JP2017535552A5 - - Google Patents

Claims (53)

1. 細胞におけるアポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）の発現を阻害するための二本鎖ＲＮＡｉ剤であって、前記二本鎖ＲＮＡｉ剤は、二本鎖領域を形成するセンス鎖およびアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖は、配列番号１のヌクレオチド配列と３ヌクレオチド以下異なる、少なくとも１５連続ヌクレオチドを含み、かつ前記アンチセンス鎖は、配列番号２のヌクレオチド配列と３ヌクレオチド以下異なる、少なくとも１５連続ヌクレオチドを含み、
   少なくとも一方の鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾ヌクレオチドであり、および
   前記センス鎖が、３’末端に付加されたリガンドと共役している、二本鎖ＲＮＡｉ剤。
2. 前記センス鎖および前記アンチセンス鎖が、表４Ａ、４Ｂ、５、８、９、１０、１１Ａ、１１Ｂ、および１２、１３に列挙される配列のいずれか１つと３ヌクレオチド以下異なる、少なくとも１５連続ヌクレオチドを含む相補性領域を含む、請求項１に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
3. 前記修飾ヌクレオチドのうちの少なくとも１つが、３’末端デオキシチミン（ｄＴ）ヌクレオチド、２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチド、２’−フルオロ修飾ヌクレオチド、２’−デオキシ修飾ヌクレオチド、ロックドヌクレオチド、アンロックドヌクレオチド、配座固定ヌクレオチド、拘束エチルヌクレオチド、脱塩基ヌクレオチド、２’−アミノ修飾ヌクレオチド、２’−Ｏ−アリル修飾ヌクレオチド、２’−Ｃ−アルキル修飾ヌクレオチド、２’−ヒドロキシル（ｈｙｄｒｏｘｌｙ）修飾ヌクレオチド、２’−メトキシエチル修飾ヌクレオチド、２’−Ｏ−アルキル修飾ヌクレオチド、モルホリノヌクレオチド、ホスホロアミド酸塩、非天然塩基を含むヌクレオチド、テトラヒドロピラン修飾ヌクレオチド、１，５−アンヒドロヘキシトール修飾ヌクレオチド、シクロヘキセニル修飾ヌクレオチド、５’−ホスホロチオエート基を含むヌクレオチド、５’−メチルホスホネート基を含むヌクレオチド、５’リン酸または５’リン酸模倣体を含むヌクレオチド、ビニルリン酸を含むヌクレオチド、アデノシン−グリコール核酸（ＧＮＡ）を含むヌクレオチド、チミジン−グリコール核酸（ＧＮＡ）Ｓ−異性体を含むヌクレオチド、２−ヒドロキシメチル−テトラヒドロフラン−５−リン酸を含むヌクレオチド、２’−デオキシチミジン−３’リン酸を含むヌクレオチド、２’−デオキシグアノシン−３’−リン酸を含むヌクレオチド、およびコレステリル誘導体またはドデカン酸ビスデシルアミド基に連結した末端ヌクレオチドからなる群から選択される、請求項１または２に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
4. 前記センス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾されている、請求項１に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
5. 前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾されている、請求項１に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
6. 前記センス鎖のヌクレオチドの実質的に全ておよび前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾ヌクレオチドである、請求項１に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
7. 前記センス鎖のヌクレオチドの全てが修飾ヌクレオチドである、請求項１に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
8. 前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの全てが修飾ヌクレオチドである、請求項１に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
9. 前記センス鎖のヌクレオチドの全ておよび前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの全てが修飾ヌクレオチドである、請求項１に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
