ES2491222T3 - Marcadores de expresión génica para el pronóstico de cáncer colorrectal - Google Patents
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Abstract
Método de predicción del desenlace clínico para un sujeto humano al que se le ha diagnosticado cáncer colorrectal tras la resección quirúrgica del cáncer, que comprende: determinar un nivel de expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN, o un producto de expresión del mismo, en una muestra biológica que comprende células de cáncer colorrectal obtenidas del sujeto humano; y predecir la probabilidad de un desenlace clínico positivo para el sujeto humano basándose en dicho nivel de expresión normalizada, en el que un aumento de la expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN, o un producto de expresión del mismo, se correlaciona negativamente con una probabilidad aumentada de un desenlace clínico positivo.
Description
E07717900
11-08-2014
Marcadores de expresión génica para el pronóstico de cáncer colorrectal
La presente invención proporciona un BGN, cuyos niveles de expresión son útiles para predecir el desenlace de cáncer colorrectal.
El cáncer colorrectal es la causa número dos de muerte relacionada con cáncer en los Estados Unidos y la Unión Europea, representando el 10% de todas las muertes relacionadas con cáncer. Aunque el cáncer de colon y el cáncer pueden representar una enfermedad idéntica o similar al nivel molecular, la cirugía para el cáncer rectal es
15 complicada por cuestiones anatómicas. Posiblemente por este motivo, la tasa de recidiva local para cáncer rectal es significativamente mayor que para cáncer de colon, y por tanto el enfoque de tratamiento es significativamente diferente. Se diagnostican aproximadamente 100.000 nuevos casos de cáncer de colon cada año en los Estados Unidos, diagnosticándose aproximadamente el 65% de estos como cáncer colorrectal en estadio II/III tal como se comenta a continuación.
El refinamiento de un diagnóstico de cáncer colorrectal implica evaluar el estado de progresión del cáncer usando criterios de clasificación convencionales. Se han usado ampliamente dos sistemas de clasificación en cáncer colorrectal, el sistema de estadificación de Astler-Coller o Duke modificado (estadios A-D) (Astler VB, Coller FA., Ann Surg 1954; 139:846-52), y más recientemente la estadificación TNM (estadios I-IV) desarrollado por el American
25 Joint Committee on Cancer (AJCC Cancer Staging Manual, 6ª edición, Springer-Verlag, Nueva York, 2002). Ambos sistemas aplican medidas de la diseminación del tumor primario a través de las capas de la pared del recto o el colon a los órganos adyacentes, ganglios linfáticos y sitios distantes para evaluar la progresión tumoral. Las estimaciones del riesgo de recidiva y las decisiones de tratamiento en cáncer de colon se basan principalmente en la actualidad en el estadio del tumor.
Hay aproximadamente 33.000 cánceres colorrectales en estadio II recién diagnosticados cada año en los Estados Unidos. Casi todos estos pacientes se tratan mediante resección quirúrgica del tumor y, además, aproximadamente el 40% se tratan actualmente con quimioterapia basada en 5-fluorouracilo (5-FU). La decisión de si administrar quimioterapia adyuvante no es sencilla. La tasa de supervivencia a cinco años para pacientes con cáncer de colon
35 en estadio II tratados con cirugía sola es de aproximadamente el 80%. El tratamiento adyuvante convencional con 5-FU + leucovorina (ácido folínico) demuestra un beneficio absoluto de sólo el 2-4% en esta población y muestra toxicidad significativa, incluyendo una tasa de muerte tóxica por quimioterapia de hasta el 1%. Por tanto, un gran número de pacientes reciben terapia tóxica de la que sólo unos cuantos se benefician.
Una prueba que pueda producir un pronóstico tras la cirugía en pacientes con cáncer colorrectal en estadio II sería de gran beneficio para guiar las decisiones de tratamiento para estos pacientes.
El beneficio de la quimioterapia en cáncer de colon en estadio III es más evidente que en estadio II. Una gran proporción de los 31.000 pacientes a los que se les diagnostica anualmente cáncer de colon en estadio III reciben
45 quimioterapia adyuvante basada en 5-FU, y el beneficio absoluto de 5-FU + leucovorina en este entorno es de alrededor del 18-24%, dependiendo del régimen particular empleado. El tratamiento quimioterápico de referencia actual para pacientes con cáncer de colon en estadio III (5-FU + leucovorina o 5-FU + leucovorina + oxaliplatino) es moderadamente eficaz, logrando una mejora en la tasa de supervivencia a 5 años de desde aproximadamente el 50% (cirugía sola) hasta aproximadamente el 65% (5-FU + leucovorina) o el 70% (5-FU + leucovorina + oxaliplatino). El tratamiento con 5-FU + leucovorina solos o en combinación con oxaliplatino va acompañado de una gama de efectos secundarios adversos, incluyendo muerte tóxica en aproximadamente el 1% de los pacientes tratados. Además, la tasa de supervivencia a tres años para pacientes con cáncer de colon en estadio III tratados con cirugía sola es de aproximadamente el 47% y no se ha establecido si existe un subconjunto de pacientes en estadio III para los que el riesgo de recidiva se asemeja al observado para pacientes en estadio II.
55 Una prueba que cuantifique el riesgo de recidiva basándose en marcadores moleculares en vez de en el estadio tumoral solo sería útil para identificar un subconjunto de pacientes en estadio III que pueden no requerir terapia adyuvante para lograr desenlaces aceptables.
La estadificación de tumores rectales se lleva a cabo basándose en criterios similares que para la estadificación de tumores de colon, aunque hay algunas diferencias que resultan por ejemplo de diferencias en la disposición de los ganglios linfáticos drenantes. Como resultado, los tumores rectales en estadio II/III soportan una correlación razonable con tumores de colon en estadio II/III en cuanto a su estado de progresión. Tal como se indicó anteriormente, la tasa de recidiva local y otros aspectos del pronóstico difieren entre cáncer rectal y cáncer de colon, 65 y estas diferencias pueden surgir de dificultades en el logro de la resección total de los tumores rectales. No obstante, no hay ninguna prueba convincente de que haya una diferencia entre cáncer de colon y cáncer rectal en
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cuanto a las características moleculares de los respectivos tumores. Pruebas de pronóstico para cáncer rectal tendrían utilidad similar en la naturaleza tal como se describe para pruebas de pronóstico de cáncer de colon y podrían aplicarse los mismos marcadores de pronóstico a ambos tipos de cáncer.
5 Además, hay una clara necesidad de fármacos más seguros y más eficaces para el tratamiento de cáncer de colon. La quimioterapia actual para cáncer de colon se basa en el enfoque relativamente rudimentario de administrar fármacos que interfieren generalmente con la proliferación de células en división. Estudios clínicos recientes han demostrado la viabilidad del desarrollo de fármacos mejorados basados en una comprensión molecular detallada de los tipos y subtipos de cáncer particulares. Por ejemplo, el gen HER2 (ERBB2) está amplificado y se sobreexpresa la proteína HER2 en un subconjunto de cánceres de mama; HERCEPTIN® (Genentech, Inc.) un fármaco seleccionado para seleccionar como diana HER2, está indicado sólo para los pacientes que tienen un número de copias superior al normal de HER2 tal como se demuestra mediante hibridación in situ fluorescente (FISH) o un alto nivel de expresión de HER2 tal como se demuestra mediante inmunohistoquímica. Los genes cuya expresión está asociada con el desenlace clínico en pacientes con cáncer humanos son un recurso valioso para la selección de dianas para
15 el examen de compuestos farmacológicos y actividades de desarrollo de fármacos adicionales.
Pueden desarrollarse fármacos dirigidos molecularmente, tales como HERCEPTIN® (Genentech, Inc.), y comercializarse conjuntamente con una prueba de diagnóstico que puede identificar pacientes que es probable que se beneficien del fármaco; un aspecto de una prueba de este tipo es la identificación de los pacientes que es probable que tengan un desenlace positivo sin ningún tratamiento distinto de cirugía sola. Por ejemplo, el 80% de los pacientes con cáncer de colon en estadio II sobreviven cinco años o más cuando se tratan con cirugía sola. Marcadores génicos que identifiquen pacientes que es más probable que estén entre el 20% cuyo cáncer experimentará recidiva sin tratamiento adicional son útiles en el desarrollo de fármacos, por ejemplo en la selección de pacientes para su inclusión en un ensayo clínico.
25
Según un primer aspecto de la presente invención, se proporciona un método de predicción del desenlace clínico para un sujeto humano al que se le ha diagnosticado cáncer colorrectal tras la resección quirúrgica del cáncer tal como se especifica en la reivindicación 1.
El desenlace clínico del método de la invención puede expresarse, por ejemplo, en términos de intervalo libre de recidiva (ILR), supervivencia global (SG), supervivencia libre de enfermedad (SLE), o intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD).
35 En una realización, el cáncer es cáncer colorrectal Duke B (estadio II) o Duke C (estadio III).
Para todos los aspectos del método de la invención, la determinación del nivel de expresión puede ser, por ejemplo, mediante un método de obtención del perfil de expresión génica. El método de obtención del perfil de expresión génica puede ser, por ejemplo, un método basado en PCR.
Para todos los aspectos de la invención, los niveles de expresión pueden normalizarse en relación con los niveles de expresión de uno o más genes de referencia, o sus productos de expresión.
45 Para todos los aspectos de la invención, el método puede comprender además la etapa de crear un informe que resume dicha predicción.
Se contempla que para cada incremento de un aumento en el nivel de uno o más transcritos de ARN predictivos o sus productos de expresión, se identifique que el paciente muestra un aumento incremental en el desenlace clínico.
La determinación de los niveles de expresión puede producirse más de una vez. La determinación de los niveles de expresión puede producirse antes de que el paciente se someta a cualquier terapia tras la resección quirúrgica.
Según un segundo aspecto de la presente invención, se proporciona un método de determinación de si un sujeto
55 humano al que se le ha diagnosticado cáncer colorrectal debe someterse a terapia adicional tras la resección quirúrgica del cáncer tal como se especifica en la reivindicación 9.
Se contempla que si se predice que la probabilidad de desenlace clínico positivo disminuye, dicho paciente se somete a terapia adicional tras dicha eliminación quirúrgica. Se contempla además que la terapia es quimioterapia y/o radioterapia.
La figura 1 muestra un dendrograma que representa la agrupación de la expresión de 142 genes que estaban
65 relacionados de manera estadísticamente significativa con el intervalo libre de recidiva (tablas 1.2A y 1.2B) en el análisis de riesgos proporcionales de Cox de una variable. El análisis de agrupación usó el método de
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amalgamación promedio de grupos-pares no ponderados y 1 -r de Pearson como medida de distancia. Las identidades de genes particulares en agrupaciones de interés se indican a lo largo del eje x.
5
A. DEFINICIONES
A menos que se defina lo contrario, los términos técnicos y científicos usados en el presente documento tienen el mismo significado que entiende comúnmente un experto habitual en la técnica a la que pertenece esta invención. Singleton et al., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology 2ª ed., J. Wiley & Sons (Nueva York, NY 1994), y March, Advanced Organic Chemistry Reactions, Mechanisms and Structure 4ª ed., John Wiley & Sons (Nueva York, NY 1992), proporcionan a un experto en la técnica una guía general para muchos de los términos usados en la presente solicitud.
15 Un experto en la técnica reconocerá muchos métodos y materiales similares o equivalentes a los descritos en el presente documento, que pueden usarse en la práctica de la presente invención.
De hecho, la presente invención no se limita de ningún modo a los métodos y materiales descritos sino que está limitada por las reivindicaciones adjuntas. Para los fines de la presente invención, los siguientes términos se definen a continuación.
El término “tumor”, tal como se usa en el presente documento, se refiere a cualquier crecimiento y proliferación celular neoplásico, ya sea maligno o benigno, y a cualquier célula o tejido precanceroso y canceroso.
25 Los términos “cáncer” y “canceroso” se refieren al, o describen el, estado fisiológico en mamíferos que se caracteriza normalmente por crecimiento celular no regulado. Los ejemplos de cáncer incluyen, pero no se limitan a, cáncer de mama, cáncer de ovario, cáncer de colon, cáncer de pulmón, cáncer de próstata, cáncer hepatocelular, cáncer gástrico, cáncer pancreático, cáncer de cuello uterino, cáncer de hígado, cáncer de vejiga, cáncer del tracto urinario, cáncer de tiroides, cáncer renal, carcinoma, melanoma y cáncer de cerebro.
La “patología” de cáncer incluye todos los fenómenos que comprometen el bienestar del paciente. Esto incluye, sin limitación, crecimiento celular anómalo o incontrolable, metástasis, interferencia con el funcionamiento normal de células vecinas, liberación de citocinas u otros productos secretores a niveles anómalos, supresión o agravamiento de la respuesta inflamatoria o inmunológica, neoplasia, tumor premaligno, tumor maligno, invasión de tejidos u
35 órganos circundantes o distantes, tales como ganglios linfáticos, etc.
El término “cáncer colorrectal” se usa en el sentido más amplio y se refiere a (1) todos los estadios y todas las formas de cáncer que surge de células epiteliales del intestino grueso y/o recto y/o (2) todos los estadios y todas las formas de cáncer que afecta al revestimiento del intestino grueso y/o el recto. En los sistemas de estadificación usados para la clasificación de cáncer colorrectal, el colon y el recto se tratan como un órgano.
Según el sistema de estadificación de tumor, ganglio, metástasis (TNM) del American Joint Committee on Cancer (AJCC) (Greene et al. (eds.), AJCC Cancer Staging Manual. 6ª Ed. Nueva York, NY: Springer; 2002), los diversos estadios de cáncer colorrectal se definen tal como sigue:
45 Tumor: T1: el tumor invade la submucosa; T2: el tumor invade la capa muscular propia; T3: el tumor invade a través de la capa muscular propia hacia la subserosa, o hacia los tejidos pericólico o perirrectal; T4: el tumor invade directamente otros órganos o estructura, y/o perfora.
Ganglio: N0: sin metástasis a ganglios linfáticos regionales; N1: metástasis en de 1 a 3 ganglios linfáticos regionales; N2: metástasis en 4 o más ganglios linfáticos regionales.
Metástasis: M0: sin metástasis distante; M1: metástasis distante presente.
55 Agrupamientos de estadios: Estadio I: T1 N0 M0; T2 N0 M0; Estadio II: T3 N0 M0; T4 N0 M0; Estadio III: cualquier T, N1-2; M0; Estadio IV: cualquier T, cualquier N, M1.
Según el sistema de estadificación de Duke modificado, los diversos estadios de cáncer colorrectal se definen tal como sigue:
Estadio A: el tumor penetra en la mucosa de la pared intestinal pero no más allá. Estadio B: el tumor penetra en y a través de la capa muscular propia de la pared intestinal; estadio C: el tumor penetra en, pero no a través de, la capa muscular propia de la pared intestinal, hay pruebas patológicas de cáncer colorrectal en los ganglios linfáticos; o el tumor penetra en y a través de la capa muscular propia de la pared intestinal, hay pruebas patológicas de cáncer en
65 los ganglios linfáticos; estadio D: el tumor se ha diseminado más allá de los confines de los ganglios linfáticos, hacia otros órganos, tales como el hígado, el pulmón o el hueso.
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Los factores de pronóstico son las variables relacionadas con la historia natural de cáncer colorrectal, que influyen en las tasas de recidiva y el desenlace de pacientes una vez que han desarrollado cáncer colorrectal. Los parámetros clínicos que se han asociado con un peor pronóstico incluyen, por ejemplo, implicación de ganglios
5 linfáticos, y tumores de grado alto. Se usan frecuentemente factores de pronóstico para clasificar pacientes en subgrupos con diferentes riesgos de recidiva iniciales.
El término “pronóstico” se usa en el presente documento para referirse a la predicción de la probabilidad de muerte o progresión atribuible a cáncer, incluyendo recidiva, diseminación metastásica y farmacorresistencia, de una enfermedad neoplásica, tal como cáncer de colon.
El término “predicción” se usa en el presente documento para referirse a la probabilidad de que un paciente tenga un desenlace clínico particular, ya sea positivo o negativo, tras la eliminación quirúrgica del tumor primario. Los métodos predictivos de la presente invención pueden usarse clínicamente para tomar decisiones de tratamiento
15 eligiendo las modalidades de tratamiento más apropiadas para cualquier paciente particular. Los métodos predictivos de la presente invención son herramientas valiosas en la predicción de si es probable que un paciente responda favorablemente a un régimen de tratamiento, tal como intervención quirúrgica. La predicción puede incluir factores de pronóstico.
El término “desenlace clínico positivo” significa una mejora en cualquier medida del estado del paciente, incluyendo las medidas usadas habitualmente en la técnica, tal como un amento en la duración del intervalo libre de recidiva (ILR), un aumento en el tiempo de supervivencia global (SG), un aumento en el tiempo de supervivencia libre de enfermedad (SLE), un aumento en la duración del intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD), y similares. Un aumento en la probabilidad de desenlace clínico positivo se corresponde con una disminución en la probabilidad de
25 recidiva del cáncer.
El término “clasificación de riesgo” significa el nivel de riesgo o la predicción de que un sujeto experimente un desenlace clínico particular. Un sujeto puede clasificarse en un grupo de riesgo o clasificarse a un nivel de riesgo basándose en los métodos predictivos de la presente invención. Un “grupo de riesgo” es un grupo de sujetos o individuos con un nivel de riesgo similar para un desenlace clínico particular.
El término supervivencia a “largo plazo” se usa en el presente documento para referirse a la supervivencia durante al menos 3 años, más preferiblemente durante al menos 5 años.
35 El término “intervalo libre de recidiva (ILR)” se usa en el presente documento para referirse al tiempo en años hasta la primera recidiva de cáncer de colon censurando para un segundo cáncer primario como primer acontecimiento o muerte sin pruebas de recidiva.
El término “supervivencia global (SG)” se usa en el presente documento para referirse al tiempo en años desde la cirugía hasta la muerte por cualquier causa.
El término “supervivencia libre de enfermedad (SLE)” se usa en el presente documento para referirse al tiempo en años hasta la recidiva de cáncer de colon o muerte por cualquier causa.
45 El término “intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD)” se usa en el presente documento para referirse al tiempo (en años) desde la cirugía hasta la primera recidiva de cáncer anatómicamente distante.
El cálculo de las medidas enumeradas anteriormente en la práctica puede variar de estudio a estudio dependiendo de la definición de acontecimientos que van o bien a censurarse o bien a no considerarse.
El término “microalineamiento” se refiere a una disposición ordenada de elementos de alineamiento hibridables, preferiblemente sondas de polinucleótido, sobre un sustrato.
El término “polinucleótido”, cuando se usa en singular o plural, se refiere de manera general a cualquier
55 polirribonucleótido o polidesoxirribonucleótido, que puede ser ARN o ADN no modificado o ARN o ADN modificado. Por tanto, por ejemplo, los polinucleótidos tal como se definen en el presente documento incluyen, sin limitación, ADN mono y bicatenario, ADN que incluye regiones mono y bicatenarias, ARN mono y bicatenario, y ARN que incluye regiones mono y bicatenarias, moléculas híbridas que comprenden ADN y ARN que pueden ser monocatenarios o, más normalmente, bicatenarios o incluir regiones mono y bicatenarias. Además, el término “polinucleótido” tal como se usa en el presente documento se refiere a regiones tricatenarias que comprenden ARN
o ADN o tanto ARN como ADN. Las hebras en tales regiones pueden ser de la misma molécula o de moléculas diferentes. Las regiones pueden incluir la totalidad de una o más de las moléculas, pero más normalmente implican sólo una región de algunas de las moléculas. Una de las moléculas de una región de triple hélice es a menudo un oligonucleótido. El término “polinucleótido” incluye específicamente ADNc. El término incluye AND (incluyendo
65 ADNc) y ARN que contienen una o más bases modificadas. Por tanto, ADN o ARN con estructuras principales modificadas para lograr estabilidad o por otros motivos son “polinucleótidos” tal como está previsto el término en el
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presente documento. Además, se incluyen ADN o ARN que comprenden bases poco comunes, tales como inosina,
o bases modificadas, tales como bases tritiadas, dentro del término “polinucleótidos” tal como se define en el presente documento. En general, el término “polinucleótido” abarca todas las formas modificadas química, enzimática y/o metabólicamente de polinucleótidos no modificados, así como las formas químicas de ADN y ARN
5 características de virus y células, incluyendo células simples y complejas.
El término “oligonucleótido” se refiere a un polinucleótido relativamente corto, que incluye, sin limitación, desoxirribonucleótidos monocatenarios, ribonucleótidos mono o bicatenarios, híbridos de ARN:ADN y ADN bicatenarios. Se sintetizan a menudo oligonucleótidos, tales como oligonucleótidos de sondas de ADN monocatenario, mediante métodos químicos, por ejemplo usando sintetizadores de oligonucleótidos automatizados que están disponibles comercialmente. Sin embargo, pueden prepararse oligonucleótidos mediante una variedad de otros métodos, incluyendo técnicas mediadas por ADN recombinante in vitro y mediante expresión de ADN en células y organismos.
15 Los términos “gen expresado de manera diferencial”, “expresión génica diferencial” y sus sinónimos, que se usan de manera intercambiable, se refieren a un gen cuya expresión se activa a un nivel superior o inferior en un sujeto que padece una enfermedad, específicamente cáncer, tal como cáncer de colon, en relación con su expresión en un sujeto normal o control. Los términos también incluyen genes cuya expresión se activa a un nivel superior o inferior en estadios diferentes de la misma enfermedad. Se entiende también que un gen expresado de manera diferencial puede o bien activarse o bien inhibirse al nivel de ácido nucleico o nivel de proteína, o bien puede someterse a corte y empalme alternativo para dar como resultado un producto de polipéptido diferente. Tales diferencias pueden evidenciarse mediante un cambio en los niveles de ARNm, expresión de superficie, secreción u otro reparto de un polipéptido, por ejemplo. La expresión génica diferencial puede incluir una comparación de la expresión entre dos o más genes o sus productos génicos, o una comparación de las razones de la expresión entre dos o más genes o
25 sus productos génicos, o incluso una comparación de dos productos procesados de manera diferente del mismo gen, que difieren entre sujetos normales y sujetos que padecen una enfermedad, específicamente cáncer, o entre diversos estadios de la misma enfermedad. La expresión diferencial incluye diferencias tanto cuantitativas, así como cualitativas, en el patrón de expresión celular o temporal en un gen o sus productos de expresión entre, por ejemplo, células enfermas y normales, o entre células que han experimentado diferentes acontecimientos de enfermedad o estadios de enfermedad. Para el fin de esta invención, se considera que está presente “expresión génica diferencial” cuando existe una diferencia de al menos aproximadamente dos veces, preferiblemente al menos aproximadamente cuatro veces; más preferiblemente al menos aproximadamente seis veces, lo más preferiblemente al menos aproximadamente diez veces entre la expresión de un gen dado en sujetos normales y enfermos, o en diversos estadios del desarrollo de la enfermedad en un sujeto enfermo.
35 El término “sobreexpresión” con respecto a un transcrito de ARN se usa para referirse al nivel del transcrito determinado mediante normalización al nivel de ARNm de referencia, que podrían ser todos los transcritos medidos en la muestra o un conjunto de referencia particular de ARNm.
La expresión “amplificación génica” se refiere a un procedimiento mediante el cual se forman múltiples copias de un gen o fragmento de gen en una línea celular o célula particular. La región duplicada (un tramo de ADN amplificado) se denomina a menudo “amplicón”. Habitualmente, la cantidad del ARN mensajero (ARNm) producido, es decir, el nivel de expresión génica, también aumenta en la proporción del número de copias producidas del gen expresado particular.
45 La “rigurosidad” de las reacciones de hibridación puede determinarse fácilmente por un experto habitual en la técnica, y generalmente es un cálculo empírico dependiente de la longitud de la sonda, temperatura de lavado y concentración de sales. En general, sondas más largas requieren temperaturas superiores para un apareamiento apropiado, mientras que sondas más cortas necesitan temperaturas inferiores. La hibridación depende generalmente de la capacidad del ADN desnaturalizado para aparearse de nuevo cuando están presentes hebras complementarias en un entorno por debajo de su temperatura de fusión. Cuanto mayor es el grado de homología deseada entre la sonda y la secuencia hibridable, mayor es la temperatura relativa que puede usarse. Como resultado, se deduce que temperaturas relativas superiores tenderían a hacer las condiciones de reacción más rigurosas, mientras que temperaturas inferiores las harían menos rigurosas. Para detalles adicionales y explicación
55 de la rigurosidad de reacciones de hibridación, véase Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology. Wiley Interscience Publishers, (1995).
“Condiciones rigurosas” o “condiciones de alta rigurosidad”, tal como se definen en el presente documento, normalmente: (1) emplean fuerza iónica baja y temperatura elevada para el lavado, por ejemplo cloruro de sodio 0,015 M/citrato de sodio 0,0015 M/dodecilsulfato de sodio al 0,1% a 50ºC; (2) emplean durante la hibridación un agente de desnaturalización, tal como formamida, por ejemplo, formamida al 50% (v/v) en albúmina sérica bovina al 0,1%/Ficoll al 0,1%/polivinilpirrolidona al 0,1%/tampón fosfato de sodio 50 mM a pH 6,5 con cloruro de sodio 750 mM, citrato de sodio 75 mM a 42ºC; o (3) emplean formamida al 50%, 5 x SSC (NaCl 0,75 M, citrato de sodio 0,075 M), fosfato de sodio 50 mM (pH 6,8), pirofosfato de sodio al 0,1%, 5 x disolución de Denhardt, ADN de
65 esperma de salmón sonicado (50 µg/ml), SDS al 0,1% y sulfato de dextrano al 10% a 42ºC, con lavados a 42ºC en 0,2 x SSC (cloruro de sodio/citrato de sodio) y formamida al 50% a 55ºC, seguido por un lavado de alta rigurosidad
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que consiste en 0,1 x SSC que contiene EDTA a 55ºC.
Pueden identificarse “condiciones moderadamente rigurosas” tal como se describe por Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Nueva York: Cold Spring Harbor Press, 1989, e incluyen el uso de disolución de
5 lavado y condiciones de hibridación (por ejemplo, temperatura, fuerza iónica y % de SDS) menos rigurosas que las descritas anteriormente. Un ejemplo de condiciones moderadamente rigurosas es la incubación durante la noche a 37ºC en una disolución que comprende: formamida al 20%, 5 x SSC (NaCl 150 mM, citrato de trisodio 15 mM), fosfato de sodio 50 mM (pH 7,6), 5 x disolución de Denhardt, sulfato de dextrano al 10% y ADN de esperma de salmón fragmentado desnaturalizado 20 mg/ml, seguido por lavado de los filtros en 1 x SSC a aproximadamente 3750ºC. El experto reconocerá cómo ajustar la temperatura, fuerza iónica, etc. según sea necesario para adaptar factores tales como la longitud de la sonda y similares.
En el contexto de la presente invención, la referencia a “al menos uno”, “al menos dos”, “al menos cinco”, etc. de los genes enumerados en cualquier conjunto de genes particular significa una cualquiera o cualquiera y todas las
15 combinaciones de los genes enumerados.
El término cáncer “negativo para ganglios”, tal como cáncer de colon “negativo para ganglios”, se usa en el presente documento para referirse a cáncer que no se ha diseminado a los ganglios linfáticos.
Las expresiones “corte y empalme” y “corte y empalme de ARN” se usan de manera intercambiable y se refieren al procesamiento del ARN que elimina intrones y une exones para producir ARNm maduro con secuencia codificante continua que se traslada al citoplasma de una célula eucariota.
En teoría, el término “exón” se refiere a cualquier segmento de un gen interrumpido que está representado en el
25 producto de ARN maduro (B. Lewin. Genes IV Cell Press, Cambridge Mass. 1990). En teoría, el término “intrón” se refiere a cualquier segmento de ADN que se transcribe pero se elimina del transcrito cortando y empalmando juntos los exones en cualquier lado del mismo. Operativamente, se producen secuencias de exón en la secuencia de ARNm de un gen tal como se define por los números de Ref. Seq ID. Operativamente, las secuencias de intrón son las secuencias intermedias dentro del ADN genómico de un gen, entremedias de las secuencias de exón y que tienen secuencias consenso de corte y empalme GT y AG en sus extremos 5’ y 3’.
El término “agrupación de expresión” se usa en el presente documento para referirse a un grupo de genes que demuestran patrones de expresión similares cuando se estudian dentro de muestras de un conjunto de pacientes definido. Tal como se usa en el presente documento, los genes dentro de una agrupación de expresión muestran
35 patrones de expresión similares cuando se estudian dentro de muestras de pacientes con cáncer del colon y/o el recto en estadio II y/o estadio III.
La práctica de la presente invención empleará, a menos que se indique lo contrario, técnicas convencionales de biología molecular (incluyendo técnicas recombinantes), microbiología, biología celular y bioquímica, que están dentro del conocimiento de la técnica. Tales técnicas se explican completamente en la bibliografía, tal como, “Molecular Cloning: A Laboratory Manual”, 2ª edición (Sambrook et al., 1989); “Oligonucleotide Synthesis” (M.J. Gait, ed., 1984); “Animal Cell Culture” (R.I. Freshney, ed., 1987); “Methods in Enzymology” (Academic Press, Inc.);
45 “Handbook of Experimental Immunology”, 4ª edición (D.M. Weir & C.C. Blackwell, eds., Blackwell Science Inc., 1987); “Gen Transfer Vectors for Mammalian Cells” (J.M. Miller & M.P. Calos, eds., 1987); “Current Protocols in Molecular Biology” (F.M. Ausubel et al., eds., 1987); y “PCR: The Polymerase Chain Reaction”, (Mullis et al., eds., 1994).
Basándose en pruebas de expresión diferencial de transcritos de ARN en células normales y cancerosas, la presente descripción proporciona marcadores génicos de pronóstico para cáncer colorrectal. Por tanto, en un aspecto particular, la presente descripción proporciona marcadores génicos de pronóstico de cáncer colorrectal en estadio II y/o estadio III, incluyendo marcadores que son específicamente de pronóstico para el desenlace de enfermedad o bien en estadio II o bien en estadio III y los que tienen valor de pronóstico en ambos estadios,
55 reflejando diferencias subyacentes en células tumorales en los dos estadios y/o en el grado de progresión tumoral. Los marcadores de pronóstico e información asociada proporcionados por la presente descripción permiten a los médicos tomar decisiones de tratamiento más inteligentes, y adaptar el tratamiento de cáncer colorrectal a las necesidades de pacientes individuales, maximizando de ese modo el beneficio del tratamiento y minimizando la exposición de pacientes a tratamientos innecesarios, que no proporcionan ningún beneficio significativo y a menudo conllevan riegos graves debido a efectos secundarios tóxicos.
Se han implicado alteraciones en el funcionamiento normal de diversos procesos fisiológicos, incluyendo proliferación, apoptosis, angiogénesis e invasión, en la patología del cáncer. La contribución relativa de disfunciones en procesos fisiológicos particulares a la patología de tipos de cáncer particulares no está bien caracterizada. 65 Cualquier proceso fisiológico integra las contribuciones de numerosos productos génicos expresados por las diversas células implicadas en el proceso. Por ejemplo, la invasión por células tumorales de tejido normal adyacente
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y la intravasación de la célula tumoral en el sistema circulatorio se ven afectadas por una serie de proteínas que median en las diversas características celulares, incluyendo la cohesión entre células tumorales, adhesión de células tumorales a células normales y tejido conjuntivo, capacidad de la célula tumoral para alterar en primer lugar su morfología y luego migrar a través de los tejidos circundantes, y capacidad de la célula tumoral para degradar
5 estructuras de tejido conjuntivo circundantes.
Pruebas de expresión génica de múltiples analitos pueden medir el nivel de expresión de uno o más genes implicados en cada uno de varias características celulares componentes o procesos fisiológicos relevantes. En algunos casos, la potencia predictiva de la prueba, y por tanto su utilidad, puede mejorarse usando los valores de expresión obtenidos para genes individuales para calcular una puntación que está más altamente correlacionada con el desenlace que el valor de expresión de los genes individuales. Por ejemplo, el cálculo de una puntuación cuantitativa (puntuación de recidiva) que predice la probabilidad de recidiva en cáncer de mama negativo para ganglios, positivo para receptor de estrógenos se describe en la solicitud de patente estadounidense en tramitación junto con la presente (número de publicación 20050048542). La ecuación usada para calcular una puntuación de
15 recidiva de este tipo puede agrupar genes con el fin de maximizar el valor predictivo de la puntuación de recidiva. La agrupación de genes puede realizarse al menos en parte basándose en el conocimiento de su contribución a funciones fisiológicas o características celulares componentes tal como se comentó anteriormente. La formación de grupos, además, puede facilitar la ponderación matemática de la contribución de diversos valores de expresión a la puntuación de recidiva. La ponderación de un grupo de genes que representan un proceso fisiológico o característica celular componente puede reflejar la contribución de ese proceso o característica a la patología del cáncer y el desenlace clínico. Por consiguiente, en un aspecto importante, la presente descripción también proporciona grupos específicos de los genes de pronóstico identificados en el presente documento, que juntos son factores de predicción del desenlace más fiables y potentes que los genes individuales o combinaciones al azar de los genes identificados.
25 Además, basándose en la determinación de una puntuación de recidiva, puede elegirse repartir pacientes en subgrupos a cualquier valor particular de la puntuación de recidiva, en donde todos los pacientes con valores en un intervalo dado pueden clasificarse como pertenecientes a un grupo de riesgo particular. Por tanto, los valores elegidos definirán subgrupos de pacientes con riesgo respectivamente mayor o menor.
La utilidad de un marcador génico en la predicción del desenlace de cáncer de colon puede no ser única para ese marcador. Puede sustituirse un marcador de prueba por un marcador alternativo que tiene un patrón de expresión que es estrechamente similar a un marcador de prueba particular o usarse además del mismo y tener poco impacto sobre la utilidad predictiva global de la prueba. Los patrones de expresión estrechamente similares de dos genes
35 pueden resultar de la implicación de ambos genes en un proceso particular y/o de estar bajo un control regulatorio común en células de tumor de colon.
El marcador de pronóstico y la información asociada proporcionados por la presente invención que predice el desenlace clínico en cánceres del colon y/o el recto en estadio II y/o estadio III tienen utilidad en el desarrollo de fármacos para tratar cánceres del colon y/o el recto en estadio II y/o estadio III.
El marcador de pronóstico y la información asociada proporcionados por la presente invención que predicen el desenlace clínico en cánceres del colon y/o el recto en estadio II y/o estadio III también tienen utilidad en el examen de pacientes para su inclusión en ensayos clínicos que someten a prueba la eficacia de compuestos farmacológicos
45 para el tratamiento de pacientes con cánceres del colon y/o el recto en estadio II y/o estadio III. En particular el marcador de pronóstico puede usarse en muestras recogidas de pacientes en un ensayo clínico y los resultados de la prueba usarse conjuntamente con los desenlaces de pacientes con el fin de determinar si es más o menos probable que los subgrupos de pacientes muestren una respuesta al fármaco que el grupo completo u otros subgrupos.
El marcador de pronóstico y la información asociada proporcionados por la presente invención que predicen el desenlace clínico en cánceres del colon y/o el recto en estadio II y/o estadio III son útiles como criterio de inclusión para un ensayo clínico. Por ejemplo, es más probable que se incluya un paciente en un ensayo clínico si los resultados de la prueba indican una probabilidad superior de que el paciente tenga un mal desenlace clínico si se
55 trata con cirugía sola y es menos probable que se incluya un paciente en un ensayo clínico si los resultados de la prueba indican una probabilidad inferior de que el paciente tenga un mal desenlace clínico si se trata con cirugía sola.
Los marcadores de pronóstico y la información asociada pueden usarse para diseñar o producir un reactivo que modula el nivel o la actividad del transcrito del gen o su producto de expresión. Dichos reactivos pueden incluir pero no se limitan a un ARN antisentido, un ARN inhibidor pequeño, una ribozima, un anticuerpo monoclonal o policlonal.
En un aspecto adicional, dicho gen o su transcrito, o más particularmente, un producto de expresión de dicho transcrito se usa en un ensayo (de examen) para identificar un compuesto farmacológico, en el que dicho compuesto
65 farmacológico se usa en el desarrollo de un fármaco para tratar cánceres del colon y/o el recto en estadio II y/o estadio III.
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En diversas realizaciones de la invención, están disponibles diversos enfoques tecnológicos para la determinación de los niveles de expresión de los genes dados a conocer, incluyendo, sin limitación, RT-PCR, microalineamientos, análisis en serie de la expresión génica (SAGE) y análisis de la expresión génica mediante secuenciación de firma
5 masiva en paralelo (MPSS), que se comentarán en detalle a continuación. En realizaciones particulares, el nivel de expresión del gen puede determinarse en relación con diversas características de los productos de expresión del gen incluyendo exones, intrones, epítopos proteicos y actividad de proteínas. En otras realizaciones, el nivel de expresión de un gen puede deducirse a partir del análisis de la estructura del gen, por ejemplo a partir del análisis del patrón de metilación del/de los promotor(es) del gen.
B.2 OBTENCIÓN DEL PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA
Los métodos de obtención del perfil de expresión génica incluyen métodos basados en análisis de hibridación de polinucleótidos, métodos basados en la secuenciación de polinucleótidos y métodos basados en proteómica. Los
15 métodos más comúnmente usados conocidos en la técnica para la cuantificación de la expresión de ARNm en una muestra incluyen transferencia de tipo Northern e hibridación in situ (Parker & Barnes, Methods in Molecular Biology 106:247-283 (1999)); ensayos de protección de ARNasa (Hod, Biotechniques 13:852-854 (1992)); y reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) (Weis et al., Trends in Genetics 8:263-264 (1992)). Alternativamente, pueden emplearse anticuerpos que pueden reconocer dúplex específicos de secuencia, incluyendo dúplex de ADN, dúplex de ARN y dúplex híbridos de ADN-ARN o dúplex de ADN-proteína. Los métodos representativos para el análisis de la expresión génica basado en secuenciación incluyen análisis en serie de la expresión génica (SAGE) y análisis de la expresión génica mediante secuenciación de firma masiva en paralelo (MPSS).
25 a. PCR con transcriptasa inversa (RT-PCR)
De las técnicas enumeradas anteriormente, el método cuantitativo más sensible y más flexible es RT-PCR, que puede usarse para comparar los niveles de ARNm en diversas muestras. Los resultados pueden usarse para comparar los patrones de expresión génica entre conjuntos de muestras, por ejemplo en tejidos normales y tumorales y en pacientes con o sin tratamiento farmacológico.
La primera etapa es el aislamiento de ARNm a partir de una muestra diana. El material de partida es normalmente ARN total aislado de las líneas de células tumorales o tumores humanos, y las correspondientes líneas celulares o tejidos normales, respectivamente. Por tanto, puede aislarse ARN a partir de una variedad de tumores primarios,
35 incluyendo líneas de células tumorales o tumor de mama, pulmón, colon, próstata, cerebro, hígado, riñón, páncreas, bazo, timo, testículos, ovario, útero, etc., con ADN combinado de donantes sanos. Si la fuente de ARNm es un tumor primario, puede extraerse ARNm, por ejemplo, a partir de muestras de tejido congelado o incrustado en parafina archivado y fijado (por ejemplo fijado con formalina).
Los métodos generales para la extracción de ARNm se conocen bien en la técnica y se dan a conocer en libros de texto convencionales de biología molecular, incluyendo Ausubel et al., Current Protocols of Molecular Biology, John Wiley and Sons (1997). Se dan a conocer métodos para la extracción de ARN a partir de tejidos incrustados en parafina, por ejemplo, en Rupp y Locker, Lab Invest. 56:A67 (1987), y De Andrés et al., BioTechniques 18:42044 (1995). En particular, puede realizarse el aislamiento del ARN usando un kit de purificación, conjunto de tampón y
45 proteasa de fabricantes comerciales, tales como Qiagen, según las instrucciones del fabricante. Por ejemplo, puede aislarse el ARN total de células en cultivo usando mini-columnas RNeasy de Qiagen. Otros kits de aislamiento de ARN disponibles comercialmente incluyen el kit de purificación de ARN y ADN completo MasterPure™ (EPICENTRE®, Madison, WI), y el kit de aislamiento de ARN en bloque de parafina (Ambion, Inc.). Puede aislarse el ARN total de muestras de tejido usando ARN Stat-60 (Tel-Test). Puede aislarse ARN preparado a partir del tumor, por ejemplo, mediante centrifugación en gradiente de densidad de cloruro de cesio.
Puesto que el ARN no puede servir como molde para la PCR, la primera etapa en la obtención del perfil de expresión génica mediante RT-PCR es la transcripción inversa del molde de ARN para dar ADNc, seguido por su amplificación exponencial en una reacción PCR. Las dos transcriptasas inversas más comúnmente usadas son la
55 transcriptasa inversa del virus de la mieloblastosis aviar (VMA-RT) y la transcriptasa inversa del virus de la leucemia murina de Moloney (VLMM-RT). La etapa de transcripción inversa normalmente se ceba usando cebadores específicos, hexámeros al azar o cebadores de oligo-dT, dependiendo de las circunstancias y el objetivo de obtención del perfil de expresión. Por ejemplo, el ARN extraído puede transcribirse de manera inversa usando un kit de PCR de ARN GeneAmp (Perkin Elmer, CA, EE.UU.), siguiendo las instrucciones del fabricante. Entonces puede usarse el ADNc derivado como molde en la reacción PCR posterior.
Aunque la etapa de PCR puede usar una variedad de ADN polimerasas dependientes de ADN termoestables, normalmente se emplea la Taq ADN polimerasa, que tiene una actividad nucleasa 5’-3’ pero carece de una actividad endonucleasa 3’-5’ de corrección de pruebas. Por tanto, la PCR TaqMan® utiliza normalmente la actividad nucleasa 65 5’ de la Tth o Taq polimerasa para hidrolizar una sonda de hibridación unida a su amplicón diana, pero puede usarse cualquier enzima con actividad nucleasa 5’ equivalente. Se usan dos cebadores de oligonucleótido para generar un
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amplicón típico de una reacción PCR. Se diseña un tercer oligonucleótido, o sonda, para detectar la secuencia de nucleótidos ubicada entre los dos cebadores de PCR. La sonda no puede extenderse mediante la enzima Taq ADN polimerasa, y se marca con un tinte fluorescente indicador y un tinte fluorescente extintor. Se extingue cualquier emisión inducida por láser del tinte indicador mediante el tinte de extinción cuando los dos tintes están ubicados
5 cercanos entre sí ya que están en la sonda. Durante la reacción de amplificación, la enzima Taq ADN polimerasa escinde la sonda de una manera dependiente del molde. Los fragmentos de la sonda resultantes se disocian en disolución, y la señal del tinte indicador liberado está libre del efecto de extinción del segundo fluoróforo. Se libera una molécula de tinte indicador por cada nueva molécula sintetizada, y la detección del tinte indicador no extinguido proporciona la base para la interpretación cuantitativa de los datos.
Puede realizarse RT-PCR TaqMan® usando equipo comercialmente disponible, tal como, por ejemplo, ABI PRISM 7700™ Sequence Detection System™ (Perkin-Elmer-Applied Biosystems, Foster City, CA, EE.UU.), o Lightcycler (Roche Molecular Biochemicals, Mannheim, Alemania). En una realización preferida, el procedimiento de nucleasa 5’ se lleva a cabo en un dispositivo de PCR cuantitativa en tiempo real tal como ABI PRISM 7700™ Sequence
15 Detection System™. El sistema consiste en un termociclador, un láser, un dispositivo de carga acoplada (CCD), una cámara y un ordenador. El sistema amplifica muestras en un formato de 96 pocillos en un termociclador. Durante la amplificación, se recoge la señal fluorescente inducida por láser en tiempo real a través de cables de fibra óptica para los 96 pocillos, y se detecta en el CCD. El sistema incluye software para manejar el instrumento y para analizar los datos.
Los datos del ensayo de nucleasa 5’ se expresan inicialmente como Ct, o el ciclo umbral. Tal como se trató anteriormente, se registran los valores de fluorescencia durante cada ciclo y representan la cantidad de producto amplificado en ese punto en la reacción de amplificación. El punto en el que se registra en primer lugar la señal fluorescente como estadísticamente significativa es el ciclo umbral (Ct).
25 Para minimizar los errores y el efecto de la variación muestra a muestra, se realiza habitualmente la RT-PCR usando un patrón interno. Se expresa el patrón interno ideal a un nivel constante entre diferentes tejidos, y no se ve afectado por el tratamiento experimental. Los ARN más frecuentemente usados para normalizar los patrones de expresión génica son ARNm para los genes de mantenimiento gliceraldehído-3-fosfato-deshidrogenasa (GAPDH) y �-actina.
Una variación más reciente de la técnica de RT-PCR es la PCR cuantitativa en tiempo real, que mide la acumulación de producto de PCR a través de una sonda fluorigénica doblemente marcada (es decir, sonda TaqMan®). La PCR en tiempo real es compatible tanto con la PCR competitiva cuantitativa, en la que se usa un competidor interno para cada secuencia diana para la normalización, como con la PCR comparativa cuantitativa que usa un gen de
35 normalización contenido dentro de la muestra, o un gen de mantenimiento para RT-PCR. Para detalles adicionales véase, por ejemplo Held et al., Genome Research 6:986-994 (1996).
Las etapas de un protocolo representativo para la obtención del perfil de expresión génica usando tejidos fijados, incrustados en parafina como fuente de ARN, incluyendo aislamiento de ARNm, purificación, extensión del cebador y amplificación se facilitan en diversos artículos de revista publicados (por ejemplo: T.E. Godfrey et al. J. Molec. Diagnostics 2: 84-91 (2000); K. Specht et al., Am. J. Pathol. 158: 419-29 (2001)). En resumen, un procedimiento representativo comienza con el corte de secciones de aproximadamente 10 µm de grosor de muestras de tejido tumoral incrustado en parafina. Entonces se extrae el ARN, se eliminan las proteínas y el ADN. Tras el análisis de la concentración de ARN, pueden incluirse etapas de reparación y/o amplificación de ARN, si es necesario, y se
45 transcribe el ARN de manera inversa usando promotores específicos de gen seguido por RT-PCR.
b. Sistema MassARRAY
En el método de obtención del perfil de expresión génica basado en MassARRAY, desarrollado por Sequenom, Inc. (San Diego, CA) tras el aislamiento de ARN y la transcripción inversa, se realizan adiciones conocidas del ADNc obtenido con una molécula de ADN sintético (competidor), que coincide con la región de ADNc seleccionada como diana en todas las posiciones; excepto por una única base, y sirve como patrón interno.
La mezcla de ADNc/competidor se amplifica por PCR y se somete a un tratamiento con enzima fosfatasa alcalina de
55 gamba (SAP) tras la PCR, lo que da como resultado la desfosforilación de los nucleótidos restantes. Tras la inactivación de la fosfatasa alcalina, se someten los productos de PCR del competidor y el ADNc a extensión del cebador, lo que genera señales de masa distintas para productos de PCR derivados de competidor y ADNc. Tras la purificación, se dispensan estos productos sobre un alineamiento de chip, que está precargado con componentes necesarios para el análisis con espectrometría de masas de tiempo de vuelo con desorción-ionización láser asistida por matriz (MALDI-TOF MS). El ADNc presente en la reacción se cuantifica entonces analizando las razones de las áreas pico en el espectro de masas generado. Para detalles adicionales véase, por ejemplo, Ding y Cantor, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100:3059-3064 (2003).
c. Otros métodos basados en PCR
65 Las técnicas basadas en PCR adicionales incluyen, por ejemplo, presentación diferencial (Liang y Pardee, Science
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257:967-971 (1992)); polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (iAFLP) (Kawamoto et al., Genome Res. 12:1305-1312 (1999)); tecnología BeadArray™ (Illumina, San Diego, CA; Oliphant et al., Discovery of Markers for Disease (suplemento a Biotechniques), junio de 2002; Ferguson et al., Analytical Chemistry 72:5618 (2000)); BeadsArray para la detección de la expresión génica (BADGE), usando el sistema Luminex100 LabMAP disponible
5 comercialmente y múltiples microesferas codificadas por color (Luminex Corp., Austin, TX) en un ensayo rápido para determinar la expresión génica (Yang et al., Genome Res. 11:1888-1898 (2001)); y análisis de obtención del perfil de expresión de alta cobertura (HiCEP) (Fukumura et al., Nucl. Acids. Res. 31(16) e94 (2003)).
d. Microalineamientos
También puede identificarse la expresión génica diferencial, o confirmarse, usando la técnica de microalineamientos. Por tanto, puede medirse el perfil de expresión de genes asociados con cáncer de colon en tejido tumoral o bien incrustado en parafina o bien reciente, usando tecnología de microalineamientos. En este método, se siembran en placas las secuencias de polinucleótido de interés (incluyendo ADNc y oligonucleótidos), o se alinean, sobre un
15 sustrato de microchip. Entonces se hibridan las secuencias alineadas con sondas de ADN específicas de células o tejidos de interés. Justo como en el método de RT-PCR, la fuente de ARNm normalmente es ARN total aislado de tumores humanos o líneas de células tumorales, y las correspondientes líneas celulares o tejidos normales. Por tanto, puede aislarse ARN a partir de una variedad de tumores primarios o líneas de células tumorales. Si la fuente de ARNm es un tumor primario, puede extraerse el ARNm, por ejemplo, de muestras de tejido congelado o incrustado en parafina archivado y fijado (por ejemplo fijado con formalina), que se preparan de manera rutinaria y se conservan en la práctica clínica diaria.
En una realización específica de la técnica de microalineamientos, se aplican insertos amplificados por PCR de clones de ADNc a un sustrato en un alineamiento denso. Preferiblemente, se aplican al menos 10.000 secuencias 25 de nucleótidos al sustrato. Los genes microalineados, inmovilizados sobre el microchip a 10.000 elementos cada uno, son adecuados para la hibridación en condiciones rigurosas. Pueden generarse sondas de ADNc marcadas de manera fluorescente a través de la incorporación de nucleótidos fluorescentes mediante transcripción inversa de ARN extraído de tejidos de interés. Las sondas de ADNc marcadas aplicadas al chip se hibridan con especificidad a cada punto de ADN en el alineamiento. Tras el lavado riguroso para eliminar sondas no unidas específicamente, se explora el chip mediante microscopía láser confocal o mediante otro método de detección, tal como una cámara CCD. La cuantificación de la hibridación de cada elemento alineado permite la evaluación de la correspondiente abundancia de ARNm. Con la fluorescencia de doble color, se hibridan por parejas sondas de ADNc marcadas por separado generadas a partir de dos fuentes de ARN con el alineamiento. Por tanto, se determina simultáneamente la abundancia relativa de los transcritos a partir de las dos fuentes correspondientes a cada gen especificado. La
35 escala miniaturizada de la hibridación permite una evaluación rápida y conveniente del patrón de expresión para grandes números de genes. Se ha mostrado que tales métodos tienen la sensibilidad requerida para detectar transcriptos raros, que se expresan a unas pocas copias por célula, y para detectar de manera reproducible diferencias de al menos aproximadamente dos veces en los niveles de expresión (Schena et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93(2):106-149 (1996)). El análisis de microalineamientos puede realizarse mediante equipo disponible comercialmente, siguiendo los protocolos del fabricante, tal como usando la tecnología Affymetrix GenChip, o la tecnología de microalineamientos de Incyte.
El desarrollo de métodos de microalineamientos para análisis a gran escala de la expresión génica hace posible buscar sistemáticamente marcadores moleculares de la clasificación del cáncer y la predicción del desenlace en una
45 variedad de tipos de tumor.
e. Análisis en serie de la expresión génica (SAGE)
El análisis en serie de la expresión génica (SAGE) es un método que permite el análisis cuantitativo y simultáneo de un gran número de transcritos de genes, sin la necesidad de proporcionar una sonda de hibridación individual para cada transcrito. En primer lugar, se genera una etiqueta de secuencia corta (aproximadamente 10-14 pb) que contiene información suficiente para identificar de manera única un transcrito, siempre que se obtenga el marcador a partir de una posición única dentro de cada transcrito. Entonces, se unen entre sí muchos transcritos para formar moléculas en serie largas, que pueden secuenciarse, revelando la identidad de las múltiples etiquetas
55 simultáneamente. El patrón de expresión de cualquier población de transcritos puede evaluarse cuantitativamente determinando la abundancia de etiquetas individuales e identificando el gen correspondiente a cada etiqueta. Para más detalles véanse, por ejemplo Velculescu et al., Science 270:484-487 (1995); y Velculescu et al., Cell 88:243-51 (1997).
f. Análisis de la expresión génica mediante secuenciación de firma masiva en paralelo (MPSS)
Este método, descrito por Brenner et al., Nature Biotechnology 18:630-634 (2000), es un enfoque de secuenciación que combina secuenciación de firma no basada en gel con clonación in vitro de millones de moldes en microperlas de 5 �m de diámetro separadas. En primer lugar, se construye una biblioteca de microperlas de moldes de ADN 65 mediante clonación in vitro. A esto le sigue el ensamblaje de un alineamiento plano de las microperlas que contienen moldes en una célula de flujo a una alta densidad (normalmente superior a 3x106 microperlas/cm2). Se analizan
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simultáneamente los extremos libres de los moldes clonados en cada microperla, usando un método de secuenciación de firma basado en fluorescencia que no requiere separación de fragmentos de ADN. Se ha mostrado que este método proporciona de manera simultánea y precisa, en una única operación, cientos de miles de secuencias de firma de gen a partir de una biblioteca de ADNc de levadura.
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g. Inmunohistoquímica
Métodos de inmunohistoquímica también son adecuados para detectar los niveles de expresión del marcador de pronóstico de la presente invención. Por tanto, se usan anticuerpos o antisueros, preferiblemente antisueros policlonales, y lo más preferiblemente anticuerpos monoclonales específicos para el marcador para detectar la expresión. Los anticuerpos pueden detectarse mediante marcaje directo de los propios anticuerpos, por ejemplo, con marcadores radiactivos, marcadores fluorescentes, marcadores de haptenos tales como biotina, o una enzima tal como peroxidasa del rábano o fosfatasa alcalina. Alternativamente, se usa anticuerpo primario no marcado conjuntamente con un anticuerpo secundario marcado, que comprende antisueros, antisueros policlonales o un
15 anticuerpo monoclonal específico para el anticuerpo primario. Se conocen bien en la técnica protocolos y kits de inmunohistoquímica y están disponibles comercialmente.
h. Proteómica
El término “proteoma” se define como la totalidad de las proteínas presentes en una muestra (por ejemplo tejido, organismo o cultivo celular) a un determinado punto de tiempo. La proteómica incluye, entre otras cosas, el estudio de los cambios globales de la expresión de proteínas en una muestra (también denominada “proteómica de expresión”). La proteómica incluye normalmente las siguientes etapas: (1) separación de proteínas individuales en una muestra mediante electroforesis en gel bidimensional (2-D PAGE); (2) identificación de las proteínas individuales
25 recuperadas del gel, por ejemplo mediante espectrometría de masas o secuenciación N-terminal y (3) análisis de los datos usando bioinformática. Los métodos de proteómica son complementos valiosos a otros métodos de obtención del perfil de expresión génica, y pueden usarse, solos o en combinación con otros métodos, para detectar los productos del marcador de pronóstico de la presente invención.
i. Análisis de metilación del promotor
Se comentan en el presente documento varios métodos para la cuantificación de transcritos de ARN (análisis de la expresión génica) o sus productos de traducción de proteínas. El nivel de expresión de genes también puede deducirse a partir de información referente a la estructura de la cromatina, tal como por ejemplo el estado de
35 metilación de promotores de genes y otros elementos reguladores y el estado de acetilación de histonas.
En particular, el estado de metilación de un promotor influye en el nivel de expresión del gen regulado por ese promotor. Se ha implicado la metilación aberrante de promotores de genes particulares en la regulación de la expresión, tal como por ejemplo el silenciamiento de genes supresores de tumores. Por tanto, puede utilizarse el examen del estado de metilación del promotor de un gen como sustituto para la cuantificación directa de los niveles de ARN.
Se han ideado varios enfoques para medir el estado de metilación de elementos de ADN particulares, incluyendo PCR específica de metilación (Herman J.G. et al. (1996) Metilation-specific PCR: a novel PCR assay for metilation
45 status of CpG islands. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 93, 9821-9826) y secuenciación de ADN por bisulfito (Frommer M. et al. (1992) A genomic sequencing protocol that yields a positive display of 5-metilcytosine residues in individual DNA strands. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 89, 1827-1831.). Más recientemente, se han usado tecnologías basadas en microalineamientos para caracterizar el estado de metilación del promotor (Chen C.M. (2003) Metilation target array for rapid analysis of CpG island hipermetilation in multiple tissue genomes. Am. J. Pathol. 163, 37-45).
j. Coexpresión de genes
Un aspecto adicional de la descripción es la identificación de agrupaciones de expresión génica. Pueden identificarse agrupaciones de expresión génica mediante el análisis de datos de expresión usando análisis
55 estadísticos conocidos en la técnica, incluyendo análisis de correlación por parejas basado en coeficientes de correlación de Pearson (Pearson K. y Lee A. (1902) Biometrika 2, 357).
En un aspecto, una agrupación de expresión identificada en el presente documento incluye BGN, CALD1, COL1A1, COL1A2, SPARC, VIM y otros genes que se sabe que se sintetizan predominantemente por células del estroma y que están implicadas en la remodelación de la matriz extracelular. Esta agrupación de expresión se denomina en el presente documento agrupación del estroma/de remodelación de la matriz extracelular.
En otro aspecto, una agrupación de expresión identificada en el presente documento incluye ANXA2, KLK6, KLK10, LAMA3, LAMC2, MASPIN, SLPI, y otros genes que codifican para genes secretados por células epiteliales, la 65 mayoría de los cuales se secretan predominantemente por células epiteliales pero que pueden secretarse por otros tipos de células. Esta agrupación de expresión se denomina en el presente documento agrupación
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secretada/epitelial.
Todavía en otro aspecto, una agrupación de expresión identificada en el presente documento incluye DUSP1, EGR1, EGR3, FOS, NR4A1, RHOB, y otros genes cuya transcripción se regula por incremento de manera temprana
5 tras la exposición de células a determinados estímulos. Una variedad de estímulos desencadenan la transcripción de genes de respuesta temprana, por ejemplo exposición a factores de crecimiento, lo que permite que las células aumenten rápidamente su motilidad y su capacidad para transportar nutrientes tales como glucosa. Esta agrupación de expresión se denomina en el presente documento agrupación de respuesta temprana.
10 Aún en otro aspecto, una agrupación de expresión identificada en el presente documento incluye MCP1, CD68, CTSB, OPN, y otros genes que codifican para proteínas asociadas habitualmente con células del sistema inmunitario. Esta agrupación de expresión se denomina en el presente documento agrupación inmunitaria.
