ES2223310T3 - Secuencias para la deteccion y la identificacion de staphyloccocus aureus resistente a la meticilina. - Google Patents

Secuencias para la deteccion y la identificacion de staphyloccocus aureus resistente a la meticilina. Download PDF

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Abstract

Un método para detectar la presencia de una cepa de Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) en una muestra, dicha cepa de MRSA siendo resistente debido a la presencia de un inserto SCCmec conteniendo un gen mecA, dicho SCCmec estando insertado en ácidos nucleicos bacterianos generando por lo tanto un punto de unión en el extremo derecho polimórfico (MREJ), dicho método comprende el paso de hibridación de los ácidos nucleicos de la muestra con varias sondas y/o cebadores, caracterizados, por: (i) dichos cebadores y/o sondas son específicos para cepas MRSA y son capaces de hibridarse con ácidos nucleicos MREJ polimórficos, dichos MREJ polimórficos comprendiendo los MREJ de tipos i,a,x; y (ii) dichos cebadores y/o sondas en conjunto pueden hibridar con al menos cuatro tipos de MREJ seleccionados de MREJ tipos de i,a,x.

Description

Secuencias para la detección y la identificación de Staphyloccocus aureus resistente a la meticilina.
Antecedentes de la invención Significado clínico de Staphylococcus aureus
La especie Staphylococcus aureus positiva a la coagulasa está muy documentada como patógeno oportunista humano. Las infecciones intrahospitalarias ocasionadas por S. aureus son una causa principal de morbomortalidad. Algunas de las infecciones más frecuentes ocasionadas por S. aureus afectan a la piel, e incluyen forúnculos o diviesos, celulitis, impétigo e infecciones de heridas posoperatorias. Algunas de las infecciones más graves producidas por S. aureus son la bacteremia, neumonía, osteomielitis, endocarditis aguda, miocarditis, pericarditis, cerebritis, meningitis, necrólisis epidérmica tóxica y varios abscesos. El envenenamiento por alimentos mediado por enterotoxinas estafilocócicas es otro síndrome importante asociado a S. aureus. El síndrome del choque tóxico, una enfermedad adquirida en la comunidad, se ha atribuido también a la infección o colonización con S. aureus toxígeno (Murray et al. Eds, 1999, Manual of Clinical Microbiology, 7ª Ed., ASM Press, Washington, D.C.).
S. aureus resistente a la meticilina (MRSA) apareció en la década de 1980 como un problema clínico y epidemiológico principal en los hospitales. Los MRSA son resistentes a todas las \beta-lactamas incluyendo las penicilinas, cefalosporinas, carbapenemos y monobactamos, que son los antibióticos usados más frecuentemente para curar las infecciones por S. aureus. Las infecciones por MRSA pueden tratarse solamente con los antibióticos más tóxicos y más costosos, que son utilizados normalmente como la última línea de defensa. Como el MRSA puede propagarse fácilmente de paciente a paciente a través del personal, los hospitales en todo el mundo están haciendo frente al problema para controlar el MRSA. Por consiguiente, existe una necesidad de desarrollar pruebas rápidas y sencillas de identificación o de diagnóstico para la detección y/o identificación del MRSA destinadas a reducir su diseminación y mejorar el diagnóstico y el tratamiento de los pacientes infectados.
La resistencia a la penicilina en el S. aureus es única porque se debe a la adquisición del ADN procedente de otros estafilococos negativos a la coagulasa (CNS), que codifican una proteína que se une a la penicilina (PBP) resistente a \beta-lactama suplementaria, que adquiere las funciones biosintéticas de las PBP normales cuando la célula se expone a antibióticos con \beta-lactama. S. aureus normalmente contiene cuatro PBP, de los cuales 1, 2 y 3 PBP son esenciales. La PBP de baja afinidad en MRSA, denominada PBP 2a (o PBP 2'), está codificada por el gen mecA cromosómico y funciona como una transpeptidasa resistente a \beta-lactama. El gen mecA está ausente en S. aureus sensible a la meticilina pero está ampliamente distribuido entre otras especie de estafilococos y está muy conservado (Ubukata et al., 1990, Antimicrob. Agents Chemother. 34:170-172).
Mediante la determinación de la secuencia nucleotídica de la zona del ADN que rodea al gen mecA de la cepa N315 de S. aureus (aislada en Japón en 1982), Hiramatsu et al. han descubierto que el gen mecA es transportado por un nuevo elemento genético, denominado cromosoma mec de la casete estafilocócica (SCCmec), insertado en el cromosoma. SCCmec es un elemento genético móvil caracterizado por la presencia del terminal invertido y de repeticiones directas, una serie de genes de recombinasa específica para el sitio (ccrA y ccrB), y el complejo génico mecA (Ito et al., 1999, Antimicrob. Agents Chemother. 43:1449-1458; Katayama et al., 2000, Antimicrob. Agents Chemother. 43:1549-1555). El elemento se escinde exactamente en el cromosoma de la cepa N315 de S. aureus y se integra en una secuencia cromosómica específica de S. aureus en la misma orientación a través de la función de una única serie de genes de recombinasa que comprende ccrA y ccrB. Se descubrieron dos elementos genéticos nuevos que compartían propiedades estructurales similares de SCCmec clonando y secuenciando la zona del ADN que rodea al gen mecA de las cepas NCTC 10442 del MRSA (la primera cepa de MRSA se aisló en Inglaterra en 1961) y 85/2082 (una cepa procedente de Nueva Zelanda aislada en 1985). Las tres SCCmec se han denominado tipo I (NCTC 10442), tipo II (N315) y tipo III (85/2082) haciendo referencia al año de aislamiento de las cepas (Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother. 45:1323-1336) (Figura 1). Hiramatsu et al. han descubierto que los ADN del SCCmec están integrados a un sitio específico en el cromosoma de S. aureus sensible a la meticilina (MSSA). En el contexto de la presente invención se caracterizaron las secuencias nucleotídicas de las zonas alrededor de los límites izquierdo y derecho del ADN de SCCmec (es decir attL y attR, respectivamente) así como a los de las zonas alrededor de la secuencia de integración del ADN de SCCmec (es decir attBscc que es la secuencia de acoplamiento del cromosoma bacteriano para el ADN del SCCmec). La secuencia attBscc se situó en el extremo 3' de un nuevo marco de lectura abierto (ORF), orfX. El orfX codifica potencialmente una identidad que comparte polipéptidos de 159 aminoácidos con algunos polipéptidos identificados anteriormente, pero de función desconocida (Ito et al., 1999, Antimicrob. Agents Chemother. 43:1449-1458). Recientemente, un nuevo tipo de SCCmec (tipo IV) se ha sido descrito tanto por Hiramatsu et al. (Ma et al, 2002, Antimicrob. Agents Chemother. 46:1147-1152) como por Oliveira et al. (Oliveira et al, 2001, Microb. Drug Resist. 7:349-360). Las secuencias del extremo derecho del nuevo SCCmec de tipo IV procedente de las cepas CA05 y 8/6-3P de S. aureus publicada por Hiramatsu et al. (Ma et al, 2002, Antimicrob. Agents Chemother. 46:1147-1152) fueron casi idénticos en 2000 nucleótidos a las SCCmec de tipo II de la cepa N315 de S. aureus (Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother. 45:1323-1336). Ninguna secuencia en el extremo derecho del SCCmec de tipo IV está disponible de las cepas HDE288 y PL72 de S. aureus descritas por Oliveira et al. (Oliveira et al, 2001, Microb. Drug Resist. 7:349-360).
\newpage
Los métodos anteriores utilizados para detectar e identificar MRSA (Saito et al., 1995, J. Clin. Microbiol. 33:2498-2500; Ubukata et al., 1992, J. Clin. Microbiol. 30:1728-1733; Murakami et al., 1991, J. Clin. Microbiol. 29:2240-2244; Hiramatsu et al., 1992, Microbiol. Inmunol. 36:445-453), que se basan en la detección del gen mecA y las secuencias cromosómicas específicas de S. aureus, encontraron dificultad en discriminar el MRSA de los estafilococos negativos a coagulasa (CNS) resistentes a la meticilina porque el gen mecA está ampliamente distribuido tanto en las especies de S. aureus como de CNS (Suzuki et al., 1992, Antimicrob. Agents Chemother. 36:429-434). Hiramatsu et al. (patente US nº 6.156.507) han descrito un ensayo de PCR específico para MRSA utilizando cebadores que pueden hibridarse específicamente a los extremos derechos de los 3 tipos de ADN de SCCmec en combinación con un cebador específico para el cromosoma de S. aureus, que corresponde a la secuencia nucleotídica en el lado derecho de la secuencia de integración SCCmec. Como las secuencias nucleotídicas que rodean la secuencia de integración SCCmec en otras especies estafilocócicas (tales como S. epidermidis y S. haemolyticus) son diferentes de las encontradas en S. aureus, este ensayo de PCR era específico para la detección del MRSA. Este ensayo de PCR suministró también información para el tipado de MREP (posición para el "polimorfismo con el extremo derecho mec") del ADN con SCCmec (Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother. 45:1323-1336; Hiramatsu et al., 1996, J. Infect. Chemother. 2:117-129). Este procedimiento de tipado se aprovecha del polimorfismo en el extremo derecho de los ADN con SCCmec adyacentes a la secuencia de integración entre los tres tipos de SCCmec. El tipo III tiene una sola secuencia nucleotídica mientras que el tipo II tiene una inserción de 102 nucleótidos en el terminal derecho del tipo L de SCCmec. El método de tipado de MREP descrito por Hiramatsu et al. (Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother. 45:1323-1336; Hiramatsu et al., 1996, J. Infect. Chemother. 2:117-129) define el tipo I de SCCmec como tipo i de MREP, tipo II de SCCmec como tipo ii de MREP y tipo III de SCCmec como tipo iii de MREP. Debe observarse que el método de tipado de MREP no puede diferenciar el nuevo SCCmec de tipo IV descrito por Hiramatsu et al. (Ma et al, 2002, Antimicrob. Agents Chemother. 46:1147-1152) del tipo II de SCCmec porque estos dos tipos de SCCmec presentan la misma secuencia nucleotídica en el extremo derecho.
El conjunto de cebadores descrito por Hiramatsu et al. que es la combinación óptima de cebadores (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60, respectivamente, en la presente invención) se ha utilizado en la presente invención para analizar por PCR una variedad de cepas de MRSA y de MSSA (Figura 1 y Tabla 1). Veinte de las 39 cepas de MRSA analizadas no se ampliaron por el ensayo de PCR multiplex de Hiramatsu et al. (Tablas 2 y 3). El método de Hiramatsu de hecho tuvo éxito en detectar menos del 50% de las 39 cepas de MRSA analizadas. Este descubrimiento demuestra que algunas cepas de MRSA tienen secuencias en el extremo derecho de la unión del extremo derecho del SCCmec del cromosoma diferente de las identificadas por Hiramatsu et al. Por consiguiente, el sistema desarrollado por Hiramatsu et al. no permite la detección de todas los MRSA. La presente invención se refiere a la generación de los datos de la secuencia de unión del extremo derecho del SCCmec del cromosoma requeridos para detectar más cepas de MRSA con objeto de mejorar el ensayo de Hiramatsu et al. Hay necesidad de desarrollar más cebadores y sondas omnipresentes para la detección de la mayoría de las cepas de MRSA en todo el mundo.
Sumario de la invención
Un objetivo de la presente invención consiste en proporcionar un procedimiento específico, omnipresente y sensible que utiliza sondas y/o cebadores de ampliación para determinar la presencia y/o la cantidad de ácidos nucleicos de todas las cepas de MRSA.
La ubicuidad de por lo menos el 50% entre las cepas que representan las cepas de MRSA de los tipo IV a X es un objetivo de la presente invención.
Por consiguiente, según la presente invención se proporciona un procedimiento para detectar la presencia o ausencia de una cepa de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA) en una muestra que comprende
a)
poner en contacto una muestra en la que ha de analizarse la presencia o ausencia de dicha cepa MRSA, incluyendo dicha cepa de MRSA un elemento mec del cromosoma del casete estafilocócico (SCCmec) que contiene un gen mecA insertado en el ADN cromosómico, generando de este modo una secuencia de tipo iv en la unión en el extremo derecho polimórfico (MREJ) que comprende secuencias tanto del extremo derecho del elemento SCCmec como del ADN cromosómico adjuntando dicho extremo derecho con un primer cebador y un segundo cebador,
en el que dichos primer y segundo cebadores son por lo menos de 10 nucleótidos de longitud, y
i)
en el que dicho primer cebador se hibrida con dicho extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia de tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por: SEC. ID nº 42 a nº 46 y nº 51 y los complementos de las mismas, y
ii)
en la que dicho primer cebador se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus para generar específicamente un amplicón si dicha cepa MRSA está presente en dicha muestra; y
b)
detectar la presencia o ausencia de dicho amplicón.
\vskip1.000000\baselineskip
El procedimiento puede comprender además en la etapa b) una puesta en contacto de dicha muestra con por lo menos un primer agente de hibridación con una secuencia MREJ de tipo iv y con por lo menos un cebador que se hibrida con una secuencia específica del ADN cromosómico de S. aureus para generar dicho amplicón.
El procedimiento puede comprender además detectar la presencia o ausencia de por lo menos una cepa más de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA) en dicha muestra, dicha por lo menos una cepa más que comprende una secuencia de ácido nucleico de tipo i, ii, iii, v, vi, vii, viii, o ix de la unión del extremo derecho de mec (MREJ), y que es resistente debido a la presencia de un elemento SCCmec que contiene un gen mecA, habiendo sido insertado dicho SCCmec en el ADN cromosómico, generando de este modo una unión en el extremo derecho polimórfico (MREJ), en el que dicho procedimiento comprende además poner en contacto dicha muestra con por lo menos un cebador y/o sonda, en el que dicho cebador y/o sonda es capaz de hibridarse específicamente con dicho extremo derecho del elemento SCCmec de por lo menos una de dichas secuencias de ácido nucleico de los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de MREJ.
En una forma de realización específica, los cebadores y/o sondas se seleccionan todos para hibridarse en condiciones de hibridación comunes, y aún más específicamente, se colocan en general en el mismo recinto físico.
Para el procedimiento anterior que comprende además detectar la presencia o ausencia de por lo menos una cepa más de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA) en dicha muestra, se han desarrollado por lo menos una cepa más de MRSA que comprende una secuencia de ácido nucleico de tipo i, ii, iii, v, vi, vii, viii, o ix en la unión del extremo derecho mec (MREJ), cebadores y/o sondas que tienen por lo menos una longitud de 10 nucleótidos y son capaces de hibridarse con MREJ de los tipos i a iii, definidos en cualquiera de las SEC. ID. nº 1, nº 20, nº 21, nº 22, nº 23, nº 24, nº 25, nº 41, nº 199; nº 2, nº 17, nº 18, nº 19, nº 26, nº 40, nº 173, nº 174, nº 175, nº 176, nº 177, nº 178, nº 179, nº 180, nº 181, nº 182, nº 183, nº 185, nº 186, nº 197; nº 4, nº 5, nº 6, nº 7, nº 8, nº 9, nº 10, nº 11, nº 12, nº 13, nº 14, nº 15, nº 16, nº 104, nº 184, nº 198 y con uno o más MREJ de los tipos v a ix, con las SEC. ID. nº 47, nº 48, nº 49, nº 50; nº 171; nº 165, nº 166; nº 167; nº 168. Al ser perfectamente omnipresentes con todas las MREJ secuenciadas, los cebadores y/o sondas por lo general pueden hibridarse con dichas SEC. ID. nº de los tipos de MREJ.
Se han diseñado los siguientes cebadores y/o sondas específicos que tienen las secuencias siguientes:
1
2
\newpage
Entre éstos, se utilizan los pares de siguientes cebadores que tienen las siguientes secuencias:
3
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También, entre éstos, se utilizan las sondas siguientes que tienen las secuencias siguientes:
SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163 y nº 164.
\vskip1.000000\baselineskip
Pueden utilizarse conjuntamente los cebadores y/o sondas que tienen las secuencias nucleotídicas siguientes. Las combinaciones preferidas hacen uso de:
i)
SEC ID nº: 64, 66, 84, 163, 164 para la detección del tipo i de MREJ.
ii)
SEC ID nº: 64, 66, 84, 163, 164 para la detección del tipo ii de MREJ.
iii)
SEC ID nº: 64, 67, 84, 163, 164 para la detección del tipo iii de MREJ.
iv)
SEC ID nº: 64, 79, 84, 163, 164 para la detección del tipo iv de MREJ.
v)
SEC ID nº: 64, 80, 84, 163, 164 para la detección del tipo v de MREJ.
vi)
SEC ID nº: 64, 112, 84, 163, 164 para la detección del tipo vii de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
Todas estas sondas y cebadores pueden utilizarse incluso conjuntamente en el mismo recinto físico.
\newpage
Otro objetivo de la presente invención consiste en proporcionar un procedimiento para determinar la presencia o ausencia de por lo menos cuatro tipos de MREJ de MRSA en una muestra que comprende:
a)
reproducir el procedimiento de la invención con cebadores y/o sondas específicas para cada una dichos por lo menos cuatro tipos de MREJ, siendo uno de los cuales el tipo iv de MREJ; y
b)
detectar cada amplicón de manera muy particular,
determinando de este modo la presencia o ausencia de los tipos MREJ de MRSA en una muestra.
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Además, la invención proporciona un kit para detectar la presencia o ausencia de una cepa MRSA de tipo iv de MREJ en una muestra que comprende:
a)
un primer oligonucleótido que se hibrida con un extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia del tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 42 a nº 46 y nº 51 y un complemento de las mismas; y
b)
un segundo nucleótido que se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus con el fin de permitir la generación de un amplicón cuando se utiliza junto con dicho primer oligonucleótido;
en el que dichos oligonucleótidos a) y b) constan de por lo menos 10 nucleótidos de longitud y permiten la detección selectiva de un amplicón que comprende secuencias tanto del extremo derecho del elemento SCCmec y del ADN cromosómico que adjunta dicho extremo derecho de dicha cepa MRSA del tipo iv de MREJ.
