CN116761818A - 检测trbc1或trbc2的方法 - Google Patents

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Abstract

公开了与TRBC1或TRBC2结合的抗体分子。此外，还公开了检测TRBC1或TRBC2的方法、评价对象或病症的方法以及使用上述抗体分子的试剂盒。

Description

检测TRBC1或TRBC2的方法
相关申请
本申请要求于2020年8月26日提交的美国临时专利申请号63/070,793的权益，该申请的全部内容特此通过引用并入。
背景技术
淋巴瘤是产生于淋巴细胞的癌症。T细胞淋巴瘤(TCL)是产生于T细胞的淋巴瘤；这些大约占美国所有非霍奇金淋巴瘤的7％。TCL的常见亚型包括：非特指型外周T细胞淋巴瘤(PTCLNOS)、间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)和皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)。每种类型的TCL均有其自身的病理和症状。鉴于对改善淋巴瘤(诸如TCL)治疗的持续需求，极需靶向淋巴瘤(例如，TCL)的新组合物和治疗。
发明内容
在一个方面，本文尤其提供了一种使用包括多肽分子的组合物鉴定需要治疗癌症(例如，淋巴瘤或白细胞(例如，T细胞淋巴瘤或白细胞))的对象的方法，所述多肽分子包括：(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合的第一抗原结合结构域，和(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，所述方法包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如获得有关信息)对象是否具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，其中：响应于所述对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞的确定，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者。
在一些实施方案中，所述多肽分子是多功能多肽分子。
在一些实施方案中，所述多肽分子是多特异性多肽分子。
在一些实施方案中，所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且所述第一抗原结合结构域包括表21-25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列
在一些实施方案中，所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且所述第一抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中：所述VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201和7442的氨基酸序列；或所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7443、224和225的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：分别包括SEQ ID NO:7422、201和7403；分别包括SEQ ID NO:7401、201和7403；分别包括SEQ ID NO:7394、201和7396；分别包括SEQ ID NO:7346、201和7398；分别包括SEQ ID NO:7346、201和7400；分别包括SEQ IDNO:7405、201和7403；分别包括SEQ ID NO:7407、201和7403；分别包括SEQ ID NO:7427、201和7403；或分别包括SEQ ID NO:7430、201和7403的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7410、224和225；或分别包括SEQ ID NO:7409、224和225的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7410、224和225；分别包括SEQ IDNO:7346、201、7398、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQID NO:7430、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7409、224和225；分别包括SEQID NO:7346、201、7400、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7409、224和225；或分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7409、224和225的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428和7431(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7419和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，所述VH和VL：分别包括SEQ ID NO:7420和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7423和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7411和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7412和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7413和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7414和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7415和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7416和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7417和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7425和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7428和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7431和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7420和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7423和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7411和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7412和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7413和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7414和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7415和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7416和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7417和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7425和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7428和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ ID NO:7431和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且其中：(i)所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对不包括TRBC2的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与不包括TRBC2的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％；(ii)所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对包括TRBC1的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与包括TRBC1的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％；或(iii)所述第一抗原结合结构域与淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)上的TRBC2的结合未明显激活淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)，例如如通过T细胞增殖、T细胞激活标志物(例如，CD69或CD25)的表达和/或细胞因子(例如，TNFα和IFNγ)的表达所测量的。
在一些实施方案中，所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且所述多肽分子与TRBC2单价地结合。
在一些实施方案中，所述多肽分子包括图30A-30D中任一个所示的构型，任选地，其中：(i)所述多肽分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30scFv，例如包括图30A所示的构型；(ii)所述多肽分子包括抗TRBC2Fab和抗NKp30 Fab，例如包括图30B所示的构型；(iii)所述多肽分子包括抗NKp30 Fab和抗TRBC2 scFv，例如包括图30C所示的构型；或(iv)所述多肽分子包括抗TRBC2 scFv和抗NKp30 scFv，例如包括图30D所示的构型。
在一些实施方案中，所述多肽分子进一步包括二聚模块，所述二聚模块包括一个或多个免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)，所述免疫球蛋白链恒定区包括以下中的一种或多种：成对的腔-突起(“杵臼结构(knob-in-a hole)”)、静电相互作用或链交换。
在一些实施方案中，所述多肽分子包括表21-25的任一个中公开的抗TRBC2氨基酸序列或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列，和/或表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个中公开的抗NKp30氨基酸序列或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，所述多肽分子包括：(i)SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；(ii)SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30scFv；或(iii)SEQ ID NO:7438、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，所述多肽分子包括：(i)SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；(ii)SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30scFv；或(iii)SEQ ID NO:7440、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合，并且其中所述第一抗原结合结构域包括表3A-3B或4的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:B001-B095中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合，并且其中所述第二抗原结合结构域包括表8A-8B、9和10的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:C001-C128中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域包括表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：分别包括SEQ ID NO:7313、6001和7315；分别包括SEQ ID NO:7313、6001和6002；分别包括SEQ ID NO:7313、6008和6009；分别包括SEQ ID NO:7313、7385和7315；分别包括SEQ ID NO:7313、7318和6009；分别包括SEQ ID NO:C019、C021和C023；分别包括SEQ ID NO:C033、C035和C037；分别包括SEQID NO:C047、C049和C051；分别包括SEQ ID NO:C061、C063和C065；分别包括SEQ ID NO:C075、C077和C079；分别包括SEQ ID NO:C089、C091和C093；分别包括SEQ ID NO:C103、C105和C107；或分别包括SEQ ID NO:C116、C118和C120的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域的VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7326、7327和7329；分别包括SEQ ID NO:6063、6064和7293；分别包括SEQ IDNO:6070、6071和6072；分别包括SEQ ID NO:6070、6064和7321；分别包括SEQ ID NO:C026、C028和C030；分别包括SEQ ID NO:C040、C042和C044；分别包括SEQ ID NO:C054、C056和C058；分别包括SEQ ID NO:C068、C070和C072；分别包括SEQ ID NO:C082、C084和C086；分别包括SEQ ID NO:C096、C098和C100；分别包括SEQ ID NO:C110、C112和C113；或分别包括SEQID NO:C123、C125和C127的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7313、6001、7315、7326、7327和7329；分别包括SEQID NO:7313、6001、6002、6063、6064和7293；分别包括SEQ ID NO:7313、6008、6009、6070、6071和6072；分别包括SEQ ID NO:7313、7385、7315、6070、6064和7321；分别包括SEQ IDNO:7313、7318、6009、6070、6064和7321；分别包括SEQ ID NO:C019、C021、C023、C026、C028和C030；分别包括SEQ ID NO:C033、C035、C037、C040、C042和C044；分别包括SEQ ID NO:C047、C049、C051、C054、C056和C058；分别包括SEQ ID NO:C061、C063、C065、C068、C070和C072；分别包括SEQ ID NO:C075、C077、C079、C082、C084和C086；分别包括SEQ ID NO:C089、C091、C093、C096、C098和C100；分别包括SEQ ID NO:C103、C105、C107、C110、C112和C113；或分别包括SEQ ID NO:C116、C118、C120、C123、C125和C127的氨基酸序列。
在一些实施方案中，(i)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7302、7298、7300、7301、7303和7304(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7309、7305、7299和7306-7308(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；(ii)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6121和6123-6128(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7294或6137-6141(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或(iii)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6122和6129-6134(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6136或6142-6147(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或(iv)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C001-C008(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C009-C016(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域的VH和VL：分别包括SEQ ID NO:7302和7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ IDNO:7302和7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域包括：SEQ ID NO:7311或7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；SEQ ID NO:6187或6188(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；SEQ ID NO:6189或6190(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或SEQ ID NO:C017-C024中的任一个的氨基酸序列。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括：响应于将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，用本文所述的多功能分子治疗所述对象(例如，向所述对象施用本文所述的多功能分子)。
在一些实施方案中，所述癌症是白血病或淋巴瘤。
在一些实施方案中，所述癌症选自获得性免疫缺陷综合征(AIDS)相关淋巴瘤、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、成人T细胞白血病/淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、中枢神经系统(CNS)淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、淋巴母细胞性淋巴瘤、套细胞淋巴瘤(MCL)、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)(例如，肝脾T细胞淋巴瘤(HSGDTCL)、皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤或肠病相关T细胞淋巴瘤)、转变型滤泡和转变型黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样真菌病和塞扎里综合征)、滤泡性淋巴瘤、淋巴浆细胞淋巴瘤/瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症、边缘区B细胞淋巴瘤、胃黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病/小细胞淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、结外T细胞/NK细胞淋巴瘤(鼻型)以及间变性大细胞淋巴瘤(例如，原发性皮肤间变性大细胞淋巴瘤或系统性间变性大细胞淋巴瘤)。
在一些实施方案中，所述癌症是外周T细胞淋巴瘤(PTCL)。
在另一方面，本文提供了一种检测样品或对象中TRBC1或TRBC2的方法，其包括：使所述样品或对象与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及检测所述抗体分子与所述样品或对象之间的复合物的形成，从而检测TRBC1或TRBC2。
在一些实施方案中，在体外或体内检测TRBC1或TRBC2。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括使参考样品或对象与所述抗体分子接触；以及检测所述抗体分子与所述参考样品或对象之间的复合物的形成，其中所述样品或对象中所述复合物的形成相对于所述参考样品或对象的变化(例如，统计学显著的变化)表明所述样品或对象中存在TRBC1或TRBC2。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括从对象获得样品。
在一些实施方案中，所述样品包括血浆、组织(例如，癌组织)、活检、血液(例如，全血)、PBMC、骨髓和/或淋巴组织(例如，淋巴结)中的一种或多种。包括血浆、组织(例如，癌组织)、活检、血液(例如，全血)、PBMC、骨髓和/或淋巴中的一种或多种，所述样品未被冷冻和/或固定。包括血浆、组织(例如，癌组织)、活检、血液(例如，全血)、PBMC、骨髓和/或淋巴中的一种或多种，所述样品已被冷冻(例如，急冻)和/或固定(例如，福尔马林固定石蜡包埋(FFPE))。包括血浆、组织(例如，癌组织)、活检、血液(例如，全血)、PBMC、骨髓和/或淋巴中的一种或多种，所述对象患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)或处于患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)的风险中。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括进行流式分析，例如使用多组方法进行流式分析。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括评估T细胞克隆性，例如以确定T细胞恶性肿瘤的存在和/或水平。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括测量来自所述生物样品的TRBC1+或TRBC2+细胞的水平(例如，确定TRBC1+或TRBC2+细胞是否例如相对于参考样品或对象耗尽)。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括测量TRBC1或TRBC2的细胞内水平。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括测量TRBC1或TRBC2的膜水平。
在一些实施方案中，本文所述的方法进一步包括评价所述对象例如在治疗后(例如，在用本文所述的抗体分子治疗后)的疾病或病症(例如，癌症)的预后、严重程度或存在或不存在的变化。
在一些实施方案中，所述抗体分子被可检测地标记。
在另一方面，本文提供了一种评价对象的方法，其包括：使来自所述对象的样品(例如，本文所述的样品)与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及检测所述抗体分子和所述样品之间的复合物的形成，从而评价所述对象。
在一些实施方案中，所述对象患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)或处于患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)的风险中。
在一些实施方案中，所述对象尚未用本文所述的抗体分子治疗。
在一些实施方案中，所述对象已用本文所述的抗体分子治疗。
在另一方面，本文提供了一种试剂盒，其包括本文所述的抗TRBC1抗体分子或抗TRBC2抗体。
在另一方面，本文提供了一种鉴定需要治疗癌症的对象的方法，其包括确定从所述对象获得的外周血单核细胞(PBMC)衍生的T细胞群体对TRBC1或TRBC2具有单型性(monotypia)和特异性，其中所述PBMC衍生的T细胞群体中对TRBC1或TRBC2的所述单型性和特异性表明所述对象患有T细胞恶性肿瘤，从而将所述对象鉴定为治疗所述癌症的候选者。
除非另有定义，否则本文所用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的相同含义。下面描述了合适的方法和材料，但类似于或等同于本文所述方法和材料的方法和材料均可以用于本发明的实践或测试中。本文提及的所有出版物、专利申请、专利和其他参考文献通过引用以其全文并入本文。在发生冲突的情况下，以包含定义的本说明书为准。此外，材料、方法和实例仅是说明性的，并不意图是限制性的。
本发明的其他特征和优点将从以下详细描述和权利要求中显而易见。
附图说明
图1A-1D是与TRBC1和NKp30结合的多特异性抗体(例如，双特异性抗体)的示例性形式和构型的示意图。图1A描绘了与抗NKp30 scFv融合的抗TRBC1抗体。抗TRBC1抗体包括两条重链和两条轻链。抗NKp30 scFv与抗TRBC1抗体的一条重链的N末端融合。图1B描绘了包括抗TRBC1 Fab、抗NKp30 scFv和Fc二聚体的抗体分子。Fc二聚体包括两条Fc链。抗TRBC1Fab重链的C末端与一条Fc链的N末端融合。抗NKp30 scFv与另一条Fc链的N末端融合。图1C和1D描绘了与两个抗NKp30 scFv融合的抗TRBC1抗体。抗TRBC1抗体包括两条重链和两条轻链。在图1C中，两个抗NKp30 scFv分别与抗TRBC1抗体的两条轻链的C末端融合。在图1D中，两个抗NKp30 scFv分别与抗TRBC1抗体的两条重链的N末端融合。
图2A-2F是包括与TRBC1和TRAIL分子(例如，三聚、二聚或单体TRAIL分子)结合的部分的抗体分子的示例性形式和构型的示意图。图2A和2D描绘了包括抗TRBC1 Fab、三聚TRAIL分子和Fc二聚体的抗体分子。图2B和2E描绘了包括抗TRBC1 Fab、二聚TRAIL分子和Fc二聚体的抗体分子。图2C和2F描绘了包括抗TRBC1 Fab、单体TRAIL分子和Fc二聚体的抗体分子。Fc二聚体包括两条Fc链。抗TRBC1 Fab重链的C末端与一条Fc链的N末端融合。三聚、二聚或单体TRAIL分子与另一条Fc链的N末端融合。在一些实施方案中，图2A中描绘的抗体分子包括SEQ ID NO:6169、6167和6159的氨基酸序列。在一些实施方案中，图2B中描绘的抗体分子包括SEQ ID NO:6169、6167和6158的氨基酸序列。在一些实施方案中，图2C中描绘的抗体分子包括SEQ ID NO:6169、6167和6157的氨基酸序列。在一些实施方案中，则图2D中描绘的抗体分子包括SEQ ID NO:6169、6167和6162的氨基酸序列。在一些实施方案中，则图2E中描绘的抗体分子包括SEQ ID NO:6169、6167和6161的氨基酸序列。在一些实施方案中，则图2F中描绘的抗体分子包括SEQ ID NO:6169、6167和6160的氨基酸序列。
图3A和3B是与TRBC1和DR5结合的多特异性抗体(例如，双特异性抗体)的示例性形式和构型的示意图。图3A描绘了包括抗TRBC1Fab、抗DR5 scFv和Fc二聚体的多特异性抗体(例如，双特异性抗体)。Fc二聚体包括两条Fc链。抗TRBC1 Fab重链的C末端与一条Fc链的N末端融合。抗DR5 scFv与另一条Fc链的N末端融合。图3B描绘了与两个抗DR5 scFv融合的抗TRBC1抗体。抗TRBC1抗体包括两条重链和两条轻链。两个抗DR5 scFv分别与抗TRBC1抗体的两条轻链的C末端融合。在一些实施方案中，图3A中描绘的多特异性抗体包括SEQ ID NO:6169、6167和6163的氨基酸序列。在一些实施方案中，图3B中描绘的多特异性抗体包括SEQID NO:6170和6168的氨基酸序列。
图4A-4B显示了H131来源的小鼠VH和VL框架1、CDR 1、框架2、CDR 2、框架3、CDR3和框架4区与其各自的人源化序列的比对。Kabat CDR以粗体显示，Chothia CDR以斜体显示，并且组合CDR以方框显示。回复突变的框架位置以双下划线显示。图4A显示了鼠H131(SEQID NO:1)和人源化H131(SEQ ID NO:9)的VH序列。图4B显示了鼠H131(SEQ ID NO:2)和人源化H131(SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:11)的VL序列。
图5A-5B显示了16G8来源的小鼠VH和VL框架1、CDR 1、框架2、CDR 2、框架3、CDR3和框架4区与其各自的人源化序列的比对。Kabat CDR以粗体显示，Chothia CDR以斜体显示，并且组合CDR以方框显示。回复突变的框架位置以双下划线显示。图5A显示了鼠16G8(SEQID NO:15)和人源化16G8(SEQ ID NO:23-25)的VH序列。图5B显示了鼠16G8(SEQ ID NO:16)和人源化16G8(SEQ ID NO:26-30)的VL序列。
图6描绘了具有映射的相应抗体的TCRBV基因家族和亚家族的系统树。亚家族身份如下：亚家族A：TCRβV6；亚家族B：TCRβV10；亚家族C：TCRβV12；亚家族D：TCRβV5；亚家族E：TCRβV7；亚家族F：TCRβV11；亚家族G：TCRβV14；亚家族H：TCRβV16；亚家族I：TCRβV18；亚家族J：TCRβV9；亚家族K：TCRβV13；亚家族L：TCRβV4；亚家族M：TCRβV3；亚家族N：TCRβV2；亚家族O：TCRβV15；亚家族P：TCRβV30；亚家族Q：TCRβV19；亚家族R：TCRβV27；亚家族S：TCRβV28；亚家族T：TCRβV24；亚家族U：TCRβV20；亚家族V：TCRβV25；和亚家族W：TCRβV29亚家族。亚家族成员在本文标题为“TCRβV(TCRβV)”的章节中详细描述。
图7是显示JOVI.1和人源化JOVI.1与人TRBC1结合的图。
图8是显示JOVI.1Fab(左)和人源化JOVI.1Fab与人TRBC1(右)结合的一组图。
图9是显示NKp30抗体与NK92细胞结合的图。数据计算为AF747阳性群体的百分比。
图10是显示NKp30抗体对NK92细胞的激活的图。数据使用仓鼠抗NKp30 mAb生成。
图11A-11E是抗TRBC1/NKp30抗体和对照分子的示意图。
图12A-12B是显示抗体与表达Fcγ受体的THP1细胞结合的图。
图13A-13D是显示与指定抗体孵育后T细胞激活的图。图13A是显示分出的CD4+％的图。图13B是显示分出的CD8+％的图。图13C是显示CD4+的CD69-CD25+％的图。图13D是显示CD8+的CD69-CD25+％的图。
图14A-14D是抗TRBC1/NKp30抗体的示意图。在图14B和14D中，“460”表示基于BIM0460的Fab；“578”表示基于BJM0578的Fab；“407”表示基于BJM0407的scFv(图18B)或Fab(图14D)；“411”表示基于BJM0411的scFv(图18B)或Fab(图14D)；并且“N297A”表示该抗体在Fc区包括N297A突变。
图15A-15D是显示指定抗体与NK细胞系KHYG-1(图15A)和TRBC1+Jurkat细胞(图15B)的结合的图。图15C是提供关于所测试抗体的信息的表格。图15D是提供与KHYG-1细胞或TRBC1+Jurkat细胞结合的EC50的表格。
图16A-16C是显示在存在NK-92效应细胞的情况下杀伤TRBC1+靶细胞的图。靶细胞是TRBC1+Jurkat细胞(图16A)或H9细胞(图16B)。TRBC2+HPB-ALL细胞用作对照(图16C)。
图17A-17C是显示在存在原代NK细胞的情况下杀伤TRBC1+靶细胞的图。靶细胞是TRBC1+Jurkat细胞(图17A)或H9细胞(图17B)。TRBC2+HPB-ALL细胞用作对照(图17C)。
图18A-18C是显示在存在抗TRBC1/NKp30抗体的情况下与TRBC1+Jurkat细胞共培养后的NK细胞激活的图。图18A显示了CD69+CD107a+NK细胞％。图18B显示了IFNγ的水平。图18C显示了TNFα的水平。
图19A-19B是显示在存在或不存在TRBC1+Jurkat细胞的情况下由NK细胞产生的细胞因子水平的图。图19A显示了IFNγ的水平。图19B显示了TNFα的水平。
图20是显示在存在TRBC1+Jurkat细胞的情况下由指定抗体诱导的NK细胞死亡％的图。
图21A和21B分别是单臂抗TRBC1抗体和双特异性抗TRBC1/NKp30抗体的示意图。
图22A-22D是显示在存在指定抗体的情况下NK细胞介导的杀伤TRBC1+PDX的图。
图23是显示在存在指定抗体的情况下杀伤TRBC1+Jurkat细胞的一组图。测试的NK细胞分离自健康供体(上图)或PTCL患者(下图)。
图24是显示在图23中所示的杀伤测定期间NK细胞的激活的一组图。测试的NK细胞分离自健康供体(上图)或PTCL患者(下图)。
图25A和25B是显示在存在指定抗体的情况下与Jurkat细胞共培养时NK细胞的IFNγ(图25A)或TNFα(图25B)分泌水平的一组图。测试的NK细胞分离自健康供体(上图)或PTCL患者(下图)。
图26A-26C是在ELISA中测量与NKp30结合的图。图26A显示了B7-H6与NKp30的结合。图26B显示了BJM1042与NKp30的结合。图26C显示了在存在不同浓度的指示抗体的情况下B7-H6与NKp30的结合。
图27A-27C是来自体内TRBC1+肿瘤研究的图。图27A显示了研究设计。图27B显示了指定处理下的肿瘤体积。图27C是显示处理后第3天肿瘤体积变化％的瀑布图。图27C从左至右显示以下处理组：无NK，PBS；无NK，TRBC1 x NKp30；NK，PBS；NK，TRBC1；NK，NKp30；和NK+1mpk BJM1042。
图28A-28B是来自体内TRBC2+肿瘤研究的图。图28A显示了研究设计。图28B显示了指定处理下的肿瘤体积。
图29A-29D是抗TRBC1/NKp30抗体的示意图。
图30A-30D是抗TRBC2/NKp30抗体的示意图。
图31A-31B是抗体设计的示意图。图31A是包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 ScFv臂的双特异性抗体的示意图。图31B显示了缺乏NK-p30结合链的与图31A类似的设计。
图32A-32C是显示抗TRBC2抗体与表达人TRBC2、人TRBC1或人NK-p30的细胞的选择性结合的代表性数据。图32A显示了与TRBC2+HPB-ALL细胞的结合；图32B显示了与NKp30+KHYG-1细胞的结合；图32C显示了与TRBC1+Jurkat细胞的结合。
图33A-33D是显示对表达TRBC2的细胞系(TRBC2+)而不是表达TRBC1(TRBC1+)的细胞系的选择性杀伤的代表性数据。图33A，显示TRBC2x NKp30双特异性在体外以KHYG-1NK细胞为效应物选择性杀伤TRBC2+HPB-ALL细胞的数据。图33B，显示TRBC2x NKp30双特异性在体外不杀伤TRBC1+Jurkat细胞的数据。图33C，显示TRBC2x NKp30双特异性在体外以原代NK细胞为效应物选择性杀伤TRBC2+HPB-ALL细胞的数据。图33D，显示TRBC2x NKp30双特异性在体外利用原代NK细胞不杀伤TRBC1+Jurkat细胞的数据。
图34A-34B是显示TRBC2xNKp30双特异性在体外激活与TRBC2+细胞共培养的NK细胞的代表性数据。图34A，显示与TRBC2+HPB-ALL细胞共培养的原代NK细胞激活的数据。图34B，显示缺乏与TRBC1+Jurkat细胞共培养的原代NK细胞激活的数据。
图35A-35D是显示TRBC2xNKp30双特异性抗体诱导TRBC1+细胞和原代NK细胞共培养物中NK激活状态相关细胞因子分泌的代表性数据。图35A显示了在体外HPB-ALL细胞和原代NK细胞共培养物中IFNγ分泌增加。图35B显示了在体外Jurkat细胞和原代NK细胞共培养物中缺乏IFNγ分泌。图35C显示了在体外HPB-ALL细胞和原代NK细胞共培养物中TNFα分泌增加。图35D显示了在体外Jurkat细胞和原代NK细胞共培养物中缺乏TNFα分泌。
图36A-36C是显示TRBC2xNKp30双特异性抗体靶向杀伤患者衍生的异种移植细胞的代表性数据。图36A，显示TRBC2x NKp30双特异性以KHYG-1细胞为效应物选择性杀伤患有成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)的患者衍生的TRBC2+细胞(PDX2)的数据。图36B，显示TRBC2x NKp30双特异性在体外以KHYG-1细胞为效应物选择性杀伤患有肝脾T细胞淋巴瘤(HTCL)的患者衍生的TRBC2+细胞(PDX5)的数据。图35C，显示TRBC2x NKp30双特异性在体外以KHYG-1细胞为效应物不杀伤患有成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)的患者衍生的TRBC1+细胞(PDX3)的数据。
图37是显示使用如图所示的靶标特异性双特异性抗体从人PBMC中特异性删除TRBC1+与TRBC2+T细胞的代表性数据。数据在处理后4天收集。
图38是显示在体内使用TRBC1xNKp30或TRBC2xNKp30双特异性抗体从人PBMC中特异性耗尽TRBC1+与TRBC2+T细胞的代表性数据。在第0天向小鼠施用人PBMC，并用TRBC1xNKp30或TRBC2xNKp30抗体处理，并在第7天收获全血。
图39是显示在移植有人NK细胞的TRBC2+HPB-ALL衍生的异种移植小鼠模型中的显著抗肿瘤活性的代表性数据。
图40是证实健康供体PBMC(T-淋巴细胞：CD4：浅灰色。CD8：灰色)中注意到的TRBC1和TRBC2的一致概况的代表性流式分析数据。
图41是证实TRBC1 T细胞淋巴瘤样品#1的单型性的代表性流式分析数据。
T-淋巴细胞：CD4：浅灰色。CD8：灰色。
异常的CD3少的CD4+T淋巴细胞。深灰色，TCRB1+
图42是证实TRBC1 T细胞淋巴瘤样品#2的单型性的代表性流动分析数据。
正常的T-淋巴细胞：CD4+CD8+：深灰色
异常的CD4+T淋巴细胞：灰色。TCRB1+
其他淋巴细胞(NK+B)：浅灰色
图43是证实TRBC2 T细胞淋巴瘤样品的单型性的代表性流式分析数据。
正常的T-淋巴细胞：CD4+CD8+：深灰色
异常的CD8+T淋巴细胞：灰色。TCRB2+
其他淋巴细胞(NK+B)：浅灰色
图44是证实TRBC2 T细胞淋巴瘤样品的单型性的代表性流动分析数据。
正常的T-淋巴细胞：CD4+CD8+：深灰色
异常的TCD4+淋巴细胞：灰色。TCRB2+
其他淋巴细胞(NK+B)：浅灰色
具体实施方式
本文公开了多功能分子(本文也称为“多特异性分子”)，其包含多个(例如，两个或更多个)功能(或结合特异性)，包括(i)优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域，和(ii)以下的一种、两种或全部：(a)选自T细胞衔接物、NK细胞衔接物(例如，与NKp30、NKp46、NKG2D或CD16结合的分子)、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物的免疫细胞衔接物；(b)细胞因子分子；和(c)间质修饰部分。本文还公开了包括优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域的抗体分子。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括见于表2、3、3A、3B、4、5、6中的序列或序列的一部分。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗原结合结构域包括见于表21-24中的序列或序列的一部分。在一些实施方案中，免疫细胞衔接物包括：包括见于表7、8、8A、8B、9、10和18中的序列或序列的一部分的NK细胞衔接物。在一些实施方案中，抗原结合结构域包括见于表2、3、3A、3B、4、5、6中的序列或序列的一部分，并且免疫细胞衔接物包括：包括见于表7、8、8A、8B、9、10和18中的序列或序列的一部分的NK细胞衔接物。在一些实施方案中，抗原结合结构域包括见于表21-24中的序列或序列的一部分，并且免疫细胞衔接物包括：包括见于表7、8、8A、8B、9、10和18中的序列或序列的一部分的NK细胞衔接物。
在一个实施方案中，多特异性或多功能分子是双特异性(或双功能)分子、三特异性(或三功能)分子或四特异性(或四功能)分子。
在一些实施方案中，多功能分子包括结合包括TRBC1的T细胞受体表面上的肿瘤抗原的抗原结合结构域，将免疫细胞(例如，经由免疫细胞衔接物)靶向至表现出包括TRBC1的T细胞受体的淋巴瘤细胞(例如，T细胞)。在一些实施方案中，多功能分子包括结合包括TRBC2的T细胞受体表面上的肿瘤抗原的抗原结合结构域，将免疫细胞(例如，经由免疫细胞衔接物)靶向至表现出包括TRBC2的T细胞受体的淋巴瘤细胞(例如，T细胞)。
不受理论束缚，在存在例如在表面上表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的细胞(例如，癌细胞，例如，淋巴瘤细胞，例如，T细胞)的情况下，预期本文公开的多特异性或多功能分子会定位(例如，桥接)并且/或者激活免疫细胞(例如，选自T细胞、NK细胞、B细胞、树突状细胞或巨噬细胞的免疫效应细胞)。预期在存在表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的细胞(例如，癌细胞，例如，淋巴瘤细胞，例如，T细胞)的情况下，使用本文所述的多特异性或多功能分子增加免疫细胞的接近度和/或活性会增强对靶细胞的免疫应答，从而提供更有效的疗法。
不受理论束缚，认为T细胞通常不表达包括TRBC1的T细胞受体和包括TRBC2的T细胞受体。在一些实施方案中，通过利用对包括TRBC1的T细胞受体或包括TRBC2的T细胞受体具有特异性但对两种类型的T细胞受体不是同时具有特异性的多特异性或多功能分子，预期通常可以减轻增加免疫细胞对T细胞的接近度或活性的有害影响。以此方式，认为本文公开的多特异性或多功能分子的使用可以增加免疫细胞向癌细胞(例如，淋巴瘤细胞，例如，T细胞)的接近度或活性，而不必通常增加免疫细胞向T细胞的接近度或活性。
公开了新型多功能(例如，多特异性)分子，其包含(i)间质修饰部分和(ii)优先与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原(例如，包括TRBC1的T细胞受体或包括TRBC2的T细胞受体)结合的抗原结合结构域。不受理论束缚，本文公开的多功能分子被认为尤其靶向(例如，定位于)癌症部位，并且改变肿瘤间质，例如，改变癌症部位附近的肿瘤微环境。多功能分子可以进一步包含以下的一种或两种：免疫细胞衔接物(例如，选自T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物中的一种、两种、三种或全部)；和/或细胞因子分子。因此，本文尤其提供了包含上述部分的多功能(例如，多特异性)分子、编码所述上述分子的核酸、产生上述分子的方法，以及使用上述分子治疗癌症的方法。
因此，本文尤其提供了包含上述部分的多特异性或多功能分子(例如，多特异性或多功能抗体分子)、编码上述分子的核酸、产生上述分子的方法，以及使用上述分子治疗疾病或病症(例如，癌症)的方法。
定义
在一些实施方案中，多功能分子包含免疫细胞衔接物。“免疫细胞衔接物”是指结合和/或激活免疫细胞(例如，参与免疫应答的细胞)的一种或多种结合特异性。在实施方案中，免疫细胞选自T细胞、NK细胞、B细胞、树突状细胞和/或巨噬细胞。免疫细胞衔接物可以是抗体分子、受体分子(例如，全长受体、受体片段或其融合体(例如，受体-Fc融合体))或配体分子(例如，全长配体、配体片段或其融合体(例如，配体-Fc融合体))，其与免疫细胞抗原(例如，T细胞、NK细胞抗原、B细胞抗原、树突状细胞抗原和/或巨噬细胞抗原)结合。在实施方案中，免疫细胞衔接物与靶免疫细胞特异性结合，例如，优先与靶免疫细胞结合。例如，当免疫细胞衔接物是抗体分子时，它以小于约10nM的解离常数与免疫细胞抗原(例如，T细胞抗原、NK细胞抗原、B细胞抗原、树突状细胞抗原和/或巨噬细胞抗原)结合。
在一些实施方案中，多功能分子包含细胞因子分子。如本文所用，“细胞因子分子”是指引发天然存在的细胞因子的至少一种活性的细胞因子的全长、片段或变体；进一步包括受体结构域(例如，细胞因子受体二聚结构域)的细胞因子；或细胞因子受体的激动剂(例如，针对细胞因子受体的抗体分子(例如，激动性抗体))。在一些实施方案中，细胞因子分子选自白介素-2(IL-2)、白介素-7(IL-7)、白介素-12(IL-12)、白介素-15(IL-15)、白介素-18(IL-18)、白介素-21(IL 21)或干扰素γ，或其片段或变体，或任何上述细胞因子的组合。细胞因子分子可以是单体或二聚体。在实施方案中，细胞因子分子可以进一步包含细胞因子受体二聚结构域。在其他实施方案中，细胞因子分子是细胞因子受体的激动剂，例如，针对选自IL-15Ra或IL-21R的细胞因子受体的抗体分子(例如，激动性抗体)。
如本文所用，在例如，抗体分子、细胞因子分子、受体分子中使用的术语“分子”包括全长的、天然存在的分子，以及变体，例如，功能变体(例如，其截短、片段、突变(例如，基本上相似的序列)或衍生形式)，只要未修饰的(例如，天然存在的)分子的至少一种功能和/或活性得到保留。
在一些实施方案中，多功能分子包含间质修饰部分。如本文所用，“间质修饰部分”是指能够改变间质(例如，降解其组分)的蛋白质(例如，酶)。在实施方案中，间质的组分选自例如ECM组分，例如，糖胺聚糖，例如，透明质酸(hyaluronan)(也称为透明质酸(hyaluronic acid)或HA)、硫酸软骨素、软骨素、硫酸皮肤素、硫酸肝素、肝素、巢蛋白、生腱蛋白、聚集蛋白聚糖和硫酸角蛋白；或细胞外蛋白，例如，胶原蛋白、层粘连蛋白、弹性蛋白、纤维蛋白原、纤连蛋白和玻连蛋白。
某些术语定义如下。
如本文所用，冠词“一(a)”和“一个(an)”是指一个/种或超过一个/种(例如，至少一个/种)的冠词语法对象。当与术语“包括”一起使用时，术语“一”或“一个”的使用可以意指“一个/种”，但也与“一个/种或多个/种”、“至少一个/种”和“一个/种或超过一个/种”的含义一致。
如本文所用，“约”和“近似”通常意指在给定测量值的性质或精度的情况下，所测量的量的可接受的误差程度。示例性误差程度在给定值范围的百分之20(20％)之内，通常在10％之内，更通常在5％之内。
如本文所用，“抗体分子”是指包括至少一个免疫球蛋白可变结构域序列的蛋白质，例如，免疫球蛋白链或其片段。抗体分子涵盖抗体(例如，全长抗体)和抗体片段。在一个实施方案中，抗体分子包括全长抗体的抗原结合或功能片段，或全长免疫球蛋白链。例如，全长抗体是天然存在或通过正常免疫球蛋白基因片段重组过程形成的免疫球蛋白(Ig)分子(例如，IgG抗体)。在实施方案中，抗体分子是指免疫球蛋白分子的免疫活性的抗原结合部分，诸如抗体片段。抗体片段(例如，功能片段)是抗体的一部分，例如，Fab、Fab′、F(ab′)2、F(ab)2、可变片段(Fv)、结构域抗体(dAb)或单链可变片段(scFv)。功能性抗体片段与完整(例如，全长)抗体识别的相同抗原结合。术语“抗体片段”或“功能片段”还包含由可变区组成的分离的片段(诸如由重链和轻链的可变区组成的“Fv”片段)，或重组单链多肽分子，其中轻链和重链可变区通过肽接头连接(“scFv蛋白”)。在一些实施方案中，抗体片段不包含无抗原结合活性的抗体部分，诸如Fc片段或单个氨基酸残基。示例性抗体分子包含全长抗体和抗体片段，例如，dAb(结构域抗体)、单链、Fab、Fab’和F(ab’)2片段，以及单链可变片段(scFv)。
如本文所用，“免疫球蛋白可变结构域序列”是指可以形成免疫球蛋白可变结构域的结构的氨基酸序列。例如，该序列可以包含天然存在的可变结构域的全部或部分氨基酸序列。例如，该序列可以包含或可以不包含一个、两个或更多个N-或C末端氨基酸，或可以包含与蛋白质结构的形成相容的其他改变。
在实施方案中，抗体分子是单特异性的，例如，其包括对单个表位的结合特异性。在一些实施方案中，抗体分子是多特异性的，例如，其包括多个免疫球蛋白可变结构域序列，其中第一免疫球蛋白可变结构域序列对第一表位具有结合特异性，并且第二免疫球蛋白可变结构域序列对第二表位具有结合特异性。在一些实施方案中，抗体分子是双特异性抗体分子。如本文所用，“双特异性抗体分子”是指对超过一个(例如，两个、三个、四个或更多个)表位和/或抗原具有特异性的抗体分子。
如本文所用，“抗原”(Ag)是指可以引起免疫应答(例如，涉及某些免疫细胞的激活和/或抗体生成)的分子。包含几乎所有蛋白质或肽在内的任何大分子均可以是抗原。抗原也可以源自基因组重组体或DNA。例如，包括编码能够引发免疫应答的蛋白质的核苷酸序列或部分核苷酸序列的任何DNA都编码“抗原”。在实施方案中，抗原不必仅由基因的全长核苷酸序列编码，抗原也不必由基因编码。在实施方案中，抗原可以被合成或者可以衍生自生物样品，例如组织样品、肿瘤样品、细胞或具有其他生物学组分的流体。如本文所用，“肿瘤抗原”或可互换地，“癌抗原”包含存在于癌(例如，可以引发免疫应答的癌细胞或肿瘤微环境)上或与之相关的任何分子。如本文所用，“免疫细胞抗原”包含存在于可引起免疫应答的免疫细胞上或与之相关的任何分子。
抗体分子的“抗原结合位点”或“结合部分”是指参与抗原结合的抗体分子例如免疫球蛋白(Ig)分子的一部分。在实施方案中，抗原结合位点由重(H)链和轻(L)链的可变(V)区的氨基酸残基形成。在重链和轻链的可变区内的三个高度分歧的序列段称为高变区，位于更保守的侧翼序列段(称为“框架区”(FR))之间。FR是天然存在于免疫球蛋白中的高变区之间并与其相邻的氨基酸序列。在实施方案中，在抗体分子中，轻链的三个高变区和重链的三个高变区在三维空间中相对于彼此布置以形成抗原结合表面，其与结合抗原的三维表面互补。重链和轻链中的每条链的三个高变区称为“互补决定区”或“CDR”。框架区和CDR已经在例如Kabat,E.A.，等人，(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版，美国卫生与公众服务部(U.S.Department of Health and Human Services),NIH出版号91-3242和Chothia,C.等人(1987)J.Mol.Biol.196:901-917中定义和描述。每条可变链(例如，可变重链和可变轻链)通常由三个CDR和四个FR构成，它们按以下氨基酸顺序从氨基末端到羧基末端排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4。
如本文所用，“癌症”可以涵盖所有类型的致癌过程和/或癌性生长。在实施方案中，癌症包含原发性肿瘤以及转移组织或恶性转化的细胞、组织或器官。在实施方案中，癌症涵盖癌症的所有组织病理学和阶段，例如癌症的浸润性/严重性的阶段。在实施方案中，癌症包括复发性和/或抗性癌症。术语“癌症”和“肿瘤”可以互换使用。例如，两个术语都涵盖实体瘤和液体瘤。如本文所用，术语“癌症”或“肿瘤”包括恶化前以及恶性癌症和肿瘤。
如本文所用，“免疫细胞”是指在免疫系统中起作用以例如保护免受感染原和异物侵害的各种细胞中的任何一种。在实施方案中，该术语包含白细胞，例如嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞、淋巴细胞和单核细胞。固有的白细胞包含吞噬细胞(例如巨噬细胞、嗜中性粒细胞和)、肥大细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞和自然杀伤细胞。固有白细胞通过经由接触来攻击更大的病原体或通过吞噬然后杀死微生物来鉴定和消灭病原体，并且是激活适应性免疫应答的介质。适应性免疫系统的细胞是特殊类型的白细胞，称为淋巴细胞。B细胞和T细胞是重要的淋巴细胞类型，并且来源于骨髓中的造血干细胞。B细胞参与体液免疫应答，而T细胞参与细胞介导的免疫应答。术语“免疫细胞”包含免疫效应细胞。
如本文所用，术语“免疫效应细胞”是指参与免疫应答，例如，促进免疫效应物应答的细胞。免疫效应细胞的实例包含但不限于T细胞(例如α/βT细胞和γ/δT细胞)、B细胞、自然杀伤(NK)细胞、自然杀伤T(NK T)细胞和肥大细胞。
术语“效应物功能”或“效应物应答”是指细胞的专有功能。T细胞的效应物功能例如可以是溶细胞活性或辅助活性，包含细胞因子的分泌。
本发明的组合物和方法涵盖具有指定序列或与其基本相同或相似的序列(例如，与指定序列的同一性为至少80％、85％、90％、95％相同或更多的序列)的多肽和核酸。在氨基酸序列的上下文中，本文使用的术语“基本上相同”是指含有足够或最少数目的氨基酸残基的第一氨基酸，所述氨基酸残基与第二氨基酸序列中的比对氨基酸残基i)相同，或ii)具有保守替代，使得第一氨基酸序列和第二氨基酸序列可以具有共同的结构域和/或共同的功能活性。例如，含有与参考序列(例如，本文提供的序列)具有至少约80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％的同一性的共同结构域的氨基酸序列。
在核苷酸序列的上下文中，本文使用的术语“基本上相同”是指第一核酸序列含有与第二核酸序列中的比对核苷酸相同的足够或最小数目的核苷酸，使得第一核苷酸序列和第二核苷酸序列编码具有共同功能活性的多肽，或编码共同的结构多肽结构域或共同的功能多肽活性的多肽。例如，与参考序列(例如，本文提供的序列)具有至少约80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的核苷酸序列。
术语“变体”是指具有与参考氨基酸序列基本相同的氨基酸序列，或由基本相同的核苷酸序列编码的多肽。在一些实施方案中，变体是功能变体。
术语“功能变体”是指具有与参考氨基酸序列基本相同的氨基酸序列，或由基本相同的核苷酸序列编码，并且能够具有参考氨基酸序列的一种或多种活性的多肽。
如下进行序列之间的同源性或序列同一性(该术语在本文中可互换使用)的计算。
为了确定两个氨基酸序列或两个核酸序列的同一性百分比，出于最佳比较目的而对序列进行比对(例如，可以在第一和第二氨基酸或核酸序列中的一个或两个中引入空位，以供最佳比对，并且出于比较的目的可以忽略非同源序列)。在一个优选的实施方案中，出于比较的目的而比对的参考序列的长度为参考序列长度的至少30％，优选至少40％，更优选至少50％、60％，并且甚至更优选至少70％、80％、90％、100％。然后比较相应氨基酸位置或核苷酸位置的氨基酸残基或核苷酸。当第一序列中的位置被与第二序列中相应位置的相同氨基酸残基或核苷酸占据时，则分子在该位置是相同的(如本文所用，氨基酸或核酸的“同一性”等同于氨基酸酸或核酸“同源性”)。
在考虑到需要将其引入以供两个序列进行最佳比对的空位的数目和每个空位的长度的情况下，两个序列之间的同一性百分比是由该序列共享的相同位置的数目的函数。
可以使用数学算法来完成序列的比较和两个序列之间的同一性百分比的确定。在一个优选的实施方案中，使用Needleman和Wunsch((1970)J.Mol.Biol.48:444-453)算法(已结合到GCG软件包(可从gcg.com获取)中的GAP程序中)，使用Blossum 62矩阵或PAM250矩阵，并且空位权重为16、14、12、10、8、6或4并且长度权重为1、2、3、4、5或6，来确定两个氨基酸序列之间的同一性百分比。在又一个优选的实施方案中，使用GCG软件包(可从gcg.com获得)中的GAP程序，使用NWSgapdna.CMP矩阵并且空位权重为40、50、60、70或80并且长度权重为1、2、3、4、5或6，来确定两个核苷酸序列之间的同一性百分比。一组特别优选的参数(除非另有说明，否则应使用的一组参数)是Blossum 62打分矩阵，其空位罚分为12，空位延伸罚分为4，并且移码空位罚分为5。
可以使用E.Meyers和W.Miller((1989)CABIOS,4:11-17)的算法(已结合至ALIGN程序(2.0版)中)，使用PAM120权重残基表(空位长度罚分为12并且空位罚分为4)，来确定两个氨基酸或核苷酸序列之间的同一性百分比。
本文所述的核酸和蛋白质序列可以用作“查询序列”以对公共数据库进行搜索，从而例如鉴定其他家族成员或相关序列。可以使用Altschul等人，(1990)J.Mol.Biol.215:403-10中的NBLAST和XBLAST程序(2.0版)进行此类搜索。可以用NBLAST程序(分值＝100，字长＝12)进行BLAST核苷酸搜索，以获得与本发明的核酸分子同源的核苷酸序列。可以使用XBLAST程序(分值＝50，字长＝3)进行BLAST蛋白质搜索，以获得与本发明的蛋白质分子同源的氨基酸序列。为了获得用于比较目的的空位比对，可以利用Altschul等人，(1997)Nucleic Acids Res.25:3389-3402中描述的空位BLAST。利用BLAST和空位BLAST程序时，可以使用各个程序(例如，XBLAST和NBLAST)的默认参数。参见ncbi.nlm.nih.gov.。
应当理解，本发明的分子可以具有另外的保守或非必需氨基酸取代，该取代对它们的功能没有实质性影响。
术语“氨基酸”旨在涵盖所有分子，无论是天然的还是合成的，其既包含氨基官能团又包含酸官能团并且能够被包含在天然存在的氨基酸的聚合物中。示例性的氨基酸包含天然存在的氨基酸；其类似物、衍生物和同类物；具有变异侧链的氨基酸类似物；以及任意前述的任一种的所有立体异构体。如本文所用，术语“氨基酸”包含D-旋光异构体或L-旋光异构体和拟肽。
“保守氨基酸取代”是其中氨基酸残基被具有相似侧链的氨基酸残基替换的一种取代。具有相似侧链的氨基酸残基家族已在本领域中定义。这些家族包含具有碱性侧链的氨基酸(例如，赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、具有酸性侧链的氨基酸(例如，天冬氨酸、谷氨酸)、具有不带电荷的极性侧链的氨基酸(例如，甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、具有非极性侧链的氨基酸(例如，丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、色氨酸)、具有β支链侧链的氨基酸(例如，苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和具有芳族侧链的氨基酸(例如，酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。
本文可互换使用的术语“多肽”、“肽”和“蛋白质”(如果是单链的话)是指任何长度的氨基酸的聚合物。该聚合物可以是直链或支链的，它可以包括修饰的氨基酸，并且可以被非氨基酸中断。该术语还涵盖已被修饰的氨基酸聚合物，所述修饰是例如，二硫键形成、糖基化、脂化、乙酰化、磷酸化或任何其他操作，诸如与标记组分的缀合。多肽可以从天然来源中分离，可以通过重组技术从真核或原核宿主中产生，或者可以是合成程序的产物。
术语“核酸”、“核酸序列”、“核苷酸序列”或“多核苷酸序列”和“多核苷酸”可互换使用。它们是指任何长度的核苷酸的聚合形式，即脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或其类似物。多核苷酸可以是单链或双链的，并且如果是单链的，则可以是编码链或非编码(反义)链。多核苷酸可以包括修饰的核苷酸，诸如甲基化的核苷酸和核苷酸类似物。核苷酸的序列可以被非核苷酸组分中断。多核苷酸可在聚合后进一步被修饰，诸如如果与标记组分缀合修饰。核酸可以是重组多核苷酸，或者是基因组、cDNA、半合成或合成来源的多核苷酸，其不是天然存在的，或是以非天然的方式与另一多核苷酸连接。
如本文所用，术语“分离的”是指从其来源或天然环境(例如，自然环境，如果其天然存在的话)中取出的材料。例如，存在于活体动物中的天然存在的多核苷酸或多肽是没有分离的，但是通过人为干预从天然系统中的某些或全部共存物质中分离的相同多核苷酸或多肽则是分离的。此类多核苷酸可以是载体的一部分，并且/或者此类多核苷酸或多肽可以是组合物的一部分，并且仍然是分离的，因为此类载体或组合物不是其在自然界中发现的环境的一部分。
下面进一步详细描述本发明的各个方面。整个说明书中阐述了其他定义。
抗体分子
在一个实施方案中，抗体分子与癌抗原(例如，肿瘤抗原或间质抗原)结合。在一些实施方案中，癌抗原是例如哺乳动物(例如，人)癌抗原。在其他实施方案中，抗体分子与免疫细胞抗原(例如，哺乳动物(例如，人)免疫细胞抗原)结合。例如，抗体分子与癌抗原或免疫细胞抗原上的表位(例如，线性或构象表位)特异性结合。
在实施方案中，抗体分子是单特异性抗体分子并且结合单一表位。例如，具有多个免疫球蛋白可变结构域序列的单特异性抗体分子，其各自结合相同的表位。
在实施方案中，抗体分子是多特异性或多功能抗体分子，例如，它包括多个免疫球蛋白可变结构域序列，其中该多个中的第一免疫球蛋白可变结构域序列对第一表位具有结合特异性，并且该多个中的第二免疫球蛋白可变结构域序列对第二表位具有结合特异性。在实施方案中，第一和第二表位在相同的抗原(例如，相同的蛋白质(或多聚体蛋白质的亚基))上。在实施方案中，第一和第二表位重叠。在实施方案中，第一和第二表位不重叠。在实施方案中，第一和第二表位在不同的抗原(例如，不同的蛋白质(或多聚体蛋白质的不同亚基))上。在实施方案中，多特异性抗体分子包含第三、第四或第五免疫球蛋白可变结构域。在实施方案中，多特异性抗体分子是双特异性抗体分子、三特异性抗体分子或四特异性抗体分子。
在实施方案中，多特异性抗体分子是双特异性抗体分子。双特异性抗体对不超过两种抗原具有特异性。双特异性抗体分子的特征在于对第一表位具有结合特异性的第一免疫球蛋白可变结构域序列和对第二表位具有结合特异性的第二免疫球蛋白可变结构域序列。在实施方案中，第一和第二表位在相同的抗原(例如，相同的蛋白质(或多聚体蛋白质的亚基))上。在实施方案中，第一和第二表位重叠。在实施方案中，第一和第二表位不重叠。在实施方案中，第一和第二表位在不同的抗原(例如，不同的蛋白质(或多聚体蛋白质的不同亚基))上。在实施方案中，双特异性抗体分子包括对第一表位具有结合特异性的重链可变结构域序列和轻链可变结构域序列以及对第二表位具有结合特异性的重链可变结构域序列和轻链可变结构域序列。在实施方案中，双特异性抗体分子包括对第一表位具有结合特异性的半抗体和对第二表位具有结合特异性的半抗体。在实施方案中，双特异性抗体分子包括对第一表位具有结合特异性的半抗体或其片段以及对第二表位具有结合特异性的半抗体或其片段。在实施方案中，双特异性抗体分子包括对第一表位具有结合特异性的scFv或Fab或其片段，以及对第二表位具有结合特异性的scFv或Fab或其片段。
在实施方案中，抗体分子包括双抗体和单链分子，以及抗体的抗原结合片段(例如，Fab、F(ab’)2和Fv)。例如，抗体分子可包含重(H)链可变结构域序列(本文缩写为VH)和轻(L)链可变结构域序列(本文缩写为VL)。在实施方案中，抗体分子包括重链和轻链(在本文中称为半抗体)或由它们组成。在另一实例中，抗体分子包含两个重(H)链可变结构域序列和两个轻(L)链可变结构域序列，从而形成两个抗原结合位点，诸如Fab、Fab’、F(ab’)2、Fc、Fd、Fd’、Fv、单链抗体(例如，scFv)、单可变结构域抗体、双抗体(Dab)(二价和双特异性)、以及嵌合(例如，人源化)抗体，它们可以通过修饰完整抗体或使用重组DNA技术从头合成的抗体产生。这些功能性抗体片段保留了与它们各自的抗原或受体选择性结合的能力。抗体和抗体片段可以来自任何类别的抗体，包含但不限于，IgG、IgA、IgM、IgD和IgE，以及来自抗体的任何亚类(例如，IgG1、IgG2、IgG3和IgG4)。抗体分子的制备可以是单克隆的或多克隆的。抗体分子还可以是人抗体、人源化抗体、CDR移植的抗体或体外生成的抗体。抗体可以具有选自，例如，IgG1、IgG2、IgG3或IgG4的重链恒定区。抗体还可以具有选自，例如，κ或λ的轻链。术语“免疫球蛋白”(Ig)在本文中与术语“抗体”可互换使用。
抗体分子的抗原结合片段的实例包括：(i)Fab片段，由VL、VH、CL和CH1结构域组成的单价片段；(ii)F(ab’)2片段，包括通过在铰链区的二硫键连接的两个Fab片段的二价片段；(iii)由VH和CH1结构域组成的Fd片段；(iv)由抗体单臂的VL和VH结构域组成的Fv片段，(v)由VH结构域组成的双抗体(dAb)片段；(vi)骆驼科或骆驼源化(camelized)可变结构域；(vii)单链Fv(scFv)，参见例如，Bird等人，(1988)Science 242:423-426；和Huston等人，(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883)；(viii)单结构域抗体。这些抗体片段使用本领域技术人员已知的常规技术获得，并且以与完整抗体相同的方式筛选片段的效用。
抗体分子包含完整分子及其功能片段。抗体分子的恒定区可经改变，例如，突变，以修饰抗体的特性(例如，增加或减少以下项中的一种或多种：Fc受体结合、抗体糖基化、半胱氨酸残基的数目、效应细胞功能或补体功能)。
抗体分子还可以是单结构域抗体。单结构域抗体可以包含其互补决定区是单结构域多肽的一部分的抗体。实例包括但不限于重链抗体、天然缺乏轻链的抗体、源自常规4链抗体的单结构域抗体、工程化抗体，以及除源自抗体的那些之外的单结构域支架。单结构域抗体可以是任何本领域的抗体，或任何未来的单结构域抗体。单结构域抗体可以源自任何物种，包括但不限于小鼠、人、骆驼、美洲驼、鱼、鲨鱼、山羊、兔和牛。根据本发明的另一方面，单结构域抗体是天然存在的单结构域抗体，称为缺乏轻链的重链抗体。例如，此类单结构域抗体公开于WO 9404678中。为清楚起见，该源自天然缺乏轻链的重链抗体的可变结构域在本文中称为VHH或纳米抗体，以区别于四链免疫球蛋白的常规VH。此类VHH分子可以源自在骆驼科(Camelidae)物种中(例如，在骆驼、美洲驼、单峰驼、羊驼和原驼中)产生的抗体。除骆驼科外的其他物种可以产生天然缺乏轻链的重链抗体；此类VHH在本发明的范围内。
VH和VL区可以细分为高变区，称为“互补决定区”(CDR)，其间散布更保守的区，称为“框架区”(FR或FW)。
框架区和CDR的范围已通过多种方法精确定义(参见Kabat,E.A.等人，(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版，美国卫生与公众服务部NIH出版号91-3242；Chothia,C.等人，(1987)J.Mol.Biol.196:901-917；以及OxfordMolecular的AbM抗体建模软件使用的AbM定义。通常参见例如Antibody Engineering LabManual(编著：Duebel,S.和Kontermann,R.,Springer-Verlag,Heidelberg)中的ProteinSequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains。
如本文所用，术语“互补决定区”和“CDR”是指抗体可变区内的氨基酸序列，其赋予抗原特异性和结合亲和力。通常，每个重链可变区中有三个CDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)，并且每个轻链可变区中有三个CDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)。
给定CDR的精确氨基酸序列边界可以使用许多已知方案中的任何一种来确定，包括Kabat等人，(1991),“Sequences of Proteins of Immunological Interest,”第5版Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(“Kabat”编号方案)，Al-Lazikani等人,(1997)JMB 273,927-948(“Chothia”编号方案)描述的那些。如本文所用，根据“Chothia”编号方案定义的CDR有时也称为“高变环”。
例如，根据Kabat，重链可变结构域(VH)中的CDR氨基酸残基编号为31-35(HCDR1)、50-65(HCDR2)和95-102(HCDR3)；并且轻链可变结构域(VL)中的CDR氨基酸残基编号为24-34(LCDR1)、50-56(LCDR2)和89-97(LCDR3)。根据Chothia，VH中的CDR氨基酸编号为26-32(HCDR1)、52-56(HCDR2)和95-102(HCDR3)；并且VL中的氨基酸残基编号为26-32(LCDR1)、50-52(LCDR2)和91-96(LCDR3)。
每个VH和VL通常包括三个CDR和四个FR，从氨基末端到羧基末端按以下顺序排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。
