JP2019528063A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2019528063A5 JP2019528063A5 JP2019508929A JP2019508929A JP2019528063A5 JP 2019528063 A5 JP2019528063 A5 JP 2019528063A5 JP 2019508929 A JP2019508929 A JP 2019508929A JP 2019508929 A JP2019508929 A JP 2019508929A JP 2019528063 A5 JP2019528063 A5 JP 2019528063A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- body fluid
- fluid sample
- cfdna
- amount
- nucleic acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 72
- 210000001124 Body Fluids Anatomy 0.000 claims description 45
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 claims description 45
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 claims description 20
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 claims description 20
- 210000000056 organs Anatomy 0.000 claims description 17
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 15
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 15
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims description 14
- 210000002700 Urine Anatomy 0.000 claims description 14
- 230000000295 complement Effects 0.000 claims description 14
- 210000003734 Kidney Anatomy 0.000 claims description 13
- 206010061481 Renal injury Diseases 0.000 claims description 12
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 claims description 11
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 claims description 10
- 229940109239 Creatinine Drugs 0.000 claims description 9
- DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N creatinine Chemical compound CN1CC(=O)NC1=N DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 230000001809 detectable Effects 0.000 claims description 8
- 206010059512 Apoptosis Diseases 0.000 claims description 7
- 102100009641 CXCL10 Human genes 0.000 claims description 7
- 101710032181 CXCL10 Proteins 0.000 claims description 7
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 claims description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 7
- 210000004072 Lung Anatomy 0.000 claims description 6
- 230000000268 renotropic Effects 0.000 claims description 6
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 claims description 5
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 claims description 5
- 230000002757 inflammatory Effects 0.000 claims description 5
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 claims description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 5
- 230000007067 DNA methylation Effects 0.000 claims description 4
- 206010022114 Injury Diseases 0.000 claims description 4
- 208000004852 Lung Injury Diseases 0.000 claims description 4
- 206010069363 Traumatic lung injury Diseases 0.000 claims description 4
- 230000001154 acute Effects 0.000 claims description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 4
- 231100000515 lung injury Toxicity 0.000 claims description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims description 4
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 claims description 4
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 3
- 208000003918 Acute Kidney Tubular Necrosis Diseases 0.000 claims description 2
- 208000007342 Diabetic Nephropathy Diseases 0.000 claims description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 claims description 2
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 claims description 2
- 101700080605 NUC1 Proteins 0.000 claims description 2
- 206010029151 Nephropathy Diseases 0.000 claims description 2
- 206010038428 Renal disease Diseases 0.000 claims description 2
- 206010038540 Renal tubular necrosis Diseases 0.000 claims description 2
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 claims description 2
- -1 aulin tricarboxylic acid Chemical class 0.000 claims description 2
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims description 2
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims description 2
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 claims description 2