En un aspecto adicional, una agrupación de expresión identificada en el presente documento incluye CCNE2,
k. Descripción general del aislamiento, la purificación y amplificación de ARNm
20 Se proporcionan en diversos artículos de revistas publicados las etapas de un protocolo representativo para la obtención del perfil de expresión génica usando tejidos fijados, incrustados en parafina como fuente de ARN, incluyendo aislamiento de ARNm, purificación, extensión del cebador y amplificación (por ejemplo: T.E. Godfrey et al, J. Molec. Diagnostics 2: 84-91 (2000); K. Specht et al., Am. J. Pathol. 158: 419-29 (2001)). En resumen, un procedimiento representativo comienza con el corte de secciones de aproximadamente 10 µm de grosor de
25 muestras de tejido tumoral incrustadas en parafina. Entonces se extrae el ARN, y se eliminan las proteínas y el ADN. Tras el análisis de la concentración de ARN, pueden incluirse etapas de reparación y/o amplificación de ARN, si es necesario, y se transcribe el ARN de manera inversa usando promotores específicos de gen seguido por RT-PCR. Finalmente, se analizan los datos para identificar la(s) mejor(es) opción/opciones de tratamiento disponible(s) para el paciente basándose en el patrón de expresión génica característico identificado en la muestra tumoral examinada,
30 dependiente de la probabilidad predicha de recidiva del cáncer.
l. Conjunto de genes de cáncer de colon, subsecuencias de genes sometidos a ensayo y aplicación clínica de los datos de expresión génica
35 Un importante aspecto de la presente invención es usar la expresión medida del gen BGN por tejido de cáncer de colon para proporcionar información de pronóstico. Para este fin es necesario corregir (normalizar) tanto las diferencias en la cantidad de ARN sometido a ensayo como la variabilidad en la calidad del ARN usado. Por tanto, el ensayo mide normalmente e incorpora la expresión de determinados genes de normalización, incluyendo genes de mantenimiento bien conocidos, tales como GAPDH y Cyp1. Alternativamente, la normalización puede basarse en la
40 señal media o mediana (Ct) de todos los genes sometidos a ensayo o un gran subconjunto de los mismos (enfoque de normalización global). En una base gen a gen, se compara la cantidad normalizada medida de un ARNm de tumor de un paciente con la cantidad encontrada en un conjunto de referencia de tejido de cáncer de colon. El número (N) de tejidos de cáncer de colon en este conjunto de referencia debe ser suficientemente alto como para garantizar que diferentes conjuntos de referencia (en su totalidad) se comportan esencialmente del mismo modo. Si
45 no se cumple esta condición, la identidad de los tejidos de cáncer de colon individuales presentes en un conjunto particular no tendrá un impacto significativo sobre las cantidades relativas de los genes sometidos a ensayo. Habitualmente, el conjunto de referencia de tejido de cáncer de colon consiste en al menos aproximadamente 30, preferiblemente al menos aproximadamente 40 muestras de tejidos de cáncer de colon FPE diferentes. A menos que se indique lo contrario, los niveles de expresión normalizada para cada ARNm/tumor sometido a
50 prueba/paciente se expresarán como un porcentaje del nivel de expresión medido en el conjunto de referencia. Más específicamente, el conjunto de referencia de un número suficientemente alto (por ejemplo 40) de tumores produce una distribución de niveles normalizados de cada especie de ARNm. El nivel medido en una muestra de tumor particular que va a analizarse se encuentra en algún percentil dentro de este intervalo, lo que puede determinarse mediante métodos bien conocidos en la técnica. A continuación, a menos que se indique lo contrario, la referencia a
55 niveles de expresión de un gen supone expresión normalizada en relación con el conjunto de referencia aunque éste no siempre se establezca de manera explícita.
m. Diseño de sondas y cebadores de PCR basados en intrones
60 Según un aspecto, se diseñan sondas y cebadores de PCR basándose en secuencias de intrones presentes en el gen que va a amplificarse. Por consiguiente, la primera etapa en el diseño de sondas/cebadores es la delineación de secuencias de intrones dentro de los genes. Esto puede realizarse mediante software disponible públicamente, tal como el software DNA BLAT desarrollado por Kent, W.J., Genome Res. 12(4):656-64 (2002), o mediante el software BLAST incluyendo sus variaciones. Las etapas posteriores siguen métodos bien establecidos de diseño de sondas y
65 cebadores de PCR.
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Con el fin de evitar señales no específicas, es importante enmascarar secuencias repetitivas dentro de los intrones cuando se diseñan los cebadores y las sondas. Esto puede lograrse fácilmente usando el programa Repeat Masker disponible en línea a través del Bailor College of Medicine, que examina secuencias de ADN frente a una biblioteca de elementos repetitivos y devuelve una secuencia de consulta en la que los elementos repetitivos están 5 enmascarados. Las secuencias de intrones enmascaradas pueden usarse entonces para diseñar secuencias de sondas y cebadores usando cualquier paquete de diseño de sondas/cebadores disponible comercialmente o públicamente de otra forma, tal como Primer Express (Applied Biosystems); MGB assay-by-design (Applied Biosystems); Primer3 (Steve Rozen y Helen J. Skaletsky (2000) Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers. En: Krawetz S, Misener S (eds) Bioinformatics Methods and Protocols: Methods in Molecular
10 Biology. Humana Press, Totowa, NJ, págs. 365-386).
Los factores más importantes considerados en el diseño de cebadores de PCR incluyen la longitud del cebador, la temperatura de fusión (Tm) y el contenido en G/C, la especificidad, las secuencias de cebadores complementarios y la secuencia del extremo 3’. En general, cebadores de PCR óptimos tienen generalmente 17-30 bases de longitud, y
15 contienen aproximadamente el 20-80%, tal como, por ejemplo, aproximadamente el 50-60% de bases G+C. Se prefieren normalmente Tm de entre 50 y 80ºC, por ejemplo de aproximadamente 50 a 70ºC.
Para directrices adicionales para el diseño de sondas y cebadores de PCR véanse, por ejemplo Dieffenbach, C.W. et al., “General Concepts for PCR Primer Design” en: PCR Primer, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
20 Laboratory Press, Nueva York, 1995, págs. 133-155; Innis y Gelfand, “Optimization of PCRs” en: PCR Protocols, A Guide to Methods and Applications, CRC Press, Londres, 1994, págs. 5-11; y Plasterer, T.N. Primerselect: Primer and probe design. Methods Mol. Biol. 70:520-527 (1997).
n. Kits
25 Los materiales para su uso en los métodos de la presente invención son adecuados para la preparación de kits producidos según procedimientos bien conocidos. Los kits comprenden agentes, lo que puede incluir sondas y/o genes específicos de genes o selectivos de genes, para cuantificar la expresión de los genes dados a conocer para predecir el desenlace del pronóstico o la respuesta al tratamiento. Tales kits pueden contener opcionalmente
30 reactivos para la extracción de ARN de muestras de tumor, en particular muestras de tejido incrustado en parafina fijado y/o reactivos para la amplificación de ARN. Además, los kits pueden comprender opcionalmente el/los reactivo(s) con una descripción de identificación o etiqueta o instrucciones referentes a su uso en los métodos de la presente invención. Los kits pueden comprender envases (incluyendo placas de microtitulación adecuadas para su uso en una implementación automatizada del método), cada uno con uno o más de los diversos reactivos
35 (normalmente en forma concentrada) utilizados en los métodos, incluyendo, por ejemplo, microalineamientos prefabricados, tampones, los nucleótido trifosfatos adecuados (por ejemplo, dATP, dCTP, dGTP y dTTP; o rATP, rCTP, rGTP y UTP), transcriptasa inversa, ADN polimerasa, ARN polimerasa y uno o más sondas y cebadores (por ejemplo, cebadores al azar o de poli(T) de longitud apropiada unidos a un promotor reactivo con la ARN polimerasa). Algoritmos matemáticos usados para estimar o cuantificar el pronóstico o información predictiva también son
40 apropiadamente posibles componentes de kits.
o. Informes de la invención
Los métodos de esta descripción, cuando se ponen en práctica para fines de diagnóstico comerciales producen
45 generalmente un informe o resumen de los niveles de expresión normalizada de uno o más de los genes seleccionados. Los métodos producirán un informe que comprende una predicción del desenlace clínico de un sujeto al que se le diagnostica cáncer colorrectal tras la resección quirúrgica de dicho cáncer. Los métodos e informes pueden incluir además almacenar el informe en una base de datos. Alternativamente, el método puede crear además un registro en una base de datos para el sujeto y rellenar el registro con datos. En una realización el informe
50 es un informe en papel, en otra realización el informe es un informe auditivo, en otra realización el informe es un registro electrónico. Se contempla que el informe se proporcione a un médico y/o al paciente. El receptor del informe puede incluir además el establecimiento de una conexión en red con un servidor que incluye los datos y el informe y solicitar los datos y el informe del servidor.
55 Los métodos proporcionados por la presente invención también pueden automatizarse en su totalidad o en parte.
Todos los aspectos de la presente descripción también pueden ponerse en práctica de manera que se incluya un número limitado de genes adicionales que se coexpresan con los genes dados a conocer, por ejemplo tal como se demuestra por coeficientes de correlación de Pearson altos, en una prueba de pronóstico o predictiva además de y/o
60 en lugar de los genes dados a conocer.
Habiendo descrito la invención, la misma se entenderá más fácilmente a través de la referencia al siguiente ejemplo, que se proporciona a modo de ilustración, y no pretende limitar la invención de ningún modo.
65 Ejemplos
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Un estudio para explorar las relaciones entre los perfiles de expresión de tumor genómicos y la probabilidad de recidiva en pacientes con Duke B y Duke C tratados con resección del colon
El objetivo primario de este estudio era determinar si hay una relación significativa entre la expresión de cada uno de 5 757 amplicones identificados en la tabla B y el desenlace clínico de pacientes con cáncer de colon en estadio II y estadio III que reciben resección del colon (cirugía) sin quimioterapia.
Diseño del estudio
10 Éste fue un estudio exploratorio usando tejido y datos de desenlace de los estudios C-01 y C0-2 del National Surgical Adjuvant Breast and Bowel Project (NSABP) en hasta 400 pacientes con Duke B (estadio II) y Duke C (estadio III) que recibieron resección del colon (cirugía) sola o cirugía y bacilo Calmette-Guerin (BCG) posoperatorio.
Criterios de inclusión
15 Pacientes incluidos o bien en el estudio del NSABP C-01: “A Clinical Trial To Evaluate Postoperative Immunotherapy And Postoperative Systemic Chemotherapy In The Management of Resectable Colon Cancer” o bien en el estudio del NSABP C-02: “A Protocol To Evaluate The Postoperative Portal Vein Infusion Of 5-Flourouracil And Heparin in Adenocarcinoma Of The Colon”. Pueden encontrarse detalles de C-01 y C-02 en el sitio web de NSABP en la
20 siguiente dirección URL:
http://www.nsabp.pitt.edu/NSABPProtocols.htm#treatment%20closed
Se combinaron muestras de tejido de las ramas de cirugía sola y cirugía + BCG posoperatorio de NSABP C01 y de 25 la rama de cirugía sola de cirugía de NSABP C02 para dar un conjunto de muestras.
Criterios de exclusión
Los pacientes incluidos en el estudio del NSABP C-01 o el estudio del NSABP C-02 se excluyeron del presente 30 estudio si se aplicaba uno o más de lo siguiente:
Ningún bloque de tumor disponible a partir del diagnóstico inicial en el archivo del NSABP.
■ Tumor insuficiente en el bloque tal como se evalúa mediante examen de portaobjetos de hematoxilina y eosina 35 (H&E)
■ ARN insuficiente (<700 ng) recuperado de las secciones de tejido para el análisis de RT-PCR.
De 1943 pacientes incluidos en el estudio del NSABP C-01 o el estudio del NSABP C-02, estaban disponibles 270
40 muestras de pacientes tras la aplicación de los criterios de exclusión y se usaron en el estudio de expresión génica dado a conocer en el presente documento. Las características clínicas y demográficas globales de las 270 muestras incluidas eran similares a las cohortes combinadas de NSABP originales.
Panel de genes
45 Se eligieron setecientos sesenta y un genes, incluyendo siete genes de referencia, para el análisis de expresión. Estos genes se enumeran en la tabla A junto con las secuencias de cebadores y sondas usados en qRT-PCR para determinar el nivel de expresión.
50 Materiales y métodos experimentales
Se evaluó cuantitativamente la expresión de 750 genes relacionados con cáncer y 7 genes designados para su uso como genes de referencia para cada paciente usando RT-PCR TaqMan®, que se realizó individualmente con introducción de ARN a 1 nanogramo por reacción.
55 Métodos de análisis de datos
Normalización por referencia
60 Para la normalización de efectos extraños; se normalizaron las mediciones de ciclo umbral (CT) obtenidas mediante RT-PCR en relación con la expresión media de un conjunto de seis genes de referencia. Las mediciones de expresión normalizadas por referencia resultantes oscilan normalmente entre 0 y 15, en donde un aumento de una unidad refleja un aumento de 2 veces en la cantidad de ARN.
65 Comparación de la cohorte de estudio con las poblaciones de los estudios del NSABP originales
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Se comparó la distribución de variables clínicas y demográficas para la cohorte de estudio actual de bloques de tejidos evaluables frente a las poblaciones de los estudios C-01 y C-02 del NSABP originales. No había diferencias clínicamente significativas en las distribuciones.
5 Análisis de una variable
Para cada uno de los 757 amplicones en estudio, se usó el modelo de riesgos proporcionales de Cox para examinar la relación entre la expresión génica y el intervalo libre de recidiva (ILR). Se usó la razón de probabilidad como prueba de significación estadística. Se aplicaron el método de Benjamini y Hochberg (Benjamini, Y. y Hochberg, Y. (1995). Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing. J.R. Statist. Soc. B 57, 289-300.), así como métodos basados en remuestreo y permutación (Tusher VG, Tibshirani R, Chu G (2001) Significance analysis of microarrays applied to the ionizing radiation response. Proc Natl Acad Sci USA, 98:51165121.; Storey JD, Tibshirani R (2001) Estimating false discovery rates under dependence, with applications to DNA microarrays. Stanford: Stanford University, Department of Statistics; informe n.º: Technical Report 2001-28.; Korn EL,
15 Troendle J, McShane L, Simon R (2001) Controlling the number of false discoveries: Application to high-dimensional genomic data. Technical Report 003. 2001. National Cancer Institute) al conjunto resultante de valores de p para estimar las tasas de falsos descubrimientos. Se repitieron todos los análisis para cada uno de los criterios de valoración alternativos: intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD), supervivencia global (SG) y supervivencia libre de enfermedad (SLE).
Análisis de múltiples variantes
Para cada uno de los 757 amplicones en estudio, se usó el modelo de riesgos proporcionales de Cox para examinar la relación entre la expresión génica e ILR, controlando al mismo tiempo los efectos de otras covariables clínicas
25 convencionales (incluyendo ubicación del tumor, tipo de cirugía, grado del tumor, número de ganglios linfáticos examinados y número de ganglios linfáticos positivos). Se usó la diferencia en las probabilidades logarítmicas del modelo (reducido) que incluye sólo las covariables clínicas convencionales y el modelo (completo) que incluye las covariables clínicas convencionales más la expresión génica como prueba de significación estadística.
Análisis no lineal
Para cada uno de los 757 amplicones en estudio, se exploraron relaciones funcionales alternativas entre expresión génica y recidiva usando varios métodos diferentes. Para cada amplicón, se ajustó un modelo de riesgos proporcionales de Cox de ILR como función de expresión génica usando una curva de tipo spline natural de 2 35 grados de libertad (GL) (Stone C, Koo C. (1985) En Proceedings of the Statistical Computing Section ASA. Washington, DC, 45-48). Se evaluó la significación estadística mediante la razón de probabilidad de 2 GL para el modelo. También se exploraron relaciones funcionales examinando el patrón de errores residuales de Martingale (suavizado) derivado a partir de modelos de riesgos proporcionales de Cox de una variable de ILR como función estrictamente lineal de la expresión génica (Gray RJ (1992) Flexible methods for analyzing survival data using splines, with applications to breast cancer prognosis. Journal of the American Statistical Asssociation, 87:942-951; Gray RJ (1994) Spline-based tests in survival analysis. Biometrics, 50:640-652.; Gray RJ (1990) Some diagnostic methods for Cox regression models through hazard smoothing. Biometrics, 46:93-102). Adicionalmente, se usaron las sumas acumuladas de errores residuales de Martingale a partir de cada uno de los mismos modelos de riesgos proporcionales de Cox para detectar desviaciones de la linealidad (Lin D, Wei’L, Ying Z. (1993) Checking the Cox
45 Model with Cumulative Sums of Martingale-Based Residuals. Vol. 80, n.º 3.557-572).
Interacción con el estadio
Se determinó si hay una relación significativamente diferente entre la expresión génica e ILR en pacientes en estadio II y estadio III. Para cada uno de los 757 amplicones, se sometió a prueba la hipótesis de que hay una diferencia significativa entre el modelo de riesgos proporcionales (reducido) para la expresión génica y el estadio del tumor frente al modelo de riesgos proporcionales (completo) basado en expresión génica, estadio del tumor y su interacción. Se usó la diferencia en las probabilidades logarítmicas de los modelos reducido y completo como prueba de significación estadística.
55 La tabla A muestra secuencias de cebadores y sondas de qRT-PCR para todos los genes incluidos en el estudio descrito en el ejemplo.
La tabla B muestra amplicones diana para todos los genes incluidos en el estudio descrito en el ejemplo.
Resultados del primer estudio de análisis
El conjunto de genes de referencia para el primer análisis fue CLTC, FZD6, NEDD8, RPLPO, RPS 13, UBB, UBC.
65 La tabla 1A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva (ILR) más corto basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
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La tabla 1B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva (ILR) más largo basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
5 La tabla 2A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa disminuida de supervivencia global (SG) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 2B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa aumentada de supervivencia global (SG) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
10 La tabla 3A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa disminuida de supervivencia libre de enfermedad (SLE) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 3B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa aumentada 15 de supervivencia libre de enfermedad (SLE) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 4A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD) más corto basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
20 La tabla 4B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD) más largo basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 5A muestra asociaciones entre expresión génica e ILR para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva (ILR) más corto, basándose en un análisis de múltiples variables que 25 controla características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis.
La tabla 5B muestra asociaciones entre expresión génica e ILR para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva (ILR) más largo, basándose en un análisis de múltiples variables que controla características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis.
30 La tabla 6 muestra genes para los que se identificó una asociación entre expresión génica y desenlace clínico basándose en un análisis de riesgos proporcionales no lineal, usando una curva de tipo spline natural de 2 grados de libertad.
35 La tabla 7 muestra todos los genes que presentan una interacción (valor de p < 0,05) con el estadio del tumor.
La tabla 1A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos >1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estadio III (Duke C) combinados usando ILR como métrica para el
40 desenlace clínico.
Tabla 1A
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- RARB
- 2,13 0,0252 RARB NM_016152
- ITGB1
- 1,94 0,0002 ITGB1 NM_002211
- ALDOA
- 1,92 0,0853 ALDOA NM_000034
- ANXA2
- 1,90 <0,0001 ANXA2 NM_004039
- CYP3A4
- 1,81 0,0038 CYP3A4 NM_017460
- KRAS2
- 1,64 0,0043 KRAS NM_004985
- COX2
- 1,62 0,0521 PTGS2 NM_000963
- RhoC
- 1,61 0,0034 RHOC NM_175744
- TJP1
- 1,60 0,0554 TJP1 NM_003257
- RhoB
- 1,57 0,0001 RHOB NM_004040
- KIAA0125
- 1,56 0,0940 KIAA0125 NM_014792
- TIMP1
- 1,52 <0,0001 TIMP1 NM_003254
- UBC
- 1,49 0,0031 UBC NM_021009
- ANXA5
- 1,49 0,0084 ANXA5 NM_001154
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- NTN1
- 1,49 0,0386 NTN1 NM_004822
- AKT3
- 1,47 <0,0001 AKT3 NM_005465
- CALD1
- 1,46 0,0007 CALD1 NM_004342
- IGFBP7
- 1,46 0,0019 IGFBP7 NM_001553
- VEGFC
- 1,45 0,0092 VEGFC NM_005429
- BGN
- 1,44 0,0002 BGN NM_001711
- CYP1B1
- 1,44 0,0180 CYP1B1 NM_000104
- DLC1
- 1,43 0,0012 DLC1 NM_006094
- S1
- 1,43 0,0063 SI NM_001041
- CCNE2 variante 1
- 1,43 0,0506 CCNE2 NM_057749
- LAMC2
- 1,42 0,0003 LAMC2 NM_005562
- TIMP2
- 1,42 0,0018 TIMP2 NM_003255
- CDC42BPA
- 1,42 0,0029 CDC42BPA NM_003607
- p21
- 1,41 0,0062 CDKN1A NM_000389
- HB-EGF
- 1,40 0,0105 HBEGF NM_001945
- TLN1
- 1,40 0,0260 TLN1 NM_006289
- DUSP1
- 1,39 <0,0001 DUSP1 NM_004417
- ROCK1
- 1,39 0,0121 ROCK1 NM_005406
- CTSB
- 1,39 0,0307 CTSB NM_001908
- ITGAV
- 1,38 0,0020 ITGAV NM_002210
- HSPG2
- 1,38 0,0215 HSPG2 NM_005529
- GADD45B
- 1,37 0,0002 GADD45B NM_015675
- VCL
- 1,37 0,0201 VCL NM_003373
- SBA2
- 1,37 0,0250 WSB2 NM_018639
- Maspina
- 1,36 <0,0001 SERPINB5 NM_002639
- CGB
- 1,36 0,0018 CGB NM_000737
- TIMP3
- 1,36 00024 TIMP3 NM_000362
- VIM
- 1,36 0,0073 VIM NM_003380
- S100A1
- 1,36 0,0247 S100A1 NM_006271
- INHBA
- 1,35 0,0008 INHBA NM_002192
- SIR2
- 1,35 0,0039 SIRT1 NM_012238
- TMSB10
- 1,35 0,0469 TMSB10 NM_021103
- CD68
- 1,34 0,0036 CD68 NM_001251
- RBX1
- 1,34 0,0469 RBX1 NM_014248
- INHBB
- 1,34 0,0514 INHBB NM_002193
- PKR2
- 1,34 0,0628 PKM2 NM_002654
- FOS
- 1,33 0,0006 FOS NM_005252
- FYN
- 1,33 0,0036 FYN NM_002037
- LOXL2
- 1,33 0,0064 LOXL2 NM_002318
- STC1
- 1,33 0,0101 STC1 NM_003155
- DKK1
- 1,33 0,0208 DKK1 NM_012242
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- IGFBP5
- 1,32 0,0064 IGFBP5 NM_000599
- EPAS1
- 1,32 0,0270 EPAS1 NM_001430
- UNC5C
- 1,32 0,0641 UNC5C NM_003728
- FAP
- 1,31 0,0017 FAP NM_004460
- IGFBP3
- 1,31 0,0041 IGFBP3 NM_000598
- SNAI2
- 1,31 0,0055 SNAI2 NM_003068
- PRKCA
- 1,31 0,0065 PRKCA NM_002737
- FST
- 1,31 0,0399 FST NM_006350
- KCNH2 iso a/b
- 1,31 0,0950 KCNH2 NM_000238
- CTHRC1
- 1,30 0,0017 CTHRC1 NM_138455
- PDGFC
- 1,30 0,0034 PDGFC NM_016205
- EGR1
- 1,30 0,0048 EGR1 NM_001964
- TAGLN
- 1,30 0,0058 TAGLN NM_003186
- SPARC
- 1,30 0,0104 SPARC NM_003118
- KLF6
- 1,30 0,0514 KLF6 NM_001300
- GRIK1
- 1,30 0,0753 GRIK1 NM_000830
- CYR61
- 1,29 0,0018 CYR61 NM_001554
- SLPI
- 1,29 0,0026 SLPI NM_003064
- COL1A2
- 1,29 0,0076 COL1A2 NM_000089
- MAPK14
- 1,29 0,0916 MAPK14 NM_139012
- LAMA3
- 1,28 0,0020 LAMA3 NM_000227
- THBS1
- 1,28 0,0053 THBS1 NM_003246
- NRP2
- 1,28 0,0120 NRP2 NM_003872
- LOX
- 1,27 0,0028 LOX NM_002317
- S100A4
- 1,27 0,0067 S100A4 NM_002961
- CXCR4
- 1,27 0,0083 CXCR4 NM_003467
- CEBPB
- 1,27 0,0943 CEBPB NM_005194
- AKAP12
- 1,26 0,0044 AKAP12 NM_005100
- ADAMTS12
- 1,26 0,0100 ADAMTS12 NM_030955
- CRYAB
- 1,25 0,0038 CRYAB NM_001885
- Grb10
- 1,25 0,0108 GRB10 NM_005311
- MCP1
- 1,25 0,0118 CCL2 NM_002982
- COL1A1
- 1,25 0,0167 COL1A1 NM_000088
- EFNB2
- 1,25 0,0241 EFNB2 NM_004093
- ANXA1
- 1,25 0,0292 ANXA1 NM_000700
- ANGPT2
- 1,25 0,0485 ANGPT2 NM_001147
- EphB6
- 1,25 0,0825 EPHB6 NM_004445
- HSPA1A
- 1,24 0,0018 HSPA1A NM_005345
- TGFB3
- 1,24 0,0081 TGFB3 NM_003239
- PTGER3
- 1,24 0,0306 PTGER3 NM_000957
- FXYD5
- 1,24 0,0367 FXYD5 NM_014164
11-08-2014 E07717900
- CAPG
- 1,24 0,0604 CAPG NM_001747
- PDGFB
- 1,23 0,0157 PDGFB NM_002608
- ANTXR1
- 1,23 0,0164 ANTXR1 NM_032208
- TGFBI
- 1,23 0,0191 TGFBI NM_000358
- CTGF
- 1,23 0,0233 CTGF NM_001901
- PDGFA
- 1,23 0,0274 NM_002607
- P14ARF
- 1,23 0,0362 S78535
- KLK10
- 1,22 0,0005 KLK10 NM_002776
- ITGA5
- 1,22 0,0178 ITGA5 NM_002205
- GBP2
- 1,22 0,0201 GBP2 NM_004120
- SIAT4A
- 1,22 0,0231 ST3GAL1 NM_003033
- GJB2
- 1,22 0,0271 GJB2 NM_004004
- LAT
- 1,22 0,0306 LAT NM_014387
- CTSL
- 1,22 0,0331 CTSL NM_001912
- DAPK1
- 1,22 0,0384 DAPK1 NM_004938
- SKP1A
- 1,22 0,0542 SKP1A NM_006930
- NDRG1
- 1,22 0,0712 NDRG1 NM_006096
- ITGB5
- 1,22 0,0991 ITGB5 NM_002213
- KLK6
- 1,21 0,0034 KLK6 NM_002774
- SFRP2
- 1,21 0,0037 SFRP2 NM_003013
- TMEPAI
- 1,21 0,0173 TMEPAI NM_020182
- ID4
- 1,21 0,0530 ID4 NM_001546
- SFRP4
- 1,20 0,0077 SFRP4 NM_003014
- HOXB7
- 1,20 0,0274 HOXB7 NM_004502
- GJA1
- 1,20 0,0311 GJA1 NM_000165
- CDH11
- 1,20 0,0662 CDH11 NM_001797
- PAI1
- 1,19 0,0060 SERPINE1 NM_000602
- S100P
- 1,19 0,0119 S100P NM_005980
- EGR3
- 1,19 0,0164 EGR3 NM_004430
- EMP1
- 1,19 0,0460 EMP1 NM_001423
- ABCC5
- 1,19 0,0536 ABCC5 NM_005688
- FZD1
- 1,19 0,0701 FZD1 NM_003505
- MAD
- 1,19 0,0811 MXD1 NM_002357
- EFNA1
- 1,19 0,0920 EFNA1 NM_004428
- OPN_osteopontina
- 1,18 0,0028 SPP1 NM_000582
- ALDH1A1
- 1,18 0,0246 ALDH1A1 NM_000689
- NR4A1
- 1,18 0,0277 NR4A1 NM_002135
- SIAT7B
- 1,18 0,0301 ST6GALNAC2 NM_006456
- p16-INK4
- 1,18 0,0439 L27211
- TUBB
- 1,18 0,0761 TUBB2 NM_001069
- IL6
- 1,18 0,0939 IL6 NM_000600
11-08-2014
- RAB32
- 1,18 0,0948 RAB32 NM_006834
- TULP3
- 1,18 0,0953 TULP3 NM_003324
- F3
- 1,17 0,0561 F3 NM_001993
- PLK3
- 1,16 0,0792 PLK3 NM_004073
- EPHA2
- 1,16 0,0962 EPHA2 NM_004431
- SLC2A1
- 1,15 0,0745 SLC2A1 NM_006516
- CXCL12
- 1,14 0,0911 CXCL12 NM_000609
- S100A2
- 1,13 0,0287 S100A2 NM_005978
- FABP4
- 1,13 0,0340 FABP4 NM_001442
- STMY3
- 1,13 0,0517 MMP11 NM_005940
- BCAS1
- 1,13 0,0939 BCAS1 NM_003657
- REG4
- 1,11 0,0026 REG4 NM_032044
- pS2
- 1,09 0,0605 TFF1 NM_003225
- MUC2
- 1,06 0,0626 MUC2 NM_002457
La tabla 1B muestra las asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estadio III (Duke C) combinados usando ILR como métrica para el desenlace clínico
Tabla 1B
- Gen
- Razón de riesgos Valor de P Símbolo oficial Número de registro
- ORC1L
- 0,42 0,0728 ORC1L NM_004153
- HSPA8
- 0,62 0,0430 HSPA8 NM_006597
- E2F1
- 0,64 0,0009 E2F1 NM_005225
- RAD54L
- 0,65 0,0026 RAD54L NM_003579
- RPLPO
- 0,67 0,0150 RPLP0 NM_001002
- BRCA1
- 0,68 0,0001 BRCA1 NM_007295
- DHFR
- 0,69 0,0096 DHFR NM_000791
- SLC25A3
- 0,69 0,0110 SLC25A3 NM_213611
- PPM1D
- 0,71 0,0033 PPMID NM_003620
- SKP2
- 0,71 0,0098 SKP2 NM_005983
- FASN
- 0,72 0,0071 FASN NM_004104
- HNRPD
- 0,72 0,0686 HNRPD NM_031370
- ENO1
- 0,73 0,0418 ENO1 NM_001428
- RPS13
- 0,75 0,0786 RPS13 NM_001017
- DDB1
- 0,75 0,0804 DDB1 NM_001923
- C20 orf1
- 0,76 0,0122 TPX2 NM_012112
- KIF22
- 0,76 0,0137 KIF22 NM_007317
- Chk1
- 0,76 0,0174 CHEK1 NM_001274
- TCF-1
- 0,77 0,0021 TCF1 NM_000545
- ST14
- 0,77 0,0446 ST14 NM_021978
- RRM1
- 0,77 0,0740 RRM1 NM_001033
- BRCA2
- 0,77 0,0800 BRCA2 NM_000059
E07717900
11-08-2014
- LMNB1
- 0,78 0,0513 LMNB1 NM_005573
- CMYC
- 0,79 0,0086 MYC NM_002467
- CDC20
- 0,79 0,0290 CDC20 NM_001255
- CSEL1
- 0,79 0,0344 CSE1L NM_001316
- Bax
- 0,79 0,0662 BAX NM_004324
- NME1
- 0,79 0,0742 NME1 NM_000269
- c-myb (MYB oficial)
- 0,80 0,0077 MYB NM_005375
- CDCA7 v2
- 0,80 0,0159 CDCA7 NM_145810
- EFP
- 0,80 0,0405 TRIM25 NM_005082
- UBE2M
- 0,80 0,0437 UBE2M NM_003969
- RRM2
- 0,81 0,0168 RRM2 NM_001034
- ABCC6
- 0,81 0,0373 ABCC6 NM_001171
- SURV
- 0,81 0,0584 BIRCS NM_001168
- CKS2
- 0,81 0,0753 CKS2 NM_001827
- RAF1
- 0,81 0,0899 RAF1 NM_002880
- EPHB2
- 0,82 0,0190 EPHB2 NM_004442
- NOTCH1
- 0,82 0,0232 NOTCH1 NM_017617
- UMPS
- 0,82 0,0456 UMPS NM_000373
- CCNE2
- 0,82 0,0544 CCNE2 NM_057749
- PI3KC2A
- 0,82 0,0916 PIK3C2A NM_002645
- CD80
- 0,82 0,0954 CD80 NM_005191
- AREG
- 0,83 0,0014 AREG NM_001657
- EREG
- 0,83 0,0062 EREG NM_001432
- MYBL2
- 0,83 0,0259 MYBL2 NM_002466
- ABCB1
- 0,83 0,0322 ABCB1 NM_000927
- HRAS
- 0,83 0,0760 HRAS NM_005343
- SLC7A5
- 0,84 0,0585 SLC7A5 NM_003486
- MAD2L1
- 0,84 0,0590 MAD2L1 NM_002358
- Ki-67
- 0,85 0,0620 MKI67 NM_002417
- MCM2
- 0,85 0,0700 MCM2 NM_004526
- ING5
- 0,85 0,0947 ING5 NM_032329
- Cdx2
- 0,88 0,0476 CDX2 NM_001265
- PTPRO
- 0,89 0,0642 PTPRO NM_030667
- cripto (TDGF1 oficial)
- 0,90 0,0803 TDGF1 NM_003212
La tabla 2A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos >1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SG como métrica para el desenlace clínico.
Tabla 2A
- Gen
- Razón de riesgos Valor de P Símbolo oficial Número de registro
- RARB
- 1,75 0,0820 RARB NM_016152
- RhoC
- 1,70 0,0001 RHOC NM_175744
E07717900
11-08-2014 E07717900
- ANXA2
- 1,64 0,0002 ANXA2 NM_004039
- CYP3A4
- 1,58 0,0064 CYP3A4 NM_017460
- p21
- 1,54 <0,0001 CDKN1A NM_000389
- ITGB1
- 1,54 0,0058 ITGB1 NM_002211
- UBC
- 1,50 0,0003 UBC NM_021009
- TNF
- 1,46 0,0859 TNF NM_000594
- VEGFC
- 1,44 0,0049 VEGFC NM_005429
- HMLH
- 1,44 0,0435 MLH1 NM_000249
- RhoB
- 1,37 0,0015 RHOB NM_004040
- TGFBR1
- 1,37 0,0127 TGFBR1 NM_004612
- SPINT2
- 1,37 0,0235 SPINT2 NM_021102
- PFN1
- 1,37 0,0842 PFN1 NM_005022
- HSPG2
- 1,36 0,0115 HSPG2 NM_005529
- TIMP1
- 1,35 0,0008 TIMP1 NM_003254
- INHBB
- 1,35 0,0190 INHBB NM_002193
- VCL
- 1,34 0,0099 VCL NM_003373
- KCNH2 iso a/b
- 1,33 0,0362 KCNH2 NM_000238
- LAMC2
- 1,32 0,0005 LAMC2 NM_005562
- FXYD5
- 1,31 0,0021 FXYD5 NM_014164
- HLA-G
- 1,31 0,0458 HLA-G NM_002127
- GADD45B
- 1,30 0,0002 GADD45B NM_015675
- CDC42
- 1,30 0,0120 CDC42 NM_001791
- LAMB3
- 1,30 0,0163 LAMB3 NM_000228
- DKK1
- 1,30 0,0209 DKK1 NM_012242
- UNC5C
- 1,30 0,0452 UNC5C NM_003728
- UBL1
- 1,29 0,0171 SUMO1 NM_003352
- HB-EGF
- 1,29 0,0262 HBEGF NM_001945
- KRAS2
- 1,29 0,0726 KRAS NM_004985
- ID3
- 1,28 0,0023 ID3 NM_002167
- LOXL2
- 1,28 0,0039 LOXL2 NM_002318
- EphB6
- 1,28 0,0322 EPHB6 NM_004445
- DUSP1
- 1,27 0,0003 DUSP1 NM_004417
- BGN
- 1,27 0,0040 BGN NM_001711
- CALD1
- 1,27 0,0119 CALD1 NM_004342
- CDC42BPA
- 1,27 0,0151 CDC42BPA NM_003607
- SBA2
- 1,27 0,0373 WSB2 NM_018639
- INHBA
- 1,26 0,0018 INHBA NM_002192
- NRP1
- 1,26 0,0113 NRP1 NM_003873
- TIMP2
- 1,26 0,0123 TIMP2 NM_003255
- KLF6
- 1,26 0,0444 KLF6 NM_001300
- KLK10
- 1,25 <0,0001 KLK10 NM_002776
11-08-2014 E07717900
- TIMP3
- 1,25 0,0083 TIMP3 NM_000362
- CAPG
- 1,25 0,0170 CAPG NM_001747
- IGFBP7
- 1,25 0,0249 IGFBP7 NM_001553
- S100A1
- 1,25 0,0529 S100A1 NM_006271
- SHC1
- 1,25 0,0605 SHC1 NM_003029
- CTSB
- 1,25 0,0766 CTSB NM_001908
- ANXA5
- 1,25 0,0787 ANXA5 NM_001154
- PKR2
- 1,25 0,0800 PKM2 NM_002654
- HSPA1A
- 1,24 0,0003 HSPA1A NM_005345
- CGB
- 1,24 0,0148 CGB NM_000737
- DLC1
- 1,24 0,0231 DLC1 NM_006094
- TMSB10
- 1,24 0,0890 TMSB10 NM_021103
- LAMA3
- 1,23 0,0017 LAMA3 NM_000227
- FOS
- 1,23 0,0028 FOS NM_005252
- SNAI2
- 1,23 0,0123 SNAI2 NM_003068
- SPARC
- 1,23 0,0134 SPARC NM_003118
- SIR2
- 1,23 0,0173 SIRT1 NM_012238
- KRT19
- 1,23 0,0217 KRT19 NM_002276
- CTSD
- 1,23 0,0395 CTSD NM_001909
- EPAS1
- 1,23 0,0409 EPAS1 NM_001430
- GAGE4
- 1,23 0,0468 GAGE4 NM_001474
- BMP4
- 1,22 0,0024 BMP4 NM_001202
- PLK3
- 1,22 0,0056 PLK3 NM_004073
- Grb10
- 1,22 0,0059 GRB10 NM_005311
- FYN
- 1,22 0,0120 FYN NM_002037
- STC1
- 1,22 0,0409 STC1 NM_003155
- G-Catenina
- 1,22 0,0661 JUP NM_002230
- HK1
- 1,22 0,0872 HK1 NM_000188
- MADH4
- 1,22 0,0956 SMAD4 NM_005359
- KLK6
- 1,21 0,0011 KLK6 NM_002774
- CTHRC1
- 1,21 0,0065 CTHRC1 NM_138455
- LAT
- 1,21 0,0146 LAT NM_014387
- IGFBP3
- 1,21 0,0149 IGFBP3 NM_000598
- AKT3
- 1,21 0,0212 AKT3 NM_005465
- HSPA1B
- 1,21 0,0262 HSPA1B NM_005346
- THY1
- 1,21 0,0278 THY1 NM_006288
- ANXA1
- 1,21 0,0322 ANXA1 NM_000700
- LOX
- 1,20 0,0067 LOX NM_002317
- CD68
- 1,20 0,0223 CD68 NM_001251
- EFNB2
- 1,20 0,0268 EFNB2 NM_004093
- DYRK1B
- 1,20 0,0473 DYRK1B NM_004714
11-08-2014 E07717900
- PTK2
- 1,20 0,0889 PTK2 NM_005607
- THBS1
- 1,19 0,0203 THBS1 NM_003246
- TAGLN
- 1,19 0,0263 TAGLN NM_003186
- TULP3
- 1,19 0,0334 TULP3 NM_003324
- SR-A1
- 1,19 0,0387 SR-A1 NM_021228
- APC
- 1,19 0,0433 APC NM_000038
- ERK1
- 1,19 0,0488 Z11696
- VIM
- 1,19 0,0661 VIM NM_003380
- CREBBP
- 1,19 0,0802 CREBBP NM_004380
- ANGPT2
- 1,19 0,0860 ANGPT2 NM_001147
- Maspina
- 1,18 0,0029 SERPINB5 NM_002639
- PDGFB
- 1,18 0,0252 PDGFB NM_002608
- S100A4
- 1,18 0,0270 S100A4 NM_002961
- EGR1
- 1,18 0,0334 EGR1 NM_001964
- IGFBP5
- 1,18 0,0526 IGFBP5 NM_000599
- NOTCH2
- 1,18 0,0527 NOTCH2 NM_024408
- PAI1
- 1,17 0,0036 SERPINE1 NM_000602
- NR4A1
- 1,17 0,0110 NR4A1 NM_002135
- BCAS1
- 1,17 0,0137 BCAS1 NM_003657
- BRK
- 1,17 0,0137 PTK6 NM_005975
- AKAP12
- 1,17 0,0195 AKAP12 NM_005100
- EMP1
- 1,17 0,0291 EMP1 NM_001423
- SIAT4A
- 1,17 0,0304 ST3GAL1 NM_003033
- MRP3
- 1,17 0,0334 ABCC3 NM_003786
- COL1A
- 1,17 0,0399 COL1A1 NM_000088
- Upa
- 1,17 0,0588 PLAU NM_002658
- UNC5B
- 1,17 0,0986 UNC5B NM_170744
- PDGFC
- 1,16 0,0355 PDGFC NM_016205
- MCP1
- 1,16 0,0449 CCL2 NM_002982
- CTGF
- 1,16 0,0576 CTGF NM_001901
- COL1A2
- 1,16 0,0612 COL1A2 NM_000089
- RAB32
- 1,16 0,0645 RAB32 NM_006834
- SIN3A
- 1,16 0,0787 SIN3A NM_015477
- SKP1A
- 1,16 0,0837 SKP1A NM_006930
- EFNA1
- 1,16 0,0957 EFNA1 NM_004428
- S100A2
- 1,15 0,0040 S100A2 NM_005978
- MMP7
- 1,15 0,0374 MMP7 NM_002423
- HOXB7
- 1,15 0,0405 HOXB7 NM_004502
- FAP
- 1,15 0,0455 FAP NM_004460
- ANTXR1
- 1,15 0,0482 ANTXR1 NM_032208
- TGFBI
- 1,15 0,0553 TGFBI NM_000358
11-08-2014
- TMEPAI
- 1,14 0,0435 TMEPAI NM_020182
- CYR61
- 1,14 0,0490 CYR61 NM_001554
- SLPI
- 1,14 0,0724 SLPI NM_003064
- TP53I3
- 1,14 0,0831 TP53I3 NM_004881
- PDGFA
- 1,14 0,0845 NM_002607
- SFRP2
- 1,13 0,0255 SFRP2 NM_003013
- S100A8
- 1,13 0,0693 S100A8 NM_002964
- F3
- 1,13 0,0708 F3 NM_001993
- Bcl2
- 1,13 0,0962 BCL2 NM_000633
- OPN_osteopontina
- 1,12 0,0097 SPP1 NM_000582
- FZD6
- 1,12 0,0692 FZD6 NM_003506
- OSM
- 1,11 0,0744 OSM NM_020530
- EGLN3
- 1,11 0,0884 EGLN3 NM_022073
- SIAT7B
- 1,11 0,0938 ST6GALNAC2 NM_006456
- FABP4
- 1,10 0,0454 FABP4 NM_001442
- EFNA3
- 1,10 0,0958 EFNA3 NM_004952
- MMP2
- 1,10 0,0969 MMP2 NM_004530
- GSTT1
- 1,09 0,0737 GSTT1 NM_000853
- REG4
- 1,07 0,0286 REG4 NM_032044
La tabla 2B muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SG como métrica para el desenlace clínico.
Tabla 2B
- Gen
- Razón de riesgos Valor de P Símbolo oficial Número de registro
- HSPA8
- 0,62 0,0145 HSPA8 NM_006597
- SKP2
- 0,70 0,0010 SKP2 NM_005983
- DHFR
- 0,74 0,0085 DHFR NM_000791
- PRDX4
- 0,74 0,0197 PRDX4 NM_006406
- RRM1
- 0,75 0,0162 RRM1 NM_001033
- SLC25A3
- 0,75 0,0342 SLC25A3 NM_213611
- RPLPO
- 0,75 0,0416 RPLP0 NM_001002
- E2F1
- 0,78 0,0190 E2F1 NM_005225
- SURV
- 0,79 0,0086 BIRC5 NM_001168
- c-myb (MYB oficial)
- 0,80 0,0020 MYB NM_005375
- BRCA1
- 0,80 0,0077 BRCA1 NM_007295
- Chk1
- 0,80 0,0186 CHEK1 NM_001274
- ST14
- 0,80 0,0407 ST14 NM_021978
- TCF-1
- 0,81 0,0045 TCF1 NM_000545
- CCNE2
- 0,81 0,0112 CCNE2 NM_057749
- PPM1D
- 0,81 0,0194 PPM1D NM_003620
- CDC20
- 0,81 0,0213 CDC20 NM_001255
E07717900
11-08-2014
- EI24
- 0,81 0,0585 EI24 NM_004879
- C20 orf1
- 0,82 0,0348 TPX2 NM_012112
- DUT
- 0,83 0,0396 DUT NM_001948
- CD44E
- 0,83 0,0439 X55150
- KIF22
- 0,83 0,0506 KIF22 NM_007317
- PPID
- 0,83 0,0615 PPID NM_005038
- UBE2M
- 0,83 0,0805 UBE2M NM_003969
- LMNB1
- 0,83 0,0868 LMNB1 NM_005573
- MCM2
- 0,84 0,0207 MCM2 NM_004526
- CDC6
- 0,84 0,0218 CDC6 NM_001254
- MRPL40
- 0,84 0,0769 MRPL40 NM_003776
- EPHB2
- 0,85 0,0253 EPHB2 NM_004442
- CMYC
- 0,85 0,0371 MYC NM_002467
- AURKB
- 0,85 0,0375 AURKB NM_004217
- CDCA7 v2
- 0,85 0,0421 CDCA7 NM_145810
- ABCB1
- 0,86 0,0390 ABCB1 NM_000927
- SMARCA3
- 0,86 0,0601 SMARCA3 NM_003071
- Cdx2
- 0,88 0,0166 CDX2 NM_001265
- PPARG
- 0,88 0,0645 PPARG NM_005037
- MYBL2
- 0,88 0,0647 MYBL2 NM_002466
- EREG
- 0,89 0,0411 EREG NM_001432
- AREG
- 0,90 0,0235 AREG NM_001657
La tabla 3A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos >1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SLE como métrica para el desenlace clínico.
Tabla 3A
- Gen
- Razón de riesgos Valor de P Símbolo oficial Número de registro
- ANXA2
- 1,74 <0,0001 ANXA2 NM_004039
- CYP3A4
- 1,69 0,0020 CYP3A4 NM_017460
- RhoC
- 1,53 0,0009 RHOC NM_175744
- TJP1
- 1,45 0,0787 TJP1 NM_003257
- UBC
- 1,43 0,0007 UBC NM_021009
- p21
- 1,42 0,0004 CDKN1A NM_000389
- HB-EGF
- 1,39 0,0032 HBEGF NM_001945
- SPINT2
- 1,37 0,0154 SPINT2 NM_021102
- HMLH
- 1,36 0,0711 MLH1 NM_000249
- VEGFC
- 1,35 0,0157 VEGFC NM_005429
- PKR2
- 1,34 0,0187 PKM2 NM_002654
- LAMC2
- 1,33 0,0002 LAMC2 NM_005562
- ITGB1
- 1,33 0,0499 ITGB1 NM_002211
- TIMP1
- 1,32 0,0007 TIMP1 NM_003254
E07717900
11-08-2014 E07717900
- VCL
- 1,31 0,0114 VCL NM_003373
- INHBB
- 1,31 0,0302 INHBB NM_002193
- GADD45B
- 1,30 <0,0001 GADD45B NM_015675
- RhoB
- 1,30 0,0053 RHOB NM_004040
- DUSP1
- 1,28 <0,0001 DUSP1 NM_004417
- HK1
- 1,28 0,0297 HK1 NM_000188
- GRIK1
- 1,28 0,0364 GRIK1 NM_000830
- FOS
- 1,27 0,0002 FOS NM_005252
- CGB
- 1,27 0,0126 CGB NM_000737
- KLF6
- 1,27 0,0288 KLF6 NM_001300
- ANXA5
- 1,27 0,0504 ANXA5 NM_001154
- KRAS2
- 1,27 0,0724 KRAS NM_004985
- INHBA
- 1,26 0,0009 INHBA NM_002192
- DLC1
- 1,26 0,0096 DLC1 NM_006094
- IGFBP7
- 1,26 0,0116 IGFBP7 NM_001553
- BGN
- 1,25 0,0039 BGN NM_001711
- LOXL2
- 1,25 0,0076 LOXL2 NM_002318
- STC1
- 1,25 0,0135 STC1 NM_003155
- CTSD
- 1,25 0,0208 CTSD NM_001909
- HSPG2
- 1,25 0,0485 HSPG2 NM_005529
- KCNH2 iso a/b
- 1,25 0,0832 KCNH2 NM_000238
- TIMP3
- 1,24 0,0057 TIMP3 NM_000362
- FXYD5
- 1,24 0,0070 FXYD5 NM_014164
- A-Catenina
- 1,24 0,0447 CTNNA1 NM_001903
- LOX
- 1,23 0,0013 LOX NM_002317
- EGR1
- 1,23 0,0037 EGR1 NM_001964
- CAPG
- 1,23 0,0191 CAPG NM_001747
- LAMB3
- 1,23 0,0377 LAMB3 NM_000228
- GAGE4
- 1,23 0,0402 GAGE4 NM_001474
- SHC1
- 1,23 0,0640 SHC1 NM_003029
- MVP
- 1,23 0,0726 MVP NM_01745
- VEGF
- 1,22 0,0250 VEGF NM_003376
- UNC5B
- 1,22 0,0256 UNC5B NM_170744
- CDC42BPA
- 1,22 0,0297 CDC42BPA NM_003607
- SBA2
- 1,22 0,0614 WSB2 NM_018639
- DKK1
- 1,22 0,0689 DKK1 NM_012242
- EphB6
- 1,22 0,0763 EPHB6 NM_004445
- IGFDP3
- 1,21 0,0078 IGFBP3 NM_000598
- HSPA1B
- 1,21 0,0167 HSPA1B NM_005346
- CALD1
- 1,21 0,0277 CALD1 NM_004342
- TIMP2
- 1,21 0,0309 TIMP2 NM_003255
11-08-2014 E07717900
- NR4A1
- 1,20 0,0023 NR4A1 NM_002135
- LAMA3
- 1,20 0,0028 LAMA3 NM_000227
- SIAT4A
- 1,20 0,0082 ST3GAL1 NM_003033
- PDGFB
- 1,20 0,0084 PDGFB NM_002608
- EMP1
- 1,20 0,0107 EMP1 NM_001423
- THBS1
- 1,20 0,0126 THBS1 NM_003246
- CD68
- 1,20 0,0143 CD68 NM_001251
- FYN
- 1,20 0,0151 FYN NM_002037
- TULP3
- 1,20 0,0213 TULP3 NM_003324
- EFNA1
- 1,20 0,0254 EFNA1 NM_004428
- SIR2
- 1,20 0,0255 SIRT1 NM_012238
- G-Catenina
- 1,20 0,0689 JUP NM_002230
- S100A1
- 1,20 0,0998 S100A1 NM_006271
- Maspina
- 1,19 0,0013 SERPINB5 NM_002639
- HSPA1A
- 1,19 0,0013 HSPA1A NM_005345
- SPARC
- 1,19 0,0359 SPARC NM_003118
- PTHR1
- 1,19 0,0801 PTHR1 NM_000316
- SNAI2
- 1,18 0,0353 SNAI2 NM_003068
- KRT19
- 1,18 0,0419 KRT19 NM_002276
- ERK1
- 1,18 0,0459 Z11696
- KLK10
- 1,17 0,0007 KLK10 NM_002776
- BMP4
- 1,17 0,0121 BMP4 NM_001202
- CYR61
- 1,17 0,0127 CYR61 NM_001554
- Grb10
- 1,17 0,0216 GRB10 NM_005311
- PLK3
- 1,17 0,0242 PLK3 NM_004073
- EFNB2
- 1,17 0,0403 EFNB2 NM_004093
- P14ARF
- 1,17 0,0439 S78535
- ID3
- 1,17 0,0446 ID3 NM_002167
- IGFBP5
- 1,17 0,0503 IGFBP5 NM_000599
- THY1
- 1,17 0,0574 THY1 NM_006288
- VIM
- 1,17 0,0858 VIM NM_003380
- EPAS1
- 1,17 0,0897 EPAS1 NM_001430
- PAI1
- 1,16 0,0039 SERPINE1 NM_000602
- F3
- 1,16 0,0172 F3 NM_001993
- CTHRC1
- 1,16 0,0181 CTHRC1 NM_138455
- ANTXR1
- 1,16 0,0237 ANTXR1 NM_032208
- FAP
- 1,16 0,0289 FAP NM_004460
- ADAMTS12
- 1,16 0,0350 ADAMTS12 NM_030955
- CTGF
- 1,16 0,0424 CTGF NM_001901
- PTGER3
- 1,16 0,0569 PTGER3 NM_000957
- ANXA1
- 1,16 0,0699 ANXA1 NM_000700
11-08-2014 E07717900
- NRP1
- 1,16 0,0797 NRP1 NM_003873
- NDRG1
- 1,16 0,0856 NDRG1 NM_006096
- KLK6
- 1,15 0,0092 KLK6 NM_002774
- EGR3
- 1,15 0,0153 EGR3 NM_004430
- HOXB7
- 1,15 0,0345 HOXB7 NM_004502
- PDGFC
- 1,15 0,0363 PDGFC NM_016205
- Herstatina
- 1,15 0,0403 AF177761
- MCP1
- 1,15 0,0409 CCL2 NM_002982
- TGFBI
- 1,15 0,0437 TGFBI NM_000358
- TP53I3
- 1,15 0,0438 TP53I3 NM_004881
- SLPI
- 1,15 0,0457 SLPI NM_003064
- PLAUR
- 1,15 0,0471 PLAUR NM_002659
- GJB2
- 1,15 0,0610 GJB2 NM_004004
- COL1A1
- 1,15 0,0647 COL1A1 NM_000088
- IL6
- 1,15 0,0790 IL6 NM_000600
- APC
- 1,15 0,0821 APC NM_000038
- S100A2
- 1,14 0,0048 S100A2 NM_005978
- TMEPAI
- 1,14 0,0300 TMEPAI NM_020182
- PDGFA
- 1,14 0,0644 NM_002607
- S100A4
- 1,14 0,0680 S100A4 NM_002961
- TAGLN
- 1,14 0,0820 TAGLN NM_003186
- Upa
- 1,14 0,0823 PLAU NM_002658
- COL1A2
- 1,14 0,0856 COL1A2 NM_000089
- OSM
- 1,13 0,0299 OSM NM_020530
- BRK
- 1,13 0,0479 PTK6 NM_005975
- SEMA3B
- 1,13 0,0525 SEMA3B NM_004636
- OPN_osteopontina
- 1,12 0,0084 SPP1 NM_000582
- S100P
- 1,12 0,0283 S100P NM_005980
- SFRP2
- 1,12 0,0291 SFRP2 NM_003013
- EGLN3
- 1,12 0,0465 EGLN3 NM_022073
- SIAT7B
- 1,12 0,0570 ST6GALNAC2 NM_006456
- MMP7
- 1,12 0,0743 MMP7 NM_002423
- FABP4
- 1,11 0,0195 FABP4 NM_001442
- AKAP12
- 1,11 0,0899 AKAP12 NM_005100
- EFNA3
- 1,10 0,0684 EFNA3 NM_004952
- SFRP4
- 1,10 0,0684 SFRP4 NM_003014
- CRYAB
- 1,10 0,0987 CRYAB NM_001885
- GSTT1
- 1,09 0,0457 GSTT1 NM_000853
- REG4
- 1,08 0,0074 REG4 NM_032044
- pS2
- 1,08 0,0302 TFF1 NM_003225
- MUC5B
- 1,08 0,0401 MUC5B XM_039877
11-08-2014
La tabla 3B muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SLE como métrica para el desenlace clínico.
Tabla 3B
- Gen
- Razón de riesgos Valor de P Símbolo oficial Número de registro
- HSPA8
- 0,70 0,0487 HSPA8 NM_006597
- SLC25A3
- 0,71 0,0084 SLC25A3 NM_213611
- E2F1
- 0,73 0,0019 E2F1 NM_005225
- SKP2
- 0,73 0,0038 SKP2 NM_005983
- PPM1D
- 0,75 0,0008 PPM1D NM_003620
- RRM1
- 0,76 0,0161 RRM1 NM_001033
- RPLPO
- 0,76 0,0388 RPLP0 NM_001002
- NPM1
- 0,78 0,0223 NPM1 NM_002520
- DDB1
- 0,78 0,0673 DDB1 NM_001923
- PRDX4
- 0,79 0,0526 PRDX4 NM_006406
- BRCA21
- 0,80 0,0051 BRCA1 NM_007295
- Chk1
- 0,80 0,0114 CHEK1 NM_001274
- SURV
- 0,81 0,0155 BIRC5 NM_001168
- C20orf1
- 0,81 0,0195 TPX2 NM_012112
- EI24
- 0,81 0,0382 EI24 NM_004879
- RAD54L
- 0,81 0,0501 RAD54L NM_003579
- DHFR
- 0,81 0,0530 DHFR NM_000791
- c-myb (MYB oficial)
- 0,82 0,0029 MYB NM_005375
- CCNE2
- 0,82 0,0109 CCNE2 NM_057749
- KIF22
- 0,82 0,0235 KIF22 NM_007317
- HMGB1
- 0,82 0,0849 HMGB1 NM_002128
- LMNB1
- 0,83 0,0665 LMNB1 NM_005573
- CDCA7 v2
- 0,84 0,0224 CDCA7 NM_145810
- CDC20
- 0,84 0,0461 CDC20 NM_001255
- FASN
- 0,84 0,0797 FASN NM_004104
- ABCB1
- 0,85 0,0157 ABCB1 NM_000927
- MCM2
- 0,85 0,0183 MCM2 NM_004526
- DUT
- 0,85 0,0469 DUT NM_001948
- KIF2C
- 0,85 0,0786 KIF2C NM_006845
- MCM6
- 0,85 0,0791 MCM6 NM_005915
- EIF4E
- 0,85 0,0863 EIF4E NM_001968
- EPHB2
- 0,86 0,0271 EPHB2 NM_004442
- RCC1
- 0,86 0,0444 RCC1 NM_001269
- EFP
- 0,86 0,0760 TRIM25 NM_005082
- AREG
- 0,87 0,0029 AREG NM_001657
E07717900
11-08-2014
- CMYC
- 0,87 0,0483 MYC NM_002467
- GCLC
- 0,87 0,0824 GCLC NM_001498
- TCF-1
- 0,88 0,0520 TCF1 NM_000545
- MYBL2
- 0,88 0,0527 MYBL2 NM_002466
- EREG
- 0,89 0,0237 EREG NM_001432
- Cdx2
- 0,90 0,0353 CDX2 NM_001265
- PTPRO
- 0,92 0,0896 PTPRO NM_030667
- cripto (TDGF1 oficial)
- 0,92 0,0913 TDGF1 NM_003212
- HLA-DRB1
- 0,93 0,0536 HLA-DRB1 NM_002124
La tabla 4A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos >1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando ILRD como métrica para el desenlace clínico.
