DE69737786T2 - Testmedium und quantitative verfahren für den nachweis und die unterscheidung von biologischen materialen in einer testprobe - Google Patents

Testmedium und quantitative verfahren für den nachweis und die unterscheidung von biologischen materialen in einer testprobe Download PDF

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Description

  • HINTERGRUND DER ERFINDUNG
  • Die vorliegende Erfindung bezieht sich auf ein Verfahren für den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung biologischer Materialien in einer Probe, die eine Vielzahl verschiedener biologischer Materialien enthält und ein Testmedium zur Verwendung in dem Verfahren.
  • Die Erfindung bezieht sich weiterhin auf ein quantitatives Verfahren für das Erkennen und den Nachweis von Escherichia coli 0157 und das gleichzeitige quantitative Erkennen und Nachweisen anderer Stämme von Escherichia coli (E. coli), von allgemeinen Coliformen und von nicht-coliformen Enterobacteriaceae in gemischten mikrobiellen Proben.
  • Es gibt eine anhaltende Notwendigkeit der Überprüfung von Fleisch, Milchprodukten, Wasser und anderen Lebensmittelproben auf das Vorhandensein von krank machenden Substanzen, wie Bakterien, anderen Mikroben und Zellen und Geweben anderer Organismen. Diese Notwendigkeit hat nach der Entdeckung der enteropathogenen E. coli 0157-Bakterien in den frühen 80er Jahren eine zusätzliche Bedeutung erhalten. Ein zusätzlicher Antrieb ergab sich aus den vor kurzem öffentlich bekannt gewordenen Fällen von Erkrankungen und Tod durch den Verzehr von wenig gekochtem Rinderhackfleisch. In der Folge wurde der Entwicklung von Testverfahren für den Nachweis des Vorhandenseins und der Mengen derartiger schädigender Substanzen inDbiologischen Materialien, wie Nahrungsmitteln, Milchprodukten, Getränken und Wasser, sowie in medizinischen und veterinärmedizinischen Testmaterialien große Aufmerksamkeit geschenkt. Dies ist sowohl für die Identifizierung potentieller Gefahren in Materialien wie für diagnostische Zwecke wichtig.
  • Zusätzlich zu der oben erwähnten Notwendigkeit des Nachweises des Vorhandenseins und der Mengen von E. coli 0157 in einer Testprobe gibt es einen fortwährenden Bedarf an schnelleren und zuverlässigeren Testverfahren für den Nachweis des Vorhandenseins vieler anderer biologischer Materialien in einer Testprobe, von denen bekannt ist, dass sie die Qualität und die Sicherheit eines Produkts beeinträchtigen. Der Nachweis des Vorhandenseins oder des Fehlens derartiger biologischer Materialien liefert eine zusätzliche Basis, auf der die Qualität und die Sicherheit verschiedener Substanzen beurteilt werden kann.
  • Die Verwendung von Indikatororganismen in der Biotechnologie, der diagnostischen Chemie, der Mikrobiologie, der Molekularbiologie und auf damit verwandten Fachgebieten als Basis, auf der die Qualität eines Produkts oder einer Testprobe bestimmt werden kann, ist allgemein bekannt. Beispielsweise wird die Menge oder die Zahl der E. coli-Bakterien oder anderer Coliforme, die in Wasser vorhanden sind, als ein wichtiger Indikator für die Sauberkeit und Sicherheit dieses Wassers angesehen. In ähnlicher Weise wird das Vorhandensein von E. coli oder anderer Coliforme in Nahrungsmitteln und Milchprodukten als ein wichtiger Indikator für die Qualität dieser Produkte angesehen. Ebenso ist die schnelle und genaue Identifizierung bestimmter Gebilde in medizinischen Testproben wichtig für die Diagnose von Krankheitszuständen. Verbesserte Testverfahren für die effiziente Identifizierung, Trennung und Zählung derartiger Bakterientypen sind erforderlich, und es gibt eine andauernde Suche nach schnelleren, genaueren und vielseitigeren Testverfahren auf diesem Gebiet.
  • Es sind zahlreiche Testverfahren verwendet worden, um einen oder mehrere Indikatororganismen zu bestimmen, zu identifizieren und zu zählen. Einige dieser Testverfahren zeigen nur das Vorhandensein oder die Abwesenheit der Mikroorganismen an, während andere Verfahren auch versuchen, einen oder mehrere der speziellen Organismen in der Testprobe zu quantifizieren. Beispielsweise kann ein Test, der als Vorhandensein-/Abwesenheits-Test (oder V/A-Test) bezeichnet wird, um das Vorhandensein oder die Abwesenheit von Coliformen und E. coli in einer Testprobe zu ermitteln. Ein Testmedium, das das β-Galactosidase-Substrat O-Nitrophenyl-β-D-galactopyranosid (ONPG) und das β-Glucuronidase-Substrat 4-Methylumbelliferyl-β-D-glucuronid (MUG) enthält, wird mit der Testprobe beimpft. Um die allgemeinen Coliformen von E. coli zu unterscheiden, beruht dieser Test auf der Tatsache, dass im Allgemeinen alle Coliforme β-Galactosidase erzeugen, während nur E. coli zusätzlich zu β-Galactosidase auch β-Glucuronidase erzeugt. Falls irgendwelche Coliforme vorhanden sind (einschließlich E. coli), nimmt das Bouillonmedium eine gelbe Farbe an aufgrund der Einwirkung des Galactosidasenzyms auf das ONPG-Material, was die Freisetzung eines diffusionsfähigen gelben Pigments hervorruft. Falls E. coli vorhanden ist, zeigt das Bouillonmedium eine blaue Fluoreszenz, wenn es mit Ultraviolett-Strahlung bestrahlt wird aufgrund des Zerfalls des MUG-Reagens unter Freisetzung des fluorogenen Farbstoffs, die durch das Reaktionsprodukt des Glucuronidaseenzyms verursacht wird. Diese Reaktionen sind sehr spezifisch und erlauben den Nachweis sowohl der Coliformen im Allgemeinen als auch von E. coli in einer einzigen Probe. Ein Nachteil dieses Tests besteht darin, dass er für beide Bakterientypen nicht direkt quantitativ ist, da beide Reagenzien diffusionsfähige Pigmente erzeugen. Der Test erfordert außerdem eine spezielle Ausrüstung für die Erzeugung der Ultraviolett-Strahlung. Außerdem kann dieser Test nur für den Nachweis von Coliformen und von E. coli verwendet werden. Andere wichtige Organismen, wie der Stamm E. coli 0157, der Glucuronidase-negativ ist, werden nicht nachgewiesen, und Gleiches gilt für andere Mikroorganismen, die Galactosidase-Glucuronidase nicht erzeugen.
  • Das Kristallviolett-Neutralrot-Galle-Agar-Verfahren (VRBA-Verfahren) ist verwendet worden, um die Menge sowohl an Coliformen als auch an E. coli in einer Testprobe zu ermitteln. Das in diesem Verfahren verwendete Testmedium enthält Gallensalze (um Nicht-Coliforme zu hemmen), Lactose und den pH-Indikator Neutralrot. Die Coliforme (eingeschlossen E. coli) wachsen in dem Medium, die Lactose wird unter Säurebildung fermentiert, und das Neutralrot nimmt in dem Bereich der Bakterienkolonie eine ziegelsteinrote Farbe an. Die Ergebnisse dieses Tests lassen sich nicht immer einfach interpretieren, und für die Ermittlung des Vorhandenseins von E. coli müssen Nachfolgetests, wie die Brillantgrün-Lactose-Bouillon-Fermentierung, das Wachstum in EC-Bouillon bei 44,5 °C und das Ausstreichen auf Eosin-Methylenblau-Agar (EMBA) durchgeführt wird. Beim Membranfilter-Verfahren (MF-Verfahren) werden Micropore-Filter verwendet, durch die Proben hindurch treten, wobei die Bakterien auf der Oberfläche des Filters zurückgehalten werden. Dieses Verfahren wird am häufigsten verwendet, wenn Bakterienpopulationen sehr klein sind, und eine große Probe benötigt wird, um hinreichende Zahlen zu erhalten. Der Filter wird dann auf der Oberfläche eines ausgewählten Mediums angeordnet, inkubiert, und die Bakterienkolonien, die auf der Membranfilteroberfläche wachsen, werden gezählt und ausgewertet. Dieses Verfahren findet breite Anwendung und liefert gute Ergebnisse, wenn es mit geeigneten Reagenzien und Medien kombiniert wird. Ein Nachteil dieses Verfahrens besteht darin, dass es teuer und zeitaufwändig ist. Es funktioniert auch nicht gut mit festen Proben oder mit Proben, die eine hohe Zahl von Mikroorganismen enthalten. Das MF-Verfahren kann in Verbindung mit dem erfindungsgemäßen Verfahren, das in dieser Anmeldung beschrieben wird, verwendet werden.
  • Das Reagens 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-galactopyranosid (X-gal) ist eine bekannte Testverbindung für den Nachweis von Coliformen. Wenn das β-Galactosidaseenzym, das von den Coliformen produziert wird, auf X-gal einwirkt, bildet das X-gal einen unlöslichen, indigoblauen Niederschlag. X-gal kann in ein Nährstoffmedium wie eine Agarplatte, eingebracht werden, und falls eine Probe, die Coliforme enthält, vorhanden ist, wachsen die Coliforme als indigoblaue Kolonien. X-gal hat gegenüber der Verbindung ONPG, die oben beschrieben wird, den Vorteil, dass es einen wasserunlöslichen Niederschlag anstelle einer diffu sionsfähigen Verbindung bildet, wodurch die Durchführung einer quantitativen Bestimmung der Coliformen ermöglicht wird, wenn die Testprobe in ein oder auf ein verfestigtes Medium gegeben wird.
  • Ein ähnliche Verbindung, 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid (X-gluc) ist eine bekannte Testverbindung für den Nachweis von E. coli. Wenn das β-Glucuronidaseenzym, das von den meisten E. coli-Stämmen erzeugt wird, darauf einwirkt, bildet X-gluc einen unlöslichen indigoblauen Niederschlag. X-gluc hat gegenüber der Verbindung MUG, die oben beschrieben wird, den Vorteil, dass es einen wasserunlöslichen Niederschlag bildet, anstelle einer diffusionsfähigen Verbindung, wodurch die Durchführung einer quantitativen Bestimmung von E. coli ermöglicht wird, wenn die Testprobe in ein oder auf ein verfestigtes Medium gegeben wird. Außerdem erfordert es nicht die Verwendung von Ultraviolettlicht. X-gluc und seine Fähigkeit, E. coli nachzuweisen, werden in Watkins et al., Appl. Environ. Microbiol. 54:1874-1875 (1988) beschrieben. Eine ähnliche Verbindung, Indoxyl-β-D-glucuronid, die ebenfalls tiefblaue Kolonien von E. coli erzeugt, wurde in Ley, et al., Can. J. Microbiol. 34:690-693 (1987) beschrieben.
  • Auch wenn X-gal und X-gluc einzeln genommen brauchbar sind für die quantitative Bestimmung entweder von Coliformen (X-gal) oder E. coli (X-gluc), weisen diese Indikatorverbindungen den Nachteil auf, dass sie beide das gleiche Chromogen enthalten. Daher können sie nicht zusammen verwendet werden, um sowohl E. coli als auch allgemeine Coliforme in einem einzigen Test mit einer einzigen Probe zu identifizieren und zu unterscheiden, da sie beide identisch gefärbte indigoblaue Kolonien erzeugen. Eine Person, die beide Reagenzien zusammen verwendet, wäre imstande, die Gesamtzahl der Coliformen quantitativ zu bestimmen, das gleiche Ergebnis, als wenn X-gal alleine verwendet würde, aber sie wäre nicht imstande, anzugeben, welche der Kolonien E. coli waren und welche andere Coliforme außer E. coli waren.
