JP2010526541A5

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Publication number: JP2010526541A5
Application number: JP2010507728A
Authority: JP
Filing date: 2008-05-12
Publication date: 2012-04-05
Anticipated expiration: 2028-05-12

Description

更に別の態様において、細胞における侵害受容シグナル伝達に関与する蛋白質の蛋白分解をモニタリングするための方法が提供される。該方法は、一般的にオリゴヌクレオチドデコイの有効量を細胞に投与することを含む。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
２つの転写因子結合部位を含むオリゴヌクレオチドデコイであって、各転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＡＰ１、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＥＴＳ１、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＳＴＡＴ、ＧＡＴＡ１、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲ転写因子よりなる群から選択される転写因子に結合する、オリゴヌクレオチドデコイ。
（項目２）
前記デコイ上の前記２つの転写因子結合部位の相対的位置が、前記オリゴヌクレオチドデコイと標的転写因子の間の結合親和性を増大させる、項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目３）
前記２つの転写因子結合部位がオーバーラップしている、項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目４）
前記２つの転写因子結合部位が同じ転写因子に結合する、項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目５）
前記転写因子がＥＧＲ１である、項目４に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目６）
前記２つの転写因子結合部位が異なる転写因子に結合する、項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目７）
前記デコイが約２０〜４０塩基対長である、項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目８）
式（３）で表される配列を含む、項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目９）
前記配列が配列番号３の配列と少なくとも７０％の同一性を有する、項目８に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目１０）
位置１５〜２１におけるヌクレオチドが存在しない、項目８に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目１１）
（ａ）配列番号４２の配列；または、
（ｂ）配列番号４２の配列と少なくとも８０％の同一性を有する配列；
を含む、項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目１２）
第３の転写因子結合部位を更に含む項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイであって、前記第３の転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＡＰ１、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＥＴＳ１、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＳＴＡＴ、ＧＡＴＡ１、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲ転写因子よりなる群から選択される転写因子に結合する、オリゴヌクレオチドデコイ。
（項目１３）
（ａ）配列番号４５の配列；または、
（ｂ）配列番号４５の配列と少なくとも７０％の同一性を有する配列；
を含む、項目１２に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（項目１４）
：
（ａ）配列番号１〜４０、４２、４５および４７〜５３よりなる群から選択される配列；（ｂ）配列番号１〜３９、４２、４５および４７〜５３よりなる群から選択される配列と少なくとも９０％の同一性を有する配列；
（ｃ）配列番号１〜１７、１９〜３９、４２、４５、４７〜５３よりなる群から選択される配列と少なくとも８５％の同一性を有する配列；または、
（ｄ）配列番号１〜５、７〜１７、１９〜３９、４２、４５および４７〜５３よりなる群から選択される配列と少なくとも８０％の同一性を有する配列；
を含む、オリゴヌクレオチドデコイ。
（項目１５）
項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイおよび薬学的に許容しうる担体を含む、医薬組成物。
（項目１６）
項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイおよび場合により前記オリゴヌクレオチドデコイを使用するための説明書を含む、キット。
（項目１７）
項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイの有効量を細胞に投与することを含む、侵害受容シグナル伝達に関与する細胞中に存在する遺伝子の転写を調節するための方法。
（項目１８）
前記細胞がニューロンである、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
転写の調節が遺伝子発現を抑制、阻害、活性化、誘導または安定化する、項目１７に記載の方法。
（項目２０）
前記遺伝子がＢＤＫＲＤ２、ＨＴＲ３Ａ、ＳＣＮ９Ａ、ＢＤＮＦ、ＧＲＭ５、ＮＯＳ１、ＧＣＨ１、ＣＤＫ５Ｒ１、およびＰＮＭＴよりなる群から選択される、項目１７に記載の方法。
（項目２１）
項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイの有効量を細胞に投与することを含む、該細胞における侵害受容シグナル伝達を調節するための方法。
（項目２２）
前記細胞がニューロンである、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
項目１に記載のオリゴヌクレオチドデコイの治療有効量を患者に投与することを含む、該患者における疼痛を処置または予防するための方法。
（項目２４）
該疼痛が急性から慢性の疼痛の何れかの疼痛である、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
前記疼痛が術後疼痛である、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
前記オリゴヌクレオチドデコイを硬膜外／硬膜周囲または髄腔内に投与する、項目２３に記載の方法。
（項目２７）
１つ以上のオリゴヌクレオチドデコイの治療有効量を患者に投与することを含む、該患者における疼痛を処置または予防するための方法であって、各オリゴヌクレオチドデコイが転写因子結合部位を含み、そして前記転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲよりなる群から選択される転写因子に結合する、方法。
（項目２８）
各オリゴヌクレオチドデコイが２つの転写因子結合部位を含み、そして各転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＡＰ１、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＥＴＳ１、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＳＴＡＴ、ＧＡＴＡ１、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲよりなる群から選択される転写因子に結合する、項目２７に記載の方法。