Tabla 4A
- Gen
- Razón de riesgos Valor de P Símbolo oficial Número de registro
- ALDOA
- 3,37 0,0106 ALDOA NM_000034
- DCK
- 2,74 0,0130 DCK NM_000788
- ITGB1
- 2,50 <0,0001 ITGB1 NM_002211
- COX2
- 2,15 0,0128 PTGS2 NM_000963
- TJP1
- 2,12 0,0072 TJP1 NM_003257
- STAT3
- 1,98 0,0062 STAT3 NM_003150
- HMLH
- 1,93 0,0087 MLH1 NM_000249
- CYP3A4
- 1,90 0,0092 CYP3A4 NM_017460
- RhoC
- 1,89 0,0033 RHOC NM_175744
- ANXA2
- 1,87 0,0025 ANXA2 NM_004039
- TIMP1
- 1,83 <0,0001 TIMP1 NM_003254
- WWOX
- 1,81 0,0288 WWOX NM_016373
- ANXA5
- 1,80 0,0029 ANXA5 NM_001154
- FUS
- 1,79 0,0179 FUS NM_004960
- PADI4
- 1,78 0,0168 PADI4 NM_012387
- RBX1
- 1,71 0,0082 RBX1 NM_014248
- CRIP2
- 1,71 0,0343 CRIP2 NM_001312
- HB-EGF
- 1,69 0,0013 HBEGF NM_001945
- KCNH2 iso a/b
- 1,69 0,0070 KCNH2 NM_000238
- SBA2
- 1,68 0,0066 WSB2 NM_018639
- RhoB
- 1,67 0,0010 RHOB NM_004040
- VIM
- 1,66 0,0010 VIM NM_003380
- LILRB3
- 1,66 0,0227 LILRB3 NM_006864
- UBC
- 1,64 0,0051 UBC NM_021009
- p21
- 1,63 0,0032 CDKN1A NM_000389
- CCNE2 variante 1
- 1,62 0,0363 CCNE2 NM_057749
- RAB6C
- 1,61 0,0107 RAB6C NM_032144
E07717900
11-08-2014 E07717900
- MSH3
- 1,61 0,0213 MSH3 NM_002439
- AKT3
- 1,59 0,0003 AKT3 NM_005465
- PI3K
- 1,58 0,0552 PIK3C2B NM_002646
- RAPIDS1
- 1,57 0,0154 RAPIGDS1 NM_021159
- CTSB
- 1,57 0,0250 CTSB NM_001908
- PRDX6
- 1,57 0,0770 PRDX6 NM_004905
- NRP2
- 1,56 0,0005 NRP2 NM_003872
- DLC1
- 1,56 0,0026 DLC1 NM_006094
- BGN
- 1,55 0,0006 BGN NM_001711
- SIR2
- 1,55 0,0016 SIRT1 NM_012238
- CALD1
- 1,53 0,0046 CALD1 NM_004342
- YWHAH
- 1,53 0,0429 YWHAH NM_003405
- CDC42
- 1,52 0,0207 CDC42 NM_001791
- ITGA5
- 1,51 0,0004 ITGA5 NM_002205
- KLF6
- 1,51 0,0197 KLF6 NM_001300
- TLN1
- 1,51 0,0414 TLN1 NM_006289
- LAMC2
- 1,49 0,0017 LAMC2 NM_005562
- STC1
- 1,49 0,0040 STC1 NM_003155
- CDC42HPA
- 1,49 0,0109 CDC42BPA NM_003607
- RBM5
- 1,49 0,0184 RBM5 NM_005778
- INHBB
- 1,49 0,0310 INHBB NM_002193
- TGFBR1
- 1,49 0,0502 TGFBR1 NM_004612
- ADAM10
- 1,49 0,0819 ADAM10 NM_001110
- CEBPB
- 1,48 0,0399 CEBPB NM_005194
- AKT1
- 1,48 0,0846 AKT1 NM_005163
- FYN
- 1,47 0,0036 FYN NM_002037
- ARG
- 1,47 0,0067 ABL2 NM_005158
- HIF1A
- 1,47 0,0221 HIF1A NM_001530
- S100A1
- 1,47 0,0293 S100A1 NM_006271
- KRAS2
- 1,47 0,0958 KRAS NM_004985
- CTHRC1
- 1,46 0,0008 CTHRC1 NM_138455
- IGFBP7
- 1,46 0,0173 IGFBP7 NM_001553
- ROCK1
- 1,46 0,0326 ROCK1 NM_005406
- VEGFC
- 1,46 0,0516 VEGFC NM_005429
- EPAS1
- 1,45 0,0316 EPAS1 NM_001430
- DUSP1
- 1,44 0,0008 DUSP1 NM_004417
- FST
- 1,44 0,0340 FST NM_006350
- GADD45B
- 1,43 0,0013 GADD45B NM_015675
- FLT4
- 1,43 0,0663 FLT4 NM_002020
- PTEN
- 1,43 0,0760 PTEN NM_000314
- FAP
- 1,42 0,0017 FAP NM_004460
11-08-2014 E07717900
- PDGFC
- 1,42 0,0033 PDGFC NM_016205
- LOXL2
- 1,42 0,0115 LOXL2 NM_002318
- Pak1
- 1,42 0,0846 PAK1 NM_002576
- Grb10
- 1,41 0,0020 GRB10 NM_005311
- INHBA
- 1,41 0,0036 INHBA NM_002192
- GJA1
- 1,41 0,0039 GJA1 NM_000165
- CTGF
- 1,41 0,0053 CTGF NM_001901
- COL1A2
- 1,41 0,0057 COL1A2 NM_000089
- PTK2
- 1,40 0,0496 PTK2 NM_005607
- THBS1
- 1,39 0,0059 THBS1 NM_003246
- RANBP9
- 1,39 0,0333 RANBP9 NM_005493
- RANBP2
- 1,39 0,0988 RANBP2 NM_006267
- ITGAV
- 1,38 0,0210 ITGAV NM_002210
- TIMP2
- 1,38 0,0285 TIMP2 NM_003255
- PTHR1
- 1,38 0,0297 PTHR1 NM_000316
- GADD45
- 1,38 0,0340 GADD45A NM_001924
- c-ab1
- 1,38 0,0526 ABL1 NM_005157
- EGR1
- 1,37 0,0097 EGR1 NM_001964
- NCAM1
- 1,37 0,0657 NCAM1 NM_000615
- VCL
- 1,37 0,0845 VCL NM_003373
- LOX
- 1,36 0,0026 LOX NM_002317
- SNAI2
- 1,36 0,0178 SNAI2 NM_003068
- SPARC
- 1,36 0,0198 SPARC NM_003118
- CDH11
- 1,36 0,0233 CDH11 NM_001797
- NFKBp50
- 1,36 0,0767 NFKBI NM_003998
- CYR61
- 1,35 0,0065 CYR61 NM_001554
- S100A4
- 1,35 0,0104 S100A4 NM_002961
- TAGLN
- 1,35 0,0168 TAGLN NM_003186
- PCAF
- 1,34 0,0327 PCAF NM_003884
- NOTCH2
- 1,34 0,0390 NOTCH2 NM_024408
- LRP5
- 1,34 0,0722 LRP5 NM_002335
- SI
- 1,34 0,0787 SI NM_001041
- GBP2
- 1,33 0,0139 GBP2 NM_004120
- Bcl2
- 1,33 0,0143 BCL2 NM_000633
- MCP1
- 1,33 0,0159 CCL2 NM_002982
- EPHA2
- 1,33 0,0184 EPHA2 NM_004431
- PRKCA
- 1,33 0,0329 PRKCA NM_002737
- TIMP3
- 1,33 0,0337 TIMP3 NM_000362
- ANGPT2
- 1,33 0,0476 ANGPT2 NM_001147
- CTSD
- 1,33 0,0766 CTSD NM_001909
- SEMA3F
- 1,33 0,0931 SEMA3F NM_004186
11-08-2014 E07717900
- BCAS1
- 1,32 0,0044 BCAS1 NM_003657
- ANXA1
- 1,32 0,0458 ANXA1 NM_000700
- KKT19
- 1,32 0,0535 KRT19 NM_002276
- PTPRJ
- 1,32 0,0618 PTPRJ NM_002843
- GAPG
- 1,32 0,0641 CAPG NM_001747
- FOS
- 1,31 0,0129 FOS NM_005252
- COL1A1
- 1,31 0,0236 COL1A1 NM_000088
- CXCR4
- 1,31 0,0251 CXCR4 NM_003467
- TUBB
- 1,31 0,0354 TUBB2 NM_001069
- PIM1
- 1,31 0,0373 PIM1 NM_002648
- IGFBP5
- 1,31 0,0477 IGFBP5 NM_000599
- AP-1 (JUN oficial)
- 1,31 0,0519 JUN NM_002228
- GCNT1
- 1,31 0,0534 GCNT1 NM_001490
- MAX
- 1,31 0,0650 MAX NM_002382
- PAI1
- 1,30 0,0017 SERPINE1 NM_000602
- SLP1
- 1,30 0,0176 SLPI NM_003064
- IGFBP3
- 1,30 0,0320 IGFBP3 NM_000598
- DAPK1
- 1,30 0,0402 DAPK1 NM_004938
- ID3
- 1,30 0,0442 ID3 NM_002167
- EFNA1
- 1,30 0,0623 EFNA1 NM_004428
- AKAP12
- 1,29 0,0162 AKAP12 NM_005100
- PDGFB
- 1,29 0,0242 PDGFB NM_002608
- CD68
- 1,29 0,0524 CD68 NM_001251
- FGFR1
- 1,29 0,0709 FGFR1 NM_023109
- GSK3B
- 1,29 0,0765 GSK3B NM_002093
- CXCL12
- 1,28 0,0129 CXCL12 NM_000609
- DPYD
- 1,28 0,0186 DPYD NM_000110
- LAMA3
- 1,28 0,0193 LAMA3 NM_000227
- MRP3
- 1,28 0,0384 ABCC3 NM_003786
- ABCC5
- 1,28 0,0402 ABCC5 NM_005688
- PDGFA
- 1,28 0,0482 NM_002607
- XPA
- 1,28 0,0740 XPA NM_000380
- NDRG1
- 1,28 0,0786 NDRG1 NM_006096
- FES
- 1,27 0,0458 FES NM_002005
- CTSL
- 1,27 0,0485 CTSL NM_001912
- IL6
- 1,27 0,0606 IL6 NM_000600
- SFRP2
- 1,26 0,0085 SFRP2 NM_003013
- Maspina
- 1,26 0,0096 SERPINB5 NM_002639
- TGFBI
- 1,26 0,0470 TGFBI NM_000358
- NOS3
- 1,26 0,0978 NOS3 NM_000603
- HSPA1A
- 1,25 0,0161 HSPA1A NM_005345
11-08-2014
- S100A8
- 1,25 0,0180 S100A8 NM_002964
- HOXB7
- 1,25 0,0396 HOXB7 NM_004502
- P14ARF
- 1,25 0,0697 S78535
- WISP1
- 1,25 0,0712 WISP1 NM_003882
- ID4
- 1,25 0,0883 ID4 NM_001546
- SFRP4
- 1,24 0,0200 SFRP4 NM_003014
- FZD6
- 1,24 0,0220 FZD6 NM_003506
- EGR3
- 1,24 0,0237 EGR3 NM_004430
- ALDH1A1
- 1,24 0,0258 ALDH1A1 NM_000689
- CRYAB
- 1,23 0,0394 CRYAB NM_001885
- TGFB3
- 1,23 0,0541 TGFB3 NM_003239
- ANTXR1
- 1,23 0,0661 ANTXR1 NM_032208
- KLK6
- 1,22 0,0211 KLK6 NM_002774
- ILT-2
- 1,22 0,0676 LILRB1 NM_006669
- EMP1
- 1,22 0,0871 EMP1 NM_001423
- PLAUR
- 1,22 0,0943 PLAUR NM_002659
- S100A2
- 1,20 0,0100 S100A2 NM_005978
- MMP7
- 1,19 0,0810 MMP7 NM_002423
- OPN_osteopontina
- 1,17 0,0231 SPP1 NM_000582
- FABP4
- 1,17 0,0325 FABP4 NM_001442
- KLK10
- 1,17 0,0452 KLK10 NM_002776
- PS2
- 1,16 0,0140 TFF1 NM_003225
- STMY3
- 1,15 0,0850 MMP11 NM_005940
- REG4
- 1,14 0,0042 REG4 NM_032044
- MUC2
- 1,09 0,0370 MUC2 NM_002457
La tabla 4B muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando ILRD como métrica para el desenlace clínico.
Tabla 4B
- Gen
- Razón de riesgos Valor de P Símbolo oficial Número de registro
- HSPA8
- 0,51 0,0261 HSPA8 NM_006597
- RPS13
- 0,58 0,0089 RPS13 NM_001017
- RPLPO
- 0,63 0,0324 RPLP0 NM_001002
- NDUFS3
- 0,66 0,0142 NDUFS3 NM_004551
- LMNB1
- 0,67 0,0202 LMNB1 NM_005573
- ST14
- 0,67 0,0206 ST14 NM_021978
- BRCA1
- 0,68 0,0032 BRCA1 NM_007295
- TMSB4X
- 0,68 0,0075 TMSB4X NM_021109
- DHFR
- 0,68 0,0356 DHFR NM_000791
- SKP2
- 0,69 0,0248 SKP2 NM_005983
- TCF-1
- 0,70 0,0015 TCF1 NM_000545
E07717900
11-08-2014
- CDC20
- 0,70 0,0067 CDC20 NM_001255
- SLC25A3
- 0,70 0,0418 SLC25A3 NM_213611
- NME1
- 0,72 0,0503 NME1 NM_000269
- RRM1
- 0,72 0,0850 RRM1 NM_001033
- MCM2
- 0,76 0,0168 MCM2 NM_004526
- ABC6
- 0,76 0,0445 ABCC6 NM_001171
- CKS2
- 0,76 0,0869 CKS2 NM_001827
- EPHB2
- 0,77 0,0174 EPHB2 NM_004442
- C20 orf1
- 0,77 0,0716 TPX2 NM_012112
- CSEL1
- 0,77 0,0725 CSE1L NM_001316
- NFKBp65
- 0,78 0,0957 RELA NM_021975
- AURKB
- 0,79 0,0742 AURKB NM_004217
- CMYC
- 0,82 0,0901 MYC NM_002467
- Cdx2
- 0,85 0,0510 CDX2 NM_001265
- EREG
- 0,85 0,0730 EREG NM_001432
- AREG
- 0,86 0,0365 AREG NM_001657
La tabla 5A muestra asociaciones entre expresión génica e ILR, controlando características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis. Se enumeran todos los genes cuya expresión se correlaciona con ILR (p<0,1) y que demostraron una razón de riesgos >1 en un análisis de múltiples variables que incluye las siguientes variables: ubicación del tumor, cirugía, grado del tumor, ganglios examinados y número de ganglios positivos.
Tabla 5A
- Gen
- RR Chi cuadrado de LR GL Valor de p
- RARB
- 2,06780 4,23265 1 0,03965
- CYP3A4
- 1,85387 7,99462 1 0,00469
- ANXA2
- 1,80012 10,84166 1 0,00099
- COX2
- 1,79051 4,52307 1 0,03344
- RhoC
- 1,73986 9,97133 1 0,00159
- MAPK14
- 1,68382 8,04253 1 0,00457
- UBC
- 1,67323 11,69444 1 0,00063
- RhoB
- 1,66612 15,92497 1 0,00007
- ITGB1
- 1,65796 8,18638 1 0,00422
- KRAS2
- 1,63873 6,80447 1 0,00909
- NTN1
- 1,61833 5,43469 1 0,01974
- ATP5E
- 1,60990 4,93660 1 0,02629
- G Catenina
- 1,58482 9,24422 1 000236
- STC1
- 1,58163 11,10757 1 0,00086
- SPINT2
- 1,52653 6,17276 1 0,01297
- Claudina 4
- 1,50290 12,29943 1 0,00045
- IGFBP7
- 1,48789 9,62569 1 0,00192
- NCAM1
- 1,48294 5,11428 1 0,02373
- TIMP1
- 1,46045 9,98492 1 0,00158
E07717900
11-08-2014 E07717900
- CEBPB
- 1,46025 5,23659 1 0,02212
- KCNH2 iso a/b
- 1,44616 3,97304 1 0,04623
- TMSB10
- 1,43107 4,65463 1 0,03097
- VEGFC
- 1,41860 4,66904 1 0,03071
- HB-EGF
- 1,41757 7,00399 1 000813
- FST
- 1,41061 5,59674 1 0,01799
- LAMC2
- 1,40860 11,33997 1 0,00076
- GADD45B
- 1,40671 12,26323 1 0,00046
- AKT3
- 1,40161 10,13028 1 0,00146
- EFNA1
- 1,40048 8,86645 1 0,00290
- p21
- 1,39939 5,42981 1 0,01980
- INHBA
- 1,38204 11,03909 1 0,00089
- CALD1
- 1,38009 6,93406 1 0,00846
- DUSP1
- 1,36464 13,04379 1 0,00030
- HSPG2
- 1,36387 4,11749 1 0,04244
- GJB2
- 1,36358 8,42204 1 0,00371
- EPAS1
- 1,36323 4,74318 1 0,02941
- BGN
- 1,35821 7,66947 1 0,00562
- TIMP2
- 1,35571 5,78791 1 0,01614
- A Catenina
- 1,35566 4,35623 1 0,03687
- LOXL2
- 1,35470 7,23663 1 0,00714
- DKK1
- 1,35126 3,88504 1 0,04872
- ITGAV
- 1,34899 8,03554 1 0,00459
- CGB
- 1,34840 7,06221 1 0,00787
- EGR1
- 1,33424 8,41855 1 0,00371
- TIMP3
- 1,33197 6,28550 1 0,01217
- VIM
- 1,33196 4,92198 1 0,02652
- TGFBI
- 1,32511 8,30278 1 0,00396
- FXYD5
- 1,32500 6,22751 1 0,01258
- VEGF
- 1,32291 4,93825 1 0,02627
- ADAMTS12
- 1,31794 7,46749 1 0,00628
- SLP1
- 1,31565 8,38324 1 0,00379
- DLC1
- 1,30862 5,51638 1 0,01884
- HOXB7
- 1,30822 8,04076 1 0,00457
- TMEPAI
- 1,30395 8,43736 1 0,00368
- IGFBP5
- 1,30260 5,44022 1 0,01968
- CDC42BPA
- 1,30167 4,20771 1 0,04024
- PDGFA
- 1,29760 5,54964 1 0,01848
- GSTp
- 1,29594 3,96268 1 0,04652
- FOS
- 1,29427 8,42847 1 0,00369
- PDGFC
- 1,28813 6,81737 1 0,00903
11-08-2014
- IGFBP3
- 1,28701 6,33625 1 0,01183
- LOX
- 1,28433 8,15598 1 0,00429
- SPARC
- 1,28260 4,75876 1 0,02915
- EFNB2
- 1,27720 4,71247 1 0,02994
- Maspina
- 1,27645 10,57657 1 0,00115
- THBS1
- 1,27619 6,61087 1 0,01014
- TAGLN
- 1,26904 5,15123 1 0,02323
- VEGF_altsplice1
- 1,26734 5,29282 1 0,02141
- S100P
- 1,26586 9,88713 1 0,00166
- HSPA1A
- 1,26209 8,59704 1 0,00337
- MAD
- 1,26112 3,96163 1 0,04655
- ANGPT2
- 1,25701 3,91148 1 0,04796
- PRKCA
- 1,24853 4,69452 1 0,03026
- F3
- 1,24848 5,06788 1 0,02437
- FAP
- 1,24657 5,19589 1 0,02264
- BRK
- 1,24507 5,44048 1 0,01968
- CD68
- 1,23943 4,02530 1 0,04482
- NR4A1
- 1,23772 7,09548 1 0,00773
- CTHRC1
- 1,23465 5,21100 1 0,02244
- SLC2A1
- 1,22967 5,22364 1 0,02228
- Grb10
- 1,22209 4,12811 1 0,04218
- p16-INK4
- 1,21325 4,44296 1 0,03505
- MDK
- 1,21116 5,25025 1 0,02194
- CYR61
- 1,19995 4,14452 1 0,04177
- LAMA3
- 1,19794 4,33073 1 0,03743
- FOXO3A
- 1,19557 4,20079 1 0,04041
- EFNA3
- 1,19439 5,51728 1 0,01883
- CRYAB
- 1,17514 3,90435 1 0,04816
- CEACAM6
- 1,16804 3,96486 1 0,04646
- OPN_osteopontina
- 1,16112 5,50891 1 0,01892
- KLKIO
- 1,15851 5,65625 1 0,01739
- SFRP2
- 1,15773 4,02893 1 0,04473
- KLK6
- 1,15163 4,65953 1 0,03088
- S100A2
- 1,14185 3,94284 1 0,04707
- REG4
- 1,09037 4,16995 1 0,04115
La tabla 5B muestra asociaciones entre expresión génica e ILR, controlando características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis. Se enumeran todos los genes cuya expresión se correlaciona con ILR (p<0,1) y que demostraron una razón de riesgos <1 en un análisis de múltiples variables que incluye las siguientes variables: ubicación del tumor, cirugía, grado del tumor, ganglios examinados y número de ganglios positivos.
Tabla 5B
E07717900
11-08-2014
- BFGF
- 0,46674 6,95233 1 0,00837
- Fasl
- 0,47324 4,08714 1 0,04321
- KLRK1
- 0,63331 10,28820 1 0,00134
- DHFR
- 0,64947 7,64434 1 0,00570
- BRCA1
- 0,65247 15,21566 1 0,00010
- SLC25A3
- 0,67480 5,72977 1 0,01668
- RAD54L
- 0,68215 5,38684 1 0,02029
- PPMID
- 0,68777 10,02879 1 0,00154
- CD80
- 0,69347 8,70087 1 0,00318
- ATP5A1
- 0,70467 4,06718 1 0,04372
- PRKCB1
- 0,73152 5,21950 1 0,02234
- KIF22
- 0,73945 5,13202 1 0,02349
- Chk1
- 0,75865 4,38139 1 0,03633
- TRAIL
- 0,76430 4,12533 1 0,04225
- CDC20
- 0,77071 5,04557 1 0,02469
- DUT
- 0,78196 4,13381 1 0,04203
- ABCB1
- 0,79434 5,33783 1 0,02087
- UMPS
- 0,80011 4,65425 1 0,03098
- ING5
- 0,80230 4,04085 1 0,04441
- CMYC
- 0,80757 4,26709 1 0,03886
- GBP1
- 0,83015 3,98302 1 0,04596
- AREG
- 0,86091 4,94239 1 0,02621
La tabla 6 muestra asociaciones entre expresión génica y desenlace clínico basándose en un análisis de riesgos proporcionales no lineal, usando una curva de tipo spline natural de 2 grados de libertad. Se enumeran todos los genes que demostraron una desviación de una relación estrictamente lineal (p<0,05) con ILR en pacientes en
5 estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados. La relación entre expresión génica e ILR no era constante a lo largo de todo el intervalo observado de valores de expresión en el estudio, por ejemplo aumentos en la expresión génica pueden haber estado relacionados con aumentos en la duración de ILR en una parte del intervalo observado y con disminuciones en la duración de ILR en una parte diferente del intervalo.
10 Tabla 6
- Gen
- Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- PTHLH
- 0,001 PTHLH NM_002820
- CDCA7 v2
- 0,002 CDCA7 NM_145810
- CREBBP
- 0,002 CREBBP NM_004380
- KLF5
- 0,002 KLF5 NM_001730
- LAMB3
- 0,004 LAMB3 NM_000228
- TGFBR1
- 0,005 TGFBR1 NM_004612
- NR4A1
- 0,005 NR4A1 NM_002135
- Upa
- 0,005 PLAU NM_002658
- Cad17
- 0,007 CDH17 NM_004063
- S100A4
- 0,008 S100A4 NM_002961
- A-Catenina
- 0,008 CTNNA1 NM_001903
- EPHB2
- 0,009 EPHB2 NM_004442
E07717900
11-08-2014 E07717900
- Axina2
- 0,011 AXIN2 NM_004655
- PTPRJ
- 0,011 PTPRJ NM_002843
- CAPN1
- 0,012 CAPN1 NM_005186
- CEGP1
- 0,013 SCUBE2 NM_020974
- APOC1
- 0,013 APOC1 NM_001645
- GHP1
- 0,015 GBP1 NM_002053
- SKP2
- 0,016 SKP2 NM_005983
- ATP5E
- 0,016 ATP5E NM_006886
- GRIK1
- 0,017 GRIK1 NM_000830
- PRKR
- 0,018 EIF2AK2 NM_002759
- FUT6
- 0,020 FUT6 NM_000150
- PFN2
- 0,020 PFN2 NM_053024
- ITGB4
- 0,021 ITGB4 NM_000213
- MADH7
- 0,021 SMAD7 NM_005904
- RALBP1
- 0,021 RALBP1 NM_006788
- AKT1
- 0,022 AKT1 NM_005163
- KLK6
- 0,022 KLK6 NM_002774
- PLK
- 0,023 PLK1 NM_005030
- CYP2C8
- 0,025 CYP2C8 NM_000770
- BTF3
- 0,026 BTF3 NM_001207
- CCNE2 variante 1
- 0,026 CCNE2 NM_057749
- STMY3
- 0,030 MMP11 NM_005940
- NRP1
- 0,030 NRP1 NM_003873
- SIAT4A
- 0,031 ST3GAL1 NM_003033
- SEMA3B
- 0,033 SEMA3B NM_004636
- TRAG3
- 0,033 CSAG2 NM_004909
- HSPE1
- 0,035 HSPE1 NM_002157
- SBA2
- 0,036 WSB2 NM_018639
- TK1
- 0,036 TK1 NM_003258
- CCNB2
- 0,037 CCNB2 NM_004701
- TMEPAI
- 0,037 TMEPAI NM_020182
- SPRY2
- 0,037 SPRY2 NM_005842
- AGXT
- 0,038 AGXT NM_000030
- ALCAM
- 0,038 ALCAM NM_001627
- HSPCA
- 0,038 HSPCA NM_005348
- TIMP3
- 0,038 TIMP3 NM_000362
- DET1
- 0,039 DET1 NM_017996
- tusc4
- 0,040 TUSC4 NM_006545
- SNAI2
- 0,040 SNAI2 NM_003068
- CD28
- 0,040 CD28 NM_006139
- RNF11
- 0,041 RNF11 NM_014372
11-08-2014
- PAI1
- 0,042 SERPINE1 NM_000602
- XRCC1
- 0,042 XRCC1 NM_006297
- EGLN1
- 0,044 EGLN1 NM_022051
- EGFR
- 0,044 EGFR NM_005228
- HES6
- 0,044 HES6 NM_018645
- KCNK4
- 0,045 KCNK4 NM_016611
- CXCR4
- 0,047 CXCR4 NM_003467
- PTP4A3
- 0,048 PTP4A3 NM_007079
- p27
- 0,048 CDKNIB NM_004064
- MADH4
- 0,049 SMAD4 NM_005359
- ICAM1
- 0,049 ICAM1 NM_000201
La tabla 7 muestra todos los genes que presentan una interacción (valor de p < 0,05) con el estadio del tumor. Se modelaron los datos usando un modelo de riesgos proporcionales de ILR con expresión génica, estadio del tumor y su interacción como factores de predicción.
Tabla 7
- Gen
- RR de estadio II RR de estadio III Valor de p para la interacción
- ICAM2
- 1,49 0,68 0,0019
- CD24
- 1,26 0,84 0,0054
- PRDX6
- 2,29 0,73 0,0058
- HSD17B2
- 0,62 1,29 0,0072
- ALCAM
- 1,61 0,94 0,0088
- SIR2
- 2,02 1,09 0,0089
- NUFIP1
- 1,32 0,79 0,0093
- EMR3
- 2,14 0,57 0,0127
- CDC20
- 0,56 0,98 0,0130
- MT3
- 1,37 0,79 0,0134
- CLTC
- 1,80 0,71 0,0144
- CYR61
- 1,73 1,10 0,0145
- WIF
- 1,34 0,78 0,0195
- TFF3
- 1,23 0,90 0,0209
- SOS1
- 1,46 0,79 0,0287
- TMSB4X
- 1,34 0,74 0,0293
- CENPE
- 3,05 0,85 0,0330
- CDH11
- 1,49 0,96 0,0339
- CAPG
- 0,90 1,50 0,0348
- TP53HP1
- 1,54 0,93 0,0357
- MGAT5
- 1,25 0,73 0,0362
- MADH2
- 1,36 0,70 0,0393
- LOX
- 1,58 1,11 0,0396
- DKK1
- 0,87 1,55 0,0415
- CKSIB
- 0,31 1,75 0,0467
E07717900
11-08-2014
- MMP7
- 0,92 1,28 0,0471
- STAT5B
- 1,28 0,86 0,0471
- CD28
- 0,69 1,25 0,0472
Resultados del segundo estudio de análisis
El conjunto de genes de referencia para el segundo análisis fue ATP5E, CLTC, GPX1, NEDD8, PGK1, UBB.
5 La tabla 1.2A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva (ILR) más corto basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 1.2B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de 10 recidiva (ILR) más largo basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 2.2A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa disminuida de supervivencia global (SG) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
15 La tabla 2.2B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa aumentada de supervivencia global (SG) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 3.2A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa disminuida de supervivencia libre de enfermedad (SLE) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
20 La tabla 3.2B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de una tasa aumentada de supervivencia libre de enfermedad (SLE) basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 4.2A muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de 25 recidiva a distancia (ILRD) más corto basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
La tabla 4.2B muestra asociaciones para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD) más largo basándose en el análisis de riesgos proporcionales de una variable.
30 La tabla 5.2A muestra asociaciones entre expresión génica e ILR para los genes cuya expresión aumentada es predictiva de un intervalo libre de recidiva (ILR) más corto, basándose en un análisis de múltiples variables que controla características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis.
La tabla 5.2B muestra asociaciones entre expresión génica e ILR para los genes cuya expresión aumentada es 35 predictiva de un intervalo libre de recidiva (ILR) más largo, basándose en un análisis de múltiples variables que controla características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis.
La tabla 6.2 muestra genes para los que se identificó una asociación entre expresión génica y desenlace clínico basándose en un análisis de riesgos proporcionales no lineal, usando una curva de tipo spline natural de 2 grados 40 de libertad.
La tabla 7.2 muestra todos los genes que presentan una interacción (valor de p < 0,05) con el estadio del tumor.
La tabla 1.2A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una
45 razón de riesgos >1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando ILR como métrica para el desenlace clínico.
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- RARB
- 2,22 0,0294 RARB NM_016152
- ITGB1
- 2,04 0,0002 ITGB1 NM_002211
- ANXA2
- 1,78 0,0003 ANXA2 NM_004039
- CYP3A4
- 1,68 0,0075 CYP3A4 NM_017460
- COX2
- 1,64 0,0604 PTGS2 NM_000963
- KRAS2
- 1,62 0,0064 KRAS NM_004985
- TJP1
- 1,58 0,0751 TJP1 NM_003257
E07717900
11-08-2014 E07717900
- KIAA0125
- 1,58 0,0889 KIAA0125 NM_014792
- RhoB
- 1,57 0,0002 RHOB NM_004040
- RhoC
- 1,56 0,0059 RHOC NM_175744
- NTN1
- 1,54 0,0336 NTN1 NM_004822
- ANXA5
- 1,52 0,0086 ANXA5 NM_001154
- TIMP1
- 1,52 <0,0001 TIMP1 NM_003254
- AKT3
- 1,50 <0,0001 AKT3 NM_005465
- CALD1
- 1,48 0,0007 CALD1 NM_004342
- IGFBP7
- 1,46 0,0023 IGFBP7 NM_001553
- CYP1B1
- 1,45 0,0222 CYP1B1 NM_000104
- BGN
- 1,44 0,0002 BGN NM_001711
- VEGFC
- 1,44 0,0151 VEGFC NM_005429
- DLC1
- 1,44 0,0014 DLC1 NM_006094
- SI
- 1,42 0,0086 SI NM_001041
- TIMP2
- 1,42 0,0022 TIMP2 NM_003255
- CDC42BPA
- 1,41 0,0038 CDC42BPA NM_003607
- LAMC2
- 1,40 0,0004 LAMC2 NM_005562
- ITGAV
- 1,40 0,0019 ITGAV NM_002210
- CTSB
- 1,40 0,0357 CTSB NM_001908
- DUSP1
- 1,39 <0,0001 DUSP1 NM_004417
- TLN1
- 1,39 0,0335 TLN1 NM_006289
- CCNE2 variante 1
- 1,39 0,0708 CCNE2 NM_057749
- TIMP3
- 1,38 0,0023 TIMP3 NM_000362
- GHI BRAF mut4
- 1,38 0,0537 GHIBRAFmut4
- HB-EGF
- 1,38 0,0109 HBEGF NM_001945
- HSPG2
- 1,38 0,0258 HSPG2 NM_005529
- VIM
- 1,37 0,0077 VIM NM_003380
- ROCK1
- 1,37 0,0168 ROCK1 NM_005406
- S100A1
- 1,36 0,0233 S100A1 NM_006271
- p21
- 1,36 0,0113 CDKN1A NM_000389
- CGB
- 1,36 0,0023 CGB NM_000737
- UBC
- 1,36 0,0137 UBC NM_021009
- GADD45B
- 1,36 0,0003 GADD45B NM_015675
- INHBA
- 1,35 0,0010 INHBA NM_002192
- VCL
- 1,34 0,0286 VCL NM_003373
- SIR2
- 1,34 0,0049 SIRT1 NM_012238
- CD68
- 134 0,0042 CD68 NM_001251
- Maspina
- 1,34 <0,0001 SERPINB5 NM_002639
- FST
- 1,33 0,0326 FST NM_006350
- EPAS1
- 1,33 0,0306 EPAS1 NM_001430
- LOXL2
- 1,33 0,0076 LOXL2 NM_002318
11-08-2014 E07717900
- STC1
- 1,33 0,0119 STC1 NM_003155
- UNC5C
- 1,32 0,0642 UNC5C NM_003728
- IGFBP5
- 1,32 0,0080 IGFBP5 NM_000599
- INHBB
- 1,32 0,0643 INHBB NM_002193
- FAP
- 1,32 0,0017 FAP NM_004460
- DKK1
- 1,31 0,0298 DKK1 NM_012242
- FYN
- 1,31 0,0053 FYN NM_002037
- CTHRC1
- 1,31 0,0017 CTHRC1 NM_138455
- FOS
- 1,31 0,0010 FOS NM_005252
- RBX1
- 1,31 0,0633 RBX1 NM_014248
- TAGLN
- 1,31 0,0058 TAGLN NM_003186
- SBA2
- 1,31 0,0439 WSB2 NM_018639
- CYR61
- 1,30 0,0018 CYR61 NM_001554
- SPARC
- 1,30 0,0117 SPARC NM_003118
- SNAI2
- 1,30 0,0076 SNAI2 NM_003068
- TMSB10
- 1,30 0,0757 TMSB10 NM_021103
- IGFBP3
- 1,30 0,0056 IGFBP3 NM_000598
- PDGFC
- 1,29 0,0040 PDGFC NM_016205
- SLPI
- 1,29 0,0026 SLPI NM_003064
- COL1A2
- 1,29 0,0087 COL1A2 NM_000089
- NRP2
- 1,29 0,0112 NRP2 NM_003872
- PRKCA
- 1,29 0,0093 PRKCA NM_002737
- KLF6
- 1,29 0,0661 KLF6 NM_001300
- THBS1
- 1,28 0,0062 THBS1 NM_003246
- EGR1
- 1,28 0,0067 EGR1 NM_001964
- S100A4
- 1,28 0,0070 S100A4 NM_002961
- CXCR4
- 1,28 0,0089 CXCR4 NM_003467
- LAMA3
- 1,27 0,0024 LAMA3 NM_000227
- LOX
- 1,26 0,0036 LOX NM_002317
- AKAP12
- 1,26 0,0046 AKAP12 NM_005100
- ADAMTS12
- 1,26 0,0109 ADAMTS12 NM_030955
- MCP1
- 1,25 0,0122 CCL2 NM_002982
- Grb10
- 1,25 0,0107 GRB10 NM_005311
- PTGER3
- 1,25 0,0240 PTGER3 NM_000957
- CRYAB
- 1,25 0,0035 CRYAB NM_001885
- ANGPT2
- 1,25 0,0566 ANGPT2 NM_001147
- ANXA1
- 1,25 0,0353 ANXA1 NM_000700
- EphB6
- 1,24 0,0960 EPHB6 NM_004445
- PDGFB
- 1,24 0,0139 PDGFB NM_002608
- COL1A1
- 1,24 0,0198 COL1A1 NM_000088
- TGFB3
- 1,23 0,0094 TGFB3 NM_003239
11-08-2014 E07717900
- CTGF
- 1,23 0,0265 CTGF NM_001901
- PDGFA
- 1,23 0,0312 NM_002607
- HSPA1A
- 1,23 0,0027 HSPA1A NM_005345
- EFNB2
- 1,23 0,0331 EFNB2 NM_004093
- CAPG
- 1,23 0,0724 CAPG NM_001747
- TGFBI
- 1,22 0,0231 TGFBI NM_000358
- SIAT4A
- 1,22 0,0253 ST3GAL1 NM_003033
- LAT
- 1,22 0,0307 LAT NM_014387
- ITGA5
- 1,22 0,0224 ITGA5 NM_002205
- GBP2
- 1,22 0,0225 GBP2 NM_004120
- ANTXR1
- 1,22 0,0204 ANTXR1 NM_032208
- ID4
- 1,22 0,0512 ID4 NM_001546
- SFRP2
- 1,22 0,0039 SFRP2 NM_003013
- TMEPAI
- 1,21 0,0170 TMEPAI NM_020182
- CTSL
- 1,21 0,0388 CTSL NM_001912
- KLK10
- 1,21 0,0007 KLK10 NM_002776
- FXYD5
- 1,21 0,0547 FXYD5 NM_014164
- GJB2
- 1,21 0,0356 GJB2 NM_004004
- P14ARF
- 1,21 0,0451 S78535
- DAPK1
- 1,21 0,0525 DAPK1 NM_004938
- SKP1A
- 1,21 0,0663 SKP1A NM_006930
- SFRP4
- 1,21 0,0078 SFRP4 NM_003014
- KLK6
- 1,20 0,0048 KLK6 NM_002774
- GJA1
- 1,20 0,0345 GJA1 NM_000165
- HOXB7
- 1,20 0,0278 HOXB7 NM_004502
- NDRG1
- 1,20 0,0948 NDRG1 NM_006096
- PAI1
- 1,19 0,0061 SERPINE1 NM_000602
- CDH11
- 1,19 0,0762 CDH11 NM_001797
- EGR3
- 1,19 0,0149 EGR3 NM_004430
- EMP1
- 1,19 0,0533 EMP1 NM_001423
- FZD1
- 1,19 0,0671 FZD1 NM_003505
- ABCC5
- 1,19 0,0631 ABCC5 NM_005688
- S100P
- 1,18 0,0160 S100P NM_005980
- OPN, osteopontina
- 1,18 0,0030 SPP1 NM_000582
- p16-INK4
- 1,17 0,0503 L27211
- NR4A1
- 1,17 0,0332 NR4A1 NM_002135
- TUBB
- 1,17 0,0950 TUBB2 NM_001069
- SIAT7B
- 1,17 0,0352 ST6GALNAC2 NM_006456
- ALDH1A1
- 1,17 0,0299 ALDH1A1 NM_000689
- F3
- 1,16 0,0654 F3 NM_001993
- SLC2A1
- 1,15 0,0806 SLC2A1 NM_006516
11-08-2014
- CXCL12
- 1,13 0,0986 CXCL12 NM_000609
- STMY3
- 1,13 0,0518 MMP11 NM_005940
- S100A2
- 1,13 0,0303 S100A2 NM_005978
- FABP4
- 1,13 0,0363 FABP4 NM_001442
- REG4
- 1,11 0,0034 REG4 NM_032044
- pS2
- 1,09 0,0690 TFF1 NM_003225
- MUC2
- 1,06 0,0674 MUC2 NM_002457
La tabla 1.2B muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando ILR como métrica para el desenlace clínico
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- ORC1L
- 0,41 0,0623 ORC1L NM_004153
- E2F1
- 0,63 0,0006 E2F1 NM_005225
- HSPA8
- 0,63 0,0346 HSPA8 NM_006597
- RAD54L
- 0,65 0,0026 RAD54L NM_003579
- BRCA1
- 0,68 0,0001 BRCA1 NM_007295
- SLC25A3
- 0,70 0,0100 SLC25A3 NM_213611
- PPM1D
- 0,71 0,0025 PPM1D NM_003620
- DHFR
- 0,71 0,0106 DHFR NM_000791
- SKP2
- 0,72 0,0087 SKP2 NM_005983
- FASN
- 0,73 0,0070 FASN NM_004104
- HNRPD
- 0,73 0,0611 HNRPD NM_031370
- ENO1
- 0,74 0,0432 ENO1 NM_001428
- C20orf1
- 0,74 0,0086 TPX2 NM_012112
- BRCA2
- 0,75 0,0515 BRCA2 NM_000059
- DDB1
- 0,75 0,0639 DDB1 NM_001923
- KIF22
- 0,76 0,0127 KIF22 NM_007317
- RPLPO
- 0,76 0,0330 RPLPO NM_001002
- Chk1
- 0,76 0,0164 CHEK1 NM_001274
- ST14
- 0,77 0,0392 ST14 NM_021978
- Bax
- 0,77 0,0502 BAX NM_004324
- TCF-1
- 0,78 0,0023 TCF1 NM_000545
- LMNB1
- 0,78 0,0458 LMNB1 NM_005573
- RRM1
- 0,78 0,0693 RRM1 NM_001033
- CSEL1
- 0,79 0,0261 CSE1L NM_001316
- CDC20
- 0,79 0,0274 CDC20 NM_001255
- PRDX2
- 0,79 0,0930 PRDX2 NM_005809
- RPS13
- 0,79 0,0906 RPS13 NM_001017
- RAF1
- 0,80 0,0717 RAF1 NM_002880
- CMYC
- 0,80 0,0095 MYC NM_002467
E07717900
11-08-2014
- UBE2M
- 0,80 0,0390 UBE2M NM_003969
- CKS2
- 0,80 0,0596 CKS2 NM_001827
- NME1
- 0,80 0,0694 NM_E1 NM_000269
- c-myb (MYB oficial)
- 0,80 0,0082 MYB NM_005375
- CD80
- 0,80 0,0688 CD80 NM_005191
- CDCA7 v2
- 0,81 0,0164 CDCA7 NM_145810
- EFP
- 0,81 0,0387 TRIM25 NM_005082
- CCNE2
- 0,81 0,0405 CCNE2 NM_057749
- SURV
- 0,81 0,0573 BIRC5 NM_001168
- RRM2
- 0,82 0,0181 RRM2 NM_001034
- ABCC6
- 0,82 0,0464 ABCC6 NM_001171
- UMPS
- 0,82 0,0371 UMPS NM_000373
- PI3KC2A
- 0,82 0,0855 PIK3C2A NM_002645
- NOTCH1
- 0,82 0,0222 NOTCH1 NM_017617
- EIF4E
- 0,82 0,0928 EIF4E NM_001968
- EPHB2
- 0,82 0,0183 EPHB2 NM_004442
- AREG
- 0,83 0,0012 AREG NM_001657
- EREG
- 0,83 0,0059 EREG NM_001432
- MYBL2
- 0,83 0,0234 MYBL2 NM_002466
- ABCB1
- 0,83 0,0342 ABCB1 NM_000927
- HRAS
- 0,83 0,0708 HRAS NM_005343
- SLC7A5
- 0,84 0,0547 SLC7A5 NM_003486
- MAD2L1
- 0,84 0,0653 MAD2L1 NM_002358
- ING5
- 0,85 0,0920 ING5 NM_032329
- Ki-67
- 0,85 0,0562 MKI67 NM_002417
- MCM2
- 0,85 0,0671 MCM2 NM_004526
- Cdx2
- 0,88 0,0430 CDX2 NM_001265
- HES6
- 0,89 0,0966 HES6 NM_018645
- PTPRO
- 0,89 0,0664 PTPRO NM_030667
- cnpto (TDGF1 oficial)
- 0,90 0,0781 TDGF1 NM_003212
La tabla 2.2A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos > 1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SG como métrica para el desenlace clínico.
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- RhoC
- 1,66 0,0002 RHOC NM_175744
- ITGB1
- 1,59 0,0049 ITGB1 NM_002211
- ANXA2
- 1,58 0,0004 ANXA2 NM_004039
- CYP3A4
- 1,49 0,0114 CYP3A4 NM_017460
- p21
- 1,49 <0,0001 CDKN1A NM_000389
- HMLH
- 1,42 0,0555 MLH1 NM_000249
E07717900
11-08-2014 E07717900
- VEGFC
- 1,41 0,0095 VEGFC NM_005429
- TGFBR1
- 1,40 0,0113 TGFBR1 NM_004612
- UBC
- 1,38 0,0013 UBC NM_021009
- RhoB
- 1,37 0,0016 RHOB NM_004040
- HSPG2
- 1,37 0,0111 HSPG2 NM_005529
- PFN1
- 1,35 0,0987 PFN1 NM_005022
- TIMP1
- 1,35 0,0008 TIMP1 NM_003254
- VCL
- 1,33 0,0116 VCL NM_003373
- INHBB
- 1,32 0,0265 INHBB NM_002193
- SPINT2
- 1,32 0,0358 SPINT2 NM_021102
- GHI BRAF mut4
- 1,31 0,0822 GHI_BRAF_mut4
- LAMC2
- 1,31 0,0007 LAMC2 NM_005562
- KCNH2 iso a/b
- 1,31 0,0474 KCNH2 NM_000238
- UNC5C
- 1,30 0,0417 UNC5C NM_003728
- CDC42
- 1,30 0,0122 CDC42 NM_001791
- UBL1
- 1,29 0,0169 SUMO1 NM_003352
- GADD45B
- 1,29 0,0003 GADD45B NM_015675
- KRAS2
- 1,29 0,0774 KRAS NM_004985
- HB EGF
- 1,29 0,0219 HBEGF NM_001945
- DKK1
- 1,28 0,0304 DKK1 NM_012242
- FXYD5
- 1,28 0,0035 FXYD5 NM_014164
- CALD1
- 1,28 0,0107 CALD1 NM_004342
- ANXA5
- 1,27 0,0723 ANXA5 NM_001154
- HLA-G
- 1,27 0,0732 HLA-G NM_002127
- DUSP1
- 1,27 0,0004 DUSP1 NM_004417
- LOXL2
- 1,27 0,0050 LOXL2 NM_002318
- CDC42BPA
- 1,27 0,0155 CDC42BPA NM_003607
- BGN
- 1,27 0,0039 BGN NM_001711
- LAMB3
- 1,27 0,0221 LAMB3 NM_000228
- EphB6
- 1,27 0,0373 EPHB6 NM_004445
- SHC1
- 1,27 0,0582 SHC1 NM_003029
- TIMP2
- 1,26 0,0126 TIMP2 NM_003255
- CTSB
- 1,26 0,0748 CTSB NM_001908
- TIMP3
- 1,26 0,0072 TIMP3 NM_000362
- ID3
- 1,26 0,0033 ID3 NM_002167
- CAPG
- 1,26 0,0162 CAPG NM_001747
- NRP1
- 1,26 0,0135 NRP1 NM_003873
- INHBA
- 1,26 0,0021 INHBA NM_002192
- KLF6
- 1,25 0,0477 KLF6 NM_001300
- IGFBP7
- 1,25 0,0251 IGFBP7 NM_001553
- S100A1
- 1,25 0,0528 S100A1 NM_006271
11-08-2014 E07717900
- EPAS1
- 1,24 0,0382 EPAS1 NM_001430
- DLC1
- 1,24 0,0228 DLC1 NM_006094
- KLK10
- 1,24 <0,0001 KLK10 NM_002776
- SBA2
- 1,24 0,0493 WSB2 NM_018639
- SPARC
- 1,24 0,0133 SPARC NM_003118
- GAGE4
- 1,23 0,0475 GAGE4 NM_001474
- HSPA1A
- 1,23 0,0004 HSPA1A NM_005345
- SIR2
- 1,23 0,0179 SIRT1 NM_012238
- CGB
- 1,23 0,0202 CGB NM_000737
- Grb10
- 1,22 0,0059 GRB10 NM_005311
- SNAI2
- 1,22 0,0145 SNAI2 NM_003068
- LAMA3
- 1,22 0,0019 LAMA3 NM_000227
- AKT3
- 1,22 0,0169 AKT3 NM_005465
- FYN
- 1,22 0,0138 FYN NM_002037
- FOS
- 1,22 0,0035 FOS NM_005252
- CTHRC1
- 1,21 0,0056 CTHRC1 NM_138455
- CTSD
- 1,21 0,0506 CTSD NM_001909
- THY1
- 1,21 0,0290 THY1 NM_006288
- ANXA1
- 1,21 0,0339 ANXA1 NM_000700
- CD68
- 1,21 0,0227 CD68 NM_001251
- G-Catenina
- 1,20 0,0789 JUP NM_002230
- PLK3
- 1,20 0,0081 PLK3 NM_004073
- STC1
- 1,20 0,0577 STC1 NM_003155
- TAGLN
- 1,20 0,0238 TAGLN NM_003186
- VIM
- 1,20 0,0632 VIM NM_003380
- HSPA1B
- 1,20 0,0302 HSPA1B NM_005346
- LAT
- 1,20 0,0184 LAT NM_014387
- KRT19
- 1,20 0,0309 KRT19 NM_002276
- IGFBP3
- 1,20 0,0167 IGFBP3 NM_000598
- BMP4
- 1,20 0,0035 BMP4 NM_001202
- KLK6
- 1,20 0,0014 KLK6 NM_002774
- THBS1
- 1,20 0,0206 THBS1 NM_003246
- TULP3
- 1,19 0,0344 TULP3 NM_003324
- ERK1
- 1,19 0,0522 Z11696
- CREBBP
- 1,19 0,0866 CREBBP NM_004380
- S100A4
- 1,19 0,0259 S100A4 NM_002961
- PDGFB
- 1,19 0,0205 PDGFB NM_002608
- EFNB2
- 1,19 0,0299 EFNB2 NM_004093
- LOX
- 1,19 0,0104 LOX NM_002317
- PTK2
- 1,18 0,0983 PTK2 NM_005607
- IGFBP5
- 1,18 0,0544 IGFBP5 NM_000599
11-08-2014 E07717900
- APC
- 1,18 0,0461 APC NM_000038
- DYRK1B
- 1,18 0,0681 DYRK1B NM_004714
- NOTCH2
- 1,18 0,0533 NOTCH2 NM_024408
- Maspina
- 1,18 0,0033 SERPINB5 NM_002639
- AKAP12
- 1,18 0,0195 AKAP12 NM_005100
- COL1A1
- 1,17 0,0417 COL1A1 NM_000088
- EMP1
- 1,17 0,0295 EMP1 NM_001423
- SIAT4A
- 1,17 0,0311 ST3GAL1 NM_003033
- PAI1
- 1,17 0,0036 SERPINE1 NM_000602
- NR4A1
- 1,17 0,0117 NR4A1 NM_002135
- EGR1
- 1,17 0,0379 EGR1 NM_001964
- BRK
- 1,17 0,0156 PTK6 NM_005975
- UNC5B
- 1,17 0,0956 UNC5B NM_170744
- SR-A1
- 1,77 0,0512 SR-A1 NM_021228
- MRP3
- 1,16 0,0353 ABCC3 NM_003786
- hCRA a
- 1,16 0,0878 U78556
- Upa
- 1,16 0,0630 PLAU NM_002658
- BCAS1
- 1,16 0,0147 BCAS1 NM_003657
- PDGFC
- 1,16 0,0375 PDGFC NM_016205
- COL1A2
- 1,16 0,0620 COL1A2 NM_000089
- CTGF
- 1,16 0,0580 CTGF NM_00190
- MCP1
- 1,16 0,0463 CCL2 NM_002982
- RAB32
- 1,16 0,0686 RAB32 NM_006834
- SKP1A
- 1,16 0,0842 SKP1A NM_006930
- FAP
- 1,16 0,0443 FAP NM_004460
- EFNA1
- 1,16 0,0990 EFNA1 NM_004428
- HOXB7
- 1,15 0,0378 HOXB7 NM_004502
- CYR61
- 1,15 0,0452 CYR61 NM_001554
- TGFBI
- 1,15 0,0591 TGFBI NM_000358
- TMEPAI
- 1,15 0,0419 TMEPAI NM_020182
- SIN3A
- 1,15 0,0853 SIN3A NM_015477
- S100A2
- 1,15 0,0038 S100A2 NM_005978
- PDGFA
- 1,15 0,0840 NM_002607
- MMP7
- 1,15 0,0469 MMP7 NM_002423
- ANTXR1
- 1,15 0,0520 ANTXR1 NM_032208
- SLPI
- 1,14 0,0755 SLPI NM_003064
- SFRP2
- 1,13 0,0253 SFRP2 NM_003013
- S100A8
- 1,13 0,0795 S100A8 NM_002964
- TP53I3
- 1,13 0,0973 TP53I3 NM_004881
- F3
- 1,13 0,0735 F3 NM_001993
- OPN, osteopontina
- 1,12 0,0100 SPP1 NM_000582
11-08-2014
- EGLN3
- 1,11 0,0883 EGLN3 NM_022073
- FZD6
- 1,11 0,0791 FZD6 NM_003506
- OSM
- 1,10 0,0913 OSM NM_020530
- FABP4
- 1,10 0,0521 FABP4 NM_001442
- GSTT1
- 1,09 0,0837 GSTT1 NM_000853
- REG4
- 1,07 0,0300 REG4 NM_032044
La tabla 2.2B muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SG como métrica para el desenlace clínico.
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- ORC1L
- 0,52 0,0895 ORC1L NM_004153
- HSPA8
- 0,64 0,0164 HSPA8 NM_006597
- SKP2
- 0,71 0,0012 SKP2 NM_005983
- PRDX4
- 0,74 0,0202 PRDX4 NM_006406
- DHFR
- 0,76 0,0111 DHFR NM_000791
- FGF18
- 0,76 0,0915 FGF18 NM_003862
- SLC25A3
- 0,76 0,0391 SLC25A3 NM_213611
- RRM1
- 0,77 0,0218 RRM1 NM_001033
- E2F1
- 0,78 0,0180 E2F1 NM_005225
- SURV
- 0,79 0,0098 BIRC5 NM_001168
- PPM1D
- 0,80 0,0154 PPM1D NM_003620
- CCNE2
- 0,80 0,0090 CCNE2 NM_057749
- BRCA1
- 0,80 0,0093 BRCA1 NM_007295
- ST14
- 0,80 0,0436 ST14 NM_021978
- c-myb (MY6 oficial)
- 0,81 0,0027 MYB NM_005375
- Chk1
- 0,81 0,0220 CHEK1 NM_001274
- C20 orf1
- 0,81 0,0305 TPX2 NM_012112
- EI24
- 0,81 0,0574 EI24 NM_004879
- CDC20
- 0,82 0,0234 CDC20 NM_001255
- TCF-1
- 0,82 0,0061 TCF1 NM_000545
- PPID
- 0,83 0,0584 PPID NM_005038
- KIF22
- 0,83 0,0466 KIF22 NM_007317
- UBE2M
- 0,83 0,0850 UBE2M NM_003969
- MRPL40
- 0,83 0,0716 MRPL40 NM_003776
- RPLPO
- 0,84 0,0987 RPLP0 NM_001002
- LMNB1
- 0,84 0,0910 LMNB1 NM_005573
- DUT
- 0,84 0,0401 DUT NM_001948
- CD44E
- 0,84 0,0483 X55150
- MCM2
- 0,85 0,0214 MCM2 NM_004526
- CDC6
- 0,85 0,0235 CDC6 NM_001254
E07717900
11-08-2014
- AURKB
- 0,85 0,0373 AURKB NM_004217
- SMARCA3
- 0,86 0,0562 SMARCA3 NM_003071
- CDCA7 v2
- 0,86 0,0435 CDCA7 NM_145810
- EPHB2
- 0,86 0,0281 EPHB2 NM_004442
- CMYC
- 0,86 0,0441 MYC NM_002467
- ABCB1
- 0,86 0,0352 ABCB1 NM_000927
- Cdx2
- 0,87 0,0156 CDX2 NM_001265
- PPARG
- 0,88 0,0655 PPARG NM_005037
- MYBL2
- 0,88 0,0667 MYBL2 NM_002466
- EREG
- 0,89 0,0352 EREG NM_001432
- AREG
- 0,90 0,0221 AREG NM_001657
La tabla 3.2A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos >1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SLE como métrica para el desenlace clínico.
