DE06814528T1 - Wiederkehrende genfusionen bei prostatakrebs - Google Patents

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Abstract

Ein Verfahren zur Diagnose von Prostata-Krebs bei einem Patienten, umfassend: (a) die Bereitstellung einer Patientenprobe; und (b) Detektion der Probe auf die Anwesenheit oder die Abwesenheit einer Genfusion umfassend einen 5'-Teil von einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens und einen 3'-Teil von einem Gen eines ETS-Familienmitglieds, wobei die Anwesenheit der Genfusion in der Probe auf Prostata-Krebs bei dem Patienten hinweist.

Claims (41)

  1. Ein Verfahren zur Diagnose von Prostata-Krebs bei einem Patienten, umfassend: (a) die Bereitstellung einer Patientenprobe; und (b) Detektion der Probe auf die Anwesenheit oder die Abwesenheit einer Genfusion umfassend einen 5'-Teil von einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens und einen 3'-Teil von einem Gen eines ETS-Familienmitglieds, wobei die Anwesenheit der Genfusion in der Probe auf Prostata-Krebs bei dem Patienten hinweist.
  2. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei das Androgen-regulierte Gen ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus TMPRSS2 und PSA.
  3. Das Verfahren nach Anspruch 2, wobei die transkriptionsregulatorische Region des Androgen-regulierten Gens eine Promotorregion des Androgen-regulierten Gens umfasst.
  4. Das Verfahren nach Anspruch 3, wobei die Promotorregion des Androgen-regulierten Gens ein Androgen-responsibles Element (ARE) des Androgen-regulierten Gens umfasst.
  5. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei das Gen des ETS-Familienmitglieds ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus ERG, ETV1 (ER81), FLI1, ETS1, ETS2, ELK1, ETV6 (TEL1), ETV7 (TEL2), GABPα, ELF1, ETV4 (E1AF; PEA3), ETV5 (ERM), ERF, PEA3/E1AF, PU.1, ESE1/ESX, SAP1 (ELK4), ETV3 (METS), EWS/FLI1, ESE1, ESE2 (ELF5), ESE3, PDEF, NET (ELK3; SAP2), NERF (ELF2) und FEV.
  6. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei der Schritt (b) die Detektion chromosomaler Umbauten genomischer DNS umfassend einen 5'-Teil von einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens und einen 3'-Teil von einem Gen eines ETS-Familienmitglieds umfasst.
  7. Das Verfahren nach Anspruch 6, wobei der Schritt (b) die Detektion chromosomaler Umbauten genomischer DNS unter Anwendung von Nukleinsäuresequenzierungstechniken umfasst.
  8. Das Verfahren nach Anspruch 6, wobei der Schritt (b) die Detektion chromosomaler Umbauten genomischer DNS unter Anwendung von Nukleinsäurehybridisationstechniken umfasst.
  9. Das Verfahren nach Anspruch 8, wobei der Schritt (b) die Detektion chromosomaler Umbauten genomischer DNS unter Anwendung von Nukleinsäurehybridisationstechniken ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus in situ Hybridisation (ISH), Mikroarray und Southern-Blot umfasst.
  10. Das Verfahren nach Anspruch 6, wobei der Schritt (b) die Detektion chromosomaler Umbauten genomischer DNS unter Anwendung eines Nukleinsäureamplifikationsverfahrens umfasst.
  11. Das Verfahren nach Anspruch 10, wobei der Schritt (b) die Detektion chromosomaler Umbauten genomischer DNS unter Anwendung eines Nukleinsäureamplifikationsverfahrens ausgewählt aus der Gruppe bestehend Polymerase-Kettenreaktion (PCR), Reverse Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion (RT-PCR), Transkriptions-Vermittelte Amplifikation (TMA), Ligase-Kettenreaktion (LCR), Strangdislokationsamplifikation (SDA) und Nukleinssäuresequenz-basierte Amplifikation (NASBA) umfasst.
  12. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei der Schritt (b) die Detektion chimärer mRNA-Transkripte umfassend einen 5'-Teil von einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens und einen 3'-Teil von einem Gen eines ETS-Familienmitglieds umfasst.
  13. Das Verfahren nach Anspruch 12, wobei der Schritt (b) die Detektion chimärer mRNA-Transkripte unter Anwendung einer Nukleinsäuresequenzierungstechnik umfasst.
  14. Das Verfahren nach Anspruch 12, wobei der Schritt (b) die Detektion chimärer mRNA-Transkripte unter Anwendung einer Nukleinsäurehybridisationstechnik umfasst.
  15. Das Verfahren nach Anspruch 14, wobei der Schritt (b) die Detektion chimärer mRNA-Transkripte unter Anwendung einer Nukleinsäurehybridisationstechnik ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus in situ Hybridisation (ISH), Mikroarray und Southern-Blot umfasst.
  16. Das Verfahren nach Anspruch 15, wobei die in situ Hybridisation Fluoreszenz-in situ-Hybridisation (FISH) unter Anwendung einer Sonde ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus: RP11-372O17; RP11-137J13; RP11-692L4; RP11-476D17; PR11-32L6; RP11-752M23; RP11-1107H21; RP11-639A7; RP11-1077M21; RP11-121A5; RP11-120C17; PR11-814F13 und RR11-535H11 ist.
