JP2015523854A5 - - Google Patents

Download PDF

Info

Publication number
JP2015523854A5
JP2015523854A5 JP2015512858A JP2015512858A JP2015523854A5 JP 2015523854 A5 JP2015523854 A5 JP 2015523854A5 JP 2015512858 A JP2015512858 A JP 2015512858A JP 2015512858 A JP2015512858 A JP 2015512858A JP 2015523854 A5 JP2015523854 A5 JP 2015523854A5
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
oligonucleotide
stranded oligonucleotide
nucleotides
nucleotide
item
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2015512858A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2015523854A (ja
Filing date
Publication date
Application filed filed Critical
Priority claimed from PCT/US2013/041440 external-priority patent/WO2013173638A1/en
Publication of JP2015523854A publication Critical patent/JP2015523854A/ja
Publication of JP2015523854A5 publication Critical patent/JP2015523854A5/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Description

本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
配列5’X−Y−Zを有する一本鎖オリゴヌクレオチドであって、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Yは、ヒトミクロRNAのシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、SMN遺伝子のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的である、一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目2)
前記オリゴヌクレオチドが、3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目1に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目3)
前記オリゴヌクレオチドが、4個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目1に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目4)
前記オリゴヌクレオチドが、長さ8〜30ヌクレオチドである、項目1〜3のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目5)
前記オリゴヌクレオチドが、長さ8〜10ヌクレオチドであり、PRC2関連領域の相補的配列のヌクレオチドの1、2、又は3個を除く全てが、シトシン又はグアノシンヌクレオチドである、項目1〜3のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目6)
前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、ヌクレオチド類似体である、項目1〜5のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目7)
前記少なくとも1個のヌクレオチド類似体が、前記少なくとも1つのヌクレオチド類似体を含まないオリゴヌクレオチドと比較して、1〜5℃の範囲のオリゴヌクレオチドのTmの増加をもたらす、項目7に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目8)
前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目1〜7のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目9)
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目1〜9のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目10)
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個のリボヌクレオチド、少なくとも1個のデオキシリボヌクレオチド、又は少なくとも1個の架橋ヌクレオチドを含む、項目1〜9のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目11)
前記架橋ヌクレオチドが、LNAヌクレオチド、cEtヌクレオチド又はENA修飾ヌクレオチドである、項目10に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目12)
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドである、項目1〜6のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目13)
前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと2’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチドを交互に含む、項目1〜6のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目14)
前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含む、項目1〜6のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴ
ヌクレオチド。
(項目15)
前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドとENAヌクレオチド類似体を交互に含む、項目1〜6のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目16)
前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドとLNAヌクレオチドを交互に含む、項目1〜6のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目17)
前記オリゴヌクレオチドの前記5’ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドである、項目13〜16のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目18)
前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含む、項目1〜6のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目19)
前記オリゴヌクレオチドの前記5’ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドである、項目19に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目20)
前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、前記デオキシリボヌクレオチドの前記5’及び3’末端の各々で、少なくとも1個のLNAヌクレオチドによってフランキングされているデオキシリボヌクレオチドを含む、項目1〜8のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目21)
少なくとも2個のヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合をさらに含む、項目1〜20のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目22)
全ヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、項目21に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目23)
前記オリゴヌクレオチドの前記3’位のヌクレオチドが、3’ヒドロキシル基を有する、項目1〜22のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目24)
前記オリゴヌクレオチドの前記3’位のヌクレオチドが、3’チオホスフェートを有する、項目1〜22のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目25)
前記5’ヌクレオチドに結合したビオチン部分をさらに含む、項目1〜24のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目26)
SMN遺伝子のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な相補性の領域を含む一本鎖オリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、以下:
a)5’X−Y−Zの配列であって、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Xは、前記ヌクレオチドの5’末端に固定されており、Yは、ミクロRNAのヒトシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列である、配列;
b)3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない配列;
c)ヌクレオチドの全ての配列に対して閾値レベルに満たない配列同一性を有し、オフターゲット遺伝子の5’末端の上流50キロベースから前記オフターゲット遺伝子の3’
末端の下流50キロベースの間にある、同等長さの配列;
d)少なくとも2つの一本鎖ループを含む二次構造を形成するRNAをコードするPRC2関連領域と相補的な配列;及び/又は
e)60%を超えるG−C含有率を有する配列
の少なくとも1つを有する、一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目27)
前記オリゴヌクレオチドが、配列5’X−Y−Zを有し、前記オリゴヌクレオチドが、長さ8〜50ヌクレオチドである、項目26に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
(項目28)
項目1〜27のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドと、担体とを含む組成物。
(項目29)
緩衝液中に項目1〜27のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドを含む組成物。
(項目30)
前記オリゴヌクレオチドが、前記担体に結合している、項目29に記載の組成物。
(項目31)
前記担体が、ペプチドである、項目30に記載の組成物。
(項目32)
前記担体が、ステロイドである、項目30に記載の組成物。
(項目33)
項目28〜32のいずれか1項に記載の組成物と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
(項目34)
項目28〜33のいずれか1項に記載の組成物を収納する容器を含むキット。
(項目35)
1細胞におけるSMN1又はSMN2の発現を増大する方法であって、項目1〜28のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドを前記細胞送達することを含む方法。
(項目36)
前記細胞への前記一本鎖オリゴヌクレオチドの送達が、前記一本鎖オリゴヌクレオチドを含まない対照細胞におけるSMN1又はSMN2の発現のレベルより少なくとも50%高い、SMN1又はSMN2の発現のレベルをもたらす、項目35に記載の方法。
(項目37)
1被験者におけるSMN1又はSMN2のレベルを増大する方法であって、項目1〜27のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドを前記被験者に投与することを含む方法。
(項目38)
1被験者におけるSMN1又はSMN2のレベル低下に関連する状態を治療する方法であって、項目1〜27のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドを前記被験者に投与することを含む方法。
(項目39)
前記状態が、脊髄性筋萎縮症である、項目38に記載の方法。
(項目40)
1細胞におけるSMNタンパク質の発現を増大する方法であって、以下:
前記細胞においてエキソン7を含むSMN2の成熟mRNAの発現を増大するのに十分な量で、SMN2のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、SMN2のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを前記細胞に送達することを含む方法。
(項目41)
前記スプライス制御配列が、SMN2のエキソンに常在する、項目40に記載の方法

