JP2011520446A5 - - Google Patents
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Description
(発明の要旨)
1つの態様において、本発明は、胚中心活性の判定において有用な組成物およびキットを提供する。別の態様において、本発明は、胚中心活性を判定するための方法を提供する。これらの態様において、患者サンプルにおけるバイオマーカーが測定される。1つの実施形態において、この活性は増加されている(すなわち、過形成によって)。この実施形態において、バイオマーカーのレベルの増加が測定できる。別の実施形態において、この活性は減少されている(すなわち、萎縮によって)。この実施形態において、バイオマーカーのレベルの減少が測定できる。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
(項目1)
生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブを含むキット。
(項目2)
前記プローブが、配列番号34、35、36、37、53、54、55、56、および57からなる群より選択される核酸に対して少なくとも90%同一である核酸試薬を含む、項目1に記載のキット。
(項目3)
生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択される少なくとも2つのマーカーを検出するための少なくとも2つのプローブを含むキット。
(項目4)
前記少なくとも2つのプローブが複数の核酸試薬を含み、その各々が、配列番号34、35、36、37、53、54、55、56、および57からなる群より選択される核酸に対して少なくとも90%同一である、項目3に記載のキット。
(項目5)
患者が日和見感染およびリンパ腫からなる群より選択される障害に対して感受性であるか否かを決定するための方法であって、
a.治療レジメンを用いて治療する前に該患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合したプローブの量を測定する工程;
d.該治療レジメンを用いて該患者を治療する工程;
e.いくつかの治療後に該患者からさらなるサンプルを入手する工程;
fおよびg.該さらなるサンプルに対して工程bおよびcを反復する工程;ならびに
h.いくつかの治療後の該サンプル中の該マーカーの量が治療前の該サンプル中のレベルよりも少ない場合、該患者が該障害に対して感受性であると決定する工程
を包含する、方法。
(項目6)
患者が日和見感染およびリンパ腫からなる群より選択される障害に対して感受性であるか否かを決定するための方法であって、
a.該患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;
d.該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも少ない場合、該患者が該障害に対して感受性であると決定する工程
を包含する、方法。
(項目7)
免疫抑制からの患者の回復を決定するための方法であって、
a.該患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;ならびに
d.該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも多い場合、該患者が免疫抑制から回復したと決定する工程
を包含する、方法。
(項目8)
ワクチン接種が有効であるか否かを決定するための方法であって、
a.患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;
d.該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも多い場合、該患者が有効なワクチン接種を受けたと決定する工程
を包含する、方法。
(項目9)
前記サンプルに加えるための安定剤をさらに含む、項目1に記載のキット。
(項目10)
前記安定剤がRNA安定剤である、項目9に記載のキット。
(項目11)
安定剤を含むサンプル収集容器をさらに含む、項目1に記載のキット。
(項目12)
前記安定剤がRNA安定剤である、項目11に記載のキット。
(項目13)
前記サンプルが末梢血サンプルである、項目5に記載の方法。
(項目14)
前記サンプルをB細胞について富化する工程をさらに含む、項目5に記載の方法。
(項目15)
少なくとも2つのマーカーのレベルが決定される、項目5に記載の方法。
(項目16)
前記サンプル中のバイオマーカーのRNAの量が決定される、項目5に記載の方法。
(項目17)
前記サンプル中の前記RNAが安定化される、項目16に記載の方法。
(項目18)
前記マーカーが、生殖細胞系列転写物ミュー(GLT−μ)、ガンマ1含有サークル転写物(CT−γ1)、ガンマ2含有サークル転写物(CT−γ2)、活性化誘導性シチジンデアミナーゼ(AID)、免疫グロブリン重鎖タイプG1(IGHG1)、および免疫グロブリン重鎖タイプA2(IGHA2)からなる群より選択される、項目5に記載の方法。
(項目19)
慢性免疫障害の継続治療のために支払うか否かを決定する方法であって、
a)生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを含む、バイオマーカーまたはバイオマーカーセットの発現レベルを得る工程;ならびに
b)該発現レベルが患者が免疫抑制されていないことを示す場合に支払いを認定する工程
を包含する、方法。
(項目20)
前記マーカーが、生殖細胞系列転写物ミュー(GLT−μ)、ガンマ1含有サークル転写物(CT−γ1)、ガンマ2含有サークル転写物(CT−γ2)、活性化誘導性シチジンデアミナーゼ(AID)、免疫グロブリン重鎖タイプG1(IGHG1)、および免疫グロブリン重鎖タイプA2(IGHA2)からなる群より選択される、項目19に記載の方法。
(項目21)
免疫調節物質を同定するためのスクリーニングのための方法であって、
a)B細胞を含むサンプルを試験薬剤と接触させる工程;
b)生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーの発現レベルを測定する工程;ならびに
c)該マーカーの該発現レベルが、該試験薬剤と接触されなかったサンプル中の該レベルと有意に異なる場合、該試験薬剤が免疫調節物質であると決定する工程