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 claims description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N edta Chemical group OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 201000005206 focal segmental glomerulosclerosis Diseases 0.000 claims description 2
- 231100000854 focal segmental glomerulosclerosis Toxicity 0.000 claims description 2
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 claims description 2
- 230000002934 lysing Effects 0.000 claims description 2
- 201000008383 nephritis Diseases 0.000 claims description 2
- 101700006494 nucA Proteins 0.000 claims description 2
- 230000003612 virological Effects 0.000 claims description 2
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 claims 7
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 claims 7
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims 6
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 5
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 claims 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims 4
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 claims 4
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 claims 3
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 claims 3
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 3
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 claims 2
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims 2
- 230000001861 immunosuppresant Effects 0.000 claims 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims 2
- PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N (3S,6S,9S,12R,15S,18S,21S,24S,30S,33S)-30-ethyl-33-[(E,1R,2R)-1-hydroxy-2-methylhex-4-enyl]-1,4,7,10,12,15,19,25,28-nonamethyl-6,9,18,24-tetrakis(2-methylpropyl)-3,21-di(propan-2-yl)-1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31-undecazacyclotritriacontane-2,5,8,11,14,17 Chemical compound CC[C@@H]1NC(=O)[C@H]([C@H](O)[C@H](C)C\C=C\C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C1=O PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N 0.000 claims 1
- RTGDFNSFWBGLEC-SYZQJQIISA-N 2-(morpholin-4-yl)ethyl (4E)-6-(4-hydroxy-6-methoxy-7-methyl-3-oxo-1,3-dihydro-2-benzofuran-5-yl)-4-methylhex-4-enoate Chemical compound COC1=C(C)C=2COC(=O)C=2C(O)=C1C\C=C(/C)CCC(=O)OCCN1CCOCC1 RTGDFNSFWBGLEC-SYZQJQIISA-N 0.000 claims 1
- LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 5-Methylcytosine Chemical compound CC1=CNC(=O)N=C1N LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000035533 AUC Effects 0.000 claims 1
- 229920002425 Alu element Polymers 0.000 claims 1
- 108010047814 Antigen-Antibody Complex Proteins 0.000 claims 1
- GIXWDMTZECRIJT-UHFFFAOYSA-N Aurintricarboxylic acid Chemical compound C1=CC(=O)C(C(=O)O)=CC1=C(C=1C=C(C(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C(C(O)=O)=C1 GIXWDMTZECRIJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229960002170 Azathioprine Drugs 0.000 claims 1
- 102100009787 CABIN1 Human genes 0.000 claims 1
- 108010066057 CABIN1 Proteins 0.000 claims 1
- 229940119017 Cyclosporine Drugs 0.000 claims 1
- 108010036949 Cyclosporine Proteins 0.000 claims 1
- 206010012601 Diabetes mellitus Diseases 0.000 claims 1
- 102000010789 Interleukin-2 Receptors Human genes 0.000 claims 1
- 108010038453 Interleukin-2 Receptors Proteins 0.000 claims 1
- 229960000951 Mycophenolic Acid Drugs 0.000 claims 1
- 206010029148 Nephrolithiasis Diseases 0.000 claims 1
- XOFYZVNMUHMLCC-ZPOLXVRWSA-N Prednisone Chemical compound O=C1C=C[C@]2(C)[C@H]3C(=O)C[C@](C)([C@@](CC4)(O)C(=O)CO)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 XOFYZVNMUHMLCC-ZPOLXVRWSA-N 0.000 claims 1
- QFJCIRLUMZQUOT-HPLJOQBZSA-N Sirolimus Chemical compound C1C[C@@H](O)[C@H](OC)C[C@@H]1C[C@@H](C)[C@H]1OC(=O)[C@@H]2CCCCN2C(=O)C(=O)[C@](O)(O2)[C@H](C)CC[C@H]2C[C@H](OC)/C(C)=C/C=C/C=C/[C@@H](C)C[C@@H](C)C(=O)[C@H](OC)[C@H](O)/C(C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1 QFJCIRLUMZQUOT-HPLJOQBZSA-N 0.000 claims 1
- 229960001967 Tacrolimus Drugs 0.000 claims 1
- QJJXYPPXXYFBGM-LFZNUXCKSA-N Tacrolimus Chemical compound C1C[C@@H](O)[C@H](OC)C[C@@H]1\C=C(/C)[C@@H]1[C@H](C)[C@@H](O)CC(=O)[C@H](CC=C)/C=C(C)/C[C@H](C)C[C@H](OC)[C@H]([C@H](C[C@H]2C)OC)O[C@@]2(O)C(=O)C(=O)N2CCCC[C@H]2C(=O)O1 QJJXYPPXXYFBGM-LFZNUXCKSA-N 0.000 claims 1
