JP2024518011A - 多様な免疫細胞のための単鎖および多鎖合成抗原受容体 - Google Patents

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Abstract

本開示は、単鎖および多鎖合成抗原受容体、そのような合成抗原受容体の製造方法、ならびに疾患および障害の治療のためのその使用を提供する。

Description

関連アプリケーションの相互参照
この出願は、2021年2月19日に出願された米国仮出願第63/151,421号および2021年9月16日に出願された米国仮出願第63/245,181号に対して、35 USC §119に基づく優先権を主張しており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。あらゆる目的のために。
技術分野
本開示は、バイオテクノロジーの分野に関し、より具体的には、単鎖および多鎖の合成抗原受容体に関する。
配列表の参照による組み込み
この出願には、「NK-DNA-PRT-1-11231_ST25.txt」というタイトルの配列表が添付されており、2022年2月21日に作成され、34,352,306バイトのデータを有し、IBM-PC、MS-Windows(登録商標)オペレーティングシステムでマシンフォーマットされています。配列表は、あらゆる目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
CAR は合成免疫受容体であり、T 細胞をリダイレクトして腫瘍細胞を選択的に殺すことができます。 CAR-T 細胞の成功にもかかわらず、このアプローチには「サイトカイン放出症候群」(CRS) や神経毒性などの毒性を含むいくつかの制限があります。
CAR-T とは対照的に、NK (ナチュラルキラー) 細胞には細胞溶解機能と抗ウイルス免疫が自然に備わっていますが、GvHD を引き起こす可能性のある TCR がありません。 CAR-NK 細胞は、CAR-T とは対照的に、過剰なサイトカイン産生を引き起こす可能性が低くなります。
第 2世代CAR は、いくつかの異なるポリペプチドの融合です。例えば、キムリアは、マウス scFv (FMC63)、ヒト CD8 ヒンジおよび膜貫通ドメイン、ヒト 4-1BB 共刺激ドメイン、およびヒト CD3z 活性化ドメインから構成されます。これらのドメインはやや恣意的な方法でつなぎ合わされており、結果として得られる構築物には、非特異的な凝集、緊張性シグナル伝達、生理学的調節の欠如など、いくつかの問題があります。
理論に束縛されるものではないが、二重特異性、二価、またはバイパラトープ性の抗原結合部分を有するCARを設計するためにscFvが使用される場合、これらの問題はさらに悪化する可能性がある。
上記の次世代 SAR 設計のほとんどのもう 1 つの大きな制限は、それらが主に T 細胞で活性を持ち、NK 細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞、好中球などの他の免疫細胞では機能しないことです。
従来第2世代CARの設計上の制限のいくつかを克服するために、Ab-TCR(参照により本明細書に組み込まれる国際公開第2017/070608 A1)、TCR受容体融合タンパク質またはTFP (参照により本明細書に組み込まれるWO 2016/187349 A1)、合成免疫受容体(SIRs)(参照により本明細書に組み込まれるWO 2018/102795 A1を参照)、三官能性T細胞抗原カプラー(Tri-TAC)(参照により本明細書に組み込まれるWO2015/117229 A1を参照)を含む次世代CARと総称されるいくつかの代替設計が報告されている。これらの代替 CAR デザインは一般に、共刺激ドメインが欠如している。
国際公開第2017/070608号 国際公開第2016/187349号 国際公開第2018/102795号 国際公開第2015/117229号
本開示は、単一特異性、二重特異性、多重特異性、および汎用の次世代SAR設計を提供する。
本開示は、細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインの特異的構成を有する合成抗原受容体(SARs)を提供し、この合成抗原受容体は、免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、NKT細胞、単球、マクロファージ、好中球など)において発現された場合、従来のキメラ抗原受容体(CAR)を発現する免疫細胞、例えばCD3z活性化ドメインと41BBまたはCD28共刺激ドメインドメインを発現する第二世代CARと比較して、免疫細胞の活性化、標的細胞の殺傷、サイトカインの分泌(例えば、IL-2、インターフェロン-γ、TNFa)およびインビボ活性の改善を示す。
本開示は、本開示のSARと同時発現できる新規なアクセサリモジュールも提供する。本開示は、以下のポリペプチドをコードする核酸を含むベクターを提供する;a)細胞膜に固定されたサイトカインの低親和性変異体(例えば、IL-2および/またはIL-15); b) エピトープタグを有する膜固定サイトカインおよびc) 自殺、生存、マーカー機能を果たす多目的遺伝子スイッチ。
本開示は、本開示の単鎖または多鎖SARのいずれか1つまたは複数を有するアクセサリモジュールのいずれか1つまたは複数を発現する細胞を作製する方法を提供する。アクセサリ モジュールは、SAR なしでセル内で表現できます。本開示はまた、本開示のアクセサリーモジュールおよび/またはSARの発現のために最適化された短いプロモーターおよび内部リボソーム部位を有する最適化されたベクターを提供する。
一態様では、本開示は、生理学的シグナル伝達を提供する単鎖の新規な次世代SAR設計に関する。さらに重要なことに、別の態様では、本開示は、マルチチェーンの新規な次世代SAR設計に関する。
態様では、本開示は、T細胞、NKT細胞、NK細胞、単球/マクロファージおよび好中球などを含む様々な免疫細胞において活性である新規な次世代合成抗原受容体(SAR)設計に関する。この開示は、任意の細胞にT細胞受容体様の抗原結合特異性を与える、ユニバーサルTCR-SAR(またはuTCR-SAR)と呼ばれる新規なSAR設計に関する。
本開示はまた、MHC(またはHLA)分子と結合してペプチド抗原に結合する能力を含む、T細胞様結合特性を有する任意の細胞を含む非T細胞を提供する。本開示は、そのような細胞を生成するための一般的な方法、および様々な疾患の治療におけるそれらの使用を提供する。
本開示はまた、細胞生存、検出、追跡、濃縮、選択および除去機能を提供するための養子細胞療法に使用できる多目的スイッチを提供する。
本開示はまた、I型およびII型膜貫通タンパク質を含むキメラ融合タンパク質を生成するための普遍的な方法を提供する。この方法は、I型タンパク質の抗原結合ドメインと、II型タンパク質のサイトゾル、膜貫通、ヒンジおよび/または細胞外抗原結合ドメインを組み込んだ合成抗原受容体を生成するために使用することができる。
また、本明細書では、本明細書に記載の単鎖、二本鎖または多鎖SARおよび/またはアクセサリーモジュールのいずれかをコードする核酸も提供される。また、本明細書では、本明細書に記載の単鎖、二本鎖、および多鎖のSARおよび/またはアクセサリーモジュールのいずれかを一緒にコードする核酸のセットも提供される。
いくつかの実施形態において、上述のSARs(単離されたSARなど)のいずれかによれば、SARをその表面に提示するエフェクター細胞(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、iPSCなど)が提供され、ここでエフェクター細胞は、SARの1つ以上のポリペプチド鎖及び/又は任意のアクセサリーモジュールをコードする1つ以上の核酸を含む1つ以上のプロモーターを有する1つ以上のベクターを含む。
また、本明細書では、本明細書に記載の単鎖、二本鎖および多鎖SARおよび/またはアクセサリーモジュールのいずれかをコードする本明細書に記載の核酸のいずれかを含む哺乳動物細胞も提供される。また、本明細書では、本明細書に記載の単鎖、二本鎖および多鎖SARおよび/またはアクセサリーモジュールのいずれかを共にコードする、本明細書に記載の核酸のセットのいずれかを含む哺乳動物細胞も提供される。
いくつかの実施形態において、本開示は、TCRとは対照的に、本開示のSARが任意の哺乳動物細胞において発現され、機能的に活性であることができることを規定する。一実施形態では、哺乳動物細胞は、T細胞、NK細胞、マクロファージ、顆粒球などである。本明細書に記載の任意の哺乳動物細胞のいくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、CD8 T細胞、CD4 + T細胞、メモリーT細胞、ナイーブT細胞、T幹細胞、Treg細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、iNKT(生得的ナチュラルキラー細胞)、NK細胞、g-NK細胞、メモリー様NK細胞、サイトカイン誘導キラー細胞 (CIK)、iPSC 由来 NK 細胞、α/β T 細胞、γ/δ T 細胞、iPSC 由来 T 細胞、B 細胞、マクロファージ/単球、iPSC。本明細書に記載される哺乳動物細胞のいずれかのいくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は以下の群から選択される:iPSC(免疫エフェクター細胞(例えば、 Tいくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、NK92、NK92MI、YTSまたはその誘導体などの不死化細胞株である。本明細書に記載の任意の哺乳動物細胞のいくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、本明細書に記載の任意の哺乳動物細胞のいくつかの実施形態では、対象は癌を有すると診断または同定され、本明細書に記載の任意の哺乳動物細胞のいくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、細胞は同種異系である。
また、限定されないが、NK細胞、単球、マクロファージ、樹状細胞および顆粒球を含むT細胞以外の細胞において機能的に発現することができる単鎖および多鎖TCRが本明細書に提供される。
また、本明細書では、本明細書に記載の哺乳動物細胞のいずれかおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。また、本明細書では、本明細書に記載の医薬組成物のいずれかを含むキットも提供される。
また、本明細書において提供されるのは、以下のものを含む医薬組成物である;本明細書に記載される一本鎖、二本鎖および多本鎖SARおよび/またはアクセサリーモジュールのいずれかをコードする本明細書に記載される核酸のいずれか、または本明細書に記載される一本鎖、二本鎖および多本鎖SARおよび/もしくはアクセサリーモジュールのいずれかを一緒にコードする本明細書に記載される核酸のセットのいずれか、および薬学的に許容される担体含む医薬組成物。また、本明細書では、本明細書に記載の医薬組成物のいずれかを含むキットも提供される。
いくつかの実施形態では、1つまたは複数の標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、標的細胞を、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによるSARを発現するエフェクター細胞と接触させることを含む、方法が提供され、ここで、 SAR は 1 つ以上の標的抗原に特異的に結合します。
いくつかの実施形態では、上記の標的細胞を死滅させる方法のいずれかによれば、接触はインビボで行われる。いくつかの実施形態では、接触はインビトロで行われる。
本明細書に記載のSARのいずれかを発現する細胞の検出、単離、精製、増殖、濃縮および除去のための方法が提供される。
また、本明細書において提供されるのは、一本鎖、二本鎖および多鎖SARおよび/またはアクセサリーモジュールを発現する細胞を作製する方法であって、本明細書に記載されるSARおよびアクセサリーモジュールのいずれかをコードする本明細書に記載される核酸のいずれか、または本明細書に記載される多鎖SARのいずれかをコードする本明細書に記載される核酸のセットのいずれかを哺乳動物細胞に導入することを含む方法である。本明細書に記載のいずれかの方法のいくつかの実施形態では、哺乳類細胞はヒト細胞である。本明細書に記載のいずれかの方法のいくつかの実施形態では、哺乳類細胞は、CD8+T細胞、CD4+T細胞、メモリーT細胞、Treg細胞、ナチュラルキラーT細胞、B細胞からなる群から選択される細胞である。 、NK細胞、およびマクロファージ/単球。本明細書に記載のいずれかの方法のいくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、対象から得られた哺乳動物細胞である。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象は癌を有すると診断または特定される。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態は、導入ステップの後に、液体培地中で細胞を培養するステップをさらに含む。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態は、導入ステップの前に、対象から哺乳動物細胞を取得するステップをさらに含む。
明細書では、治療有効量の本明細書に記載の哺乳動物細胞のいずれかを対象に投与することを含む、対象における疾患(例えば、癌、感染症、アレルギー、免疫障害など)を治療する方法も提供する。本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの実施形態は、投与ステップの前に被験体に投与される哺乳動物細胞を得るため、被験体から初期細胞を得るステップ、および本明細書に記載される一本鎖、二本鎖、多鎖SARおよび/またはアクセサリーモジュールのいずれかをコードする本明細書に記載される核酸のいずれか、または本明細書に記載される一本鎖、二本鎖、多鎖SARおよび/またはアクセサリーモジュールのいずれかを一緒にコードする本明細書に記載される核酸のセットのいずれかを初期細胞に導入するステップをさらに含む。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態は、導入ステップと投与ステップとの間に、対象に投与される細胞を液体培地中で培養するステップをさらに含む。本明細書に記載のいずれかの方法のいくつかの実施形態では、対象はヒトである。
本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、異種抗原結合ドメインは以下の群から選択される:抗体、抗体フラグメント(vL、vH、Fabなど)、scFv、(scFv)2、VHHドメイン、FHVH(完全ヒトvHドメイン)、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場(例えば、 センチリン、アフィボディ、ZIPドメイン、アダプターなど)、VNARドメイン、リガンド、TCR、TCRの可変ドメイン(Va、Vb、Vg、Vd)および受容体。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、異種抗原結合ドメインはscFvを含む。
本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、異種抗原結合領域は単一の抗原に特異的に結合する。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、単一抗原は腫瘍抗原である。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、表Bに列挙される抗原から選択される。
本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、N末端からC末端方向またはC末端からN末端方向に進む場合、単鎖SARは、天然に存在しない細胞外抗原結合ドメイン、任意のリンカー、天然に存在する受容体の任意の細胞外リガンド結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、任意の細胞質共刺激性ドメイン、およびITAMを構成する任意の細胞質一次シグナル伝達ドメインを含む。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾル一次シグナル伝達ドメインは、互いに直接隣接する。本明細書に記載の単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、膜貫通ドメインと任意の細胞質一次シグナル伝達ドメインは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、任意の一次シグナル伝達ドメインおよび共刺激ドメインは、互いに直接隣接する。本明細書に記載のいずれかの一本鎖SARのいくつかの実施形態では、任意の一次シグナル伝達ドメインと共刺激ドメインは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、共刺激ドメインとITAMは互いに直接隣接する。本明細書に記載されるいずれかの単鎖SARのいくつかの実施形態において、共刺激ドメインとITAMは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。
本明細書に記載の単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、N末端からC末端方向またはC末端からN末端方向に進む場合、単鎖SARは、非天然起源の細胞外抗原結合ドメイン(複数可)を含む、 任意のリンカー、天然に存在する受容体の任意の細胞外リガンド結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、一次シグナル伝達ドメイン、およびITAMを含む。
本明細書に記載される一本鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、N末端からC末端方向またはC末端からN末端方向に進む場合、単鎖SARは、非天然に存在する細胞外抗原結合ドメイン(複数可)、膜貫通ドメイン、一次シグナル伝達ドメイン、ITAM、および共刺激ドメインを含む。
本明細書に記載される一本鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、N末端からC末端方向またはC末端からN末端方向に行く場合、単鎖合成抗原受容体は、非天然に存在する細胞外抗原結合ドメイン(複数可)、膜貫通ドメイン、第2の細胞内シグナル伝達ドメイン、ITAM、および第1の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
本明細書に記載の単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、N末端からC末端方向へ、またはC末端からN末端方向へ行く場合、単鎖合成抗原受容体は、異種細胞外抗原結合ドメイン(複数可)、膜貫通ドメイン、ITAM、一次シグナル伝達ドメイン、および共刺激ドメインを含む。
。本明細書に記載の単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、N末端からC末端方向へ、またはC末端からN末端方向へ行く場合、単鎖合成抗原受容体は、非天然に存在する細胞外抗原結合ドメイン(複数可)、膜貫通ドメイン、ITAM、第2の細胞内シグナル伝達ドメイン、および第1の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
本明細書に記載の単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインと膜貫通ドメインは互いに直接隣接している。本明細書に記載の単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、細胞外抗原結合ドメインと膜貫通ドメインは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。
本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインはCD3zに由来する。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインはFcRγに由来する。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインはDAP10に由来する。本明細書に記載される単鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインはDAP12に由来する。
また、本明細書に記載される単鎖SARのいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸も本明細書に提供される。また、本明細書に記載される単鎖SARのいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む、本明細書に記載される核酸のいずれかを含むベクターも本明細書に提供される。
また、本明細書では、本明細書に記載のベクターのいずれかを含む哺乳動物細胞も提供される。本明細書に記載される哺乳動物細胞のいずれかのいくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、T細胞、NK細胞、マクロファージ、またはiPSCである。
また、本明細書にはSAR発現細胞を作製する方法が提供され、該方法は、本明細書に記載の核酸または本明細書に記載のベクターのいずれかを哺乳動物細胞に導入することを含む。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、哺乳動物細胞はヒト細胞である。本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの実施形態において、哺乳動物細胞は、CD8+T細胞、CD4+T細胞、ナイーブT細胞、メモリーT細胞、Treg細胞、ナチュラルキラーT細胞、NK細胞、B細胞、およびマクロファージ/単球の群から選択される細胞である。本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの実施形態において、哺乳動物細胞は、免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞、NK細胞またはNKT細胞)を生じさせることができるiPSC(人工多能性幹細胞)、胚性幹細胞または造血幹細胞からなる群から選択される細胞である。いくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、NK92、NK92MIまたはその誘導体などの不死化細胞株である。 本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は被験体から得られた哺乳動物細胞である。本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象は癌を有すると診断または同定される。本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの実施形態は、導入する工程の後に細胞を液体培地中で培養する工程をさらに含む。
また、本明細書では、治療有効量の本明細書に記載の哺乳動物細胞のいずれかを対象に投与することを含む、対象における癌を治療する方法も提供する。本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの実施形態は、投与ステップの前に、対象から初期細胞を得るステップ、および本明細書に記載される核酸のいずれかまたは本明細書に記載されるベクターのいずれかを初期細胞に導入して対象に投与される哺乳動物細胞を得るステップをさらに含む。本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの実施形態は、導入ステップと投与ステップとの間に被験体に投与される細胞を液体培地で培養するステップをさらに含む。本明細書に記載のいずれかの方法のいくつかの実施形態では、対象はヒトである。
本明細書では、以下を含む少なくとも1つの第1のポリペプチドを含む多重鎖SARが提供される。オプションのヒンジドメイン、膜貫通ドメイン。およびオプションのサイトゾルドメイン。
本明細書に記載される多重鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、Vα、Vβ、Vγ、Vδ、vL、vHドメイン、scFv、a(scFv) 2 a VHH ドメイン、FHVH (完全ヒト vH ドメイン)、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、VNAR ドメイン、リガンド、および受容体。本明細書に記載される多重鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインはscFvを含む。
本明細書に記載される多重鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、少なくとも1つの第1のポリペプチドは、単一の抗原に特異的に結合する細胞外抗原結合領域を含む。本明細書に記載される多重鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、単一抗原は腫瘍抗原である。
本明細書に記載される多重鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、SARはITAMを欠いているが、ITAMを含む一次刺激ドメインを含むシグナル伝達タンパク質を補充する。本明細書に記載される多重鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態では、SARは、CD3z、FcRγ、DAP10および/またはDAP10の群から選択されるシグナル伝達タンパク質を動員する。
本明細書に記載される多鎖SARのいずれかのいくつかの実施形態において、N末端からC末端方向またはC末端からN末端方向に進む場合、多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドは、異種抗原結合ドメイン(複数可)を含む、 任意のリンカー、天然に存在する受容体の任意の細胞外ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、任意の細胞質共刺激性ドメイン、およびITAMを構成する任意の細胞質一次シグナル伝達ドメインを含む。本明細書に記載される多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、膜貫通ドメインおよび任意の細胞質一次シグナル伝達ドメインは、互いに直接隣接する。本明細書に記載の多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態において、膜貫通ドメインと任意の細胞質一次シグナル伝達ドメインは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。本明細書に記載される多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、任意の一次シグナル伝達ドメインおよび共刺激ドメインは、互いに直接隣接する。本明細書に記載の多鎖SARの少なくとも第一のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態において、任意の一次シグナル伝達ドメインとコスティミュレイトリードメインは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。本明細書に記載の多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、共刺激ドメインとITAMは互いに直接隣接している。本明細書に記載の多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態において、共刺激ドメインとITAMは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。
本明細書に記載される多重鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、N末端からC末端の方向に、またはC末端からN末端の方向に進む場合、多重鎖は、 SARには、異種抗原結合ドメイン、任意のリンカー、任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、一次シグナル伝達ドメイン、およびITAMが含まれる。
本明細書に記載される多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、N末端からC末端の方向に、またはC末端からN末端の方向に進む場合、少なくとも最初のポリペプチドは、多重鎖SARのポリペプチドには、異種抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、一次シグナル伝達ドメイン、ITAM、および共刺激ドメインが含まれる。
本明細書に記載される多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、N末端からC末端の方向に、またはC末端からN末端の方向に進む場合、少なくとも最初のポリペプチドは、多重鎖SARのポリペプチドには、異種抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、第2の細胞内シグナル伝達ドメイン、ITAM、および第1の細胞内シグナル伝達ドメインが含まれる。
本明細書に記載される多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、N末端からC末端の方向に、またはC末端からN末端の方向に進む場合、少なくとも最初のポリペプチドは、多重鎖 SAR のポリペプチドには、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、ITAM、一次シグナル伝達ドメイン、および共刺激ドメインが含まれます。
本明細書に記載される多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、N末端からC末端の方向に、またはC末端からN末端の方向に進む場合、第1のポリペプチドは、多重鎖 SAR には、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、ITAM、第 2 の細胞内シグナル伝達ドメイン、および第 1 の細胞内シグナル伝達ドメインが含まれます。
本明細書に記載の多重鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインと膜貫通ドメインは互いに直接隣接している。本明細書に記載の多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態において、細胞外抗原結合ドメインと膜貫通ドメインは、1~500アミノ酸(例えば、1~250アミノ酸、または1~50アミノ酸)離れている。
本明細書に記載される多鎖SARの少なくとも第1のポリペプチドのいずれかのいくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインは、CD3z、FcRγ、DAP10、またはDAP12の群から選択される1つまたは複数のタンパク質に由来する。
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明および図面、および特許請求の範囲から明らかになるであろう。
本発明は、以下の非限定的な図においてさらに説明される。
図 1 は、さまざまな二重鎖の単一特異性、二重特異性、および多重特異性 SAR の概略図を示しています。
図2は、異なる形態のAABD(例えば、vHH、SVH、aVH、アフィボディ、セントイリンなど)を含む異なる二重鎖単一特異性、二重特異性および多重特異性SARの概略図を示す。
図3は、本開示の単鎖および二本鎖CD16-SARが発現時に有することができる様々なフォーマットの描写を示す。これらの SAR は、Ig 様ドメイン (D1 および D2 ドメイン) の両方を含む CD16 の細胞外ドメイン全体に基づいています。
図4は、本開示のCD16-SARが発現時に有することができる様々なフォーマットの描写を示す。これらの SAR は、CD16 の部分的な細胞外ドメインに基づいています。 SAR はモジュール形式であるため、CD16 モジュールを NKp44、NKp46などに由来するさまざまなモジュールで置き換えて、多様な SAR を生成できます。
図5は、本開示のNKp30 SARが発現時に有することができる様々な形式の描写を示す。 SAR はモジュール形式であるため、NKp30 モジュールを NKp44、NKp46などに由来するさまざまなモジュールで置き換えて、多様な SAR を生成できます。
図6は、 CD19を発現するRS4;11 GLuc標的細胞と2時間共培養したときの、示されたSAR構築物を発現するNK92細胞を用いたマタドール細胞傷害性アッセイの結果を示す。
図7は、 RS4;11 GLuc標的細胞と2時間共培養した場合に、示されたSAR構築物を発現するNK92細胞を用いたマタドール細胞毒性アッセイの結果を示す。
図8は、 L363-GLuc標的細胞と2時間共培養した場合に、示されたSAR構築物を発現するNK92細胞を用いたマタドール細胞毒性アッセイの結果を示す。
図9は、 RS4;11 Gluc標的細胞と2時間共培養した場合に、示されたSAR構築物を発現するNK92細胞を用いたマタドール細胞毒性アッセイの結果を示す。
図10は、 RS4;11 GLuc標的細胞と2時間共培養した場合に、示されたSAR構築物を発現するNK92細胞を用いたマタドール細胞傷害性アッセイの結果を示す。
図11は、 L363-Gluc標的細胞と2時間共培養した場合に、示されたSAR構築物を発現するNK92細胞を用いたマタドール細胞毒性アッセイの結果を示す。
図12は、 NKG2DなどのII型膜タンパク質の細胞外ドメインへの抗原結合ドメインの融合を含むSARの作製の一般的な説明を示す。
図13A~Cは、以下を示す。(A) NK92、初代NK細胞およびU266細胞(NY-ESO1+/HLA-A2)と共培養した場合のNY-ESO1ペプチド(SEQ ID NO: 10880)を標的とするuTCR-SAR(061621-SCjJ7;SEQ ID NO: 9366)を発現する初代T細胞による細胞死、(B) TNFαのアップレギュレーション、および(C)T細胞をコントロールT2細胞またはペプチドを負荷したT2細胞と共培養した場合のNY-ESO1ペプチドを標的とするuTCR-SAR(061621-SCjJ7;SEQ ID NO: 9366)を発現する初代T細胞によるIFNγのアップレギュレーション。
詳細な説明
次に、本発明をさらに説明する。以下の文章では、本発明のさまざまな態様がより詳細に定義される。そのように定義された各態様は、特に反対のことが明確に示されない限り、他の任意の態様と組み合わせることができます。特に、好ましいまたは有利であると示された任意の特徴は、好ましいまたは有利であると示された他の任意の特徴と組み合わせることができる。
特に明記されていない限り、または文脈から暗黙的に示されている場合を除き、以下の用語および語句には、以下に示す意味が含まれます。明示的に別段の記載がない限り、または文脈から明らかでない限り、以下の用語および語句は、その用語または語句が関連する技術分野で獲得した意味を排除するものではありません。本発明の範囲は特許請求の範囲によってのみ限定されるため、定義は特定の実施形態の説明を助けるために提供されるものであり、特許請求の範囲に記載された発明を限定することを意図したものではない。
他に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。
本明細書で使用される場合、「含む」という用語は、一実施形態にとって有用であるが、有用であるかどうかにかかわらず、不特定の要素を含めることができる組成物、方法、およびそのそれぞれの構成要素に関して使用される。一般に、本明細書で使用される用語は一般に「オープンな」用語として意図されていることが当業者には理解されよう(例えば、用語「含む」は「含むがそれに限定されない」と解釈されるべきであり、用語「有する」は「含むがそれに限定されない」と解釈されるべきである)は「少なくとも有する」と解釈されるべきであり、「含む」という用語は「含まれるがこれに限定されない」と解釈されるべきである、など)。
一般に、本明細書に記載される細胞および組織培養、病理学、腫瘍学、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学、ならびにタンパク質および核酸の化学およびハイブリダイゼーションに関連して使用される命名法およびそれらの技術は、当技術分野でよく知られており、一般に使用されているものである。 。本開示の方法および技術は、一般に、当技術分野で周知の従来の方法に従って、また、別段の指示がない限り、本明細書全体にわたって引用および議論される様々な一般的およびより具体的な参考文献に記載されているように実施される。例えば、Sambrookら、Molecular Cloning: A Laboratory Manual (第4版、Cold Spring Harbor Laboratory Press、コールドスプリングハーバー、ニューヨーク州(2013))を参照されたい。本明細書に記載される免疫学、分子生物学、分析化学、有機合成化学、および医薬化学に関連して使用される命名法、ならびにそれらの実験手順および技術は、当技術分野でよく知られており、一般的に使用されているものである。標準的な技術は、化学合成、化学分析、医薬品の調製、製剤化、送達、および患者の治療に使用されます。
本明細書で使用される「自律的抗原結合ドメイン」または「AABD」という用語は、自律的に、すなわち、別の抗原結合ドメインの不在下で抗原に結合することができる抗原結合ドメインを指す。例示的AABDは、vLドメインの不在下で抗原と結合することができる単一vHドメインまたは自律的vHドメイン(aVH)、典型的には単一ヒトvHドメイン(SVH)である。別の例示的AABDは、完全ヒトvHドメイン(FHVH)である。別の例示的AABDは、vHドメインの不在下で抗原と結合することができる単一vLドメインまたは自律的vLドメイン、典型的には単一ヒトvLドメイン(SVL)である。AABDはまた、自律的に抗原と結合することができる他の抗原結合ドメインも指す。ある実施形態において、AABDは、非scFv抗原結合ドメインである。例示的な非scFVベースの自律的抗原結合ドメインとしては、限定するものではないが、vHHドメイン、ヒト化vHHドメイン、単一可変ドメイン-TCR(svd-TCR)、および非免疫グロブリン抗原結合足場、例えば、DARPIN、アフィボディ、ZIPドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、R4など)が挙げられる。)、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、オボディ、リピボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質またはそのフラグメント。非scFVベースの自律的抗原結合ドメインのさらなる例としては、受容体のリガンド結合ドメイン(例えば、CD16-V158A、NKG2D)またはそのフラグメント、リガンドの受容体結合ドメイン(例えば、APRIL、トロンボポエチンなど。)またはそのフラグメント、アダプター(例えば、RZIP、EZIP、E4、K4、NKG2D-YA、NKG2D-AFなど。)またはそのフラグメント、アダプター結合タンパク質(例えば、ULBP2R 、ULBP2-S3など。)またはそのフラグメント、エピトープまたはタグ(例えば、Streptag、FLAGタグなど。)、自己抗原またはそのフラグメントなどが挙げられる。
本開示は、単一特異性、二重特異性および多重特異性SARを作製するための構成要素としての、複数のヒトVHドメインなどのヒトVH(またはvH)ドメインなどのAABDの使用を記載した。ある実施形態において、本開示は、単一特異性、二重特異性および多重特異性の新規SARを作製するための構成要素としての、複数のヒトVHドメインなどのヒトVHドメインなどのAABDの使用を記載する。
量、時間的持続時間などの測定可能な値を指す場合の「約」という用語は、±20%、場合によっては±10%、または場合によっては±5%、または場合によっては、特定の値から±1%、または場合によっては±0.1%であり、そのような変動は、開示された方法を実行するか、または本明細書に組成物を説明するのに適切であるためである。さらに、任意の値または範囲 (たとえば、 20 未満または同様の用語) には、そのような値の間またはその値までの任意の整数が明示的に含まれます。したがって、例えば、「1から5個の変異」には、1、2、3、4、および/または5個の変異が明示的に含まれる。
本明細書に記載される「ABR」または「抗原結合受容体」という用語は、抗原結合ドメインを有する任意の受容体を指す。 ABRの抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、VHH、抗体、抗体フラグメント(例えば、 Fab)、抗体様部分、Vα、Vβ、svd-TCR、サイトカイン、受容体などを含み得る。 、ABR には、細胞表面での発現を可能にする膜貫通ドメインまたは膜アンカードメインがあります。例示的なABRには、第1世代CAR、第2世代CAR、TFP、SIR、STAR、zSIR、cTCR、TCR、Ab-TCR、TRI-TACまたはTACなどが含まれる明細書に記載の合成抗原受容体(SAR) 、も ABR の例です。
「Ab-TCR」または「AbTCR」という用語は、参照により本明細書に組み込まれるWO2017/070608 A1に記載されているような次世代CARプラットフォームを指す。ある実施形態において、Ab-TCRは、少なくとも1つのTCRシグナル伝達モジュールを動員することができるTCRモジュールに融合された標的抗原に特異的に結合する抗体部分を含んでなる。Ab-TCRの構築に使用可能な例示的TCRモジュールは、配列番号6009-6014(表6)および参照により本明細書に組み込まれるWO2017/070608 A1に提供される。
「アクセサリモジュール」という用語は、PDL1、PDL2、 CD80、CD86 、crmA、p35、 hNEMO-K277A (またはNEMO-K277A)、 hNEMO-K277A-delta-V249-K555、mNEMO-K270A、K13のいずれか1つまたは複数を指します。 -opt、IKK2-S177E-S181E (またはIKK2-SS/EE) 、IKK1-S176E-S180E (または IKK1-SS/EE)、MyD88-L265P、TCL-1a、MTCP-1、CMV- 141、41BBL 、 CD40L 、vFLIP-K13、MC159、cFLIP-L/MRITα、cFLIP-p22、HTLV1 Tax、HTLV2 Tax、HTLV2 Tax-RS変異体、FKBPx2-K13、FKBPx2-HTLV2-Tax、FKBPx2-HTLV2-Tax-RS、IL6R-304 -vHH-Alb8-vHH、IL12f、PD1-4H1 scFV、PD1-5C4 scFV、PD1-4H1-Alb8-vHH、PD1-5C4-Alb8-vHH、CTLA4-イピリムマブ-scFv、CTLA4-イピリムマブ-Alb8-vHH、IL6 -19A-scFV、IL6-19A-scFV-Alb8-vHH、sHVEM、sHVEM-Alb8-vHH、hTERT、Fx06、Brd4 をターゲットとした shRNA、IgSP-[hTRAC-opt2]、IgSP-[hTRBC-opt2]、マルチ目的スイッチ(例えば、IL2-tBCMA、IL15-tBCMA、IL2-RQR、IL15-RQRなど)、NKG2C、CD94、 DAP10、DAP12、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ 、および免疫細胞(例えば、 NK細胞またはT細胞、例えば、 SAR-NK細胞、SAR-T細胞またはTCR-T細胞)を使用して、免疫細胞の活性を減少、調節、または改変する。一実施形態では、アクセサリモジュールは治療対照(例えば、イカパーゼ9)である。いくつかの実施形態において、アクセサリーモジュールは、SARもしくはTCRまたはSAR発現細胞もしくはTCR発現細胞の発現もしくは活性を増加、減少、調節もしくは修飾するために、SARもしくはTCRなどの免疫受容体と共発現される。アクセサリーモジュールは、単一のベクターまたは 2 つ以上の異なるベクターを使用して SAR または TCR と共発現させることができます。いくつかの実施形態では、アクセサリーモジュールは、抗原提示細胞、例えば、樹状細胞において発現される。
本明細書で使用される場合、「親和性」は、結合強度の尺度を表すことを意味する。親和性は一般に、結合剤がその標的に結合する「能力」を指します。当技術分野では、「親和性」を測定するために多数の方法が使用されている。例えば、親和性を計算するための結合実験の使用を含む、抗原に対する抗体の親和性を計算する方法は当技術分野で知られている。本明細書で使用される場合、用語「特異的結合」は、少なくとも10 -6 Mの結合親和性を有する抗体と抗原との間の接触を意味する。ある態様において、抗体は少なくとも約10 -7 Mの親和性で結合し、典型的には、 10 -8 M、10 -9 M、10 -10 M、10 -11 M、または 10 -12 M。
本明細書で使用される「抗体」という用語は、抗原と特異的に結合する免疫グロブリン分子に由来するタンパク質またはポリペプチド配列を指す。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナル、多重鎖または単鎖、または完全な免疫グロブリンであり得、天然源または組換え源に由来し得る。抗体は、「ヒト化」、「キメラ」 、完全ヒトまたは非ヒトであってもよい。抗体は単一のドメイン(例えば、単一のvHドメイン)を有してもよい。
「抗体フラグメント」という用語は、抗原のエピトープと(例えば、結合、立体障害、安定化/不安定化、空間分布によって)特異的に相互作用する能力を保持する、抗体の少なくとも一部を指す。抗体フラグメントの例としては、限定するものではないが、Fab、Fab'、F(ab'h、Fvフラグメント、scFv抗体フラグメント、ジスルフィド結合Fvs(sdFv)、VHおよびCHlドメインからなるFdフラグメント、線状抗体、vLまたはvHのいずれかなどの単一ドメイン抗体(sdAb)、ラクダ科動物vHHドメイン、ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された2つのFabフラグメントを含む二価フラグメントなどの抗体フラグメントから形成される多重特異性抗体、 および単離されたCDRまたは抗体の他のエピトープ結合フラグメント。抗原結合フラグメントはまた、単一ドメイン抗体、マキシボディ、ミニボディ、ナノボディ、イントラボディ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、v-NARおよびビス-scFvに組み込むこともできる(例えば、Hollinger and Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136, 2005を参照)。抗原結合断片は、フィブロネクチンIII型(Fn3)などのポリペプチドに基づいて足場にグラフトすることもできる(フィブロネクチンポリペプチドミニボディを記載している米国特許第6,703,199号を参照のこと)。
「抗体重鎖」という用語は、天然に存在する立体構造で抗体分子に存在する2種類のポリペプチド鎖のうちの大きい方を指し、通常、これによって抗体が属するクラスが決定される。
「抗体軽鎖」という用語は、天然に存在する立体構造で抗体分子中に存在する2種類のポリペプチド鎖のうちの小さい方を指す。カッパ (κ) 軽鎖およびラムダ (λ) 軽鎖は、2 つの主要な抗体軽鎖アイソタイプを指します。
「抗がん剤」とは、異常な細胞分裂および増殖を阻害し、新生物細胞の遊走を阻害し、浸潤を阻害し、またはがんの増殖および転移を防止する薬剤を指す。この用語には、化学療法剤、生物学的薬剤(例えば、 siRNA、改変MLVなどのウイルスベクター、アデノウイルス、細胞傷害性遺伝子を送達するヘルペスウイルス)、抗体などが含まれる。
「抗癌効果」または「抗腫瘍効果」という用語は、限定するものではないが、腫瘍体積の減少、癌細胞数の減少、転移数の減少、平均余命の延長、癌細胞増殖の減少、癌細胞生存の減少を含む様々な手段によって現れ得る生物学的効果を指し、 または癌性状態に関連する様々な生理学的症状の改善。「抗癌効果」はまた、そもそも癌の発生を予防するSARの能力によっても現れ得る。
「抗原」または「Ag」という用語は、免疫応答を引き起こす分子を指す。この免疫応答は、抗体産生もしくは特定の免疫学的にコンピテントな細胞の活性化のいずれか、あるいはその両方を伴い得る。当業者は、事実上全てのタンパク質またはペプチドを含む任意の高分子が抗原として働き得ることを理解するであろう。さらに、抗原は、組換えまたはゲノムDNAに由来し得る。本明細書で使用される場合、「抗原」という用語は、一般に、本明細書に記載の抗原結合ドメインによって特異的に認識される結合パートナーを指す。抗原または抗原結合ドメインのいずれかによって特異的に結合され得る抗原の非限定的な例は、表Bに記載されている。
「抗原提示細胞」または「APC」という用語は、主要組織適合性複合体(MHC)と複合体を形成した外来抗原を提示する補助細胞(例えば、 B細胞、樹状細胞など)などの免疫系細胞を指す。 )表面に。
例えば、感染性病原体の力価の減少、感染性病原体のコロニー数の減少、感染症の改善を含むがこれらに限定されない、様々な手段によって現れることができる生物学的効果を指す。感染症に伴うさまざまな生理学的症状。
「抗原結合ドメイン」または「抗原結合モジュール」または「抗原結合セグメント」または「抗原特異的ドメイン」(ASD)は、その一次、二次もしくは三次配列、翻訳後修飾および/または電荷のために高い特異度で抗原に結合するポリペプチドまたはペプチドを指す。ASDは、非特異的ドメインよりも高い親和性で標的に結合することができる。 抗原結合ドメインは、異なる源、例えば、抗体(全長重鎖、Fab断片、一本鎖Fv(scFv)断片、二価一本鎖抗体またはダイアボディ)、非免疫グロブリン結合タンパク質、リガンドまたは受容体に由来し得る。いくつかの実施形態では、当業者には理解されるように、高親和性で所与の同族体または抗原に結合するほぼいずれの分子もASDとして使用することができる。 いくつかの実施形態では、抗原結合ドメインは、T細胞受容体(TCR)またはその一部を含む。 代表的実施形態では、種々の抗原結合ドメインの標的抗原および配列番号は、本明細書の表3~7に記載されている。代表的実施形態では、vL、vH、scFV、およびそれらのCDR領域の標的抗原および配列番号は、参照により全内容が本明細書に組み込まれる、特許出願PCT/US18/53247の表6A~Cおよび特許出願PCT/US19/ 035096の表3~4に記載されている。
Ka )」という用語は、受容体とリガンドの会合の平衡定数として定義される。
「自己抗体」とは、自己抗原に特異的なB細胞によって産生される抗体を指す。
「自己抗原」という用語は、自己抗体の産生などの自己免疫応答の産生を刺激する内因性抗原を指す。自己抗原の例としては、デスモグレイン1、デスモグレイン3、およびそれらの断片が挙げられるが、これらに限定されない。
「結合力」は、結合剤とその標的との間の相互作用の強さを指す(例えば、抗体とその抗原標的、受容体とその同族体などとの間の相互作用の強さ)。機能アッセイにおける抗体活性(例えば、 、フローサイトメトリーアッセイまたはMalibu-Gloアッセイ)も抗体親和性を反映します。
「アーキテクチャ」という用語は、異なるSARおよび一般的に任意である任意のアクセサリーモジュールを含む異なる構成要素(例えば、抗原結合ドメイン、ヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、シグナル伝達ドメイン)の構成を指す。一実施形態では、SARおよびアクセサリーモジュールは、単一の核酸分子によってコードされる。別の実施形態では、SARは第1の核酸分子によってコードされ、アクセサリーモジュールは第2の核酸分子によってコードされる。いくつかの実施形態では、アクセサリモジュールは、アクセサリモジュール内の構成要素の数に応じて、複数の核酸分子によってコードされる。 SARおよびアクセサリモジュールの2つ以上の構成要素は、2Aリボソームスキップ配列(例えば、 P2A 、T2A、F2Aなど)などの切断可能なリンカーによって分離され得る。 SARおよびアクセサリモジュールの2つ以上の構成要素は、内部リボソーム侵入配列(IRES)によって分離され得る。例示的なIRESはKSHVに由来する。 SARおよびアクセサリーモジュールの2つ以上の構成要素をコードする核酸の発現は、別個のプロモーターによって駆動され得る。プロモーターの例としては、EF1α、EFS、EFS2、CMV、RSV、mutRSV、MNDU3、Hsp70、およびHsp90が挙げられる。
表 A1 : 従来の CAR アーキテクチャ。第 1 世代の従来型 CAR (従来型 CAR I) は、細胞内シグナル伝達 (ISD) ドメイン (例えば、 CD3z) を持ち、共刺激ドメインを持ちません。 TCR融合タンパク質(TFP)は、従来のCAR 1の別の例です。第2世代の従来のCAR(従来のCAR 2またはCAR II)には、1つの共刺激ドメイン(例:41BBまたはCD28 )と細胞内シグナル伝達(ISD)ドメイン(例: CD3z)があります。 )。第 3 世代の従来型 CAR (従来型 CAR 3 または CAR III) は、2 つの共刺激ドメイン (例: 41BB および CD28) と細胞内シグナル伝達 (ISD) ドメイン (例: CD3z) を持っています。 Ab-TCR は、vL リンカー TCR ドメイン (TCRD および vH リンカー TCR ドメイン (TCRD) を組み込んだ二重鎖受容体であり、PCT/US2016/058305 に記載されています。cTCR は、一本鎖、1.5 鎖、または、1 つまたは複数の TCR 定常鎖 (TCR-C) に融合され、T 細胞シグナル伝達の活性化をもたらす vL および vH フラグメントに由来する抗原結合ドメインからなる二重鎖受容体。型核酸配列および対応する野生型アミノ酸配列。cTCR のさまざまな構成は PCT/US2017/064379 またはWO 2018/102795 A1 に記載されています。合成免疫受容体は次世代 CAR であり、PCT/US2017/064379 またはWO 2018/102795 A1 . SIRは、一本鎖、一本鎖、または二本鎖の受容体である 一実施形態では、SIRの抗原結合ドメインは、1つまたは複数のTCR定常鎖に融合されたvLおよびvH断片に由来するいくつかの実施形態では、SIRのTCR定常鎖は、コドン最適化された核酸配列によってコードされ、その発現および鎖対合を増強する1つまたは複数の変異を含む。 zSIRは、任意のリンカーを用いて2つのCD3z鎖またはその断片に作動可能に連結された抗原結合ドメイン(例えば、vL、vHなど)を含む二重鎖受容体であり、PCT/US2019/035096に記載されている。
表A1-1~A1-19は、本開示の単一特異性、二重特異性、および多重特異性SARの例示的なアーキテクチャを提供する。使用される略語は次のとおりです。SP (シグナルペプチド)。 AADB (自律抗原結合ドメイン); L (オプションのリンカー); LL (長いリンカー)、(AABD-L)n (オプションのリンカーを含む n コピーの AABD、n = 0、1、2、3、4 以上)、AABD1-4 (1 つ以上の抗原を標的とする異なる AABD)、V1 (vL、vH、Va、Vb、Vg または Vd鎖)、Ig (Ig リンカー)、 TCR-Ig (TCR 鎖由来の Ig リンカードメイン)、ConP (接続ペプチド)、TM (膜貫通ドメイン)、CP (サイトゾルドメイン) )、IC(細胞内ドメイン)、Ca(TCRαの定常鎖)、Cb(TCRβの定常鎖)、Cg(TCRγの定常鎖)、Cd(TCRδの定常鎖)、scFv(単鎖フラグメント可変)、scTFv( TCRの2つの可変フラグメント(例えば、VaおよびVb)を含む単鎖フラグメント)、dCa/dCb/dCg/dCd(Igリンカードメインを欠くTCRα、β、γまたはδのN末端欠失定常鎖)、TCR-ConP (TCRα、β、γまたはδ定常鎖の連結ペプチド)、Ca-ConP(TCRα定常鎖の連結ペプチド)、IgCL(免疫グロブリン軽鎖からのIgリンカー)、IgCH1(免疫グロブリン重鎖からのIgリンカー)、CD3εγδ ECD( CD3ε、γまたはδ鎖の細胞外ドメイン)、CSD(共刺激ドメイン)、4-1BBまたはBB(4-1BBの共刺激ドメイン)、CD28または28(CD28の共刺激ドメイン)、CD3zまたはzdまたはz( CD3z)。 NKp30-Ig (Nkp30 の免疫グロブリン様ドメイン)、NKp44-Ig (Nkp44 の免疫グロブリン様ドメイン)、NKp46-Ig1-Ig2 (Nkp46 の免疫グロブリン様ドメイン 1 および 2)、CD16-D1 (CD16 のドメイン 1)、CD16- D2 (CD16 のドメイン 2)、scTCR (単鎖 TCR)、細胞外ドメイン (ECD)、活性化ドメイン (AD)。 Va、Vb、Vg、Vd (TCRα、β、γ、δの可変ドメイン)、FCRG (FcRγ);ヒンジドメイン (Hn)。
本明細書で使用される場合、「有益な結果」または「望ましい結果」には、疾患状態の重症度の軽減または緩和、疾患状態の悪化の防止、疾患状態の治癒、疾患状態の発症の防止、患者が病状を発症する可能性を低下させ、患者の生命または余命を延長します。
「同じエピトープに結合する」とは、抗体、scFv、または他の抗原結合ドメインが標的抗原に結合し、例示された抗体、scFv、または他の抗原結合ドメインと同じエピトープを有する能力を意味する。一例として、例示された抗体、scFv、または他の結合剤および他の抗体のエピトープは、標準的なエピトープマッピング技術を使用して決定することができる。当技術分野で周知のエピトープマッピング技術には、Methods in Molecular Biology、Vol. 66 (Glenn E. Morris 編、1996) Humana Press、トトワ、ニュージャージー。本開示のscFv、SAR、抗体および他の免疫治療薬によって結合されるヒトCD20、BCMAおよびヒトMPL抗原の例示的なエピトープは、それぞれ特許出願PCT/US18/の配列番号15149~15154、15155~15159および15160に提供される。 53247に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本開示がポリペプチド、タンパク質、ポリヌクレオチド、抗体、SARまたはそれらのフラグメントに関連する場合、本開示の範囲内においてそれらの等価物または生物学的等価物が意図されることは、明示的な記載がなくとも、また別段の意図がない限り推察される。本明細書で使用される場合、「その生物学的等価物」または「変異体」または「機能的変異体」という用語は、参照タンパク質、抗体またはその断片、その断片の受容体、リガンドまたは断片を指す場合、「その等価物」と同義であることを意図する。その、非免疫グロブリン抗原結合ドメインまたはその断片、SARまたはその断片、ポリペプチドまたは核酸は、所望の構造または機能を依然として維持しながら最小限の相同性を有するものを意味する。本明細書に特に記載しない限り、上記のいずれも、選択的にスプライシングされたアイソフォームおよび他の動物種からの等価物を含むその等価物も含むことが企図される。例えば、等価物は、少なくとも約70%の相同性もしくは同一性、または少なくとも80%の相同性もしくは同一性、あるいは少なくとも約85%、あるいは少なくとも約90%、あるいは少なくとも約95%、または少なくとも約95%の相同性もしくは同一性を意図する。あるいは、少なくとも98%パーセントの相同性または同一性を有し、参照タンパク質、ポリペプチド、抗体もしくはそのフラグメントまたは核酸と実質的に同等の生物学的活性を示す。あるいは、ポリヌクレオチドに言及する場合、その等価物は、ストリンジェントな条件下で参照ポリヌクレオチドまたはその相補体とハイブリダイズするポリヌクレオチドである。あるいは、ポリペプチドまたはタンパク質に言及する場合、その等価物は、参照ポリペプチドまたはタンパク質をコードするポリヌクレオチドまたはその相補体にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されたポリペプチドまたはタンパク質である。
タンパク質が互いに同一性または相同性を有し、類似または同一の機能を保持できることが認識されるであろう。本明細書で使用されるポリペプチド「変異体」は、ポリペプチドの治療的、抗原的、および/または免疫原的特性が保持されるように、保存的置換および/または修飾においてのみ列挙されたポリペプチドと異なるポリペプチドである。ポリペプチド変異体は、典型的には、同定されたポリペプチドに対して少なくとも約70%、より典型的には少なくとも約90%、最も典型的には少なくとも約95%の相同性を示す。あるいは、免疫反応性を有するポリペプチドについては、上記ポリペプチドのいずれかのアミノ酸配列を改変し、改変されたポリペプチドの免疫反応性を評価することによって変異体を同定することもできる。このような修飾配列は、例えば本明細書に記載の代表的な手順を使用して調製および試験することができる。本開示には、生物学的活性を保持しながら、本明細書に記載のアミノ酸配列のいずれかと少なくとも70%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、98.5%、99%または99.9%の同一性を有するSARおよびSAR成分(例えば CD16、CD32、CD64、FcRγ、DAP10、DAP12、DNAM1、OX40、2B4の細胞外領域、ヒンジ領域、膜貫通領域および細胞質領域、 KIR2DL1、KIR2DS4、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2D、NKG2A、NKG2C、NKG2E、NKG2F、NKG2H、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、CD3zなど )が含まれる。本開示には、抗原結合ドメイン、細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、共刺激ドメイン、生物学的活性を保持しながら、本明細書に記載の配列のいずれかと少なくとも70%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、98.5%、99%または99.9%の同一性を有するアクセサリーモジュールも含まれる。バリアントには、他の種のホモログや選択的スプライスされたアイソフォームが含まれます。
本明細書で使用される場合、用語「CD3複合体」は、TCR活性化の膜貫通シグナル伝達のための多数のタンパク質を含む細胞表面分子集合体を指す。
本明細書で使用するとき、用語「CDR」または「相補性決定領域」は、重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドの両方の可変領域内に見出される非連続抗原結合部位を意味することを意図する。これらの特定の領域は、Kabatら、 J.Bio.化学。 252:6609-6616 (1977); Kabat et al.、米国保健福祉省、「免疫学的に興味深いタンパク質の配列」(1991)。 Chothiaら、 J.Mol.バイオ。 196:901-917 (1987);およびMacCallumら、 J.Mol.バイオ。 25 262:732-745(1996)、ここでの定義には、相互に比較した場合のアミノ酸残基の重複またはサブセットが含まれる。それにも関わらず、抗体またはグラフト化抗体またはその変異体のCDRを指すいずれかの定義の適用は、本明細書で定義され使用される用語の範囲内にあることが意図される。本明細書で使用される場合、抗体の異なるCDRは、異なる定義の組み合わせによっても定義され得る。たとえば、vHCDR1 は Kabat に基づいて定義でき、VHCDR2 は Chothia に基づいて定義できます。上記で引用した参考文献のそれぞれによって定義されるCDRを包含するアミノ酸残基は以下のとおりである。
本開示のSAR、二特異性抗体の抗原結合ドメインを構成し得る例示的なvL及びvHセグメントのCDRのSEQ ID および 本開示の他の免疫治療薬の抗原結合ドメインを構成し得る例示的なvLおよびvHセグメントのCDRのSEQ IDは、PCT/US2018/053247のそれぞれSEQ ID NO:13204~14121およびSEQ ID NO:14122~15039(表6A、B)、PCT/US2017/064379の表5~6、およびPCT/US2021/022641の表39に提供されており、これらは参照により本明細書に組み込まれる。本開示のSAR、抗体、および他の免疫療法薬の抗原結合ドメインを構成することができる例示的なvLおよびvHセグメントの配列番号も本開示の表3に提供される。本開示に提供されるvLフラグメントおよびscFvの軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3(例えば表3)は、SEQ ID NO:10882~11118、11119~11355および11356~11592に提供される。本開示で提供されるvLフラグメントのCDR1、CDR2およびCDR3(例えば表3)は、SEQ ID NO:10882~11118、11119~11355および11356~11592で提供される。本開示で提供されるvHフラグメントおよびscFvの重鎖CDR1、CDR2およびCDR3(例えば表3)は、それぞれ、SEQ ID NO:11593-11829、11830-12066、12067-12303で提供される。
いくつかの実施形態では、標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュール(Fab様またはFv様抗原結合モジュールなど)への言及は、抗原結合モジュールが(a)で標的抗原に結合することを意味する。他の分子に対する結合親和性の少なくとも約10倍(例えば、約10、20、30、40、50、75、100、200、300、400、500、750、1000以上)の親和性;または(b)約1/10以下のK d (例えば、 1/10、1/20、1/30、1/40、1/50、1175、1/100、1/200、1/300) 、1/400、1/500、1/750、1/1000以下)は、他の分子に結合するためのそのK d倍である。結合親和性は、ELISA、蛍光活性化細胞選別(FACS)分析、Malibu-Gloアッセイ、Topangaアッセイ、または放射性免疫沈降アッセイ(RIA)などの当技術分野で公知の方法によって決定することができる。
「癌」および「癌性」とは、典型的には無秩序な細胞増殖を特徴とする哺乳類の生理学的状態を指すまたは説明する。 「腫瘍」および「癌」という用語は、本明細書では互換的に使用され、例えば、両方の用語は、固体および液体、例えば、びまん性または循環性の腫瘍を包含する。本明細書で使用される場合、「癌」または「腫瘍」という用語には、前癌性癌および悪性癌および腫瘍が含まれる。 「癌」という用語は、組織病理学的タイプまたは浸潤段階に関係なく、あらゆる種類の癌性増殖または発癌過程、転移組織または悪性形質転換細胞、組織、または器官を含むことを意味する。
「細胞療法」または「細胞ベースの療法」または「免疫細胞療法」または「免疫エフェクター細胞療法」は、疾患の予防または治療のための細胞の使用を伴う療法を指す。細胞療法の非限定的な例としては、CAR-T細胞療法、NK細胞療法、組換えTCR-T細胞療法、TIL(腫瘍浸潤リンパ球)が挙げられる。
「化学療法剤」とは、癌の化学療法に有用であることが知られている化合物である。
は、養子細胞移入と呼ばれる技術を使用した、癌の治療法としての使用が企図される人工(非天然)免疫細胞(例えば、 T細胞)受容体である。 CAR は、人工 T 細胞受容体、キメラ T 細胞受容体、またはキメラ免疫受容体としても知られています。 CAR は、CAR が結合する特定の抗原に応答して T 細胞の活性化と増殖を刺激するように特別に構築されています。一般に、CARは、免疫エフェクター細胞内で発現されると、標的細胞、典型的には癌細胞に対する特異性、および細胞内シグナル生成を細胞に提供する、ポリペプチドのセットを指し、最も単純な実施形態では典型的には2つである。いくつかの実施形態では、CARは、少なくとも細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、および刺激分子および/または共刺激分子に由来する機能的シグナル伝達ドメインを含む細胞質シグナル伝達ドメイン(本明細書では「細胞内シグナル伝達ドメイン」とも呼ばれる)を含む。分子。いくつかの態様では、ポリペプチドのセットは互いに隣接している。一態様では、刺激分子は、T細胞受容体複合体に関連するゼータ鎖である。一態様では、細胞質シグナル伝達ドメインは、以下に定義する少なくとも1つの共刺激分子に由来する1つまたは複数の機能的シグナル伝達ドメインをさらに含む。一実施形態では、共刺激分子は、本明細書に記載の共刺激分子、例えば、 4-1BB(すなわち、 CD137)、CD27、OX40、2B4、および/またはCD28から選択される。一実施形態では、CARは、CAR融合タンパク質のアミノ末端(N末端)に任意のリーダー配列を含む。一実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメインのN末端にリーダー配列をさらに含み、リーダー配列は、細胞プロセシングおよび細胞内へのCARの局在化中に抗原結合ドメイン(例えば、scFv)から任意に切断される。細胞膜。様々な実施形態において、CARは、抗原特異的ドメイン(ASD)、ヒンジ領域(HR)、膜貫通ドメイン(TMD)、任意の共刺激ドメイン(CSD)および細胞内シグナル伝達ドメイン(ISD)を含む組換えポリペプチドである。オプションの共刺激ドメインは一般に、第 1 世代 CAR コンストラクトには存在しませ。異なる抗原結合ドメイン(例えば、 vLおよびvHフラグメント、vHH、リガンドおよび受容体など)を含み、41BB共刺激ドメインを組み込むいくつかの例示的な第2世代CARの核酸配列およびタンパク質配列を配列番号1455~1703に示す。およびPCT/US2020/014237の341-7589 (表8 )。
「コドン最適化」または「種コドンバイアスの制御」は、特定の宿主細胞の好ましいコドン使用を指す。当業者には理解されるように、コード配列を改変して特定の宿主におけるその発現を増強することは有利であり得る。当業者は、遺伝暗号の縮重的な性質により、ヌクレオチド配列が異なる様々なDNA化合物を使用して、本開示の所与のポリペプチドをコードできることを認識するであろう。
本明細書で使用される場合、「共発現」とは、2つ以上のポリヌクレオチドまたは遺伝子の発現を指す。遺伝子は、例えば、単一のタンパク質または単一のポリペプチド鎖としてのキメラタンパク質をコードする核酸であり得る。本明細書に記載されるSAR(例えば、CAR、SIR、zSIR、またはTCRなど)は、単一のポリヌクレオチド鎖によってコードされ、単一のポリペプチド鎖として発現され得、このポリペプチド鎖は、その後、各々が異なる機能単位を表す異なるポリペプチドに切断される。いくつかの実施形態において、SARが2つ以上の機能的ポリペプチド単位からなる場合、異なる機能的単位は、1つ以上のポリヌクレオチド鎖を使用して共発現される。一実施形態では、共刺激は、SARまたはTCRと同時発現されるが、SAR(例えば、 CAR 、SIR、zSIR、またはTCRなど)ポリペプチドの不可欠な部分ではないアクセサリーモジュールによって提供される。別の実施形態では、異なるポリヌクレオチド鎖は、切断可能なリンカー(例えば、 T2A、F2A、P2A、E2Aなど)をコードする核酸配列によって連結される(表20) 。別の実施形態では、切断効率を高めるために、Ser-Gly-Ser-Gly(SGSG)モチーフ(配列番号1239および1240)も切断可能なリンカー配列の上流に追加される。例示的な切断可能なリンカーおよびフリン切断部位の核酸およびアミノ酸配列を表20に提供する。 SARの異なる単位をコードするポリヌクレオチドは、IRES(内部リボソーム侵入部位)配列によって連結され得る。一実施形態では、 SARの異なる機能単位(例えば、2つ以上の鎖)は、単一のベクターを使用して発現される。 SAR のさまざまな機能単位は、単一のプロモーターまたは複数のプロモーターを使用して発現させることができます。一実施形態では、SARの異なる機能単位は、2つ以上のベクターを使用して発現される。例示的な切断可能なリンカーおよびフリン切断部位の核酸およびアミノ酸配列を表20に提供する。
「保存的置換」または「保存的配列修飾」とは、コードされたタンパク質の結合特性または機能に有意な影響を与えないか、または変化させないアミノ酸修飾を指す。例えば、「保存的配列修飾」は、本開示のSARの結合特性または機能に有意な影響を与えないか、または変更しないアミノ酸修飾を指す(例えば、定常鎖、抗体、抗体フラグメント、または非抗体における保存的変化) 。免疫グロブリン結合ドメイン)。このような保存的修飾には、アミノ酸の置換、付加および欠失が含まれる。保存的アミノ酸置換とは、アミノ酸残基が同様の側鎖を有するアミノ酸残基に置換される置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野において定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖 (例、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖 (例、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖 (例、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン)を持つアミノ酸が含まれます。 、システイン、トリプトファン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン)、β分岐側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)。したがって、本開示のSAR内の1つまたは複数のアミノ酸残基は、同じ側鎖ファミリーからの他のアミノ酸残基で置換することができ、改変されたSARは、本明細書に記載される結合アッセイおよび/または機能アッセイを使用して試験することができる。
「共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン」または「共刺激ドメイン」または「CSD」は、T細胞の増殖、生存および/または発達を増強するSARの部分を指す。本開示のSARは、ゼロ、1つまたは複数の共刺激ドメインを含んでもよい。各共刺激ドメインは、例えば、TNFRスーパーファミリーのメンバー、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、BAFF-R、HVEM、CD27、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40またはそれらの組み合わせのいずれか1つ以上の共刺激ドメインからなる。さらに例示的な共刺激ドメインとしては、2B4のシグナル伝達ドメイン、NKp30、NKp44、NKp46、GITR、CD81、CD160、DAP10およびB7-H3が挙げられる。他の共刺激ドメイン(例えば、他のタンパク質からの)は当業者には明らかであり、本開示の代替実施形態と関連して使用することができる。共刺激ドメインは、それが由来する分子の細胞内部分全体、または天然の細胞内シグナル伝達ドメイン全体、またはその機能的断片もしくは誘導体を含むことができる。本開示のSARは、ゼロ、1つまたは複数の共刺激ドメインを含んでもよい。
「共刺激分子」または「共刺激受容体」という用語は、共刺激リガンドと特異的に結合し、それによって増殖、活性化またはサイトカイン分泌など、これらに限定されない免疫細胞による共刺激応答を媒介する免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞など)上の同族結合パートナーを指す共刺激細胞外分子は、効率的な免疫応答に寄与する、抗原受容体またはそのリガンド以外の細胞表面分子です。共刺激分子には、MHC クラス I 分子、BTLA、Toll リガンド受容体、OX40、Dap10、CD27、CD28、CD2、CD5、CD8、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/ CD18)、ICOS (CD278)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CD81、および 4-1BB (CD137)。共刺激受容体は、NK 細胞やマクロファージなどの T 細胞以外の細胞上で発現される場合があります。
「cTCR」という用語は、野生型TCR核酸コード配列、およびTCRに由来しない抗原結合ドメインに連結された対応する野生型TCRタンパク質を指す。 cTCRは、(Gross、Waks、およびEshhar、1989)に記載されている ADDIN EN.CITE 。 cTCRは、いくつかの実施形態において、参照対照として使用される。例えば、CD19結合ドメインおよびCD19-SIR(変異体TCR鎖およびCD19結合ドメインを含む)を有するcTCRは、標的抗原に対して異なる発現および/または異なる結合親和性を有することになる。
「サイトゾル」または「細胞質」という用語は、薬剤、例えば、成熟型の細胞の細胞質に位置するタンパク質を指す。サイトゾルタンパク質は核に移行できますが、膜貫通タンパク質ではなく、細胞外に分泌されません。
は、発熱、低血圧、息切れ、腎機能障害、呼吸器疾患などの一連の兆候や症状を伴って現れる細胞療法(例、SAR-T、二重特異性T細胞結合抗体など)の合併症です。肺機能不全および/または毛細管漏出症候群。
「変性疾患」という用語は、細胞の変性変化に基づく継続的なプロセスの結果として組織や器官に影響を及ぼし、通常の身体の磨耗や運動や食事などのライフスタイルの選択によるものであっても、時間の経過とともにますます悪化する病気を指します。習慣。変性疾患の例には、アルツハイマー病、クロイツフェルト・ヤコブ病、糖尿病(II型)、およびアテローム性動脈硬化症が含まれる。
本明細書で使用される用語「由来」は、第1の分子と第2の分子との間の関係を示す。これは一般に、第 1 分子と第 2 分子の間の構造的類似性を指し、第 2 分子に由来する第 1 分子に対するプロセスやソースの制限を意味したり含んだりするものではありません。例えば、抗体分子に由来する抗原結合ドメインの場合、抗原結合ドメインは、必要な機能、すなわち抗原に結合する能力を有するのに十分な抗体構造を保持している。これは、抗体を産生する特定のプロセスに対する制限を意味するものではなく、例えば、抗原結合ドメインを提供するために、抗体配列から始めて、目的外の配列を削除するか、または突然変異を導入しなければならないことを意味するものではない。抗原結合ドメインで。
「二量体化分子」という用語は、本明細書で使用される場合、第1のスイッチドメインと第2のスイッチドメインとの結合を促進する分子を指す。実施形態において、二量体化分子は、対象において天然に存在しないか、または有意な二量体化をもたらす濃度では存在しない。実施形態では、二量体化分子は小分子、例えばラパマイシンまたはラパログ、例えばRAD001、リミデュシドまたはAP20187である。リミドゥシドは、約0.01~1mg/kgであり得、細胞培養物中で約0.1nMのEC50を有する。 AP20187は、単回または複数回の用量で約2~10 mg/kg/日投与することができる。
本明細書に記載の標的抗原の発現に関連する疾患、または標的を発現する細胞に関連する状態が含まれるが、これらに限定されない。本明細書に記載の抗原には、例えば、癌もしくは悪性腫瘍などの増殖性疾患、または骨髄異形成、骨髄異形成症候群もしくは骨髄増殖性障害または前白血病などの前癌状態が含まれる。または、本明細書に記載の標的抗原を発現する細胞に関連する非癌関連の兆候。
本明細書で使用される「遺伝子改変細胞によって標的化される疾患」は、治療を達成するために遺伝子改変細胞が罹患細胞を標的とするか健康な細胞を標的とするかに関係なく、本開示の遺伝子改変細胞による、任意の疾患に何らかの様式で関与する任意の細胞の標的化を包含する。有益な結果。
用語 「解離定数( K d ) 」は、受容体-リガンド(結合ドメイン-同族体など)相互作用の解離の平衡定数として定義されます。いくつかの実施形態では、本開示のSARは、約0.1pM~約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。
本明細書で使用される「非天然免疫受容体の多様なセット」または「SARの多様なセット」とは、複数の非天然免疫受容体を指す。 または抗原を標的とするSARS。実施形態では、SARの多様なセットは、シグナル伝達鎖または「バックボーン」の多様なセットに連結された同じ結合ドメインを有する。一実施形態では、SARの多様なセットは、標的抗原に対して多様な範囲の結合親和性を有し得る。一実施形態では、SARの多様なセットは、多様な発現レベルを示し得る。
本明細書で使用される場合、「エピトープ」は、免疫応答を誘発することができる抗原の部分、または抗体もしくは抗体断片に結合する抗原の部分であると定義される。エピトープはタンパク質配列または部分配列でありえます。
本明細書で使用される場合、用語「エンゲージャー」は、免疫細胞(例えば、 T細胞、NK細胞、NKT細胞、B細胞、マクロファージ、好中球)および免疫細胞の活性化をもたらす腫瘍細胞。エンゲージャーの例としては、二重特異性 T 細胞エンゲージャー (BiTE)、二重特異性キラー細胞エンゲージャー (BiKE)、三重特異性キラー細胞エンゲージャー (TRiKE)、または多重特異性キラー細胞エンゲージャー、またはユニバーサルが挙げられますが、これらに限定されません。複数の免疫細胞タイプと互換性のあるエンゲイジャー。
「発現ベクター」という用語は、発現されるヌクレオチド配列に作動可能に連結された発現制御配列を含む組換えポリヌクレオチドを含むベクターを指す。発現ベクターには、発現に十分なシス作用性エレメントが含まれます。発現のための他の要素は、宿主細胞によって、またはインビトロ発現系で供給され得る。発現ベクターには、組換えポリヌクレオチドを組み込むコスミド、プラスミド(例えば、裸の、またはリポソームに含まれる)およびウイルス(例えば、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス)を含む当技術分野で知られているすべてのベクターが含まれる。
タンパク質(例えば、SAR、IL-2、IL-15など)の「機能部分」(「生物学的活性部分」 )とは、完全長タンパク質または成熟タンパク質の1つまたは複数の機能を保持するタンパク質の部分を指す。 IL-12またはIL-15のそのような機能には、NK細胞生存の促進、NK細胞およびT細胞の活性化および増殖の調節、ならびに造血幹細胞からのNK細胞発生のサポートが含まれる。
本明細書で使用される場合、「F(ab)」は、抗原に結合するが一価であり、Fc部分を持たない抗体構造の断片を指し、例えば、酵素パパインによって消化された抗体は2つのF(ab)を生成する。フラグメントおよびFcフラグメント(例えば、重(H)鎖定常領域;抗原に結合しないFc領域)。
本明細書で使用される場合、「F(ab')2」は、全IgG抗体のペプシン消化によって生成される抗体フラグメントを指し、このフラグメントは2つの抗原結合(ab')(二価)領域を有し、各(ab')領域は抗原に結合するためにSS結合によって結合されたH鎖の一部と軽(L)鎖の2つの別々のアミノ酸鎖であり、残りのH鎖部分は一緒に結合されている。 「F(ab')2」フラグメントは、2 つの個別の Fab' フラグメントに分割できます。
本明細書で使用される「FcRγ」または「FCER1G」または「FCRG」または「FcRy」という用語は、Gene ID: 2207で表される遺伝子を指します。これは、高親和性IgE受容体および他のFc受容体の一部であるジスルフィドリンカー膜貫通シグナル伝達アダプターです。 。
用語「機能的部分」は、SARに関して使用される場合、それが一部であるSAR(親SAR)の生物学的活性を保持するSARの任意の部分または断片を指す。機能的部分には、例えば、標的細胞を認識、あるいは疾患を検出、治療、予防する能力を、親SARと類似程度、同程度、あるいはそれ以上に保持するSARの部分が含まれる。親SARに関して、機能部分は、例えば、親SARの約10%、25%、30%、50%、68%、80%、90%、95%、またはそれ以上を含み得る。
例えば、可変重鎖領域と可変軽鎖領域を一緒に)、単独でまたは組み合わせて使用されるグリシンおよび/またはセリン残基などのアミノ酸からなるペプチドリンカーを指す。 )。一実施形態では、柔軟なポリペプチドリンカーは、Gly/Serリンカーであり、アミノ酸配列(Gly-Gly-Gly-Gly-Ser) 、(例えば、配列番号2431)を含み、ここで、nは、以下に等しい正の整数である。たとえば、n= 1 、n=2、n=3。 n=4、n=5およびn=6、n=7、n=8、n=9およびn=10。一実施形態では、柔軟なポリペプチドリンカーには、(Gly 4 Ser) 4または(Gly 4 Ser) 3が含まれるが、これらに限定されない
本明細書で使用される「遺伝子改変細胞」、「リダイレクト細胞」、「遺伝子操作細胞」または「改変細胞」は、本開示のSARを発現する細胞を指す。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、SARをコードするベクターを含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、同じベクター内にSARおよび1つまたは複数のアクセサリー分子(例えば、 PDL1、PDL2、crmA、MC159など)をコードするベクターを含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、SARをコードする第1のベクターおよびアクセサリー分子をコードする第2のベクターを含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、SARをコードする第1のベクターと、2つ以上のアクセサリー分子をコードする第2のベクターとを含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、SARをコードする第1のベクター、第1のアクセサリー分子をコードする第2のベクター、および第2のアクセサリー分子をコードする第3のベクターを含む。
本明細書で定義される「HLA非依存性TCR」または「MHC非依存性TCR」は、MHC制限とは独立して抗原を認識できるTCRである。例示的な実施形態では、HLA非依存性TCRは、MHC複合体によって提示されない細胞表面上の抗原に結合し得る。一実施形態では、HLA非依存性TCRは、MHC複合体による提示とは独立して細胞表面上に発現される抗原に結合し得る。 HLA非依存性TCRは、天然に存在するTCRであり得る。例示的な実施形態では、HLA非依存性TCRは、遍在的に発現される単型抗原提示分子であるMR1を認識するMC.7.G5(MC7G5)である。 HLA非依存性TCRは、操作されたTCRまたは組換えTCRであり得る。例示的な実施形態では、HLA非依存性TCRは、CD19、CD20、メソテリン、PSMS、またはBCMAなどの細胞表面上で発現されるタンパク質に結合し得る操作されたTCRである。 TCRの可変ドメインを操作する方法(例えば、CDR移植など)は当技術分野で知られており、タンパク質(例えば、CD19、MSLN、PSMAなど)またはタンパク質に結合できるHLA非依存性TCRを生成するために使用することができる。エピトープはMHC複合体とは独立して細胞外に発現します。本開示は、1つ以上のAABDを含む、HLA非依存性TCRを含むTCRの骨格を有する二重特異性、バイパラトピックおよび多重特異性SARを提供する。TCR(例えば、HLA非依存性TCR)の骨格を有する本開示のSARのAABDドメインは、完全ヒト、ヒト化または非ヒトであり得る。一実施形態において、本開示は、1つ以上の完全ヒトvHドメインを含むTCR(例えば、HLA非依存性TCR)を提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上の完全ヒトvLドメインを含むTCR(例えば、HLA非依存性TCR)を提供する。
本明細書で定義される「HLA非依存性TCR可変ドメイン」は、HLA非依存性様式で抗原に結合することができるTCRの可変ドメインである。 HLA非依存性可変ドメインは、HLA非依存性TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの可変ドメインであり得る。 HLA非依存性TCR可変ドメインは、単一可変ドメインTCR(すなわち、svd-TCR)であり得る。 HLA非依存性TCR可変ドメインは、天然に存在するHLA非依存性可変ドメインであってもよいし、操作されたHLA非依存性可変ドメインであってもよい。例示的な実施形態において、改変されたHLA非依存可変ドメインは、当技術分野で公知の技術(例えば、CDRグラフティング、ファージディスプレイライブラリーのスクリーニングなど)を使用して、タンパク質(例えば、CD19、CD22、BCMA、MSLN、PSMA)の細胞外ドメインに対して生成され得る。
本明細書で使用される場合、「HLA制限された」または「MHC制限された」とは、MHC分子とそのペプチドの両方を必要とする抗原認識を指す。 「HLA 制限を受けない」、「HLA 非依存性」、または「MHC 制限を受けない」抗原認識とは異なります。
本明細書で使用される場合、「異種遺伝子」という用語は、その自然環境にはない遺伝子を指す。例えば、異種遺伝子には、ある種から別の種に導入された遺伝子が含まれます。異種遺伝子には、何らかの方法で改変された(例えば、突然変異、複数のコピーの付加、非天然の調節配列への結合など)、生物に固有の遺伝子も含まれる。別の例として、異種遺伝子には、以前または将来の細胞系統または細胞の分化状態で発現される遺伝子が含まれる。異種遺伝子は、通常、染色体中の遺伝子配列と天然には見られないDNA配列と結合しているか、染色体の天然には見られない部分(例えば、遺伝子が通常発現していない遺伝子座で発現している遺伝子)と結合している点で、内因性遺伝子とは区別される。
本明細書で使用される「ヒンジ領域」(HR)は、SARの抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとの間にある親水性領域を指す。ヒンジ領域には、抗体のFc断片またはその断片もしくは誘導体、抗体のヒンジ領域またはその断片もしくは誘導体、抗体のCH2領域、抗体のCH3領域、人工スペーサー配列またはそれらの組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。ヒンジ領域の例としては、CD8aヒンジ、および、例えばIgG(ヒトIgG4など)のGly3またはCH1およびCH3ドメインと同程度に小さくてもよいポリペプチドからなる人工スペーサーが挙げられるがこれらに限定されない。いくつかの実施形態において、ヒンジ領域は、(i)IgG4のヒンジ、CH2およびCH3領域、(ii)IgG4のヒンジ領域、(iii)IgG4のヒンジおよびCH2、(iv)CD8aのヒンジ領域、(v)IgG1のヒンジ、CH2およびCH3領域、(vi)IgG1のヒンジ領域、または(vi)IgG1のヒンジおよびCH2領域のいずれか1つ以上である。いくつかの例示的なヒンジ領域が本開示の表29に提供されている。他のヒンジ領域も当業者には明らかであり、本開示の代替実施形態と関連して使用することができる。
「免疫障害」という用語は、免疫系の機能不全を特徴とする疾患を指す。自己免疫疾患は、体の正常な部分に対する異常な免疫反応によって生じる症状です。自己免疫疾患には少なくとも 80 種類あります。
例えば、免疫エフェクター応答の促進に関与する細胞を指す。免疫エフェクター細胞の例としては、T細胞、例えば、アルファ/ベータT細胞およびガンマ/デルタT細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、マスト細胞、単球/マクロファージおよび骨髄性細胞が挙げられる。派生食細胞。
「免疫エフェクター機能」または「免疫エフェクター応答」、「エフェクター機能」とは、分化した細胞の特殊な機能を指す。 T細胞またはNK細胞のエフェクター機能は、例えば、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性またはヘルパー活性であり得る。例えば、免疫エフェクター機能または免疫応答は、標的細胞の死滅または成長もしくは増殖の阻害を促進する、T細胞またはNK細胞の特性を指す。 T 細胞の場合、一次刺激と共刺激は免疫エフェクターの機能または応答の例です。抗原提示細胞(例えば、樹状細胞)の場合、抗原提示およびサイトカイン分泌はエフェクター機能の例である。
本明細書で使用される「免疫応答」とは、自然免疫、体液性免疫、細胞性免疫、免疫、炎症反応、獲得(適応)免疫、自己免疫および/または過剰免疫を含むがこれらに限定されない免疫を指す。
本明細書で使用される場合、「インターロイキン-2」(「IL-2」)および「インターロイキン-15」(「IL-15」)は、TおよびNK細胞の活性化および増殖を調節するサイトカインを指す。これらのサイトカインは多くの生物学的活性を共有しています。それらは共通の受容体サブユニットに結合することがわかっており、同じ受容体をめぐって競合する可能性があり、その結果、互いの活性を負に制御する可能性があります。様々なIL-2およびIL-15分子の配列が当技術分野で知られている。一態様では、IL-2は、野生型IL-2、または70~99.9%のアミノ酸配列相同性を有するその変異体(例えば、配列番号7833~7837)である。一態様では、IL-15は、野生型IL-15、または70~99.9%のアミノ酸配列相同性を有するその変異体(例えば、配列番号7838~7841)である。いくつかの態様では、IL-2は哺乳類IL-2である。いくつかの態様では、IL-15は、哺乳動物IL-15(例えば、ホモ・サピエンス・インターロイキン15(IL15)、転写バリアント3、mRNA、NCBI参照配列:NM_000585.4;カニスルプス・ファミリアリス・インターロイキン15(IL15)、mRNA、 NCBI 参照配列: NM_001197188.1; Felis catusインターロイキン 15 (IL15)、mRNA、NCBI 参照配列: NM_001009207.1)。特定の態様では、IL-2またはIL-15のすべてまたは機能的部分は、膜貫通タンパク質のすべてまたは一部に結合している。一態様では、NK細胞またはT細胞は、膜貫通タンパク質の全部または一部に融合したIL-2またはIL-15の全部または一部を含む融合タンパク質を発現する。特定の態様では、膜貫通タンパク質の部分は、膜貫通タンパク質の膜貫通ドメインの全部または一部を含む。
本明細書で使用される「細胞内シグナル伝達ドメイン」(ISD)または「活性化ドメイン」という用語は、分子の細胞内シグナル伝達部分を指す。細胞内シグナル伝達ドメインは、細胞の免疫エフェクター機能を促進するシグナルを生成します。免疫エフェクター機能の例には、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性およびヘルパー活性が含まれます。エフェクター機能シグナルを伝達するドメインの例としては、 T細胞受容体複合体のz鎖またはそのホモログ、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3ポリペプチド(γ、δおよびε)、sykファミリーチロシンキナーゼ(Syk、ZAP 70など)、srcファミリーチロシンキナーゼ(Lck、Fyn、Lynなど)およびCD2、CD5、CD28のようなT細胞形質導入に関与する他の分子が挙げられるがこれらに限定されるものではない。他の細胞内シグナル伝達ドメインは当業者には明らかであり、本開示の代替実施形態と関連して使用することができる。
別の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、「一次細胞内シグナル伝達ドメイン」または「活性化ドメイン」を含むことができる。例示的な一次細胞内シグナル伝達ドメインには、一次刺激または抗原依存性シミュレーションに関与する分子に由来するものが含まれる。別の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは共刺激細胞内ドメインを含むことができる。例示的な共刺激細胞内シグナル伝達ドメインには、共刺激シグナルまたは抗原非依存性刺激を担う分子に由来するドメインが含まれる。例えば、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3zの細胞質配列を含むことができ、共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、CD28または41BBなどの共受容体または共刺激分子に由来する細胞質配列を含むことができる。
一次細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフまたはITAMとして知られるシグナル伝達モチーフを含むことができる。一次細胞質シグナル伝達配列を含むITAMの例としては、CD3-ゼータ、共通FcRガンマ(FCER1GまたはFcRγまたはFCRG)、FcガンマRIIIa、FcRベータ(FcイプシロンR1b)、CD3ガンマ、CD3に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない。デルタ、CD3 イプシロン、CD79a、CD79b、DAP10、および DAP12。
本明細書で使用される「単離された」という用語は、他の物質を実質的に含まない分子、生物学的物質、または細胞物質を指す。一態様では、「単離された」という用語は、他のDNAまたはRNAから分離された、DNAまたはRNAなどの核酸、またはタンパク質またはポリペプチド(例えば、抗体またはその誘導体)、または細胞または細胞小器官、または組織または器官を指す。天然源に存在するRNA、タンパク質またはポリペプチド、細胞または細胞小器官、または組織または器官。 「単離された」という用語はまた、組換えDNA技術によって生成される場合には細胞材料、ウイルス材料、もしくは培地を実質的に含まない、または化学合成される場合には化学前駆体もしくは他の化学物質を実質的に含まない核酸またはペプチドを指す。さらに、「単離された核酸」は、天然には断片として存在せず、天然の状態では見出されないであろう核酸断片を含むことを意味する。 「単離された」という用語は、本明細書では、他の細胞タンパク質から単離されたポリペプチドを指すのにも使用され、精製されたポリペプチドと組換えポリペプチドの両方を包含することを意味する。 「単離された」という用語は、本明細書では、他の細胞または組織から単離された細胞または組織を指すためにも使用され、培養された細胞または組織と操作された細胞または組織の両方を包含することを意味する。
「長いリンカー」または「長いリンカードメイン」は、長さが25~500アミノ酸のリンカーである。一実施形態では、長いリンカーは、約25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125である。 、130、135、140、145、150、160、170、180、190、200、210、220、230、250、275、300、325、350、375、400、450、500のアミノ酸および任意の数長さ的にはその間。一実施形態では、長いリンカーは、25~125アミノ酸の長さである。一実施形態では、長いリンカーは、長さが50~150アミノ酸である。一実施形態では、長いリンカーは、75アミノ酸と175アミノ酸との間の長さである。一実施形態では、長いリンカーは、長さが100~200アミノ酸である。一実施形態では、長いリンカーは、長さが120~220アミノ酸である。一実施形態では、長いリンカーは、長さが100~300アミノ酸である。
一実施形態において、リンカーは、免疫グロブリン(Ig)ドメインもしくはIg様ドメインもしくはそれらの断片をコードするか、またはそれらを含む。 「Igドメイン」、「Igリンカードメイン」、「Ig様ドメイン」または「Ig様リンカードメイン」という用語は、本開示では互換的に使用される。免疫グロブリンドメインは、ギリシャのキートポロジーを持つ2枚のβシートに配置された7~9本の逆平行β鎖の2層サンドイッチからなるタンパク質ドメインの一種で、約125個のアミノ酸から構成されています。 Ig ドメインは、IgV、IgC1、IgC2、または IgI として分類できます。 9 つのベータ鎖を持つ IgV ドメインは、一般に 7 つのベータ鎖を持つ IgC ドメインよりも長くなります。一実施形態では、リンカーはIgVドメインまたはその断片を含む。一実施形態では、リンカーはIgCドメインまたはその断片を含む。 Ig ドメインは、免疫グロブリン、T 細胞受容体鎖、クラス I MHC、クラス II MHC、β2 ミクログロブリン、コレセプター (例: CD4 、CD8、CD19など)、抗原受容体アクセサリー分子 (例: CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD79a ) に見られます。 、CD79b)、共刺激分子または阻害分子(例えば、CD28、CD80、 CD86)、NK細胞受容体(例えば、KIR)、白血球免疫ログリン様受容体(LILR)、IgSF CAM(例えば、NCAM、ICAM、CD2など)、サイトカイン受容体(例えば、IL-1R、CSF-1Rなど)、成長因子受容体(例えば、PDGFR)、受容体チロシンキナーゼおよびホスファターゼ、Ig結合受容体、細胞骨格タンパク質(例えば、タイチン、パRAJIンなど)および他のタンパク質(例えば、 、CD147、CD90など)。例示的なIgリンカードメインは、IgCL(配列番号3536)およびIgG1-CH1(配列番号3537)である。追加の例示的なIgリンカーを表13に示す(配列番号(PRT):3538~3569)。一実施形態では、リンカーはEセットドメインを有する。 Eセットドメインは、免疫グロブリンおよび/またはフィブロネクチンIII型スーパーファミリーに関連している可能性がある「初期」Ig様フォールドファミリーです。一実施形態では、リンカーはフィブロネクチンIII型ドメインを有する。
いくつかの実施形態において、本開示のSARは以下を含むFv様またはFc-TCR抗原結合モジュールを含む;a)vL、VαまたはVγドメインからなる第1の抗原結合ドメインを含む第1のポリペプチド鎖と、b)vH、VβまたはVδドメインを含む第2の抗原結合ドメインを含む第2のポリペプチド鎖。いくつかの実施形態では、vL、VαまたはVγドメインのC末端に融合された第1のペプチドリンカーおよび/またはvL、VαまたはVγドメインのC末端に融合された第2のペプチドリンカーが存在する。いくつかの実施形態では、第1および第2のペプチドリンカーは互いに結合することができる。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、免疫グロブリン重鎖および/または軽鎖定常領域に由来する。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、CH3抗体ドメインまたはその変異体を含む。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーに含まれる免疫グロブリン重鎖定常ドメイン(例えば、CH1またはCH3)は、IgG(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4)、IgA(例えば、IgA1またはIgA2)、IgD、 IgM または IgE 重鎖、場合によりヒト。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、TCRサブユニット定常領域に由来する。例えば、いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、a)TCRαおよびβサブユニット定常ドメインに由来する。または b) TCR γ および δ サブユニット定常ドメイン。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは合成である。いくつかの実施形態では、vL、VαまたはVγおよびvH、VβまたはVδのCDRのすべてが、同じ抗体またはTCR部分に由来する。いくつかの実施形態では、vL抗体ドメインおよびvH抗体ドメインは、2つ以上の抗体部分に由来する抗体CDRを含む。いくつかの実施形態では、vL抗体ドメインは、vH抗体ドメインに由来する抗体CDRを含み、および/またはvL抗体ドメインは、vH抗体ドメインに由来する抗体CDRを含む。いくつかの実施形態では、vL抗体ドメインは、1つの抗体に由来するフレームワーク領域および別の抗体に由来する1つまたは複数のCDRを含み、および/またはvH抗体ドメインは、1つの抗体に由来するフレームワーク領域および別の抗体に由来する1つまたは複数のCDRを含む。いくつかの実施形態では、VαドメインおよびVβドメインは、2つ以上のTCRに由来するTCR CDRを含む。いくつかの実施形態では、VαドメインはVβ TCRドメインに由来するCDRを含み、および/またはVβドメインはVαドメインに由来するCDRを含む。いくつかの実施形態では、Vαドメインは、1つのTCRに由来するフレームワーク領域および別のTCRに由来する1つ以上のCDRを含み、および/またはVβドメインは、1つのTCRに由来するフレームワーク領域および別のTCRに由来する1つ以上のCDRを含む。いくつかの実施形態では、VγドメインおよびVδドメインは、2つ以上のTCRに由来するTCR CDRを含む。いくつかの実施形態では、VγドメインはVδ TCRドメインに由来するCDRを含み、および/またはVδドメインはVγドメインに由来するCDRを含む。いくつかの実施形態では、Vγドメインは、1つのTCRに由来するフレームワーク領域および別のTCRに由来する1つまたは複数のCDRを含み、および/またはVδドメインは、1つのTCRに由来するフレームワーク領域および別のTCRに由来する1つまたは複数のCDRを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のポリペプチド鎖は、共有結合(例えば、ペプチドまたは他の化学結合)または非共有結合などによって結合される。いくつかの実施形態では、第1および第2の抗原結合ドメインはジスルフィド結合によって連結されている。いくつかの実施形態では、第1および第2のペプチドリンカーはジスルフィド結合によって連結される。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それが由来する配列と比較して1つまたは複数の修飾(例えば、アミノ酸置換、挿入、および/または欠失)を含む変異体である。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、互いに対するそれらの結合親和性を実質的に変化させない1つまたは複数の修飾を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、互いの結合親和性を増大させる、および/または天然に存在しないジスルフィド結合を導入する1つまたは複数の修飾を含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のペプチドリンカーは、ノブイントゥホール修飾を含む(例えば、Carter P.Immunol Methods.248:7-15、2001を参照)。いくつかの実施形態では、第1および第2のペプチドリンカーは、それらの相互の会合を強化するために静電ステアリングによって修飾される(例えば、WO2006106905およびGunasekaran Kら、J Biol Chem.285:19637-46、2010を参照)。いくつかの実施形態では、Fv様またはTCR-Fv様抗原結合モジュールは、ヒト、ヒト化、キメラ、半合成、または完全合成である。
IgCLおよびIgG1-CH1リンカーを含む例示的なSAR構築物は、CD8SP-hu-mROO5-1-vL-xho-IgCL-Bam-DAP10-opt1-Spe-CD3zCP-opt1-F-P2A-dSPE-IgSP-hu-によって表される。 mROO5-1-vH-Mlu-IgG1-CH1-Kpn-DAP10-opt2-Xba-CD3zCP-opt2-F-F2A-dXBA-Nde-K13-opt(配列番号5869)。この構築物中のIgG1-CHIインカー(配列番号(DNA): 1143、配列番号(PRT):3537)は、表13に示す他のIg様リンカー、例えばIgG2-IC-CHI1、IgG3-CHI1で置き換えることができる。 、IgG4-CHI1、IgAI-CHI1、IgA2-CHI1、IgD-CHI1、IgE-CHI1またはIgM-CHI1。 IgCLおよびIgG1-CH1リンカーは、それぞれTCRαおよびTCRβに由来するIg様リンカーによって置き換えることもできる(表13) 。あるいは、IgCLおよびIgG1-CH1リンカーは、TCRγ鎖およびTCRδ鎖に由来するIg様リンカーによって置き換えることもできる(表13) 。
本明細書で使用する場合、「リガンド」という用語は、受容体に結合する分子を指す。特に、リガンドは別の細胞上の受容体に結合し、細胞間の認識および/または相互作用を可能にします。
本明細書で使用される場合、用語「リンカー」(「リンカードメイン」または「リンカー領域」とも)は、SARポリヌクレオチドまたはSARポリヌクレオチドの2つ以上のドメインまたは領域を結合するオリゴまたはポリペプチド(またはポリペプチドをコードするオリゴ)を指す。ポリペプチド、それぞれ本明細書に開示される。リンカーは、1 ~ 500 アミノ酸の長さまたは 3 ~ 1500 ヌクレオチドの長さのいずれかにすることができます。いくつかの実施形態では、「リンカー」は、切断可能または非切断可能である。特に明記しない限り、本明細書で使用される「リンカー」という用語は、非切断性リンカーを意味する。前記非切断性リンカーは、隣接するタンパク質ドメインの互いに対する自由な動きを可能にする柔軟な残基から構成され得る。このような残基の非限定的な例としては、グリシンおよびセリンが挙げられる。いくつかの実施形態では、リンカーは非柔軟性残基を含む。切断可能なリンカーの例としては、2Aリンカー(例えば、T2A)、2A様リンカーまたはその機能的等価物、およびそれらの組み合わせが挙げられる。いくつかの実施形態では、リンカーには、ピコルナウイルス2A様リンカー、ブタテスコウイルス(P2A)、テセアシグナウイルス(T2A)のCHYSEL配列、またはそれらの組み合わせ、変異体および機能的等価物が含まれる。いくつかの実施形態では、リンカー配列は、2Aグリシンと2Bプロリンとの間の切断をもたらすモチーフを含み得る(例えば、 T2A配列を参照)。いくつかの例示的な切断可能なリンカーの核酸配列は配列番号1233から配列番号1238で提供され、いくつかの例示的なリンカーのアミノ酸配列は配列番号3627から配列番号3632で提供される。本明細書で使用される用語は、当業者には容易に理解されるであろう。リンカーモジュールは、表 13 に示す TCR および抗体リンカーも指します。
一実施形態では、切断効率を高めるために、Ser-Gly-Ser-Gly(SGSG)モチーフ(配列番号3633)も切断可能なリンカー配列の上流に追加される。切断可能なリンカーの潜在的な欠点は、N 末端タンパク質の末端に残された小さな 2A タグがタンパク質の機能に影響を与えたり、タンパク質の抗原性に寄与したりする可能性があることです。この制限を克服するために、いくつかの実施形態では、翻訳後の残りの2Aペプチドの切断を促進するために、フリン切断部位(RAKR)(配列番号3635)がSGSGモチーフの上流に追加される。
「レンチウイルス」という用語は、レトロウイルス科の属を指します。レンチウイルスは、非分裂細胞に感染できるという点で、レトロウイルスの中でも独特です。大量の遺伝情報を宿主細胞の DNA に送達できるため、遺伝子送達ベクターの最も効率的な方法の 1 つです。 HIV、SIV、および FIV はすべてレンチ ウイルスの例です。
「レンチウイルスベクター」という用語は、レンチウイルスゲノムの少なくとも一部に由来するベクターを指し、特に、Milone et al.に提供されているような自己不活化レンチウイルスベクターを含む。 、モル。それで。 17(8): 1453-1464 (2009)。臨床で使用され得るレンチウイルスベクターの他の例には、例えば、 Oxford BioMedicaのLENTIVECTOR(登録商標)遺伝子送達技術、LentigenのLENTIMAX(商標)ベクターシステムなどが含まれるが、これらに限定されない。非臨床タイプのレンチウイルスベクターも入手可能であり、当業者には知られているであろう。レンチウイルスベクターの他の例は、pLENTI-EF1α(配列番号1)、pLENTI-EF1α-DWPRE(配列番号2)、pCCLc-MNDU3-WPRE(配列番号4)およびpCCLc-MNDU3-Eco-Nheである。 -Sal-WPRE (配列番号5)。例示的な実施形態では、SAR、またはSARプラスアクセサリーモジュール、またはアクセサリーモジュールをコードする核酸断片は、pLENTI-EF1αとpCCLc-EF1αに存在するNhe I部位とSal I部位との間にクローニングすることができる。 MNDU3-Eco-Nhe-Sal-WPREベクターは、当技術分野で知られている方法を使用する。
本明細書で使用される「キラー細胞免疫グロブリン様受容体」または「KIR」は、ナチュラルキラー細胞およびT細胞のサブセットによって発現される膜貫通糖タンパク質のファミリーを指す。
哺乳綱の任意のメンバーを指す。
「マーカー遺伝子」は、標的細胞によって通常は発現されないタンパク質をコードしており、これにより形質導入の成功の同定が可能になります。マーカー遺伝子は、形質導入された細胞(例えば、SAR発現細胞)の選択的除去または濃縮にも使用することができる。例示的なマーカー遺伝子には、tEGFR、CD20、tCD19、tBCMA、およびRQR8が含まれる。
「多目的スイッチ」または「多目的遺伝子」は、自殺、生存、およびマーカー機能を提供するタンパク質をコードします。一実施形態では、上記の機能はすべて単一のポリペプチド鎖によって提供される。多目的スイッチの例としては、IL2-tBCMA、IL15-tBCMA、IL2-RQR8、IL2-tHer2などが挙げられます。
本明細書で使用される「ミモトープ」は、エピトープの構造を模倣する巨大分子、多くの場合ペプチドである。この特性により、エピトープによって引き起こされるものと同様の抗体応答が引き起こされます。特定のエピトープ抗原に対する抗体は、そのエピトープを模倣するミモトープを認識します。ミモトープはペプチドアプタマーの一種です。
用語「多鎖合成抗原受容体」「多鎖SAR」は、2つ以上のポリペプチド鎖を含む合成抗原受容体を意味する。マルチチェーン SAR はダブルチェーン SAR になる場合があります。二重鎖SARは、2つの膜関連ドメイン(例えば、膜貫通ドメインまたは膜アンカードメイン)を含む。 CD19を標的とする例示的な多鎖SARは、CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-vL-Xho-CD16-F158V-FL-TMCP-v1-F-P2A-Spe-SP-Bst-CD19-hu-mROO5-1である。 -vH-Mlu-CD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3-F-F2A-Xba-PAC(配列番号(DNA):5451および配列番号(PRT):6283)。このSAR構築物では、hu-mROO5-1 vL フラグメントは CD16-F158V-FL-TMCP-v1 モジュールに操作可能にリンクされ、hu-mROO5-1-vH フラグメントはCD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3に操作可能にリンクされます。 TMCP-v3。この SAR の 2 つの鎖は、フリン (F) および P2A 切断可能なリンカー配列によって分離されています。この SAR 構築物はまた、フリン (F) および F2A 切断可能リンカー配列によって SAR ポリペプチドから分離されたピューロマイシン耐性遺伝子 (PAC) も発現します。 SAR はモジュール設計であるため、CD16A-F158V-S197P-FL-v3 モジュールおよび CD16-F158V-FL-TMCP-v1 モジュールを他のシグナリング モジュールに置き換えて、異なるシグナリング チェーンで SAR を生成できます。さらに、hu-mROO5-1 vLおよびhu-mROO5-vHフラグメントは、異なる抗原を標的とするSARを生成するために、他の抗原を標的とする抗原結合ドメイン(例えば、vL、vH、vHH、FHVH、セントチリン、svd-TCRなど)によって置換され得る。 。このようなマルチチェーン SAR の例は、仮出願の表 41に示されています。 (例えば、配列番号5451~5462、5483~5494、5515~5526、5547~5558、5579~5590、5611~5622、5643~5654など)。これらの新規なSARの発現および活性は、最適な機能活性を有するSARを選択するために、本開示に記載される方法を使用して試験することができる。
本明細書で使用される場合、「MHC」または「主要組織適合性複合体」は、哺乳動物における多数の遺伝子によってコードされる細胞表面分子を指す。 MHC 分子にはクラス I とクラス II が含まれます。クラス I 分子は、ヒトでは「HLA」または「ヒト白血球抗原」とも呼ばれます。 HLA 分子発現の複雑さの一部により、HLA は HLA システムとも呼ばれます。ヒトは、典型的にはプロセシングされた抗原をCD8細胞に提示することに関与する、すなわちHLA制限されたHLA-A、HLA-BおよびHLA-C分子を発現する。 DR、DQ、DPなどのクラスII分子は、典型的には、CD4+細胞への外部由来ペプチドの提示、すなわちMHCクラスII制限に関与している。一般に制限される MHC には、移植 (骨髄) マッチングの場合と同様に、クラス I とクラス II の両方が含まれます。
本明細書で使用される「ネイティブ」または「天然に存在する」または「内因性」とは、細胞にとって天然であるか、または細胞内で天然に発現される遺伝子、タンパク質、核酸(例えば、DNA、RNAなど)またはその断片を指す。したがって、T細胞の天然または内在性TCRα鎖ポリペプチドは、TCRα定常鎖に結合した可変ドメイン(Vα)からなる。天然または内在性のTCRα鎖前駆体ポリペプチドはまた、成熟ポリペプチドから切断されるアミノ末端シグナルペプチドからなる。
本明細書で使用される「天然受容体」または「天然受容体」または「内因性受容体」または「天然受容体」は、天然に存在し、抗原結合ドメインまたはリガンド結合ドメインを含む任意の受容体を指す。この用語には、他の哺乳動物種の機能的変異体、アイソフォーム、ホモログが含まれます。天然受容体は、標的に結合すると細胞シグナルを伝達することができる場合、「天然シグナル伝達受容体」または「天然シグナル伝達受容体」であり得る。天然に存在する受容体または天然受容体は、細胞に固有のものであるか、または細胞内で自然に発現される。天然に存在するシグナル伝達受容体または天然受容体の例としては、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DS4、NKG2Dなどが挙げられるが、これらに限定されない。本開示の目的では、CD3シグナル伝達鎖(CD3ε、CD3γ、CD3δおよびCD3ζ) は「天然に存在する受容体」の定義には含まれず、代わりにシグナル伝達アダプターとして分類されます。
本明細書で使用される場合、「非TCR天然受容体」または「非TCR天然シグナル伝達受容体」または「非TCR受容体」または「非TCRシグナル伝達受容体」という用語は、T細胞ではない受容体を指す。受容体(TCR)。非 TCR 受容体は、T 細胞以外の細胞でも発現する可能性があります。非 TCR 受容体は、CD3ζ、CD3ε、CD3δ、および/または CD3γ 鎖の発現を欠く細胞で発現する可能性があります。 「非TCR天然受容体」は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの膜貫通ドメインおよび/またはサイトゾルドメインを欠いている。 「非TCR天然受容体」はTCRシグナル伝達モジュール全体を動員しません。一実施形態では、「非TCR天然受容体」は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαポリペプチドを含まない。一実施形態では、「非TCR天然受容体」は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαのコード領域全体を含まない。一実施形態では、「非TCR天然受容体」は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの定常鎖全体を含まない。一実施形態では、「非TCR天然受容体」は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδまたはプレTCRαのヒンジドメイン全体(または接続ペプチド)を含まない。一実施形態では、「非TCR天然受容体」は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδまたはプレTCRαの膜貫通ドメインおよび細胞質ゾルドメイン全体を含まない。非 TCR 受容体は、T 細胞以外の細胞でも発現する可能性があります。 「非TCRシグナル伝達受容体」は、 TCR可変ドメイン(例えば、 Vα、Vβ、Vγ、Vδ)またはIgドメイン(例えば、配列番号1158~1175)などのTCRの断片を含み得る。非TCRシグナル伝達受容体は、TCR定常鎖全体(すなわち、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの定常鎖)を含まない。
本明細書で使用する場合、「非T細胞受容体モジュール」または「非TCRモジュール」または「非TCRシグナル伝達モジュール」または「NTCRM」という用語は、T細胞受容体膜貫通ドメインからなる配列を欠き、さらにT細胞受容体連結ペプチドおよび/または細胞内ドメインの全部または一部を欠く可能性のあるモジュールを指す。NTCRMは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδまたはpre-TCRαの膜貫通ドメインからなる配列を欠く。NTCRMはさらに、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδまたはプレTCRαの連結ペプチドおよび/または細胞内ドメインの全部または一部を欠くことがある。
本明細書で使用される場合、用語「非CD3アダプターモジュール」または「非CD3アダプター」または「非TCR/CD3アダプター」または「「非TCR/CD3シグナル伝達アダプター」または「NCAM」は、T細胞受容体/CD3受容体複合体の構成要素ではないシグナル伝達アダプターを指す。一実施形態において、「非TCR/CD3アダプター」は、CD3ε、CD3ζ、CD3γもしくはCD3δ鎖またはそれらの変異体の膜貫通領域および/または細胞質領域を含まない。
本明細書で使用される「N末端付近」という用語は、N末端30アミノ酸以内を意味する。。例えば、「vLおよび/またはvHドメインのN末端またはN末端近傍に作動可能に連結されたAABD」という用語は、vLまたはvHフラグメントのN末端に作動可能に連結されたAABD、またはvLまたはvHドメインを構成するN末端2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、25または30アミノ酸に作動可能に連結されたAABDを意味する。同様に、「Vaおよび/またはVbドメインのN末端またはN末端近傍に作動可能に連結されたAABD」という用語は、VaまたはVbフラグメントのN末端に作動可能に連結されたAABD、またはVaまたはVbドメインを構成するN末端2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25または30アミノ酸に作動可能に連結されたAABDを意味する。本開示のAABDは、直接または介在リンカー配列を介して、別のドメインのN末端またはその近くに機能可能に連結され得る。
本明細書で使用される場合、「ナチュラルキラー細胞受容体」または「NK受容体」は、ナチュラルキラー(NK)細胞において発現される細胞表面受容体を指し、他の哺乳動物種からの機能的変異体、アイソフォームおよび相同体を含む。 NK受容体は、活性化受容体であっても抑制性受容体であってもよい。例示的な活性化NK受容体には、 NKp30、NKp44、NKp46、NKG2DおよびKIR3DS4が含まれる。例示的な阻害性NK受容体には、CD94-NKG2A、TIGITおよびCD96が含まれる。
本明細書で使用される場合、「ナチュラルキラー細胞」(「NK細胞」)は、免疫系の細胞傷害性リンパ球の一種を指す。
本明細書で使用される場合、「NKp30」または「NCR3」は、腫瘍細胞の溶解においてNK細胞を助ける可能性がある天然の細胞傷害性受容体(NCR)であるタンパク質をコードする遺伝子(遺伝子ID:259197)である。この用語には、他の哺乳動物種の機能的変異体、アイソフォーム、ホモログが含まれます。
本明細書で使用される場合、「NKp44」または「NCR2」は、天然の細胞傷害性受容体(NCR)であるタンパク質をコードする遺伝子(遺伝子ID:9436)である。この用語には、他の哺乳動物種の機能的変異体、アイソフォーム、ホモログが含まれます。
本明細書で使用される場合、「NKp46」または「NCR1」は、天然の細胞傷害性受容体(NCR)であるタンパク質をコードする遺伝子(遺伝子ID:9437)である。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする 5 つの転写バリアントが発見されています。この用語には、他の哺乳動物種の機能的変異体、アイソフォーム、ホモログが含まれます。
本明細書で使用される場合、 「NKG2D」または「 KLRK1 」は、C型レクチンのメンバーであるタンパク質をコードする遺伝子(遺伝子ID:22914)である。コードされた膜貫通タンパク質は、II 型膜配向 (細胞外 C 末端を持つ) と C 型レクチン ドメインの存在によって特徴付けられます。この用語には、他の哺乳動物種の機能的変異体、アイソフォーム、ホモログが含まれます。
本明細書で使用される場合、「非天然作用物質」または「非天然」または「外因性」とは、細胞内で自然に発現されない作用物質を指す。別の言い方をすると、非天然物質は細胞内で発現するように「操作」されています。非天然物質は、天然物質のクローン版であってもよい。例示的な非天然物質としては、SAR(例えば、CAR、SIR、Ab-TCR、TFP、組換えTCR)が挙げられる。非天然物質は、レンチウイルスまたはレトロウイルス媒介遺伝子導入などの当技術分野で公知の遺伝子導入技術を使用して細胞内に発現させることができる。非天然物質は、外因性プロモーター(例えば、 EF1αプロモーター)または内因性プロモーター(例えば、 TCRαまたはTRACプロモーター)を使用して免疫細胞内で発現され得る。内因性遺伝子 (例、 CD16、NKp30など) がクローン化され、細胞内で異所的に発現される場合、それは非天然物質の別の例となります。
本明細書で使用される場合、「非天然免疫受容体」または「外因性免疫受容体」 「非天然受容体」は、免疫細胞において自然には発現されない免疫受容体を指す。別の言い方をすると、天然に存在しない免疫受容体は、免疫細胞内で発現するように「操作」されています。非天然免疫受容体は、天然免疫受容体のクローン化バージョンであり得る。あるいは、天然に存在しない免疫受容体は、組換え分子生物学技術を使用して生成されるキメラ受容体であってもよい。例示的な非天然免疫受容体は、SAR(例えば、第2世代CAR、SIR、cTCR、STAR、zSIR、Ab-TCR、TFP、および組換えTCR)である。
本明細書で使用される場合、「非天然TCR抗原結合ドメイン」または「外因性TCR抗原結合ドメイン」は、天然に存在するTCRに関してキメラで非天然であるTCR定常領域に作動可能に連結された結合ドメインを指す。 別の言い方をすれば、自然界に存在しないTCR抗原結合ドメインは、組換え分子生物学的技術を用いて、TCRと作動可能に結合するように "操作 "され、さらに抗原結合ドメインは、自然界に存在するTCRとは異なる分子から得られるか、またはその分子に由来する。本質的にTCRとは異なる抗原結合ドメインには、抗体vHおよびvLフラグメント、ヒト化抗体フラグメント、キメラ抗体フラグメント、受容体リガンドなどが含まれる。
本明細書で使用される場合、「非天然抗原結合ドメイン」または「非天然細胞外抗原結合ドメイン」または「異種抗原結合ドメイン」は、天然受容体の一部ではない抗原結合ドメインを指す。別の言い方をすれば、天然に存在しない抗原結合ドメインは、天然に存在するシグナル伝達レセプターと作動可能に連結するように、組換え分子生物学的技術を用いて「操作」され、さらに抗原結合ドメインは、天然に存在するシグナル伝達レセプターとは異なる分子から得られるか、またはそれに由来する。例示的な異種抗原結合ドメインには、抗体、抗体断片(例えば、vL、vH、scFv、Fab、F(ab)2など)、単一ドメイン抗体(例えば、sVH、FHVH、vHHなど)、非免疫グロブリン抗原結合が含まれる。ドメイン、単一可変ドメイン -TCR (svd-TCR)、組換え TCR、HLA 非依存性 TCR、scTCR、エピトープ、アダプター、リガンド、および受容体。
「作動可能に連結された」または「機能的に連結された」または「作動可能に連結された」という用語は、各成分が機能的であり得るように、第1の成分と第2の成分との間の機能的連結または結合を指す。例えば、作動可能に連結されることには、後者の発現をもたらす、調節配列と異種核酸配列との間の結合が含まれる。例えば、第1の核酸配列が第2の核酸配列と機能的関係にある場合、第1の核酸配列は第2の核酸配列と作動可能に連結される。作動可能に連結された2つのポリペプチドに関して、第1のポリペプチドはいかなる連結からも独立して機能し、第2のポリペプチドは2つの間の連結が存在しない場合のように機能する。本開示のSARの異なるドメインとの関連で使用される「機能的に連結された」という用語は、共有結合(例えば、ペプチド結合または非ペプチド化学結合)を介して連結されたドメインを指す。例示的な実施形態において、CD16Aの細胞外ドメインのN末端に操作可能に連結された異種抗原結合ドメイン(例えば、CD19 scFv)を含むSARは、CD16Aの細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインをコードする核酸配列にフレーム内で融合したCD19 scFvからなる核酸配列によってコードされるSARポリペプチドを指す。一実施形態では、SARポリペプチドの異なるドメイン間の機能的な結合は、ペプチド結合を介して達成される。しかしながら、特定の実施形態では、SARの異なるドメインは、非ペプチド結合、例えば、ジスルフィド結合を介して、または化学的結合などを介して連結され得る。
2つ以上の核酸またはポリペプチド配列の文脈における「パーセント同一性」は、同じである2つ以上の配列を指す。 2つの配列が「実質的に同一」であるとは、2つの配列を比較し、比較ウィンドウまたは以下の配列比較アルゴリズムの1つを使用して、または手動アライメントと目視検査によって測定された指定領域にわたって最大対応するようにアライメントしたときに、同じアミノ酸残基またはヌクレオチドが特定の割合を有する(例えば、60%の同一性、任意で70%、71%。72%. 73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%の同一性が、指定された領域にわたって、あるいは指定されない場合は配列全体にわたって認められる)場合をいう。場合により、同一性は、少なくとも約50ヌクレオチド(または10アミノ酸)長の領域にわたって存在し、より典型的には、100~500もしくは1000以上のヌクレオチド(または20、50、200以上のアミノ酸)の領域にわたって存在する。酸)の長さ。