抗体分子可以是多克隆或单克隆抗体。
如本文所用，术语“单克隆抗体”或“单克隆抗体组合物”是指单分子组合物的抗体分子制剂。单克隆抗体组合物对特定表位展示出单一结合特异性和亲和力。单克隆抗体可以通过杂交瘤技术或通过不使用杂交瘤技术的方法(例如，重组方法)来制备。
抗体可以重组产生，例如，通过噬菌体展示或通过组合方法产生。
用于生成抗体的噬菌体展示和组合方法是本领域已知的(如描述于例如Ladner等人，美国专利号5,223,409；Kang等人，国际公开号WO 92/18619；Dower等人，国际公开号WO91/17271；Winter等人，国际公开WO 92/20791；Markland等人，国际公开号WO 92/15679；Breitling等人，国际公开WO 93/01288；McCafferty等人，国际公开号WO 92/01047；Garrard等人，国际公开号WO 92/09690；Ladner等人，国际公开号WO90/02809；Fuchs等人，(1991)Bio/Technology 9:1370-1372；Hay等人，(1992)Hum Antibod Hybridomas 3:81-85；Huse等人，(1989)Science246:1275-1281；Griffths等人，(1993)EMBO J 12:725-734；Hawkins等人，(1992)J Mol Biol 226:889-896；Clackson等人，(1991)Nature352:624-628；Gram等人，(1992)PNAS 89:3576-3580；Garrad等人，(1991)Bio/Technology 9:1373-1377；Hoogenboom等人，(1991)Nuc Acid Res19:4133-4137；和Barbas等人，(1991)PNAS88:7978-7982，所有这些的内容通过引用并入本文)。
在一个实施方案中，抗体是完全人抗体(例如，在小鼠中制备的抗体，该抗体已经基因工程化以从人免疫球蛋白序列产生抗体)，或非人抗体，例如，啮齿动物(小鼠或大鼠)、山羊、灵长类动物(例如，猴)、骆驼抗体。优选地，非人抗体是啮齿动物(小鼠或大鼠抗体)。产生啮齿动物抗体的方法是本领域已知的。
可以使用携带人免疫球蛋白基因的转基因小鼠而不是小鼠体系来生成人单克隆抗体。来自用感兴趣抗原免疫接种的这些转基因小鼠的脾细胞用于产生杂交瘤，该杂交瘤分泌对来自人蛋白质的表位具有特异性亲和力的人mAb(参见，例如，Wood等人，国际申请WO91/00906，Kucherlapati等人，PCT公开WO 91/10741；Lonberg等人，国际申请WO 92/03918；Kay等人，国际申请92/03917；Lonberg,N.等人，1994Nature 368:856-859；Green,L.L.等人1994Nature Genet.7:13-21；Morrison,S.L.等人，1994Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6851-6855；Bruggeman等人，1993Year Immunol 7:33-40；Tuaillon等人，1993PNAS 90:3720-3724；Bruggeman等人，1991Eur J Immunol 21:1323-1326)。
抗体分子可以是其中可变区或其一部分(例如，CDR)是在非人生物体(例如，大鼠或小鼠)中生成的一种分子。嵌合、CDR移植和人源化抗体在本发明范围内。在非人生物体(例如，大鼠或小鼠)中生成，然后在例如可变框架或恒定区中被修饰以降低在人体内的抗原性的抗体分子在本发明范围内。
“有效人”蛋白质是基本上不引起中和抗体应答的蛋白质，例如，人抗鼠抗体(HAMA)应答。例如，如果抗体分子被重复施用，例如，在治疗慢性或复发性疾病状况时，HAMA在许多情况下可能有问题。HAMA应答可潜在使重复抗体施用无效，因为抗体从血清中的清除率增加(参见例如，Saleh等人,Cancer Immunol.Immunother.,32:180-190(1990))，并且还因为潜在变态反应(参见例如，LoBuglio等人，Hybridoma,5:5117-5123(1986))。
嵌合抗体可以通过本领域已知的重组DNA技术产生(参见Robinson等人，国际专利公开PCT/US86/02269；Akira等人，欧洲专利申请184,187；Taniguchi,M.,欧洲专利申请171,496；Morrison等人，欧洲专利申请173,494；Neuberger等人，国际申请WO 86/01533；Cabilly等人美国专利号4,816,567；Cabilly等人，欧洲专利申请125,023；Better等人(1988Science 240:1041-1043)；Liu等人(1987)PNAS 84:3439-3443；Liu等人，1987,J.Immunol.139:3521-3526；Sun等人(1987)PNAS 84:214-218；Nishimura等人,1987,Canc.Res.47:999-1005；Wood等人(1985)Nature314:446-449；和Shaw等人,1988,J.NatlCancer Inst.80:1553-1559)。
人源化或CDR移植的抗体将具有至少一个或两个但通常所有三个被供体CDR替换的(免疫球蛋白重链和/或轻链的)接受体CDR。抗体可以被非人CDR的至少一部分替换或仅部分CDR可以被非人CDR替换。仅需替换与抗原结合所需数目的CDR。优选地，供体将是啮齿动物抗体，例如大鼠或小鼠抗体，并且接受体将是人框架或人共有框架。通常，提供CDR的免疫球蛋白称为“供体”，并且提供框架的免疫球蛋白称为“受体”。在一个实施方案中，供体免疫球蛋白是非人(例如，啮齿动物)的免疫球蛋白。受体框架是天然存在的(例如，人)框架或共有框架，或与其具有约85％或更高，优选90％、95％、99％或更高同一性的序列。
如本文所用，术语“共有序列”是指由相关序列家族中最常出现的氨基酸(或核苷酸)形成的序列(参见例如，Winnaker,From Genes to Clones(Verlagsgesellschaft,Weinheim,Germany 1987))。在蛋白质家族中，共有序列中的每个位置均被家族中该位置最常出现的氨基酸占据。如果两个氨基酸均等地出现，则二者均可被包含在共有序列中。“共有框架”是指在共有免疫球蛋白序列中的框架区。
抗体分子可以通过本领域已知的方法人源化(参见例如，Morrison,S.L.,1985,Science 229:1202-1207,Oi等人,1986,BioTechniques 4:214，和Queen等人，US 5,585,089、US 5,693,761和US 5,693,762，所有这些的内容特此通过引用并入)。
人源化或CDR移植的抗体分子可以通过CDR移植或CDR取代产生，其中免疫球蛋白链的一个、两个或所有CDR可以被替换。参见例如，美国专利5,225,539；Jones等人，1986Nature 321:552-525；Verhoeyan等人，1988Science 239:1534；Beidler等人，1988J.Immunol.141:4053-4060；Winter US 5,225,539，所有这些的内容通过特此引用明确并入。Winter描述了可用于制备本发明人源化抗体的CDR移植方法(英国专利申请GB2188638A，1987年3月26日提交；Winter US 5,225,539)，其内容通过引用明确并入。
其中特定氨基酸已经被取代、缺失或添加的人源化抗体分子也在本发明的范围内。从供体选择氨基酸的标准描述于US 5,585,089，例如，US 5,585,089的第12-16列，例如，US 5,585,089的第12-16列，其内容特此通过引用并入。1992年12月23日公开的Padlan等人，EP 519596A1描述了用于人源化抗体的其他技术。
抗体分子可以是单链抗体。单链抗体(scFV)可经工程化(参见例如，Colcher,D.等人(1999)Ann N Y Acad Sci 880:263-80；和Reiter,Y.(1996)Clin Cancer Res 2:245-52)。单链抗体可经二聚化或多聚化以产生对相同靶蛋白的不同表位具有特异性的多价抗体。
在其他实施方案中，抗体分子具有重链恒定区，其选自例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD和IgE的重链恒定区；特别地选自例如IgG1、IgG2、IgG3和IgG4的(例如，人)重链恒定区。在另一个实施方案中，抗体分子具有轻链恒定区，其选自例如κ或λ的(例如，人)轻链恒定区。恒定区可经改变(例如，突变)以修饰抗体的特性(例如，增加或减少以下项中的一种或多种：Fc受体结合、抗体糖基化、半胱氨酸残基的数目、效应细胞功能和/或补体功能)。在一个实施方案中，抗体具有：效应物功能；并且可以固定补体。在其他实施方案中，抗体不会募集效应细胞；或固定补体。在另一个实施方案中，抗体结合Fc受体的能力降低或没有结合Fc受体的能力。例如，它是不支持与Fc受体结合的同种型或亚型、片段或其他突变体，例如，它具有被诱变或缺失的Fc受体结合区。
改变抗体恒定区的方法是本领域已知的。功能改变(例如，对效应物配体(诸如细胞上的FcR或补体的C1组分)的亲和力改变)的抗体可以通过用不同的残基替换抗体恒定部分中的至少一个氨基酸残基来产生(参见例如，EP 388,151A1，美国专利号5,624,821和美国专利号5,648,260，其全部内容特此通过引用并入)。可以描述相似类型的改变，如果其应用于鼠或其他物种，则免疫球蛋白将减少或消除这些功能。
抗体分子可以被衍生或连接至另一功能分子(例如，另一种肽或蛋白质)。如本文所用，“衍生的”抗体分子是已被修饰的一种抗体分子。衍生方法包括但不限于添加荧光部分、放射性核苷酸、毒素、酶或亲和配体诸如生物素。因此，本发明的抗体分子旨在包括本文所述抗体的衍生形式和其他修饰形式，包括免疫粘附分子。例如，抗体分子可以被功能性地连接(通过化学偶联、遗传融合、非共价缔合或其他方式)至一个或多个其他分子实体，诸如另一种抗体(例如，双特异性抗体或双抗体)、可检测试剂、细胞毒剂、药物试剂和/或可介导抗体或抗体部分与另一种分子缔合的蛋白质或肽(诸如链霉亲和素核心区或多组氨酸标签)。
一种类型的衍生抗体分子是通过交联两种或更多种抗体(相同或不同类型，例如以产生双特异性抗体)而产生的。合适的交联剂包括异双功能的交联剂(其具有两个被适当的间隔基隔开的不同的反应性基团(例如，间马来酰亚胺基苯甲酰基-N-羟基琥珀酰亚胺酯))或同双功能的交联剂(例如，辛二酸二琥珀酰亚胺酯)。此类接头可从Pierce ChemicalCompany,Rockford,Ill获得。
多特异性或多功能抗体分子
全文描述了本文定义的多特异性和多功能分子的示例性结构。在以下文献中进一步描述了示例性结构：Weidle U等人(2013)The Intriguing Options of MultispecificAntibody Formats for Treatment of Cancer.Cancer Genomics&Proteomics 10:1-18(2013)；和Spiess C等人(2015)Alternative molecular formats and therapeuticapplications for bispecific antibodies.Molecular Immunology 67:95-106；其每一个全部内容通过引用并入本文)。
在实施方案中，多特异性抗体分子可包括超过一个的抗原结合位点，其中不同的位点对不同的抗原具有特异性。在实施方案中，多特异性抗体分子可以结合同一抗原上的超过一个(例如，两个或更多个)的表位。在实施方案中，多特异性抗体分子包括对靶细胞(例如，癌细胞)具有特异性的抗原结合位点和对免疫效应细胞具有特异性的不同抗原结合位点。在一个实施方案中，多特异性抗体分子是双特异性抗体分子。双特异性抗体分子可分为五个不同的结构组：(i)双特异性免疫球蛋白G(BsIgG)；(ii)附加有额外的抗原结合部分的IgG；(iii)双特异性抗体片段；(iv)双特异性融合蛋白；以及(v)双特异性抗体缀合物。
BsIgG是对每种抗原为单价的形式。示例性的BsIgG形式包括但不限于crossMab、DAF(二合一)、DAF(四合一)、DutaMab、DT-IgG、杵臼结构常见LC、杵臼结构组装体、电荷对、Fab臂交换、SEEDbody、三功能抗体(triomab)、LUZ-Y、Fcab、κλ抗体、正交Fab。参见Spiess等人，Mol.Immunol.67(2015):95-106。示例性的BsIgG包括卡妥索单抗(catumaxomab)(Fresenius Biotech，Trion Pharma，Neopharm)，其含有抗CD3臂和抗EpCAM臂；以及厄马索单抗(ertumaxomab)(Neovii Biotech，Fresenius Biotech)，其靶向CD3和HER2。在一些实施方案中，BsIgG包括经工程化用于异源二聚化的重链。例如，可以使用“杵臼结构”策略、SEED平台、常见的重链(例如，在κλ抗体中)和使用异源二聚Fc区来将重链工程化以进行异源二聚化。参见Spiess等人，Mol.Immunol.67(2015):95-106。用来避免BsIgG中同源二聚体的重链配对的策略包括杵臼结构、Duobody、azymetric、电荷对、HA-TF、SEEDbody和差异A蛋白亲和力。参见上文。BsIgG可以通过在不同宿主细胞中分别表达组分抗体并随后纯化/组装成BsIgG来产生。BsIgG也可以通过在单个宿主细胞中表达组分抗体来产生。可以使用亲和色谱法纯化BsIgG，例如使用A蛋白和连续的pH洗脱。
附加有额外的抗原结合部分的IgG是双特异性抗体分子的另一种形式。例如，可以通过在单特异性IgG上(例如在重链或轻链的N末端或C末端)附加额外的抗原结合单元，将单特异性IgG工程化为具有双特异性。示例性的额外的抗原结合单元包括单结构域抗体(例如，可变重链或可变轻链)、工程化的蛋白支架和成对的抗体可变结构域(例如，单链可变片段或可变片段)。参见上文。附加的IgG形式的实例包括双可变结构域IgG(DVD-Ig)、IgG(H)-scFv、scFv-(H)IgG、IgG(L)-scFv、scFv-(L)IgG、IgG(L,H)-Fv、IgG(H)-V、V(H)-IgG、IgG(L)-V、V(L)-IgG、KIH-IgG-scFab、2scFv-IgG、IgG-2scFv、scFv4-Ig、zybody和DVI-IgG(四合一)。参见Spiess等人，Mol.Immunol.67(2015):95-106。IgG-scFv的实例是MM-141(Merrimack Pharmaceuticals)，其结合IGF-1R和HER3。DVD-Ig的实例包括结合IL-1α和IL-1β的ABT-981(AbbVie)；以及结合TNF和IL-17A的ABT-122(AbbVie)。
双特异性抗体片段(BsAb)是缺乏一些或全部抗体恒定结构域的双特异性抗体分子的形式。例如，一些BsAb缺乏Fc区。在实施方案中，双特异性抗体片段包括通过肽接头连接的重链区和轻链区，所述肽接头允许BsAb在单个宿主细胞中有效表达。示例性的双特异性抗体片段包括但不限于纳米抗体、纳米抗体-HAS、BiTE、双抗体(Diabody)、DART、TandAb、sc双抗体、sc双抗体-CH3、双抗体-CH3、三抗体(triple body)、微抗体、微体、TriBi微体、scFv-CH3 KIH、Fab-scFv、scFv-CH-CL-scFv、F(ab’)2、F(ab’)2-scFv2、scFv-KIH、Fab-scFv-Fc、四价HCAb、sc双抗体-Fc、双抗体-Fc、串联scFv-Fc和细胞内抗体。参见上文。例如，BiTE形式包括串联scFv，其中组分scFv与T细胞上的CD3和癌细胞上的表面抗原结合。
双特异性融合蛋白包含与其他蛋白连接的抗体片段，例如，以增加额外的特异性和/或功能。双特异性融合蛋白的一个实例是immTAC，其包括与识别HLA呈递肽的亲和力成熟的T细胞受体连接的抗CD3 scFv。在实施方案中，对接锁定(DNL)方法可用于生成具有更高价态的双特异性抗体分子。而且，与白蛋白结合蛋白或人血清白蛋白的融合体可以延长抗体片段的血清半衰期。参见上文。
在实施方案中，化学缀合，例如抗体和/或抗体片段的化学缀合，可用于产生BsAb分子。参见上文。示例性的双特异性抗体缀合物包括CovX体形式，其中低分子量药物在每个Fab臂或抗体或其片段中位点特异性地缀合至单个反应性赖氨酸。在实施方案中，缀合改善了低分子量药物的血清半衰期。示例性的CovX体是CVX-241(NCT01004822)，其包括缀合至两个抑制VEGF或Ang2的短肽的抗体。参见上文。
可以通过在宿主系统中重组表达例如至少一种或多种组分来产生抗体分子。示例性的宿主系统包括真核细胞(例如，哺乳动物细胞，例如CHO细胞，或昆虫细胞，例如SF9或S2细胞)和原核细胞(例如大肠杆菌(E.coli))。双特异性抗体分子可以通过组分在不同宿主细胞中的单独表达以及随后的纯化/组装来产生。或者，可以通过在单个宿主细胞中表达组分来产生抗体分子。双特异性抗体分子的纯化可以通过各种方法进行，诸如亲和色谱法，例如，使用A蛋白和连续的pH洗脱进行的亲和色谱法。在其他实施方案中，亲和标签可以用于纯化，例如含组氨酸的标签、myc标签或链霉亲和素标签。
CDR移植的支架
在实施方案中，抗体分子是CDR移植的支架结构域。在实施方案中，支架结构域基于纤连蛋白结构域，例如纤连蛋白III型结构域。纤连蛋白III型(Fn3)结构域的整体折叠与最小的功能性抗体片段(抗体重链的可变结构域)的折叠紧密相关。Fn3的末尾有三个环；BC、DE和FG环的位置大致对应于抗体的VH结构域的CDR1、2和3的位置。Fn3没有二硫键；因此，与抗体及其片段不同，Fn3在还原条件下是稳定的(参见例如，WO 98/56915；WO 01/64942；WO 00/34784)。可以(例如，使用本文所述的CDR或高变环)修饰或改变Fn3结构域，例如，以选择与本文所述的抗原/标志物/细胞结合的结构域。
在实施方案中，支架结构域(例如，折叠结构域)基于抗体，例如通过从单克隆抗体的重链可变结构域中删除三条β链而产生的“微抗体”支架(参见例如，Tramontano等人，1994，J Mol.Recognit.7:9；和Martin等人,1994,EMBO J.13:5303-5309)。“微抗体”可用于呈现两个高变环。在实施方案中，支架结构域是V样结构域(参见例如，Coia等人，WO 99/45110)或是衍生自淀粉酶抑肽(tendamistatin)的结构域，该淀粉酶抑肽是由两个二硫键保持在一起的74残基的六链β片层夹心结构(参见例如McConnell和Hoess,1995,JMol.Biol.250:460)。例如，可以(例如，使用CDR或高变环)修饰或改变淀粉酶抑肽的环，例如以选择与本文所述的标志物/抗原/细胞结合的结构域。另一个示例性的支架结构域是衍生自CTLA-4的胞外结构域的β-夹心结构(参见例如，WO 00/60070)。
其他示例性的支架结构域包括但不限于T细胞受体；MHC蛋白；胞外结构域(例如，纤连蛋白III型重复序列，EGF重复序列)；蛋白酶抑制剂(例如，Kunitz结构域、大肠杆菌素、BPTI等)；TPR重复序列；三叶结构；锌指结构域；DNA结合蛋白；特别是单体DNA结合蛋白；RNA结合蛋白；酶，例如蛋白酶(特别是灭活的蛋白酶)，RNA酶；伴侣分子，例如硫氧还蛋白和热休克蛋白；以及细胞内信号传导结构域(诸如SH2和SH3结构域)。参见例如US 20040009530和US 7,501,121，其通过引用并入本文。
在实施方案中，例如通过以下标准中的一个或多个来评估和选择支架结构域：(1)氨基酸序列，(2)几个同源结构域的序列，(3)3维结构，和/或(4)在pH、温度、盐度、有机溶剂、氧化剂浓度范围内的稳定性数据。在实施方案中，支架结构域是小的、稳定的蛋白质结构域，例如少于100、70、50、40或30个氨基酸的蛋白质。该结构域可以包含一个或多个二硫键或可以螯合金属，例如锌。
基于抗体的融合体
可以生成包括附着于抗体N或C末端的另外结合实体的多种形式。这些具有单链或二硫键稳定化的Fv或Fab的融合体导致生成对每种抗原具有二价结合特异性的四价分子。scFv和scFab与IgG的结合能够产生可识别三种或更多种不同抗原的分子。
抗体-Fab融合体
抗体-Fab融合体是双特异性抗体，其包括与抗体重链的C末端融合的针对第一靶标的传统抗体和针对第二靶标的Fab。通常，抗体和Fab将具有共同的轻链。抗体融合体可以通过以下方式产生：(1)将靶标融合体的DNA序列工程化，以及(2)将靶标DNA转染到合适的宿主细胞中以表达融合蛋白。似乎抗体-scFv融合体可以通过CH3结构域的C末端与scFv的N末端之间的(Gly)-Ser接头连接，如Coloma，J.等人，(1997)Nature Biotech 15:159所述。
抗体-scFv融合体
抗体-scFv融合体是双特异性抗体，其包括与抗体重链的C末端融合的传统抗体和具有独特特异性的scFv。scFv可以直接通过scFv重链或通过接头肽融合至C末端。抗体融合体可以通过以下方式产生：(1)将靶标融合体的DNA序列工程化，以及(2)将靶标DNA转染到合适的宿主细胞中以表达融合蛋白。似乎抗体-scFv融合体可以通过CH3结构域的C末端与scFv的N末端之间的(Gly)-Ser接头连接，如Coloma，J.等人，(1997)Nature Biotech 15:159所述。
可变结构域免疫球蛋白DVD
一种相关的形式是双重可变结构域免疫球蛋白(DVD)，其通过较短的接头序列由在V结构域N末端的第二个特异性位置的VH和VL结构域构成。
其他示例性的多特异性抗体形式包括，例如在以下专利中描述的那些：US20160114057A1、US20130243775A1、US20140051833、US20130022601、US20150017187A1、US20120201746A1、US20150133638A1、US20130266568A1、US20160145340A1、WO2015127158A1、US20150203591A1、US20140322221A1、US20130303396A1、US20110293613、US20130017200A1、US20160102135A1、WO2015197598A2、WO2015197582A1、US9359437、US20150018529、WO2016115274A1、WO2016087416A1、US20080069820A1、US9145588B、US7919257和US20150232560A1。采用完整抗体-Fab/scFab形式的示例性的多特异性分子包括在以下专利中描述的那些：US9382323B2、US20140072581A1、US20140308285A1、US20130165638A1、US20130267686A1、US20140377269A1、US7741446B2和WO1995009917A1。采用结构域交换形式的示例性的多特异性分子包括在以下专利中描述的那些：US20150315296A1、WO2016087650A1、US20160075785A1、WO2016016299A1、US20160130347A1、US20150166670、US8703132B2、US20100316645、US8227577B2、US20130078249。
含Fc的实体(微抗体)
含Fc的实体(也称为微抗体)可以通过将scFv与恒定重链结构域3的C末端(CH3-scFv)和/或与具有不同特异性的抗体的铰链区(scFv-铰链-Fc)融合而生成。也可以制备具有与IgG的CH3结构域的C末端融合的二硫键稳定化的可变结构域(无肽接头)的三价实体。
含Fc的多特异性分子
在一些实施方案中，本文公开的多特异性分子包含免疫球蛋白恒定区(例如，Fc区)。示例性的Fc区可以选自IgG1、IgG2、IgG3或IgG4的重链恒定区；更特别地，人IgG1、IgG2、IgG3或IgG4的重链恒定区。
在一些实施方案中，免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)被改变(例如，突变)以增加或减少以下一项或多项：Fc受体结合、抗体糖基化、半胱氨酸残基的数目、效应细胞功能或补体功能。
在其他实施方案中，第一免疫球蛋白链恒定区和第二免疫球蛋白链恒定区(例如，第一Fc区和第二Fc区)的界面被改变(例如，突变)以例如相对于非工程化界面(例如，天然存在的界面)增加或减少二聚化。例如，免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)的二聚化可以通过为第一Fc区和第二Fc区的Fc界面提供以下的一种或多种来增强：成对的突起-腔(“杵臼结构”)、静电相互作用或链交换，以使得例如相对于非工程化界面，异源多聚体形式与同源多聚体形式的比例更大。
在一些实施方案中，多特异性分子包括在选自例如人IgG1的Fc区的347、349、350、351、366、368、370、392、394、395、397、398、399、405、407或409的一个或多个中的位置的成对的氨基酸取代例如，免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)可以包括选自以下的成对的氨基酸取代：T366S、L368A或Y407V(例如，对应于腔或臼)和T366W(例如，对应于突起或杵)。
在其他实施方案中，多功能分子包含半衰期延长剂，例如人血清白蛋白，或针对人血清白蛋白的抗体分子。
异源二聚化的抗体分子及其制备方法
已经公开了产生多特异性抗体的各种方法来解决不正确的重链配对的问题。示例性方法描述如下。示例性的多特异性抗体形式和制备所述多特异性抗体的方法也公开于例如Speiss等人，Molecular Immunology67(2015)95–106；和Klein等人，mAbs 4:6,653–663；2012年11月/12月中；其每一个的全部内容通过引用并入本文。
异源二聚化的双特异性抗体基于天然IgG结构，其中两个结合臂识别不同的抗原。通过强制重链异源二聚化，并结合将轻链(例如，共有轻链)错配最小化的技术，来生成能够实现确定的单价(和同时的)抗原结合的IgG衍生形式。强制重链异源二聚化可以使用例如杵臼结构或链交换工程化结构域(SEED)获得。
杵臼结构(Knob-in-Hole)
杵臼结构在US 5,731,116、US 7,476,724和Ridgway,J.等人(1996)Prot.Engineering 9(7):617-621中描述，一般说来涉及：(1)使一种或两种抗体的CH3结构域突变以促进异源二聚化；和(2)在促进异源二聚化的条件下将突变的抗体组合。“杵”或“突起”通常是通过将亲本抗体中的小氨基酸替换为较大的氨基酸(例如，T366Y或T366W)来产生的；“臼”或“腔”是通过将亲本抗体中的较大残基替换为较小氨基酸(例如，Y407T、T366S、L368A和/或Y407V)来产生的。
对于包含Fc结构域的双特异性抗体，可以利用将特定突变引入重链的恒定区来促进Fc部分的正确异源二聚化。在Klein等人，(mAbs(2012)4:6,1-11)中综述了几种此类技术，其内容通过引用整体并入本文。这些技术包括“杵臼结构”(KiH)法，该方法涉及将庞大的残基引入一条抗体重链的一个CH3结构域中。该庞大的残基配合到配对重链的另一个CH3结构域中的互补“臼(hole)”中，从而促进重链的正确配对(参见例如，US7642228)。
示例性的KiH突变包括“杵(knob)”重链中的S354C、T366W和“臼”重链中的Y349C、T366S、L368A、Y407V。表1提供了其他示例性的KiH突变，以及另外的任选的稳定化Fc半胱氨酸突变。
表1.示例性的Fc KiH突变和任选的半胱氨酸突变
Igawa和Tsunoda提供了其他Fc突变，他们鉴定了一条链的CH3结构域中的3个带负电荷的残基，其与另一条链的CH3结构域中的3个带正电荷的残基配对。这些特定的带电荷残基对为：356-K439、E357-K370、D399-K409，反之亦然。通过单独地或与新鉴定的二硫桥结合地在链A中引入以下三个突变中的至少两个：E356K、E357K和D399K，以及在链B中引入以下三个突变中的至少两个：K370E、K409D、K439E，能够促进非常有效的异源二聚化，同时抑制同源二聚化(Martens T等人，A novel one-armed antic-Met antibody inhibitsglioblastoma growth in vivo.Clin Cancer Res 2006；12:6144-52；PMID:17062691)。Xencor基于结构计算和序列信息的组合定义了41个变体对，随后筛选了最大异源二聚化，定义了链A上的S364H、F405A(HA)和链B上的Y349T、T394F(TF)的组合(Moore GL等人，Anovel bispecific antibody format enables simultaneous bivalent and monovalentco-engagement of distinct target antigens.MAbs 2011；3:546-57；PMID:22123055)。
促进多特异性抗体异源二聚化的其他示例性的Fc突变包括在以下参考文献中描述的那些，其各自内容通过引用并入本文：WO2016071377A1、US20140079689A1、US20160194389A1、US20160257763、WO2016071376A2、WO2015107026A1、WO2015107025A1、WO2015107015A1、US20150353636A1、US20140199294A1、US7750128B2、US20160229915A1、US20150344570A1、US8003774A1、US20150337049A1、US20150175707A1、US20140242075A1、US20130195849A1、US20120149876A1、US20140200331A1、US9309311B2、US8586713、US20140037621A1、US20130178605A1、US20140363426A1、US20140051835A1和US20110054151A1。
稳定化半胱氨酸突变也已经与KiH和其他促进Fc异源二聚化的变体组合使用，参见例如US7183076。其他示例性半胱氨酸修饰包括例如在US20140348839A1、US7855275B2和US9000130B2公开的那些。
链交换工程化结构域(SEED)
通过设计链交换工程化结构域(SEED)C(H)3异源二聚体来支持双特异性和不对称融合蛋白设计的异源二聚Fc平台是已知的。人IgG和IgA C(H)3结构域的这些衍生物产生互补的人SEED C(H)3异源二聚体，其由人IgA和IgG C(H)3序列的交替区段构成。当在哺乳动物细胞中表达时，所得的一对SEED C(H)3结构域优先缔合形成异源二聚体。SEEDbody(Sb)融合蛋白由[IgG1铰链]-C(H)2-[SEED C(H)3]组成，其可以与一个或多个融合伴侣遗传连接(例如，参见Davis JH等人，SEEDbodies:fusion proteins based on strand exchangeengineered domain(SEED)CH3 heterodimers in an Fc analogue platform forasymmetric binders or immunofusions and bispecific antibodies.Protein Eng DesSel2010；23:195-202；PMID:20299542和US8871912。其每一个的内容通过引用并入本文)。
Duobody
产生具有正确重链配对的双特异性抗体的“Duobody”技术是已知的。DuoBody技术涉及三个基本步骤，用于在生产后的交换反应中生成稳定的双特异性人IgG1抗体。第一步，使用标准的哺乳动物重组细胞系分别生产两个IgG1，每个IgG1在第三恒定(CH3)结构域中含有单个匹配的突变。随后，根据用于回收和纯化的标准方法来纯化这些IgG1抗体。在生产和(生产后的)纯化后，两个抗体在定制的实验室条件下重组，从而以非常高的产率(通常>95％)产生双特异性抗体产物(参见例如Labrijn等人，PNAS 2013；110(13):5145-5150和Labrijn等人，Nature Protocols 2014；9(10):2450-63，其各自的内容通过引用并入本文)。
静电相互作用
公开了使CH3氨基酸变化为带电荷的氨基酸来制备多特异性抗体的方法，使得同二聚体的形成在静电上是不利的。EP1870459和WO 2009089004描述了在宿主细胞中共表达不同抗体结构域时有利于异源二聚体形成的其他策略。在这些方法中，用带电荷的氨基酸替换两个CH3结构域中组成重链恒定结构域3(CH3)、CH3-CH3界面的一个或多个残基，使得同二聚体形成在静电上是不利的并且异源二聚化在静电上是有利的。在以下参考文献中描述了使用静电相互作用制备多特异性分子的其他方法，每个参考文献的内容通过引用并入本文，包括US20100015133、US8592562B2、US9200060B2、US20140154254A1和US9358286A1。
共有轻链
需要避免轻链错配以生成双特异性IgG的均质制剂。其实现方式之一是通过使用共有轻链原理，即将共享一个轻链但仍具有不同特异性的两种结合物组合。增强由单体混合物形成期望的双特异性抗体的示例性方法是通过提供共有的可变轻链来与双特异性抗体的每个异聚可变重链区相互作用。产生具有共同轻链的双特异性抗体的组合物和方法公开于例如US7183076B2、US20110177073A1、EP2847231A1、WO2016079081A1和EP3055329A1中，其各自的内容通过引用并入本文。
CrossMab
减少轻链错配的另一种选择是CrossMab技术，它通过交换一半双特异性抗体的Fab中的CH1和CL结构域来避免非特异性L链错配。此类交错变体保留了结合特异性和亲和力，但是使两个臂如此不同，以至于防止了L链错配。CrossMab技术(如前述Klein等人中所概述)涉及重链和轻链之间的结构域互换，以促进正确配对的形成。简而言之，为了通过使用两个不同的轻链-重链对来构建可以结合两种抗原的双特异性IgG样CrossMab抗体，采用了两步式修饰过程。首先，使用异源二聚化方法(例如，杵臼结构(KiH)技术)将二聚化界面工程化到每个重链的C末端，以确保仅有效地形成了来自一个抗体(例如，抗体A)和第二抗体(例如，抗体B)的两条不同重链的异源二聚体。接下来，交换一种抗体(抗体A)的恒定重链1结构域(CH1)和恒定轻链结构域(CL)，同时使可变重链(VH)和可变轻链(VL)结构域保持如一。CH1和CL结构域的交换确保修饰的抗体(抗体A)轻链仅与修饰的抗体(抗体A)重链有效地二聚化，而未修饰的抗体(抗体B)轻链仅与未修饰的抗体(抗体B)重链有效地二聚化；因此仅有效地形成期望的双特异性CrossMab(参见例如Cain,C.SciBX 4(28)；doi:10.1038/scibx.2011.783，其内容通过引用并入本文)。
共有重链
增强由单体混合物形成期望的双特异性抗体的示例性方法是通过提供共有的可变重链来与双特异性抗体的每个异聚可变轻链区相互作用。产生具有共有重链的双特异性抗体的组合物和方法公开于例如US20120184716、US20130317200和US20160264685A1中，其各自的内容通过引用并入本文。
氨基酸修饰
产生具有正确的轻链配对的多特异性抗体的替代组合物和方法包括各种氨基酸修饰。例如，Zymeworks描述了在CH1和/或CL结构域中具有一个或多个氨基酸修饰，在VH和/或VL结构域中具有一个或多个氨基酸修饰，或其组合的异源二聚体，这些修饰是轻链和重链之间的界面的一部分，并在每条重链和所期望的轻链之间建立优先配对，使得当异源二聚体对的两条重链和两条轻链在细胞中共表达时，第一异源二聚体的重链优先与一条轻链而不是彼此配对(参见例如，WO2015181805)。其他示例性方法描述于WO2016026943(Argen-X)、US20150211001、US20140072581A1、US20160039947A1和US20150368352中。
λ/κ形式
包括λ轻链多肽和κ轻链多肽的多特异性分子(例如，多特异性抗体分子)可用于允许异源二聚化。生成包括λ轻链多肽和κ轻链多肽的双特异性抗体分子的方法公开于2017年9月22日提交的PCT/US17/53053，其通过引用全文并入本文。
在实施方案中，多特异性分子包括多特异性抗体分子，例如，包括两种结合特异性的抗体分子，例如，双特异性抗体分子。多特异性抗体分子包括：
对第一表位具有特异性的λ轻链多肽1(LLCP1)；
对第一表位具有特异性的重链多肽1(HCP1)；
对第二表位具有特异性的κ轻链多肽2(KLCP2)；以及
对第二表位具有特异性的重链多肽2(HCP2)。
如本文所用，术语“λ轻链多肽1(LLCP1)”是指包括足够的轻链(LC)序列的多肽，使得当与同源重链可变区结合时，可以介导与其表位的特异性结合以及与HCP1的复合。在一个实施方案中，其包括CH1区的全部或片段。在一个实施方案中，LLCP1包括LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4和CH1，或来自其中的足以介导其表位的特异性结合以及与HCP1的复合的序列。LLCP1与其HCP1一起对第一表位提供特异性(而KLCP2与其HCP2一起对第二表位提供特异性)。如本文其他地方所述，LLCP1对HCP1的亲和力高于对HCP2的亲和力。
如本文所用，术语“κ轻链多肽2(KLCP2)”是指包括足够的轻链(LC)序列的多肽，使得当与同源重链可变区结合时，可以介导与其表位的特异性结合以及与HCP2的复合。在一个实施方案中，其包括CH1区的全部或片段。在一个实施方案中，KLCP2包括LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4和CH1，或来自其中的足以介导其表位的特异性结合以及与HCP2的复合的序列。KLCP2与其HCP2一起为第二表位提供特异性(而LLCP1与其HCP1一起为第一表位提供特异性)。
如本文所用，术语“重链多肽1(HCP1)”是指包括足够的重链(HC)序列(例如，HC可变区序列)的多肽，使得当与同源LLCP1结合时可以介导与其表位的特异性结合以及与HCP1的复合。在一个实施方案中，其包括CH1区的全部或片段。在一个实施方案中，其包括CH2和/或CH3区的全部或片段。在一个实施方案中，HCP1包括HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2和CH3，或来自其中的足以实现以下各项的序列：(i)介导其表位的特异性结合以及与LLCP1的复合，(ii)如本文所述优先与LLCP1而非KLCP2复合；以及(iii)如本文所述优先与HCP2而非另一HCP1分子复合。HCP1与其LLCP1一起提供对第一表位的特异性(而KLCP2与其HCP2一起提供对第二表位的特异性)。
如本文所用，术语“重链多肽2(HCP2)”是指包括足够的重链(HC)序列(例如，HC可变区序列)的多肽，使得当与同源LLCP1结合时可以介导与其表位的特异性结合以及与HCP1的复合。在一个实施方案中，其包括CH1区的全部或片段。在一个实施方案中，其包括CH2和/或CH3区的全部或片段。在一个实施方案中，HCP1包括HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2和CH3，或来自其中的足以实现以下各项的序列：(i)介导其表位的特异性结合以及与KLCP2的复合，(ii)如本文所述优先与KLCP2而非LLCP1复合；以及(iii)如本文所述优先与HCP1而非另一HCP2分子复合。HCP2与其KLCP2一起提供对第二表位的特异性(而LLCP1与其HCP1一起提供对第一表位的特异性)。
在本文公开的多特异性抗体分子的一些实施方案中：LLCP1对HCP1的亲和力高于对HCP2的亲和力；并且/或者KLCP2对HCP2的亲和力高于对HCP1的亲和力。
在实施方案中，LLCP1对HCP1的亲和力充分大于其对HCP2的亲和力，使得在预选条件下，例如在水性缓冲液中(例如在pH 7下)、在盐水中(例如在pH 7下)，或在生理条件下，至少75％、80％、90％、95％、98％、99％、99.5％或99.9％的多特异性抗体分子具有与HCP1复合或接合的LLCP1。
在本文公开的多特异性抗体分子的一些实施方案中：HCP1对HCP2的亲和力高于对HCP1第二分子的亲和力；并且/或者
HCP2对HCP1的亲和力高于对HCP2第二分子的亲和力。
在实施方案中，HCP1对HCP2的亲和力充分大于其对HCP1第二分子的亲和力，使得在预选条件下，例如在水性缓冲液中(例如在pH 7下)、在盐水中(例如在pH 7下)，或在生理条件下，至少75％、80％、90％、95％、98％、99％99.5％或99.9％的多特异性抗体分子具有与HCP2复合或接合的HCP1。
在另一方面，本文公开了一种用于制备或产生多特异性抗体分子的方法。该方法包括：在(i)-(iv)缔合的条件下：
(i)提供第一重链多肽(例如，包括第一重链可变区(第一VH)、第一CH1、第一重链恒定区(例如，第一CH2、第一CH3或两者)中的一个、两个、三个或全部的重链多肽)；
(ii)提供第二重链多肽(例如，包括第二重链可变区(第二VH)、第二CH1、第二重链恒定区(例如，第二CH2、第二CH3或两者)中的一个、两个、三个或全部的重链多肽)；
(iii)提供优先与第一重链多肽(例如，第一VH)缔合的λ链多肽(例如，λ轻可变区(VLλ)、λ轻恒定链(VLλ)或两者)；以及
(iv)提供优先与第二重链多肽(例如，第二VH)缔合的κ链多肽(例如，κ轻可变区(VLκ)、κ轻恒定链(VLκ)或两者)。
在实施方案中，第一重链和第二重链多肽形成增强异源二聚化的Fc界面。
在实施方案中，将(i)-(iv)(例如，编码(i)-(iv)的核酸)引入单个细胞(例如，单个哺乳动物细胞，例如，CHO细胞)中。在实施方案中，(i)-(iv)在细胞中表达。
在实施方案中，将(i)-(iv)(例如，编码(i)-(iv)的核酸)引入不同的细胞(例如，不同的哺乳动物细胞，例如，两个或更多个CHO细胞)中。在实施方案中，(i)-(iv)在细胞中表达。
在一个实施方案中，该方法进一步包括例如使用λ特异性和/或κ特异性纯化(例如，亲和色谱)纯化细胞表达的抗体分子。
在实施方案中，该方法进一步包括评估细胞表达的多特异性抗体分子。例如，纯化的细胞表达的多特异性抗体分子可以通过本领域已知的技术(包括质谱法)进行分析。在一个实施方案中，将纯化的细胞表达的抗体分子裂解，例如用木瓜蛋白酶消化以产生Fab部分，并使用质谱法进行评估。
在实施方案中，该方法以高产率(例如，至少75％、80％、90％、95％、98％、99％99.5％或99.9％)产生正确配对的κ/λ多特异性(例如，双特异性)抗体分子。
在其他实施方案中，多特异性(例如，双特异性)抗体分子包含：
(i)第一重链多肽(HCP1)(例如，包括第一重链可变区(第一VH)、第一CH1、第一重链恒定区(例如，第一CH2、第一CH3或两者)中的一个、两个、三个或全部的重链多肽)，例如，其中HCP1与第一表位结合；
(ii)第二重链多肽(HCP2)(例如，包括第二重链可变区(第二VH)、第二CH1、第二重链恒定区(例如，第二CH2、第二CH3或两者)中的一个、两个、三个或全部的重链多肽)，例如，其中HCP2与第二表位结合；
(iii)优先与第一重链多肽(例如，第一VH)缔合的λ轻链多肽(LLCP1)(例如，λ轻可变区(VLl)、λ轻恒定链(VLl)或两者)，例如，其中LLCP1与第一表位结合；以及
(iv)优先与第二重链多肽(例如，第二VH)缔合的κ轻链多肽(KLCP2)(例如，κ轻可变区(VLk)、κ轻恒定链(VLk)或两者)，例如，其中KLCP2与第二表位结合。
在实施方案中，第一重链和第二重链多肽形成增强异源二聚化的Fc界面。在实施方案中，多特异性抗体分子具有第一结合特异性和第二结合特异性，所述第一结合特异性包含杂合的VLl-CLl，其异源二聚化至与Fc恒定CH2-CH3结构域连接的第一重链可变区(具有杵修饰)，并且所述第二结合特异性包含杂合的VLk-CLk，其异源二聚化至与Fc恒定CH2-CH3结构域连接的第二重链可变区(具有臼修饰)。
TRBC1和TRBC2抗原结合结构域
本公开内容尤其提供了抗体分子，例如，多特异性(例如，双特异性、三特异性、四特异性)或多功能分子，其包括(例如，经工程化为含有)与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原结合的一个或多个抗原结合结构域。在一些实施方案中，肿瘤抗原包括：包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体。在一些实施方案中，抗原结合结构域优先与包括TRBC1的T细胞受体结合(例如，相对于包括TRBC2的T细胞受体)。在一些实施方案中，抗原结合结构域优先与包括TRBC2的T细胞受体结合(例如，相对于包括TRBC1的T细胞受体)。在一些实施方案中，多功能分子包含(例如，经工程化为含有)选择性靶向表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞的一个或多个抗原结合结构域。在一些实施方案中，抗原结合结构域选择性靶向表达包括TRBC1的T细胞受体或包括TRBC2的T细胞受体的淋巴细胞。
T细胞受体(TCR)是在淋巴细胞(特别是在T淋巴细胞(T细胞)上)的表面上发现的受体。TCR负责通过经由相关的CD3进行信号传导并激活T细胞，来识别由其他免疫细胞(例如，B细胞)上的主要组织相容性复合体(MHC)分子呈递的抗原片段。人的绝大多数TCR是包括α链和β链的异源二聚体。TCR的α链和β链均包括可变区和恒定区。α链和β链的可变区由不同的DNA元件(β链的V、D和J元件；α链的V和J元件)编码。这些元件之间的重组在很大程度上产生TCR抗原结合特异性的变化。TCRβ链恒定区选自两个不同的结构域：β恒定结构域1和β恒定结构域2。不希望受理论束缚，认为大多数包括β链的TCR包括包括β恒定结构域1或β恒定结构域2的β链，而不是同时包括恒定结构域1和恒定结构域2的β链。
在一些实施方案中，本申请的多功能或多特异性分子或抗体分子包括与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原(例如，包括TRBC1的T细胞受体、TRBC1、包括TRBC2的T细胞受体或TRBC2)结合的抗原结合结构域。在一些实施方案中，本申请的多功能或多特异性分子或抗体分子包括选择性靶向表达包括TRBC1的T细胞受体、TRBC1、包括TRBC2的T细胞受体或TRBC2的淋巴细胞的抗原结合结构域。虽然在最典型情况中呈递包包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的淋巴细胞或淋巴瘤细胞是T细胞，但癌症导致许多非疾病表达模式的破坏。因此，在一些实施方案中，淋巴瘤细胞或淋巴细胞可能不是T细胞。在一些实施方案中，淋巴瘤细胞或淋巴细胞是B细胞。在一些实施方案中，淋巴瘤细胞或淋巴细胞是自然杀伤细胞。
在一些实施方案中，抗原结合结构域(例如，第一抗原结合结构域)包括本领域已知的抗TRBC1抗体的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列。在一些实施方案中，CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列选自JOVI.1。
TRBC1抗原结合结构域
在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括表2、表6或表3中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括表2、表6或表3中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括表4中公开的VH和/或VL，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括表5中公开的氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括表3A和/或表3B中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括表3A和/或表3B中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括表4中公开的VH和/或VL，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、7355和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7354、201和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ IDNO:7354、7355和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:223、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7367、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:223、7368和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ IDNO:223、224和7369的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7367、7368和7369的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、223、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7354、201、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7351、253、250-252、254、7343、7344、7350和7352(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:258、255-257、259、260和7357-7360(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7351和258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:253和258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原(例如，包括TRBC1的T细胞受体、TRBC1、包括TRBC2的T细胞受体或TRBC2)结合的抗原结合结构域(例如，第一抗原结合结构域)包括表2、3、3A、3B、4、5或6的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列。在一些实施方案中，与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原(例如，包括TRBC1的T细胞受体、TRBC1、包括TRBC2的T细胞受体或TRBC2)结合的抗原结合结构域(例如，第一抗原结合结构域)包括表5的重链和/或轻链氨基酸序列。在一些实施方案中，选择性靶向表达包括TRBC1的T细胞受体、TRBC1、包括TRBC2的T细胞受体或TRBC2的淋巴细胞的抗原结合结构域(例如，第一抗原结合结构域)包括表2、3、3A、3B、4、5或6中公开的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列。在一些实施方案中，选择性靶向表达包括TRBC1的T细胞受体、TRBC1、包括TRBC2的T细胞受体或TRBC2的淋巴细胞的抗原结合结构域(例如，第一抗原结合结构域)包括表5的重链和/或轻链氨基酸序列。与包括TRBC1的肿瘤抗原结合或选择性靶向表达TRBC1的淋巴细胞的抗原结合结构域可被称为靶向TRBC1(即，靶向TRBC1的抗原结合结构域)。与包括TRBC2的肿瘤抗原结合或选择性靶向表达TRBC2的淋巴细胞的抗原结合结构域可被称为靶向TRBC2(即，靶向TRBC2的抗原结合结构域)。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:200的重链互补决定区1(VHCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:201的VHCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:202的VHCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，TRBC1抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:200的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:201的VHCDR2氨基酸序列和/或SEQ ID NO:202的VHCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:223的轻链互补决定区1(VLCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:224的VLCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:225的VLCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:223的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:224的VLCDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:225的VLCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:203的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:204的VHFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:205的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:206的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:226的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:227的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:228的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:229的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:203的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:204的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:205的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:206的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:226的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:227的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:228的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:229的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:207的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:208的VHFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:209的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:210的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:207的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ IDNO:208的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:209的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:210的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:211的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:212的VHFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:213的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:214的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:211的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:212的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:213的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:214的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:215的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:216的VHFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:217的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:218的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:215的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:216的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:217的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:218的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:219的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:220的VHFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:221的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:222的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:219的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:220的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:221的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:222的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:230的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:231的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:232的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:233的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:230的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:231的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:232的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:233的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:234的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:235的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:236的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:237的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:234的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:235的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:236的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:237的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:238的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:239的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:240的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:241的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:238的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:239的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:240的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:241的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:242的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:243的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:244的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:245的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:242的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:243的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:244的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:245的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:246的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:247的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:248的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:249的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:246的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:247的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:248的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:249的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:250的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:250具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:255的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:255具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:250的氨基酸序列。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:255的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:250的氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:255的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:251的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:251具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:251的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:252的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:252具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:252的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:253的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:253具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:253的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:254的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:254具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:254的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:256的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:256具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:256的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:257的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:257具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:257的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:258的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:258具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:258的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:259的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:259具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:259的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:260的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:260具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:260的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQ IDNO:6154的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6154具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQID NO:6154的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQ IDNO:6155的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6155具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQID NO:6155的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括轻链，所述轻链包括SEQ IDNO:6156的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6156具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括轻链，所述轻链包括SEQID NO:6156的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQ IDNO:6167的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6167具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQID NO:6167的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQ IDNO:6168的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6168具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链，所述重链包括SEQID NO:6168的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括轻链，所述轻链包括SEQ IDNO:6169的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6169具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括轻链，所述轻链包括SEQID NO:6169的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6154的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6154具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，所述轻链包括SEQ ID NO:6156的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6156具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6154的氨基酸序列，所述轻链包括SEQ ID NO:6156的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6155的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6155具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，所述轻链包括SEQ ID NO:6156的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6156具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6155的氨基酸序列，所述轻链包括SEQ ID NO:6156的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6167的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6167具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，所述轻链包括SEQ ID NO:6169的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6169具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6167的氨基酸序列，所述轻链包括SEQ ID NO:6169的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6168的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6168具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，所述轻链包括SEQ ID NO:6169的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6169具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向TRBC1的抗原结合结构域包括重链和轻链，所述重链包括SEQ ID NO:6168的氨基酸序列，所述轻链包括SEQ ID NO:6169的氨基酸序列。