  17. Das Verfahren nach Anspruch 12, wobei der Schritt (b) die Detektion chimärer mRNA-Transkripte unter Anwendung eines Nukleinsäureamplifikationsverfahrens umfasst.
  18. Das Verfahren nach Anspruch 17, wobei der Schritt (b) die Detektion chimärer mRNA-Transkripte DNS unter Anwendung eines Nukleinsäureamplifikationsverfahrens ausgewählt aus der Gruppe bestehend Polymerase-Kettenreaktion (PCR), Reverse Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion (RT-PCR), Transkriptions-Vermittelte Amplifikation (TMA), Ligase-Kettenreaktion (LCR), Strangdislokationsamplifikation (SDA), und Nukleinssäuresequenz-basierte Amplifikation (NASBA) umfasst.
  19. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei der Schritt (b) die Detektion eines Amino-endständig verkürzten Proteins eines ETS-Familienmitglieds als Ergebnis einer Fusion einer transkriptionsregulatorischen Region einer Androgen-regulierten Region eines Androgen-regulierten Gens mit einem Gen eines ETS-Familienmitglieds umfasst.
  20. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei der Schritt (b) die Detektion eines chimären Proteins umfasst, welches einen Amino-endständigen Teil von einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens und einen Carboxy-endständigen Teil eines Gens von einem Eta-Familienmitglied aufweist.
  21. Das Verfahren nach Anspruch 19 oder 20, wobei der Schritt (b) die Detektion des Proteins unter Anwendung einer Proteinsequenzierungstechnik umfasst.
  22. Das Verfahren nach Anspruch 19 oder 20, wobei der Schritt (b) die Detektion des Proteins unter Anwendung eines Immuntests umfasst.
  23. Das Verfahren nach Anspruch 22, wobei der Schritt (b) die Detektion des Proteins unter Anwendung eines Immuntests ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus Immunpräzipitation; Western-Blot; ELISA; Immunhistochemie; Immunzytochemie; Durchflusszytometrie; und Immun-PCR umfasst.
  24. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei die Probe ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Gewebe, Blut, Urin, Samen, Prostata-Sekreten und Prostata-Zellen.
  25. Das Verfahren nach Anspruch 1, wobei die Genfusion eine Fusion aus TMPRSS2 and ERG ist und wobei das Verfahren des Weiteren den Schritt der Charakterisierung der Prostata-Zellen basierend auf der Anwesenheit oder Abwesenheit einer genomischen Deletion in der Genfusion umfasst.
  26. Das Verfahren nach Anspruch 25, wobei dar Genumbau eine Deletion genomischer DNS zwischen dem TMPRSS2 and dem ERG Gen auf dem Chromosom 21 ist.
  27. Das Verfahren nach Anspruch 26, wobei die Deletion die Deletion von Exon 1 des ERG-Gens einschließt.
  28. Das Verfahren nach Anspruch 26, wobei die Deletion die Deletion von Exon 3 des TMPRSS2-Gens einschließt.
  29. Das Verfahren nach Anspruch 26, wobei zwischen 2,8 and 2,85 Megabasen genomischer DNS deletiert sind.
  30. Das Verfahren nach Anspruch 29, wobei die Deletion unter Anwendung eines FISH-Assays unter Verwendung mindestens einer Fluoreszenz-markierten Sonde ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus dem BAC-Klon RP11-137J13 und dem BAC-Klon RP11-24A11 detektiert wird.
  31. Das Verfahren nach Anspruch 28, wobei die Deletion unter Anwendung der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) detektiert wird.
  32. Das Verfahren nach Anspruch 31, wobei die PCR unter Verwendung eines Primers ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus SEQ ID Nr. 55 – SEQ ID Nr. 58 durchgeführt wird.
  33. Das Verfahren nach Anspruch 26, wobei die Anwesenheit der Deletion auf Metastasen-bildenden Prostata-Krebs bei dem Patienten hinweist.
  34. Eine Zusammensetzung für die Diagnose von Prostata-Krebs bei einem Patienten umfassend mindestens Eines der folgenden: (a) eine markierte Sonde umfassend eine Sequenz, welche mit der Grenzzone, an der der 5'-Teil einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens mit dem 3'-Teil eines Gens von einem ETS-Familienmitglied fusioniert, hybridisiert; (b) einer erste markierte Sonde umfassend eine Sequenz, welche mit einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens hybridisiert und eine zweite markierte Sonde umfassend eine Sequenz, welche mit einem Gen eines ETS-Familienmitglieds hybridisiert; (c) ein erster Amplifikationsoligonukleotid umfassend eine Sequenz, welche mit einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens hybridisiert und ein zweiter Amplifikationsoligonukleotid umfassend eine Sequenz, welche mit einem Gen eines ETS-Familienmitglieds hybridisiert; (d) ein Antikörper, der gegen ein Amino-endständig verkürztes Protein eines ETS-Familienmitglieds gerichtet ist und das Ergebnis einer Fusion einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens mit einem Gen eines ETS-Familienmitglieds ist; und (e) ein Antikörper, der gegen ein chimäres Protein mit einem Amino-endständigen Teil von einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens und einem Carboxy-endständigen Teil von einem Gen eines ETS-Familienmitglieds gerichtet ist.