10. 細胞におけるアポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）の発現の阻害能を有する二本鎖ＲＮＡｉ剤であって、前記二本鎖ＲＮＡｉ剤は、二本鎖領域を形成するセンス鎖およびアンチセンス鎖を含み、前記アンチセンス鎖は、ＡＰＯＣ３をコードするｍＲＮＡの一部と相補的な領域を含み、各鎖は約１４〜約３０ヌクレオチド長であり、前記二本鎖ＲＮＡｉ剤は、式（ＩＩＩ）：
    センス：５’ｎ_ｐ−Ｎ_ａ−（ＸＸＸ）_ｉ−Ｎ_ｂ−ＹＹＹ−Ｎ_ｂ−（ＺＺＺ）_ｊ−Ｎ_ａ−ｎ_ｑ３’
    アンチセンス：３’ｎ_ｐ’−Ｎ_ａ’−（Ｘ’Ｘ’Ｘ’）_ｋ−Ｎ_ｂ’−Ｙ’Ｙ’Ｙ’−Ｎ_ｂ’−（Ｚ’Ｚ’Ｚ’）_ｌ−Ｎ_ａ’−ｎ_ｑ’５’（ＩＩＩ）
    ［式中：
    ｉ、ｊ、ｋ、およびｌは、各々独立して０または１であり；
    ｐ、ｐ’、ｑ、およびｑ’は、各々独立して０〜６であり；
    各Ｎ_ａおよびＮ_ａ’は、独立して、修飾または非修飾のいずれかまたはこれらの組み合わせである０〜２５ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド配列を表し、各配列は少なくとも２つの異なる修飾のヌクレオチドを含み；
    各Ｎ_ｂおよびＮ_ｂ’は、独立して、修飾または非修飾のいずれかまたはこれらの組み合わせである０〜１０ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド配列を表し；
    各ｎ_ｐ、ｎ_ｐ’、ｎ_ｑ、およびｎ_ｑ’（この各々は存在することもまたは存在しないこともある）は、独立してオーバーハングヌクレオチドを表し；
    ＸＸＸ、ＹＹＹ、ＺＺＺ、Ｘ’Ｘ’Ｘ’、Ｙ’Ｙ’Ｙ’、およびＺ’Ｚ’Ｚ’は、各々独立して、３連続ヌクレオチド上の３つの同一の修飾の１つのモチーフを表し；
    Ｎ_ｂ上の修飾はＹ上の修飾と異なり、かつＮ_ｂ’上の修飾はＹ’上の修飾と異なる］によって表され；および
    前記センス鎖は少なくとも１つのリガンドと共役している、二本鎖ＲＮＡｉ剤。
11. 式（ＩＩＩ）が式（ＩＩＩａ）：
    センス：５’ｎ_ｐ−Ｎ_ａ−ＹＹＹ−Ｎ_ａ−ｎ_ｑ３’
    アンチセンス：３’ｎ_ｐ’−Ｎ_ａ’−Ｙ’Ｙ’Ｙ’−Ｎ_ａ’−ｎ_ｑ’５’（ＩＩＩａ）
    によって表される、請求項１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
12. 前記二本鎖領域が１５〜３０ヌクレオチド対長である、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
13. 前記二本鎖領域が１７〜２３ヌクレオチド対長である、請求項１２に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
14. 前記二本鎖領域が１７〜２５ヌクレオチド対長である、請求項１２に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
15. 前記二本鎖領域が２３〜２７ヌクレオチド対長である、請求項１２に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
16. 前記二本鎖領域が１９〜２１ヌクレオチド対長である、請求項１２に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
17. 前記二本鎖領域が２１〜２３ヌクレオチド対長である、請求項１２に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
18. 各鎖が１５〜３０ヌクレオチドを有する、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
19. 各鎖が１９〜３０ヌクレオチドを有する、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
20. 前記ヌクレオチド上の修飾が、表５、９、１０、１１Ｂ、１２、および１３に列挙するとおりの修飾、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
21. 前記ヌクレオチド上の前記修飾が２’−Ｏ−メチルおよび２’−フルオロ修飾である、請求項１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
22. 前記リガンドが、二価または三価の分枝リンカーを介して付加された１つ以上のＧａｌＮＡｃ誘導体である、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
23. 前記リガンドが、
    

