ES2809455T3 - Métodos para tratamiento tumoral usando anticuerpo biespecífico CD3xCD20 - Google Patents

Métodos para tratamiento tumoral usando anticuerpo biespecífico CD3xCD20 Download PDF

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Abstract

Un anticuerpo biespecífico para uso en un método de tratamiento o mejora del cáncer de linfocitos B en un sujeto, que comprende administrar un protocolo de aumento de dosis que reduce el efecto de una cascada de citoquinas, en donde el protocolo de aumento de dosis comprende administrar una primera dosis del anticuerpo durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis, en donde el anticuerpo biespecífico comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano, un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20 humano, y un dominio Fc quimérico unido a cada uno del primer y segundo dominios de unión a antígeno, en donde el dominio Fc quimérico comprende: (a) una secuencia de aminoácidos de la bisagra inferior de IgG2 humana que comprende PCPAPPVA (SEQ ID NO: 52) desde las posiciones 228 a 236 según la numeración EU; (b) una IgG1 humana o una secuencia de aminoácidos de la bisagra superior de IgG4 humana desde las posiciones 216 a 227 según la numeración EU; (c) una secuencia de aminoácidos del dominio CH2 de IgG4 humana desde las posiciones 237 a 340 según la numeración EU; y (d) un dominio CH1 de IgG1 humana y un dominio CH3 de IgG1 humana, o un dominio CH1 de IgG4 humana y un dominio CH3 de IgG4 humana; en donde el anticuerpo biespecífico exhibe una mayor afinidad de unión por FcγRIIA humano respecto a FcγRIIB humano, y exhibe poca o ninguna afinidad de unión detectable por FcγRI humano y FcγRIII humano, medida en un ensayo de resonancia de plasmón superficial.

Description

DESCRIPCIÓN
Métodos para tratamiento tumoral usando anticuerpo biespecífico CD3xCD20
Esta solicitud incorpora, como referencia, el Listado de Secuencias presentado en un formulario legible en ordenador como nombre de archivo 10162WO01_ST25.txt creado el 3 de junio, 2014 (83.392 bytes).
Campo de la invención
La presente invención se refiere a anticuerpos biespecíficos, dirigidos a los antígenos CD20 y CD3, y métodos de destrucción tumoral. La presente invención también se refiere a métodos para reducir y/o controlar las funciones efectoras que pueden resultar de la unión a Fc en asociación con terapias de anticuerpos para tratamiento tumoral.
Antecedentes
Un anticuerpo biespecífico que tiene un grupo de unión a CD20 y un grupo de unión a CD3 puede proporcionar la interferencia necesaria para aumentar la actividad antitumoral. Una tercera modalidad en tal anticuerpo biespecífico es el dominio Fc. Se ha encontrado que la modificación de las propiedades de unión a Fc aumenta la potencia antitumoral de un anticuerpo terapéutico.
La unión de un dominio Fc de inmunoglobulina a su receptor lleva las células efectoras a sitios del antígeno unido, resultando finalmente en una variedad de señalización y respuestas inmunes. Estas diversas "funciones efectoras", como CDC y ADCC, son los resultados de inmunoglobulinas de la clase G (IgG) que forman un complejo entre el dominio Fab de la IgG y un antígeno diana, mientras que el dominio Fc de la IgG se une a receptores Fc en células efectoras. Algunas funciones efectoras de IgG son independientes de la unión al antígeno e incorporan funciones como niveles séricos circulantes y capacidad de transferir Ig a través de barreras. Otras funciones efectoras se consideran esenciales para uso en terapias de inmunoglobulina, como los tratamientos contra el cáncer. El mecanismo ADCC en particular se considera uno de los principales mecanismos antitumorales de anticuerpos terapéuticos que ya se encuentran en el mercado, como rastuzumab (cáncer de mama metastásico) y rituximab (linfoma no Hodgkin). Las estrategias terapéuticas actuales generalmente sugieren que las funciones efectoras reducidas (o la unión reducida al receptor gamma Fc) por dominios Fc modificados de anticuerpos pueden ser útiles para anticuerpos cuyo objeto es neutralizar o inhibir la actividad biológica de un antígeno (p.ej., bloqueadores o antagonistas de anticuerpos), o activar o iniciar la señalización celular cadena abajo (p.ej., agonistas de anticuerpos).
Sin embargo, el diseño de anticuerpos dirigidos contra tumores con función efectora reducida es contradictorio para la terapia tumoral, ya que se espera que reduzca la citotoxicidad (es decir, ADCC y CDC) de células diana que no será eficaz para tratar la enfermedad, es decir, destruir células tumorales o inhibir el crecimiento tumoral.
Una estrategia, descrita en el presente documento, utiliza la unión diferencial del receptor Fc combinada con la unión al antígeno biespecífico para dirigirse específicamente a marcadores tumorales, así como desencadenar la muerte de linfocitos T específicos de tumor. El dominio Fc del anticuerpo se diseña para controlar cuidadosamente la unión al receptor Fc para eliminar o reducir la destrucción indeseable de células como linfocitos T, linfocitos citolíticos naturales y macrófagos con receptores de Fc. Un patrón de unión único con respecto a la interacción del receptor Fc que comprende interacciones de unión al receptor FcyRII, pero sin interacciones FcyRI o FcyRIII, es sorprendentemente beneficioso para una terapia de Ig de direccionamiento tumoral en el contexto de anticuerpos biespecíficos que se unen tanto a CD3 como a CD20. Aun así, es necesario encontrar mejores terapias que estimulen el sistema inmunitario y sean eficaces en ablación tumoral, sin causar un exceso de liberación de citoquinas y toxicidad para el paciente. Las terapias biespecíficas actuales, como anticuerpos BiTE® (activador de linfocitos T biespecíficos), sin embargo, se administran en pequeñas dosis a intervalos frecuentes. Existe una necesidad médica insatisfecha de opciones de tratamiento adicionales con regímenes de dosificación tolerables para pacientes con neoplasias malignas de linfocitos B CD20+, especialmente aquellos pacientes que recaen o progresan después de la terapia inicial.
WO 2014/047231 describe anticuerpos biespecíficos que se unen a CD3 y CD20 y que pueden usarse en el tratamiento de tumores de linfocitos B.
Breve sumario de la invención
La presente invención proporciona un anticuerpo biespecífico para uso en un método para tratar o mejorar el cáncer de linfocitos B en un sujeto, que comprende administrar un protocolo de aumento de dosis que reduce el efecto de una cascada de citoquinas, en donde el protocolo de aumento de dosis comprende administrar una primera dosis del anticuerpo durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis, en donde el anticuerpo biespecífico comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano, un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20 humano, y un dominio Fc quimérico unido a cada uno del primer y segundo dominios de unión a antígeno, en donde el dominio Fc quimérico comprende:
(a) una secuencia de aminoácidos de la bisagra inferior de IgG2 humana que comprende PCPAPPVA (SEQ ID NO: 52) desde las posiciones 228 a 236 según la numeración EU;
(b) una IgG1 humana o una secuencia de aminoácidos de la bisagra superior de IgG4 humana desde las posiciones 216 a 227 según la numeración EU;
(c) una secuencia de aminoácidos del dominio CH2 de IgG4 humana desde las posiciones 237 a 340 según la numeración EU; y
(d) un dominio c H1 de IgG1 humana y un dominio CH3 de IgG1 humana, o un dominio CH1 de IgG4 humana y un dominio CH3 de IgG4 humana;
en donde el anticuerpo biespecífico exhibe una mayor afinidad de unión por FcyRIIA humano respecto a FcyRIIB humano, y exhibe poca o ninguna afinidad de unión detectable por FcyRI humano y FcyRIII humano, medida en un ensayo de resonancia de plasmón superficial.
En este documento también se describen, en un primer aspecto, anticuerpos biespecíficos con dominios de unión a Fc alterados que se unen a CD3 y CD20 humanos y que además se diseñan para tener funciones efectoras específicas que no se encuentran en el repertorio natural del sistema inmune. Los anticuerpos según este aspecto de la divulgación son útiles, entre otros, para dirigirse a linfocitos T que expresan CD3, y para estimular la activación de linfocitos T, p.ej., en circunstancias en donde la destrucción mediada por linfocitos T es beneficiosa o deseable como parte de un anticuerpo biespecífico que dirige la activación de linfocitos T mediada por CD3 a tipos celulares específicos, como células tumorales anti-CD20. Los anticuerpos de la divulgación se administran en un protocolo de aumento de dosis para mejorar su eficacia para estimular el sistema inmunitario, es decir, activación de linfocitos T, mientras minimiza los efectos tóxicos, p.ej., tormenta de citoquinas.
En otro aspecto, la divulgación proporciona el uso de un anticuerpo biespecífico para tratar o mejorar el cáncer de linfocitos B, o un método de tratamiento en un sujeto, que comprende administrar una primera dosis del anticuerpo durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis, en donde el anticuerpo biespecífico comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano, un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20 humano, y un dominio Fc quimérico unido a cada uno del primer y segundo dominios de unión a antígeno, y el tratamiento o mejora del cáncer comprende: (a) suprimir el crecimiento tumoral en el sujeto, (b) mediar la lisis de linfocitos p en el sujeto, (c) tratar un cáncer de linfocitos B en el sujeto, (d) tratar el cáncer que es positivo para la expresión de CD20 en el sujeto, o (e) tratar el cáncer melanoma que expresa CD20 en el sujeto.
En otro aspecto, la divulgación proporciona el uso de un anticuerpo biespecífico para tratar o mejorar la carga tumoral o el cáncer, o un método de tratamiento en un sujeto, que comprende administrar una primera dosis del anticuerpo durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis, en donde el anticuerpo biespecífico comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano, un segundo dominio de unión a antígeno que se une al antígeno diana tumoral humano o antígeno específico de tumor, y un dominio Fc quimérico unido a cada uno del segundo dominios de unión a antígeno, y el tratamiento o mejora de la carga tumoral o cáncer comprende: (a) suprimir el crecimiento tumoral en el sujeto, (b) mediar la lisis de células tumorales en el sujeto, (c) tratar el cáncer que es positivo para el antígeno diana tumoral o expresión del antígeno específico de tumor en el sujeto, o (d) tratar el cáncer que expresa el antígeno diana tumoral, o tumores que expresan el antígeno específico de tumor en el sujeto.
Los ejemplos de anticuerpos anti-CD3/CD20 se enumeran en las Tablas 1 a 8 de este documento. La Tabla 1 expone los identificadores de secuencia de aminoácidos de las regiones variables de cadena pesada (HCVR) y las regiones variables de cadena ligera (LCVR), así como regiones determinantes de la complementariedad de cadena pesada (HCDR1, HCDR2 y HCDR3), y regiones determinantes de la complementariedad de cadena ligera (LCDR1, lCd R2 y LCDR3) de los anticuerpos biespecíficos ejemplares. La Tabla 2 expone los identificadores de secuencia de las moléculas de ácido nucleico que codifican las h Cv R, LCVRs, HCDR1, HCDR2 HCDR3, LCDR1, LCDR2 y LCDR3 de los ejemplos de anticuerpos biespecíficos. La Tabla 3 expone las combinaciones de identificadores de secuencia de aminoácidos de los anticuerpos biespecíficos ejemplares incluyendo HCVR, combinaciones de región constante de cadena pesada (CH) y LCVR. La Tabla 4 expone los identificadores de secuencia de ácidos nucleicos, las combinaciones de moléculas de ácido nucleico que codifican la HCVR, combinaciones de región constante de cadena pesada (CH) y LCVR de los anticuerpos biespecíficos ejemplares.
La Tabla 5 describe los identificadores de secuencia de aminoácidos para los ejemplos de cadena pesada de la divulgación, en donde el anticuerpo biespecífico comprende una HCVR que comprende una HCDR1, HCDR2 y HCDR3 de la Tabla 5 emparejadas con una CH de la divulgación. La Tabla 6 describe por separado los identificadores de secuencia de aminoácidos para los ejemplos de la cadena ligera de la divulgación, en donde el anticuerpo biespecífico comprende una LCVR que comprende un LCDR1, LCDR2 y LCDR3 de la Tabla 6.
La presente divulgación proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden una HCVR que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre secuencias de aminoácidos de HCVR enumeradas en la Tabla 1, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 % o al menos 99 % de identidad de secuencia con la misma.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden una LCVR que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre la secuencia de aminoácidos de LCVR enumerada en la Tabla 1, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 % o al menos 99 % de identidad de secuencia con la misma.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende un par de secuencias de aminoácidos de HCVR y LCVR (HCVR/LCVR) que comprende un par de secuencias de aminoácidos contenidas dentro de los ejemplos de anticuerpos anti-CD3/CD20 enumerados en la Tabla 2. En determinados casos, el par de secuencias de aminoácidos HCVR/LCVR se selecciona del grupo que consiste en SEQ ID NO: 2/10 (p.ej., Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2).
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende una CDR1 de cadena pesada (HCDR1) que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos de HCDR1 enumeradas en la Tabla 1 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende una CDR2 de cadena pesada (HCDR2) que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos de HCDR2 enumeradas en la Tabla 1 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende una CDR3 de cadena pesada (HCDR3) que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos de HCDR3 enumeradas en la Tabla 1 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende una CDR1 de cadena ligera (LCDR1) que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos de LCDR1 enumeradas en la Tabla 1 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende una CDR2 de cadena ligera (LCDR2) que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos de LCDR2 enumeradas en la Tabla 1 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende una CDR3 de cadena ligera (LCDR3) que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos de LCDR3 enumeradas en la Tabla 1 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende un par de secuencias de aminoácidos HCDR3 y LCDR3 (HCDR3/LCDR3) que comprende las secuencias de aminoácidos HCDR3 enumeradas en la Tabla 1 junto con cualquiera de las secuencias de aminoácidos LCDR3 enumeradas en la Tabla 1, como el par de secuencias de aminoácidos HCDR3/LCDR3 seleccionado del grupo que consiste en SEQ ID NO: 8/16 (p.ej., Anticuerpo 1 o Anticuerpo 2).
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden un conjunto de seis Cd R (es decir, HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3) contenidas en la Tabla 1. En determinados casos, el conjunto de secuencias de aminoácidos HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 es SEQ ID NOs: 4-6-8-20-22-24; o 12-14-16-20-22-24 (p.ej., Anticuerpo 1 o Anticuerpo 2).
En un aspecto relacionado, la presente divulgación proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden un conjunto de seis CDR (es decir, HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3) contenidas dentro de un par de secuencias de aminoácidos HCVR/LCVR como se define en los anticuerpos ejemplares enumerados en la Tabla 1. Por ejemplo, la presente divulgación incluye anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprende el conjunto de secuencias de aminoácidos HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 contenido dentro de un par de secuencias de aminoácidos HCVR/LCVR seleccionado del grupo que consiste en SEQ ID NO: 2/18 (p.ej., Anticuerpo 1 o Anticuerpo 2). Los métodos y técnicas para identificar las CDR dentro de las secuencias de aminoácido de HCVR y LCVR son bien conocidos en la técnica y pueden usarse para identificar las CDR dentro de las secuencias de aminoácidos de HCVR y/o LCVR específicas divulgadas en el presente documento. Las convenciones ejemplares que pueden usarse para identificar los límites de las CDR incluyen, p.ej., la definición de Kabat, la definición de Chothia y la definición de AbM. En términos generales, la definición de Kabat se basa en la variabilidad de secuencia, la definición de Chothia se basa en la ubicación de las regiones de bucles estructurales y la definición de AbM es un compendio entre las estrategias de Kabat y Chothia. Véase, p.ej., Kabat, "Sequences of Proteins of Immunological Interest", National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991); Al-Lazikani et al., J. Mol. Biol. 273:927-948 (1997); y Martin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:9268-9272 (1989). También están disponibles bases de datos públicas para identificar las secuencias de CDR dentro de un anticuerpo.
La presente divulgación también proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican los anticuerpos o partes de los mismos, por ejemplo, la presente divulgación proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican las secuencias de aminoácidos de HCVR o LCVR enumeradas en la Tabla 1; en ciertos casos, la molécula de ácido nucleico comprende una secuencia de polinucleótidos seleccionada entre las secuencias de ácidos nucleicos de HCVR/LCVR enumeradas en la Tabla 2, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 % o al menos 99 % de identidad de secuencia con la misma.
La presente divulgación también proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican las secuencias de aminoácidos HCDR1 o HCDR2 o HCDR3 enumeradas en la Tabla 1; en ciertos casos, la molécula de ácido nucleico comprende una secuencia de polinucleótidos seleccionada entre cualquiera de las secuencias de ácidos nucleicos HCDR1 o HCDR2 o HCDR3 enumeradas en la Tabla 2, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 % o al menos 99 % de identidad de secuencia con la misma.
La presente divulgación también proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican cualquiera de las secuencias de aminoácidos de LCDR1 o LCDR2 o LCDR3 enumeradas en la Tabla 1; en ciertos casos, la molécula de ácido nucleico comprende una secuencia de polinucleótidos seleccionada entre cualquiera de las secuencias de ácidos nucleicos LCDR1 o LCDR2 o LCDR3 enumeradas en la Tabla 2, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 % o al menos 99 % de identidad de secuencia con la misma.
La presente divulgación también proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican una HCVR, en donde la HCVR comprende un conjunto de tres CDR (es decir, HCDR1-HCDR2-HCDR3), en donde el conjunto de secuencias de aminoácidos HCDR1-HCDR2-HCDR3 es como se define en los ejemplos de anticuerpos anti-CD3 enumerados en la Tabla 1.
La presente divulgación también proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican una LCVR, en donde la LCVR comprende un conjunto de tres c Dr (es decir, LCDR1-LCDR2-LCDR3), en donde el conjunto de secuencia de aminoácidos LCDR1-LCDR2-LCDR3 es como se define mediante los ejemplos de anticuerpos anti-CD3 enumerados en la Tabla 1.
La presente divulgación también proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican tanto una HCVR como una LCVR, en donde la HCVR comprende una secuencia de aminoácidos de las secuencias de aminoácidos de HCVR enumeradas en la Tabla 1, y en donde la LCVR comprende una secuencia de aminoácidos de las secuencias de aminoácidos de LCVR enumeradas en la Tabla 1. En determinados casos, la molécula de ácido nucleico comprende una secuencia de polinucleótidos seleccionada entre cualquiera de las secuencias de ácidos nucleicos de HCVR enumeradas en la Tabla 2, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 % o al menos 99 % de identidad de secuencia con la misma, y una secuencia de polinucleótidos seleccionada entre las secuencias de ácidos nucleicos de LCVR enumeradas en la Tabla 2, o una secuencia sustancialmente similar de las mismas que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 % o al menos 99 % de identidad de secuencia con la misma. En ciertos casos según este aspecto de la divulgación, la molécula de ácido nucleico codifica una HCVR y LCVR, en donde la HCVR y LCVR se derivan del mismo anticuerpo anti-CD3 enumerado en la Tabla 1.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden una región constante de cadena pesada (CH) que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre las secuencias de aminoácidos de CH enumeradas en la Tabla 2 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden una región constante de cadena pesada (CH) codificada por una secuencia de ácidos nucleicos seleccionada entre las secuencias de ácidos nucleicos de CH enumeradas en la Tabla 2 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona vectores de expresión recombinantes capaces de expresar un polipéptido que comprende una región variable de cadena pesada o ligera de un anticuerpo anti-CD3 y una región variable de cadena pesada o ligera de un anticuerpo anti-CD20. Por ejemplo, la presente divulgación incluye vectores de expresión recombinantes que comprenden cualquiera de las moléculas de ácido nucleico mencionadas anteriormente, es decir, moléculas de ácido nucleico que codifican cualquiera de las HCVR, LCVR, y/o secuencias de CDR, y/o secuencias de CH como se establece en la Tabla 1 y la Tabla 2. Dentro del alcance de la presente divulgación también se incluyen células hospedadoras en donde se han introducido dichos vectores, así como métodos para producir los anticuerpos o partes de los mismos mediante el cultivo de las células hospedadoras en condiciones que emiten la producción de los anticuerpos o fragmentos de anticuerpo, y recuperación de los anticuerpos y fragmentos de anticuerpo así producidos.
En otro aspecto, la divulgación proporciona una cantidad terapéuticamente eficaz de un anticuerpo humano recombinante o fragmento del mismo que se une específicamente a CD3 y CD20, en donde el anticuerpo comprende un dominio Fc quimérico, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. En un aspecto relacionado, la divulgación presenta una composición que es una combinación de un anticuerpo anti-CD3/CD20 y un segundo agente terapéutico. En un caso, el segundo agente terapéutico es cualquier agente que se combine ventajosamente con un anticuerpo anti-CD3/CD20. Los agentes ejemplares que pueden combinarse ventajosamente con un anticuerpo anti-CD3/CD20 incluyen, sin limitación, otros agentes que se unen y/o activan la señalización de CD3 (incluyendo otros anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, etc.) y/o agentes que no se unen directamente a CD3 pero que, sin embargo, activan o estimulan la activación de células inmunes, o aumentan la destrucción tumoral. En cualquier parte del presente documento se describen terapias de combinación y coformulaciones adicionales que implican los anticuerpos anti-CD3 de la presente divulgación.
Según otro aspecto, la presente divulgación proporciona moléculas de unión a antígeno biespecíficas que se unen a CD3 y un antígeno diana, en donde la molécula comprende un dominio Fc quimérico que tiene una función efectora reducida. En ciertos casos, la molécula comprende un dominio Fc quimérico como se describe en este documento. Según ciertos casos ejemplares, las moléculas de unión a antígeno biespecíficas se unen a CD3 y CD20; en este documento tales moléculas de unión a antígeno biespecíficas también se denominan "moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20". La parte anti-CD20 de la molécula biespecífica anti-CD3/anti-CD20 es útil para atacar a las células tumorales que expresan CD20 (p.ej., tumores de linfocitos B), y la parte anti-CD3 de la molécula biespecífica es útil para activar linfocitos T. La unión simultánea de CD20 en una célula tumoral y CD3 en un linfocito T media la destrucción dirigida (lisis celular) de la célula tumoral diana con el linfocito T activado y facilitada por células efectoras que se unen al dominio Fc quimérico. Por tanto, las moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación son útiles, entre otros, para tratar enfermedades y trastornos relacionados o causados por tumores que expresan CD20 (p.ej., linfomas y tumores melanoma).
Las moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación proporcionan además un método para la regresión de tumores CD20-positivos. Por tanto, la divulgación proporciona un método para tratar un cáncer de linfocitos B en un sujeto, comprendiendo el método administrar una cantidad terapéutica de moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación en donde la cantidad es suficiente para reducir la carga tumoral, producir regresión tumoral o reducir el desarrollo tumoral en el sujeto.
Las moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación proporcionan además un método para supresión o regresión del melanoma CD20-positivo. Por tanto, la divulgación proporciona un método para tratar el melanoma en un sujeto, comprendiendo el método administrar una cantidad terapéutica de moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación en donde la cantidad es suficiente para inhibir el crecimiento tumoral, reducir la carga tumoral, o reducir el desarrollo tumoral en el sujeto.
Las moléculas de unión a antígeno biespecíficas según este aspecto de la presente divulgación comprenden un primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a c D3 humano, y un segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20, y un dominio Fc quimérico. La presente divulgación incluye moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 (p.ej., anticuerpos biespecíficos) en donde cada dominio de unión a antígeno comprende una región variable de cadena pesada (HCVR) emparejada con una región variable de cadena ligera (LCVR). En ciertos ejemplos de la divulgación, el dominio de unión a antígeno anti-CD3 y el dominio de unión a antígeno anti-CD20 comprenden cada uno diferente, HCVR distintos emparejados con una LCVR común. Por ejemplo, como se ilustra en este documento en el Ejemplo 2, se construyeron anticuerpos biespecíficos que comprenden un primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3, en donde el primer dominio de unión a antígeno comprende un par HCVR/LCVR derivado de un anticuerpo anti-CD3; y un segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20, en donde el segundo dominio de unión a antígeno comprende una HCVR derivada de un anticuerpo anti-CD20 emparejado con una LCVR derivada de un anticuerpo anti-CD3 (p.ej., la misma LCVR que está incluida en el dominio de unión a antígeno CD3). En otras palabras, en las moléculas ejemplares desveladas en este documento, el emparejamiento de una HCVR de un anticuerpo anti-CD20 con una LCVR de un anticuerpo anti-CD3 crea un dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 (pero no se une a CD3). En dichos casos, el primer y segundo dominios de unión a antígeno comprenden HCVR anti-CD3 y anti-CD20 distintas pero comparten una LCVR anti-CD3 común.
La presente divulgación proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende cualquiera de las secuencias de aminoácidos de HCVR como se establece en la Tabla 1 o la Tabla 2. El primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 también puede comprender cualquiera de las secuencias de aminoácidos de LCVR como se establece en la Tabla 1 o la Tabla 2. Según determinados casos, el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende cualquiera de los pares de secuencias de aminoácidos de HCVR/LCVR como se establece en la Tabla 1 o la Tabla 2. La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a c D3 comprende cualquiera de las secuencias de aminoácidos de cadena pesada CDR1-CDR2-CDR3 como se establece en la Tabla 1 o la Tabla 2, y/o cualquiera de las secuencias de aminoácidos de cadena ligera CDR1-CDR2-CDR3 como se establece en la Tabla 1 o la Tabla 2.
Según determinados casos, la presente divulgación proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende una región variable de cadena pesada (HCVR) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 10 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende una región variable de la cadena ligera (LCVR) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende la SEQ ID NO: 18, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende un par de secuencias de aminoácidos de HCVR y LCVR (HCVR/LCVR) seleccionadas del grupo que consiste en SEQ ID NO: 10/18.
La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende un dominio CDR3 de cadena pesada (HCDR3) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 16, o una secuencia sustancialmente similar a la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; y un dominio CDR3 de cadena ligera (LCDR3) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 24, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
En determinados casos, el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende un par de secuencias de aminoácidos HCDR3/LCDR3 que comprende SEQ ID NOs: 16/24.
La presente divulgación también proporciona moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 comprende un dominio CDR1 de cadena pesada (HCDR1) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 12, o una secuencia sustancialmente similar del mismo que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; un dominio CDR2 de cadena pesada (HCDR2) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende la SEQ ID NO: 14, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; un dominio CDR1 de cadena ligera (LCDR1) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 20, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; y un dominio CDR2 de cadena ligera (LCDR2) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 22, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
Ciertas moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 ejemplares, no limitantes de la divulgación incluyen un primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 que comprende dominios HCDR1 -HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, respectivamente, que tienen las secuencias de aminoácidos seleccionadas del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 12-14-16-20-22-24.
La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 comprende una región variable de cadena pesada (HCVR) que tiene la secuencia de aminoácidos que comprende la SEQ ID NO: 2, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 comprende una región variable de cadena ligera (LCVR) que tiene la secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 18 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia. La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 comprende una región variable de cadena ligera (LCVR) que tiene la secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 75 o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 comprende un par de secuencias de aminoácidos de HCVR y LCVR (HCVR/LCVR) que comprende SEQ ID NO: 2/18, o SEQ ID NO: 2/75.
La presente divulgación también proporciona moléculas biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a c D20 comprende un dominio CDR3 de cadena pesada (HCDR3) que tiene la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 8, o una secuencia sustancialmente similar a la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; y un dominio CDR3 de cadena ligera (LCDR3) que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende SEQ ID NO: 24, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
En determinados casos, el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 comprende un par de secuencias de aminoácidos HCDR3/LCDR3 que comprende SEQ ID NO: 8/24.
La presente divulgación también proporciona moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 comprende un dominio CDR1 de cadena pesada (HCDR1) que tiene la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 4, o una secuencia sustancialmente similar del mismo que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; un dominio CDR2 de cadena pesada (HCDR2) que tiene la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 6, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; un dominio CDR1 de cadena ligera (LCDR1) que tiene una secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 20, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia; y un dominio CDR2 de cadena ligera (LCDR2) que tiene una secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 22, o una secuencia sustancialmente similar de la misma que tiene al menos 90 %, al menos 95 %, al menos un 98 % o al menos un 99 % de identidad de secuencia.
Ciertas moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 ejemplares, no limitantes de la divulgación incluyen un segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 que comprende dominios HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, respectivamente, que tienen las secuencias de aminoácidos seleccionadas del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 4-6-8-20-22-24 (p.ej., Anticuerpo 1 o Anticuerpo 2).
En un aspecto relacionado, la divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 en donde el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 comprende los dominios CDR de cadena pesada y ligera contenidos dentro de las secuencias de región variable de cadena pesada y ligera (HCVR/LCVR) de SEQ ID NOs: 2/18.
En otro aspecto, la presente divulgación proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican cualquiera de las secuencias de HCVR, LCVR o CDR de las moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 desveladas en este documento, incluyendo moléculas de ácido nucleico que comprenden las secuencias de polinucleótidos como se expone en las Tablas 2, 7 y 8 de este documento, así como moléculas de ácido nucleico que comprenden dos de las secuencias de polinucleótidos como se expone en las Tablas 2, 7 y 8 en cualquier combinación funcional o disposición de las mismas. Vectores de expresión recombinantes que portan los ácidos nucleicos de la divulgación, y células hospedadoras en donde se han introducido dichos vectores, también están incluidas en la divulgación, así como métodos de producción de los anticuerpos mediante el cultivo de las células hospedadoras en condiciones que permiten la producción de los anticuerpos y la recuperación de los anticuerpos producidos.
La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 en donde cualquiera de los dominios de unión a antígeno mencionados anteriormente que se unen específicamente a CD3 se combinan, conectan o asocian con cualquiera de los dominios de unión a antígeno mencionados anteriormente que se unen específicamente a CD20 para formar una molécula de unión a antígeno biespecífica que se une a CD3 y CD20.
En otro aspecto, la divulgación proporciona un anticuerpo biespecífico que comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano, un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20 humano, y un dominio Fc quimérico unido a cada uno del primer y segundo dominios de unión a antígeno. En un aspecto relacionado, el anticuerpo biespecífico puede unirse específicamente a FcyRIIA humano y FcyRIIB humano. La presente divulgación proporciona moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 que se unen preferentemente a FcyRIIA humano y FcyRIIB humano y muestran poca o ninguna afinidad de unión a FcyRI humano o FcyRIII humano. Los anticuerpos biespecíficos de la divulgación pueden unirse específicamente a FcyRIIA humano y FcyRIIB humano a afinidades más altas que los anticuerpos que se unen a FcyRI humano o FcyRIII humano, medido en un ensayo in vitro. En algunos casos, en donde el anticuerpo se une específicamente tanto a FcyRIIA humano como a FcyRIIB humano, y exhibe afinidad de unión Kd inferior a 1 |jM a cada uno de FcyRI humano y FcyRIII humano, medido en un ensayo in vitro.
En otros aspectos, la divulgación proporciona un anticuerpo biespecífico que comprende un primer y segundo polipéptido de cadena pesada, cada uno de los cuales comprende un dominio Fc quimérico, en donde el primer polipéptido de cadena pesada comprende un dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano, y en donde el segundo polipéptido de cadena pesada comprende un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20 humano.
En otros casos, el anticuerpo exhibe una mayor afinidad de unión por FcyRIIA humano respecto a su FcyRIIB humano de unión, medido en un ensayo in vitro. En aún otros casos, el anticuerpo se une a FcyRIIA humano y exhibe un valor Kd menor respecto a su FcyRIIB humano de unión, medido en un ensayo in vitro. En algunos casos, el anticuerpo se une a FcyRIIA humano a 25 °C con un valor Kd entre 10 y 30 pM, medido en un ensayo in vitro. En algunos casos, el anticuerpo se une a FcyRIIB humano a 25 °C que tiene un valor Kd entre 100 y 250 pM, medido en un ensayo in vitro. En otro caso, el anticuerpo exhibe poca o ninguna afinidad de unión detectable a FcyRI humano, medido en un ensayo in vitro. En algunos casos, el anticuerpo exhibe poca o ninguna afinidad de unión detectable a FcyRIII humano, medido en un ensayo in vitro.
En algunos casos, el ensayo in vitro es un ensayo de resonancia de plasmón superficial.
En algunos casos, el anticuerpo exhibe una citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC) reducida en comparación con un anticuerpo que comprende un dominio Fc de tipo silvestre, medido en un ensayo de citotoxicidad in vitro.
En algunos casos, el anticuerpo exhibe citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC) insignificante o no detectable.
En algunos casos, el anticuerpo exhibe una citotoxicidad dependiente del complemento disminuida (CDC) en comparación con un anticuerpo que comprende un dominio Fc de tipo silvestre, medido en un ensayo de citotoxicidad in vitro.
En algunos casos, el anticuerpo exhibe menos del 50 % de citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) de la población celular total.
En algunos casos, el anticuerpo exhibe citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) insignificante o no detectable.
En algunos casos, el anticuerpo exhibe una disminución de la destrucción de células portadoras de receptores Fc, como linfocitos NK o macrófagos, en comparación con un anticuerpo que comprende un dominio Fc de tipo silvestre. En algunos casos, el anticuerpo exhibe una disminución de la destrucción de linfocitos T que tienen receptores Fc por linfocitos NK o macrófagos en comparación con un anticuerpo que comprende un dominio Fc de tipo silvestre.
