ES2223310T3 - Secuencias para la deteccion y la identificacion de staphyloccocus aureus resistente a la meticilina. - Google Patents
Secuencias para la deteccion y la identificacion de staphyloccocus aureus resistente a la meticilina. Download PDFInfo
- Publication number
- ES2223310T3 ES2223310T3 ES02740158T ES02740158T ES2223310T3 ES 2223310 T3 ES2223310 T3 ES 2223310T3 ES 02740158 T ES02740158 T ES 02740158T ES 02740158 T ES02740158 T ES 02740158T ES 2223310 T3 ES2223310 T3 ES 2223310T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- baselineskip
- type
- mrej
- sec
- detection
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
Abstract
Un método para detectar la presencia de una cepa de Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) en una muestra, dicha cepa de MRSA siendo resistente debido a la presencia de un inserto SCCmec conteniendo un gen mecA, dicho SCCmec estando insertado en ácidos nucleicos bacterianos generando por lo tanto un punto de unión en el extremo derecho polimórfico (MREJ), dicho método comprende el paso de hibridación de los ácidos nucleicos de la muestra con varias sondas y/o cebadores, caracterizados, por: (i) dichos cebadores y/o sondas son específicos para cepas MRSA y son capaces de hibridarse con ácidos nucleicos MREJ polimórficos, dichos MREJ polimórficos comprendiendo los MREJ de tipos i,a,x; y (ii) dichos cebadores y/o sondas en conjunto pueden hibridar con al menos cuatro tipos de MREJ seleccionados de MREJ tipos de i,a,x.
Description
Secuencias para la detección y la identificación
de Staphyloccocus aureus resistente a la meticilina.
La especie Staphylococcus aureus positiva
a la coagulasa está muy documentada como patógeno oportunista
humano. Las infecciones intrahospitalarias ocasionadas por S.
aureus son una causa principal de morbomortalidad. Algunas de
las infecciones más frecuentes ocasionadas por S. aureus
afectan a la piel, e incluyen forúnculos o diviesos, celulitis,
impétigo e infecciones de heridas posoperatorias. Algunas de las
infecciones más graves producidas por S. aureus son la
bacteremia, neumonía, osteomielitis, endocarditis aguda,
miocarditis, pericarditis, cerebritis, meningitis, necrólisis
epidérmica tóxica y varios abscesos. El envenenamiento por
alimentos mediado por enterotoxinas estafilocócicas es otro síndrome
importante asociado a S. aureus. El síndrome del choque
tóxico, una enfermedad adquirida en la comunidad, se ha atribuido
también a la infección o colonización con S. aureus toxígeno
(Murray et al. Eds, 1999, Manual of Clinical Microbiology, 7ª
Ed., ASM Press, Washington, D.C.).
S. aureus resistente a la meticilina
(MRSA) apareció en la década de 1980 como un problema clínico y
epidemiológico principal en los hospitales. Los MRSA son
resistentes a todas las \beta-lactamas incluyendo
las penicilinas, cefalosporinas, carbapenemos y monobactamos, que
son los antibióticos usados más frecuentemente para curar las
infecciones por S. aureus. Las infecciones por MRSA pueden
tratarse solamente con los antibióticos más tóxicos y más costosos,
que son utilizados normalmente como la última línea de defensa. Como
el MRSA puede propagarse fácilmente de paciente a paciente a través
del personal, los hospitales en todo el mundo están haciendo frente
al problema para controlar el MRSA. Por consiguiente, existe una
necesidad de desarrollar pruebas rápidas y sencillas de
identificación o de diagnóstico para la detección y/o identificación
del MRSA destinadas a reducir su diseminación y mejorar el
diagnóstico y el tratamiento de los pacientes infectados.
La resistencia a la penicilina en el S.
aureus es única porque se debe a la adquisición del ADN
procedente de otros estafilococos negativos a la coagulasa (CNS),
que codifican una proteína que se une a la penicilina (PBP)
resistente a \beta-lactama suplementaria, que
adquiere las funciones biosintéticas de las PBP normales cuando la
célula se expone a antibióticos con \beta-lactama.
S. aureus normalmente contiene cuatro PBP, de los cuales 1,
2 y 3 PBP son esenciales. La PBP de baja afinidad en MRSA,
denominada PBP 2a (o PBP 2'), está codificada por el gen
mecA cromosómico y funciona como una transpeptidasa
resistente a \beta-lactama. El gen mecA
está ausente en S. aureus sensible a la meticilina pero está
ampliamente distribuido entre otras especie de estafilococos y está
muy conservado (Ubukata et al., 1990, Antimicrob. Agents
Chemother. 34:170-172).
Mediante la determinación de la secuencia
nucleotídica de la zona del ADN que rodea al gen mecA de la
cepa N315 de S. aureus (aislada en Japón en 1982), Hiramatsu
et al. han descubierto que el gen mecA es
transportado por un nuevo elemento genético, denominado cromosoma
mec de la casete estafilocócica (SCCmec), insertado
en el cromosoma. SCCmec es un elemento genético móvil
caracterizado por la presencia del terminal invertido y de
repeticiones directas, una serie de genes de recombinasa específica
para el sitio (ccrA y ccrB), y el complejo génico
mecA (Ito et al., 1999, Antimicrob. Agents
Chemother. 43:1449-1458; Katayama et
al., 2000, Antimicrob. Agents Chemother.
43:1549-1555). El elemento se escinde exactamente
en el cromosoma de la cepa N315 de S. aureus y se integra en
una secuencia cromosómica específica de S. aureus en la
misma orientación a través de la función de una única serie de genes
de recombinasa que comprende ccrA y ccrB. Se
descubrieron dos elementos genéticos nuevos que compartían
propiedades estructurales similares de SCCmec clonando y
secuenciando la zona del ADN que rodea al gen mecA de las
cepas NCTC 10442 del MRSA (la primera cepa de MRSA se aisló en
Inglaterra en 1961) y 85/2082 (una cepa procedente de Nueva Zelanda
aislada en 1985). Las tres SCCmec se han denominado tipo I
(NCTC 10442), tipo II (N315) y tipo III (85/2082) haciendo
referencia al año de aislamiento de las cepas (Ito et al.,
2001, Antimicrob. Agents Chemother.
45:1323-1336) (Figura 1). Hiramatsu et al.
han descubierto que los ADN del SCCmec están integrados a un
sitio específico en el cromosoma de S. aureus sensible a la
meticilina (MSSA). En el contexto de la presente invención se
caracterizaron las secuencias nucleotídicas de las zonas alrededor
de los límites izquierdo y derecho del ADN de SCCmec (es
decir attL y attR, respectivamente) así como a los de
las zonas alrededor de la secuencia de integración del ADN de
SCCmec (es decir attBscc que es la secuencia de
acoplamiento del cromosoma bacteriano para el ADN del
SCCmec). La secuencia attBscc se situó en el extremo
3' de un nuevo marco de lectura abierto (ORF), orfX. El
orfX codifica potencialmente una identidad que comparte
polipéptidos de 159 aminoácidos con algunos polipéptidos
identificados anteriormente, pero de función desconocida (Ito et
al., 1999, Antimicrob. Agents Chemother.
43:1449-1458). Recientemente, un nuevo tipo de
SCCmec (tipo IV) se ha sido descrito tanto por Hiramatsu
et al. (Ma et al, 2002, Antimicrob. Agents
Chemother. 46:1147-1152) como por Oliveira et
al. (Oliveira et al, 2001, Microb. Drug Resist.
7:349-360). Las secuencias del extremo derecho del
nuevo SCCmec de tipo IV procedente de las cepas CA05 y
8/6-3P de S. aureus publicada por Hiramatsu
et al. (Ma et al, 2002, Antimicrob. Agents
Chemother. 46:1147-1152) fueron casi idénticos
en 2000 nucleótidos a las SCCmec de tipo II de la cepa N315
de S. aureus (Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents
Chemother. 45:1323-1336). Ninguna secuencia en
el extremo derecho del SCCmec de tipo IV está disponible de
las cepas HDE288 y PL72 de S. aureus descritas por Oliveira
et al. (Oliveira et al, 2001, Microb. Drug
Resist. 7:349-360).
\newpage
Los métodos anteriores utilizados para detectar
e identificar MRSA (Saito et al., 1995, J. Clin.
Microbiol. 33:2498-2500; Ubukata et al.,
1992, J. Clin. Microbiol. 30:1728-1733;
Murakami et al., 1991, J. Clin. Microbiol.
29:2240-2244; Hiramatsu et al., 1992,
Microbiol. Inmunol. 36:445-453), que se basan
en la detección del gen mecA y las secuencias cromosómicas
específicas de S. aureus, encontraron dificultad en
discriminar el MRSA de los estafilococos negativos a coagulasa (CNS)
resistentes a la meticilina porque el gen mecA está
ampliamente distribuido tanto en las especies de S. aureus
como de CNS (Suzuki et al., 1992, Antimicrob. Agents
Chemother. 36:429-434). Hiramatsu et al.
(patente US nº 6.156.507) han descrito un ensayo de PCR específico
para MRSA utilizando cebadores que pueden hibridarse específicamente
a los extremos derechos de los 3 tipos de ADN de SCCmec en
combinación con un cebador específico para el cromosoma de S.
aureus, que corresponde a la secuencia nucleotídica en el lado
derecho de la secuencia de integración SCCmec. Como las
secuencias nucleotídicas que rodean la secuencia de integración
SCCmec en otras especies estafilocócicas (tales como S.
epidermidis y S. haemolyticus) son diferentes de las
encontradas en S. aureus, este ensayo de PCR era específico
para la detección del MRSA. Este ensayo de PCR suministró también
información para el tipado de MREP (posición para el "polimorfismo
con el extremo derecho mec") del ADN con SCCmec
(Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother.
45:1323-1336; Hiramatsu et al., 1996, J.
Infect. Chemother. 2:117-129). Este
procedimiento de tipado se aprovecha del polimorfismo en el extremo
derecho de los ADN con SCCmec adyacentes a la secuencia de
integración entre los tres tipos de SCCmec. El tipo III
tiene una sola secuencia nucleotídica mientras que el tipo II tiene
una inserción de 102 nucleótidos en el terminal derecho del tipo L
de SCCmec. El método de tipado de MREP descrito por
Hiramatsu et al. (Ito et al., 2001, Antimicrob.
Agents Chemother. 45:1323-1336; Hiramatsu et
al., 1996, J. Infect. Chemother.
2:117-129) define el tipo I de SCCmec como
tipo i de MREP, tipo II de SCCmec como tipo ii de MREP y
tipo III de SCCmec como tipo iii de MREP. Debe observarse
que el método de tipado de MREP no puede diferenciar el nuevo
SCCmec de tipo IV descrito por Hiramatsu et al. (Ma
et al, 2002, Antimicrob. Agents Chemother.
46:1147-1152) del tipo II de SCCmec porque
estos dos tipos de SCCmec presentan la misma secuencia
nucleotídica en el extremo derecho.
El conjunto de cebadores descrito por Hiramatsu
et al. que es la combinación óptima de cebadores (SEC. ID.
nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a
las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60, respectivamente, en la presente
invención) se ha utilizado en la presente invención para analizar
por PCR una variedad de cepas de MRSA y de MSSA (Figura 1 y Tabla
1). Veinte de las 39 cepas de MRSA analizadas no se ampliaron por
el ensayo de PCR multiplex de Hiramatsu et al. (Tablas 2 y
3). El método de Hiramatsu de hecho tuvo éxito en detectar menos
del 50% de las 39 cepas de MRSA analizadas. Este descubrimiento
demuestra que algunas cepas de MRSA tienen secuencias en el extremo
derecho de la unión del extremo derecho del SCCmec del
cromosoma diferente de las identificadas por Hiramatsu et al.
Por consiguiente, el sistema desarrollado por Hiramatsu et
al. no permite la detección de todas los MRSA. La presente
invención se refiere a la generación de los datos de la secuencia
de unión del extremo derecho del SCCmec del cromosoma
requeridos para detectar más cepas de MRSA con objeto de mejorar el
ensayo de Hiramatsu et al. Hay necesidad de desarrollar más
cebadores y sondas omnipresentes para la detección de la mayoría de
las cepas de MRSA en todo el mundo.
Un objetivo de la presente invención consiste en
proporcionar un procedimiento específico, omnipresente y sensible
que utiliza sondas y/o cebadores de ampliación para determinar la
presencia y/o la cantidad de ácidos nucleicos de todas las cepas de
MRSA.
La ubicuidad de por lo menos el 50% entre las
cepas que representan las cepas de MRSA de los tipo IV a X es un
objetivo de la presente invención.
Por consiguiente, según la presente invención se
proporciona un procedimiento para detectar la presencia o ausencia
de una cepa de Staphylococcus aureus resistente a la
meticilina (MRSA) en una muestra que comprende
- a)
- poner en contacto una muestra en la que ha de analizarse la presencia o ausencia de dicha cepa MRSA, incluyendo dicha cepa de MRSA un elemento mec del cromosoma del casete estafilocócico (SCCmec) que contiene un gen mecA insertado en el ADN cromosómico, generando de este modo una secuencia de tipo iv en la unión en el extremo derecho polimórfico (MREJ) que comprende secuencias tanto del extremo derecho del elemento SCCmec como del ADN cromosómico adjuntando dicho extremo derecho con un primer cebador y un segundo cebador,
- en el que dichos primer y segundo cebadores son por lo menos de 10 nucleótidos de longitud, y
- i)
- en el que dicho primer cebador se hibrida con dicho extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia de tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por: SEC. ID nº 42 a nº 46 y nº 51 y los complementos de las mismas, y
- ii)
- en la que dicho primer cebador se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus para generar específicamente un amplicón si dicha cepa MRSA está presente en dicha muestra; y
- b)
- detectar la presencia o ausencia de dicho amplicón.
\vskip1.000000\baselineskip
El procedimiento puede comprender además en la
etapa b) una puesta en contacto de dicha muestra con por lo menos un
primer agente de hibridación con una secuencia MREJ de tipo iv y con
por lo menos un cebador que se hibrida con una secuencia específica
del ADN cromosómico de S. aureus para generar dicho
amplicón.
El procedimiento puede comprender además
detectar la presencia o ausencia de por lo menos una cepa más de
Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA) en
dicha muestra, dicha por lo menos una cepa más que comprende una
secuencia de ácido nucleico de tipo i, ii, iii, v, vi, vii, viii, o
ix de la unión del extremo derecho de mec (MREJ), y que es
resistente debido a la presencia de un elemento SCCmec que
contiene un gen mecA, habiendo sido insertado dicho
SCCmec en el ADN cromosómico, generando de este modo una
unión en el extremo derecho polimórfico (MREJ), en el que dicho
procedimiento comprende además poner en contacto dicha muestra con
por lo menos un cebador y/o sonda, en el que dicho cebador y/o sonda
es capaz de hibridarse específicamente con dicho extremo derecho
del elemento SCCmec de por lo menos una de dichas secuencias
de ácido nucleico de los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de
MREJ.
En una forma de realización específica, los
cebadores y/o sondas se seleccionan todos para hibridarse en
condiciones de hibridación comunes, y aún más específicamente, se
colocan en general en el mismo recinto físico.
Para el procedimiento anterior que comprende
además detectar la presencia o ausencia de por lo menos una cepa
más de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina
(MRSA) en dicha muestra, se han desarrollado por lo menos una cepa
más de MRSA que comprende una secuencia de ácido nucleico de tipo i,
ii, iii, v, vi, vii, viii, o ix en la unión del extremo derecho mec
(MREJ), cebadores y/o sondas que tienen por lo menos una longitud
de 10 nucleótidos y son capaces de hibridarse con MREJ de los tipos
i a iii, definidos en cualquiera de las SEC. ID. nº 1, nº 20, nº
21, nº 22, nº 23, nº 24, nº 25, nº 41, nº 199; nº 2, nº 17, nº 18,
nº 19, nº 26, nº 40, nº 173, nº 174, nº 175, nº 176, nº 177, nº
178, nº 179, nº 180, nº 181, nº 182, nº 183, nº 185, nº 186, nº
197; nº 4, nº 5, nº 6, nº 7, nº 8, nº 9, nº 10, nº 11, nº 12, nº 13,
nº 14, nº 15, nº 16, nº 104, nº 184, nº 198 y con uno o más MREJ de
los tipos v a ix, con las SEC. ID. nº 47, nº 48, nº 49, nº 50; nº
171; nº 165, nº 166; nº 167; nº 168. Al ser perfectamente
omnipresentes con todas las MREJ secuenciadas, los cebadores y/o
sondas por lo general pueden hibridarse con dichas SEC. ID. nº de
los tipos de MREJ.
Se han diseñado los siguientes cebadores y/o
sondas específicos que tienen las secuencias siguientes:
\newpage
Entre éstos, se utilizan los pares de siguientes
cebadores que tienen las siguientes secuencias:
\vskip1.000000\baselineskip
También, entre éstos, se utilizan las sondas
siguientes que tienen las secuencias siguientes:
SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº
162, nº 163 y nº 164.
\vskip1.000000\baselineskip
Pueden utilizarse conjuntamente los cebadores
y/o sondas que tienen las secuencias nucleotídicas siguientes. Las
combinaciones preferidas hacen uso de:
- i)
- SEC ID nº: 64, 66, 84, 163, 164 para la detección del tipo i de MREJ.
- ii)
- SEC ID nº: 64, 66, 84, 163, 164 para la detección del tipo ii de MREJ.
- iii)
- SEC ID nº: 64, 67, 84, 163, 164 para la detección del tipo iii de MREJ.
- iv)
- SEC ID nº: 64, 79, 84, 163, 164 para la detección del tipo iv de MREJ.
- v)
- SEC ID nº: 64, 80, 84, 163, 164 para la detección del tipo v de MREJ.
- vi)
- SEC ID nº: 64, 112, 84, 163, 164 para la detección del tipo vii de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
Todas estas sondas y cebadores pueden utilizarse
incluso conjuntamente en el mismo recinto físico.
\newpage
Otro objetivo de la presente invención consiste
en proporcionar un procedimiento para determinar la presencia o
ausencia de por lo menos cuatro tipos de MREJ de MRSA en una muestra
que comprende:
- a)
- reproducir el procedimiento de la invención con cebadores y/o sondas específicas para cada una dichos por lo menos cuatro tipos de MREJ, siendo uno de los cuales el tipo iv de MREJ; y
- b)
- detectar cada amplicón de manera muy particular,
determinando de este modo la presencia o
ausencia de los tipos MREJ de MRSA en una muestra.
\vskip1.000000\baselineskip
Además, la invención proporciona un kit para
detectar la presencia o ausencia de una cepa MRSA de tipo iv de MREJ
en una muestra que comprende:
- a)
- un primer oligonucleótido que se hibrida con un extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia del tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 42 a nº 46 y nº 51 y un complemento de las mismas; y
- b)
- un segundo nucleótido que se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus con el fin de permitir la generación de un amplicón cuando se utiliza junto con dicho primer oligonucleótido;
en el que dichos oligonucleótidos a) y b)
constan de por lo menos 10 nucleótidos de longitud y permiten la
detección selectiva de un amplicón que comprende secuencias tanto
del extremo derecho del elemento SCCmec y del ADN cromosómico
que adjunta dicho extremo derecho de dicha cepa MRSA del tipo iv de
MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
El kit puede comprender además por lo menos un
oligonucleótido para la detección de por lo menos una cepa de MRSA
adicional que comprende un tipo MREJ seleccionado de entre el grupo
constituido por el tipo i de MREJ, tipo ii de MREJ, tipo iii de
MREJ, tipo v de MREJ, tipo vi de MREJ, tipo vii de MREJ, tipo viii
de MREJ y tipo ix de MREJ, por ejemplo, tal como los descritos
anteriormente.
También se describen los ácidos nucleicos
seleccionados de entre las SEC. ID. nº
- i)
- SEC ID nº: 42, 43, 44, 45, 46, 51 para la secuencia de tipo iv de MREJ;
- ii)
- SEC ID nº: 47, 48, 49, 50 para la secuencia de tipo v de MREJ;
- iii)
- SEC ID nº: 171 para la secuencia de tipo vi de MREJ;
- iv)
- SEC ID nº: 165, 166 para la secuencia de tipo vii de MREJ;
- v)
- SEC ID nº: 167 para la secuencia de tipo viii de MREJ;
- vi)
- SEC ID nº: 168 para la secuencia de tipo ix de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
Se describen también oligonucleótidos de por lo
menos 10 nucleótidos de longitud que se hibridan con cualquiera de
estos ácidos nucleicos y que se hibridan con uno o más MREJ de los
tipos seleccionados de iv a ix. Entre estos, los pares de cebadores
(o sondas) con las siguientes SEC. ID. nº
están también comprendidas dentro del alcance de
la presente invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Además, se describen también las sondas internas
con las secuencias nucleotídicas definidas en cualquiera de las SEC.
ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163 o nº 164.
Las composiciones de materia que comprenden los cebadores y/o las
sondas de que se hibridan con uno o más MREJ de los tipos
seleccionados del iv a ix así como con los ácidos nucleicos
anteriores, que comprende o no cebadores y/o sondas, que se hibridan
con uno o más MREJ de los tipos seleccionados del i a iii, son
además objetivos de la presente invención. Las composiciones
preferidas comprenderían los cebadores que tienen las secuencias
nucleotídicas definidas en las SEC. ID. nº
o las sondas, cuyas SEC. ID. son: nº 32, nº 83,
nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163, nº 164 o ambas.
\vskip1.000000\baselineskip
Se proporciona específicamente un procedimiento
en el que cada uno de los ácidos nucleicos de MRSA o una variante o
parte de los mismos comprende una zona diana seleccionada hibridable
con dichos cebadores o sondas desarrollados para ser
omnipresentes;
en el que cada uno de dichos ácidos nucleicos o
una variante o parte de los mismos comprende una zona diana
seleccionada hibridable con dichos cebadores o sondas;
comprendiendo dicho procedimiento las etapas de
puesta en contacto de dichas muestra con dichas sondas o cebadores y
de detección de la presencia y/o la cantidad de sondas hibridadas o
productos ampliados como indicación de la presencia y/o la cantidad
de MRSA.
