JP2020033347A5 - - Google Patents

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JP2020033347A5
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したがって、本明細書において、説明の目的で、本発明の特定の実施形態を記載したが、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく様々な変更がなされ得ることが理解される。したがって、本発明は、特許請求の範囲によるものを除いて、限定を受けない。

本開示は以下のものも含む。
［１］
細胞取り込み部分およびＭｃｌ−１結合ドメインを含むプロファイリングペプチドであって、Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の配列に０〜８個の改変を有する配列を有する、プロファイリングペプチド。
［２］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の配列に０〜６個の改変を有する配列を有する、前記１に記載のプロファイリングペプチド。
［３］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１との少なくとも７５％の同一性を有する、前記１または２に記載のプロファイリングペプチド。
［４］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の配列に０〜３個の改変を有する配列を有する、前記１〜３のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［５］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１との少なくとも９０％の同一性を有する、前記１〜４のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［６］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の配列に０〜２個の改変を有する配列を有する、前記１〜５のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［７］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の少なくとも１０個の連続アミノ酸を含む、前記１〜６のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［８］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１との少なくとも９５％の同一性を有する、前記１〜７のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［９］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の配列に０または１個の改変を有する配列を有する、前記１〜８のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１０］
前記改変がそれぞれ独立して、保存的なアミノ酸の置換、付加または欠失である、前記１〜９のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１１］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の少なくとも１５個の連続アミノ酸を含む、前記１〜１０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１２］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の少なくとも２０個の連続アミノ酸を含む、前記１〜１１のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１３］
Ｍｃｌ−１結合ドメインが配列番号１の配列を有する、前記１〜１２のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１４］
細胞取り込み部分が１〜２０アミノ酸のアミノ酸配列を含む、前記１〜１３のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１５］
細胞取り込み部分が、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）転写活性化因子（ＴＡＴ）ペプチド導入ドメインの少なくとも５個の連続アミノ酸を含む、前記１〜１４のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１６］
細胞取り込み部分が配列番号１２との少なくとも９０％の同一性を有する、前記１〜１５のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１７］
細胞取り込み部分が配列番号１２の配列を含む、前記１〜１６のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１８］
細胞取り込み部分が、アンテナペディア細胞膜（ＡＮＴ）移行ドメインの少なくとも５個の連続アミノ酸を含む、前記１〜１４のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［１９］
細胞取り込み部分が配列番号１３との少なくとも９０％の同一性を有する、前記１〜１４または１８のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２０］
細胞取り込み部分が配列番号１３の配列を含む、前記１〜１４、１８または１９のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２１］
細胞取り込み部分がアルギニンに富むアミノ配列を含む、前記１〜１４のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２２］