En algunos casos, el anticuerpo exhibe afinidad de unión Kd para FcyRIIA humano mayor que su afinidad de unión Kd para FcyRIIB humano, que es mayor que su afinidad de unión Kd para FcyRI humano, que es mayor o igual que su afinidad de unión Kd para FcyRIII humano, medido en un ensayo in vitro. En otros casos, el anticuerpo exhibe afinidad de unión a FcyRIIA humano Kd > FcyRIIB humano > FcyRI humano > FcyRIII humano, medido en un ensayo in vitro. En algunos casos, el anticuerpo exhibe afinidad de unión Kd para FcyRIIA humano mayor que su afinidad de unión Kd para FcyRIIB humano, que es mayor que su afinidad de unión a FcyRIII humano Kd que es mayor o igual que su afinidad de unión a FcyRI humano Kd, medido en un ensayo in vitro. En otros casos, el anticuerpo exhibe afinidad de unión a FcyRIIA humano Kd > FcyRIIB humano > FcyRIII humano > FcyRI humano, medido en un ensayo in vitro. En algunos casos, el FcyRIII humano es FcyRIIIA humano o FcyRIIIB humano.
En algunos casos, el dominio Fc quimérico comprende una bisagra quimérica.
En otro aspecto, la presente divulgación proporciona un anticuerpo biespecífico que comprende un primer dominio de unión a antígeno, un segundo dominio de unión a antígeno y una región constante de cadena pesada (CH) quimérica, en donde (a) el primer dominio de unión a antígeno se une a CD3, (b) el segundo dominio de unión a antígeno se une a CD20. En ciertos aspectos de la divulgación, la región CH quimérica se une con mayor afinidad a FcyRIIA humano y FcyRIIB humano, en comparación con un anticuerpo que comprende una región CH de tipo silvestre, medido en un ensayo in vitro. En otro aspecto más, la CH quimérica se une con menor o ninguna afinidad a FcyRI humano y a FcyRIII humano, en comparación con un anticuerpo que comprende una región CH de tipo silvest re, medido en un ensayo in vitro.
El anticuerpo biespecífico proporcionado para uso en la presente invención exhibe una mayor afinidad de unión por FcyRIIA humano respecto a FcyRIIB humano, y exhibe poca o ninguna afinidad de unión detectable por FcyRI humano y FcyRIII humano, medida en un ensayo de resonancia de plasmón superficial.
La divulgación proporciona anticuerpos biespecíficos que comprenden una región bisagra quimérica. En algunos aspectos, la región bisagra quimérica comprende restos de secuencia de aminoácidos de las posiciones 216 a 236 (numeración EU). Se construyen los anticuerpos biespecíficos de la divulgación en donde la bisagra quimérica comprende una secuencia de aminoácidos de la bisagra inferior de IgG2 humana PCPAPPVA (SEQ ID NO: 52) desde las posiciones 228 a 236 (numeración EU). En determinados casos, los anticuerpos biespecíficos de la divulgación comprenden una bisagra quimérica y la parte de bisagra superior de la bisagra quimérica comprende restos de aminoácidos de las posiciones 216 a 227 (numeración EU) de una bisagra superior IgG1. En otros casos, los anticuerpos biespecíficos de la divulgación comprenden una bisagra quimérica y la parte de bisagra superior de la bisagra quimérica comprende restos de aminoácidos de las posiciones 216 a 227 (numeración EU) de una bisagra superior IgG4.
En un caso, el anticuerpo biespecífico comprende una secuencia de aminoácidos de bisagra quimérica EPKSCDKTHTCPPCPAPPVA (Se Q ID NO: 53). En otro caso, el anticuerpo biespecífico comprende una secuencia de aminoácidos de bisagra quimérica ESKy Gp PCPPCPAPPVA (SEQ ID NO: 54). En determinados casos, el anticuerpo biespecífico comprende una secuencia de aminoácidos del dominio IgG4 CH2 humano desde las posiciones 237 a 340 (numeración EU). En otros casos, el anticuerpo biespecífico comprende un dominio CH3 derivado de un dominio CH3 de IgG1 humana o un dominio CH3 de IgG4 humana. En aún otros casos, el anticuerpo biespecífico comprende un dominio CH1 de IgG1 humana y un dominio de CH3 de IgG1 humana. En más casos, el anticuerpo biespecífico comprende un dominio CH1 de IgG4 humana y un dominio de CH3 de IgG4 humana. El anticuerpo biespecífico proporcionado para uso en la presente invención comprende un dominio Fc quimérico unido a cada uno el primer y segundo dominios de unión a antígeno, en donde el dominio Fc quimérico comprende:
(a) una secuencia de aminoácidos de la bisagra inferior de IgG2 humana que comprende PCPAPPVA (SEQ ID NO: 52) desde las posiciones 228 a 236 según la numeración EU;
(b) una IgG1 humana o una secuencia de aminoácidos de la bisagra superior de IgG4 humana desde las posiciones 216 a 227 según la numeración EU;
(c) una secuencia de aminoácidos del dominio CH2 de IgG4 humana desde las posiciones 237 a 340 según la numeración EU; y
(d) un dominio c H1 de IgG1 humana y un dominio CH3 de IgG1 humana, o un dominio CH1 de IgG4 humana y un dominio CH3 de IgG4 humana;
en donde el anticuerpo biespecífico exhibe una mayor afinidad de unión por FcyRIIA humano respecto a FcyRIIB humano, y exhibe poca o ninguna afinidad de unión detectable por FcyRI humano y FcyRIII humano, medida en un ensayo de resonancia de plasmón superficial.
Un aspecto de la divulgación proporciona un método para fabricar un anticuerpo biespecífico que comprende una región quimérica de cadena pesada constante, comprendiendo dicho método: (a) transfectar una célula hospedadora con una molécula de ácido nucleico que codifica una primera cadena ligera capaz de unirse al antígeno CD3, conteniendo dicha molécula de ácido nucleico una secuencia de nucleótidos que codifica la región VL de la primera y una secuencia de nucleótidos que codifica la región CL constante de una Ig, en donde dicha secuencia de nucleótidos que codifica la región VL de un anticuerpo específico de antígeno seleccionado y dicha secuencia de nucleótidos que codifica la región CL de una Ig están unidas operativamente entre sí; (b) transfectar la célula hospedadora de la etapa (a) con una molécula de ácido nucleico que codifica una primera cadena pesada del anticuerpo capaz de unirse al antígeno CD3, comprendiendo dicha molécula de ácido nucleico una secuencia de nucleótidos que codifica la región VH y una secuencia de nucleótidos que codifica una región CH quimérica constante de una Ig humana, en donde dicha secuencia de nucleótidos que codifica la región VH y la secuencia de nucleótidos que codifica la región CH de dicha Ig están unidas operativamente entre sí; en donde la región CH codifica una o más modificaciones de aminoácidos en el dominio CH3 que reduce o elimina la unión del segundo dominio CH3 a la proteína A; (c) transfectar la célula hospedadora de la etapa (a) con una molécula de ácido nucleico que codifica una segunda cadena pesada del anticuerpo capaz de unirse al antígeno CD20, comprendiendo dicha molécula de ácido nucleico una secuencia de nucleótidos que codifica la región VH y una secuencia de nucleótidos que codifica una región CH quimérica de una Ig humana, en donde dicha secuencia de nucleótidos que codifica la región VH y la secuencia de nucleótidos que codifica la región CH de dicha Ig están unidas operativamente entre sí; y (c) preparar dicho anticuerpo coexpresando las moléculas de ácido nucleico de (a) y (b) en dicha célula hospedadora.
En algunos aspectos, el método para preparar el anticuerpo biespecífico comprende opcionalmente transfectar la célula hospedadora de la etapa (a) con una molécula de ácido nucleico que codifica una segunda cadena ligera capaz de unirse al antígeno CD20, comprendiendo dicha molécula de ácido nucleico una secuencia de nucleótidos que codifica la región VL de la segunda cadena ligera y una secuencia de nucleótidos que codifica la región CL constante de una Ig, en donde dicha secuencia de nucleótidos que codifica la región VL de la segunda cadena ligera y dicha secuencia de nucleótidos que codifica la región CL de una Ig están unidas operativamente entre sí.
En algunos casos, la primera cadena pesada comprende una región CH3 que comprende una modificación H95R (por numeración de exón IMGT; H435R por numeración EU). En otro caso, la primera cadena pesada comprende una región CH3 que comprende además una modificación Y96F (IMGT; Y436F por numeración EU). En más casos, el método comprende aislar el anticuerpo usando la Proteína A.
Otro aspecto de la divulgación proporciona un anticuerpo biespecífico que comprende: (a) una primera cadena pesada que comprende un dominio de unión a antígeno capaz de reconocer y unirse a un primer antígeno diana, (b) una segunda cadena pesada que comprende un dominio de unión a antígeno capaz de reconocer y unirse a un segundo antígeno diana, y (c) un dominio de unión a antígeno de cadena ligera común capaz de reconocer y unirse al primer o segundo antígenos diana, en donde la cadena pesada de (a) o (b) o ambas (a) y (b) comprende la región constante de cadena pesada (CH) que comprende una región bisagra quimérica que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 53 o SEQ ID NO: 54.
En determinados casos, la región constante de cadena pesada (CH) comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, o SEQ ID NO: 32. En algunos casos, la secuencia de nucleótidos que codifica CH quimérica comprende SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, o SEQ ID NO: 33. En otros casos, la secuencia quimérica de nucleótidos CH codifica la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, o SEQ ID NO: 32. En aún otros casos, la secuencia de nucleótidos de la región CH comprende la secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31 o SEQ ID NO: 33.
En determinados aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena ligera que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 35. En otros aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica la cadena ligera que comprende la secuencia de nucleótidos SEQ ID NO: 34.
En determinados aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena pesada que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 37. En otros aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica la cadena pesada que comprende la secuencia de nucleótidos SEQ ID NO: 36.
En determinados aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena pesada que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 40. En otros aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica la cadena pesada que comprende la secuencia de nucleótidos SEQ ID NO: 38 o SEQ ID NO: 39.
En determinados aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena pesada que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 42. En otros aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica la cadena pesada que comprende la secuencia de nucleótidos SEQ ID NO: 41.
En determinados aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena pesada que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 44. En otros aspectos, el anticuerpo biespecífico comprende una molécula de ácido nucleico que codifica la cadena pesada que comprende la secuencia de nucleótidos SEQ ID NO: 43.
En otro aspecto, la divulgación proporciona una cantidad terapéuticamente eficaz de la molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 como se desvela en este documento. En un aspecto relacionado, la divulgación presenta una composición que es una combinación de una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 y un segundo agente terapéutico. En un caso, el segundo agente terapéutico es cualquier agente que se combine ventajosamente con una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20. Los agentes ejemplares que pueden combinarse ventajosamente con una molécula de unión a antígeno biespecífico anti-CD3/anti-CD20 se discuten en detalle en otras partes del presente documento.
En otro aspecto más, la divulgación proporciona métodos terapéuticos para dirigirse a/destruir células tumorales que expresan CD20 usando una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación, en donde los métodos terapéuticos comprenden administrar una cantidad terapéuticamente eficaz de una composición farmacéutica que comprende una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación a un sujeto que lo necesite. En algunos casos, los métodos terapéuticos para dirigirse a/destruir células tumorales que expresan CD20 usando una molécula o anticuerpo de unión a antígeno biespecífico anti-CD3/CD20 de la divulgación comprenden administrar una primera dosis de la molécula o anticuerpo de unión a antígeno durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis.
En algunos casos, el uso de la molécula de unión a antígeno biespecífica comprende administrar una primera dosis del anticuerpo durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis. En determinados aspectos, la primera dosis del anticuerpo y la segunda dosis del anticuerpo están en una formulación adecuada.
La presente divulgación incluye el uso de una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad o trastorno relacionado o causado por la expresión de CD20.
La presente divulgación también incluye un anticuerpo biespecífico que comprende un primer dominio de unión a antígeno, un segundo dominio de unión a antígeno y una región constante de cadena pesada (CH) quimérica, en donde: el primer dominio de unión a antígeno se une a CD3, el segundo dominio de unión a antígeno se une a CD20, la región CH quimérica se une con mayor afinidad a FcyRIIA humano y FcyRIIB humano, en comparación con un anticuerpo que comprende una región Ch de tipo silvestre, tal anticuerpo biespecífico para uso en la fabricación de un medicamento. La divulgación proporciona un anticuerpo biespecífico que comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3, un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20, y una región CH quimérica que se une con mayor afinidad a FcyRIIA humano que a FcyRIIB humano, para su uso en la fabricación de un medicamento.
Otras realizaciones resultarán evidentes tras la revisión de la descripción detallada adjunta.
Breve descripción de las figuras
Figura 1 ilustra los aminoácidos de bisagra utilizados en la construcción de regiones bisagra quiméricas y las convenciones de numeración de aminoácidos correspondientes.
Figura 2 representa la secuencia de aminoácidos de la región constante de cadena pesada de IgG1 humana que incluye los dominios CH1, bisagra, CH2 y CH3 que se describe como IGHG1 en UniProtKB/Swiss-Prot N.° de Acceso P01857 (SEQ ID NO: 45).
Figura 3 representa la secuencia de aminoácidos de la región constante de cadena pesada de IgG2 humana que incluye los dominios CH1, bisagra, CH2 y CH3 que se describe como IGHG2 en UniProtKB/Swiss-Prot N.° de Acceso P01859 (SEQ ID NO: 46).
Figura 4 representa la secuencia de aminoácidos de la región constante de cadena pesada de IgG4 humana que incluye los dominios CH1, bisagra, CH2 y CH3 que se describe como IGHG4 en UniProtKB/Swiss-Prot N.° de Acceso P01861 (SEQ ID NO: 47).
Figuras 5A y 5B: Curvas de dosis-respuesta que representan la falta de actividad CDC respecto a células de Daudi (FIG. 5A) y Raji (FIG. 5B) en presencia de anticuerpos que tienen regiones Ch de tipo silvestre o de bisagra quimérica. (Anticuerpo 4 de "Control" = Ab biespecífico con Ch de wt IgG1; Anticuerpo 1; Anticuerpo 2; Control de isotipo IgG1 = Ab inespecífico con Ch de wt IgG1).
Figuras 6A y 6B: Curvas de dosis-respuesta que representan la falta de actividad ADCC respecto a células de Daudi (FIG. 6a ) y Raji (FIG. 6B) en presencia de anticuerpos que tienen regiones Ch de tipo silvestre o de bisagra quimérica. (Anticuerpo 4 de "Control" = Ab biespecífico con Ch de wt IgG1; Anticuerpo 1; Anticuerpo 2; Control de isotipo IgG1 = Ab inespecífico con Ch de wt IgG1).
Figuras 7A-7F muestran el volumen tumoral (en mm3) con el tiempo en ratones NSG implantados por vía subcutánea con una mezcla de células tumorales Raji y PBMC (o sin control de PBMC- Fig. 7D), mientras que se administró un anticuerpo biespecífico CD3xCD20 de la divulgación (Ab 1) o vehículo o anticuerpo de control después de implantación tumoral y tratamiento, comenzando el mismo día de la implantación tumoral (Día 0), y medido durante 25 días. Fig. 7A: Ningún ratón mostró inhibición del crecimiento tumoral con el tratamiento con Vehículo; Fig. 7B: 1 de 5 (1/5) ratones mostró inhibición del crecimiento tumoral con un tratamiento de 0,4 mg/kg de Ab5 de Control (Ab anti-FelD1); Fig. 7C: 5/5 ratones mostraron inhibición del crecimiento tumoral con 0,4 mg/kg de tratamiento con el Anticuerpo 1 (Ab 1); Fig. 7D: 0/5 ratones mostraron inhibición del crecimiento tumoral donde no se implantaron PBMC y con un tratamiento con Ab1 de 0,4 mg/kg; Fig. 7E: 5/5 ratones mostraron inhibición del crecimiento tumoral con 0,04 mg/kg de tratamiento con Ab 1; y Fig. 7F: 5/5 ratones mostraron inhibición del crecimiento tumoral con 0,004 mg/kg de tratamiento con Ab 1.
Figuras 8A y 8B muestran el volumen tumoral (en mm3) con el tiempo en ratones NSG implantados por vía subcutánea con una mezcla de células tumorales Raji y PBMC, y tratados con Ab1 (CD3xCD20-Fc quimérico) comparado con el vehículo, con o sin suplemento de IgG (Fig. 8A), o tratados con Ab4 (CD3xCD20-wtFc) comparado con el vehículo, con o sin suplemento con IgG (Fig. 8B). Ambos anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 demuestran una inhibición significativa del crecimiento tumoral con suplemento de IgG en este modelo. Como se ve en Fig. 8A, el anticuerpo biespecífico CD3xCD20-Fc quimérico (Ab 1) demuestra la inhibición completa del crecimiento tumoral durante el periodo de tiempo probado con o sin suplemento con IgG en este experimento. Figura 9 ilustra la regresión de tumores establecidos (~ 200-400 mm3) hacia el 14o día en ratones NSG tratados con anticuerpo biespecífico CD3xCD20. Los ratones NSG se implantaron por vía subcutánea con una mezcla de células tumorales Raji y PBMC (células emparejadas con HLA) 15 días antes del tratamiento, después los tumores se establecieron y midieron. Los ratones se trataron con 0,4 mg/kg de Anticuerpo 1 (anticuerpo CD3xCD20-Fc quimérico), o 0,4 mg/kg de control Ab5 (Ab anti-FelD1), o control de vehículo una vez por semana (Día 7, Día 14, Día 21).
Figura 10 ilustra la regresión de tumores establecidos (-500-900 mm3) hacia el 21er día en ratones NSG tratados con el anticuerpo biespecífico CD3xCD20 Los ratones NSG se implantaron por vía subcutánea con una mezcla de células tumorales Raji y PBMC (células emparejadas con HLA) 15 días antes del tratamiento, después los tumores se establecieron y midieron. Los ratones se trataron con 0,4 mg/kg de Anticuerpo 1 (anticuerpo CD3xCD20-Fc quimérico), o 0,4 mg/kg de control Ab5 (Ab anti-FelD1), o control de vehículo una vez por semana (Día 7, Día 14, Día 21).
Figuras 11A y 11B representan la potencia in vivo de la administración de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 de Anticuerpo 1 y Anticuerpo 4 comparado con la administración de anticuerpos monoespecíficos (rituximab) midiendo los cambios en los niveles de linfocitos B CD20+ o niveles de linfocitos T CD3+ en sangre periférica de monos cinomolgos en un estudio de 7 días. El Día 0 se administraron anticuerpos o placebo. Fig. 11A: Los niveles de linfocitos B en sangre periférica se redujeron significativamente el día 2 en todas las muestras, excepto placebo; Fig. 11B: Se observó una pérdida transitoria de linfocitos T el día 2 y se restableció a los niveles iniciales el día 4 en sangre periférica de animales tratados con anticuerpos biespecíficos. No se observó pérdida de linfocitos T (por debajo del valor inicial) en los grupos placebo o rituximab (Rituxan).
Figuras 12A y 12B representan la potencia in vivo de la administración de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 de Anticuerpo 1 y Anticuerpo 4 midiendo los cambios en los niveles de linfocitos B CD20+ o niveles de linfocitos T CD3+ en sangre periférica de monos cinomolgos en un estudio a largo plazo (3 meses). Placebo (vehículo) o anticuerpos biespecíficos se administraron a 1,0 mg/kg el Día 0. Fig. 12A: Los niveles de linfocitos B en sangre periférica se empobrecieron significativamente el día 2 y los niveles se mantuvieron empobrecidos durante el estudio en todas las muestras excepto placebo; Fig. 12B: Se observó una pérdida transitoria de linfocitos T el día 2, después, los linfocitos T se recuperaron a niveles iniciales el día 4, y se mantuvieron alrededor del valor inicial como se midió durante todo el estudio (> 80 días) para animales tratados con anticuerpos biespecíficos. No se observó pérdida transitoria de linfocitos T en animales tratados con placebo.
Figuras 13A y 13B representan la potencia in vivo de la administración de dosis bajas de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 de Anticuerpo 1 y Anticuerpo 4 midiendo los cambios en los niveles de linfocitos B CD20+ o niveles de linfocitos T CD3+ en sangre periférica de monos cinomolgos en un estudio a largo plazo (2 meses). Los anticuerpos biespecíficos se administraron a 0,01 mg/kg o 0,001 mg/kg (1 pg/kg) el Día 0. Fig. 13A: Los niveles de células p en sangre periférica se empobrecieron significativamente el día 2 y los niveles se mantuvieron empobrecidos durante el estudio, similar a lo observado para animales tratados con dosis más altas de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 (ver también Figuras 11A o 12A); Fig. 13B: Los animales tratados con dosis muy bajas (1 pg/kg) de anticuerpos biespecíficos experimentan la misma pérdida transitoria de linfocitos T y la recuperación que se observa en los animales tratados con dosis más altas de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 (ver también Figuras 11B o 12B).
Figura 14 muestra la correlación de la pérdida de linfocitos B con la pérdida de anticuerpos en sangre periférica de animales tratados con Anticuerpo 1 CD3xCD20-Fc quimérico. Ya que la exposición a anticuerpos (símbolos abiertos) en la circulación de animales se empobrece con el tiempo, las poblaciones de linfocitos B (símbolos sólidos) comienzan a recuperarse (p.ej., como se observó el día 81 para el animal n.° 106881 (círculo sólido)).
Figura 15 muestra la correlación de la pérdida de linfocitos B con la pérdida de anticuerpos en sangre periférica de animales tratados con Anticuerpo 2 CD3xCD20-Fc quimérico. Ya que la exposición a anticuerpos (símbolos abiertos) en la circulación de animales se empobrece con el tiempo, Las poblaciones de linfocitos B (símbolos sólidos) comienzan a recuperarse (p.ej., como se observó el día 66 para el animal n.° 106876 (triángulo sólido) y el día 68 para el animal n.° 106877 (cuadrado sólido)).
Figura 16 muestra la correlación de la pérdida de linfocitos B con la pérdida de anticuerpos en sangre periférica de animales tratados con anticuerpo biespecífico CD3xCD20-wtFc (Ab 4). Ya que la exposición a anticuerpos (símbolos abiertos) en la circulación de animales se empobrece con el tiempo, Las poblaciones de linfocitos B (símbolos sólidos) comienzan a recuperarse (p.ej., como se observó el día 91 para el animal n.° 106870 (triángulo sólido) y el día 64 para el animal n.° 106872 (círculo sólido)).
Figuras 17A y 17B representan el empobrecimiento de linfocitos B de tejido en bazo (Fig. 17A) o ganglios linfáticos mesentéricos (Fig. 17B) de monos cinomolgos resultantes de la administración de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 en comparación con el anticuerpo monoespecífico anti-CD20, con dosis mucho más bajas (dosis de 0,01 a 1,0 mg/kg) administradas a las cohortes biespecíficas. Este empobrecimiento no se observó en la cohorte de animales de control con placebo en ninguno de los tejidos. Ambos anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 (Ab1 y Ab 4) causaron un empobrecimiento de linfocitos B dependiente de la dosis en los órganos linfoides, y en dosis iguales o superiores a 0,1 mg/kg, Los anticuerpos biespecíficos empobrecen los linfocitos B con mayor eficacia que rituximab.
Figuras 18A y 18B ilustran que los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 inducen proliferación de PBMC humanas (Fig. 18A) o PBMC de cinomolgos (Fig. 18B) en un bioensayo in vitro, mientras que el Anticuerpo de Control 5 (-▲ -; no específico de CD3xCD20) no exhibió actividad.
Figuras 19A y 19B ilustran destrucción mediana de Raji mediada por CD3xCD20 en un ensayo de citotoxicidad. La destrucción de células diana mediada por el anticuerpo 1 con valores de CE50 representativos de 25,0 pM y 9,10 pM para linfocitos T humanos (Figura 19A) y de cinomolgo (Figura 19B), respectivamente. La destrucción de células diana mediada por el anticuerpo 4 con valores de CE50 representativos de 15,7 pM y 1,73 pM para linfocitos T humanos (Figura 19A) y de cinomolgo (Figura 19B), respectivamente. No se observó actividad del control (-▲-). Figuras 20A y 208B ilustran que el anticuerpo biespecífico CD3xCD20 media la destrucción celular por linfocitos T sin tratamiento. Figura 20A muestra un diagrama de dispersión FACS representativo a la concentración más elevada de Anticuerpo 4 probada. Las células de tipo silvestre B16F10.9 están marcadas con CFDA-SE y los linfocitos B16F10.9/CD20 están marcados con Rastreador de Células Violetas. Las células efectoras no están marcadas. El segundo panel de Fig. 20A muestra que las células que expresan CD20 se eliminan (cuadrante inferior derecho) mediante tratamiento con anti-CD3xCD20. Figura 20B muestra la proporción de linfocitos B16F10.9/CD20 supervivientes después de 48 horas en presencia de anticuerpos CD20xCD3, es decir, Anticuerpo 4 (wtFc), Anticuerpo 1 (Fc quimérico) o Ab 5 de Control, y PBMC. El porcentaje de supervivencia se determinó comparando el porcentaje de linfocitos B16F10.9/CD20 con los linfocitos B16F10.9 negativos para CD20 en la población de células vivas. Ab 4 y Ab 1 se dirigieron específicamente a linfocitos T humanos para destruir solo las células diana que expresan CD20 (Figura 20B) en una población celular mixta. La destrucción de células diana solo se observó en presencia de los anticuerpos biespecíficos, con linfocitos B16F10.9/CD20 empobrecidas de forma dependiente de la dosis por Anticuerpo 4 (CE5012,8 pM) y Anticuerpo 1 (CE5019,5 pM) (Figura 20B). Menos del 5 % de las células que expresan CD20 estaban vivas a la dosis más alta probada (10 pg/ml).
Figura 21 muestra el porcentaje de células activadas (CD69+) del total de células efectoras CD2+ en un ensayo de citotoxicidad de 48 horas dirigido a linfocitos B16F10.9/CD20, tal activación inducida por cualquiera de los anticuerpos CD20xCD3, es decir, Anticuerpo 4 (wtFc) o Anticuerpo 1 (Fc quimérico).
Figuras 22A y 22B ilustran que el anticuerpo biespecífico CD3xCD20 indujo la agrupación de linfocitos T con las células diana (células CD20+) mediante sus grupos de unión biespecíficos. Las células efectoras se tiñen con CFSE y las células CD20+ se tiñen con Rastreador de Células Violetas, y se abren para separar los cuadrantes. Después de incubación con un anticuerpo de control irrelevante (Anticuerpo de Control 5), no aparece agrupamiento (doble tinción) en la mezcla celular (Fig. 22A). Después de incubación con el anticuerpo biespecífico CD3xCD20 (Ab 4), los grupos de células aparecen porque están teñidos con CFSE y Violeta (ver el cuadrante superior izquierdo en el diagrama de dispersión de Fig. 22B, como se destaca por el cuadrado en negrita).
Figura 23 muestra un estudio del volumen tumoral (en mm3) en ratones NSG implantados por vía subcutánea con una mezcla de células tumorales Raji y PBMC mientras que un anticuerpo biespecífico CD3xCD20 de la divulgación (Ab 1) a 0,4 mg/kg, 2X/semana (i.p), Control de anticuerpo irrelevante Ab 6 a 0,4 mg/kg, 2X/semana (i.p), o el vehículo se comparó con rituximab, anticuerpo anti-CD20 a 8 mg/kg, 5X/semana (i.p), y CD19xCD3 BiTE a 0,5 mg/kg, 5X/semana (i.v). (Para CD19xCD3 BiTE, véase Nagorsen D, et al. Pharmacol Ther. Dic 2012; 136(3):334-42, 2012.) Cada uno se administró después de la implantación del tumor. Los datos se expresan como media (ETM) y se sometieron a análisis ANOVA. Ab1, que se dosificó 2x por semana i.p., fue comparable a la potencia de CD19xCD3 BiTE que se dosificó 5x/semana i.v. en este modelo in vivo.
Figura 24 muestra el estudio del volumen tumoral (en mm3) en ratones NSG implantados por vía subcutánea con mezcla de Raji/PBMC, análogamente a la Figura 23, sin embargo, el análisis ANOVA se proporciona para AB1, Ab 6 de Control, rituximab y control de vehículo. Ab 1 dosificado 2x por semana fue superior al tratamiento con rituximab (dosificado a 8 mg/kg; 5x/semana i.p.) para suprimir tumores Raji establecidos.
Figuras 25A y 25B ilustran el crecimiento tumoral retardado cuando el tratamiento se inició simultáneamente o posteriormente con trasplante de tumor hCD20/B16F10.9 en ratones humanizados tratados con anticuerpo biespecífico CD3xCD20. Fig. 25A: Los ratones hCD3 se implantaron por vía subcutánea con células de melanoma B16F10.9 transducidas con hCD20 y se trataron simultáneamente con 0,004 mg/kg o 0,4 mg/kg de anticuerpo 1 (anticuerpo CD3xCD20-Fc quimérico), o 4 mg/kg de Ab5 de control (Ab anti-FelD1) o control de vehículo (i.p. 2 veces por semana). Fig. 25B: Los ratones hCD3 se implantaron por vía subcutánea con células de melanoma hCD20/B16F10.9 y los tumores establecidos se trataron el día 10 y posteriormente con el anticuerpo 1 (anticuerpo CD3xCD20-Fc quimérico) o control. Los ratones se trataron i.p. dos veces por semana con 0,4 mg/kg o 4 mg/kg de Ab1, o 0,4 mg/kg de Ab5 de Control (Ab anti-FelD1), o control de vehículo.
Descripción detallada
Antes de describir la presente invención, debe entenderse que la presente invención no se limita a métodos ni condiciones experimentales particulares descritos, ya que dichos métodos y condiciones pueden variar. También debe entenderse que la terminología usada en el presente documento únicamente tiene el fin de describir realizaciones particulares y no se pretende que sea limitante, ya que el alcance de la presente invención estará limitado únicamente por las reivindicaciones adjuntas.
A menos que se defina lo contrario, todos los términos técnicos y científicos utilizados en el presente documento tienen el mismo significado que el que entiende comúnmente un experto habitual en la materia a la que pertenece la presente invención. Tal como se utiliza en el presente documento, el término "aproximadamente", cuando se usa en referencia a un valor numérico indicado particular, significa que el valor puede variar con respecto al valor indicado en no más de un 1 %. Por ejemplo, tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "aproximadamente 100" incluye 99 y 101 y todos los valores intermedios (p.ej., 99,1, 99,2, 99,3, 99,4, etc.).
Aunque cualquier método y material similar o equivalente a los descritos en este documento puede usarse en la práctica o ensayo de la presente invención, a continuación se describen los métodos y materiales preferidos.
Definiciones
La expresión "CD3", tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a un antígeno que se expresa en linfocitos T como parte del receptor multimolecular de linfocitos T (TCR) y que consiste en un homodímero o heterodímero formado a partir de la asociación de dos de las cuatro cadenas receptoras: CD3-épsilon, CD3-delta, CD3-zeta, y CD3-gamma. Todas las referencias a proteínas, polipéptidos y fragmentos de proteína en este documento pretenden referirse a la versión humana de la proteína, polipéptido o fragmento de proteína respectivos a menos que se especifique explícitamente como de una especie no humana. Por tanto, la expresión "CD3" significa CD3 humano a menos que se especifique que proviene de una especie no humana, p.ej., "CD3 de ratón", "CD3 de mono", etc.
Tal como se utiliza en el presente documento, "un anticuerpo que se une a CD3" o un "anticuerpo anti-CD3" incluye anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que reconocen específicamente una subunidad c D3 única (p.ej., épsilon, delta, gamma o zeta), así como anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que reconocen específicamente un complejo dimérico de dos subunidades CD3 (p.ej., dímeros gamma/épsilon, delta/épsilon y zeta/zeta de CD3). Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno pueden unirse a CD3 soluble y/o CD3 expresado en la superficie celular. CD3 soluble incluye proteínas CD3 naturales, así como variantes de proteínas CD3 recombinantes como, p.ej., construcciones CD3 monoméricas y diméricas, que carecen de un dominio transmembrana o que no están asociadas con una membrana celular.
Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "CD3 expresado en la superficie celular" significa una o más proteínas CD3 que se expresan en la superficie de una célula in vitro o in vivo, de modo que al menos una parte de una proteína CD3 está expuesta al lado extracelular de la membrana celular y es accesible a una parte de unión a antígeno de un anticuerpo. "CD3 expresado en la superficie celular" incluye proteínas CD3 contenidas dentro del contexto de un receptor de linfocitos T funcional en la membrana de una célula. La expresión "CD3 expresado en la superficie celular" incluye la proteína CD3 expresado como parte de un homodímero o heterodímero en la superficie de una célula (p.ej., gamma/épsilon, delta/épsilon y zeta/zeta de CD3). La expresión, "CD3 expresado en la superficie celular" también incluye una cadena CD3 (p.ej., cD3-épsilon, CD3-delta o cD3-gamma) que se expresa por sí misma, sin otros tipos de cadenas CD3, en la superficie de una célula. Una "CD3 expresado en la superficie celular" puede comprender o consistir en una proteína CD3 expresado en la superficie de una célula que normalmente expresa la proteína CD3. Como alternativa, "CD3 expresado en la superficie celular" puede comprender o consistir en una proteína CD3 expresado en la superficie de una célula que normalmente no expresa CD3 humano en su superficie pero que ha sido diseñada artificialmente para expresar CD3 en su superficie.
Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "anticuerpo anti-CD3" incluye tanto anticuerpos monovalentes con una sola especificidad, como anticuerpos biespecíficos que comprenden un primer grupo que se une a CD3 y un segundo grupo que se une a un segundo antígeno (diana), en donde el grupo anti-CD3 comprende cualquiera de las secuencias de HCVR/LCVR o CDR como se establece en Tabla 1 o Tabla 2 en este documento. Ejemplos de anticuerpos biespecíficos anti-CD3 se describen en otras partes del presente documento. La expresión "molécula de unión a antígeno" incluye anticuerpos y fragmentos de anticuerpos de unión a antígeno, incluyendo, p.ej., anticuerpos biespecíficos. Los ejemplos de anticuerpos anti-CD3 también se describen en US 2007/0280945A1; y en la solicitud internacional PCT N.° PCT/US13/60511, presentada el 19 de septiembre, 2013 y publicada como WO2014/047231.
