Tn Ag)または(GalNAcα―Ser/Thr);前立腺特異的膜抗原(PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1);FMS様チロシンキナーゼ3(FLT3);腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72);CD38;CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化CD43エピトープ、非造血器癌で発現するグリコシル化CD43エピトープ;癌胎児性抗原(CEA);上皮細胞接着分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);インターロイキン13受容体サブユニットアルファ2(IL−13Ra2またはCD213A2);メソテリン;インターロイキン11受容体α(IL−11Ra);前立腺幹細胞抗原(PSCA);プロテアーゼセリン21(テスティシンまたはPRSS21);血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2);ルイス(Y)抗原;CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR―β);ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4);CD20;葉酸受容体α;受容体チロシンプロテインキナーゼERBB2(Her2/neu);ムチン1、細胞表面関連(MUC1);上皮細胞増殖因子受容体(EGFR);神経細胞接着分子(NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性フォスファターゼ(PAP);伸長因子2変異(ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質α(FAP);インスリン様増殖因子1受容体(IGF−1受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX);プロテアソーム(プロソーム、マクロパイン)サブユニット、β型9(LMP2);糖タンパク質100(gp100);易切断領域(BCR)およびアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ1(Ab1)(bcr−ab1)から成る癌遺伝子融合タンパク質;チロシナーゼ;エフリン型A受容体2(EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子(sLe);ガングリオシドGM3(aNeu5Ac(2−3)bClalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);トランスグルタミナーゼ5(TGS5);高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA);O−アセチル―GD2ガングリオシド(OAcGD2);葉酸受容体β;腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248);腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R);クローディン6(CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR);Gタンパク質共役受容体クラスCグループ5メンバーD(GPRC5D);染色体Xオープンリーディングフレーム61(CXORF61);CD97;CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ(ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的1(PLAC1);グロボHグリコセラミドの六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY−BR−1);ウロプラキン2(UPK2);A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1);アドレナリン受容体β3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3);Gタンパク質共役受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6コンプレックス遺伝子座K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2);TCRγ代替リーディングフレームタンパク質(TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1);癌/精巣抗原1(NY−ES0−1);癌/精巣抗原2(LAGE−1a);黒色腫関連抗原1(MAGE−A1);染色体12pに位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6−AML);精子タンパク質17(SPA17);X抗原ファミリーメンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体2(Tie2);黒色腫癌精巣抗原1(MAD−CT−1);黒色腫癌精巣抗原2(MAD−CT−2);Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質p53(p53);p53変異体;プロステイン;サバイビン;テロメラーゼ;前立腺癌腫抗原1(PCT A−1またはガレクチン8)、T細胞によって認識される黒色腫抗原1(MelanAまたはMARTI);ラット肉腫(Ras)変異体;ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座切断点;アポトーシスの黒色腫阻害物質(ML−IAP);ERG(膜貫通型プロテアーゼ、セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子);NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV(NA17);ペアードボックスタンパク質Pax−3(PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリンB1;v−myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性癌遺伝子の神経芽細胞腫由来のホモログ(MYCN);RasホモログファミリーメンバーC(RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP−2);チトクロームP4501B1(CYP1B1);CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様(BORISすなわちBrother of the Regulator of Imprinted Sites)、T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3(SART3);ペアードボックスタンパク質Pax−5(PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32(OY−TES1);リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK);Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP−4);滑膜肉腫、X切断点2(SSX2);糖化最終産物の受容体(RAGE−1);腎臓ユビキタス1(RU1);腎臓ユビキタス2(RU2);レグマイン;ヒト乳頭腫ウイルスE6(HPV E6);ヒト乳頭腫ウイルスE7(HPV E7);腸由来カルボキシルエステラーゼ;熱ショックタンパク質70−2変異体(mut hsp 70−2);CD79a;CD79b;CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1):IgA受容体のFc断片(FCARまたはCD89);白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2);CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF);C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A);骨髄間質細胞抗原2(BST2);EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2);リンパ球抗原75(LY75);グリピカン3(GPC3);Fc受容体様5(FCRL5);および免疫グロブリンλ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、ビオチン、c−MYCエピトープタグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原)フコシルGM1、PTK7、gpNMB、CDH1−CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b−IGL11、ALK TCRγδ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、Tn