  35. Ein Verfahren für die Analyse von Prostata-Krebszellen auf eine Deletion von genomischer DNS als Hinweis auf einen Krebs-assoziierten Umbau, umfassend: (a) den Erwerb einer Testprobe der Prostata-Zellen; (b) die Analyse der Prostata-Zellprobe um das Expressionsniveau eines oder mehrerer Gene ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus: ETS2; WRB; PCP4; und MX1 zu ermitteln; (c) den Vergleich der in Schritt b) ermittelten Expressionsniveaus mit dem Niveau in einer Kontrollprobe; und (d) die Feststellung, dass eine Deletion stattgefunden hat wenn das für das Gen in der Testprobe ermittelte Expressionsniveau geringer ist als das der Kontrollprobe.
  36. Ein Verfahren zur Behandlung von Prostata-Krebs bei einem Patienten umfassend: die Verabreichung eines Mittels an den Patienten, welches mindestens eine biologische Aktivität einer Genfusion mit einem 5'-Teil von einer transkriptionsregulatorischen Region eines Androgen-regulierten Gens und einem 3'-Teil von einem Gen eines ETS-Familienmitglieds inhibiert.
  37. Das Verfahren nach Anspruch 36, wobei das Androgen-regulierte Gen ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus TMPRSS2 and PSA.
  38. Das Verfahren nach Anspruch 37, wobei die transkriptionsregulatorische Region des Androgen-regulierten Gens eine Promotorregion des Androgen-regulierten Gens umfasst.
  39. Das Verfahren nach Anspruch 38, wobei die Promotorregion des Androgen-regulierten Gens ein Androgen-responsibles Element des Androgen-regulierten Gens umfasst.
  40. Das Verfahren nach Anspruch 36, wobei das ETS-Familienmitgliedgen ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus ERG, ETV1 (ER81), FLI1, ETS1, ETS2, ELK1, ETV6 (TEL1), ETV7 (TEL2), GABPα, ELF1, ETV4 (E1AF; PEA3), ETV5 (ERM), ERF, PEA3/E1AF, PU.1, ESE1/ESX, SAP1 (ELK4), ETV3 (METS), EWS/FLI1, ESE1, ESE2 (ELF5), ESE3, PDEF, NET (ELK3; SAP2), NERF (ELF2) und FEV.
  41. Das Verfahren nach Anspruch 36, wobei das Mittel ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus einem kleinen Molekül/einer niedermolekularen Verbindung, einer siRNS, einer Antisense-Nukleinsäure und einem Antikörper.
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US (9) US7718369B2 (de)
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IL (1) IL190095A (de)
WO (1) WO2007033187A2 (de)

Families Citing this family (55)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8008012B2 (en) * 2002-01-24 2011-08-30 Health Discovery Corporation Biomarkers downregulated in prostate cancer
US11105808B2 (en) 2004-11-12 2021-08-31 Health Discovery Corporation Methods for screening, predicting and monitoring prostate cancer
DE06814528T1 (de) 2005-09-12 2012-01-05 The Regent Of The University Of Michigan Wiederkehrende genfusionen bei prostatakrebs
US9957569B2 (en) * 2005-09-12 2018-05-01 The Regents Of The University Of Michigan Recurrent gene fusions in prostate cancer
US8273539B2 (en) * 2006-09-25 2012-09-25 Mayo Foundation For Medical Education And Research Extracellular and membrane-associated prostate cancer markers
US8541169B2 (en) 2006-10-10 2013-09-24 The Henry M. Jackson Foundation For The Advancement Of Military Medicine, Inc. Prostate cancer-specific alternations in ERG gene expression and detection and treatment methods based on those alterations
WO2008058018A2 (en) 2006-11-02 2008-05-15 Mayo Foundation For Medical Education And Research Predicting cancer outcome
US20100129804A1 (en) * 2006-11-08 2010-05-27 Chinnaiyan Arul M Spink1 as a prostate cancer marker and uses thereof
US8999634B2 (en) * 2007-04-27 2015-04-07 Quest Diagnostics Investments Incorporated Nucleic acid detection combining amplification with fragmentation
EP2171094B1 (de) 2007-07-06 2011-11-16 The Regents of the University of Michigan Mipol1-etv1-gen-neuanordnungen
CA2814246A1 (en) * 2007-07-06 2009-01-15 The Regents Of The University Of Michigan Solute carrier family 45 member 3 (slc45a3) and erg family gene fusions in prostate cancer
AU2008275978B9 (en) * 2007-07-18 2014-11-20 Gen-Probe Incorporated Compositions and methods to detect TMPRSS2/ERG transcript variants in prostate cancer
US8106037B2 (en) 2007-08-03 2012-01-31 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Identification and treatment of estrogen responsive prostate tumors
WO2009051734A1 (en) * 2007-10-17 2009-04-23 The General Hospital Corporation Microchip-based devices for capturing circulating tumor cells and methods of their use