El término "CD20", tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a la proteína CD20 humana a menos que se especifique que proviene de una especie no humana (p.ej., "CD20 de ratón", "CD20 de mono", etc.). La proteína CD20 humana tiene la secuencia de aminoácidos como en la secuencia de referencia NCBI NP_690605.1.
Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "anticuerpo anti-CD20" incluye anticuerpos monovalentes con una sola especificidad, como Rituxan (rituximab), como se describe en US 7.879.984. Los ejemplos de anticuerpos anti-CD20 también se describen en US 7.879.984 y solicitud internacional PCT N.° PCT/US13/60511, presentada el 19 de septiembre, 2013 y publicada como WO2014/047231.
"Antígeno diana tumoral" se refiere a un antígeno diana expresado por células tumorales, sin embargo, puede ser expresado por la célula relacionada (o células sanas) antes de transformarse en un tumor. "Antígeno específico de tumor" se refiere a un antígeno que se expresa o existe dentro de la célula tumoral pero que generalmente no existe en una célula sana o en células de origen diferente.
El término "anticuerpo", tal como se utiliza en el presente documento, significa cualquier molécula de unión a antígeno o complejo molecular que comprende al menos una región determinante de complementariedad (CDR) que se une o interactúa específicamente con un antígeno particular (p.ej., CD3). El término "anticuerpo" incluye moléculas de inmunoglobulina que comprenden cuatro cadenas polipeptídicas, dos cadenas pesadas (H) y dos cadenas ligeras (L) interconectadas por enlaces disulfuro, así como multímeros de las mismas (p.ej., IgM). Cada cadena pesada comprende una región variable de cadena pesada (abreviada en el presente documento como HCVR o VH) y una región constante de cadena pesada. La región constante de cadena pesada comprende tres dominios, CH1, CH2 y CH3. Cada cadena ligera comprende una región variable de cadena ligera (abreviada en el presente documento como LCVR o Vl) y una región constante de cadena ligera. La región constante de cadena ligera comprende un dominio (Cl1). Las regiones Vh y Vl pueden subdividirse además en regiones de hipervariabilidad, denominadas regiones determinantes de la complementariedad (CDR), intercaladas con regiones que están más conservadas, denominadas regiones marco (FR, por sus siglas en inglés). Cada Vh y Vl está compuesta por tres CDR y cuatro FR, dispuestas desde el extremo amino hasta el extremo carboxilo en el siguiente orden: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. En diferentes casos de la divulgación, las FR del anticuerpo anti-CD3 (o la parte de unión a antígeno de la misma) pueden ser idénticas a las secuencias de la línea germinal humana, o pueden modificarse natural o artificialmente. Una secuencia consenso de aminoácidos se puede definir basándose en un análisis paralelo de dos o más CDR.
El término "anticuerpo", tal como se utiliza en el presente documento, también incluye fragmentos de unión al antígeno de moléculas de anticuerpo completas. Las expresiones "parte de unión al antígeno" de un anticuerpo, "fragmento de unión al antígeno" de un anticuerpo y similares, tal como se utiliza en el presente documento, incluyen cualquier polipéptido o glicoproteína de origen natural, obtenible enzimáticamente, sintético o modificado por ingeniería genética que se une específicamente a un antígeno para formar un complejo. Los fragmentos de unión al antígeno de un anticuerpo pueden obtenerse, p.ej., de moléculas de anticuerpo completas, usando cualquier técnica convencional adecuada tal como digestión proteolítica o técnicas de ingeniería genética recombinante que implican la manipulación y expresión de ADN que codifica dominios variables, y opcionalmente constantes, de anticuerpo. Dicho ADN se conoce y/o se puede adquirir fácilmente de, p.ej., fuentes comerciales, bibliotecas de ADN (incluyendo, p.ej., fagotecas de anticuerpos), o puede sintetizarse. El a Dn puede secuenciarse y manipularse químicamente o usando técnicas de biología molecular, por ejemplo, para disponer uno o más dominios variables y/o constantes en una configuración adecuada, o para introducir codones, crear restos de cisteína, modificar, añadir o suprimir aminoácidos, etc.
Los ejemplos no limitantes de fragmentos de unión al antígeno incluyen: (i) fragmentos Fab; (ii) fragmentos F(ab')2; (iii) fragmentos Fd; (iv) fragmentos Fv; (v) moléculas Fv de cadena sencilla (scFv); (vi) fragmentos dAb; y (vii) unidades de reconocimiento mínimo que consisten en los restos de aminoácidos que imitan la región hipervariable de un anticuerpo (p.ej., una región determinante de complementariedad (CDR) aislada, tal como un péptido CDR3) o un péptido FR3-CDR3-FR4 restringido. Otras moléculas modificadas por ingeniería genética, tales como anticuerpos específicos de dominio, anticuerpos de dominio único, anticuerpos de dominio suprimido, anticuerpos quiméricos, anticuerpos injertados con CDR, diacuerpos, triacuerpos, tetracuerpos, minicuerpos, nanocuerpos (p.ej., nanocuerpos monovalentes, nanocuerpos bivalentes, etc.), agentes inmunofarmacéuticos modulares pequeños (s MiP) y dominios IgNAR variables de tiburón, también se abarcan dentro de la expresión "fragmento de unión al antígeno", como se usa en el presente documento.
Un fragmento de unión al antígeno de un anticuerpo normalmente comprenderá al menos un dominio variable. El dominio variable puede ser de cualquier tamaño o composición de aminoácidos y generalmente comprenderá al menos una CDR que está adyacente a o en fase con una o más secuencias marco. En fragmentos de unión al antígeno que tienen un dominio Vh asociado con un dominio Vl, los dominios Vh y Vl pueden situarse uno con respecto al otro en cualquier disposición adecuada. Por ejemplo, la región variable puede ser dimérica y contener dímeros V h-Vh, Vh-Vl o Vl-Vl. Como alternativa, el fragmento de unión a antígeno de un anticuerpo puede contener un dominio Vh o Vl monomérico.
En determinados casos, un fragmento de unión a antígeno de un anticuerpo puede contener al menos un dominio variable unido covalentemente a al menos un dominio de fragmento constante (Fc), o de otro modo unido a un dominio Fc. Las configuraciones ejemplares, no limitantes de dominios variables y constantes que pueden encontrarse dentro de un fragmento de unión a antígeno de un anticuerpo de la presente divulgación incluyen: (i) VH-CH1-bisagra-CH2-Ch3; (ii) VH-bisagra-CH2-CH3; (iii) Vh-Cl; (iv) Vl-Ch1-Ch2-Ch3; (v) Vl-Ch2-Ch3; y (vi) Vl-Cl. En cualquier configuración de dominios variables y constantes, incluyendo cualquiera de las configuraciones ilustrativas enumeradas anteriormente, los dominios variables y constantes pueden estar directamente unidos entre sí o pueden estar unidos (relacionados) por una bisagra quimérica total o parcial de la divulgación, o por CH1 total o parcial y bisagra quimérica. Una región bisagra puede consistir en al menos aminoácidos de bisagra superior e inferior que dan como resultado un enlace flexible o semiflexible entre dominios variables y/o constantes adyacentes en una sola molécula de polipéptido. Además, un fragmento de unión a antígeno de un anticuerpo de la presente divulgación puede comprender un homo-dímero o hetero-dímero (u otro multímero) de cualquiera de las configuraciones de dominio variable y constante enumeradas anteriormente en asociación no covalente entre sí y/o con uno o más dominios Vh o Vl monoméricos (p.ej., mediante enlace(s) disulfuro).
Un formato de anticuerpos multiespecífico, incluyendo los formatos de anticuerpo biespecífico ejemplares divulgados en este documento, comprende típicamente al menos dos dominios variables diferentes, en donde cada dominio variable puede unirse específicamente a un antígeno separado. Los formatos multiespecíficos pueden adaptarse para uso en el contexto de un fragmento de unión a antígeno de un anticuerpo de la presente divulgación usando técnicas rutinarias disponibles en la técnica.
Los anticuerpos de la presente divulgación se modifican para tener una citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) o citotoxicidad mediada por células dependiente de anticuerpos (ADCC) disminuida o nula como se mide in vitro. "Citotoxicidad dependiente del complemento" (CDC) se refiere a la lisis de células que expresan antígeno por un anticuerpo de la divulgación en presencia del complemento. "Citotoxicidad mediada por células dependiente de anticuerpos" (ADCC) se refiere a una reacción mediada por células en donde las células citotóxicas no específicas que expresan receptores Fc (FcR) (p.ej., Linfocitos citolíticos naturales (NK), neutrófilos y macrófagos) reconocen el anticuerpo unido en una célula diana y de ese modo da lugar a la lisis de la célula diana. La CDC y la ADCC pueden medirse usando ensayos que son bien conocidos y están disponibles en la técnica. (Véase, p.ej., patentes de Estados Unidos N.os 5.500.362 y 5.821.337, y Clynes et al. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 95:652-656). La región constante de cadena pesada (CH) de un anticuerpo es importante en la capacidad de un anticuerpo para fijar el complemento y mediar la citotoxicidad dependiente de células. Por tanto, la CH de un anticuerpo puede seleccionarse en función de si es deseable que el anticuerpo medie en la citotoxicidad.
En determinados casos, los anticuerpos biespecíficos son anticuerpos humanos. La expresión "anticuerpo humano", tal como se utiliza en el presente documento, pretende incluir anticuerpos que tienen regiones variables y constantes derivadas de secuencias de inmunoglobulina de la línea germinal humana. Los anticuerpo humanos pueden incluir restos de aminoácido no codificados por secuencias de inmunoglobulinas de la línea germinal humana (p.ej., mutaciones introducidas por mutagénesis aleatoria o específica de sitio in vitro o por mutación somática in vivo), por ejemplo, en las CDR y en particular CDR3. Sin embargo, la expresión "anticuerpo humano", tal como se utiliza en el presente documento, no pretende incluir anticuerpos en donde las secuencias CDR derivadas de la línea germinal de otra especie de mamífero, tal como de un ratón, se han injertado en secuencias marco humanas.
Los anticuerpos de la divulgación pueden, en algunos casos, ser anticuerpos humanos recombinantes. La expresión "anticuerpo humano recombinante", tal como se utiliza en el presente documento, pretende incluir todos los anticuerpos humanos que se preparan, expresados, crean o aíslan por medios recombinantes, tales como anticuerpos expresados usando un vector de expresión recombinante introducido por transfección en una célula hospedadora (descrito en más detalle posteriormente), anticuerpos aislados de una biblioteca combinatoria de anticuerpos humanos, recombinante (descrita posteriormente), anticuerpos aislados de un animal (p. ej., un ratón) que es transgénico para genes de inmunoglobulina humana (véase, p. ej., Taylor etal. (1992) Nucl. Acids Res. 20:6287-6295) o anticuerpos preparados, expresados, creados o aislados por cualquier otro medio que implique el corte y empalme de secuencias génicas de inmunoglobulina humana en otras secuencias de ADN. Dichos anticuerpos humanos recombinantes tienen regiones variables y constantes procedentes de secuencias de inmunoglobulina de la línea germinal humana. En determinados casos, sin embargo, tales anticuerpos humanos recombinantes están sujetos a mutagénesis in vitro (o, cuando se usa un animal transgénico para secuencias de Ig humana, mutagénesis somática in vivo) y, por tanto, las secuencias de aminoácidos de las regiones Vh y Vl de los anticuerpos recombinantes son secuencias que, aunque proceden de, y están relacionadas con, secuencias de V h y Vl de línea germinal humana, no pueden existir de forma natural dentro del repertorio de la línea germinal de anticuerpos humanos in vivo.
Los anticuerpos humanos pueden existir en dos formas que están asociadas con heterogeneidad de bisagra. En una forma, una molécula de inmunoglobulina comprende una construcción de cuatro cadenas estable de aproximadamente 150-160 kDa en donde los dímeros se mantienen juntos por un enlace disulfuro intercatenario de la cadena pesada. En una segunda forma, los dímeros no están unidos mediante enlaces disulfuro intercatenarios y se forma una molécula de aproximadamente 75-80 kDa compuesta de una cadena ligera y pesada acopladas covalentemente (semianticuerpo). Estas formas han sido extremadamente difíciles de separar, incluso después de purificación por afinidad.
La frecuencia de aparición de la segunda forma en diversos isotipos de IgG intacta se debe a, pero sin limitación, diferencias estructurales asociadas con el isotipo de la región bisagra del anticuerpo. Una sustitución de un único aminoácido en la región bisagra de la bisagra de IgG4 humana puede reducir significativamente la aparición de la segunda forma (Angal et al. (1993) Molecular Immunology 30:105) hasta los niveles típicamente observados usando una bisagra de IgG1 humana. La presente divulgación incluye anticuerpos que tienen una o más mutaciones en la región bisagra que pueden, en producción, por ejemplo, mejorar el rendimiento de la forma de anticuerpo deseada.
Los anticuerpos de la divulgación pueden ser anticuerpos aislados. Un "anticuerpo aislado", tal como se utiliza en el presente documento, significa un anticuerpo que se ha identificado y separado y/o recuperado de al menos un componente de su entorno natural. Por ejemplo, un anticuerpo que se ha separado o retirado de al menos un componente de un organismo, o de un tejido o célula en donde existe de forma natural o se produce de forma natural el anticuerpo, es un "anticuerpo aislado" para los fines de la presente divulgación. Un anticuerpo aislado también incluye un anticuerpo in situ dentro de una célula recombinante. Los anticuerpos aislados son anticuerpos que se han sometido a al menos una etapa de purificación o aislamiento. Según determinados casos, un anticuerpo aislado puede estar sustancialmente libre de otro material celular y/o agentes químicos.
Las regiones variables anti-CD3 o anti-CD20 descritas en este documento pueden comprender una o más sustituciones, inserciones y/o deleciones de aminoácidos en las regiones marco y/o CDR de los dominios variables de cadena pesada y ligera en comparación con las secuencias de la línea germinal correspondientes de las cuales se derivaron los anticuerpos. Dichas mutaciones pueden averiguarse fácilmente comparando las secuencias de aminoácidos divulgadas en este documento con secuencias de la línea germinal disponibles en, por ejemplo, bases de datos de secuencias de anticuerpos públicas. La presente divulgación incluye anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que se obtienen a partir de cualquiera de las secuencias de aminoácidos divulgadas en el presente documento, en donde uno o más aminoácidos dentro de una o más regiones marco y/o CDR están mutados en el resto o restos correspondientes de la secuencia de la línea germinal de la que se obtuvo el anticuerpo, o en el resto o restos correspondientes de otra secuencia de la línea germinal humana, o en una sustitución de aminoácidos conservativa del resto o restos de la línea germinal correspondientes (dichos cambios de secuencia se mencionan en el presente documento colectivamente como "mutaciones de la línea germinal"). Un experto en la técnica, partiendo con las secuencias de la región variable de cadena pesada y ligera divulgadas en el presente documento, puede producir fácilmente numerosos anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno que comprenden una o más mutaciones de la línea germinal individuales o combinaciones de las mismas. En determinados casos, todos los restos marco y/o CDR dentro de los dominios Vh y/o Vl mutan de vuelta a los restos encontrados en la secuencia de la línea germinal humana de la que se obtuvo el anticuerpo. En otros casos, únicamente determinados restos mutan de vuelta a la secuencia de la línea germinal original, p.ej., únicamente los restos mutados encontrados dentro de los primeros 8 aminoácidos de FR1 o dentro de los últimos 8 aminoácidos de FR4, o únicamente los restos mutados encontrados dentro de CDR1, CDR2 o CDR3. En otros casos, uno o más del resto(s) marco y/o CDR están mutados a los restos correspondientes de una secuencia de línea germinal diferente (es decir, una secuencia de línea germinal que es diferente de la secuencia de la línea germinal de la cual se derivó originalmente el anticuerpo). Además, los anticuerpos de la presente divulgación pueden contener cualquier combinación de dos o más mutaciones de la línea germinal dentro de las regiones marco y/o CDR, p.ej., en donde determinados restos individuales están mutados al resto correspondiente de una secuencia de la línea germinal particular mientras que otros restos determinados que difieren de la secuencia de la línea germinal original se mantienen o están mutados al resto correspondiente de una secuencia de la línea germinal diferente. Una vez obtenidas, los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno que contienen una o más mutaciones de la línea germinal pueden ensayarse fácilmente con respecto a una o más propiedades deseadas tales como, mejor especificidad de unión, mayor afinidad de unión, propiedades biológicas antagonista o agonistas mejoradas o potenciadas (según pueda ser el caso), menor inmunogenicidad, etc. Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno obtenidos de esta manera general están incluidos en la presente divulgación.
La presente divulgación también incluye regiones variables anti-CD3 o anti-CD20 que comprenden variantes de cualquiera de las secuencias de aminoácidos de HCVR, LCVR, y/o CDR desveladas en este documento que tienen una o más sustituciones conservativas. Por ejemplo, la presente divulgación incluye anticuerpos anti-CD3 que tienen secuencias de aminoácidos de HCVR, LCVR, y/o CDR con, p.ej., 10 o menos, 8 o menos, 6 o menos, 4 o menos, etc., sustituciones conservativas de aminoácidos respecto a cualquiera de las secuencias de aminoácidos de HCVR, LCVR, y/o CDR expuestas en la Tabla 1 de este documento.
El término "epítopo" se refiere a un determinante antigénico que interactúa con un sitio de unión a antígeno específico en la región variable de una molécula de anticuerpo conocida como parátopo. Un único antígeno puede tener más de un epítopo. Por tanto, diferentes anticuerpos pueden unirse a diferentes áreas en un antígeno o puede tener diferentes efectos biológicos. Los epítopos pueden ser conformacionales o lineales. Un epítopo conformacional se produce por yuxtaposición espacial de aminoácidos de diferentes segmentos de la cadena de polipéptido lineal. Un epítopo lineal es uno producido por restos de aminoácidos adyacentes en una cadena polipeptídica. En determinadas circunstancias, un epítopo puede incluir restos de sacáridos, grupos fosforilo o grupos sulfonilo en el antígeno.
La expresión "identidad sustancial" o "sustancialmente idéntico", cuando hace referencia a un ácido nucleico o fragmento del mismo, indica que, cuando se alinean de forma óptima con inserciones o eliminaciones de nucleótidos apropiadas con otro ácido nucleico (o su hebra complementaria), existe identidad de secuencia de nucleótidos en al menos aproximadamente un 95 % y, más preferentemente, al menos aproximadamente un 96 %, 97 %, 98 % o 99 % de las bases nucleotídicas, medida por cualquier algoritmo bien conocido de identidad de secuencias, tal como FASTA, BLAST o Gap, como se discute a continuación. Una molécula de ácido nucleico que tiene identidad sustancial con una molécula de ácido nucleico de referencia puede, en determinados casos, codificar un polipéptido que tiene la misma secuencia de aminoácidos o una secuencia de aminoácidos sustancialmente similar al polipéptido codificado por la molécula de ácido nucleico de referencia.
Aplicada a polipéptidos, la expresión "similitud sustancial" o "sustancialmente similar" significa que dos secuencias peptídicas, cuando se alinean de forma óptima, tal como mediante los programas GAP o BESTFIT usando ponderaciones de hueco predeterminadas, comparten al menos un 95 % de identidad de secuencia, incluso más preferentemente al menos un 98 % o 99 % de identidad de secuencia. Preferentemente, las posiciones de los restos que no son idénticas difieren por sustituciones de aminoácidos conservativas. Una "sustitución de aminoácido conservativa" es una en donde un resto de aminoácido está sustituido por otro resto de aminoácido que tiene una cadena lateral (grupo R) con propiedades químicas similares (p.ej., carga o hidrofobicidad). En general, una sustitución de aminoácidos conservativa no cambiará sustancialmente las propiedades funcionales de una proteína. En los casos en donde dos o más secuencias de aminoácidos difieren entre sí por sustituciones conservativas, el porcentaje de identidad de secuencia o grado de similitud puede ajustarse al alza para corregir la naturaleza conservativa de la sustitución. Los medios para hacer este ajuste son bien conocidos para los expertos en la materia. Véase, p.ej., Pearson (1994) Methods Mol. Biol. 24: 307-331. Los ejemplos de grupos de aminoácidos que tienen cadenas laterales con propiedades químicas similares incluyen (1) cadenas laterales alifáticas: glicina, alanina, valina, leucina e isoleucina; (2) cadenas laterales de hidroxilo-alifáticas: serina y treonina; (3) cadenas laterales que contienen amida: asparagina y glutamina; (4) cadenas laterales aromáticas: fenilalanina, tirosina y triptófano; (5) cadenas laterales básicas: lisina, arginina e histidina; (6) cadenas laterales ácidas: aspartato y glutamato, y (7) cadenas laterales que contienen azufre que son cisteína y metionina. Son grupos de sustitución de aminoácidos conservativa preferidos: valina-leucina-isoleucina, fenilalanina-tirosina, lisina-arginina, alanina-valina, glutamato-aspartato y asparaginaglutamina. Como alternativa, un remplazo conservativo es cualquier cambio que tenga un valor positivo en la matriz de probabilidad logarítmica PAM250 divulgada en Gonnet et al. (1992) Science 256: 1443-1445. Un reemplazo "moderadamente conservativo" es cualquier cambio que tenga un valor no negativo en la matriz de probabilidad logarítmica PAM250.
La similitud de secuencia para polipéptidos, que también se menciona como identidad de secuencia, se mide típicamente usando un programa informático de análisis de secuencias. El programa informático de análisis de proteínas empareja secuencias similares usando medidas de similitud asignadas a diversas sustituciones, eliminaciones y otras modificaciones, incluyendo sustituciones de aminoácidos conservativas. Por ejemplo, el programa informático GCG contiene programas tales como Gap y Bestfit que pueden usarse con parámetros por defecto para determinar la homología de secuencia o la identidad de secuencia entre polipéptidos muy relacionados, tales como polipéptidos homólogos de diferentes especies de organismos o entre una proteína de tipo silvestre y una muteína de la misma. Véase, p.ej., GCG Versión 6.1. Las secuencias polipeptídicas también pueden compararse usando FASTA usando parámetros por defecto o recomendados, un programa en GCG Versión 6.1. FASTA (p.ej., FASTA2 y FASTA3) proporciona alineaciones y porcentajes de identidad de secuencia de las regiones del mejor solapamiento entre las secuencias de consulta y de búsqueda (Pearson (2000) supra). Otro algoritmo preferente al comparar una secuencia de la divulgación con una base de datos que contiene una gran cantidad de secuencias de diferentes organismos es el programa informático BLAST, especialmente BLASTP o TBLASTN, usando parámetros por defecto. Véase, p.ej., Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-410 y Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res.
25:3389-402.
Moléculas de unión a antígeno biespecíficas
Los anticuerpos de la presente divulgación pueden ser biespecíficos o multiespecíficos. El anticuerpo proporcionado para uso en la presente invención es biespecífico y comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano y un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20 humano. Los anticuerpos multiespecíficos pueden ser específicos para diferentes epítopos de un polipéptido diana o pueden contener dominios de unión a antígeno específicos para más de un polipéptido diana. Véase, p.ej., Tutt et al., 1991, J. Immunol. 147:60-69; Kufer et al., 2004, Trends Biotechnol. 22:238-244. Los anticuerpos anti-CD3xCD20 de la presente divulgación pueden unirse o coexpresarse con otra molécula funcional, p.ej., otro péptido o proteína. Por ejemplo, un anticuerpo o fragmento del mismo puede unirse de forma funcional (p.ej., por acoplamiento químico, fusión genética, asociación no covalente o de otra manera) a una o más entidades moleculares diferentes, como otro anticuerpo o fragmento de anticuerpo para producir un anticuerpo biespecífico o multiespecífico con una especificidad de unión adicional.
Por tanto, la presente divulgación incluye anticuerpos biespecíficos en donde un grupo de una inmunoglobulina se une al CD3 humano, y el otro brazo de la inmunoglobulina es específico para un antígeno diana. El antígeno diana al que se une el otro grupo del anticuerpo biespecífico CD3 puede ser cualquier antígeno expresado en o cerca de una célula, tejido, órgano, microorganismo o virus, contra el cual se desea una respuesta inmune dirigida. El grupo de unión a CD3 puede comprender cualquiera de las secuencias de aminoácidos de HCVR/LCVR o CDR como se establece en la Tabla 1 en este documento.
En el contexto de anticuerpos biespecíficos de la presente divulgación en donde un grupo del anticuerpo se une a CD3 y el otro grupo se une a un antígeno diana, el antígeno diana puede ser un antígeno asociado a tumor. Los ejemplos no limitantes de antígenos específicos asociados a tumores incluyen, p.ej., AFP, ALK, proteínas BAGE, BIRC5 (survivina), BIRC7, la p-catenina, brc-abl, BRCA1, BORIS, CA9, anhidrasa carbónica IX, caspasa-8, CALR, CCR5, CD19, CD20(MS4A1), CD22, CD30, CD40, CDK4, CEA, CTLA4, ciclina-B1, CYP1B1, EGFR, EGFRvIII, ErbB2/Her2, ErbB3, ErbB4, ETV6-AML, EpCAM, EphA2, Fra-1, FOLR1, proteínas GAGE (p.ej., GAGE-1, -2), GD2, GD3, GloboH, glipicano-3, GM3, gp100, Her2, HLA/B-raf, HLA/kras, HLA/MAGE-A3, hTERT, LMP2, proteínas MAGE (p.ej., MAGE-1, -2, -3, -4, -6, y -12), MART-1, mesotelina, ML-IAP, Muc1, Muc2, Muc3, Muc4, Muc5, Muc16 (CA-125), MUM1, NA17, NY-BR1, NY-BR62, NY-BR85, NY-ES01, OX40, p15, p53, PAP, PAX3, PAX5, PCTA-1, PLAC1, PRLR, PRAME, PSMA(FOLHI), proteínas RAGE, Ras, RGS5, Rho, SART-1, SART-3, Steap-1, Steap-2, TAG-72, TGF-p, TMPRSS2, antígeno Thompson-nouvelle (Tn), TRP-1, TRP-2, tirosinasa, y uroplaquina-3.
En el contexto de anticuerpos biespecíficos de la presente divulgación en donde un grupo del anticuerpo se une a CD3 y el otro grupo se une a un antígeno diana, El antígeno diana puede ser un antígeno asociado a una enfermedad infecciosa. Los ejemplos no limitantes de antígenos asociados a enfermedades infecciosas incluyen, p.ej., un antígeno que se expresa en la superficie de una partícula viral, o se expresa preferentemente en una célula infectada con un virus, en donde el virus se selecciona del grupo que consiste en VIH, hepatitis (A, B o C), virus del herpes (p.ej., HSV-1, HSV-2, CMV, HAV-6, VZV, virus Epstein Barr), adenovirus, virus de la gripe, flavivirus, ecovirus, rinovirus, virus coxsackie, coronavirus, virus sincitial respiratorio, virus de las paperas, rotavirus, virus del sarampión, virus de la rubeola, parvovirus, virus vaccinia, HTLV, virus del dengue, virus del papiloma, virus de molusco, poliovirus, virus de la rabia, virus JC, y virus de la encefalitis arboviral. Como alternativa, el antígeno diana puede ser un antígeno que se expresa en la superficie de una bacteria, o se expresa preferentemente en una célula que está infectada con una bacteria, en donde la bacteria se selecciona del grupo que consiste en clamidia, rickettsia, micobacterias, estafilococos, estreptococos, neumonococos, meningococos, gonococos, klebsiella, proteus, serratia, pseudomonas, legionella, difteria, salmonela, bacilos, cólera, tétanos, botulismo, ántrax, peste, leptospira, y bacterias de la enfermedad de Lyme. En determinados casos, el antígeno diana es un antígeno que se expresa en la superficie de un hongo, o se expresa preferentemente en una célula que está infectada con un hongo, en donde el hongo se selecciona del grupo que consiste en Candida (albicans, krusei, glabrata, tropicalis, etc.), Crytococcus neoformans, Aspergillus (fumigatus, niger, etc.), Mucorales (mucor, absidia, rhizopus, etc.), Sporothrix schenkii, Blastomyces dermatitidis, Paracoccidioides brasiliensis, Coccidioides immitis e Histoplasma capsulatum. En determinados casos, el antígeno diana es un antígeno que se expresa en la superficie de un parásito, o se expresa preferentemente en una célula que está infectada con un parásito, en donde el parásito se selecciona del grupo que consiste en Entamoeba histolytica, Balantidium coli, Naegleriafowleri, Acanthamoeba sp., Giardia lambia, Cryptosporidium sp., Pneumocystis carinii, Plasmodium vivax, Babesia microti, Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi, Leishmania donovani, Toxoplasma gondii, Nippostrongylus brasiliensis, Taenia crassiceps, y Brugia malayi. Los ejemplos no limitantes de antígenos asociados a patógenos específicos incluyen, p.ej., gp120 de VIH, CD4 de VIH, glucoproteína L de hepatitis B, glucoproteína M de hepatitis B, glucoproteína S de hepatitis B, E1 de hepatitis C, E2 de hepatitis C, proteína específica de hepatocitos, gB del virus del herpes simple, gB de citomegalovirus y proteína de envoltura HTLV.
Según ciertos casos ejemplares, La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas que se unen específicamente a CD3 y CD20. En este documento tales moléculas pueden denominarse, p.ej., moléculas biespecíficas "anti-CD3/anti-CD20", o "anti-CD3/CD20", o "anti-CD3xCD20" o "CD3xCD20", u otra terminología similar.
Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "molécula de unión a antígeno" significa una proteína, polipéptido o complejo molecular que comprende o consiste en al menos una región determinante de complementariedad (CDR) que sola, o en combinación con una o más CDR y/o regiones marco (FR) adicionales, se une específicamente a un antígeno particular. En determinados casos, una molécula de unión a antígeno es un anticuerpo o un fragmento de un anticuerpo, como se definen esos términos en otras partes de este documento.
Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "molécula de unión a antígeno biespecífica" significa una proteína, polipéptido o complejo molecular que comprende al menos un primer dominio de unión a antígeno y un segundo dominio de unión a antígeno. Cada dominio de unión a antígeno dentro de la molécula de unión a antígeno biespecífica comprende al menos una CDR que sola, o en combinación con una o más CDR y/o FR adicionales, se une específicamente a un antígeno particular. En el contexto de la presente divulgación, el primer dominio de unión a antígeno se une específicamente a un primer antígeno (p.ej., CD3), y el segundo dominio de unión a antígeno se une específicamente a un segundo, antígeno distinto (p.ej., CD20).
En ciertos ejemplos de la presente divulgación, la molécula de unión a antígeno biespecífica es un anticuerpo biespecífico. Cada dominio de unión a antígeno de un anticuerpo biespecífico comprende un dominio variable de cadena pesada (HCVR) y un dominio variable de cadena ligera (LCVR). En el contexto de una molécula de unión a antígeno biespecífica que comprende un primer y un segundo dominios de unión a antígeno (p.ej., un anticuerpo biespecífico), las CDR del primer dominio de unión a antígeno pueden designarse con el prefijo "A1" y las CDR del segundo dominio de unión a antígeno pueden designarse con el prefijo "A2". Por tanto, en este documento las CDR del primer dominio de unión a antígeno pueden denominarse A1-HCDR1, A1-HCDR2, y A1-HCDR3; y las CDR del segundo dominio de unión a antígeno en este documento pueden denominarse A2-HCDR1, A2-HCDR2, y A2-HCDR3.
El primer dominio de unión a antígeno y el segundo dominio de unión a antígeno pueden estar unidos directa o indirectamente entre sí para formar una molécula de unión a antígeno biespecífica de la presente divulgación (es decir, ScFv biespecífico) unido adicionalmente a un dominio Fc. Como alternativa, el primer dominio de unión a antígeno y el segundo dominio de unión a antígeno pueden estar unidos a un dominio Fc separado. Las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la presente divulgación comprenderán típicamente dos dominios Fc que son cada uno individualmente parte de una cadena pesada de anticuerpo separada. El primer y el segundo de niños Fc pueden ser de la misma secuencia, excepto por tener una mutación en el dominio Ch3 destinado a facilitar o facilidad de purificación de heterodiméricos (es decir, moléculas biespecíficas).
La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas que comprenden un primer dominio Ch3 y un segundo dominio Ch3 de Ig, en donde el primer y el segundo dominio Ch3 de Ig difieren entre sí en al menos un aminoácido, y en donde al menos una diferencia de aminoácido reduce la unión del anticuerpo biespecífico a proteína A en comparación con un anticuerpo biespecífico que carece de la diferencia de aminoácido. En un caso, el primer dominio Ch3 de Ig se une a la proteína A y el segundo dominio Ch3 de Ig contiene una mutación que reduce o elimina la unión a la proteína A, como una modificación H435R (por numeración EU; H95R por numeración de exón IMGT). El segundo Ch3 puede comprender además una modificación Y436F (por numeración EU; Y96F por IMGT). Otras modificaciones adicionales que pueden encontrarse dentro del segundo Ch3 incluyen: D356E, L358M, N384S, K392N, V397M, y V422I por EU (D16E, L18M, N44S, K52N, V57M, y V82I por IMGT) en el caso de dominios Ch3 de IgG1; y Q355R, N384S, K392N, V397M, R409K, E419Q, y V422I por EU (Q15R, N44S, K52N, V57M, R69K, E79Q y V82I por IMGT) en el caso de dominios CH3 de IgG4.
