JP2006519443A - バーチャルスライドを閲覧するためのシステムおよび方法 - Google Patents
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Abstract
Description
以下で、本発明の典型的な実装例を、図9A〜9Fに関して説明する。この典型的な実施の形態は、あくまで例として説明されるものであり、これまでに記載し添付の特許請求の範囲にも記載される本発明の広がりおよび技術的範囲を限定するものとして解釈するべきではない。
このコンピュータは、バーチャルスライド画像を収容し、スライド・データへのアクセスのために使用されるネットワーク・アプリケーション・プログラム・インターフェイス(「API」)を提供する。この装置は、インテル‐アーキテクチャのコンピュータであってマイクロソフト・ウインドウズまたはリナックスを動作させており、典型的には、かなりのメモリ(キャッシュ用)および大量のディスク記憶領域(バーチャルスライドの保存用)を装備する強力なPCである。
このコンピュータは、ウェブ・インターフェイスを使用してバーチャルスライド・データにアクセスするために使用されるウェブサイトを収容している。ウェブビューア(WebViewer)ソフトウェアが、ウェブサーバに一体化されている。この装置は、マイクロソフト・ウインドウズおよびマイクロソフト・インターネット・インフォメーション・サーバ(IIS)を動作させるインテル‐アーキテクチャのコンピュータであってよく、あるいはアパッチ(Apache)を動作させる任意のアーキテクチャのコンピュータであってよい。ウェブ・サーバ装置が、イメージサーバ装置と同じであることも可能である。
バーチャルスライドは、典型的には200MB〜4GBのサイズの別個独立のファイルとして保存される。イメージサーバ装置は、容量および堅牢性の理由で、複数の別個独立のディスクからなる冗長アレイ(「RAID」)を備えて構成されることが多い。
認証用のデータおよび注釈を含むバーチャルスライド情報が、SQLデータベースに保存される。このデータベースは、通常はイメージサーバ装置に位置するが、必ずしもそのようである必要はない。典型的な実装例は、マイクロソフト・データベース・エンジン(「MSDE」)またはマイクロソフトSQLサーバを使用する。データベースへのアクセスは、システムの一部として提供されるサービスを経由する。このサービスへのインターフェイスは、TCP/IPによるHTTPであり、データベース・アクセスの分散を可能にする。
イメージサーバは、バーチャルスライド・データへのアクセスのためのネットワークAPIを提供するスタンドアロンのアプリケーションである。イメージサーバは、バーチャルスライド画像ファイルにアクセスするとともに、認証および注釈データへのアクセスのため、データベースへのインターフェイスを有している。
イメージスコープは、スライド情報の閲覧のために簡単かつ簡潔なグラフィカル・ユーザ・インターフェイスを提供するスタンドアロンのアプリケーションである。イメージスコープは、イメージサーバのネットワークAPIを利用してイメージサーバとやり取りし、あるいはバーチャルスライド・ファイルを直接読み出すことができる。
ウェブビューア・ソフトウェアは、スライド情報を閲覧するためのHTMLユーザ・インターフェイスをウェブ・ブラウザに届けるため、標準的なウェブ・サーバのもとで動作する。HTMLページは、ウェブ・ブラウザにイメージサーバからのJPEG画像情報を要求させる画像タグ(<IMG>)を含んでいる。HTMLページとJPEG画像の組み合わせが、ウェブビューア・インターフェイスを構成する。
任意のプラットフォーム上のあらゆる標準的なウェブ・ブラウザを、ウェブビューアを利用してバーチャルスライド・データを閲覧すべく使用することができる。
イメージサーバは、バーチャルスライド・ファイルのブロックにアクセスするため、TCP/IPによるHTTPメッセージ・インターフェイスをサポートしている。これらのブロックは、イメージビューア(クライアント側)によって解凍され、処理される。
イメージサーバは、バーチャルスライド・ファイルのサブ領域にアクセスするため、TCP/IPによるHTTPメッセージ・インターフェイスをサポートしている。これらの領域は、イメージサーバ(サーバ側)によって解凍および処理され、JPEG画像として再圧縮されてブラウザへと送信される。
これは、ウェブ・ブラウザとウェブ・サーバとの間の標準的なTCP/IPによるHTTPインターフェイスであって、ブラウザへとHTMLページを届けるために使用される。ウェブビューアが、ページの動的な生成、および応答データの処理を行なう。
クライアントがHTTP要求を行い、応答としてXMLフォーマットの画像注釈データを受け取る。さらに、注釈データを、XMLフォーマットの画像注釈データを含んでいるHTTP投稿によって、更新することができる。
クライアントがHTTP要求を行い、画像属性を取得するためのXMLフォーマットの応答データを受け取る。
クライアントがHTTP要求を行い、応答として画像ファイル・ブロックを受け取る。ブロックは、(X,Y)位置およびレベルによって要求される。クライアントが、画像ファイル・ブロックの解凍(JPEG2000コーデックを使用)および適切な解像度への拡大縮小を担当する。