ag、CSPG4−HMW−MAA、Timl−/HVCR1、CSF2RA(GM−CSFRα)、TGFβR2、VEGFR2/KDR、ルイスAg、TCRβ鎖、TCRβ2鎖、TCRγ鎖、TCRδ鎖、FITC、黄体化ホルモン受容体(LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性性腺刺激ホルモン受容体(CGHR)、CCR4、GD3、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1−Tax、CMVpp65、EBV−EBNA3c、インフルエンザAヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、KSHV−K8.1タンパク質、KSHV−gHタンパク質、デスモグレイン3(Dsg3)に対する自己抗体、デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体、HLA、HLA―A、HLA―A2、HLA―B、HLA―C、HLA―DP、HLA−DM、HLA−DOA、HLA−DOB,HLA―DQ、HLA―DR、HLA―G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、クローディン18.2(CLD18A2またはCLDN18A.2)、P糖タンパク質、STEAP1、LIV1、NECTIN−4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素イオンチャネル、およびTNT抗体によって認識される抗原から成る群から選択される、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、抗体、抗体断片、scFv、Fv、Fab、(Fab’)2、単一ドメイン抗体(SDAB)、vHまたはvLドメイン、ラクダ科動物由来vHHドメイン、非免疫グロブリン抗原結合スカフォールド、例えば、DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、オボディーズ、リピボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質、受容体、またはリガンドを有する、請求項121に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
(i)配列番号2506〜2680または12160〜12278のいずれかに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする重鎖可変領域(vH)と、
(ii)配列番号2307〜2482または12042〜12159のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする軽鎖可変領域(vL)と、
(iii)配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする単鎖可変断片(scFv)と、
(iv)配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードするラクダ科動物VHHと、
(v)配列番号439〜443のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列によりコードされ、同種に結合するポリペプチドをコードする非免疫グロブリンスカフォールドと、
(vi)配列番号2736〜2748のうちいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、抗原に結合するポリペプチドをコードする受容体と、
(vii)配列番号2758〜2768または12359〜12361のうちのいずれか1つに記載の配列またはそれに少なくとも98%同一の配列を有し、同種に結合するポリペプチドをコードするリガンドと、
から成る群から選択される、請求項121に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号13999〜14879または14880のいずれかに記載の、選択標的抗原のための1つ以上の軽鎖相補性決定領域、および/または配列番号14881〜15761または15762のいずれかに記載の、選択標的抗原のための1つ以上の重鎖相補性決定領域を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2307〜2482または12042〜12159のうちいずれか1つの配列を含む可変軽鎖(vL)ドメイン、および/または10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2506〜2680または12160〜12278のうちいずれか1つの配列を含む可変重鎖(vH)ドメインを有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のいずれかに記載の、選択された抗原のための1つ以上のラクダ科動物vHH相補性決定領域を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2728〜2732または12296〜12301のいずれかに記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を含む非免疫グロブリン抗原結合ドメインを有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、配列番号2307〜2482または12042〜12159のうちのいずれか1つの配列を有する可変軽鎖(vL)ドメインのうち1つ以上の軽鎖相補性決定領域と、配列番号2506〜2680または12160〜12278のうちのいずれか1つの配列を有する可変重鎖(vH)ドメインのうち1つ以上の重鎖相補性決定領域とを含むscFvドメインを有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、各々10までの保存アミノ酸置換体を有する、配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224から成る群から選択される配列を含むscFv断片を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る1つ以上の受容体を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、10までの保存アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361のうちいずれかの配列を含む1つ以上のリガンドを有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、CD16A、NKG2D、CD4、PD1、デスモグレイン3(Dsg3)、またはCD4−DC−SIGNの細胞外ドメインを有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、hTPO、mTPO、CGHα鎖、CGHβ鎖、FHβ鎖、TSHβ鎖、APRIL、またはそれらの組み合わせのうち1つ以上の細胞外ドメインを有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれかの配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)と、
a)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか記載のラクダ科動物vHH、または
b)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、または
c)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、または
d)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインと、
を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、
10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2701〜2725または12279〜12294のうちいずれか記載のラクダ科動物vHHと、
a)配列番号2770〜2939、12303〜12357、または18162〜18224のうちいずれかの配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有する任意の単鎖可変断片(scFv)、または
b)配列番号2728〜2732または12296〜12301のうちいずれか記載の配列を有し、10までの保存的アミノ酸置換体を有している任意の非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、または
c)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2736〜2748のうちいずれかのアミノ酸配列から成る受容体の任意の細胞外ドメイン、または
d)10までの保存的アミノ酸置換体を有し、配列番号2758〜2768または12359〜12361の任意の配列を有するリガンドの任意の細胞外ドメインと、
を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、リンカー領域により前記TCR定常領域の各々に任意に接続されており、前記リンカー領域の核酸は、配列番号2981〜3003およびそれらの任意の組み合わせから成る群から選択されるアミノ酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列をコードするか、あるいは前記リンカーは、配列番号701〜725から成る群から選択される核酸配列またはそれと少なくとも98%同一である配列によってコードされている、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記1つ以上の非天然TCR抗原結合ドメインは、それを取得した抗体よりも少なくとも5倍少ない標的抗原への結合親和性を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記SIRをコードするポリヌクレオチドは、各鎖のN末端に存在し配列番号1〜9および10から成る群から選択される配列を有するリーダー配列またはシグナルペプチドを更に有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記SIRはSIRヘテロ二量体を有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記ポリペプチドは、切断可能リンカーによって結合される2つのSIRを有する、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーは、自己切断による切断可能リンカーである、請求項140に