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- ANXA2
- 1,67 <0,0001 ANXA2 NM_004039
- CYP3A4
- 1,59 0,0035 CYP3A4 NM_017460
- RhoC
- 1,52 0,0010 RHOC NM_175744
- TJP1
- 1,44 0,0951 TJP1 NM_003257
- HB-EGF
- 1,39 0,0023 HBEGF NM_001945
- p21
- 1,39 0,0006 CDKN1A NM_000389
- HMLH
- 1,37 0,0678 MLH1 NM_000249
- ITGB1
- 1,37 0,0419 ITGB1 NM_002211
- UBC
- 1,34 0,0024 UBC NM_021009
- VEGFC
- 1,33 0,0246 VEGFC NM_005429
- TIMP1
- 1,33 0,0007 TIMP1 NM_003254
- CCNE2 variante 1
- 1,32 0,0745 CCNE2 NM_057749
- SPINT2
- 1,32 0,0224 SPINT2 NM_021102
- LAMC2
- 1,32 0,0002 LAMC2 NM_005562
- VCL
- 1,31 0,0119 VCL NM_003373
- RhoB
- 1,31 0,0049 RHOB NM_004040
- PKR2
- 1,30 0,0258 PKM2 NM_002654
- ANXA5
- 1,30 0,0406 ANXA5 NM_001154
- GADD45B
- 1,30 0,0001 GADD45B NM_015675
- INHBB
- 1,29 0,0368 INHBB NM_002193
- DUSP1
- 1,29 <0,0001 DUSP1 NM_004417
- KRAS2
- 1,28 0,0686 KRAS NM_004985
- KLF6
- 1,28 0,0284 KLF6 NM_001300
- IGFBP7
- 1,27 0,0103 IGFBP7 NM_001553
- GRIK1
- 1,27 0,0421 GRIK1 NM_000830
E07717900
11-08-2014 E07717900
- DLC1
- 1,27 0,0084 DLC1 NM_006094
- FOS
- 1,26 0,0003 FOS NM_005252
- HSPG2
- 1,26 0,0443 HSPG2 NM_005529
- INHBA
- 1,26 0,0009 INHBA NM_002192
- TIMP3
- 1,26 0,0045 TIMP3 NM_000362
- BGN
- 1,26 0,0035 BGN NM_001711
- CGB
- 1,26 0,0172 CGB NM_000737
- HK1
- 1,26 0,0352 HK1 NM_000188
- SHC1
- 1,25 0,0562 SHC1 NM_003029
- STC1
- 1,25 0,0161 STC1 NM_003155
- LOXL2
- 1,24 0,0078 LOXL2 NM_002318
- CAPG
- 1,24 0,0161 CAPG NM_001747
- UNC5B
- 1,23 0,0204 UNC5B NM_170744
- MVP
- 1,23 0,0729 MVP NM_017458
- CTSD
- 1,23 0,0256 CTSD NM_001909
- EGR1
- 1,23 0,0041 EGR1 NM_001964
- LOX
- 1,23 0,0017 LOX NM_002317
- CDC42BPA
- 1,23 0,0278 CDC42BPA NM_003607
- GAGE4
- 1,23 0,0425 GAGE4 NM_001474
- CALD1
- 1,22 0,0239 CALD1 NM_004342
- FXYD5
- 1,22 0,0096 FXYD5 NM_014164
- EphB6
- 1,22 0,0825 EPHB6 NM_004445
- LAMB3
- 1,22 0,0444 LAMB3 NM_000228
- VEGF
- 1,21 0,0267 VEGF NM_003376
- PDGFB
- 1,21 0,0062 PDGFB NM_002608
- TIMP2
- 1,21 0,0292 TIMP2 NM_003255
- A-Catenina
- 1,21 0,0598 CTNNA1 NM_001903
- IGFBP3
- 1,21 0,0081 IGFBP3 NM_000598
- CD68
- 1,21 0,0138 CD68 NM_001251
- S100A1
- 1,21 0,0886 S100A1 NM_006271
- SIAT4A
- 1,21 0,0076 ST3GAL1 NM_003033
- HSPA1B
- 1,21 0,0182 HSPA1B NM_005346
- DKK1
- 1,20 0,0900 DKK1 NM_012242
- SBA2
- 1,20 0,0733 WSB2 NM_018639
- SIR2
- 1,20 0,0250 SIRT1 NM_012238
- THBS1
- 1,20 0,0119 THBS1 NM_003246
- FYN
- 1,20 0,0156 FYN NM_002037
- TULP3
- 1,20 0,0205 TULP3 NM_003324
- LAMA3
- 1,20 0,0026 LAMA3 NM_000227
- NR4A1
- 1,20 0,0022 NR4A1 NM_002135
- EFNA1
- 1,20 0,0258 EFNA1 NM_004428
11-08-2014 E07717900
- EMP1
- 1,20 0,0102 EMP1 NM_001423
- SPARC
- 1,19 0,0333 SPARC NM_003118
- G-Catenina
- 1,19 0,0761 JUP NM_002230
- CYR61
- 1,19 0,0103 CYR61 NM_001554
- Maspina
- 1,19 0,0015 SERPINB5 NM_002639
- HSPA1A
- 1,18 0,0018 HSPA1A NM_005345
- PTHR1
- 1,18 0,0856 PTHR1 NM_000316
- EPAS1
- 1,18 0,0789 EPAS1 NM_001430
- Grb10
- 1,18 0,0173 GRB10 NM_005311
- ERK1
- 1,18 0,0464 Z11696
- VIM
- 1,18 0,0772 VIM NM_003380
- SNAI2
- 1,18 0,0379 SNAI2 NM_003068
- IGFBP5
- 1,17 0,0492 IGFBP5 NM_000599
- CTHRC1
- 1,17 0,0155 CTHRC1 NM_138455
- THY1
- 1,17 0,0562 THY1 NM_006288
- NRP1
- 1,17 0,0747 NRP1 NM_003873
- PTGER3
- 1,17 0,0493 PTGER3 NM_000957
- ID3
- 1,17 0,0437 ID3 NM_002167
- F3
- 1,17 0,0157 F3 NM_001993
- CTGF
- 1,17 0,0394 CTGF NM_001901
- KRT19
- 1,17 0,0517 KRT19 NM_002276
- PAI1
- 1,17 0,0033 SERPINE1 NM_000602
- FAP
- 1,17 0,0260 FAP NM_004460
- ANXA1
- 1,16 0,0688 ANXA1 NM_000700
- KLK10
- 1,16 0,0009 KLK10 NM_002776
- EFNB2
- 1,16 0,0447 EFNB2 NM_004093
- P14ARF
- 1,16 0,0573 S78535
- MCP1
- 1,16 0,0359 CCL2 NM_002982
- PLK3
- 1,16 0,0296 PLK3 NM_004073
- ANTXR1
- 1,16 0,0243 ANTXR1 NM_032208
- ADAMTS12
- 1,16 0,0346 ADAMTS12 NM_030955
- EGR3
- 1,16 0,0109 EGR3 NM_004430
- APC
- 1,16 0,0733 APC NM_000038
- PDGFC
- 1,16 0,0326 PDGFC NM_016205
- BMP4
- 1,16 0,0151 BMP4 NM_001202
- HOXB7
- 1,15 0,0281 HOXB7 NM_004502
- NDRG1
- 1,15 0,0912 NDRG1 NM_006096
- Herstatina
- 1,15 0,0380 AF177761
- TMEPAI
- 1,15 0,0268 TMEPAI NM_020182
- IL6
- 1,15 0,0914 IL6 NM_000600
- PDGFA
- 1,15 0,0599 NM_002607
11-08-2014
- TGFBI
- 1,15 0,0439 TGFBI NM_000358
- Upa
- 1,15 0,0740 PLAU NM_002658
- S100A4
- 1,15 0,0621 S100A4 NM_002961
- SLPI
- 1,15 0,0447 SLPI NM_003064
- KLK6
- 1,15 0,0112 KLK6 NM_002774
- COL1A1
- 1,15 0,0637 COL1A1 NM_000088
- GJB2
- 1,15 0,0604 GJB2 NM_004004
- PKD1
- 1,15 0,0939 PKD1 NM_000296
- TP53I3
- 1,15 0,0450 TP53I3 NM_004881
- PLAUR
- 1,14 0,0477 PLAUR NM_002659
- TAGLN
- 1,14 0,0739 TAGLN NM_003186
- COL1A2
- 1,14 0,0818 COL1A2 NM_000089
- S100A2
- 1,14 0,0045 S100A2 NM_005978
- AKT3
- 1,14 0,0949 AKT3 NM_005465
- SEMA3B
- 1,13 0,0467 SEMA3B NM_004636
- BRK
- 1,13 0,0476 PTK6 NM_005975
- OSM
- 1,13 0,0344 OSM NM_020530
- SFRP2
- 1,12 0,0279 SFRP2 NM_003013
- MRP3
- 1,12 0,0946 ABCC3 NM_003786
- EGLN33
- 1,12 0,0452 EGLN3 NM_022073
- SIAT7B
- 1,12 0,0603 ST6GALNAC2 NM_006456
- OPN, osteopontina
- 1,12 0,0082 SPP1 NM_000582
- S100P
- 1,12 0,0313 S100P NM_005980
- AKAP12
- 1,12 0,0865 AKAP12 NM_005100
- MMP7
- 1,11 0,0909 MMP7 NM_002423
- FABP4
- 1,11 0,0214 FABP4 NM_001442
- CRYAB
- 1,11 0,0960 CRYAB NM_001885
- SFRP4
- 1,10 0,0625 SFRP4 NM_003014
- EFNA3
- 1,10 0,0707 EFNA3 NM_004952
- GSTT1
- 1,09 0,0516 GSTT1 NM_000853
- pS2
- 1,08 0,0313 TFF1 NM_003225
- REG4
- 1,08 0,0080 REG4 NM_032044
- IGFBP2
- 1,08 0,0846 IGFBP2 NM_000597
- MUC5B
- 1,08 0,0387 MUC5B XM_039877
La tabla 3.2B muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando SLE como métrica para el desenlace clínico.
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- HSPA8
- 0,72 0,0604 HSPA8 NM_006597
- SLC25A3
- 0,73 0,0126 SLC25A3 NM_213611
E07717900
11-08-2014 E07717900
- E2F1
- 0,73 0,0019 E2F1 NM_005225
- IFIT1
- 0,74 0,0820 IFIT1 NM_001548
- PPM1D
- 0,74 0,0007 PPM1D NM_003620
- SKP2
- 0,75 0,0049 SKP2 NM_005983
- RRM1
- 0,78 0,0224 RRM1 NM_001033
- DDB1
- 0,79 0,0720 DDB1 NM_001923
- NPM1
- 0,79 0,0255 NPM1 NM_002520
- PRDX4
- 0,80 0,0570 PRDX4 NM_006406
- BRCA1
- 0,80 0,0064 BRCA1 NM_007295
- C20 orf1
- 0,81 0,0180 TPX2 NM_012112
- Chk1
- 0,81 0,0148 CHEK1 NM_001274
- EI24
- 0,81 0,0417 EI24 NM_004879
- CCNE2
- 0,81 0,0094 CCNE2 NM_057749
- HMGB1
- 0,82 0,0852 HMGB1 NM_002128
- SURV
- 0,82 0,0185 BIRC5 NM_001168
- KIF22
- 0,82 0,0264 KIF22 NM_007317
- RAD54L
- 0,82 0,0674 RAD54L NM_003579
- c-myb (MYB oficial)
- 0,82 0,0038 MYB NM_005375
- DHFR
- 0,82 0,0669 DHFR NM_000791
- TNFRSF5
- 0,83 0,0855 CD40 NM_001250
- LMNB1
- 0,83 0,0741 LMNB1 NM_005573
- CDC20
- 0,85 0,0538 CDC20 NM_001255
- CDCA7 v2
- 0,85 0,0277 CDCA7 NM_145810
- FASN
- 0,85 0,0919 FASN NM_004104
- MCM2
- 0,85 0,0194 MCM2 NM_004526
- ABCB1
- 0,85 0,0169 ABCB1 NM_000927
- EIF4E
- 0,85 0,0902 EIF4E NM_001968
- DUT
- 0,86 0,0535 DUT NM_001948
- C20ORF126
- 0,86 0,0932 PDRG1 NM_030815
- MCM6
- 0,86 0,0970 MCM6 NM_005915
- EFP
- 0,87 0,0850 TRIM25 NM_005082
- EPHB2
- 0,87 0,0314 EPHB2 NM_004442
- GCLC
- 0,87 0,0862 GCLC NM_001498
- RFC1
- 0,87 0,0540 RCC1 NM_001269
- AREG
- 0,87 0,0028 AREG NM_001657
- CMYC
- 0,88 0,0584 MYC NM_002467
- MYBL2
- 0,88 0,0567 MYBL2 NM_002466
- TCF-1
- 0,88 0,0644 TCF1 NM_000545
- EREG
- 0,89 0,0232 EREG NM_001432
- Cdx2
- 0,90 0,0354 CDX2 NM_001265
- PTPRO
- 0,92 0,0935 PTPRO NM_030667
11-08-2014
- cnpto (TDGF1 oficial)
- 0,92 0,0950 TDGF1 NM_003212
- HLA-DRB1
- 0,93 0,0521 HLA-DRB1 NM_002124
La tabla 4.2A muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos >1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando ILRD como métrica para el desenlace clínico.
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- ALDOA
- 3,21 0,0189 ALDOA NM_000034
- DCK
- 2,60 0,0248 DCK NM_000788
- ITGB1
- 2,58 0,0002 ITGB1 NM_002211
- COX2
- 2,16 0,0198 PTGS2 NM_000963
- TJP1
- 2,10 0,0122 TJP1 NM_003257
- STAT3
- 1,87 0,0148 STAT3 NM_003150
- ANXA5
- 1,83 0,0043 ANXA5 NM_B001154
- GHI BRAF mut4
- 1,82 0,0024 GHI_BRAF_mut4
- TIMP1
- 1,80 <0,0001 TIMP1 NM_003254
- hMLH
- 1,80 0,0242 MLH1 NM_000249
- PADI4
- 1,74 0,0288 PADI4 NM_012387
- rhoC
- 1,74 0,0093 RHOC NM_175744
- CYP3A4
- 173 0,0219 CYP3A4 NM_017460
- WWOX
- 1,72 0,0467 WWOX NM_016373
- ANXA2
- 1,70 0,0081 ANXA2 NM_004039
- LILRB3
- 1,70 0,0295 LILRB3 NM_006864
- VIM
- 1,66 0,0015 VIM NM_003380
- FUS
- 1,65 0,0432 FUS NM_004960
- KCNH2 Iso a/b
- 1,64 0,0111 KCNH2 NM_000238
- RhoB
- 1,63 0,0019 RHOB NM_004040
- CRIP2
- 1,62 0,0455 CRIP2 NM_001312
- AKT3
- 1,60 0,0004 AKT3 NM_005465
- RBX1
- 1,60 0,0195 RBX1 NM_014248
- HB-EGF
- 1,59 0,0032 HBEGF NM_001945
- NRP2
- 1,55 0,0007 NRP2 NM_003872
- MSH3
- 1,55 0,0353 MSH3 NM_002439
- PI3K
- 1,54 0,0651 PIK3C2B NM_002646
- BGN
- 1,54 0,0009 BGN NM_001711
- RAB6C
- 1,54 0,0210 RAB6C NM_032144
- CTSB
- 1,53 0,0415 CTSB NM_001908
- DLC1
- 1,53 0,0047 DLC1 NM_006094
- p21
- 1,53 0,0085 CDKN1A NM_000389
- CCNE2 variante 1
- 1,52 0,0647 CCNE2 NM_057749
- CALD1
- 1,51 0,0069 CALD1 NM_004342
E07717900
11-08-2014 E07717900
- SBA2
- 1,51 0,0202 WSB2 NM_018639
- SIR2
- 1,51 0,0028 SIRT1 NM_012238
- ITGA5
- 1,50 0,0006 ITGA5 NM_002205
- RAP1GDS1
- 1,50 0,0317 RAP1GDS1 NM_021159
- CTHRC1
- 1,46 0,0010 CTHRC1 NM_138455
- STC1
- 1,46 0,0083 STC1 NM_003155
- KLF6
- 1,46 0,0362 KLF6 NM_001300
- CDC42BPA
- 1,45 0,0187 CDC42BPA NM_003607
- CEBPB
- 1,45 0,0605 CEBPB NM_005194
- LAMC2
- 1,45 0,0031 LAMC2 NM_005562
- TGFBR1
- 1,45 0,0824 TGFBR1 NM_004612
- TLN1
- 1,45 0,0730 TLN1 NM_006289
- CDC42
- 1,44 0,0387 CDC42 NM_001791
- FYN
- 1,43 0,0070 FYN NM_002037
- IGFBP7
- 1,43 0,0283 IGFBP7 NM_001553
- ARG
- 1,43 0,0119 ABL2 NM_005158
- HIF1A
- 1,42 0,0397 HIF1A NM_001530
- FST
- 1,42 0,0460 FST NM_006350
- S100A1
- 1,42 0,0473 S100A1 NM_006271
- FAP
- 1,42 0,0023 FAP NM_004460
- DUSP1
- 1,42 0,0014 DUSP1 NM_004417
- EPAS1
- 1,41 0,0494 EPAS1 NM_001430
- Grb10
- 1,41 0,0027 GRB10 NM_005311
- VEGFC
- 1,41 0,0894 VEGFC NM_005429
- INHBB
- 1,41 0,0710 INHBB NM_002193
- GADD45B
- 1,40 0,0023 GADD45B NM_015675
- UBC
- 1,40 0,0368 UBC NM_021009
- GJA1
- 1,40 0,0053 GJA1 NM_000165
- COL1A2
- 1,40 0,0086 COL1A2 NM_000089
- RBM5
- 1,40 0,0423 RBM5 NM_005778
- ROCK1
- 1,39 0,0604 ROCK1 NM_005406
- CTGF
- 1,39 0,0081 CTGF NM_001901
- FLT4
- 1,39 0,0978 FLT4 NM_002020
- PDGFC
- 1,39 0,0052 PDGFC NM_016205
- INHBA
- 1,39 0,0058 INHBA NM_002192
- LOXL2
- 1,38 0,0209 LOXL2 NM_002318
- THBS1
- 1,37 0,0090 THBS1 NM_003246
- ITGAV
- 1,37 0,0298 ITGAV NM_002210
- NCAM1
- 1,36 0,0714 NCAM1 NM_000615
- PTHR1
- 1,35 0,0410 PTHR1 NM_000316
- TIMP2
- 1,35 0,0446 TIMP2 NM_003255
11-08-2014 E07717900
- LOX
- 1,35 0,0041 LOX NM_002317
- SPARC
- 1,35 0,0292 SPARC NM_003118
- TAGLN
- 1,34 0,0222 TAGLN NM_003186
- CYR61
- 1,34 0,0086 CYR61 NM_001554
- RANBP9
- 1,34 0,0553 RANBP9 NM_005493
- GADD45
- 1,34 0,0604 GADD45A NM_001924
- S100A4
- 1,34 0,0141 S100A4 NM_002961
- SNAI2
- 1,33 0,0263 SNAI2 NM_003068
- EGR1
- 1,33 0,0174 EGR1 NM_001964
- CDH11
- 1,33 0,0355 CDH11 NM_001797
- SI
- 1,33 0,0967 SI NM_001041
- PTK2
- 1,33 0,0911 PTK2 NM_005607
- MCP1
- 1,32 0,0215 CCL2 NM_002982
- PCAF
- 1,32 0,0463 PCAF NM_003884
- c-abl
- 1,32 0,0868 ABL1 NM_005157
- TIMP3
- 1,32 0,0455 TIMP3 NM_000362
- ANGPT2
- 1,31 0,0711 ANGPT2 NM_001147
- NOTCH2
- 1,30 0,0645 NOTCH2 NM_024408
- GBP2
- 1,30 0,0218 GBP2 NM_004120
- PAI1
- 1,30 0,0022 SERPINE1 NM_000602
- CXCR4
- 1,30 0,0341 CXCR4 NM_003467
- BCAS1
- 1,30 0,0060 BCAS1 NM_003657
- COL1A1
- 1,29 0,0349 COL1A1 NM_000088
- PIM1
- 1,29 0,0507 PIM1 NM_002648
- PDGFB
- 1,29 0,0288 PDGFB NM_002608
- Bcl2
- 1,29 0,0270 BCL2 NM_000633
- SLPI
- 1,29 0,0222 SLPI NM_003064
- IGFBP5
- 1,29 0,0676 IGFBP5 NM_000599
- ANXA1
- 1,29 0,0690 ANXA1 NM_000700
- FGFR1
- 1,28 0,0790 FGFR1 NM_023109
- CAPG
- 1,28 0,0987 CAPG NM_001747
- PRKCA
- 1,28 0,0548 PRKCA NM_002737
- EPHA2
- 1,28 0,0339 EPHA2 NM_004431
- AKAP12
- 1,28 0,0215 AKAP12 NM_005100
- FOS
- 1,28 0,0219 FOS NM_005252
- CXCL12
- 1,27 0,0169 CXCL12 NM_000609
- GCNT1
- 1,27 0,0875 GCNT1 NM_001490
- IGFBP3
- 1,27 0,0499 IGFBP3 NM_000598
- DPYD
- 1,27 0,0259 DPYD NM_000110
- CD68
- 1,27 0,0752 CD68 NM_001251
- EFNA1
- 1,27 0,0890 EFNA1 NM_004428
11-08-2014
- ABCC5
- 1,26 0,0536 ABCC5 NM_005688
- TUBB
- 1,26 0,0635 TUBB2 NM_001069
- PDGFA
- 1,26 0,0676 NM_002607
- DAPK1
- 1,26 0,0701 DAPK1 NM_004938
- SFRP2
- 1,25 0,0109 SFRP2 NM_003013
- ID3
- 1,25 0,0744 ID3 NM_002167
- CTSL
- 1,25 0,0679 CTSL NM_001912
- LAMA3
- 1,25 0,0299 LAMA3 NM_000227
- KRT19
- 1,25 0,0982 KRT19 NM_002276
- S100A8
- 1,25 0,0228 S100A8 NM_002964
- IL6
- 1,25 0,0933 IL6 NM_000600
- MRP3
- 1,25 0,0538 ABCC3 NM_003786
- FES
- 1,25 0,0694 FES NM_002005
- AP-1 (JUN oficial)
- 1,25 0,0974 JUN NM_002228
- WISP1
- 1,24 0,0897 WISP1 NM_003882
- SFRP4
- 1,24 0,0250 SFRP4 NM_003014
- TGFBI
- 1,24 0,0692 TGFBI NM_000358
- Maspina
- 1,24 0,0152 SERPINB5 NM_002639
- HOXB7
- 1,23 0,0541 HOXB7 NM_004502
- P14ARF
- 1,23 0,0944 S78535
- HSPA1A
- 1,23 0,0259 HSPA1A NM_005345
- EGR3
- 1,22 0,0312 EGR3 NM_004430
- CRYAB
- 1,22 0,0483 CRYAB NM_001885
- ALDH1A1
- 1,22 0,0372 ALDH1A1 NM_000689
- TGFB3
- 1,22 0,0673 TGFB3 NM_003239
- KLK6
- 1,21 0,0288 KLK6 NM_002774
- ANTXR1
- 1,21 0,0942 ANTXR1 NM_032208
- FZD6
- 1,20 0,0479 FZD6 NM_003506
- ILT-2
- 1,20 0,0930 LILRB1 NM_006669
- S100A2
- 1,20 0,0116 S100A2 NM_005978
- MMP7
- 1,18 0,0987 MMP7 NM_002423
- FABP4
- 1,17 0,0371 FABP4 NM_001442
- OPN, osteopontina
- 1,17 0,0301 SPP1 NM_000582
- KLK10
- 1,16 0,0581 KLK10 NM_002776
- pS2
- 1,15 0,0186 TFF1 NM_003225
- REG4
- 1,14 0,0053 REG4 NM_032044
- MUC2
- 1,09 0,0429 MUC2 NM_002457
La tabla 4.2B muestra asociaciones entre desenlace clínico y expresión génica para los genes que demostraron una razón de riesgos <1,0 y para los que p<0,1. Se aplicó análisis de regresión de riesgos proporcionales de Cox de una variable en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados usando ILRD como métrica para el desenlace clínico.
- Gen
- Razón de riesgos Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- HSPA8
- 0,48 0,0114 HSPA8 NM_006597
- RPS13
- 0,64 0,0082 RPS13 NM_001017
- NDUFS3
- 0,66 0,0096 NDUFS3 NM_004551
- ST14
- 0,66 0,0132 ST14 NM_021978
- LMNB1
- 0,66 0,0135 LMNB1 NM_005573
- TMSB4X
- 0,67 0,0039 TMSB4X NM_021109
- DHFR
- 0,68 0,0260 DHFR NM_000791
- BRCA1
- 0,68 0,0029 BRCA1 NM_007295
- SKP2
- 0,68 0,0151 SKP2 NM_005983
- SLC25A3
- 0,69 0,0265 SLC25A3 NM_213611
- CDC20
- 0,69 0,0048 CDC20 NM_001255
- RPLPO
- 0,70 0,0320 RPLPO NM_001002
- TCF-1
- 0,70 0,0013 TCF1 NM_000545
- RRM1
- 0,71 0,0598 RRM1 NM_001033
- ATP5A1
- 0,71 0,0827 ATP5A1 NM_004046
- NME1
- 0,73 0,0378 NM_E1 NM_000269
- CKS2
- 0,74 0,0537 CKS2 NM_001827
- EI24
- 0,74 0,0639 EI24 NM_004879
- C20 orf1
- 0,74 0,0435 TPX2 NM_012112
- SDC1
- 0,74 0,0930 SDC1 NM_002997
- CSEL1
- 0,75 0,0443 CSE1L NM_001316
- ABCC6
- 0,76 0,0416 ABCC6 NM_001171
- MCM2
- 0,76 0,0136 MCM2 NM_004526
- NFKBp65
- 0,77 0,0672 RELA NM_021975
- EPHB2
- 0,77 0,0133 EPHB2 NM_004442
- FASN
- 0,78 0,0980 FASN NM_004104
- AURKB
- 0,78 0,0528 AURKB NM_004217
- VDR
- 0,79 0,0832 VDR NM_000376
- UMPS
- 0,80 0,0721 UMPS NM_000373
- UBE2C
- 0,81 0,0860 UBE2C NM_007019
- CMYC
- 0,82 0,0742 MYC NM_002467
- MYBL2
- 0,83 0,0780 MYBL2 NM_002466
- Cdx2
- 0,84 0,0392 CDX2 NM_001265
- MX1
- 0,85 0,0786 MX1 NM_002462
- EREG
- 0,85 0,0638 EREG NM_001432
- AREG
- 0,85 0,0295 AREG NM_001657
La tabla 5.2A muestra asociaciones entre expresión génica e ILR, controlando características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis. Se enumeran todos los genes cuya expresión se correlaciona con ILR (p<0,1) y que demuestran una razón de riesgos >1 en un análisis de múltiples variantes que incluye las siguientes variables: ubicación del tumor, año de cirugía, grado del tumor, protocolo de tratamiento (C-01
o C-02), tratamiento con BCG (sí o no) y clasificación de pacientes según el estado de ganglios linfáticos tal como sigue: 0 ganglios positivos y <12 ganglios examinados, 0 ganglios positivos y ≥12 ganglios examinados, 1-3 ganglios
positivos y ≥4 ganglios positivos.
- Gen
- Razón de riesgos Chi cuadrado de LR GL Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- RARB
- 2,02 3,42 1 0,0644 RARB NM_016152
- COX2
- 1,69 3,13 1 0,0768 PTGS2 NM_000963
- RhoC
- 1,60 8,71 1 0,0032 RHOC NM_175744
- CYP3A4
- 1,57 5,15 1 0,0233 CYP3A4 NM_017460
- RhoB
- 1,54 12,40 1 0,0004 RHOB NM_004040
- ANXA2
- 1,54 7,01 1 0,0081 ANXA2 NM_004039
- ITGB1
- 1,54 5,54 1 0,0186 ITGB1 NM_002211
- NTN1
- 1,53 3,63 1 0,0568 NTN1 NM_004822
- KRAS2
- 1,51 4,83 1 0,0279 KRAS NM_004985
- IGFBP7
- 1,44 8,53 1 0,0035 IGFBP7 NM_001553
- TIMP1
- 1,43 9,03 1 0,0027 TIMP1 NM_003254
- WWOX
- 1,43 2,73 1 0,0988 WWOX NM_016373
- CYP1B1
- 1,39 3,69 1 0,0548 CYP1B1 NM_000104
- KCNH2 iso a/b
- 1,38 3,23 1 0,0723 KCNH2 NM_000238
- STC1
- 1,37 6,55 1 0,0105 STC1 NM_003155
- ITGAV
- 1,37 9,37 1 0,0022 ITGAV NM_002210
- VEGFC
- 1,37 3,62 1 0,0571 VEGFC NM_005429
- G-Catenina
- 1,36 4,78 1 0,0287 JUP NM_002230
- S100A1
- 1,34 4,12 1 0,0423 S100A1 NM_006271
- GADD45B
- 1,34 9,63 1 0,0019 GADD45B NM_015675
- NCAM1
- 1,33 3,00 1 0,0832 NCAM1 NM_000615
- CALD1
- 1,33 6,05 1 0,0139 CALD1 NM_004342
- FST
- 1,33 4,24 1 0,0396 FST NM_006350
- INHBA
- 1,33 9,68 1 0,0019 INHBA NM_002192
- BGN
- 1,33 7,27 1 0,0070 BGN NM_001711
- Claudina 4
- 1,33 7,13 1 0,0076 CLDN4 NM_001305
- CEBPB
- 1,33 2,96 1 0,0851 CEBPB NM_005194
- LAMC2
- 1,32 8,62 1 0,0033 LAMC2 NM_005562
- SPINT2
- 1,32 3,14 1 0,0762 SPINT2 NM_021102
- AKT3
- 1,32 7,54 1 0,0060 AKT3 NM_005465
- TIMP3
- 1,32 6,33 1 0,0119 TIMP3 NM_000362
- MAPK14
- 1,31 2,75 1 0,0972 MAPK14 NM_139012
- HB-EGF
- 1,31 4,74 1 0,0294 HBEGF NM_001945
- DUSP1
- 1,30 11,34 1 0,0008 DUSP1 NM_004417
- EFNA1
- 1,30 5,87 1 0,0154 EFNA1 NM_004428
- PTK2
- 1,29 3,60 1 0,0576 PTK2 NM_005607
- DLC1
- 1,29 5,19 1 0,0227 DLC1 NM_006094
- EPAS1
- 1,28 3,30 1 0,0693 EPAS1 NM_001430
- THBS1
- 1,28 7,51 1 0,0061 THBS1 NM_003246
- TIMP2
- 1,28 4,20 1 0,0404 TIMP2 NM_003255
- TGFBI
- 1,27 6,68 1 0,0098 TGFBI NM_000358
- DKK1
- 1,27 3,05 1 0,0806 DKK1 NM_012242
- SPARC
- 1,26 4,37 1 0,0366 SPARC NM_003118
- PDGFC
- 1,26 6,74 1 0,0094 PDGFC NM_016205
- RAB6C
- 1,26 3,27 1 0,0704 RAB6C NM_032144
- LOXL2
- 1,26 4,48 1 0,0343 LOXL2 NM_002318
- CD68
- 1,25 4,68 1 0,0305 CD68 NM_001251
- LOX
- 1,25 7,16 1 0,0075 LOX NM_002317
- CDC42BPA
- 1,25 3,35 1 0,0671 CDC42BPA NM_003607
- TAGLN
- 1,25 4,83 1 0,0279 TAGLN NM_003186
- CTHRC1
- 1,25 5,96 1 0,0146 CTHRC1 NM_138455
- PDGFA
- 1,25 4,63 1 0,0314 NM_002607
- TMEPAI
- 1,24 5,63 1 0,0176 TMEPAI NM_020182
- RAB32
- 1,24 4,48 1 0,0343 RAB32 NM_006834
- HSPA1A
- 1,24 8,19 1 0,0042 HSPA1A NM_005345
- VIM
- 1,24 2,97 1 0,0848 VIM NM_003380
- IGFBP5
- 1,23 3,69 1 0,0549 IGFBP5 NM_000599
- EGR1
- 1,23 5,12 1 0,0236 EGR1 NM_001964
- ANGPT2
- 1,23 2,96 1 0,0852 ANGPT2 NM_001147
- NDRG1
- 1,22 2,91 1 0,0879 NDRG1 NM_006096
- VEGF_altsplice1
- 1,22 4,08 1 0,0433 AF486837
- SLPI
- 1,22 4,94 1 0,0262 SLPI NM_003064
- FOS
- 1,22 5,67 1 0,0172 FOS NM_005252
- VEGF
- 1,22 2,80 1 0,0942 VEGF NM_003376
- ADAMTS12
- 1,22 4,40 1 0,0359 ADAMTS12 NM_030955
- Maspina
- 1,22 7,60 1 0,0058 SERPINB5 NM_002639
- CGB
- 1,22 3,25 1 0,0713 CGB NM_000737
- CYR61
- 1,21 5,22 1 0,0224 CYR61 NM_001554
- GJB2
- 1,21 3,77 1 0,0522 GJB2 NM_004004
- IGFBP3
- 1,21 4,24 1 0,0396 IGFBP3 NM_000598
- PRKCA
- 1,21 3,81 1 0,0508 PRKCA NM_002737
- S100P
- 1,21 6,98 1 0,0082 S100P NM_005980
- NRP2
- 1,21 3,25 1 0,0714 NRP2 NM_003872
- EFNB2
- 1,21 3,00 1 0,0834 EFNB2 NM_004093
- COL1A2
- 1,21 3,59 1 0,0581 COL1A2 NM_000089
- VEGFB
- 1,20 2,80 1 0,0942 VEGFB NM_003377
- HOXB7
- 1,20 4,37 1 0,0367 HOXB7 NM_004502
- Grb10
- 1,20 3,91 1 0,0480 GRB10 NM_005311
- FAP
- 1,20 4,12 1 0,0425 FAP NM_004460
- GJA1
- 1,20 4,80 1 0,0285 GJA1 NM_000165
- CTGF
- 1,19 3,38 1 0,0660 CTGF NM_001901
- NR4A1
- 1,18 5,13 1 0,0235 NR4A1 NM_002135
- COL1A1
- 1,18 2,77 1 0,0961 COL1A1 NM_000088
- ABCC5
- 1,17 2,80 1 0,0945 ABCC5 NM_005688
- EMP1
- 1,17 3,06 1 0,0804 EMP1 NM_001423
- SFRP2
- 1,17 4,89 1 0,0270 SFRP2 NM_003013
- SLC2A1
- 1,17 3,52 1 0,0606 SLC2A1 NM_006516
- F3
- 1,17 3,10 1 0,0783 F3 NM_001993
- S100A4
- 1,17 2,87 1 0,0900 S100A4 NM_002961
- BRK
- 1,17 2,81 1 0,0935 PTK6 NM_005975
- CRYAB
- 1,17 3,77 1 0,0523 CRYAB NM_001885
- MDK
- 1,16 3,84 1 0,0500 MDK NM_002391
- OPN, osteopontina
- 1,16 6,07 1 0,0138 SPP1 NM_000582
- SFRP4
- 1,16 4,09 1 0,0432 SFRP4 NM_003014
- SIAT4A
- 1,16 2,76 1 0,0969 ST3GAL1 NM_003033
- LAMA3
- 1,16 3,23 1 0,0725 LAMA3 NM_000227
- AKAP12
- 1,15 2,74 1 0,0976 AKAP12 NM_005100
- KLK10
- 1,15 5,23 1 0,0221 KLK10 NM_002776
- EGR3
- 1,14 3,16 1 0,0755 EGR3 NM_004430
- PAI1
- 1,13 3,39 1 0,0655 SERPINE1 NM_000602
- CEACAM6
- 1,13 2,98 1 0,0845 CEACAM6 NM_002483
- KLK6
- 1,13 3,74 1 0,0532 KLK6 NM_002774
- Nkd-1
- 1,11 3,34 1 0,0674 NKD1 NM_033119
- IGFBP2
- 1,11 3,15 1 0,0758 IGFBP2 NM_000597
- REG4
- 1,08 3,51 1 0,0610 REG4 NM_032044
La tabla 5.2B muestra asociaciones entre expresión génica e ILR, controlando características demográficas y clínicas particulares de pacientes incluidos en el análisis. Se enumeran todos los genes cuya expresión se correlaciona con ILR (p<0,1) y que demuestran una razón de riesgos <1 en un análisis de múltiples variantes que incluye las siguientes variables: ubicación del tumor, año de cirugía, grado del tumor, protocolo de tratamiento (C-01
o C-02), tratamiento con BCG (sí o no) y clasificación de pacientes según el estado de ganglios linfáticos tal como sigue: 0 ganglios positivos y <12 ganglios examinados, 0 ganglios positivos y ≥12 ganglios examinados, 1-3 ganglios positivos y ≥4 ganglios positivos.
- Gen
- Razón de riesgos Chi cuadrado de LR GL Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- Fasl
- 0,43 5,57 1 0,0183 FASLG NM_000639
- BFGF
- 0,57 4,68 1 0,0306 NUDT6 NM_007083
- EstR1
- 0,57 3,22 1 0,0726 ESR1 NM_000125
- IFIT1
- 0,60 4,30 1 0,0381 IFIT1 NM_001548
- KLRK1
- 0,64 10,81 1 0,0010 KLRK1 NM_007360
- E2F1
- 0,65 7,49 1 0,0062 E2F1 NM_005225
- BRCA1
- 0,66 16,33 1 <0,0001 BRCA1 NM_007295
- RAD54L
- 0,67 6,36 1 0,0117 RAD54L NM_003579
- ATP5A1
- 0,67 5,50 1 0,0190 ATP5A1 NM_004046
- MCM3
- 0,68 2,84 1 0,0922 MCM3 NM_002388
- DHFR
- 0,68 7,44 1 0,0064 DHFR NM_000791
- HSPA8
- 0,68 2,96 1 0,0855 HSPA8 NM_006597
- APG-1
- 0,71 5,86 1 0,0155 HSPA4L NM_014278
- BRCA2
- 0,71 4,69 1 0,0304 BRCA2 NM_000059
- TRAIL
- 0,71 7,27 1 0,0070 TNFSF10 NM_003810
- SLC25A3
- 0,71 5,56 1 0,0184 SLC25A3 NM_213611
- PPM1D
- 0,72 8,02 1 0,0046 PPM1D NM_003620
- Chk1
- 0,73 6,61 1 0,0102 CHEK1 NM_001274
- CD80
- 0,73 6,85 1 0,0089 CD80 NM_005191
- MADH2
- 0,73 3,93 1 0,0476 SMAD2 NM_005901
- KIF22
- 0,75 5,77 1 0,0163 KIF22 NM_007317
- TNFRSF5
- 0,76 3,52 1 0,0607 CD40 NM_001250
- C20 orf1
- 0,76 4,82 1 0,0281 TPX2 NM_012112
- ENO1
- 0,76 2,88 1 0,0894 ENO1 NM_001428
- PRKCB1
- 0,77 4,25 1 0,0393 PRKCB1 NM_002738
- RAF1
- 0,77 4,17 1 0,0412 RAF1 NM_002880
- RRM1
- 0,78 3,07 1 0,0799 RRM1 NM_001033
- UBE2M
- 0,78 4,43 1 0,0352 UBE2M NM_003969
- SKP2
- 0,79 3,42 1 0,0644 SKP2 NM_005983
- DUT
- 0,79 4,38 1 0,0364 DUT NM_001948
- EI24
- 0,80 2,85 1 0,0912 EI24 NM_004879
- UMPS
- 0,80 4,96 1 0,0260 UMPS NM_000373
- EFP
- 0,81 3,83 1 0,0502 TRIM25 NM_005082
- HRAS
- 0,81 3,80 1 0,0513 HRAS NM_005343
- CDC20
- 0,81 3,78 1 0,0519 CDC20 NM_001255
- CSF1
- 0,82 2,86 1 0,0910 CSF1 NM_000757
- CKS2
- 0,82 2,90 1 0,0886 CKS2 NM_001827
- ABCB1
- 0,82 4,02 1 0,0450 ABCB1 NM_000927
- CDC6
- 0,83 4,23 1 0,0397 CDC6 NM_001254
- GBP1
- 0,83 4,34 1 0,0373 GBP1 NM_002053
- SURV
- 0,83 2,91 1 0,0878 BIRC5 NM_001168
- CCNE2
- 0,83 2,75 1 0,0975 CCNE2 NM_057749
- RRM2
- 0,83 4,19 1 0,0407 RRM2 NM_001034
- CMYC
- 0,84 3,34 1 0,0677 MYC NM_002467
- TCF-1
- 0,84 3,96 1 0,0466 TCF1 NM_000545
- c-myb (MYB oficial)
- 0,84 3,72 1 0,0538 MYB NM_005375
- NOTCH1
- 0,85 3,39 1 0,0658 NOTCH1 NM_017617
- MCM2
- 0,85 3,30 1 0,0693 MCM2 NM_004526
- ING5
- 0,85 2,84 1 0,0922 ING5 NM_032329
- AREG
- 0,88 3,72 1 0,0538 AREG NM_001657
- HLA-DRB1
- 0,90 3,84 1 0,0500 HLA-DRB1 NM_002124
La tabla 6.2 muestra asociaciones entre expresión génica y desenlace clínico basándose en un análisis de riesgos proporcionales no lineal, usando una curva de tipo spline natural de 2 grados de libertad. Se enumeran todos los genes que demostraron una desviación de una relación estrictamente lineal (p<0,05) con ILR en pacientes en estadio II (Duke B) y estado III (Duke C) combinados. La relación entre expresión génica e ILR no era constante a lo largo de todo el intervalo observado de valores de expresión en el estudio, por ejemplo aumentos en la expresión génica pueden haber estado relacionados con aumentos en la duración de ILR en una parte del intervalo observado y con disminuciones en la duración de ILR en una parte diferente del intervalo.
- Gen
- Valor de p Símbolo oficial Número de registro
- PTHLH
- <0,0001 PTHLH NM_002820
- TGFBR1
- 0,0011 TGFBR1 NM_004612
- CDCA7 v2
- 0,0020 CDCA7 NM_145810
- S100A4
- 0,0034 S100A4 NM_002961
- CREBBP
- 0,0040 CREBBP NM_004380
- Upa
- 0,0040 PLAU NM_002658
- KLF5
- 0,0048 KLF5 NM_001730
- CYP2C8
- 0,0070 CYP2C8 NM_000770
- HES6
- 0,0090 HES6 NM_018645
- Cad17
- 0,0093 CDH17 NM_004063
- CEGP1
- 0,0100 SCUBE2 NM_020974
- GHI k-ras mut3
- 0,0100 GHI_k-ras_mut3
- AKT1
- 0,0104 AKT1 NM_005163
- LAMB3
- 0,0111 LAMB3 NM_000228
- CAPG
- 0,0120 CAPG NM_001747
- FUT6
- 0,0130 FUT6 NM_000150
- A-Catenina
- 0,0141 CTNNA1 NM_001903
- CAPN1
- 0,0167 CAPN1 NM_005186
- HSPE1
- 0,0180 HSPE1 NM_002157
- MADH4
- 0,0180 SMAD4 NM_005359
- STMY3
- 0,0190 MMP11 NM_005940
- TRAG3
- 0,0200 CSAG2 NM_004909
- GBP1
- 0,0200 GBP1 NM_002053
- EFNA1
- 0,0210 EFNA1 NM_004428
- SEMA3B
- 0,0210 SEMA3B NM_004636
- CLTC
- 0,0216 CLTC NM_004859
- BRK
- 0,0240 PTK6 NM_005975
- Fas
- 0,0240 FAS NM_000043
- CCNE2 variante 1
- 0,0243 CCNE2 NM_057749
- TMEPAI
- 0,0246 TMEPAI NM_020182
- PTPRJ
- 0,0260 PTPRJ NM_002843
- SKP2
- 0,0261 SKP2 NM_005983
- AGXT
- 0,0273 AGXT NM_000030
- MAP2
- 0,0320 MAP2 NM_031846
- PFN2
- 0,0330 PFN2 NM_053024
- ATP5E
- 0,0350 ATP5E NM_006886
- NRP1
- 0,0352 NRP1 NM_003873
- MYH11
- 0,0360 MYH11 NM_002474
- cIAP2
- 0,0369 BIRC3 NM_001165
- INHBA
- 0,0370 INHBA NM_002192
- EGLN1
- 0,0371 EGLN1 NM_022051
- GRIK1
- 0,0380 GRIK1 NM_000830
- KDR
- 0,0380 KDR NM_002253
- KLK6
- 0,0388 KLK6 NM_002774
- APOC1
- 0,0390 APOC1 NM_001645
- EP300
- 0,0390 EP300 NM_001429
- DET1
- 0,0390 DET1 NM_017996
- ITGB4
- 0,0394 ITGB4 NM_000213
- CD3z
- 0,0400 CD3Z NM_000734
- MAX
- 0,0400 MAX NM_002382
- PAI1
- 0,0407 SERPINE1 NM_000602
- MADH7
- 0,0430 SMAD7 NM_005904
- SIR2
- 0,0440 SIRT1 NM_012238
- NEDD8
- 0,0440 NEDD8 NM_006156
- EPHB2
- 0,0445 EPHB2 NM_004442
- BTF3
- 0,0460 BTF3 NM_001207
- CD34
- 0,0470 CD34 NM_001773
- VEGF_altsplice2
- 0,0480 AF214570
- Wnt-5b
- 0,0480 WNT5B NM_032642
- RXRA
- 0,0482 RXRA NM_002957
- tusc4
- 0,0486 TUSC4 NM_006545
La tabla 7.2 muestra todos los genes que presentan una interacción (valor de p < 0,1) con el estadio del tumor. Se modelaron los datos usando un modelo de riesgos proporcionales de ILR con expresión génica, estadio del tumor y su interacción como factores de predicción. Los pacientes que tenían 0 ganglios positivos pero <12 ganglios examinados se excluyeron de estos análisis.