を包含する、方法。
1つの態様において、本発明は、胚中心活性の判定において有用な組成物およびキットを提供する。別の態様において、本発明は、胚中心活性を判定するための方法を提供する。これらの態様において、患者サンプルにおけるバイオマーカーが測定される。1つの実施形態において、この活性は増加されている(すなわち、過形成によって)。この実施形態において、バイオマーカーのレベルの増加が測定できる。別の実施形態において、この活性は減少されている(すなわち、萎縮によって)。この実施形態において、バイオマーカーのレベルの減少が測定できる。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
(項目1)
生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブを含むキット。
(項目2)
前記プローブが、配列番号34、35、36、37、53、54、55、56、および57からなる群より選択される核酸に対して少なくとも90%同一である核酸試薬を含む、項目1に記載のキット。
(項目3)
生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択される少なくとも2つのマーカーを検出するための少なくとも2つのプローブを含むキット。
(項目4)
前記少なくとも2つのプローブが複数の核酸試薬を含み、その各々が、配列番号34、35、36、37、53、54、55、56、および57からなる群より選択される核酸に対して少なくとも90%同一である、項目3に記載のキット。
(項目5)
患者が日和見感染およびリンパ腫からなる群より選択される障害に対して感受性であるか否かを決定するための方法であって、
a.治療レジメンを用いて治療する前に該患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合したプローブの量を測定する工程;
d.該治療レジメンを用いて該患者を治療する工程;
e.いくつかの治療後に該患者からさらなるサンプルを入手する工程;
fおよびg.該さらなるサンプルに対して工程bおよびcを反復する工程;ならびに
h.いくつかの治療後の該サンプル中の該マーカーの量が治療前の該サンプル中のレベルよりも少ない場合、該患者が該障害に対して感受性であると決定する工程
を包含する、方法。
(項目6)
患者が日和見感染およびリンパ腫からなる群より選択される障害に対して感受性であるか否かを決定するための方法であって、
a.該患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;
d.該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも少ない場合、該患者が該障害に対して感受性であると決定する工程
を包含する、方法。
(項目7)
免疫抑制からの患者の回復を決定するための方法であって、
a.該患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;ならびに
d.該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも多い場合、該患者が免疫抑制から回復したと決定する工程
を包含する、方法。
(項目8)
ワクチン接種が有効であるか否かを決定するための方法であって、
a.患者からサンプルを入手する工程;
b.生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブと該サンプルを接触させる工程;
c.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;
d.該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも多い場合、該患者が有効なワクチン接種を受けたと決定する工程
を包含する、方法。
(項目9)
前記サンプルに加えるための安定剤をさらに含む、項目1に記載のキット。
(項目10)
前記安定剤がRNA安定剤である、項目9に記載のキット。
(項目11)
安定剤を含むサンプル収集容器をさらに含む、項目1に記載のキット。
(項目12)
前記安定剤がRNA安定剤である、項目11に記載のキット。
(項目13)
前記サンプルが末梢血サンプルである、項目5に記載の方法。
(項目14)
前記サンプルをB細胞について富化する工程をさらに含む、項目5に記載の方法。
(項目15)
少なくとも2つのマーカーのレベルが決定される、項目5に記載の方法。
(項目16)
前記サンプル中のバイオマーカーのRNAの量が決定される、項目5に記載の方法。
(項目17)
前記サンプル中の前記RNAが安定化される、項目16に記載の方法。
(項目18)
前記マーカーが、生殖細胞系列転写物ミュー(GLT−μ)、ガンマ1含有サークル転写物(CT−γ1)、ガンマ2含有サークル転写物(CT−γ2)、活性化誘導性シチジンデアミナーゼ(AID)、免疫グロブリン重鎖タイプG1(IGHG1)、および免疫グロブリン重鎖タイプA2(IGHA2)からなる群より選択される、項目5に記載の方法。
(項目19)
慢性免疫障害の継続治療のために支払うか否かを決定する方法であって、
a)生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを含む、バイオマーカーまたはバイオマーカーセットの発現レベルを得る工程;ならびに
b)該発現レベルが患者が免疫抑制されていないことを示す場合に支払いを認定する工程
を包含する、方法。
(項目20)
前記マーカーが、生殖細胞系列転写物ミュー(GLT−μ)、ガンマ1含有サークル転写物(CT−γ1)、ガンマ2含有サークル転写物(CT−γ2)、活性化誘導性シチジンデアミナーゼ(AID)、免疫グロブリン重鎖タイプG1(IGHG1)、および免疫グロブリン重鎖タイプA2(IGHA2)からなる群より選択される、項目19に記載の方法。
(項目21)
免疫調節物質を同定するためのスクリーニングのための方法であって、
a)B細胞を含むサンプルを試験薬剤と接触させる工程;
b)生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーの発現レベルを測定する工程;ならびに