(項目42)
前記エキソンが、エキソン7又はエキソン8である、項目41に記載の方法。
(項目43)
前記スプライス制御配列が、SMN2のイントロン−エキソン接合部を横断する、項目40に記載の方法。
(項目44)
前記イントロン−エキソン接合部が、イントロン6/エキソン7接合部又はイントロン7/エキソン8接合部である、項目43に記載の方法。
(項目45)
前記スプライス制御配列が、SMN2のイントロンに常在する、項目40に記載の方法。
(項目46)
前記イントロンが、イントロン6又はイントロン7である、項目45に記載の方法。
(項目47)
前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、配列5’X−Y−Zを有し、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Yは、ヒトミクロRNAのシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列である、項目40〜46のいずれか1項に記載の方法。
(項目48)
前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目40〜47のいずれか1項に記載の方法。
(項目49)
前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、4個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目40〜47のいずれか1項に記載の方法。
(項目50)
前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、長さ8〜30ヌクレオチドである、項目40〜49のいずれか1項に記載の方法。
(項目51)
前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、長さ8〜10ヌクレオチドであり、PRC2関連領域の相補的配列のヌクレオチドの1、2、又は3個を除く全てが、シトシン又はグアノシンヌクレオチドである、項目40〜50のいずれか1項に記載の方法。
(項目52)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを同時に前記細胞に送達する、項目40〜51のいずれか1項に記載の方法。
(項目53)
前記細胞が被験者において存在し、前記細胞に送達する前記ステップが、前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを共製剤として前記被験者に送達することを含む、項目40〜52のいずれか1項に記載の方法。
(項目54)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、リンカーを介して前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドと共有結合している、項目40〜53のいずれか1項に記載の方法。
(項目55)
前記リンカーが、オリゴヌクレオチド、ペプチド、低pH不安定性結合、又はジスルフィド結合を含む、項目54に記載の方法。
(項目56)
前記リンカーが、オリゴヌクレオチドを含み、任意選択で、前記オリゴヌクレオチドが、1〜10個のチミジン又はウリジンを含む、項目54又は55に記載の方法。
(項目57)
前記リンカーが、前記第1及び第2一本鎖オリゴヌクレオチドに比して、哺乳動物の抽
出物中で切断を受けやすい、項目54〜56のいずれか1項に記載の方法。
(項目58)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドと共有結合していない、項目40〜53のいずれか1項に記載の方法。
(項目59)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドと前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、個別に前記細胞に送達される、項目40〜51及び項目58のいずれか1項に記載の方法。
(項目60)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、ヌクレオチド類似体である、項目40〜59のいずれか1項に記載の方法。
(項目61)
前記少なくとも1個のヌクレオチド類似体が、前記少なくとも1個のヌクレオチド類似体を含まないオリゴヌクレオチドと比較して、1〜5℃の範囲のオリゴヌクレオチドのTmの増加をもたらす、項目60に記載の方法。
(項目62)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目40〜61のいずれか1項に記載の方法。
(項目63)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目40〜62のいずれか1項に記載の方法。
(項目64)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個のリボヌクレオチド、少なくとも1個のデオキシリボヌクレオチド、又は少なくとも1個の架橋ヌクレオチドを含む、項目40〜62のいずれか1項に記載の方法。
(項目65)
前記架橋ヌクレオチドが、LNAヌクレオチド、cEtヌクレオチド又はENA修飾ヌクレオチドである、項目64に記載の方法。
(項目66)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドである、項目40〜60のいずれか1項に記載の方法。
(項目67)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと2’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチドを交互に含む、項目40〜60のいずれか1項に記載の方法。
(項目68)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含む、項目40〜60のいずれか1項に記載の方法。
(項目69)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドとENAヌクレオチド類似体を交互に含む、項目40〜60のいずれか1項に記載の方法。
(項目70)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドとLNAヌクレオチドを交互に含む、項目40〜60のいずれか1項に記載の方法。
(項目71)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記5’ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドである、項目67〜70のいずれか1項に記載
の方法。
(項目72)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含む、項目40〜60のいずれか1項に記載の方法。
(項目73)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記5’ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドである、項目72に記載の方法。
(項目74)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、前記デオキシリボヌクレオチドの5’及び3’末端の各々で、少なくとも1個のLNAヌクレオチドによってフランキングされているデオキシリボヌクレオチドを含む、項目40〜60のいずれか1項に記載の方法。
(項目75)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、少なくとも2個のヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合をさらに含む、項目40〜74のいずれか1項に記載の方法。
(項目76)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、全ヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合をさらに含む、項目75に記載の方法。
(項目77)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記3’位のヌクレオチドが、3’ヒドロキシル基を有する、項目40〜76のいずれか1項に記載の方法。
(項目78)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記3’位のヌクレオチドが、3’チオホスフェートを有する、項目40〜76のいずれか1項に記載の方法。
(項目79)
ビオチン部分が、前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記5’又は3’ヌクレオチドに結合している、項目40〜78のいずれか1項に記載の方法。
(項目80)
被験者における脊髄性筋萎縮症を治療する方法であって、以下:
前記被験者においてSMN2タンパク質の発現を増大するのに十分な量で、SMN2のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、SMN2のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを前記被験者に送達すること
を含む方法。
(項目81)
SMN2のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、SMN2のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを含む組成物。
(項目82)
前記スプライス制御配列が、SMN2のエキソンに常在する、項目81に記載の組成物。
(項目83)
前記エキソンが、エキソン7又はエキソン8である、項目82に記載の組成物。
(項目84)
前記スプライス制御配列が、SMN2のイントロン−エキソン接合部を横断する、項目81に記載の組成物。
(項目85)
前記イントロン−エキソン接合部が、前記イントロン6/エキソン7接合部又は前記イントロン7/エキソン8接合部である、項目84に記載の組成物。
(項目86)
前記スプライス制御配列が、SMN2のイントロンに常在する、項目81に記載の組成物。
(項目87)
前記イントロンが、イントロン6又はイントロン7である、項目86に記載の組成物。
(項目88)
前記スプライス制御配列が、少なくとも1つのhnRNAP結合配列を含む、項目81〜87のいずれか1項に記載の組成物。
(項目89)
前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、配列5’X−Y−Zを有し、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Yは、ヒトミクロRNAのシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列である、項目81〜88のいずれか1項に記載の方法。
(項目90)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目81〜89のいずれか1項に記載の組成物。
(項目91)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、4個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目81〜90のいずれか1項に記載の組成物。
(項目92)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、長さ8〜30ヌクレオチドである、項目81〜91のいずれか1項に記載の組成物。
(項目93)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、長さ8〜10ヌクレオチドであり、前記PRC2関連領域の相補的配列の前記ヌクレオチドの1、2、又は3個を除く全てが、シトシン又はグアノシンヌクレオチドである、項目81〜92のいずれか1項に記載の組成物。
(項目94)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、リンカーを介して前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドと共有結合している、項目81〜93のいずれか1項に記載の組成物。
(項目95)
前記リンカーが、オリゴヌクレオチド、ペプチド、低pH不安定性結合、又はジスルフィド結合を含む、項目94に記載の組成物。
(項目96)
前記リンカーが、オリゴヌクレオチドを含み、任意選択で、前記オリゴヌクレオチドが、1〜10個のチミジン又はウリジンを含む、項目94又は95に記載の組成物。
(項目97)
前記リンカーが、第1及び第2一本鎖オリゴヌクレオチドに比して、哺乳動物の抽出物中で切断を受けやすい、項目94〜96のいずれか1項に記載の組成物。
(項目98)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドと共有結合していない、項目81〜93のいずれか1項に記載の組成物。
(項目99)
さらに担体を含む、項目81〜98のいずれか1項に記載の組成物。
(項目100)
前記担体が、薬学的に許容される担体である、項目99に記載の組成物。
(項目101)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、ヌクレオチド類似体である、項目81〜100のいずれか1項に記載の組成物。
(項目102)
前記少なくとも1個のヌクレオチド類似体が、前記少なくとも1個のヌクレオチド類似体を含まないオリゴヌクレオチドと比較して、1〜5℃の範囲のオリゴヌクレオチドのTmの増加をもたらす、項目101に記載の組成物。
(項目103)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目104)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目81〜103のいずれか1項に記載の組成物。
(項目105)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個のリボヌクレオチド、少なくとも1個のデオキシリボヌクレオチド、又は少なくとも1個の架橋ヌクレオチドを含む、項目81〜103のいずれか1項に記載の組成物。
(項目106)
前記架橋ヌクレオチドが、LNAヌクレオチド、cEtヌクレオチド又はENA修飾ヌクレオチドである、項目105に記載の組成物。
(項目107)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドである、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目108)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと2’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチドを交互に含む、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目109)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含む、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目110)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドとENAヌクレオチド類似体を交互に含む、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目111)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドとLNAヌクレオチドを交互に含む、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目112)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記5’ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドである、項目108〜111のいずれか1項に記載の組成物。
(項目113)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含む、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目114)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記5’ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドである、項目113に記載の組成物。
(項目115)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、前記デオキシリボヌクレオチドの5’及び3’末端の各々で、少なくとも1個のLNAヌクレオチドによってフランキングされているデオキシリボヌクレオチドを含む、項目81〜101のいずれか1項に記載の組成物。
(項目116)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、少なくとも2個のヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合をさらに含む、項目81〜115のいずれか1項に記載の組成物。
(項目117)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、全ヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合をさらに含む、項目115又は116に記載の組成物。
(項目118)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記3’位のヌクレオチドが、3’ヒドロキシル基を有する、項目81〜117のいずれか1項に記載の組成物。
(項目119)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記3’位のヌクレオチドが、3’チオホスフェートを有する、項目81〜118のいずれか1項に記載の組成物。
(項目120)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの前記5’又は3’ヌクレオチドに結合したビオチン部分をさらに含む、項目81〜119のいずれか1項に記載の組成物。
(項目121)
一般式A−B−Cを含む化合物であって、
ここで、Aは、1遺伝子のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な一本鎖オリゴヌクレオチドであり、Bは、リンカーであり、Cは、前記遺伝子のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な一本鎖オリゴヌクレオチドである、化合物。
(項目122)
Bが、オリゴヌクレオチド、ペプチド、低pH不安定結合、又はジスルフィド結合を含む、項目121に記載の化合物。
(項目123)
前記スプライス制御配列が、前記遺伝子のエキソン内に常在する、項目121又は122に記載の化合物。
(項目124)
前記スプライス制御配列が、前記遺伝子のイントロン−エキソン接合部を横断する、項目121又は122に記載の化合物。
(項目125)
前記スプライス制御配列が、前記遺伝子のイントロン内に常在する、項目121又は122に記載の化合物。
(項目126)
前記スプライス制御配列が、少なくとも1つのhnRNAP結合配列を含む、項目121〜125のいずれか1項に記載の化合物。
(項目127)
Cの前記配列を有するオリゴヌクレオチドと、1細胞における前記mRNA前駆体のスプライス制御配列とのハイブリダイゼーションにより、前記細胞における前記mRNA前駆体のプロセシングから生じる成熟mRNAでの特定のエキソンの封入が起こる、項目121〜126のいずれか1項に記載の化合物。
(項目128)
Cの前記配列を有するオリゴヌクレオチドと、1細胞における前記mRNA前駆体のスプライス制御配列とのハイブリダイゼーションにより、前記細胞における前記mRNA前駆体のプロセシングから生じる成熟mRNAでの特定のイントロン又はエキソンの排除が起こる、項目121〜126のいずれか1項に記載の化合物。
(項目129)
前記遺伝子が、SMN2である、項目121〜128のいずれか1項に記載の化合物。
(項目130)
前記スプライス制御配列が、イントロン6、イントロン7、エキソン7、エキソン8又はイントロン7とエキソン8の接合部に常在する、項目129に記載の化合物。
(項目131)
Aが、配列5’X−Y−Zを有し、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Yは、ヒトミクロRNAのシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列である、項目121〜130のいずれか1項に記載の化合物。
(項目132)
Aが、3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目121〜131のいずれか1項に記載の化合物。
(項目133)
Aが、4個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目121〜132のいずれか1項に記載の化合物。
(項目134)
Aが、長さ8〜30ヌクレオチドである、項目121〜133のいずれか1項に記載の化合物。
(項目135)
Aが、長さ8〜10ヌクレオチドであり、前記PRC2関連領域の相補的配列のヌクレオチドの1、2、又は3個を除く全てが、シトシン又はグアノシンヌクレオチドである、項目121〜134のいずれか1項に記載の化合物。
(項目136)
Bが、1〜10個のチミジン又はウリジンを含むオリゴヌクレオチドである、項目121〜151のいずれか1項に記載の化合物。
(項目137)
Bが、A及びCに比して、哺乳動物の抽出物中で切断を受けやすい、項目121〜136のいずれか1項に記載の化合物。
(項目138)
前記化合物の少なくとも1個のヌクレオチドが、ヌクレオチド類似体である、項目121〜137のいずれか1項に記載の化合物。
(項目139)
前記化合物の少なくとも1個のヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目121〜138のいずれか1項に記載の化合物。
(項目140)
前記化合物の各ヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目121〜139のいずれか1項に記載の化合物。
(項目141)
前記化合物が、少なくとも1個のリボヌクレオチド、少なくとも1個のデオキシリボヌ
クレオチド、又は少なくとも1個の架橋ヌクレオチドを含む、項目121〜140のいずれか1項に記載の化合物。
(項目142)
前記架橋ヌクレオチドが、LNAヌクレオチド、cEtヌクレオチド又はENA修飾ヌクレオチドである、項目141に記載の化合物。
(項目143)
1遺伝子のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な第1一本鎖オリゴヌクレオチドを収容する第1容器と;
前記遺伝子のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な第2一本鎖オリゴヌクレオチドを収容する第2容器と
を含むキット。
(項目144)
前記スプライス制御配列が、前記遺伝子のエキソンに常在する、項目143に記載のキット。
(項目145)
前記スプライス制御配列が、前記遺伝子のイントロン−エキソン接合部を横断する、項目143に記載のキット。
(項目146)
前記スプライス制御配列が、前記遺伝子のイントロンに常在する、項目145に記載のキット。
(項目147)
前記スプライス制御配列が、少なくとも1つのhnRNAP結合配列を含む、項目143〜146のいずれか1項に記載のキット。
(項目148)
Cの前記配列を有するオリゴヌクレオチドと、1細胞における前記mRNA前駆体の前記スプライス制御配列とのハイブリダイゼーションにより、前記細胞における前記mRNA前駆体のプロセシングから生じる成熟mRNAでの特定のエキソンの封入が起こる、項目143〜147のいずれか1項に記載のキット。
(項目149)
Cの前記配列を有するオリゴヌクレオチドと、1細胞における前記mRNA前駆体の前記スプライス制御配列とのハイブリダイゼーションにより、前記細胞における前記mRNA前駆体のプロセシングから生じる成熟mRNAでの特定のイントロン又はエキソンの排除が起こる、項目143〜149のいずれか1項に記載のキット。
(項目150)
前記遺伝子が、SMN2である、項目143〜149のいずれか1項に記載のキット。
(項目151)
前記スプライス制御配列が、イントロン6、イントロン7、エキソン7、エキソン8又はイントロン7とエキソン8の接合部に常在する、項目150に記載のキット。
(項目152)
前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、配列5’X−Y−Zを有し、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Yは、ヒトミクロRNAのシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列である、項目143〜151のいずれか1項に記載のキット。
(項目153)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目143〜152のいずれか1項に記載のキット。
(項目154)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、4個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない、項目143〜153のいずれか1項に記載のキット。
(項目155)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、長さ8〜30ヌクレオチドである、項目143〜154のいずれか1項に記載のキット。
(項目156)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、長さ8〜10ヌクレオチドであり、前記PRC2関連領域の相補的配列のヌクレオチドの1、2、又は3個を除く全てが、シトシン又はグアノシンヌクレオチドである、項目143〜155のいずれか1項に記載のキット。
(項目157)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、ヌクレオチド類似体である、項目143〜156のいずれか1項に記載のキット。
(項目158)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目143〜157のいずれか1項に記載のキット。
(項目159)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、項目143〜158のいずれか1項に記載のキット。
(項目160)
前記第1一本鎖オリゴヌクレオチド又は第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個のリボヌクレオチド、少なくとも1個のデオキシリボヌクレオチド、又は少なくとも1個の架橋ヌクレオチドを含む、項目143〜159のいずれか1項に記載のキット。
(項目161)
前記架橋ヌクレオチドが、LNAヌクレオチド、cEtヌクレオチド又はENA修飾ヌクレオチドである、項目160に記載のキット。
本明細書に開示する本発明の態様は、細胞における特定の遺伝子の発現を上方制御する上で有用な方法及び組成物を提供する。ある実施形態において、1遺伝子のPRC2関連領域をターゲティングし、これによりその遺伝子の上方制御を引き起こす一本鎖オリゴヌクレオチドが提供される。また、本明細書において、遺伝子の特定のスプライス変異体の発現を選択的に誘導するのに有用な方法及び関連一本鎖オリゴヌクレオチドも提供される。ある実施形態では、上記方法は、1細胞においてスプライス変異体によりコードされる特定のタンパク質アイソフォームのレベルを制御する上で有用である。ある実施形態では、上記方法は、疾患を治療するのに十分なレベルまでタンパク質の発現を誘導する上で有用である。

Claims (19)