- Gen
- RR de estadio II RR de estadio III Valor de p para la interacción Símbolo oficial Número de registro
- SOS1
- 3,35 0,81 0,0009 SOS1 NM_005633
- ALCAM
- 2,36 0,94 0,0020 ALCAM NM_001627
- pS2
- 1,58 1,04 0,0040 TFF1 NM_003225
- TGFB2
- 1,83 0,95 0,0064 TGFB2 NM_003238
- TFF3
- 1,57 0,90 0,0066 TFF3 NM_003226
- KLF6
- 0,35 1,34 0,0092 KLF6 NM_001300
- SNRPF
- 0,50 1,16 0,0106 SNRPF NM_003095
- CENPA
- 2,41 0,94 0,0106 CENPA NM_001809
- HES6
- 1,69 0,86 0,0119 HES6 NM_018645
- CLDN1
- 0,51 0,95 0,0124 CLDN1 NM_021101
- FGF2
- 0,19 0,97 0,0125 FGF2 NM_002008
- LEF
- 1,94 0,94 0,0141 LEF1 NM_016269
- MADH2
- 2,70 0,74 0,0145 SMAD2 NM_005901
- TP53BP1
- 2,31 0,91 0,0153 TP53BP1 NM_005657
- CCR7
- 1,89 0,98 0,0182 CCR7 NM_001838
- MRP3
- 2,26 1,08 0,0204 ABCC3 NM_003786
- UPP1
- 0,16 1,02 0,0208 UPP1 NM_003364
- PTEN
- 3,46 1,00 0,0216 PTEN NM_000314
- ST14
- 1,64 0,66 0,0223 ST14 NM_021978
- FYN
- 2,28 1,10 0,0241 FYN NM_002037
- CD24
- 1,33 0,84 0,0260 CD24 NM_013230
- LMYC
- 1,80 0,82 0,0275 RLF NM_012421
- CDC42BPA
- 2,82 1,12 0,0315 CDC42BPA NM_003607
- CAV1
- 2,11 0,95 0,0364 CAV1 NM_001753
- CHFR
- 1,81 0,99 0,0382 CHFR NM_018223
- MGAT5
- 1,59 0,72 0,0383 MGAT5 NM_002410
- FPGS
- 1,93 0,71 0,0402 FPGS NM_004957
- EMR3
- 2,63 0,57 0,0488 EMR3 NM_032571
- SIR2
- 2,17 1,07 0,0538 SIRT1 NM_012238
- PTK2B
- 1,44 0,93 0,0542 PTK2B NM_004103
- Axina 2
- 1,38 0,90 0,0549 AXIN2 NM_004655
- TRAG3
- 0,46 1,12 0,0570 CSAG2 NM_004909
- MMP7
- 0,78 1,28 0,0608 MMP7 NM_002423
- PFN2
- 1,33 0,84 0,0610 PFN2 NM_053024
- PTPRJ
- 2,05 1,00 0,0632 PTPRJ NM_002843
- CXCR4
- 1,96 1,08 0,0644 CXCR4 NM_003467
- CCNA2
- 1,55 0,79 0,0661 CCNA2 NM_001237
- MMP12
- 0,74 1,11 0,0685 MMP12 NM_002426
- KRT8
- 0,64 1,27 0,0694 KRT8 NM_002273
- ABCC5
- 2,06 1,14 0,0704 ABCC5 NM_005688
- PRDX6
- 2,09 0,74 0,0711 PRDX6 NM_004905
- WIF
- 1,54 0,77 0,0738 WIF1 NM_007191
- cdc25A
- 2,48 0,94 0,0769 CDC25A NM_001789
- KLF5
- 1,87 1,03 0,0772 KLF5 NM_001730
- LRP5
- 1,92 0,98 0,0783 LRP5 NM_002335
- PTPD1
- 0,54 1,00 0,0789 PTPN21 NM_007039
- RALBP1
- 2,20 0,91 0,0791 RALBP1 NM_006788
- TP53BP2
- 1,82 1,05 0,0819 TP53BP2 NM_005426
- STAT5B
- 1,57 0,86 0,0822 STAT5B NM_012448
- PPARG
- 1,32 0,79 0,0844 PPARG NM_005037
- HB-EGF
- 0,50 1,38 0,0845 HBEGF NM_001945
- RARA
- 1,77 0,96 0,0848 RARA NM_000964
- GCNT1
- 1,86 1,07 0,0883 GCNT1 NM_001490
- Ki-67
- 1,53 0,86 0,0885 MKI67 NM_002417
- EFNB2
- 1,76 1,05 0,0895 EFNB2 NM_004093
- LGMN
- 0,59 1,37 0,0900 LGMN NM_001008530
- DKK1
- 0,68 1,51 0,0922 DKK1 NK_012242
- MADH4
- 2,04 0,98 0,0964 SMAD4 NM_005359
- BIK
- 1,53 0,94 0,0966 BIK NM_001197
- CD44v3
- 1,58 0,97 0,0996 AJ251595v3
Tabla A
- Gen
- Registro Reactivo Secuencia Número ID de secuencia
- A-Catenina
- NM_001903.1 Cebador directo CGTTCCGATCCTCTATACTGCAT SEQ ID NO:1
- Sonda
- ATGCCTACAGCACCCTGATGTCGCA SEQ ID NO:2
- Cebador inverso
- AGGTCCCTGTTGGCCTTATAGG SEQ ID NO:3
- ABCB1
- NM_000927.2 Cebador directo AAACACCACTGGAGCATTGA SEQ ID NO:4
- Sonda
- CTCGCCAATGATGCTGCTCAAGTT SEQ ID NO:5
- Cebador inverso
- CAAGCCTGGAACCTATAGCC SEQ ID NO:6
- ABCC5
- NM_005688.1 Cebador directo TGCAGACTGTACCATGCTGA SEQ ID NO:7
- Sonda
- CTGCACACGGTTCTAGGCTCCG SEQ ID NO:8
- Cebador inverso
- GGCCAGCACCATAATCCTAT SEQ ID NO:9
- ABCC6
- NM_001171.2 Cebador directo GGATGAACCTCGACCTGC SEQ ID NO:10
- Sonda
- CCAGATAGCCTCGTCCGAGTGCTC SEQ ID NO:11
- Cebador inverso
- GAGCTGCACCGTCTCCAG SEQ ID NO:12
- ACP1
- NM_004300.2 Cebador directo GCTACCAAGTCCGTGCTGT SEQ ID NO:13
- Sonda
- TGATCGACAAATGTTACCCAGACACACA SEQ ID NO:14
- Cebador inverso
- GAAAACTGCTTCTGCAATGG SEQ ID NO:15
- ADAM10
- NM_001110.1 Cebador directo CCCATCAACTTGTGCCAGTA SEQ ID NO:16
- Sonda
- TGCCTACTCCACTGCACAGACCCT SEQ ID NO:17
- Cebador inverso
- GGTGATGGTTCGACCACTG SEQ ID NO:18
- ADAM17
- NM_003183.3 Cebador directo GAAGTGCCAGGAGGCGATTA SEQ ID NO:19
- Sonda
- TGCTACTTGCAAAGGCGTGTCCTACTGC SEQ ID NO:20
- Cebador inverso
- CGGGCACTCACTGCTATTACC SEQ ID NO:21
- ADAMTS12
- NM_030955.2 Cebador directo GGAGAAGGGTGGAGTGCAG SEQ ID NO:22
- Sonda
- CGCACAGTCAGAATCCATCTGGGT SEQ ID NO:23
- Cebador inverso
- CAGGGTCAGGTCTCTGGATG SEQ ID NO:24
- ADPRT
- NM_001618.2 Cebador directo TTGACAACCTGCTGGACATC SEQ ID NO:25
- Sonda
- CCCTGAGCAGACTGTAGGCCACCT SEQ ID NO:26
- Cebador inverso
- ATGGGATCCTTGCTGCTATC SEQ ID NO:27
- AGXT
- NM_000030.1 Cebador directo CTTTTCCCTCCAGTGGCA SEQ ID NO:28
- Sonda
- CTCCTGGAAACAGTCCACTTGGGC SEQ ID NO:29
- Cebador inverso
- ATTTGGAAGGCACTGGGTTT SEQ ID NO:30
- AKAP12
- NM_005100.2 Cebador directo TAGAGAGCCCCTGACAATCC SEQ ID NO:31
- Sonda
- TGGCTCTAGCTCCTGATGAAGCCTC SEQ ID NO:32
- Cebador inverso
- GGTTGGTCTTGGAAAGAGGA SEQ ID NO:33
- AKT1
- NM_005163.1 Cebador directo CGCTTCTATGGCGGTGAGAT SEQ ID NO:34
- Sonda
- CAGCCCTGGACTACCTGCACTCGG SEQ ID NO:35
- Cebador inverso
- TCCCGGTACACCACGTTCTT SEQ ID NO:36
- AKT2
- NM_001626.2 Cebador directo TCCTGCCACCCTTCAAACC SEQ ID NO:37
- Sonda
- CAGGTCACGTCCGAGGTCGACACA SEQ ID NO:38
- Cebador inverso
- GGCGGTAAATTCATCATCGAA SEQ ID NO:39
- AKT3
- NM_005465.1 Cebador directo TTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACA SEQ ID NO:40
- Sonda
- TCACGGTACACAATCTTTCCGGA SEQ ID NO:41
- Cebador inverso
- CCAGCATTAGATTCTCCAACTTGA SEQ ID NO:42
- AL137428
- AL137428.1 Cebador directo CAAGAAGAGGCTCTACCCTGG SEQ ID NO:43
- Sonda
- ACTGGGAATTTCCAAGGCCACCTT SEQ ID NO:44
- Cebador inverso
- AAATGAGCTCTGCGATCCTC SEQ ID NO:45
- ALCAM
- NM_001627.1 Cebador directo GAGGAATATGGAATCCAAGGG SEQ ID NO:46
- Sonda
- CCAGTTCCTGCCGTCTGCTCTTCT SEQ ID NO:47
- Cebador inverso
- GTGGCGGAGATCAAGAGG SEQ ID NO:48
- ALDH1A1
- NM_000689.1 Cebador directo GAAGGAGATAAGGAGGATGTTGACA SEQ ID NO:49
- Sonda
- AGTGAAGGCCGCAAGACAGGCTTTTC SEQ ID NO:50
- Cebador inverso
- CGCCACGGAGATCCAATC SEQ ID NO:51
- ALDOA
- NM_000034.2 Cebador directo GCCTGTACGTGCCAGCTC SEQ ID NO:52
- Sonda
- TGCCAGAGCCTCAACTGTCTCTGC SEQ ID NO:53
- Cebador inverso
- TCATCGGAGCTTGATCTCG SEQ ID NO:54
- AMFR
- NM_001144.2 Cebador directo GATGGTTCAGCTCTGCAAGGA SEQ ID NO:55
- Sonda
- CGATTTGAATATCTTTCCTTCTCGCCCACC SEQ ID NO:56
- Cebador inverso
- TCGACCGTGGCTGCTCAT SEQ ID NO:57
- ANGPT2
- NM_001147.1 Cebador directo CCGTGAAAGCTGCTCTGTAA SEQ ID NO:58
- Sonda
- AAGCTGACACAGCCCTCCCAAGTG SEQ ID NO:59
- Cebador inverso
- TTGCAGTGGGAAGAACAGTC SEQ ID NO:60
- ANTXR1
- NM_032208.1 Cebador directo CTCCAGGTGTACCTCCAACC SEQ ID NO:61
- Sonda
- AGCCTTCTCCCACAGCTGCCTACA SEQ ID NO:62
- Cebador inverso
- GAGAAGGCTGGGAGACTCTG SEQ ID NO:63
- ANXA1
- NM_000700.1 Cebador directo GCCCCTATCCTACCTTCAATCC SEQ ID NO:64
- Sonda
- TCCTCGGATGTCGCTGCCT SEQ ID NO:65
- Cebador inverso
- CCTTTAACCATTATGGCCTTATGC SEQ ID NO:66
- ANXA2
- NM_004039.1 Cebador directo CAAGACACTAAGGGCGACTACCA SEQ ID NO:67
- Sonda
- CCACCACACAGGTACAGCAGCGCT SEQ ID NO:68
- Cebador inverso
- CGTGTCGGGCTTCAGTCAT SEQ ID NO:69
- ANXA5
- NM_001154.2 Cebador directo GCTCAAGCCTGGAAGATGAC SEQ ID NO:70
- Sonda
- AGTACCCTGAAGTGTCCCCCACCA SEQ ID NO:71
- Cebador inverso
- AGAACCACCAACATCCGCT SEQ ID NO:72
- AP-1 (JUN oficial)
- NM_002228.2 Cebador directo GACTGCAAAGATGGAAACGA SEQ ID NO:73
- Sonda
- CTATGACGATGCCCTCAACGCCTC SEQ ID NO:74
- Cebador inverso
- TAGCCATAAGGTCCGCTCTC SEQ ID NO:75
- APC
- NM_000038.1 Cebador directo GGACAGCAGGAATGTGTTTC SEQ ID NO:76
- Sonda
- CATTGGCTCCCCGTGACCTGTA SEQ ID NO:77
- Cebador inverso
- ACCCACTCGATTTGTTTCTG SEQ ID NO:78
- APEX-1
- NM_001641.2 Cebador directo GATGAAGCCTTTCGCAAGTT SEQ ID NO:79
- Sonda
- CTTTCGGGAAGCCAGGCCCTT SEQ ID NO:80
- Cebador inverso
- AGGTCTCCACACAGCACAAG SEQ ID NO:81
- APG-1
- NM_014278.2 Cebador directo ACCCCGGCCTGTATATCAT SEQ ID NO:82
- Sonda
- CCAATGGCTCGAGTTCTTGATCCC SEQ ID NO:83
- Cebador inverso
- CTATCTGGCTCTTTGCTGCAT SEQ ID NO:84
- APN (ANPEP oficial)
- NM_001150.1 Cebador directo CCACCTTGGACCAAAGTAAAGC SEQ ID NO:85
- Sonda
- CTCCCCAACACGCTGAAACCCG SEQ ID NO:86
- Cebador inverso
- TCTCAGCGTCACCTGGTAGGA SEQ ID NO:87
- APOC1
- NM_001645.3 Cebador directo GGAAACACACTGGAGGACAAG SEQ ID NO:88
- Sonda
- TCATCAGCCGCATCAAACAGAGTG SEQ ID NO:89
- Cebador inverso
- CGCATCTTGGCAGAAAGTT SEQ ID NO:90
- AREG
- NM_001657.1 Cebador directo TGTGAGTGAAATGCCTTCTAGTAGTGA SEQ ID NO:91
- Sonda
- CCGTCCTCGGGAGCCGACTATGA SEQ ID NO:92
- Cebador inverso
- TTGTGGTTCGTTATCATACTCTTCTGA SEQ ID NO:93
- ARG
- NM_005158.2 Cebador directo CGCAGTGCAGCTGAGTATCTG SEQ ID NO:94
- Sonda
- TCGCACCAGGAAGCTGCCATTGA SEQ ID NO:95
- Cebador inverso
- TGCCCAGGGCTACTCTCACTT SEQ ID NO:96
- ARHF
- NM_019034.2 Cebador directo ACTGGCCCACTTAGTCCTCA SEQ ID NO:97
- Sonda
- CTCCCAACCTGCTGTCCCTCAAG SEQ ID NO:98
- Cebador inverso
- CTGAACTCCACAGGCTGGTA SEQ ID NO:99
- ATOH1
- NM_005172.1 Cebador directo GCAGCCACCTGCAACTTT SEQ ID NO:100
- Sonda
- CAGGCGAGAGAGCATCCCGTCTAC SEQ ID NO:101
- Cebador inverso
- TCCAGGAGGGACAGCTCA SEQ ID NO:102
- ATP5A1
- NM_004046.3 Cebador directo GATGCTGCCACTCAACAACT SEQ ID NO:103
- Sonda
- AGTTAGACGCACGCCACGACTCAA SEQ ID NO:104
- Cebador inverso
- TGTCCTTGCTTCAGCAACTC SEQ ID NO:105
- ATP5E
- NM_006886.2 Cebador directo CCGCTTTCGCTACAGCAT SEQ ID NO:106
- Sonda
- TCCAGCCTGTCTCCAGTAGGCCAC SEQ ID NO:107
- Cebador inverso
- TGGGAGTATCGGATGTAGCTG SEQ ID NO:108
- AURKB
- NM_004217.1 Cebador directo AGCTGCAGAAGAGCTGCACAT SEQ ID NO:109
- Sonda
- TGACGAGCAGCGAACAGCCACG SEQ ID NO:110
- Cebador inverso
- GCATCTGCCAACTCCTCCAT SEQ ID NO:111
- Axina 2
- NM_004655.2 Cebador directo GGCTATGTCTTTGCACCAGC SEQ ID NO:112
- Sonda
- ACCAGCGCCAACGACAGTGAGATA SEQ ID NO:113
- Cebador inverso
- ATCCGTCAGCGCATCACT SEQ ID NO:114
- axina 1
- NM_003502.2 Cebador directo CCGTGTGACAGCATCGTT SEQ ID NO:115
- Sonda
- CGTACTACTTCTGCGGGGAACCCA SEQ ID NO:116
- Cebador inverso
- CTCACCAGGGTGCGGTAG SEQ ID NO:117
- B-Catenina
- NM_001904.1 Cebador directo GGCTCTTGTGCGTACTGTCCTT SEQ ID NO:118
- Sonda
- AGGCTCAGTGATGTCTTCCCTGTCACCAG SEQ ID NO:119
- Cebador inverso
- TCAGATGACGAAGAGCACAGATG SEQ ID NO:120
- BAD
- NM_032989.1 Cebador directo GGGTCAGGTGCCTCGAGAT SEQ ID NO:121
- Sonda
- TGGGCCCAGAGCATGTTCCAGATC SEQ ID NO:122
- Cebador inverso
- CTGCTCACTCGGCTCAAACTC SEQ ID NO:123
- BAG1
- NM_004323.2 Cebador directo CGTTGTCAGCACTTGGAATACAA SEQ ID NO:124
- Sonda
- CCCAATTAACATGACCCGGCAACCAT SEQ ID NO:125
- Cebador inverso
- GTTCAACCTCTTCCTGTGGACTGT SEQ ID NO:126
- BAG2
- NM_004282.2 Cebador directo CTAGGGGCAAAAAGCATGA SEQ ID NO:127
- Sonda
- TTCCATGCCAGACAGGAAAAAGCA SEQ ID NO:128
- Cebador inverso
- CTAAATGCCCAAGGTGACTG SEQ ID NO:129
- BAG3
- NM_004281.2 Cebador directo GAAAGTAAGCCAGGCCCAGTT SEQ ID NO:130
- Sonda
- CAGAACTCCCTCCTGGACACATCCCAA SEQ ID NO:131
- Cebador inverso
- ACCTCTTTGCGGATCACTTGA SEQ ID NO:132
- Bak
- NM_001188.1 Cebador directo CCATTCCCACCATTCTACCT SEQ ID NO:133
- Sonda
- ACACCCCAGACGTCCTGGCCT SEQ ID NO:134
- Cebador inverso
- GGGAACATAGACCCACCAAT SEQ ID NO:135
- Bax
- NM_004324.1 Cebador directo CCGCCGTGGACACAGACT SEQ ID NO:136
- Sonda
- TGCCACTCGGAAAAAGACCTCTCGG SEQ ID NO:137
- Cebador inverso
- TTGCCGTCAGAAAACATGTCA SEQ ID NO:138
- BBC3
- NM_014417.1 Cebador directo CCTGGAGGGTCCTGTACAAT SEQ ID NO:139
- Sonda
- CATCATGGGACTCCTGCCCTTACC SEQ ID NO:140
- Cebador inverso
- CTAATTGGGCTCCATCTCG SEQ ID NO.141
- BCAS1
- NM_003657.1 Cebador directo CCCCGAGACAACGGAGATAA SEQ ID NO:142
- Sonda
- CTTTCCGTTGGCATCCGCAACAG SEQ ID NO:143
- Cebador inverso
- CTCGGGTTTGGCCTCTTTC SEQ ID NO:144
- Bcl2
- NM_000633.1 Cebador directo CAGATGGACCTAGTACCCACTGAGA SEQ ID NO:145
- Sonda
- TTCCACGCCGAAGGACAGCGAT SEQ ID NO:146
- Cebador inverso
- CCTATGATTTAAGGGCATTTTTCC SEQ ID NO.147
- BCL2L10
- NM_020396.2 Cebador directo GCTGGGATGGCTTTTGTCA SEQ ID NO:148
- Sonda
- TCTTCAGGACCCCCTTTCCACTGGC SEQ ID NO:149
- Cebador inverso
- GCCTGGACCAGCTGTTTTCTC SEQ ID NO:150
- BCL2L11
- NM_138621.1 Cebador directo AATTACCAAGCAGCCGAAGA SEQ ID NO:151
- Sonda
- CCACCCACGAATGGTTATCTTACGACTG SEQ ID NO:152
- Cebador inverso
- CAGGCGGACAATGTAACGTA SEQ ID NO:153
- BCL2L12
- NM_138639.1 Cebador directo AACCCACCCCTGTCTTGG SEQ ID NO:154
- Sonda
- TCCGGGTAGCTCTCAAACTCGAGG SEQ ID NO:155
- Cebador inverso
- CTCAGCTGACGGGAAAGG SEQ ID NO:156
- Bclx
- NM_001191.1 Cebador directo CTTTTGTGGAACTCTATGGGAACA SEQ ID NO:157
- Sonda
- TTCGGCTCTCGGCTGCTGCA SEQ ID NO:158
- Cebador inverso
- CAGCGGTTGAAGCGTTCCT SEQ ID NO:159
- BCRP
- NM_004827.1 Cebador directo TGTACTGGCGAAGAATATTTGGTAAA SEQ ID NO:160
- Sonda
- CAGGGCATCGATCTCTCACCCTGG SEQ ID NO:161
- Cebador inverso
- GCCACGTGATTCTTCCACAA SEQ ID NO:162
- BFGF
- NM_007083.1 Cebador directo CCAGGAAGAATGCTTAAGATGTGA SEQ ID NO:163
- Sonda
- TTCGCCAGGTCATTGAGATCCATCCA SEQ ID NO:164
- Cebador inverso
- TGGTGATGGGAGTTGTATTTTCAG SEQ ID NO:165
- BGN
- NM_001711.3 Cebador directo GAGCTCCGCAAGGATGAC SEQ ID NO:166
- Sonda
- CAAGGGTCTCCAGCACCTCTACGC SEQ ID NO:167
- Cebador inverso
- CTTGTTGTTCACCAGGACGA SEQ ID NO:168
- BID
- NM_001196.2 Cebador directo GGACTGTGAGGTCAACAACG SEQ ID NO:169
- Sonda
- TGTGATGCACTCATCCCTGAGGCT SEQ ID NO:170
- Cebador inverso
- GGAAGCCAAACACCAGTAGG SEQ ID NO:171
- BIK
- NM_0011973 Cebador directo ATTCCTATGGCTCTGCAATTGTC SEQ ID NO:172
- Sonda
- CCGGTTAACTGTGGCCTGTGCCC SEQ ID NO:173
- Cebador inverso
- GGCAGGAGTGAATGGCTCTTC SEQ ID NO:174
- BIN1
- NM_004305.1 Cebador directo CCTGCAAAAGGGAACAAGAG SEQ ID NO:175
- Sonda
- CTTCGCCTCCAGATGGCTCCC SEQ ID NO:176
- Cebador inverso
- CGTGGTTGACTCTGATCTCG SEQ ID NO:177
- BLMH
- NM_000386.2 Cebador directo GGTTGCTGCCTCCATCAAAG SEQ ID NO:178
- Sonda
- ACATCACAGCCAAACCACACAGCCTCT SEQ ID NO:179
- Cebador inverso
- CCAGCTTGCTATTGAAGTGTTTTC SEQ ID NO:180
- BMP2
- NM_001200.1 Cebador directo ATGTGGACGCTCTTTCAATG SEQ ID NO:181
- Sonda
- ACCGCAGTCCGTCTAAGAAGCACG SEQ ID NO:182
- Cebador inverso
- ACCATGGTCGACCTTTAGGA SEQ ID NO:183
- BMP4
- NM_001202.2 Cebador directo GGGCTAGCCATTGAGGTG SEQ ID NO:184
- Sonda
- CTCACCTCCATCAGACTCGGACCC SEQ ID NO:185
- Cebador inverso
- GCTAATCCTGACATGCTGGC SEQ ID NO:186
- BMP7
- NM_001719.1 Cebador directo TCGTGGAACATGACAAGGAATT SEQ ID NO:187
- Sonda
- TTCCACCCACGCTACCACCATCG SEQ ID NO:188
- Cebador inverso
- TGGAAAGATCAAACCGGAACTC SEQ ID NO:189
- BMPR1A
- NM_004329.2 Cebador directo TTGGTTCAGCGAACTATTGC SEQ ID NO:190
- Sonda
- CAAACAGATTCAGATGGTCCGGCA SEQ ID NO:191
- Cebador inverso
- TCTCCATATCGGCCTTTACC SEQ ID NO:192
- BRAF
- NM_004333.1 Cebador directo CCTTCCGACCAGCAGATGAA SEQ ID NO:193
- Sonda
- CAATTTGGGCAACGAGACCGATCCT SEQ ID NO:194
- Cebador inverso
- TTTATATGCACATTGGGAGCTGAT SEQ ID NO:195
- BRCA1
- NM_007295.1 Cebador directo TCAGGGGGCTAGAAATCTGT SEQ ID NO:196
- Sonda
- CTATGGGCCCTTCACCAACATGC SEQ ID NO:197
- Cebador inverso
- CCATTCCAGTTGATCTGTGG SEQ ID NO:198
- BRCA2
- NM_000059.1 Cebador directo AGTTCGTGCTTTGCAAGATG SEQ ID NO:199
- Sonda
- CATTCTTCACTGCTTCATAAAGCTCTGCA SEQ ID NO:200
- Cebador inverso
- AAGGTAAGCTGGGTCTGCTG SEQ ID NO:201
- BRK
- NM_005975.1 Cebador directo GTGCAGGAAAGGTTCACAAA SEQ ID NO:202
- Sonda
- AGTGTCTGCGTCCAATACACGCGT SEQ ID NO:203
- Cebador inverso
- GCACACACGATGGAGTAAGG SEQ ID NO:204
- BTF3
- NM_001207.2 Cebador directo CAGTGATCCACTTTAACAACCCTAAAG SEQ ID NO:205
- Sonda
- TCAGGCATCTCTGGCAGCGAACAC SEQ ID NO:206
- Cebador inverso
- AGCATGGCCTGTAATGGTGAA SEQ ID NO:207
- BTRC
- NM_033637.2 Cebador directo GTTGGGACACAGTTGGTCTG SEQ ID NO:208
- Sonda
- CAGTCGGCCCAGGACGGTCTACT SEQ ID NO:209
- Cebador inverso
- TGAAGCAGTCAGTTGTGCTG SEQ ID NO:210
- BUB1
- NM_004336.1 Cebador directo CCGAGGTTAATCCAGCACGTA SEQ ID NO:211
- Sonda
- TGCTGGGAGCCTACACTTGGCCC SEQ ID NO:212
- Cebador inverso
- AAGACATGGCGCTCTCAGTTC SEQ ID NO:213
- BUB1B
- NM_001211.3 Cebador directo TCAACAGAAGGCTGAACCACTAGA SEQ ID NO:214
- Sonda
- TACAGTCCCAGCACCGACAATTCC SEQ ID NO:215
- Cebador inverso
- CAACAGAGTTTGCCGAGACACT SEQ ID NO:216
- BUB3
- NM_004725.1 Cebador directo CTGAAGCAGATGGTTCATCATT SEQ ID NO:217
- Sonda
- CCTCGCTTTGTTTAACAGCCCAGG- SEQ ID NO:218
- Cebador inverso
- GCTGATTCCCAAGAGTCTAACC SEQ ID NO:219
- c-abl
- NM_005157.2 Cebador directo CCATCTCGCTGAGATACGAA SEQ ID NO:220
- Sonda
- GGGAGGGTGTACCATTACAGGATCAACA SEQ ID NO:221
- Cebador inverso
- AGACGTAGAGCTTGCCATCA SEQ ID NO:222
- c-kit
- NM_000222.1 Cebador directo GAGGCAACTGCTTATGGCTTAATTA SEQ ID NO:223
- Sonda
- TTACAGCGACAGTCATGGCCGCAT SEQ ID NO:224
- Cebador inverso
- GGCACTCGGCTTGAGCAT SEQ ID NO:225
- c-myb (MYB oficial)
- NM_005375.1 Cebador directo AACTCAGACTTGGAAATGCCTTCT SEQ ID NO:226
- Sonda
- AACTTCCACCCCCCTCATTGGTCACA SEQ ID NO:227
- Cebador inverso
- CTGGTCTCTATGAAATGGTGTTGTAAC SEQ ID NO:228
- c-Src
- NM_005417.3 Cebador directo TGAGGAGTGGTATTTTGGCAAGA SEQ ID NO:229
- Sonda
- AACCGCTCTGACTCCCGTCTGGTG SEQ ID NO:230
- Cebador inverso
- CTCTCGGGTTCTCTGCATTGA SEQ ID NO:231
- C20 orf1
- NM_012112.2 Cebador directo TCAGCTGTGAGCTGCGGATA SEQ ID NO:232
- Sonda
- CAGGTCCCATTGCCGGGCG SEQ ID NO:233
- Cebador inverso
- ACGGTCCTAGGTTTGAGGTTAAGA SEQ ID NO:234
- C20ORF126
- NM_030815.2 Cebador directo CCAGCACTGCTCGTTACTGT SEQ ID NO:235
- Sonda
- TGGGACCTCAGACCACTGAAGGC SEQ ID NO:236
- Cebador inverso
- TTGACTTCACGGCAGTTCATA SEQ ID NO:237
- C8orf4
- NM_020130.2 Cebador directo CTACGAGTCAGCCCATCCAT SEQ ID NO:238
- Sonda
- CATGGCTACCACTTCGACACAGCC SEQ ID NO:239
- Cebador inverso
- TGCCCACGGCTTTCTTAC SEQ ID NO:240
- CA9
- NM_001216.1 Cebador directo ATCCTAGCCCTGGTTTTTGG SEQ ID NO:241
- Sonda
- TTTGCTGTCACCAGCGTCGC SEQ ID NO:242
- Cebador inverso
- CTGCCTTCTCATCTGCACAA SEQ ID NO:243
- Cad17
- NM_004063.2 Cebador directo GAAGGCCAAGAACCGAGTCA SEQ ID NO:244
- Sonda
- TTATATTCCAGTTTAAGGCCAATCCTC SEQ ID NO:245
- Cebador inverso
- TCCCCAGTTAGTTCAAAAGTCACA SEQ ID NO:246
- CALD1
- NM_004342.4 Cebador directo CACTAAGGTTTGAGACAGTTCCAGAA SEQ ID NO:247
- Sonda
- AACCCAAGCTCAAGACGCAGGACGAG SEQ ID NO:248
- Cebador inverso
- GCGAATTAGCCCTCTACAACTGA SEQ ID NO:249
- CAPG
- NM_001747.1 Cebador directo GATTGTCACTGATGGGGAGG SEQ ID NO:250
- Sonda
- AGGACCTGGATCATCTCAGCAGGC SEQ ID NO:251
- Cebador inverso
- CCTTCAGAGCAGGCTTGG SEQ ID NO:252
- CAPN1
- NM_005186.2 Cebador directo CAAGAAGCTGTACGAGCTCATCA SEQ ID NO:253
- Sonda
- CCGCTACTCGGAGCCCGACCTG SEQ ID NO:254
- Cebador inverso
- GCAGCAAACGAAATTGTCAAAG SEQ ID NO:255
- CASP8
- NM_033357.1 Cebador directo CCTCGGGGATACTGTCTGAT SEQ ID NO:256
- Sonda
- CAACAATCACAATTTTGCAAAAGCACG SEQ ID NO:257
- Cebador inverso
- GAAGTTTGGGCACTTTCTCC SEQ ID NO:258
- CASP9
- NM_001229.2 Cebador directo TGAATGCCGTGGATTGCA SEQ ID NO:259
- Sonda
- CACTAGCCCTGGACCAGCCACTGCT SEQ ID NO:260
- Cebador inverso
- ACAGGGATCATGGGACACAAG SEQ ID NO:261
- CAT
- NM_001752.1 Cebador directo ATCCATTCGATCTCACCAAGGT SEQ ID NO:262
- Sonda
- TGGCCTCACAAGGACTACCCTCTCATCC SEQ ID NO:263
- Cebador inverso
- TCCGGTTTAAGACCAGTTTACCA SEQ ID NO:264
- CAV1
- NM_001753.3 Cebador directo GTGGCTCAACATTGTGTTCC SEQ ID NO:265
- Sonda
- ATTTCAGCTGATCAGTGGGCCTCC SEQ ID NO:266
- Cebador inverso
- CAATGGCCTCCATTTTACAG SEQ ID NO:267
- CBL
- NM_005188.1 Cebador directo TCATTCACAAACCTGGCAGT SEQ ID NO:268
- Sonda
- TTCCGGCTGAGCTGTACTCGTCTG SEQ ID NO:269
- Cebador inverso
- CATACCCAATAGCCCACTGA SEQ ID NO:270
- CCL20
- NM_004591.1 Cebador directo CCATGTGCTGTACCAAGAGTTTG SEQ ID NO:271
- Sonda
- CAGCACTGACATCAAAGCAGCCAGGA SEQ ID NO:272
- Cebador inverso
- CGCCGCAGAGGTGGAGTA SEQ ID NO:273
- CCL3
- NM_002983.1 Cebador directo AGCAGACAGTGGTCAGTCCTT SEQ ID NO:274
- Sonda
- CTCTGCTGACACTCGAGCCCACAT SEQ ID NO:275
- Cebador inverso
- CTGCATGATTCTGAGCAGGT SEQ ID NO:276
- CCNA2
- NM_001237.2 Cebador directo CCATACCTCAAGTATTTGCCATCAG SEQ ID NO:277
- Sonda
- ATTGCTGGAGCTGCCTTTCATTTAGCACT SEQ ID NO:278
- Cebador inverso
- AGCTTTGTCCCGTGACTGTGTA SEQ ID NO:279
- CCNB1
- NM_031966.1 Cebador directo TTCAGGTTGTTGCAGGAGAC SEQ ID NO:280
- Sonda
- Sonda
- TGTCTCCATTATTGATCGGTTCATGCA SEQ ID NO:281
- Cebador inverso
- CATCTTCTTGGGCACACAAT SEQ ID NO:282
- CCNB2
- NM_004701.2 Cebador directo AGGCTTCTGCAGGAGACTCTGT SEQ ID NO:283
- Sonda
- TCGATCCATAATGCCAACGCACATG SEQ ID NO:284
- Cebador inverso
- GGGAAACTGGCTGAACCTGTAA SEQ ID NO:285
- CCND1
- NM_001758.1 Cebador directo GCATGTTCGTGGCCTCTAAGA SEQ ID NO:286
- Sonda
- AAGGAGACCATCCCCCTGACGGC SEQ ID NO:287
- Cebador inverso
- CGGTGTAGATGCACAGCTTCTC SEQ ID NO:288
- CCND3
- NM_001760.2 Cebador directo CCTCTGTGCTACAGATTATACCTTTGC SEQ ID NO:289
- Sonda
- TACCCGCCATCCATGATCGCCA SEQ ID NO:290
- Cebador inverso
- CACTGCAGCCCCAATGCT SEQ ID NO:291
- CCNE1
- NM_001238.1 Cebador directo AAAGAAGATGATGACCGGGTTTAC SEQ ID NO:292
- Sonda
- CAAACTCAACGTGCAAGCCTCGGA SEQ ID NO:293
- Cebador inverso
- GAGCCTCTGGATGGTGCAAT SEQ ID NO:294
- CCNE2
- NM_057749.1 Cebador directo GGTCACCAAGAAACATCAGTATGAA SEQ ID NO:295
- Sonda
- CCCAGATAATACAGGTGGCCAACAATTCCT SEQ ID NO:296
- Cebador inverso
- TTCAATGATAATGCAAGGACTGATC SEQ ID NO:297
- CCNE2 variante 1
- NM_057749var1 Cebador directo ATGCTGTGGCTCCTTCCTAACT SEQ ID NO:298
- Sonda
- TACCAAGCAACCTACATGTCAAGAAAGCCC SEQ ID NO:299
- Cebador inverso
- ACCCAAATTGTGATATACAAAAAGGTT SEQ ID NO:300
- CCR7
- NM_001838.2 Cebador directo GGATGACATGCACTCAGCTC SEQ ID NO:301
- Sonda
- CTCCCATCCCAGTGGAGCCAA SEQ ID NO:302
- Cebador inverso
- CCTGACATTTCCCTTGTCCT SEQ ID NO:303
- CD105
- NM_000118.1 Cebador directo GCAGGTGTCAGCAAGTATGATCAG SEQ ID NO:304
- Sonda
- CGACAGGATATTGACCACCGCCTCATT SEQ ID NO:305
- Cebador inverso
- TTTTTCCGCTGTGGTGATGA SEQ ID NO:306
- CP134 (TNFRSF4 oficial)
- NM_003327.1 Cebador directo GCCCAGTGCGGAGAACAG SEQ ID NO:307
- Sonda
- CCAGCTTGATTCTCGTCTCTGCACTTAAGC SEQ ID NO:308
- Cebador inverso
- AATCACACGCACCTGGAGAAC SEQ ID NO:309
- CD18
- NM_000211.1 Cebador directo CGTCAGGACCCACCATGTCT SEQ ID NO:310
- Sonda
- CGCGGCCGAGACATGGCTTG SEQ ID NO:311
- Cebador inverso
- GGTTAATTGGTGACATCCTCAAGA SEQ ID NO:312
- CD24
- NM_013230.1 Cebador directo TCCAACTAATGCCACCACCAA SEQ ID NO:313
- Sonda
- CTGTTGACTGCAGGGCACCACCA SEQ ID NO:314
- Cebador inverso
- GAGAGAGTGAGACCACGAAGAGACT SEQ ID NO.315
- CD28
- NM_006139.1 Cebador directo TGTGAAAGGGAAACACCTTTG SEQ ID NO:316
- Sonda
- CCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCT SEQ ID NO:317
- Cebador inverso
- AGCACCCAAAAGGGCTTAG SEQ ID NO:318
- CD31
- NM_000442.1 Cebador directo TGTATTTCAAGACCTCTGTGCACTT SEQ ID NO:319
- Sonda
- TTTATGAACCTGCCCTGCTCCCACA SEQ ID NO:320
- Cebador inverso
- TTAGCCTGAGGAATTGCTGTGTT SEQ ID NO:321
- CD34
- NM_001773.1 Cebador directo CCACTGCACACACCTCAGA SEQ ID NO:322
- Sonda
- CTGTTCTTGGGGCCCTACACCTTG SEQ ID NO:323
- Cebador inverso
- CAGGAGTTTACCTGCCCCT SEQ ID NO:324
- CD3z
- NM_000734.1 Cebador directo AGATGAAGTGGAAGGCGCTT SEQ ID NO:325
- Sonda
- Sonda
- CACCGCGGCCATCCTGCA SEQ ID NO:326
- Cebador inverso
- TGCCTCTGTAATCGGCAACTG SEQ ID NO:327
- CD44E
- X55150 Cebador directo ATCACCGACAGCACAGACA SEQ ID NO:328
- Sonda
- CCCTGCTACCAATATGGACTCCAGTCA SEQ ID NO:329
- Cebador inverso
- ACCTGTGTTTGGATTTGCAG SEQ ID NO:330
- CD44s
- M59040.1 Cebador directo GACGAAGACAGTCCCTGGAT SEQ ID NO:331
- Sonda
- CACCGACAGCACAGACAGAATCCC SEQ ID NO:332
- Cebador inverso
- ACTGGGGTGGAATGTGTCTT SEQ ID NO:333
- CD44v3
- AJ251595v3 Cebador directo CACACAAAACAGAACCAGGACT SEQ ID NO:334
- Sonda
- ACCCAGTGGAACCCAAGCCATTC SEQ ID NO:335
- Cebador inverso
- CTGAAGTAGCACTTCCGGATT SEQ ID NO:336
- CD44v6
- AJ251595v6 Cebador directo CTCATACCAGCCATCCAATG SEQ ID NO:337
- Sonda
- CACCAAGCCCAGAGGACAGTTCCT SEQ ID NO:338
- Cebador inverso
- TTGGGTTGAAGAAATCAGTCC SEQ ID NO:339
- CD68
- NM_001251.1 Cebador directo TGGTTCCCAGCCCTGTGT SEQ ID NO:340
- Sonda
- CTCCAAGCCCAGATTCAGATTCGAGTCA SEQ ID NO:341
- Cebador inverso
- CTCCTCCACCCTGGGTTGT SEQ ID NO:342
- CD80
- NM_005191.2 Cebador directo TTCAGTTGCTTTGCAGGAAG SEQ ID NO:343
- Sonda
- TTCTGTGCCCACCATATTCCTCTAGACA SEQ ID NO:344
- Cebador inverso
- TTGATCAAGGTCACCAGAGC SEQ ID NO:345
- CD82
- NM_002231.2 Cebador directo GTGCAGGCTCAGGTGAAGTG SEQ ID NO:346
- Sonda
- TCAGCTTCTACAACTGGACAGACAACGCTG SEQ ID NO:347
- Cebador inverso
- GACCTCAGGGCGATTCATGA SEQ ID NO:348
- CD8A
- NM_171827.1 Cebador directo AGGGTGAGGTGCTTGAGTCT SEQ ID NO:349
- Sonda
- CCAACGGCAAGGGAACAAGTACTTCT SEQ ID NO:350
- Cebador inverso
- GGGCACAGTATCCCAGGTA SEQ ID NO:351
- CD9
- NM_001769.1 Cebador directo GGGCGTGGAACAGTTTATCT SEQ ID NO:352
- Sonda
- AGACATCTGCCCCAAGAAGGACGT SEQ ID NO:353
- Cebador inverso
- CACGGTGAAGGTTTCGAGT SEQ ID NO:354
- CDC2
- NM_001786.2 Cebador directo GAGAGCGACGCGGTTGTT SEQ ID NO:355
- Sonda
- TAGCTGCCGCTGCGGCCG SEQ ID NO:356
- Cebador inverso
- GTATGGTAGATCCCGGCTTATTATTC SEQ ID NO:357
- CDC20
- NM_001255.1 Cebador directo TGGATTGGAGTTCTGGGAATG SEQ ID NO:358
- Sonda
- ACTGGCCGTGGCACTGGACAACA SEQ ID NO:359
- Cebador inverso
- GCTTGCACTCCACAGGTACACA SEQ ID NO:360
- cdc25A
- NM_001789.1 Cebador directo TCTTGCTGGCTACGCCTCTT SEQ ID NO:361
- Sonda
- TGTCCCTGTTAGACGTCCTCCGTCCATA SEQ ID NO:362
- Cebador inverso
- CTGCATTGTGGCACAGTTCTG SEQ ID NO:363
- CDC25B
- NM_021874.1 Cebador directo AAACGAGCAGTTTGCCATCAG SEQ ID NO:364
- Sonda
- CCTCACCGGCATAGACTGGAAGCG SEQ ID NO:365
- Cebador inverso
- GTTGGTGATGTTCCGAAGCA SEQ ID NO:366
- CDC25C
- NM_001790.2 Cebador directo GGTGAGCAGAAGTGGCCTAT SEQ ID NO.367
- Sonda
- CTCCCCGTCGATGCCAGAGAACT SEQ ID NO:368
- Cebador inverso
- CTTCAGTCTTGGCCTGTTCA SEQ ID NO:369
- CDC4
- NM_018315.2 Cebador directo GCAGTCCGCTGTGTTCAA SEQ ID NO:370
- Sonda
- TGCTCCACTAACAACCCTCCTGCC SEQ ID NO:371
- Cebador inverso
- GGATCCCACACCTTTACCATAA SEQ ID NO.372
- CDC42
- NM_001791.2 Cebador directo TCCAGAGACTGCTGAAAA SEQ ID NO:373
- Sonda
- CCCGTGACCTGAAGGCTGTCAAG SEQ ID NO:374
- Cebador inverso
- TGTGTAAGTGCAGAACAC SEQ ID NO:375
- CDC42BPA
- NM_003607.2 Cebador directo GAGCTGAAAGACGCACACTG SEQ ID NO:376
- Sonda
- AATTCCTGCATGGCCAGTTTCCTC SEQ ID NO:377
- Cebador inverso
- GCCGCTCATTGATCTCCA SEQ ID NO.378
- CDC6
- NM_001254.2 Cebador directo GCAACACTCCCCATTTACCTC SEQ ID NO:379
- Sonda
- TTGTTCTCCACCAAAGCAAGGCAA SEQ ID NO.380
- Cebador inverso
- TGAGGGGGACCATTCTCTTT SEQ ID NO.381
- CDCA7 v2
- NM_145810.1 Cebador directo AAGACCGTGGATGGCTACAT SEQ ID NO:382
- Sonda
- ATGAAGATGACCTGCCCAGAAGCC SEQ ID NO:383
- Cebador inverso
- AGGGTCACGGATGATCTGG SEQ ID NO:384
- CDH1
- NM_004360.2 Cebador directo TGAGTGTCCCCCGGTATCTTC SEQ ID NO:385
- Sonda
- TGCCAATCCCGATGAAATTGGAAATTT SEQ ID NO:386
- Cebador inverso
- CAGCCGCTTTCAGATTTTCAT SEQ ID NO:387
- CDH11
- NM_001797.2 Cebador directo GTCGGCAGAAGCAGGACT SEQ ID NO:388
- Sonda
- CCTTCTGCCCATAGTGATCAGCGA SEQ ID NO:389
- Cebador inverso
- CTACTCATGGGCGGGATG SEQ ID NO:390
- CDH3
- NM_001793.3 Cebador directo ACCCATGTACCGTCCTCG SEQ ID NO.391
- Sonda
- CCAACCCAGATGAAATCGGCAACT SEQ ID NO:392
- Cebador inverso
- CCGCCTTCAGGTTCTCAAT SEQ ID NO:393
- CDK2
- NM_B001798.2 Cebador directo AATGCTGCACTACGACCCTA SEQ ID NO:394
- Sonda
- CCTTGGCCGAAATCCGCTTGT SEQ ID NO:395
- Cebador inverso
- TTGGTCACATCCTGGAAGAA SEQ ID NO:396
- CDX1
- NM_001804.1 Cebador directo AGCAACACCAGCCTCCTG SEQ ID NO:397
- Sonda
- CACCTCCTCTCCAATGCCTGTGAA SEQ ID NO:398
- Cebador inverso
- GGGCTATGGCAGAAACTCCT SEQ ID NO:399
- Cdx2
- NM_001265.2 Cebador directo GGGCAGGCAAGGTTTACA SEQ ID NO:400
- Sonda
- ATCTTAGCTGCCTTTGGCTTCCGC SEQ ID NO:401
- Cebador inverso
- GTCTTTGGTCAGTCCAGCTTTC SEQ ID NO:402
- CEACAM1
- NM_001712.2 Cebador directo ACTTGCCTGTTCAGAGCACTCA SEQ ID NO:403
- Sonda
- TCCTTCCCACCCCCAGTCCTGTC SEQ ID NO:404
- Cebador inverso
- TGGCAAATCCGAATTAGAGTGA SEQ ID NO:405
- CEACAM6
- NM_002483 2 Cebador directo CACAGCCTCACTTCTAACCTTCTG SEQ ID NO:406
- Sonda
- ACCCACCCACCACTGCCAAGCTC SEQ ID NO:407
- Cebador inverso
- TTGAATGGCGTGGATTCAATAG SEQ ID NO:408
- CEBPB
- NM_005194.2 Cebador directo GCAACCCACGTGTAACTGTC SEQ ID NO:409
- Sonda
- CCGGGCCCTGAGTAATCGCTTAA SEQ ID NO:410
- Cebador inverso
- ACAAGCCCGTAGGAACATCT SEQ ID NO:411
- CEGP1
- NM_020974.1 Cebador directo TGACAATCAGCACACCTGCAT SEQ ID NO:412
- Sonda
- CAGGCCCTCTTCCGAGCGGT SEQ ID NO:413
- Cebador inverso
- TGTGACTACAGCCGTGATCCTTA SEQ ID NO:414
- CENPA
- NM_001809.2 Cebador directo TAAATTCACTCGTGGTGTGGA SEQ ID NO:415
- Sonda
- CTTCAATTGGCAAGCCCAGGC SEQ ID NO:416
- Cebador inverso
- GCCTCTTGTAGGGCCAATAG SEQ ID NO:417
- CENPE
- NM_001813.1 Cebador directo GGATGCTGGTGACCTCTTCT SEQ ID NO:418
- Sonda
- TCCCTCACGTTGCAACAGGAATTAA SEQ ID NO:419
- Cebador inverso
- GCCAAGGCACCAAGTAACTC SEQ ID NO:420
- CENPF
- NM_016343.2 Cebador directo CTCCCGTCAACAGCGTTC SEQ ID NO:421
- Sonda
- ACACTGGACCAGGAGTGCATCCAG SEQ ID NO:422
- Cebador inverso
- GGGTGAGTCTGGCCTTCA SEQ ID NO:423
- CES2
- NM_003869.4 Cebador directo ACTTTGCGAGAAATGGGAAC SEQ ID NO:424
- Sonda
- AGTGTGGCAGACCCTCGCCATT SEQ ID NO:425
- Cebador inverso
- CAGGTATTGCTCCTCCTGGT SEQ ID NO:426
- CGA (CHGA oficial)
- NM_001275.2 Cebador directo CTGAAGGAGCTCCAAGACCT SEQ ID NO:427
- Sonda
- TGCTGATGTGCCCTCTCCTTGG SEQ ID NO:428
- Cebador inverso
- CAAAACCGCTGTGTTTCTTC SEQ ID NO:429
- CGB
- NM_000737.2 Cebador directo CCACCATAGGCAGAGGCA SEQ ID NO:430
- Sonda
- ACACCCTACTCCCTGTGCCTCCAG SEQ ID NO:431
- Cebador inverso
- AGTCGTCGAGTGCTAGGGAC SEQ ID NO:432
- CHAF1B
- NM_005441.1 Cebador directo GAGGCCAGTGGTGGAAACAG SEQ ID NO:433
- Sonda
- AGCTGATGAGTCTGCCCTACCGCCTG SEQ ID NO:434
- Cebador inverso
- TCCGAGGCCACAGCAAAC SEQ ID NO:435
- CHD2
- NM_001271.1 Cebador directo CTCTGTGCGAGGCTGTCA SEQ ID NO:436
- Sonda
- ACCCATCTCGGGATCCCTGATACC SEQ ID NO:437
- Cebador inverso
- GGTAAGGACTGTGGGCTGG SEQ ID NO:438
- CHFR
- NM_018223.1 Cebador directo AAGGAAGTGGTCCCTCTGTG SEQ ID NO:439
- Sonda
- TGAAGTCTCCAGCTTTGCCTCAGC SEQ ID NO:440
- Cebador inverso
- GACGCAGTCTTTCTGTCTGG SEQ ID NO:441
- Chk1
- NM_001274.1 Cebador directo GATAAATTGGTACAAGGGATCAGCTT SEQ ID NO:442
- Sonda
- CCAGCCCACATGTCCTGATCATATGC SEQ ID NO:443
- Cebador inverso
- GGGTGCCAAGTAACTGACTATTCA SEQ ID NO:444
- Chk2
- NM_007194.1 Cebador directo ATGTGGAACCCCCACCTACTT SEQ ID NO:445
- Sonda
- AGTCCCAACAGAAACAAGAACTTCAGGCG SEQ ID NO:446
- Cebador inverso
- CAGTCCACAGCACGGTTATACC SEQ ID NO:447
- CIAP1
- NM_0011662. Cebador directo TGCCTGTGGTGGGAAGCT SEQ ID NO:448
- Sonda
- TGACATAGCATCATCCTTTGGTTCCCAGTT SEQ ID NO:449
- Cebador inverso
- GGAAAATGCCTCCGGTGTT SEQ ID NO:450
- cIAP2
- NM_001165.2 Cebador directo GGATATTTCCGTGGCTCTTATTCA SEQ ID NO:451
- Sonda
- TCTCCATCAAATCCTGTAAACTCCAGAGCA SEQ ID NO:452
- Cebador inverso
- CTTCTCATCAAGGCAGAAAAATCTT SEQ ID NO:453
- CKS1B
- NM_001826.1 Cebador directo GGTCCCTAAAACCCATCTGA SEQ ID NO:454
- Sonda
- TGAACGCCAAGATTCCTCCATTCA SEQ ID NO:455
- Cebador inverso
- TAATGGACCCATCCCTGACT SEQ ID NO:456
- CKS2
- NM_001827.1 Cebador directo GGCTGGACGTGGTTTTGTCT SEQ ID NO:457
- Sonda
- CTGCGCCCGCTCTTCGCG SEQ ID NO:458
- Cebador inverso
- CGCTGCAGAAAATGAAACGA SEQ ID NO:459
- Claudina 4
- NM_001305.2 Cebador directo GGCTGCTTTGCTGCAACTG SEQ ID NO:460
- Sonda
- CGCACAGACAAGCCTTACTCCGCC SEQ ID NO:461
- Cebador inverso
- CAGAGCGGGCAGCAGAATA SEQ ID NO:462
- CLDN1
- NM_021101.3 Cebador directo TCTGGGAGGTGCCCTACTT SEQ ID NO:463
- Sonda
- TGTTCCTGTCCCCGAAAAACAACC SEQ ID NO:464
- Cebador inverso
- TGGATAGGGCCTTGGTGTT SEQ ID NO:465
- CLDN7
- NM_001307.3 Cebador directo GGTCTGCCCTAGTCATCCTG SEQ ID NO:466
- Sonda
- TGCACTGCTCTCCTGTTCCTGTCC SEQ ID NO:467
- Cebador inverso
- GTACCCAGCCTTGCTCTCAT SEQ ID NO:468
- CLIC1
- NM_001288.3 Cebador directo CGGTACTTGAGCAATGCCTA SEQ ID NO:469
- Sonda
- CGGGAAGAATTCGCTTCCACCTG SEQ ID NO:470
- Cebador inverso
- TCGATCTCCTCATCATCTGG SEQ ID NO:471
- CLTC
- NM_004859.1 Cebador directo ACCGTATGGACAGCCACAG SEQ ID NO:472
- Sonda
- TCTCACATGCTGTACCCAAAGCCA SEQ ID NO:473
- Cebador inverso
- TGACTACAGGATCAGCGCTTC SEQ ID NO:474
- CLU
- NM_001831.1 Cebador directo CCCCAGGATACCTACCACTACCT SEQ ID NO:475
- Sonda
- CCCTTCAGCCTGCCCCACCG SEQ ID NO:476
- Cebador inverso
- TGCGGGACTTGGGAAAGA SEQ ID NO:477
- cMet
- NM_000245.1 Cebador directo GACATTTCCAGTCCTGCAGTCA SEQ ID NO:478
- Sonda
- Sonda
- TGCCTCTCTGCCCCACCCTTTGT SEQ ID NO:479
- Cebador inverso
- CTCCGATCGCACACATTTGT SEQ ID NO:480
- cMYC
- NM_002467.1 Cebador directo TCCCTCCACTCGGAAGGACTA SEQ ID NO:481
- Sonda
- TCTGACACTGTCCAACTTGACCCTCTT SEQ ID NO:482
- Cebador inverso
- CGGTTGTTGCTGATCTGTCTCA SEQ ID NO:483
- CNN
- NM_001299.2 Cebador directo TCCACCCTCCTGGCTTTG SEQ ID NO:484
- Sonda
- TCCTTTCGTCTTCGCCATGCTGG SEQ ID NO:485
- Cebador inverso
- TCACTCCCACGTTCACCTTGT SEQ ID NO:486
- COL1A1
- NM_000088.2 Cebador directo GTGGCCATCCAGCTGACC SEQ ID NO:487
- Sonda
- TCCTGCGCCTGATGTCCACCG SEQ ID NO:488
- Cebador inverso
- CAGTGGTAGGTGATGTTCTGGGA SEQ ID NO:489
- COL1A2
- NM_B000089.2 Cebador directo CAGCCAAGAACTGGTATAGGAGCT SEQ ID NO:490
- Sonda
- Sonda
- TCTCCTAGCCAGACGTGTTTCTTGTCCTTG SEQ ID NO:491
- Cebador inverso
- AAACTGGCTGCCAGCATTG SEQ ID NO:492
- COPS3
- NM_003653.2 Cebador directo ATGCCCAGTGTTCCTGACTT SEQ ID NO:493
- Sonda
- CGAAACGCTATTCTCACAGGTTCAGC SEQ ID NO:494
- Cebador inverso
- CTCCCCATTACAAGTGCTGA SEQ ID NO:495
- COX2
- NM_B000963.1 Cebador directo TCTGCAGAGTTGGAAGCACTCTA SEQ ID NO:496
- Sonda
- CAGGATACAGCTCCACAGCATCGATGTC SEQ ID NO:497
- Cebador inverso
- GCCGAGGCTTTTCTACCAGAA SEQ ID NO:498
- COX3
- MITOCOX3 Cebador directo TCGAGTCTCCCTTCACCATT SEQ ID NO:499
- Sonda
- CGACGGCATCTACGGCTCAACAT SEQ ID NO:500
- Cebador inverso
- GACGTGAAGTCCGTGGAAG SEQ ID NO:501
- CP
- NM_000096.1 Cebador directo CGTGAGTACACAGATGCCTCC SEQ ID NO:502
- Sonda
- TCTTCAGGGCCTCTCTCCTTTCGA SEQ ID NO:503
- Cebador inverso
- CCAGGATGCCAAGATGCT SEQ ID NO:504
- CRBP
- NM_002899.2 Cebador directo TGGTCTGCAAGCAAGTATTCAAG SEQ ID NO:505
- Sonda
- TCTGCTTGGGCCTCACTGCACCT SEQ ID NO:506
- Cebador inverso
- GCTGATTGGTTGGGACAAGGT SEQ ID NO:507
- CREBBP
- NM_004380.1 Cebador directo TGGGAAGCAGCTGTGTACCAT SEQ ID NO:508
- Sonda
- CCTCGCGATGCTGCCTACTACAGCTATC SEQ ID NO:509
- Cebador inverso
- GAAACACTTCTCACAGAAATGATACCTATT SEQ ID NO:510
- CRIP2
- NM_001312.1 Cebador directo GTGCTACGCCACCCTGTT SEQ ID NO:511
- Sonda
- CCGATGTTCACGCCTTTGGGTC SEQ ID NO:512
- Cebador inverso
- CAGGGGCTTCTCGTAGATGT SEQ ID NO:513
- cnpto (TDGF1 oficial)
- NM_003212.1 Cebador directo GGGTCTGTGCCCCATGAC SEQ ID NO:514
- Sonda
- CCTGGCTGCCCAAGAAGTGTTCCCT SEQ ID NO:515
- Cebador inverso
- TGACCGTGCCAGCATTTACA SEQ ID NO:516
- CRK(a)
- NM_016823.2 Cebador directo CTCCCTAACCTCCAGAATGG SEQ ID NO:517
- Sonda
- ACTCGCTTCTGGATAACCCTGGCA SEQ ID NO:518
- Cebador inverso
- TGTCTTGTCGTAGGCATTGG SEQ ID NO:519
- CRMP1
- NM_001313.1 Cebador directo AAGGTTTTTGGATTGCAAGG SEQ ID NO:520
- Sonda
- ACCGTCATACATGCCCCTGGAAAC SEQ ID NO:521
- Cebador inverso
- GGGTGTAGCTGGTACCTCGT SEQ ID NO:522
- CRYAB
- NM_001885.1 Cebador directo GATGTGATTGAGGTGCATGG SEQ ID NO:523
- Sonda
- TGTTCATCCTGGCGCTCTTCATGT SEQ ID NO:524
- Cebador inverso
- GAACTCCCTGGAGATGAAACC SEQ ID NO:525
- CSEL1
- NM_001316.2 Cebador directo TTACGCAGCTCATGCTCTTG SEQ ID NO.526
- Sonda
- ACGGCTCTTTACTATGCGAGGGCC SEQ ID NO:527
- Cebador inverso