Pueden usarse otros formatos o tecnologías de anticuerpos biespecíficos para preparar las moléculas de unión a antígeno biespecíficas. Por ejemplo, un anticuerpo o fragmento del mismo que tiene una primera especificidad de unión a antígeno puede unirse funcionalmente (p.ej., por acoplamiento químico, fusión genética, asociación no covalente o de otra manera) a una o más entidades moleculares diferentes, como otro anticuerpo o fragmento de anticuerpo que tiene una segunda especificidad de unión a antígeno para producir una molécula de unión a antígeno biespecífica. Los formatos biespecíficos ejemplares específicos que pueden usarse incluyen, sin limitación, p.ej., formatos biespecíficos basados en scFv o de diacuerpo, fusiones IgG-scFv, dominio variable doble (DVD)-Ig, cuadroma, botón en ojal, cadena ligera habitual (p.ej., cadena ligera habitual con botón en ojal, etc.), CrossMab, CrossFab, (SEED)cuerpo, cremallera de leucina, duocuerpo, IgG1/IgG2, Fab de acción doble (DAF)-IgG y formatos biespecíficos de Mab2 (véase, p.ej., Klein et al., 2012, "mAbs" 4:6, 1-11, y las referencias citadas en el mismo, para una revisión de los formatos anteriores).
En el contexto de moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la presente divulgación, los dominios Fc pueden comprender uno o más cambios de aminoácido (p.ej., inserciones, eliminaciones o sustituciones) en comparación con la versión quimérica especificada del dominio Fc, sin cambiar la funcionalidad deseada. Por ejemplo, la divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas que comprenden una o más modificaciones en el dominio Fc dando como resultado un dominio Fc modificado que tiene una interacción de unión modificada (p.ej., mejorada o disminuida) entre Fc y FcRn. En un caso, la molécula de unión a antígeno biespecífica comprende una modificación en una región Ch2 o Ch3, en donde la modificación aumenta la afinidad del dominio Fc a FcRn en un entorno ácido (p.ej., en un endosoma donde el pH varía de aproximadamente 5,5 a aproximadamente 6,0). Los ejemplos no limitantes de tales modificaciones de Fc incluyen, p.ej., una modificación en la posición 250 (p.ej., E o Q); 250 y 428 (p.ej., L o F); 252 (p.ej., L/Y/F/W o T), 254 (p.ej., S o T) y 256 (p.ej., S/R/Q/E/D o T); o una modificación en la posición 428 y/o 433 (p.ej.,L/R/S/P/Q o K) y/o 434 (p.ej., H/F o Y); o una modificación en la posición 250 y/o 428; o una modificación en la posición 307 o 308 (p.ej., 308F, V308F), y 434. En un caso, la modificación comprende una modificación 428L (p.ej., M428L) y 434S (p.ej., N434S); una modificación 428L, 259I (p.ej., V259l) y 308F (p.ej., V308F); una modificación 433K (p.ej., H433K) y 434 (p.ej., 434Y); una modificación 252, 254 y 256 (p.ej., 252Y, 254T y 256E); una modificación de 250Q y 428L (p.ej., t 250Q y M428L); y una modificación 307 y/o 308 (p.ej., 308F o 308P).
Variantes de secuencia
Los anticuerpos y moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la presente divulgación pueden comprender una o más sustituciones, inserciones y/o deleciones de aminoácido en las regiones marco y/o CDR de los dominios variables de cadena pesada y ligera en comparación con las secuencias de la línea germinal correspondientes de las que se derivaron los dominios de unión a antígeno individuales. Dichas mutaciones pueden averiguarse fácilmente comparando las secuencias de aminoácidos divulgadas en este documento con secuencias de la línea germinal disponibles en, por ejemplo, bases de datos de secuencias de anticuerpos públicas. Las moléculas de unión a antígeno de la presente Divulgación pueden comprender dominios de unión a antígeno que se derivan de cualquiera de las secuencias de aminoácidos ejemplares desveladas en este documento, en donde uno o más aminoácidos dentro de una o más regiones marco y/o c Dr están mutados en el resto o restos correspondientes de la secuencia de la línea germinal de la que se obtuvo el anticuerpo, o en el resto o restos correspondientes de otra secuencia de la línea germinal humana, o en una sustitución de aminoácidos conservativa del resto o restos de la línea germinal correspondientes (dichos cambios de secuencia se mencionan en el presente documento colectivamente como "mutaciones de la línea germinal"). Un experto en la técnica, partiendo con las secuencias de la región variable de cadena pesada y ligera divulgadas en el presente documento, puede producir fácilmente numerosos anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno que comprenden una o más mutaciones de la línea germinal individuales o combinaciones de las mismas. En determinados casos, todos los restos de marco y/o CDR dentro de los dominios VH y/o Vl se vuelven a mutar a los restos encontrados en la secuencia original de la línea germinal de la cual se originó originalmente el dominio de unión al antígeno. En otros casos, únicamente determinados restos mutan de vuelta a la secuencia de la línea germinal original, p.ej., únicamente los restos mutados encontrados dentro de los primeros 8 aminoácidos de FR1 o dentro de los últimos 8 aminoácidos de FR4, o únicamente los restos mutados encontrados dentro de CDR1, CDR2 o CDR3. En otros casos, uno o más del resto(s) del marco y/o CDR están mutados a los restos correspondientes de una secuencia de línea germinal diferente (es decir, una secuencia de la línea germinal que es diferente de la secuencia de la línea germinal de la cual se derivaba originalmente el dominio de unión al antígeno). Además, los dominios de unión a antígeno pueden contener cualquier combinación de dos o más mutaciones de línea germinal dentro de las regiones marco y/o CDR, p.ej., en donde determinados restos individuales están mutados al resto correspondiente de una secuencia de la línea germinal particular mientras que otros restos determinados que difieren de la secuencia de la línea germinal original se mantienen o están mutados al resto correspondiente de una secuencia de la línea germinal diferente. Una vez obtenidas, los dominios de unión a antígeno que contienen una o más mutaciones de línea germinal pueden analizarse fácilmente para una o más propiedades deseadas como, mejor especificidad de unión, mayor afinidad de unión, propiedades biológicas antagonista o agonistas mejoradas o potenciadas (según pueda ser el caso), menor inmunogenicidad, etc. En la presente divulgación se incluyen moléculas de unión a antígeno biespecíficas que comprenden uno o más dominios de unión a antígeno obtenidos de esta manera general.
La presente divulgación también incluye moléculas de unión a antígeno en donde uno o ambos dominios de unión a antígeno comprenden variantes de cualquiera de las secuencias de aminoácidos de HCVR, LCVR, y/o CDR desveladas en este documento que tienen una o más sustituciones conservativas. Por ejemplo, la presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno que comprenden un dominio de unión a antígeno que tiene secuencias de aminoácidos de HCVR, LCVR, y/o CDR con, p.ej., 10 o menos, 8 o menos, 6 o menos, 4 o menos, etc., sustituciones conservativas de aminoácidos respecto a cualquiera de las secuencias de aminoácidos de HCVR, LCVR, y/o CDR desveladas en este documento. Una "sustitución de aminoácido conservativa" es una en donde un resto de aminoácido está sustituido por otro resto de aminoácido que tiene una cadena lateral (grupo R) con propiedades químicas similares (p.ej., carga o hidrofobicidad). En general, una sustitución de aminoácidos conservativa no cambiará sustancialmente las propiedades funcionales de una proteína. Los ejemplos de grupos de aminoácidos que tienen cadenas laterales con propiedades químicas similares incluyen (1) cadenas laterales alifáticas: glicina, alanina, valina, leucina e isoleucina; (2) cadenas laterales de hidroxilo-alifáticas: serina y treonina; (3) cadenas laterales que contienen amida: asparagina y glutamina; (4) cadenas laterales aromáticas: fenilalanina, tirosina y triptófano; (5) cadenas laterales básicas: lisina, arginina e histidina; (6) cadenas laterales ácidas: aspartato y glutamato, y (7) cadenas laterales que contienen azufre que son cisteína y metionina. Son grupos de sustitución de aminoácidos conservativa preferidos: valina-leucina-isoleucina, fenilalanina-tirosina, lisina-arginina, alanina-valina, glutamato-aspartato y asparaginaglutamina. Como alternativa, un reemplazo preservativo es cualquier cambio que tenga un valor positivo en la matriz de probabilidad logarítmica PAM250 descrita en Gonnet et al. (1992) Science 256:1443-1445. Un remplazo "moderadamente conservativo" es cualquier cambio que tenga un valor no negativo en la matriz de probabilidad logarítmica PAM250.
La similitud de secuencia para polipéptidos, que también se menciona como identidad de secuencia, puede medirse usando un software de análisis de secuencias. El programa informático de análisis de proteínas empareja secuencias similares usando medidas de similitud asignadas a diversas sustituciones, eliminaciones y otras modificaciones, incluyendo sustituciones de aminoácidos conservativas. Por ejemplo, el programa informático GCG contiene programas tales como Gap y Bestfit que pueden usarse con parámetros por defecto para determinar la homología de secuencia o la identidad de secuencia entre polipéptidos muy relacionados, tales como polipéptidos homólogos de diferentes especies de organismos o entre una proteína de tipo silvestre y una muteína de la misma. Véase, p.ej., GCG Versión 6.1. Las secuencias polipeptídicas también pueden compararse usando FASTA usando parámetros por defecto o recomendados, un programa en GCG Versión 6.1. FASTA (p.ej., FASTA2 y FASTA3) proporciona alineamientos y porcentaje de identidad de secuencias de las regiones con la mejor superposición entre secuencias de consulta y búsqueda (Pearson (2000) supra). Otro algoritmo preferente al comparar una secuencia de la divulgación con una base de datos que contiene una gran cantidad de secuencias de diferentes organismos es el programa informático BLAST, especialmente BLASTP o TBLASTN, usando parámetros por defecto. Véase, p.ej., Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-410 y Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-402.
Unión dependiente del pH
La presente divulgación incluye anticuerpos biespecíficos anti-CD3/anti-CD20, con características de unión dependientes del pH. Por ejemplo, un anticuerpo anti-CD3 de la presente divulgación puede exhibir una unión reducida a CD3 a pH ácido en comparación con pH neutro. Como alternativa, los anticuerpos anti-CD3 de la divulgación pueden exhibir una unión mejorada a CD3 a pH ácido en comparación con pH neutro. La expresión "pH ácido" incluye valores de pH inferiores a aproximadamente 6,2, p.ej., aproximadamente 6,0, 5,95, 5,9, 5,85, 5,8, 5,75, 5,7, 5,65, 5,6, 5,55, 5,5, 5,45, 5,4, 5,35, 5,3, 5,25, 5,2, 5,15, 5,1, 5,05, 5,0 o inferior. Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "pH neutro" significa un pH de aproximadamente 7,0 a aproximadamente 7,4. La expresión "pH neutro" incluye valores de pH de aproximadamente 7,0, 7,05, 7,1, 7,15, 7,2, 7,25, 7,3, 7,35 y 7,4.
En determinados casos, "unión reducida ... a pH ácido en comparación con pH neutro" se expresa en términos de una relación del valor Kd del anticuerpo que se une a su antígeno a pH ácido respecto al valor Kd del anticuerpo que se une a su antígeno a pH neutro (o viceversa). Por ejemplo, puede considerarse que un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo exhibe "unión reducida a CD3 a pH ácido en comparación con pH neutro" para fines de la presente divulgación si el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo exhibe una relación de Kd ácido/neutro de aproximadamente 3,0 o superior. En ciertos casos ejemplares, la relación de Kd ácido/neutro para un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de la presente divulgación puede ser aproximadamente 3,0, 3,5, 4,0, 4,5, 5.0, 5,5, 6,0, 6,5, 7,0, 7,5, 8,0, 8,5, 9,0, 9,5, 10,0, 10,5, 11,0, 11,5, 12,0, 12,5, 13,0, 13,5, 14,0, 14,5, 15,0, 20,0. 25,0, 30.0, 40,0, 50,0, 60,0, 70,0, 100,0 o superior.
Se pueden obtener anticuerpos con características de unión dependientes del pH, p.ej., rastreando una población de anticuerpos para la unión reducida (o potenciada) a un determinado antígeno a pH ácido en comparación con el pH neutro. Adicionalmente, las modificaciones del dominio de unión al antígeno a nivel de aminoácidos pueden producir anticuerpos con características dependientes del pH. Por ejemplo, mediante la sustitución de uno o más aminoácidos de un dominio de unión al antígeno (p.ej., dentro de una CDR) con un resto de histidina, puede obtenerse un anticuerpo con unión al antígeno reducida a pH ácido en relación con el pH neutro.
Unión al receptor Fc
Se proporcionan moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 y anticuerpos de la divulgación que comprenden un dominio Fc quimérico, como un dominio constante bisagra-CH2-CH3 de una cadena pesada de Ig, derivado de diferentes isotipos de IgG y con características únicas con respecto a unión y activación del receptor Fc. Ciertos dominios Fc de la divulgación están diseñados para comprender una bisagra quimérica.
El término "quimérico", tal como se utiliza en el presente documento, significa compuesto de partes de diferente origen. La expresión "proteína quimérica" incluye una primera proteína de aminoácidos unida a una segunda proteína de aminoácidos que normalmente no está unida en la naturaleza. Las secuencias de aminoácidos normalmente pueden existir como proteínas separadas o en una disposición diferente en la misma proteína, y se unen en un polipéptido de fusión en una nueva disposición. Las proteínas quiméricas pueden crearse mediante diversos métodos conocidos en la técnica, p.ej., mediante síntesis química o creando un polinucleótido que codifica los aminoácidos de la proteína quimérica en la disposición deseada. Las proteínas quiméricas ejemplares incluyen las secuencias bisagra quiméricas que conectan los dominios de cadena pesada de IgG, y las proteínas de fusión diseñadas para producir los anticuerpos humanos y proteínas de unión a antígeno de la presente divulgación.
Las proteínas quiméricas desveladas en este documento se diseñaron para minimizar la creación de epítopos inmunogénicos en las uniones, p.ej., en comparación con una región o dominio de IgG Fc de tipo silvestre. Por tanto, las proteínas modificadas genéticamente de la divulgación tienen una inmunogenicidad reducida y muestran una unión reducida a los receptores Fc, así como reducidas para funciones no efectoras.
El término "bisagra", tal como se utiliza en el presente documento, pretende incluir la región de estos de aminoácidos consecutivos que conectan el C-terminal del dominio Ch1 al N-terminal del dominio Ch2 de una inmunoglobulina. Varios aminoácidos del N-terminal del dominio Ch2, que están codificados por el exón Ch2, también se consideran parte de la "bisagra inferior". Sin estar unido a ninguna teoría, se han caracterizado aminoácidos de la región bisagra de IgG1, IgG2 e IgG4 que comprenden 12-15 aminoácidos consecutivos codificados por un exón de bisagra distinto y varios aminoácidos N-terminales del dominio Ch2 (codificados por el exón Ch2) (Brekke, O. H., et al. Immunology Today 16(2):85-90 (1995)). Por otro lado, IgG3 comprende una región bisagra que consta de cuatro segmentos: un segmento superior que se asemeja a la región bisagra de IgG1 y 3 segmentos que son repeticiones idénticas de aminoácidos exclusivas de IgG3.
El término "bisagra quimérica", tal como se utiliza en el presente documento, pretende incluir una proteína quimérica que comprende una primera secuencia de aminoácidos derivada de la región bisagra de una molécula de Ig y una segunda secuencia de aminoácidos derivada de la región bisagra de una clase o subclase diferente de molécula de Ig. Las bisagras quiméricas ejemplares de la presente divulgación comprenden una primera secuencia de aminoácidos, o una secuencia de "bisagra superior", derivada de una región bisagra de IgG1 humana o una región bisagra de IgG4 humana, y una segunda secuencia de aminoácidos, o una secuencia de "bisagra inferior', derivada de una región bisagra de IgG2 humana. En determinados casos, la primera secuencia o "bisagra superior' comprende restos de aminoácido de las posiciones 216 a 227 según la numeración EU. En algunos casos, la segunda secuencia o "bisagra inferior" comprende estos de aminoácido de las posiciones 228 a 236 según la numeración EU.
Para los fines de esta divulgación, una región "bisagra superior" pretende incluir restos de aminoácido de las posiciones 216 a 227 según la numeración EU (restos de aminoácido de las posiciones 226 a 240 según la numeración de Kabat) (ver Figura 1). Se pretende que una región "bisagra inferior" incluya restos de aminoácido de las posiciones 228 a 236 según la numeración EU (restos de aminoácido de las posiciones 241 a 249 según la numeración de Kabat) (ver Figura 1).
En la presente divulgación para la conveniencia del practicante de la invención, en este documento se han identificado aminoácidos de la región bisagra para IgG1, IgG2 e IgG4 humanas mediante el sistema de numeración EU de Kabat (Kabat, E.A. et al., Sequences of Proteins of Immunological interest. 5a ed. US Department of Health and Human Services, Publicación del NIH N.° 91-3242 (1991)), también conocida como "numeración EU" o "índice EU", como se actualizan según el Diagrama Científico del IMGT®, IMGT®, the international ImMunoGeneTics information system®, http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/Numbering/Hu_IGHGnber.html, creado: 17 de mayo de 2001, última actualización: 10 de enero de 2013.
La correspondencia entre la numeración EU para aminoácidos bisagra de IgG1, IgG2 e IgG4 humana, y la numeración del dominio único de IMGT, numeración de exón IMGT y convenciones de numeración de Kabat (ver también Kabat, E.A. et al., 1991, supra) se describen en las Tablas A a F como sigue:
T l A: N m r i n i r I 1
Figure imgf000023_0001
Figure imgf000024_0001
T l B: N m r i n i r mini I 1
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T l : N m r i n i r I 2
Figure imgf000024_0004
Figure imgf000024_0005
continuación
Figure imgf000024_0006
T l D: N m r i n i r mini I 2
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T l E: N m r i n i r I 4
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Figure imgf000025_0001
T l F: N m r i n i r mini I 4
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El término "unión" en el contexto de la unión de un anticuerpo, Ig, fragmento de unión a anticuerpo, o proteína que contiene Fc a cualquiera, p.ej., un antígeno predeterminado o para un FcyR, se refiere típicamente a una i nteracción o asociación entre un mínimo de dos entidades, o estructuras moleculares, como una interacción anticuerpo-antígeno, o una proteína que contiene Fc a un FcyR.
Por ejemplo, la afinidad de unión corresponde típicamente a un valor Kd de aproximadamente 10-7 M o inferior, como aproximadamente 10-8 M o inferior, como aproximada de 10-9 M o inferior cuando se determina mediante, por ejemplo, tecnología de resonancia de plasmón superficial (SPR) en un instrumento BIAcore 3000 que utiliza el antígeno o FcR como ligando y anticuerpo, Ig, fragmento de unión a anticuerpo o proteína que contiene Fc como analito (o antiligando). En consecuencia, el anticuerpo u otra proteína de unión se une al antígeno o receptor predeterminado con una afinidad correspondiente a un valor Kd que es al menos diez veces inferior, como al menos 100 veces inferior, por ejemplo al menos 1.000 veces inferior, como al menos 10.000 veces inferior, por ejemplo, al menos 100.000 veces inferior que su afinidad para unirse a un antígeno no específico (p.ej., BSA, caseína).
El término "Kd" (M), tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a la constante de equilibrio de disociación de una interacción anticuerpo-antígeno particular, o la constante de equilibrio de disociación de un anticuerpo, Ig, fragmento de unión a anticuerpo, o proteína que contiene Fc a un FcyR. Existe una relación inversa entre Kd y afinidad de unión, por tanto, cuanto menor es el valor Kd, mayor es la afinidad (es decir, más fuerte). Por tanto, las expresiones "afinidad mayor" o "afinidad más fuerte" se refieren a una mayor capacidad para formar una interacción y, por tanto, un valor Kd menor y, por el contrario, las expresiones "afinidad menor" o "afinidad más débil" se refieren a una menor capacidad para formar una interacción y, por tanto, un valor Kd mayor. En algunas circunstancias, una mayor afinidad de unión (o Kd) de una molécula particular (p.ej., anticuerpo) a su molécula asociada interactiva (p.ej., receptor X) en comparación con la afinidad de unión de la molécula (p.ej., anticuerpo) a otra molécula asociada interactiva (p.ej., receptor Y) puede expresarse como una relación de unión determinada dividiendo el valor KD más elevado (afinidad menor, o más débil) por el valor KD más bajo (afinidad mayor, o más fuerte), por ejemplo, expresada como afinidad de unión 5 veces o 10 veces superior, según sea el caso.
El término "kd" (s -1 o 1/s), tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a la constante de velocidad de disociación de una interacción anticuerpo-antígeno particular, o la constante de velocidad de disociación de un anticuerpo, Ig, fragmento de unión a anticuerpo, o proteína que contiene Fc a un FcyR. Dicho valor también se conoce como valor kd.
El término "ka"(M-1 x s-1 o 1/M), tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a la constante de velocidad de asociación de una interacción anticuerpo-antígeno particular, o la constante de velocidad de asociación de un anticuerpo, Ig, fragmento de unión a anticuerpo, o proteína que contiene Fc a un FcyR.
El término "Ka" (M-1 o 1/M), tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a la constante de equilibrio de asociación de una interacción anticuerpo-antígeno particular, o la constante de equilibrio de asociación de un anticuerpo, Ig, fragmento de unión a anticuerpo, o proteína que contiene Fc a un FcyR. La constante de equilibrio de asociación se obtiene dividiendo la ka entre la kd.
El término "CE50" o "CE50", tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a la concentración eficaz semimáxima, que incluye la concentración de un anticuerpo que induce una respuesta a medio camino entre el valor inicial y el máximo después de un tiempo de exposición específico. La CE50 representa esencialmente la concentración de un anticuerpo donde se observa el 50 % de su efecto máximo. Por tanto, se observa una unión reducida con un aumento de la CE50, o valor de concentración eficaz semimáxima.
En un caso, la unión disminuida puede definirse como un aumento de la concentración de anticuerpos CE50 que permite la unión a la cantidad semimáxima de células diana.
En algunos casos, la disminución de la actividad citotóxica, como ADCC o CDC, puede definirse como un aumento de la concentración de anticuerpos CE50 que permite la lisis de la cantidad semimáxima de células diana. La citotoxicidad también se mide como porcentaje de citotoxicidad, o porcentaje de lisis, que es la fracción de una población total de células observada como lisada en un ensayo de liberación de calceína o un ensayo equivalente. El porcentaje de citotoxicidad puede medirse como se describe en el Ejemplo 6.
En otros casos, la disminución de la proliferación puede definirse como un aumento de la concentración de anticuerpos CE50 que permite la proliferación de la cantidad semimáxima de células diana.
La expresión "funciones efectoras", tal como se utiliza en el presente documento, pretende incluir las capacidades funcionales impartidas por una proteína que contiene Fc al unirse a un FcyR. Sin quedar unido a ninguna teoría, la formación de un complejo Fc/FcyR recluta una variedad de células efectoras a sitios de antígeno unido, dando como resultado típicamente diversos sucesos de señalización dentro de las células e importantes respuestas inmunitarias posteriores.
Las proteínas de unión a antígeno que contienen Fc quimérico y anticuerpos de la divulgación muestran funciones efectoras alteradas o reducidas en comparación con las proteínas o anticuerpos de unión a antígeno que contienen Fc de tipo silvestre correspondientes. Véase, p.ej., Publicación PCT N.° WO 2014/121087, publicado el 07 de agosto, 2014.
En algunos casos, la función efectora que se reduce o altera es una función efectora citotóxica, p.ej., citotoxicidad, citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) o citotoxicidad dependiente de anticuerpos (ADCC). En un caso, la función efectora que se reduce o altera es citotoxicidad dependiente del complemento. En otro caso, la función efectora que se reduce o altera es citotoxicidad dependiente de anticuerpos. En otros casos, la función efectora que se reduce o altera es proliferación celular de las células diana.
Varias funciones efectoras de anticuerpos están mediadas, al menos en parte, por receptores Fc (FcR), que se unen a la región Fc de un anticuerpo en el dominio constante (específicamente, el dominio CH2 y CH3) de una inmunoglobulina típica. Hay varios receptores de Fc que son específicos para las diferentes clases de inmunoglobulinas, es decir, IgG, IgE, IgA, IgM y IgD. La familia del receptor Fc de IgG humana se divide en tres grupos: FcyRI (CD64), que puede unirse a IgG con alta afinidad, FcyRII (CD32) y FcyRIII (CD16), ambos receptores de baja afinidad. Cada subclase de FcyR está codificada por dos o tres genes, y el empalme de ARN alternativo conduce a múltiples transcripciones, por tanto, existe una amplia diversidad en las isoformas de FcyR (p.ej., FcyRIA (CD64; FCGR1A), FcyRIB (CD64; FCRG1B), FcyRIIA (CD32A; FCGR2A), FcyRIIB (CD32B; FCGR2B), FcyRIIC (CD32C; FCGR2C), FcyRIIIA (CD16a; FCGR3A), y FcyRIIIB (CD16b; FCg R3B)). Adicionalmente, el FcRn, o receptor de Fc neonatal (también conocido como el transportador del receptor Fc, alfa, o FCGRT) puede transferir anticuerpos IgG de la madre al feto a través de la placenta. Además, los receptores Fc se expresan en una variedad de células, incluyendo, p.ej., los linfocitos B, monocitos, células dendríticas, neutrófilos y ciertos linfocitos. Por ejemplo, las células U937, una línea celular de monocitos humanos, expresan tanto FcyRI como FcyRIIA (ver, p.ej., Jones, et al. J Immunol 135(5):3348-53 (1985); y Brooks, et al. J Exp Med 170:1369-85 (octubre 1989)). Cada receptor mencionado en este documento, incluye cualquier forma funcional conocida del receptor, incluyendo variantes de transcripción, isoformas y polimorfismos.
La unión de un Fc de Ig a su receptor lleva estas células efectoras a sitios del antígeno unido, resultando finalmente en una variedad de señalización y respuestas inmunitarias, incluyendo activación de linfocitos B, respuestas inflamatorias, respuestas citotóxicas, y respuestas fagocíticas. Como tal, la unión reducida o alterada de un Fc de Ig a su receptor puede dar como resultado funciones efectoras reducidas.
La expresión "fagocitosis celular dependiente de anticuerpos", o "ADCP", se relaciona con un efecto o función que elimina (o destruye) una célula diana al envolver la célula diana en lugar de inducir la citólisis. ADCP puede ser un importante mecanismo in vivo para destruir células tumorales. ADCP puede medirse mediante métodos de citometría de flujo de fluorescencia de dos colores, por ejemplo métodos que utilizan, p.ej., PKH2 (colorante fluorescente verde) y anticuerpos monoclonales conjugados con ficoeritrina (rojo) contra diferentes proteínas de la superficie celular para diferenciar las células de ensayo, determinando así la actividad fagocítica y la tasa de fagocitosis. Las medidas de ADCP se conocen bien en la técnica. Las estrategias terapéuticas que activan selectivamente FcYRIla respecto a FcYRIIb pueden mejorar la actividad fagocítica de los macrófagos (Richards, JO, et al. 2008 Mol Cancer Ther 7(8):2517-27). Las proteínas quiméricas que se unen al antígeno que contienen Fc y los anticuerpos de la divulgación se unen y activan FcyRIIA humano. En determinadas circunstancias, las proteínas de unión a antígeno y anticuerpos de la divulgación se unen a FcyRIIA humano con mayor afinidad de unión que los anticuerpos a FcyRIIB. En algunos casos, el anticuerpo exhibe afinidad de unión Kd a FcyRIIA humano más de aproximadamente 5 veces superior que su afinidad de unión Kd a FcyRIIB humano. En otros casos, el anticuerpo exhibe afinidad de unión Kd a FcyRIIA humano superior a aproximadamente 6-, 7-, 8-, 9-, 10-, 11-, 12-, 13-, 14-, 15-, 16-, 17-, 18-, 19-, o 20veces superior a su afinidad de unión Kd FcyRIIB humano.
Características biológicas de los anticuerpos y moléculas de unión a antígeno biespecíficas
La presente divulgación incluye anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen a CD3 y CD20 humanos. Por ejemplo, la presente divulgación incluye anticuerpos anti-CD3xCD20 que se unen a células de Jurkat (CD3+) y células de Raji (CD20+) con un valor CE50 inferior a aproximadamente 60 nM, medido mediante un ensayo de unión in vitro, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 3 en este documento (p.ej., evaluando la unión de células de Jurkat o células de Raji a los anticuerpos CD3xCD20), o un ensayo sustancialmente similar. En determinados casos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de la presente divulgación se unen a CD3 o CD20 en la superficie de la célula (p.ej., célula de Jurkat y/o célula de Raji) con un valor CE50 inferior a aproximadamente 75 nM, menos de aproximadamente 70 nM, menos de aproximadamente 65 nM, menos de aproximadamente 60 nM, menos de aproximadamente 50 nM, menos de aproximadamente 40 nM, menos de aproximadamente 30 nM, o menos de aproximadamente 25 nM, medido mediante un ensayo de unión in vitro, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 4 en este documento, o un ensayo sustancialmente similar.
La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas (p.ej., anticuerpos biespecíficos) que pueden unirse simultáneamente a CD3 humano y CD20 humano. Según determinados casos, Las moléculas de unión a antígeno biespecíficas interactúan específicamente con las células que expresan CD3 y/o CD20. El grado en que una molécula de unión a antígeno biespecífica se une a células que expresan CD3 y/o CD20 puede evaluarse mediante clasificación celular activada por fluorescencia (FACS), como se ilustra en el Ejemplo 4 en este documento. Por ejemplo, la presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas que se unen específicamente a líneas de linfocitos T humanos que expresan CD3 (p.ej., Jurkat), líneas de células p humanas que expresan CD20 (p.ej., Raji) y linfocitos T de primate (p.ej., células mononucleares de sangre periférica de cinomolgos [PBMC]). La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas que se unen a cualquiera de las células y líneas celulares mencionadas anteriormente con un valor CE50 de aproximadamente 8,74 x10'6 a aproximadamente 5,99 x 10'8, o inferior, como se determina usando un ensayo FACS como se expone en el Ejemplo 4 o un ensayo sustancialmente similar.
La presente divulgación incluye anticuerpos biespecíficos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen a CD3 humano con alta afinidad. La presente divulgación también incluye anticuerpos biespecíficos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen a CD3 humano con afinidad media o baja, dependiendo del contexto terapéutico y las propiedades de direccionamiento particulares que se deseen. Por ejemplo, en el contexto de una molécula de unión a antígeno biespecífica, en donde un grupo se une a CD3 y otro grupo se une a un antígeno / (p.ej., CD20), puede ser deseable que el grupo de unión a antígeno diana se una al antígeno diana con alta afinidad mientras que el grupo anti-CD3 se une a CD3 solo con afinidad moderada o baja. De esta manera, puede conseguirse la orientación preferente de la molécula de unión a antígeno a células que expresan el antígeno diana mientras se evita la unión de CD3 general/no dirigida y los consiguientes efectos secundarios adversos asociados con ella.
La presente divulgación también incluye anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen a CD3 humano e inducen la destrucción de células tumorales mediada por linfocitos T. Por ejemplo, la presente divulgación incluye anticuerpos anti-CD3xCD20 que inducen la destrucción de células tumorales mediada por linfocitos T con una CE50 inferior a aproximadamente 60 pM, medido en un ensayo de destrucción de células tumorales in vitro mediado por linfocitos T, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 5 en este documento (p.ej., evaluando el alcance de la muerte de células tumorales Raji por PBMC humanas en presencia de anticuerpos anti-CD3), o un ensayo sustancialmente similar. En determinados casos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de la presente divulgación inducen la muerte de células tumorales mediada por linfocitos T (p.ej., destrucción de células de Raji mediada por PBMC) con un valor CE50 inferior a aproximadamente 56 pM, inferior a aproximadamente 50 pM, inferior a aproximadamente 45 pM, inferior a aproximadamente 40 pM, inferior a aproximadamente 35 pM, inferior a aproximadamente 30 pM, inferior a aproximadamente 25 pM, inferior a aproximadamente 20 pM, inferior a aproximadamente 15 pM, inferior a aproximadamente 10 pM, inferior a aproximadamente 5 pM, o inferior a aproximadamente 1 pM, medido por un ensayo de destrucción de células tumorales in vitro mediado por linfocitos T, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 5 en este documento, o un ensayo sustancialmente similar.
La presente divulgación también incluye anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen a CD3/CD20 humano e inducen citotoxicidad dependiente del complemento (CDC), aunque en menor medida que los anticuerpos que tienen un dominio Fc de IgG de tipo silvestre. Por ejemplo, la presente divulgación incluye anticuerpos anti-CD3xCD20 que inducen la muerte por CDC de células de Raji o Daudi (que expresan CD20) con un porcentaje de citotoxicidad (% de citotoxicidad) inferior a aproximadamente 50 %, medido en un ensayo de destrucción de células tumorales in vitro mediado por linfocitos T, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 6 en este documento (p.ej., evaluando el grado de destrucción de células diana (Raji o Daudi) en presencia de anticuerpos complementarios y anti-CD3xCD20), o un ensayo sustancialmente similar. En determinados casos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno inducen la destrucción de células CDC (p.ej., muerte mediada por complemento de células de Raji o Daudi) con un porcentaje de citotoxicidad inferior a aproximadamente el 45 %, inferior a aproximadamente el 40 %, inferior a aproximadamente el 35 %, inferior a aproximadamente el 30 %, inferior a aproximadamente el 25 %, inferior a aproximadamente el 20 %, inferior a aproximadamente el 15 %, inferior a aproximadamente el 10 %, inferior a aproximadamente el 5 %, inferior a aproximadamente el 1 %, inferior a la citotoxicidad de fondo, o no hay citotoxicidad detectable medida por un ensayo de destrucción celular in vitro mediado por complemento, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 6 en este documento, o un ensayo sustancialmente similar.
