ES2277027T3 - Polinucleotido que codifica para una nitrilasa, y polipeptido expresado mediante el citado polinucleotido. - Google Patents
Polinucleotido que codifica para una nitrilasa, y polipeptido expresado mediante el citado polinucleotido. Download PDFInfo
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Abstract
Un polinucleótido que codifica para una nitrilasa, que comprende el gen nitrilasa denominado Nit B, contenido en el plásmido pRPA-BCAT3, depositado en el CBS, con el número CBS 998 - 96.
Description
Polinucleótido que codifica para una nitrilasa,
y polipéptido expresado mediante el citado polinucleótido.
La presente invención, se refiere a un
polinucleótido que codifica para una nitrilasa, un polipéptido y un
material que tiene una actividad nitrilasa.
La presente invención, se inscribe en un nuevo
procedimiento para preparar ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)-butanóico
(HMTBA) y / o su sal de amonio (HMTBS).
El ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butírico
y sus sales, se han venido utilizando durante un largo período de
tiempo, en la alimentación de animales, como reemplazante para la
metionina, en donde, éstos, tienen la ventaja, con respecto a la
última, de que éstos existen como un líquido, el cual facilita su
uso por parte de empresas productoras de alimentos.
La forma de preparar químicamente el ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico,
ha venido siendo conocida desde un largo período de tiempo. A dicho
efecto, deben mencionarse las patentes europeas EP 142 488 y EP 143
000, patentes éstas, las cuales describen la hidrólisis del
2-hidroxi-4-(metiltio)-hidroxibutironitrilo
(HMTBN), mediante un procedimiento en dos etapas. La primera etapa,
consiste en poner en contacto el
2-hidroxi-4(metiltio)hidroxibutiro-nitrilo,
con un ácido mineral fuerte, tal como el ácido clorhídrico o el
ácido sulfúrico. En una etapa subsiguiente, después de la dilución
con agua, se completa la hidrólisis, a una alta temperatura. Se
procede, a continuación, a extraer el ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico,
con un ácido orgánico no muy miscible con agua, tal como una
cetona, de una forma preferible, una metilisobutilcetona y, a
continuación, el disolvente, se elimina por evaporación. Este tipo
de procedimiento, utilizado de una forma industrial, comporta, no
obstante, algunos inconvenientes. Así, este produce una cantidad
molar de sulfato amónico, que es por lo menos igual a la cantidad
molar del nitrilo introducido, cuyo sulfato, debe ser eliminado,
generando, con ello, residuos industriales que van en contra de las
políticas medioambientales. Este procedi-
miento, necesita también el uso de cantidades significantes de disolvente, el cual es absolutamente necesario reciclar.
miento, necesita también el uso de cantidades significantes de disolvente, el cual es absolutamente necesario reciclar.
Otros procedimientos, tales como los que se
describen en las patentes estadounidenses US 3.773.927 y US
4.353.924, consisten en hidrolizar el 2-hidroxi-4-metiltio)-hidroxibutironitrilo con ácido clorhídrico y, a continuación, concentrar el medio, con separación del cloruro amónico formado. La sal obtenida, es tan difícil de eliminar, como la sal previa y, además, el ácido obtenido, tiene una fuerte coloración.
4.353.924, consisten en hidrolizar el 2-hidroxi-4-metiltio)-hidroxibutironitrilo con ácido clorhídrico y, a continuación, concentrar el medio, con separación del cloruro amónico formado. La sal obtenida, es tan difícil de eliminar, como la sal previa y, además, el ácido obtenido, tiene una fuerte coloración.
Un procedimiento para la hidrólisis química del
metiltiohidroxipropionitrilo, se describe, adicionalmente, en la
patente europea EP 330 521, la cual, de la misma forma que antes,
consiste en realizar la hidrólisis, en un medio sulfúrico. La
mezcla, se neutraliza parcialmente con amoníaco. Aparece, entonces,
una separación bifásica. La fase orgánica, contiene la mayoría de
ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butírico
y, la fase acuosa, contiene la mayoría de la sal de amonio
producida. Se procede, a continuación, a filtrar la fase orgánica,
después de la evaporación del agua contenida, con objeto de
recuperar el sulfato amónico disuelto. A continuación, se procede a
diluir el ácido
2-hidroxi-4-metiltio-butírico,
con una reducida cantidad de agua, y éste se estabiliza con una
pequeña cantidad de ácido sulfúrico. Con la solución amónica,
después de haber eliminado el agua, puede obtenerse directamente
sulfato amónico, apto para su comercialización. Este procedimiento,
resuelve parcialmente los inconvenientes de los procedimientos
correspondientes al arte anterior de la técnica, en cuanto a lo
referente al uso de disolventes orgánicos, pero éste no resuelve, en
ningún caso, los problemas relacionados con los rechazos de las
sales minerales.
Entre las patentes pertenecientes a las sales
del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico,
pueden mencionarse las patentes estadounidenses US 2.745.745, US
2.938.053 y US 3.175.00, las cuales se refieren a sales de calcio y
/ o de amonio. La mezcla obtenida mediante la hidrólisis de
2-hidroxi-4-metil-tiobutironitrilo,
se trata con hidróxido o carbonato cálcico. Entonces, el sulfato
cálcico, precipita, liberando amoníaco, el cual forma la sal de
amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico.
Aquí, otra vez, subsiste el problema consistente en la eliminación
del sulfato cálcico.
En la publicación de solicitud de patente
internacional WO 96 / 01 808, se describe adicionalmente un
procedimiento el cual consiste en realizar una hidrólisis y una
extracción, mediante un disolvente orgánico, de la misma forma que
en el primer documento de la arte anterior de la técnica citado y, a
continuación, la neutralización de la solución orgánica, mediante
amoníaco. Este procedimiento, de la misma forma que la mayoría de
los procedimientos descritos anteriormente, tiene como resultado la
formación de por lo menos un mol de sulfato o de cloruro amónico,
por mol introducido de nitrilo, y requiere el reciclado de
cantidades significativas de disolvente orgánico. Con ello, no es
posible obtener una solución de una sal de amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltio-butírico,
a un coste industrialmente atractivo.
El documento de patente internacional WO 96 / 09
403, se describe adicionalmente el uso de una nitrilasa, como
catalizador para hidrolizar un grupo nitrilo en un ácido
carboxílico. No obstante, el procedimiento descrito en este
documento, no puede utilizarse a escala industrial, debido a la
insuficiente actividad del microorganismo, el cual sintetiza estas
nitrilasas.
Se ha descubierto ahora, mediante el
procedimiento descrito posteriormente, a continuación, el cual
aplica varias etapas específicas, el hecho de que era posible el
obtener ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutanóico
y / o su sal de amonio, de una forma enzimática, y a una escala
industrial, con un alto rendimiento productivo, sin necesidad de
utilizar disolventes, y sin una producción concomitante de sales
minerales.
Este procedimiento para la preparación del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico
y / o la sal de amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico,
mediante la hidrólisis enzimática del
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo,
consiste en el hecho de que:
a) en una primera etapa, se prepara un
material biológico, con una actividad nitrilasa,
b) en una segunda etapa, éste se
inmoviliza,
c) en una tercera etapa, el
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo,
se pone en presencia del material biológico de esta forma
inmovilizado, con objeto de obtener la sal de amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico,
d) en una cuarta etapa, la sal obtenida en la
etapa c) se convierte opcionalmente en el correspondiente ácido,
y
e) en una quinta etapa, se concentra el
producto obtenido en la etapa c) ó en la etapa d).
Con objeto de obtener el material biológico con
la actividad nitrilasa, requerida para aplicar el procedimiento
anteriormente definido, arriba, la presente invención, propone, de
una forma notable, un polinucleótido que codifica para una
nitrilasa, que comprende el gen nitrilasa denominado Nit B,
contenido en el plásmido pRPA-BCAT3, depositado en
el CBS, con el número CBS 998-96, y un polipéptido
con una actividad nitrilasa, el cual comprende una secuencia de
nitrilasa, capaz de poderse obtener mediante la expresión del gen
nitrilasa, denominado Nit B, clonado en el plásmido
pRPA-BCAT3, depositado en el CBS, con el número
998-96.
La invención, se expondrá ahora, de una forma
detallada, en la descripción que se facilita a continuación, para
la cual, se hará referencia a las figuras anexadas, en la
cuales.
- La figura 1, ilustra un diagrama de una célula
de electrodiálisis, utilizada en la etapa opcional d).
- La figura 1A, ilustra una célula de
electrodiálisis, con una membrana bipolar con tres
compartimientos.
- La figura 1B, ilustra una célula de
electrodiálisis, con una membrana bipolar con dos
compartimientos.
- La figura 2, ilustra un diagrama de una
instalación para aplicar el procedimiento en concordancia con la
invención.
- La figura 3, ilustra el mapa de restricción de
plásmidos pROA-BCAT1-5.
- La figura 4, ilustra la estrategia para las
secuenciación del fragmento de 1.130 pb, que contiene la secuencia
de DNA (designada mediante nit B, en la figura) que codifica para el
polipéptido con una actividad nitrilasa en concordancia con la
invención. Los números, se refieren a la identidad de los cebadores
utilizados para la secuenciación, así como también las notaciones
M13FWD y M13REV.
- La figura 5, ilustra el mapa de restricción de
los plásmidos pRPA-BCAT12 y
pRPA-BCAT-13.
- La figura 6, ilustra la electroforesis sobre
gel SDS-PAGE al 10%, mostrando la expresión de
secuencias de DNA en concordancia con la invención, en las cepas:
E. coli BL21 (DE3) / pRPA - BCAT-12,
BL21(DE3) / pRPA-BCAT-13,
BL21(DE3) / pRPA-BCAT-12 +
pXL2231, BL21(DE3) /
pRPA-BACT-13 + pXL2231. Cada pista,
corresponde a una cantidad de 10 \mug de proteínas solubles, y un
volumen equivalente de fracción bruta e insoluble.
- La figura 7, ilustra la electroforesis sobre
gel SDS-PAGE al 10%, mostrando la expresión de la
secuencias de DNA de referencia en concordancia con la invención,
en las cepas E. coli DH5\alpha /
pRPA-BCAT3, DH5\alpha /
pRPA-BCAT6, DH5\alpha / pRPA-BCAT6
+ pXL2035, RPA-BIOCAT76. Cada pista, corresponde a
una cantidad de 10 \mug de proteínas solubles, y un volumen
equivalente de fracción bruta e insoluble.
- La figura 8, ilustra el mapa de restricción
del plásmido pRPA-BACT14.
- La figura 9, ilustra la electroforesis sobre
gel SDS-PAGE al 10%, mostrando la expresión de
secuencias de DNA en concordancia con la invención, en las cepas
P. putida G2081 (pRPA - BCAT-14), G2081
(pRPA-BCAT-23), G2081
(pRPA-BCAT-24), A. faecalis
ATCC8750 (pRPA-BCAT-14), A.
faecalis ATCC8750
(pRPA-BCAT-23), A. faecalis
ATCC8750 (pRPA-BACT-24).