  1. 配列5’X−Y−Zを有する一本鎖オリゴヌクレオチドであって、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Yは、ヒトミクロRNAのシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、前記一本鎖オリゴヌクレオチドが、SMN遺伝子のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的である、一本鎖オリゴヌクレオチド。
  2. (a)前記オリゴヌクレオチドが、個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含ま任意選択で、前記オリゴヌクレオチドが、3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない;及び/あるいは
    (b)前記オリゴヌクレオチドが、
    i.長さ8〜30ヌクレオチドであるか、又は
    ii.長さ8〜10ヌクレオチドであり、前記PRC2関連領域の相補的配列のヌクレオチドの1、2、又は3個を除く全てが、シトシン又はグアノシンヌクレオチドである、請求項1に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  3. 前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、ヌクレオチド類似体であり、任意選択で、
    前記少なくとも1個のヌクレオチド類似体が、前記少なくとも1つのヌクレオチド類似体を含まないオリゴヌクレオチドと比較して、1〜5℃の範囲のオリゴヌクレオチドのTmの増加をもたらす、請求項1又は2に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  4. (a)前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオチドが、2’O−メチルを含任意選択で、(b)前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、2’O−メチルを含む、請求項1〜のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  5. (a)前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個のリボヌクレオチド、少なくとも1個のデオキシリボヌクレオチド、又は少なくとも1個の架橋ヌクレオチドを含任意選択で、前記架橋ヌクレオチドが、LNAヌクレオチド、cEtヌクレオチド又はENA修飾ヌクレオチドであるか;あるいは、
    (b)前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドを含み、前記デオキシリボヌクレオチドの5’及び3’末端の各々には、少なくとも1個のLNAヌクレオチドがフランキングされている、請求項1〜3又は4(a)のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  6. (a)前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、LNAヌクレオチドであるか;あるいは
    (b)前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチドが、
    (i)デオキシリボヌクレオチドと2’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチドを交互に含むか;
    (ii)デオキシリボヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含むか;
    (iii)デオキシリボヌクレオチドとENAヌクレオチド類似体を交互に含むか;
    (iv)デオキシリボヌクレオチドとLNAヌクレオチドを交互に含むか;又は
    (v)LNAヌクレオチドと2’−O−メチルヌクレオチドを交互に含む、請求項1〜のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  7. 前記オリゴヌクレオチドの5’ヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチド又はLNAヌクレオチドである、請求項6(b)に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  8. 少なくとも2個のヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合をさらに含任意選択で、全ヌクレオチドの間に、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合をさらに含む、請求項1〜のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  9. (a)前記オリゴヌクレオチドの3’位のヌクレオチドが、3’ヒドロキシル基を有する、
    (b)前記オリゴヌクレオチドの3’位のヌクレオチドが、3’チオホスフェートを有する、及び/又は
    (c)前記オリゴヌクレオチドが、5’ヌクレオチドに結合したビオチン部分をさらに含む、請求項1〜のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド。
  10. SMN遺伝子のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な相補性の領域を含む一本鎖オリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、以下:
    a)5’X−Y−Zの配列であって、ここで、Xは、任意のヌクレオチドであり、Xは、前記オリゴヌクレオチドの5’末端に固定されており、Yは、ミクロRNAのヒトシード配列ではない、長さ6ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり、Zは、長さ1〜23ヌクレオチドのヌクレオチド配列である、配列;
    b)3個以上の連続したグアノシンヌクレオチドを含まない配列;
    c)ヌクレオチドの全ての配列に対して閾値レベルに満たない配列同一性を有し、オフターゲット遺伝子の5’末端の上流50キロベースから前記オフターゲット遺伝子の3’末端の下流50キロベースの間にある、同等長さの配列;
    d)少なくとも2つの一本鎖ループを含む二次構造を形成するRNAをコードするPRC2関連領域と相補的な配列;及び/又は
    e)60%を超えるG−C含有率を有する配列
    の少なくとも1つを有し、任意選択で、(a)〜(e)のうちのいずれかにおいて、前記オリゴヌクレオチドが、配列5’X−Y−Zを有し、前記オリゴヌクレオチドが、長さ8〜50ヌクレオチドである、一本鎖オリゴヌクレオチド。
  11. 請求項1〜10のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドと、担体とを含む組成物であって、任意選択で、
    (a)前記組成物が、薬学的に許容される担体を含む医薬組成物である、
    (b)前記組成物が、緩衝液中に前記一本鎖オリゴヌクレオチドを含む、及び/又は
    (c)前記オリゴヌクレオチドが、前記担体に結合しており、任意選択で、前記担体が、ペプチド又はステロイドである、
    組成物
  12. 請求項11に記載の組成物を収納する容器を含むキット。
  13. 1細胞におけるSMN1又はSMN2の発現を増大するための組成物であって、請求項1〜10のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドを含み、任意選択で、前記細胞への前記組成物の送達が、前記一本鎖オリゴヌクレオチドを含まない対照細胞におけるSMN1又はSMN2の発現のレベルより少なくとも50%高い、SMN1又はSMN2の発現のレベルをもたらす、組成物
  14. 1被験者におけるSMN1又はSMN2のレベルを増大するための組成物であって、請求項1〜10のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドを含む、組成物
  15. 1被験者におけるSMN1又はSMN2のレベル低下に関連する状態を治療するための組成物であって、請求項1〜10のいずれか1項に記載の一本鎖オリゴヌクレオチドを含み、任意選択で、前記状態が、脊髄性筋萎縮症である、組成物
  16. 1細胞におけるSMNタンパク質の発現を増大するための組合せ物であって、以下:
    前記細胞においてエキソン7を含むSMN2の成熟mRNAの発現を増大するのに十分な量で、SMN2のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、SMN2のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを含み、任意選択で、前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、リンカーを介して前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドと共有結合している、組合せ物
  17. 被験者における脊髄性筋萎縮症を治療するための組合せ物であって、以下:
    MN2のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、SMN2のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを含み、前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドおよび前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドが、前記被験者においてSMNタンパク質の発現を増大するのに十分な量で前記被験者に投与されるものであることを特徴とする、組合せ物
  18. SMN2のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な第1一本鎖オリゴヌクレオチドと、SMN2のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な第2一本鎖オリゴヌクレオチドとを含む組成物であって、任意選択で、前記第1一本鎖オリゴヌクレオチドが、リンカーを介して前記第2一本鎖オリゴヌクレオチドと共有結合している、組成物
  19. 一般式A−B−Cを含む化合物であって、
    ここで、Aは、1遺伝子のPRC2関連領域の少なくとも8個の連続したヌクレオチドと相補的な一本鎖オリゴヌクレオチドであり、Bは、リンカーであり、Cは、前記遺伝子のmRNA前駆体のスプライス制御配列と相補的な一本鎖オリゴヌクレオチドであり、任意選択で、前記遺伝子はSMN2である、化合物。
JP2015512858A 2012-05-16 2013-05-16 Smn遺伝子ファミリー発現を調節するための組成物及び方法 Pending JP2015523854A (ja)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261647858P 2012-05-16 2012-05-16
US61/647,858 2012-05-16
US201261719394P 2012-10-27 2012-10-27
US61/719,394 2012-10-27
US201361785529P 2013-03-14 2013-03-14
US61/785,529 2013-03-14
PCT/US2013/041440 WO2013173638A1 (en) 2012-05-16 2013-05-16 Compositions and methods for modulating smn gene family expression

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2015523854A JP2015523854A (ja) 2015-08-20
JP2015523854A5 true JP2015523854A5 (ja) 2016-06-30

Family

ID=49584305

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2015512858A Pending JP2015523854A (ja) 2012-05-16 2013-05-16 Smn遺伝子ファミリー発現を調節するための組成物及び方法

Country Status (13)

Country Link
US (1) US10059941B2 (ja)
EP (1) EP2850186B1 (ja)
JP (1) JP2015523854A (ja)
KR (1) KR20150030205A (ja)
CN (1) CN104540947A (ja)
AU (1) AU2013262649A1 (ja)
CA (1) CA2873794A1 (ja)
DK (1) DK2850186T3 (ja)
EA (1) EA201492123A1 (ja)
HK (1) HK1208700A1 (ja)
SG (1) SG11201407483YA (ja)
WO (1) WO2013173638A1 (ja)
ZA (1) ZA201409228B (ja)

Families Citing this family (37)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK2638163T3 (en) 2010-11-12 2017-07-24 Massachusetts Gen Hospital POLYCOMB-ASSOCIATED NON-CODING RNAs
US9920317B2 (en) 2010-11-12 2018-03-20 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US10837014B2 (en) 2012-05-16 2020-11-17 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating SMN gene family expression
EA201492122A1 (ru) 2012-05-16 2015-10-30 Рана Терапьютикс, Инк. Композиции и способы для модулирования экспрессии utrn
US10174323B2 (en) 2012-05-16 2019-01-08 The General Hospital Corporation Compositions and methods for modulating ATP2A2 expression
KR20150030205A (ko) 2012-05-16 2015-03-19 라나 테라퓨틱스, 인크. Smn 유전자 패밀리 발현을 조절하기 위한 조성물 및 방법
EP2850188A4 (en) 2012-05-16 2016-01-20 Rana Therapeutics Inc COMPOSITIONS AND METHODS FOR MODULATING THE EXPRESSION OF THE MULTIGENIC FAMILY OF HEMOGLOBIN
AU2013262709A1 (en) 2012-05-16 2015-01-22 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating MECP2 expression
US9885040B2 (en) * 2013-04-12 2018-02-06 The Curators Of The University Of Missouri SMN2 element 1 antisense compositions and methods and uses thereof
WO2015051283A1 (en) 2013-10-04 2015-04-09 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for treating amyotrophic lateral sclerosis
CN103911346B (zh) * 2014-03-27 2016-09-07 江苏雄鸣医药科技有限公司 一种用于治疗脊髓性肌萎缩症药物筛选的细胞模型
WO2016040748A1 (en) 2014-09-12 2016-03-17 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for detection of smn protein in a subject and treatment of a subject
WO2016070060A1 (en) 2014-10-30 2016-05-06 The General Hospital Corporation Methods for modulating atrx-dependent gene repression
WO2016149455A2 (en) 2015-03-17 2016-09-22 The General Hospital Corporation The rna interactome of polycomb repressive complex 1 (prc1)
US10851371B2 (en) 2015-04-10 2020-12-01 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of SMN expression
US11249071B2 (en) 2015-04-24 2022-02-15 California Institute Of Technology Reactivation of x chromosome genes
CA2996164A1 (en) * 2015-08-28 2017-03-09 Sarepta Therapeutics, Inc. Modified antisense oligomers for exon inclusion in spinal muscular atrophy
EP3368671A1 (en) * 2015-10-26 2018-09-05 Translate Bio Ma, Inc. Methods and compositions for increasing smn expression
WO2017087486A1 (en) 2015-11-16 2017-05-26 Ohio State Innovation Foundation Methods and compositions for treating disorders and diseases using survival motor neuron (smn) protein
EP3471779A4 (en) * 2016-06-16 2020-07-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. COMBINATIONS FOR MODULATING THE SMN EXPRESSION
US11197881B2 (en) 2016-10-27 2021-12-14 California Institute Of Technology HDAC inhibitor compositions for reactivation of the X chromosome
CN110290794A (zh) 2016-11-01 2019-09-27 纽约州州立大学研究基金会 5-卤代尿嘧啶修饰的微rna及其在癌症治疗中的用途
AU2017368050A1 (en) 2016-11-29 2019-06-20 Puretech Lyt, Inc. Exosomes for delivery of therapeutic agents
US11401519B2 (en) * 2017-06-07 2022-08-02 University Of Massachusetts Anti-ADAM33 oligonucleotides and related methods
WO2019048632A1 (en) 2017-09-08 2019-03-14 Mina Therapeutics Limited STABILIZED COMPOSITIONS OF SMALL ACTIVATORY RNA (PARNA) OF HNF4A AND METHODS OF USE
US20200208152A1 (en) 2017-09-08 2020-07-02 Mina Therapeutics Limited Stabilized sarna compositions and methods of use
WO2019075357A1 (en) * 2017-10-12 2019-04-18 Wave Life Sciences Ltd. OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND RELATED METHODS
AU2019350786A1 (en) 2018-09-26 2021-05-13 Greenlight Biosciences, Inc. Control of Coleopteran insects
BR112021009053A2 (pt) 2018-11-08 2021-08-24 Greenlight Biosciences, Inc. Controle de infestação de insetos
WO2020146519A1 (en) * 2019-01-09 2020-07-16 Coyote Bioscience Usa Inc. Methods and systems for identification of spinal muscular atrophy
JP2022544538A (ja) * 2019-08-15 2022-10-19 バイオジェン・エムエイ・インコーポレイテッド 脊髄性筋萎縮症のための併用療法
CA3151996A1 (en) 2019-08-19 2021-02-25 Mina Therapeutics Limited Oligonucleotide conjugate compositions and methods of use
US20220064638A1 (en) 2020-02-28 2022-03-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating smn2
CN113444722A (zh) * 2020-03-24 2021-09-28 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 单碱基编辑介导的剪接修复在制备治疗脊髓性肌萎缩症中的应用
US20240141384A1 (en) * 2021-02-19 2024-05-02 University Of Florida Research Foundation, Incoporated Methods and compositions to confer regulation to gene therapy cargoes by heterologous use of alternative splicing cassettes
WO2023020421A1 (en) * 2021-08-16 2023-02-23 Hangzhou Jiayin Biotech Ltd. Regulation of imprinting silenced genes by smn1 and snrpn expression and uses thereof
WO2023034983A2 (en) * 2021-09-03 2023-03-09 Camp4 Therapeutics Corporation Modulation of gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas