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El kit puede comprender además por lo menos un oligonucleótido para la detección de por lo menos una cepa de MRSA adicional que comprende un tipo MREJ seleccionado de entre el grupo constituido por el tipo i de MREJ, tipo ii de MREJ, tipo iii de MREJ, tipo v de MREJ, tipo vi de MREJ, tipo vii de MREJ, tipo viii de MREJ y tipo ix de MREJ, por ejemplo, tal como los descritos anteriormente.
También se describen los ácidos nucleicos seleccionados de entre las SEC. ID. nº
i)
SEC ID nº: 42, 43, 44, 45, 46, 51 para la secuencia de tipo iv de MREJ;
ii)
SEC ID nº: 47, 48, 49, 50 para la secuencia de tipo v de MREJ;
iii)
SEC ID nº: 171 para la secuencia de tipo vi de MREJ;
iv)
SEC ID nº: 165, 166 para la secuencia de tipo vii de MREJ;
v)
SEC ID nº: 167 para la secuencia de tipo viii de MREJ;
vi)
SEC ID nº: 168 para la secuencia de tipo ix de MREJ.
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Se describen también oligonucleótidos de por lo menos 10 nucleótidos de longitud que se hibridan con cualquiera de estos ácidos nucleicos y que se hibridan con uno o más MREJ de los tipos seleccionados de iv a ix. Entre estos, los pares de cebadores (o sondas) con las siguientes SEC. ID. nº
4
400
están también comprendidas dentro del alcance de la presente invención.
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Además, se describen también las sondas internas con las secuencias nucleotídicas definidas en cualquiera de las SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163 o nº 164. Las composiciones de materia que comprenden los cebadores y/o las sondas de que se hibridan con uno o más MREJ de los tipos seleccionados del iv a ix así como con los ácidos nucleicos anteriores, que comprende o no cebadores y/o sondas, que se hibridan con uno o más MREJ de los tipos seleccionados del i a iii, son además objetivos de la presente invención. Las composiciones preferidas comprenderían los cebadores que tienen las secuencias nucleotídicas definidas en las SEC. ID. nº
5
o las sondas, cuyas SEC. ID. son: nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163, nº 164 o ambas.
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Descripción detallada de la invención
Se proporciona específicamente un procedimiento en el que cada uno de los ácidos nucleicos de MRSA o una variante o parte de los mismos comprende una zona diana seleccionada hibridable con dichos cebadores o sondas desarrollados para ser omnipresentes;
en el que cada uno de dichos ácidos nucleicos o una variante o parte de los mismos comprende una zona diana seleccionada hibridable con dichos cebadores o sondas;
comprendiendo dicho procedimiento las etapas de puesta en contacto de dichas muestra con dichas sondas o cebadores y de detección de la presencia y/o la cantidad de sondas hibridadas o productos ampliados como indicación de la presencia y/o la cantidad de MRSA.
En el procedimiento, las secuencias de los fragmentos del ADN de la unión del extremo derecho del cromosoma con SCCmec, denominadas a partir de aquí posición de MREJ para la "unión del extremo derecho de mec" incluyendo las secuencias del extremo derecho de SCCmec y del ADN cromosómico para el lado derecho del punto de integración de SCCmec, se utilizan como secuencias precursoras a partir de las cuales derivan los cebadores y/o las sondas. Las secuencias de MREJ incluyen las secuencias de patente de los inventores así como las secuencias obtenidas a partir de las bases de datos públicas y de la patente US nº 6.156.507 y se seleccionaron por su capacidad para detectar sensible, específica, omnipresente y rápidamente los ácidos nucleicos de MRSA objetivo.
Los fragmentos de ADN y los oligonucleótidos (cebadores y sondas) de la patente de los inventores se aplican en los procedimientos y kits de la invención.
Son asimismo objeto de la presente invención la composición de los materiales tales como kits para diagnóstico que comprenden cebadores o sondas de ampliación para la detección de MRSA.
En los procedimientos y kits anteriores, las sondas y cebadores no se limitan a los ácidos nucleicos, y pueden incluir, pero no se limitan a, análogos de nucleótidos. Los reactivos para diagnóstico constituidos por las sondas y las cebadores pueden estar presentes en cualquier forma adecuada (unidos a un soporte sólido, líquido, liofilizado, etc.).
En los procedimientos y kits anteriores, las reacciones de ampliación pueden incluir pero no se limitan a: a) la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), b) la reacción en cadena de la ligasa (RCL), c) la ampliación basada en la secuencia del ácido nucleico (NASBA), d) la replicación de la secuencia automantenida (3SR), e) la ampliación por desplazamiento de cadena (SDA), f) la ampliación de la señal del ADN ramificado (ADNb), g) la ampliación mediada por transcripción (TMA), h) la tecnología de la sonda de ciclación (CPT), i) PCR anidada, j) PCR multiplex, k) la ampliación en fase sólida (SPA), l) la ampliación de la señal dependiente de la nucleasa (NDSA), m) la tecnología de ampliación del círculo rodante (RCA), n) la ampliación por desplazamiento de la cadena anclada, o) la ampliación del círculo rodante en fase sólida (inmovilizada).
En los procedimientos y kits anteriores, la detección de los ácidos nucleicos de los genes diana puede incluir tecnologías en tiempo real o después de la ampliación. Estas tecnologías de detección pueden incluir, pero no se limitan a los métodos basados en la transferencia de energía de resonancia por fluorescencia (FRET) tal como la hibridación adyacente de las sondas (incluyendo los procedimientos sonda a sonda y sonda a cebador), la sonda TaqMan, la sonda molecular fluorescente, la sonda Scorpion, la sonda para nanopartículas y la sonda Amplifluor. Otros procedimientos de detección incluyen la detección de ácidos nucleicos del gen diana por procedimientos inmunológicos, los procedimientos de hibridación en fase sólida sobre filtros, chips o cualquier otro soporte sólido. En estos sistemas, la hibridación puede controlarse por fluorescencia, quimioluminiscencia, potenciometría, espectrometría de masas, resonancia en plasmón, polarimetría, colorimetría, citometría de flujo o escanometría. El secuenciado de nucleótidos, incluyendo el secuenciado por terminación en didesoxi o el secuenciado por hibridación (por ejemplo secuenciado utilizando un chip de ADN) representa otro procedimiento para detectar y caracterizar los ácidos nucleicos de genes diana.
En una forma de realización preferida, se utiliza un protocolo de PCR para la ampliación del ácido nucleico.
Un procedimiento para la detección de una multitud de cepas potenciales de MRSA que tiene diferentes tipos de MREJ puede realizarse en reacciones independientes y en recintos físicos, un tipo a la vez. Alternativamente, podría realizarse simultáneamente en diferentes tipos en recintos físicos independientes, o en el mismo recinto físico. En este último escenario podría realizarse una reacción PCR multiplex que requeriría que los oligonucleótidos fuesen capaces de hibridarse con una zona diana en condiciones comunes. Ya que muchas sondas o cebadores son específicos para un determinado tipo de MREJ, una forma de realización posible es el tipado de una cepa de MRSA. Cuando una mezcla de oligonucleótidos se hibrida conjuntamente con más de un tipo se utiliza en un solo recinto físico o recipiente, diferentes etiquetas deberían utilizarse para distinguir un tipo de otro.
En el contexto de la presente invención se propone desarrollar un ensayo basado en ADN o un kit para detectar e identificar MRSA. Aunque las secuencias de los genes orfX y de algunos fragmentos de ADN con SCCmec están disponibles en las bases de datos públicas y se han utilizado para desarrollar ensayos basados en ADN para la detección de MRSA, nuevos datos de secuencias que permiten mejorar la detección e identificación del MRSA que son objeto de la presente invención nunca han sido caracterizados anteriormente ni se conocían pero no demostraron estar localizados en el extremo derecho de SCCmec adyacente a la secuencia de integración (Tabla 4). Estas nuevas secuencias no podrían haber sido previstas ni detectadas por el ensayo de la PCR específico para MRSA desarrollado por Hiramatsu et al. (patente US nº 6.156.507). Estas secuencias permitirán mejorar los ensayos basados en ADN actuales para el diagnóstico de MRSA porque permiten el diseño de cebadores y sondas omnipresentes para la detección e identificación de más cepas de MRSA incluyendo todos los clones epidémicos principales de todo el mundo.
Pueden utilizarse los kits para diagnóstico, los cebadores y las sondas mencionados anteriormente para detectar y/o identificar el MRSA, si dichos kits para diagnóstico, cebadores y sondas se utilizan para aplicaciones in vitro o in situ. Dichas muestras pueden incluir pero no se limitan a: cualquier muestra química, cualquier muestra medioambiental, cualquier cultivo microbiano, cualquier colonia microbiana, cualquier tejido y cualquier estirpe celular.
Es también un objetivo de la presente invención que dichos kits para diagnóstico, cebadores y sondas puedan utilizarse solos o en combinación con cualquier otro ensayo adecuado para detectar y/o identificar microorganismos, incluyendo pero sin limitarse a: cualquier ensayo basado en la detección de ácidos nucleicos, cualquier inmunoanálisis, cualquier análisis enzimático, cualquier análisis bioquímico, cualquier análisis lisotípico, cualquier análisis serológico, cualquier medio de cultivo diferenciado, cualquier medio de cultivo de enriquecimiento, cualquier medio de cultivo selectivo, cualquier medio de análisis específico, cualquier medio de cultivo de identificación, cualquier medio de cultivo de enumeración, cualquier cepa celular, cualquier cultivo o estirpes celulares específicas y cualquier ensayo de infección en animales.
En los procedimientos y kits descritos en la presente memoria a continuación, las sondas de oligonucleótidos y las sondas de ampliación proceden de secuencias mayores (es decir, fragmentos de ADN de por lo menos 100 pares de bases). Todas las secuencias de ADN se han obtenido de las secuencias de la patente de los inventores o de bases de datos públicas (Tablas 5, 6, 7, 8 y 9).
Es evidente para cada uno de los expertos en la materia que las secuencias oligonucleotídicas aparte de las descritas en la presente invención y que son apropiadas para la detección y/o identificación de MRSA pueden proceder también de las secuencias de fragmentos de la patente o de secuencias de las bases de datos públicas seleccionadas. Por ejemplo, los cebadores o sondas oligonucleotídicas pueden ser más cortas pero de una longitud de por lo menos 10 nucleótidos o más largas que las seleccionadas; pueden también seleccionarse de cualquier parte en los fragmentos de ADN de la patente o de las secuencias seleccionadas de bases de datos públicas; pueden ser también variantes del mismo oligonucleótido. Si el ADN diana o una variante del mismo se hibrida con un oligonucleótido dado, o si el ADN diana o una variante del mismo puede ampliarse mediante un par cebador de la PCR de oligonucleótidos, lo contrario también es verdad; un ADN diana dado puede hibridarse con una sonda de oligonucleótido variante o puede ampliarse mediante un cebador de PCR del oligonucleótido variante. Alternativamente, los oligonucleótidos pueden diseñarse a partir de dichas secuencias de fragmentos de ADN para su utilización en los procedimientos de ampliación aparte de la PCR. Por consiguiente, la parte central de la presente invención es la detección y/o identificación del MRSA mediante secuencias de ADN genómicas diana que se utilizan como fuente de sondas de oligonucleótidos específicas y omnipresentes y/o de cebadores de ampliación. Aunque la selección y evaluación de los oligonucleótidos adecuados para diagnóstico requiere mucho esfuerzo, es muy posible para los expertos en la materia derivar, a partir de los fragmentos de ADN seleccionados, otros oligonucleótidos aparte de los enumerados en las Tablas 5, 6, 7, 8 y 9 que son adecuados para diagnóstico. Cuando un fragmento de la patente o una secuencia de base de datos pública se selecciona para su especificidad y ubicuidad, aumenta la probabilidad de que los subconjuntos de las mismas sean también específicos y omnipresentes.
Los fragmentos de ADN de la patente se han obtenido como un repertorio de secuencias creadas por ampliación de ácidos nucleicos de MRSA con nuevos cebadores. Estos cebadores y el repertorio de ácidos nucleicos así como el repertorio de secuencias nucleotídicas se aplican en los procedimientos y kits de la presente invención (Tablas 4, 5, 6, 7, 8 y 9).
Las reivindicaciones por consiguiente están de acuerdo con la presente invención.
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Secuencias para la detección e identificación de MRSA
En la descripción de la presente invención, las expresiones "ácidos nucleicos" y "secuencias" pueden utilizarse indistintamente. Sin embargo, los "ácidos nucleicos" son entidades químicas mientras que las "secuencias" son las piezas de información codificadas por estos "ácidos nucleicos". Tanto los ácidos nucleicos como las secuencias son fuentes de información igualmente valiosas para la materia que concierne a la presente invención.
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Diseño y síntesis de cebadores y sondas de oligonucleótidos
Como parte de las reglas de diseño, se evaluó la idoneidad de todos los oligonucleótidos (sondas para hibridación y cebadores para ampliación del ADN por PCR) para la hibridación o ampliación por PCR por análisis informático utilizando programas convencionales (es decir los programas del paquete GCG Wisconsin, el programa de análisis de cebador Oligo^{TM} 6 y MFOLD 3.0). La idoneidad potencial de los pares de cebadores de la PCR se evaluaron también antes de su síntesis verificando la ausencia de propiedades no necesarias tales como grandes tramos de un nucleótido y una gran proporción de restos G o C en el extremo 3' (Persing et al., 1993, Diagnostic Molecular Microbiology: Principles and Applications, American Society for Microbiology, Washington, D.C.). Se sintetizaron cebadores para ampliación de oligonucleótidos utilizando un sintetizador de ADN automático (Applied Biosystems). Se evaluaron diseños moleculares fluorescentes utilizando los criterios establecidos por Kramer et al. (http://www.molecular-
beacons.org).
La secuencia de oligonucleótidos de los cebadores o sondas puede proceder de una de las dos cadenas del ADN doble. Los cebadores o sondas pueden estar constituidos por las bases A, C, G o T o análogas y pueden degenerarse en una o más posiciones del nucleótido seleccionado (Nichols et al., 1994, Nature 369:492-493). Los cebadores y sondas pueden estar constituidos también por análogos de nucleótidos tales como los ácidos nucleicos bloqueados (LNA) (Koskin et al., 1998, Tetrahedron 54:3607-3630), y ácidos nucleicos peptídicos (ANP) (Egholm et al., 1993, Nature 365:566-568). Los cebadores o sondas pueden ser de cualquier longitud adecuada y pueden seleccionarse en cualquier parte dentro de las secuencias de ADN de los fragmentos de la patente, o de las secuencias de la base de datos seleccionada que son adecuadas para la detección del MRSA.
Las variantes de un gen microbiano diana dado son naturales y son atribuibles a la variación de la secuencia dentro del gen durante la evolución (Watson et al., 1987, Molecular Biology of the Gene, 4ª ed., The Benjamin/Cummings Publishing Company, Menlo Park, CA; Lewin, 1989, Genes IV, John Wiley & Sons, Nueva York, NY). Por ejemplo, diferentes cepas de la misma especie microbiana pueden tener una sola o más variaciones nucleotídicas en el punto de hibridación del oligonucleótido. Los expertos en la materia conocen bien la existencia de ácidos nucleicos variantes y/o secuencias para un gen específico y que la frecuencia de las variaciones de la secuencia depende de la presión selectiva durante la evolución en un producto génico dado. La detección de una secuencia de la variante para una zona entre dos cebadores de PCR puede demostrarse secuenciando el producto de la ampliación. Con objeto de demostrar la presencia de las variaciones de la secuencia en el punto de hibridación del cebador, se tiene que ampliar un ADN diana mayor con cebadores de PCR fuera de este punto de hibridación. El secuenciado de este fragmento mayor permitirá la detección de la variación de la secuencia en este punto de hibridación del cebador. Una estrategia similar puede aplicarse para demostrar las variaciones en el punto de hibridación de la sonda. En la medida en que la divergencia de los ácidos nucleicos y/o las secuencias diana o parte de las mismas no afecte de manera significativa la sensibilidad y/o especificidad y/o la ubicuidad de los cebadores o sondas de ampliación, los ADN microbianos variantes están dentro del alcance de la presente invención. Las variantes de los cebadores o sondas seleccionadas pueden también utilizarse para ampliar o hibridar un ADN diana variante.
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Ampliación del ADN
Para la ampliación del ADN por el procedimiento la PCR ampliamente utilizado, los pares de cebador procedían de los fragmentos de ADN de la patente de los inventores o de las secuencias de la base de datos pública.
Durante la ampliación del ADN por PCR, se utilizan dos cebadores oligonucleotídicos que se unen respectivamente a cada cadena del ADN diana desnaturalizado térmicamente del genoma microbiano para ampliar exponencialmente in vitro el ADN diana mediante ciclos térmicos sucesivos que permiten la desnaturalización del ADN, la hibridación de los cebadores y la síntesis de nuevas dianas en cada ciclo (Persing et al., 1993, Diagnostic Molecular Microbiology: Principles and Applications, American Society for Microbiology, Washington, D.C.).
En resumen, los protocolos de la PCR en un termociclador convencional (PTC-200 de MJ Research Inc., Watertown, MA) fueron los siguientes: Suspensiones bacterianas estandarizadas tratadas o ADN genómico preparado a partir de cultivos bacterianos o muestras clínicas se ampliaron en 20 \mul de mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0), MgCl_{2} 2,5 mM, 0,4 \muM de cada cebador, 200 \muM de cada uno de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,3 \mug/\mul de albúmina de suero bovino (BSA) (Sigma-Aldrich Canada Ltd., Oakville, Ontario, Canadá) y 0,5 unidades de Taq ADN polimerasa (Promega Corp., Madison, WI) combinada con el anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences, Palo Alto, CA). El anticuerpo TaqStart^{TM}, que es un anticuerpo monoclonal neutralizante para la Taq ADN polimerasa, se añadió a todas las reacciones PCR para mejorar la especificidad y la sensibilidad de las ampliaciones (Kellogg et al., 1994, Biotechniques 16:1134-1137). El tratamiento de los cultivos bacterianos o de muestras clínicas consiste en un protocolo rápido para lisar las células microbianas y eliminar o neutralizar los inhibidores de RPC (descritos en la solicitud US 60/306.163 en trámite con la presente). Para la ampliación del ADN genómico purificado, se añadieron las muestras directamente a la mezcla de ampliación por PCR. Se utilizó un control interno, procedente de las secuencias no encontradas en las secuencias MREJ diana o en el genoma humano, para comprobar la eficacia de la reacción PCR y la ausencia de inhibición significativa de la PCR.