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーは、2Aリンカー、2A様リンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である、請求項140に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーは、T2Aリンカー、P2A、F2A、E2Aリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち任意の1つ以上である、請求項140に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーは、配列番号780〜785のうち任意の1つ以上の配列を有する、請求項140に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーの前には、任意に、フーリン切断部位、フーリン様切断部位、またはそれらの機能的等価物が位置する、請求項140に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーに先行する前記フーリン切断部位は、配列番号788〜790のうち任意の1つ以上の配列を有する、請求項145に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーの前には可撓性リンカーが位置する、請求項140〜146のいずれか一項に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーに先行する前記可撓性リンカーは、Ser−Glyリンカー、Ser−Gly−Ser−Glyリンカー、またはそれらの機能的等価物のうち1つ以上をコードする、請求項147に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記切断可能リンカーに先行する前記可撓性リンカーは、配列番号786〜787の配列を有する、請求項147に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 順番が、フーリン切断部位、可撓性リンカー、切断可能リンカーとなるよう、前記フーリン切断部位の後ろに前記可撓性リンカーが位置し、その後ろに前記切断可能リンカーが位置する、請求項147に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 前記SIRは、選択抗原のために、多様な結合親和性を有するように設計される、請求項111に記載の単離された合成免疫受容体(SIR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
- 請求項111記載の少なくとも1つのポリペプチドまたはヘテロ二量体を有する免疫エフェクター細胞または幹細胞。
- 請求項1記載の少なくとも1つの組換えポリヌクレオチドを有する免疫エフェクター細胞または幹細胞。
- 請求項104記載の少なくとも1つのベクターを有する免疫エフェクター細胞または幹細胞。
- 複数のSIRポリペプチドを有する、請求項152〜154のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞または幹細胞。
- 前記複数のSIRポリペプチドのうち少なくとも1つのSIRポリペプチドは、少なくとも1つの他のSIRポリペプチドとは異なる抗原を標的にする、請求項155に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記複数のSIRポリペプチドのうち少なくとも1つのSIRポリペプチドは、同じ抗原を標的にする、請求項155に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記複数のSIRポリペプチドのうち少なくとも1つのSIRポリペプチドは、少なくとも1つの他のSIRポリペプチドとは異なる抗原への結合親和性を有する、請求項157に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記免疫細胞は、少なくとも1つのキメラ抗原受容体(CAR)ポリペプチドを更に有する、請求項152〜154のいずれか一項に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記SIRポリペプチドの抗原結合ドメインは、前記CARポリペプチドの抗原結合ドメインとは異なる抗原を標的にする、請求項159に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記CARポリペプチドは、共刺激シグナル伝達ドメインを含むが第一シグナル伝達ドメインは含まない細胞内シグナル伝達ドメインを有するか、あるいは第一シグナル伝達ドメインは含むが共刺激シグナル伝達ドメインは含まない細胞内シグナル伝達ドメインを有する、請求項159に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記CARポリペプチドは、4−1BB、CD28、CD27、またはOX−40から成る群から選択されたタンパク質の機能性シグナル伝達ドメインを含む共刺激シグナル伝達ドメインを有するか、あるいは前記CARポリペプチドは、CD3ζの機能性シグナル伝達ドメインを含む第一シグナル伝達ドメインを有する、請求項161に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記CARポリペプチドは抑制CARポリペプチドであり、前記抑制CARポリペプチドは、抑制分子の抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内ドメインを有し、前記抑制分子は、PD1、PD−L1、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、TGFRβ、CEACAM−1、CEACAM−3、およびCEACAM−5から成る群から選択される、請求項159に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記CARポリペプチドは、第一シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインおよび/または細胞内シグナル伝達ドメインを更に有し、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの機能ドメインを含む第一シグナル伝達ドメインと、4−1BBおよび/またはCD28の機能ドメインを含む共刺激シグナル伝達ドメインを有する、請求項159に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記CARポリペプチドは、配列番号3077〜配列番号3083のアミノ酸配列を有する、請求項159に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 前記免疫エフェクター細胞は、任意に、免疫エフェクター細胞を発生可能なヒトT細胞、ヒトNKT細胞、または合成T細胞、あるいは幹細胞であり、前記T細胞は、ジアシルグリセロールキナーゼ(DGK)および/またはイカロス欠損および/またはBrd4欠損である、請求項152〜154のいずれか一項に記載の免疫細胞または幹細胞。
- 請求項152記載の免疫細胞またはエフェクター細胞の母集団であって、複数の異なるSIRポリペプチドを有する、免疫細胞またはエフェクター細胞の母集団。
- 前記複数の異なるSIRポリペプチドは、異なる配列を有するが同じ標的抗原に結合する、請求項167に記載の免疫細胞またはエフェクター細胞の母集団。
- 前記細胞の母集団は、特定の病型に存在する異なる抗原を標的とするSIRポリペプチドを有する、請求項167に記載の免疫細胞またはエフェクター細胞の母集団。
- SIR発現免疫エフェクター細胞を作製する方法であって、前記SIRポリペプチドが発現する条件下で、免疫エフェクター細胞、あるいは免疫エフェクター細胞を発生可能な造血器幹細胞または前駆細胞へ、請求項104記載の少なくとも1つのベクターまたは請求項1記載の少なくとも1つの組換えポリヌクレオチドを導入する工程を含む、方法。
- a)免疫エフェクター細胞の母集団を提供する工程と、
b)前記母集団から制限T細胞を除去する工程であって、それにより制限T枯渇細胞を提供する工程と、
を更に有し、
工程a)およびb)は、前記ベクターまたは前記SIRをコードする組み換えポリヌクレオチドを前記母集団に導入する前に実行される、
請求項170に記載の方法。 - 前記制限T細胞は、抗CD25抗体または抗GITR抗体を用いて、前記細胞母集団から除去される、請求項171に記載の方法。
- a)免疫エフェクター細胞の母集団を提供する工程と、
b)前記母集団からP−糖タンパク質(P−gpまたはPgp、MDR1、ABCB1、CD243)陽性細胞を濃縮する工程であって、それによりP−糖タンパク質(P−gpまたはPgp、MDR1、ABCB1、CD243)濃縮細胞の母集団を提供する工程と、
を更に有し、
工程a)およびb)は、前記ベクターまたは前記SIRをコードする組み換えポリヌクレオチドを導入する前または後に実行される、請求項170に記載の方法。 - P−糖タンパク質陽性細胞は、
i)P−糖タンパク質に特異的な工程のカクテルの1つ以上を用いる免疫選別と、
ii)P−糖タンパク質がポンプとして活性であると言う条件下で、P−糖タンパク質の基質である蛍光染料の1つ以上、テトラメチルローダミンメチルエステル(TMRM)、アドリアマイシン、およびアクチノマイシンDを用いて染色し、前記染料で染色されにくい細胞を濃縮することと、
iii)P−糖タンパク質の基質である光毒性化合物、例えば、TH9402、2−(4,5−ジブロモ−6−アミノ−3−イミノ−3H−キサンテン−9−イル)安息香酸メチルエステル塩酸塩、2−(4,5−ジブロモ−6−アミノ−3−イミノ−3H−キサンテン−9−イル)安息香酸エチルエステル塩酸塩、2−(4,5−ジブロモ−6−アミノ−3−イミノ−3H−キサンテン−9−イル)安息香酸オクチルエステル塩酸塩、2−(4,5−ジブロモ−6−アミノ−3−イミノ−3H−キサンテン−9−イル)安息香酸n−ブチルエステル塩酸塩、2−(6−エチルアミノ−3−エチルイミノ−3H−キサンテン−9−イル)安息香酸n−ブチルエステル塩酸塩、またはその誘導体、またはそれらの組み合わせの任意の1つ以上に耐性な細胞の選別と、