細胞取り込み部分が３〜１０個の連続アルギニン残基を含む、前記１〜１４または２１のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２３］
細胞取り込み部分がＭｃｌ−１結合ドメインのＮ末端に結合している、前記１〜２２のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２４］
細胞取り込み部分がＭｃｌ−１結合ドメインのＣ末端に結合している、前記１〜２２のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２５］
細胞取り込み部分が、リンカーを介してＭｃｌ−１結合ドメインに結合している、前記１〜２４のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２６］
リンカーが１〜５アミノ酸のアミノ酸配列である、前記２５に記載のプロファイリングペプチド。
［２７］
２０アミノ酸から５０アミノ酸の長さである、前記１〜２６のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２８］
３０アミノ酸から４０アミノ酸の長さである、前記１〜２７のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［２９］
配列番号１４または配列番号１５の配列を含む、前記１〜１８または２４〜２８のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［３０］
配列番号１４または配列番号１５の配列からなる、前記１〜１８または２４〜２９のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド。
［３１］
前記１〜３０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチド、および担体を含む、組成物。
［３２］
検出試薬をさらに含む、前記３１に記載の組成物。
［３３］
検出試薬が、３，３’−ジヘキシルオキサカルボシアニンヨージド（ＤｉＯＣ６）である、前記３２に記載の組成物。
［３４］
検出試薬が電位差色素である、前記３２に記載の組成物。
［３５］
電位差色素がＪＣ−１またはローダミン１２３である、前記３４に記載の組成物。
［３６］
細胞透過化剤を含まない、前記３２〜３５のいずれか一項に記載の組成物。
［３７］
細胞をさらに含む、前記３２〜３６のいずれか一項に記載の組成物。
［３８］
細胞が癌細胞である、前記３７に記載の組成物。
［３９］
癌細胞が血液癌である、前記３８に記載の組成物。
［４０］
血液癌が、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性リンパ球性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、または非ホジキンリンパ腫である、前記３９に記載の組成物。
［４１］
必要とする対象において癌を処置するための方法であって、治療薬を含む処置レジメンを、Ｍｃｌ−１依存パーセンテージが少なくとも１５％である対象に投与することを含み、Ｍｃｌ−１依存パーセンテージが、複数の癌細胞の第１の部分を、前記１〜３０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチドまたは前記３１〜３６のいずれか一項に記載の組成物と接触させることを含むインビトロの方法によって得られる、方法。
［４２］
インビトロの方法が、前記複数の癌細胞のミトコンドリアの完全性の変化を検出することをさらに含む、前記４１に記載の方法。
［４３］
前記複数の癌細胞についてのＭｃｌ−１依存パーセンテージが、ミトコンドリアの完全性の変化に少なくとも基づく、前記４２に記載の方法。
［４４］
対象が少なくとも２０％のＭｃｌ−１依存パーセンテージを有する、前記４１〜４３のいずれか一項に記載の方法。
［４５］
対象が少なくとも３０％のＭｃｌ−１依存パーセンテージを有する、前記４１〜４４のいずれか一項に記載の方法。
［４６］
対象が少なくとも４０％のＭｃｌ−１依存パーセンテージを有する、前記４１〜４５のいずれか一項に記載の方法。
［４７］
治療薬がサイクリン依存性キナーゼ９（ＣＤＫ９）阻害剤である、前記４１〜４６のいずれか一項に記載の方法。
［４８］
ＣＤＫ９阻害剤がアルボシジブである、前記４７に記載の方法。
［４９］
Ａｒａ−Ｃもしくはミトキサントロンまたはその両方を投与することをさらに含む、前記４１〜４８のいずれか一項に記載の方法。
［５０］
Ｂｃｌ−２阻害剤を投与することをさらに含む、前記４１〜４９のいずれか一項に記載の方法。
［５１］
Ｂｃｌ−２阻害剤がベネトクラックスである、前記５０に記載の方法。
［５２］
Ａｒａ−Ｃもしくはダウノルビシンまたはその両方を投与することをさらに含む、前記４１〜５１のいずれか一項に記載の方法。
［５３］
Ｂｒｄ４阻害剤もしくはＤＮＡメチルトランスフェラーゼ阻害剤またはその両方を投与することをさらに含む、前記４１〜５２のいずれか一項に記載の方法。
［５４］
インビトロの方法が、前記複数の癌細胞の少なくとも第１の部分をジテルペノイドと接触させることをさらに含む、前記４１〜５３のいずれか一項に記載の方法。
［５５］
インビトロの方法が、
前記複数の癌細胞の第２の部分を、陰性対照を用いて処理すること、および
前記複数の癌細胞の第３の部分を、陽性対照を用いて処理すること
をさらに含む、前記４１〜５４のいずれか一項に記載の方法。
［５６］
インビトロの方法が、前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分をフローサイトメトリーによって解析することをさらに含む、前記５５に記載の方法。
［５７］
対象由来の複数の癌細胞についての感受性プロファイルを作成する方法であって、
複数の癌細胞の第１の部分を、前記１〜３０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチドまたは前記３１〜３６のいずれか一項に記載の組成物と接触させること、および
前記複数の癌細胞の第１の部分のミトコンドリアの完全性の変化を検出すること
を含む、方法。
［５８］
ミトコンドリアの完全性の変化に少なくとも基づいて前記複数の癌細胞の第１の部分についてのＭｃｌ−１依存パーセンテージを決定することをさらに含む、前記５７に記載の方法。