  • Ein vor kurzem entwickeltes Testverfahren für den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung allgemeiner Coliforme und von E. coli in einer Testprobe wird in dem US-Patent Nr. 5,210,022 beschrieben, die auf den Anmelder dieser Anmeldung übertragen wurde. Dieses Verfahren verbessert die Verfahren des Standes der Technik, da es die quantitative Bestimmung allgemeiner Coliforme und von E. coli in einer einzigen Probe erlaubt. Zusätzliche, bestätigende Tests sind nicht erforderlich. Die Testprobe wird zu einem Medium gegeben, das ein β-Galactosidase-Substrat, wie 6-Chlorindolyl-β-D-galactosid, und ein β-Glucuronidase-Substrat, wie 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid (X-gluc) enthält. Das β-Galactosidase-Substrat ist imstande, bei der Reaktion mit β-Galactosidase einen wasserunlöslichen Niederschlag mit einer ersten Farbe zu bilden, und das β-Glucuronidase-Substrat ist imstande, bei der Reaktion mit β-Glucuronidase einen wasserunlöslichen Niederschlag mit einer zweiten Farbe, die gegenüber der ersten Farbe kontrastiert, zu bilden. Als Ergebnis können allgemeine Coliforme quantifiziert werden, indem die Kolonien mit der ersten Farbe (die eine β-Galactosidase-Aktivität haben) ausgezählt werden, und E. coli kann quantifiziert werden, indem die Kolonien mit der zweiten Farbe (die sowohl eine β-Galactosidase- als auch β-Glucuronidase-Aktivität haben) ausgezählt werden. Obwohl das in dem Patent beschriebene Verfahren hervorragende Ergebnisse bei der Unterscheidung und dem Nachweis von allgemeinen Coliformen und von E. coli liefert, ist es nicht imstande, das Vorhandensein von E. coli 0157-Stämmen und nicht-coliformen Enterobacteriaceae festzustellen und zu quantifizieren.
  • Ein Verfahren zum Zählen von E. coli und der Gesamtzahl der Coliformen wird in der PCT-Anmeldung mit der internationalen Veröffentlichungsnummer WO 95/30024 offenbart. Dieses Verfahren schließt die Verwendung eines β-D-Galactosidase-Substrats und einer Kohlenstoffquelle, wie Adonit, Esculin, Salicin, Amygdalin, oder Cellobiose, ein. Sowohl E. coli- als auch Nicht-E. coli-coliforme Bakterien liefern in Gegenwart des β-D-Galactosidase-Substrats Reaktionsproduktsignale.
  • Zusätzlich erzeugen die nicht-E. coli-coliformen Bakterien ein Reaktionsproduktsignal in Gegenwart der Kohlenstoffquelle. Das Reaktionsproduktsignal kann sich als eine Reaktion niedrigerer Intensität, bezogen auf die β-D-Galactosidasereaktion, in einem lokalen Bereich, offenbaren, oder es kann ein niedrigerer lokaler pH-Wert oder eine höhere reduktive Metabolitkonzentration sein. E. coli metabolisiert die Kohlenstoffquelle nicht und sorgt daher nicht für ein Reaktionsproduktsignal in dessen Gegenwart. Die PCT-Anmeldung mit der internationalen Veröffentlichungsnummer WO 95/30024 schlägt außerdem vor, dass das Verfahren einen Schritt enthalten kann, mit dem eine Kontamination mit einer Subspezies durch E. coli 0157:H7 ausgeschlossen werden kann. Das Dokument schlägt vor, dass ein β-D-Glucuronpyranosid-Substrat oder Sorbit ausgenutzt werden kann; das Dokument liefert jedoch keinen Hinweis oder keine spezifischen Beispiele, wie diese Verbindungen in dem Verfahren verwendet werden könnten. Außerdem ist die Verwendung von Sorbit chemisch und optisch inkompatibel mit dem Verfahren entgegen der Beschreibung. Außerdem können mindestens einige der pH-Indikatoren (d. h. wie Phenolrot), die von WO 95/30024 vorgeschlagen werden, chemisch und optisch inkompatibel mit dem X-Gluc-Substrat (β-D-Glucuronpyranosid) sein, dessen Verwendung mit dem Red-Gal-Galactosidase-Substrat empfohlen wird.
  • Andere bekannte Verfahren für den Nachweis und für die Unterscheidung bestimmter Mikroorganismen basieren auf den Unterschieden, die die Mikroorganismen im Hinblick auf ihre Fähigkeit zeigen, bestimmte Kohlenwasserstoffe, wie den Zucker Sorbit, zu fermentieren. Man weiß beispielsweise von allgemeinen Coliformen und von den meisten Stämmen von E. coli, dass sie die Fähigkeit haben, Sorbit zu fermentieren. E. coli 0157 und die meisten nicht-coliformen Enterobacteriaceae fermentieren Sorbit nicht. Im Ergebnis, wenn eine Testprobe zu einem fermentierbaren Medium gegeben wird, das Sorbit als die einzige Kohlenstoffquelle enthält, wie MacConkey-Sorbit-Agar, in Gegenwart eines geeigneten pH-Indikators, wie Neutralrot, wachsen die allgemeinen Coliformen und die meisten E. coli-Stämme aufgrund der Säureproduktion bei der Sorbitfermentation als rote Kolonien, Stämme, die Sorbit nicht fermentieren, wie E. coli 0157, auf diesem Medium als farblose Kolonien. Da es jedoch auch viele nicht-sorbit-fermentierende Enterobacteriaceae gibt, ist es praktisch unmöglich, E. coli 0157 mit irgendeiner Sicherheit auf diesem Medium nachzuweisen. Zusätzlich ist der Test nicht im Stande, E. coli von allgemeinen Coliformen zu unterscheiden.
  • Es gibt daher einen Bedarf an der Bereitstellung eines Testverfahrens, das für die Unterscheidung einer größeren Vielzahl biologischer Materialien in Proben, die gemischte Populationen enthalten, brauchbar ist, als dies mit den existierenden Verfahren erreicht werden kann. Weiterhin gibt es einen Bedarf an Verfahren, die schneller, einfacher und vielseitiger als die Verfahren des Stands der Technik sind.
  • ZUSAMMENFASSUNG DER ERFINDUNG
  • Die vorliegende Erfindung überwindet die Nachteile der Verfahren des Standes der Technik, indem sie ein Testverfahren für den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung biologischer Materialien in einer Testprobe, die eine Vielzahl verschiedener biologischer Materialien enthält, und ein Medium zur Verwendung in dem Testverfahren bereitstellt.
  • In einer ihrer Ausführungsformen umfasst die vorliegende Erfindung ein Verfahren für den Nachweis des Vorhandenseins und den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung bestimmter biologischer Materialien in einer Testprobe, die eine Vielzahl verschiedener biologischer Materialien umfasst, wobei ein erstes biologisches Material eine Enzymspezifität für ein erstes chromogenes Substrat und ein zweites biologisches Material eine Enzymspezifität für ein zweites chromogenes Substrat hat, und wobei mindestens einige der biologischen Materialien imstande sind, ein Kohlenhydrat, wie einen Zucker, zu fermentie ren. Ein Testmedium, das imstande ist, eine Matrix oder eine feste Oberfläche mit der Testprobe zu bilden, wird bereitgestellt. Das Testmedium umfasst ein erstes chromogenes Substrat, ein zweites chromogenes Substrat, eine fermentierbare Kohlenstoffquelle, wie einen speziellen Zucker, einen pH-Indikator und ein Nährstoffgrundmedium. Das erste chromogene Substrat ist imstande, bei der Umsetzung mit einem Enzym, das von dem ersten biologischen Material erzeugt wird oder in diesem vorhanden ist, eine wasserunlösliche Verbindung mit einer ersten Farbe zu bilden, und das zweite chromogene Substrat ist imstande, bei der Umsetzung mit einem Enzym, das von dem zweiten biologischen Material erzeugt wird oder in diesem vorhanden ist, eine wasserunlösliche Verbindung mit einer Farbe zu bilden, die gegenüber der ersten Farbe kontrastiert. Die fermentierbare Kohlenstoffquelle ist imstande, einen Teil des Mediums bei der Fermentierung durch Zuckerfermentierende Bestandteile der Testprobe anzusäuern. Der PH-Indikator verursacht eine dritte Farbe, die als Reaktion auf die Ansäuerung gebildet wird, wobei die dritte Farbe eine gefärbte Zone um die Zucker-fermentierenden Bestandteile umfasst und visuell von der allgemeinen Hintergrundfarbe des Mediums unterscheidbar ist. Das Nährstoffgrundmedium umfasst vorzugsweise einen Feststoff, ein Gel oder eine Lösung für die Bildung eines Feststoffs. Der pH-Wert des Testmediums wird auf einen Bereich eingestellt, der für die Farbänderung des pH-Indikators bei der Ansäuerung des Mediums förderlich ist, und anschließend wird die Testprobe in das Testmedium geimpft. Das Testmedium, das mit der Testprobe geimpft wurde, wird dann unter Bedingungen inkubiert, die für das Wachstum von Kolonien des biologischen Materials förderlich sind. Die inkubierte Testprobe kann dann untersucht werden: Auf das Vorhandensein von Kolonien, die die erste Farbe aufweisen und die die dritte gefärbte Zone sichtbar wahrnehmbar und unterscheidbar darum herum haben, wobei diese Kolonien Zucker-fermentierende Kolonien des ersten biologischen Materials darstellen; auf das Vorhandensein von Kolonien, die eine zweite Farbe aufweisen und die die dritte gefärbte Zone sichtbar erkennbar und unterscheidbar darum herum aufweisen, wobei diese Kolonien Zucker fermentierende Kolonien des zweiten biologischen Materials darstellen, auf das Vorhandensein von Kolonien, die die erste Farbe haben und die weder die zweite Farbe noch die dritte gefärbte Zone erkennbar und unterscheidbar aufweisen, wobei diese Kolonien Kolonien eines dritten biologischen Materials darstellen; auf das Vorhandensein von Kolonien, die weder die erste noch die zweite Farbe haben, mit der oder ohne die dritte gefärbte Zone, wobei derartige Kolonien Kolonien von mindestens einem vierten biologischen Material sind; und auf das Vorhandensein von Kolonien, die eine vierte Farbe haben, mit der oder ohne die dritte gefärbte Zone, wobei derartige Kolonien Kolonien von mindestens einem fünften biologischen Material sind. Alle der jeweiligen Kolonien werden dann gezählt, um die Zahl aller spezifizierten biologischen Materialien, die in der Testprobe vorhanden sind, zu liefern.