クライアントがHTTP要求を行い、応答としてJPEG画像を受け取る。領域は、画像の任意のサブ領域であり、(X,Y)位置および解像度ならびに所望の寸法によって要求される。JPEG2000の解凍および適切な解像度への拡大縮小は、イメージサーバ・プロセスによってなされる。
このコントローラのプロパティおよび方法は、バーチャルスライドへのすべてのアクセスをカプセル化する。コントローラのウインドウが、スライド情報を表示する表示窓の表面である。
ビューポート/ファイルオブジェクト/TCP/IPライブラリが、イメージサーバへのHTTP要求を生成し、応答としてバーチャル・ファイル・ブロックを受け取る。さらに、このインターフェイスは、画像属性を取り出すためにも使用される。
MVCインターセプトが、VMCサーバへのHTTP要求を生成し、XMLフォーマットの応答を受け取る。このインターフェイスは、インターセプトした指令をVMCサーバへと渡すために使用され(このアプリケーションがセッションを「リード」している場合)、VMCサーバからの指令を受信するために使用される(このアプリケーションが「従」である場合)。
あらゆるプラットフォーム上のあらゆる標準的なブラウザがサポートされる。
これは、通常は、ウインドウズのもとで動作するマイクロソフト・インターネット・インフォメーション・サーバ(IIS)、またはリナックスまたはユニックス(Unix)のもとで動作するアパッチである。コーン・シェル(Korn Shell)をサポートするプラットフォーム上でCGIインターフェイスをサポートするあらゆるウェブ・サーバが、サポートされる。
これらは、ウェブ・サーバ・プロセスのもとで動作し、コモン・ゲートウェイ・インターフェイス(CGI)を通じて惹起される。これらのスクリプトは、常駐のコーン・シェル・インタプリタを必要とする。ウェブビューアが、ウェブ閲覧のためのインターフェイスを有するHTMLページを構築し、インターフェイスからの入力(マウスのクリック)を処理する。
イメージスコープが動作しているコンピュータ。
注釈の表示および編集のためのユーザ・インターフェイスを提供するアプリケーション。
イメージサーバが動作しているコンピュータ。
注釈を含むバーチャルスライド画像データへのアクセスのためのネットワークAPIを提供するプロセス。
このSQLデータベース(典型的には、MSDEまたはSQLサーバ)が、サーバ上に注釈情報を保存する。
各ユーザがイメージスコープ・ビューアを動作させているコンピュータ。
VMCセッションのためのクライアント・インターフェイスを実装するアプリケーション・プログラム。
VMCサーバ・アプリケーションが動作しているコンピュータ。このコンピュータは、VMCセッションにおいて閲覧される画像を提供するイメージサーバ装置と同じであってよいが、必ずしも同じである必要はない。
イメージスコープ・ビューアを一体に相互接続することによってVMCセッションを管理するアプリケーション。各クライアントは、TCP/IPによるHTTP要求を使用してVMCサーバと通信する。
SQLデータベース(典型的には、MSDEまたはSQLサーバ)が、認証情報を保存する。これがVMCサーバへとアクセスするための認証情報であり、イメージサーバ装置上の画像にアクセスするために必要とされる認証情報と相違していてよいことに、注意すべきである。
Claims (48)
- バーチャル顕微鏡スライドを閲覧するためのサーバ・システムであって、
バーチャルスライド画像ファイル、認証情報、および注釈データを含んでいるデータ記憶領域と、
バーチャルスライド要求を受信し、要求の種類を特定し、処理のために該要求を案内し、応答を提供するように構成された接続モジュールと、
バーチャルスライド要求を受信し、前記データ記憶領域からバーチャルスライド・データを取り出し、応答としてバーチャルスライド・データを提供するように構成されたバーチャルスライド・モジュールと、を有しているサーバ・システム。 - 前記バーチャルスライド要求が、ユーザ認証情報を含んでおり、
前記接続モジュールが、該バーチャルスライド要求内のユーザ認証情報を検証するため、前記データ記憶領域の認証情報にアクセスするように構成されている請求項1に記載のシステム。 - 前記バーチャルスライド要求が、バーチャルスライド画像データの要求を含んでいる請求項1に記載のシステム。
- 前記バーチャルスライド要求が、バーチャルスライドに関連する情報の要求を含んでいる請求項1に記載のシステム。
- 前記接続モジュールから注釈データを受信して、前記データ記憶領域に注釈データを保存するよう構成された注釈モジュールをさらに有している請求項1に記載のシステム。
- 前記バーチャルスライド要求が、注釈データの要求を含んでいる請求項5に記載のシステム。
- さらに前記バーチャルスライド・モジュールが、
前記データ記憶領域からのバーチャルスライド・データを一時的に保存するように構成されたキャッシュと、
バーチャルスライド画像データを圧縮および解凍するように構成されたコーデック、とを有している請求項1に記載のシステム。 - さらに前記キャッシュが、
最近に閲覧したバーチャルスライド画像の個別的な部位であって、前記データ記憶領域内のバーチャルスライド画像の対応する部位と事実上同じフォーマットで前記個別的な部位を保存するように構成されたブロック・キャッシュと、