iv)P−糖タンパク質の基質である細胞毒性化合物、例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、タキソール、パクリタキセル、ミトキサントロン、エトポシド、アドリアマイシン、ダウノルビシン、およびアクチノマイシンDに対する耐性の細胞の選別と、
から成る群から選択される方法の任意の1つ以上を用いて濃縮される、請求項173に記載の方法。 - RNA組換え細胞の母集団を発生させる方法であって、
インビトロ転写RNA(複数も可)または合成RNA(複数も可)を細胞または細胞の母集団に導入する工程を有し、前記RNA(複数も可)は請求項1記載の組換えポリヌクレオチド(複数も可)を有する、
方法。 - 被験者に抗病性免疫を提供する方法であって、
請求項152〜154のいずれか一項記載の免疫エフェクター細胞を発生可能な有効量の免疫エフェクター細胞または幹細胞を前記被験者に投与する工程を有し、前記細胞は、免疫エフェクター細胞を発生可能な自己T細胞、同種T細胞、自己NKT細胞、同種NKT細胞、自己または同種造血器幹細胞、または自己または同種iPSCである
方法。 - 前記同種T細胞、あるいは同種NKT細胞または造血器幹細胞またはiPSCは、機能性TCRまたは機能性HLAの発現を欠如している、あるいは斯かる発現が少ない、請求項176に記載の方法。
- 病気関連抗原の発現に関連した病気を有する被験者の治療において、あるいは病気関連抗原の発現に関連した病気のリスクが増大している被験者の病気の予防において、免疫エフェクター細胞の効果を増大させる作用物質と併用して使用されるための、1つ以上の合成免疫受容体(SIR)を有する免疫エフェクター細胞を発生可能な免疫エフェクター細胞または幹細胞を有する組成物であって、
(i)前記SIR分子は、病気関連抗原に結合する1つ以上の抗原結合ドメインに任意のリンカーを通して結合する1つ以上のT細胞受容体定常鎖を有しており、前記病気関連抗原は、CD5、CD19;CD123;CD22;CD30;CD171;CS−1(CD2サブセット1、CRACC、SLAMF7、CD319、および19A24とも呼ばれる);C型レクチン様分子1(CLL−1またはCLECL1);CD33;上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRviii);ガングリオシドG2(GD2);ガングリオシドGD3(aNeu5Ac(2−8)aNeu5Ac(2−3)bDGalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA);Tn抗原((Tn Ag)または(GalNAcα―Ser/Thr);前立腺特異的膜抗原(PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1);FMS様チロシンキナーゼ3(FLT3);腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72);CD38;CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化CD43エピトープ、非造血器癌で発現するグリコシル化CD43エピトープ;癌胎児性抗原(CEA);上皮細胞接着分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);インターロイキン13受容体サブユニットアルファ2(IL−13Ra2またはCD213A2);メソテリン;インターロイキン11受容体α(IL−11Ra);前立腺幹細胞抗原(PSCA);プロテアーゼセリン21(テスティシンまたはPRSS21);血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2);ルイス(Y)抗原;CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR―β);ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4);CD20;葉酸受容体α;受容体チロシンプロテインキナーゼERBB2(Her2/neu);ムチン1、細胞表面関連(MUC1);上皮細胞増殖因子受容体(EGFR);神経細胞接着分子(NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性フォスファターゼ(PAP);伸長因子2変異(ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質α(FAP);インスリン様増殖因子1受容体(IGF−1受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX);プロテアソーム(プロソーム、マクロパイン)サブユニット、β型9(LMP2);糖タンパク質100(gp100);易切断領域(BCR)およびアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ1(Ab1)(bcr−ab1)から成る癌遺伝子融合タンパク質;チロシナーゼ;エフリン型A受容体2(EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子(sLe);ガングリオシドGM3(aNeu5Ac(2−3)bClalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);トランスグルタミナーゼ5(TGS5);高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA);O−アセチル―GD2ガングリオシド(OAcGD2);腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248);腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R);クローディン6(CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR);Gタンパク質共役受容体クラスCグループ5メンバーD(GPRC5D);染色体Xオープンリーディングフレーム61(CXORF61);CD97;CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ(ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的1(PLAC1);グロボHグリコセラミドの六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY−BR−1);ウロプラキン2(UPK2);A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1);アドレナリン受容体β3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3);Gタンパク質共役受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6コンプレックス遺伝子座K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2);TCRγ代替リーディングフレームタンパク質(TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1);癌/精巣抗原1(NY−ES0−1);癌/精巣抗原2(LAGE−1a);黒色腫関連抗原1(MAGE−A1);染色体12pに位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6−AML);精子タンパク質17(SPA17);X抗原ファミリーメンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体2(Tie2);黒色腫癌精巣抗原1(MAD−CT−1);黒色腫癌精巣抗原2(MAD−CT−2);Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質p53(p53);p53変異体;プロステイン;サバイビン;テロメラーゼ;前立腺癌腫抗原1(PCT A−1またはガレクチン8)、T細胞によって認識される黒色腫抗原1(MelanAまたはMARTI);ラット肉腫(Ras)変異体;ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座切断点;アポトーシスの黒色腫阻害物質(ML−IAP);ERG(膜貫通型プロテアーゼ、セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子);NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV(NA17);ペアードボックスタンパク質Pax−3(PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリンB1;v−myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性癌遺伝子の神経芽細胞腫由来のホモログ(MYCN);RasホモログファミリーメンバーC(RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP−2);チトクロームP4501B1(CYP1B1);CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様(BORISすなわちBrother of the Regulator of Imprinted Sites)、T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3(SART3);ペアードボックスタンパク質Pax−5(PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32(OY−TES1);リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK);Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP−4);滑膜肉腫、X切断点2(SSX2);糖化最終産物の受容体(RAGE−1);腎臓ユビキタス1(RU1);腎臓ユビキタス2(RU2);レグマイン;ヒト乳頭腫ウイルスE6(HPV