En el procedimiento, las secuencias de los
fragmentos del ADN de la unión del extremo derecho del cromosoma
con SCCmec, denominadas a partir de aquí posición de MREJ
para la "unión del extremo derecho de mec" incluyendo
las secuencias del extremo derecho de SCCmec y del ADN
cromosómico para el lado derecho del punto de integración de
SCCmec, se utilizan como secuencias precursoras a partir de
las cuales derivan los cebadores y/o las sondas. Las secuencias de
MREJ incluyen las secuencias de patente de los inventores así como
las secuencias obtenidas a partir de las bases de datos públicas y
de la patente US nº 6.156.507 y se seleccionaron por su capacidad
para detectar sensible, específica, omnipresente y rápidamente los
ácidos nucleicos de MRSA objetivo.
Los fragmentos de ADN y los oligonucleótidos
(cebadores y sondas) de la patente de los inventores se aplican en
los procedimientos y kits de la invención.
Son asimismo objeto de la presente invención la
composición de los materiales tales como kits para diagnóstico que
comprenden cebadores o sondas de ampliación para la detección de
MRSA.
En los procedimientos y kits anteriores, las
sondas y cebadores no se limitan a los ácidos nucleicos, y pueden
incluir, pero no se limitan a, análogos de nucleótidos. Los
reactivos para diagnóstico constituidos por las sondas y las
cebadores pueden estar presentes en cualquier forma adecuada (unidos
a un soporte sólido, líquido, liofilizado, etc.).
En los procedimientos y kits anteriores, las
reacciones de ampliación pueden incluir pero no se limitan a: a) la
reacción en cadena de la polimerasa (PCR), b) la reacción en cadena
de la ligasa (RCL), c) la ampliación basada en la secuencia del
ácido nucleico (NASBA), d) la replicación de la secuencia
automantenida (3SR), e) la ampliación por desplazamiento de cadena
(SDA), f) la ampliación de la señal del ADN ramificado (ADNb), g)
la ampliación mediada por transcripción (TMA), h) la tecnología de
la sonda de ciclación (CPT), i) PCR anidada, j) PCR multiplex, k)
la ampliación en fase sólida (SPA), l) la ampliación de la señal
dependiente de la nucleasa (NDSA), m) la tecnología de ampliación
del círculo rodante (RCA), n) la ampliación por desplazamiento de
la cadena anclada, o) la ampliación del círculo rodante en fase
sólida (inmovilizada).
En los procedimientos y kits anteriores, la
detección de los ácidos nucleicos de los genes diana puede incluir
tecnologías en tiempo real o después de la ampliación. Estas
tecnologías de detección pueden incluir, pero no se limitan a los
métodos basados en la transferencia de energía de resonancia por
fluorescencia (FRET) tal como la hibridación adyacente de las
sondas (incluyendo los procedimientos sonda a sonda y sonda a
cebador), la sonda TaqMan, la sonda molecular fluorescente,
la sonda Scorpion, la sonda para nanopartículas y la sonda
Amplifluor. Otros procedimientos de detección incluyen la detección
de ácidos nucleicos del gen diana por procedimientos inmunológicos,
los procedimientos de hibridación en fase sólida sobre filtros,
chips o cualquier otro soporte sólido. En estos sistemas, la
hibridación puede controlarse por fluorescencia,
quimioluminiscencia, potenciometría, espectrometría de masas,
resonancia en plasmón, polarimetría, colorimetría, citometría de
flujo o escanometría. El secuenciado de nucleótidos, incluyendo el
secuenciado por terminación en didesoxi o el secuenciado por
hibridación (por ejemplo secuenciado utilizando un chip de ADN)
representa otro procedimiento para detectar y caracterizar los
ácidos nucleicos de genes diana.
En una forma de realización preferida, se
utiliza un protocolo de PCR para la ampliación del ácido
nucleico.
Un procedimiento para la detección de una
multitud de cepas potenciales de MRSA que tiene diferentes tipos de
MREJ puede realizarse en reacciones independientes y en recintos
físicos, un tipo a la vez. Alternativamente, podría realizarse
simultáneamente en diferentes tipos en recintos físicos
independientes, o en el mismo recinto físico. En este último
escenario podría realizarse una reacción PCR multiplex que
requeriría que los oligonucleótidos fuesen capaces de hibridarse
con una zona diana en condiciones comunes. Ya que muchas sondas o
cebadores son específicos para un determinado tipo de MREJ, una
forma de realización posible es el tipado de una cepa de MRSA.
Cuando una mezcla de oligonucleótidos se hibrida conjuntamente con
más de un tipo se utiliza en un solo recinto físico o recipiente,
diferentes etiquetas deberían utilizarse para distinguir un tipo de
otro.
En el contexto de la presente invención se
propone desarrollar un ensayo basado en ADN o un kit para detectar
e identificar MRSA. Aunque las secuencias de los genes orfX y
de algunos fragmentos de ADN con SCCmec están disponibles en
las bases de datos públicas y se han utilizado para desarrollar
ensayos basados en ADN para la detección de MRSA, nuevos datos de
secuencias que permiten mejorar la detección e identificación del
MRSA que son objeto de la presente invención nunca han sido
caracterizados anteriormente ni se conocían pero no demostraron
estar localizados en el extremo derecho de SCCmec adyacente a
la secuencia de integración (Tabla 4). Estas nuevas secuencias no
podrían haber sido previstas ni detectadas por el ensayo de la PCR
específico para MRSA desarrollado por Hiramatsu et al.
(patente US nº 6.156.507). Estas secuencias permitirán mejorar los
ensayos basados en ADN actuales para el diagnóstico de MRSA porque
permiten el diseño de cebadores y sondas omnipresentes para la
detección e identificación de más cepas de MRSA incluyendo todos los
clones epidémicos principales de todo el mundo.
Pueden utilizarse los kits para diagnóstico, los
cebadores y las sondas mencionados anteriormente para detectar y/o
identificar el MRSA, si dichos kits para diagnóstico, cebadores y
sondas se utilizan para aplicaciones in vitro o in
situ. Dichas muestras pueden incluir pero no se limitan a:
cualquier muestra química, cualquier muestra medioambiental,
cualquier cultivo microbiano, cualquier colonia microbiana,
cualquier tejido y cualquier estirpe celular.
Es también un objetivo de la presente invención
que dichos kits para diagnóstico, cebadores y sondas puedan
utilizarse solos o en combinación con cualquier otro ensayo adecuado
para detectar y/o identificar microorganismos, incluyendo pero sin
limitarse a: cualquier ensayo basado en la detección de ácidos
nucleicos, cualquier inmunoanálisis, cualquier análisis enzimático,
cualquier análisis bioquímico, cualquier análisis lisotípico,
cualquier análisis serológico, cualquier medio de cultivo
diferenciado, cualquier medio de cultivo de enriquecimiento,
cualquier medio de cultivo selectivo, cualquier medio de análisis
específico, cualquier medio de cultivo de identificación, cualquier
medio de cultivo de enumeración, cualquier cepa celular, cualquier
cultivo o estirpes celulares específicas y cualquier ensayo de
infección en animales.
En los procedimientos y kits descritos en la
presente memoria a continuación, las sondas de oligonucleótidos y
las sondas de ampliación proceden de secuencias mayores (es decir,
fragmentos de ADN de por lo menos 100 pares de bases). Todas las
secuencias de ADN se han obtenido de las secuencias de la patente de
los inventores o de bases de datos públicas (Tablas 5, 6, 7, 8 y
9).
Es evidente para cada uno de los expertos en la
materia que las secuencias oligonucleotídicas aparte de las
descritas en la presente invención y que son apropiadas para la
detección y/o identificación de MRSA pueden proceder también de las
secuencias de fragmentos de la patente o de secuencias de las bases
de datos públicas seleccionadas. Por ejemplo, los cebadores o
sondas oligonucleotídicas pueden ser más cortas pero de una longitud
de por lo menos 10 nucleótidos o más largas que las seleccionadas;
pueden también seleccionarse de cualquier parte en los fragmentos
de ADN de la patente o de las secuencias seleccionadas de bases de
datos públicas; pueden ser también variantes del mismo
oligonucleótido. Si el ADN diana o una variante del mismo se hibrida
con un oligonucleótido dado, o si el ADN diana o una variante del
mismo puede ampliarse mediante un par cebador de la PCR de
oligonucleótidos, lo contrario también es verdad; un ADN diana dado
puede hibridarse con una sonda de oligonucleótido variante o puede
ampliarse mediante un cebador de PCR del oligonucleótido variante.
Alternativamente, los oligonucleótidos pueden diseñarse a partir de
dichas secuencias de fragmentos de ADN para su utilización en los
procedimientos de ampliación aparte de la PCR. Por consiguiente, la
parte central de la presente invención es la detección y/o
identificación del MRSA mediante secuencias de ADN genómicas diana
que se utilizan como fuente de sondas de oligonucleótidos
específicas y omnipresentes y/o de cebadores de ampliación. Aunque
la selección y evaluación de los oligonucleótidos adecuados para
diagnóstico requiere mucho esfuerzo, es muy posible para los
expertos en la materia derivar, a partir de los fragmentos de ADN
seleccionados, otros oligonucleótidos aparte de los enumerados en
las Tablas 5, 6, 7, 8 y 9 que son adecuados para diagnóstico.
Cuando un fragmento de la patente o una secuencia de base de datos
pública se selecciona para su especificidad y ubicuidad, aumenta la
probabilidad de que los subconjuntos de las mismas sean también
específicos y omnipresentes.
Los fragmentos de ADN de la patente se han
obtenido como un repertorio de secuencias creadas por ampliación de
ácidos nucleicos de MRSA con nuevos cebadores. Estos cebadores y el
repertorio de ácidos nucleicos así como el repertorio de secuencias
nucleotídicas se aplican en los procedimientos y kits de la presente
invención (Tablas 4, 5, 6, 7, 8 y 9).
Las reivindicaciones por consiguiente están de
acuerdo con la presente invención.
\vskip1.000000\baselineskip
En la descripción de la presente invención, las
expresiones "ácidos nucleicos" y "secuencias" pueden
utilizarse indistintamente. Sin embargo, los "ácidos
nucleicos" son entidades químicas mientras que las
"secuencias" son las piezas de información codificadas por
estos "ácidos nucleicos". Tanto los ácidos nucleicos como las
secuencias son fuentes de información igualmente valiosas para la
materia que concierne a la presente invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Como parte de las reglas de diseño, se evaluó la
idoneidad de todos los oligonucleótidos (sondas para hibridación y
cebadores para ampliación del ADN por PCR) para la hibridación o
ampliación por PCR por análisis informático utilizando programas
convencionales (es decir los programas del paquete GCG Wisconsin, el
programa de análisis de cebador Oligo^{TM} 6 y MFOLD 3.0). La
idoneidad potencial de los pares de cebadores de la PCR se evaluaron
también antes de su síntesis verificando la ausencia de propiedades
no necesarias tales como grandes tramos de un nucleótido y una gran
proporción de restos G o C en el extremo 3' (Persing et al.,
1993, Diagnostic Molecular Microbiology: Principles and
Applications, American Society for Microbiology, Washington, D.C.).
Se sintetizaron cebadores para ampliación de oligonucleótidos
utilizando un sintetizador de ADN automático (Applied Biosystems).
Se evaluaron diseños moleculares fluorescentes utilizando los
criterios establecidos por Kramer et al.
(http://www.molecular-
beacons.org).
beacons.org).
La secuencia de oligonucleótidos de los
cebadores o sondas puede proceder de una de las dos cadenas del ADN
doble. Los cebadores o sondas pueden estar constituidos por las
bases A, C, G o T o análogas y pueden degenerarse en una o más
posiciones del nucleótido seleccionado (Nichols et al., 1994,
Nature 369:492-493). Los cebadores y sondas
pueden estar constituidos también por análogos de nucleótidos tales
como los ácidos nucleicos bloqueados (LNA) (Koskin et al.,
1998, Tetrahedron 54:3607-3630), y ácidos
nucleicos peptídicos (ANP) (Egholm et al., 1993,
Nature 365:566-568). Los cebadores o sondas
pueden ser de cualquier longitud adecuada y pueden seleccionarse en
cualquier parte dentro de las secuencias de ADN de los fragmentos de
la patente, o de las secuencias de la base de datos seleccionada que
son adecuadas para la detección del MRSA.
Las variantes de un gen microbiano diana dado
son naturales y son atribuibles a la variación de la secuencia
dentro del gen durante la evolución (Watson et al., 1987,
Molecular Biology of the Gene, 4ª ed., The Benjamin/Cummings
Publishing Company, Menlo Park, CA; Lewin, 1989, Genes IV, John
Wiley & Sons, Nueva York, NY). Por ejemplo, diferentes cepas de
la misma especie microbiana pueden tener una sola o más variaciones
nucleotídicas en el punto de hibridación del oligonucleótido. Los
expertos en la materia conocen bien la existencia de ácidos
nucleicos variantes y/o secuencias para un gen específico y que la
frecuencia de las variaciones de la secuencia depende de la presión
selectiva durante la evolución en un producto génico dado. La
detección de una secuencia de la variante para una zona entre dos
cebadores de PCR puede demostrarse secuenciando el producto de la
ampliación. Con objeto de demostrar la presencia de las variaciones
de la secuencia en el punto de hibridación del cebador, se tiene
que ampliar un ADN diana mayor con cebadores de PCR fuera de este
punto de hibridación. El secuenciado de este fragmento mayor
permitirá la detección de la variación de la secuencia en este punto
de hibridación del cebador. Una estrategia similar puede aplicarse
para demostrar las variaciones en el punto de hibridación de la
sonda. En la medida en que la divergencia de los ácidos nucleicos
y/o las secuencias diana o parte de las mismas no afecte de manera
significativa la sensibilidad y/o especificidad y/o la ubicuidad de
los cebadores o sondas de ampliación, los ADN microbianos variantes
están dentro del alcance de la presente invención. Las variantes de
los cebadores o sondas seleccionadas pueden también utilizarse para
ampliar o hibridar un ADN diana variante.
\vskip1.000000\baselineskip
Para la ampliación del ADN por el procedimiento
la PCR ampliamente utilizado, los pares de cebador procedían de los
fragmentos de ADN de la patente de los inventores o de las
secuencias de la base de datos pública.
Durante la ampliación del ADN por PCR, se
utilizan dos cebadores oligonucleotídicos que se unen
respectivamente a cada cadena del ADN diana desnaturalizado
térmicamente del genoma microbiano para ampliar exponencialmente
in vitro el ADN diana mediante ciclos térmicos sucesivos que
permiten la desnaturalización del ADN, la hibridación de los
cebadores y la síntesis de nuevas dianas en cada ciclo (Persing
et al., 1993, Diagnostic Molecular Microbiology: Principles
and Applications, American Society for Microbiology, Washington,
D.C.).
En resumen, los protocolos de la PCR en un
termociclador convencional (PTC-200 de MJ Research
Inc., Watertown, MA) fueron los siguientes: Suspensiones
bacterianas estandarizadas tratadas o ADN genómico preparado a
partir de cultivos bacterianos o muestras clínicas se ampliaron en
20 \mul de mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR contenía KCl
50 mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0), MgCl_{2} 2,5 mM,
0,4 \muM de cada cebador, 200 \muM de cada uno de los cuatro
dNTP (Pharmacia Biotech), 3,3 \mug/\mul de albúmina de suero
bovino (BSA) (Sigma-Aldrich Canada Ltd., Oakville,
Ontario, Canadá) y 0,5 unidades de Taq ADN polimerasa
(Promega Corp., Madison, WI) combinada con el anticuerpo
TaqStart^{TM} (BD Biosciences, Palo Alto, CA). El
anticuerpo TaqStart^{TM}, que es un anticuerpo monoclonal
neutralizante para la Taq ADN polimerasa, se añadió a todas
las reacciones PCR para mejorar la especificidad y la sensibilidad
de las ampliaciones (Kellogg et al., 1994, Biotechniques
16:1134-1137). El tratamiento de los cultivos
bacterianos o de muestras clínicas consiste en un protocolo rápido
para lisar las células microbianas y eliminar o neutralizar los
inhibidores de RPC (descritos en la solicitud US 60/306.163 en
trámite con la presente). Para la ampliación del ADN genómico
purificado, se añadieron las muestras directamente a la mezcla de
ampliación por PCR. Se utilizó un control interno, procedente de
las secuencias no encontradas en las secuencias MREJ diana o en el
genoma humano, para comprobar la eficacia de la reacción PCR y la
ausencia de inhibición significativa de la PCR.
El número de ciclos llevados a cabo para los
ensayos por PCR varía según el nivel de sensibilidad requerido. Por
ejemplo, el nivel de sensibilidad requerido para la detección
microbiana directamente de una muestra clínica es mayor que para la
detección de un cultivo microbiano. Por consiguiente, para la
detección directa de muestras clínicas se requieren probablemente
ensayos por PCR más sensibles que tienen más ciclos térmicos.
Los expertos en la técnica de amplificación de
ácidos nucleicos conocen la existencia de otros procedimientos de
ampliación rápida tal como la reacción en cadena de la ligasa (LCR),
la PCR con transcriptasa inversa, (RT-PCR), la
ampliación mediada por transcripción (TMA), la replicación de la
secuencia automantenida (3SR), la ampliación basada en la secuencia
del ácido nucleico (NASBA), la ampliación por desplazamiento de
cadena (SDA), ADN ramificado (ADNb), la tecnología de la sonda de
ciclación (CPT), la ampliación en fase sólida (SFA), la tecnología
de ampliación del círculo rodante (RCA), RCA en fase sólida, SDA
anidada y la ampliación de la señal dependiente de la nucleasa
(NDSA), (Lee et al., 1997, Nucleic Acid Amplification
Technologies: Application to Disease Diagnosis, Eaton Publishing,
Boston, MA; Persing et al., 1993, Diagnostic Molecular
Microbiology: Principles and Applications, American Society for
Microbiology, Washington, D.C.; Westin et al., 2000, Nat.
Biotechnol. 18:199-204). El alcance de la
presente invención no se limita a la utilización de la ampliación
por PCR, sino que más bien incluye la utilización de cualquier
procedimiento de ampliación de ácidos nucleicos o cualquier otro
procedimiento que pueda utilizarse para aumentar la sensibilidad y/o
la rapidez de las pruebas de diagnóstico basadas en ácidos
nucleicos. El alcance de la presente invención también la
utilización de cualquier tecnología de ampliación y detección de
ácidos nucleicos incluyendo las tecnologías de detección en tiempo
real o después de la ampliación, cualquier tecnología de ampliación
combinada con detección, cualesquiera de las tecnologías de chips o
matriz de ácido nucleico por hibridación, cualesquiera de las
tecnologías de chips de ampliación o combinación de la ampliación y
chips de hibridación. La detección e identificación por cualquier
procedimiento de secuenciado de nucleótidos está también bajo el
alcance de la presente invención.
Puede aplicarse también cualquier
oligonucleótido procedente de las secuencias de ADN de MREJ de S.
aureus y utilizadas con cualquiera de las tecnologías de
ampliación y/o de hibridación de ácidos nucleicos cuando se pone en
práctica la presente invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Según Hiramatsu et al. (Ito et
al., 1999, Antimicrob. Agents Chemother.
43:1449-1458; Katayama et al., 2000,
Antimicrob. Agents Chemother. 44:1549-1555;
Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother.
45:1323-1336; Ma et al., 2002, Antimicrob.
Agents Chemother. 46:1147-1152), cuatro tipos
de ADN con SCCmec se encuentran entre las cepas de MRSA.
Ellos han descubierto que los ADN con SCCmec están
integrados en la zona específica del cromosoma MSSA (denominada
orfX). Los inventores desarrollaron un ensayo por PCR
multiplex específico para MRSA que incluye cebadores que pueden
hibridar al extremo derecho de extremidad de los tipos I, II y III
de SCCmec (SEC. ID. nº 18, nº 19, nº 20, nº 21, nº 22, nº 23,
nº 24 en la patente US nº 6.156.507 correspondientes a las SEC. ID.
nº 52, nº 53, nº 54, nº 55, nº 56, nº 57, nº 58, respectivamente,
en la presente invención) así como cebadores específicos para el
cromosoma de S. aureus a la derecha del punto de integración
de SCCmec (SEC. ID. nº 25, nº 28, nº 27, nº 26 y nº 29 en la
patente US nº 6.156.507 correspondientes a las SEC. ID. nº 59, nº
60, nº 61, nº 62 y nº 63, respectivamente en la presente invención)
(Tabla 1 y Figura 1). El conjunto de cebadores descritos por
Hiramatsu et al. que es la combinación óptima de cebadores
(SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507
correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60 en la presente
invención) se utilizó en la presente invención para probar por PCR
una variedad de MRSA, MSSA, CNS resistente a la meticilina (MRCNS) y
las cepas de CNS sensibles a la meticilina (MSCNS) (Tabla 2). Se
realizó un ensayo por PCR realizado utilizando un termociclador
convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.) para
probar la ubicuidad, la especificidad y la sensibilidad de estos
cebadores utilizando el siguiente protocolo: un \mul de una
suspensión bacteriana estandarizada tratada o de una preparación de
ADN genómico purificado a partir de bacterias se ampliaron en 20
\mul de mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR contenía KCl 50
mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0), Triton
X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 2,5 mM, 0,4 \muM de
cada uno de los cebadores específicos para SCCmec y
cromosomas de S. aureus (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la
patente US nº 6.156.507 correspondientes a las SEC. ID. nº 56, nº 58
y nº 60 de la presente invención, 200 \muM de cada uno de los
cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,3 \mug/\mul de BSA (Sigma) y
0,5 U de Taq polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo
TaqStart^{TM} (BD Biosciences).
Las reacciones PCR se sometieron a continuación
a 3 min de ciclación térmica a 94ºC seguido de 40 ciclos de 60
segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 60 segundos a
55ºC para la etapa de hibridación y 60 segundos a 72ºC para la
etapa de ampliación, seguido a continuación de una ampliación
terminal de 7 minutos a 72ºC utilizando un termociclador
convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.). La
detección de los productos de la PCR se realizó por electroforesis
en geles de agarosa (2%) que contenían 0,25 \mug/ml de bromuro de
etidio.