パーセント配列同一性および配列類似性を決定するために使用できるアルゴリズムの 2 つの例は、BLAST および BLAST 2.0 アルゴリズムです。これらは、Altschul et al. に記載されています。 、(1977)Nuc。酸の解像度。 25:3389-3402;およびAltschulら。 、(1990) J.Mol .バイオル。 215:403-410、それぞれ。 BLAST 分析を実行するためのソフトウェアは、国立バイオテクノロジー情報センターを通じて公的に入手可能です。
2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、E.MeyersおよびW.Miller、(1988)Comput.応用生物科学。 4:11-17)、これは、PAM120 重み剰余テーブル、ギャップ長ペナルティ 12 およびギャップ ペナルティ 4 を使用して、ALIGN プログラム (バージョン 2.0) に組み込まれています。
標的抗原の非限定的な例を表Bに列挙する。本開示のSARは、表Bに列挙する1つまたは複数(例えば、2、3、4、5またはそれ以上)の標的抗原に直接または本明細書に記載のSARアダプターを介して結合し得る。 。
いくつかの実施形態において、本開示のSARは、疾患関連抗原由来のペプチド(例えば、腫瘍関連抗原またはウイルスコード抗原;例えば、NY-ESO-1、MAGE-A3、MAGE-A4、WT1、変異体Ras、HPV16-E7、EBV-LMP2A、AFP、gp100、PSA、変異体p53、HIV-1などに由来するペプチド)とMHCクラスIタンパク質とを含む複合体に特異的に結合する1つ以上の抗原結合ドメイン(例えば、vL、vH、Va、Vb、Vg、Vd、Fv、TCR-Fv、svd-TCR、scTCRなど)を含み、ここで、MHCクラスIタンパク質は、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-E、HLA-F、またはHLA-Gである。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質は、HLA-A、HLA-B、またはHLA-Cである。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質はHLA-Aである。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質はHLA-Bである。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質はHLA-Cである。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質はHLA-A01、HLA-A02、HLA-A03、HLA-A09、HLA-A 10、HLA-A11、HLA-A 19、HLA-A23、HLA-A24、HLA-A 19、HLA-A24です。 A25、HLA-A26、HLA-A28、HLA-A29、HLA-A30、HLA-A31、HLA-A32、HLA-A33、HLA-A34、HLA-A36、HLA-A43、HLA-A66、HLA-A68、 HLA-A69、 HLA-A74、または HLA-A80。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質はHLA-A02である。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質は、HLA-A*02:01、HLA-A*02:02、HLA-A*02:03、HLAなどのHLA-A*02:01~555のいずれか1つである。 -A*02:04、HLA-A*02:05、HLA-A*02:06、HLA-A*02:07、HLA-A*02:08、HLA-A*02:09、HLA-A *02: 10、HLA-A*02: 11、HLA-A*02: 12、HLA-A*02: 13、HLA-A*02: 14、HLA-A*02: 15、HLA-A*02 :16、HLA-A*02:17、HLA-A*02:18、HLA-A*02:19、HLA-A*02:20、HLA-A*02:21、HLA-A*02:22 、または HLA-A*02:24。いくつかの実施形態では、MHCクラスIタンパク質はHLA-A * 02:01である。 HLA-A * 02:01は、白人全体の39~46%で発現されており、したがって、本開示で使用するためのMHCクラスIタンパク質の適切な選択を表す。
いくつかの実施形態において、本開示のSARは、疾患関連抗原由来のペプチド(例えば、腫瘍関連またはウイルスコード抗原、例えば、NY-ESO-1、MAGE-A3、MAGE-A4、WT1、変異体Ras、HPV16-E7、EBV-LMP2A、AFP、gp100、PSA、変異体p53、HIV-1などに由来するペプチド)とMHCクラスIIタンパク質とを含む複合体に特異的に結合する1つ以上の抗原結合ドメイン(例えば、vL、vH、Va、Vb、Vg、Vd、Fv、TCR-Fv、svd-TCR、scTCRなど)を含み、ここで、MHCクラスIIタンパク質は、HLA-DP、HLA-DQ、またはHLA-DRである。
本開示のSARは、疾患関連抗原由来のペプチドと、他の種(例えば、イヌ、ネコ、マウス、ラット、ウシ、ウマ、サルなど)由来のMHCクラスIタンパク質またはクラスIIタンパク質とを含む複合体にも結合することができる。 )
本明細書で使用される「受容体」という用語は、1つまたは複数のリガンドに選択的に結合する細胞膜上に存在するポリペプチドまたはその一部を指す。
本明細書で使用される場合、用語「領域」または「部分」は、核酸分子に関して使用される場合、本明細書に記載されるCD3ζシグナル伝達領域などの、分子の全長より短い連結されたヌクレオチドのセットを指す。
「レトロウイルスベクター」という用語は、レトロウイルスゲノムの少なくとも一部に由来するベクターを指す。レトロウイルスベクターの例には、AddgeneまたはClontechから入手可能なMSCVneo、MSCV-pac(またはMSCV-puro)、MSCV-hygroが含まれる。
本明細書で使用される「SAR」又は「合成抗原受容体」という用語は、従来のCARを含み、また、以下のような細胞に抗原特異性を付与する新しいアプローチも包含する;抗体-TCRキメラ分子又はAb-TCR(参照により本明細書に組み込まれるWO 2017/070608 A1)、TCR受容体融合タンパク質またはTFP(参照により本明細書に組み込まれるWO 2016/187349 A1)、合成免疫受容体(SIR)(参照により本明細書に組み込まれるWO 2018/102795 A1)、STAR(WO2020/029774参照)、HLA非依存性TCR(WO2019157454A1参照)、三機能性T細胞抗原カプラー(Tri-TAC又はTAC)(参照により本明細書に組み込まれるWO2015/117229 A1)及びzSIR(参照により本明細書に組み込まれるPCT/US2019/035096)。二重特異性および多重特異性 CAR は、PCT/US2021/022641 に記載されている。 「SAR」という用語は、CARおよび他の抗原結合受容体(組換えTCRを含むがこれに限定されない)を包含する。
通常、「SAR-T」という用語は、合成抗原受容体を発現するように操作された T 細胞を指すために使用されます。したがって、そのようなSARを有するTリンパ球は、一般にSAR-Tリンパ球と呼ばれます。 SAR は、造血幹細胞、人工多能性幹細胞 (iPSC)、NK 細胞、マクロファージなどの T 細胞以外の細胞でも発現する可能性があります。いくつかの実施形態では、SARは、NK92、NK92MIまたはその誘導体などの不死化細胞株で発現される。 「SAR-NK」という用語は、SARを発現するように操作されたNK細胞を指す。
合成抗原受容体を発現するように操作されたT細胞(例えば、αβ T細胞、γδ T細胞、Treg、TILなど)を指すために使用される。したがって、そのようなSARを有するTリンパ球は、一般にSAR-Tリンパ球と呼ばれます。 SAR は、造血幹細胞、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞 (iPSC)、NK 細胞、NKT 細胞、単球、マクロファージ、B 細胞、顆粒球、樹状細胞、サイトカインなどの T 細胞以外の細胞でも発現する可能性があります。いくつかの実施形態では、SARは、NK92、NK92MIまたはその誘導体などの不死化細胞株で発現される。 「SAR-NK」という用語は、SARを発現するように操作されたNK(ナチュラルキラー)細胞を指します。
「眠れる森の美女トランスポゾン」または「眠れる森の美女トランスポゾンベクター」という用語は、眠れる森の美女トランスポゾンゲノムの少なくとも一部に由来するベクターを指す。
「TCR定常鎖」または「T細胞受容体の定常領域」という用語は、TCRα/TCRa、TCRβ1/TCRb1、TCRβ2/TCRb2、TCRγ/TCRd、TCRδ/TCRdおよびプレTCRαの定常鎖として定義される。例示的なTCR定常鎖を表12に列挙する。 TCR定常鎖は、Ig様C1ドメイン(例えば、配列番号1168~1175;表13)、連結ペプチド(例えば、配列番号1177~1184;表13 )などのいくつかのサブドメインに分割することができる。 14)、膜貫通ドメイン(配列番号1187~1190 ;表15)、およびサイトゾルドメイン(例えば、配列番号1193~1196 ;表16) 。 TCRα、TCRβ1/β2、TCRγ、およびTCRδ鎖のサイトゾルドメインは短く、一般にそれらのシグナル伝達活性において重要な役割を果たしているとは考えられていません。本開示は、TCR鎖の例示的な欠失変異体および変異体も提供する(表12) 。これらの欠失変異体やバリアントは、相補的なTCR鎖と対合する能力、TCR/CD3複合体と会合する能力、標的抗原発現細胞と係合した際にT細胞シグナルを伝達する能力(例えば、NFAT経路を活性化する)など、元のTCR鎖の機能的・生物学的特性の1つ以上を保持している限り、SARの構築に使用することができる。
「単鎖可変領域」または「scFv」という用語は、軽鎖の可変領域からなる少なくとも1つの抗体フラグメントと重鎖の可変領域からなる少なくとも1つの抗体フラグメントとを含む融合タンパク質を指し、ここで軽鎖および重鎖の可変領域は、例えば、合成リンカー、例えば、短い可撓性ポリペプチドリンカーを介して連続的に連結されており、また単鎖ポリペプチドとして発現可能であり、そして scFvは、それが由来するインタクト抗体の特異性を保持する。特に指定しない限り、本明細書で使用される場合、scFvは、いずれの順序でvLおよびvH可変領域を有してもよく、例えば、ポリペプチドのN末端およびC末端に関して、scFvは、vL-リンカー-vHを含んでもよく、またはvL-リンカー-vHを含んでもよい。 vH-リンカー-vL。本開示では、scFvは、vL-Gly-Ser-Linker-vHとも記載される。あるいは、scFvは(vL+vH)または(vH+vL)とも記載されます。
。本明細書において、「特異的に結合する」または「特異的である」という用語は、標的と抗体または抗体部分との間の結合のような、測定可能で再現可能な相互作用を指し、生物学的分子を含む異種の分子集団の存在下で標的の存在を決定する。いくつかの実施形態では、抗原に特異的に結合するSARまたは抗原結合ドメインは、他の標的に対する結合親和性の少なくとも約10倍である結合親和性で、抗原の1つ以上の抗原決定基(例えば、細胞表面抗原またはペプチド/MHCタンパク質複合体)と反応する。
「シグナル伝達ドメイン」という用語は、セカンドメッセンジャーを生成するか、そのようなメッセンジャーに応答してエフェクターとして機能することによって、規定のシグナル伝達経路を介して細胞内に情報を伝達し、細胞活動を調節するタンパク質の機能領域を指す。
「シグナル伝達モジュール」という用語は、細胞シグナルを開始することができる、1つまたは複数のシグナル伝達メディエーターまたはシグナル伝達アダプターを含む分子または分子複合体を指します。細胞シグナルには、NFAT、NFATなどの細胞シグナル伝達経路の活性化が含まれますが、これらに限定されません。 AKT、STAT、またはNF-κB経路 例示的な実施形態では、シグナル伝達モジュールは、シグナル伝達複合体の一部である細胞質免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ(ITAM)を有する1つまたは複数のタンパク質を動員する。例示的に、NK細胞において機能するシグナル伝達モジュールには、CD3ζ、FcRγ、DAP10およびDAP12などのシグナル伝達アダプターが含まれる。
「シグナル伝達メディエーター」または「シグナル伝達アダプター」という用語は、天然または非天然シグナル伝達受容体によって動員されたときに細胞シグナルを開始または阻害することができる分子を指す。シグナル伝達受容体とは対照的に、シグナル伝達アダプターにはそれ自体の抗原結合ドメインまたはリガンド結合ドメインがありません。シグナル伝達アダプターの例としては、CD3ζ (CD3z)、FcRγ、DAP10、DAP12、CD3ε、CD3γ、およびCD3δが挙げられる。一実施形態において、本開示は、1つ以上の異種抗原結合ドメインが、シグナル伝達アダプターの1つ以上の鎖のヒンジドメインまたは膜貫通ドメインに機能的に連結されているSARを提供する。一実施形態では、SARは、TCR複合体の構成要素であるシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ε、CD3ε、CD3γ、CD3εなど)を含む。一実施形態では、SARは、TCR複合体のTCRα鎖、β鎖、γ鎖、および/またはδ鎖と相互作用するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、TCR複合体のTCRα、β、γおよび/またはδ鎖と相互作用しないシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、 TCRα/β膜貫通領域内の正に荷電した残基と相互作用する、その膜貫通ドメイン内に保存されたアスパラギン酸残基を有するシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ)を含む。一実施形態では、SARは、その膜貫通ドメインに保存されたアスパラギン酸残基を欠くシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、TCR複合体の構成要素ではないシグナル伝達アダプター(例えば、DAP10)を含む。一実施形態では、SARは、細胞シグナル伝達を活性化するシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ)を含む。一実施形態では、SARは、細胞シグナル伝達を阻害するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、1つまたは複数のITAMモチーフを有するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、2つ以上のITAMモチーフを有するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、単一のITAMモチーフを有するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、ITAMモチーフを欠くシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、天然型のジスルフィドリンカー二量体であるシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、その天然の形態ではジスルフィドリンカー二量体ではない。一実施形態では、SARは、天然状態では膜貫通領域に位置する鎖間ジスルフィド結合を含むシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、膜貫通領域に位置しない鎖間ジスルフィド結合を含む天然状態のシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、天然状態ではその細胞外領域に位置する鎖間ジスルフィド結合を含むシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインは、長さが10アミノ酸未満である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインは、長さが8アミノ酸未満である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインは、長さが10アミノ酸を超える。一実施形態では、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインは、15アミノ酸を超える長さである。一実施形態では、SARは、タンパク質のリン酸化を誘導するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、タンパク質の脱リン酸化を誘導するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、Zap70と相互作用するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、Zap70と相互作用しないシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、二重鎖SARの2つの鎖は、同一のシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζおよびCD3ζ)を含む。一実施形態では、二重鎖SARの2つの鎖は、同一ではないシグナル伝達アダプター(例えば、CD3εとFcRγ、またはCD3εとDAP10など)を含む。
「シグナル伝達鎖」または「シグナル伝達断片」という用語は、細胞シグナル伝達受容体の膜貫通および/または細胞内領域、および場合により細胞外ヒンジ/接続ペプチド領域を含むポリペプチドを指す。例示的なシグナル伝達鎖には、TCRα、TCRβ、TCRγおよびTCRδの定常鎖が含まれる。さらなる例示的なシグナル伝達鎖には、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、DAP10、DAP12、DNAM-1、NKG2D、CD32、CD64、KIR3DL1、KIR2DS4、FcRγおよびCD3zの膜貫通領域および/または細胞内領域からなる鎖が含まれる。いくつかの実施形態では、シグナル伝達鎖は、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、DAP10、DAP12、DNAM-1、NKG2D、CD32、CD64、KIR3DL1、KIR2DS4、FcRγおよびCD3zのヒンジドメインまたは接続ペプチドも含む。
「合成抗原受容体」または「SAR」という用語は、細胞の表面上で発現することができ、少なくとも1つの異種抗原結合ドメインおよび少なくとも1つの膜関連ドメインを含む、天然に存在しない受容体または合成受容体を指し、ここで、膜関連ドメインは膜貫通ドメインまたは膜アンカードメイン(すなわち、GPI結合ドメイン)であり得る。 SARの抗原結合ドメインは、その膜関連ドメインに対して異種である、すなわち、抗原結合ドメインは膜関連ドメインとは異なる供給源に由来する。 SARは、ヒンジドメイン、細胞外リガンド結合ドメイン、および/またはサイトゾルドメインをさらに含み得る。一実施形態では、SARは、エフェクター細胞内で発現されると、標的細胞、典型的には癌細胞に対する特異性、および細胞内シグナル生成を細胞に提供するポリペプチドまたはポリペプチドのセットを含む。 SAR は、単一チェーン、2 チェーン、または 3 つ以上のチェーンにすることができます。 SAR は、単一特異性、二重特異性、または多重特異性の場合があります。 SARは、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを有し得る。 「SAR」という用語には、従来のキメラ抗原受容体(例えば、第2世代CAR)および次世代CAR(例えば、SIR、cTCR、AbTCR、zSIR、HIT、TFP、TACなど)が含まれる。本開示は、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4 KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、 CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、 CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、Siglec3、Siglec-7、Siglec-9、CD3ζ、DAP10、DAP12、FcRγ、TCRαβおよびTCRγδなどに由来する1つ以上の領域、ならびにその変異体および断片を含む新規SAR組成物を記載する。本開示はまた、他の種からの選択的スプライシングされたアイソフォームおよびホモログを含む、上記の遺伝子および/またはタンパク質の機能的変異体を含むSARを提供する。本開示のSARの構築に使用できる上記遺伝子およびタンパク質の例示的な領域または断片は、仮出願の表12~18および表25~31に提供される。天然受容体の例示的な細胞外ドメインは、配列番号10842~10877に提供される。 本開示のSARはまた、仮出願の表12-18および25-31に提供されたフラグメントのいずれかと70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%または99%の相同性を有するポリペプチドまたはフラグメントを用いて構築することもできる。SARの構築に使用できる例示的な追加成分(例えば、vL、vH、scFv、vHHなど)の核酸配列およびアミノ酸配列を表2~11に提供する。本開示のSARはまた、仮出願の表2-18および25-31に提供されたフラグメントのいずれかと70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%または99%の相同性を有するポリペプチドまたはフラグメントを用いて構築することもできる。本開示の例示的なSARは、仮出願の表32~34に提供される。 SAR はモジュール設計であり、SAR の 1 つのモジュールを別のモジュールと交換することで追加の SAR を構築できます。これらの新規なSARの発現および活性は、最適な機能活性を有するSARを選択するために、本開示に記載される方法を使用して試験することができる。
「単鎖合成抗原受容体」または「単鎖SAR」という用語は、単一のポリペプチド鎖を含む合成抗原受容体を意味する。 CD19を標的とし、CD16シグナル伝達鎖に基づく例示的な単鎖SARは、CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-(vL-vH)-CD16A-F158V-S197P-FL-v3(配列番号4954)である。この SAR では、CD19 を標的とするヒト化 scFv (hu-mROO5-1) が、F158V および S197P 変異を保有する CD16 の高親和性非切断性変異体 (CD16A-F158V-S197P-FL) の細胞外、膜貫通、およびサイトゾルドメインに機能的に連結されています。 -v3)。異なる抗原結合ドメインがCD16A-F158V-S197P-FL-v3モジュールに機能的に連結されている追加の例示的な単鎖SARは、仮出願の表36~39に提供される。さらなる例示的な単鎖SARは、配列番号5463~5482に提供される。 SAR はモジュール設計であるため、CD16A-F158V-S197P-FL-v3 モジュール (配列番号 (DNA): 1417 および配列番号 (PRT): 3811) は、NKp30-ECDTMCP- などの他のモジュールで置き換えることができます。 opt2 (配列番号1375)、NKp44-ECDTMCP-opt2 (配列番号1389)、NKp46-ECDTMCP-opt2 (配列番号1405)、CD8-hinge-NKG2D-TM-2B4CP-opt-2 (配列番号1389)配列番号1434)、CD32-ECDTMCP-opt2(配列番号1582)、CD64-ECDTMCP-opt2(配列番号1584)、2B4-ECDTMCP-opt2(配列番号1580)、OX40-ECDTMCP-opt2 (配列番号1578)、CD28-ECDTMCP-opt2(配列番号1576)、41BB-ECDTMCP-opt2(配列番号1574)、KIR3DL1(配列番号9644)およびKIR2DS4(配列番号9653) )などを使用して、異なるシグナル伝達チェーンを持つ単一チェーン SAR を生成します。 SARの構築に使用することができる、天然に存在する受容体に由来する例示的なモジュールは、配列番号9635~9668に提供される。このようなSARの例は、配列番号9860~9895および仮出願の表41に提供されている。これらの新規なSARの発現および活性は、最適な機能活性を有するSARを選択するために、本開示に記載される方法を使用して試験することができる。
「合成免疫受容体」または代替的に「SIR」という用語は、エフェクター細胞内で発現されると、標的細胞、典型的には癌細胞に対する特異性を細胞に提供する、ポリペプチドのセット、いくつかの実施形態では典型的には2つを指す。細胞内シグナル生成を伴う。 SIRは、参照により本明細書に組み込まれるWO2018/102795A1に記載されている次世代CARプラットフォームを表す。典型的な実施形態では、SIRは、本明細書に記載の抗原に結合する1つ以上の抗原結合ドメイン(例えば、抗体または抗体フラグメント、リガンドまたは受容体)を含み、1つ以上のT細胞受容体定常鎖または領域に結合する。オプションのリンカー経由。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのセットは互いに隣接している。いくつかの実施形態では、SIRは、2つ以上のポリペプチドの2つ以上のセットを含む。 SIRの各セットのポリペプチドは互いに隣接しているが(機能性ポリペプチドユニット1)、他のセットのポリペプチド(機能性ポリペプチドユニット2)とは隣接していない。いくつかの実施形態では、SIRのT細胞受容体定常鎖(または領域)は、ヒトT細胞受容体アルファ(TCRアルファまたはTCRαまたはTCRaまたはhTCRアルファまたはhTCRαまたはhTCRaまたはCα)の定常鎖から選択され、ヒトT細胞受容体-β1(TCR-β1またはTCRβ1またはTCRb1またはhTCR-β1またはhTCRβ1またはhTCRb1またはCβ1)、ヒトT細胞受容体-β2(TCR-β2またはTCRβ2またはTCRb2またはhTCR-β2またはhTCRβ2またはhTCRb2またはCβ2は、TCR-ベータ、TCRβ、TCRb、またはCβとも呼ばれます)、ヒトプレT細胞受容体アルファ((プレTCRアルファまたはプレTCRαまたはプレTCRaまたはプレCα)、ヒトT細胞受容体ガンマ(TCR-ガンマまたはTCRγまたはTCRgまたはhTCR) -ガンマまたはhTCRγまたはhTCRgまたはhTCRγ1またはhTCRガンマ1、またはCγ)、またはヒトT細胞受容体-デルタ(TCR-デルタまたはTCRdまたはTCRδまたはhTCR-デルタまたはhTCRdまたはhTCRδまたはCδ)。いくつかの実施形態では、SIRのTCR定常鎖は、それらの野生型ヌクレオチド配列によってコードされるが、他の態様では、SIRのTCR定常鎖は、野生型ではないヌクレオチド配列によってコードされる。シーケンス。いくつかの実施形態では、SIRのTCR定常鎖は野生型ポリペプチド配列をコードするが、他の実施形態では、SIRのTCR定常鎖は、1つまたは複数の変異を有するポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、SIRのTCR定常鎖は、1つ以上の突然変異を有するそれらのコドン最適化配列によってコードされる。本開示はまた、対応する全長TCR鎖の生物学的特性および機能的特性の少なくとも1つを保持するTCR定常鎖の欠失変異体もカバーする。本明細書に記載のものなど、特定の腫瘍メーカー「X」を標的とする抗原結合ドメイン(例えば、 scFvまたはvHH)を含むSIRは、X-SIRまたはXSIRとも呼ばれる。例えば、CD19を標的とする抗原結合ドメインを含むSIRは、CD19-SIRまたはCD19SIRと呼ばれる。 SIR の TCR 定常鎖/ドメインは、SIR が最終的に使用される同じ種に由来する可能性があります。例えば、ヒトで使用する場合、SIRのTCR定常鎖がヒトTCR定常鎖に由来するか、またはヒトTCR定常鎖から構成されることが有益であり得る。しかしながら、場合によっては、TCR定常鎖は、SIRが最終的に使用される同じ種に由来するが、TCR定常鎖の発現を増強するアミノ酸置換を行うように修飾されていることが有益である。例えば、ヒトで使用する場合、SIRのTCR定常鎖がヒトTCR定常鎖に由来するか、またはヒトTCR定常鎖から構成されるが、特定のアミノ酸がマウスTCR定常鎖の対応するアミノ酸で置換されることが有益である可能性がある。 。このようなマウス化されたTCR定常鎖は、SIRの発現の増加をもたらす。 SIRまたはその機能的部分は、アミノ末端またはカルボキシ末端、または両方の末端に追加のアミノ酸を含むことができ、これらの追加のアミノ酸は、SIRを構成するTCRまたは抗原結合ドメインのアミノ酸配列には見出されない。望ましくは、追加のアミノ酸は、SIRまたは機能部分の生物学的機能、例えば、標的細胞の認識、癌の検出、癌の治療または予防などを妨げない。追加のアミノ酸は、生物活性を増強することがさらに望ましい。親 SIR の生物学的活性に影響します。
本明細書で使用されるSVHドメインという用語は、単一のヒトV Hドメイン抗体(V H sdAb)を指す。したがって、これらの用語は同じ意味で使用されます。 SVH という用語は、独立した vH ドメインと同じ意味で使用されます。 SVH は自律抗原結合ドメイン (AABD) の一例です。例示的なSVHは、配列番号(DNA):827~828および配列番号(PRT):3221~3222に示される完全ヒトvHドメイン(FHVH)である。別の例示的なSVHは、配列番号(DNA):830~831および配列番号(PRT):8223~8224に示されるchVHドメインである。別の例示的なSVHは、配列番号(DNA):850~851および配列番号(PRT):3244~3245に示されるaVHドメインである。他の例示的なSVHドメインの配列番号を表5に示す。本開示のSARの構築に使用できる追加のSVHドメインは、WO2016062988、WO2016113556、WO2017191476、WO2018039180、WO2019006072、WO2018237037、WO2018に提供される。 119215、WO2019126756、国際公開第2019055689号および国際公開第2020018922号は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
「刺激」という用語は、刺激分子(例えば、 TCR/CD3複合体)とその同族リガンド(または標的抗原)との結合によって誘導され、それによって例えば限定されないが、シグナル伝達事象を媒介することによって誘導される一次応答を指す。 、TCR/CD3を介したシグナル伝達。刺激は、特定の分子の発現の変化を媒介する可能性があります。
「「刺激性分子」という用語は、免疫細胞シグナル伝達経路の少なくとも一 部に対して、免疫細胞の活性化を刺激的に制御する細胞質シグナル 配列を提供する免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、B細胞)により発現される分子を指す。ある態様では、シグナルは、例えば、TCR/CD3複合体とペプチドを負荷したMHC分子との結合によって開始される一次シグナルであり、 増殖、活性化、分化などを含むがこれらに限定されないT細胞応答の媒介につながる一次シグナルである。刺激的に作用する一次細胞質シグナル伝達配列(「一次シグナル伝達ドメイン」とも呼ばれる)は、免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフまたはITAMとして知られるシグナル伝達モチーフを含む場合がある。細胞質シグナル伝達配列を含むITAMの例としては、CD3ゼータ、FcRγ、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3イプシロン、CD79a、CD79b、DAP10、およびDAP12に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない。
例えば、任意の家畜化された哺乳動物またはヒト)を含むことを意図する。 「対象」または「個体」または「動物」または「患者」という用語は、本明細書では互換的に使用され、本開示の組成物または医薬組成物の投与が望まれる任意の対象、特に哺乳動物対象を指す。哺乳動物対象には、ヒト、非ヒト霊長類、イヌ、ネコ、モルモット、ウサギ、ラット、マウス、ウマ、ウシ、ウシなどが含まれ、ヒトが好ましい。
本明細書で使用される「スイッチドメイン」または「二量体化ドメイン」は、典型的には、二量体化分子の存在下で別のスイッチドメインと会合するポリペプチドベースの実体を指す。
「自殺遺伝子」、「自殺スイッチ」、または「キルスイッチ」は、細胞死に導く誘導能力を持つタンパク質をコードします。自殺遺伝子の例としては、HSV-TK、iCaspase 9、tEGFR、CD20、tCD19、tHer2、tBCMA、RQR8などが挙げられる。例えば、CD20発現細胞は、抗体リツキシマブによる処理によって選択的に除去することができる。同様に、tBCMA発現細胞はベランタマブマフォドチンによる処理によって選択的に除去でき、tHer2発現細胞はハーセプチンによる処理によって選択的に除去できます。
「生存遺伝子」、「生存スイッチ」、または「生命スイッチ」は、細胞に生存促進シグナルを提供するタンパク質をコードします。例示的な生存遺伝子には、膜アンカー型のIL2および膜アンカー型のIL15が含まれる。
本明細書で使用される場合、「Tリンパ球」または「T細胞」という用語は、CD3(CD3+)およびT細胞受容体(TCR+)を発現する細胞を指す。一実施形態では、T細胞は、CD3およびTCRを発現する天然の細胞(すなわち、組換えまたは操作された細胞ではない)である。
本明細書で使用される場合、「TCR」または「T細胞受容体」という用語は、典型的にはMHC分子によって提示される抗原の認識(すなわち、抗原認識)に関与するアルファ-ベータまたはガンマ-デルタ受容体を形成する二量体の異種細胞表面シグナル伝達タンパク質を指す。 MHC 分子の文脈では)。本開示のTCRは、天然に存在しないもの、および/または精製されたもの、および/または操作されたものであってもよい。本開示のTCRは、親TCRと比較して、α鎖可変ドメインおよび/またはβ鎖可変ドメインに存在する複数の変異を有し得る。 「改変されたTCR」および「変異体TCR」は、本明細書では同義的に使用され、一般に、親TCRと比較して、特にそのVaおよび/またはVbまたはVgおよび/またはVdドメインにおいて導入された1つまたは複数の変異を有するTCRを意味する。操作された TCR は、HLA 依存性または HLA 非依存性の様式で抗原に結合する可能性があります。
本明細書で使用する「導入遺伝子」という用語は、生物(例えば、非ヒト動物)のゲノムに組み込まれ、有性生殖中に生物の子孫に伝達される異種遺伝子を指す。
本明細書で使用される場合、「Tリンパ球」または「T細胞」という用語は、CD3(CD3+)およびT細胞受容体(TCR+)を発現する細胞を指す。一実施形態では、T細胞は、CD3およびTCRを天然に発現する天然細胞(すなわち、 CD3またはTCRを発現するように操作されていない細胞)である。 「T細胞」および「Tリンパ球」という用語は、本明細書では交換可能であり、同義的に使用される。例には、ナイーブ T 細胞 (「リンパ球前駆細胞」)、セントラル メモリー T 細胞、エフェクター メモリー T 細胞、幹メモリー T 細胞 (T scm )、iPSC 由来 T 細胞、合成 T 細胞、腫瘍浸潤 T 細胞が含まれますが、これらに限定されません。 (TIL)、αβ T細胞、γδ T細胞、制御性T細胞(Treg)、またはそれらの組み合わせ。
「非T細胞」という用語は、T細胞ではない細胞を指す。一実施形態では、非T細胞は、CD3およびT細胞受容体の細胞表面発現を欠いている。一実施形態では、非T細胞は、OKT3などのT細胞活性化抗体に応答しない。一実施形態では、非T細胞はCD3の表面発現を欠いている。一実施形態では、非T細胞は、CD3ε、CD3γ、およびCD3δの群から選択される1つまたは複数のCD3鎖の発現を欠いている。一実施形態では、非T細胞は、TCR遺伝子の生殖系列構成を示し、T細胞遺伝子再構成を受けていない。一実施形態では、非T細胞は、機能的なT細胞/CD3受容体複合体を形成する能力を欠いている。非T細胞の例としては、NK細胞、B細胞、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞、および上皮細胞が挙げられる。非 T 細胞は不死化細胞株であってもよい。例示的な実施形態では、非T細胞は、NK細胞株、例えば、NK92、NK92MI、NKGおよびYTSなどである。一実施形態では、非T細胞は、CD3およびT細胞受容体の発現を欠くiPSC由来細胞である。
「T細胞受容体モジュール」または「TCRM」という用語は、T細胞受容体に由来する配列を含むヘテロ二量体を指す。 TCRMは、T細胞受容体膜貫通ドメインを含み、さらに、T細胞受容体接続ペプチドおよび/または細胞内ドメインのすべてまたは一部を含み得る。
本明細書で使用される「TCR-Fv」または「断片可変TCR」の「Fv-TCR」という用語は、TCR鎖の可変ドメインによって形成される抗原結合モジュールを指す。 TCR-Fvは、VαおよびVβドメイン、またはVγおよびVδドメインによって形成され得る。 TCR-Fvは、可変ドメインが由来するTCRの標的抗原(例えば、ペプチド/MHC複合体)に対して一部またはすべての特異的結合親和性を示す。一実施形態では、本開示のSARは、TCR由来のVα/Vβ鎖またはVγ/Vδ鎖がその2つのポリペプチドに結合する場合に、TCR-Fv抗原結合モジュールを形成する能力を実証する。
本明細書で使用される「Fv」または「フラグメント可変」という用語は、抗体の可変ドメインによって形成される抗原結合モジュールを指す。 Fv は、vL ドメインと vH ドメインによって形成されます。 Fvは、可変ドメインが由来する抗体の標的抗原に対する特異的結合親和性の一部またはすべてを示します。一実施形態では、本開示のSARは、抗体に由来するvL鎖およびvH鎖がその2つのポリペプチドに結合する場合に、Fv抗原結合モジュールを形成する能力を実証する。
本明細書で使用する「膜貫通タンパク質」または「膜タンパク質」は、生体膜(例えば、細胞膜などの生体膜)のリン脂質二重層などの膜上および/または膜内に位置するタンパク質である。一部のタンパク質は膜表面にのみ結合していますが、他のタンパク質は膜内に埋め込まれた 1 つ以上の領域および/または膜の片側または両側のドメインを持っています。膜貫通タンパク質の具体例としては、CD8a、CD4、CD3ζ、CD16、NKp30、NKp44、NKG2Dなどが挙げられる。
本明細書で使用される場合、「膜貫通モジュール」または「TMM」は、膜貫通タンパク質(例えば、CD16A)を含む分子または分子複合体を指す。
例えば、CD16A)または膜アンカータンパク質(例えば、CD16B)を含む分子または分子複合体を指す。この用語には、CD16A などの膜貫通タンパク質、および CD16B などの GPI (グリコシルホスファチジルイノシトール) 結合タンパク質が含まれます。 MAMは、ヒンジドメインおよび/またはサイトゾルドメインのすべてまたは一部をさらに含み得る。
本明細書で使用される「治療薬」とは、例えば、疾患を治療、阻害、予防し、その影響を軽減し、重症度を軽減し、発症の可能性を低減し、進行を遅らせ、および/または治癒するために使用される薬剤を指す。治療剤が標的とする疾患としては、、感染症、癌腫、肉腫、リンパ腫、白血病、胚細胞腫瘍、芽細胞腫、さまざまな免疫細胞上で発現される抗原、さまざまな血液疾患および/または炎症性疾患に関連する細胞上で発現される抗原が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される「治療的対照」とは、SAR発現細胞の活性を制御するために使用される要素を指す。いくつかの実施形態では、本開示のSAR発現細胞の活性を制御するための治療対照は、短縮型上皮成長因子受容体(tEGFR)、短縮型上皮成長因子受容体viii(tEGFRviii)、短縮型CD30(tCD30)、短縮型上皮成長因子受容体viii(tEGFRviii)、短縮型CD30(tCD30)、短縮型上皮成長因子受容体(tEGFRviii)のいずれか1つ以上を含む。 BCMA (tBCMA)、短縮型 CD19 (tCD19)、チミジンキナーゼ、シトシン デアミナーゼ、ニトロレダクターゼ、キサンチン-グアニン ホスホリボシル トランスフェラーゼ、ヒト カスパーゼ 8、ヒト カスパーゼ 9、誘導性カスパーゼ 9、プリン ヌクレオシド ホスホリラーゼ、リナマラーゼ/リナマリン/グルコース オキシダーゼ、デオキシリボヌクレオシドキナーゼ、西洋わさびペルオキシダーゼ (HRP)/インドール-3-酢酸 (IAA)、ガンマ-グルタミルシステイン合成酵素、CD20/αCD20、CD34/チミジンキナーゼキメラ、dox 依存性カスパーゼ-2、変異型チミジンキナーゼ (HSV-TKSR39)、AP1903/Fasシステム、キメラサイトカイン受容体(CCR)、選択マーカー、およびそれらの組み合わせ。例示的な治療対照を暫定出願の表24に示す。
「治療効果」という用語は、例えば、腫瘍体積の減少、癌細胞数の減少、転移数の減少、余命の延長、癌細胞増殖の減少、癌細胞生存の減少、感染性薬剤の力価の減少、感染性薬剤のコロニー数の減少、病状に関連する様々な生理学的症状の改善などを含む様々な手段によって明らかにすることができる生物学的効果を指すが、これらに限定されない。「治療効果」は、そもそも疾患の発生を予防する、または疾患の再発を予防するペプチド、ポリヌクレオチド、細胞および抗体の能力によっても現れることができる。
本明細書で使用される用語「治療上有効な量」とは、疾患または障害の少なくとも1つ以上の症状を減少させるために、本明細書に開示される1つ以上のペプチドまたはその変異体、変種、アナログもしくは誘導体を含む薬学的組成物の量を指し、所望の効果を提供するのに十分な量の薬学的組成物に関する。本明細書で使用する「治療有効量」という語句は、任意の医学的治療に適用できる妥当な利益/リスク比で、障害を治療するのに十分な組成物の量を意味する。
TCR受容体融合タンパク質」または「TFP 」という用語は、参照により本明細書に組み込まれるWO2016/187349A1に記載されている次世代SARプラットフォームを指す。一実施形態では、TFPは、CD3ε、CD3γ、CD3δ、TCRα、またはTCRβなどのTCR鎖に融合された標的抗原に特異的に結合する抗体部分を含む。 TFPの構築に使用できる例示的なTCR鎖は、本開示の配列番号11903~11906によって表され、参照により本明細書に組み込まれるWO2017/070608A1に提供されている。 CD3ε鎖を組み込んだTFPは、CD3ε TFPまたはTFPεと呼ばれる。 CD3γ鎖を組み込んだTFPは、CD3γTFPまたはTFPγと呼ばれる。 CD3δ鎖を組み込んだTFPは、CD3δ TFPまたはTFPδと呼ばれる。CD3ε、CD3γまたはCD3δ鎖を組み込んだTFPを総称して、 CD3ε/γ/δ TFPまたはTFPε/γ/δと呼ぶ。
「トランスファーベクター」という用語は、単離された核酸を含み、単離された核酸を細胞の内部に送達するために使用できる物質の組成物を指す。線状ポリヌクレオチド、イオン性または両親媒性化合物と結合したポリヌクレオチド、プラスミド、およびウイルスを含むがこれらに限定されない、多数のベクターが当技術分野で知られている。したがって、「トランスファーベクター」という用語には、自律的に複製するプラスミドまたはウイルスが含まれる。この用語はまた、例えばポリリジン化合物、リポソームなどの、細胞への核酸の導入を促進する非プラスミドおよび非ウイルス化合物をさらに含むものと解釈されるべきである。ウイルス転移ベクターの例としては、アデノウイルスベクター、アデノウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクターなどが挙げられるが、これらに限定されない。
例えば、SAR)の領域を指す。本開示のSARの膜貫通ドメインは、膜貫通タンパク質(例えば、I型膜貫通タンパク質またはII型膜貫通タンパク質)の膜貫通領域、人工疎水性配列、またはそれらの組み合わせである。他の膜貫通ドメインは当業者には明らかであり、本開示の代替実施形態と関連して使用することができる。いくつかの実施形態では、TMDコード化SARは、T細胞受容体のα鎖、β鎖、またはゼータ鎖の膜貫通ドメイン、CD3γ、CD3ε、CD3δ、CD28、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、 CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、KIRDS2、OX40、CD2、CD27、LFA-1(CD11a、CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、 GITR、CD40、BAFFR、HVEM (LIGHTR)、SLAMF7、NKp80 (KLRF1)、CD160、CD19、IL2R ベータ、IL2R ガンマ、IL7R α、ITGA1、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f 、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、TNFR2、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244) 、2B4)、CD84、CD96 (触覚)、CEACAM1、CRT AM、Ly9 (CD229)、CD160 (BY55)、PSGL1、CD100 (SEMA4D)、SLAMF6 (NTB-A、Lyl08)、SLAM (SLAMF1、CD150、IPO- 3)、BLAME (SLAMF8)、SELPLG (CD162)、LTBR、PAG/Cbp、NKp44、NKp30、NKp46、NKG2D、および/またはNKG2C。例示的な膜貫通ドメインは、仮出願の表28に提供されている。本開示のSARの膜貫通ドメインは、受容体にとって天然のものであっても、非天然のものであってもよい。 SARはモジュール設計であるため、いくつかの実施形態では、1つのSARの膜貫通ドメインは、その生物学的特性および機能的特性を保持している限り、別のSARの膜貫通ドメインによって置き換えることができる。したがって、NKp30ベースのSARにおけるNKp30膜貫通ドメインは、NKp44の膜貫通ドメインによって置き換えられる可能性がある。得られた非天然膜貫通ドメインを有するSARは、当技術分野で公知のアッセイおよび本開示に記載のアッセイを使用して、その細胞表面発現および機能活性について試験することができる。
本明細書で使用される場合、「三機能性T細胞抗原カプラー」または「Tri-TAC」または「TAC」は、参照により本明細書に組み込まれる国際公開第2015/117229 A1号に記載されている次世代SARプラットフォームを指す。異なる抗原を標的とするTri-TACは、当技術分野で公知の技術を使用し、本開示に記載される抗原結合ドメイン(例えば、 vLおよびvH断片、scFv、vHH、リガンドおよび受容体など)を使用して構築することができる。
本明細書で使用される場合、用語「治療する」、「処置する」、または「改善する」は、治療的処置を意味し、その目的は、疾患または障害に関連する状態の進行または重症度を逆転させる、緩和する、改善する、阻害する、減速させる、または停止させることである。
本明細書で使用される「腫瘍」とは、悪性か良性かを問わず、すべての新生物細胞の成長および増殖、ならびにすべての前がん性およびがん性の細胞および組織を指す。
は、宿主を形質転換して発現を促進するために、ポリヌクレオチド配列(例えば、外来遺伝子)を宿主細胞に導入することができる媒体を指す(導入された配列の転写および翻訳など) 。ベクターには、プラスミド、ファージ、ウイルスなどが含まれます。
「ウイルスベクター」という用語は、ウイルスから得られる、またはウイルスに由来するベクターを指す。典型的には、ウイルスは、レンチウイルスおよびガンマレトロウイルスを含むがこれらに限定されないレトロウイルスである。本開示のウイルスベクターは、ガンマレトロウイルスベクターなどのレトロウイルスベクターであってもよい。ウイルスベクターは、ヒト免疫不全ウイルスに基づいていてもよい。本開示のウイルスベクターは、レンチウイルスベクターであってもよい。ベクターは、ウマ伝染性貧血ウイルス(EIAV)などの非霊長類レンチウイルスに基づいていてもよい。本開示のウイルスベクターは、ウイルスエンベロープ内に有糸分裂促進性T細胞活性化膜貫通タンパク質および/またはサイトカインベースのT細胞活性化膜貫通タンパク質を含む。分裂促進性T細胞活性化膜貫通タンパク質および/またはサイトカインベースのT細胞活性化膜貫通タンパク質は、上で説明したように、宿主細胞膜に由来する。
「ゼータ」、あるいは「ゼータ鎖」、「CD3-ゼータ」または「TCR-ゼータ」「CD3ζ」という用語は、GenBank Ace として提供されるタンパク質として定義されます。 BAG36664.1、または非ヒト種、例えば、マウス、げっ歯類、サル、類人猿などからの同等の残基、および「ゼータ刺激ドメイン」、あるいは「CD3-ゼータ刺激ドメイン」または「 「TCRゼータ刺激ドメイン」は、T細胞活性化に必要な初期シグナルを機能的に伝達するのに十分な、ゼータ鎖の細胞質ドメイン由来のアミノ酸残基、またはその機能的誘導体として定義される。
HLAクラスI欠損、又はHLAクラスII欠損、又はその両方を含む「HLA欠損」とは、HLAクラスIタンパク質ヘテロダイマー及び/又はHLAクラスIIヘテロダイマーを含む完全なMHC複合体の表面発現を欠くか、もはや維持しないか、又はそのレベルが低下している細胞を指し、したがってその減少または低下したレベルは、他の細胞または合成方法によって天然に検出可能なレベルよりも低い。
本明細書で使用される「改変HLA欠損iPSC」とは、分化能の改善、抗原ターゲティング、抗原提示、抗体認識、持続性、免疫回避、抑制に対する抵抗性、増殖、コスト刺激、サイトカイン刺激、サイトカイン産生(オートクラインまたはパラクライン)、走化性、細胞細胞毒性に関連する、しかしこれらに限定されない、タンパク質を発現する遺伝子を導入することによりさらに改変されたHLA欠損iPSCを指し、例えば、非古典的HLAクラスIタンパク質(例えば、HLA-EやHLA-G)、キメラ抗原受容体(CAR)、T細胞受容体(TCR)、CD16 Fc受容体、BCL1 lb、NOTCH、RUNX1、IL15、41BB、DAP 10、DAP 12、CD24、CD3z、41BBL、CD47、CD 113、PDL1などである。「改変型HLA欠損」細胞には、iPS細胞以外の細胞も含まれる。
FcγR 受容体である CD16 には、Fc 受容体 FcγRIIIa (CD16a) および FcγRIIIb (CD16b) という 2 つのアイソフォームがあることが確認されています。特に明記しない限り、CD16 は、CD16a および CD16b アイソフォームの両方、およびヒトまたは非ヒト種に由来するその他の選択的にスプライスされた変異体を指します。 CD16a は NK 細胞によって発現される膜貫通タンパク質であり、標的細胞に付着した単量体 IgG に結合して NK 細胞を活性化し、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害 (ADCC) を促進します。本明細書で使用される「高親和性CD16」、「非切断性CD16」、または「高親和性非切断性CD16(hnCD16)」は、CD16の天然または非天然変異体を指す。野生型CD16は、低い親和性を有し、は、NK細胞活性化時に白血球上のさまざまな細胞表面分子の細胞表面密度を調節するタンパク質分解性切断プロセスである、ドメイン外脱落を受けやすい。 F176V(またはF158VもしくはV158)は、高い親和性を有する例示的なCD16多型変異体である。膜近位領域(位置189~212)の切断部位(位置195~198)が変化または除去されたCD16変異体は、脱落を受けない。切断部位および膜近位領域は、国際公開第2015148926号パンフレットに詳細に記載されており、その全開示は参照により本明細書に組み込まれる。 CD16 S197P または S197R バリアントは、操作された CD16 の非切断型バージョンです。 F158V と S197P (または S197R) の両方を含む CD16 バリアントは、高い親和性を持ち、切断されません。別の例示的な高親和性非切断性CD16(hnCD16)変異体は、CD64細胞外ドメインの3つのエクソンのうちの1つ以上に由来する細胞外ドメインを含む操作されたCD16である。本開示のCD16 SARは、野生型CD16配列、またはその天然もしくは非天然変異体、例えばF158VおよびS197P(またはS197R)を含み得る。
CD16またはCD16変異体を発現する免疫細胞およびiPSCは当技術分野で知られているが、一実施形態では、本開示は、CD16またはCD16変異体の細胞外Fc結合領域を含むSARを提供する。一実施形態では、CD16-SARは、抗体または抗体断片のFc領域に結合する能力を保持しているが、その非天然抗原結合ドメイン(例えば、AABD、scFv、vHH、FHVH、 Fvなど)。一実施形態では、CD16 SARの抗原結合ドメインは、CD16またはCD16変異体のD1ドメイン(配列番号3836)のN末端領域またはN末端領域の近く、すなわち、またはCD16 または CD16 変異体の細胞外ドメインの N 末端領域近く。一実施形態では、任意のリンカーが、SARの抗原結合ドメインとCD16またはCD16変異体のD1ドメインとの間に存在する。例示的なリンカーは、仮出願の表11に提供されている。
一実施形態では、、CD16-SARは、抗体または抗体フラグメントのFc領域と結合する能力を欠くが、その非天然抗原結合ドメイン(例えば、AABD、scFv、vHH、FHVH、Fvなど)を介して抗原と結合する能力を有する。例示的な実施形態では、CD16-SARは、任意選択のヒンジドメインを介してCD16の膜貫通ドメインおよび任意選択で細胞質ドメインに操作可能に連結される1つまたは複数の非天然抗原結合ドメイン(例えば、AABD、scFv、vHH、FHVH、Fvなど)を含む。一実施形態では、CD16-SARは、その標的抗原に結合すると、CD3zおよび/またはFceRy1などのシグナル伝達アダプターを動員する能力を有する。 SAR の結合ドメインは、目的のエピトープまたは抗原に結合します。例えば、SARによって認識されるエピトープは、SARの結合ドメインとして使用されるscFvによって認識されるエピトープから決定される。例えば、CD19を標的とするSAR CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-vL-Xho-IgCL-DAP10-opt1- F-P 2A-Spe-IgSP-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-Ig1CH1-DAP10-opt2- F-F 2A-Xba-PAC(配列番号2275)の抗原特異的ドメインは、hu-mROO5-1 scFv (SEQ ID NO: 3027) 由来の vL (SEQ ID NO: 2543) と vH (SEQ ID NO: 2785) の断片から構成されているので、SARは、scFvおよび/またはscFvが由来する親抗体と同じエピトープを標的とすることが予想される。本開示のSARおよびバックボーンの構築において使用されるいくつかのscFvおよび/またはその親抗体によって認識されるエピトープは、当該技術分野において公知である。あるいは、SARが標的とするエピトープは、その標的抗原の一連の変異体を作製し、当技術分野で公知の技術、例えば、Topanga Assay(Gopalakrishnan, R, Sci Reports, 2019)を用いて、SAR発現細胞に結合する変異体の能力を試験するで決定することができる。一例として、CD19を標的とするSAR CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-vL-Xho-IgCL-DAP10-opt1- F-P 2A-Spe-IgSP-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-Ig1CH1-DAP10-opt2- F-F 2A-Xba-PAC(配列番号2275)によって認識されるエピトープは、CD19-ECD-GGSG-NLuc-4xFlag-2xStreptag-8xHis-T2A-Pac(DNA配列番号1282)の欠失および点変異体のパネルを作製することによって決定することができる。変異体構築物を適当な細胞株(例えば、293FT細胞)にトランスフェクトし、融合タンパク質を含む上清を回収してNLuc活性を測定し、異なる変異CD19-ECD-GGSG-NLuc-4xFlag-2xStreptag-8xHis融合タンパク質が上清中に分泌されていることを確認する。その後、融合タンパク質は、CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-vL-Xho-IgCL-DAP10-opt1-F-P2A-Spe-IgSP-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-Ig1CH1-DAP10-opt2-F-F2A-Xba-PAC(SEQ ID NO: 2275)構築物を発現する細胞(例えば、Jurkat細胞またはT細胞)に結合する能力について試験されるであろう。SAR発現細胞に結合しない変異体は、CD19特異的SARによって標的とされるエピトープを含有する候補である。特定のSARが認識するエピトープを決定する別のアプローチとして、異なる試験抗体を用いた機能的競合アッセイが考えられる。例えば、CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-vL-Xho-IgCL-DAP10-opt1-F-P2A-Spe-IgSP-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-Ig1CH1-DAP10-opt2-F-F2A-Xba-PAC(SEQ ID NO: 2275)SARを発現するT細胞は、漸増濃度の異なる試験CD19抗体の非存在下および存在下で、CD19を発現する細胞株(例えば、RAJI細胞)と共培養することができる。試験CD19抗体により認識されるエピトープが、SAR CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-vL-Xho-IgCL-DAP10-opt1-F-P2A-Spe-IgSP-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-Ig1CH1-DAP10-opt2-F-F2A-Xba-PAC(SEQ ID NO: 2275)により認識されるエピトープと重なる場合、試験抗体は、CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-vL-Xho-IgCL-DAP10-opt1-F-P2A-Spe-IgSP-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-Ig1CH1-DAP10-opt2-F-F2A-Xba-PAC (SEQ ID NO: 2275)SARを発現するT細胞によって誘導される標的細胞死滅およびサイトカイン産生を用量依存的に遮断すると予想される。試験抗体と同じアイソタイプの非特異的抗体がコントロールとして含まれ、SARを発現するT細胞によって誘導される標的細胞の殺傷とサイトカイン産生には影響を与えないと予想される。同様に、特異的SARをJurkat-NFAT-EGFP細胞で発現させ 標的細胞株との共培養によりSAR発現Jurkat-NFAT-GFP細胞によるEGFP誘導を阻害する試験抗体の能力を用いて、試験抗体により認識されるエピトープが前記SARにより認識されるエピトープと重なるかどうかを決定することができる。
一実施形態において、本開示は、天然に存在する(すなわち、ネイティブまたは内因性)受容体またはその変異体に任意のリンカーを介して操作可能に連結される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むSAR(単離されたSARなど)を提供する。一実施形態では、SARは、天然受容体の結合能力および機能を保持するが、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインによって与えられる結合能力および機能も獲得する。一実施形態では、SARは、天然受容体の結合能力および機能を部分的または完全に保持する。一実施形態では、SARは、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインによって与えられる結合能力および機能を獲得する。
一実施形態では、天然に存在する受容体は、細胞(例えば、免疫細胞、例えば、免疫エフェクター細胞)の表面に発現される任意の受容体である。例示的な実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、単球/マクロファージ、顆粒球およびB細胞から選択されるが、これらに限定されない。一実施形態では、天然に存在するシグナル伝達受容体は、免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、NKT細胞、マクロファージ、樹状細胞など)の表面上に発現される。
一実施形態では、天然に存在する受容体は細胞シグナル伝達を誘導する、すなわち、それは天然に存在するシグナル伝達受容体である。天然に存在するシグナル伝達受容体は、活性化受容体(すなわち、細胞活性化を誘導する)または抑制性受容体(すなわち、細胞活性化をブロックする)であり得る。一実施形態では、天然に存在する受容体は、NK細胞受容体、例えば、NK活性化受容体またはNK阻害受容体である。一実施形態では、天然に存在するシグナル伝達受容体は、細胞毒性を誘導する受容体であり得る。別の実施形態では、天然に存在するシグナル伝達受容体は、共刺激を提供する受容体であり得る。
一実施形態では、本開示のSARの構築に使用できる天然受容体は、膜貫通ドメインを有する。一実施形態では、天然に存在する受容体は、膜貫通アダプタータンパク質を動員することができる。一実施形態では、天然に存在する受容体は、限定されないが、CD3ε、FcRγ、DAP10、DAP12またはそれらの変異体もしくは断片の群から選択される膜貫通アダプタータンパク質を動員することができる。このような受容体の例としては、CD16A、NKp30、NKp44、NKp46およびNKG2Dが挙げられる。一実施形態では、天然に存在する受容体は、その膜貫通領域内に負に荷電した残基(例えば、アスパラギン酸)を含む膜貫通アダプタータンパク質を動員することができる。一実施形態では、天然に存在する受容体は、シグナル伝達アダプタータンパク質の膜貫通領域内の負に帯電した残基(例えば、アスパラギン酸)と相互作用する正に帯電した残基(リジンまたはアルギニン)を含む膜貫通ドメインを有する。一実施形態では、天然に存在する受容体は、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインを有する。一実施形態では、天然に存在する受容体は、ヒンジ(スペーサー)ドメインおよび膜貫通ドメインを有する。一実施形態では、天然に存在する受容体は、ヒンジ(空間)ドメイン、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインを有する。このような受容体の例は、CD16Aである。一実施形態では、天然に存在する受容体は、ヒンジ(空間)ドメイン、膜アンカードメイン(例えば、GPI結合ドメイン)を有するが、サイトゾルドメインを欠いている。このような受容体の例は、CD16Bである。
例示的な実施形態では、本開示のSARの構築に使用することができる天然に存在する受容体としては、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1が挙げられるが、これらに限定されない。 、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D 、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、 CD5 、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、Siglec3、Siglec-7、Siglec-9、TCRαβおよびTCRγδ など、およびそのバリアントおよびフラグメント。
一実施形態では、本開示のSARの構築に使用できる天然に存在する受容体は、T細胞受容体ではない。一実施形態では、本開示のSARの構築に使用できる天然に存在する受容体は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαではない。一実施形態では、SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの定常鎖を含まない。一実施形態では、SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの細胞外ドメイン全体を含まない。一実施形態では、本開示のSARの構築に使用できる天然に存在する非T細胞受容体は、細胞内活性化ドメインを含む。一実施形態では、アクティベーションドメインは1つ以上のITAMを含む。一実施形態では、アクティベーションドメインは1つ以上のITIMを含む。一実施形態では、本開示のSARの構築に使用できる天然に存在する非T細胞受容体は、共刺激ドメインを含む。
例示的な実施形態では、SARは、CD3ε、FcRγ、DAP10、またはDAP12に由来する細胞内活性化ドメインを含む。
一実施形態において、本開示は非TCR天然型受容体、すなわちTCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδまたはpre-TCRαではない受容体の細胞外ドメイン全体に作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。一実施形態において、本開示は、非TCR天然受容体の部分細胞外ドメインに機能的に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。一実施形態において、本開示は、非TCR天然受容体の部分細胞外ドメインに機能的に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。一実施形態では、本開示は、NTCRM(非T細胞受容体モジュール)の全体または部分細胞外ドメインに作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。一実施形態では、本開示のSARの構築に使用できる天然シグナル伝達受容体は、CD4、CD8、CD28、CD27、CD16A、またはNKG2Dではない。
一実施形態では、本開示は、任意のリンカーを介して天然に存在する受容体の全体または部分的な細胞外ドメインに作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供し、ここで受容体はTCR/CD3受容体複合体の一部ではない。一実施形態において、本開示は、任意のリンカーを介して天然に存在する受容体ポリペプチド鎖の細胞外ドメインの全体または一部に作動可能に連結される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供し、ここで受容体ポリペプチド鎖はTCR/CD3受容体複合体の一部ではない。一実施形態において、本開示は、天然に存在する受容体またはその変異体もしくはフラグメントの細胞外ドメインの全体または一部に任意のリンカーを介して作動可能に連結される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供し、ここで、受容体はTCR/CD3受容体複合体と会合しない。
一実施形態では、本開示は、天然に存在する受容体またはその変異体もしくは断片の全体または部分的な抗原(またはリガンド)結合ドメインに機能的に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。
ある実施形態において、本開示は、天然に存在する非TCRシグナル伝達受容体またはNTCRMまたはその変異体もしくはフラグメントの全体もしくは部分的な抗原(またはリガンド)結合ドメインに作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含んでなるSARを提供する。ある実施形態において、本開示は、非TCRシグナル伝達受容体またはNTCRMの全体または部分的な抗原(またはリガンド)結合ドメインまたはその変異体もしくはフラグメントに操作的に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含んでなるSARを提供する。ある実施形態において、本開示は、天然に存在するシグナル伝達受容体またはその変異体もしくはフラグメントの全体または部分的な抗原(またはリガンド)結合ドメインに操作的に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含んでなるSARを提供し、天然に存在するシグナル伝達受容体はTCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδまたはpreTCRαではない。ある実施形態において、本開示のSARは、天然に存在する非TCRシグナル伝達受容体の抗原結合特性の少なくとも一部を保持する。ある実施形態において、本開示のSARは、異種抗原結合ドメインのうちの1つ以上によって付与される新規な抗原結合特性を獲得する。ある実施形態において、本開示のSARは、天然に存在する非TCRシグナル伝達受容体の抗原結合特性の少なくとも一部を保持し、異種抗原結合ドメインのうちの1つ以上によって付与される新規な抗原結合特性を獲得する。
一実施形態では、任意のリンカーを介して、 TCRの可変ドメイン(すなわち、Vα、Vβ、Vδ、またはVγ)に由来する異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。天然に存在するシグナル伝達受容体。一実施形態では、天然に存在するシグナル伝達受容体は、NTCRM(非T細胞受容体モジュール)である。
は、任意のリンカーを介してNTCRMのヒンジドメインに作動可能に連結されたTCRの可変ドメイン(すなわち、 Vα 、Vβ、Vδ、またはVγ)に由来する異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。 -T細胞受容体モジュール)および/またはシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ε、FcRγ、DAP10、DAP10など)またはそれらの変異体もしくは断片。
一実施形態では、SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの細胞外ドメイン全体を含まない。一実施形態では、SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαの膜貫通ドメインを含まない。
本開示のSARの概略図を図1~5および表に示します。 A1-1からA1-19まで。
一実施形態では、本開示のSARの構築に使用できる天然受容体は、単一のポリペプチド鎖または複数のポリペプチド鎖を含み得る。天然に存在する受容体は、多重鎖受容体複合体(例えば、T細胞受容体複合体)の構成要素である可能性がある。
一実施形態では、SARは、2つ以上の抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、SARは、1つまたは複数の異種(または非天然)抗原結合ドメインを含む。本開示のSARの構築に使用することができる例示的な異種抗原結合ドメインには、自律抗原結合ドメイン(例えば、完全ヒトvHドメイン、vHHドメイン、単鎖TCR、組換えTCRまたはsvd-TCRなど)、 scFv、抗体、抗体フラグメント(vL、vH、Fabなど)、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン(例、セントイリン、アフィボディ、DARPIN、ZIPドメイン、アダプターなど)、リガンド、受容体の細胞外ドメイン(例、 、CD16A細胞外ドメイン、NKp30細胞外ドメインなど)、自己抗原、TCR、TCR可変フラグメント(例えば、Va、Vb、Vg、Vdなど)およびそれらの変異体およびフラグメントなど。例示的な実施形態では、1つまたはより異種の抗原結合ドメインは、scTCR、svd-TCRまたはTCR模倣scFvまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、SARは、TCR様結合能力、例えば、ペプチド/MHC複合体に結合する能力を獲得する。
現在臨床使用されている第二世代キメラ抗原受容体構築物(例えば、アクシカブタジーン・シロロイセル、リソカブタジーン・マラルーセルなど)は、茎(ヒンジ)、膜貫通、共刺激および細胞質ドメインに操作的に連結された異種抗原結合ドメイン(例えば、scFv)を含み、これらは次に、複数の異なる天然受容体に由来する。別の態様では、天然に存在するシグナル伝達受容体(例えば、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2D、KIR2DS4など)の膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインの天然構成またはシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ、FcRγ、DAP10、DAP12など)からなるSAR(例えば、次世代CAR)が提供される。このようなSARは、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターの膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインの非天然構成を含むSARと比較して、優れた生理学的細胞シグナル伝達および調節を示す。別の側面において、本開示は、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターの膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインの天然構成を含んでなるSARが、非天然構成を含んでなるSARに比べてin vitroおよびin vivoで優れた有効性を示すことを提供する。
一実施形態では、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体もしくはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントの細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインの全体と任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる。一実施形態において、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体またはその変異体もしくは断片の細胞外抗原結合ドメイン全体、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインに任意のリンカーを介して操作可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる。一実施形態において、SARは、1つの天然に存在するレセプターの細胞外抗原結合ドメインの一部または全体と、別の天然に存在するシグナル伝達レセプターまたはその変異体もしくはフラグメントの膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインと、任意のリンカーを介して操作可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる。一実施形態において、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体、シグナル伝達アダプター、またはその変異体もしくは断片の、部分的な細胞外ドメインではなく、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインの全体に、任意のリンカーを介して操作可能に連結された、1つ以上の異種抗原結合ドメインを含んでなる。一実施形態では、SARは、任意のリンカーおよび/またはスペーサー(例えば、ヒンジドメイン)を介して、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターの膜貫通ドメインおよび任意で細胞質ドメイン、またはその変異体または断片に操作可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含んでなる。一実施形態において、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターのヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、および任意に細胞質ドメイン、またはその変異体もしくは断片に、任意のリンカーを介して操作可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる。
一実施形態では、SARの異なるドメインは、ペプチド結合を介して機能的に連結されている、すなわち、それらはポリペプチド鎖の一部である。
一実施形態では、SARは細胞内活性化ドメインを含む。例示的な実施形態では、SARは、シグナル伝達アダプターに由来する細胞内活性化ドメインを含む。例示的な実施形態では、SARは、CD3ε、FcRγ、DAP10、またはDAP12に由来する細胞内活性化ドメインを含む。一実施形態では、SARの活性化ドメインは、1つ以上のITAMモチーフを含む。一実施形態では、SARは、1つまたは複数のITAMモチーフを有する活性化ドメインを含む。一実施形態では、SARは、2つ以上のITAMモチーフを有する活性化ドメインを含む。一実施形態では、 SARは、単一のITAMモチーフを有する活性化ドメインを含む。一実施形態では、SARは、ITAMモチーフを欠く活性化ドメインを含む。一実施形態では、SARは、チロシンベースのモチーフ(YINM)を含む活性化ドメインを含む。一実施形態では、SARは、PI3Kおよび/またはGrb2のp85サブユニットを動員する活性化ドメインを含む。一実施形態では、SARは、NFAT、PI3K、NF-κB、およびERKシグナル伝達経路のうちの1つまたは複数を活性化する活性化ドメインを含む。
一実施形態では、SARは細胞内阻害ドメインを含む。例示的な実施形態では、SARは、PD1に由来する細胞内阻害ドメインを含む。一実施形態では、SARの阻害ドメインは、1つ以上のITIMモチーフを含む。
一実施形態において、SARはシグナル伝達アダプターを動員することができる。例示的な実施形態では、SARは、限定されないが、CD3ε、FcRγ、DAP10、およびDAP12の群から選択される1つまたは複数のシグナル伝達アダプターを動員することができる。例示的な実施形態において、SARは、CD3ζ、FcRγ、DAP10およびDAP12からなる群から選択される1つ以上のシグナル伝達アダプターを動員することができるが、これらに限定されない。一実施形態では、SARは、そのヒンジ、膜貫通、またはサイトゾルドメインとの相互作用を介してシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、SARは、ヒンジ、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインのうちの1つ以上との相互作用を介してシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、本開示のSARを発現する免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞など)は、その1つ以上の異種抗原結合ドメインが標的抗原に結合するときに、シグナル伝達アダプターを動員する。一実施形態において、本開示のSARを発現する免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞など)は、標的細胞を活性化し、増殖し、サイトカインを分泌し、および/または標的細胞の殺傷を調節(誘導または抑制)し、MHC制限抗体型特異性および/またはMHC非制限抗体型特異性を有する。
ある実施形態において、SARは、サイトゾルドメインを欠いている。ある実施形態において、SARは、長さが100アミノ酸未満(すなわち、90、80、70、60、50、50、40、30、25、20、15、10、5または2アミノ酸長未満)のサイトゾルドメインを含んでなる。ある実施形態において、SARは、長さが50アミノ酸未満のサイトゾルドメインを含んでなる。ある実施形態において、SARは、長さが25アミノ酸未満のサイトゾルドメインを含んでなる。ある実施形態において、SARは、長さが10アミノ酸未満のサイトゾルドメインを含んでなる。ある実施形態において、SARは、長さが5アミノ酸未満のサイトゾルドメインを含んでなる。ある実施形態において、SARは、細胞内活性化ドメインを欠いている。ある実施形態において、SARは、ITAMモチーフを含む細胞内ドメインを欠いている。ある実施形態において、SARは、細胞内シグナル伝達ドメインを欠いている。ある実施形態において、SARは、細胞内共刺激ドメインを欠いている。ある実施形態において、SARは、CD3z、2B4、4-1BB、CD28、ICOS、CD2、CD40、DAP10およびDAP12のうちの1つ以上に由来する細胞内ドメインを欠いている。ある実施形態において、SARは、プロテインキナーゼまたはプロテインホスファターゼを直接動員することができる細胞内シグナル伝達ドメインを欠いている。
ある実施形態において、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントの膜貫通と細胞質ドメインとの間に挿入される共刺激ドメインを欠いている。第2世代CARとは対照的に、一実施形態では、本開示のSARの膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインは、単一の天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントに由来する。別の実施形態において、本開示のSARの膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインは、単一の天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントに由来し、共刺激受容体に由来する異種共刺激ドメインによって中断されない。別の実施形態において、本開示のSARの膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインは、単一の天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターに由来し、互いに当接する。別の実施形態において、本開示のSARのヒンジ、膜貫通および細胞質ドメインは、単一の天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターもしくはそれらの変異体に由来し、それぞれに隣接し、すなわち、それらは中断することなく1つの連続した鎖で存在する。
ある実施形態において、SARは、1以上の共刺激ドメインをさらに含む。ある例示的実施形態において、SARは、CD28、4-1BB、CD27、OX40、CD2、CD40、CD81もしくは2B4またはそれらの変異体に由来する1以上の共刺激ドメインを含んでなる。他の共刺激ドメインも当技術分野で公知であり、本開示の別の実施形態で使用することができる。ある実施形態において、1以上の共刺激ドメインは、SARの傍膜領域に位置する。ある実施形態において、1以上の共刺激ドメインは、I型膜貫通SARの膜貫通領域に対してC末端に位置する。ある実施形態において、1以上の共刺激ドメインは、II型膜貫通SARの膜貫通領域に対してN末端に存在する。別の実施形態において、SARは、共刺激ドメインを欠いている。
ある実施形態において、本開示は、1以上の共刺激ドメインを含んでなるSARを提供する。共刺激ドメインは、天然に存在するシグナル伝達受容体(例えば、CD16AまたはNKp30など)もしくはシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ、FcRγなど)またはその変異体もしくはフラグメントに由来する膜貫通ドメインと細胞質ドメインとの間に挿入される。例示的な実施形態において、本開示は、天然に存在するシグナル伝達受容体(例えば、CD16A、CD16B、CD64、NKp30など)に由来する細胞外ドメインに操作的に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含んでなるSARを提供し、これは次にヒンジドメイン(例えば、CD8ヒンジまたはCD28ヒンジ)、膜貫通ドメイン(例えば、 CD8またはCD28膜貫通ドメイン)、共刺激ドメイン(例えば、4-1BBまたはCD28共刺激ドメイン)および活性化ドメイン(例えば、CD3ζまたはFcRγ活性化ドメイン)が含まれる。例示的なこのようなSARは、配列番号10818および10821によって表される。別の例示的実施形態において、本開示は、1以上の異種抗原結合ドメインを含んでなるSARを提供する。これらのドメインは、シグナル伝達アダプターに由来する細胞外ヒンジドメイン(例えば、CD3ζ、FcRγなど)に操作的に連結されている。ヒンジドメインは、次に、膜貫通ドメイン(例えば、CD3ζまたはFcRγ膜貫通ドメイン)、共刺激ドメイン(例えば、4-1BB、CD28、2B4またはOX40共刺激ドメイン)および活性化ドメイン(例えば、CD3ζまたはFcRγ活性化ドメインなど)に連結される。
ある実施形態において、SARは、1以上の異種抗原結合ドメイン(例えば、scFv、vHH、FHVH、センチリン、scTCR、svd-TCRなど)を含んでなる。これらのドメインは、任意選択のリンカーを介して、天然に存在する(または天然の)シグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントの細胞外ドメインのアミノ末端またはアミノ末端付近に操作的に連結される。ある実施形態において、SARの1以上の異種抗原結合ドメインは、任意選択のリンカーを介して、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントのヒンジ(もしくはスペーサー)ドメインのアミノ末端またはアミノ末端付近に操作的に連結される。ある実施形態において、SARの1つ以上の異種抗原結合ドメインは、任意選択のリンカーを介して、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントの膜貫通ドメインのアミノ末端またはアミノ末端付近に操作的に連結される。ある実施形態において、SARの1つ以上の異種抗原結合ドメインは、任意選択のリンカーを介して、ヒンジ(スペーサー)ドメイン、天然に存在するシグナル伝達受容体の膜貫通ドメインおよび細胞質ドメイン、またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントに操作的に連結される。ある実施形態において、SARの1つ以上の異種抗原結合ドメインは、任意選択のリンカーを介して、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくはフラグメントの膜貫通ドメインおよび細胞質ゾルドメインに操作的に連結される。
例示的な実施形態では、SARを含む天然に存在する(または内在性)シグナル伝達受容体は、細胞外側にN末端およびサイトゾル側にC末端を有するI型(またはグループ1)膜貫通タンパク質である。このようなI型(またはグループ1)内因性受容体の例としては、CD16A、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DSが挙げられる。 4、KIR2DS5、KIR3DS1 、 CRTAM、TIGIT、CD96、2B4、SLAMF6、SLAMF7、CD27、CD100、CD160、ILT2/LILRB1、CD33、SIGLEC-7、SIGLEC-9、CD32、CD64など
一実施形態では、本開示は、I型膜貫通天然(または天然)シグナル伝達受容体のアミノ末端またはアミノ末端付近に機能的に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む合成抗原受容体(SAR)を提供する。オプションのリンカー経由。一実施形態では、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体の結合能力および機能を保持するが、さらに、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインによって付与される結合能力を獲得する。一実施形態では、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインは、scTCR、svd-TCRまたはTCR模倣抗体またはその断片を含む。いくつかの実施形態では、SARは、TCRのような結合能力を獲得する。一実施形態では、SARは、I型膜貫通タンパク質である内因性受容体のアミノ末端またはアミノ末端付近に機能的に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、SARは、任意のリンカーを介して、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2のN末端またはN末端付近に作動可能に連結された異種(非天然)抗原結合ドメインを含む。 、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、CRTAM、TIGIT、CD96、2B4、SLAMF6、SLAMF7、CD27、CD100、CD160 、ILT2/LILRB1、CD33 、SIGLEC-7、SIGLEC-9、CD32、または CD64。一実施形態では、SARはN末端シグナルペプチドも含む。一実施形態では、SARは、シグナルペプチドのC末端に位置する1つまたは複数の抗原結合ドメインを含む。
一実施形態において、SARは、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、 KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、CRTAM、TIGIT、CD96、2B4、SLAMF6、SLAMF7、CD27、CD100、CD160、ILT2/LILRB1、CD33、SIGLEC-7、SIGLEC-9、CD32またはCD64のヒンジ(スペーサー)、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインを含んでなるポリペプチドに、1つ以上の任意のリンカーを介して操作可能に連結される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含んでなる。
例示的な実施形態において、天然に存在する(または内因性の)シグナル伝達レセプターは、そのC末端が細胞外側にあり、N末端が細胞質側にあるII型(またはグループ2)膜貫通タンパク質である。本開示は、I型膜タンパク質とII型膜タンパク質との融合タンパク質を生成するための一般的な方法を提供し、それはI型膜タンパク質の1つ以上のモジュールがII型膜タンパク質の全領域または部分領域に機能的に連結された融合体である例示的な実施形態では、シグナルペプチド配列を欠くI型タンパク質の抗原結合ドメインのN末端は、II型膜タンパク質のC末端に任意の連結を介して機能的に連結される。一実施形態において、SARは、天然に存在する(または内因性の)シグナル伝達受容体のカルボキシ末端またはカルボキシ末端近傍に、1つ以上の任意のリンカーを介して操作可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる。このようなII型(またはグループ2)内因性受容体の例には、NKG2D、NKG2A、NKG2C、NKG2F、NKG2E、NKG2H、KLRG1、CD161およびCD94などが含まれるが、これらに限定されない。一実施形態において、1つ以上の異種抗原結合ドメイン(例えば、vHH、FHVH、センチリン、scTCR、svd-TCR)は、1つ以上の任意のリンカーを介して、II型(2群)膜貫通タンパク質である内因性受容体のC末端またはC末端近傍にフレーム内で操作可能に連結される。一実施形態において、SARは、NKG2D、NKG2A、NKG2C、NKG2F、NKG2E、NKG2H、KLRG1、CD161またはCD94のC末端またはC末端近傍に任意のリンカーを介して操作可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む。NKG2DのC末端に結合したHer2およびHer3 vHHドメインを含むこのようなSARの例は、それぞれ配列番号(DNA):7696~7697および配列番号(PRT):8388~8389で表される。一実施形態では、1つ以上の異種抗原結合ドメインは、任意のリンカーを介して、II型(グループ2)膜貫通タンパク質である内因性受容体のヒンジドメインに機能的に連結される。一実施形態では、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインは、任意のリンカーを介して、NKG2D、NKG2A、NKG2B、NKG2C、NKG2F、NKG2E、NKG2H、KLRG1、CD161またはCD94のヒンジドメインに機能的に連結される。
細胞表面での NKG2D の効率的な発現には、DAP10 の存在が必要です。本明細書では、細胞(例えば、iPSC)を遺伝子操作してNKG2Dを導入することによって、NKG2D-SAR(すなわち、NKG2Dの膜貫通ドメインおよび/または細胞質ドメインを含むSAR)を単独で、またはDAP10とともに安定して過剰発現するエフェクター細胞を取得するための戦略が提供される。 -SAR、および場合によりDAP10を細胞(例えば、iPSC)に導入し、その後、指示されたiPSC分化からNK細胞およびT細胞を含むエフェクター細胞を誘導する。本開示はまた、NKG2D膜貫通ドメインを含むSARとともにアクセサリーモジュールとしてのDAP10の異所性発現によって、DAP10を欠く細胞、または低レベルのDAP10を発現する細胞におけるNKG2D-SARの効率的な発現のための戦略も提供する。
CD94/NKG2C は、HLA-E に結合し、免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフを含むタンパク質である DAP12 と会合するヘテロ二量体受容体です。細胞表面でのCD94/NKG2Cの効率的な発現にはDAP12の存在が必要であり、DAP12の膜貫通ドメインとNKG2Cの荷電アミノ酸がこの相互作用を媒介します。本明細書では、細胞(例えば、iPSC)を遺伝子操作してNKG2C-SARを導入し、場合により、NKG2C-SARを導入することによって、NKG2C-SAR(すなわち、NKG2Cの膜貫通ドメインを含むSAR)を単独で、またはDAP12とともに安定して過剰発現するエフェクター細胞を取得するための戦略が提供される。 DAP12を細胞(例えば、iPSC)に導入し、その後、誘導されたiPSC分化からNK細胞およびT細胞を含むエフェクター細胞を誘導する。いくつかの実施形態では、NKG2C-SARはさらにCD94またはCD94-SARと共発現される。
過剰発現されたNKG2C-SARを含むiPSCまたはそれに由来するエフェクター細胞において、細胞はさらに、過剰発現されたCD94もしくはCD94-SARおよび/またはDAP12を含む。一実施形態では、NKG2C-SARおよびCD94(またはCD94-SAR)および/またはDAP12は、別個の構築物で発現される。別の実施形態では、NKG2C-SARおよびCD94(またはCD94-SAR)および/またはDAP12は、ビシストロン性またはトリシストロン性構築物中で共発現され、自己切断性2Aコード配列によって連結される。別の実施形態では、NKG2C-SAR、CD94(またはCD94-SAR)およびDAP12は、別個の構築物中で発現される。
、既知のCD94および/またはシグナル伝達アダプター(例えば、DAP10、DAP12など)の共発現によって同様に効率的に発現され得ることを提供する。彼らと関わること。
一実施形態では、本開示は、II型膜貫通天然シグナル伝達受容体のカルボキシ末端またはカルボキシ末端付近に、任意のリンカーを介して機能的に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。一実施形態では、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体の結合能力および機能を保持しているが、さらに、異種抗原結合ドメインによって与えられる結合能力を獲得する。一実施形態では、本開示は、合成抗原受容体を生成するために、II型膜貫通天然シグナル伝達受容体のヒンジドメインまたは膜貫通ドメインに任意のリンカーを介してインフレームで機能的に連結される1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを提供する。一実施形態では、得られるSARは、天然シグナル伝達受容体の結合能力および機能を保持するが、さらに、異種抗原結合ドメインによって付与される結合能力を獲得する。一実施形態では、本開示のSARは、天然に存在する受容体の結合特性および生理学的調節を保持しながら、天然に存在する受容体が応答できる標的抗原に加えて標的抗原にも応答できる追加の抗原結合能力を獲得する。
本開示はまた、天然シグナル伝達鎖またはシグナル伝達アダプターもしくはその変異体の細胞外ドメインに任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む単鎖SARを提供する。本開示はまた、天然シグナル伝達鎖またはシグナル伝達アダプターもしくはその変異体のヒンジ(スペーサー)ドメインに任意のリンカーを介して機能的に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む単鎖SARを提供する。本開示はまた、天然シグナル伝達鎖またはシグナル伝達アダプターもしくはその変異体の膜貫通ドメインに任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む単鎖SARを提供する。例示的なシグナル伝達鎖またはシグナル伝達アダプターとしては、CD3ζ、FcRγ、DAP10もしくはDAP12、またはそれらの変異体が挙げられるが、これらに限定されない。一実施形態では、シグナル伝達鎖/アダプターは、共刺激ドメインをさらに含む。
一実施形態では、本開示は、任意のリンカーを介して、NCAM(非CD3アダプターモジュール)の全体または部分的な細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、または膜貫通ドメインに作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。
一実施形態では、本開示は、任意選択のリンカーを介してシグナル伝達アダプターの全体的または部分的な細胞外ドメイン、ヒンジドメインまたは膜貫通ドメインに作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供し、シグナル伝達アダプター(またはシグナル伝達鎖) ) は CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ ではありません。一実施形態では、シグナル伝達アダプターはFcRγではない。
一実施形態では、単鎖SARの1つ以上の異種抗原結合ドメインは、自律抗原結合ドメイン(AABD)、例えば、単一ドメイン抗体、単一vHドメイン、FHVH、vHHドメイン、svd-TCR、非免疫グロブリンを含む。抗原結合足場(例、DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディ、レペボディ、ファイノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン) 、Armadillo リピートタンパク質またはそのフラグメント)。一実施形態において、単鎖SARの1つ以上の異種抗原結合ドメインは、抗体または抗体フラグメント(例えば、vL、vH、Fab、Fab'2、scFvおよびscTCRなど)を含む。
SAR はモジュール形式であるため、その異なるドメインを他のドメインに置き換えて、多様な生物学的活性と特性を備えた新しい SAR を生成できる。したがって、あるSARの細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび/または細胞質ドメインは、得られたSARが、元のSARの生物学的活性(例えば、抗原結合、細胞シグナル伝達など)の少なくとも1つを有する限り、別のSARの細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび/または細胞質ドメインで置換することができる。一実施形態では、本開示は、新しいモジュール(共刺激ドメイン)をSARに挿入できることを規定する。一実施形態において、本開示は、1つの天然に存在するシグナル伝達レセプターの細胞外ドメインの全体または一部に任意のリンカーを介して操作可能に連結され、次いで、異なる天然に存在するレセプターまたはその変異体の膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインに操作可能に連結される、1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。例示的な実施形態では、CD16A細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞質ドメインからなるSARの細胞外ドメインがCD64の細胞外ドメインで置換され、CD20 vHHドメイン、CD64細胞外ドメイン、CD16A膜貫通ドメイン、およびCD16A細胞質ドメインからなる新しいSAR(SEQ ID NO: 4722)が生成される。
一実施形態では、SARの異なるドメインは、単一の天然受容体またはシグナル伝達アダプターに由来する。一実施形態では、SARの異なるドメインは、2つ以上の天然に存在する受容体またはシグナル伝達アダプターに由来する。一実施形態において、SARは、天然に存在する1つのレセプターの抗原結合ドメインの一部または全体と、1つ以上の異なるレセプターまたはその変異体もしくはフラグメント由来のヒンジ、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインと、任意のリンカーを介して操作可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる。例示的な実施形態において、SARは、N末端からC末端まで、CD19 scFv、CD16抗原結合ドメイン(D1およびD2)、CD8ヒンジドメイン、CD8膜貫通ドメイン、4-1BB共刺激ドメイン、およびCD3z活性化ドメインからなる。このようなSARのアミノ酸配列は、配列番号10836に示される。別の例示的な実施形態では、SARは、N末端からC末端まで、CD19 scFv、CD16A抗原結合ドメイン(D1およびD2)、CD16Aヒンジドメイン、 CD28 膜貫通ドメイン、CD28 共刺激ドメイン、および CD3z 活性化ドメインからなる。別の例示的な実施形態では、SARは、N末端からC末端まで、CD19 scFv、CD64抗原結合ドメイン、CD16Aヒンジドメイン、CD16A膜貫通ドメイン、CD16Aサイトゾルドメインを含む。このようなSARのアミノ酸配列は配列番号10832に示されている。
一実施形態では、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体またはその変異体のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメインに任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む。サイトゾルドメインはすべて、単一の天然シグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプター、あるいはそれらの変異体または断片に由来する。一実施形態では、SIRを含むヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメインは、単一の天然シグナル伝達受容体(例えば、CD16A)またはシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ)またはその変異体もしくは断片に由来する。別の実施形態では、SIRを構成するヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインは、1つ以上の天然に存在するシグナル受容体(例えば、CD16Aのヒンジドメインおよび膜貫通ドメインは、NKp30の細胞質ドメインなどと作動的に連結している)またはシグナル伝達アダプター(例えば、CD16Aのヒンジドメインおよび膜貫通ドメインは、FcRγの細胞質ドメインなどと作動的に連結している)に由来する。一実施形態において、SARは、天然に存在するシグナル伝達受容体のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインに任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなり、ここで、ヒンジ、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインは、1つ以上の天然に存在するシグナル伝達レセプター、シグナル伝達アダプター、またはそれらの変異体もしくはフラグメントに由来する。
一実施形態において、本開示は、アミノ(N)末端からカルボキシ(C)末端までの以下の一般式を有する2つ以上の鎖を含む非ネイティブタンパク質(すなわち、合成タンパク質)を生成する方法を提供する:
チェーン 1: SP1-A1-L1-H1-M1-(C1)n
チェーン 2: SP2-A2-L2-H2-M2-(C2)n
ここで、SP1およびSP2は、成熟ポリペプチド鎖から切断される任意のシグナルペプチドである; A1およびA2は、互いに相互作用し得る2つのタンパク質ドメインであり、L1およびL2は、任意のリンカーであり、H1およびH2は、任意のヒンジまたはスペーサードメインであり、M1およびM2は、膜アンカーまたは膜貫通ドメインであり、C1およびC2は、任意の細胞質ドメインである。一実施形態では、A1およびA2ドメインは抗体に由来しない。一実施形態では、A1およびA2ドメインは抗体断片ではない。一実施形態では、A1およびA2ドメインはM1およびM2ドメインに対して異種である、すなわち、A1およびM1ドメインは異なるタンパク質に由来し、同様にA2およびM2ドメインは異なるタンパク質に由来する。例示的な実施形態では、A1およびA2ドメインはTCR(例えば、TCRのVαおよびVβドメイン)に由来し、M1およびM2ドメインはCD3εに由来する。一実施形態では、A1ドメインおよびA2ドメインは自律ドメインではない。一実施形態では、A1ドメインとA2ドメインは、無関係なタンパク質に対する親和性よりも大きい親和性を互いに有する。一実施形態では、A1およびA2ドメインは互いに会合して、抗原結合ドメインを生成し得る。一実施形態では、非天然タンパク質は合成抗原受容体である。一実施形態では、L1およびL2リンカーは長いリンカーである。一実施形態では、L1およびL2リンカーはIg様リンカーである。一実施形態では、L1リンカーおよびL2リンカーは、1つまたは複数のジスルフィド結合によって結合される。一実施形態では、M1およびM2ドメインは膜貫通ドメインである。一実施形態では、M1およびM2ドメインは同じタンパク質(例えば、CD3ζ)に由来する。一実施形態では、M1ドメインおよびM2ドメインは、異なるタンパク質(例えば、CD3εおよびFcRγ)に由来する。一実施形態では、M1ドメインとM2ドメインは、配列が同一であり、かつ/または70%以上(例えば、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%、99.9%など)のアミノ酸配列相同性を有する。一実施形態では、M1ドメインとM2ドメインは互いに関連する。一実施形態では、M1およびM2ドメインはジスルフィド結合によって結合される。一実施形態では、M1および/またはM2ドメインは、1つまたは複数のシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、C1、C2ドメインは細胞シグナル伝達ドメイン(例えば、活性化ドメインまたは共刺激ドメインなど)である。一実施形態では、各鎖は複数のサイトゾルドメインを有し得る。一実施形態では、両鎖は、A1-L1-H1セグメントおよびA2-L2-H2セグメントが細胞外側に位置する細胞表面上で発現される。本開示は、合成タンパク質をコードする核酸、アミノ酸配列、合成タンパク質をコードする1つ以上のベクター、および合成タンパク質を発現する細胞を提供する。
本開示はまた、二重鎖SAR (例えば、分離された二重鎖SAR)を提供する。一実施形態において、本開示は、シグナル伝達受容体の細胞外ドメイン全体もしくは部分ドメイン、膜貫通ドメイン、および任意選択で細胞質ドメイン、シグナル伝達アダプター、またはその変異体もしくはフラグメントからなる少なくとも1つのモジュールに、任意選択でリンカーを介して操作可能に連結される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。一実施形態では、シグナル伝達受容体は非TCRシグナル伝達受容体である。一実施形態では、シグナリングアダプタは非CD3アダプタである。一実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。
一実施形態において、本開示は、シグナル伝達受容体(例えば、CD16A、CD16B、NKp30など)の膜貫通ドメインまたは膜関連ドメイン、シグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ、FcRγ)またはその変異体もしくはフラグメントからなる膜関連モジュール(MAM)に任意のペプチドリンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)を介して操作可能に連結されている、それぞれが少なくとも1つの抗原結合ドメイン(例えば、vL、vβ、Vα、Vβ、VγまたはVδなど)を含む2つの鎖からなる二重鎖SARを提供する。いくつかの実施形態では、MAMは、全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、シグナル伝達受容体のヒンジドメインおよび/またはサイトゾルドメイン、および/またはシグナル伝達アダプターのヒンジドメインおよび/またはサイトゾルドメインをさらに含む。一実施形態では、シグナル伝達受容体は非TCRシグナル伝達受容体である。一実施形態では、モジュールはNTCRMである。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(すなわち、NCAM)である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。一実施形態では、MAMは、TCRα、β、γ、δ、プレTCRα、CD3ε、CD3ε、CD3γまたはCD3δの膜貫通ドメインを含まない。いくつかの実施形態において、第1鎖の少なくとも1つの抗原結合ドメイン(例えば、vL、Vα、またはVγ)は、第2鎖の少なくとも1つの相補的抗原結合ドメイン(例えば、vH、Vβ、またはVδ)と会合して、標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュール(例えば、FvまたはFc-TCR)を形成する。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のペプチドリンカーと第2のペプチドリンカーは、1つ以上のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のペプチドリンカーおよび/または第2のペプチドリンカーは、それぞれ、長さが約5~約500アミノ酸である。一実施形態では、第1および第2の抗原結合ドメインは相補鎖(例えば、vLとvH、VαとVβ、またはVγとVδ)を含む。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメイン(例えば、vL、VαまたはVγ)および/または第2の抗原結合ドメイン(例えば、vH、VβまたはVδ)のN末端またはN末端付近に付着している1つ以上の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。いくつかの実施形態では、標的抗原は細胞表面抗原である。いくつかの実施形態では、細胞表面抗原は、タンパク質、炭水化物、および脂質からなる群から選択される。例示的な実施形態では、標的抗原は、表Bに列挙される抗原のうちの1つまたは複数である。例示的な実施形態では、細胞表面抗原は、以下の1つ以上の群から選択されるが、これらに限定されない: CD2、CD5、CD19、CD20、CD22、CD33、CD70、CD123、CD138、CD179b、CLL-1、FLT3、クローディン18. 2、BCMA、GCC、MPL、SLAMF7、ROR1、ROR2、GPRC5D、FCRL5、MSLN、EGFR、EGFRviii、PSMA、PSCA、KLK2、IL13Ra2、TROP2、PTK7、DLL3、Muc1、Muc16、またはHer2。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ペプチドおよび主要組織適合性複合体(MHC)タンパク質を含む複合体である。例示的な実施形態では、ペプチド抗原は、表Bに列挙される抗原のうちの1つまたは複数である。例示的な実施形態において、ペプチド/MHC複合体は、NY-ESO-1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE4、WT1、AFP、TERT、MART-1、pp66-CMV、HPV16-E7、PRAME、EBV-LMP2A、HIV-1、PSAまたはgp100のうちの1つ以上に由来するペプチドを含む。
一実施形態において、本開示は、シグナル伝達受容体のヒンジ、膜貫通ドメイン、および任意選択で細胞質ドメインからなるモジュールに任意選択でリンカーを介して作動可能に連結される1つまたは複数の異種抗原結合ドメインからなる2本の鎖の各々からなる二重鎖SAR、またはシグナル伝達アダプター、またはその変異体もしくはフラグメントを提供する。一実施形態において、本開示は、各々が、シグナル伝達受容体の膜貫通ドメインおよび任意選択で細胞質ドメイン、シグナル伝達アダプター、またはその変異体もしくはフラグメントからなるモジュールに任意のリンカーを介して作動可能に連結される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む2つの鎖からなる二重鎖SARを提供する。一実施形態において、本開示は、シグナル伝達受容体の膜貫通ドメイン、またはシグナル伝達アダプター、またはその変異体もしくはフラグメントからなるモジュールに任意のリンカーを介して作動可能に連結された、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインからなる2つの鎖の各々からなる二重鎖SARを提供する。一実施形態において、本開示は、シグナル伝達受容体の細胞質ドメイン、シグナル伝達アダプター、またはその変異体もしくはフラグメントからなるモジュールに任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる2つの鎖の各々からなる二重鎖SARを提供する。一実施形態では、シグナル伝達受容体は非TCRシグナル伝達受容体である。一実施形態では、モジュールはNTCRMである。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(すなわち、NCAM)である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。
一実施形態において、本開示は、各鎖がシグナル伝達受容体(例えば、ネイティブ受容体)、シグナル伝達アダプター(例えば、NCAM)、またはそれらの変異体もしくはフラグメントの細胞外、膜貫通または細胞質ドメインからなるモジュール(例えば、NTCRM)に任意のリンカーを介して操作可能に連結された、1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる二重鎖SARを提供する。一実施形態では、二本鎖SARを含むシグナル伝達受容体およびシグナル伝達アダプターは天然に存在する。一実施形態では、二本鎖SARを含むシグナル伝達受容体およびシグナル伝達アダプターは、天然に存在しない。一実施形態では、二重鎖SARを含むシグナル伝達受容体およびシグナル伝達アダプターは、非T細胞受容体および非CD3アダプターである。一実施形態では、二重鎖SARを含むシグナル伝達受容体およびシグナル伝達アダプターは、天然に存在する非T細胞受容体および非CD3アダプターである。
一実施形態において、本開示は、天然に存在するシグナル伝達受容体(例えば、CD16A)、シグナル伝達アダプター(例えば、FcRγ)またはその変異体もしくはフラグメントの細胞外、膜貫通または細胞質ドメインからなる少なくとも1つのモジュール(例えば、NTCRM)に任意のリンカーを介して操作可能に連結される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。
本出願は、1つの局面において、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)に融合した1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む構築物(単離された構築物など)を提供する。例示的な実施形態では、NTCRMは、以下の非TCRレセプターの1つ以上に由来するが、これらに限定されない: CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、 KIR2DS5、KIR3DS1、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、ILT2。
いくつかの実施形態では、SARは、標的抗原に特異的に結合する1つまたは複数の異種抗原結合ドメインおよび少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(すなわち、NCAM)である。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ペプチドおよびMHCタンパク質(例えば、MHCクラスIタンパク質またはMHCクラスIIタンパク質)を含む複合体である。いくつかの実施形態では、標的抗原は細胞表面抗原である。
いくつかの実施形態において、標的抗原に特異的に結合するSAR(単離されたSARなど)が提供され、ここで、SARは以下からなる: a)vL、VαまたはVγドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)からなる第1の抗原結合ドメインを含む第1のポリペプチド鎖;および b)vH、VβまたはVδドメインからなる第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)からなる第2のポリペプチド鎖であって、ここで、第1の抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインおよび第2の抗原結合ドメインの相補的なvH、VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成し、第1のMAMおよび第2のMAMは、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成し、NTCRMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化し、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することが可能である。一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαから選択されるTCR鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMまたは第2のMAMは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαから選択されるTCR鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、NTCRMは、i)TCRαおよびTCRβ、ii)TCRγおよびTCRδ、またはiii)プレTCRαおよびTCRβから選択される2つのTCR鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、CD3ε、CD3γ、CD3δまたはCD3εから選択されるCD3鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、TCR鎖およびCD3鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、CD3εの膜貫通ドメインを含まない。例示的な実施形態では、NTCRMは、以下の非TCRレセプターの1つ以上に由来するが、これらに限定されない: CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、 KIR2DS5、KIR3DS1、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、ILT2。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは、CD3ε、FcRγ、DAP10および/またはDAP12、あるいはそれらの変異体もしくは断片のうちの1つ以上から選択されるがこれらに限定されない。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(NCAM)である。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメインと第1のMAMとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の抗原結合ドメインと第2のMAMとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のペプチドリンカーおよび/または第2のペプチドリンカーは、それぞれ長さが約5~約500アミノ酸である。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。例示的な実施形態において、第1および/または第2のリンカーは、個々に、免疫グロブリン由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO: 3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO: 3560、 SEQ ID NO:3536-3551)、またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO:3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562;TCRg-Ig3、SEQ ID NO:3566;またはTCRd-Ig3、SEQ ID NO:3568など)、またはその変異体もしくはフラグメントを含む。いくつかの実施形態では、vLドメインはIgCLリンカーに結合され、vHドメインはIgCH1リンカーに結合される。いくつかの実施形態では、vLドメインはIgCH1リンカーに結合され、vHドメインはIgCLリンカーに結合される。いくつかの実施形態では、VαドメインはCα由来リンカー(例えば、TCRa-Ig3)に結合され、VβドメインはCβ由来リンカー(例えば、TCRb-Ig3)に結合される。いくつかの実施形態では、VβドメインはCα由来リンカー(例えば、TCRa-Ig3)に結合され、VαドメインはCβ由来リンカー(例えば、TCRb-Ig3)に結合される。いくつかの実施形態では、VγドメインはCγ由来リンカー(例えば、TCRg-Ig3)に結合され、VδドメインはCδ由来リンカー(例えば、TCRd-Ig3)に結合される。いくつかの実施形態では、VγドメインはCδ由来リンカー(例えば、TCRd-Ig3)に結合され、VδドメインはCγ由来リンカー(例えば、TCRg-Ig3)に結合される。いくつかの実施形態では、可変ドメインおよびリンカーの他の構成が想定される。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、2つのポリペプチド鎖の発現、親和性および対合を増加させる変異を含む。一実施形態では、第1および第2の抗原結合ドメインは相補鎖(例えば、vLとvH、VαとVβ、またはVγとVδ)を含む。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメイン(例えば、vL、VαまたはVγ)および/または第2の抗原結合ドメイン(例えば、vH、VβまたはVδ)のN末端またはN末端付近に付着している1つ以上の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。いくつかの実施形態において、AABDは、単一vHドメイン(SVH)、単一vLドメイン(SVL)、vHHドメイン、単一ドメイン抗体、TCRの単一可変ドメイン(svd-TCR)、非免疫グロブリン抗原結合スキャフォールド、受容体のリガンド結合ドメイン、リガンドの受容体結合ドメイン、自己抗原、アダプター結合ドメイン、Fc結合ドメイン、またはそれらのフラグメントもしくはバリアントのうちの1つ以上から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、SARは、約0.1pMから約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。いくつかの実施形態では、標的抗原は細胞表面抗原である。例示的な実施形態では、標的抗原は、表Bに列挙される抗原のうちの1つまたは複数である。いくつかの実施形態では、細胞表面抗原は、タンパク質、炭水化物、および脂質からなる群から選択される。いくつかの実施形態において、細胞表面抗原は、CD2、CD5、CD19、CD20、CD22、CD33、CD70、CD123、CD138、CD179b、CLL-1、FLT3、クローディン18. 2、BCMA、GCC、MPL、SLAMF7、ROR1、ROR2、GPRC5D、FCRL5、MSLN、EGFR、EGFRviii、PSMA、PSCA、KLK2、IL13Ra2、TROP2、PTK7、DLL3、Muc1、Muc16、またはHer2である。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ペプチドおよび主要組織適合性複合体(MHC)タンパク質を含む複合体である。例示的な実施形態において、ペプチド/MHC複合体は、NY-ESO-1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE4、WT1、AFP、TERT、MART-1、pp66-CMV、HPV16-E7、PRAME、EBV-LMP2A、HIV-1、PSAまたはgp100のうちの1つ以上に由来するペプチドを含む。
一実施形態では、SARのvLドメインおよびvHドメインは、MHC依存的に細胞内ペプチドを認識できるTCR模倣抗体に由来する。一実施形態では、SARのVαおよびVβドメインは、細胞表面タンパク質を認識できるHLA非依存性TCRに由来する。一実施形態では、SARは二重特異性または多重特異性である。一実施形態では、本開示は、MHC制限されている2つ以上の抗原に結合できるSARを提供する。一実施形態では、SARは、MHC制限抗原および/またはMHC非制限抗原の2つ以上に結合することができる。一実施形態において、SARは、そのFvまたはTCR-Fvドメインを介してペプチド/MHC複合体に結合し、そのvLおよびvH、VαおよびVβ、またはVγおよびVδドメインのN末端またはN末端付近に結合している1つ以上のsvd-TCRを介して1つ以上のペプチド/MHC複合体に結合することができる。一実施形態において、SARは、そのFv、TCR-Fvドメインおよび/またはsvd-TCRドメインを介して1つ以上のペプチド/MHC複合体に結合し、そのVαおよびVβまたはVγおよびVδドメインのN末端またはN末端近傍に結合している1つ以上のAABD(例えば、vHH、FHVH、センチリンなど)を介して1つ以上の表面抗原と結合することができる。
いくつかの実施形態では、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、第1のポリペプチドは、第1のMAMのN末端側に第1のヒンジドメイン(または接続ペプチド)またはその断片(例えば、膜貫通ドメイン)をさらに含み、および/または第2のMAMは、第2のMAMのN末端に第2のヒンジドメイン(または接続ペプチド)またはその断片(例えば、膜貫通ドメイン)をさらに含む。いくつかの実施形態では、SARは、第1のMAM内の残基と第2のMAM内の残基との間のジスルフィド結合、および/または第1のヒンジドメイン内の残基と第2のヒンジドメイン内の残基との間のジスルフィド結合を含む。いくつかの実施形態において、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、第1のMAMは、第1のヒンジドメインのN末端に第1の相同抗原結合ドメインまたはそのフラグメントをさらに含み、および/または第2のポリペプチドは、第2のヒンジドメインのN末端に第2の相同抗原結合ドメインまたはそのフラグメントをさらに含む。一実施形態では、2つの相同抗原結合ドメインは、2つのヒンジドメインと同じ非T細胞受容体に由来する。いくつかの実施形態では、第1のMAMは、第1の膜貫通ドメインのC末端側に第1のサイトゾルドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のMAMは、第2の膜貫通ドメインのC末端側に第2のサイトゾルドメインをさらに含む。一実施形態では、第1および/または第2のサイトゾルドメインは、1つまたは複数のITAMを含む活性化ドメインである。いくつかの実施形態では、SARは、約0.1pMから約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。
いくつかの実施形態では、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、第1のポリペプチド鎖は、第1の膜貫通ドメインのC末端側に第1の共刺激ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の膜貫通ドメインのC末端側に第2の共刺激ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態において、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、第1のポリペプチド鎖は、第1の膜貫通ドメインのC末端に1つ以上の共刺激性ドメインを含み、および/または第2のポリペプチド鎖は、第2の膜貫通ドメインのC末端に1つ以上の共刺激性ドメインを含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメインのN末端に第1のシグナル伝達ペプチドをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の抗原結合ドメインのN末端に第2のシグナル伝達ペプチドをさらに含む。