    

    である、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
24. 前記リガンドが前記センス鎖の３’末端に付加されている、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
25. 以下の概略図
    

    

    ［式中、ＸはＯまたはＳである］に示されるとおりのリガンドと共役している、請求項２４に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
26. 少なくとも１つのホスホロチオエートまたはメチルホスホネートヌクレオチド間結合をさらに含む、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
27. 前記ホスホロチオエートまたはメチルホスホネートヌクレオチド間結合が一方の鎖の３’末端にある、請求項２６に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
28. ６〜８つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、請求項２６に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
29. 前記アンチセンス鎖が５’末端に２つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合および３’末端に２つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、前記センス鎖が５’末端または３’末端のいずれかに少なくとも２つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、請求項２８に記載の二本鎖ＲＮＡｉ。
30. 表４Ａ、４Ｂ、５、８、９、１１Ａ、１１Ｂ、１２、および１３のいずれか１つに列挙されるＲＮＡｉ剤の群から選択される、請求項１または１０に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
31. 細胞におけるアポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）の発現の阻害能を有する二本鎖ＲＮＡｉ剤であって、前記二本鎖ＲＮＡｉ剤は、二本鎖領域を形成するセンス鎖およびアンチセンス鎖を含み、
    前記センス鎖は５’−ＧＣＵＵＡＡＡＡＧＧＧＡＣＡＧＵＡＵＵＣＵ−３’（配列番号１３）を含み、かつ前記アンチセンス鎖は５’−ＡＧＡＡＵＡＣＵＧＵＣＣＣＵＵＵＵＡＡＧＣＡＡ−３’（配列番号１４）を含み、
    前記センス鎖のヌクレオチドの実質的に全ておよび前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾ヌクレオチドであり、
    前記センス鎖は、３’末端に付加されたリガンドと共役し、および
    前記リガンドは、二価または三価の分枝リンカーを介して付加された１つ以上のＧａｌＮＡｃ誘導体である、二本鎖ＲＮＡｉ剤。
32. 細胞におけるアポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）の発現の阻害能を有する二本鎖ＲＮＡｉ剤であって、前記二本鎖ＲＮＡｉ剤は、二本鎖領域を形成するセンス鎖およびアンチセンス鎖を含み、
    前記センス鎖は５’−ＧＣＵＵＡＡＡＡＧＧＧＡＣＡＧＵＡＵＵＣＵ−３’（配列番号１３）を含み、かつ前記アンチセンス鎖は５’−ＵＧＡＡＵＡＣＵＧＵＣＣＣＵＵＵＵＡＡＧＣＡＡ−３’（配列番号１５）を含み、
    前記センス鎖のヌクレオチドの実質的に全ておよび前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾ヌクレオチドであり、
    前記センス鎖は、３’末端に付加されたリガンドと共役し、および
    前記リガンドは、二価または三価の分枝リンカーを介して付加された１つ以上のＧａｌＮＡｃ誘導体である、二本鎖ＲＮＡｉ剤。
33. 細胞におけるアポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）の発現の阻害能を有する二本鎖ＲＮＡｉ剤であって、前記二本鎖ＲＮＡｉ剤は、二本鎖領域を形成するセンス鎖およびアンチセンス鎖を含み、
    前記センス鎖は５’−ＧＣＵＵＡＡＡＡＧＧＧＡＣＡＧＵＡＵＵＣＡ−３’（配列番号６５９）を含み、かつ前記アンチセンス鎖は５’−ＵＧＡＡＵＡＣＵＧＵＣＣＣＵＵＵＵＡＡＧＣＡＡ−３’（配列番号６７０）を含み、
    前記センス鎖のヌクレオチドの実質的に全ておよび前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾ヌクレオチドであり、
    前記センス鎖は、３’末端に付加されたリガンドと共役し、および
    前記リガンドは、二価または三価の分枝リンカーを介して付加された１つ以上のＧａｌＮＡｃ誘導体である、二本鎖ＲＮＡｉ剤。
34. 前記センス鎖のヌクレオチドの全ておよび前記アンチセンス鎖のヌクレオチドの全てが修飾を含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
35. 前記修飾ヌクレオチドのうちの少なくとも１つが、３’末端デオキシチミン（ｄＴ）ヌクレオチド、２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチド、２’−フルオロ修飾ヌクレオチド、２’−デオキシ修飾ヌクレオチド、ロックドヌクレオチド、アンロックドヌクレオチド、配座固定ヌクレオチド、拘束エチルヌクレオチド、脱塩基ヌクレオチド、２’−アミノ修飾ヌクレオチド、２’−Ｏ−アリル修飾ヌクレオチド、２’−Ｃ−アルキル修飾ヌクレオチド、２’−ヒドロキシル（ｈｙｄｒｏｘｌｙ）修飾ヌクレオチド、２’−メトキシエチル修飾ヌクレオチド、２’−Ｏ−アルキル修飾ヌクレオチド、モルホリノヌクレオチド、ホスホロアミド酸塩、非天然塩基を含むヌクレオチド、テトラヒドロピラン修飾ヌクレオチド、１，５−アンヒドロヘキシトール修飾ヌクレオチド、シクロヘキセニル修飾ヌクレオチド、５’−ホスホロチオエート基を含むヌクレオチド、５’−メチルホスホネート基を含むヌクレオチド、５’リン酸または５’リン酸模倣体を含むヌクレオチド、ビニルリン酸を含むヌクレオチド、アデノシン−グリコール核酸（ＧＮＡ）を含むヌクレオチド、チミジン−グリコール核酸（ＧＮＡ）Ｓ−異性体を含むヌクレオチド、２−ヒドロキシメチル−テトラヒドロフラン−５−リン酸を含むヌクレオチド、２’−デオキシチミジン−３’リン酸を含むヌクレオチド、２’−デオキシグアノシン−３’−リン酸を含むヌクレオチド、およびコレステリル誘導体またはドデカン酸ビスデシルアミド基に連結した末端ヌクレオチドからなる群から選択される、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
36. ２’−フルオロ修飾を含むヌクレオチドを１０個以下含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
37. ２’−フルオロ修飾を含むヌクレオチドを６個以下含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
38. 前記センス鎖が、２’−フルオロ修飾を含むヌクレオチドを４個以下含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
39. 前記アンチセンス鎖が、２’−フルオロ修飾を含むヌクレオチドを６個以下含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
40. 前記アンチセンス鎖が、２’−フルオロ修飾を含むヌクレオチドを２個以下含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
41. 前記アンチセンス鎖の５’ヌクレオチドに５’−リン酸または５’−リン酸模倣体をさらに含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
42. 前記アンチセンス鎖の５’ヌクレオチドに５’−リン酸模倣体をさらに含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
43. 前記５’−リン酸模倣体が５’−ビニルリン酸（５’−ＶＰ）である、請求項４２に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
44. 前記リガンドが、
    