- GCAGCTGTAAAGAGAGTGGCAT SEQ ID NO:528
- CSF1
- NM_000757.3 Cebador directo TGCAGCGGCTGATTGACA SEQ ID NO:529
- Sonda
- TCAGATGGAGACCTCGTGCCAAATTACA SEQ ID NO:530
- Cebador inverso
- CAACTGTTCCTGGTCTACAAACTCA SEQ ID NO:531
- CSK(SRC)
- NM_004383.1 Cebador directo CCTGAACATGAAGGAGCTGA SEQ ID NO:532
- Sonda
- TCCCGATGGTCTGCAGCAGCT SEQ ID NO:533
- Cebador inverso
- CATCACGTCTCCGAACTCC SEQ ID NO:534
- CTAG1B
- NM_0013271. Cebador directo GCTCTCCATCAGCTCCTGTC SEQ ID NO:535
- Sonda
- CCACATCAACAGGGAAAGCTGCTG SEQ ID NO:536
- Cebador inverso
- AACACGGGCAGAAAGCACT SEQ ID NO:537
- CTGF
- NM_001901.1 Cebador directo GAGTTCAAGTGCCCTGACG SEQ ID NO:538
- Sonda
- AACATCATGTTCTTCTTCATGACCTCGC SEQ ID NO:539
- Cebador inverso
- AGTTGTAATGGCAGGCACAG SEQ ID NO:540
- CTHRC1
- NM_138455.2 Cebador directo GCTCACTTCGGCTAAAATGC SEQ ID NO:541
- Sonda
- ACCAACGCTGACAGCATGCATTTC SEQ ID NO:542
- Cebador inverso
- TCAGCTCCATTGAATGTGAAA SEQ ID NO:543
- CTLA4
- NM_005214.2 Cebador directo CACTGAGGTCCGGGTGACA SEQ ID NO:544
- Sonda
- CACCTGGCTGTCAGCCTGCCG SEQ ID NO:545
- Cebador inverso
- GTAGGTTGCCGCACAGACTTC SEQ ID NO:546
- CTNNBIP1
- NM_020248.2 Cebador directo GTTTTCCAGGTCGGAGACG SEQ ID NO:547
- Sonda
- CTTTGCAGCTACTGCCTCCGGTCT SEQ ID NO:548
- Cebador inverso
- AGCATCCAGGGTGTTCCA SEQ ID NO:549
- CTSB
- NM_001908.1 Cebador directo GGCCGAGATCTACAAAAACG SEQ ID NO:550
- Sonda
- CCCCGTGGAGGGAGCTTTCTC SEQ ID NO:551
- Cebador inverso
- GCAGGAAGTCCGAATACACA SEQ ID NO:552
- CTSD
- NM_001909.1 Cebador directo GTACATGATCCCCTGTGAGAAGGT SEQ ID NO:553
- Sonda
- ACCCTGCCCGCGATCACACTGA SEQ ID NO:554
- Cebador inverso
- GGGACAGCTTGTAGCCTTTGC SEQ ID NO:555
- CTSH
- NM_004390.1 Cebador directo GCAAGTTCCAACCTGGAAAG SEQ ID NO:556
- Sonda
- TGGCTACATCCTTGACAAAGCCGA SEQ ID NO:557
- Cebador inverso
- CATCGCTTCCTCGTCATAGA SEQ ID NO:558
- CTSL
- NM_001912.1 Cebador directo GGGAGGCTTATCTCACTGAGTGA SEQ ID NO:559
- Sonda
- TTGAGGCCCAGAGCAGTCTACCAGATTCT SEQ ID NO:560
- Cebador inverso
- CCATTGCAGCCTTCATTGC SEQ ID NO:561
- CTSL2
- NM_001333.2 Cebador directo TGTCTCACTGAGCGAGCAGAA SEQ ID NO:562
- Sonda
- CTTGAGGACGCGAACAGTCCACCA SEQ ID NO:563
- Cebador inverso
- ACCATTGCAGCCCTGATTG SEQ ID NO:564
- CUL1
- NM_003592.2 Cebador directo ATGCCCTGGTAATGTCTGCAT SEQ ID NO:565
- Sonda
- CAGCCACAAAGCCAGCGTCATTGT SEQ ID NO:566
- Cebador inverso
- GCGACCACAAGCCTTATCAAG SEQ ID NO:567
- CUL4A
- NM_003589.1 Cebador directo AAGCATCTTCCTGTTCTTGGA SEQ ID NO:568
- Sonda
- TATGTGCTGCAGAACTCCACGCTG SEQ ID NO:569
- Cebador inverso
- AATCCCATATCCCAGATGGA SEQ ID NO:570
- CXCL12
- NM_000609.3 Cebador directo GAGCTACAGATGCCCATGC SEQ ID NO:571
- Sonda
- TTCTTCGAAAGCCATGTTGCCAGA SEQ ID NO:572
- Cebador inverso
- TTTGAGATGCTTGACGTTGG SEQ ID NO:573
- CXCR4
- NM_003467.1 Cebador directo TGACCGCTTCTACCCCAATG SEQ ID NO:574
- Sonda
- CTGAAACTGGAACACAACCACCCACAAG SEQ ID NO:575
- Cebador inverso
- AGGATAAGGCCAACCATGATGT SEQ ID NO:576
- CYBA
- NM_000101.1 Cebador directo GGTGCCTACTCCATTGTGG SEQ ID NO:577
- Sonda
- TACTCCAGCAGGCACACAAACACG SEQ ID NO:578
- Cebador inverso
- GTGGAGCCCTTCTTCCTCTT SEQ ID NO:579
- CYP1B1
- NM_000104.2 Cebador directo CCAGCTTTGTGCCTGTCACTAT SEQ ID NO:580
- Sonda
- CTCATGCCACCACTGCCAACACCTC SEQ ID NO:581
- Cebador inverso
- GGGAATGTGGTAGCCCAAGA SEQ ID NO:582
- CYP2C8
- NM_000770.2 Cebador directo CCGTGTTCAAGAGGAAGCTC SEQ ID NO:583
- Sonda
- TTTTCTCAACTCCTCCACAAGGCA SEQ ID NO:584
- Cebador inverso
- AGTGGGATCACAGGGTGAAG SEQ ID NO:585
- CYP3A4
- NM_017460.3 Cebador directo AGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATAT SEQ ID NO:586
- Sonda
- CACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAA SEQ ID NO:587
- Cebador inverso
- GCAAACCTCATGCCAATGC SEQ ID NO:588
- CYR61
- NM_001554.3 Cebador directo TGCTCATTCTCGAGGAGCAT SEQ ID NO:589
- Sonda
- CAGCACCCTTGGCAGTTTCGAAAT SEQ ID NO:590
- Cebador inverso
- GTGGCTGCATTAGTGTCCAT SEQ ID NO:591
- DAPK1
- NM_004938.1 Cebador directo CGCTGACATCATGAATGTTCCT SEQ ID NO:592
- Sonda
- TCATATCCAAACTCGCCTCCAGCCG SEQ ID NO:593
- Cebador inverso
- TCTCTTTCAGCAACGATGTGTCTT SEQ ID NO:594
- DCC
- NM_005215.1 Cebador directo AAATGTCCTCCTCGACTGCT SEQ ID NO:595
- Sonda
- ATCACTGGAACTCCTCGGTCGGAC SEQ ID NO:596
- Cebador inverso
- TGAATGCCATCTTTCTTCCA SEQ ID NO:597
- DCC_exones1 8-23
- X7613218-23 Cebador directo GGTCACCGTTGGTGTCATCA SEQ ID NO:598
- Sonda
- CAGCCACGATGACCACTACCAGCACT SEQ ID NO:599
- Cebador inverso
- GAGCGTCGGGTGCAAATC SEQ ID NO:600
- DCC_exones 67
- X761326-7 Cebador directo ATGGAGATGTGGTCATTCCTAGTG SEQ ID NO:601
- Sonda
- TGCTTCCTCCCACTATCTGAAAATAA SEQ ID NO:602
- Cebador inverso
- CACCACCCCAAGTATCCGTAAG SEQ ID NO:603
- DCK
- NM_000788.1 Cebador directo GCCGCCACAAGACTAAGGAAT SEQ ID NO:604
- Sonda
- AGCTGCCCGTCTTTCTCAGCCAGC SEQ ID NO:605
- Cebador inverso
- CGATGTTCCCTTCGATGGAG SEQ ID NO:606
- DDB1
- NM_001923.2 Cebador directo TGCGGATCATCCGGAATG SEQ ID NO:607
- Sonda
- AATTGGAATCCACGAGCATGCCAGC SEQ ID NO:608
- Cebador inverso
- TCCTTTGATGCCTGGTAAGTCA SEQ ID NO:609
- DET1
- NM_017996.2 Cebador directo CTTGTGGAGATCACCCAATCAG SEQ ID NO:610
- Sonda
- CTATGCCCGGGACTCGGGCCT SEQ ID NO:611
- Cebador inverso
- CCCGCCTGGATCTCAAACT SEQ ID NO:612
- DHFR
- NM_000791.2 Cebador directo TTGCTATAACTAAGTGCTTCTCCAAGA SEQ ID NO:613
- Sonda
- CCCAACTGAGTCCCCAGCACCT SEQ ID NO:614
- Cebador inverso
- GTGGAATGGCAGCTCACTGTAG SEQ ID NO:615
- DHPS
- NM_013407.1 Cebador directo GGGAGAACGGGATCAATAGGAT SEQ ID NO:616
- Sonda
- CTCATTGGGCACCAGCAGGTTTCC SEQ ID NO:617
- Cebador inverso
- GCATCAGCCAGTCCTCAAACT SEQ ID NO:618
- DIABLO
- NM_019887.1 Cebador directo CACAATGGCGGCTCTGAAG SEQ ID NO:619
- Sonda
- AAGTTACGCTGCGCGACAGCCAA SEQ ID NO:620
- Cebador inverso
- ACACAAACACTGTCTGTACCTGAAGA SEQ ID NO:621
- DIAPH1
- NM_005219.2 Cebador directo CAAGCAGTCAAGGAGAACCA SEQ ID NO:622
- Sonda
- TTCTTCTGTCTCCCGCCGCTTC SEQ ID NO:623
- Cebador inverso
- AGTTTTGCTCGCCTCATCTT SEQ ID NO:624
- DICER1
- NM_177438.1 Cebador directo TCCAATTCCAGCATCACTGT SEQ ID NO:625
- Sonda
- AGAAAAGCTGTTTGTCTCCCCAGCA SEQ ID NO:626
- Cebador inverso
- GGCAGTGAAGGCGATAAAGT SEQ ID NO:627
- DKK1
- NM_012242.1 Cebador directo TGACAACTACCAGCCGTACC SEQ ID NO:628
- Sonda
- AGTGCCGCACTCCTCGTCCTCT SEQ ID NO:629
- Cebador inverso
- GGGACTAGCGCAGTACTCATC SEQ ID NO:630
- DLC1
- NM_006094.3 Cebador directo GATTCAGACGAGGATGAGCC SEQ ID NO:631
- Sonda
- AAAGTCCATTTGCCACTGATGGCA SEQ ID NO:632
- Cebador inverso
- CACCTCTTGCTGTCCCTTTG SEQ ID NO:633
- DPYD
- NM_000110.2 Cebador directo AGGACGCAAGGAGGGTTTG SEQ ID NO:634
- Sonda
- CAGTGCCTACAGTCTCGAGTCTGCCAGTG SEQ ID NO:635
- Cebador inverso
- GATGTCCGCCGAGTCCTTACT SEQ ID NO:636
- DR4
- NM_003844.1 Cebador directo TGCACAGAGGGTGTGGGTTAC SEQ ID NO:637
- Sonda
- CAATGCTTCCAACAATTTGTTTGCTTGCC SEQ ID NO:638
- Cebador inverso
- TCTTCATCTGATTTACAAGCTGTACATG SEQ ID NO:639
- DR5
- NM_003842.2 Cebador directo CTCTGAGACAGTGCTTCGATGACT SEQ ID NO:640
- Sonda
- CAGACTTGGTGCCCTTTGACTCC SEQ ID NO:641
- Cebador inverso
- CCATGAGGCCCAACTTCCT SEQ ID NO:642
- DRG1
- NM_004147.3 Cebador directo CCTGGATCTCCCAGGTATCA SEQ ID NO:643
- Sonda
- ACCTTTCCCATCCTTGGCACCTTC SEQ ID NO:644
- Cebador inverso
- TGCAATGACTTGACGACCTC SEQ ID NO:645
- DSP
- NM_004415.1 Cebador directo TGGCACTACTGCATGATTGACA SEQ ID NO:646
- Sonda
- CAGGGCCATGACAATCGCCAA SEQ ID NO:647
- Cebador inverso
- CCTGCCGCATTGTTTTCAG SEQ ID NO:648
- DTYMK
- NM_B012145.1 Cebador directo AAATCGCTGGGAACAAGTG SEQ ID NO:649
- Sonda
- CGCCCTGGCTCAACTTTTCCTTAA SEQ ID NO:650
- Cebador inverso
- AATGCGTATCTGTCCACGAC SEQ ID NO:651
- DUSP1
- NM_004417.2 Cebador directo AGACATCAGCTCCTGGTTCA SEQ ID NO:652
- Sonda
- CGAGGCCATTGACTTCATAGACTCCA SEQ ID NO:653
- Cebador inverso
- GACAAACACCCTTCCTCCAG SEQ ID NO:654
- DUSP2
- NM_004418.2 Cebador directo TATCCCTGTGGAGGACAACC SEQ ID NO:655
- Sonda
- CCTCCTGGAACCAGGCACTGATCT SEQ ID NO:656
- Cebador inverso
- CACCCAGTCAATGAAGCCTA SEQ ID NO:657
- DUT
- NM_001948.2 Cebador directo ACACATGGAGTGCTTCTGGA SEQ ID NO:658
- Sonda
- ATCAGCCCACTTGACCACCCAGTT SEQ ID NO:659
- Cebador inverso
- CTCTTGCCTGTGCTTCCAC SEQ ID NO:660
- DYRK1B
- NM_004714.1 Cebador directo AGCATGACACGGAGATGAAG SEQ ID NO:661
- Sonda
- CACCTGAAGCGGCACTTCATGTTC SEQ ID NO:662
- Cebador inverso
- AATACCAGGCACAGGTGGTT SEQ ID NO:663
- E2F1
- NM_005225.1 Cebador directo ACTCCCTCTACCCTTGAGCA SEQ ID NO:664
- Sonda
- CAGAAGAACAGCTCAGGGACCCCT SEQ ID NO:665
- Cebador inverso
- CAGGCCTCAGTTCCTTCAGT SEQ ID NO:666
- EDN1 endotelina
- NM_001955.1 Cebador directo TGCCACCTGGACATCATTTG SEQ ID NO:667
- Sonda
- CACTCCCGAGCACGTTGTTCCGT SEQ ID NO:668
- Cebador inverso
- TGGACCTAGGGCTTCCAAGTC SEQ ID NO:669
- EFNA1
- NM_004428.2 Cebador directo TACATCTCCAAACCCATCCA SEQ ID NO:670
- Sonda
- CAACCTCAAGCAGCGGTCTTCATG SEQ ID NO:671
- Cebador inverso
- TTGCCACTGACAGTCACCTT SEQ ID NO:672
- EFNA3
- NM_004952.3 Cebador directo ACTACATCTCCACGCCCACT SEQ ID NO:673
- Sonda
- CCTCAGACACTTCCAGTGCAGGTTG SEQ ID NO:674
- Cebador inverso
- CAGCAGACGAACACCTTCAT SEQ ID NO:675
- EFNB1
- NM_B004429.3 Cebador directo GGAGCCCGTATCCTGGAG SEQ ID NO:676
- Sonda
- CCCTCAACCCCAAGTTCCTGAGTG SEQ ID NO:677
- Cebador inverso
- GGATAGATCACCAAGCCCTTC SEQ ID NO:676
- EFNB2
- NM_004093.2 Cebador directo TGACATTATCATCCCGCTAAGGA SEQ ID NO:679
- Sonda
- CGGACAGCGTCTTCTGCCCTCACT SEQ ID NO:680
- Cebador inverso
- GTAGTCCCCGCTGACCTTCTC SEQ ID NO:681
- EFP
- NM_005082.2 Cebador directo TTGAACAGAGCCTGACCAAG SEQ ID NO:682
- Sonda
- TGATGCTTTCTCCAGAAACTCGAACTCA SEQ ID NO:683
- Cebador inverso
- TGTTGAGATTCCTCGCAGTT SEQ ID NO:684
- EGFR
- NM_005228.1 Cebador directo TGTCGATGGACTTCCAGAAC SEQ ID NO:685
- Sonda
- CACCTGGGCAGCTGCCAA SEQ ID NO:686
- Cebador inverso
- ATTGGGACAGCTTGGATCA SEQ ID NO:687
- EGLN1
- NM_022051.1 Cebador directo TCAATGGCCGGACGAAAG SEQ ID NO:688
- Sonda
- CATTGCCCGGATAACAAGCAACCATG SEQ ID NO.689
- Cebador inverso
- TTTGGATTATCAACATGACGTACATAAC SEQ ID NO:690
- EGLN3
- NM_022073.2 Cebador directo GCTGGTCCTCTACTGCGG SEQ ID NO:691
- Sonda
- CCGGCTGGGCAAATACTACGTCAA SEQ ID NO:692
- Cebador inverso
- CCACCATTGCCTTAGACCTC SEQ ID NO:693
- EGR1
- NM_001964.2 Cebador directo GTCCCCGCTGCAGATCTCT SEQ ID NO:694
- Sonda
- CGGATCCTTTCCTCACTCGCCCA SEQ ID NO:695
- Cebador inverso
- CTCCAGCTTAGGGTAGTTGTCCAT SEQ ID NO:696
- EGR3
- NM_004430.2 Cebador directo CCATGTGGATGAATGAGGTG SEQ ID NO:697
- Sonda
- ACCCAGTCTCACCTTCTCCCCACC SEQ ID NO:698
- Cebador inverso
- TGCCTGAGAAGAGGTGAGGT SEQ ID NO:699
- EI24
- NM_004879.2 Cebador directo AAAGTGGTGAATGCCATTTG SEQ ID NO:700
- Sonda
- CCTCAAATGCCAGGTCAGCTATATCCTG SEQ ID NO:701
- Cebador inverso
- GTGAGGCTTCCTCCCTGATA SEQ ID NO:702
- EIF4E
- NM_001968.1 Cebador directo GATCTAAGATGGCGACTGTCGAA SEQ ID NO:703
- Sonda
- ACCACCCCTACTCCTAATCCCCCGACT SEQ ID NO:704
- Cebador inverso
- TTAGATTCCGTTTTCTCCTCTTCTG SEQ ID NO:705
- EIF4EL3
- NM_004846.1 Cebador directo AAGCCGCGGTTGAATGTG SEQ ID NO:706
- Sonda
- TGACCCTCTCCCTCTCTGGATGGCA SEQ ID NO:707
- Cebador inverso
- TGACGCCAGCTTCAATGATG SEQ ID NO:708
- ELAVL1
- NM_001419.2 Cebador directo GACAGGAGGCCTCTATCCTG SEQ ID NO:709
- Sonda
- CACCCCACCCTCCACCTCAATC SEQ ID NO:710
- Cebador inverso
- GTGAGGTAGGTCTGGGGAAG SEQ ID NO:711
- EMP1
- NM_001423.1 Cebador directo GCTAGTACTTTGATGCTCCCTTGAT SEQ ID NO:712
- Sonda
- CCAGAGAGCCTCCCTGCAGCCA SEQ ID NO:713
- Cebador inverso
- GAACAGCTGGAGGCCAAGTC SEQ ID NO:714
- EMR3
- NM_032571.2 Cebador directo TGGCCTACCTCTTCACCATC SEQ ID NO:715
- Sonda
- TCAACAGCCTCCAAGGCTTCTTCA SEQ ID NO:716
- Cebador inverso
- TGAGGAGGCAGTAGACCAAGA SEQ ID NO:717
- EMS1
- NM_005231.2 Cebador directo GGCAGTGTCACTGAGTCCTTGA SEQ ID NO:718
- Sonda
- ATCCTCCCCTGCCCCGCG SEQ ID NO:719
- Cebador inverso
- TGCACTGTGCGTCCCAAT SEQ ID NO:720
- ENO1
- NM_001428.2 Cebador directo CAAGGCCGTGAACGAGAAGT SEQ ID NO:721
- Sonda
- CTGCAACTGCCTCCTGCTCAAAGTCA SEQ ID NO:722
- Cebador inverso
- CGGTCACGGAGCCAATCT SEQ ID NO:723
- EP300
- NM_001429.1 Cebador directo AGCCCCAGCAACTACAGTCT SEQ ID NO:724
- Sonda
- CACTGACATCATGGCTGGCCTTG SEQ ID NO:725
- Cebador inverso
- TGTTCAAAGGTTGACCATGC SEQ ID NO:726
- EPAS1
- NM_001430.3 Cebador directo AAGCCTTGGAGGGTTTCATTG SEQ ID NO:727
- Sonda
- TGTCGCCATCTTGGGTCACCACG SEQ ID NO:728
- Cebador inverso
- TGCTGATGTTTTCTGACAGAAAGAT SEQ ID NO:729
- EpCAM
- NM_002354.1 Cebador directo GGGCCCTCCAGAACAATGAT SEQ ID NO:730
- Sonda
- CCGCTCTCATCGCAGTCAGGATCAT SEQ ID NO:731
- Cebador inverso
- TGCACTGCTTGGCCTTAAAGA SEQ ID NO:732
- EPHA2
- NM_004431.2 Cebador directo CGCCTGTTCACCAAGATTGAC SEQ ID NO:733
- Sonda
- TGCGCCCGATGAGATCACCG SEQ ID NO:734
- Cebador inverso
- GTGGCGTGCCTCGAAGTC SEQ ID NO:735
- EPHB2
- NM_004442.4 Cebador directo CAACCAGGCAGCTCCATC SEQ ID NO:736
- Sonda
- CACCTGATGCATGATGGACACTGC SEQ ID NO:737
- Cebador inverso
- GTAATGCTGTCCACGGTGC SEQ ID NO:738
- EPHB4
- NM_004444.3 Cebador directo TGAACGGGGTATCCTCCTTA SEQ ID NO:739
- Sonda
- CGTCCCATTTGAGCCTGTCAATGT SEQ ID NO:740
- Cebador inverso
- AGGTACCTCTCGGTCAGTGG SEQ ID NO:741
- EphB6
- NM_004445.1 Cebador directo ACTGGTCCTCCATCGGCT SEQ ID NO:742
- Sonda
- CCTTGCACCTCAAACCAAAGCTCC SEQ ID NO:743
- Cebador inverso
- CCAGTGTAGCATGAGTGCTGA SEQ ID NO:744
- EPM2A
- NM_005670.2 Cebador directo ACTGTGGCACTTAGGGGAGA SEQ ID NO:745
- Sonda
- CTGCCTCTGCCCAAAGCAAATGTC SEQ ID NO.746
- Cebador inverso
- AGTGGAAATGTGTCCTGGCT SEQ ID NO:747
- ErbB3
- NM_001982.1 Cebador directo CGGTTATGTCATGCCAGATACAC SEQ ID NO:748
- Sonda
- CCTCAAAGGTACTCCCTCCTCCCGG SEQ ID NO:749
- Cebador inverso
- GAACTGAGACCCACTGAAGAAAGG SEQ ID NO:750
- ERCC1
- NM_001983.1 Cebador directo GTCCAGGTGGATGTGAAAGA SEQ ID NO:751
- Sonda
- CAGCAGGCCCTCAAGGAGCTG SEQ ID NO:752
- Cebador inverso
- CGGCCAGGATACACATCTTA SEQ ID NO:753
- ERCC2
- NM_000400.2 Cebador directo TGGCCTTCTTCACCAGCTA SEQ ID NO:754
- Sonda
- AGGCCACGGTGCTCTCCATGTACT SEQ ID NO:755
- Cebador inverso
- CAAGGATCCCCTGCTCATAC SEQ ID NO:756
- EREG
- NM_001432.1 Cebador directo ATAACAAAGTGTAGCTCTGACATGAATG SEQ ID NO:757
- Sonda
- TTGTTTGCATGGACAGTGCATCTATCTGGT SEQ ID NO:758
- Cebador inverso
- CACACCTGCAGTAGTTTTGACTCA SEQ ID NO:759
- ERK1
- Z11696.1 Cebador directo ACGGATCACAGTGGAGGAAG SEQ ID NO:760
- Sonda
- CGCTGGCTCACCCCTACCTG SEQ ID NO:761
- Cebador inverso
- CTCATCCGTCGGGTCATAGT SEQ ID NO:762
- ERK2
- NM_002745.1 Cebador directo AGTTCTTGACCCCTGGTCCT SEQ ID NO:763
- Sonda
- TCTCCAGCCCGTCTTGGCTT SEQ ID NO:764
- Cebador inverso
- AAACGGCTCAAAGGAGTCAA SEQ ID NO:765
- ESPL1
- NM_012291.1 Cebador directo ACCCCCAGACCGGATCAG SEQ ID NO:766
- Sonda
- CTGGCCCTCATGTCCCCTTCACG SEQ ID NO:767
- Cebador inverso
- TGTAGGGCAGACTTCCTCAAACA SEQ ID NO:768
- EstR1
- NM_B0001251 Cebador directo CGTGGTGCCCCTCTATGAC SEQ ID NO:769
- Sonda
- CTGGAGATGCTGGACGCCC SEQ ID NO:770
- Cebador inverso
- GGCTAGTGGGCGCATGTAG SEQ ID NO:771
- ETV4
- NM_001986.1 Cebador directo TCCAGTGCCTATGACCCC SEQ ID NO:772
- Sonda
- CAGACAAATCGCCATCAAGTCCCC SEQ ID NO:773
- Cebador inverso
- ACTGTCCAAGGGCACCAG SEQ ID NO:774
- F3
- NM_001993.2 Cebador directo GTGAAGGATGTGAAGCAGACGTA SEQ ID NO:775
- Sonda
- TGGCACGGGTCTTCTCCTACC SEQ ID NO:776
- Cebador inverso
- AACCGGTGCTCTCCACATTC SEQ ID NO:777
- FABP4
- NM_001442.1 Cebador directo GCTTTGCCACCAGGAAAGT SEQ ID NO:778
- Sonda
- CTGGCATGGCCAAACCTAACATGA SEQ ID NO:779
- Cebador inverso
- CATCCCCATTCACACTGATG SEQ ID NO:780
- FAP
- NM_004460.2 Cebador directo CTGACCAGAACCACGGCT SEQ ID NO:781
- Sonda
- CGGCCTGTCCACGAACCACTTATA SEQ ID NO:782
- Cebador inverso
- GGAAGTGGGTCATGTGGG SEQ ID NO:783
- fas
- NM_000043.1 Cebador directo GGATTGCTCAACAACCATGCT SEQ ID NO:784
- Sonda
- TCTGGACCCTCCTACCTCTGGTTCTTACGT SEQ ID NO:785
- Cebador inverso
- GGCATTAACACTTTTGGACGATAA SEQ ID NO:786
- fasl
- NM_000639.1 Cebador directo GCACTTTGGGATTCTTTCCATTAT SEQ ID NO:787
- Sonda
- ACAACATTCTCGGTGCCTGTAACAAAGAA SEQ ID NO:788
- Cebador inverso
- GCATGTAAGAAGACCCTCACTGAA SEQ ID NO:789
- FASN
- NM_004104.4 Cebador directo GCCTCTTCCTGTTCGACG SEQ ID NO:790
- Sonda
- TCGCCCACCTACGTACTGGCCTAC SEQ ID NO:791
- Cebador inverso
- GCTTTGCCCGGTAGCTCT SEQ ID NO:792
- FBXO5
- NM_012177.2 Cebador directo GGCTATTCCTCATTTTCTCTACAAAGTG SEQ ID NO:793
- Sonda
- CCTCCAGGAGGCTACCTTCTTCATGTTCAC SEQ ID NO:794
- Cebador inverso
- GGATTGTAGACTGTCACCGAAATTC SEQ ID NO:795
- FBXW7
- NM_033632.1 Cebador directo CCCCAGTTTCAACGAGACTT SEQ ID NO:796
- Sonda
- TCATTGCTCCCTAAAGAGTTGGCACTC SEQ ID NO:797
- Cebador inverso
- GTTCCAGGAATGAAAGCACA SEQ ID NO:798
- FDXR
- NM_004110.2 Cebador directo GAGATGATTCAGTTACCGGGAG SEQ ID NO:799
- Sonda
- AATCCACAGGATCCAAAATGGGCC SEQ ID NO:800
- Cebador inverso
- ATCTTGTCCTGGAGACCCAA SEQ ID NO:801
- FES
- NM_002005.2 Cebador directo CTCTGCAGGCCTAGGTGC SEQ ID NO:802
- Sonda
- CTCCTCAGCGGCTCCAGCTCATAT SEQ ID NO:803
- Cebador inverso
- CCAGGACTGTGAAGAGCTGTC SEQ ID NO:804
- FGF18
- NM_003862.1 Cebador directo CGGTAGTCAAGTCCGGATCAA SEQ ID NO:805
- Sonda
- CAAGGAGACGGAATTCTACCTGTGC SEQ ID NO:806
- Cebador inverso
- GCTTGCCTTfGCGGTTCA SEQ ID NO:807
- FGF2
- NM_002006.2 Cebador directo AGATGCAGGAGAGAGGAAGC SEQ ID NO:808
- Sonda
- CCTGCAGACTGTTTTTGCCCAAT SEQ ID NO:809
- Cebador inverso
- GTTTTGCAGCCTTACCCAAT SEQ ID NO:810
- FGFR1
- NM_023109.1 Cebador directo CACGGGACATTCACCACATC SEQ ID NO:811
- Sonda
- ATAAAAAGACAACCAACGGCCGACTGC SEQ ID NO:812
- Cebador inverso
- GGGTGCCATCCACTTCACA SEQ ID NO:813
- FGFR2 isoforma 1
- NM_000141.2 Cebador directo GAGGGACTGTTGGCATGCA SEQ ID NO:814
- Sonda
- TCCCAGAGACCAACGTTCAAGCAGTTG SEQ ID NO:815
- Cebador inverso
- GAGTGAGAATTCGATCCAAGTCTTC SEQ ID NO:816
- FHIT
- NM_002012.1 Cebador directo CCAGTGGAGCGCTTCCAT SEQ ID NO:817
- Sonda
- TCGGCCACTTCATCAGGACGCAG SEQ ID NO:818
- Cebador inverso
- CTCTCTGGGTCGTCTGAAACAA SEQ ID NO:819
- FIGF
- NM_004469.2 Cebador directo GGTTCCAGCTTTCTGTAGCTGT SEQ ID NO:820
- Sonda
- ATTGGTGGCCACACCACCTCCTTA SEQ ID NO:821
- Cebador inverso
- GCCGCAGGTTCTAGTTGCT SEQ ID NO:822
- FLJ12455
- NM_022078.1 Cebador directo CCACCAGCATGAAGTTTCG SEQ ID NO:823
- Sonda
- ACCCCTCACAAAGGCCATGTCTGT SEQ ID NO:824
- Cebador inverso
- GGCTGTCTGAAGCACAACTG SEQ ID NO:825
- FLJ20712
- AK000719.1 Cebador directo GCCACACAAACATGCTCCT SEQ ID NO:826
- Sonda
- ATGTCTTTCCCAGCAGCTCTGCCT SEQ ID NO:827
- Cebador inverso
- GCCACAGGAAACTTCCGA SEQ ID NO:828
- FLT1
- NM_002019.1 Cebador directo GGCTCCCGAATCTATCTTTG SEQ ID NO:829
- Sonda
- CTACAGCACCAAGAGCGACGTGTG SEQ ID NO:830
- Cebador inverso
- TCCCACAGCAATACTCCGTA SEQ ID NO:831
- FLT4
- NM_002020.1 Cebador directo ACCAAGAAGCTGAGGACCTG SEQ ID NO:832
- Sonda
- AGCCCGCTGACCATGGAAGATCT SEQ ID NO:833
- Cebador inverso
- CCTGGAAGCTGTAGCAGACA SEQ ID NO:834
- FOS
- NM_005252.2 Cebador directo CGAGCCCTTTGATGACTTCCT SEQ ID NO:835
- Sonda
- TCCCAGCATCATCCAGGCCCAG SEQ ID NO:836
- Cebador inverso
- GGAGCGGGCTGTCTCAGA SEQ ID NO:837
- FOXO3A
- NM_001455.1 Cebador directo TGAAGTCCAGGACGATGATG SEQ ID NO:838
- Sonda
- CTCTACAGCAGCTCAGCCAGCCTG SEQ ID NO:839
- Cebador inverso
- ACGGCTTGCTTACTGAAGGT SEQ ID NO:840
- FPGS
- NM_004957.3 Cebador directo CAGCCCTGCCAGTTTGAC SEQ ID NO:841
- Sonda
- ATGCCGTCTTCTGCCCTAACCTGA SEQ ID NO:842
- Cebador inverso
- GTTGCCTGTGGATGACACC SEQ ID NO:843
- FRP1
- NM_003012.2 Cebador directo TTGGTACCTGTGGGTTAGCA SEQ ID NO:844
- Sonda
- TCCCCAGGGTAGAATTCAATCAGAGC SEQ ID NO:845
- Cebador inverso
- CACATCCAAATGCAAACTGG SEQ ID NO:846
- FST
- NM_006350 2 Cebador directo GTAAGTCGGATGAGCCTGTCTGT SEQ ID NO:847
- Sonda
- CCAGTGACAATGCCACTTATGCCAGC SEQ ID NO:848
- Cebador inverso
- CAGCTTCCTTCATGGCACACT SEQ ID NO:849
- Furin
- NM_002569.1 Cebador directo AAGTCCTCGATACGCACTATAGCA SEQ ID NO:850
- Sonda
- CCCGGATGGTCTCCACGTCAT SEQ ID NO:851
- Cebador inverso
- CTGGCATGTGGCACATGAG SEQ ID NO:852
- FUS
- NM_004960.1 Cebador directo GGATAATTCAGACAACAACACCATCT SEQ ID NO:853
- Sonda
- TCAATTGTAACATTCTCACCCAGGCCTTG SEQ ID NO:854
- Cebador inverso
- TGAAGTAATCAGCCACAGACTCAAT SEQ ID NO:855
- FUT1
- NM_000148.1 Cebador directo CCGTGCTCATTGCTAACCA SEQ ID NO:856
- Sonda
- TCTGTCCCTGAACTCCCAGAACCA SEQ ID NO:857
- Cebador inverso
- CTGCCCAAAGCCAGATGTA SEQ ID NO:858
- FUT3
- NM_000149.1 Cebador directo CAGTTCGGTCCAACAGAGAA SEQ ID NO:859
- Sonda
- AGCAGGCAACCACCATGTCATTTG SEQ ID NO:860
- Cebador inverso
- TGCGAATTATATCCCGATGA SEQ ID NO:861
- FUT6
- NM_000150.1 Cebador directo CGTGTGTCTCAAGACGATCC SEQ ID NO:862
- Sonda
- TGTGTACCCTAATGGGTCCCGCTT SEQ ID NO:863
- Cebador inverso
- GGTCCCTGTGCTGTCTGG SEQ ID NO:864
- FXYD5
- NM_014164.4 Cebador directo AGAGCACCAAAGCAGCTCAT SEQ ID NO:865
- Sonda
- CACTGATGACACCACGACGCTCTC SEQ ID NO:866
- Cebador inverso
- GTGCTTGGGGATGGTCTCT SEQ ID NO:867
- FYN
- NM_002037.3 Cebador directo GAAGCGCAGATCATGAAGAA SEQ ID NO:868
- Sonda
- CTGAAGCACGACAAGCTGGTCCAG SEQ ID NO:869
- Cebador inverso
- CTCCTCAGACACCACTGCAT SEQ ID NO:870
- FZD1
- NM_003505.1 Cebador directo GGTGCACCAGTTCTACCCTC SEQ ID NO:871
- Sonda
- ACTTGAGCTCAGCGGAACACTGCA SEQ ID NO:872
- Cebador inverso
- GCGTACATGGAGCACAGGA SEQ ID NO:873
- FZD2
- NM_001466.2 Cebador directo TGGATCCTCACCTGGTCG SEQ ID NO:874
- Sonda
- TGCGCTTCCACCTTCTTCACTGTC SEQ ID NO:875
- Cebador inverso
- GCGCTGCATGTCTACCAA SEQ ID NO:876
- FZD6
- NM_003506.2 Cebador directo AATGAGAGAGGTGAAAGCGG SEQ ID NO:877
- Sonda
- CGGAGCTAGCACCCCCAGGTTAAG SEQ ID NO:878
- Cebador inverso
- AGGTTCACCACAGTCCTGTTC SEQ ID NO:879
- G-Catenina
- NM_002230.1 Cebador directo TCAGCAGCAAGGGCATCAT SEQ ID NO:880
- Sonda
- CGCCCGCAGGCCTCATCCT SEQ ID NO:881
- Cebador inverso
- GGTGGTTTTCTTGAGCGTGTACT SEQ ID NO:882
- G1P2
- NM_005101.1 Cebador directo CAACGAATTCCAGGTGTCC SEQ ID NO:883
- Sonda
- CTGAGCAGCTCCATGTCGGTGTC SEQ ID NO:884
- Cebador inverso
- GATCTGCGCCTTCAGCTC SEQ ID NO:885
- GADD45
- NM_001924.2 Cebador directo GTGCTGGTGACGAATCCA SEQ ID NO:886
- Sonda
- TTCATCTCAATGGAAGGATCCTGCC SEQ ID NO:887
- Cebador inverso
- CCCGGCAAAAACAAATAAGT SEQ ID NO:888
- GADD45B
- NM_015675.1 Cebador directo ACCCTCGACAAGACCACACT SEQ ID NO:889
- Sonda
- AACTTCAGCCCCAGCTCCCAAGTC SEQ ID NO:890
- Cebador inverso
- TGGGAGTTCATGGGTACAGA SEQ ID NO:891
- GADD45G
- NM_006705.2 Cebador directo CGCGCTGCAGATCCATTT SEQ ID NO:892
- Sonda
- CGCTGATCCAGGCTTTCTGCTGC SEQ ID NO:893
- Cebador inverso
- CGCACTATGTCGATGTCGTTCT SEQ ID NO:894
- GAGE4
- NM_001474.1 Cebador directo GGAACAGGGTCACCCACAGA SEQ ID NO:895
- Sonda
- TCAGGACCATCTTCACACTCACACCCA SEQ ID NO:896
- Cebador inverso
- GATTTGGCGGGTCCATCTC SEQ ID NO:897
- GBP1
- NM_002053.1 Cebador directo TTGGGAAATATTTGGGCATT SEQ ID NO:898
- Sonda
- TTGGGACATTGTAGACTTGGCCAGAC SEQ ID NO:899
- Cebador inverso
- AGAAGCTAGGGTGGTTGTCC SEQ ID NO:900
- GBP2
- NM_004120.2 Cebador directo GCATGGGAACCATCAACCA SEQ ID NO:901
- Sonda
- CCATGGACCAACTTCACTATGTGACAGAGC SEQ ID NO:902
- Cebador inverso
- TGAGGAGTTTGCCTTGATTCG SEQ ID NO:903
- GCLC
- NM_001498.1 Cebador directo CTGTTGCAGGAAGGCATTGA SEQ ID NO:904
- Sonda
- CATCTCCTGGCCCAGCATGTT SEQ ID NO:905
- Cebador inverso
- GTCAGTGGGTCTCTAATAAAGAGATGAG SEQ ID NO:906
- GCLM
- NM_002061.1 Cebador directo TGTAGAATCAAACTCTTCATCATCAACTAG SEQ ID NO:907
- Sonda
- TGCAGTTGACATGGCCTGTTCAGTCC SEQ ID NO:908
- Cebador inverso
- CACAGAATCCAGCTGTGCAACT SEQ ID NO:909
- GCNT1
- NM_001490.3 Cebador directo TGGTGCTTGGAGCATAGAAG SEQ ID NO:910
- Sonda
- TGCCCTTCACAAAGGAAATCCCTG SEQ ID NO:911
- Cebador inverso
- GCAACGTCCTCAGCATTTC SEQ ID NO:912
- GDF15
- NM_004864.1 Cebador directo CGCTCCAGACCTATGATGACT SEQ ID NO:913
- Sonda
- TGTTAGCCAAAGACTGCCACTGCA SEQ ID NO:914
- Cebador inverso
- ACAGTGGAAGGACCAGGACT SEQ ID NO:915
- GIT1
- NM_014030.2 Cebador directo GTGTATGACGAGGTGGATCG SEQ ID NO:916
- Sonda
- AGCCAGCCACACTGCATCATTTTC SEQ ID NO:917
- Cebador inverso
- ACCAGAGTGCTGTGGTTTTG SEQ ID NO:918
- GJA1
- NM_000165.2 Cebador directo GTTCACTGGGGGTGTATGG SEQ ID NO.919
- Sonda
- ATCCCCTCCCTCTCCACCCATCTA SEQ ID NO:920
- Cebador inverso
- AAATACCAACATGCACCTCTCTT SEQ ID NO:921
- GJB2
- NM_004004.3 Cebador directo TGTCATGTACGACGGCTTCT SEQ ID NO:922
- Sonda
- AGGCGTTGCACTTCACCAGCC SEQ ID NO:923
- Cebador inverso
- AGTCCACAGTGTTGGGACAA SEQ ID NO:924
- GPX1
- NM_000581.2 Cebador directo GCTTATGACCGACCCCAA SEQ ID NO:925
- Sonda
- CTCATCACCTGGTCTCCGGTGTGT SEQ ID NO:926
- Cebador inverso
- AAAGTTCCAGGCAACATCGT SEQ ID NO:927
- GPX2
- NM_002083.1 Cebador directo CACACAGATCTCCTACTCCATCCA SEQ ID NO:928
- Sonda
- CATGCTGCATCCTAAGGCTCCTCAGG SEQ ID NO:929
- Cebador inverso
- GGTCCAGCAGTGTCTCCTGAA SEQ ID NO:930
- Grb10
- NM_005311.2 Cebador directo CTTCGCCTTTGCTGATTGC SEQ ID NO:931
- Sonda
- CTCCAAACGCCTGCCTGACGACTG SEQ ID NO:932
- Cebador inverso
- CCATAACGCACATGCTCCAA SEQ ID NO:933
- GRB14
- NM_004490.1 Cebador directo TCCCACTGAAGCCCTTTCAG SEQ ID NO:934
- Sonda
- CCTCCAAGCGAGTCCTTCTTCAACCG SEQ ID NO:935
- Cebador inverso
- AGTGCCCAGGCGTAAACATC SEQ ID NO:936
- GRB2
- NM_002086.2 Cebador directo GTCCATCAGTGCATGACGTT SEQ ID NO:937
- Sonda
- AGGCCACGTATAGTCCTAGCTGACGC SEQ ID NO:938
- Cebador inverso
- AGCCCACTTGGTTTCTTGTT SEQ ID NO:939
- GRB7
- NM_005310.1 Cebador directo CCATCTGCATCCATCTTGTT SEQ ID NO:940
- Sonda
- CTCCCCACCCTTGAGAAGTGCCT SEQ ID NO:941
- Cebador inverso
- GGCCACCAGGGTATTATCTG SEQ ID NO:942
- GRIK1
- NM_000830.2 Cebador directo GTTGGGTGCATCTCTCGG SEQ ID NO:943
- Sonda
- AATTCATGCCGAGATACAGCCGCT SEQ ID NO:944
- Cebador inverso
- CGTGCTCCATCTTCCTAGCTT SEQ ID NO:945
- GRO1
- NM_001511.1 Cebador directo CGAAAAGATGCTGAACAGTGACA SEQ ID NO:946
- Sonda
- CTTCCTCCTCCCTTCTGGTCAGTTGGAT SEQ ID NO:947
- Cebador inverso
- TCAGGAACAGCCACCAGTGA SEQ ID NO.948
- GRP
- NM_002091.1 Cebador directo CTGGGTCTCATAGAAGCAAAGGA SEQ ID NO:949
- Sonda
- AGAAACCACCAGCCACCTCAACCCA SEQ ID NO:950
- Cebador inverso
- CCACGAAGGCTGCTGATTG SEQ ID NO:951
- GRPR
- NM_005314.1 Cebador directo ATGCTGCTGGCCATTCCA SEQ ID NO:952
- Sonda
- CCGTGTTTTCTGACCTCCATCCCTTCC SEQ ID NO:953
- Cebador inverso
- AGGTCTGGTTGGTGCTTTCCT SEQ ID NO:954
- GSK3B
- NM_002093.2 Cebador directo GACAAGGACGGCAGCAAG SEQ ID NO:955
- Sonda
- CCAGGAGTTGCCACCACTGTTGTC SEQ ID NO:956
- Cebador inverso
- TTGTGGCCTGTCTGGACC SEQ ID NO:957
- GSTA3
- NM_000847.3 Cebador directo TCTCCAACTTCCCTCTGCTG SEQ ID NO:958
- Sonda
- AGGCCCTGAAAACCAGAATCAGCA SEQ ID NO:959
- Cebador inverso
- ACTTCTTCACCGTGGGCA SEQ ID NO:960
- GSTM1
- NM_000561.1 Cebador directo AAGCTATGAGGAAAAGAAGTACACGAT SEQ ID NO:961
- Sonda
- TCAGCCACTGGCTTCTGTCATAATCAGGAG SEQ ID NO:962
- Cebador inverso
- GGCCCAGCTTGAA TTTTTCA SEQ ID NO:963
- GSTM3
- NM_000849.3 Cebador directo CAATGCCATCTTGCGCTACAT SEQ ID NO:964
- Sonda
- CTCGCAAGCACAACATGTGTGGTGAGA SEQ ID NO:965
- Cebador inverso
- GTCCACTCGAATCTTTTCTTCTTCA SEQ ID NO:966
- GSTp
- NM_000852.2 Cebador directo GAGACCCTGCTGTCCCAGAA SEQ ID NO:967
- Sonda
- TCCCACAATGAAGGTCTTGCCTCCCT SEQ ID NO:968
- Cebador inverso
- GGTTGTAGTCAGCGAAGGAGATC SEQ ID NO:969
- GSTT1
- NM_000853.1 Cebador directo CACCATCCCCACCCTGTCT SEQ ID NO:970
- Sonda
- CACAGCCGCCTGAAAGCCACAAT SEQ ID NO:971
- Cebador inverso
- GGCCTCAGTGTGCATCATTCT SEQ ID NO:972
- H2AFZ
- NM_002106.2 Cebador directo CCGGAAAGGCCAAGACAA SEQ ID NO:973
- Sonda
- CCCGCTCGCAGAGAGCCGG SEQ ID NO:974
- Cebador inverso
- AATACGGCCCACTGGGAACT SEQ ID NO:975
- HB-EGF
- NM_001945.1 Cebador directo GACTCCTTCGTCCCCAGTTG SEQ ID NO:976
- Sonda
- TTGGGCCTCCCATAATTGCTTTGCC SEQ ID NO:977
- Cebador inverso
- TGGCACTTGAAGGCTCTGGTA SEQ ID NO:978
- hCRA a
- U78556.1 Cebador directo TGACACCCTTACCTTCCTGAGAA SEQ ID NO:979
- Sonda
- TCTGCTTTCCGCGCTCCCAGG SEQ ID NO:980
- Cebador inverso
- AAAAACACGAGTCAAAAATAGAAGTCACT SEQ ID NO:981
- HDAC1
- NM_004964 2 Cebador directo CAAGTACCACAGCGATGACTACATTAA SEQ ID NO:982
- Sonda
- TTCTTGCGCTCCATCCGTCCAGA SEQ ID NO:983
- Cebador inverso
- GCTTGCTGTACTCCGACATGTT SEQ ID NO:984
- HDAC2
- NM_001527.1 Cebador directo GGTGGCTACACAATCCGTAA SEQ ID NO:985
- Sonda
- TGCAGTCTCATATGTCCAACATCGAGC SEQ ID NO:986
- Cebador inverso
- TGGGAATCTCACAATCAAGG SEQ ID NO:987
- HDGF
- NM_004494.1 Cebador directo TCCTAGGCATTCTGGACCTC SEQ ID NO:988
- Sonda
- CATTCCTACCCCTGATCCCAACCC SEQ ID NO:989
- Cebador inverso
- GCTGTTGATGCTCCATCCTT SEQ ID NO:990
- hENT1
- NM_004955.1 Cebador directo AGCCGTGACTGTTGAGGTC SEQ ID NO:991
- Sonda
- AAGTCCAGCATCGCAGGCAGC SEQ ID NO:992
- Cebador inverso
- AAGTAACGTTCCCAGGTGCT SEQ ID NO:993
- Hepsn
- NM_002151.1 Cebador directo AGGCTGCTGGAGGTCATCTC SEQ ID NO:994
- Sonda
- CCAGAGGCCGTTTCTTGGCCG SEQ ID NO:995
- Cebador inverso
- CTTCCTGCGGCCACAGTCT SEQ ID NO:996
- HER2
- NM_004448.1 Cebador directo CGGTGTGAGAAGTGCAGCAA SEQ ID NO:997
- Sonda
- CCAGACCATAGCACACTCGGGCAC SEQ ID NO:998
- Cebador inverso
- CCTCTCGCAAGTGCTCCAT SEQ ID NO:999
- Herstatina
- AF177761.2 Cebador directo CACCCTGTCCTATCCTTCCT SEQ ID NO:1000
- Sonda
- CCCTCTTGGGACCTAGTCTCTGCCT SEQ ID NO:1001
- Cebador inverso
- GGCCAGGGGTAGAGAGTAGA SEQ ID NO:1002
- HES6
- NM_018645.3 Cebador directo TTAGGGACCCTGCAGCTCT SEQ ID NO:1003
- Sonda
- TAGCTCCCTCCCTCCACCCACTC SEQ ID NO:1004
- Cebador inverso
- CTACAAAATTCTTCCTCCTGCC SEQ ID NO:1005
- HGF
- M29145.1 Cebador directo CCGAAATCCAGATGATGATG SEQ ID NO:1006
- Sonda
- CTCATGGACCCTGGTGCTACACG SEQ ID NO:1007
- Cebador inverso
- CCCAAGGAATGAGTGGATTT SEQ ID NO:1008
- HIF1A
- NM_001530.1 Cebador directo TGAACATAAAGTCTGCAACATGGA SEQ ID NO:1009
- Sonda
- TTGCACTGCACAGGCCACATTCAC SEQ ID NO:1010
- Cebador inverso
- TGAGGTTGGTTACTGTTGGTATCATATA SEQ ID NO:1011
- HK1
- NM_000188.1 Cebador directo TACGCACAGAGGCAAGCA SEQ ID NO:1012
- Sonda
- TAAGAGTCCGGGATCCCCAGCCTA SEQ ID NO:1013
- Cebador inverso
- GAGAGAAGTGCTGGAGAGGC SEQ ID NO:1014
- HLA-DPB1
- NM_002121.4 Cebador directo TCCATGATGGTTCTGCAGGTT SEQ ID NO:1015
- Sonda
- CCCCGGACAGTGGCTCTGACG SEQ ID NO:1016
- Cebador inverso
- TGAGCAGCACCATCAGTAACG SEQ ID NO:1017
- HLADRA
- NM_019111.3 Cebador directo GACGATTTGCCAGCTTTGAG SEQ ID NO:1018
- Sonda
- TCAAGGTGCATTGGCCAACATAGC SEQ NO:1019 ID
- Cebador inverso
- TCCAGGTTGGCTTTGTCC SEQ NO:1020 ID
- HLA-DRB1
- NM_002124.1 Cebador directo GCTTTCTCAGGACCTGGTTG SEQ NO:1021 ID
- Sonda
- CATTTTCTGCAGTTGCCGAACCAG SEQ NO:1022 ID
- Cebador inverso
- AGGAAGCCACAAGGGAGG SEQ NO:1023 ID
- HLA-G
- NM_002127.2 Cebador directo CCTGCGCGGCTACTACAAC SEQ NO:1024 ID
- Sonda
- CGAGGCCAGTTCTCACACCCTCCAG SEQ NO:1025 ID
- Cebador inverso
- CAGGTCGCAGCCAATCATC SEQ NO:1026 ID
- HMGB1
- NM_002128.3 Cebador directo TGGCCTGTCCATTGGTGAT SEQ NO:1027 ID
- Sonda
- TTCCACATCTCTCCCAGTTTCTTCGCAA SEQ NO:1028 ID
- Cebador inverso
- GCTTGTCATCTGCAGCAGTGTT SEQ NO:1029 ID
- hMLH
- NM_000249.2 Cebador directo CTACTTCCAGCAACCCCAGA SEQ NO:1030 ID
- Sonda
- TCCACATCAGAATCTTCCCG SEQ NO:1031 ID
- Cebador inverso
- CTTTCGGGAATCATCTTCCA SEQ NO:1032 ID
- HNRPAB
- NM_004499.2 Cebador directo CAAGGGAGCGACCAACTGA SEQ NO:1033 ID
- Sonda
- CTCCATATCCAAACAAAGCATGTGTGCG SEQ NO:1034 ID
- Cebador inverso
- GTTTGCCAAGTTAAATTTGGTACATAAT SEQ NO:1035 ID
- HNRPD
- NM_031370.2 Cebador directo GCCAGTAAGAACGAGGAGGA SEQ NO:1036 ID
- Sonda
- AAGGCCATTCAAACTCCTCCCCAC SEQ NO:1037 ID
- Cebador inverso
- CGTCGCTGCTTCAGAGTGT SEQ NO:1038 ID
- HoxA1
- NM_005522.3 Cebador directo AGTGACAGATGGACAATGCAAGA SEQ NO:1039 ID
- Sonda
- TGAACTCCTTCCTGGAATACCCCA SEQ NO:1040 ID
- Cebador inverso
- CCGAGTCGCCACTGCTAAGT SEQ NO:1041 ID
- HoxA5
- NM_019102.2 Cebador directo TCCCTTGTGTTCCTTCTGTGAA SEQ NO:1042 ID
- Sonda
- AGCCCTGTTCTCGTTGCCCTAATTCATC SEQ NO:1043 ID
- Cebador inverso
- GGCAATAAACAGGCTCATGATTAA SEQ NO:1044 ID
- HOXB13
- NM_006361.2 Cebador directo CGTGCCTTATGGTTACTTTGG SEQ NO:1045 ID
- Sonda
- ACACTCGGCAGGAGTAGTACCCGC SEQ NO:1046 ID
- Cebador inverso
- CACAGGGTTTCAGCGAGC SEQ NO:1047 ID
- HOXB7
- NM_004502.2 Cebador directo CAGCCTCAAGTTCGGTTTTC SEQ NO:1048 ID
- Sonda
- ACCGGAGCCTTCCCAGAACAAACT SEQ NO:1049 ID
- Cebador inverso
- GTTGGAAGCAAACGCACA SEQ NO:1050 ID
- HRAS
- NM_005343.2 Cebador directo GGACGAATACGACCCCACT SEQ NO:1051 ID
- Sonda
- ACCACCTGCTTCCGGTAGGAATCC SEQ NO:1052 ID
- Cebador inverso
- GCACGTCTCCCCATCAAT SEQ NO:1053 ID
- HSBP1
- NM_001537.1 Cebador directo GGAGATGGCCGAGACTGAC SEQ NO:1054 ID
- Sonda
- CAAGACCGTGCAGGACCTCACCT SEQ NO:1055 ID
- Cebador inverso
- CTGCAGGAGTGTCTGCACC SEQ NO:1056 ID
- HSD17B1
- NM_0004131 Cebador directo CTGGACCGCACGGACATC SEQ NO:1057 ID
- Sonda
- ACCGCTTCTACCAATACCTCGCCCA SEQ NO:1058 ID
- Cebador inverso
- CGCCTCGCGAAAGACTTG SEQ NO:1059 ID
- HSD17B2
- NM_002153.1 Cebador directo GCTTTCCAAGTGGGGAATTA SEQ NO:1060 ID
- Sonda
- AGTTGCTTCCATCCAACCTGGAGG SEQ NO:1061 ID
- Cebador inverso
- TGCCTGCGATATTTGTTAGG SEQ NO:1062 ID
- HSPA1A
- NM_B005345.4 Cebador directo CTGCTGCGACAGTCCACTA SEQ NO:1063 ID
- Sonda
- AGAGTGACTCCCGTTGTCCCAAGG SEQ NO:1064 ID
- Cebador inverso
- CAGGTTCGCTCTGGGAAG SEQ NO:1065 ID
- HSPA1B
- NM_005346.3 Cebador directo GGTCCGCTTCGTCTTTCGA SEQ NO:1066 ID
- Sonda
- TGACTCCCGCGGTCCCAAGG SEQ NO:1067 ID
- Cebador inverso
- GCACAGGTTCGCTCTGGAA SEQ NO:1068 ID
- HSPA4
- NM_002154.3 Cebador directo TTCAGTGTGTCCAGTGCATC SEQ NO:1069 ID
- Sonda
- CATTTTCCTCAGACTTGTGAACCTCCACT SEQ NO:1070 ID
- Cebador inverso
- ATCTGTTTCCATTGGCTCCT SEQ NO:1071 ID
- HSPA5
- NM_005347.2 Cebador directo GGCTAGTAGAACTGGATCCCAACA SEQ NO:1072 ID
- Sonda
- TAATTAGACCTAGGCCTCAGCTGCACTGCC SEQ NO:1073 ID
- Cebador inverso
- GGTCTGCCCAAATGCTTTTC SEQ NO:1074 ID
- HSPA8
- NM_006597.3 Cebador directo CCTCCCTCTGGTGGTGCTT SEQ NO:1075 ID
- Sonda
- CTCAGGGCCCACCATTGAAGAGGTTG SEQ NO:1076 ID
- Cebador inverso
- GCTACATCTACACTTGGTTGGCTTAA SEQ NO:1077 ID
- HSPB1
- NM_001540.2 Cebador directo CCGACTGGAGGAGCATAAA SEQ NO:1078 ID
- Sonda
- CGCACTTTTCTGAGCAGACGTCCA SEQ NO:1079 ID
- Cebador inverso
- ATGCTGGCTGACTCTGCTC SEQ NO:1080 ID
- HSPCA
- NM_005348.2 Cebador directo CAAAAGGCAGAGGCTGATAA SEQ NO:1081 ID
- Sonda
- TGACCAGATCCTTCACAGACTTGTCGT SEQ NO:1082 ID
- Cebador inverso
- AGCGCAGTTTCATAAAGCAA SEQ NO:1083 ID
- HSPE1
- NM_002157.1 Cebador directo GCAAGCAACAGTAGTCGCTG SEQ NO:1084 ID
- Sonda
- TCTCCACCCTTTCCTTTAGAACCCG SEQ NO:1085 ID
- Cebador inverso
- CCAACTTTCACGCTAACTGGT SEQ NO:1086 ID
- HSPG2
- NM_005529 2 Cebador directo GAGTACGTGTGCCGAGTGTT SEQ NO:1087 ID
- Sonda
- CAGCTCCGTGCCTCTAGAGGCCT SEQ NO:1088 ID
- Cebador inverso
- CTCAATGGTGACCAGGACA SEQ NO:1089 ID
- ICAM1
- NM_000201.1 Cebador directo GCAGACAGTGACCATCTACAGCTT SEQ NO:1090 ID
- Sonda
- CCGGCGCCCAACGTGATTCT SEQ NO:1091 ID
- Cebador inverso
- CTTCTGAGACCTCTGGCTTCGT SEQ NO:1092 ID
- ICAM2
- NM_000873.2 Cebador directo GGTCATCCTGACACTGCAAC SEQ NO:1093 ID
- Sonda
- TTGCCCACAGCCACCAAAGTG SEQ NO:1094 ID
- Cebador inverso
- TGCACTCAATGGTGAAGGAC SEQ NO:1095 ID
- ID1
- NM_002165.1 Cebador directo AGAACCGCAAGGTGAGCAA SEQ NO.1096 ID
- Sonda
- TGGAGATTCTCCAGCACGTCATCGAC SEQ NO:1097 ID
- Cebador inverso
- TCCAACTGAAGGTCCCTGATG SEQ NO:1098 ID
- ID2
- NM_002166.1 Cebador directo AACGACTGCTACTCCAAGCTCAA SEQ NO:1099 ID
- Sonda