- 229940107955 Thymoglobulin Drugs 0.000 claims 1
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 claims 1
- 230000001028 anti-proliferant Effects 0.000 claims 1
- LMEKQMALGUDUQG-UHFFFAOYSA-N azathioprine Chemical compound CN1C=NC([N+]([O-])=O)=C1SC1=NC=NC2=C1NC=N2 LMEKQMALGUDUQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 229960001265 ciclosporin Drugs 0.000 claims 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 claims 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 claims 1
- 200000000010 kidney injury Diseases 0.000 claims 1
- 239000003628 mammalian target of rapamycin inhibitor Substances 0.000 claims 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims 1
- 229960004866 mycophenolate mofetil Drugs 0.000 claims 1
- HPNSFSBZBAHARI-RUDMXATFSA-N mycophenolic acid Chemical compound OC1=C(C\C=C(/C)CCC(O)=O)C(OC)=C(C)C2=C1C(=O)OC2 HPNSFSBZBAHARI-RUDMXATFSA-N 0.000 claims 1
- 229960004618 prednisone Drugs 0.000 claims 1
- 239000012474 protein marker Substances 0.000 claims 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 claims 1
- 229960002930 sirolimus Drugs 0.000 claims 1
- 150000003431 steroids Chemical class 0.000 claims 1
- 108010056900 thymoglobulin Proteins 0.000 claims 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
Description
いくつかの態様において、本開示は、以下の工程を含む臓器損傷を検出する方法を提供する:損傷を有すると推測されるかまたは損傷を発症する可能性が高い臓器から採取された体液試料において、cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を測定する工程であって、1種または複数種のマーカーは、(i)1種または複数種の炎症マーカー、(ii)1種または複数種のアポトーシスマーカー、(iii)全タンパク質、および(iv)DNAメチル化マーカーのうち1つまたは複数からなる群より選択される、工程;cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を使用してITスコアを得る工程;ならびにITスコアが所定のカットオフより高い場合、患者が臓器に損傷を有するかまたは患者が臓器に損傷を発症し得ることを決定する工程。いくつかの態様において、臓器損傷は腎損傷である。いくつかの態様において、ITスコアは、クレアチニンをさらに含めることによって得られる。いくつかの態様において、ITスコアは、プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量、体液試料中に存在するクレアチニン、1種もしくは複数種の炎症マーカー(例えば、CXCL10)、1種もしくは複数種のアポトーシスマーカー(例えば、クラスタリンのような腎尿細管損傷マーカー)、クレアチニン、および/または1種もしくは複数種のDNAメチル化マーカーの量を使用して、数学モデルを使用することによって得られる。
[本発明1001]
細胞溶解を阻害しかつ体液中のヌクレアーゼを阻害するために十分な濃度で、ホルムアルデヒドドナー、キレート剤、アウリントリカルボン酸、およびポリエチレングリコール(PEG)を含む、溶液。
[本発明1002]
ホルムアルデヒドドナーがジアゾリジニル尿素である、本発明1001の溶液。
[本発明1003]
キレート剤がEDTAである、本発明1001の溶液。
[本発明1004]
アジ化ナトリウムをさらに含む、本発明1001の溶液。
[本発明1005]
緩衝剤を含む、本発明1001または1004の溶液。
[本発明1006]
体液試料をさらに含む、本発明1001〜1005のいずれかの溶液。
[本発明1007]
体液試料が、臓器移植を受けたことがあるかまたは腎疾患を有する患者に由来する、本発明1001〜1006のいずれかの溶液。
[本発明1008]
臓器移植が腎移植である、本発明1007の溶液。
[本発明1009]
以下の工程を含む、体液試料中のセルフリーDNA(cfDNA)内のAluコピー数を検出する方法:
ヒトから体液試料を得る工程;
体液試料からcfDNAを抽出する工程;
核酸プローブに相補的であるcfDNAに核酸プローブがハイブリダイズすることを可能にする条件下で、cfDNAを核酸プローブと接触させることによって、反応混合物を形成させる工程であって、核酸プローブが、3'末端および5'末端を有する核酸配列を有し、核酸プローブが、SEQ ID NO:1の20〜292個の連続ヌクレオチドに相補的であり、3'末端または5'末端が、検出可能な標識に共有結合で連結されている、工程;
該プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を定量化し、それによって、体液試料中のセルフリーDNA(cfDNA)内のAluコピー数を検出する工程。
[本発明1010]
前記プローブがSEQ ID NO:2の少なくとも50個の連続ヌクレオチドに相補的である、本発明1009の方法。
[本発明1011]
反応混合物を形成させる前に本発明1001の溶液を体液試料と混合する工程をさらに含む、本発明1009または1010の方法。
[本発明1012]
体液試料が尿試料であり、
前記方法が、反応混合物中のクレアチニンの量を定量化する工程をさらに含む、
本発明1009の方法。
[本発明1013]
前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を、尿試料中のクレアチニンの量に対して正規化して、ハイブリダイズしたDNAの正規化された量を得る工程を含む、本発明1012の方法。
[本発明1014]
ハイブリダイズしたcfDNAの正規化された量を、腎臓状態を示すカットオフ値と比較する工程をさらに含む、本発明1013の方法。
[本発明1015]
前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの検出された量またはcfDNAの正規化された量がカットオフ値より大きい場合、患者が腎損傷を有すると決定する工程
をさらに含む、本発明1014の方法。
[本発明1016]
ヒトが腎移植を受けたことがある患者であり、腎損傷が、患者が急性拒絶エピソードを有することを示す、本発明1015の方法。
[本発明1017]
ヒトが腎移植を受けたことがある患者であり、
前記方法が、cfDNAの正規化された量と、尿試料が患者から採取された時点での腎臓移植からの期間とに基づき、腎臓の健康を決定するための予測スコアを生成する工程をさらに含む、
本発明1015の方法。
[本発明1018]
予測スコアが予測スコアのカットオフ値より大きい時、患者が急性拒絶エピソードを有すると決定される、本発明1017の方法。
[本発明1019]
尿試料が、BKウイルス性腎炎、巣状分節性糸球体硬化症、急性尿細管壊死、IgA疾患、および糖尿病性腎疾患からなる群より選択される疾患によって引き起こされた腎損傷を有すると推測される個体に由来する、本発明1014の方法。
[本発明1020]
CXCL10の量を定量化する工程をさらに含む、本発明1009の方法。
[本発明1021]
前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な50〜150ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、本発明1009の方法。
[本発明1022]
前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な70〜100ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、本発明1009の方法。