La presente divulgación también incluye anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen a CD3/CD20 humano que no inducen significativamente citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC) en comparación con los anticuerpos que tienen un dominio Fc de IgG de tipo silvestre. Por ejemplo, la presente divulgación incluye anticuerpos anti-CD3xCD20 sin destrucción apreciable de células de Raji o Daudi (que expresan CD20) con un porcentaje de citotoxicidad (% de citotoxicidad) inferior a aproximadamente 20 % (o inferior a la citotoxicidad de fondo), medido en un ensayo de destrucción celular in vitro mediada por linfocitos NK, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 7 en este documento (p.ej., evaluando el grado de destrucción de células diana (Raji o Daudi) en presencia de linfocitos NK y anticuerpos anti-CD3xCD20), o un ensayo sustancialmente similar. Los ensayos sustancialmente similares pueden incluir la presencia de linfocitos NK, macrófagos, neutrófilos, eosinófilos u otras células que expresan FcyRIII, incluyendo células que expresan FcyRIII variante. En determinados casos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno no muestran actividad ADCC detectable (p.ej., destrucción de células de Raji o Daudi mediada por linfocitos NK o FcyRIII) con un porcentaje de citotoxicidad inferior a aproximadamente el 30 %, inferior a aproximadamente el 25 %, inferior a aproximadamente el 20 %, inferior a aproximadamente el 15 %, inferior a aproximadamente el 10 %, inferior a aproximadamente el 5 %, inferior a aproximadamente el 1 %, inferior a la citotoxicidad de fondo, o sin actividad citotóxica detectable medida por un ensayo de destrucción celular in vitro mediado por FcyRIII, p.ej., usando el formato de ensayo como se define en el Ejemplo 7 en este documento, o un ensayo sustancialmente similar.
Según determinados casos, la presente divulgación incluye anticuerpos y fragmentos de anticuerpo que se unen a antígenos que se unen a FcyRIIA humano (p.ej., a 25 °C) con una Kd inferior a aproximadamente 23,5 pM medido por resonancia de plasmón superficial, p.ej., usando un formato de ensayo como se define en el Ejemplo 8 en este documento. En determinados casos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de la presente divulgación se unen a FcyRIIA con una Kd inferior a aproximadamente 20,5 pM, inferior a aproximadamente 20 pM, inferior a aproximadamente 19,3 pM, inferior a aproximadamente 18 pM, inferior a aproximadamente 17 pM, inferior a aproximadamente 16 pM, inferior a aproximadamente 15 pM, inferior a aproximadamente 10 pM, inferior a aproximadamente 9 pM, inferior a aproximadamente 8 pM, inferior a aproximadamente 7 pM, inferior a aproximadamente 6 pM, inferior a aproximadamente 5 pM, inferior a aproximadamente 4 pM, inferior a aproximadamente 3 pM, inferior a aproximadamente 2 pM, inferior a aproximadamente 1 pM, menos de aproximadamente 900 nM, menos de aproximadamente 800 nM, o menos de aproximadamente 700 nM, tal como se mide mediante resonancia de plasmón superficial, p.ej., usando un formato de ensayo como se define en el Ejemplo 8 en este documento (p.ej., formato de captura de mAb o captura de antígeno), o un ensayo sustancialmente similar.
Según determinados casos, la presente divulgación incluye anticuerpos y fragmentos de anticuerpo que se unen a antígenos que se unen a FcyRIIB humano (p.ej., a 25 °C) con una Kd inferior a aproximadamente 233 pM medido por resonancia de plasmón superficial, p.ej., usando un formato de ensayo como se define en el Ejemplo 8 en este documento. En determinados casos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno se unen a FcyRIIB con una Kd inferior a aproximadamente 200 pM, inferior a aproximadamente 190 pM, inferior a aproximadamente 180 pM, inferior a aproximadamente 170 pM, inferior a aproximadamente 160 pM, inferior a aproximadamente 150 pM, inferior a aproximadamente 140 pM, inferior a aproximadamente 130 pM, inferior a aproximadamente 125 pM, inferior a aproximadamente 123 pM, inferior a aproximadamente 120 pM, inferior a aproximadamente 110 pM, inferior a aproximadamente 100 pM, inferior a aproximadamente 90 pM, inferior a aproximadamente 80 pM, inferior a aproximadamente 70 pM, inferior a aproximadamente 60 pM, inferior a aproximadamente 50 pM, o inferior a aproximadamente 40 pM, tal como se mide mediante resonancia de plasmón superficial, p.ej., usando un formato de ensayo como se define en el Ejemplo 8 en este documento (p.ej., formato de captura de mAb o captura de antígeno), o un ensayo sustancialmente similar.
La presente divulgación también incluye anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen a CD3xCD20 con una semivida disociativa (t1^ ) superior a aproximadamente 8 días, medida por resonancia de plasmón superficial a 25 °C o 37 °C, p.ej., usando un formato de ensayo como se define en el Ejemplo 9 en este documento, o un ensayo sustancialmente similar. En determinados casos, los anticuerpos exhiben un t 1^ superior a aproximadamente 5 días, superior a 6 días, superior a aproximadamente 7 días, superior a aproximadamente 8 días, superior a aproximadamente 9 días, superior a aproximadamente 10 días, superior a aproximadamente 11 días, superior a aproximadamente 12 días, superior a aproximadamente 13 días, superior a aproximadamente 14 días, superior a aproximadamente 15 días, o superior a aproximadamente 20 días, medido por resonancia de plasmón superficial a 25 °C o 37 °C, p.ej., usando un formato de ensayo como se define en el Ejemplo 9 en este documento (p.ej., formato de captura de mAb o captura de antígeno), o un ensayo sustancialmente similar.
La presente divulgación también incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 que no exhiben actividad sustancial en uno o más ensayos seleccionados del grupo que consiste en: (a) inducir la proliferación de PBMC in vitro; (b) citotoxicidad CDC (ver, p.ej., Ejemplo 6 en este documento); (d) ADCC (ver, p.ej., Ejemplo 7 en este documento).
La presente divulgación también incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 que exhiben actividad sustancial en uno o más ensayos seleccionados del grupo que consiste en: (a) empobrecimiento de linfocitos B (p.ej., linfocitos B CD45+/CD20+) en monos cinomolgos (véase, p.ej., Ejemplos 10 y 11 en este documento); (b) disminución del volumen del tumor de linfocitos B (p.ej., volumen del tumor Raji) en modelos de ratones inmunodeficientes (ver, p.ej., Ejemplo 12A); y (c) regresión de tumores en modelos de ratón con tumores establecidos (ver, p.ej., Ejemplo 12B).
La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 que pueden empobrecer los linfocitos B en un sujeto (ver, p.ej., Ejemplo 10). Por ejemplo, según determinados casos, se proporcionan moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20, en donde una administración única de la molécula de unión a antígeno biespecífica a un sujeto (p.ej., a una dosis de aproximadamente 1 mg/kg, de aproximadamente 0,9 mg/kg, de aproximadamente 0,8 mg/kg, de aproximadamente 0,7 mg/kg, de aproximadamente 0,6 mg/kg, de aproximadamente 0,5 mg/kg, de aproximadamente 0,4 mg/kg, de aproximadamente 0,3 mg/kg, de aproximadamente 0,2 mg/kg, aproximadamente 0,1 mg/kg, aproximadamente 0,08 mg/kg, aproximadamente 0,06 mg/kg aproximadamente 0,04 mg/kg, aproximadamente 0,03 mg/kg, aproximadamente 0,02 mg/kg, aproximadamente 0,01 mg/kg, o inferior) provoca una reducción del número de linfocitos B en el sujeto (p.ej., en una muestra de sangre tomada del sujeto) por debajo de los niveles detectables. En determinados casos, una administración única de la molécula de unión al antígeno biespecífico anti-CD3/anti-CD20 a una dosis de aproximadamente 0,1 mg/kg provoca una reducción del número de linfocitos B en el sujeto por debajo de los niveles detectables aproximadamente hacia el día 7, hacia el día 6, hacia el día 5, hacia el día 4, hacia el día 3, aproximadamente el día 2, o aproximadamente el día 1 después de la administración de la molécula de unión a antígeno biespecífica al sujeto. Según determinados casos, una administración única de una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 de la divulgación, a una dosis de aproximadamente 0,01 mg/kg, hace que el número de linfocitos B permanezca por debajo de niveles detectables hasta al menos aproximadamente 7 días, 8 días, 9 días, 10 días, 11 días, 12 días, 13 días, 14 días, 15 días, 16 días, 17 días o más, después de la administración. Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "por debajo de los niveles detectables" significa que no pueden detectarse linfocitos B directamente o indirectamente en una muestra de sangre extraída de un sujeto utilizando ensayos estándar de detección de linfocitos B, p.ej., un ensayo FACS para marcadores de linfocitos B, como se establece en el Ejemplo 10, en el presente documento.
Como alternativa, se dispone un solo, la primera dosis se administra a una dosis baja, como 10 pg, o 30 pg, o 100 pg, y luego, después de un periodo de tiempo, se administra una segunda dosis a una dosis más alta, como dos o tres veces mayor que la primera dosis, a fin de evitar, reducir o mejorar la tormenta de citoquinas en un paciente. Reducir la "tormenta de citoquinas" en un paciente se refiere a reducir el efecto de una cascada de citoquinas o hipercitoquinas, en donde dicha reacción inmunitaria negativa puede ser causada por, pero no se limita a, un circuito de retroalimentación positiva entre citoquinas y glóbulos blancos, y/o niveles muy elevados de varias citoquinas.
El anticuerpo biespecífico proporcionado para uso en la presente invención se proporciona para uso en un método para tratar o mejorar el cáncer de linfocitos B en un sujeto, que comprende administrar un protocolo de aumento de dosis que reduce el efecto de una cascada de citoquinas, en donde el protocolo de aumento de dosis comprende administrar una primera dosis del anticuerpo durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis.
Según el Ejemplo 20, en el presente documento, se administra una primera dosis (inicial) de la molécula de unión a antígeno biespecífica de la divulgación (p.ej., Ab 1), seguido de una segunda dosis posterior después de un periodo de tiempo, en donde la segunda dosis supera (es mayor que) la primera dosis. En algunos casos, la segunda dosis es aproximadamente 2 veces mayor o aproximadamente 3 veces mayor que la primera dosis. En otro caso, la molécula de unión a antígeno biespecífica se administra a la primera dosis semanalmente durante semanas consecutivas, como cuatro (4) semanas consecutivas. En otro caso, la primera dosis se administra semanalmente seguido de dosis mensuales durante un periodo de tiempo adicional (o un número designado de dosis mensuales). En algunos casos, siguiendo el régimen de dosificación designado para la primera dosis, la segunda dosis se administra semanalmente seguido de dosis mensuales durante un periodo de tiempo adicional. En algunos casos, la primera dosis (inicial) es de 10 pg y la segunda dosis es de 30 pg. En algunos casos, la primera dosis (inicial) es de 30 pg y la segunda dosis es de 100 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 100 pg y la segunda dosis es de 300 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 300 pg y la segunda dosis es de 100 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 1000 pg y la segunda dosis es de 2000 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 2000 pg y la segunda dosis es de 3000 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 3000 pg y la segunda dosis es de 4000 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 4000 pg y la segunda dosis es de 5000 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 5000 pg y la segunda dosis es de 6000 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 6000 pg y la segunda dosis es de 7000 pg. En otros casos, la primera dosis (inicial) es de 7000 pg y la segunda dosis es de 8000 pg.
La presente divulgación también proporciona moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 que, cuando se administran a un sujeto, no causan más que una disminución transitoria de linfocitos T. Por ejemplo, se proporcionan moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 que, cuando se administran a un sujeto a una dosis de aproximadamente 0,01 mg/kg, o aproximadamente 0,1 mg/kg, o aproximadamente 1 mg/kg hace que el número de linfocitos T disminuya el día 1 después de la administración, pero en donde el número de linfocitos T por microlitro de sangre rebota en momentos posteriores (p.ej., aproximadamente el día 2, día 4, día 7, día 14, día 28 o posterior a la administración). Por ejemplo, la presente divulgación proporciona una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20, en donde el número de linfocitos T por microlitro de sangre extraída del sujeto en aproximadamente el día 4 hasta aproximadamente el día 7 después de la administración de la molécula de unión al antígeno al sujeto a una dosis de aproximadamente 0,01 mg/kg o aproximadamente 0,1 mg/kg, o aproximadamente 1 mg/kg es igual o mayor que el número de linfocitos T por microlitro de sangre extraída del sujeto antes de la administración de la molécula de unión a antígeno biespecífica, como se detecta mediante ensayos estándar de detección de linfocitos T, p.ej., un ensayo FACS para marcadores de linfocitos T, como se establece en el Ejemplo 10, en el presente documento.
Mapeo de epítopos y tecnologías relacionadas
El epítopo en CD3 o en CD20 al que se unen las moléculas de unión a antígeno de la presente divulgación puede consistir en una única secuencia contigua de 3 o más (p.ej., 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 o más) aminoácidos de una proteína CD3. Como alternativa, el epítopo puede consistir en una pluralidad de aminoácidos no contiguos (o secuencias de aminoácidos) de CD3 o c D20. Los anticuerpos de la divulgación pueden interactuar con aminoácidos contenidos dentro de una sola cadena CD3 (p.ej., CD3-épsilon, CD3-delta o CD3-gamma), o pueden interactuar con aminoácidos en dos o más cadenas CD3 diferentes. El término "epítopo", tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a un determinante antigénico que interactúa con un sitio de unión a antígeno específico en la región variable de una molécula de anticuerpo conocida como parátopo. Un único antígeno puede tener más de un epítopo. Por tanto, diferentes anticuerpos pueden unirse a diferentes áreas en un antígeno o puede tener diferentes efectos biológicos. Los epítopos pueden ser conformacionales o lineales. Un epítopo conformacional se produce por yuxtaposición espacial de aminoácidos de diferentes segmentos de la cadena de polipéptido lineal. Un epítopo lineal es uno producido por restos de aminoácidos adyacentes en una cadena polipeptídica. En determinadas circunstancias, un epítopo puede incluir restos de sacáridos, grupos fosforilo o grupos sulfonilo en el antígeno.
Para determinar si un dominio de unión a antígeno de un anticuerpo "interactúa con uno o más aminoácidos" dentro de un polipéptido o proteína pueden usarse diversas técnicas conocidas por los expertos en la materia. Las técnicas ejemplares incluyen, p.ej., ensayo de bloqueo cruzado rutinario tal como el descrito en Antibodies, Harlow y Lane (Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harb., NY), análisis mutacional de barrido con alanina, análisis de transferencias de péptidos (Reineke, 2004, Methods Mol Biol 248:443-463), y análisis de escisión de péptidos. Además, pueden emplearse métodos tales como escisión de epítopos, extracción de epítopos y modificación química de antígenos (Tomer, 2000, Protein Science 9:487-496). Otro método que puede usarse para identificar los aminoácidos dentro de un polipéptido con el que interactúa un dominio de unión a antígeno de un anticuerpo es el intercambio de hidrógeno/deuterio detectado por espectrometría de masas. En términos generales, el método de intercambio hidrógeno/deuterio implica el marcaje con deuterio de la proteína de interés, seguido de la unión del anticuerpo a la proteína marcada con deuterio. A continuación, el complejo de proteína/anticuerpo se transfiere a agua para permitir que tenga lugar el intercambio de hidrógeno-deuterio en todos los restos excepto los restos protegidos por el anticuerpo (que permanecen marcados con deuterio). Después de la disociación del anticuerpo, la proteína diana se somete a escisión por proteasa y análisis de espectrometría de masas, revelando de esta manera los restos marcados con deuterio que corresponden a los aminoácidos específicos con los que interacciona el anticuerpo. Véase, p.ej., Ehring (1999) Analytical Biochemistry 267(2):252-259; Engen y Smith (2001) Anal. Chem. 73:256A-265A. Para fines de mapeo de epítopos también puede usarse cristalografía de rayos X del complejo antígeno/anticuerpo.
La presente divulgación incluye además anticuerpos anti-CD3 que se unen al mismo epítopo que cualquiera de los anticuerpos ejemplares específicos descritos en este documento (p.ej., anticuerpos que comprenden cualquiera de las secuencias de aminoácidos como se establece en la Tabla 1 en este documento). De manera análoga, la presente divulgación también incluye anticuerpos anti-CD3 que compiten por unirse a CD3 con cualquiera de los anticuerpos ejemplares específicos descritos en este documento (p.ej., anticuerpos que comprenden cualquiera de las secuencias de aminoácidos como se establece en la Tabla 1 en este documento).
La presente divulgación también incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas que comprenden un primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 humano, y un segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 humano, en donde el primer dominio de unión a antígeno se une al mismo epítopo en CD3 como un dominio de unión a antígeno específico de CD3 ejemplar descrito en este documento, y/o en donde el segundo dominio de unión a antígeno se une al mismo epítopo en CD20 como un dominio de unión a antígeno específico de CD20 ejemplar descrito en este documento.
De manera análoga, la presente Divulgación también incluye moléculas de unión a antígeno biespecíficas que comprenden un primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 humano, y un segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 humano, en donde el primer dominio de unión a antígeno compite por unirse a CD3 con cualquiera de los dominios de unión a antígeno específicos de CD3 ejemplares descritos en este documento, y/o en donde el segundo dominio de unión a antígeno compite por unirse a CD20 con cualquiera de los dominios de unión a antígeno específicos de CD20 ejemplares descritos en el presente documento.
Puede determinarse fácilmente si una molécula de unión a antígeno particular (p.ej., un anticuerpo) o un dominio de unión a antígeno de la misma se une al mismo epítopo o si compite por unirse a, una molécula de unión a antígeno de referencia de la presente divulgación usando métodos de rutina conocidos en la técnica. Por ejemplo, para determinar si un anticuerpo de ensayo se une al mismo epítopo en CD3 (o CD20) como una molécula de unión a antígeno biespecífica de referencia de la presente divulgación, primero se permite la unión de una molécula biespecífica de referencia a una proteína CD3 (o proteína CD20). A continuación, se evalúa la capacidad de un anticuerpo de ensayo para unirse a la molécula CD3 (o CD20). Si el anticuerpo de ensayo puede unirse a CD3 (o CD20) después de unión de saturación con la molécula de unión a antígeno biespecífica de referencia, puede concluirse que el anticuerpo de ensayo se une a un epítopo diferente de CD3 (o CD20) que la molécula de unión a antígeno biespecífica de referencia. Por otro lado, si el anticuerpo de ensayo no puede unirse a la molécula CD3 (o CD20) después de unión de saturación con la molécula de unión a antígeno biespecífica de referencia, entonces el anticuerpo de ensayo puede unirse al mismo epítopo de CD3 (o CD20) que el epítopo unido por la molécula de unión a antígeno biespecífica de referencia de la divulgación. Después puede realizarse una experimentación de rutina adicional (p.ej., análisis de mutación de péptidos y unión peptídica) para confirmar si la falta observada de unión del anticuerpo de ensayo se debe realmente a la unión al mismo epítopo que la molécula de unión a antígeno biespecífica de referencia o si el bloqueo estérico (u otro fenómeno) es responsable de la falta de unión observada. Los experimentos de este tipo pueden realizarse usando ELISA, RIA, Biacore, citometría de flujo o cualquier otro ensayo cuantitativo o cualitativo de unión de anticuerpos disponible en la técnica. Según ciertos casos de la presente divulgación, dos proteínas de unión a antígeno se unen al mismo epítopo (o superpuesto) si, p.ej., un exceso en un factor de 1, 5-, 10-, 20 o 100 veces de una proteína de unión a antígeno inhibe la unión de la otra en al menos un 50 %, pero preferentemente un 75 %, 90 % o incluso un 99 %, medida en un ensayo de unión competitiva (véase, p.ej., Junghans et al., Cancer Res. 1990:50:1495-1502). Como alternativa, se considera que dos proteínas de unión a antígeno se unen al mismo epítopo si esencialmente todas las mutaciones de aminoácidos en el antígeno que reducen o eliminan la unión de una proteína de unión a antígeno reducen o eliminan la unión de la otra. Se considera que dos proteínas de unión a antígeno tienen "epítopos superpuestos" si solo un subconjunto de las mutaciones de aminoácidos que reducen o eliminan la unión de una proteína de unión a antígeno reduce o elimina la unión de la otra.
Para determinar si un anticuerpo o dominio de unión a antígeno del mismo compite por unirse con una molécula de unión a antígeno de referencia, se realiza la metodología de unión descrita anteriormente en dos orientaciones: En una primera orientación, se permite que la molécula de unión al antígeno de referencia se una a una proteína CD3 (o proteína CD20) en condiciones de saturación, seguido de evaluación de la unión del anticuerpo de ensayo a la molécula CD3 (o CD20). En una segunda orientación, se permite que el anticuerpo de ensayo se una a una molécula CD3 (o CD20) en condiciones de saturación seguido de una evaluación de la unión de la molécula de unión al antígeno de referencia a la molécula CD3 (o CD20). Si, en ambas orientaciones, solo la primera molécula de unión al antígeno (saturante) es capaz de unirse a la molécula CD3 (o CD20), entonces se concluye que el anticuerpo de ensayo y la molécula de unión a antígeno de referencia compiten por unirse al CD3 (o CD20). Como apreciará un experto en la materia, un anticuerpo que compite por unirse con una molécula de unión a antígeno de referencia no necesariamente se une al mismo epítopo que el anticuerpo de referencia, sino que puede bloquear estéricamente la unión del anticuerpo de referencia mediante la unión a un epítopo solapante o adyacente.
Preparación de dominios de unión a antígeno y construcción de moléculas biespecíficas
Los dominios de unión a antígeno específicos para antígenos particulares pueden prepararse mediante cualquier tecnología generadora de anticuerpos conocida en la técnica. Una vez obtenidas, dos dominios de unión a antígeno diferentes, específicos para dos antígenos diferentes (p.ej., CD3 y CD20), pueden disponerse apropiadamente uno con respecto al otro para producir una molécula de unión a antígeno biespecífica de la presente divulgación usando métodos de rutina. (Una discusión de formatos de anticuerpos biespecíficos ejemplares que pueden usarse para construir las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la presente divulgación se proporciona en otras partes del presente documento). En determinados casos, uno o más de los componentes individuales (p.ej., cadenas pesadas y ligeras) de las moléculas de unión a antígeno multiespecíficas de la divulgación se derivan de anticuerpos quiméricos, humanizados o completamente humanos. Los métodos para fabricar tales anticuerpos se conocen bien en la técnica. Por ejemplo, una o más de las cadenas pesadas y/o ligeras de las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la presente divulgación pueden prepararse usando la tecnología VELOCIMMUNE™. Usando la tecnología VELOCIMMUNE™ (o cualquier otra tecnología de generación de anticuerpos humanos), los anticuerpos quiméricos de alta afinidad contra un antígeno particular (p.ej., CD3 o CD20) se aislan inicialmente con una región variable humana y una región constante de ratón. Los anticuerpos se caracterizan y seleccionan por características deseables, entre las que se incluyen la afinidad, selectividad, epítopo, etc. Las regiones constantes de ratón se reemplazan con una región constante humana deseada para generar cadenas pesadas y/o ligeras completamente humanas que pueden incorporarse en las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la presente divulgación.
Los animales genéticamente modificados pueden usarse para hacer moléculas de unión a antígeno biespecíficas humanas. Por ejemplo, puede usarse un ratón genéticamente modificado que es incapaz de reorganizar y expresar una secuencia variable de cadena ligera de inmunoglobulina endógena de ratón, en donde el ratón expresa solo uno o dos dominios variables de cadena ligera humana codificados por secuencias de inmunoglobulina humana unidas operativamente al gen constante kappa de ratón en el locus kappa de ratón endógeno. Tales ratones genéticamente modificados pueden usarse para producir moléculas de unión a antígeno biespecíficas completamente humanas que comprenden dos cadenas pesadas diferentes que se asocian con una cadena ligera idéntica que comprende un dominio variable derivado de uno de dos segmentos de genes de región variable de cadena ligera humana diferentes. (Véase, p.ej., US 2011/0195454 para una discusión detallada de tales ratones diseñados y su uso para producir moléculas de unión a antígeno biespecíficas).
Bioequivalentes
La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno que tienen secuencias de aminoácidos que varían de las de las moléculas ejemplares desveladas en este documento pero que retienen la capacidad de unirse a CD3 y/o CD20. Tales moléculas variantes pueden comprender una o más adiciones, eliminaciones o sustituciones de aminoácidos cuando se comparan con la secuencia precursora, pero exhiben actividad biológica que es esencialmente equivalente a la de las moléculas de unión a antígeno biespecíficas descritas.
La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno que son bioequivalentes a cualquiera de las moléculas de unión a antígeno ejemplares expuestas en este documento. Dos proteínas de unión a antígeno, o anticuerpos, se consideran bioequivalentes si, por ejemplo, son equivalentes farmacéuticos o alternativas farmacéuticas cuya tasa y grado de absorción no muestran una diferencia significativa cuando se administran a la misma dosis molar en condiciones experimentales similares, en una sola dosis o en múltiples dosis. Algunas proteínas de unión a antígeno se considerarán equivalentes o alternativas farmacéuticas si son equivalentes en el grado de su absorción pero no en su tasa de absorción y, sin embargo, pueden considerarse bioequivalentes porque tales diferencias en la tasa de absorción son intencionales y se reflejan en el marcado, no son esenciales para obtener las concentraciones eficaces del fármaco en el organismo en, p.ej., el uso crónico, y se consideran médicamente insignificantes para el producto farmacológico particular estudiado.
En un caso, dos proteínas de unión a antígeno son bioequivalentes si no hay diferencias clínicamente importantes en su seguridad, pureza y potencia.
En un caso, dos proteínas de unión a antígeno son bioequivalentes si un paciente puede cambiarse una o más veces entre el producto de referencia y el producto biológico sin un aumento esperado en el riesgo de efectos adversos, incluyendo un cambio clínicamente significativo en la inmunogenicidad, o eficacia disminuida, en comparación con la terapia continuada sin dicho cambio.
En un caso, dos proteínas de unión a antígeno son bioequivalentes si ambas actúan por un mecanismo o mecanismos comunes de acción para la afección o afecciones de uso, en la medida en que dichos mecanismos sean conocidos.
La bioequivalencia puede demostrarse por métodos in vivo e in vitro. Las medidas de bioequivalencia incluyen, p.ej., (a) un ensayo in vivo en seres humanos u otros mamíferos, en donde se mide la concentración del anticuerpo o sus metabolitos en sangre, plasma, suero u otro líquido biológico como una función del tiempo; (b) un ensayo in vitro que se ha correlacionado con y es razonablemente predictivo de datos de biodisponibilidad in vivo en seres humanos; (c) un ensayo in vivo en seres humanos u otros mamíferos en donde se mide el efecto farmacológico agudo apropiado del anticuerpo (o su diana) como una función del tiempo; y (d) en un ensayo clínico bien controlado que establece la seguridad, eficacia, biodisponibilidad o bioequivalencia de una proteína de unión a antígeno.
Las variantes bioequivalentes de las moléculas de unión a antígeno biespecíficas ejemplares expuestas en este documento pueden construirse mediante, por ejemplo, generando diversas sustituciones de restos o secuencias o eliminando restos terminales o internos o secuencias no necesarias para la actividad biológica. Por ejemplo, pueden eliminarse restos de cisteína no esenciales para la actividad biológica, o remplazarse con otros aminoácidos, para evitar la formación de puentes disulfuro intramoleculares innecesarios o incorrectos tras la renaturalización. En otros contextos, las proteínas de unión a antígeno bioequivalentes pueden incluir variantes de las moléculas de unión a antígeno biespecíficas ejemplares expuestas en este documento que comprenden cambios de aminoácidos que modifican las características de glicosilación de las moléculas, p.ej., mutaciones que eliminan o retiran la glicosilación.
Selectividad de especie y reactividad cruzada de especie
Según ciertos casos de la divulgación, se proporcionan moléculas de unión a antígeno que se unen al CD3 humano pero no al CD3 de otras especies. También se proporcionan moléculas de unión a antígeno que se unen al CD20 humano pero no al CD20 de otras especies. La presente divulgación también incluye moléculas de unión a antígeno que se unen a CD3 humano y a CD3 de una o más especies no humanas; y/o moléculas de unión a antígeno que se unen al CD20 humano y al CD20 de una o más especies no humanas.
Según ciertos ejemplos de la divulgación, se proporcionan moléculas de unión a antígeno que se unen a CD3 humano y/o CD20 humano y pueden unirse o no unirse, según sea el caso, a uno o más CD3 y/o CD20 de ratón, rata, cobaya, hámster, jerbo, cerdo, gato, perros, conejo, cabra, ovejas, vacas, caballo, camello, cinomolgo, tití, rhesus o chimpancé. Por ejemplo, en un caso ejemplar particular de la presente divulgación, se proporcionan moléculas de unión a antígeno biespecíficas que comprenden un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano y CD3 cinomolgo, y un segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 humano.
Inmunoconjugados
La presente divulgación incluye moléculas de unión a antígeno conjugadas con un resto terapéutico ("inmunoconjugado"), tal como una citotoxina, un fármaco quimioterapéutico, un inmunodepresor o un radioisótopo. Los agentes citotóxicos incluyen cualquier agente que sea perjudicial para las células. En la técnica se conocen ejemplos de agentes citotóxicos y agentes quimioterapéuticos adecuados para formar inmunoconjugados, (véase, por ejemplo, el documento WO 05/103081).
Formulación terapéutica y administración
Tal como se utiliza en el presente documento, las expresiones "cantidad eficaz" y "cantidad terapéuticamente picar" se refieren a la cantidad del agente terapéutico activo suficiente para producir una respuesta terapéutica deseada sin efectos secundarios adversos indebidos como toxicidad, irritación o respuesta alérgica. La "cantidad eficaz" específica variará, obviamente, con factores como la afección particular que se está tratando, el estado físico del paciente, el tipo de animal a tratar, la duración del tratamiento, la naturaleza de la terapia concurrente (si existe), y las formulaciones específicas empleadas y la estructura de los compuestos o sus derivados. En este caso, una cantidad se consideraría terapéuticamente eficaz si diera como resultado uno o más de, pero sin limitación, los siguientes: (a) la inhibición del crecimiento tumoral (p.ej., cáncer de linfocitos B); y (b) la reversión o estabilización de un cáncer de linfocitos B.
La dosis de la molécula de unión a antígeno administrada a un paciente puede variar según la edad y el tamaño del paciente, enfermedad diana, afecciones, la vía de administración y similares. La dosis preferida se calcula típicamente de acuerdo con el peso corporal o el área superficial del cuerpo. Cuando una molécula de unión a antígeno biespecífica de la presente divulgación se usa con fines terapéuticos en un paciente adulto, puede ser ventajoso administrar por vía intravenosa la molécula de unión a antígeno biespecífica de la presente divulgación normalmente a una dosis única de aproximadamente 0,01 a aproximadamente 20 mg/kg de peso corporal, más preferentemente de aproximadamente 0,02 a aproximadamente 7, de aproximadamente 0,03 a aproximadamente 5 o de aproximadamente 0,05 a aproximadamente 3 mg/kg de peso corporal. Dependiendo de la gravedad de la afección, pueden ajustarse la frecuencia y la duración del tratamiento. Las dosis eficaces y los programas para administrar una molécula de unión a antígeno biespecífica pueden determinarse empíricamente; por ejemplo, puede controlarse el progreso del paciente por evaluación periódica, y ajustarse la dosis en consecuencia. Además, pueden realizarse aumentos de escala de las dosificaciones entre especies usando métodos bien conocidos en la técnica (p.ej., Mordenti et al., 1991, Pharmaceut. Res. 8:1351).
Se conocen varios sistemas de administración y pueden usarse para administrar la composición farmacéutica de la divulgación, p.ej., encapsulación en liposomas, micropartículas, microcápsulas, células recombinantes capaces de expresar los virus mutantes, endocitosis mediada por receptor (véase, p.ej., Wu et al., 1987, J. Biol. Chem. 262:4429-4432). Los métodos de introducción incluyen, pero sin limitación, intradérmica, intramuscular, intraperitoneal, intravenosa, subcutánea, intranasal, epidural y otras vías. La composición puede administrarse por cualquier vía conveniente, por ejemplo, por infusión o inyección en bolo, por absorción a través de revestimientos epiteliales o mucocutáneos (p. ej., mucosa oral, mucosa rectal e intestinal, etc.) y pueden administrarse junto con otros agentes biológicamente activos. La administración puede ser sistémica o local.
Una composición farmacéutica de la presente divulgación puede administrarse por vía subcutánea o intravenosa con una aguja y jeringa estándar. Además, con respecto a la administración subcutánea, un dispositivo de administración en pluma tiene aplicaciones fácilmente en la administración de una composición farmacéutica de la presente divulgación. Dicho dispositivo inyector de pluma puede ser reutilizable o desechable. Un dispositivo inyector de pluma reutilizable usa en general un cartucho reemplazable que contiene una composición farmacéutica. Una vez que se ha administrado toda la composición farmacéutica dentro del cartucho y que el cartucho está vacío, el cartucho vacío puede desecharse fácilmente y remplazarse con un nuevo cartucho que contiene la composición farmacéutica. El dispositivo inyector de pluma puede entonces reutilizarse. En un dispositivo inyector de pluma desechable, no hay cartucho reemplazable. Además, el dispositivo inyector de pluma desechable viene precargado con la composición farmacéutica mantenida en un depósito dentro del dispositivo. Una vez que el depósito se vacía de la composición farmacéutica, el dispositivo completo se desecha.