  • In einer anderen Ausführungsform umfasst die vorliegende Erfindung ein Verfahren für das Erkennen des Vorhandenseins und den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung von E. coli 0157, anderer E. coli-Stämme, die E. coli 0157 nicht einschließen, allgemeiner Coliforme und nicht-coliformer Enterobacteriaceae in einer Testprobe. Ein Testmedium, das imstande ist, eine Matrix oder eine feste Oberfläche mit der Testprobe zu bilden, wird bereitgestellt. Das Testmedium umfasst ein chromogenes β-Galactosidase-Substrat, das imstande ist, bei der Umsetzung mit β-Galactosidase eine wasserunlösliche Verbindung mit einer ersten Farbe zu bilden, ein chromogenes β-Glucuronidase-Substrat, das imstande ist, bei der Umsetzung mit β-Glucuronidase einen zweiten wasserunlöslichen Bestandteil mit einer Farbe zu bilden, die sichtbar gegenüber der ersten Farbe kontrastiert, Sorbit als die einzige fermentierbare Kohlenstoffquelle, einen pH-Indikator zum Verursachen einer dritten Farbe, die bei der Ansäuerung gebildet wird, die aus der Sorbitfermentierung resultiert, wobei die dritte Farbe eine gefärbte Zone um die Sorbit-fermentierenden Bestandteile umfasst, die gegenüber der normalen Hintergrundfarbe des Mediums kontrastiert, und ein Nährstoffgrundmedium. Der pH-Wert des Testmediums wird auf einen Bereich eingestellt, der für die Farbänderung des pH-Indika tors beim Ansäuern des Mediums förderlich ist, und die Probe wird anschließend in das Testmedium geimpft. Das Testmedium, das die Probe enthält, wird unter Bedingungen inkubiert, die für das Wachsturn von allgemeinen Coliformen, E. coli, E. coli 0157 und nicht-coliformen Enterobacteriaceae förderlich ist, um so den ersten gefärbten und den zweiten gefärbten Niederschlag, die den Kolonien entsprechen, zu erzeugen, und eine Zone mit der dritten Farbe um die Sorbitfermentierenden Bestandteile zu erzeugen. Das Testmedium kann dann auf das Vorhandensein von Kolonien untersucht werden, die die erste Farbe und die dritte gefärbte Zone sichtbar erkennbar und unterscheidbar darum herum aufweisen, wobei diese Kolonien Kolonien allgemeiner Coliforme sind, die eine β-Galactosidase-Aktivität, jedoch keine β-Glucuronidase-Aktivität aufweisen und die Kolonien sind, die Sorbit fermentieren; auf das Vorhandensein von Kolonien, die eine zweite Farbe und die dritte gefärbte Zone sichtbar erkennbar und unterscheidbar darum herum aufweisen, wobei diese Kolonien Kolonien von E. coli sind, die eine β-Glucuronidase-Aktivität und eine β-Galactosidase-Aktivität aufweisen und die Kolonien sind, die Sorbit fermentieren; auf das Vorhandensein von Kolonien, die die erste Farbe und weder die zweite Farbe noch die dritte gefärbte, erkennbare und davon unterscheidbare Zone aufweisen, wobei diese Kolonien Kolonien von E. coli 0157 sind, die eine β-Galactosidase-Aktivität, aber keine β-Glucuronidase-Aktivität aufweisen und die Kolonien sind, die Sorbit nicht fermentieren; auf das Vorhandensein von Kolonien, die weder die erste Farbe noch die zweite Farbe haben, mit oder ohne die dritte gefärbte Zone, wobei diese Kolonien nicht-coliforme Enterobacteriaceae sind, die weder eine β-Galactosidase-Aktivität, noch eine β-Glucuronidase-Aktivität aufweisen, mit oder ohne die Fähigkeit, Sorbit zu fermentieren; und auf das Vorhandensein von Kolonien, die eine vierte Farbe haben, mit oder ohne die dritte gefärbte Zone, wobei diese Kolonien bestimmte Stämme einiger Gattungen, wie Salmonella oder Shigella, repräsentieren, die keine β-Galactosidase-Aktivität aufweisen, aber eine β-Glucuronidase-Aktivität haben, mit oder ohne die Fähigkeit, Sorbit zu fermentieren. All diese Kolonien können dann ausge zählt werden, um ein Zählergebnis für alle ausgewählten Mikroorganismen zu liefern. Alternativ müssen nur die besonderen Kolonien von Interesse in der besonderen Testprobe gezählt werden.
  • Die vorliegende Erfindung umfasst in einer weiteren Ausführungsform der Erfindung ein Testmedium für den Nachweis des Vorhandenseins biologischer Materialien in einer Testprobe. Das Testmedium umfasst ein erstes chromogenes Substrat, das ein β-Galactosid ist, ein zweites chromoges Substrat, das ein β-Glucuronid ist, eine fermentierbare Kohlenstoffquelle, die Sorbit umfasst, einen pH-Indikator und ein Nährstoffgrundmedium. Das erste chromogene Substrat ist bei der Umsetzung mit einem Enzym des ersten biologischen Materials imstande, eine wasserunlösliche Verbindung mit einer ersten Farbe zu bilden, und das zweite chromogene Substrat ist bei der Umsetzung mit einem Enzym des zweiten biologischen Materials imstande, eine wasserunlösliche Verbindung mit einer zweiten Farbe zu bilden, die gegenüber der ersten Farbe kontrastiert. Die fermentierbare Kohlenstoffquelle ist imstande, einen Teil des Mediums bei der Fermentierung durch Zucker-fermentierende Bestandteile der Testprobe anzusäuern. Der pH-Indikator verursacht eine dritte Farbe, die als Reaktion auf die Ansäuerung gebildet wird, wobei die dritte Farbe eine gefärbte Zone um die Zucker-fermentierenden Bestandteile bildet. Das Nährstoffgrundmedium kann einen Feststoff, ein Gel oder eine Lösung für die Bildung eines Feststoffs umfassen.
  • Das Verfahren und die Medien der vorliegenden Erfindung erlauben es, biologische Substanzen gleichzeitig zu züchten, zu isolieren, zu quantifizieren und nachzuweisen, wie allgemeine E. coli-Stämme, E. coli 0157, andere coliforme und nicht-coliforme Mitglieder der Enterobacteriaceae-Familie in einer Probe, die in einer einzigen Petrischale in das Testmedium eingebracht wird. Eine vorherige Anreicherung der Probe ist nicht erforderlich, obwohl eine vorherige Anreicherung angewendet werden kann, wenn dies erwünscht wird. Die Testergebnisse stehen innerhalb von 24-48 Stunden zur Verfügung, und der Test um fast im Wesentlichen die bloße Zugabe der Testprobe zu dem Medium in der Platte, das Inkubieren des Testmediums und das Zählen der jeweiligen Kolonien in der Testprobe. Die meisten anderen Tests erfordern mehr Schritte und sie erfordern im Allgemeinen einen längeren Zeitraum, über den die Testergebnisse erhalten werden. Zusätzlich hängt das erfindungsgemäße Verfahren nicht von einer sorgfältig kontrollierten Inkubationstemperatur ab.
  • DETAILLIERTE BESCHREIBUNG DER ERFINDUNG
  • Das Verfahren und das Medium der vorliegenden Erfindung erlauben es, eine Vielzahl ausgewählter biologischer Materialien in einer Probe aus gemischten Populationen biologischer Materialien gleichzeitig quantitativ nachzuweisen und zu unterscheiden.
  • Das erfindungsgemäße Verfahren und Medium sind besonders gut brauchbar für den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung von E. coli 0157 in gemischten mikrobiellen Proben, mit gleichzeitigem quantitativem Nachweis und Unterscheidung anderer Stämme von E. coli, von allgemeinen Coliformen, und von nicht-coliformen Enterobacteriaceae.
  • Mikroorganismen, die eine β-Galactosidase-Aktivität aufweisen, schließen die Mikroorganismen ein, die allgemein unter der Bezeichnung "coliform" bekannt sind. Es gibt verschiedene Definitionen von "coliform", aber die allgemein akzeptierten Definitionen schließen Bakterien ein, die Mitglieder der Familie der Enterobacteriaceae sind und die die Fähigkeit haben, den Zucker Lactose unter Entwicklung von Gasen und Säuren zu fermentieren.
  • Mikroorganismen, die eine β-Glucuronidase-Aktivität zusätzlich zur β-Galactosidase-Aktivität aufweisen, schließen in erster Linie die meisten Stämme der Coliforme der Art E. coli mit Ausnahme von E. coli 0157 ein. E. coli 0157 ist einer von etwa 3 % E. coli-Stämmen, die β-Galactosidase-Aktivität zeigen, jedoch keine β-Glucuronidase-Aktivität zeigen.
  • Der Ausdruck "allgemeine Coliforme", wie er in dieser Anmeldung verwendet wird, bezieht sich auf Coliforme, die verschieden sind von den verschiedenen Stämmen von E. coli. Diese "allgemeinen Coliforme" sind gram-negativ, keine Sporen bildende Mikroorganismen, die β-Galactosidase-Aktivität aufweisen (d. h. sie fermentieren Lactose), jedoch keine β-Glucuronidase-Aktivität aufweisen und die die Fähigkeit haben, den Zucker Sorbit zu fermentieren.
  • Der Ausdruck "nicht-coliforme Enterobacteriaceae", wie er in dieser Anmeldung verwendet wird, bezieht sich auf Mikroorganismen der Familie Enterobacteriaceae, die keine β-Galactosidase-Aktivität haben.
  • Der Ausdruck "β-Galactosidase-Substrat", wie er hier verwendet wird, bezieht sich auf ein β-Galactosid, das Galactose enthält, die über eine β-Bindung mit einem Substituenten verbunden ist, der einen unlöslichen, gefärbten Niederschlag bildet, wenn er durch die Einwirkung von β-Galactosidase auf das Substrat freigesetzt wird.
  • Der Ausdruck "β-Glucuronidase-Substrat", wie er hier verwendet wird, bezieht sich auf ein β-Glucuronid, das Glucuronsäure enthält, die über eine β-Bindung mit einem Substituenten verbunden ist, der einen unlöslichen, gefärbten Niederschlag bildet, wenn er durch die Einwirkung von β-Glucuronidase auf das Substrat freigesetzt wird.
  • Die β-Galactosidase-Substrate und Verbindungen, die hier als "Galactoside" bezeichnet werden, sowie die β-Glucuronidase-Substrate und Verbindungen, die hier als "Glucuronide" bezeichnet werden, können jeweils Carboxylatsalze umfassen, die bei der Umsetzung einer passenden Base mit der geeigneten Carboxygruppe des Galactosids oder der Glucuronsäure gebildet werden. Geeignete Basen schließen Alkalimetall- oder Erdalkalimetallhydroxide, Alkalimetall- oder Erdalkali metallcarbonate ein, zum Beispiel Natriumhydroxid, Kaliumhydroxid, Calciumhydroxid, Magnesiumhydroxid und die entsprechenden Carbonate; und Stickstoffbasen, wie Ammoniak, und Alkylamine, wie Trimethylamin, Triethylamin und Cyclohexylamin.
  • Das Verfahren der vorliegenden Erfindung ist so konzipiert, dass es die unterscheidenden Merkmale, die in bestimmten Mikroorganismen gefunden werden, ausnützt, um damit die Mikroorganismen quantitativ nachzuweisen und voneinander zu unterscheiden. Das Verfahren ist besonders geeignet für den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung der verschiedenen Klassen der zuvor beschriebenen Mikroorganismen, d. h. von allgemeinen Coliformen, E. coli und von E. coli 0157 und nicht-coliformen Enterobacteriaceae. Auch wenn das erfindungsgemäße Verfahren für die oben beschriebenen Mikroorganismen besonders gut geeignet ist, ist es nicht auf den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung dieser speziellen Mikroorganismen beschränkt, da die Techniken Anwendung bei dem quantitativen Nachweis und der Unterscheidung einer großen Vielzahl biologischer Materialien finden.
  • Die Abtrennung und der Nachweis von E. coli 0157 von anderen Stämmen von E. coli ist besonders problematisch gewesen, da alle E. coli-Stämme viele gemeinsame Merkmale haben. Es gibt jedoch drei Hauptunterschiede, die eine Grundlage liefern, auf der E. coli 0157 von den anderen E. coli-Stämmen unterschieden werden kann. Diese sind das unvorteilhafte Wachstum von E. coli 0157 bei Temperaturen oberhalb von 42 °C, die Unfähigkeit von E. coli 0157, das Enzym Glucuronidase zu erzeugen, und die Unfähigkeit von E. coli 0157, den Zucker Sorbit zu fermentieren. Auch wenn diese Unterschiede einen allgemeinen Hintergrund für die Verwendung beim Nachweis und dem Trennen der beiden E. coli-Typen liefern, werden dieser Nachweis und diese Trennung durch zusätzliche Faktoren erschwert.