E6);ヒト乳頭腫ウイルスE7(HPV E7);腸由来カルボキシルエステラーゼ;熱ショックタンパク質70−2変異体(mut hsp 70−2);CD79a;CD79b;CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1):IgA受容体のFc断片(FCARまたはCD89);白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2);CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF);C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A);骨髄間質細胞抗原2(BST2);EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2);リンパ球抗原75(LY75);グリピカン3(GPC3);Fc受容体様5(FCRL5);および免疫グロブリンλ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、ビオチン、c−MYCエピトープタグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原)フコシルGM1、PTK7、gpNMB、CDH1−CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b−IGL11、ALK TCRγδ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、CSPG4−HMW−MAA、Timl−/HVCR1、CSF2RA(GM−CSFRα)、TGFβR2、VEGFR2/KDR、ルイスAg、TCRβ鎖、TCRβ2鎖、TCRγ鎖、TCRδ鎖、FITC、黄体化ホルモン受容体(LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性性腺刺激ホルモン受容体(CGHR)、CCR4、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1−Tax、CMVpp65、EBV−EBNA3c、インフルエンザAヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、KSHV−K8.1タンパク質、KSHV−gHタンパク質、デスモグレイン3(Dsg3)に対する自己抗体、デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体、HLA、HLA―A、HLA―A2、HLA―B、HLA―C、HLA―DP、
HLA−DM、HLA−DOA、HLA−DOB,HLA―DQ、HLA―DR、HLA―G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、クローディン18.2(CLD18A2またはCLDN18A.2)、P糖タンパク質、STEAP1、LIV1、NECTIN−4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素イオンチャネル、およびTNT抗体によって認識される抗原から成る群から選択され、
(ii)前記免疫細胞の効果を増大させるための作用物質が、
−プロテインホスファターゼ阻害剤と、
−キナーゼ阻害剤(例えば、P13K/AKT阻害剤、mTOR阻害剤、LCK阻害剤、またはBTK阻害剤)と、
−サイトカインと、
−免疫抑制分子の阻害剤と、
−TREG細胞のレベルまたは活性を減少させる作用物質と、
−SIR修飾細胞の増殖および維持を増大させる作用物質と、
−ケモカインと、
−SIRの発現を増大させる作用物質と、
−SIRの発現または活性の調整を可能にする作用物質と、
−SIR修飾細胞の生存および/または維持の制御を可能にする作用物質と、
−SIR修飾細胞の副作用を制御する作用物質と、
−Brd4阻害剤と、
−病気の部位へ治療薬(例えばsHVEM)または予防薬を送達する作用物質と、
−SIRが標的とする抗原の発現を増大させる作用物質と、
−アデノシンA2a受容体アンタゴニストと、
の1つ以上から選択される
組成物。 - 被験者における病気関連抗原の発現に関連する病気を治療または予防する方法であって、
免疫細胞の効果を増大させる作用物質との併用で、合成免疫受容体(SIR)分子を有する有効量の免疫エフェクター細胞を前記被験者へ投与する工程を有し、
(i)前記SIR分子は、病気関連抗原に結合する1つ以上の抗原結合ドメインに任意のリンカーを通して結合する1つ以上のT細胞受容体定常鎖を有しており、前記病気関連抗原は、CD5、CD19;CD123;CD22;CD30;CD171;CS−1(CD2サブセット1、CRACC、SLAMF7、CD319、および19A24とも呼ばれる);C型レクチン様分子1(CLL−1またはCLECL1);CD33;上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRviii);ガングリオシドG2(GD2);ガングリオシドGD3(aNeu5Ac(2−8)aNeu5Ac(2−3)bDGalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA);Tn抗原((Tn Ag)または(GalNAcα―Ser/Thr);前立腺特異的膜抗原(PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1);FMS様チロシンキナーゼ3(FLT3);腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72);CD38;CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化CD43エピトープ、非造血器癌で発現するグリコシル化CD43エピトープ;癌胎児性抗原(CEA);上皮細胞接着分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);インターロイキン13受容体サブユニットアルファ2(IL−13Ra2またはCD213A2);メソテリン;インターロイキン11受容体α(IL−11Ra);前立腺幹細胞抗原(PSCA);プロテアーゼセリン21(テスティシンまたはPRSS21);血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2);ルイス(Y)抗原;CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR―β);ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4);CD20;葉酸受容体α;受容体チロシンプロテインキナーゼERBB2(Her2/neu);ムチン1、細胞表面関連(MUC1);上皮細胞増殖因子受容体(EGFR);神経細胞接着分子(NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性フォスファターゼ(PAP);伸長因子2変異(ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質α(FAP);インスリン様増殖因子1受容体(IGF−1受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX);プロテアソーム(プロソーム、マクロパイン)サブユニット、β型9(LMP2);糖タンパク質100(gp100);易切断領域(BCR)およびアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ1(Ab1)(bcr−ab1)から成る癌遺伝子融合タンパク質;チロシナーゼ;エフリン型A受容体2(EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子(sLe);ガングリオシドGM3(aNeu5Ac(2−3)bClalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);トランスグルタミナーゼ5(TGS5);高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA);O−アセチル―GD2ガングリオシド(OAcGD2);葉酸受容体β;腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248);腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R);クローディン6(CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR);Gタンパク質共役受容体クラスCグループ5メンバーD(GPRC5D);染色体Xオープンリーディングフレーム61(CXORF61);CD97;CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ(ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的1(PLAC1);グロボHグリコセラミドの六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY−BR−1);ウロプラキン2(UPK2);A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1);アドレナリン受容体β3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3);Gタンパク質共役受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6コンプレックス遺伝子座K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2);TCRγ代替リーディングフレームタンパク質(TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1);癌/精巣抗原1(NY−ES0−1);癌/精巣抗原2(LAGE−1a);黒色腫関連抗原1(MAGE−A1);染色体12pに位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6−AML);精子タンパク質17(SPA17);X抗原ファミリーメンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体2(Tie2);黒色腫癌精巣抗原1(MAD−CT−1);黒色腫癌精巣抗原2(MAD−CT−2);Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質p53(p53);p53変異体;プロステイン;サバイビン;テロメラーゼ;前立腺癌腫抗原1(PCT