Numerosos dispositivos de administración reutilizables de pluma y autoinyector tienen aplicaciones en la administración subcutánea de una composición farmacéutica de la presente divulgación. Ejemplos incluyen, aunque sin limitación, AUTOPEN™ (Owen Mumford, Inc., Woodstock, RU), DISETRONIC™ (Disetronic Medical Systems, Bergdorf, Suiza), pluma HUMALOG MIX 75/25™, pluma HUMALOG™, pluma HUMALIN 70/30™ (Eli Lilly y Co., Indianápolis, IN), NOVOPEN™ I, II y III (Novo Nordisk, Copenhague, Dinamarca), NOVOPEN JUNIOR™ (Novo Nordisk, Copenhague, Dinamarca), pluma BD™ (Becton Dickinson, Franklin Lakes, NJ), OPTIPEN™, OpT iPEN PRO™, OPTlPEN STARLET™ y OpTICLIK™ (sanofi-aventis, Frankfurt, Alemania), por nombrar solo algunos. Los ejemplos de dispositivos de administración en pluma desechable que tienen aplicaciones en la administración subcutánea de una composición farmacéutica de la presente divulgación incluyen, aunque sin limitación, la pluma SOLOSTAR™ (sanofi-aventis), el FLEXPEN™ (Novo Nordisk) y el KWIKPEN™ (Eli Lilly), el autoinyector SURECLICK™ (Amgen, Thousand Oaks, CA), el PENLET™ (Haselmeier, Stuttgart, Alemania), el EPIPEN (Dey, L.P.), y la pluma HUMIRA™ (Abbott Labs, Abbott Park IL), por nombrar solo algunos.
En determinadas situaciones, la composición farmacéutica puede suministrarse en un sistema de liberación controlada. En un caso, puede usarse una bomba (véase Langer, anteriormente citado; Sefton, 1987, CRC Crit. Ref. Biomed. Eng. 14:201). En otro caso, se pueden usar materiales poliméricos; véase, "Medical Applications of Controlled Release", Langer y Wise (eds.), 1974, CRC Pres., Boca Ratón, Florida. En todavía otro caso, un sistema de liberación controlada puede ubicarse en las proximidades de la diana de la composición, siendo necesaria, por tanto, solo una fracción de la dosis sistémica (véase, p.ej., Goodson, 1984, en "Medical Applications of Controlled Release", supra, vol. 2, pág. 115-138). Se analizan otros sistemas de liberación controlada en la revisión de Langer, 1990, Science 249:1527-1533.
Las preparaciones inyectables pueden incluir formas farmacéuticas para la vía intravenosa, subcutánea, inyecciones intracutáneas e intramusculares, infusiones por goteo, etc. Estas preparaciones inyectables pueden prepararse por métodos conocidos públicamente. Por ejemplo, las preparaciones inyectables pueden prepararse, p.ej., disolviendo, suspendiendo o emulsionando el anticuerpo o su sal descrita anteriormente en un medio acuoso estéril o un medio oleoso usado convencionalmente para inyecciones. Como medio acuoso para inyecciones, existen, por ejemplo, solución salina fisiológica, una solución isotónica que contiene glucosa y otros coadyuvantes, etc., que pueden usarse en combinación con un agente solubilizante apropiado tal como un alcohol (p.ej., etanol), un polialcohol (p.ej., propilenglicol, polietilenglicol), un tensioactivo no iónico [p.ej., polisorbato 80, h CO-50 (aducto de polioxietileno (50 mol) de aceite de ricino hidrogenado)], etc. Como el medio oleoso, se emplean, p.ej., aceite de sésamo, aceite de soja, etc., que pueden usarse en combinación con un agente solubilizante tal como benzoato de bencilo, alcohol bencílico, etc. La inyección preparada de este modo se carga preferentemente en una ampolla apropiada.
Ventajosamente, las composiciones farmacéuticas para su uso oral o parenteral descritas anteriormente se preparan en formas farmacéuticas en una dosis unitaria adecuada para ajustarse a una dosis de los principios activos. Dichas formas farmacéuticas en una dosis unitaria incluyen, por ejemplo, comprimidos, píldoras, cápsulas, inyecciones (p.ej., ampollas, viales), supositorios, etc.
Usos terapéuticos de las moléculas de unión a antígeno
La presente divulgación incluye métodos que comprenden administrar a un sujeto que lo necesita una composición terapéutica que comprende un anticuerpo anti-CD3 o una molécula de unión a antígeno biespecífica que se une específicamente a c D3 y un antígeno diana (p.ej., CD20). La composición terapéutica puede comprender cualquiera de los anticuerpos o moléculas de unión a antígeno biespecíficas como se describe en este documento y un vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable. Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "un sujeto que lo necesita" se refiere a un animal humano o no humano que muestra uno o más síntomas o indicios de cáncer (p.ej., un sujeto que expresa un tumor o padece cualquiera de los cánceres mencionados a continuación), o que de otra manera se beneficiaría de una inhibición o reducción en la actividad de CD20 o un empobrecimiento de linfocitos B CD20+ o una regresión de los tumores de linfocitos B CD20+.
Los anticuerpos y las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la divulgación (y composiciones terapéuticas que los comprenden) son útiles, entre otros, para tratar cualquier enfermedad o trastorno en donde la estimulación, activación y/o orientación de una respuesta inmunitaria sería beneficiosa. En particular, las moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 de la presente divulgación pueden usarse para el tratamiento, prevención y/o mejora de cualquier enfermedad o trastorno asociado o mediado por expresión o actividad de CD20 o proliferación de linfocitos B CD20+. El mecanismo de acción mediante el cual se logran los métodos terapéuticos incluyen destrucción de células que expresan CD20 en presencia de células efectoras, por ejemplo, mediante apoptosis, fagocitosis, o por una combinación de dos o más de estos mecanismos o mecanismos citotóxicos similares. Las células que expresan CD20 que pueden inhibirse o destruirse usando las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la divulgación incluyen, por ejemplo, linfocitos B tumorigénicos.
La reducción de la carga tumoral o la regresión tumoral incluye la desaparición parcial o completa de un tumor o tumores en un sujeto. Se entiende que la regresión tumoral representa una tendencia hacia una menor carga tumoral o un estado de enfermedad menos grave. Como tal, la regresión es una disminución progresiva de la eliminación de tumores malignos medibles en el organismo, incluyendo disminución del tamaño del tumor y/o disminución del número de tumores. La reducción del desarrollo tumoral incluye una inhibición o supresión parcial o completa del crecimiento tumoral adicional o nuevo.
Las moléculas de unión a antígeno de la presente divulgación pueden usarse para tratar, p.ej., tumores primarios y/o metastásicos que surgen en el cerebro y las meninges, la orofaringe, el árbol pulmonar y bronquial, el tracto gastrointestinal, el sistema reproductor masculino y femenino, músculo, hueso, la piel y anejos cutáneos, tejido conectivo, bazo, sistema inmunitario, las células que forman la sangre y la médula ósea, el hígado y el sistema urinario, y órganos sensitivos especiales tales como el ojo. En determinados casos, Las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la divulgación se usan para tratar uno o más de los siguientes cánceres: carcinoma de células renales, carcinoma de páncreas, cáncer de mama, cáncer de cabeza y cuello, cáncer de próstata, gliomas malignos, osteosarcoma, cáncer colorrectal, cáncer gástrico (p.ej., cáncer gástrico con amplificación MET), mesotelioma maligno, mieloma múltiple, cáncer de ovario, cáncer de pulmón microcítico, cáncer de pulmón no microcítico, sarcoma sinovial, cáncer de tiroides o melanoma. Según ciertos casos ejemplares, las moléculas de unión a antígeno biespecíficas de la presente divulgación se usan para tratar un cáncer de linfocitos B (p.ej., linfoma de Hodgkin, linfoma no Hodgkin [NHL], leucemia/linfoma linfoblástico de linfocitos B precursores, neoplasias de linfocitos B maduros, leucemia linfocítica crónica de linfocitos B/linfoma microlinfocítico, leucemia prolinfocítica de linfocitos B, linfoma linfoplasmacítico, linfoma de células del manto, linfoma folicular, linfoma cutáneo del centro folicular, linfoma de linfocitos B de zona marginal, tricoleucemia, linfoma difuso de linfocitos B grandes, linfoma de Burkitt, plasmacitoma, mieloma de células plasmáticas, trastorno linfoproliferativo posterior a trasplante, macroglobulinemia de Waldenstrom y linfoma anaplásico macrocelular.
Las moléculas de unión a antígeno biespecíficas anti-CD3/anti-CD20 de la presente divulgación se administran en una cantidad suficiente para reducir la carga tumoral, producir regresión tumoral, inhibir el crecimiento tumoral o reducir el desarrollo tumoral en el sujeto. En algunos ejemplos de la divulgación, la cantidad administrada está entre aproximadamente 0,001 mg/kg y aproximadamente 1 mg/kg. En otros casos, la cantidad administrada es de aproximadamente 0,4 mg/kg. En otros casos, la cantidad administrada es de aproximadamente 0,04 mg/kg. En aún otros casos, la cantidad administrada es de aproximadamente 0,004 mg/kg.
Según ciertos casos de la presente divulgación, las moléculas de unión a antígeno son útiles para tratar a un paciente afectado por un linfoma de linfocitos B (p.ej., NHL) que es resistente o no responde de manera incompleta a la terapia anti-CD20 sola (p.ej., resistente a la terapia con rituximab). Según otros casos relacionados de la divulgación, se proporcionan métodos que comprenden administrar una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 como se desvela en este documento a un paciente que padece un linfoma de linfocitos B (p.ej., NHL) que es refractario a la terapia anti-CD20 (p.ej., un paciente con un tumor refractario al rituximab o con linfoma de linfocitos B recidivante o refractario). Pueden usarse métodos analíticos/diagnósticos conocidos en la técnica, como exploración tumoral, etc., para determinar si un paciente alberga un tumor resistente a, responde de forma incompleta o es resistente al tratamiento anti-CD20 solo.
La presente divulgación también incluye métodos para tratar el cáncer residual en un sujeto. Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "cáncer residual" significa la existencia o persistencia de una o más células cancerosas en un sujeto después de tratamiento con una terapia anticáncer.
Según ciertos aspectos, la presente divulgación proporciona métodos para tratar una enfermedad o trastorno asociado con la expresión de CD20 (p.ej., linfoma de linfocitos B) que comprende administrar una o más de las moléculas de unión a antígeno biespecíficas descritas en otras partes de este documento a un sujeto después de que el sujeto haya recibido monoterapia anti-CD20 (p.ej., después de la administración de una composición farmacéutica que comprende un anticuerpo anti-CD20 como rituximab). Por ejemplo, la presente divulgación incluye métodos para tratar el linfoma de linfocitos B que comprende administrar una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 a un paciente 1 día, 2 días, 3 días, 4 días, 5 días, 6 días, 1 semana, 2 semanas, 3 semanas o 4 semanas, 2 meses, 4 meses, 6 meses, 8 meses, 1 año o más después de que el sujeto haya recibido monoterapia anti-CD20 (p.ej., tratamiento con rituximab o un tratamiento equivalente del mismo).
Terapias y formulaciones combinadas
La presente divulgación proporciona métodos que comprenden administrar una composición farmacéutica que comprende cualquiera de los ejemplos de anticuerpos y moléculas de unión a antígeno biespecíficas descritas en este documento en combinación con uno o más agentes terapéuticos adicionales. Los ejemplos de agentes terapéuticos adicionales que pueden combinarse o administrarse en combinación con una molécula de unión a antígeno de la presente divulgación incluyen, p.ej., un antagonista de EGFR (p.ej., un anticuerpo anti-EGFR [p.ej., cetuximab o panitumumab] o inhibidor de molécula pequeña de EGFR [p.ej., gefitinib o erlotinib]), un antagonista de otro miembro de la familia EGFR como Her2/ErbB2, ErbB3 o ErbB4 (p.ej., anticuerpo anti-ErbB2, anti-ErbB3 o anti-ErbB4 o inhibidor de molécula pequeña de ErbB2, ErbB3 o ErbB4), un antagonista de EGFRvIII (p.ej., un anticuerpo que se une específicamente a EGFRvIII), un anagonista de cMET (p.ej., un anticuerpo anti-cMET), un antagonista de IGF1R (p.ej., un anticuerpo anti-IGF1R), un inhibidor de B-raf (p.ej., vemurafenib, sorafenib, GDC-0879, PLX-4720), un inhibidor de PDGFR-a (p.ej., un anticuerpo anti-PDGFR-a), un inhibidor de PDGFR-p (p.ej., un anticuerpo anti-PDGFR-p), un antagonista de VEGF (p.ej., una trampa de VEGF, véase, p.ej., el documento US 7087411 (también mencionado en este documento como "proteína de fusión inhibidora de VEGF"), anticuerpo anti-VEGF (p.ej., bevacizumab), un inhibidor de quinasa de molécula pequeña del receptor de VEGF (p.ej., sunitinib, sorafenib o pazopanib)), un antagonista de DLL4 (p.ej., un anticuerpo anti-DLL4 desvelado en US 2009/0142354), un antagonista de Ang2 (p.ej., un anticuerpo anti-Ang2 desvelado en US 2011/0027286 como H1H685P), un antagonista de FOLH1 (p.ej., un anticuerpo anti-FOLH1), un antagonista de PRLR (p.ej., un anticuerpo anti-PRLR), un antagonista de STEAP1 o STEAP2 (p.ej., un anticuerpo anti-STEAP1 o un anticuerpo anti-STEAP2), un antagonista de TMPRSS2 (p.ej., un anticuerpo anti-TMPRSS2), un antagonista de MSLN (p.ej., un anticuerpo anti-MSLN), un antagonista de c A9 (p.ej., un anticuerpo anti-CA9), un antagonista de uroplaquina (p.ej., un anticuerpo antiuroplaquina), un antagonista monovalente de CD20 (p.ej., un anticuerpo anti-CD20 monovalente como rituximab), etc. Otros agentes que pueden administrarse beneficiosamente en combinación con las moléculas de unión a antígeno de la divulgación incluyen inhibidores de citoquinas, incluyendo inhibidores de citocina de molécula pequeña y anticuerpos que se unen a citocinas tales como IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-8, IL-9, IL-11, IL-12, IL-13, IL-17, IL-18 o a sus receptores respectivos. Las composiciones farmacéuticas de la presente divulgación (p.ej., composiciones farmacéuticas que comprenden una molécula de unión a antígeno biespecífica anti-CD3/anti-CD20 como se desvela en este documento) también pueden administrarse como parte de un régimen terapéutico que comprende una o más combinaciones terapéuticas seleccionadas entre "ICE ": ifosfamida (p.ej., Ifex®), carboplatino (p.ej., Paraplatin®), etopósido (p.ej., Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16); "DHAP": dexametasona (p.ej., Decadron®), citarabina (p.ej., Cytosar-U®, arabinósido de citosina, ara-C), cisplatino (p.ej., Platinol®-AQ); y "ESHAP": etopósido (p.ej., Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16), metilprednisolona (p.ej., Medrol®), dosis altas de citarabina, cisplatino (p.ej., Platinol®-AQ).
La presente divulgación también incluye combinaciones terapéuticas que comprenden cualquiera de las moléculas de unión a antígeno mencionadas en este documento y un inhibidor de uno o más de VEGF, Ang2, DLL4, EGFR, ErbB2, ErbB3, ErbB4, EGFRvIII, cMet, IGF1R, B-raf, PDGFR-a, PDGFR-p, FOLH1, PRLR, STEAP1, STEAP2, TMPRSS2, MSLN, CA9, uroplaquina, o cualquiera de las citoquinas mencionadas anteriormente, en donde el inhibidor es un aptámero, una molécula antisentido, una ribozima, un ARNip, un pepticuerpo, un nanocuerpo o un fragmento de anticuerpo (p.ej., fragmento Fab; fragmento F(ab')2; fragmento Fd; fragmento Fv; scFv; fragmento dAb; u otras moléculas genomanipuladas, tales como diacuerpos, triacuerpos, tetracuerpos, minicuerpos y unidades de reconocimiento mínimas). Las moléculas de unión a antígeno de la divulgación también pueden administrarse y/o formularse conjuntamente en combinación con antivirales, antibióticos, analgésicos, corticosteroides y/o AINE. Las moléculas de unión a antígeno de la divulgación también pueden administrarse como parte de un régimen de tratamiento que también incluye tratamiento con radiación y/o quimioterapia convencional.
Los componentes terapéuticamente activos adicionales pueden administrarse justo antes de, simultáneamente con, o poco después de la administración de una molécula de unión a antígeno de la presente divulgación (para los fines de la presente divulgación, dichos regímenes de administración se consideran la administración de una molécula de unión a antígeno "en combinación con" un componente terapéuticamente activo adicional).
La presente divulgación incluye composiciones farmacéuticas en donde una molécula de unión a antígeno de la presente divulgación se formula conjuntamente con uno o más de los componentes terapéuticamente activos adicionales como se describe en otra parte del presente documento.
Regímenes de administración
Según ciertos casos de la presente divulgación, pueden administrarse dosis múltiples de una molécula de unión a antígeno (p.ej., un anticuerpo anti-CD3 o una molécula de unión a antígeno biespecífica que se une específicamente a CD20 y CD3) a un sujeto durante un periodo de tiempo definido. Los métodos según este aspecto de la divulgación comprenden administrar secuencialmente a un sujeto múltiples dosis de una molécula de unión a antígeno de la divulgación. Tal como se utiliza en el presente documento, "administrar secuencialmente" significa que cada dosis de una molécula de unión a antígeno se administra al sujeto en un momento diferente, p.ej., en días diferentes separados por un intervalo predeterminado (p.ej., horas, días, semanas o meses). La presente divulgación incluye métodos que comprenden administrar secuencialmente al paciente una dosis inicial única de una molécula de unión a antígeno, seguido de una o más dosis secundarias de la molécula de unión a antígeno, y opcionalmente seguido de una o más dosis terciarias de la molécula de unión a antígeno.
Las expresiones "dosis inicial", "dosis secundarias", y "dosis terciarias", se refieren a la secuencia temporal de administración de la molécula de unión a antígeno de la divulgación. Por tanto, la "dosis inicial" o "primera dosis" es la dosis que se administra al comienzo del régimen de tratamiento (también conocida como "dosis de referencia"); las "dosis secundarias" son las dosis que se administran después de la dosis inicial; y las "dosis terciarias" son las dosis que se administran después de las dosis secundarias. Las dosis inicial, secundaria y terciaria pueden contener la misma cantidad de la molécula de unión a antígeno, pero generalmente pueden diferir entre sí en términos de frecuencia de administración. En determinados casos, sin embargo, la cantidad de una molécula de unión a antígeno contenida en las dosis inicial, secundaria y/o terciaria varían entre sí (p.ej., ajustadas hacia arriba o hacia abajo según corresponda) durante el curso del tratamiento. En determinados casos, dos o más (p.ej., 2, 3, 4 o 5) dosis se administran al comienzo del régimen de tratamiento como "dosis de carga" seguidas de dosis posteriores que se administran con menos frecuencia (p.ej., "dosis de mantenimiento").
Se ha descubierto que la administración de una primera dosis, administrada a una concentración mínima, y después una dosis posterior o segunda, administrada en dos o tres veces la primera dosis, beneficiará al paciente
En algunos casos, una primera dosis de molécula de unión a antígeno se administra a un paciente consecutivamente durante un primer periodo de tiempo, y una segunda dosis posterior de dicha molécula de unión a antígeno se administra a un paciente consecutivamente durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis. En otros casos, la primera dosis se administra una vez por semana o dos veces por semana durante 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 o más semanas. En otro caso, la segunda dosis se administra una vez a la semana, dos veces a la semana, una vez al mes, o dos veces al mes durante 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 o más semanas o meses.
En un ejemplo de la presente divulgación, cada dosis secundaria y/o terciaria se administra de 1 a 26 (p.ej., 1, 11. 2, 21. 3, 31. 4, 41. 5, 51. 6, 61. 7, 71. 8, 81. 9, 91. 10, 101, 11, 111, 12, 121, 13, 131, 14, 141, 15, 151, 16, 161, 17, 171, 18, 181, 19, 191, 20, 201, 21,211, 22, 221, 23, 231, 24, 241, 25, 251, 26, 261 o más) semanas después de la dosis inmediatamente anterior. La expresión "la dosis inmediatamente anterior", tal como se utiliza en el presente documento, significa, en una secuencia de administraciones múltiples, la dosis de la molécula de unión a antígeno que se administra a un paciente antes de la administración de la siguiente dosis en la secuencia sin dosis intermedias.
Los métodos según este aspecto de la divulgación pueden comprender administrar a un paciente cualquier cantidad de dosis secundarias y/o terciarias de una molécula de unión a antígeno (p.ej., una molécula de unión a antígeno biespecífica que se une específicamente a CD20 y CD3). Por ejemplo, en determinados casos, solo se administra una dosis secundaria única al paciente. En otros casos, dos o más (p.ej., 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 o más) dosis secundarias se administran al paciente. De manera análoga, en determinados casos, solo se administra una dosis terciaria única al paciente. En otros casos, dos o más (p.ej., 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 o más) dosis terciarias se administran al paciente.
En casos que implican múltiples dosis secundarias, cada dosis secundaria puede administrarse con la misma frecuencia que las otras dosis secundarias. Por ejemplo, cada dosis secundaria puede administrarse al paciente de 1 a 2 semanas después de la dosis inmediatamente anterior. Igualmente, en casos que implican múltiples dosis terciarias, cada dosis terciaria puede administrarse con la misma frecuencia que las otras dosis terciarias. Por ejemplo, cada dosis terciaria puede administrarse al paciente de 2 a 4 semanas después de la dosis inmediatamente anterior. Como alternativa, La frecuencia con la que se administran las dosis secundarias y/o terciarias a un paciente puede variar en el transcurso del régimen de tratamiento. La frecuencia de administración también puede ajustarse durante el curso de tratamiento por un médico dependiendo de las necesidades del paciente individual después de examen clínico.
Usos de diagnóstico de los anticuerpos
Los anticuerpos anti-CD3xCD20 de la presente divulgación también pueden usarse para detectar y/o medir CD3, o células que expresan CD3 en una muestra, p.ej., con fines de diagnóstico. Por ejemplo, un anticuerpo anti-CD3xCD20, o fragmento del mismo, puede usarse para diagnosticar una afección o enfermedad caracterizada por la expresión aberrante (p.ej., sobreexpresión, subexpresión, ausencia de expresión, etc.) de CD3. Los ensayos de diagnóstico ejemplares para CD3 pueden comprender, p.ej., poner en contacto una muestra, obtenida de un paciente, con un anticuerpo anti-CD3xCD20 de la divulgación, en donde el anticuerpo está marcado con una etiqueta detectable o molécula indicadora. Como alternativa, un anticuerpo anti-CD3xCD20 sin marcar puede usarse en aplicaciones de diagnóstico en combinación con un anticuerpo secundario que está marcado de manera detectable. El marcador detectable o molécula indicadora puede ser un radioisótopo, tal como 3H, 14C, 32P, 35S o 125I; un resto fluorescente o quimioluminiscente como isotiocianato de fluoresceína o rodamina; o una enzima tal como una fosfatasa alcalina, beta-galactosidasa, peroxidasa de rábano rusticano o luciferasa. Los ensayos ejemplares específicos que pueden usarse para detectar o medir CD3 en una muestra incluyen el ensayo de inmunosorción enzimática (ELISA), radioinmunoensayo (RIA) y clasificación de células activadas por fluorescencia (FACS).
Los anticuerpos anti-CD3xCD20 de la presente divulgación también pueden usarse para detectar y/o medir células que expresan CD20 o CD20 en una muestra, o para diagnosticar una afección o enfermedad caracterizada por una expresión anómala (p.ej., sobreexpresión, subexpresión, ausencia de expresión, etc.) de CD20, análogamente.
Las muestras que pueden usarse en ensayos de diagnóstico de CD3 o CD20 según la presente divulgación incluyen cualquier muestra de tejido o fluido obtenible de un paciente que contenga cantidades detectables de proteína CD3 y/o CD20, o fragmentos de la misma, en condiciones normales o patológicas. Generalmente, Los niveles de CD3 o CD20 en una muestra particular obtenida de un paciente sano (p.ej., un paciente no afectado por una enfermedad o afección asociada con niveles o actividad anómalos de CD3 o c D20) se medirán para establecer inicialmente un nivel inicial o estándar, de CD3 o CD20. Este nivel inicial de CD3 o CD20 puede compararse contra los niveles de CD3 medidos en muestras obtenidas de individuos sospechosos de tener una enfermedad o afección relacionada con CD3 o CD20, respectivamente.
Ejemplos
Los siguientes ejemplos se presentan para proporcionar a los expertos en la materia una divulgación y descripción completa de cómo preparar y usar los métodos y las composiciones de la invención, y no se pretende que limiten el alcance de lo que los inventores consideran su invención. Se han realizado esfuerzos para garantizar la precisión con respecto a los números usados (p.ej., sumas, temperatura, etc.) pero deben tenerse en cuenta algunos errores y desviaciones experimentales. Salvo que se indique de otro modo, las partes son partes en peso, el peso molecular es peso molecular promedio, la temperatura está en grados centígrados y la presión es atmosférica o cercana a la atmosférica.
Ejemplo 1. Generación de anticuerpos anti-CD3 y anti-CD20
Se conocen varios métodos para aislar anticuerpos anti-CD3 o anti-CD20. Los anticuerpos anti-CD3 completamente humanos utilizados en los siguientes ejemplos se aislaron directamente de linfocitos B positivos para antígeno sin fusión con células de mieloma, como se describe en el documento US 2007/0280945A1.
En los métodos pueden usarse ejemplos adicionales de anticuerpos anti-CD3, y la descripción de tales anticuerpos y las propiedades biológicas de tales anticuerpos anti-CD3 se describen en Solicitud Internacional PCT N.° PCTVUS13/60511, presentada el 19 de septiembre, 2013 y publicada como WO2014/047231. Los ejemplos de anticuerpos anti-CD20 y las propiedades biológicas de dichos anticuerpos anti-CD20 se describen en US 7.879.984 y Solicitud Internacional PCT N.° PCT/US13/60511, presentada el 19 de septiembre, 2013 y publicada como WO2014/047231.
El anticuerpo anti-CD20 y su método para fabricar el anticuerpo usado para construir los anticuerpos biespecíficos de este ejemplo es como se describe en US 7.879.984.
Los identificadores de secuencia de aminoácidos de las regiones variables de cadena pesada y ligera y las CDR usadas para construir el grupo de unión a antígeno anti-CD3 y el grupo de unión a anti-CD20 de la divulgación de anticuerpos biespecíficos se exponen en la Tabla 1. Los identificadores de secuencia de ácidos nucleicos correspondientes se exponen en la Tabla 2.
Tabla 1: Identificadores de secuencia de aminoácidos SEQ ID NOs
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Tabla 2: Identificadores de secuencia de ácidos nucleicos SEQ ID NOs
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Ejemplo 2. Generación de anticuerpos biespecíficos que se unen a CD3 y CD20
Los anticuerpos biespecíficos que comprenden un dominio de unión específico anti-CD3 y un dominio de unión específico anti-CD20 se construyeron con las secuencias anteriores usando metodologías estándar en donde una cadena pesada y una cadena ligera de un anticuerpo anti-CD3 se combinaron con una cadena pesada de un anticuerpo anti-CD20.
Como tal, los anticuerpos biespecíficos creados según el presente Ejemplo comprenden dos dominios de unión a antígeno separados (es decir, grupos de unión). El primer dominio de unión a antígeno comprende una región variable de cadena pesada derivada de un anticuerpo anti-CD20 ("CD20-VH"), emparejada con una región variable de cadena ligera derivada de un anticuerpo anti-CD3 ("CD3-VL"). El emparejamiento CD20-VH/CD3-VL crea un dominio de unión a antígeno que reconoce específicamente CD20. El segundo dominio de unión a antígeno comprende una región variable de cadena pesada derivada de un anticuerpo anti-CD3 ("CD3-VH"), emparejada con una región variable de cadena ligera derivada de un anticuerpo anti-CD3 ("CD3-VL"). El emparejamiento CD3-VH/CD3-VL crea un dominio de unión a antígeno que reconoce específicamente CD3. Se utilizó el mismo CD20-VH en todos los anticuerpos biespecíficos creados en este ejemplo y se denomina "CD20-VH-A".
El dominio constante de cadena pesada (CH) de tipo silvestre para cada cadena pesada se reemplazó con un CH quimérico por técnicas recombinantes. El CH de un grupo de unión (p.ej., el grupo de unión anti-CD3) contiene una mutación en la región CH3 del CH que facilita el aislamiento del biespecífico.
Un sumario de las partes componentes de los diversos anticuerpos biespecíficos preparados según este Ejemplo se expone en la Tabla 3 y la Tabla 4.
Tabla 3: Identificadores de secuencia de aminoácidos
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Tabla 4: Identificadores de secuencia de ácidos nucleicos
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Las Tablas 5 y 6 establecen los identificadores de secuencia de aminoácidos para las diversas regiones variables de cadena pesada (Tabla 5) y las regiones variables de cadena ligera (Tabla 6) con sus correspondientes CDR de los anticuerpos biespecíficos de este Ejemplo.
T l : I n ifi r n i min i n
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Tabla 6: Identificadores de Secuencia de Aminoácidos de Cadena Li era
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Además, Las tablas 7 y 8 establecen los identificadores de secuencia para las secuencias de nucleótidos que codifican las diversas regiones variables de cadena pesada (Tabla 7), regiones constantes de cadena pesada y regiones variables de cadena ligera (Tabla 8) con sus correspondientes CDR de los anticuerpos biespecíficos de este Ejemplo.
Tabla 7: Identificadores de Secuencia de Ácidos Nucleicos de Cadena Pesada
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Tabla 8: Identificadores de Secuencia de Ácidos Nucleicos de Cadena Li era
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Además de los anticuerpos biespecíficos descritos anteriormente, los siguientes anticuerpos de control también se utilizaron en algunos de los experimentos expuestos en los siguientes ejemplos:
Anticuerpo de Control 1: Anticuerpo monoclonal "OKT-3" contra antígenos de superficie de linfocitos T humanos como se establece en US 4.361.549 y disponible del hibridoma CRL-8001 (Colección Americana de Cultivos Tipo, Manassas, VA).
Anticuerpo de Control 2: Anticuerpo "SP34" reactivo contra la cadena épsilon del complejo T3 en linfocitos T humanos, disponible en BD Pharmagen, Cat N.° 55052.
Anticuerpo de Control 3: Anticuerpo terapéutico anti-CD20, con secuencias de cadena pesada y ligera de Rituxan (Rituximab) como se desvela en Us 5.736.137.
(Control) Anticuerpo 4: También conocido como anticuerpo CD3xCD20-Fc tipo silvestre (wtFc), este anticuerpo se fabricó de manera análoga a los métodos anteriores que tienen un grupo anti-CD20 que comprende un par de secuencias de aminoácidos HCVR/LCVR de SEQ ID NO: 2/18 (secuencias de aminoácidos HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 de SEQ ID NOs: 4-6-8-20-22-24), y una región CH de IgG1 de tipo silvestre (SEQ ID NO: 45); y un grupo anti-CD3 que comprende un par de secuencias de aminoácidos HCVR/LCVR de SEQ ID NOs: 10/18 (secuencias de aminoácidos HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 de SEQ ID NOs: 12-14­ 16-20-22-24), y una región CH de IgG1 de tipo silvestre con 2 modificaciones de aminoácidos (SEQ ID NO: 48) en el dominio CH3 para facilitar el aislamiento. El anticuerpo CD3xCD20-wtFc (Anticuerpo 4) puede denominarse anticuerpo de control combinado que tiene un dominio Fc de IgG1 de tipo silvestre (es decir, emparejado con los dominios de unión a antígeno de los anticuerpos CD3xCD20-Fc quimérico de la divulgación), para comparar funciones efectoras de anticuerpos u otras propiedades, respecto a anticuerpos que tienen diferentes secuencias o estructura de dominio Fc.
Anticuerpo de Control 5: El anticuerpo monoclonal anti-FelD1 se une a un antígeno felino sin reactividad cruzada con CD20 o CD3 humano. Este control de anticuerpo no específico de IgG1 se obtuvo mediante métodos descritos en la Publicación PCT N.° WO2013/166236, publicada el 7 de noviembre, 2013.
Anticuerpo de Control 6: El dominio de unión a antígeno anti-FelD1 como se describe en la Publicación PCT N.° WO2013/166236 se diseñó como se describe en este documento para contener un dominio Fc de IgG4 quimérico de forma análoga a Ab 1. Control Ab 6 no tiene reactividad cruzada con CD20 o CD3 humano, pero tiene una función efectora similar a Ab 1.
Ejemplo 3. Construcción Quimérica de Cadena Pesada
La generación de las cadenas pesadas quiméricas, por ejemplo, CH de IgG4 quimérica (SEQ ID NO: 26) y un CH de IgG1 quimérica (SEQ ID NO: 30), se realizó usando técnicas de clonación estándar. Primero, el CH de IgG4 quimérica se generó mediante un proceso de amplificación por PCR de dos etapas. Dos fragmentos de PCR, Fragmento 1 y 2, se amplificaron usando una construcción de vector de partida pR001 que contiene un ADN del CH hlgG4 de tipo silvestre usando pares de cebadores que flanquean la región CH, P1-P2 y P3-P4, respectivamente. Ver Tabla 9 a continuación). Los cebadores introdujeron tanto la secuencia de bisagra inferior IgG2 deseada (que codifica SEQ ID NO: 52) como los sitios de restricción flanqueantes en los fragmentos. Estos dos fragmentos se unieron después usando los cebadores de PCR P2 y P4. La secuencia resultante se insertó en pR001 a través de sitios de restricción Xho1-Not1 generando una construcción vectorial pR002 que contiene CH de IgG4 quimérica que tiene una secuencia de bisagra inferior IgG2. La secuencia se confirmó usando los cebadores P10 y P11.