Cada pista, corresponde a una cantidad de 10
\mug de proteínas solubles, y un volumen equivalente de fracción
bruta y posiblemente insoluble.
- La figura 10, ilustra el mapa de restricción
del plásmido pCGL1087.
- La figura 11, ilustra el mapa de restricción
del plásmido pOS48.7.
La primera etapa, consiste en la preparación de
material biológico con una actividad nitrilasa.
El material biológico, puede consistir en una
solución enzimática, tal cual, o en células enteras o rotas, que
tengan una actividad nitrilasa.
De una forma ventajosa, se utiliza un
microorganismo que exprese nitrilasa.
La nitrilasa, puede proceder, notablemente, de
un microorganismo, de una forma particular, de un microorganismo
del género Alcaligenes, Rhodococcus ó Gordona, notablemente,
Alcaligenes faecalis, Rhodoccus sp. HT
29-7, Gordona terrae, de una forma
preferible, las cepas descritas en la publicación de patente
internacional WO 96 / 09 403.
Se utiliza, de una forma ventajosa, un
microorganismo que exprese actividad nitrilasa, tal y como se
obtiene mediante la transferencia de información genética que
codifique para la nitrilasa, de un microorganismo madre, en un
microorganismo huésped. De una forma particular, en el E.
coli, se puede utilizar una co-expresión de
proteínas de caperuza (de acompañamiento) Gro ESL, para mejorar las
prestaciones de la cepa recombinante.
Para este propósito, se utiliza cualquier vector
de expresión apropiado, de una forma notable, un vector
plásmido.
La secuencia de nucléotido utilizada en este
caso, se emplazará, entonces, bajo el control de señales, que
permitan el expresarla en un huésped celular. El huésped celular
utilizado, puede seleccionarse de entre sistemas procarióticos,
tales como bacterias Gram-positivas o
Gram-negativas, o eucariotas, tales como, por
ejemplo, levaduras, hongos, o cualquier otra sistema. Las señales
que controlan la expresión de polipéptidos, se seleccionan en
concordancia del huésped celular utilizado. Para este propósito, el
DNA que codifica para una nitrilasa, puede insertarse en vectores
auto-replicantes, en el huésped seleccionado, o
vectores integrantes del huésped seleccionado. Tales tipos de
vectores, se preparan mediante procedimientos usualmente utilizados
por parte de aquéllas personas expertas en el arte especializado de
la técnica y, las construcciones resultantes, pueden introducirse
en un huésped apropiado, mediante procedimientos standard, tales
como una electroporación.
Como microorganismo huésped, se pueden citar, de
una forma particular, los Alcaligenes faecalis,
Pseudonomas putida, Escherichia coli, o
microorganismos del género Bacillus, Corynebacterium, Streptomyces,
Saccharomyces, Kluyveromyces, Penicillium y Aspergillus.
Como vector de expresión preferido en E.
coli, es el plásmido pRPA-BACT6.
La segunda etapa del procedimiento, consiste en
inmovilizar el material biológico. Esta inmovilización, se realiza,
de una forma ventajosa, en presencia de un soporte sólido, y
mediante el cual, se pueden obtener partículas sólidas, cuya talla,
forma y resistencia mecánica, pueden ser controladas. Ésta permite,
también, la utilización simultánea de polímero de poliazetidina y
de otros agentes reticulantes.
Este procedimiento de inmovilización, puede
involucrar a células enteras o permeabilizadas. Éste puede también
aplicarse a una solución enzimática, exenta de células.
Las enzimas utilizadas para la permeabilización,
son las nitrilasas.
El procedimiento de inmovilización, consiste en
inmovilizar el material biológico activo, en un soporte sólido, con
un tamaño de grano, notablemente comprendido dentro de unos márgenes
situados entre 1 \mum y 3 mm, de una forma preferible, entre 10
\mum 3 mm, por mediación de agentes químicos que reaccionan con
las funciones amina (NH_{2}, NH), carboxilo (COOH), hidroxi (OH),
tiol (SH) o amida (CONH_{2}) del agente biológico y del soporte.
Con estos agentes químicos, el material biológico y el soporte,
puede también insolubilizarse en agua. La masa obtenida, es muy
flexible, y a ésta, se le puede también dar forma, con objeto de
obtener partículas con la deseada forma y el deseado tamaño. La
cohesión y el tamaño de estas partículas, se obtienen, también,
mediante secado.
El material biológico a ser inmovilizado, pueden
también contener, posiblemente o eventualmente, un material
biológico inactivo, en una cantidad correspondiente a unos
porcentajes situados entre un 0 y un 200, en peso. EL material
biológico inactivo, pueden ser proteínas (albúmina, gelatina) o
polisacáridos (citosan, k-carragheenan,
alginato).
El soporte inerte, sobre el cual se deposita el
material biológico, y el polímero, pueden consistir en partículas
orgánicas o inorgánicas, porosas o no porosas, hidrofílicas o
hidrofóbicas. Entre estas partículas, se pueden citar, de una forma
no limitativa:
- resinas intercambiadoras de iones,
- alúmina,
- sílices sintéticas o diátomos y geles de
sílice,
- zeolitas,
- carbones
- proteínas insolubles en agua, tales como el
gluten,
- polisacáridos, tales como el almidón.
El soporte inerte, puede añadirse en una
cantidad correspondiente a un porcentaje que va de un 0,01 a un
500%, en peso, del material biológico y, de una forma preferible,
del 10 al 200%.
Los agentes químicos utilizados para la
insolubilización del material biológico, pueden ser polímeros o
moléculas bifuncionalizadas, las cuales reaccionan con las
funciones amina (NH_{2}, NH), carboxílica (COOH), hidroxi (OH),
tiol (SH) ó amida (CONH_{2}). Se pueden mencionar:
- los polímeros de poliazetadina,
- los polímeros de polietilenimina,
- los polímeros de poliamina,
- los polímeros de isocianato,
- los geles de alginato,
- los geles de carragheenan,
- las aminas, tales como la
hexametilendiamina,
- los aldehídos, tales como el
gluturaldehído,
- los ácidos carboxílicos, tales como el ácido
adípico, y
- los isocianatos.
El procedimiento de inmovilización, puede
involucrar uno o más de estos agentes químicos. El agente químico,
se añade en concordancia con una concentración correspondiente a un
porcentaje situado entre un 1 y un 50%, en peso, de una forma
relativa al material biológico y al soporte. Una cantidad
correspondiente a un porcentaje situado entre un 5 y un 30%, será
la preferida, con objeto de obtener partículas suficientemente
sólidas, y retener una actividad significante, y que no tenga
demasiados problemas de difusión interna.
El período de tratamiento de reticulación, es de
0,5 a 24 horas.
La temperatura del procedimiento, se encuentra
comprendida, de una forma general, dentro de unos márgenes situados
entre 4 y 65°C. Una temperatura situada entre 20 y 40°C, es la que
se preferirá. La temperatura utilizada durante el procedimiento de
inmovilización, será también dependiente de la estabilidad del
material biológico utilizado.
El pH, durante la fase de inmovilización, se
mantendrá dentro de unos valores de 5 y 11. Un pH entre unos
valores de 6 y 10, es el que se prefiere, con una preferencia para
los pHs alcalinos. El pH, se selecciona, también, en concordancia
con la resistencia al material biológico, y se determinará
fácilmente, por parte de una persona experta en el arte
especializado de la técnica.
La forma del biocatalizador, debe permitir el
que éste se pueda utilizar en cualquier sistema, notablemente, en
lecho fijo.
Un procedimiento de formulación, puede ser el de
extrusión. Para realizar este cometido, el material biológico y el
soporte, se reticulan mediante la adición de uno o más agentes
químicos. Después del tratamiento, la masa insoluble, se recupera
mediante centrifugación, o después de floculación y filtración. Se
prefiere un contenido de materia seca, de por lo menos un 10%. Se
procede, a continuación, a extrusionar la masa. Con este
procedimiento, se obtienen perfiles en forma de "macarrones" o
"fideos", de una forma preferible, con un diámetro comprendido
dentro de unos márgenes situados entre 0,3 y 0,5 mm, y una longitud
comprendida dentro de unos márgenes situados entre 1 y 10 mm. A
estos "fideos", se les puede dar forma de esferas. Se procede,
a continuación, a secar las partículas obtenidas.
Otro procedimiento de formulación, puede ser el
de recubrimiento mediante proyección pulverizada ("spray
coating"). Parea realizar este cometido, el material biológico,
se mezcla con uno o más agentes químicos. Después de la reacción,
la mezcla, se proyecta por pulverización (spray), sobre el soporte,
como una capa fina. Con este procedimiento, se obtienen gránulos,
con un diámetro medio de partícula comprendida dentro de unos
márgenes situados entre 0,1 y 2 mm.
\newpage
La partículas obtenidas, pueden entonces
eventualmente sumergirse en una solución de un agente reductor, tal
como el hidroboruro sódico, con objeto de reducir las funciones
imina formadas, durante la reticulación.
Las partículas obtenidas, son lo suficientemente
sólidas y resistentes al desgaste por fricción, como para poder ser
utilizadas en un lecho fijo, un lecho fluidificado, o un reactor
agitado.
La tercera etapa del procedimiento en
concordancia con la presente invención, consiste en aplicar el
material biológico inmovilizado en uno o más columnas de reactores.
El propósito de esta etapa, es la de posibilitar la producción en
continuo de la sal de amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico,
a partir del
2-hidroxi-4-metiltio-butironitrilo.
La(s) columna(s) o
reactor(es), se alimenta(n) mediante una solución pura
o diluida de
2-hidroxi-4-metil-tiobutironitrilo,
o una mezcla que contenga
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo,
y la sal de amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico.
La(s) columna(s) o
reactor(es), se aplica(n), de una forma preferible, a
una temperatura comprendida dentro de unos márgenes situados entre
10 y 60°C, y a un pH situado entre unos valores de 5 y 9.
El sistema aplicado, puede consistir en dos o
más columnas conectadas las unas con las otras, en serie, con,
según una primera forma de presentación de la invención, el
suministro de la solución acuosa de
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo
localizado en la cabeza de la primera columna, con un suministro
simultáneo para las otras columnas de la solución de
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo,
en una cantidad limitada a la solubilidad de este compuesto, en la
mezcla de reacción; este sistema, se denomina un sistema por etapas
o zonas. En concordancia con una segunda forma de presentación de
la invención, se utilizan una o más columnas conectadas la una con
la otra, en paralelo, en un bucle de circulación. En concordancia
con esta instalación, se procede a introducir de una forma
continua, el
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo,
en una solución acuosa, al interior del bucle y, el medio de
circulación, se bombea de forma continua, de tal forma que, el
volumen, en el bucle, se mantenga constante; este sistema, se
denomina sistema de bucle.