Claims

２つの転写因子結合部位を含むオリゴヌクレオチドデコイであって、各転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＡＰ１、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＥＴＳ１、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＳＴＡＴ、ＧＡＴＡ１、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲ転写因子よりなる群から選択される転写因子に結合する、オリゴヌクレオチドデコイ。
前記デコイ上の前記２つの転写因子結合部位の相対的位置が、前記オリゴヌクレオチドデコイと標的転写因子の間の結合親和性を増大させる、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
前記２つの転写因子結合部位がオーバーラップしている、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
前記２つの転写因子結合部位が同じ転写因子に結合する、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
前記転写因子がＥＧＲ１である、請求項４に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
前記２つの転写因子結合部位が異なる転写因子に結合する、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
前記デコイが約２０〜４０塩基対長である、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
式（３）で表される配列を含む、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
前記配列が配列番号３の配列と少なくとも７０％の同一性を有する、請求項８に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
位置１５〜２１におけるヌクレオチドが存在しない、請求項８に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（ａ）配列番号４２の配列；または、
（ｂ）配列番号４２の配列と少なくとも８０％の同一性を有する配列；
を含む、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
第３の転写因子結合部位を更に含む請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイであって、前記第３の転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＡＰ１、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＥＴＳ１、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＳＴＡＴ、ＧＡＴＡ１、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲ転写因子よりなる群から選択される転写因子に結合する、オリゴヌクレオチドデコイ。
（ａ）配列番号４５の配列；または、
（ｂ）配列番号４５の配列と少なくとも７０％の同一性を有する配列；
を含む、請求項１２に記載のオリゴヌクレオチドデコイ。
（ａ）配列番号１〜４０、４２、４５および４７〜５３よりなる群から選択される配列；（ｂ）配列番号１〜３９、４２、４５および４７〜５３よりなる群から選択される配列と少なくとも９０％の同一性を有する配列；
（ｃ）配列番号１〜１７、１９〜３９、４２、４５、４７〜５３よりなる群から選択される配列と少なくとも８５％の同一性を有する配列；または、
（ｄ）配列番号１〜５、７〜１７、１９〜３９、４２、４５および４７〜５３よりなる群から選択される配列と少なくとも８０％の同一性を有する配列；
を含む、オリゴヌクレオチドデコイ。
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイおよび薬学的に許容しうる担体を含む、医薬組成物。
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイおよび場合により前記オリゴヌクレオチドデコイを使用するための説明書を含む、キット。
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイの有効量を含む、侵害受容シグナル伝達に関与する細胞中に存在する遺伝子の転写を調節するための組成物。
前記細胞がニューロンである、請求項１７に記載の組成物。
転写の調節が遺伝子発現を抑制、阻害、活性化、誘導または安定化する、請求項１７に記載の組成物。
前記遺伝子がＢＤＫＲＤ２、ＨＴＲ３Ａ、ＳＣＮ９Ａ、ＢＤＮＦ、ＧＲＭ５、ＮＯＳ１、ＧＣＨ１、ＣＤＫ５Ｒ１、およびＰＮＭＴよりなる群から選択される、請求項１７に記載の組成物。
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイの有効量を含む、該細胞における侵害受容シグナル伝達を調節するための組成物。
前記細胞がニューロンである、請求項２１に記載の組成物。
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドデコイの治療有効量を含む、患者における疼痛を処置または予防するための組成物。
前記疼痛が急性から慢性の疼痛の何れかの疼痛である、請求項２３に記載の組成物。
前記疼痛が術後疼痛である、請求項２３に記載の組成物。
前記組成物を硬膜外／硬膜周囲または髄腔内に投与することを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
１つ以上のオリゴヌクレオチドデコイの治療有効量を含む、患者における疼痛を処置または予防するための組成物であって、各オリゴヌクレオチドデコイが転写因子結合部位を含み、そして前記転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲよりなる群から選択される転写因子に結合する、組成物。
各オリゴヌクレオチドデコイが２つの転写因子結合部位を含み、そして各転写因子結合部位がＰＯＵ１Ｆ１、ＰＯＵ２Ｆ、ＰＯＵ３Ｆ、ＰＯＵ５Ｆ１、ＵＳＦ、ＥＧＲ１、ＣＲＥＢ／ＡＴＦ、ＡＰ１、ＣＥＢＰ、ＳＲＦ、ＥＴＳ１、ＭＥＦ２、ＳＰ１、ＲＵＮＸ、ＮＦＡＴ、ＥＬＫ１、三元複合体因子、ＳＴＡＴ、ＧＡＴＡ１、ＥＬＦ１、核因子−顆粒球／マクロファージａ、ＰＯＵ４Ｆ１、ＨＮＦ１、ＺＦＨＸ３、ＩＲＦ、ＴＥＡＤ１、ＴＢＰ、ＮＦＹ、ｃａｃｃｃ−ボックス結合因子、ＫＬＦ４、ＫＬＦ７、ＩＫＺＦ、ＭＡＦ、ＲＥＳＴ、ＨＳＦ、ＫＣＮＩＰ３およびＰＰＡＲよりなる群から選択される転写因子に結合する、請求項２７に記載の組成物。