AU2008354371B2 (en) * 2008-04-10 2015-07-09 The Henry M. Jackson Foundation For The Advancement Of Military Medicine, Inc. Prostate cancer-specific alterations in ERG gene expression and detection and treatment methods based on those alterations
US8455615B2 (en) 2008-05-01 2013-06-04 Beth Israel Deaconess Medical Center Methods and compositions for prostate cancer immunotherapy
EP2806054A1 (de) 2008-05-28 2014-11-26 Genomedx Biosciences Inc. Systeme und Verfahren zur expressionsbasierten Unterscheidung verschiedener klinischer Krankheitszustände bei Prostatakrebs
US10407731B2 (en) 2008-05-30 2019-09-10 Mayo Foundation For Medical Education And Research Biomarker panels for predicting prostate cancer outcomes
WO2010096660A2 (en) * 2009-02-19 2010-08-26 Cornell University Compositions and methods for diagnosing prostate cancer based on detection of slc45a3-elk4 fusion transcript
WO2010101994A2 (en) * 2009-03-03 2010-09-10 The Regents Of The University Of Michigan Gene fusion targeted therapy
WO2010126972A1 (en) * 2009-04-29 2010-11-04 The Henry M. Jackson Foundation For The Advancement Of Military Medicine, Inc. Erg monoclonal antibodies
WO2010138460A1 (en) 2009-05-26 2010-12-02 Quest Diagnostics Investments Incorporated Methods for detecting gene dysregulations
CN102712953A (zh) * 2009-09-17 2012-10-03 密歇根大学董事会 前列腺癌中的复发性基因融合物
US8546552B2 (en) 2009-12-23 2013-10-01 Quest Diagnostics Investments Incorporated TMPRSS2 for the diagnosis of prostate disease
CN103003294A (zh) * 2010-02-19 2013-03-27 密执安大学评议会 基因融合靶向治疗
SG10201505769PA (en) * 2010-07-27 2015-09-29 Genomic Health Inc Method for using gene expression to determine prognosis of prostate cancer
US8945556B2 (en) 2010-11-19 2015-02-03 The Regents Of The University Of Michigan RAF gene fusions
WO2012075069A2 (en) * 2010-12-02 2012-06-07 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Signatures and determinants associated with cancer and methods of use thereof
ES2638089T3 (es) * 2011-02-24 2017-10-18 Ventana Medical Systems, Inc. Presencia de reordenamientos del gen ERG y sobreexpresión de proteínas en NIP de bajo grado (NIP-BG) en biopsias de próstata
WO2012145129A2 (en) 2011-04-18 2012-10-26 Cornell University Molecular subtyping, prognosis and treatment of prostate cancer
WO2012149522A1 (en) * 2011-04-28 2012-11-01 Baylor College Of Medicine Recurrent chimeric rnas enriched in human prostate cancer as biomarkers
CA2842821A1 (en) * 2011-08-08 2013-02-14 The Henry M. Jackson Foundation For The Advancement Of Military Medicine, Inc. Isolation and detection of cancer cells
AU2012352153B2 (en) 2011-12-13 2018-07-26 Veracyte, Inc. Cancer diagnostics using non-coding transcripts
BR122015032159A2 (pt) 2011-12-30 2019-08-27 Abbott Molecular Inc método para detectar câncer de próstata utilizando conjunto de sondas compreendendo sondas lócus específicas para myc e para homólogo de fosfatase e tensina (pten) e sondas centroméricas para cromossomos 7, 8 e 10, bem como conjunto de sondas e kit
EP3739595A3 (de) 2012-01-31 2021-01-27 Genomic Health, Inc. Genexpressionsprofilalgorithmus und test zur bestimmung der prognose von prostatakrebs
EP3435084B1 (de) 2012-08-16 2023-02-22 Decipher Biosciences, Inc. Prostatakrebsprognose unter verwendung von biomarkern
JP6044935B2 (ja) 2013-03-11 2016-12-14 学校法人日本大学 新規ｐｉポリアミド
US20160000946A1 (en) * 2013-03-14 2016-01-07 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Radiolabeled anti-glypican-3 immunoconjugates for immuno-pet imaging of hepatocellular carcinoma
EP2971139A4 (de) 2013-03-15 2016-12-07 Abbott Molecular Inc Systeme und verfahren zum nachweis der veränderung einer genomkopienanzahl
JP6663347B2 (ja) * 2013-03-15 2020-03-11 ヤンセン ファーマシューティカ エヌ．ベー． 予測バイオマーカーのためのアッセイ
JP6978835B2 (ja) * 2014-03-20 2021-12-08 コニカミノルタ株式会社 プローブ試薬および該プローブ試薬を用いたｆｉｓｈ
CN103923925B (zh) * 2014-05-07 2016-06-08 杨举伦 抑制ER81基因表达的siRNA及其在乳腺癌细胞中的应用
US9994912B2 (en) 2014-07-03 2018-06-12 Abbott Molecular Inc. Materials and methods for assessing progression of prostate cancer
WO2017061128A1 (ja) 2015-10-08 2017-04-13 凸版印刷株式会社 ピロールイミダゾール含有ポリアミドを用いた標的二本鎖核酸分子の濃縮方法およびキット
AU2017315425B2 (en) 2016-08-24 2023-11-09 The Regents Of The University Of Michigan Use of genomic signatures to predict responsiveness of patients with prostate cancer to post-operative radiation therapy
WO2018102682A1 (en) 2016-12-01 2018-06-07 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Radiolabeled anti-pd-l1 antibodies for immuno-pet imaging