[本発明1023]
前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な80〜90ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、本発明1009の方法。
[本発明1024]
ヌクレオチド配列が正確に81個のヌクレオチドを有する、本発明1023の方法。
[本発明1025]
検出可能な標識がビオチンであり、
前記方法が、ストレプトアビジンと連結されたシグナル生成剤と、検出可能な標識とを接触させる工程を含む、
本発明1009〜1024のいずれかの方法。
[本発明1026]
シグナル生成剤が、化学発光、色、または蛍光を生成する、本発明1009の方法。
[本発明1027]
患者の腎移植受容から0〜400日後または10〜100日後または20〜50日後または移植腎の寿命中に、尿試料が採取される、本発明1009〜1026のいずれかの方法。
[本発明1028]
(i)尿試料から抽出された未増幅のセルフリーDNA(cfDNA)と、
(ii)核酸配列を有し3'末端および5'末端を有する核酸プローブと
を含む反応混合物であって、
核酸プローブがSEQ ID NO:1の20〜292個の連続ヌクレオチドに相補的であり、3'末端または5'末端が検出可能な標識に共有結合で連結されている、反応混合物。
[本発明1029]
臓器移植が肺移植である、本発明1007の溶液。
[本発明1030]
体液試料が気管支肺胞洗浄(BAL)液試料であり、
前記方法が、BAL液の全体積を定量化する工程をさらに含む、
本発明1009の方法。
[本発明1031]
前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を、全BAL液試料体積に対して正規化して、ハイブリダイズしたDNAの正規化された量を得る工程を含む、本発明1030の方法。
[本発明1032]
ハイブリダイズしたcfDNAの正規化された量を、肺状態を示すカットオフ値と比較する工程をさらに含む、本発明1031の方法。
[本発明1033]
プローブにハイブリダイズしたcfDNAの検出された量またはcfDNAの正規化された量が、カットオフ値より大きい場合、患者が肺損傷を有すると決定する工程
をさらに含む、本発明1032の方法。
[本発明1034]
ヒトが肺移植を受けたことがある患者であり、肺損傷が、患者が拒絶エピソードを有することを示す、本発明1033の方法。
[本発明1035]
以下の工程を含む、臓器損傷を検出する方法:
損傷を有すると推測されるかまたは損傷を発症する可能性が高い臓器から採取された体液試料において、cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を測定する工程であって、1種または複数種のマーカーが、
(i)1種または複数種の炎症マーカー、
(ii)1種または複数種のアポトーシスマーカー、
(iii)全タンパク質、および
(iv)DNAメチル化マーカーのうちの1つまたは複数
からなる群より選択される、工程;
cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を使用して、ITスコアを得る工程;
ITスコアが所定のカットオフより高い場合、患者が臓器に損傷を有するかまたは患者が臓器に損傷を発症し得ることを決定する工程。
[本発明1001]
細胞溶解を阻害しかつ体液中のヌクレアーゼを阻害するために十分な濃度で、ホルムアルデヒドドナー、キレート剤、アウリントリカルボン酸、およびポリエチレングリコール(PEG)を含む、溶液。
[本発明1002]
ホルムアルデヒドドナーがジアゾリジニル尿素である、本発明1001の溶液。
[本発明1003]
キレート剤がEDTAである、本発明1001の溶液。
[本発明1004]
アジ化ナトリウムをさらに含む、本発明1001の溶液。
[本発明1005]
緩衝剤を含む、本発明1001または1004の溶液。
[本発明1006]
体液試料をさらに含む、本発明1001〜1005のいずれかの溶液。
[本発明1007]
体液試料が、臓器移植を受けたことがあるかまたは腎疾患を有する患者に由来する、本発明1001〜1006のいずれかの溶液。
[本発明1008]
臓器移植が腎移植である、本発明1007の溶液。
[本発明1009]
以下の工程を含む、体液試料中のセルフリーDNA(cfDNA)内のAluコピー数を検出する方法:
ヒトから体液試料を得る工程;
体液試料からcfDNAを抽出する工程;
核酸プローブに相補的であるcfDNAに核酸プローブがハイブリダイズすることを可能にする条件下で、cfDNAを核酸プローブと接触させることによって、反応混合物を形成させる工程であって、核酸プローブが、3'末端および5'末端を有する核酸配列を有し、核酸プローブが、SEQ ID NO:1の20〜292個の連続ヌクレオチドに相補的であり、3'末端または5'末端が、検出可能な標識に共有結合で連結されている、工程;
該プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を定量化し、それによって、体液試料中のセルフリーDNA(cfDNA)内のAluコピー数を検出する工程。
[本発明1010]
前記プローブがSEQ ID NO:2の少なくとも50個の連続ヌクレオチドに相補的である、本発明1009の方法。
[本発明1011]
反応混合物を形成させる前に本発明1001の溶液を体液試料と混合する工程をさらに含む、本発明1009または1010の方法。
[本発明1012]
体液試料が尿試料であり、
前記方法が、反応混合物中のクレアチニンの量を定量化する工程をさらに含む、
本発明1009の方法。
[本発明1013]
前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を、尿試料中のクレアチニンの量に対して正規化して、ハイブリダイズしたDNAの正規化された量を得る工程を含む、本発明1012の方法。
[本発明1014]
ハイブリダイズしたcfDNAの正規化された量を、腎臓状態を示すカットオフ値と比較する工程をさらに含む、本発明1013の方法。
[本発明1015]
前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの検出された量またはcfDNAの正規化された量がカットオフ値より大きい場合、患者が腎損傷を有すると決定する工程
をさらに含む、本発明1014の方法。
[本発明1016]
ヒトが腎移植を受けたことがある患者であり、腎損傷が、患者が急性拒絶エピソードを有することを示す、本発明1015の方法。
[本発明1017]
ヒトが腎移植を受けたことがある患者であり、
前記方法が、cfDNAの正規化された量と、尿試料が患者から採取された時点での腎臓移植からの期間とに基づき、腎臓の健康を決定するための予測スコアを生成する工程をさらに含む、
本発明1015の方法。
[本発明1018]
予測スコアが予測スコアのカットオフ値より大きい時、患者が急性拒絶エピソードを有すると決定される、本発明1017の方法。
[本発明1019]
尿試料が、BKウイルス性腎炎、巣状分節性糸球体硬化症、急性尿細管壊死、IgA疾患、および糖尿病性腎疾患からなる群より選択される疾患によって引き起こされた腎損傷を有すると推測される個体に由来する、本発明1014の方法。
[本発明1020]
CXCL10の量を定量化する工程をさらに含む、本発明1009の方法。
[本発明1021]
前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な50〜150ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、本発明1009の方法。
[本発明1022]
前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な70〜100ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、本発明1009の方法。
[本発明1023]
前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な80〜90ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、本発明1009の方法。
[本発明1024]
ヌクレオチド配列が正確に81個のヌクレオチドを有する、本発明1023の方法。
[本発明1025]
検出可能な標識がビオチンであり、
前記方法が、ストレプトアビジンと連結されたシグナル生成剤と、検出可能な標識とを接触させる工程を含む、
本発明1009〜1024のいずれかの方法。
[本発明1026]
シグナル生成剤が、化学発光、色、または蛍光を生成する、本発明1009の方法。
[本発明1027]
患者の腎移植受容から0〜400日後または10〜100日後または20〜50日後または移植腎の寿命中に、尿試料が採取される、本発明1009〜1026のいずれかの方法。
[本発明1028]
(i)尿試料から抽出された未増幅のセルフリーDNA(cfDNA)と、
(ii)核酸配列を有し3'末端および5'末端を有する核酸プローブと
を含む反応混合物であって、