いくつかの実施形態において、第1及び/又は第2のMAM及びNTCRMは、非T細胞受容体及び/又はシグナル伝達アダプターの膜貫通/膜固定ドメイン、任意の細胞質ドメイン、任意の共刺激ドメイン、任意のヒンジドメイン及び/又は任意の細胞外ドメインから構成される。
いくつかの実施形態において、第1及び/又は第2のMAM及びNTCRMは、単一の非T細胞受容体及び/又は単一のシグナル伝達アダプター又はその変異体に全て由来する、膜貫通/膜アンカードメイン、任意の細胞質ドメイン、任意の共刺激ドメイン、任意のヒンジドメイン及び/又は任意の細胞外ドメインから構成される。例示的な実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、すべてCD3εに由来するヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインを含み、第2のポリペプチド鎖は、すべてFcRγまたはCD16Aに由来するヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインを含む。
いくつかの実施形態において、第1および/または第2のMAMならびにNTCRMは、膜貫通/膜アンカードメイン、任意選択で細胞質ドメイン、任意選択でヒンジドメインおよび/または任意選択で細胞外ドメインが、1つ以上の異なる非T細胞受容体および/またはシグナル伝達アダプターまたはそのバリアントに由来して構成される。例示的な実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、CD3ζヒンジドメイン、CD3ζ膜貫通ドメインおよびFcRγ細胞質ドメインからなり、第2のポリペプチド鎖は、DAP10ヒンジドメイン、41-BB共刺激ドメインおよびCD3ζ活性化ドメインからなる細胞質ドメインに結合したDAP10膜貫通ドメインからなる。
いくつかの実施形態では、2つの膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意の共刺激ドメイン、任意のヒンジドメイン、および/または任意の細胞外ドメインは、配列が同一であり、同じタンパク質に由来する。いくつかの実施形態において、2つの膜貫通/膜アンカードメイン、任意の細胞質ドメイン、任意の共刺激ドメイン、任意のヒンジドメインおよび/または任意の細胞外ドメインは、配列が異なり、かつ/または異なるタンパク質由来である。。
いくつかの実施形態では、2つの膜貫通/膜アンカードメイン、任意選択のサイトゾルドメイン、任意選択の共刺激ドメイン、任意選択のヒンジドメイン、および/または任意選択の細胞外ドメインは、配列が異なり、かつ/または異なるタンパク質に由来する。
一実施形態において、本開示は、以下を含む標的抗原に特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)シグナル伝達受容体またはその変異体の細胞外ドメインに1つ以上の任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる第1の鎖;および、b)第2のシグナル伝達レセプターまたはその変異体の細胞外ドメインに、1つ以上の任意のリンカーを介して作動可能に連結された、1つ以上の異種抗原結合ドメインからなる第2の鎖。一実施形態では、一方または両方のシグナル伝達受容体は天然に存在する。一実施形態では、一方または両方のシグナル伝達受容体は、天然に存在する非T細胞受容体である。一実施形態において、第1の鎖上に存在する少なくとも1つの異種抗原結合ドメイン(例えば、vL、Vα、またはVγなど)は、第1の鎖上に存在する少なくとも1つの異種抗原結合ドメイン(例えば、vH、Vβ、またはVδなど)と会合する。 2番目の鎖は、標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュール(例えば、FvまたはTCR-Fvなど)を形成する。いくつかの実施形態では、標的抗原は細胞表面抗原である。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ペプチドおよびMHCタンパク質(例えば、MHCクラスIタンパク質またはMHCクラスIIタンパク質)を含む複合体である。いくつかの実施形態では、SARは、約0.1pMから約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のペプチドリンカーと第2のペプチドリンカーは、1つ以上のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖の第1の任意のリンカーの残基と第2のポリペプチド鎖の第2の任意のリンカーの残基との間にジスルフィド結合が存在する。いくつかの実施形態では、第1のリンカーおよび/または第2のリンカーは、それぞれ、長さが約5~約500アミノ酸である。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。いくつかの実施形態において、第1および/または第2のリンカーは、個々に、免疫グロブリン由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO: 3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO: 3560、 SEQ ID NO:3536-3551)、またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO:3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562;TCRg-Ig3、SEQ ID NO:3566;もしくはTCRd-Ig3、SEQ ID NO:3568など)、またはその変異体もしくはフラグメントを含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のシグナル伝達受容体は、少なくとも1つのシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζまたはNCAMなど)を動員できる非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは、CD3ε、FcRγ、DAP10および/またはDAP12からなる群から選択される。
一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)vL(抗体の軽鎖の可変ドメイン)、Va(TCRaまたはVαの可変ドメイン)、またはVg(TCRgまたはVγの可変ドメイン)ドメインからなり、非TCRシグナル受容体鎖またはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と任意のリンカーを介して操作可能に連結される第1の抗原結合ドメイン;および、b)第2の非TCRシグナル伝達レセプター鎖またはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と任意のリンカーを介して作動可能に連結している、vH(抗体の重鎖の可変ドメイン)、Vb(TCRbまたはVβの可変ドメイン)またはVdドメイン(TCRdまたはVδの可変ドメイン)である第2の抗原結合ドメイン、ここで、第一抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインと第二抗原結合ドメインのvH、VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体鎖またはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結しているvLドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と作動可能に連結しているvHドメイン、ここで、vLおよびvHドメインは、MHC依存性および/またはMHC非依存的に標的抗原に特異的に結合するFv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体またはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結しているVαドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と作動可能に連結しているVβドメイン、ここで、VαおよびVβドメインは、MHC依存的にペプチド/MHC複合体に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体またはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結されたVγドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の細胞外抗原結合ドメインの全体または部分と作動可能に連結しているVδドメイン、ここで、VγおよびVδドメインは、MHC依存的またはMHC非依存的に抗原に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。例示的な実施形態では、非TCRシグナル伝達受容体は、以下の1つ以上から選択されるが、これらに限定されない: CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3 、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1 、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、 DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、 CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas 、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、および ILT2。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。いくつかの実施形態において、第1および/または第2のリンカーは、個々に、免疫グロブリン由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO: 3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO: 3560、 SEQ ID NO:3536-3551)、またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO:3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562;TCRg-Ig3、SEQ ID NO:3566;もしくはTCRd-Ig3、SEQ ID NO:3568など)、またはその変異体もしくはフラグメントからなる。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメイン(例えば、vL、VαまたはVγ)および/または第2の抗原結合ドメイン(例えば、vH、VβまたはVδ)のN末端またはN末端付近に付着している1つ以上の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。
一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)vL(抗体の軽鎖の可変ドメイン)、Va(TCRaまたはVαの可変ドメイン)、またはVg(TCRgまたはVγの可変ドメイン)ドメインからなり、非TCRシグナル受容体鎖またはその変異体の全体または部分的ヒンジドメインに任意のペプチドリンカーを介して操作可能に連結される、第1の抗原結合ドメイン;および、b)第2の抗原結合ドメインであって、任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプター鎖またはその変異体の全体または部分的ヒンジドメインに作動可能に連結される、vH(抗体の重鎖の可変ドメイン)、Vb(TCRbまたはVβの可変ドメイン)またはVdドメイン(TCRdまたはVδの可変ドメイン)、ここで、第一抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインと第二抗原結合ドメインのvH、VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体鎖またはその変異体の全体または部分的ヒンジドメインに任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結されたvLドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の全体的または部分的ヒンジドメインに作動可能に連結しているvHドメイン、ここで、vLおよびvHドメインは、MHC依存性および/またはMHC非依存的に標的抗原に特異的に結合するFv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)任意のペプチドリンカーを介して、非TCRシグナル受容体またはその変異体のヒンジドメインの全体または部分と作動可能に連結しているVαドメイン;および、b)第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の全体的または部分的ヒンジドメインに任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結しているVβドメインであって、ここで、VαおよびVβドメインは、MHC依存的にペプチド/MHC複合体に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)任意のペプチドリンカーを介して、非TCRシグナル受容体またはその変異体のヒンジドメインの全体または部分と作動可能に連結しているVγドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の全体的または部分的なヒンジドメインと作動可能に連結しているVδドメイン、ここで、VγおよびVδドメインは、MHC依存的またはMHC非依存的に抗原に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。例示的な実施形態では、非TCRシグナル伝達受容体は、以下の1つ以上から選択されるが、これらに限定されない: CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3 、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1 、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、 DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、 CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas 、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、および ILT2。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。いくつかの実施形態において、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個々に、免疫グロブリン由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO: 3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO: 3560、 SEQ ID NO:3536-3551)、またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO:3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562;TCRg-Ig3、SEQ ID NO:3566;またはTCRd-Ig3、SEQ ID NO:3568など)、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメイン(例えば、vL、VαまたはVγ)および/または第2の抗原結合ドメイン(例えば、vH、VβまたはVδ)のN末端またはN末端付近に付着している1つ以上の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。
一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)vL(抗体の軽鎖の可変ドメイン)、Va(TCRaまたはVαの可変ドメイン)、またはVg(TCRgまたはVγの可変ドメイン)ドメインからなり、非TCRシグナル受容体鎖またはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分と任意のペプチドリンカーを介して操作可能に連結される、第1の抗原結合ドメイン;および、b)第2の抗原結合ドメインであって、任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプター鎖またはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分と作動可能に連結している、vH(抗体の重鎖の可変ドメイン)、Vb(TCRbまたはVβの可変ドメイン)またはVdドメイン(TCRdまたはVδの可変ドメイン)、ここで、第一抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインと第二抗原結合ドメインのvH、VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体鎖またはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分と任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結しているvLドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分と作動可能に連結しているvHドメイン、ここで、vLおよびvHドメインは、MHC依存性および/またはMHC非依存的に標的抗原に特異的に結合するFv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体またはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメイン全体または部分と任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結されたVαドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分と作動可能に連結しているVβドメインであって、ここで、VαおよびVβドメインは、MHC依存的にペプチド/MHC複合体に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体またはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメイン全体または部分と任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結されたVγドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプターまたはその変異体の膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分と作動可能に連結しているVδドメイン、ここで、VγドメインおよびVδドメインは、MHC依存的またはMHC非依存的に抗原に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。例示的な実施形態では、非TCRシグナル伝達受容体は、以下の1つ以上から選択されるが、これらに限定されない: CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3 、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1 、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、 DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、 CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas 、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、および ILT2。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。いくつかの実施形態において、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個々に、免疫グロブリン由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO: 3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO: 3560、 SEQ ID NO:3536-3551)、またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO:3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562;TCRg-Ig3、SEQ ID NO:3566;もしくはTCRd-Ig3、SEQ ID NO:3568など)もしくはそのフラグメントからなる。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメイン(例えば、vL、VαまたはVγ)および/または第2の抗原結合ドメイン(例えば、vH、VβまたはVδ)のN末端またはN末端付近に付着している1つ以上の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。
一実施形態において、本開示は、以下を含む抗原と特異的に結合する二重鎖SARを提供する;a)非TCRシグナル受容体鎖またはシグナル伝達アダプターの膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分またはその変異体またはフラグメントに任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結された第1の抗原結合ドメイン;および、b)任意のペプチドリンカーを介して、第2の非TCRシグナル伝達レセプター鎖またはシグナル伝達アダプターの膜貫通/膜アンカリングドメインの全体または部分またはその変異体またはフラグメントに作動可能に連結している第2の抗原結合ドメイン。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。 いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。一実施形態において、第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、それぞれの標的抗原に特異的に結合する。一実施形態では、抗原結合ドメインの一方または両方は、自律抗原結合ドメイン(例えば、AABD、例えば、vHH、FHVH、SVH、センチリン、DARPIN、svd-TCR、アダプター、アダプター結合ドメイン、受容体のリガンド結合ドメイン、リガンドの受容体結合ドメインなど)である。一実施形態では、抗原結合ドメインの一方または両方は、抗体、抗体フラグメント(例えば、Fab)、scFv、TCRまたはscTCRを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のポリペプチド鎖は、第1および/または第2の抗原結合ドメインのN末端またはN末端付近に結合する1つまたは複数の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。一実施形態では、第1および/または第2のシグナル伝達鎖は、活性化ドメインおよび任意の共刺激ドメインを含むサイトゾルドメインを含む。
一実施形態では、二重鎖SARは、元のシグナル伝達受容体(例えば、非T細胞受容体)の全体または部分的な結合特性を保持し、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインによって付与される結合特性も獲得する。一実施形態では、二重鎖SARは、元のシグナル伝達受容体の全体的または部分的な結合特性を保持する。一実施形態では、二重鎖SARは、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインによって付与される結合特性をさらに獲得する。一実施形態では、二重鎖SARは、2つのシグナル伝達受容体のシグナル伝達特性を保持する。一実施形態では、二重鎖SARは、単独で活性化された場合には2つのシグナル伝達受容体のいずれによっても示されない新たなシグナル伝達特性を獲得する。一実施形態では、二重鎖SARは、単独で活性化された場合に、2つのシグナル伝達受容体のシグナル伝達特性に付加的な新たなシグナル伝達特性を獲得する。一実施形態では、二重鎖SARは、単独で活性化された場合に、2つのシグナル伝達受容体のシグナル伝達特性の相乗的である新たなシグナル伝達特性を獲得する。
一実施形態では、二本鎖SARの一方または両方の鎖を含むシグナル伝達受容体は、単一の膜貫通ドメインを有するI型膜タンパク質である。一実施形態では、シグナル伝達受容体は、天然に存在するシグナル伝達受容体である。一実施形態では、シグナル伝達受容体は非TCRシグナル伝達受容体である。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、シグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ、FcRγ、DAP10またはDAP12など)を動員することができる。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、活性化ドメインを含むシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、1つまたは複数のITAMを含むシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、1つまたは複数のITIMを含むシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、共刺激ドメインを含むシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは天然に存在する。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは非天然に存在する。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、細胞内シグナル伝達経路(例えば、NFAT、NF-κB、ERK、PI3Kなど)を活性化するシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、細胞内シグナル伝達経路(例えば、NFAT、NF-κB、ERK、PI3Kなど)を阻害するシグナル伝達アダプターを動員することができる。
一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖が共刺激ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、活性化ドメインおよび共刺激ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖が細胞内活性化ドメインを含む。例示的な実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、シグナル伝達アダプターに由来する細胞内活性化ドメインを含む。例示的な実施形態では、二本鎖SARの一方または両方の鎖は、CD3ε、FcRγ、DAP10、またはDAP12に由来する細胞内活性化ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖に存在する活性化ドメインは、1つまたは複数のITAMを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、1つまたは複数のITAMを含む活性化ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、2つ以上のITAMモチーフを含む活性化ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、単一のITAMを含む活性化ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖はITAMを欠いている。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、チロシンベースのモチーフ(YINM)を含む活性化ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、PI3Kおよび/またはGrb2のp85サブユニットを動員する活性化ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、NFAT、PI3K、NF-κBおよび/またはERKシグナル伝達経路のうちの1つまたは複数を活性化する活性化ドメインを含む。
一実施形態では、SARは細胞内阻害ドメインを含む。例示的な実施形態では、SARは、PD1に由来する細胞内阻害ドメインを含む。一実施形態では、SARの阻害ドメインは、1つ以上のITIMモチーフを含む。
一実施形態では、SARは、シグナル伝達アダプターを動員することができる。例示的な実施形態では、SARはCD3ζ、FcRγ、DAP10およびDAP12の群から選択される1つ以上のシグナル伝達アダプターを動員することができるが、これらに限定されない。
一実施形態では、本開示は、少なくとも1つがシグナル伝達アダプターを動員できる2つのポリペプチド鎖に、任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。一実施形態において、本開示は、それぞれがシグナル伝達アダプターを動員することができる2つのポリペプチド鎖に、任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。一実施形態では、一方または両方のポリペプチドは、ヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、少なくとも1つのポリペプチドは膜貫通ドメインを含む。一実施形態では、両方のポリペプチドが膜貫通ドメインを含む。一実施形態では、少なくとも1つのポリペプチドはサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、両方のポリペプチドがサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、本開示は、少なくとも1つがシグナル伝達アダプターを動員できる2つのポリペプチド鎖に、任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上の細胞内活性化ドメインを含む2つのポリペプチド鎖に任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。一実施形態では、本開示は、少なくとも1つが細胞内活性化ドメインを含む2つのポリペプチド鎖に、任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む二重鎖SARを提供する。
一実施形態では、シグナリングアダプタは非TCR/CD3シグナリングアダプタである。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、TCR/CD3シグナル伝達複合体の構成要素ではない。一実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは非天然シグナル伝達アダプター、すなわち自然界には存在しないシグナル伝達アダプターである。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは1つ以上のITAMを含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは1つ以上のITIMを含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、ジスルフィド結合した二量体タンパク質である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターはI型膜貫通タンパク質である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、シグナル伝達タンパク質、例えばプロテインキナーゼ、例えばZAP70を動員することができる。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、1つ以上の細胞シグナル伝達経路、例えば、NFAT、NF-κB、ERK、PI3Kなどを活性化することができる。
一実施形態では、二重鎖SARの2つの鎖を構成する2つの非TCRシグナル伝達レセプター鎖は、同じタイプおよび配列である(例えば、両方のシグナル伝達鎖は、CD16A、NKp46またはNKp30などの細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインからなる)。例示的なそのような二重鎖SARは、SEQ ID NO: 6383-6293、4675、4696および8344で表される。一実施形態では、一実施形態では、二重鎖SARの2つのシグナル伝達鎖は異なるタイプである(例えば、一方の鎖はCD16Aの細胞外、膜貫通および細胞質ドメインからなり、第2の鎖はNKp30の細胞外、膜貫通および細胞質ドメインからなるか、またはCD16Aのヒンジ、膜貫通および細胞質ドメインからなり、第2の鎖はCD3ζなどのヒンジ、膜貫通および細胞質ドメインからなる)。このようなSARの例は、配列番号4695および4670によって表される。
一実施形態では、二重鎖SARの2つのシグナル伝達鎖は、同じ受容体に由来する(例えば、両方の鎖がCD16Aに由来する)。このようなSARの例は、配列番号4676によって表される。一実施形態では、二重鎖SARの2つのシグナル伝達鎖は、異なる受容体に由来する(例えば、1つの鎖はNKp44に由来し、第2の鎖はNKp30に由来するなど)。このようなSARの例は、配列番号4713によって表される。
一実施形態では、本開示は、非TCR受容体シグナル伝達鎖(例えば、CD16A)に由来する第1の鎖と、シグナル伝達アダプター(例えば、CD3εまたはFcRγ)に由来する第2の鎖とを含む二重鎖SARを提供する。このようなSARの例は、配列番号4670によって表される。
一実施形態では、二重鎖SARは、非TCRレセプターシグナル伝達鎖(例えば、CD16A)に由来する第一の鎖と、TCRシグナル伝達鎖(例えば、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、preTCRαの定数鎖またはその変異体もしくは断片)に由来する第二の鎖とから構成され得る。いくつかの実施形態では、本開示は、1つの非TCRモジュール(またはNTCRM)および1つのTCRモジュール(またはTCRM)を含む二重鎖SARを提供する。このようなSARの例は、配列番号4708~4710によって表される。
一実施形態では、異種抗原結合ドメインのvL/vH、Vα/Vβ、Vγ/Vδ鎖と非TCRシグナル伝達鎖との間の任意のリンカーは、表13に表されるIg様リンカー(SEQ ID NO(DNA)1142~1175およびSEQ ID NO(PRT):3536~3569)である。
一実施形態では、二重鎖SARの構築に使用されるシグナル伝達受容体は、免疫細胞の表面に発現される任意の受容体である。一実施形態では、シグナル伝達受容体は、免疫細胞の表面に発現される天然に存在するシグナル伝達受容体のシグナル伝達鎖である。例示的な実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、単球/マクロファージ、顆粒球およびB細胞から選択されるが、これらに限定されない。本開示の二重鎖SARの構築に使用することができる例示的なシグナル受容体としては、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3.KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、 CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、Siglec3、Siglec-7、Siglec-9など、またはその変異体。さらなる実施形態では、自律抗原結合ドメイン(例えば、完全ヒトvHドメイン、vHH、単鎖TCRなど)、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン(例えば、セントイリン、アフィボディなど)、リガンド(例えば、APRIL、TPO、 NKG2D-YA-G4Sx3-NKG2D-YAなど)、および受容体の細胞外ドメイン(たとえば、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2D、CD16Aなど)、アダプター結合ドメイン(たとえば、EZip、RZip、E4、R4など) )は、SARに追加の抗原結合能力を与えるために、SARのvL、vH、Vα、Vβ、Vγ、またはVδ鎖のアミノ末端またはアミノ末端近くに機能的に連結することができる。
いくつかの実施形態では、標的抗原に特異的に結合するSAR(単離されたSARなど)が提供され、ここでSARは:a)vL、VαまたはVγドメインからなる第1の抗原結合ドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)を含む第1のポリペプチド鎖;および、b)vH、VβまたはVδドメインからなる第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)を含む第2のポリペプチド鎖を含み、ここで、第1の抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインおよび第2の抗原結合ドメインの相補的なvH、VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成し、第1のMAMおよび/または第2のMAMは、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。一実施形態において、SARは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化し、及び/又は少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態において、第1および/または第2のMAMは、以下のシグナル伝達アダプターのうちの1つまたは複数に由来するが、これらに限定されない: CD3ζ、FcRγ。DAP10もしくはDAP12、またはそれらの変異体もしくはフラグメント。一実施形態では、NTCRMは以下のシグナル伝達アダプターの1つ以上から構成されるが、これらに限定されない: CD3ζ、FcRγ。DAP10またはDAP12。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(NCAM)である。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメインと第1のMAMとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の抗原結合ドメインと第2のMAMとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のペプチドリンカーと第2のペプチドリンカーは、1つ以上のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のペプチドリンカーおよび/または第2のペプチドリンカーは、それぞれ、長さが約5~約500アミノ酸である。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの親和性および鎖対合を増大させる変異を含む。いくつかの実施形態において、第1および/または第2のリンカーは、個々に、免疫グロブリン由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO: 3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO: 3560、 SEQ ID NO:3536-3551)、またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO:3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562;TCRg-Ig3、SEQ ID NO:3566;もしくはTCRd-Ig3、SEQ ID NO:3568など)もしくはそのフラグメントを含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。一実施形態では、第1および第2の抗原結合ドメインは相補鎖(例えば、vLとvH、VαとVβ、またはVγとVδ)を含む。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメイン(例えば、vL、VαまたはVγ)および/または第2の抗原結合ドメイン(例えば、vH、VβまたはVδ)のN末端またはN末端付近に付着している1つ以上の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。いくつかの実施形態では、SARは、約0.1pMから約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。いくつかの実施形態では、標的抗原は細胞表面抗原である。例示的な実施形態では、標的抗原は、表Bに列挙される抗原のうちの1つまたは複数である。いくつかの実施形態では、細胞表面抗原は、タンパク質、炭水化物、および脂質からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、細胞表面抗原は、CD19、CD20、CD22、CD33、CD70、CD123、CD138、CLL -1、FLT3、クローディン18.2、BCMA、GCC、MPL、SLAMF7、ROR1、ROR2、GPRC5D、 FCRL5、MSLN、EGFR、EGFRviii、PSMA、PSCA、KLK2、IL13Ra2、TROP2、PTK7、DLL3、Muc1、Muc16、または Her2。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ペプチドおよび主要組織適合性複合体(MHC)タンパク質を含む複合体である。例示的な実施形態において、ペプチド/MHC複合体は、NY-ESO-1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE4、WT1、AFP、TERT、MART-1、pp66-CMV、HPV16-E7、PRAME、EBV-LMP2A、HIV-1、PSAまたはgp100のうちの1つ以上に由来するペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、第1のMAMは、第1の膜貫通ドメインに対してN末端側に第1のヒンジドメインまたはその断片をさらに含み、第2のMAMは、第2のヒンジドメインまたは第2のヒンジドメインまたはその断片をさらに含む。そのN末端から第2の膜貫通ドメインまでの断片。いくつかの実施形態では、NTCRMは、第1のヒンジドメイン内の残基と第2のヒンジドメイン内の残基との間にジスルフィド結合を含む。いくつかの実施形態では、第1のMAMは、第1の膜貫通ドメインのC末端側に第1のサイトゾルドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のMAMは、第2の膜貫通ドメインのC末端側に第2のサイトゾルドメインをさらに含む。一実施形態では、第1および/または第2のサイトゾルドメインは、1つまたは複数のITAMを含む活性化ドメインである。いくつかの実施形態では、SARは、約0.1pMから約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。
いくつかの実施形態では、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、第1のポリペプチド鎖は、第1の膜貫通ドメインのC末端側に第1の共刺激ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の膜貫通ドメインのC末端側に第2の共刺激ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメインのN末端に第1のシグナル伝達ペプチドをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の抗原結合ドメインのN末端に第2のシグナル伝達ペプチドをさらに含む。
一実施形態では、本開示は、a)vL(抗体の軽鎖の可変ドメイン)、Va(TCRαまたはVαの可変ドメイン)、または任意のペプチドリンカーを介して、シグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的なヒンジドメインに機能的に連結されるVg(TCRgまたはVγの可変ドメイン)ドメイン;およびb)第2の抗原結合ドメイン、任意のペプチドを介して作動可能に連結された、vH(抗体の重鎖の可変ドメイン)、Vb(TCRbまたはVβの可変ドメイン)、またはVdドメイン(TCRdまたはVδの可変ドメイン)第二のシグナル伝達アダプターまたはその変異体のヒンジドメイン全体または部分的リンカーであり、第一の抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインと第二の抗原結合ドメインの相補的vH、VβまたはVδドメインが形成される標的抗原に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様抗原結合モジュール。一実施形態では、本開示は、a)シグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的ヒンジドメインに任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結されたvLドメイン;およびb)任意のペプチドリンカーを介して、第2のシグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的なヒンジドメインに作動可能に連結されるvHドメインであって、ここで、vLおよびvHドメインは、特異的に結合するFv様抗原結合モジュールを形成する。 MHC 依存性および/または MHC 非依存性の方法で標的抗原を検出します。一実施形態では、本開示は、a)シグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的ヒンジドメインに任意のペプチドリンカーを介して機能的に連結されたVαドメイン;およびb)任意のペプチドリンカーを介して、第2のシグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的なヒンジドメインに作動可能に連結されたVβドメインであって、VαおよびVβドメインは、特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。 MHC依存的な方法でのペプチド/MHC複合体。一実施形態では、本開示は、a)シグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的ヒンジドメインに任意のペプチドリンカーを介して機能的に連結されたVγドメイン; b)任意のペプチドリンカーを介して、第2のシグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的なヒンジドメインに作動可能に連結されたVδドメインであって、VγおよびVδドメインは、特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する、Vδドメイン。 MHC 依存性または MHC 非依存性の方法で抗原に結合します。例示的な実施形態では、シグナル伝達アダプターは、以下の1つ以上から選択されるが、これらに限定されない: CD3ε、FcRγ、DAP10もしくはDAP10、またはその変異体もしくは断片。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(NCAM)である。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のリンカーは、個別に、免疫グロブリン(例えば、配列番号3536~3551)に由来するIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカーを含む。 (例えば、TCRb-Ig3、配列番号3560;TCRa-Ig3、配列番号3562;TCRg-Ig3、配列番号3566;またはTCRd-Ig3、配列番号3568など)または変異体、またはその断片。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。 いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは、1つまたは複数の共刺激ドメインをさらに含む。例示的な実施形態では、シグナル伝達アダプターは、CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEMもしくはICOSからの共刺激ドメイン、あるいは変異体もしくは断片を含む。その。 いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリン(例えば、配列番号3536~3551)またはTCR-Ig様由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)を含む。リンカー(例えば、TCRb-Ig3、配列番号3560;TCRa-Ig3、配列番号3562;TCRg-Ig3、配列番号3566;またはTCRd-Ig3、配列番号3568など)またはフラグメントその。 いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のポリペプチド鎖は、第1のポリペプチド鎖(例えば、vL、VαまたはVγ)のN末端またはN末端近くに結合する1つまたは複数の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。 /または第2(例えば、vH、VβまたはVδ)抗原結合ドメイン。
一実施形態では、本開示は、a)任意のペプチドリンカーを介して全体または部分的な膜貫通/膜に作動可能に連結された、vL、Vα、またはVγドメインを含む第1の抗原結合ドメインを含む抗原に特異的に結合する二重鎖SARを提供する。シグナル伝達アダプターまたはその変異体のアンカードメイン; b)第2のシグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的な膜貫通/膜アンカーリングドメインに任意のペプチドリンカーを介して作動可能に連結されたvH、VβまたはVδドメインを含む第2の抗原結合ドメインであって、ここで、vL、第一の抗原結合ドメインのVαまたはVγドメインと、第二の抗原結合ドメインの相補的vH、VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成する。一実施形態では、本開示は、a)シグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的な膜貫通/膜アンカーリングドメインに任意のペプチドリンカーを介して機能的に連結されたvLドメイン; b)任意のペプチドリンカーを介して、第2のシグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的な膜貫通/膜アンカーリングドメインに機能的に連結されているvHドメインであって、vLおよびvHドメインは、特異的に結合するFv様抗原結合モジュールを形成する。 MHC依存性および/またはMHC非依存性の様式で標的抗原に結合します。一実施形態では、本開示は、a)シグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的な膜貫通/膜アンカーリングドメインに任意のペプチドリンカーを介して機能的に連結されたVαドメイン; b)任意のペプチドリンカーを介して第2のシグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的な膜貫通/膜アンカーリングドメインに作動可能に連結されたVβドメインであって、VαおよびVβドメインがTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成し、 MHC依存的にペプチド/MHC複合体に特異的に結合します。一実施形態では、本開示は、a)シグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的な膜貫通/膜アンカーリングドメインに任意のペプチドリンカーを介して機能的に連結されたVγドメイン; b)任意のペプチドリンカーを介して第2のシグナル伝達アダプターまたはその変異体の全体または部分的な膜貫通/膜アンカーリングドメインに作動可能に連結されたVδドメインであって、VγおよびVδドメインがTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成するVδドメインMHC依存性またはMHC非依存性の様式で抗原に特異的に結合します。例示的な実施形態では、シグナル伝達アダプターは、以下の1つ以上から選択されるが、これらに限定されない: CD3ε、FcRγ、DAP10もしくはDAP12、またはそれらの変異体もしくは断片。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(NCAM)である。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは、1つまたは複数の共刺激ドメインをさらに含む。例示的な実施形態では、シグナル伝達アダプターは、CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEMもしくはICOSからの共刺激ドメイン、あるいは変異体もしくは断片を含む。その。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリン(例えば、配列番号3536~3551)またはTCR-Ig様由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)を含む。リンカー(例えば、TCRb-Ig3、配列番号3560;TCRa-Ig3、配列番号3562;TCRg-Ig3、配列番号3566;またはTCRd-Ig3、配列番号3568など)または変異体またはその断片。 いくつかの実施形態では、第1および第2のポリペプチド鎖は、第1のポリペプチド鎖(例えば、vL、VαまたはVγ)のN末端またはN末端近くに結合する1つまたは複数の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。 /または第2(例えば、vH、VβまたはVδ)抗原結合ドメイン。
一実施形態では、本開示は、a)シグナル伝達アダプターの1つの鎖(またはシグナル伝達鎖)のアミノ末端またはアミノ末端近くに任意のリンカーを介して作動可能に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むSARを提供する。 ) またはその変形。およびb)任意のリンカーを介して、シグナル伝達アダプター(またはシグナル伝達鎖)またはその変異体の第2の鎖のアミノ末端またはアミノ末端付近に機能的に連結された1つまたは複数の異種抗原結合ドメイン。一実施形態では、そのようなSARは、元のシグナリングアダプタ(またはシグナリングチェーン)のシグナリング能力を保持する。一実施形態では、SARは、異種抗原結合ドメインによって与えられる結合能力も獲得する。例示的な実施形態では、シグナル伝達アダプターは、細胞(例えば、免疫細胞、例えば、免疫エフェクター細胞)の原形質膜上で発現できる任意のシグナル伝達アダプター(またはシグナル伝達鎖)である。例示的な実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、単球/マクロファージ、顆粒球またはB細胞から選択されるが、これらに限定されない。本開示のSARの構築に使用することができる例示的なシグナル伝達アダプター(またはシグナル伝達鎖)としては、CD3z(CD3ζ)、FcRγ(FcεRIγ)、DAP10およびDAP12など、またはそれらの変異体が挙げられるが、これらに限定されない。
本開示は、1つ以上の異種抗原結合ドメインが、シグナル伝達アダプターの1つ以上の鎖の細胞外ドメイン(例えば、ヒンジまたはスペーサードメイン)に機能的に連結されているSARを提供する。一実施形態では、SARは、TCR複合体の構成要素であるシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ε、CD3ε、CD3γ、CD3εなど)を含む。一実施形態では、SARは、 TCR複合体のTCRα鎖、β鎖、γ鎖、および/またはδ鎖と相互作用するシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ)を含む。一実施形態では、SARは、TCR複合体のTCRα、β、γおよび/またはδ鎖と相互作用しないシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、膜貫通領域またはTCRα、TCRβ、TCRγもしくはTCRδにおける正に荷電した残基(リジンまたはアルギニン)と相互作用する、その膜貫通ドメインに保存されたアスパラギン酸残基を有するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、その膜貫通ドメインに保存されたアスパラギン酸残基を欠くシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、TCR複合体の構成要素ではないシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3シグナル伝達アダプター(NCAM)である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、CD3εまたはその変異体ではない。
いくつかの実施形態では、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、SARは、細胞シグナル伝達を活性化するシグナル伝達アダプター(例えば、 CD3ζ )を含む。一実施形態では、SARは、細胞シグナル伝達を阻害するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、 1つ以上のITAMモチーフを有するシグナル伝達アダプター(例えば、 CD3ζ)を含む。一実施形態では、SARは、2つ以上のITAMモチーフを有するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、単一のITAMモチーフを有するシグナル伝達アダプター(例えば、FcRγ)を含む。一実施形態では、SARは、ITAMモチーフを欠くシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、チロシンベースのモチーフ(YINM)を含むシグナル伝達アダプター(例えば、DAP10)を含む。一実施形態では、SARは、 PI3Kおよび/またはGrb2のp85サブユニットを動員するシグナル伝達アダプター(例えば、DAP10)を含む。一実施形態では、SARは、天然型のジスルフィドリンカー二量体であるシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、その天然の形態ではジスルフィドリンカー二量体ではない。一実施形態では、SARは、天然状態では膜貫通領域に位置する鎖間ジスルフィド結合を含むシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ)を含む。一実施形態では、SARは、天然状態では膜貫通領域に位置しない鎖間ジスルフィド結合を含むシグナル伝達アダプター(例えば、DAP10およびDAP12)を含む。一実施形態では、SARは、天然状態ではその細胞外領域に位置する鎖間ジスルフィド結合を含むシグナル伝達アダプターを含む。
いくつかの実施形態では、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインの長さは10アミノ酸未満である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインは、長さが8アミノ酸未満である。一実施形態では、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインは、長さが10アミノ酸を超える。一実施形態では、シグナル伝達アダプターの細胞外ドメインは、15アミノ酸を超える長さである。
いくつかの実施形態では、上記のSAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、 SARは、タンパク質のリン酸化を誘導するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、タンパク質の脱リン酸化を誘導するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、Zap70と相互作用するシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、SARは、Zap70と相互作用しないシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、二重鎖SARの2つの鎖は、同一のシグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζおよびCD3ζ)を含む。一実施形態では、二重鎖SARの2つの鎖は、同一ではないシグナル伝達アダプター(例えば、CD3εとFcRγ、またはCD3εとDAP10、またはDAP10とDAP12など)を含む。
いくつかの実施形態において、上述したシグナル伝達アダプターを含む二重鎖SAR(単離されたSARなど)のいずれかによれば、二重鎖SARの1つまたは両方の鎖は、共刺激ドメイン(例えば、4-1BB、CD28、2B4、OX40などに由来する共刺激ドメイン)を含むシグナル伝達アダプターを含む。一実施形態では、二重鎖SARの片方の鎖または両方の鎖は、活性化ドメイン(例えば、CD3ζ活性化ドメイン)に作動的に連結された共刺激ドメイン(例えば、4-1BB、CD28、2B4、OX40などに由来する共刺激ドメイン)を含むシグナル伝達アダプターを含んでなる。CD28および4-1BBのコスティミュレイトリードメインに連結される例示的なCD3ζシグナルアダプターは、それぞれSEQ ID NO:3493および3494に示されている。CD3ζの活性化ドメインと融合したOX40の共刺激ドメインからなる例示的なSARは、SEQ ID NO: 4460および4479で表される。一実施形態では、二重鎖SARの一方または両方の鎖は、2つの異なるシグナル伝達アダプターの細胞質ドメインの融合を含むシグナル伝達アダプターからなる。DAP10とCD3ζの細胞質ドメインの融合を含む鎖からなる例示的なこのようなSARは、SEQ ID NO: 4460で表される。 一実施形態において、SARは、鎖間ジスルフィド結合を消失させる変異を有するCD3z(またはCD3ζ)、FcRγ、DAP10およびDAP12の変異体からなるシグナル伝達アダプターを含む。例示的なこのようなシグナル伝達アダプターは、SEQ ID NO:3747、3753、3760、3817および3820で表される。 一実施形態において、シグナル伝達鎖は、それらのITAMモチーフに1つ以上の変異を有するCD3z、FcRγ、DAP10およびDAP12の変異体(例えば、CD3zのIXX変異体)からなる。例示的なこのようなシグナル伝達アダプターは、SEQ ID NO: 9824で表される。
本開示の二本鎖SARの構築に使用できる例示的な抗原結合ドメインには、抗体の可変ドメイン(例えば、vL、vH)、 TCRの可変ドメイン(例えば、Va、Vb、VgまたはVd鎖)が含まれる。など)、抗体、抗体断片(例えば、Fab、Fab2)、自律抗原結合ドメイン(例えば、完全ヒトvHドメイン、vHH、単鎖TCR、svd-TCRなど)、scFv、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン(例えば、セントイリン、アフィボディ、ZIPドメイン、アダプターなど)、リガンド、受容体の細胞外ドメイン、自己抗原、TCR、HLA非依存性TCR、TCRの可変ドメイン(例えば、Va 、 Vb、Vg、さらなる実施形態では、自律的抗原結合ドメイン(例えば、完全ヒトvHドメイン、vHH、単鎖TCRなど)、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン(例えば、セントイリン、アフィボディなど) 。 )、リガンド(例えば、APRIL、TPO、NKG2D-YA-G4Sx3-NKG2D-YAなど)、および受容体の細胞外ドメイン(例えば、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2D、CD16Aなど)、アダプター結合ドメイン(例えば、EZip、RZip、E4、R4など)は、SARのvL、vH、Vα、Vβ、Vγ、またはVδ鎖のアミノ末端またはアミノ末端近くに機能的に結合して、追加の抗原結合能力をSARに付与することができる。 SAR。
一実施形態では、二重鎖SARの2つのシグナル伝達アダプターは同じタイプである(例えば、両方の鎖がCD3εに由来する)。このようなSARの例は、配列番号4702によって表される。一実施形態では、二重鎖SARを構成する2つのシグナル伝達アダプターは、異なるタイプのものである(例えば、1つのシグナル伝達アダプターはCD3εに由来し、第2のアダプターはFcRγなどに由来する) . )。このようなSARの例は、配列番号6733によって表される。
一実施形態では、二重鎖SARは、非TCR受容体シグナル伝達鎖(例えば、CD16A)に由来する1つの鎖と、シグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζまたはFcRγ)に由来する別の鎖とを含み得る。このようなSARの例は、配列番号4670によって表される。
一実施形態では、二重鎖SARは、シグナル伝達アダプター(例えば、CD3ε)を含む1つの鎖と、TCR定常鎖(例えば、TCRα-T48C)を含む別の鎖とを含み得る。
一実施形態では、任意のリンカーは長いリンカーである。一実施形態では、異種抗原結合ドメインのvL/vH、Vα/Vβ、Vγ/Vδ鎖と非TCRシグナル伝達鎖との間の任意のリンカーは、Ig様リンカー(配列番号(DNA):1142~1175)である。および配列番号(PRT):3536~3569)を表13に示す。
いくつかの実施形態において、本開示は、 T細胞の標的認識特性および機能を有する、T細胞ではない細胞を提供する。一実施形態において、本開示は、細胞にT細胞受容体様の標的認識および/またはシグナル伝達を与える受容体を発現する、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)を提供する。一実施形態では、本開示は、細胞にT細胞受容体様の標的認識および/またはシグナルを与える二重鎖または多重鎖受容体を発現する、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)を提供する。変換。一実施形態では、二重鎖または多重鎖受容体は、少なくとも2つの膜関連ドメイン(例えば、膜貫通ドメインまたは膜アンカードメイン)を含む。一実施形態では、二重鎖または多重鎖受容体は、少なくとも2つの膜貫通ドメインを含む。一実施形態では、T細胞受容体様認識は、MHC分子によって提示されるペプチド標的への特異的結合を含む。一実施形態では、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)は、T細胞鎖の発現を欠き、および/または機能的TCR鎖の発現を欠く。一実施形態では、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)は、機能的なTCR/CD3複合体の発現を欠いている。一実施形態では、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)は、 CD3ε、CD3γ、およびCD3δ、またはそれらの変異体もしくは断片のうちの1つ以上の発現を欠いている。一実施形態では、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)は、1つ以上のCD3ε、CD3γおよびCD3δ鎖またはその変異体もしくは断片を外因的に発現するように操作されていない。一実施形態では、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)は、1つ以上のTCR鎖またはその変異体もしくは断片を外因的に発現するように操作されていない。一実施形態では、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)は、CD3アゴニスト抗体によって活性化されない。一実施形態では、T細胞ではない細胞(すなわち、非T細胞)は、OKT3抗体によって活性化されない。
一実施形態では、本開示は、NK細胞、g-NK細胞、記憶様NK細胞、サイトカイン誘導性キラー細胞(CIK)、iPSC、修飾HLAから生成される、T細胞受容体様の標的認識を有する非T細胞を提供する。欠損iPSC、iPSC由来NK細胞、iPSC由来T細胞、B細胞、マクロファージ/単球、顆粒球、樹状細胞、不死化細胞株、不死化NK細胞株、NK92細胞株、NK92MI細胞株またはその誘導体。一実施形態において、本開示は、機能的T細胞ではない細胞への単一受容体の導入後に生成される、T細胞受容体様標的認識を有する非T細胞を提供する。一実施形態では、本開示は、4つのCD3鎖、すなわちCD3ε、CD3γ、CD3δおよびCD3εの異所性発現を伴う遺伝子改変なしに生成される、T細胞受容体様の標的認識を有する非T細胞を提供する。機能的なT細胞。
例えば、SAR、例えば、uTCR-SAR)を発現する非T細胞は、標的抗原に特異的に結合すると、少なくとも1つのシグナル伝達アダプターの動員を引き起こす。一実施形態では、二重鎖受容体を発現する非T細胞は、標的抗原に特異的に結合すると、少なくとも1つのシグナル伝達経路の活性化をもたらす。例示的な実施形態では、シグナル伝達経路は、NFAT、NF-κB、PI3K、またはERK経路の群から選択されるが、これらに限定されない。一実施形態において、二重鎖受容体を発現する非T細胞は、標的抗原に結合すると、少なくとも1つの生物学的活性の活性化をもたらす。一実施形態では、生物活性は、細胞の活性化、増殖、分化、サイトカイン分泌、食作用、遊走、または細胞毒性の群から選択されるが、これらに限定されない。
別の態様では、本開示は、主要組織適合性複合体(MHC)制限抗原特異的細胞傷害性を有する、限定されないが、ナチュラルキラー(NK)細胞などの修飾細胞を提供する。 MHCは、MHCクラスI、MHCクラスII、およびMHC様分子のいずれかであり得る。 MHC様分子の非限定的な例はHLA-Eである。
、2つの膜貫通/膜関連ドメインおよびTCR様抗原認識を有する二重鎖受容体を発現する、ナチュラルキラー(NK)細胞またはマクロファージなどであるがこれらに限定されない修飾細胞を産生するための方法を提供する。 。この方法は、細胞(例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞またはマクロファージ)を提供すること、およびTCR様結合特性を有する抗原特異的受容体を発現するように細胞を改変することを含む。改変されたセルは任意のセルであり得る。一般に使用される非限定的な例は、NK-92細胞、YTS細胞、および初代ヒトNK細胞である。
別の実施形態では、本開示は、任意の細胞型で発現可能なTCR様結合特性を有するSARのクラスを提供する。このようなTCR様結合特性を有し、普遍的な発現をするSARは、Universal TCR-SARまたはuTCR-SARまたはuTCRと称される。本明細書で提供されるのは、T細胞だけでなく、NK細胞、単球、マクロファージ、樹状細胞、顆粒球、内皮細胞、上皮細胞などを含むがこれらに限定されない任意の他の細胞でも発現可能な、TCRの可変抗原結合ドメイン(例えば、Va/Vα、Vb/Vβ、Vg/Vγ、Vd/Vδなど)からなる単鎖および多鎖(例えば、二重鎖)uTCR-SARである。一実施形態において、uTCRを発現する細胞は、細胞増殖、活性化、サイトカイン分泌、細胞傷害性の増加により、その抗原を発現する標的細胞に応答する。一実施形態において、標的抗原は、MHC複合体の一部として提示されるペプチドである。一実施形態では、標的抗原は脂質である。uTCRは、そのTCR結合ドメインがHLA非依存性TCRに由来する場合、非MHC制限抗原にも応答し得る。一実施形態において、本開示は、MHC複合体によって提示された場合に細胞内ペプチドに結合する特性を含む、TCR様結合特性を有する二重鎖レセプターを機能的に発現するT細胞ではない細胞を提供する。
、非TCRシグナル伝達受容体の全部または一部の細胞外ドメインに任意のリンカーを介して作動可能に連結されたscTCR、svd-TCRもしくはTCR模倣scFvまたはその断片を含む1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む単鎖uTCR-SARを提供する。 。いくつかの実施形態では、本開示は、scTCR、svd-TCR、またはTCR模倣scFvを含む単鎖SARが、 TCR様結合能力(例えば、ペプチド/MHC複合体に結合する能力)を獲得し、以下を含む任意の細胞で発現できることを提供する。 T細胞ではない、またはTCR鎖を発現する細胞。
いくつかの実施形態において、標的抗原に特異的に結合するuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)が提供され、ここで、uTCR-SARは、以下からなる:a)第1の抗原結合ドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)を含む第1のポリペプチド鎖;ならびに、b)第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)を含む第2のポリペプチド鎖、ここで、第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、標的抗原に特異的に結合するTCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールを形成し、第1のMAMおよび第2のMAMは、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。一実施形態において、NTCRMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化し、及び/又は少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる。
一実施形態では、uTCR-SARの第1および第2の抗原結合ドメインは、TCRの抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、uTCR-SARの第1および第2の抗原結合ドメインは、MHC分子によって提示されるペプチドに特異的に結合するTCRの抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、第1および第2の抗原結合ドメインは、TCRの可変ドメインを含む。一実施形態では、第1および第2の抗原結合ドメインは、TCRのVα、Vβ、Vγ、およびVδドメインを含む。一実施形態では、第1の抗原結合ドメインはVαドメインまたはその変異体もしくは断片を含み、第2の抗原結合ドメインはVβドメインまたはその変異体もしくは断片を含む。一実施形態では、第1の抗原結合ドメインはVγドメインまたはその変異体もしくは断片を含み、第2の抗原結合ドメインはVδドメインまたはその変異体もしくは断片を含む。一実施形態では、第1の抗原結合ドメインは、プレTCRαの抗原結合ドメインまたはその変異体もしくは断片を含み、第2の抗原結合ドメインは、Vβドメインまたはその変異体もしくは断片を含む。一実施形態では、標的抗原はペプチド/MHC複合体である。一実施形態では、uTCR-SARによって認識されるペプチドは細胞内ペプチドである。一実施形態では、uTCR-SARの標的抗原はMHC非依存性抗原である。一実施形態では、標的抗原は脂質である。一実施形態では、uTCR-SARは、HLA非依存性TCRの可変ドメインを含み、その標的抗原は細胞表面タンパク質である。いくつかの実施形態では、uTCR-SARは、約0.1pM~約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。
一実施形態では、第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、抗体または抗体断片に由来しない。一実施形態では、第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、抗体またはその変異体もしくは断片の可変ドメインではない。一実施形態では、第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、抗体のvLドメインおよびvHドメインではない。一実施形態では、第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、TCR模倣抗体のvLドメインおよびvHドメインではない。
一実施形態では、TCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールは、MHC分子によって提示されるペプチドに特異的に結合する。一実施形態では、TCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールは、 MHC分子によって提示されない抗原(例えば、HLA非依存性抗原)に特異的に結合する。一実施形態では、TCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールは、脂質抗原に特異的に結合する。
一実施形態では、uTCR-SARのMAMの少なくとも1つは、シグナル伝達アダプターの膜貫通ドメインを含む。一実施形態では、uTCR-SARの両方のMAMは、シグナル伝達アダプターの膜貫通ドメインを含む。一実施形態では、uTCR-SARのMAMの少なくとも1つは、シグナル伝達アダプターを動員することができるシグナル伝達受容体の膜貫通ドメイン/膜関連ドメインを含む。一実施形態では、uTCR-SARのMAMは両方とも、シグナル伝達アダプターを動員することができるシグナル伝達受容体の膜貫通ドメイン/膜関連ドメインを含む。
いくつかの実施形態において、標的抗原に特異的に結合するuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)が提供され、ここで、uTCR-SARは、以下からなる:a)VαドメインまたはVγドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)からなる第1の抗原結合ドメインを含む第1のポリペプチド鎖;および、b)VβドメインまたはVδドメインからなる第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)からなる第2のポリペプチド鎖;を含む、ここで、第1の抗原結合ドメインのVαまたはVγドメインおよび第2の抗原結合ドメインの相補的なVβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するTCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールを形成し、第1のMAMおよび第2のMAMは、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。一実施形態では、NTCRMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化することができ、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、標的抗原はペプチド/MHC複合体である。
いくつかの実施形態において、標的抗原に特異的に結合するuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)が提供され、ここで、uTCR-SARは、以下からなる:a)Vαドメイン(TCRα鎖由来の可変ドメイン)および第1の膜関連モジュール(MAM)からなる第1の抗原結合ドメインを含む第1のポリペプチド鎖;ならびに、b)Vβドメイン(TCRβ鎖由来の可変ドメイン)からなる第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)からなる第2のポリペプチド鎖;を含み、ここで、第1の抗原結合ドメインのVαドメインおよび第2の抗原結合ドメインのVβは、標的抗原に特異的に結合するTCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールを形成し、第1のMAMおよび第2のMAMは、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。一実施形態では、NTCRMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化することができ、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、標的抗原はペプチド/MHC複合体である。一実施形態では、標的抗原は、MHC(HLA)非依存性抗原である。
いくつかの実施形態において、標的抗原に特異的に結合するuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)が提供され、ここで、uTCR-SARは以下からなる:a)Vγドメイン(TCRγ鎖由来の可変ドメイン)および第1の膜関連モジュール(MAM)からなる第1の抗原結合ドメインを含む第1のポリペプチド鎖;ならびに、b)Vδドメイン(TCRδ鎖由来の可変ドメイン)からなる第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)からなる第2のポリペプチド鎖;を含み、ここで、第1の抗原結合ドメインのVγドメインおよび第2の抗原結合ドメインのVδは、標的抗原に特異的に結合するTCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールを形成し、第1のMAMおよび第2のMAMは、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。一実施形態では、NTCRMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化することができ、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、標的抗原はペプチド/MHC複合体である。一実施形態では、標的抗原は、MHC(HLA)非依存性抗原である。一実施形態では、標的抗原は脂質である。
いくつかの実施形態において、標的抗原に特異的に結合するuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)が提供され、ここで、uTCR-SARは、以下からなる:a)V-preTCRαドメイン(preTCRα鎖由来の可変ドメイン)および第1の膜関連モジュール(MAM)からなる第1の抗原結合ドメインを含む第1のポリペプチド鎖;ならびに、b)Vβドメイン(TCRβ鎖由来の可変ドメイン)および第二の膜関連モジュール(MAM)を含む第二の抗原結合ドメインを含む第二のポリペプチド鎖、ここで、第1の抗原結合ドメインのVαドメインおよび第2の抗原結合ドメインのVβは、標的抗原に特異的に結合するTCR様(例えば、TCR-Fv)抗原結合モジュールを形成し、第1のMAMおよび第2のMAMは、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。一実施形態では、NTCRMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化することができ、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる。一実施形態では、標的抗原はペプチド/MHC複合体である。
一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαから選択されるTCR鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMまたは第2のMAMは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRαから選択されるTCR鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、CD3ε、CD3γ、CD3δまたはCD3εから選択されるCD3鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、TCR鎖およびCD3鎖の膜貫通ドメインを含まない。一実施形態では、第1のMAMおよび第2のMAMは、CD3εの膜貫通ドメインを含まない。いくつかの実施形態では、uTCR-SARの第1および第2のMAMは、シグナル伝達アダプターの膜貫通ドメインまたは膜結合ドメインを含む。一実施形態では、シグナル伝達アダプターは、CD3ε、FcRγ、DAP10および/またはDAP12、あるいはそれらの変異体もしくは断片のうちの1つ以上から選択されるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターは非CD3アダプター(NCAM)である。いくつかの実施形態では、シグナル伝達アダプターはCD3εではない。一実施形態では、uTCR-SARのMAMは非TCR受容体を含む。一実施形態では、非TCRは、以下のうちの1つ以上から選択されるが、これらに限定されない: CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3 、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、 KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、 DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、 CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、 CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、および ILT2。 NKp46およびCD16およびNKp30のヒンジドメインを含む2つのポリペプチドに結合したNY-ESO-1 TCRの可変ドメインを含む例示的なuTCR-SARは、それぞれ配列番号10467および10468で表される。 NKp30の細胞外ドメインを含む2つのポリペプチドに結合したNY-ESO-1 TCRのVaおよびVbドメインを含む例示的なuTCR-SARは、配列番号10469によって表される。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖と第2のポリペプチド鎖は、1つ以上のジスルフィド結合を介して連結されている。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメインと第1のMAMとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の抗原結合ドメインと第2のMAMとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結される。いくつかの実施形態では、第1のペプチドリンカーおよび/または第2のペプチドリンカーは、それぞれ、長さが約5~約500アミノ酸である。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、個別に、Cα、Cβ、Cγ、またはCδ TCRドメイン、あるいはその変異体もしくは断片を含む。例示的な実施形態において、第1および/または第2のリンカーは、個々に、免疫グロブリン由来のIg様リンカー(例えば、IgCL、IgCH1など)またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO: 3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO: 3560、 SEQ ID NO:3536-3551)、またはTCR-Ig様リンカー(例えば、TCRb-Ig3、SEQ ID NO:3560;TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562;TCRg-Ig3、SEQ ID NO:3566;またはTCRd-Ig3、SEQ ID NO:3568など)、またはその変異体もしくはフラグメントを含む。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のペプチドリンカーは、それらの発現、親和性、および鎖対合を増加させる変異を含む。一実施形態では、第1および第2の抗原結合ドメインは相補鎖(例えば、VαとVβまたはVγとVδ)を含む。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメイン(例えば、vL、VαまたはVγ)および/または第2の抗原結合ドメイン(例えば、vH、VβまたはVδ)のN末端またはN末端付近に付着している1つ以上の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む。いくつかの実施形態では、SARは、約0.1pMから約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ペプチドおよび主要組織適合性複合体(MHC)タンパク質を含む複合体である。例示的な実施形態において、ペプチド/MHC複合体は、NY-ESO-1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE4、WT1、AFP、TERT、MART-1、pp66-CMV、HPV16-E7、PRAME、EBV-LMP2A、HIV-1、PSAまたはgp100のうちの1つ以上に由来するペプチドを含む。いくつかの実施形態では、uTCRは、細胞表面抗原を標的とすることができるHLA非依存性TCRである。一実施形態では、標的抗原は細胞表面抗原である。例示的な実施形態では、標的抗原は、表Bに列挙される抗原のうちの1つまたは複数である。いくつかの実施形態では、細胞表面抗原は、タンパク質、炭水化物、および脂質からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、細胞表面抗原は、CD2、CD5、CD19、CD20、CD22、CD33、CD70、CD123、CD138、CD179b、CLL-1、FLT3、クローディン18.2、BCMA、GCC、MPL、SLAMF7、 ROR1、ROR2、GPRC5D、FCRL5、MSLN、EGFR、EGFRviii、PSMA、PSCA、KLK2、IL13Ra2、TROP2、PTK7、DLL3、Muc1、Muc16、または Her2。一実施形態では、uTCR-SARは二重特異性または多重特異性である。一実施形態では、本開示は、MHC制限されている2つ以上の抗原に結合できるuTCRを提供する。一実施形態では、uTCR-SARは、MHC制限抗原および/またはMHC非制限抗原の2つ以上に結合することができる。一実施形態において、uTCR-SARは、そのTCR-Fvドメインを介してペプチド/MHC複合体に結合し、そのVαおよびVβ、またはVγおよびVδドメインのN末端またはN末端付近に結合している1つ以上のsvd-TCRを介して、1つ以上のペプチド/MHC複合体に結合することができる。一実施形態において、uTCR-SARは、そのTCR-Fvドメインおよびsvd-TCRドメインを介して1つまたは複数のペプチド/MHC複合体に結合し、そのVαおよびVβまたはVγおよびVδドメインのN末端またはN末端付近に結合している1つまたは複数のAABD(例えば、vHH、FHVH、センチリンなど)を介して1つまたは複数の表面抗原に結合することができる。
いくつかの実施形態において、上記のuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)のいずれかによれば、第1のMAMは、第1の膜貫通ドメインのN末端に第1のヒンジドメインまたはそのフラグメントをさらに含み、および/または第2のMAMは、第2の膜貫通ドメインのN末端に第2のヒンジドメインまたはそのフラグメントをさらに含む。いくつかの実施形態では、NTCRMは、第1のヒンジドメイン内の残基と第2のヒンジドメイン内の残基との間にジスルフィド結合を含む。いくつかの実施形態において、上記のuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)のいずれかによれば、第1のMAMは、第1のヒンジドメインのN末端に第1の抗原結合ドメインまたはそのフラグメントをさらに含み、および/または第2のMAMは、第2のヒンジドメインのN末端に第2の抗原結合ドメインまたはそのフラグメントをさらに含む。いくつかの実施形態では、第1のMAMは、第1の膜貫通ドメインのC末端側に第1のサイトゾルドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のMAMは、第2の膜貫通ドメインのC末端側に第2のサイトゾルドメインをさらに含む。一実施形態では、第1および/または第2のサイトゾルドメインは、1つまたは複数のITAMを含む活性化ドメインである。いくつかの実施形態では、uTCR-SARは、約0.1pM~約500nMの平衡解離定数(Kd)で標的抗原に結合する。
いくつかの実施形態では、上記のuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)のいずれかによれば、第1のポリペプチド鎖は、第1の膜貫通ドメインのC末端側に第1の共刺激ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の膜貫通ドメインのC末端側に第2の共刺激ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態において、上記のuTCR-SAR(単離されたuTCR-SARなど)のいずれかによれば、第1のポリペプチド鎖は、第1の膜貫通ドメインのC末端に1つ以上の共刺激性ドメインを含み、および/または第2のポリペプチド鎖は、第2の膜貫通ドメインのC末端に1つ以上の共刺激性ドメインを含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド鎖は、第1の抗原結合ドメインのN末端に第1のシグナル伝達ペプチドをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチド鎖は、第2の抗原結合ドメインのN末端に第2のシグナル伝達ペプチドをさらに含む。
一実施形態において、本開示は、非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を含む少なくとも1つのポリペプチドに融合したTCR可変ドメイン(例えば、Va/Vα、Vb/Vβ、Vg/Vγ、Vd/Vδなど)を含む抗原(例えば、ペプチド/MHC複合体)を特異的に標的化する二重鎖uTCR-SAR構築物(単離された構築物など)を提供する。いくつかの実施形態において、SARは、標的抗原(例えば、ペプチド/MHC複合体または脂質抗原)に特異的に結合する1つ以上のTCR可変ドメインと、少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができる非T細胞受容体モジュール(NTCRM)とを含んでいる。例示的な実施形態では、シグナル伝達アダプターは、CD3ε、FcRγ、DAP10、またはDAP12のうちの1つまたは複数であるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ペプチドおよびMHCタンパク質(例えば、MHCクラスIタンパク質またはMHCクラスIIタンパク質)を含む複合体である。
一実施形態では、uTCR-SARは細胞の表面上で発現される。一実施形態では、uTCR-SARは、T細胞ではない細胞の表面上で発現される。一実施形態では、uTCR-SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、プレTCRα鎖、またはそれらの変異体もしくは断片の発現を欠く細胞の表面上で発現される。一実施形態では、uTCR-SARは、CD3ε、Cd3γおよびCD3δ鎖、またはそれらの変異体もしくは断片の発現を欠く細胞の表面上で発現される。一実施形態において、TCR様特性を有するuTCR-SARは、T細胞において発現された場合、機能的に活性である(すなわち、細胞増殖、サイトカイン分泌または細胞毒性を誘導することができる)。一実施形態において、uTCR-SARは、T細胞ではない細胞(すなわち、NK細胞、マクロファージ、顆粒球樹状細胞などで発現された場合)において発現された場合、機能的に活性である(すなわち、細胞増殖、サイトカイン分泌、または細胞毒性を誘導することができる)。一実施形態では、SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδおよびプレTCRα鎖またはその変異体もしくは断片のうちの1つ以上の発現を欠く細胞において発現され、機能的に活性である。一実施形態では、uTCR-SARは、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδおよびプレTCRα鎖またはその変異体の発現および/または機能を欠く細胞において発現され、機能的に活性である。一実施形態では、uTCR-SARは、CD3ε、Cd3γおよびCD3δ鎖またはそれらの変異体の発現および/または機能を欠く細胞において発現され、機能的に活性である。
一実施形態において、uTCR-SARはT細胞にTCR様抗原認識を付与する。一実施形態において、uTCR-SARは、T細胞以外の細胞(例えば、NK細胞、g-NK細胞、メモリー様NK細胞、CIK、単球、マクロファージ、樹状細胞、上皮細胞、iPSC由来NK細胞など)にTCR様抗原認識を付与する。一実施形態では、uTCR-SARは、MHC(HLA)依存的にペプチド抗原に結合することができる。例示的な実施形態では、 uTCR-SARを発現する細胞(例えば、NK細胞またはマクロファージ)は、MHC(HLA)依存的に細胞内ペプチド抗原を認識することができる。例示的な実施形態において、uTCR-SARを発現する免疫細胞(例えば、NK細胞またはマクロファージ)は、MHC(HLA)依存的様式で細胞内ペプチド抗原を認識し、1つ以上の細胞シグナル伝達経路(例えば、NFAT、PI3K、NF-κB経路など)を活性化することができる。例示的な実施形態において、uTCR-SARを発現する免疫細胞(例えば、NK細胞またはマクロファージ)は、MHC(HLA)依存的様式で細胞内ペプチド抗原を認識し、1つ以上の細胞シグナル伝達経路(例えば、NFAT、PI3K、NF-κB経路など)を遮断することができる。一実施形態では、uTCR/SARを発現する免疫細胞(例えば、NK細胞、T細胞、またはマクロファージ)は、細胞の活性化、増殖、サイトカイン分泌(例えば、IFNγ、TNFαおよびIL2の分泌)および/または細胞毒性を誘導する能力を有する。標的ペプチド抗原に結合すると。一実施形態では、uTCR-SARを発現する免疫細胞(例えば、NK細胞、T細胞、またはマクロファージ)は、細胞の活性化、増殖、サイトカイン分泌(例えば、IFNγ、TNFαおよびIL2の分泌)および/または細胞毒性をブロックする能力を有する。標的ペプチド抗原に結合すると。一実施形態では、uTCR-SARは活性化受容体である。一実施形態では、uTCR-SARは阻害性受容体である。
一実施形態において、uTCR-SARは、TCRの可変ドメイン(例えば、Va/Vα、Vb/Vβ、Vg/Vγ、Vd/Vδ及びpreTCRα)に由来する1つ以上の抗原結合ドメインからなり、2つの鎖を有する。一実施形態において、uTCR-SARは、Va/VαドメインとVb/Vβドメインからなる。一実施形態において、uTCR-SARは、Vg/VγドメインおよびVd/Vδドメインからなる。一実施形態において、uTCR-SARは、preTCRαおよびVb/Vβドメインからなる。一実施形態において、uTCR SARの2つの可変ドメインは、2つの別個のポリペプチド鎖上に存在する。 一実施形態において、uTCR SARの抗原結合ドメイン(例えば、ペプチド/MHC複合体結合ドメイン)を構成する2つの可変ドメインは、単一のポリペプチド鎖の一部ではない。一実施形態では、uTCR-SARの2つの可変ドメインは、リンカーを介して操作可能に連結されていない、すなわち、uTCRは一本鎖TCR(scTCR)ではない。
一実施形態では、uTCRの一方または両方の鎖は膜貫通ドメインまたは膜アンカードメインを含む。一実施形態では、uTCR SARの一方または両方の鎖がサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、uTCR SARの一方または両方の鎖は、シグナル伝達タンパク質またはシグナル伝達アダプターを動員することができる膜貫通ドメインおよび/またはサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、二本鎖uTCR SARの一方または両方の鎖は、1つまたは複数のサイトゾル活性化ドメインを含む。一実施形態では、二本鎖uTCR SARの一方または両方の鎖は、そのサイトゾルドメインに1つまたは複数のITAMを含む。例示的な実施形態では、二本鎖uTCR SARの一方または両方の鎖は、1、2または3個のITAMを含むサイトゾルドメインを含む。例示的な実施形態では、uTCR SARの1つの鎖は単一のITAMを有するサイトゾルドメインを含み、一方、第2の鎖は3つのITAMを有するサイトゾルドメインを有する。例示的な実施形態では、1つの鎖は単一の1ITAMを有するサイトゾルドメインを含み、一方、第2の鎖は2つまたは3つのITAMを有するサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、二重uTCR SARの一方または両方の鎖は、1つまたは複数の阻害モチーフ、例えばITIMを含む。一実施形態では、uTCR-SARは、1つ以上のITAMが変異しているCD3ζ鎖に由来するサイトゾル活性化ドメインを含む。例示的な実施形態では、uTCR-SARは、1つ以上のITAMのチロシン残基がフェニルアラニンに変異しているCD3ε鎖に由来するサイトゾル活性化ドメインを含む。
一実施形態では、本開示はまた、シグナル伝達鎖(アダプター)及び/又は非TCR受容体の細胞外ドメインに操作可能に連結された抗原結合ドメインとしてTCRの可変ドメイン(例えば、Vα、Vβ、Vγ及びVδ等)を含み、共刺激性ドメインを含むuTCR-SARを提供する。
一実施形態では、TCR様結合特性を有する二重鎖uTCR SARの鎖の一方または両方は、任意に、1つ以上の共刺激ドメインを含む。一実施形態では、1つまたは複数の共刺激ドメインは、一方または両方の鎖の膜近傍領域に位置する。例示的な実施形態では、共刺激ドメインは、4-1BB、CD28、CD27、CD81、OX40、2B4、またはCD2などのサイトゾルドメインに由来する。CD28および4-1BBの共刺激ドメインからなる例示的なCD3ζシグナル鎖は、それぞれSEQ ID NO:3493および3494に示されている。 SARはモジュール形式であるため、CD28と4-1BBのコスティミュラトリードメインを、他の共刺激性レセプター(例えば、OX40、2B4、CD2、CD81など)やその変異体由来の共刺激性ドメインに置き換えて、新規なuTCR-SARを生成することができる。同様に、CD3ζシグナル伝達鎖の一方または両方を他のシグナル伝達鎖と置換して、FcRγ、DAP10およびDAP10およびその変異体のシグナル伝達鎖に基づいて、異なる共刺激ドメインを含む新規uTCR-SARを生成することができる。代表的なこのようなuTCR-SAR標的NY-ESO1ペプチド/MHC複合体は、配列番号10481~10530によって表される。
一実施形態では、TCR様結合特性を有するuTCR SARは、単一特異的である。一実施形態では、TCR様結合特性を有するuTCR SARは二重特異性である。一実施形態では、TCR様結合特性を有するuTCR SARはバイパラトピックである。一実施形態では、TCR様結合特性を有するuTCR SARは多重特異性である。一実施形態において、本開示は、MHC複合体によって提示された場合に2つ以上の異なる細胞内ペプチドに結合することができるTCR様結合特性を有するuTCR SARを提供する。一実施形態において、本開示は、細胞内ペプチドおよび細胞表面発現(または細胞外)タンパク質(例えば、CD19、CD20など)に結合できるTCR様結合特性を有するuTCR SARを提供する。 NY-ESO-1ペプチド/MHC複合体およびCD20の両方を標的とするこのようなuTCR-SARの例は、配列番号10478によって表される。この構築物では、CD20を標的とするvHHドメインが、小さなリンカーを介してNY-ESO-1ペプチドを標的とするVbドメインのN末端に結合されている。 CD20 vHH ドメインは、他の表面抗原またはペプチド/MHC複合体を標的とする他の AABD に置き換えることができます。例示的な実施形態では、CD20 vHHドメインは、MAGE-A3ペプチド/HLA-A2複合体を標的とする単一可変ドメインTCRによって置換されて、NY-ESO-1ペプチドとMAGE-A3ペプチドの両方を標的とすることができる二重特異性uTCR-SARを生成する。 AABD は、uTCR の Va ドメインに結合して二重特異性 SAR を生成したり、Vb ドメインと Va ドメインの両方に結合して多重特異性 uTCR-SAR を生成したりすることもできます。さらに、1つ以上のAABD(例えば、vHH、FHVH、セントチリン、svd-TCR)を、uTCR-SARの可変ドメインのそれぞれのN末端に結合させることができる。一実施形態において、本開示は、MHC(またはHLA)依存性およびMHC(HLA)非依存性様式で標的抗原に結合できるTCR様結合特性を有するuTCR SARを提供する。
一実施形態において、TCR結合特性を有するuTCR SARは、ペプチド/MHC複合体に結合するフラグメント可変TCR(TCR-Fv)を形成するために互いに会合する2つの可変ドメイン(例えば、VαとVβまたはVγとVδなど)からなる。一実施形態では、TCR結合特性を有するSARは、1つまたは複数の自律的抗原結合ドメイン(例えば、vHH、FHVH、svd-TCRなど)をさらに含む。一実施形態では、1つ以上の自律抗原結合ドメイン(例えば、vHH、FHVH、svd-TCRなど)は、任意のリンカーを介して、TCR可変ドメイン(例えば、VαとVβ、またはVγとVδなど)の一方または両方のN末端またはN末端付近に操作可能に連結される。例示的な実施形態において、本開示は、Vα/Vβドメインを介してMHCと複合体化したNY-ESO-1ペプチドを認識し、NY-ESO-1もしくはMAGE-A3を標的とするsvd-TCR、またはCD20もしくはBCMAなどを標的とするvHHもしくはFHVHドメインを共発現する二重鎖SARを提供する。 NY-ESO-1ペプチド/MHC複合体、CD20およびBCMAを標的とするこのようなuTCR-SARの例は、配列番号10479によって表される。
一実施形態において、本開示は、TCRのVa(Vα)ドメインが、任意のリンカー(例えば、TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562)を介して、1つの膜アンカー型ポリペプチド鎖の細胞外ドメインに作動可能に連結され、かつ、Vb(Vβ)ドメインが、任意のリンカー(例えば、TCR様リンカー、例えば、TCRb-Ig3;例えば、SEQ ID NO: 3560)を介して第2の膜固定ポリペプチド鎖の細胞外ドメインに操作可能に連結されている二重鎖uTCR SARを提供する。一実施形態では、二本鎖SARを構成する膜アンカー型ポリペプチド鎖の一方または両方が膜貫通タンパク質である。
例示的な実施形態において、本開示は、TCR由来のVa(Vα)ドメインが、任意のリンカー(例えば、TCRa-Ig3、SEQ ID NO:3562)を介して、シグナル伝達アダプター(例えば、CD3ζ、FcRγ、DAP10もしくはDAP12など)の1つの鎖またはそのバリアントの細胞外ヒンジドメインに作動可能に連結され、かつ、Vb(Vβ)ドメインが、任意のリンカー(例えば、TCR様リンカー、例えば、TCRb-Ig3;例えば、SEQ ID NO: 3560)を介して、シグナル伝達アダプターまたはそのバリアントの第2鎖の細胞外ヒンジドメインに操作可能に連結されているuTCR-SARを提供する。細胞(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージなど)において発現された場合にNY-ESO-1ペプチド/HLA-A*02:01複合体を認識する例示的なそのようなuTCR-SARは、SEQ ID NO(DNA:9355およびSEQ ID NO: (PRT):10447に示される。SARはモジュラー形式であるため、このSARのCD3ζシグナル伝達鎖の一方または両方は、FcRγ、DAP10およびDAP10のシグナル伝達鎖またはその変異体を含む、他のシグナル伝達鎖/アダプターによって置き換えることができる。さらに、リンカードメインを他のリンカードメインで置き換えることもできる。例示的な実施形態において、Ig様リンカーTCRa-Ig3(SEQ ID NO: 3562)は、IgCLリンカー(SEQ ID NO: 3536)で置換され、そして、リンカーTCRb-Ig3(SEQ ID NO: 3560)は、IgG-CH1(SEQ ID NO: 3537)、IgG2-0C-CH1(SEQ ID NO: 3543)、IgG2-IC-CHI1(SEQ ID NO: 3544)、IgG3-CHI1(SEQ ID NO:3545)、IgG4-CHI1(SEQ ID NO:3546)、IgAI-CHI1(SEQ ID NO:3547)、IgA2-CHI1、IgD-CHI1、IgE-CHI1またはIgM-CHI1(SEQ ID NO:3551)で置換される。NY-ESO-1ペプチド/MHC複合体を標的とするこのような例示的なuTCR-SAR構築物は、配列番号9357~9365によって表される。
いくつかの実施形態では、VαドメインはIgCLリンカーに結合され、VβドメインはIgCH1リンカーに結合される。いくつかの実施形態では、VβドメインはIgCH1リンカーに結合され、VαドメインはIgCLリンカーに結合される。いくつかの実施形態では、VαドメインはCα由来リンカー(例えば、TCRa-Ig3)に結合され、VβドメインはCβ由来リンカー(例えば、TCRb-Ig3)に結合される。いくつかの実施形態では、VβドメインはCα由来リンカー(例えば、TCRa-Ig3)に結合され、VαドメインはCβ由来リンカー(例えば、TCRb-Ig3)に結合される。このような構築物の例は、配列番号10448によって表される。いくつかの実施形態において、VγドメインはCγ由来のリンカー(例えば、TCRg-Ig3)に結合され、VδドメインはCδ由来のリンカー(例えば、TCRd-Ig3)に結合される。このような構築物の例は、配列番号10694である。この構築物には、Vd2 および Vg9 可変ドメインがある。いくつかの実施形態では、VγドメインはCδ由来リンカー(例えば、TCRd-Ig3)に結合され、VδドメインはCγ由来リンカー(例えば、TCRg-Ig3)に結合される。このような構築物の例は、配列番号10693によって表される。いくつかの実施形態では、可変ドメインおよびリンカーの他の構成が想定される。
例示的な実施形態では、TCRγおよびTCRδの可変ドメインからなるuTCR-SARの場合、Vγフラグメントはシグナル伝達アダプター(例えば、 CD3ζ、FcRγ、DAP10またはDAP10など)にTCRγ由来のIg様リンカー(例えば、TCRg-Ig3、SEQ ID NO: 3566)を介して結合され、Vδフラグメントはシグナル伝達アダプターの第二の鎖にTCRδ鎖由来のIg様リンカー(例えば、TCRd-Ig3、SEQ ID NO: 3568)を介して結合される。TCRg-Ig3 および TCRg-Ig3 リンカードメインは、他のリンカードメインで置き換えることができる。本開示は、Ig(例えば、IgCLおよびIgG-CH1)またはTCRα/β(例えば、 TCRa-Ig3およびTCRb-Ig3)を、TCRγ(例えば、TCRg-Ig3、SEQ ID NO: 3566)およびTCRδ鎖(例えば、TCRd-Ig3、SEQ ID NO: 3568)由来のリンカーの一方または両方に置換することができる。
本開示は、2つのシグナル伝達鎖が異なるタイプ(例えば、CD3ζとFcγR、CD3ζとDAP10、CD3ζとDAP12、FcRγとDAP10など)であるTCRの可変ドメインを抗原結合ドメインとして含むヘテロ二量体二重鎖uTCR-SARを提供する。本開示は、1つまたは両方のシグナル伝達鎖が、天然に存在するシグナル伝達受容体、例えばCD16A、NKp30、NKp44、NKp44などの膜貫通ドメインおよび任意選択で細胞質ドメインからなるヘテロ二量体二重鎖uTCR-SARを提供する。このようなuTCR-SARの一方または両方の鎖は、1つ以上の共刺激ドメインをさらに含んでいてもよい。NY-ESO-1ペプチド/HLA-A*02:01およびMAGE-A3ペプチド/HLA-A*02:01複合体を標的とし、異なる結合ドメイン、リンカー、活性化ドメインおよび共刺激ドメインからなる例示的なuTCR-SAR構築物は、それぞれSEQ ID NO (PRT): 10447-10530および10531-10610で表される。複数の癌型を認識するHLA非依存性TCRであるMC.7.G5の可変ドメインを含む例示的なuTCR-SAR構築物は、SEQ ID NO (PRT): 10620-10692およびSEQ ID NO (DNA): 9528-9600で表される。
本開示は、CD16(FcγRIII)の部分領域または全体領域を含む単鎖、二本鎖、および二本鎖ヘテロ二量体SARを提供する。本開示は、生物学的活性を保持しながら、本明細書に記載されるCD16配列のいずれかと70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、98.5%、99%または99.9%の同一性を有するCD16またはその断片からなるSARを提供する。本開示のCD16-SARの構築において使用することができる例示的な全長CD16核酸配列およびアミノ酸配列は、SEQ ID NO (DNA)に提供される: 1415-1417およびSEQ ID NO(PRT):3809-3811、または非ヒト種、例えば、マウス、げっ歯類、サル、類人猿などからの同等残基(すなわち、ホモログ)。本開示のCD16 SARの構築に使用できるCD16フラグメントは、仮出願の表25~30に提供されている。 CD16 SARはまた、その配列が表25~30に提供されるCD16断片の変異体、または非ヒト種からの同等の残基を使用して構築することもできる。本開示の例示的な単鎖、二本鎖、および二本鎖ヘテロ二量体SARは、仮出願の表32、34、および36~39に提供される。
CD16 には、細胞外ドメインと膜貫通ドメインに配列相同性のある CD16a と CD16b という 2 つのアイソフォームがあります。特に明記しない限り、CD16は、CD16a (FcγRIIIa)およびCD16b (FcγRIIIb)アイソフォームの両方、およびヒトまたは非ヒト種に由来する他の任意のスプライシング変異体を指す。ただし、CD16b アイソフォームにはサイトゾル ドメインが欠如しているため、CD16 サイトゾル ドメインに関する説明は、CD16a アイソフォームおよび非ヒト種の同等の残基のみに関係します。いくつかの実施形態では、本開示のCD16 SARの構築に使用できるCD16配列には、免疫グロブリンFc領域(例えば、CD16A-F158V;配列番号1415)に対するCD16の親和性を増加させる変異体および変異体が含まれ得る。さらに、細胞表面からの切断を防止します(例えば、CD16A-F158V-S197P; 配列番号1453)。
1415~1417に示されるヒトCD16の核酸配列を含む。特定の実施形態では、SARのヌクレオチド配列は、配列番号3809~3811のアミノ酸配列の少なくとも1、5または10の修飾を有するが20以下の修飾を有するCD16のアミノ酸配列をコードする配列を含むか、または配列番号3809~3811のアミノ酸配列に対して70~99%の同一性を有する配列。特定の実施形態では、SAR分子は、配列番号3809~3811のアミノ酸配列、または非ヒト種由来の同等の残基を含む。
一実施形態では、本開示は、CD16またはその変異体の部分領域または全体領域を含む単鎖CD16 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、CD16細胞外ドメインの部分領域または全体領域を含む単鎖CD16 SARを提供する。本開示のCD16-SARの構築に使用することができる例示的なCD16細胞外ドメイン配列は、配列番号(DNA):1496~1509および配列番号(PRT):3890~3903、または同等の残基(すなわち、 、ホモログ)非ヒト種由来。一実施形態において、本開示は、CD16ヒンジドメインの部分領域または全体領域を含むCD16 SARを提供する。本開示のCD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16ヒンジドメイン配列は、配列番号(DNA):1545~1547および配列番号(PRT):3939~3941、または同等の残基(すなわち、 、ホモログ)非ヒト種由来。一実施形態では、本開示は、CD16膜貫通ドメインの部分領域または全体領域を含むCD16 SARを提供する。本開示のCD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16膜貫通配列は、配列番号(DNA):1528~1530および配列番号(PRT):3922~3924、または同等の残基(すなわち、ホモログ)ヒト以外の種に由来する。一実施形態では、本開示は、CD16サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含むCD16 SARを提供する。本開示のCD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16膜貫通配列は、配列番号(DNA):1556~1558および配列番号(PRT):3950~3952、または同等の残基(すなわち、ホモログ)ヒト以外の種に由来する。本開示はまた、同一性または相同性を有する野生型CD16の少なくとも1つの生物学的活性を保持するCD16の変異体またはその断片を含むSARを提供する。
一実施形態において、CD16 SARは、CD16膜貫通ドメインおよびCD16細胞質ドメインにCD16ヒンジドメインを介して結合している、両方の免疫グロブリン様ドメイン(すなわち、D1およびD2)からなるCD16細胞外ドメインからなる。BCMAを標的とする例示的なそのようなCD16 SARは、CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn-G4S-EcoR1-Xho-CD16-F158V-FL-TMCP-v1-F-P2A-SpeXba-PAC(SEQ ID NO(DNA):1638およびSEQ ID NO(PRT):4032)異なる抗原を標的とするscFv、FHVH、vHHおよび非免疫グロブリン抗原結合足場を含むさらなる例示的なこのようなSARは、配列番号(DNA):4851~5121に提供される。このようなCD16 SARはまた、抗体のFc領域、抗体フラグメントまたは二重特異性/三重特異性エンゲージャーに結合し、抗体依存性細胞傷害性を媒介する能力を保持している。したがって、SAR CD8SP-BCMA-FHVH-33-CD16A-F158V-S197P-FL-v3(SEQ ID NO: 5062)を発現する免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、単球/マクロファージ、好中球など)は、BCMA FCVH領域を介してBCMA発現標的細胞を標的とすることができる。さらに、このような免疫細胞は、ハーセプチンの存在下で、標的化されたHer2発現標的細胞にリダイレクトすることができる。あるいは、このような免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)は、リツキシマブの存在下で、標的CD20発現標的細胞にリダイレクトされ得る。
一実施形態では、CD16 SARは、CD16の最初の免疫グロブリン様ドメイン(すなわち、D1)を欠いている部分的CD16細胞外ドメインを含む。このようなCD16 SARは、D1およびD2ドメインと、 CD16ヒンジドメインを介してCD16膜貫通ドメインおよびCD16サイトゾルドメインに結合する第2免疫グロブリン様ドメイン(すなわち、D2)との間のリンカー領域を含む。 BCMAを標的とするこのようなCD16 SARの例は、CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn-G4S-EcoR1-Xho-CD16-F158V-D2TMCPv1-F-P2A-SpeXba-PAC(配列番号(DNA):1664および配列番号1664)によって表されるID NO (PRT): 4058)。このようなCD16-SARは、CD16のD2ドメインのみを含み、D1ドメインを欠いているため、抗体に結合する能力を欠いている。
一実施形態では、CD16 SARは、CD16ヒンジドメインを介してCD16膜貫通ドメインおよびCD16サイトゾルドメインに結合するCD16 D2ドメインを含む。このようなCD16-SARは、CD16のD2ドメインのみを含み、D1ドメインを欠いているため、抗体に結合する能力を欠いている。
一実施形態では、CD16 SARは、CD16膜貫通ドメインおよびCD16サイトゾルドメインに結合するCD16ヒンジドメインの部分的または全体を含む。 BCMAを標的とするそのようなCD16 SARの例は、CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn-G4S-EcoR1-Xho-CD16-F158V-Hinge-TM-CP-v1 -F-P2A-SpeXba-PAC(配列番号( DNA): 1690および配列番号(PRT): 4084)。このような CD16-SAR は、D1 ドメインと D2 ドメインの両方を欠いているため、抗体に結合する能力がありません。
一実施形態では、CD16 SARは、抗原結合ドメイン(例えば、scFvまたはAABD)とCD16のヒンジドメインとの間に存在する異種ヒンジ(スペーサー)ドメインを含む。 CD19を標的とするこのようなCD16 SARの例は、CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-scFv-CD8-hinge-CD16A-Hinge-TM-CP-V158-F-P2A-PAC(配列番号(DNA):7693)によって表される。および配列番号(PRT):8385)。この構築物は、CD8ヒンジを介して、CD16Aヒンジ、膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメインをコードするフラグメントに機能的に連結されたCD19標的hu-mROO5-1 scFvを含む。代替の実施形態では、CD8ヒンジ領域は、CD16A膜貫通ドメインおよび細胞質ゾルドメインに直接連結される。 SARはモジュール設計であるため、上記構築物中のCD19-hu-mROO5-1-scFvは、別の抗原を標的とする抗原結合ドメイン(例えば、scFv、AABDなど)に置き換えることができる。さらに、CD8 ヒンジ ドメインを別のヒンジ ドメインに置き換えることもできます。 CD8ヒンジの代わりにCD28ヒンジを含む例示的なそのような構築物は、CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-scFv-CD28-Ig-113-137-CD16A-v158-Hinge-TM-CP-v2-Fによって提示される。 -F2A-PAC(配列番号(DNA):7683;配列番号(PRT):8375)(表46)。
例えば、Gly4-Ser )を有するCD16のD2ドメインとヒンジドメインとの間に挿入されるAABD(例えば、vHH、FHVH、chVH、セントチリン、アフィボディなど)を含む。リンカ)。例示的な実施形態では、このようなCD16 SARのアミノ末端からカルボキシ末端までの異なるドメインには、N末端シグナルペプチド、CD16-D1ドメイン、CD16-D2ドメイン、任意のリンカー、AABD(例えば、vHH、FHVH、センチリン、アフィボディなど)、任意のリンカー、CD16 ヒンジ ドメイン、CD16 膜貫通ドメイン、および CD16 サイトゾル ドメイン。
SARの構築に使用され得る様々なCD16ドメイン(すなわち、細胞外、D1、D2、ヒンジ、膜貫通、およびサイトゾル)は、以下の条件を満たす限り、その全配列または欠失変異体もしくは変異体を含み得ることが理解されるべきである。ドメインは、その機能的特性の少なくとも 1 つを保持します。 CD16ドメインは、それらの野生型配列、または高親和性(例えば、F158V)もしくは高親和性非切断性(例えば、F158V/S197PもしくはF158V/S197R)変異体の1つ以上を含み得る。
一実施形態において、CD16 SARの抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、Fv、Va、Vb、Vg、Vd、TCR-Fv、vHH、FHVH、単ドメイン抗体、単鎖TCR(scTCR)、単可変ドメインTCR(svd-TCR)、非免疫グロブリン抗原結合スキャフォールド、リガンド(例.APRIL)、または受容体の細胞外ドメイン(PD1、NKG2D、NKp30、NKp44、NKp46など)を含む。一本鎖SARの鎖は、1つの抗原に結合してもよいし、2つ以上の抗原(例えば、2つ、3つ、4つなど)に結合してもよい。一本鎖CD16 SARの鎖は、1つ以上のアダプター(例えば、RZIP、EZIP、NKG2D-YA、NKG2D-FAなど)をさらに含んでいてもよい。
いくつかの実施形態において、本開示のCD16 SARは、一般式の分子を含む:AABD(n)-任意選択CD16 D1ドメイン-任意選択CD16リンカードメイン-任意選択CD16 D2ドメイン、CD16ヒンジドメイン-CD16膜貫通ドメイン-任意選択細胞内コスティミュラトリードメイン(n)-任意選択CD16細胞内シグナル伝達ドメインここで、nは1以上である。一実施形態では、nは少なくとも2、例えば2、3、4または5である。AABD(自律抗原結合ドメイン)は、抗原結合ドメインを形成し、細胞内で発現される場合には細胞外側に位置する。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHドメインまたはヒト化vHドメインである。一実施形態では、AABDは、完全ヒト単一VH(SVH)ドメインまたはヒト化SVHドメインである。 SVH ドメインは自律 vH ドメインとしても知られ、vL ドメインが存在しない場合でもターゲットに結合できます。 一実施形態では、AABDは完全ヒトvHHドメインまたはヒト化vHHドメインである。
は、DARPIN、アフィボディ、ZIPドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、R4など)、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディなどの非免疫グロブリン抗原結合足場である。 、レペボディ、ファイノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、またはその断片;受容体の細胞外ドメイン(例えば、NKG2D)、リガンド(例えば、APRIL、トロンボポエチン)など。
本開示のCD16 SARは、一般式:
scFv( n )-任意のCD16 D1-任意のCD16リンカードメイン-任意の-CD16 D2ドメイン、CD16ヒンジドメイン-CD16膜貫通ドメイン-任意の-細胞内共刺激ドメイン(n)-任意のCD16細胞内シグナル伝達ドメイン、ここで、nは1以上である。
別の実施形態では、共刺激ドメインもCD16-SARのCD16鎖に組み込まれる。例示的な共刺激ドメインには、41BB、CD28、OX40および2B4などの共刺激ドメインが含まれる(表30;配列番号(DNA):1565~1572および配列番号(PRT):3959~3966)。まとめると、上記の結果は、現世代 CAR の設計制限の一部を克服する養子細胞療法のための新しいプラットフォームを提供し、CAR への補完的なアプローチも提供します。
異なる抗原を標的とするscFv断片と融合したCD16A全体からなるSARの核酸配列およびアミノ酸配列は、それぞれSEQ ID NO (DNA):4851-5039およびSEQ ID NO (PRT):5151-5339で表される。scFv断片とその標的抗原の順番は、表3に示したscFvと標的抗原の順番と同じである。これらのCD16に基づくSAR構築物の完全な名称は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる仮出願の表36にも記載されている。異なるscFv、単一ドメイン抗体、アダプターまたはscTCRに結合したCD16全長配列からなる追加のSARをSEQ ID NO(PRT):10043-10323に示す。 CD16の全長配列からなり、CD19を標的とするscFvに結合したvHHフラグメントまたはFHVHフラグメントからなる例示的なSARは、SEQ ID NO: 10324-10326で表される。 CD16全長配列からなり、アダプター(SEQ ID NO: 10331-32)またはscTCR(SEQ ID NO: 10329-10330)を含む例示的なSARもまた提供される。
異なる抗原を標的とするvHHおよびFHVHフラグメントと融合したCD16A全体からなる例示的なSARの核酸配列およびアミノ酸配列は、それぞれSEQ ID NO (DNA):5040-5108およびSEQ ID NO (PRT):5340-5408で表される。これらのSARSの名称および標的抗原は、仮出願の表37に提供される。異なる抗原を標的とする非免疫グロブリン抗原結合ドメインと融合したCD16A全体からなる例示的なSARの核酸配列およびアミノ酸配列は、それぞれSEQ ID NO (DNA):5110-5121およびSEQ ID NO (PRT):5410-5421で表される。これらのSARSの名称および標的抗原は、仮出願の表38に提供される。受容体、アダプターおよびサイトカインの細胞外抗原結合ドメインと融合したCD16A全体からなる例示的なSARの核酸配列およびアミノ酸配列は、それぞれSEQ ID NO (DNA):5123-5129およびSEQ ID NO (PRT):5423-5429で表される。これらのSARSの名称および標的抗原は、仮出願の表39に記載されている。