表2.源自JOVI.1的TRBC1靶向抗原结合结构域的示例性重链CDR和FWR
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表6.源自JOVI.1的TRBC1靶向抗原结合结构域的示例性重链CDR和FWR(根据Kabat编号方案)
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表3.源自JOVI.1的TRBC1靶向抗原结合结构域的示例性轻链CDR和FWR
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表3A.靶向TRBC1的抗原结合结构域的示例性重链CDR和FWR
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表3B.靶向TRBC1的抗原结合结构域的示例性轻链CDR和FWR
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表4.靶向TRBC1的抗原结合结构域的示例性可变区
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表5.示例性靶向TRBC1的抗原结合结构域/抗体分子
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TRBC2抗原结合结构域
在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗原结合结构域包括表21或表22中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗原结合结构域包括表21或表22中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗原结合结构域包括表23中公开的VH和/或VL，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗原结合结构域包括表24中公开的氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201和7442的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7422、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7401、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ IDNO:7394、201和7396的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201和7398的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201和7400的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7405、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7407、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7427、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7430、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7443、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7410、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7409、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201、7442、7443、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7410、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7410、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7346、201、7398、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7427、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7394、201、7396、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7407、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428和7431(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7419和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7420和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7423和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7411和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7412和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7413和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7414和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7415和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7416和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7417和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7425和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7428和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7431和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQID NO:7420和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7423和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7411和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7412和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7413和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7414和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7415和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7416和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7417和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7425和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7428和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7431和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗原结合结构域包括选自SEQ ID NO:7433、7434、7435、7436和7437的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
表21.靶向TRBC2的抗原结合结构域的示例性重链CDR和FWR
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表22.靶向TRBC2的抗原结合结构域的示例性轻链CDR和FWR
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表23.靶向TRBC2的抗原结合结构域的示例性可变区
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表24.示例性靶向TRBC2的抗原结合结构域/抗体分子
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与TRBC1/TRBC2和NKp30结合的抗体分子
在一些实施方案中，本公开内容的特征在于与TRBC1和NKp30结合的多功能抗体分子。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括图29A-29D中任一个所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC1 Fab。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC1scFv。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗NKp30 Fab。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC1 Fab和抗NKp30 scFv，例如，包括图29A所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC1 Fab和抗NKp30 Fab，例如，包括图29B所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗NKp30 Fab和抗TRBC1 scFv，例如，包括图29C所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC1 scFv和抗NKp30 scFv，例如，包括图29D所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括本文公开的抗TRBC1抗原结合结构域，例如表2、3、3A、3B、4、5或6中公开的抗TRBC1抗原结合结构域。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括本文公开的抗NKp30抗原结合结构域，例如表7、8、8A、8B、9、10和18中公开的抗NKp30抗原结合结构域。
在一些实施方案中，与TRBC1和NKp30结合的示例性多功能抗体分子在表19中公开。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:7351的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:7302的抗NKp30 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ ID NO:7309的抗NKp30VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7351的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ ID NO:7311的抗NKp30 scFv(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7382、7380和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:253的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:7302的抗NKp30 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ ID NO:7309的抗NKp30VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:253的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ IDNO:7311的抗NKp30 scFv(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7379、7380和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:7351的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:7302的抗NKp30 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ ID NO:7305的抗NKp30VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7351的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ ID NO:7310的抗NKp30 scFv(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7382、7380和7384(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:253的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQ ID NO:7302的抗NKp30 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ ID NO:7305的抗NKp30VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:253的抗TRBC1 VH(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)、SEQID NO:258的抗TRBC1 VL(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)和SEQ IDNO:7310的抗NKp30 scFv(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，抗TRBC1/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7379、7380和7384(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
表19.与TRBC1和NKp30结合的示例性抗体分子
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在一些实施方案中，本公开内容的特征在于与TRBC2和NKp30结合的多功能抗体分子。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括图30A-30D中任一个所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC2 Fab。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC2scFv。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗NKp30 Fab。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 scFv，例如，包括图30A所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 Fab，例如，包括图30B所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗NKp30 Fab和抗TRBC2 scFv，例如，包括图30C所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括抗TRBC2 scFv和抗NKp30 scFv，例如，包括图30D所示的构型。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括本文公开的抗TRBC2抗原结合结构域，例如表21-24中公开的抗TRBC2抗原结合结构域。在一些实施方案中，多功能抗体分子包括本文公开的抗NKp30抗原结合结构域，例如表7、8、8A、8B、9、10和18中公开的抗NKp30抗原结合结构域。
在一些实施方案中，与TRBC2和NKp30结合的示例性多功能抗体分子在表25中公开。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7438、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7440、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7438、7439和7384(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能抗体分子包括SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，抗TRBC2/NKp30抗体分子包括SEQ ID NO:7440、7439和7384(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
表25.与TRBC2和NKp30结合的示例性抗体分子
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多功能抗体效应物功能和Fc变体
在一些实施方案中，本文公开的多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)包括Fc区，例如，如本文所述的Fc区。在一些实施方案中，Fc区是野生型Fc区，例如，野生型人Fc区。在一些实施方案中，Fc区包括变体，例如，在Fc区中包括至少一个氨基酸残基的添加、取代或缺失的Fc区，该添加、取代或缺失导致例如对至少一种Fc受体的亲和力降低或消除。
抗体的Fc区与许多受体或配体(包括Fc受体(例如，FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIIA)、补体蛋白C1q和其他分子(诸如蛋白A和G))相互作用。这些相互作用对于包括以下各项的各种效应物功能和下游信号传导事件至关重要：抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)、抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)和补体依赖性细胞毒性(CDC)。
在一些实施方案中，包括变体Fc区的多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)对Fc受体(例如，本文所述的Fc受体)的亲和力已降低，例如，消除。在一些实施方案中，降低的亲和力是与具有野生型Fc区的其他方面相似的抗体比较。
在一些实施方案中，包括变体Fc区的多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)具有一种或多种以下特性：(1)效应物功能降低(例如，ADCC、ADCP和/或CDC降低)；(2)与一种或多种Fc受体的结合降低；和/或(3)与C1q补体的结合降低。在一些实施方案中，特性(1)-(3)中任一项或全部的降低是与具有野生型Fc区的其他方面相似的抗体比较。
在一些实施方案中，包括变体Fc区的多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)对人Fc受体(例如，FcγR I、FcγR II和/或FcγR III)具有降低的亲和力。在一些实施方案中，包括变体Fc区的多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)包括人IgG1区或人IgG4区。
示例性Fc区变体在表20中提供并且还在Saunders O,(2019)Frontiers inImmunology；第10卷,第1296章中公开，其全部内容通过引用并入本文。
在一些实施方案中，多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)包括表20中公开的Fc区变体(例如，突变)中的任何一种或全部或任何组合。在一些实施方案中，多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)包括Asn297Ala(N297A)突变。在一些实施方案中，多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体分子或抗TRBC2/NKp30抗体分子)包括Leu234Ala/Leu235Ala(LALA)突变。
表20：示例性Fc修饰
靶向TRBC1的抗体分子
在另一方面，本公开内容的特征在于与TRBC1结合的抗体分子(例如，单克隆抗体分子)或其片段。
在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗体分子或其片段包括表2、表6或表3中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗体分子或其片段包括表2、表6或表3中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗体分子或其片段包括表4中公开的VH和/或VL，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗体分子或其片段包括表5中公开的氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，与TRBC1结合的抗体分子或其片段包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、7355和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7354、201和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ IDNO:7354、7355和202的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:223、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7367、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:223、7368和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ IDNO:223、224和7369的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7367、7368和7369的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、223、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7354、201、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、7367、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、7368和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、224和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、7367、7368和7369(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7351、253、250-252、254、7343、7344、7350和7352(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:258、255-257、259、260和7357-7360(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7351和258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:253和258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，抗体分子或其片段包括：
重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:215的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:216的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:217的VHFWR3氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:218的VHFWR4氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:238的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:239的VLFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:240的VLFWR3氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:241的VLFWR4氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。
在一些实施方案中，抗体分子或其片段包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:200的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:201的VHCDR2氨基酸序列和/或SEQ ID NO:202的VHCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗体分子或其片段包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:223的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:224的VLCDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:225的VLCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗体分子或其片段包括VH和/或VL，所述VH包括SEQ ID NO:253的氨基酸序列(或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，所述VL包括SEQ ID NO:258的氨基酸序列(或与其具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，抗体分子或其片段包括与SEQ ID NO:253和/或258基本上同源的VH和/或VL。
靶向TRBC2的抗体分子
在另一方面，本公开内容的特征在于与TRBC2结合的抗体分子(例如，单克隆抗体分子)或其片段。
在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子或其片段包括表21或表22中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子或其片段包括表21或表22中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子或其片段包括表23中公开的VH和/或VL，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子或其片段包括表24中公开的氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子或其片段包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201和7442的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7422、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7401、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ IDNO:7394、201和7396的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201和7398的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7346、201和7400的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7405、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7407、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7427、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7430、201和7403的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7443、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7410、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7409、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201、7442、7443、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7410、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7410、224和225的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7346、201、7398、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7427、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7410、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7394、201、7396、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ IDNO:7407、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7409、224和225(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428和7431(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7419和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7420和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7423和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7411和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7412和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7413和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7414和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7415和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7416和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7417和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7425和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7428和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7431和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQID NO:7420和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7423和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7411和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7412和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7413和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7414和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7415和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7416和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7417和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7425和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7428和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7431和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在另一方面，本公开内容的特征在于抗体分子，例如IgM抗体分子，其包括：(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)选择性结合的第一抗原结合结构域，和(ii)(例如，通过结合C1q)激活补体途径的补体激活结构域。在一些实施方案中，抗体分子(例如，IgM抗体分子)包括靶向TRBC1的抗原结合结构域。在一些实施方案中，抗体分子是IgM抗体分子，例如，其多聚化为四聚体、五聚体和/或六聚体并且能够激活补体途径。在一些实施方案中，IgM抗体分子包括靶向TRBC1的抗原结合结构域，其包括重链，所述重链包括SEQ ID NO:6173的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6173具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTGYVMHWVRQAPGQGLEWMGFINPYNDDIQSNERFRGRVTITSDKSTTTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGAGYNFDGAYRFFDFWGQGTLVTVSSGSASAPTLFPLVSCENSPSDTSSVAVGCLAQDFLPDSITFSWKYKNNSDISSTRGFPSVLRGGKYAATSQVLLPSKDVMQGTDEHVVCKVQHPNGNKEKNVPLPVIAELPPKVSVFVPPRDGFFGNPRKSKLICQATGFSPRQIQVSWLREGKQVGSGVTTDQVQAEAKESGPTTYKVTSTLTIKESDWLGQSMFTCRVDHRGLTFQQNASSMCVPDQDTAIRVFAIPPSFASIFLTKSTKLTCLVTDLTTYDSVTISWTRQNGEAVKTHTNISESHPNATFSAVGEASICEDDWNSGERFTCTVTHTDLPSPLKQTISRPKGVALHRPDVYLLPPAREQLNLRESATITCLVTGFSPADVFVQWMQRGQPLSPEKYVTSAPMPEPQAPGRYFAHSILTVSEEEWNTGETYTCVVAHEALPNRVTERTVDKSTGKPTLYNVSLVMSDTAGTCY(SEQ ID NO:6173)。
在一些实施方案中，IgM抗体分子包括靶向TRBC1的抗原结合结构域，其包括轻链，所述轻链包括SEQ ID NO:6174的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6174具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
MKNHLLFWGVLAVFIKAVHVKAQEDERIVLVDNKCKCARITSRIIRSSEDPNEDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTRFVYHLSDLCKKCDPTEVELDNQIVTATQSNICDEDSATETCYTYDRNKCYTAVVPLVYGGETKMVETALTPDACYPD(SEQ ID NO:6174)。
在一些实施方案中，IgM抗体分子包括靶向TRBC1的抗原结合结构域，其包括SEQID NO:6173和6174的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6173和6174具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)和本文例如在表3或4中提供的轻链序列的氨基酸序列。
在一些实施方案中，补体激活结构域包括能够结合C1q或被C1q结合的抗体分子的一部分，例如，IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD或IgE的一部分。在一些实施方案中，补体激活结构域包括Ch2、Ch3或Ch4结构域。
不希望受理论束缚，认为在靶细胞(例如，表达TRBC1或TRBC2的细胞，例如，表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞，例如，表达TRBC1或TRBC2的淋巴瘤细胞)附近的补体激活可诱导靶细胞死亡。在一些实施方案中，在本文所述的方法中使用抗体分子(例如，IgM抗体分子)或多功能分子诱导靶细胞的补体介导的细胞死亡。
在另一方面，本公开内容的特征在于与TRBC1和NKp30结合的多特异性抗体分子(例如，双特异性抗体分子)。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括一个或多个与TRBC1结合的部分，例如，一个或多个与TRBC1结合的Fab，例如，一个或两个与TRBC1结合的Fab。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括一个或多个与NKp30结合的部分，例如，一个或多个与NKp30结合的scFv，例如，一个或两个与NKp30结合的scFv。在一些实施方案中，与TRBC1结合的部分包括本文公开的抗TRBC1序列，例如，包括表2-5中公开的CDR、VH、VL、重链或轻链序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与NKp30结合的部分包括本文公开的抗NKp30序列，例如，包括表7、8、8A、8B、9、10中公开的CDR、VH、VL、重链或轻链序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括图1A所示的构型。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括抗TRBC1抗体分子和抗NKp30抗体分子，例如，包括两条重链和两条轻链的抗TRBC1抗体分子，以及与抗TRBC1抗体的一条重链的N末端融合的抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链形成异源二聚体，例如，经由杵臼结构突变形成异源二聚体。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链包括N297A突变。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链不包括N297A突变。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括第一链、第二链、第三链和第四链，其中第一链包括抗TRBC1轻链可变区(VL)和轻链恒定区(CL)；第二链包括抗NKp30 scFv、抗TRBC1重链可变区(VH)、CH1、CH2和CH3；第三链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3；并且第四链包括抗TRBC1 VL和CL。
在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括图1B所示的构型。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括抗TRBC1抗体分子和抗NKp30抗体分子。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括抗TRBC1 Fab、抗NKp30 scFv、和包括两条Fc链的Fc二聚体。在一些实施方案中，抗TRBC1 Fab重链的C末端与一条Fc链的N末端融合，并且抗NKp30 scFv与另一条Fc链的N末端融合。在一些实施方案中，两条Fc链形成异源二聚体，例如，经由杵臼结构突变形成异源二聚体。在一些实施方案中，两条Fc链包括N297A突变。在一些实施方案中，两条Fc链不包括N297A突变。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括第一链、第二链和第三链，其中第一链包括抗TRBC1 VL和CL；第二链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3；并且第三链包括抗NKp30 scFv、CH2和CH3。
在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括图1C所示的构型。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括抗TRBC1抗体分子和抗NKp30抗体分子，例如，包括两条重链和两条轻链的抗TRBC1抗体分子，以及分别与抗TRBC1抗体分子的两条轻链的C末端融合的两个抗NKp30scFv。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链形成同源二聚体。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链包括N297A突变。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链不包括N297A突变。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括第一链、第二链、第三链和第四链，其中第一链包括抗TRBC1 VL、CL和抗NKp30 scFv；第二链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3；第三链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3；并且第四链包括抗TRBC1 VL、CL和抗NKp30scFv。
在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括图1D所示的构型。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括抗TRBC1抗体分子和抗NKp30抗体分子，例如，包括两条重链和两条轻链的抗TRBC1抗体分子，以及分别与抗TRBC1抗体分子的两条重链的N末端融合的两个抗NKp30scFv。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链形成同源二聚体。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链包括N297A突变。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链不包括N297A突变。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括第一链、第二链、第三链和第四链，其中第一链包括抗TRBC1 VL和CL；第二链包括抗NKp30 scFv、抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3；第三链包括抗NKp30 scFv、抗TRBC1VH、CH1、CH2和CH3；并且第四链包括抗TRBC1 VL和CL。
在另一方面，本公开内容的特征在于包括与TRBC1和TRAIL分子(例如，三聚、二聚或单体TRAIL分子)结合的部分的抗体分子。在一些实施方案中，抗体分子包括一个或多个与TRBC1结合的部分，例如，一个或多个与TRBC1结合的Fab，例如，一个与TRBC1结合的Fab。在一些实施方案中，与TRBC1结合的部分包括本文公开的抗TRBC1序列，例如，包括表2-5中公开的CDR、VH、VL、重链或轻链序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，抗体分子包括TRAIL分子(例如，三聚、二聚或单体TRAIL分子)。在一些实施方案中，TRAIL的每个单体包括人TRAIL的氨基酸残基122-281，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，TRAIL的每个单体包括人TRAIL的氨基酸残基95-281，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，抗体分子包括图2A-2F所示的构型。在一些实施方案中，抗体分子包括与TRBC1和三聚、二聚或单体TRAIL分子结合的部分，例如，包括抗TRBC1 Fab、三聚、二聚或单体TRAIL分子，以及包括两条Fc链的Fc二聚体。在一些实施方案中，两条Fc链形成异源二聚体，例如，经由杵抓结构突变形成异源二聚体。在一些实施方案中，两条Fc链包括N297A突变。在一些实施方案中，两条Fc链不包括N297A突变。在一些实施方案中，抗TRBC1Fab的重链的C末端与一条Fc链的N末端融合。在一些实施方案中，三聚、二聚或单体TRAIL分子与另一Fc链的N末端融合。在一些实施方案中，抗体分子包括第一链、第二链和第三链。在一些实施方案中，第一链包括抗TRBC1 VL和CL，例如，包括SEQ ID NO:6169的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第二链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6167的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第三链包括三聚TRAIL分子、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6159或6162的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第三链包括二聚TRAIL分子、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6158或6161的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第三链包括单体TRAIL分子、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6157或6160的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。
在另一方面，本公开内容的特征在于与TRBC1和DR5结合的多特异性抗体分子(例如，双特异性抗体分子)。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括一个或多个与TRBC1结合的部分，例如，一个或多个与TRBC1结合的Fab，例如，一个与TRBC1结合的Fab。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括一个或多个与DR5结合的部分，例如，一个或多个与DR5结合的scFv，例如，一个或两个与DR5结合的scFv。在一些实施方案中，与TRBC1结合的部分包括本文公开的抗TRBC1序列，例如，包括表2-5中公开的CDR、VH、VL、重链或轻链序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与DR5结合的部分包括本文公开的抗DR5序列，例如，包括表11中公开的CDR、VH、VL、重链或轻链序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括图3A所示的构型。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括抗TRBC1 Fab、抗DR5 scFv、和包括两条Fc链的Fc二聚体。在一些实施方案中，两条Fc链形成异源二聚体，例如，经由杵抓结构突变形成异源二聚体。在一些实施方案中，两条Fc链包括N297A突变。在一些实施方案中，两条Fc链不包括N297A突变。在一些实施方案中，抗TRBC1 Fab的重链的C末端与一条Fc链的N末端融合。在一些实施方案中，抗DR5 scFv与另一条Fc链的N末端融合。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括第一链、第二链和第三链。在一些实施方案中，第一链包括抗TRBC1 VL和CL，例如，包括SEQ IDNO:6169的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第二链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6167的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第三链包括抗DR5 scFv、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6163的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括图3B所示的构型。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括抗TRBC1抗体分子和抗DR5抗体分子，例如，包括两条重链和两条轻链的抗TRBC1抗体分子，以及分别与抗TRBC1抗体的两条轻链的C末端融合的两个抗DR5scFv。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链包括N297A突变。在一些实施方案中，抗TRBC1抗体的两条重链不包括N297A突变。在一些实施方案中，多特异性抗体分子包括第一链、第二链、第三链和第四链。在一些实施方案中，第一链包括抗TRBC1 VL、CL和抗DR5scFv，例如，包括SEQ ID NO:6170的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第二链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6168的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第四链包括抗TRBC1 VH、CH1、CH2和CH3，例如，包括SEQ ID NO:6168的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第一链包括抗TRBC1 VL、CL和抗DR5 scFv，例如，包括SEQ ID NO:6170的氨基酸序列，或与其具有至少70％、80％、90％、95％或99％同一性的序列。
本文公开的抗体分子的用途包括但不限于本文公开的治疗癌症(例如，表达TRBC1的癌症)的方法；本文公开的鉴定、评价或选择需要治疗的对象(例如，确定对象是否具有表达TRBC1的癌细胞)的方法；以及实验室或诊断分析(例如，包括检测TRBC1或表达TRBC1的细胞的存在和/或水平的免疫测定)的方法。
细胞因子分子和细胞因子抑制剂分子
细胞因子通常是影响细胞活性的多肽，例如，通过信号转导途径影响细胞活性。因此，多特异性或多功能多肽的细胞因子是有用的并且可以与受体介导的信号传导相关联，该信号传导从细胞膜外传递信号以调节细胞内的应答。细胞因子是蛋白质信号传导化合物，该化合物是免疫应答的介质。它们控制许多不同的细胞功能，包括增殖、分化和细胞存活/凋亡；细胞因子还参与多种病理生理过程，包括病毒感染和自身免疫性疾病。细胞因子在各种刺激下由先天(单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞)和适应性(T细胞和B细胞)免疫系统的各种细胞合成。细胞因子可分为两类：促炎和抗炎。促炎细胞因子(包括IFNγ、IL-1、IL-6和TNF-α)主要源自先天免疫细胞和Th1细胞。抗炎细胞因子(包括IL-10、IL-4、IL-13和IL-5)由Th2免疫细胞合成。
本公开内容尤其提供了多特异性(例如，双特异性、三特异性、四特异性)或多功能分子，其包括(例如，经工程化为含有)一种或多种细胞因子分子，例如，免疫调节(例如，促炎)细胞因子及其变体，例如，功能变体。因此，在一些实施方案中，细胞因子分子是白介素或变体，例如，其功能变体。在一些实施方案中，白介素是促炎白介素。在一些实施方案中，白介素选自白介素-2(IL-2)、白介素-12(IL-12)、白介素-15(IL-15)、白介素-18(IL-18)、白介素-21(IL-21)、白介素-7(IL-7)或干扰素γ。在一些实施方案中，细胞因子分子是促炎细胞因子。
在某些实施方案中，细胞因子是单链细胞因子。在某些实施方案中，细胞因子是多链细胞因子(例如，细胞因子包括2条或更多条(例如，2条)多肽链。示例性多链细胞因子是IL-12。
有用的细胞因子的实例包括但不限于GM-CSF、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-21、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1β、TGF-β、TNF-α和TNFβ。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子是选自GM-CSF、IL-2、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-15、IL-21、IFN-α、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1β和TGF-β的细胞因子。在一个实施方案中，i多特异性或多功能多肽的细胞因子是选自IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IFN-α和IFN-γ的细胞因子。在某些实施方案中，细胞因子经突变以去除N-和/或O-糖基化位点。糖基化的消除增加了在重组生产中可获得的产品的同质性。
在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子是IL-2。在具体的实施方案中，IL-2细胞因子可以引发一种或多种选自以下的细胞应答：激活的T淋巴细胞的增殖、激活的T淋巴细胞的分化、细胞毒性T细胞(CTL)活性、激活的B细胞的增殖、激活的B细胞的分化、自然杀伤(NK)细胞的增殖、NK细胞的分化、激活的T细胞或NK细胞的细胞因子分泌，以及NK/淋巴细胞激活的杀伤(LAK)抗肿瘤细胞毒性。在另一个具体的实施方案中，IL-2细胞因子是对IL-2受体α亚基具有降低的结合亲和力的突变IL-2细胞因子。α亚基(也称为CD25)与β亚基和γ亚基(也分别称为CD122和CD132)一起形成异源三聚高亲和力IL-2受体，而仅由β亚基和γ亚基组成的二聚受体称为中等亲和力IL-2受体。如通过引用以其全文并入本文中的PCT专利申请号PCT/EP2012/051991中所述，与野生型IL-2多肽相比，与IL-2受体的α亚基结合降低的突变IL-2多肽在调节性T细胞中诱导IL-2信号传导的能力降低，在T细胞中诱导较少的激活诱导细胞死亡(AICD)，并且在体内具有降低的毒性特征。在根据本发明的多特异性或多功能多肽中使用这种毒性降低的细胞因子特别有利，由于存在Fc结构域而具有长血清半衰期。在一个实施方案中，根据本发明的多特异性或多功能多肽的突变IL-2细胞因子包括至少一个氨基酸突变，与非突变的IL-2细胞因子相比，该氨基酸突变降低或消除突变IL-2细胞因子对IL-2受体的α亚基(CD25)的亲和力但保留了突变IL-2细胞因子对中等亲和力IL-2受体(由IL-2受体的β亚基和γ亚基组成)的亲和力。在一个实施方案中，一个或多个氨基酸突变是氨基酸取代。在具体的实施方案中，突变IL-2细胞因子在选自对应于人IL-2的残基42、45和72的位置的一个、两个或三个位置处包括一个、两个或三个氨基酸取代。在更具体的实施方案中，突变IL-2细胞因子在对应于人IL-2的残基42、45和72的位置处包括三个氨基酸取代。在甚至更具体的实施方案中，突变IL-2细胞因子是包括氨基酸取代F42A、Y45A和L72G的人IL-2。在一个实施方案中，突变IL-2细胞因子在对应于人IL-2的位置3的位置处另外包括氨基酸突变，其消除IL-2的O-糖基化位点。特别地，所述另外的氨基酸突变是用丙氨酸残基替换苏氨酸残基的氨基酸取代。可用于本发明的特定突变IL-2细胞因子在对应于人IL-2的残基3、42、45和72的位置处包括四个氨基酸取代。具体的氨基酸取代是T3A、F42A、Y45A和L72G。如PCT专利申请号PCT/EP2012/051991和所附实施例中所证明的，所述四重突变IL-2多肽(IL-2qm)未表现出对CD25有可检测的结合，在T细胞中诱导细胞凋亡的能力降低，在T.sub.reg细胞中诱导IL-2信号传导的能力降低，并且体内毒性特征降低。然而，它保留了激活效应细胞中IL-2信号传导、诱导效应细胞增殖和生成IFN-γ作为NK细胞的次级细胞因子的能力。
根据以上实施方案中任一项的IL-2或突变IL-2细胞因子可以包括另外的突变，其进一步提供优势，诸如表达或稳定性增加。例如，位置125的半胱氨酸可以被中性氨基酸诸如丙氨酸替换，以避免形成二硫键桥接的IL-2二聚体。因此，在某些实施方案中，根据本发明的多特异性或多功能多肽的IL-2或突变IL-2细胞因子在对应于人IL-2的残基125的位置处包括另外的氨基酸突变。在一个实施方案中，所述另外的氨基酸突变是氨基酸取代481A。
在具体的实施方案中，多特异性或多功能多肽的IL-2细胞因子包括SEQ ID NO:7227的多肽序列[APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]。在另一个具体的实施方案中，多特异性或多功能多肽的IL-2胞因子包括SEQ ID NO:7228的多肽序列[APASSSTKKT QLQLEHLLLD LQMILNGINN YKNPKLTRMLTAKFAMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNGAQSKNFHL RPRDLISNIN VIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]。
在另一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子是IL-12。在具体的实施方案中，所述IL-12细胞因子是单链IL-12细胞因子。在甚至更具体的实施方案中，单链IL-12细胞因子包括7229的多肽序列[IWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGGSGGGGSGGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS]。在一个实施方案中，IL-12细胞因子可以引发选自以下的一种或多种细胞应答：NK细胞增殖、NK细胞分化、T细胞增殖和T细胞分化。
在另一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子是IL-10。在具体的实施方案中，所述IL-10细胞因子是单链IL-10细胞因子。在甚至更具体的实施方案中，单链IL-10细胞因子包括7230的多肽序列[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRNGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSSPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]。在另一个具体的实施方案中，IL-10细胞因子是单体IL-10细胞因子。在更具体的实施方案中，单体IL-10细胞因子包括7231的多肽序列[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENGGGSGGKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]。在一个实施方案中，IL-10细胞因子可以引发选自以下的一种或多种细胞应答：细胞因子分泌的抑制、抗原呈递细胞对抗原呈递的抑制、氧自由基释放的减少和T细胞增殖的抑制。根据本发明的其中细胞因子是IL-10的多特异性或多功能多肽特别可用于下调炎症，例如用于治疗炎性病症。