- TGCCCAGCATCCCCCAGAACAA SEQ NO:1100 ID
- Cebador inverso
- GGATTTCCATCTTGCTCACCTT SEQ NO:1101 ID
- ID3
- NM_002167.2 Cebador directo CTTCACCAAATCCCTTCCTG SEQ NO:1102 ID
- Sonda
- TCACAGTCCTTCGCTCCTGAGCAC SEQ NO:1103 ID
- Cebador inverso
- CTCTGGCTCTTCAGGCTACA SEQ NO:1104 ID
- ID4
- NM_001546.2 Cebador directo TGGCCTGGCTCTTAATTTG SEQ NO:1105 ID
- Sonda
- CTTTTGTTTTGCCCAGTATAGACTCGGAAG SEQ NO:1106 ID
- Cebador inverso
- TGCAATCATGCAAGACCAC SEQ NO:1107 ID
- IFIT1
- NM_001548.1 Cebador directo TGACAACCAAGCAAATGTGA SEQ NO:1108 ID
- Sonda
- AAGTTGCCCCAGGTCACCAGACTC SEQ NO:1109 ID
- Cebador inverso
- CAGTCTGCCCATGTGGTAAT SEQ NO:1110 ID
- IGF1
- NM_000618.1 Cebador directo TCCGGAGCTGTGATCTAAGGA SEQ NO:1111 ID
- Sonda
- TGTATTGCGCACCCCTCAAGCCTG SEQ NO:1112 ID
- Cebador inverso
- CGGACAGAGCGAGCTGACTT SEQ NO:1113 ID
- IGF1R
- NM_000875.2 Cebador directo GCATGGTAGCCGAAGATTTCA SEQ NO:1114 ID
- Sonda
- CGCGTCATACCAAAATCTCCGATTTTGA SEQ NO:1115 ID
- Cebador inverso
- TTTCCGGTAATAGTCTGTCTCATAGATATC SEQ NO:1116 ID
- IGF2
- NM_000612.2 Cebador directo CCGTGCTTCCGGACAACTT SEQ NO:1117 ID
- Sonda
- TACCCCGTGGGCAAGTTCTTCCAA SEQ NO:1118 ID
- Cebador inverso
- TGGACTGCTTCCAGGTGTCA SEQ NO:1119 ID
- IGFBP2
- NM_000597.1 Cebador directo GTGGACAGCACCATGAACA SEQ NO:1120 ID
- Sonda
- CTTCCGGCCAGCACTGCCTC SEQ NO:1121 ID
- Cebador inverso
- CCTTCATACCCGACTTGAGG SEQ NO:1122 ID
- IGFBP3
- NM_000598.1 Cebador directo ACGCACCGGGTGTCTGA SEQ NO:1123 ID
- Sonda
- CCCAAGTTCCACCCCCTCCATTCA SEQ NO:1124 ID
- Cebador inverso
- TGCCCTTTCTTGATGATGATTATC SEQ NO:1125 ID
- IGFBP5
- NM_000599.1 Cebador directo TGGACAAGTACGGGATGAAGCT SEQ NO:1126 ID
- Sonda
- CCCGTCAACGTACTCCATGCCTGG SEQ NO:1127 ID
- Cebador inverso
- CGAAGGTGTGGCACTGAAAGT SEQ NO:1128 ID
- IGFBP6
- NM_002178.1 Cebador directo TGAACCGCAGAGACCAACAG SEQ NO:1129 ID
- Sonda
- ATCCAGGCACCTCTACCACGCCCTC SEQ NO:1130 ID
- Cebador inverso
- GTCTTGGACACCCGCAGAAT SEQ NO:1131 ID
- IGFBP7
- NM_001553 Cebador directo GGGTCACTATGGAGTTCAAAGGA SEQ NO:1132 ID
- Sonda
- CCCGGTCACCAGGCAGGAGTTCT SEQ NO:1133 ID
- Cebador inverso
- GGGTCTGAATGGCCAGGTT SEQ NO:1134 ID
- IHH
- NM_002181.1 Cebador directo AAGGACGAGGAGAACACAGG SEQ NO:1135 ID
- Sonda
- ATGACCCAGCGCTGCAAGGAC SEQ NO:1136 ID
- Cebador inverso
- AGATAGCCAGCGAGTTCAGG SEQ NO:1137 ID
- IL-8
- NM_000584.2 Cebador directo AAGGAACCATCTCACTGTGTGTAAAC SEQ NO:1138 ID
- Sonda
- TGACTTCCAAGCTGGCCGTGGC SEQ NO:1139 ID
- Cebador inverso
- ATCAGGAAGGCTGCCAAGAG SEQ NO:1140 ID
- IL10
- NM_000572.1 Cebador directo GGCGCTGTCATCGATTTCTT SEQ NO:1141 ID
- Sonda
- CTGCTCCACGGCCTTGCTCTTG SEQ NO:1142 ID
- Cebador inverso
- TGGAGCTTATTAAAGGCATTCTTCA SEQ NO:1143 ID
- IL1B
- NM_000576.2 Cebador directo AGCTGAGGAAGATGCTGGTT SEQ NO:1144 ID
- Sonda
- TGCCCACAGACCTTCCAGGAGAAT SEQ NO:1145 ID
- Cebador inverso
- GGAAAGAAGGTGCTCAGGTC SEQ NO:1146 ID
- IL6
- NM_000600.1 Cebador directo CCTGAACCTTCCAAAGATGG SEQ NO:1147 ID
- Sonda
- CCAGATTGGAAGCATCCATCTTTTTCA SEQ NO:1148 ID
- Cebador inverso
- ACCAGGCAAGTCTCCTCATT SEQ NO:1149 ID
- IL6ST
- NM_002184.2 Cebador directo GGCCTAATGTTCCAGATCCT SEQ NO:1150 ID
- Sonda
- CATATTGCCCAGTGGTCACCTCACA SEQ NO:1151 ID
- Cebador inverso
- AAAATTGTGCCTTGGAGGAG SEQ NO:1152 ID
- ILT-2
- NM_006669.1 Cebador directo AGCCATCACTCTCAGTGCAG SEQ NO:1153 ID
- Sonda
- CAGGTCCTATCGTGGCCCCTGA SEQ NO:1154 ID
- Cebador inverso
- ACTGCAGAGTCAGGGTCTCC SEQ NO:1155 ID
- IMP-1
- NM_006546.2 Cebador directo GAAAGTGTTTGCGGAGCAC SEQ NO:1156 ID
- Sonda
- CTCCTACAGCGGCCAGTTCTTGGT SEQ NO:1157 ID
- Cebador inverso
- GAAGGCGTAGCCGGATTT SEQ NO:1158 ID
- IMP2
- NM_006548.3 Cebador directo CAATCTGATCCCAGGGTTGAA SEQ NO:1159 ID
- Sonda
- CTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACA SEQ NO:1160 ID
- Cebador inverso
- GGCCCTGCTGGTGGAGATA SEQ NO:1161 ID
- ING1L
- NM_001564.1 Cebador directo TGTTTCCAAGATCCTGCTGA SEQ NO:1162 ID
- Sonda
- CCATCTTTGCTTTATCTGAGGCTCGTTC SEQ NO:1163 ID
- Cebador inverso
- TCTTTCTGGTTGGCTGGAAT SEQ NO:1164 ID
- ING5
- NM_032329.4 Cebador directo CCTACAGCAAGTGCAAGGAA SEQ NO:1165 ID
- Sonda
- CCAGCTGCACTTTGTCGTCACTGT SEQ NO:1166 ID
- Cebador inverso
- CATCTCGTAGGTCTGCATGG SEQ NO:1167 ID
- INHA
- NM_002191.2 Cebador directo CCTCCCAGTTTCATCTTCCACTA SEQ NO:1168 ID
- Sonda
- ATGTGCAGCCCACAACCACCATGA SEQ NO:1169 ID
- Cebador inverso
- AGGGACTGGAAGGGACAGGTT SEQ NO:1170 ID
- INHBA
- NM_002192.1 Cebador directo GTGCCCGAGCCATATAGCA SEQ NO:1171 ID
- Sonda
- ACGTCCGGGTCCTCACTGTCCTTCC SEQ NO:1172 ID
- Cebador inverso
- CGGTAGTGGTTGATGACTGTTGA SEQ NO:1173 ID
- INHBB
- NM_002193.1 Cebador directo AGCCTCCAGGATACCAGCAA SEQ NO:1174 ID
- Sonda
- AGCTAAGCTGCCATTTGTCACCG SEQ NO:1175 ID
- Cebador inverso
- TCTCCGACTGACAGGCATTTG SEQ NO:1176 ID
- IRS1
- NM_005544.1 Cebador directo CCACAGCTCACCTTCTGTCA SEQ NO:1177 ID
- Sonda
- TCCATCCCAGCTCCAGCCAG SEQ NO:1178 ID
- Cebador inverso
- CCTCAGTGCCAGTCTCTTCC SEQ NO:1179 ID
- ITGA3
- NM_002204.1 Cebador directo CCATGATCCTCACTCTGCTG SEQ NO:1180 ID
- Sonda
- CACTCCAGACCTCGCTTAGCATGG SEQ NO:1181 ID
- Cebador inverso
- GAAGCTTTGTAGCCGGTGAT SEQ NO:1182 ID
- ITGA4
- NM_000885.2 Cebador directo CAACGCTTCAGTGATCAATCC SEQ NO:1183 ID
- Sonda
- CGATCCTGCATCTGTAAATCGCCC SEQ NO:1184 ID
- Cebador inverso
- GTCTGGCCGGGATTCTTT SEQ NO:1185 ID
- ITGA5
- NM_002205.1 Cebador directo AGGCCAGCCCTACATTATCA SEQ NO:1186 ID
- Sonda
- TCTGAGCCTTGTCCTCTATCCGGC SEQ NO:1187 ID
- Cebador inverso
- GTCTTCTCCACAGTCCAGCA SEQ NO:1188 ID
- ITGA6
- NM_000210.1 Cebador directo CAGTGACAAACAGCCCTTCC SEQ NO:1189 ID
- Sonda
- TCGCCATCTTTTGTGGGATTCCTT SEQ NO:1190 ID
- Cebador inverso
- GTTTAGCCTCATGGGCGTC SEQ NO:1191 ID
- ITGA7
- NM_002206.1 Cebador directo GATATGATTGGTCGCTGCTTTG SEQ NO:1192 ID
- Sonda
- CAGCCAGGACCTGGCCATCCG SEQ NO:1193 ID
- Cebador inverso
- AGAACTTCCATTCCCCACCAT SEQ NO:1194 ID
- ITGAV
- NM_002210.2 Cebador directo ACTCGGACTGCACAAGCTATT SEQ NO:1195 ID
- Sonda
- CCGACAGCCACAGAATAACCCAAA SEQ NO:1196 ID
- Cebador inverso
- TGCCATCACCATTGAAATCT SEQ NO:1197 ID
- ITGB1
- NM_002211.2 Cebador directo TCAGAATTGGATTTGGCTCA SEQ NO:1198 ID
- Sonda
- TGCTAATGTAAGGCATCACAGTCTTTTCCA SEQ NO:1199 ID
- Cebador inverso
- CCTGAGCTTAGCTGGTGTTG SEQ NO:1200 ID
- ITGB3
- NM_000212.1 Cebador directo ACCGGGAGCCCTACATGAC SEQ NO:1201 ID
- Sonda
- AAATACCTGCAACCGTTACTGCCGTGAC SEQ NO:1202 ID
- Cebador inverso
- CCTTAAGCTCTTTCACTGACTCAATCT SEQ NO:1203 ID
- ITGB4
- NM_000213.2 Cebador directo CAAGGTGCCCTCAGTGGA SEQ NO:1204 ID
- Sonda
- CACCAACCTGTACCCGTATTGCGA SEQ NO:1205 ID
- Cebador inverso
- GCGCACACCTTCATCTCAT SEQ NO:1206 ID
- ITGB5
- NM_002213.3 Cebador directo TCGTGAAAGATGACCAGGAG SEQ NO:1207 ID
- Sonda
- TGCTATGTTTCTACAAAACCGCCAAGG SEQ NO:1208 ID
- Cebador inverso
- GGTGAACATCATGACGCAGT SEQ NO:1209 ID
- K-ras
- NM_033360.2 Cebador directo GTCAAAATGGGGAGGGACTA SEQ NO:1210 ID
- Sonda
- TGTATCTTGTTGAGCTATCCAAACTGCCC SEQ NO:1211 ID
- Cebador inverso
- CAGGACCACCACAGAGTGAG SEQ NO.1212 ID
- KCNH2 iso a/b
- NM_000238.2 Cebador directo GAGCGCAAAGTGGAAATCG SEQ NO:1213 ID
- Sonda
- TAGGAAGCAGCTCCCATCTTTCCGGTA SEQ NO:1214 ID
- Cebador inverso
- TCTTCACGGGCACCACATC SEQ NO:1215 ID
- KCNH2 iso a/c
- NM_172057.1 Cebador directo TCCTGCTGCTGGTCATCTAC SEQ NO:1216 ID
- Sonda
- TGTCTTCACACCCTACTCGGCTGC SEQ NO:1217 ID
- Cebador inverso
- CCTTCTTCCGTCTCCTTCAG SEQ NO:1218 ID
- KCNK4
- NM_016611.2 Cebador directo CCTATCAGCCGCTGGTGT SEQ NO:1219 ID
- Sonda
- ATCCTGCTCGGCCTGGCTTACTTC SEQ NO:1220 ID
- Cebador inverso
- TGGTGGTGAGCACTGAGG SEQ NO:1221 ID
- KDR
- NM_002253.1 Cebador directo GAGGACGAAGGCCTCTACAC SEQ NO:1222 ID
- Sonda
- CAGGCATGCAGTGTTCTTGGCTGT SEQ NO:1223 ID
- Cebador inverso
- AAAAATGCCTCCACTTTTGC SEQ NO:1224 ID
- Ki-67
- NM_002417.1 Cebador directo CGGACTTTGGGTGCGACTT SEQ NO:1225 ID
- Sonda
- CCACTTGTCGAACCACCGCTCGT SEQ NO:1226 ID
- Cebador inverso
- TTACAACTCTTCCACTGGGACGAT SEQ NO:1227 ID
- KIAA0125
- NM_014792.2 Cebador directo GTGTCCTGGTCCATGTGGT SEQ NO:1228 ID
- Sonda
- CACGTGTCTCCACCTCCAAGGAGA SEQ NO:1229 ID
- Cebador inverso
- GGGAGGTGCACACTGAGG SEQ NO:1230 ID
- KIF22
- NM_007317.1 Cebador directo CTAAGGCACTTGCTGGAAGG SEQ NO:1231 ID
- Sonda
- TCCATAGGCAAGCACACTGGCATT SEQ NO:1232 ID
- Cebador inverso
- TCTTCCCAGCTCCTGTGG SEQ NO:1233 ID
- KIF2C
- NM_006845.2 Cebador directo AATTCCTGCTCCAAAAGAAAGTCTT SEQ NO:1234 ID
- Sonda
- AAGCCGCTCCACTCGCATGTCC SEQ NO:1235 ID
- Cebador inverso
- CGTGATGCGAAGCTCTGAGA SEQ NO:1236 ID
- KIFC1
- XM_371813.1 Cebador directo CCACAGGGTTGAAGAACCAG SEQ NO:1237 ID
- Sonda
- AGCCAGTTCCTGCTGTTCCTGTCC SEQ NO:1238 ID
- Cebador inverso
- CACCTGATGTGCCAGACTTC SEQ NO:1239 ID
- Kitlng
- NM_000899.1 Cebador directo GTCCCCGGGATGGATGTT SEQ NO:1240 ID
- Sonda
- CATCTCGCTTATCCAACAATGACTTGGCA SEQ NO:1241 ID
- Cebador inverso
- GATCAGTCAAGCTGTCTGACAATTG SEQ NO:1242 ID
- KLF5
- NM_001730.3 Cebador directo GTGCAACCGCAGCTTCTC SEQ NO:1243 ID
- Sonda
- CTCTGACCACCTGGCCCTGCATAT SEQ NO:1244 ID
- Cebador inverso
- CGGGCAGTGCTCAGTTCT SEQ NO:1245 ID
- KLF6
- NM_001300.4 Cebador directo CACGAGACCGGCTACTTCTC SEQ NO:1246 ID
- Sonda
- AGTACTCCTCCAGAGACGGCAGCG SEQ NO:1247 ID
- Cebador inverso
- GCTCTAGGCAGGTCTGTTGC SEQ NO:1248 ID
- KLK10
- NM_002776.1 Cebador directo GCCCAGAGGCTCCATCGT SEQ NO:1249 ID
- Sonda
- CCTCTTCCTCCCCAGTCGGCTGA SEQ NO:1250 ID
- Cebador inverso
- CAGAGGTTTGAACAGTGCAGACA SEQ NO:1251 ID
- KLK6
- NM_002774.2 Cebador directo GACGTGAGGGTCCTGATTCT SEQ NO:1252 ID
- Sonda
- TTACCCCAGCTCCATCCTTGCATC SEQ NO:1253 ID
- Cebador inverso
- TCCTCACTCATCACGTCCTC SEQ NO:1254 ID
- KLRK1
- NM_007360.1 Cebador directo TGAGAGCCAGGCTTCTTGTA SEQ NO:1255 ID
- Sonda
- TGTCTCAAAATGCCAGCCTTCTGAA SEQ NO:1256 ID
- Cebador inverso
- ATCCTGGTCCTCTTTGCTGT SEQ NO:1257 ID
- KNTC2
- NM_006101.1 Cebador directo ATGTGCCAGTGAGCTTGAGT SEQ NO:1258 ID
- Sonda
- CCTTGGAGAAACACAAGCACCTGC SEQ NO:1259 ID
- Cebador inverso
- TGAGCCCCTGGTTAACAGTA SEQ NO:1260 ID
- KRAS2
- NM_004985.3 Cebador directo GAGACCAAGGTTGCAAGGC SEQ NO:1261 ID
- Sonda
- AAGCTCAAAGGTTCACACAGGGCC SEQ NO:1262 ID
- Cebador inverso
- CAGTCCATGCTGTGAAACTCTC SEQ NO:1263 ID
- KRT19
- NM_002276.1 Cebador directo TGAGCGGCAGAATCAGGAGTA SEQ NO:1264 ID
- Sonda
- CTCATGGACATCAAGTCGCGGCTG SEQ NO:1265 ID
- Cebador inverso
- TGCGGTAGGTGGCAATCTC SEQ NO:1266 ID
- KRT8
- NM_002273.1 Cebador directo GGATGAAGCTTACATGAACAAGGTAGA SEQ NO:1267 ID
- Sonda
- CGTCGGTCAGCCCTTCCAGGC SEQ NO:1268 ID
- Cebador inverso
- CATATAGCTGCCTGAGGAAGTTGAT SEQ NO:1269 ID
- LAMA3
- NM_000227.2 Cebador directo CAGATGAGGCACATGGAGAC SEQ NO:1270 ID
- Sonda
- CTGATTCCTCAGGTCCTTGGCCTG SEQ NO:1271 ID
- Cebador inverso
- TTGAAATGGCAGAACGGTAG SEQ NO:1272 ID
- LAMB3
- NM_000228.1 Cebador directo ACTGACCAAGCCTGAGACCT SEQ NO:1273 ID
- Sonda
- CCACTCGCCATACTGGGTGCAGT SEQ NO:1274 ID
- Cebador inverso
- GTCACACTTGCAGCATTTCA SEQ NO:1275 ID
- LAMC2
- NM_005562.1 Cebador directo ACTCAAGCGGAAATTGAAGCA SEQ NO:1276 ID
- Sonda
- AGGTCTTATCAGCACAGTCTCCGCCTCC SEQ NO:1277 ID
- Cebador inverso
- ACTCCCTGAAGCCGAGACACT SEQ NO:1278 ID
- LAT
- NM_014387.2 Cebador directo GTGAACGTTCCGGAGAGC SEQ NO:1279 ID
- Sonda
- ATCCAGAGACGCTTCTGCGCTCTC SEQ NO:1280 ID
- Cebador inverso
- ACATTCACATACTCCCGGCT SEQ NO:1281 ID
- LCN2
- NM_005564.2 Cebador directo CGCTGGGCAACATTAAGAG SEQ NO:1282 ID
- Sonda
- TCACCACTCGGACGAGGTAACTCG SEQ NO:1283 ID
- Cebador inverso
- AGCATGCTGGTTGTAGTTGGT SEQ NO:1284 ID
- LDLRAP1
- NM_015627.1 Cebador directo CAGTGCCTCTCGCCTGTC SEQ NO:1285 ID
- Sonda
- ACTGGGACAAGCCTGACAGCAGC SEQ NO:1286 ID
- Cebador inverso
- TGAAGAGGTCATCCTGCTCTG SEQ NO:1287 ID
- LEF
- NM_016269.2 Cebador directo GATGACGGAAAGCATCCAG SEQ NO:1288 ID
- Sonda
- TGGAGGCCTCTACAACAAGGGACC SEQ NO:1289 ID
- Cebador inverso
- CCCGGAATAACTCGAGTAGGA SEQ NO:1290 ID
- LGALS3
- NM_002306.1 Cebador directo AGCGGAAAATGGCAGACAAT SEQ NO:1291 ID
- Sonda
- ACCCAGATAACGCATCATGGAGCGA SEQ NO:1292 ID
- Cebador inverso
- CTTGAGGGTTTGGGTTTCCA SEQ NO:1293 ID
- LGMN
- NM_001008530.1 Cebador directo TTGGTGCCGTTCCTATAGATG SEQ NO:1294 ID
- Sonda
- CAGTGCTTGCCTCCATCTTCAGGA SEQ NO:1295 ID
- Cebador inverso
- GAACCTGCCACGATCACC SEQ NO:1296 ID
- LILRB3
- NM_006864.1 Cebador directo CACCTGGTCTGGGAAGATACC SEQ NO:1297 ID
- Sonda
- ACCGAGACCCCAATCAAAACCTCC SEQ NO:1298 ID
- Cebador inverso
- AAGAGCAGCAGGACGAAGG SEQ NO:1299 ID
- LMNB1
- NM_005573.1 Cebador directo TGCAAACGCTGGTGTCACA SEQ NO:1300 ID
- Sonda
- CAGCCCCCCAACTGACCTCATC SEQ NO:1301 ID
- Cebador inverso
- CCCCACGAGTTCTGGTTCTTC SEQ NO:1302 ID
- LMYC
- NM_012421.1 Cebador directo CCCATCCAGAACACTGATTG SEQ NO:1303 ID
- Sonda
- TGACCTCCATCCCTTTCACTTGAATG SEQ NO:1304 ID
- Cebador inverso
- CTGCTTTCTATGCACCCTTTC SEQ NO:1305 ID
- LOX
- NM_002317.3 Cebador directo CCAATGGGAGAACAACGG SEQ NO:1306 ID
- Sonda
- CAGGCTCAGCAAGCTGAACACCTG SEQ NO:1307 ID
- Cebador inverso
- CGCTGAGGCTGGTACTGTG SEQ NO:1308 ID
- LOXL2
- NM_002318.1 Cebador directo TCAGCGGGCTCTTAAACAA SEQ NO:1309 ID
- Sonda
- CAGCTGTCCCCGCAGTAAAGAAGC SEQ NO:1310 ID
- Cebador inverso
- AAGACAGGAGTTGACCACGC SEQ NO:1311 ID
- LRP5
- NM_002335.1 Cebador directo CGACTATGACCCACTGGACA SEQ NO:1312 ID
- Sonda
- CGCCCATCCACCCAGTAGATGAAC SEQ NO:1313 ID
- Cebador inverso
- CTTGGCTCGCTTGATGTTC SEQ NO:1314 ID
- LRP6
- NM_002336.1 Cebador directo GGATGTAGCCATCTCTGCCT SEQ NO:1315 ID
- Sonda
- ATAGACCTCAGGGCCTTCGCTGTG SEQ NO:1316 ID
- Cebador inverso
- AGTTCAAAGCCAATAGGGCA SEQ NO:1317 ID
- LY6D
- NM_003695.2 Cebador directo AATGCTGATGACTTGGAGCAG SEQ NO:1318 ID
- Sonda
- CACAGACCCCACAGAGGATGAAGC SEQ NO:1319 ID
- Cebador inverso
- CTGCATCCTCTGTGGGGT SEQ NO:1320 ID
- MAD
- NM_002357.1 Cebador directo TGGTTCTGATTAGGTAACGTATTGGA SEQ NO:1321 ID
- Sonda
- CTGCCCACAACTCCCTTGCACGTAA SEQ NO:1322 ID
- Cebador inverso
- GGTCAAGGTGGGACACTGAAG SEQ NO:1323 ID
- MAD1L1
- NM_003550.1 Cebador directo AGAAGCTGTCCCTGCAAGAG SEQ NO:1324 ID
- Sonda
- CATGTTCTTCACAATCGCTGCATCC SEQ NO:1325 ID
- Cebador inverso
- AGCCGTACCAGCTCAGACTT SEQ NO:1326 ID
- MAD2L1
- NM_002358.2 Cebador directo CCGGGAGCAGGGAATCAC SEQ NO:1327 ID
- Sonda
- CGGCCACGATTTCGGCGCT SEQ NO:1328 ID
- Cebador inverso
- ATGCTGTTGATGCCGAATGA SEQ NO:1329 ID
- MADH2
- NM_005901.2 Cebador directo GCTGCCTTTGGTAAGAACATGTC SEQ NO:1330 ID
- Sonda
- TCCATCTTGCCATTCACGCCGC SEQ NO:1331 ID
- Cebador inverso
- ATCCCAGCAGTCTCTTCACAACT SEQ NO:1332 ID
- MADH4
- NM_005359.3 Cebador directo GGACATTACTGGCCTGTTCACA SEQ NO:1333 ID
- Sonda
- TGCATTCCAGCCTCCCATTTCCA SEQ NO:1334 ID
- Cebador inverso
- ACCAATACTCAGGAGCAGGATGA SEQ NO:1335 ID
- MADH7
- NM_005904.1 Cebador directo TCCATCAAGGCTTTCGACTA SEQ NO:1336 ID
- Sonda
- CTGCAGGCTGTACGCCTTCTCG SEQ NO:1337 ID
- Cebador inverso
- CTGCTGCATAAACTCGTGGT SEQ NO:1338 ID
- MAP2
- NM_031846.1 Cebador directo CGGACCACCAGGTCAGAG SEQ NO:1339 ID
- Sonda
- CCACTCTTCCCTGCTCTGCGAATT SEQ NO:1340 ID
- Cebador inverso
- CAGGGGTAGTGGGTGTTGAG SEQ NO:1341 ID
- MAP2K1
- NM_002755.2 Cebador directo GCCTTTCTTACCCAGAAGCAGAA SEQ NO:1342 ID
- Sonda
- TCTCAAAGTCGTCATCCTTCAGTTCTCCCA SEQ NO:1343 ID
- Cebador inverso
- CAGCCCCCAGCTCACTGAT SEQ NO:1344 ID
- MAP3K1
- XM_042066.8 Cebador directo GGTTGGCATCAAAAGGAACT SEQ NO:1345 ID
- Sonda
- AATTGTCCCTGAAACTCTCCTGCACC SEQ NO:1346 ID
- Cebador inverso
- TGCCATAAATGCAATTGTCC SEQ NO:1347 ID
- MAPK14
- NM_139012.1 Cebador directo TGAGTGGAAAAGCCTGACCTATG SEQ NO:1348 ID
- Sonda
- TGAAGTCATCAGCTTTGTGCCACCACC SEQ NO:1349 ID
- Cebador inverso
- GGACTCCATCTCTTCTTGGTCAA SEQ NO:1350 ID
- Maspm
- NM_002639.1 Cebador directo CAGATGGCCACTTTGAGAACATT SEQ NO:1351 ID
- Sonda
- AGCTGACAACAGTGTGAACGACCAGACC SEQ NO:1352 ID
- Cebador inverso
- GGCAGCATTAACCACAAGGATT SEQ NO:1353 ID
- MAX
- NM_002382.3 Cebador directo CAAACGGGCTCATCATAATGC SEQ NO:1354 ID
- Sonda
- TGATGTGGTCCCTACGTTTTCGTTCCA SEQ NO:1355 ID
- Cebador inverso
- TCCCGCAAACTGTGAAAGCT SEQ NO:1356 ID
- MCM2
- NM_004526.1 Cebador directo GACTTTTGCCCGCTACCTTTC SEQ NO:1357 ID
- Sonda
- ACAGCTCATTGTTGTCACGCCGGA SEQ NO:1358 ID
- Cebador inverso
- GCCACTAACTGCTTCAGTATGAAGAG SEQ NO:1359 ID
- MCM3
- NM_002388.2 Cebador directo GGAGAACAATCCCCTTGAGA SEQ NO:1360 ID
- Sonda
- TGGCCTTTCTGTCTACAAGGATCACCA SEQ NO:1361 ID
- Cebador inverso
- ATCTCCTGGATGGTGATGGT SEQ NO:1362 ID
- MCM6
- NM_005915.2 Cebador directo TGATGGTCCTATGTGTCACATTCA SEQ NO:1363 ID
- Sonda
- CAGGTTTCATACCAACACAGGCTTCAGCAC SEQ NO:1364 ID
- Cebador inverso
- TGGGACAGGAAACACACCAA SEQ NO:1365 ID
- MCP1
- NM_002982.1 Cebador directo CGCTCAGCCAGATGCAATC SEQ NO:1366 ID
- Sonda
- TGCCCCAGTCACCTGCTGTTA SEQ NO:1367 ID
- Cebador inverso
- GCACTGAGATCTTCCTATTGGTGAA SEQ NO:1368 ID
- MDK
- NM_002391.2 Cebador directo GGAGCCGACTGCAAGTACA SEQ NO:1369 ID
- Sonda
- ATCACACGCACCCCAGTTCTCAAA SEQ NO:1370 ID
- Cebador inverso
- GACTTTGGTGCCTGTGCC SEQ NO:1371 ID
- MDM2
- NM_002392.1 Cebador directo CTACAGGGACGCCATCGAA SEQ NO:1372 ID
- Sonda
- CTTACACCAGCATCAAGATCCGG SEQ NO:1373 ID
- Cebador inverso
- ATCCAACCAATCACCTGAATGTT SEQ NO:1374 ID
- MGAT5
- NM_002410.2 Cebador directo GGAGTCGAAGGTGGACAATC SEQ NO:1375 ID
- Sonda
- AATGGCACCGGAACAAACTCAACC SEQ NO:1376 ID
- Cebador inverso
- TGGGAACAGCTGTAGTGGAGT SEQ NO:1377 ID
- MGMT
- NM_002412.1 Cebador directo GTGAAATGAAACGCACCACA SEQ NO:1378 ID
- Sonda
- CAGCCCTTTGGGGAAGCTGG SEQ NO:1379 ID
- Cebador inverso
- GACCCTGCTCACAACCAGAC SEQ NO:1380 ID
- mGST1
- NM_020300.2 Cebador directo ACGGATCTACCACACCATTGC SEQ NO:1381 ID
- Sonda
- TTTGACACCCCTTCCCCAGCCA SEQ NO:1382 ID
- Cebador inverso
- TCCATATCCAACAAAAAAACTCAAAG SEQ NO:1383 ID
- MMP1
- NM_002421.2 Cebador directo GGGAGATCATCGGGACAACTC SEQ NO:1384 ID
- Sonda
- AGCAAGATTTCCTCCAGGTCCATCAAAAGG SEQ NO:1385 ID
- Cebador inverso
- GGGCCTGGTTGAAAAGCAT SEQ NO:1386 ID
- MMP12
- NM_002426.1 Cebador directo CCAACGCTTGCCAAATCCT SEQ NO:1387 ID
- Sonda
- AACCAGCTCTCTGTGACCCCAATT SEQ NO:1388 ID
- Cebador inverso
- ACGGTAGTGACAGCATCAAAACTC SEQ NO:1389 ID
- MMP2
- NM_004530.1 Cebador directo CCATGATGGAGAGGCAGACA SEQ NO:1390 ID
- Sonda
- CTGGGAGCATGGCGATGGATACCC SEQ NO:1391 ID
- Cebador inverso
- GGAGTCCGTCCTTACCGTCAA SEQ NO:1392 ID
- MMP7
- NM_002423.2 Cebador directo GGATGGTAGCAGTCTAGGGATTAACT SEQ NO:1393 ID
- Sonda
- CCTGTATGCTGCAACTCATGAACTTGGC SEQ NO:1394 ID
- Cebador inverso
- GGAATGTCCCATACCCAAAGAA SEQ NO:1395 ID
- MMP9
- NM_004994.1 Cebador directo GAGAACCAATCTCACCGACA SEQ NO:1396 ID
- Sonda
- ACAGGTATTCCTCTGCCAGCTGCC SEQ NO:1397 ID
- Cebador inverso
- CACCCGAGTGTAACCATAGC SEQ NO:1398 ID
- MRP1
- NM_004996.2 Cebador directo TCATGGTGCCCGTCAATG SEQ NO:1399 ID
- Sonda
- ACCTGATACGTCTTGGTCTTCATCGCCAT SEQ NO:1400 ID
- Cebador inverso
- CGATTGTCTTTGCTCTTCATGTG SEQ NO:1401 ID
- MRP2
- NM_000392.1 Cebador directo AGGGGATGACTTGGACACAT SEQ NO:1402 ID
- Sonda
- CTGCCATTCGACATGACTGCAATTT SEQ NO:1403 ID
- Cebador inverso
- AAAACTGCATGGCTTTGTCA SEQ NO:1404 ID
- MRP3
- NM_003786.2 Cebador directo TCATCCTGGCGATCTACTTCCT SEQ NO:1405 ID
- Sonda
- TCTGTCCTGGCTGGAGTCGCTTTCAT SEQ NO:1406 ID
- Cebador inverso
- CCGTTGAGTGGAATCAGCAA SEQ NO:1407 ID
- MRP4
- NM_005845.1 Cebador directo AGCGCCTGGAATCTACAACT SEQ NO:1408 ID
- Sonda
- CGGAGTCCAGTGTTTTCCCACTTG SEQ NO:1409 ID
- Cebador inverso
- AGAGCCCCTGGAGAGAAGAT SEQ NO:1410 ID
- MRPL40
- NM_003776.2 Cebador directo ACTTGCAGGCTGCTATCCTT SEQ NO:1411 ID
- Sonda
- TTCCTACTCTCAGGGGCAGCATGTT SEQ NO:1412 ID
- Cebador inverso
- AGCAGACTTGAACCCTGGTC SEQ NO:1413 ID
- MSH2
- NM_000251.1 Cebador directo GATGCAGAATTGAGGCAGAC SEQ NO:1414 ID
- Sonda
- CAAGAAGATTTACTTCGTCGATTCCCAGA SEQ NO:1415 ID
- Cebador inverso
- TCTTGGCAAGTCGGTTAAGA SEQ NO:1416 ID
- MSH3
- NM_002439.1 Cebador directo TGATTACCATCATGGCTCAGA SEQ NO:1417 ID
- Sonda
- TCCCAATTGTCGCTTCTTCTGCAG SEQ NO:1418 ID
- Cebador inverso
- CTTGTGAAAATGCCATCCAC SEQ NO:1419 ID
- MSH6
- NM_000179.1 Cebador directo TCTATTGGGGGATTGGTAGG SEQ NO:1420 ID
- Sonda
- CCGTTACCAGCTGGAAATTCCTGAGA SEQ NO:1421 ID
- Cebador inverso
- CAAATTGCGAGTGGTGAAAT SEQ NO:1422 ID
- MT3
- NM_005954.1 Cebador directo GTGTGAGAAGTGTGCCAAGG SEQ NO:1423 ID
- Sonda
- CTCTCCGCCTTTGCACACACAGT SEQ NO:1424 ID
- Cebador inverso
- CTGCACTTCTCTGCTTCTGC SEQ NO:1425 ID
- MTA1
- NM_004689.2 Cebador directo CCGCCCTCACCTGAAGAGA SEQ NO:1426 ID
- Sonda
- CCCAGTGTCCGCCAAGGAGCG SEQ NO:1427 ID
- Cebador inverso
- GGAATAAGTTAGCCGCGCTTCT SEQ NO:1428 ID
- MUC1
- NM_002456.1 Cebador directo GGCCAGGATCTGTGGTGGTA SEQ NO:1429 ID
- Sonda
- CTCTGGCCTTCCGAGAAGGTACC SEQ NO:1430 ID
- Cebador inverso
- CTCCACGTCGTGGACATTGA SEQ NO:1431 ID
- MUC2
- NM_002457.1 Cebador directo CTATGAGCCATGTGGGAACC SEQ NO:1432 ID
- Sonda
- AGCTTCGAGACCTGCAGGACCATC SEQ NO:1433 ID
- Cebador inverso
- ATGTTGGAGTGGATGCCG SEQ NO:1434 ID
- MUC58
- XM_039877.11 Cebador directo TGCCCTTGCACTGTCCTAA SEQ NO:1435 ID
- Sonda
- TCAGCCATCCTGCACACCTACACC SEQ NO:1436 ID
- Cebador inverso
- CAGCCACACTCATCCACG SEQ NO:1437 ID
- MUTYH
- NM_012222.1 Cebador directo GTACGACCAAGAGAAACGGG SEQ NO:1438 ID
- Sonda
- TCTGCCCGTCTTCTCCATGGTAGG SEQ NO:1439 ID
- Cebador inverso
- CCTGTCCAGGTCCATCTCA SEQ NO:1440 ID
- MVP
- NM_017458.1 Cebador directo ACGAGAACGAGGGCATCTATGT SEQ NO:1441 ID
- Sonda
- CGCACCTTTCCGGTCTTGACATCCT SEQ NO:1442 ID
- Cebador inverso
- GCATGTAGGTGCTTCCAATCAC SEQ NO:1443 ID
- MX1
- NM_002462.2 Cebador directo GAAGGAATGGGAATCAGTCATGA SEQ NO:1444 ID
- Sonda
- TCACCCTGGAGATCAGCTCCCGA SEQ NO:1445 ID
- Cebador inverso
- GTCTATTAGAGTCAGATCCGGGACAT SEQ NO:1446 ID
- MXD4
- NM_006454.2 Cebador directo AGAAACTGGAGGAGCAGGAC SEQ NO:1447 ID
- Sonda
- TGCAGCTGCTCCTTGATGCTCAGT SEQ NO:1448 ID
- Cebador inverso
- CTTCAGGAAACGATGCTCCT SEQ NO:1449 ID
- MYBL2
- NM_002466.1 Cebador directo GCCGAGATCGCCAAGATG SEQ NO:1450 ID
- Sonda
- CAGCATTGTCTGTCCTCCCTGGCA SEQ NO:1451 ID
- Cebador inverso
- CTTTTGATGGTAGAGTTCCAGTGATTC SEQ NO:1452 ID
- MYH11
- NM_002474.1 Cebador directo CGGTACTTCTCAGGGCTAATATATACG SEQ NO:1453 ID
- Sonda
- CTCTTCTGCGTGGTGGTCAACCCCTA SEQ NO:1454 ID
- Cebador inverso
- CCGAGTAGATGGGCAGGTGTT SEQ NO:1455 ID
- MILK
- NM_053025.1 Cebador directo TGACGGAGCGTGAGTGCAT SEQ NO:1456 ID
- Sonda
- CCCTCCGAGATCTGCCGGATGTACT SEQ NO:1457 ID
- Cebador inverso
- ATGCCCTGCTTGTGGATGTAC SEQ NO:1458 ID
- NAT2
- NM_000015.1 Cebador directo TAACTGACATTCTTGAGCACCAGAT SEQ NO:1459 ID
- Sonda
- CGGGCTGTTCCCTTTGAGAACCTTAACA SEQ NO:1460 ID
- Cebador inverso
- ATGGCTTGCCCACAATGC SEQ NO:1461 ID
- NAV2
- NM_182964.3 Cebador directo CTCTCCCAGCACAGCTTGA SEQ NO:1462 ID
- Sonda
- CCTCACTGAGTCAACCAGCCTGGA SEQ NO:1463 ID
- Cebador inverso
- CACCAGTGTCATCCAGCAAC SEQ NO:1464 ID
- NCAM1
- NM_000615.1 Cebador directo TAGTTCCCAGCTGACCATCA SEQ NO:1465 ID
- Sonda
- CTCAGCCTCGTCGTTCTTATCCACC SEQ NO:1466 ID
- Cebador inverso
- CAGCCTTGTTCTCAGCAATG SEQ NO:1467 ID
- NDE1
- NM_017668.1 Cebador directo CTACTGCGGAAAGTCGGG SEQ NO:1468 ID
- Sonda
- CTGGAGTCCAAACTCGCTTCCTGC SEQ NO:1469 ID
- Cebador inverso
- GGACTGATCGTACACGAGGTT SEQ NO:1470 ID
- NDRG1
- NM_006096.2 Cebador directo AGGGCAACATTCCACAGC SEQ NO:1471 ID
- Sonda
- CTGCAAGGACACTCATCACAGCCA SEQ NO:1472 ID
- Cebador inverso
- CAGTGCTCCTACTCCGGC SEQ NO:1473 ID
- NDUFS3
- NM_004551.1 Cebador directo TATCCATCCTGATGGCGTC SEQ NO:1474 ID
- Sonda
- CCCAGTGCTGACTTTCCTCAGGGA SEQ NO:1475 ID
- Cebador inverso
- TTGAACTGTGCATTGGTGTG SEQ NO:1476 ID
- NEDD8
- NM_006156.1 Cebador directo TGCTGGCTACTGGGTGTTAGT SEQ NO:1477 ID
- Sonda
- TGCAGTCCTGTGTGCTTCCCTCTC SEQ NO:1478 ID
- Cebador inverso
- GACAACCAGGGACACAGTCA SEQ NO:1479 ID
- NEK2
- NM_002497.1 Cebador directo GTGAGGCAGCGCGACTCT SEQ NO:1480 ID
- Sonda
- TGCCTTCCCGGGCTGAGGACT SEQ NO:1481 ID
- Cebador inverso
- TGCCAATGGTGTACAACACTTCA SEQ NO:1482 ID
- NF2
- NM_000268.2 Cebador directo ACTCCAGAGCTGACCTCCAC SEQ NO:1483 ID
- Sonda
- CTACAATGACTTCCCAGGCTGGGC SEQ NO:1484 ID
- Cebador inverso
- TCAGGGCTTCAGTGTCTCAC SEQ NO:1485 ID
- NFKBp50
- NM_003998.1 Cebador directo CAGACCAAGGAGATGGACCT SEQ NO:1486 ID
- Sonda
- AAGCTGTAAACATGAGCCGCACCA SEQ NO:1487 ID
- Cebador inverso
- AGCTGCCAGTGCTATCCG SEQ NO:1488 ID
- NFKBp65
- NM_021975.1 Cebador directo CTGCCGGGATGGCTTCTAT SEQ NO:1489 ID
- Sonda
- CTGAGCTCTGCCCGGACCGCT SEQ NO:1490 ID
- Cebador inverso
- CCAGGTTCTGGAAACTGTGGAT SEQ NO:1491 ID
- NISCH
- NM_007184.1 Cebador directo CCAAGGAATCATGTTCGTTCAG SEQ NO:1492 ID
- Sonda
- TGGCCAGCAGCCTCTCGTCCAC SEQ NO:1493 ID
- Cebador inverso
- TGGTGCTCGGGAGTCAGACT SEQ NO:1494 ID
- Nkd-1
- NM_033119.3 Cebador directo GAGAGAGTGAGCGAACCCTG SEQ NO:1495 ID
- Sonda
- CCAGGCTCCAAGAAGCAGCTGAAG SEQ NO:1496 ID
- Cebador inverso
- CGTCGCACTGGAGCTCTT SEQ NO:1497 ID
- NM_B
- NM_021077.1 Cebador directo GGCTGCTGGTACAAATACTGC SEQ NO:1498 ID
- Sonda
- TGTCTGCCCCTATTATTGGTGTCATTTCT SEQ NO:1499 ID
- Cebador inverso
- CAATCTAAGCCACGCTGTTG SEQ NO:1500 ID
- NM_BR
- NM_002511.1 Cebador directo TGATCCATCTCTAGGCCACA SEQ NO:1501 ID
- Sonda
- TTGTCACCTTAGTTGCCCGGGTTC SEQ NO:1502 ID
- Cebador inverso
- GAGCAAATGGGTTGACACAA SEQ NO:1503 ID
- NM_E1
- NM_000269.1 Cebador directo CCAACCCTGCAGACTCCAA SEQ NO:1504 ID
- Sonda
- CCTGGGACCATCCGTGGAGACTTCT SEQ NO:1505 ID
- Cebador inverso
- ATGTATAATGTTCCTGCCAACTTGTATG SEQ NO:1506 ID
- NOS3
- NM_000603.2 Cebador directo ATCTCCGCCTCGCTCATG SEQ NO:1507 ID
- Sonda
- TTCACTCGCTTCGCCATCACCG SEQ NO:1508 ID
- Cebador inverso
- TCGGAGCCATACAGGATTGTC SEQ NO:1509 ID
- NOTCH1
- NM_017617.2 Cebador directo CGGGTCCACCAGTTTGAATG SEQ NO:1510 ID
- Sonda
- CCGCTCTGCAGCCGGGACA SEQ NO:1511 ID
- Cebador inverso
- GTTGTATTGGTTCGGCACCAT SEQ NO:1512 ID
- NOTCH2
- NM_024408.2 Cebador directo CACTTCCCTGCTGGGATTAT SEQ NO:1513 ID
- Sonda
- CCGTGTTGCACAGCTCATCACACT SEQ NO:1514 ID
- Cebador inverso
- AGTTGTCAAACAGGCACTCG SEQ NO:1515 ID
- NPM1
- NM_002520.2 Cebador directo AATGTTGTCCAGGTTCTATTGC SEQ NO:1516 ID
- Sonda
- AACAGGCATTTTGGACAACACATTCTCG SEQ NO:1517 ID
- Cebador inverso
- CAAGCAAAGGGTGGAGTTC SEQ NO:1518 ID
- NR4A1
- NM_002135.2 Cebador directo CACAGCTTGCTTGTCGATGTC SEQ NO:1519 ID
- Sonda
- CCTTCGCCTGCCTCTCTGCCC SEQ NO:1520 ID
- Cebador inverso
- ATGCCGGTCGGTGATGAG SEQ NO:1521 ID
- NRG1
- NM_013957.1 Cebador directo CGAGACTCTCCTCATAGTGAAAGGTAT SEQ NO:1522 ID
- Sonda
- ATGACCACCCCGGCTCGTATGTCA SEQ NO:1523 ID
- Cebador inverso
- CTTGGCGTGTGGAAATCTACAG SEQ NO:1524 ID
- NRP1
- NM_003873.1 Cebador directo CAGCTCTCTCCACGCGATTC SEQ NO:1525 ID
- Sonda
- CAGGATCTACCCCGAGAGAGCCACTCAT SEQ NO:1526 ID
- Cebador inverso
- CCCAGCAGCTCCATTCTGA SEQ NO:1527 ID
- NRP2
- NM_003872.1 Cebador directo CTACAGCCTAAACGGCAAGG SEQ NO:1528 ID
- Sonda
- AGGACCCCAGGACCCAGCAG SEQ NO:1529 ID
- Cebador inverso
- GTTCCCTTCGAACAGCTTTG SEQ NO:1530 ID
- NTN1
- NM_004822.1 Cebador directo AGAAGGACTATGCCGTCCAG SEQ NO:1531 ID
- Sonda
- ATCCACATCCTGAAGGCGGACAAG SEQ NO:1532 ID
- Cebador inverso
- CCGTGAACTTCCACCAGTC SEQ NO:1533 ID
- NUFIP1
- NM_012345.1 Cebador directo GCTTCCACATCGTGGTATTG SEQ NO:1534 ID
- Sonda
- CTTCTGATAGGTTTCCTCGGCATCAGA SEQ NO:1535 ID
- Cebador inverso
- AACTGCAGGGTTGAAGGACT SEQ NO:1536 ID
- ODC1
- NM_002539.1 Cebador directo AGAGATCACCGGCGTAATCAA SEQ NO:1537 ID
- Sonda
- CCAGCGTTGGACAAATACTTTCCGTCA SEQ NO:1538 ID
- Cebador inverso
- CGGGCTCAGCTATGATTCTCA SEQ NO:1539 ID
- OPN.
- NM_000582.1 Cebador directo CAACCGAAGTTTTCACTCCAGTT SEQ NO:1540 ID
- Sonda
- TCCCCACAGTAGACACATATGATGGCCG SEQ NO:1541 ID
- Cebador inverso
- CCTCAGTCCATAAACCACACTATCA SEQ NO:1542 ID
- ORC1L
- NM_004153.2 Cebador directo TCCTTGACCATACCGGAGG SEQ NO:1543 ID
- Sonda
- TGCATGTACATCTCCGGTGTCCCT SEQ NO:1544 ID
- Cebador inverso
- CAGTGGCAGTCTTCCCTGTC SEQ NO:1545 ID
- OSM
- NM_020530.3 Cebador directo GTTTCTGAAGGGGAGGTCAC SEQ NO:1546 ID
- Sonda
- CTGAGCTGGCCTCCTATGCCTCAT SEQ NO:1547 ID
- Cebador inverso
- AGGTGTCTGGTTTGGGACA SEQ NO:1548 ID
- OSMR
- NM_003999.1 Cebador directo GCTCATCATGGTCATGTGCT SEQ NO:1549 ID
- Sonda
- CAGGTCTCCTTGATCCACTGACTTTTCA SEQ NO:1550 ID
- Cebador inverso
- TGTAAGGGTCAGGGATGTCA SEQ NO:1551 ID
- P14ARF
- S78535.1 Cebador directo CCCTCGTGCTGATGCTACT SEQ NO:1552 ID
- Sonda
- CTGCCCTAGACGCTGGCTCCTC SEQ NO:1553 ID
- Cebador inverso
- CATCATGACCTGGTCTTCTAGG SEQ NO:1554 ID
- p16-INK4
- L27211.1 Cebador directo GCGGAAGGTCCCTCAGACA SEQ NO:1555 ID
- Sonda
- CTCAGAGCCTCTCTGGTTCTTTCAATCGG SEQ NO:1556 ID
- Cebador inverso
- TGATGATCTAAGTTTCCCGAGGTT SEQ NO:1557 ID
- p21
- NM_000389.1 Cebador directo TGGAGACTCTCAGGGTCGAAA SEQ NO:1558 ID
- Sonda
- CGGCGGCAGACCAGCATGAC SEQ NO:1559 ID
- Cebador inverso
- GGCGTTTGGAGTGGTAGAAATC SEQ NO:1560 ID
- p27
- NM_004064.1 Cebador directo CGGTGGACCACGAAGAGTTAA SEQ NO:1561 ID
- Sonda
- CCGGGACTTGGAGAAGCACTGCA SEQ NO:1562 ID
- Cebador inverso
- GGCTCGCCTCTTCCATGTC SEQ NO:1563 ID
- P53
- NM_000546.2 Cebador directo CTTTGAACCCTTGCTTGCAA SEQ NO:1564 ID
- Sonda
- AAGTCCTGGGTGCTTCTGACGCACA SEQ NO:1565 ID
- Cebador inverso
- CCCGGGACAAAGCAAATG SEQ NO:1566 ID
- p53R2
- AB036063.1 Cebador directo CCCAGCTAGTGTTCCTCAGA SEQ NO:1567 ID
- Sonda
- TCGGCCAGCTTTTTCCAATCTTTG SEQ NO:1568 ID
- Cebador inverso
- CCGTAAGCCCTTCCTCTATG SEQ NO:1569 ID
- PADI4
- NM_012387.1 Cebador directo AGCAGTGGCTTGCTTTCTTC SEQ NO:1570 ID
- Sonda
- CCTGTGATGTCCCAGTTTCCCACTC SEQ NO:1571 ID
- Cebador inverso
- TGCTAGGACCATGTTGGGAT SEQ NO:1572 ID
- PAI1
- NM_000602.1 Cebador directo CCGCAACGTGGTTTTCTCA SEQ NO:1573 ID
- Sonda
- CTCGGTGTTGGCCATGCTCCAG SEQ NO:1574 ID
- Cebador inverso
- TGCTGGGTTTCTCCTCCTGTT SEQ NO:1575 ID
- Pak1
- NM_002576.3 Cebador directo GAGCTGTGGGTTGTTATGGA SEQ NO:1576 ID
- Sonda
- ACATCTGTCAAGGAGCCTCCAGCC SEQ NO:1577 ID
- Cebador inverso
- CCATGCAAGTTTCTGTCACC SEQ NO:1578 ID
- PARC
- NM_015089.1 Cebador directo GGAGCTGACCTGCTTCCTAC SEQ NO:1579 ID
- Sonda
- TCCTTATGCATCGAGGCCAGGC SEQ NO:1580 ID
- Cebador inverso
- AGCAGAGCACCACAGCATAG SEQ NO:1581 ID
- PCAF
- NM_003884.3 Cebador directo AGGTGGCTGTGTTACTGCAA SEQ NO:1582 ID
- Sonda
- TGCCACAGTTCTGCGACAGTCTACC SEQ NO:1583 ID
- Cebador inverso
- CACCTGTGTGGTTTCGTACC SEQ NO:1584 ID
- PCNA
- NM_002592.1 Cebador directo GAAGGTGTTGGAGGCACTCAAG SEQ NO:1585 ID
- Sonda
- ATCCCAGCAGGCCTCGTTGATGAG SEQ NO:1586 ID
- Cebador inverso
- GGTTTACACCGCTGGAGCTAA SEQ NO:1587 ID
- PDGFA
- NM_002607.2 Cebador directo TTGTTGGTGTGCCCTGGTG SEQ NO:1588 ID
- Sonda
- TGGTGGCGGTCACTCCCTCTGC SEQ NO:1589 ID
- Cebador inverso
- TGGGTTCTGTCCAAACACTGG SEQ NO:1590 ID
- PDGFB
- NM_002608.1 Cebador directo ACTGAAGGAGACCCTTGGAG SEQ NO:1591 ID
- Sonda
- TCTCCTGCCGATGCCCCTAGG SEQ NO:1592 ID
- Cebador inverso
- TAAATAACCCTGCCCACACA SEQ NO:1593 ID
- PDGFC
- NM_016205.1 Cebador directo AGTTACTAAAAAATACCACGAGGTCCTT SEQ NO:1594 ID
- Sonda
- CCCTGACACCGGTCTTTGGTCTCAACT SEQ NO:1595 ID
- Cebador inverso
- GTCGGTGAGTGATTTGTGCAA SEQ NO:1596 ID
- PDGFD
- NM_025208.2 Cebador directo TATCGAGGCAGGTCATACCA SEQ NO:1597 ID
- Sonda
- TCCAGGTCAACTTTTGACTTCCGGT SEQ NO:1598 ID
- Cebador inverso
- TAACGCTTGGCATCATCATT SEQ NO:1599 ID
- PDGFRa
- NM_006206.2 Cebador directo GGGAGTTTCCAAGAGATGGA SEQ NO:1600 ID
- Sonda
- CCCAAGACCCGACCAAGCACTAG SEQ NO:1601 ID
- Cebador inverso
- CTTCAACCACCTTCCCAAAC SEQ NO:1602 ID
- PDGFRb
- NM_002609.2 Cebador directo CCAGCTCTCCTTCCAGCTAC SEQ NO:1603 ID
- Sonda
- ATCAATGTCCCTGTCCGAGTGCTG SEQ NO:1604 ID
- Cebador inverso
- GGGTGGCTCTCACTTAGCTC SEQ NO:1605 ID
- PFN1
- NM_005022.2 Cebador directo GGAAAACGTTCGTCAACATC SEQ NO:1606 ID
- Sonda
- CAACCAGGACACCCACCTCAGCT SEQ NO:1607 ID
- Cebador inverso
- AAAACTTGACCGGTCTTTGC SEQ NO:1608 ID
- PFN2
- NM_053024.1 Cebador directo TCTATACGTCGATGGTGACTGC SEQ NO:1609 ID
- Sonda
- CTCCCCACCTTGACTCTTTGTCCG SEQ NO:1610 ID
- Cebador inverso
- GCCGACAGCCACATTGTAT SEQ NO:1611 ID
- PGK1
- NM_000291.1 Cebador directo AGAGCCAGTTGCTGTAGAACTCAA SEQ NO:1612 ID
- Sonda
- TCTCTGCTGGGCAAGGATGTTCTGTTC SEQ NO:1613 ID
- Cebador inverso
- CTGGGCCTACACAGTCCTTCA SEQ NO:1614 ID
- PI3K
- NM_002646.2 Cebador directo TGCTACCTGGACAGCCCG SEQ NO:1615 ID
- Sonda
- TCCTCCTGAAACGAGCTGTGTCTGACTT SEQ NO:1616 ID
- Cebador inverso
- AGGCCGTCCTTCAGTAACCA SEQ NO:1617 ID
- PI3KC2A
- NM_002645.1 Cebador directo ATACCAATCACCGCACAAACC SEQ NO:1618 ID
- Sonda
- TGCGCTGTGACTGGACTTAACAAATAGCCT SEQ NO:1619 ID
- Cebador inverso
- CACACTAGCATTTTCTCCGCATA SEQ NO:1620 ID
- PIK3CA
- NM_006218.1 Cebador directo GTGATTGAAGAGCATGCCAA SEQ NO:1621 ID
- Sonda
- TCCTGCTTCTCGGGATACAGACCA SEQ NO:1622 ID
- Cebador inverso
- GTCCTGCGTGGGAATAGC SEQ NO:1623 ID
- PIM1
- NM_002648.2 Cebador directo CTGCTCAAGGACACCGTCTA SEQ NO:1624 ID
- Sonda
- TACACTCGGGTCCCATCGAAGTCC SEQ NO:1625 ID
- Cebador inverso
- GGATCCACTCTGGAGGGC SEQ NO:1626 ID
- Pin1
- NM_006221.1 Cebador directo GATCAACGGCTACATCCAGA SEQ NO:1627 ID
- Sonda
- TCAAAGTCCTCCTCTCCCGACTTGA SEQ NO:1628 ID
- Cebador inverso
- TGAACTGTGAGGCCAGAGAC SEQ NO:1629 ID
- PKD1
- NM_000296.2 Cebador directo CAGCACCAGCGATTACGAC SEQ NO:1630 ID
- Sonda
- AGCCATTGTGAGGACTCTCCCAGC SEQ NO:1631 ID
- Cebador inverso
- CTGAATAGGCCCACGTCC SEQ NO:1632 ID
- PKR2
- NM_002654.3 Cebador directo CCGCCTGGACATTGATTCAC SEQ NO:1633 ID
- Sonda
- ACCCATCACAGCCCGGAACACTG SEQ NO:1634 ID
- Cebador inverso
- CTGGGCCAATGGTACAGATGA SEQ NO:1635 ID
- PLA2G2A
- NM_000300.2 Cebador directo GCATCCCTCACCCATCCTA SEQ NO:1636 ID
- Sonda
- AGGCCAGGCAGGAGCCCTTCTATA SEQ NO:1637 ID
- Cebador inverso
- GCTGGAAATCTGCTGGATGT SEQ NO:1638 ID
- PLAUR
- NM_002659.1 Cebador directo CCCATGGATGCTCCTCTGAA SEQ NO:1639 ID
- Sonda
- CATTGACTGCCGAGGCCCCATG SEQ NO:1640 ID
- Cebador inverso
- CCGGTGGCTACCAGACATTG SEQ NO:1641 ID
- PLK
- NM_005030.2 Cebador directo AATGAATACAGTATTCCCAAGCACAT SEQ NO:1642 ID
- Sonda
- AACCCCGTGGCCGCCTCC SEQ NO:1643 ID
- Cebador inverso
- TGTCTGAAGCATCTTCTGGATGA SEQ NO:1644 ID
- PLK3
- NM_004073.2 Cebador directo TGAAGGAGACGTACCGCTG SEQ NO:1645 ID
- Sonda
- CAAGCAGGTTCACTACACGCTGCC SEQ NO:1646 ID
- Cebador inverso
- CAGGCAGTGAGAGGCTGG SEQ NO:1647 ID
- PLOD2
- NM_000935.2 Cebador directo CAGGGAGGTGGTTGCAAAT SEQ NO:1648 ID
- Sonda
- TCCAGCCTTTTCGTGGTGACTCAA SEQ NO:1649 ID
- Cebador inverso
- TCTCCCAGGATGCATGAAG SEQ NO:1650 ID
- PMS1
- NM_000534.2 Cebador directo CTTACGGTTTTCGTGGAGAAG SEQ NO:1651 ID
- Sonda
- CCTCAGCTATACAACAAATTGACCCCAAG SEQ NO:1652 ID
- Cebador inverso
- AGCAGCCGTTCTTGTTGTAA SEQ NO:1653 ID
- PMS2
- NM_000535.2 Cebador directo GATGTGGACTGCCATTCAAA SEQ NO:1654 ID
- Sonda
- TCGAAATTTACATCCGGTATCTTCCTGG SEQ NO:1655 ID
- Cebador inverso
- TGCGAGATTAGTTGGCTGAG SEQ NO:1656 ID
- PPARG
- NM_005037.3 Cebador directo TGACTTTATGGAGCCCAAGTT SEQ NO:1657 ID
- Sonda
- TTCCAGTGCATTGAACTTCACAGCA SEQ NO:1658 ID
- Cebador inverso
- GCCAAGTCGCTGTCATCTAA SEQ NO:1659 ID
- PPID
- NM_005038.1 Cebador directo TCCTCATTTGGATGGGAAAC SEQ NO:1660 ID
- Sonda
- TTCCTTTAATTACTTGGCCAAACACCACA SEQ NO:1661 ID
- Cebador inverso
- CCAATATCCTTGCCACTCCTA SEQ NO.1662 ID
- PPM1D
- NM_003620.1 Cebador directo GCCATCCGCAAAGGCTTT SEQ NO:1663 ID
- Sonda
- TCGCTTGTCACCTTGCCATGTGG SEQ NO:1664 ID
- Cebador inverso
- GGCCATTCCGCCAGTTTC SEQ NO:1665 ID
- PPP2R4.