最近にアクセスしたバーチャルスライド情報を保存するように構成されたファイル情報キャッシュと、
最近に閲覧したバーチャルスライド画像の個別的なサブ領域を保存するように構成され、前記コーデックに通信可能に接続されているサブ領域キャッシュと、を有している請求項7に記載のシステム。 - 前記個別的なサブ領域が、前記データ記憶領域内のバーチャルスライド画像のフォーマットと異なるフォーマットに変換されている請求項8に記載のシステム。
- 前記キャッシュが、最近に認証されたユーザに関する情報を保存するように構成された認証キャッシュをさらに有している請求項7に記載のシステム。
- 当該サーバ・システムに通信リンクを介して通信可能に接続されるクライアント・ビューアをさらに有している請求項1に記載のシステム。
- 前記通信リンクが直接のケーブル接続である請求項11に記載のシステム。
- 前記通信リンクがネットワーク接続である請求項11に記載のシステム。
- 前記クライアント・ビューアが、
バーチャルスライド画像データおよび関連するバーチャルスライド情報を受信して、該画像データおよび情報を閲覧のために処理するように構成された表示域コントローラと、
前記バーチャルスライド画像データおよび関連するバーチャルスライド情報を表示するように構成されたグラフィカル・ユーザ・インターフェイスと、を有している請求項11に記載のシステム。 - 前記表示域コントローラが、
画像データを受信し、画像データをキャッシュに保持し、画像データを表示のために前記グラフィカル・ユーザ・インターフェイスへと提供するように構成されたレンダリング・エンジンをさらに有している請求項14に記載のシステム。 - 前記レンダリング・エンジンが、バーチャルスライド画像データを所望の解像度へと拡大縮小するように構成された画像拡大縮小モジュールをさらに有している請求項15に記載のシステム。
- 前記レンダリング・エンジンが、バーチャルスライド画像データを直角方向に回転させるように構成された画像変形モジュールをさらに有している請求項15に記載のシステム。
- 前記レンダリング・エンジンが、バーチャルスライド画像データをフィルタ処理するように構成された画像フィルタ処理モジュールをさらに有している請求項15に記載のシステム。
- 前記レンダリング・エンジンが、バーチャルスライド画像データに対応する表示ピクセルのカラー値を変更するよう構成された画像ガンマ調節器をさらに有している請求項15に記載のシステム。
- 当該サーバ・システムから受信したバーチャルスライド画像データのブロックを解凍するように構成されたコーデックをさらに有している請求項11に記載のシステム。
- 当該サーバ・システムに通信可能に接続されたウェブ・サーバおよび要求元ブラウザをさらに有しており、
該ウェブ・サーバが、該要求元ブラウザからバーチャルスライド要求を受信し、該要求を当該サーバ・システムへと送信し、対応する応答を当該サーバ・システムから受信し、該対応する応答を前記要求元ブラウザに提供するように構成されている請求項1に記載のシステム。 - バーチャルスライドの同時閲覧のためのシステムであって、
バーチャル顕微鏡カンファレンス・サーバと、
リーダ・クライアント・ビューアと、
参加者クライアント・ビューアとを有しており、
前記リーダ・クライアント・ビューアが、前記バーチャル顕微鏡カンファレンス・サーバへとバーチャルスライド閲覧指令を発し、該サーバが、応答としてのバーチャルスライド・データを前記リーダ・クライアント・ビューアおよび前記参加者クライアント・ビューアに提供することを特徴とするシステム。 - 前記バーチャル顕微鏡カンファレンス・サーバが、前記バーチャルスライド閲覧指令を受信および処理するように構成されたバーチャル顕微鏡カンファレンス・セッション・マネージャをさらに有している請求項22に記載のシステム。
- 前記バーチャル顕微鏡カンファレンス・サーバが、複数のエントリを含んでいるバーチャル顕微鏡カンファレンス・セッション・テーブルをさらに有しており、
第1のセッション・テーブル・エントリが、前記リーダ・クライアント・ビューアに関連付けられ、第2のセッション・テーブル・エントリが、前記参加者クライアント・ビューアに関連付けられている請求項23に記載のシステム。 - セッション・テーブルのエントリが、対応するクライアント・ビューアについての現在の閲覧状態を含んでいる請求項24に記載のシステム。
- バーチャルスライド画像データを閲覧するための方法であって、
複数の焦点レベルで顕微鏡スライドをスキャンするステップと、
対応する焦点レベルのそれぞれについて個別的なバーチャルスライド画像を生成するステップと、
前記複数の焦点レベルのそれぞれに対応する複数のバーチャルスライド画像を、三次元バーチャルスライド画像へと組み合わせるステップと、
所望の焦点レベルおよび所望の解像度を含んでいるバーチャルスライド画像要求を受信するステップと、
第1のバーチャルスライド画像および第2のバーチャルスライド画像を、前記所望の焦点レベルが該第1のバーチャルスライド画像の焦点レベルと該第2のバーチャルスライド画像の焦点レベルとの間になるように特定するステップと、
前記第1のバーチャルスライド画像の解像度を前記所望の解像度へと拡大縮小するステップと、
前記第2のバーチャルスライド画像の解像度を前記所望の解像度へと拡大縮小するステップと、