Veinte de las 39 cepas de MRSA probadas no se
ampliaron con el ensayo de PCR desarrollado por Hiramatsu et
al. (Ejemplo 1, Tablas 2 y 3).
Con el fin de crear un ensayo de diagnóstico
rápido para los MRSA, en el contexto de la presente invención se
desarrollaron nuevas series de cebadores específicos para el extremo
derecho de los tipos I y II de SCCmec (SEC. ID. nº 66, nº
100 y nº 101) (Anexo 1), el tipo II de SCCmec (SEC. ID. nº 97
y nº 99), el tipo III de SCCmec (SEC. ID. nº 77, nº 98 y nº
102) y en el cromosoma de S. aureus a la derecha del punto de
integración de SCCmec (SEC. ID. nº 64, nº 70, nº 71, nº 72,
nº 73, nº 74, nº 75 y nº 76) (Tabla 5). Estos cebadores, que
amplían amplicones cortos (171 a 278 pb) son compatibles para su
utilización en ensayos rápidos por PCR (Tabla 7). El diseño de
estos cebadores estaba basado en el análisis de alineamientos de
secuencias múltiples de las secuencias orfX y SCCmec descritas por
Hiramatsu et al. (patente US nº 6.156.507) o disponibles en
el GenBank (Tabla 10, Anexo 1). Estas diferentes series de cebadores
se utilizaron para probar por PCR una variedad de cepas de MRSA,
MSSA, MRCNS, y MSCNS. Se desarrollaron varios cebadores para
ampliación destinados a detectar los tres tipos de SCCmec (SEC. ID.
nº 97 y nº 99 para el tipo II de SCCmec, las SEC. ID. nº 66, nº 100
y nº 101 para los tipos I y II de SCCmec y las SEC. ID. nº 67, nº 98
y nº 102 para el tipo III de SCCmec). Los cebadores se
seleccionaron según su especificidad para las cepas MRSA, su
sensibilidad analítica en la PCR y la longitud del producto de la
PCR. Se seleccionó una serie de 2 cebadores para la zona del extremo
derecho de SCCmec (SEC. ID. nº 66 específica para los tipos I y II
de SCCmec; SEC. ID. nº 67 específica para el tipo III de SCCmec).
De los 8 cebadores diferentes diseñados para hibridar en el
cromosoma de S. aureus a la derecha del punto de integración
de SCCmec (gen orfX diana) (SEC. ID. nº 64, nº 70, nº 71, nº 72, nº
73, nº 74, nº 75 y nº 76), solo uno (SEC. ID. nº 64) se observó que
era específico para el MRSA basado en el ensayo con una variedad de
cepas de MILSA, MSSA, MRCNS y MSCNS (Tabla 12). Por consiguiente, se
desarrolló un ensayo de PCR que utiliza el conjunto óptimo de
cebadores (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) que podría ampliar las
cepas de MRSA específicamente que contienen los tipos I, II y III de
SCCmec (Figura 2, Anexo I). Aunque el ensayo de la PCR desarrollado
con estas nuevas series de cebadores era muy sensible (es decir
permitía la detección de 2 a 5 copias de genoma para los tres tipos
de SCCmec) (Tabla 11), presentaba los mismos defectos (es decir
falta de ubicuidad) del ensayo desarrollado por Hiramatsu et
al. Las 20 cepas de MRSA que no fueron ampliadas por los
cebadores de Hiramatsu et al. no fueron detectadas tampoco
por el conjunto de cebadores que comprenden las SEC. ID. nº 64, nº
66 y nº 67 (Tablas 3 y 12). Evidentemente, se necesitan herramientas
para diagnóstico destinadas a conseguir por lo menos el 50% de
ubicuidad entre las cepas ensayadas.
Con el fin de crear un procedimiento de
detección e identificación más omnipresente (es decir con capacidad
para detectar todas o la mayoría de las cepas MRSA) para MRSA, los
inventores determinaron la secuencia de la MREJ presente en estas
20 cepas de MRSA que no se ampliaron. Esta investigación ha
conducido al descubrimiento e identificación de siete nuevas
secuencias diana de MREJ distintas que pueden utilizarse para el
diagnóstico. Estas siete nuevas secuencias de MREJ no pudieron
predecirse ni detectarse con el sistema descrito en la patente US
nº 6.156.507 por Hiramatsu et al. Concretamente, la presente
invención representa un procedimiento mejorado para la detección e
identificación de MRSA porque proporciona un procedimiento de
diagnóstico más omnipresente que permite la detección de todos los
clones principales de MRSA epidémicos en todo el mundo.
\vskip1.000000\baselineskip
Ya que el ADN procedente de veinte cepas de MRSA
no se amplió en el conjunto de cebadores desarrollados por
Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente
US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60
en la presente invención) (Tablas 2 y 3) ni con el conjunto de
cebadores desarrollado en la presente invención basada en los
mismos tres tipos (I, II y III) de SCCmec secuencias (SEC.
ID. nº 64, nº 66 y nº 67) (Tabla 12), la secuencia nucleotídica del
MREJ se determinó para dieciséis de estas veinte cepas de MRSA.
La transposasa de IS431 está asociada con
frecuencia a la inserción de genes resistentes dentro del locus
mec. El gen que codifica esta transposasa ha sido descrito
frecuentemente en una o más copias en el segmento derecho de
SCCmec (Oliveira et al, 2000, Antimicrob. Agents
Chemother. 44:1906-1910; Ito et al.,
2001, Antimicrob. Agents Chemother.
45:1323-36). Por consiguiente, en un primer intento
de secuenciar la nueva MREJ para 16 de las 20 cepas de MRSA
descritas en la Tabla 3, se diseñó un cebador en la secuencia del
gen que codifica la transposasa de IS431 (SEC. ID. nº 68) y
combinada con un cebador específico para orfX a la derecha
del punto de integración de SCCmec (SEC. ID. nº 70) (Tablas 5
y 8). La estrategia utilizada para seleccionar estos cebadores se
ilustra en la Figura 3.
Se ampliaron los fragmentos de MREJ que han de
ser secuenciados utilizando el protocolo de ampliación siguiente:
un \mul de suspensión celular tratada (o de una preparación de ADN
genómico purificada) se transfirió directamente a 4 tubos que
contenían 39 \mul de una mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR
contenía KCl 50 mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0),Triton
X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 2,5 mM, 1 \muM de cada
uno de los 2 cebadores (SEC. ID. nº 68 y nº 70), 200 \muM de cada
uno de los cuatro dNTP, 3,3 \mug/\mul de BSA
(Sigma-Aldrich Canada Ltd.) y 0,5 unidades de
Taq ADN polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo
TaqStart^{TM} (BD Biosciences). Las reacciones PCR se
sometieron a continuación a ciclación utilizando un termociclador
convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.) de la
forma siguiente: 3 minutos a 94ºC seguido de 40 ciclos de 5 segundos
a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 30 segundos a 55ºC para
la etapa de hibridación y 2 min. a 72ºC para la etapa de
ampliación.
Posteriormente, las cuatro mezclas ampliadas por
PCR se mezclaron y 10 \mul de la mezcla se resolvieron por
electroforesis en un gel de agarosa al 1,2% que contenía 0,25
\mug/ml de bromuro de etidio. Se observaron los amplicones a
continuación con un Alpha-Imager (Alpha Innotech
Corporation, San Leandro, CA) por exposición a la luz UV a 254 nm.
El tamaño del amplicón se estimó por comparación con una escala de
peso molecular de 1 kb (Life Technologies, Burlington, Ontario,
Canadá). La mezcla ampliada por PCR restante (150 \mul, en total)
se resolvió también por electroforesis en un gel de agarosa al 1,2%.
Los amplicones se observaron a continuación por tinción con azul de
metileno (Flores et al., 1992, Biotechniques,
13:203-205). El tamaño del amplicón se estimó otra
vez por comparación con una escala de peso molecular de 1 kb. De las
dieciséis cepas seleccionadas procedentes de las veinte descritas
en la Tabla 3, se ampliaron seis utilizando las SEC. ID. nº 68 y nº
70 como cebadores (CCRI-178,
CCRI-8895, CCRI-8903,
CCRI-1324, CCRI-1331 y
CCRI-9504). Para estas seis cepas de MRSA, se
obtuvo un producto de ampliación de 1,2 kb. La banda correspondiente
a este de producto de ampliación específico se separó del gel de
agarosa y se purificó utilizando el kit de extracción en gel
QIAquick^{TM} (Qiagen Inc., Chatsworth, CA). El fragmento de ADN
purificado en gel se utilizó a continuación directamente en el
protocolo de secuenciado. Ambas cadenas de los productos de
ampliación de MREJ se secuenciaron por el procedimiento de
secuenciado de terminación de la cadena de disesoxinucleótido
utilizando un secuenciador de ADN automático de Applied Biosystems
(Modelo 377) con su Big Dye^{TM} Sequencing Ready Reaction Kit
(Applied Biosystems, Foster City, CA). Las reacciones de
secuenciado se realizaron utilizando los mismos cebadores (SEC. ID.
nº 68 y nº 70) y 10 ng/100 pb por reacción de los amplicones
purificados en gel. El secuenciado de MREJ de las seis cepas de
MRSA (CCRI-178, CCRI-8895,
CCRI-8903, CCRI-1324,
CCRI-1331 y CCRI-9504) descritas en
la Tabla 3 proporcionaron las SEC. ID. nº 42, nº 43, nº 44, nº 45,
nº 46 y nº 51, respectivamente (Tabla 4).
Para asegurar que la secuencia determinada no
contenía errores atribuibles al secuenciado de los artefactos de la
PCR, los inventores han secuenciado dos preparaciones de los
productos de preparación de MREJ purificado en gel que se originan
a partir de dos ampliaciones independientes por PCR. Para la mayoría
de los fragmentos diana, las secuencias determinadas para ambas
preparaciones del amplicón fueron idénticas. Además, las secuencias
de ambas cadenas eran 100% complementarias confirmando de este modo
la alta precisión de la secuencia determinada. Las secuencias de
MREJ determinadas utilizando la estrategia anterior se describen en
el Listado de secuencias y en la Tabla 4.
Para secuenciar MREJ en cepas para las que no se
había obtenido ningún amplicón utilizando la estrategia que incluye
cebadores específicos para el gen de transposasa de IS431 y
orfX, se utilizó otra estrategia que utiliza cebadores de
las secuencias mecA y orfX diana para ampliar
fragmentos genómicos mayores. Una nueva mecA (SEC. ID. nº
69) diana del cebador de PCR (Tabla 8) debe utilizarse en
combinación con el mismo cebador en la secuencia orfX (SEC.
ID. nº 70). La estrategia utilizada para seleccionar estos cebadores
se ilustra en la Figura 3.
Se utilizó el protocolo de ampliación siguiente:
el ADN genómico purificado (300 ng) se transfirió hasta un volumen
final de 50 \mul de una mezcla de reacción de PCR. Cada reacción
PCR contenía 1x tampón Herculase (Stratagene, La Jolla, CA), 0,8
\muM de cada uno de los 2 cebadores (SEC. ID. nº 69 y nº 70), 0,56
mM de cada uno de los cuatro dNTP y 5 unidades de Herculase
(Stratagene). Las reacciones PCR se sometieron a ciclación
utilizando un ciclador térmico convencional (PTC-200
de MJ Research Inc.) de la forma siguiente: 2 min. a 92ºC seguido
de 35 o 40 ciclos de 10 s a 92ºC para la etapa de desnaturalización,
30 s a 55ºC para la etapa de hibridación y 30 min. a 68ºC para la
etapa de ampliación.
Posteriormente, 10 \mul de la mezcla ampliada
por PCR se resolvieron por electroforesis en un gel de agarosa al
0,7% que contenía 0,25 \mug/ml de bromuro de etidio. Los
amplicones se observaron a continuación como se describió
anteriormente. El tamaño del amplicón se estimó por comparación con
una escala de peso molecular de 1 kb (Life Technologies). Se llevó
a cabo a continuación una reacción de reampliación en 2 a 5 tubos
utilizando el mismo protocolo con 3 \mul de la primera reacción
PCR utilizada como muestra de ensayo para la segunda ampliación.
Las mezclas de PCR reampliadas se mezclaron y también se resolvieron
por electroforesis en un gel de agarosa al 0,7%. Los amplicones se
observaron a continuación tiñendo con azul de metileno tal como se
describió anteriormente. Se obtuvo un producto de ampliación de
aproximadamente 12 kb utilizando la estrategia de ampliación para
todas las cepas ensayadas. La banda correspondiente al producto de
ampliación específico se separó del gel de agarosa y se purificó
como se describió anteriormente. El fragmento de ADN purificado en
gel se utilizó a continuación directamente en el protocolo de
secuenciado como se describió anteriormente. Las reacciones de
secuenciado se llevaron a cabo utilizando los mismos cebadores de
ampliación (SEC. ID. nº 69 y nº 70) y 425 a 495 mg de los
amplicones purificados en gel por reacción. Posteriormente, se
utilizaron cebadores de secuenciado interno (SEC. ID. nº 65, nº 77
y nº 96) (Tabla 8) para obtener datos de secuencia en ambas cadenas
para una parte mayor del amplicón. Cinco de las 20 cepas de MRSA
(CCRI-1331, CCRI-1263,
CCRI-1377, CCRI-1311 y
CCRI-2025) descritas en la Tabla 3 se secuenciaron
utilizando esta estrategia, proporcionando las SEC. ID. nº 46, nº
47, nº 48, nº 49 y nº 50, respectivamente (Tabla 4). La secuencia en
el gen mecA se obtuvo también a partir de los amplicones
generados proporcionando las SEC. ID. nº 27, nº 28, nº 29, nº 30 y
nº 31 de las cepas CCRI-2025,
CCRI-1263, CCRI-1311,
CCRI-1331 y CCRI-1377,
respectivamente (Tabla 4). Se obtuvieron secuencias mayores dentro
del gen mecA y de las zonas corriente abajo también para las
cepas CCRI-2025, CCRI-1331, y
CCRI-1377 como se describe a continuación.
Para obtener secuencias mayores del gen
orfX, se utilizaron otras dos estrategias que utilizan
secuencias mecA y orfX diana de cebadores (en el
codón de inicio) para ampliar fragmentos mayores de cromosoma. Se
diseñó un nuevo cebador de PCR en orfX (SEC. ID. nº 132) para
ser utilizado en combinación con el mismo cebador en el gen
mecA (SEC. ID. nº 69). La estrategia utilizada para
seleccionar estos cebadores se ilustra en la Figura 3. Ocho cepas
de S. aureus se ampliaron utilizando las SEC. ID. nº 69 y nº
132 de cebadores (CCRI-9860,
CCRI-9208, CCRI-9504,
CCRI-1331, CCRI-9583,
CCRI-9681, CCRI-2025 y
CCRI-1377). La estrategia utilizada para seleccionar
estos cebadores se ilustra en la Figura 3.
Se utilizó el siguiente protocolo de ampliación:
el ADN genómico purificado (350 a 500 ng) se transfirió a 50 \mul
de una mezcla de reacción de PCR. Cada reacción PCR contenía 1x
tampón Herculase (Stratagene), 0,8 \muM de cada uno del
conjunto de 2 cebadores (SEC. ID. nº 69 y nº 132), 0,56 mM de cada
uno de los cuatro dNTP y 7,5 unidades de Herculase
(Stratagene) con MgCl_{2} 1 mM. Las reacciones PCR se sometieron a
termociclación tal como se describió anteriormente.
Posteriormente, 5 pl de la mezcla ampliada por
PCR se resolvieron por electroforesis en un gel de agarosa al 0,8%
que contenía 0,25 \mug/ml de bromuro de etidio. Los amplicones se
observaron a continuación como se describió anteriormente. Para una
cepa de S. aureus (CCRI-9583), se realizó a
continuación una reampliación utilizando las SEC. ID. nº 96 y nº
158 de los cebadores (Figura 3) en 4 tubos, utilizando el mismo
protocolo de la PCR, con 2 \mul de la primera reacción PCR como
muestra de ensayo para la segunda ampliación. Las mezclas de PCR
reampliadas se mezclaron y también se resolvieron por electroforesis
en un gel de agarosa al 0,8%. Los amplicones se observaron a
continuación tiñendo con azul de metileno tal como se describió
anteriormente. Se obtuvo una banda de aproximadamente 12 a 20 kb
utilizando esta estrategia de ampliación dependiendo de las cepas
ensayadas. La banda correspondiente al producto de ampliación
específico se separó del gel de agarosa y se purificó utilizando un
kit de extracción en gel QLAquick^{TM} o un kit de extracción en
gel QIAEX II (QIAGEN Inc.). Se ampliaron también dos cepas,
CCRI-9583 y CCRI-9589, con las SEC.
ID. nº 132 y nº 150 de cebadores, generando un producto de
ampliación de 1,5 kb. Se secuenciaron amplicones largos
(12-20 kb) utilizando 0,6 a 1 \mug por reacción,
mientras que los amplicones cortos (1,5 kb) se secuenciaron
utilizando 150 ng por reacción. Las reacciones de secuenciado se
realizaron utilizando diferentes series de cebadores para cada cepa
de S. aureus: 1) SEC. ID. nº 68, nº 70, nº 132, nº 145, nº
146, nº 147, nº 156, nº 157 y nº 158 para la cepa
CCRI-9504; 2) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 154 y nº
155 para la cepa CCRI-2025; 3) SEC. ID. nº 70, nº
132, nº 148, nº 149, nº 158 y nº 159 para la cepa
CCRI-9681; 4) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 187, y nº
188 para la cepa CCRI-9860; 5) SEC. ID. nº 70, nº
132, nº 150 y nº 159 para la cepa CCRI-9589; 6) SEC.
ID. nº 114, nº 123, nº 132, nº 150 y nº 158 para la cepa
CCRI-9583; 7) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 154 y nº
155 para la cepa CCRI-1377, 8) SEC. ID. nº 70, nº
132, nº 158 y nº 159 para la cepa CCRI-9208; 9) SEC.
ID. nº 68, nº 70, nº 132, nº 145, nº 146, nº 147 y nº 158 para la
cepa CCRI-1331; y 10) SEC. ID. nº 126 y nº 127 para
la cepa
CCRI-9770.
CCRI-9770.
En una cepa (CCRI-9770) se
demostró que los genes orfX y orfSA0022 se había
eliminado total o parcialmente basándose en la ampliación que
utiliza cebadores específicos para estos genes (SEC. ID. nº 132 y n:
159) y las SEC. ID. nº 128 y nº 129, respectivamente) (Tabla 8).
Posteriormente, se diseñó un nuevo cebador de PCR en
orfSA0021 (SEC. ID. nº 126) para ser utilizado con el mismo
cebador en el gen mecA (SEC. ID. nº 69). Se obtuvo un
producto de ampliación de 4,5 kb con este conjunto cebador. La
ampliación, purificación de amplicones y el secuenciado de
amplicones se llevó a cabo tal como se describió anteriormente.
Para obtener la secuencia de la zona
SCCmec que contiene mecA para diez de las 20 cepas de
MRSA descritas en la Tabla 3 (CCRI-9504,
CCRI-2025, CCRI-9208,
CCRI-1331, CCRI-9681,
CCRI-9860, CCRI-9770,
CCRI-9589, CCRI-9583 y
CCRI-1377), el cebador descrito anteriormente
diseñado en mecA (SEC. ID. nº 69) se utilizó en combinación
con un cebador diseñado en la zona corriente abajo de mecA
(SEC. ID. nº 118) (Tabla 8). Se obtuvo un producto de ampliación de
2 kb para todas las cepas probadas. Para una cepa,
CCRI-9583, se llevó a cabo una reampliación con las
SEC. ID. nº 96 y nº 118 de los cebadores con el amplicón generado
con los cebadores SEC. ID. nº 69 y nº 132 descrito anteriormente.
La ampliación, reampliación, purificación de los amplicones y las
reacciones de secuenciado se llevaron a cabo como se describió
anteriormente. Las reacciones de secuenciado se llevaron a cabo con
los amplicones generados con las SEC. ID. nº 69 y nº 132 descritas
anteriormente o las SEC. ID. nº 69 y nº 118. Se utilizaron
diferentes conjuntos de cebadores de secuenciado para cada cepa de
S. aureus.: 1) SEC. ID. nº 69, nº 96, nº 117, nº 118, nº
120, nº 151, nº 152 para las cepas CCRI-9504,
CCRI-2025, CCRI-1331,
CCRI-9770 y CCRI-1377; 2) SEC. ID.
nº 69, nº 96, nº 118 y nº 120 para las cepas
CCRI-9208, CCRI-9681 y
CCRI-9589; 3) SEC. ID. nº 69, nº 96, nº 117, nº
118, nº 120 y nº 152 para las cepas CCRI-9860; y 4)
SEC. ID. nº 96, nº 117, nº 118, nº 119, nº 120, nº 151 y nº 152 para
las cepas CCRI-9583.
Las secuencias obtenidas para 16 de las 20 cepas
no ampliables por el ensayo de Hiramatsu (Tabla 4) se compararon a
continuación con las secuencias disponibles en las bases de datos
públicas. En todos los casos, las porciones de la secuencia tenían
una identidad próxima al 100% con las secuencias disponibles
públicamente para orfX (SEC. ID. nº 42 a nº 51, nº 165 a nº
168 y nº 171) o mecA y la zona corriente abajo (SEC. ID. nº
27 a nº 31, nº 189 a nº 193, nº 195, nº 197 a nº 199 y nº 225). Sin
embargo, aunque la fracción orfX de los fragmentos (SEC. ID.
nº 42 a nº 51, nº 165 a nº 168 y nº 171) compartía casi el 100% de
identidad con el gen orfX de la cepa NCTC 8325 de MSSA
descrita por Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 3), la secuencia
del ADN en el extremo derecho del propio SCCmec se demostró
que era muy diferente de las de los tipos I, II, III, y IV
descritos por Hiramatsu et al. (Tabla 13, Figura 4). Se
obtuvieron seis nuevos tipos de secuencia diferentes.