在另一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子是IL-15。在具体的实施方案中，所述IL-15细胞因子是对IL-15受体的α亚基具有降低的结合亲和力的突变IL-15细胞因子。不希望受理论束缚，与野生型IL-15多肽相比，与IL-15受体α亚基结合降低的突变IL-15多肽与全身的成纤维细胞结合的能力降低，导致药代动力学和毒性特征改善。使用毒性降低的细胞因子(诸如所述的突变IL-2和突变IL-15效应物部分)在根据本发明的多特异性或多功能多肽中特别有利，该多肽由于存在Fc结构域而具有较长的血清半衰期。在一个实施方案中，根据本发明的多特异性或多功能多肽的突变IL-15细胞因子包括至少一个氨基酸突变，与非突变的IL-15细胞因子相比，该突变降低或消除突变IL-15细胞因子对IL-15受体的α亚基的亲和力，但保留突变IL-15细胞因子对中等亲和力IL-15/IL-2受体(由IL-15/IL-2受体的β亚基和γ亚基组成)的亲和力。在一个实施方案中，氨基酸突变是氨基酸取代。在具体的实施方案中，突变IL-15细胞因子在对应于人IL-15的残基53的位置处包括氨基酸取代。在更具体的实施方案中，突变IL-15细胞因子是包括氨基酸取代E53A的人IL-15。在一个实施方案中，突变IL-15细胞因子在对应于人IL-15的位置79的位置处另外包括氨基酸突变，其消除IL-15的N-糖基化位点。特别地，所述另外的氨基酸突变是用丙氨酸残基替换天冬酰胺残基的氨基酸取代。在更具体的实施方案中，IL-15细胞因子包括7232的多肽序列[NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLASGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGAVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS]。在一个实施方案中，IL-15细胞因子可以引发选自以下的一种或多种细胞应答：激活的T淋巴细胞的增殖、激活的T淋巴细胞的分化、细胞毒性T细胞(CTL)活性、激活的B细胞的增殖、激活的B细胞的分化、自然杀伤(NK)细胞的增殖、NK细胞的分化、激活的T细胞或NK细胞的细胞因子分泌，以及NK/淋巴细胞激活的杀伤(LAK)抗肿瘤细胞毒性。
可用作多特异性或多功能多肽中的效应物部分的突变细胞因子分子可以使用本领域熟知的遗传或化学方法通过缺失、取代、插入或修饰来制备。遗传方法可包括编码DNA序列的位点特异性诱变、PCR、基因合成等。例如可以通过测序来验证正确的核苷酸变化。取代或插入可以涉及天然和非天然氨基酸残基。氨基酸修饰包括熟知的化学修饰方法，诸如添加或去除糖基化位点或碳水化合物附着等。
在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是GM-CSF。在具体的实施方案中，GM-CSF细胞因子可以引起粒细胞、单核细胞或树突状细胞的增殖和/或分化。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是IFN-α。在具体的实施方案中，IFN-α细胞因子可以引发选自以下的一种或多种细胞应答：抑制病毒感染细胞中的病毒复制，和上调主要组织相容性复合物I(MHC I)的表达。在另一个具体的实施方案中，IFN-α细胞因子可以抑制肿瘤细胞的增殖。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是IFNγ。在具体的实施方案中，IFN-γ细胞因子可以引发选自以下的一种或多种细胞应答：巨噬细胞活性增加、MHC分子表达增加和NK细胞活性增加。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是IL-7。在具体的实施方案中，IL-7细胞因子可以引起T和/或B淋巴细胞的增殖。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是IL-8。在具体的实施方案中，IL-8细胞因子可以引发中性粒细胞的趋化性。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是MIP-1α。在具体的实施方案中，MIP-1α细胞因子可以在单核细胞和T淋巴细胞中引发趋化性。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是MIP-1β。在具体的实施方案中，MIP-1β细胞因子可以在单核细胞和T淋巴细胞中引发趋化性。在一个实施方案中，多特异性或多功能多肽的细胞因子(特别是单链细胞因子)是TGF-β。在具体的实施方案中，TGF-β细胞因子可以引发选自以下的一种或多种细胞应答：单核细胞的趋化性、巨噬细胞的趋化性、激活的巨噬细胞中IL-1表达的上调、和激活的B细胞中IgA表达的上调。
在一个实施方案中，本发明的多特异性或多功能多肽与细胞因子受体结合的解离常数(KD)是对照细胞因子与细胞因子受体结合的解离常数的至少约1、1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5或10倍。在另一个实施方案中，多特异性或多功能多肽与细胞因子受体结合的KD是包括两个或更多个效应物部分的相应多特异性或多功能多肽与细胞因子受体结合的KD的至少2、3、4、5、6、7、8、9或10倍。在另一个实施方案中，多特异性或多功能多肽与细胞因子受体结合的解离常数KD是包括两种或更多种细胞因子的相应多特异性或多功能多肽与细胞因子受体结合的解离常数的约10倍。
在一些实施方案中，本文公开的多特异性分子包括细胞因子分子。在实施方案中，细胞因子分子包括细胞因子的全长、片段或变体；细胞因子受体结构域，例如，细胞因子受体二聚化结构域；或细胞因子受体的激动剂，例如，细胞因子受体的抗体分子(例如，激动性抗体)。
在一些实施方案中，细胞因子分子选自IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-7、IL-21或干扰素γ，或其片段或变体，或任何上述细胞因子的组合。细胞因子分子可以是单体或二聚体。在实施方案中，细胞因子分子可以进一步包含细胞因子受体二聚结构域。
在其他实施方案中，细胞因子分子是细胞因子受体的激动剂，例如，针对选自IL-15Ra或IL-21R的细胞因子受体的抗体分子(例如，激动性抗体)。
在一个实施方案中，细胞因子分子是IL-15，例如，人IL-15(例如，包括氨基酸序列：NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(SEQ ID NO:7017)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7017的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代。
在一些实施方案中，细胞因子分子包括受体二聚化结构域，例如，IL15Rα二聚化结构域。在一个实施方案中，IL15Rα二聚化结构域包括氨基酸序列：MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVL(SEQ ID NO:7018)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7018的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。在一些实施方案中，多特异性分子的细胞因子分子(例如，IL-15)和受体二聚化结构域(例如，IL15Rα二聚化结构域)共价连接，例如，经由接头(例如，Gly-Ser接头，例如，包括氨基酸序列SGGSGGGGSGGGSGGGGSLQ(SEQ ID NO:7019)的接头共价连接。在其他实施方案中，多特异性分子的细胞因子分子(例如，IL-15)和受体二聚化结构域(例如，IL15Rα二聚化结构域)不是共价连接的，例如，是非共价缔合的。
在其他实施方案中，细胞因子分子是IL-2，例如，人IL-2(例如，包括氨基酸序列：APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(SEQ ID NO:7020)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7020的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代))。
在其他实施方案中，细胞因子分子是IL-18，例如，人IL-18(例如，包括氨基酸序列：YFGKLESKLSVIRNLNDQVLFIDQGNRPLFEDMTDSDCRDNAPRTIFIISMYKDSQPRGMAVTISVKCEKISTLSCENKIISFKEMNPPDNIKDTKSDIIFFQRSVPGHDNKMQFESSSYEGYFLACEKERDLFKLILKKEDELGDRSIMFTVQNED(SEQ ID NO:7021)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7021的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代))。
在其他实施方案中，细胞因子分子是IL-21，例如，人IL-21(例如，包括以下氨基酸序列：QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS(SEQ ID NO:7022)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7022的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代))。
在其他实施方案中，细胞因子分子是干扰素γ，例如，人干扰素γ(例如，包括氨基酸序列：QDPYVKEAENLKKYFNAGHSDVADNGTLFLGILKNWKEESDRKIMQSQIVSFYFKLFKNFKDDQSIQKSVETIKEDMNVKFFNSNKKKRDDFEKLTNYSVTDLNVQRKAIHELIQVMAELSPAAKTGKRKRSQMLFRG(SEQ IDNO:7023)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7023的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代))。
TGF-β抑制剂
本公开内容尤其进一步提供了多特异性(例如，双特异性、三特异性、四特异性)或多功能分子，其包括(例如，经工程化为含有)一种或多种细胞因子抑制剂分子，例如，免疫调节(例如，促炎)细胞因子的抑制剂及其变体，例如，功能变体。因此，在一些实施方案中，细胞因子抑制剂分子是TGF-β抑制剂。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂结合并抑制TGF-β，例如，降低TGF-β的活性。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂抑制TGF-β1(例如，降低其活性)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂抑制TGF-β2(例如，降低其活性)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂抑制TGF-β3(例如，降低其活性)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂抑制TGF-β1和TGF-β3(例如，降低其活性)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂抑制TGF-β1、TGF-β2和TGF-β3(例如，降低其活性)。
在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括能够抑制TGF-β(例如，降低其活性)的TGF-β受体的部分(例如，TGF-β受体的胞外结构域)，或其功能片段或变体。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR1多肽(例如，TGFBR1的胞外结构域或其功能变体)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR2多肽(例如，TGFBR2的胞外结构域或其功能变体)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR3多肽(例如，TGFBR3的胞外结构域或其功能变体)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR1多肽(例如，TGFBR1的胞外结构域或其功能变体)和TGFBR2多肽(例如，TGFBR2的胞外结构域或其功能变体)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR1多肽(例如，TGFBR1的胞外结构域或其功能变体)和TGFBR3多肽(例如，TGFBR3的胞外结构域或其功能变体)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR2多肽(例如，TGFBR2的胞外结构域或其功能变体)和TGFBR3多肽(例如，TGFBR的胞外结构域或其功能变体)。
可用作TGF-β抑制剂的示例性TGF-β受体多肽已在US8993524、US9676863、US8658135、US20150056199、US20070184052和WO2017037634中公开，其全部内容通过引用并入本文。
在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR1的胞外结构域或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:95的胞外结构域，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:96的胞外结构域，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:97的胞外结构域，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:104的氨基酸序列，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQID NO:105的氨基酸序列，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。
在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR2的胞外结构域或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:98的胞外结构域，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:99的胞外结构域，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:100的氨基酸序列，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:101的氨基酸序列，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQID NO:102的氨基酸序列，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:103的氨基酸序列，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。
在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括TGFBR3的胞外结构域或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:106的胞外结构域，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:107的胞外结构域，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括SEQ ID NO:108的氨基酸序列，或与其基本相同的序列(例如，与其具有至少80％、85％、90％或95％同一性的序列)。
在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括不超过一个TGF-β受体胞外结构域。在一些实施方案中，TGF-β抑制剂包括例如经由接头连接在一起的两个或更多个(例如，两个、三个、四个、五个或更多个)TGF-β受体胞外结构域。
表16.TGF-β多肽或TGF-β受体多肽的示例性氨基酸序列
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免疫细胞衔接物(Engager)
本文公开的多特异性或多功能分子的免疫细胞衔接物可以介导与免疫细胞(例如，免疫效应细胞)的结合和/或激活免疫细胞。在一些实施方案中，免疫细胞选自T细胞、NK细胞、B细胞、树突状细胞或巨噬细胞衔接物，或其组合。在一些实施方案中，免疫细胞衔接物选自T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物中的一种、两种、三种或全部，或其组合。免疫细胞衔接物可以是免疫系统的激动剂。在一些实施方案中，免疫细胞衔接物可以是抗体分子、配体分子(例如，进一步包括免疫球蛋白恒定区(例如，Fc区)的配体)、小分子、核苷酸分子。
自然杀伤细胞衔接物
自然杀伤(NK)细胞以独立于抗体的方式识别和破坏肿瘤和病毒感染的细胞。NK细胞的调节是通过激活和抑制NK细胞表面的受体来介导的。激活受体的一个家族是自然细胞毒性受体(NCR)，其包括NKp30、NKp44和NKp46。NCR通过识别癌细胞上的硫酸乙酰肝素来启动肿瘤靶向。NKG2D是一种受体，在激活的杀伤(NK)细胞上提供刺激性和共刺激性先天免疫应答，从而导致细胞毒活性。DNAM1是参与细胞毒性T淋巴细胞(CTL)和NK细胞介导的细胞间粘附、淋巴细胞信号传导、细胞毒性和淋巴因子分泌的受体。DAP10(也称为HCST)是一种跨膜衔接蛋白，与KLRK1缔合形成淋巴样细胞和髓样细胞中的激活受体KLRK1-HCST；该受体在触发针对表达细胞表面配体(诸如MHC I类链相关的MICA和MICB)和U(任选地L1)6-结合蛋白(ULBP)的靶细胞的细胞毒性中起主要作用；它KLRK1-HCST受体在针对肿瘤的免疫监视中起作用，并且是肿瘤细胞的细胞溶解所必需的；实际上，不表达KLRK1配体的黑色素瘤细胞逃脱了NK细胞介导的免疫监视。CD16是IgG的Fc区的受体，其结合复合或聚集的IgG以及单体IgG，从而介导抗体依赖性的细胞毒性(ADCC)和其他抗体依赖性应答，诸如吞噬作用。
本公开内容尤其提供了多特异性(例如，双特异性，三特异性，四特异性)或多功能分子，其被工程化为含有一个或多个介导与NK细胞结合和/或激活NK细胞的NK细胞衔接物。因此，在一些实施方案中，NK细胞衔接物选自结合(例如激活)以下的抗原结合结构域或配体：NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例如，CD16a、CD16b或两者)、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(也称为SLAMF4或2B4)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E或CD160。
在一些实施方案中，NK细胞衔接物是与NKp30(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的NKp30)结合的抗原结合结构域并且包括表7、8、8A、8B、9或10中公开的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列。在一些实施方案中，NK细胞衔接物是与NKp30(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的NKp30)结合的抗原结合结构域并且包括美国专利号6,979,546、美国专利号9,447,185、PCT申请号WO2015121383A1、PCT申请号WO2016110468A1、PCT申请号WO2004056392A1或美国申请公开号US20070231322A1中公开的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列，其序列通过引用并入本文。在一些实施方案中，NK细胞衔接物(例如，与NKp30结合的抗原结合结构域)与NK细胞的结合激活NK细胞。与NKp30(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的NKp30)结合的抗原结合结构域可被称为靶向NKp30、NK细胞或两者。
在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括表7、表18或表8中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括表7、表18或表8中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括表9中公开的VH和/VL或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括表10中公开的氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，与NKP30结合的抗原结合结构域包括表8A和/或表8B中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与NKP30结合的抗原结合结构域包括表8A和/或表8B中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与NKP30结合的抗原结合结构域包括表9中公开的VH和/或VL或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、6001和7315的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、6001和6002的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、6008和6009的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ IDNO:7313、7385和7315的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、7318和6009的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:C019、C021和C023的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:C033、C035和C037的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:C047、C049和C051的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:C061、C063和C065的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:C075、C077和C079的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:C089、C091和C093的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:C103、C105和C107的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ IDNO:C116、C118和C120的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7326、7327和7329的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:6063、6064和7293的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:6070、6071和6072的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ IDNO:6070、6064和7321的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C026、C028和C030的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C040、C042和C044的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C054、C056C058的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C068、C070和C072的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C082、C084和C086的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C096、C098和C100的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C110、C112和C113的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C123、C125和C127的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、6001、7315、7326、7327和7329的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、6001、6002、6063、6064和7293的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、6008、6009、6070、6071和6072的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、7385、7315、6070、6064和7321的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7313、7318、6009、6070、6064和7321的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ IDNO:C019、C021、C023、C026、C028和C030的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C033、C035、C037、C040、C042和C044的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C047、C049、C051、C054、C056和C058的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C061、C063、C065、C068、C070和C072的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C075、C077、C079、C082、C084和C086的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ IDNO:C089、C091、C093、C096、C098和C100的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C103、C105、C107、C110、C112和C113的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:C116、C118、C120、C123、C125和C127的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7298或7300-7304(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7299或7305-7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7302和7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7302和7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6121或6123-6128(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7294或6137-6141(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6122或6129-6134(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6136或6142-6147(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7295和7296的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:7297和7296的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VH和VL分别包括SEQ ID NO:6122和6136的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括SEQ ID NO:7310的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括SEQ ID NO:7311的氨基酸序列(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，与NKp30结合的抗原结合结构域包括SEQ ID NO:6187、6188、6189或6190(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6000的重链互补决定区1(VHCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6001的VHCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6002的VLCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，NKp30抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6000的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6001的VHCDR2氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6002的VHCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6063的轻链互补决定区1(VLCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6064的VLCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:7293的VLCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6063的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6064的VLCDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:7293的VLCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6000的重链互补决定区1(VHCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6001的VHCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6002的VHCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)，所述VL包括SEQ ID NO:6063的轻链互补决定区1(VLCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6064的VLCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:7293的VLCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，NKp30抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ ID NO:6000的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6001的VHCDR2氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6002的VHCDR3氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6063的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6064的VLCDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:7293的VLCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6007的重链互补决定区1(VHCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6008的VHCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6009的VLCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，NKp30抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6007的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6008的VHCDR2氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6009的VHCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6070的轻链互补决定区1(VLCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6071的VLCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6072的VLCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6070的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6071的VLCDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:6072的VLCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6007的重链互补决定区1(VHCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6008的VHCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6009的VHCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)，所述VL包括SEQ ID NO:6070的轻链互补决定区1(VLCDR1)氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6071的VLCDR2氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6072的VLCDR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3或4个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。在一些实施方案中，NKp30抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ ID NO:6007的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6008的VHCDR2氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6009的VHCDR3氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6070的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:6071的VLCDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:6072的VLCDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6003的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6004的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6005的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6006的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6066的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6067的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:7292的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6069的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6003的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6004的VHFWR2氨基酸序列、SEQID NO:6005的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6006的VHFWR4氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6066的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6067的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:7292的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6069的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6003的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6004的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6005的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6006的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6066的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6067的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:7292的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6069的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6003的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6004的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6005的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6006的VHFWR4氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6066的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6067的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:7292的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6069的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6010的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6011的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6012的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6013的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6073的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6074的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6075的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6076的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6010的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6011的VHFWR2氨基酸序列、SEQID NO:6012的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6013的VHFWR4氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6073的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6074的VLFWR2氨基酸序列、SEQ ID NO:6075的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6076的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6010的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6011的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6012的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6013的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6073的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6074的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6075的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6076的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6010的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6011的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6012的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6013的VHFWR4氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6073的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6074的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6075的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6076的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6014的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6015的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6016的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6017的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6014的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6015的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6016的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6017的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6077的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6078的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6079的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6080的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6077的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6078的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6079的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6080的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6018的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6019的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6020的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6021的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6018的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6019的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6020的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6021的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6081的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6082的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6083的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6084的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6081的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6082的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6083的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6084的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6022的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6023的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6024的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6025的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6022的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6023的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6024的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6025的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6085的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6086的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6087的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6088的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6085的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6086的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6087的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6088的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6026的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6027的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6028的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6029的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6026的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6027的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6028的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6029的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6089的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6090的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6091的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6092的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6089的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6090的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6091的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6092的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6030的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6032的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6033的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6034的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6030的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6032的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6033的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6034的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6093的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6094的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6095的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6096的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6093的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6094的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6095的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6096的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6035的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6036的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6037的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6038的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6035的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6036的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6037的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6038的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6039的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6040的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6041的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6042的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6039的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6040的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6041的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6042的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6097的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6098的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6099的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6100的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6097的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6098的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6099的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6100的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6043的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6044的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6045的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6046的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6043的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6044的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6045的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6046的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6101的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6102的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6103的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6104的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6101的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6102的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6103的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6104的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6047的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6048的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6049的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6050的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6047的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6048的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6049的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6050的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6105的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6106的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6107的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6108的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6105的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6106的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6107的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6108的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6051的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6052的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6053的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6054的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6051的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6052的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6053的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6054的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6109的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6110的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6111的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6112的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6109的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6110的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6111的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6112的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6055的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6056的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6057的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6058的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6055的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6056的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6057的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6058的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6113的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6114的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6115的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6116的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6113的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6114的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6115的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6116的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6059的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6060的VHFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6061的VHFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6062的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6059的VHFWR1氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6060的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6061的VHFWR3氨基酸序列(或具有不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6062的VHFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6117的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列、SEQ ID NO:6118的VLFWR2氨基酸序列、SEQ IDNO:6119的VLFWR3氨基酸序列和/或SEQ ID NO:6120的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6117的VLFWR1氨基酸序列(或具有不超过1、2或3个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6118的VLFWR2氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:6119的VLFWR3氨基酸序列(或具有不超过1个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)和/或SEQ ID NO:6120的VLFWR4氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6148的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6148具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6149的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6149具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6150的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6150具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6148的氨基酸序列。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6149的氨基酸序列。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6150的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6148的氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6150的氨基酸序列。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ ID NO:6149的氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6150的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6151的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6151具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6152的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6152具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6153的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6153具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6151的氨基酸序列。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6152的氨基酸序列。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6153的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ IDNO:6151的氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6153的氨基酸序列。在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括SEQ ID NO:6152的氨基酸序列，所述VL包括SEQ ID NO:6153的氨基酸序列。