Family Cites Families (400)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
US4469863A (en) 1980-11-12 1984-09-04 Ts O Paul O P Nonionic nucleic acid alkyl and aryl phosphonates and processes for manufacture and use thereof
DE3280400D1 (de) 1981-10-23 1992-06-04 Molecular Biosystems Inc Oligonukleotides heilmittel und dessen herstellungsverfahren.
US5023243A (en) 1981-10-23 1991-06-11 Molecular Biosystems, Inc. Oligonucleotide therapeutic agent and method of making same
US4476301A (en) 1982-04-29 1984-10-09 Centre National De La Recherche Scientifique Oligonucleotides, a process for preparing the same and their application as mediators of the action of interferon
JPS5927900A (ja) 1982-08-09 1984-02-14 Wakunaga Seiyaku Kk 固定化オリゴヌクレオチド
FR2540122B1 (fr) 1983-01-27 1985-11-29 Centre Nat Rech Scient Nouveaux composes comportant une sequence d'oligonucleotide liee a un agent d'intercalation, leur procede de synthese et leur application
US4605735A (en) 1983-02-14 1986-08-12 Wakunaga Seiyaku Kabushiki Kaisha Oligonucleotide derivatives
US4948882A (en) 1983-02-22 1990-08-14 Syngene, Inc. Single-stranded labelled oligonucleotides, reactive monomers and methods of synthesis
US4824941A (en) 1983-03-10 1989-04-25 Julian Gordon Specific antibody to the native form of 2'5'-oligonucleotides, the method of preparation and the use as reagents in immunoassays or for binding 2'5'-oligonucleotides in biological systems
DE3329892A1 (de) 1983-08-18 1985-03-07 Köster, Hubert, Prof. Dr., 2000 Hamburg Verfahren zur herstellung von oligonucleotiden
US4587044A (en) 1983-09-01 1986-05-06 The Johns Hopkins University Linkage of proteins to nucleic acids
US5118802A (en) 1983-12-20 1992-06-02 California Institute Of Technology DNA-reporter conjugates linked via the 2' or 5'-primary amino group of the 5'-terminal nucleoside
US5550111A (en) 1984-07-11 1996-08-27 Temple University-Of The Commonwealth System Of Higher Education Dual action 2',5'-oligoadenylate antiviral derivatives and uses thereof
US5367066A (en) 1984-10-16 1994-11-22 Chiron Corporation Oligonucleotides with selectably cleavable and/or abasic sites
US5430136A (en) 1984-10-16 1995-07-04 Chiron Corporation Oligonucleotides having selectably cleavable and/or abasic sites
US5258506A (en) 1984-10-16 1993-11-02 Chiron Corporation Photolabile reagents for incorporation into oligonucleotide chains
US4828979A (en) 1984-11-08 1989-05-09 Life Technologies, Inc. Nucleotide analogs for nucleic acid labeling and detection
FR2575751B1 (fr) 1985-01-08 1987-04-03 Pasteur Institut Nouveaux nucleosides de derives de l'adenosine, leur preparation et leurs applications biologiques
US5405938A (en) 1989-12-20 1995-04-11 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
US5185444A (en) 1985-03-15 1993-02-09 Anti-Gene Deveopment Group Uncharged morpolino-based polymers having phosphorous containing chiral intersubunit linkages
US5235033A (en) 1985-03-15 1993-08-10 Anti-Gene Development Group Alpha-morpholino ribonucleoside derivatives and polymers thereof
US5166315A (en) 1989-12-20 1992-11-24 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
US4762779A (en) 1985-06-13 1988-08-09 Amgen Inc. Compositions and methods for functionalizing nucleic acids
US5317098A (en) 1986-03-17 1994-05-31 Hiroaki Shizuya Non-radioisotope tagging of fragments
JPS638396A (ja) 1986-06-30 1988-01-14 Wakunaga Pharmaceut Co Ltd ポリ標識化オリゴヌクレオチド誘導体
DE3788914T2 (de) 1986-09-08 1994-08-25 Ajinomoto Kk Verbindungen zur Spaltung von RNS an eine spezifische Position, Oligomere, verwendet bei der Herstellung dieser Verbindungen und Ausgangsprodukte für die Synthese dieser Oligomere.
US5264423A (en) 1987-03-25 1993-11-23 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Inhibitors for replication of retroviruses and for the expression of oncogene products
US5276019A (en) 1987-03-25 1994-01-04 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Inhibitors for replication of retroviruses and for the expression of oncogene products
US4904582A (en) 1987-06-11 1990-02-27 Synthetic Genetics Novel amphiphilic nucleic acid conjugates
AU598946B2 (en) 1987-06-24 1990-07-05 Howard Florey Institute Of Experimental Physiology And Medicine Nucleoside derivatives
US5585481A (en) 1987-09-21 1996-12-17 Gen-Probe Incorporated Linking reagents for nucleotide probes
US4924624A (en) 1987-10-22 1990-05-15 Temple University-Of The Commonwealth System Of Higher Education 2,',5'-phosphorothioate oligoadenylates and plant antiviral uses thereof
US5188897A (en) 1987-10-22 1993-02-23 Temple University Of The Commonwealth System Of Higher Education Encapsulated 2',5'-phosphorothioate oligoadenylates
US5525465A (en) 1987-10-28 1996-06-11 Howard Florey Institute Of Experimental Physiology And Medicine Oligonucleotide-polyamide conjugates and methods of production and applications of the same
DE3738460A1 (de) 1987-11-12 1989-05-24 Max Planck Gesellschaft Modifizierte oligonukleotide
US5403711A (en) 1987-11-30 1995-04-04 University Of Iowa Research Foundation Nucleic acid hybridization and amplification method for detection of specific sequences in which a complementary labeled nucleic acid probe is cleaved
WO1989005358A1 (en) 1987-11-30 1989-06-15 University Of Iowa Research Foundation Dna and rna molecules stabilized by modifications of the 3'-terminal phosphodiester linkage and their use as nucleic acid probes and as therapeutic agents to block the expression of specifically targeted genes
US5082830A (en) 1988-02-26 1992-01-21 Enzo Biochem, Inc. End labeled nucleotide probe
EP0406309A4 (en) 1988-03-25 1992-08-19 The University Of Virginia Alumni Patents Foundation Oligonucleotide n-alkylphosphoramidates
US5278302A (en) 1988-05-26 1994-01-11 University Patents, Inc. Polynucleotide phosphorodithioates
US5109124A (en) 1988-06-01 1992-04-28 Biogen, Inc. Nucleic acid probe linked to a label having a terminal cysteine
US5216141A (en) 1988-06-06 1993-06-01 Benner Steven A Oligonucleotide analogs containing sulfur linkages
US5175273A (en) 1988-07-01 1992-12-29 Genentech, Inc. Nucleic acid intercalating agents
US5262536A (en) 1988-09-15 1993-11-16 E. I. Du Pont De Nemours And Company Reagents for the preparation of 5'-tagged oligonucleotides
US5512439A (en) 1988-11-21 1996-04-30 Dynal As Oligonucleotide-linked magnetic particles and uses thereof
US5457183A (en) 1989-03-06 1995-10-10 Board Of Regents, The University Of Texas System Hydroxylated texaphyrins
US5599923A (en) 1989-03-06 1997-02-04 Board Of Regents, University Of Tx Texaphyrin metal complexes having improved functionalization
US5391723A (en) 1989-05-31 1995-02-21 Neorx Corporation Oligonucleotide conjugates
US5256775A (en) 1989-06-05 1993-10-26 Gilead Sciences, Inc. Exonuclease-resistant oligonucleotides
US4958013A (en) 1989-06-06 1990-09-18 Northwestern University Cholesteryl modified oligonucleotides
US5451463A (en) 1989-08-28 1995-09-19 Clontech Laboratories, Inc. Non-nucleoside 1,3-diol reagents for labeling synthetic oligonucleotides
US5134066A (en) 1989-08-29 1992-07-28 Monsanto Company Improved probes using nucleosides containing 3-dezauracil analogs
US5254469A (en) 1989-09-12 1993-10-19 Eastman Kodak Company Oligonucleotide-enzyme conjugate that can be used as a probe in hybridization assays and polymerase chain reaction procedures
US5399676A (en) 1989-10-23 1995-03-21 Gilead Sciences Oligonucleotides with inverted polarity
US5264564A (en) 1989-10-24 1993-11-23 Gilead Sciences Oligonucleotide analogs with novel linkages
US5264562A (en) 1989-10-24 1993-11-23 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide analogs with novel linkages
US5292873A (en) 1989-11-29 1994-03-08 The Research Foundation Of State University Of New York Nucleic acids labeled with naphthoquinone probe
US5177198A (en) 1989-11-30 1993-01-05 University Of N.C. At Chapel Hill Process for preparing oligoribonucleoside and oligodeoxyribonucleoside boranophosphates
US5130302A (en) 1989-12-20 1992-07-14 Boron Bilogicals, Inc. Boronated nucleoside, nucleotide and oligonucleotide compounds, compositions and methods for using same
US5486603A (en) 1990-01-08 1996-01-23 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide having enhanced binding affinity
US5578718A (en) 1990-01-11 1996-11-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Thiol-derivatized nucleosides
US6753423B1 (en) 1990-01-11 2004-06-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for enhanced biostability and altered biodistribution of oligonucleotides in mammals
US5587470A (en) 1990-01-11 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5623065A (en) 1990-08-13 1997-04-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped 2' modified oligonucleotides
US5914396A (en) 1990-01-11 1999-06-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-O-modified nucleosides and phosphoramidites
US5459255A (en) 1990-01-11 1995-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-2 substituted purines
US5587361A (en) 1991-10-15 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US6005087A (en) 1995-06-06 1999-12-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
US6395492B1 (en) 1990-01-11 2002-05-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Derivatized oligonucleotides having improved uptake and other properties
US5681941A (en) 1990-01-11 1997-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted purines and oligonucleotide cross-linking
US5149797A (en) 1990-02-15 1992-09-22 The Worcester Foundation For Experimental Biology Method of site-specific alteration of rna and production of encoded polypeptides
US5220007A (en) 1990-02-15 1993-06-15 The Worcester Foundation For Experimental Biology Method of site-specific alteration of RNA and production of encoded polypeptides
US5214136A (en) 1990-02-20 1993-05-25 Gilead Sciences, Inc. Anthraquinone-derivatives oligonucleotides
AU7579991A (en) 1990-02-20 1991-09-18 Gilead Sciences, Inc. Pseudonucleosides and pseudonucleotides and their polymers
US5321131A (en) 1990-03-08 1994-06-14 Hybridon, Inc. Site-specific functionalization of oligodeoxynucleotides for non-radioactive labelling
US5470967A (en) 1990-04-10 1995-11-28 The Dupont Merck Pharmaceutical Company Oligonucleotide analogs with sulfamate linkages
EP0455905B1 (en) 1990-05-11 1998-06-17 Microprobe Corporation Dipsticks for nucleic acid hybridization assays and methods for covalently immobilizing oligonucleotides
WO1992000386A1 (en) 1990-06-27 1992-01-09 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Methods for detecting spinal muscular atrophy type i and types ii/iii and marker therefor
US5489677A (en) 1990-07-27 1996-02-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleoside linkages containing adjacent oxygen and nitrogen atoms
US5623070A (en) 1990-07-27 1997-04-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Heteroatomic oligonucleoside linkages
US5602240A (en) 1990-07-27 1997-02-11 Ciba Geigy Ag. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5677437A (en) 1990-07-27 1997-10-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. Heteroatomic oligonucleoside linkages
US5218105A (en) 1990-07-27 1993-06-08 Isis Pharmaceuticals Polyamine conjugated oligonucleotides
US5618704A (en) 1990-07-27 1997-04-08 Isis Pharmacueticals, Inc. Backbone-modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through radical coupling
US5541307A (en) 1990-07-27 1996-07-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogs and solid phase synthesis thereof
US5610289A (en) 1990-07-27 1997-03-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogues
US5608046A (en) 1990-07-27 1997-03-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated 4'-desmethyl nucleoside analog compounds
BR9106702A (pt) 1990-07-27 1993-06-08 Isis Pharmaceuticals Inc Analogo de oligonucleotideos e processos para modular a producao de uma proteina por um organismo e para tratar um organismo
US5138045A (en) 1990-07-27 1992-08-11 Isis Pharmaceuticals Polyamine conjugated oligonucleotides
US5688941A (en) 1990-07-27 1997-11-18 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods of making conjugated 4' desmethyl nucleoside analog compounds
US5245022A (en) 1990-08-03 1993-09-14 Sterling Drug, Inc. Exonuclease resistant terminally substituted oligonucleotides
DE69115702T2 (de) 1990-08-03 1996-06-13 Sterling Winthrop Inc Verbindungen und verfahren zur unterdrückung der genexpression
US5177196A (en) 1990-08-16 1993-01-05 Microprobe Corporation Oligo (α-arabinofuranosyl nucleotides) and α-arabinofuranosyl precursors thereof
US5512667A (en) 1990-08-28 1996-04-30 Reed; Michael W. Trifunctional intermediates for preparing 3'-tailed oligonucleotides
US5214134A (en) 1990-09-12 1993-05-25 Sterling Winthrop Inc. Process of linking nucleosides with a siloxane bridge
US5561225A (en) 1990-09-19 1996-10-01 Southern Research Institute Polynucleotide analogs containing sulfonate and sulfonamide internucleoside linkages
JPH06505704A (ja) 1990-09-20 1994-06-30 ギリアド サイエンシズ,インコーポレイテッド 改変ヌクレオシド間結合
US5432272A (en) 1990-10-09 1995-07-11 Benner; Steven A. Method for incorporating into a DNA or RNA oligonucleotide using nucleotides bearing heterocyclic bases
KR930702373A (ko) 1990-11-08 1993-09-08 안토니 제이. 페이네 합성 올리고누클레오티드에 대한 다중 리포터(Reporter)그룹의 첨합
JP3514779B2 (ja) 1991-04-17 2004-03-31 株式会社アズウェル アポリポプロテインe遺伝子タイプの検査方法及びその検査に好適なプライマー及びプローブ