Debe señalarse que Hiramatsu et al.
demostraron que el tipo I de SCCmec podía estar asociado con
el tipo i de MREP, los tipos II y IV de SCCmec están
asociados con el tipo ii de MREP y el tipo III de SCCmec
está asociado con el tipo iii de MREP. Los datos de secuenciado de
MREJ de los inventores de varias cepas de MRSA condujeron al
descubrimiento de 6 nuevos tipos de MREP denominados tipos iv, v,
vi, vii, viii y ix. Las MREJ que comprenden distintos tipos de MREP
se designaron según el esquema de numeración de MREP. Por
consiguiente el tipo i de MREP está comprendido dentro del tipo i de
MREJ, el tipo ii de MREP está comprendido dentro del tipo ii de MREJ
y así sucesivamente hasta el tipo ix de MREP.
Las secuencias dentro del extremo derecho de
SCCmec obtenidas a partir de las cepas
CCRI-178, CCRI-8895,
CCRI-8903, CCRI-1324,
CCRI-1331 y CCRI-9504 (SEC. ID. nº
42, nº 43, nº 44, nº 45, nº 46 y nº 51) eran casi idénticas entre
sí y presentaban casi el 100% de identidad con IS431 (números
de registro en GenBank AF422691, ABO37671, AF411934). Sin embargo,
los datos de la secuencia de los inventores pusieron de manifiesto
por primera vez la posición de esta secuencia IS431 en el
extremo derecho de SCCmec adyacente a la secuencia de
integración. Por consiguiente, como las secuencias en el extremo
derecho de SCCmec de estas 6 cepas de MRSA eran diferentes
de las del tipo I de SCCmec de la cepa NCTC 10442, del tipo
II de SCCmec de la cepa N315, del tipo III de SCCmec
de la cepa 85/2082 y del tipo IV de SCCmec de las cepas CA05
y 8/6-3P descritas por Hiramatsu et al. (Ito
et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother.
45:1323-1336; Ma et al., 2002,
Antimicrob. Agents Chemother. 46:1147-1152),
estas nuevas secuencias se denominaron tipo iv de MREP (SEC. ID. nº
42 a nº 46 y nº 51). Una búsqueda en BLAST con el fragmento
SCCmec de las secuencias de tipo iv de MREP produjo
alineaciones significativas con las secuencias que codifican
fracciones de una variedad de transposasas conocidas. Por ejemplo,
cuando se compara con el nº de registro AB037671 del GenBank, el
tipo iv de MREP de la SEC. ID. nº 51 compartía el 98% de identidad
con la supuesta transposasa de IS431 y su zona corriente
abajo; dos huecos de 7 nucleótidos cada uno estaban también
presentes en esta alineación.
Las secuencias obtenidas a partir de las cepas
CCRI-1263, CCRI-1377,
CCRI-1311 y CCRI-2025 (SEC. ID. nº
47 a nº 50), eran casi idénticas entre sí y diferentes de los tres
tipos de SCCmec y del tipo iv de MREP y, por consiguiente,
se denominaron tipo v de MREP. Cuando se comparan con las secuencias
del GenBank que utiliza BLAST, las secuencias de tipo v de MREP no
compartían ninguna homología significativa con ninguna secuencia
publicada, excepto para los primeros 28 nucleótidos. Este segmento
corto corresponde a los 11 últimos nucleótidos de codificación de
orfX, seguido de los 17 nucleótidos corriente abajo,
incluyendo la repetición derecha invertida (IR-R) de
SCCmec.
La secuencia obtenida de la cepa
CCRI-9208 era también diferente de los tres tipos de
SCCmec y de los tipos iv y v de MREP y, por consiguiente, se
denominó tipo vi de MREP (SEC. ID. nº 171). En una búsqueda en
BLAST, el tipo vi de MREP se demostró que era único, no presentando
ninguna homología significativa con ninguna secuencia publicada.
Las secuencias obtenidas de las cepas
CCRI-9583 y CCRI-9589 eran también
diferentes de los tres tipos de SCCmec y de los tipos iv a
vi de MREP y se denominaron por consiguiente tipo vii de MREP (SEC.
ID. nº 165 y nº 166). En una búsqueda en BLAST, el tipo vii de MREP
se demostró también que era único, no presentando ninguna homología
significativa con ninguna secuencia publicada. La secuencia obtenida
a partir de la cepa CCRI-9860 fue también diferente
de los tres tipos de SCCmec y de los tipos iv a vii de MREP y
se denominó por consiguiente tipo viii de MREP (SEC. ID. nº 167).
La secuencia de la cepa CCRI-9681 era también
diferente de los tres tipos de SCCmec y de los tipos iv a
viii de MREP y se denominó por consiguiente tipo ix de MREP (SEC.
ID. nº 168). Las búsquedas en BLAST con la fracción SCCmec
de las secuencias de los tipos viii y ix de EPMR proporcionaron
alineaciones significativas, pero solamente para los primeros ~150
nucleótidos de cada tipo de MREP. Por ejemplo, el comienzo de la
secuencia de tipo viii de MREP presentaba 88% de identidad con una
fracción del nº de registro AB063173 en el GenBank, pero no se
encontró ninguna homología significativa con ninguna secuencia
publicada en el resto de la secuencia. De la misma manera, los
primeros ~150 nucleótidos del tipo ix de MREP tenían el 97% de
identidad con la misma fracción de AB063173, siendo el resto de la
secuencia exclusiva. La fracción homóloga corta de los tipos viii y
ix de MREP corresponde en AB063173 con los 14 últimos nucleótidos de
codificación de orfX, la IR-R de
SCCmec, y una fracción de orfCM009. Aunque
compartiendo similitudes, los tipos viii y ix de MREP son muy
diferentes uno de otro; como se muestra en la Tabla 13, existe
solamente el 55,2% de identidad entre ambos tipos para los primeros
500 nucleótidos de la fracción SCCmec.
Por último, no se obtuvieron ninguna secuencia
en SSCmec de la cepa CRI-9770. Sin embargo,
como se describe en el apartado "Secuenciado de las secuencias
nucleotídicas de MREJ de las cepas de MRSA no ampliables con los
cebadores específicos para los tipos I, II y III de
SCCmec", esta cepa presenta aparentemente una eliminación
parcial o total de los genes orfX y orfSA0022 en el
ADN cromosómico a la derecha del punto de integración de
SCCmec y esto representaría una nueva unión del extremo
derecho. Se denominó por lo tanto esta nueva secuencia tipo x de
MREP (SEC. ID. nº 172). El secuenciado futuro debería poner de
manifiesto si este también denominado tipo x de MREJ contiene un
nuevo tipo x de MREP o si la falta de ampliación es producida de
hecho por la variación en la parte cromosómica de la MREJ.
Las secuencias del primer fragmento de 500
nucleótidos del extremo derecho de todos los SCCmec obtenidos
en la presente invención se compararon con los tipos I, II y III de
SCCmec utilizando los programas Pileup y Gap de GCG. La
Tabla 13 representa las identidades a nivel de nucleótidos entre los
extremos derechos de SCCmec de las seis nuevas secuencias
con las de los tipos I, II y III de SCCmec utilizando el
programa Gap de GCG. Aunque los tipos I y II de SCCmec
presentaban casi el 79,2% de identidad (diferenciándose solamente
en una inserción de 102 pb presente en el tipo II de SCCmec)
(Figuras 1, 2 y 4), todos los demás tipos de MREP presentaron
identidades que oscilan entre 40,9 y 57,1%. Esto explica porqué los
extremos derechos de los nuevos tipos iv a ix de MREP dados a
conocer en la presente invención podrían no haber sido previstos ni
detectados con el sistema descrito por Hiramatsu et al.
Cuatro cepas (CCRI-1312,
CCRI-1325, CCRI-9773 y
CCRI-9774) descritas en la Tabla 3 no fueron
secuenciadas sino más bien caracterizadas utilizando los cebadores
de PCR. Las cepas CCRI-1312 y
CCRI-1325 se demuestra que contienen el tipo v de
MREP que utiliza cebadores de ampliación específica descritos en los
ejemplos 4, 5 y 6 mientras que las cepas CCRI-9773
y CCRI-9774 se demuestra que contienen el tipo vii
de MREP que utiliza los cebadores específicos de ampliación
descritos en el ejemplo 7.
Para obtener la secuencia completa del
SCCmec presente en las cepas MRSA descritas en la presente
invención, se desarrollaron los cebadores que se dirigen al
cromosoma de S. aureus a la izquierda (corriente arriba del
gen mecA) del punto de integración SCCmec. Basándose
en las secuencias de las bases de datos públicas disponibles, se
diseñaron 5 cebadores diferentes (SEC. ID. nº 85 a nº 89) (Tabla 9).
Estos cebadores pueden utilizarse en combinación con los cebadores
específicos para el cromosoma de S. aureus para secuenciar
el SCCmec completo o, alternativamente, utilizarse en
combinación con el cebador específico para mecA (SEC. ID. nº
81) para secuenciar la unión del extremo izquierdo de SCCmec.
Se han desarrollado también varios cebadores específicos para
secuencias conocidas de SCCmec extendidas a lo largo del
locus con objeto de obtener la secuencia completa de SCCmec
(Tabla 9). Estos cebadores permitirán asignar un tipo de
SCCmec a las cepas de MRSA descritas en la presente
invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Las secuencias de MREJ determinadas por los
inventores o seleccionadas a partir de bases de datos públicas se
utilizaron para seleccionar cebadores de PCR para la detección e
identificación de MRSA. La estrategia utilizada para seleccionar
estos cebadores de PCR se basó en el análisis de alineaciones de
secuencias múltiples de varias secuencias de MREJ.
En el análisis de los datos de las secuencias de
los seis nuevos tipos iv a ix de MREP descritos anteriormente, se
diseñaron los cebadores específicos para cada secuencia de nuevo
tipo de MREP (SEC. ID. nº 79, nº 80, nº 109, nº 112, nº 113, nº
115, nº 116 y nº 204) (Figura 2, Tabla 5, Ejemplos 3, 4, 5, 6, 7 y
8). Los cebadores específicos para los tipos iv, v y vii de MREP
(SEC. ID. nº 79, nº 80 y nº 112) se utilizaron en multiplex con los
tres cebadores para detectar los tipos I, II y III de SCCmec
(SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) y el cebador específico para el
orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 64) (Ejemplos 3, 4, 5,
6 y 7). Los cebadores específicos para los tipos vi, viii y ix de
MREP (SEC. ID. nº 204, nº 115, nº 116 y nº 109) se diseñaron también
y se probaron frente a su diana específica (Ejemplo 8).
\vskip1.000000\baselineskip
Clásicamente, la detección de los productos de
ampliación por PCR se lleva a cabo por electroforesis en gel de
agarosa teñido con bromuro de etidio convencional como se describió
anteriormente. Sin embargo es evidente que pueden utilizarse otros
procedimientos para la detección de los productos de ampliación
específicos, que pueden ser más rápidos y más prácticos para el
diagnóstico rutinario. Los ejemplos de dichos procedimientos se
describen en la solicitud de patente WO 01/23604 A2 en trámite con
la presente.
La detección del amplicón puede realizarse
también mediante soporte sólido o hibridación líquida utilizando
sondas de ADN internas específicas para la especie que hibridan un
producto de ampliación. Dichas sondas pueden generarse de cualquier
secuencia del repertorio de los inventores y diseñarse para hibridar
específicamente productos de ampliación de ADN que son objeto de la
presente invención. Alternativamente, los amplicones pueden
caracterizarse por secuenciado. Véase la solicitud de patente en
trámite con la presente WO 01/23604 A2 para ejemplos de
procedimientos de detección y secuenciado.
Con objeto de mejorar la eficacia de la
ampliación de ácidos nucleicos, puede modificarse la composición de
la mezcla de reacción (Chakrabarti y Schutt, 2002,
Biotechniques, 32:866-874;
Al-Soud y Radstrom, 2002, J. Clin.
Microbiol., 38:4463-4470;
Al-Soud y Radstrom, 1998, Appl. Environ.
Microbiol., 64:3748-3753; Wilson, 1997,
Appl. Environ. Microbiol., 63:3741-3751).
Dichas modificaciones de la mezcla de reacción de ampliación
incluyen la utilización de varias polimerasas o la adición de
facilitadores de ampliación de ácido nucleico tales como betaína,
BSA, sulfóxidos, proteína gp32, detergentes, cationes, cloruro de
tetrametilamonio y otros.
En una forma de realización preferida, se
controló la detección en tiempo real de la ampliación por PCR
publicando sondas moleculares fluorescentes en un aparato Smart
Cycler® (Cepheid, Sunnyvale, CA). Se desarrolló un ensayo por PCR
multiplex que contiene cebadores específicos para los tipos i a v de
MREP y orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº
79 y nº 80), una sonda molecular fluorescente específica para la
secuencia orfX (SEC. ID. nº 84, véase el Anexo II y la
Figura 2) y un control interno para controlar que la inhibición de
la PCR. El control interno contiene secuencias complementarias para
los cebadores específicos para el tipo iv de MREP y para
orfX (SEC. ID. nº 79 y nº 64). El ensayo también contiene una
sonda molecular fluorescente marcada con
tetracloro-6-carboxifluoresceína
(TET) específica para la secuencia en el fragmento de ADN generado
durante la ampliación del control interno. Cada reacción de PCR
contenía KCl 50 mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0),Triton
X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,8 \muM de
cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID. nº 66 y
nº 67) y cebador específico para orfX (SEC. ID. nº 64), 0,4 \muM
de cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID. nº 79
y nº 80), 80 copias de la referencia interna, 0,2 \muM de la sonda
molecular fluorescente marcada con TET específica para la
referencia interna, 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente
(SEC. ID. nº 84) marcada con
6-carboxi-fluoresceína (FAM), 330
\muM de cada uno de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,45
\mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,875 U de Taq ADN polimerasa
(Promega) acoplada con el anticuerpo TaqStart^{TM} (BD
Biosciences). La ampliación por PCR en el Smart Cycler® se llevó a
cabo de la forma siguiente: 3 min. a 95ºC para la desnaturalización
inicial, a continuación cuarenta y ocho ciclos en tres etapas
consistentes en 5 segundos a 95ºC para la etapa de
desnaturalización, 15 segundos a 60ºC para la etapa de hibridación,
y 15 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación. Las pruebas de
sensibilidad realizadas utilizando ADN genómico purificado de una
cepa de MRSA de cada tipo (i a v) de MREP presentaba un límite de
detección de 2 a 10 copias del genoma (Ejemplo 5). Ninguno de los 26
MRCNS o 10 MSCNS probados eran positivos con este ensayo multiplex.
Las ocho cepas de MRSA (CCRI-9208,
CCRI-9770, CCRI-9681,
CCRI-9860, CCRI-9583,
CCRI-9773, CCRI-9774,
CCRI-9589) que albergan las secuencias de los nuevos
tipos vi, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención
permanecieron indetectables (Ejemplo 5).
En una forma de realización preferida, se evaluó
la detección de MRSA utilizando el ensayo de la PCR multiplex en
tiempo real en el aparato Smart Cycler® (Cepheid, Sunnyvale, CA)
directamente de muestras clínicas. Un total de 142 extensiones
nasales se recogieron durante el programa de vigilancia hospitalaria
de MRSA en el Montreal General Hospital (Montreal, Quebec, Canadá).
Las muestras de las extensiones se analizaron en el Centre de
Recherche en Infectiologie de l'Université Laval a las 24 horas de
la recogida. Durante la recepción, las extensiones se colocaron en
placas en manitol agar-agar y a continuación el
material nasal de la misma extensión se preparó con un protocolo de
preparación de muestras sencillo y rápido descrito en la solicitud
de patente en trámite número US 60/306.163. La identificación
clásica de MRSA se realizó por los procedimientos de cultivo
habituales.
El ensayo de PCR detectó 33 de las 34 muestras
positivas para MRSA basado en el procedimiento de cultivo. En
comparación con el cultivo, el ensayo de la PCR detectó 8 muestras
adicionales positivas a MRSA para una sensibilidad de 97,1% y una
especificidad de 92,6% (Ejemplo 6): Este ensayo de PCR multiplex
representa un procedimiento rápido y potente para la detección
específica de vehículos de MRSA directamente de las muestras
nasales y puede utilizarse con algunos tipos de muestras clínicas
tales como heridas, sangre o cultivo sanguíneo, CSF, etc.
En una forma de realización preferida, se
desarrolló un ensayo de PCR multiplex que contiene cebadores
específicos para los tipos i, ii, iii, iv, v, y vi y de MREP y
orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 66, nº 67, nº 79, nº
80 y nº 112) y tres sondas moleculares fluorescentes específicas
para la secuencia orfX que permitió la detección de los
polimorfismos de dos secuencias identificados en esta zona de la
secuencia orfX. Cuatro de las cepas que no fueron detectadas por el
ensayo multiplex para la detección de los tipos i a v de MREP se
detectaron ahora con este ensayo multiplex mientras que las cuatro
cepas de MRSA (CCRI-9208, CCRI-9770,
CCRI-9681 y CCRI-9860) que albergan
los tipos vi, viii, ix y x de MREP descritos en la presente
invención permanecieron indetectables (Ejemplo 7). Los cebadores
específicos para los tipos vi, viii y ix de MREP (SEC. ID. nº 204,
nº 115, nº 116 y nº 109) se diseñaron también y se demostró que
detectan sus cepas diana específicas (Ejemplo 8). Mientras que los
cebadores y sondas dadas a conocer por Hiramatsu et al.,
permitían la detección solamente del 48,7% (19 cepas de cada 39) de
las cepas de MRSA de la Tabla 2, los cebadores y sondas procedentes
de la presente invención permiten la detección del 97,4% de las
cepas (38 cepas de cada 39) (véanse los Ejemplos 7 y 8). Por
consiguiente puede decirse que el análisis de los inventores tiene
una ubicuidad superior al 50% para las cepas de MRSA enumeradas en
la Tabla 2.
\vskip1.000000\baselineskip
La especificidad de los cebadores y sondas
oligonucleotídicos se determinó por ampliación de ADN o por
hibridación con especies de estafilococos. Todas las especies de
estafilococos ensayadas eran probablemente patógenos asociados a
infecciones o contaminantes potenciales que pueden aislarse de
muestras clínicas. Cada ADN diana pudo liberarse de células
microbianas utilizando los tratamientos químicos y/o físicos
convencionales para lisar las células (Sambrook et al.,
1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª ed., Cold Spring
Harbour Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY) o
alternativamente, se utilizó ADN genómico purificado con el kit
GNOME^{TM} DNA (Qbiogene, Carlsbad, CA). Posteriormente, el ADN se
sometió a ampliación con el conjunto de cebadores. Los cebadores o
sondas específicos se hibridaron solamente con el ADN diana.
En los cebadores de oligonucleotídicos
descubiertos para ampliar específicamente el ADN en el MRSA diana se
determinó posteriormente su ubicuidad por ampliación (es decir los
cebadores omnipresentes ampliaron de manera eficaz la mayoría o
todas las cepas de MRSA). Por último, se determinó la sensibilidad
analítica de los ensayos de la PCR utilizando diluciones de 10
veces o 2 veces de ADN genómico purificado procedente de los
microorganismos diana. Para la mayoría de los ensayos, se
obtuvieron niveles de sensibilidad comprendidos en el intervalo de
copias de 2 a 10 genomas. La especificidad, ubicuidad y sensibilidad
analítica de los ensayos de la PCR se determinaron directamente con
cultivos bacterianos o con ADN genómico bacteriano purificado.
Se analizaron sondas moleculares fluorescentes
utilizando la plataforma Smart Cycler® tal como se describió
anteriormente. Una sonda molecular fluorescente se consideraba
específica solamente cuando hibridaba solamente al ADN ampliado en
el MREJ de S. aureus. En las sondas moleculares fluorescentes
descubiertas por ser específicas se determinó posteriormente su
ubicuidad (es decir, las sondas omnipresentes detectaron eficazmente
la mayoría o todas las cepas del MRSA) por hibridación con los ADN
bacterianos de varias cepas de MRSA.
\vskip1.000000\baselineskip
Las cepas de referencia utilizadas para
construir subrepertorios de datos de la secuencia de unión del
extremo derecho del cromosoma de SCCmec de la patente, así
como para probar los ensayos de ampliación e hibridación, se
obtuvieron en: (i) la American Type Culture Collection (ATCC), (ii)
el Laboratoire de santé publique du Québec (LSPQ)
(Ste-Anne de Bellevue, Québec, Canadá), (iii) los
Centres for Disease Control and Prevention (CDC) (Atlanta, GA),
(iv) el Institut Pasteur (París, Francia) y v) la Harmony Collection
(Londres, Reino Unido) (Tabla 14). Las cepas clínicas de MRSA,
MSSA, MRCNS y MSCNS de varias áreas geográficas se utilizaron
también en la presente invención (Tabla 15). La identidad de las
cepas de MRSA de los inventores se confirmó por ensayo genotípico y
se reconfirmó por análisis de la PCR utilizando los cebadores
específicos para S. aureus y los cebadores específicos para
mecA (SEC. ID. nº 69 y nº 81) (Martineau et al., 2000,
Antimicrob. Agents Chemother,
44:231-238).
Para una mayor claridad, a continuación se
presentan los Ejemplos, Tablas, Figuras y Anexos de la presente
invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo 1: Los cebadores desarrollados por
Hiramatsu et al. pueden detectar solamente cepas de MRSA que
pertenecen a los tipos i, ii e iii de MREP aunque omitiendo los
nuevos tipos de MREP frecuentes.
Ejemplo 2: Detección e identificación de MRSA
utilizando cebadores específicos para las secuencias de los tipos i,
ii e iii de MREP desarrollados en la presente invención.
Ejemplo 3: Desarrollo de un ensayo de la PCR
multiplex en un termociclador convencional para la detección e
identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii,
iii, iv y v de MREP.
Ejemplo 4: Desarrollo de un ensayo de la PCR
multiplex en tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e
identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii,
iii, iv y v de MREP.
