JP2017060479A5

JP2017060479A5 -

Info

Publication number: JP2017060479A5
Application number: JP2016206825A
Authority: JP
Filing date: 2016-10-21
Publication date: 2018-03-15

Description

ある実施形態では、非貪食白血球、生存している／死につつある／死んだ原核細胞および真核細胞ならびにその断片をまだ貪食していない／内部に取り込んでいない貪食白血球、およびＤＮＡ量が２ｎ（すなわち、ＤＮＡ指数が１）である白血球などの（例えば、血液、尿、および唾液から単離された）白血球（ＷＢＣ）亜集団は、評価を受ける個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、メタボロームプロファイル、グリコームプロファイル、グリコプロテオームプロファイル、リピドームプロファイルおよび／またはリポプロテオームプロファイルを報告および排除するのに有用である。診断を受ける疾患、病状および／または症状に関係のない患者特異的シグネチャをこのように同定することにより、癌またはその他の疾患または障害または症状を有している疑いがある個体の無細胞体液内（全血、血漿、血清、尿、唾液、脳脊髄液、羊水、眼内液、鼻汁、肺洗浄液、腹腔液、大便、およびリンパ液など）の腫瘍／その他の疾患／症状に特異的なシグネチャを同定および検出することが可能となる。したがって、無細胞体液（例えば、全血、血清、血漿、尿、唾液、脳脊髄液、羊水、眼内液、鼻汁、肺洗浄液、腹腔液、大便、リンパ液）に存在する疾患または症状に特異的なマーカーのプロファイルを、任意の非貪食白血球または非侵襲的に（例えば、頬袋から擦り取ることにより）得ることができる細胞におけるプロファイルと比較することにより、あるいはＤＮＡ指数が１である任意の貪食白血球および／または非貪食白血球または非侵襲的に（例えば、頬袋から擦り取ることにより）得ることができる細胞におけるプロファイルと比較することにより、非貪食細胞において、あるいはＤＮＡ量が２である（すなわち、ＤＮＡ指数が１である）任意の白血球および／またはその他の体細胞において、発現していない、発現低下している、または診断もしくは検出される疾患もしくは症状の結果としてではなくこれらの細胞内で発現する（すなわち、個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、およびエピジェネティックプロファイルに関連する）、患者特異的、且つ腫瘍特異的、疾患特異的、または症状特異的なシグネチャが同定されることになる。同様に、無細胞体液、および（ＤＮＡ量が２ｎである）非貪食白血球、ＤＮＡ量が２である（すなわち、ＤＮ指数が１である）任意の白血球、または非侵襲的に得ることができるＤＮＡ量が２ｎであるその他の任意の哺乳類細胞のタンパク質発現プロファイルにより、非貪食細胞、あるいはＤＮＡ量が２である（すなわち、ＤＮＡ指数が１である）任意の白血球および／またはその他の体細胞において、発現していない、発現低下している、または診断もしくは検出される疾患もしくは症状の結果としてではなくこれらの細胞において発現する（すなわち、個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、およびエピジェネティックプロファイルに関連する）、体液内の腫瘍特異的、疾患特異的、または症状特異的なタンパク質シグネチャが同定および検出されることになる。さらに、無細胞体液、および（ＤＮＡ量が２ｎである）非貪食白血球、ＤＮＡ量が２である（すなわち、ＤＮＡ指数が１である）任意の白血球、または非侵襲的に得ることができるＤＮＡ量が２ｎであるその他の任意の哺乳類細胞の脂質プロファイルにより、非貪食細胞、あるいはＤＮＡ量が２である（すなわち、ＤＮＡ指数が１である）任意の白血球および／またはその他の体細胞において、発現していない、発現低下している、または診断もしくは検出される疾患もしくは症状の結果としてではなくこれらの細胞において発現する（すなわち、個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、およびエピジェネティックプロファイルに関連する）、体液内の腫瘍特異的、疾患特異的、または症状特異的な脂質シグネチャが同定および検出されることになる。

Claims

（ａ）無細胞体液試料から、疾患または症状の１つまたは複数のマーカーについての第１プロファイルを得ること、
（ｂ）ＤＮＡ量が２ｎである貪食細胞（２ｎ貪食細胞）集団または非貪食細胞集団から、前記１つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも１つについての第２プロファイルを得ること、および
（ｃ）前記マーカーのうちの少なくとも１つまたは複数について、第１プロファイルと第２プロファイルとの差異を同定することを含む、
ｉｎｖｉｔｒｏで疾患もしくは症状のシグネチャを同定する方法。
前記１つまたは複数のマーカーが、ＤＮＡ、ＲＮＡ、タンパク質、炭水化物、および脂質からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
前記無細胞体液試料が、生存している病気の細胞、死んだ病気の細胞、アポトーシスを起こした病気の細胞、循環腫瘍細胞、感染性因子、胎生細胞、栄養芽細胞、またはこれらの断片を含む、請求項１に記載の方法。
前記無細胞体液試料が、全血、尿、大便、唾液、リンパ液、脳脊髄液、滑液、嚢胞液、腹水、血漿、血清、眼内液、鼻汁、肺洗浄液、腹腔液、胸水、妊娠第１三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第２三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第３三半期の妊婦から得られた体液、母体血、羊水、絨毛膜絨毛試料、着床前胚の体液、母体尿、母体唾液、胎盤試料、胎児血液、洗浄液および頸膣部液、間質液、または眼液を含む、請求項１に記載の方法。
前記貪食細胞が、好中球、マクロファージ、単球、樹状細胞、泡沫細胞、マスト細胞、好酸球、またはこれらの混合物である、請求項１に記載の方法。
前記非貪食細胞が、Ｔ細胞、Ｂ細胞、ヌル細胞、好塩基球、またはこれらの混合物である、請求項１に記載の方法。
前記無細胞体液試料が、抽出、遠心分離、および濾過からなる群から選択される方法により得られる、請求項１に記載の方法。
前記疾患もしくは症状が感染である、請求項１に記載の方法。
前記疾患もしくは症状が癌である、請求項１に記載の方法。
前記疾患もしくは症状が、心血管系の疾患または症状、腎臓関連の疾患または症状、胎児期もしくは妊娠関連の疾患または症状、神経性もしくは精神神経性の疾患または症状、自己免疫もしくは免疫関連の疾患または症状、癌、感染性の疾患または症状、ミトコンドリア病、呼吸器胃腸管系の疾患または症状、生殖器系の疾患または症状、眼部の疾患または症状、筋骨格系の疾患または症状、あるいは皮膚の疾患または症状である、請求項１に記載の方法。
前記同定が、前記第１プロファイルと前記第２プロファイルを比較することを含む、請求項１に記載の方法。