El tipo de reactor utilizado en esta invención,
puede ser de lecho fijo, del tipo de lecho fluidificado, o del tipo
agitado de forma continua. Los reactores del tipo de lecho fijo, son
los que se utilizan de una forma preferible, debido al hecho de
que, éstos, reducen los problemas de desgaste por fricción que
puedan experimentarse con las partículas de las células
inmovilizadas. Si el microorganismo se utiliza tal cual, se
utilizará entonces, de una forma preferible, un reactor agitado,
acoplado con un módulo de ultrafiltración, para separar de una
forma continua el microorganismo, del producto de interés.
La cuarta etapa, la cual es una etapa opcional,
consiste en convertir la sal de amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltio-butírico,
en el correspondiente ácido. Esta etapa, puede realizarse en
concordancia con dos procedimientos:
- bien ya se mediante electroforesis, por
mediación de un electrodializador, con dos o tres
compartimientos,
- o bien ya sea mediante el calentamiento de la
solución acuosa, a lo cual puede seguir una extracción líquido -
líquido.
Según el procedimiento de electrodiálisis, se
utilizará un electrodializador con dos o tres compartimientos.
Por "compartimiento", se pretende dar a
entender el espacio comprendido, o bien ya sea entre dos membranas,
o bien ya sea entre una membrana bipolar y homopolar, o bien ya sea
entre membranas homopolares adyacentes. Por "célula", se
pretende dar a entender un juego de dos o tres compartimientos. Una
apilamiento o montón, comprende de 5 a 300 células. El
electrodializador, consiste en un apilamiento y, por supuesto,
incluye un ánodo y un cátodo.
Las membranas homopolares que pueden ser
utilizadas en el ámbito de la presente invención, se dividen en dos
amplias familias, según su procedimiento de fabricación.
Así, de este modo, pueden utilizarse las
membranas heterogéneas preparadas a partir de resinas
intercambiadoras de iones, mezcladas con un ligante, tal como el
poli(cloruro de vinilo), polietileno u otro ligante. El juego
con ello formado, puede recubrir una trama o red, tal como, por
ejemplo, un tejido de poliéster o de poliacrilonitrilo.
Las membranas homogéneas obtenidas mediante la
introducción de un grupo funcional sobre un soporte inerte,
mediante injerto químico o radioquímico, pueden también ser
utilizadas. El procedimiento químico mayormente utilizado, consiste
en funcionalizar látex, a partir de un polímero que incluya ciclos
aromáticos, tales como, por ejemplo, los copolímeros de estireno -
divinilbenceno o de estireno-butadieno. El látex de
esta forma funcionalizado, puede entonces utilizarse para recubrir
una trama o red, como para las membranas heterogéneas. El
procedimiento radioquímico, incluye generalmente el injertar, bajo
la influencia de una radiación, un compuesto aromático, tal como
estireno, sobre un soporte inerte, tal como una película de
polietileno o de politetrafluoroetileno. El ciclo aromático, se
funcionaliza, a continuación, como en el procedimiento químico.
Las membranas intercambiadoras de iones,
incluyen a los grupos de ácidos fuertes, lo más a menudo, grupos
sulfonato, o grupos de ácidos débiles, a menudo, grupos carboxilato.
Más raramente, los grupos de ácidos, pueden ser grupos
PO_{3}^{2-}, HPO_{3}^{2-}, ASO_{3}^{2-},
SeO_{3}^{2-}.
Las membranas intercambiadoras de iones,
incluyen a los grupos básicos fuertes, lo más a menudo, grupos de
amonio cuaternario, o grupos básicos débiles, lo mas a menudo,
grupos amina. Más raramente, los grupos básicos, pueden ser grupos
de fosfonio cuaternario, o grupos de sulfonio.
En el presente procedimiento, las membranas
catiónicas, incluyen, de una forma preferible, grupos de ácidos
fuertes, y entre éstos últimos, de una forma preferencial, los
grupos sulfonato y, las membranas aniónicas, incluyen, de una forma
preferible, grupos básicos fuertes y, entre éstos últimos, grupos de
amonio cuaternario.
Las membranas bipolares, son un ensamblaje de
dos membranas, una catiónica, y otra aniónica. Cuando la membrana
se somete a una campo eléctrico suficiente, el agua de sulfatación,
en la interfase de la membrana, se disocia en iones de H^{+} y
OH^{-}, los cuales migran, respectivamente, al cátodo, atravesando
la fase (faz) catiónica, y al ánodo, atravesando la fase aniónica.
Como membranas bipolares, pueden mencionarse, como ejemplos, las
membranas comercializadas en el mercado, por parte de la firma
Aqualitics, por parte de la firma Tokuyama Soda ó por parte de la
firma FuMaTech.
El ánodo del electrodializador, puede consistir
en materiales del tipo convencionalmente utilizados en
electrodiálisis por ejemplo, grafito, níquel ó titanio, recubiertos
con metales preciosos u óxidos de metales preciosos, notablemente,
titanio platinado.
El electrodializador, se alimenta con la
solución acuosa a ser tratada. Es también necesario el hacer
circular una solución de un anolito, en el ánodo, y una solución de
un catolito, en el cátodo. Puede utilizarse una solución individual
de electrolito. En el presente procedimiento, es apropiado un
circuito individual de electrolito. El rol interpretativo de la
solución de electrolito, es la de proporcionar una conductividad
suficiente. De una forma preferible, esta conductividad, será igual
o mayor a 20 milisiemens por centímetro (mS/cm), sin que este
límite inferior, deba ser considerado como crítico para la
aplicación de este procedimiento.
El electrolito aplicado, es un compuesto
ionizable, tal como una sal, un ácido o una base. El electrolito,
se selecciona, de una forma preferible, de entre compuestos no
electroactivos. Así, por ejemplo, es preferible el utilizar sales
neutras, tales como los sulfatos, ácidos, tales como el ácido
sulfúrico, y bases, tales como la sosa.
Las densidades de corriente aplicadas son, de
una forma general, las correspondientes a un valor situado entre 0,2
y 1,5 kA/m^{2} y, de una forma preferible, situadas entre 0,4 y 1
kA/m^{2}.
La temperatura a la cual se aplica el
procedimiento de la invención, es la correspondiente a un valor
comprendido dentro de unos márgenes compatibles con la estabilidad
de las membranas. Se preferirá, normalmente, operar a una
temperatura comprendida dentro de unos márgenes situados entre 30 y
60°C.
El electrodializador, puede funcionar de
diferentes formas. En primer lugar, éste puede funcionar de una
forma continua, pasando, la solución a ser tratada, de una forma
continua, a través del apilamiento o montón; se procede entonces a
posicionar varias zonas o etapas en serie, en el caso en el que, la
tasa de tratamiento a realizar, así lo requiera. Éste puede también
funcionar en forma de lotes, es decir, de forma discontinua,
recirculando entonces, la solución a ser tratada, en un tanque,
hasta que se obtenga la deseada tasa de tratamiento. Finalmente,
éste puede funcionar pasando directamente, con una recirculación
parcial.
En concordancia con una primera alternativa,
puede acontecer una disociación de la sal de amonio, convirtiéndose
en ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico,
y en amoníaco, en una célula de electrodiálisis con membranas
bipolares de tres compartimientos, tal y como se ilustra en la
figura 1A, de una forma esquemática.
Un aparato de electrodiálisis apropiado para la
aplicación del procedimiento, consiste en diferentes
compartimientos, delimitados mediante membranas catiónicas (MC),
membranas bipolares (MB) y membranas aniónicas (MA),
respectivamente. Estos compartimientos, se dividen en un
compartimiento de sal (S) que se empobrecen en compuestos a separar,
en un compartimiento de base (B) y un compartimiento de ácido (A),
en donde, el ácido y la base, regenerados a partir de la sal, se
concentran, respectivamente.
La sal de amonio, se introduce en el
compartimiento de sal. Bajo la acción del campo eléctrico, el ión
amonio, migra hacia el cátodo, dejando el compartimiento (S), en
donde éste se encuentra, a través de una membrana intercambiadora
de cationes (membrana catiónica), y se combina con los iones
OH^{-}, procedentes de la cara o fase catiónica de la membrana
bipolar, dentro de la cual acontece la disociación de agua, bajo el
efecto del campo eléctrico.
De una forma simultánea, los iones de
carboxilato
(2-hidroxi-4-(metiltio)butanoato),
migran hacia el ánodo, dejando el compartimiento (S) en donde éstos
se encuentran, a través de una membrana intercambiadora de aniones
(membrana aniónica). Después de pasar al interior del siguiente
compartimiento (A), éstos se protonizan, mediante la adición de
iones de H^{+}, procedentes de la cara catiónica de la membrana
bipolar. Los tres compartimientos adyacentes (B), (A), (S), forman
una célula de electrodiálisis.
En una segunda alternativa, puede acontecer una
regeneración de ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico,
en una célula de electrodiálisis, con membranas bipolares de dos
compartimientos, tal y como se ilustra en la figura 1B. Estos
compartimientos, se encuentran delimitados por membranas catiónicas
y membranas bipolares, respectivamente. Estos compartimientos, se
encuentran divididos en compartimientos de sal / ácido (S/A) y de
base (B).
La sal de amonio, se introduce en el
compartimiento de sal / ácido. Bajo la acción del campo eléctrico,
el ión amonio, migra hacia el cátodo, saliendo del compartimiento
(S/A), en donde éste se encuentra, a través de una membrana
intercambiadora de cationes (membrana catiónica), y se combina con
los iones OH^{-}, procedentes de la cara aniónica de la membrana
bipolar, dentro de la cual, acontece la disociación del agua, bajo
el efecto del campo eléctrico.
De una forma simultánea, el compartimiento S/A,
se convierte en ácido, mediante la adición de iones H^{+},
procedentes de la cara catiónica de la membrana bipolar. Ambos, los
compartimientos adyacentes (B) y (S/A), forman una célula de
electrodiálisis.
Esta configuración, tiene la ventaja de un menor
consumo, y permite el poder variar el deseado valor de relación sal
/ ácido.
Con objeto de poder obtener un apropiado
funcionamiento del electrodializador, la conductividad eléctrica
del compartimiento de base (así como también la del compartimiento
de ácido, en el caso de la configuración de tres compartimientos),
debe ser suficiente y puede ajustarse mediante la adición de un
electrolito de soporte. Así, de este modo, la conductividad de la
solución de amonio, puede incrementarse, mediante la adición de una
sal de amonio, tal como sulfato amónico.
En una alternativa preferida, se procede a
introducir una mezcla de una sal de amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico
y de
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo,
en el compartimiento de sal de una célula de electrodiálisis con
tres compartimientos. La sal, se disociará de la misma forma que la
anteriormente descrita, en un ión
2-hidroxi-4-metiltio-butirato,
y migrará hacia el ánodo, en donde, éste, se transformará en ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico,
el ión amonio migrará hacia el cátodo, en donde, éste se
transformará en amoníaco; en el compartimiento de sal, permanecerán
el agua y el
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo
no convertido, el cual se reciclará a la columna de hidrólisis.
En concordancia con el procedimiento de
calentamiento, el ácido, se recupera procediendo a desplazar el
equilibrio sal de amonio / ácido libre, mediante al calentamiento
de la solución acuosa rica en HMTBS, y retirando el amoníaco de
esta forma liberado. Esto puede lograrse procediendo a calentar,
bajo la acción del vacío, a la presión atmosférica, mediante
tratamiento de agotamiento, o sin él. Puede considerarse el uso de
CO_{2}, con objeto de facilitar el desplazamiento del equilibrio.