Ejemplo 5: Desarrollo de un ensayo de la PCR
multiplex en tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e
identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii,
iii, iv y v de MREP e incluyendo una referencia interna.
Ejemplo 6: Detección de MRSA utilizando el
ensayo multiplex en tiempo real del Smart Cycler® basado en las
secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP para la detección
de MRSA directamente en muestras clínicas.
Ejemplo 7: Desarrollo de un ensayo de la PCR
multiplex en tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e
identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii,
iii, iv, v, vi y vii de MREP.
Ejemplo 8: Desarrollo de ensayos de la PCR en
tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e identificación
de MRSA basado en los tipos vi, viii y ix de MREP.
\vskip1.000000\baselineskip
La Tabla 1 proporciona información acerca de
todos los cebadores de la PCR desarrollados por Hiramatsu et
al. en la patente US nº 6.156.507.
La Tabla 2 es una compilación de resultados
(ubicuidad y especificidad) para la detección de la unión del
extremo derecho SCCmec-orfX utilizando los
cebadores descritos por Hiramatsu et al. en la patente US nº
6.156.507 en un termociclador convencional.
La Tabla 3 es una lista de las cepas de MRSA no
ampliables utilizando cebadores diana de los tipos I, II y III de
las secuencias de la unión del extremo derecho de
SCCmec-orfX.
La Tabla 4 es una lista de nuevas secuencias
puestas de manifiesto en la presente invención.
La Tabla 5 proporciona información acerca de
todos los cebadores desarrollados en la presente invención.
La Tabla 6 es una lista de las sondas modelo
moleculares desarrolladas en la presente invención.
La Tabla 7 presenta los tamaños del amplicón de
los diferentes pares de cebador descritos por Hiramatsu et
al. en la patente US nº 6.156.507 o desarrollados en la presente
invención.
La Tabla 8 proporciona información acerca de los
cebadores desarrollados en la presente invención para secuenciar la
unión del extremo derecho del cromosoma de SCCmec.
La Tabla 9 proporciona información acerca de los
cebadores desarrollados en la presente invención para obtener la
secuencia del SCCmec completa.
La Tabla 10 es una lista de las secuencias
disponibles en las bases de datos públicas (GenBank, proyectos de
genoma o patente US nº 6.156.507) utilizadas en la presente
invención para diseñar cebadores y sondas.
La Tabla 11 proporciona la sensibilidad
analítica del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención
utilizando los tipos I, II e III de cebadores diana de las
secuencias de unión al extremo derecho de
SCCmec-orfX y realizadas utilizando un
termociclador convencional.
La Tabla 12 es una compilación de resultados
(ubicuidad y especificidad) para la detección de MRSA utilizando los
cebadores desarrollados en la presente invención con los tipos I, II
y III diana de las secuencias de unión del extremo derecho de
SCCmec-orfX y realizadas utilizando un
termociclador convencional.
La Tabla 13 presenta una comparación de
identidades de secuencias entre los 500 primeros nucleótidos de los
extremos derechos de SCCmec entre 9 tipos de MREP.
\global\parskip0.950000\baselineskip
La Tabla 14 proporciona información acerca de
las cepas de referencia de MRSA, MSSA, MRCNS y MSCNS utilizadas para
validar los ensayos de la PCR desarrollados en la presente
invención.
La Tabla 15 proporciona información acerca del
origen de las cepas clínicas de MRSA, MSSA, MRCNS y MSCNS utilizadas
para validar los ensayos de la PCR descritos en la presente
invención.
La Tabla 16 representa la sensibilidad analítica
del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención
utilizando cebadores que se dirigen a 5 tipos de secuencias de MREP
y realizados en un termociclador convencional.
La Tabla 17 es una compilación de resultados
(ubicuidad y especificidad) para el ensayo de la PCR desarrollado en
la presente invención utilizando 5 tipos de secuencias de MREP que
dirigen los cebadores y realizado en un termociclador
convencional.
La Tabla 18 representa la sensibilidad analítica
del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención
utilizando la plataforma Smart Cycler® para la detección de 5 tipos
de MREP.
La Tabla 19 es una compilación de resultados
(ubicuidad y especificidad) para el ensayo de la PCR desarrollado en
la presente invención utilizando cebadores y una sonda molecular
fluorescente que se dirige a 5 tipos de secuencias de MREP y se
realiza en la plataforma Smart Cycler®.
La Tabla 20 representa la sensibilidad analítica
del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención
utilizando la plataforma Smart Cycler® para la detección de 6 tipos
de MREP.
La Tabla 21 es una compilación de resultados
(ubicuidad y especificidad) para el ensayo de la PCR desarrollado en
la presente invención utilizando cebadores y una sonda molecular
fluorescente que se dirige a 6 tipos de secuencias de MREP y se
realiza en la plataforma Smart Cycler®.
\vskip1.000000\baselineskip
La Figura 1 es un diagrama que ilustra la
posición de los cebadores desarrollados por Hiramatsu et al.
(patente US nº 6.156.507) en la unión del extremo derecho del
cromosoma de SCCmec para la detección e identificación de
MRSA.
La Figura 2 es un diagrama que ilustra la
posición de los cebadores seleccionados en la presente invención en
la unión del extremo derecho de SCCmec-orfX
para la detección e identificación de MRSA.
La Figura 3 es un diagrama que ilustra la
posición de los cebadores seleccionados en la presente invención
para secuenciar nuevos tipos de MREP.
La Figura 4 ilustra una alineación de la
secuencia de nueve tipos de MREP.
\vskip1.000000\baselineskip
Figura 1. Organización esquemática de las
uniones del extremo derecho de SCCmecorfX de los tipos I, II
y III y localización de los cebadores (SEC. ID. nº 52 a nº 63)
descritos por Hiramatsu et al. para la detección e
identificación de MRSA. Los tamaños de amplicón se representan en la
Tabla 7.
Figura 2. Organización esquemática de los tipos
i, ii, iii, iv, v, vi, vii, viii y ix de MREP y localización de los
cebadores y modelo molecular que se dirige a todos los tipos de MREP
(SEC. ID. nº 20, nº 64, nº 66, nº 67, nº 79, nº 80, nº 84, nº 112,
nº 115, nº 116, nº 84, nº 163 y nº 164) que se desarrollaron en la
presente invención. Los tamaños de amplicón se representan en la
Tabla 7.
Figura 3. Organización esquemática de las
uniones del extremo derecho del cromosoma SCCmec y
localización de los cebadores (SEC. ID. nº 65, nº 68, nº 69, nº 70,
nº 77, nº 96, nº 118, nº 126, nº 132, nº 150 y nº 158) desarrollados
en la presente invención para el secuenciado de los tipos iv, v, vi,
vii, viii, ix y x de MREP.
Figura 4. Alineación de secuencia múltiple de
nueve tipos de MREP (representados por fragmentos de las SEC. ID. nº
1, nº 2, nº 104, nº 51, nº 50, nº 171, nº 165, nº 167 y nº 168 para
los tipos i, ii, iii, iv, v, vi, vii, viii y ix,
respectivamente).
\vskip1.000000\baselineskip
Los Anexos muestran las estrategias utilizadas
para la selección de cebadores y sondas internas:
El Anexo I ilustra la estrategia para la
selección de cebadores de las secuencias SCCmec y orfX
específicas para los tipos I y II de SCCmec.
\global\parskip1.000000\baselineskip
El Anexo II ilustra la estrategia para la
selección de sondas moleculares fluorescentes específicas para la
detección en tiempo real de las uniones del extremo derecho de
SCCmec-orfX.
Como se muestra en estos Anexos, los cebadores
de ampliación seleccionados pueden contener inosinas y/o
ambigüedades de base. La inosina es un análogo nucleotídico capaz
de unirse específicamente a cualquiera de los cuatro nucleótidos A,
C, G o T. Alternativamente, se utilizaron oligonucleótidos
degenerados que consisten en una mezcla de oligonucleótidos con dos
o más de los cuatro nucleótidos A, C, G o T en el punto de los
emparejamientos incorrectos. La inclusión de inosina y/o de
degeneraciones en los cebadores de ampliación permite la tolerancia
de emparejamiento incorrecto permitiendo de este modo la ampliación
de un despliegue más amplio de secuencias nucleotídicas diana
(Dieffenbach y Dveksler, 1995, PCR Primer: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, Nueva York).
\vskip1.000000\baselineskip
Como se muestra en la Figura 1, Hiramatsu et
al. han desarrollado varios cebadores que pueden hibridar
específicamente los extremos derechos de los ADN de SCCmec de
los tipos I, II y III. Ellos combinaron estos cebadores con
cebadores específicos para la zona cromosómica de S. aureus
situada a la derecha del punto de integración de SCCmec para
la detección de MRSA. Hiramatsu et al. demostraron que el
conjunto de cebadores (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente
US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60
en la presente invención) era el más específico y omnipresente para
la detección de MRSA. Este conjunto de cebadores proporciona
productos de ampliación de 1,5 kb para el tipo I de SCCmec,
1,6 kb para el tipo II de SCCmec, y 1,0 kb para el tipo III
de SCCmec (Tabla 7). La ubicuidad y especificidad de este
ensayo de PCR multiplex se determinó en 39 cepas de MRSA, 41 cepas
de SAMS, 9 cepas de MRCNS y 11 cepas de MSCNS (Tabla 2). Un \mul
de una suspensión bacteriana estandarizada tratada o de una
preparación de ADN genómico bacteriano purificada en bacterias se
ampliaron en 20 \mul de mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR
contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton
X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 2,5 mM, 0,4 \muM de
cada uno de los cebadores específicos para SCCmec y
orfX (SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60), 200 \muM de cada uno
de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,3 \mug/\mul de BSA
(Sigma) y 0,5 U de Taq polimerasa (Promega) acoplada con
anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences).
Las reacciones de PCR se sometieron a
continuación a ciclación térmica: 3 min. a 94ºC seguido de 40 ciclos
de 60 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 60
segundos a 55ºC para la etapa de hibridación y 60 segundos a 72ºC
para la etapa de ampliación, seguidas a continuación de una
ampliación terminal de 7minutos a 72ºC utilizando un termociclador
convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.). La
detección de los productos de PCR se realizó por electroforesis en
geles de agarosa (2%) que contenían 0,25 \mug/\mul de bromuro de
etidio.
Ninguna de las cepas de MRCNS o MSCNS ensayadas
se detectaron con el conjunto de cebadores que detecta los tipos I,
II y III de SCCmec. Veinte de las 39 cepas de MRSA no se
detectaron con este ensayo de PCR multiplex (Tablas 2 y 3). Una de
estas cepas de MRSA no detectada corresponde al clon de MRSA
portugués muy epidémico (cepa CCRI-9504; De
Lencastre et al., 1994. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect.
Dis. 13:64-73) y otro corresponde al clon
CMRSA1 de MRSA canadiense muy epidémico (cepa
CCRI-9589; Simor et al. CCDR 1999,
25-12, 15 de junio). Estos datos demuestran que el
conjunto cebador desarrollado por Hiramatsu et al. (SEC. ID.
nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a
las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60 en la presente invención) no está
omnipresente para la detección de MRSA y sugiere que algunas cepas
de MRSA tengan secuencias en la unión del extremo derecho de
SCCmec que son diferentes de las identificadas por Hiramatsu
et al. Otros tipos de secuencias de SCCmec u otras
secuencias en el extremo derecho de SCCmec (tipo MREP) se
encuentran en MRSA. Una limitación de este ensayo es la detección no
específica de 13 cepas de MSSA (Tabla 2).
\vskip1.000000\baselineskip
Basándose en análisis de alineaciones de
secuencia múltiple de las secuencias de orfX y SCCmec
descritas por Hiramatsu et al. o disponibles en el GenBank,
se diseñó un conjunto de cebadores (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67)
capaces de ampliar segmentos cortos de los tipos I, II y III de las
uniones del extremo derecho de SCCmec-orfX
procedentes de las cepas de MRSA y discriminante de MRCNS (Anexo I y
Figura 2). El conjunto elegido de cebadores proporciona productos
de ampliación de 176 pb para el tipo I de SCCmec, 278 bp del
tipo II de SCCmec y 223 bp para el tipo III de SCCmec
y permite la rápida ampliación por PCR. Estos cebadores se
utilizaron en una PCR multiplex para probar su ubicuidad y
especificidad utilizando 208 cepas de MRSA, 252 cepas de MSSA, 41
cepas de CMSRM y 21 cepas de MRCNS (Tabla 12). La ampliación y
detección por PCR se llevó a cabo tal como se describe en el
Ejemplo 1. Las reacciones por PCR se sometieron a continuación a
ciclado térmico (3 minutos a 94ºC seguido de 30 ó 40 ciclos de 1
segundo a 95ºC para la etapa de desnaturalización y 30 segundos a
60ºC para la etapa de hibridación-ampliación y a
continuación seguida por una ampliación térmica de 2 minutos a
72ºC) utilizando un termociclador convencional (PTC-
200 de MJ Research Inc.). La detección de los productos de la PCR se realizó como se describe en el Ejemplo 1.
200 de MJ Research Inc.). La detección de los productos de la PCR se realizó como se describe en el Ejemplo 1.
Ninguna de las cepas de MRCNS o de MSCNS
ensayadas se detectaron con este conjunto de cebadores (Tabla 12).
Sin embargo, las veinte cepas de MRSA que no se detectaron con el
conjunto cebador desarrollado por Hiramatsu et al. (SEC. ID.
nº 56, nº 58 y nº 60) no se detectaron tampoco con los cebadores
desarrollados en la presente invención (Tablas 3 y 12). Estos datos
demuestran también que algunas cepas de MRSA tienen secuencias en
la unión del extremo derecho del cromosoma de SCCmec que son
diferentes de las identificadas por Hiramatsu et al. De
nuevo, como se observa con los cebadores de Hiramatsu, 13 cepas de
MSSA se detectaron también no específicamente (Tabla 12). El
significado clínico de este descubrimiento continúa sin ser
demostrado ya que estas cepas de MSSA aparentes podrían ser el
resultado de una eliminación reciente en el locus mec
(Deplano et al., 2000, J. Antimicrob. Chemotherapy,
46:617-619; Inglis et al., 1990, J. Gen
Microbiol., 136:2231-2239; Inglis et al.,
1990, J. Infect. Dis., 167:323-328; Lawrence
et al. 1996, J. Hosp. Infect.,
33:49-53; Wada et al., 1991, Biochem.
Biophys. Res. Comm., 176:1319-1326).
\vskip1.000000\baselineskip
En el análisis de los datos de la secuencia de
dos de los nuevos tipos iv y v de MREP descritos en la presente
invención, se diseñaron dos nuevos cebadores (SEC. ID. nº 79 y nº
80) y se utilizaron en multiplex con las tres SEC. ID. nº 64, nº 66
y nº 67 de cebadores descritas en el Ejemplo 2. La ampliación y
detección por PCR de los productos de PCR se realizó tal como se
describe en el Ejemplo 2. Los ensayos de sensibilidad se realizaron
utilizando diluciones de diez veces o de dos veces del ADN genómico
purificado procedente de varias cepas de MRSA y cada tipo de MREP
presentaba un límite de detección de 5 a 10 copias de genoma (Tabla
16). Se llevaron a cabo pruebas de especificidad utilizando 0,1 ng
de ADN genómico purificado o 1 \mul de una suspensión bacteriana
estandarizada. Todas las cepas de MRCNS o de MSCNS probadas eran
negativas con este ensayo multiplex (Tabla 17). Doce de las 20
cepas de MRSA que no se detectaron con la PCR multiplex descrita en
los Ejemplos 1 y 2 no se detectaron ahora con este ensayo
multiplex. De nuevo, como se observa con los cebadores de Hiramatsu,
13 cepas de MSSA se detectaron también de forma no específica
(Tabla 12). Las ocho cepas de MRSA (CCRI-9208,
CCRI-9583, CCRI-9773,
CCRI-9774, CCRI-9589,
CCRI-9860, CCRI-9681,
CCRI-9770), y que alojan las nuevas secuencias de
los tipos vi, vii, viii, ix y x de MREP descritas en la presente
invención permanecieron indetectables.
\vskip1.000000\baselineskip
El ensayo de la PCR multiplex descrito en el
Ejemplo 3 que contiene cebadores (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº
79 y nº 80) se adaptó a la plataforma de Smart Cycler® (Cepheid).
Una sonda molecular fluorescente específica para la secuencia de
orfX se desarrolló (SEC. ID. nº 84, véase el Anexo II). Cada
reacción PCR contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH
9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,5 mM, 0,4
\muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec y
orfX (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) 0,2
\muM de la sonda molecular fluorescente marcada con FAM (SEC. ID.
nº 84), 200 \muM de cada uno de los cuatro dNTP, 3,3 \mug/\mul
de BSA y 0,5 U de Taq polimerasa acoplada con anticuerpo
TaqStart^{TM}. La ampliación por PCR en el Smart Cycler® se
realizó de la manera siguiente: 3 min. a 94ºC para la
desnaturalización inicial, a continuación cuarenta y cinco ciclos de
tres etapas consistentes en 5 segundos a 95ºC para la etapa de
desnaturalización, 15 segundos a 59ºC para la etapa de hibridación
y 10 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación. La detección de
fluorescencia se llevó a cabo al final de cada etapa de
hibridación. Las pruebas de sensibilidad se realizaron utilizando
ADN genómico purificado procedente de varias cepas de MRSA de cada
tipo de MREP presentó un límite de detección de 2 a 10 copias de
genoma (Tabla 18). Ninguna de las MRCNS o MSCNS eran positivas con
este ensayo multiplex (tabla 19). De nuevo, como se observa con los
cebadores de Hiramatsu, se detectaron también 13 cepas de MSSA de
manera no específica. Doce de las veinte cepas de MRSA que no se
detectaron con la PCR multiplex descrita en los Ejemplos 1 y 2 se
detectaron por este ensayo multiplex. Como se describe en el Ejemplo
3, las ocho cepas de MRSA que alojan las secuencias de los tipos
vi, vii, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención
permanecieron indetectables.
\vskip1.000000\baselineskip
El ensayo de la PCR multiplex descrito en el
Ejemplo 4 que contiene cebadores específicos para los tipos i a v
de MREP y orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº
67, nº 79 y nº 80, y una sonda molecular fluorescente específica
para la secuencia orfX (SEC. ID. nº 84, véase Anexo II) se
optimizó para incluir un control interno para controlar la
inhibición por la PCR. Este control interno contenía secuencias
complementarias a los cebadores específicos para el tipo iv de MREP
y para orfX (SEC. ID. nº 79 y nº 64). Este ensayo contiene
también una sonda molecular fluorescente marcada con TET específica
para la secuencia en el amplicón generado por ampliación del
control interno. Cada reacción PCR contenía 50 KCl mM,
Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton
X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,8 \muM de
cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID. nº 66 y
nº 67) y cebador específico para orfX (SEC. ID. nº 64), 0,4
\muM de cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID.
nº 79 y nº 80), 80 copias de la referencia interna, 0,2 \muM de la
sonda molecular fluorescente marcada con TET específica para la
referencia interna, 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente
marcada con FAM (SEC. ID. nº 84), 330 \muM de los cuatro dNTP
(Pharmacia Biotech), 3,45 \mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,875 U de
Taq polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo
TaqStart^{TM} (BD Biosciences). La ampliación por PCR en
el Smart Cycler® se realizó de la manera siguiente: 3 min. a 95ºC
para la desnaturalización inicial, a continuación cuarenta y ocho
ciclos de tres etapas consistentes en 5 segundos a 95ºC para la
etapa de desnaturalización, 15 segundos a 60ºC para la etapa de
hibridación y 15 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación. Se
realizaron pruebas de sensibilidad utilizando ADN genómico
purificado procedente de una cepa de MRSA de cada tipo de MREP (i a
v) presentó un límite de detección de 2 a 10 copias de genoma.
Ninguna de las 26 MRCNS o 10 MSCNS eran positivas con este ensayo
multiplex. De nuevo, como se observa con los cebadores de
Hiramatsu, se detectaron también 13 cepas de MSSA de manera no
específica. Como se describe en los Ejemplos 3 y 4, las ocho cepas
de MRSA que alojan las nuevas secuencias de los tipos vi a x de MREP
descritas en la presente invención permanecieron indetectables.
\vskip1.000000\baselineskip
El ensayo descrito en el Ejemplo 5 se adaptó
para la detección directamente procedente de muestras clínicas. Se
analizaron un total de 142 extensiones nasales recogidas durante el
programa de vigilancia en hospital de MRSA en el Montreal General
Hospital (Montreal, Quebec, Canadá). Las muestras de extensiones se
analizaron en el Centre de Recherche en Infectiologie de la
Universidad Laval a las 24 horas de la recogida. A la recepción, las
extensiones se colocaron en agar-agar con manitol y
a continuación se preparó el material nasal de la misma extensión
con un protocolo rápido de preparación de la muestra descrito en la
solicitud de patente número US 60/306.163 en trámite con la
presente. La identificación clásica de MRSA se llevó a cabo por
procedimientos de cultivo convencionales.
El ensayo de la PCR descrito en el Ejemplo 5
detectó 33 de las 34 muestras positivas para MRSA basándose en el
procedimiento de cultivo. En comparación con el cultivo, el ensayo
de la PCR detectó 8 muestras positivas a MRSA adicionales para una
sensibilidad del 97,1% y una muestra del 92,6%. Este ensayo de la
PCR multiplex representa un procedimiento rápido y potente para la
detección específica de vehículos de MRSA directamente de las
muestras nasales y puede utilizarse con cualquier tipo de muestras
clínicas tales como heridas, sangre o cultivo sanguíneo, CSF
etc.