応答用のバーチャルスライド画像を、前記拡大縮小された第1のバーチャルスライド画像および前記拡大縮小された第2のバーチャルスライド画像から補間するステップと、
前記所望の焦点レベルおよび前記所望の解像度にある前記応答用のバーチャルスライド画像を提供するステップと、を含んでいる方法。 - 前記バーチャルスライド画像要求が、所望の位置をさらに含んでおり、
前記特定するステップが、前記第1のバーチャルスライド画像の或る部位および前記第2のバーチャルスライド画像の或る部位を特定するステップをさらに含んでおり、前記所望の位置が各部位の中にある請求項26に記載の方法。 - 前記応答用のバーチャルスライド画像をスキューするステップをさらに含んでいる請求項26に記載の方法。
- 前記スキューするステップが、
前記拡大縮小された第1のバーチャルスライド画像の画像ピクセルを、第1の方向にずらすステップと、
前記拡大縮小された第2のバーチャルスライド画像の画像ピクセルを、前記第1の方向と反対である第2の方向にずらすステップとをさらに含んでいる請求項28に記載の方法。 - バーチャルスライド画像ファイルの構造であって、
バーチャルスライド画像を取り込んだ際の解像度に事実上等しい解像度を有するベースライン画像と、
ベースライン画像の全体の画像であって、かつベースライン画像よりも低い解像度を有しているサムネイル画像と、
ベースライン画像の全体の拡大縮小バージョンであり、かつベースライン画像よりも低くサムネイル画像よりも高い解像度を有している中間レベル画像とを含んでいるバーチャルスライド画像ファイルの構造。 - 前記ベースライン画像が、複数のデータ・ブロックをさらに含んでいる請求項30に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックが圧縮されている請求項31に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックがJPEG2000を使用して圧縮されている請求項32に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックが、画像の完全性を検証するためのチェックサムを含んでいる請求項31に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックが、圧縮後の画像の忠実度の指標を含んでいる請求項31に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 前記画像の忠実度の指標が、元の画像データからの平均二乗平均平方根距離として計算される請求項35に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 前記画像の忠実度の指標が、前記元の画像データからの平均三乗平均立方根距離として計算される請求項35に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 前記サムネイル画像が、JPEG2000を使用して圧縮されている請求項30に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 前記サムネイル画像が、最大512ピクセルの幅および最大512ピクセルの高さを有している請求項30に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 複数の中間レベル画像をさらに含んでいる請求項30に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各中間レベル画像が、複数のデータ・ブロックをさらに含んでいる請求項40に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックが圧縮されている請求項41に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックがJPEG2000を使用して圧縮されている請求項42に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックが、画像の完全性を検証するためのチェックサムを含んでいる請求項41に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 各データ・ブロックが、圧縮後の画像の忠実度の指標を含んでいる請求項41に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 前記画像の忠実度の指標が、前記元の画像データからの平均二乗平均平方根距離として計算される請求項45に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 前記画像の忠実度の指標が、前記元の画像データからの平均三乗平均立方根距離として計算される請求項45に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
- 前記バーチャルスライド画像ファイルが、タグ付き画像ファイル・フォーマット規格を使用して保存される請求項41に記載のバーチャルスライド画像ファイルの構造。
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