在一些实施方案中，靶向NKp30的抗原结合结构域包括scFv。在一些实施方案中，scFv包括选自SEQ ID NO:6187-6190的氨基酸序列，或与其具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
表7.靶向NKp30的抗原结合结构域的示例性重链CDR和FWR
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表18.靶向NKp30的抗原结合结构域的示例性重链CDR和FWR(根据Kabat编号方案)
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表8.靶向NKp30的抗原结合结构域的示例性轻链CDR和FWR
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表8A.靶向NKp30的抗原结合结构域的示例性重链CDR和FWR
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表8B.靶向NKp30的抗原结合结构域的示例性轻链CDR和FWR
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表9.靶向NKp30的抗原结合结构域的示例性可变区
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表10.示例性靶向NKp30的抗原结合结构域/抗体分子
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在一些实施方案中，NK细胞衔接物是与NKp46(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的NKp46)结合的抗原结合结构域并且包括表15中公开的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列。在一些实施方案中，NK细胞衔接物(例如，与NKp46结合的抗原结合结构域)与NK细胞的结合激活NK细胞。与NKp46(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的NKp46)结合的抗原结合结构域可被称为靶向NKp46、NK细胞或两者。
在一些实施方案中，NK细胞衔接物是与NKG2D(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的NKG2D)结合的抗原结合结构域并且包括表15中公开的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列。在一些实施方案中，NK细胞衔接物(例如，与NKG2D结合的抗原结合结构域)与NK细胞的结合激活NK细胞。与NKG2D(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的NKG2D)结合的抗原结合结构域可被称为靶向NKG2D、NK细胞或两者。
在一些实施方案中，NK细胞衔接物是与CD16(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的CD16)结合的抗原结合结构域并且包括表15中公开的任何CDR氨基酸序列、框架区(FWR)氨基酸序列或可变区氨基酸序列。在一些实施方案中，NK细胞衔接物(例如，与CD16结合的抗原结合结构域)与NK细胞的结合激活NK细胞。与CD16(例如，在NK细胞的表面存在(例如，表达或展示)的CD16)结合的抗原结合结构域可被称为靶向CD16、NK细胞或两者。
表15.靶向NKp46、NKG2D或CD16的抗原结合结构域的示例性可变区
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在一个实施方案中，NK细胞衔接物是NKp30的配体，例如是B7-6，例如包括以下氨基酸序列DLKVEMMAGGTQITPLNDNVTIFCNIFYSQPLNITSMGITWFWKSLTFDKEVKVFEFFGDHQEAFRPGAIVSPWRLKSGDASLRLPGIQLEEAGEYRCEVVVTPLKAQGTVQLEVVASPASRLLLDQVGMKENEDKYMCESSGFYPEAINITWEKQTQKFPHPIEISEDVITGPTIKNMDGTFNVTSCLKLNSSQEDPGTVYQCVVRHASLHTPLRSNFTLTAARHSLSETEKTDNFS(SEQ ID NO:7233)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7233的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是NKp44或NKp46的配体，即病毒HA。病毒血凝素(HA)是病毒表面的糖蛋白。HA蛋白允许病毒经由唾液酸糖部分与细胞膜结合，所述膜有助于病毒膜与细胞膜融合(参见例如，Eur J Immunol.2001年9月；31(9):2680-9“Recognition of viral hemagglutinins by NKp44 but not by NKp30”；和Nature.2001年2月22日；409(6823):1055-60“Recognition of haemagglutinins on virus-infectedcells by NKp46 activates lysis by human NK cells”，其各自的内容均通过引用并入本文)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是选自MICA、MICB或ULBP1的NKG2D配体，例如，其中：
(i)MICA包括氨基酸序列：EPHSLRYNLTVLSWDGSVQSGFLTEVHLDGQPFLRCDRQKCRAKPQGQWAEDVLGNKTWDRETRDLTGNGKDLRMTLAHIKDQKEGLHSLQEIRVCEIHEDNSTRSSQHFYYDGELFLSQNLETKEWTMPQSSRAQTLAMNVRNFLKEDAMKTKTHYHAMHADCLQELRRYLKSGVVLRRTVPPMVNVTRSEASEGNITVTCRASGFYPWNITLSWRQDGVSLSHDTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRICQGEEQRFTCYMEHSGNHSTHPVPSGKVLVLQSHW(SEQ ID NO:7234)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7324的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)；
(ii)MICB包括氨基酸序列：AEPHSLRYNLMVLSQDESVQSGFLAEGHLDGQPFLRYDRQKRRAKPQGQWAEDVLGAKTWDTETEDLTENGQDLRRTLTHIKDQKGGLHSLQEIRVCEIHEDSSTRGSRHFYYDGELFLSQNLETQESTVPQSSRAQTLAMNVTNFWKEDAMKTKTHYRAMQADCLQKLQRYLKSGVAIRRTVPPMVNVTCSEVSEGNITVTCRASSFYPRNITLTWRQDGVSLSHNTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRIRQGEEQRFTCYMEHSGNHGTHPVPSGKVLVLQSQRTD(SEQ ID NO:7235)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7235的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如取代、缺失或插入，例如保守取代)；或者
(iii)ULBP1包括氨基酸序列：GWVDTHCLCYDFIITPKSRPEPQWCE VQGLVDERPFLHYDCVNHKAKAFASLGKKVNVTKTWEEQTETLRDVVDFLKGQLLDIQVENLIPIEPLTLQARMSCEHEAHGHGRGSWQFLFNGQKFLLFDSNNRKWTALHPGAKKMTEKWEKNRDVTMFFQKISLGDCKMWLEEFLMYWEQMLDPTKPPSLAPG(SEQID NO:7236)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7236的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是选自NECTIN2或NECL5的DNAM1配体，例如，其中：
(i)NECTIN2包括氨基酸序列：QDVRVQVLPEVRGQLGGTVELPCHLLPPVPGLYISLVTWQRPDAPANHQNVAAFHPKMGPSFPSPKPGSERLSFVSAKQSTGQDTEAELQDATLALHGLTVEDEGNYTCEFATFPKGSVRGMTWLRVIAKPKNQAEAQKVTFSQDPTTVALCISKEGRPPARISWLSSLDWEAKETQVSGTLAGTVTVTSRFTLVPSGRADGVTVTCKVEHESFEEPALIPVTLSVRYPPEVSISGYDDNWYLGRTDATLSCDVRSNPEPTGYDWSTTSGTFPTSAVAQGSQLVIHAVDSLFNTTFVCTVTNAVGMGRAEQVIFVRETPNTAGAGATGG(SEQ ID NO:7237)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7237的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)；或者
(ii)NECL5包括氨基酸序列：WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(SEQ ID NO:7238)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7238的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是DAP10的配体，即NKG2D的衔接子(参见例如，Proc Natl Acad Sci U S A.2005年5月24日；102(21):7641–7646；和Blood,2011年9月15日，第118卷，第11期，其各自的全部内容通过引用并入本文)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是CD16的配体，即CD16a/b配体，例如，进一步包括抗体Fc区的CD16a/b配体(参见例如，Front Immunol.2013；4:讨论了抗体如何使用Fc通过CD16触发NK细胞，其全部内容并入本文)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是CRTAM的配体，即NECL2，例如，其中NECL2包括氨基酸序列：QNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTTILTIITDSRAGEEGSIRAVDH(SEQ ID NO:7239)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7239的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是CD27的配体，即CD70，例如，其中CD70包括氨基酸序列：QRFAQAQQQLPLESLGWDVAELQLNHTGPQQDPRLYWQGGPALGRSFLHGPELDKGQLRIHRDGIYMVHIQVTLAICSSTTASRHHPTTLAVGICSPASRSISLLRLSFHQGCTIASQRLTPLARGDTLCTNLTGTLLPSRNTDETFFGVQWVRP(SEQ ID NO:7240)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7240的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是PSGL1的配体，即L-选择素(CD62L)，例如，其中L-选择素包括氨基酸序列：WTYHYSEKPMNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSGHGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSCSEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTFICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYN(SEQ ID NO:7241)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7241的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是CD96的配体，即NECL5，例如，其中NECL5包括氨基酸序列：WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(SEQ ID NO:7238)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7238的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是CD100(SEMA4D)的配体，即CD72，例如，其中CD72包括氨基酸序列：RYLQVSQQLQQTNRVLEVTNSSLRQQLRLKITQLGQSAEDLQGSRRELAQSQEALQVEQRAHQAAEGQLQACQADRQKTKETLQSEEQQRRALEQKLSNMENRLKPFFTCGSADTCCPSGWIMHQKSCFYISLTSKNWQESQKQCETLSSKLATFSEIYPQSHSYYFLNSLLPNGGSGNSYWTGLSSNKDWKLTDDTQRTRTYAQSSKCNKVHKTWSWWTLESESCRSSLPYICEMTAFRFPD(SEQ ID NO:7242)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7242的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是NKp80的配体，即CLEC2B(AICL)，例如，其中CLEC2B(AICL)包括氨基酸序列：KLTRDSQSLCPYDWIGFQNKCYYFSKEEGDWNSSKYNCSTQHADLTIIDNIEEMNFLRRYKCSSDHWIGLKMAKNRTGQWVDGATFTKSFGMRGSEGCAYLSDDGAATARCYTERKWICRKRIH(SEQ ID NO:7243)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7243的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，NK细胞衔接物是CD244的配体，即CD48，例如，其中CD48包括氨基酸序列：QGHLVHMTVVSGSNVTLNISESLPENYKQLTWFYTFDQKIVEWDSRKSKYFESKFKGRVRLDPQSGALYISKVQKEDNSTYIMRVLKKTGNEQEWKIKLQVLDPVPKPVIKIEKIEDMDDNCYLKLSCVIPGESVNYTWYGDKRPFPKELQNSVLETTLMPHNYSRCYTCQVSNSVSSKNGTVCLSPPCTLARS(SEQ ID NO:7244)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7244的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在一些实施方案中，NK细胞衔接物是病毒血凝素(HA)，HA是在流感病毒表面上发现的糖蛋白。它负责使病毒与膜上带有唾液酸的细胞，诸如上呼吸道中的细胞或红细胞结合。HA具有至少18种不同的抗原。这些亚型被命名为H1至H18。NCR可以识别病毒蛋白。已经证明NKp46能够与流感的HA和副粘病毒(包括仙台病毒和新城疫病毒)的HA-NA相互作用。除了NKp46，NKp44也可以在功能上与不同流感亚型的HA相互作用。
死亡受体信号衔接物
死亡受体(例如，死亡受体4和5(DR4和DR5，也分别称为TRAIL-R1和TRAIL-R2))是在正常人体组织中广泛表达的三聚I型跨膜蛋白。死亡受体的激活导致细胞内信号传导，该细胞内信号传导诱导细胞死亡。TNF相关凋亡诱导配体(TRAIL)(也称为Apo2L)是三聚蛋白，其与死亡受体结合，激活死亡受体的细胞死亡诱导信号传导(Amarante-Mendes和Griffith.Pharmacol Ther.2015年11月；155:117-31)。
本公开内容尤其提供了多特异性(例如，双特异性、三特异性、四特异性)或多功能分子，其经工程化以含有一种或多种死亡受体信号衔接物，所述死亡受体信号衔接物在靶细胞(例如，肿瘤抗原呈递细胞(例如，癌细胞，例如，淋巴瘤细胞)，或表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞)上介导与死亡受体的结合和/或死亡受体信号传导的激活。因此，在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括一种或多种TRAIL多肽或其片段(TRAIL分子)、一种或多种死亡受体或其片段(死亡受体分子)或一种或多种特异性结合死亡受体(例如，并激活死亡受体信号传导)的抗原结合结构域。不希望受理论束缚，认为可以激活靶细胞上的死亡受体信号传导的死亡受体信号衔接物可以诱导靶细胞(例如，靶疾病细胞，例如，靶癌细胞)的死亡。
死亡受体信号衔接物可以包括来自或衍生于本领域技术人员已知的TRAIL和死亡受体变化形式的TRAIL分子和/或死亡受体分子。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括人TRAIL分子或死亡受体分子。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括小鼠TRAIL分子或死亡受体分子。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括哺乳动物TRAIL分子或死亡受体分子。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括(例如，相对于野生型的TRAIL分子或死亡受体分子)截短的TRAIL分子或死亡受体分子。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括至少包括与人TRAIL的氨基酸95-281对应的残基的截短的TRAIL分子，例如，包括与人TRAIL的氨基酸95-281对应的残基的截短的TRAIL分子。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括截短的TRAIL分子，其包括人TRAIL的95-281的残基。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括至少包括与人TRAIL的氨基酸122-281对应的残基的截短的TRAIL分子，例如，包括与人TRAIL的氨基酸122-281对应的残基的截短的TRAIL分子。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括截短的TRAIL分子，其包括人TRAIL的122-281的残基。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括一个、两个或三个TRAIL分子(例如，死亡受体信号衔接物分别是单体、二聚或三聚TRAIL分子)。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括一个、两个或三个死亡受体分子(例如，死亡受体信号衔接物分别是单体、二聚或三聚死亡受体分子)。在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括与死亡受体(例如，一个或多个死亡受体，例如，相同或不同的死亡受体)特异性结合的一个、两个或三个抗原结合结构域。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括选自表11的氨基酸序列(或与选自表11的序列具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6157的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6157具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6158的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6158具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6159的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6159具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6160的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6160具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6161的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6161具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6162的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6162具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6163的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6163具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6164的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6164具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6165的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6165具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，死亡受体信号衔接物包括在与本公开内容的多功能分子的另一组分相同的多肽链上，例如，死亡受体信号衔接物包括在与优先结合淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原(其中肿瘤抗原是T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2))的第一抗原结合结构域的重链和/或轻链、选择性靶向表达T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)的淋巴细胞的第一抗原结合结构域的重链和/或轻链、免疫细胞衔接物、细胞因子分子或间质修饰部分相同的多肽链上，例如，作为融合蛋白。在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和第一抗原结合结构域的轻链，该第一抗原结合结构域优先结合淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原，其中肿瘤抗原是T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)。在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和第一抗原结合结构域的轻链，该第一抗原结合结构域选择性靶向表达T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)的淋巴细胞。
在一些实施方案中，包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链的融合蛋白包括SEQ ID NO:6170的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6170具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链的融合蛋白包括SEQ ID NO:6171的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6171具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链的融合蛋白包括SEQ ID NO:6172的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6172具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链以及靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的重链，该轻链包括SEQ ID NO:6170的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6170具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，该重链包括SEQ ID NO:6167的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6167具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链以及靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的重链，该轻链包括SEQ ID NO:6170的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6170具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，该重链包括SEQ ID NO:6168的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6168具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链以及靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的重链，该轻链包括SEQ ID NO:6171的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6171具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，该重链包括SEQ ID NO:6167的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6167具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链以及靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的重链，该轻链包括SEQ ID NO:6171的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6171具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，该重链包括SEQ ID NO:6168的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6168具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链以及靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的重链，该轻链包括SEQ ID NO:6172的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6172具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，该重链包括SEQ ID NO:6167的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6167具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。在一些实施方案中，多功能分子包括融合蛋白，该融合蛋白包括死亡受体信号衔接物和靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的轻链以及靶向TRBC1的第一抗原结合结构域的重链，该轻链包括SEQ ID NO:6172的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6172具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)，该重链包括SEQ ID NO:6168的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6168具有至少约77％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
表11.示例性死亡受体信号衔接物
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T细胞衔接物
本公开内容尤其提供了多特异性(例如，双、三、四特异性)或多功能分子，其被工程化以含有介导与T细胞结合和/或激活T细胞的一个或多个T细胞衔接物。因此，在一些实施方案中，T细胞衔接物选自结合(并且例如在一些实施方案中进行激活)以下中的一种或多种的抗原结合结构域或配体：CD3、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-4BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2或CD226。在其他实施方案中，T细胞衔接物选自结合但不激活以下中的一种或多种的抗原结合结构域或配体：CD3、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-4BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2或CD226。
TCRβV抗原结合结构域
在一些实施方案中，T细胞衔接物是结合(例如，并且在一些实施方案中激活)TCRβ的抗原结合结构域(例如，抗体分子或其片段)。本公开内容尤其提供了结合(例如，特异性结合)人TCRβV链(TCRβV)的抗体分子及其片段，该人TCRβV链(TCRβV)是例如TCRβV基因家族，例如TCRβV亚家族，例如如本文所述的TCRβV亚家族。TCRβV家族和亚家族是本领域已知的，例如，如Yassai等人，(2009)Immunogenetics 61(7)第493-502页；Wei S和ConcannonP.(1994)Human Immunology 41(3)第201-206页所述。本文所述的抗体可以是重组抗体，例如，重组非鼠抗体，例如，重组人或人源化抗体。在本公开内容中，TCRβV和TCRBV可互换使用。
在一些实施方案中，本公开内容提供了包括与人TCRβV(例如，TCRβV家族，例如，基因家族)结合的抗TCRβV抗体分子的T细胞衔接物。在一些实施方案中，TCRBV基因家族包括一个或多个亚家族，例如，如本文所述的亚家族，例如，在图6中的亚家族。在一些实施方案中，TCRβV基因家族包括亚家族，该亚家族包括：TCRβV6亚家族、TCRβV10亚家族、TCRβV12亚家族、TCRβV5亚家族、TCRβV7亚家族、TCRβV11亚家族、TCRβV14亚家族、TCRβV16亚家族、TCRβV18亚家族、TCRβV9亚家族、TCRβV13亚家族、TCRβV4亚家族、TCRβV3亚家族、TCRβV2亚家族、TCRβV15亚家族、TCRβV30亚家族、TCRβV19亚家族、TCRβV27亚家族、TCRβV28亚家族、TCRβV24亚家族、TCRβV20亚家族、TCRβV25亚家族或TCRβV29亚家族。
在一些实施方案中，TCRβV6亚家族也称为TCRβV13.1。在一些实施方案中，TCRβV6亚家族包括：TCRβV6-4*01、TCRβV6-4*02、TCRβV6-9*01、TCRβV6-8*01、TCRβV6-5*01、TCRβV6-6*02、TCRβV6-6*01、TCRβV6-2*01、TCRβV6-3*01或TCRβV6-1*01。在一些实施方案中，TCRβV6包括TCRβV6-5*01。在一些实施方案中，TCRβV6(例如，TCRβV6-5*01)由SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2识别(例如，结合)。在一些实施方案中，TCRβV6(例如，TCRβV6-5*01)由SEQID NO:9和/或SEQ ID NO:10识别(例如，结合)。在一些实施方案中，TCRβV6由SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:11识别(例如，结合)。
在一些实施方案中，TCRβV10亚家族也称为TCRβV12。在一些实施方案中，TCRβV10亚家族包括：TCRβV10-1*01、TCRβV10-1*02、TCRβV10-3*01或TCRβV10-2*01。
在一些实施方案中，TCRβV12亚家族也称为TCRβV8.1。在一些实施方案中，TCRβV12亚家族包括：TCRβV12-4*01、TCRβV12-3*01或TCRβV12-5*01。在一些实施方案中，TCRβV12由SEQ ID NO:15和/或SEQ ID NO:16识别(例如，结合)。在一些实施方案中，TCRβV12由SEQ IDNO 23-25中的任一个和/或SEQ ID NO:26-30中的任一个识别(例如，结合)。
在一些实施方案中，TCRβV5亚家族选自：TCRβV5-5*01、TCRβV5-6*01、TCRβV5-4*01、TCRβV5-8*01、TCRβV5-1*01。
在一些实施方案中，TCRβV7亚家族包括TCRβV7-7*01、TCRβV7-6*01、TCRβV7 -8*02、TCRβV7 -4*01、TCRβV7-2*02、TCRβV7-2*03、TCRβV7-2*01、TCRβV7-3*01、TCRβV7-9*03或TCRβV7-9*01。
在一些实施方案中，TCRβV11亚家族包括：TCRβV11-1*01、TCRβV11-2*01或TCRβV11-3*01。
在一些实施方案中，TCRβV14亚家族包括TCRβV14*01。
在一些实施方案中，TCRβV16亚家族包括TCRβV16*01。
在一些实施方案中，TCRβV18亚家族包括TCRβV18*01。
在一些实施方案中，TCRβV9亚家族包括TCRβV9*01或TCRβV9*02。
在一些实施方案中，TCRβV13亚家族包括TCRβV13*01。
在一些实施方案中，TCRβV4亚家族包括TCRβV4-2*01、TCRβV4-3*01或TCRβV4-1*01。
在一些实施方案中，TCRβV3亚家族包括TCRβV3-1*01。
在一些实施方案中，TCRβV2亚家族包括TCRβV2*01。
在一些实施方案中，TCRβV15亚家族包括TCRβV15*01。
在一些实施方案中，TCRβV30亚家族包括TCRβV30*01或TCRβV30*02。
在一些实施方案中，TCRβV19亚家族包括TCRβV19*01或TCRβV19*02。
在一些实施方案中，TCRβV27亚家族包括TCRβV27*01。
在一些实施方案中，TCRβV28亚家族包括TCRβV28*01。
在一些实施方案中，TCRβV24亚家族包括TCRβV24-1*01。
在一些实施方案中，TCRβV20亚家族包括TCRβV20-1*01或TCRβV20-1*02。
在一些实施方案中，TCRβV25亚家族包括TCRβV25-1*01。
在一些实施方案中，TCRβV29亚家族包括TCRβV29-1*01。
表12：TCRβV亚家族和亚家族成员列表
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抗TCRβV抗体
在一方面，本公开内容提供了一种抗TCRβV抗体分子，其与人TCRβV(例如，TCRβV基因家族，例如，TCRβV亚家族中的一个或多个，例如，如本文所述的TCRβV亚家族，例如，在图6中的TCRβV亚家族)结合。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与选自以下的一个或多个TCRβV亚家族结合：TCRβV6亚家族、TCRβV10亚家族、TCRβV12亚家族、TCRβV5亚家族、TCRβV7亚家族、TCRβV11亚家族、TCRβV14亚家族、TCRβV16亚家族、TCRβV18亚家族、TCRβV9亚家族、TCRβV13亚家族、TCRβV4亚家族、TCRβV3亚家族、TCRβV2亚家族、TCRβV15亚家族、TCRβV30亚家族、TCRβV19亚家族、TCRβV27亚家族、TCRβV28亚家族、TCRβV24亚家族、TCRβV20亚家族、TCRβV25亚家族或TCRβV29亚家族。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与TCRβV6亚家族结合，该亚家族包括：TCRβV6-4*01、TCRβV6-4*02、TCRβV6-9*01、TCRβV6-8*01、TCRβV6-5*01、TCRβV6-6*02、TCRβV6-6*01、TCRβV6-2*01、TCRβV6-3*01或TCRβV6-1*01。在一些实施方案中，TCRβV6亚家族包括TCRβV6-5*01。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与TCRβV10亚家族结合，该亚家族包括：TCRβV10-1*01、TCRβV10-1*02、TCRβV10-3*01或TCRβV10-2*01。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与TCRβV12亚家族结合，该亚家族包括：TCRβV12-4*01、TCRβV12-3*01或TCRβV12-5*01。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与TCRβV5亚家族结合，该亚家族包括：TCRβV5-5*01、TCRβV5-6*01、TCRβV5-4*01、TCRβV5-8*01、TCRβV5-1*01。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子不与TCRβV12结合，或与TCRβV12结合的亲和力和/或结合特异性与美国专利5,861,155中所述的16G8鼠抗体或其人源化形式的亲和力和/或结合特异性相比较小(例如，小约10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或为约1/2、1/5或1/10)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与TCRβV12结合的亲和力和/或结合特异性与美国专利5,861,155中所述的16G8鼠抗体或其人源化形式的亲和力和/或结合特异性相比较大(例如，大约10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或为约2、5或10倍)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与除TCRβV12以外的TCRβV区(例如，如本文所述的TCRβV区，例如，TCRβV6亚家族(例如，TCRβV6-5*01))的亲和力和/或结合特异性与美国专利5,861,155中所述的16G8鼠抗体或其人源化形式的亲和力和/或结合特异性相比较大(例如，大约10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或为约2、5或10倍)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子不与TCRβV5-5*01或TCRβV5-1*01结合，或与TCRβV5-5*01或TCRβV5-1*01结合的亲和力和/或结合特异性与美国专利5,861,155中所述的TM23鼠抗体或其人源化形式的亲和力和/或结合特异性相比较小(例如，小约10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或为约1/2、1/5或1/10)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与TCRβV5-5*01或TCRβV5-1*01结合的亲和力和/或结合特异性与美国专利5,861,155中所述的TM23鼠抗体或其人源化形式的亲和力和/或结合特异性相比较大(例如，大约10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或为约2、5或10倍)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子与除TCRβV5-5*01或TCRβV5-1*01以外的TCRβV区(例如，如本文所述的TCRβV区，例如，TCRβV6亚家族(例如，TCRβV6-5*01))的亲和力和/或结合特异性与美国专利5,861,155中所述的TM23鼠抗体或其人源化形式的亲和力和/或结合特异性相比较大(例如，大约10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或为约2、5或10倍)。
抗TCRβV6抗体
因此，在一方面，本公开内容提供了与人TCRβV6(例如，TCRβV6亚家族)结合的抗TCRβV抗体分子，该TCRβV6亚家族包括：TCRβV6-4*01、TCRβV6-4*02、TCRβV6-9*01、TCRβV6-8*01、TCRβV6-5*01、TCRβV6-6*02、TCRβV6-6*01、TCRβV6-2*01、TCRβV6-3*01或TCRβV6-1*01。在一些实施方案中，TCRβV6亚家族包括TCRβV6-5*01。
在一些实施方案中，TCRβV6-5*01由SEQ ID NO:43的核酸序列，或与其具有85％、90％、95％、99％或更高同一性的序列编码。
SEQ ID NO:43
ATGAGCATCGGCCTCCTGTGCTGTGCAGCCTTGTCTCTCCTGTGGGCAGGTCCAGTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCCAAAATTCCAGGTCCTGAAGACAGGACAGAGCATGACACTGCAGTGTGCCCAGGATATGAACCATGAATACATGTCCTGGTATCGACAAGACCCAGGCATGGGGCTGAGGCTGATTCATTACTCAGTTGGTGCTGGTATCACTGACCAAGGAGAAGTCCCCAATGGCTACAATGTCTCCAGATCAACCACAGAGGATTTCCCGCTCAGGCTGCTGTCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCAGCAGTTACTC
在一些实施方案中，TCRβV6-5*01包括SEQ ID NO:44的氨基酸序列，或与其具有85％、90％、95％、99％或更高同一性的氨基酸序列。
SEQ ID NO:44
MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSY
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是非鼠抗体分子，例如人或人源化抗体分子。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是人抗体分子。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是人源化抗体分子。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是分离的或重组的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的至少一个抗原结合区，例如可变区或其抗原结合片段。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高多)的序列)的至少一个、两个、三个或四个可变区。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的至少一个或两个重链可变区。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的至少一个或两个轻链可变区。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括IgG4(例如，人IgG4)的重链恒定区。在又一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括IgG1(例如，人IgG1)的重链恒定区。在一个实施方案中，重链恒定区包括表17中列出的氨基序列或与其基本上相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括κ轻链恒定区，例如人κ轻链恒定区。在一个实施方案中，轻链恒定区包括表17中列出的氨基序列或与其基本上相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链可变区的至少一个、两个或三个互补决定区(CDR)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自包括表13所示氨基酸序列或由表13所示核苷酸序列编码的氨基酸序列的重链可变区的至少一个、两个或三个CDR(或全体所有CDR)。在一个实施方案中，相对于表13中所示的氨基酸序列或由表13中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，一个或多个CDR(或全体所有CDR)具有一个、两个或三个、四个、五个、六个或更多个改变，例如氨基酸取代或缺失。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的轻链可变区的至少一个、两个或三个互补决定区(CDR)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自包括表13所示氨基酸序列或由表13所示核苷酸序列编码的氨基酸序列的轻链可变区的至少一个、两个或三个CDR(或全体所有CDR)。在一个实施方案中，相对于表13中所示的氨基酸序列或由表13中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，一个或多个CDR(或全体所有CDR)具有一个、两个或三个、四个、五个、六个或更多个改变，例如氨基酸取代或缺失。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括来自包括表13所示氨基酸序列或由表13所示核苷酸序列编码的氨基酸序列的重链和轻链可变区的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(或全体所有CDR)。在一个实施方案中，相对于表13中所示的氨基酸序列或由表13中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，一个或多个CDR(或全体所有CDR)具有一个、两个或三个、四个、五个、六个或更多个改变，例如氨基酸取代或缺失。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体)的所有六个CDR，或密切相关的CDR，例如相同CDR或具有至少一个氨基酸改变但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的CDR。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)可以包括本文所述的任何CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链可变区的根据Kabat等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，表13所列的根据Kabat定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表13中所示的根据Kabat等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的轻链可变区的根据Kabat等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，表13所列的根据Kabat定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表13中所示的根据Kabat等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Kabat等人的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(例如，表13所列的根据Kabat定义的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR)；或相对于表13中所示的根据Kabat等人的一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Kabat等人的所有六个CDR(例如，表13所列的根据Kabat定义的所有六个CDR)；或相对于表13中所示的根据Kabat等人的所有六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的所有六个CDR。在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)可以包括本文所述的任何CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括至少一个、两个或三个具有与本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体)的相应高变环相同的规范结构的高变环，例如与本文所述抗体的重链和/或轻链可变结构域的至少环1和/或环2具有相同的规范结构。高变环规范结构的描述参见例如Chothia等人，(1992)J.Mol.Biol.227:799-817；Tomlinson等人，(1992)J.Mol.Biol.227:776-798。这些结构可以通过查看这些参考文献中描述的表来确定。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链可变区的根据Chothia等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，表13所列的根据Chothia定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表13中所示的根据Chothia等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的轻链可变区的根据Chothia等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，表13所列的根据Chothia定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表13中所示的根据Chothia等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Chothia等人的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(例如，表13所列的根据Chothia定义的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR)；或相对于表13中所示的根据Chothia等人的一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子包括来自本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或表13中所述的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体，或由表13中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Chothia等人的所有六个CDR(例如，表13所列的根据Chothia定义的所有六个CDR)；或相对于表13中所示的根据Chothia等人的所有六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的所有六个CDR。在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)可以包括本文所述的任何CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)分子包括根据Kabat等人、Chothia等人定义或如表13所述的CDR或高变环的组合。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)可含有根据Kabat和Chothia定义的CDR或高变环的任何组合。
在一些实施方案中，如表13列出的组合的CDR是包括Kabat CDR和Chothia CDR的CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)分子包括被鉴定为表13中的组合CDR的CDR或高变环的组合。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)可含有根据表13中所述的“组合”CDR的CDR或高变环的任何组合。
在一个实施方案中，例如在包括可变区、CDR(例如，组合的CDR、Chothia CDR或Kabat CDR)或本文在例如表13中提及的其他序列的实施方案中，抗体分子是单特异性抗体分子、双特异性抗体分子、二价抗体分子、双互补位(biparatopic)抗体分子，或包括抗体的抗原结合片段(例如，半抗体或半抗体的抗原结合片段)的抗体分子。在某些实施方案中，抗体分子包括多特异性分子，例如双特异性分子，例如，如本文所述的双特异性分子。
在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:11的轻链互补决定区1(LC CDR1)、轻链互补决定区2(LC CDR2)和轻链互补决定区3(LC CDR3)中的一个、两个或全部，和/或
(ii)SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:9的重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3)中的一个、两个或全部。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括SEQ ID NO:2的LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3，以及SEQ ID NO:1的HC CDR1、HCCDR2和HC CDR3。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括SEQ ID NO:10的LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3，以及SEQ ID NO:9的HC CDR1、HCCDR2和HC CDR3。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括SEQ ID NO:11的LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3，以及SEQ ID NO:9的HC CDR1、HCCDR2和HC CDR3。
在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:6的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:7的LC CDR2氨基酸序列或SEQID NO:8的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)SEQ ID NO:3的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:4的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:5的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
(i)轻链可变区(VL)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:6的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:7的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:8的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)重链可变区(VH)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:3的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:4的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:5的HC CDR3氨基酸序列。
在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:51的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:52的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:53的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)SEQ ID NO:45的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:46的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:47的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
(i)轻链可变区(VL)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:51的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:52的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:53的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)重链可变区(VH)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:45的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:46的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:47的HC CDR3氨基酸序列。
在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:54的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:55的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:56的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)SEQ ID NO:48的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:49的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:50的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
(i)轻链可变区(VL)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:54的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:55的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:56的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)重链可变区(VH)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:48的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:49的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:50的HC CDR3氨基酸序列。
在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)的轻链或重链可变框架(例如，涵盖至少FR1、FR2、FR3和任选地FR4的区域)可以选自：(a)轻链或重链可变框架，其包括至少80％、85％、87％、90％、92％、93％、95％、97％、98％或100％的来自人轻链或重链可变框架的氨基酸残基，例如来自人成熟抗体、人种系序列或人共有序列的轻链或重链可变框架残基；(b)轻链或重链可变框架，其包括20％至80％、40％至60％、60％至90％或70％至95％的来自人轻链或重链可变框架的氨基酸残基，例如来自人成熟抗体、人种系序列或人共有序列的轻链或重链可变框架残基；(c)非人框架(例如，啮齿动物框架)；或(d)已被修饰以例如去除抗原或细胞毒性决定簇的非人框架，例如去免疫或部分人源化的非人框架。在一个实施方案中，轻链或重链可变框架区(特别是FR1、FR2和/或FR3)包括与人种系基因的VL或VH区段的框架至少70％、75％、80％、85％、87％、88％、90％、92％、94％、95％、96％、97％、98％、99％相同或相同的轻链或重链可变框架序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括重链可变结构域，其相对于BHM1709或BHM1710的氨基酸序列，.g.整个可变区(例如，图4A所示的区域)中的FR区的氨基酸序列，或在SEQ ID NO:9中的氨基酸序列具有至少一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、十个、十五个、二十个或更多个改变(例如，氨基酸取代或缺失)。