Se obtiene una mezcla de HMTBS y de HMTBA, con un porcentaje del 5
al 99,9% de HMTBA y, de una forma preferible, del 10 al 50% de
HMTBA, en base a la suma de HMTBA y HMTBS. Las viscosidades de
estas soluciones, son las correspondientes a un valor comprendido
entre 1.200 y 30 mm^{2}\cdots^{-1} (1.200 y 30 cSt
-[centistokes] -) y, de una forma preferible, entre 200 y 50
mm^{2}\cdots^{-1} (200 y 30 cSt), a una temperatura de
25°C.
Las soluciones acuosas, pueden descomponerse
mediante la extracción del ácido, con la utilización de productos
disolventes, los cuales son parcialmente miscibles con agua, o no
miscibles con agua. Existe un amplio número de posibles
disolventes, para la separación. Los disolventes preferidos, son
las cetonas C5-C8, de una forma particular, la
metilisobutilcetona; éteres, tales como el isopropiléter; alcoholes,
tales como el isopropanol; ésteres; aminas terciarias, tales como
la trioctilamina. Dentro del ámbito de la invención, los disolventes
preferidos, son: acetona, MIBK, isopropanol, acetato de
isopropanol, éter isobutílico o éter propílico, ó THF,
trioctilamina. El valor de relación de la fase acuosa y la fase
acrílica, no es crítico. No obstante, por razones del nivel de
eficiencia, este valor de relación, no debería ser inferior a una
relación de 1 / 1 y, por rezones de la eficacia de la rentabilidad
o coste, no debería ser inferior a una relación de 1 / 3. Se
prefiere una relación de 1 / 1,5 - 2,0.
Esta extracción, puede aplicarse en forma de
lotes (de forma discontinua), o de forma continua, en cualquier
tipo de tecnología de extracción del tipo líquido / líquido. Pueden
mencionarse, por ejemplo, las cascadas de los mezcladores
decantadores a co- o a contra-corriente, extractores
centrífugos, columnas cargadas o de placas, etc.
La solución acuosa empobrecida en ácido libre,
puede tratarse, otra vez, y ello, tantas veces como se desee, hasta
el agotamiento completo de amoníaco, en caso deseado.
La fase orgánica, se somete a un tratamiento
para aislar HMTBA. Esto se realiza, de una forma mediante la
evaporación del disolvente, o mediante la extracción con agua
caliente. Con objeto de evitar la posible deterioración de HMTBA,
la tensión térmica, puede mantenerse tan pequeña como sea posible,
mediante la aplicación de vacío.
En ambos de estos procedimientos para disociar
sal de amonio, se genera una sal de amoníaco. Ésta última, puede
ser tratada, con objeto de concentrar el amoníaco. Se preferirá la
destilación y concentración del amoníaco, en una o varias zonas o
etapas. Podrá contemplarse una etapa previa de agotamiento. La
solución concentrada en amoníaco, puede enviarse de vuelta a la
síntesis del ácido cianhídrico, la cual se encuentra involucrada en
la síntesis del
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo.
En la primera etapa, se procede a concentrar la
solución acuosa de HMTBS y / o ácido libre. Esto se realiza, de
una forma preferible, mediante la evaporación del agua.
En la figura 2, se ilustra, de una forma
esquemática, una instalación para aplicar el procedimiento, y ésta
comprende los conductos 1, 2, respectivamente, para introducir
cianhidrina de AMTP y agua, en el interior del reactor 3. El
reactor 3, es un lecho fijo con recirculación, el cual se carga con
cepas o enzimas inmovilizadas. Se procede, a continuación, a
recuperar una solución concentrada de HMBTS, en la salida del
reactor 4, vía el conducto 5.
Esta solución concentrada de HMBTS, puede
experimentar dos tratamientos totalmente independientes, en
concordancia con el tipo de producto final deseado.
En el caso en el que se desee recuperar un
producto que contenga una alta proporción de HMBTS, la solución del
conducto 5, se lleva al interior de un evaporador 6, con el cual se
procede a concentrar el producto, y se recupera una solución
concentrada consistente principalmente en HMBTS, y que contiene una
reducida cantidad de ácido libre, en el conducto 8. El agua en
exceso, así como una fracción del amoníaco, se descargan a través
del conducto 7.
En el caso en el que se desee recuperar un
producto que contenga una alta proporción de ácido libre, la
solución concentrada de HMBTS del conducto 5, se lleva al interior
de un sistema de electrodiálisis bipolar 9. En este aparato, el
amoníaco, se separa, más o menos, del ácido, mediante
electrodiálisis. La mezcla empobrecida en amonio, se recupera en el
conducto 11 y, a continuación, se concentra en el evaporador 12, con
objeto de obtener una solución concentrada, consistente,
principalmente, en ácido libre y que contiene poco o nada de HMTBS.
La solución rica en amoníaco, se recupera mediante un agotamiento
15.
Este efluente de amoníaco, pueden concentrarse
mediante destilación, 16 y, el agua, se recupera en 18. La solución
concentrada de amoníaco 17, puede enviarse de vuelta a la síntesis
de HCN.
Los ejemplos que se facilitan a continuación,
ilustran la invención.
Se cultivan células de Alcaligenes
faecalis, durante un tiempo de 24 horas, a una temperatura de
30°C, en un medio mínimo, en presencia de benzonitrilo (0,5 g/l).
Después de la centrifugación del cultivo, se recoge la torta de
centrifugación, en un tampón TG (25 mM Tris-HCl, 10%
(peso / volumen) glicerol, pH 7,5. La suspensión celular, se trata
mediante ultrasonidos, y se centrifuga, con objeto de obtener el
extracto bruto. Se procede, a continuación, a tratar el extracto
bruto, con sulfato amónico, hasta un 30% de saturación. El
precipitado obtenido, se resuspende en tampón TG y, a continuación,
se dializa con 2 litros del mismo tampón, durante el transcurso de
toda una noche. La solución obtenida, se deposita, a continuación,
sobre una columna intercambiadora de iones del tipo Q Sepharose
Fast Flow HR 26/10, equilibrada previamente con tampón TG. La
actividad, se eluye, a continuación, con un gradiente de NaCl de 0
a 1 M. La fracciones activas, se depositan, a continuación, sobre
una columna intercambiadora de iones del tipo Q HR 5/5, equilibrada
previamente con tampón TG. La nitrilasa, se eluye con gradiente de
NaCl de 0 a 1 M. Finalmente, se procede a colectar las fracciones
que contienen actividad y, la concentración en sulfato de amonio,
se lleva, entonces, a un valor 1 M. Esta solución, se deposita, a
continuación, en columna de interacción hidrofóbica de Fenil
Superosa HR 5/5, con tampón TG, al que se le ha adicionado
previamente (NH_{4})_{2}SO_{4} 1 M. A continuación, la
actividad, se eluye mediante un gradiente de sulfato amónico de 1 M
a 0 M.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
Condiciones operativas: [nitrilo] = 50 mM;
tampón fosfato 100 mM, pH 7,0; 30°C.
El peso molecular de la proteína, se determina
mediante filtración en gel. Éste es de aproximadamente 260 kDa.
Sobre gel SDS-PAGE, se observa una banda individual
de 43 kDa (95% de pureza. Así, por lo tanto, se trata probablemente
de una proteína de una estructura \alpha_{6}, pesando, \alpha,
43 kDa.
La secuencia NH_{2}-terminal
mostrada en el ejemplo 1, tiene una identidad total con la secuencia
del extremo N-terminal de la nitrilasa de A.
faecalis JM3 (Kobayashi et al., 1993, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 90: 247 - 251), mientras que, los extremos
N-terminales de las nitrilasas bacterianas, tienen
una identidad del 35 al 57%, sobre 14 residuos. Los inventores, han
planteado la hipótesis de que, la nitrilasa de la invención,
purificada a partir de la cepa ATCC8750, era similar a la descrita
por parte de Kobayashi et al., (anteriormente citada). La
estrategia de clonación, consistía, entonces, en la amplificación,
por PCR, del gen de esta nitrilasa, sobre DNA genómico de la cepa
ATCC8750, por mediación de dos sondas nucleotídicas, determinadas a
partir de la secuencia dada por Kobayashi et al., (citada
anteriormente).
\newpage
Se procedió a sintetizar las dos sondas: una de
ellas, puede hibridar con la parte 5'de la secuencia dada por
Kobayashi et al. (anteriormente citada) y, la otra, con la
parte 3'.
Parte 5' | (PCRAF1): | CCGGGAATTCATATGCAGACAAGAAAAATCGTCC | |
Parte 3' | (PCRAF2): | TCCTTCTGCGTCCCCGATCCCGCAT |
El cebador PCRAF1, incluye 12 nucleótidos en 5',
permitiendo la introducción de los sitios de restricción de las
enzimas EcoRI y NdeI, corriente arriba del codón de iniciación ATG.
El cebador PCRAF2, permite la introducción del sitio de restricción
de la enzima BamHI. El DNA genómico de la cepa A. faecalis
ATCC8750, se extrajo, en concordancia con el protocolo CTAB,
descrito por parte de Ausubel et al. (Current Protocols in
Molecular Biology, - Protocolos actuales en biología molecular -,
John Wiley & Sons Inc., ed., 2.4.1 - 2.4.5) y se utilizaron 100
ng, para cada reacción de PCR. Con objeto de actuar en la
especificidad de amplificación, se procedió a someter a tests de
ensayo, diferentes concentraciones de MgCl_{2}, tal como se indica
en Ausubel et al., (anteriormente citado), en un volumen
total de muestra de 100 \mul, y con 2,5 unidades de Taq
DNA-polimerasa (Perking Elmer). Se llevaron a cabo
dos reacciones de adición, con 1,5 mM MgCl_{2} y 5% DMSO ó 5%
formamida. Se programó un termociclador Perkin Elmer 9600, con la
siguiente secuencia: 5 minutos a una temperatura de 95°C, 30 ciclos
(30 segundos a 95°C, 30 segundos a 55°C, 45 segundos a 72°C, y 4
minutos a 72°C. Los diferentes productos de amplificación, se
analizaron en gel de agarosa al 0,8%. Se procedió a amplificar, en
todas las reacciones, una banda mayoritaria, cuyo tamaño
correspondía a al tamaño esperado de 1,15 kb, pero, de una forma
más específica, con 1,5 mM MgCl_{2} y 5% DMSO. Se procedió, por lo
tanto, a retener los productos de la reacción, bajo estas
condiciones, para la continuación. La muestra, se trató con
proteinasa K, y se precipitó con etanol, después de una extracción
con fenol-cloroformo. La torta obtenida, la cual se
recogió como una suspensión, se incubó durante un transcurso de
tiempo de 2 horas, a una temperatura de 37°C, con 40 unidades de
enzima EcoRI y 40 unidades de enzima BAMHI. Después de la migración
sobre gel de agarosa al 7%, la banda de 1,15 kb, se cortó, y se
extrajo, con objeto de clonarla en el vector pBSK^{-} abierto
EcoRI-BamHI (Stratagene, La Jolla, USA), mediante
procedimientos convencionales. Se procedió a analizar cinco clones
independientes, denominados
pRPA-BCAT1-5, mediante la digestión
enzimática del ADN plásmido, con las enzimas NdeI, EcoRI, BamHI,
BspMI y Bg1II (figura 3). Los perfiles obtenidos, correspondían a
los perfiles teóricos de restricción de un plásmido obtenido
mediante este procedimiento, con la secuencia descrita por parte de
Kobayashi et al. (anteriormente citado). La cepa XL1Blue
(pRPA-BCAT3), se depositó en el CBS, con el número
CBS 989 - 96.