核酸プローブがSEQ ID NO:1の20〜292個の連続ヌクレオチドに相補的であり、3'末端または5'末端が検出可能な標識に共有結合で連結されている、反応混合物。
[本発明1029]
臓器移植が肺移植である、本発明1007の溶液。
[本発明1030]
体液試料が気管支肺胞洗浄(BAL)液試料であり、
前記方法が、BAL液の全体積を定量化する工程をさらに含む、
本発明1009の方法。
[本発明1031]
前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を、全BAL液試料体積に対して正規化して、ハイブリダイズしたDNAの正規化された量を得る工程を含む、本発明1030の方法。
[本発明1032]
ハイブリダイズしたcfDNAの正規化された量を、肺状態を示すカットオフ値と比較する工程をさらに含む、本発明1031の方法。
[本発明1033]
プローブにハイブリダイズしたcfDNAの検出された量またはcfDNAの正規化された量が、カットオフ値より大きい場合、患者が肺損傷を有すると決定する工程
をさらに含む、本発明1032の方法。
[本発明1034]
ヒトが肺移植を受けたことがある患者であり、肺損傷が、患者が拒絶エピソードを有することを示す、本発明1033の方法。
[本発明1035]
以下の工程を含む、臓器損傷を検出する方法:
損傷を有すると推測されるかまたは損傷を発症する可能性が高い臓器から採取された体液試料において、cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を測定する工程であって、1種または複数種のマーカーが、
(i)1種または複数種の炎症マーカー、
(ii)1種または複数種のアポトーシスマーカー、
(iii)全タンパク質、および
(iv)DNAメチル化マーカーのうちの1つまたは複数
からなる群より選択される、工程;
cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を使用して、ITスコアを得る工程;
ITスコアが所定のカットオフより高い場合、患者が臓器に損傷を有するかまたは患者が臓器に損傷を発症し得ることを決定する工程。
Claims (68)
- 以下の工程を含む、腎損傷を検出するための体液試料を調製する方法:
体液試料を得る工程;
(i)体液試料由来のcfDNAを、核酸プローブと接触させて、体液試料由来のcfDNAを測定する工程であって、該核酸プローブがAluリピートにハイブリダイズするように構成されているヌクレオチド配列を含む、工程;
(ii)体液試料由来の炎症マーカーを、それに対する抗体と接触させて、体液試料由来の炎症マーカーを測定する工程;
(iii)体液試料由来のアポトーシスマーカーを、それに対する抗体と接触させて、体液試料由来のアポトーシスマーカーを測定する工程;
(iv)体液試料由来のクレアチニンを、検出試薬と接触させて、体液試料由来のクレアチニンを測定する工程;
(v)体液試料由来の全タンパク質マーカーを、検出試薬と接触させて、体液試料由来の全タンパク質を測定する工程;および
(vi) 体液試料由来のメチル化DNAを、5-メチルシトシンを認識する抗体と接触させて、体液試料由来のメチル化DNAを測定する工程。 - 工程(i)〜(vi)から得られた測定値を分析して、腎損傷を示すスコアを生成する工程をさらに含む、請求項1記載の方法。
- 前記炎症マーカーがC-X-Cモチーフケモカインリガンドであり、前記アポトーシスマーカーがクラスタリンである、請求項1または2記載の方法。
- 前記C-X-Cモチーフケモカインリガンドが、CXCL10である、請求項3記載の方法。
- 前記スコアが、工程(i)〜(vi)からの測定値を非線形モデルに入力することにより生成される、請求項2〜4のいずれか一項記載の方法。
- 前記核酸プローブが、SEQ ID NO:1またはSEQ ID NO:2の少なくとも20〜300個の連続ヌクレオチドに対して相補的であるヌクレオチド配列を含む、請求項1〜5のいずれか一項記載の方法。
- 全タンパク質に対する検出試薬が、比色試薬である、請求項1〜6のいずれか一項記載の方法。
- クラスタリンに対する抗体が、ELISAに基づくアッセイの一部である、請求項3〜7のいずれか一項記載の方法。
- CXCL10に対する抗体が、ELISAに基づくアッセイの一部である、請求項4〜8のいずれか一項記載の方法。
- 核酸プローブと接触させる前に、cfDNAが増幅されていない、請求項1〜9のいずれか一項記載の方法。
- 工程(i)〜(vi)の前に、体液試料が溶液で安定化されている、請求項1〜10のいずれか一項記載の方法。
- 安定化溶液が、細胞溶解を阻害しかつ体液試料中のヌクレアーゼを阻害するために十分な濃度で、ホルムアルデヒドドナー、キレート剤、アウリントリカルボン酸、およびポリエチレングリコール(PEG)を含む、請求項11記載の方法。
- 体液試料が尿である、請求項1〜12のいずれか一項記載の方法。
- 前記スコアが、腎損傷の推定確率を表す複合値である、請求項2〜13のいずれか一項記載の方法。
- 前記スコアが、0〜100にスケーリングされている、請求項14記載の方法。
- 前記スコアが、少なくとも91%の感度と少なくとも91%の特異度で、腎損傷を検出するために使用される、請求項2〜15のいずれか一項記載の方法。
- 前記スコアが、90%より大きい、受信者動作特性曲線の下面積(AUC)で、腎損傷を検出するために使用される、請求項2〜15のいずれか一項記載の方法。
- 前記非線形モデルが、腎結石、免疫複合体、癌、糖尿病、および移植拒絶を含む、腎損傷の複数の原因を有する対象と対照を評価することによって生成される、請求項5記載の方法。
- 前記非線形モデルが、少なくとも400の試料を評価することによって生成される、請求項18記載の方法。
- 移植術後期間の異なる時点において、対象から複数の体液試料を得る工程をさらに含む、請求項1〜19のいずれか一項記載の方法。
- 体液試料由来のcfDNAを核酸プローブと接触させることにより、固定化cfDNA/核酸プローブ複合体が生じる、請求項1〜20のいずれか一項記載の方法。
- 検出基質を含む溶液と前記複合体を接触させる工程をさらに含む、請求項21記載の方法。
- 前記検出基質が、化学発光基質である、請求項22記載の方法。
- クラスタリンに対する抗体が、マイクロウェルに基づくアッセイにおいて使用される、請求項3〜23のいずれか一項記載の方法。
- CXCL10に対する抗体が、マイクロウェルに基づくアッセイにおいて使用される、請求項4〜24のいずれか一項記載の方法。
- 腎損傷に罹患している対象が、医学的介入を必要としているかどうかを決定するための方法であって、請求項2記載の方法によって生成されたスコアを得る工程を含み、該スコアに基づいて、該対象に対する医学的介入の必要性が示される、方法。
- 前記医学的介入が、対象へ免疫抑制薬を投与することまたは対象への免疫抑制薬の投与量を変更することを含む、請求項26記載の方法。
- 前記免疫抑制薬が、カルシニューリン阻害剤、抗増殖剤、mTOR阻害剤、ステロイド、または導入剤である、請求項27記載の方法。
- 前記免疫抑制薬が、タクロリムス、シクロスポリン、ミコフェノール酸モフェチル、ミコフェノール酸ナトリウム、アザチオプリン、シロリムス、プレドニゾン、サイモグロブリン、IL2受容体遮断薬、およびベラタセプトからなる群より選択される、請求項27または28記載の方法。
- 移植術後期間の異なる時点において、対象から複数の体液試料を得る工程をさらに含む、請求項26〜29のいずれか一項記載の方法。
- 細胞溶解を阻害しかつ体液中のヌクレアーゼを阻害するために十分な濃度で、ホルムアルデヒドドナー、キレート剤、アウリントリカルボン酸、およびポリエチレングリコール(PEG)を含む、溶液。
- ホルムアルデヒドドナーがジアゾリジニル尿素である、請求項31記載の溶液。
- キレート剤がEDTAである、請求項31または32記載の溶液。
- アジ化ナトリウムをさらに含む、請求項31〜33のいずれか一項記載の溶液。
- 緩衝剤を含む、請求項31または34記載の溶液。
- 体液試料をさらに含む、請求項31〜35のいずれか一項記載の溶液。
- 体液試料が、臓器移植を受けたことがあるかまたは腎疾患を有する患者に由来する、請求項31〜36のいずれか一項記載の溶液。
- 臓器移植が腎移植である、請求項37記載の溶液。
- 以下の工程を含む、体液試料中のセルフリーDNA(cfDNA)を検出する方法:
ヒトから体液試料を得る工程;
体液試料からcfDNAを抽出する工程;
核酸プローブに相補的であるcfDNAに核酸プローブがハイブリダイズすることを可能にする条件下で、cfDNAを核酸プローブと接触させることによって、反応混合物を形成させる工程であって、核酸プローブが、3'末端および5'末端を有する核酸配列を有し、核酸プローブが、SEQ ID NO:1の少なくとも20個かつ292個以下の連続ヌクレオチドにハイブリダイズするように構成されており、3'末端または5'末端が、検出可能な標識に共有結合で連結されている、工程;および
該プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を定量化する工程。 - 前記プローブがSEQ ID NO:2の少なくとも50個の連続ヌクレオチドに相補的である、請求項39記載の方法。