US11208697B2 (en) 2017-01-20 2021-12-28 Decipher Biosciences, Inc. Molecular subtyping, prognosis, and treatment of bladder cancer
WO2018165600A1 (en) 2017-03-09 2018-09-13 Genomedx Biosciences, Inc. Subtyping prostate cancer to predict response to hormone therapy
EP3600371A4 (de) * 2017-03-21 2021-06-09 The Regents of The University of Michigan Gegen erg gerichtete therapie
CA3062716A1 (en) 2017-05-12 2018-11-15 Decipher Biosciences, Inc. Genetic signatures to predict prostate cancer metastasis and identify tumor agressiveness
TW202043256A (zh) 2019-01-10 2020-12-01 美商健生生物科技公司 前列腺新抗原及其用途
US11741686B2 (en) 2020-12-01 2023-08-29 Raytheon Company System and method for processing facility image data
CN112522404B (zh) * 2020-12-10 2023-06-09 珠海中科先进技术研究院有限公司 一种用于检测前列腺癌的多重荧光pcr试剂盒
CN113025721A (zh) * 2021-04-28 2021-06-25 苏州宏元生物科技有限公司 一种前列腺癌诊断和预后评估试剂盒
CN115083516B (zh) * 2022-07-13 2023-03-21 北京先声医学检验实验室有限公司 一种基于靶向RNA测序技术检测基因融合的Panel设计和评估方法

Family Cites Families (138)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US684315A (en) * 1891-10-19 1901-10-08 Western Electric Co Multiple-switchboard system.
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
US4109496A (en) 1977-12-20 1978-08-29 Norris Industries Trapped key mechanism
US4323546A (en) 1978-05-22 1982-04-06 Nuc Med Inc. Method and composition for cancer detection in humans
US4873191A (en) 1981-06-12 1989-10-10 Ohio University Genetic transformation of zygotes
US4683203A (en) 1984-04-14 1987-07-28 Redco N.V. Immobilized enzymes, processes for preparing same, and use thereof
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
US4965188A (en) 1986-08-22 1990-10-23 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US4839296A (en) 1985-10-18 1989-06-13 Chem-Elec, Inc. Blood plasma test method
EP0232967B1 (de) 1986-01-10 1993-04-28 Amoco Corporation Kompetitiver homogener Test
US4800159A (en) 1986-02-07 1989-01-24 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences
US5080891A (en) 1987-08-03 1992-01-14 Ddi Pharmaceuticals, Inc. Conjugates of superoxide dismutase coupled to high molecular weight polyalkylene glycols
US4853219A (en) * 1987-08-06 1989-08-01 President And Fellows Of Harvard College Antibodies to angiogenin: immunotherapeutic agents
US5283174A (en) 1987-09-21 1994-02-01 Gen-Probe, Incorporated Homogenous protection assay
US5130238A (en) 1988-06-24 1992-07-14 Cangene Corporation Enhanced nucleic acid amplification process
US4968103A (en) 1988-07-22 1990-11-06 Photofinish Cosmetics Inc. Method of making a brush
US5225326A (en) 1988-08-31 1993-07-06 Research Development Foundation One step in situ hybridization assay
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
US5530101A (en) 1988-12-28 1996-06-25 Protein Design Labs, Inc. Humanized immunoglobulins
GB8901778D0 (en) 1989-01-27 1989-03-15 Univ Court Of The University O Manipulatory technique
DE69028257T2 (de) 1989-07-11 1997-01-09 Gen Probe Inc Verfahren zur Vervielfältigung von Nukleinsäuresequenzen
CA2020958C (en) 1989-07-11 2005-01-11 Daniel L. Kacian Nucleic acid sequence amplification methods
US5614396A (en) 1990-06-14 1997-03-25 Baylor College Of Medicine Methods for the genetic modification of endogenous genes in animal cells by homologous recombination
US5602240A (en) 1990-07-27 1997-02-11 Ciba Geigy Ag. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5489677A (en) 1990-07-27 1996-02-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleoside linkages containing adjacent oxygen and nitrogen atoms
US5455166A (en) 1991-01-31 1995-10-03 Becton, Dickinson And Company Strand displacement amplification
US5539082A (en) 1993-04-26 1996-07-23 Nielsen; Peter E. Peptide nucleic acids
US5714331A (en) 1991-05-24 1998-02-03 Buchardt, Deceased; Ole Peptide nucleic acids having enhanced binding affinity, sequence specificity and solubility
US5719262A (en) 1993-11-22 1998-02-17 Buchardt, Deceased; Ole Peptide nucleic acids having amino acid side chains
WO1994004679A1 (en) 1991-06-14 1994-03-03 Genentech, Inc. Method for making humanized antibodies
US5565332A (en) 1991-09-23 1996-10-15 Medical Research Council Production of chimeric antibodies - a combinatorial approach
US5270184A (en) 1991-11-19 1993-12-14 Becton, Dickinson And Company Nucleic acid target generation
US5545524A (en) 1991-12-04 1996-08-13 The Regents Of The University Of Michigan Compositions and methods for chromosome region-specific probes
DE69326967T2 (de) 1992-01-17 2000-06-15 Lakowicz Joseph R Phasenmodulationsenergieübertragungsfluoroimmunassay