［５９］
前記複数の癌細胞の第２の部分を、陰性対照を用いて処理すること、および
前記複数の癌細胞の第３の部分を、陽性対照を用いて処理すること
をさらに含む、前記５７または５８に記載の方法。
［６０］
ミコトンドリア完全性の変化が、ミトコンドリアの膜電位の変化によって測定される、前記４２〜５９のいずれか一項に記載の方法。
［６１］
ミトコンドリアの膜電位の変化が、検出試薬を使用して測定される、前記６０に記載の方法。
［６２］
検出試薬が色素である、前記６１に記載の方法。
［６３］
ミトコンドリアの完全性の変化が、シトクロムＣ漏出によって測定される、前記４２〜５９のいずれか一項に記載の方法。
［６４］
対象由来の複数の癌細胞についての感受性プロファイルを作成する方法であって、
複数の癌細胞を試料から単離すること、
前記複数の癌細胞を標識と接触させること、
前記複数の癌細胞の第１の部分を、陰性対照を用いて処理すること、
前記複数の癌細胞の第２の部分を、陽性対照を用いて処理すること、
前記複数の癌細胞の第３の部分を、前記１〜３０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチドまたは前記３１〜３６のいずれか一項に記載の組成物を用いて処理すること、
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分を色素と接触させること、ならびに
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分をフローサイトメトリーによって解析すること
を含む、方法。
［６５］
色素が、３，３’−ジヘキシルオキサカルボシアニンヨージド（ＤｉＯＣ６）である、前記６２または６４に記載の方法。
［６６］
色素が電位差色素である、前記６２または６４に記載の方法。
［６７］
電位差色素がＪＣ−１またはローダミン１２３である、前記６６に記載の方法。
［６８］
前記複数の癌細胞が血液癌由来である、前記４１〜６７のいずれか一項に記載の方法。
［６９］
血液癌が、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性リンパ球性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、または非ホジキンリンパ腫である、前記６８に記載の方法。
［７０］
血液癌が急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）である、前記６９に記載の方法。
［７１］
前記複数の癌細胞が対象の末梢血から得られる、前記４１〜７０のいずれか一項に記載の方法。
［７２］
前記複数の癌細胞が対象の骨髄から得られる、前記４１〜７１のいずれか一項に記載の方法。
［７３］
前記複数の癌細胞が冷凍されている、前記４１〜７２のいずれか一項に記載の方法。
［７４］
前記複数の癌細胞の第１の部分が、細胞透過化剤によって透過化されていない、前記４１〜７３のいずれか一項に記載の方法。
［７５］
前記複数の癌細胞の第１の部分をジテルペノイドと接触させることをさらに含む、前記５７〜７４のいずれか一項に記載の方法。
［７６］
ジテルペノイドがリアノジンである、前記５４または７５に記載の方法。
［７７］
陰性対照が水である、前記５４、５５または５８〜７６のいずれか一項に記載の方法。
［７８］
陽性対照が、カルボニルシアニド−４−（トリフルオロメトキシ）フェニルヒドラゾン（ＦＣＣＰ）、カルボニルシアニドｍ−クロロフェニルヒドラゾン（ＣＣＣＰ）、またはＮ５，Ｎ６−ビス（２−フルオロフェニル）−［１，２，５］オキサジアゾロ［３，４−ｂ］ピラジン−５，６−ジアミン（ＢＡＭ−１５）である、前記５５、５６または５９〜７７のいずれか一項に記載の方法。
［７９］
陽性対照がＣＣＣＰである、前記５５、５５または５９〜７８のいずれか一項に記載の方法。
［８０］
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分をフローサイトメトリーによって解析することをさらに含む、前記５９〜７９に記載の方法。
［８１］
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分のフローサイトメトリーによる解析が、ＣＤ４５ｄｉｍ、ＣＤ１３、ＣＤ３３およびＣＤ３４ｈｉｇｈ集団に対してゲーティングすることを含む、前記５６または８０に記載の方法。
［８２］
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分のフローサイトメトリーによる解析が、ＣＤ４５ｄｉｍ、ＣＤ３およびＣＤ２０ｈｉｇｈ集団に対してゲーティングすることを含む、前記５６または８０に記載の方法。
［８３］
前記１〜３０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチドまたは前記３１〜４０のいずれか一項に記載の組成物、および検出試薬を含むキット。
［８４］
細胞透過化剤を含まない、前記８３に記載のキット。
［８５］
前記４１〜８２のいずれか一項に記載の方法の工程を含む記載された指示書をさらに含む、前記８３または８４に記載のキット。
［８６］
Ｍｃｌ−１依存パーセンテージが少なくとも１５％である対象において癌の処置に使用するための治療用組成物であって、Ｍｃｌ−１依存パーセンテージが、
複数の癌細胞の第１の部分を、前記１〜３０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチドまたは前記３１〜３６のいずれか一項に記載の組成物と接触させること
を含むインビトロの方法によって得られる、治療用組成物。
［８７］
Ｍｃｌ−１依存パーセンテージが少なくとも１５％である対象に投与される、治療薬を含む癌治療用組成物であって、Ｍｃｌ−１依存パーセンテージが、
複数の癌細胞の第１の部分を、前記１〜３０のいずれか一項に記載のプロファイリングペプチドまたは前記３１〜３６のいずれか一項に記載の組成物と接触させること
を含むインビトロの方法によって得られる、治療用組成物。
［８８］
対象が少なくとも２０％の予め決定された値のＭｃｌ−１依存パーセンテージを有する、前記８６または８７に記載の治療用組成物。
［８９］