  • In gemischten Populationen von Mikroorganismen, die in der Natur gefunden werden, wie denjenigen, die sowohl E. coli als auch E. coli 0157 enthalten, sind normalerweise auch viele andere nahe verwandte Organismen vorhanden. Viele dieser Mikroorganismen sind imstande, unter den gleichen oder ähnlichen Bedingungen wie die E. coli-Stämme zu leben und ihren Stoffwechsel durchzuführen. Die meisten der nahe verwandten Organismen sind Mitglieder aus der Familie der Enterobacteriaceae, wie dies alle Arten von E. coli sind. Die Enterobacteriaceae sind gram-negative, keine Sporen bildende, stäbchenförmige Bakterien. Einige der am besten bekannten Gattungen sind Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Escherichia, Klebsiella, Proteus, Salmonella, Shigella und Yersinia. Zu dieser Familie gehören die Gattungen, die üblicherweise als die coliformen Bakterien bezeichnet werden. Coliforme Bakterien weisen die allgemeinen gattungsgemäßen Merkmale auf, sie erzeugen aber zusätzlich das Enzym Galactosidase, das bei der Fermentierung des Zuckers Lactose mitwirkt. Die coliforme Gattung Escherichia erzeugt ebenfalls das Enzym Galactosidase, und zusätzlich erzeugen die meisten Stämme dieser Gattung auch das Enzym Glucuronidase. Der Stamm E. coli 0157 ist jedoch einer von nur etwa 3 % Escherichia coli-Stämme, die nicht die Fähigkeit haben, Glucuronidase zu erzeugen.
  • Aufgrund der charakteristischen Ähnlichkeiten dieser nahe verwandten Bakterien hat es sich als schwierig erwiesen, E. coli 0157 nachzuweisen und von den anderen Mitgliedern aus der Familie der Enterobacteriaceae-Familie zu trennen. Im Ergebnis sind einfach zu studierende und zu formulierende Testmedien für die Durchführung dieses Nachweises und dieser Trennung, nicht verfügbar gewesen, und es ist im Allgemeinen notwendig gewesen, zu komplizierten und kostspieligen Verfahren überzugehen, die Antigen-Antikörper-Übereinstimmung oder DNA-Sonden verwenden, um das Vorhandensein von E. coli 0157 in gemischten mikrobiellen Populationen zu ermitteln. Derartige Techniken sind nicht nur kostspielig und zeitaufwändig, sondern sie liefern oft auch falsch positive oder falsch negative Ergebnisse.
  • Das in dem US-Patent Nr. 5,210,022 beschriebene Verfahren erlaubt den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung von allgemeinen Coliformen und von E. coli. Die Unterscheidung dieser beiden Mikroorganismen basiert auf der charakteristischen Fähigkeit der allgemeinen Coliformen, Galactosidase zu erzeugen, und dadurch bei der Umsetzung mit einem β-Galactosid einen wasserunlöslichen Niederschlag mit einer ersten Farbe zu bilden, und der charakteristischen Fähigkeit von E. coli, zusätzlich zur Galactosidase Glucuronidase zu erzeugen und dadurch bei der Umsetzung mit einem β-Glucuronid einen wasserunlöslichen Niederschlag mit einer Farbe zu bilden, die gegenüber der ersten Farbe kontrastiert.
  • Die vorliegende Erfindung geht über das in dem US-Patent Nr. 5,210,022 gelehrte Verfahren hinaus. Mit dem erfindungsgemäßen Verfahren kann nicht nur wie in dem Patent ein quantitativer Nachweis und eine Unterscheidung von allgemeinen Coliformen und von E. coli, sondern auch des enteropathogenen E. coli 0157 wie auch von verschiedenen Arten von nicht-coliformen Enterobacteriaceae durchgeführt werden. Sorbit und ein geeigneter pH-Indikator werden in ein Testmedium mit den chromogenen Reagenzien eingebracht. Da einer der Unterschiede zwischen E. coli 0157 und anderen E. coli die Unfähigkeit von E. coli 0157 ist, den Zucker Sorbit zu verstoffwechseln, liefert die Verwendung von Sorbit in dem Testmedium ein Mittel für die Unterscheidung dieser beiden E. coli-Stämme. Die chromogenen Reagenzien werden so ausgewählt, dass sie eine Grundlage für die quantitative Unterscheidung von Coliformen, die eine β-Galactosidase-Aktivität aufweisen, von denjenigen Stämmen von E. coli bieten, die β-Galactosidase-Aktivität zusätzlich zur β-Glucuronidase-Aktivität aufweisen. Die Aufnahme von Sorbit und des pH-Indikators in das Medium beeinträchtigt diese quantitative Unterscheidung der Coliformen von E. coli nicht, sondern erlaubt zusätzlich den quantitativen Nachweis und die quantitative Unterscheidung von E. coli 0157 und nicht-coliformer Enterobacteriaceae von allgemeinen Coliformen und den meisten anderen E. coli. E. coli 0157 kann von den nicht-coliformen Enterobactertaceae aufgrund der β-Galactosidase-Aktivität von E. coli 0157 unterschieden werden, einer Aktivität, die in den nicht-coliformen Enterobacteriaceae nicht vorhanden ist.
  • Das spezifische β-Galactosidase-Substrat (β-Galactosid) und das spezifische β-Glucuronidase-Substrat (β-Glucuronid) zur Verwendung in dem Testmedium werden so ausgewählt, dass die von allen Substraten gebildeten Niederschläge kontrastierende Farben aufweisen, wodurch ein Weg bereitgestellt wird, allgemeine Coliforme von E. coli zu unterscheiden. Im Ergebnis können Kolonien von Mikroorganismen, die β-Galactosidase-Aktivität, aber keine β-Glucuronidase-Aktivität aufweisen, und Kolonien von Mikroorganismen, die entweder nur die β-Glucuronidase-Aktivität oder sowohl die β-Galactosidase- als auch die β-Glucuronidase-Aktivität aufweisen, visuell unterschieden werden. Die genaue Farbe der einzelnen Typen von Kolonien von Mikroorganismen ist nicht kritisch, solange alle Typen unterschieden werden können. Die Niederschläge sollten in dem Testmedium unlöslich sein, so dass die Kolonien von Mikroorganismen, die die Niederschläge bilden, visuell ausgezählt werden können. Weiterhin sollte es sich bei dem β-Galactosid und dem β-Glucuronid um Verbindungen handeln, die nahezu farblos oder nicht dunkel gefärbt sind, damit sie den Nachweis der gefärbten unlöslichen Niederschläge, die durch die Einwirkung von β-Galactosidase und β-Glucuronidase erzeugt werden, nicht stören. Die β-Galactoside und β-Glucuronide sollten Verbindungen sein, die in dem Testmedium löslich gemacht werden können.
  • Die Entscheidung, ob ein gegebenes β-Galactosid oder β-Glucuronid in dem Testmedium brauchbar ist, kann durch einen einfachen Test erfolgen. Das β-Galactosid oder β-Glucuronid wird in ein festes Testmedium eingebracht, das dann mit allgemeinen Coliformen oder E. coli beimpft wird. Wenn in dem Testmedium gefärbte Kolonien wachsen, kann das spezielle β-Galactosid oder β-Glucuronid verwendet werden, vorbehaltlich des folgenden Tests. Ob ein gegebenes β-Galactosid und ein gegebenes β-Glucuronid zusammen verwendet werden können, kann durch das gemeinsame Einbringen der beiden Verbindungen in ein festes Medium entschieden werden, das dann mit einem Gemisch aus allgemeinen Coliformen und E. coli beimpft wird und bei einer geeigneten Temperatur inkubiert wird. Falls die Kolonien von E. coli und die Kolonien von allgemeinen Coliformen durch einen Farbkontrast zwischen allen Kolonietypen visuell unterschieden werden können, ist die spezielle Kombination aus β-Galactosid und β-Glucuronid geeignet.
  • Eine geeignete chromogene Verbindung für die Durchführung des Verfahrens dieser Erfindung ist 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-galactopyranosid (X-gal). X-gal ist ein im Handel erhältliches β-Galactosidase-Substrat, das einen unlöslichen Niederschlag bildet, der eine annähernd indigoblaue Farbe hat, wenn es durch β-Galactosidase umgesetzt wird. Zulässige β-Glucuronide, die mit X-gal verwendet werden können, schließen Verbindungen ein, die einen unlöslichen Niederschlag bilden, der eine Farbe wie Rot oder Gelb hat, die mit Indigoblau kontrastiert und die von der indigoblauen Farbe nicht vollständig maskiert wird. Ein Beispiel hierfür ist die Verbindung 6-Chlorindolyl-β-D-glucuronid. Diese Verbindung erzeugt einen unlöslichen Niederschlag, der eine magentafarbene Farbe aufweist, die mit Indigoblau kontrastiert und von Indigoblau visuell unterscheidbar ist. Die Herstellung dieser Verbindung und anderer geeigneter Verbindungen zur Verwendung in dieser Erfindung wird in dem oben erwähnten US-Patent Nr. 5,210,022 beschrieben.
  • Eine andere geeignete chromogene Verbindung für die Durchführung des Verfahrens ist 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid (X-gluc). X-gluc ist ein im Handel erhältliches β-Glucuronid, das einen unlöslichen Niederschlag erzeugt, der eine annähernd indigoblaue Farbe hat, wenn es durch β-Glucuronidase umgesetzt wird. Indoxyl-β-D-glucuronid ist eine ähnliche Verbindung, deren Herstellung in dem oben erwähnten Artikel von Ley et al., in Can J. Microbiol. beschrieben wird. Zulässige β-Galactoside, die mit X-gluc oder Indoxyl-β-D-glucuronid verwendet werden können, schließen Substrate ein, die einen unlöslichen Niederschlag bilden, der eine Farbe wie Rot oder Gelb aufweist, die mit Indigoblau kontrastiert. Ein Beispiel für ein geeignetes β-Galactosid ist die Verbindung 6-Chlorindolyl-β-D-galactosid. Diese Verbindung erzeugt einen unlöslichen Niederschlag, der eine magentafarbene Farbe aufweist, die mit Indigoblau kontrastiert und von Indigoblau visuell unterscheidbar ist. Die Herstellung dieser Verbindung wird in dem oben erwähnten US-Patent Nr. 5,210,022 beschrieben. Andere geeignete chromogene Verbindungen werden ebenfalls in dem Patent aufgelistet.
  • Es ist bevorzugt, dass das β-Galactosid und das β-Glucuronid so ausgewählt werden, dass das β-Glucuronid einen unlöslichen Niederschlag erzeugt, dessen Farbe dunkler ist als die Farbe des unlöslichen Niederschlags, der von dem β-Galactosid erzeugt wird. Dies ermöglicht es dem Niederschlag, der von dem β-Glucuronid erzeugt wird, den Niederschlag zu maskieren, der von dem β-Galactosid in Kolonien von E. coli erzeugt wird, und macht es für Kolonien von E. coli einfacher, von Kolonien von allgemeinen Coliformen unterschieden zu werden. Alternativ kann der Niederschlag, der durch das β-Galactosid erzeugt wird, durch die Verwendung von mehr von dem β-Glucuronid und weniger von dem β-Galactosid maskiert werden. In einer bevorzugten Ausführungsform wird 6-Chlor-3-indolylgalactosid als das β-Galactosid verwendet und 5-Brom-4-chlor-3-indolylglucuronid wird als das β-Glucuronid verwendet. Wenn diese Substrate in dem Medium verwendet werden, werden Coliforme durch das Vorhandensein von roten Kolonien nachgewiesen, die durch das Vorhandensein des Enzym Galactosidase erzeugt werden. E. coli wird durch die Bildung purpurfarbener (rot und blau) Kolonien nachgewiesen, die durch das Vorhandensein sowohl von Galactosidase (die rote Kolonien erzeugt) als auch von Glucuronidase (die blaue Kolonien erzeugt) in diesen Stämmen von E. coli nachgewiesen.