US5965722A (en) 1991-05-21 1999-10-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense inhibition of ras gene with chimeric and alternating oligonucleotides
WO1994008003A1 (en) 1991-06-14 1994-04-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE INHIBITION OF THE ras GENE
US7015315B1 (en) 1991-12-24 2006-03-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped oligonucleotides
US5539082A (en) 1993-04-26 1996-07-23 Nielsen; Peter E. Peptide nucleic acids
US5714331A (en) 1991-05-24 1998-02-03 Buchardt, Deceased; Ole Peptide nucleic acids having enhanced binding affinity, sequence specificity and solubility
US5719262A (en) 1993-11-22 1998-02-17 Buchardt, Deceased; Ole Peptide nucleic acids having amino acid side chains
US5371241A (en) 1991-07-19 1994-12-06 Pharmacia P-L Biochemicals Inc. Fluorescein labelled phosphoramidites
US5571799A (en) 1991-08-12 1996-11-05 Basco, Ltd. (2'-5') oligoadenylate analogues useful as inhibitors of host-v5.-graft response
US5661134A (en) 1991-10-15 1997-08-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating Ha-ras or Ki-ras having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US6831166B2 (en) 1992-10-23 2004-12-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. Derivatized oligonucleotides having improved uptake and other properties
US8153602B1 (en) 1991-11-19 2012-04-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Composition and methods for the pulmonary delivery of nucleic acids
US5484908A (en) 1991-11-26 1996-01-16 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotides containing 5-propynyl pyrimidines
US20070032446A1 (en) 1991-12-24 2007-02-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped 2' modified oligonucleotides
ATE515510T1 (de) 1991-12-24 2011-07-15 Isis Pharmaceuticals Inc Durch dna-abschnitte unterbrochene modifizierte oligonukleotide
US5700922A (en) 1991-12-24 1997-12-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. PNA-DNA-PNA chimeric macromolecules
US5565552A (en) 1992-01-21 1996-10-15 Pharmacyclics, Inc. Method of expanded porphyrin-oligonucleotide conjugate synthesis
US5595726A (en) 1992-01-21 1997-01-21 Pharmacyclics, Inc. Chromophore probe for detection of nucleic acid
US5633360A (en) 1992-04-14 1997-05-27 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide analogs capable of passive cell membrane permeation
US5434257A (en) 1992-06-01 1995-07-18 Gilead Sciences, Inc. Binding compentent oligomers containing unsaturated 3',5' and 2',5' linkages
US5272250A (en) 1992-07-10 1993-12-21 Spielvogel Bernard F Boronated phosphoramidate compounds
US6346614B1 (en) 1992-07-23 2002-02-12 Hybridon, Inc. Hybrid oligonucleotide phosphorothioates
US5652355A (en) 1992-07-23 1997-07-29 Worcester Foundation For Experimental Biology Hybrid oligonucleotide phosphorothioates
TW244371B (ja) 1992-07-23 1995-04-01 Tri Clover Inc
AU678769B2 (en) 1992-07-27 1997-06-12 Hybridon, Inc. Oligonucleotide alkylphosphonothioates
US5574142A (en) 1992-12-15 1996-11-12 Microprobe Corporation Peptide linkers for improved oligonucleotide delivery
ES2086997T3 (es) 1993-01-25 1996-07-01 Hybridon Inc Oligonucleotido-alquilfosfonatos y -alquilfosfonotioatos.
US5476925A (en) 1993-02-01 1995-12-19 Northwestern University Oligodeoxyribonucleotides including 3'-aminonucleoside-phosphoramidate linkages and terminal 3'-amino groups
GB9304618D0 (en) 1993-03-06 1993-04-21 Ciba Geigy Ag Chemical compounds
WO1994022891A1 (en) 1993-03-31 1994-10-13 Sterling Winthrop Inc. Oligonucleotides with amide linkages replacing phosphodiester linkages
NZ266386A (en) 1993-05-11 1997-11-24 Univ North Carolina Use of antisense rna oligonucleotides in regulating gene expression
US5502177A (en) 1993-09-17 1996-03-26 Gilead Sciences, Inc. Pyrimidine derivatives for labeled binding partners
US5457187A (en) 1993-12-08 1995-10-10 Board Of Regents University Of Nebraska Oligonucleotides containing 5-fluorouracil
CA2178729A1 (en) 1993-12-09 1995-06-15 Eric B. Kmiec Compounds and methods for site-directed mutations in eukaryotic cells
US5596091A (en) 1994-03-18 1997-01-21 The Regents Of The University Of California Antisense oligonucleotides comprising 5-aminoalkyl pyrimidine nucleotides
US5625050A (en) 1994-03-31 1997-04-29 Amgen Inc. Modified oligonucleotides and intermediates useful in nucleic acid therapeutics
US5525711A (en) 1994-05-18 1996-06-11 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Pteridine nucleotide analogs as fluorescent DNA probes
FR2720757B1 (fr) 1994-06-03 1996-08-02 Inst Nat Sante Rech Med Procédé et sondes pour la détection de marqueurs liés au locus des amyotrophies spinales infantiles.
US5597696A (en) 1994-07-18 1997-01-28 Becton Dickinson And Company Covalent cyanine dye oligonucleotide conjugates
US5580731A (en) 1994-08-25 1996-12-03 Chiron Corporation N-4 modified pyrimidine deoxynucleotides and oligonucleotide probes synthesized therewith
EP0708178A1 (en) 1994-10-19 1996-04-24 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) Survival motor neuron (SMN) gene: a gene for spinal muscular atrophy
US6608035B1 (en) 1994-10-25 2003-08-19 Hybridon, Inc. Method of down-regulating gene expression
US5652356A (en) 1995-08-17 1997-07-29 Hybridon, Inc. Inverted chimeric and hybrid oligonucleotides
US8217015B2 (en) 2003-04-04 2012-07-10 Arrowhead Madison Inc. Endosomolytic polymers
TR199801581T2 (xx) 1996-02-14 1998-10-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. �ekerle de�i�tirilmi� bo�luklu oligon�kleotid'ler.
US6015710A (en) 1996-04-09 2000-01-18 The University Of Texas System Modulation of mammalian telomerase by peptide nucleic acids
US5898031A (en) 1996-06-06 1999-04-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligoribonucleotides for cleaving RNA
US5912332A (en) 1996-07-26 1999-06-15 Hybridon, Inc. Affinity-based purification of oligonucleotides using soluble multimeric oligonucleotides
CA2294900A1 (en) 1997-07-02 1999-01-14 Sdg, Inc. Targeted liposomal constructs for diagnostic and therapeutic uses
JPH1133863A (ja) 1997-07-23 1999-02-09 Howa Mach Ltd 工具交換装置及び工具交換用の押出し装置
US6794499B2 (en) * 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US7572582B2 (en) 1997-09-12 2009-08-11 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US7715989B2 (en) 1998-04-03 2010-05-11 Elitech Holding B.V. Systems and methods for predicting oligonucleotide melting temperature (TmS)
EP1088066B1 (en) 1998-06-19 2006-11-29 McGILL UNIVERSITY Antisense oligonucleotide constructs based on beta-arabinofuranose and its analogues
US6503754B1 (en) 2000-09-07 2003-01-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of BH3 interacting domain death agonist expression
US6646113B1 (en) * 1998-09-17 2003-11-11 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Nucleic acid molecule encoding human survival of motor neuron-interacting protein 1 (SIP1) deletion mutants
US6210892B1 (en) 1998-10-07 2001-04-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Alteration of cellular behavior by antisense modulation of mRNA processing
EP0999270A1 (en) * 1998-10-09 2000-05-10 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) Method of regulating SMN gene expression
US6465628B1 (en) 1999-02-04 2002-10-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Process for the synthesis of oligomeric compounds
CZ296576B6 (cs) 1999-02-12 2006-04-12 Sankyo Company Limited Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem
US9029523B2 (en) 2000-04-26 2015-05-12 Ceres, Inc. Promoter, promoter control elements, and combinations, and uses thereof
US20080281041A1 (en) 1999-06-07 2008-11-13 Rozema David B Reversibly Masked Polymers
US6284538B1 (en) 1999-07-21 2001-09-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense inhibition of PTEN expression
US20040002153A1 (en) 1999-07-21 2004-01-01 Monia Brett P. Modulation of PTEN expression via oligomeric compounds
WO2001007662A1 (en) 1999-07-22 2001-02-01 Genaissance Pharmaceuticals, Inc. Drug target isogenes: polymorphisms in the prostaglandin-endoperoxide synthase 2 gene
US6677445B1 (en) 1999-08-27 2004-01-13 Chiron Corporation Chimeric antisense oligonucleotides and cell transfecting formulations thereof
IL132972A0 (en) 1999-11-16 2001-03-19 Yissum Res Dev Co Pharmaceutical compositions comprising acetylcholinesterase antisense deoxynucleotides for the treatment of muscular and neuromuscular disorders
US6187545B1 (en) * 2000-01-19 2001-02-13 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense modulation of pepck-cytosolic expression
US6287860B1 (en) 2000-01-20 2001-09-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense inhibition of MEKK2 expression
EP1133993A1 (en) 2000-03-10 2001-09-19 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Substances for the treatment of spinal muscular atrophy
CA2404780A1 (en) 2000-03-27 2001-10-04 University Of Delaware Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides
JP2004509604A (ja) 2000-03-28 2004-04-02 アイシス・ファーマシューティカルス・インコーポレーテッド mRNAプロセッシングのアンチセンスモジュレーションによる、細胞行動の改変
US20040241651A1 (en) 2000-04-07 2004-12-02 Alexander Olek Detection of single nucleotide polymorphisms (snp's) and cytosine-methylations
US6784291B2 (en) 2000-05-04 2004-08-31 Avi Biopharma, Inc. Splice-region antisense composition and method
US6777439B2 (en) 2000-05-30 2004-08-17 Advanced Research & Technology Institute, Inc. Compositions and methods for identifying agents which modulate PTEN function and PI-3 kinase pathways
US6727355B2 (en) 2000-08-25 2004-04-27 Jcr Pharmaceuticals Co., Ltd. Pharmaceutical composition for treatment of Duchenne muscular dystrophy
CA2437942C (en) 2000-11-09 2013-06-11 Cold Spring Harbor Laboratory Chimeric molecules to modulate gene expression
WO2002040501A2 (en) 2000-11-20 2002-05-23 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois Membrane scaffold proteins
US20040058356A1 (en) 2001-03-01 2004-03-25 Warren Mary E. Methods for global profiling gene regulatory element activity
US6825338B2 (en) * 2001-03-30 2004-11-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Labeled oligonucleotides, methods for making same, and compounds useful therefor
EP1446500B1 (en) 2001-05-08 2008-08-20 Darwin Molecular Corporation A method for regulating immune function in primates using the foxp3 protein
US20050176025A1 (en) 2001-05-18 2005-08-11 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of B-cell CLL/Lymphoma-2 (BCL-2) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
AU2002344853A1 (en) 2001-06-14 2003-01-02 Active Pass Pharmaceuticals, Inc. Abca10 transporter
US7407943B2 (en) 2001-08-01 2008-08-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of apolipoprotein B expression
US7259150B2 (en) 2001-08-07 2007-08-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of apolipoprotein (a) expression
ATE348104T1 (de) 2001-10-29 2007-01-15 Univ Mcgill Azyklische linker enthaltende oligonukleotide und deren verwendungen
WO2003056030A2 (en) * 2001-11-08 2003-07-10 The Johns Hopkins University Methods and systems of nucleic acid sequencing
US20030198983A1 (en) 2002-02-01 2003-10-23 Affymetrix, Inc. Methods of genetic analysis of human genes
US20080207542A1 (en) 2002-03-26 2008-08-28 Sirna Therapeutics, Inc. RNA inteference mediated inhibition of hepatitis C virus (HVC) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
SI2264172T1 (sl) 2002-04-05 2017-12-29 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligomerne spojine za modulacijo izražanja HIF-1alfa
US20050130924A1 (en) 2002-06-26 2005-06-16 Monia Brett P. Antisense inhibition via RNAse H-independent reduction in mRNA
WO2004011613A2 (en) 2002-07-29 2004-02-05 Epigenesis Pharmaceuticals, Inc. Composition & methods for treatment and screening
US20050003369A1 (en) 2002-10-10 2005-01-06 Affymetrix, Inc. Method for depleting specific nucleic acids from a mixture
US20040219565A1 (en) 2002-10-21 2004-11-04 Sakari Kauppinen Oligonucleotides useful for detecting and analyzing nucleic acids of interest
AU2003291755A1 (en) * 2002-11-05 2004-06-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomers comprising modified bases for binding cytosine and uracil or thymine and their use
US7250496B2 (en) 2002-11-14 2007-07-31 Rosetta Genomics Ltd. Bioinformatically detectable group of novel regulatory genes and uses thereof
US7655785B1 (en) 2002-11-14 2010-02-02 Rosetta Genomics Ltd. Bioinformatically detectable group of novel regulatory oligonucleotides and uses thereof
EP1560931B1 (en) 2002-11-14 2011-07-27 Dharmacon, Inc. Functional and hyperfunctional sirna
EP2141233B1 (en) 2002-11-18 2016-10-19 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense design
WO2004069992A2 (en) 2003-02-10 2004-08-19 Santaris Pharma A/S Oligomeric compounds for the modulation of ras expression
ES2576677T3 (es) 2003-03-21 2016-07-08 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Análogos de ARN interfirientes cortos
FR2853663B1 (fr) 2003-04-14 2007-08-31 Aventis Pharma Sa Procede d'obtention de lignees de mastocytes a partir de tissus de porcs et procede de production de molecules de type heparine
US8092992B2 (en) 2003-05-29 2012-01-10 Salk Institute For Biological Studies Transcriptional regulation of gene expression by small double-stranded modulatory RNA
WO2004113867A2 (en) 2003-06-16 2004-12-29 University Of Massachusetts Exon analysis
EP1648914A4 (en) 2003-07-31 2009-12-16 Regulus Therapeutics Inc OLIGOMERIC COMPOUNDS AND COMPOSITIONS USEFUL FOR MODULATING SMALL NON-CODING RNA