El inserto clonado en el plásmido
pRPA-BCAT3, se secuenció por parte de la firma
Genome Express S.A. (Grenoble, Francia), a partir de una
preparación de DNA, realizada en el laboratorio (kit Wizzard
Midi-Prep, Promega), La estrategia para la
secuenciación de este fragmento, realizada en concordancia con
procedimientos convencionales que son conocidos por parte de las
personas expertas en el arte especializado de la técnica, se indican
en la figura 4. Los diez cebadores nucleotídicos internos
(identificados mediante los números 623 - 629 y 681 - 682, en la
figura 4), se sintetizaron a partir de la secuencia de la nitrilasa
de A. faecalis JM3 (Kobayashi et al., (anteriormente
citado). Este juego, se completó mediante los cebadores universales
"Reverse" y "M13 Forward". Cada región, se leyó por lo
menos una vez, en cada cepa hebra de DNA.
La secuencia de DNA obtenida, tiene dos
diferencias, de una forma relativa, con respecto a la secuencia
publicada: una de ellas, en la estructura que se supone que va ser
utilizada como un terminador de transcripción y, la otra, en el gen
de nitrilasa, denominado nitB, que conduce a la sustitución Asn 279
\rightarrow Asp. Se procedió, a continuación, a secuenciar ambas
regiones, en el laboratorio, sobre los plásmidos
pRPA-BCAT1, 2, 4, 5, con dos cebadores específicos,
el 710 y el 682 (véase la figura 4). El reemplazo C \rightarrow
T, en la posición 1412 (en concordancia con la numeración de
Kobayashi - anteriormente citado, más arriba), en el terminador, se
encontró, otra vez, en otros clones. Esto es una mutación, la cual
diferencia ambas cepas de A. faecalis. El reemplazo A
\rightarrow G, en la posición 1138, se encuentra únicamente
presente, en el plásmido pRPA - BCAT3. Esto es, por lo tanto, una
mutación introducida durante la PCR, por la Taq
DNA-Polimerasa.
Con objeto de confirmar la identificación de la
secuencia de DNA clonada con el gen de nitrilasa purificada, se
procedió a emplazar el gen nitB, bajo el control del promotor de gen
\Phi fago T7 (PT7), según el procedimiento operativo que se
describe a continuación: se procedió a clonar los insertos
NdeI-BamHI de 1,13-kb, de los
plásmidos pRPA-BCAT3 y pRPA-BCAT4,
en el vector pXL2432, con objeto de proporcionar respectivamente
los vectores pRPA-BCAT12 y
pRPA-BCAT13, descritos en la figura 5. El vector
madre pXL2432, es un híbrido entre la región de plásmido pET9
(Studier et al., 1990, Methods in Enzymol. 185, 60 - 69),
comprendida entre los sitios AccI y EcoRI, la cual abarca el origen
de la replicación (ORI) y el marcador de selección portador de la
resistencia a la kanamicina (Kan), y la región comprendida entre los
sitios EcoRI y AccI del plásmido pET11a (Novagen Inc., Madison Wi,
USA). La cual abarca la casete de expresión, el gen del IacI, y el
regulador del número de copias ROP.
Se procedió a realizar cultivos, bajo
condiciones de inducción, en concordancia con el procedimiento
operativo que se facilita a continuación: se procedió a cultivar la
cepa BL21 (DE3) Novagen Inc, Madison WI, USA), que contenía el
plásmido pRPA-BCAT12, la cepa BL21 (DE3) que
contenía el plásmido pRPA-BCAT13, así como la cepa
BL21 (DE3), que contenía el plásmido pXL2432, durante un tiempo de
16 horas, en medio LB, a una temperatura de 37°C (Miller, 1972,
Experiments in Molecular Genetics, - Experimentos en genética
molecular -, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y), que contenía 50
\mug/ml de kanamicina y, a continuación, se diluyeron a un valor
correspondiente a una concentración 100 veces inferior, en el mismo
medio, y la misma temperatura. Cuando los cultivos hubieron
alcanzado una OD600 comprendida entre 0,5 y 1, se procedió a añadir
IPTG, a una concentración final de 1 mM. Después de 6 horas de
cultivo, se colectaron las bacterias. Se adoptó un procedimiento
operativo similar, con objeto de cultivar las cepas BL21 (DE3), que
contenía los plásmidos pRPA-BCAT12 y pXL2231, la
cepa BL21 (DE3) que contenía los plásmidos
pRPA-BCAT13 y pXL2231, así como la cepa BL21 (DE3)
que contenía los plásmidos pXL2432 y pXL2231, procediendo a añadir
tetraciclina, al medio de cultivo, en una cantidad de 12 \mug/ml
de medio. El plásmido pXL2231, el cual deriva del vector pXL1835
(solicitud de patente francesa 90 / 05 185, de fecha 24.04.1990),
pertenece al grupo de incompatibilidad IncP, y es por lo tanto
compatible con los plásmidos pRPA-BCAT12 y
pRPA-BCAT13, los cuales tienen el origen de
replicación del plásmido ColE1. Su marcador de selección, es la
resistencia la tetraciclina, y éste porta un fragmento de
ecoRI-HindIII, de 2,2 kb, que contiene los genes
GroES y GroEL, que codifican para caperuzas moleculares de E.
coli (Fayer et al., 1986, Mol. Gen. Genet. 202: 425 -
445).
La expresión de nitrilasa, se analizó en un gel
de SDS-PA al 10%, en una fracción bruta, después de
la sonificación (tratamiento mediante ultrasonidos) de las células,
y después de la centrifugación, en la torta, y en el sobrenadante.
Los resultados obtenidos, se presentan en la figura 6, y éstos
muestran una alto nivel de expresión de nitrilasa (NitB), en los
extractos de células, en donde, uno de los plásmidos, contiene el
inserto nitB; no obstante, esta proteína, se encuentra
esencialmente en forma insoluble, si bien, con la presencia del
plásmido pXL2231, puede incrementarse la cantidad de polipéptido de
nitrilasa, en la fracción soluble.
En la figura 6, M, representa el marcador de
pesos moleculares; éstos últimos, se indican en kDa. Por otra
parte, las pistas, tienen los significados que se facilitan a
continuación:
- A, D, G, representan las fracciones de BL21
(DE3) + pRPA-BCAT12 / pRPA-BCAT13 /
KL2432; respectivamente;
- B, E, H, representan los sobrenadantes
obtenidos a partir de estas mismas cepas, respectivamente;
- C, F, I, representan las tortas obtenidas a
partir de estas mismas cepas, respectivamente;
- J, N, Q, representan las fracciones brutas,
respectivamente obtenidas, a partir de
BL21 (DE3) + pXL2231 +
pRPA-BCAT12 / pRPA-BCAT13 /
KL2432;
- K, O, R, representan los sobrenadantes
obtenidos a partir de estas cepas, respectivamente;
- L, P, S, representan las tortas obtenidas a
partir de estas cepas, respectivamente.
Las cepas BL21 (DE3) /
pRPA-BCAT12 + pXL2231, se denominó
pRPA-BIOCAT126. La cepa BL21 (DE3) /
pRPA-BCAT13 + PXL2231, se denominó
pRPA-BIOBCAT127. Las actividades nitrilasa de
cultivos de pRPA-BIOCAT126,
pRPA-BIOCAT127 y pRPA-BIOCAT66, la
cual corresponde a las de BL21 (DE3 = / pXL2432, se determinaron de
la forma que sigue: los cultivos, se realizaron en concordancia con
el protocolo descrito anteriormente, arriba, procediendo a cambiar
el volumen de cultivo (50 ml) y la concentración final de IPTG (0,1
mM). Los cultivos, se centrifugaron y, las tortas de células, se
recogieron en 10 ml de tampón fosfato de potasio 100 mM, pH 7. La
hidrólisis de HMTBN, se realizó con 500 \mul de esta suspensión,
añadida a 500 \mul de solución de HMTBN 200 mM, pH 7. La cinética
de la hidrólisis se obtuvo procediendo a mezclar 100 \mul de esta
mezcla, a 900 \mul de ácido fosfórico 0,1 N, a intervalos
regulares, durante 1 a 4 horas. Las cantidades de HMTBA producidas,
se analizaron mediante HPLC, tal y como se describe en el documento
de solicitud de patente internacional WO 96 / 09 403. Los
resultados, se recopilan en la tabla 2.
Abreviaciones: Km: Kanamicina 50 \mug/ml; Tc: tetraciclina 12 \mug/ml; hrs: horas; U: kg de HMTBA forma- | |
dos por hora y por kg de peso en seco. |
Con objeto de mejorar la solubilización del
polipéptido de nitrilasa expresado, el plásmido
pRPA-BCAT37, se construyó de la forma que se
describe a continuación. Se obtuvo el plásmido pXL2391, procediendo
a ligar el fragmento de 5,9 kb de EcoRI-PvuII del
plásmido pDSK519 (Keen et al., 1998, Gene 70: 191 - 197), se
trató con polimerasa de Klenow, con el fragmento de HindIII de
2.056 pb, extraído del plásmido pHP45\OmegaSp (Prentki y Krisch),
1984, Gene 29: 303 - 313), y tratado con Nucleasa de Mung Bean. Se
procedió, a continuación, a digerir el plásmido pXL2391, con SmaI y
SacI y, el inserto de 2,3 que porta el operón GroESL, extraído del
plásmido pXL2231, digerido con HinIII, tratado con Klenow y digerido
con SacI, se introdujo en éste. El plásmido
pRPA-BCAT37, es por lo tanto un derivado del
plásmido RSF1010, con un mayor número de copias que el plásmido
pXL2231, compatible con el plásmido que porta el origen ColE1, y que
porta un marcador de resistencia a la estreptomicina. Este
plásmido, se introdujo en la cepa BL21 (DE3) /
pRPA-BCAT12, con objeto de proporcionar la cepa
RPA-BIOCAT171. Se procedió a determinar la actividad
de un cultivo realizado en concordancia con un procedimiento
operativo similar, tal y como el que se ha descrito anteriormente,
arriba, pero reemplazando la tetraciclina por la estreptomicina, a
100 \mug/ml, y ésta se proporciona en la tabla 3 que se facilita a
continuación.