\vskip1.000000\baselineskip
En el análisis de la nueva secuencia de datos
del tipo vii de MREP descrita en la presente invención (SEC. ID. nº
165 y nº 166), se diseñaron y se ensayaron dos nuevos cebadores
(SEC. ID. nº 112 y nº 113) en multiplex con los 3 cebadores SEC. ID.
nº 64, nº 66 y nº 67 descritos en el Ejemplo 2. La SEC. ID. nº 112
del cebador se seleccionó para su utilización en el multiplex
basándose en su sensibilidad. Tres sondas moleculares fluorescentes
específicas para la secuencia orfX que permitía la detección
de dos polimorfismos de la secuencia identificados en esta zona de
la secuencia orfX, basada en el análisis de las SEC. ID. nº
173 a nº 186, se utilizaron también en el multiplex (SEC. ID. nº 84,
nº 163 y nº 164). Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM,
Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton
X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,8 \muM de
cada uno de los cebadores específicos para SCCmec (SEC. ID.
nº 66 y nº 67) y el cebador específico para orfX (SEC. ID. nº
64), 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para
SCCmec (SEC. ID. nº 79 y nº 80), 0,2 \muM de la sonda
molecular fluorescente marcada con FAM (SEC. ID. nº 84), 330 \muM
de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,45 \mug/\mul de BSA
(Sigma) y 0,875 U de Taq polimerasa (Promega) acoplada con el
anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences). La ampliación
por PCR en el Smart Cycler® se realizó de la manera siguiente: 3
min. a 95ºC para la desnaturalización inicial, a continuación
cuarenta y ocho ciclos de tres etapas consistentes en 5 segundos a
95ºC para la etapa de desnaturalización, 15 segundos a 60ºC para la
etapa de hibridación y 15 segundos a 72ºC para la etapa de
ampliación. La detección de fluorescencia se realizó al final de
cada etapa de hibridación. Las pruebas de sensibilidad se realizaron
utilizando ADN genómico purificado procedente de varias cepas de
MRSA y cada tipo de MREP presentó un límite de detección de 2 copias
de genoma (Tabla 20). Ninguna de las 26 MRCNS o de las 8 MSCNS
dieron positivas con este ensayo multiplex. De nuevo, como se
observa con los cebadores de Hiramatsu, 13 cepas de MSSA se
detectaron también de manera no específica. (Tabla 21). Cuatro de
las cepas que no se detectaron con el ensayo multiplex para la
detección de los tipos i a v de MREP se detectaron ahora con este
ensayo multiplex mientras que las cuatro cepas de MRSA
(CCRI-9208, CCRI-9770,
CCRI-9681 y CCRI-9860) que
alojan
las secuencias de los tipos vi, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención permanecieron indetectables.
las secuencias de los tipos vi, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención permanecieron indetectables.
\vskip1.000000\baselineskip
En el análisis de los nuevos datos de la
secuencia de los tipos vi, viii y ix de MREP descritos en la
presente invención, se diseñaron nuevos cebadores específicos para
el tipo vi de MREP (SEC. ID. nº 201) un cebador específico para el
tipo viii de MREP (SEC. ID. nº 115), un cebador específico para el
tipo ix de MREP (SEC. ID. nº 109) y un cebador específico para ambos
tipos viii y ix de MREP (SEC. ID. nº 116). Cada cebador de PCR se
utilizó en combinación con el cebador específico para orfX
(SEC. ID. nº 64) y se ensayó frente a su cepa diana específica. Cada
reacción PCR contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH
9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,4
\muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec
y para orfX, 200 \muM de los cuatro dNTP, 3,4 \mug/\mul
de BSA (Sigma) y 0,875 U de Taq polimerasa acoplada con el
anticuerpo TaqStart^{TM}. Se realizó la ampliación por PCR
como se describe en el Ejemplo 7. Los ensayos de sensibilidad
realizados utilizando ADN genómico purificado a partir de sus
respectivas cepas diana de MRSA demostraron que la mejor combinación
de pares de cebador fue las SEC. ID. nº 64 y nº 115 para la
detección de los tipos viii y ix de MREP simultáneamente. Estos
nuevos cebadores específicos para SCCmec pueden utilizarse
en ensayos múltiples con cebadores específicos para los tipos i,
ii, iii, iv, v y vii de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y
nº 80) descritos en Ejemplos anteriores para proporcionar un ensayo
de MRSA más omnipresente.
En conclusión, los inventores han mejorado la
ubicuidad de la detección de cepas de MRSA. Se han identificado
nuevos tipos iv a x de MREJ. Entre las cepas representativas de
estos nuevos tipos, los cebadores y/o sondas de Hiramatsu tuvieron
éxito al detectar menos del 50% de los mismos. Los inventores han
pasado ampliamente por consiguiente el límite del 50% por lo menos
de ubicuidad, ya que sus cebadores y sondas fueron diseñados para
detectar el 100% de las cepas probadas como representativas de los
tipos iv a ix de MREJ. Por consiguiente, aunque la ubicuidad
depende de la mezcla de cepas y representativas que están bajo
análisis, los inventores saben ahora que cerca del 100% de
ubicuidad es un objetivo alcanzable, cuando utilizan las secuencias
de las uniones de la derecha (MREJ) para derivar sondas y cebadores
que tratan de polimorfismo en esta zona. Dependiendo de cuántos
tipos desconocidos de MREJ existen, los inventores disponen de un
margen de maniobra comprendido entre 50% (superior a los cebadores
de Hiramatsu para las cepas ensayadas) y 100% si los inventores
secuencian todos los MREJ existentes para proporcionar
apropiadamente las presentes herramientas y procedimientos de
diagnóstico, siguiendo las directrices anteriores.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
ANEXO
I
Estrategia para la selección de
cebadores de ampliación específicos para MREP de los tipos i e
ii
\newpage
ANEXO I
(continuación)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
ANEXO
II
Estrategia para la selección de
una sonda específica molecular fluorescente para la detección en
tiempo real de
MREJ
\global\parskip0.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTES
\hskip1.5cmHULETSKY, Ann ^{1}, 1231 Av des Pins, Sillery, Quebec, Canadá, G1S 4J3
\hskip1.5cmROSSBACH, Valery ^{1}, 55 Rue du Sauternes, Aylmer, Quebec, Canadá, J9H 3W7
\hskip1.5cm^{1}:ciudadanía canadiense
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: SECUENCIAS PARA LA DETECCIÓN E IDENTIFICACIÓN DE STAPHYLOCOCCUS AUREUS RESISTENTE A LA METICILINA
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 233
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DIRECCIÓN/DESTINATARIO
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CP:
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- MEDIO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE SOPORTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FECHA DE SOLICITUD ACTUAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FECHA DE SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- DATOS DE ABOGADO/AGENTE DE INFORMACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO:
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE CONTACTO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FAX:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3050 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NCTC 10442
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB033763
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. nº: 1
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3050 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de D86934
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 3
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3183 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NCTC 8325
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014440
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 479 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 86/560
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013471
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 4
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 5
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 86/961
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013472
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 5
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA SEC ID nº:
6
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/3907
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013473
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 6
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 7
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 86/2652
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013474
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 8
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 309 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/1340
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013475
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 9
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 471 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/1762
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013476
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 9
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013477
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 11
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2111
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013478
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 12
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/5495
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013479
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 12
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 13
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 478 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/1836
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013480
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 13
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 14
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 479 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2147
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013481
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 15
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/3619
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013482
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 16
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/3566
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB013483
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 17
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2232
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014402
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 18
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2235
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014403
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 19
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 458 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: MR108
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014404
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 20
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/9302
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014430
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 21
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 84/9580
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014431
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 22
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/1940
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014432
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 23
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 61/6219
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014433
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 24
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 340 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 64/4176
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014434
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 25
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 369 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 64/3846
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: AB014435
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 26
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3050 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 26
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 27
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 657 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 28
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 782 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1263
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 28
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 29
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 744 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1311
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 30
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 652 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1331
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 30
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 31
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2436 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1377
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 32
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 336 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus epidermidis
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: G3
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 15, PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 34
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 260 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus haemolyticus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: SH 518
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 16, PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 35
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: ATCC 25923
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 9, PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 36
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: STP23
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 10 PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 37
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: STP43
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 12 PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 38
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: STP53
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 13 PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 39
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1500 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 476
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de Genome project
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 40
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1501 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 252
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de Genome project
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 41
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: COL
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de Genome project
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 42
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1045 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: ATCC 33592
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 43
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1118 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-8895
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 43
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 44
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1118 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-8903
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 44
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 45
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1113 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1324
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 46
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2153 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1331
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 47
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 737 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1263
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 48
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1592 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1377
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 49
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 730 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1311
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 49
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 50
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1696 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 51
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2122 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9504
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 52
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 53
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 54
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 55
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 56
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 57
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 58
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 59
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 60
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 60
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 61
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 62
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 62
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 63
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 63
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 64
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 64
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 65
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 65
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 66
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 66
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 67
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 67
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 68
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 68
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 69
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 69
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 70
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 70
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 71
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 71
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 72
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 72
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 73
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 73
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 74
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 74
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 75
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 75
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 76
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 76
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 77
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 77
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 78
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NCTC 8325
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de X52593
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 78
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 79
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 79
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 80
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 80
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 81
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 81
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 82
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NCTC 10442
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB033763
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 82
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 83
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 83
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 84
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 84
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 85
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 85
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 86
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 86
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 87
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 87
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 88
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 88
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 89
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 89
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 90
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de D86934
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 90
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 91
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB037671
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 91
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 92
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NCTC 10442
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB033763
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 92
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 93
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de D86934
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 93
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 94
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 94
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 95
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NCTC 8325
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de X53818
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 95
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 96
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 96
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 97
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 97
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 98
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 98
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 99
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 99
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 100
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 100
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 101
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 101
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 102
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 102
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 103
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 103
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 104
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1256 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB037671
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 104
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 105
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 105
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 106
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 106
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 107
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 107
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 108
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 108
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 109
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 109
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 110
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 110
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 111
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 111
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 112
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 112
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 113
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 113
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 114
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 114
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 115
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 115
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 116
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 116
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 117
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 117
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 118
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 118
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 119
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 119
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 120
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 120
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 121
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 121
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 122
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 122
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 123
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 123
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 124
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 124
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 125
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 125
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 126
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 126
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 127
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 127
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 128
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 128
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 129
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 129
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 130
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 130
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 131
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 131
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 132
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 132
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 133
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 133
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 134
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 134
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 135
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 135
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 136
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 136
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 137
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 137
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 138
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 138
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 139
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 139
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 140
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 140
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 141
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 141
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 142
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 142
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 143
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 143
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 144
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 144
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 145
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 145
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 146
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 146
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 147
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 147
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 148
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 148
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 149
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 149
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 150
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 150
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 151
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 151
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 152
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 152
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 153
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 153
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 154
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 154
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 155
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 155
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 156
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 156
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 157
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 157
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 158
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 158
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 159
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 159
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 160
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 48 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 160
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 161
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 161
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 162
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 162
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 163
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 163
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 164
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 164
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 165
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1282 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9583
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 165
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 166
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1108 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9589
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 166
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 167
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1530 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9860
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 167
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 168
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1256 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9681
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 168
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 169
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 846 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9887
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 169
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 170
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1270 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9772
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 170
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 171
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 991 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9208
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 171
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 172
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 748 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9770
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 172
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 173
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 917 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9864
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 173
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 174
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1132 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9865
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 174
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 175
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1133 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9866
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 175
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 176
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1087 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9867
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 176
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 177
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 903 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9868
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 177
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 178
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1114 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9869
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 178
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 179
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1121 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9871
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 179
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 180
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1121 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9872
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 180
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 181
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1131 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9873
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 181
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 182
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 896 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9874
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 182
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 183
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1125 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9875
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 183
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 184
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 679 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9876
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 184
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 185
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1125 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9882
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 185
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 186
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 926 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9885
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 186
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 187
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 187
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 188
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 188
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 189
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2154 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9583
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 189
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 190
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2410 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9504
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 190
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA SEC ID nº:
191
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1858 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9208
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 191
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 192
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1861 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9589
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 192
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 193
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1861 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9681
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 193
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 194
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1052 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9772
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 194
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 195
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3101 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9770
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 195
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 196
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3506 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9887
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 196
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 197
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 928 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-175
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 197
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 198
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 782 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1262
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 198
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 199
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 709 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-8894
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 199
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 200
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 200
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 201
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 201
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 202
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 202
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 203
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 203
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 204
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 204
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 205
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 205
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 206
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 206
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 207
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 207
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 208
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 208
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 209
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 209
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 210
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 210
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 211
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 211
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 212
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 212
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 213
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 213
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 214
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 214
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 215
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 215
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 216
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 216
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 217
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 217
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 218
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 218
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 219
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 721 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9504
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 219
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 220
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1791 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1331
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 220
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 221
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 600 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-1377
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 221
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 222
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1640 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 222
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 223
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 592 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 223
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 224
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2386 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9860
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 224
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 225
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 623 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9860
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 225
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 226
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 651 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de L29436
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 226
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 227
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 563 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de L29436
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 227
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 228
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1380 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de S67449
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 228
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 229
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1365 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 229
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 230
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 831 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 230
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 231
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4193 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AP003129
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 231
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 232
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2996 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB037671
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 232
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 233
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1410 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: CCRI-9681
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 233
Claims (36)
1. Procedimiento para detectar la presencia o
ausencia de una cepa de Staphylococcus aureus resistente a la
meticilina (MRSA) de tipo iv de MREJ que comprende:
- a)
- poner en contacto una muestra que ha de analizarse para la presencia o ausencia de dicha cepa de MRSA, incluyendo dicha cepa de MRSA un elemento mec del cromosoma del casete estafilocócico (SCCmec) que contiene un gen mecA insertado en el ADN cromosómico, generando así una secuencia de tipo iv de la unión del extremo derecho polimórfico (MREJ) que comprende las secuencias tanto del extremo derecho del elemento SCCmec como del ADN cromosómico contiguo a dicho extremo derecho
- con un primer cebador y un segundo cebador,
- en el que dichos primer y segundo cebadores son por lo menos 10 nucleótidos de longitud, y
- i)
- en el que dicho primer cebador se hibrida con dicho extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia de tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por: SEC. ID nº 42-46 y nº 51 y los complementos de las mismas, y
- ii)
- en el que dicho primer cebador se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus para generar específicamente un amplicón si dicha cepa de MRSA está presente en dicha muestra; y
- b)
- detectar la presencia o ausencia de dicho amplicón.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Procedimiento según la reivindicación 1, en
el que dicha secuencia cromosómica de S. aureus se selecciona
de entre ORFx, SEC. ID. nº: 172, SEC. ID. nº: 231 y un complemento
de los mismos.
3. Procedimiento según la reivindicación 2, en
el que dicha secuencia cromosómica de S. aureus es ORFx.
4. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que dicho procedimiento comprende la
utilización de por lo menos un cebador y/o sonda seleccionados de
entre las SEC. ID. nº siguientes: nº 79, nº 77, nº 145, nº 147, nº
64, nº 71, nº 72, nº 73, nº 74, nº 75, nº 76, nº 0, nº 103, nº 130,
nº 132, nº 158, nº 159, nº 59, nº 62, nº 126, nº 127, nº 128, nº
129, nº 131, nº 200, nº 201, nº 60, nº 61, nº 63, nº 68, nº 32, nº
83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163, nº 164, nº 85, nº86, nº
87, nº 88 y nº 89, para la detección del tipo iv de MREJ.
5. Procedimiento según la reivindicación 4, que
comprende la utilización de un par cebador constituido por las SEC.
ID. nº 64 y nº 79.
6. Procedimiento según la reivindicación 5, que
comprende además la utilización de por lo menos una sonda que
presenta una secuencia seleccionada de entre el grupo constituido
por las SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163
y nº 164.
7. Procedimiento según la reivindicación 6, en
el que dichos cebadores y sondas presentan las secuencias
nucleotídicas siguientes: SEC. ID. nº 64, nº 79, nº 84, nº 163, nº
164 para la detección del tipo iv de MREJ.
8. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 7, que comprende además detectar la presencia o
ausencia de por lo menos una cepa adicional de Staphylococcus
aureus resistente a la meticilina (MRSA) en dicha muestra,
comprendiendo dicha por lo menos una cepa de MRSA adicional una
secuencia de ácido nucleico de tipo i, ii, iii, v, vi, vii, viii, o
ix de la unión del extremo derecho de mec (MREJ), y siendo
resistente debido a la presencia de un elemento SCCmec que
contiene un gen mecA, habiendo sido insertado dicho
SCCmec en el ADN cromosómico, generando así una unión del
extremo derecho polimórfico (MREJ), en el que dicho procedimiento
comprende además poner en contacto dicha muestra con por lo menos un
cebador y/o sonda, que puede hibridarse específicamente con dicho
extremo derecho del elemento SCCmec de dicha por lo menos una
de dichas secuencias de ácido nucleico de los tipos i, ii, iii, v,
vi, vii, viii y ix de MREJ.
9. Procedimiento según la reivindicación 8, en
el que dichos cebador y/o sonda presentan por lo menos 10
nucleótidos de longitud y pueden hibridarse con dicho extremo
derecho del elemento SCCmec de por lo menos una de dichas
secuencias de ácido nucleico de los tipos i, ii, iii, v, vi, vii,
viii y ix de MREJ que comprenden una secuencia seleccionada de entre
el grupo constituido por:
- a)
- SEC ID nº: 1, 20-25, 41 y 199 para el tipo i de MREJ;
- b)
- SEC ID nº: 2, 17-19, 26, 40, 173-183, 185, 186 y 197 para el tipo ii de MREJ;
- c)
- SEC ID nº: 4-16, 104, 184 y 198 para el tipo iii de MREJ;
- d)
- SEC ID nº: 47-50 para el tipo v de MREJ;
- e)
- SEC ID nº: 171 para el tipo vi de MREJ;
- f)
- SEC ID nº: 165 y 166 para el tipo vii de MREJ;
- g)
- SEC ID nº: 167 para el tipo viii de MREJ; y
- h)
- SEC ID nº: 168 para el tipo ix de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
10. Procedimiento según la reivindicación 8 ó 9,
que comprende la utilización de por lo menos un cebador y/o sonda
seleccionados de entre las SEC. ID. nº siguientes:
- a)
- 66, 100, 101, 105, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo i de MREJ;
- b)
- 66, 97, 99, 100, 101, 106, 117, 118, 124, 125, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo ii de MREJ;
- c)
- 67, 98, 102, 107, 108, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159; 58, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32; 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo iii de MREJ;
- d)
- 65, 80, 146, 154, 155, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo v de MREJ;
- e)
- 202, 203, 204, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo vi de MREJ;
- f)
- 112, 113, 114, 119, 120, 121, 122, 123, 150, 151, 153, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo vii de MREJ;
- g)
- 115, 116, 187, 188, 207, 208, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo viii de MREJ; y
- h)
- 109, 148, 149, 205, 206, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo ix de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
11. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 8 a 10, que comprende además la utilización de por
lo menos un par cebador seleccionado de entre las SEC. ID. nº
siguientes:
- a)
- 64/66, 64/100, 64/101; 59/52, 59/53, 59/54, 59/55, 59/56, 59/57, 60/52, 60/53, 60/54, 60/55, 60/56, 60/57, 61/52, 61/53, 61/54, 61/55, 61/56, 61/57, 62/52, 62/53, 62/54, 62/55, 62/56, 62/57, 63/52, 63/53, 63/54, 63/55, 63/56 y 63/57, para la detección del tipo i de MREJ;
- b)
- 64/66, 64/97, 64/99, 64/100, 64/101, 59/52, 59/53, 59/54, 59/55, 59/56, 59/57, 60/52, 60/53, 60/54, 60/55, 60/56, 60/57, 61/52, 61/53, 61/54, 61/55, 61/56, 61/57, 62/52, 62/53, 62/54, 62/55, 62/56, 62/57, 63/52, 63/53, 63/54, 63/55, 63/56 y 63/57, para la detección del tipo ii de MREJ;
- c)
- 64/67, 64/98, 64/102; 59/58, 60/58, 61/58, 62/58 y 63/58, para la detección del tipo iii de MREJ;
- d)
- 64/80, para la detección del tipo v de MREJ;
- e)
- 64/204, para la detección del tipo vi de MREJ;
- f)
- 64/112 y 64/113, para la detección del tipo vii de MREJ;
- g)
- 64/115 y 64/116, para la detección del tipo viii de MREJ; y
- h)
- 64/109 y 64/116, para la detección del tipo ix de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
12. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 8 a 11, que comprende la utilización de por lo
menos una sonda que presenta una secuencia seleccionada de entre el
grupo constituido por: SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161,
nº 162, nº 163 y nº 164 para la detección de dicha por lo menos una
cepa MRSA adicional del tipo i, ii, iii, v, vi, vii, viii o ix de
MREJ.
13. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 8 a 12, que comprende la utilización de cebadores y
sondas que presentan las secuencias nucleotídicas siguientes:
- a)
- SEC ID nº: 64, 66, 84, 163, 164 para la detección del tipo i o ii de MREJ;
- b)
- SEC ID nº: 64, 67, 84, 163, 164 para la detección del tipo iii de MREJ;
- c)
- SEC ID nº: 64, 80, 84, 163, 164 para la detección del tipo v de MREJ; y
- d)
- SEC ID nº: 64, 112, 84, 163, 164 para la detección del tipo vii de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
14. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 13, en el que múltiples cebadores y/o sondas se
utilizan conjuntamente en el mismo recinto físico.
15. Procedimiento para el tipado de un MREJ de
tipo iv de una cepa de MRSA, y por lo menos una cepa de MRSA
adicional seleccionada de entre los tipos i, ii, iii, v, vi, vii,
viii y ix de MREJ que comprende las etapas siguientes: reproducir el
procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14 con
cebadores y/o sondas específicos para dicho tipo iv de MREJ y
específicos para dicha por lo menos una cepa de MRSA adicional
seleccionada de entre los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de
MREJ, y detectar cada amplicón distintivamente como indicación de la
presencia de dicho tipo iv de MREJ y dicho por lo menos un tipo de
MREJ adicional.
16. Utilización de un kit específico para la
detección de una cepa de MRSA que comprende una secuencia de ácido
nucleico del tipo iv de MREJ, para la realización de cualquiera de
los procedimientos según las reivindicaciones 1 a 7.
17. Utilización de un kit específico para la
detección de una cepa de MRSA que comprende una secuencia de ácido
nucleico de tipo iv de MREJ y por lo menos una cepa de MRSA
adicional seleccionada de entre los tipos i, ii, iii, v, vi, vii,
viii y ix de MREJ, para la realización de cualquiera de los
procedimientos según las reivindicaciones 8 a 15.
18. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 15, en el que se utiliza una pluralidad de
diversos cebadores y/o sondas.
19. Procedimiento según la reivindicación 18, en
el que dicha pluralidad de cebadores y/o sondas se selecciona en su
totalidad para hibridarse en las mismas condiciones de
hibridación.
20. Procedimiento según la reivindicación 19, en
el que dicha pluralidad de cebadores y/o sondas pueden hibridarse
con dicho tipo iv de MREJ, y por lo menos un tipo de MREJ adicional
seleccionado de entre tipo i de MREJ, tipo ii de MREJ, tipo iii de
MREJ, tipo iv de MREJ, tipo v de MREJ, tipo vi de MREJ, tipo vii de
MREJ, tipo viii de MREJ y tipo ix de MREJ.
21. Procedimiento para determinar la presencia o
ausencia de por lo menos cuatro tipos de MRET de MRSA en una muestra
que comprende:
- a)
- reproducir el procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 8 a 15, 19 y 20 con cebadores y/o sondas específicos para cada uno de dichos por lo menos cuatro tipos de MREJ, siendo uno de los cuales el tipo iv de MREJ; y
- b)
- detectar cada amplicón de manera específica,
determinando así la presencia o ausencia de los
tipos de MREJ de MRSA en una muestra.
\vskip1.000000\baselineskip
22. Procedimiento según la reivindicación 21,
para determinar la presencia o ausencia del tipo iv, tipo i, tipo ii
y tipo iii de MREJ.
23. Procedimiento según la reivindicación 21,
para determinar la presencia o ausencia del tipo iv, tipo i, tipo ii
tipo iii, y tipo vii de MREJ.
24. Procedimiento según la reivindicación 21,
para determinar la presencia o ausencia del tipo iv, tipo i, tipo
ii, tipo iii, tipo v, tipo vi, tipo vii, tipo viii y tipo ix de
MREJ.
25. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4, en el que dicho procedimiento comprende la
utilización de por lo menos un cebador y/o sonda específicos para un
tipo iv de MREJ que comprende una secuencia seleccionada de entre
las SEC. ID. nº 79, nº 145, nº 147 y nº 68, y por lo menos un
cebador y/o una sonda específicos para el cromosoma de S.
aureus y que comprende una secuencia seleccionada de entre las
SEC. ID. nº 32, nº 59, nº 60-64, nº
70-76, nº 83-89, nº 103, nº
126-132, nº 160-164, nº 200 y nº
201.
26. Kit para detectar la presencia o ausencia de
una cepa MRSA de tipo iv de MREJ en una muestra que comprende:
- a)
- un primer oligonucleótido que se hibrida con un extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia de tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 42-46 y nº 51 y un complemento de las mismas; y
- b)
- un segundo nucleótido que se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus;
en el que dichos oligonucleótidos a) y b)
constan de por lo menos 10 nucleótidos de longitud y permiten la
generación selectiva de un amplicón que comprende secuencias tanto
del extremo derecho del elemento SCCmec y del ADN cromosómico
contiguo a dicho extremo derecho de dicha cepa MRSA de tipo iv de
MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
27. Kit según la reivindicación 26, en el que
dicha secuencia específica del ADN cromosómico de S. aureus
es ORFx.
28. Kit según la reivindicación 26 ó 27, que
comprende además por lo menos un oligonucleótido para la detección
de por lo menos una cepa adicional de MRSA que comprende un tipo de
MREJ seleccionado de entre el grupo constituido por: tipo i de MREJ,
tipo ii de MREJ, tipo iii de MREJ, tipo v de MREJ, tipo vi de MREJ,
tipo vii de MREJ, tipo viii de MREJ y tipo ix de MREJ.
29. Kit según cualquiera de las reivindicaciones
26 a 28, en el que dicho oligonucleótido en a) se selecciona de
entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 79, nº 145, nº 147 y
nº 68.
30. Kit según cualquiera de las reivindicaciones
26 a 29, en el que dicho oligonucleótido en b) comprende una
secuencia seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC.
ID. nº 32, nº 59, nº 60-64, nº
70-76, nº 83-89, nº 103, nº
126-132, nº 160-164, nº 200 y nº
201.
31. Kit según la reivindicación 30, que
comprende un par de oligonucleótidos constituidos por las SEC ID nº
64 y nº 79.
32. Kit según la reivindicación 31, que
comprende además por lo menos una sonda seleccionada de entre el
grupo constituido por las SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº
161, nº 162, nº 163 y nº 164.
33. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 15 y 18 a 25, en el que se utiliza la PCR en
tiempo real.
34. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 26, en el que se utiliza la PCR múltiple.
35. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 25, 33 y 34 o kit según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 32, en el que dicho extremo derecho de
SCCmec de una secuencia de tipo iv de ácido nucleico de MREJ
está constituido por la SEC. ID nº 42 o un complemento de la
misma.
36. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 25, 33 y 34 o kit según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 32, en el que dicha secuencia de tipo iv de
ácido nucleico de MREJ es la SEC. ID nº 43, nº 44, nº 45, nº 46, nº
51 o un complemento de las mismas.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CA2348042 | 2001-06-04 | ||
CA002348042A CA2348042A1 (en) | 2001-06-04 | 2001-06-04 | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2223310T1 ES2223310T1 (es) | 2005-03-01 |
ES2223310T3 true ES2223310T3 (es) | 2010-03-24 |
Family
ID=4169064
Family Applications (8)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES10181536T Expired - Lifetime ES2526518T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo ix resistentes a meticilina |
ES10181533T Expired - Lifetime ES2536887T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo v resistentes a meticilina |
ES09174581T Expired - Lifetime ES2389467T3 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de staphyloccocus aureus resistente a meticilina |
ES14168420T Expired - Lifetime ES2568072T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Secuencias para la detección e identificación de Staphylococcus aureus resistente a meticilina |
ES10181534T Expired - Lifetime ES2526517T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo vi resistentes a meticilina |
ES10181535.5T Expired - Lifetime ES2526410T3 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo viii resistentes a meticilina |
ES02740158T Expired - Lifetime ES2223310T3 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Secuencias para la deteccion y la identificacion de staphyloccocus aureus resistente a la meticilina. |
ES14168417.5T Expired - Lifetime ES2567056T3 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Secuencias para la detección e identificación de Staphylococcus aureus resistentes a meticilina |
Family Applications Before (6)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES10181536T Expired - Lifetime ES2526518T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo ix resistentes a meticilina |
ES10181533T Expired - Lifetime ES2536887T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo v resistentes a meticilina |
ES09174581T Expired - Lifetime ES2389467T3 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de staphyloccocus aureus resistente a meticilina |
ES14168420T Expired - Lifetime ES2568072T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Secuencias para la detección e identificación de Staphylococcus aureus resistente a meticilina |
ES10181534T Expired - Lifetime ES2526517T5 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo vi resistentes a meticilina |
ES10181535.5T Expired - Lifetime ES2526410T3 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Métodos y secuencias para la detección e identificación de cepas de Staphylococcus aureus MREJ tipo viii resistentes a meticilina |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES14168417.5T Expired - Lifetime ES2567056T3 (es) | 2001-06-04 | 2002-06-04 | Secuencias para la detección e identificación de Staphylococcus aureus resistentes a meticilina |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (5) | US7449289B2 (es) |
EP (9) | EP2322661B2 (es) |
JP (1) | JP4579532B2 (es) |
AT (1) | ATE447623T1 (es) |
AU (6) | AU2002315592B2 (es) |
CA (7) | CA2348042A1 (es) |
DE (2) | DE02740158T1 (es) |
DK (6) | DK2322664T4 (es) |
ES (8) | ES2526518T5 (es) |
WO (1) | WO2002099034A2 (es) |
Families Citing this family (78)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7087414B2 (en) | 2000-06-06 | 2006-08-08 | Applera Corporation | Methods and devices for multiplexing amplification reactions |
US7666588B2 (en) | 2001-03-02 | 2010-02-23 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid forensic analysis of mitochondrial DNA and characterization of mitochondrial DNA heteroplasmy |
US20040121313A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of bioagents in organs for transplantation |
US7226739B2 (en) | 2001-03-02 | 2007-06-05 | Isis Pharmaceuticals, Inc | Methods for rapid detection and identification of bioagents in epidemiological and forensic investigations |
US20030027135A1 (en) | 2001-03-02 | 2003-02-06 | Ecker David J. | Method for rapid detection and identification of bioagents |
CA2348042A1 (en) | 2001-06-04 | 2002-12-04 | Ann Huletsky | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
US7217510B2 (en) | 2001-06-26 | 2007-05-15 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for providing bacterial bioagent characterizing information |
US7081339B2 (en) * | 2002-04-12 | 2006-07-25 | Primera Biosystems, Inc. | Methods for variation detection |
US8323897B2 (en) | 2002-12-04 | 2012-12-04 | Applied Biosystems, Llc | Multiplex amplification of polynucleotides |
CA2508726A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-07-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for rapid identification of pathogens in humans and animals |
US8158354B2 (en) | 2003-05-13 | 2012-04-17 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid purification of nucleic acids for subsequent analysis by mass spectrometry by solution capture |
US7964343B2 (en) | 2003-05-13 | 2011-06-21 | Ibis Biosciences, Inc. | Method for rapid purification of nucleic acids for subsequent analysis by mass spectrometry by solution capture |
US8546082B2 (en) | 2003-09-11 | 2013-10-01 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
US20120122103A1 (en) | 2003-09-11 | 2012-05-17 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of bacteria |
US8097416B2 (en) | 2003-09-11 | 2012-01-17 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
EP1529847B1 (en) * | 2003-11-07 | 2006-04-05 | Federal Rep. of Germany repr. by the Ministry of Health & Soc. Security, the latter repr. by the Pres. of the Robert Koch Ins. | Method for detecting methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) |
EP1541696A1 (en) * | 2003-12-09 | 2005-06-15 | Institut Pasteur | A DNA macro-array for staphylococcus aureus identification and typing |
US7666592B2 (en) | 2004-02-18 | 2010-02-23 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for concurrent identification and quantification of an unknown bioagent |
ES2641832T3 (es) | 2004-05-24 | 2017-11-14 | Ibis Biosciences, Inc. | Espectrometría de masas con filtración de iones selectiva por establecimiento de umbrales digitales |
US20050266411A1 (en) | 2004-05-25 | 2005-12-01 | Hofstadler Steven A | Methods for rapid forensic analysis of mitochondrial DNA |
US7811753B2 (en) | 2004-07-14 | 2010-10-12 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for repairing degraded DNA |
US20060057613A1 (en) * | 2004-07-26 | 2006-03-16 | Nanosphere, Inc. | Method for distinguishing methicillin resistant S. aureus from methicillin sensitive S. aureus in a mixed culture |
WO2006135400A2 (en) | 2004-08-24 | 2006-12-21 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for rapid identification of recombinant organisms |
US20060205040A1 (en) | 2005-03-03 | 2006-09-14 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of adventitious viruses |
US8084207B2 (en) | 2005-03-03 | 2011-12-27 | Ibis Bioscience, Inc. | Compositions for use in identification of papillomavirus |
US20060252069A1 (en) * | 2005-04-21 | 2006-11-09 | Zhang Kunyan | Pcr for mrsa sccmec typing |
US8026084B2 (en) | 2005-07-21 | 2011-09-27 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid identification and quantitation of nucleic acid variants |
US11834720B2 (en) | 2005-10-11 | 2023-12-05 | Geneohm Sciences, Inc. | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) of MREJ types xi to xx |
AU2013200217B2 (en) * | 2005-10-11 | 2016-05-12 | Becton Dickinson Infusion Therapy Systems Inc. | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) of MREJ types xi to xx |
US7838221B2 (en) * | 2005-10-11 | 2010-11-23 | Geneohm Sciences, Inc. | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) |
EP2010679A2 (en) | 2006-04-06 | 2009-01-07 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for the use in identification of fungi |
JP5346801B2 (ja) | 2006-05-12 | 2013-11-20 | セフィード | Dna組換え接合部の検出 |
EP2049688B1 (en) * | 2006-08-01 | 2018-01-24 | Applied Biosystems, LLC | Detection of analytes and nucleic acids |
US9149473B2 (en) | 2006-09-14 | 2015-10-06 | Ibis Biosciences, Inc. | Targeted whole genome amplification method for identification of pathogens |
CA2569552A1 (fr) * | 2006-11-23 | 2008-05-23 | Boreal Pharma Recherche Clinique Inc. | Methode de detection du staphylocoque dore resistant a la methicilline (sarm) |
EP2118311B1 (en) * | 2006-12-19 | 2013-07-03 | GeneOhm Sciences, Inc. | Detection of staphylococcus aureus and identification of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
CA2673958C (en) * | 2006-12-29 | 2014-04-08 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Methods for detecting methicillin-resistant s. aureus as well as primers, probes and kits for the same |
US8535888B2 (en) * | 2006-12-29 | 2013-09-17 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Compositions and methods for detecting methicillin-resistant S. aureus |
JP5680304B2 (ja) | 2007-02-23 | 2015-03-04 | アイビス バイオサイエンシズ インコーポレイティッド | 迅速な法医学的dna分析法 |
CA2684570A1 (en) | 2007-04-19 | 2008-10-30 | Molecular Detection Inc. | Methods, compositions and kits for detection and analysis of antibiotic-resistant bacteria |
EP2158334B1 (en) | 2007-05-18 | 2012-12-26 | AdvanDx, Inc. | Detection of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
WO2008151023A2 (en) | 2007-06-01 | 2008-12-11 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods and compositions for multiple displacement amplification of nucleic acids |
WO2009018000A1 (en) * | 2007-07-31 | 2009-02-05 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Detection of methicillin-resistant and methicillin-sensitive staphylococcus aureus in biological samples |
AU2008343878B2 (en) | 2007-12-21 | 2014-08-07 | bioMérieux | Detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus |
WO2010033627A2 (en) | 2008-09-16 | 2010-03-25 | Ibis Biosciences, Inc. | Sample processing units, systems, and related methods |
US8534447B2 (en) | 2008-09-16 | 2013-09-17 | Ibis Biosciences, Inc. | Microplate handling systems and related computer program products and methods |
WO2010033599A2 (en) | 2008-09-16 | 2010-03-25 | Ibis Biosciences, Inc. | Mixing cartridges, mixing stations, and related kits, systems, and methods |
EP2373813B1 (de) | 2008-12-30 | 2012-10-31 | Qiagen Hamburg GmbH | Verfahren zum nachweis methicillin-resistenter staphylococcus aureus (mrsa)-stämme |
WO2010093943A1 (en) | 2009-02-12 | 2010-08-19 | Ibis Biosciences, Inc. | Ionization probe assemblies |
US9719083B2 (en) | 2009-03-08 | 2017-08-01 | Ibis Biosciences, Inc. | Bioagent detection methods |
WO2010114842A1 (en) | 2009-03-30 | 2010-10-07 | Ibis Biosciences, Inc. | Bioagent detection systems, devices, and methods |
WO2010121298A1 (en) * | 2009-04-20 | 2010-10-28 | Human Genetic Signatures Pty Ltd | Detection of staphylococcus aureus |
US8950604B2 (en) | 2009-07-17 | 2015-02-10 | Ibis Biosciences, Inc. | Lift and mount apparatus |
EP2454000A4 (en) | 2009-07-17 | 2016-08-10 | Ibis Biosciences Inc | SYSTEMS FOR IDENTIFYING BIOLOGICAL SUBSTANCES |
US9416409B2 (en) | 2009-07-31 | 2016-08-16 | Ibis Biosciences, Inc. | Capture primers and capture sequence linked solid supports for molecular diagnostic tests |
EP3098325A1 (en) | 2009-08-06 | 2016-11-30 | Ibis Biosciences, Inc. | Non-mass determined base compositions for nucleic acid detection |
AR077840A1 (es) | 2009-08-11 | 2011-09-28 | Univ Brandeis | Ensayos de deteccion e identificacion de especies y tipos de staphylococcus |
AR077841A1 (es) * | 2009-08-11 | 2011-09-28 | Univ Brandeis | Metodos kits y composiciones de deteccion de acido nucleico a multiples temperaturas, con sonda unica |
EP2473630B1 (en) * | 2009-09-04 | 2017-11-08 | QIAGEN GmbH | Optimized probes and primers and methods of using same for the detection, screening, isolation and sequencing of vancomycin resistance genes and vancomycin resistant enterococci |
WO2012047189A2 (en) * | 2009-09-04 | 2012-04-12 | Intelligent Medical Devices, Inc. | Optimized probes and primers and methods of using same for the detection, screening, isolation and sequencing of mrsa, mssa, staphylococcus markers and the antibiotic resistance gene mec a |
EP2488656B1 (en) | 2009-10-15 | 2015-06-03 | Ibis Biosciences, Inc. | Multiple displacement amplification |
WO2011066504A1 (en) * | 2009-11-30 | 2011-06-03 | Physicians Reference Laboratory, Llc | Methods and compositions for detecting methicillin-resistant staphylococcus aureus |
US8715936B2 (en) | 2010-01-13 | 2014-05-06 | Medical Diagnostic Laboratories, Llc | Method of determining types I, II, III, IV or V or methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in a biological sample |
WO2011115840A2 (en) | 2010-03-14 | 2011-09-22 | Ibis Biosciences, Inc. | Parasite detection via endosymbiont detection |
US20120165229A1 (en) * | 2010-12-07 | 2012-06-28 | Intelligent Medical Devices, Inc. | Optimized probes and primers and methods of using same for the detection, screening, isolation and sequencing of mrsa, mssa, staphylococcus markers, and the antibiotic resistance gene mec a |
JPWO2012161117A1 (ja) * | 2011-05-20 | 2014-07-31 | 株式会社ニッピ | サイトメガロウイルスゲノム識別用プライマーセット |
CN104169437B (zh) | 2011-12-23 | 2017-07-11 | 生物梅里埃公司 | 甲氧西林抗性金黄色葡萄球菌的mecA变体菌株的检测 |
EP2617836A1 (en) * | 2012-01-23 | 2013-07-24 | Steffen Mergemeier | Method for detecting a methicillin resistant coagulase positive Staphylococcus aureus strain |
JP2015513907A (ja) * | 2012-04-06 | 2015-05-18 | ジーンオーム サイエンシーズ カナダ、インク.Geneohm Sciences Canada,Inc. | MREJタイプXXIのメチシリン耐性Staphylococcusaureus(MRSA)を検出および同定するための配列 |
US11098349B2 (en) | 2015-11-04 | 2021-08-24 | The Translational Genomics Research Institute | Systems and methods of diagnosing and characterizing infections |
US10500670B2 (en) * | 2015-11-06 | 2019-12-10 | Elco Enterprises, Inc. | Flexible wire guide system |
AU2018316218B2 (en) | 2017-08-11 | 2024-07-25 | Gen-Probe Incorporated | Compositions and methods for detecting Staphylococcus aureus |
US20200308628A1 (en) * | 2017-10-12 | 2020-10-01 | Mitsui Chemicals, Inc. | mecA GENE AMPLIFICATION PRIMER PAIR, mecA GENE DETECTION KIT AND mecA GENE DETECTION METHOD |
WO2019118550A1 (en) | 2017-12-13 | 2019-06-20 | Gen-Probe Incorporated | Methods for biological sample processing |
CN110579390B (zh) * | 2019-09-30 | 2021-12-21 | 河南乾坤路桥工程有限公司 | 一种混凝土施工中预埋钢管安全性能测试装置及测试方法 |
CN114867871A (zh) | 2019-12-27 | 2022-08-05 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 用于检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的组合物和方法 |
WO2023089186A1 (en) | 2021-11-22 | 2023-05-25 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Compositions and methods for detecting vana and/or vanb genes associated with multidrug resistance |
EP4289972A1 (en) | 2022-06-09 | 2023-12-13 | Congen Biotechnologie GmbH | Method for detecting methicillin resistant staphylococcus aureus |
Family Cites Families (128)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US306163A (en) | 1884-10-07 | Sule compact | ||
US4458066A (en) | 1980-02-29 | 1984-07-03 | University Patents, Inc. | Process for preparing polynucleotides |
US4683195A (en) * | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US4683202A (en) * | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US5272236A (en) | 1991-10-15 | 1993-12-21 | The Dow Chemical Company | Elastic substantially linear olefin polymers |
US5210015A (en) | 1990-08-06 | 1993-05-11 | Hoffman-La Roche Inc. | Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase |
AU8495291A (en) | 1990-09-14 | 1992-04-15 | Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha | Method of detecting mesitylene-cephem-resistant staphylococcus aureus |
KR100236506B1 (ko) | 1990-11-29 | 2000-01-15 | 퍼킨-엘머시터스인스트루먼츠 | 폴리머라제 연쇄 반응 수행 장치 |
US5455166A (en) | 1991-01-31 | 1995-10-03 | Becton, Dickinson And Company | Strand displacement amplification |
CA2218875C (en) | 1991-07-23 | 2000-11-07 | The Research Foundation Of State University Of New York | Improvements in the in situ pcr |
JPH0549477A (ja) | 1991-08-05 | 1993-03-02 | Wakunaga Pharmaceut Co Ltd | スタフイロコツカス属細菌類の検出 |
CA2075423A1 (en) | 1991-08-13 | 1993-02-14 | Paul Luther Skatrud | Rapid method for detection of methicillin resistant staphylococci |
US5783638A (en) | 1991-10-15 | 1998-07-21 | The Dow Chemical Company | Elastic substantially linear ethylene polymers |
DE4338119A1 (de) | 1993-11-08 | 1995-05-11 | Bayer Ag | Spezifische Gensonden und Verfahren zum quantitativen Nachweis von methicillinresistenten Staphylococcen |
US5496706A (en) * | 1993-12-17 | 1996-03-05 | Helsinki University Licensing, Ltd. | Methods and materials for the detection of Staphylococcus aureus |
US6090592A (en) * | 1994-08-03 | 2000-07-18 | Mosaic Technologies, Inc. | Method for performing amplification of nucleic acid on supports |