可替代地，或与本文所述的重链取代组合，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括轻链可变结构域，其相对于BHM1709或BHM1710的氨基酸序列，例如整个可变区(例如，图4B所示)中的FR区的氨基酸序列，或在SEQ ID NO:10或SEQID NO:11中的氨基酸序列具有至少一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、十个、十五个、二十个或更多个改变(例如，氨基酸取代或缺失)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括如图4A所示的一个、两个、三个或四个重链框架区，或与其基本上相同的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括如图4B所示的一个、两个、三个或四个轻链框架区，或与其基本上相同的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的轻链框架区1，例如示于图4B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的轻链框架区2，例如示于图4B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的轻链框架区3，例如示于图4B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的轻链框架区4，例如示于图4B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括轻链可变结构域，其包括框架区，例如框架区1(FR1)，所述框架区包括改变，例如根据Kabat编号在位置10处的取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，FR1在位置10处包括苯丙氨酸，例如丝氨酸至苯丙氨酸取代。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括轻链可变结构域，其包括框架区，例如框架区2(FR2)，所述框架区包括改变，例如根据Kabat编号在本文公开的位置处的取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，FR2在位置36处包括组氨酸，例如根据Kabat编号在位置36处的取代，例如酪氨酸至组氨酸的取代。在一些实施方案中，FR2在位置46处包括丙氨酸，例如根据Kabat编号在位置46处的取代，例如精氨酸至丙氨酸的取代。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括轻链可变结构域，其包括框架区，例如框架区3(FR3)，所述框架区包括改变，例如根据Kabat编号在本文公开的位置处的取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，FR3在位置87处包括苯丙氨酸，例如根据Kabat编号在位置87处的取代，例如酪氨酸至苯丙氨酸的取代。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包括：(a)框架区1(FR1)，其在位置10处包括苯丙氨酸，例如根据Kabat编号在位置10处的取代，例如丝氨酸至苯丙氨酸取代；(b)框架区2(FR2)，其在位置36处包括组氨酸，例如根据Kabat编号在位置36处的取代，例如酪氨酸至组氨酸的取代，以及在位置46处包括丙氨酸，例如根据Kabat编号在位置46处的取代，例如精氨酸至丙氨酸的取代；和(c)框架区3(FR3)，其在位置87处包括苯丙氨酸，例如根据Kabat编号在位置87处的取代，例如酪氨酸至苯丙氨酸的取代，例如，如SEQ ID NO:10的氨基酸序列所示。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包括：(a)框架区2(FR2)，其在位置36处包括组氨酸，例如根据Kabat编号在位置36处的取代，例如酪氨酸至组氨酸取代，以及在位置46处包括丙氨酸，例如根据Kabat编号在位置46处的取代，例如精氨酸至丙氨酸的取代；和(b)框架区3(FR3)，其在位置87处包括苯丙氨酸，例如根据Kabat编号在位置87处的取代，例如酪氨酸至苯丙氨酸的取代，例如，如SEQ ID NO:11的氨基酸序列所示。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包括：(a)框架区1(FR1)，其包括根据Kabat编号在本文公开的一个或多个(例如，全部)位置处的改变，例如取代(例如，保守取代)；(b)框架区2(FR2)，其包括根据Kabat编号在本文公开的一个或多个(例如，全部)位置处的改变，例如取代(例如，保守取代)；以及(c)框架区3(FR3)，其包括根据Kabat编号在本文公开的一个或多个(例如，全部)位置处的改变，例如取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的重链框架区1，例如示于图4A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的重链框架区2，例如示于图4A
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的重链框架区3，例如示于图4A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的重链框架区4，例如示于图4A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括重链可变结构域，其包括框架区，例如框架区3(FR3)，所述框架区包括改变，例如根据Kabat编号在本文公开的位置处的取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，FR3在位置73处包括苏氨酸，例如根据Kabat编号在位置73处的取代，例如谷氨酸至苏氨酸的取代。在一些实施方案中，FR3在位置94处包括甘氨酸，例如根据Kabat编号在位置94处的取代，例如精氨酸至甘氨酸的取代。在一些实施方案中，取代是相对于人种系重链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括重链可变结构域，其包括框架区3(FR3)，所述框架区在位置73处包括苏氨酸，例如根据Kabat编号在位置73处的取代，例如谷氨酸至苏氨酸的取代，以及在位置94处包括甘氨酸，例如根据Kabat编号在位置94处的取代，例如精氨酸至甘氨酸的取代，例如，如SEQID NO:10的氨基酸序列所示。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709或BHM1710的重链框架区1-4，例如SEQ ID NO:9或如图4A和4B所示。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709的轻链框架区1-4，例如SEQ ID NO:10或如图4A和4B所示。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1710的轻链框架区1-4，例如SEQ ID NO:11或如图4A和4B所示。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1709的重链框架区1-4(例如SEQ ID NO:9)；和BHM1709的轻链框架区1-4(例如SEQ ID NO:10)或如图4A和4B所示。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括BHM1710的重链框架区1-4(例如SEQ ID NO:9)；和BHM1710的轻链框架区1-4(例如SEQ ID NO:11)或如图4A和4B所示。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子的重链或轻链可变结构域或两者包括氨基酸序列，其与本文公开的氨基酸基本相同，例如与本文所述抗体(例如，选自BHM1709或BHM1710的抗体，或如表13所述的抗体，或由表13的核苷酸序列编码的抗体)的可变区的同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高；或与本文所述抗体的可变区相差至少1或5个残基，但相差少于40、30、20或10个残基。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括至少一个、两个、三个或四个抗原结合区(例如，可变区)，该抗原结合区具有表13所列的氨基酸序列或与其基本相同的序列(例如，与其的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的序列，或与表13中所示序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基)。在另一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括由具有表13所列的核苷酸序列或与其基本相同的序列(例如，与其的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的序列，或与表13中所示序列相差不超过3、6、15、30或45个核苷酸)的核酸编码的VH和/或VL结构域。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:9的氨基酸序列、与SEQ ID NO:9的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:9的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和/或
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:10的氨基酸序列、与SEQ ID NO:10的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:10的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:9的氨基酸序列、与SEQ ID NO:9的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:9的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和/或
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:11的氨基酸序列、与SEQ ID NO:11的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:11的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是完整的抗体或其片段(例如，Fab、F(ab’)2、Fv或单链Fv片段(scFv))。在实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是单克隆抗体或具有单一特异性的抗体。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)也可以是人源化的、嵌合的、骆驼的、鲨鱼的或体外生成的抗体分子。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是人源化抗体分子。抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)的重链和轻链可以是全长的(例如，抗体可以包括至少一条并且优选两条完整的重链，以及至少一条并且优选两条完整的轻链)或可以包括抗原结合片段(例如，Fab、F(ab’)2、Fv、单链Fv片段、单结构域抗体、双抗体(dAb)、二价抗体，或双特异性抗体或其片段、其单结构域变体或骆驼抗体)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)为多特异性分子形式，例如双特异性分子形式，例如如本文所述的双特异性分子形式。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)具有选自例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD和IgE的重链恒定区的重链恒定区(Fc)。在一些实施方案中，Fc区选自IgG1、IgG2、IgG3和IgG4的重链恒定区。在一些实施方案中，Fc区选自IgG1或IgG2(例如，人IgG1或IgG2)的重链恒定区。在一些实施方案中，重链恒定区是人IgG1。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)具有选自例如κ或λ(优选κ(例如人κ))的轻链恒定区的轻链恒定区。在一个实施方案中，恒定区被改变(例如，突变)以修饰抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)的性质(例如，增加或减少以下一项或多项：Fc受体结合、抗体糖基化、半胱氨酸残基的数目、效应细胞功能或补体功能)。例如，相对于例如人IgG1，恒定区在位置296(M至Y)、298(S至T)、300(T至E)、477(H至K)和478(N至F)处发生突变，以改变Fc受体结合(例如，突变位置对应于SEQ ID NO:212或214的位置132(M至Y)、134(S至T)、136(T至E)、313(H至K)和314(N至F)；或SEQ ID NO:215、216、217或218的位置135(M至Y)、137(S至T)、139(T至E)、316(H至K)和317(N至F))。
表13：鼠、嵌合和人源化抗体分子的氨基酸和核苷酸序列。抗体分子包括鼠mAbH131和人源化mAb H131克隆BHM1709和BHM1710。显示了重链和轻链CDR的氨基酸，以及重链和轻链可变区及重链和轻链的氨基酸和核苷酸序列。
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抗TCRβV12抗体
因此，在一方面，本公开内容提供了与人TCRβV12(例如，TCRβV12亚家族)结合的抗TCRβV抗体分子，所述亚家族包括：TCRβV12-4*01、TCRβV12-3*01或TCRβV12-5*01。在一些实施方案中，TCRβV12亚家族包括TCRβV12-4*01。在一些实施方案中，TCRβV12亚家族包括TCRβV12-3*01。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)是非鼠抗体分子，例如人或人源化抗体分子。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)是人抗体分子。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)是人源化抗体分子。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)是分离的或重组的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的至少一个抗原结合区，例如可变区或其抗原结合片段。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的至少一个、两个、三个或四个可变区。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的至少一个或两个重链可变区。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的至少一个或两个轻链可变区。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括IgG4(例如，人IgG4)的重链恒定区。在又另一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括IgG1(例如，人IgG1)的重链恒定区。在一个实施方案中，重链恒定区包括表17中列出的氨基序列或与其基本上相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括κ轻链恒定区，例如人κ轻链恒定区。在一个实施方案中，轻链恒定区包括表17中列出的氨基序列或与其基本上相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链可变区的至少一个、两个或三个互补决定区(CDR)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自包括表14中所示的氨基酸序列，或由表14中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列的重链可变区的至少一个、两个或三个CDR(或全体所有CDR)。在一个实施方案中，相对于表14中所示的氨基酸序列或由表14中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，一个或多个CDR(或全体所有CDR)具有一个、两个或三个、四个、五个、六个或更多个改变，例如氨基酸取代或缺失。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的轻链可变区的至少一个、两个或三个互补决定区(CDR)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自包括表14中所示的氨基酸序列或由表14中所示核苷酸序列编码的氨基酸序列的轻链可变区的至少一个、两个或三个CDR(或全体所有CDR)。在一个实施方案中，相对于表14中所示的氨基酸序列或由表14中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，一个或多个CDR(或全体所有CDR)具有一个、两个或三个、四个、五个、六个或更多个改变，例如氨基酸取代或缺失。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自包括表14中所示的氨基酸序列或由表14中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列的重链和轻链可变区的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(或全体所有CDR)。在一个实施方案中，相对于表14中所示的氨基酸序列或由表14中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，一个或多个CDR(或全体所有CDR)具有一个、两个或三个、四个、五个、六个或更多个改变，例如氨基酸取代或缺失。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)分子包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体)的所有六个CDR，或密切相关的CDR，例如相同CDR或具有至少一个氨基酸改变但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的CDR。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)可以包括本文所述的任何CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，如表14中所述选择的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链可变区的根据Kabat等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，根据表14所列的Kabat定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表14中所示的根据Kabat等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的轻链可变区的根据Kabat等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，根据表14所列的Kabat定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表14中所示的根据Kabat等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Kabat等人的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(例如，根据表14所列的Kabat定义的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR)；或相对于表14中所示的根据Kabat等人的一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如，表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体；或由表14中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Kabat等人的所有六个CDR(例如，根据表14所列的Kabat定义的所有六个CDR)；或相对于表14中所示的根据Kabat等人的所有六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的所有六个CDR。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)可以包括本文所述的任何CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括至少一个、两个或三个具有与本文所述抗体(例如表14中所述的抗体)的相应高变环相同的规范结构的高变环，例如与本文所述抗体的重链和/或轻链可变结构域的至少环1和/或环2具有相同的规范结构。高变环规范结构的描述参见例如Chothia等人，(1992)J.Mol.Biol.227:799-817；Tomlinson等人，(1992)J.Mol.Biol.227:776-798。这些结构可以通过查看这些参考文献中描述的表来确定。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如表14中所述选择的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链可变区的根据Chothia等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，根据表14所列的Chothia定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表14中所示的根据Chothia等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如表14中所述的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的轻链可变区的根据Chothia等人的至少一个、两个或三个CDR(例如，根据表14所列的Chothia定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表14中所示的根据Chothia等人的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Chothia等人的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(例如，根据表14所列的Chothia定义的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR)；或相对于表14中所示的根据Chothia等人的一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包含来自本文所述抗体(例如表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体；或由表14中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据Chothia等人的所有六个CDR(例如，根据表14所列的Kabat定义的所有六个CDR)；或相对于表14中所示的根据Chothia等人的所有六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的所有六个CDR。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)可以包括本文所述的任何CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如表14中所述选择的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链可变区的根据组合的CDR的至少一个、两个或三个CDR(例如，根据表14所列的组合的CDR定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表14中所示的根据组合的CDR的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如表14中所述的抗体，或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的轻链可变区的根据组合的CDR的至少一个、两个或三个CDR(例如，根据表14所列的组合的CDR定义的至少一个、两个或三个CDR)；或相对于表14中所示的根据组合的CDR的一个、两个或三个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个或三个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体。(例如表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据组合的CDR的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(例如，根据表14所列的组合的CDR定义的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR)；或相对于表14中所示的根据组合的CDR的一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括来自本文所述抗体(例如表14中所述的抗体，或由表14中的核苷酸序列编码的抗体；或由表14中的核苷酸序列编码的抗体；或与前述序列中任一个基本相同(例如，同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高)的序列)的重链和轻链可变区的根据组合的CDR的所有六个CDR(例如，根据表14所列的组合的CDR定义的所有六个CDR)；或相对于表14中所示的根据组合的CDR的所有六个CDR具有至少一个氨基酸改变，但不超过两个、三个或四个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)的所有六个CDR。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)可以包括本文所述的任何CDR。
在一些实施方案中，如表13列出的组合的CDR是包括Kabat CDR和Chothia CDR的CDR。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(e例如，抗TCRβV12抗体分子)分子包括被鉴定为表13中的组合CDR的CDR或高变环的组合。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)可以含有根据表13中所述的“组合”CDR的CDR或高变环的任何组合。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括根据Kabat等人和Chothia等人定义的或如表13所述的CDR或高变环的组合
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)可以含有根据Kabat和Chothia定义的CDR或高变环的任何组合。
在一个实施方案中，例如在包括可变区、CDR(例如，组合的CDR、Chothia CDR或Kabat CDR)或本文在例如表14中提及的其他序列的实施方案中，抗体分子是单特异性抗体分子、双特异性抗体分子、二价抗体分子、双互补位抗体分子，或包括抗体的抗原结合片段(例如，半抗体或半抗体的抗原结合片段)的抗体分子。在某些实施方案中，抗体分子包括多特异性分子，例如双特异性分子，例如，如本文所述的双特异性分子。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:30的轻链互补决定区1(LC CDR1)、轻链互补决定区2(LC CDR2)和轻链互补决定区3(LC CDR3)中的一个、两个或全部，和/或
(ii)SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:25的重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3)中的一个、两个或全部。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:20的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:21的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:22的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)SEQ ID NO:17的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:18的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:19的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
(i)轻链可变区(VL)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:20的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:21的LC CDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:2的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)重链可变区(VH)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:17的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:18的HC CDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:19的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:63的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:64的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:65的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)SEQ ID NO:57的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:58的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:59的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
(i)轻链可变区(VL)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:63的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:64的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:65的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)重链可变区(VH)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:57的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:58的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:59的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
(i)SEQ ID NO:66的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:67的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:68的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)SEQ ID NO:60的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:61的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:62的HC CDR3氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
(i)轻链可变区(VL)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:63的LC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:64的LC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:65的LC CDR3氨基酸序列；和/或
(ii)重链可变区(VH)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:57的HC CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:58的HC CDR2氨基酸序列或SEQ ID NO:59的HC CDR3氨基酸序列。
在一个实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)的轻链或重链可变框架(例如，涵盖至少FR1、FR2、FR3和任选FR4的区域)可以选自：(a)轻链或重链可变框架，其包括至少80％、85％、87％、90％、92％、93％、95％、97％、98％或100％的来自人轻链或重链可变框架的氨基酸残基，例如来自人成熟抗体、人种系序列或人共有序列的轻链或重链可变框架残基；(b)轻链或重链可变框架，其包括20％至80％、40％至60％、60％至90％或70％至95％的来自人轻链或重链可变框架的氨基酸残基，例如来自人成熟抗体、人种系序列或人共有序列的轻链或重链可变框架残基；(c)非人框架(例如，啮齿动物框架)；或(d)已被修饰以例如去除抗原或细胞毒性决定簇的非人框架，例如去免疫或部分人源化的非人框架。在一个实施方案中，轻链或重链可变框架区(特别是FR1、FR2和/或FR3)包括与人种系基因的VL或VH区段的框架至少70％、75％、80％、85％、87％、88％、90％、92％、94％、95％、96％、97％、98％、99％相同或相同的轻链或重链可变框架序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括重链可变结构域，其相对于表14所述氨基酸序列，例如整个可变区(例如图5A和5B所示)中的FR区的氨基酸序列，或在SEQ ID NO:23-25中的氨基酸序列具有至少一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、十个、十五个、二十个或更多个改变(例如，氨基酸取代或缺失)。
可替代地，或与本文所述的重链取代组合，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链可变结构域，其相对于本文所述抗体的氨基酸序列，例如整个可变区(例如图5A和5B所示)中的FR区的氨基酸序列，或在SEQ ID NO:26-30中的氨基酸序列具有至少一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、十个、十五个、二十个或更多个氨基酸改变(例如，氨基酸取代或缺失)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括如图5A所示的一个、两个、三个或四个重链框架区，或与其基本上相同的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括如图5B所示的一个、两个、三个或四个轻链框架区，或与其基本上相同的序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链框架区1，例如示于图5B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链框架区2，例如示于图5B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链框架区3，例如示于图5B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链框架区4，例如示于图5B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区1(FR1)，所述框架区包括改变，例如根据Kabat编号在本文公开的一个或多个(例如，所有)位置处的取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，FR1在位置1处包括天冬氨酸，例如根据Kabat编号在位置1处的取代，例如丙氨酸至天冬氨酸取代。在一些实施方案中，FR1在位置2处包括天冬酰胺，例如根据Kabat编号在位置2处的取代，例如异亮氨酸至天冬酰胺取代、丝氨酸至天冬酰胺取代或酪氨酸至天冬酰胺取代。在一些实施方案中，FR1在位置4处包括亮氨酸，例如根据Kabat编号在位置4处的取代，例如蛋氨酸至亮氨酸取代。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区1(FR1)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置1处的取代，例如丙氨酸至天冬氨酸取代；根据Kabat编号在位置2处的取代，例如异亮氨酸至天冬酰胺取代、丝氨酸至天冬酰胺取代或酪氨酸至天冬酰胺取代；和根据Kabat编号在位置4处的取代，例如蛋氨酸至亮氨酸取代。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区1(FR1)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置1处的取代，例如丙氨酸至天冬氨酸取代；和根据Kabat编号在位置2处的取代，例如异亮氨酸至天冬酰胺取代、丝氨酸至天冬酰胺取代或酪氨酸至天冬酰胺取代。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区1(FR1)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置1处的取代，例如丙氨酸至天冬氨酸取代；和根据Kabat编号在位置4处的取代，例如蛋氨酸至亮氨酸取代。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区1(FR1)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置2处的取代，例如异亮氨酸至天冬酰胺取代、丝氨酸至天冬酰胺取代或酪氨酸至天冬酰胺取代；和根据Kabat编号在位置4处的取代，例如蛋氨酸至亮氨酸取代。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区3(FR3)，所述框架区包括改变，例如根据Kabat编号在本文公开的一个或多个(例如，所有)位置处的取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，FR3在位置66处包括甘氨酸，例如根据Kabat编号在位置66处的取代，例如赖氨酸至甘氨酸取代，或丝氨酸至甘氨酸取代。在一些实施方案中，FR3在位置69处包括天冬酰胺，例如根据Kabat编号在位置69处的取代，例如酪氨酸至天冬酰胺取代。在一些实施方案中，FR3在位置71处包括酪氨酸，例如根据Kabat编号在位置71处的取代，例如苯丙氨酸至酪氨酸取代，或丙氨酸至酪氨酸取代。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区3(FR3)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置66处的取代，例如赖氨酸至甘氨酸取代，或丝氨酸至甘氨酸取代；和根据Kabat编号在位置69处的取代，例如酪氨酸至天冬酰胺取代。。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区3(FR3)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置66处的取代，例如赖氨酸至甘氨酸取代，或丝氨酸至甘氨酸取代；和根据Kabat编号在位置71处的取代，例如苯丙氨酸至酪氨酸取代，或丙氨酸至酪氨酸取代。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区3(FR3)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置69处的取代，例如酪氨酸至天冬酰胺取代；和根据Kabat编号在位置71处的取代，例如苯丙氨酸至酪氨酸取代，或丙氨酸至酪氨酸取代。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，其包括框架区，例如框架区3(FR3)，所述框架区包括根据Kabat编号在位置66处的取代，例如赖氨酸至甘氨酸取代，或丝氨酸至甘氨酸取代；根据Kabat编号在位置69处的取代，例如酪氨酸至天冬酰胺取代；和根据Kabat编号在位置71处的取代，例如苯丙氨酸至酪氨酸取代，或丙氨酸至酪氨酸取代。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，所述轻链包括：框架区1(FR1)，其包括根据Kabat编号在位置2处的取代，例如异亮氨酸至天冬酰胺取代；和框架区3(FR3)，其包括根据Kabat编号在位置69处的取代，例如苏氨酸至天冬酰胺取代，和根据Kabat编号在位置71处的取代，例如苯丙氨酸至酪氨酸取代，例如如SEQ IDNO:26的氨基酸序列所示。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，所述轻链包括：(a)框架区1(FR1)，其包括根据Kabat编号在位置1处的取代，例如丙氨酸至天冬氨酸取代，以及根据Kabat编号在位置2处的取代，例如异亮氨酸至天冬酰胺取代；和(b)框架区3(FR3)，其包括根据Kabat编号在位置69处的取代，例如苏氨酸至天冬酰胺取代，以及根据Kabat编号在位置71处的取代，例如苯丙氨酸至酪氨酸取代，例如如SEQ ID NO:27的氨基酸序列所示在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，所述轻链包括：(a)框架区1(FR1)，其包括根据Kabat编号在位置2处的取代，例如丝氨酸至天冬酰胺取代，以及根据Kabat编号在位置4处的取代，例如蛋氨酸至亮氨酸取代；和(b)框架区3(FR3)，其包括根据Kabat编号在位置69处的取代，例如苏氨酸至天冬酰胺取代，以及根据Kabat编号在位置71处的取代，例如苯丙氨酸至酪氨酸取代，例如如SEQ ID NO:28的氨基酸序列所示在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，所述轻链包括：(a)框架区1(FR1)，其包括根据Kabat编号在位置2处的取代，例如丝氨酸至天冬酰胺取代；和(b)框架区3(FR3)，其包括根据Kabat编号在位置66处的取代，例如赖氨酸至甘氨酸取代，根据Kabat编号在位置69处的取代，例如苏氨酸至天冬酰胺取代，以及根据Kabat编号在位置71处的取代，例如丙氨酸至酪氨酸取代，例如如SEQ ID NO:29的氨基酸序列所示。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链，所述轻链包括：(a)框架区1(FR1)，其包括根据Kabat编号在位置2处的取代，例如酪氨酸至天冬酰胺取代；和(b)框架区3(FR3)，其包括根据Kabat编号在位置66处的取代，例如丝氨酸至甘氨酸取代，根据Kabat编号在位置69处的取代，例如苏氨酸至天冬酰胺取代，以及根据Kabat编号在位置71处的取代，例如丙氨酸至酪氨酸取代，例如如SEQ ID NO:29的氨基酸序列所示。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包括：(a)框架区1(FR1)，其包括根据Kabat编号的在本文公开的一个或多个(例如，全部)位置处的改变，例如取代(例如，保守取代)；和(b)框架区3(FR3)，其包括根据Kabat编号的在本文公开的一个或多个(例如，全部)位置处的改变，例如取代(例如，保守取代)。在一些实施方案中，取代是相对于人种系轻链框架区序列而言的。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括重链框架区1，例如示于图5A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括重链框架区2，例如示于图5A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括重链框架区3，例如示于图5A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括重链框架区4，例如示于图5A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括重链框架区1-4，例如SEQ ID NO:20-23，或示于图5A。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括轻链框架区1-4，例如SEQ ID NO:26-30，或示于图5B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括重链框架区1-4，例如SEQ ID NO:23-25；和轻链框架区1-4,例如SEQ ID NO:26-30，或示于图5A和5B。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)的重链或轻链可变结构域或两者包括氨基酸序列，其与本文公开的氨基酸基本相同，例如与本文所述抗体(例如，表14所述的抗体，或由表14的核苷酸序列编码的抗体)的可变区的同一性为至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高；或与本文所述抗体的可变区相差至少1或5个残基，但相差少于40、30、20或10个残基。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括至少一个、两个、三个或四个抗原结合区(例如，可变区)，该抗原结合区具有表14所列的氨基酸序列或与其基本相同的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的序列，或与表14中所示序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基)。在另一个实施方案中，，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括由具有表14所列的核苷酸序列或与其基本相同的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的序列，或与表14中所示序列相差不超过3、6、15、30或45个核苷酸)的核酸编码的VH和/或VL结构域。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:25的氨基酸序列、与SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:25的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:25的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和/或
VL结构域，所述VL结构域包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:30的氨基酸序列、与SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:30的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ IDNO:28、SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:30的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:23的氨基酸序列、与SEQ ID NO:23的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:23的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:26的氨基酸序列、与SEQ ID NO:26的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:26的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:23的氨基酸序列、与SEQ ID NO:23的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:23的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:27的氨基酸序列、与SEQ ID NO:27的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:27的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:23的氨基酸序列、与SEQ ID NO:23的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:23的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:28的氨基酸序列、与SEQ ID NO:28的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:28的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:23的氨基酸序列、与SEQ ID NO:23的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:23的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:29的氨基酸序列、与SEQ ID NO:29的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:29的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:23的氨基酸序列、与SEQ ID NO:23的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:23的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:30的氨基酸序列、与SEQ ID NO:30的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:30的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:24的氨基酸序列、与SEQ ID NO:24的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:24的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:26的氨基酸序列、与SEQ ID NO:26的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:26的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:24的氨基酸序列、与SEQ ID NO:24的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:24的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:27的氨基酸序列、与SEQ ID NO:27的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:27的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:24的氨基酸序列、与SEQ ID NO:24的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:24的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:28的氨基酸序列、与SEQ ID NO:28的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:28的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:24的氨基酸序列、与SEQ ID NO:24的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:24的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:29的氨基酸序列、与SEQ ID NO:29的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:29的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:24的氨基酸序列、与SEQ ID NO:24的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:24的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:30的氨基酸序列、与SEQ ID NO:30的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:30的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:25的氨基酸序列、与SEQ ID NO:25的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:25的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:26的氨基酸序列、与SEQ ID NO:26的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:26的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:25的氨基酸序列、与SEQ ID NO:25的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:25的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:27的氨基酸序列、与SEQ ID NO:27的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:27的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:25的氨基酸序列、与SEQ ID NO:25的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:25的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:28的氨基酸序列、与SEQ ID NO:28的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:28的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:25的氨基酸序列、与SEQ ID NO:25的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:25的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:29的氨基酸序列、与SEQ ID NO:29的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:29的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)包括：
VH结构域，所述VH结构域包括SEQ ID NO:25的氨基酸序列、与SEQ ID NO:25的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:25的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列；和
VL结构域，所述VL结构域包括SEQ ID NO:30的氨基酸序列、与SEQ ID NO:30的氨基酸序列的同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:30的氨基酸序列相差不超过1、2、5、10或15个氨基酸残基的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)是完整的抗体或其片段(例如，Fab、F(ab’)2、Fv或单链Fv片段(scFv))。在实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV6(例如，抗TCRβV6-5*01)抗体分子)是单克隆抗体或具有单一特异性的抗体。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)也可以是人源化的、嵌合的、骆驼的、鲨鱼的或体外生成的抗体分子。在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)是人源化抗体分子。抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)的重链和轻链可以是全长的(例如，抗体可以包括至少一条并且优选两条完整的重链，以及至少一条并且优选两条完整的轻链)或可以包括抗原结合片段(例如，Fab、F(ab’)2、Fv、单链Fv片段、单结构域抗体、双抗体(dAb)、二价抗体，或双特异性抗体或其片段、其单结构域变体或骆驼抗体)。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)为多特异性分子形式，例如双特异性分子形式，例如如本文所述的双特异性分子形式。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)具有选自例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD和IgE的重链恒定区的重链恒定区(Fc)。在一些实施方案中，Fc区选自IgG1、IgG2、IgG3和IgG4的重链恒定区。在一些实施方案中，Fc区选自IgG1或IgG2(例如，人IgG1或IgG2)的重链恒定区。在一些实施方案中，重链恒定区是人IgG1。
在一些实施方案中，抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)具有选自例如κ或λ(优选κ(例如人κ))的轻链恒定区的轻链恒定区。在一个实施方案中，恒定区被改变(例如，突变)以修饰抗TCRβV抗体分子(例如，抗TCRβV12抗体分子)的性质(例如，增加或减少以下一项或多项：Fc受体结合、抗体糖基化、半胱氨酸残基的数目、效应细胞功能或补体功能)。例如，相对于例如人IgG1，恒定区在位置296(M至Y)、298(S至T)、300(T至E)、477(H至K)和478(N至F)处发生突变，以改变Fc受体结合(例如，突变位置对应于SEQ ID NO:212或214的位置132(M至Y)、134(S至T)、136(T至E)、313(H至K)和314(N至F)；或SEQ ID NO:215、216、217或218的位置135(M至Y)、137(S至T)、139(T至E)、316(H至K)和317(N至F))。
表14：鼠和人源化抗体分子的氨基酸和核苷酸序列。抗体分子包括鼠mAb 16G8和人源化mAb 16G8。显示了重链和轻链CDR的氨基酸，以及重链和轻链可变区及重链和轻链的氨基酸和核苷酸序列。
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表17.人IgG重链和人κ轻链的恒定区氨基酸序列
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B细胞、巨噬细胞和树突状细胞衔接物
宽泛地说，B细胞(也称为B淋巴细胞)是淋巴细胞亚型的一种白细胞。它们通过分泌抗体在适应性免疫系统的体液免疫成分中起作用。此外，B细胞呈递抗原(它们也被分类为专业抗原呈递细胞(APC))并分泌细胞因子。巨噬细胞是一种经由吞噬作用吞噬并消化细胞碎片、异物、微生物、癌细胞的白细胞。除吞噬作用外，它们在非特异性防御(先天免疫)中起重要作用，并通过募集其他免疫细胞(诸如淋巴细胞)来帮助启动特异性防御机制(适应性免疫)。例如，它们作为T细胞的抗原呈递者是重要的。除了增加炎症和刺激免疫系统外，巨噬细胞还起重要的抗炎作用，并且可以通过释放细胞因子来降低免疫反应。树突状细胞(DC)是抗原呈递细胞，作用于处理抗原物质并将其在细胞表面上呈递给免疫系统的T细胞。
本公开内容尤其提供了多特异性(例如，双特异性、三特异性、四特异性)或多功能分子，其包含(例如，经工程化以含有)一种或多种介导结合和/或激活B细胞、巨噬细胞和/或树突状细胞的B细胞、巨噬细胞和/或树突状细胞衔接物。
因此，在一些实施方案中，免疫细胞衔接物包括选自以下的一种或多种的B细胞、巨噬细胞和/或树突状细胞衔接物：CD40配体(CD40L)或CD70配体；与CD40或CD70结合的抗体分子；针对OX40的抗体分子；OX40配体(OX40L)；Toll样受体的激动剂(例如，如本文所述，例如TLR4，例如组成型活性TLR4(caTLR4)，或TLR9激动剂)；41BB；CD2；CD47；或STING激动剂，或其组合。
在一些实施方案中，B细胞衔接物是CD40L、OX40L或CD70配体，或与OX40、CD40或CD70结合的抗体分子。
在一些实施方案中，巨噬细胞衔接物是CD2激动剂。在一些实施方案中，巨噬细胞衔接物是与以下结合的抗原结合结构域：CD40L或与CD40结合的抗原结合结构域或配体、Toll样受体(TLR)激动剂(例如，如本文所述)，例如TLR9或TLR4(例如，caTLR4(组成型活性TLR4))、CD47或STING激动剂。在一些实施方案中，STING激动剂是环二核苷酸，例如环二GMP(cdGMP)或环二AMP(cdAMP)。在一些实施方案中，STING激动剂是生物素化的。
在一些实施方案中，树突状细胞衔接物是CD2激动剂。在一些实施方案中，树突状细胞衔接物是与以下的一种或多种结合的配体、受体激动剂或抗体分子：OX40L、41BB、TLR激动剂(例如，如本文所述)(例如，TLR9激动剂、TLR4(例如，caTLR4(组成型活性TLR4))、CD47或STING激动剂。在一些实施方案中，STING激动剂是环二核苷酸，例如环二GMP(cdGMP)或环二AMP(cdAMP)。在一些实施方案中，STING激动剂是生物素化的。
在其他实施方案中，免疫细胞衔接物介导结合或激活B细胞、巨噬细胞和/或树突状细胞中的一种或多种。示例性的B细胞、巨噬细胞和/或树突状细胞衔接物可以选自以下的一种或多种：CD40配体(CD40L)或CD70配体；与CD40或CD70结合的抗体分子；针对OX40的抗体分子；OX40配体(OX40L)；Toll样受体激动剂(例如TLR4，例如组成型活性TLR4(caTLR4)或TLR9激动剂)；41BB激动剂；CD2；CD47；或STING激动剂，或其组合。
在一些实施方案中，B细胞衔接物选自CD40L、OX40L或CD70配体或与OX40、CD40或CD70结合的抗体分子中的一种或多种。
在其他实施方案中，巨噬细胞衔接物选自以下的一种或多种：CD2激动剂；CD40L；OX40L；与OX40、CD40或CD70结合的抗体分子；Toll样受体激动剂或其片段(例如TLR4，例如组成型活性TLR4(caTLR4))；CD47激动剂；或STING激动剂。
在其他实施方案中，树突状细胞衔接物选自以下的一种或多种：CD2激动剂、OX40抗体、OX40L、41BB激动剂、Toll样受体激动剂或其片段(例如TLR4，例如组成型活性TLR4(caTLR4))、CD47激动剂或STING激动剂。
在一个实施方案中，OX40L包括氨基酸序列：QVSHRYPRIQSIKVQFTEYKKEKGFILTSQKEDEIMKVQNNSVIINCDGFYLISLKGYFSQEVNISLHYQKDEEPLFQLKKVRSVNSLMVASLTYKDKVYLNVTTDNTSLDDFHVNGGELILIHQNPGEFCVL(SEQ ID NO:7245)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7245的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在另一个实施方案中，CD40L包括氨基酸序列：MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL(SEQ ID NO:7246)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7246的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在其他实施方案中，STING激动剂包括环二核苷酸，例如环二GMP(cdGMP)、环二AMP(cdAMP)或其组合，任选地具有2’,5’或3’,5’磷酸键。
在一个实施方案中，免疫细胞衔接物包括41BB配体，例如，其包括氨基酸序列：ACPWAVSGARASPGSAASPRLREGPELSPDDPAGLLDLRQGMFAQLVAQNVLLIDGPLSWYSDPGLAGVSLTGGLSYKEDTKELVVAKAGVYYVFFQLELRRVVAGEGSGSVSLALHLQPLRSAAGAAALALTVDLPPASSEARNSAFGFQGRLLHLSAGQRLGVHLHTEARARHAWQLTQGATVLGLFRVTPEIPAGLPSPRSE(SEQ ID NO:7247)、其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其具有95％至99.9％同一性，或与SEQ ID NO:7247的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
Toll样受体
Toll样受体(TLR)是进化保守的受体，是果蝇属Toll蛋白的同源物，并且识别被称为病原体相关微生物模式(PAMP)(仅由微生物病原体表达)或与危险相关的分子模式(DAMP)(从坏死或垂死细胞释放的内源性分子)的高度保守的结构基序。PAMP包括各种细菌细胞壁组分，诸如脂多糖(LPS)、肽聚糖(PGN)和脂肽，以及鞭毛蛋白、细菌DNA和病毒双链RNA。DAMP包括细胞内蛋白(诸如热休克蛋白)以及来自细胞外基质的蛋白质片段。相应的PAMP或DAMP对TLR的刺激会引发信号传导级联，从而导致转录因子(诸如AP-1、NF-κB和干扰素调节因子(IRF))的激活。TLR发出的信号导致多种细胞应答，包括干扰素(IFN)、促炎性细胞因子和效应细胞因子的产生，它们指导适应性免疫应答。TLR与多种炎性和免疫病症有关，并在癌症中起作用(Rakoff-Nahoum S.&Medzhitov R.,2009.Toll-like receptorsand cancer.Nat Revs Cancer 9:57-63)。
TLR是I型跨膜蛋白，其特征在于含有富含亮氨酸的重复序列(LRR)的胞外结构域和含有称为Toll/IL-1受体(TIR)结构域的保守区域的胞质尾区。已经表征了十个人类TLR和十二个鼠TLR，人类中为TLR1至TLR10，并且小鼠中为TLR1至TLR9、TLR11、TLR12和TLR13，TLR10的同源物是假基因。TLR2对于识别革兰氏阳性细菌中的多种PAMP(包括细菌脂蛋白、脂甘露聚糖和脂磷壁酸)至关重要。TLR3与病毒衍生的双链RNA有关。TLR4主要被脂多糖激活。TLR5检测细菌鞭毛蛋白，并且对未甲基化的CpG DNA的应答则需要TLR9。最后，TLR7和TLR8识别小的合成抗病毒分子，并且据报道单链RNA是其天然配体。据报道，TLR11识别尿道致病性大肠杆菌和来自鼠弓形虫(Toxoplasma gondii)的抑制蛋白样蛋白质。TLR彼此异源二聚化的能力显然会扩展TLR的全部特异性。例如，对二酰化脂蛋白的应答需要TLR2和TLR6的二聚体，而TLR2和TLR1相互作用以识别三酰化脂蛋白。TLR的特异性还受到各种衔接子和辅助分子的影响，诸如应答于LPS而与TLR4形成复合物的MD-2和CD14。