El número de ciclos llevados a cabo para los ensayos por PCR varía según el nivel de sensibilidad requerido. Por ejemplo, el nivel de sensibilidad requerido para la detección microbiana directamente de una muestra clínica es mayor que para la detección de un cultivo microbiano. Por consiguiente, para la detección directa de muestras clínicas se requieren probablemente ensayos por PCR más sensibles que tienen más ciclos térmicos.
Los expertos en la técnica de amplificación de ácidos nucleicos conocen la existencia de otros procedimientos de ampliación rápida tal como la reacción en cadena de la ligasa (LCR), la PCR con transcriptasa inversa, (RT-PCR), la ampliación mediada por transcripción (TMA), la replicación de la secuencia automantenida (3SR), la ampliación basada en la secuencia del ácido nucleico (NASBA), la ampliación por desplazamiento de cadena (SDA), ADN ramificado (ADNb), la tecnología de la sonda de ciclación (CPT), la ampliación en fase sólida (SFA), la tecnología de ampliación del círculo rodante (RCA), RCA en fase sólida, SDA anidada y la ampliación de la señal dependiente de la nucleasa (NDSA), (Lee et al., 1997, Nucleic Acid Amplification Technologies: Application to Disease Diagnosis, Eaton Publishing, Boston, MA; Persing et al., 1993, Diagnostic Molecular Microbiology: Principles and Applications, American Society for Microbiology, Washington, D.C.; Westin et al., 2000, Nat. Biotechnol. 18:199-204). El alcance de la presente invención no se limita a la utilización de la ampliación por PCR, sino que más bien incluye la utilización de cualquier procedimiento de ampliación de ácidos nucleicos o cualquier otro procedimiento que pueda utilizarse para aumentar la sensibilidad y/o la rapidez de las pruebas de diagnóstico basadas en ácidos nucleicos. El alcance de la presente invención también la utilización de cualquier tecnología de ampliación y detección de ácidos nucleicos incluyendo las tecnologías de detección en tiempo real o después de la ampliación, cualquier tecnología de ampliación combinada con detección, cualesquiera de las tecnologías de chips o matriz de ácido nucleico por hibridación, cualesquiera de las tecnologías de chips de ampliación o combinación de la ampliación y chips de hibridación. La detección e identificación por cualquier procedimiento de secuenciado de nucleótidos está también bajo el alcance de la presente invención.
Puede aplicarse también cualquier oligonucleótido procedente de las secuencias de ADN de MREJ de S. aureus y utilizadas con cualquiera de las tecnologías de ampliación y/o de hibridación de ácidos nucleicos cuando se pone en práctica la presente invención.
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Evaluación del procedimiento de detección de MRSA desarrollado por Hiramatsu et al.
Según Hiramatsu et al. (Ito et al., 1999, Antimicrob. Agents Chemother. 43:1449-1458; Katayama et al., 2000, Antimicrob. Agents Chemother. 44:1549-1555; Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother. 45:1323-1336; Ma et al., 2002, Antimicrob. Agents Chemother. 46:1147-1152), cuatro tipos de ADN con SCCmec se encuentran entre las cepas de MRSA. Ellos han descubierto que los ADN con SCCmec están integrados en la zona específica del cromosoma MSSA (denominada orfX). Los inventores desarrollaron un ensayo por PCR multiplex específico para MRSA que incluye cebadores que pueden hibridar al extremo derecho de extremidad de los tipos I, II y III de SCCmec (SEC. ID. nº 18, nº 19, nº 20, nº 21, nº 22, nº 23, nº 24 en la patente US nº 6.156.507 correspondientes a las SEC. ID. nº 52, nº 53, nº 54, nº 55, nº 56, nº 57, nº 58, respectivamente, en la presente invención) así como cebadores específicos para el cromosoma de S. aureus a la derecha del punto de integración de SCCmec (SEC. ID. nº 25, nº 28, nº 27, nº 26 y nº 29 en la patente US nº 6.156.507 correspondientes a las SEC. ID. nº 59, nº 60, nº 61, nº 62 y nº 63, respectivamente en la presente invención) (Tabla 1 y Figura 1). El conjunto de cebadores descritos por Hiramatsu et al. que es la combinación óptima de cebadores (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60 en la presente invención) se utilizó en la presente invención para probar por PCR una variedad de MRSA, MSSA, CNS resistente a la meticilina (MRCNS) y las cepas de CNS sensibles a la meticilina (MSCNS) (Tabla 2). Se realizó un ensayo por PCR realizado utilizando un termociclador convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.) para probar la ubicuidad, la especificidad y la sensibilidad de estos cebadores utilizando el siguiente protocolo: un \mul de una suspensión bacteriana estandarizada tratada o de una preparación de ADN genómico purificado a partir de bacterias se ampliaron en 20 \mul de mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 2,5 mM, 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec y cromosomas de S. aureus (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondientes a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60 de la presente invención, 200 \muM de cada uno de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,3 \mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,5 U de Taq polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences).
Las reacciones PCR se sometieron a continuación a 3 min de ciclación térmica a 94ºC seguido de 40 ciclos de 60 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 60 segundos a 55ºC para la etapa de hibridación y 60 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación, seguido a continuación de una ampliación terminal de 7 minutos a 72ºC utilizando un termociclador convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.). La detección de los productos de la PCR se realizó por electroforesis en geles de agarosa (2%) que contenían 0,25 \mug/ml de bromuro de etidio.
Veinte de las 39 cepas de MRSA probadas no se ampliaron con el ensayo de PCR desarrollado por Hiramatsu et al. (Ejemplo 1, Tablas 2 y 3).
Con el fin de crear un ensayo de diagnóstico rápido para los MRSA, en el contexto de la presente invención se desarrollaron nuevas series de cebadores específicos para el extremo derecho de los tipos I y II de SCCmec (SEC. ID. nº 66, nº 100 y nº 101) (Anexo 1), el tipo II de SCCmec (SEC. ID. nº 97 y nº 99), el tipo III de SCCmec (SEC. ID. nº 77, nº 98 y nº 102) y en el cromosoma de S. aureus a la derecha del punto de integración de SCCmec (SEC. ID. nº 64, nº 70, nº 71, nº 72, nº 73, nº 74, nº 75 y nº 76) (Tabla 5). Estos cebadores, que amplían amplicones cortos (171 a 278 pb) son compatibles para su utilización en ensayos rápidos por PCR (Tabla 7). El diseño de estos cebadores estaba basado en el análisis de alineamientos de secuencias múltiples de las secuencias orfX y SCCmec descritas por Hiramatsu et al. (patente US nº 6.156.507) o disponibles en el GenBank (Tabla 10, Anexo 1). Estas diferentes series de cebadores se utilizaron para probar por PCR una variedad de cepas de MRSA, MSSA, MRCNS, y MSCNS. Se desarrollaron varios cebadores para ampliación destinados a detectar los tres tipos de SCCmec (SEC. ID. nº 97 y nº 99 para el tipo II de SCCmec, las SEC. ID. nº 66, nº 100 y nº 101 para los tipos I y II de SCCmec y las SEC. ID. nº 67, nº 98 y nº 102 para el tipo III de SCCmec). Los cebadores se seleccionaron según su especificidad para las cepas MRSA, su sensibilidad analítica en la PCR y la longitud del producto de la PCR. Se seleccionó una serie de 2 cebadores para la zona del extremo derecho de SCCmec (SEC. ID. nº 66 específica para los tipos I y II de SCCmec; SEC. ID. nº 67 específica para el tipo III de SCCmec). De los 8 cebadores diferentes diseñados para hibridar en el cromosoma de S. aureus a la derecha del punto de integración de SCCmec (gen orfX diana) (SEC. ID. nº 64, nº 70, nº 71, nº 72, nº 73, nº 74, nº 75 y nº 76), solo uno (SEC. ID. nº 64) se observó que era específico para el MRSA basado en el ensayo con una variedad de cepas de MILSA, MSSA, MRCNS y MSCNS (Tabla 12). Por consiguiente, se desarrolló un ensayo de PCR que utiliza el conjunto óptimo de cebadores (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) que podría ampliar las cepas de MRSA específicamente que contienen los tipos I, II y III de SCCmec (Figura 2, Anexo I). Aunque el ensayo de la PCR desarrollado con estas nuevas series de cebadores era muy sensible (es decir permitía la detección de 2 a 5 copias de genoma para los tres tipos de SCCmec) (Tabla 11), presentaba los mismos defectos (es decir falta de ubicuidad) del ensayo desarrollado por Hiramatsu et al. Las 20 cepas de MRSA que no fueron ampliadas por los cebadores de Hiramatsu et al. no fueron detectadas tampoco por el conjunto de cebadores que comprenden las SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67 (Tablas 3 y 12). Evidentemente, se necesitan herramientas para diagnóstico destinadas a conseguir por lo menos el 50% de ubicuidad entre las cepas ensayadas.
Con el fin de crear un procedimiento de detección e identificación más omnipresente (es decir con capacidad para detectar todas o la mayoría de las cepas MRSA) para MRSA, los inventores determinaron la secuencia de la MREJ presente en estas 20 cepas de MRSA que no se ampliaron. Esta investigación ha conducido al descubrimiento e identificación de siete nuevas secuencias diana de MREJ distintas que pueden utilizarse para el diagnóstico. Estas siete nuevas secuencias de MREJ no pudieron predecirse ni detectarse con el sistema descrito en la patente US nº 6.156.507 por Hiramatsu et al. Concretamente, la presente invención representa un procedimiento mejorado para la detección e identificación de MRSA porque proporciona un procedimiento de diagnóstico más omnipresente que permite la detección de todos los clones principales de MRSA epidémicos en todo el mundo.
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Secuenciado de secuencias nucleotídicas de MREJ de las cepas de MRSA no ampliables con cebadores específicos para los tipos I, II y III de SCCmec
Ya que el ADN procedente de veinte cepas de MRSA no se amplió en el conjunto de cebadores desarrollados por Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60 en la presente invención) (Tablas 2 y 3) ni con el conjunto de cebadores desarrollado en la presente invención basada en los mismos tres tipos (I, II y III) de SCCmec secuencias (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) (Tabla 12), la secuencia nucleotídica del MREJ se determinó para dieciséis de estas veinte cepas de MRSA.
La transposasa de IS431 está asociada con frecuencia a la inserción de genes resistentes dentro del locus mec. El gen que codifica esta transposasa ha sido descrito frecuentemente en una o más copias en el segmento derecho de SCCmec (Oliveira et al, 2000, Antimicrob. Agents Chemother. 44:1906-1910; Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother. 45:1323-36). Por consiguiente, en un primer intento de secuenciar la nueva MREJ para 16 de las 20 cepas de MRSA descritas en la Tabla 3, se diseñó un cebador en la secuencia del gen que codifica la transposasa de IS431 (SEC. ID. nº 68) y combinada con un cebador específico para orfX a la derecha del punto de integración de SCCmec (SEC. ID. nº 70) (Tablas 5 y 8). La estrategia utilizada para seleccionar estos cebadores se ilustra en la Figura 3.
Se ampliaron los fragmentos de MREJ que han de ser secuenciados utilizando el protocolo de ampliación siguiente: un \mul de suspensión celular tratada (o de una preparación de ADN genómico purificada) se transfirió directamente a 4 tubos que contenían 39 \mul de una mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0),Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 2,5 mM, 1 \muM de cada uno de los 2 cebadores (SEC. ID. nº 68 y nº 70), 200 \muM de cada uno de los cuatro dNTP, 3,3 \mug/\mul de BSA (Sigma-Aldrich Canada Ltd.) y 0,5 unidades de Taq ADN polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences). Las reacciones PCR se sometieron a continuación a ciclación utilizando un termociclador convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.) de la forma siguiente: 3 minutos a 94ºC seguido de 40 ciclos de 5 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 30 segundos a 55ºC para la etapa de hibridación y 2 min. a 72ºC para la etapa de ampliación.
Posteriormente, las cuatro mezclas ampliadas por PCR se mezclaron y 10 \mul de la mezcla se resolvieron por electroforesis en un gel de agarosa al 1,2% que contenía 0,25 \mug/ml de bromuro de etidio. Se observaron los amplicones a continuación con un Alpha-Imager (Alpha Innotech Corporation, San Leandro, CA) por exposición a la luz UV a 254 nm. El tamaño del amplicón se estimó por comparación con una escala de peso molecular de 1 kb (Life Technologies, Burlington, Ontario, Canadá). La mezcla ampliada por PCR restante (150 \mul, en total) se resolvió también por electroforesis en un gel de agarosa al 1,2%. Los amplicones se observaron a continuación por tinción con azul de metileno (Flores et al., 1992, Biotechniques, 13:203-205). El tamaño del amplicón se estimó otra vez por comparación con una escala de peso molecular de 1 kb. De las dieciséis cepas seleccionadas procedentes de las veinte descritas en la Tabla 3, se ampliaron seis utilizando las SEC. ID. nº 68 y nº 70 como cebadores (CCRI-178, CCRI-8895, CCRI-8903, CCRI-1324, CCRI-1331 y CCRI-9504). Para estas seis cepas de MRSA, se obtuvo un producto de ampliación de 1,2 kb. La banda correspondiente a este de producto de ampliación específico se separó del gel de agarosa y se purificó utilizando el kit de extracción en gel QIAquick^{TM} (Qiagen Inc., Chatsworth, CA). El fragmento de ADN purificado en gel se utilizó a continuación directamente en el protocolo de secuenciado. Ambas cadenas de los productos de ampliación de MREJ se secuenciaron por el procedimiento de secuenciado de terminación de la cadena de disesoxinucleótido utilizando un secuenciador de ADN automático de Applied Biosystems (Modelo 377) con su Big Dye^{TM} Sequencing Ready Reaction Kit (Applied Biosystems, Foster City, CA). Las reacciones de secuenciado se realizaron utilizando los mismos cebadores (SEC. ID. nº 68 y nº 70) y 10 ng/100 pb por reacción de los amplicones purificados en gel. El secuenciado de MREJ de las seis cepas de MRSA (CCRI-178, CCRI-8895, CCRI-8903, CCRI-1324, CCRI-1331 y CCRI-9504) descritas en la Tabla 3 proporcionaron las SEC. ID. nº 42, nº 43, nº 44, nº 45, nº 46 y nº 51, respectivamente (Tabla 4).
Para asegurar que la secuencia determinada no contenía errores atribuibles al secuenciado de los artefactos de la PCR, los inventores han secuenciado dos preparaciones de los productos de preparación de MREJ purificado en gel que se originan a partir de dos ampliaciones independientes por PCR. Para la mayoría de los fragmentos diana, las secuencias determinadas para ambas preparaciones del amplicón fueron idénticas. Además, las secuencias de ambas cadenas eran 100% complementarias confirmando de este modo la alta precisión de la secuencia determinada. Las secuencias de MREJ determinadas utilizando la estrategia anterior se describen en el Listado de secuencias y en la Tabla 4.
Para secuenciar MREJ en cepas para las que no se había obtenido ningún amplicón utilizando la estrategia que incluye cebadores específicos para el gen de transposasa de IS431 y orfX, se utilizó otra estrategia que utiliza cebadores de las secuencias mecA y orfX diana para ampliar fragmentos genómicos mayores. Una nueva mecA (SEC. ID. nº 69) diana del cebador de PCR (Tabla 8) debe utilizarse en combinación con el mismo cebador en la secuencia orfX (SEC. ID. nº 70). La estrategia utilizada para seleccionar estos cebadores se ilustra en la Figura 3.
Se utilizó el protocolo de ampliación siguiente: el ADN genómico purificado (300 ng) se transfirió hasta un volumen final de 50 \mul de una mezcla de reacción de PCR. Cada reacción PCR contenía 1x tampón Herculase (Stratagene, La Jolla, CA), 0,8 \muM de cada uno de los 2 cebadores (SEC. ID. nº 69 y nº 70), 0,56 mM de cada uno de los cuatro dNTP y 5 unidades de Herculase (Stratagene). Las reacciones PCR se sometieron a ciclación utilizando un ciclador térmico convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.) de la forma siguiente: 2 min. a 92ºC seguido de 35 o 40 ciclos de 10 s a 92ºC para la etapa de desnaturalización, 30 s a 55ºC para la etapa de hibridación y 30 min. a 68ºC para la etapa de ampliación.
Posteriormente, 10 \mul de la mezcla ampliada por PCR se resolvieron por electroforesis en un gel de agarosa al 0,7% que contenía 0,25 \mug/ml de bromuro de etidio. Los amplicones se observaron a continuación como se describió anteriormente. El tamaño del amplicón se estimó por comparación con una escala de peso molecular de 1 kb (Life Technologies). Se llevó a cabo a continuación una reacción de reampliación en 2 a 5 tubos utilizando el mismo protocolo con 3 \mul de la primera reacción PCR utilizada como muestra de ensayo para la segunda ampliación. Las mezclas de PCR reampliadas se mezclaron y también se resolvieron por electroforesis en un gel de agarosa al 0,7%. Los amplicones se observaron a continuación tiñendo con azul de metileno tal como se describió anteriormente. Se obtuvo un producto de ampliación de aproximadamente 12 kb utilizando la estrategia de ampliación para todas las cepas ensayadas. La banda correspondiente al producto de ampliación específico se separó del gel de agarosa y se purificó como se describió anteriormente. El fragmento de ADN purificado en gel se utilizó a continuación directamente en el protocolo de secuenciado como se describió anteriormente. Las reacciones de secuenciado se llevaron a cabo utilizando los mismos cebadores de ampliación (SEC. ID. nº 69 y nº 70) y 425 a 495 mg de los amplicones purificados en gel por reacción. Posteriormente, se utilizaron cebadores de secuenciado interno (SEC. ID. nº 65, nº 77 y nº 96) (Tabla 8) para obtener datos de secuencia en ambas cadenas para una parte mayor del amplicón. Cinco de las 20 cepas de MRSA (CCRI-1331, CCRI-1263, CCRI-1377, CCRI-1311 y CCRI-2025) descritas en la Tabla 3 se secuenciaron utilizando esta estrategia, proporcionando las SEC. ID. nº 46, nº 47, nº 48, nº 49 y nº 50, respectivamente (Tabla 4). La secuencia en el gen mecA se obtuvo también a partir de los amplicones generados proporcionando las SEC. ID. nº 27, nº 28, nº 29, nº 30 y nº 31 de las cepas CCRI-2025, CCRI-1263, CCRI-1311, CCRI-1331 y CCRI-1377, respectivamente (Tabla 4). Se obtuvieron secuencias mayores dentro del gen mecA y de las zonas corriente abajo también para las cepas CCRI-2025, CCRI-1331, y CCRI-1377 como se describe a continuación.