US5681702A (en) * | 1994-08-30 | 1997-10-28 | Chiron Corporation | Reduction of nonspecific hybridization by using novel base-pairing schemes |
US6001564A (en) | 1994-09-12 | 1999-12-14 | Infectio Diagnostic, Inc. | Species specific and universal DNA probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial pathogens and associated antibiotic resistance genes from clinical specimens for routine diagnosis in microbiology laboratories |
US20020055101A1 (en) | 1995-09-11 | 2002-05-09 | Michel G. Bergeron | Specific and universal probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial pathogens and antibiotic resistance genes from clinical specimens for routine diagnosis in microbiology laboratories |
US5702895A (en) * | 1995-01-19 | 1997-12-30 | Wakunaga Seiyaku Kabushiki Kaisha | Method and kit for detecting methicillin-resistant Staphylococcus aureus |
US6271351B1 (en) | 1995-03-23 | 2001-08-07 | Biopure Corporation | Method for preserving a hemoglobin blood substitute |
US5994066A (en) | 1995-09-11 | 1999-11-30 | Infectio Diagnostic, Inc. | Species-specific and universal DNA probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial pathogens and associated antibiotic resistance genes from clinical specimens for routine diagnosis in microbiology laboratories |
US6833253B2 (en) | 1996-01-05 | 2004-12-21 | Human Genome Sciences, Inc. | Staphylococcus aureus polynucleotides and polypeptides |
US6737248B2 (en) | 1996-01-05 | 2004-05-18 | Human Genome Sciences, Inc. | Staphylococcus aureus polynucleotides and sequences |
WO2001016292A2 (en) | 1999-09-01 | 2001-03-08 | Human Genome Sciences, Inc. | 37 staphylococcus aureus genes and polypeptides |
US5612473A (en) | 1996-01-16 | 1997-03-18 | Gull Laboratories | Methods, kits and solutions for preparing sample material for nucleic acid amplification |
JP3957338B2 (ja) | 1996-02-23 | 2007-08-15 | 株式会社カイノス | 診断薬 |
US6117635A (en) * | 1996-07-16 | 2000-09-12 | Intergen Company | Nucleic acid amplification oligonucleotides with molecular energy transfer labels and methods based thereon |
CA2283458A1 (en) | 1999-09-28 | 2001-03-28 | Michel G. Bergeron | Highly conserved genes and their use to generate species-specific, genus-specific, family-specific, group-specific and universal nucleic acid probes and amplification primers to rapidly detect and identify bacterial, fungal and parasitical pathogens from clinical specimens for diagnosis |
AU775763B2 (en) | 1996-11-04 | 2004-08-12 | Infectio Diagnostic (I.D.I.) Inc. | Species-specific, genus-specific and universal DNA probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial and fungal pathogens and associated antibiotic resistance genes from clinical specimens for diagnosis in microbiology laboratories |
US20030049636A1 (en) | 1999-05-03 | 2003-03-13 | Bergeron Michel G. | Species-specific, genus-specific and universal DNA probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial and fungal pathogens and associated antibiotic resistance genes from clinical specimens for diagnosis in microbiology laboratories |
US20100267012A1 (en) | 1997-11-04 | 2010-10-21 | Bergeron Michel G | Highly conserved genes and their use to generate probes and primers for detection of microorganisms |
US5866366A (en) * | 1997-07-01 | 1999-02-02 | Smithkline Beecham Corporation | gidB |
US6380370B1 (en) * | 1997-08-14 | 2002-04-30 | Genome Therapeutics Corporation | Nucleic acid and amino acid sequences relating to Staphylococcus epidermidis for diagnostics and therapeutics |
JPH1156371A (ja) * | 1997-08-22 | 1999-03-02 | Kainosu:Kk | 同定方法 |
US6083587A (en) | 1997-09-22 | 2000-07-04 | Baxter International Inc. | Multilayered polymer structure for medical products |
JP3042612B2 (ja) * | 1997-09-30 | 2000-05-15 | 日本電気株式会社 | 磁気抵抗ヘッドの孤立再生波形規定方法、及びこれを用いた磁気ディスク装置 |
GB9805918D0 (en) * | 1998-03-19 | 1998-05-13 | Nycomed Amersham Plc | Sequencing by hybridisation |
US6117986A (en) * | 1998-06-10 | 2000-09-12 | Intergen Company, L.P. | Pyrimidines linked to a quencher |
EP2322666A3 (en) | 1999-09-28 | 2011-08-10 | Geneohm Sciences Canada, Inc. | Highly conserved gene and its use to generate species-specific, genus-specific, family-specific, group-specific and universal nucleic acid probes for microorganisms. |
US7829313B2 (en) | 2000-03-24 | 2010-11-09 | Eppendorf Array Technologies | Identification and quantification of a plurality of biological (micro)organisms or their components |
US20100099860A1 (en) | 2000-03-24 | 2010-04-22 | Remacle Jose | Capture molecules for the detection of amplicons with high sensitivity |
US7875442B2 (en) | 2000-03-24 | 2011-01-25 | Eppendorf Array Technologies | Identification and quantification of a plurality of biological (micro)organisms or their components |
US20080085515A1 (en) | 2000-03-24 | 2008-04-10 | Eppendorf Array Technologies Sa (Eat) | Identification of multiple biological (micro) organisms by detection of their nucleotide sequences on arrays |
EP1136566A1 (en) | 2000-03-24 | 2001-09-26 | Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix | Method and kit for detection and/or quantification of homologus nucleotide sequences on arrays |
US7202026B2 (en) | 2000-03-24 | 2007-04-10 | Eppendorf Array Technologies Sa (Eat) | Identification of a large number of biological (micro)organisms groups at different levels by their detection on a same array |
US7205104B2 (en) | 2000-03-24 | 2007-04-17 | Eppendorf Array Technologies Sa (Eat) | Identification of biological (micro) organisms by detection of their homologous nucleotide sequences on arrays |
US20070298423A1 (en) | 2000-03-24 | 2007-12-27 | Eppendorf Array Technologies Sa (Eat) | Identification of multiple biological (micro) organisms by specific amplification and detection of their nucleotide sequences on arrays |
US20060281112A1 (en) | 2000-03-24 | 2006-12-14 | Jose Remacle | Design of capture molecules for the detection of amplicons with high sensitivity |
US8288128B2 (en) | 2004-11-18 | 2012-10-16 | Eppendorf Array Technologies S.A. | Real-time quantification of multiple targets on a micro-array |
DE10051174A1 (de) | 2000-10-16 | 2002-05-02 | Microdiagnostics Ag | Verfahren zum Nachweis von Staphylokokken und dazu geeignete Mittel |
US20040121314A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of bioagents in containers |
US7666588B2 (en) | 2001-03-02 | 2010-02-23 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid forensic analysis of mitochondrial DNA and characterization of mitochondrial DNA heteroplasmy |
US7718354B2 (en) | 2001-03-02 | 2010-05-18 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid identification of pathogens in humans and animals |
US20030027135A1 (en) | 2001-03-02 | 2003-02-06 | Ecker David J. | Method for rapid detection and identification of bioagents |
US20040121310A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of bioagents in forensic studies |
US7226739B2 (en) | 2001-03-02 | 2007-06-05 | Isis Pharmaceuticals, Inc | Methods for rapid detection and identification of bioagents in epidemiological and forensic investigations |
US20040121313A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of bioagents in organs for transplantation |
US7955796B2 (en) | 2001-03-15 | 2011-06-07 | Jacques Schrenzel | Method for the direct detection of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
CA2348042A1 (en) | 2001-06-04 | 2002-12-04 | Ann Huletsky | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
KR100439532B1 (ko) | 2001-07-03 | 2004-07-09 | 주식회사 코메드 | 포도상구균 균종의 항생제 내성의 신속 검출을 위한멀티플렉스 pcr |
FR2829500B1 (fr) | 2001-09-13 | 2003-12-12 | Hemosystem | Procede de concentration et de detection de germes pathogenes a partir de produits sanguins et/ou de leurs derives et dispositif pour le mettre en oeuvre |
US7399590B2 (en) | 2002-02-21 | 2008-07-15 | Asm Scientific, Inc. | Recombinase polymerase amplification |
US20050115903A1 (en) | 2002-04-09 | 2005-06-02 | Genesystems | Method and apparatus for extracting nucleic acids from a complex mixture |
US20040110138A1 (en) | 2002-11-01 | 2004-06-10 | University Of Ottawa | Method for the detection of multiple genetic targets |
CA2508726A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-07-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for rapid identification of pathogens in humans and animals |
EP1579002B1 (en) | 2002-12-13 | 2014-02-12 | Geneohm Sciences Canada, Inc. | Methods to verify the efficiency of sample preparation and nucleic acid amplification and/or detection |
US20040185438A1 (en) | 2003-03-10 | 2004-09-23 | Ecker David J. | Methods of detection and notification of bioagent contamination |
US20070031850A1 (en) | 2003-06-05 | 2007-02-08 | Mounts William M | Nucleic acid arrays for detecting multiple strains of a non-viral species |
US7205111B2 (en) | 2003-07-24 | 2007-04-17 | Marshfield Clinic | Rapid identification of bacteria from positive blood cultures |
DE10339609A1 (de) | 2003-08-28 | 2005-03-24 | Forschungszentrum Karlsruhe Gmbh | Oligonukleotid, Verfahren und System zur Detektion von Antibiotikaresistenz-vermittelnden Genen in Mikroorganismen mittels der Echtzeit-PCR |
US20120122103A1 (en) | 2003-09-11 | 2012-05-17 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of bacteria |
US20060240412A1 (en) | 2003-09-11 | 2006-10-26 | Hall Thomas A | Compositions for use in identification of adenoviruses |
US20100129811A1 (en) | 2003-09-11 | 2010-05-27 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of pseudomonas aeruginosa |
US20080138808A1 (en) | 2003-09-11 | 2008-06-12 | Hall Thomas A | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
US20100035239A1 (en) | 2003-09-11 | 2010-02-11 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of bacteria |
US20080146455A1 (en) | 2003-09-11 | 2008-06-19 | Hall Thomas A | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
US8546082B2 (en) | 2003-09-11 | 2013-10-01 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
US8097416B2 (en) | 2003-09-11 | 2012-01-17 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
EP1529847B1 (en) | 2003-11-07 | 2006-04-05 | Federal Rep. of Germany repr. by the Ministry of Health & Soc. Security, the latter repr. by the Pres. of the Robert Koch Ins. | Method for detecting methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) |
EP1541696A1 (en) | 2003-12-09 | 2005-06-15 | Institut Pasteur | A DNA macro-array for staphylococcus aureus identification and typing |
CA2560521C (en) | 2004-02-18 | 2012-01-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of bacteria |
US7666592B2 (en) | 2004-02-18 | 2010-02-23 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for concurrent identification and quantification of an unknown bioagent |
CA2562517A1 (en) | 2004-04-16 | 2005-10-27 | Spartan Bioscience Inc. | System for rapid nucleic acid amplification and detection |
US20060057613A1 (en) | 2004-07-26 | 2006-03-16 | Nanosphere, Inc. | Method for distinguishing methicillin resistant S. aureus from methicillin sensitive S. aureus in a mixed culture |
WO2006135400A2 (en) | 2004-08-24 | 2006-12-21 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for rapid identification of recombinant organisms |
EP1812594B1 (en) | 2004-11-18 | 2013-01-09 | Eppendorf Array Technologies | Real-time quantification of multiple targets on a micro-array |
EP1659183A1 (en) | 2004-11-18 | 2006-05-24 | Eppendorf Array Technologies | Real-time quantification of multiple targets on a micro-array |
JP2006271370A (ja) | 2005-03-02 | 2006-10-12 | Kitasato Inst:The | 黄色ブドウ球菌とメチシリン耐性菌の検出方法及びキット |
US8084207B2 (en) | 2005-03-03 | 2011-12-27 | Ibis Bioscience, Inc. | Compositions for use in identification of papillomavirus |
US20060205040A1 (en) | 2005-03-03 | 2006-09-14 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of adventitious viruses |
CA2605021A1 (en) | 2005-04-13 | 2007-08-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of adenoviruses |
WO2006116127A2 (en) | 2005-04-21 | 2006-11-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of bacteria |
US20060252069A1 (en) | 2005-04-21 | 2006-11-09 | Zhang Kunyan | Pcr for mrsa sccmec typing |
MY141881A (en) | 2005-06-29 | 2010-07-16 | Univ Malaya | Method and kit for detecting methicillin-resistant staphylococcus aureus |
AU2012247038B2 (en) | 2005-07-25 | 2013-09-19 | Abbott Diagnostics Scarborough, Inc. | Methods for Multiplexing Recombinase Polymerase Amplification |
EP2829615B1 (en) | 2005-07-25 | 2018-05-09 | Alere San Diego, Inc. | Kit for multiplexing recombinase polymerase amplification |
CN101248190A (zh) | 2005-08-26 | 2008-08-20 | 皇家飞利浦电子股份有限公司 | 检测微生物和抗生素抗性标记物的方法及其中所用的核酸寡核苷酸 |
US7838221B2 (en) | 2005-10-11 | 2010-11-23 | Geneohm Sciences, Inc. | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) |
US11834720B2 (en) * | 2005-10-11 | 2023-12-05 | Geneohm Sciences, Inc. | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) of MREJ types xi to xx |
DE602006021269D1 (de) | 2005-11-18 | 2011-05-26 | Eppendorf Array Tech Sa | Reaktionsgefäss zur Real-time PCR umfassend Oligonukleotidproben wobei die Amplifikationsprodukte durch Hybridisierung und ohne Öffnen des Reaktionsgefässes gemessen werden |
JP2009519010A (ja) | 2005-11-28 | 2009-05-14 | アイビス バイオサイエンシズ インコーポレイティッド | 外来混入ウイルスの同定に使用するための組成物 |
EP1997886B1 (en) | 2006-02-21 | 2013-06-05 | National University Corporation University of Toyama | Rapid method for identifying causative microorganism of infectious disease |
US8900828B2 (en) | 2006-05-01 | 2014-12-02 | Cepheid | Methods and apparatus for sequential amplification reactions |
JP5346801B2 (ja) | 2006-05-12 | 2013-11-20 | セフィード | Dna組換え接合部の検出 |
EP2041301B1 (en) | 2006-05-17 | 2014-12-31 | Eppendorf Array Technologies SA | Identification and quantification of a plurality of biological (micro)organisms or their components |
WO2007132001A1 (en) | 2006-05-17 | 2007-11-22 | Eppendorf Array Technologies S.A. | Design of capture molecules for the detection of amplicons with high sensitivity |
EP2035142B1 (en) | 2006-05-17 | 2011-09-21 | Eppendorf Array Technologies SA | Lid for pcr vessel comprising probes permitting pcr amplification and detection of the pcr product by hybridisation without opening the pcr vessel |
EP1903116A1 (en) | 2006-09-01 | 2008-03-26 | Bundesrepublik Deutschland vertr. d. d. Bundes- ministerium für Gesundheit und Soziale Sicherung letztvertr. d.d. Präs. d. Robert Koch Instituts | Supplementation of sequence based typing of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) by PCR-based grouping of SCCmec-elements; sequencing directly from the multiplex-PCR |
US9149473B2 (en) | 2006-09-14 | 2015-10-06 | Ibis Biosciences, Inc. | Targeted whole genome amplification method for identification of pathogens |
CA2569552A1 (fr) | 2006-11-23 | 2008-05-23 | Boreal Pharma Recherche Clinique Inc. | Methode de detection du staphylocoque dore resistant a la methicilline (sarm) |
EP2118311B1 (en) | 2006-12-19 | 2013-07-03 | GeneOhm Sciences, Inc. | Detection of staphylococcus aureus and identification of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
CA2673958C (en) | 2006-12-29 | 2014-04-08 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Methods for detecting methicillin-resistant s. aureus as well as primers, probes and kits for the same |
US8535888B2 (en) | 2006-12-29 | 2013-09-17 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Compositions and methods for detecting methicillin-resistant S. aureus |
WO2008118809A1 (en) | 2007-03-23 | 2008-10-02 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of mixed populations of bioagents |
CA2684570A1 (en) * | 2007-04-19 | 2008-10-30 | Molecular Detection Inc. | Methods, compositions and kits for detection and analysis of antibiotic-resistant bacteria |
WO2009037575A2 (en) | 2007-04-19 | 2009-03-26 | Uti Limited Partnership | Multiplex pcr assay for identification of usa300 and usa400 community-associated methicillin resistant staphylococcal aureus strains |
WO2009018000A1 (en) | 2007-07-31 | 2009-02-05 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Detection of methicillin-resistant and methicillin-sensitive staphylococcus aureus in biological samples |
WO2009049007A2 (en) | 2007-10-10 | 2009-04-16 | Magellan Biosciences, Inc. | Compositions, methods and systems for rapid identification of pathogenic nucleic acids |
US20100304366A1 (en) | 2007-11-13 | 2010-12-02 | Wu Ling-Chuan Chen | Methods for Determining Virulence and Invasiveness Among Various Staphylococcus Aureus Strains |
EP2238264B1 (en) | 2007-12-21 | 2012-08-01 | Gen-Probe Incorporated | Detection of antibiotic-resistant microorganisms |
AU2008343878B2 (en) | 2007-12-21 | 2014-08-07 | bioMérieux | Detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus |
EP2235216A4 (en) | 2007-12-26 | 2011-04-06 | Zeus Scientific Inc | METHODS AND COMPOSITIONS USING DIAGNOSIS KITS FOR THE DETECTION OF METHICILLINL RESISTANT STAPHYLOCOCCUS AUREUS BACTERIA IN SAMPLES |
FI121884B (fi) | 2008-01-17 | 2011-05-31 | Mobidiag Oy | Menetelmä metisilliiniresistenttien stafylokokkien havaitsemiseksi ja tunnistamiseksi sekä menetelmään tarkoitettu koetin ja testipakkaus |
CA2717244A1 (en) | 2008-03-03 | 2009-09-11 | Saitama Medical University | Method of distinguishing inflammatory pathogen causing acute respiratory infection |
US8265848B2 (en) | 2009-01-06 | 2012-09-11 | GM Global Technology Operations LLC | Method and apparatus for adapting minimum torque converter slip for neutral idle control |
US20130059290A1 (en) | 2009-09-25 | 2013-03-07 | Alere San Diego, Inc. | Detection of nucleic acids in crude matrices |
JP2015513907A (ja) | 2012-04-06 | 2015-05-18 | ジーンオーム サイエンシーズ カナダ、インク.Geneohm Sciences Canada,Inc. | MREJタイプXXIのメチシリン耐性Staphylococcusaureus(MRSA)を検出および同定するための配列 |
-
2001
- 2001-06-04 CA CA002348042A patent/CA2348042A1/en not_active Abandoned
-
2002
- 2002-06-04 CA CA2997303A patent/CA2997303C/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 EP EP10181536.3A patent/EP2322661B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 CA CA2735990A patent/CA2735990C/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 DK DK10181534.8T patent/DK2322664T4/da active
- 2002-06-04 DK DK10181535.5T patent/DK2322655T3/en active
- 2002-06-04 CA CA2899816A patent/CA2899816C/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 EP EP10181534.8A patent/EP2322664B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 ES ES10181536T patent/ES2526518T5/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 DK DK10181533.0T patent/DK2322663T4/da active
- 2002-06-04 CA CA3103122A patent/CA3103122A1/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 AT AT02740158T patent/ATE447623T1/de not_active IP Right Cessation
- 2002-06-04 ES ES10181533T patent/ES2536887T5/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 ES ES09174581T patent/ES2389467T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 EP EP02740158A patent/EP1397510B1/en not_active Revoked
- 2002-06-04 US US10/479,674 patent/US7449289B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 EP EP14168417.5A patent/EP2781603B1/en not_active Revoked
- 2002-06-04 EP EP15195621.6A patent/EP3064593A1/en not_active Withdrawn
- 2002-06-04 DE DE02740158T patent/DE02740158T1/de active Pending
- 2002-06-04 AU AU2002315592A patent/AU2002315592B2/en not_active Expired
- 2002-06-04 DE DE60234256T patent/DE60234256D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 ES ES14168420T patent/ES2568072T5/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 DK DK02740158.7T patent/DK1397510T3/da active
- 2002-06-04 ES ES10181534T patent/ES2526517T5/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 EP EP14168420.9A patent/EP2781604B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 ES ES10181535.5T patent/ES2526410T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 CA CA2448975A patent/CA2448975C/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 JP JP2003502144A patent/JP4579532B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 EP EP09174581A patent/EP2236621B1/en not_active Revoked
- 2002-06-04 ES ES02740158T patent/ES2223310T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 DK DK10181536.3T patent/DK2322661T4/da active
- 2002-06-04 CA CA2874274A patent/CA2874274C/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 ES ES14168417.5T patent/ES2567056T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 EP EP10181535.5A patent/EP2322655B1/en not_active Revoked
- 2002-06-04 WO PCT/CA2002/000824 patent/WO2002099034A2/en active Application Filing
- 2002-06-04 EP EP10181533.0A patent/EP2322663B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-06-04 DK DK09174581.0T patent/DK2236621T3/da active
-
2006
- 2006-05-02 US US11/416,500 patent/US9777335B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2008
- 2008-03-20 AU AU2008201307A patent/AU2008201307C1/en not_active Expired
-
2010
- 2010-12-08 AU AU2010249229A patent/AU2010249229B2/en not_active Expired
-
2011
- 2011-05-23 AU AU2011202390A patent/AU2011202390B2/en not_active Expired
- 2011-05-23 AU AU2011202389A patent/AU2011202389B2/en not_active Expired
- 2011-05-23 AU AU2011202388A patent/AU2011202388B2/en not_active Expired
-
2017
- 2017-09-18 US US15/707,421 patent/US10577664B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2019
- 2019-09-11 US US16/568,156 patent/US10801074B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2020
- 2020-10-09 US US17/067,524 patent/US20210230672A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2223310T3 (es) | Secuencias para la deteccion y la identificacion de staphyloccocus aureus resistente a la meticilina. | |
AU2002315592A1 (en) | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphyloccocus aureus |