TLR信号传导由至少两个不同的途径组成：导致炎性细胞因子产生的MyD88依赖性途径，以及与IFN-β刺激和树突状细胞成熟相关的MyD88非依赖性途径。除TLR3以外，MyD88依赖性途径是除TLR3以外的所有TLR共有的(Adachi O.等人,1998.Targeted disruptionof the MyD88 gene results in loss of IL-1-and IL-18-mediatedfunction.Immunity.9(1):143-50)。通过PAMP或DAMP激活后，TLR异源或同源二聚化经由胞质TIR结构域诱导衔接蛋白的募集。各个TLR通过使用不同的衔接分子诱导不同的信号传导应答。TLR4和TLR2信号传导需要衔接子TIRAP/Mal，该衔接子参与MyD88依赖性途径。TLR3以MyD88非依赖性方式通过衔接子TRIF/TICAM-1触发应答于双链RNA的IFN-β产生。TRAM/TICAM-2是参与MyD88非依赖性途径的另一个衔接分子，其功能被限制于TLR4途径。
TLR3、TLR7、TLR8和TLR9识别病毒核酸并诱导I型IFN。根据激活的TLR，导致I型IFN诱导的信号传导机制不同。它们涉及干扰素调节因子IRF，其是已知在抗病毒防御、细胞生长和免疫调节中起关键作用的转录因子亚家族。三个IRF(IRF3、IRF5和IRF7)充当病毒介导的TLR信号传导的直接转导物。TLR3和TLR4激活IRF3和IRF7，而TLR7和TLR8激活IRF5和IRF7(Doyle S.等人，2002.IRF3 mediates aTLR3/TLR4-specific antiviral geneprogram.Immunity.17(3):251-63)。此外，已显示由TLR9配体CpG-A刺激的I型IFN产生是由PI(3)K和mTOR介导的(Costa-Mattioli M.&Sonenberg N.2008.RAPping production oftype I interferon in pDCs through mTOR.Nature Immunol.9:1097-1099)。
TLR-9
TLR9识别DNA分子中未甲基化的CpG序列。与细菌基因组或病毒DNA相比，CpG位点在脊椎动物基因组上相对较少(约1％)。TLR9由免疫系统的许多细胞表达，诸如B淋巴细胞、单核细胞、自然杀伤(NK)细胞和浆细胞样树突状细胞。TLR9在内体区室中细胞内表达，并通过与富含CpG基序的DNA结合来提醒免疫系统有病毒和细菌感染。TLR9信号导致激活引发促炎症反应的细胞，从而导致产生细胞因子，诸如I型干扰素和IL-12。
TLR激动剂
TLR激动剂可以激动一种或多种TLR，例如人TLR-1、2、3、4、5、6、7、8、9或10中的一种或多种。在一些实施方案中，本文所述的辅助剂是TLR激动剂。在一些实施方案中，TLR激动剂特异性地激动人TLR-9。在一些实施方案中，TLR-9激动剂是CpG部分。如本文所用，CpG部分是线性的二核苷酸，具有序列：5’—C—磷酸—G—3’，即，仅被一个磷酸分开的胞嘧啶和鸟嘌呤。
在一些实施方案中，CpG部分包括至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30或更多个CpG二核苷酸。在一些实施方案中，CpG部分由1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个CpG二核苷酸组成。在一些实施方案中，CpG部分具有1-5、1-10、1-20、1-30、1-40、1-50、5-10、5-20、5-30、10-20、10-30、10-40或10-50个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中，TLR-9激动剂是合成的ODN(寡脱氧核苷酸)。CpG ODN是短的合成的单链DNA分子，含有在特定的序列背景中的未甲基化的CpG二核苷酸(CpG基序)。与基因组细菌DNA中发现的天然磷酸二酯(PO)骨架相反，CpG ODN具有部分或完全硫代磷酸酯(PS)骨架。CpG ODN主要分为三类：A、B和C类，它们的免疫刺激活性不同。CpG-A ODN的特征是PO中心含CpG的回文基序和PS修饰的3’poly-G串。它们诱导pDC产生大量IFN-α，但是是TLR9依赖性NF-κB信号传导和促炎性细胞因子(例如，IL-6)产生的较弱刺激物。CpG-BODN含有具有一个或多个CpG二核苷酸的完整PS骨架。它们强烈激活B细胞和TLR9依赖性NF-κB信号传导，但微弱刺激IFN-α分泌。CpG-CODN结合了A类和B类的特征。它们含有完整的PS骨架和含CpG的回文基序。C类CpG ODN诱导pDC产生大量的IFN-α并刺激B细胞。
间质修饰部分
实体瘤具有模仿正常组织的结构的独特结构，并包括两个不同但相互依存的区室：实质(赘生性细胞)和赘生性细胞诱导并分散于其中的间质。所有肿瘤都具有间质，并且需要间质来提供营养支持和清除废物。在肿瘤以细胞悬液(例如白血病、腹水肿瘤)生长的情况下，血浆充当间质(Connolly JL等人，Tumor Structure and Tumor StromaGeneration.在Kufe DW等人编著，Holland-Frei Cancer Medicine.第6版Hamilton:BCDecker；2003中)。间质包括多种细胞类型，包括成纤维细胞/肌纤维母细胞、神经胶质细胞、上皮细胞、脂肪、血管、平滑肌和免疫细胞，以及细胞外基质(ECM)和细胞外分子(LiHanchen等人，Tumor Microenvironment:The Role of the Tumor Stroma in Cancer.Jof Cellular Biochemistry 101:805-815(2007))。
本文所述的间质修饰部分包括能够降解间质组分的部分(例如蛋白质，例如酶)，该间质组分是例如ECM组分，例如，糖胺聚糖，例如，透明质酸(hyaluronan)(也称为透明质酸(hyaluronic acid)或HA)、硫酸软骨素、软骨素、硫酸皮肤素、硫酸肝素、肝素、巢蛋白、生腱蛋白、聚集蛋白聚糖和硫酸角蛋白；或细胞外蛋白，例如，胶原蛋白、层粘连蛋白、弹性蛋白、纤维蛋白原、纤连蛋白和玻连蛋白。
间质修饰酶
在一些实施方案中，间质修饰部分是酶。例如，间质修饰部分可包括但不限于透明质酸酶、胶原酶、软骨素酶、基质金属蛋白酶(例如，巨噬细胞金属弹性蛋白酶)。
透明质酸酶
透明质酸酶是在整个动物界中发现的一组中性和酸性的活性酶。透明质酸酶在底物特异性和作用机理方面有所不同。透明质酸酶一般分为三类：(1)哺乳动物型透明质酸酶(EC 3.2.1.35)，它们是内切-β-N-乙酰基己糖胺酶，四糖和六糖为主要终产物。它们同时具有水解和转糖苷酶活性，并且可以降解透明质酸和硫酸软骨素；(2)细菌透明质酸酶(EC4.2.99.1)降解透明质酸，并在不同程度上降解硫酸软骨素和硫酸皮肤素。它们是内切-β-N-乙酰基己糖胺酶，通过β消除反应起作用，主要产生二糖终产物；(3)来自水蛭、其他寄生虫和甲壳类动物的透明质酸酶(EC 3.2.1.36)是内切-β-葡糖醛酸糖苷酶，其通过水解β1-3键生成四糖和六糖终产物。
哺乳动物的透明质酸酶可以进一步分为两组：(1)中性活性酶和(2)酸性活性酶。人类基因组中有六个透明质酸酶样基因：HYAL1、HYAL2、HYAL3 HYAL4 HYALP1和PH20/SPAM1。HYALP1是假基因，并且尚未显示HYAL3具有针对任何已知底物的酶活性。HYAL4是一种软骨素酶并且对透明质酸缺乏活性。HYAL1是原型酸活性酶，并且PH20是原型中性活性酶。酸性活性透明质酸酶(诸如HYAL1和HYAL2)在中性pH下缺乏催化活性。例如，HYAL1在超过pH 4.5下在体外没有催化活性(Frost和Stern,“A Microtiter-Based Assay forHyaluronidase Activity Not Requiring Specialized Reagents”,AnalyticalBiochemistry,第251卷，第263-269页(1997)。HYAL2是一种在体外具有非常低的特异性活性的酸性活性酶。
在一些实施方案中，透明质酸酶是哺乳动物透明质酸酶。在一些实施方案中，透明质酸酶是重组人透明质酸酶。在一些实施方案中，透明质酸酶是中性活性透明质酸酶。在一些实施方案中，透明质酸酶是中性活性的可溶性透明质酸酶。在一些实施方案中，透明质酸酶是重组PH20中性活性酶。在一些实施方案中，透明质酸酶是重组PH20中性活性的可溶性酶。在一些实施方案中，透明质酸酶是糖基化的。在一些实施方案中，透明质酸酶具有至少一种N连接的聚糖。重组透明质酸酶可以使用本领域技术人员已知的常规方法例如US7767429来生产，该专利的全部内容通过引用并入本文。
在一些实施方案中，透明质酸酶是rHuPH20(也称为目前由Halozyme制造；在2005年被FDA批准(参见例如Scodeller P(2014)Hyaluronidase and otherExtracellular Matrix Degrading Enzymes for Cancer Therapy:New Uses and Nano-Formulations.J Carcinog Mu tage 5:178；US7767429；US8202517；US7431380；US8450470；US8772246；US8580252，其各自的全部内容通过引用并入本文)。rHuPH20由基因工程化的CHO细胞产生，该细胞含有编码人透明质酸酶PH20的可溶性片段的DNA质粒。在一些实施方案中，透明质酸酶是糖基化的。在一些实施方案中，透明质酸酶具有至少一种N连接的聚糖。重组透明质酸酶可以使用本领域技术人员已知的常规方法例如US7767429来生产，该专利的全部内容通过引用并入本文。在一些实施方案中，rH uPH20具有与以下氨基酸序列至少95％(例如，至少96％、97％、98％、99％、100％)相同的序列：LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(SEQ ID NO:7248)。
在本文提供的任何方法中，抗透明质酸试剂可以是降解透明质酸的试剂或可以是抑制透明质酸合成的试剂。例如，抗透明质酸试剂可以是透明质酸降解酶。在另一个实例中，抗透明质酸试剂为抑制透明质酸合成的试剂。例如，抗透明质酸试剂是抑制透明质酸合成的试剂，诸如针对HA合酶的有义或反义核酸分子，或者是小分子药物。例如，抗透明质酸试剂是4-甲基伞形酮(MU)或其衍生物，或来氟米特或其衍生物。此类衍生物包括例如4-甲基伞形酮(MU)的衍生物，即6,7-二羟基-4-甲基香豆素或5,7-二羟基-4-甲基香豆素。
在本文提供的方法的其他实例中，透明质酸降解酶是透明质酸酶。在一些实例中，透明质酸降解酶是PH20透明质酸酶或其截短形式，该截短形式缺乏C末端糖基磷脂酰肌醇(GPI)附着位点或GPI附着位点的一部分。在特定的实例中，透明质酸酶是选自人、猴、牛、绵羊、大鼠、小鼠或豚鼠PH20的PH20。例如，透明质酸降解酶是具有中性活性并被N-糖基化的人PH20透明质酸酶，并且选自(a)为全长PH20或为PH20的C末端截短形式的透明质酸酶多肽，其中截短形式至少包括SEQ ID NO:7248的氨基酸残基36-464，诸如36-481、36-482、36-483，其中全长PH20具有SEQ ID NO:7248所示的氨基酸序列；或(b)包括与SEQ ID NO:7248所示的氨基酸序列的多肽或截短形式具有至少85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更多的序列同一性的氨基酸序列的透明质酸酶多肽；或(c)包括氨基酸取代的(a)或(b)的透明质酸酶多肽，其中该透明质酸酶多肽具有与SEQ ID NO:7248所示的多肽或其相应的截短形式具有至少85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更多的序列同一性的氨基酸序列。在示例性实例中，透明质酸降解酶是PH20，其包括称为rHuPH20的组成。
在其他实例中，抗透明质酸试剂是透明质酸降解酶，其通过缀合至聚合物而被修饰。聚合物可以是PEG，并且抗透明质酸试剂PEG化的透明质酸降解酶。因此，在本文提供的方法的一些实例中，透明质酸降解酶通过缀合至聚合物而被修饰。例如，透明质酸降解酶缀合至PEG，因此透明质酸降解酶被PEG化。在示例性的实例中，透明质酸降解酶是PEG化的PH20酶(PEGPH20)。在本文提供的方法中，皮质类固醇可以是糖皮质激素，选自可的松、地塞米松、氢化可的松、甲泼尼龙、泼尼松龙和泼尼松。
软骨素酶
软骨素酶是在整个动物界中发现的酶，其通过内切糖苷酶反应降解糖胺聚糖，特别是软骨素和硫酸软骨素。在一些实施方案中，软骨素酶是哺乳动物软骨素酶。在一些实施方案中，软骨素酶是重组人软骨素酶。在一些实施方案中，软骨素酶是HYAL4。其他示例性的软骨素酶包括软骨素酶ABC(衍生自普通变形杆菌(Proteus vulgaris)；日本专利申请公开号6-153947，T.Yamagata等人，J.Biol.Chem.,243,1523(1968),S.Suzuki等人,J.Biol.Chem.,243,1543(1968))、软骨素酶AC(衍生自肝素黄杆菌(Flavobacteriumheparinum)；T.Yamagata等人,J.Biol.Chem.,243,1523(1968))、软骨素酶AC II(衍生自金黄节杆菌(Arthrobacter aurescens)；K.Hiyama和S.Okada,J.Biol.Chem.,250,1824(1975),K.Hiyama和S.Okada,J.Biochem.(Tokyo),80,1201(1976))、透明质酸酶ACIII(衍生自黄杆菌属种(Flavobacterium sp.)Hp102；Hirofumi Miyazono等人,Seikagaku,61,1023(1989))、软骨素酶B(衍生自肝素黄杆菌；Y.M.Michelacci和C.P.Dietrich,Biochem.Biophys.Res.Commun.,56,973(1974),Y.M.Michelacci和C.P.Dietrich,Biochem.J.,151,121(1975),Kenichi Maeyama等人,Seikagaku,57,1189(1985))、软骨素酶C(衍生自黄杆菌属种Hp102；Hirofumi Miyazono等人,Seikagaku,61,1023(1939))等。
基质金属蛋白酶
基质金属蛋白酶(MMP)是锌依赖性内肽酶，其是参与细胞外基质(ECM)降解的主要蛋白酶。MMP能够降解各种细胞外分子和许多生物活性分子。已在人体中鉴定出二十四种MMP基因，根据结构域排布和底物偏好可将其分为六类：胶原酶(MMP-1、-8和-13)、明胶酶(MMP-2和MMP-9)、间质溶素(MMP-3、-10和-11)、间质溶解因子(MMP-7和MMP-26)、膜类型(MT)-MMP(MMP-14、-15、-16、-17、-24和-25)和其他(MMP-12、-19、-20、-21、-23、-27和-28)。在一些实施方案中，间质修饰部分是人重组MMP(例如，MMP-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、10、-11、-12、-13、-14、15、-15、-17、-18、-19、20、-21、-22、-23或-24)。
胶原酶
三种哺乳动物胶原酶(MMP-1、-8和-13)是能够裂解胶原细胞外基质的主要分泌的内肽酶。除了纤维胶原，胶原酶还可以裂解其他几种基质和非基质蛋白，包括生长因子。胶原酶被合成为非活性的替代形式，并且一旦被激活，其活性就会被金属蛋白酶的特异性组织抑制剂TIMP以及非特异性蛋白酶抑制剂所抑制(Ala-aho R等人，Biochimie.Collagenases in cancer.2005年3月-4月；87(3-4):273-86)。在一些实施方案中，间质修饰部分是胶原酶。在一些实施方案中，胶原酶是人重组胶原酶。在一些实施方案中，胶原酶是MMP-1。在一些实施方案中，胶原酶是MMP-8。在一些实施方案中，胶原酶是MMP-13。
巨噬细胞金属弹性蛋白酶
巨噬细胞金属弹性蛋白酶(MME)，也称为MMP-12，是MMP基质溶素亚组的成员，并且催化可溶和不可溶弹性蛋白以及多种基质和非基质底物的水解，包括IV型胶原蛋白、纤连蛋白、层粘连蛋白、玻连蛋白、巢蛋白、乙酰肝素和硫酸软骨素(Erja等人，Journal of Investigative Dermatology(2000)114,1113–1119；doi:10.1046/j.1523-1747.2000.00993)。在一些实施方案中，间质修饰部分是MME。在一些实施方案中，MME是人重组MME。在一些实施方案中，MME是MMP-12。
其他间质修饰部分
在一些实施方案中，间质修饰部分导致以下中的一种或多种：减少间质或细胞外基质(ECM)组分的水平或产生；减少肿瘤纤维化；增加组织间隙肿瘤运输；改善肿瘤灌注；扩大肿瘤微脉管系统；降低肿瘤中的组织间隙液压(IFP)；或减少或增强药剂(例如，癌症治疗剂或细胞疗法)向肿瘤或肿瘤脉管系统的渗透或扩散。
在一些实施方案中，减少的间质或ECM组分选自糖胺聚糖或细胞外蛋白，或其组合。在一些实施方案中，糖胺聚糖选自透明质酸(也称为透明质酸或HA)、硫酸软骨素、软骨素、硫酸皮肤素、肝素、硫酸肝素、巢蛋白、生腱蛋白、聚集蛋白聚糖和硫酸角蛋白。在一些实施方案中，细胞外蛋白选自胶原蛋白、层粘连蛋白、弹性蛋白、纤维蛋白原、纤连蛋白或玻连蛋白。在一些实施方案中，间质修饰部分包括降解肿瘤间质或细胞外基质(ECM)的酶分子。在一些实施方案中，酶分子选自透明质酸酶分子、胶原酶分子、软骨素酶分子、基质金属蛋白酶分子(例如，巨噬细胞金属弹性蛋白酶)或上述中任一种的变体(例如，片段)。术语“酶分子”包括酶的全长、片段或变体，例如保留天然存在的酶的至少一种功能性质的酶变体。
在一些实施方案中，间质修饰部分降低了透明质酸的水平或产生。在其他实施方案中，间质修饰部分包括透明质酸降解酶、抑制透明质酸合成的试剂或抗透明质酸的抗体分子。
在一些实施方案中，透明质酸降解酶是透明质酸酶分子，例如其全长或其变体(例如，其片段)。在一些实施方案中，透明质酸降解酶在中性或酸性pH，例如约4-5的pH中具有活性。在一些实施方案中，透明质酸酶分子是哺乳动物透明质酸酶分子，例如重组人透明质酸酶分子，例如其全长或变体(例如其片段，例如截短形式)。在一些实施方案中，透明质酸酶分子选自HYAL1、HYAL2或PH-20/SPAM1，或其变体(例如，其截短形式)。在一些实施方案中，截短形式缺乏C末端糖基磷脂酰肌醇(GPI)附着位点或GPI附着位点的一部分。在一些实施方案中，透明质酸酶分子被糖基化，例如包括至少一种N连接的聚糖。
在一些实施方案中，透明质酸酶分子包括氨基酸序列：LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(SEQ ID NO:7256)，或其片段，或与其基本相同(例如，与其95％至99.9％相同，或对SEQ ID NO:7256的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在一些实施方案中，透明质酸酶分子包括：
(i)SEQ ID NO:7256的36-464的氨基酸序列；
(ii)PH20的36-481、36-482或36-483的氨基酸序列，其中PH20具有SEQ ID NO:7256所示的氨基酸序列；或者
(iii)与SEQ ID NO:7256所示的氨基酸序列的多肽或截短形式具有至少95％至100％序列同一性的氨基酸序列；或者
(iv)对SEQ ID NO:7256所示的氨基酸序列具有30、20、10、5或更少的氨基酸取代的氨基酸序列。在一些实施方案中，透明质酸酶分子包括与SEQ ID NO:7256的氨基酸序列至少95％(例如，至少95％、96％、97％、98％、99％、100％)相同的氨基酸序列。在一些实施方案中，透明质酸酶分子由与SEQ ID NO:7256的核苷酸序列至少95％(例如，至少95％、96％、97％、98％、99％、100％)相同的核苷酸序列编码。
在一些实施方案中，透明质酸酶分子是PH20，例如rHuPH20。在一些实施方案中，透明质酸酶分子是HYAL1并包括氨基酸序列：FRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW(SEQ IDNO:7253)或其片段或与其基本相同的氨基酸序列(例如，与其95％至99.9％相同，或对SEQID NO:7253的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
在一些实施方案中，透明质酸降解酶(例如，透明质酸酶分子)进一步包括聚合物，例如缀合至聚合物，例如PEG。在一些实施方案中，透明质酸降解酶是PEG化的PH20酶(PEGPH20)。在一些实施方案中，透明质酸降解酶(例如，透明质酸酶分子)进一步包括免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)，该免疫球蛋白链恒定区选自例如IgG1、IgG2、IgG3和IgG4的重链恒定区，更具体而言，选自人IgG1、IgG2、IgG3或IgG4的重链恒定区。在一些实施方案中，免疫球蛋白恒定区(例如，Fc区)与透明质酸降解酶(例如，透明质酸酶分子)连接，例如共价连接。在一些实施方案中，免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)被改变(例如，突变)以增加或减少以下中的一种或多种：Fc受体结合、抗体糖基化、半胱氨酸残基的数目、效应细胞功能或补体功能。在一些实施方案中，透明质酸降解酶(例如，透明质酸酶分子)形成二聚体。
在一些实施方案中，间质修饰部分包括透明质酸合成(例如，HA合酶)的抑制剂。在一些实施方案中，抑制剂包括针对HA合酶的有义或反义核酸分子或为小分子药物。在一些实施方案中，抑制剂是4-甲基伞形酮(MU)或其衍生物(例如，6,7-二羟基-4-甲基香豆素或5,7-二羟基-4-甲基香豆素)或来氟米特或其衍生物。
在一些实施方案中，间质修饰部分包括针对透明质酸的抗体分子。
在一些实施方案中，间质修饰部分包括胶原酶分子，例如哺乳动物胶原酶分子，或其变体(例如，片段)。在一些实施方案中，胶原酶分子是胶原酶分子IV，例如，包括以下氨基酸序列：YNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC(SEQ ID NO:7254)，或其片段，或与其基本相同(例如，与其95％至99.9％相同，或对SEQ ID NO:7254的氨基酸序列具有至少一个氨基酸改变，但不超过五个、十个或十五个改变(例如，取代、缺失或插入，例如，保守取代)。
接头
本文公开的多特异性或多功能分子可以进一步包括接头，例如，在以下的一种或多种之间的接头：抗原结合结构域与细胞因子分子、抗原结合结构域与免疫细胞衔接物、抗原结合结构域与间质修饰部分、细胞因子分子与免疫细胞衔接物、细胞因子分子与间质修饰部分、免疫细胞衔接物与间质修饰部分、抗原结合结构域与免疫球蛋白链恒定区、细胞因子分子与免疫球蛋白链恒定区、免疫细胞衔接物与免疫球蛋白链恒定区，或间质修饰部分与免疫球蛋白链恒定区。在实施方案中，接头选自：可裂解的接头、不可裂解的接头、肽接头、柔性接头、刚性接头、螺旋接头或非螺旋接头，或其组合。
在一个实施方案中，多特异性分子可包括一个、两个、三个或四个接头，例如肽接头。在一个实施方案中，肽接头包括Gly和Ser。在一些实施方案中，肽接头选自GGGGS(SEQID NO:7249)；GGGGSGGGGS(SEQ ID NO:7250)；GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:7251)；和DVPSGPGGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:7252)。在一些实施方案中，肽接头是接头的A(EAAAK)nA(SEQ ID NO:7255)家族(例如，如Protein Eng.(2001)14(8):529-532所述)。这些是刚性螺旋接头，n范围为2-5。在一些实施方案中，肽接头选自AEAAAKEAAAKAAA(SEQ ID NO:75)；AEAAAKEAAAKEAAAKAAA(SEQ ID NO:76)；AEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(SEQ ID NO:77)；和AEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(SEQ ID NO:78)。
核酸
还公开了编码前述多特异性或多功能分子的核酸。
在某些实施方案中，本发明的特征在于核酸，其包括编码如本文所述的抗体分子的重链和轻链可变区和CDR或高变环的核苷酸序列。例如，本发明的特征在于分别编码选自本文公开的一种或多种抗体分子的抗体分子的重链和轻链可变区的第一核酸和第二核酸。核酸可包括如本文表中所列的核苷酸序列，或与其基本相同(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更高的序列)或与本文表中所示的序列相差不超过3、6、15、30或45个核苷酸的序列。
在某些实施方案中，核酸可包括编码来自重链可变区的至少一个、两个或三个CDR或高变环的核苷酸序列，所述重链可变区具有如本文表中所列的氨基酸序列或与其基本同源的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更多的序列，和/或具有一个或多个取代(例如，保守取代)的序列)。在其他实施方案中，核酸可包括编码来自轻链可变区的至少一个、两个或三个CDR或高变环的核苷酸序列，所述轻链可变区具有如本文表中所列的氨基酸序列或与其基本同源的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更多的序列，和/或具有一个或多个取代(例如，保守取代)的序列)。在又一个实施方案中，核酸可以包括编码来自重链可变区和轻链可变区的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR或高变环的核苷酸序列，所述重链可变区和轻链可变区具有本文表中所列的氨基酸序列，或与其基本同源的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更多的序列，和/或具有一个或多个取代(例如，保守取代)的序列)。
在某些实施方案中，核酸可以包括编码来自重链可变区的至少一个、两个或三个CDR或高变环的核苷酸序列，所述重链可变区具有如本文表中所列的核苷酸序列，与其基本同源的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更多的序列，和/或能够在本文描述的严格条件下杂交的序列)。在另一个实施方案中，核酸可以包括编码来自轻链可变区的至少一个、两个或三个CDR或高变环的核苷酸序列，所述轻链可变区具有如本文表中所列的核苷酸序列，或与其基本同源的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更多的序列，和/或能够在本文描述的严格条件下杂交的序列)。在另一个实施方案中，核酸可以包括编码来自重链可变区和轻链可变区的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR或高变环的核苷酸序列，所述重链可变区和轻链可变区具有本文表中所列的核苷酸序列，或与其基本同源的序列(例如，与其同一性为至少约85％、90％、95％、99％或更多的序列，和/或能够在本文描述的严格条件下杂交的序列)。
在某些实施方案中，核酸可以包括编码本文公开的细胞因子分子、免疫细胞衔接物或间质修饰部分的核苷酸序列。
在另一方面，本申请的特征在于含有本文所述核酸的宿主细胞和载体。核酸可以存在于同一宿主细胞或不同的宿主细胞中存在的单个载体或不同载体中，如下文更详细地描述。
载体
本文还提供了载体，其包括编码本文所述的多特异性或多功能分子的核苷酸序列。在一个实施方案中，载体包括编码本文所述的多特异性或多功能分子的核苷酸。在一个实施方案中，载体包括本文所述的核苷酸序列。载体包括但不限于病毒、质粒、粘粒、λ噬菌体或酵母人工染色体(YAC)。
可以采用许多载体系统。例如，一类载体利用源自动物病毒的DNA元件，所述动物病毒诸如例如牛乳头瘤病毒、多瘤病毒、腺病毒、牛痘病毒、杆状病毒、逆转录病毒(劳斯(Rous)肉瘤病毒、MMTV或MOMLV)或SV40病毒。另一类载体利用源自RNA病毒(诸如西门利克(Semliki)森林病毒、东方马脑炎病毒和黄病毒)的RNA元件。
另外，可以通过引入一种或多种允许选择转染的宿主细胞的标志物来选择DNA被稳定整合到其染色体中的细胞。例如，标志物可以向营养缺陷宿主提供质子移变、杀生物剂抗性(例如抗生素)或对重金属(诸如铜)的抗性等。可选择的标志基因可以直接连接到待表达的DNA序列，或可以通过共转化引入相同的细胞中。mRNA的最佳合成可能还需要其他元件。这些元件可包括剪接信号，以及转录启动子、增强子和终止信号。
一旦含有构建体的表达载体或DNA序列准备好用于表达，就可以将表达载体转染或引入合适的宿主细胞中。可以采用多种技术来实现这一点，诸如例如，原生质体融合、磷酸钙沉淀、电穿孔、逆转录病毒转导、病毒转染、基因枪、基于脂质的转染或其他常规技术。在原生质体融合的情况下，将细胞在培养基中生长并筛选适当的活性。用于培养所得转染细胞和用于回收产生的抗体分子的方法和条件是本领域技术人员已知的，并且基于本说明书，可以根据所使用的特定表达载体和哺乳动物宿主细胞进行改变或优化。
细胞
在另一方面，本申请的特征在于含有本文所述核酸的宿主细胞和载体。核酸可以存在于同一宿主细胞或不同宿主细胞中的单个载体或不同载体中。宿主细胞可以是真核细胞，例如，哺乳动物细胞、昆虫细胞、酵母细胞或原核细胞，例如，大肠杆菌。例如，哺乳动物细胞可以是培养的细胞或细胞系。示例性的哺乳动物细胞包括淋巴细胞细胞系(例如，NSO)、中国仓鼠卵巢细胞(CHO)、COS细胞、卵母细胞和来自转基因动物的细胞，例如，乳腺上皮细胞。
本发明还提供了包括编码本文所述抗体分子的核酸的宿主细胞。
在一个实施方案中，对宿主细胞进行基因工程化以包括编码抗体分子的核酸。
在一个实施方案中，通过使用表达盒对宿主细胞进行基因工程化。短语“表达盒”是指核苷酸序列，其能够影响基因在与此类序列相容的宿主中的表达。此类盒可以包括启动子，具有或没有内含子的可读框以及终止信号。也可以使用对影响表达所必需或有帮助的其他因素，诸如例如诱导型启动子。
本发明还提供了包括本文所述载体的宿主细胞。
该细胞可以是但不限于真核细胞、细菌细胞、昆虫细胞或人细胞。合适的真核细胞包括但不限于Vero细胞、HeLa细胞、COS细胞、CHO细胞、HEK293细胞、BHK细胞和MDCKII细胞。合适的昆虫细胞包括但不限于Sf9细胞。
用途和组合疗法
本文所述的方法包括通过使用本文所述的多特异性分子(例如，使用本文所述的药物组合物)来治疗对象的癌症。还提供了用于减轻或改善对象的癌症症状的方法，以及用于抑制癌症生长和/或杀伤一种或多种癌细胞的方法。在实施方案中，本文所述的方法在a本文所述施用或施用有本文所述的药物组合物的对象中减小肿瘤的大小和/或减少癌细胞的数目。
在实施方案中，癌症是血液学癌症。在实施方案中，血液学癌症是白血病或淋巴瘤。如本文所用，“血液学癌症”是指造血或淋巴样组织的肿瘤，例如，影响血液、骨髓或淋巴结的肿瘤。示例性的血液学恶性肿瘤包括但不限于白血病(例如，急性淋巴母细胞性白血病(ALL)、急性髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性髓细胞性白血病(CML)、毛细胞白血病、急性单核细胞白血病(AMoL)、慢性骨髓单核细胞性白血病(CMML)、幼年型骨髓单核细胞白血病(JMML)或大颗粒淋巴细胞白血病)、淋巴瘤(例如，艾滋病相关淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤(例如，经典霍奇金淋巴瘤或结节性淋巴细胞为主型霍奇金淋巴瘤)、蕈样真菌病、非霍奇金淋巴瘤(例如，B细胞非霍奇金淋巴瘤(例如，伯基特淋巴瘤、小淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、免疫母细胞性大细胞淋巴瘤、前体B淋巴母细胞性淋巴瘤或套细胞淋巴瘤)或T细胞非霍奇金淋巴瘤(蕈样真菌病、间变性大细胞淋巴瘤或前体T淋巴母细胞性淋巴瘤))、原发性中枢神经系统淋巴瘤、塞扎里综合征、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症)、慢性骨髓增生性肿瘤、郎格汉斯细胞组织细胞增多症、多发性骨髓瘤/浆细胞肿瘤、骨髓增生异常综合征或骨髓增生异常/骨髓增生性肿瘤。
在实施方案中，癌症是实体癌。示例性的实体癌包括但不限于卵巢癌、直肠癌、胃癌、睾丸癌、肛门区域癌、子宫癌、结肠癌、直肠癌、肾细胞癌、肝癌、非小细胞肺癌、小肠癌、食道癌、黑色素瘤、卡波济氏肉瘤、内分泌系统癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头或颈癌、皮肤或眼内恶性黑色素瘤、子宫癌、脑干神经胶质瘤、垂体腺瘤、表皮样癌、子宫颈鳞状细胞癌、输卵管癌、子宫内膜癌、阴道癌、软组织肉瘤、尿道癌、外阴癌、阴茎癌、膀胱癌、肾癌或输尿管癌、肾盂癌、脊柱轴肿瘤、中枢神经系统(CNS)赘生物、原发性CNS淋巴瘤、肿瘤血管生成、所述癌症的转移性病变，或其组合。
在某些实施方案中，癌症是上皮细胞的、间充质细胞的或血液系统的恶性肿瘤。在某些实施方案中，所治疗的癌症是实体瘤(例如类癌、癌或肉瘤)、软组织肿瘤(例如血红素恶性肿瘤)和转移性病变，例如本文公开的任何癌症的转移性病变。在一个实施方案中，所治疗的癌症是纤维化或增生性实体瘤，例如具有以下的一种或多种的肿瘤：有限的肿瘤灌注、压缩的血管、纤维化的肿瘤间质或增加的组织间隙液压。在一个实施方案中，实体瘤选自胰腺癌(例如，胰腺腺癌或胰腺导管腺癌)、乳腺癌、结肠癌、结直肠癌、肺癌(例如，小细胞肺癌(SCLC)或非小细胞肺癌)(NSCLC))、皮肤癌、卵巢癌、肝癌、食管癌、子宫内膜癌、胃癌、头颈癌、肾癌或前列腺癌中的一种或多种。
癌症的实例包括但不限于癌、淋巴瘤、母细胞瘤、肉瘤和白血病或淋巴样恶性肿瘤。此类癌症的更具体实例如下所示并包括：鳞状细胞癌(例如上皮鳞状细胞癌)、肺癌(包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞癌)、腹膜癌、肝细胞癌、胃(gastric)癌或胃(stomach)癌(包括胃肠癌)、胰腺癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝细胞瘤、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、结直肠癌、子宫内膜癌或子宫癌、唾液腺癌、肾(kidney)癌或肾(renal)癌、前列腺癌、外阴癌、甲状腺癌、肝癌、肛门癌、阴茎癌以及头颈癌。术语“癌症”包括原发性恶性细胞或肿瘤(例如，其细胞未迁移至对象体内除原始恶性肿瘤或肿瘤的部位以外的部位的那些)和继发性恶性细胞或肿瘤(例如，由恶性细胞或肿瘤细胞向不同于原始肿瘤部位的继发性部位的迁移引起的那些)。
癌症或恶性肿瘤的其他实例包括但不限于：儿童急性淋巴母细胞性白血病、急性淋巴母细胞性白血病、急性淋巴细胞白血病、急性髓性白血病、肾上腺皮质癌、成人(原发性)肝细胞癌、成人(原发性)肝癌、成人急性淋巴细胞白血病、成人急性髓性白血病、成人霍奇金病、成人霍奇金淋巴瘤、成人淋巴细胞白血病、成人非霍奇金淋巴瘤、成人原发性肝癌、成人软组织肉瘤、与艾滋病相关的淋巴瘤、与艾滋病相关的恶性肿瘤、肛门癌、星形细胞瘤、胆管癌、膀胱癌、骨癌、脑干神经胶质瘤、脑瘤、乳腺癌、肾盂和输尿管癌、中枢神经系统(原发性)淋巴瘤、中枢神经系统淋巴瘤、小脑星形细胞瘤、大脑星形细胞瘤、宫颈癌、儿童(原发性)肝细胞癌、儿童(原发性)肝癌、儿童急性淋巴母细胞性白血病、儿童急性髓性白血病、儿童脑干神经胶质瘤、儿童小脑星形细胞瘤、儿童大脑星形细胞瘤、儿童颅外生殖细胞瘤、儿童霍奇金病、儿童霍奇金淋巴瘤、儿童下丘脑和视觉通路神经胶质瘤、儿童淋巴母细胞性白血病、儿童髓母细胞瘤、儿童非霍奇金淋巴瘤、儿童松果体和幕上原始神经外胚层肿瘤、儿童原发性肝癌、儿童横纹肌肉瘤、儿童软组织肉瘤、儿童视觉通路和下丘脑神经胶质瘤、慢性淋巴细胞白血病、慢性髓细胞性白血病、结肠癌、皮肤T细胞淋巴瘤、内分泌胰腺胰岛细胞癌、子宫内膜癌、室管膜瘤、上皮样癌、食管癌、尤文肉瘤及相关肿瘤、外分泌胰腺癌、颅外生殖细胞瘤、性腺外生殖细胞瘤、肝外胆管癌、眼癌、女性乳腺癌、高歇氏病、胆囊癌、胃癌、胃肠道类癌、胃肠道肿瘤、生殖细胞肿瘤、妊娠滋养细胞肿瘤、多毛细胞白血病、头颈癌、肝细胞癌、霍奇金病、霍奇金淋巴瘤、高丙种球蛋白血症、下咽癌、肠癌、眼内黑色素瘤、胰岛细胞癌、胰岛细胞胰腺癌、卡波济氏肉瘤、肾癌、喉癌、唇和口腔癌、肝癌、肺癌、淋巴组织增生性病症、巨球蛋白血症、男性乳腺癌、恶性间皮瘤、恶性胸腺瘤、髓母细胞瘤、黑色素瘤、间皮瘤、转移性隐匿性原发性鳞状颈癌、转移性原发性鳞状颈癌、转移性鳞状颈癌、多发性骨髓瘤、多发性骨髓瘤/浆细胞肿瘤、骨髓增生异常综合征、髓细胞性白血病、髓性白血病、骨髓增生性病症、鼻腔和鼻窦癌、鼻咽癌、神经母细胞瘤、妊娠期非霍奇金淋巴瘤、非黑色素瘤皮肤癌、非小细胞肺癌、隐匿性原发性转移性鳞状颈癌、口咽癌、骨/恶性纤维肉瘤、骨肉瘤/恶性纤维组织细胞瘤、骨肉瘤/骨恶性纤维组织细胞瘤、卵巢上皮瘤、卵巢生殖细胞肿瘤、卵巢低恶性潜能肿瘤、胰腺癌、副蛋白血症、紫癜、甲状旁腺癌、阴茎癌、嗜铬细胞瘤、垂体瘤、浆细胞肿瘤/多发性骨髓瘤、原发性中枢神经系统淋巴瘤、原发性肝癌、前列腺癌、直肠癌、肾细胞癌、肾盂和输尿管癌、视网膜母细胞瘤、横纹肌肉瘤、唾液腺癌、结节病肉瘤、塞扎里综合征、皮肤癌、小细胞肺癌、小肠癌、软组织肉瘤、鳞状颈癌、胃癌、幕上原始神经外胚层和松果体肿瘤、T细胞淋巴瘤、睾丸癌、胸腺瘤、甲状腺癌、肾盂和输尿管移行细胞癌、肾盂和输尿管移行癌、滋养细胞瘤、输尿管和肾盂细胞癌、尿道癌、子宫癌、子宫肉瘤、阴道癌、视觉通路和下丘脑神经胶质瘤、外阴癌、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症、肾母细胞瘤以及位于上文所列器官系统中的除瘤形成以外的任何其他过度增生性疾病。
在其他实施方案中，如上所述和本文所述的多特异性分子用于治疗过度增殖性病症，例如过度增殖性结缔组织病症(例如过度增殖性纤维化疾病)。在一个实施方案中，过度增殖性纤维化疾病是多系统的或器官特异性的。示例性的过度增生性纤维化疾病包括但不限于多系统性病症(例如系统性硬化病、多灶性纤维硬化、骨髓移植受者中的硬皮病移植物抗宿主病、肾源性系统性纤维化、硬皮病)和器官特异性病症(例如眼、肺、肝脏、心脏、肾脏、胰腺、皮肤和其他器官的纤维化)。在其他实施方案中，病症选自肝硬化或结核病。在其他实施方案中，病症是麻风病。
在实施方案中，以适合于待治疗或预防的疾病的方式施用多特异性分子(或药物组合物)。施用的量和频率将取决于诸如患者的状况以及患者疾病的类型和严重性的因素。适当的剂量可以通过临床试验确定。例如，当指示“有效量”或“治疗量”时，医师可以通过考虑肿瘤大小的个体差异、感染或转移的程度、对象的年龄、体重和状况来确定待施用的药物组合物(或多特异性分子)的精确量。在实施方案中，本文描述的药物组合物可以以104至109个细胞/kg体重的剂量施用，例如105至106个细胞/kg体重，包含在这些范围内的所有整数值。在实施方案中，本文所述的药物组合物可以以这些剂量多次施用。在实施方案中，本文所述的药物组合物可以使用在免疫疗法中所述的输注技术来施用(参见例如Rosenberg等人，New Eng.J.of Med.319:1676,1988)。
在实施方案中，癌症是骨髓增生性赘生物，例如原发性或特发性骨髓纤维化(ML)、原发性血小板增多症(ET)、真性红细胞增多症(PV)或慢性髓细胞性白血病(CML)。在实施方案中，癌症是骨髓纤维化。在实施方案中，对象具有骨髓纤维化。在实施方案中，对象具有钙网蛋白突变，例如本文公开的钙网蛋白突变。在实施方案中，对象不具有JAK2-V617F突变。在实施方案中，对象具有JAK2-V617F突变。在实施方案中，对象具有MPL突变。在实施方案中，对象不具有MPL突变。
在实施方案中，癌症是实体癌。示例性的实体癌包括但不限于卵巢癌、直肠癌、胃癌、睾丸癌、肛门区域癌、子宫癌、结肠癌、直肠癌、肾细胞癌、肝癌、非小细胞肺癌、小肠癌、食道癌、黑色素瘤、卡波济氏肉瘤、内分泌系统癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头或颈癌、皮肤或眼内恶性黑色素瘤、子宫癌、脑干神经胶质瘤、垂体腺瘤、表皮样癌、子宫颈鳞状细胞癌、输卵管癌、子宫内膜癌、阴道癌、软组织肉瘤、尿道癌、外阴癌、阴茎癌、膀胱癌、肾癌或输尿管癌、肾盂癌、脊柱轴肿瘤、中枢神经系统(CNS)赘生物、原发性CNS淋巴瘤、肿瘤血管生成、所述癌症的转移性病变，或其组合。
在实施方案中，将多特异性分子或药物组合物肠胃外施用于对象。在实施方案中，将细胞经静脉内、皮下、肿瘤内、结节内、肌内、皮内或腹膜内施用于对象。在实施方案中，将细胞直接施用(例如注射)到肿瘤或淋巴结中。在实施方案中，细胞以输注(例如，如Rosenberg等人，New Eng.J.of Med.319:1676,1988所述)或静脉推注的形式施用。在实施方案中，细胞以可注射的储库制剂形式施用。
在实施方案中，对象是哺乳动物。在实施方案中，对象是人、猴、猪、狗、猫、牛、绵羊、山羊、兔、大鼠或小鼠。在实施方案中，对象是人。在实施方案中，对象是儿科对象，例如小于18岁，例如小于17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1岁或更小。在实施方案中，对象是成年人，例如，至少18岁，例如，至少19、20、21、22、23、24、25、25-30、30-35、35-40、40-50、50-60、60-70、70-80或80-90岁。
组合疗法
本文公开的多特异性或多功能分子可以与第二治疗剂或程序组合使用。
在实施方案中，在对象被诊断出患有癌症之后，例如在从对象消除癌症之前，施用/执行多特异性或多功能分子和第二治疗剂或程序。在实施方案中，同时或并行施用/执行多特异性或多功能分子和第二治疗剂或程序。例如，一种治疗的递送在开始第二治疗的递送时仍在进行，例如，在治疗的施用上存在重叠。在其他实施方案中，顺序地施用/执行多特异性或多功能分子和第二治疗剂或程序。例如，一种治疗的递送在另一治疗的递送开始之前停止。
在实施方案中，组合疗法可以比单独使用任一药剂的单一疗法产生更有效的治疗。在实施方案中，第一治疗和第二治疗的组合比单独的第一治疗或第二治疗更有效(例如，导致症状和/或癌细胞的更大减少)。在实施方案中，与作为单一疗法施用时通常达到相似效果所需的第一或第二治疗剂量相比，组合疗法允许使用更低剂量的第一治疗或第二治疗。在实施方案中，组合疗法具有部分加和作用、完全加和作用或大于加和作用。
在一个实施方案中，将多特异性或多功能分子与疗法例如癌症疗法(例如，抗癌剂、免疫疗法、光动力疗法(PDT)、手术和/或辐射中的一种或多种)组合施用。术语“化学疗法”、“化疗剂”和“抗癌剂”在本文中可互换使用。多特异性或多功能分子和疗法例如癌症疗法的施用可以顺序(有或没有重叠)或同时进行。多特异性或多功能分子的施用在疗法(例如癌症疗法)过程期间可以是连续或间歇的。本文所述的某些疗法可用于治疗癌症和非癌性疾病。例如，使用本文所述的方法和组合物，可以在癌性和非癌性病况(例如，结核病)中提高PDT的功效(例如，在Agostinis,P.等人，(2011)CA Cancer J.Clin.61:250-281中综述)。
抗癌疗法
在其他实施方案中，多特异性或多功能分子与低分子量或小分子量化疗剂组合施用。示例性的低分子量或小分子量化疗剂包括但不限于：13-顺式-维甲酸(异维甲酸、)、2-CdA(2-氯脱氧腺苷、克拉屈滨、LEUSTATINTM)、5-阿扎胞苷(阿扎胞苷、/>)、5-氟尿嘧啶(5-FU、氟尿嘧啶、/>)、6-巯嘌呤(6-MP、巯嘌呤、/>)、6-TG(6-硫鸟嘌呤、硫鸟嘌呤、THIOGUANINE/>)、abraxane(紫杉醇蛋白结合型)、放线菌素D(更生霉素，/>)、阿利维甲酸全反式维甲酸(ATRA、维甲酸、/>)、六甲蜜胺(六甲基三聚氰胺、HMM、/>)、氨甲蝶呤(甲氨蝶呤、甲氨蝶呤钠、MTX、TREXALLTM、)、氨磷汀/>阿糖胞嘧啶(Ara-C、阿糖胞苷、)、三氧化二砷/>天冬酰胺酶(欧文氏菌L-天冬酰胺酶、L-天冬酰胺酶、/>)、BCNU(卡莫司汀、/>)、苯达莫司汀/>贝沙罗汀/>博来霉素白消安/> )、甲酰四氢叶酸钙(嗜橙菌因子、亚叶酸、甲酰四氢叶酸)、喜树碱-11(CPT-11、伊立替康、/>)、卡培他滨/>卡铂/>卡莫司汀压片(带有卡莫司汀植入物的prolifeprospan 20、/>压片)、CCI-779(坦罗莫司、/>)、CCNU(洛莫司汀、CeeNU)、CDDP(顺铂、/> )、苯丁酸氮芥(留可然)、环磷酰胺(/> )、达卡巴嗪(DIC、DTIC、咪唑甲酰胺、)、道诺霉素(柔红霉素、盐酸柔红霉素、盐酸红比霉素、)、地西他滨/>右雷佐生/>DHAD(米托蒽醌、/>)、多西紫杉醇/>多柔比星表柔比星(ELLENCETM)、雌莫司汀依托泊苷(VP-16、依托泊苷磷酸盐、/> )、氟尿苷/>氟达拉滨氟尿嘧啶(乳霜)(CARACTM、/> )、吉西他滨/>羟基脲(/>DROXIATM、MYLOCELTM)、伊达比星异环磷酰胺/>伊沙匹隆(IXEMPRATM)、LCR(醛基长春碱、长春新碱、VCR、/>VINCASAR/>)、L-PAM(L-溶肉瘤素、美法仑、苯丙氨酸氮芥、/>)、二氯甲基二乙胺(盐酸二氯甲基二乙胺、氮芥、氮芥子气、)、美司钠(MESNEXTM)、丝裂霉素(丝裂霉素C、MTC、/>)、奈拉滨/>奥沙利铂(ELOXATINTM)、紫杉醇(/>ONXALTM)、培门冬酶(PEG-L-天冬酰胺酶、/>)、培美曲塞/>喷司他丁甲基苄肼/>链脲菌素/>替莫唑胺/>替尼泊苷(VM-26、/>)、TESPA(硫代磷酰胺、塞替派、TSPA、/>)、托泊替康/>长春碱(硫酸长春碱、长春花碱、VLB、/>)、长春瑞滨(酒石酸长春瑞滨、)和伏立诺他/>
在另一个实施方案中，多特异性或多功能分子与生物制剂联合施用。可用于治疗癌症的生物制剂是本领域已知的，并且本发明的结合分子可以例如与此类已知的生物制剂联合施用。例如，FDA已批准以下用于治疗乳腺癌的生物制剂：(曲妥珠单抗，Genentech Inc.,South San Francisco,Calif.；在HER2阳性乳腺癌中具有抗肿瘤活性的人源化单克隆抗体)；/>(氟维司群，AstraZeneca Pharmaceuticals,LP,Wilmington,Del.；用于治疗乳腺癌的雌激素受体拮抗剂)；/>(阿那曲唑，AstraZeneca Pharmaceuticals,LP；阻断制造雌激素所需的芳香酶的非甾体芳香酶抑制剂)；/>(依西美坦，Pfizer Inc.,New York,N.Y.；用于治疗乳腺癌的不可逆的甾族芳香酶灭活剂)；/>(来曲唑，Novartis Pharmaceuticals,East Hanover,N.J.；FDA批准用于治疗乳腺癌的非甾体芳香酶抑制剂)；和/>(他莫昔芬，AstraZeneca Pharmaceuticals,LP；FDA批准用于治疗乳腺癌的非甾体抗雌激素药)。可以与本发明的结合分子组合的其他生物制剂包括：/>(贝伐单抗，GenentechInc.；第一种经FDA批准的旨在抑制血管生成的疗法)；和/>(替伊莫单抗，Biogen Idec,Cambridge,Mass.；目前批准用于治疗B细胞淋巴瘤的放射性标记的单克隆抗体)。
此外，FDA已批准以下用于治疗结直肠癌的生物制剂： (西妥昔单抗，ImClone Systems Inc.,New York,N.Y.和Bristol-MyersSquibb,New York,N.Y.是针对表皮生长因子受体(EGFR)的单克隆抗体)；/>(甲磺酸伊马替尼；蛋白激酶抑制剂)；和/>(盐酸左旋咪唑，JanssenPharmaceutica Products,LP,Titusville,N.J.；免疫调节剂，1990年被FDA批准在Dukes C期结肠癌患者的手术切除后，与5-氟尿嘧啶组合用作辅助治疗)。
对于肺癌的治疗，示例性的生物制剂包括(盐酸厄洛替尼，OSIPharmaceuticals Inc.,Melville,N.Y.；设计为靶向人表皮生长因子受体1(HER1)途径的小分子)。
对于多发性骨髓瘤的治疗，示例性的生物制剂包括Velcade(硼替佐米，Millennium Pharmaceuticals,Cambridge Mass.；蛋白酶体抑制剂)。其他生物制剂包括/>(沙利度胺，Clegene Corporation,Warren,N.J.；免疫调节剂并且似乎具有多种作用，包括抑制骨髓瘤细胞的生长和存活以及抗血管生成的能力)。
另外的示例性癌症治疗性抗体包括但不限于3F8、阿巴伏单抗(abagovomab)、阿德木单抗(adecatumumab)、阿夫土珠单抗(afutuzumab)、培化阿珠单抗(alacizumab pegol)、阿仑珠单抗(alemtuzumab)喷替酸阿妥莫单抗(altumomab pentetate)/>马安莫单抗(anatumomabmafenatox)、安芦组单抗(anrukinzumab)(IMA-638)、阿泊珠单抗(apolizumab)、阿西莫单抗(arcitumomab)/>巴维昔单抗(bavituximab)、贝妥莫单抗(bectumomab)/>贝利木单抗(belimumab)贝索单抗(besilesomab)贝伐珠单抗(bevacizumab)/>比伐单抗美登素(bivatuzumab mertansine)、兰妥莫单抗(blinatumomab)、维布妥昔单抗(brentuximabvedotin)、莫坎妥珠单抗美登素(cantuzumab mertansine)、卡罗单抗喷地肽(capromabpendetide)/>卡妥索单抗(catumaxomab)/>CC49、西妥昔单抗(cetuximab)(C225，/>)、泊西他珠单抗(citatuzumabbogatox)、西妥木单抗(cixutumumab)、泰坦-克利妥珠单抗(clivatuzumab tetraxetan)、可那木单抗、达西珠单抗(dacetuzumab)、地舒单抗(denosumab)/>地莫单抗(detumomab)、依美昔单抗(ecromeximab)、依屈洛单抗(edrecolomab)依洛珠单抗(elotuzumab)、西依匹莫单抗(epitumomab cituxetan)、依帕珠单抗(epratuzumab)、厄妥玛索单抗(ertumaxomab)/>埃达组单抗(etaracizumab)、法利珠单抗(farletuzumab)、芬妥木单抗(figitumumab)、非苏木单抗(fresolimumab)、加利昔单抗(galiximab)、吉妥珠单抗奥唑米星(gemtuzumabozogamicin)/>吉妥昔单抗(girentuximab)、glembatumumabvedotin、替伊莫单抗(ibritumomab)(替伊莫单抗(ibritumomab tiuxetan)，)、伊戈伏单抗(igovomab)/>英妥木单抗(intetumumab)、伊诺珠单抗奥唑米星(inotuzumab ozogamicin)、伊匹木单抗(ipilimumab)、伊妥木单抗(iratumumab)、拉贝珠单抗(labetuzumab)来沙木单抗(lexatumumab)、林妥珠单抗(lintuzumab)、鲁卡木单抗(lucatumumab)、鲁昔单抗(lumiliximab)、马帕木单抗(mapatumumab)、马妥珠单抗(matuzumab)、米拉珠单抗(milatuzumab)、明瑞莫单抗(minretumomab)、米妥莫单抗(mitumomab)、他那可单抗(nacolomab tafenatox)、他那莫单抗(naptumomabestafenatox)、奈昔木单抗(necitumumab)、尼妥珠单抗(nimotuzumab)巯诺莫单抗(nofetumomab merpentan)奥法木单抗(ofatumumab)/>奥拉单抗(olaratumab)、莫奥珠单抗(oportuzumab monatox)、奥戈伏单抗(oregovomab)帕木单抗(panitumumab)/>培妥莫单抗(pemtumomab)/>培妥珠单抗(pertuzumab)/>平妥莫单抗(pintumomab)、普林木单抗(pritumumab)、雷莫芦单抗(ramucirumab)、雷珠单抗(ranibizumab)/>利妥木单抗(rilotumumab)、利妥昔单抗(rituximab) 罗妥木单抗(robatumumab)、沙妥莫单抗喷地肽(satumomab pendetide)、西罗珠单抗(sibrotuzumab)、司妥昔单抗(siltuximab)、松妥珠单抗(sontuzumab)、他珠单抗(tacatuzumab tetraxetan)/>帕他莫单抗(taplitumomab paptox)、替妥莫单抗(tenatumomab)、TGN1412、替西木单抗(ticilimumab)(曲美木单抗(tremelimumab))、替加珠单抗(tigatuzumab)、TNX-650、托西莫单抗(tositumomab)/>曲妥珠单抗(trastuzumab)/>曲美木单抗、西莫白介素单抗(tucotuzumab celmoleukin)、维妥珠单抗(veltuzumab)、伏洛昔单抗(volociximab)、伏妥木单抗(votumumab)/>扎芦木单抗(zalutumumab)/>和扎木单抗(zanolimumab)
在其他实施方案中，多特异性或多功能分子与病毒癌症治疗剂组合施用。示例性的病毒癌症治疗剂包括但不限于牛痘病毒(vvDD-CDSR)、表达癌胚抗原的麻疹病毒、重组牛痘病毒(TK缺失加GM-CSF)、塞内卡谷病毒001、新城病毒、柯萨奇病毒A21、GL-ONC1、表达EBNA1C末端/LMP2嵌合蛋白的重组修饰痘苗安卡拉疫苗、表达癌胚抗原的麻疹病毒、G207溶瘤病毒、表达p53的修饰痘苗病毒安卡拉疫苗、OncoVEX GM-CSF修饰的单纯疱疹1病毒、鸡痘病毒疫苗载体、重组牛痘前列腺特异性抗原疫苗、人乳头瘤病毒16/18L1病毒样颗粒/AS04疫苗、MVA-EBNA1/LMP2注射液疫苗、四价HPV疫苗、四价人乳头瘤病毒(6、11、16、18型)重组疫苗重组鸡痘-CEA(6D)/TRICOM疫苗、重组牛痘-CEA(6D)-TRICOM疫苗、重组修饰牛痘安卡拉-5T4疫苗、重组鸡痘-TRICOM疫苗、溶瘤性疱疹病毒NV1020、HPV L1VLP疫苗V504、人乳头瘤病毒二价(16和18型)疫苗/>单纯疱疹病毒HF10、Ad5CMV-p53基因、重组牛痘DF3/MUC1疫苗、重组牛痘-MUC-1疫苗、重组牛痘-TRICOM疫苗、ALVAC MART-1疫苗、表达人前脑啡肽原(NP2)的复制缺陷型单纯疱疹病毒I型(HSV-1)载体、野生型呼肠孤病毒、呼肠孤病毒3Dearing/>溶瘤病毒HSV1716、基于重组修饰牛痘安卡拉(MVA)的编码爱泼斯坦-巴尔病毒靶抗原的疫苗、重组鸡痘-前列腺特异性疫苗抗原疫苗、重组牛痘前列腺特异性抗原疫苗、重组牛痘-B7.1疫苗、rAd-p53基因、Ad5-δ24RGD、HPV疫苗580299、JX-594(胸苷激酶缺失的牛痘病毒加GM-CSF)、HPV-16/18L1/AS04、鸡痘病毒疫苗载体、牛痘酪氨酸酶疫苗、MEDI-517HPV-16/18VLP AS04疫苗、含有单纯疱疹病毒的胸苷激酶的腺病毒载体TK99UN、HspE7、FP253/氟达拉滨、ALVAC(2)黑色素瘤多抗原治疗疫苗、ALVAC-hB7.1、金丝雀痘-hIL-12黑色素瘤疫苗、Ad-REIC/Dkk-3、rAd-IFNSCH 721015、TIL-Ad-INFg、Ad-ISF35和柯萨奇病毒A21(CVA21，/>)。
在其他实施方案中，多特异性或多功能分子与纳米药物组合施用。示例性的癌症纳米药物包括但不限于(紫杉醇结合的白蛋白纳米颗粒)、CRLX101(与线性环糊精基聚合物缀合的CPT)、CRLX288(将多西紫杉醇与可生物降解的聚合物聚(乳酸-共-乙醇酸)缀合)、阿糖胞苷脂质体(Ara-C脂质体，DEPOCYTTM)、柔红霉素脂质体多柔比星脂质体/>胶囊化的柔红霉素柠檬酸脂质体/>和PEG抗VEGF适体/>
在一些实施方案中，多特异性或多功能分子与紫杉醇或紫杉醇制剂(例如结合蛋白质的紫杉醇(例如/>))组合施用。示例性的紫杉醇制剂包括但不限于结合纳米颗粒白蛋白的紫杉醇(/>由AbraxisBioscience销售)、二十二碳六烯酸结合的紫杉醇(DHA-紫杉醇、Taxoprexin，由Protarga销售)、结合聚谷氨酸的紫杉醇(PG-紫杉醇、聚谷紫杉醇、CT-2103、XYOTAX，由CellTherapeutic销售)、肿瘤激活的前药(TAP)、ANG105(与紫杉醇的三个分子结合的Angiopep-2，由ImmunoGen销售)、紫杉醇-EC-1(与识别erbB-2的肽EC-1结合的紫杉醇；参见Li等人，Biopolymers(2007)87:225-230)和葡萄糖缀合的紫杉醇(例如2’-紫杉醇甲基2-葡萄糖吡喃葡萄糖基琥珀酸酯，参见Liu等人，Bioorganic&Medicinal Chemistry Letters(2007)17:617-620)。
用于治疗癌症的示例性的RNAi和反义RNA试剂包括但不限于CALAA-01、siG12DLODER(Local Drug EluteR)和ALN-VSP02。
其他癌症治疗剂包括但不限于细胞因子(例如，阿地白介素(IL-2、白介素-2、)、α干扰素(IFN-α、干扰素α、/>A(干扰素α-2b)、(干扰素α-2a))、依泊汀α/>非格司亭(filgrastim)(G-CSF、粒细胞-集落刺激因子、/>)、GM-CSF(粒细胞巨噬细胞集落刺激因子、沙格司亭(sargramostim)、LEUKINETM)、IL-11(白介素-11、奥普瑞白介素、/>)、干扰素α-2b(PEG缀合物)(PEG干扰素、PEG-INTRONTM)和培非司亭(pegfilgrastim)(NEULASTATM))、激素治疗剂(例如，氨鲁米特(aminoglutethimide)阿那曲唑(anastrozole)/>比卡鲁胺(bicalutamide)/>依西美坦(exemestane)/>氟甲睾酮(fluoxymesterone)/>氟他胺(flutamide)氟维司群(fulvestrant)/>戈舍瑞林(goserelin)来曲唑(letrozole)/>亮丙瑞林(leuprolide)(ELIGARDTM，/>LUPRON/>VIADURTM)、甲地孕酮(megestrol)(醋酸甲地孕酮、/>)、尼鲁米特(nilutamide)/> 奥曲肽(octreotide)(醋酸奥曲肽、/>SANDOSTATIN/>)、雷洛昔芬(raloxifene)/>罗米司亭(romiplostim)他莫昔芬(tamoxifen)/>和托瑞米芬(toremifene))、磷脂酶A2抑制剂(例如阿那格雷/>)、生物应答调节剂(例如BCG/> 和达贝泊汀(Darbepoetin)α/>)、靶向治疗剂(例如硼替佐米(bortezomib)/>达沙替尼(dasatinib)(SPRYCELTM)、地尼白介素(denileukin diftitox)/>厄洛替尼(erlotinib)依维莫司(everolimus)/>吉非替尼(gefitinib)甲磺酸伊马替尼(imatinib mesylate)(STI-571，GLEEVECTM)、拉帕替尼(lapatinib)/>索拉非尼(sorafenib)/>和SU11248(舒尼替尼(sunitinib)，/>))、免疫调制和抗血管生成剂(例如CC-5013(来那度胺(lenalidomide)、/>)和沙利度胺(thalidomide)/>)、糖皮质激素(例如可的松(氢化可的松、氢化可的松磷酸钠、氢化可的松琥珀酸钠、HYDROCORT/>氢化可的松磷酸、)、地卡特隆(decadron)(地塞米松(dexamethasone)、醋酸地塞米松、磷酸地塞米松、)、甲泼尼龙(6-甲基泼尼松龙、醋酸甲泼尼龙、甲泼尼龙琥珀酸钠、 )、泼尼松龙/> 和泼尼松(/>LIQUID))和双膦酸盐(例如帕米膦酸二钠和唑来膦酸/>)
在一些实施方案中，多特异性或多功能分子与酪氨酸激酶抑制剂(例如受体酪氨酸激酶(RTK)抑制剂)组合使用。示例性的酪氨酸激酶抑制剂包括但不限于表皮生长因子(EGF)途径抑制剂(例如表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂)、血管内皮生长因子(VEGF)途径抑制剂(例如针对VEGF的抗体、VEGF阱、血管内皮生长因子受体(VEGFR)抑制剂(例如VEGFR-1抑制剂、VEGFR-2抑制剂、VEGFR-3抑制剂))、血小板衍生的生长因子(PDGF)途径抑制剂(例如，血小板衍生的生长因子受体(PDGFR)抑制剂(例如，PDGFR-β抑制剂))、RAF-1抑制剂、KIT抑制剂和RET抑制剂。在一些实施方案中，与AHCM试剂组合使用的抗癌剂选自：阿昔替尼(axitinib)(AG013736)、波舒替尼(bosutinib)(SKI-606)、西地尼布(cediranib)(RECENTINTM、AZD2171)、达沙替尼(dasatinib)(BMS-354825)、厄洛替尼吉非替尼(gefitinib)/>伊马替尼(imatinib)(CGP57148B、STI-571)、拉帕替尼(lapatinib)来妥替尼(lestaurtinib)(CEP-701)、奈拉替尼(neratinib)(HKI-272)、尼洛替尼(nilotinib)/>司马尼布(semaxanib)(司马沙尼(semaxinib)，SU5416)、舒尼替尼(sunitinib)(/>SU11248)、托西尼布(toceranib)/>凡他尼布(vandetanib)(/>ZD6474)、伐拉尼布(vatalanib)(PTK787、PTK/ZK)、曲妥珠单抗/>贝伐珠单抗利妥昔单抗/>西妥昔单抗/>帕木单抗/>雷珠单抗/>尼洛替尼/>索拉非尼/>阿仑珠单抗/>吉妥珠单抗奥唑米星ENMD-2076、PCI-32765、AC220、多维替尼乳酸盐(TKI258、CHIR-258)、BIBW 2992(TOVOKTM)、SGX523、PF-04217903、PF-02341066、PF-299804、BMS-777607、ABT-869、MP470、BIBF 1120/>AP24534、JNJ-26483327、MGCD265、DCC-2036、BMS-690154、CEP-11981、替沃扎尼(tivozanib)(AV-951)、OSI-930、MM-121、XL-184、XL-647、XL228、AEE788、AG-490、AST-6、BMS-599626、CUDC-101、PD153035、培利替尼(pelitinib)(EKB-569)、凡他尼布(vandetanib)(凡德他尼)、WZ3146、WZ4002、WZ8040、ABT-869(利尼伐尼(linifanib))、AEE788、AP24534(泊那替尼(ponatinib))、AV-951(替沃扎尼(tivozanib))、阿昔替尼(axitinib)、BAY 73-4506(瑞戈非尼(regorafenib))、丙氨酸布立尼布(brivanib alaninate)(BMS-582664)、布立尼布(BMS-540215)、西地尼布(cediranib)(AZD2171)、CHIR-258(多维替尼)、CP 673451、CY472、E7080、Ki8751、马赛替尼(masitinib)(AB1010)、MGCD-265、二磷酸莫替沙尼(motesanib diphosphate)(AMG-706)、MP-470、OSI-930、盐酸帕唑帕尼(Pazopanib Hydrochloride)、PD173074、甲苯磺酸索拉非尼(SorafenibTosylate)(Bay 43-9006)、SU 5402、TSU-68(SU6668)、伐拉尼布(vatalanib)、XL880(GSK1363089、EXEL-2880)。选定的酪氨酸激酶抑制剂选自舒尼替尼、厄洛替尼、吉非替尼或索拉非尼。在一个实施方案中，酪氨酸激酶抑制剂是舒尼替尼。
在一个实施方案中，多特异性或多功能分子与抗血管生成剂或血管靶向剂或血管破坏剂中的一种或多种组合施用。示例性的抗血管生成剂包括但不限于VEGF抑制剂(例如，抗VEGF抗体(例如贝伐珠单抗)；VEGF受体抑制剂(例如伊曲康唑(itraconazole))；细胞增殖素和/或内皮细胞迁移的抑制剂(例如，羧酰胺基三唑、TNP-470)；血管生成刺激剂的抑制剂(例如，舒拉明)等。血管靶向剂(VTA)或血管破坏剂(VDA)被设计成损害癌症肿瘤的脉管系统(血管)，引起中心性坏死(在例如Thorpe,P.E.(2004)Clin.Cancer Res.卷10:415-427中综述)。VTA可以是小分子。示例性的小分子VTA包括但不限于微管失稳药物(例如康普瑞汀A-4磷酸二钠(CA4P)、ZD6126、AVE8062、Oxi 4503)；和伐地美生(vadimezan)(ASA404)。
免疫检查点抑制剂
在其他实施方案中，本文所述的方法包括免疫检查点抑制剂与多特异性或多功能分子的组合使用。该方法可用于体内治疗方案。
在实施方案中，免疫检查点抑制剂抑制检查点分子。示例性的检查点分子包括但不限于CTLA4、PD1、PD-L1、PD-L2、TIM3、LAG3、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14或CD270)、BTLA、KIR、MHC I类、MHC II类、GAL9、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1和A2aR。参见例如Pardoll.Nat.Rev.Cancer 12.4(2012):252-64，其通过引用并入本文。
在实施方案中，免疫检查点抑制剂是PD-1抑制剂，例如抗PD-1抗体，诸如纳武利尤单抗、派姆单抗或匹地利珠单抗。纳武利尤单抗(也称为MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538或BMS-936558)是特异性抑制PD1的完全人IgG4单克隆抗体。参见例如，US 8,008,449和WO2006/121168。派姆单抗(也称为帕博利珠单抗、MK-3475、MK03475、SCH-900475或Merck)是与PD-1结合的人源化IgG4单克隆抗体。参见例如Hamid,O.等人(2013)New England Journal of Medicine 369(2):134–44，US 8,354,509和WO2009/114335。匹地利珠单抗(也称为CT-011或Cure Tech)是与PD1结合的人源化IgG1k单克隆抗体。参见例如，WO2009/101611。在一个实施方案中，PD-1的抑制剂是具有与纳武利尤单抗、派姆单抗或匹地利珠单抗的序列基本相同或相似的序列(例如，与其同一性为至少85％、90％、95％或更高的序列)的抗体分子。另外的抗PD1抗体(例如AMP 514(Amplimmune))在例如US 8,609,089、US 2010028330和/或US 20120114649中描述。/>
在一些实施方案中，PD-1抑制剂是免疫粘附素，例如包括与恒定区(例如，免疫球蛋白的Fc区)融合的PD-1配体(例如PD-L1或PD-L2)的细胞外/PD-1结合部分的免疫粘附素。在实施方案中，PD-1抑制剂是AMP-224(B7-DCIg，例如，在WO2011/066342和WO2010/027827中所述)，其是阻断B7-H1与PD-1之间的相互作用的PD-L2 Fc融合可溶性受体。
在实施方案中，免疫检查点抑制剂是PD-L1抑制剂，例如，抗体分子。在一些实施方案中，PD-L1抑制剂是YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105。在一些实施方案中，抗PD-L1抗体是MSB0010718C(也称为A09-246-2；Merck Serono)，其是与PD-L1结合的单克隆抗体。例如在WO2013/079174中描述了示例性的人源化抗PD-L1抗体。在一个实施方案中，PD-L1抑制剂是抗PD-L1抗体，例如YW243.55.S70。YW243.55.S70抗体描述于例如WO 2010/077634中。在一个实施方案中，PD-L1抑制剂是MDX-1105(也称为BMS-936559)，其描述于例如WO2007/005874中。在一个实施方案中，PD-L1抑制剂是MDPL3280A(Genentech/Roche)，其是针对PD-L1的人Fc优化的IgG1单克隆抗体。参见例如美国专利号7,943,743和美国公开号20120039906。在一个实施方案中，PD-L1的抑制剂是具有与YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105的序列基本相同或相似的序列(例如，与其的同一性为至少85％、90％、95％或更高的序列)的抗体分子。
在实施方案中，免疫检查点抑制剂是PD-L2抑制剂，例如AMP-224(其是阻断PD1和B7-H1之间相互作用的PD-L2 Fc融合可溶性受体)。参见例如WO2010/027827和WO2011/066342。
在一个实施方案中，免疫检查点抑制剂是LAG-3抑制剂，例如，抗LAG-3抗体分子。在实施方案中，抗LAG-3抗体是BMS-986016(也称为BMS986016；Bristol-Myers Squibb)。BMS-986016和其他人源化抗LAG-3抗体描述于例如US 2011/0150892、WO2010/019570和WO2014/008218中。
在实施方案中，免疫检查点抑制剂是TIM-3抑制剂，例如，抗TIM3抗体分子，例如描述于美国专利号8,552,156、WO 2011/155607、EP 2581113和美国公开号2014/044728中。
在实施方案中，免疫检查点抑制剂是CTLA-4抑制剂，例如，抗CTLA-4抗体分子。示例性的抗CTLA4抗体包括曲美木单抗(来自Pfizer的IgG2单克隆抗体，以前称为替西木单抗，CP-675,206)；和伊匹木单抗(也称为MDX-010，CAS号477202-00-9)。其他示例性的抗CTLA-4抗体描述于例如美国专利号5,811,097中。
诊断用途