本開示の異なるSARSは、モジュール設計である。したがって、CD16A-F158V-FL-v1をコードする配列(配列番号1415)は、異なるシグナル伝達モジュールをコードする配列(例えば、配列番号9635~9740;9813~9851)によって置き換えられ得る。このようなモジュールの例としては、CD16-F158V-D2TMCPv1 (配列番号1450)、CD16- F158V-Hinge-TM-CP (配列番号1451)、NKp30-ECDTMCP-opt1 (配列番号1369)、NKp30-Hingeが挙げられる。 -TMCP-opt1 (配列番号1370)、NKp44-ECDTMCP-opt1 (配列番号1382)、NKp44-Hinge-TM-CP-opt1 (配列番号1383)、NKp46-ECDTMCP-opt1 (配列番号1382) NO: 1395)、NKp46-Linker-Ig1-Hinge-TM-CP-opt1 (配列番号: 1396)、NKp46-Ig1-Hinge-TM-CP-opt1 (配列番号: 1397)、および NKp46-Hinge- TM-CP-opt1(配列番号1398)。 1つ以上のCD16A-F158V-FL-v1モジュールが異なるシグナル伝達モジュールで置き換えられる例示的なSARSは、配列番号(PRT):9860~10042および配列番号(DNA):8768~8950によって表される。様々な例示的な構築物の名前および配列番号もまた、その全体が参照により本明細書に組み込まれる仮出願の表33に示されている。
SARの構築に使用することができる、異なる天然に存在する受容体の細胞外、膜貫通、およびサイトゾルドメインを含むポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号(PRT):9633~9668に提供される。例示的なSARを配列番号9860~9895に示す。 SARの構築に使用することができる、異なる天然受容体のヒンジ、膜貫通、およびサイトゾルドメインを含むポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号(PRT):9669~9704に提供される。これらのポリペプチドに結合したCD19 scFvおよびCD28のヒンジドメインを含む例示的なCD19 SARを配列番号9896~9931に示す。 SARの構築に使用することができる、異なる天然受容体の膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメインを含むポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号(PRT):9705~9740に提供される。これらのポリペプチドに結合したCD19 scFvおよびCD28のヒンジドメインを含む例示的なCD19 SARを配列番号9957~9992に示す。上記のSARのいずれかにおけるCD19 scFVドメインは、異なる抗原結合ドメイン(例えば、scFv、vHH、FHVH、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、scTCR、scv-TCR、受容体のリガンド結合ドメイン、受容体結合)と置き換えることができる。 (リガンドまたはアダプターなどのドメイン) 新規 SAR を生成するために異なる抗原を標的とするドメイン。例示的な抗原結合ドメインは、仮出願の表3~10に示されている。 SARはまた、天然に存在する受容体に結合した2つの異種抗原結合ドメインを含み得る。
一実施形態では、CD16 SARは、CD16の細胞外ドメイン全体を含み、次の式を有する:
AABD(n)-CD16 D1-CD16リンカードメイン-CD16 D2ドメイン-CD16ヒンジドメイン-CD16膜貫通ドメイン-CD16細胞内ドメイン、nは1以上であり、AABDは完全ヒトvHドメインまたはヒト化vHHドメインを含む。 CD16細胞外ドメインは、F158V および S197P 変異を保有している可能性があります。 CD16の細胞外ドメイン全体を含み、異なる抗原を標的とする例示的なCD16 SARの核酸配列およびアミノ酸配列は、配列番号(DNA):4851~5129および8951~9244、ならびに配列番号(PRT):5151~5429に提供される。および10043-10336および仮出願の表36~39に記載されている。配列番号5151~5429、8951~9244のSARコンストラクトの抗原結合ドメインの組成および順序は、表3に示す配列番号2924~3160のscFvの順序と同じである。配列番号9140~9153および9188~9215を有する構築物はBCMAを標的とし、配列番号9216~9222を有する構築物はPSMAを標的とし、配列番号9223~9231を有する構築物はメソテリンを標的とする。配列番号9232および9234を有する構築物は、CD19およびBCMAの両方を標的とする二重特異性CD16-SARであり、一方、配列番号9233を有する構築物は、CD20およびCD19を標的とする二重特異性CD16 SARである。配列番号9237および9238の構築物は、標的抗原としてNY-ESO-1ペプチド(配列番号10880)およびMAGE-A3ペプチド(112~120)(配列番号10879)ペプチドを標的とするscTCRを含むがSAR配列番号9241を有する構築物は、MAGE-A3ペプチド-270~279(配列番号10878)を標的とする単一可変ドメインTCR(svd-TCR)を含む。構築物配列番号9239および9240は、抗原結合ドメインとしてRzipアダプターおよびEZipアダプターを含む。最後に、配列番号9242~9244を有する構築物は、他のアダプターを含む。
単鎖 CD16-SAR を発現する T 細胞は、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、NFAT シグナル伝達を活性化し、IL2 産生を誘導し、T 細胞増殖を促進し、T 細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮する可能性があります。別の例示的な実施形態では、単鎖CD16-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、IL2産生を誘導し、NK細胞増殖を促進し、NK細胞活性化を促進し、または細胞毒性を発揮することができる。別の例示的な実施形態では、単鎖CD16-SARを発現する単球/マクロファージは、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、標的細胞の食作用を誘導することができる。別の例示的な実施形態では、単鎖CD16-SARを発現する顆粒球(例えば、好中球)は、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、標的細胞の食作用を誘導することができる。
特定の実施形態において、本開示は、各鎖がCD16またはその変異体の部分配列または全体配列を含む2つの鎖を含む、CD16-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16細胞外ドメインの部分領域または全体領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。本開示の二本鎖CD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16細胞外ドメイン配列は、配列番号(DNA):1496~1509および配列番号(PRT):3890~3903に提供される。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16ヒンジドメインの部分領域または全体領域を含む二本鎖CD16 SARを提供する。本開示の二本鎖CD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16ヒンジドメイン配列は、配列番号(DNA):1545~1547および配列番号(PRT):3939~3941に提供される。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16膜貫通ドメインの部分領域または全体領域を含む、二本鎖CD16 SARを提供する。本開示の二本鎖CD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16膜貫通配列は、配列番号(DNA):1528~1530および配列番号(PRT):3922~3924で提供される。一実施形態では、本開示は、各鎖がCD16サイトゾルドメインの部分的または全体の領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。本開示のCD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16膜貫通配列は、配列番号(DNA):1556~1558および配列番号(PRT):3950~3952で提供される。
本開示は、抗体のvLフラグメントが2つのCD16鎖のうちの1つに結合することができ、vHフラグメントが他のCD16鎖に結合できることを提供する。このような2つの鎖(例えば、vL- CD16およびvH- CD16)が同一細胞内で共発現すると、vL断片およびvH断片は同族抗原と結合し、細胞シグナルを伝達することができる。例示的な実施形態では、そのようなCD16-SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の例示的な実施形態では、このようなCD16-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、IL2産生を誘導し、NK細胞増殖を促進し、NK細胞活性化を促進し、または細胞毒性を発揮することができる。別の例示的な実施形態では、そのようなCD16-SARを発現する単球/マクロファージは、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、標的細胞の食作用を誘導することができる。別の例示的な実施形態では、単鎖CD16-SARを発現する単球/マクロファージは、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、標的細胞の食作用を誘導することができる。別の例示的な実施形態では、単鎖CD16-SARを発現する顆粒球(例えば、好中球)は、同族標的抗原を発現する細胞に曝露されると、標的細胞の食作用を誘導することができる。
二重鎖CD16-SARの発現および活性は、vL/vHとCD16フラグメントとの間にリンカーを組み込むことによって、さらに増大させることができる。特に、IgCL(SEQ ID NO(DNA);1142およびSEQ ID NO (PRT): 3536)およびIgCHドメイン(SEQ ID NO (DNA): 抗体由来のIgCLドメイン(SEQ ID NO (DNA): 1143-1157 and SEQ ID NO (PRT): 3537-3551)は、vL/vHフラグメントとCD16フラグメントの間の有用なリンカーとして機能する。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13 ;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
一実施形態では、二重鎖CD16 SARの各鎖は、CD16膜貫通ドメインおよびCD16細胞質ドメインにCD16ヒンジドメインを介して結合している、両方の免疫グロブリン様ドメイン(すなわち、D1およびD2)からなるCD16細胞外ドメインからなる。 CD20およびBCMAを標的とするこのような二重鎖CD16 SARの例は、SAR CD8SP-CD20-VHH-2HC2D6-USC1-xho-IgCL-Bam-CD16-F158V-FL-TMCP-v1-F-P2A-SP-Apa-によって表される。 BCMA917-vHH-E59D-Mlu-IgG1-CH1-Kpn-CD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3-F-F2A-PAC (配列番号(DNA): 1633 および配列番号(PRT): 4027) 。このSARでは、CD20 vHHドメインがIgCLリンカーを介して一方のCD16鎖に結合し、BCMA vHHがIgG1-CH1リンカーを介してもう一方のCD16鎖に結合している。この二重鎖CD16 SARの2つの鎖は、P2A切断可能なリンカーを介在させた単一のベクターから発現される。このSAR構築物はピューロマイシン耐性カセット(PAC)も発現するが、これはオプションである。 CD19を標的とする別の例示的な二本鎖CD16 SARは、CD8SP-hu-mROO5-1-vL-xho-IgCL-Bam-CD16-F158V-FL-TMCP-v1-F-P2A-SP-hu-mROO5-1-vHによって表される-Mlu-IgG1-CH1-Kpn-CD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3-F-F2A-K13-opt(配列番号(DNA):1628および配列番号(PRT):4022)。このSARでは、hu-mROO5-1 vLドメインがIgCLリンカーを介して一方のCD16鎖に結合し、hu-mROO5-1 vHドメインがIgG1-CH1リンカーを介してもう一方のCD16鎖に結合している。 hu-mROO5-1 vLおよびvHフラグメントは結合して、ヒトCD19に結合できるFvを形成する。この二重鎖 CD16 SAR の 2 つの鎖は、P2A 切断可能なリンカーを介して単一のベクターから発現されます。このSAR構築物は、ヒトヘルペスウイルス8由来のコドン最適化vFLIP K13モジュールを含むアクセサリーモジュールも発現するが、これは任意である。配列番号(DNA):1629および配列番号(PRT):4023で表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1628および配列番号(PRT):4022で表されるSAR構築物と類似しているが、例外として、K13 モジュールが伝染性軟属腫ウイルスの MC159 モジュールに置き換えられます。配列番号(DNA):1630および配列番号(PRT):4024によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1628および配列番号(PRT):4022によって表されるSAR構築物と類似しているが、例外は、K13 モジュールがピューロマイシン耐性遺伝子に置き換えられることです。配列番号(DNA):1625および配列番号(PRT):4020によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1630および配列番号(PRT):4024によって表されるSAR構築物と類似しているが、例外として、IgCL および IgG1-CH1 リンカー ドメインが欠落しており、hu-mROO5-1 vL および vH フラグメントが 2 つの CD16 鎖に直接結合しています。配列番号(DNA):1631および配列番号(PRT):4025によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1630および配列番号(PRT):4024によって表されるSAR構築物と類似しているが、例外は、ヒトCD20を標的とするvHHドメインが短いGly4Serx2リンカー(配列番号(DNA):1024)を介してhu-mROO5-1 vL領域のアミノ末端に結合していることである。この構築物は、CD19 と CD20 の両方をターゲットにすることができます。配列番号(DNA):1632および配列番号(PRT):4026によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1631および配列番号(PRT):4025によって表されるSAR構築物と類似しているが、例外は、ヒトBCMAを標的とするvHHドメインが短いG4Sx3リンカー(配列番号(DNA):40)を介してhu-mROO5-1 vH領域のアミノ末端に結合していることである。この構築物は、CD19、CD20、および BCMA をターゲットにすることができます。配列番号(DNA):1634および配列番号(PRT):4028によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1630および配列番号(PRT):4024によって表されるSAR構築物と類似しているが、 IgCLおよびIgG1-CH1リンカードメインがTCRb-ECD(TCRb-wt-opt-8ECD;配列番号1166)およびTCRa-ECD(TCRa-Ig-Like-C1-Domain-6MD;配列番号)によって置き換えられるという例外ID NO: 1168) リンカードメイン。配列番号(DNA):1635および配列番号(PRT):4029によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1631および配列番号(PRT):4025によって表されるSAR構築物と類似しているが、 IgCLおよびIgG1-CH1リンカードメインがTCRb-ECD(TCRb-wt-opt-8ECD;配列番号1166)およびTCRa-ECD(TCRa-Ig-Like-C1-Domain-6MD;配列番号)によって置き換えられるという例外ID NO: 1168) リンカードメイン。配列番号(DNA):1636および配列番号(PRT):4030によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1632および配列番号(PRT):4026によって表されるSAR構築物と類似しているが、 IgCLおよびIgG1-CH1リンカードメインがTCRb-ECD(TCRb-wt-opt-8ECD;配列番号1166)およびTCRa-ECD(TCRa-Ig-Like-C1-Domain-6MD;配列番号)によって置き換えられるという例外ID NO: 1168) リンカードメイン。配列番号(DNA):1637および配列番号(PRT):4031によって表される二本鎖CD16 SARは、配列番号(DNA):1633および配列番号(PRT):4027によって表されるSAR構築物と類似しているが、 IgCLおよびIgG1-CH1リンカードメインがTCRb-ECD(TCRb-wt-opt-8ECD;配列番号1166)およびTCRa-ECD(TCRa-Ig-Like-C1-Domain-6MD;配列番号)によって置き換えられるという例外ID NO: 1168) リンカードメイン。
一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16の部分的または全体の領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16細胞外ドメインの一部または全領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16 D1ドメインの部分領域または全体領域を含む二本鎖CD16 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16 D2ドメインの部分領域または全体領域を含む、二本鎖CD16 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16ヒンジドメインの部分領域または全体領域を含む二本鎖CD16 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16膜貫通ドメインの部分領域または全体領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、各鎖がCD16サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含む、二本鎖CD16 SARを提供する。
一実施形態では、二重鎖CD16 SARの各鎖は、CD16ヒンジドメインを介してCD16膜貫通ドメインおよびCD16サイトゾルドメインに結合する免疫グロブリン様ドメイン(すなわち、D1およびD2)の両方を含むCD16細胞外ドメインを含む。一実施形態では、二本鎖CD16 SARの各鎖は、抗体のFc領域、抗体フラグメントまたは二重特異性/三重特異性エンゲージャーに結合し、抗体依存性細胞傷害性を媒介する能力も保持する。一実施形態では、二重鎖CD16 SARの各鎖は、CD16ヒンジドメインを介してCD16膜貫通ドメインおよびCD16サイトゾルドメインに結合する第2の免疫グロブリン様ドメイン(すなわち、D2)を含む部分的CD16細胞外ドメインを含む。一実施形態では、このような二本鎖CD16 SARの各鎖は、CD16のD2ドメインのみを含み、D1ドメインを欠いているため、抗体または抗体断片のFc部分に結合する能力を欠いている。一実施形態では、二本鎖CD16 SARの各鎖は、CD16膜貫通ドメインおよびCD16サイトゾルドメインに結合する部分的または全体のCD16ヒンジドメインを含む。一実施形態では、このような二本鎖CD16 SARの各鎖は、D1およびD2ドメインの両方を欠いているため、抗体または抗体断片のFc部分に結合する能力を欠いている。
必要に応じて介在してCD16のD2ドメインとヒンジドメインとの間に挿入されるAABD(例えば、vHH、FHVH、chVH、セントチリン、アフィボディなど)を含む。リンカー(例えば、グリシン-セリンリンカー)。例示的な実施形態では、アミノ末端からカルボキシ末端までの二本鎖CD16 SARを含むそのような鎖の異なるドメインには、N末端シグナルペプチド、CD16-D1ドメイン、CD16-D2ドメイン、任意のリンカー、AABD(例えば、vHH)が含まれる。 、FHVH、セントチリン、アフィボディなど)、任意のリンカー、CD16ヒンジドメイン、CD16膜貫通ドメインおよびCD16サイトゾルドメイン。
二本鎖CD16 SARの構築に使用され得る様々なCD16ドメイン(すなわち、細胞外、D1、D2、ヒンジ、膜貫通およびサイトゾルなど)は、それらの全配列または欠失変異体を含み得ること、またはそのドメインの機能的特性を保持している限り、バリアントとなります。一実施形態では、二本鎖CD16 SARの一方または両方の鎖の抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、Fv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンド、または受容体の細胞外ドメイン。
一実施形態では、二本鎖CD16 SARの両方の鎖が抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、二本鎖CD16 SARの鎖のうちの1つだけが抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、二本鎖CD16 SARの鎖の1つは、非天然抗原結合ドメイン(例えば、scFv、vL、vH、Fv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン)を含む。骨格、リガンド、または受容体の細胞外ドメイン)、第二の鎖は、CD16細胞外ドメインを介して抗体または抗体フラグメントのFc部分、または二重特異性/三重特異性エンゲージャーに結合します。
一実施形態では、二本鎖CD16 SARの一方の鎖は、vLドメインからなる抗原結合ドメインを含み、二本鎖CD16 SARの第2の鎖は、vHドメインからなる抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、二重鎖CD16 SARの両鎖は、同じクラス(すなわち、scFv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンドまたは受容体など)の抗原結合ドメインからなる。一実施形態では、二本鎖CD16 SARの各鎖は、vHHドメインを含む。一実施形態では、二本鎖CD16 SARの各鎖はFHVHドメインを含む。一実施形態では、二重鎖CD16 SARの両鎖は、異なるクラス(すなわち、scFv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンドまたは受容体など)の抗原結合ドメインからなる。例示的な実施形態では、二本鎖CD16 SARの一方の鎖は、vHHドメインに由来する抗原結合ドメインを含み、一方、第2の鎖は、FHVHドメインに由来する抗原結合ドメインを含む。
二本鎖CD16 SARの2つの鎖は、同じ抗原(例えば、CD19)または異なる抗原(例えば、CD19およびCD20)を標的とすることができる。二本鎖CD16 SARの2つの鎖は、単一抗原(例えばCD19)または2つの異なる抗原(例えばCD19およびCD20)の2つの異なるエピトープを標的とすることができる。二本鎖SARの各鎖は、1つの抗原または複数の抗原(例えば、2つ、3つ、4つなど)に結合し得る。二本鎖CD16 SARの各鎖は、アダプター(例えば、RZIP、EZIP、NKG2D-YA、NKG2D-FAなど)をさらに含み得る。
別の実施形態では、共刺激ドメインは、二本鎖CD16-SARのCD16鎖の一方または両方にも組み込まれる。例示的な共刺激ドメインには、41BB、CD28、OX40および2B4などの共刺激ドメインが含まれる(表30;配列番号(DNA):1565~1572および配列番号(PRT):3959~3966)。まとめると、上記の結果は、CAR の設計制限の一部を克服する養子細胞療法のための新しいプラットフォームを提供し、SAR への補完的なアプローチも提供します。
本明細書に記載されるCD16A-SARの2つの鎖は、単一のポリヌクレオチド鎖によってコードされ、単一のポリペプチド鎖に翻訳され、その後、異なるタンパク質に切断される。本明細書に記載されるCD16A-SARの2つの鎖は、2つの別個のプロモーターを使用して発現され、2つの別個のポリヌクレオチド鎖によってコードされ得る。本明細書に記載されるCD16A-SARの2つの鎖は、単一のベクターによってコードされ得る。本明細書に記載されるCD16A-SARの2つの鎖は、2つの異なるベクターによってコードされ得る。 CD16-SARをコードする核酸分子は、1つ以上のリーダー配列(シグナルペプチドとしても知られる)を含むことができる。一実施形態では、CD16A-SARの各機能単位(例えば、CD3z鎖に結合した抗原結合ドメインとフリン-SGSG切断可能なリンカー)は、次のようにCD16A-SARを細胞表面に向けるリーダー配列によって先行することができる。 I型膜貫通タンパク質。一実施形態では、CD16-SARの抗原結合ドメインは細胞外に面している。いくつかの実施形態では、リーダー配列は、配列番号31~34のいずれかの核酸配列および配列番号2425~2428のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、短い核酸配列(3~9個の核酸)含む制限酵素部位は、CD16A-SARの異なるサブユニット間、例えば、シグナル配列とCD16-SARの抗原結合ドメインの間、または抗原結合鎖とCD16鎖の間に位置する。
本開示の異なるSARSは、モジュール設計である。したがって、CD16A-F158V-FL-v1 (配列番号1415)およびCD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3 (配列番号1417)をコードする配列は、異なるシグナル伝達モジュールをコードする配列によって置き換えられ得る(表25)。例示的なそのようなモジュールとしては、CD16-F158V-D2TMCPv1(SEQ ID NO: 1450)、CD16-F158V-Hinge-TM-CP(SEQ ID NO: 1451)、NKp30-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1369)、NKp30-Hinge-TMCP-opt1(SEQ ID NO: 1370)、NKp44-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1382)、NKp44-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1383)、NKp46-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1395)、NKp46-Linker-Ig1-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1396)、NKp46-Ig1-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1397)、およびNKp46-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1398)、41BB-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1573)、CD28-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1575)、OX40-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1577)、2B4-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1579)、CD32-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1581)およびCD64-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1583)が挙げられる。CD16A-F158V-FL-v1およびCD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3モジュールの1つ以上が異なるシグナル伝達モジュールに置き換えられた例示的なSARSのSEQ ID NOは、仮出願の表33に示されている。
特定の実施形態において、本開示は、CD16の部分領域または全領域を組み込んだ2本の鎖を含む、CD16-SARと称される合成抗原受容体の新規なプラットフォームを提供する。
代替の実施形態において、本開示は、鎖の1つがCD16細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。本開示の二本鎖CD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16細胞外ドメイン配列は、配列番号(DNA):1496~1509および配列番号(PRT):3890~3903に提供される。一実施形態において、本開示は、鎖の一方がCD16ヒンジドメインの部分領域または全領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。本開示の二本鎖CD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16ヒンジドメイン配列は、配列番号(DNA):1545~1547および配列番号(PRT):3939~3941に提供される。一実施形態では、本開示は、鎖の1つがCD16膜貫通ドメインの部分的または全体の領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。本開示の二本鎖CD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16膜貫通配列は、配列番号(DNA):1528~1530および配列番号(PRT):3922~3924で提供される。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがCD16サイトゾルドメインの部分的または全体の領域を含む二重鎖CD16 SARを提供する。本開示のCD16-SARの構築に使用できる例示的なCD16膜貫通配列は、配列番号(DNA):1556~1558および配列番号(PRT):3950~3952で提供される。
本開示は、抗体のvLフラグメントをCD16鎖に結合させ、vHフラグメントをCD3z、FcRγ. NKp30、NKp44、NKp46、TCRα定数鎖、TCRβ定数鎖、TCRγ定数鎖またはTCRδ定数鎖などの別のシグナル伝達鎖に結合させることができることを提供する。あるいは、本開示は、抗体のvHフラグメントをCD16鎖に結合させ、vLフラグメントをCD3z、FcRγ、NKp30、NKp44、NKp46、TCRα定数鎖、TCRβ定数鎖、TCRγ定数鎖またはTCRδ定数鎖などの別のシグナル伝達鎖に結合させることができることを提供する。このような2つの鎖(例えば、vL- CD16とvH- CD3z)が同一細胞内で共発現すると、vL断片とvH断片は同族抗原と結合し、T細胞シグナルを伝達することができる。特に、そのようなCD16ヘロ二量体SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の例示的な実施形態では、このようなCD16-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露された場合、IL2産生を誘導し、NK細胞増殖を促進し、NK細胞活性化を促進し、または細胞毒性を発揮することができる。 CD16ヘテロ二量体SARの発現および活性は、vL/vHとCD16および他のシグナル伝達鎖(例えば、CD3z、FcRγ、NKp30、NKp44、NKp46など)との間にリンカーを組み込むことによってさらに増加させることができる。特に、IgCL(SEQ ID NO(DNA).1142およびSEQ ID NO (PRT): 3536)およびIgCHドメイン(SEQ ID NO (DNA): 抗体由来のIgCLドメイン(SEQ ID NO (DNA): 1143-1157 and SEQ ID NO (PRT): 3537-3551)は、vL/vHフラグメントとCD16フラグメントの間の有用なリンカーとして機能する。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
本開示の異なるSARSは、モジュール設計である。したがって、CD16A-F158V-FL-v1をコードする配列(配列番号1415)は、仮出願の表25に示される異なるシグナル伝達モジュールをコードする配列に置き換えることができる。例示的なそのようなモジュールとしては、CD16-F158V-D2TMCPv1(SEQ ID NO: 1450)、CD16-F158V-Hinge-TM-CP(SEQ ID NO: 1451)、NKp30-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1369)、NKp30-Hinge-TMCP-opt1(SEQ ID NO: 1370)、NKp44-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1382)、NKp44-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1383)、NKp46-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1395)、NKp46-Linker-Ig1-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1396)、NKp46-Ig1-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1397)、NKp46-Hinge-TM-CP-opt1(SEQ ID NO: 1398)、41BB-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1573)、CD28-ECDTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1575)、OX40-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1577)、2B4-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1579)、CD32-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1581)およびCD64-ECTTMCP-opt1(SEQ ID NO: 1583)。CD16A-F158V-FL-v1モジュールの1つ以上が異なるシグナル伝達モジュールに置き換えられた例示的なSARSのSEQ ID NOを表33に示す。
また、本明細書では、本明細書で企図され記載される編集の中でも特に、CD16 SARを含むように遺伝子操作されたクローンiPSCも提供される。一実施形態では、CD16 SARは、高親和性CD16 SARまたは高親和性非切断性CD16 SAR(hnCD16-SAR)である。遺伝子操作されたiPSCは、iPSCに導入されたCD16-SAR(例えば、高親和性CD16 SARまたはhnCD16-SAR)を含むエフェクター細胞に分化することができる。いくつかの実施形態では、CD16-SARを含む誘導エフェクター細胞はNK細胞である。いくつかの実施形態では、CD16-SARを含む誘導エフェクター細胞はT細胞である。一実施形態では、iPSCまたはその派生細胞において発現されるCD16-SAR(例えば、高親和性CD16 SARまたはhnCD16-SAR)は、ADCC抗体またはその断片だけでなく、二重特異性、三重特異性、または多重特異性にも結合する。前記CD16 SARのCD16またはCD64細胞外結合ドメインを認識するエンゲイジャーまたはバインダー。したがって、本出願は、誘導体エフェクター細胞上で発現されるCD16-SARの細胞外ドメインとの結合を介して、1つまたは複数の予め選択されたADCC抗体を予めロードされた、誘導体エフェクター細胞またはその細胞集団を提供する。状態、疾患の治療における治療的使用であって、前記CD16-SARが、CD64の細胞外結合ドメイン、またはFI76VおよびS197Pを有するCD16の細胞外結合ドメインを含む、方法。一実施形態では、CD16-SARの抗原結合ドメインは、AABD、scFv、Fv、受容体の細胞外ドメイン、リガンド、または別の非免疫グロブリン抗原結合モジュールを含む。一実施形態では、CD16-SARは、CD16またはCD64のFc結合ドメインのN末端またはその近くに結合した抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、CD16-SARは、 Fc結合ドメインのN末端にまたはその近くに結合された抗原結合ドメイン(例えば、AABD、例えば、FHVH、chVH、aVH、vHH、Darpin、セントチリン、アフィボディなど)をさらに含む。 CD16 または CD64 の。
いくつかの他の実施形態では、キメラFc-SAR(CFc SAR)は、非天然膜貫通ドメイン、非天然刺激ドメインおよび/または非天然シグナル伝達ドメインを含むように生成される。本明細書で使用される「非天然」または「非天然」という用語は、膜貫通ドメイン、刺激ドメイン、またはシグナル伝達ドメインが、細胞外ドメインを提供する受容体以外の異なる受容体に由来することを意味する。ここでの図では、CD16 またはその変異体に基づく CFc-SAR には、CD16 に由来する膜貫通ドメイン、刺激ドメイン、またはシグナル伝達ドメインがありません。いくつかの実施形態では、外因性CD16ベースのCFc-SARは、CD3D、CD3E、CD3G、CD3z、CD4、CD8、CD8a、CD8b、CD27、CD28、CD40、CD84、CD166、4-1BB、 0X40、ICOS、ICAM-1、CTLA-4、PD-1、LAG-3、2B4、BTLA、CD16、IL-7、IL12、IL15、KIR2DL4、KIR2DSI、MKp30、MKp44、NKp46、NKG2C、NKG2D、T細胞受容体ポリペプチド。いくつかの実施形態では、CD16ベースのCFc-SARは、CD27、CD28、4-1BB、OX40、ICOS、PD-1、LAG-3、2B4、BTLA、DAP10、DAP12、 CTLA-4、または NKG2D ポリペプチド。いくつかの実施形態では、外因性CD16ベースのCFc-SARは、CD3z、2B4、 DAP10、DAP12、DNAM1、CD137(41BB)、IL21、IL7、IL12、IL15、NKp30、NKp44、 NKp46、NKG2C、またはNKG2Dポリペプチド。 CD16-SARの一実施形態では、提供されるキメラ受容体は、両方ともIL7、IL12、IL15、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2C、およびNKG2Dポリペプチドの1つに由来する膜貫通ドメインおよびシグナル伝達ドメインを含む。 CD16ベースのCFc-SARの特定の一実施形態は、NKG2Dの膜貫通ドメイン、2B4の刺激ドメイン、およびCD3zのシグナル伝達ドメインを含む。 CD16の細胞外ドメインは、CD64またはCD16の細胞外ドメインの全長または部分配列に由来し、CD16の細胞外ドメインは、F176V(または158V)およびS197P(またはS197R)を含む。
CD16ベースのキメラFc-SARの別の実施形態は、CD3zの膜貫通ドメインおよびシグナル伝達ドメインを含む。ここで、CD16の細胞外ドメインは、CD64またはCD16の細胞外ドメインの全長または部分配列に由来し、CD16の細胞外ドメインはFI76VおよびS197Pを含む。一実施形態では、CD16キメラFc SARの抗原結合ドメインは、AABD(例えば、FHVH、vHHなど)、scFv、Fv、リガンド、受容体の細胞外ドメイン、または別の非免疫グロブリン抗原結合モジュールを含む。一実施形態では、CD16キメラFc SARは、CD16またはCD64のFc結合ドメインのN末端またはその近くに結合した抗原結合ドメインをさらに含む。一実施形態では、hnCD16-キメラFc SARは、 FcのN末端またはその近くに結合した抗原結合ドメイン(例えば、AABD、例えば、FHVH、chVH、aVH、vHH、Darpin、センチリン、アフィボディなど)をさらに含む。 CD16 または CD64 の結合ドメイン。
上述のCD16ベースのキメラFc SARの様々な実施形態は、抗体またはその断片のFc領域に結合することができる。または二重、三重、または多重特異性のエンゲージャーまたはバインダーの Fc 領域に対して。さらに、CD16ベースのキメラFc SARは、それらの抗原結合ドメインによって特定される抗原(すなわち、AABD、scFv、Fvなど)に結合することができる。したがって、BCMA-FHVHに基づく抗原結合ドメインを有するCD16ベースのキメラFc SARは、BCMAに結合する能力を有しつつ、抗体のFc領域に結合する可能性がある。結合すると、CD16-CFc SAR の刺激ドメインおよび/またはシグナル伝達ドメインは、エフェクター細胞の活性化およびサイトカイン分泌を可能にし、抗体またはその抗原結合ドメイン (例: AABD、 scFv 、 Fvなど)、またはFc領域だけでなく腫瘍抗原結合成分を有する前記二重特異性、三重特異性、または多重特異性エンゲージャーまたは結合剤。理論に制限されることなく、CD16 ベースのキメラ Fc 受容体の非天然の膜貫通ドメイン、刺激ドメインおよび/またはシグナル伝達ドメイン、または細胞外ドメインへのエンゲイジャー結合を通じて、CFc-SAR はエフェクター細胞の殺傷能力に寄与する可能性があります。エフェクター細胞の増殖および/または拡大の可能性を増加させます。抗体とエンゲージャーは、抗原を発現する腫瘍細胞とCFc-SARを発現するエフェクター細胞を近接させることができ、これは腫瘍細胞の死滅の促進にも寄与します。二重、三重、多重特異性エンゲージャーまたは結合剤の例示的な腫瘍抗原には、B7H3、BCMA、CD10、CD19、CD20、CD22、CD24、CD30、CD33、CD34、CD38、CD44、CD79a、 CD79b、CD123、CD138、CD179b、CEA、CLEC 12A、CS-1、DLL3、EGFR、EGFRvIII、EPCAM、FLT-3、FOLR1、FOLR3、GD2、gpA33、HER2、HM1.24、LGR5、MSLN、MCSP、MICA /B、PSMA、PAMA、P-カドヘリン、ROR1。腫瘍細胞を攻撃する際にCD16ベースのCFc-SARを発現するエフェクター細胞を関与させるのに適したいくつかの非限定的な例示的な二重、三重、多重特異性エンゲージャーまたはバインダーには、CD16(またはCD64)-CD30、CD16(またはCD64)-BCMA、 CD16 (または CD64)-IL15 -EPCAM、および CD16 (または CD64)-IL15-CD33。
誘導体NKにおける切断不可能なバージョンのCD16-SAR(hnCD16- SARなど)は、CD16の脱落を回避し、一定の発現を維持します。派生 NK 細胞では、非切断性 CD16-SAR により TNFa および CD107a の発現が増加し、細胞機能の向上が示されます。非切断性 CD16 はまた、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害 (ADCC)、および二重、三重、または多重特異性エンゲージャーの関与を強化します。 ADCC は、抗体でコーティングされた標的細胞への CD16 の結合を介した NK 細胞媒介溶解のメカニズムです。派生NK細胞に導入されたhnCD16-SARのさらなる高親和性特性により、細胞療法を必要とする対象に細胞を投与する前に、CD16を介してADCC抗体をNK細胞にin vitroでロードすることも可能になります。提供されるように、hnCD16-SARは、F176V(または158V)およびS197P(またはS197R)を含み得る。開示されるように、本出願はまた、状態、疾患、または感染症の治療における治療的使用に十分な量の1つまたは複数の予め選択されたADCC抗体が予め負荷された、派生NK細胞またはその細胞集団を提供する。
例えば、AABD、scFv、Fvなど)に結合した野生型CD16配列を含む。したがって、本開示のCD16-SARは、hnCD16または野生型CD16コード領域を含み得る。
一実施形態では、本開示のCD16-SARは、CD16またはその変異体の膜貫通ドメインおよび細胞内ドメインにインフレームで融合されたCD32またはCD64のFc結合領域を含む。例示的な実施形態では、そのようなCD16 SARにおける異なるモジュールの順序は、NH 2 からC末端まで以下を含み得る:
抗原結合ドメイン(n) - CD32 - Fc結合ドメイン - CD16膜貫通ドメイン - CD16 - 細胞内ドメイン;ここで、n = 1、2、3、またはそれ以上です。
例示的な実施形態では、そのようなCD16 SARにおける異なるモジュールの順序は、NH 2 からC末端まで以下を含み得る: ここで、n=1、2、3、またはそれ以上。
抗原結合ドメイン(n)-CD64-Fc結合ドメイン-CD16膜貫通ドメイン-CD16-細胞内ドメイン
CD64の細胞外ドメインとCD16の膜貫通ドメインおよび細胞内ドメインに融合したCD20 vHHドメインを含む例示的なCD20標的SAR構築物は、配列番号(DNA):2328および配列番号(PRT):4722によって表される。他の抗原を標的とするドメインは、CD20 vHHドメインを、異なる抗原を標的とする抗原結合ドメイン(例えば、scFv、vHH、FHVH、セントイリンなど)で置き換えることによって生成することができる。
初代NK細胞とは異なり、一次供給源(すなわち、末梢血、臍帯血、または他のドナー組織などの天然/天然供給源)由来の成熟T細胞はCD16を発現しません。外因性CD16-SAR構築物を発現する成熟T細胞がCD16 SARの細胞表面発現を示し、標的抗原発現細胞に曝露されたときに細胞シグナル(例えば、NFATシグナル伝達)を伝達できることは予想外であった。
また、発現された外因性 CD16-SAR を含む iPSC が T 細胞の発生生物学を損なわず、外因性 CD16-SAR を発現するだけでなく、獲得されたADCCメカニズム。派生T細胞におけるこの獲得されたADCCは、二重標的化のためのアプローチとして、および/またはCAR-T細胞療法で頻繁に起こる抗原逃避を救済するためのアプローチとしてさらに使用することができ、CAR-T標的抗原発現または発現の減少または喪失により腫瘍が再発する場合に使用することができる。 CAR (キメラ抗原受容体) による認識を避けるために、変異した抗原を除去します。前記派生T細胞が外因性CD16-SAR発現を介して獲得されたADCCを含む場合、および抗体がSARによって標的化される腫瘍抗原とは異なる腫瘍抗原を標的とする場合、抗体は、SAR-T抗原の回避をレスキューし、再発または再発を軽減または予防するために使用することができる。 CAR-T治療でよく見られる標的腫瘍の再発。二重標的化を達成しながら抗原逃避を低減および/または防止するこのような戦略は、1つまたは複数のSARを発現するNK細胞にも同様に適用可能である。
したがって、本開示は、外因性CD16-SARを含む派生T細胞を提供する。いくつかの実施形態では、CD16-SARは、CD16の野生型配列を含む。いくつかの実施形態では、派生T細胞に含まれるhnCD16は、F176V(158V)およびS197R(またはS197P)を含む。いくつかの他の実施形態では、派生T細胞に含まれるhnCD16は、CD64に由来する完全または部分的な細胞外ドメインを含むか、または非天然膜貫通ドメイン、刺激ドメインおよびシグナル伝達ドメインのうちの少なくとも1つをさらに含み得る。説明したように、このような派生 T 細胞は、ADCC によって媒介されるモノクローナル抗体で腫瘍を標的にし、抗体の治療効果を高める獲得機構を備えています。開示されるように、本出願はまた、状態、疾患、または感染症の治療における治療的使用に十分な量で、1つまたは複数の予め選択されたADCC抗体が予め負荷された、誘導T細胞またはその細胞集団を提供する。
初代NK細胞および初代T細胞に加えて、本開示のCD16 SARは不死化細胞株で発現させることができる。本開示のCD16 SARの発現に適した例示的な不死化細胞株には、NK92細胞株およびNK92MI細胞株が含まれる。さらに、本開示のCD16 SARは、多能性造血幹細胞(例えば、CD34+幹細胞)で発現させることができ、これを分化させて、異なる系統に属するCD16 SAR発現血液細胞を生成することができる。
特定の実施形態において、本開示は、NKp30鎖の全体または部分配列を含む、NKp30-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
NKp30 SARの構築に使用できるNKp30鎖の核酸配列は、配列番号1395~1414に提供される(仮出願の表25)。対応するアミノ酸配列をそれぞれ配列番号3789~3808に示す。
一実施形態において、本開示は、NKp30の部分領域または全体領域を含む単鎖NKp30 SARを提供する。代替の実施形態では、本開示は、NKp30細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む単鎖NKp30 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、NKp30ヒンジドメインの部分領域または全体領域を含むNKp30 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、NKp30膜貫通ドメインの部分領域または全体領域を含むNKp30 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、NKp30サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含むNKp30 SARを提供する。
一実施形態では、NKp30 SARは、NKp30ヒンジドメインを介してNKp30膜貫通ドメインおよびNKp30サイトゾルドメインに結合するNKp30 Igドメインを含む。一実施形態では、NKp30 SARは、NKp30膜貫通ドメインおよびNKp30サイトゾルドメインに結合したNKp30ヒンジドメインを含む。
SARの構築に使用され得る様々なNKp30ドメイン(すなわち、細胞外、Igドメイン、ヒンジ、膜貫通、およびサイトゾル)は、その配列全体または欠失変異体もしくは変異体を含み得ることが理解されるべきである。ドメインは、その機能的特性の少なくとも一部を保持します。
一実施形態では、NKp30 SARの抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、Fv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンドまたは受容体を含む。単鎖SARの鎖は、1つの抗原または複数の抗原(例えば、2つ、3つ、4つなど)に結合し得る。単鎖NKp30 SARの鎖は、1つまたは複数のアダプター(例えば、RZIP、EZIP、NKG2D-YA、NKG2D-FAなど)をさらに含み得る。
開示のNKp30 SARは、一般式:
AABD(n)-任意のNKp30 Igドメイン、NKp30ヒンジドメイン-NKp30膜貫通ドメイン-任意の細胞内共刺激ドメイン(n)-NKp30細胞内シグナル伝達ドメイン(nは1以上)。一実施形態では、nは少なくとも2、例えば2、3、4または5である。AABD(自律抗原結合ドメイン)は、抗原結合ドメインを形成し、細胞内で発現される場合には細胞外側に位置する。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHドメインまたはヒト化vHドメインである。一実施形態では、AABDは、完全ヒト単一VH(SVH)ドメインまたはヒト化SVHドメインである。 SVH ドメインは自律 vH ドメインとしても知られ、vL ドメインが存在しない場合でもターゲットに結合できます。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHHドメインまたはヒト化vHHドメインである。
は、DARPIN、アフィボディ、ZIPドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、R4など)、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディなどの非免疫グロブリン抗原結合足場である。 、レペボディ、ファイノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、またはその断片;受容体(例えば、NKp30、CD16-F158V、NKG2D)、リガンド(例えば、APRIL、トロンボポエチン)など。
開示のNKp30 SARは、一般式:
scFv(n)-NKp30 Igドメイン-NKp30ヒンジドメイン-NKp30膜貫通ドメイン-任意の-細胞内共刺激ドメイン(n)-任意のNKp30細胞内シグナル伝達ドメイン、ここで、nは1以上である。特定の実施形態において、本開示は、2つのNKp30鎖の全体または部分配列を含む、NKp30-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
本開示は、抗体のvLフラグメントが2つのNKp30鎖のうちの1つに結合することができ、vHフラグメントが他のNKp30鎖に結合することができることを規定する。このような2つの鎖(例えば、 vL-NKp30およびvH-NKp30)が同じ細胞内で共発現される場合、vLおよびvHフラグメントはそれらの同族抗原に結合し、T、NK細胞またはマクロファージシグナルを伝達することができる。特に、このようなNKp30-SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の実施形態では、このようなNKp30-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NK細胞の増殖を促進し、NK細胞の活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。 NKp30-SAR の発現と活性は、vL/vH フラグメントと NKP30 フラグメントの間にリンカーを組み込むことによってさらに高めることができます。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと NKp30 フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
別の実施形態では、共刺激ドメインもNKp30-SARのNKp30鎖に組み込まれる。例示的な共刺激ドメインには、41BB、CD28、OX40および2B4などの共刺激ドメインが含まれる(表30;配列番号(DNA):1565~1572および配列番号(PRT):3959~3966)。まとめると、上記の結果は、SAR の設計制限の一部を克服する養子細胞療法のための新しいプラットフォームを提供し、SAR への補完的なアプローチも提供します。
本明細書に記載されるNKp30-SARの2つの鎖は、単一のポリヌクレオチド鎖によってコードされ、単一のポリペプチド鎖に翻訳され、その後、異なるタンパク質に切断される。本明細書に記載されるNKp30-SARの2つの鎖は、2つの別個のプロモーターを使用して発現され、2つの別個のポリヌクレオチド鎖によってコードされ得る。本明細書に記載されるNKp30-SARの2つの鎖は、単一のベクターによってコードされ得る。本明細書に記載されるNKp30-SARの2つの鎖は、2つの異なるベクターによってコードされ得る。 NKp30-SARをコードする核酸分子は、1つまたは複数のリーダー配列(シグナルペプチドとしても知られる)を含むことができる。一実施形態では、NKp30-SARの各機能単位(例えば、CD3z鎖に結合した抗原結合ドメインとフリン-SGSGで切断可能なリンカー)は、NKp30-SARを細胞表面に向けるリーダー配列によって先行することができる。 I型膜貫通タンパク質。一実施形態では、NKp30-SARの抗原結合ドメインは細胞外に面している。いくつかの実施形態では、リーダー配列は、配列番号31~34のいずれかの核酸配列および配列番号2425~2428のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、短い核酸配列(3~9個の核酸)制限酵素部位を含む制限酵素部位は、NKp30-SARの異なるサブユニット間、例えば、シグナル配列とNKp30-SARの抗原結合ドメインの間、または抗原結合とNKp30鎖の間に位置する。
特定の実施形態において、本開示は、2つの鎖を含み、そのうちの1つがNKp30の部分領域または全体領域を組み込む、NKp30-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
代替の実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp30細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む二重鎖NKp30 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp30ヒンジドメインの部分的または全体の領域を含む、二本鎖NKp30 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp30膜貫通ドメインの部分的または全体の領域を含む、二重鎖NKp30 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp30サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含む二重鎖NKp30 SARを提供する。
本開示は、抗体のvL断片をNKp30鎖に結合させることができ、vH断片をCD3z、FcRγなどの別のシグナル伝達鎖に結合させることができることを規定する。 CD16、NKp44、NKp46、TCRα定常鎖、TCRβ定常鎖、TCRγ定常鎖、またはTCRδ定常鎖など。あるいは、本開示は、抗体のvHフラグメントをNKp30鎖に結合させることができ、vLフラグメントをNKp30鎖に結合させることができることを提供する。別のシグナル伝達鎖、例えばCD3z、FcRγ、CD16、NKp44、NKp46、TCRα定常鎖、TCRβ定常鎖、TCRγ定常鎖またはTCRδ定常鎖など。2つのそのような鎖(例えば、vL-NKp30およびvH-CD3z )が存在する場合同じ細胞内で共発現すると、vL フラグメントと vH フラグメントはそれらの同族抗原に結合し、T 細胞シグナルを伝達することができます。特に、そのようなNKp30ヘロ二量体SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の例示的な実施形態では、このようなNKp30-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、IL2産生を誘導し、NK細胞増殖を促進し、NK細胞活性化を促進し、または細胞毒性を発揮することができる。 NKp30ヘテロ二量体SARの発現および活性は、vL/vHとNKp30および他のシグナル伝達鎖(例えば、CD3z、FcRγ、NKp30、NKp44、NKp46など)との間にリンカーを組み込むことによってさらに増加させることができる。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと NKp30 フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。
特定の実施形態において、本開示は、NKp44鎖の全体または部分配列を含む、NKp44-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。NKp44 SARの構築に使用できるNKp44鎖の核酸配列は、対応するアミノ酸配列は、それぞれ配列番号3775~3788に示される。
一実施形態では、本開示は、NKp44の部分領域または全体領域を含む単鎖NKp44 SARを提供する。代替の実施形態では、本開示は、NKp44細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む単鎖NKp44 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、NKp44ヒンジドメインの部分領域または全体領域を含むNKp44 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、NKp44膜貫通ドメインの部分領域または全体領域を含むNKp44 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、NKp44サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含むNKp44 SARを提供する。
一実施形態では、NKp44 SARは、NKp44ヒンジドメインを介してNKp44膜貫通ドメインおよびNKp44サイトゾルドメインに結合するNKp44 Igドメインを含む。一実施形態では、NKp44 SARは、NKp44膜貫通ドメインおよびNKp44サイトゾルドメインに結合したNKp44ヒンジドメインを含む。
SARの構築に使用され得る様々なNKp44ドメイン(すなわち、細胞外、Igドメイン、ヒンジ、膜貫通、およびサイトゾル)は、その配列全体または欠失変異体もしくは変異体を含み得ることが理解されるべきである。ドメインは、その機能的特性の少なくとも一部を保持します。
一実施形態では、NKp44 SARの抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、Fv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンドまたは受容体を含む。単鎖SARの鎖は、1つの抗原または複数の抗原(例えば、2つ、3つ、4つなど)に結合し得る。単鎖NKp44 SARの鎖は、1つまたは複数のアダプター(例えば、RZIP、EZIP、NKG2D-YA、NKG2D-FAなど)をさらに含み得る。
開示のNKp44 SARは、一般式:
AABD(n)-任意のNKp44 Igドメイン、NKp44ヒンジドメイン-NKp44膜貫通ドメイン-任意の細胞内共刺激ドメイン(n)-NKp44細胞内シグナル伝達ドメイン、nは1以上。一実施形態では、nは少なくとも2、例えば2、3、4または5である。AABD(自律抗原結合ドメイン)は、抗原結合ドメインを形成し、細胞内で発現される場合には細胞外側に位置する。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHドメインまたはヒト化vHドメインである。一実施形態では、AABDは、完全ヒト単一VH(SVH)ドメインまたはヒト化SVHドメインである。 SVH ドメインは自律 vH ドメインとしても知られ、vL ドメインが存在しない場合でもターゲットに結合できます。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHHドメインまたはヒト化vHHドメインである。
は、DARPIN、アフィボディ、ZIPドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、R4など)、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディなどの非免疫グロブリン抗原結合足場である。 、レペボディ、ファイノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、またはその断片;受容体(例えば、NKp44、NKG2D)、リガンド(例えば、APRIL、トロンボポエチン)など。
本開示のNKp44 SARは、一般式:
scFv(n)-NKp44 Igドメイン-NKp44ヒンジドメイン-NKp44膜貫通ドメイン-任意の-細胞内共刺激ドメイン(n)-任意のNKp44細胞内シグナル伝達ドメイン、ここで、nは1以上である。
特定の実施形態において、本開示は、2つのNKp44鎖の全体または部分配列を含む、NKp44-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。本開示は、抗体のvLフラグメントが2つのNKp44鎖の一方に結合することができ、vHフラグメントが他方のNKp44鎖に結合できることを規定する。このような2つの鎖(例えば、 vL-NKp44およびvH-NKp44)が同じ細胞内で共発現される場合、vLおよびvHフラグメントはそれらの同族抗原に結合し、TまたはNK細胞シグナルを伝達することができる。特に、このようなNKp44-SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の実施形態では、このようなNKp44-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、 NK細胞の増殖を促進し、NK細胞の活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。 NKp44-SAR の発現と活性は、vL/vH フラグメントと NKP30 フラグメントの間にリンカーを組み込むことによってさらに高めることができます。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと NKp44 フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
別の実施形態では、共刺激ドメインもNKp44-SARのNKp44鎖に組み込まれる。例示的な共刺激ドメインには、41BB、CD28、OX40および2B4などの共刺激ドメインが含まれる(表30;配列番号(DNA):1565~1572および配列番号(PRT):3959~3966)。まとめると、上記の結果は、SAR の設計制限の一部を克服する養子細胞療法のための新しいプラットフォームを提供し、SAR への補完的なアプローチも提供します。
本明細書に記載されるNKp44-SARの2つの鎖は、単一のポリヌクレオチド鎖によってコードされ、単一のポリペプチド鎖に翻訳され、その後、異なるタンパク質に切断される。本明細書に記載されるNKp44-SARの2つの鎖は、2つの別個のプロモーターを使用して発現され、2つの別個のポリヌクレオチド鎖によってコードされ得る。本明細書に記載されるNKp44-SARの2つの鎖は、単一のベクターによってコードされ得る。本明細書に記載されるNKp44-SARの2つの鎖は、2つの異なるベクターによってコードされ得る。 NKp44-SARをコードする核酸分子は、1つまたは複数のリーダー配列(シグナルペプチドとしても知られる)を含むことができる。一実施形態では、NKp44-SARの各機能単位(例えば、CD3z鎖に結合した抗原結合ドメインとフリン-SGSG切断可能なリンカー)は、NKp44-SARを細胞表面に向けるリーダー配列によって先行することができる。 I型膜貫通タンパク質。一実施形態では、NKp44-SARの抗原結合ドメインは細胞外に面している。いくつかの実施形態では、リーダー配列は、配列番号31~34のいずれかの核酸配列および配列番号2425~2428のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、短い核酸配列(3~9個の核酸)制限酵素部位を含むものは、NKp44-SARの異なるサブユニット間、例えばシグナル配列とNKp44-SARの抗原結合ドメインの間、または抗原結合とNKp44鎖の間に位置する。
特定の実施形態において、本開示は、2つの鎖を含み、そのうちの1つがNKp44の部分領域または全体領域を組み込む、NKp44-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
代替の実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp44細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む、二重鎖NKp44 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp44ヒンジドメインの部分的または全体の領域を含む、二本鎖NKp44 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp44膜貫通ドメインの部分的または全体の領域を含む、二重鎖NKp44 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp44サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含む二重鎖NKp44 SARを提供する。
本開示は、抗体のvL断片をNKp44鎖に結合させることができ、vH断片をCD3z、FcRγなどの別のシグナル伝達鎖に結合させることができることを規定する。 CD16、NKp30、NKp46、TCRα定常鎖、TCRβ定常鎖、TCRγ定常鎖、またはTCRδ定常鎖など。あるいは、本開示は、抗体のvHフラグメントをNKp44鎖に結合させることができ、vLフラグメントをNKp44鎖に結合させることができることを提供する。別のシグナル伝達鎖、例えばCD3z、FcRγ、CD16、NKp30、NKp46、TCRα定常鎖、TCRβ定常鎖、TCRγ定常鎖またはTCRδ定常鎖など。2つのそのような鎖(例えば、vL-NKp44およびvH-CD3z )が存在する場合同じ細胞内で共発現すると、vL フラグメントと vH フラグメントはそれらの同族抗原に結合し、T 細胞シグナルを伝達することができます。特に、このようなNKp44ヘロ二量体SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の例示的な実施形態では、このようなNKp44-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、IL2産生を誘導し、NK細胞増殖を促進し、NK細胞活性化を促進し、または細胞毒性を発揮することができる。 NKp44ヘテロ二量体SARの発現および活性は、vL/vHとNKp44および他のシグナル伝達鎖(例えば、CD3z、FcRγ、NKp44、NKp44、NKp46など)との間にリンカーを組み込むことによってさらに増加させることができる。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと NKp44 フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
特定の実施形態において、本開示は、NKp46鎖の全体または部分配列を含む、NKp46-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
NKp46 SARの構築に使用できるNKp46鎖の核酸配列を配列番号1381~1394に示す(表25)。対応するアミノ酸配列をそれぞれ配列番号3775~3788に示す(表25)。
一実施形態において、本開示は、NKp46の部分領域または全体領域を含む単鎖NKp46 SARを提供する。代替の実施形態では、本開示は、NKp46細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む単鎖NKp46 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、NKp46ヒンジドメインの部分領域または全体領域を含むNKp46 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、NKp46膜貫通ドメインの部分領域または全体領域を含むNKp46 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、NKp46サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含むNKp46 SARを提供する。
一実施形態では、NKp46 SARは、NKp46ヒンジドメインを介してNKp46膜貫通ドメインおよびNKp46サイトゾルドメインに結合するNKp46 Igドメインを含む。一実施形態では、NKp46 SARは、NKp46膜貫通ドメインおよびNKp46サイトゾルドメインに結合したNKp46ヒンジドメインを含む。
SARの構築に使用され得る様々なNKp46ドメイン(すなわち、細胞外、Igドメイン、ヒンジ、膜貫通、およびサイトゾル)は、その配列全体または欠失変異体もしくは変異体を含み得ることが理解されるべきである。ドメインは、その機能的特性の少なくとも一部を保持します。
一実施形態では、NKp46 SARの抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、Fv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンドまたは受容体を含む。単鎖SARの鎖は、1つの抗原または複数の抗原(例えば、2つ、3つ、4つなど)に結合し得る。単鎖NKp46 SARの鎖は、1つまたは複数のアダプター(例えば、RZIP、EZIP、NKG2D-YA、NKG2D-FAなど)をさらに含み得る。
開示のNKp46 SARは、一般式:
AABD(n)-任意のNKp46 Igドメイン、NKp46ヒンジドメイン-NKp46膜貫通ドメイン-任意の細胞内共刺激ドメイン(n)-NKp46細胞内シグナル伝達ドメイン(nは1以上)。一実施形態では、nは少なくとも2、例えば2、3、4または5である。AABD(自律抗原結合ドメイン)は、抗原結合ドメインを形成し、細胞内で発現される場合には細胞外側に位置する。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHドメインまたはヒト化vHドメインである。一実施形態では、AABDは、完全ヒト単一VH(SVH)ドメインまたはヒト化SVHドメインである。 SVH ドメインは自律 vH ドメインとしても知られ、vL ドメインが存在しない場合でもターゲットに結合できます。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHHドメインまたはヒト化vHHドメインである。
は、DARPIN、アフィボディ、ZIPドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、R4など)、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディなどの非免疫グロブリン抗原結合足場である。 、レペボディ、ファイノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、またはその断片;受容体(例えば、NKp46、NKG2D)、リガンド(例えば、APRIL、トロンボポエチン)など。
開示のNKp46 SARは、一般式:
scFv(n)-NKp46 Igドメイン-NKp46ヒンジドメイン-NKp46膜貫通ドメイン-任意の-細胞内共刺激ドメイン(n)-任意のNKp46細胞内シグナル伝達ドメイン、ここで、nは1以上である。
特定の実施形態では、本開示は、2つのNKp46鎖の全体または部分配列を含む、NKp46-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。本開示は、抗体のvLフラグメントが2つのNKp46鎖のうちの1つに結合することができ、vHフラグメントが他のNKp46鎖に結合することができることを規定する。このような2つの鎖(例えば、 vL-NKp46およびvH-NKp46)が同じ細胞内で共発現される場合、vLおよびvHフラグメントはそれらの同族抗原に結合し、TまたはNK細胞シグナルを伝達することができる。特に、そのようなNKp46-SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の実施形態では、このようなNKp46-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NK細胞の増殖を促進し、NK細胞の活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。 NKp46-SAR の発現と活性は、vL/vH フラグメントと NKP30 フラグメントの間にリンカーを組み込むことによってさらに高めることができます。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと NKp46 フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
別の実施形態では、共刺激ドメインもNKp46-SARのNKp46鎖に組み込まれる。例示的な共刺激ドメインには、41BB、CD28、OX40および2B4などの共刺激ドメインが含まれる(表30;配列番号(DNA):1565~1572および配列番号(PRT):3959~3966)。まとめると、上記の結果は、SAR の設計制限の一部を克服する養子細胞療法のための新しいプラットフォームを提供し、SAR への補完的なアプローチも提供します。
本明細書に記載されるNKp46-SARの2つの鎖は、単一のポリヌクレオチド鎖によってコードされ、単一のポリペプチド鎖に翻訳され、その後、異なるタンパク質に切断される。本明細書に記載されるNKp46-SARの2つの鎖は、2つの別個のプロモーターを使用して発現され、2つの別個のポリヌクレオチド鎖によってコードされ得る。本明細書に記載されるNKp46-SARの2つの鎖は、単一のベクターによってコードされ得る。本明細書に記載されるNKp46-SARの2つの鎖は、2つの異なるベクターによってコードされ得る。 NKp46-SARをコードする核酸分子は、1つまたは複数のリーダー配列(シグナルペプチドとしても知られる)を含むことができる。一実施形態では、NKp46-SARの各機能単位(例えば、CD3z鎖に結合した抗原結合ドメインとフリン-SGSGで切断可能なリンカー)は、NKp46-SARを細胞表面に向けるリーダー配列によって先行することができる。 I型膜貫通タンパク質。一実施形態では、NKp46-SARの抗原結合ドメインは細胞外に面している。いくつかの実施形態では、リーダー配列は、配列番号31~34のいずれかの核酸配列および配列番号2425~2428のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、短い核酸配列(3~9個の核酸)を含む制限酵素部位は、NKp46-SARの異なるサブユニット間、例えば、シグナル配列とNKp46-SARの抗原結合ドメインとの間、または抗原結合とNKp46鎖との間に位置する。
特定の実施形態において、本開示は、2つの鎖を含み、そのうちの1つがNKp46の部分領域または全体領域を組み込む、NKp46-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
代替の実施形態では、本開示は、鎖の1つがNKp46細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む二重鎖NKp46 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp46ヒンジドメインの部分的または全体の領域を含む、二本鎖NKp46 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp46膜貫通ドメインの部分的または全体の領域を含む、二重鎖NKp46 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、鎖の1つがNKp46サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含む、二重鎖NKp46 SARを提供する。
本開示は、抗体のvL断片をNKp46鎖に結合させることができ、vH断片をCD3z、FcRγなどの別のシグナル伝達鎖に結合させることができることを規定する。 CD16、NKp30、NKp44、TCRα定常鎖、TCRβ定常鎖、TCRγ定常鎖、またはTCRδ定常鎖など。あるいは、本開示は、抗体のvHフラグメントをNKp46鎖に結合させることができ、vLフラグメントをNKp46鎖に結合させることができることを提供する。別のシグナル伝達鎖、例えば、CD3z、FcRγ、CD16、NKp30、NKp44、TCRα定常鎖、TCRβ定常鎖、TCRγ定常鎖またはTCRδ定常鎖など。このような2つの鎖(例えば、vL-NKp46およびvH-CD3z)が存在する場合、同じ細胞内で共発現すると、vL フラグメントと vH フラグメントはそれらの同族抗原に結合し、T 細胞シグナルを伝達することができます。特に、そのようなNKp46ヘロ二量体SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の例示的な実施形態では、このようなNKp46-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、IL2産生を誘導し、NK細胞増殖を促進し、NK細胞活性化を促進し、または細胞毒性を発揮することができる。 NKp46ヘテロ二量体SARの発現および活性は、vL/vHとNKp46および他のシグナル伝達鎖(例えば、CD3z、FcRγ、NKp46、NKp46、NKp46など)との間にリンカーを組み込むことによってさらに増加させることができる。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと NKp46 フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。
本開示はまた、共刺激受容体(配列番号9860~9993)を含む他のNK受容体の細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインに基づくSARを提供する。 SAR はモジュール形式であるため、これらのコンストラクト内の CD19 を標的とする hu-mROO5-scFv を表 3~7 に記載の他の抗原結合ドメインと切り替えて、新規の単一特異性および二重特異性 SAR を生成できます。
NKG2D は、N 末端が細胞内に位置する II 型タンパク質です。 NKG2Dの断片に基づくCARは当該技術分野で記載されているが、それらはNKG2Dのサイトゾルドメインおよび膜貫通ドメインの天然の構成を欠いている。本開示は、1つ以上の抗原結合ドメイン(例えば、AABD、scFv)を含むポリペプチドのN末端が、N末端からC末端まで細胞内ドメイン、膜貫通ドメイン、およびドメインドメインを含むポリペプチドにインフレームで融合されているSARを提供する。オプションのリンカーを介したNKG2DまたはII型膜タンパク質の細胞外ドメイン。このような構築物の概略図を図12に示す。そのようなSARの例を配列番号7686~7687に示す。さらに、 ATG開始コドンを有するアダプター(例えば、CD3z)のサイトゾルドメインのN末端をNKG2DのN末端に融合して、SARに活性化ドメインを提供することができる。本開示はまた、抗原結合ドメインのN末端ドメインがNKG2C、NKG2A、NKG2EおよびNKG2F受容体の細胞外ドメインに融合されているSARを提供する。このスキームを使用して、抗原結合ドメインを含むI型タンパク質を含む任意のI型タンパク質とII型タンパク質との間の融合タンパク質を生成することができる。このスキームは、II型受容体のヒンジ、膜貫通、およびサイトゾルドメインのみを含み、その細胞外ドメインを欠く融合を生成するために使用することもできる。
最後に、本開示は、1つの抗原結合ドメインが1つの受容体鎖のC末端に結合し、第2の抗原結合ドメインが第2の受容体鎖のC末端に結合する、II型タンパク質に基づくヘテロ二量体SARを生成する方法も提供する。ヘテロ二量体鎖。 NKG2EおよびCD94を含むそのような受容体の例は、配列番号10341に提供される。
特定の実施形態において、本開示は、2つのCD3z鎖に由来する部分配列または全体配列を含む合成抗原受容体の新規プラットフォームが、NK細胞、NK92細胞株、単球/マクロファージおよび好中球などの免疫細胞において機能的に発現され得ることを提供する。内在性 TCR 鎖が欠如しています。特定の実施形態では、本開示は、iPSC細胞、胚性幹細胞、または造血幹細胞において発現することができ、分化して免疫細胞を生成することができる、2つのCD3z鎖に由来する部分的または全体の配列を含む、SARの新規プラットフォームを提供する。 zSAR を発現する NK 細胞、単球/マクロファージ、好中球など。 zSARの構築に使用できる例示的なCD3z鎖の核酸配列は、配列番号1090および1096に提供される。対応するアミノ酸配列は、それぞれ配列番号3484および3490に提供される。本開示は、抗体のvLフラグメントが2つのCD3z鎖のうちの1つに結合することができ、vHフラグメントが他のCD3z鎖に結合できることを規定する。このような2つの鎖(例えば、 vL-CD3zおよびvH-CD3z)が同じ細胞内で共発現される場合、vLおよびvHフラグメントはそれらの同族抗原に結合し、T細胞シグナルを伝達することができる。特に、そのようなzSARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、増殖、活性化の増加を示し、細胞毒性を発揮する可能性がある。 zSAR の発現と活性は、vL/vH フラグメントと CD3z フラグメントの間にリンカーを組み込むことによってさらに高めることができます。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと CD3z フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
別の実施形態では、共刺激ドメインもzSARのCD3z鎖に組み込まれる。例示的な共刺激ドメインには、41BBおよびCD28の共刺激ドメインが含まれる。 41BBおよびCD28共刺激ドメインを含むCD3z鎖は、それぞれ配列番号1100、1102、および1099および1101に示されている。 41BBおよびCD28共刺激ドメインの代わりに使用できる他の例示的な共刺激ドメイン(例えば、OX40および2B4)は、仮出願の表30に提供される。まとめると、上記の結果は、CAR の設計制限の一部を克服する養子細胞療法のための新しいプラットフォームを提供し、SIR への補完的なアプローチも提供します。
本明細書に記載されるzSARの2つの鎖は、単一のポリヌクレオチド鎖によってコードされ、単一のポリペプチド鎖に翻訳され、その後、異なるタンパク質に切断される。本明細書に記載されるzSARの2つの鎖は、2つの別個のプロモーターを使用して発現され、2つの別個のポリヌクレオチド鎖によってコードされ得る。本明細書に記載されるzSARの2つの鎖は、単一のベクターによってコードされ得る。本明細書に記載されるzSARの2つの鎖は、2つの異なるベクターによってコードされ得る。 zSARをコードする核酸分子は、1つまたは複数のリーダー配列(シグナルペプチドとしても知られる)を含むことができる。一実施形態では、zSARの各機能単位(例えば、CD3z鎖に結合した抗原結合ドメインとフリン-SGSG切断可能なリンカー)は、zSARをI型膜貫通として細胞表面に導くリーダー配列によって先行され得る。タンパク質。一実施形態では、zSARの抗原結合ドメインは細胞外に面している。いくつかの実施形態では、リーダー配列は、配列番号31~34のいずれかの核酸配列および配列番号2425~2428のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、短い核酸配列(3~9個の核酸)を含む制限酵素部位は、zSARの異なるサブユニット間、例えばシグナル配列とzSARの抗原結合ドメインの間、または抗原結合鎖とCD3z鎖の間に位置する。
例えば、NK細胞、単球/マクロファージ、好中球、NK92細胞株など)または免疫を生じさせることができる幹細胞(例えば、iPSC、造血幹細胞など)において発現され得るCD19を標的とする。細胞は CD8SP-hu-mROO5-1-vL-IgCL-Bam-CD3zECDTMCP-opt-F-P2A-Spe-SP-Bst-hu-mROO5-1-vH-IgG1-CH1-KPN-CD3zECDTMCP (配列番号2306) 。 NK細胞において機能的に発現され得るCD19を標的とするさらなる例示的なzSARを配列番号(DNA):2287~2291に示す。
本開示はまた、TCRのVa、b、g、dドメインが抗原結合ドメインとして使用されるzSARを提供する。このような SAR は、uTCR-SAR のように機能します。
zSARの一方または両方のCD3ドメインを、DAP10、DAP12もしくはFcRγまたはその断片もしくは変異体などの他のシグナル伝達アダプターで置換して、これらのアダプターを含む新規SARを生成することができる。
本開示は、DAP10(配列番号(DNA):1349~1350)の部分領域または全体領域を含む単鎖、二本鎖、および二本鎖ヘテロ二量体SARを提供する。本開示の例示的な単鎖、二本鎖、および二本鎖ヘテロ二量体DAP10 SARは、仮出願の表32および表33に提供される。 。
一実施形態では、本開示は、DAP10の部分領域または全体領域を含む単鎖DAP10 SARを提供する。代替の実施形態では、本開示は、CD16細胞外ドメインの部分的または全体の領域を含む単鎖DAP10 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、DAP10膜貫通ドメインの部分領域または全体領域を含むDAP10 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、DAP10サイトゾルドメインの部分領域または全体領域を含むDAP10 SARを提供する。 DAP10を含む例示的なSARSは、CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn-G4S-EcoR1-Xho-DAP10-opt1-F-P2A-SpeXba-PACであり、配列番号(DNA):2002および配列番号( PRT): 4396。
一実施形態において、本開示は、活性化ドメインをコードする配列にそのC末端でインフレームで融合されたDAP10の部分的または全体的領域を含む単鎖DAP10 SARを提供する。一実施形態では、活性化ドメインは、CD3zのサイトゾルドメイン(配列番号(DNA):1562~1564および配列番号(PRT):3956~3958)に由来する。 CD3z活性化ドメインに融合されたDAP10を含む例示的なSARSは、CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn-G4S-EcoR1-Xho-DAP10-opt1-Spe-CD3zCP-opt1-F-P2A-SpeXba-PAC(配列番号(DNA))である。 ):2037および配列番号(PRT):4431)。
SARの構築に使用され得る異なるDAP10ドメインは、ドメインがその機能的特性の少なくとも一部を保持する限り、その全配列、欠失変異体もしくは変異体を含み得ることが理解されるべきである。
一実施形態では、DAP10 SARの抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、Fv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンドまたは受容体を含む。単鎖SARの鎖は、1つの抗原または複数の抗原(例えば、2つ、3つ、4つなど)に結合し得る。単鎖CD16 SARの鎖は、1つまたは複数のアダプター(例えば、RZIP、EZIP、NKG2D-YA、NKG2D-FAなど)をさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、本開示のDAP10 SARは、一般式:
AABD(n)-DAP10ヒンジドメイン-DAP10膜貫通ドメイン-DAP10-細胞内シグナル伝達ドメイン-任意の活性化ドメイン(nは1以上である)。一実施形態では、nは少なくとも2、例えば2、3、4または5である。AABD(自律抗原結合ドメイン)は、抗原結合ドメインを形成し、細胞内で発現される場合には細胞外側に位置する。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHドメインまたはヒト化vHドメインである。一実施形態では、AABDは、完全ヒト単一VH(SVH)ドメインまたはヒト化SVHドメインである。 SVH ドメインは自律 vH ドメインとしても知られ、vL ドメインが存在しない場合でもターゲットに結合できます。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHHドメインまたはヒト化vHHドメインである。
は、DARPIN、アフィボディ、ZIPドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、R4など)、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディなどの非免疫グロブリン抗原結合足場である。 、レペボディ、ファイノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、またはその断片;受容体(例えば、CD16-F158V、NKG2D)、リガンド(例えば、APRIL、トロンボポエチン)など。
特定の実施形態において、本開示は、2つのDAP10鎖を含む、DAP10-SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。本開示は、抗体のvLフラグメントが2つのDAP10鎖のうちの1つに結合することができ、vHフラグメントが他のDAP10鎖に結合できることを規定する。このような2つの鎖(例えば、 vL-DAP10およびvH-DAP10)が同じ細胞内で共発現される場合、vLおよびvH断片はそれらの同族抗原に結合し、T細胞シグナルを伝達することができる。特に、そのようなDAP10-SARを発現するT細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NFATシグナル伝達を活性化し、IL2産生を誘導し、T細胞増殖を促進し、T細胞活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。別の実施形態では、このようなDAP10-SARを発現するNK細胞は、同族標的抗原を発現する細胞株に曝露されると、NK細胞の増殖を促進し、NK細胞の活性化を促進し、細胞毒性を発揮することができる。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH フラグメントと DAP10 フラグメントの間の有用なリンカーとして機能します。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、表13;配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
別の実施形態では、共刺激ドメインもDAP10-SARのDAP10鎖に組み込まれる。例示的な共刺激ドメインには、41BB、CD28、OX40および2B4などの共刺激ドメインが含まれる(表30;配列番号(DNA):1565~1572および配列番号(PRT):3959~3966)。まとめると、上記の結果は、SAR の設計制限の一部を克服する養子細胞療法のための新しいプラットフォームを提供し、SAR への補完的なアプローチも提供します。
本明細書に記載されるDAP10-SARの2つの鎖は、単一のポリヌクレオチド鎖によってコードされ、単一のポリペプチド鎖に翻訳され、その後、異なるタンパク質に切断される。本明細書に記載されるDAP10-SARの2つの鎖は、2つの別個のプロモーターを使用して発現され、2つの別個のポリヌクレオチド鎖によってコードされ得る。本明細書に記載されるDAP10-SARの2つの鎖は、単一のベクターによってコードされ得る。本明細書に記載されるDAP10-SARの2つの鎖は、2つの異なるベクターによってコードされ得る。 DAP10-SARをコードする核酸分子は、1つまたは複数のリーダー配列(シグナルペプチドとしても知られる)を含むことができる。一実施形態では、DAP10-SARの各機能単位(例えば、CD3z鎖に結合した抗原結合ドメインとフリン-SGSGで切断可能なリンカー)は、DAP10-SARを細胞表面に導くリーダー配列によって先行することができる。 I型膜貫通タンパク質。一実施形態では、DAP10-SARの抗原結合ドメインは細胞外に面している。いくつかの実施形態では、リーダー配列は、配列番号31~34のいずれかの核酸配列および配列番号2425~2428のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、短い核酸配列(3~9個の核酸)含む制限酵素部位は、DAP10-SARの異なるサブユニット間、例えばシグナル配列とDAP10-SARの抗原結合ドメインの間、または抗原結合とCD3z鎖の間に位置する。
本開示の異なるSARSは、モジュール設計である。したがって、DAP10モジュールをコードする配列(配列番号1349)は、異なるシグナリングモジュールをコードする配列に置き換えることができる(表25)。このようなモジュールの例としては、DAP12-ECDTMCP-opt1 (配列番号1362)、DAP12-C35S-ECDTMCP-opt1 (配列番号1366)、CD3z-ECDTM-opt1 (配列番号1351)、mutCD3z-ECDTM-opt1が挙げられる。 (配列番号1353)、CD3z-ECDTM-OX40-opt1(配列番号1357)、FcRy-C24S-ECDTMCP-opt1(配列番号1423)、FcRy-ECDTMCP-opt1(配列番号1419) 、mutCD3z-ECDTM-2B4CP-opt1 (配列番号1426)、CD8-hinge-NKG2D-TM-2B4CP-opt1 (配列番号1430)、mutCD8-hinge-NKG2D-TM-2B4CP-opt-1 (配列番号1430) ID NO: 1438)。 1つ以上のDAP10モジュールが異なるシグナリングモジュールに置き換えられた例示的なSARSの配列番号は、仮出願の表33に示されている。
特定の実施形態において、本開示は、4-1BB、CD28、OX40および2B4を含むがこれらに限定されない、共刺激受容体の全体または部分配列を含む、共刺激SARと称される合成抗原受容体の新規プラットフォームを提供する。
共刺激SARの構築に使用できる共刺激受容体鎖の核酸配列を配列番号1573~1580に示す(表25)。対応するアミノ酸配列をそれぞれ配列番号3967~3974に示す。例示的な共刺激受容体の全体または部分配列を含む例示的な単鎖、二本鎖、および二本鎖ヘテロ二量体SARは、仮出願の表41および表42に提供される。
一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメインに結合した4-1BBの部分的または全体の領域を含む単鎖4-1BB SARを提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上の抗原結合ドメインに結合したCD28の部分的または全体的領域を含む単鎖CD28 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメインに結合したOX40の部分領域または全体領域を含む単鎖OX40 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメインに結合した2B4の部分的または全体の領域を含む単鎖2B4 SARを提供する。
一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメインに結合した4-1BBの部分的または全体領域を含む二重鎖4-1BB SARを提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上の抗原結合ドメインに結合したCD28の部分的または全体的領域を含む二本鎖CD28 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメインに結合したOX40の部分領域または全体領域を含む二重鎖OX40 SARを提供する。一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメインに結合した2B4の部分的または全体の領域を含む二重鎖2B4 SARを提供する。
一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメインに結合した4-1BBの部分的または全体領域を含む二重鎖ヘテロ二量体4-1BB SARを提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上の抗原結合ドメインに結合したCD28の部分的または全体的領域を含む二本鎖ヘテロ二量体CD28 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上の抗原結合ドメインに結合したOX40の部分的または全体的領域を含む二本鎖ヘテロ二量体OX40 SARを提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上の抗原結合ドメインに結合した2B4の部分的または全体的領域を含む二重鎖ヘテロ二量体2B4 SARを提供する。
二本鎖ヘテロ二量体SARの場合、一方の鎖は共刺激受容体(例えば、4-1BB、CD28、OX40、2B4など)から構成され、もう一方の鎖は共刺激受容体から構成され得ることに留意されたい。活性化シグナルを伝達できる受容体(例えば、CD16)。
SARの構築に使用され得る様々な共刺激受容体ドメインは、ドメインがその機能特性の少なくとも一部を保持する限り、それらの全配列、欠失変異体もしくは変異体を含み得ることが理解されるべきである。
一実施形態では、共刺激SARの抗原結合ドメインは、scFv、vL、vH、Fv、vHH、FHVH、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場、リガンドまたは受容体を含む。単鎖SARの鎖は、1つの抗原または複数の抗原(例えば、2つ、3つ、4つなど)に結合し得る。単鎖共刺激受容体SARの鎖は、1つまたは複数のアダプター(例えば、RZIP、EZIP、NKG2D-YA、NKG2D-FAなど)をさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、本開示の共刺激SARは、一般式:
AABD(n)- 共刺激受容体ヒンジドメイン- 共刺激受容体膜貫通ドメイン- 共刺激受容体 -細胞内シグナル伝達ドメイン - 任意の活性化ドメイン ここで、nは1以上である。一実施形態では、nは少なくとも2、例えば2、3、4または5である。AABD(自律抗原結合ドメイン)は、抗原結合ドメインを形成し、細胞内で発現される場合には細胞外側に位置する。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHドメインまたはヒト化vHドメインである。一実施形態では、AABDは、完全ヒト単一VH(SVH)ドメインまたはヒト化SVHドメインである。 SVH ドメインは自律 vH ドメインとしても知られ、vL ドメインが存在しない場合でもターゲットに結合できます。
一実施形態では、AABDは完全ヒトvHHドメインまたはヒト化vHHドメインである。
SAR を符号化するベクトルには一般に、SAR を符号化する能力が制限されている。例えば、SAR ポリヌクレオチドのサイズは、レンチウイルスまたはレトロウイルスベクターの力価に影響する。したがって、サイズが小さい SAR が望ましい。一態様において、本開示は、1765ヌクレオチド未満、1770ヌクレオチド未満、1780ヌクレオチド未満、1790ヌクレオチド未満、1800ヌクレオチド未満、1820ヌクレオチド未満のサイズの、2つのシグナルペプチドおよび介在する2Aリンカーを含む非特異的二本鎖SARを記載する。一態様において、本開示は、シグナル配列を含まない鎖の一方が815ヌクレオチド、820ヌクレオチド、825ヌクレオチドまたは850ヌクレオチドより長くなく、シグナル配列を含まない第2の鎖が790ヌクレオチド、800ヌクレオチド、810ヌクレオチド、815ヌクレオチド、820ヌクレオチド、825ヌクレオチドまたは850ヌクレオチドより長くない、非特異的二重鎖SARを記載する。一態様では、SARは、SIR、cTCR、Ab-TCR、AABD-TCR、εTFP、γTFP、δTFP、αβTFP、γδTFP、またはTCRの骨格を有する。一態様では、SARはSIRの骨格を有する。一態様において、SARは、SIR、cTCR、Ab-TCR、AABD-TCR、αβTFP、γδTFP、またはTCRαおよびTCRβ定数鎖を有するTCRの骨格を有する。一態様において、SARは、SIR、cTCR、Ab-TCR、AABD-TCR、αβTFP、γδTFP、またはTCRγおよびTCRδ定数鎖を有するTCRの骨格を有する。
本開示はまた、TCRα(配列番号(DNA):7172~7271;配列番号(PRT):7863~7963)、TCRβ(配列番号(DNA):7273~7398;配列番号(PRT):7863~7963)の定常鎖の新規な欠失変異体も提供する。配列番号(PRT): 7965-8090)、TCRγ(配列番号(DNA): 7400-7499; 配列番号(PRT): 8092-8191)およびTCRδ(配列番号(DNA): 7501-7600)これらは、SIRおよびcTCRバックボーンに基づくSIRおよびcTCRおよびSARの構築に使用することができる。 TCRα、TCRβ、TCRγ、およびTCRδの定常鎖の欠失変異体の使用は、SIR/SAR構築物のサイズを縮小し、ウイルスベクターへのパッケージングを改善し、それによってウイルスベクターの力価および形質導入効率を改善するのに役立ちます。ここで説明する TCRα、TCRβ (β1 または β2)、TCRγ および TCRδ 鎖の定常鎖の欠失変異体を使用して、完全長の定常鎖で構成される SAR と比較して、多様な発現、結合親和性および活性を有する SAR を構築できます。例えば、ここに記載したTCRα、TCRβ(β1またはβ2)、TCRγおよびTCRδ鎖の定数鎖の欠失変異体は、全長の定数鎖からなるSARと比較して、発現、結合親和性、シグナル伝達活性、サイトカイン産生および/または細胞毒性が増加したSARを構築するために使用することができる。あるいは、ここに記載したTCRα、TCRβ(β1またはβ2)、TCRγおよびTCRδ鎖の定数鎖の欠失変異体を用いて、全長の定数鎖からなるSARと比較して、発現、結合親和性、シグナル伝達活性、サイトカイン産生および/または細胞毒性が低下したSARを構築することもできる。完全長の定数鎖からなるSARと比較して、発現、結合親和性、シグナル伝達活性、サイトカイン産生および/または細胞毒性が増加したSAR構築物は、標的抗原の発現量が少ない疾患細胞(例えば、腫瘍細胞)を標的とするのに有用であると考えられる。発現、結合親和性、シグナル伝達活性、サイトカイン産生および/または細胞毒性が、全長の定常鎖からなるSARと比較して低下しているSAR構築物は、標的抗原を低発現している健常細胞を温存しながら、標的抗原の高レベルの発現を有する腫瘍細胞を選択的に標的とするために有用である。
一態様では、本開示は、TCRα定常鎖断片の長さが370、380、390、400、410または421ヌクレオチド未満であり、TCRβ定常鎖断片が490ヌクレオチド未満、500ヌクレオチド未満である二重鎖SARを記載し、長さは510ヌクレオチド未満、520ヌクレオチド未満、530ヌクレオチド未満、または540ヌクレオチド未満。一態様では、SARは、SIR、cTCR、Ab-TCR、AABD-TCR、αβTFP、またはTCRの骨格を有する。一態様では、SARはSIRのバックボーンを有する。一態様では、SARは、TCRαおよびTCRβ定常鎖、またはTCRγおよびTCRδ定常鎖を有するSIRの骨格を有する。一態様では、SARは、TCRαおよびTCRβ定常鎖、またはTCRγおよびTCRδ定常鎖を有するcTCRの骨格を有する。一態様では、TCRαおよびTCRβ定常鎖フラグメントは、それらの鎖対合を強化し、内因性TCRαβ鎖との鎖対合を減少させる変異を保有する。一態様では、TCRαおよびTCRβ定常鎖フラグメントは、2つの鎖の間に余分なシステイン結合(二重結合)をもたらす突然変異を保有する。
1つの局面において、本開示は、SEQ ID NO: 7864-7963で表されるTCRα定数鎖のいずれかから選択されるTCRα定数鎖欠失変異体、またはSEQ ID NO: 7864-7963で表されるアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%、99.9%の相同性を有する変異体を含むSARを提供する。一態様では、本開示は、配列番号7864~7963のいずれかを含むTCRα定常鎖断片、または相補的TCRβ定常鎖と対合する能力を保持するそれらの欠失変異体もしくは機能的変異体を含むSARを提供する。一態様において、本開示は、TCR/CD3複合体に取り込まれ、TCRシグナル伝達モジュールを動員し、および/または標的抗原との係合時にT細胞シグナル伝達を誘導する能力を保持する、SEQ ID NO:7864-7963またはそれらの欠失変異体もしくは機能的変異体のいずれかを含むTCRα定数鎖フラグメントを含むSARを提供する。SARの構築に使用できるTCRα定数鎖欠失変異体および機能的変異体の追加。
1つの局面において、本開示は、SEQ ID NO: 7965-8090で表されるTCRβ定数鎖のいずれかから選択されるTCRβ定数鎖欠失変異体、またはSEQ ID NO: 7965-8090で表されるアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%、99.9%の相同性を有する変異体を含むSARを提供する。一態様では、本開示は、配列番号7965~8090のいずれかを含むTCRβ定常鎖断片、または相補的TCRα定常鎖と対合する能力を保持するそれらの欠失変異体もしくは機能的変異体を含むSARを提供する。一態様において、本開示は、TCR/CD3複合体に取り込まれ、TCRシグナル伝達モジュールを動員し、および/または標的抗原との結合時にT細胞シグナル伝達を誘導する能力を保持する、SEQ ID NO:7965-8090またはそれらの欠失変異体もしくは機能的変異体のいずれかを含むTCRβ定数鎖フラグメントを含むSARを提供する。SARの構築に使用できるTCRβ定数鎖欠失変異体および機能的変異体の追加。
1つの局面において、本開示は、SEQ ID NO: 8092-8191で表されるTCRγ定数鎖のいずれかから選択されるTCRγ定数鎖欠失変異体、またはSEQ ID NO: 8092-8191で表されるアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%、99.9%の相同性を有する変異体を含むSARを提供する。一態様では、本開示は、配列番号8092~8191のいずれかを含むTCRγ定常鎖断片、または相補的TCRδ定常鎖と対合する能力を保持するそれらの欠失変異体もしくは機能的変異体を含むSARを提供する。一態様において、本開示は、TCR/CD3複合体に取り込まれ、TCRシグナル伝達モジュールを動員し、および/または標的抗原との結合時にT細胞シグナル伝達を誘導する能力を保持する、SEQ ID NO:8092-8191またはそれらの欠失変異体もしくは機能的変異体のいずれかを含むTCRγ定数鎖フラグメントを含むSARを提供する。SARの構築に使用できるTCRγ定数鎖欠失変異体および機能的変異体の追加。
1つの局面において、本開示は、SEQ ID NO: 8193-8292で表されるTCRδ定数鎖のいずれかから選択されるTCRδ定数鎖欠失変異体、またはSEQ ID NO: 8193-8292で表されるアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%、99.9%の相同性を有する変異体を含むSARを提供する。一態様では、本開示は、配列番号8193~8292のいずれかを含むTCRδ定常鎖断片、または相補的TCRγ定常鎖と対合する能力を保持するそれらの欠失変異体もしくは機能的変異体を含むSARを提供する。一態様において、本開示は、TCR/CD3複合体に取り込まれ、TCRシグナル伝達モジュールを動員し、および/または標的抗原との係合時にT細胞シグナル伝達を誘導する能力を保持する、SEQ ID NO:8193-8292のいずれかまたはそれらの欠失変異体もしくは機能変異体を含むTCRδ定数鎖フラグメントを含むSARを提供する。SARの構築に使用できるTCRδ定数鎖欠失変異体および機能的変異体の追加。
など)、scFv、(scFv)2、VHHの群から選択される。ドメイン、FHVH (完全ヒト vH ドメイン)、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合足場 (例、セントイリン、アフィボディ、ZIP ドメイン、アダプターなど)、VNAR ドメイン、リガンド、TCR、可変TCR および受容体のドメイン (Va、Vb、Vg、Vd)。本明細書に記載されるいずれかのSARのいくつかの実施形態では、異種抗原結合ドメインはscFvを含む。
本開示のSARの抗原結合ドメインは、 HLA非依存性TCR、単一ドメインTCR、受容体のリガンド結合ドメイン、リガンドの受容体結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合足場、アダプターまたはその断片。
一態様では、本開示は、合成抗原受容体(SAR)の新規組成物を提供する。別の態様では、本開示は、SARの新規な構成/アーキテクチャを提供する。別の態様では、本開示は、有用な生物学的特性(例えば、発現、結合親和性、エフェクター機能など)を有するSARを提供する。別の態様では、本開示は、1つまたは複数の抗原に結合できるSARを提供する。別の態様では、本開示は、抗原の1つまたは複数のエピトープに結合できるSARを提供する。
一態様では、本開示は、1つを超える(すなわち、2、3、4、5またはそれ以上)抗原結合ドメインを含む合成抗原受容体(SAR)を提供する。別の態様では、本開示は、2つ以上の抗原または抗原の2つ以上のエピトープに結合および/または応答することができるSARを提供する。別の態様では、本開示は、複数の抗原または抗原の複数のエピトープに結合および/または応答することができる二重特異性および/または多重特異性SARを提供する。別の態様では、本開示は、二重特異性および/または多重特異性SARの構築に有用な抗原結合ドメインを提供する。別の態様では、本開示は、二重特異性および/または多重特異性SARの有用な構成(すなわち、異なるドメインの位置)を提供する。本開示の二重特異性および多重特異性SARは、免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞、NKT細胞、NK細胞など)において発現された場合、同じ抗原または同じ抗原のエピトープを標的とする2つ以上の非特異的SARと比較して、ほぼ同等の有効性またはそれ以上の有効性で、複数の抗原または複数の抗原のエピトープに結合および/または応答する能力を付与する。
二重特異性または多重特異性SARにおいて2つ以上の抗原結合ドメインが存在すると、立体障害、非特異的凝集、発現不良、タンパク質のアンフォールディング、および/または抗原結合の妨害が生じる可能性がある。さらに、SARの膜貫通ドメインに対する抗原結合ドメインの位置は、得られる受容体によるシグナル伝達を最適化するために最適化される必要がある。 二つ以上のscFvを組み込んだ二重特異性CARおよび多重特異性CARが当技術分野で記載されている。しかしながら、本開示は、SAR中に1つ以上のscFv(すなわち、2、3、4またはそれ以上)が存在すると、しばしば立体障害、非特異的凝集、強直性シグナル伝達、発現不良、タンパク質のアンフォールディング、および/または抗原結合の妨害が生じ、その結果、シグナル伝達およびエフェクター機能(例えば、サイトカイン産生、細胞毒性など)が低下することを同定している。したがって、2つ以上の抗原結合ドメインからなる二重特異性SARや多特異性SARを作製する際の主要な課題は、立体障害、非特異的凝集、強直性シグナル伝達、貧弱な発現、タンパク質のアンフォールディング、および/またはシグナル伝達やエフェクター機能(サイトカイン産生、細胞毒性など)の低下につながる抗原結合の妨害を軽減するために、そのようなSARに組み込むべき有用な抗原結合ドメイン(例えば、scFv、Fv、Fab、vHH、FHVH、Centyrin、アフィボディ、サイトカイン、レセプター、svd-TCRなど)を決定することである。
第二の課題は、二重特異性および多重特異性 SAR を構成する様々な抗原結合ドメインの有用な配置を決定することである。例えば、非特異的凝集、強直性シグナル伝達、発現不良、タンパク質のアンフォールディング、および/またはシグナル伝達やエフェクター機能(サイトカイン産生、細胞毒性など)の低下をもたらす抗原結合への干渉を軽減するために、互いに対する、およびSARの他の成分(例えば、ヒンジドメイン、膜貫通ドメインなど)に対する様々な抗原結合ドメインの最適な順序を決定する必要がある。これは、全てのSARにとって、特に、抗原結合ドメインが2つの異なるフラグメント(例えば、vLとvH、VaとVb、またはVgとVdなど)で構成されている本開示に記載されているような多鎖SAR(例えば、二重鎖CD16 SAR、二重鎖Dap10 SAR、二重鎖NKp30 SARなど)にとって重要な課題である。例えば、2つの別々のCD16鎖に作動可能に連結されるが結合してCに結合するFvを形成するvLおよびvHフラグメントを介してCD19に結合する二重鎖SARへの第2の抗原結合ドメイン(例えば、scFvまたはvHHドメイン)の結合は、vL断片とvH断片の相互作用を阻害する可能性があり、その結果、CD19に結合する機能的なFvを形成できなくなる
抗原結合ドメインと細胞膜の間の距離を決定するヒンジドメインの長さは、キメラ抗原受容体を介したシグナル伝達に影響を与える可能性があります。したがって、この分野におけるもう1つの課題は、複数の抗原結合ドメインの付着が、標的抗原と細胞膜の間の距離を増加させることにより、有効な免疫学的シナプスの形成やSARを介したシグナル伝達に悪影響を及ぼす可能性があるかどうかが現時点では不明であることである。 。
SAR における複数の抗原結合ドメインの融合は、立体障害や不適切なフォールディングを引き起こす可能性があります。この分野における別の課題は、二重特異性/多重特異性SARの異なる抗原結合ドメイン間にリンカードメインが必要かどうかが現時点では不明であることである。リンカードメインの長さや性質も不明である。不適切なリンカーを添加すると、2つの鎖間の相互作用や機能的なFvの形成が阻害される可能性があるため、これは二重鎖SAR(二重鎖CD16 SAR、二重鎖NKp30 SAR、二重鎖NKp44 SAR、二重鎖Dap10 SARなど)の場合に特に重要である。さらに、リンカーは、標的抗原と細胞膜の間の距離を増加させることにより、効果的な免疫学的シナプスの形成および SAR を介したシグナル伝達に悪影響を与える可能性がありる。
一態様では、本開示は上記の問題に対する解決策を提供する。
一態様では、本開示は、1つ以上の抗原結合ドメインおよび1つ以上の膜貫通ドメインを有するSARを提供する。一実施形態では、本開示は、二重特異性SARおよび多重特異性SARの構築に有用な抗原結合ドメインを提供する。
本開示は、異なる抗原結合ドメイン、ヒンジドメイン、リンカードメイン、接続ペプチド、膜貫通ドメイン、活性化ドメイン、共刺激ドメイン、アクセサリーモジュールおよび治療制御などを含むいくつかの例示的なSARを提供する。本開示のいくつかの例示的なSARの核酸配列およびアミノ酸配列は、SEQ ID NO(DNA)に記載されている: 1600-2328、4851-5129、5451-6282、7160-7170、7601-7747、8768-9602、10817-10830、およびSEQ ID NO(PRT):3994-4722、5151-5429、6283-7114、7852-7862、8293-8439、9860-10694に記載されている。本開示の例示的なSARの名称および構成は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる仮出願の表32~34および36~42に提供される。 SARの構築において使用され得る例示的な成分のSEQ ID(DNA)およびSEQ ID(PRT)は、SEQ ID NO(DNA):31~1243、1308~1572および8535~8767ならびにSEQ ID NO(PRT):2425~3637、3702~3966および9627~9859、10832~10841および12304~12311に提供される。本開示のSARの構築において使用できる異なるSAR構成要素および補助試薬の名称は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる仮出願の表1~31に記載されている。 SARの標的抗原、構成および組成は、BLASTのようなプログラムを用いて構成モジュールの配列相同性検索を行うことにより、本開示で提供される核酸配列およびアミノ酸配列から推測することができる。あるいは、ApE([https://]jorgensen.biology.utah.edu/wayned/ape/)のようなソフトウェアを用いて、本開示で核酸配列が提供される異なるSAR構築物の組成を決定することもできる。最後に、本開示の異なるSARの構成および構成は、当業者であればそれらの名前から推測することができる。
一実施形態では、本開示は、本明細書で提供される例示的なSARのいずれかによって表されるアーキテクチャおよび/または構成を有する新規なSARを提供する。一実施形態において、本開示は、本明細書で提供される例示的なSARのいずれかの組成物またはその機能的変異体を有する新規SARを提供する。一実施形態において、本開示は、本明細書で提供される例示的なSARのいずれかのアミノ酸配列と少なくとも70%の相同性(例えば、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%の相同性)を有する新規SARを提供する。一実施形態において、本開示は、本明細書で提供される例示的なSARのいずれかのアミノ酸配列と少なくとも70%の相同性(例えば、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%の相同性)を有する新規SARを提供する(任意のアクセサリーモジュールを除く)。一実施形態において、本開示は、抗原結合ドメインおよびシグナル伝達鎖(例えば、CD16鎖)を含む領域において、本明細書で提供される例示的なSARのいずれかのアミノ酸配列と少なくとも70%の相同性(例えば、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、99%の相同性)を有する新規SARを提供する。
一態様では、本開示は、有利な抗原結合ドメインを有するSARを作製するための構成要素としての、ヒトVHドメイン、典型的には複数のヒトVHドメインを含む自律抗原結合ドメイン(AABD)の使用に関する。
本開示は、一態様では、自律抗原結合ドメイン(AABD)、その生成方法、および合成抗原受容体および潜在的に抗体治療薬の構築のためのかかるドメインの使用に関する。一実施形態では、AABDドメインは安定性が改善されている。別の実施形態では、AABDドメインは改善された熱安定性を有する。別の実施形態では、AABDドメインは溶解性が改善されている。別の実施形態では、AABDドメインは、自己凝集の傾向が少ない。別の実施形態では、AABDドメインは、N末端シグナルペプチドとともに哺乳動物細胞で発現される場合、細胞外空間で分泌される能力が向上している。
一態様では、AABDは単一ドメイン抗体または抗体断片である。一態様では、AABDは、可変軽鎖(VLまたはvL)ドメインの非存在下で抗原に結合できる単一可変重鎖(VHまたはvH)ドメイン(SVHドメイン)またはその断片である。別の態様では、AABDは、vLドメインの非存在下で可溶性タンパク質として発現され得る、そのフラグメントの単一可変重鎖(VH)ドメイン(またはSVHドメイン)である。別の態様では、AABDは、N末端分泌シグナルに結合すると、vLドメインの非存在下で分泌タンパク質として発現され得る、単一可変重鎖(VH)ドメイン(またはSVHドメイン)またはその断片である。 。本開示の特定の実施形態は、第1のAABDを含むSARに関し、第1のAABDは、第2のドメインの非存在下で抗原に特異的に結合する。
一態様では、AABDは、可変重鎖(VHまたはvH)ドメインの非存在下で抗原に結合できる単一可変軽鎖(VLまたはvL)ドメインまたはSVLドメインまたはその断片である。別の態様では、AABDは、vHドメインの非存在下で可溶性タンパク質として発現できる単一可変軽鎖(VL)ドメイン(またはSVLドメイン)またはその断片である。別の態様では、AABDは、 N末端分泌シグナルに結合すると、vHドメインの非存在下で分泌タンパク質として発現され得る、単一可変軽鎖(VL)ドメイン(またはSVLドメイン)またはその断片である。 。
いくつかの実施形態では、AABDは、非scFvベースの抗原結合ドメイン、ラクダ科動物のvHHドメイン、ヒト化vHHドメイン、非免疫グロブリン抗原結合足場、サイトカインまたはリガンドの受容体結合ドメイン、サイトカインまたはリガンドのリガンド結合ドメインである。受容体、単一可変ドメインT細胞受容体(TCR)、自己抗原、またはその断片。
一実施形態では、AABDは、アダプタードメイン、アダプター結合ドメイン、またはそれらの断片である。例示的なアダプターおよびアダプター結合ドメインには、RZIP、EZIP、E4、K4、NKG2D-YA、NKG2D-AF、Dドメインなどが含まれるが、これらに限定されない。
「単一ドメイン抗体、可変単一ドメイン、または免疫グロブリン単一可変ドメイン(ISV)」という用語はすべて当技術分野で周知であり、標的抗原に結合する抗体の単一可変フラグメントを表す。これらの用語は、本明細書では同じ意味で使用されます。以下に説明するように、本開示の様々な態様の実施形態は、異なる抗原、例えば、CD19、CD20、CD22、BCMA、CD38、MPL、CD123、CD33、メソセリン、Her2、CS1/SLAMF7、CD30、GD2、GD3、FLT3、ROR1、CD79b、Lym1、Lym2、PSCA、PSMA、ALK、CD138、CEA、FAP、TAJ、CD229、IL13Ra2、CD32b、GPC3、Muc16、および軽鎖の非存在下でのKIR3DL2に結合する、SVHドメインと呼ばれる単一重鎖可変ドメイン抗体/免疫グロブリン重鎖単一可変ドメインを含むSARに関する。通常は、ヒト重鎖単一可変ドメイン抗体が使用される。
したがって、いくつかの実施形態では、本開示のSARは、単一ドメイン抗体を含む、またはそれからなる結合ドメインを含み、前記ドメインは単一のヒト重鎖可変ドメイン(SVH)である。したがって、いくつかの態様では、本開示のSARは、VLドメインを欠く1つまたは複数の結合ドメインを含む。
したがって、いくつかの実施形態では、本開示のSARは、単一ドメイン抗体を含む、またはそれからなる結合ドメインを含み、前記ドメインはラクダ科のvHH(またはVHH)ドメインまたはヒト化vHHドメインである。
本明細書で使用される場合、VHドメインは、ヒトVHドメインまたは非ヒトVHドメインである。
SVH ドメインは 12 ~ 14 kDa の小分子で、さまざまな形式に組み合わせることで、SAR の多価または多重特異性抗原結合ドメインを得ることができます。 SVH ドメインは堅牢であり、血清中での高い親和性と安定性が特徴です。 SVH ドメインは、血清中での高い溶解性と凝集の欠如によっても特徴付けられます。
各単一 VH ドメイン (SVH) 抗体は、アミノ末端からカルボキシ末端に FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4 の順序で配置された 3 つの CDR と 4 つの FR を含みます。したがって、本開示の一実施形態では、ドメインは、以下の式FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4を有するヒト可変重鎖(VH)ドメインである。
一実施形態では、本開示は、Kabat系に従ってW103R置換を有するSVHドメインを使用して構築され得る一本鎖および多鎖SAR(例えば、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、Dap10など)を提供する。W103R置換を有するCD19を標的とする例示的なSVHはCD19-FHVH-354であり、SEQ ID NO (DNA)で表される: 836およびSEQ ID NO (PRT): 3230で表される。別の実施形態において、本開示は、Kabat系によるW103R置換を有するSVHドメインを含む、二重特異性、二価または二パラトピック抗原結合部分を有する多鎖SARを提供する。
別の実施形態では、本開示は、Kabatシステムに従ってW103R置換を有するSVHドメインからなる、多特異的、多価又は多パラトープ抗原結合部分を有する多鎖SARを提供する。 AABDは本質的にモジュラーであるため、AABDを異なる抗原を標的とする他のAABDで置換して、それらの抗原を標的とするSARを開発することができる。
別の実施形態において、本開示は、Kabat系に従ったW103R置換を有するSVHを含む、二重特異性、二価またはバイパラトープ抗原結合部分を有する一本鎖SARを提供する。
一実施形態では、本開示は、適切な条件下でジスルフィド結合を形成し、および/またはジスルフィド架橋を形成することができる非標準システインの導入によって安定化されたSVHを使用して単鎖および多鎖SARを構築できることを提供する。非標準的システインを含む例示的なSVHはCEA-300-aVHであり、配列番号(DNA):954および配列番号(PRT):3348で提供される。さらなる例示的なそのようなSVHは、WO2019149715で提供され、これはその特許文献1に組み込まれる。全体を参照により本明細書に記載する。
一実施形態において、本開示は、SVHドメインが、Kabat番号付けに従って、(i)52aおよび71位または(ii)33および52位に置換システインを含み、前記システインがジスルフィド結合を形成することが可能であり、および/または好適な条件下でジスルフィド結合を形成する、SVHを含む一本鎖SARを提供することによって、既存の養子細胞療法の欠点を緩和することを目的とする。
本開示の一実施形態では、SARを作製するために使用されるSVHドメインは、Kabat番号付けに従って、44E、45E、45R、(101-1)Y、および101Dからなる群から選択される置換を含む。特に、SVHは、Kabatの番号付けに従って、置換44E、45Eまたは45R、(101-1)Yおよび101Dを含む。一実施形態では、SVHドメインは、Kabat番号付けに従って、G44E、T45E、T45R、F(101-1)Y、およびA101Dからなる群から選択される置換を含む。一実施形態では、SVHドメインは、Kabat番号付けに従って、置換G44E、T45E、T45R、F(101-1)Y、およびA101Dを含む。
本開示の一実施形態では、SARは、Kabatナンバリングに従って44E、45E、および(101-1)Yからなる群から選択される置換を有するSVHを含む。一実施形態では、SARは、Kabat番号付けに従って、置換44E、45E、および(101-1)Yを有するSVHドメインを含む。一実施形態では、SVHドメインに存在する場合、SVHドメインは、Kabat番号付けに従ってG44E、T45E、およびF(101-1)Yからなる群から選択される置換を含む。一実施形態では、SARは、Kabatナンバリングによる置換G44E、T45E、およびF(101-1)Yを含むSVHドメインを含む。