Abreviaciones: Km: Kanamicina 50 \mug/ml; Sm: estreptomicina 100 \mug/ml; hrs: horas; U: kg de HMTBA |
formados por hora y por kg de peso en seco. |
Se procedió a construir el plásmido
pRPA-BCAT6, clonando, sobre pBCAT3 (véase la figura
3), el fragmento de 0,6 kb de ScaI-NdeI de pXL2158,
que contiene el promotor Ptrp y el sitio para fijar el ribosoma
RBScII (Levy-Schill et al., 1995, Gene 161:
15 - 20). La expresión, se realizó con la cepa DH5lalpha, que
contiene el plásmido pRPA-BCAT6 y / o el pXL2035
(Levy-Schill et al., mencionado
anteriormente), mediante el siguiente procedimiento operativo: Se
procedió a incubar el pre-cultivo, durante un
transcurso de tiempo de 16 horas, a una temperatura de 37°C, en
medio M9 glucosa (Miller, J.H. 1972. Experiments in Molecular
Genetics, - Experimentos en Genética Molecular -, Cold Spring
Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.), que contiene un 0,4%
de casaminoácidos, 100 /g/ml de triptofano, 100 \mug/ml de
carbenicilina. Para cepas que contengan pXK2035, se añade
kanamicina, en una cantidad 50 \mug/l. La expresión, se realiza,
después de la dilución a un valor 100 veces inferior, al de la
concentración del cultivo saturado, en un medio idéntico, pero sin
triptofano, e incubación durante un tiempo de 8 a 16 horas, a
37°C.
El análisis en SDS-PAGE de los
extractos de las diferentes cepas, se realizó de la misma forma que
la que se ha descrito en el ejemplo previo, y se muestra en la
figura 7.
En esta figura, M, representa el marcador de
pesos moleculares; éstos últimos, se indican en kDa. Por otra
parte, las pistas, tienen los significados que se facilitan a
continuación:
- L, I, F, C representan las fracciones brutas
obtenidas a partir de las cepas DH5alpha +
pRPA-BCAT/3, /6, /6 +
pRPA-BIOCAT76, respectivamente;
- K, H, E, B, representan los sobrenadantes
obtenidos a partir de estas mismas cepas, respectivamente;
- J, G, D, A, representan las tortas obtenidas a
partir de estas mismas cepas, respectivamente.
Con el plásmido pRPA-BCAT6,
puede obtenerse una pequeña acumulación de un polipéptido de 43 kDa,
mayoritariamente insoluble. La co-expresión del
Groe a partir del plásmido pXL2035, reduce la sobreexpresión, pero,
después de tres trasplantes sucesivos de la cepa DH5alpha
(pRPA-BCAT6 + pXL2035), la cepa
RPA-BIOCAT76 seleccionada, se encuentra, otra vez,
con un elevado nivel de expresión del polipéptido de nitrilasa,
siendo éste último casi completamente soluble. Los ensayos de las
actividades de los cultivos realizados en concordancia con los
procedimientos operativos descritos anteriormente, arriba, y en los
ejemplos previos, se muestran en la tabla 4.
Abreviaciones: Km: Kanamicina 50 \mug/ml; Cb: carbenicilina 100 \mug/ml; hrs: horas; U: kg de HMTBA | |
formados por hora y por kg de peso en seco. |
Estos datos, muestran el hecho de que, la
co-expresión de GroE, posibilita la expresión de la
nitrilasa a ser mejorada, y que, una selección de cepas
convencional, mediante transplantes sucesivos, contribuye también a
mejorar la actividad de los recombinantes.
Se utilizó el sistema descrito en el ejemplo 5,
para producir nitrilasa en Pseudomonas putida y
Alcaligenes faecalis. Se procedió a introducir el fragmento
de 1,14 kb de NdeI-XbaI de
pRPA-BCAT6, que contenía el gen nitB, en los sitios
NdeI-XbaI del vector pXL1289. El vector pXL1289, es
un derivado de pKT230 (Bagdasarian et al., 1981, Gene 15:
237 - 247), que porta un origen de replicación
multi-huésped (oriV), en bacterias Gram negativas,
y el cual contiene un fragmento de 120 pb de
EcoRi-NdI, que porta el promotor Ptrp y del PBScII
de pXL534 (Latta et al., 1990, DNA and Cell Biology, -
Biología del DNA y de la célula -, 9: 129 - 137), un inserto
XbaI-BamHI, que codifica para el gen cobA (Crouzet
et al., 1990, J. Bacteriol. 172: 5968 - 5979) y un inserto
XbaI-BamHI, de 500 pb, que contiene el terminador
TrrnB de pXL534 (Latta et al., 1990, DNA and Cell Biology, -
Biología del DNA y de la célula -, 9: 129 - 137). El plásmido
pRPA-BCAT14 obtenido es, por lo tanto, un derivado
del pKT230, que contiene un gen que imparte resistencia a la
kanamicina (Kan) y el gen nitB, bajo el control de Ptrp:RBScII
(Figura 8).
En el momento de la introducción de este
plásmido en la cepa de E. coli DH5 alpha, se seleccionó un
clon particular: éste expresaba una nitrilasa, para la cual, el
peso molecular sobre gel de SDS-PA, es de 44 kDa,
en lugar de 43 kDa. El plásmido hospedado mediante este clon, tiene
el mismo perfil de restricción que el pRPA-BCAT14,
y se denominó pRPA-BCAT24. Finalmente, se construyó
el plásmido pRPA-BCAT23, en concordancia con el
mismo procedimiento operativo que para el
pRPA-BCAT14, pero con los siguientes cambios: el
fragmento de 135 pb StuI-BsmI de
pRPA-BCAT6, se reemplazó mediante el fragmento
StuI-BsmI de pRPA-BCAT4. El plásmido
pRPA-BCAT23, por lo tanto, expresa una nitrilasa
NitB, con un residuo Asn en la posición 279.
Los plásmidos pRPA-BCAT14, 23 y
24, se introdujeron, mediante electroporación, en la cepa
Pseudomonas putida G2081. La cepa G2081, deriva de la cepa
KR2440 (Bagdasarian y Timmis, 1981, en Hofschneid y Goebel, Topics
en Microbiology and Immunology, - Tópicos en microbiología e
inmunología, 47, Springer Verlag, Berling), mediante la selección
de la resistencia espontánea al ácido nalidíxico y a la rifanpicina.
El vector pKT230, se utilizó como un plásmido de control.
Los plásmidos pRPA-BCAT14,
pRPA-BCAT23, pRPA-BCAT24 y pKT230,
se extrajeron, a continuación, de las cepas de P. putida,
con objeto de introducirse, mediante electroporación, en la cepa de
A. faecalis ATCC8750 (=pRPA-BIOCAT1).
Las cepas G2081 (pRPA-BIOCAT14),
G2081 (pRPA-BIOCAT23), G2081
(pRPA-BCAT14), G2081 (pRPA-
BCAT23), G2081 (pRPA-BCAT24), (pRPA-BIOCAT1) (pKT230, se cultivaron durante el transcurso de toda la noche, a una temperatura de 30°C, en medio LB que contenía 50 mg/l de kanamicina. Estos precultivos, se diluyeron hasta un valor correspondiente a una concentración 100 veces menor, respecto a su concentración inicial, en medio M9, que contenía 50 mg/l de kanamicina, y se incubaron durante 20 horas, a una temperatura de 30°C.
BCAT23), G2081 (pRPA-BCAT24), (pRPA-BIOCAT1) (pKT230, se cultivaron durante el transcurso de toda la noche, a una temperatura de 30°C, en medio LB que contenía 50 mg/l de kanamicina. Estos precultivos, se diluyeron hasta un valor correspondiente a una concentración 100 veces menor, respecto a su concentración inicial, en medio M9, que contenía 50 mg/l de kanamicina, y se incubaron durante 20 horas, a una temperatura de 30°C.
Después de la sonificación (tratamiento mediante
ultrasonidos) de las células, se procedió a medir la expresión de
nitrilasa sobre un gel 10% SDS-PA, después de la
sonificación de las células, y después de la centrifugación, en la
torta, y en el sobrenadante. Los resultados obtenidos, se presentan
en la figura 9. Para las cepas RPA-BIOCAT1 (pKT230)
y G2081 (pKT230), se depositaron únicamente los extractos brutos
(pistas A e I, respectivamente. En esta figura, M, representa el
marcador de pesos moleculares; éstos últimos pesos, vienen indicados
en kDa. Por otra parte, las pistas, tienen los significados que se
facilitan a continuación:
- C, D, F, representan las fracciones obtenidas
a partir de las cepas RPA-BIOCAT1
(pRPA-BCAT14), RPA-BIOCAT1
(pRPA-BCAT14), RPA-BIOCAT1
(pRPA-BCAT24), respectivamente;
- C, E, G, representan los sobrenadantes
obtenidos a partir de estas mismas cepas, respectivamente;
- H, representa la torta obtenida a partir de
RPA-BIOCAT1 (pRPA-BCAT24),
- J, L, O, representan las fracciones brutas,
respectivamente obtenidas, a partir de las cepas G2081
(pRPA-BCAT14), G2081 (pRPA-BCAT23),
G2081 (pRPA-BCAT24), respectivamente;
- K, N, P, representan los sobrenadantes
obtenidos a partir de estas mismas cepas, respectivamente;
- Q, representa la torta obtenida a partir de
G2081 (pRPA-BCAT24).
Este experimento, muestra el hecho de que, las
cepas de P. putida, expresan grandes cantidades de los tres
polipéptidos de nitrilasa solubles, y que únicamente el polipéptido
de nitrilasa de 44 kDa, se sobre-expresa mediante
la cepa de A. faecalis. Los ensayos de actividad de estos
cultivos, realizados en concordancia con el protocolo descrito en
el ejemplo 4, muestra el hecho de que, las cepas G2081
(pRPA-BCAT23), G2081 (pRPA-BCAT24),
y RPA-BIOCAT1 (pRPA-BCAT24), tienen
una actividad nitrilasa en HMTBN.
Se procedió a realizar la expresión de la
nitrilasa, en la cepa CGL1010 (= ATCC 14757), por mediación del
promotor PcspB (Peyret et al., 1993, Molecular Microbiol. 9:
97 - 109). Se amplificó un fragmento de 530 pb, que contenía el
promotor PcspB, a partir del plásmido pCGL815 (Peyret et al.,
anteriormente citado, arriba), por mediación de los siguientes
cebadores KS1 y KS2.