A−1またはガレクチン8)、T細胞によって認識される黒色腫抗原1(MelanAまたはMARTI);ラット肉腫(Ras)変異体;ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座切断点;アポトーシスの黒色腫阻害物質(ML−IAP);ERG(膜貫通型プロテアーゼ、セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子);NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV(NA17);ペアードボックスタンパク質Pax−3(PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリンB1;v−myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性癌遺伝子の神経芽細胞腫由来のホモログ(MYCN);RasホモログファミリーメンバーC(RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP−2);チトクロームP4501B1(CYP1B1);CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様(BORISすなわちBrother of the Regulator of Imprinted Sites)、T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3(SART3);ペアードボックスタンパク質Pax−5(PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32(OY−TES1);リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK);Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP−4);滑膜肉腫、X切断点2(SSX2);糖化最終産物の受容体(RAGE−1);腎臓ユビキタス1(RU1);腎臓ユビキタス2(RU2);レグマイン;ヒト乳頭腫ウイルスE6(HPV E6);ヒト乳頭腫ウイルスE7(HPV E7);腸由来カルボキシルエステラーゼ;熱ショックタンパク質70−2変異体(mut hsp 70−2);CD79a;CD79b;CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1):IgA受容体のFc断片(FCARまたはCD89);白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2);CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF);C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A);骨髄間質細胞抗原2(BST2);EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2);リンパ球抗原75(LY75);グリピカン3(GPC3);Fc受容体様5(FCRL5);および免疫グロブリンλ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、ビオチン、c−MYCエピトープタグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原)フコシルGM1、PTK7、gpNMB、CDH1−CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b−IGL11、ALK TCRγδ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、CSPG4−HMW−MAA、Timl−/HVCR1、CSF2RA(GM−CSFRα)、TGFβR2、VEGFR2/KDR、ルイスAg、TCRβ鎖、TCRβ2鎖、TCRγ鎖、TCRδ鎖、FITC、黄体化ホルモン受容体(LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性性腺刺激ホルモン受容体(CGHR)、CCR4、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1−Tax、CMVpp65、EBV−EBNA3c、インフルエンザAヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、KSHV−K8.1タンパク質、KSHV−gHタンパク質、デスモグレイン3(Dsg3)に対する自己抗体、デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体、HLA、HLA―A、HLA―A2、HLA―B、HLA―C、HLA―DP、HLA−DM、HLA−DOA、HLA−DOB,HLA―DQ、HLA―DR、HLA―G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、クローディン18.2(CLD18A2またはCLDN18A.2)、P糖タンパク質、STEAP1、LIV1、NECTIN−4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素イオンチャネル、およびTNT抗体によって認識される抗原から成る群から選択され、
(ii)前記免疫細胞の効果を増大させるための作用物質が、
−プロテインホスファターゼ阻害剤と、
−キナーゼ阻害剤(例えば、P13K/AKT阻害剤、mTOR阻害剤、LCK阻害剤、またはBTK阻害剤)と、
−サイトカインと、
−免疫抑制分子の阻害剤と、
−TREG細胞のレベルまたは活性を減少させる作用物質と、
−SIR修飾細胞の増殖および維持を増大させる作用物質と、
−ケモカインと、
−SIRの発現を増大させる作用物質と、
−SIRの発現または活性の調整を可能にする作用物質と、
−SIR修飾細胞の生存および/または維持の制御を可能にする作用物質と、
−SIR修飾細胞の副作用を制御する作用物質と、
−Brd4阻害剤と、
−病気の部位へ治療薬(例えばsHVEM)または予防薬を送達する作用物質と、
−SIRが標的とする抗原の発現を増大させる作用物質と、
−アデノシンA2a受容体アンタゴニストと、
の1つ以上から選択され、それにより前記被験者を治療する、あるいは前記被験者の病気を予防する、
方法。 - 被験者における病気関連抗原の発現に関連する病気を治療または予防する方法であって、
合成免疫受容体(SIR)分子を含む有効量の免疫エフェクター細胞を前記被験者へ投与する工程を有し、
(i)前記SIR分子は、病気関連抗原に結合する1つ以上の抗原結合ドメインに任意のリンカーを通して結合する1つ以上のT細胞受容体定常鎖を有しており、前記病気関連抗原は、CD5、CD19;CD123;CD22;CD23;CD30;CD171;CS−1(CD2サブセット1、CRACC、SLAMF7、CD319、および19A24とも呼ばれる);C型レクチン様分子1(CLL−1またはCLECL1);CD33;上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRviii);ガングリオシドG2(GD2);ガングリオシドGD3(aNeu5Ac(2−8)aNeu5Ac(2−3)bDGalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA);Tn抗原((Tn Ag)または(GalNAcα―Ser/Thr);前立腺特異的膜抗原(PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1);FMS様チロシンキナーゼ3(FLT3);腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72);CD38;CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化CD43エピトープ、非造血器癌で発現するグリコシル化CD43エピトープ;癌胎児性抗原(CEA);上皮細胞接着分子(EPCAM);B7H3(CD276);KIT(CD117);インターロイキン13受容体サブユニットアルファ2(IL−13Ra2またはCD213A2);メソテリン;インターロイキン11受容体α(IL−11Ra);前立腺幹細胞抗原(PSCA);プロテアーゼセリン21(テスティシンまたはPRSS21);血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2);ルイス(Y)抗原;CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR―β);ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4);CD20;葉酸受容体α(FRaまたはFR1);葉酸受容体β(FRb);受容体チロシンプロテインキナーゼERBB2(Her2/neu);ムチン1、細胞表面関連(MUC1);上皮細胞増殖因子受容体(EGFR);神経細胞接着分子(NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性フォスファターゼ(PAP);伸長因子2変異(ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