  • Andere β-Galactoside und β-Glucuronide, die verwendet werden können, schließen diejenigen ein, die in die allgemeine Kategorie substituierter Indolyl-β-galactoside und Indolyl-β-glucuronide fallen. Auch wenn es nicht beabsichtigt ist, die Erfindung auf eine besondere Theorie oder einen besonderen Mechanismus einzuschränken, wird angenommen, dass, wenn β-Galactosidase- und β-Glucuronidase-Substrate, die substituierte Indolylsubstituenten aufweisen, durch ihre jeweiligen Enzyme umgesetzt werden, die substituierten Indolylsubstituenten, die durch die Einwirkung der Enzyme freigesetzt werden, in situ in unlösliche Indigoanaloga umgewandelt werden. Wenn beispielsweise 6-Chlorindolyl-β-D-galactosid durch β-Galactosidase umgesetzt wird, reagiert das freigesetzte 6-Chlorindolyl mit sich selbst und bildet 6,6'-Dichlorindigo, einen magentafarbenen Niederschlag. Dies deutet darauf hin, dass andere Verbindungen, die 6-Chlorindolyl-β-D-galactosid oder 6-Chlorindolyl-β-D-glucuronid ähneln, hergestellt werden könnten und verwendet werden könnten, basierend auf symmetrischen Indigoanaloga, die eine Farbe aufweisen, die 6,6'-Dichlorindigo ähnelt. Über die Synthese und die Absorptionsspektren symmetrischer Chlorindigos wurde von Sadler et al., JACS 78, 1251-1255 (1956) berichtet. Es erscheint darin, dass die Verbindungen 4,4',6,6'-Tetrachlorindigo, 6,6',7,7'-Tetrachlorindigo und 4,4',6,6',7,7'-Hexachlorindigo eine ähnliche Farbe wie 6,6'-Dichlorindigo haben. Die entsprechenden β-Galactoside, nämlich 4,6-Dichlorindolyl-β-D-galactosid, 6,7-Dichlorindolyl-β-D-galactosid und 4,6,7-Trichlorindolyl-β-D-galactosid und deren Salze könnten demnach hergestellt werden und als β-Galactosidase-Substrate in gleicher Weise wie 6-Chlorindolyl-β-D-galactosid verwendet werden. Andere Galactosidase-Substrate, die für die Verwendung in der Erfindung geeignet sind, um rötlich gefärbte Niederschläge zu bilden, schließen 5-Brom-6-chlor-3-indolyl-β-D-galactosid und 6-Chlor-3-indolyl-β-D-galactosid ein. Es ist außerdem herausgefunden worden, dass bestimmte Naphthyl-substituierte Galactoside, wie 2-Naphthyl-β-D-galactosid als Galactosidase-Substrate verwendet werden können, da diese Naphthyl-substituierten Verbindungen unter den Bedingun gen, die in dem erfindungsgemäßen Verfahren angegeben werden, einen roten Niederschlag bilden.
  • In ähnlicher Weise könnten die entsprechenden β-Glucuronide, nämlich 4,6-Dichlorindolyl-β-D-glucuronid, 6,7-DichIorindolyl-β-D-glucuronid und 4,6,7-Trichlorindolyl-β-D-glucuronid und deren Salze sowie Naphthyl-substituierte Glucuronide, wie Naphthol-AS-BA-β-D-glucuronid, hergestellt werden und als β-Glucuronidase-Substrate in gleicher Weise wie 6-Chlorindolyl-β-D-glucuronid verwendet werden. Andere geeignete Glucuronidase-Substrate, die rötlich gefärbte Niederschläge bilden, schließen 5-Brom-6-chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid und 6-Chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid ein. In der Praxis würden die oben aufgezählten Glucuronide jedoch nicht mit den aufgezählten Galactosiden verwendet, weil die gefärbten Niederschläge, die durch die jeweiligen Substrate erzeugt werden, nicht leicht unterschieden werden könnten, da sie alle das gleiche Chromogen enthalten. In solchen Fällen, in denen ein rötlicher Niederschlag durch das Galactosidase-Substrat erzeugt wird, können eher Glucuronide wie 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid, Indoxyl-β-D-glucuronid, 4-Chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid, 5-Brom-3-indolyl-β-D-glucuronid und N-Methyl-3-indolyl-β-D-glucuronid und deren Salze verwendet werden, da die Niederschläge, die von diesen Substraten gebildet werden, eine Farbe (im Allgemeinen Blau oder Grün) aufweisen, die gegenüber der Farbe kontrastiert, die von diesen Galactosiden (im Allgemeinen eine rötliche Farbe) gebildet wird.
  • In ähnlicher Weise würden, falls die oben angegebenen Glucuronide verwendet werden, die einen rötlich gefärbten Niederschlag bilden, die ausgewählten Galactoside diejenigen sein, die Niederschläge bilden, die eine Farbe aufweisen, die von der Farbe der Niederschläge unterscheidbar ist, die durch das Glucuronidase-Substrat gebildet wird. In diesem Fall würden geeignete Galactoside 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-galactosid, 4-Chlor-3-indolyl-β-D-galactosid, 5-Brom-3-indolyl-β-D-glucuronid und N-Methyl-3-indolyl-β-D-galactosid und deren Salze einschließen. Die meisten der oben aufgezählten Verbindungen oder deren Salze können von kommerziellen Bezugsquellen erhalten werden, wie Inalco Pharmaceuticals, Inc., Horsham, PA, und Diagnostic Chemicals Limited, Oxford, CT.
  • Eine geeignete Kohlenstoffquelle und ein geeigneter pH-Indikator werden ebenfalls in das Testmedium eingebracht. Der Zucker Sorbit wird als Kohlenstoffquelle verwendet, um die Unterscheidung von Sorbitfermentierenden Mikroorganismen, wie allgemeine Coliforme und E. coli, von Mikroorganismen, die Sorbit nicht fermentieren, wie E. coli 0157 und einige nicht-coliforme Enterobacteriaceae, zu ermöglichen.
  • Der pH-Indikator ruft eine gefärbte Zone hervor, die um diejenigen Kolonien erzeugt wird, die Sorbit unter Erzeugung einer Säure fermentieren. Keine Zone wird in der Umgebung der Kolonien erzeugt, die Sorbit nicht fermentieren. Der pH-Wert des fertigen Mediums ist kritisch für die Effektivität dieses Verfahrens, da der pH-Wert so sein muss, dass der pH-Indikator die Farbe des Mediums in die gewünschte Farbe umwandelt. Obwohl verschiedene pH-Indikatoren verwendet werden können, ist Phenolrot der bevorzugte Indikator, wenn das Verfahren verwendet wird, um E. coli 0157 nachzuweisen und von den oben angegebenen Mikroorganismen zu unterscheiden. Wenn Phenolrot als pH-Indikator verwendet wird, sollte der pH-Wert innerhalb des Bereichs von etwa 7,0 bis 7,6 und vorzugsweise auf etwa 7,2 eingestellt werden. Durch die Verwendung von Phenolrot bei diesem pH-Wert wird in der Umgebung der Sorbit-fermentierenden Mikroorganismen aufgrund der Erzeugung einer Säure bei der Fermentierung eine gelbe Zone erzeugt. Der Bereich um die Mikroorganismen herum, die Sorbit nicht fermentieren, bleibt farblos, oder in einigen Fällen wird er rot aufgrund einer kleinen Menge Farbstoff, die aus den Niederschlägen heraustritt, die durch das Vorhandensein von Galactosidase gebildet werden. Andere Indikatoren wie Bromthymolblau (BTB) sind ebenfalls verwendet worden, um E. coli 0157 nachzuweisen und von E. coli zu unterscheiden. Wenn andere pH-Indikatoren verwendet werden, müssen die Reakti onsbedingungen auf den passenden pH-Wert für den speziellen ausgewählten Indikator eingestellt werden. Zusätzlich ist es wichtig, wenn ein pH-Indikator ausgewählt wird, einen Indikator auszuwählen, der beim Ansäuern oder Alkalischmachen Farben erzeugt, die von den Farben der speziellen, in dem Testmedium verwendeten Chromogene unterscheidbar sind.
  • Es ist wichtig, die Zuckermenge, die in das Medium eingebracht wird, zu kontrollieren. Beispielsweise führt eine zu hohe Konzentration an Sorbit zu einer übermäßigen Säurebildung. In einem solchen Fall kann eine relativ kleine Zahl säurebildender Kolonien dafür sorgen, dass sich das Medium in der gesamten Petrischale gelb verfärbt, wodurch die Kolonien maskiert werden, die Sorbit nicht verwenden. Die Sorbitmenge sollte vorzugsweise im Bereich von 2 bis 7 Gramm pro Liter Medium, am bevorzugtesten bei etwa 5 g/l Medium liegen.
  • Für beste Ergebnisse sollte zusätzlich ein Überzug aus dem Medium über der Probe angeordnet werden, um die Bakterien in der Matrix des Mediums zu fixieren. Da Kolonien, die auf einer der Luft ausgesetzten Oberfläche des Mediums wachsen, gegebenenfalls nicht in exakt gleicher Weise wie diejenigen reagieren, die in das Medium eingebettet sind, führt die Zugabe eines Überzugs aus dem Medium zu konsistenteren und genaueren Testergebnissen.
  • Herstellung des Testmediums
  • Die Herstellung eines Testmediums zur Verwendung beim quantitativen Nachweis und der Unterscheidung von E. coli 0157 unter gleichzeitigem quantitativem Erkennen und Nachweis von E. coli, von allgemeinen coliformen und nicht-coliformen Enterobacteriaceae in gemischten mikrobiellen Proben wird im Folgenden beschrieben.
  • Das Testmedium wird erzeugt, indem die ausgewählten Chromogene, d. h. das β-Galactosid und das β-Glucuronid, Sorbit und der pH- Indikator mit einem Nährstoffgrundmedium kombiniert werden. Sorbit ist der einzige Zucker, der zu dem Medium gegeben wird, da das Testverfahren von der Fermentierung oder der Nicht-Fermentierung von Sorbit als einem der Vorgänge für die Unterscheidung abhängt. Wenn Phenolrot als pH-Indikator verwendet wird, ist dieser Indikator unter neutralen oder alkalischen Bedingungen rot, und er ist gelb unter sauren Bedingungen, die bei der Fermentierung von Sorbit entstehen. In einer bevorzugten Ausführungsform werden auch Gallensalze zu dem Medium gegeben, um das Wachstum vieler Bakterien, die von den Mitgliedern der Enterobacteriaceae verschieden sind, zu hemmen, wodurch der Test selektiver gemacht wird.
  • Das Nährstoffgrundmedium kann ein beliebiges Medium von vielen Kulturmediumsformulierungen sein, die auf dem Fachgebiet für die Züchtung von Mikroorganismen auf dem Fachgebiet bekannt sind. Im Allgemeinen schließen derartige Medien Wachstumsnährstoffe, Puffer, Wasser und einen Gelbildner ein. Mögliche Gelbildner schließen u. a. Agare, Pektine, Carrageenane, Alginate, Johannisbrotkernmehl, Xanthane, Guar-Mehl und Gellane ein.