- 反応混合物を形成させる前に請求項31記載の溶液を体液試料と混合する工程をさらに含む、請求項39または40記載の方法。
- 体液試料が尿試料であり、
前記方法が、反応混合物中のクレアチニンの量を定量化する工程をさらに含む、
請求項39〜41のいずれか一項記載の方法。 - 前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を、尿試料中のクレアチニンの量に対して正規化して、ハイブリダイズしたDNAの正規化された量を得る工程を含む、請求項42記載の方法。
- ハイブリダイズしたcfDNAの正規化された量を、腎臓状態を示すカットオフ値と比較する工程をさらに含む、請求項42または43記載の方法。
- 前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの検出された量またはcfDNAの正規化された量がカットオフ値より大きい場合、患者が腎損傷を有すると決定する工程
をさらに含む、請求項42〜44のいずれか一項記載の方法。 - ヒトが腎移植を受けたことがある患者であり、腎損傷が、患者が急性拒絶エピソードを有することを示す、請求項42〜45のいずれか一項記載の方法。
- ヒトが腎移植を受けたことがある患者であり、
前記方法が、cfDNAの正規化された量と、尿試料が患者から採取された時点での腎臓移植からの期間とに基づき、腎臓の健康を決定するための予測スコアを生成する工程をさらに含む、
請求項42〜45のいずれか一項記載の方法。 - 予測スコアが予測スコアのカットオフ値より大きい時、患者が急性拒絶エピソードを有すると決定される、請求項47記載の方法。
- 尿試料が、BKウイルス性腎炎、巣状分節性糸球体硬化症、急性尿細管壊死、IgA疾患、および糖尿病性腎疾患からなる群より選択される疾患によって引き起こされた腎損傷を有すると推測される個体に由来する、請求項42〜44のいずれか一項記載の方法。
- CXCL10の量を定量化する工程をさらに含む、請求項39〜49のいずれか一項記載の方法。
- 前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な50〜150ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、請求項39〜50のいずれか一項記載の方法。
- 前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な70〜100ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、請求項39〜50のいずれか一項記載の方法。
- 前記プローブが、SEQ ID NO:1に相補的な80〜90ヌクレオチドのヌクレオチド配列を含む、請求項39〜50のいずれか一項記載の方法。
- 前記ヌクレオチド配列が正確に81個のヌクレオチドを有する、請求項53記載の方法。
- 検出可能な標識がビオチンであり、
前記方法が、ストレプトアビジンと連結されたシグナル生成剤と、検出可能な標識とを接触させる工程を含む、
請求項39〜54のいずれか一項記載の方法。 - シグナル生成剤が、化学発光、色、または蛍光を生成する、請求項39〜55のいずれか一項記載の方法。
- 患者の腎移植受容から0〜400日後または10〜100日後または20〜50日後または移植腎の寿命中に、尿試料が採取される、請求項39〜56のいずれか一項記載の方法。
- (i)尿試料から抽出された未増幅のセルフリーDNA(cfDNA)と、
(ii)核酸配列を有し3'末端および5'末端を有する核酸プローブと
を含む反応混合物であって、
核酸プローブがSEQ ID NO:1の20〜292個の連続ヌクレオチドに相補的であり、3'末端または5'末端が検出可能な標識に共有結合で連結されている、反応混合物。 - 臓器移植が肺移植である、請求項37記載の溶液。
- 体液試料が気管支肺胞洗浄(BAL)液試料であり、
前記方法が、BAL液の全体積を定量化する工程をさらに含む、
請求項39記載の方法。 - 前記プローブにハイブリダイズしたcfDNAの量を、全BAL液試料体積に対して正規化して、ハイブリダイズしたDNAの正規化された量を得る工程を含む、請求項60記載の方法。
- ハイブリダイズしたcfDNAの正規化された量を、肺状態を示すカットオフ値と比較する工程をさらに含む、請求項61記載の方法。
- プローブにハイブリダイズしたcfDNAの検出された量またはcfDNAの正規化された量が、カットオフ値より大きい場合、患者が肺損傷を有すると決定する工程
をさらに含む、請求項60〜62のいずれか一項記載の方法。 - ヒトが肺移植を受けたことがある患者であり、肺損傷が、患者が拒絶エピソードを有することを示す、請求項60〜63のいずれか一項記載の方法。
- 以下の工程を含む、臓器損傷を検出する方法:
損傷を有すると推測されるかまたは損傷を発症する可能性が高い臓器から採取された体液試料において、cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を測定する工程であって、1種または複数種のマーカーが、
(i)1種または複数種の炎症マーカー、
(ii)1種または複数種のアポトーシスマーカー、
(iii)全タンパク質、および
(iv)DNAメチル化マーカーのうちの1つまたは複数
からなる群より選択される、工程;
cfDNAの量および1種または複数種のマーカーの量を使用して、ITスコアを得る工程;
ITスコアが所定のカットオフより高い場合、患者が臓器に損傷を有すると決定するか、患者が臓器に損傷を発症し得ると予測する工程。 - ホルムアルデヒドドナーが、5g/L〜20g/Lの濃度で存在し、
PEGが、1g/L〜30g/Lの濃度で存在し、
アウリントリカルボン酸が、0.2mM〜10mMの濃度で存在し、かつ
キレート剤が、2mM〜50mMの濃度で存在する、
請求項31〜38のいずれか一項記載の溶液。 - 前記体液試料が尿である、請求項36〜38のいずれか一項記載の溶液。
- 前記体液試料が、気管支肺胞洗浄(BAL)液試料である、請求項36〜38のいずれか一項記載の溶液。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662376299P | 2016-08-17 | 2016-08-17 | |
US62/376,299 | 2016-08-17 | ||
PCT/US2017/047372 WO2018035340A1 (en) | 2016-08-17 | 2017-08-17 | A novel immunoprobe-based method to assess organ injury status through a biofluid-based cell-free dna (cfdna) assay |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2019528063A JP2019528063A (ja) | 2019-10-10 |
JP2019528063A5 true JP2019528063A5 (ja) | 2020-10-15 |
JP7109424B2 JP7109424B2 (ja) | 2022-07-29 |
Family
ID=61197090
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019508929A Active JP7109424B2 (ja) | 2016-08-17 | 2017-08-17 | 体液に基づくセルフリーDNA(cfDNA)アッセイを通して臓器損傷状態を査定するための新規のイムノプローブに基づく方法 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (6) | US11124824B2 (ja) |
EP (2) | EP3845665A1 (ja) |
JP (1) | JP7109424B2 (ja) |
CN (2) | CN117965692A (ja) |
AU (2) | AU2017313138B2 (ja) |
CA (1) | CA3033650A1 (ja) |
WO (1) | WO2018035340A1 (ja) |
Families Citing this family (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11939634B2 (en) | 2010-05-18 | 2024-03-26 | Natera, Inc. | Methods for simultaneous amplification of target loci |
US11168351B2 (en) | 2015-03-05 | 2021-11-09 | Streck, Inc. | Stabilization of nucleic acids in urine |
WO2016183106A1 (en) | 2015-05-11 | 2016-11-17 | Natera, Inc. | Methods and compositions for determining ploidy |