一実施形態では、SARのSVHドメインは、それぞれ配列番号21411、21412、21413および21414のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3およびFR4を含むvHフレームワークを含む。
一実施形態では、SARのSVHドメインは、それぞれ配列番号4819~4822のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3、およびFR4を含むvHフレームワークを含む。
一実施形態では、SARのSVHドメインは、それぞれ配列番号4823~4826のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3、およびFR4を含むvHフレームワークを含む。
本開示の一実施形態では、SARのSVHドメインは、それぞれ配列番号4827~4830のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3、及びFR4を含むvHフレームワークを含む。
本開示の一実施形態では、SVHドメインは、それぞれ配列番号4831~4834のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3、及びFR4を含むvHフレームワークを含む。
本開示の一実施形態では、SVHドメインは、それぞれ配列番号4835~4838のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3、及びFR4を含むvHフレームワークを含む。
一実施形態では、SVHドメインは、それぞれ配列番号4839~4842のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3、およびFR4を含むvHフレームワークを含む。
一実施形態では、SVHドメインは、それぞれ配列番号4843~4846のアミノ酸配列に対して少なくとも85%の配列同一性を有するFR1、FR2、FR3、およびFR4を含むvHフレームワークを含む。
配列番号4819~4650によるFR1~4はヒトにおいて免疫原性ではないため、SVHドメインはSARの構築に特に有用である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるSAR構築物は、目的の標的タンパク質、例えば、抗原などの腫瘍細胞上に発現されるタンパク質を認識するヒトSVLドメイン(典型的には複数のヒトSVLドメイン)を含む。本明細書で使用されるSVLドメインという用語は、単一のヒトVLドメイン抗体(VL sdAb)を指す。したがって、これらの用語は同じ意味で使用されます。 SVL という用語は、独立 vL ドメインまたは自律 vL ドメインと同じ意味で使用されます。 SVL は AABD の一種です。
一態様では、SARのAABDはラクダ科のvHHドメインである。本開示は、複数のvHHドメインを含むSARにも関する。本開示はまた、ヒト化vHHドメインを含むSARに関する。本開示のSARの構築に使用できる例示的なvHHドメインおよびそれらの標的抗原を表5に示す。
一態様では、SARのAABDは、DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディ、レペボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、Dドメイン、またはそれらの断片。本開示はまた、複数の非免疫グロブリン抗原結合足場を含むSARに関する。本開示のSARの構築に使用できる例示的な非免疫グロブリン抗原結合足場およびその標的抗原を表7~9に示す。
一態様では、SARのAABDは、アダプター結合ドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、K4、NKG2D-AF、NKG2D-YA、またはDドメインなど)である。本開示には、複数のアダプターに結合するSARも含まれる。一実施形態では、アダプター結合ドメインはロイシンジッパードメインである。一態様では、SARのAABDはアダプター(例えば、RZIP、EZIP、E4、K4、Dドメイン、Streptag、FITC、ビオチン、ULBP2R、ULBP2-S3など)に結合する。アダプターおよびアダプター結合タンパク質が相互に置換され得ることは、当業者には理解される。したがって、SAR は、EZIP モジュールを含む SAR アダプタにバインドする RZIP モジュールを含むことができます。あるいは、SAR は EZIP モジュールを備え、 SAR アダプタは RZIP モジュールを備えることができます。本開示には、複数のアダプターに結合するSARも含まれる。
一態様では、SARのAABDは、受容体の細胞外リガンド結合ドメインまたはその断片である。本開示はまた、受容体の複数の細胞外リガンド結合ドメインを含むSARを含む。
一態様では、SARのAABDは、リガンド、サイトカイン、またはそれらの断片の細胞外受容体結合ドメインである。本開示はまた、リガンドまたはサイトカインの複数の細胞外受容体結合ドメインを含むSARを含む。
一態様では、SARのAABDは自己抗原である。本開示には、複数の自己抗原を含むSARも含まれる。 SARの構築に使用できる例示的な自己抗原は、Dsg3またはその断片である。
一態様では、SARのAABDは、T細胞受容体の単一可変ドメイン(svd-TCR)である。本開示はまた、T細胞受容体の複数の単一可変ドメインを含むSARを含む。 svd-TCRドメインを含む例示的なポリヌクレオチドは、PCT/US2021/022641の配列番号(DNA):21563-21564およびWO2021030182に提供されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
一態様では、SARのAABDは、細胞の表面上に発現される抗原に結合できる任意の単一ドメインタンパク質である。
SAR 内の複数の AABD は、異なる組み合わせで存在する可能性があります (たとえば、2 つのセントリリン、1 つのセントリリンと 1 つの vHH ドメイン、vHH ドメインと SVH ドメインとセントリリンなど)。
1つの態様において、SARのAABDはセンチリンである。本開示はまた、複数のセンチリンを含むSARに関する。一態様では、SARのAABDはDARPINSである。本開示は、複数のDARPINを備えるSARにも関する。同様に、本開示は、アフィボディ、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディ、リペボディ、ファイノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質などの複数の非免疫グロブリン抗原結合ドメインを含むSARに関する。
いくつかの実施形態では、SARは複数のAABDを含む。一実施形態では、第1のAABDは第2のAABDに連結されており、第1および第2のAABDは抗原に特異的に結合する。一実施形態では、SARによって認識される抗原は、MHC複合体に結合するペプチド抗原である。いくつかの実施形態では、SARの2つ以上のAABDは同じ抗原を認識する。他の実施形態では、SARの2つ以上のAABDは、異なる抗原を認識する。
第2世代CARのようなSARにおいて典型的に使用されるscFvは、望ましくない凝集、クラスター形成および免疫原性の可能性を有するが、自律抗原結合ドメイン(AABD)の使用は、安定なフォーマットを提供する。これは、二重特異性、二価またはバイパラトピック抗原結合部位を有するSARを設計する際に特に有用である。本明細書で本発明者らによって実証されたように、複数のAABDドメインはこのような多量体フォーマットで容易に使用することができるため、複数の標的抗原または抗原の複数のエピトープを同時に標的とすることを可能にする多特異的SARの生成が容易になる。
一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原(例えば、1、2、3、4、5、6つまたはそれ以上の抗原)を標的とすることができるSARを提供する。一実施形態において、本開示は、1つ以上のエピトープ(例えば、1、2、3、4、5、6つ以上のエピトープ)を標的とすることができるSARを提供する。一実施形態では、本開示は、1つまたは複数の抗原結合ドメイン(例えば、1、2、3、4、5、6つまたはそれ以上の抗原結合ドメイン)を含むSARを提供する。
一実施形態において、本開示は、各鎖が、ゼロ、膜貫通ドメインに作動可能に連結された1つ以上の抗原結合ドメイン、任意選択で活性化ドメイン、および任意選択で共刺激ドメインを含む、1つ以上の鎖からなるSARを提供する。一実施形態では、活性化ドメインは、1つまたは複数のITAMモチーフをコードする。
一実施形態において、本開示は、以下を含む合成抗原レセプターを提供する;(a)1つ以上の抗原特異的標的化領域、(b)少なくとも1つの細胞外リンカードメイン、(c)少なくとも1つの膜貫通ドメイン、(d)任意選択の共刺激ドメイン、および(e)任意選択の細胞内シグナル伝達ドメイン、ここで、1つの抗原特異的標的化領域は抗原特異的一本鎖Fv(scFv)フラグメントからなり、第2の抗原特異的標的化ドメインはAABDからなる。例示的な実施形態では、AABDは、非scFv抗原結合モジュール(例えば、SVH、vHH、FHVH、SVL、svd-TCR、セントチリン、DARPIN、CD16A、CD64、CD32、NKG2D、NKG2D-AF、NKG2D-YA)である。 、RZIP、EZIP、E4、K4、Dドメインなど)。
一実施形態において、本開示は、以下を含む二重特異性または多重特異性合成抗原レセプターを提供する;(a)少なくとも2つの抗原特異的標的化領域、(b)少なくとも1つの細胞外リンカードメイン、(c)少なくとも1つの膜貫通ドメイン、(d)任意の共刺激ドメイン、および(e)任意の細胞内シグナル伝達ドメイン、ここで、1つの抗原特異的標的化領域は抗原特異的一本鎖Fv(scFv)フラグメントからなり、第2の抗原特異的標的化ドメインはAABDからなる。例示的な実施形態において、AABDは、非scFv抗原結合モジュール(例えば、SVH、vHH、FHVH、SVL、svd-TCR、Centyrin、DARPIN、CD16A、CD64、CD32、NKG2D、NKG2D-AF、NKG2D-YA、RZIP、EZIP、E4、K4、Dドメインなど)である。2つのAABDからなり、CD38およびBCMAを標的とする例示的な二重特異性SARは、CD8SP-CD38-717-vHH-Ecoil-BCMA-346-vHH-CD16A-F158V-S197P-FL-v3(SEQ ID NO(DNA):5100;SEQIDNO(PRT):5400)である。一実施形態において、本開示は、一般式(AABD)n-任意選択リンカードメイン-scFv-ヒンジドメイン-膜貫通ドメイン-任意選択1つ以上の共刺激ドメイン-活性化ドメイン;ここで、n=0、1、2、3、4、5またはそれ以上であり、活性化ドメインは1つまたは複数のITAMモチーフを含み得る二重特異性または多重特異性合成抗原受容体を提供する。例示的なこのようなSARは、IgSP-Apa-CD20-USC1-vHH-2HCD26-G4Sx3v2-hu-mROO5-1-scFv-CD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3(SEQ ID NO(DNA).7160およびSEQ ID NO (PRT):7853)。このSARは、CD19を標的とするヒト化hu-mROO5-1 scFvに代表される抗原結合ドメインと、CD20を標的とするCD20-vHH-2HCD26に代表される第二の抗原結合ドメインを有する。2 つの抗原結合ドメインは、Gly-Ser (G4Sx3v2) 柔軟なリンカーを介して結合されている。このSAR構築物はまた、CD16細胞外ドメイン(CD16 D1およびD2ドメインを含む)、CD16ヒンジおよび膜貫通ドメイン、ならびにCD16細胞質ドメインからなる。他の例示的な二重特異性SARは、配列番号7161~7170によって表される。
別の例示的な二重特異性SARは、IgSP-Apa-CD20-USC1-vHH-2HCD26-G4Sx3v2-hu-mROO5-1-scFv-CD28-Hinge-CD16-F158V-S197P-Hinge-TM-CP-v3(配列番号3)によって表される。 :7164)。この構築物は、CD16 D1およびD2ドメインを欠き、CD28ヒンジドメインを含むことを除いて、上記の配列番号7160を有する構築物と同様である。
一実施形態において、本開示は、各鎖が、膜貫通ドメインに作動可能に連結された0、1、2またはそれ以上の抗原結合ドメインを含むが活性化ドメインを欠く、1またはそれ以上の鎖からなるSARを提供する。このようなSARはそれ自体の活性化ドメインを欠いているが、活性化ドメインをコードするタンパク質を含むシグナル伝達モジュールの動員によりシグナル伝達が可能である。このようなSARによって補充され得るシグナル伝達タンパク質の例には、CD3z、DAP10またはDAP12が含まれる。このようなSARの例は、CD16 SAR、NKp30 SAR、NKp44 SAR、またはNKp46 SARのバックボーンに基づいている。例示的な実施形態では、本開示は、1つ以上のAABDが二本鎖SARの一方または両方の鎖のN末端またはN末端付近に結合しているSARを提供する。例示的な実施形態では、本開示は、1つ以上のAABDが、SARの一方または両方の鎖を含むvL断片またはvH断片のN末端またはN末端付近に結合しているSARを提供する。例示的な実施形態では、本開示は、1つ以上のAABDが、TCRの一方または両方の鎖を含むVa、Vb、VgまたはVdフラグメントのN末端またはN末端付近に結合しているSARを提供する。例示的な実施形態では、AABDは、非scFv抗原結合モジュール(例えば、SVH、vHH、FHVH、SVL、svd-TCR、セントチリン、DARPIN、CD16A、CD64、CD32、NKG2D、NKG2D-AF、NKG2D-YA)である。 、RZIP、EZIP、E4、K4、Dドメインなど)。
一実施形態において、本開示は、以下を含む1本半鎖SARまたは2本鎖SARを提供する;一般式(AABD)n-任意選択リンカードメイン-scFv-任意選択リンカー-TCR定数鎖を有する一本鎖、および、一般式(AABD)n-任意選択リンカードメイン-CD16/NKp30/NKp44/Nkp46定数鎖を有する第2の鎖、ここでn=0、1、2、3、4、5またはそれ以上。CD16/NKp30/NKp44/Nkp46定数鎖は、免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞など)にシグナルを直接伝達することができるか、または免疫細胞にシグナルを伝達することができる1つ以上のシグナル伝達タンパク質を動員することができる、完全長CD16/NKp30/NKp44/NKp46ポリペプチドまたはその断片もしくは変異体もしくは変異体を含む送信されるシグナルは、細胞の増殖、活性化、サイトカイン分泌および/または細胞毒性を刺激するシグナルを含み得る。
一実施形態において、本開示は、2つの鎖を含む二重鎖二特異性合成抗原レセプターを提供し、各鎖は以下を含む (a)1つ以上の異種抗原特異的標的化領域、(b)少なくとも1つの細胞外リンカードメイン、(c)少なくとも1つの膜貫通ドメイン、(d)任意の共刺激ドメイン、および(e)任意の細胞内シグナル伝達ドメイン、ここで、1つの抗原特異的標的化領域は、第2の鎖上に存在するvHフラグメントおよび/またはvLフラグメントと結合してフラグメント可変体(Fv)を作製することが可能なvLフラグメントおよび/またはvHフラグメントからなり、第2の抗原特異的標的化ドメインは、AABD(e. g., vHH、SVH、センチリン、アフィボディなど)からなる。一実施形態では、Fvは抗原に結合する。別の実施形態では、Fvは抗原に結合しない。一実施形態では、Fvは、AABDを含む第2の抗原特異的ターゲティングドメインの結合のための足場として機能する。一実施形態では、AABDは非scFv抗原結合ドメインである。
2本の鎖を含む例示的な二重鎖二重特異性SARは、CD8SP-CD20-VHH-2HC2D6-USC1-Kpn-G4S-EcoR1-hu-mROO5-1-vL-xho-IgCL-Bam-NKp30-ECDTMCP-opt1-F-P2A-である。 SP-hu-mROO5-1-vH-Mlu-IgG1-CH1-Kpn-NKp30-ECDTMCP-opt2-F-F2A-PACであり、配列番号(DNA): 1605および配列番号(PRT): 3999で表される。 SAR コンストラクトの一方の鎖は、IgCL リンカーを介して NKp30 細胞外、膜貫通、およびサイトゾルドメインに融合されたヒト化 hu-mROO5-1 vL フラグメントを含み、SAR のもう一方の鎖は、IgCL リンカーに融合されたヒト化 hu-mROO5-1 vH フラグメントを含みます。 NKp30の細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインを含む第2鎖。 IgG1-CH1 リンカー経由。 SAR の hu-mROO5-1 vL フラグメントと hu-mROO5-1 vH フラグメントは一緒になって、CD19 を標的とする Fv を形成します。 CD20を標的とするvHHフラグメント(CD20-USC1-vHH-2HCD26;配列番号841)は、グリシン-セリンリンカーを介してhu-mROO5-1 vHフラグメントのN末端に融合される。したがって、SAR は hu-mROO5-1 Fv を介して CD19 を標的とし、CD20-USC1-vHH-2HCD26 を介して CD20 を標的とします。 SAR はモジュール形式であることに注意してください。したがって、SAR の 1 つのモジュールを別のモジュールに置き換えることができます。例えば、hu-mROO5-1 vLフラグメントおよびhu-mROO5-1 vHフラグメントは、異なる抗原を標的とするvL/vHフラグメントと置き換えることができる。同様に、CD20-USC1-vHH-2HCD26 モジュールは、異なる抗原を標的とする別の AABD に置き換えることができます。 IgCLおよびIgG1-CH1リンカーは、配列番号1142~1175(表13)で提供される他の適切なIg様リンカーと置き換えることができる。最後に、両方のNKp30断片の一方を、NKp44、NKp46、CD16、CD3zまたはDAP10に由来するポリペプチドの一方または両方で置き換えることができる。
NKp30 ECDTMCP 鎖の 1 つが CD16-F158V-S197P-FL-TMCP 鎖で置換された例示的な構築物は、CD8SP-CD20-VHH-2HC2D6-USC1-Kpn-G4S-EcoR1-hu-mROO5-1- で表されます。 vL-xho-IgCL-Bam-NKp30-ECDTMCP-opt1-F-P2A-SP-hu-mROO5-1-vH-Mlu-IgG1-CH1-Kpn-CD16-F158V-S197P-FL-TMCP-v3-F- F2A-PAC(配列番号(DNA):1618および配列番号(PRT):4012)。他の例示的な単一特異性、二重特異性、および三重特異性SAR構築物は、仮出願の表32に提供される。
CD19、CD20およびBCMAを標的とする例示的な三重特異性二重鎖構築物は、配列番号(DNA):1714および配列番号(PRT):4108によって表される。CD19、CD20およびBCMAを標的とする別の例示的な三重特異性二重鎖構築物は、配列番号によって表される。番号 (DNA): 1619 および配列番号 (PRT): 4013。
開示のSARは、 1つ、典型的には2つ以上のvH(V )ドメイン、すなわち、1つ以上のvH単一ドメイン抗体を含み、軽鎖を欠いている。一実施形態では、SARは少なくとも2つを含む。 vH 単一ドメイン (SVH) 抗体。
開示のSARは、1つ、典型的には2つ以上のVHHドメイン、すなわち、1つ以上のVHH単一ドメイン抗体を含み、軽鎖を欠いている。一実施形態では、SARは少なくとも2つのVHH単一ドメインを含む。
開示のSARは、 1つ、典型的には2つ以上の非免疫グロブリン抗原結合足場、すなわち、 DARPIN、アフィボディ、ZIPドメイン(例えば、RZIP、EZIP、E4、R4などから選択される1つ以上のドメイン)を含む。 ) 、アフィリン、アドネクチン、アフィチン、ボディ、レペボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質またはフラグメントその。一実施形態では、SARは2つのAABDを含む。一実施形態では、SARは、Fv(すなわち、結合してFvを形成するvL/vH断片)および少なくとも1つのAABDを含む。
開示のSARは、 1つ以上の抗原を標的とする少なくとも2つのAABD(例えば、2つのSVHドメインまたは2つのVHHドメイン、または1つのSVHおよび1つのVHHドメインなど)を含む。
開示のSARは、 1つまたは複数の抗原を標的とする少なくとも2つの抗原結合ドメインを含む。
開示のSARの抗原結合ドメインは、同じ抗原に特異的な2つまたは少なくとも2つのAABD(例えば、SVH、VHH、セントチリンなど)を含み、したがって二価の結合分子を提供する。一実施形態では、抗原結合ドメインは、同じ抗原に特異的であるが、前記抗原上の異なるエピトープに結合する2つまたは少なくとも2つのAABD(例えば、SVH、VHH、セントチリンなど)を含む。換言すれば、抗原結合ドメインは、第1のエピトープに結合する第1のAABD(例えば、 SVH、VHH、センチリンなど)と、第2のエピトープに結合する第2のAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)とを含む。 。エピトープは重複している可能性があります。したがって、抗原結合ドメインはバイパラトープ性であり、本開示の範囲にはバイパラトープ性SARが含まれる。さらに別の実施形態では、抗原結合ドメインは、同じ抗原に特異的であり、前記抗原上の同じエピトープに結合する2つのAABD(例えば、SVH、VHH、セントイリンなど)を含む。
本開示のSARの抗原結合ドメインは、Fv(例えば、異なるシグナル鎖に結合し、単鎖フラグメント可変形式またはscFv形式では存在しないvLフラグメントおよびvHフラグメント)と、Fvによって結合されるものと同じ抗原に特異的である少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)とを含み、したがって、二価結合分子を提供する。一実施形態では、抗原結合ドメインは、Fvと、Fvと同じ抗原に特異的であるが前記抗原上の異なるエピトープに結合する少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)とを含む。言い換えれば、抗原結合ドメインは、第一のエピトープに結合するFvと、第二のエピトープに結合する第二のAABD(例えば、SVH、VHH、Centyrinなど)から構成される。エピトープは重複している可能性がある。したがって、抗原結合ドメインはバイパラトープであり、本開示の範囲にはバイパラトープSARが含まれる。さらに別の実施形態では、抗原結合ドメインは、同じ抗原に特異的であり、前記抗原上の同じエピトープに結合するFvおよび少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)を含む。さらに別の実施形態では、抗原結合ドメインはFvと少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)から構成され、Fv断片はいかなる特異的抗原にも有意な親和性で結合しないか、または有意でない親和性で結合し、1つ以上のAABDの結合のための足場として役立つにすぎない。
一実施形態では、本開示のSARの抗原結合ドメインは、TCR-Fv(例えば、異なるシグナル鎖に結合され、単鎖TCR形式またはscTCR形式には存在しないVα/VβフラグメントまたはVγ/Vδフラグメント)と、TCR-Fvによって結合されるのと同じ抗原に特異的である少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)とからなり、したがって二価の結合分子を提供する。一実施形態では、抗原結合ドメインは、TCR-Fv(例えば、Va/VbまたはVg/Vd)およびTCR-Fvと同じ抗原に特異的であるが、前記抗原上の異なるエピトープに結合する少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)を含む。すなわち、抗原結合ドメインは、第一のエピトープに結合するTCR-Fvと、第二のエピトープに結合する第二のAABD(例えば、SVH、VHH、Centyrinなど)から構成される。エピトープは重複している可能性がある。したがって、抗原結合ドメインは、バイパラトープであり、本開示の範囲は、バイパラトープSARを含む。さらに別の実施形態では、抗原結合ドメインは、同じ抗原に特異的であり、前記抗原上の同じエピトープに結合するTCR-Fvおよび少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)を含む。さらに別の実施形態では、抗原結合ドメインはTCR-Fvと少なくとも1つのAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)から構成され、TCR-Fv断片は、いかなる特異的抗原にも有意な親和性で結合しないか、または有意でない親和性で結合し、1つ以上のAABDの結合のための足場として役立つにすぎない。
別の実施形態では、抗原結合ドメインは、2つの異なる抗原に特異的な2つのAABD(例えば、SVH、VHH、セントイリンなど)を含み、したがって二重特異性抗原結合ドメインを提供する。換言すれば、抗原結合ドメインは、第1の標的に結合する第1のAABD(例えば、 SVH、VHH、センチリンなど)と、第2の標的に結合する第2のAABD(例えば、SVH、VHH、センチリンなど)とを含む。 。したがって、特定の実施形態では、本開示は二重特異性SARに関する。
本明細書で使用する場合、「二重特異性SAR」または「二重特異性抗原結合ドメイン」という用語は、従って、以下のものからなるポリペプチドを指す;第1の標的抗原に対して結合特異性を有する結合部位を有する、本明細書に記載の結合分子、および、第2の標的抗原に対する結合特異性を有する結合部位を有する第2のポリペプチドドメイン、すなわち、二重特異性結合分子は2つの標的に対する特異性を有する。第1の標的および第2の標的は、同じではない、すなわち、異なる標的、例えば、タンパク質である;両方とも細胞表面に存在し得る。したがって、本明細書に記載の二重特異性結合分子は、第1の標的および第2の標的を発現する(またはその細胞表面に提示する)細胞に選択的かつ特異的に結合することができる。別の実施形態では、結合分子は2つ以上の抗原結合ドメインからなり、多重特異性結合分子を提供する。本明細書に記載の多特異的抗原結合ドメインは、第一の標的を結合することに加えて、1つ以上の付加的な標的を結合することができる。すなわち、多特異的ポリペプチドは、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、少なくとも6つ、またはそれ以上の標的を結合することができ、ここで、多特異的ポリペプチド剤は、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、少なくとも6つ、またはそれ以上の標的結合部位をそれぞれ有する。
3つ以上のAABD(例えば、SVH、VHH、セントイリンなど)を含む抗原結合ドメインも本開示の範囲内である。
一態様では、本開示は、2つ以上の抗原を標的とするための本開示のSARの最適な構成を記載する。一態様では、本開示は、1つ以上の抗原の2つ以上のエピトープを標的とするための本開示のSARの最適な構成を記載する。
本開示の単鎖および二本鎖SARは、当技術分野で公知の方法を用いて内在性TCRα、TCRβ、TCRおよび/またはTCRδ遺伝子の発現が減少または除去されたT細胞において発現され得る。内因性の機能的なTRAC、TRBC、TRGCおよび/またはTRDC鎖の発現が減少または除去されたそのようなT細胞は、同種異系細胞治療の目的に使用することができる。
本開示の一本鎖SARおよび二本鎖SARは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるPCT/US2018/053247に記載されるような方法を使用して、T細胞のTRAC、TRBC、TRGCおよび/またはTRDC遺伝子座に標的化され得る。内在性TRAC、TRBC、TRGCおよび/またはTRDC遺伝子座がSARの挿入によって破壊されたそのようなT細胞は、同種異系細胞治療の目的に使用することができる。
本開示はまた、同種異系SAR-T細胞を生成する目的で、二重特異性および多重特異性SARをTRACおよび/またはTRBC遺伝子座に標的化するための組成物および方法を提供する。
一実施形態では、本開示の一本鎖SARおよび二本鎖SARは、免疫細胞、例えば、T細胞、NK細胞、NKT細胞、単球、マクロファージおよび/または好中球などで発現される1つ以上の遺伝子をコードする内因性遺伝子座を標的とすることができる。
一実施形態では、本開示の単鎖および二本鎖SARは、NK細胞で発現される1つまたは複数の遺伝子をコードする内在性遺伝子座を標的とすることができる。
一実施形態では、本開示の一本鎖および二本鎖SARは、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DS4、DAP10、DAP12、FcRγ、CD3z、NKG2D、NKG2AおよびDNAM1からなる群から選択される1つ以上の遺伝子をコードする内因性遺伝子座を標的とすることができる。
一実施形態では、本開示の一本鎖SARおよび二本鎖SARは、SARの抗原結合ドメインが、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、DAP10、DAP12、FcRγ、CD3z、NKG2D、NKG2CおよびDNAM1遺伝子の細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、および/または膜貫通ドメインの一部または全部とフレーム内で発現されるように、CD16A、CD16B NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DS4、DAP10、DAP12、FcRγ、CD3z、NKG2D、NKG2C、およびDNAM1のうちの1つ以上をコードする内因性遺伝子座に標的化される。
一実施形態では、本開示の一本鎖および二本鎖SARは、SARの抗原結合ドメインが、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DS4、DAP10、DAP12、FcRγ、CD3z、およびDNAM1遺伝子をコードするシグナルペプチドの下流およびフレーム内に挿入されるように、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DS4、DAP10、DAP12、FcRγ、CD3z、およびDNAM1遺伝子の1つまたは複数をコードする内因性遺伝子座に標的化される。
ゲノム操作されたiPSCの指向性分化による、T細胞およびNK細胞を含む免疫細胞の生成方法は、WO2020117526、WO2020210398、WO2019126748、WO2019112899、WO2019018603およびUS10370452を含めて当技術分野で公知であり、これらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
一態様では、SARの新規抗原結合ドメインは、造血系細胞上で優先的にまたは排他的に発現される抗原に結合する。造血系細胞上で優先的にまたは排他的に発現される例示的な抗原は、CD19、CD20、CD22、BCMA、CS1、CD33、MPL、CD138、CD38およびCD123である。一態様では、SARの新規な抗原結合ドメインは、非造血系細胞上で優先的にまたは排他的に発現される抗原に結合する。非造血系細胞上で優先的にまたは排他的に発現される例示的な抗原は、メソテリン(MSLN)、Her2、EGFR、PSMA、PSCA、GPC3などである。ある態様では、SARは2つ以上の新規抗原結合ドメインを発現し、新規抗原結合ドメインの少なくとも1つは造血系細胞に優先的または排他的に発現する抗原に結合し、新規抗原ドメインの少なくとも1つは非造血系細胞に発現する抗原に結合する。
本開示は、SARの2つ以上のAABD(例えば、SVH、VHH、セントチリンなど)がリンカー、例えばペプチドリンカーによって接続され得ることを規定する。リンカーはまた、FvまたはTCR-Fvを含むvLおよび/またはvHドメインとAABDとの間に存在し得る。例えばリンカーを含む適切なリンカーには、(Gly 4 Ser) nなどのGS残基が含まれ、ここでn = 1から10、例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9または10である。リンカーは、配列番号(DNA): 1024~1028および配列番号(PRT): 3418~3422で提供される。
リンカーはまた、SARのFvまたはTCR-Fvを含むvLおよびvHドメインと、vLおよびvHドメインが結合するTCR定常鎖接続ペプチドとの間に存在し得る。特に、IgCLドメイン(配列番号(DNA):1142および配列番号(PRT):3536)およびIgCHドメイン(配列番号(DNA):1143~1157および配列番号(PRT):3537~3551)抗体に由来するものは、vL/vH とシグナル伝達鎖の間の有用なリンカーとして機能します。追加のIg様ドメインは当技術分野で公知であり(例えば、配列番号(DNA):1168~1175および配列番号(PRT):3562~3569)、本開示の代替実施形態において有用なリンカーとして機能し得る。
いくつかの実施形態では、SARの抗原結合ドメインを含む1つまたは複数のAABDは、介在するvL/vHフラグメントなしでシグナル伝達鎖に結合される。このような構築物では、リンカーは、SARのAABDと、AABDが結合するシグナル伝達鎖との間にも存在し得る。一実施形態では、二本鎖SARのAABDの一方はリンカーIgCL(配列番号1142)に結合され、他方のAABDはリンカーIgG1-CH1(配列番号1143)に結合される。一実施形態では、二本鎖SARのAABDの一方はリンカーIgCL(配列番号1142)に結合され、他方のAABDはリンカーIgG4-CHI1(配列番号1152)に結合される。一実施形態では、二本鎖SARのAABDの一方はリンカーTCRa-wt-opt-6ECD(配列番号1158)に結合され、他方のAABDはリンカーTCRb-wt-opt-6ECD(配列番号1158)に結合される。 ID NO: 1160)。
いくつかの実施形態において、SARポリペプチド分子の抗原結合ドメインは、2つのシグナル伝達鎖(例えば、CD16A、NKp30、NKp44、NKp46、DAP10、DAP12など、または本明細書に記載されるそれらの変異体もしくはバリアント)のNH2末端またはNH2末端近傍に別々に結合される抗体のvLドメインおよびvHドメインに由来するか、またはそれらから構成され を結合して、特定の抗原に結合する断片変数を共同で構成する。
いくつかの実施形態において、SARポリペプチド分子の抗原結合ドメインは、MHC分子と会合して特異的ペプチド抗原に結合するフラグメント可変-TCR(TCR-Fv)を共同で構成するために、2つのシグナル鎖(例えば、CD16A、NKp30、NKp44、NKp46、CD3z、DAP10、DAP12など、または本明細書に記載されるその変異体もしくはバリアント)のNH2末端又はNH2末端付近に別々に結合されるTCRのVα及びVβドメインに由来するか、又はそれらから構成される。
いくつかの実施形態において、SARポリペプチド分子の抗原結合ドメインは、特異的ペプチド抗原/MHCまたは脂質抗原に結合するフラグメント可変-TCR(TCR-Fv)を共同で構成するために、2つのポリペプチド鎖(例えば、CD16A、NKp30、NKp44、NKp46、CD3z、DAP10、DAP12など、または本明細書に記載されるその変異体もしくはバリアント)のNH2末端またはNH2末端近傍に別々に結合されるTCRのVγドメインおよびVδドメインに由来するか、またはこれらからなる。
いくつかの実施形態では、SARポリペプチドは、単鎖可変フラグメント(scFv)として発現され、シグナル伝達鎖(例えば、CD16A 、 NKp30 、 NKp44、NKp46、DAP10、DAP12tなど、または本明細書に記載のそれらの変異体もしくは変異体)。
特定の実施形態では、二重鎖SARの2つのポリペプチド鎖のAABDは、構造が類似している(例えば、両方のAABDは、SVHまたはラクダ科動物のVHHドメインまたはアフィボディまたはセントチリンである)。一実施形態では、二重鎖SARの2つのポリペプチド鎖のAABDは構造が類似していない(例えば、第1の抗原結合ドメインはSVHであり、第2の抗原結合ドメインはラクダ科動物VHHである)。
いくつかの実施形態では、コードされるSARポリペプチドの抗原結合ドメインは、対応する野生型配列または非野生型配列の抗体、単一ドメイン抗体(SDAB )、VHドメイン、VLドメイン、ラクダ科VHHドメイン、または、DARPIN、アフィボディ、アフィリン、アデクチン、アフィチン、オボディ、レペボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクチン、アンチカリン、クニッツドメイン、アルマジロリピートタンパク質、自己抗原、受容体またはリガンドなどの非免疫グロブリン足場のコドン最適化ヌクレオチド配列によってコードされる。
SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、SEQ ID NO 2440~2676の軽鎖可変ドメイン(vLまたはVL)アミノ酸配列のいずれか1つ以上を含み、ここで、最大20個のアミノ酸残基であるが、21個以下のアミノ酸が、他のアミノ酸残基、またはSEQ ID NO 2440~2676のアミノ酸配列に対して70~99.9%の同一性を有する配列、またはSEQ ID NO:2440~2676の相補性決定領域(CDR)に対して70~100%の同一性を有する配列、または10736から10972の3つの相補性決定領域の各々において3個までのアミノ酸置換を有する配列によって置換されている。 表3は、本開示で使用する例示的なvLドメインのscFvの標的抗原、名称、SEQ ID NO(DNA)、SEQ ID NO(PRT)、SEQ ID NO(PRT)を示す。
いくつかの実施形態において、SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、SEQ ID NO: 2682-2918の重鎖可変ドメイン(vHまたはVH)アミノ酸配列のいずれか1つ以上を含み、ここで、最大20個のアミノ酸残基であるが、21個以下のアミノ酸が、任意の他のアミノ酸残基、または配列番号2682~2918のアミノ酸配列と70~99.9%の同一性を有する配列によって置換される。SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、SEQ ID NO: 2682-2918の重鎖可変ドメイン(vHまたはVH)アミノ酸配列のいずれか1つ以上を含み、ここで、最大20個のアミノ酸残基であるが、21個以下のアミノ酸が、他のアミノ酸残基、またはSEQ ID NO: 2682-2918のアミノ酸配列に対して70~99.9%の同一性を有する配列、またはSEQ ID NO: 2682-2918の相補性決定領域(CDR)に対して70~100%の同一性を有する配列、またはSEQ ID NO: 2682-2918の3つの相補性決定領域のいずれかにおいて3個までのアミノ酸置換を有する配列によって置換される。表3は、本開示で使用する例示的なvHドメインのscFvの標的抗原、名称、SEQ ID NO(DNA)、SEQ ID NO(PRT)、SEQ ID NO(PRT)を示す。
いくつかの実施形態において、SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、SEQ ID NO:3253-3296のラクダ科単一ドメイン抗体(vHHまたはVHH)アミノ酸配列のいずれか1つ以上からなり、ここで、最大20個のアミノ酸残基であるが、21個以下のアミノ酸が、他のアミノ酸残基、またはSEQ ID NO:3253-3296のアミノ酸配列に対して70~99.9%の同一性を有する配列、またはSEQ 3253-3296の3つの相補性決定領域(CDR)のいずれかに3個までのアミノ酸置換を有する配列によって置換される。
いくつかの実施形態では、SARポリペプチドのコードされた1つまたは複数の抗原結合ドメインは、SEQ ID NO: 3366-3377の非免疫グロブリン抗原結合スカフォールドアミノ酸配列のいずれか1つまたは複数を含み、ここで、最大20個のアミノ酸残基であるが、21個以下のアミノ酸が任意の他のアミノ酸残基、または配列番号3366~3377のアミノ酸配列と70~99%の同一性を有する配列によって置換される。
いくつかの実施形態では、SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、SEQ ID NO 3378-3395のレセプターアミノ酸配列のいずれか1つ以上からなり、ここで、最大20個のアミノ酸残基であるが、21個以下のアミノ酸が、任意の他のアミノ酸残基、または配列番号3378~3395のアミノ酸配列に対して70~99.9%の同一性を有する配列によって置換される。
いくつかの実施形態では、SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、配列番号3391の自己抗原アミノ酸配列を含み、最大19個のアミノ酸残基であるが、20個以下のアミノ酸が、任意の他のアミノ酸残基、または配列番号3391のアミノ酸配列と70~100%の同一性を有する配列によって置換される。
いくつかの実施形態では、SAR分子のコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、配列番号3396~3406のリガンドアミノ酸配列のいずれか1つ以上を含み、ここで、最大20個のアミノ酸残基であるが、21個以下のアミノ酸が、配列番号3396~3406のアミノ酸配列に対して70~100%の同一性を有する任意の他のアミノ酸残基または配列によって置換される。
いくつかの実施形態では、SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、配列番号2924~3160のscFvアミノ酸配列のいずれか1つ以上を含み、ここで、40個までのアミノ酸残基であるが、41個以下のアミノ酸が、その他のアミノ酸残基、またはSEQ ID NO 2924~3160のアミノ酸配列に対して70~100%の同一性を有する配列、またはSEQ ID NO 2924~3160の各々における6つの相補性決定領域(CDR)において70~100%の同一性を有する配列、またはSEQ ID NO:2924~3160の各々における6つの相補性決定領域(CDR)のいずれかに最大3個の置換を有する配列によって置換される。
いくつかの実施形態では、SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、抗原結合部分、例えば、この抗原を標的とするvLおよびvH断片のCDR、または表3に列挙されるvLおよびvH断片のCDRのいずれかにおいて3個までのアミノ酸置換を有するドメインのCDRのいずれか1つ以上を含む。表3に示したvLおよびvHフラグメントのCDR1-3の配列は、当技術分野で公知の方法により決定することができる。
いくつかの実施形態では、SARポリペプチドのコードされた1つ以上の抗原結合ドメインは、この抗原を標的とするvHHフラグメントの抗原結合部分、例えばCDRのいずれか1つ以上を含む。
一実施形態では、SARの抗原結合ドメインは、この標的抗原に結合することが知られている受容体の抗原結合部分である。
別の実施形態では、本開示は、本開示のSARのいずれかと異なる標的上の同じエピトープに結合するSAR(すなわち、本開示のSARのいずれかと異なる標的への結合について相互競合する能力を有するSAR)を提供する。開示)。いくつかの実施形態では、これらのSARの抗原特異的ドメインは、SARの成分として使用された抗体のvL断片、vH断片、および/またはscFv断片から決定され得る。いくつかの実施形態では、本開示のSARによって認識される標的エピトープを決定するための交差競合研究のための参照抗体は、本明細書に記載されるvL、vH、scFv、SVH、vHH、非免疫グロブリン抗原結合ドメインである。例示的な実施形態では、配列番号3027によって表される参照scFv hu-mROO5-1を交差競合研究に使用して、本開示のhu-mROO5-1ベースのSARによって認識される標的エピトープを決定することができる。いくつかの実施形態では、記載される本開示のSARによって認識される標的エピトープを決定するための交差競合研究のための参照AABDフラグメントは、本明細書に記載されるAABDフラグメントである。いくつかの実施形態では、記載される本開示のSARによって認識される標的エピトープを決定するための相互競合研究のための相互競合研究のための参照非免疫グロブリン抗原結合足場は、非免疫グロブリン抗原結合足場ベースのAABDである。いくつかの実施形態では、本開示のSARによって認識される標的エピトープを決定するための相互競合研究のための参照リガンドはリガンドである。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の二重特異性SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異性SARのそれぞれの親和性と比較して、標的抗原のそれぞれに対して30%以上(例:40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、99%以上など)の親和性を示す。結合親和性は、Topanga Assayなどの当技術分野で知られているアッセイを使用して測定することができる。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の二重特異性SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異性SARの各々のシグナル伝達活性と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対して30%以上(例えば、40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上、99%以上など)のシグナル伝達活性を示す。シグナル伝達活性は、Jurkat-NFAT-GFP細胞アッセイなどの当技術分野で知られている方法を使用して測定することができる。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の二重特異性SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異性SARの各々のサイトカイン産生と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対して30%以上(例えば、40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上、99%以上など)のサイトカイン(例えば、TNFα、IFNγ、IL-2など)産生を示す。サイトカイン産生(例えば、TNFα、IFNγ、IL-2など)は、ELISAなどの当技術分野で知られている方法を使用して測定することができる。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の二重特異性SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異性SARの各々の細胞傷害活性と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対して30%以上(例えば、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または95%、99%など)の細胞傷害活性を示す。細胞傷害活性は、マタドールまたは放射性クロム放出アッセイなどの当技術分野で知られている方法を使用して測定することができる。
本明細書に記載の他の実施形態において、本開示の二特異性SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異性SARの各々のインビボ活性と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対するインビボ活性の30%以上(例えば、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または95%、99%等)を示す。一実施形態では、インビボ活性は、免疫不全マウスの異種移植モデルを使用して測定される。
本明細書に記載される他の実施形態において、本開示の多特異的SARは、エフェクター細胞において発現され、同様の条件下で比較された場合、対応する非特異的SARの各々の親和性と比較して、標的抗原の各々に対して30%以上(例えば、40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上、99%以上など)の親和性を示す。結合親和性は、Topanga Assayなどの当技術分野で知られているアッセイを使用して測定することができる。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の多特異的SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異的SARの各々のシグナル伝達活性と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対するシグナル伝達活性の30%以上(例えば、40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上、99%以上など)を示す。シグナル伝達活性は、Jurkat-NFAT-GFP細胞アッセイなどの当技術分野で知られている方法を使用して測定することができる。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の多特異的SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異的SARの各々の細胞傷害活性と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対して30%以上(例えば、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または95%、99%など)の細胞傷害活性を示す。細胞傷害活性は、マタドールまたは放射性クロム放出アッセイなどの当技術分野で知られている方法を使用して測定することができる。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の多特異的SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異的SARの各々のサイトカイン産生と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対して30%以上(例えば、40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上、99%以上など)のサイトカイン(例えば、TNFα、IFNγ、IL-2など)産生を示す。サイトカイン産生(例えば、TNFα、IFNγ、IL-2など)は、ELISAなどの当技術分野で知られている方法を使用して測定することができる。
本明細書に記載される他の実施形態では、本開示の多特異的SARは、エフェクター細胞で発現させ、同様の条件下で比較した場合、対応する非特異的SARの各々のインビボ活性と比較して、標的抗原発現細胞の各々に対するインビボ活性の30%以上(例えば、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または95%、99%など)を示す。一実施形態では、インビボ活性は、免疫不全マウスの異種移植モデルを使用して測定される。
いくつかの実施形態では、細胞表面に存在する場合、二重特異性SARのFvまたはTCR-Fv(すなわち、vL/vH、Vα/VβまたはVγ/Vδフラグメント)によって構成される抗原結合ドメインの同族抗原に対する結合親和性は、前記SARのvL、vH、Vα、Vβ、VγまたはVδフラグメントのN末端領域に結合している1つまたは複数のAABDによって実質的に低下しない。一実施形態では、SARは二重鎖SARである。
いくつかの実施形態では、細胞の表面に存在する場合、二重特異性SARのFvまたはTCR-Fv(すなわち、vL/vH、Vα/VβまたはVγ/Vδフラグメント)によって構成される抗原結合ドメインの、前記SARのvL、vH、Vα、Vβ、Vγおよび/またはVδフラグメントのN末端領域またはN末端近傍に結合している1つまたは複数のAABDを含む同族抗原に対する抗原結合親和性が、対応する非特異的SARの抗原結合ドメインの抗原結合親和性の少なくとも70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%であり、ここで、1つ以上のAABDは、vL、vH、Vα、Vβ、VγまたはVδ断片のN末端領域またはN末端領域の近くに結合しない。
いくつかの実施形態では、前記第2のSAR鎖の存在下での前記第1のSAR鎖の抗原結合ドメインのその同族抗原に対する結合は、前記第2のSAR鎖の非存在下での前記第1のSAR鎖の抗原結合ドメインのその同族抗原に対する結合の70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%である。
いくつかの実施形態では、SARの第2の鎖(またはCAR)の存在下でのSARの第1の鎖の抗原結合ドメインのその同族抗原への結合は、SARの第2の鎖(またはCAR)の非存在下でのSARの第1の鎖の抗原結合ドメインのその同族抗原への結合の70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%である。
一実施形態では、V ドメインは、SEQ ID NO: 3210-3252と比較して1つ以上のアミノ酸置換、欠失、挿入または他の改変を有するSEQ ID NO: 3210-3252から選択され、単一ドメイン抗体の生物学的機能を保持する。
別の実施形態では、V ドメインは、SEQ ID NO: 3210-3252と比較して1つ以上のアミノ酸置換、欠失、挿入または他の改変を有するSEQ ID NO: 3210-3252から選択され、単一ドメイン抗体の生物学的機能を保持する。一実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸置換は、1つまたは複数のフレームワーク領域内にある。別の実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換は、1つ以上のCDR内にある。一実施形態では、アミノ酸置換はフレームワーク配列およびCDR配列内にある。
本開示はまた、本明細書に記載される単一ドメイン抗体の配列最適化された変異体を含む。
開示のSARの結合ドメインは、 BCMAに対するバイパラトピック標的化を提供する。したがって、結合ドメインは、BCMAの第1エピトープに結合する第1AABD(例えば、V H単一ドメイン抗体)およびBCMAの第2エピトープに結合するAABD(例えば、V H単一ドメイン抗体)を含む。第1および第2のエピトープは重複していてもよい。
開示のSARの結合ドメインは、 CD22に対するバイパラトピック標的化を提供する。したがって、結合ドメインは、 CD22の第1のエピトープに結合する第1のV H単一ドメイン抗体およびCD22の第2のエピトープに結合する第2のV H単一ドメイン抗体を含む。第1および第2のエピトープは重複していてもよい。
開示のSARの結合ドメインは、 CD38に対するバイパラトピック標的化を提供する。したがって、結合ドメインは、 CD38の第1のエピトープに結合する第1のV H単一ドメイン抗体およびCD38の第2のエピトープに結合する第2のV H単一ドメイン抗体を含む。第1および第2のエピトープは重複していてもよい。
開示のSARの結合ドメインは、 CEAに対するバイパラトピック標的化を提供する。したがって、結合ドメインは、CEAの第1のエピトープに結合する第1のV H単一ドメイン抗体およびCEAの第2のエピトープに結合する第2のV H単一ドメイン抗体を含む。第1および第2のエピトープは重複していてもよい。
開示のSARの結合ドメインは、 PSMAに対するバイパラトピック標的化を提供する。したがって、結合ドメインは、PSMAの第1のエピトープに結合する第1のV 単一ドメイン抗体およびPSMAの第2のエピトープに結合する第2のV H単一ドメイン抗体を含む。第1および第2のエピトープは重複していてもよい。
一実施形態において、本開示のSARの結合ドメインは、二重特異的標的化を提供する。したがって、結合ドメインは、BCMAに結合するV H単一ドメイン抗体と、第2の標的を標的とする第2の結合部分とを含む。第2の結合部分は、抗体フラグメント、典型的にはV 単一ドメイン抗体、セントチリン、アフィボディ、またはvHHドメインであり得る。第2の標的は、CD19、CD20、CD22、BCMA、PSCA、CS1、GPC3、CSPG4、EGFR、5T4、L1 CAM、MUC16、ROR1、cKit、ROR1、メソテリン、IL3Ra、c-Met、EGFRvIII、GDから選択され得る。 2、NY-ESO-1 TCRまたはMAGE A3 TCR、HER2、ウィルムス腫瘍遺伝子1(WT1)、癌胎児性抗原(CEA)、ムチン16、MUC1、免疫チェックポイント標的、またはそれらの組み合わせ。しかし、当業者であれば、他の腫瘍抗原も本開示の範囲内の潜在的な組み合わせ標的であることを理解するであろう。単鎖 SAR の場合、2 つの結合ドメインはどちらの順序で存在してもよい。
一実施形態では、SARの第1結合ドメインは、BCMAと結合するAABD(例えば、VH単一ドメイン抗体またはSVH、vHHまたはセンチリンなど)と、CD38を標的とする第2結合部分とからなる。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。例示的なvL/vHフラグメントおよびそれらの標的抗原を表3に示す。一実施形態では、SARは、結合して異なる抗原を標的とするTCR-Fvを形成するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。例示的なVa/VbまたはVg/Vd断片およびそれらの標的抗原を表4に示す。
一実施形態では、SARの1つの結合ドメインは、BCMAと結合するAABD(例えば、VH単一ドメイン抗体またはSVH、vHHまたはセンチリンなど)と、CD19を標的とする第2の結合部分とからなる。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。例示的なvL/vHフラグメントおよびそれらの標的抗原を表3に示す。一実施形態では、SARは、結合して異なる抗原を標的とするTCR-Fvを形成するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。例示的なVa/VbまたはVg/Vd断片およびそれらの標的抗原を表4に示す。
一実施形態では、SARの第1結合ドメインは、BCMAと結合するAABD(例えば、VH単一ドメイン抗体またはSVH、vHHまたはセンチリンなど)と、CD22を標的とする第2結合部分とからなる。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。例示的なvL/vHフラグメントおよびそれらの標的抗原を表3に示す。一実施形態では、SARは、異なる抗原を標的とするTCR-Fv(またはTCR-Fv)を形成するために結合するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。例示的なVa/VbまたはVg/Vd断片およびそれらの標的抗原を表4に示す。
一実施形態では、SARの第1結合ドメインは、BCMAと結合するAABD(例えば、VH単一ドメイン抗体またはSVH、vHHまたはセンチリンなど)と、CD20を標的とする第2結合部分とからなる。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。
一実施形態では、SARの第1の結合ドメインは、CD22に結合するAABDと、CD20を標的とする第2の結合部分とを含む。
一実施形態では、SARの第1の結合ドメインは、CD22に結合するAABDと、CD19を標的とする第2の結合部分とを含む。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。一実施形態では、SARは、結合して異なる抗原を標的とするTCR-Fvを形成するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。
一実施形態では、SARの第1の結合ドメインは、CD19に結合するAABDと、CD20を標的とする第2の結合部分とを含む。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。一実施形態では、SARは、結合して異なる抗原を標的とするTCR-Fvを形成するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。
CD19に結合するAABDと、CD38を標的とする第2の結合部分とを含む。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。一実施形態では、SARは、結合して異なる抗原を標的とするTCR-Fvを形成するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。
CD19に結合するAABDと、CD123を標的とする第2の結合部分とを含む。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。一実施形態では、SARは、結合して異なる抗原を標的とするTCR-Fvを形成するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。
CD19に結合するAABDと、BAFF-Rを標的とする第2の結合部分とを含む。一実施形態では、SARは、結合して特定の抗原を標的とするFvを形成するvL/vHフラグメントをさらに含む。一実施形態では、SARは、結合して異なる抗原を標的とするTCR-Fvを形成するVa/VbまたはVg/Vd断片をさらに含む。
上記で詳細に記載した結合ドメインに加えて、本開示のSARは、1つまたは複数のシグナル伝達鎖またはフラグメントおよびその変異体をさらに含んでもよい。 例示的なシグナル伝達鎖およびフラグメントは、SEQ ID NO(DNA):1349~1584および8541~8767(新規鎖)ならびにSEQ NO(PRT):3743~3966、3385、3394、7818~7822、9633~9859に提供される。本開示はまた、細胞外ドメイン、細胞外および膜貫通ドメイン、膜貫通ドメイン、ヒンジドメイン(SEQ ID NO(DNA):1535~1549およびSEQ ID NO (PRT):3929~3943)、細胞質ドメイン(SEQ ID NO (DNA):1550~1564およびSEQ ID NO (PRT):3944~3958)およびコスティミュレイトリードメイン(SEQ ID NO (DNA):1565~1572およびSEQ ID NO (PRT):3959~3966)を提供する。例示的な実施形態では、SARを構築するためのシグナル伝達鎖および断片は、SEQ ID NO: 3743-3966 3385, 3394, 7818-7822, 9633-9859 で表されるポリペプチド、またはそれらと少なくとも60%、70%、80%もしくは90%の相同性を有する断片、またはそれらの機能的変異体、または非ヒト種、例えばマウス、げっ歯類、サル、類人猿などの同等残基(すなわちホモログ)からなる。他の哺乳動物種からのシグナル伝達鎖およびフラグメントを、本開示のSARを作製するために本開示の方法において使用できることが理解されるべきである。さらに、ヒトおよび他の哺乳動物種に由来するシグナル伝達鎖およびフラグメントのハイブリッドであるシグナル伝達鎖およびフラグメントを、本開示のSARを作製するために本開示の方法において使用することができる。最後に、本明細書に記載のシグナル伝達鎖およびフラグメントの選択的にスプライシングされたアイソフォームを本開示の方法で使用して、SARを作製することができる。
本開示のSARは、1つ以上の膜貫通ドメインを含む。本明細書で使用される「膜貫通ドメイン」(TMD)は、原形質膜を横断し、小胞体シグナル伝達ドメインおよび抗原結合ドメインに接続されるSARの領域を指し、後者の場合、必要に応じてヒンジドメインまたは接続ドメインを介して、ペプチド。一実施形態では、本開示のSARの膜貫通ドメインは、 I型またはII型膜貫通タンパク質の膜貫通領域、または人工疎水性配列、またはそれらの組み合わせである。一実施形態では、膜貫通ドメインは、CD16、CD64、CD32、KIR2DS4、CD3z、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2D、DAP10、DAP12、CD28およびCD8に由来する膜貫通ドメインを含む。他の膜貫通ドメインは当業者には明らかであり、本開示の代替実施形態と関連して使用することができる。具体的には、配列番号3914~3928に示されるTMD配列が開示の範囲内にある。
開示のSARは、細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。 「細胞内シグナル伝達ドメイン」、「細胞質ドメイン」、または「エンドドメイン」は、活性化シグナルをT細胞に伝達し、細胞がその特殊な機能を実行するように指示するドメインです。具体的には、配列番号3944~3958に示される細胞内シグナル伝達ドメイン配列が開示の範囲内にある。
開示のSARは、抗原特異的結合後のSAR-T細胞活性を増強するための1つ以上の共刺激ドメインをさらに含む。複数の共刺激ドメインを単一の SAR に含めて、複数のシグナル伝達経路を動員することができます。具体的には、配列番号3959~3966を有する共刺激ドメイン配列が開示の範囲内にある。
一実施形態において、本開示のSARは、細胞外抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとを接続するヒンジまたはスペーサー領域をさらに含む。このヒンジまたはスペーサー領域を使用して、得られる SAR のさまざまな長さと柔軟性を実現できる。本開示に従って使用できるヒンジ領域またはスペーサー領域の例としては、抗体のFc断片またはその断片もしくは誘導体、抗体のヒンジ領域またはその断片もしくは誘導体、抗体のCH2領域、抗体のCH3領域、CD8Aヒンジドメイン、CD28ヒンジドメイン、CD16ヒンジドメイン、NKp30ヒンジドメイン、NKp44ヒンジドメイン、NKp46ヒンジドメイン、および人工スペーサー配列、例えばペプチド配列、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。他のヒンジまたはスペーサ領域は当業者には明らかであり、本開示の代替実施形態と関連して使用することができる。具体的には、配列番号3592~3598および3929~3943に示されるヒンジ配列が開示の範囲内にある。 TCR接続ペプチド(配列番号3571~3579)もヒンジドメインとして機能し得る。
開示のSARは、 SARの異なるドメインを接続する「リンカードメイン」または「リンカー領域」をさらに含む。このドメインには、長さ約 1 ~ 500 アミノ酸のオリゴまたはポリペプチド領域が含まれます。適切なリンカーは当業者には明らかであり、本開示の代替実施形態と関連して使用することができる。
開示のSARは、 「リーダー配列」をさらに含む。一実施形態では、リーダー配列はCD8Aドメインである。具体的には、配列番号2425~2430のリーダー配列が開示の範囲内にある。
開示のSARは、阻害シグナルを伝達する抗原結合ドメインを含む。
開示のSARは、可溶性ポリペプチドアダプターまたはタグに結合することを可能にするアダプター結合ドメインを含む。例示的なアダプターおよびアダプター結合ドメインは、配列番号3407~3435に提供される。例示的な実施形態では、RZIPコード化SARを、CD19発現細胞を標的とするために、CD19を標的とする抗原結合ドメインを含むEZIPコード化ポリペプチド(配列番号3409)と併用することができる。同様に、NKG2D-AF-G4Sx3-NKG2D-AFコード化SAR(例えば、SEQ ID NO: 5481)は、BCMAを標的化するために、ULBP2Rコード化ポリペプチド(例えば、CD8SP-BCMA-FHVH93-GS-ULBP2R、SEQ ID NO: 5131)と組み合わせて使用され得る。代替の実施形態において、NKG2D-YA-G4Sx3-NKG2D-YAコード化SAR(例えば、SEQ ID NO: 5482)は、BCMAを標的化するために、ULBP2-S3コード化ポリペプチド(例えば、CD8SP-BCMA-FHVH93-GS-ULBP2-S3、SEQ ID NO: 5132)と組み合わせて使用され得る。同様に、Streptag(SEQ ID NO: 4970)またはFITC(例えば、SEQ ID NO: 4963-4964)を標的とする抗原結合ドメインをコードするSARは、Streptag標識またはFITC標識抗体/抗体フラグメントと組み合わせて、後者によって結合された抗原を標的とするために使用することができる。他のアダプターは当技術分野で知られており(例えば、WO2019099440およびDiana Darowskiら、MABS、2019、VOL.11、NO.4、621-631)、本開示の代替実施形態で使用することができる。
SARは、標識、例えば、蛍光標識または他のタグなどのイメージングを容易にする標識をさらに含んでもよい。これは、例えば腫瘍結合を画像化する方法に使用できます。標識は抗原結合ドメインに結合していてもよい。
本明細書に記載されるSARは、単一のポリペプチド鎖として合成され得る。この実施形態では、抗原特異的標的化領域はN末端にあり、縦列に配置され、リンカーペプチドによって分離されている。
例えば、抗体または抗体フラグメント、リガンドまたは受容体)を含む単離されたSARポリペプチド分子を提供する。 。
いくつかの実施形態では、SARは、単一のシグナル伝達鎖(クラス1)のNH2末端に連結された単一の抗原結合ドメインを含有する単一のポリペプチドを含むか、またはそれからなり得る。
いくつかの実施形態では、SARは、集合して機能的SAR(クラス2)を作製する2つのポリペプチドを含むか、またはそれらからなる。このような二重鎖クラス2SARのポリペプチドのそれぞれは、シグナル伝達鎖を含み、(クラス2Aのように)1つ以上の抗原結合ドメインを含むか、または(クラス2Bのように)含まない。クラス 2A SAR では、各抗原結合ドメインが別個のシグナル伝達鎖の N 末端に結合しています。例えば、抗原結合ドメイン1(抗体のvLフラグメントなど)が一方のDAP10鎖に結合して機能的ポリペプチドユニット1を構成し、抗原結合ドメイン2(抗体のvHフラグメント)が第2のDAP10鎖に結合して機能的ポリペプチドユニット2を構成する。このようなSARの2つの機能的なポリペプチドユニットは、同じ細胞内で共発現され、互いに対になって機能的に活性になる。各抗原結合ドメインは二重特異性または多重特異性であり、それによってクラス 2 SAR が 2 つを超える抗原を標的にすることができることに留意すべきである。
いくつかの実施形態では、クラス2SARの2つの機能的ポリペプチド単位は、異なるベクターを使用して細胞内で共発現される。いくつかの実施形態において、クラス2SARの2つの機能的ポリペプチド単位は、クラス2SARの2つの機能的ポリペプチド単位をコードする2つのポリヌクレオチドをコードするために2つの別個の調節エレメント(例えば、プロモーター)を用いる単一のベクターを用いて細胞内で共発現される。本開示は、第2のポリペプチドユニットまたは第3のアクセサリーモジュールを発現させるために使用できる小さなプロモーターが、EFSプロモーター、EFS2プロモーター、またはRSVプロモーターであることを提供する。いくつかの実施形態において、クラス2 SARの2つの機能的ポリペプチド単位は、SARの2つのポリペプチドをコードするヌクレオチド断片を分離するIRES配列を含むポリヌクレオチドを発現するために単一のプロモーターを用いる単一のベクターを用いて細胞内で共発現される。いくつかの実施形態において、クラス2 SARの2つの機能的ポリペプチド単位は、切断可能なリンカー(例えば、F2A、T2A、E2A、P2Aなど)を含む単一のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現するために単一のプロモーターを用いる単一のベクターを用いて細胞内で共発現される。その結果、mRNAは1つのポリペプチドをコードし、このポリペプチドはその後、SARの2つの機能的ポリペプチドユニットを生成する。いくつかの実施形態では、クラス2 SARの2つの機能的ポリペプチド単位は、両方の機能的ポリペプチド単位をコードする単一のmRNA配列のトランスフェクションを用いて共発現されるが、他の実施形態では、2つの機能的ポリペプチド単位は、それぞれが1つの機能的ポリペプチド単位をコードする2つの異なるmRNA配列のトランスフェクションによって共発現される。いくつかの実施形態において、SARをコードするベクターまたはmRNAは、追加の遺伝子/タンパク質(治療コントロール、阻害分子、アクセサリーモジュールなど)をコードしていてもよく、これらは、別々のプロモーター(例えば、EFS、EFS2またはRSVプロモーター)またはそれらの組み合わせを使用して発現されるIRESまたは切断可能なリンカーによって、SARコード配列から分離されていてもよい。別の実施形態では、治療対照または補助モジュールまたはその両方は、SARが発現される細胞において、別個のベクターまたはmRNAを使用して発現され得る。治療コントロールまたはアクセサリーモジュールは、SARの機能にとって必須ではなく、本実施形態のSARのいずれも、治療コントロールまたはアクセサリーモジュールなしで使用できることは理解されるべきである。例えば、PAC(ピューロマイシン耐性遺伝子)などの抗生物質耐性カセットは、SARの機能を損なうことなく、本開示のSARコードベクターから除去することができる。
また、親SARと実質的または有意な配列同一性または類似性を有し、それが変異体であるSARの生物学的活性を保持する、本明細書に記載のSARの機能的変異体も提供される。機能的変異体には、例えば、親SARと同程度、同じ程度、またはより高い程度まで標的細胞を認識する能力を保持する、本明細書に記載のSAR(親SAR)の変異体が含まれる。親SARに関して、機能的変異体は、例えば、少なくとも約30%、約50%、約75%、約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、親SARとアミノ酸配列において約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%以上同一である。
機能的変異体は、例えば、少なくとも1つの保存的アミノ酸置換を有する親SARのアミノ酸配列を含み得る。あるいは、またはさらに、機能的変異体は、少なくとも1つの非保存的アミノ酸置換を有する親SARのアミノ酸配列を含むことができる。この場合、非保存的アミノ酸置換が機能的変異体の生物学的活性を妨害したり阻害したりしないのが一般的である。非保存的アミノ酸置換は、機能的変異体の生物活性を増強することができ、その結果、機能的変異体の生物活性は、親CARと比較して増加する。
SAR(機能的部分および機能的変異体を含む)は、SAR(またはその機能的部分もしくは機能的変異体)がその生物学的活性、例えば、抗原に特異的に結合する能力、哺乳動物における疾患細胞を検出する能力、または哺乳動物における疾患を治療もしくは予防する能力などを保持することを条件として、任意の長さ、すなわち任意の数のアミノ酸からなることができる。例えば、SARは約300~約5000アミノ酸長、例えば300、400、500、600、700、800、900、1000またはそれ以上のアミノ酸長であり得る。
別の態様では、本開示は、上で定義したSARをコードする少なくとも1つの核酸を含む単離された核酸構築物に関する。一実施形態では、核酸は、表Bに列挙された標的の1つを標的とするタンパク質をコードする。
明細書に記載の任意のSARポリペプチドに対して少なくとも60%、70%、80%または90%の相同性を有する配列も本開示の範囲内である。 SARはモジュール設計であるため、本明細書で説明するSARの1つ以上のモジュールを異なるモジュールで置き換えることによって、追加のSARを生成することができる。例えば、 SARの抗原結合ドメイン(すなわち、vL、vH、scFv、vHH、FHVH、セントチリンなど)は、他の抗原を標的とする抗原結合ドメインによって置き換えることができる。
「核酸」、「ポリヌクレオチド」、または「核酸分子」という用語は、デオキシリボ核酸(DNA)またはリボ核酸(RNA)、あるいはDNAまたはRNAの組み合わせを指す。 RNAには、インビトロで転写されたRNAまたは合成RNAが含まれます。本明細書に記載のSARポリペプチドをコードするmRNA配列)。核酸は、自殺遺伝子をさらに含み得る。構築物は、プラスミド、ベクター、転写または発現カセットの形態であってもよい。
一実施形態では、ベクターは、インビトロ転写ベクター、例えば、本明細書に記載の核酸分子のRNAを転写するベクターである。発現ベクターは、ウイルスベクターの形態で細胞に提供され得る。ウイルスベクター技術は当技術分野で周知であり、例えば、Sambrook et al. (分子クローニング:実験マニュアル、コールドスプリングハーバー研究所、ニューヨーク、2013)。哺乳動物細胞への遺伝子導入のために、ウイルスに基づいたシステムが数多く開発されています。例えば、アデノウイルスベクター等のレトロウイルスが用いられる。一実施形態では、レンチウイルスベクターが使用される。これは例で実証されています。本開示はまた、上記のSARを含むウイルスに関する。
本開示には、細胞に直接トランスフェクトできるRNA構築物も含まれる。トランスフェクションに使用するmRNAを作製する方法は、特別に設計されたプライマーによる鋳型のin vitro転写(IVT)を含み、3'および5'非翻訳配列(「UTR」)(例えば、本明細書に記載される、 本明細書に記載の3'および/または5'UTR)、5'キャップ(例えば、本明細書に記載の5'キャップ)および/または内部リボソーム進入部位(IRES)(例えば、本明細書に記載のIRES)、発現させる核酸、およびポリAテールを含むコンストラクトを産生するために、ポリAを付加する(典型的には50-2000塩基長)(SEQ ID NO:13-16)。このようにして生成された RNA は、さまざまな種類の細胞に効率的にトランスフェクトできる。一実施形態では、鋳型はSARの配列を含む。一実施形態では、RNA SARベクターは、エレクトロポレーションによって細胞、例えば、T細胞、NK細胞、またはiPSCに形質導入される。別の実施形態では、RNA SARベクターは、マイクロ流体デバイスを使用して細胞膜に一時的な摂動を引き起こすことによって、細胞、例えば、T細胞またはNK細胞に形質導入される。 SARの異なる鎖(または機能的ポリペプチド単位)は、1つまたは複数のベクター、異なるベクターまたは技術の組み合わせを使用して細胞に導入することもできる。
別の実施形態では、SARの一方の鎖または機能的ポリペプチド単位はレトロウイルスベクターを使用して導入することができ、他方の機能的ポリペプチド単位はレンチウイルスベクターを使用して導入することができる。別の態様では、一方の機能的ポリペプチド単位はレンチウイルスベクターを使用して導入され、他方の機能的ポリペプチド単位はスリーピングビューティートランスポゾンを使用して導入される。さらに別の態様では、1つの機能的ポリペプチド単位はレンチウイルスベクターを使用して導入され、他の機能的ポリペプチド単位はRNAトランスフェクションを使用して導入される。さらに別の態様では、1つの機能的ポリペプチド単位は、当技術分野で公知の遺伝子ターゲティング技術を使用する内因性TCR鎖遺伝子座での遺伝子組換えによって細胞内に産生され、一方、他の機能的ポリペプチド単位は、レンチウイルスまたはレトロウイルスベクターを使用して導入される。
RNAは、多数の異なる方法のいずれかを使用して標的細胞に導入することができ、例えば、エレクトロポレーション、リポフェクションを使用したカチオン性リポソーム媒介トランスフェクション、ポリマーカプセル化、ペプチド媒介トランスフェクション、または銃銃粒子を含むがこれらに限定されない市販の方法を使用することができる。 「遺伝子銃」などの送達システム(例えば、Nishikawa, et al. Hum Gene Ther., 12(8):861-70 (2001)を参照)、またはマイクロ流体デバイスを使用して細胞膜に一時的な摂動を引き起こすことによる(以下を参照)例えば、特許出願WO2013/059343A1およびPCT/US2012/060646)。
いくつかの実施形態では、非ウイルス法には、トランスポゾン(転移因子とも呼ばれる)の使用が含まれる。
トランスポゾンを使用する核酸送達の例示的な方法には、Sleeping Beautyトランスポゾンシステム(SBTS)およびpiggyBac(PB)トランスポゾンシステムが含まれる。
いくつかの実施形態では、 SBTSを使用する遺伝子挿入とヌクレアーゼ(例えば、ジンクフィンガーヌクレアーゼ (ZFN)、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ (TALEN)、CRISPR/Cas システム、または人工メガヌクレアーゼ再工学ホーミングエンドヌクレアーゼ)。
いくつかの実施形態では、非ウイルス送達方法の使用により、細胞、例えば、T、NK、NKT、幹細胞またはiPSCもしくは合成T細胞の再プログラミング、および対象への細胞の直接注入が可能になる。
さらなる態様では、本発明はまた、上記のような1つ以上の核酸構築物を含む単離された細胞または細胞集団にも関する。したがって、細胞は、本開示のSAR核酸構築物を発現するように遺伝子改変されている。したがって、本発明は、本発明のSAR核酸構築物を含み、それを安定に発現する遺伝子操作された細胞を提供する。一実施形態では、細胞は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、制御性T細胞、造血幹細胞および/または多能性胚/誘導幹細胞からなる群から選択される。T細胞は、本開示のSAR核酸構築物によるトランスフェクションのために患者から単離され得る。
例えば、細胞は、ex vivoで本開示の核酸でトランスフェクトすることができる。様々な方法により、本開示のSARを発現する安定なトランスフェクタントが生成される。一実施形態では、細胞を安定にトランスフェクトし、再方向付けする方法は、裸のDNAを使用するエレクトロポレーションによるものである。本開示のSARをコードする裸のDNAを使用して細胞を遺伝子操作する追加の方法には、化学的形質転換法(例えば、リン酸カルシウム、デンドリマー、リポソームおよび/またはカチオン性ポリマーを使用する)、非化学的形質転換法(例えば、エレクトロポレーションを使用する)が含まれるが、これらに限定されない。 、光学的形質転換、遺伝子エレクトロトランスファーおよび/または流体力学的送達)および/または粒子ベースの方法(例えば、遺伝子銃を使用するインペールフェクションおよび/またはマグネトフェクション)。組み込まれた再構成されていないベクターの存在およびSARの発現を示すトランスフェクトされた細胞は、エクスビボで拡張され得る。ウイルス形質導入法を使用して、本開示のSARを発現するリダイレクトされた細胞を生成することもできる。
いくつかの実施形態では、本開示のベクターはプロモーターをさらに含むことができる。プロモーターの非限定的な例としては、例えば、EF-1プロモーター、CMV IE遺伝子プロモーター、EF-1αプロモーター、MNDU3プロモーター、ユビキチンCプロモーター、コアプロモーター、またはホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)プロモーターが挙げられる。 。いくつかの実施形態では、プロモーターはEF-1プロモーターである。さらなる実施形態では、EF-1プロモーターは配列番号7を含む。いくつかの実施形態では、ベクターはRNA核酸である。いくつかの実施形態では、ベクターはポリ(A)テールを含む。
別の態様において、本開示は、SAR、例えば本明細書に記載のSARをコードする核酸、またはSAR分子、例えば本明細書に記載のSARをコードする核酸を含むベクターと、細胞、例えば本明細書に記載のT、NK、NK細胞株、マクロファージ、NKT、幹細胞、iPSCまたは合成T細胞に導入する(例えば、形質導入する)ことを含む、細胞(例えば、免疫エフェクター細胞またはその集団)を作製する方法を提供する。
細胞は、免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞、NK細胞もしくはNKT細胞、またはそれらの組み合わせ)、または免疫エフェクター細胞もしくは合成T細胞を生じさせることができる幹細胞/前駆細胞であり得る。いくつかの実施形態では、細胞は、NK92、NK92MIまたはその誘導体などの不死化細胞株である。いくつかの実施形態では、本方法における細胞は、内在性T細胞受容体α、β1、β2、プレTCRα、γもしくはδ、またはそれらの組み合わせの定常鎖を欠損している。いくつかの実施形態では、本方法における細胞は、HLA抗原を欠損している。いくつかの実施形態では、本方法における細胞はβ2ミクログロブリンを欠損している。いくつかの実施形態において、本方法における細胞は、SARの標的抗原の発現が欠損している。例えば、SAR発現T細胞は、SARがCD5を指向する場合には内因性CD5が欠損しており、SARがTCR-β1定数鎖を指向する場合にはTCR-β1定数鎖が欠損しており、SARがTCR-β2を指向する場合にはTCR-β2定数鎖が欠損しており、SARがCS1を指向する場合にはCS1が欠損している
いくつかの実施形態では、SARをコードする核酸分子を導入することは、SARをコードする核酸分子を含むベクターを形質導入すること、またはSARをコードする核酸分子をトランスフェクトすることを含み、ここで、核酸分子はインビトロ転写されたRNAである。いくつかの実施形態では、SARの2つ以上の成分をコードする核酸分子は、細胞に2つ以上のベクターを形質導入することによって、またはSARの異なるサブユニットをコードする2つ以上の核酸分子をトランスフェクトすることによって導入される。例えば、細胞は、それぞれがSARの2つの機能的ポリペプチド単位のうちの1つをコードする2つの別個のベクターで形質導入され得る。同様に、細胞は、 SARの2つの機能的ポリペプチド単位のうちの1つをそれぞれコードする2つの別個のインビトロ転写RNAで形質導入され得る。 SARの機能的ポリペプチド単位に加えて、RNAの各々は、両方のRNAで形質導入された細胞を選択するために使用され得る異なる選択マーカーまたはレポーター(例えば、tEGFR、tBCMA、またはCD34もしくはCNB30もしくは変異体DHFR)を有し得、したがって、SARの機能的ポリペプチドユニットの両方を発現する。
一実施形態では、本開示のSARは、内因性遺伝子の調節エレメントを使用して発現させることができる。一実施形態では、SARの1つまたは複数の異種抗原結合ドメインをコードする発現カセットは、天然に存在するシグナル伝達受容体またはシグナル伝達アダプターの遺伝子座を標的とする。一実施形態では、SARの1つまたは複数の異種抗原結合ドメインは、天然の受容体またはシグナル伝達アダプターの全体または部分的な細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、およびサイトゾルドメインをコードするmRNAと融合して転写される。一実施形態では、SARの1つ以上の異種抗原結合ドメインは、天然の受容体またはシグナル伝達アダプターのヒンジドメインおよびサイトゾルドメインをコードするmRNAと融合して転写される。一実施形態では、SARの1つ以上の異種抗原結合ドメインは、天然の受容体またはシグナル伝達アダプターの膜貫通ドメインおよび細胞質ゾルドメインをコードするmRNAと融合して転写される。一実施形態では、SARは、天然に存在する受容体またはシグナル伝達アダプターのプロモーターおよび転写調節エレメントの下で発現される。一実施形態では、内因性遺伝子座へのSARの標的化は、天然に存在する受容体またはシグナル伝達アダプターの発現の破壊をもたらす。
遺伝子を任意の特定の遺伝子座に標的化する方法は、当技術分野で知られている。一実施形態では、この方法は、CRISP/Cas9またはZnフィンガーヌクレアーゼまたはTAL ENの使用を含む。一実施形態では、SAR発現カセットは、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、 KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、 CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、そしてCD161の群から選択される天然受容体の遺伝子座を標的とする。一実施形態では、SAR発現カセットは、TAPIの遺伝子座、TAP2、タパシン、NLRC5、CIITA、RFXANK、CIITA、RFX5、RFXAP、TCRαもしくはβ定数領域、NKG2A、NKG2D、CD38、CD5、CD52、CD33、CD123、CLL-1、CIS、CBL-B、SOCS2、PD1、CTLA4、LAG3、TIM3、TIGIT、または染色体6p21領域の遺伝子を標的とする。
いくつかの実施形態では、本方法はさらに、a)免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞又はNK細胞)の集団を提供する工程;及びb)該集団からT制御細胞を除去し、それによりT制御欠失細胞の集団を提供するステップを含み、ここで、ステップa)およびb)は、SARをコードする核酸を集団に導入する前に行われる。
一実施形態では、細胞はヒトT細胞、NK細胞、マクロファージまたは樹状細胞である。いくつかの実施形態では、細胞はイヌ細胞である。
一実施形態では、細胞はT細胞であり、T細胞は1つ以上の内因性T細胞受容体鎖を欠損している。本開示による機能的TCRの発現を安定に欠くT細胞は、Znフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、CRISP/Cas9、および内因性T細胞受容体鎖を標的とするshRNAの使用などの様々なアプローチを使用して産生され得る。
機能的な内在性TCRを欠くT細胞は、例えば、その表面に機能的な内在性TCRを全く発現しないように操作されるか、機能的な内在性TCRを構成する1つ以上のサブユニット(例えば、内在性TCRα、TCRβ1、TCRβ2、TCRγ、TCRδまたはプレTCRαの定数鎖)を発現しないように操作されるか、またはその表面に機能的な内在性TCRをほとんど産生しないように操作され得る。あるいは、T細胞は、例えば、TCRのサブユニットの1つ以上の突然変異型または切断型の発現によって、実質的に障害された内因性TCRを発現することができる。 「実質的に障害のあるTCR」という用語は、このTCRが宿主において有害な免疫反応を誘発しないことを意味する。
本開示は、NK細胞において発現され、シグナル伝達活性を示すだけでなく、T細胞、および単球/マクロファージ、好中球、樹状細胞を含む他の免疫系譜においても発現され、シグナル伝達活性を示すことができる新規鎖(例えば、NKp30、NKp44、NKp46、DAP10、CD3z、NKG2D、CD16など)に基づくSARを提供する。本開示は、非T細胞におけるTCR様結合特性、すなわちペプチド/MHC複合体に結合する能力の普遍的な方法を提供する。したがって、本開示は、TCR様結合特性を有する非T細胞を提供する。実施形態では、本開示は、本開示のSARを発現させることによって、T細胞ではない細胞にTCR様結合特性を付与することができることを提供し、ここで、SARは、TCRの可変ドメインを含むがTCRモジュールを欠くuTCR-SARである。この実施形態では、本開示は、複数の遺伝子操作を必要とせずに、任意の細胞にTCR様の結合特性を与える簡単なワンステップ方法を提供する。一実施形態では、この方法は細胞内でのuTCR-SARの異所性発現を伴い、複数のCD3サブユニットの異所性発現および高発現クローンの選択に必要な追加のステップおよび時間の浪費を必要としない。したがって、この方法は、初代NK細胞、造血幹細胞またはiPSCなどの初代細胞を含む任意の細胞にT細胞様の結合およびシグナル伝達を与えるのに適している。この方法はまた、NK細胞株(例えば、NK92、NK92MI、NKGおよびYTS細胞株)のような不死化細胞株に対して、抗原に対するT細胞様結合(すなわち、ペプチド抗原に対するHLA依存的結合)および/またはTCR様シグナル伝達および細胞傷害性を付与するために用いることもできる。
本開示のSAR(例えば、uTCR-SAR、CD16-SARなど)は、非T細胞を含む任意の細胞において発現され得るため、本開示の方法は、生理的T細胞受容体複合体を介したシグナル伝達に依存するSIR、AbTCRなどの他の次世代CARプラットフォームと比較して、明確な利点を有する。本開示は、複数の組織および系統において活性なプロモーター(例えば、EF1α、MNDU3、ユビキチンなど)下で発現されるSARを提供する。本開示は、本開示のSARを幹細胞(例えば、造血幹細胞またはiPSC)中で発現させることができ、幹細胞を分化させると、NK、T、マクロファージ、好塩基球、好中球、B細胞、顆粒球、樹状細胞などの複数の系譜においてSARが機能的に発現し、それによってSARが標的とする抗原に対する強力な免疫応答がもたらされることを提供する。一実施形態では、SARはインビボで造血幹細胞において発現され、異なる血液系統への分化がインビボで起こる。本開示の別の実施形態では、SARはインビトロで幹細胞(例えば、iPSC)内で発現され、異なる血液系統への分化がインビトロで起こる。次いで、インビトロで分化および増殖した複数の系統の血液細胞が対象に投与される。
いくつかの実施形態において、本開示は、初代細胞(例えば、 一次NK細胞、g-NK細胞、CIK、メモリー様NK細胞、マクロファージ、樹状細胞、好中球、B細胞、顆粒球など)、細胞株、造血幹細胞、iPSC細胞、HLA欠損iPSC細胞、HLA欠損NK細胞、HLA欠損NK細胞株などの群から選択され、TCR様結合特性および/またはシグナル伝達活性を有する非T細胞を提供する。
以上のことから、本出願は、少なくとも1つのSARを含むiPS細胞、iPS細胞株細胞、またはそれからの誘導体細胞を提供し、誘導体細胞は、SARを含むiPS細胞の分化から得られる機能的エフェクター細胞である。いくつかの実施形態において、誘導体細胞は造血細胞であり、これには限定されないが、確定的造血内皮(HE)能を有する中胚葉細胞、確定的HE、CD34造血細胞、造血幹細胞および前駆細胞が含まれる、 造血多能性前駆細胞(MPP)、T細胞前駆細胞、NK細胞前駆細胞、骨髄系細胞、好中球前駆細胞、T細胞、NKT細胞、NK細胞、B細胞、好中球、樹状細胞、およびマクロファージであるが、これには限定されない。いくつかの実施形態において、機能的誘導体造血細胞は、T細胞、NK細胞、制御細胞などのエフェクター細胞からなる。
別の実施形態では、SARを含むiPSCまたはその誘導細胞は、IL2、IL4、IL6、IL7、IL9、IL10、IL11、IL12、IL15、IL18およびIL21のうちの少なくとも1つを含む外因性サイトカインおよび/またはサイトカイン受容体をさらに含む。
さらに、少なくともSAR発現を含むiPSC、iPS細胞株細胞、またはそれからの誘導体細胞が提供され、細胞の活性化、生存、持続、および/または増殖に寄与するサイトカインシグナル伝達を可能にするために、少なくとも1つの外因性サイトカインおよび/またはその受容体(IL)をコードするポリヌクレオチドをさらに含み得、ここで、iPSC株は、改善された活性化、生存、持続性、拡大、およびエフェクター細胞機能を有する機能的誘導体造血細胞を産生するために、指向性分化が可能である。外因的に導入されたサイトカインシグナル伝達(複数可)は、IL2、IL4、IL6、IL7、IL9、IL10、IL11、IL12、IL15、IL18、およびIL21のいずれか1つ、または2つ以上のシグナル伝達を含む。いくつかの実施形態では、サイトカインシグナル伝達は構成的に活性化される。いくつかの実施形態では、サイトカインシグナル伝達の活性化は誘導性である。いくつかの実施形態において、サイトカインシグナル伝達の活性化は、一過性及び/又は一時的である。いくつかの実施形態では、細胞表面サイトカイン/サイトカイン受容体の一過性/時間的発現は、レトロウイルス、センダイウイルス、アデノウイルス、エピソーム、ミニサークル、またはmRNAを含むRNAを介して行われる。いくつかの実施形態において、SAR過剰発現iPSCまたはその誘導体細胞に含まれる外因性細胞表面サイトカインおよび/または受容体は、IL7、IL10、IL15、IL18またはIL21シグナル伝達を可能にする。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL2、IL15、IL7などの膜アンカー型である。hIL2の膜アンカー型をコードする例示的な構築物は、配列番号1330によって表される。いくつかの実施形態では、サイトカインは、多目的スイッチの一部である。
また、SARおよび過剰発現されたNKG2C、CD94、DAP12、DAP10、BiKE、TriKE、hnCD16、CAR、IL、B2Mノックアウトおよび/またはCITAノックアウト;ならびに任意選択で、HLA-Gをコードするポリヌクレオチドを含む、iPS細胞、改変HLA欠損iPCS、iPS細胞株細胞、またはそれからの誘導体細胞が提供され、ここで、iPS細胞は、機能的な誘導体造血細胞を産生するために指向性分化が可能である。iPSCおよびその誘導体であるNK細胞またはT細胞の一実施形態では、細胞は他のゲノム編集の中でもB2M-/- CIITA-/-からなり、HLA-IおよびHLA-IIの両方が欠損しており、iPSCおよびその誘導体であるエフェクター細胞は持続性および/または生存性が改善されている。いくつかの実施形態では、エフェクター細胞は、インビボでの持続性および/または生存が増加している。
そのようなものとして、本明細書で提供されるのは、SAR、外因性サイトカイン/レセプター、B2Mノックアウト、およびCIITAノックアウトを含むiPSCであり;ここで、B2Mがノックアウトされる場合、HLA-Gをコードするポリヌクレオチドが任意に導入され;そしてiPSCが、機能的な誘導体造血細胞を産生するために指向性分化が可能である。また、本出願には、過剰発現SAR、外因性サイトカイン/レセプター、B2Mノックアウト、およびCIITAノックアウトからなる機能的iPSC誘導体造血細胞も含まれ、ここで、B2Mがノックアウトされる場合、HLA-Gをコードするポリヌクレオチドが任意に導入され、そして誘導体造血細胞は、確定造血内皮(HE)能を有する中胚葉細胞、確定HE、CD34造血細胞、造血幹細胞および前駆細胞、造血多能性前駆細胞(MPP)、T細胞前駆細胞、NK細胞前駆細胞、骨髄系細胞、好中球前駆細胞、T細胞、NKT細胞、NK細胞、B細胞、好中球、樹状細胞、およびマクロファージを含むが、これらに限定されない。また、本出願には、過剰発現したSAR、外因性サイトカイン/受容体、B2Mノックアウト、およびCIITAノックアウトを含む機能的iPSC誘導造血細胞も含まれる。ここで、B2Mがノックアウトされる場合、HLA-Gをコードするポリヌクレオチドが任意に導入され、派生造血細胞には、最終的造血内皮(HE)能を有する中胚葉細胞、最終的HE、CD34造血細胞、造血細胞が含まれるが、これらに限定されない。幹細胞および前駆細胞、造血多分化能前駆細胞 (MPP)、T 細胞前駆細胞、NK 細胞前駆細胞、骨髄細胞、好中球前駆細胞、T 細胞、NKT 細胞、NK 細胞、B 細胞、好中球、樹状細胞、およびマクロファージ。
SARを構成する前記1つまたは複数の外因性ポリヌクレオチドを含む細胞または細胞の集団の一実施形態では、細胞は、以下の1つまたは複数をさらに含む:(i)BiKEまたはTriKE;(ii)B2Mヌルまたは低値;(iii)CIITAヌルまたは低値;(iv)HLA-Gまたは非開裂型HLA-Gの導入発現;(v)キメラ抗原受容体(CAR);(vi)細胞表面発現外来性サイトカインまたはその受容体の部分ペプチドまたは完全ペプチド;(vii)多目的スイッチをコードする付属モジュール;(viii)B2M、TAPI、TAP2、タパシン、NLRC5、CIITA、RFXANK、CIITA、RFX5、RFXAP、TCRαまたはβ一定領域、 NKG2A、NKG2D、CD38、CD5、CD52、CD33、CD123、CLL-1、CIS、CBL-B、SOCS2、PD1、CTLA4、LAG3、TIM3、TIGIT、または染色体6p21領域のいずれかの遺伝子の少なくとも1つにおける欠失または発現低下、および(ix)HLA-E、41BBL、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ、DAP10、DAP12、CD4、CD8、CD16、CD47、CD94、CD113、CD131、CD137、CD80、PDL1、A2AR、Fcレセプター、エンゲイジャー、または二重特異性もしくは多重特異性エンゲイジャーもしくは万能エンゲイジャーと結合するための表面トリガーレセプターの少なくとも1つにおいて、導入または発現の増加。
uTCR-SARの代替アプローチにおいて、本開示はまた、NK細胞またはNK細胞株などの非T細胞において発現される内因性TCRシグナルに依存するSIR、AbTCR、cTCRおよび他の類似のプラットフォーム上でSARを発現させる方法を提供する。一実施形態では、細胞は免疫細胞(例えば、NK、単球、マクロファージ、好中球、NK92細胞株など)または幹細胞(例えば、iPSC)であり、免疫細胞または幹細胞は、CD3ε、CD3γ、CD3δおよびCD3ζのうちの1つ以上、またはそれらの変異体を異所的に発現するように操作される。一実施形態では、細胞は免疫細胞または幹細胞(例えば、iPSC)であり、免疫細胞(例えば、NK、単球、マクロファージ、好中球など)または幹細胞(例えば、iPSC)は、1つ以上のCD3ε、CD3γ、CD3δまたはその変異体を異所的に発現するように操作される。一実施形態において、CD3ε、CD3γ、CD3δおよびCD3ζを異所的に発現するように操作された細胞は、本開示の1つ以上のSARも発現する。一実施形態では、本開示のSARは、1つ以上のTCR定数鎖またはそのフラグメント(例えば、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδなどの定数鎖)からなる。1つ以上のTCR定常鎖または断片を含む例示的なSARとしては、SIR(配列番号2305)、cTCR、Ab-TCR(配列番号2309および2310)、STAR、HIT、TFPおよびTFPαβおよびTFPγδが挙げられる。一実施形態において、細胞におけるCD3ε、CD3γ、CD3δ及び/又はCD3ζの発現は、1つ以上のTCR定数鎖又は断片を含むSARの機能発現を促進する。。
一実施形態では、細胞は幹細胞であり、幹細胞は1つ以上の内因性T細胞受容体鎖を欠損している。別の実施形態では、細胞は、SARの1つ以上の標的抗原(例えば、MPL、CD33、CD123、CD19など)が欠失されているか、またはSARによってもはや認識されない形態に変異されている幹細胞である。 。一例として、CD19を標的とするSARは、CRISP/Cas9またはZnフィンガーヌクレアーゼを使用してCD19を欠損させた幹細胞で発現されるため、そのような幹細胞によって産生されるB細胞は、CD19を標的とするSARを発現するT細胞によって排除されない。 SAR。あるいは、CD19を標的とするSARは、内因性CD19がCRISP/Cas9またはZnフィンガーヌクレアーゼを使用してSARの標的とならない形態に変異した幹細胞で発現され、そのような幹細胞によって産生されるB細胞がSARによって排除されないようにする。 CD19 を標的とする SAR を発現する T 細胞。別の実施形態では、SARは免疫エフェクター細胞で発現され、自家ドナーまたは同種ドナーからの幹細胞は、SAR標的抗原の発現を欠くか、またはそうではない変異型のSAR標的抗原を発現するように遺伝子操作される。 SARによって認識されています。たとえば、CD19を標的とするSARは、CRISP/Cas9またはZnフィンガーヌクレアーゼを使用してCD19を欠損させた自家または同種造血幹細胞とともに患者に注入されたT細胞で発現され、そのような幹細胞によって産生されるB細胞はCD19 を標的とする SAR を発現する T 細胞によって細胞は排除されません。あるいは、CD19 を標的とする SAR は、CRISP/Cas9 または Zn フィンガー ヌクレアーゼを使用して内因性 CD19 が SAR の標的とならない形態に変異している自家または同種造血幹細胞とともに患者に注入される T 細胞で発現されます。そのため、そのような幹細胞によって産生されたB細胞は、CD19を標的とするSARを発現するT細胞によって排除されない。同様のアプローチを使用して、治療のためにこれらの抗原を標的とするSAR-T細胞を受けている被験者において、shRNA、CRISP/Cas9またはZnフィンガーヌクレアーゼを使用して、幹細胞内の他の内因性抗原(例えば、MPL、CD33、CD123など)を変異または除去することができる。これらの抗原が疾患関連細胞または疾患の原因となる細胞上で発現される特定の疾患について説明します。
免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、単球/マクロファージ、好中球など)または幹細胞を対象から得ることができる。 「対象」という用語は、免疫応答が誘発され得る生体(例えば、哺乳動物)を含むことを意図している。対象の例としては、ヒト、サル、チンパンジー、イヌ、ネコ、マウス、ラット、およびそれらのトランスジェニック種が挙げられる。免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、単球/マクロファージ、好中球など)は、末梢血単核球、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、生体組織などの多くの供給源から得ることができます。感染部位、腹水、胸水、脾臓組織、腫瘍。一実施形態では、免疫細胞は、CXCR4アンタゴニスト(例えば、プレリキサフォル)などの動員剤を投与された対象から得られる。免疫細胞は組織常在性ガンマデルタ T 細胞であり、 SAR の発現前にin vitro で培養および増殖させることができます。
免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、単球/マクロファージ、好中球など)は、幹細胞のインビトロ分化によって得ることができる。一実施形態では、免疫細胞は、 iPSCのインビトロ分化によって得られる。
SARを発現するために使用される免疫細胞は、自己免疫細胞であっても同種異系免疫細胞であってもよい。
-SARを含む本開示のSARを発現する細胞は、疾患の治療に使用される。
したがって、本開示は、本明細書に記載のSARを含む細胞または細胞集団を被験体に投与することを含み、癌などの疾患の予防および/または処置のための方法に関し、前記方法は、それを必要とする被験体に、本開示の細胞および/または医薬組成物の薬学的に活性な量を投与することを含む。
本開示はまた、治療において使用するための、本明細書に記載のSAR、SARを含む細胞または細胞集団に関する。本開示はまた、癌の治療に使用するための、本明細書に記載のSARまたはSARを含む細胞に関する。本開示はまた、癌の治療のための薬剤の製造における、本明細書に記載のSARまたはSARを含む細胞の使用にも関する。
別の態様では、本開示は、対象における標的細胞集団または組織に対するT細胞媒介免疫応答を刺激する方法であって、SARを発現する細胞または細胞集団の有効量を対象に投与することを含む方法に関する。本開示の抗原結合ドメインは、標的細胞集団または組織を特異的に認識するように選択される。
別の態様では、本開示は、対象において抗腫瘍免疫を提供する方法であって、本開示のSARを発現するように遺伝子改変された有効量の細胞または細胞集団を哺乳動物に投与することにより、被験者の抗腫瘍免疫。
別の態様では、本発明は、本発明のSAR核酸構築物を前記細胞または細胞集団において発現させることを含む、遺伝子改変された細胞または細胞集団を生成する方法に関する。この方法は、本明細書に記載の核酸(例えば、インビトロ転写RNAまたは合成RNA;本明細書に記載のSARポリペプチドをコードするmRNA配列)を細胞に導入することを含み得る。実施形態において、RNAは、SARポリペプチドを一時的に発現する。一実施形態では、細胞は、本明細書に記載の細胞、例えば、免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞もしくはNK細胞、または細胞集団)である。このような方法によって生成された細胞も本開示の範囲内である。
別の態様では、本開示は、本開示のSARで前記細胞を形質転換することを含む、適応免疫療法に使用するための細胞集団を生成するエクスビボ方法に関する。
本開示のある態様において、免疫エフェクター細胞、例えばT細胞又はNK細胞は、FicollTM分離のような当業者に公知の任意の数の技術を用いて、被験者から採取された単位血液から得ることができる。一実施形態では、個体の循環血液由来の細胞は、アフェレーシスによって得られる。一態様において、細胞は、T細胞及び/又はNK細胞が薬剤の投与によって動員された対象から収集される。いくつかの実施形態では、免疫細胞の収集前に、CXCR4アンタゴニスト(例えば、Plerixafor)、サイトカイン(例えば、 G-CSF、GM-CSFまたはサルグラモスチム、ノイラスタまたはペグフィルガストリム)、β2アゴニスト(エピネフリンなど)、チロシンキナーゼ阻害剤(ダサチニブなど)、化学療法薬(シクロホスファミド、ドキソルビシンなど)を単独でまたは組み合わせて投与したドナーから免疫細胞を収集する。いくつかの実施形態では、ドナーは自己ドナーであるが、他の実施形態では、ドナーは同種ドナーである。
通常、アフェレーシス製品には、T 細胞、単球、顆粒球、B 細胞、NK 細胞、その他の有核白血球、赤血球、血小板などのリンパ球が含まれています。一態様では、アフェレーシスによって収集された細胞を洗浄して血漿画分を除去し、場合により、その後の処理ステップのために細胞を適切な緩衝液または培地に入れることができる。一実施形態では、細胞はリン酸緩衝食塩水(PBS)で洗浄される。別の実施形態では、洗浄溶液はカルシウムを欠き、マグネシウムを欠く場合があり、またはすべてではないにしても多くの二価カチオンを欠く場合がある。
別の実施形態では、本明細書に記載のSAR発現エフェクター細胞は、SAR発現細胞の活性を増強する薬剤をさらに発現することができる。いくつかの実施形態では、薬剤は、阻害分子を阻害する薬剤である。阻害分子の非限定的な例としては、PD-1、PD-L1、CTLA-4、TIM-3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3および/またはCEACAM-5)、LAG-3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4およびTGFRβが挙げられる。一実施形態において、阻害分子を阻害する薬剤は、細胞に陽性シグナルを提供する第2のポリペプチド、例えば、 41BB、CD27、OX40、CD28、Dap10、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1、Lck、TNFR-1、TNFR-II、Fas、CD30、CD40またはこれらの組み合わせ)および/または一次シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ζシグナル伝達ドメイン)のような細胞内シグナル伝達ドメインと会合した、阻害分子に結合する第1のポリペプチド、例えば、scFvもしくはVHH、またはレセプターもしくはリガンドフラグメントを含む。一実施形態では、阻害性分子を阻害する薬剤は、本明細書に記載のシグナル伝達鎖(例えば、CD16、NKp30、NKp44、およびNKp46など)に関連する第1のポリペプチド、例えば、scFvもしくはVHHフラグメント、または阻害性分子に結合する受容体もしくはリガンドフラグメントからなる。
別の実施形態では、本明細書に記載のSAR発現細胞は、アクセサリーモジュール、例えば、SAR発現細胞の活性を調節する薬剤をさらに発現することができる。 SAR発現細胞の活性を増強または調節することができる薬剤を含むアクセサリーモジュールのいくつかの例を配列番号3702~3725に提供する。例えば、一実施形態では、薬剤は、CD3ε、CD3δ、CD3ε、CD3γ、またはそれらの組み合わせの発現および/または活性を増加させる薬剤であり得る。別の実施形態では、薬剤は、SAR発現細胞に共刺激シグナルを提供する薬剤(例えば、vFLIP K13、vFLIP MC159、cFLIP-L、cFLIP-p22、HTLV1 Tax、HTLV2 Tax、41BBまたはCD28)であり得る。別の実施形態では、薬剤は、誘導可能な様式でSAR発現細胞に共刺激シグナルを提供する薬剤(例えば、FKBPx2-K13、Myr-MYD88-CD40-Fv'-Fvなど)であり得る。別の実施形態において、薬剤は、SAR発現細胞の増殖または持続を促進するサイトカインまたはケモカイン(例えば、CD40L、IL2、IL-7、IL-15、IL12fまたはIL-21)であり得る。例示的な実施形態では、薬剤は膜アンカー型のヒトIL2(配列番号(DNA):1330および配列番号(PRT):3724)である。
本開示は、「多目的スイッチ」として機能する治療用制御装置/付属品モジュールも提供する。例示的な実施形態では、多目的スイッチは、細胞内で異所的に発現される場合、養子細胞療法の目的で生死スイッチとして機能する。一実施形態では、多目的スイッチは、受容体結合ドメインを含む第1モジュールと、キルスイッチとして機能する第2モジュールおよび膜アンカーモジュールとして機能する第3モジュールとのインフレーム融合を含む。一実施形態では、第1のモジュールは、細胞表面上に発現される受容体に結合する、すなわち、受容体の細胞外ドメインに結合する。一実施形態では、第1のモジュールは、結合すると生存促進および/または増殖シグナルを細胞に伝達する受容体に結合する。一実施形態では、第1モジュールはシスで受容体に結合する(すなわち、分子スイッチを発現する細胞と同じ細胞上で発現される受容体に結合する)。 一実施形態では、第1のモジュールはトランスで受容体に結合する(すなわち、分子スイッチを発現する細胞以外の細胞上で発現される受容体に結合する)。一実施形態では、第1のモジュールは受容体にシスおよびトランスで結合する。一実施形態では、第2モジュールと第3モジュールは同じ内因性タンパク質に由来する。一実施形態では、第2および第3モジュールは、異なる内因性タンパク質に由来する。一実施形態では、第2のモジュールは、内在性タンパク質の細胞外ドメインまたはその断片を含む。一実施形態では、第2のモジュールを使用して、分子スイッチを発現する細胞の死を誘導することができる。一実施形態では、第2のモジュールは、薬剤が結合したときに分子スイッチを発現する細胞の死を誘導するために使用することができる。例示的な実施形態では、第2のモジュールに結合したときに分子スイッチを発現する細胞の死を誘導する薬剤は、抗体、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、抗体薬物複合体、二重特異性抗体、またはフラグメントである。その。一実施形態では、第2のモジュールを使用して、分子スイッチを発現する細胞を選択的に濃縮または枯渇させることができる。一実施形態では、第2のモジュールを使用して、薬剤が結合したときに分子スイッチを発現する細胞を選択的に検出、富化および/または枯渇させることができる。例示的な実施形態では、第2のモジュールに結合した場合に分子スイッチを発現する細胞を選択的に検出、富化および/または枯渇させるために使用できる薬剤は、抗体、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、または非免疫グロブリン抗原結合ドメインである。その断片。一実施形態では、分子スイッチは、エクスビボで細胞を選択的に検出、濃縮、および/または枯渇させるために使用される。一実施形態では、分子スイッチは、インビボで細胞を選択的に枯渇させるために使用される。一実施形態において、分子スイッチを発現する細胞を検出、枯渇または濃縮するために使用される薬剤(すなわち、抗体、抗体薬物複合体、二重特異性抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメインまたはその断片)は、FDAによってヒトへの投与が承認されている。ヒトへの投与がFDAによって承認されている例示的な薬剤は当技術分野で知られており、リツキシマブ、ハーセプチン、アービトラックス、アドセトリス、エンブレルなどが挙げられるが、これらに限定されない。一実施形態では、分子スイッチを発現する細胞を検出、枯渇、濃縮するために使用される薬剤は、生体外臨床使用についてFDAによって承認されている。例示的なそのような薬剤は、臨床的に承認されたCliniMACS CD34システム(Miltenyi)と併せて使用されることがFDAによって承認されているCD34に対する抗体である。例示的な多目的スイッチは、Synth-IL2-Nde-tBCMA-L244ter (配列番号(DNA):7152および配列番号(PRT):7843)であり、細胞外ドメインにインフレームで融合されたIL2のIL2受容体結合ドメインを含むそしてBCMAの膜貫通ドメイン。この多目的スイッチは、免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞など)で発現されると、IL2を含むN末端モジュールを介してIL2受容体に結合することによって生存シグナルを免疫細胞に提供する。この多目的スイッチの 2 番目のモジュールは、 BCMA 結合剤 ( BCMA 抗体など) によって認識される BCMA の細胞外ドメインを含み、導入遺伝子 (SARなど) を発現する細胞の検出、選択的除去、および/または濃縮に使用できます。 。第2のモジュールを含むBCMAの細胞外ドメインは、 BCMAを標的とする抗体または抗体薬物複合体などのBCMA標的薬剤の使用による導入遺伝子(例えば、SAR)発現細胞の選択的自殺にも使用することができる。この分子スイッチの 3 番目のモジュールは、BCMA のヒンジおよび/または膜貫通ドメインで構成され、スイッチを細胞膜に固定する役割を果たします。一実施形態では、第2のモジュールは、エピトープまたはミモトープの1つまたは複数のコピーを含む合成モジュールである。一実施形態では、エピトープは内因性タンパク質の細胞外ドメインに存在する。一実施形態では、ミモトープは、内因性タンパク質の細胞外ドメインに存在するエピトープを模倣する。エピトープまたはミモトープの1つ以上のコピーを含む例示的な合成モジュールは、 CD34エピトープおよび2つのCD20ミモトープを有するモジュールであるRQR8である。 RQR8 モジュールを使用すると、臨床的に承認された CliniMACS CD34 システム (Miltenyi) を使用した選択が可能になります。さらに、この構築物は広く使用されている医薬品抗体リツキシマブに結合し、導入遺伝子発現細胞の選択的欠失をもたらします。追加の例示的な多目的分子スイッチとしては、IL2またはその変異体とtBCMA(SEQ ID NO(DNA).7151~7155)、IL15またはその変異体およびtBCMA(SEQ ID NO(DNA):7156~7157)、IL2およびその変異体およびtHer2、IL2およびその変異体およびtEGFR、IL2およびそのRQR8などである。多目的スイッチはモジュール形式であるため、1 つのモジュールを別のモジュールに置き換えることができる。したがって、IL2モジュールは、異なるサイトカイン(例えば、IL15、IL18、IL21など)で置き換えることができます。これらの多目的タンパク質は、サイトカイン部分(例えば、IL2、IL15、IL18、IL21など)を通じて生存促進シグナルを提供しますが、第二のモジュール(例えば、RQR3、tBCMA、tHer2、tEGFR、tCD19など)に結合する薬剤(例えば、抗体)の使用によって細胞を死滅させるために使用でき、それによって自殺遺伝子として作用し、毒性に直面しても、投与された T 細胞の選択的削除が可能になります。 2番目のモジュール(例えば、RQR3、tBCMA、tHer2、tEGFR、tCD19など)も、形質導入の測定のためのマーカーとして使用し、形質導入された細胞の選択を可能にすることができる。
別の実施形態では、薬剤は阻害分子を阻害する薬剤であり得る。阻害分子、例えばPD1は、いくつかの実施形態において、SAR発現細胞が免疫エフェクター応答を行う能力を低下させることができる。別の実施形態では、薬剤は、PD1またはCTLA4を標的とするscFVであり得る。一実施形態では、薬剤は、第1のポリペプチド、例えば、PD1、PD-L1、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3および/またはCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4もしくはTGFRβなどの阻害分子、またはこれらのいずれかのフラグメント(例えば、これらのいずれかの細胞外ドメインの少なくとも一部)、ならびに本明細書に記載の細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、共刺激ドメイン(例えば、本明細書に記載の41BB、CD27またはCD28)および/または一次シグナル伝達ドメイン(例えば、本明細書に記載のCD3ゼータシグナル伝達ドメイン)を含む)である第2のポリペプチドを含む。一実施形態において、薬剤は、PD1またはそのフラグメントの第1のポリペプチド(例えば、PD1の細胞外ドメインの少なくとも一部)、および本明細書に記載される細胞内シグナル伝達ドメインの第2のポリペプチド(例えば、本明細書に記載されるCD28シグナル伝達ドメインおよび/または本明細書に記載されるCD3ゼータシグナル伝達ドメイン)を含む。
一実施形態では、本明細書に記載のSAR発現エフェクター細胞は、同じまたは異なる標的に対する異なる抗原結合ドメインを含み得る第2のSARをさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、第2のSARは、第1のSARと同じまたは異なる細胞タイプを標的とすることができる。
一実施形態では、本明細書に記載のSAR発現エフェクター細胞は、同じまたは異なる抗原結合ドメイン、場合により同じまたは異なる標的を有する第2のSARをさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、第2のSARは、第1のSARと同じまたは異なる細胞タイプを標的とすることができる。 2 つの SAR は、同じバックボーンを持つ場合もあれば、異なるバックボーンを持つ場合もあります。例示的な実施形態では、2つのSARは、CD16 SARのバックボーンを有し得る。別の例示的な実施形態では、1つのSARはSIRのバックボーンを有することができ、一方、第2のSARはCD16 SARのバックボーンを有することができる。別の例示的な実施形態では、1つのSARはAb-TCRのバックボーンを有することができ、一方、第2のSARはCD16 SARのバックボーンを有することができる。異なる骨格上のいくつかの例示的なSARの核酸配列およびアミノ酸配列は、仮出願の表32および表34に示されている。一実施形態では、SARは、疾患関連抗原と同じ疾患細胞型(例えば、癌)上に発現される標的に対する抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、SAR発現細胞は、第1の抗原を標的とする第1のSARと、第2の異なる抗原を標的とし、一次シグナル伝達ドメインを有さない細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2SAR(または第2世代CAR)とを含む。ただし、共刺激シグナル伝達ドメインです。理論に束縛されることは望まないが、コスティミュレイトリーシグナル伝達ドメイン、例えば4-1BB、CD28、CD27、2B4またはOX40をSAR(例えば第2世代CAR)に配置することで、両方の標的が発現している細胞に対するSAR活性を調節することができる。一実施形態では、一実施形態では、SAR発現細胞は、i)本明細書に記載の標的抗原に結合する1つ以上の抗原結合ドメイン、および1つまたは2つのシグナル伝達鎖を含む第1の疾患関連抗原SAR(例えば、CD16 SAR)、およびii)異なる標的抗原(例えば、第1の標的抗原と同じ疾患関連(例えば、癌)細胞型に発現する抗原)を標的とする第2世代CARまたはTFPεを含み、そして抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、一次シグナル伝達ドメインおよび共刺激ドメインを含む。別の実施形態では、SAR発現細胞は、i)本明細書に記載の標的抗原と結合する抗原結合ドメイン、および1つまたは2つのシグナル伝達鎖を含む第1のSAR(例えば、CD16 SAR)と、ii)第一の標的抗原以外の抗原(例えば、第一の標的抗原と同じ癌細胞型に発現する抗原)を標的とし、第一の標的抗原に特異的な抗原結合ドメインを含むCARを含み、そして抗原に特異的な抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、およびコスティミュレイトリーシグナリングドメインを含む。このCAR構築物はCD3zドメインを欠いている。さらに別の実施形態では、SAR発現細胞は、i)本明細書に記載の標的抗原に結合する1つ以上の抗原結合ドメイン、および1つまたは2つのシグナル伝達鎖を含む第1の疾患関連抗原SAR(例えば、CD16 SAR)、およびii)異なる標的抗原(例えば、第1の標的抗原と同じ疾患関連(例えば、癌)細胞型に発現する抗原)を標的とするCARを含み、そして共刺激ドメインはない、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび一次シグナル伝達ドメインを含む。
別の例示的な実施形態では、免疫細胞は2つのSARを発現し得、その一方は共刺激シグナルを提供し、他方は一次活性化シグナルを提供する。一実施形態では、1つのSARは4-1BBベースのSARのバックボーンを有することができ、一方、第2のSARはCD16ベースのSARのバックボーンを有することができる。別の例示的な実施形態では、1つのSARはCD28ベースのSARのバックボーンを有し、第2のSARはCD16ベースのSARのバックボーンを有し得る。別の例示的な実施形態では、1つのSARはOX40ベースのSARのバックボーンを有することができ、一方、第2のSARはCD16ベースのSARのバックボーンを有することができる。別の例示的な実施形態では、1つのSARは2B4 SARのバックボーンを有することができ、一方、第2のSARはCD16ベースのSARのバックボーンを有することができる。
SARは活性化シグナルを免疫エフェクター細胞に伝達することができるが、活性化ドメインを含むITAMを有さない可能性があることが理解されるべきである。このような SAR は、ITAM を含む活性化ドメインを持つタンパク質をリクルートする可能性があります。活性化ドメインを含むITAMを欠くSARの例としては、CD16のバックボーンを有するSARが挙げられるが、これに限定されない。
一実施形態では、CARは抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、41BB、CD27、2B4、OX40、CD28、Dap10、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1、Lck、TNFR-1、TNFR-II、Fas、CD30、CD40またはそれらの組み合わせからの1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインなど)および/または一次シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ゼータシグナル伝達ドメインなどであるが、これらに限定されない)を含む。
一実施形態では、SAR発現エフェクター細胞は、本明細書に記載のSARおよび阻害性CARを含む。一実施形態では、阻害性CARは、正常細胞には結合するが、癌細胞には結合しない抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、阻害性CARは、阻害性分子の抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内ドメインを含む。例えば、阻害性CARの細胞内ドメインは、PD1、PD-L1、CTLA-4、TIM-3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3および/またはCEACAM-5)のいずれか1つの細胞内ドメインであり得る。 )、LAG-3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4またはTGFRベータ。
特定の実施形態では、第1のSAR分子(例えば、CD16 SAR、NKp30 SAR、NKp44 SAR、NKp46 SARまたはDAP10 SARなど)の抗原結合ドメイン から構成される の抗原結合ドメインはscFvを構成し、第2のSAR分子(例えば、CD16 SAR、NKp30 SAR、NKp44 SAR、NKp46 SARまたはDAP10 SARなど)の抗原結合ドメインはscFvを構成しない。例えば、第1のSAR分子の抗原結合ドメインはscFvを含み、第2のSAR分子の抗原結合ドメインはラクダ科動物のVHHドメインを含む。
一実施形態では、本開示は、本明細書に記載の腫瘍抗原に結合する抗原結合ドメインを含むSAR、およびPD1細胞外ドメインまたは断片を含むCARを発現する免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞、NK細胞)を提供する。その。いくつかの実施形態では、細胞は、inhKIR細胞質ドメインを含む阻害分子をさらに含む。膜貫通ドメイン、例えばKIR膜貫通ドメイン;および阻害剤細胞質ドメイン、例えばITIMドメイン、例えばinhKIR ITIMドメイン。
本開示はまた、SAR分子、SAR分子を発現する細胞、またはSAR分子をコードする核酸を含む細胞を対象に投与することを含む方法を提供する。一実施形態において、対象は、本明細書に記載の障害を有し、例えば、対象は、本明細書に記載の標的抗原を発現する癌、感染症、アレルギー疾患、変性疾患、または自己免疫疾患を有する。さらに一実施形態では、対象は、本明細書に記載の障害のリスクが増加しており、例えば、対象は、本明細書に記載の標的抗原を発現する癌、感染症、アレルギー疾患、変性疾患、または自己免疫疾患のリスクが増加している。一実施形態では、対象はヒトである。別の実施形態では、対象は動物である。さらに別の実施形態では、対象は犬などの愛玩動物である。
一実施形態では、本開示は、疾患を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、免疫エフェクター細胞(例えば、 T細胞またはNK細胞)、または免疫エフェクター細胞を発現するように操作され得る幹細胞を提供することによって提供する。標的化X-SIRであって、Xは本明細書に記載の疾患関連抗原を表し、疾患の原因細胞または疾患関連細胞は前記X抗原を発現する。表49は、異なる抗原のリストと、これらの抗原を標的とするSARを発現する免疫エフェクター細胞を使用して予防、阻害または治療できる例示的な疾患を示す。