Para obtener secuencias mayores del gen orfX, se utilizaron otras dos estrategias que utilizan secuencias mecA y orfX diana de cebadores (en el codón de inicio) para ampliar fragmentos mayores de cromosoma. Se diseñó un nuevo cebador de PCR en orfX (SEC. ID. nº 132) para ser utilizado en combinación con el mismo cebador en el gen mecA (SEC. ID. nº 69). La estrategia utilizada para seleccionar estos cebadores se ilustra en la Figura 3. Ocho cepas de S. aureus se ampliaron utilizando las SEC. ID. nº 69 y nº 132 de cebadores (CCRI-9860, CCRI-9208, CCRI-9504, CCRI-1331, CCRI-9583, CCRI-9681, CCRI-2025 y CCRI-1377). La estrategia utilizada para seleccionar estos cebadores se ilustra en la Figura 3.
Se utilizó el siguiente protocolo de ampliación: el ADN genómico purificado (350 a 500 ng) se transfirió a 50 \mul de una mezcla de reacción de PCR. Cada reacción PCR contenía 1x tampón Herculase (Stratagene), 0,8 \muM de cada uno del conjunto de 2 cebadores (SEC. ID. nº 69 y nº 132), 0,56 mM de cada uno de los cuatro dNTP y 7,5 unidades de Herculase (Stratagene) con MgCl_{2} 1 mM. Las reacciones PCR se sometieron a termociclación tal como se describió anteriormente.
Posteriormente, 5 pl de la mezcla ampliada por PCR se resolvieron por electroforesis en un gel de agarosa al 0,8% que contenía 0,25 \mug/ml de bromuro de etidio. Los amplicones se observaron a continuación como se describió anteriormente. Para una cepa de S. aureus (CCRI-9583), se realizó a continuación una reampliación utilizando las SEC. ID. nº 96 y nº 158 de los cebadores (Figura 3) en 4 tubos, utilizando el mismo protocolo de la PCR, con 2 \mul de la primera reacción PCR como muestra de ensayo para la segunda ampliación. Las mezclas de PCR reampliadas se mezclaron y también se resolvieron por electroforesis en un gel de agarosa al 0,8%. Los amplicones se observaron a continuación tiñendo con azul de metileno tal como se describió anteriormente. Se obtuvo una banda de aproximadamente 12 a 20 kb utilizando esta estrategia de ampliación dependiendo de las cepas ensayadas. La banda correspondiente al producto de ampliación específico se separó del gel de agarosa y se purificó utilizando un kit de extracción en gel QLAquick^{TM} o un kit de extracción en gel QIAEX II (QIAGEN Inc.). Se ampliaron también dos cepas, CCRI-9583 y CCRI-9589, con las SEC. ID. nº 132 y nº 150 de cebadores, generando un producto de ampliación de 1,5 kb. Se secuenciaron amplicones largos (12-20 kb) utilizando 0,6 a 1 \mug por reacción, mientras que los amplicones cortos (1,5 kb) se secuenciaron utilizando 150 ng por reacción. Las reacciones de secuenciado se realizaron utilizando diferentes series de cebadores para cada cepa de S. aureus: 1) SEC. ID. nº 68, nº 70, nº 132, nº 145, nº 146, nº 147, nº 156, nº 157 y nº 158 para la cepa CCRI-9504; 2) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 154 y nº 155 para la cepa CCRI-2025; 3) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 148, nº 149, nº 158 y nº 159 para la cepa CCRI-9681; 4) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 187, y nº 188 para la cepa CCRI-9860; 5) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 150 y nº 159 para la cepa CCRI-9589; 6) SEC. ID. nº 114, nº 123, nº 132, nº 150 y nº 158 para la cepa CCRI-9583; 7) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 154 y nº 155 para la cepa CCRI-1377, 8) SEC. ID. nº 70, nº 132, nº 158 y nº 159 para la cepa CCRI-9208; 9) SEC. ID. nº 68, nº 70, nº 132, nº 145, nº 146, nº 147 y nº 158 para la cepa CCRI-1331; y 10) SEC. ID. nº 126 y nº 127 para la cepa
CCRI-9770.
En una cepa (CCRI-9770) se demostró que los genes orfX y orfSA0022 se había eliminado total o parcialmente basándose en la ampliación que utiliza cebadores específicos para estos genes (SEC. ID. nº 132 y n: 159) y las SEC. ID. nº 128 y nº 129, respectivamente) (Tabla 8). Posteriormente, se diseñó un nuevo cebador de PCR en orfSA0021 (SEC. ID. nº 126) para ser utilizado con el mismo cebador en el gen mecA (SEC. ID. nº 69). Se obtuvo un producto de ampliación de 4,5 kb con este conjunto cebador. La ampliación, purificación de amplicones y el secuenciado de amplicones se llevó a cabo tal como se describió anteriormente.
Para obtener la secuencia de la zona SCCmec que contiene mecA para diez de las 20 cepas de MRSA descritas en la Tabla 3 (CCRI-9504, CCRI-2025, CCRI-9208, CCRI-1331, CCRI-9681, CCRI-9860, CCRI-9770, CCRI-9589, CCRI-9583 y CCRI-1377), el cebador descrito anteriormente diseñado en mecA (SEC. ID. nº 69) se utilizó en combinación con un cebador diseñado en la zona corriente abajo de mecA (SEC. ID. nº 118) (Tabla 8). Se obtuvo un producto de ampliación de 2 kb para todas las cepas probadas. Para una cepa, CCRI-9583, se llevó a cabo una reampliación con las SEC. ID. nº 96 y nº 118 de los cebadores con el amplicón generado con los cebadores SEC. ID. nº 69 y nº 132 descrito anteriormente. La ampliación, reampliación, purificación de los amplicones y las reacciones de secuenciado se llevaron a cabo como se describió anteriormente. Las reacciones de secuenciado se llevaron a cabo con los amplicones generados con las SEC. ID. nº 69 y nº 132 descritas anteriormente o las SEC. ID. nº 69 y nº 118. Se utilizaron diferentes conjuntos de cebadores de secuenciado para cada cepa de S. aureus.: 1) SEC. ID. nº 69, nº 96, nº 117, nº 118, nº 120, nº 151, nº 152 para las cepas CCRI-9504, CCRI-2025, CCRI-1331, CCRI-9770 y CCRI-1377; 2) SEC. ID. nº 69, nº 96, nº 118 y nº 120 para las cepas CCRI-9208, CCRI-9681 y CCRI-9589; 3) SEC. ID. nº 69, nº 96, nº 117, nº 118, nº 120 y nº 152 para las cepas CCRI-9860; y 4) SEC. ID. nº 96, nº 117, nº 118, nº 119, nº 120, nº 151 y nº 152 para las cepas CCRI-9583.
Las secuencias obtenidas para 16 de las 20 cepas no ampliables por el ensayo de Hiramatsu (Tabla 4) se compararon a continuación con las secuencias disponibles en las bases de datos públicas. En todos los casos, las porciones de la secuencia tenían una identidad próxima al 100% con las secuencias disponibles públicamente para orfX (SEC. ID. nº 42 a nº 51, nº 165 a nº 168 y nº 171) o mecA y la zona corriente abajo (SEC. ID. nº 27 a nº 31, nº 189 a nº 193, nº 195, nº 197 a nº 199 y nº 225). Sin embargo, aunque la fracción orfX de los fragmentos (SEC. ID. nº 42 a nº 51, nº 165 a nº 168 y nº 171) compartía casi el 100% de identidad con el gen orfX de la cepa NCTC 8325 de MSSA descrita por Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 3), la secuencia del ADN en el extremo derecho del propio SCCmec se demostró que era muy diferente de las de los tipos I, II, III, y IV descritos por Hiramatsu et al. (Tabla 13, Figura 4). Se obtuvieron seis nuevos tipos de secuencia diferentes.
Debe señalarse que Hiramatsu et al. demostraron que el tipo I de SCCmec podía estar asociado con el tipo i de MREP, los tipos II y IV de SCCmec están asociados con el tipo ii de MREP y el tipo III de SCCmec está asociado con el tipo iii de MREP. Los datos de secuenciado de MREJ de los inventores de varias cepas de MRSA condujeron al descubrimiento de 6 nuevos tipos de MREP denominados tipos iv, v, vi, vii, viii y ix. Las MREJ que comprenden distintos tipos de MREP se designaron según el esquema de numeración de MREP. Por consiguiente el tipo i de MREP está comprendido dentro del tipo i de MREJ, el tipo ii de MREP está comprendido dentro del tipo ii de MREJ y así sucesivamente hasta el tipo ix de MREP.
Las secuencias dentro del extremo derecho de SCCmec obtenidas a partir de las cepas CCRI-178, CCRI-8895, CCRI-8903, CCRI-1324, CCRI-1331 y CCRI-9504 (SEC. ID. nº 42, nº 43, nº 44, nº 45, nº 46 y nº 51) eran casi idénticas entre sí y presentaban casi el 100% de identidad con IS431 (números de registro en GenBank AF422691, ABO37671, AF411934). Sin embargo, los datos de la secuencia de los inventores pusieron de manifiesto por primera vez la posición de esta secuencia IS431 en el extremo derecho de SCCmec adyacente a la secuencia de integración. Por consiguiente, como las secuencias en el extremo derecho de SCCmec de estas 6 cepas de MRSA eran diferentes de las del tipo I de SCCmec de la cepa NCTC 10442, del tipo II de SCCmec de la cepa N315, del tipo III de SCCmec de la cepa 85/2082 y del tipo IV de SCCmec de las cepas CA05 y 8/6-3P descritas por Hiramatsu et al. (Ito et al., 2001, Antimicrob. Agents Chemother. 45:1323-1336; Ma et al., 2002, Antimicrob. Agents Chemother. 46:1147-1152), estas nuevas secuencias se denominaron tipo iv de MREP (SEC. ID. nº 42 a nº 46 y nº 51). Una búsqueda en BLAST con el fragmento SCCmec de las secuencias de tipo iv de MREP produjo alineaciones significativas con las secuencias que codifican fracciones de una variedad de transposasas conocidas. Por ejemplo, cuando se compara con el nº de registro AB037671 del GenBank, el tipo iv de MREP de la SEC. ID. nº 51 compartía el 98% de identidad con la supuesta transposasa de IS431 y su zona corriente abajo; dos huecos de 7 nucleótidos cada uno estaban también presentes en esta alineación.
Las secuencias obtenidas a partir de las cepas CCRI-1263, CCRI-1377, CCRI-1311 y CCRI-2025 (SEC. ID. nº 47 a nº 50), eran casi idénticas entre sí y diferentes de los tres tipos de SCCmec y del tipo iv de MREP y, por consiguiente, se denominaron tipo v de MREP. Cuando se comparan con las secuencias del GenBank que utiliza BLAST, las secuencias de tipo v de MREP no compartían ninguna homología significativa con ninguna secuencia publicada, excepto para los primeros 28 nucleótidos. Este segmento corto corresponde a los 11 últimos nucleótidos de codificación de orfX, seguido de los 17 nucleótidos corriente abajo, incluyendo la repetición derecha invertida (IR-R) de SCCmec.
La secuencia obtenida de la cepa CCRI-9208 era también diferente de los tres tipos de SCCmec y de los tipos iv y v de MREP y, por consiguiente, se denominó tipo vi de MREP (SEC. ID. nº 171). En una búsqueda en BLAST, el tipo vi de MREP se demostró que era único, no presentando ninguna homología significativa con ninguna secuencia publicada.
Las secuencias obtenidas de las cepas CCRI-9583 y CCRI-9589 eran también diferentes de los tres tipos de SCCmec y de los tipos iv a vi de MREP y se denominaron por consiguiente tipo vii de MREP (SEC. ID. nº 165 y nº 166). En una búsqueda en BLAST, el tipo vii de MREP se demostró también que era único, no presentando ninguna homología significativa con ninguna secuencia publicada. La secuencia obtenida a partir de la cepa CCRI-9860 fue también diferente de los tres tipos de SCCmec y de los tipos iv a vii de MREP y se denominó por consiguiente tipo viii de MREP (SEC. ID. nº 167). La secuencia de la cepa CCRI-9681 era también diferente de los tres tipos de SCCmec y de los tipos iv a viii de MREP y se denominó por consiguiente tipo ix de MREP (SEC. ID. nº 168). Las búsquedas en BLAST con la fracción SCCmec de las secuencias de los tipos viii y ix de EPMR proporcionaron alineaciones significativas, pero solamente para los primeros ~150 nucleótidos de cada tipo de MREP. Por ejemplo, el comienzo de la secuencia de tipo viii de MREP presentaba 88% de identidad con una fracción del nº de registro AB063173 en el GenBank, pero no se encontró ninguna homología significativa con ninguna secuencia publicada en el resto de la secuencia. De la misma manera, los primeros ~150 nucleótidos del tipo ix de MREP tenían el 97% de identidad con la misma fracción de AB063173, siendo el resto de la secuencia exclusiva. La fracción homóloga corta de los tipos viii y ix de MREP corresponde en AB063173 con los 14 últimos nucleótidos de codificación de orfX, la IR-R de SCCmec, y una fracción de orfCM009. Aunque compartiendo similitudes, los tipos viii y ix de MREP son muy diferentes uno de otro; como se muestra en la Tabla 13, existe solamente el 55,2% de identidad entre ambos tipos para los primeros 500 nucleótidos de la fracción SCCmec.
Por último, no se obtuvieron ninguna secuencia en SSCmec de la cepa CRI-9770. Sin embargo, como se describe en el apartado "Secuenciado de las secuencias nucleotídicas de MREJ de las cepas de MRSA no ampliables con los cebadores específicos para los tipos I, II y III de SCCmec", esta cepa presenta aparentemente una eliminación parcial o total de los genes orfX y orfSA0022 en el ADN cromosómico a la derecha del punto de integración de SCCmec y esto representaría una nueva unión del extremo derecho. Se denominó por lo tanto esta nueva secuencia tipo x de MREP (SEC. ID. nº 172). El secuenciado futuro debería poner de manifiesto si este también denominado tipo x de MREJ contiene un nuevo tipo x de MREP o si la falta de ampliación es producida de hecho por la variación en la parte cromosómica de la MREJ.
Las secuencias del primer fragmento de 500 nucleótidos del extremo derecho de todos los SCCmec obtenidos en la presente invención se compararon con los tipos I, II y III de SCCmec utilizando los programas Pileup y Gap de GCG. La Tabla 13 representa las identidades a nivel de nucleótidos entre los extremos derechos de SCCmec de las seis nuevas secuencias con las de los tipos I, II y III de SCCmec utilizando el programa Gap de GCG. Aunque los tipos I y II de SCCmec presentaban casi el 79,2% de identidad (diferenciándose solamente en una inserción de 102 pb presente en el tipo II de SCCmec) (Figuras 1, 2 y 4), todos los demás tipos de MREP presentaron identidades que oscilan entre 40,9 y 57,1%. Esto explica porqué los extremos derechos de los nuevos tipos iv a ix de MREP dados a conocer en la presente invención podrían no haber sido previstos ni detectados con el sistema descrito por Hiramatsu et al.
Cuatro cepas (CCRI-1312, CCRI-1325, CCRI-9773 y CCRI-9774) descritas en la Tabla 3 no fueron secuenciadas sino más bien caracterizadas utilizando los cebadores de PCR. Las cepas CCRI-1312 y CCRI-1325 se demuestra que contienen el tipo v de MREP que utiliza cebadores de ampliación específica descritos en los ejemplos 4, 5 y 6 mientras que las cepas CCRI-9773 y CCRI-9774 se demuestra que contienen el tipo vii de MREP que utiliza los cebadores específicos de ampliación descritos en el ejemplo 7.
Para obtener la secuencia completa del SCCmec presente en las cepas MRSA descritas en la presente invención, se desarrollaron los cebadores que se dirigen al cromosoma de S. aureus a la izquierda (corriente arriba del gen mecA) del punto de integración SCCmec. Basándose en las secuencias de las bases de datos públicas disponibles, se diseñaron 5 cebadores diferentes (SEC. ID. nº 85 a nº 89) (Tabla 9). Estos cebadores pueden utilizarse en combinación con los cebadores específicos para el cromosoma de S. aureus para secuenciar el SCCmec completo o, alternativamente, utilizarse en combinación con el cebador específico para mecA (SEC. ID. nº 81) para secuenciar la unión del extremo izquierdo de SCCmec. Se han desarrollado también varios cebadores específicos para secuencias conocidas de SCCmec extendidas a lo largo del locus con objeto de obtener la secuencia completa de SCCmec (Tabla 9). Estos cebadores permitirán asignar un tipo de SCCmec a las cepas de MRSA descritas en la presente invención.
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Selección de cebadores de ampliación para las secuencias SCCmec/orfX
Las secuencias de MREJ determinadas por los inventores o seleccionadas a partir de bases de datos públicas se utilizaron para seleccionar cebadores de PCR para la detección e identificación de MRSA. La estrategia utilizada para seleccionar estos cebadores de PCR se basó en el análisis de alineaciones de secuencias múltiples de varias secuencias de MREJ.
En el análisis de los datos de las secuencias de los seis nuevos tipos iv a ix de MREP descritos anteriormente, se diseñaron los cebadores específicos para cada secuencia de nuevo tipo de MREP (SEC. ID. nº 79, nº 80, nº 109, nº 112, nº 113, nº 115, nº 116 y nº 204) (Figura 2, Tabla 5, Ejemplos 3, 4, 5, 6, 7 y 8). Los cebadores específicos para los tipos iv, v y vii de MREP (SEC. ID. nº 79, nº 80 y nº 112) se utilizaron en multiplex con los tres cebadores para detectar los tipos I, II y III de SCCmec (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) y el cebador específico para el orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 64) (Ejemplos 3, 4, 5, 6 y 7). Los cebadores específicos para los tipos vi, viii y ix de MREP (SEC. ID. nº 204, nº 115, nº 116 y nº 109) se diseñaron también y se probaron frente a su diana específica (Ejemplo 8).