US20170145475A1 (en) | 2015-11-20 | 2017-05-25 | Streck, Inc. | Single spin process for blood plasma separation and plasma composition including preservative |
WO2018022991A1 (en) | 2016-07-29 | 2018-02-01 | Streck, Inc. | Suspension composition for hematology analysis control |
EP3845665A1 (en) | 2016-08-17 | 2021-07-07 | The Regents Of The University Of California | A novel immunoprobe-based method to assess organ injury status through a biofluid-based cell-free dna (cfdna) assay |
US11814750B2 (en) | 2018-05-31 | 2023-11-14 | Personalis, Inc. | Compositions, methods and systems for processing or analyzing multi-species nucleic acid samples |
US10801064B2 (en) | 2018-05-31 | 2020-10-13 | Personalis, Inc. | Compositions, methods and systems for processing or analyzing multi-species nucleic acid samples |
US11525159B2 (en) * | 2018-07-03 | 2022-12-13 | Natera, Inc. | Methods for detection of donor-derived cell-free DNA |
WO2022133159A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Nephrosant, Inc. | Kits for stabilization of urine samples |
CA3226436A1 (en) * | 2021-07-23 | 2023-01-26 | Megan E. Mcnamara | Use of circulating cell-free methylated dna to detect tissue damage |
WO2024057280A1 (en) | 2022-09-16 | 2024-03-21 | Illumina Cambridge Limited | Nanoparticle with polynucleotide binding site and method of making thereof |
Family Cites Families (28)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0821041B2 (ja) | 1988-06-01 | 1996-03-04 | 横河電機株式会社 | プリント基板cadの部品シンボル作成方法 |
US5849517A (en) | 1991-05-08 | 1998-12-15 | Streck Laboratories, Inc. | Method and composition for preserving antigens and nucleic acids and process for utilizing cytological material produced by same |
JPH0821041A (ja) | 1994-07-07 | 1996-01-23 | Ig Tech Res Inc | 瓦棒葺屋根の改修構造 |
WO1996021041A1 (fr) | 1994-12-29 | 1996-07-11 | Eiken Kagaku Kabushiki Kaisha | Procede de detection cellulaire |
JPH1021041A (ja) * | 1996-06-28 | 1998-01-23 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | 操作パネル |
US7537889B2 (en) * | 2003-09-30 | 2009-05-26 | Life Genetics Lab, Llc. | Assay for quantitation of human DNA using Alu elements |
EP1888786A4 (en) * | 2005-05-27 | 2009-12-30 | Wayne John Cancer Inst | USE FREE CIRCULATIVE DNA FOR THE DIAGNOSIS, FORECAST AND TREATMENT OF CANCER |
US20090081678A1 (en) | 2007-09-21 | 2009-03-26 | Streck, Inc. | Nucleic acid isolation in preserved whole blood |
JP2010017178A (ja) | 2008-06-11 | 2010-01-28 | Sumitomo Chemical Co Ltd | Dnaを定量又は検出する方法 |
NO2398912T3 (ja) | 2009-02-18 | 2018-02-10 | ||
US8404444B2 (en) | 2009-02-25 | 2013-03-26 | Diacarta Llc | Method for predicting the level of damage to cells by measuring free circulating Alu nucleic acid |
WO2011014741A1 (en) | 2009-07-31 | 2011-02-03 | Artemis Health, Inc. | Methods and compositions for cell stabilization |
WO2011057184A1 (en) | 2009-11-09 | 2011-05-12 | Streck, Inc. | Stabilization of rna in and extracting from intact cells within a blood sample |
CA2784889C (en) * | 2009-12-20 | 2018-06-19 | Astute Medical, Inc. | Methods and compositions for diagnosis and prognosis of renal injury and renal failure |
US20130323763A1 (en) * | 2011-02-10 | 2013-12-05 | Sapporo Medical University | Method for diagnosing acute lung injury |
JP5214042B2 (ja) | 2012-02-03 | 2013-06-19 | アンリツ株式会社 | 光素子パッケージの製造方法 |
US10472679B2 (en) * | 2012-05-15 | 2019-11-12 | Cornell University | Non-invasive method of diagnosing renal fibrosis |
US20150225712A1 (en) * | 2012-08-21 | 2015-08-13 | Qiagen Gmbh | Method for isolating nucleic acids from a formaldehyde releaser stabilized sample |
WO2014029792A1 (en) | 2012-08-21 | 2014-02-27 | Qiagen Gmbh | Virus particle stabilisation and method for isolating viral nucleic acids |
WO2014074501A1 (en) * | 2012-11-06 | 2014-05-15 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Molecular markers for diagnosis of acute cellular rejection and acute tubular necrosis |
EP2971135A4 (en) * | 2013-03-15 | 2016-11-09 | Immucor Gti Diagnostics Inc | METHODS AND COMPOSITIONS FOR ESTIMATING RENAL STATUS USING URINE ACELLULAR DNA |
CN105121643A (zh) | 2013-03-18 | 2015-12-02 | 凯杰有限公司 | 细胞外核酸的稳定化和分离 |