  • Das folgende Beispiel beschreibt die Herstellung eines Testmediums, das für die Verwendung in der vorliegenden Erfindung geeignet ist. Die Mengen der aufgezählten einzelnen Bestandteile werden für ein Liter Testmedium angegeben:
    Pepton (hydrolysiertes Casein) 10 g
    Hefeextrakt 5 g
    Natriumchlorid 3 g
    Gallensalze 1 g
    Sorbit 5 g
    Phenolrot 25 mg
    5-Brom-4-chlor-3-indolylglucuronid 75 mg
    6-Chlor-3-indolylgalactosid 150 mg
    Agar mit bakteriologischer Qualität 17 g
  • Die obigen Bestandteile werden in etwa einem Liter entionisiertem Wasser, das auf 90-100 °C erhitzt ist, vermischt. Der pH-Wert der Lösung wird dann mit NaOH oder Weinsäure (10 %-ige Lösungen) auf etwa 7,2 eingestellt. Das Medium wird 15 Minuten bei 121 °C und einem Druck von 15 Pfund sterilisiert, auf 45 °C abgekühlt und für die Verwendung in sterile Petriplatten gegossen (20 ml/Platte).
  • Ein Testmedium auf Pektinbasis kann unter Anwendung der gleichen Schritte, wie sie oben beschrieben werden, hergestellt werden, mit dem Unterschied, dass 25 g niedrig methoxyliertes Pektin anstelle des Agargummis als Verfestigungsmedium verwendet werden. Dieses Medium wird bei Raumtemperatur in Petrischalen gegossen, die eine dünne Gelschicht enthalten, die Calciumionen enthält, die sich mit dem Pektin unter Bildung eines festen Gels verbinden. Ein geeignetes Pektin-Kulturmedium wird in dem US-Patent Nr. 4,241,186 und dem US-Patent Nr. 4,282,317 beschrieben. Ein Medium auf Pektin-Basis ist gegenüber einem Standard-Agarmedium bevorzugt, weil es für den Anwender die Vorteile der Bequemlichkeit und der Temperaturunabhängigkeit mit sich bringt. Die Verwendung von Pektin-Medium ist in der Literatur ausführlich beschrieben worden, und sie wurde als Ergebnis gemeinschaftlicher ADAC-Studien sowie anderer veröffentlichter und betriebsinterner Untersuchungen angenommen. Ein geeignetes Pektin-Medium zur Verwendung in dem erfindungsgemäßen Verfahren ist von RCR Scientific, Inc., Goshen, Indiana, im Handel erhältlich.
  • Obwohl das Verfahren als ein Verfahren beschrieben worden ist, das in seiner bevorzugten Ausführungsform ein festes Pektin- oder Agarmedium verwendet, muss das Medium nicht notwendigerweise in fester Form vorliegen. Beispielsweise kann eine Einlage als Absorptionsmittel in einer Petrischale angeordnet werden, und ein flüssiges Medium, das alle zuvor beschriebenen erforderlichen Nährstoffe und Reagenzien enthält, wird so zugegeben, dass es von der Einlage absorbiert wird. Die als Absorptionsmittel verwendete Einlage bildet liefert eine feste Oberfläche, auf der die Mikroorganismen als getrennte Koloniebildende Einheiten wachsen können, die denjenigen ähneln, die sich auf einem Medium entwickeln, das mit Agar oder anderen Verfestigungsmitteln verfestigt ist.
  • Beimpfen des Testmediums mit der Probe
  • Das Testmedium kann mit der zu untersuchenden Probe unter Anwendung jedes beliebigen Verfahrens beimpft werden, das auf dem Fachgebiet für das Beimpfen eines Mediums mit einer Probe, die Mikroorganismen enthält, bekannt ist. Beispielsweise kann die zu untersuchende Probe vor der Zugabe des Mediums in die Petrischale gegeben werden, oder die Probe kann zu dem nichtverfestigten Medium gegeben werden, bevor dieses in die Schalen gegossen wird (Gießplattierungstechnik – "pour plate technique"). Wenn die Gießplattierungstechnik verwendet wird, wird eine Überzugsschicht zugegeben, nachdem sich das Medium in der Schale verfestigt hat. Alternativ kann die Testprobe auf der Oberfläche der Platten verteilt werden, nachdem die Platten abgekühlt sind und sich verfestigt haben, und anschließend kann sie mit einer Überzugsschicht bedeckt werden (Ausstreichplattierungstechnik – "swab" bzw. "streck plate technique").
  • Das erfindungsgemäße Verfahren kann außerdem in Kombination mit dem oben beschriebenen Membranfilter-Verfahren (MF-Verfahren) verwendet werden. Bei diesem Verfahren wird die Probe, die in den meisten Fällen eine wässrige Lösung umfasst, die das nachzuweisende biologische Material enthält, durch einen Micropore-Filter filtriert, wobei die biologischen Materialien auf der Oberfläche des Filters festgehalten werden. Der Filter wird dann in einer Petrischale auf der Oberfläche des für die Inkubation vorgesehenen Mediums angeordnet, um es den biologischen Materialien auf der Oberfläche zu ermöglichen, zu sichtbaren Kolonien heranzuwachsen. Das Medium in der Petrischale kann vorverfestigtes Agarmedium oder vorverfestigtes Medium auf Pektinbasis oder alternativ eine Einlage als Absorptionsmittel sein, die mit dem flüssigen Medium getränkt ist, das die erforderlichen Nährstoffe und Reagenzien enthält. Letztere Vorgehensweise erlaubt es, das erfindungsgemäße Verfahren ohne ein gesondertes Verfestigungsmittel in dem Medium zu verwenden, und stellt dennoch eine harte Oberfläche bereit, auf der sich die biologischen Materialien entwickeln können, so dass sie als deutliche, getrennte Kolonie-bildende Einheiten wachsen können, die den Einheiten ähneln, die sich auf einem Medium entwickeln, das mit Agar oder anderen Mitteln verfestigt worden ist.
  • Inkubation des Testmediums
  • Das beimpfte Testmedium wird über einen ausreichenden Zeitraum und bei einer ausreichenden Temperatur inkubiert, um es den einzelnen Mikroorganismen, die in der Probe vorhanden sind, zu ermöglichen, zu nachweisbaren Kolonien zu wachsen. Geeignete Inkubationsbedingungen für das Wachstum von Mikroorganismen in einem Medium sind auf dem Fachgebiet wohl bekannt. Für den quantitativen Nachweis und die quantitative Unterscheidung von E. coli 0157 in der beschriebenen Weise wird das Testmedium vorzugsweise etwa 24-48 Stunden bei einer Temperatur von etwa 30-40 °C inkubiert.
  • Die Selektivität des Verfahrens kann gewünschtenfalls weiter verbessert werden, indem die Inkubationstemperatur auf 42 °C anstelle eines Wertes im Bereich von 30-40 °C eingestellt wird. E. coli (eingeschlossen der Stamm 0157) wächst gut bei 42 °C, diese Temperatur wirkt jedoch hemmend auf das Wachstum vieler anderer verwandter Mikroben. Die Verwendung dieser höheren Temperatur kann für verbesserte Ergebnisse für bestimmte Mikroorganismen sorgen, indem die Selektivität verbessert wird, gleichzeitig nimmt jedoch die Gesamtbrauchbarkeit des allgemeinen Mediums ab, da es keinen genauen Hinweis auf das Vorhandensein bestimmter anderer mikrobieller Arten gibt.
  • Soweit keine Inhibitoren der allgemeinen mikrobiellen Population verwendet werden, wächst auch die allgemeine mikrobielle Population (zusätzlich zu den nicht-coliformen Enterobacteriaceae, den allgemeinen Coliformen, E. coli und E. coli 0157) in dem inkubierten Testmedium. Da die von den allgemeinen Coliformen und den verschiedenen E. coli-Stämmen verschiedenen Mikroorganismen selten β-Galactosidase oder β-Glucuronidase erzeugen, zeigen sich die meisten Mikroorganismen der allgemeinen mikrobiellen Population normalerweise auf einer Standard-Agargießplatte als weiße oder farblose Kolonien.
  • Untersuchung des Testmediums und Auszählung der Mikroorganismen
  • Allgemeine Coliforme erzeugen β-Galactosidase, die auf das β-Galactosid in dem Testmedium einwirkt, was zur Folge hat, dass das β-Galactosid einen unlöslichen Niederschlag bildet, der eine Farbe aufweist, die sich nach dem speziellen verwendeten β-Galactosid richtet. Da der gebildete Niederschlag in dem Testmedium unlöslich ist, bleibt er in der unmittelbaren Umgebung der β-Galactosidase-erzeugenden Mikroorganismen. Da sich diese Mikroorganismen unter Bildung von Kolonien vermehren, haben die Kolonien die Farbe, die von dem β-Galactosid erzeugt wird.
  • Da die meisten Stämme von E. coli sowohl β-Galactosidase als auch β-Glucuronidase erzeugen, werden unlösliche Niederschläge sowohl vom β-Galactosid als auch vom β-Glucuronid erzeugt durch die Einwirkung der jeweiligen Enzyme. Die Kolonien von E. coli zeigen sich als Kolonien, die eine Farbe aufweisen, die verschieden von der Farbe der Kolonien der allgemeinen Coliformen sind und gegenüber dieser Farbe kontrastieren aufgrund des Vorhandensein des kontrastierend gefärbten unlöslichen Niederschlags des β-Glucuronids. E. coli 0157 reagiert, da es einer von den 3 % E. coli-Stämmen ist, die Glucuronidase-negativ sind, in gleicher Weise wie die allgemeinen Coliformen und verursacht die Bildung eines unlöslichen Niederschlags, der die gleiche Far be wie der Niederschlag aufweist, der von den allgemeinen Coliformen gebildet wird.
  • Die Kolonien derjenigen Mikroorganismen, die Sorbit fermentieren, werden infolge der Säure, die bei der Sorbitfermentierung entsteht, weiter verändert. In der Umgebung dieser Sorbit-fermentierenden Kolonien wird eine Zone erzeugt, die in Übereinstimmung mit dem speziellen verwendeten pH-Indikator und dem pH-Wert des Reaktionsmediums gefärbt ist. Keine Zone wird in der Umgebung der Kolonien erzeugt, die Sorbit nicht fermentieren, wie E. coli 0157.
  • Da die spezifischen Chromogene, nämlich β-Galactosidase und β-Glucuronid, und der spezifische pH-Indikator so ausgewählt werden, dass die bei der Inkubation resultierenden Farben einen sichtbaren Kontrast liefern, können die vorhandenen Kolonien jedes Typs von Mikroorganismen visuell unterschieden werden. Wenn beispielsweise 6-Chlor-3-indolylgalactosid als β-Galactosid verwendet wird, 5-Brom-4-chlor-3-indolylglucuronid als β-Glucuronid verwendet wird und Phenolrot als pH-Indikator in dem Testmedium verwendet wird, erscheinen E. coli 0157-Kolonien in dem inkubierten Medium als rote Kolonien (CFU), die von einer merklichen rötlichen Trübung um die Kolonie herum umgeben sind. Die rötliche Trübung um diese Kolonien herum wird von einer kleinen Menge Enzym verursacht, die in das Medium, das die Kolonie umgibt, hinauswandert, wobei dieses Hinauswandern einen schwach gefärbten roten Hof um die Kolonie erzeugt, und sie wird nicht infolge eines Farbwechsels des pH-Indikators erzeugt. Andere E. coli-Kolonien erscheinen als purpurfarbene (resultierend von der Kombination von roten und blauen Kolonien) Kolonien (CFU), die von einer gelben Zone umgeben sind, die durch die Reaktion des pH-Indikators auf die Säure, die bei der Fermentierung entsteht, hervorgerufen wird. Allgemeine Coliforme erscheinen als rote Kolonien (CFU), die von einer gelben Zone umgeben sind. Einige nicht-coliforme Enterobacteriaceae, wie die meisten Salmonella-Stämme erscheinen als farblose oder weiße Kolonien (CFU), die von einer gelben Zone umgeben sind, da die meisten Salmonella Sorbit unter Säurebildung fermentieren, aber weder Galactosidase noch Glucuronidase erzeugen. Bestimmte Stämme einiger Gattungen, wie Salmonella oder Shigella, wachsen als hellblaue Kolonien aufgrund der Erzeugung von Glucuronidase (aber nicht Galactosidase). Andere Enterobacteriaceae, wie Proteus, erscheinen als farblose Kolonien ohne jegliche Zone, die diese Kolonien umgibt, aufgrund des Fehlens entweder der Produktion beider Enzyme oder der Fermentierung von Sorbit unter Säurebildung.