US7888497B2 (en) 2003-08-13 2011-02-15 Rosetta Genomics Ltd. Bioinformatically detectable group of novel regulatory oligonucleotides and uses thereof
US20050108783A1 (en) * 2003-09-23 2005-05-19 Chihiro Koike Porcine invariant chain protein, full length cDNA, genomic organization, and regulatory region
EP1675949A2 (en) 2003-10-23 2006-07-05 Sirna Therapeutics, Inc. RNA INTERFERENCE MEDIATED INHIBITION OF NOGO AND NOGO RECEPTOR GENE EXPRESSION USING SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)
GB0324854D0 (en) 2003-10-24 2003-11-26 Expresson Biosystems Ltd App/ena antisense
UA88457C2 (ru) 2003-10-30 2009-10-26 Коли Фармасьютикал Гмбх Иммуностимулирующая нуклеиновая кислота с улучшенной иммуностимулирующей эффективностью
CA2566823A1 (en) 2003-11-05 2005-05-19 Board Of Regents, The University Of Texas System Diagnostic and therapeutic methods and compositions involving pten and breast cancer
DK1706489T3 (da) 2003-12-23 2010-09-13 Santaris Pharma As Oligomer forbindelser for modulationen af BCL-2
US20050244851A1 (en) 2004-01-13 2005-11-03 Affymetrix, Inc. Methods of analysis of alternative splicing in human
EP1713332A4 (en) 2004-01-23 2010-08-18 Avi Biopharma Inc ANTISENSE OLIGOMERS AND METHOD FOR INDUCTION OF IMMUNOTHERAPY AND IMMUNOSUPPRESSION
US20050164209A1 (en) 2004-01-23 2005-07-28 Bennett C. F. Hepatocyte free uptake assays
DK1713912T3 (da) 2004-01-30 2013-12-16 Santaris Pharma As Modificerede Korte Interfererende RNA (Modificerede siRNA)
WO2005089169A2 (en) 2004-03-12 2005-09-29 Exelixis, Inc. Mptens as modifiers of the pten pathway and methods of use
WO2005094370A2 (en) 2004-03-29 2005-10-13 The General Hospital Corporation Oligonucleotide complex compositions and methods of use as gene alteration tools
US7374927B2 (en) 2004-05-03 2008-05-20 Affymetrix, Inc. Methods of analysis of degraded nucleic acid samples
WO2005116204A1 (ja) 2004-05-11 2005-12-08 Rnai Co., Ltd. Rna干渉を生じさせるポリヌクレオチド、および、これを用いた遺伝子発現抑制方法
US7687616B1 (en) 2004-05-14 2010-03-30 Rosetta Genomics Ltd Small molecules modulating activity of micro RNA oligonucleotides and micro RNA targets and uses thereof
US20050265927A1 (en) 2004-05-17 2005-12-01 Yale University Intranasal delivery of nucleic acid molecules
USRE47769E1 (en) 2004-06-28 2019-12-17 The University Of Western Australia Antisense oligonucleotides for inducing exon skipping and methods of use thereof
US8029985B2 (en) 2004-09-01 2011-10-04 Vybion, Inc. Amplified bioassay
US7838657B2 (en) * 2004-12-03 2010-11-23 University Of Massachusetts Spinal muscular atrophy (SMA) treatment via targeting of SMN2 splice site inhibitory sequences
US9550990B2 (en) 2004-12-10 2017-01-24 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Regulation of epigenetic control of gene expression
US7879992B2 (en) 2005-01-31 2011-02-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modification of MyD88 splicing using modified oligonucleotides
CA2596506C (en) 2005-02-09 2021-04-06 Avi Biopharma, Inc. Antisense composition and method for treating muscle atrophy
WO2006130201A1 (en) 2005-03-14 2006-12-07 Board Of Regents, The University Of Texas System Antigene oligomers inhibit transcription
US7449297B2 (en) * 2005-04-14 2008-11-11 Euclid Diagnostics Llc Methods of copying the methylation pattern of DNA during isothermal amplification and microarrays
JP5362350B2 (ja) 2005-04-15 2013-12-11 ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア 小分子活性化rna分子及び使用方法
US8586719B2 (en) 2005-04-27 2013-11-19 Pacific Arrow Limited Triterpenes for modulating gene expression and cell membrane, and as antiprotozoal agents
EP3470072A1 (en) * 2005-06-23 2019-04-17 Biogen MA Inc. Compositions and methods for modulation of smn2 splicing
US8067571B2 (en) 2005-07-13 2011-11-29 Avi Biopharma, Inc. Antibacterial antisense oligonucleotide and method
WO2007031091A2 (en) 2005-09-15 2007-03-22 Santaris Pharma A/S Rna antagonist compounds for the modulation of p21 ras expression
EP1957648B1 (en) 2005-11-17 2014-04-23 Board of Regents, The University of Texas System Modulation of gene expression by oligomers targeted to chromosomal dna
JP5078904B2 (ja) 2005-11-21 2012-11-21 ジヨンソン・アンド・ジヨンソン・リサーチ・ピーテイワイ・リミテツド 多標的干渉rnaならびにそれらの使用および設計方法
EP1976567B1 (en) 2005-12-28 2020-05-13 The Scripps Research Institute Natural antisense and non-coding rna transcripts as drug targets
WO2007133812A2 (en) 2005-12-30 2007-11-22 Philadelphia Health & Education Corporation, D/B/A Drexel University College Of Medicine Improved carriers for delivery of nucleic acid agents to cells and tissues
EP2388327A1 (en) 2006-01-27 2011-11-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and compositions for the use in modulation of micrornas
US7569686B1 (en) 2006-01-27 2009-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for synthesis of bicyclic nucleic acid analogs
CA2640171C (en) 2006-01-27 2014-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. 6-modified bicyclic nucleic acid analogs
US8362229B2 (en) 2006-02-08 2013-01-29 Quark Pharmaceuticals, Inc. Tandem siRNAS
US20100004320A1 (en) 2006-04-03 2010-01-07 Santaris Pharma A/S Pharmaceutical Composition
CA2647125C (en) 2006-04-07 2015-02-03 Georg-August-Universitaet Goettingen Stiftung Oeffentlichen Rechts Synthetic mecp2 sequence for protein substitution therapy
AU2007258117B2 (en) 2006-05-05 2013-05-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating gene expression
WO2008002996A2 (en) 2006-06-27 2008-01-03 Shanghai Institutes For Biological Sciences Rheumatoid arthritis t cell vaccine
CN101500548A (zh) 2006-08-18 2009-08-05 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 用于体内递送多核苷酸的多缀合物
US9617581B2 (en) 2006-08-25 2017-04-11 Duke University Methods for in vivo identification of endogenous mRNA targets of MicroRNAs
WO2008025069A1 (en) 2006-08-28 2008-03-06 The Walter And Eliza Hall Institute Of Medical Research Methods of modulating cellular activity and compositions therefor
WO2008029619A1 (fr) 2006-09-07 2008-03-13 Daiichi Sankyo Company, Limited Oligonucléotide antisens ena ayant une action spécifique de la séquence
WO2008036282A1 (en) 2006-09-18 2008-03-27 The Regents Of The University Of Californina Upregulating activity or expression of bdnf to mitigate cognitive impairment in asymptomatic huntington's subjects
ATE540118T1 (de) 2006-10-18 2012-01-15 Isis Pharmaceuticals Inc Antisense-verbindungen
AU2007323469B2 (en) 2006-11-23 2014-07-24 Guangdong Maijinjia Biotechnology Co., Ltd Oligonucleotides for modulating target RNA activity
US8420791B2 (en) 2006-11-27 2013-04-16 Ludwig Institute For Cancer Research Ltd. Expression of FoxP3 by cancer cells
WO2008089397A2 (en) 2007-01-19 2008-07-24 The Regents Of The University Of Michigan Adrb2 cancer markers
ITMI20070127A1 (it) 2007-01-29 2008-07-30 Fond I R C C S Proteine e-o peptidi per la prevenzione e-o cura di malattie neurodegenerative
WO2008103761A2 (en) 2007-02-20 2008-08-28 Sequenom, Inc. Methods and compositions for cancer diagnosis and treatment based on nucleic acid methylation
US7858592B2 (en) 2007-02-26 2010-12-28 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Interfering RNAs against the promoter region of P53
WO2008113832A2 (en) 2007-03-22 2008-09-25 Santaris Pharma A/S SHORT RNA ANTAGONIST COMPOUNDS FOR THE MODULATION OF TARGET mRNA
WO2008141282A2 (en) 2007-05-11 2008-11-20 The Regents Of The University Of Michigan Materials and methods for foxp3 tumor suppression
JP2010529847A (ja) 2007-06-14 2010-09-02 ミルクス セラピューティクス アンパーツゼルスカブ 標的rna活性の調節のためのオリゴヌクレオチド
US20090082297A1 (en) 2007-06-25 2009-03-26 Lioy Daniel T Compositions and Methods for Regulating Gene Expression
JP5864100B2 (ja) * 2007-06-29 2016-02-17 サレプタ セラピューティクス インコーポレイテッド 組織特異的ペプチドコンジュゲートおよび方法
WO2009027349A2 (en) 2007-08-24 2009-03-05 Oryzon Genomics Sa Treatment and prevention of neurodegenerative diseases
US8440637B2 (en) 2007-10-04 2013-05-14 Santaris Pharma A/S Combination treatment for the treatment of hepatitis C virus infection
JP2010539990A (ja) 2007-10-04 2010-12-24 ボード オブ リージェンツ ザ ユニバーシティー オブ テキサス システム アンチセンス転写物を標的とするagRNAおよびギャップマーを用いた遺伝子発現の調節方法
ITRM20070523A1 (it) 2007-10-05 2009-04-06 Consiglio Nazionale Ricerche Acido nucleico codificante per una proteina regolatrice specifica della trascrizione dell'utrofina proteina da esso codificata e sue applicazioni
AU2008323970B2 (en) 2007-11-09 2014-05-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of Factor 7 expression
EP2219680A2 (en) 2007-11-13 2010-08-25 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating protein expression
US8937217B2 (en) 2007-12-18 2015-01-20 E. I. Du Pont De Nemours And Company Down-regulation of gene expression using artificial microRNAs
WO2009090182A1 (en) 2008-01-14 2009-07-23 Santaris Pharma A/S C4'-substituted - dna nucleotide gapmer oligonucleotides
WO2009114487A2 (en) 2008-03-07 2009-09-17 Senesco Technologies, Inc. Use of sirna to achieve down regulation of an endogenous gene in combination with the use of a sense construct to achieve expression of a desired polynucleotide
WO2009109665A1 (en) 2008-03-07 2009-09-11 Santaris Pharma A/S Pharmaceutical compositions for treatment of microrna related diseases
US8846639B2 (en) 2008-04-04 2014-09-30 Isis Pharmaceutical, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleosides and having reduced toxicity
US20110263687A1 (en) 2008-04-07 2011-10-27 Riken Rna molecules and uses thereof
US8916532B2 (en) 2008-04-28 2014-12-23 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods for enhancing utrophin production via inhibition of microRNA
US8633019B2 (en) * 2008-05-27 2014-01-21 Ptc Therapeutics, Inc. Methods for treating spinal muscular atrophy
US8222221B2 (en) 2008-06-04 2012-07-17 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of gene expression through endogenous small RNA targeting of gene promoters
CA2635187A1 (en) 2008-06-05 2009-12-05 The Royal Institution For The Advancement Of Learning/Mcgill University Oligonucleotide duplexes and uses thereof
EP2310505B1 (en) 2008-06-30 2017-08-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antidote oligomers
US8901095B2 (en) 2008-07-29 2014-12-02 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Selective inhibition of polyglutamine protein expression
WO2010036213A1 (en) 2008-09-26 2010-04-01 Agency For Science, Technology And Research 3-deazaneplanocin derivatives
MY188457A (en) 2008-10-03 2021-12-10 Opko Curna Llc Treatment of apolipoprotein-a1 related diseases by inhibition of natural antisense transcript to apolipoprotein-a1
WO2010045512A2 (en) 2008-10-16 2010-04-22 Mdrna , Inc. Processes and compositions for liposomal and efficient delivery of gene silencing therapeutics
CA2743249A1 (en) 2008-11-17 2010-05-20 F. Hoffmann-La Roche Ag Compositions and methods for inhibiting expression of factor vii genes
GB0821457D0 (en) 2008-11-24 2008-12-31 Trillion Genomics Ltd Oligonucleotides
KR101829469B1 (ko) 2008-12-04 2018-03-30 큐알엔에이, 인크. Epo에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의해 에리트로포에틴(epo) 관련된 질환의 치료
MX2011005912A (es) 2008-12-04 2011-06-17 Opko Curna Llc Tratamiento de enfermedades relacionadas con factor de crecimiento endotelial vascular por inhibicion de transcrito antisentido natural para factor de crecimiento endotelial vascular.
RU2551234C2 (ru) 2008-12-04 2015-05-20 КьюРНА,Инк.,US Лечение сиртуин 1 (sirt1)-связанных заболеваний путем ингибирования натурального антисмыслового транскрипта
KR101866152B1 (ko) 2008-12-04 2018-06-08 큐알엔에이, 인크. 종양 억제 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의해 종양 억제 유전자 관련된 질환의 치료
US9023820B2 (en) 2009-01-26 2015-05-05 Protiva Biotherapeutics, Inc. Compositions and methods for silencing apolipoprotein C-III expression
CA2752237C (en) 2009-02-12 2020-03-24 Opko Curna, Llc Treatment of brain derived neurotrophic factor (bdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bdnf
WO2010093906A2 (en) 2009-02-12 2010-08-19 Curna, Inc. Treatment of glial cell derived neurotrophic factor (gdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to gdnf
WO2010093860A2 (en) 2009-02-13 2010-08-19 The General Hospital Corporation Isolation of factors that associate directly or indirectly with chromatin
WO2010102058A2 (en) 2009-03-04 2010-09-10 Curna, Inc. Treatment of sirtuin 1 (sirt1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to sirt 1
US9464287B2 (en) 2009-03-16 2016-10-11 Curna, Inc. Treatment of nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (NRF2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to NRF2
WO2010107740A2 (en) 2009-03-17 2010-09-23 Curna, Inc. Treatment of delta-like 1 homolog (dlk1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to dlk1
DK2417257T3 (da) 2009-04-10 2016-06-06 Ass Inst De Myologie Tricyclo-dna-antisense-oligonukleotider, sammensætninger, og fremgangsmåder til behandlingen af sygdom
US8815586B2 (en) 2009-04-24 2014-08-26 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of gene expression using oligomers that target gene regions downstream of 3′ untranslated regions
NO2424987T3 (ja) 2009-05-01 2018-04-14
KR101722541B1 (ko) 2009-05-06 2017-04-04 큐알엔에이, 인크. Ttp에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 트리스테트라프롤린 관련된 질환의 치료
US9155754B2 (en) 2009-05-06 2015-10-13 Curna, Inc. Treatment of ABCA1 gene related diseases by inhibition of a natural antisense transcript to ABCA1
JP5931720B2 (ja) 2009-05-08 2016-06-08 クルナ・インコーポレーテッド Dmdファミリーに対する天然アンチセンス転写物の抑制によるジストロフィンファミリー関連疾患の治療