- NM_178001.1 Cebador directo GGCTCAGAGCATAAGGCTTC SEQ NO:1666 ID
- Sonda
- TTGGTCACTTCTCCCAACTTGGGC SEQ NO:1667 ID
- Cebador inverso
- ACGGGAACTCAGAAAACTGG SEQ NO:1668 ID
- PR
- NM_000926.2 Cebador directo GCATCAGGCTGTCATTATGG SEQ NO:1669 ID
- Sonda
- TGTCCTTACCTGTGGGAGCTGTAAGGTC SEQ NO:1670 ID
- Cebador inverso
- AGTAGTTGTGCTGCCCTTCC SEQ NO:1671 ID
- PRDX2
- NM_005809.4 Cebador directo GGTGTCCTTCGCCAGATCAC SEQ NO.1672 ID
- Sonda
- TTAATGATTTGCCTGTGGGACGCTCC SEQ NO.1673 ID
- Cebador inverso
- CAGCCGCAGAGCCTCATC SEQ NO:1674 ID
- PRDX3
- NM_006793.2 Cebador directo TGACCCCAATGGAGTCATCA SEQ NO:1675 ID
- Sonda
- CATTTGAGCGTCAACGATCTCCCAGTG SEQ NO:1676 ID
- Cebador inverso
- CCAAGCGGAGGGTTTCTTC SEQ NO:1677 ID
- PRDX4
- NM_B006406.1 Cebador directo TTACCCATTTGGCCTGGATTAA SEQ NO:1678 ID
- Sonda
- CCAAGTCCTCCTTGTCTTCGAGGGGT SEQ NO:1679 ID
- Cebador inverso
- CTGAAAGAAGTGGAATCCTTATTGG SEQ NO:1680 ID
- PRDX6
- NM_004905.2 Cebador directo CTGTGAGCCAGAGGATGTCA SEQ NO:1681 ID
- Sonda
- CTGCCAATTGTGTTTTCCTGCAGC SEQ NO:1682 ID
- Cebador inverso
- TGTGATGACACCAGGATGTG SEQ NO:1683 ID
- PRKCA
- NM_002737.1 Cebador directo CAAGCAATGCGTCATCAATGT SEQ NO:1684 ID
- Sonda
- CAGCCTCTGCGGAATGGATCACACT SEQ NO:1685 ID
- Cebador inverso
- GTAAATCCGCCCCCTCTTCT SEQ NO:1686 ID
- PRKCB1
- NM_002738.5 Cebador directo GACCCAGCTCCACTCCTG SEQ NO:1687 ID
- Sonda
- CCAGACCATGGACCGCCTGTACTT SEQ NO:1688 ID
- Cebador inverso
- CCCATTCACGTACTCCATCA SEQ NO:1689 ID
- PRKCD
- NM_006254.1 Cebador directo CTGACACTTGCCGCAGAGAA SEQ NO:1690 ID
- Sonda
- CCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCAC SEQ NO:1691 ID
- Cebador inverso
- AGGTGGTCCTTGGTCTGGAA SEQ NO:1692 ID
- PRKR
- NM_002759.1 Cebador directo GCGATACATGAGCCCAGAACA SEQ NO:1693 ID
- Sonda
- AGGTCCACTTCCTTTCCATAGTCTTGCGA SEQ NO:1694 ID
- Cebador inverso
- TCAGCAAGAATTAGCCCCAAAG SEQ NO:1695 ID
- pS2
- NM_003225.1 Cebador directo GCCCTCCCAGTGTGCAAAT SEQ NO:1696 ID
- Sonda
- TGCTGTTTCGACGACACCGTTCG SEQ NO:1697 ID
- Cebador inverso
- CGTCGATGGTATTAGGATAGAAGCA SEQ NO:1698 ID
- PTCH
- NM_000264.2 Cebador directo CCACGACAAAGCCGACTAC SEQ NO:1699 ID
- Sonda
- CCTGAAACAAGGCTGAGAATCCCG SEQ NO:1700 ID
- Cebador inverso
- TACTCGATGGGCTCTGCTG SEQ NO:1701 ID
- PTEN
- NM_000314.1 Cebador directo TGGCTAAGTGAAGATGACAATCATG SEQ NO:1702 ID
- Sonda
- CCTTTCCAGCTTTACAGTGAATTGCTGCA SEQ NO:1703 ID
- Cebador inverso
- TGCACATATCATTACACCAGTTCGT SEQ NO:1704 ID
- PTGER3
- NM_000957.2 Cebador directo TAACTGGGGCAACCTTTTCT SEQ NO:1705 ID
- Sonda
- CCTTTGCCTTCCTGGGGCTCTT SEQ NO:1706 ID
- Cebador inverso
- TTGCAGGAAAAGGTGACTGT SEQ NO:1707 ID
- PTHLH
- NM_002820.1 Cebador directo AGTGACTGGGAGTGGGCTAGAA SEQ NO:1708 ID
- Sonda
- TGACACCTCCACAACGTCGCTGGA SEQ NO:1709 ID
- Cebador inverso
- AAGCCTGTTACCGTGAATCGA SEQ NO:1710 ID
- PTHR1
- NM_000316.1 Cebador directo CGAGGTACAAGCTGAGATCAAGAA SEQ NO:1711 ID
- Sonda
- CCAGTGCCAGTGTCCAGCGGCT SEQ NO:1712 ID
- Cebador inverso
- GCGTGCCTTTCGCTTGAA SEQ NO:1713 ID
- PTK2
- NM_005607.3 Cebador directo GACCGGTCGAATGATAAGGT SEQ NO:1714 ID
- Sonda
- ACCAGGCCCGTCACATTCTCGTAC SEQ NO:1715 ID
- Cebador inverso
- CTGGACATCTCGATGACAGC SEQ NO:1716 ID
- PTK2B
- NM_004103.3 Cebador directo CAAGCCCAGCCGACCTAAG SEQ NO:1717 ID
- Sonda
- CTCCGCAAACCAACCTCCTGGCT SEQ NO:1718 ID
- Cebador inverso
- GAACCTGGAACTGCAGCTTTG SEQ NO:1719 ID
- PTP4A3
- NM_007079.2 Cebador directo CCTGTTCTCGGCACCTTAAA SEQ NO:1720 ID
- Sonda
- ACCTGACTGCCCCGGGGTCTAATA SEQ NO:1721 ID
- Cebador inverso
- TATTGCCTTCGGGTGTCC SEQ NO:1722 ID
- PTP4A3v2
- NM_032611.1 Cebador directo AATATTTGTGCGGGGTATGG SEQ NO:1723 ID
- Sonda
- CCAAGAGAAACGAGATTTAAAAACCCACC SEQ NO:1724 ID
- Cebador inverso
- AACGAGATCCCTGTGCTTGT SEQ NO:1725 ID
- PTPD1
- NM_007039.2 Cebador directo CGCTTGCCTAACTCATACTTTCC SEQ NO:1726 ID
- Sonda
- TCCACGCAGCGTGGCACTG SEQ NO:1727 ID
- Cebador inverso
- CCATTCAGACTGCGCCACTT SEQ NO:1728 ID
- PTPN1
- NM_002827.2 Cebador directo AATGAGGAAGTTTCGGATGG SEQ NO:1729 ID
- Sonda
- CTGATCCAGACAGCCGACCAGCT SEQ NO:1730 ID
- Cebador inverso
- CTTCGATCACAGCCAGGTAG SEQ NO:1731 ID
- PTPRF
- NM_002840.2 Cebador directo TGTTTTAGCTGAGGGACGTG SEQ NO:1732 ID
- Sonda
- CCGACGTCCCCAAACCTAGCTAGG SEQ NO:1733 ID
- Cebador inverso
- TACCAACCCTGGAATGTTGA SEQ NO:1734 ID
- PTPRJ
- NM_002843.2 Cebador directo AACTTCCGGTACCTCGTTCGT SEQ NO:1735 ID
- Sonda
- ACTACATGAAGCAGAGTCCTCCCGAATCG SEQ NO:1736 ID
- Cebador inverso
- AGCACTGCAATGCACCAGAA SEQ NO:1737 ID
- PTPRO
- NM_030667.1 Cebador directo CATGGCCTGATCATGGTGT SEQ NO:1738 ID
- Sonda
- CCCACAGCAAATGCTGCAGAAAGT SEQ NO:1739 ID
- Cebador inverso
- CCATGTGTACAAACTGCAGGA SEQ NO:1740 ID
- PTTG1
- NM_004219.2 Cebador directo GGCTACTCTGATCTATGTTGATAAGGAA SEQ NO:1741 ID
- Sonda
- CACACGGGTGCCTGGTTCTCCA SEQ NO:1742 ID
- Cebador inverso
- GCTTCAGCCCATCCTTAGCA SEQ NO:1743 ID
- RAB32
- NM_006834.2 Cebador directo CCTGCAGCTGTGGGACAT SEQ NO:1744 ID
- Sonda
- CGATTTGGCAACATGACCCGAGTA SEQ NO:1745 ID
- Cebador inverso
- AGCACCAACAGCTTCCTTG SEQ NO:1746 ID
- RAB6C
- NM_032144.1 Cebador directo GCGACAGCTCCTCTAGTTCCA SEQ NO:1747 ID
- Sonda
- TTCCCGAAGTCTCCGCCCG SEQ NO:1748 ID
- Cebador inverso
- GGAACACCAGCTTGAATTTCCT SEQ NO:1749 ID
- RAC1
- NM_006908.3 Cebador directo TGTTGTAAATGTCTCAGCCCC SEQ NO:1750 ID
- Sonda
- CGTTCTTGGTCCTGTCCCTTGGA SEQ NO:1751 ID
- Cebador inverso
- TTGAGCAAAGCGTACAAAGG SEQ NO:1752 ID
- RAD51C
- NM_058216.1 Cebador directo GAACTTCTTGAGCAGGAGCATACC SEQ NO:1753 ID
- Sonda
- AGGGCTTCATAATCACCTTCTGTTC SEQ NO:1754 ID
- Cebador inverso
- TCCACCCCCAAGAATATCATCTAGT SEQ NO:1755 ID
- RAD54L
- NM_003579.2 Cebador directo AGCTAGCCTCAGTGACACACATG SEQ NO:1756 ID
- Sonda
- ACACAACGTCGGCAGTGCAACCTG SEQ NO:1757 ID
- Cebador inverso
- CCGGATCTGACGGCTGTT SEQ NO:1758 ID
- RAF1
- NM_002880.1 Cebador directo CGTCGTATGCGAGAGTCTGT SEQ NO:1759 ID
- Sonda
- TCCAGGATGCCTGTTAGTTCTCAGCA SEQ NO:1760 ID
- Cebador inverso
- TGAAGGCGTGAGGTGTAGAA SEQ NO:1761 ID
- RALBP1
- NM_006788.2 Cebador directo GGTGTCAGATATAAATGTGCAAATGC SEQ NO:1762 ID
- Sonda
- TGCTGTCCTGTCGGTCTCAGTACGTTCA SEQ NO:1763 ID
- Cebador inverso
- TTCGATATTGCCAGCAGCTATAAA SEQ NO:1764 ID
- RANBP2
- NM_006267.3 Cebador directo TCCTTCAGCTTTCACACTGG SEQ NO:1765 ID
- Sonda
- TCCAGAAGAGTCATGCAACTTCATTTCTG SEQ NO:1766 ID
- Cebador inverso
- AAATCCTGTTCCCACCTGAC SEQ NO:1767 ID
- ranBP7
- NM_006391.1 Cebador directo AACATGATTATCCAAGCCGC SEQ NO:1768 ID
- Sonda
- AAGCCAATTTTGTCCACAATGGCA SEQ NO:1769 ID
- Cebador inverso
- GCCAACAAGCACTGTTATCG SEQ NO:1770 ID
- RANBP9
- NM_005493.2 Cebador directo CAAGTCAGTTGAGACGCCAGTT SEQ NO:1771 ID
- Sonda
- TTCTATGGCGGCCTGACTTCCTCCA SEQ NO:1772 ID
- Cebador inverso
- TGCAGCTCTCGTCCAAAGTG SEQ NO:1773 ID
- RAP1GDS1
- NM_021159.3 Cebador directo TGTGGATGCTGGATTGATTT SEQ NO:1774 ID
- Sonda
- CCACTGGTGCAGCTGCTAAATAGCA SEQ NO:1775 ID
- Cebador inverso
- AAGCAGCACTTCCTGGTCTT SEQ NO:1776 ID
- RARA
- NM_000964.1 Cebador directo AGTCTGTGAGAAACGACCGAAAC SEQ NO:1777 ID
- Sonda
- TCGGGCTTGGGCACCTCCTTCTT SEQ NO:1778 ID
- Cebador inverso
- CGGCGTCAGCGTGTAGCT SEQ NO:1779 ID
- RARB
- NM_016152.2 Cebador directo TGCCTGGACATCCTGATTCT SEQ NO:1780 ID
- Sonda
- TGCACCAGGTATACCCCAGAACAAGA SEQ NO:1781 ID
- Cebador inverso
- AAGGCCGTCTGAGAAAGTCA SEQ NO:1782 ID
- RASSF1
- NM_007182.3 Cebador directo AGTGGGAGACACCTGACCTT SEQ NO:1783 ID
- Sonda
- TTGATCTTCTGCTCAATCTCAGCTTGAGA SEQ NO:1784 ID
- Cebador inverso
- TGATCTGGGCATTGTACTCC SEQ NO:1785 ID
- RBM5
- NM_005778.1 Cebador directo CGAGAGGGAGAGCAAGACCAT SEQ NO:1786 ID
- Sonda
- CTGCGCGGCCTTCCCATCA SEQ NO:1787 ID
- Cebador inverso
- TCTCGAATATCGCTCTCTGTGATG SEQ NO:1788 ID
- RBX1
- NM_014248.2 Cebador directo GGAACCACATTATGGATCTTTGC SEQ NO:1789 ID
- Sonda
- TAGAATGTCAAGCTAACCAGGCGTCCGC SEQ NO:1790 ID
- Cebador inverso
- CATGCGACAGTACACTCTTCTGAA SEQ NO:1791 ID
- RCC1
- NM_001269.2 Cebador directo GGGCTGGGTGAGAATGTG SEQ NO:1792 ID
- Sonda
- ATACCAGGGCCGGCTTCTTCCTCT SEQ NO:1793 ID
- Cebador inverso
- CACAACATCCTCCGGAATG SEQ NO:1794 ID
- REG4
- NM_032044.2 Cebador directo TGCTAACTCCTGCACAGCC SEQ NO:1795 ID
- Sonda
- TCCTCTTCCTTTCTGCTAGCCTGGC SEQ NO:1796 ID
- Cebador inverso
- TGCTAGGTTTCCCCTCTGAA SEQ NO:1797 ID
- RFC
- NM_003056.1 Cebador directo TCAAGACCATCATCACTTTCATTGT SEQ NO:1798 ID
- Sonda
- CCTCCCGGTCCGCAAGCAGTT SEQ NO:1799 ID
- Cebador inverso
- GGATCAGGAAGTACACGGAGTATAACT SEQ NO:1800 ID
- RhoB
- NM_004040.2 Cebador directo AAGCATGAACAGGACTTGACC SEQ NO:1801 ID
- Sonda
- CTTTCCAACCCCTGGGGAAGACAT SEQ NO:1802 ID
- Cebador inverso
- CCTCCCCAAGTCAGTTGC SEQ NO:1803 ID
- rhoC
- NM_175744.1 Cebador directo CCCGTTCGGTCTGAGGAA SEQ NO:1804 ID
- Sonda
- TCCGGTTCGCCATGTCCCG SEQ NO:1805 ID
- Cebador inverso
- GAGCACTCAAGGTAGCCAAAGG SEQ NO:1806 ID
- RIZ1
- NM_012231.1 Cebador directo CCAGACGAGCGATTAGAAGC SEQ NO:1807 ID
- Sonda
- TGTGAGGTGAATGATTTGGGGGA SEQ NO:1808 ID
- Cebador inverso
- TCCTCCTCTTCCTCCTCCTC SEQ NO:1809 ID
- RNF11
- NM_014372.3 Cebador directo ACCCTGGAAGAGATGGATCA SEQ NO:1810 ID
- Sonda
- CCATCATACAGATCACACACTCCCGG SEQ NO:1811 ID
- Cebador inverso
- ATTGGGTCCCCATAAACAAA SEQ NO:1812 ID
- ROCK1
- NM_005406.1 Cebador directo TGTGCACATAGGAATGAGCTTC SEQ NO:1813 ID
- Sonda
- TCACTCTCTTTGCTGGCCAACTGC SEQ NO:1814 ID
- Cebador inverso
- GTTTAGCACGCAATTGCTCA SEQ NO:1815 ID
- ROCK2
- NM_004850.3 Cebador directo GATCCGAGACCCTCGCTC SEQ NO:1816 ID
- Sonda
- CCCATCAACGTGGAGAGCTTGCT SEQ NO:1817 ID
- Cebador inverso
- AGGACCAAGGAATTTAAGCCA SEQ NO:1818 ID
- RPLPO
- NM_001002.2 Cebador directo CCATTCTATCATCAACGGGTACAA SEQ NO:1819 ID
- Sonda
- TCTCCACAGACAAGGCCAGGACTCG SEQ NO:1820 ID
- Cebador inverso
- TCAGCAAGTGGGAAGGTGTAATC SEQ NO:1821 ID
- RPS13
- NM_001017.2 Cebador directo CAGTCGGCTTTACCCTATCG SEQ NO:1822 ID
- Sonda
- CAACTTCAACCAAGTGGGGACGCT SEQ NO:1823 ID
- Cebador inverso
- TCTGCTCCTTCACGTCGTC SEQ NO:1824 ID
- RRM1
- NM_001033.1 Cebador directo GGGCTACTGGCAGCTACATT SEQ NO:1825 ID
- Sonda
- CATTGGAATTGCCATTAGTCCCAGC SEQ NO:1826 ID
- Cebador inverso
- CTCTCAGCATCGGTACAAGG SEQ NO:1827 ID
- RRM2
- NM_001034.1 Cebador directo CAGCGGGATTAAACAGTCCT SEQ NO:1828 ID
- Sonda
- CCAGCACAGCCAGTTAAAAGATGCA SEQ NO:1829 ID
- Cebador inverso
- ATCTGCGTTGAAGCAGTGAG SEQ NO:1830 ID
- RTN4
- NM_007008.1 Cebador directo GACTGGAGTGGTGTTTGGTG SEQ NO:1831 ID
- Sonda
- CCAGCCTATTCCTGCTGCTTTCATTG SEQ NO:1832 ID
- Cebador inverso
- CTGTTACGCTCACAATGCTG SEQ NO:1833 ID
- RUNX1
- NM_001754.2 Cebador directo AACAGAGACATTGCCAACCA SEQ NO:1834 ID
- Sonda
- TTGGATCTGCTTGCTGTCCAAACC SEQ NO:1835 ID
- Cebador inverso
- GTGATTTGCCCAGGAAGTTT SEQ NO:1836 ID
- RXRA
- NM_002957.3 Cebador directo GCTCTGTTGTGTCCTGTTGC SEQ NO:1837 ID
- Sonda
- TCAGTCACAGGAAGGCCAGAGCC SEQ NO:1838 ID
- Cebador inverso
- GTACGGAGAAGCCACTTCACA SEQ NO:1839 ID
- S100A1
- NM_006271.1 Cebador directo TGGACAAGGTGATGAAGGAG SEQ NO:1840 ID
- Sonda
- CCTCCCCGTCTCCATTCTCGTCTA SEQ NO:1841 ID
- Cebador inverso
- AGCACCACATACTCCTGGAA SEQ NO:1842 ID
- S100A2
- NM_005978.2 Cebador directo TGGCTGTGCTGGTCACTACCT SEQ NO:1843 ID
- Sonda
- CACAAGTACTCCTGCCAAGAGGGCGAC SEQ NO:1844 ID
- Cebador inverso
- TCCCCCTTACTCAGCTTGAACT SEQ NO:1845 ID
- S100A4
- NM_002961.2 Cebador directo GACTGCTGTCATGGCGTG SEQ NO:1846 ID
- Sonda
- ATCACATCCAGGGCCTTCTCCAGA SEQ NO:1847 ID
- Cebador inverso
- CGAGTACTTGTGGAAGGTGGAC SEQ NO:1848 ID
- S100A8
- NM_002964.3 Cebador directo ACTCCCTGATAAAGGGGAATTT SEQ NO:1849 ID
- Sonda
- CATGCCGTCTACAGGGATGACCTG SEQ NO:1850 ID
- Cebador inverso
- TGAGGACACTCGGTCTCTAGC SEQ NO:1851 ID
- S100A9
- NM_002965.2 Cebador directo CTTTGGGACAGAGTGCAAGA SEQ NO:1852 ID
- Sonda
- CGATGACTTGCAAAATGTCGCAGC SEQ NO:1853 ID
- Cebador inverso
- TGGTCTCTATGTTGCGTTCC SEQ NO:1854 ID
- S100P
- NM_005980.2 Cebador directo AGACAAGGATGCCGTGGATAA SEQ NO:1855 ID
- Sonda
- TTGCTCAAGGACCTGGACGCCAA SEQ NO:1856 ID
- Cebador inverso
- GAAGTCCACCTGGGCATCTC SEQ NO:1857 ID
- SAT
- NM_002970.1 Cebador directo CCTTTTACCACTGCCTGGTT SEQ NO:1858 ID
- Sonda
- TCCAGTGCTCTTTCGGCACTTCTG SEQ NO:1859 ID
- Cebador inverso
- ACAATGCTGTGTCCTTCCG SEQ NO:1860 ID
- SBA2
- NM_018639.3 Cebador directo GGACTCAACGATGGGCAG SEQ NO:1861 ID
- Sonda
- CCCTGTCTGCACCTCCCAGATCTT SEQ NO:1862 ID
- Cebador inverso
- CGGAAAGATTCAAAAGCAGG SEQ NO:1863 ID
- SDC1
- NM_002997.1 Cebador directo GAAATTGACGAGGGGTGTCT SEQ NO:1864 ID
- Sonda
- CTCTGAGCGCCTCCATCCAAGG SEQ NO:1865 ID
- Cebador inverso
- AGGAGCTAACGGAGAACCTG SEQ NO:1866 ID
- SEMA3B
- NM_004636.1 Cebador directo GCTCCAGGATGTGTTTCTGTTG SEQ NO:1867 ID
- Sonda
- TCGCGGGACCACCGGACC SEQ NO:1868 ID
- Cebador inverso
- ACGTGGAGAAGACGGCATAGA SEQ NO:1869 ID
- SEMA3F
- NM_004186.1 Cebador directo CGCGAGCCCCTCATTATACA SEQ NO:1870 ID
- Sonda
- CTCCCCACAGCGCATCGAGGAA SEQ NO:1871 ID
- Cebador inverso
- CACTCGCCGTTGACATCCT SEQ NO:1872 ID
- SEMA4B
- NM_020210.1 Cebador directo TTCCAGCCCAACACAGTGAA SEQ NO:1873 ID
- Sonda
- ACTTTGGCCTGCCCGCTCCTCT SEQ NO:1874 ID
- Cebador inverso
- GAGTCGGGTCGCCAGGTT SEQ NO:1875 ID
- SFRP2
- NM_003013.2 Cebador directo CAAGCTGAACGGTGTGTCC SEQ NO:1876 ID
- Sonda
- CAGCACCGATTTCTTCAGGTCCCT SEQ NO:1877 ID
- Cebador inverso
- TGCAAGCTGTCTTTGAGCC SEQ NO:1878 ID
- SFRP4
- NM_003014.2 Cebador directo TACAGGATGAGGCTGGGC SEQ NO:1879 ID
- Sonda
- CCTGGGACAGCCTATGTAAGGCCA SEQ NO:1880 ID
- Cebador inverso
- GTTGTTAGGGCAAGGGGC SEQ NO:1881 ID
- SGCB
- NM_B000232.1 Cebador directo CAGTGGAGACCAGTTGGGTAGTG SEQ NO:1882 ID
- Sonda
- CACACATGCAGAGCTTGTAGCGTACCCA SEQ NO:1883 ID
- Cebador inverso
- CCTTGAAGAGCGTCCCATCA SEQ NO:1884 ID
- SHC1
- NM_003029.3 Cebador directo CCAACACCTTCTTGGCTTCT SEQ NO.1885 ID
- Sonda
- CCTGTGTTCTTGCTGAGCACCCTC SEQ NO:1886 ID
- Cebador inverso
- CTGTTATCCCAACCCAAACC SEQ NO:1887 ID
- SHH
- NM_000193.2 Cebador directo GTCCAAGGCACATATCCACTG SEQ NO:1888 ID
- Sonda
- CACCGAGTTCTCTGCTTTCACCGA SEQ NO:1889 ID
- Cebador inverso
- GAAGCAGCCTCCCGATTT SEQ NO:1890 ID
- SI
- NM_001041.1 Cebador directo AACGGACTCCCTCAATTTGT SEQ NO:1891 ID
- Sonda
- TGTCCATGGTCATGCAAATCTTGC SEQ NO:1892 ID
- Cebador inverso
- GAAATTGCAGGGTCCAAGAT SEQ NO:1893 ID
- Siah-1
- NM_003031.2 Cebador directo TTGGCATTGGAACTACATTCA SEQ NO:1894 ID
- Sonda
- TCCGCGGTATCCTCGGATTAGTTC SEQ NO:1895 ID
- Cebador inverso
- GGTATGGAGAAGGGGGTCC SEQ NO:1896 ID
- SIAT4A
- NM_003033.2 Cebador directo AACCACAGTTGGAGGAGGAC SEQ NO:1897 ID
- Sonda
- CAGAGACAGTTTCCCTCCCCGCT SEQ NO:1898 ID
- Cebador inverso
- CGAAGGAAGGGTGTTGGTAT SEQ NO:1899 ID
- SIAT7B
- NM_006456.1 Cebador directo TCCAGCCCAAATCCTCCT SEQ NO:1900 ID
- Sonda
- TGGCACATCCTACCCCAGATGCTA SEQ NO:1901 ID
- Cebador inverso
- GGTGTCCTGGAGTCCTTGAA SEQ NO:1902 ID
- SIM2
- NM_005069.2 Cebador directo GATGGTAGGAAGGGATGTGC SEQ NO:1903 ID
- Sonda
- CGCCTCTCCACGCACTCAGCTAT SEQ NO:1904 ID
- Cebador inverso
- CACAAGGAGCTGTGAATGAGG SEQ NO:1905 ID
- SIN3A
- NM_015477.1 Cebador directo CCAGAGTCATGCTCATCCAG SEQ NO:1906 ID
- Sonda
- CTGTCCCTGCACTGGTGCAACTG SEQ NO:1907 ID
- Cebador inverso
- CCACCTTCAGCCTCTGAAAT SEQ NO:1908 ID
- SIR2
- NM_012238.3 Cebador directo AGCTGGGGTGTCTGTTTCAT SEQ NO:1909 ID
- Sonda
- CCTGACTTCAGGTCAAGGGATGG SEQ NO:1910 ID
- Cebador inverso
- ACAGCAAGGCGAGCATAAAT SEQ NO:1911 ID
- SKP1A
- NM_006930.2 Cebador directo CCATTGCCTTTGCTTTGTTCAT SEQ NO:1912 ID
- Sonda
- TCCCATGGTTTTTATTCTGCCCTGCTG SEQ NO:1913 ID
- Cebador inverso
- TTCCGGATTTCCTTTCTTTGC SEQ NO:1914 ID
- SKP2
- NM_005983.2 Cebador directo AGTTGCAGAATCTAAGCCTGGAA SEQ NO:1915 ID
- Sonda
- CCTGCGGCTTTCGGATCCCA SEQ NO:1916 ID
- Cebador inverso
- TGAGTTTTTGCGAGAGTATTGACA SEQ NO:1917 ID
- SLC25A3
- NM_213611.1 Cebador directo TCTGCCAGTGCTGAATTCTT SEQ NO:1918 ID
- Sonda
- TGCTGACATTGCCCTGGCTCCTAT SEQ NO:1919 ID
- Cebador inverso
- TTCGAACCTTAGCAGCTTCC SEQ NO:1920 ID
- SLC2A1
- NM_006516.1 Cebador directo GCCTGAGTCTCCTGTGCC SEQ NO:1921 ID
- Sonda
- ACATCCCAGGCTTCACCCTGAATG SEQ NO:1922 ID
- Cebador inverso
- AGTCTCCACCCTCAGGCAT SEQ NO:1923 ID
- SLC31A1
- NM_001859.2 Cebador directo CCGTTCGAAGAGTCGTGAG SEQ NO:1924 ID
- Sonda
- TCTCCGAATCTTAACCCGTCACCC SEQ NO:1925 ID
- Cebador inverso
- AGTCCAGCCACTAGCACCTC SEQ NO:1926 ID
- SLC5A8
- NM_145913.2 Cebador directo CCTGCTTTCAACCACATTGA SEQ NO:1927 ID
- Sonda
- TCCCATTGCTCTTGCCACTCTGAT SEQ NO:1928 ID
- Cebador inverso
- AGAGCAGCTTCACAAACGAG SEQ NO:1929 ID
- SLC7A5
- NM_003486.4 Cebador directo GCGCAGAGGCCAGTTAAA SEQ NO:1930 ID
- Sonda
- AGATCACCTCCTCGAACCCACTCC SEQ NO:1931 ID
- Cebador inverso
- AGCTGAGCTGTGGGTTGC SEQ NO:1932 ID
- SLPI
- NM_003064.2 Cebador directo ATGGCCAATGTTTGATGCT SEQ NO:1933 ID
- Sonda
- TGGCCATCCATCTCACAGAAATTGG SEQ NO:1934 ID
- Cebador inverso
- ACACTTCAAGTCACGCTTGC SEQ NO:1935 ID
- SMARCA3
- NM_003071.2 Cebador directo AGGGACTGTCCTGGCACAT SEQ NO:1936 ID
- Sonda
- AGCAAAAGACCCAGGACATCTGCA SEQ NO:1937 ID
- Cebador inverso
- CAACAAATTTGCCGCAGTC SEQ NO:1938 ID
- SNAI1
- NM_005985.2 Cebador directo CCCAATCGGAAGCCTAACTA SEQ NO:1939 ID
- Sonda
- TCTGGATTAGAGTCCTGCAGCTCGC SEQ NO:1940 ID
- Cebador inverso
- GTAGGGCTGCTGGAAGGTAA SEQ NO:1941 ID
- SNAI2
- NM_003068.3 Cebador directo GGCTGGCCAAACATAAGCA SEQ NO:1942 ID
- Sonda
- CTGCACTGCGATGCCCAGTCTAGAAAATC SEQ NO:1943 ID
- Cebador inverso
- TCCTTGTCACAGTATTTACAGCTGAA SEQ NO:1944 ID
- SNRPF
- NM_003095.1 Cebador directo GGCTGGTCGGCAGAGAGTAG SEQ NO:1945 ID
- Sonda
- AAACTCATGTAAACCACGGCCGAATGTTG SEQ NO:1946 ID
- Cebador inverso
- TGAGGAAAGGTTTGGGATTGA SEQ NO:1947 ID
- SOD1
- NM_000454.3 Cebador directo TGAAGAGAGGCATGTTGGAG SEQ NO:1948 ID
- Sonda
- TTTGTCAGCAGTCACATTGCCCAA SEQ NO:1949 ID
- Cebador inverso
- AATAGACACATCGGCCACAC SEQ NO:1950 ID
- SOD2
- NM_000636.1 Cebador directo GCTTGTCCAAATCAGGATCCA SEQ NO:1951 ID
- Sonda
- AACAACAGGCCTTATTCCACTGCTGGG SEQ NO:1952 ID
- Cebador inverso
- AGCGTGCTCCCACACATCA SEQ NO:1953 ID
- SOS1
- NM_005633.2 Cebador directo TCTGCACCAAATTCTCCAAG SEQ NO:1954 ID
- Sonda
- AACACCGTTAACACCTCCGCCTG SEQ NO:1955 ID
- Cebador inverso
- GTGGTACTGGAAGCACCAGA SEQ NO:1956 ID
- SOX17
- NM_022454.2 Cebador directo TCGTGTGCAAGCCTGAGA SEQ NO:1957 ID
- Sonda
- CTCCCCTACCAGGGGCATGACTC SEQ NO:1958 ID
- Cebador inverso
- CTGTCGGGGAGATTCACAC SEQ NO:1959 ID
- SPARC
- NM_003118.1 Cebador directo TCTTCCCTGTACACTGGCAGTTC SEQ NO:1960 ID
- Sonda
- TGGACCAGCACCCCATTGACGG SEQ NO:1961 ID
- Cebador inverso
- AGCTCGGTGTGGGAGAGGTA SEQ NO:1962 ID
- SPINT2
- NM_0211102 1 Cebador directo AGGAATGCAGCGGATTCCT SEQ NO:1963 ID
- Sonda
- CCCAAGTGCTCCCAGAAGGCAGG SEQ NO:1964 ID
- Cebador inverso
- TCGCTGGAGTGGTCTTCAGA SEQ NO:1965 ID
- SPRY1
- AK026960.1 Cebador directo CAGACCAGTCCCTGGTCATAGG SEQ NO:1966 ID
- Sonda
- CTGGGTCCGGATTGCCCTTTCAG SEQ NO:1967 ID
- Cebador inverso
- CCTTCAAGTCATCCACAATCAGTT SEQ NO:1968 ID
- SPRY2
- NM_005842.1 Cebador directo TGTGGCAAGTGCAAATGTAA SEQ NO:1969 ID
- Sonda
- CAGAGGCCTTGGGTAGGTGCACTC SEQ NO:1970 ID
- Cebador inverso
- GTCGCAGATCCAGTCTGATG SEQ NO:1971 ID
- SR-A1
- NM_021228.1 Cebador directo AGATGGAAGAAGCCAACCTG SEQ NO:1972 ID
- Sonda
- CTGGATCAGCTCCTGGGCCTTC SEQ NO:1973 ID
- Cebador inverso
- CTGTGGCTGAGGATCTGGT SEQ NO:1974 ID
- ST14
- NM_021978.2 Cebador directo TGACTGCACATGGAACATTG SEQ NO:1975 ID
- Sonda
- AGGTGCCCAACAACCAGCATGT SEQ NO:1976 ID
- Cebador inverso
- AAGAATTTGAAGCGCACCTT SEQ NO:1977 ID
- STAT1
- NM_007315.1 Cebador directo GGGCTCAGCTTTCAGAAGTG SEQ NO:1978 ID
- Sonda
- TGGCAGTTTTCTTCTGTCACCAAAA SEQ NO:1979 ID
- Cebador inverso
- ACATGTTCAGCTGGTCCACA SEQ NO:1980 ID
- STAT3
- NM_003150.1 Cebador directo TCACATGCCACTTTGGTGTT SEQ NO:1981 ID
- Sonda
- TCCTGGGAGAGATTGACCAGCA SEQ NO:1982 ID
- Cebador inverso
- CTTGCAGGAAGCGGCTATAC SEQ NO:1983 ID
- STAT5A
- NM_003152.1 Cebador directo GAGGCGCTCAACATGAAATTC SEQ NO:1984 ID
- Sonda
- CGGTTGCTCTGCACTTCGGCCT SEQ NO:1985 ID
- Cebador inverso
- GCCAGGAACACGAGGTTCTC SEQ NO:1986 ID
- STAT5B
- NM_012448.1 Cebador directo CCAGTGGTGGTGATCGTTCA SEQ NO:1987 ID
- Sonda
- CAGCCAGGACAACAATGCGACGG SEQ NO:1988 ID
- Cebador inverso
- GCAAAAGCATTGTCCCAGAGA SEQ NO:1989 ID
- STC1
- NM_003155.1 Cebador directo CTCCGAGGTGAGGAGGACT SEQ NO:1990 ID
- Sonda
- CACATCAAACGCACATCCCATGAG SEQ NO:1991 ID
- Cebador inverso
- ACCTCTCCCTGGTTATGCAC SEQ NO:1992 ID
- STK11
- NM_000455.3 Cebador directo GGACTCGGAGACGCTGTG SEQ NO:1993 ID
- Sonda
- TTCTTGAGGATCTTGACGGCCCTC SEQ NO:1994 ID
- Cebador inverso
- GGGATCCTTCGCAACTTCTT SEQ NO:1995 ID
- STK15
- NM_003600.1 Cebador directo CATCTTCCAGGAGGACCACT SEQ NO:1996 ID
- Sonda
- CTCTGTGGCACCCTGGACTACCTG SEQ NO:1997 ID
- Cebador inverso
- TCCGACCTTCAATCATTTCA SEQ NO:1998 ID
- STMN1
- NM_005563.2 Cebador directo AATACCCAACGCACAAATGA SEQ NO:1999 ID
- Sonda
- CACGTTCTCTGCCCCGTTTCTTG SEQ NO:2000 ID
- Cebador inverso
- GGAGACAATGCAAACCACAC SEQ NO:2001 ID
- STMY3
- NM_005940.2 Cebador directo CCTGGAGGCTGCAACATACC SEQ NO:2002 ID
- Sonda
- ATCCTCCTGAAGCCCTTTTCGCAGC SEQ NO:2003 ID
- Cebador inverso
- TACAATGGCTTTGGAGGATAGCA SEQ NO:2004 ID
- STS
- NM_000351.2 Cebador directo GAAGATCCCTTTCCTCCTACTGTTC SEQ NO:2005 ID
- Sonda
- CTTCGTGGCTCTCGGCTTCCCA SEQ NO:2006 ID
- Cebador inverso
- GGATGATGTTCGGCCTTGAT SEQ NO:2007 ID
- SURV
- NM_001168.1 Cebador directo TGTTTTGATTCCCGGGCTTA SEQ NO:2008 ID
- Sonda
- TGCCTTCTTCCTCCCTCACTTCTCACCT SEQ NO:2009 ID
- Cebador inverso
- CAAAGCTGTCAGCTCTAGCAAAAG SEQ NO:2010 ID
- TAGLN
- NM_003186.2 Cebador directo GATGGAGCAGGTGGCTCAGT SEQ NO:2011 ID
- Sonda
- CCCAGAGTCCTCAGCCGCCTTCAG SEQ NO:2012 ID
- Cebador inverso
- AGTCTGGAACATGTCAGTCTTGATG SEQ NO:2013 ID
- TBP
- NM_003194.1 Cebador directo GCCCGAAACGCCGAATATA SEQ NO:2014 ID
- Sonda
- TACCGCAGCAAACCGCTTGGG SEQ NO:2015 ID
- Cebador inverso
- CGTGGCTCTCTTATCCTCATGAT SEQ NO:2016 ID
- TCF-1
- NM_000545.3 Cebador directo GAGGTCCTGAGCACTGCC SEQ NO:2017 ID
- Sonda
- CTGGGTTCACAGGCTCCTTTGTCC SEQ NO:2018 ID
- Cebador inverso
- GATGTGGGACCATGCTTGT SEQ NO:2019 ID
- TCF-7
- NM_003202.2 Cebador directo GCAGCTGCAGTCAACAGTTC SEQ NO:2020 ID
- Sonda
- AAGTCATGGCCCAAATCCAGTGTG SEQ NO:2021 ID
- Cebador inverso
- CTGTGAATGGGGAGGGGT SEQ NO:2022 ID
- TCF7L1
- NM_031283.1 Cebador directo CCGGGACACTTTCCAGAAG SEQ NO:2023 ID
- Sonda
- TCTCACTTCGGCGAAATAGTCCCG SEQ NO:2024 ID
- Cebador inverso
- AGAACGCGCTGTCCTGAG SEQ NO:2025 ID
- TCF7L2
- NM_030756.1 Cebador directo CCAATCACGACAGGAGGATT SEQ NO:2026 ID
- Sonda
- AGACACCCCTACCCCACAGCTCTG SEQ NO:2027 ID
- Cebador inverso
- TGGACACGGAAGCATTGAC SEQ NO:2028 ID
- TCFL4
- NM_170607.2 Cebador directo CTGACTGCTCTGCTTAAAGGTGAA SEQ NO:2029 ID
- Sonda
- TAGCAGGAACAACAACAAAAGCCAACCAA SEQ NO:2030 ID
- Cebador inverso
- ATGTCTTGCACTGGCTACCTTGT SEQ NO:2031 ID
- TEK
- NM_000459.1 Cebador directo ACTTCGGTGCTACTTAACAACTTACATC SEQ NO:2032 ID
- Sonda
- AGCTCGGACCACGTACTGCTCCCTG SEQ NO:2033 ID
- Cebador inverso
- CCTGGGCCTTGGTGTTGAC SEQ NO:2034 ID
- TERC
- U86046.1 Cebador directo AAGAGGAACGGAGCGAGTC SEQ NO:2035 ID
- Sonda
- CACGTCCCACAGCTCAGGGAATC SEQ NO:2036 ID
- Cebador inverso
- ATGTGTGAGCCGAGTCCTG SEQ NO:2037 ID
- TERT
- NM_003219.1 Cebador directo GACATGGAGAACAAGCTGTTTGC SEQ NO:2038 ID
- Sonda
- ACCAAACGCAGGAGCAGCCCG SEQ NO:2039 ID
- Cebador inverso
- GAGGTGTCACCAACAAGAAATCAT SEQ NO:2040 ID
- TFF3
- NM_003226.1 Cebador directo AGGCACTGTTCATCTCAGTTTTTCT SEQ NO:2041 ID
- Sonda
- CAGAAAGCTTGCCGGGAGCAAAGG SEQ NO:2042 ID
- Cebador inverso
- CATCAGGCTCCAGATATGAACTTTC SEQ NO:2043 ID
- TGFA
- NM_003236.1 Cebador directo GGTGTGCCACAGACCTTCCT SEQ NO:2044 ID
- Sonda
- TTGGCCTGTAATCACCTGTGCAGCCTT SEQ NO:2045 ID
- Cebador inverso
- ACGGAGTTCTTGACAGAGTTTTGA SEQ NO:2046 ID
- TGFB2
- NM_003238.1 Cebador directo ACCAGTCCCCCAGAAGACTA SEQ NO:2047 ID
- Sonda
- TCCTGAGCCCGAGGAAGTCCC SEQ NO:2048 ID
- Cebador inverso
- CCTGGTGCTGTTGTAGATGG SEQ NO:2049 ID
- TGFB3
- NM_003239.1 Cebador directo GGATCGAGCTCTTCCAGATCCT SEQ NO:2050 ID
- Sonda
- CGGCCAGATGAGCACATTGCC SEQ NO:2051 ID
- Cebador inverso
- GCCACCGATATAGCGCTGTT SEQ NO:2052 ID
- TGFBI
- NM_000358.1 Cebador directo GCTACGAGTGCTGTCCTGG SEQ NO:2053 ID
- Sonda
- CCTTCTCCCCAGGGACCTTTTCAT SEQ NO:2054 ID
- Cebador inverso
- AGTGGTAGGGCTGCTGGAC SEQ NO:2055 ID
- TGFBR1
- NM_004612.1 Cebador directo GTCATCACCTGGCCTTGG SEQ NO:2056 ID
- Sonda
- AGCAATGACAGCTGCCAGTTCCAC SEQ NO:2057 ID
- Cebador inverso
- GCAGACGAAGCACACTGGT SEQ NO:2058 ID
- TGFBR2
- NM_003242.2 Cebador directo AACACCAATGGGTTCCATCT SEQ NO:2059 ID
- Sonda
- TTCTGGGCTCCTGATTGCTCAAGC SEQ NO:2060 ID
- Cebador inverso
- CCTCTTCATCAGGCCAAACT SEQ NO:2061 ID
- THBS1
- NM_003246.1 Cebador directo CATCCGCAAAGTGACTGAAGAG SEQ NO:2062 ID
- Sonda
- CCAATGAGCTGAGGCGGCCTCC SEQ NO:2063 ID
- Cebador inverso
- GTACTGAACTCCGTTGTGATAGCATAG SEQ NO:2064 ID
- THY1
- NM_006288.2 Cebador directo GGACAAGACCCTCTCAGGCT SEQ NO:2065 ID
- Sonda
- CAAGCTCCCAAGAGCTTCCAGAGC SEQ NO:2066 ID
- Cebador inverso
- TTGGAGGCTGTGGGTCAG SEQ NO:2067 ID
- TIMP1
- NM_003254.1 Cebador directo TCCCTGCGGTCCCAGATAG SEQ NO:2068 ID
- Sonda
- ATCCTGCCCGGAGTGGAACTGAAGC SEQ NO:2069 ID
- Cebador inverso
- GTGGGAACAGGGTGGACACT SEQ NO:2070 ID
- TIMP2
- NM_003255.2 Cebador directo TCACCCTCTGTGACTTCATCGT SEQ NO:2071 ID
- Sonda
- CCCTGGGACACCCTGAGCACCA SEQ NO:2072 ID
- Cebador inverso
- TGTGGTTCAGGCTCTTCTTCTG SEQ NO:2073 ID
- TIMP3
- NM_000362.2 Cebador directo CTACCTGCCTTGCTTTGTGA SEQ NO:2074 ID
- Sonda
- CCAAGAACGAGTGTCTCTGGACCG SEQ NO:2075 ID
- Cebador inverso
- ACCGAAATTGGAGAGCATGT SEQ NO:2076 ID
- TJP1
- NM_003257.1 Cebador directo ACTTTGCTGGGACAAAGGTC SEQ NO:2077 ID
- Sonda
- CTCGGGCCTGCCCACTTCTTC SEQ NO:2078 ID
- Cebador inverso
- CACATGGACTCCTCAGCATC SEQ NO:2079 ID
- TK1
- NM_003258.1 Cebador directo GCCGGGAAGACCGTAATTGT SEQ NO:2080 ID
- Sonda
- CAAATGGCTTCCTCTGGAAGGTCCCA SEQ NO:2081 ID
- Cebador inverso
- CAGCGGCACCAGGTTCAG SEQ NO:2082 ID
- TLN1
- NM_006289.2 Cebador directo AAGCAGAAGGGAGAGCGTAAGA SEQ NO:2083 ID
- Sonda
- CTTCCAGGCACACAAGAATTGTGGGC SEQ NO:2084 ID
- Cebador inverso
- CCTTGGCCTCAATCTCACTCA SEQ NO:2085 ID
- TMEPAI
- NM_020182.3 Cebador directo CAGAAGGATGCCTGTGGC SEQ NO:2086 ID
- Sonda
- ATTCCGTTGCCTGACACTGTGCTC SEQ NO:2087 ID
- Cebador inverso
- GTAGACCTGCGGCTCTGG SEQ NO:2088 ID
- TMSB10
- NM_021103.2 Cebador directo GAAATCGCCAGCTTCGATAA SEQ NO:2089 ID
- Sonda
- CGTCTCCGTTTTCTTCAGCTTGGC SEQ NO:2090 ID
- Cebador inverso
- GTCGGCAGGGTGTTCTTTT SEQ NO:2091 ID
- TMSB4X
- NM_021109.2 Cebador directo CACATCAAAGAACTACTGACAACGAA SEQ NO:2092 ID
- Sonda
- CCGCGCCTGCCTTTCCCA SEQ NO:2093 ID
- Cebador inverso
- CCTGCCAGCCAGATAGATAGACA SEQ NO:2094 ID
- TNC
- NM_002160.1 Cebador directo AGCTCGGAACCTCACCGT SEQ NO:2095 ID
- Sonda
- CAGCCTTCGGGCTGTGGACATAC SEQ NO:2096 ID
- Cebador inverso
- GTAGCAGCCTTGAGGCCC SEQ NO:2097 ID
- TNF
- NM_000594.1 Cebador directo GGAGAAGGGTGACCGACTCA SEQ NO:2098 ID
- Sonda
- CGCTGAGATCAATCGGCCCGACTA SEQ NO:2099 ID
- Cebador inverso
- TGCCCAGACTCGGCAAAG SEQ NO:2100 ID
- TNFRSF5
- NM_001250.3 Cebador directo TCTCACCTCGCTATGGTTCGT SEQ NO:2101 ID
- Sonda
- TGCCTCTGCAGTGCGTCCTCTGG SEQ NO:2102 ID
- Cebador inverso
- GATGGACAGCGGTCAGCAA SEQ NO:2103 ID
- TNFRSF6B
- NM_003823.2 Cebador directo CCTCAGCACCAGGGTACCA SEQ NO:2104 ID
- Sonda
- TGACGGCACGCTCACACTCCTCAG SEQ NO:2105 ID
- Cebador inverso
- TGTCCTGGAAAGCCACAAAGT SEQ NO:2106 ID
- TNFSF4
- NM_003326.2 Cebador directo CTTCATCTTCCCTCTACCCAGA SEQ NO:2107 ID
- Sonda
- CAGGGGTTGGACCCTTTCCATCTT SEQ NO:2108 ID
- Cebador inverso
- GCTGCATTTCCCACATTCTC SEQ NO:2109 ID
- TOP2A
- NM_001067.1 Cebador directo AATCCAAGGGGGAGAGTGAT SEQ NO:2110 ID
- Sonda
- CATATGGACTTTGACTCAGCTGTGGC SEQ NO:2111 ID
- Cebador inverso
- GTACAGATTTTGCCCGAGGA SEQ NO:2112 ID
- TOP2B
- NM_001068.1 Cebador directo TGTGGACATCTTCCCCTCAGA SEQ NO:2113 ID
- Sonda
- TTCCCTACTGAGCCACCTTCTCTG SEQ NO:2114 ID
- Cebador inverso
- CTAGCCCGACCGGTTCGT SEQ NO:2115 ID
- TP
- NM_001953.2 Cebador directo CTATATGCAGCCAGAGATGTGACA SEQ NO:2116 ID
- Sonda
- ACAGCCTGCCACTCATCACAGCC SEQ NO:2117 ID
- Cebador inverso
- CCACGAGTTTCTTACTGAGAATGG SEQ NO:2118 ID
- TP53BP1
- NM_005657.1 Cebador directo TGCTGTTGCTGAGTCTGTTG SEQ NO:2119 ID
- Sonda
- CCAGTCCCCAGAAGACCATGTCTG SEQ NO:2120 ID
- Cebador inverso
- CTTGCCTGGCTTCACAGATA SEQ NO:2121 ID
- TP53BP2
- NM_005426.1 Cebador directo GGGCCAAATATTCAGAAGC SEQ NO:2122 ID
- Sonda
- CCACCATAGCGGCCATGGAG SEQ NO:2123 ID
- Cebador inverso
- GGATGGGTATGATGGGACAG SEQ NO:2124 ID
- TP53I3
- NM_004881.2 Cebador directo GCGGACTTAATGCAGAGACA SEQ NO:2125 ID
- Sonda
- CAGTATGACCCACCTCCAGGAGCC SEQ NO:2126 ID
- TRAG3
- Cebador inverso TCAAGTCCCAAAATGTTGCT SEQ NO:2127 ID
- NM_004909.1
- Cebador directo GACGCTGGTCTGGTGAAGATG SEQ NO:2128 ID
- Sonda
- CCAGGAAACCACGAGCCTCCAGC SEQ NO:2129 ID
- Cebador inverso
- TGGGTGGTTGTTGGACAATG SEQ NO:2130 ID
- TRAIL
- NM_003810.1 Cebador directo CTTCACAGTGCTCCTGCAGTCT SEQ NO:2131 ID
- Sonda
- AAGTACACGTAAGTTACAGCCACACA SEQ NO:2132 ID
- Cebador inverso
- CATCTGCTTCAGCTCGTTGGT SEQ NO:2133 ID
- TS
- NM_001071.1 Cebador directo GCCTCGGTGTGCCTTTCA SEQ NO:2134 ID
- Sonda
- CATCGCCAGCTACGCCCTGCTC SEQ NO:2135 ID
- Cebador inverso
- CGTGATGTGCGCAATCATG SEQ NO:2136 ID
- TST
- NM_003312.4 Cebador directo GGAGCCGGATGCAGTAGGA SEQ NO:2137 ID
- Sonda
- ACCACGGATATGGCCCGAGTCCA SEQ NO:2138 ID
- Cebador inverso
- AAGTCCATGAAAGGCATGTTGA SEQ NO:2139 ID
- TUBA1
- NM_006000.1 Cebador directo TGTCACCCCGACTCAACGT SEQ NO:2140 ID
- Sonda
- AGACGCACCGCCCGGACTCAC SEQ NO:2141 ID
- Cebador inverso
- ACGTGGACTGAGATGCATTCAC SEQ NO:2142 ID
- TUBB
- NM_001069.1 Cebador directo CGAGGACGAGGCTTAAAAAC SEQ NO:2143 ID
- Sonda
- TCTCAGATCAATCGTGCATCCTTAGTGAA SEQ NO:2144 ID
- Cebador inverso
- ACCATGCTTGAGGACAACAG SEQ NO:2145 ID
- TUFM
- NM_003321.3 Cebador directo GTATCACCATCAATGCGGC SEQ NO:2146 ID
- Sonda
- CATGTGGAGTATAGCACTGCCGCC SEQ NO:2147 ID
- Cebador inverso
- CAGTCTGTGTGGGCGTAGTG SEQ NO:2148 ID
- TULP3
- NM_003324.2 Cebador directo TGTGTATAGTCCTGCCCCTCAA SEQ NO:2149 ID
- Sonda
- CCGGATTATCCGACATCTTACTGTGA SEQ NO:2150 ID
- Cebador inverso
- CCCGATCCATTCCCCTTTTA SEQ NO:2151 ID
- tusc4
- NM_006545.4 Cebador directo GGAGGAGCTAAATGCCTCAG SEQ NO:2152 ID
- Sonda
- ACTCATCAATGGGCAGAGTGCACC SEQ NO:2153 ID
- Cebador inverso
- CCTTCAAGTGGATGGTGTTG SEQ NO:2154 ID
- UBB
- NM_018955.1 Cebador directo GAGTCGACCCTGCACCTG SEQ NO:2155 ID
- Sonda
- AATTAACAGCCACCCCTCAGGCG SEQ NO:2156 ID
- Cebador inverso
- GCGAATGCCATGACTGAA SEQ NO:2157 ID
- UBC
- NM_021009.2 Cebador directo ACGCACCCTGTCTGACTACA SEQ NO:2158 ID
- Sonda
- CATCCAGAAAGAGTCCACCCTGCA SEQ NO:2159 ID
- Cebador inverso
- ACCTCTAAGACGGAGCACCA SEQ NO:2160 ID
- UBE2C
- NM_007019.2 Cebador directo TGTCTGGCGATAAAGGGATT SEQ NO:2161 ID
- Sonda
- TCTGCCTTCCCTGAATCAGACAACC SEQ NO:2162 ID
- Cebador inverso
- ATGGTCCCTACCCATTTGAA SEQ NO:2163 ID
- UBE2M
- NM_003969.1 Cebador directo CTCCATAATTTATGGCCTGCAGTA SEQ NO:2164 ID
- Sonda
- TCTTCTTGGAGCCCAACCCCGAG SEQ NO:2165 ID
- Cebador inverso
- TGCGGCCTCCTTGTTCAG SEQ NO:2166 ID
- UBL1
- NM_003352.3 Cebador directo GTGAAGCCACCGTCATCATG SEQ NO:2167 ID
- Sonda
- CTGACCAGGAGGCAAAACCTTCAACTGA SEQ NO:2168 ID
- Cebador inverso
- CCTTCCTTCTTATCCCCCAAGT SEQ NO:2169 ID
- UCP2
- NM_003355.2 Cebador directo ACCATGCTCCAGAAGGAGG SEQ NO:2170 ID
- Sonda
- CCCCGAGCCTTCTACAAAGGGTTC SEQ NO:2171 ID
- Cebador inverso
- AACCCAAGCGGAGAAAGG SEQ NO:2172 ID
- UGT1A1
- NM_000463.2 Cebador directo CCATGCAGCCTGGAATTTG SEQ NO:2173 ID
- Sonda
- CTACCCAGTGCCCCAACCCATTCTC SEQ NO:2174 ID
- Cebador inverso
- GAGAGGCCTGGGCACGTA SEQ NO:2175 ID
- UMPS
- NM_000373.1 Cebador directo TGCGGAAATGAGCTCCAC SEQ NO:2176 ID
- Sonda
- CCCTGGCCACTGGGGACTACACTA SEQ NO:2177 ID
- Cebador inverso
- CCTCAGCCATTCTAACCGC SEQ NO:2178 ID
- UNC5A
- XM_030300.7 Cebador directo GACAGCTGATCCAGGAGCC SEQ NO:2179 ID
- Sonda
- CGGGTCCTGCACTTCAAGGACAGT SEQ NO:2180 ID
- Cebador inverso
- ATGGATAGGCGCAGGTTG SEQ NO:2181 ID
- UNC5B
- NM_170744.2 Cebador directo AGAACGGAGGCCGTGACT SEQ NO:2182 ID
- Sonda
- CGGGACGCTGCTCGACTCTAAGAA SEQ NO:2183 ID
- Cebador inverso
- CATGCACAGCCCATCTGT SEQ NO:2184 ID
- UNC5C
- NM_003728.2 Cebador directo CTGAACACAGTGGAGCTGGT SEQ NO:2185 ID
- Sonda
- ACCTGCCGCACACAGAGTTTGC SEQ NO:2186 ID
- Cebador inverso
- CTGGAAGATCTGCCCTTCTC SEQ NO:2187 ID
- upa
- NM_002658.1 Cebador directo GTGGATGTGCCCTGAAGGA SEQ NO:2188 ID
- Sonda
- AAGCCAGGCGTCTACACGAGAGTCTCAC SEQ NO:2189 ID
- Cebador inverso
- CTGCGGATCCAGGGTAAGAA SEQ NO:2190 ID
- UPP1
- NM_003364.2 Cebador directo ACGGGTCCTGCCTCAGTT SEQ NO:2191 ID
- Sonda
- TCAGCTTTCTCTGCATTGGCTCCC SEQ NO:2192 ID
- Cebador inverso
- CGGGGCAATCATTGTGAC SEQ NO:2193 ID
- VCAM1
- NM_001078.2 Cebador directo TGGCTTCAGGAGCTGAATACC SEQ NO:2194 ID
- Sonda
- CAGGCACACACAGGTGGGACACAAAT SEQ NO:2195 ID
- Cebador inverso
- TGCTGTCGTGATGAGAAAATAGTG SEQ NO:2196 ID
- VCL
- NM_003373.2 Cebador directo GATACCACAACTCCCATCAAGCT SEQ NO:2197 ID
- Sonda
- AGTGGCAGCCACGGCGCC SEQ NO:2198 ID
- Cebador inverso
- TCCCTGTTAGGCGCATCAG SEQ NO:2199 ID
- VCP
- NM_007126.2 Cebador directo GGCTTTGGCAGCTTCAGAT SEQ NO:2200 ID
- Sonda
- AGCTCCACCCTGGTTCCCTGAAG SEQ NO:2201 ID
- Cebador inverso
- CTCCACTGCCCTGACTGG SEQ NO:2202 ID
- VDAC1
- NM_003374.1 Cebador directo GCTGCGACATGGATTTCGA SEQ NO:2203 ID
- Sonda
- TTGCTGGGCCTTCCATCCGG SEQ NO:2204 ID
- Cebador inverso
- CCAGCCCTCGTAACCTAGCA SEQ NO:2205 ID
- VDAC2
- NM_003375.2 Cebador directo ACCCACGGACAGACTTGC SEQ NO:2206 ID
- Sonda
- CGCGTCCAATGTGTATTCCTCCAT SEQ NO:2207 ID
- Cebador inverso
- AGCTTTGCCAAGGTCAGC SEQ NO:2208 ID
- VDR
- NM_000376.1 Cebador directo GCCCTGGATTTCAGAAAGAG SEQ NO:2209 ID
- Sonda
- CAAGTCTGGATCTGGGACCCTTTCC SEQ NO:2210 ID
- Cebador inverso
- AGTTACAAGCCAGGGAAGGA SEQ NO:2211 ID
- VEGF
- NM_003376.3 Cebador directo CTGCTGTCTTGGGTGCATTG SEQ NO:2212 ID
- Sonda
- TTGCCTTGCTGCTCTACCTCCACCA SEQ NO:2213 ID
- Cebador inverso
- GCAGCCTGGGACCACTTG SEQ NO:2214 ID
- VEGF_altsplice1
- AF486837.1 Cebador directo TGTGAATGCAGACCAAAGAAAGA SEQ NO:2215 ID
- Sonda
- AGAGCAAGACAAGAAAATCCCTGTGGGC SEQ NO:2216 ID
- Cebador inverso
- GCTTTCTCCGCTCTGAGCAA SEQ NO:2217 ID
- VEGF_altsplice2
- AF214570.1 Cebador directo AGCTTCCTACAGCACAACAAAT SEQ NO:2218 ID
- Sonda
- TGTCTTGCTCTATCTTTCTTTGGTCTGCA SEQ NO:2219 ID
- Cebador inverso
- CTCGGCTTGTCACATTTTTC SEQ NO:2220 ID
- VEGFB
- NM_003377.2 Cebador directo TGACGATGGCCTGGAGTGT SEQ NO:2221 ID
- Sonda
- CTGGGCAGCACCAAGTCCGGA SEQ NO:2222 ID
- Cebador inverso
- GGTACCGGATCATGAGGATCTG SEQ NO:2223 ID
- VEGFC
- NM_005429.2 Cebador directo CCTCAGCAAGACGTTATTTGAAATT SEQ NO:2224 ID
- Sonda
- CCTCTCTCTCAAGGCCCCAAACCAGT SEQ NO:2225 ID
- Cebador inverso
- AAGTGTGATTGGCAAAACTGATTG SEQ NO:2226 ID
- VIM
- NM_003380.1 Cebador directo TGCCCTTAAAGGAACCAATGA SEQ NO:2227 ID
- Sonda
- ATTTCACGCATCTGGCGTTCCA SEQ NO:2228 ID
- Cebador inverso
- GCTTCAACGGCAAAGTTCTCTT SEQ NO:2229 ID
- WIF
- NM_007191.2 Cebador directo TACAAGCTGAGTGCCCAGG SEQ NO:2230 ID
- Sonda
- TACAAAAGCCTCCATTTCGGCACC SEQ NO:2231 ID
- Cebador inverso
- CACTCGCAGATGCGTCTTT SEQ NO:2232 ID
- WISP1
- NM_003882.2 Cebador directo AGAGGCATCCATGAACTTCACA SEQ NO:2233 ID
- Sonda
- CGGGCTGCATCAGCACACGC SEQ NO:2234 ID
- Cebador inverso
- CAAACTCCACAGTACTTGGGTTGA SEQ NO:2235 ID
- Wnt-3a
- NM_033131.2 Cebador directo ACAAAGCTACCAGGGAGTCG SEQ NO:2236 ID
- Sonda
- TTTGTCCACGCCATTGCCTCAG SEQ NO:2237 ID
- Cebador inverso
- TGAGCGTGTCACTGCAAAG SEQ NO:2238 ID
- Wnt-5a
- NM_003392.2 Cebador directo GTATCAGGACCACATGCAGTACATC SEQ NO:2239 ID
- Sonda
- TTGATGCCTGTCTTCGCGCCTTCT SEQ NO:2240 ID
- Cebador inverso
- TGTCGGAATTGATACTGGCATT SEQ NO:2241 ID
- Wnt-5b
- NM_032642.2 Cebador directo TGTCTTCAGGGTCTTGTCCA SEQ NO:2242 ID
- Sonda
- TTCCGTAAGAGGCCTGGTGCTCTC SEQ NO:2243 ID
- Cebador inverso
- GTGCACGTGGATGAAAGAGT SEQ NO:2244 ID
- WNT2
- NM_003391.1 Cebador directo CGGTGGAATCTGGCTCTG SEQ NO:2245 ID
- Sonda
- CTCCCTCTGCTCTTGACCTGGCTC SEQ NO:2246 ID
- Cebador inverso
- CCATGAAGAGTTGACCTCGG SEQ NO:2247 ID
- WWOX
- NM_016373.1 Cebador directo ATCGCAGCTGGTGGGTGTA SEQ NO:2248 ID
- Sonda
- CTGCTGTTTACCTTGGCGAGGCCTTT SEQ NO:2249 ID
- Cebador inverso
- AGCTCCCTGTTGCATGGACTT SEQ NO:2250 ID
- XPA
- NM_000380.2 Cebador directo GGGTAGAGGGAAAAGGGTTC SEQ NO:2251 ID
- Sonda
- CAAAGGCTGAACTGGATTCTTAACCAAGA SEQ NO:2252 ID
- Cebador inverso
- TGCACCACCATTGCTATTATT SEQ NO:2253 ID
- XPC
- NM_004628.2 Cebador directo GATACATCGTCTGCGAGGAA SEQ NO:2254 ID
- Sonda
- TTCAAAGACGTGCTCCTGACTGCC SEQ NO:2255 ID
- Cebador inverso
- CTTTCAATGACTGCCTGCTC SEQ NO:2256 ID
- XRCC1
- NM_006297.1 Cebador directo GGAGATGAAGCCCCCAAG SEQ NO:2257 ID
- Sonda
- AGAAGCAACCCCAGACCAAAACCA SEQ NO:2258 ID
- Cebador inverso
- GTCCAGCTGCCTGAGTGG SEQ NO:2259 ID
- YB-1
- NM_004559.1 Cebador directo AGACTGTGGAGTTTGATGTTGTTGA SEQ NO:2260 ID
- Sonda
- TTGCTGCCTCCGCACCCTTTTCT SEQ NO:2261 ID
- Cebador inverso
- GGAACACCACCAGGACCTGTAA SEQ NO:2262 ID
- YWHAH
- NM_003405.2 Cebador directo CATGGCCTCCGCTATGAA SEQ NO:2263 ID
- Sonda
- AGGTTCATTCAGCTCTGTCACCGC SEQ NO:2264 ID
- Cebador inverso
- GGAGATTTCGATCTTCATTGGA SEQ NO:2265 ID
- zbtb7
- NM_015898.2 Cebador directo CTGCGTTCACACCCCAGT SEQ NO:2266 ID
- Sonda
- TCTCTCCAGAACAGCTCGCCCTGT SEQ NO:2267 ID
- Cebador inverso
- CTCAGCCACGACAGATGGT SEQ NO:2268 ID
- ZG16
- NM_152338.1 Cebador directo TGCTGAGCCTCCTCTCCTT SEQ NO:2269 ID
- Sonda
- TACTCCTCATCACAGTGCCCCTGC SEQ NO:2270 ID
- Cebador inverso
- GGATGGGGGTTAGTGATAAGG SEQ NO:2271 ID
Tabla B
Claims (12)
- REIVINDICACIONES1. Método de predicción del desenlace clínico para un sujeto humano al que se le ha diagnosticado cáncer colorrectal tras la resección quirúrgica del cáncer, que comprende:determinar un nivel de expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN, o un producto de expresión del mismo, en una muestra biológica que comprende células de cáncer colorrectal obtenidas del sujeto humano; ypredecir la probabilidad de un desenlace clínico positivo para el sujeto humano basándose en dicho nivel de expresión normalizada, en el que un aumento de la expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN, o un producto de expresión del mismo, se correlaciona negativamente con una probabilidad aumentada de un desenlace clínico positivo.
-
- 2.
- Método según la reivindicación 1, en el que el cáncer colorrectal es cáncer colorrectal Duke B (estadio II) o Duke C (estadio III).
-
- 3.
- Método según la reivindicación 2, en el que el cáncer colorrectal es cáncer de colon Duke B (estadio II) o Duke C (estadio III).
-
- 4.
- Método según cualquier reivindicación anterior, en el que el nivel de expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN se determina usando un método basado en PCR.
-
- 5.
- Método según cualquier reivindicación anterior, en el que el nivel de expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN se normaliza en relación con el nivel de expresión de un transcrito de ARN de al menos un gen de referencia.
-
- 6.
- Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en el que el nivel de expresión normalizada de un producto de expresión de un transcrito de ARN de BGN se normaliza en relación con el nivel de expresión de un producto de expresión de un transcrito de ARN de al menos un gen de referencia.
-
- 7.
- Método según cualquiera de las reivindicaciones 2-6, que comprende:
determinar el nivel de expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN en una muestra biológica que comprende células de cáncer colorrectal obtenidas del sujeto humano, ypredecir la probabilidad de recidiva de cáncer colorrectal para el sujeto humano basándose en el nivel de expresión normalizada, en el que un aumento de la expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN se correlaciona positivamente con una probabilidad aumentada de recidiva de cáncer colorrectal. -
- 8.
- Método según cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que el desenlace clínico se expresa en términos de intervalo libre de recidiva (ILR), supervivencia global (SG), supervivencia libre de enfermedad (SLE) o intervalo libre de recidiva a distancia (ILRD).
-
- 9.
- Método según cualquier reivindicación anterior, que comprende además la etapa de crear un informe que resume dicha predicción.
-
- 10.
- Método de determinación de si un sujeto humano al que se le ha diagnosticado cáncer colorrectal debe someterse a terapia adicional tras la resección quirúrgica del cáncer, que comprende llevar a cabo un método según cualquiera de las reivindicaciones 3 a 8, en el que si la probabilidad de recidiva de cáncer colorrectal aumenta, se le recomienda al paciente terapia adicional tras la resección quirúrgica.
-
- 11.
- Método según la reivindicación 10, en el que la terapia adicional es quimioterapia.
-
- 12.
- Método según la reivindicación 10 u 11, en el que la terapia adicional es radioterapia.
190 191imagen1
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