質α(FAP);インスリン様増殖因子1受容体(IGF−1受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX);プロテアソーム(プロソーム、マクロパイン)サブユニット、β型9(LMP2);糖タンパク質100(gp100);易切断領域(BCR)およびアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ1(Ab1)(bcr−ab1)から成る癌遺伝子融合タンパク質;チロシナーゼ;エフリン型A受容体2(EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子(sLe);ガングリオシドGM3(aNeu5Ac(2−3)bClalp(1−4)bDGlcp(1−1)Cer);トランスグルタミナーゼ5(TGS5);高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA);O−アセチル―GD2ガングリオシド(OAcGD2);腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248);腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R);クローディン6(CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR);Gタンパク質共役受容体クラスCグループ5メンバーD(GPRC5D);染色体Xオープンリーディングフレーム61(CXORF61);CD97;CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ(ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的1(PLAC1);グロボHグリコセラミドの六糖部分(GloboH);乳腺分化抗原(NY−BR−1);ウロプラキン2(UPK2);A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1);アドレナリン受容体β3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3);Gタンパク質共役受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6コンプレックス遺伝子座K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2);TCRγ代替リーディングフレームタンパク質(TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1);癌/精巣抗原1(NY−ES0−1);癌/精巣抗原2(LAGE−1a);黒色腫関連抗原1(MAGE−A1);染色体12pに位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6−AML);精子タンパク質17(SPA17);X抗原ファミリーメンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体2(Tie2);黒色腫癌精巣抗原1(MAD−CT−1);黒色腫癌精巣抗原2(MAD−CT−2);Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質p53(p53);p53変異体;プロステイン;サバイビン;テロメラーゼ;前立腺癌腫抗原1(PCT A−1またはガレクチン8)、T細胞によって認識される黒色腫抗原1(MelanAまたはMARTI);ラット肉腫(Ras)変異体;ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座切断点;アポトーシスの黒色腫阻害物質(ML−IAP);ERG(膜貫通型プロテアーゼ、セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子);NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV(NA17);ペアードボックスタンパク質Pax−3(PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリンB1;v−myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性癌遺伝子の神経芽細胞腫由来のホモログ(MYCN);RasホモログファミリーメンバーC(RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP−2);チトクロームP4501B1(CYP1B1);CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様(BORISすなわちBrother of the Regulator of Imprinted Sites)、T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3(SART3);ペアードボックスタンパク質Pax−5(PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32(OY−TES1);リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK);Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP−4);滑膜肉腫、X切断点2(SSX2);糖化最終産物の受容体(RAGE−1);腎臓ユビキタス1(RU1);腎臓ユビキタス2(RU2);レグマイン;ヒト乳頭腫ウイルスE6(HPV E6);ヒト乳頭腫ウイルスE7(HPV E7);腸由来カルボキシルエステラーゼ;熱ショックタンパク質70−2変異体(mut hsp 70−2);CD79a;CD79b;CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1):IgA受容体のFc断片(FCARまたはCD89);白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2);CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF);C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A);骨髄間質細胞抗原2(BST2);EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2);リンパ球抗原75(LY75);グリピカン3(GPC3);Fc受容体様5(FCRL5);および免疫グロブリンλ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、ビオチン、c−MYCエピトープタグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原)フコシルGM1、PTK7、gpNMB、CDH1−CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b−IGL11、TCRγδ、NKG2D、CD32(FCGR2A)、Timl−/HVCR1、CSF2RA(GM−CSFRα)、TGFβR2、ルイスAg、TCRβ鎖、TCRβ2鎖、TCRγ鎖、TCRδ鎖、FITC、黄体化ホルモン受容体(LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性性腺刺激ホルモン受容体(CGHR)、CCR4、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1−Tax、CMVpp65、EBV−EBNA3c、KSHV K8.1、KSHV−gH、インフルエンザAヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、KSHV−K8.1タンパク質、KSHV−gHタンパク質、デスモグレイン3(Dsg3)に対する自己抗体、デスモグレイン1(Dsg1)に対する自己抗体、HLA、HLA―A、HLA―A2、HLA―B、HLA―C、HLA―DP、HLA−DM、HLA−DOA、HLA−DOB,HLA―DQ、HLA―DR、HLA―G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子1(TF1)、AFP、GPRC5D、クローディン18.2(CLD18A2またはCLDN18A.2)、P糖タンパク質、STEAP1、LIV1、NECTIN−4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素イオンチャネル、およびTNT抗体によって認識される抗原から成る群から選択され、
(ii)前記SIR分子の抗原結合ドメインは、前記抗原結合ドメインを誘導した抗体よりも少なくとも5倍少ない結合親和性を有する、
方法。 - 前記病気関連抗原の発現に関連する病気は、増殖症、前癌状態、癌、および前記病気関連の発現に関連する非癌関連適応症から成る群から選択される、請求項178〜180のいずれか一項に記載の使用または方法。
- 前記癌は、慢性リンパ球性白血病(CLL)、急性白血病、急性リンパ性白血病(ALL)、B細胞急性リンパ性白血病(B−ALL)、T細胞急性リンパ性白血病(T−ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、B細胞前リンパ球性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、原発性滲出液リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリーセルリンパ腫、小細胞型または大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性症状、MALTリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄異形成および骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞腫瘍、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、および前白血病の1つ以上から選択される血液癌である、請求項183に記載の使用または方法。