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Detección de los productos de ampliación
Clásicamente, la detección de los productos de ampliación por PCR se lleva a cabo por electroforesis en gel de agarosa teñido con bromuro de etidio convencional como se describió anteriormente. Sin embargo es evidente que pueden utilizarse otros procedimientos para la detección de los productos de ampliación específicos, que pueden ser más rápidos y más prácticos para el diagnóstico rutinario. Los ejemplos de dichos procedimientos se describen en la solicitud de patente WO 01/23604 A2 en trámite con la presente.
La detección del amplicón puede realizarse también mediante soporte sólido o hibridación líquida utilizando sondas de ADN internas específicas para la especie que hibridan un producto de ampliación. Dichas sondas pueden generarse de cualquier secuencia del repertorio de los inventores y diseñarse para hibridar específicamente productos de ampliación de ADN que son objeto de la presente invención. Alternativamente, los amplicones pueden caracterizarse por secuenciado. Véase la solicitud de patente en trámite con la presente WO 01/23604 A2 para ejemplos de procedimientos de detección y secuenciado.
Con objeto de mejorar la eficacia de la ampliación de ácidos nucleicos, puede modificarse la composición de la mezcla de reacción (Chakrabarti y Schutt, 2002, Biotechniques, 32:866-874; Al-Soud y Radstrom, 2002, J. Clin. Microbiol., 38:4463-4470; Al-Soud y Radstrom, 1998, Appl. Environ. Microbiol., 64:3748-3753; Wilson, 1997, Appl. Environ. Microbiol., 63:3741-3751). Dichas modificaciones de la mezcla de reacción de ampliación incluyen la utilización de varias polimerasas o la adición de facilitadores de ampliación de ácido nucleico tales como betaína, BSA, sulfóxidos, proteína gp32, detergentes, cationes, cloruro de tetrametilamonio y otros.
En una forma de realización preferida, se controló la detección en tiempo real de la ampliación por PCR publicando sondas moleculares fluorescentes en un aparato Smart Cycler® (Cepheid, Sunnyvale, CA). Se desarrolló un ensayo por PCR multiplex que contiene cebadores específicos para los tipos i a v de MREP y orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80), una sonda molecular fluorescente específica para la secuencia orfX (SEC. ID. nº 84, véase el Anexo II y la Figura 2) y un control interno para controlar que la inhibición de la PCR. El control interno contiene secuencias complementarias para los cebadores específicos para el tipo iv de MREP y para orfX (SEC. ID. nº 79 y nº 64). El ensayo también contiene una sonda molecular fluorescente marcada con tetracloro-6-carboxifluoresceína (TET) específica para la secuencia en el fragmento de ADN generado durante la ampliación del control interno. Cada reacción de PCR contenía KCl 50 mM, tris-HCl 10 Mm (pH 9,0),Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,8 \muM de cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID. nº 66 y nº 67) y cebador específico para orfX (SEC. ID. nº 64), 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID. nº 79 y nº 80), 80 copias de la referencia interna, 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente marcada con TET específica para la referencia interna, 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente (SEC. ID. nº 84) marcada con 6-carboxi-fluoresceína (FAM), 330 \muM de cada uno de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,45 \mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,875 U de Taq ADN polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences). La ampliación por PCR en el Smart Cycler® se llevó a cabo de la forma siguiente: 3 min. a 95ºC para la desnaturalización inicial, a continuación cuarenta y ocho ciclos en tres etapas consistentes en 5 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 15 segundos a 60ºC para la etapa de hibridación, y 15 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación. Las pruebas de sensibilidad realizadas utilizando ADN genómico purificado de una cepa de MRSA de cada tipo (i a v) de MREP presentaba un límite de detección de 2 a 10 copias del genoma (Ejemplo 5). Ninguno de los 26 MRCNS o 10 MSCNS probados eran positivos con este ensayo multiplex. Las ocho cepas de MRSA (CCRI-9208, CCRI-9770, CCRI-9681, CCRI-9860, CCRI-9583, CCRI-9773, CCRI-9774, CCRI-9589) que albergan las secuencias de los nuevos tipos vi, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención permanecieron indetectables (Ejemplo 5).
En una forma de realización preferida, se evaluó la detección de MRSA utilizando el ensayo de la PCR multiplex en tiempo real en el aparato Smart Cycler® (Cepheid, Sunnyvale, CA) directamente de muestras clínicas. Un total de 142 extensiones nasales se recogieron durante el programa de vigilancia hospitalaria de MRSA en el Montreal General Hospital (Montreal, Quebec, Canadá). Las muestras de las extensiones se analizaron en el Centre de Recherche en Infectiologie de l'Université Laval a las 24 horas de la recogida. Durante la recepción, las extensiones se colocaron en placas en manitol agar-agar y a continuación el material nasal de la misma extensión se preparó con un protocolo de preparación de muestras sencillo y rápido descrito en la solicitud de patente en trámite número US 60/306.163. La identificación clásica de MRSA se realizó por los procedimientos de cultivo habituales.
El ensayo de PCR detectó 33 de las 34 muestras positivas para MRSA basado en el procedimiento de cultivo. En comparación con el cultivo, el ensayo de la PCR detectó 8 muestras adicionales positivas a MRSA para una sensibilidad de 97,1% y una especificidad de 92,6% (Ejemplo 6): Este ensayo de PCR multiplex representa un procedimiento rápido y potente para la detección específica de vehículos de MRSA directamente de las muestras nasales y puede utilizarse con algunos tipos de muestras clínicas tales como heridas, sangre o cultivo sanguíneo, CSF, etc.
En una forma de realización preferida, se desarrolló un ensayo de PCR multiplex que contiene cebadores específicos para los tipos i, ii, iii, iv, v, y vi y de MREP y orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 66, nº 67, nº 79, nº 80 y nº 112) y tres sondas moleculares fluorescentes específicas para la secuencia orfX que permitió la detección de los polimorfismos de dos secuencias identificados en esta zona de la secuencia orfX. Cuatro de las cepas que no fueron detectadas por el ensayo multiplex para la detección de los tipos i a v de MREP se detectaron ahora con este ensayo multiplex mientras que las cuatro cepas de MRSA (CCRI-9208, CCRI-9770, CCRI-9681 y CCRI-9860) que albergan los tipos vi, viii, ix y x de MREP descritos en la presente invención permanecieron indetectables (Ejemplo 7). Los cebadores específicos para los tipos vi, viii y ix de MREP (SEC. ID. nº 204, nº 115, nº 116 y nº 109) se diseñaron también y se demostró que detectan sus cepas diana específicas (Ejemplo 8). Mientras que los cebadores y sondas dadas a conocer por Hiramatsu et al., permitían la detección solamente del 48,7% (19 cepas de cada 39) de las cepas de MRSA de la Tabla 2, los cebadores y sondas procedentes de la presente invención permiten la detección del 97,4% de las cepas (38 cepas de cada 39) (véanse los Ejemplos 7 y 8). Por consiguiente puede decirse que el análisis de los inventores tiene una ubicuidad superior al 50% para las cepas de MRSA enumeradas en la Tabla 2.
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Ensayos de especificidad, ubicuidad y sensibilidad para cebadores y sondas de oligonucleótidos
La especificidad de los cebadores y sondas oligonucleotídicos se determinó por ampliación de ADN o por hibridación con especies de estafilococos. Todas las especies de estafilococos ensayadas eran probablemente patógenos asociados a infecciones o contaminantes potenciales que pueden aislarse de muestras clínicas. Cada ADN diana pudo liberarse de células microbianas utilizando los tratamientos químicos y/o físicos convencionales para lisar las células (Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª ed., Cold Spring Harbour Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY) o alternativamente, se utilizó ADN genómico purificado con el kit GNOME^{TM} DNA (Qbiogene, Carlsbad, CA). Posteriormente, el ADN se sometió a ampliación con el conjunto de cebadores. Los cebadores o sondas específicos se hibridaron solamente con el ADN diana.
En los cebadores de oligonucleotídicos descubiertos para ampliar específicamente el ADN en el MRSA diana se determinó posteriormente su ubicuidad por ampliación (es decir los cebadores omnipresentes ampliaron de manera eficaz la mayoría o todas las cepas de MRSA). Por último, se determinó la sensibilidad analítica de los ensayos de la PCR utilizando diluciones de 10 veces o 2 veces de ADN genómico purificado procedente de los microorganismos diana. Para la mayoría de los ensayos, se obtuvieron niveles de sensibilidad comprendidos en el intervalo de copias de 2 a 10 genomas. La especificidad, ubicuidad y sensibilidad analítica de los ensayos de la PCR se determinaron directamente con cultivos bacterianos o con ADN genómico bacteriano purificado.
Se analizaron sondas moleculares fluorescentes utilizando la plataforma Smart Cycler® tal como se describió anteriormente. Una sonda molecular fluorescente se consideraba específica solamente cuando hibridaba solamente al ADN ampliado en el MREJ de S. aureus. En las sondas moleculares fluorescentes descubiertas por ser específicas se determinó posteriormente su ubicuidad (es decir, las sondas omnipresentes detectaron eficazmente la mayoría o todas las cepas del MRSA) por hibridación con los ADN bacterianos de varias cepas de MRSA.
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Cepas bacterianas
Las cepas de referencia utilizadas para construir subrepertorios de datos de la secuencia de unión del extremo derecho del cromosoma de SCCmec de la patente, así como para probar los ensayos de ampliación e hibridación, se obtuvieron en: (i) la American Type Culture Collection (ATCC), (ii) el Laboratoire de santé publique du Québec (LSPQ) (Ste-Anne de Bellevue, Québec, Canadá), (iii) los Centres for Disease Control and Prevention (CDC) (Atlanta, GA), (iv) el Institut Pasteur (París, Francia) y v) la Harmony Collection (Londres, Reino Unido) (Tabla 14). Las cepas clínicas de MRSA, MSSA, MRCNS y MSCNS de varias áreas geográficas se utilizaron también en la presente invención (Tabla 15). La identidad de las cepas de MRSA de los inventores se confirmó por ensayo genotípico y se reconfirmó por análisis de la PCR utilizando los cebadores específicos para S. aureus y los cebadores específicos para mecA (SEC. ID. nº 69 y nº 81) (Martineau et al., 2000, Antimicrob. Agents Chemother, 44:231-238).
Para una mayor claridad, a continuación se presentan los Ejemplos, Tablas, Figuras y Anexos de la presente invención.
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Descripción de los ejemplos
Ejemplo 1: Los cebadores desarrollados por Hiramatsu et al. pueden detectar solamente cepas de MRSA que pertenecen a los tipos i, ii e iii de MREP aunque omitiendo los nuevos tipos de MREP frecuentes.
Ejemplo 2: Detección e identificación de MRSA utilizando cebadores específicos para las secuencias de los tipos i, ii e iii de MREP desarrollados en la presente invención.
Ejemplo 3: Desarrollo de un ensayo de la PCR multiplex en un termociclador convencional para la detección e identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP.
Ejemplo 4: Desarrollo de un ensayo de la PCR multiplex en tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP.
Ejemplo 5: Desarrollo de un ensayo de la PCR multiplex en tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP e incluyendo una referencia interna.
Ejemplo 6: Detección de MRSA utilizando el ensayo multiplex en tiempo real del Smart Cycler® basado en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP para la detección de MRSA directamente en muestras clínicas.
Ejemplo 7: Desarrollo de un ensayo de la PCR multiplex en tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basado en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv, v, vi y vii de MREP.
Ejemplo 8: Desarrollo de ensayos de la PCR en tiempo real en el Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basado en los tipos vi, viii y ix de MREP.
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Descripción de las tablas
La Tabla 1 proporciona información acerca de todos los cebadores de la PCR desarrollados por Hiramatsu et al. en la patente US nº 6.156.507.
La Tabla 2 es una compilación de resultados (ubicuidad y especificidad) para la detección de la unión del extremo derecho SCCmec-orfX utilizando los cebadores descritos por Hiramatsu et al. en la patente US nº 6.156.507 en un termociclador convencional.
La Tabla 3 es una lista de las cepas de MRSA no ampliables utilizando cebadores diana de los tipos I, II y III de las secuencias de la unión del extremo derecho de SCCmec-orfX.
La Tabla 4 es una lista de nuevas secuencias puestas de manifiesto en la presente invención.
La Tabla 5 proporciona información acerca de todos los cebadores desarrollados en la presente invención.
La Tabla 6 es una lista de las sondas modelo moleculares desarrolladas en la presente invención.
La Tabla 7 presenta los tamaños del amplicón de los diferentes pares de cebador descritos por Hiramatsu et al. en la patente US nº 6.156.507 o desarrollados en la presente invención.
La Tabla 8 proporciona información acerca de los cebadores desarrollados en la presente invención para secuenciar la unión del extremo derecho del cromosoma de SCCmec.
La Tabla 9 proporciona información acerca de los cebadores desarrollados en la presente invención para obtener la secuencia del SCCmec completa.
La Tabla 10 es una lista de las secuencias disponibles en las bases de datos públicas (GenBank, proyectos de genoma o patente US nº 6.156.507) utilizadas en la presente invención para diseñar cebadores y sondas.
La Tabla 11 proporciona la sensibilidad analítica del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención utilizando los tipos I, II e III de cebadores diana de las secuencias de unión al extremo derecho de SCCmec-orfX y realizadas utilizando un termociclador convencional.
La Tabla 12 es una compilación de resultados (ubicuidad y especificidad) para la detección de MRSA utilizando los cebadores desarrollados en la presente invención con los tipos I, II y III diana de las secuencias de unión del extremo derecho de SCCmec-orfX y realizadas utilizando un termociclador convencional.
La Tabla 13 presenta una comparación de identidades de secuencias entre los 500 primeros nucleótidos de los extremos derechos de SCCmec entre 9 tipos de MREP.
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La Tabla 14 proporciona información acerca de las cepas de referencia de MRSA, MSSA, MRCNS y MSCNS utilizadas para validar los ensayos de la PCR desarrollados en la presente invención.
La Tabla 15 proporciona información acerca del origen de las cepas clínicas de MRSA, MSSA, MRCNS y MSCNS utilizadas para validar los ensayos de la PCR descritos en la presente invención.
La Tabla 16 representa la sensibilidad analítica del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención utilizando cebadores que se dirigen a 5 tipos de secuencias de MREP y realizados en un termociclador convencional.
La Tabla 17 es una compilación de resultados (ubicuidad y especificidad) para el ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención utilizando 5 tipos de secuencias de MREP que dirigen los cebadores y realizado en un termociclador convencional.
La Tabla 18 representa la sensibilidad analítica del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención utilizando la plataforma Smart Cycler® para la detección de 5 tipos de MREP.
La Tabla 19 es una compilación de resultados (ubicuidad y especificidad) para el ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención utilizando cebadores y una sonda molecular fluorescente que se dirige a 5 tipos de secuencias de MREP y se realiza en la plataforma Smart Cycler®.
La Tabla 20 representa la sensibilidad analítica del ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención utilizando la plataforma Smart Cycler® para la detección de 6 tipos de MREP.
La Tabla 21 es una compilación de resultados (ubicuidad y especificidad) para el ensayo de la PCR desarrollado en la presente invención utilizando cebadores y una sonda molecular fluorescente que se dirige a 6 tipos de secuencias de MREP y se realiza en la plataforma Smart Cycler®.
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Descripción de las figuras
La Figura 1 es un diagrama que ilustra la posición de los cebadores desarrollados por Hiramatsu et al. (patente US nº 6.156.507) en la unión del extremo derecho del cromosoma de SCCmec para la detección e identificación de MRSA.
La Figura 2 es un diagrama que ilustra la posición de los cebadores seleccionados en la presente invención en la unión del extremo derecho de SCCmec-orfX para la detección e identificación de MRSA.
La Figura 3 es un diagrama que ilustra la posición de los cebadores seleccionados en la presente invención para secuenciar nuevos tipos de MREP.
La Figura 4 ilustra una alineación de la secuencia de nueve tipos de MREP.
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Leyendas de las figuras
Figura 1. Organización esquemática de las uniones del extremo derecho de SCCmecorfX de los tipos I, II y III y localización de los cebadores (SEC. ID. nº 52 a nº 63) descritos por Hiramatsu et al. para la detección e identificación de MRSA. Los tamaños de amplicón se representan en la Tabla 7.
Figura 2. Organización esquemática de los tipos i, ii, iii, iv, v, vi, vii, viii y ix de MREP y localización de los cebadores y modelo molecular que se dirige a todos los tipos de MREP (SEC. ID. nº 20, nº 64, nº 66, nº 67, nº 79, nº 80, nº 84, nº 112, nº 115, nº 116, nº 84, nº 163 y nº 164) que se desarrollaron en la presente invención. Los tamaños de amplicón se representan en la Tabla 7.
Figura 3. Organización esquemática de las uniones del extremo derecho del cromosoma SCCmec y localización de los cebadores (SEC. ID. nº 65, nº 68, nº 69, nº 70, nº 77, nº 96, nº 118, nº 126, nº 132, nº 150 y nº 158) desarrollados en la presente invención para el secuenciado de los tipos iv, v, vi, vii, viii, ix y x de MREP.
Figura 4. Alineación de secuencia múltiple de nueve tipos de MREP (representados por fragmentos de las SEC. ID. nº 1, nº 2, nº 104, nº 51, nº 50, nº 171, nº 165, nº 167 y nº 168 para los tipos i, ii, iii, iv, v, vi, vii, viii y ix, respectivamente).
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Descripción de los anexos
Los Anexos muestran las estrategias utilizadas para la selección de cebadores y sondas internas:
El Anexo I ilustra la estrategia para la selección de cebadores de las secuencias SCCmec y orfX específicas para los tipos I y II de SCCmec.
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El Anexo II ilustra la estrategia para la selección de sondas moleculares fluorescentes específicas para la detección en tiempo real de las uniones del extremo derecho de SCCmec-orfX.