ATE316573T1 (de) 1992-10-30 2006-02-15 Gen Hospital Corp Wechselwirkendes fallensystem zur isolierung von proteinen
GB9223084D0 (en) 1992-11-04 1992-12-16 Imp Cancer Res Tech Compounds to target cells
KR100283601B1 (ko) 1993-02-19 2001-03-02 아만 히데아키 글리세롤 유도체, 디바이스 및 의약 조성물
US5925517A (en) 1993-11-12 1999-07-20 The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits
JP3448090B2 (ja) 1994-02-16 2003-09-16 浜松ホトニクス株式会社 エネルギー移動検出法およびその装置
US20050214309A1 (en) 1994-03-18 2005-09-29 Hinrichs Steven H Methods and compositions for modulating transcription factor activity
US5648211A (en) 1994-04-18 1997-07-15 Becton, Dickinson And Company Strand displacement amplification using thermophilic enzymes
DE69535178T2 (de) 1994-06-10 2006-12-14 Genvec, Inc. Adenoviren-vektor systeme und zelllinien
DE69534166T2 (de) 1994-10-28 2006-03-09 Trustees Of The University Of Pennsylvania Rekombinanter adenovirus und methoden zu dessen verwendung
JP3189000B2 (ja) 1994-12-01 2001-07-16 東ソー株式会社 特定核酸配列の検出方法
US5872154A (en) 1995-02-24 1999-02-16 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Method of reducing an immune response to a recombinant adenovirus
US5707618A (en) 1995-03-24 1998-01-13 Genzyme Corporation Adenovirus vectors for gene therapy
AU6261696A (en) 1995-06-05 1996-12-24 Trustees Of The University Of Pennsylvania, The A replication-defective adenovirus human type 5 recombinant as a vaccine carrier
US5856125A (en) * 1995-06-05 1999-01-05 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services ETS2 repressor factor (ERF) genetic locus and its products
US5710029A (en) 1995-06-07 1998-01-20 Gen-Probe Incorporated Methods for determining pre-amplification levels of a nucleic acid target sequence from post-amplification levels of product
DK1445322T4 (da) 1995-06-15 2012-09-03 Crucell Holland Bv Pakningssystemer for humant rekombinant adenovirus til anvendelse ved genterapi
US5854206A (en) 1995-08-25 1998-12-29 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of prostate cancer
US5994316A (en) 1996-02-21 1999-11-30 The Immune Response Corporation Method of preparing polynucleotide-carrier complexes for delivery to cells
US6121489A (en) 1996-03-05 2000-09-19 Trega Biosciences, Inc. Selectively N-alkylated peptidomimetic combinatorial libraries and compounds therein
KR19990087802A (ko) 1996-03-15 1999-12-27 길리스 스티브 전립선암의 면역치료 및 면역진단을 위한 화합물 및 방법
JP3898228B2 (ja) 1996-04-12 2007-03-28 ザ パブリック ヘルス リサーチ インスティチュート オブ ザ シティー オブ ニューヨーク インク 検出プローブ、キット及びアッセイ
WO1998015837A1 (en) 1996-10-07 1998-04-16 Meat And Livestock Commission Assay for duroc muscle fibre type
US5994132A (en) 1996-10-23 1999-11-30 University Of Michigan Adenovirus vectors
US7125969B1 (en) 1996-11-27 2006-10-24 The Regents Of The University Of California ETS-related gene overexpressed in human breast and epithelial cancers
US6395278B1 (en) 1997-02-25 2002-05-28 Corixa Corporation Prostate specific fusion protein compositions
US20030185830A1 (en) 1997-02-25 2003-10-02 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
AU731840B2 (en) 1997-02-25 2001-04-05 Corixa Corporation Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US6943236B2 (en) * 1997-02-25 2005-09-13 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US20030103981A1 (en) 1997-02-27 2003-06-05 Incyte Genomics, Inc. Methods of use of a prostate-associated protease in the diagnosis and treatment of prostate cancer
US20020119531A1 (en) 1997-02-27 2002-08-29 Olga Bandman Prostate-associated protease antibody
US6043033A (en) 1997-02-27 2000-03-28 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Human prostate-associated protease
CA2283267A1 (en) 1997-03-07 1998-09-11 Clare Chemical Research Llc Fluorometric detection using visible light
US6080912A (en) 1997-03-20 2000-06-27 Wisconsin Alumni Research Foundation Methods for creating transgenic animals
EP2060630B1 (de) 1997-04-10 2012-10-24 Stichting Katholieke Universiteit University Medical Centre Nijmegen PCA3, PCA3-Gene und Verfahren zu ihrer Verwendung
US5830730A (en) 1997-05-08 1998-11-03 The Regents Of The University Of California Enhanced adenovirus-assisted transfection composition and method
US6187799B1 (en) 1997-05-23 2001-02-13 Onyx Pharmaceuticals Inhibition of raf kinase activity using aryl ureas
WO1999002685A1 (en) 1997-07-11 1999-01-21 Introgene B.V. Interleukin-3 gene therapy for cancer
US6506559B1 (en) 1997-12-23 2003-01-14 Carnegie Institute Of Washington Genetic inhibition by double-stranded RNA