    

    である、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
45. 以下の概略図
    

    

    ［式中、ＸはＯまたはＳである］に示されるとおりのリガンドと共役する、請求項４４に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤。
46. 表４Ａ、４Ｂ、５、８、９、１０、１１Ａ、１１Ｂ、１２、および１３のいずれか１つに列挙されるＲＮＡｉ配列を含む二本鎖ＲＮＡｉ剤。
47. 請求項１〜４６のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤を含む医薬組成物。
48. 細胞におけるアポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）発現を阻害するための組成物であって、請求項１〜４６のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤を含む、組成物。
49. アポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）関連疾患を有する対象を治療するための組成物であって、請求項１〜４６のいずれか一項に記載の二本鎖ＲＮＡｉ剤を含む、組成物。
50. 前記ＡＰＯＣ３関連疾患が高トリグリセリド血症である、請求項４９に記載の組成物。
51. 前記ＡＰＯＣ３関連疾患が、非アルコール性脂肪性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝炎、多嚢胞性卵巣症候群、腎疾患、肥満症、２型真性糖尿病（インスリン抵抗性）、高血圧症、アテローム性動脈硬化症（ａｒｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ）および膵炎からなる群から選択される、請求項４９に記載の組成物。
52. 前記二本鎖ＲＮＡｉ剤が約０．０１ｍｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇまたは約０．５ｍｇ／ｋｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇの用量で含まれる、請求項４８に記載の組成物。
53. 前記二本鎖ＲＮＡｉ剤が約１０ｍｇ／ｋｇ〜約３０ｍｇ／ｋｇの用量で含まれる、請求項４９に記載の組成物。