Además, se generó un CH de IgG1quimérica mediante amplificación por PCR de múltiples etapas. El fragmento 1a se generó usando los cebadores P2 y P5 (véase la Tabla 9 a continuación) a partir del molde pR85503 (que contiene un ADN de CH de IgG1 humana de tipo silvestre). El fragmento 2a se amplificó con los cebadores P6 y P8 usando pR002 (que contiene el ADN de CH de IgG4 quimérica) como molde. El fragmento 3 se preparó usando los cebadores P7 y P9 del molde pR003 (ADN de CH de hlgG1 de tipo silvestre; SEQ ID NO: 45). Los fragmentos 1a y 2a se unieron usando los cebadores P2 y P8, que generó el Fragmento 4. La unión de los Fragmentos 2a y 3 usando los cebadores P6 y P9 creó el Fragmento 5. Los fragmentos 4 y 5 se fusionaron usando los cebadores P2 y P9. La secuencia resultante se insertó en pR001 a través de sitios de restricción Xho1-Not1 generando una construcción pR004 que tiene una región constante de IgG1 con la bisagra inferior IgG2 y el dominio CH2 de IgG4. La secuencia se confirmó usando los cebadores P10 y P11.
T l : r r n r i n r P R n r i n i n l i h im ri
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Ejemplo 4. Los anticuerpos biespecíficos CD20 x CD3 se unen selectivamente a linfocitos T de Jurkat, Raji y Mono en comparación con anticuerpos monoespecíficos
El anticuerpo CD3xCD20-wtFc (Anticuerpo de Control 4) se comparó con los anticuerpos de Control monoespecíficos, como se establece en el Ejemplo 2, mediante un método de enlace FACS por su capacidad de unirse a Jurkat (CD3+, CD20 - línea de linfocitos T humanos), Raji (CD3-, CD20+ línea de linfocitos B humanos), o PBMC de cinomolgo ("células mkT").
Los datos de FACS se obtuvieron utilizando el siguiente protocolo: Las células a 2x105 por pocillo se incubaron con anticuerpos diluidos en serie durante 30 min en hielo. Después de la incubación, las células se lavaron y las células secundarias apropiadas (células Jurkat, RAJI) o un cóctel de anticuerpos secundarios (para PBMC de cino) se añadieron y se incubaron durante 30 minutos adicionales. Después de la incubación, las células se lavaron, se resuspendieron en PBS frío que contenía BSA al 1 % y se analizaron por citometría de flujo en un BD FACS Canto II. Las células Jurkat y Raji se seleccionaron mediante dispersiones laterales y directas, mientras que los linfocitos T de cinomolgo también se seleccionaron en una población CD2+CD4+. Las CE50 para titulación de unión celular se determinaron usando el software Prism con valores calculados usando un análisis de regresión no lineal de 4 parámetros. Los resultados se muestran en la Tabla 10.
Tabla 10. Valores de unión de CE50 (Molar) para anticuerpos monoespecíficos frente a biespecíficos
CD3xCD20
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Tal como se muestra en la Tabla 10, el panel de anticuerpos probados mostró un rango de afinidades de unión en las diferentes líneas celulares, dependiendo de sus especificidades. El Anticuerpo de Control 4 Biespecífico mostró la capacidad de unir líneas diana tanto humanas como de cinomolgo. El Anticuerpo de Control 4 comprende las mismas regiones variables anti-CD3xCD20 con Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2, sin embargo tiene una región Ch de IgG1 de tipo silvestre. Control 1 anti-CD3 (OKT3), Control 2 anti-CD3 (SP34) y Control 3 anti-CD20 unidos a Jurkat, linfocitos T de cinomolgo y RAJI, respectivamente.
Ejemplo 5. Los anticuerpos biespecíficos CD20 x CD3 con CH de tipo silvestre inducen citotoxicidad a células de Raji en presencia de linfocitos T activados
La capacidad de los anticuerpos biespecíficos CD20 x CD3 para redirigir la destrucción mediada por linfocitos T a células de Raji que expresan CD20 se probó en un ensayo de citotoxicidad in vitro. Además, también se estudió la capacidad de los anticuerpos anti-CD3 biespecíficos y parentales para destruir las células U937 mediante interacciones Fc/FcR.
Los ensayos de eliminación de calceína se realizaron utilizando el siguiente protocolo: Se aislaron PBMC humanas y de cinomolgo sobre placa de ficoll o con medios de separación de células de mamífero Lympholyte, respectivamente. Las PBMC aisladas se activaron durante un periodo de varios días con medios que contenían IL-2 humana recombinante (30 U/ml) y perlas de activación de linfocitos T (anti-CD3/CD28 para PBMC humanas, anti-CD2/CD3/CD28 para PBMC de cinomolgo).
Las células diana (Raji para destrucción mediada por CD20 y U937 para destrucción mediada por FcR) se marcaron con calceína, y se incubaron con linfocitos T activados en una relación efector:diana de 10:1 utilizando diluciones en serie de anticuerpos 3 veces en un curso de 3 horas a 37 °C. Después de incubación, las placas se centrifugaron y los sobrenadantes se transfirieron a una placa de fondo transparente negro translúcido para análisis de fluorescencia. Las CE50 definidas como la concentración molar de anticuerpo biespecífico que induce una citotoxicidad del 50 % se determinó usando Prism. Los valores se calcularon utilizando un análisis de regresión no lineal de 4 parámetros. Los resultados se resumen en la Tabla 10.
T l 11. V l r E r i xi i in i r D2 x D r l l R i 7
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Como se muestra en la Tabla 11, el anticuerpo biespecífico CD20 x CD3 que contiene grupos anti-CD3 reactivos cruzados específicos para humanos y cinomolgos, y una región CH de IgG1 de tipo silvestre, pudo redirigir específicamente la citotoxicidad a células de Raji en presencia de linfocitos T activados en humanos. En presencia de linfocitos T activados por cinomolgos, Raji se destruyeron cuando se incubaron con el anticuerpo Ab 4 de Control biespecífico que tiene un grupo anti-CD3 que activa linfocitos T de mono. Tanto el anticuerpo biespecífico como el Ab 1 de Control (mAb anti-CD3) mostraron actividad en el ensayo de destrucción dependiente de Fc/FcR U937. Esta actividad podría bloquearse mediante la adición de bloqueo de IgG humana no específica a la reacción (datos no mostrados).
Ejemplo 6- Los anticuerpos biespecíficos CD20 x CD3 que comprenden regiones CH quiméricas muestran una función efectora disminuida en un ensayo CDC
Los anticuerpos CD20xCD3 biespecíficos con regiones CH quiméricas (Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2), como se describió anteriormente en el Ejemplo 2, diseñaron para alterar o reducir la función efectora. En comparación con los anticuerpos que comprenden una región constante de cadena pesada de tipo silvestre (wt) del isotipo IgG1 (Ab 4 de Control), las sustituciones de aminoácidos en la región CH pueden dificultar la capacidad de una Ig Fc para unirse a su receptor(es). Por tanto, la señalización y respuestas inmunes, como activación de linfocitos B o fagocitosis, pueden alterarse. Se examinó el efecto de las modificaciones de aminoácidos en la región CH sobre la citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) (en este ejemplo) y la función efectora de la citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC) (véase Ejemplo 7).
Para examinar el efecto del Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2 sobre la función efectora de CDC, las células de Raji (diana) que expresan CD20 (5000/pocillo) o las células de Daudi se sembraron en placas en presencia de un 5 % de complemento de suero humano. Diluciones en serie del Anticuerpo 1, Anticuerpo 2 y anticuerpos de control, a partir de 100 nM, se añadieron a las células durante 4 h a 37 °C. La lisis de las células diana se determinó usando el kit CytoToxGlo™ (Promega) y se calculó el porcentaje de citotoxicidad.
El porcentaje de citotoxicidad se calculó utilizando la ecuación:
% de citotoxicidad = ((Ls - Lsr)/(Lmr-Lsr))*100 % donde Lsr es el valor inicial de luminiscencia de la célula diana de referencia y Lmr es la liberación máxima de calceína de las células lisadas con digitonina. La CE50 para citotoxicidad se determinó usando el software Prism (GraphPad). Los valores se calcularon utilizando un análisis de regresión no lineal de 4 parámetros y se muestran en Tabla 12 y Figuras 5A y 5B.
La actividad CDC del Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2 contra células de Daudi y Raji disminuye significativamente en comparación con el anticuerpo correspondiente que tiene una región constante de cadena pesada en peso. Ver Tabla 12 y Figuras 5A/B. Se observó cierta actividad CDC con el Anticuerpo 1 contra células de Raji, sin embargo, los resultados globales muestran que los anticuerpos quiméricos tienen respuestas efectoras más débiles que los anticuerpos de control de Fc de IgG1 wt.
Tabla 12: Los anticuerpos biespecíficos CD20xCD3 que comprenden regiones CH quiméricas muestran actividad reducida en ensa os CDC que miden la función efectora
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Ejemplo 7- Los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 que comprenden regiones CH quiméricas muestran una función efectora disminuida en un ensayo ADCC
Para examinar el efecto de Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2 frente a anticuerpo biespecífico con regiones CH de tipo silvestre (y regiones variables idénticas) sobre la función efectora de ADCC, los linfocitos NK positivos para CD56 no estimulados recientemente aislados o las células NK92 diseñadas para expresar el alelo V de mayor afinidad de FcYRIIIa se sembraron en placas con células de Raji o Daudi CD20 positivas marcadas con calceína en presencia de anticuerpos quiméricos CH (Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2) y anticuerpo de control wt-CH (Anticuerpo de Control 4). La liberación de calceína de células diana se monitorizó y el porcentaje de citotoxicidad se determinó. El porcentaje de citotoxicidad y CE50 se calcularon como se describió para el ensayo CDC, anteriormente. Los resultados se muestran en Tabla 13 y en Figuras 6A y 6B.
Los anticuerpos quiméricos CH, Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2, no median la actividad ADCC (Tabla 13) contra células de Raji o Daudi.
Tabla 13: Los anticuerpos biespecíficos CD3 x CD20 que comprenden regiones CH quiméricas muestran actividad reducida en ensa os ADCC que miden la función efectora
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Ejemplo 8-Afinidades de unión derivadas de resonancia de plasmón superficial y constantes cinéticas de anticuerpos quiméricos
Los anticuerpos biespecíficos anti-CD3 x anti-CD20 que tienen Anticuerpo 1 y Anticuerpo 4 con regiones quiméricas constantes de cadena pesada se analizaron usando la tecnología de Resonancia de Plasmón de Superficial (SPR) (Biacore) para determinar sus parámetros de unión cinética a receptores Fcy humanos y de cinomolgo. Los controles de isotipo, en particularcontrol de isotipo wt-IgG1 y control de isotipo wt-IgG4 CPPC, se probaron de manera similar.
En resumen, los experimentos SPR se realizaron a 25 °C en un instrumento Biacore T200 que emplea un chip recubierto con carboximetildextrano (CM-5). Un anticuerpo monoclonal de ratón anti-penta-histidina (GE Healthcare) se inmovilizó en la superficie del chip sensor CM-5 usando química estándar de acoplamiento de amina. 140RU-376RU de proteínas de FcyR humanas o de mono marcadas con His se capturaron en el chip CM-5 anti-penta-histidina acoplado a amina y se inyectaron soluciones madre de anticuerpos a 20 pl/min durante 2,5 minutos sobre las proteínas capturadas. La respuesta de unión a mAb se controló y, para receptores de baja afinidad, se calculó el equilibrio de unión en estado estacionario. Las constantes de velocidad de asociación (ka) y disociación (kd) cinéticas se determinaron procesando y ajustando los datos a un modelo de unión 1:1 usando el programa informático de ajuste de curvas Scrubber 2.0. Las constantes en equilibrio de disociación de unión (Kd) y las semividas disociativas (t1/2) se calcularon a aprtir de las constantes de velocidad cinéticas como: Kd (M) = kd / ka; y t i /2 (min) = (In2/(60*kd).
Tabla 14: Parámetros de unión cinética para anticuerpos de cadena pesada quiméricos y de tipo silvestre wt
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Como demuestran los resultados en la Tabla 14, Los anticuerpos biespecíficos Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2 no muestran unión a FcyRI humano, en comparación con los anticuerpos que tienen la región CH de hlgG1 o CH de hlgG4-CPPC de tipo silvestre, en el ensayo SPR. Los anticuerpos biespecíficos quiméricos de cadena pesada de esta divulgación también muestran una unión débil o nula para varios de los receptores FcRy humanos de baja afinidad (p.ej., unión débil en FcRyIIA humano, FcRyIIB, y no se detectó unión en FcRyI humano, FcRy IIIA o FcRy IIIB) en comparación con anticuerpos con la secuencia wt hlgG1 o hlgG4-CPPC Fc (Tabla 15, a continuación).
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Ejemplo 9 Perfil farmacocinético de anticuerpos quiméricos
El perfil toxicocinético del Anticuerpo 1 y Anticuerpo 2 se evaluó obteniendo muestras de sangre de monos cinomolgos machos (3 animales/grupo de tratamiento) que recibieron una infusión IV de 30 minutos, seguido de un periodo de observación de 12 semanas. Se recogieron muestras de sangre para el análisis toxicocinético de las concentraciones totales de fármaco en suero antes de la dosis y después de la dosis a los 5 minutos, a las 5, 24, 48, 72 y 168 horas, y los días 14, 21, 35, 49, 66 y 84. Las muestras de suero resultantes se analizaron mediante un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas directo (ELISA) para determinar la concentración total del fármaco de Ab 1 o Ab 2. La toxicocinética de los artículos de ensayo se evaluó mediante análisis no compartimental (Phoenix WinNonLin) para determinar los parámetros farmacocinéticos. Los resultados se muestran en la Tabla 16 (AUC = área bajo la curva de concentración frente a tiempo; Cmáx = concentración máxima observada en suero).
Tabla 16: Perfil farmacocinético de anticuerpos quiméricos en suero de monos cinomolgos después de una infusión intravenosa única a monos cinomol os
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Después de una dosis intravenosa única de 1,0 mg/kg de Ab 1 y Ab 2 en monos cinomolgos, concentraciones máximas medias (Cmáx) de 33,4 y 26,0 pg/ml, respectivamente, y valores medios de AUC0-168h de 100 y 61,1 día*ug/ml, respectivamente, se observaron. La semivida terminal aparente se calculó entre 8,14-14,0 días de estas dos moléculas. Los datos indican que la exposición continua a Ab 1 y Ab 2 se mantuvo en todos los animales durante la mayor parte del periodo de observación de 12 semanas y la exposición fue comparable entre los grupos de tratamiento. No se observó inmunogenicidad aparente con los artículos de ensayo. Los perfiles farmacocinéticos generales de Ab 1 y Ab 2 son típicos de anticuerpos monoclonales dosificados en mono cinomolgo.
Ejemplo 10. Los anticuerpos biespecíficos CD3 x CD20 pueden empobrecer los linfocitos B CD20+ en monos cinomolgos con dosis más bajas que los anticuerpos monoespecíficos
Para determinar la potencia in vivo de la administración de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 de Anticuerpo 1 y Anticuerpo 4 de control, los cambios en los niveles de linfocitos B CD20+ en sangre periférica de monos cinomolgos se examinaron mediante FACS después de administración del anticuerpo biespecífico anti-CD3xCD20 en comparación con anticuerpo anti-CD20 monoespecífico (Ab 3 de Control). El estudio se realizó en monos cinomolgos machos (Macaca fascicularis) organizados en ocho grupos de dosificación de 3 animales por grupo de dosificación como sigue: Grupo 1 fue el grupo de placebo (administración de control del vehículo); Grupo 2 recibió anticuerpo monoespecífico (Ab 3 de Control; rituxan) a 30 mg/kg (30 mg/kg en mono es equivalente a la dosis humana de 375 mg/m2 que se considera una dosis clínica máxima); Grupo 3 es el Anticuerpo 4 de Control biespecífico CD3xCD20 a 0,01 mg/kg; Grupo 4: Anticuerpo 4 a 0,1 mg/kg; Grupo 5 - Anticuerpo 4 a 1 mg/kg; Grupo 6 - Anticuerpo 1 a 0,01 mg/kg; Grupo 7 - Anticuerpo 1 a 0,1 mg/kg; y Grupo 8 - Anticuerpo 1 a 1 mg/kg. Se extrajo sangre el día -7 y el día -4 antes de la dosificación de los animales. Las dosis de fármaco o vehículo de anticuerpo (placebo) se administraron mediante infusión i.v. y se extrajo sangre a 2, 4 y 7 días después de la dosificación. Las muestras de sangre fueron analizadas por FACS para linfocitos B (CD20; Tabla 17) y marcadores de linfocitos T (CD3, véase a continuación) y el número absoluto de estos tipos de células se determinó.
En resumen, se incubaron 100 pl de sangre con 1,5 ml de tampón de lisis de glóbulos rojos en tubos Eppendorf durante tres minutos. Las células se centrifugaron durante cinco minutos a 0,4xg, se lavaron 2x con lavado FACS (PBS FBS al 3 %) y se bloquearon durante 10 minutos a temperatura ambiente con reactivo de bloqueo Fc. Las células se incubaron durante 30 minutos a 4 °C con anticuerpos directamente conjugados a hCD45 y reactivos fluorescentes CD20. La determinación cuantitativa de subconjuntos de linfocitos B (CD20) o subconjuntos de linfocitos T (CD3) se realizó primero utilizando una estrategia de activación heterogénea que consistía en la tinción fluorescente CD45 y la demarcación de la característica de dispersión lateral (SSC) (CD45brightSSCdim) para delinear las poblaciones de glóbulos blancos (WBC). Después las poblaciones de linfocitos B se identificaron mediante el uso de anticuerpos relevantes marcados con fluorescencia (CD20 APC-Cy7). Después de la coloración, las células se lavaron dos veces antes de la adquisición de FACS mediante un citómetro FACSCanto y se analizaron con el software FlowJo. Los resultados se muestran en Tabla 17 y en Figuras 11A y 11B.
Tabla 17: Número de CD45 circulantes, célulaspositivas para CD20 en sangre periférica de mono después de tratamiento
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Como se muestra en Tabla 17 y Figura 11A, la administración de los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 y el anticuerpo monoespecífico anti-CD20 dio como resultado el empobrecimiento de los linfocitos B circulantes a los niveles iniciales en el primer punto temporal medido (día 2). Este empobrecimiento no se observó en la cohorte de animales control con placebo. El empobrecimiento de linfocitos B en las cohortes biespecíficas se mantuvo durante 1 semana después de la administración de 1 mg/kg de anticuerpos biespecíficos, y el empobrecimiento de linfocitos B también se mantuvo en las cohortes biespecíficas de dosis de 0,01 y 0,10 mg/kg.
Los niveles de linfocitos T (CD3+) también se monitorizaron en este experimento mediante anticuerpos anti-CD3 marcados con fluorescencia. Se observó una pérdida transitoria de linfocitos T circulantes el día 2 después de la dosis en las cohortes de anticuerpos biespecíficos (Ab 4 y Ab 1; todas las dosis). No se observó pérdida de linfocitos T (por debajo del valor inicial) en los grupos de Control (Placebo) de Vehículo o Ab 3 de Control (Rituxan) en los momentos medidos. Los niveles de linfocitos T volvieron a los niveles iniciales en las cohortes de anticuerpos biespecíficos en el momento del día 4 y se mantuvieron en los niveles iniciales hasta el final del experimento (ver Figura 11B).
La potencia in vivo de los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 de Anticuerpo 1 y Anticuerpo 4 se midió en sangre periférica de monos cinomolgos en un estudio a largo plazo (3 meses) que midió los cambios en los niveles de linfocitos B CD20+ o niveles de linfocitos T CD3+, análogamente al estudio descrito anteriormente. Placebo (vehículo) o anticuerpos biespecíficos se administraron a 1,0 mg/kg el Día 0. Los niveles de linfocitos B en sangre periférica se redujeron significativamente en el día 2 en ambas cohortes de anticuerpos biespecíficos y los niveles permanecieron empobrecidos durante la duración del estudio en todas las muestras excepto el placebo (ver Fig. 12A). Se observó una pérdida transitoria de linfocitos T el día 2 en las cohortes biespecíficas, después, los linfocitos T se recuperaron a los niveles iniciales en el día 4 y permanecieron alrededor del valor inicial según se midió durante todo el estudio (> 80 días) para los animales tratados con anticuerpos biespecíficos (Fig. 12B). No se observó pérdida transitoria de linfocitos T en animales tratados con placebo.
Para medir además la potencia in vivo del anticuerpo biespecífico CD3xCD20 Anticuerpo 1 y Anticuerpo 4 a dosis bajas de administración, los cambios en los niveles de linfocitos B CD20+ o los niveles de linfocitos T CD3+ se midieron en sangre periférica de monos cinomolgos en un estudio a largo plazo (2 meses), análogamente a los experimentos anteriores. Los anticuerpos biespecíficos se administraron a 0,01 mg/kg o 0,001 mg/kg (1 pg/kg) el Día 0. Los niveles de linfocitos B en sangre periférica se empobrecieron significativamente el día 2 y los niveles permanecieron empobrecidos durante el periodo del estudio para ambas cohortes CD3xCD20 (Fig. 13A), similar a la observada en animales tratados con dosis más altas de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 (como se observa en Tabla 17 y Figuras 11A o 12A). Los animales tratados con dosis muy bajas (1 pg/kg) de anticuerpos biespecíficos experimentan la misma pérdida transitoria de linfocitos T y recuperación que la observada en animales tratados con dosis más altas de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 (ver Fig. 13B en comparación con Figuras 11B o 12B).
La pérdida de linfocitos B como se observó en los estudios descritos se correlacionó con la pérdida de anticuerpos circulantes en sangre periférica de animales tratados con CD3xCD20-Fc quimérico Anticuerpo 1 (ver Figura 14). Como la exposición de anticuerpos en la circulación de animales se empobrece con el tiempo, las poblaciones de linfocitos B comienzan a recuperarse (p.ej., como se observó en el día 81 para el animal no. 106881).
La correlación de la pérdida de linfocitos B con la pérdida de anticuerpos circulantes en la sangre periférica también se observó en animales tratados con CD3xCD20-Fc quimérico Anticuerpo 2 (ver Figura 15), mientras que la exposición de anticuerpos en la circulación de animales se empobrece con el tiempo, entonces las poblaciones de linfocitos B comienzan a recuperarse, p.ej., como se observó en el día 66 para el animal no. I06876, y en el día 68 para el animal no. I06877. También se observó una correlación similar en animales tratados con el anticuerpo biespecífico CD3xCD20-wtFc (Ab 4) (ver Figura 16). Como la exposición de anticuerpos en la circulación de animales se empobrece con el tiempo, Las poblaciones de linfocitos B comienzan a recuperarse (ver Figura 16, p.ej., como se observó el día 91 para el animal no. I06870, y el día 64 para el animal no. I06872).
Ejemplo 11. Los anticuerpos biespecíficos CD3 x CD20 pueden empobrecer los linfocitos B CD20+ en tejidos linfoides de monos cinomolgos con dosis más bajas que los anticuerpos monoespecíficos
Los cambios en los niveles de linfocitos B CD20+ en tejidos linfoides de monos cinomolgos se examinaron mediante FACS después de administración del anticuerpo biespecífico anti-CD3xCD20 (Anticuerpo 1 o Anticuerpo 4) en comparación con el anticuerpo anti-CD20 monoespecífico (Ab 3 de Control- Rituxan). El estudio se realizó en monos cinomolgos macho (Macaca fascicularis) organizados en ocho grupos de dosificación de 3 animales por grupo de dosificación como flujos, análogamente a los Grupos 1-8 como se describió en el Ejemplo 10, anteriormente. Las dosis de fármaco o vehículo de anticuerpo se administraron mediante infusión i.v. y los animales se sacrificaron y los tejidos se recogieron a los 7 días después de la administración. Las muestras de tejido se analizaron mediante FACS para glóbulos blancos (CD45+), y específicamente linfocitos B (CD20+), marcadores, entonces se determinó el % de volumen de linfocitos B.
Las poblaciones de linfocitos B se identificaron mediante el uso de anticuerpos relevantes marcados con fluorescencia (CD20 APC-Cy7) y la adquisición de FACS, de manera análoga al método descrito anteriormente para Ejemplo 10. Los resultados se muestran en Tabla 18 y en Figuras 17A y 17B.
Tabla 18: Porcentaje de células CD20 positivas en ganglios linfáticos mesentéricos y bazo de mono después de tratamiento
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continuación
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Como se muestra en Tabla 18 y Figura 17A, La administración de los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 en comparación con el anticuerpo monoespecífico anti-CD20 dio como resultado empobrecimiento de linfocitos B de tejido en bazo a dosis mucho más bajas (dosis de 0,01 a 1,0 mg/kg) para las cohortes biespecíficas. Este empobrecimiento no se observó en la cohorte de animales control con placebo.
Como se muestra en Tabla 18 y Figura 17B, la administración de los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 en comparación con el anticuerpo monoespecífico anti-CD20 dio como resultado empobrecimiento de linfocitos B de tejido en ganglios linfáticos mesentéricos a dosis mucho más bajas (dosis de 0,01 a 1,0 mg/kg) para las cohortes biespecíficas, con la dosis de 0,1 mg/kg y la dosis de 1 mg/kg de anticuerpo biespecífico dando como resultado empobrecimiento de linfocitos B más eficaz que en la cohorte monoespecífica. Este empobrecimiento no se observó en la cohorte de animales control con placebo.
Ejemplo 12. Tratamiento tumoral con anticuerpo biespecífico CD3 x CD20
A. El tratamiento con anticuerpo biespecífico CD20 x CD3 suprime el crecimiento tumoral Raji en ratones NSG
Para evaluar la eficacia de determinados anticuerpos biespecíficos anti-CD3xCD20 en la reducción del crecimiento tumoral Raji, ratones NSG (ratones NOD/LtSz-scid/IL2RYnul°) adquiridos en Jackson Laboratories (Bar Harbor, Maine, EE.UU.) fueron coimplantados por vía subcutánea con 2x106 células tumorales Raji y 5x105 PBMC humanas (Día 0). El mismo día, los ratones fueron tratados con una dosis intraperitoneal de 0,4, 0,04 o 0,004 mg/kg por ratón (N = 5 ratones por grupo de tratamiento) de Anticuerpo 1, o Anticuerpo de Control 5 (un anticuerpo de IgG1 para una diana irrelevante), o Control de Vehículo. Comenzando el Día 0, los ratones fueron tratados dos veces por semana con una dosis intraperitoneal de fármaco o vehículo durante el resto del estudio. El tamaño tumoral se midió dos veces por semana usando calibradores, y el volumen tumoral se calculó como Volumen = (longitud x anchura2)/2. Los análisis estadísticos se realizaron utilizando el software GraphPad Prism 5.0 (versión Macintosh).
La significación estadística se determinó mediante ANOVA bilateral con comparaciones múltiples de Tukey después del ensayo. Los datos de cada una de las lecturas se compararon entre grupos de tratamiento. Un umbral de p<0,05 se consideró estadísticamente significativo. Los resultados se muestran en Figuras 7A-7F. Estos resultados muestran que Anticuerpo 1 (CD3xCD20-Fc quimérico) se dirige a tumores Raji en ratones que tienen células inmunes humanas coimplantadas, dando como resultado la supresión completa del crecimiento tumoral a las dosis probadas (FIG. 7C: 0,4 mg/kg de Ab1; FIG. 7E: 0,04 mg/kg de Ab1; FIG. 7F: 0,004 mg/kg de Ab1). Este ejemplo demuestra que el tratamiento con Anticuerpo 1 biespecífico CD3xCD20 fue eficaz para inhibir el crecimiento tumoral a partir del momento de la implantación del tumor. El crecimiento del tumor Raji permaneció completamente suprimido hasta 23 días después de la implantación en ratones que recibieron dosis de 0,4, 0,04 o 0,004 mg/kg de Anticuerpo 1, en relación con el control. También se observó que ni el Anticuerpo 1 ni el Anticuerpo de Control tuvieron un efecto significativo en el peso corporal del ratón durante el estudio (datos no mostrados).
El efecto antitumoral de los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 se probó adicionalmente en un modelo de ratón NSG similar (como se describió anteriormente), sin embargo, cada ratón NSG se dosificó con 1 mg de IgG de ratón (Fc de mlgG2a) el Día -1, y una vez por semana desde entonces. Los resultados se muestran en Figuras 8A-8B.
Este experimento demuestra que el tratamiento con Anticuerpo 1 biespecífico CD3xCD20 (CD3xCD20-Fc quimérico) o con Anticuerpo 4 biespecífico CD3xCD20 (CD3xCD20-wtFc) fue eficaz para inhibir el crecimiento tumoral a partir del momento de la implantación del tumor a las dosis de Ab biespecífico analizadas en presencia de IgG circulante (Figuras 8A-8B). Como se ve en Fig. 8A, el Anticuerpo 1 (anticuerpo biespecífico CD3xCD20-Fc quimérico) demuestra la inhibición completa del crecimiento tumoral durante el periodo de tiempo probado con o sin suplementación con IgG en este experimento.
B. El tratamiento con anticuerpo biespecífico CD3 x CD20 reduce tumores establecidos en ratones NSG Se evaluó la eficacia de anticuerpos biespecíficos anti-CD3xCD20 seleccionados en la reducción de tumores establecidos en ratones NSG. Los ratones NSG (ratones NOD/LtSz-scid/IL2RYnul°) se adquirieron en Jackson Laboratories (Bar Harbor, Maine, EE.UU.) y se implantaron por vía subcutánea con células tumorales Raji compatibles con HLA (2x106) y PBMC humanas (5x105) (Día -15). Se permitió que los tumores se establecieran en el hospedador durante 15 días antes del tratamiento. Un día antes de la administración del fármaco (Día -1), los ratones recibieron dosis de suplementos de 5 mg de Fc de mlgG2a. Los ratones se dosificaron posteriormente con Fc de mlgG2a a 5 mg por ratón una vez por semana durante el periodo del experimento (Día 7, Día 14, etc.). Los ratones se separaron en 2 grupos experimentales antes de administrar el fármaco según el tamaño tumoral: Grupo 1: -200-400 mm3 o Grupo 2: -500-900 mm3.
Después del tratamiento farmacológico, en tamaño tumoral se monitorizó y registró en cada ratón el Día 0, 3, 6, 10, 14, 17, 21 y 28. El tamaño tumoral se midió dos veces por semana usando calibradores, y el volumen tumoral se calculó como Volumen = (longitud x anchura2)/2. La presencia de tumores también se determinó por palpación. Los análisis estadísticos se realizaron utilizando el software GraphPad Prism 5.0 (versión Macintosh). Los datos de cada una de las lecturas se compararon entre grupos de tratamiento. Los resultados se muestran en Figuras 9 y 10.
a. Grupo 1: tumores de -200-400 mm3. Desde el Día 0, varias cohortes de 4 o 5 ratones cada una fueron tratadas con la dosis indicada de fármaco o vehículo una vez por semana (es decir, Día 7, Día 14, etc.) como sigue:
i. Control: vehículo solo
ii. Anticuerpo 5 de Control, 0,4 mg/kg
iii. Anticuerpo 1 (CD20xCD3-Fc quimérico), 0,4 mg/kg
b. Grupo 2: tumores de -500-900 mm3. Desde el Día 0, varias cohortes de 4 ratones cada una fueron tratadas con la dosis indicada del fármaco una vez por semana (es decir, Día 7, Día 14, etc.) como sigue:
i. Anticuerpo 5 de Control, 0,4 mg/kg
ii. Anticuerpo 1 (CD20xCD3-Fc quimérico), 0,4 mg/kg
Los tumores retrocedieron completamente en la cohorte administrada con 0,4 mg/kg de Anticuerpo 1 (CD20xCD3-Fc quimérico) durante 14 días. Ver Figura 9.
En el modelo con tumores establecidos más grandes (es decir, Grupo 2, -500-900 mm3), el tratamiento con Anticuerpo 1 (CD20xCD3-Fc quimérico) (0,4 mg/kg) dio como resultado la ablación completa de los tumores observados en ratones en 21 días. Ver Figura 10.
Ejemplo 13. Los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 inducen proliferación de PBMC in vitro
La capacidad de los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 seleccionados y las construcciones de control para estimular las células mononucleares de sangre periférica (PBMC) e inducir la proliferación se evaluó mediante cuantificación catalizada por ATP (CellTiter Glo®). La activación de PBMC da como resultado la liberación de citoquinas que impulsan la proliferación celular.
Los datos de proliferación se obtuvieron utilizando el siguiente protocolo: PBMC derivadas de humano o mono cinomolgo (5x105/pocillo) se incubaron con diluciones en serie de anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 o anticuerpo de control y anticuerpo comercial anti-CD28 (humano: 200 ng/ml, cino: 500 ng/ml) durante 72 horas a 37 °C. Las células se cuantificaron usando Cell Titer Glo® y se midió la luminiscencia a medida que se leía la viabilidad celular usando un lector de placas de múltiples etiquetas VICTOR X5 (PerkinElmer) para detectar células vivas. La viabilidad celular (inducción doble de células estimuladas frente a células no estimuladas) se determinó dividiendo la luminiscencia de las células estimuladas entre la luminiscencia inicial de las células no estimuladas y se representaron utilizando el software Prism. Los resultados se resumen en Tabla 19 y Figuras 18A y 18B.
Tabla 19. CE50 para proliferación de PBMC humanas y de cinomolgo inducida por anticuerpos biespecíficos anti-CD3x CD20
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Como se muestra en Tabla 19 y Figuras 18A-18B, ambos anticuerpos biespecíficos CD20 x CD3 indujeron proliferación de PBMC humanas o de cinomolgos. El Anticuerpo 1 indujo proliferación tanto de PBMC humanas como de cinomolgos con una potencia aproximadamente igual. Ab 5 de Control no exhibió actividad.