別の実施形態において、本開示は、癌を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、記載のX標的SAR(またはX標的SAR)を発現するように操作された免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)を提供することによって提供する。ここで、癌細胞は抗原標的「X」を発現する。一実施形態では、Xは正常細胞と癌細胞の両方で発現されるが、正常細胞ではより低いレベルで発現される。一実施形態では、この方法は、Xを標的とするSARがXを発現する癌細胞に結合して死滅させることを可能にするが、30%、25%、20%、15%、10%未満の親和性でXに結合するSARを選択するステップをさらに含む。例えば、本明細書に記載のアッセイによって決定されるように、 Xを発現する正常細胞の5%以下が死滅する。例えば、本明細書に記載のGluc放出細胞毒性アッセイを使用して、例えば癌細胞を標的とするX標的SARを同定することができる。一実施形態では、選択されたSARは、約10 -4 M~10 -8 M、より一般的には約10 -5 M~10 -7 M、典型的には約10 -6 Mの結合親和性K D を有する抗原結合ドメインを有する。標的抗原の場合は 10 -7 M。一実施形態では、選択された抗原結合ドメインは、少なくとも2分の1、5分の1、10分の1、20分の1、30分の1、50分の1、100分の1、または1,000分の1低い結合親和性を有する。参照抗体、例えば、本明細書に記載され、SARの結合ドメインが由来する抗体。
は、本明細書に記載の二重特異性SAR(またはAxB標的化SAR)を発現するように操作された免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞)をそれを必要とする対象に提供することによって癌を治療または予防する方法を提供し、ここで、 Aおよび B は、SAR の標的となる 2 つの異なる抗原を表します。一実施形態では、抗原AはCD19であり、抗原BはCD22であり、疾患はB細胞リンパ腫または白血病である。一実施形態では、抗原AはCD19であり、抗原BはCD20であり、疾患はB細胞リンパ腫または白血病である。一実施形態では、抗原AはCD19であり、抗原BはBCMAであり、疾患はB細胞リンパ腫または白血病である。一実施形態では、抗原AはCD19であり、抗原BはCD38であり、疾患はB細胞リンパ腫または白血病である。一実施形態では、抗原AはBCMAであり、抗原BはCD38であり、疾患は形質細胞障害または原発性滲出性リンパ腫(PEL)である。一実施形態では、抗原AはBCMAであり、抗原BはCS1/SLAMF7であり、疾患は形質細胞障害または原発性滲出性リンパ腫(PEL)である。一実施形態では、抗原AはCD123であり、抗原BはMPLであり、疾患は急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、骨髄増殖性障害または骨髄線維症である。一実施形態では、抗原AはCD123であり、抗原BはCD33であり、疾患は急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、または骨髄増殖性障害である。一実施形態では、抗原Aおよび抗原Bの両方が血球上で発現される。一実施形態では、一方の抗原は、血液系細胞(例えば、正常B細胞またはリンパ腫細胞)上で優先的または排他的に発現され、他方の抗原は、非血液細胞(例えば、前立腺癌細胞)上で優先的または排他的に発現される。例示的な実施形態では、抗原AはPSMAであり、抗原BはCD19であり、疾患は前立腺癌である。このような構築物では、CD19の標的化は、正常B細胞上で発現されるCD19の標的化によってSAR細胞に増殖シグナルを提供し、一方、PSMAの標的化は前立腺癌細胞の死滅を誘導する。
別の実施形態では、本開示は、疾患を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、免疫エフェクター細胞(例えば、 T細胞またはNK細胞)、または免疫エフェクター細胞を発現するように操作され得る幹細胞を提供することによって提供する。 CD19×C20二重特異性SARにおいて、疾患原因細胞または疾患関連細胞はCD19およびCD20を発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫疾患である。一実施形態では、治療または予防される癌は、急性B細胞白血病、慢性B細胞白血病、またはB細胞リンパ腫である。
別の実施形態では、本開示は、疾患を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、免疫エフェクター細胞(例えば、 T細胞またはNK細胞)、または免疫エフェクター細胞を発現するように操作され得る幹細胞を提供することによって提供する。 CD19×C22二重特異性SARにおいて、疾患原因細胞または疾患関連細胞はCD19およびCD22を発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫疾患である。一実施形態では、治療または予防される癌は、急性B細胞白血病、慢性B細胞白血病、またはB細胞リンパ腫である。
別の実施形態では、本開示は、疾患を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、免疫エフェクター細胞(例えば、 T細胞またはNK細胞)、または免疫エフェクター細胞を発現するように操作され得る幹細胞を提供することによって提供する。 CD19×C22×CD20三重特異性SARにおいて、疾患原因細胞または疾患関連細胞は、CD19、CD22、およびCD20を発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫疾患である。一実施形態では、治療または予防される癌は、急性B細胞白血病、慢性B細胞白血病、またはB細胞リンパ腫である。
別の実施形態では、本開示は、疾患を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、免疫エフェクター細胞(例えば、 T細胞またはNK細胞)、または免疫エフェクター細胞を発現するように操作され得る幹細胞を提供することによって提供する。 BCMAxCD38二重特異性SAR。疾患の原因となる細胞または疾患に関連する細胞はBCMAおよびCD38を発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫疾患である。一実施形態では、治療または予防される癌は、形質細胞障害(例えば、形質細胞白血病、骨髄腫)である。
は、CD5を発現するように操作された免疫エフェクター細胞を生じさせることができる免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)または幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、疾患を治療または予防する方法を提供する。 -SAR、疾患の原因となる細胞または疾患に関連する細胞がCD5を発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫疾患である。一実施形態では、治療または予防される癌は、T細胞白血病またはT細胞リンパ腫である。一実施形態では、治療または予防される免疫障害は、多発性硬化症、関節リウマチ、強直性脊椎炎、炎症性腸疾患、糖尿病、移植片対宿主病、または自己免疫性甲状腺炎である。
は、TCRB1を発現するように操作された免疫エフェクター細胞を生じさせることができる免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)または幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、疾患を治療または予防する方法を提供する。 -SARにおいて、疾患の原因となる細胞または疾患に関連する細胞がTCRB1(T細胞受容体ベータ1鎖)を発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫疾患である。一実施形態では、治療または予防される癌は、T細胞白血病またはT細胞リンパ腫である。一実施形態では、治療または予防される免疫障害は、多発性硬化症、関節リウマチ、強直性脊椎炎、炎症性腸疾患、糖尿病、移植片対宿主病、または自己免疫性甲状腺炎である。
は、TCRB2を発現するように操作された免疫エフェクター細胞を生じさせることができる免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)または幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、疾患を治療または予防する方法を提供する。 -SIRでは、疾患の原因となる細胞または疾患に関連する細胞がTCRB2(T細胞受容体ベータ2 SAR)を発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫障害である。一実施形態では、治療または予防される癌は、T細胞白血病またはT細胞リンパ腫である。一実施形態では、治療または予防される免疫障害は、多発性硬化症、関節リウマチ、強直性脊椎炎、炎症性腸疾患、糖尿病、移植片対宿主病、または自己免疫性甲状腺炎である。
例えば、T細胞またはNK細胞)、またはTを発現するように操作された免疫エフェクター細胞を生じさせることができる幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、疾患を治療または予防する方法を提供する。細胞受容体ガンマデルタ-SIRであり、疾患原因細胞または疾患関連細胞はT細胞受容体ガンマデルタを発現する。一実施形態では、治療または予防される疾患は、癌または免疫障害である。一実施形態では、治療または予防される癌は、T細胞白血病またはT細胞リンパ腫である。一実施形態では、治療または予防される免疫障害は、多発性硬化症、関節リウマチ、強直性脊椎炎、炎症性腸疾患、糖尿病、移植片対宿主病、または自己免疫性甲状腺炎である。
別の実施形態では、本開示は、疾患を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、免疫エフェクター細胞(例えば、 T細胞またはNK細胞)、または免疫エフェクター細胞を発現するように操作され得る幹細胞を提供することによって提供する。 SAR エンコード CD4-DC-SIGN。一実施形態では、治療または予防される疾患はHIV1/AIDSである。
別の実施形態では、本開示は、自己免疫疾患を治療または予防する方法を、それを必要とする対象に、発現するように操作された免疫エフェクター細胞を生じさせることができる免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)または幹細胞を提供することによって提供する方法を提供する。自己抗原またはその断片をコードするSAR。一実施形態では、自己免疫疾患は、糖尿病、関節リウマチ、多発性硬化症、尋常性天疱瘡、腫瘍随伴性天疱瘡、糸球体腎炎、強直性脊椎炎、潰瘍性大腸炎、またはクローン病である。一態様では、疾患は尋常性天疱瘡であり、SARの抗原結合ドメインはデスモグレイン3の細胞外ドメイン(Dsg3)を含む。
例えば、T細胞またはNK細胞)または免疫エフェクターを生じさせることができる幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。天然に存在する受容体の細胞外ドメイン(例えば、CD16、CD64、NKp44、NKp30、NKp46、NKG2Dなど)またはその断片を1つまたは複数の薬剤(例えば、抗体、抗体フラグメント、抗原結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合ドメインフラグメント、自律的抗原結合ドメイン、二重特異性エンゲージャー、二重特異性T細胞エンゲージャーまたはBiTE、二重特異性キラーエンゲージャーまたはBiKE、三重特異性エンゲージャー、三重特異性T細胞これらは、 SARを含む天然に存在する受容体に結合し、疾患関連細胞上に発現される抗原にも結合する。一実施形態では、SARは、Fc受容体(例えば、CD16またはCD69)の細胞外ドメインを含む。 など)およびSAR発現細胞は、Fc受容体に結合する1つまたは複数の薬剤(例えば、抗体、抗体断片または非免疫グロブリン抗原結合ドメイン)とともに投与される。例示的な実施形態では、SARは、天然に存在する受容体(例えば、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2DまたはNKG2C)の細胞外ドメインを含み、SAR発現細胞は、1つまたは複数の薬剤(例えば、 BiKE、TRiKE、BiTE)とともに投与される。天然に存在する受容体の細胞外ドメインに結合します。例示的な実施形態では、SARは、NKp46の細胞外ドメインを含み、CD19発現細胞を標的とするように、NKp46およびCD19に結合する二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)または三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)とともに投与される。例示的な実施形態では、SARは、NKp46の細胞外ドメインを含み、メソテリン発現細胞を標的とするために、NKp46およびメソテリンに結合する二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)とともに投与される。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。
一態様では、薬剤(例えば、抗体、BiKE、TRiKEまたはその断片)は、対象へのSAR細胞の投与前に、エクスビボでSAR発現細胞に結合される。一態様では、薬剤(例えば、抗体、BiKE、TRiKEまたはそれらの断片)は、インビボで投与される。一態様では、薬剤(例えば、抗体、BiKE、TRiKEまたはその断片)は、SAR発現細胞の注入前、注入と同時に、または注入後に投与される。一態様では、薬剤の単回用量が投与されるが、他の態様では、薬剤(例えば、抗体、BiKE、TRiKEまたはその断片)の複数回用量が投与される。一態様では、複数のタイプの薬剤が投与される。一態様では、薬剤(例えば、抗体、BiKE、TRiKE、またはそれらの断片)は、単一の抗原を標的とする。一態様では、1つまたは複数の薬剤(例えば、抗体、BiKE、TRiKEまたはその断片)は、複数の抗原を標的とする。例示的な実施形態では、SARはNKp44の細胞外ドメインを含み、SAR発現細胞は、CD19発現細胞を標的とするようにNKp46およびCD19に結合する二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)または三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)とともに投与される。例示的な実施形態では、SARはNKp44の細胞外ドメインを含み、SAR発現細胞は、NKp46に結合する三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)およびSAR上の共刺激受容体(例えば、CD28または4-1BB)とともに投与される。 -CD19発現腫瘍細胞を標的として死滅させるために、腫瘍細胞上でエフェクター細胞およびCD19を発現する。例示的な実施形態では、SARは、 NKp46およびCD16の両方の細胞外ドメインを含み、SAR発現細胞は、有効性が増大してメソテリン発現細胞を標的とするように、NKp46、CD16およびメソテリンに結合する三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)とともに投与される。例示的なBiKEおよびTRiKEは、Gauthier Lら、CELL、(2019)、117、1701に記載されている。他のBiKEおよびTRiKEは当技術分野で知られており、本開示の代替実施形態で使用することができる。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。
例えば、T細胞またはNK細胞)または免疫エフェクターを生じさせることができる幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。 SARのCD16ドメインに結合する抗体または抗体フラグメントおよび疾患関連細胞上に発現される抗原とともに、CD16またはその欠失もしくは点変異フラグメントをコードするユニバーサルSARを発現するように操作された細胞。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。
別の実施形態では、本開示は、それを必要とする対象に免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞)または免疫エフェクター細胞を生じさせることができる幹細胞を提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。免疫グロブリン結合受容体(例えば、CD16、CD64など)またはその欠失または点変異断片をコードするユニバーサルSARを発現するように操作されている。 SARを発現する免疫エフェクター細胞は、SAR受容体の免疫グロブリン結合ドメインおよび疾患関連細胞上に発現する1つまたは複数の抗原に結合する1つまたは複数の抗体または抗体断片とともに患者に投与される。一態様では、抗体は、対象へのSAR細胞の投与前に、エクスビボでSAR発現細胞に結合される。一態様では、抗体はインビボで投与される。一態様では、抗体または抗体フラグメントは、SAR発現細胞の注入前、注入と同時、または注入後に投与される。一態様では、複数回用量の抗体または抗体断片が投与される。一態様では、複数のタイプの抗体または抗体断片が投与される。一態様では、抗体または抗体断片は単一の抗原を標的とする。一態様では、抗体または抗体断片は複数の抗原を標的とする。例示的な抗体は、リツキシマブ、ハーセプチン、エルビトラックスなどである。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。
それを必要とする対象に免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞)または免疫エフェクター細胞を生じさせることができる幹細胞を提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。本明細書に記載のシグナル伝達鎖に結合した免疫グロブリン結合受容体またはその欠失もしくは点変異断片(例えば、配列番号3914~3958)をコードするユニバーサルSARと、抗原結合ドメイン(例えば、 scFv、vHH、vL、vH、または非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、BiTE、BiKE、TRiKE)。 SARを発現する免疫エフェクター細胞は、SAR受容体の免疫グロブリン結合ドメインに結合する1つまたは複数の抗原結合ドメイン、および疾患関連細胞上に発現する1つまたは複数の抗原とともに患者に投与される。一態様では、抗原結合ドメインは、対象へのSAR細胞の投与前に、エクスビボでSAR発現細胞に結合される。一態様では、抗原結合ドメインはインビボで投与される。一態様では、抗体または抗体フラグメントは、SAR発現細胞の注入前、注入と同時、または注入後に投与される。一態様では、複数回用量の抗原結合ドメインが投与される。一態様では、複数のタイプの抗原結合ドメインが投与される。一態様では、抗原結合ドメインは単一の抗原を標的とする。一態様では、抗原結合ドメインは複数の抗原を標的とする。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。
例えば、T細胞、NK細胞および/またはマクロファージなど)または幹細胞を提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。免疫グロブリン受容体またはその欠失もしくは点変異断片をコードするユニバーサルSARを、上記の受容体に結合する1つまたは複数の抗体または抗体断片とともに発現するように操作された免疫エフェクター細胞を生じさせることができる。疾患関連細胞上でより多くの抗原が発現します。
別の実施形態では、本開示は、それを必要とする対象に免疫エフェクター細胞(例えば、T、NK細胞および/またはマクロファージ)または幹細胞を提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。 T細胞受容体定常鎖に結合したCD16またはその欠失もしくは点変異体(例えばF158V変異体)フラグメントをコードするユニバーサルSARと、抗原結合ドメイン(例えば、 、scFv、vHH、vL、vH、または非免疫グロブリン抗原結合ドメイン)がT細胞受容体定常鎖に結合している。 SARを発現する免疫エフェクター細胞は、SARのCD16ドメインに結合する1つ以上の抗体または抗体フラグメントおよび疾患関連細胞上に発現する1つ以上の抗原とともに患者に投与される。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。一実施形態では、抗体はインビボで投与される。一実施形態では、抗体はエクスビボでCD16-SAR細胞に結合する。一実施形態では、抗体の複数回の注入が投与される。
例えば、NK細胞またはT細胞)または免疫エフェクターを生じさせることができる幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。 SARのCD16ドメインに結合する1つ以上の抗体または抗体フラグメントとともに、CD16またはその欠失もしくは点突然変異フラグメント(例えば、 F158V突然変異体)をコードするユニバーサルSARを発現するように操作された細胞、および1つ以上の疾患関連細胞上に発現する抗原。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。
、NKG2D受容体をコードするSARを発現するように操作された免疫エフェクター細胞(例えば、NK細胞またはT細胞)を、それを必要とする対象に提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。またはその欠失もしくは点変異断片(例えば、配列番号3407および3435)。一実施形態では、NKG2D変異体は、NKG2D-AF-G4Sx3-NKG2D-AF(配列番号3407)である。一実施形態では、NKG2D変異体は、NKG2D-YA-G4Sx3-NKG2D-YA(配列番号3435)である。一実施形態では、抗原結合ドメイン(例えば、scFv、vHH、FHVHなど)を含むタンパク質とともに、NKG2D-AF-G4Sx3-NKG2D-AF(配列番号3407)を発現するSARを発現する免疫エフェクター細胞を対象に投与する。 ULBP2Rと融合。 ULBP2Rと融合したBCMA-93-FHVHを含む例示的なタンパク質は、配列番号5431に示される。別の実施形態では、NKG2D-YA-G4Sx3-NKG2D-YA(配列番号5)を発現するSARを発現する免疫エフェクター細胞が対象に投与される。 : 3435)、 ULBP2-S3と融合した抗原結合ドメイン(例えば、scFv、vHH、FHVHなど)を含むタンパク質を含む。 ULBPP2-S3と融合したBCMA-93-FHVHを含む例示的なタンパク質は、配列番号5432に示される。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、または形質細胞、B細胞、または細胞である。 T細胞。
は、CD19を発現するように操作された免疫エフェクター細胞を生じさせることができる免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)または幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、疾患を治療または予防する方法を提供する。 -ターゲットを絞った SAR。一態様では、疾患は免疫疾患またはアレルギー疾患である。
例えば、T細胞またはNK細胞)をそれを必要とする対象に提供することによって疾患を治療または予防する方法を提供する。一態様では、疾患は免疫疾患またはアレルギー疾患である。
例えば、T細胞またはNK細胞)をそれを必要とする対象に提供することによって疾患を治療または予防する方法を提供する。一態様では、疾患は免疫疾患またはアレルギー疾患である。
例えば、T細胞またはNK細胞)または免疫エフェクターを生じさせることができる幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。疾患関連細胞上で発現される抗原に結合する、FITC標識抗体、抗体フラグメント、抗体フラグメント、受容体、リガンド、または非免疫グロブリン足場とともに、FITC-SARを発現するように操作された細胞。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、形質細胞、B細胞、またはT細胞である。
例えば、T細胞またはNK細胞)または免疫エフェクターを生じさせることができる幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。疾患関連細胞上で発現される抗原に結合するビオチン標識抗体、抗体断片、抗体断片、受容体、リガンド、または非免疫グロブリン足場とともにアビジン-SARを発現するように操作された細胞。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、または形質細胞である。
例えば、T細胞またはNK細胞)または免疫エフェクターを生じさせることができる幹細胞を、それを必要とする対象に提供することによって、癌、感染症、自己免疫疾患またはアレルギー疾患を治療または予防する方法を提供する。疾患関連細胞上で発現される抗原に結合する、Streptag含有抗体、抗体フラグメント、受容体、リガンド、または非免疫グロブリン足場とともにStreptag-SARを発現するように操作された細胞。一態様では、疾患関連細胞は、癌細胞、感染細胞、または形質細胞である。
開示は、その抗原結合ドメインが抗体またはIgEに結合する抗体フラグメント。一態様では、疾患は免疫疾患またはアレルギー疾患である。
、PD1-SAR(すなわち、抗原結合ドメインとしてPD1の細胞外ドメインを含むSAR)を用いた対象のインビボ治療に関する。 PD1-SAR は、癌性腫瘍の増殖を阻害するために単独で使用される場合があります。あるいは、PD1-SAR は、他の SAR、CAR、免疫原性物質、標準的な癌治療法、または他の抗体と組み合わせて使用することもできます。一実施形態では、対象は、本明細書に記載のPD1-SARおよびX-SARで治療される。別の実施形態では、PD1-SARは、別のSARまたはCAR、例えば本明細書に記載のSARまたはCAR、およびキナーゼ阻害剤、例えば本明細書に記載のキナーゼ阻害剤と併用される。
、癌性腫瘍の増殖が阻害されるように、X-SARおよびPD1-CARまたはCTL4-CARを使用して対象をインビボで治療することに関する。一実施形態では、対象は、本明細書に記載のPD1-CARまたはCTLA4-CARおよびX-SARで治療される。
免疫系の特定の細胞は、特定の標的細胞に対して細胞傷害活性を示します。細胞傷害性 T リンパ球は、MHC クラス I 分子に結合した抗原由来ペプチドを特異的に認識できる T 細胞受容体 (TcR) を発現します。対照的に、ナチュラルキラー (NK) 細胞は MHC 制限を受けておらず、殺傷効果を発揮するために MHC 分子による抗原提示を必要としません。これらは、ペプチドをロードした MHC の非存在下でストレスを受けた細胞を認識し、MHC を欠いている細胞を殺すことができます。したがって、NK 細胞は自然免疫において重要な役割を果たしています。これがなければ、これらの「非 MHC」細胞は他の免疫細胞によって検出され破壊されないからです。
NK 細胞 (「大型顆粒リンパ球」とも定義される) は、共通リンパ前駆細胞 (B リンパ球および T リンパ球も生じます) から分化した細胞系統を表します。 T細胞とは異なり、NK細胞は原形質膜にCD3を天然には含みません。重要なのは、NK細胞はTCRを発現せず、通常、他の抗原特異的な細胞表面受容体も欠如しています(TCRおよびCD3と同様に、免疫グロブリンB細胞受容体も発現せず、代わりに通常はCD16およびCD56を発現します)。したがって、NK細胞は、細胞は CD3-、CD56+ 表現型によって区別されます。NK 細胞の細胞傷害活性は感作を必要としませんが、IL-2 を含むさまざまなサイトカインによる活性化によって増強されます。NK 細胞は一般に、抗原に必要な適切なまたは完全なシグナル伝達経路を欠いていると考えられています。したがって、抗原受容体依存性のシグナル伝達、活性化、および拡張はできないと考えられています。
癌を治療するための T 細胞ベースの治療法が多数開発されています。 TCRに基づく細胞療法アプローチはいくつかの研究で有望であることが示されているが、MHC制限という欠点がある。すなわち、使用されるTCRは患者の免疫タイプに適合しなければならない。 TCR とは異なり、CAR は受信者と MHC を一致させる必要がありません。しかし、これまでのところ、CARの適切な標的として使用できる癌特異的表面抗原はほとんど同定されておらず、したがって癌治療におけるCARの使用は現時点では限られている。 TCR または CAR による T 細胞の修飾を伴うすべての養子細胞療法アプローチでは、患者または組織タイプが一致するドナーからの T 細胞の単離と修飾が必要であり、製造に必要な時間とコストが増加します。手順の。 ACTの上記制限を克服しようとする代替方法は、例えばWO98/49268に記載されているように、細胞傷害性NK細胞を利用する。しかし、NK細胞はCD3ε、γ、δ鎖の発現を欠き、天然の状態ではTCRを発現しません。 CD3ε、γ、δ、および ζ 鎖を異所的に発現するように操作された NK92 細胞株は、TCR 発現をサポートすることが示されています。ただし、この方法は面倒です。
本開示は、ユニバーサルTCR(またはuTCR-SAR)と呼ばれる新規なTCRを提供する。一実施形態では、uTCR-SARは発現に関してCD3鎖に依存せず、任意の細胞で発現することができる。一実施形態では、uTCR-SARは、2つの鎖を有するという点で生理学的TCRに似ている。一実施形態では、uTCRの抗原結合ドメインは、TCRに由来する可変ドメイン(Va/VαおよびVb/VβまたはVg/VγおよびVd/Vδ)を含む。一実施形態では、uTCRは完全なTCR定常鎖を欠いている。一実施形態では、uTCRの一方または両方の鎖は、TCR定常鎖の膜貫通ドメインおよび/またはサイトゾルドメインを欠いている。一実施形態では、uTCRの一方または両方の鎖は、TCR定常鎖のヒンジ、膜貫通および/またはサイトゾルドメインを欠いている。
本開示は、NK細胞に基づく癌特異的キラー細胞を普遍的に使用できるように提供することを目的としている。これは、現在T細胞に必要とされているように、細胞が治療対象の免疫型に適合している必要がないことを意味する。に基づいた治療法ですが、必要に応じて対象者の特定の免疫タイプやがんタイプに合わせて調整することもできます。したがって、ユニバーサルキラー細胞は個別化医療に使用できる可能性があります。
一実施形態では、対象には、本開示のSARを発現する異なる細胞が投与される。一実施形態では、SARは、 SARの複数の異なる系統(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞など)に分化する幹細胞(例えば、造血幹細胞またはiPSC)において発現される。発現している細胞。天然の T 細胞受容体およびいくつかの次世代 CAR プラットフォーム (たとえば、SIR、Ab-TCR、HIT、または TFPなど) は、T 細胞でのみ機能的に発現できます。本開示のuTCR-SARの利点は、それが任意の細胞型で発現できることである。一実施形態では、SAR (例えば、uTCR-SAR)は、幹細胞(例えば、造血幹細胞またはiPSC)内で発現され、幹細胞(例えば、造血幹細胞またはiPSC)は、エクスビボで複数の異なる系統(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、顆粒球)に分化する、樹状細胞など)のuTCR-SAR発現細胞。次いで、対象に、SAR(例えば、uTCR-SAR)発現細胞の集団を投与する。代替の実施形態では、SAR(例えば、uTCR-SAR)は、造血幹細胞において発現され、次いで、対象に投与される。 SAR発現造血幹細胞は、インビボで複数系統のSAR発現免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞など)に分化する。
本開示はまた、SIR、cTCR、Ab-TCR、TFPαβおよびTFPγδなどの次世代キメラ受容体が、NK細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞および好中球において乏しいまたは無視できる程度の発現を示すことを提供する。本開示は、NK細胞、NK細胞株(例えば、NK92およびその誘導体)、単球/マクロファージ、単球細胞株、および好中球におけるSIR、cTCR、Ab-TCR、TFPαβおよびTFPγδの発現方法を提供する。この方法には、NK 細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞、および好中球における CD3 複合体の 1 つ以上の鎖の異所性発現が含まれます。代替の実施形態では、この方法は、分化してNK細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞と好中球。一実施形態では、NK細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞、好中球および幹細胞において異所的に発現され得るCD3複合体の鎖には、CD3ε、CD3γ、CD3δおよびCD3εが含まれる。 SIR、cTCR、Ab-TCR、TFPαβの機能的発現を促進するために、NK細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞、好中球および幹細胞において異所的に発現させることができる例示的なCD3ε、CD3γ、CD3δおよびCD3ζ鎖の配列番号。およびTFPγδは仮出願の表18に記載されている。一実施形態では、CD3ε、CD3γ、CD3δおよびCD3ε鎖は、SIR、cTCR、Ab-TCR、TFPαβおよびTFPγδの機能的発現を促進するために、NK細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞、好中球および幹細胞において異所的に発現される。代替の実施形態では、CD3ε、CD3γ、およびCD3δ鎖は、NK細胞、単球/マクロファージ、樹状細胞、および好中球細胞において異所的に発現され、SIR、cTCR、Ab-TCR、TFPαβおよびTFPγδの機能的発現を促進する。一実施形態では、CD3複合体の1つ以上の鎖が単一のベクターを使用して発現される。例示的なベクターは、配列番号1331および1332によって表される。別の実施形態では、CD3複合体の1つ以上の鎖は、2つ以上のベクターを使用して発現される。
いくつかの態様では、SAR発現細胞(例えば、免疫エフェクター細胞、幹細胞またはiPSCなど)は、異なるCAR修飾細胞(例えば、T細胞、NK細胞、NKT細胞、 g-NK、CIK細胞、マクロファージ、樹状細胞、顆粒球、幹細胞、iPSCなど)。特に明記しない限り、養子細胞療法製品の製造および投与に関する当該技術分野で知られている技術は、SARをコードするベクターの生成、SARをコードするベクターによる遺伝子改変のための異なる細胞型の採取、単離および培養に使用することができる。 SAR 発現細胞の増殖、保存、輸送、解凍、効力試験、無菌試験および投与に使用します。
SARは、エクスビボおよび/またはインビボで標的細胞(例えば、T細胞、NK細胞、造血細胞など)に導入することができる。 SAR発現エフェクター細胞は、対象への投与前にエクスビボで増殖させることができる。一実施形態では、SAR発現エフェクター細胞は、対象への投与前に2~30日間エクスビボで増殖させることができる。本開示は、SAR発現細胞が無増殖プロトコールを使用して製造できることを規定する。一実施形態では、SAR発現細胞は、1日または2日の期間にわたって製造される。一実施形態では、SAR発現細胞は、3日、4日、5日、6日、7日、10日、15日、21日または30日未満の期間にわたって製造される。 SAR を発現するエフェクター細胞は、保存のために凍結保存し、投与前に解凍することができます。
本開示の別の態様では、本開示によるSARまたはSARを含む単離細胞もしくは細胞集団と、場合により薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物が提供される。
本開示の遺伝子改変細胞または医薬組成物は、非経口投与を含む任意の都合のよい経路によって投与することができる。非経口投与には、例えば、静脈内、筋肉内、動脈内、腹腔内、鼻腔内、直腸内、膀胱内、皮内、局所または皮下投与が含まれる。組成物は、1つ以上の投与単位の形態をとることができる。
SAR発現免疫細胞は、細胞の絶対数で個体に投与することができ、例えば、前記個体は、約1000細胞/注射から最大約100億細胞/注射、例えば約、少なくとも約、または約100億細胞/注射で投与することができる。注入ごとに最大約 lx l0 8 、 lx l0 7 、 5 x l0 7 、 lx l0 6 、 5 x l0 6 、 lx l0 5 、 5 x l0 5 、 lx l0 4 、 (など) の SAR 細胞、または任意の 2 つの数値の間の任意の範囲 (エンドポイントも含む)。他の実施形態では、SAR発現細胞は、細胞の相対数によってそのような個体に投与することができ、例えば、前記個体には、個体1キログラム当たり約1000個の細胞から最大約100億個の細胞を、例えば少なくとも約1000個の細胞を投与することができる。 1kgあたり約、または最大約1x l0 8 、1x l0 7 、5 x l0 7 、 1x l0 6 、5 x l0 6 、1x l0 5 、5 x l0 5 、1x l0 4個(など)の細胞個々の数値、または任意の 2 つの数値間の任意の範囲 (終点も含む)。 SAR細胞はまた、前記患者におけるSAR細胞の数と腫瘍のサイズとの間のおおよその比率に従って、そのような患者に投与することもできる。腫瘍のサイズは、X線、超音波画像化などの従来の画像化方法によって決定または推定することができる。他の実施形態では、総線量は、体表面積m 2によって計算することができ、 1m 2当たり1×10 8 、1×10 、5×10 、1×10 6を含む。平均的な人の身長は 1.6 ~ 1.8 平方メートルです
SAR発現免疫細胞(例えば、NK92細胞株)は、投与前に放射線照射することができる。 SAR発現免疫細胞は、対象に投与する前に、それらを複製不能にする薬剤(例えば、マイトマイシン-C)で処理することができる。
SAR発現細胞、および場合により他の抗腫瘍剤は、患者に1回投与することができ、または複数回、例えば1、2、3、4、5、6、7、 8 、9日に1回、または複数回投与することができる。 10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、または23時間ごと、または1、2、3、4、5、6、または7日に1回、あるいは1日ごとに1回治療期間中の 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10 週間以上、またはエンドポイントを含む任意の 2 つの数値の間の任意の範囲。
SAR発現細胞は、静脈内、腹腔内、胸膜内、くも膜下腔内、脳室内、皮内、皮下、腫瘍内、病変内、肝内経路などの当技術分野で公知の異なる経路によって投与することができる。
いくつかの実施形態では、SAR発現細胞は、化学療法、放射線療法、生物学的療法、抗体療法またはホルモン治療などの従来の療法を含む他の療法と組み合わせて投与される。一実施形態では、SAR発現細胞は、対象がリンパ球除去化学療法を受けた後に対象に投与される。一実施形態では、SAR発現細胞は、対象がリンパ球除去化学療法と骨髄除去化学療法の両方を受けた後に対象に投与される。一実施形態では、SAR発現細胞は、対象がエトポシドを含む化学療法を受けた後に対象に投与される。一実施形態では、SAR発現細胞は、以下のうちの1つ以上から選択される薬剤とともに投与される。プロテインホスファターゼ阻害剤。キナーゼ阻害剤(例えば、srcキナーゼ阻害剤); Lckキナーゼ阻害剤(例えば、ダサチニブ)。 SAR発現エフェクター細胞上に発現される1つ以上の抗原および標的細胞上に発現される1つ以上の抗原(例えば、抗体、抗体フラグメント、BiTE、BiKE、TRiKEなど)に結合する薬剤;サイトカイン(例えば、IL2、IL15など)。免疫阻害分子の阻害剤(例えば、PD1またはPDL1阻害剤); TREG細胞のレベルまたは活性を低下させる薬剤(例えば、ラパマイシン)。 SAR修飾細胞(例えば、IL2、IL15、IL18、IL21など)の増殖および/または存続を増加させる薬剤;ケモカイン。 SARの発現を増加させる薬剤。 SARの発現または活性の調節を可能にする薬剤; SAR修飾細胞の生存および/または持続の制御を可能にする薬剤。 SAR修飾細胞の副作用を制御する薬剤(例えば、トシリズマブ、アナキンラ、ステロイド、ダサチニブ、イブルチニブなど)。 Brd4阻害剤。治療薬または予防薬を疾患の部位に送達する薬剤。 SARが向けられる標的抗原の発現を増加させる薬剤(例えば、BCMA標的SARとともに使用される場合のγセクレターゼ阻害剤)。 SARと同時発現される多目的スイッチに結合する薬剤(例えば、リツキシマブ、ハーセプチンまたは);同種異系SAR細胞を免疫攻撃から保護する薬剤(例えば、CD52抗体)およびアデノシンA2a受容体アンタゴニスト。
一実施形態では、本方法は、本明細書に記載のSAR分子を発現する細胞を、SAR発現細胞の活性を増強する薬剤と組み合わせて投与することを含み、ここで薬剤はサイトカイン、例えば、IL-2、IL- 2 、 7、IL-15、IL-21、またはそれらの組み合わせ。サイトカインは、例えば、SAR発現細胞の投与と同時または直後に送達することができる。あるいは、サイトカインは、SAR発現細胞の投与後、例えば、SAR発現細胞に対する対象の応答を評価した後、長期間後に送達することができる。一実施形態では、サイトカインは、対象に投与と同時に(例えば、同日に投与)、または投与直後に(例えば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日投与)、対象に投与される。他の実施形態では、サイトカインは、長期間(例えば、少なくとも2週間、3週間、4週間、6週間、または6週間)後に対象に投与される。細胞または細胞集団の投与後、または細胞に対する対象の反応の評価後、数週間、8週間、10週間、またはそれ以上)。
[0001]本開示は、Src阻害剤(例えば、Lck阻害剤、例えば、ダサチニブ、ポナチニブなど)が本開示のSARの活性を制御できることを規定する。一実施形態では、ダサチニブは、CD3z、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、またはNKG2Dなどの膜貫通ドメインおよび/またはサイトゾルドメインを含むSARの活性を制御することができる。一実施形態では、本開示は、本開示の新規なSAR発現細胞の副作用を治療するのは、Src阻害剤(例えば、Lck阻害剤、例えば、ダサチニブ)である。一実施形態では、ダサチニブは、SAR発現細胞の活性を制御または停止させるために、SAR発現細胞の投与後に患者に投与される。一実施形態では、ダサチニブは、SAR発現細胞によって引き起こされるサイトカイン放出症候群(CRS)を予防および/または治療するために対象に投与される。一実施形態では、ダサチニブは、SAR発現細胞によって引き起こされる神経合併症を予防および/または治療するために対象に投与される。一実施形態では、ダサチニブは、SAR発現細胞によって引き起こされるCRSおよび神経合併症を予防および/または治療するために、他の薬剤(例えば、ステロイド、トシリズマブ、アナキンラなど)と組み合わせて使用される。
[0002]一実施形態では、ダサチニブは、少なくとも10mg/日、20mg/日、40mg/日、60mg/日、70mg/日、90mg/日、100mg/日、140mg/日、180mgの用量で経口投与される。 /日、210mg/日、250mg/日または280mg/日。 一実施形態では、本開示は、本開示の新規なSAR発現細胞の副作用を治療するために投与できる薬剤がポナチニブであることを提供する。一実施形態では、ポナチニブは、CAR発現細胞の活性を制御または停止させるために、CAR発現細胞の投与後に患者に投与される。一実施形態では、ポナチニブは、少なくとも15mg/日、30mg/日、45mg/日、60mg/日の用量で経口投与される。一実施形態では、ポナチニブは、SAR発現細胞によって引き起こされるサイトカイン放出症候群(CRS)を予防および/または治療するために対象に投与される。一実施形態では、ポナチニブは、SAR発現細胞によって引き起こされる神経合併症を予防および/または治療するために対象に投与される。一実施形態では、ポナチニブは、SAR発現細胞によって引き起こされるCRSおよび神経合併症を予防および/または治療するために、他の薬剤(例えば、ステロイド、トシリズマブ、アナキンラなど)と組み合わせて使用される。
[0003]一実施形態では、本開示は、チロシンキナーゼ阻害剤を使用して、新規シグナル伝達ドメインを有する本開示のSAR発現細胞の持続期間を延長できることを提供する。一実施形態では、本開示は、チロシンキナーゼ阻害剤を使用して、新規シグナル伝達ドメインを有する本開示のSAR発現細胞の持続期間を延長することができることを提供し、ここで、SARは、CD3z、CD16A、CD16B、NKp30の膜貫通ドメインおよび/または細胞質ゾルドメインを含む。 、NKp44、NKp46、および/またはNKG2Dなど。 一実施形態では、本開示は、チロシンキナーゼ阻害剤を使用して、新規シグナル伝達ドメインによる本開示のSAR発現細胞の消耗を遅延/逆転させることができることを提供し、ここで、SARは、CD3z、CD16、NKp30 、一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤は、Srcキナーゼ阻害剤である。一実施形態では、Srcキナーゼ阻害剤はLck阻害剤である。一実施形態では、Lck阻害剤はダサチニブまたはポナチニブである。一実施形態では、ダサチニブは、本開示のSAR発現細胞の枯渇を予防/遅延させるために使用することができる。一実施形態では、SARは、CD3z、CD16、NKp30、 NKp44、NKp46、および/またはNKG2Dなどの膜貫通ドメインおよび/またはサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、ダサチニブを使用して、SAR発現細胞の消耗を逆転させることができる。開示。一実施形態では、SARは、CD3z、CD16A、CD16B、NKp30、NKp44、NKp46、および/またはNKG2Dなどの膜貫通ドメインおよび/またはサイトゾルドメインを含む。一実施形態では、ダサチニブは、SAR発現細胞を投与された対象に投与される。断続的に。一実施形態では、対象は複数サイクルのチロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ダサチニブ)を受ける。一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ダサチニブまたはポナチニブ)による治療は、本開示のSAR発現細胞のアポトーシスを防止する。一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ダサチニブまたはポナチニブ)は、PD1、TIM-3、およびLAG-3からなる群から選択される少なくとも1つのTまたはNK細胞枯渇マーカーの発現を減少させる。一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ダサチニブまたはポナチニブ)による治療は、SAR発現細胞上のCD62LまたはCCR7の発現を増加させる。一実施形態では、治療は、SAR発現細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)の少なくとも部分的な機能を回復するのに十分な時間継続される。一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ダサチニブまたはポナチニブ)は、SAR発現細胞を継続的に投与された対象に投与される。実施形態では、ダサチニブは、約10mg/日~240mg/日(例えば、10mg/日、20mg/日、40mg/日、50mg/日、70mg/日、80mg/日、100mg/日)の用量で投与される。 1日、110mg/日、120mg/日、140mg/日、180mg/日、210mg/日、240mg/日または300mg/日)。
[0004]一実施形態では、ポナチニブを使用して、本開示のSAR発現細胞の持続期間を延長することができる。一実施形態では、ポナチニブを使用して、本開示のSAR発現細胞の枯渇を遅らせることができる。一実施形態では、ポナチニブは、SAR発現細胞を断続的に投与された対象に投与される。一実施形態では、ポナチニブは、SAR発現細胞を継続的に投与された対象に投与される。
開示の組成物は、液体、例えば、溶液、エマルション、または懸濁液の形態であってもよい。この液体は、注射、注入(例えば、IV注入)または皮下による送達に有用であり得る。本開示の液体組成物は、溶液、懸濁液、または他の同様の形態であっても、以下の1つまたは複数を含むこともできる:水、食塩水、典型的には生理食塩水、リンガー液、等張性塩化ナトリウム、固定油などの滅菌希釈剤。合成モノグリセリドまたは合成ジグリセリド、ポリエチレングリコール、グリセリン、またはその他の溶媒など。ベンジルアルコールやメチルパラベンなどの抗菌剤。張度を調整するための薬剤、例えば塩化ナトリウムまたはブドウ糖。組成物は、ガラス、プラスチック、または他の材料で作られたアンプル、使い捨て注射器、または複数回用量のバイアルに封入することができる。
本開示の医薬組成物の量は、障害または状態の性質に依存し、標準的な臨床技術によって決定することができる。さらに、最適な用量範囲を特定するのに役立つように、インビトロまたはインビボアッセイを任意で使用することができます。組成物に使用される正確な用量は、投与経路、疾患または障害の重症度にも依存し、医師の判断および各患者の状況に従って決定されるべきである。
開示の組成物は、適切な用量が得られるように、有効量の本開示の結合分子を含む。化合物の正確な用量は、特定の製剤、適用方法、およびその特定の部位、宿主および治療される疾患に応じて変化するであろう。年齢、体重、性別、食事、投与時間、排泄速度、宿主の状態、薬剤の組み合わせ、反応感受性、疾患の重症度などの他の要因も考慮されるものとします。投与は、最大耐用量の範囲内で連続的または定期的に行うことができる。
典型的には、この量は、組成物の重量に基づいて本開示の結合分子の少なくとも約0.01%である。
本開示の典型的な組成物は、非経口用量単位が約0.01重量%~約2重量%の本開示の結合分子を含むように調製される。
静脈内投与の場合、組成物は、典型的には動物の体重の約0.1mg/kgから約250mg/kg、典型的には動物の体重の約0.1mg/kgから約20mg/kgの間などを含むことができる。通常、動物の体重1kg当たり約1mg~約10mgである。
本発明の組成物は、エアロゾル、スプレー、懸濁液などの適切な担体の形態、または使用に適した任意の他の形態をとることができる。適切な医薬担体の他の例は、EW Martinによる「Remington's Pharmaceutical Sciences」に記載されている。
医薬組成物は、製薬分野で周知の方法論を使用して調製することができる。例えば、注射により投与することを意図した組成物は、本開示の結合分子を水と組み合わせて溶液を形成することによって調製することができる。界面活性剤を添加して、均一な溶液または懸濁液の形成を促進することができる。
開示の医薬組成物は、他の治療薬、例えば、抗癌剤、化学療法薬、手術または放射線と同時投与することができる。
一実施形態では、癌は、血液癌または悪性腫瘍、または固形腫瘍から選択される。一実施形態では、癌は転移性である。
一実施形態では、癌は、任意の器官または組織の任意の癌である。本開示のSARが標的とする例示的な疾患および抗原を表49に示す。例示的な実施形態では、SARは、BCMAおよびCD38を標的とするために使用され、多発性骨髄腫、形質細胞性白血病、原発性滲出性リンパ腫および全身性エリテマトーデス(SLE)などの形質細胞障害および自己免疫障害を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のBCMAおよびCD38に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。別の例示的な実施形態では、SARは、BCMAおよびCD22を標的とするために使用され、リンパ腫、急性リンパ性白血病、多発性骨髄腫、形質細胞性白血病、原発性滲出性リンパ腫および全身性エリテマトーデス(SLE)などのリンパ系疾患および形質細胞疾患を治療するために使用される。 。このようなSARには、本明細書に記載のBCMAおよびCD22に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。一実施形態では、SARは、CD19、CD22、BCMA、およびCD20を標的とするために使用され、多発性骨髄腫、形質細胞白血病、原発性滲出性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、急性リンパ腫などの形質細胞、リンパ系および自己免疫疾患を治療するために使用される。リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病、全身性エリテマトーデス(SLE)。このようなSARには、本明細書に記載のCD19、CD22、BCMAおよびCD20に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。一実施形態では、SARは、PSMAおよびCD19を標的とし、前立腺癌を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のPSMAおよびCD19に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。 CD19 特異的抗原結合ドメインは、主に SAR の活性化、増殖、および拡大を刺激するために使用されます。
一実施形態では、本開示のSARは、任意の疾患(例えば、感染症、アレルギー、自己免疫、変性疾患など)を治療するために使用される。
一実施形態では、SARは、BCMAおよびCD19を標的とするために使用され、リンパ腫、急性リンパ性白血病、多発性骨髄腫、形質細胞白血病原発性滲出性リンパ腫および全身性エリテマトーデス(SLE)などのリンパ系障害および形質細胞障害を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のBCMAおよびCD19に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、BCMA、CD38、およびCD22を標的とするために使用され、多発性骨髄腫、形質細胞白血病、原発性滲出性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、B-ALLなどのリンパ系、形質細胞および自己免疫疾患を治療するために使用される。 、慢性リンパ性白血病および全身性エリテマトーデス(SLE)。このようなSARには、本明細書に記載のBCMA、CD38、およびCD22に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、 BCMA、CD38、およびCD19を標的とするために使用され、多発性骨髄腫、形質細胞白血病、原発性滲出性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、B-ALLなどのリンパ系、形質細胞および自己免疫疾患を治療するために使用される。 、慢性リンパ性白血病および全身性エリテマトーデス(SLE)。このようなSARには、本明細書に記載のBCMA、CD38、およびCD19に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、BCMA、CD38、CD22、およびCD19を標的とするために使用され、多発性骨髄腫、形質細胞白血病、原発性滲出性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、B型リンパ腫などのリンパ系、形質細胞および自己免疫疾患を治療するために使用される。 -ALL、慢性リンパ性白血病、全身性エリテマトーデス(SLE)。このようなSARには、本明細書に記載のBCMA、CD38、CD22およびCD19に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、BCMA、CD38、CD22、CD20およびCD19を標的とするために使用され、多発性骨髄腫、形質細胞白血病、原発性滲出性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫などのリンパ系、形質細胞および自己免疫疾患を治療するために使用される。 、B-ALL、慢性リンパ性白血病、全身性エリテマトーデス(SLE)。このようなSARには、本明細書に記載のBCMA、CD38、CD22、CD20およびCD19に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、CD19およびCD22を標的とするために使用され、リンパ腫、急性リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病および全身性エリテマトーデス(SLE)などのリンパ性疾患および自己免疫疾患を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のCD19およびCD22に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、CD19およびCD20を標的とするために使用され、リンパ腫、急性リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病および全身性エリテマトーデス(SLE)などのリンパ性疾患および自己免疫疾患を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のCD19およびCD22に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、CD19、CD22、およびCD20を標的とするために使用され、リンパ腫、急性リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病および全身性エリテマトーデス(SLE)などのリンパ性疾患および自己免疫疾患を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のCD19、CD20およびCD22に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。
一実施形態では、SARは、PSMAを標的とし、前立腺癌を治療するために使用される。このようなSARは、本明細書に記載されるPSMAに特異的な抗原結合ドメインを含む。
一実施形態では、SARは、PSMAおよびCD22を標的とし、前立腺癌を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のPSMAおよびCD22に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。 CD22 特異的抗原結合ドメインは、主に SAR の活性化、増殖、および拡大を刺激するために使用されます。
一実施形態では、SARは、PSMAおよびCD20を標的とし、前立腺癌を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のPSMAおよびCD20に特異的な抗原結合ドメインが含まれる。 CD20 特異的抗原結合ドメインは、主に SAR の活性化、増殖、および拡大を刺激するために使用されます。
一実施形態では、SARは、PSMAおよびBCMAを標的とし、前立腺癌を治療するために使用される。このようなSARには、本明細書に記載のPSMAおよびBCMAに特異的な抗原結合ドメインが含まれる。 BCMA 特異的抗原結合ドメインは、主に SAR の活性化、増殖、および拡大を刺激するために使用されます。
開示のSARまたはSARを含む細胞は、既存の療法または治療薬、例えば抗癌療法と組み合わせて使用される。したがって、別の態様では、本発明は、本発明のSAR-TもしくはSAR-NKおよび/もしくはSAR-マクロファージまたは医薬組成物の投与と、抗癌療法とを含む併用療法にも関する。抗癌療法には、治療薬または放射線療法が含まれ得、遺伝子療法、ウイルス療法、RNA療法、骨髄移植、ナノ療法、標的抗癌療法、または腫瘍溶解薬が含まれる。他の治療薬の例としては、他のチェックポイント阻害剤、抗腫瘍剤、免疫原性薬剤、弱毒化癌細胞、腫瘍抗原、腫瘍由来の抗原または核酸でパルスされた樹状細胞などの抗原提示細胞、免疫刺激サイトカイン(例えば、IL- 2 、 IFNa2、GM-CSF)、標的となる小分子および生体分子(シグナル伝達経路の構成要素、例えばチロシンキナーゼのモジュレーターおよび受容体チロシンキナーゼの阻害剤、ならびにEGFRアンタゴニストを含む腫瘍特異的抗原に結合する薬剤など)、抗炎症剤、細胞毒性剤、放射性毒性剤、または免疫抑制剤、および免疫刺激サイトカイン(例えば、GM-CSF)をコードする遺伝子でトランスフェクトされた細胞、化学療法。一実施形態では、本開示のSAR-TまたはSAR-NKおよび/またはSAR-Tおよび/またはSAR-マクロファージ医薬組成物は、手術と組み合わせて使用される。本開示のSAR-TまたはSAR-NK医薬組成物は、他の治療法と同時に、または異なる時点で、例えば同時に、別々に、または連続的に投与することができる。
免疫細胞(例えば、NK、T細胞など)の生存、したがって細胞毒性にはサイトカインのサポートが必要です。インターロイキン-15 (IL-15) と IL-2 を非分泌型の膜結合型で発現させると、NK 細胞と T 細胞の増殖が維持され、細胞毒性が改善されることが知られています。
本開示は、IL-2および/またはIL-15の低親和性変異体のすべてまたは機能的部分を発現する免疫細胞を産生する方法を提供する。 IL-2および/またはIL-15の全部または一部は、膜結合ポリペプチド、分泌ポリペプチド、またはそれらの組み合わせとして発現され得る。この方法は、IL-2またはIL-15の低親和性変異体のすべてまたは機能的部分をコードする核酸を1つまたは複数の免疫細胞(例えば、 NK細胞)に導入することを含む。一態様では、IL-2またはIL-15の低親和性変異体の全部または機能的部分をコードする核酸は、膜貫通タンパク質の全部または一部に連結(例えば、融合)される。あるいは、またはさらに、IL-2またはIL-15変異体のすべてまたは機能的部分をコードする核酸が免疫細胞(例えば、 NK細胞)に導入される。当業者には明らかなように、IL-2またはIL-15変異体のすべてまたは機能的部分をコードする核酸、およびIL-2またはIL-15変異体のすべてまたは機能的部分がすべてに融合されている態様は、または、膜貫通タンパク質の一部が免疫細胞(たとえば、NK細胞)に導入されます。これは、単一の核酸または複数の(たとえば、別々の; 2つの)核酸を使用して行うことができます。NK細胞またはT細胞は、条件下で維持されます。 IL-15またはIL-2のすべてまたは機能部分が膜結合ポリペプチドおよび/または分泌ポリペプチドとして発現され、それによってIL-15またはIL-2のすべてまたは機能部分を発現するNK細胞またはT細胞が産生される。膜結合ポリペプチドおよび/または分泌ポリペプチドとしてのIL-2 特定の態様では、IL-15またはIL-2のすべてまたは機能的部分をコードする核酸が、CD8aのシグナルペプチドおよびCD8aのシグナルペプチドに融合される。 CD8a の膜貫通ドメインの一部が NK 細胞に導入されます。
さらに別の態様では、本開示は、NK細胞の増殖および/または生存を増強する方法(例えば、インビトロ、エクスビボ、および/またはインビボ)を対象とする。この方法は、IL-15またはIL-2のすべてまたは機能的部分をコードする核酸を導入することを含む。 IL-15の全部または一部(例えば、野生型IL-15)をコードする核酸、および/または膜貫通タンパク質の全部または一部に融合したIL-15の全部または機能的部分をコードする核酸をNKに導入することができる。細胞。したがって、NK細胞は、IL-15のすべてまたは機能部分を、膜結合ポリペプチド、分泌ポリペプチド、またはそれらの組み合わせとして発現することができる。 NK細胞は、IL-15の全部または一部が膜結合ポリペプチド、分泌ポリペプチド、またはそれらの組み合わせとして発現され、NK細胞が増殖する条件下で維持される。特定の態様では、IL-15の全部または機能的部分をコードする核酸がCD8aのシグナルペプチドに融合され、CD8aの膜貫通ドメインの全部または一部がNK細胞に導入される。いくつかの態様では、この方法は、膜結合型IL-15および/または分泌型IL-15を含むNK細胞をIL-2と接触させることをさらに含むことができる。いくつかの態様では、IL-2の濃度は約10 IU/mlから約1000 IU/mlである。他の態様では、IL-2の濃度は、約20、40、60、80、100、120、140、160、180、200、220、240、260、280、300、320、340、360、380、 400、420、440、460、480、500、520、540、560、580、600、620、640、660、680、700、720 740、760、780、800、820、840、860、88 0、900 、920、940、960、980IU/ml。
当業者には明らかなように、核酸を導入するためのさまざまな方法を使用することができる。
また、当業者には明らかなように、 ( i ) IL-15のすべてまたは機能的部分が膜結合ポリペプチドとして発現され、かつ、 /または分泌ポリペプチドとして、および/または(ii)膜結合型IL-15および/または分泌型IL-15増殖物を含むNK細胞を使用することができる。この方法は、本明細書で提供される方法によって産生される1つまたは複数のNK細胞を単離または分離することをさらに含むことができる。さらに、方法は、1つまたは複数のNK細胞を培養することをさらに含むことができる。いくつかの態様では、NK細胞株が産生される。
本開示は、本明細書に記載の方法によって産生される(1つ以上の)ナチュラルキラー(NK)細胞または細胞株、および本明細書に提供されるNK細胞を含む組成物も包含する。特定の態様では、組成物は、本明細書で提供される1つ以上のNK細胞または細胞株を含む医薬組成物である。医薬組成物は、IL-2のすべてまたは機能部分(例えば、(1つまたは複数の)IL-2タンパク質のすべてまたは機能部分;IL-2のすべてまたは機能部分をコードする核酸)をさらに含むことができる。
例えば、T細胞、NK細胞、NK-T細胞)にIL2および/またはIL15シグナル伝達を提供するために使用できる、膜アンカー型のIL2およびIL15およびそれらの低親和性変異体(表43)を提供する。本開示のSARを発現する免疫細胞(例えば、配列番号8428)。代表的な低親和性IL2変異体の配列番号を配列番号7834~7837に示す。代表的な低親和性IL15変異体の配列番号は、配列番号7839~7841に提供される。膜アンカー型IL2および/またはIL15の低親和性変異体には、変異体が発現する細胞に選択的に生存シグナルを提供し、隣接する細胞のIL2および/またはIL15シグナル伝達を刺激しないという利点がある。したがって、膜アンカー型IL2および/またはIL15の低親和性変異体には、治療指数が向上するという利点がある。
次世代 SAR コンストラクトの技術的な課題は、その検出、単離、精製、または除去のための簡単な方法が存在しないことです。 SAR構築物へのエピトープタグの付加は記載されているが、その標的抗原へのSAR結合および/またはオフターゲットシグナル伝達を妨害するという問題がある。出願人は、結合活性およびシグナル伝達活性を妨げることなく、エピトープタグを膜アンカー型サイトカイン(例えば、IL2および1L15)に付加できることを発見した。本開示は、膜アンカー型のIL2およびIL15、ならびに検出、単離に使用できる1つまたは複数のエピトープタグ(例えば、セツキシマブミモトープ、リツキシマブタグ、ハーセプチンミモトープ、MYCタグ、StreptagIIなど)も含むそれらの低親和性変異体を提供する。 、SAR発現細胞を含む、それらを発現する細胞の精製および/または枯渇。例示的なエピトープタグは、PCT/US2021/022641の表37を含む文献で知られており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。これらのエピトープタグは、PCT/US2021/022641に記載の方法を使用して、免疫細胞(例えば、SAR発現NK細胞またはT細胞)の検出、単離、精製および/または枯渇に使用することができる。
養子免疫療法の有効性の向上は、CRS、神経毒性、移植片対宿主病(GvHD)、リンパ球増殖、挿入変異誘発などの重篤な短期および長期の有害事象の報告と関連しています。改変された T 細胞は投与後何年も増殖して存続する可能性があるため、毒性に直面しても養子注入された T 細胞の選択的欠失を可能にする安全機構を組み込むことが望ましい。自殺遺伝子により、 in vivoで形質導入された細胞の選択的欠失が可能になります。 HSV-TK と iCasp9 という 2 つの自殺遺伝子が臨床試験中です。
養子細胞療法の効率を最大化するためには、形質導入効率をモニタリングし、形質導入された細胞を選択するための機構を有することが望ましい。次いで、形質導入された細胞の精製された集団を患者に投与することができる。
次世代 CAR 構築物 (例えば、SIR、zSIR、Ab-TCRなど) の発現を含む一部の T 細胞工学戦略では、容易に検出可能な表面タンパク質のトランスジェニック発現がもたらされない可能性があります。このような場合、末梢血中の細胞の形質導入の測定と追跡は困難です。さらに、一部の設定では、たとえば GvHD 遺伝子治療プロトコルでは、形質導入された T 細胞のみを投与することが不可欠です。ここでは、臨床グレードの分類を可能にするマーカーが必要です。
ピューロマイシン耐性遺伝子 (PAC)、tEGFR、CD20、低親和性神経成長因子受容体など、いくつかのマーカー遺伝子が報告されています。最近では、短縮型 CD34 および RQR8 がマーカーとして使用されています。これらには、CD34 Miltenyi CliniMACS 選択システムが臨床グレードの分類に容易に利用できるという利点があります。
マーカーおよび自殺遺伝子(例えば、HSV-TK、iCaspase 9、tEGFRなど)は長いコード配列を有しており、これらのタンパク質をマーカー遺伝子として含めると、ベクターのパッケージング能力と転写効率に負担がかかる可能性があります。最後に、上記の自殺遺伝子および/またはマーカー遺伝子はいずれも免疫細胞に生存シグナルを提供することができません。自殺機能、マーカー機能、生存機能は 2 つ以上の遺伝子を含めることによって提供できますが、これによりベクターのパッケージング能力と転写効率にさらに負担がかかる可能性があります。したがって、自殺、生存、およびマーカー機能を提供できる多目的遺伝子スイッチが必要とされている。
本開示は、自殺、生存、およびマーカー機能を果たす多目的遺伝子スイッチを提供する。例示的な実施形態では、多目的スイッチは、細胞内で異所的に発現される場合、養子細胞療法の目的で生死(または生存自殺)スイッチとして機能する。一実施形態では、多目的スイッチは次の式を有する。SP-D1-L1-D2-L2-D3-L3-D4。ここで、SP は多目的スイッチの細胞表面輸送を可能にし、切断されて成熟ペプチドを生成する任意のシグナルペプチドです。D1 は細胞生存を促進する受容体に結合する受容体結合ドメインです。D2 はマーカー/自殺ドメインです。D3 はD1およびD2ドメインが標的細胞の表面から突き出ることを可能にするヒンジドメイン/ストークドメイン、D4は分子スイッチを標的細胞に固定する膜結合ドメイン(例えば、膜貫通ドメインまたは膜アンカードメイン)である。細胞膜および L1、L2、および L3 はオプションのリンカードメインです。
一実施形態では、多目的スイッチは、受容体結合ドメインを含む第1のモジュール(D1)と、マーカー/自殺スイッチとして機能する第2のモジュール(D2)および第3のモジュール(D3)とのフレーム内融合を含む。ヒンジ/ストークドメインとして機能し、膜結合ドメインとして機能する第 4 モジュール (D4) として機能します。一実施形態では、D2、D3、およびD4モジュールは、同じ内在性タンパク質に由来する。一実施形態では、D2、D3、およびD4モジュールは、異なる内因性タンパク質に由来する。一実施形態では、D3およびD4は、同じ内因性タンパク質に由来する。一実施形態では、D3およびD4は、異なる内因性タンパク質に由来する。
一実施形態では、第1のモジュール(D1)は、細胞表面上に発現される受容体に結合する、すなわち、受容体の細胞外ドメインに結合する。一実施形態では、第1のモジュール(D1)は、結合すると生存促進および/または増殖シグナルを細胞に伝達する受容体に結合する。一実施形態では、第1モジュールはシスで受容体に結合する(すなわち、分子スイッチを発現する細胞と同じ細胞上で発現される受容体に結合する)。 一実施形態では、第1のモジュールはトランスで受容体に結合する(すなわち、分子スイッチを発現する細胞以外の細胞上で発現される受容体に結合する)。一実施形態では、第1のモジュールは受容体にシスおよびトランスで結合する。一実施形態では、第1のモジュール(D1)は、サイトカイン、ケモカイン、リガンド、またはそれらの変異体もしくは断片の受容体結合ドメインを含む。例示的なサイトカイン、ケモカインおよびリガンドには、以下のいずれかが含まれるが、これらに限定されない:IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7 、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-14、IL-15、IL-16、IL18、IL-19、IL20、IL-21、IL -22、IL-23、IL27、IL-28、CD40L、4-1BBL、CD30L、OX40L、FLT3-L、エイプリル、BAFF、ランテス、MIP、エリスロポエチン、トロンボポエチン、SCF(幹細胞因子)、G-CSF、一実施形態では、第1のモジュールは、抗体、抗体フラグメント(例えば、scFv、vL、vH、Fabなど)、単一ドメイン抗体(例えば、vHH、FHVHなど)である。または受容体に結合できる非免疫グロブリン抗原結合モジュール。例示的な実施形態では、受容体は以下の1つから選択される:IL-1R、IL2R、IL-3R、IL-4R、IL-5R、IL-6R、IL-7R、IL-8R、IL-9R、IL- 10R、IL-11R、IL-12R、IL-13R、IL-15R、IL-18R、IL-19R、IL-20R、IL-21R、IL-22R、IL-23R、IL-27R、IL-28R、 CCR1、CCR3、CCR5、MIP-1R、PF4 受容体、エリスロポエチン受容体 (Epo-R)、TPO-R/MPL、GSF-R、c-Kit、および M-CSF 受容体。
一実施形態では、第2のモジュール(D2)は、内在性タンパク質の細胞外ドメインまたはその断片を含む。例示的な実施形態では、D2は、以下の内因性タンパク質またはその断片のうちの1つまたは複数の細胞外ドメインを含む。 CD19; CD123; CD22; CD30; CD38、CD52、CD171; CS1 (SLAMF7、CD319); C型レクチン様分子-1 (CLL-1またはCLECL1); CD33;上皮成長因子受容体バリアント III (EGFRviii);ガングリオシド G2 (GD2);ガングリオシドGD3; BCMA; Tn 抗原 (Tn Ag);前立腺特異的膜抗原 (PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体 1 (ROR1)。 FMS 様チロシンキナーゼ 3 (FLT3);腫瘍関連糖タンパク質 72 (TAG72); CD38; CD44v6;癌胎児性抗原 (CEA);上皮細胞接着分子 (EPCAM); B7H3 (CD276);キット (CD117);インターロイキン 13 受容体サブユニット アルファ 2 (IL-13Ra2 または CD213A2)。メソテリン;インターロイキン 11 受容体アルファ (IL-11Ra);前立腺幹細胞抗原 (PSCA);プロテアーゼ セリン 21 (テスティシンまたは PRSS21);血管内皮増殖因子受容体 2 (VEGFR2);ルイス(Y)抗原; CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ (PDGFR-ベータ);段階特異的胚抗原-4 (SSEA-4); CD20;葉酸受容体アルファ (FRα または FR1);葉酸受容体ベータ (FRb);受容体チロシンプロテインキナーゼ ERBB2 (Her2/neu);ムチン 1、細胞表面関連 (MUC1)。上皮成長因子受容体 (EGFR);神経細胞接着分子 (NCAM);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質アルファ (FAP);インスリン様成長因子 1 受容体 (IGF-1 受容体)、炭酸脱水酵素 IX (CA1X)。エフリン A 型受容体 2 (EphA2);シアリルルイス接着分子 (sLe);ガングリオシドGM3;高分子量黒色腫関連抗原 (HMWMAA); o-アセチル-GD2 ガングリオシド (OAcGD2);腫瘍内皮マーカー 1 (TEM1/CD248)。腫瘍内皮マーカー 7 関連 (TEM7R);クローディン 6 (CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR); G タンパク質共役受容体クラス C グループ 5、メンバー D (GPRC5D)。 CD97; CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ (ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的 1 (PLAC1); globoH グリコセラミド (GloboH) の六糖部分。乳腺分化抗原 (NY-BR-1);ウロプラキン 2 (UPK2); A 型肝炎ウイルス細胞受容体 1 (HAVCR1);アドレナリン受容体ベータ 3 (ADRB3);パネキシン 3 (PANX3); G タンパク質共役受容体 20 (GPR20);リンパ球抗原 6 複合体、遺伝子座 K 9 (LY6K)。嗅覚受容体 51E2 (OR51E2); TCR ガンマ代替リーディング フレーム タンパク質 (TARP);アンドロゲン受容体; T 細胞によって認識される扁平上皮癌抗原 3 (SART3); CD79a; CD79b; CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体 1 (LAIR1); IgA 受容体の Fc フラグメント (FCAR または CD89)。白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリー A メンバー 2 (LILRA2); CD300 分子様ファミリーメンバー f (CD300LF); C 型レクチンドメインファミリー 12 メンバー A (CLEC12A);骨髄間質細胞抗原 2 (BST2); EGF 様モジュールを含むムチン様ホルモン受容体様 2 (EMR2)。リンパ球抗原 75 (LY75);グリピカン-3 (GPC3); Fc受容体様5 (FCRL5);免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、CD34、LAMP1 TROP2、GFRα4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原);フコシル-GM1、PTK7、gpNMB、CDH1/CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL-2R、IL-4R、IL-6R、IL11Ra、IL13Ra2、IL-17R、CD179b-IGLl1、TCRガンマデルタ、NKG2D、CD32 ( FCGR2A)、Tim1-/HVCR1、CSF2RA (GM-CSFR-alpha)、TGFbetaR2、Lews Ag、TCR-beta1 鎖、TCR-beta2 鎖、TCR-γ 鎖、TCR-δ 鎖、FITC、黄体ホルモン受容体 (LHR) 、卵胞刺激ホルモン受容体 (FSHR)、性腺刺激ホルモン受容体 (CGHR または GR)、CCR4、SLAMF6、SLAMF4、CD99、Ras G12V、組織因子 1 (TF1)、GPRC5D、Claudin18.2 (CLD18A2 または CLDN18A.2)、P -糖タンパク質、STRAP1、Liv1、ネクチン-4、Cripto、gpA33、BST1/CD157、低コンダクタンスクロライドチャネル(LCCC)、TAJ/TROY、MPL(TPO-R)、KIR3DL2、CD32b、CD229、Toso、PD-1、 PD-L1、PD-L2、TNFR1、TRAIL-R1 (DR4)、TRAIL-R2 (DR5)、CTLA4、IL-36R、CD25、LAG3、VEGF-A、MASP-2、胸腺間質リンホポエチン、組織因子、IFNAR1 、IL5、 IL-6、IL-12、IL-23、 IL-17A、IL-13、アンジオポエチン様3、CGRP、IL-23p19、vWF、C5、IFNγ、CD4、CD8、CD7、NKp30、NKp44、 NKp46、NKG2D、PDGRFα、α4β7インテグリン、 α4インテグリン、VEGF、GPIIb/IIIa PCSK9、Blys 、およびBAFF-R。
一実施形態では、第2のモジュール(D2)を使用して、分子スイッチを発現する細胞の死を誘導することができる。一実施形態では、第2のモジュール(D2)は、薬剤が結合したときに分子スイッチを発現する細胞の死を誘導するために使用することができる。例示的な実施形態では、第2のモジュールに結合したときに分子スイッチを発現する細胞の死を誘導する薬剤は、抗体、抗体フラグメント、scFv、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、抗体薬物複合体である。 、二重特異性抗体もしくはその断片、または細胞(例えば、CAR-T、SAR-T、SAR-NK細胞など)。一実施形態では、第2のモジュールを使用して、分子スイッチを発現する細胞を選択的に濃縮または枯渇させることができる。一実施形態では、第2のモジュールを使用して、薬剤が結合したときに分子スイッチを発現する細胞を選択的に検出、富化および/または枯渇させることができる。例示的な実施形態では、第2のモジュールに結合した場合に分子スイッチを発現する細胞を選択的に検出、富化および/または枯渇させるために使用できる薬剤は、抗体、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、または非免疫グロブリン抗原結合ドメインである。その断片。一実施形態では、分子スイッチは、エクスビボで細胞を選択的に検出、濃縮および/または枯渇させるために使用される。一実施形態では、分子スイッチは、インビボで細胞を選択的に枯渇させるために使用される。一実施形態では、分子スイッチを発現する細胞を検出、枯渇または濃縮するために使用される薬剤(すなわち、抗体、抗体薬物複合体、二重特異性抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメインまたはその断片)は、ヒトに対して承認されている。 FDAによる管理。ヒトへの投与に関してFDAによって承認されている、またはFDAの承認を保留中の例示的な薬剤は当技術分野で知られており、限定されないが、リツキシマブ、ハーセプチン、アービトラックス、アドセトリス、エンブレル、 トレメリムマブ、 モスネツズマブ、 テクリストマブ、 ドナネマブ、 スペソリマブ、ファリシマブ、 チスレリズマブ、ベランタマブマフォドチン、ペンブロリズマブ、ニボルマブおよびQbendなど。抗体を使用して細胞を選択的に枯渇および/または濃縮する方法は、当技術分野で知られている(例えば、WO2018/178378)。一実施形態では、分子スイッチを発現する細胞を検出、枯渇または濃縮するために使用される薬剤は、エクスビボ臨床使用についてFDAによって承認されている。このような薬剤の例は、臨床的に承認されたCliniMACS CD34システム(Miltenyi)と併用することがFDAによって承認されたCD34に対する抗体である。
本開示の分子スイッチは、ポリペプチドが標的細胞の表面で発現されると、D1およびD2ドメインを標的細胞の表面から突出させるヒンジ/ストーク配列(D3)を含む。
ストーク配列(D3)は、D1およびD2を細胞表面から十分に遠ざけ、例えばD1の受容体への結合および/または抗体のD2ドメインへの結合を容易にする。
ストーク配列 (D3) は、D1-D2 ドメインを細胞表面から持ち上げます。
ストーク配列は、実質的に直線状のアミノ酸配列であってもよい。ストーク配列は、D1 および D2 ドメインを標的細胞の表面から遠ざけるのに十分な長さである可能性がありますが、そのコード配列がベクターのパッケージングおよび形質導入効率を損なうほど長くはありません。ストーク配列は、例えば、長さが20~100アミノ酸であってもよい。ストーク配列は、長さが約 40 ~ 50 アミノ酸であり得る。
ストーク配列は高度にグリコシル化されている可能性があります。
ストーク配列は、配列番号(DNA):7132および配列番号(PRT):7824で表される配列を含むか、またはそれらとほぼ同等の長さであり得る。
ストーク/ヒンジ配列は、必要に応じて細胞内アンカー配列と一緒に、膜貫通ドメイン (D4) に機能的に連結されています。膜貫通ドメインおよび細胞内アンカー配列は、ストーク配列の細胞外部分と同じタンパク質に由来してもよいし、または異なるタンパク質に由来してもよい。ストーク/ヒンジおよび膜貫通ドメインおよび細胞内アンカー配列は、CD8 に由来する可能性があります。例示的なCD8ヒンジおよび膜貫通配列は、配列番号(PRT):3603に提供される。
分子スイッチは、同じであっても異なっていてもよい、任意のリンカー(またはスペーサー)ドメインであるL1、L2およびL3を含んでもよい。例示的なリンカーは、配列番号3418~3434に提供される。分子スイッチは、アミノ末端にシグナルペプチドを含んでもよい。例示的なシグナルペプチドは、配列番号2425~2428に提供される。ポリペプチドが標的細胞によって発現されると、シグナルペプチドが切断され、成熟ペプチド産物が生成されます。
例示的な多目的スイッチは、Synth-IL2-Nde-tBCMA-L244ter (配列番号(DNA):7152および配列番号(PRT):7843)であり、細胞外ドメインにインフレームで融合されたIL2のIL2受容体結合ドメインを含むそしてBCMAの膜貫通ドメイン。この多目的スイッチは、免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞など)で発現されると、 IL2のIL-2R結合ドメインを含むN末端D1モジュールを介してIL2受容体に結合することによって生存シグナルを免疫細胞に提供する。この多目的スイッチの第 2 モジュール (D2) は、BCMA 結合剤 ( BCMA 抗体など) によって認識される BCMA の細胞外ドメインを含み、導入遺伝子 ( SARなど) の検出、選択的除去、および/または濃縮に使用できます。 )発現細胞。第2(D2)モジュールを含むBCMAの細胞外ドメインは、BCMAを標的とする抗体または抗体薬物複合体などのBCMA標的薬剤の使用による導入遺伝子(例えば、SAR)発現細胞の選択的自殺にも使用することができる(例えば、ベランタマブ マホドチン)。この分子スイッチの 3 番目 (D3) および 4 番目 (D4) モジュールは、BCMA のヒンジ/ストークおよび膜貫通ドメインで構成され、スイッチを細胞膜に固定する役割を果たします。
分子スイッチはモジュール形式であるため、結果として得られるスイッチが少なくとも 1 つの生物学的活性 (生存スイッチまたは自殺スイッチとして機能する能力など)を保持している限り、異なるモジュールを他のモジュールで置き換えることができます。したがって、IL2モジュールは、異なるサイトカイン(例えば、IL15、IL18、IL21など)で置き換えることができます。これらの多目的タンパク質は、サイトカイン部分(例えば、IL2、IL15、IL18、IL21など)を通じて生存促進シグナルを提供しますが、第二のモジュール(例えば、RQR3、tBCMA、tHer2、tEGFR、tCD19、tCD30など)に結合する薬剤(例えば、抗体)を使用することにより細胞を死滅させるために使用でき、それによって自殺として作用する毒性にもかかわらず、投与された T 細胞の選択的欠失を可能にする遺伝子。第2のモジュール(例えば、RQR3、tBCMA、tHer2、tEGFR、tCD19、tCD30など)も、形質導入の測定のためのマーカーとして使用し、形質導入された細胞の選択を可能にすることができる。
例示的な実施形態では、IL2モジュールは、低親和性IL2変異体、IL15またはIL15変異体によって置き換えることができる。 tBCMAに融合された低親和性IL2変異体を含む例示的な多目的スイッチは、配列番号(DNA):7152~7155および配列番号(PRT):7844~7847で提供される。 IL-15およびtBCMAに融合されたその低親和性変異体を含む例示的な多目的スイッチは、配列番号(DNA):7156~7157および配列番号(PRT):7848~7849で提供される。別の例示的な実施形態では、tBCMAモジュールを他のモジュールで置き換えることができる。例示的な多目的スイッチは、tCD30に融合されたIL2を含む。配列番号(DNA):7158および配列番号(PRT):7850で提供される。例示的な多目的スイッチは、tEGFRおよび他の表面タンパク質(例えば、Her3、CD19、PD1)に融合されたサイトカインを含む。 、PDL1、CD40など)も同様に構築でき、本開示の代替実施形態で使用できる。
多目的スイッチ発現カセットはサイズがコンパクトで、ウイルスベクターに簡単にパッケージ化できます。これらは、個別のプロモーターを必要とする個々のマーカー、自殺遺伝子、生存遺伝子をコードする発現カセットよりもはるかに扱いやすいサイズです。それらは、個々の遺伝子によって示される感度と少なくとも等しい感度を有する生存、自殺、およびマーカー遺伝子要素を含むという追加の利点を有する。
一実施形態では、第2のモジュール(D2)は、エピトープまたはミモトープの1つ以上のコピーを含む合成モジュールである。一実施形態では、エピトープは内因性タンパク質の細胞外ドメインに存在する。一実施形態では、ミモトープは、内因性タンパク質の細胞外ドメインに存在するエピトープを模倣する。例示的な内因性タンパク質は、前のセクションに示されている。エピトープまたはミモトープの1つ以上のコピーを含む例示的な合成モジュールはRQR8(配列番号9619)であり、これはCD34エピトープおよび2つのCD20ミモトープを有するモジュールであり、WO/2013/153391に記載されている。参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。 RQR8モジュールを使用すると、臨床的に承認された CliniMACS CD34 システム (Miltenyi) を使用した選択が可能になります。さらに、この構築物は広く使用されている医薬品抗体リツキシマブに結合し、導入遺伝子発現細胞の選択的欠失をもたらします。追加の多目的分子スイッチの例 IL2またはその変異体およびtBCMA(配列番号(DNA):7151~7155)、IL15またはその変異体およびtBCMA(配列番号(DNA):7156~7157)、IL2およびその変異体およびtHer2を含む融合タンパク質を含み、 IL2およびその変異体およびtEGFR、IL2およびそのRQR8、IL2およびその変異体およびCD30(配列番号7850)など。多目的スイッチはモジュール形式であるため、1つのモジュールを別のモジュールに置き換えることができる。
開示の多目的スイッチをコードするポリペプチドは、配列番号7843~7850および9621~9625として示される配列の変異体を含むか、またはそれらから構成され得、これは、示される配列と少なくとも70%、80%または90%の同一性を有する。配列番号7843~7850および9621~9625ポリペプチドの機能活性を保持している限り、配列番号7843~7850および9621~9625として挙げられる。例えば、配列 7843-7847 の変異体は、(i) IL-2R に結合するはずです。 (ii) BCMA 抗体 (例えば、J6M0 またはベランタマブ マフォドチン)に結合します。 (iii) 細胞表面に発現すると、J6M0 またはベランタマブ マフォドチンの存在下で細胞の死滅を誘導します。 J6M0 は US9273141B2 に記載されています。
相同性比較は、目によって、またはGCG Wisconsin Bestfitパッケージなどの容易に利用可能な配列比較プログラムを利用して行うことができる。
開示の多目的分子スイッチは、ポリペプチドが対象タンパク質(POI)に融合されている融合タンパク質の形態であってもよい。融合タンパク質は、多目的スイッチをコードするポリペプチドと目的のタンパク質との間に自己切断ペプチド(例えば、P2AまたはF2A)を含んでもよい。
目的のタンパク質は、標的細胞の表面で発現する分子です。 POI は、標的細胞が生体内にある場合に治療効果または予防効果を発揮する可能性があります。 POIは、SAR(例えば、CAR、SIR、zSIR、HIT、STAR、cTCR、Ab-TCR、TFP、TAC、組換えTCRなど)または内因性TCRであり得る。
開示の多目的スイッチをコードするポリペプチドまたは融合タンパク質をコードすることができる核酸配列を提供する。
核酸は、標的細胞によって発現されると、コードされた多目的スイッチポリペプチドを標的細胞の細胞表面で発現させる。核酸が多目的スイッチポリペプチドとPOIの両方を(例えば融合タンパク質として)コードする場合、本開示のポリペプチドとPOIの両方が標的細胞の表面で発現されるはずである。
核酸配列は、RNAであっても、cDNAなどのDNAであってもよい。
本開示は、多目的分子スイッチの核酸配列を含むベクターも提供する。ベクターはまた、目的の導入遺伝子、すなわち、POI (例えば、SAR)をコードする遺伝子を含み得る。
ベクターは、多目的スイッチをコードするポリペプチドおよび場合により目的のタンパク質を発現するように、標的細胞をトランスフェクトまたは形質導入できなければならない。
ベクターは、プラスミドなどの非ウイルスベクターであってもよい。ベクターは、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターなどのウイルスベクターであってもよい。ベクターは、ポリペプチドをコードする核酸と、POIを含む核酸とを別個の実体として、または単一のヌクレオチド配列として含んでもよい。それらが単一のヌクレオチド配列として存在する場合、それらは、下流配列の翻訳を可能にするために、2つのコード部分の間に1つ以上の内部リボソーム進入部位(IRES)配列を含み得る。一実施形態では、多目的分子スイッチおよびPOIは、別個のプロモーターを使用して単一のベクターから発現され得る。別の実施形態では、多目的スイッチおよびPOIは、別個のベクトルから表現され得る。
開示の多目的スイッチポリペプチドを発現する細胞を提供する。細胞は、細胞表面で多目的スイッチポリペプチドおよびPOI(例えば、SAR)を共発現し得る。本開示はまた、本開示の多目的スイッチポリペプチドをコードすることができる核酸配列を含む細胞を提供する。細胞は、本開示によるベクターで形質導入またはトランスフェクトされている可能性がある。この細胞は養子細胞療法に適している可能性がある。細胞は、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)などのT細胞であってもよい。 T 細胞は既存の特異性を持っている可能性があります。例えば、それはエプスタイン・バーウイルス(EBV)特異的T細胞であり得る。細胞は、NK細胞、NKT細胞、iPSC由来T細胞、または合成T細胞であってもよい。細胞は患者に由来してもよい。例えば、細胞は患者から採取され、その後、本開示によるベクターでエクスビボで形質導入され得る。 ACT に適した T 細胞集団には、バルク末梢血単核球 (PBMC)、CD8+ 細胞 (たとえば、CD4 枯渇 PBMC) が含まれます。制御性T細胞(Treg)が選択的に枯渇したPBMC。分離された中央記憶 (Tcm) セル。 EBV 固有の CTL。およびトリウイルス固有の CTL。
本開示は、本開示による細胞を含む細胞集団も含む。細胞集団は、本開示によるベクターで形質導入されている可能性がある。細胞集団の一部の細胞は、細胞表面で本開示による多目的スイッチポリペプチドを発現し得る。細胞集団の一部の細胞は、細胞表面で多目的スイッチポリペプチドおよびPOI (例えば、SAR)を共発現し得る。細胞集団は、エクスビボ患者由来の細胞集団であってもよい。
例えばSARなどのタンパク質をコードする)による形質導入を測定するための方法を提供し、この方法は、本開示の多目的スイッチポリペプチドを共発現するベクターを細胞集団に形質導入するステップを含む。目的のタンパク質(例えば、SAR)と、細胞表面上の多目的スイッチ(例えば、BCMA、QBEnd10結合エピトープなど)の発現を検出することと、本開示の多目的スイッチポリペプチドを発現する細胞の割合が対応する。目的の導入遺伝子で形質導入された細胞の割合に応じて調整します。
、以下のステップを含む、 POI(例えば、SAR)を発現する細胞を選択するための方法を提供する。
i ) POI(例えば、 SAR);と
(ii)多目的スイッチ(例えば、BCMA結合エピトープ、Her2結合エピトープ、またはQBEnd10結合エピトープ)を発現すると同定された細胞を選択する。
細胞は、FACSまたはMiltenyi cliniMACSシステムなどの当技術分野で知られている方法によって同定および/または分類され得る。
、上記の方法を使用して細胞集団からPOI(例えばSAR)を発現する細胞を選択するステップを含む、POI(例えばSAR)を発現する細胞が濃縮された精製細胞集団を調製するための方法を提供する。 。本開示は、そのような方法によって調製されたPOI発現細胞の精製集団も提供する。精製された細胞集団において、細胞の少なくとも80%、85%、90%または95%がPOI(および本開示による多目的スイッチポリペプチド)を発現し得る。
細胞表面における本開示のポリペプチドの発現を検出するステップを含む、インビボで形質導入された細胞を追跡するための方法を提供する。細胞は、生物発光イメージングなどの当技術分野で知られている方法によってインビボで追跡され得る。このような用途のために、本開示のポリペプチドは、ルシフェラーゼなどの検出可能なタンパク質と共発現するように操作され得る。
本開示はまた、本開示によるベクターによって形質導入された細胞を欠失させるための方法を提供し、この方法は、多目的スイッチポリペプチドに結合する薬剤に細胞を曝露するステップを含む。一実施形態では、薬剤は多目的スイッチポリペプチドのD2ドメインに結合する。一実施形態では、薬剤は抗体(例えば、リツキシマブ、エルチブトラックスまたはJ6M0)であり、細胞は補体の存在下で抗体に曝露される。一実施形態では、薬剤は抗体薬物複合体(例えば、ベランタマブ・マフォドチン、T-DM1またはエンヘルツなど)である。一実施形態では、多目的スイッチはtBCMAまたはその変異体もしくは断片を含み、薬剤はJ6M0またはベランタマブマフォドチンである。一実施形態では、多目的スイッチはtHer2またはその変異体もしくは断片を含み、薬剤はハーセプチン、 T-DM1またはエンヘルツである。一実施形態では、多目的スイッチはRQR8またはその変異体もしくは断片を含み、薬剤はリツキシマブである。一実施形態では、多目的スイッチはtEGFRまたはその変異体もしくは断片を含み、薬剤はErbitruxである。
開示の多目的スイッチポリペプチドが細胞の表面で発現される場合、ポリペプチドのD2ドメインへの薬剤(例えばリツキシマブ)の結合により細胞の溶解が引き起こされる。薬剤(例えば、リツキシマブ)の複数の分子が、細胞表面で発現される多目的スイッチポリペプチドごとに結合し得る。
、例えば薬剤(例えば、リツキシマブ、ハーセプチン、エルビトラックス、J6M0、ベランタマブ・マフォドチン、T-DM1またはエンヘルツなど)を患者に投与することによって、インビボで起こり得る。移入された細胞を削除する決定は、移入された細胞に起因する望ましくない影響が患者で検出された場合に生じる可能性がある。たとえば、許容できないレベルの毒性が検出される可能性があります。異なる薬剤の投与量、経路、および投与頻度は当技術分野で知られており、薬剤および対象の臨床状態に応じて変化するであろう。一実施形態では、薬剤の複数用量が投与される。
遺伝子改変された T 細胞の養子移入は、抗腫瘍免疫応答などの望ましい免疫応答を生成するための魅力的なアプローチです。
本開示は、対象における疾患を治療および/または予防するための方法を提供し、この方法は、本開示による細胞を対象に投与するステップを含む。この方法は、細胞集団を対象に投与するステップを含んでもよい。細胞集団は、上記の方法を使用して、目的の導入遺伝子を発現する細胞を濃縮することができる。
この方法には次の手順が含まれる場合があります。
o (i) 患者から血液サンプルなどの細胞サンプルを採取する。
o (ii) T細胞を抽出するステップ、
o 多目的スイッチをコードする核酸配列および目的の導入遺伝子(例えば、SAR)を含む本発明のベクターをT細胞に形質導入またはトランスフェクトする工程、
o (iv) 形質導入された細胞をエクスビボで拡大する
o (v) 細胞を患者に戻す。
形質導入された細胞は、腫瘍特異的標的化および殺傷の強化などの所望の治療特性を有する可能性がある。
次世代 SAR 構築物 (例えば、SIR、zSIR、Ab-TCR、HIT、STARなど) の技術的課題は、それらの検出、単離、精製、または枯渇のための簡単な方法が存在しないことです。 CAR構築物へのキルスイッチの付加は記載されているが、SARの標的抗原への結合および/またはオフターゲットシグナル伝達を妨害するという問題がある。出願人は、サイトカイン(例えば、IL2および1L15など)が、それらの結合およびシグナル伝達活性を妨げることなく、膜アンカー型分子(例えば、BCMA、CD30など)にインフレームで融合できることを発見した。本開示は、サイトカイン(例えば、IL2およびIL15など)および膜アンカー分子(例えば、BCMAまたはCD30)に融合されたそれらの低親和性変異体を提供する。 BCMAおよびCD30(例えば、 Adcetris)に対して利用可能なFDA承認の抗体および抗体薬物複合体があるため、これらの分子は、毒性の場合にそれらを発現する細胞(例えば、SAR細胞)を根絶するためのキルスイッチとして使用することができる。
融合構築物はまた、それらを発現する細胞の検出、単離、精製および/または枯渇に使用できる1つまたは複数のエピトープタグ(例えば、セツキシマブミモトープ、リツキシマブタグ、ハーセプチンミモトープ、MYCタグ、StreptagIIなど)を含んでもよい。 SAR発現細胞。例示的なエピトープタグは文献で知られている(例えば、配列番号3423~3434。これらのエピトープタグは、免疫細胞(例えば、SAR発現NK細胞またはT細胞)の検出、単離、精製および/または枯渇に使用することができる。 PCT/US2021/022641に記載されている方法。
製品は、容器と、容器上の、または容器に付随するラベルまたは添付文書とを備えることができる。適切な容器には、例えば、ボトル、バイアル、注射器などが含まれる。容器は、ガラスまたはプラスチックなどのさまざまな材料から形成され得る。一般に、容器は、本明細書に記載の疾患または障害を治療するのに有効な組成物を保持し、滅菌アクセスポートを有し得る(例えば、容器は、静脈内溶液バッグまたは皮下注射針によって穿刺可能な栓を有するバイアルであり得る)。 。組成物中の少なくとも1つの活性薬剤は、その表面に本開示のSARを提示するエフェクター細胞である。ラベルまたは添付文書は、組成物が特定の症状の治療に使用されることを示しています。ラベルまたは添付文書は、SARエフェクター細胞組成物を患者に投与するための説明書をさらに含むことになる。本明細書に記載の併用療法を含む製品およびキットも企図される。
添付文書とは、治療用製品の市販パッケージに慣例的に含まれる説明書を指し、そのような治療用製品の使用に関する適応症、用法、用量、投与、禁忌および/または警告に関する情報が含まれています。いくつかの実施形態では、添付文書は、組成物が標的抗原陽性癌(副腎皮質癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸癌、胆管癌、結腸直腸癌、食道癌、神経膠芽腫、神経膠腫、肝細胞癌など)を治療するために使用されることを示す。 、頭頸部がん、腎臓がん、肺がん、黒色腫、中皮腫、多発性骨髄腫、膵臓がん、褐色細胞腫、形質細胞腫、神経芽腫、卵巣がん、前立腺がん、肉腫、胃がん、子宮がんまたは甲状腺がん)。他の実施形態では、添付文書は、組成物が標的抗原陽性ウイルス感染(例えば、CMV、EBV、HCVなどによる感染)を治療するために使用されることを示す。
さらに、製品は、静菌注射用水(BWFI)、リン酸緩衝生理食塩水、リンゲル液、およびブドウ糖溶液などの薬学的に許容される緩衝液を含む第2の容器をさらに含んでもよい。さらに、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、注射器など、商業的およびユーザーの観点から望ましい他の材料を含んでもよい。
例えば、本明細書に記載の標的抗原陽性疾患または障害の治療に有用なキットも提供され、必要に応じて製品と組み合わせて使用される。本開示のキットは、 SARエフェクター細胞組成物(または単位剤形および/または製品)を含む1つまたは複数の容器を含み、いくつかの実施形態では、別の薬剤(本明細書に記載の薬剤など)および/または使用説明書をさらに含む。本明細書に記載の方法のいずれかに従って使用する。キットは、治療に適した個体の選択に関する説明をさらに含んでもよい。
開示のキットに提供される説明書は、典型的には、ラベルまたは添付文書(例えば、キットに含まれる紙シート)に書かれた説明書であるが、機械読み取り可能な説明書(例えば、磁気または光学記憶ディスクに記録された説明書)もまた、同様である。許容できる。
例えば、いくつかの実施形態では、キットは、その表面にSARを提示するエフェクター細胞を含む組成物を含む。いくつかの実施形態では、キットは、a)その表面にSARを提示するエフェクター細胞を含む組成物、およびb)有効量の少なくとも1つの他の薬剤を含み、他の薬剤は、MHCタンパク質の発現を増加させ、および/またはMHCタンパク質の発現を増強する。 MHCタンパク質(例えば、IFNγ、IFNP、IFNa、またはHsp90阻害剤)によるペプチドの表面提示。いくつかの実施形態では、キットは、a)その表面にSARを提示するエフェクター細胞を含む組成物、およびb)標的抗原陽性疾患(癌または癌など)の治療のために個体にSARエフェクター細胞組成物を投与するための説明書を含む。ウイルス感染)。いくつかの実施形態では、キットは、a)その表面にSARを提示するエフェクター細胞を含む組成物、b)有効量の少なくとも1つの他の薬剤を含み、他の薬剤は、MHCタンパク質の発現を増加させ、および/または表面を強化する。 MHCタンパク質によるペプチドの提示、およびc)標的抗原陽性疾患(癌またはウイルス感染など)の治療のために個体にSARエフェクター細胞組成物および他の薬剤を投与するための指示。 SARエフェクター細胞組成物および他の薬剤は、別個の容器または単一の容器中に存在することができる。例えば、キットは、1つの異なる組成物、または1つの組成物がSARエフェクター細胞を含み、別の組成物が他の薬剤を含む2つ以上の組成物を含んでもよい。
組成物を形成するためにSARをエフェクター細胞(個体に由来するエフェクター細胞、例えば、T細胞またはナチュラルキラー細胞など)と組み合わせるための説明書を含む。表面にSARを提示するエフェクター細胞を含み、標的抗原陽性疾患(癌またはウイルス感染など)の治療のために個体にSARエフェクター細胞組成物を投与するステップ。いくつかの実施形態では、キットは、a)SARを含む組成物、およびb)エフェクター細胞(細胞傷害性細胞など)を含む。
いくつかの実施形態では、キットは、a)SARを含む組成物、b)エフェクター細胞(細胞傷害性細胞など)、およびc)SARをエフェクター細胞と組み合わせて、細胞上に存在するエフェクター細胞を含む組成物を形成するための説明書を含む。その表面をSARとし、標的抗原陽性疾患(癌またはウイルス感染など)の治療のために個体にSARエフェクター細胞組成物を投与する。
いくつかの実施形態では、キットは、SARをコードする核酸(または核酸のセット)を含む。いくつかの実施形態では、キットは、a)SARをコードする核酸(または核酸のセット)、およびb)核酸(または核酸のセット)を発現するための宿主細胞(エフェクター細胞など)を含む。いくつかの実施形態では、キットは、a)SARをコードする核酸(または核酸のセット)、およびb)i)宿主細胞(エフェクター細胞、例えば、T細胞など)内でSARを発現させるための説明書を含む。 ii)SARを発現する宿主細胞を含む組成物を調製するステップ、およびiii)標的抗原陽性疾患(癌またはウイルス感染症など)の治療のために、SARを発現する宿主細胞を含む組成物を個体に投与するステップ。いくつかの実施形態では、宿主細胞は個体に由来する。いくつかの実施形態では、キットは、a)SARをコードする核酸(または核酸のセット)、b)核酸(または核酸のセット)を発現するための宿主細胞(エフェクター細胞など)、およびcを含む。 )i)宿主細胞においてSARを発現させること、ii)SARを発現する宿主細胞を含む組成物を調製すること、およびiii)標的抗原の治療のために個体にSARを発現する宿主細胞を含む組成物を投与するための指示、陽性の病気(がんやウイルス感染など)。
開示のキットは、適切な包装に入っている。適切な包装には、バイアル、ボトル、瓶、柔軟な包装(例えば、密封されたマイラーまたはプラスチックバッグ)などが含まれるが、これらに限定されない。キットはオプションで、バッファーや解釈情報などの追加コンポーネントを提供する場合があります。したがって、本出願は、バイアル(密封バイアルなど)、ボトル、ジャー、柔軟な包装などを含む製品も提供する。
SARエフェクター細胞組成物の使用に関する説明書には、一般に、意図する治療のための用量、投与スケジュール、および投与経路に関する情報が含まれる。容器は、単位用量、バルクパッケージ(例えば、複数回用量パッケージ)、またはサブユニット用量であり得る。例えば、1週間、8日、9日、10日、11日のいずれかのような長期間にわたって個体に効果的な治療を提供するために十分な用量の本明細書に開示されるSARエフェクター細胞組成物を含むキットが提供され得る。 、12日、13日、2週間、3週間、4週間、6週間、8週間、3か月、4か月、5か月、7か月、8か月、9か月、またはそれ以上。キットはまた、複数の単位用量のSARおよび医薬組成物および使用説明書を含み、薬局、例えば病院薬局および調剤薬局での保管および使用に十分な量で包装されてもよい。
本開示は、熱ショックタンパク質70(Hsp70)の膜露出エピトープを標的とするvL、vH、およびscFvを提供する(表47)。本開示はまた、Hsp70を標的とするこれらのvL、vH、およびscFvポリペプチドに基づく、Hsp70を標的とするSARを提供する。 Hsp70を標的とする例示的なSARの配列番号は、(配列番号(DNA):7754~7808および配列番号(PRT):8446~8500)に提供される。 SARは、レンチウイルス媒介遺伝子導入を使用して免疫細胞(例えば、T細胞およびNK細胞など)で発現され、本開示に記載されるインビトロおよびインビボアッセイを使用して、Hps70発現Daudi細胞に対する細胞毒性について試験される。
多くの異なるバックボーンを持つ SAR のin vivo送達が、急性リンパ性白血病患者でテストされます。レンチウイルス媒介遺伝子導入やウイルス様粒子による遺伝子導入など、多くの送達方法が試みられています。 SIR、cTCR、および Ab-TCR のバックボーンを持つ SAR は、第1世代 CAR、第 2世代CAR、第 3世代のバックボーンを持つ SAR と比較して、 in vivo遺伝子送達においてより安全であることが観察されています。 CAR、TFPε、TFPγ、TFPδ、TFPζ、CD16-SAR、NKp30-SAR、NKp44-SAR、NKp46-SAR、DAP10-SAR、またはNKG2D SAR。 SIR、acTCR、および Ab-TCR の骨格を持つ CD19-SAR をコードするレンチウイルス ベクターは、循環 CD19 発現 B-ALL 細胞への挿入頻度が、SIR の骨格を持つ SAR をコードするレンチウイルス ベクターと比較して低いことが観察されます。第1世代CAR、第2世代CAR、第3世代CAR、TFPε、TFPγ、TFPδ、TFPζ、CD16-SAR、NKp30-SAR、NKp44-SAR、NKp46-SAR、DAP10-SAR、またはNKG2D SAR。さらに、挿入後であっても、SIR、acTCR、およびAb-TCRの骨格を有するSARは、循環CD19発現B-ALL細胞では発現しないが、第1世代CARの骨格を有するSARは良好に発現することが観察される。第 2世代CAR、第 3世代CAR、TFPε、TFPγ、TFPδ、TFPζ、CD16-SAR、NKp30-SAR、NKp44-SAR、NKp46-SAR、DAP10-SAR、または NKG2D SAR が循環 B-ALL で観察される細胞。さらに、SAR の偶発的な挿入による B-ALL 再発のリスクは、第1世代のバックボーンを持つ SAR と比較して、SIR、cTCR、および Ab-TCR のバックボーンを持つ SAR の方が低いことにも注目されます。 CAR、第2世代CAR、第3世代CAR、TFPε、TFPγ、TFPδ、TFPζ、CD16-SAR、NKp30-SAR、NKp44-SAR、NKp46-SAR、DAP10-SAR、またはNKG2D SAR。
例えば、メソテリン、PSMAなど)を標的とするCAR-T細胞は、患者への注入時に不十分な増殖を示すことが観察されている。本開示は、血球上で発現される抗原(例えば、CD19、BCMA、CD20など)を標的とすることができるSARを提供することによって、この問題の解決策を提供する。このようなSARは、固形腫瘍を標的とするSARとともに免疫細胞内で共発現され、固形腫瘍を標的とするSAR-T細胞に増殖上の利点をもたらすことができる。例えば、CD19を標的とするSAR(配列番号7660)は、免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)において、PSMAを標的とするSAR(配列番号7617)またはHer2を標的とするSARと共発現され得る。 PSMA SARを発現し、CD19 SARも共発現する免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)は、PSMA SARを単独で発現する免疫細胞と比較して、より大きな増殖およびインビボ持続性を示すことが観察される。二重特異性または多重特異性免疫細胞(例えば、二重特異性または多重特異性CAR-T細胞またはCAR-NK細胞)を生成するための本開示のSARの特有の利点は、第1世代または第世代と比較してそれらの比較的小さいサイズに基づいている。第 2世代CAR。したがって、ウイルスベクター (レンチウイルスベクターやレトロウイルスベクターなど) に簡単にパッケージ化できます。さらに、本開示のSARは、多くの異なるシグナル伝達鎖(例えば、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、DAP10、NKG2D、CD3zなど)を含む。異なるシグナル伝達鎖(すなわち、骨格)を有するSARを組み合わせて、シグナル伝達タンパク質に関して互いに競合しない様々な二重特異性および多重特異性SARを生成することができる。したがって、本開示のSARは、多様な免疫応答を生成するために使用することができる。
前述したように、レンチウイルス インサートのサイズにはパッケージングの制限があります。本開示は、細胞治療および他の遺伝子工学応用のための遺伝子発現のための、ヒトヘルペスウイルス8型(カポジ肉腫関連ヘルペスウイルスまたはKSHV)由来の内部リボソーム侵入配列(IRES)の使用について記載する。他の既知のIRESと比較して、KSHV IRES (配列番号7116)はサイズが比較的小さいため、ウイルスベクターに容易にパッケージングすることができる。我々は、介在するKSHV IRES配列を使用してSIRカセットの後にtBCMAが発現される二本鎖SIRをコードするレンチウイルスベクターを生成した。我々は、レンチウイルスベクターに感染したT細胞におけるtBCMAの効果的な発現を観察した。また、標準的なパッケージングミックスを使用して 293FT 細胞にパッケージングした場合、得られたレンチウイルスベクターの良好な力価も観察されました。また、T 細胞における SIR の高レベルの発現も観察され、KSVH IRES の存在が上流の SIR の発現に影響を与えないことが示唆されました。上記構築物に感染したT細胞におけるSIRおよびtBCMAの発現は両方とも、F2Aリボソームスキップ配列を使用してtBCMAが発現されたレンチウイルスベクターに感染したT細胞におけるそれらの発現と比べて良好であった。
本開示は、以下の例示的な発明の態様を企図している。
態様1. 標的抗原に特異的に結合する合成抗原受容体(SAR)であって、(i)以下からなる群から選択される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む第1のモジュールを含む、合成抗原受容体(SAR)。 a)抗体; b) 抗体フラグメント; c) 抗体の重鎖可変領域(vHドメイン)またはその断片。 d)抗体の軽鎖可変領域(vLドメイン)またはその断片; e)単鎖可変フラグメント(scFv)またはそのフラグメント; f)単一ドメイン抗体(SDAB)またはその断片; g) vHHドメインまたはその断片; h)抗体の単量体可変領域; i)単一のvHドメイン(SVH)またはその断片; j)単一のvLドメイン(SVL)またはその断片; k)DARPIN、アフィボディ、アフィリス、アドネクチン、アフィチン、オボディ、レペボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、セントイリン、プロネクティから選択される非免疫グロブリン抗原結合足場、アンチカリン、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、Dドメイン、および上記のいずれかのフラグメント; l)受容体またはその断片のリガンド結合ドメイン; m) リガンドの受容体結合ドメイン; n) 二重特異性抗体、抗体断片、scFV、vHH、SDAB、非免疫グロブリン抗原結合足場、受容体、またはリガンド。 o) 自己抗原またはその断片。 p)アダプター結合ドメインまたはその断片; q)Fc結合ドメインまたはその断片; r)TCRまたはHLA非依存性TCRまたはその断片; s)TCRまたはそのフラグメントのVa、Vb、VgまたはVdフラグメント、(ii)少なくとも1つの膜関連ドメインを含む第2のモジュールであって、膜関連ドメインは膜貫通ドメインまたは膜アンカードメインであり得る; (iii)1つ以上のサイトゾルドメインを含む任意の第3のモジュールであって、第1、第2、および任意の第3のモジュールは、1つ以上の任意のリンカーを介して機能的に連結されている。
態様2. 1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む第1のモジュールが、任意のリンカーを介して、(1)全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体の膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;または(2)天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;または(3)天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体の膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;または、(4)天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体の細胞質ゾルドメイン。または(5)シグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくは断片の全体または部分的な細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメイン。
態様3.a )天然に存在する受容体が、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδおよびプレTCRαからなる群から選択されるT細胞受容体を含まない、態様2に記載のSAR。および/またはb)天然に存在する受容体はT細胞受容体モジュール(TCRM)を含まない。および/またはc)シグナル伝達アダプターは、CD3ε、CD3γ、CD3εおよびCD3δの群から選択されるCD3アダプターではない。および/または)シグナル伝達アダプターが FcRγ ではない。
態様4. 天然に存在する受容体が、N末端細胞外ドメインを有するI型膜タンパク質であり、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むポリペプチドのN末端が、任意の結合を介して機能的に連結されている、態様2または3に記載のSAR。 a)天然に存在する受容体ポリペプチド鎖の全部または一部の細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン、またはその断片または変異体。またはb)天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;またはc)天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体の膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;または d) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖のサイトゾルドメインまたはその断片もしくは変異体。
態様5. 天然に存在する受容体I型膜タンパク質が、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1からなる群から選択される、態様4に記載のSAR。 、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas 、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、LAIR1、それらの変異体および断片。
態様6. 天然に存在する受容体が、C末端細胞外ドメインを有するII型膜タンパク質であり、1つまたは複数の異種抗原結合ドメインをコードするポリペプチドのN末端が、任意の結合を介して機能的に連結されている、態様2または3に記載のSAR。 a)天然に存在する受容体ポリペプチド鎖の全部または一部の細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン、またはその断片または変異体。またはb)天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;またはc)天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体の膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;または d) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖のサイトゾルドメインまたはその断片もしくは変異体。
態様 7.II型膜タンパク質のN末端に機能的に連結されたシグナル伝達アダプターのサイトゾルドメインを含むポリペプチドのN末端をさらに含む、態様6に記載のSAR。
態様8. シグナル伝達アダプターが、CD3ε、FcRγ、DAP10またはDAP10の群から選択される、態様7に記載のSAR。
態様9. シグナル伝達アダプターのサイトゾルドメインのN末端に作動可能に連結された1つ以上の共刺激ドメインを含むポリペプチドのN末端をさらに含む、態様8に記載のSAR。
態様10.1 つ以上の共刺激ドメインが、CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40からなる群から選択される、態様9に記載のSAR。 、HVEM、アイコス。
態様 11.DAP10を含むアクセサリーモジュールと同時発現される、態様10に記載のSAR。
態様12. 天然に存在する受容体II型膜タンパク質が、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、KLRG1、CD94、CD161、それらの変異体、およびそれらの断片からなる群から選択される、態様6~10のいずれかに記載のSAR。 。
態様13. 全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾルドメインがすべて単一の天然に存在する受容体に由来し、1つの連続したポリペプチド鎖中に存在する、態様3に記載のSAR。
態様14. 全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾルドメインが、2つ以上の異なる天然受容体に由来する、態様2に記載のSAR。
態様15.a) 天然に存在する受容体の全部または部分的な細胞外抗原結合ドメインが、1つまたは複数の異なる天然に由来する任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾルドメインに機能的に連結されている、態様14に記載のSAR。受容体;または、b)天然に存在する受容体の全体または部分的な細胞外抗原結合ドメインおよび任意のヒンジドメインが、1つまたは複数の異なる天然に存在する受容体に由来する膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾルドメインに機能的に連結されており、またはc)天然に存在する受容体の全部または一部の細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジおよび膜貫通ドメインが、1つまたは複数の異なる天然に存在する受容体に由来するサイトゾルドメインに機能的に連結されている。
態様16. サイトゾルドメインがITAMを含む活性化ドメインを含む、態様2に記載のSAR。
態様17. サイトゾルドメインがITAMを含む活性化ドメインを欠いている、態様2に記載のSAR。
態様18. サイトゾルドメインが、CD3ε、FcRγ、DAP10および/またはDAP10の群から選択される1つまたは複数のシグナル伝達アダプターを動員する、態様2に記載のSAR。
態様19. サイトゾルドメインが1つ以上の共刺激ドメインを含む、態様2に記載のSAR。
態様20.1 つ以上の共刺激ドメインが、CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40からなる群から選択される、態様2に記載のSAR。 、HVEM、ICOS、それらのバリアント、およびそれらのフラグメント。
態様21. サイトゾルドメインが共刺激ドメインを欠いている、態様2に記載のSAR。
態様22. サイトゾルドメインが、膜貫通ドメインと活性化ドメインとの間に位置する1つまたは複数の共刺激ドメインを含む、態様2に記載のSAR。
態様23. 天然受容体が、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4からなる群から選択される、態様2に記載のSAR。 、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I 、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、それらの変異体およびそれらの断片。
態様24. 天然に存在する受容体の細胞外抗原結合ドメインの抗原結合特性を部分的または完全に保持し、細胞外抗原結合ドメインに位置する1つまたは複数の異種抗原結合ドメインの抗原結合特異性を獲得する、態様2および3に記載のSAR。最初のモジュール。
態様25. 細胞の表面上で発現されると、細胞にMHC(またはHLA)依存性および/またはMHC(またはHLA)非依存性の抗原認識を与えることができる、態様1に記載のSARであって、a) SAR の抗原結合ドメインは単一の連続したポリペプチド鎖で構成されていません。および/またはb)SARの抗原結合ドメインは、抗体または抗体断片に由来しない。および/またはc)SARはT細胞受容体モジュールを含まない。
態様26.SAR の抗原認識ドメインがTCRの少なくとも2つの可変ドメインに由来する、態様25に記載のSAR。
態様27.2 つの可変ドメインが、Vα、Vβ、Vγ、VδおよびプレTCRαから選択される少なくとも2つの可変ドメインのヘテロ二量体を含む、態様26に記載のSAR。
態様28.2 つの可変ドメインがVαおよびVβ、またはVγおよびVδである、態様27に記載のSAR。
態様29.2 つの可変ドメインが柔軟なペプチドリンカーによって連結されていない、態様28に記載のSAR。
態様30. 単鎖TCR(sc-TCR)ではない、態様29に記載のSAR。
態様31.2 つの鎖を有し、少なくとも1つの鎖が膜結合している、態様25に記載のSAR。
態様32. 両方の鎖が膜結合している、態様31に記載のSAR。
態様33.MHC (HLA)分子と複合体を形成したペプチドに結合することができる、態様25に記載のSAR。
態様34. 細胞の表面上で発現すると、ペプチド/MHC複合体によって結合されたときに少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員する能力を細胞に付与する、態様25に記載のSAR。
態様35. 細胞の表面上で発現されると、ペプチド/MHC複合体によって結合されたときに少なくとも1つのシグナル伝達経路を開始する能力を細胞に与える、態様25に記載のSAR。
態様36. 非T細胞において機能的に発現され得る、態様25に記載のSAR。
態様37. 機能的CD3複合体の発現を欠く細胞において機能的に発現され得る、態様36に記載のSAR。
態様38.CD3γ鎖 、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の機能的発現を欠く細胞において機能的に発現され得る、態様37に記載のSAR。
態様39. 非T細胞にT細胞様抗原認識を与えることができる、態様36に記載のSAR。
態様40.CD3γ鎖 、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の機能的発現を欠くT細胞にT細胞様抗原認識を与えることができる、態様36に記載のSAR。
態様41. 非T細胞への抗原認識時にT細胞様シグナル伝達を与えることができる、態様36に記載のSAR。
態様42.CD3γ鎖 、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の機能的発現を欠くT細胞にT細胞様シグナル伝達を与えることができる、態様36に記載のSAR。
態様43. 任意の細胞にT細胞様の抗原認識を与えることができる、態様222に記載のSAR。
態様44. 少なくとも2つの鎖を含む、態様1に記載のSARであって、a)第1のポリペプチド鎖が、vL、VαまたはVγドメインを含む第1の抗原結合ドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)を含み; b)第2のポリペプチド鎖は、vH、VβまたはVδドメインを含む第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)を含む;ここで、第1の抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインと第2の抗原結合ドメインの相補的vH、VβまたはVδドメインは、標的に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様の抗原結合モジュールを形成する抗原;第1のMAMおよび第2のMAMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化する、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員できる非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。