KS1: | 5'-ACGCGTCGACCAGATCGTCAAGTTGTGG-3' | |
KS2: | 5'-CATAGAGGCGAAGGCTCCTTG-3' |
Después de la digestión mediante SalI, el
fragmento amplificado de 530 pb, se clonó en el plásmido pBSK
(Stratagene, La Jolla USA), y se abrió mediante SalI y EcoRV, con
objeto de proporcionar el plásmido pCGL1084. Se fabricó un
adaptador EcoNI/NdeI, mediante hibridación, de ambos de los dos
oligonucleótidos KS8 y KS9 siguientes:
KS8: | 5'-TCAAGGAGCCTTCGCCTCA-3' | |
KS9: | 5'-TATGAGGCGAAGGCTCCTTG-3' |
El gen de la nitrilasa, se extrajo del plásmido
pRPA-BCAT6, como un fragmento
NdeI-XbaI, de 1,1 kb. Éste se introdujo en pCGL1084
y se abrió con EcoNI y XbaI, mediante la utilización del adaptador
EcoNI/NdeI, descrito anteriormente, arriba, con objeto de obtener
el plásmido pCGL1086. El fragmento SalI-BamHI de
pCGL1086 que contiene PcspB::nitB, se clonó en el vector pCGL482
(Peyret et al., citado anteriormente), en los sitios Sal I y
BamHI, conduciendo al plásmido pCG1087. El plásmido pCG1087 (figura
10), es por lo tanto un vector lanzadera, basado en pBI1
(Santamaría et al., 184, J. Gen. Microbiol. 130: 2237 -
2246), que contiene el origen de replicación de pACYC 184,
reconocido en E. coli, un gen que imparte resistencia al
cloranfenicol (Cm) y la fusión PcspB::nitB.
Los plásmidos pCGL1087 y pCGL 482, se
introdujeron, mediante electroporación, en CGL1010, tal y como se
describe por parte Bonnamy et al., 1990 (FEMS Microbiol.
Lett. 66: 263 - 270). Después 20 horas de cultivo a una temperatura
de 30°C, en medio de infusión Brain Heart 3,7% (Difco Laboratories,
Detroit, USA) aditivado con 5 mg/ml de cloranfenicol, se realizaron
ensayos de actividad nitrilasa, en muestras de cultivo, tal y como
se describe en el ejemplo 4. Los resultados, muestran que, la cepa
CGL1010 (pCGL1087), tiene actividad nitrilasa, mientras que, la
cepa CGL1010 (pCGL482) no tiene ninguna actividad.
Se procedió a realizar la expresión de la
nitrilasa, en la cepa TK24 de S. Lividands (Hopwood et
al., 1985, Genetic manipulation of Streptomyces; A laboratory
Manual, - Manipulación genética de Streptomyces; Un manual de
laboratorio -, The John Innes Foundation, Norwich), por mediación
del plásmido pIJ6021 (Takano et al., 1995, Gene 166: 133 -
137), mediante la utilización del promotor PtipA (Homes et
al., 1993, EMBO J. 12: 3182 - 3119)).
Se procedió a la modificación del plásmido
pUC19, (Yanisch-Perron et al., 1985, Gene 33:
103 - 119), sometiendo a deleción el fragmento Tfi I, de 140 pb,
mediante la digestión de Tfi I, tratando con Klenow y ligando el
vector sobre sí mismo. El plásmido obtenido, se abrió con EcoRI y
BamHI, con objeto de clonar el fragmento de 1,5 kb de
EcoRI-BamHI de pRPA-BCAT3, que
contenía el gen nitB. El plásmido pOS48.4 de esta forma obtenido,
tiene un sitio individual Tfi I, localizado entre el gen nitN y el
sitio BamHI. Este sitio, se utilizó para insertar un fragmento
\Omegahyg de 2,3 kb, expresado a partir del plásmido
pHP45\Omegahyg (Blondelet - Rouault et al., Gene,
submmited - [propuesto]-), después de la digestión mediante BamHI y
tratamiento con Klenow. El fragmento \Omegahyg, contiene el gen
de higromicina-fosfotransferasa (hyg) de
Streptomyces Hygroscopicus (Zalacain et al., 1986,
Nucl. Acids Res., 14: 1565 - 1581, e imparte, a la S.
lividans, resistencia a la higromicina. El plásmido pOS48.5 de
esta forma obtenido, se utilizó para aislar un fragmento
NdeI-BamHI de 3,45 kb, que contenía el gen de la
nitrilasa, seguido por el gen hyg, el cual se clonó en el plásmido
pIJ6021 (Takano et al., citado anteriormente), abierto
mediante NdeI y BamHI. Puesto que, el plásmido pIJ6021, sólo se
replica en Streptomyces, la mezcla de ligación se transformó en
S. lividans TK24, mediante procedimientos convencionales
(Hopwood et al., citado anteriormente), mediante la selección
de clones que resisten a 200 mg/l de higromicina (Boehringer
Manheim). Los DNAs plasmídicos de estos clones, se extrajeron
mediante procedimientos convencionales (Hopwood et al.,
anteriormente citado), y sus perfiles de restricción, correspondían
propiamente a la construcción esperada, la cual se denominó
pOS48.7
(figura 11).
(figura 11).
Los clones de S. lividans que contienen
pOS48.7, así como el clon que contiene el plásmido pIJ6021, se
cultivaron en 50 ml de medio TSB ((Triptic Soy Broth, Difco), a
una temperatura de 30°C, durante un transcurso de tiempo de 72
horas, con una selección de kanamicina de 5 mg/l, y después, se
añadió tioestreptón a la concentración de 5 mg/l y, el cultivo, se
continuó durante un transcurso de tiempo 18 horas más, bajo las
condiciones descritas (Hopwood et., anteriormente citado). El
cultivo, se recolectó y, el ensayo de actividad, realizado bajo las
condiciones descritas en el ejemplo 4, muestra el hecho de que, la
cepa S. lividans TK24 (POS48.7), expresa actividad
nitrilasa, contrariamente a la cepa TK24 (pIJ6021).
La secuencia primaria, de la nitrilasa de
Comanonas testosteroni sp., descrita en
Levy-Chill et al., 1995 (citado
anteriormente, arriba), presenta un 31% de identidad con la
secuencia primaria de la nitrilasa descrita en esta invención. La
cepa recombinante de C. coli TG1 (pXL2158, pXL2035), la cual
expresa la nitrilasa de C. testosteroni, se cultivó mediante
las condiciones descritas por parte de Levy-Schill
et al., (citado anteriormente, arriba), y se procedió a
cultivar una torta de células, en un tampón fosfato 100 mM, a un pH
7, con 50 mM HMTBN, a una temperatura de 30°C. La actividad medida,
era de 2,3 kg/h.kg CS. De la misma forma que la nitrilasa de la
invención, la nitrilasa de C. testosteroni, es capaz de
hidrolizar el HMTBN.
Adicionalmente, los datos mostrados en el
ejemplo 4, con los plásmidos pBCAT12 y pBCAT13, muestran el hecho
de que, con las sustitución Asn 279 \rightarrow Asp 279 sobre la
nitrilasa de A. faecalis ATCC8750, sobre la nitrilasa de
A. faecalis ATCC8750, puede retenerse la actividad sobre
HMTBN.
Se procedió a añadir 5 g de células secas, a 20
g de agua, ajustada a un valor pH de 7,0. La cantidad indicada de
soporte (CELITE 545), Prolabo, Francia), se añade, a continuación y,
después de una perfecta homogeneización, la suspensión, se reticula
mediante la adición de un porcentaje del 15% de gluturaldehído, en
base al peso total de la masa en seco, seguido de un 10% de
polietilenimina (SEDIPUR, BASF, Alemania). La suspensión, se añade
durante 1 hora, a la temperatura ambiente.
Se procede, a continuación, a flocular la
suspensión, mediante la adición de un floculante aniónico Superfloc
A100. A continuación, se recubre la masa, mediante filtración.
Esta masa, se suspende a continuación, otra vez,
mediante la adición de un 10% de poliazetidina (KYMENE 557,
Hercules, USA), en base al peso total de la masa en seco. La masa
todavía húmeda, se extrusiona, a continuación, a través de un
orificio 0,5 mm de diámetro, y se seca.
La actividad de las partículas obtenidas, se
determina, a continuación, según un procedimiento descrito en el
documento de patente internacional WO 96 / 09 403.
La adición de soporte para las células, mejora
notablemente la actividad.
Se procedió a repetir el experimento,
reemplazando el CELITE por gluten de trigo soluble en agua
(Roquette, Francia), o gelatina totalmente soluble en agua (SBI,
Francia).
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{ * \begin{minipage}[t]{150mm}La suspensión celular, no flocula, y no es filtrable. Este ejemplo, muestra el hecho de que, el gluten, puede ser sustituido por CELITE. Por otro lado, si la adición es gelatina (totalmente soluble), es imposible el proceder a dar forma al catalizador, mediante la técnica descrita anteriormente, arriba (extrusión).\end{minipage} \cr}
Se procedió a mezclar 10 g de Escherichia
coli BIOCAT171 del ejemplo 4, preparada mediante cultivo
aeróbico en un medio LB, con 10 g de CLAREL 78 (CECA, Francia) en
500 g de tampón fosfato 100 mM pH 7,0. Después de la
homogeneización, se añadieron 6 g de gluturaldehído al 25% y, la
suspensión, se agitó durante un transcurso de tiempo de 15 minutos,
a la temperatura ambiente. A continuación, se añadieron 2 g de
polietilenimina, así como 6 g de gluturaldehído al 25%. El conjunto
en su totalidad, se agitó durante un tiempo de una hora, a la
temperatura ambiente. El conjunto en su totalidad, se floculó
mediante la adición de 5 ml de una solución de SUPERFLOC A100 al
0,2% (CYTEC, Francia). La masa, se filtró y, la suspensión obtenida,
se mezcló con 16 g de poliazetidina al 12,5% (KYMENE 557, Hércules)
y, a continuación, se extrusionó a través de un orificio de 0,5 mm
de diámetro. Los perfiles en forma de fideos o de macarrones
obtenidos, se secaron a una temperatura de 35°C, en un horno, y a
continuación, se sumergieron durante un transcurso de tiempo de 30
minutos, en un baño de NaBH_{4} al 1%, preparado en un tampón
borato 50 mM, pH 10,0. Se procedió, a continuación, a lavar el
biocatalizador, con agua destilada. El catalizador, se almacenó a
una temperatura de 5°C, a la temperatura ambiente, en un tampón
fosfato 500 mM pH 8,0.
Se procedió a cargar una columna con control de
temperatura mediante termostato, con un diámetro interior de 3 cm y
una altura de 45 cm, con 100 g de biocatalizador. Esta columna, se
encuentra conectada a una bomba, vía un bucle de recirculación. El
volumen total del reactor, es de 430 ml. El bucle, se llena con una
solución de sal de amonio al 25% del ácido
hidroxilmetiltiobutiríco. La solución, se introduce, desde la parte
superior de la columna, hacia el fondo, a un caudal por hora
correspondiente a un valor de 20 l/h. El agua que circula en la
doble manta de la columna y el intercambiador de calor, permite el
que se mantenga la temperatura, a una nivel de 35°C. Se procede a
añadir agua desmineralizada al bucle, a un caudal de flujo de 80
g/h, Se añade
2-hidroxi-4-metiltiobutironitrilo,
a un caudal de 20 g/h. El exceso de volumen del medio de reacción,
se descarga desde el fondo de la columna, de tal forma que, el
volumen del bucle, permanezca constante. Así, de este modo, se
obtiene un flujo continuo, con una tasa de conversión de nitrilo del
95%. Adicionalmente, además, la concentración de la solución acuosa
de la sal de amonio de ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutírico
obtenido en la salida del reactor, es del 25%.