DK2432881T3 (en) 2009-05-18 2018-02-26 Curna Inc TREATMENT OF REPROGRAMMING FACTOR-RELATED DISEASES BY INHIBITING NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPTS TO A REPROGRAMMING FACTOR
EP2432882B1 (en) 2009-05-22 2019-12-25 CuRNA, Inc. TREATMENT OF TRANSCRIPTION FACTOR E3 (TFE3) and INSULIN RECEPTOR SUBSTRATE 2 (IRS2) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO TFE3
WO2010138806A2 (en) 2009-05-28 2010-12-02 Curna, Inc. Treatment of antiviral gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an antiviral gene
US20120171170A1 (en) 2009-06-16 2012-07-05 Opko Curna, Llc Treatment of collagen gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a collagen gene
CN102612560B (zh) 2009-06-16 2017-10-17 库尔纳公司 通过抑制针对对氧磷酶1(pon1)的天然反义转录物来治疗pon1相关的疾病
JP6073133B2 (ja) 2009-06-24 2017-02-01 クルナ・インコーポレーテッド 腫瘍壊死因子受容体2(tnfr2)に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるtnfr2関連疾患の治療
WO2010151674A2 (en) 2009-06-26 2010-12-29 Curna, Inc. Treatment of down syndrome gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a down syndrome gene
US20140099666A1 (en) 2009-07-06 2014-04-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for enhancing production of a biological product
CA2768598A1 (en) 2009-07-22 2011-01-27 Cenix Bioscience Gmbh Delivery system and conjugates for compound delivery via naturally occurring intracellular transport routes
WO2011010706A1 (ja) 2009-07-23 2011-01-27 武田薬品工業株式会社 Fgf21シスエレメント結合物質
WO2011011700A2 (en) 2009-07-24 2011-01-27 Curna, Inc. Treatment of sirtuin (sirt) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a sirtuin (sirt)
ES2585360T3 (es) 2009-08-05 2016-10-05 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con un gen de la insulina (INS) por inhibición de la transcripción antisentido natural en un gen de la insulina (INS)
ES2599986T3 (es) 2009-08-11 2017-02-06 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con adiponectina (ADIPOQ) mediante la inhibición de un transcrito antisentido natural de una adiponectina (ADIPOQ)
WO2011022606A2 (en) 2009-08-21 2011-02-24 Curna, Inc. Treatment of 'c terminus of hsp70-interacting protein' (chip) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to chip
KR101892760B1 (ko) 2009-08-25 2018-08-28 큐알엔에이, 인크. IQGAP에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 GTPase 활성화 단백질을 함유하는 IQ 모티프(IQGAP)와 관련된 질환의 치료
WO2011025862A2 (en) 2009-08-28 2011-03-03 Curna, Inc. Treatment of atp-binding cassette sub-family b member 1 (abcb1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to abcb1
WO2011032109A1 (en) 2009-09-11 2011-03-17 Sma Foundation Biomarkers for spinal muscular atrophy
WO2011038210A2 (en) 2009-09-25 2011-03-31 Curna, Inc. Treatment of filaggrin (flg) related diseases by modulation of flg expression and activity
WO2011038205A2 (en) 2009-09-25 2011-03-31 Curna, Inc. Treatment of growth hormone (gh) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to gh
US9364495B2 (en) 2009-10-20 2016-06-14 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oral delivery of therapeutically effective LNA oligonucleotides
KR101138048B1 (ko) 2009-11-06 2012-04-23 성균관대학교산학협력단 Bdnf의 발현을 증가시키는 신규 펩타이드 및 이를 포함하는 알츠하이머병 또는 파킨슨병의 예방 및 치료용 약학 조성물
RU2639550C2 (ru) 2009-12-16 2017-12-21 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с сайт-1 мембраносвязанной пептидазой транскрипционных факторов (mbtps1), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к mbtps1
WO2011079263A2 (en) 2009-12-23 2011-06-30 Curna, Inc. Treatment of uncoupling protein 2 (ucp2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ucp2
WO2011079261A2 (en) 2009-12-23 2011-06-30 Curna, Inc. Treatment of hepatocyte growth factor (hgf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to hgf
ES2657452T3 (es) 2009-12-29 2018-03-05 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con el factor respiratorio nuclear 1 (NRF1) mediante inhibición de transcrito antisentido natural a NRF1
WO2011090741A2 (en) 2009-12-29 2011-07-28 Opko Curna, Llc TREATMENT OF TUMOR PROTEIN 63 (p63) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO p63
DK2519632T3 (en) 2009-12-31 2018-07-23 Curna Inc TREATMENT OF INSULIN RECEPTOR SUBSTRATE 2- (IRS2) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPTION TO IRS2 AND TRANSCRIPTION FACTOR E3 (TFE3)
WO2011082409A2 (en) 2010-01-04 2011-07-07 Curna, Inc. Treatment of interferon regulatory factor 8 (irf8) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to irf8
KR101853509B1 (ko) 2010-01-06 2018-04-30 큐알엔에이, 인크. 췌장 발달 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 췌장 발달 유전자와 관련된 질환의 치료
ES2664866T3 (es) 2010-01-11 2018-04-23 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con la globulina fijadora de hormonas sexuales (shbg) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a shbg
WO2011091390A2 (en) 2010-01-25 2011-07-28 Opko Curna, Llc Treatment of rnase h1 related diseases by inhibition of natural antisense transcript to rnase h1
WO2011097388A1 (en) 2010-02-03 2011-08-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Selective inhibition of polyglutamine protein expression
WO2011097582A2 (en) 2010-02-08 2011-08-11 Opko Curna Llc Treatment of arachidonate 12-lipoxygenase, 12r type (alox12b) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to alox12b
US20130059902A1 (en) 2010-02-08 2013-03-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions useful in treatment of diseases or conditions related to repeat expansion
US8962586B2 (en) 2010-02-22 2015-02-24 Curna, Inc. Treatment of pyrroline-5-carboxylate reductase 1 (PYCR1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to PYCR1
WO2011117353A1 (en) 2010-03-24 2011-09-29 Mirrx Therapeutics A/S Bivalent antisense oligonucleotides
TWI600759B (zh) 2010-04-02 2017-10-01 可娜公司 藉由抑制群落刺激因子3(csf3)之天然反義轉錄物以治療csf3相關疾病
JP5978203B2 (ja) 2010-04-09 2016-08-24 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド Fgf21に対する天然アンチセンス転写物の阻害による線維芽細胞増殖因子(fgf21)線維芽細胞増殖因子fgf21)関連疾患の治療
WO2011130371A1 (en) 2010-04-13 2011-10-20 Life Technologies Corporation Compositions and methods for inhibition of nucleic acids function
RU2018110642A (ru) 2010-05-03 2019-02-27 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с сиртуином (sirt), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к сиртуину (sirt)
TWI531370B (zh) 2010-05-14 2016-05-01 可娜公司 藉由抑制par4天然反股轉錄本治療par4相關疾病
WO2011146674A2 (en) 2010-05-19 2011-11-24 Opko Curna Llc Treatment of bcl2-like 11 (bcl2l11) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bcl2l11
AR081295A1 (es) 2010-05-19 2012-08-01 Opko Curna Llc Tratamiento de enfermedades relacionadas con lim homeobox 2(lhx2) mediante la inhibicion del transcripto antisentido natural a polinucleotidos lhx2
NO2576784T3 (ja) 2010-05-26 2018-04-14
EP3299464B1 (en) 2010-05-26 2019-10-02 CuRNA, Inc. Treatment of atonal homolog 1 (atoh1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to atoh1
EP2582397A4 (en) 2010-06-15 2014-10-29 Isis Pharmaceuticals Inc COMPOUNDS AND METHODS FOR MODULATING THE INTERACTION BETWEEN PROTEINS AND TARGET NUCLEIC ACIDS
US20120004278A1 (en) 2010-06-18 2012-01-05 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Linc rnas in cancer diagnosis and treatment
JP6023705B2 (ja) 2010-06-23 2016-11-09 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド ナトリウムチャネル、電位依存性、αサブユニット(SCNA)に対する天然アンチセンス転写物の阻害によるSCNA関連疾患の治療
GB201010557D0 (en) 2010-06-23 2010-08-11 Mina Therapeutics Ltd RNA molecules and uses thereof
EP2591797A4 (en) 2010-07-09 2014-01-15 Inst Pasteur Of Shanghai Cas FACTOR FOR REGULATING FOXP3 AND REGULATORY T CELLS AND USE THEREOF
TW201209163A (en) 2010-07-12 2012-03-01 Opko Curna Llc Treatment of BCL2 binding component 3 (BBC3) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to BBC3
CN103068982B (zh) 2010-07-14 2017-06-09 库尔纳公司 通过抑制盘状大同系物(dlg)的天然反义转录物而治疗dlg相关疾病
DK3031920T3 (da) 2010-07-19 2019-10-14 Ionis Pharmaceuticals Inc Modulation af dystrofi myotonica-protein kinase (dmpk) ekspression
US20140011860A1 (en) 2010-07-19 2014-01-09 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating target nuclear and sub-nuclear nucleic acid molecules in cells and animals
WO2012018881A2 (en) 2010-08-03 2012-02-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the regulation of rna
WO2012024478A2 (en) 2010-08-19 2012-02-23 Opko Curna Llc Treatment of nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to nampt
JP6389036B2 (ja) 2010-09-10 2018-09-12 エピザイム インコーポレイテッド ヒトezh2の阻害剤、およびその使用方法
EP2625274B1 (en) 2010-10-06 2017-07-19 CuRNA, Inc. Treatment of sialidase 4 (neu4) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to neu4
JP6049623B2 (ja) 2010-10-22 2016-12-21 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド α‐L‐イズロニダーゼ(IDUA)への天然アンチセンス転写物の阻害によるIDUA関連疾患の治療
JP6073795B2 (ja) 2010-10-27 2017-02-01 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド インターフェロン関連発生制御因子1(ifrd1)への天然アンチセンス転写物の阻害によるifrd1関連疾患の治療
WO2012064806A2 (en) 2010-11-11 2012-05-18 The University Of North Carolina At Chapel Hill Methods and compositions for unsilencing imprinted genes
DK2638163T3 (en) * 2010-11-12 2017-07-24 Massachusetts Gen Hospital POLYCOMB-ASSOCIATED NON-CODING RNAs
WO2012087983A1 (en) 2010-12-20 2012-06-28 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding rnas
US9920317B2 (en) 2010-11-12 2018-03-20 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US10000752B2 (en) 2010-11-18 2018-06-19 Curna, Inc. Antagonat compositions and methods of use
JP6071893B2 (ja) 2010-11-23 2017-02-01 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド Nanogへの天然アンチセンス転写物の阻害によるnanog関連疾患の治療
US9206479B2 (en) 2011-02-09 2015-12-08 University Of Rochester Methods and compositions related to Staufen 1 binding sites formed by duplexing Alu elements
WO2012144220A1 (en) 2011-04-22 2012-10-26 Oncotherapy Science, Inc. Ezh2 as target gene for cancer therapy and diagnosis
US8557787B2 (en) 2011-05-13 2013-10-15 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Diagnostic, prognostic and therapeutic uses of long non-coding RNAs for cancer and regenerative medicine
ES2653247T3 (es) 2011-06-09 2018-02-06 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con la frataxina (FXN) mediante inhibición del transcrito antisentido natural al gen FXN
EP2723902A4 (en) 2011-06-24 2015-02-18 Murdoch Childrens Res Inst TREATMENT AND DIAGNOSIS OF EPIGENETIC DISORDERS AND DISEASES
CA2844144A1 (en) 2011-07-05 2013-01-10 The General Hospital Corporation Rna-yy1 interactions
EA029151B1 (ru) 2011-09-06 2018-02-28 Курна, Инк. ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С АЛЬФА-СУБЪЕДИНИЦАМИ ПОТЕНЦИАЛЗАВИСИМЫХ НАТРИЕВЫХ КАНАЛОВ (SCNxA), С ПОМОЩЬЮ МАЛЫХ МОЛЕКУЛ
AU2012308320C1 (en) 2011-09-14 2018-08-23 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds
US9209196B2 (en) 2011-11-30 2015-12-08 Sharp Kabushiki Kaisha Memory circuit, method of driving the same, nonvolatile storage device using the same, and liquid crystal display device
ITMI20120275A1 (it) 2012-02-24 2013-08-25 Biogenera Societa A Responsabilita Limitata Oligonucleotidi per la modulazione dell'espressione genica e loro usi
TR201815503T4 (tr) 2012-03-15 2018-11-21 Curna Inc Beyin kaynaklı nörotrofik faktör (bknf) ile ilişkili hastalıkların doğal antisens transkriptinin bknf'ye inhibisyonu ile muamelesi.
AU2013262658A1 (en) 2012-05-16 2015-01-22 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating APOA1 and ABCA1 expression
EP2850184A4 (en) 2012-05-16 2016-01-27 Rana Therapeutics Inc COMPOSITIONS AND METHOD FOR MODULATING GENE EXPRESSION
WO2013173601A1 (en) 2012-05-16 2013-11-21 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating bdnf expression
US10174323B2 (en) 2012-05-16 2019-01-08 The General Hospital Corporation Compositions and methods for modulating ATP2A2 expression
AU2013262709A1 (en) 2012-05-16 2015-01-22 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating MECP2 expression
AU2013262663A1 (en) 2012-05-16 2015-01-22 The General Hospital Corporation D/B/A Massachusetts General Hospital Compositions and methods for modulating gene expression
WO2013173635A1 (en) 2012-05-16 2013-11-21 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating gene expression
KR20150030205A (ko) 2012-05-16 2015-03-19 라나 테라퓨틱스, 인크. Smn 유전자 패밀리 발현을 조절하기 위한 조성물 및 방법
EP2850188A4 (en) 2012-05-16 2016-01-20 Rana Therapeutics Inc COMPOSITIONS AND METHODS FOR MODULATING THE EXPRESSION OF THE MULTIGENIC FAMILY OF HEMOGLOBIN
AU2013262706A1 (en) 2012-05-16 2015-01-22 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating PTEN expression
EA201492122A1 (ru) 2012-05-16 2015-10-30 Рана Терапьютикс, Инк. Композиции и способы для модулирования экспрессии utrn
WO2014025887A1 (en) 2012-08-07 2014-02-13 The General Hospital Corporation Selective reactivation of genes on the inactive x chromosome
EP2895200B1 (en) 2012-09-14 2019-11-06 Translate Bio MA, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds
CN104884618A (zh) 2012-11-15 2015-09-02 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 寡核苷酸缀合物
WO2014172698A1 (en) 2013-04-19 2014-10-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulation nucleic acids through nonsense mediated decay
US20160122760A1 (en) 2013-06-07 2016-05-05 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating foxp3 expression
CN105324119A (zh) 2013-06-16 2016-02-10 国立大学法人东京医科齿科大学 具有外显子跳跃效应的双链反义核酸
WO2015035476A1 (en) 2013-09-16 2015-03-19 University Of Western Sydney Modulation of gene expression