c)該マーカーの該発現レベルが、該試験薬剤と接触されなかったサンプル中の該レベルと有意に異なる場合、該試験薬剤が免疫調節物質であると決定する工程
を包含する、方法。
Claims (21)
- 生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを検出するためのプローブを含むキット。
- 前記プローブが、配列番号34、35、36、37、53、54、55、56、および57からなる群より選択される核酸に対して少なくとも90%同一である核酸試薬を含む、請求項1に記載のキット。
- 生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択される少なくとも2つのマーカーを検出するための少なくとも2つのプローブを含むキット。
- 前記少なくとも2つのプローブが複数の核酸試薬を含み、その各々が、配列番号34、35、36、37、53、54、55、56、および57からなる群より選択される核酸に対して少なくとも90%同一である、請求項3に記載のキット。
- 生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを、患者が日和見感染およびリンパ腫からなる群より選択される障害に対して感受性であるか否かの指標とする方法であって、
a.治療レジメンを用いて治療する前に該患者から得られたサンプルと、該マーカーを検出するためのプローブとを接触させる工程;
b.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;および
c.該治療レジメンを用いたいくつかの治療後に該患者から得られたさらなるサンプルについて工程aおよびbを反復する工程;
を包含し、
いくつかの治療後の該サンプル中の該マーカーの量が治療前の該サンプル中のレベルよりも少ない場合、該患者が該障害に対して感受性であることの指標である、方法。 - 生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを、患者が日和見感染およびリンパ腫からなる群より選択される障害に対して感受性であるか否かの指標とする方法であって、
a.該患者から得られたサンプルと、該マーカーを検出するためのプローブとを接触させる工程;および
b.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;
を包含し、
該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも少ない場合、該患者が該障害に対して感受性であることの指標である、方法。 - 生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを、免疫抑制からの患者の回復の指標とする方法であって、
a.該患者から得られたサンプルと、該マーカーを検出するためのプローブとを接触させる工程;および
b.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;
を包含し、
該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも多い場合、該患者が免疫抑制から回復したことの指標である、方法。 - 生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを、ワクチン接種が有効であるか否かの指標とする方法であって、
a.患者から得られたサンプルと、該マーカーを検出するためのプローブとを接触させる工程;および
b.該サンプル中の該マーカーの量を決定するために該サンプルに結合した該プローブの量を測定する工程;
を包含し、
該マーカーの量があらかじめ決定した標準よりも多い場合、該患者が有効なワクチン接種を受けたことの指標である、方法。 - 前記サンプルに加えるための安定剤をさらに含む、請求項1に記載のキット。
- 前記安定剤がRNA安定剤である、請求項9に記載のキット。
- 安定剤を含むサンプル収集容器をさらに含む、請求項1に記載のキット。
- 前記安定剤がRNA安定剤である、請求項11に記載のキット。
- 前記サンプルが末梢血サンプルである、請求項5に記載の方法。
- 前記サンプルをB細胞について富化する工程をさらに含む、請求項5に記載の方法。
- 少なくとも2つのマーカーのレベルが決定される、請求項5に記載の方法。
- 前記サンプル中のバイオマーカーのRNAの量が決定される、請求項5に記載の方法。
- 前記サンプル中の前記RNAが安定化される、請求項16に記載の方法。
- 前記マーカーが、生殖細胞系列転写物ミュー(GLT−μ)、ガンマ1含有サークル転写物(CT−γ1)、ガンマ2含有サークル転写物(CT−γ2)、活性化誘導性シチジンデアミナーゼ(AID)、免疫グロブリン重鎖タイプG1(IGHG1)、および免疫グロブリン重鎖タイプA2(IGHA2)からなる群より選択される、請求項5に記載の方法。
- 慢性免疫障害の継続治療のために支払うか否かを決定するための電子装置であって、
a)生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーを含む、バイオマーカーまたはバイオマーカーセットの発現レベルを得るための手段;ならびに
b)該発現レベルが該患者が免疫抑制されていないことを示す場合に支払いを認定するための手段
を含む、電子装置。 - 前記マーカーが、生殖細胞系列転写物ミュー(GLT−μ)、ガンマ1含有サークル転写物(CT−γ1)、ガンマ2含有サークル転写物(CT−γ2)、活性化誘導性シチジンデアミナーゼ(AID)、免疫グロブリン重鎖タイプG1(IGHG1)、および免疫グロブリン重鎖タイプA2(IGHA2)からなる群より選択される、請求項19に記載の電子装置。
- 免疫調節物質を同定するためのスクリーニングのための方法であって、
a)B細胞を含むサンプルを試験薬剤と接触させる工程;ならびに
b)生殖細胞系列スイッチ転写物、サークル転写物、およびDNA組換えエフェクターからなる群より選択されるマーカーの発現レベルを測定する工程;
を包含し、
該マーカーの該発現レベルが、該試験薬剤と接触されなかったサンプル中の該レベルと有意に異なる場合、該試験薬剤が免疫調節物質であることの指標である、方法。
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