Como se muestra en estos Anexos, los cebadores de ampliación seleccionados pueden contener inosinas y/o ambigüedades de base. La inosina es un análogo nucleotídico capaz de unirse específicamente a cualquiera de los cuatro nucleótidos A, C, G o T. Alternativamente, se utilizaron oligonucleótidos degenerados que consisten en una mezcla de oligonucleótidos con dos o más de los cuatro nucleótidos A, C, G o T en el punto de los emparejamientos incorrectos. La inclusión de inosina y/o de degeneraciones en los cebadores de ampliación permite la tolerancia de emparejamiento incorrecto permitiendo de este modo la ampliación de un despliegue más amplio de secuencias nucleotídicas diana (Dieffenbach y Dveksler, 1995, PCR Primer: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, Nueva York).
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Ejemplos Ejemplo 1 Los cebadores desarrollados por Hiramatsu et al. pueden detectar solamente las cepas de MRSA que pertenecen a los tipos i, ii e iii de MREP mientras que omite los nuevos tipos de MREP frecuentes
Como se muestra en la Figura 1, Hiramatsu et al. han desarrollado varios cebadores que pueden hibridar específicamente los extremos derechos de los ADN de SCCmec de los tipos I, II y III. Ellos combinaron estos cebadores con cebadores específicos para la zona cromosómica de S. aureus situada a la derecha del punto de integración de SCCmec para la detección de MRSA. Hiramatsu et al. demostraron que el conjunto de cebadores (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60 en la presente invención) era el más específico y omnipresente para la detección de MRSA. Este conjunto de cebadores proporciona productos de ampliación de 1,5 kb para el tipo I de SCCmec, 1,6 kb para el tipo II de SCCmec, y 1,0 kb para el tipo III de SCCmec (Tabla 7). La ubicuidad y especificidad de este ensayo de PCR multiplex se determinó en 39 cepas de MRSA, 41 cepas de SAMS, 9 cepas de MRCNS y 11 cepas de MSCNS (Tabla 2). Un \mul de una suspensión bacteriana estandarizada tratada o de una preparación de ADN genómico bacteriano purificada en bacterias se ampliaron en 20 \mul de mezcla de reacción PCR. Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 2,5 mM, 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec y orfX (SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60), 200 \muM de cada uno de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,3 \mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,5 U de Taq polimerasa (Promega) acoplada con anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences).
Las reacciones de PCR se sometieron a continuación a ciclación térmica: 3 min. a 94ºC seguido de 40 ciclos de 60 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 60 segundos a 55ºC para la etapa de hibridación y 60 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación, seguidas a continuación de una ampliación terminal de 7minutos a 72ºC utilizando un termociclador convencional (PTC-200 de MJ Research Inc.). La detección de los productos de PCR se realizó por electroforesis en geles de agarosa (2%) que contenían 0,25 \mug/\mul de bromuro de etidio.
Ninguna de las cepas de MRCNS o MSCNS ensayadas se detectaron con el conjunto de cebadores que detecta los tipos I, II y III de SCCmec. Veinte de las 39 cepas de MRSA no se detectaron con este ensayo de PCR multiplex (Tablas 2 y 3). Una de estas cepas de MRSA no detectada corresponde al clon de MRSA portugués muy epidémico (cepa CCRI-9504; De Lencastre et al., 1994. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 13:64-73) y otro corresponde al clon CMRSA1 de MRSA canadiense muy epidémico (cepa CCRI-9589; Simor et al. CCDR 1999, 25-12, 15 de junio). Estos datos demuestran que el conjunto cebador desarrollado por Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60 en la presente invención) no está omnipresente para la detección de MRSA y sugiere que algunas cepas de MRSA tengan secuencias en la unión del extremo derecho de SCCmec que son diferentes de las identificadas por Hiramatsu et al. Otros tipos de secuencias de SCCmec u otras secuencias en el extremo derecho de SCCmec (tipo MREP) se encuentran en MRSA. Una limitación de este ensayo es la detección no específica de 13 cepas de MSSA (Tabla 2).
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Ejemplo 2 Detección e identificación de MRSA que utiliza cebadores específicos para las secuencias de los tipos i, ii e iii de MREP desarrolladas en la presente invención
Basándose en análisis de alineaciones de secuencia múltiple de las secuencias de orfX y SCCmec descritas por Hiramatsu et al. o disponibles en el GenBank, se diseñó un conjunto de cebadores (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) capaces de ampliar segmentos cortos de los tipos I, II y III de las uniones del extremo derecho de SCCmec-orfX procedentes de las cepas de MRSA y discriminante de MRCNS (Anexo I y Figura 2). El conjunto elegido de cebadores proporciona productos de ampliación de 176 pb para el tipo I de SCCmec, 278 bp del tipo II de SCCmec y 223 bp para el tipo III de SCCmec y permite la rápida ampliación por PCR. Estos cebadores se utilizaron en una PCR multiplex para probar su ubicuidad y especificidad utilizando 208 cepas de MRSA, 252 cepas de MSSA, 41 cepas de CMSRM y 21 cepas de MRCNS (Tabla 12). La ampliación y detección por PCR se llevó a cabo tal como se describe en el Ejemplo 1. Las reacciones por PCR se sometieron a continuación a ciclado térmico (3 minutos a 94ºC seguido de 30 ó 40 ciclos de 1 segundo a 95ºC para la etapa de desnaturalización y 30 segundos a 60ºC para la etapa de hibridación-ampliación y a continuación seguida por una ampliación térmica de 2 minutos a 72ºC) utilizando un termociclador convencional (PTC-
200 de MJ Research Inc.). La detección de los productos de la PCR se realizó como se describe en el Ejemplo 1.
Ninguna de las cepas de MRCNS o de MSCNS ensayadas se detectaron con este conjunto de cebadores (Tabla 12). Sin embargo, las veinte cepas de MRSA que no se detectaron con el conjunto cebador desarrollado por Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 56, nº 58 y nº 60) no se detectaron tampoco con los cebadores desarrollados en la presente invención (Tablas 3 y 12). Estos datos demuestran también que algunas cepas de MRSA tienen secuencias en la unión del extremo derecho del cromosoma de SCCmec que son diferentes de las identificadas por Hiramatsu et al. De nuevo, como se observa con los cebadores de Hiramatsu, 13 cepas de MSSA se detectaron también no específicamente (Tabla 12). El significado clínico de este descubrimiento continúa sin ser demostrado ya que estas cepas de MSSA aparentes podrían ser el resultado de una eliminación reciente en el locus mec (Deplano et al., 2000, J. Antimicrob. Chemotherapy, 46:617-619; Inglis et al., 1990, J. Gen Microbiol., 136:2231-2239; Inglis et al., 1990, J. Infect. Dis., 167:323-328; Lawrence et al. 1996, J. Hosp. Infect., 33:49-53; Wada et al., 1991, Biochem. Biophys. Res. Comm., 176:1319-1326).
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Ejemplo 3 Desarrollo de un ensayo de PCR multiplex en un termociclador convencional para la detección e identificación de MRSA basados en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP
En el análisis de los datos de la secuencia de dos de los nuevos tipos iv y v de MREP descritos en la presente invención, se diseñaron dos nuevos cebadores (SEC. ID. nº 79 y nº 80) y se utilizaron en multiplex con las tres SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67 de cebadores descritas en el Ejemplo 2. La ampliación y detección por PCR de los productos de PCR se realizó tal como se describe en el Ejemplo 2. Los ensayos de sensibilidad se realizaron utilizando diluciones de diez veces o de dos veces del ADN genómico purificado procedente de varias cepas de MRSA y cada tipo de MREP presentaba un límite de detección de 5 a 10 copias de genoma (Tabla 16). Se llevaron a cabo pruebas de especificidad utilizando 0,1 ng de ADN genómico purificado o 1 \mul de una suspensión bacteriana estandarizada. Todas las cepas de MRCNS o de MSCNS probadas eran negativas con este ensayo multiplex (Tabla 17). Doce de las 20 cepas de MRSA que no se detectaron con la PCR multiplex descrita en los Ejemplos 1 y 2 no se detectaron ahora con este ensayo multiplex. De nuevo, como se observa con los cebadores de Hiramatsu, 13 cepas de MSSA se detectaron también de forma no específica (Tabla 12). Las ocho cepas de MRSA (CCRI-9208, CCRI-9583, CCRI-9773, CCRI-9774, CCRI-9589, CCRI-9860, CCRI-9681, CCRI-9770), y que alojan las nuevas secuencias de los tipos vi, vii, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención permanecieron indetectables.
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Ejemplo 4 Desarrollo de un ensayo de PCR multiplex en el Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basados en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP
El ensayo de la PCR multiplex descrito en el Ejemplo 3 que contiene cebadores (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) se adaptó a la plataforma de Smart Cycler® (Cepheid). Una sonda molecular fluorescente específica para la secuencia de orfX se desarrolló (SEC. ID. nº 84, véase el Anexo II). Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,5 mM, 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec y orfX (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente marcada con FAM (SEC. ID. nº 84), 200 \muM de cada uno de los cuatro dNTP, 3,3 \mug/\mul de BSA y 0,5 U de Taq polimerasa acoplada con anticuerpo TaqStart^{TM}. La ampliación por PCR en el Smart Cycler® se realizó de la manera siguiente: 3 min. a 94ºC para la desnaturalización inicial, a continuación cuarenta y cinco ciclos de tres etapas consistentes en 5 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 15 segundos a 59ºC para la etapa de hibridación y 10 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación. La detección de fluorescencia se llevó a cabo al final de cada etapa de hibridación. Las pruebas de sensibilidad se realizaron utilizando ADN genómico purificado procedente de varias cepas de MRSA de cada tipo de MREP presentó un límite de detección de 2 a 10 copias de genoma (Tabla 18). Ninguna de las MRCNS o MSCNS eran positivas con este ensayo multiplex (tabla 19). De nuevo, como se observa con los cebadores de Hiramatsu, se detectaron también 13 cepas de MSSA de manera no específica. Doce de las veinte cepas de MRSA que no se detectaron con la PCR multiplex descrita en los Ejemplos 1 y 2 se detectaron por este ensayo multiplex. Como se describe en el Ejemplo 3, las ocho cepas de MRSA que alojan las secuencias de los tipos vi, vii, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención permanecieron indetectables.
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Ejemplo 5 Desarrollo del ensayo de PCR multiplex en tiempo real en un Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basadas en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP incluyendo un control interno
El ensayo de la PCR multiplex descrito en el Ejemplo 4 que contiene cebadores específicos para los tipos i a v de MREP y orfX de S. aureus (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80, y una sonda molecular fluorescente específica para la secuencia orfX (SEC. ID. nº 84, véase Anexo II) se optimizó para incluir un control interno para controlar la inhibición por la PCR. Este control interno contenía secuencias complementarias a los cebadores específicos para el tipo iv de MREP y para orfX (SEC. ID. nº 79 y nº 64). Este ensayo contiene también una sonda molecular fluorescente marcada con TET específica para la secuencia en el amplicón generado por ampliación del control interno. Cada reacción PCR contenía 50 KCl mM, Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,8 \muM de cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID. nº 66 y nº 67) y cebador específico para orfX (SEC. ID. nº 64), 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para MREP (SEC. ID. nº 79 y nº 80), 80 copias de la referencia interna, 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente marcada con TET específica para la referencia interna, 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente marcada con FAM (SEC. ID. nº 84), 330 \muM de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,45 \mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,875 U de Taq polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences). La ampliación por PCR en el Smart Cycler® se realizó de la manera siguiente: 3 min. a 95ºC para la desnaturalización inicial, a continuación cuarenta y ocho ciclos de tres etapas consistentes en 5 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 15 segundos a 60ºC para la etapa de hibridación y 15 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación. Se realizaron pruebas de sensibilidad utilizando ADN genómico purificado procedente de una cepa de MRSA de cada tipo de MREP (i a v) presentó un límite de detección de 2 a 10 copias de genoma. Ninguna de las 26 MRCNS o 10 MSCNS eran positivas con este ensayo multiplex. De nuevo, como se observa con los cebadores de Hiramatsu, se detectaron también 13 cepas de MSSA de manera no específica. Como se describe en los Ejemplos 3 y 4, las ocho cepas de MRSA que alojan las nuevas secuencias de los tipos vi a x de MREP descritas en la presente invención permanecieron indetectables.
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Ejemplo 6 Detección de MRSA utilizando el ensayo multiplex en tiempo real en el Smart Cycler® basada en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP directamente de muestras clínicas
El ensayo descrito en el Ejemplo 5 se adaptó para la detección directamente procedente de muestras clínicas. Se analizaron un total de 142 extensiones nasales recogidas durante el programa de vigilancia en hospital de MRSA en el Montreal General Hospital (Montreal, Quebec, Canadá). Las muestras de extensiones se analizaron en el Centre de Recherche en Infectiologie de la Universidad Laval a las 24 horas de la recogida. A la recepción, las extensiones se colocaron en agar-agar con manitol y a continuación se preparó el material nasal de la misma extensión con un protocolo rápido de preparación de la muestra descrito en la solicitud de patente número US 60/306.163 en trámite con la presente. La identificación clásica de MRSA se llevó a cabo por procedimientos de cultivo convencionales.
El ensayo de la PCR descrito en el Ejemplo 5 detectó 33 de las 34 muestras positivas para MRSA basándose en el procedimiento de cultivo. En comparación con el cultivo, el ensayo de la PCR detectó 8 muestras positivas a MRSA adicionales para una sensibilidad del 97,1% y una muestra del 92,6%. Este ensayo de la PCR multiplex representa un procedimiento rápido y potente para la detección específica de vehículos de MRSA directamente de las muestras nasales y puede utilizarse con cualquier tipo de muestras clínicas tales como heridas, sangre o cultivo sanguíneo, CSF etc.
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Ejemplo 7 Desarrollo del ensayo de PCR multiplex en tiempo real en un Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basadas en las secuencias de los tipos i, ii, iii, iv, v y vii de MREP
En el análisis de la nueva secuencia de datos del tipo vii de MREP descrita en la presente invención (SEC. ID. nº 165 y nº 166), se diseñaron y se ensayaron dos nuevos cebadores (SEC. ID. nº 112 y nº 113) en multiplex con los 3 cebadores SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67 descritos en el Ejemplo 2. La SEC. ID. nº 112 del cebador se seleccionó para su utilización en el multiplex basándose en su sensibilidad. Tres sondas moleculares fluorescentes específicas para la secuencia orfX que permitía la detección de dos polimorfismos de la secuencia identificados en esta zona de la secuencia orfX, basada en el análisis de las SEC. ID. nº 173 a nº 186, se utilizaron también en el multiplex (SEC. ID. nº 84, nº 163 y nº 164). Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,8 \muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec (SEC. ID. nº 66 y nº 67) y el cebador específico para orfX (SEC. ID. nº 64), 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec (SEC. ID. nº 79 y nº 80), 0,2 \muM de la sonda molecular fluorescente marcada con FAM (SEC. ID. nº 84), 330 \muM de los cuatro dNTP (Pharmacia Biotech), 3,45 \mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,875 U de Taq polimerasa (Promega) acoplada con el anticuerpo TaqStart^{TM} (BD Biosciences). La ampliación por PCR en el Smart Cycler® se realizó de la manera siguiente: 3 min. a 95ºC para la desnaturalización inicial, a continuación cuarenta y ocho ciclos de tres etapas consistentes en 5 segundos a 95ºC para la etapa de desnaturalización, 15 segundos a 60ºC para la etapa de hibridación y 15 segundos a 72ºC para la etapa de ampliación. La detección de fluorescencia se realizó al final de cada etapa de hibridación. Las pruebas de sensibilidad se realizaron utilizando ADN genómico purificado procedente de varias cepas de MRSA y cada tipo de MREP presentó un límite de detección de 2 copias de genoma (Tabla 20). Ninguna de las 26 MRCNS o de las 8 MSCNS dieron positivas con este ensayo multiplex. De nuevo, como se observa con los cebadores de Hiramatsu, 13 cepas de MSSA se detectaron también de manera no específica. (Tabla 21). Cuatro de las cepas que no se detectaron con el ensayo multiplex para la detección de los tipos i a v de MREP se detectaron ahora con este ensayo multiplex mientras que las cuatro cepas de MRSA (CCRI-9208, CCRI-9770, CCRI-9681 y CCRI-9860) que alojan
las secuencias de los tipos vi, viii, ix y x de MREP descritas en la presente invención permanecieron indetectables.
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Ejemplo 8 Desarrollo de los ensayos de PCR en tiempo real del Smart Cycler® para la detección e identificación de MRSA basado en los tipos vi, viii y ix de MREP
En el análisis de los nuevos datos de la secuencia de los tipos vi, viii y ix de MREP descritos en la presente invención, se diseñaron nuevos cebadores específicos para el tipo vi de MREP (SEC. ID. nº 201) un cebador específico para el tipo viii de MREP (SEC. ID. nº 115), un cebador específico para el tipo ix de MREP (SEC. ID. nº 109) y un cebador específico para ambos tipos viii y ix de MREP (SEC. ID. nº 116). Cada cebador de PCR se utilizó en combinación con el cebador específico para orfX (SEC. ID. nº 64) y se ensayó frente a su cepa diana específica. Cada reacción PCR contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH 9,0), Triton X-100 al 0,1%, MgCl_{2} 3,45 mM, 0,4 \muM de cada uno de los cebadores específicos para SCCmec y para orfX, 200 \muM de los cuatro dNTP, 3,4 \mug/\mul de BSA (Sigma) y 0,875 U de Taq polimerasa acoplada con el anticuerpo TaqStart^{TM}. Se realizó la ampliación por PCR como se describe en el Ejemplo 7. Los ensayos de sensibilidad realizados utilizando ADN genómico purificado a partir de sus respectivas cepas diana de MRSA demostraron que la mejor combinación de pares de cebador fue las SEC. ID. nº 64 y nº 115 para la detección de los tipos viii y ix de MREP simultáneamente. Estos nuevos cebadores específicos para SCCmec pueden utilizarse en ensayos múltiples con cebadores específicos para los tipos i, ii, iii, iv, v y vii de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) descritos en Ejemplos anteriores para proporcionar un ensayo de MRSA más omnipresente.