  • Die Kolonien aller Typen von Mikroorganismen können dann durch Zählen der Kolonien mit der jeweiligen Farbkombination oder durch die Anwendung anderer Verfahren, die auf dem Fachgebiet für das Auszählen von Mikroorganismen auf einer Testplatte bekannt sind, ausgezählt werden. Die Anzahl der Kolonien jedes Typs weist auf die Anzahl der Mikroorganismen jeden Typs hin, die ursprünglich in der Probe vor der Inkubation enthalten war. Die Vielseitigkeit des erfindungsgemäßen Verfahrens ermöglicht den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung von genau so vielen der biologischen Materialien, wie sie in der speziellen Testprobe von Interesse sein können. Wenn in einer speziellen Probe beispielsweise nur allgemeine Coliforme, E. coli und E. coli 0157 von Interesse sind, können die Kolonien, die diesen Bakterien entsprechen, ausgezählt werden, und in diesem Fall ist es nicht erforderlich, auch die Kolonien anderer biologischer Materialien, wie Salmonella, Shigella und Proteus, auszuzählen.
  • Es soll demnach verstanden werden, dass die Erfindung, so wie sie beschrieben wird, verwendet werden kann, um vielfältige Typen von Mikroorganismen in einer eirizigen Testprobe quantitativ nachzuweisen und zu unterscheiden, indem einfach verschiedene Farbkombinationen unterschieden werden, die als Ergebnis von kontrollierten Reaktionen, an denen diese Mikroorganismen beteiligt sind, gebildet werden.
  • Optionale Bestandteile
  • Das erfindungsgemäße Verfahren erfordert keine Inhibitoren. Wie jedoch festgestellt wurde, kann das Medium selektiver gemacht werden, wenn es für den Nachweis und die Differenzierung biologischer Materialien, wie allgemeiner Coliforme, E. coli und E. coli 0157 verwendet wird, indem verschiedene Verbindungen zugegeben werden, von denen bekannt ist, dass sie die allgemeine mikrobielle Population hemmen, jedoch nur geringfügige oder keine Auswirkungen auf Coliforme haben. Beispielsweise können Substanzen wie Galle, Natriumlaurylsulfat, Desoxycholate und/oder Polyglycolether zu dem Medium gegeben werden, um das Wachstum von Bakterien, die in dem speziellen Test nicht von Interesse sind, zu hemmen. Vorgeschlagene Konzentrationen dieser Verbindungen pro Liter Medium sind: a) Gallensalze, etwa 1,0 g/Liter, b) Natriumlaurylsulfat (etwa 0,2 g/Liter), c) Natriumdesoxycholat, etwa 0,2 g/Liter, d) Polyglycolether, etwa 0,1 ml/Liter. Die Zugabe von einer oder mehreren dieser Verbindungen kann den Hintergrund der vorhandenen Mikroorganismen (Nicht-Enterobacteriaceae) verringern, wodurch eine weniger voll belegte Platte erhalten wird, und sie kann die Möglichkeit einer Hemmung oder einer Störung durch die Nicht-Enterobacteriaceae-Organismen in der Probe verringern. Es ist auch möglich, das Vorhandensein einiger Nicht-E. coli-Enterobacteriaceae und/oder Coliforme durch die Zugabe von Chemikalien wie Acriflavin, und/oder Antibiotika, wie Cefsulodin, Cefoxim, Novobiocin und ähnlicher hemmender Verbindungen, die auf dem Fachgebiet bekannt sind, zu beseitigen. Wie mit den obigen Inhibitoren verringert dieser Ansatz jedoch die Fähigkeit des Mediums, diejenigen Mikroorganismen, die durch diese Materialien gehemmt oder entfernt werden, durchzumustern und zu quantifizieren.
  • Es ist auch möglich, die Enzymerzeugung der allgemeinen Coliformen durch die Zugabe von sehr kleinen Mengen Enzym-Induktoren zu verstärken. Ein spezieller Induktor für β-Galactosidase ist beispielsweise im Handel erhältlich und ist chemisch als Isopropyl-β-D-thiogalactopy ranosid (IPTG) bekannt. Die Zugabe von etwa 150 mg IPTG pro Liter Medium hat eine positive und merkliche Wirkung auf die Geschwindigkeit der Enzymerzeugung für einige Arten von Coliformen.
  • Beispiel
  • Es wurden Testplatten hergestellt, die die in der oben angegebenen Formulierung aufgezählten Bestandteile enthalten, jedoch unter Ersatz des Agars durch Pektin als Gelbildner. Das Medium wurde mit den jeweiligen, in der folgenden Tabelle angegebenen Bakterien beimpft.
  • Die Tabelle beschreibt die Art und Weise, in der E. coli 0157, allgemeine Coliforme, E. coli und die nicht-coliformen Enterobacteriaceae, Proteus und Salmonella, unterschieden werden können, wenn das in dem obigen Beispiel beschriebene Testmedium verwendet wird. Wie in der Tabelle gezeigt wird, können, wenn das erfindungsgemäße Testmedium in einem Test für den Nachweis oder die Unterscheidung von E. coli 0157 in einer Probe verwendet wird, die allgemeine Coliforme oder E. coli und nicht-coliforme Enterobacteriaceae, Proteus und Salmonella, enthält, visuelle Unterscheidungen für jede der spezifischen Kolonien der jeweiligen Mikroorganismen getroffen werden. Die Vielseitigkeit des erfindungsgemäßen Verfahrens ist mit dem anderen, in der Tabelle beschriebenen Testmedien nicht möglich. VERGLEICHSMEDIEN
    Medium Nr. (1) (2) (3) (4) (5) (6)
    ECO157 rot rote Trübung rot rote Zone weiß keine Zone weiß blau weiß
    Andere E. coli (meistens) purpurfarben gelbe Zone rot gelbe Zone blau rot blau blau
    gelbe Zone
    Coliforme (meistens) rot gelbe Zone rot gelbe Zone weiß rot blau weiß
    gelbe Zone
    Proteus (meistens) weiß keine Zone weiß keine Zone weiß keine Zone weiß weiß weiß
    Salmonella (meistens) weiß gelbe Zone weiß gelbe Zone weiß weiß o. rot weiß o. rot weiß o. rot
    gelbe Zone
    • (1) Oben angegebene Formulierung des Mediums.
    • (2) Oben angegebene Formulierung des Mediums ohne 5-Brom-4-chlor-3-indolylglucuronid.
    • (3) Oben angegebene Formulierung des Mediums ohne 6-Chlor-3-indolylgalactosid.
    • (4) MacConkey-Sorbit-Standardformulierung.
    • (5) MacConkey-Sorbit plus 5-Brom-4-chlor-3-indolylgalactosid.
    • (6) MacConkey-Sorbit plus 5-Brom-4-chlor-3-indolylglucuronid.
  • Auch wenn diese Erfindung primär im Hinblick auf ihre bevorzugte Ausführungsform beschrieben worden ist, ist es dem Fachmann unmittelbar ersichtlich, dass die vorliegende Erfindung weiter abgewandelt werden kann, um den Nachweis und die Unterscheidung anderer biologischer Materialien, die in Proben gemischter Populationen enthalten sind, zu ermöglichen. Diese Anmeldung ist daher so gedacht, dass sie beliebige Veränderungen, Verwendungen oder Anpassungen die Erfindung, die ihre allgemeinen Prinzipien anwenden, abdeckt. Die erfindungsgemäße Technik kann beispielsweise verwendet werden, um eine große Vielzahl biologischer Materialien quantitativ nachzuweisen und zu unterscheiden, solange diese biologischen Materialien Unterschiede hinsichtlich der Enzymspezifität zeigen und mindestens einige der biologischen Materialien Unterschiede hinsichtlich ihrer jeweiligen Fähigkeiten zeigen, verschiedene Kohlenwasserstoffe bei einem ausge wählten pH-Wert in Gegenwart eines geeigneten pH-Indikators zur Verwendung bei dem pH-Wert zu fermentieren. Bei der praktischen Durchführung der vorliegenden Erfindung muss man nur feststellen, dass die speziellen Chromogene, die für die visuelle Unterscheidung verwendet werden sollen, bei der Umsetzung mit den jeweiligen Enzymen unterscheidbare Farben liefern, und man muss einen geeigneten Kohlenwasserstoff und einen geeigneten pH-Indikator so auswählen, dass noch eine weitere visuell unterscheidbare Farbe bei der Fermentierung des Kohlenwasserstoffs unter den geeigneten Reaktionsbedingungen für den pH-Indikator erzeugt wird.
  • Zusätzlich zu dem oben Beschriebenen ist die vorliegende Anmeldung so gedacht, dass sie solche Abwandlungen von der vorliegenden Offenbarung einschließt, die einem bei der bekannten und gewöhnlichen Praxis auf dem Gebiet, zu dem diese Erfindung gehört, einfallen und die innerhalb der Grenzen der beigefügten Ansprüche liegen.

Claims (35)

  1. Verfahren für den quantitativen Nachweis und die Unterscheidung bestimmter biologischer Materialien in einer Testprobe, die eine Vielzahl verschiedener biologischer Materialien umfasst, wobei ein erstes dieser biologischen Materialien Enzymspezifität für ein erstes chromogenes Substrat hat und ein zweites dieser biologischen Materialien Enzymspezifität für ein zweites chromogenes Substrat hat und wobei mindestens einige der biologischen Materialien in der Testprobe imstande sind, ein Kohlenhydrat zu fermentieren, wobei das Verfahren die folgenden Schritte umfasst: – Bereitstellen eines Testmediums, das imstande ist, eine Matrix oder eine feste Oberfläche mit der Testprobe zu bilden, wobei das Testmedium umfasst: das erste chromogene Substrat und das zweite chromogene Substrat, wobei das erste chromogene Substrate imstande ist, bei der Umsetzung mit einem Enzym des ersten biologischen Materials eine wasserunlösliche Verbindung mit einer ersten Farbe zu bilden, und wobei das zweite chromogene Substrat bei der Umsetzung mit einem Enzym des zweiten biologischen Materials imstande ist, eine wasserunlösliche Verbindung mit einer Farbe zu bilden, die gegenüber der ersten Farbe kontrastiert; einen fermentierbaren Bestandteil, der imstande ist, bei der Fermentierung einen Teil des Mediums anzusäuern, wobei dieser Bestandteil ein Kohlenhydrat umfasst, und wobei die Fermentierung durch Kohlenhydrat-fermentierende Bestandteile in der Testprobe verursacht wird; einen pH-Indikator zum Erzeugen einer dritten Farbe, die bei der Reaktion auf die Ansäuerung entsteht, wobei die dritte Farbe eine gefärbte Zone um die Kohlenhydratfermentierenden Bestandteile umfasst; und ein Nährstoffgrundmedium; – Einstellen des pH-Werts des Testmediums auf einen Wert in einem Bereich, der beim Ansäuern dieses Teils des Mediums für die Farbänderung des pH-Indikators förderlich ist; – Beimpfen des Testmediums mit der Testprobe; – Inkubieren des Testmediums unter Bedingungen, die für das Wachstum von Kolonien oder die Aktivität der biologischen Materialien förderlich sind, um so die kontrastierenden, farbigen, wasserunlöslichen Verbindungen zu bilden; – Untersuchen des Testmediums auf das Vorhandensein von Kolonien, die die erste Farbe haben und die dritte gefärbte Zone aufweisen, die um die Kolonie herum sichtbar und unterscheidbar ist, wobei die Kolonien Kolonien des ersten biologischen Materials sind, die Kohlenhydrate fermentieren; auf das Vorhandensein von Kolonien, die eine zweite Farbe haben, die mit der ersten Farbe einen Kontrast bildet, und die die dritte gefärbte Zone aufweisen, die drum herum sichtbar und unterscheidbar ist, wobei derartige Kolonien Kolonien des zweiten biologischen Materials sind, die Kohlenhydrate fermentieren; und auf das Vorhandensein von Kolonien, die die erste Farbe haben und die die zweite Farbe oder die dritte gefärbte Zone, die sichtbar und davon unterscheidbar ist, nicht haben, wobei derartige Kolonien Kolonien eines dritten biologischen Materials sind; und – Auszählen aller Kolonien.