態様45. 第1のポリペプチド鎖が、第1の抗原結合ドメインと第1のMAMとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、第2のポリペプチド鎖が、第2の抗原結合ドメインとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、態様44に記載のSAR。そして2番目のMAM。
態様46. 第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を個別に含む、態様45に記載のSAR。
態様47. 第1および/または第2のペプチドリンカーが、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む、態様46に記載のSAR。
態様48. 第1および/または第2のペプチドリンカーが、個別に、Cα、Cβ、CγもしくはCδ TCRドメイン、またはその断片を含む、態様46に記載のSAR。
態様49. 第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖が1つ以上のジスルフィド結合を介して連結されている、態様44または45に記載のSAR。
態様50. 第1および/または第2のペプチドリンカーが、2つのポリペプチド鎖の発現、親和性および/または対合を増加させる変異を含む、態様45に記載のSAR。
態様51.第1および/または第2のペプチドリンカーが、配列番号3536~3569および 9627~9631、10832~10841および12304~12311のいずれか1つに記載の配列を含む、態様45に記載のSAR、または少なくとも70%の同一性を有する配列。
態様52. 第1のポリペプチドが、第1のMAMのN末端側に第1のヒンジドメインまたはその断片をさらに含む、態様44に記載のSAR。および/または第2のポリペプチドは、第2のMAMのN末端に第2のヒンジドメインまたはその断片をさらに含む。
態様53. 第1のMAM中の残基と第2のMAM中の残基および/または第1のヒンジドメイン中の残基と第2のヒンジドメイン中の残基との間のジスルフィド結合を含む、態様44に記載のSAR。
態様54. 第1のポリペプチドが、第1のヒンジドメインのN末端に第1の相同抗原結合ドメインまたはその断片をさらに含む、および/または第2のポリペプチドが、第2の相同抗原結合ドメインまたはその断片をさらに含む、態様44に記載のSAR。ここで、2つの相同な抗原結合ドメインは、対応するヒンジドメインと同じ天然に存在する非T細胞受容体に由来する。
態様55. 第1のポリペプチドが、第1のMAMを含む第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に任意の活性化ドメインを含む第1のサイトゾルドメインをさらに含む、態様44に記載のSAR。および/または第2のポリペプチドは、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端に任意の活性化ドメインを含む第2のサイトゾルをさらに含む。
態様56. 第1のポリペプチド鎖が、第1のMAMの第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側にある共刺激ドメイン配列を含む第1のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含み、態様44に記載のSAR。および/または第2のポリペプチド鎖は、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に共刺激ドメイン配列を含む第2のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含む。
態様57. 共刺激ドメインがCD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEMもしくはICOSから選択される、態様56に記載のSAR、または変異体またはその断片。
態様58. 第1および/または第2のMAMおよびNTCRMが、非T細胞の膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意のヒンジドメイン、および/または任意の細胞外ドメインから構成される、態様44に記載のSAR。受容体および/またはシグナル伝達アダプター。
態様59. 第1および/または第2のMAMおよびNTCRMが、すべて、単一の非T細胞受容体および/またはシグナル伝達アダプターもしくはその変異体。
態様60.第1および/または第2のMAMおよびNTCRM が、異なる非細胞由来の膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意のヒンジドメインおよび/または任意の細胞外ドメインから構成される、態様58に記載のSAR。 -T細胞受容体および/またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体。
態様61.2 つの膜貫通/膜アンカードメイン、任意の細胞質ドメイン、任意の共刺激ドメイン、任意のヒンジドメイン、および/または任意の細胞外ドメインが配列において同一であり、同じタンパク質に由来する、態様58に記載のSAR。
態様62.2 つの膜貫通/膜アンカードメイン、任意の細胞質ドメイン、任意の共刺激ドメイン、任意のヒンジドメインおよび/または任意の細胞外ドメインが、配列が異なり、および/または異なるタンパク質に由来する、態様58に記載のSAR。
態様63.a )非T細胞受容体が天然に存在する受容体であり、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3からなる群から選択される、態様58に記載のSAR。 、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4 -1BB、CD27 、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、いずれかのバリアント前述の内容およびその断片。 b)シグナル伝達アダプターは、CD3ε、FcRγ、DAP10、前述のもののいずれかの変異体、およびそれらの断片からなる群から選択される。
態様64.a )第1のMAMおよび第2のMAMが、CD3ε、CD3γ、CD3δまたはCD3εから選択されるCD3鎖の膜貫通ドメインおよび場合によりサイトゾルドメインを含まない、態様44に記載のSAR。および/またはb)第1のMAMおよび第2のMAMは、TCR鎖およびCD3鎖の膜貫通ドメインを含まない。および/またはc)第1のMAMおよび第2のMAMは、CD3εの膜貫通ドメインを含まない。
態様65.MAM のうちの1つだけが、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδおよびプレTCRαからなる群から選択されるT細胞受容体に由来する、態様44に記載のSAR。
態様66. 少なくとも2つの鎖を含む、態様1に記載のSARであって、a)第1のポリペプチド鎖が、vLドメインを含む第1の抗原結合ドメインと、TCRα、TCRβ、TCRγもしくはTCRδまたは変異体から選択される第1のTCR定常鎖とを含む、SAR。その; b)第2のポリペプチド鎖は、vHドメインと、TCRα、TCRβ、TCRγもしくはTCRδまたはその変異体から選択される第2のTCR定常鎖とを含む第2の抗原結合ドメインを含み;ここで、第1のTCR定常鎖はTCRαの定常鎖であり、第2のTCR定常鎖はTCRβの定常鎖である、または、第1のTCR定常鎖はTCRβの定常鎖であり、第2のTCR定常鎖はTCRαの定常鎖である、または、第1のTCR定常鎖はTCRγの定常鎖であり、第2のTCR定常鎖はTCRδの定常鎖であるか、または第1のTCR定常鎖はTCRδの定常鎖であり、第2のTCR定常鎖はTCRγの定常鎖である、または第1のTCR定常鎖はTCRγの定常鎖である、定常鎖および/または第2のTCR定常鎖は、そのN末端領域でアミノ酸残基を欠き、ここで、vLおよびvHドメインは、標的抗原に特異的に結合するFv様抗原結合モジュールを形成し;第1のTCR定常鎖および第2のTCR定常鎖は、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化する、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができるT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成する。
態様67.a )TCRα定常鎖が、配列番号(PRT):7863~7963のアミノ酸配列、またはそれに対して80~99%の相同性を有する配列によって表される、態様66に記載のSAR。 b)TCRβ定常鎖は、配列番号(PRT):7964~8089のアミノ酸配列、またはそれと80~99%の相同性を有する配列によって表される。 c)TCRγ定常鎖は、配列番号(PRT):8091~8191のアミノ酸配列、またはそれと80~99%の相同性を有する配列によって表される。 d)TCRδ定常鎖は、配列番号(PRT):8192~8292のアミノ酸配列、またはそれに対して80~99%の相同性を有する配列によって表される。
態様68. 第1および/または第2のポリペプチド鎖が、第1のポリペプチド鎖のN末端またはN末端付近に結合する1つまたは複数の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む、態様44または66に記載のSAR。および/または第2の抗原結合ドメイン。
態様69. AABDが、単一vHドメイン(SVH)、単一vLドメイン(SVL)、vHHドメイン、単一ドメイン抗体、単一可変ドメインの1つまたは複数から選択される、態様68に記載のSAR。 TCR(svd-TCR)、非免疫グロブリン抗原結合足場、受容体のリガンド結合ドメイン、リガンドの受容体結合ドメイン、自己抗原、アダプター結合ドメイン、Fc結合ドメイン、その断片、および/またはその変形。
態様70. 1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むモジュールが、a)細胞表面タンパク質抗原、b)ペプチド/MHC複合体、およびc) 脂質抗原。
態様71. 標的抗原が、CD19;CD19;およびCD19からなる群から選択される、態様1に記載のSAR。 CD123; CD22; CD30; CD171; CS-1 (CD2 サブセット 1、CRACC、SLAMF7、CD319、および 19A24 とも呼ばれます)。 C型レクチン様分子-1 (CLL-1またはCLECL1); CD33;上皮成長因子受容体バリアント III (EGFRviii);ガングリオシド G2 (GD2);ガングリオシドGD3; TNF 受容体ファミリーメンバー B 細胞成熟 (BCMA); Tn 抗原 ((Tn Ag); 前立腺特異的膜抗原 (PSMA); 受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体 1 (ROR1); FmsLike チロシンキナーゼ 3 (FLT3); 腫瘍関連糖タンパク質 72 (TAG72); CD38; CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化 CD43 エピトープ、非造血系癌で発現するグリコシル化 CD43 エピトープ、癌胎児性抗原 (CEA)、上皮細胞接着分子 (EPCAM)、B7H3 (CD276)、KIT (CD117) ; インターロイキン 13 受容体サブユニット アルファ-2 (IL-13Ra2 または CD213A2); メソセリン; インターロイキン 11 受容体アルファ (IL-11Ra); 前立腺幹細胞抗原 (PSCA); プロテアーゼ セリン 21 (テスティシンまたは PRSS21); 血管内皮増殖因子受容体 2 (VEGFR2); ルイス (Y) 抗原; CD24; 血小板由来成長因子受容体ベータ (PDGFR-ベータ); 胎児期特異的抗原-4 (SSEA-4); CD20; 葉酸受容体アルファ; 受容体チロシンタンパク質キナーゼ ERBB2 (Her2/neu); ムチン 1、細胞表面関連 (MUC1); 上皮成長因子受容体 (EGFR);神経細胞接着分子 (NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性ホスファターゼ (PAP);伸長因子 2 変異 (ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質アルファ (FAP);インスリン様成長因子 1 受容体 (IGF-1 受容体)、炭酸脱水酵素 IX (CA1X)。プロテアソーム (プロソーム、マクロペイン) サブユニット、ベータ タイプ、9 (LMP2);糖タンパク質 100 (gpl00);ブレークポイントクラスター領域 (BCR) とアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ 1 (Abl) (bcr-abl) からなる癌遺伝子融合タンパク質。チロシナーゼ;エフリン A 型受容体 2 (EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子 (sLe);ガングリオシドGM3;トランスグルタミナーゼ 5 (TGS5);高分子量黒色腫関連抗原 (HMWMAA); o-アセチル-GD2 ガングリオシド (OAcGD2);葉酸受容体ベータ。腫瘍内皮マーカー 1 (TEM1/CD248)。腫瘍内皮マーカー 7 関連 (TEM7R);クローディン 6 (CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR); G タンパク質共役受容体クラス C グループ 5、メンバー D (GPRC5D)。染色体 X オープン リーディング フレーム 61 (CXORF61); CD97; CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ (ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的 1 (PLAC1); globoH グリコセラミド (GloboH) の六糖部分。乳腺分化抗原 (NY-BR-1);ウロプラキン 2 (UPK2); A 型肝炎ウイルス細胞受容体 1 (HAVCR1);アドレナリン受容体ベータ 3 (ADRB3);パネキシン 3 (PANX3); G タンパク質共役受容体 20 (GPR20);リンパ球抗原 6 複合体、遺伝子座 K 9 (LY6K)。嗅覚受容体 51E2 (OR51E2); TCR ガンマ代替リーディング フレーム タンパク質 (TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質 (WT1);がん/精巣抗原 1 (NY-ES0-1);癌/精巣抗原 2 (LAGE-1a);黒色腫関連抗原 1 (MAGE-A1); MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、PRAME、PSA、ETS 転座バリアント遺伝子 6、染色体 12p 上に位置 (ETV6-AML)。精子タンパク質 17 (SPA17); X抗原ファミリー、メンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体 2 (Tie 2);黒色腫癌精巣抗原-1 (MAD-CT-1);黒色腫癌精巣抗原-2 (MAD-CT-2); Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質 p53 (p53); p53 変異体。プロステイン;生き残っている。テロメラーゼ;前立腺癌腫瘍抗原-1 (PCT A-1 またはガレクチン 8)、T 細胞によって認識される黒色腫抗原 1 (MelanA または MARTI)。ラット肉腫 (Ras) 変異体。ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座ブレークポイント;黒色腫アポトーシス阻害剤 (ML-IAP); ERG (膜貫通プロテアーゼ、セリン 2 (TMPRSS2) ETS 融合遺伝子); N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ V (NA17);ペアボックスタンパク質Pax-3 (PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリン B1; v-myc 鳥骨髄細胞腫症ウイルス性腫瘍遺伝子神経芽細胞腫由来ホモログ (MYCN); Ras ホモログファミリーメンバー C (RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質 2 (TRP-2);シトクロム P450 1B 1 (CYP1B 1); CCCTC 結合因子 (ジンクフィンガータンパク質) 様 (BORIS またはインプリント部位調節因子の兄弟)、T 細胞 3 (SART3) によって認識される扁平上皮癌抗原。ペアボックスタンパク質 Pax-5 (PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32 (OY-TES1);リンパ球特異的プロテインチロシンキナーゼ(LCK);キナーゼアンカータンパク質 4 (AKAP-4)。滑膜肉腫、X ブレークポイント 2 (SSX2)。最終糖化生成物 (RAGE-1) の受容体。腎臓ユビキタス 1 (RU1);腎臓ユビキタス 2 (RU2);レグマイン。ヒトパピローマウイルス E6 (HPV E6);ヒトパピローマウイルス E7 (HPV E7);腸のカルボキシルエステラーゼ。熱ショックタンパク質 70-2 変異 (mut hsp70-2)。 CD79a; CD79b; CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体 1 (LAIR1); IgA 受容体の Fc フラグメント (FCAR または CD89)。白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリー A メンバー 2 (LILRA2); CD300 分子様ファミリーメンバー f (CD300LF); C 型レクチンドメインファミリー 12 メンバー A (CLEC12A);骨髄間質細胞抗原 2 (BST2); EGF 様モジュールを含むムチン様ホルモン受容体様 2 (EMR2)。リンパ球抗原 75 (LY75);グリピカン-3 (GPC3); Fc受容体様5 (FCRL5);免疫グロブリン ラムダ様ポリペプチド 1 (IGLL1)、MPL、ビオチン、c-MYC エピトープ タグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea (CA19.9; シアリル ルイス抗原) フコシル- GM1、PTK7、gpNMB、CDH1-CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b-IGLl1、ALK TCRガンマデルタ、NKG2D、CD32 (FCGR2A)、Tn ag、CSPG4-HMW-MAA、Tim1-/HVCR1、 CSF2RA (GM-CSFR-alpha)、TGFbetaR2、VEGFR2/KDR、Lews Ag、TCR-beta1 鎖、TCR-beta2 鎖、TCR-γ 鎖、TCR-δ 鎖、FITC、黄体形成ホルモン受容体 (LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性ゴナドトロピンホルモン受容体(CGHR)、CCR4、GD3、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1-Tax、CMV pp65、EBV-EBNA3c、インフルエンザA型ヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC (GCC)、デスモグレイン 3 に対する自己抗体 (Dsg3)、デスモグレイン 1 に対する自己抗体 (Dsg1)、HLA、HLA-A、HLA-A2、HLA-B、HLA-C、HLA-DP、HLA-DM、HLA-DOA 、HLA-DOB、HLA-DQ、HLA-DR、HLA-G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子 1 (TF1)、AFP、GPRC5D、claudin18.2 (CLD18A2 OR CLDN18A.2)、P-糖タンパク質、 STEAP1、LIV1、NECTIN-4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素チャネル、および SARS-CoV2 スパイクタンパク質。
態様72. コードされたSARポリペプチドが、以下からなる群から選択される1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む、態様1に記載のSAR: (i)配列番号1のいずれかに記載の配列を含む重鎖可変領域(vH)配列番号2682~2918、またはそれと少なくとも80%の同一性を有する配列、または配列番号2682~2682~2918のいずれか1つ以上に記載の配列に対して3つの相補性決定領域(CDR)において少なくとも80%の同一性を有する配列。 2918、または配列番号2682~2918のいずれか1つ以上に記載の配列の3つのCDRに3つ未満の置換を有する配列、または配列番号2918に属するCDR1、CDR2およびCDR3に3つ未満の置換を有する配列。 vHおよび配列番号: 11593~11829、11830~12066、12067~12303、または配列番号2682~2682~のいずれか1つ以上に示される配列と同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合する配列。 2918であり、その抗原に結合するポリペプチドをコードする。 (ii)配列番号2440~2676のいずれか1つに示される配列、または配列番号2440~2676のいずれか1つ以上に示される配列に対して少なくとも80%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域(vL): 2440~2676、または配列番号2440~2676のいずれか1つ以上に記載の配列と3つの相補性決定領域(CDR)において少なくとも80%の同一性を有する配列、または3つの配列のうち3つ未満の置換を有する配列配列番号12440~2676のいずれか1つ以上に示される配列のCDR、またはvLに属し、配列番号12440~2676に示されるCDR1、CDR2およびCDR3に3つ未満の置換を有する配列のCDR。 それぞれ、10882~11118、11119~1135 5および11356~11592、または配列番号2440~2440~のいずれか1つ以上に示される配列と同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合する配列。 2676であり、その抗原に結合するポリペプチドをコードする。 (iii)配列番号2924~3160のいずれか1つに記載の配列もしくはそれと少なくとも80%の同一性を有する配列、または6つの相補性において少なくとも70%の同一性を有する配列を含む単鎖可変断片(scFv)配列番号2924~3160のいずれか1つ以上に示される配列、または配列番号2924~3160のいずれか1つ以上に示される配列の6つのCDRにおいて6個未満の置換を有する配列に対する決定領域(CDR)と、 2924~3160、またはscFVを含むvHに属し、配列番号: 11593~11829、11830~12066、12067~12303は、 scFvを含むvLに属し、配列番号: それぞれ、10882~11118、11119~11355、および11356~1159 、または配列番号2924~3160のいずれか1つ以上に示される配列と同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合する配列。そしてその抗原に結合するポリペプチドをコードする。 (iv)配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つに記載の配列、または少なくとも70%の同一性を有する配列を含む、単一ドメイン抗体、vHHドメイン、SVH、および/またはFHVHドメイン配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上に示される配列、および/または3つの相補性決定領域(CDR)においていずれか1つまたは複数に示される配列と少なくとも70%の同一性を有する配列配列番号3210~3353、10695~10713、または配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上に記載の配列の3つのCDRに3つ未満の置換を有する配列、または配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上の配列配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上に示される配列として同じ標的抗原または標的抗原上の同じエピトープに結合し、その抗原に結合するポリペプチドをコードするもの; (v) 配列番号3366~3377のいずれか1つのポリヌクレオチド、または配列番号3366~3377のいずれか1つもしくは複数に記載の配列と少なくとも70%の同一性を有する配列によってコードされる非免疫グロブリン足場配列番号3366~3377のいずれか1つ以上に記載の配列と同じ標的抗原または標的抗原上の同じエピトープに結合するもの;(vi)記載の配列を含む受容体のリガンド結合ドメイン配列番号3378~3395、3880、3882、3886、3893、3896、3897、またはそれと少なくとも70%の同一性を有し、その同族体に結合するポリペプチドをコードする配列のいずれかにおいて; (vii)配列番号3396~3406、10786~10787のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含み、その同族体に結合するポリペプチドをコードするリガンドの受容体結合ドメイン; (viii)配列番号3407~3435、10771~10780のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含み、そのアダプターに結合するポリペプチドをコードするアダプター結合ドメイン; (ix)配列番号10788~10791のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含み、その自己抗体または自己抗体産生細胞に結合するポリペプチドをコードする自己抗原; (x)配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれかに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含むTCR可変領域(Va、Vb、VgまたはVd)、または3つの相補性決定領域(CDR)において、配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれか1つ以上に記載の配列、または3つ未満の置換を有する配列と少なくとも70%の同一性を有する配列。配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれか1つ以上に示される配列、または配列セットと同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合する配列の3つのCDR第4に、配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれか1つ以上において、その抗原に結合するポリペプチドをコードするもの; (xi)配列番号9613~9614のいずれかに記載の配列、またはそれに対して少なくとも70%の同一性を有する配列、または3つの配列において70~99%の同一性を有する配列を含む単一可変TCRドメイン(svd-TCR)配列番号9613~9614のいずれか1つ以上に示される配列に対する相補性決定領域(CDR)、または配列番号9613~9614のいずれか1つ以上に示される配列の3つのCDRにおいて3つ未満の置換を有する配列に対する相補性決定領域(CDR)、 9613~9614、または配列番号9613~9614のいずれか1つ以上に記載の配列と同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合し、その抗原に結合するポリペプチドをコードする配列。
態様73. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターもしくはその断片が、配列番号3743~3966、3385、3394、7818~7822、9633~9859から選択される配列を含む、態様2または58に記載のSAR。またはそれに対する配列に対して70%の相同性を有する配列。
態様74. 天然 に存在する受容体のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質ゾルドメインおよび/またはシグナル伝達アダプターを含むポリペプチドが、配列番号9669~9704、3813、8721から選択される配列を含む、態様2または58に記載のSAR。 、8733および8746、またはそれらの配列に対して70%の相同性を有する配列。
態様75. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターの膜関連ドメインが、配列番号3914~3928、9741~9776、9852~9855から選択される配列を含む、態様1、2、または58に記載のSAR。またはそれに対する配列に対して70%の相同性を有する配列。
態様76. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターのサイトゾルドメインが、配列番号3944~3958、9777~9812、9856~9859から選択される配列を含む、態様1、2または58に記載のSAR。それに対する配列に対して70%の相同性を有する配列。
態様77. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターの活性化ドメインが、配列番号9856~9859および9777から選択される配列、または配列に対して70%の相同性を有する配列を含む、態様16または55に記載のSAR。そこに。
態様78. 共刺激ドメインが、配列番号9807~9810から選択される配列、またはその配列に対して70%の相同性を有する配列を含む、態様9、48および56に記載のSAR。
態様79 各鎖のN末端に存在するリーダー配列またはシグナルペプチドをさらに含み、場合により配列番号2425~2430からなる群から選択される配列を含む、態様1に記載のSAR。
態様80.SARが SARヘテロ二量体を含む、態様1に記載の単離されたSARポリペプチド。
態様81 ポリペプチドが、切断可能なリンカーによって連結された2つのSAR鎖を含む、態様1または80に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様82. 切断 可能リンカーが自己切断性切断可能リンカーである、態様81に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様83 切断 可能なリンカーが、2Aリンカー、2A様リンカーまたはその機能的等価物のいずれか1つ以上である、態様82に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様84 切断 可能なリンカーが、T2Aリンカー、P2A、F2A、E2Aリンカー、またはそれらの機能的等価物のいずれか1つ以上である、態様83に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様85. 切断 可能なリンカーが配列番号3627~3632のいずれか1つまたは複数の配列を含む、態様84に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様86. 切断 可能リンカーの前にフリン切断部位もしくはフリン様切断部位またはその機能的等価物が任意に存在する、態様84に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様87 切断 可能なリンカーに先行するフリン切断部位が、配列番号3635~3636のいずれか1つ以上の配列を含む、態様86に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様88. 切断 可能なリンカーの前に柔軟なリンカーが存在する、態様86~87のいずれか1つの単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様89. 切断可能なリンカーに先行する柔軟なリンカーが1つ以上のSer-Glyリンカーまたはその機能的等価物をコードする、態様88に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様90. 切断可能なリンカーに先行する柔軟なリンカーが配列番号3633~3634の配列を含む、態様89に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様91. フリン切断部位の順序となるように、フリン切断部位の後に柔軟なリンカーが続き、その後に切断可能なリンカーが続く、態様88~90のいずれか1つの単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 - 柔軟なリンカー - 切断可能なリンカー。
態様92.SARが、 選択された抗原に対して所望の結合親和性を有するように設計されている、態様1または80に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
態様93.a) サイトカインまたはその変異体、およびa)サイトカインまたはその変異体からなる群から選択されるポリペプチドを含むアクセサリーモジュールをさらに発現する、態様1に記載のSAR。 b) 膜アンカー型サイトカイン。 c) エピトープタグを有する膜アンカー型サイトカイン。 d) 自殺、生存、マーカー機能として機能する多目的スイッチ。 e) シグナル伝達アダプター分子。 f) キルスイッチ。
態様94.a) サイトカインが、配列番号7833~7842の配列またはそれに対して最大70%の配列相同性を有する変異体を含み、かつb)膜アンカー型サイトカインが、配列番号7833~7842を有する配列を含む、態様93に記載のアクセサリーモジュール。配列番号7825~7832またはそれに対して最大70%の配列相同性を有する変異体、c)多目的スイッチは、配列番号7843~7850の配列またはそれに対して70%の配列相同性を有する変異体を含む、およびd)アダプターは、CD3ζ、FcRγ、DAP10およびDAP12の群から選択される。
態様95.式 :SP-D1-L1-D2-L2-D3-L3-D4を有する態様94の多目的スイッチを含むポリペプチド。式中、SPは、多目的スイッチの細胞表面輸送を可能にし、切断されて成熟ペプチドを生成する任意のシグナルペプチドであり、D1は、細胞の生存を促進する受容体に結合する受容体結合ドメインであり、
多目的スイッチを標的細胞に固定する膜結合ドメインです。細胞膜、L1、L2、および L3 はオプションのリンカーです。
態様96. 多目的スイッチポリペプチドが、第1のモジュール(D1)、(D2)、(D3)および(D4)のインフレーム融合を含む、態様95に記載のポリペプチド。
態様97 a)D3およびD4モジュールが同じ内因性タンパク質に由来する、態様96に記載のポリペプチド。または b) D2、D3、および D4 モジュールが異なる内因性タンパク質に由来する。または c) D3 と D4 は同じ内因性タンパク質に由来します。または d) D3 と D4 は異なる内因性タンパク質に由来します。
態様98. 第1のモジュール(D1)が細胞表面上で発現される受容体に結合する、態様95に記載のポリペプチド。
態様99. 受容体が結合すると、生存促進および/または増殖シグナルを細胞に伝達する、態様98に記載のポリペプチド。
態様100. 第1のモジュールが受容体にシスで結合する、および/または第1のモジュールが受容体にトランスで結合する、態様98に記載のポリペプチド。
態様101. 第1のモジュール(D1)が、サイトカイン、ケモカイン、リガンド、またはそれらの変異体もしくは断片の受容体結合ドメインを含む、態様95に記載のポリペプチド。
態様102.前記 D1が、IL2、IL4、IL6、IL7、IL9、IL10、IL11、IL12、IL15からなる群から選択されるサイトカイン、ケモカインまたはリガンドの受容体結合ドメインを含む、態様101に記載の多目的スイッチ。 、IL18、IL21、CD40L、4-1BBL、CD30L、OX40L、FLT3-L、エイプリル、BAFF、ランテス、MIP、エリスロポエチン、トロンボポエチン、SCF(幹細胞因子)、G-CSF、GM-CSF、M-CSF、前述のいずれかの変形、および前述のいずれかのフラグメント。
態様 103.D1が、配列番号7833~7842で表される配列を有するポリペプチド、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する変異体を含む、態様101に記載のポリペプチド。
態様104. D1が、受容体に結合できる抗体、抗体フラグメント、単一ドメイン抗体、一本鎖抗体、scFv、または非免疫グロブリン抗原結合モジュールを含む、態様95に記載のポリペプチド。
態様105. D1が、IL2R、IL6R、IL7R、IL9R、IL10R、IL11R、IL12R、IL15R、IL18、IL21 CCR1、CCR3、CCR5、 MIP-1R、PF4 受容体、エリスロポエチン受容体 (Epo-R)、TPO-R/MPL、GSF-R、c-Kit、および M-CSF 受容体。
態様106.D2が 非内在性ポリペプチドを含む、態様95に記載のポリペプチド。
態様107.D2 が内在性タンパク質の細胞外ドメインまたはその変異体もしくは断片を含む、態様95に記載のポリペプチド。
態様108. D2が、以下の内因性タンパク質またはその変異体もしくは断片のうちの1つまたは複数の細胞外ドメインを含む、態様95に記載のポリペプチド: CD5; CD19; CD123; CD22; CD30; CD38、CD52、CD171; CS1 (SLAMF7、CD319); C型レクチン様分子-1 (CLL-1またはCLECL1); CD33;上皮成長因子受容体バリアント III (EGFRviii);ガングリオシド G2 (GD2);ガングリオシドGD3; BCMA; Tn 抗原 (Tn Ag);前立腺特異的膜抗原 (PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体 1 (ROR1)。 FMS 様チロシンキナーゼ 3 (FLT3);腫瘍関連糖タンパク質 72 (TAG72); CD38; CD44v6;癌胎児性抗原 (CEA);上皮細胞接着分子 (EPCAM); B7H3 (CD276);キット (CD117);インターロイキン 13 受容体サブユニット アルファ 2 (IL-13Ra2 または CD213A2)。メソテリン;インターロイキン 11 受容体アルファ (IL-11Ra);前立腺幹細胞抗原 (PSCA);プロテアーゼ セリン 21 (テスティシンまたは PRSS21);血管内皮増殖因子受容体 2 (VEGFR2);ルイス(Y)抗原; CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ (PDGFR-ベータ);段階特異的胚抗原-4 (SSEA-4); CD20;葉酸受容体アルファ (FRα または FR1);葉酸受容体ベータ (FRb);受容体チロシンプロテインキナーゼ ERBB2 (Her2/neu);ムチン 1、細胞表面関連 (MUC1)。上皮成長因子受容体 (EGFR);神経細胞接着分子 (NCAM);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質アルファ (FAP);インスリン様成長因子 1 受容体 (IGF-1 受容体)、炭酸脱水酵素 IX (CA1X)。エフリン A 型受容体 2 (EphA2);シアリルルイス接着分子 (sLe);ガングリオシドGM3;高分子量黒色腫関連抗原 (HMWMAA); o-アセチル-GD2 ガングリオシド (OAcGD2);腫瘍内皮マーカー 1 (TEM1/CD248)。腫瘍内皮マーカー 7 関連 (TEM7R);クローディン 6 (CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR); G タンパク質共役受容体クラス C グループ 5、メンバー D (GPRC5D)。 CD97; CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ (ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的 1 (PLAC1); globoH グリコセラミド (GloboH) の六糖部分。乳腺分化抗原 (NY-BR-1);ウロプラキン 2 (UPK2); A 型肝炎ウイルス細胞受容体 1 (HAVCR1);アドレナリン受容体ベータ 3 (ADRB3);パネキシン 3 (PANX3); G タンパク質共役受容体 20 (GPR20);リンパ球抗原 6 複合体、遺伝子座 K 9 (LY6K)。嗅覚受容体 51E2 (OR51E2); TCR ガンマ代替リーディング フレーム タンパク質 (TARP);アンドロゲン受容体; T 細胞によって認識される扁平上皮癌抗原 3 (SART3); CD79a; CD79b; CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体 1 (LAIR1); IgA 受容体の Fc フラグメント(FCAR または CD89)。白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリー A メンバー 2 (LILRA2); CD300 分子様ファミリーメンバー f (CD300LF); C 型レクチンドメインファミリー 12 メンバー A (CLEC12A);骨髄間質細胞抗原 2 (BST2); EGF 様モジュールを含むムチン様ホルモン受容体様 2 (EMR2)。リンパ球抗原 75 (LY75);グリピカン-3 (GPC3); Fc受容体様5 (FCRL5);免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、CD34、LAMP1 TROP2、GFRα4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原);フコシル-GM1、PTK7、gpNMB、CDH1/CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL-2R、IL-4R、IL-6R、IL11Ra、IL13Ra2、IL-17R、CD179b-IGLl1、TCRガンマデルタ、NKG2D、CD32 ( FCGR2A)、Tim1-/HVCR1、CSF2RA (GM-CSFR-alpha)、TGFbetaR2、Lews Ag、TCR-beta1 鎖、TCR-beta2 鎖、TCR-γ 鎖、TCR-δ 鎖、FITC、黄体ホルモン受容体 (LHR) 、卵胞刺激ホルモン受容体 (FSHR)、性腺刺激ホルモン受容体 (CGHR または GR)、CCR4、SLAMF6、SLAMF4、CD99、Ras G12V、組織因子 1 (TF1)、GPRC5D、Claudin18.2 (CLD18A2 または CLDN18A.2)、P -糖タンパク質、STRAP1、Liv1、ネクチン-4、Cripto、gpA33、BST1/CD157、低コンダクタンスクロライドチャネル(LCCC)、TAJ/TROY、MPL(TPO-R)、KIR3DL2、CD32b、CD229、Toso、PD-1、 PD-L1、PD-L2、TNFR1、TRAIL-R1 (DR4)、TRAIL-R2 (DR5)、CTLA4、IL-36R、CD25、LAG3、VEGF-A、MASP-2、胸腺間質リンホポエチン、組織因子、IFNAR1 、IL5、IL-6、IL-12、IL-23、IL-17A、IL-13、アンジオポエチン様3、CGRP、IL-23p19、vWF、C5、IFNγ、CD4、CD8、CD7、NKp30、NKp44、 NKp46、NKG2D、PDGRFα、α4β7インテグリン、α4インテグリン、VEGF、GPIIb/IIIa PCSK9、Blys、およびBAFF-R。
態様109. D2が、多目的スイッチを発現する細胞を検出、富化および/または死滅させるために使用できる薬剤によって結合され得る、態様95に記載のポリペプチド。
態様110. 薬剤が、抗体、抗体断片、scFv、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、抗体薬物複合体、二重特異性ドメインのうちの1つまたは複数から選択される、態様109に記載のポリペプチド。抗体もしくはその断片、または細胞。
態様111. D2に結合する薬剤がインビボまたはエクスビボでのヒト臨床使用が承認されている、態様110に記載のポリペプチド。
アスペクト112. アスペクト111のポリペプチド。これは、リツキシマブ、ヘルセプチン、エンテルトゥ、エルビトラックス、アドセトリス、エンブレル、トレメリムマブ、モスネトゥズマブ、テクリスタマブ、ドナネマブ、スピソリマブ、ファーリシマブ、トスレイムカッサンマブ、トスレン科、エンブレル、トレメリムマブ、モスネチュズマブ、エンブレル、エンブレル、エンブレル、エンブレル、エンブレル、エンブレクマブ、エンブレル、エンブレキマブ、エンブレルから構成されるアスペクト111のポリペプチドです。 、タファシタマブ、ペンブロリズマブ、ニボルマブおよびQbend10。
態様113.D3 が5~100アミノ酸長のストーク(ヒンジドメイン)配列を含む、態様95に記載のポリペプチド。
態様114. 配列番号(PRT):7843~7850、配列番号(PRT):9625および配列番号:9620~9624によって表されるアミノ酸配列を含む、態様95に記載のポリペプチド、または少なくとも80を有する変異体。それに対する%相同性。
態様115. 配列番号7843~7849として示される配列、または配列番号7843~7849として示される配列と少なくとも80%の同一性を有し、かつ( i) J6M0 に結合します。 (ii) ベランタマブ マフォドチンに結合し、(iii) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると生存を促進します。 (v) T 細胞または NK 細胞の表面で発現すると、ベランタマブ マフォドチンの存在下で細胞の死滅を誘導します。
態様116. 配列番号9620~9624として示される配列、または配列番号9620~9624として示される配列と少なくとも80%の同一性を有し、かつ( i) QBEND10 をバインドします。 (ii) リツキシマブに結合し、(iii) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると生存を促進します。 (v) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると、リツキシマブの存在下で補体を介した細胞の死滅を誘導します。
態様117. 配列番号9625として示される配列、または配列番号9625として示される配列と少なくとも80%の同一性を有し、(i)ハーセプチンに結合するその変異体を含む、態様95に記載のポリペプチド。 ; (ii) Enhertu に結合し、(iii) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると、生存を促進します。 (v) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると、ハーセプチンまたはエネヘルツの存在下で細胞の死滅を誘導します。
態様118.態様 1のSARの第1および/または第2のポリペプチド鎖および/または態様93の1つ以上のアクセサリーモジュールをコードする組換え核酸。
態様119. アクセサリーと共発現される、態様118に記載の組換えポリヌクレオチドを含む組換え発現システムであって、アクセサリーモジュールが、短縮型上皮成長因子受容体(tEGFR)、短縮型上皮成長因子受容体からなる群から選択される、組換え発現システム。 viii (tEGFRviii)、短縮型 CD30 (tCD30)、短縮型 BCMA (tBCMA)、短縮型 CD19 (tCD19)、CD34、チミジンキナーゼ、シトシン デアミナーゼ、ニトロレダクターゼ、キサンチン-グアニン ホスホリボシル トランスフェラーゼ、ヒト カスパーゼ 8、ヒト カスパーゼ 9、誘導性カスパーゼ 9 (icaspase9)、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、リナマラーゼ/リナマリン/グルコースオキシダーゼ、デオキシリボヌクレオシドキナーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)/インドール-3-酢酸(IAA)、ガンマ-グルタミルシステインシンテターゼ、CD20/アルファCD20、CD34/チミジンキナーゼキメラ、dox-依存性カスパーゼ-2、変異型チミジンキナーゼ (HSV-TKSR39)、AP1903/Fas システム、キメラサイトカイン受容体 (CCR)、選択マーカー、多目的スイッチ、vFLIP-K13、vFLIP-MC159、4-1BBL-CD40L 、DAP10、DAP12、NKG2C、CD94、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ、ジヒドロキシ葉酸受容体(DHFR)、変異型DHFR、メチル化DNAタンパク質システインメチルトランスフェラーゼ、イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼII(IMDHP2)、ピューロマイシンアセチルトランスフェラーゼ(PAC) )、ブラストサイジン耐性遺伝子、変異体カルシニューリン a/b(Can/b)、CNa12、CNb30、およびそれらの組み合わせ。
態様120. SARの1つまたは2つの鎖および1つまたは複数のアクセサリーモジュールをコードする組換えポリヌクレオチドが、任意の柔軟なリンカー、任意のフリン切断部位またはフリン様切断をコードするヌクレオチド配列によって連結されている、態様119に記載の組換え発現システム。サイトと切断可能なリンカー。
態様121.SAR の1つまたは2つの鎖および1つまたは複数のアクセサリーモジュールをコードする組換えポリヌクレオチドが、i)1つまたは複数のプロモーターを使用して発現される、態様120に記載の組換え発現系。 ii) 1 つ以上の内部リボソーム侵入部位 (IRES)。 iii) 1つまたは複数の切断可能なリンカー; iv) i、ii、iii の任意の組み合わせ。
態様122.a )プロモーターが、MNDU3プロモーター、EF1αプロモーター、EFSプロモーター(配列番号8505)、EFS2プロモーター(配列番号8506)、RSVプロモーター(配列番号8506)である、態様121に記載の組換え発現系。 :8507)、またはmutRSVプロモーター(配列番号8508)、またはそれと70%の同一性を有する配列; b)IRESは、K-IRES(配列番号8504)またはそれと70%の同一性を有する配列である。
態様123. 態様118の組換えポリヌクレオチドおよび態様119の組換え発現系を含む少なくとも1つのベクターであって、ベクターがDNAベクター、RNAベクター、プラスミド、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、レトロウイルスベクター、バキュロウイルスベクター、スリーピングビューティートランスポゾンベクター、ピギーバックトランスポゾンベクター。
態様124.1 つ以上の構成的プロモーターまたは調節可能なプロモーターを含む、態様123に記載のベクター。
態様125. プロモーターが、MNDU3プロモーター、EF1αプロモーター、EFSプロモーター(配列番号8505)、EFS2プロモーター(配列番号8506)、RSVプロモーター(配列番号8507)から選択される、態様104に記載のベクター。 )、またはmutRSVプロモーター(配列番号8508)、CMV IE遺伝子プロモーター、EF-1aプロモーター、ユビキチンCプロモーター、MSCV LTRプロモーター、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)プロモーター、または合成Notch(SynNotch)プロモーター。
態様126. ベクターがインビトロ転写ベクターであるか、またはベクターがポリ(A)テールもしくは3'UTRをさらに含む、態様123に記載のベクター。
態様127. 態様 1の少なくとも1つのSARポリペプチドまたはヘテロ二量体、態様118の核酸、任意のアクセサリーモジュール、態様119の組換え発現系、および態様123のベクターを含む、エフェクター細胞または幹細胞。
態様128. 細胞が複数の一本鎖または二本鎖SARポリペプチドを含む、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様129 複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つの単鎖または二本鎖SARポリペプチドが、少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる抗原を標的とする、態様128に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様130. 複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが同じ抗原を標的とする、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様131. 複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが、抗原に対して少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる結合親和性を含む、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様132. 複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが、少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる天然受容体またはシグナル伝達アダプターを含む、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様133. 複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが、少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、サイトゾルドメインを有する、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様134. 複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが活性化受容体であり、少なくとも1つの他のSARポリペプチドが阻害性受容体である、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様135. 複数のSARポリペプチドのうちの2つ以上のSARポリペプチドが活性化受容体であるか、または複数のSARポリペプチドのうちの2つ以上のSARポリペプチドが阻害性受容体である、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様136 複数のSARポリペプチドのうちの2つ以上のSARポリペプチドが、異なるシグナル伝達アダプターを動員し、および/または異なるシグナル伝達経路を活性化する、態様127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
態様137. エフェクター細胞が、α/β T細胞、γ/δ T細胞、CD8+ T細胞、CD4+ T細胞、メモリーT細胞、ナイーブT細胞、T幹細胞、Treg細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、iNKT(先天性ナチュラルキラー細胞)、NK細胞、g-NK細胞、記憶様NK細胞、サイトカイン誘導性キラー細胞(CIK)、iPSC 、改変型HLA欠損iPSC、iPSC由来NK細胞、iPSC由来T細胞、B細胞、マクロファージ/単球、顆粒球、樹状細胞、不死化細胞株、不死化NK細胞株、NK92細胞株、NK92MI細胞株、YTS細胞、またはそれらの誘導体。
態様138. 複数の多様なSARポリペプチドを含む、態様127~137のいずれか1つのエフェクター細胞の集団。
態様139 複数の多様なSARポリペプチドが異なる配列を含むが、同じ標的抗原または異なる抗原に結合する、態様138に記載の免疫細胞またはエフェクター細胞の集団。
態様140. 態様127のSAR発現エフェクター細胞を作製する方法であって、態様123の少なくとも1つのベクターまたは態様118の少なくとも1つの組換えポリヌクレオチドをエフェクター細胞、細胞株、造血幹細胞、 SARポリペプチドおよび任意のアクセサリーモジュールが発現されるような条件下で、エフェクター細胞を生じさせることができる前駆細胞またはIPSC。
態様141. エフェクター細胞が、機能的TCR、機能的HLA、β2マクログロブリン、TAPI、TAP2、タパシン、NLRC5、CIITA、RFXANK、CIITA、RFX5、RFXAP、 TCRαまたはβ定常領域、NKG2A、NKG2D、CD38、CD5、CD52、CD33、CD123、CLL-1、CIS、CBL-B、SOCS2、PD1、CTLA4、LAG3、TIM3、TIGIT、または染色体6p21領域内の任意の遺伝子;および/またはHLA-E、41BBL、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ、DAP10、DAP12、CD4、CD8、CD16、CD47、CD94、CD113、CD131、CD137、CD80、 PDL1、A2AR、Fc受容体、エンゲージャー、または二重特異性または多重特異性またはユニバーサルエンゲージャーと結合するための表面トリガー受容体。
態様142. 第1の内因性TCRサブユニットおよび/または第2の内因性TCRサブユニットの発現を遮断または減少させるようにエフェクター細胞が修飾されている、態様127に記載のエフェクター細胞。
態様143.T 細胞受容体(TCR)および/またはCD3ε、CD3γもしくはCD3δを発現せず、非TCR抗原認識ドメインを含む組換え二本鎖SARを発現するように組換え発現によって修飾されている、態様127に記載のエフェクター細胞。前記細胞は、CD3鎖CD3γ、CD3δ、CD3ε、およびCD3εを発現し、CD3鎖およびSARは、細胞の表面に位置する機能的CD3-SAR複合体を形成する、T細胞受容体モジュール(TCRM)を含む、T細胞受容体モジュール(TCRM)を含む。
態様144.T 細胞受容体(TCR)を発現せず、および/またはCD3ε、CD3γもしくはCD3δを発現せず、細胞にとって外因性の組換え二本鎖TCRを発現するように組換え発現によって修飾されている、態様127に記載のエフェクター細胞、前記組換え二本鎖TCRは、a)VαおよびVβドメイン、またはb)VγおよびVδドメインを含むTCR抗原認識ドメインと非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を含むSARである。
態様145. 非T細胞受容体に由来する第1のMAMおよび第2のMAMを含む非T細胞受容体モジュール(NTCRM)に任意のリンカーを介して作動可能に連結されたTCR抗原認識モチーフを含む、態様144に記載のエフェクター細胞。 /またはシグナル伝達アダプターを含み、さらに任意の細胞質共刺激ドメインを含む。
態様146.NK 細胞、g-NK細胞、記憶様NK細胞、サイトカイン誘導性キラー細胞(CIK)、iPSC、修飾HLA欠損iPSC、iPSCからなる群から選択される、態様143~145のエフェクター細胞。 -由来NK細胞、B細胞、顆粒球、マクロファージ/単球、樹状細胞、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、CD3γ、CD3δ、CD3εまたはCD3ε鎖の1つ以上が欠損しているT細胞、不死化細胞株、不死化NK細胞株、NK92細胞株、NK92MI細胞株、YTS細胞またはそれらの誘導体。
態様147. インビトロ転写されたRNAまたは複数のRNAまたは合成RNAまたは複数のRNAを細胞または細胞の集団に導入することを含む、態様127のエフェクター細胞を生成する方法であって、前記RNAまたは複数のRNAが態様118の組換えポリヌクレオチドまたは複数のポリヌクレオチドを含む、方法。
態様148. 態様 127~146のいずれか1つの免疫エフェクター細胞を生じさせることができる有効量の免疫エフェクター細胞または幹細胞を対象に投与することを含む、対象に抗疾患免疫を提供する方法であって、細胞は、自己T細胞もしくは同種T細胞、または自己NK細胞もしくは同種NK細胞、または自己マクロファージもしくは同種マクロファージ、または自己顆粒球もしくは同種顆粒球、または自己樹状細胞もしくは同種異系細胞である。樹状細胞、エフェクター細胞を生じさせることができる自己造血幹細胞もしくは同種造血幹細胞、または自己もしくは同種異系iPSC。
態様149 同種異系T、NK、マクロファージ、顆粒球、樹状細胞、造血幹細胞またはiPSCが、機能的TCR、機能的HLA、β2マクログロブリン、TAPI、TAP2、タパシン、NLRC5、CIITA、RFXANK、CIITA、RFX5、RFXAP、TCRαまたはβ定常領域、NKG2A、NKG2D、CD38、CD5、CD52、CD33、CD123、CLL-1、CIS、CBL-B、SOCS2、PD1、CTLA4、 LAG3、TIM3、TIGIT、または染色体 6p21 領域内の任意の遺伝子。および/またはHLA-E、41BBL、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ、DAP10、DAP12、CD4、CD8、CD16、CD47、CD94、CD113、CD131、CD137、CD80、 PDL1、A2AR、Fc受容体、エンゲージャー、または二重特異性または多重特異性またはユニバーサルエンゲージャーと結合するための表面トリガー受容体。
態様150. 標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、標的細胞を態様127に記載のエフェクター細胞と接触させることを含み、SARが標的抗原に特異的に結合する方法。
態様151. 標的細胞を、SAR発現エフェクター細胞上で発現される1つまたは複数の抗原および標的細胞上で発現される1つまたは複数の抗原に結合する1つまたは複数の薬剤と接触させるステップをさらに含む、態様150に記載の方法。
態様152. 薬剤が、SAR発現エフェクター細胞を、薬剤によって標的化される抗原を発現する標的細胞にリダイレクトすることができる、態様151に記載の方法。
態様153. 作用 物質が、抗体、抗体、抗体、抗原結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン断片、自律的抗原結合ドメイン、二重特異性エンゲージャー、二重特異性T細胞エンゲージャーである、態様151に記載の方法。 BiTE)、二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)、三重特異性エンゲージャー、三重特異性T細胞エンゲージャー、または三重特異性キラーエンゲージャー( TRiKE)、またはそれらの組み合わせ。
態様154. エフェクター細胞が、1つまたは複数の天然受容体の細胞外ドメインを含むSARを発現する、態様151に記載の方法。
態様155. SARが、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、 KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD 81、 CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、および CD161。
態様156. 薬剤が、抗体、抗体、抗原結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン断片、自律的抗原結合ドメイン、二重特異性エンゲージャー、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、天然に存在する受容体または変異体の1つまたは複数の細胞外ドメインに特異的に結合できる少なくとも1つのドメインを含む、二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)、三重特異性エンゲージャー、三重特異性T細胞エンゲージャー、または三重特異性キラーエンゲージャー( TriKE)、またはSARを含むその断片。
態様157. 作用物質が以下に特異的に結合する、態様151または156に記載の方法。 a)SARを含む1つ以上の天然受容体またはその変異体もしくは断片の細胞外ドメイン;および/または b) SAR の一部ではない 1 つまたは複数の天然に存在する受容体の細胞外ドメイン。
態様158. 薬剤が、1つ以上の天然に存在する共刺激受容体の細胞外ドメインに特異的に結合することができる、態様151または157に記載の方法。
態様159. 薬剤が、1つ以上の天然に存在する活性化受容体の細胞外ドメインに特異的に結合することができる、態様151または157に記載の方法。
態様160. 薬剤が、共刺激ドメインを含むSARの細胞外ドメインに特異的に結合することができる、態様151または157に記載の方法。
態様161. 薬剤が、活性化ドメインおよび共刺激ドメインを含むSARの細胞外ドメインに特異的に結合することができる、態様151または157に記載の方法。
態様162. SARがFc受容体の細胞外ドメインを発現し、薬剤が抗体、抗体、抗原結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン断片、自律的抗原結合ドメイン、 Fcドメインを含む、二重特異性エンゲージャー、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)、三重特異性エンゲージャー、三重特異性T細胞エンゲージャー、または三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)。
態様163. Fc受容体が、CD16A、CD16B、CD64、CD32またはその変異体もしくは断片のうちの1つまたは複数である、態様162に記載の方法。
態様164. 標的抗原が、表Bに列挙される抗原の1つまたは複数である、態様151に記載の方法。
態様165. 生存を調節する薬剤と組み合わせて、合成抗原受容体(SAR)分子を含む、態様123~146のいずれかに記載の免疫エフェクター細胞の有効量を対象に投与する、態様148または149に記載の方法。免疫細胞の増殖、分化、および/または有効性を決定する薬剤であり、薬剤は以下の1つまたは複数から選択される。a)プロテインホスファターゼ阻害剤。 b) キナーゼ阻害剤。 c) Lckキナーゼ阻害剤。 d)SAR発現エフェクター細胞上に発現される1つ以上の抗原および標的細胞上に発現される1つ以上の抗原に結合する薬剤; e) サイトカイン; f)免疫阻害分子の阻害剤。 g) TREG細胞のレベルまたは活性を低下させる薬剤。 h)SAR修飾細胞の増殖および/または存続を増加させる薬剤; i) ケモカイン; j) SARの発現を増加させる薬剤; k) SARの発現または活性の調節を可能にする薬剤; l) SAR修飾細胞の生存および/または持続の制御を可能にする薬剤; m) SAR 修飾細胞の副作用を制御する薬剤。 n) Brd4阻害剤。 o) 疾患部位に治療薬または予防薬を送達する薬剤。 p)SARが向けられる標的抗原の発現を増加させる薬剤; q) SAR と同時発現される多目的スイッチに結合するエージェント。 r)アデノシンA2a受容体アンタゴニスト。
態様166. 態様1のSARポリペプチド分子、態様118のポリヌクレオチド、態様119のベクター、態様127~146のいずれか1つの細胞、および/または態様151および165の薬剤を含む医薬組成物、薬学的に許容される担体。
態様167. 有効量の態様166に記載の医薬組成物を個体に投与することを含む、それを必要とする個体における標的抗原関連疾患を予防または治療する方法。
態様168. 標的抗原関連疾患が、増殖性疾患、前癌状態、癌、免疫疾患、アレルギー性疾患、変性疾患、感染症、および癌に関連しない適応症。
態様169. 癌が、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性白血病、急性リンパ性白血病(ALL)、B細胞急性リンパ性白血病(B- ALL)、T細胞急性リンパ性白血病(T-ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、B細胞性前リンパ性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、濾胞性リンパ腫、有毛性リンパ腫細胞性白血病、小細胞性または大細胞性濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性疾患、MALT リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫 (PEL)、多発性骨髄腫、骨髄異形成および骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫リンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞腫瘍、ワルデンストローム マクログロブリン血症、または前白血病。
態様170. 癌が、結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝臓癌、肺の非小細胞癌、小腸の癌、食道がん、黒色腫、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部のがん、皮膚または眼内の悪性黒色腫、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門部のがん、胃がん、精巣がん、子宮がん、卵管がん、子宮内膜がん、子宮頸がん、膣がん、外陰がん、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、内分泌系がん、甲状腺がん、がん副甲状腺のがん、副腎がん、軟部組織の肉腫、尿道がん、陰茎がん、小児固形腫瘍、膀胱がん、腎臓または尿管のがん、腎盂がん、新生物中枢神経系(CNS)、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、メルケル細胞がん、類表皮がん、扁平上皮がん、T細胞リンパ腫、環境誘発がん、前記癌の組み合わせ、および前記癌の転移病変。
態様171. 疾患が、コロナウイルス、SARS-CoV2およびその変異体、HIV1、HIV2、HTLV1、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、サイトメガロウイルス( CMV)、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、BKウイルス、ヒトヘルペスウイルス6、ヒトヘルペスウイルス8インフルエンザウイルス、パラインフルエンザウイルス、鳥インフルエンザウイルス、MERSおよびSARSコロナウイルス、クリミアコンゴ出血熱ウイルス、ライノウイルス、エンテロウイルス、デングウイルス、西部ナイルウイルス、エボラウイルス、マールブルグウイルス、ラッサ熱ウイルス、ジカウイルス、RSV、麻疹ウイルス、ムンプスウイルス、ライノウイルス、水痘ウイルス、単純ヘルペスウイルス1型および2型、水痘・帯状疱疹ウイルス、HIV-1、HTLV1、肝炎ウイルス、エンテロウイルス、B型肝炎ウイルス、C型肝炎ウイルス、ニパおよびリフトバレー熱ウイルス、日本脳炎ウイルス、メルケル細胞ポリオーマウイルス、または結核菌、非定型抗酸菌種、ニューモシスチス・ジロベシ、トキソプラズマ症、リケッチア、ノカルジア、アスペルギルス、ムコールの感染に関連している、またはカンジダ。
態様172. 疾患が、糖尿病、多発性硬化症、関節リウマチ、尋常性天疱瘡、強直性脊椎炎、星本甲状腺炎、SLE、サルコイドーシス、強皮症、混合性結合組織病、移植片対宿主病、またはアルツハイマー病。
態様173. ベクターでトランスフェクトまたは形質導入された細胞の表面上の多目的スイッチの発現を検出するステップを含む、態様93に記載のSARをコードするベクターおよび多目的スイッチの形質導入効率を調べるための方法。
態様174. 態様95のSARを発現する細胞を選択するための方法であって、以下の工程を含む方法: i)態様140によるベクターでトランスフェクトまたは形質導入された細胞の表面上の多目的スイッチの発現を検出する工程; (ii)多目的スイッチを発現していると識別されたセルを選択する。
態様175.SAR を発現する細胞が濃縮された精製細胞集団を調製する方法であって、態様174に記載の方法を使用して細胞集団からSARを発現する細胞を選択するステップを含む、方法。
態様176.以下のステップを含む、態様175に記載の方法:(i)生体 外で患者から単離された細胞集団に、態様140に記載のベクターを形質導入またはトランスフェクトする工程; (ii)側面174に記載の方法により、形質導入/トランスフェクトされた細胞集団からSARを発現する細胞を選択するステップ。
態様177 態様94~117の多目的スイッチポリペプチドを発現する細胞が濃縮され、従ってSARを発現する細胞が濃縮された細胞集団。
態様178.細胞 表面における態様173のいずれかに記載の多目的スイッチポリペプチドの発現を検出するステップを含む、インビボで形質導入された細胞を追跡するための方法。
態様179 多目的スイッチを含むアクセサリモジュールに結合する薬剤に細胞を曝露するステップを含む、態様127に記載のセルを削除する方法。
態様180.a )多目的スイッチが配列番号7843~7850の配列またはそれと80%相同性を有する変異体を含み、薬剤がベランタマブマフォドチンである、態様179に記載の方法。 b)多目的スイッチは、配列番号9620~9624の配列またはそれと80%の相同性を有する変異体を含み、薬剤はリツキシマブまたはCD20抗体である。 c)多目的スイッチは、配列番号9625の配列またはそれと80%の相同性を有する変異体を含み、薬剤はハーセプチン、エンヘルツ、またはHer2標的化抗体である。 d)多目的スイッチは配列番号7850の配列またはそれと80%の相同性を有する変異体を含み、薬剤はアドセトリスまたはCD30標的化抗体である。
態様181. 態様1の少なくとも1つのSARポリペプチド分子、態様93のアクセサリーモジュール、態様94の多目的スイッチ、態様118の組換えポリヌクレオチド、態様119の組換え発現システム、態様119のベクターを含むキット。態様123または態様127の細胞、態様151および/または態様165の薬剤、ならびに態様166の組成物。
態様182.a ) 生体外で実施される、態様140に記載の方法。 b)生体内;または c) ex vivoとin vivoの両方。
態様183. 少なくとも2つの鎖を含む、態様1に記載のSARであって、a)第1のポリペプチド鎖が、VαまたはVγドメインを含む第1の抗原結合ドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)を含み; b)第2のポリペプチド鎖は、VβまたはVδドメインを含む第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)を含む。第1の抗原結合ドメインのVαまたはVγドメインと第2の抗原結合ドメインの相補的VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成し;第1のMAMおよび第2のMAMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化する、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員できる非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。
態様184. 第1のポリペプチド鎖が第1の抗原結合ドメインと第1のMAMの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、第2のポリペプチド鎖が第2の抗原結合ドメインの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、態様183に記載のSAR。そして2番目のMAM。
態様185. 第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を個別に含む、態様184に記載のSAR。
態様186. 第1のポリペプチドが、第1のMAMを含む第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に第1のサイトゾルドメインをさらに含む、態様183に記載のSAR。および/または第2のポリペプチドは、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に第2のサイトゾルドメインをさらに含む。
態様187. 第1のポリペプチド鎖が、第1のMAMの第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側にある共刺激ドメイン配列を含む第1のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含み、態様183に記載のSAR。および/または第2のポリペプチド鎖は、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に共刺激ドメイン配列を含む第2のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含む。
態様188. 共刺激ドメインがCD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEMもしくはICOSから選択される、態様187に記載のSAR、または変異体またはその断片。
態様189. 第1および/または第2のMAMおよびNTCRMが、非T細胞の膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意のヒンジドメイン、および/または任意の細胞外ドメインから構成される、態様183に記載のSAR。受容体および/またはシグナル伝達アダプター。
態様190.a )非T細胞受容体が、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1からなる群から選択される、態様189に記載のSAR。 、KIR3DL2、KIR3DL4、 KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5 、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、前述のいずれかの変異体およびその断片;および/またはb)シグナル伝達アダプターは、CD3ε、FcRγ、DAP10、前述のいずれかの変異体、およびそれらの断片からなる群から選択される。
態様191. 非T細胞において発現されると、それにT細胞受容体様の標的結合認識および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターの動員および/または少なくとも1つのシグナル伝達経路の活性化を付与する、態様183に記載のSAR。 。
態様192.a) SAR発現エフェクター細胞を含む医薬組成物の投与による毒性を予防または逆転させるために、対象に治療有効量のチロシンキナーゼ阻害剤をさらに投与する、態様167に記載の方法。および/またはb)SAR発現エフェクター細胞の枯渇を防止または逆転させる。
態様193 チロシンキナーゼ阻害剤がLck阻害剤である、態様192に記載の方法。
態様194. チロシンキナーゼ阻害剤がダサチニブまたはポナチニブである、態様192に記載の方法。
態様195. 治療により、対象におけるT細胞によるIL-2の分泌が増加する、態様192に記載の方法。
態様196. 治療により対象におけるT細胞のアポトーシスが減少する、態様192に記載の方法。
態様197. 治療により、PD-1、TIM-3、およびLAG-3からなる群から選択される少なくとも1つのT細胞枯渇マーカーの発現が減少する、態様192に記載の方法。
態様198. 治療によりCD62LまたはCCR7の発現が増加する、態様192に記載の方法。
態様199 複数サイクルの治療が対象に施される、態様192に記載の方法。
態様200. チロシンキナーゼ阻害剤が断続的に投与される、態様192に記載の方法。
態様201. チロシンキナーゼ阻害剤が、少なくとも部分的なT細胞機能を回復するのに十分な期間投与され、その後中止される、態様192に記載の方法。
態様202. チロシンキナーゼ阻害剤が経口投与される、態様192に記載の方法。
態様203. 対象に投与される遺伝子操作されたT細胞に関連する毒性がサイトカイン放出症候群である、態様192に記載の方法。
態様204. 対象に投与される遺伝子操作されたT細胞に関連する毒性がオンターゲットオフ腫瘍毒性またはオフターゲットオフターゲット腫瘍毒性である、態様192に記載の方法。
態様205.対象 がヒトである、態様192に記載の方法。
態様206.T 細胞の標的認識特性および機能を有するT細胞ではない細胞であって、細胞a)TCRα、TCRβ、TCRα、TCRβ、 TCRγ、TCRδ、またはpreTCR;および/またはb)CD3ε、CD3γおよび/またはCD3δの群から選択される1つ以上のCD3鎖の発現を欠く;および/または c) 機能的な TCR モジュール (TCRM) を形成する能力が欠如している。
態様207.TCRM を含み、T細胞の細胞標的認識特性を与える二重鎖受容体を発現する、態様206に記載の細胞。
態様208. 標的抗原に特異的に結合するTCR-Fv抗原結合モジュールを形成することができる受容体を細胞表面上に発現することができる、態様207に記載の細胞。
態様209.TCR -Fvを構成する2つの可変ドメインが単一のポリペプチド鎖の一部ではない、態様208に記載の受容体。
態様210.TCR -Fvを構成する2つの可変ドメインが、a)VαおよびVβ、またはb)VγおよびVδである、態様206に記載の細胞。
態様211. 標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、標的細胞を態様206に記載のエフェクター細胞と接触させることを含み、細胞が標的抗原を特異的に認識する方法。
態様212. その標的ペプチド抗原を発現する標的細胞を死滅させることができる、態様210に記載の細胞。
態様213. 態様206の細胞および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
態様214. 有効量の態様206の細胞または態様213の医薬組成物を個体に投与することを含む、それを必要とする個体における標的抗原関連疾患を予防または治療する方法。
態様215.T 細胞受容体様抗原認識を有する態様206の非T細胞を作製する方法。
態様216.TCR 様抗原認識を有する非T細胞が、a)TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδおよびプレTCRα鎖、またはb)TCRα鎖およびTCRβ鎖の二量体、またはc)を発現しない、態様215に記載の方法。 TCRγ鎖およびTCRδ鎖の二量体、またはd)プレTCRα鎖およびTCRβ鎖の二量体。
態様217.a )TCR鎖の外因性発現、またはb)CD3ε、CD3γおよびCD3δの群から選択されるCD3鎖の外因性発現を含まない、態様215に記載の方法。
態様218. 単一の遺伝子改変を含む、態様215に記載の方法。
態様219. 二本鎖受容体をコードする1つまたは2つの組換えポリヌクレオチドの導入を含む、態様215に記載の方法。
態様220.NK 細胞、iNKT(先天性ナチュラルキラー細胞)、g-NK細胞、記憶様NK細胞、サイトカイン誘導性キラー細胞(CIK)、iPSC、改変型HLA欠損iPSC、iPSCである、態様210に記載の細胞。 -由来NK細胞、B細胞、マクロファージ/単球、顆粒球、樹状細胞、不死化細胞株、不死化NK細胞株、NK92細胞株、NK92MI細胞株、YTS細胞、NKG細胞株、またはそれらの誘導体。
態様221.II 型膜貫通タンパク質と、N末端シグナルペプチドを有するI型膜貫通タンパク質または分泌タンパク質との間の単離された融合タンパク質。
態様222. I型膜貫通タンパク質またはN末端シグナルペプチドを有する分泌タンパク質の細胞外ドメインと融合したII型タンパク質のサイトゾル、膜貫通および部分的または全体の細胞外ドメインを含む、態様221に記載の単離された融合タンパク質。 。
態様223.I 型膜タンパク質またはN末端シグナルペプチドを有する分泌タンパク質の全部または一部の細胞外ドメインをコードするポリペプチドのN末端が、C末端シグナルペプチドに機能的に連結されている、態様221に記載の単離された融合タンパク質。 N 末端から C 末端の方向にある II 型タンパク質の末端。
態様224.a) N末端シグナルペプチドを有するI型膜タンパク質または分泌タンパク質をコードするポリヌクレオチドの5’末端を3’にインフレームで融合させるステップを含む、態様221に記載の融合タンパク質を作製する方法。 II型タンパク質の部分的または全体の細胞外ドメインをコードするヌクレオチドの末端; b)融合タンパク質の発現を可能にするために、適切な細胞に組換えポリヌクレオチドを導入するステップ。
態様225. 融合タンパク質が、特定の抗原を標的とするキメラ抗原受容体または合成抗原受容体をコードする、態様221に記載の単離された融合タンパク質。
態様226. 態様224によって作製され、態様221の融合タンパク質を発現する細胞、および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
態様227。 態様226の組成物を使用する治療方法。
態様228. 配列番号1600~2328、4851~5129、5451~6282、7160~7170、7601~7747、8768~9602、10817~からなる群から選択される配列を含む合成免疫受容体をコードする組換えポリヌクレオチド。 10830、または上記のいずれか1つに記載の合成免疫受容体をコードするヌクレオチド配列と少なくとも75%の同一性を有する配列。
態様229. 配列番号3994~4722、5151~5429、6283~7114、7852~7862、8293~8439、9860~10694からなる群より選択される合成免疫受容体ポリペプチドをコードするアミノ酸配列、または配列番号:上記のいずれか1つに記載の合成免疫受容体をコードするアミノ酸配列と少なくとも75%の同一性を有する。
異なる細胞表面および細胞内抗原を標的とする異なる構築物の細胞毒性を測定するためにルシフェラーゼ(例えば、 GLucまたはNLuc)を発現するように操作された細胞株を表Aに提供する。これらの実験で使用した細胞株、細胞株上の標的抗原、およびそれらの増殖培地を以下の表Aに示します。細胞は、5% CO 2加湿インキュベーター内で 37℃で培養されました。細胞株は、ATCC、NIH AIDS 試薬プログラムから入手したもの、または研究室で入手したものです。
NFAT 依存性 EGFP (または GFP) レポーター遺伝子を操作して JNG と名付けられた Jurkat 細胞株 (クローン E6-1) は、カリフォルニア大学サンフランシスコ校の Arthur Weiss 博士から寄贈されたもので、CAR シグナル伝達を研究することが記載されています (( Wu, CY et al. , Science 350:293-302,2015). Jurkat 細胞は 10% FBS を補充した RPMI-1640 培地で維持しました. NK92MI 細胞は ATCC から入手し、提供された説明書に従って維持しました. NK92 細胞はT2 細胞も ATCC から入手し、20% FBS および 200 U/mL の hIL2 を含む RPMI 培地で維持しました。
SARをコードするレンチウイルスベクターの生成
SAR 構築物は、レンチウイルス、レトロウイルス、またはスリーピング ビューティーのトランスポゾン ベクターでクローン化されました。例示的なベクターは配列番号1~6に提供される。本開示のSARを生成するために使用できる他のベクターは当技術分野で知られている。 psPAX2ベクターは Didier Trono から贈られたものです (Addgene プラスミド # 12260) 。 pLP/VSVGエンベローププラスミドおよび293FT細胞は、Invitrogen(ThermoFisher Scientific)から入手した。レトロウイルス転移ベクター MSCVneo、MSCVhygro、および MSCVpac とパッケージングベクター pKAT は以前に記載されています (PCT/US2018/53247)。 SAR(例えば、2世代CAR、SIR、Ab-TCRおよびTFPなど)の生成方法、GGS-NLuc融合タンパク質の生成および使用、およびルシフェラーゼ(例えば、 GLucおよびLuc146-)の生成および使用。 1H2) マタドールアッセイを使用した細胞毒性の測定のためのレポーター細胞株が記載されています (PCT/US2017/024843、PCT/US2017/025602、PCT/US2017/052344、PCT/US2017/064379 および PCT/US2018/53247)。これらは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
SAR の抗原結合ドメインを含む配列は、コドン最適化され、公的に入手可能なソフトウェア (例: ThermoFisher または IDT) および商用ベンダー (例: IDT) を使用して人工的に合成されます。得られた断片は PCR 増幅され、標準的な分子生物学技術を使用して、さまざまな SIR バックボーンを含むさまざまなベクターにクローン化されます。一般に、SAR 構築物は通常、レンチウイルス ベクター内でクローン化されます。 SIR コンストラクトの配列は自動配列決定を使用して確認されます。
例示的なSAR構築物コード化ベクターは、pCCLc-MNDU3-Nhe-CD8SP-R1-NY-ESO-IG4-Vb-Xho-TCRβECD-Bam-CD3zECDTMCP-opt-F-P2A-Spe-SP-Bst-NY-ESO-IG4である。 -Va-Mlu-TCRαECD-Kpn-CD3zECDTMCP-opt2-F-F2A-Xba-PAC-Sal-ΔWPRE (配列番号9366)。この構築物は、pCCLc-MNDU3-delta-WPRE レンチウイルス ベクター バックボーン (配列番号 6) にクローン化されます。ベクターは、CD8シグナルペプチド(配列番号31)、EcoRI部位、NY-ESOを標的とするTCR (IG4)のVβ/Vbドメインを含むヌクレオチドを含むSAR構築物の発現を駆動するMNDU3プロモーターを含む。 -1 (配列番号: 966)、Xho I 部位、TCRβECD リンカー (または TCRβ-Ig3; 配列番号: 1166)、BamH I 制限部位、CD3zECDTMCP-opt シグナル伝達鎖 (配列番号: 1089)ヒト CD3z の細胞外、膜貫通および細胞質ドメイン、フリン切断部位、P2A 切断可能リンカー、Spe I 制限部位、シグナルペプチド、Bst I 制限部位、NY-ESO を標的とする TCR (IG4) の Vα/Va ドメイン-1ペプチド/HLA-A2 (配列番号966)、 Mlu I部位、TCRαECDリンカー(またはTCRa-Ig3; 配列番号1168)、Kpn I制限部位、第2のCD3zECDTMCP-opt2シグナル伝達モジュール(配列番号10816)は、ヒトCD3zの細胞外、膜貫通および細胞質ドメイン、フリン切断部位、F2A切断可能リンカー、Xba I制限部位、プロモマイシン耐性(PAC)カセットおよびSal I制限部位を含む。発現カセットには多くの便利な制限部位があり、抗原結合ドメイン断片 ( Vb 、Va、vL、vH ドメインなど)、リンカー ( TCRβECD 、TCRαECD、IgCL、IgG-CHI など)、またはシグナル伝達鎖 (例: CD3zECDTMCP-opt および opt2) を切り取って、別のモジュールと置き換えることができます。したがって、当業者は、このベクターおよび抗原結合ドメイン(例えば、抗体のvLおよびvHドメイン)の配列を使用して、他の任意の新しい抗原を標的とし、異なるリンカーおよびシグナル伝達鎖を含むSARを生成することができる。
レンチウイルスおよびレトロウイルスベクター
レンチウイルスは、本質的に以前に記載されているように(Natarajan et al、Scientific Reports、10:2318)、 PCT / US2018/53247。 293FT細胞を10%FCSを含むDMEM(本明細書ではDMEM-10と呼ぶ)中で増殖させた。トランスフェクションの約 48 ~ 72 時間後、すべての培地を収集、プールし、1000 rpm で 1 分間遠心分離して、細胞破片および非接着細胞を除去しました。無細胞上清を0.45μmシリンジフィルターを通して濾過した。場合によっては、4℃、18500 rpmで2時間の遠心分離によって上清をさらに濃縮しました。ウイルスペレットをXVIVO培地に初期容量の1/10で再懸濁しました。ウイルスは、標的細胞に感染させるために新鮮な状態で使用されるか、アリコートに分けて -80°C で凍結保存されました。
T細胞、NK細胞、PBMCの感染
軟膜細胞は、ロサンゼルス小児病院の血液銀行から健康な匿名化された成人ドナーから入手し、Ficoll-Hypaque 勾配遠心分離によって末梢血単核球 (PBMC) を分離するために使用されました。 PBMCは、そのまま使用するか、または製造業者の指示に従って磁性マイクロビーズ(Miltenyi Biotech)を使用してT細胞またはNK細胞を単離するために使用した。 PBMCまたは単離されたT細胞を、10ng/mlのCD3抗体、10ng/mlのCD28抗体および100IUの組換えヒト-IL2で置き換えたXVIVO培地(Lonza)中に再懸濁した。細胞は、5% CO2 加湿インキュベーター内で 37°C で培養されました。レンチウイルスベクターによる感染の前に、細胞を上記の培地中で1日間活性化した。一般に、初代細胞(例えば、 T細胞)は、午前中にスピン感染( 8μgの存在下でXVIVO培地に再懸濁された濃縮ウイルス300μlを用いて、1800rpm、 37 ℃で90分間)を使用して感染させた。 /mlのPolybrene(R) (Sigma、カタログ番号H9268) 培地を夕方に交換し、感染をさらに2日間繰り返し、合計3回の感染を行った。3回目の感染後、細胞をペレット化し、新鮮な溶液に再懸濁した。 10ng/ml CD3 抗体、10ng/ml CD28 抗体および 100 IU 組換えヒト IL2 を含み、それぞれの抗生物質 (指示がある場合) を補充した XVIVO 培地を、特に指示がない限り、選択のために細胞培養フラスコに入れます。薬剤選択を使用しない場合は培地に 10 ~ 15 日間、薬剤選択を使用する場合には 20 ~ 30 日間培養します。JNG および癌細胞株の感染では、約 500,000 個の細胞を 2 ml の未濃縮ウイルスで感染させました。上清をポリブレン(Sigma、カタログ番号. H9268)。翌朝、細胞をペレット化し、必要に応じてそれぞれの抗生物質を含む培地に再懸濁し、選択のために細胞培養フラスコに入れました。初代NK細胞をNK活性化ビーズ(Miltenyi Biotech)で24~96時間刺激した後、ポリブレン(登録商標)を含まない濃縮レンチウイルスベクターで感染させた。分析前に、細胞をIL-2含有NK培地中で増殖させた。
健康なドナーからの血液を使用して、NK 細胞分離キット (Miltenyi) を使用して NK 細胞を分離しました。 NK92細胞はATCCから入手した。 NK初代細胞およびNK92細胞は、20%ウシ胎児血清、0.2mMイノシトール、0.1mM 2-メルカプトエタノール、2mM L-グルタミン、1.5g/L重炭酸ナトリウム、 0.02mM葉酸。 NK92細胞については、培地に200 IU/mlのIL2をさらに補充した。 NK初代細胞を感染前に7日間培養し、500μL/mlのIL2で活性化した。レンチウイルス感染は、6ウェルプレートでのスピン感染により濃縮されたレンチウイルス上清を用いて行われました。初代NK細胞の場合、約500 IU/ml IL2を補充し、ポリブレンを含まない500μlの濃縮ウイルスを感染させた1.5ml培地中の400万個のNK細胞。 NK92細胞については、6μg/mlのポリブレンを使用した。プレートを2,800 rpmで90分間、32 ℃で5時間遠心分離しました。 5時間後に培地を交換し、翌日感染を繰り返した。
本質的に、レンチウイルスベクター産生について上記したのと同様の手順を、レトロウイルスベクターの生成に使用した。ただし、293FT細胞を、一般に、10μgのレトロウイルス構築物、4μgのレトロウイルス構築物を使用して、10mlのDMEM-10培地中の10cm組織培養プレートでトランスフェクトした。 pKATおよび2μgのVSVGプラスミド。ウイルスの収集と標的細胞の感染は、基本的にレンチウイルスベクターについて上述したように実施した。
抗体、ペプチド、薬物
NY-ESO1 (配列番号:10880)、MAGE-A3-270-270 (配列番号:10878)、およびMAGE-A3-112-120 (配列番号:10879)ペプチドは、Genscriptによって合成された。ジギトニンはSigma から購入し (カタログ番号 D141)、DMSO で 100mg/ml のストック溶液を作成しました。 1 mg/ml の希釈ストックを PBS で作成しました。細胞溶解に使用したジギトニンの最終濃度は、別段の記載がない限り、30μg/mlであった。
エリサ
市販の ELISA を使用して、特定の標的細胞株と 24 ~ 96 時間共培養した CAR 発現 Jurkat-NFAT-GFP エフェクター細胞または T 細胞の細胞培養上清中のヒト IL2、IFNγ、IL6、および TNFα を測定しました。 R&D Systems (ミネソタ州ミネアポリス) および BD Biosciences のキットを使用し、製造元の推奨に従ってください。
SARの発現を検出するためのFACS解析
マウス抗ヒトc-Myc APC結合モノクローナル抗体(カタログ番号IC3696A)は、R&D Systems(ミネソタ州ミネアポリス)から入手した。ビオチン化プロテイン L は GeneScript (ニュージャージー州ピスカタウェイ) から購入し、リン酸緩衝生理食塩水 (PBS) で 1 mg/ml に再構成し、4℃で保存しました。 ストレプトアビジン-APC (SA1005) は ThermoFisher Scientific から購入しました。 APC 標識 NY-ESO-1/HLA-A2 および MAGE-A3 (270-279)-HLA-A2 四量体は、エモリー大学の NIH 四量体施設から入手しました。それらは、 NY-ESO1 (配列番号: 10880) および MAGE-A3-270-279 (配列番号: 10878) ペプチドを標的とします。
四量体を使用した SAR の検出では、1 × 10 6細胞を収集し、4% ウシ血清アルブミン (BSA) 洗浄バッファーを含む 3 ml の氷冷 1 × PBS で 3 回洗浄しました。洗浄後、細胞を、10μlのAPC結合四量体を含む氷冷洗浄緩衝液0.1mlに再懸濁し、暗所で1時間インキュベートし、続いてFACSによる分析前に氷冷洗浄緩衝液で2回洗浄した。
プロテイン L 染色を使用した SAR の検出では、1 × 10 6細胞を収集し、4% ウシ血清アルブミン (BSA) 洗浄バッファーを含む 3 ml の氷冷 1 × PBS で 3 回洗浄しました。洗浄後、細胞を、1μgのプロテインLを含む氷冷洗浄緩衝液0.1mlに4℃で1時間再懸濁した。細胞を氷冷した洗浄緩衝液で3回洗浄し、次いで、0.1mlの洗浄緩衝液中の10μlのAPC結合ストレプトアビジンとともに(暗所で)30分間インキュベートし、続いて氷冷した洗浄緩衝液で2回洗浄した。 FACSは、BD BiosciencesのFACSVerseアナライザーを使用して実施されました。
細胞死アッセイ
細胞死を測定するために、PCT/US2017/052344「非放射性細胞毒性アッセイ」に記載されているように、Gluc、NLuc、または熱安定性甲虫ルシフェラーゼ (LucPPe または Luc146-1H2) の異所性サイトゾル発現に基づくマタドール アッセイを利用しました。他に示さない限り、異なるルシフェラーゼを安定して発現する標的細胞を、標的細胞の増殖に使用した培地中の384ウェルプレートに三重に播種した。懸濁液中で増殖する標的細胞は一般にウェル当たり2~3×10 の濃度で播種したが、接着性単層として増殖する標的細胞はウェル当たり1~2×10 4の濃度で播種した。他に示されない限り、標的細胞は、エフェクター:標的(E:T)比で、遺伝子改変された(すなわち、SARを発現する)エフェクター細胞(例えば、T細胞およびNK細胞、または細胞株(NK92、NK92MIまたはTHP細胞))と共培養された。 4 時間から 96 時間、1:1 から 10:1 まで変化します。標的細胞が付着細胞 (例: HeLa 細胞)として増殖する場合、T 細胞を添加する前に一晩ウェルの底に付着させました。 GLuc 発現標的細胞の場合、天然セロエントRAJIン (Nanaolight) を含む 0.5 x CTZ アッセイ緩衝液を直接注入することにより、BioTek シナジー プレート リーダーで測定されるルシフェラーゼ活性の増加によって、エフェクター細胞を介した標的細胞の溶解誘導をアッセイしました。ルシフェリンは、Luc146-1H2 を発現する標的細胞の基質として使用されました。 培地のみを含むウェル(Med)、およびSAR構築物に感染していないエフェクター細胞とともに標的細胞をインキュベートしたウェル(UI)におけるルシフェラーゼ活性を、示されている場合には対照として使用した。
標的細胞上の抗原の発現を検出し、SAR の構築に使用されるさまざまな抗原結合部分の抗原結合活性を測定するアッセイ
標的細胞上の抗原の発現は、PCT/US2017/025602に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれるように、抗体による免疫染色または高感度抗原検出アッセイと組み合わせたバイオインフォマティクスによって決定された。
SAR を発現する免疫エフェクター細胞は、機能的な SAR を特定するために以下のアッセイでテストされます。
(A) Topanga アッセイ( NLuc 結合アッセイ) : コントロール ベクターおよび SAR を発現する Jurkat-NFAT-GFP、T 細胞または NK 細胞を標的 CD19-Nluc 融合タンパク質で染色し、標的抗原への結合能力を測定することによってアッセイします。 Topanga アッセイを使用した Nluc 活性。以下の図に示すように、CD19モノクローナルhu-mROO5-1のvLおよびvH断片がDAP10のヒンジ、膜貫通およびサイトゾルドメインに結合している新規次世代SAR(配列番号2275)を発現するNK92MI細胞IgCL および IgG-CH1 リンカーを介した細胞は、コントロールの親細胞と比較して、CD19-Nluc Topanga 試薬への結合の増加を示します。第2世代CAR(配列番号5141)は、ポジティブコントロールとして機能する。
この実験は、さまざまな次世代 SAR を発現する NK92MI 細胞で繰り返されます。次の図に示すように、SAR (配列番号: 2277) を発現する NK92MI 細胞は、Topanga アッセイにおいて CD19-Nluc 融合タンパク質に対して非常に高い結合を示しました。 DAP10-SAR (配列番号2275) を発現するNK92MI細胞も、中程度のCD19結合を示した。
インビトロでの細胞毒性活性のアッセイ。 未感染の NK92 細胞または T 細胞、またはコントロールベクターまたは SAR を発現する細胞を、非分泌型のルシフェラーゼ (GLuc、NLuc、Turboluc 16 など) を発現する標的細胞株と 4 ~ 96 時間共培養し、 PCT/US17/52344に記載されているように、ルシフェラーゼ活性を測定することによって細胞溶解を検査した。以下の表に示すように、SAR(配列番号2277)を発現するNK92MI細胞は、マタドールアッセイで測定した場合、最も高い細胞毒性を示した。 DAP10-SAR(配列番号2275)を発現するNK92MI細胞も、中程度の細胞毒性を示した。
NF-κB 活性化アッセイ
Jurkat 細胞は、NF-κB 応答性プロモーターの下でホタル ルシフェラーゼ cDNA (Luc) を発現するように操作されました。続いて、以下の SAR 構築物をコードするレンチウイルス ベクターを細胞に感染させ、さまざまな SAR を安定して発現する細胞を生成しました。異なる SAR を発現する Jurkat-NF-κB 細胞を RAJI-wt (CD19+ve) または RAJI-CD19-KO (CD19-null) 細胞と 24 時間共培養し、ルシフェラーゼ活性を測定しました。
添付の表53は、配列番号2275および2277のSARを発現するジャーカット細胞によるNF-κB活性の誘導を示す。配列番号1860のNKp46 SARによるNF-κB誘導はなかった。
NFAT プロモーターの誘導により GFP 発現が促進されます。 Jurkat-NFAT-GFP (JNG) 細胞は、さまざまな SAR 構築物をコードするレンチウイルス ベクターに感染し、ピューロマイシンで選択されます。対照JNG細胞およびSAR発現JNG細胞を、それらの同族抗原を発現する異なる標的細胞株と約24時間共培養する。したがって、CD19を標的とするSARを発現するJNG細胞をCD19抗原発現細胞株RAJIと共培養し、標的抗原に結合して細胞シグナル伝達を誘導するJNG細胞の能力を、フローサイトメトリーを使用してGFP発現の誘導を測定することによってアッセイする。 CD19 を欠く RAJI 細胞 (RAJI-CD19-KO) をネガティブコントロールとして使用します。 GFP 発現の誘導は、対照細胞に対して GFP を誘導する SAR 発現細胞の割合に応じて、 1+、2+、3+などとして定量化されます。したがって、1.6+は、SARを発現するJNG細胞の約16%が、標的細胞との共培養時に、対照JNG親細胞で見られるレベルを超えるGFP誘導を示したことを意味する。以下の表の結果は、ほとんどの一本鎖および二本鎖SAR構築物の発現によるNFAT誘導性GFP発現の活性化を示している。この結果はまた、配列番号2276、2280、2314~2316、2319~2326によって表されるSARなどの二本鎖ヘテロ二量体SAR構築物によるNFATの誘導を示す。この結果はさらに、CD16Aの完全な細胞外ドメインを有する少なくとも1つの鎖を発現するSAR構築物が、その抗原結合ドメイン(例えば、BCMA-FHVH)の標的となる抗原を発現する細胞に応答するだけでなく、結合する能力も保持していることを示している。異なる抗原を標的とする抗体の Fc 領域に。したがって、例示的な実施形態では、SAR構築物CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn- G4S-EcoR1-CD16A-F158V-FL-F-P2A-Spe-IgHSP-Apa-CD20-VHH-USC1-2HC2D6を発現するJNG細胞は、 -Bam-G4S-Bst-CD16A-F158V-FL-v2-F2A-Xba-PAC(配列番号2283)は、RAJI(CD19+およびBCMA+)およびL363(CD19-ve)と共培養すると、NFAT駆動型GFPを誘導します/BCMA+) 細胞株は、それぞれその抗原結合ドメイン BCMA-FHVH93 および CD20-VHH-USC1-2HC2D6 を介して検出されます。さらに重要なことは、このSAR(配列番号2283)構築物を発現するJNG細胞は、Her2発現SKOV3細胞と共培養した場合にGFPを誘導できないことである。ただし、この SAR 構築物を構成する 2 本の CD16A-F158V-FL 鎖のいずれかに結合できるハーセプチン (1μg/ml) の存在下で、この SAR を発現する JNG 細胞を SKOV3 細胞と共培養すると、GFP の強力な誘導が観察されます。 。 SAR コンストラクト CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn-G4S-EcoR1-CD16A-V158A-FL-F-P2A-Spe-IgHSP-Apa-CD20-VHH を発現する JNG 細胞を用いて実験を繰り返した場合にも、本質的に同様の結果が得られます。 -USC1-2HC2D6-Bam-G4S-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-[hTCRa-T48C-opt]-F-F2A-Xba-PAC (配列番号2314)。この構築物は、一方のシグナル伝達鎖が CD16A-V158A-FL で構成され、もう一方のシグナル伝達鎖が [hTCRa-T48C-opt] で構成される二本鎖ヘテロ二量体 SAR です。対照的に、最初のIg様ドメインを欠くCD16A鎖(CD16-V158A-D2TMCP-v1)を含む配列番号2315および2316で表されるSAR構築物は、SKOV3細胞と共培養した場合、GFPを誘導できない。ハーセプチン。しかし、これらの SAR 構築物は、RAJI 細胞との共培養時に依然として GFP を活性化する可能性があり、CD20-VHH-USC1-2HC2D6-Bam-G4S-Bst-CD19-hu-mROO5-1-vH-Mlu-[hTCRa] による機能的なシグナル伝達を示唆しています。 -T48C-opt] チェーンがこのコンストラクトに存在します。一方、この SAR を発現する JNG 細胞は、L363 細胞との共培養時に GFP を誘導できず、BCMA-FHVH93-Kpn-CD16-V158A-D2TMCP 鎖が発現していないか、機能的に活性ではないことが示唆されます。同様に、構築物CD8SP-Sph-BCMA-FHVH93-Kpn-CD16-V158A-D2TMCP-v1-F-P2A-Spe-IgHSP-Apa-CD20-VHH-USC1-2HC2D6-Bam-CD16-F158V-S197Pを発現するJNG細胞-D2TMCP-v3-F-F2A-Xba-PAC (配列番号2322) は、RAJI 細胞または L363 細胞と共培養した場合、GFP を誘導できません。さらに、これらの細胞は、ハーセプチンの存在下でSKOV3細胞と共培養するとGFPを誘導できません。これらの結果は、BCMA-FHVH93-Kpn-CD16-V158A-D2TMCP-v1 鎖も CD20-VHH-USC1-2HC2D6-Bam-CD16-F158V-S197P-D2TMCP-v3 鎖も機能的に発現されていないことを示唆しています。
この結果はさらに、 2つの別個の鎖に結合したvLおよびvHフラグメントを含む多くの二本鎖構築物を発現するJNG細胞が、その同族抗原発現細胞との共培養によりGFPを誘導できることを実証する。このような構築物の例は、2275~2278、2280~2282、2319、2321、2300、2323~2326によって表される。これらの結果は、vL および vH フラグメントが集合して、2 本の別個の鎖に結合している場合でも、同族抗原に結合してシグナルを伝達できる機能的な Fv を形成できることを示しています。これは、2 つの鎖が構造的に異なり、ヘテロ二量体化またはホモ二量体化が知られていない場合に観察されます。このような二本鎖ヘテロ二量体構築物の例は、配列番号2276、2280、2323~2326によって表される。
結果はさらに、CD16の細胞外、膜貫通、およびサイトゾルドメイン全体をコードする1つまたは2つの鎖を含むSAR構築物(例えば、配列番号3843、3853および3863)が、コードするSAR構築物と比較して、NFAT駆動型GFPの強い誘導を示すことを実証する。 CD16の最初のIgドメインを欠いているCD16鎖(例えば、配列番号3844、3854、および3864)。さらに、CD16の細胞外、膜貫通、およびサイトゾルドメイン全体をコードするCD16の1つまたは2つの鎖を含むSAR構築物(例えば、配列番号3843、3853および3863)は、一般に、NFAT駆動GFPのより強力な誘導を示す。同様に、配列番号3763または3769で表されるNKp30の細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメイン全体(例えば、NKp30-ECDTMCP-opt1またはopt2)を含むSAR構築物(例えば、配列番号2297)を発現するJNG細胞は、強い同族抗原発現細胞株と共培養した場合のNFAT駆動型GFPの誘導。
TCRα、β、γおよびδ鎖が欠失した多くの二本鎖SIRが構築され、JNG細胞で発現されました。以下の表に示すように、驚くべきことに、TCRα、β、γ、またはδ鎖が欠失したSIR(配列番号7619~7625)は、JNG細胞で発現させた場合に強いNFAT-GFP活性を示した。 δ鎖を使用して、さまざまな発現およびシグナル伝達活性を備えた多様な SIR パネルを生成し、多様な免疫応答を生成できます。
NFAT プロモーターの誘導により GFP 発現が促進されます。 Jurkat-NFAT-GFP (JNG) 細胞は、抗原結合ドメインとして scFv または vHH ドメイン、シグナル伝達鎖として CD16A-F158V-S197P-FL-v3 を含むさまざまな CD16-SAR 構築物をコードするレンチウイルス ベクターに感染します。細胞は薬物選択を行わずに 4 日間増殖させます。対照JNG細胞およびSAR発現JNG細胞を、それらの同族抗原を発現する異なる標的細胞株と約24時間共培養する。したがって、CD19を標的とするSARを発現するJNG細胞をCD19抗原発現細胞株RAJIと共培養し、標的抗原に結合して細胞シグナル伝達を誘導するJNG細胞の能力を、フローサイトメトリーを使用してGFP発現の誘導を測定することによってアッセイする。結果は、標的抗原を発現する細胞株と共培養した場合に、異なる SAR を発現する JNG 細胞による NFAT 駆動の GFP 発現の誘導を示しています。仮出願の表36~38に列挙されている他のCD16 SAR構築物を用いて実験を繰り返した場合にも、本質的に同様の結果が得られる。
異なる SAR 構築物を発現する JNG および NK92 細胞を生成し、前のセクションで説明したように、標的抗原を発現する細胞株を使用して、NFAG-GFP アッセイおよび細胞毒性アッセイ (マタドール アッセイ) についてテストしました。配列番号および標的抗原とともに表されるさまざまなSAR構築物の結果の要約を以下に提供する。マタドールアッセイにおける誘導倍数は、対照 NK92 細胞との共培養時に観察されたルシフェラーゼ活性と比較した、標的細胞と SAR 発現 NK92 細胞との共培養時のルシフェラーゼ活性の増加として計算されました。共培養アッセイは、0.3:1~1:1のE:T比で2時間実施した。
CD19 標的 SAR を発現する NK92 細胞は、CD19 発現 NALM6 細胞および RAJI 細胞に対して細胞毒性を示す
NK92細胞を、示されたCD19-TARGETED SAR構築物をコードするレンチウイルスベクターに感染させた。細胞をピューロマイシン中で選択した。親NK92細胞またはSAR発現NK92細胞を、エフェクター:標的(E:T)比0.25:1でGlucを安定発現する指定の標的細胞株と2連で4時間共培養しました。共培養期間の終わりに、CTZ アッセイ緩衝液を添加した後、マタドール アッセイによって Gluc 活性を測定しました。結果は、さまざまな CD19 標的 SAR を発現する NK92 細胞との共培養により、Nalm6-Gluc 細胞および RAJI-Gluc 細胞を含む培養物中で Gluc 活性が特異的に増加することを示しています。対照的に、 CD19 発現が欠如している RAJI-CD19-KO、U927、および THP-1 細胞を含む培養物では、GLuc 活性の有意な増加はありません。これはアッセイの特異性を示しています。従来の第2世代CAR(配列番号5441)を発現するNK92細胞は、Nalm6細胞およびRAJI細胞に対して最も高い細胞毒性を示しましたが、RAJI-CD19-KO、U937およびTHP-1細胞に対しても非特異的な細胞毒性を示しました。
マタドールアッセイ
示された SAR を発現する NK92 親細胞と NK92 細胞、および RS4;11-Gluc 標的細胞を、E:T 比 0.3:1 および 1:1 (それぞれ 5,000 : 15,000 細胞および 15,000 : 15,000 細胞) で共インキュベートしました。 2時間のインキュベーション後、セエレテRAJIンの添加によるマタドールアッセイを使用して細胞死を測定しました。結果は図6に示されており、配列番号7695、7692および7607を有するSARによる細胞死の効果的な誘導を示している。
マタドールアッセイ
示された SAR を発現する NK92 親細胞と NK92 細胞、および RS4;11-Gluc 標的細胞を、E:T 比 0.3:1 および 1:1 (それぞれ 5,000 : 15,000 細胞および 15,000 : 15,000 細胞) で共インキュベートしました。 2時間のインキュベーション後、セエレテRAJIンの添加によるマタドールアッセイを使用して細胞死を測定しました。結果を図7に示し、配列番号7679を有するSARによる細胞死の効果的な誘導を示している。
マタドールアッセイ
示された SAR を発現する NK92 親細胞および NK92 細胞、および L363-Gluc 標的細胞を、0.3:1 および 1:1 の E:T 比 (それぞれ 5,000 : 15,000 細胞および 15,000 : 15,000 細胞) で共インキュベートしました。 2時間のインキュベーション後、セエレテRAJIンの添加によるマタドールアッセイを使用して細胞死を測定しました。結果を図8に示し、配列番号7679のSARによる細胞死の効果的な誘導を示している。
マタドールアッセイ
示された SAR を発現する NK92 親細胞と NK92 細胞、および RS4;11-Gluc 標的細胞を、E:T 比 0.3:1 および 1:1 (それぞれ 5,000 : 15,000 細胞および 15,000 : 15,000 細胞) で共インキュベートしました。 2時間のインキュベーション後、セエレテRAJIンの添加によるマタドールアッセイを使用して細胞死を測定しました。示されているように、hu-mROO5-1-scFv、CD28ヒンジ領域、およびNKp44-Hinge-TMCPまたはNKp46-Hinge-TMCPを含む両方のSAR構築物は、効果的な細胞死を誘導した。結果を図 9 に示します。
マタドールアッセイ
示された SAR を発現する NK92 親細胞と NK92 細胞、および RS4;11-Gluc 標的細胞を、E:T 比 0.3:1 および 1:1 (それぞれ 5,000 : 15,000 細胞および 15,000 : 15,000 細胞) で共インキュベートしました。 2時間のインキュベーション後、セエレテRAJIンの添加によるマタドールアッセイを使用して細胞死を測定しました。結果を図 10に示します。
マタドールアッセイ
示された SAR を発現する NK92 親細胞および NK92 細胞、および L363-Gluc 標的細胞を、0.3:1 および 1:1 の E:T 比 (それぞれ 5,000 : 15,000 細胞および 15,000 : 15,000 細胞) で共インキュベートしました。 NK92細胞およびNK92-SAR細胞はまた、膜アンカー型IL2(配列番号7133)を共発現した。 2時間のインキュベーション後、セエレテRAJIンの添加によるマタドールアッセイを使用して細胞死を測定しました。結果を図 11 に示します。
マタドールアッセイ
NK92 細胞は、SAR コンストラクト NKG2D-opt2-G4Sx3-Bst-Her2-47D5-vHH-Mlu-F-F2A-Xba-PAC (配列番号 7696) および NKG2D-opt2-G4Sx3-Bst-Her3- を発現するように操作されました。 21F06-vHH-Mlu-F-F2A-Xba-PAC(配列番号7697)。 NK92 親細胞と SAR を発現する NK92 細胞を、E:T 比 1:1 で SKOV3-Gluc 標的細胞と共培養します。細胞死は、セエレテRAJIンの添加によるマタドールアッセイを使用して測定されました。結果は、配列番号7696および7697を有するSAR構築物を発現するNK92細胞との共培養によるGluc活性の増加を示し、細胞死の誘導を反映している。
SAR-NK細胞
NY-ESO1 (157-165) ペプチド (配列番号: 10880) を標的とする NY-ESO1-Tetramer-APC (HLA-A*02:01 human NY-ESO1 157-165 C165V APC-Labeled Tetramer) は NIH から入手しました四量体施設。 NY-ESO1-SIR(061621-SCjJ7;配列番号9366)に感染したJNG細胞をピューロマイシンで選択した。安定した細胞を、暗所、室温で30分間、NY-ESO1-テトラマー-APC(HLA-A*02:01ヒトNY-ESO1 157-165 C165V APC標識テトラマー)で染色し、フローサイトメトリーで分析した。 NY-ESO1 SARを発現するJNG細胞は、JNG-UI細胞(1.42%)と比較してAPC陽性(10%)であった。同様に、NY-ESO1-SAR (061621-SCjJ7; 配列番号9366) で一過的にトランスフェクトされ、NY-ESO1-四量体-APC で染色された 293FT 細胞は、トランスフェクトされていない 293FT 細胞 (0.97%) と比較して、52.3% APC 陽性でした。 。実験は、SARのVaドメインが異なるVaドメイン(配列番号8514)で置き換えられた構築物を用いて繰り返された。この SAR 構築物をトランスフェクトした 293FT 細胞は、NY-ESO1-tetramer-APC で >70% の染色を示し、このプラットフォームを使用して TCR 様結合能力を持ち、異なる可変ドメインを含む異なる SAR を構築できることが示されました。次に、NY-ESO1-SIR (061621-SCjJ7; 配列番号9366) 構築物のリンカードメイン(すなわち、TCRa-Ig3およびTCRb-Ig3)およびシグナル伝達モジュール(たとえば、CD3zECDTMCP-optおよびCD3zECDTMCP opt2)を置換した。異なるリンカー(例えば、IgCL、IgG-CHIなど)、および異なるシグナル伝達アダプターおよびその変異体およびフラグメントを含むシグナル伝達モジュールによって。得られたSAR構築物は、配列番号9427~9434によって表される。この構築物は、293FT 細胞にトランスフェクトされた場合、NY-ESO1-四量体-APC による染色の増加を示しました。 NY-ESO1を標的とし、異なるバックボーンを含む他の例示的な構築物は、配列番号9356~9426によって表され、同様に試験される。 MAGE-A3 (112-120)/HLA-A2 (配列番号: 9439-9506、9517-9518) を標的とする uTCR-SAR 構築物を、 NIH 四量体施設。
THP-1細胞は、uTCR-SAR NY-ESO1-SAR(061621-SCjJ7;配列番号9366)をコードするレンチウイルスベクターで安定に形質導入される。細胞は、NY-ESO1-四量体-APCによる染色の増加と、表面NY-ESO1/HLA-A2複合体発現による標的細胞の食作用の増加を示します。
NY-ESO1-SAR (061621-SCjJ7; 配列番号9366) をコードする濃縮レンチウイルスベクターを使用して、NK92 細胞株、初代 T 細胞および初代 NK 細胞を感染させました。感染後、細胞を上記のようにNY-ESO1-四量体-APCで染色した。 NY-ESO1-SAR (061621-SCjJ7; 配列番号: 9366) の発現により、NK92 細胞株では APC+ ve 細胞が 4.93% から 84.06% に増加し、初代 NK 細胞では 3.3% から 10.98% に増加し、初代培養細胞では APC+ ve 細胞が増加しました。 T細胞は29%から59.3%へ。これらの結果は、NY-ESO1-SARがT細胞と非T細胞の両方を含むさまざまな細胞株で機能的に発現でき、それらの細胞にTCR様結合能力を付与できることを示しています。
NK92細胞、初代NK細胞、およびNY-ESO1-SAR(061621-SCjJ7;配列番号9366)を発現する初代T細胞を、50IU/mlのIL2を補充したXVIVO培地中で1日間増殖させた。 NYESOペプチド(10μM)、CD28アゴニスト抗体(1μg/ml)、NY-ESO-1ペプチド+CD28抗体の存在下および非存在下でGLucを発現するT2-細胞と共培養を行った。 T2細胞にNY-ESO1ペプチドを37℃で30分間ロードしました。さらに、外来性 HLA-A2 コード配列と NY-ESO-1 コード配列を発現するレンチウイルス ベクター (020122-BBjV1) を感染させた T2 細胞を対照として含めました。さらに、L363 (NY-ESO1+/HLA-A2+) および U266 (NY-ESO1+/HLA-A2+) 細胞を発現する Gluc。 020122-BBjV1 ベクターで形質導入された L363 細胞および U266 細胞が含まれていました。すべての標的細胞とエフェクター細胞を、サプリメントを含まない XVIVO 培地中で白色 384 ウェル プレートに E:T 比 1:1 で 4 時間播種しました。標的細胞は、30μlの培地中10,000細胞/ウェルで使用しました。マタドールアッセイは、自動ディスペンサーを使用してウェルモードでPBS中の1:100 CTZアッセイ緩衝液15μlを注入した後に実施した。発光を5秒間読み取った。その結果、NY-ESO1-SAR (061621-SCjJ7; 配列番号9366) に感染したNK92、初代NKおよび初代T細胞を含むU266-Gluc細胞の培養物における細胞死を反映するGluc活性の顕著な増加が示されました。感染していないコントロール細胞と比較して。 Gluc 活性は、NK92 培養物における 23356 から、NY-ESO1-SAR を発現する NK92 における 334646 まで増加しました。 Gluc 活性は、初代 NK 細胞の培養における 17788 から、NY-ESO1-SAR を発現する初代 NK における 162764 まで増加しました。 Gluc 活性は、初代 T 細胞の培養における 2183 から、NY-ESO1-SAR を発現する初代 T 細胞における 491493 まで増加しました。同様に、NK92、初代NK細胞、および初代T細胞におけるNY-ESO1-SAR(061621-SCjJ7;配列番号9366)の発現は、L363細胞および020122-BBjV1ベクターで安定的に形質導入されたL363細胞に対する細胞毒性の増加を示した。未感染のコントロール細胞。最後に、NK92細胞および初代NK細胞におけるNY-ESO1-SAR(061621-SCjJ7;配列番号9366)の発現は、NY-ESO1ペプチドを負荷されたT2細胞に対する細胞毒性の増加を、NY-ESO1ペプチドを負荷されたT2細胞に対して示した。ペプチドが詰め込まれています。
対照T2細胞またはNY-ESO1ペプチドを負荷したT2細胞を、96ウェルU底プレート中の100μl培地中に50K細胞/ウェルでプレーティングした。対照エフェクター細胞(NK92および初代T細胞)、またはNY-ESO1-SARをコードするレンチウイルスベクター(061621-SCjJ7;配列番号9366)に感染させたエフェクター細胞を、E:T比1:1で添加した。 。 24時間後、ELISAのために上清を収集した。その結果、NK92細胞およびNY-ESO1-SAR(061621-SCjJ7;配列番号9366)を発現する初代T細胞と共培養した場合、NY-ESO1ペプチドを負荷したT2細胞におけるIFNγおよびTNFαの産生が増加することが示された。 )非感染対照細胞と比較した(図13)。この効果は、NY-ESO1ペプチドが負荷されたT2細胞に特異的であり、NY-ESO1ペプチドが負荷されていないT2細胞では同じ程度には見られなかった。
NK92、初代NK、および初代T細胞は、uTCR-SAR CD8SP-MAGE-A3-112-120-Vb-TCRb-S57C-ECD-CD3zECDTMCP-opt-F-P2A-MAGE-A3-112を発現するレンチウイルス構築物に感染します。 -120-Va-TCRa-T48C-ECD-CD3zECDTMCP-opt2(配列番号9450)は、HLA-A2と複合したMAGE-A3ペプチド(112~120)を標的とする。 MAGE-A3ペプチド(配列番号10879)を負荷したT2細胞を使用して、実験を上記のように繰り返す。 uTCR-SAR 発現細胞との共培養は、形質導入されていない細胞との共培養と比較して、細胞毒性およびサイトカイン (IFNγ および TNFα) 産生の増加をもたらすことが示されています。ペプチドが負荷されていない T2 細胞は、ネガティブコントロールとして機能します。
本質的に上記と同様のアプローチを使用して、NY-ESO1、MAGE-A3および他の細胞内ペプチド抗原を標的とするuTCR-SARを発現する一次マクロファージを生成することができる。
本質的に上記と同様のアプローチを使用して、他のペプチド抗原を標的とするuTCR-SARを生成および試験することができる。 NY-ESO1、MAGE-A3、MC7.G5(HLA非依存性TCR)およびVd2/Vg9(γδTCR)を標的とするTCRの可変ドメインを含むいくつかの追加の例示的な単一特異性および二重特異性uTCR-SAR構築物の配列番号を提示する。配列番号9355~9602において。これらの構築物は、初代NK細胞、初代T細胞、NK細胞株、iPSC細胞、造血細胞および他のエフェクター細胞(例えば、CIK、メモリー様NK、g-NK樹状細胞など)で発現させ、技術を使用して活性を試験することができます。当該技術分野において知られている。
THP-1 細胞上の CD19 標的 SAR の発現
ATCC から入手した THP-1 (単球) 細胞に、CD19 を標的とする指定の SAR 構築物をコードするレンチウイルス ベクターを感染させました。細胞をピューロマイシン中で選択した。 CD19 標的 SAR 発現 THP-1 細胞が CD19 細胞外ドメインに結合する能力は、以前に記載されているように FLAG-CD19-ECD-GGSG-NLuc-AcV5 (配列番号 3675) を使用する Topanga アッセイによってテストされました (Gopalakrishnan, R)ら、Sci. Reports、9:1957、2019)。結果は、親THP-1細胞と比較して、配列番号2312、2291、5138、2313によって表されるSARを発現するTHP -1細胞へのCD19 Topanga試薬の結合の増加を示す。これらの結果は、これらの SAR が単球系統の THP-1 細胞の表面で機能的に発現することができ、CD19 標的抗原への結合の増加を示すことを示しています。
CD19-TARGETED SAR を発現する THP-1 細胞は、CD19+ RAJI 細胞の貪食作用の増加を示す