En conclusión, los inventores han mejorado la ubicuidad de la detección de cepas de MRSA. Se han identificado nuevos tipos iv a x de MREJ. Entre las cepas representativas de estos nuevos tipos, los cebadores y/o sondas de Hiramatsu tuvieron éxito al detectar menos del 50% de los mismos. Los inventores han pasado ampliamente por consiguiente el límite del 50% por lo menos de ubicuidad, ya que sus cebadores y sondas fueron diseñados para detectar el 100% de las cepas probadas como representativas de los tipos iv a ix de MREJ. Por consiguiente, aunque la ubicuidad depende de la mezcla de cepas y representativas que están bajo análisis, los inventores saben ahora que cerca del 100% de ubicuidad es un objetivo alcanzable, cuando utilizan las secuencias de las uniones de la derecha (MREJ) para derivar sondas y cebadores que tratan de polimorfismo en esta zona. Dependiendo de cuántos tipos desconocidos de MREJ existen, los inventores disponen de un margen de maniobra comprendido entre 50% (superior a los cebadores de Hiramatsu para las cepas ensayadas) y 100% si los inventores secuencian todos los MREJ existentes para proporcionar apropiadamente las presentes herramientas y procedimientos de diagnóstico, siguiendo las directrices anteriores.
TABLA 1 Cebadores de ampliación por PCR publicados por Hiramatsu et al. en la patente US nº 6.156.507 descritos en el listado siguiente
7
TABLA 2 Ensayos de especificidad y ubicuidad realizados en un termociclador convencional utilizando un conjunto óptimo de cebadores descrito por Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, 58 y 60 respectivamente, en la presente invención) para la detección de MRSA
9
TABLA 3 Origen de las cepas MRSA no ampliables utilizando los cebadores diseñados por Hiramatsu et al. (SEC. ID. nº 22, nº 24 y nº 28 en la patente US nº 6.156.507 correspondiente a las SEC. ID. nº 56, 58 y 60 respectivamente, en la presente invención), así como los cebadores desarrollados desarrollados en los tipos i, ii y iii (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) de MREP diana de la presente invención
11
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TABLA 4 Secuencias nucleotídicas de MREJ de Staphylococcus aureus dadas a conocer en la presente invención
12
TABLA 4 (continuación)
13
TABLA 4 (continuación)
14
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TABLA 5 Cebadores de PCR desarrollados en la presente invención
15
TABLA 5 (continuación)
16
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TABLA 6 Sondas moleculares fluorescentes desarrolladas en la presente invención
17
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TABLA 7 Longitud de los amplicones obtenidos con los diferentes pares de cebador que son objeto de la presente invención
18
TABLA 7 (continuación)
19
TABLA 8 Otros cebadores desarrollados en la presente invención
20
TABLA 9 Cebadores de ampliación y/o secuenciado desarrollados en la presente invención
21
TABLA 9 (continuación)
22
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TABLA 10 Origen de los ácidos nucleicos y/o de las secuencias disponibles en las bases de datos públicas halladas en el listado de secuencias
23
TABLA 10 (continuación)
24
TABLA 10 (continuación)
25
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TABLA 11 Sensibilidad analítica del ensayo de PCR específico para MRSA que se dirige a los tipos i, ii y iii de MREP en un termociclador convencional utilizando el conjunto de cebadores desarrollado en la presente invención (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67)
26
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TABLA 12 Ensayos de especificidad y ubicuidad llevados a cabo en un termociclador convencional utilizando el conjunto de cebadores que se dirigen a los tipos i, ii y iii de MREP desarrollados en la presente invención (SEC. ID. nº 64, nº 66 y nº 67) para la detección de MRSA
27
28
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TABLA 13 Porcentaje de la identidad de secuencias para los primeros 500 nucleótidos de los extremos derechos de SCCmec entre los 9 tipos de MREP^{a,b}
29
TABLA 14 Cepas de referencia utilizadas para el ensayo de sensibilidad y/o especificidad y/o ubicuidad de los ensayos de PCR específicos para MRSA que se dirigen a las secuencias MREJ
30
TABLA 14 (continuación)
31
TABLA 14 (continuación)
32
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TABLA 15 Cepas clínicas utilizadas para probar la sensibilidad y/o especificidad y/o ubicuidad de los ensayos de PCR específicos para MRSA que se dirigen a las secuencias MREJ
33
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TABLA 16 Sensibilidad analítica de los ensayos realizados en un termociclador convencional utilizando el conjunto de cebadores que se dirigen a los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) desarrollados en la presente invención para la detección e identificación de MRSA
34
TABLA 16 (continuación)
35
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TABLA 17 Pruebas de especificidad y ubicuidad llevadas a cabo en un termociclador convencional utilizando el conjunto de cebadores que se dirigen a los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) desarrollados en la presente invención para la detección de MRSA
36
TABLA 18 Sensibilidad analítica de los ensayos realizados en el termociclador Smart Cycler® utilizando el conjunto de cebadores que se dirigen a los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) y sonda molecular fluorescente (SEC. ID. nº 84) desarrollados en la presente invención para la detección e identificación de MRSA
37
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TABLA 19 Ensayos de especificidad y ubicuidad realizados en el termociclador Smart Cycler® utilizando el conjunto de cebadores que se dirigen a los tipos i, ii, iii, iv y v de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) y sonda molecular fluorescente (SEC. ID. nº 84) desarrollados en la presente invención para la detección de MRSA
38
39
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TABLA 20 Sensibilidad analítica de los ensayos realizados en el termociclador Smart Cycler® utilizando el conjunto de cebadores que se dirigen a los tipos i, ii, iii, iv, v y vii de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) y sonda molecular fluorescente (SEC. ID. nº 84) desarrollados en la presente invención para la detección e identificación de MRSA
40
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TABLA 21 Ensayos de especificidad y ubicuidad realizados en el termociclador Smart Cycler® utilizando el conjunto de cebadores que se dirigen a los tipos i, ii, iii, iv, vi y vii de MREP (SEC. ID. nº 64, nº 66, nº 67, nº 79 y nº 80) y sonda molecular fluorescente (SEC. ID. nº 84) desarrollados en la presente invención para la detección e identificación de MRSA
41
42
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ANEXO I
Estrategia para la selección de cebadores de ampliación específicos para MREP de los tipos i e ii
43
\newpage
ANEXO I (continuación)
44
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ANEXO II
Estrategia para la selección de una sonda específica molecular fluorescente para la detección en tiempo real de MREJ
45
46
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(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTES
\hskip1.5cm
HULETSKY, Ann ^{1}, 1231 Av des Pins, Sillery, Quebec, Canadá, G1S 4J3
\hskip1.5cm
ROSSBACH, Valery ^{1}, 55 Rue du Sauternes, Aylmer, Quebec, Canadá, J9H 3W7
\hskip1.5cm
^{1}:ciudadanía canadiense
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: SECUENCIAS PARA LA DETECCIÓN E IDENTIFICACIÓN DE STAPHYLOCOCCUS AUREUS RESISTENTE A LA METICILINA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 233
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DIRECCIÓN/DESTINATARIO
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD:
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO:
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS:
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CP:
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
MEDIO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE SOPORTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO:
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FECHA DE SOLICITUD ACTUAL
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FECHA DE SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
DATOS DE ABOGADO/AGENTE DE INFORMACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO:
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE CONTACTO:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FAX:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 1
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3050 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: NCTC 10442
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB033763
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. nº: 1
\vskip1.000000\baselineskip
47
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3050 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de D86934
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 2
\vskip1.000000\baselineskip
49
50
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 3
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3183 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: NCTC 8325
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014440
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 3
\vskip1.000000\baselineskip
51
52
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 479 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 86/560
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013471
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 4
53
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 5
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 86/961
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013472
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 5
54
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA SEC ID nº: 6
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/3907
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013473
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 6
55
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 7
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 86/2652
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013474
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 7
\vskip1.000000\baselineskip
56
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 8
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 309 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/1340
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013475
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 8
\vskip1.000000\baselineskip
57
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 9
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 471 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/1762
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013476
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 9
58
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 10
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013477
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 10
59
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 11
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2111
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013478
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 11
60
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 12
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/5495
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013479
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 12
61
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 13
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 478 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/1836
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013480
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 13
62
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 14
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 479 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2147
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013481
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 14
63
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 15
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/3619
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013482
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 15
64
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 16
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/3566
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB013483
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 16
65
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 17
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2232
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014402
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 17
66
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 18
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2235
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014403
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 18
67
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 19
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 458 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: MR108
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014404
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 19
68
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 20
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/9302
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014430
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 20
\vskip1.000000\baselineskip
69
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 21
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 84/9580
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014431
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 21
\vskip1.000000\baselineskip
70
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 22
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/1940
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014432
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 22
71
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 23
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 385 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 61/6219
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014433
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 23
72
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 24
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 340 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 64/4176
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014434
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 24
\vskip1.000000\baselineskip
73
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 25
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 369 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 64/3846
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: AB014435
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 25
\vskip1.000000\baselineskip
74
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 26
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3050 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 26
\vskip1.000000\baselineskip
75
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 27
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 657 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 27
\vskip1.000000\baselineskip
77
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 28
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 782 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1263
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 28
\vskip1.000000\baselineskip
78
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 29
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 744 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1311
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 29
\vskip1.000000\baselineskip
79
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 30
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 652 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1331
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 30
\vskip1.000000\baselineskip
80
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 31
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2436 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1377
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 31
\vskip1.000000\baselineskip
81
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 32
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 32
\vskip1.000000\baselineskip
83
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 336 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus epidermidis
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: G3
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 15, PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 33
\vskip1.000000\baselineskip
84
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 34
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 260 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus haemolyticus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: SH 518
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 16, PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 34
85
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 35
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: ATCC 25923
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 9, PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 35
\vskip1.000000\baselineskip
86
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 36
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: STP23
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 10 PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 36
\vskip1.000000\baselineskip
87
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 37
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: STP43
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 12 PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 37
\vskip1.000000\baselineskip
88
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 38
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 225 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: STP53
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: SEC ID nº: 13 PATENTE US nº 6.156.507
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 38
\vskip1.000000\baselineskip
89
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 39
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1500 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 476
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de Genome project
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 39
90
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 40
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1501 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 252
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de Genome project
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 40
92
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 41
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2480 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: COL
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de Genome project
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 41
93
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 42
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1045 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: ATCC 33592
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 42
95
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 43
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1118 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-8895
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 43
96
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 44
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1118 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-8903
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 44
97
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 45
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1113 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1324
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 45
98
99
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 46
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2153 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1331
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 46
\vskip1.000000\baselineskip
100
101
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 47
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 737 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1263
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 47
\vskip1.000000\baselineskip
102
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 48
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1592 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1377
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 48
103
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 49
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 730 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1311
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 49
\vskip1.000000\baselineskip
104
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 50
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1696 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 50
\vskip1.000000\baselineskip
105
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 51
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2122 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9504
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 51
\vskip1.000000\baselineskip
107
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 52
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 52
\vskip1.000000\baselineskip
109
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 53
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 53
\vskip1.000000\baselineskip
110
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 54
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 54
\vskip1.000000\baselineskip
111
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 55
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 55
\vskip1.000000\baselineskip
112
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 56
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 56
\vskip1.000000\baselineskip
113
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 57
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 57
\vskip1.000000\baselineskip
114
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 58
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 58
\vskip1.000000\baselineskip
115
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 59
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 59
\vskip1.000000\baselineskip
116
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 60
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 60
\vskip1.000000\baselineskip
117
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 61
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 61
\vskip1.000000\baselineskip
118
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 62
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 62
\vskip1.000000\baselineskip
119
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 63
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 33 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 63
\vskip1.000000\baselineskip
120
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 64
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 19 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 64
\vskip1.000000\baselineskip
121
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 65
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 65
\vskip1.000000\baselineskip
122
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 66
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 66
\vskip1.000000\baselineskip
123
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 67
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 67
\vskip1.000000\baselineskip
124
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 68
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 68
\vskip1.000000\baselineskip
125
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 69
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 69
\vskip1.000000\baselineskip
126
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 70
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 70
\vskip1.000000\baselineskip
127
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 71
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 19 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 71
\vskip1.000000\baselineskip
128
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 72
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 72
\vskip1.000000\baselineskip
129
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 73
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 73
\vskip1.000000\baselineskip
130
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 74
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 74
\vskip1.000000\baselineskip
131
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 75
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 75
\vskip1.000000\baselineskip
132
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 76
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 76
\vskip1.000000\baselineskip
133
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 77
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 77
\vskip1.000000\baselineskip
134
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 78
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: NCTC 8325
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de X52593
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 78
\vskip1.000000\baselineskip
135
136
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 79
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 79
\vskip1.000000\baselineskip
137
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 80
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 80
\vskip1.000000\baselineskip
138
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 81
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 81
\vskip1.000000\baselineskip
139
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 82
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: NCTC 10442
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB033763
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 82
\vskip1.000000\baselineskip
140
141
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 83
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 83
142
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 84
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 84
143
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 85
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 85
144
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 86
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 86
145
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 87
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 87
146
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 88
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 88
147
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 89
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 89
\vskip1.000000\baselineskip
148
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 90
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de D86934
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 90
149
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 91
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2007 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB037671
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 91
151
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 92
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: NCTC 10442
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB033763
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 92
\vskip1.000000\baselineskip
153
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 93
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de D86934
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 93
\vskip1.000000\baselineskip
154
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 94
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 94
\vskip1.000000\baselineskip
155
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 95
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 675 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: NCTC 8325
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de X53818
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 95
\vskip1.000000\baselineskip
156
157
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 96
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 96
\vskip1.000000\baselineskip
158
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 97
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 97
\vskip1.000000\baselineskip
159
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 98
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 98
\vskip1.000000\baselineskip
160
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 99
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 99
\vskip1.000000\baselineskip
161
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 100
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 100
\vskip1.000000\baselineskip
162
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 101
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 101
\vskip1.000000\baselineskip
163
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 102
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 102
\vskip1.000000\baselineskip
164
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 103
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 103
\vskip1.000000\baselineskip
165
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 104
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1256 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB037671
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 104
\vskip1.000000\baselineskip
166
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 105
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 105
\vskip1.000000\baselineskip
168
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 106
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 106
\vskip1.000000\baselineskip
169
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 107
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 107
\vskip1.000000\baselineskip
170
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 108
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 35 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 108
\vskip1.000000\baselineskip
171
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 109
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 109
\vskip1.000000\baselineskip
172
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 110
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 110
\vskip1.000000\baselineskip
173
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 111
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 111
\vskip1.000000\baselineskip
174
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 112
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 112
\vskip1.000000\baselineskip
175
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 113
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 113
\vskip1.000000\baselineskip
176
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 114
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 114
\vskip1.000000\baselineskip
177
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 115
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 115
\vskip1.000000\baselineskip
178
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 116
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 116
\vskip1.000000\baselineskip
179
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 117
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 117
\vskip1.000000\baselineskip
180
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 118
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 118
\vskip1.000000\baselineskip
181
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 119
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 119
\vskip1.000000\baselineskip
182
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 120
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 120
\vskip1.000000\baselineskip
183
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 121
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 121
\vskip1.000000\baselineskip
184
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 122
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 122
\vskip1.000000\baselineskip
185
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 123
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 123
\vskip1.000000\baselineskip
186
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 124
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 124
\vskip1.000000\baselineskip
187
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 125
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 125
\vskip1.000000\baselineskip
188
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 126
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 126
\vskip1.000000\baselineskip
189
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 127
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 127
\vskip1.000000\baselineskip
190
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 128
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 128
\vskip1.000000\baselineskip
191
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 129
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 129
\vskip1.000000\baselineskip
192
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 130
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 130
\vskip1.000000\baselineskip
193
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 131
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 131
\vskip1.000000\baselineskip
194
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 132
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 132
\vskip1.000000\baselineskip
195
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 133
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 133
\vskip1.000000\baselineskip
196
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 134
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 134
\vskip1.000000\baselineskip
197
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 135
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 135
\vskip1.000000\baselineskip
198
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 136
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 136
\vskip1.000000\baselineskip
199
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 137
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 137
\vskip1.000000\baselineskip
200
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 138
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 138
\vskip1.000000\baselineskip
201
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 139
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 139
\vskip1.000000\baselineskip
202
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 140
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 140
\vskip1.000000\baselineskip
203
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 141
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 141
\vskip1.000000\baselineskip
204
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 142
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 142
\vskip1.000000\baselineskip
205
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 143
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 143
\vskip1.000000\baselineskip
206
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 144
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 144
\vskip1.000000\baselineskip
207
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 145
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 145
\vskip1.000000\baselineskip
208
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 146
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 146
\vskip1.000000\baselineskip
209
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 147
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 147
\vskip1.000000\baselineskip
210
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 148
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 148
\vskip1.000000\baselineskip
211
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 149
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 149
\vskip1.000000\baselineskip
212
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 150
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 150
\vskip1.000000\baselineskip
213
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 151
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 151
\vskip1.000000\baselineskip
214
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 152
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 152
\vskip1.000000\baselineskip
215
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 153
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 153
\vskip1.000000\baselineskip
216
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 154
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 154
\vskip1.000000\baselineskip
217
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 155
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 155
\vskip1.000000\baselineskip
218
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 156
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 156
\vskip1.000000\baselineskip
219
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 157
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 157
\vskip1.000000\baselineskip
220
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 158
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 158
\vskip1.000000\baselineskip
221
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 159
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 159
\vskip1.000000\baselineskip
222
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 160
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 48 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 160
\vskip1.000000\baselineskip
223
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 161
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 161
\vskip1.000000\baselineskip
224
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 162
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 162
\vskip1.000000\baselineskip
225
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 163
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 163
\vskip1.000000\baselineskip
226
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 164
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 164
\vskip1.000000\baselineskip
227
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 165
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1282 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9583
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 165
\vskip1.000000\baselineskip
228
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 166
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1108 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9589
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 166
229
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 167
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1530 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9860
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 167
\vskip1.000000\baselineskip
230
231
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 168
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1256 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9681
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 168
\vskip1.000000\baselineskip
232
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 169
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 846 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9887
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 169
\vskip1.000000\baselineskip
233
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 170
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1270 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9772
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 170
\vskip1.000000\baselineskip
234
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 171
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 991 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9208
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 171
\vskip1.000000\baselineskip
236
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 172
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 748 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9770
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 172
237
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 173
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 917 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9864
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 173
238
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 174
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1132 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9865
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 174
\vskip1.000000\baselineskip
240
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 175
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1133 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9866
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 175
\vskip1.000000\baselineskip
241
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 176
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1087 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9867
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 176
\vskip1.000000\baselineskip
242
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 177
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 903 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9868
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 177
\vskip1.000000\baselineskip
243
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 178
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1114 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9869
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 178
244
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 179
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1121 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9871
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 179
\vskip1.000000\baselineskip
245
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 180
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1121 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9872
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 180
\vskip1.000000\baselineskip
246
247
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 181
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1131 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9873
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 181
248
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 182
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 896 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9874
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 182
249
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 183
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1125 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9875
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 183
\vskip1.000000\baselineskip
250
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 184
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 679 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9876
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 184
\vskip1.000000\baselineskip
252
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 185
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1125 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9882
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 185
\vskip1.000000\baselineskip
253
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 186
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 926 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9885
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 186
\vskip1.000000\baselineskip
254
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 187
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 187
\vskip1.000000\baselineskip
256
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 188
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 188
\vskip1.000000\baselineskip
257
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 189
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2154 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9583
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 189
\vskip1.000000\baselineskip
258
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 190
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2410 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9504
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 190
\vskip1.000000\baselineskip
259
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA SEC ID nº: 191
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1858 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9208
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 191
\vskip1.000000\baselineskip
260
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 192
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1861 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9589
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 192
\vskip1.000000\baselineskip
261
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 193
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1861 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9681
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 193
262
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 194
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1052 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9772
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 194
263
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 195
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3101 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9770
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 195
\vskip1.000000\baselineskip
264
265
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 196
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3506 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9887
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 196
266
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 197
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 928 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-175
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 197
268
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 198
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 782 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1262
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 198
\vskip1.000000\baselineskip
269
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 199
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 709 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-8894
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 199
270
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 200
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 200
\vskip1.000000\baselineskip
271
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 201
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 201
\vskip1.000000\baselineskip
272
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 202
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 202
\vskip1.000000\baselineskip
273
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 203
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 203
\vskip1.000000\baselineskip
274
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 204
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 204
\vskip1.000000\baselineskip
275
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 205
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 205
\vskip1.000000\baselineskip
276
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 206
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 206
\vskip1.000000\baselineskip
277
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 207
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 207
\vskip1.000000\baselineskip
278
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 208
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 208
\vskip1.000000\baselineskip
279
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 209
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 209
\vskip1.000000\baselineskip
280
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 210
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 210
\vskip1.000000\baselineskip
281
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 211
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 35 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 211
\vskip1.000000\baselineskip
282
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 212
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 212
\vskip1.000000\baselineskip
283
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 213
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 213
\vskip1.000000\baselineskip
284
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 214
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 214
\vskip1.000000\baselineskip
285
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 215
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 34 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 215
\vskip1.000000\baselineskip
286
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 216
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 216
\vskip1.000000\baselineskip
287
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 217
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 217
\vskip1.000000\baselineskip
288
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 218
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 218
\vskip1.000000\baselineskip
289
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 219
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 721 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9504
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 219
\vskip1.000000\baselineskip
290
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 220
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1791 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1331
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 220
\vskip1.000000\baselineskip
291
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 221
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 600 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-1377
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 221
292
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 222
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1640 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 222
\vskip1.000000\baselineskip
293
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 223
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 592 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-2025
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 223
\vskip1.000000\baselineskip
295
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 224
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2386 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9860
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 224
296
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 225
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 623 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9860
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 225
297
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 226
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 651 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de L29436
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 226
\vskip1.000000\baselineskip
298
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 227
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 563 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de L29436
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 227
\vskip1.000000\baselineskip
299
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 228
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1380 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de S67449
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 228
\vskip1.000000\baselineskip
300
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 229
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1365 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 229
\vskip1.000000\baselineskip
302
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 230
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 831 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: HUC19
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AF181950
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 230
304
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 231
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 4193 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: N315
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AP003129
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 231
305
306
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 232
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2996 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: 85/2082
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REGISTRO: Extraído de AB037671
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 232
\vskip1.000000\baselineskip
307
308
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID nº: 233
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1410 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: Ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO FILAMENTO: Doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: Lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO MOLECULAR: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Staphylococcus aureus
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: CCRI-9681
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 233
309

Claims (36)

1. Procedimiento para detectar la presencia o ausencia de una cepa de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA) de tipo iv de MREJ que comprende:
a)
poner en contacto una muestra que ha de analizarse para la presencia o ausencia de dicha cepa de MRSA, incluyendo dicha cepa de MRSA un elemento mec del cromosoma del casete estafilocócico (SCCmec) que contiene un gen mecA insertado en el ADN cromosómico, generando así una secuencia de tipo iv de la unión del extremo derecho polimórfico (MREJ) que comprende las secuencias tanto del extremo derecho del elemento SCCmec como del ADN cromosómico contiguo a dicho extremo derecho
con un primer cebador y un segundo cebador,
en el que dichos primer y segundo cebadores son por lo menos 10 nucleótidos de longitud, y
i)
en el que dicho primer cebador se hibrida con dicho extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia de tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por: SEC. ID nº 42-46 y nº 51 y los complementos de las mismas, y
ii)
en el que dicho primer cebador se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus para generar específicamente un amplicón si dicha cepa de MRSA está presente en dicha muestra; y
b)
detectar la presencia o ausencia de dicho amplicón.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que dicha secuencia cromosómica de S. aureus se selecciona de entre ORFx, SEC. ID. nº: 172, SEC. ID. nº: 231 y un complemento de los mismos.