US20160376652A1 (en) * | 2013-09-06 | 2016-12-29 | Immucor Gti Diagnostics, Inc. | Compositions and methods for diagnosis and prediction of solid organ graft rejection |
PT4026917T (pt) | 2014-04-14 | 2024-02-12 | Yissum Research And Development Company Of The Hebrew Univ Of Jerusalem Ltd | Método e kit para determinar a morte de células ou de tecido ou a origem de tecidos ou de células de dna por análise de metilação do dna |
WO2015161880A1 (en) | 2014-04-24 | 2015-10-29 | Euroclone S.P.A. | An in vitro diagnostic method for cancer by means of circulating, cell-free dna |
EP3623792B1 (en) | 2014-07-09 | 2021-09-01 | Exosome Diagnostics, Inc. | Methods for isolating microvesicles and extracting nucleic acids from biological samples |
EP3497232A1 (en) * | 2016-08-12 | 2019-06-19 | Streck, Inc. | Molecular reference controls |
EP3845665A1 (en) | 2016-08-17 | 2021-07-07 | The Regents Of The University Of California | A novel immunoprobe-based method to assess organ injury status through a biofluid-based cell-free dna (cfdna) assay |
-
2017
- 2017-08-17 EP EP21152914.4A patent/EP3845665A1/en active Pending
- 2017-08-17 EP EP17842131.9A patent/EP3500687A4/en not_active Withdrawn
- 2017-08-17 CN CN202410041779.5A patent/CN117965692A/zh active Pending
- 2017-08-17 CN CN201780063968.0A patent/CN109890977A/zh active Pending
- 2017-08-17 WO PCT/US2017/047372 patent/WO2018035340A1/en unknown
- 2017-08-17 CA CA3033650A patent/CA3033650A1/en active Pending
- 2017-08-17 US US16/325,385 patent/US11124824B2/en active Active
- 2017-08-17 AU AU2017313138A patent/AU2017313138B2/en active Active
- 2017-08-17 JP JP2019508929A patent/JP7109424B2/ja active Active
-
2019
- 2019-10-09 US US16/597,782 patent/US10982272B2/en active Active
-
2020
- 2020-10-07 US US17/065,417 patent/US10995368B2/en active Active
-
2021
- 2021-07-15 US US17/376,919 patent/US11926868B2/en active Active
- 2021-10-11 US US17/498,489 patent/US11505822B2/en active Active
-
2022
- 2022-05-06 US US17/738,988 patent/US11753680B2/en active Active
-
2024
- 2024-04-02 AU AU2024202089A patent/AU2024202089A1/en active Pending
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2019528063A5 (ja) | ||
WO2022271820A1 (en) | Spatial detection of sars-cov-2 using templated ligation | |
Barker et al. | Limitations of using feline coronavirus spike protein gene mutations to diagnose feline infectious peritonitis | |
Arroyo et al. | Next generation sequencing for human papillomavirus genotyping | |
Nicot et al. | Diversity of hepatitis E virus genotype 3 | |
JP2008249727A5 (ja) | ||
CN111455114B (zh) | SARS-CoV-2的高通量检测试剂盒 | |
CN111187860A (zh) | 新型冠状病毒多重pcr快速检测试剂盒 | |
No et al. | Comparison of targeted next-generation sequencing for whole-genome sequencing of Hantaan orthohantavirus in Apodemus agrarius lung tissues | |
WO2018210201A1 (zh) | 一种用于早期诊断、预测脓毒血症并发急性肾损伤的分子标记物、试剂盒及应用 | |
Calistri et al. | Editorial commentary: unbiased next-generation sequencing and new pathogen discovery: undeniable advantages and still-existing drawbacks | |
CN106191311B (zh) | 一种快速检测豚鼠LCMV、SV、PVM、Reo-3病毒的多重液相基因芯片方法及试剂 | |
Simanavicius et al. | Detection of rat hepatitis E virus, but not human pathogenic hepatitis E virus genotype 1–4 infections in wild rats from Lithuania | |
CA3116522A1 (en) | A method of detecting small rna | |
JP2015530868A5 (ja) | ||
CN110029160B (zh) | 一种基于血浆lncRNA组合物的肺结核病疗效评价试剂盒及其用途 | |
WO2016008014A1 (en) | Method of predicting rapid progression of fibrosis and therapy and reagents therefor | |
CN110241264B (zh) | 一种乙型肝炎病毒(hbv)dna定量检测试剂盒 | |
CN110452975A (zh) | 用于检测ddcfDNA的产品在制备检测肺部感染引起的移植肾损伤和预后中的用途 | |
CN111411169A (zh) | 用于恒温扩增检测麻疹病毒的核酸序列、试剂盒及方法和应用 | |
JP5845489B2 (ja) | B型肝炎ウイルス群を検出し、遺伝子多様性を評価するためのオリゴヌクレオチドのセット、並びにそれを用いた方法 | |
Hans et al. | Combination of an unbiased amplification method and a resequencing microarray for detecting and genotyping equine arteritis virus | |
KR102229647B1 (ko) | 신장이식 환자의 급성거부반응 진단용 miRNA 바이오 마커 및 이의 용도 | |
CN105219885A (zh) | 可避免假阴性的手足口病毒CoxA16恒温荧光检测引物组、试剂盒及检测方法 | |
US20090325161A1 (en) | Kit and method for quantitatively detecting multiplepathogens without gene amplification |