7.5 x 10 4 THP-1 細胞を、10% FBS を含む RPMI 中の 1ng/mL の PMA (ホルボール 12-ミリスチン酸 13-アセテート) を使用して単球/マクロファージ系統に分化させました。 2 セット 3 回で 48 時間。細胞は付着するようになり、2回洗浄した。次いで、7.5×110 4 個のRAJI-Nluc細胞およびRAJI-CD19-KO-Nluc細胞標的細胞を適切なウェルに3~4時間添加した。懸濁細胞を除去し、プレートを2回洗浄した。 PBS中のEDTA 500μLを加え、37 ℃で5分間インキュベートしました。細胞をはぎ取り、チューブに入れ、4 ℃ 、1000rpmで5分間回転させました。PBSを除去し、100μLの1xウミシイタケルシフェラーゼアッセイ溶解液を加えました。緩衝液(Promega)をチューブに加え、氷上で10分間インキュベートした。サンプルを4 、12,000で10分間遠心分離した。25μLの上清を3回収集し、25μLのCTZ(セレントRAJIン)アッセイ緩衝液を加え、プレートリーダーを使用して発光を測定した。以下の表60に示すように、配列番号2291および5138のSARを発現するTHP-1細胞は、RAJI細胞との共培養において、THP-1親細胞と比較してより高いNLuc活性を示した。これらの結果は、CD19-TARGETED-SAR 発現THP-1 細胞による CD19 発現 RAJI 細胞の貪食作用の増加を示しています。対照的に、配列番号2291および5138のSARを発現するTHP-1細胞は、CD19発現を欠くRAJI-CD19-KO細胞との共培養において、THP-1親細胞と比較してNLuc活性の増加を示さなかった。
多目的スイッチの表現。
NK92細胞は、SARをコードし、異なる膜アンカー型サイトカインまたは多目的スイッチを含むアクセサリーモジュールを共発現するレンチウイルスベクターで安定に形質導入された。 Synth-IL2-tBCMA-L24多目的スイッチを発現する例示的な構築物は、配列番号8509~8512によって表される。感染後、NK92細胞をIL2から取り出した。配列番号7133~7137、7151~7157および8529~8534によって表されるアクセサリーモジュールの共発現により、IL2を欠く培地で増殖させた場合、NK92細胞は生存したが、対照の形質導入されていないNK92細胞は死滅した。マタドールアッセイで測定したところ、さまざまな SAR 構築物を発現する NK92 細胞は、SAR の強力な発現と活性を示しました。 IL2-tHer2 (配列番号: 8533)、IL2-RQR8 (配列番号: 8529)、およびIL2-tBCMA (配列番号: 7151)を表す多目的スイッチを発現するNK92細胞を、ハーセプチン、リツキシマブ、およびJ6MO抗体で染色した。それぞれ Her2、RQR8、BCAM に結合し、陽性染色を示すことがわかりました。さらに、IL2-RQR8 (配列番号: 8529) を発現する NK92 細胞も、CD34 に結合する QBEND-10 抗体による染色を示します。上記の多目的スイッチを発現するJNG細胞は、上記の抗体を使用して検出された場合、多目的スイッチの細胞表面発現も示す。これらの結果は、SAR発現細胞が、多目的スイッチに結合する抗体で染色し、続いて細胞選別(例えば、フロー選別または磁気選別)することによって検出、単離および精製できることを示す。これらの結果はさらに、多目的スイッチに結合する抗体で染色し、続いて細胞選別(例えば、フロー選別または磁気選別)を使用するネガティブ選択によってSAR発現細胞を除去できることを示す。さらに、多目的スイッチを発現する細胞は、ハーセプチン、リツキシマブ、J6M0、BCMA-ADC などのスイッチに結合する抗体で処理すると死滅します。
短い内部プロモーター(例えば、EFS、EFS2、RSVなど)を使用してアクセサリーモジュールが発現される構築物が、SARおよびアクセサリーモジュールの優れた発現を示すことも観察された。これは、2 つの鎖を持つ SAR コンストラクトの場合に特に見られました。
養子細胞療法のための複数の抗原を標的とする自己 SAR-T 細胞の使用。患者は、感染症(例えば、HIV1、EBV、CMV、HTLV1など)、変性疾患(例えば、アルツハイマー病)、自己免疫疾患(例えば、尋常性天疱瘡)、アレルギー性疾患(例えば、慢性特発性蕁麻疹)を含む多くの異なる疾患を有する。また、複数のがんが、さまざまな疾患原因抗原または疾患関連抗原を標的とする養子移入された自己 SAR-T 細胞を用いた免疫療法の IRB 承認の第 I 相臨床試験に登録されています。さまざまな疾患の SAR は、疾患の原因細胞または疾患関連細胞における標的抗原の既知の発現に基づいて選択されます。可能であれば、疾患の原因細胞または疾患関連細胞上の SAR 標的の発現は、SAR の抗原結合ドメインが柔軟なリンカーを介して非分泌型の NLuc タンパク質に融合した ABD-GGS-NLuc 融合タンパク質との結合によって確認されます。 。あるいは、市販の抗体を使用した免疫組織化学またはフローサイトメトリーを使用して、疾患の原因細胞または疾患関連細胞上の SAR 標的の発現を確認します。 T細胞は、白血球除去法を使用して対象から収集され、適切なSARをコードするレンチウイルスベクターで形質導入され、 CD3/CD28ビーズを使用してエクスビボで増殖されます。得られた細胞生成物は、品質管理試験(無菌性試験および腫瘍特異的細胞毒性試験を含む)を受けた後、凍結保存されます。一方、研究参加者はリンパ除去化学療法(30 mg/m 2 /日のフルダラビンと500 mg/m 2 /日のシクロホスファミド×3日間)を開始します。リンパ球除去療法の完了から1日後、研究参加者は形質導入されたリンパ球を静脈内注入され、続いて耐性が得られるまで8時間ごとに高用量(720,000 IU/kg)IL-2(アルデスロイキン;プロメテウス、カリフォルニア州サンディエゴ)が投与される。事前に保管された SAR-T 細胞産物は、患者のベッドサイドで輸送され、解凍されて注入されます。 SAR-T生成物の用量は、研究プロトコールに従って、 1×10 SAR+ve CD3細胞/kgから5×10 9 SAR+ve CD3細胞/kgまで変化する。 SAR-T 製品は、1 回の注入または分割注入で投与できます。研究参加者には、T細胞注入の少なくとも30分前に、15 mg/kgのアセトアミノフェンPO(最大650 mg)およびジフェンヒドラミン0.5~1 mg/kg IV(最大用量50 mg)を前投与することができます。研究参加者は、必要に応じてヒトIL-2の毎日の注射を受けることができる。その後、医師の裁量で臨床および実験室の相関追跡研究を実行できます。
養子細胞療法のための同種異系 SAR-T 細胞の使用。同種骨髄移植を受けた再発性急性リンパ性白血病または高リスク中悪性度B細胞リンパ腫の患者は、養子移植された同種SAR-T細胞による免疫療法を受けることができます。ドナー (同種異系移植に使用したものと同じドナー) から収集した白血球除去製品は、Miltenyi Biotec の CliniMACS Prodigy(R) システムを使用し、メーカーの推奨に従って CD3 陽性 T リンパ球の選択を受けます。 TRACおよびβ2Mの発現は、当技術分野で公知の技術を使用するCRISP9媒介ノックアウトによって除去され、TCR/CD3複合体およびHLAの細胞表面発現を欠くT細胞が選択される。細胞は、CD3およびCD28磁気ビーズベースの人工抗原提示細胞を使用して活性化され、臨床グレードのCD20標的SARウイルス(例えば、CD8SP - CD20-VHH-USC1-CD16A-F158V-S197P-FL-v3(配列番号2))で形質導入される。 : 5047]). 細胞は閉鎖系で 9 ~ 12 日間増殖され、得られた細胞製品は品質管理試験 (無菌性および腫瘍特異的細胞毒性試験を含む) を受けた後、凍結保存されます。その間、研究参加者はリンパ除去化学療法を開始します(30 mg/m 2 /日のフルダラビンと 500 mg/m 2 /日のシクロホスファミド x 3 日間) リンパ球除去レジメンの完了 1 日後、研究参加者は形質導入リンパ球の静脈内注入を受け、続いて高用量 (720,000 IU/kg) が投与されます。 ) IL-2 (アルデスロイキン; プロメテウス、カリフォルニア州サンディエゴ) 耐性が得られるまで 8 時間ごと。SAR-T 細胞製品は患者のベッドサイドで輸送、解凍され、注入されます。SAR-T 製品の用量は 1 x 10 から変化する場合があります。研究プロトコルに従って、 4 SAR+ve CD3 細胞/kg ~ 5 x 10 9 SAR+ve CD3 細胞/kg。 SAR 製品は、1 回の注入または分割注入で投与できます。研究参加者には、SAR-T細胞注入の少なくとも30分前に、15 mg/kgのアセトアミノフェンPO(最大650 mg)およびジフェンヒドラミン0.5~1 mg/kg IV(最大用量50 mg)を前投与することができます。その後、臨床および臨床検査の相関追跡研究を医師の裁量で実施できます。これには、CD20 発現 ALL/リンパ腫細胞および/または養子移入された T 細胞の存在に関する定量的 RT-PCR 研究が含まれる場合があります。 FDG-PET および/または CT スキャン。疾患特有の病理学的評価のための骨髄検査。リンパ節生検。および/または遺伝子導入研究に適用されるFDAの生物学的反応修飾物質諮問委員会によって定められたガイドラインに従った長期追跡調査。免疫抑制剤の使用も医師の裁量に任されています。本質的に同様のアプローチを、本開示のSARを発現する同種異系免疫細胞(例えば、T細胞)を用いて他の疾患を治療するために使用することができ、この場合、SARは、疾患の原因細胞または疾患関連細胞上に発現される1つまたは複数の抗原を標的とする。基本的に同様のプロトコルを使用して、表 36 ~ 38 にリストされている他の SAR コンストラクトをテストします。
SARを発現する自己または同種異系NK細胞の使用
ドナー(同種異系移植に使用したものと同じドナー)から収集した白血球除去製品は、Miltenyi Biotec の CliniMACS Prodigy(R) システムを使用し、メーカーの推奨に従って NK 細胞の選択を受けます。 NK細胞は、hIL2を使用して3~5日間活性化され、その後、CD20を標的とするSAR (例えば、CD8SP-CD20-VHH-USC1-CD16A-F158V-S197P-FL-v3(配列番号5047)をコードするレンチウイルスベクターで形質導入される)レンチウイルスは、膜アンカー型の IL2 もコードします (配列番号 1330)。NK 細胞を、ヒト CD20 を 50 単位で発現する人工抗原提示 K562 細胞 (aAPC) の存在下で、エクスビボで 15 日間増殖させます。得られた細胞産物は、品質管理試験 (無菌性および腫瘍特異的細胞毒性試験を含む) を受けた後、凍結保存されます。その間、研究参加者はリンパ枯渇化学療法 (30 mg/m2/日とフルダラビン 500 mg/m2) を開始します。 m2/日シクロホスファミド x 3 日) リンパ球除去レジメンの完了 1 日後、研究参加者は形質導入された NK 細胞を静脈内に注入され、続いて耐性が得られるまで 8 時間ごとに高用量 (720,000 IU/kg) IL-2 が投与されます。 NK 細胞産物は患者のベッドサイドで輸送され、解凍されて注入されます。 SAR-NK産物の用量は、研究プロトコールに従って1×10 4 SAR+ve NK細胞/kgから5×10 9 SAR+ve NK細胞/kgまで変化し得る。 SAR-NK産物は、1回の注入または分割注入で投与することができます。
SARを発現するiPSC由来NK細胞の作製
CD19 標的 SAR コンストラクトCD8SP-CD19-FHVH-354-CD16A-F158V-S197P-FL-v3 (配列番号 5042) は、 2 つの異なる臍帯幹細胞由来 iPSC 細胞株 (606A1、NCRM-1) で発現されます。末梢血由来iPSC細胞株(648A1)。抗FLAG-FITCを使用するTopanga試薬およびFACSとの結合によって決定されるSARを発現する単一細胞クローンは、単離され、増殖され、QC分析(例えば、染色体の完全性、多能性、同一性確認、マイコプラズマおよび不妊性)を受ける。各 iPSC 細胞株に由来するいくつかの独立したクローンは、液体窒素中で凍結され、マスターセルバンクとして機能します。
iPSCおよびSARトランスフェクトiPSCからのNK細胞の誘導は、当技術分野で知られているプロトコールを使用して行われる。簡単に説明すると、3,000 個の TrypLE 適応 iPSC を、40 ng/ml ヒト幹細胞因子 (SCF)、20 ng/ml ヒト血管内皮増殖因子 (VEGF)、および 20 ng を含む APEL 培養物を含む 96 ウェル丸底プレートに播種します。 /ml 組換えヒト骨形成タンパク質 4 (BMP-4)。造血分化の 11 日目後、CD34+/CD43+ および CD34+/CD45+ についてフローサイトメトリーによって細胞の造血前駆細胞を評価します。
次に、スピン胚様体 (EB) を、NK 細胞培養条件下でコーティングされていない 24 ウェル プレートの各ウェルに直接移します。その後、5 ng/mL IL-3 (最初の週のみ)、10 ng/mL IL-15、20 ng/mL IL-7、20 ng/mL SCF、および 10 ng/mL flt3 を使用して、細胞はさらに NK 細胞に分化します。リガンドを28~32日間保持します。半分の培地交換は毎週行われます。 50単位/mLのhIL-2の存在下で、ヒトCD19を発現する人工抗原提示K562細胞(aAPC)を発現する照射mbIL-21を使用して、NK細胞を増殖のために回収する。 Matador アッセイを使用したin vitro効力試験の後、細胞はNSG マウスの NALM6 異種移植モデルを使用したin vivo研究に使用されます。追加の無菌性および効力アッセイの後、細胞は、CD19発現B細胞急性リンパ性白血病(B-ALL)、慢性リンパ性白血病、およびびまん性大細胞型B細胞リンパ腫の患者の治療のためのヒト臨床試験に使用される予定です。
本質的に同様の手順が、当技術分野で知られているiPSCからT細胞への分化のためのプロトコールを使用して、本開示のSARを発現するiPSC由来T細胞の生成に使用されるであろう。
SARを発現するNK92細胞の作製と利用
、CD20を標的とするSAR (例えば、CD8SP-CD20-VHH-USC1-CD16A-F158V-S197P-FL-v3(配列番号5047))をコードするレンチウイルスベクターで形質導入される。膜アンカー型のIL2をコードする(配列番号1330) NK92細胞を、ヒトCD20を発現する人工抗原提示K562細胞(aAPC)および50単位/mLのhIL-2の存在下で、エクスビボで15日間増殖させる。細胞はγ線照射され、得られた細胞産物は品質管理試験(無菌性および腫瘍特異的なインビトロおよびインビボ細胞毒性試験を含む)を受けた後、細胞は凍結保存されます。その間、研究参加者はリンパ除去化学療法(30 mg)を開始します。 /m2/日のフルダラビンと 500 mg/m2/日のシクロホスファミド x 3 日)リンパ球除去レジメンの完了 1 日後、研究参加者は形質導入された NK92 細胞を静脈内注入されます。SAR-NK 製品の用量は 1 x 10 から変化する場合があります。研究プロトコルに従って、 4 SAR+ve NK92 細胞/kg ~ 5 x 10 9 SAR+ve NK92 細胞/kg。 SAR-NK92産物は、単回注入または分割注入で投与することができる。
SARを発現するように操作された造血幹細胞の生成
CD34陽性造血幹細胞は、G-CSF動員白血球除去産物から精製され、 CD8SP-CD19-FHVH-354-CD16A-F158V-S197P-FL-v3(配列番号: 5042) 。造血幹細胞における内因性CD19の発現は、米国特許第10660919号に記載の技術を使用して任意に除去される。被験者は骨髄破壊的化学療法を受け、その後遺伝子改変幹細胞が注入されます。本質的に同様のアプローチを使用して、造血幹細胞における内因性CD33の除去と組み合わせてCD33標的SAR(例えば配列番号4871)を発現させる。本質的に同様のアプローチを使用して、造血幹細胞における内因性MPLの除去と組み合わせてMPL標的SAR(例えば配列番号4919)を発現させる。
マクロファージ/単球を発現するSARの生成と利用
CD8SP-CD19-FHVH-354-CD16A-F158V-S197P-FL-v3 (配列番号5042)で表されるCD19標的SARは、マクロファージ/単球で発現され、記載された方法を用いたCD19発現リンパ腫の治療に使用されます。 WO2019152781に記載。
SAR-T/NK 細胞肝動脈注入。静脈内注入に加えて、SAR-T 細胞および SAR-NK 細胞を動脈内に注入して、疾患に関係する局所領域または臓器に高濃度の SAR 発現細胞を提供することもできます。
SAR-T/NK細胞の腹腔内投与。 SAR -T/NK細胞は、本質的にKoneru Mら(Journal of Translational Medicine;2015;13:102)に記載されているように、腹腔内投与することもできる。
腫瘍内注射のための SAR-T/NK 細胞の使用。 SAR -T/NK細胞はまた、基本的にBrown CEら、Clin Cancer Res. 2015年9月15日; 21(18): 4062-4072。
異なるSAR発現細胞の組み合わせ
患者は、1 つまたは複数の抗原を標的とする異なる SAR 発現細胞の組み合わせを投与される場合があります。例えば、患者は、CD19標的SAR-T、CD20標的SAR-NK、およびCD22標的SARマクロファージを受けてもよい。あるいは、対象は、CD19標的SAR-T細胞、CD19標的SAR-NK細胞、およびCD19標的SARマクロファージを受けてもよい。
SAR の組み合わせを使用して免疫応答を微調整し、閾値効果が達成された場合にのみシグナル伝達がトリガーされるようにすることができます。したがって、配列番号7601のBCMAを標的とするSARおよび配列番号7607のCD19を標的とするSARを発現するNK細胞は、BCMAおよびCD19の両方を発現する細胞に曝露された場合、相加効果または相乗効果を示す可能性がある。相加的/相乗的効果は、異なる抗原 (BCMA や CD19など)を標的とすることによって達成できます。相加的/相乗効果を達成する別のアプローチは、同じ抗原を標的とするが、異なるシグナル伝達鎖を含む異なる SAR 受容体を介することです。例えば、配列番号7607のCD19-SARを発現するNK細胞(CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-scFv-NKp30-ECDTMCP-opt2-F-F2A-PAC)は、別のCD19-SARを共発現することもできる配列番号7676(CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-CD16A-v158-S197P-FL-v3-F-F2A-PAC)を有する。代替の実施形態では、2つのSARは、同じ抗原の異なるエピトープを標的とすることができる。例えば、配列番号7607のCD19-SARを発現するNK細胞(CD8SP-CD19-hu-mROO5-1-scFv-NKp30-ECDTMCP-opt2-F-F2A-PAC)は、別のCD19-SARを共発現することもできる配列番号7660 (FMC64-CD16A-v158-S197P-FL-v3-F-F2A-PAC)を有する、または配列番号7668 (hCD19-Bu12-CD16A-v158-S197P-FL-v3)を有するCD19-SAR -F-F2A-PAC)。
別の実施形態では、CD16シグナル伝達鎖を含むSARを、NKp30、NKp44、NKp44、NKG2D、Dap10および/またはCD3zシグナル伝達鎖を含むSARと組み合わせて、相加的/相乗効果を得ることができる。別の実施形態では、NKp30シグナル伝達鎖を含むSARを、CD16、NKp44、NKp46、NKG2D、Dap10および/またはCD3zシグナル伝達鎖を含むSARと組み合わせて、相加的/相乗効果を得ることができる。同様に、NKp44シグナル伝達鎖を含むSARを、CD16、NKp30、NKp46、NKG2D、Dap10および/またはCD3zシグナル伝達鎖を含むSARと組み合わせて、相加的/相乗効果を得ることができる。同様に、NKp46シグナル伝達鎖を含むSARを、CD16、NKp30、NKp44、NKG2D、Dap10および/またはCD3zシグナル伝達鎖を含むSARと組み合わせて、相加的/相乗効果を得ることができる。同様に、DAP10シグナル伝達鎖を含むSARを、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2D、および/またはCD3zシグナル伝達鎖を含むSARと組み合わせて、相加的/相乗効果を得ることができる。同様に、CD3zシグナル伝達鎖を含むSARを、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、NKG2D、および/またはDAP10シグナル伝達鎖を含むSARと組み合わせて、相加的/相乗効果を得ることができる。同様に、NKG2Dシグナル伝達鎖を含むSARを、CD16、NKp30、NKp44、NKp46、CD3z、および/またはDAP10シグナル伝達鎖を含むSARと組み合わせて、相加的/相乗効果を得ることができる。

Claims (245)

  1. 標的抗原に特異的に結合する合成抗原受容体(SAR)であって、以下を含むSAR:
    (i) 以下からなる群から選択される1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む第1のモジュール:
    a) 抗体。
    b) 抗体フラグメント;
    c) 抗体の重鎖可変領域(vHドメイン)またはその断片;
    d) 抗体の軽鎖可変領域(vLドメイン)またはその断片;
    e) 単鎖可変フラグメント(scFv)またはそのフラグメント;
    f) 単一ドメイン抗体(SDAB)またはそのフラグメント;
    g) vHHドメインまたはその断片;
    h) 抗体の単量体可変領域。
    i) 単一のvHドメイン(SVH)またはその断片。
    j) 単一の vL ドメイン (SVL) またはそのフラグメント。
    k) DARPIN、アフィボディ、アフィリス、アドネクチン、アフィチン、オボディ、レペボディ、フィノマー、アルファボディ、アビマー、アトリマー、センチリン、プロネクティ、アンチカリンから選択される非免疫グロブリン抗原結合足場、クニッツドメイン、Armadilloリピートタンパク質、Dドメイン、および上記のいずれかのフラグメント;
    l) 受容体またはその断片のリガンド結合ドメイン;
    m) リガンドの受容体結合ドメイン。
    n) 二重特異性抗体、抗体フラグメント、scFV、vHH、SDAB、非免疫グロブリン抗原結合足場、受容体またはリガンド。
    o) 自己抗原またはその断片;
    p) アダプター結合ドメインまたはその断片;
    q) Fc結合ドメインまたはその断片;
    r) TCRまたはHLA非依存性TCRまたはその断片;と
    s) TCRのVa、Vb、VgもしくはVd断片またはその断片、

    (ii) 少なくとも1つの膜関連ドメインを含む第2のモジュールであって、膜関連ドメインは膜貫通ドメインまたは膜アンカードメインであり得る。と
    (iii) 1つまたは複数のサイトゾルドメインを含む任意の第3モジュール、
    ここで、第 1 モジュール、第 2 モジュール、およびオプションの第 3 モジュールは、1 つ以上のオプションのリンカーを介して動作可能にリンクされます。
  2. 1つ以上の異種抗原結合ドメインを含む前記第1のモジュールが、任意のリンカーを介して、以下を含むポリペプチドに機能的に連結されている、請求項1に記載の単鎖SAR:
    (1) 天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体の全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    (2) 天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    (3) 天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体の膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    (4) 天然に存在する受容体またはその断片もしくは変異体のサイトゾルドメイン。また
    (5) シグナル伝達アダプターまたはその変異体もしくは断片の全体または部分的な細胞外ドメイン、ヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメイン。
  3. 請求項2に記載のSARであって、
    a) 天然に存在する受容体は、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、およびプレTCRαからなる群から選択されるT細胞受容体を含まない。および/または
    b) 天然に存在する受容体は、T細胞受容体モジュール(TCRM)を含まない。および/または
    c) シグナル伝達アダプターは、CD3ζ、CD3γ、CD3ε、およびCD3δの群から選択されるCD3アダプターではない。および/または
    d) シグナル伝達アダプターは FcRγ ではありません。
  4. 前記天然に存在する受容体が、N末端細胞外ドメインを有するI型膜タンパク質であり、1つ以上の異種抗原結合ドメインを含むポリペプチドのN末端が、任意のリンカーを介して前記細胞外ドメインに機能的に連結されている、請求項2または3に記載のSAR。を含むポリペプチドのN末端またはN末端付近
    a) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体の全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    b) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    c) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体の膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    d) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖のサイトゾルドメイン、またはその断片もしくは変異体。
  5. 前記天然受容体I型膜タンパク質が、 CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、 KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、 CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、 CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、LAIR1、それらの変異体および断片。
  6. 前記天然に存在する受容体が、C末端細胞外ドメインを有するII型膜タンパク質であり、1つ以上の異種抗原結合ドメインをコードするポリペプチドのN末端が、任意のリンカーを介して前記細胞外ドメインに機能的に連結されている、請求項2または3に記載のSAR。以下を含むポリペプチドのC末端またはC末端付近:
    a) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体の全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    b) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体のヒンジドメイン、膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    c) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖またはその断片もしくは変異体の膜貫通/膜関連ドメインおよび任意のサイトゾルドメイン;また
    d) 天然に存在する受容体ポリペプチド鎖のサイトゾルドメイン、またはその断片もしくは変異体。
  7. II型膜タンパク質のN末端に作動可能に連結されたシグナル伝達アダプターのサイトゾルドメインを含むポリペプチドのN末端をさらに含む、請求項6に記載のSAR。
  8. 前記シグナル伝達アダプターが、CD3ζ、FcRγ、DAP10またはDAP10の群から選択される、請求項7に記載のSAR。
  9. 前記シグナル伝達アダプターのサイトゾルドメインのN末端に作動可能に連結された1つ以上の共刺激ドメインを含むポリペプチドのN末端をさらに含む、請求項8に記載のSAR。
  10. 前記1つまたは複数の共刺激ドメインが、 CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEMおよびアイコス。
  11. DAP10を含むアクセサリモジュールと同時発現される、請求項10に記載のSAR。
  12. 前記天然受容体II型膜タンパク質が、 NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、 KLRG1、CD94、CD161、それらの変異体、およびそれらの断片からなる群から選択される、請求項6~10のいずれか一項に記載のSAR。
  13. 前記全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、前記任意選択のヒンジドメイン、前記膜貫通ドメインおよび任意選択のサイトゾルドメインがすべて単一の天然に存在する受容体に由来し、1つの連続したポリペプチド鎖中に存在する、請求項3に記載のSAR 。
  14. 細胞外抗原結合ドメイン全体または部分、任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾルドメインが、2つ以上の異なる天然受容体に由来する、請求項2に記載のSAR。
  15. 請求項14に記載のSARであって、
    a) 天然に存在する受容体の全体または部分的な細胞外抗原結合ドメインは、1つまたは複数の異なる天然に存在する受容体に由来する任意のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾルドメインに機能的に連結されており、また
    b) 天然に存在する受容体の全体または部分的な細胞外抗原結合ドメインおよび任意のヒンジドメインは、1つまたは複数の異なる天然に存在する受容体に由来する膜貫通ドメインおよび任意のサイトゾルドメインに機能的に連結されており、また
    c) 天然に存在する受容体の全体または部分的な細胞外抗原結合ドメイン、任意のヒンジおよび膜貫通ドメインは、1つまたは複数の異なる天然に存在する受容体に由来するサイトゾルドメインに機能的に連結されている。
  16. 前記サイトゾルドメインがITAMを含む活性化ドメインを含む、請求項2に記載のSAR。
  17. 前記サイトゾルドメインがITAMを含む活性化ドメインを欠いている、請求項2に記載のSAR。
  18. 前記細胞質ゾルドメインが、CD3ε、FcRγ、DAP10および/またはDAP10の群から選択される1つまたは複数のシグナル伝達アダプターを動員する、請求項2に記載のSAR。
  19. 前記サイトゾルドメインが1つ以上の共刺激ドメインを含む、請求項2に記載のSAR。
  20. 前記1つ以上の共刺激ドメインが、 CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEM、 ICOS、そのバリアント、およびそのフラグメント。
  21. 前記サイトゾルドメインが共刺激ドメインを欠いている、請求項2に記載のSAR。
  22. 前記サイトゾルドメインが、前記膜貫通ドメインと前記活性化ドメインとの間に位置する1つまたは複数の共刺激ドメインを含む、請求項2に記載のSAR。
  23. 天然に存在する受容体が、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、 KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、 TNFR- II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、それらの変異体およびそれらの断片。
  24. 前記SARが、天然に存在する受容体の細胞外抗原結合ドメインの抗原結合特性を部分的または完全に保持し、第1のモジュールに位置する1つまたは複数の異種抗原結合ドメインの抗原結合特異性を獲得する、請求項2または3に記載のSAR。 。
  25. 細胞の表面上で発現されると、細胞にMHC(またはHLA)依存性および/またはMHC(またはHLA)非依存性の抗原認識を与えることができる、請求項1に記載のSAR。
    a) SARの抗原結合ドメインは単一の連続したポリペプチド鎖から構成されていません。および/または
    b) SARの抗原結合ドメインは抗体または抗体断片に由来しない。および/または
    c) SAR には T 細胞受容体モジュールが含まれていません。
  26. 前記SARの抗原認識ドメインが、TCRの少なくとも2つの可変ドメインに由来する、請求項25に記載のSAR。
  27. 前記2つの可変ドメインが、Vα、Vβ、Vγ、VδおよびプレTCRαから選択される少なくとも2つの可変ドメインのヘテロ二量体を含む、請求項26に記載のSAR。
  28. 前記2つの可変ドメインが、VαおよびVβ、またはVγおよびVδである、請求項27に記載のSAR。
  29. 前記2つの可変ドメインが柔軟なペプチドリンカーによって連結されていない、請求項28に記載のSAR。
  30. 単鎖TCR(sc-TCR)ではない、請求項29に記載のSAR。
  31. 2つの鎖を有し、少なくとも1つの鎖が膜結合している、請求項25に記載のSAR。
  32. 両方の鎖が膜結合している、請求項31に記載のSAR。
  33. MHC(HLA)分子と複合体を形成したペプチドに結合することができる、請求項25に記載のSAR。
  34. 細胞の表面上で発現されると、ペプチド/MHC複合体によって結合されたときに少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員する能力を細胞に付与する、請求項25に記載のSAR。
  35. 細胞の表面上で発現されると、ペプチド/MHC複合体によって結合されたときに少なくとも1つのシグナル伝達経路を開始する能力を細胞に与える、請求項25に記載のSAR。
  36. 非T細胞において機能的に発現され得る、請求項25に記載のSAR。
  37. 機能的CD3複合体の発現を欠く細胞において機能的に発現され得る、請求項36に記載のSAR。
  38. CD3γ鎖、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の機能的発現を欠く細胞において機能的に発現され得る、請求項37に記載のSAR。
  39. 非T細胞にT細胞様の抗原認識を与えることができる、請求項36に記載のSAR。
  40. CD3γ鎖、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の機能的発現を欠くT細胞にT細胞様の抗原認識を与えることができる、請求項36に記載のSAR。
  41. 非T細胞に対する抗原認識時にT細胞様シグナル伝達を与えることができる、請求項36に記載のSAR。
  42. CD3γ鎖、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の機能的発現を欠くT細胞にT細胞様シグナル伝達を与えることができる、請求項36に記載のSAR。
  43. 任意の細胞にT細胞様の抗原認識を与えることができる、請求項222に記載のSAR。
  44. 少なくとも2つの鎖を含み、
    a)第1のポリペプチド鎖は、vL、Vα、またはVγドメインを含む第1の抗原結合ドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)を含む;と
    b)第2のポリペプチド鎖は、vH、Vβ、またはVδドメインを含む第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)を含む;
    ここで、第1の抗原結合ドメインのvL、VαまたはVγドメインと第2の抗原結合ドメインの相補的vH、VβまたはVδドメインは、標的に特異的に結合するFvまたはTCR-Fv様の抗原結合モジュールを形成する抗原;と
    ここで、第1のMAMおよび第2のMAMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化する、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員できる非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。
  45. 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のMAMとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のMAMとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、請求項44に記載のSAR 。ママ。
  46. 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む、請求項45に記載のSAR。
  47. 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、個別に、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を含む、請求項46に記載のSAR。
  48. 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、個別に、Cα、Cβ、CγもしくはCδ TCRドメイン、またはその断片を含む、請求項46に記載のSAR。
  49. 前記第1のポリペプチド鎖および前記第2のポリペプチド鎖が、1つまたは複数のジスルフィド結合を介して連結されている、請求項44または45に記載のSAR 。
  50. 第1および/または第2のペプチドリンカーが、2つのポリペプチド鎖の発現、親和性および/または対合を増加させる変異を含む、請求項45に記載のSAR 。
  51. 、配列番号3536~3569および9627~9631のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含む、請求項45に記載のSAR 。
  52. 前記第1のポリペプチドが、前記第1のMAMのN末端側に第1のヒンジドメインまたはその断片をさらに含む、請求項44に記載のSAR。および/または第2のポリペプチドは、第2のMAMのN末端に第2のヒンジドメインまたはその断片をさらに含む。
  53. 前記第1のMAMと前記第2のMAMの残基、および/または前記第1のヒンジドメインの残基と前記第2のヒンジドメインの残基との間のジスルフィド結合を含む、請求項44に記載のSAR。
  54. 前記第1のポリペプチドが、前記第1のヒンジドメインのN末端側に第1の相同抗原結合ドメインまたはその断片をさらに含む、および/または前記第2のポリペプチドが、前記第1のヒンジドメインのN末端側に第2の相同抗原結合ドメインまたはその断片をさらに含む、請求項44に記載のSAR。第2のヒンジドメインでは、2つの相同抗原結合ドメインは、対応するヒンジドメインと同じ天然に存在する非T細胞受容体に由来する。
  55. が、第1のMAMを含む第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端に任意の活性化ドメインを含む第1のサイトゾルドメインをさらに含む、請求項44に記載のSAR。および/または第2のポリペプチドは、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端に任意の活性化ドメインを含む第2のサイトゾルをさらに含む。
  56. 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1のMAMの第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側にある共刺激ドメイン配列を含む第1のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含む、請求項44に記載のSAR。および/または第2のポリペプチド鎖は、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に共刺激ドメイン配列を含む第2のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含む。
  57. 前記共刺激ドメインが、 CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEMもしくはICOS、または変異体もしくはその断片。
  58. 前記第1および/または第2のMAMおよびNTCRMが、非T細胞受容体の膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意のヒンジドメインおよび/または任意の細胞外ドメインから構成される、請求項44に記載のSAR。または信号アダプター。
  59. 前記第1および/または第2のMAMおよびNTCRMが、すべて単一の非結合ドメインに由来する、膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意のヒンジドメイン、および/または任意の細胞外ドメインから構成される、請求項58に記載のSAR。 T細胞受容体および/またはシグナル伝達アダプターまたはその変異体。
  60. 前記第1および/または第2のMAMおよびNTCRMが、異なる非T細胞に由来する膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意のヒンジドメイン、および/または任意の細胞外ドメインから構成される、請求項58に記載のSAR。受容体および/またはシグナル伝達アダプターまたはそれらの変異体。
  61. 、および/または任意の細胞外ドメインが配列において同一であり、同じタンパク質に由来する、請求項58に記載のSAR。
  62. 前記2つの膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意の共刺激ドメイン、任意のヒンジドメイン、および/または任意の細胞外ドメインが、配列が異なり、かつ/または異なるタンパク質に由来する、請求項58に記載のSAR。
  63. 請求項58に記載のSARであって、
    a) T細胞受容体は天然に存在する受容体であり、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4からなる群から選択される。 、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、 TNFR -II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、前述のいずれかの変異体、およびそれらの断片;と
    b) 前述のいずれかの変異体、およびそれらの断片からなる群から選択される。
  64. 請求項44に記載のSARであって、
    a) 第1のMAMおよび第2のMAMは、CD3ε、CD3γ、CD3δまたはCD3εから選択されるCD3鎖の膜貫通ドメインおよび場合によりサイトゾルドメインを含まない。および/または
    b) 第1のMAMおよび第2のMAMは、TCR鎖およびCD3鎖の膜貫通ドメインを含まない。および/または
    c) 第一のMAMと第二のMAMはCD3ζの膜貫通ドメインを含まない。
  65. 前記MAMのうちの1つだけが、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、およびプレTCRαからなる群から選択されるT細胞受容体に由来する、請求項44に記載のSAR。
  66. 少なくとも2つの鎖を含み、
    a)第1のポリペプチド鎖は、vLドメインを含む第1の抗原結合ドメインと、TCRα、TCRβ、TCRγもしくはTCRδまたはその変異体から選択される第1のTCR定常鎖とを含み;と
    b)第2のポリペプチド鎖は、vHドメインと、TCRα、TCRβ、TCRγもしくはTCRδまたはその変異体から選択される第2のTCR定常鎖とを含む第2の抗原結合ドメインを含み;
    ここで、最初の TCR 定常鎖は TCRα の定常鎖であり、2 番目の TCR 定常鎖は TCRβ の定常鎖、または
    ここで、最初の TCR 定常鎖は TCRβ の定常鎖であり、2 番目の TCR 定常鎖は TCRα の定常鎖、または
    ここで、最初の TCR 定常鎖は TCRγ の定常鎖であり、2 番目の TCR 定常鎖は TCRδ の定常鎖、または
    ここで、最初の TCR 定常鎖は TCRδ の定常鎖であり、2 番目の TCR 定常鎖は TCRγ の定常鎖、または
    ここで、第1のTCR定常鎖および/または第2のTCR定常鎖は、そのN末端領域のアミノ酸残基を欠いている
    ここで、vLおよびvHドメインは、標的抗原に特異的に結合するFv様抗原結合モジュールを形成し;と
    ここで、第1のTCR定常鎖および第2のTCR定常鎖は、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化する、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員することができるT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成する。
  67. 請求項66に記載のSARであって、
    a) TCRα定常鎖は、配列番号(PRT):7863~7963のアミノ酸配列、またはそれと80~99%の相同性を有する配列によって表される。と
    b) TCRβ定常鎖は、 SED ID NO(PRT):7964~8089のアミノ酸配列、またはそれに対して80~99%の相同性を有する配列によって表される。と
    c) TCRγ定常鎖は、配列番号(PRT):8091~8191のアミノ酸配列、またはそれに対して80~99%の相同性を有する配列によって表される。と
    d) TCRδ定常鎖は、SED ID NO(PRT):8192~8292のアミノ酸配列、またはそれに対して80~99%の相同性を有する配列によって表される。
  68. 前記第1および/または第2のポリペプチド鎖が、第1および/または第2のポリペプチド鎖のN末端またはN末端付近に結合する1つまたは複数の自律抗原結合ドメイン(AABD)をさらに含む、請求項44または66に記載のSAR 。 2番目の抗原結合ドメイン。
  69. 前記AABDが、単一vHドメイン(SVH)、単一vLドメイン(SVL)、vHHドメイン、単一ドメイン抗体、TCRの単一可変ドメイン(svd)のうちの1つ以上から選択される、請求項68に記載のSAR。 -TCR)、非免疫グロブリン抗原結合足場、受容体のリガンド結合ドメイン、リガンドの受容体結合ドメイン、自己抗原、アダプター結合ドメイン、Fc結合ドメイン、その断片、および/またはその変形。
  70. 1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含むモジュールが、a)細胞表面タンパク質抗原、b)ペプチド/MHC複合体、およびc)脂質からなる群から選択される1つまたは複数の標的抗原に特異的に結合する、請求項1に記載のSAR。抗原。
  71. 前記標的抗原が、CD19、CD19、およびCD19からなる群から選択される、請求項1に記載のSAR。 CD123; CD22; CD30; CD171; CS-1 (CD2 サブセット 1、CRACC、SLAMF7、CD319、および 19A24 とも呼ばれます)。 C型レクチン様分子-1 (CLL-1またはCLECL1); CD33;上皮成長因子受容体バリアント III (EGFRviii);ガングリオシド G2 (GD2);ガングリオシドGD3; TNF 受容体ファミリーメンバー B 細胞成熟 (BCMA); Tn 抗原 ((Tn Ag); 前立腺特異的膜抗原 (PSMA); 受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体 1 (ROR1); FmsLike チロシンキナーゼ 3 (FLT3); 腫瘍関連糖タンパク質 72 (TAG72); CD38; CD44v6;急性白血病またはリンパ腫で発現するが造血前駆細胞では発現しないグリコシル化 CD43 エピトープ、非造血系癌で発現するグリコシル化 CD43 エピトープ、癌胎児性抗原 (CEA)、上皮細胞接着分子 (EPCAM)、B7H3 (CD276)、KIT (CD117) ; インターロイキン 13 受容体サブユニット アルファ-2 (IL-13Ra2 または CD213A2); メソセリン; インターロイキン 11 受容体アルファ (IL-11Ra); 前立腺幹細胞抗原 (PSCA); プロテアーゼ セリン 21 (テスティシンまたは PRSS21); 血管内皮増殖因子受容体 2 (VEGFR2); ルイス (Y) 抗原; CD24; 血小板由来成長因子受容体ベータ (PDGFR-ベータ); 胎児期特異的抗原-4 (SSEA-4); CD20; 葉酸受容体アルファ; 受容体チロシンタンパク質キナーゼ ERBB2 (Her2/neu); ムチン 1、細胞表面関連 (MUC1); 上皮成長因子受容体 (EGFR);神経細胞接着分子 (NCAM);プロスターゼ;前立腺酸性ホスファターゼ (PAP);伸長因子 2 変異 (ELF2M);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質アルファ (FAP);インスリン様成長因子 1 受容体 (IGF-1 受容体)、炭酸脱水酵素 IX (CA1X)。プロテアソーム (プロソーム、マクロペイン) サブユニット、ベータ タイプ、9 (LMP2);糖タンパク質 100 (gpl00);ブレークポイントクラスター領域 (BCR) とアベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ 1 (Abl) (bcr-abl) からなる癌遺伝子融合タンパク質。チロシナーゼ;エフリン A 型受容体 2 (EphA2);フコシルGM1;シアリルルイス接着分子 (sLe);ガングリオシドGM3;トランスグルタミナーゼ 5 (TGS5);高分子量黒色腫関連抗原 (HMWMAA); o-アセチル-GD2 ガングリオシド (OAcGD2);葉酸受容体ベータ。腫瘍内皮マーカー 1 (TEM1/CD248)。腫瘍内皮マーカー 7 関連 (TEM7R);クローディン 6 (CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR); G タンパク質共役受容体クラス C グループ 5、メンバー D (GPRC5D)。染色体 X オープン リーディング フレーム 61 (CXORF61); CD97; CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ (ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的 1 (PLAC1); globoH グリコセラミド (GloboH) の六糖部分。乳腺分化抗原 (NY-BR-1);ウロプラキン 2 (UPK2); A 型肝炎ウイルス細胞受容体 1 (HAVCR1);アドレナリン受容体ベータ 3 (ADRB3);パネキシン 3 (PANX3); G タンパク質共役受容体 20 (GPR20);リンパ球抗原 6 複合体、遺伝子座 K 9 (LY6K)。嗅覚受容体 51E2 (OR51E2); TCR ガンマ代替リーディング フレーム タンパク質 (TARP);ウィルムス腫瘍タンパク質 (WT1);がん/精巣抗原 1 (NY-ES0-1);癌/精巣抗原 2 (LAGE-1a);黒色腫関連抗原 1 (MAGE-A1); MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、PRAME、PSA、ETS 転座バリアント遺伝子 6、染色体 12p 上に位置 (ETV6-AML)。精子タンパク質 17 (SPA17); X抗原ファミリー、メンバー1A(XAGE1);アンジオポエチン結合細胞表面受容体 2 (Tie 2);黒色腫癌精巣抗原-1 (MAD-CT-1);黒色腫癌精巣抗原-2 (MAD-CT-2); Fos関連抗原1;腫瘍タンパク質 p53 (p53); p53 変異体。プロステイン;生き残っている。テロメラーゼ;前立腺癌腫瘍抗原-1 (PCT A-1 またはガレクチン 8)、T 細胞によって認識される黒色腫抗原 1 (MelanA または MARTI)。ラット肉腫 (Ras) 変異体。ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT);肉腫転座ブレークポイント;黒色腫アポトーシス阻害剤 (ML-IAP); ERG (膜貫通プロテアーゼ、セリン 2 (TMPRSS2) ETS 融合遺伝子); N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ V (NA17);ペアボックスタンパク質Pax-3 (PAX3);アンドロゲン受容体;サイクリン B1; v-myc 鳥骨髄細胞腫症ウイルス性腫瘍遺伝子神経芽細胞腫由来ホモログ (MYCN); Ras ホモログファミリーメンバー C (RhoC);チロシナーゼ関連タンパク質 2 (TRP-2);シトクロム P450 1B 1 (CYP1B 1); CCCTC 結合因子 (ジンクフィンガータンパク質) 様 (BORIS またはインプリント部位調節因子の兄弟)、T 細胞 3 (SART3) によって認識される扁平上皮癌抗原。ペアボックスタンパク質 Pax-5 (PAX5);プロアクロシン結合タンパク質sp32 (OY-TES1);リンパ球特異的プロテインチロシンキナーゼ(LCK);キナーゼアンカータンパク質 4 (AKAP-4)。滑膜肉腫、X ブレークポイント 2 (SSX2)。最終糖化生成物 (RAGE-1) の受容体。腎臓ユビキタス 1 (RU1);腎臓ユビキタス 2 (RU2);レグマイン。ヒトパピローマウイルス E6 (HPV E6);ヒトパピローマウイルス E7 (HPV E7);腸のカルボキシルエステラーゼ。熱ショックタンパク質 70-2 変異 (mut hsp70-2)。 CD79a; CD79b; CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体 1 (LAIR1); IgA 受容体の Fc フラグメント (FCAR または CD89)。白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリー A メンバー 2 (LILRA2); CD300 分子様ファミリーメンバー f (CD300LF); C 型レクチンドメインファミリー 12 メンバー A (CLEC12A);骨髄間質細胞抗原 2 (BST2); EGF 様モジュールを含むムチン様ホルモン受容体様 2 (EMR2)。リンパ球抗原 75 (LY75);グリピカン-3 (GPC3); Fc受容体様5 (FCRL5);免疫グロブリン ラムダ様ポリペプチド 1 (IGLL1)、MPL、ビオチン、c-MYC エピトープ タグ、CD34、LAMP1 TROP2、GFRalpha4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea (CA19.9; シアリル ルイス抗原) フコシル- GM1、PTK7、gpNMB、CDH1-CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL11Ra、IL13Ra2、CD179b-IGLl1、ALK TCRガンマデルタ、NKG2D、CD32 (FCGR2A)、Tn ag、CSPG4-HMW-MAA、Tim1-/HVCR1、 CSF2RA (GM-CSFR-alpha)、TGFbetaR2、VEGFR2/KDR、Lews Ag、TCR-beta1 鎖、TCR-beta2 鎖、TCR-γ 鎖、TCR-δ 鎖、FITC、黄体形成ホルモン受容体 (LHR)、卵胞刺激ホルモン受容体(FSHR)、絨毛性ゴナドトロピンホルモン受容体(CGHR)、CCR4、GD3、SLAMF6、SLAMF4、HIV1エンベロープ糖タンパク質、HTLV1-Tax、CMV pp65、EBV-EBNA3c、インフルエンザA型ヘマグルチニン(HA)、GAD、PDL1、グアニリルシクラーゼC (GCC)、デスモグレイン 3 に対する自己抗体 (Dsg3)、デスモグレイン 1 に対する自己抗体 (Dsg1)、HLA、HLA-A、HLA-A2、HLA-B、HLA-C、HLA-DP、HLA-DM、HLA-DOA 、HLA-DOB、HLA-DQ、HLA-DR、HLA-G、IGE、CD99、RAS G12V、組織因子 1 (TF1)、AFP、GPRC5D、claudin18.2 (CLD18A2 OR CLDN18A.2)、P-糖タンパク質、 STEAP1、LIV1、NECTIN-4、CRIPTO、GPA33、BST1/CD157、低コンダクタンス塩素チャネル、および SARS-CoV2 スパイクタンパク質。
  72. コードされたSARポリペプチドが、以下からなる群から選択される1つまたは複数の異種抗原結合ドメインを含む、請求項1に記載のSAR。
    (i) 配列番号2682~2918のいずれかに記載の配列もしくはそれと少なくとも80%の同一性を有する配列、または3つの相補性決定において少なくとも80%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域(vH)配列番号2682~2918のいずれか1つ以上に示される配列、または配列番号2682のいずれか1つ以上に示される配列の3つのCDRにおいて3つ未満の置換を有する配列に対する領域(CDR) -2918、またはvHに属し、それぞれ配列番号11593~11829、11830~12066、12067~12303で示されるCDR1、CDR2およびCDR3に3つ未満の置換を有する配列、または結合する配列配列番号2682~2918のいずれか1つ以上に記載され、その抗原に結合するポリペプチドをコードする配列として、同じ標的抗原または標的抗原上の同じエピトープに対して;
    番号2440~2676のいずれか1つに示される配列、または配列番号2440~2676のいずれか1つ以上に示される配列に対して少なくとも80%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域(vL) : 2440~2676、または配列番号2440~2676のいずれか1つ以上に記載の配列と3つの相補性決定領域(CDR)において少なくとも80%の同一性を有する配列、または3つの配列のうち3つ未満の置換を有する配列配列番号12440~2676のいずれか1つ以上に示される配列のCDR、またはvLに属し、配列番号10882~11118に示されるCDR1、CDR2、およびCDR3に3つ未満の置換を有する配列のCDR 、11119~11355および11356~11592をそれぞれコードする配列、または配列番号2440~2676のいずれか1つ以上に示される配列として同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合する配列。その抗原に結合するポリペプチド。
    (iii)配列番号2924~3160のいずれか1つに記載の配列もしくはそれと少なくとも80%の同一性を有する配列、または6つの相補性において少なくとも70%の同一性を有する配列を含む単鎖可変断片(scFv)配列番号2924~3160のいずれか1つ以上に示される配列、または配列番号2924~3160のいずれか1つ以上に示される配列の6つのCDRにおいて6個未満の置換を有する配列に対する決定領域(CDR)と、 2924~3160、またはscFVを含むvHに属し、それぞれ配列番号11593~11829、11830~12066、12067~12303に示されるCDR1、CDR2およびCDR3に3つ未満の置換を有する配列およびそれ以下を含むvLに属する軽鎖CDR1、CDR2、およびCDR3の3つの置換よりも、 scFvおよびscFvは、それぞれ配列番号10882~11118、11119~11355および11356~1159で示されるか、またはいずれか1つ以上の配列として同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合する配列である。配列番号2924~3160の、その抗原に結合するポリペプチドをコードするもの;
    (iv)配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つに記載の配列、または少なくとも70 %の同一性を有する配列を含む、単一ドメイン抗体、vHHドメイン、SVH、および/またはFHVHドメイン配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上に示される配列、および/または3つの相補性決定領域(CDR)においていずれか1つまたは複数に示される配列と少なくとも70%の同一性を有する配列配列番号3210~3353、10695~10713、または配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上に記載の配列の3つのCDRに3つ未満の置換を有する配列、または配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上の配列配列番号3210~3353、10695~10713のいずれか1つ以上に示される配列として同じ標的抗原または標的抗原上の同じエピトープに結合し、その抗原に結合するポリペプチドをコードするもの;
    配列番号3366~3377のいずれか1つのポリヌクレオチド、または配列番号3366~3377のいずれか1つもしくは複数に記載の配列と少なくとも70%の同一性を有する配列によってコードされる非免疫グロブリン足場配列番号3366~3377のいずれか1つ以上に示される配列と同じ標的抗原または標的抗原上の同じエピトープに結合するもの;
    (vi)配列番号3378~3395、3880、3882、3886、3893、3896、3897のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含む受容体のリガンド結合ドメインであって、その同族体に結合するポリペプチドをコードする。
    (vii)配列番号3396~3406、10786~10787のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含み、その同族体に結合するポリペプチドをコードするリガンドの受容体結合ドメイン;
    (viii)配列番号3407~3435、10771~10780のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含み、そのアダプターに結合するポリペプチドをコードするアダプター結合ドメイン;
    (ix)配列番号10788~10791のいずれか1つに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含み、その自己抗体または自己抗体産生細胞に結合するポリペプチドをコードする自己抗原;
    (x)配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれかに記載の配列、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を含むTCR可変領域(Va、Vb、VgまたはVd)、または3つの相補性決定領域(CDR)において、配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれか1つ以上に記載の配列、または3つ未満の置換を有する配列と少なくとも70%の同一性を有する配列。配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれか1つ以上に示される配列、または配列セットと同じ標的抗原もしくは標的抗原上の同じエピトープに結合する配列の3つのCDR第4に、配列番号3357~3364、9606~9614、10781~10782のいずれか1つ以上において、その抗原に結合するポリペプチドをコードするもの;と
    (xi)配列番号9613~9614のいずれかに記載の配列、またはそれに対して少なくとも70%の同一性を有する配列、または3つの相補性において70~99%の同一性を有する配列を含む単一可変TCRドメイン(svd-TCR)配列番号9613~9614のいずれか1つ以上に示される配列、または配列番号9613のいずれか1つ以上に示される配列の3つのCDRにおいて3つ未満の置換を有する配列に対する決定領域(CDR) -9614、または配列番号9613~9614のいずれか1つまたは複数に記載の配列と同じ標的抗原または標的抗原上の同じエピトープに結合し、その抗原に結合するポリペプチドをコードする配列。
  73. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターもしくはその断片が、配列番号3743~3966、3385、3394、7818~7822、9633~9859から選択される配列、または配列から選択される配列を含む、請求項2または58に記載のSAR 。それに対する配列に対して70%の相同性を有する。
  74. 受容体のヒンジドメイン、膜貫通ドメインおよびサイトゾルドメインおよび/またはシグナル伝達アダプターを含むポリペプチドが、配列番号9669~9704、3813、8721、8733および8746、またはそれに対する配列に対して70%の相同性を有する配列。
  75. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターの膜関連ドメインが、配列番号3914~3928、9741~9776、9852~9855から選択される配列、または配列から選択される配列を含む、請求項1、2、または58に記載のSAR 。それに対する配列に対して70%の相同性を有する。
  76. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターのサイトゾルドメインが、配列番号3944~3958、9777~9812、9856~9859から選択される配列、または70を有する配列を含む、請求項1、2または58に記載のSAR 。配列に対する相同性%。
  77. 天然に存在する受容体および/またはシグナル伝達アダプターの活性化ドメインが、配列番号9856~9859および9777から選択される配列、またはその配列に対して70%相同性を有する配列を含む、請求項16または55に記載のSAR 。
  78. 前記共刺激ドメインが、配列番号9807~9810から選択される配列、またはその配列に対して70%の相同性を有する配列を含む、請求項9、48 、および56に記載のSAR 。
  79. 各鎖のN末端に存在するリーダー配列またはシグナルペプチドをさらに含み、場合により配列番号2425~2430からなる群から選択される配列を含む、請求項1に記載のSAR。
  80. 前記SARがSARヘテロ二量体を含む、請求項1に記載の単離されたSARポリペプチド。
  81. 切断可能なリンカーによって連結された2つのSAR鎖を含む、請求項1または80に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  82. 前記切断可能リンカーが自己切断性切断可能リンカーである、請求項81に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  83. 前記切断可能なリンカーが、2Aリンカー、2A様リンカー、またはそれらの機能的等価物のいずれか1つ以上である、請求項82に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  84. 前記切断可能なリンカーが、T2Aリンカー、P2A、F2A、E2Aリンカー、またはそれらの機能的等価物のいずれか1つ以上である、請求項83に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  85. 前記切断可能なリンカーが、配列番号3627~3632のいずれか1つ以上の配列を含む、請求項84に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  86. 前記切断可能なリンカーが、必要に応じて、フリン切断部位、フリン様切断部位、またはそれらの機能的等価物によって先行される、請求項84に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  87. 前記切断可能リンカーに先行するフリン切断部位が、配列番号3635~3636のいずれか1つ以上の配列を含む、請求項86に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  88. 前記切断可能なリンカーの前に柔軟なリンカーが存在する、請求項86~87のいずれか一項に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  89. 切断可能なリンカーに先行する柔軟なリンカーが、1つ以上のSer-Glyリンカーまたはその機能的等価物をコードする、請求項88に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  90. 切断可能なリンカーに先行する柔軟なリンカーが配列番号3633~3634の配列を含む、請求項89に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  91. フリン切断部位-フレキシブルリンカーの順序となるように、フリン切断部位の後にフレキシブルリンカーが続き、その次に切断可能なリンカーが続く、請求項88~90のいずれか一項に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。 -切断可能なリンカー。
  92. 前記SARが、選択された抗原に対して所望の結合親和性を有するように設計されている、請求項1または80に記載の単離された合成抗原受容体(SAR)ポリペプチドまたはポリペプチドヘテロ二量体。
  93. からなる群から選択されるポリペプチドを含むアクセサリーモジュールをさらに発現する、請求項1に記載のSAR:
    a) サイトカインまたはその変異体;
    b) 膜アンカー型サイトカイン。
    c) エピトープタグを有する膜アンカー型サイトカイン。
    d)自殺、生存、マーカー機能として機能する多目的スイッチ。
    e) シグナル伝達アダプター分子。と
    f) キルスイッチ。
  94. 請求項93に記載のアクセサリモジュールであって、
    a) サイトカインは、配列番号7833~7842の配列、またはそれに対して最大70%の配列相同性を有する変異体を含み、そして
    b) 膜アンカー型サイトカインは、配列番号7825~7832の配列、またはそれに対して最大70%の配列相同性を有する変異体を含み、
    c) 多目的スイッチは、配列番号7843~7850の配列、またはそれに対して70%の配列相同性を有する変異体を含み、
    d) アダプターは、CD3ζ、FcRγ、DAP10、および DAP12 のグループから選択されます。
  95. 式: を有する、請求項94に記載の多目的スイッチを含むポリペプチド:
    SP-D1-L1-D2-L2-D3-L3-D4;ここで
    SP は、多目的スイッチの細胞表面輸送を可能にするオプションのシグナルペプチドであり、切断されて成熟ペプチドが生成されます。
    D1は細胞の生存を促進する受容体に結合する受容体結合ドメインであり、
    D2 はマーカー/自殺ドメインであり、
    は、D1 および D2 ドメインが標的細胞の表面から突き出ることを可能にするヒンジ ドメイン/ストーク ドメインです。
    D4 は多目的スイッチを細胞膜に固定する膜結合ドメインです。
    L1、L2、および L3 はオプションのリンカーです。
  96. 前記多目的スイッチポリペプチドが、第1のモジュール(D1)、(D2)、(D3)および(D4)のインフレーム融合を含む、請求項95に記載のポリペプチド。
  97. 請求項96に記載のポリペプチドであって、
    a) D3 モジュールと D4 モジュールは同じ内因性タンパク質に由来します。また
    b) D2、D3、および D4 モジュールは、異なる内因性タンパク質に由来します。また
    c) D3 と D4 は同じ内因性タンパク質に由来します。また
    d) D3 と D4 は、異なる内因性タンパク質に由来します。
  98. 第1のモジュール(D1)が細胞表面上で発現される受容体に結合する、請求項95に記載のポリペプチド。
  99. 前記受容体が結合すると、生存促進および/または増殖シグナルを細胞に伝達する、請求項98に記載のポリペプチド。
  100. シスで前記受容体に結合する、および/または前記第1のモジュールが前記受容体にトランスで結合する、請求項98に記載のポリペプチド。
  101. 第1のモジュール(D1)が、サイトカイン、ケモカイン、リガンド、またはそれらの変異体もしくは断片の受容体結合ドメインを含む、請求項95に記載のポリペプチド。
  102. 前記D1が、IL2、IL4、IL6、IL7、IL9、IL10、IL11、IL12、IL15、IL18 、 IL21 、CD40L、4-1BBL、CD30L、OX40L、FLT3-L、APRIL、BAFF、Rantes、MIP、エリスロポエチン、トロンボポエチン、SCF(幹細胞因子)、G-CSF、GM-CSF、M-CSF、のバリアント前述のいずれか、および前述のいずれかの断片。
  103. 前記D1が、配列番号7833~7842で表される配列を有するポリペプチド、またはそれと少なくとも70%の同一性を有する変異体を含む、請求項101に記載のポリペプチド。
  104. 前記D1が、受容体に結合できる抗体、抗体フラグメント、単一ドメイン抗体、一本鎖抗体、scFv、または非免疫グロブリン抗原結合モジュールを含む、請求項95に記載のポリペプチド。
  105. 前記D1が、IL2R、IL6R、IL7R、IL9R、IL10R、IL11R、IL12R、IL15R、IL18、IL21 CCR1、CCR3、CCR5、MIP-1Rからなる群から選択される受容体に結合する、請求項95または104に記載のポリペプチド。 、PF4 受容体、エリスロポエチン受容体 (Epo-R)、TPO-R/MPL、GSF-R、c-Kit、および M-CSF 受容体。
  106. D2が非内因性ポリペプチドを含む、請求項95に記載のポリペプチド。
  107. 前記D2が、内在性タンパク質の細胞外ドメインまたはその変異体もしくは断片を含む、請求項95に記載のポリペプチド。
  108. 前記D2が、以下の内因性タンパク質またはその変異体もしくは断片のうちの1つ以上の細胞外ドメインを含む、請求項95に記載のポリペプチド。 CD19; CD123; CD22; CD30; CD38、CD52、CD171; CS1 (SLAMF7、CD319); C型レクチン様分子-1 (CLL-1またはCLECL1); CD33;上皮成長因子受容体バリアント III (EGFRviii);ガングリオシド G2 (GD2);ガングリオシドGD3; BCMA; Tn 抗原 (Tn Ag);前立腺特異的膜抗原 (PSMA);受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体 1 (ROR1)。 FMS 様チロシンキナーゼ 3 (FLT3);腫瘍関連糖タンパク質 72 (TAG72); CD38; CD44v6;癌胎児性抗原 (CEA);上皮細胞接着分子 (EPCAM); B7H3 (CD276);キット (CD117);インターロイキン 13 受容体サブユニット アルファ 2 (IL-13Ra2 または CD213A2)。メソテリン;インターロイキン 11 受容体アルファ (IL-11Ra);前立腺幹細胞抗原 (PSCA);プロテアーゼ セリン 21 (テスティシンまたは PRSS21);血管内皮増殖因子受容体 2 (VEGFR2);ルイス(Y)抗原; CD24;血小板由来増殖因子受容体ベータ (PDGFR-ベータ);段階特異的胚抗原-4 (SSEA-4); CD20;葉酸受容体アルファ (FRα または FR1);葉酸受容体ベータ (FRb);受容体チロシンプロテインキナーゼ ERBB2 (Her2/neu);ムチン 1、細胞表面関連 (MUC1)。上皮成長因子受容体 (EGFR);神経細胞接着分子 (NCAM);エフリンB2;線維芽細胞活性化タンパク質アルファ (FAP);インスリン様成長因子 1 受容体 (IGF-1 受容体)、炭酸脱水酵素 IX (CA1X)。エフリン A 型受容体 2 (EphA2);シアリルルイス接着分子 (sLe);ガングリオシドGM3;高分子量黒色腫関連抗原 (HMWMAA); o-アセチル-GD2 ガングリオシド (OAcGD2);腫瘍内皮マーカー 1 (TEM1/CD248)。腫瘍内皮マーカー 7 関連 (TEM7R);クローディン 6 (CLDN6);甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR); G タンパク質共役受容体クラス C グループ 5、メンバー D (GPRC5D)。 CD97; CD179a;未分化リンパ腫キナーゼ (ALK);ポリシアル酸;胎盤特異的 1 (PLAC1); globoH グリコセラミド (GloboH) の六糖部分。乳腺分化抗原 (NY-BR-1);ウロプラキン 2 (UPK2); A 型肝炎ウイルス細胞受容体 1 (HAVCR1);アドレナリン受容体ベータ 3 (ADRB3);パネキシン 3 (PANX3); G タンパク質共役受容体 20 (GPR20);リンパ球抗原 6 複合体、遺伝子座 K 9 (LY6K)。嗅覚受容体 51E2 (OR51E2); TCR ガンマ代替リーディング フレーム タンパク質 (TARP);アンドロゲン受容体; T 細胞によって認識される扁平上皮癌抗原 3 (SART3); CD79a; CD79b; CD72;白血球関連免疫グロブリン様受容体1 (LAIR1); IgA 受容体の Fc フラグメント (FCAR または CD89)。白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリー A メンバー 2 (LILRA2); CD300 分子様ファミリーメンバー f (CD300LF); C 型レクチンドメインファミリー 12 メンバー A (CLEC12A);骨髄間質細胞抗原 2 (BST2); EGF 様モジュールを含むムチン様ホルモン受容体様 2 (EMR2)。リンパ球抗原 75 (LY75);グリピカン-3 (GPC3); Fc受容体様5 (FCRL5);免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド1(IGLL1)、MPL、CD34、LAMP1 TROP2、GFRα4、CDH17、CDH6、NYBR1、CDH19、CD200R、Slea(CA19.9;シアリルルイス抗原);フコシル-GM1、PTK7、gpNMB、CDH1/CD324、DLL3、CD276/B7H3、IL-2R、IL-4R、IL-6R、IL11Ra、IL13Ra2、IL-17R、CD179b-IGLl1、TCRガンマデルタ、NKG2D、CD32 ( FCGR2A)、Tim1-/HVCR1、CSF2RA (GM-CSFR-alpha)、TGFbetaR2、Lews Ag、TCR-beta1 鎖、TCR-beta2 鎖、TCR-γ 鎖、TCR-δ 鎖、FITC、黄体ホルモン受容体 (LHR) 、卵胞刺激ホルモン受容体 (FSHR)、性腺刺激ホルモン受容体 (CGHR または GR)、CCR4、SLAMF6、SLAMF4、CD99、Ras G12V、組織因子 1 (TF1)、GPRC5D、Claudin18.2 (CLD18A2 または CLDN18A.2)、P -糖タンパク質、STRAP1、Liv1、ネクチン-4、Cripto、gpA33、BST1/CD157、低コンダクタンスクロライドチャネル(LCCC)、TAJ/TROY、MPL(TPO-R)、KIR3DL2、CD32b、CD229、Toso、PD-1、 PD-L1、PD-L2、TNFR1、TRAIL-R1 (DR4)、TRAIL-R2 (DR5)、CTLA4、IL-36R、CD25、LAG3、VEGF-A、MASP-2、胸腺間質リンホポエチン、組織因子、IFNAR1 、IL5、IL-6、IL-12、IL-23、IL-17A、IL-13、アンジオポエチン様3、CGRP、IL-23p19、vWF、C5、IFNγ、CD4、CD8、CD7、NKp30、NKp44、 NKp46、NKG2D、PDGRFα、α4β7インテグリン、α4インテグリン、VEGF、GPIIb/IIIa PCSK9、Blys、およびBAFF-R。
  109. 前記D2は、前記多目的スイッチを発現する細胞を検出、富化および/または死滅させるために使用できる薬剤によって結合され得る、請求項95に記載のポリペプチド。
  110. 前記薬剤が、抗体、抗体フラグメント、scFv、単一ドメイン抗体、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン、抗体薬物複合体、二重特異性抗体、またはその断片または細胞。
  111. D2に結合する薬剤がインビボまたはエクスビボでのヒト臨床使用が承認されている、請求項110に記載のポリペプチド。
  112. 前記薬剤が、リツキシマブ、ハーセプチン、エンヘルツ、エルビトラックス、アドセトリス、エンブレル、トレメリムマブ、モスネツズマブ、テクリスタマブ、ドナネマブ、スペソリマブ、ファリシマブ、ベランタマブ マフォドチン、ティスレリズマブ、ロンカツキシマブ テシリン、タファシタマブ、ペンブロリズマブ、ニボルマブ、Qbend10。
  113. 前記D3が、長さ5~100アミノ酸のストーク(ヒンジドメイン)配列を含む、請求項95に記載のポリペプチド。
  114. 配列番号(PRT):7843~7850、配列番号(PRT):9625、および配列番号:9620~9624によって表されるアミノ酸配列を含む、請求項95に記載のポリペプチド、またはそれらに対して少なくとも80%の相同性を有する変異体。 。
  115. 配列番号7843~7849として示される配列、または配列番号7843~7849として示される配列と少なくとも80%の同一性を有し、(i)結合するその変異体を含む、請求項95に記載のポリペプチド。 J6M0; (ii) ベランタマブ マフォドチンに結合し、(iii) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると生存を促進します。 (v) T 細胞または NK 細胞の表面で発現すると、ベランタマブ マフォドチンの存在下で細胞の死滅を誘導します。
  116. 配列番号9620~9624として示される配列、または配列番号9620~9624として示される配列と少なくとも80%の同一性を有し、(i)結合するその変異体を含む、請求項95に記載のポリペプチド。 Qベンド10; (ii) リツキシマブに結合し、(iii) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると生存を促進します。 (v) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると、リツキシマブの存在下で補体を介した細胞の死滅を誘導します。
  117. 配列番号9625として示される配列、または配列番号9625として示される配列と少なくとも80%の同一性を有し、(i)ハーセプチンに結合するその変異体を含む、請求項95に記載のポリペプチド。 (ii) Enhertu に結合し、(iii) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると、生存を促進します。 (v) T 細胞または NK 細胞の表面に発現すると、ハーセプチンまたはエネヘルツの存在下で細胞の死滅を誘導します。
  118. 請求項1に記載のSARおよび/または請求項93に記載の1つ以上のアクセサリーモジュールの第1および/または第2のポリペプチド鎖をコードする組換え核酸。
  119. アクセサリーと共発現される、請求項118に記載の組換えポリヌクレオチドを含む組換え発現系であって、前記アクセサリーモジュールが、短縮型上皮成長因子受容体(tEGFR)、短縮型上皮成長因子受容体viii(tEGFRviii)からなる群から選択される、組換え発現システム。 )、短縮型 CD30 (tCD30)、短縮型 BCMA (tBCMA)、短縮型 CD19 (tCD19)、CD34、チミジンキナーゼ、シトシン デアミナーゼ、ニトロレダクターゼ、キサンチン-グアニン ホスホリボシル トランスフェラーゼ、ヒト カスパーゼ 8、ヒト カスパーゼ 9、誘導性カスパーゼ 9 (icaspase9) 、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、リナマラーゼ/リナマリン/グルコースオキシダーゼ、デオキシリボヌクレオシドキナーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)/インドール-3-酢酸(IAA)、ガンマ-グルタミルシステインシンテターゼ、CD20/アルファCD20、CD34/チミジンキナーゼキメラ、dox依存性カスパーゼ- 2、変異型チミジンキナーゼ(HSV-TKSR39)、AP1903/Fasシステム、キメラサイトカイン受容体(CCR)、選択マーカー、多目的スイッチ、vFLIP-K13、vFLIP-MC159、4-1BBL-CD40L、DAP10、 DAP12、NKG2C、CD94、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ、ジヒドロキシ葉酸受容体(DHFR)、変異型DHFR、メチル化DNAタンパク質システインメチルトランスフェラーゼ、イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼII(IMDHP2)、ピューロマイシンアセチルトランスフェラーゼ(PAC)、ブラストサイジン耐性遺伝子、変異体カルシニューリン a/b (Can/b)、CNa12、CNb30、およびそれらの組み合わせ。
  120. SARの1つまたは2つの鎖および1つまたは複数のアクセサリーモジュールをコードする組換えポリヌクレオチドが、任意の柔軟なリンカー、任意のフリン切断部位またはフリン様切断部位、およびフリン様切断部位をコードするヌクレオチド配列によって連結されている、請求項119に記載の組換え発現システム。切断可能なリンカー。
  121. SARの1つまたは2つの鎖および1つまたは複数のアクセサリーモジュールをコードする組換えポリヌクレオチドが、以下を使用して発現される、請求項120に記載の組換え発現システム。
    i) 1つ以上のプロモーターと、
    ii) 1 つ以上の内部リボソーム侵入部位 (IRES);
    iii) 1つ以上の切断可能なリンカー;
    iv) i、ii、iii の任意の組み合わせ。
  122. 請求項121に記載の組換え発現システムであって、
    a) プロモーターは、MNDU3プロモーター、EF1αプロモーター、EFSプロモーター(配列番号8505)、EFS2プロモーター(配列番号8506)、RSVプロモーター(配列番号8507)、またはmutRSVプロモーター(配列番号8508)である。またはそれと70%の同一性を有する配列;と
    b) IRESは、K-IRES(配列番号8504)、またはそれと70%の同一性を有する配列である。
  123. 請求項118に記載の組換えポリヌクレオチドおよび請求項119に記載の組換え発現系を含む少なくとも1つのベクターであって、前記ベクターが、DNAベクター、RNAベクター、プラスミド、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、レトロウイルスベクターからなる群から選択される、少なくとも1つのベクター。 、バキュロウイルスベクター、スリーピングビューティートランスポゾンベクター、およびピギーバックトランスポゾンベクター。
  124. 1つ以上の構成的プロモーターまたは調節可能なプロモーターを含む、請求項123に記載のベクター。
  125. 前記プロモーターが、MNDU3プロモーター、EF1αプロモーター、 EFSプロモーター(配列番号8505)、EFS2プロモーター(配列番号8506)、RSVプロモーター(配列番号8507)、またはmutRSVプロモーター(配列番号8508) 、CMV IE遺伝子プロモーター、EF-1aプロモーター、ユビキチンCプロモーター、MSCV LTRプロモーター、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)プロモーター、または合成Notch(SynNotch)プロモーター。
  126. 前記ベクターがインビトロ転写ベクターであるか、または前記ベクターがポリ(A)テールもしくは3'UTRをさらに含む、請求項123に記載のベクター。
  127. 請求項1に記載の少なくとも1つのSARポリペプチドまたはヘテロ二量体、請求項118に記載の核酸、任意のアクセサリーモジュール、請求項119に記載の組換え発現系、および請求項123に記載のベクターを含む、エフェクター細胞または幹細胞。
  128. 前記細胞が複数の一本鎖または二本鎖SARポリペプチドを含む、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  129. 前記複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つの単鎖または二本鎖SARポリペプチドが、少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる抗原を標的とする、請求項128に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  130. 前記複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが同じ抗原を標的とする、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  131. 前記複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが、少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる抗原に対する結合親和性を含む、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  132. 前記複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが、少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる天然受容体またはシグナル伝達アダプターを含む、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  133. 前記複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが、少なくとも1つの他のSARポリペプチドとは異なる細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、サイトゾルドメインを有する、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  134. 前記複数のSARポリペプチドのうちの少なくとも1つのSARポリペプチドが活性化受容体であり、少なくとも1つの他のSARポリペプチドが抑制性受容体である、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  135. 前記複数のSARポリペプチドのうちの2つ以上のSARポリペプチドが活性化受容体であるか、または前記複数のSARポリペプチドのうちの2つ以上のSARポリペプチドが阻害性受容体である、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  136. うちの2つ以上のSARポリペプチドが、異なるシグナル伝達アダプターを動員し、および/または異なるシグナル伝達経路を活性化する、請求項127に記載のエフェクター細胞または幹細胞。
  137. 前記エフェクター細胞が、α/β T細胞、γ/δ T細胞、CD8 + T細胞、CD4 + T細胞、メモリーT細胞、ナイーブ細胞である、請求項127~136のいずれか一項に記載のエフェクター細胞または細胞。 T細胞、T幹細胞、Treg細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、iNKT(先天性ナチュラルキラー細胞)、NK細胞、g-NK細胞、記憶様NK細胞、サイトカイン誘導性キラー細胞(CIK)、iPSC、改変型HLA欠損iPSC、iPSC由来NK細胞、iPSC由来T細胞、B細胞、マクロファージ/単球、顆粒球、樹状細胞、不死化細胞株、不死化NK細胞株、NK92細胞株、NK92MI細胞株、YTS細胞またはその誘導体。
  138. 複数の多様なSARポリペプチドを含む、請求項127~137のいずれか一項に記載のエフェクター細胞の集団。
  139. 前記複数の多様なSARポリペプチドが異なる配列を含むが、同じ標的抗原または異なる抗原に結合する、請求項138に記載の免疫細胞またはエフェクター細胞の集団。
  140. 請求項123に記載の少なくとも1つのベクターまたは請求項118に記載の少なくとも1つの組換えポリヌクレオチドを、エフェクター細胞、細胞株、造血幹細胞、前駆細胞、または細胞に導入することを含む、請求項127に記載のSAR発現エフェクター細胞を作製する方法。 SARポリペプチドおよび任意のアクセサリーモジュールが発現されるような条件下で、エフェクター細胞を生じさせることができるIPSC。
  141. 前記エフェクター細胞が、機能的TCR、機能的HLA、β2マクログロブリン、 TAPI、TAP2、タパシン、NLRC5、CIITA、RFXANK、CIITA、RFX5、RFXAP、TCRαもしくはβの発現を欠いているか、または発現が低い、請求項127に記載のエフェクター細胞。定常領域、NKG2A、NKG2D、CD38、CD5、CD52、CD33、CD123、CLL-1、CIS、CBL-B、SOCS2、PD1、CTLA4、LAG3、TIM3、TIGIT、または染色体6p21領域内の任意の遺伝子;および/またはHLA-E、41BBL、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ、DAP10、DAP12、CD4、CD8、CD16、CD47、CD94、CD113、CD131、CD137、CD80、 PDL1、A2AR、Fc受容体、エンゲージャー、または二重特異性または多重特異性またはユニバーサルエンゲージャーと結合するための表面トリガー受容体。
  142. 第1の内因性TCRサブユニットおよび/または第2の内因性TCRサブユニットの発現を遮断または減少させるようにエフェクター細胞が修飾されている、請求項127に記載のエフェクター細胞。
  143. T細胞受容体(TCR)および/またはCD3ε、CD3γもしくはCD3δを発現せず、非TCR抗原認識ドメインおよびT細胞受容体を含む組換え二本鎖SARを発現するように組換え発現によって修飾されている、請求項127に記載のエフェクター細胞。細胞受容体モジュール(TCRM)において、前記細胞はCD3鎖CD3γ、CD3δ、 CD3εおよびCD3εを発現し、CD3鎖およびSARは細胞の表面に位置する機能的CD3-SAR複合体を形成する。
  144. T細胞受容体(TCR)を発現せず、および/またはCD3ε、CD3γもしくはCD3δを発現せず、細胞にとって外因性の組換え二本鎖TCRを発現するように組換え発現によって修飾されている、請求項127に記載のエフェクター細胞であって、前記組換え細胞が、二本鎖TCRは、a) VαおよびVβドメイン、またはb) VγおよびVδドメインを含むTCR抗原認識ドメインと非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を含むSARである。
  145. 非T細胞受容体および/またはシグナル伝達に由来する第1のMAMおよび第2のMAMを含む非T細胞受容体モジュール(NTCRM)に任意のリンカーを介して作動可能に連結されたTCR抗原認識モチーフを含む、請求項144に記載のエフェクター細胞。アダプターを含み、さらに任意のサイトゾル共刺激ドメインを含む。
  146. NK細胞、g-NK細胞、記憶様NK細胞、サイトカイン誘導性キラー細胞(CIK)、iPSC、修飾HLA欠損iPSC、iPSC由来NKからなる群から選択される、請求項143~145に記載のエフェクター細胞。細胞、B細胞、顆粒球、マクロファージ/単球、樹状細胞、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、CD3γ、CD3δ、CD3εまたはCD3ζ鎖のうちの1つまたは複数が欠損しているT細胞、不死化細胞株、不死化NK細胞株、NK92細胞株、NK92MI細胞株、YTS細胞またはそれらの誘導体。
  147. 請求項127に記載のエフェクター細胞を生成する方法であって、インビトロ転写されたRNA(単数または複数)または合成RNA(単数または複数)を細胞または細胞集団に導入することを含み、前記RNA(単数または複数)が請求項118に記載の組換えポリヌクレオチドを含む、方法。
  148. 請求項127~146のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞を生じさせることができる有効量の免疫エフェクター細胞または幹細胞を対象に投与することを含む、対象に抗疾患免疫を提供する方法であって、前記細胞は、自己T細胞もしくは同種T細胞、または自己NK細胞もしくは同種NK細胞、または自己マクロファージもしくは同種マクロファージ、または自己顆粒球もしくは同種顆粒球、または自己樹状細胞もしくは同種樹状細胞、または、エフェクター細胞を生じさせることができる自己造血幹細胞もしくは同種造血幹細胞、あるいは自己もしくは同種異系iPSC。
  149. TAPI、TAP2、タパシン、NLRC5の発現を欠いているか、または発現が低い、請求項148に記載の方法。 、CIITA、RFXANK、CIITA、RFX5、RFXAP、TCRαまたはβ定常領域、NKG2A、NKG2D、CD38、CD5、CD52、CD33、CD123、CLL-1、CIS、CBL-B、SOCS2、PD1、CTLA4、LAG3、TIM3 、TIGIT、または染色体 6p21 領域内の任意の遺伝子。および/またはHLA-E、41BBL、CD3ε、CD3γ、CD3δ、CD3ζ、FcRγ、DAP10、DAP12、CD4、CD8、CD16、CD47、CD94、CD113、CD131、CD137、CD80、 PDL1、A2AR、Fc受容体、エンゲージャー、または二重特異性または多重特異性またはユニバーサルエンゲージャーと結合するための表面トリガー受容体。
  150. 標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、標的細胞を請求項127に記載のエフェクター細胞と接触させることを含み、SARが標的抗原に特異的に結合する方法。
  151. 前記標的細胞を、前記SAR発現エフェクター細胞上に発現される1つ以上の抗原および標的細胞上に発現される1つ以上の抗原に結合する1つ以上の薬剤と接触させるステップをさらに含む、請求項150に記載の方法。
  152. 前記薬剤が、SAR発現エフェクター細胞を、前記薬剤によって標的化される抗原を発現する標的細胞に向け直すことができる、請求項151に記載の方法。
  153. 前記薬剤が、抗体、抗体、抗体、抗原結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン断片、自律的抗原結合ドメイン、二重特異性エンゲージャー、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)、三重特異性エンゲージャー、三重特異性T細胞エンゲージャー、もしくは三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)、またはそれらの組み合わせ。
  154. 前記エフェクター細胞が、1つ以上の天然受容体の細胞外ドメインを含むSARを発現する、請求項151に記載の方法。
  155. が、CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1の群から選択される1つ以上の天然受容体の細胞外ドメインを含む、請求項154に記載の方法。 、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、 CD5 、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、および CD161。
  156. 請求項151に記載の方法、 ここで、薬剤は、抗体、抗体、抗原結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン断片、自律的抗原結合ドメイン、二重特異性エンゲージャー、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)であり、 SARを構成する天然受容体またはその変異体もしくは断片の1つまたは複数の細胞外ドメインに特異的に結合することができる少なくとも1つのドメインを含む、三重特異性エンゲージャー、三重特異性T細胞エンゲージャー、または三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)。
  157. 作用物質が以下に特異的に結合する、請求項151または156に記載の方法。
    a) SARを構成する1つ以上の天然受容体またはその変異体もしくは断片の細胞外ドメイン;および/または
    b) SAR の一部ではない1 つ以上の天然に存在する受容体の細胞外ドメイン。
  158. 前記薬剤が、1つ以上の天然に存在する共刺激受容体の細胞外ドメインに特異的に結合することができる、請求項151または157に記載の方法。
  159. 前記薬剤が、1つ以上の天然に存在する活性化受容体の細胞外ドメインに特異的に結合することができる、請求項151または157に記載の方法。
  160. 前記薬剤が、共刺激ドメインを含むSARの細胞外ドメインに特異的に結合することができる、請求項151または157に記載の方法。
  161. 前記薬剤が、活性化ドメインおよび共刺激ドメインを含むSARの細胞外ドメインに特異的に結合することができる、請求項151または157に記載の方法。
  162. し、前記薬剤が抗体、抗体、抗原結合ドメイン、非免疫グロブリン抗原結合ドメイン断片、自律的抗原結合ドメイン、二重特異性エンゲージャーである、請求項154または155に記載の方法。 、Fcドメインを含む、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、二重特異性キラーエンゲージャー(BiKE)、三重特異性エンゲージャー、三重特異性T細胞エンゲージャー、または三重特異性キラーエンゲージャー(TRiKE)。
  163. 前記Fc受容体が、CD16A、CD16B、CD64、CD32、またはその変異体もしくは断片のうちの1つ以上である、請求項162に記載の方法。
  164. 標的抗原が、表Bに列挙される抗原のうちの1つまたは複数である、請求項151に記載の方法。
  165. 生存、増殖、分化を調節する薬剤と組み合わせて、合成抗原受容体(SAR)分子を含む、請求項123~146のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞の有効量が対象に投与される、請求項148または149に記載の方法。および/または免疫細胞の有効性、ここで作用物質は、以下の1つ以上から選択される:
    a) プロテインホスファターゼ阻害剤。
    b) キナーゼ阻害剤。
    c) Lckキナーゼ阻害剤。
    d) SAR発現エフェクター細胞上に発現される1つ以上の抗原および標的細胞上に発現される1つ以上の抗原に結合する薬剤;
    e) サイトカイン。
    f) 免疫阻害分子の阻害剤;
    g) TREG細胞のレベルまたは活性を低下させる薬剤。
    h) SAR修飾細胞の増殖および/または存続を増加させる薬剤。
    i) ケモカイン。
    j) SARの発現を増加させる薬剤。
    k) SARの発現または活性の調節を可能にする薬剤;
    l) SAR修飾細胞の生存および/または持続の制御を可能にする薬剤。
    m) SAR 修飾細胞の副作用を制御する薬剤。
    n) Brd4阻害剤。
    o) 治療薬または予防薬を疾患の部位に送達する薬剤。
    p) SARの対象となる標的抗原の発現を増加させる薬剤。
    q) SAR と同時発現される多目的スイッチに結合するエージェント。と
    r) アデノシンA2a受容体アンタゴニスト。
  166. 請求項1に記載のSARポリペプチド分子、請求項118に記載のポリヌクレオチド、請求項119に記載のベクター、請求項127~146のいずれか一項に記載の細胞、および/または請求項151および165に記載の薬剤と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。 。
  167. 有効量の請求項166に記載の医薬組成物を個体に投与することを含む、それを必要とする個体における標的抗原関連疾患を予防または治療する方法。
  168. 前記標的抗原関連疾患が、増殖性疾患、前がん状態、癌、免疫疾患、アレルギー性疾患、変性疾患、感染症、および非抗原性疾患からなる群から選択される、請求項167に記載の方法。 -がん関連の適応症。
  169. 前記癌が、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性白血病、急性リンパ性白血病(ALL)、B細胞急性リンパ性白血病(B-ALL)、 T細胞急性リンパ性白血病(T-ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、B細胞性前リンパ性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞または大細胞濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性疾患、MALT リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫 (PEL)、多発性骨髄腫、骨髄異形成および骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞腫瘍、ワルデンストローム マクログロブリン血症、または前白血病。
  170. 前記癌が、結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝臓癌、肺の非小細胞癌、小腸の癌、腸管の癌からなる群から選択される、請求項168に記載の使用または方法。食道、黒色腫、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部のがん、皮膚または眼内の悪性黒色腫、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門部のがん、胃がん、精巣がん、子宮がん、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、膣癌、外陰癌、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、内分泌系癌、甲状腺癌、副甲状腺癌腺、副腎がん、軟部肉腫、尿道がん、陰茎がん、小児固形腫瘍、膀胱がん、腎臓または尿管のがん、腎盂がん、中枢腫瘍神経系(CNS)、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管形成、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、メルケル細胞がん、類表皮がん、扁平上皮がん、T細胞リンパ腫、環境誘発がん、上記の組み合わせ癌、および前記癌の転移病変。
  171. 前記疾患が、コロナウイルス、SARS-CoV2およびその変異体、HIV1、HIV2、HTLV1、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、サイトメガロウイルス(CMV)、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、BKウイルス、ヒトヘルペスウイルス6型、ヒトヘルペスウイルス8型インフルエンザウイルス、パラインフルエンザウイルス、鳥インフルエンザウイルス、MERSおよびSARSコロナウイルス、クリミアコンゴ出血熱ウイルス、ライノウイルス、エンテロウイルス、デング熱ウイルス、西ナイルウイルス、エボラウイルス、マールブルグウイルス、ラッサ熱ウイルス、ジカウイルス、RSV、麻疹ウイルス、ムンプスウイルス、ライノウイルス、水痘ウイルス、単純ヘルペスウイルス1型および2型、水痘帯状疱疹ウイルス、HIV-1、HTLV1、肝炎ウイルス、エンテロウイルス、肝炎B ウイルス、C 型肝炎ウイルス、ニパおよびリフトバレー熱ウイルス、日本脳炎ウイルス、メルケル細胞ポリオーマウイルス、または結核菌、非定型抗酸菌種、ニューモシスティス ジロベシ、トキソプラズマ症、リケッチア、ノカルジア、アスペルギルス、ムコール、またはカンジダの感染に関連している。
  172. 前記疾患が、糖尿病、多発性硬化症、関節リウマチ、尋常性天疱瘡、強直性脊椎炎、星本甲状腺炎、SLE、サルコイドーシス、強皮症、混合結合組織からなる群から選択される免疫疾患または変性疾患である、請求項168に記載の使用または方法。病気、移植片対宿主病、またはアルツハイマー病。
  173. ベクターでトランスフェクトまたは形質導入された細胞の表面上の多目的スイッチの発現を検出するステップを含む、請求項93に記載のSARをコードするベクターおよび多目的スイッチの形質導入効率を調べる方法。
  174. 請求項95に記載のSARを発現する細胞を選択するための方法であって、以下のステップを含む方法: i)請求項140に記載のベクターでトランスフェクトまたは形質導入された細胞の表面上の多目的スイッチの発現を検出するステップ;と
    (ii) 多目的スイッチを表現していると識別されたセルを選択します。
  175. 請求項174に記載の方法を使用して、細胞集団からSARを発現する細胞を選択するステップを含む、SARを発現する細胞が濃縮された精製細胞集団を調製する方法。
  176. 以下のステップを含む、請求項175に記載の方法。
    (i) エクスビボで単離された細胞集団に、請求項140に記載のベクターを形質導入またはトランスフェクトするステップと、と
    (ii) 請求項174に記載の方法により、形質導入/トランスフェクトされた細胞集団からSARを発現する細胞を選択するステップ。
  177. 請求項94~117に記載の多目的スイッチポリペプチドを発現する細胞が濃縮され、従ってSARを発現する細胞が濃縮された細胞集団。
  178. における請求項173のいずれかに記載の多目的スイッチポリペプチドの発現を検出するステップを含む、インビボで形質導入された細胞を追跡するための方法。
  179. 前記多目的スイッチを備える前記アクセサリモジュールに結合する薬剤に前記セルをさらすステップを含む、請求項127に記載のセルを削除する方法。
  180. 請求項179に記載の方法であって、
    a) 多目的スイッチは、配列番号7843~7850の配列またはそれと80%の相同性を有する変異体を含み、薬剤はベランタマブ・マフォドチンである。
    b) 多目的スイッチは、配列番号9620~9624の配列またはそれと80%の相同性を有する変異体を含み、薬剤はリツキシマブまたはCD20抗体であり、
    c) 多目的スイッチは配列番号9625の配列またはそれと80%の相同性を有する変異体を含み、薬剤はハーセプチン、エンヘルツ、またはHer2標的化抗体である。と
    d) 多目的スイッチは、配列番号7850の配列またはそれと80%の相同性を有する変異体を含み、薬剤はアドセトリスまたはCD30標的化抗体である。
  181. 請求項1に記載の少なくとも1つのSARポリペプチド分子、請求項93に記載のアクセサリーモジュール、請求項94に記載の多目的スイッチ、請求項118に記載の組換えポリヌクレオチド、請求項119に記載の組換え発現系、請求項123に記載のベクター、または請求項127に記載の細胞、請求項151および/または165に記載の薬剤、および請求項166に記載の組成物。
  182. 実施される、請求項140に記載の方法。 b)生体内;または c) ex vivoとin vivoの両方。
  183. 少なくとも2つの鎖を含み、
    a)第1のポリペプチド鎖は、VαまたはVγドメインを含む第1の抗原結合ドメインおよび第1の膜関連モジュール(MAM)を含む;と
    b)第2のポリペプチド鎖は、VβまたはVδドメインを含む第2の抗原結合ドメインおよび第2の膜関連モジュール(MAM)を含む;
    第1の抗原結合ドメインのVαまたはVγドメインと第2の抗原結合ドメインの相補的VβまたはVδドメインは、標的抗原に特異的に結合するTCR-Fv様抗原結合モジュールを形成し;と
    ここで、第1のMAMおよび第2のMAMは、少なくとも1つのシグナル伝達経路を活性化する、および/または少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員できる非T細胞受容体モジュール(NTCRM)を形成する。
  184. 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のMAMとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のMAMとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、請求項183に記載のSAR 。ママ。
  185. 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、個別に、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニットに由来する定常ドメインまたはその断片を含む、請求項184に記載のSAR。
  186. 前記第1のポリペプチドが、前記第1のMAMを含む第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に第1のサイトゾルドメインをさらに含む、請求項183に記載のSAR。および/または第2のポリペプチドは、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に第2のサイトゾルドメインをさらに含む。
  187. 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1のMAMの第1の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側にある共刺激ドメイン配列を含む第1のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含む、請求項183に記載のSAR。および/または第2のポリペプチド鎖は、第2のMAMを含む第2の膜貫通/膜アンカードメインのC末端側に共刺激ドメイン配列を含む第2のアクセサリー細胞内ドメインをさらに含む。
  188. 前記共刺激ドメインが、 CD28、4-1BB、OX40、2B4、CD27、CD81、CD2、CD5、BAFF-R、CD30、CD40、HVEMもしくはICOS、または変異体もしくはその断片。
  189. 前記第1および/または第2のMAMおよびNTCRMが、非T細胞受容体の膜貫通/膜アンカードメイン、任意のサイトゾルドメイン、任意のヒンジドメインおよび/または任意の細胞外ドメインから構成される、請求項183に記載のSAR。または信号アダプター。
  190. 請求項189に記載のSARにおいて、
    a) 非T細胞受容体は、 CD16A、CD16B、CD64、CD32、NKp30、NKp44、NKp46、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL4、KIR2DL4、KIR2DS1、 KIR2DS2、KIR2からなる群から選択される。 DS3 、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1、NKG2D、NKG2C、NKG2A、NKG2E、NKG2F、DNAM-1、2B4、OX40、CD28、4-1BB、CD27、CD81、CD2、CD5、TNFR-I、TNFR-II、Fas、 CD30 、CD40、CRTAM、TIGIT、CD96、SLAMF6、SLAMF7、CD100、CD160、CEACAM、ILT2、KLRG1、LAIR1、CD161、前述のいずれかの変異体およびその断片;および/または
    b) 前述のいずれかの変異体、およびそれらの断片からなる群から選択される。
  191. 非T細胞において発現されると、非T細胞にT細胞受容体様の標的結合認識及び/又は少なくとも1つのシグナル伝達アダプターの動員及び/又は少なくとも1つのシグナル伝達経路の活性化を与える、請求項183に記載のSAR。
  192. 前記対象がさらに治療有効量のチロシンキナーゼ阻害剤を投与される、請求項167に記載の方法。
    a) SAR発現エフェクター細胞を含む医薬組成物の投与による毒性を予防または逆転させる。および/または
    b) SAR を発現するエフェクター細胞の枯渇を防止または逆転します。
  193. 前記チロシンキナーゼ阻害剤がLck阻害剤である、請求項192に記載の方法。
  194. 前記チロシンキナーゼ阻害剤がダサチニブまたはポナチニブである、請求項192に記載の方法。
  195. 治療により、前記対象におけるT細胞によるIL-2の分泌が増加する、請求項192に記載の方法。
  196. 治療により、前記対象におけるT細胞のアポトーシスが減少する、請求項192に記載の方法。
  197. 治療が、PD-1、TIM-3、およびLAG-3からなる群から選択される少なくとも1つのT細胞枯渇マーカーの発現を減少させる、請求項192に記載の方法。
  198. 治療によりCD62LまたはCCR7の発現が増加する、請求項192に記載の方法。
  199. 複数サイクルの治療が前記対象に施される、請求項192に記載の方法。
  200. 前記チロシンキナーゼ阻害剤が断続的に投与される、請求項192に記載の方法。
  201. 前記チロシンキナーゼ阻害剤が、少なくとも部分的なT細胞機能を回復するのに十分な期間投与され、その後中止される、請求項192に記載の方法。
  202. 前記チロシンキナーゼ阻害剤が経口投与される、請求項192に記載の方法。
  203. 対象に投与される遺伝子操作されたT細胞に関連する毒性がサイトカイン放出症候群である、請求項192に記載の方法。
  204. 対象に投与される遺伝子操作されたT細胞に関連する毒性がオンターゲットオフ腫瘍毒性またはオフターゲットオフターゲット腫瘍毒性である、請求項192に記載の方法。
  205. 前記対象がヒトである、請求項192に記載の方法。
  206. T細胞の標的認識特性および機能を有するT細胞ではない細胞であって、
    a) TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδ、またはプレTCRの群から選択される1つまたはすべてのTCR定常鎖またはその断片の発現を欠き、および/または
    b) CD3ε、CD3γ、および/またはCD3δの群から選択される1つまたは複数のCD3鎖の発現を欠いている。および/または
    c) 機能的な TCR モジュール (TCRM) を形成する能力がありません。
  207. TCRMを含み、T細胞の細胞標的認識特性を与える二重鎖受容体を発現する、請求項206に記載の細胞。
  208. 標的抗原に特異的に結合するTCR-Fv抗原結合モジュールを形成することができる受容体を細胞表面上に発現することができる、請求項207に記載の細胞。
  209. TCR-Fvを構成する2つの可変ドメインが単一のポリペプチド鎖の一部ではない、請求項208に記載の受容体。
  210. TCR-Fvを構成する2つの可変ドメインが、
    a) VαとVβ、または
    b) VγとVδ。
  211. 標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、標的細胞を請求項206に記載のエフェクター細胞と接触させることを含み、細胞が標的抗原を特異的に認識する方法。
  212. 標的ペプチド抗原を発現する標的細胞を死滅させることができる、請求項210に記載の細胞。
  213. 請求項206に記載の細胞と薬学的に許容される担体とを含む薬学的組成物。
  214. 有効量の請求項206に記載の細胞または請求項213に記載の医薬組成物を個体に投与することを含む、それを必要とする個体における標的抗原関連疾患を予防または治療する方法。
  215. T細胞受容体様抗原認識を有する、請求項206に記載の非T細胞を作製する方法。
  216. TCR様抗原認識を有する非T細胞が、TCR様抗原認識を発現しない、請求項215に記載の方法。
    a) TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRδおよびpreTCRα鎖、または
    b) TCRα鎖とTCRβ鎖の二量体、または
    c) TCRγ鎖とTCRδ鎖の二量体、または
    d) preTCRα鎖とTCRβ鎖の二量体。
  217. 請求項215に記載の方法であって、前記方法は、
    a) TCR鎖の外因性発現、または
    b) CD3ε、CD3γ、およびCD3δの群から選択されるCD3鎖の外因性発現。
  218. 単一の遺伝子改変を含む、請求項215に記載の方法。
  219. 二本鎖受容体をコードする1つまたは2つの組換えポリヌクレオチドの導入を含む、請求項215に記載の方法。
  220. NK細胞、iNKT(先天性ナチュラルキラー細胞)、g-NK細胞、メモリー様NK細胞、サイトカイン誘導性キラー細胞(CIK)、iPSC、改変型HLA欠損iPSC、iPSC由来NKである、請求項210に記載の細胞。細胞、B細胞、マクロファージ/単球、顆粒球、樹状細胞、不死化細胞株、不死化NK細胞株、NK92細胞株、NK92MI細胞株、YTS細胞、NKG細胞株、またはそれらの誘導体。
  221. II型膜貫通タンパク質とI型膜貫通タンパク質またはN末端シグナルペプチドを有する分泌タンパク質との間の単離された融合タンパク質。
  222. I型膜貫通タンパク質またはN末端シグナルペプチドを有する分泌タンパク質の細胞外ドメインと融合したII型タンパク質のサイトゾル、膜貫通、および部分的または全体の細胞外ドメインを含む、請求項221に記載の単離された融合タンパク質。
  223. I型膜タンパク質またはN末端シグナルペプチドを有する分泌タンパク質の全部または一部の細胞外ドメインをコードするポリペプチドのN末端が、I型膜タンパク質のC末端に機能的に連結されている、請求項221に記載の単離された融合タンパク質。 N 末端から C 末端への配向の II 型タンパク質。
  224. 請求項221に記載の融合タンパク質を作製する方法であって、
    a)N末端シグナルペプチドを有するI型膜タンパク質または分泌タンパク質をコードするポリヌクレオチドの5’末端を、II型タンパク質の部分的または全体の細胞外ドメインをコードするヌクレオチドの3’末端にインフレームで融合させる工程;と
    b)融合タンパク質の発現を可能にするために、適切な細胞に組換えポリヌクレオチドを導入するステップ。
  225. 特定の抗原を標的とするキメラ抗原受容体または合成抗原受容体をコードする、請求項221に記載の単離された融合タンパク質。
  226. 請求項221に記載の融合タンパク質を発現する、請求項224によって作製された細胞、および薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物。
  227. 請求項226に記載の組成物を使用する治療方法。
  228. 配列番号1600~2328、4851~5129、5451~6282、7160~7170、7601~7747、8768~9602および10817~10830からなる群から選択される配列を含む合成免疫受容体をコードする組換えポリヌクレオチド、または上記のいずれか1つに記載の合成免疫受容体をコードするヌクレオチド配列に対して少なくとも75%の同一性を有する配列。
  229. 配列番号3994~4722、5151~5429、6283~7114、7852~7862、8293~8439、9860~10694、10832~10841、12304~からなる群から選択される合成免疫受容体ポリペプチドをコードするアミノ酸配列。 12311、または上記のいずれか1つに記載の合成免疫受容体をコードするアミノ酸配列と少なくとも75%の同一性を有する配列。
  230. アミノ(N)末端からカルボキシ(C)末端までの以下の一般式を有する2つ以上の鎖を含む非天然タンパク質(すなわち、合成タンパク質)を生成するための方法:
    チェーン 1: SP1-A1-L1-H1-M1-(C1)n
    チェーン 2: SP2-A2-L2-H2-M2-(C2)n
    ここで、SP1およびSP2は、成熟ポリペプチド鎖から切断される任意のシグナルペプチドであり、 A1 と A2 は相互作用できる 2 つのタンパク質ドメイン、L1 と L2 はオプションのリンカー、H1 と H2 はオプションのヒンジ ドメインまたはスペーサー ドメイン、M1 と M2 は膜アンカーまたは膜貫通ドメイン、C1 と C2 はオプションのサイトゾル ドメインです。
  231. A1およびA2ドメインが抗体に由来せず、抗体断片でもない、請求項230に記載の方法。
  232. A1およびA2ドメインがM1およびM2ドメインに対して異種である、請求項230に記載の方法。
  233. 前記A1ドメインおよびA2ドメインは自律ドメインではないことを特徴とする請求項230に記載の方法。
  234. 前記A1ドメインおよびA2ドメインが、無関係なタンパク質に対するそれらの親和性よりも大きい互いに対する親和性を有する、請求項230に記載の方法。
  235. A1およびA2ドメインが互いに結合して抗原結合ドメインを生成し得る、請求項230に記載の方法。
  236. 前記L1およびL2リンカーが、a)長いリンカーである、請求項230に記載の方法。 b) Ig様リンカー;または c) 免疫グロブリンに由来するリンカー。 d)TCR定常鎖に由来するリンカー。
  237. L1リンカーおよびL2リンカーが1つまたは複数のジスルフィド結合によって結合される、請求項230に記載の方法。
  238. M1およびM2ドメインが膜貫通ドメインである、請求項230に記載の方法。
  239. 前記M1およびM2ドメインが、a)同じタンパク質に由来する、請求項238に記載の方法。 b) 異なるタンパク質。または c) 配列が同一である、および/または 70% を超えるアミノ酸配列相同性を有する
  240. M1ドメインとM2ドメインが互いに関連する、請求項230に記載の方法。
  241. 前記M1およびM2ドメインがジスルフィド結合によって結合されている、請求項230に記載の方法。
  242. M1および/またはM2ドメインが1つまたは複数のシグナル伝達アダプターを動員できる、請求項230に記載の方法。
  243. C1およびC2ドメインが、少なくとも1つのシグナル伝達アダプターを動員する、および/または少なくとも1つのシグナル伝達経路を開始することができる、請求項242に記載の方法。
  244. 両方の鎖が細胞表面上で発現される、請求項230に記載の方法。
  245. A1-L1-H1セグメントおよびA2-L2-H2セグメントが細胞外側に位置する、請求項230に記載の方法。
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Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3428194B1 (en) 2017-07-14 2021-08-18 Immatics Biotechnologies GmbH Improved dual specificity polypeptide molecule
CN115551891A (zh) * 2020-03-02 2022-12-30 加利福尼亚大学董事会 用于治疗癌症的嵌合抗原受体及相关方法和组合物
JP2024518378A (ja) 2021-05-05 2024-05-01 イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー Prameに特異的に結合する抗原結合タンパク質
WO2024052389A1 (en) * 2022-09-08 2024-03-14 F. Hoffmann-La Roche Ag Recombinant t cell receptors
CN116514992B (zh) * 2022-11-07 2024-05-24 武汉波睿达生物科技有限公司 一种信号肽序列优化的靶向cd19的嵌合抗原受体及其应用
WO2024102954A1 (en) * 2022-11-10 2024-05-16 Massachusetts Institute Of Technology Activation induced clipping system (aics)

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2350415A1 (en) * 1998-11-18 2000-05-25 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Inflammation-associated genes
EP2478760A1 (en) * 2005-05-10 2012-07-25 Monsanto Technology LLC Genes and uses for plant improvement
US9833476B2 (en) * 2011-08-31 2017-12-05 The Trustees Of Dartmouth College NKP30 receptor targeted therapeutics
EP2892930B1 (en) * 2012-09-07 2019-08-14 University Of Miami Fusion proteins for promoting an immune response, nucleic acids encoding same, and methods of making and use thereof
TWI750110B (zh) * 2014-07-21 2021-12-21 瑞士商諾華公司 使用人類化抗-bcma嵌合抗原受體治療癌症
KR102460387B1 (ko) * 2015-03-27 2022-10-28 이뮤너티바이오, 인크. 암의 치료를 위한 유전적으로 변형된 nk-92 세포 및 모노클로날 항체
CN117384961A (zh) * 2016-02-23 2024-01-12 萨克生物研究学院 对病毒动力学影响最小的治疗性腺病毒中的外源基因表达
WO2018102795A2 (en) * 2016-12-02 2018-06-07 University Of Southern California Synthetic immune receptors and methods of use thereof
CN108728465A (zh) * 2017-04-14 2018-11-02 深圳新诺微环生物科技有限公司 一种表达靶细胞-效应细胞桥接器的微环dna载体及其制备方法和应用
KR102653878B1 (ko) * 2018-08-01 2024-04-01 난트퀘스트, 인크. 면역 요법의 안정한 유전적 변형을 위한 귀소 수용체 또는 사이토카인, 및 키메라 항원 수용체를 포함하는 4 시스트론 시스템 (a quadricistronic system comprising a homing receptor or a cytokine, and chimeric antigen receptor for genetic modification of immunotherapies)

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