3. Procedimiento según la reivindicación 2, en el que dicha secuencia cromosómica de S. aureus es ORFx.
4. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en el que dicho procedimiento comprende la utilización de por lo menos un cebador y/o sonda seleccionados de entre las SEC. ID. nº siguientes: nº 79, nº 77, nº 145, nº 147, nº 64, nº 71, nº 72, nº 73, nº 74, nº 75, nº 76, nº 0, nº 103, nº 130, nº 132, nº 158, nº 159, nº 59, nº 62, nº 126, nº 127, nº 128, nº 129, nº 131, nº 200, nº 201, nº 60, nº 61, nº 63, nº 68, nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163, nº 164, nº 85, nº86, nº 87, nº 88 y nº 89, para la detección del tipo iv de MREJ.
5. Procedimiento según la reivindicación 4, que comprende la utilización de un par cebador constituido por las SEC. ID. nº 64 y nº 79.
6. Procedimiento según la reivindicación 5, que comprende además la utilización de por lo menos una sonda que presenta una secuencia seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163 y nº 164.
7. Procedimiento según la reivindicación 6, en el que dichos cebadores y sondas presentan las secuencias nucleotídicas siguientes: SEC. ID. nº 64, nº 79, nº 84, nº 163, nº 164 para la detección del tipo iv de MREJ.
8. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, que comprende además detectar la presencia o ausencia de por lo menos una cepa adicional de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA) en dicha muestra, comprendiendo dicha por lo menos una cepa de MRSA adicional una secuencia de ácido nucleico de tipo i, ii, iii, v, vi, vii, viii, o ix de la unión del extremo derecho de mec (MREJ), y siendo resistente debido a la presencia de un elemento SCCmec que contiene un gen mecA, habiendo sido insertado dicho SCCmec en el ADN cromosómico, generando así una unión del extremo derecho polimórfico (MREJ), en el que dicho procedimiento comprende además poner en contacto dicha muestra con por lo menos un cebador y/o sonda, que puede hibridarse específicamente con dicho extremo derecho del elemento SCCmec de dicha por lo menos una de dichas secuencias de ácido nucleico de los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de MREJ.
9. Procedimiento según la reivindicación 8, en el que dichos cebador y/o sonda presentan por lo menos 10 nucleótidos de longitud y pueden hibridarse con dicho extremo derecho del elemento SCCmec de por lo menos una de dichas secuencias de ácido nucleico de los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de MREJ que comprenden una secuencia seleccionada de entre el grupo constituido por:
a)
SEC ID nº: 1, 20-25, 41 y 199 para el tipo i de MREJ;
b)
SEC ID nº: 2, 17-19, 26, 40, 173-183, 185, 186 y 197 para el tipo ii de MREJ;
c)
SEC ID nº: 4-16, 104, 184 y 198 para el tipo iii de MREJ;
d)
SEC ID nº: 47-50 para el tipo v de MREJ;
e)
SEC ID nº: 171 para el tipo vi de MREJ;
f)
SEC ID nº: 165 y 166 para el tipo vii de MREJ;
g)
SEC ID nº: 167 para el tipo viii de MREJ; y
h)
SEC ID nº: 168 para el tipo ix de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
10. Procedimiento según la reivindicación 8 ó 9, que comprende la utilización de por lo menos un cebador y/o sonda seleccionados de entre las SEC. ID. nº siguientes:
a)
66, 100, 101, 105, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo i de MREJ;
b)
66, 97, 99, 100, 101, 106, 117, 118, 124, 125, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo ii de MREJ;
c)
67, 98, 102, 107, 108, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159; 58, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32; 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo iii de MREJ;
d)
65, 80, 146, 154, 155, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo v de MREJ;
e)
202, 203, 204, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo vi de MREJ;
f)
112, 113, 114, 119, 120, 121, 122, 123, 150, 151, 153, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo vii de MREJ;
g)
115, 116, 187, 188, 207, 208, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo viii de MREJ; y
h)
109, 148, 149, 205, 206, 64, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 70, 103, 130, 132, 158, 159, 59, 62, 126, 127, 128, 129, 131, 200, 201, 60, 61, 63, 32, 83, 84, 160, 161, 162, 163, 164, 85, 86, 87, 88 y 89, para la detección del tipo ix de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
11. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 8 a 10, que comprende además la utilización de por lo menos un par cebador seleccionado de entre las SEC. ID. nº siguientes:
a)
64/66, 64/100, 64/101; 59/52, 59/53, 59/54, 59/55, 59/56, 59/57, 60/52, 60/53, 60/54, 60/55, 60/56, 60/57, 61/52, 61/53, 61/54, 61/55, 61/56, 61/57, 62/52, 62/53, 62/54, 62/55, 62/56, 62/57, 63/52, 63/53, 63/54, 63/55, 63/56 y 63/57, para la detección del tipo i de MREJ;
b)
64/66, 64/97, 64/99, 64/100, 64/101, 59/52, 59/53, 59/54, 59/55, 59/56, 59/57, 60/52, 60/53, 60/54, 60/55, 60/56, 60/57, 61/52, 61/53, 61/54, 61/55, 61/56, 61/57, 62/52, 62/53, 62/54, 62/55, 62/56, 62/57, 63/52, 63/53, 63/54, 63/55, 63/56 y 63/57, para la detección del tipo ii de MREJ;
c)
64/67, 64/98, 64/102; 59/58, 60/58, 61/58, 62/58 y 63/58, para la detección del tipo iii de MREJ;
d)
64/80, para la detección del tipo v de MREJ;
e)
64/204, para la detección del tipo vi de MREJ;
f)
64/112 y 64/113, para la detección del tipo vii de MREJ;
g)
64/115 y 64/116, para la detección del tipo viii de MREJ; y
h)
64/109 y 64/116, para la detección del tipo ix de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
12. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 8 a 11, que comprende la utilización de por lo menos una sonda que presenta una secuencia seleccionada de entre el grupo constituido por: SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163 y nº 164 para la detección de dicha por lo menos una cepa MRSA adicional del tipo i, ii, iii, v, vi, vii, viii o ix de MREJ.
13. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 8 a 12, que comprende la utilización de cebadores y sondas que presentan las secuencias nucleotídicas siguientes:
a)
SEC ID nº: 64, 66, 84, 163, 164 para la detección del tipo i o ii de MREJ;
b)
SEC ID nº: 64, 67, 84, 163, 164 para la detección del tipo iii de MREJ;
c)
SEC ID nº: 64, 80, 84, 163, 164 para la detección del tipo v de MREJ; y
d)
SEC ID nº: 64, 112, 84, 163, 164 para la detección del tipo vii de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
14. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13, en el que múltiples cebadores y/o sondas se utilizan conjuntamente en el mismo recinto físico.
15. Procedimiento para el tipado de un MREJ de tipo iv de una cepa de MRSA, y por lo menos una cepa de MRSA adicional seleccionada de entre los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de MREJ que comprende las etapas siguientes: reproducir el procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14 con cebadores y/o sondas específicos para dicho tipo iv de MREJ y específicos para dicha por lo menos una cepa de MRSA adicional seleccionada de entre los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de MREJ, y detectar cada amplicón distintivamente como indicación de la presencia de dicho tipo iv de MREJ y dicho por lo menos un tipo de MREJ adicional.
16. Utilización de un kit específico para la detección de una cepa de MRSA que comprende una secuencia de ácido nucleico del tipo iv de MREJ, para la realización de cualquiera de los procedimientos según las reivindicaciones 1 a 7.
17. Utilización de un kit específico para la detección de una cepa de MRSA que comprende una secuencia de ácido nucleico de tipo iv de MREJ y por lo menos una cepa de MRSA adicional seleccionada de entre los tipos i, ii, iii, v, vi, vii, viii y ix de MREJ, para la realización de cualquiera de los procedimientos según las reivindicaciones 8 a 15.
18. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15, en el que se utiliza una pluralidad de diversos cebadores y/o sondas.
19. Procedimiento según la reivindicación 18, en el que dicha pluralidad de cebadores y/o sondas se selecciona en su totalidad para hibridarse en las mismas condiciones de hibridación.
20. Procedimiento según la reivindicación 19, en el que dicha pluralidad de cebadores y/o sondas pueden hibridarse con dicho tipo iv de MREJ, y por lo menos un tipo de MREJ adicional seleccionado de entre tipo i de MREJ, tipo ii de MREJ, tipo iii de MREJ, tipo iv de MREJ, tipo v de MREJ, tipo vi de MREJ, tipo vii de MREJ, tipo viii de MREJ y tipo ix de MREJ.
21. Procedimiento para determinar la presencia o ausencia de por lo menos cuatro tipos de MRET de MRSA en una muestra que comprende:
a)
reproducir el procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 8 a 15, 19 y 20 con cebadores y/o sondas específicos para cada uno de dichos por lo menos cuatro tipos de MREJ, siendo uno de los cuales el tipo iv de MREJ; y
b)
detectar cada amplicón de manera específica,
determinando así la presencia o ausencia de los tipos de MREJ de MRSA en una muestra.
\vskip1.000000\baselineskip
22. Procedimiento según la reivindicación 21, para determinar la presencia o ausencia del tipo iv, tipo i, tipo ii y tipo iii de MREJ.
23. Procedimiento según la reivindicación 21, para determinar la presencia o ausencia del tipo iv, tipo i, tipo ii tipo iii, y tipo vii de MREJ.
24. Procedimiento según la reivindicación 21, para determinar la presencia o ausencia del tipo iv, tipo i, tipo ii, tipo iii, tipo v, tipo vi, tipo vii, tipo viii y tipo ix de MREJ.
25. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que dicho procedimiento comprende la utilización de por lo menos un cebador y/o sonda específicos para un tipo iv de MREJ que comprende una secuencia seleccionada de entre las SEC. ID. nº 79, nº 145, nº 147 y nº 68, y por lo menos un cebador y/o una sonda específicos para el cromosoma de S. aureus y que comprende una secuencia seleccionada de entre las SEC. ID. nº 32, nº 59, nº 60-64, nº 70-76, nº 83-89, nº 103, nº 126-132, nº 160-164, nº 200 y nº 201.
26. Kit para detectar la presencia o ausencia de una cepa MRSA de tipo iv de MREJ en una muestra que comprende:
a)
un primer oligonucleótido que se hibrida con un extremo derecho del elemento SCCmec de una secuencia de tipo iv de MREJ seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 42-46 y nº 51 y un complemento de las mismas; y
b)
un segundo nucleótido que se hibrida con una secuencia cromosómica de S. aureus;
en el que dichos oligonucleótidos a) y b) constan de por lo menos 10 nucleótidos de longitud y permiten la generación selectiva de un amplicón que comprende secuencias tanto del extremo derecho del elemento SCCmec y del ADN cromosómico contiguo a dicho extremo derecho de dicha cepa MRSA de tipo iv de MREJ.
\vskip1.000000\baselineskip
27. Kit según la reivindicación 26, en el que dicha secuencia específica del ADN cromosómico de S. aureus es ORFx.
28. Kit según la reivindicación 26 ó 27, que comprende además por lo menos un oligonucleótido para la detección de por lo menos una cepa adicional de MRSA que comprende un tipo de MREJ seleccionado de entre el grupo constituido por: tipo i de MREJ, tipo ii de MREJ, tipo iii de MREJ, tipo v de MREJ, tipo vi de MREJ, tipo vii de MREJ, tipo viii de MREJ y tipo ix de MREJ.
29. Kit según cualquiera de las reivindicaciones 26 a 28, en el que dicho oligonucleótido en a) se selecciona de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 79, nº 145, nº 147 y nº 68.
30. Kit según cualquiera de las reivindicaciones 26 a 29, en el que dicho oligonucleótido en b) comprende una secuencia seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 32, nº 59, nº 60-64, nº 70-76, nº 83-89, nº 103, nº 126-132, nº 160-164, nº 200 y nº 201.
31. Kit según la reivindicación 30, que comprende un par de oligonucleótidos constituidos por las SEC ID nº 64 y nº 79.
32. Kit según la reivindicación 31, que comprende además por lo menos una sonda seleccionada de entre el grupo constituido por las SEC. ID. nº 32, nº 83, nº 84, nº 160, nº 161, nº 162, nº 163 y nº 164.
33. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 y 18 a 25, en el que se utiliza la PCR en tiempo real.
34. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 19 a 26, en el que se utiliza la PCR múltiple.
35. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 25, 33 y 34 o kit según cualquiera de las reivindicaciones 26 a 32, en el que dicho extremo derecho de SCCmec de una secuencia de tipo iv de ácido nucleico de MREJ está constituido por la SEC. ID nº 42 o un complemento de la misma.
36. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 25, 33 y 34 o kit según cualquiera de las reivindicaciones 26 a 32, en el que dicha secuencia de tipo iv de ácido nucleico de MREJ es la SEC. ID nº 43, nº 44, nº 45, nº 46, nº 51 o un complemento de las mismas.
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