Ejemplo 14. Los biespecíficos CD20 x CD3 median la destrucción celular por linfocitos T activados in vitro
Se aislaron PBMC humanas o de cinomolgo sobre Ficoll-Paque o usando medios de separación de células de mamífero Lympholyte, respectivamente. PBMC aisladas (1x106 células/ml de PBMC humanas o 5x106 células/ml de PBMC de cinomolgos) se activaron durante 7 y 21 días, respectivamente, en medios completos (RPMI suplementado con FBS al 10 %, 100 U/ml de penicilina, estreptomicina 100 pg/ml, 292 pg/ml de L-glutamina) que contenía IL-2 humana recombinante (30 U/ml para PBMC humanas, 100 U/ml para PBMC de cinomolgos) y perlas de activación de linfocitos T (anti-CD3/CD28 para PBMC humanas, anti-CD2/CD3/CD28 para PBMC de cinomolgos). Las células de Raji que expresan CD20 (2x106 células/ml) se marcaron con 8 pM de Calceína-AM durante 30 minutos a 37 °C y se lavaron 3 veces con medio. Las células diana marcadas con calceína (10.000-20.000 células/pocillo) se sembraron en placas en 200 pl con linfocitos T activados (relación efector/célula diana 10:1) y diluciones en serie del Anticuerpo 1, Ab 4 o Ab 5 de Control (rango de concentración en humanos: 2 nM a 0,00003 nM; rango de concentración en cinomolgos: 6,6 nM a 0,002 pM) en medio completo durante 2 horas a 37 °C. Después de incubación, las placas se centrifugaron y los sobrenadantes se transfirieron a una placa de fondo transparente negro translúcido para análisis de fluorescencia. El porcentaje de citotoxicidad se calculó utilizando la ecuación:
% de citotoxicidad = ((FS - FSR)/(FMR-FSR))*100 %,
donde FS es liberación de calceína del pocillo de ensayo, FSR es liberación espontánea de calceína y FMR es liberación máxima de calceína de las células lisadas con Triton-X.
La CE50 de viabilidad celular (cuantificación catalizada por ATP) se determinó utilizando el software Prism. La lisis celular (citotoxicidad) se midió mediante liberación de calceína como una fracción de liberación máxima. El porcentaje de citotoxicidad celular se calculó como liberación observada en comparación con liberación máxima y valores de CE50 determinados. Los resultados se muestran en Tabla 20 y en Figuras 19A (linfocitos T humanos) y 19B (linfocitos T de mono).
T l 2 . V l r E r i xi i in i r D x D2 n l l R i
Figure imgf000050_0001
Como se muestra en la Tabla 20, el Anticuerpo 1 medió la destrucción de células diana con valores de CE50 representativos de 25,0 pM y 9,10 pM para linfocitos T humanos (Figura 19A) y de cinomolgo (Figura 19B), respectivamente. La destrucción de células diana mediada por el anticuerpo 4 con valores de CE50 representativos de 15,7 pM y 1,73 pM para linfocitos T humanos (Figura 19A) y de cinomolgo (Figura 19B), respectivamente. No se observó actividad del control.
Para controlar la destrucción específica de células diana con CD20 mediante citometría de flujo, células de mieloma murino parental B16F10.9 (que no expresan CD20) y linfocitos B16F10.9 diseñados para expresar de manera estable CD20 humano (B16F10.9/CD20) se marcaron con 1 pM de colorantes fluorescentes de rastreo de éster de succinimidilo de diacetato de carboxifluoresceína (CFDA-SE) y Rastreador de Células Violetas, respectivamente. Después del etiquetado, las células se mezclaron en una relación 1:1 y se sembraron en placas durante una noche a 37 °C. Por separado, Las PBMC humanas se sembraron en placas en medio RPMI suplementado a 1x106 células/ml y se incubaron durante la noche a 37 °C para enriquecer los linfocitos mediante empobrecimiento de macrófagos adherentes, células dendríticas y algunos monocitos. Al día siguiente, las células diana se incubaron conjuntamente con PBMC sin tratamiento empobrecidada en células adherentes (relación célula Efector/Diana 4:1) y una dilución en serie de anticuerpos biespecíficos de ensayo CD3xCD20 o Anticuerpos 5 de Control de IgG1 (intervalo de concentraciones: 66,7 nM a 0,25 pM) durante 48 horas a 37 °C. Las células se eliminaron de las placas de cultivo celular utilizando un tampón de disociación celular libre de enzimas y se analizaron mediante FACs . Para análisis FACS, las células se tiñeron con un rastreador de glóbulos rojos muertos/vivos (Invitrogen). Para la evaluación de la especificidad de destrucción, las células se seleccionaron en poblaciones vivas marcadas con violeta y CFDA-SE. El porcentaje de cada población se informó para el cálculo de supervivencia ajustada como sigue: Supervivencia ajustada = (R1/R2)*100, donde R1 = [(B16F10.9/CD20)/células espectadoras (B16F10.9)]*100 en ausencia de anticuerpo, y R2 = la misma proporción pero en presencia de anticuerpo de ensayo.
Tabl 21. V l r E r r i n ífi i n n linf i B1 F1 . CD20
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Tanto CD3xCD20-Fc quimérico (Anticuerpo 1) como CD3xCD20-wtFc (Anticuerpo 4) se dirigieron específicamente a linfocitos T humanos para destruir solo células diana que expresan CD20 (Figura 20A-B) en una población mixta de células. La destrucción de células diana solo se observó en presencia del anticuerpo biespecífico, con linfocitos B16F10.9/CD20 empobrecidos de forma dependiente de la dosis por el Anticuerpo 1 (CE50 19,5 pM) y Anticuerpo 4 (CE5012,8 pM) (Figura 20B). Menos del 5 % de células que expresan CD20 estaban vivas a la dosis más alta probada (10 pg/ml) (Figura 20B). No se observó evidencia de destrucción celular en la población de linfocitos B16F10.9 parentales o en la población B16F10.9/CD20 con Ab 5 de Control, un anticuerpo de control de IgG1.
Ejemplo 15. El anticuerpo biespecífico CD3xCD20 regula positivamente el marcador de activación temprano CD69 en los linfocitos T en un ensayo in vitro FACS de 20 horas
CD69+ es uno de los primeros marcadores de superficie celular inducibles que indica que los linfocitos T se han activado. La activación de linfocitos T puede determinarse examinando la regulación positiva de marcadores específicos de superficie celular, como CD69.
La capacidad del anticuerpo biespecífico CD3xCD20 para regular positivamente el marcador de activación temprana CD69 en linfocitos T humanos o de cinomolgo en sangre completa se determinó en un ensayo FACS in vitro de 20 horas. En resumen, La activación de linfocitos T se evaluó incubando sangre completa humana o de cinomolgo recién aislada (100 pl) en placas de 96 pocillos de fondo plano con diluciones en serie de 5 veces (humano) o 10 veces (cinomolgo) del Anticuerpo 1, Anticuerpo 4 o Ab 5 de Control (rango de concentraciones de 50 nM a 0,0006 nM) en RPMI+L-glutamato a un volumen final de 200 pl durante 20 horas a 37 °C. Después de incubación, las placas se centrifugaron durante 5 minutos a 1000 rpm y el plasma se eliminó. Para medir la regulación positiva de CD69 en linfocitos T, un cóctel de fenotipado que contiene anticuerpos conjugados directamente a CD2 y CD69, así como CD45, CD4, CD8 y CD19 (humano) o CD16 (cinomolgo) se añadió directamente a la sangre durante 30 minutos a 4 °C. Los glóbulos rojos se lisaron durante 15 minutos con 1,5 ml de tampón PharmLyse siguiendo las instrucciones del fabricante. Las células se lavaron dos veces, se resuspendieron en 200 pl de PBS frío FBS al 1 %, y se analizaron por citometría de flujo utilizando un citómetro BD FACSCanto. Los linfocitos T CD4+ se identificaron por primera vez en linfocitos CD45+ pequeños viables y después en linfocitos T CD19-/CD2+/CD4+ (humanos) o linfocitos T CD16-/CD2+/CD4+ (cinomolgo).
El porcentaje de linfocitos T activados (CD69+) del total de células efectoras CD2+ se informa. Ver Tabla 22 y también Figura 21. Los resultados muestran que los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 activaron significativamente los linfocitos T detectados por el marcador de activación temprana CD69.
Tabla 22. V l r E r r i n ífi i n n linf i B1 F1 . /CD20
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Ejemplo 16. Los anticuerpos biespecíficos CD3xCD20 inducen la agrupación de linfocitos T con células diana
Un formato de agrupamiento celular se usó para determinar que el anticuerpo biespecífico CD3xCD20 unía linfocitos T con células diana (células CD20+) mediante sus grupos de unión biespecíficos. Las células efectoras se sometieron a tinción previa con CFSE, y las células CD20+ se sometieron a tinción previa con Rastreador de Células Violetas durante 24 horas, y se seleccionaron para separar los cuadrantes después de incubación con un anticuerpo de control irrelevante (Anticuerpo 5 de Control, anticuerpo de isotipo IgG1 irrelevante). Ver Figura 22A, que representa la ausencia de agrupamiento (doble tinción) en la mezcla celular para tratamiento con anticuerpos irrelevantes. Después de incubación con anticuerpo biespecífico CD3xCD20, aparecen agrupamientos celulares debido a la tinción con CFSE y Violeta (ver Figura 22B, en el cuadrante superior izquierdo en el diagrama de dispersión como se resalta con el cuadrado en negrita).
Ejemplo 17. Expresión de marcadores Tim-3 y PD-1 inhibitorios en células CD3+
La disfunción de linfocitos T, o empobrecimiento, ocurre en hospedadores portadores de tumores. Los receptores Tim-3 y PD-1 se han identificado como marcadores de linfocitos T empobrecidos en estados de enfermedad crónica. Según los investigadores Sakuishi, K. et al. (J. Exp. Med. 207(10):2187-2194, 2010), los linfocitos infiltrantes de tumor (TIL) que son positivos para Tim-3 y PD-1 (Tim-3+PD-1+TIL) exhiben el fenotipo de empobrecimiento más grave según lo definido por incapacidad para proliferar y producir IL-2, TNF e IFN-y.
Se extrajeron células positivas para CD3 de sangre y tumores de ratones NSG que se coimplantaron por vía subcutánea con células tumorales Raji emparejadas con HLA y PBMC humanas - ver Ejemplo 12B, anteriormente en este documento. En resumen, se permitió que los tumores se establecieran en el hospedador durante 15 días antes del tratamiento, después los ratones se separaron en dos grupos de tratamiento en función del tamaño del tumor (ver Ejemplo 12B). Se extrajo sangre de los ratones tratados (Ab biespecífico) y no tratados el Día 9 de cada grupo de estudio, es decir, Grupo 1, -200-400 mm3 o Grupo 2, -500-900 mm3. Los ratones que no fueron tratados (vehículo o Ab de Control) con tumores que alcanzan 1500 mm3 se sacrificaron al final del estudio y se evaluó la expresión de PD1 y Tim-3 en estos tumores.
Para experimentos con linfocitos T circulantes, se seleccionaron fracciones de linfocitos T CD45+CD3+ viables para identificación del marcador usando anticuerpos marcados directamente contra Tim-3 o PD-1 (disponibles comercialmente en Biolegend). Los linfocitos Tim-3+PD-1+ fueron la fracción predominante de linfocitos T circulantes en sangre de animales no tratados. Sin embargo, los linfocitos T en sangre de animales tratados con anticuerpo biespecífico CD20xCD3 (Ab 1) mostraron fracciones más bajas de linfocitos Tim-3+PD-1+.
Las células tumorales de los hospedadores no tratados se separaron y se tiñeron para viabilidad. El análisis FACS se realizó para células individuales viables para clasificar las fracciones celulares CD45+CD3+, que después se probaron para expresión de Tim-3 o PD-1.
Se encontró que los receptores inhibitorios Tim-3 y PD-1 se expresaban en CD3+TIL en linfomas de linfocitos B de NSG de ratones sin tratar durante los experimentos descritos en Ejemplo 12B, y que los linfocitos Tim-3+PD-1+ fueron la fracción predominante de tumores infiltrantes de linfocitos T.
Ejemplo 18. El tratamiento con anticuerpo biespecífico CD3 x CD20 es más eficaz que el anticuerpo anti-CD20+ en ratones NSG con tumores Raji establecidos
Se evaluó la eficacia de anticuerpos biespecíficos anti-CD3xCD20 seleccionados en la reducción de tumores establecidos en ratones NSG. Los ratones NSG (ratones NOD/LtSz-scid/IL2RYnul°; Jackson Laboratories) fueron coimplantados por vía subcutánea con células tumorales Raji (2x106) y PBMC humanas (5x105) (el Día -14) (como en el Ejemplo 12B).
El Ab1 biespecífico CD20xCD3 (dosificado a 0,4 mg/kg; 2x/semana i.p.) fue comparable al CD19xCD3 BiTE (dosificado a 0,5 mg/kg; 5x/semana i.v.) (Figura 23) y superior al tratamiento con rituximab (dosificado a 8 mg/kg; 5x/semana i.p.) (Figura 24) para suprimir tumores Raji establecidos
Ejemplo 19. Tratamiento de melanoma con anticuerpo biespecífico CD3 x CD20
Los investigadores determinaron que ciertas subpoblaciones de cánceres melanoma en pacientes, como células tumorales de melanoma CD20+, pueden representar características que inician el tumor y un mayor riesgo de recurrencia de la enfermedad (Pinc et al. Mol Ther. 20(5):1056-1062, 2012, epub 21 Feb 2012). El anticuerpo Ab1 biespecífico CD20xCD3 demostró una potente actividad contra otras células tumorales que expresan CD20, ya que retrasó significativamente el crecimiento tumoral de B16F10.9 (B16F10.9/CD20) transducido por hCD20 en ratones inmunocompetentes.
Ejemplo 20. Un ensayo clínico en Fase 1 para estudiar la seguridad y la tolerabilidad de un anticuerpo monoclonal biespecífico anti-CD20xCD3 en pacientes con neoplasias malignas de linfocitos B CD20+ previamente tratadas con terapia con anticuerpos dirigidos contra CD20
Objetivos de estudio y descripción general
El objetivo principal del presente estudio es evaluar la seguridad, tolerabilidad y toxicidades limitantes de la dosis (DLT) de un anticuerpo monoclonal biespecífico anti-CD20xCD3 administrado por vía intravenosa. El anticuerpo monoclonal biespecífico anti-CD20xCD3 utilizado en el presente estudio es el anticuerpo al que se hace referencia en otras partes del presente documento como "Ab1".
Los objetivos secundarios del estudio son: (a) caracterizar el perfil farmacocinético (PK) de Ab1; (b) evaluar la inmunogenicidad de Ab1; (c) estudiar la actividad antitumoral preliminar de Ab1 administrado a pacientes con neoplasias malignas de linfocitos B CD20+ (linfoma no Hodgkin [NHL] y leucemia linfocítica crónica [CLL]) previamente tratadas con terapia con anticuerpos anti-CD20.
Ciertos objetivos exploratorios del estudio evalúan biomarcadores que pueden correlacionarse con mecanismo de acción, toxicidad observada y posible actividad antitumoral que incluyen, pero sin limitación: perfilado de citoquinas, subconjuntos de linfocitos B y linfocitos T de sangre periférica y fenotipos inmunes, y cambios en la expresión génica en sangre periférica.
Diseño del Estudio
Un estudio de aumento de dosis, multicéntrico, sin enmascaramiento se inició con el anticuerpo monoclonal anti-CD20xCD3 "Ab1" administrado como una infusión IV. Los pacientes se asignaron a una cohorte de nivel de dosis (DL) que consiste en una dosis de partida inicial, seguida de una dosis más alta para la segunda y posteriores administraciones de dosis. Los pacientes se inscribieron según la indicación (NHL o CLL). En cada DL, hay 2 cohortes (una para cada indicación), con 3 a 6 pacientes por cohorte.
Los pacientes que inicialmente muestran un beneficio clínico y que posteriormente recaen o progresan pueden volver a tratarse con Ab1 en el DL más alto que se considera tolerable en el momento de la recaída o la progresión.
Los pacientes ya inscritos se sometieron a procedimientos de detección para determinar la elegibilidad dentro de los 28 días anteriores a la administración inicial de Ab1. Los pacientes se inscribieron secuencialmente según la indicación (NHL o CLL) en orden de confirmación de elegibilidad por parte del patrocinador hasta que cada cohorte se llenara según los criterios del protocolo.
Hubo cohortes de aumento de dosis independientes para NHL y CLL en cada DL. Cada DL consta de una dosis inicial y una segunda y posterior dosis, que será mayor que la dosis inicial, siempre que se tolere la dosis inicial.
El aumento de dosis sigue un diseño tradicional de aumento de dosis de 3+3. Se planifican de tres a 6 pacientes por cohorte en función de la toxicidad observada.
Una vez completada la fase de aumento de dosis, y tras la determinación de una dosis recomendada para estudio adicional, de planean 3 cohortes de expansión en NHL indolente, NHL agresivo y CLL, con 10 pacientes en cada cohorte de expansión.
En el primer DL, habrá un periodo de espera de 48 horas entre las administraciones de fármacos del estudio inicial para los primeros 3 pacientes dentro de la misma indicación. Los pacientes posteriores en el primer DL no serán tratados el mismo día, independientemente de la indicación. En cohortes posteriores, siempre que no se observe toxicidad inesperada en cohortes anteriores o dentro de la cohorte, las infusiones iniciales para los primeros 3 pacientes deben administrarse con al menos 24 horas de diferencia.
Después de que cada cohorte de pacientes se enrola, trata y completa el periodo de observación de DLT, la apertura de cohortes de DL posteriores para inscripción (o expansión de la cohorte de DL abierta actual) se determinará una vez que el patrocinador y el investigador hayan revisado los datos de seguridad. El periodo de observación de DLT se define como los primeros 28 días de tratamiento, que en este estudio corresponde con el periodo de inducción. Durante la inducción, los pacientes serán tratados con 4 administraciones semanales de Ab1.
Para que DLT sea evaluable, un paciente individual debe haber recibido al menos las 2 primeras administraciones de Ab1 (semana 1 día 1 y semana 2 día 1). Adicionalmente, el paciente debe ser monitorizado durante al menos 28 días después de la primera administración y al menos 21 días desde la segunda administración.
Duración del estudio
El periodo de tratamiento es de 6 meses. Los pacientes serán tratados inicialmente con hasta 9 dosis de Ab1 - 4 dosis semanales durante un periodo de inducción de 4 semanas, seguido de 5 dosis adicionales administradas mensualmente durante un periodo de mantenimiento de 5 meses. El periodo de seguimiento será de 6 meses. Población de pacientes
Se pueden requerir hasta 84 pacientes en las cohortes de aumento de dosis para ambas indicaciones (NHL y CLL) durante la fase de aumento de dosis (suponiendo que DL1 a DL7 inscriban a 6 pacientes), se pueden inscribir 36 pacientes adicionales si se añaden DL8 a DL10, y hasta 30 pacientes adicionales (20 NHL [10 cada NHL indolente y agresivo] y 10 CLL) pueden ser necesarios en las cohortes de expansión, para un total de 150 pacientes.
Los pacientes deben haber documentado neoplasia maligna de linfocitos B CD20+, con enfermedad activa que no responde a la terapia previa, que se han tratado previamente con terapia de anticuerpos dirigida por CD20, para quienes no existen opciones de atención estándar y para quienes el tratamiento con un anticuerpo anti-CD20 puede ser apropiado.
Los criterios de inclusión para el estudio son los siguientes: (1) Tener neoplasia maligna de linfocitos B CD20+ documentada, con enfermedad activa que no responde a la terapia previa, para quienes no existen opciones de atención estándar y para quienes el tratamiento con un anticuerpo anti-CD20 puede ser apropiado; (2) Debe haber recibido tratamiento previo con una terapia de anticuerpos anti-CD20; (3) Todos los pacientes (NHL de linfocitos B y CLL) deben tener al menos una lesión medible bidimensional >1,5 cm) documentada por tomografía computarizada; (4) Los pacientes con CLL deben tener glóbulos blancos (WBC) <200 x 109; (5) Edad >18 años; (6) estado de rendimiento del Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) <1; (7) Esperanza de vida de al menos 6 meses; (8) Función adecuada de la médula ósea documentada por: (a) Recuentos plaquetarios >75 x 109/l, (b) Nivel de Hb >9 g/dl, y (c) ANC >1 x 109/l; (9) Función orgánica adecuada; (10) Disposición para someterse a un pretratamiento obligatorio de biopsia tumoral, si a criterio del investigador, el paciente tiene una lesión accesible que puede biopsiarse sin riesgo significativo para el paciente; (11) Dispuesto y capaz de cumplir con las visitas a la clínica y los procedimientos relacionados con el estudio; y (12) Proporcionar consentimiento informado firmado.
Los criterios de exclusión para el estudio son los siguientes: (1) Linfoma primario del sistema nervioso central (SNC) o afectación conocida o sospechada del SNC por LNH no primario del SNC; (2) Historia o patología relevante del SNC actual como (a) Epilepsia, convulsión, paresia, afasia, apoplejía, lesiones cerebrales graves, enfermedad cerebelosa, síndrome cerebral orgánico, psicosis, o (b) Evidencia de presencia de lesiones inflamatorias y/o vasculitis en MRI cerebral; (3) quimioterapia estándar anti-linfoma (no biológica) o radioterapia en los 28 días previos a la primera administración del fármaco del estudio; (4) Terapia previa con blinatumomab; (5) trasplante alogénico de células madre; (6) Tratamiento con rituximab, alemtuzumab u otro agente biológico en investigación o comercial en las 12 semanas previas a la primera administración del fármaco del estudio [NOTA: para pacientes con linfoma agresivo para los que se requiere tratamiento inmediato, el periodo de reposo farmacológico puede reducirse a 28 días]; (7) terapia inmunosupresora (que no sea biológica) en los 28 días posteriores a la primera administración del fármaco del estudio; (8) Tratamiento con un agente no biológico en investigación en los 28 días de la primera administración del fármaco del estudio; (9) Historia de reacciones alérgicas atribuidas a compuestos de composición química o biológica similar del fármaco del estudio; (10) Historia de hipersensibilidad a cualquier compuesto en el grupo de antibióticos tetraciclina; (11) Historia de neoplasia maligna diferente a la neoplasia maligna de linfocitos B en los 5 años anteriores al ingreso al estudio, con la excepción del carcinoma de células basales o escamosas resecado/extirpado de la piel o carcinoma in situ del cuello uterino; (12) Infecciones bacterianas activas conocidas, virales, fúngicas, micobacterianas u otra infección o cualquier episodio importante de infección que requiera hospitalización o tratamiento con anti­ infecciosos IV en las 4 semanas de la primera administración; (13) Evidencia de enfermedad simultánea significativa o afección médica que podría interferir con la realización del estudio, o poner al paciente en un riesgo significativo; (14) Tratamiento continuo con corticosteroides sistémicos, con la excepción del uso de corticosteroides para otras indicaciones (no tumorales y no inmunosupresoras) hasta un máximo de 5 mg/día de prednisona o equivalente; (15) Infección con el virus de inmunodeficiencia humana (VIH) o infección crónica con el virus de la hepatitis B (VHB) o el virus de la hepatitis C (VHC); (16) Hipersensibilidad conocida tanto al alopurinol como a la rasburicasa; (17) Mujeres embarazadas o en periodo de lactancia; (18) Hombres o mujeres sexualmente activos en edad fértil que no están dispuestos a practicar la anticoncepción adecuada durante el estudio.
Tratamientos
Ab1 se suministró como un líquido en viales estériles, de un solo uso. Cada vial contiene un volumen extraíble de 1 ml de Ab1 a una concentración de 2 mg/ml. Se proporcionarán instrucciones detalladas de preparación y administración a los sitios en el manual de farmacia.
La dosis inicial de Ab1 a nivel de dosis (DL) 1 fue de 30 mcg; las dosis pueden subir hasta 8000 mcg si se alcanza DL10. Se administraron dosis de Ab1 a pacientes inscritos en un entorno ambulatorio mediante infusión IV durante al menos 60 minutos. Los niveles de dosis se ilustran en Tabla 23.
T l 2 . A m n i h r r i n n NHL LL
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Claims (9)

REIVINDICACIONES
1. Un anticuerpo biespecífico para uso en un método de tratamiento o mejora del cáncer de linfocitos B en un sujeto, que comprende administrar un protocolo de aumento de dosis que reduce el efecto de una cascada de citoquinas, en donde el protocolo de aumento de dosis comprende administrar una primera dosis del anticuerpo durante un primer periodo de tiempo y administrar consecutivamente una segunda dosis de dicho anticuerpo durante un segundo periodo de tiempo, en donde dicha segunda dosis supera dicha primera dosis, en donde el anticuerpo biespecífico comprende un primer dominio de unión a antígeno que se une a CD3 humano, un segundo dominio de unión a antígeno que se une a CD20 humano, y un dominio Fc quimérico unido a cada uno del primer y segundo dominios de unión a antígeno, en donde el dominio Fc quimérico comprende:
(a) una secuencia de aminoácidos de la bisagra inferior de IgG2 humana que comprende PCPAPPVA (SEQ ID NO: 52) desde las posiciones 228 a 236 según la numeración EU;
(b) una IgG1 humana o una secuencia de aminoácidos de la bisagra superior de IgG4 humana desde las posiciones 216 a 227 según la numeración EU;
(c) una secuencia de aminoácidos del dominio CH2 de IgG4 humana desde las posiciones 237 a 340 según la numeración EU; y
(d) un dominio c H1 de IgG1 humana y un dominio CH3 de IgG1 humana, o un dominio CH1 de IgG4 humana y un dominio CH3 de IgG4 humana;
en donde el anticuerpo biespecífico exhibe una mayor afinidad de unión por FcyRIIA humano respecto a FcyRIIB humano, y exhibe poca o ninguna afinidad de unión detectable por FcyRI humano y FcyRIII humano, medida en un ensayo de resonancia de plasmón superficial.
2. Un anticuerpo biespecífico para uso según la reivindicación 1, en donde el tratamiento o mejora del cáncer de linfocitos B comprende:
(i) suprimir el crecimiento tumoral en el sujeto, en donde la supresión del crecimiento tumoral comprende:
(a) inhibir el crecimiento de los tumores,
(b) disminuir el tamaño de los tumores, o
(c) disminuir el número de tumores;
(ii) mediar la lisis de linfocitos B en el sujeto, en donde los linfocitos B son linfocitos pre-B, linfocitos B maduros, o células de linfoma no Hodgkin de linfocitos B; o
(iii) tratar el cáncer que es positivo para la expresión de CD20 en el sujeto, en donde el sujeto se selecciona sobre la base de un cáncer residual.
3. Un anticuerpo biespecífico para uso según una cualquiera de las reivindicaciones 1-2, en donde:
(i) el cáncer es linfoma o leucemia; y/o
(ii) el cáncer se selecciona del grupo que consiste en: linfoma folicular, leucemia linfocítica crónica de linfocitos B, linfoma linfoblástico de linfocitos B, linfoma de Hodgkin, linfoma no Hodgkin, linfoma difuso de linfocitos B grandes, linfoma de la zona marginal, linfoma de células del manto, leucemia de células pilosas y linfoma de Burkitt.
4. Un anticuerpo biespecífico para uso según una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en donde la primera dosis es de hasta 1000 microgramos.
5. Un anticuerpo biespecífico para uso según una cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en donde:
(i) el sujeto padece un tumor que es resistente, o que responde incompletamente a (a) la terapia monoespecífica anti-CD20 sola, o (b) la monoterapia con rituximab; y/o
(ii) en donde el sujeto ha recibido una terapia de anticuerpo monoespecífico anti-CD20 al menos de 1 día a 1 año antes de la administración del anticuerpo biespecífico.
6. Un anticuerpo biespecífico para uso según una cualquiera de las reivindicaciones 1-5, en donde el anticuerpo biespecífico comprende:
(a) una secuencia de aminoácidos de bisagra quimérica EPKSCDKTHTCPPCPAPPVA (SEQ ID NO: 53); o (b) una secuencia de aminoácidos de bisagra quimérica ESKYGPPCPPCPAPPVA (Se Q ID NO: 54).
7. Un anticuerpo biespecífico para uso según una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en donde:
(a) el primer dominio de unión a antígeno comprende una secuencia de aminoácidos de región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende SEQ ID NO: 10;
(b) el primer dominio de unión a antígeno comprende una secuencia de aminoácidos de región variable de cadena ligera (LCVR) que comprende SEQ ID NO: 18;
(c) el segundo dominio de unión a antígeno comprende una secuencia de aminoácidos de región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende SEQ ID NO: 2;
(d) el primer dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD3 humano comprende una secuencia de aminoácidos de región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende SEQ ID NO: 10, y una secuencia de aminoácidos de región variable de cadena ligera (LCVR) que comprende SEQ ID NO: 18;
(e) el segundo dominio de unión a antígeno que se une específicamente a CD20 humano comprende una secuencia de aminoácidos de región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende SEQ ID NO: 2, y una secuencia de aminoácidos de región variable de cadena ligera (LCVR) que comprende SEQ ID NO: 18;
(f) el primer dominio de unión a antígeno (A1) comprende tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena pesada (HCDR1, HCDR2, HCDR3) y tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena ligera (LCDR1, Lc Dr 2, LCDR3), en donde
(i) A1-HCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 12;
(ii) A1-HCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 14;
(iii) A1-HCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 16;
(iv) A1-LCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 20;
(v) A1-LCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 22; y
(vi) A1-LCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 24;
(g) el segundo dominio de unión a antígeno (A2) que se une específicamente a CD20 humano comprende tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena pesada (HCDR1, HCDR2, HCDR3) y tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena ligera (LCDR1, LCDR2, LCDR3), en donde
(i) A2-HCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 4;
(ii) A2-HCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 6;
(iii) A2-HCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 8;
(iv) A2-LCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 20;
(v) A2-LCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 22; y
(vi) A2-LCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 24; o
(h) el primer dominio de unión a antígeno (A1) que se une específicamente a CD3 humano comprende tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena pesada (A1-HCDR1, A1-HCDR2, A1-HCDR3) y tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena ligera (A1-LCDR1, A1-LCDR2, A1-LCDR3), y en donde el segundo dominio de unión a antígeno (A2) que se une específicamente a CD20 humano comprende tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena pesada (A2-HCDR1, A2-HCDR2 y A2-HCDR3) y tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena ligera (A2-LCDR1, A2-LCDR2 y A2-LCDR3); en donde
(i) A1-HCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 12;
(ii) A1-HCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 14;
(iii) A1-HCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 16;
(iv) A1-LCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 20;
(v) A1-LCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 22;
(vi) A1-LCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 24;
(vii) A2-HCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 4;
(viii) A2-HCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 6;
(ix) A2-HCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 8;
(x) A2-LCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 20;
(xi) A2-LCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 22; y
(xii) A2-LCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 24.
8. Un anticuerpo biespecífico para uso según una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en donde:
el primer dominio de unión a antígeno compite por unirse a CD3 humano con una proteína de unión a antígeno de referencia, que comprende:
(a) tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena pesada (A1-HCDR1, A1-HCDR2 y A1-HCDR3) y tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena ligera (A1-LCDR1, A1-LCDR2 y A1-LCDR3), en donde (i) A1-HCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos Se Q ID NO: 12; (ii) A1-HCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 14; (iii) A1-HCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 16; (iv) A1-LCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 20; (v) A1-LCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ Id NO: 22; y (vi) A1-LCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 24; o
(b) una región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 10, y una región variable de cadena ligera (LCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 18; o
el segundo dominio de unión a antígeno compite por unirse a CD20 humano con una proteína de unión a antígeno de referencia que comprende:
(c) tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena pesada (A2-HCDR1, A2-HCDR2 y A2-HCDR3) y tres regiones determinantes de la complementariedad de cadena ligera (A2-LCDR1, A2-LCDR2 y A2-LCDR3), en donde (i) A2-HCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 4; (ii) A2-HCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 6; (iii) A2-HCDR3 comprende SEQ ID NO: 8; (iv) A2-LCDR1 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 20; (v) A2-LCDR2 comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 22; y (vi) A2-LCDR3 comprende la secuencia de aminoácidos s Eq ID NO: 24; o
(d) una región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 2, y una región variable de cadena ligera (LCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 18; o el primer dominio de unión a antígeno compite por unirse a CD3 humano con una proteína de unión a antígeno de referencia que comprende (i) una región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 10, y (ii) una región variable de cadena ligera (LCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 18; y el segundo dominio de unión a antígeno compite por unirse a CD20 humano con una proteína de unión a antígeno de referencia que comprende (iii) una región variable de cadena pesada (HCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 2, y una región variable de cadena ligera (LCVR) que comprende la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 18.
9. Un anticuerpo biespecífico para uso según una cualquiera de las reivindicaciones 1-8, en donde el anticuerpo: (a) se une a células humanas que expresan CD3 humano y células de mono cinomolgo que expresan CD3 de cinomolgo;
(b) se une a linfocitos T humanos o a linfocitos T de cinomolgo;
(c) se une a células humanas que expresan CD20 humano;
(d) se une a linfocitos B humanos;
(e) se une a linfocitos T humanos que expresan CD3 con un valor de CE50 entre 1x10'12 M y 1x10'6 M;
(f) se une a linfocitos T humanos que expresan CD3 con un valor de CE50 entre 1x10'9 M y 1x10'8 M;
(g) se une a linfocitos B humanos que expresan CD20 con un valor de CE50 entre 1x10'12 M y 1x10'6 M;
(h) se une a linfocitos B humanos que expresan CD20 con un valor de CE50 entre 1x10'9 M y 1x10'8 M; o (i) mejora la citotoxicidad mediada por linfocitos T de linfocitos B humanos que son resistentes o refractarios a la citotoxicidad mediada por anti-CD20.
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