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2015523854A5 (ja)
JP2015523853A5 (ja)
JP2016522674A5 (ja)
JP2015518710A5 (ja)
JP2015518711A5 (ja)
JP2015519057A5 (ja)
JP2015518712A5 (ja)
JP2015518713A5 (ja)
AU2021203174A1 (en) Compositions and methods for modulating RNA
US10538763B2 (en) Compounds and methods for modulation of DUX4
US10041074B2 (en) Euchromatic region targeting methods for modulating gene expression
JP2015523855A5 (ja)
JP2015518714A5 (ja)
JP2013510561A5 (ja)
JP2016502858A5 (ja)
JP2016513976A5 (ja)
US20180237775A1 (en) Antisense oligonucleotides and uses thereof
JP2015502365A5 (ja)
US9034838B2 (en) miR-31 in duchenne muscular dystrophy therapy
US20180028557A1 (en) Hybrid oligonucleotides and uses thereof
JP2011505798A5 (ja)
CA3224145A1 (en) Novel rna therapeutics and uses thereof
WO2021132591A1 (ja) エクソン50のスキッピングを誘導するアンチセンス核酸
JP2023506547A (ja) B型肝炎ウイルス感染を処置するためのcops3阻害剤の使用
WO2019038228A1 (en) OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF TOM1 EXPRESSION