El electrodializador utilizado, consiste en un
apilamiento de 9 células o celdas, con 2 dm^{2} de superficie
activa, consistiendo, cada una, en 2 compartimientos que se designan
continuación:
- compartimiento sal / ácido: limitado en el
lado del catalizador, mediante una membrana intercambiadora de
cationes del tipo Neosepta CMB de la firma Tokuyama soda, y en el
lado del ánodo, mediante la cara catiónica de una membrana bipolar
Aqualitics.
- compartimiento base: limitado en el lado de la
membrana catiónica, y sobre el lado del cátodo, mediante la cara
aniónica de la membrana bipolar.
El ánodo, consiste en titanio platinado. El
cátodo, es de acero inoxidable.
El electrolito, consiste en una solución acuosa
de sulfato de sodio, con una conductividad de 100 mS/cm, a una
temperatura de 40°C. El caudal de circulación, en los electrodos, es
de 2 x 100 l/h. El volumen, es de 5 l.
El compartimiento "base", se llena,
inicialmente, con 5 litros de una solución de sulfato amónico al
1%.
El compartimiento "sal / ácido", se llena
inicialmente con 5 litros de una solución de 1,44 mol/l de sal de
amonio del ácido
2-hidroxi-4-metiltiobutanóico.
El caudal de recirculación de la solución, se
fija, inicialmente, a un valor de 130 l/h para el compartimiento
sal / ácido, y a un valor de 190 /h, para el compartimiento
base.
La electrodiálisis, se realiza en forma de
lotes, es decir, en forma discontinua (régimen de funcionamiento en
recirculación, a una temperatura media de 40°C. la intensidad, se
impone que sea la correspondiente a un valor de 9 A; es decir, una
densidad de corriente correspondiente de 0,45 kA/m^{2}.
Después de 155 minutos de funcionamiento, la
conductividad del compartimiento sal / ácido, ha cambiado de 59
mS/cm, a 7,8 mS/cm.
El compartimiento sal / ácido, contiene 1,35
mol/l de ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico,
100% del cual, es en forma de ácido.
El rendimiento de Faraday, se estima que es el
correspondiente a un valor de un 71% y, el consumo de energía, es
estima que es de 0,53 KWh, por kg de ácido formado.
El electrodializador utilizado, consiste en un
apilamiento de 9 células o celdas, con una configuración idéntica a
la configuración del que se ha descrito en el ejemplo 12.
El compartimiento "base", se llena,
inicialmente, con 5,27 litros de una solución de sulfato amónico al
1%.
El compartimiento "sal / ácido", se llena
inicialmente con 4,8 litros de una solución de 1,39 mol/l de sal de
amonio del ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico.
El caudal de recirculación de la solución, se
fija, inicialmente, a un valor de 60 l/h, para el compartimiento
sal / ácido, y a un valor de 150 /h, para el compartimiento
base.
La electrodiálisis, se realiza en forma de
lotes, es decir, en forma discontinua (régimen de funcionamiento en
recirculación, a una temperatura media de 40°C. la intensidad, se
impone que sea la correspondiente a un valor de 9 A; es decir, una
densidad de corriente correspondiente de 0,45 kA/m^{2}.
Después de 172 minutos de funcionamiento, la
conductividad del compartimiento sal / ácido, ha cambiado de 59
mS/cm, a 9,5 mS/cm.
El volumen final del compartimiento sal / ácido,
es de 4,67 litros.
La composición, es la siguiente:
ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico:
1,24 mol/l
2-hidroxi-4-(metiltio)butanoato
amónico: 1,48 mol/l. 100% del cual, es forma de ácido.
La tasa de conversión, es del 86%. El 89% del
producto final, es en forma de ácido.
El rendimiento de Faraday, se estima que es el
correspondiente a un valor de un 74%. El consumo de energía, es
estima que es de 0,58 KWh, por kg de ácido formado.
Se utiliza, en este ejemplo, un
electrodializador semejante al que se ha utilizado en el ejemplo
13.
El compartimiento "base", se llena,
inicialmente, con 5,46 litros de una solución de sulfato amónico al
1%.
El compartimiento "sal / ácido", se llena
inicialmente con 5,23 litros de una solución de 1,24 mol/l de sal
de amonio del ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico.
El caudal de recirculación de la solución, se
fija, inicialmente, a un valor de 90 l/h, para el compartimiento
sal / ácido, y a un valor de 150 /h, para el compartimiento
base.
La electrodiálisis, se realiza en forma de
lotes, es decir, en forma discontinua (régimen de funcionamiento en
recirculación, a una temperatura media de 40°C. la intensidad, se
impone que sea la correspondiente a un valor de 14 A; es decir, una
densidad de corriente correspondiente de 0,7 kA/m^{2}.
Después de 105 minutos de funcionamiento, la
conductividad del compartimiento sal / ácido, cambia de 57,6 mS/cm,
a 9,8 mS/cm.
La composición final del compartimiento sal /
ácido, es la siguiente:
ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico:
1,28 mol/l
2-hidroxi-4-(metiltio)butanoato
amónico: 0,14 mol/l.
90% del producto final, es en forma de
ácido.
Se utiliza, en este ejemplo, un
electrodializador semejante al que se ha utilizado en el ejemplo
13.
El test de ensayo, de aplica con los contenidos
de compartimiento base que se han obtenido al completar el ejemplo
14.
El compartimiento "sal / ácido", se llena
inicialmente con 5,2 litros de una solución de 1,44 mol/l de sal de
amonio del ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico.
El caudal de recirculación de la solución, se
fija, inicialmente, a un valor de 50 l/h, para el compartimiento
sal / ácido, y a un valor de 150 /h, para el compartimiento
base.
La electrodiálisis, se realiza en forma de
lotes, es decir, en forma discontinua (régimen de funcionamiento en
recirculación, a una temperatura media de 42°C. la intensidad, se
impone que sea la correspondiente a un valor de 19 A; es decir, una
densidad de corriente correspondiente de 0,95 kA/m^{2}.
Después de 53 minutos de funcionamiento, la
conductividad del compartimiento sal / ácido, cambia de 59 mS/cm, a
27 mS/cm.
El volumen final del compartimiento sal / ácido,
es de 4,85 litros.
La composición final del compartimiento sal /
ácido, es la siguiente:
ácido
2-hidroxi-4-(metiltio)butanóico:
0,87 mol/l
2-hidroxi-4-(metiltio)butanoato
amónico: 0,56 mol/l.
90% del producto final, es en forma de
ácido.
La tasa de conversión, es del 56%. El 61% del
producto final, es en forma de ácido.
El rendimiento de Faraday, es del 74%. El
consumo de energía, es estima que es de 0,7 KWh, por kg de ácido
formado.
Se procede a concentrar, por lotes (es decir, de
forma discontinua), 200,1 g de solución de HMTBS, a aproximadamente
1,5 M, en un evaporador rotativo. La temperatura del baño, es de 45
+/- 5°C. La presión, se controla a un valor de alrededor de
2,5\cdot10^{3}Pa (25 mbar). La temperatura, en la caldera,
cambia, desde una temperatura de 25°C, al principio de la
destilación, a una temperatura de 40°C, al final de ésta. Después de
un transcurso de tiempo de 3 horas, se recuperan 41,9 g de un medio
viscoso amarillo, cuyas características, son las siguientes:
Después de ajustar el contenido (dilución con
H_{2}O), se obtiene un producto, cuyas características son las
siguientes:
\newpage
Mediante potenciometría, se obtiene la
siguiente distribución de masas:
Se procede a medir, mediante HPLC, el valor de
la relación de las superficies monómero ó dímeros / (monómero +
dímeros):
monómero / (monómero + dímeros) | 100 |
dímeros / (monómero + dímeros)(*) | 0 |
(*) no se detectan dímeros |
Se procede a concentrar, por lotes (es decir, de
forma discontinua), 200,0 g de solución de HMTBS, a aproximadamente
1,5 M, en un evaporador rotativo. La temperatura del baño, es de 121
+/- 5°C. La presión, se controla a un valor de alrededor de
9,5\cdot10^{4}Pa. La temperatura, en la caldera, cambia, desde
una temperatura de 100°C, al principio de la destilación, a una
temperatura de 113°C, al final de ésta. Después de un transcurso de
tiempo de 3 horas, se recuperan 41,5 g de un medio viscoso marrón,
cuyas características, son las siguientes:
Después de ajustar el contenido (dilución con
H_{2}O), se obtiene un producto, cuyas características son las
siguientes:
Mediante potenciometría, se obtiene la
siguiente distribución de masas:
Se procede a medir, mediante HPLC, el valor de
la relación de las superficies monómero ó dímeros / (monómero +
dímeros):
monómero / (monómero + dímeros) | 95,0 |
dímeros / (monómero + dímeros)(*) | 0 |
A 100,0 g del medio descrito en el ejemplo nº
17, se le añaden 40,0 g de H_{2}O. El medio, se extrae con 75,0
g de éter de isopropilo. Después de la separación de las fases, se
recuperan 25,6 g de HMTBA, en la fase orgánica, después de la
evaporación, siendo, las características de éste último, las
siguientes.
Las soluciones de los ejemplos 26 y 17, no
cambiaron, en su contenido en dímeros, después de 40 días de
almacenaje.
Claims (9)
1. Un polinucleótido que codifica para una
nitrilasa, que comprende el gen nitrilasa denominado Nit B,
contenido en el plásmido pRPA-BCAT3, depositado en
el CBS, con el número CBS 998 - 96.
2. Un vector que comprende un polinucleótido
según la reivindicación 1.
3. Un vector, según la reivindicación 2, que
consiste en un plásmido.
4. Un polipéptido con actividad nitrilasa, que
comprende una secuencia de nitrilasa, capaz de obtenerse mediante
la expresión del gen nitrilasa denominado Nit B, clonado en el
plásmido pRPA-BCAT3, depositado en el CBS, con el
número CBS 998 - 96.
5. El polipéptido, según la reivindicación 4,
caracterizado por el hecho de que, la secuencia de nitrilasa,
se co-expresa con una proteína de caperuza.
6. El polipéptido, según la reivindicación 5,
caracterizado por el hecho de que, la proteína de caperuza,
es la proteína GroESL de Escherichia coli.
7. El polipéptido, según una cualquiera de las
reivindicaciones 4 a 6, caracterizado por el hecho de que,
la secuencia de nitrilasa, es susceptible de poderse obtener
mediante la expresión del gen nitrilasa, en un microorganismo
huésped.
8. El polipéptido, según la reivindicación 7,
caracterizado por el hecho de que, el microorganismo huésped,
se selecciona de entre el grupo formado por Escherichia coli,
Alcaligenes faecalis, Pseudomonas putida, y los
géneros Bacillus, Corynebacterium, Streptomyces, Saccharomyces,
Kluyveromyces, Penicillium y Aspergillus.
9. Material biológico, que comprende un
polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 4 a 8.
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