  2. Verfahren nach Anspruch 1, das einen Schritt einschließt, in dem das Testmedium weiterhin auf das Vorhandensein von Kolonien untersucht wird, die eine Farbe haben, die verschieden von der ersten Farbe und der zweiten Farbe ist, oder die farblos sind, mit oder ohne die dritte gefärbte Zone, wobei derartige Kolonien Kolonien von mindestens einem vierten biologischen Material sind.
  3. Verfahren nach Anspruch 1, das einen Schritt einschließt, in dem das Testmedium weiterhin auf das Vorhandensein von Kolonien, die weder die erste Farbe noch die zweite Farbe aufweisen, mit oder ohne die dritte gefärbte Zone, wobei derartige Kolonien Kolonien von mindestens einem vierten biologischen Material sind; und auf das Vorhandensein von Kolonien, die eine vierte Farbe aufweisen, mit oder ohne die dritte gefärbte Zone, wobei derartige Kolonien Kolonien von mindestens einem fünften biologischen Material sind, untersucht wird.
  4. Verfahren nach Anspruch 1, wobei das erste chromogene Substrat 6-Chlor-3-indolylgalactosid umfasst und wobei das zweite chromogene Substrat 5-Brom-4-chlor-3-indolylglucouronid umfasst, wobei das Kohlenhydrat Sorbit umfasst und der pH-Indikator Phenolrot umfasst.
  5. Verfahren nach Anspruch 1, wobei das Testmedium weiterhin mindestens einen Wachstumsinhibitor umfasst.
  6. Verfahren nach Anspruch 5, wobei der mindestens eine Wachstumsinhibitor Galle, Natriumlaurylsulfat, Natriumdesoxycholat oder Polyglycolether umfasst.
  7. Verfahren nach Anspruch 1, wobei das Testmedium weiterhin mindestens Acriflavin und/oder mindestens ein Antibiotikum enthält.
  8. Verfahren nach Anspruch 1, wobei das Testmedium weiterhin eine Substanz zum Auslösen der Reaktion enthält.
  9. Verfahren nach Anspruch 1, wobei die Reaktion bei einer Inkubationstemperatur im Bereich von 30 bis 40 °C durchgeführt wird und die Inkubation 24 bis 48 h dauert, und wobei der pH-Wert des Testmediums etwa 7,2 beträgt.
  10. Testmedium für den Nachweis des Vorhandenseins bestimmter biologischer Materialien in einer Testprobe, die eine Vielzahl verschiedener biologischer Materialien enthält, wobei das Testmedium umfasst: – ein Nährstoffgrundmedium; – ein erstes chromogenes Substrat, bei dem es sich um ein β-Galactosid handelt, das imstande ist, bei der Umsetzung mit einem Enzym eines ersten biologischen Materials einen wasserunlöslichen Bestandteil mit einer ersten Farbe zu bilden; – ein zweites chromogenes Substrat, bei dem es sich um ein β-Glucuronid handelt, das imstande ist, bei der Umsetzung mit einem Enzym eines zweiten biologischen Materials eine wasserunlösliche Verbindung mit einer Farbe zu bilden, die mit der ersten Farbe kontrastiert; – einen fermentierbaren Bestandteil, der Sorbit umfasst, der imstande ist, einen Teil des Testmediums infolge der Fermentierung anzusäuern, wobei der fermentierbare Bestandteil ein Kohlenhydrat umfasst, wobei die Fermentierung durch Kohlenhydratfermentierende biologische Materialien in der Testprobe verursacht wird; und – einen pH-Indikator, der eine dritte Farbe verursacht, die als Reaktion auf die Ansäuerung entsteht, wobei die dritte Farbe eine gefärbte Zone um die Kohlenhydrat-fermentierenden biologischen Materialien umfasst.
  11. Testmedium nach Anspruch 10, wobei das Nährstoffgrundmedium einen Feststoff, ein Gel, eine Lösung für die Erzeugung eines Feststoffs oder ein absorbierendes Substrat, das absorbierte Nährstoffe enthält, umfasst.
  12. Testmedium nach Anspruch 10 wobei das Nährstoffgrundmedium einen Gelbildner umfasst, der unter Agar-Gelbildner, Pektinen, Carrageenen, Alginaten, Johannisbrotkernmehl, Xanthin, Guar und Gellan ausgewählt wird.
  13. Testmedium nach Anspruch 10, wobei das Testmedium weiterhin eine enzyminduzierende Substanz umfasst.
  14. Testmedium nach Anspruch 10, wobei das Testmedium einen Wachstumsinhibitor einschließt.
  15. Testmedium nach Anspruch 10, wobei der pH-Indikator Phenolrot umfasst.
  16. Testmedium nach Anspruch 10, wobei das Nährstoffgrundmedium Peptone umfasst.
  17. Verfahren nach Anspruch 1, wobei das erste biologische Material allgemeine Coliforme einschließt, das zweite biologische Material E. coli einschließt und das dritte biologische Material E. coli 0157 einschließt; und wobei das erste chromogene Substrat ein β-Galactosid ist, das zweite chromogene Substrat ein β-Glucuronid ist und wobei der fermentierbare Bestandteil Sorbit umfasst.
  18. Verfahren nach Anspruch 17, wobei nicht-coliforme Enterobacteriaceae-Kolonien, die weder eine β-Galactosidase-Aktivität noch eine β-Glucuronidase-Aktivität haben, getrennt ausgezählt werden in Abhängigkeit vom Vorhandensein der dritten gefärbten Zone, die um die Kolonien herum sichtbar und unterscheidbar ist, wobei die Kolonien, die um sie herum diese dritte gefärbte Zone aufweisen, im Wesentlichen Salmonella-Kolonien sind, und wobei die Kolonien, die diese dritte gefärbte Zone nicht aufweisen, im Wesentlichen Proteus-Kolonien sind.
  19. Verfahren nach Anspruch 18, wobei das Testmedium weiterhin auf das Vorhandensein von Kolonien mit einer vierten Farbe, mit oder ohne die dritte gefärbte Zone, die um sie herum sichtbar und unterscheidbar ist, untersucht wird, wobei es sich bei diesen Ko lonien im Wesentlichen um Shigella-Kolonien und einige Salmonelle-Stämme handelt.
  20. Verfahren nach Anspruch 17, wobei das chromogene β-Galactosidase-Substrat 6-Chlor-3-indolylgalactosid umfasst.
  21. Verfahren nach Anspruch 17, wobei das chromogene β-Glucuronidase-Substrat 5-Brom-4-chlor-3-indolylglucuronid umfasst.
  22. Verfahren nach Anspruch 17, wobei es sich bei dem pH-Indikator um Phenolrot handelt und wobei das Medium auf einen pH-Wert von etwa 7,2 eingestellt wird.
  23. Verfahren nach Anspruch 17, wobei das Testmedium weiterhin Wachstumsinhibitoren umfasst.
  24. Verfahren nach Anspruch 23, wobei die Inhibitoren unter Galle, Natriumlaurylsulfat, Natriumdesoxycholat und Polyglycolether ausgewählt werden.
  25. Verfahren nach Anspruch 17, wobei das Testmedium weiterhin mindestens Acriflavin und/oder mindestens ein Antibiotikum enthält.
  26. Verfahren nach Anspruch 17, wobei das Testmedium weiterhin eine die Reaktion induzierende Substanz umfasst.
  27. Verfahren nach Anspruch 26, wobei die die Reaktion induzierende Substanz Isopropyl-β-D-thiogalactopyranosid umfasst.
  28. Verfahren nach Anspruch 22, wobei die Reaktion bei einer Inkubationstemperatur im Bereich von 30 bis 40 °C stattfindet und die Inkubation 24 bis 48 h dauert und wobei der pH-Wert des Testmediums etwa 7,2 beträgt.
  29. Verfahren nach Anspruch 17, wobei das Nährstoffgrundmedium einen Feststoff, ein Gel oder eine Lösung für die Erzeugung eines Feststoffs umfasst.
  30. Verfahren nach Anspruch 29, wobei das Nährstoffgrundmedium einen festen Träger auf der Basis eines Gelbildners bildet, wobei der Gelbildner unter Agar und Pektin wird.
  31. Testmedium nach Anspruch 10, wobei das erste biologische Material allgemeine Coliforme einschließt, das zweite biologische Material E. coli-Stämme einschließt und ein weiteres Material von der Vielzahl verschiedener biologischer Materialien E. coli 0157 einschließt; und wobei das erste chromogene Substrat ein β-Galactosid einschließt, das unter 6-Chlorindolyl-β-D-galactosid, 5-Brom-6-chlor-3-indolyl-β-D-galactosid, 6-Chlor-3-indolyl-β-D-galactosid, 4,6-Dichlorindolyl-β-D-galactosid, 6,7-Dichlorindolyl-β-D-galactosid, 4,6,7-Trichlorindolyl-β-D-galactosid, 2-Naphthyl-β-D-galactosid und Salzen dieser Verbindungen ausgewählt wird, das zweite chromogene Substrat ein β-Glucuronid einschließt, das unter 5-Brom-4-chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid, Indoxyl-β-D-glucuronid, 4-Chlor-3-indolyl-β-D-glucuronid, 5-Brom-3-indolyl-β-D-glucuronid und N-Methyl-3-indolyl-f,β-D-glucuronid und Salzen dieser Verbindungen ausgewählt wird; und wobei der fermentierbare Bestandteil Sorbit einschließt.
  32. Testmedium nach Anspruch 31, wobei das Testmedium außerdem eine enzyminduzierende Substanz umfasst.
  33. Testmedium nach Anspruch 32, wobei die enzyminduzierende Substanz Isopropyl-β-D-thiogalactopyranosid umfasst.
  34. Testmedium nach Anspruch 31, wobei es sich bei dem pH-Indikator um Phenolrot handelt.
  35. Testmedium nach Anspruch 31, wobei das Medium einen Inhibitor einschließt, der unter Gallensalzen, Natriumlaurylsulfat, Natriumdesoxycholat, Polyglycolethern und Gemischen dieser Verbindungen ausgewählt wird.
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