対象が少なくとも３０％の予め決定された値のＭｃｌ−１依存パーセンテージを有する、前記８６〜８８のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９０］
対象が少なくとも４０％のＭｃｌ−１依存パーセンテージを有する、前記８６〜８９のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９１］
治療薬がサイクリン依存性キナーゼ９（ＣＤＫ９）阻害剤である、前記８６〜９０のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９２］
ＣＤＫ９阻害剤がアルボシジブである、前記９１に記載の治療用組成物。
［９３］
Ａｒａ−Ｃもしくはミトキサントロンまたはその両方の投与をさらに含む、前記８６〜９２のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９４］
Ｂｃｌ−２阻害剤の投与をさらに含む、前記８６〜９３のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９５］
Ｂｃｌ−２阻害剤がベネトクラックスである、前記９４に記載の治療用組成物。
［９６］
Ａｒａ−Ｃもしくはダウノルビシンまたはその両方の投与をさらに含む、前記８６〜９５のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９７］
Ｂｒｄ４阻害剤もしくはＤＮＡメチルトランスフェラーゼ阻害剤またはその両方の投与をさらに含む、前記８６〜９６のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９８］
癌細胞が血液癌である、前記８６〜９７のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［９９］
血液癌が、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性リンパ球性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、または非ホジキンリンパ腫である、前記９８に記載の治療用組成物。
［１００］
前記複数の癌細胞が対象の末梢血から得られる、前記８６〜９９のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［１０１］
前記複数の癌細胞が対象の骨髄から得られる、前記８６〜９９のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［１０２］
前記複数の癌細胞が冷凍されている、前記８６〜１０１のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［１０３］
前記複数の癌細胞の第１の部分が、細胞透過化剤によって透過化されていない、前記８６〜１０２のいずれか一項に記載の治療用組成物。
［１０４］
インビトロの方法が、前記複数の癌細胞のミトコンドリアの完全性の変化を検出することをさらに含む、前記８６〜１０３に記載の治療用組成物。
［１０５］
前記複数の癌細胞についてのＭｃｌ−１依存パーセンテージが、ミトコンドリアの完全性の変化に少なくとも基づく、前記１０４に記載の治療用組成物。
［１０６］
ミトコンドリアの完全性の変化が、ミトコンドリアの膜電位の変化によって測定される、前記１０４または１０５に記載の治療用組成物。
［１０７］
ミトコンドリアの膜電位の変化が検出試薬を使用して測定される、前記１０６に記載の治療用組成物。
［１０８］
検出試薬が色素である、前記１０７に記載の治療用組成物。
［１０９］
色素が、３，３’−ジヘキシルオキサカルボシアニンヨージド（ＤｉＯＣ６）である、前記１０８に記載の治療用組成物。
［１１０］
色素が電位差色素である、前記１０８に記載の治療用組成物。
［１１１］
電位差色素がＪＣ−１またはローダミン１２３である、前記１１０に記載の治療用組成物。
［１１２］
ミトコンドリアの完全性の変化が、シトクロムＣ漏出によって測定される、前記１０４または１０５に記載の治療用組成物。
［１１３］
インビトロの方法が、少なくとも前記複数の癌細胞の第１の部分をジテルペノイドと接触させることをさらに含む、前記８６〜１１２に記載の治療用組成物。
［１１４］
ジテルペノイドがリアノジンである、前記１１３に記載の治療用組成物。
［１１５］
インビトロの方法が、
前記複数の癌細胞の第２の部分を、陰性対照を用いて処理すること、および
前記複数の癌細胞の第３の部分を、陽性対照を用いて処理すること
をさらに含む、前記８６〜１１４に記載の治療用組成物。
［１１６］
陰性対照が水である、前記１１５に記載の治療用組成物。
［１１７］
陽性対照が、カルボニルシアニド−４−（トリフルオロメトキシ）フェニルヒドラゾン（ＦＣＣＰ）、カルボニルシアニドｍ−クロロフェニルヒドラゾン（ＣＣＣＰ）、またはＮ５，Ｎ６−ビス（２−フルオロフェニル）−［１，２，５］オキサジアゾロ［３，４−ｂ］ピラジン−５，６−ジアミン（ＢＡＭ−１５）である、前記１１５または１１６に記載の治療用組成物。
［１１８］
陽性対照がＣＣＣＰである、前記１１７に記載の治療用組成物。
［１１９］
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分のフローサイトメトリーによる解析をさらに含む、前記１１５〜１１８に記載の治療用組成物。
［１２０］
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分のフローサイトメトリーによる解析が、ＣＤ４５ｄｉｍ、ＣＤ１３、ＣＤ３３およびＣＤ３４ｈｉｇｈ集団に対してゲーティングすることを含む、前記１１５〜１１９に記載の治療用組成物。
［１２１］
前記複数の癌細胞の第１の部分、第２の部分および第３の部分のフローサイトメトリーによる解析が、ＣＤ４５ｄｉｍ、ＣＤ３およびＣＤ２０ｈｉｇｈ集団に対してゲーティングすることを含む、前記１１１〜１２０に記載の治療用組成物。

Claims (1)

  1. 本願明細書に記載の発明。
JP2019166124A 2016-12-19 2019-09-12 プロファイリングペプチドおよび感受性プロファイリングのための方法 Active JP7219685B2 (ja)

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