- 前記癌は、結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝臓癌、肺非小細胞癌、小腸癌、食道癌、黒色腫、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、頭または首の癌、皮膚または眼内悪性黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門領域の癌、胃癌、精巣癌、子宮癌、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頚癌、膣癌、外陰部の癌、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、内分泌系癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟部肉腫、尿道癌、陰茎癌、小児の充実性腫瘍、膀胱癌、腎臓または尿管の癌、腎盂癌、中枢神経(CNS)の腫瘍、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、脊髄軸腫瘍、脳幹グリオーマ、垂体腺腫、カポジ肉腫、メルケル細胞癌、類表皮癌、扁平上皮癌、T細胞リンパ腫、環境誘発癌、前記癌の組み合わせ、および前記癌の転移巣から成る群から選択される、請求項183に記載の使用または方法。
- 前記病気は、ウイルス感染に関連しており、限定されないが、HIV1、HIV2、HTLV1、エプスタインバーウイルス(EBV)、サイトメガロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、BKウイルス、ヒトヘルペスウイルス6型、ヒトヘルペスウイルス8型、インフルエンザウイルス、パラインフルエンザウイルス、鳥インフルエンザウイルス、MERSおよびSARSコロナウイルス、クリミア・コンゴ出血熱ウイルス、ライノウイルス、エンテロウイルス、デング熱ウイルス、ウェストナイルウイルス、エボラウイルス、マールブルグウイルス、ラッサ熱ウイルス、ジカウイルス、RSV、麻疹ウイルス、ムンプスウイルス、ライノウイルス、水痘ウイルス1型および2型、水痘帯状疱疹ウイルス、HIV−1、HTLV1、肝炎ウイルス、エンテロウイルス、B型肝炎ウイルス、C型肝炎ウイルス、ニパおよびリフトバレー熱ウイルス、日本脳炎ウイルス、メルケル細胞ポリオーマウイルスあるいは結核菌感染に関連したウイルス、異型マイコバクテリア種、ニューモシスチスジロベシ、トキソプラズマ症、リケッチャー、ノカルディア、アスペルギルス、ムコール、およびカンジダを含む、請求項183に記載の使用または方法。
- 前記病気は免疫病または変性疾患であり、限定されないが、真正糖尿病、多発性硬化症、関節リウマチ炎、尋常性天疱瘡、強直性脊椎炎、橋本甲状腺炎、SLE、サルコイドーシス、強皮症、混合性結合組織症、移植片対宿主病、およびアルツハイマー病を含む、請求項183に記載の使用または方法。
- (i)前記プロテインホスファターゼ阻害剤はSHP−1阻害剤および/またはSHP−2阻害剤であり、
(ii)前記キナーゼ阻害剤は、CDK4阻害剤、CDK4/6阻害剤、mTOR阻害剤、MNK阻害剤、および重複P13K/mTOR阻害剤のうち1つ以上から選択され、
(iii)前記免疫抑制因子を阻害する作用物質は、前記抑制分子の発現を阻害する、抗体または抗体断片、阻害性核酸、クラスター化された、等間隔にスペーサーが入った、短い回文型のリピート(CRISPR)、TALエフェクターヌクレアーゼ(TALEN)、またはジンクフィンガーエンドヌクレアーゼ(ZFN)を含み、
(iv)前記TREG細胞のレベルまたは活性を減少させる作用物質は、シクロホスファミド、抗GITR抗体、CD25枯渇、またはそれらの組み合わせから選択され、および/または、
(v)前記Brd4阻害剤は、米国特許第20140256706A1号記載のJQ1、MS417、OTXO15、LY303511、およびBrd4阻害剤、あるいはそれらの誘導体から選択される、
請求項178〜180または182〜184のいずれかに記載の使用または方法。 - 前記免疫抑制剤は、PD1、PD−L1、CTLA−4、TIM−3、LAG−3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、TGFRβ、CEACAM−1、 CEACAM−3、およびCEACAM−5から成る群から選択される、請求項178〜180または182〜184のいずれかに記載の使用または方法。
- 前記抑制分子を阻害する作用物質は、抑制分子またはその断片を含む第一ポリペプチドと、細胞へ陽性シグナルを提供する第二ポリペプチドとを有し、前記第一および第二ポリペプチドは、前記SIR含有免疫細胞上で発現し、(i)前記第一ポリペプチドは、PD1、PD−L1、CTLA−4、TIM−3、LAG−3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、TGFRβ、CEACAM−1、 CEACAM−3、およびCEACAM−5、またはその断片、および/または前記第二ポリペプチドは、第一シグナル伝達ドメインおよび/または共刺激シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインを有する、請求項178〜180または182〜184のいずれかに記載の使用または方法。
- 前記第一シグナル伝達ドメインはCD3ζの機能性ドメインを有し、および/または前記共刺激シグナル伝達ドメインは、41BB、CD27、およびCD28から選択されるタンパク質の機能性ドメインを有する、請求項188に記載の使用または方法。
- 前記サイトカインは、IL−15および/またはIL−21から選択される、請求項178〜180または182〜184のいずれかに記載の使用または方法。
- 前記SIR分子(複数も可)を含む前記免疫エフェクター細胞と、前記免疫エフェクター細胞の効果を増大させる作用物質とは、実質的に同時に、または連続的に投与される、請求項178〜180または182〜184のいずれかに記載の使用または方法。
- 前記SIR分子は、GITRを標的とする分子、および/またはGITR機能を調節する分子と併用して投与される、請求項191に記載の使用または方法。
- 前記GITRを標的とする分子および/またはGITR機能を調節する分子は、前記SIR発現細胞または細胞母集団の前に、あるいはアフェレシスの前に投与される、請求項192に記載の使用または方法。
- 前記被験者はヒトである、請求項178〜180または182〜184のいずれかの使用または方法。
- 組成物であって、
請求項1記載の少なくとも1つのポリヌクレオチドと、請求項111記載のSIRポリペプチド分子と、請求項104記載のベクターまたは請求項152〜153のいずれか一項記載の細胞と、薬学的に許容される賦形剤とを有する、
組成物。 - キットであって、
請求項1記載の少なくとも1つのポリヌクレオチド、請求項111記載のSIRポリペプチド分子、請求項104記載のベクターまたは請求項152〜153のいずれか一項記載の細胞、および/または請求項144記載の組成物を有する、
キット。 - 組換えポリヌクレオチドであって、
配列番号900〜2264、配列番号4531〜6013、配列番号7519〜8160、配列番号8803〜9230、配列番号9659〜9856、配列番号10474〜12041、配列番号15786〜16011、配列番号16240〜16465、配列番号16694〜16926、配列番号17162〜配列番号17394、配列番号17864〜17979、配列番号18321〜18322、配列番号18242〜18259、配列番号18280〜18588、配列番号18899、および配列番号18915〜18916、および配列番号19248〜19246から成る群から選択される配列を有するか、あるいは配列番号900〜2264、配列番号4531〜6013、配列番号7519〜8160、配列番号8803〜9230、配列番号9659〜9856、配列番号10474〜12041、配列番号15786〜16011、配列番号16240〜16465、配列番号16694〜16926、配列番号17162〜配列番号17394、配列番号17864〜17979、配列番号18321〜18322、配列番号18242〜18259、配列番号18280〜18588、配列番号18899、および配列番号18915〜18916、および配列番号19248〜19246のうちいずれか1つに記載の合成免疫受容体をコードするヌクレオチド配列に少なくとも75%同一の配列を有する、合成免疫受容体をコードする、
組換えポリヌクレオチド。 - アミノ酸配列であって、
配列番号3135〜4498、配列番号6044〜7518、配列番号8161〜8802、配列番号9231〜9658、配列番号9873〜10070、配列番号12431〜13998、配列番号16013〜16238、配列番号16467〜16692、配列番号16928〜17160、配列番号17396〜17628、配列番号17981〜18096、配列番号18239〜18240、配列番号18261〜18278、配列番号18590〜18898、配列番号18900、および配列番号18919〜18920、および配列番号19248〜19246から成る群から選択される合成免疫受容体ポリペプチドをコードするアミノ酸配列、あるいは配列番号3135〜4498、配列番号6044〜7518、配列番号8161〜8802、配列番号9231〜9658、配列番号9873〜10070、配列番号12431〜13998、配列番号16013〜16238、配列番号16467〜16692、配列番号16928〜17160、配列番号17396〜17628、配列番号17981〜18096、配列番号18239〜18240、配列番号18261〜18278、配列番号18590〜18898、配列番号18900、および配列番号18919〜18920、および配列番号19248〜19246のいずれか1つに記載の前記合成免疫受容体ポリペプチドをコードするアミノ酸配列に少なくとも75%同一の配列である
アミノ酸配列。
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