US5981225A (en) 1998-04-16 1999-11-09 Baylor College Of Medicine Gene transfer vector, recombinant adenovirus particles containing the same, method for producing the same and method of use of the same
US7037667B1 (en) 1998-06-01 2006-05-02 Agensys, Inc. Tumor antigen useful in diagnosis and therapy of prostate and colon cancer
EP1082341B1 (de) 1998-06-01 2010-12-08 Agensys, Inc. Tumorantigen verwendbar in der diagnose und therapie von prostata und dickdarm-krebs
WO1999065929A1 (en) 1998-06-16 1999-12-23 The Regents Of The University Of California Exons 4 and 7 encode separate transactivating and chromatin localizing domains in esx
US6166194A (en) 1998-06-29 2000-12-26 Myriad Genetics, Inc. TMPRSS2 is a tumor suppressor
ATE440963T1 (de) 1998-07-02 2009-09-15 Gen Probe Inc Molekulare fackeln
EP1870466A3 (de) 1998-07-14 2008-03-19 Corixa Corporation Zusammensetzungen und Verfahren zur Behandlung und Diagnose von Prostatakrebs
EP1109896A4 (de) 1998-08-14 2005-11-02 Aventis Pharm Prod Inc Adenovirale formulierungen zur gentherapie
CA2341061A1 (en) 1998-08-27 2000-03-09 Aventis Pharma S.A. Targeted adenovirus vectors for delivery of heterologous genes
DE69939874D1 (de) 1998-09-02 2008-12-18 Diadexus Inc Verfahren zur diagnose, bewertung sowie bilddarstellung verschiedener krebserkrankungen
US6872811B1 (en) 1998-09-30 2005-03-29 Millennium Pharmaceuticals, Inc. HRPCa9 and HRPCa10 nucleic acids and polypeptides
AU6502199A (en) 1998-09-30 2000-04-17 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Expression analysis of specific nucleic acids and polypeptides useful in the diagnosis and treatment of prostate cancer
US6573043B1 (en) 1998-10-07 2003-06-03 Genentech, Inc. Tissue analysis and kits therefor
US6902892B1 (en) 1998-10-19 2005-06-07 Diadexus, Inc. Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
JP2002527758A (ja) 1998-10-19 2002-08-27 ダイアデクスアス・インコーポレーテッド 前立腺癌を診断、監視、病期分類、イメージング及び治療する方法
US6828429B1 (en) 1999-03-26 2004-12-07 Henry M. Jackson Foundation For The Advancement Of Military Medicine Prostate-specific gene, PCGEM1, and the methods of using PCGEM1 to detect, treat, and prevent prostate cancer
US6303305B1 (en) 1999-03-30 2001-10-16 Roche Diagnostics, Gmbh Method for quantification of an analyte
AU4484400A (en) 1999-04-23 2000-11-10 University Of Washington Prostate-specific polynucleotides, polypeptides and their methods of use
JP2002543854A (ja) 1999-05-14 2002-12-24 カイロン コーポレイション 癌におけるｅｔｓドメインタンパク質の発現
DE60014762T2 (de) 1999-05-24 2005-10-13 Tosoh Corp., Shinnanyo Methode zum Nachweis von Ribonukleinsäuren
AU2001236519A1 (en) 2000-01-24 2001-07-31 Millennium Pharmaceuitcals, Inc. Identification, assessment, prevention, and therapy of prostate cancer
DE10004102A1 (de) 2000-01-31 2002-06-20 Metagen Pharmaceuticals Gmbh Nachweis von differenzieller Genexpression
AU2001241541A1 (en) 2000-02-17 2001-08-27 Millennium Predictive Medicine, Inc. Novel genes, compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of human prostate cancer
AU2001261676A1 (en) 2000-05-16 2001-11-26 Glaxo Group Limited Method and reagent for the inhibition of erg
WO2001098537A2 (en) 2000-06-17 2001-12-27 Third Wave Technologies, Inc. Nucleic acid accessible hybridization sites
NZ523715A (en) 2000-07-27 2004-07-30 Univ Australian A set of oligonucleotide probes 'promiscuous' probes that hybridise to target sequences common to more than one of the target polynucleotides
WO2002024680A1 (en) 2000-09-21 2002-03-28 Smithkline Beecham P.L.C. Imidazole derivatives as raf kinase inhibitors
US7892730B2 (en) 2000-12-22 2011-02-22 Sagres Discovery, Inc. Compositions and methods for cancer
US6897024B2 (en) 2001-05-31 2005-05-24 Stichting Katholieke Universiteit More Particularly The University Medical Centre Nijmegen Nucleic acid molecules comprising the promoter for PCA3, and uses thereof
US20040009481A1 (en) 2001-06-11 2004-01-15 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of human prostate cancer
AU2002337657A1 (en) 2001-07-25 2003-02-17 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel genes, compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of prostate cancer
US6537811B1 (en) 2001-08-01 2003-03-25 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense inhibition of SAP-1 expression
US7229774B2 (en) 2001-08-02 2007-06-12 Regents Of The University Of Michigan Expression profile of prostate cancer
ES2253533T3 (es) 2001-09-06 2006-06-01 Adnagen Ag Procedimiento para la deteccion cualitativa y/o cuantitativa de celulas.
US6949342B2 (en) 2001-12-21 2005-09-27 Whitehead Institute For Biomedical Research Prostate cancer diagnosis and outcome prediction by expression analysis
AU2003211058A1 (en) 2002-02-20 2003-09-09 Sirna Therapeutics, Inc. RNA INTERFERENCE MEDIATED TARGET DISCOVERY AND TARGET VALIDATION USING SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)
WO2004023973A2 (en) 2002-09-12 2004-03-25 Incyte Corporation Molecules for diagnostics and therapeutics
US7790867B2 (en) 2002-12-05 2010-09-07 Rosetta Genomics Inc. Vaccinia virus-related nucleic acids and microRNA
ES2427853T3 (es) 2003-02-07 2013-11-04 Diagnocure Inc. Procedimiento para detectar cáncer de próstata en una muestra
US20060228710A1 (en) 2003-02-14 2006-10-12 Morris David W Novel therapeutic targets in cancer
WO2004092397A2 (en) 2003-04-15 2004-10-28 Novartis Ag Tmprss2 regulatory sequences and uses thereof
US8679789B2 (en) 2003-05-01 2014-03-25 Gen-Probe Incorporated Oligonucleotides comprising a molecular switch
WO2004097358A2 (en) 2003-05-02 2004-11-11 Bayer Healthcare Ag Diagnostics and therapeutics for diseases associated with human transmembrane serine protease 2 (tmprss2)
CA2528669A1 (en) 2003-06-09 2005-01-20 The Regents Of The University Of Michigan Compositions and methods for treating and diagnosing cancer
EP1636379A2 (de) 2003-06-26 2006-03-22 Exonhit Therapeutics S.A. Prostata-spezifische gene und deren verwendung als ziele für die therapie und diagnose von prostatakrebs
CA2432365A1 (en) 2003-06-30 2004-12-30 Jack A. Schalken Specific method of prostate cancer detection based on pca3, and kits therefore
WO2005007090A2 (en) 2003-07-03 2005-01-27 President And Fellows Of Harvard College Inhibitors of the map kinase pathway
WO2005007830A2 (en) 2003-07-14 2005-01-27 Mayo Foundation For Medical Education And Research Methods and compositions for diagnosis, staging and prognosis of prostate cancer
DE602004024549D1 (de) 2003-09-05 2010-01-21 Univ Jefferson Diagnose und überwachung von hepatozellulärem karzinom
WO2005038054A1 (en) 2003-10-20 2005-04-28 Zicai Liang METHOD OF MEASURING THE EFFICACY OF siRNA MOLECULES
WO2005042732A2 (en) * 2003-10-28 2005-05-12 Wisconsin Alumni Research Foundation STABLE CELL LINES EXPRESSING HERG1a AND HERG1b
GB0327726D0 (en) 2003-11-28 2003-12-31 Isis Innovation Method
EP1747292B1 (de) 2004-05-07 2015-07-08 The Henry M. Jackson Foundation for the Advancement of Military Medicine, Inc. Verfahren zur diagnose oder behandlung von prostatakrebs mittels erg-gen, alleine oder in kombination mit anderen ober- oder unterexprimierten genen bei prostatakrebs
CN102680686A (zh) 2004-08-13 2012-09-19 千年药品公司 用于鉴定、评估、预防和治疗前列腺癌的基因、组合物、试剂盒和方法
CA2577122C (en) 2004-08-27 2017-06-13 Gen-Probe Incorporated Single-primer nucleic acid amplification methods
US20060275794A1 (en) 2005-03-07 2006-12-07 Invitrogen Corporation Collections of matched biological reagents and methods for identifying matched reagents
US7638278B2 (en) 2005-05-13 2009-12-29 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Markers of DNA copy number alteration for improved prognostication in prostate cancer
DE06814528T1 (de) 2005-09-12 2012-01-05 The Regent Of The University Of Michigan Wiederkehrende genfusionen bei prostatakrebs
US9957569B2 (en) * 2005-09-12 2018-05-01 The Regents Of The University Of Michigan Recurrent gene fusions in prostate cancer
US8541169B2 (en) 2006-10-10 2013-09-24 The Henry M. Jackson Foundation For The Advancement Of Military Medicine, Inc. Prostate cancer-specific alternations in ERG gene expression and detection and treatment methods based on those alterations
CA2814246A1 (en) 2007-07-06 2009-01-15 The Regents Of The University Of Michigan Solute carrier family 45 member 3 (slc45a3) and erg family gene fusions in prostate cancer
JPWO2009044899A1 (ja) 2007-10-03 2011-02-17 協和発酵キリン株式会社 細胞の増殖を制御する核酸
WO2010096660A2 (en) 2009-02-19 2010-08-26 Cornell University Compositions and methods for diagnosing prostate cancer based on detection of slc45a3-elk4 fusion transcript
CN102712953A (zh) 2009-09-17 2012-10-03 密歇根大学董事会 前列腺癌中的复发性基因融合物

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