在一些实施方案中，本文所述的抗体分子可用于诊断方法，例如，用于确定对象是否患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤，例如T细胞恶性肿瘤)或处于患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤，例如T细胞恶性肿瘤)的风险中。在一些实施方案中，抗体分子用于伴随诊断，以例如确定对象在例如治疗(例如，用本文所述的抗体分子治疗)后是否显示出疾病或病症(例如，癌症)的预后、严重程度或存在或不存在的变化。
一般来说，诊断方法包括使本文所述的抗体分子与生物样品(例如，包括组织或细胞，或其部分或成分)接触。在一些实施方案中，该方法包括流式分析，例如使用多组方法进行流式分析。在一些实施方案中，该方法包括免疫组化(例如，发色或荧光方法)。在一些实施方案中，该方法包括免疫组化(例如固定组织的免疫组化，例如FFPE组织的免疫组化)。在一些实施方案中，该方法包括评估T细胞克隆性，例如以确定T细胞恶性肿瘤的存在和/或水平。在一些实施方案中，该方法包括测量来自生物样品的TRBC1+细胞的水平(例如，确定TRBC1+细胞是否被耗尽，例如，相对于参考样品，例如，来自健康对象或尚未用本文所述抗体分子治疗的对象的参考样品)。在一些实施方案中，该方法包括测量来自生物样品的TRBC2+细胞的水平(例如，确定TRBC2+细胞是否被耗尽，例如，相对于参考样品，例如，来自对象或尚未用本文所述抗体分子治疗的对象的参考样品)。在一些实施方案中，该方法包括测量TRBC1的细胞内水平(例如，细胞内表达)。在一些实施方案中，该方法包括测量TRBC1的膜水平(例如，膜表达)。在一些实施方案中，该方法包括测量TRBC2的细胞内水平(例如，细胞内表达)。在一些实施方案中，该方法包括测量TRBC2的膜水平(例如，膜表达)。
在一个方面，本公开内容提供了一种用于在体外(例如，在生物样品(诸如组织活检(例如，来自癌症组织))或血液样品(例如，来自对象)中)或体内(例如，在对象体内成像)检测TRBC1或TRBC2蛋白质的存在的诊断方法。该方法包括：(i)使样品与本文所述的抗体分子接触，或向对象施用本文所述的抗体分子；(任选地)(ii)使例如来自健康对象或尚未用本文所述抗体分子治疗的对象的参考样品(例如，对照样品)或参考对象(例如，对照对象)(例如，健康对象或尚未用本文所述抗体分子治疗的对象)接触；和(iii)检测抗体分子与样品或对象以及(任选地)参考样品或对象之间复合物的形成。在一些实施方案中，在样品或对象中复合物的形成相对于参考样品或对象的变化(例如，统计学上的显著变化)表明样品或对象中存在TRBC1或TRBC2。
在一些实施方案中，生物样品包括血浆、组织(例如癌组织)、活检、血液(例如全血)、PBMC、骨髓和/或淋巴组织(例如淋巴结)中的一种或多种。在一些实施方案中，生物样品是刚从对象获得的(例如，没有经过冷冻和/或固定)。在一些实施方案中，生物样品已被冷冻(例如，急冻)。在一些实施方案中，生物样品已被固定(例如，福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样品)。
抗体分子可以直接或间接地用可检测物质进行标记以便于检测结合或未结合的抗体。合适的可检测物质包括例如各种酶、辅基、荧光材料、发光材料和放射性材料，例如如上所述和下文更详细描述的。
术语“样品”指用于检测多肽的样品时包括但不限于细胞、细胞裂解物、细胞的蛋白质或膜提取物、体液或组织样品。
抗体分子与TRBC1或TRBC2之间的复合物的形成可以通过测量或可视化与TRBC1或TRBC2抗原结合的结合分子或未结合的结合分子来检测。可以使用常规的检测测定，例如组织免疫组化、流式分析、免疫-细胞-化学分析、荧光显微镜、酶联免疫吸附测定(ELISA)和/或放射性免疫测定(RIA)。除标记抗体分子外，还可以通过竞争性免疫测定利用标记有可检测物质的标准品和未标记的抗体分子来测定样品中TRBC1或TRBC2的存在。在这种测定中，组合生物样品、标记的标准品和抗体分子，并确定与未标记的结合分子结合的标记标准品的数量。样品中TRBC1或TRBC2的数量与和抗体分子结合的标记标准品的数量成反比。
实施例
实施例1：对亚美尼亚仓鼠进行免疫接种以生成抗NKp30抗体
简而言之，用完全弗氏佐剂中的人NKp30蛋白的胞外结构域对亚美尼亚仓鼠进行免疫接种，并在第14天和第28天用不完全弗氏佐剂(IFA)中的NKp30加强两次。在第56天再次给予在IFA中的加强，并在三天后收获动物。收集脾脏并与P3X63Ag8.653鼠骨髓瘤细胞系融合。将125ul中的0.9x 10^5个细胞/孔置于96孔板中并饲喂125μl的I-20+2ME+HAT(IMDM(4g/L葡萄糖))，其中补充有20％胎牛血清、4mM L-谷氨酰胺、1mM丙酮酸钠、50U青霉素、50μg链霉素和50μM 2-ME，不存在或存在HAT或HT以用于选择，并且在第7、11天和此后所需的时间饲喂杂交瘤克隆因子(最终1％)。在融合后大约2周(细胞汇合约50％)，收集上清液并测定结合。
实施例2：NKp30 mAb的杂交瘤筛选
筛选前18小时用BG160(hNKp30细胞抗原)转染Expi293细胞。筛选当天，将转染的细胞稀释至0.05x10^6/mL，并添加抗亚美尼亚仓鼠Fc Alexa Fluor 488至终浓度为0.4ug/mL。将50uL(2,500个细胞)该混合物添加到384孔板的每个孔中。使用相同密度带有第二的未转染293细胞作为阴性对照。将5uL杂交瘤上清液添加到细胞混合物中，并将板在37℃下孵育1小时。然后将板在Mirrorball上成像。鉴定阳性克隆并通过系列稀释来亚克隆以获得克隆选择的杂交瘤。使用相同方案再次确认后，收获杂交瘤细胞并回收相应的重链和轻链序列。将DNA亚克隆到pcDNA3.4中以用于随后表达相应抗体并进行进一步验证。
实施例3：NKp30抗体与NK92细胞的结合
用含有0.5％ BSA和0.1％叠氮化钠(染色缓冲液)的PBS洗涤NK-92细胞，并以200,000个细胞/孔添加到96孔V型底的板中。将仓鼠NKp30抗体以2.0倍系列稀释添加到细胞，并在室温下孵育1小时。将板用染色缓冲液洗涤两次。以1:100的稀释度(1.4mg/ml的原液)添加与AF647缀合的针对仓鼠Fc的二抗(Jackson，127-605-160)，并在4℃下与细胞一起孵育30分钟，然后用染色缓冲液洗涤。随后将细胞在室温下用4％多聚甲醛固定10分钟。在CytoFLEX LS(Beckman Coulter)上读取板。将数据计算为AF747阳性群体的百分比(图9)。
实施例4：使用NK92细胞系测量NKp30抗体活性的生物测定
将NKp30抗体在PBS中进行三倍系列稀释，并于2-8℃下在平底96孔板中孵育过夜。将板在PBS中洗涤两次，并将40,000个NK-92细胞添加至含有IL-2的生长培养基中。在收集上清液之前，将板在37℃、5％CO2的加湿培养箱中孵育16-24小时。按照MSD测定说明书测量上清液中的IFNγ水平(图10)。将从与仓鼠同种型IgG一起孵育的细胞收集的上清液用作阴性对照，并将来自与NKp30单克隆抗体(R&D，克隆210847)一起孵育的细胞的上清液用作阳性对照。使用仓鼠抗NKp30 mAB生成数据。
实施例5：测量人源化JOVI.1变体与人TRBC1的结合的ELISA
进行ELISA测定以测定人源化JOVI.1变体与人TRBC1的结合。微孔板分别用1ug/mL的在100μL中的每种JOVI.1变体包被，并用2％BSA封闭。将hTRBC1(BIM0444)的系列稀释(7点，5倍稀释，100nM至6.4pM)以100μL/孔转移到包被和封闭的板，并在室温下孵育1小时。将板洗涤三次并与抗组氨酸标签Fc辣根过氧化物酶缀合物一起孵育30分钟，然后添加HRP底物TMB。将板显色5分钟，用1M HCL终止并在450nm波长下读取。ELISA数据显示抗TRBC1 mAb(二价)与人TRBC1的直接结合(图7)。
实施例6：测量人源化JOVI.1变体与人TRBC1的结合的测定
进行Octet测定以检查JOVI.1人源化变体的结合。使蛋白A生物传感器在25℃的PBS中平衡。使传感器负载在PBS中的20μg/mL的hTRBC1(BIM0444)至应答为1.5nM，随后进行JOVI1.1 fab(BIM0446和BIM0460)的系列稀释(7点，2倍稀释，50nM至0.78nM)。
进一步的Octet参数包括：
基线：在PBS中30秒
负载：20秒至应答为1.5nM
基线：60秒
缔合：60秒
解离：在PBS中60秒
Octet数据显示抗TRBC1 Fab与hTRBC1的结合(图8)。hTRBC1被传感器尖端捕获并浸入含有不同浓度单价Fab的溶液中。
实施例7：人源化抗NKp30抗体的生成和表征
选择一系列仓鼠抗NKp30抗体。这些抗体显示与人NKp30和食蟹猴NKp30结合并诱导NK-90细胞产生IFNγ(数据未显示)。示例性的仓鼠抗NKp30抗体15E1、9G1、15H6、9D9、3A12和12D10的VH和VL序列公开于表9。基于15E1、9G1和15H6的示例性人源化抗NKp30抗体的VH和VL序列也公开于表9。这些抗体的Kabat CDR公开于表18和表8。
选择两个基于15E1的人源化构建体。第一构建体BJM0407是Fab，其包括：包括SEQID NO:7302的氨基酸序列的重链可变区和包括SEQ ID NO:7305的氨基酸序列的λ轻链可变区。其对应的scFv构建体BJM0859包括SEQ ID NO:7310的氨基酸序列。第二构建体BJM0411是Fab，其包括包括SEQ ID NO:7302的氨基酸序列的重链可变区和包括SEQ ID NO:7309的氨基酸序列的κ轻链可变区。其对应的scFv构建体BJM0860包括SEQ ID NO:7311的氨基酸序列。BJM0407和BJM0411显示出相当的生物物理特征，例如对NKp30的结合亲和力和热稳定性。scFv构建体BJM0859和BJM0860也显示出相当的生物物理特性。
实施例8：人源化抗TRBC1抗体的生成和表征
将鼠抗TRBC1抗体JOVI.1人源化，产生许多人源化变体。示例性人源化变体的VH和VL序列公开于表4。选择一种人源化变体BIM0460，其包括：包括SEQ ID NO:253的氨基酸序列的VH和包括SEQ ID NO:258的氨基酸序列的VL。BIM0460进一步通过种系修饰，产生许多种系化变体。示例性种系化变体的VH和VL序列也公开于表4。选择一种种系化变体BJM0578，其包括：包括SEQ ID NO:7351的氨基酸序列的VH和包括SEQ ID NO:258的氨基酸序列的VL。这些人源化和种系化变体的Kabat CDR公开于表6和表3。BIM0460显示以17nM的亲和力与人TRBC1结合。BJM0578显示以110nM的亲和力与人TRBC1结合。
实施例9：细胞因子分泌和T细胞激活剖析。
本实施例探讨了ADCC失效形式是否更适合于与TRBC1和NKp30结合的抗体。在板包被时或在Fc衔接时在溶液中的JOVI.1衔接诱导T细胞增殖和激活(数据未显示)。这可能是对治疗T细胞淋巴瘤患者(例如，外周T细胞淋巴瘤(PTCL)患者)的不利因素。
生成了五个构建体，如图11A-11E所示。BJM1052是包括抗TRBC1Fab(基于BIM0460)和抗NKp30 scFv(基于BJM0407)的双特异性抗体(图11A)。BJM1052包括SEQ ID NO:B7379(抗TRBC1 HC)、SEQ ID NO:7380(抗TRBC1 LC)和SEQ ID NO:7383(抗NKp30 scFv-Fc)的氨基酸序列。BJM1052在其Fc区包括N297A突变。BJM1042是包括抗TRBC1 Fab(基于BJM0578)和抗NKp30 scFv(基于BJM0407)的双特异性抗体(图11B)。BJM1042包括SEQ ID NO:7382(抗TRBC1HC)、SEQ ID NO:7380(抗TRBC1 LC)和SEQ ID NO:7383(抗NKp30scFv-Fc)的氨基酸序列。BJM1042在其Fc区包括N297A突变。BJM0889是包括抗TRBC1 Fab(基于BIM0460)的单臂抗体(图11C)。BJM1083是包括抗TRBC1 Fab(基于BJM0578)的单臂抗体(图11D)。BJM0889和BJM1083在Fc区均包括N297A突变。BJM1053与BJM1052相似，不同之处在于BJM1053具有ADCC有效的Fc区。
如图12A和12B所示，Fc有效的抗体BJM1053和hIgG1与表达Fcγ受体的THP1细胞结合，而N297A突变抗体(BJM1052、BJM1042和BJM0889)未显示出显著的结合。
为了检测具有N297A突变(Fc失效)的抗体是否更安全，将100nM、10nM或1nM的抗TRBC1/NKp30抗体和对照分子添加至溶液中的PBMC，并在第1天和第5天测量T细胞增殖。Fc失效的抗体BJM1052和BJM1042显示出比Fc有效的抗体BJM1053更少的淋巴细胞聚集(数据未显示)。在第5天，用BJM1052和BJM1042处理的PBMC中T细胞激活显著降低，如增殖T细胞的百分比(图13A和13B)以及CD69-CD25+T细胞的百分比(图13C和13D)所证明的。
实施例10：与TRBC1和NKp30的体外结合
生成多种构建体，如图14A-14D所示。图14A所示的是包括抗TRBC1 Fab(基于BIM0460或BJM0578)和抗NKp30 scFv(基于BJM0407或BJM0411)的双特异性抗体。双特异性抗体在其Fc区可具有或不具有N297A突变。图14B中列出的分子具有图14A所示的构型。
图14C显示了包括抗TRBC1 Fab(基于BIM0460或BJM0578)和抗NKp30 Fab(基于BJM0407或BJM0411)的双特异性抗体。双特异性抗体在其Fc区可具有或不具有N297A突变。图14D中列出的分子具有图14C所示的构型。
所有测试的抗TRBC1/NKp30抗体均表现出与NK细胞系KHYG-1(图15A和15D)以及TRBC1+Jurkat细胞(图15C和15D)的结合。
实施例11：TRBC1+细胞系的体外细胞溶解
在本实施例中，测试了抗TRBC1/NKp30抗体在存在NK细胞的情况下诱导杀伤表达TRBC1的细胞的能力。本实施例中测试的抗体显示在图11A-11E中。
在第一项研究中，使NK-92效应细胞与CFSE标记的靶细胞以5:1的比例培养4小时。使用流式细胞术来测量靶细胞裂解并对死亡的靶细胞进行门控。在存在NK-92效应细胞的情况下，抗TRBC1/NKp30双特异性抗体BJM1052和BJM1042诱导杀伤TRBC1+Jurkat细胞(图16A)和H9细胞(图16B)，但不诱导杀伤TRBC2+HPB-ALL细胞(图16C)。
在第二项研究中，原代NK细胞与CFSE标记的靶细胞以5:1的比例培养4小时。对于H9细胞，使用10:1的E:T比。使用流式细胞术测量靶细胞裂解。在存在原代NK细胞的情况下，抗TRBC1/NKp30双特异性抗体BJM1052和BJM1042诱导杀伤TRBC1+Jurkat细胞(图17A)和H9细胞(图17B)，但不诱导杀伤TRBC2+HPB-ALL细胞(图17C)。
在第三项研究中，NK细胞和靶细胞在存在抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052和BJM1042的情况下共培养4小时，收集上清液，并使用MSD测量细胞因子水平。靶细胞裂解与NK细胞激活相关，如CD69+CD107a+NK细胞的百分比(图18A)、IFNγ分泌(图18B)和TNFα分泌(图18C)所证实的那样。
下一项研究检查了抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052和BJM1042是否在没有靶细胞的情况下激活NK细胞。在没有靶细胞的情况下，将原代NK细胞与50nM的抗体一起孵育4小时，然后收集上清液以测量IFNγ和TNFα水平。如图19A和19B所示，由抗TRBC1/NKp30抗体介导的NK细胞激活需要NK细胞和靶细胞两者的存在。
最后，抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052和BJM1042在存在靶细胞的情况下不诱导NK细胞死亡(图20)。
实施例12：患者来源的TRBC1+或TRBC2+PDX的选择性体外细胞溶解
T细胞淋巴瘤的常见亚型包括：非特指型外周T细胞淋巴瘤(PTCL-NOS)；间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)；血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)；和皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)。T细胞淋巴瘤的不常见亚型包括：成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)；T细胞淋巴母细胞性淋巴瘤；肝脾γ-δT细胞淋巴瘤；肠病型T细胞淋巴瘤；鼻NK/T细胞淋巴瘤；治疗相关的T细胞淋巴瘤。在从健康供体分离的PBMC和从PTCL患者分离的PBMC中观察到类似的TRBC1频率和表达(数据未显示)。
两个患者来源的异种移植(PDX)样品经测试为TRBC1阳性：PDX3来源于急性淋巴母细胞性白血病(T-ALL)患者，并且PDX6来源于原发性皮肤CD30+T细胞淋巴增殖性病症(CTCL)患者。
将图21A和21B中显示的抗体用于功能性杀伤测定。BJM0145是单臂抗TRBC1抗体。BJM0773是双特异性抗体，其包括抗TRBC1 Fab和抗NKp30 scFv。PDX样品用CFSE标记，并在存在BJM0145或BJM0773(0.01nM-10nM)的情况下，与原代NK细胞或KHYG1细胞以5:1的E:T比培养5小时。使用以下计算来测量特异性杀伤：
经处理的死亡％ (PDX+NK) - 死亡PDX％
100％(最大杀伤)-死亡PDX％
如图22A-22D所示，抗TRBC1/NKp30抗体BJM0773有效杀伤TRBC1阳性PDX3和PDX6。单臂抗TRBC1抗体BJM0145由于ADCC而在原代NK细胞存在时表现出弱杀伤(图22A和22C)，但在KHYG1细胞(CD16缺陷型NK细胞)存在时则未表现出杀伤(图22B和22D)。单臂抗TRBC1抗体或双特异性抗TRBC1/NKp30抗体不杀伤TRBC1阴性PDX(数据未显示)。
实施例13：使用来自PTCL患者的NK细胞对TRBC1+Jurkat细胞进行的体外细胞溶解
本实施例检验了在存在分离自PTCL患者的NK细胞的情况下，抗TRBC1/NKp30抗体是否可以介导对TRBC1+靶细胞的杀伤。
NK细胞和NKp30+NK细胞在PTCL患者的PBMC中以正常比例存在(数据未显示)。通过阴性选择从PTCL患者和健康供体的PBMC中富集NK细胞，然后与200U/ml IL-2一起孵育过夜。第二天，在存在10nM抗体的情况下，将NK细胞与Jurkat细胞共培养4小时。
如图23所示，PTCL患者来源的NK细胞在存在抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042的情况下杀伤TRBC1+Jurkat细胞。NK细胞在杀伤测定期间被激活，如CD69+CD107+NK细胞的百分比所证明的(图24)。双特异性抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052和BJM1042比单臂抗TRBC1抗体FJM0889诱导更高水平的IFNγ(图25A)和TNFα(图25B)。
实施例14：与B7-H6(NKp30的天然配体)的竞争
NKp30的天然配体包括B7-H6、pp65、BAT3和BAG6。B7-H6存在于许多癌细胞系和原代癌细胞(例如，T细胞和B细胞淋巴瘤、白血病和黑色素瘤)上。膜结合的B7-H6可以介导原代人NK细胞的激活和靶细胞的杀伤。另一方面，可溶性B7-H6存在于血清或肿瘤微环境中，并且可以抑制抗NKp30 mAb的结合，下调NKp30表达，并抑制NKp30介导的激活和靶细胞杀伤。
本实施例检查了双特异性抗TRBC1/NKp30抗体是否与B7-H6竞争结合NKp30。
如图26A和26B所示，双特异性抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042与NKp30的结合比B7-H6更强。在竞争测定中，将B7H6(4μg/ml，约143nM)和不同浓度的抗体(BJM1042、抗NKp30或抗NKp46)同时添加到NKp30包被的ELISA板。如图26C所示，B7H6结合信号随竞争抗体浓度的增加而减弱。BJM1042与B7-H6竞争结合NKp30，达到与阳性对照抗NKp30抗体相似的水平(图26C)。阴性对照抗NKp46抗体不干扰B7-H6与NKp30的结合，表明在该ELISA中观察到的干扰是特异性的(图26C)。
实施例15：TRBC1细胞系衍生模型的体内杀伤
本实施例在体内模型中检查抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042的抗肿瘤活性。
在第0天，给NOG-IL-15小鼠皮下植入H9肿瘤细胞。肿瘤植入后16天，给小鼠移植体外扩增的原代NK细胞。Nk植入后两周(肿瘤植入后31天)，将小鼠按肿瘤体积随机分组，并给予1mg/kg BJM1042或相关对照。暴露于测试物后每天测量肿瘤体积和体重。
抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042在移植有原代NK细胞的NOG-IL-15小鼠中诱导皮下H9肿瘤的消退(图27B和27C)。BJM1042在不存在NK细胞的情况下也抑制肿瘤生长，但与在存在NK细胞的情况下的处理相比抑制程度较小(图27B和27C)。使用抗TRBC1对照抗体BJM1083观察到类似结果(图27B和27C)。
实施例16：针对TRBC1的体内特异性
在本实施例中，在原代NK细胞移植的NOG-IL-15小鼠中使用表达TRBC2的HPB-ALL异种移植物来评价BJM1042的特异性。
在第0天，给NOG-IL-15小鼠皮下植入5e6个TRBC2+HPB-ALL细胞。肿瘤植入后12天，给小鼠移植2e6个体外扩增的原代NK细胞。NK植入后2天(肿瘤植入后14天)，将小鼠按肿瘤体积随机分组并给予0.5mg/kg BJM1042或相关对照。每周两次用治疗剂处理小鼠。每周两次通过卡尺定量肿瘤体积。每周两次测量体重。
诱导表达TRBC1的H9和Jurkat肿瘤消退的抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042不影响表达TRBC2的HPB-ALL肿瘤的生长(图28B)。这些分子在使用的剂量下的耐受性良好，并且未导致体重减轻或任何其他明显的副作用(数据未显示)。
实施例17：抗TRBC1/NKp30抗体的生物物理分析
分析了抗TRBC1/NKp 30抗体BJM1042和BJM1052的生物物理特性。BJM1042和BJM1052表现出高稳定性和低聚集倾向。BJM1042和BJM1052显示出保留的与FcRn的结合以及减少或可忽略不计的与Fcγ受体的结合。
实施例18：示例性抗TRBC1抗体分子的Biacore分析
在本实施例中，分析了一系列示例性的抗TRBC1抗体分子对TRBC1的结合亲和力。简而言之，表面等离子体共振(SPR)测量通过使用BIAcore T200进行。每个示例性的抗TRBC1抗体构建体经由抗人Fc抗体固定在CM5芯片上，至应答为50RU。在固定各抗体构建体的表面上注射人TRBC1(BIM0443)，浓度为15.6nM、31.2nM、62.5nM、125nM、250nM和500nM，流速为20μl/min。使用1:1的结合模型对数据进行拟合。
如表26所示，与亲本抗体相比，示例性抗体显示保持对人TRCB1的亲和力。
表26：Biacore结果
实施例19：示例性抗NKp30抗体分子的Biacore分析
在本实施例中，分析了一系列示例性的抗NKp30抗体分子对NKp30的结合亲和力。简而言之，表面等离子体共振(SPR)测量通过使用BIAcore T200进行。人NKp30(BKM0179)经由抗鼠Fc抗体固定在CM5芯片上，至应答为50RU。在固定人NKp30的表面上注射各示例性抗体构建体，浓度为3.9nM、7.8nM、15.6nM、31.2nM、62.5nM和125nM，并且流速为20μl/min。使用1:1的结合模型对数据进行拟合。
如表27所示，与亲本抗体相比，大部分示例性抗体显示保持对人NKp30的亲和力。
表27：Biacore结果
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实施例20.示例性抗TRBC2抗体的生成
使用基于展示的方法工程化抗TRBC1抗体以引入对TRBC2的特异性。通过多个分子进化循环，使抗TRBC1抗体突变以实现TRBC2结合并失去TRBC1结合。为此，使用随机诱变(1)或改良版的Kunkel诱变(2)建立scFv文库。使用标准噬菌体展示(3)和酵母展示技术(4)对人TRBC2进行文库选择。在选择期间，加入不同浓度的未标记TRBC1的竞争者以富集不结合TRBC1的突变体。选择之后是标准的筛选方法，诸如ELISA和流式细胞术，以鉴定特异性结合TRBC2的单个克隆。在命中测序和分析突变-活性相关性之后，用上述同样的方法构建第二代文库，以提高TRBC2的特异性结合，去除潜在的CDR-脱酰胺位点，并根据最接近的种系比对使CDR人源化。文库的选择和单个克隆的筛选如上述重复进行，修改是应用更严格的条件以选择具有增强但特异性的TRBC2亲和力的克隆。在命中测序之后，scFv基因被重新格式化为生物相关的抗体格式，以进行表达、纯化和分类。
实施例21.用于在流式基测定中诊断T细胞恶性肿瘤中的TRBC1与TRBC2单型性的TRBC1和TRBC2抗体
健康的人类供体PBMC衍生的T细胞群体含有TRBC1+和TRBC2+隔室，而T细胞恶性肿瘤则主要是单型的。流式方法已被应用于测试一个健康供体PBMC和四个预先诊断为T恶性肿瘤的PBMC样品中的TRBC1与TRBC2的单型性和特异性。患者的肝素化全血用ACK裂解缓冲液裂解，然后进行20min的Fc阻断。用Jovi.1(TRBC1抗体)或BKM0213(TRBC2抗体)对患者的血液进行染色。用PBS洗涤细胞，然后用含有CD56-PE(NK标志物)、CD3-AF700(T细胞标志物)、CD4-BV421(T细胞标志物)、CD8-Percp cy5.5(T细胞标志物)的抗体混合物染色，并进行活/死染色。然后固定细胞，并在CytoFLEX LX上获得流式评估。
援引并入
本文提及的所有出版物和专利均通过引用以其全文并入本文，如同每个单独的出版物或专利被具体地且单独地指示为通过引用并入。
等同方案
本领域技术人员将认识到或能够仅使用常规实验来确定本文描述的本发明的特定实施方案的许多等同方案。此类等同方案旨在被以下权利要求涵盖。
示例性实施方案
上述多功能分子、核酸、载体、宿主细胞或方法中的任一种的其他特征包括以下一个或多个示例性实施方案。
本领域技术人员将认识到或能够仅使用常规实验来确定本文描述的本发明的特定实施方案的许多等同方案。此类等同方案旨在被以下示例性实施方案涵盖。
示例性实施方案1
本公开内容尤其涉及新型多特异性或多功能分子，其包括(i)抗原结合结构域，其与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原(例如，包括T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)的T细胞受体或包括T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)的T细胞受体)结合；以及以下中的一种、两种或全部：(ii)免疫细胞衔接物(例如，选自NK细胞衔接物、T细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物)；(iii)细胞因子分子；和/或(iv)间质修饰部分。术语“多特异性”或“多功能”在本文中可互换使用。
不希望受理论束缚，预期本文公开的多特异性或多功能分子将免疫细胞(例如，免疫效应细胞，选自NK细胞、T细胞、B细胞、树突状细胞或巨噬细胞)靶向(例如，定位、桥接和/或激活)表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的靶细胞(例如，癌细胞(例如，淋巴瘤细胞))，并且/或者改变肿瘤间质，例如，改变癌症部位附近的肿瘤微环境。预期使用本文所述的多特异性分子增加免疫细胞的接近度和/或活性以增强对靶细胞(例如，癌细胞，例如，淋巴瘤细胞)的免疫应答，从而提供更有效的疗法(例如，更有效的癌症疗法)。不受理论束缚，对靶细胞(例如，癌细胞)的靶向、局部免疫应答被认为具有降低本文所述的多特异性分子的全身毒性的作用。此外，在靶癌细胞是T细胞(例如，表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的T细胞)的情况下，以较小程度靶向非癌性T细胞(例如，不靶向非癌性T细胞)的针对癌性T细胞群体的靶向免疫应答被认为比全身性消除所有T细胞具有较低的有害作用。
不希望受理论束缚，克隆来源的T细胞淋巴瘤对TRBC1或TRBC2呈阳性，但不是两者均呈阳性。在TRBC1+T细胞恶性肿瘤的情况下，本文公开的抗TRBC1分子(例如，与TRBC1和NKp30结合的多功能分子)可以耗尽TRBC1+细胞，同时保留TRBC2+非恶性T细胞。类似地，在TRBC2+T细胞恶性肿瘤的情况下，本文公开的抗TRBC2分子(例如，与TRBC2和NKp30结合的多功能分子)可以耗尽TRBC2+细胞，同时保留TRBC1+非恶性T细胞。
不希望受理论的束缚，在一些实施方案中，本文公开的多功能分子(例如，抗TRBC1/NKp30抗体)仅在存在表达TRBC1的细胞的情况下激活NK细胞。不希望受理论的束缚，在一些实施方案中，本文公开的多功能分子(例如，抗TRBC2/NKp30抗体)仅在存在表达TRBC2的细胞的情况下激活NK细胞。
因此，本文尤其提供了包括上述部分的多特异性分子(例如，多特异性或多功能抗体分子)、编码上述分子的核酸、生产上述分子的方法，以及使用上述分子治疗癌症的方法。
在一方面，本公开内容的特征在于一种检测样品或对象中TRBC1或TRBC2的方法，其包括：使所述样品或对象与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及检测所述抗体分子与所述样品或对象之间的复合物的形成，从而检测TRBC1或TRBC2。
在一些实施方案中，在体外或体内检测TRBC1或TRBC2。
在一些实施方案中，该方法进一步包括使参考样品或对象与所述抗体分子接触；以及检测所述抗体分子与所述参考样品或对象之间的复合物的形成，其中所述样品或对象中所述复合物的形成相对于所述参考样品或对象的变化表明所述样品或对象中存在TRBC1或TRBC2。
在一些实施方案中，该方法进一步包括从对象获得样品。
在一些实施方案中，样品包括血浆、组织(例如，癌组织)、活检、血液(例如，全血)、PBMC、骨髓和/或淋巴组织(例如，淋巴结)中的一种或多种。在一些实施方案中，样品未被冷冻和/或固定。在一些实施方案中，样品已被福尔马林固定(例如，福尔马林固定石蜡包埋(FFPE))。在一些实施方案中，样品已被染色(例如，用于免疫组化进行分析)。在一些实施方案中，样品已被冷冻和/或固定。
在一些实施方案中，所述对象患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)或处于患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)的风险中。
在一些实施方案中，该方法进一步包括进行流式分析，例如使用多组方法进行流式分析。在一些实施方案中，该方法进一步包括进行免疫组化(IHC)分析，例如单色或以多重格式进行。在一些实施方案中，IHC方法包括明场发色IHC。在实施方案中，明场发色IHC方法包括通过一抗(例如，用不同的色原直接标记的一抗)直接检测抗原。在一些实施方案中，IHC方法包括荧光IHC。在实施方案中，荧光IHC方法包括通过一抗(例如，用不同的荧光团直接标记的一抗)直接检测抗原。在一些实施方案中，该方法进一步包括在样品(例如，固定样品，例如，FFPE样品)上进行免疫组化。在一些实施方案中，该方法进一步包括评估T细胞克隆性，例如以确定T细胞恶性肿瘤的存在和/或水平。在一些实施方案中，该方法进一步包括测量来自生物样品的TRBC1+或TRBC2+细胞的水平(例如，确定TRBC1+或TRBC2+细胞是否例如相对于参考样品或对象耗尽)。在一些实施方案中，该方法进一步包括测量TRBC1或TRBC2的细胞内水平。在一些实施方案中，该方法进一步包括测量TRBC1或TRBC2的膜水平。
在一些实施方案中，该方法包括组合本文所述的两种或更多种检测方法。在实施方案中，该方法包括基于核酸的方法和基于抗体的方法。
在一些实施方案中，该方法进一步包括评价所述对象例如在治疗(例如，用本文所述的抗体分子治疗)后的疾病或病症(例如癌症)的预后、严重程度或存在或不存在的变化。
在一些实施方案中，所述抗体分子被可检测地标记。在一些实施方案中，抗体分子是抗TRBC1抗体分子。在一些实施方案中，抗体分子是抗TRBC2抗体分子。
在一个方面，本发明的特征在于一种评价(例如，鉴定)对象的方法，包括：使来自对象的样品(例如，本文所述的样品)与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及
检测抗体分子与样品之间的复合物的形成，从而评价对象。
在一些实施方案中，所述对象患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)或处于患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)的风险中。在一些实施方案中，所述对象尚未用本文所述的抗体分子治疗。在一些实施方案中，所述对象已用本文所述的抗体分子治疗。
在一方面，本公开内容的特征在于一种试剂盒，其包括本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子和用于检测样品或对象中TRBC1或TRBC2的方法(例如，按照本文所述的方法)的说明。
示例性实施方案2
在一个方面，本文提供了一种多功能分子，其包括(i)第一抗原结合结构域，其与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，和(ii)第二抗原结合结构域，其与NKp30结合。
在一些实施方案中，第一抗原结合结构域与TRBC2结合。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域包括表21-25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201和7442的氨基酸序列。在一些实施方案中，VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7443、224和225的氨基酸序列。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201、7442、7443、224和225的氨基酸序列。在一些实施方案中，VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：分别包括SEQID NO:7422、201和7403；分别包括SEQ ID NO:7401、201和7403；分别包括SEQ ID NO:7394、201和7396；分别包括SEQ ID NO:7346、201和7398；分别包括SEQ ID NO:7346、201和7400；分别包括SEQ ID NO:7405、201和7403；分别包括SEQ ID NO:7407、201和7403；分别包括SEQID NO:7427、201和7403；或分别包括SEQ ID NO:7430、201和7403的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7410、224和225；或分别包括SEQ ID NO:7409、224和225的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7410、224和225；分别包括SEQ IDNO:7346、201、7400、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7410、224和225；分别包括SEQID NO:7422、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7409、224和225；分别包括SEQID NO:7405、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7409、224和225；分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7409、224和225；或分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7409、224和225的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428和7431(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7419和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，所述VH和VL：分别包括SEQ ID NO:7420和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7423和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7411和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7412和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7413和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7414和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7415和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7416和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7417和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7425和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7428和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7431和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7420和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7423和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7411和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7412和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7413和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7414和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7415和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7416和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7417和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7425和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7428和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；分别包括SEQ ID NO:7431和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对不包括TRBC2的T细胞受体的亲和力，任选地，其中第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过第一抗原结合结构域与不包括TRBC2的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对包括TRBC1的T细胞受体的亲和力，任选地，其中第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过第一抗原结合结构域与包括TRBC1的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域与淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)上的TRBC2的结合未明显激活淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)，例如如通过T细胞增殖、T细胞激活标志物(例如，CD69或CD25)的表达和/或细胞因子(例如，TNFα和IFNγ)的表达所测量的。在一些实施方案中，多功能分子在不存在表达TRBC2的细胞的情况下不激活NK细胞或基本上不激活NK细胞。
在一些实施方案中，第一抗原结合结构域与TRBC1结合。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域包括表2、3、3A、3B、4、5、6和19的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包含轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：分别包括SEQ ID NO:7346、7355和202；分别包括SEQ ID NO:7346、201和202；分别包括SEQ ID NO:7354、201和202；或分别包括SEQ ID NO:7354、7355和202的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:223、224和225；分别包括SEQ ID NO:7367、224和225；分别包括SEQ ID NO:223、7368和225；分别包括SEQ ID NO:223、224和7369；或分别包括SEQ ID NO:7367、7368和7369的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ IDNO:7346、7355、202、223、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、7367、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、7368和225；分别包括SEQ ID NO:7346、7355、202、223、224和7369；分别包括SEQ IDNO:7346、7355、202、7367、7368和7369；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、7367、224和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、7368和225；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、223、224和7369；分别包括SEQ ID NO:7346、201、202、7367、7368和7369；分别包括SEQID NO:7354、201、202、223、224和225；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、7367、224和225；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、223、7368和225；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、223、224和7369；分别包括SEQ ID NO:7354、201、202、7367、7368和7369；分别包括SEQ IDNO:7354、7355、202、223、224和225；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、7367、224和225；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、7368和225；分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、223、224和7369；或分别包括SEQ ID NO:7354、7355、202、7367、7368和7369的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7351、253、250-252、254、7343、7344、7350和7352(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:258、255-257、259、260和7357-7360(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，所述VH和VL：分别包括SEQ ID NO:7351和258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ ID NO:253和258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
在一些实施方案中，第一抗原结合结构域对包括TRBC1的T细胞受体的亲和力高于对不包括TRBC1的T细胞受体的亲和力，任选地，其中第一抗原结合结构域与TRBC1之间的结合的KD不超过第一抗原结合结构域与不包括TRBC1的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域对包括TRBC1的T细胞受体的亲和力高于对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力，任选地，其中第一抗原结合结构域与TRBC1之间的结合的KD不超过第一抗原结合结构域与包括TRBC2的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％。在一些实施方案中，第一抗原结合结构域与淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)上的TRBC1的结合未明显激活淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)，例如，如T细胞增殖、T细胞激活标志物(例如，CD69或CD25)的表达和/或对细胞因子(例如，TNFα和IFNγ)的表达所测量的。在一些实施方案中，多功能分子在不存在表达TRBC1的细胞的情况下不激活NK细胞或基本上不激活NK细胞。
在一些实施方案中，第二抗原结合结构域包括表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：分别包括SEQ ID NO:7313、6001和7315；分别包括SEQ ID NO:7313、6001和6002；分别包括SEQID NO:7313、6008和6009；分别包括SEQ ID NO:7313、7385和7315；分别包括SEQ ID NO:7313、7318和6009；分别包括SEQ ID NO:C019、C021和C023；分别包括SEQ ID NO:C033、C035和C037；分别包括SEQ ID NO:C047、C049和C051；分别包括SEQ ID NO:C061、C063和C065；分别包括SEQ ID NO:C075、C077和C079；分别包括SEQ ID NO:C089、C091和C093；分别包括SEQID NO:C103、C105和C107；或分别包括SEQ ID NO:C116、C118和C120的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域的VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3包括以下的氨基酸序列：分别包括SEQ ID NO:7326、7327和7329；分别包括SEQ ID NO:6063、6064和7293；分别包括SEQ ID NO:6070、6071和6072；分别包括SEQ ID NO:6070、6064和7321；分别包括SEQ IDNO:C026、C028和C030；分别包括SEQ ID NO:C040、C042和C044；分别包括SEQ ID NO:C054、C056和C058；分别包括SEQ ID NO:C068、C070和C072；分别包括SEQ ID NO:C082、C084和C086；分别包括SEQ ID NO:C096、C098和C100；分别包括SEQ ID NO:C110、C112和C113；分别包括SEQ ID NO:C123、C125和C127的氨基酸序列。
在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：分别包括SEQ ID NO:7313、6001、7315、7326、7327和7329；分别包括SEQID NO:7313、6001、6002、6063、6064和7293；分别包括SEQ ID NO:7313、6008、6009、6070、6071和6072；分别包括SEQ ID NO:7313、7385、7315、6070、6064和7321；分别包括SEQ IDNO:7313、7318、6009、6070、6064和7321；分别包括SEQ ID NO:C019、C021、C023、C026、C028和C030；分别包括SEQ ID NO:C033、C035、C037、C040、C042和C044；分别包括SEQ ID NO:C047、C049、C051、C054、C056和C058；分别包括SEQ ID NO:C061、C063、C065、C068、C070和C072；分别包括SEQ ID NO:C075、C077、C079、C082、C084和C086；分别包括SEQ ID NO:C089、C091、C093、C096、C098和C100；分别包括SEQ ID NO:C103、C105、C107、C110、C112和C113；或分别包括SEQ ID NO:C116、C118、C120、C123、C125和C127的氨基酸序列。
在一些实施方案中，第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQID NO:7302、7298、7300、7301、7303和7304(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7309、7305、7299、7306-7308(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6121或6123-6128(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7294或6137-6141(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6122或6129-6134(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQID NO:6136或6142-6147(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C001-C008(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C009-C016(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域的VH和VL：分别包括SEQID NO:7302和7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或分别包括SEQ ID NO:7302和7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。在一些实施方案中，所述第二抗原结合结构域包括：SEQ ID NO:7311或7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；SEQ ID NO:6187或6188(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；SEQ ID NO:6189或6190(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；SEQ ID NO:C017-C024中的任一个的氨基酸序列。
在一些实施方案中，多功能分子与TRBC2单价结合。在一些实施方案中，多功能分子包括图30A-30D中任一个所示的构型，任选地，其中：(i)所述多功能抗体分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 scFv，例如，包括图30A所示的构型；(ii)所述多功能抗体分子包括抗TRBC2Fab和抗NKp30 Fab，例如，包括图30B所示的构型；(iii)所述多功能抗体分子包括抗NKp30 Fab和抗TRBC2 scFv，例如，包括图30C所示的构型；或(iv)所述多功能抗体分子包括抗TRBC2 scFv和抗NKp30scFv，例如，包括图30D所示的构型。
在一些实施方案中，多功能分子与TRBC1单价结合。在一些实施方案中，多功能分子包括图29A-29D中任一个所示的构型，任选地，其中：(i)所述多功能抗体分子包括抗TRBC1 Fab和抗NKp30 scFv，例如，包括图29A所示的构型；(ii)所述多功能抗体分子包括抗TRBC1Fab和抗NKp30 Fab，例如，包括图29B所示的构型；(iii)所述多功能抗体分子包括抗NKp30 Fab和抗TRBC1 scFv，例如，包括图29C所示的构型；或(iv)所述多功能抗体分子包括抗TRBC1 scFv和抗NKp30scFv，例如，包括图29D所示的构型。
在一些实施方案中，本文公开的多功能分子进一步包括二聚模块，其包括一个或多个免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)，所述免疫球蛋白链恒定区包括以下中的一种或多种：成对的腔-突起(“杵臼结构”)、静电相互作用或链交换。
在一些实施方案中，多功能分子包括表21-25的任一个中公开的抗TRBC2氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列；和/或表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个中公开的抗NKp30氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，多功能分子包括SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL。在一些实施方案中，多功能分子包括SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，多功能分子包括SEQ ID NO:7438、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，多功能分子包括SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL。在一些实施方案中，多功能分子包括SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv。在一些实施方案中，多功能分子包括SEQ ID NO:7440、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能分子包括表2、3、3A、3B、4、5、6和19的任一个中公开的抗TRBC1氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列；和/或表7、8、8A、8B、9、10、18和19的任一个中公开的抗NKp30氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，多功能分子包括：
(i)SEQ ID NO:7351(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；(ii)SEQ ID NO:7351(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv；或(iii)SEQ ID NO:7382、7380和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，多功能分子包括：(i)SEQ ID NO:253(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；(ii)SEQ ID NO:253(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv；或(iii)SEQ ID NO:7379、7380和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，多功能分子包括：(i)SEQ ID NO:7351(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；(ii)SEQ ID NO:7351(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL和SEQ ID NO:7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv；或(iii)SEQ ID NO:7382、7380和7384(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。在一些实施方案中，多功能分子包括：(i)SEQ ID NO:253(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；(ii)SEQ ID NO:253(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VH、SEQ ID NO:258(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC1 VL和SEQ ID NO:7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv；或(iii)SEQ ID NO:7379、7380和7384(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
在一些实施方案中，多功能分子包括重链恒定区变体，例如，Fc区变体，其包括导致对至少一种Fc受体的亲和力降低或消除的一个或多个突变，任选地其中所述一个或多个突变导致抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)、抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)或补体依赖性细胞毒性(CDC)降低或消除。在一些实施方案中，Fc区变体包括表20中公开的一个或多个突变，任选地其中Fc区变体包括N297A突变。
示例性实施方案3
在一方面，本公开内容的特征在于一种多功能分子，其包括：
(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，
其中第一抗原结合结构域包括表3A-3B或4的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:B001-B095中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，第二抗原结合结构域包括本文公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种多功能分子，其包括：
(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，
其中第二抗原结合结构域包括表8A-8B、9或10的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NOC001-C128中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，第一抗原结合结构域包括本文公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域。
在一方面，本公开内容的特征在于一种多功能分子，其包括：
(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，
其中第一抗原结合结构域包括表3A-3B或4的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:B001-B095中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列；并且
其中第二抗原结合结构域包括表8A-8B、9或10的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:C001-C128中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
示例性实施方案4
在一个方面，本文提供了一种与TRBC2结合的抗体分子，其包括表21-25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子包括表21或表22中公开的一个或多个CDR(例如，VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和/或VLCDR3)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子包括表21或表22中公开的一个或多个框架区(例如，VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3和/或VLFWR4)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子包括表23中公开的VH和/或VL，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。在一些实施方案中，与TRBC2结合的抗体分子包括表24中公开的氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一个方面，本文提供了一种与NKp30结合的抗体分子，其包括表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一个方面，本文提供了一种与TRBC1结合的抗体分子，其包括表2、3、3A、3B、4、5、6和19的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
在一些实施方案中，抗体分子包括重链恒定区变体，例如，Fc区变体，其包括导致对至少一种Fc受体的亲和力降低或消除的一个或多个突变，任选地其中所述一个或多个突变导致抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)、抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)或补体依赖性细胞毒性(CDC)降低或消除。在一些实施方案中，Fc区变体包括表20中公开的一个或多个突变，任选地其中Fc区变体包括N297A突变。
在一些实施方案中，本文公开的氨基酸序列包括METDTLLLWVLLLWVPGSTG(SEQ IDNO:SEQ ID NO:7444)信号肽。在一些实施方案中，本文公开的氨基酸序列不包括METDTLLLWVLLLWVPGSTG(SEQ ID NO:SEQ ID NO:7444)的信号肽
在一方面，本文提供了一种核酸分子，其编码本文公开的多功能分子或本文公开的抗体分子。在一方面，本文提供了一种载体，例如，表达载体，其包括本文公开的核酸分子。在一方面，本文提供了一种细胞，其包括本文公开的核酸分子或本文公开的载体。在一方面，本文提供了一种药物组合物，其包括本文公开的多功能分子或本文公开的抗体分子以及药学上可接受的载剂、赋形剂或稳定剂。
在一方面，本文提供了一种制备(例如，产生)本文公开的多功能分子或本文公开的抗体分子的方法，其包括在合适的条件下(例如，适合基因表达和/或同源二聚化或异源二聚化的条件下)培养本文公开的细胞。
在一方面，本文提供了一种治疗癌症的方法，其包括向有此需要的对象施用本文公开的多功能分子或本文公开的抗体分子，其中所述多功能分子或抗体分子以有效治疗所述癌症的量施用。在一些实施方案中，该方法进一步包括鉴定、评价或选择需要治疗的对象，其中鉴定、评价或选择包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞。在一些实施方案中，该方法进一步包括：响应于确定对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞；任选地，选择所述对象用多功能分子治疗，所述多功能分子包括与包括TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域；和施用包括与包括TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域的本文公开的多功能分子。在一些实施方案中，所述方法进一步包括：响应于确定对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞；任选地，选择所述对象用多功能分子治疗，所述多功能分子包括与包括TRBC1的T细胞受体结合的抗原结合结构域；和施用包括与包括TRBC1的T细胞受体结合的抗原结合结构域的本文公开的多功能分子。
在一方面，本文提供了一种治疗癌症(例如，淋巴瘤或白血病，例如，T细胞淋巴瘤或白血病)的方法，其包括：响应于确定对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，向所述对象施用本文公开的多功能分子，其中所述多功能分子的第一抗原结合结构域与TRBC2结合，其中所述多功能分子以有效治疗所述癌症的量施用。在一方面，本文提供了一种治疗癌症(例如，淋巴瘤或白血病，例如，T细胞淋巴瘤或白血病)的方法，其包括：响应于确定对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞，向所述对象施用本文公开的多功能分子，其中所述多功能分子的第一抗原结合结构域与TRBC1结合，其中所述多功能分子以有效治疗所述癌症的量施用。
在一方面，本文提供了一种鉴定需要使用本文公开的多功能分子治疗癌症(例如，淋巴瘤或白血病，例如，T细胞淋巴瘤或白血病)的对象的方法，其包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞，其中：
响应于确定所述对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并且任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，或响应于确定所述对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并且任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者。
在一些实施方案中，所述方法进一步包括：
响应于将所述对象鉴定为使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，用(例如，向对象施用)包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗所述对象，或响应于将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，用(例如，向对象施用)包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗所述对象。
在上述方法的一些实施方案中，所述癌症是白血病或淋巴瘤。在一些实施方案中，所述癌症选自获得性免疫缺陷综合征(AIDS)相关淋巴瘤、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、成人T细胞白血病/淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、中枢神经系统(CNS)淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、淋巴母细胞性淋巴瘤、套细胞淋巴瘤(MCL)、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)(例如，肝脾T细胞淋巴瘤(HSGDTCL)、皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤或肠病相关T细胞淋巴瘤)、转变型滤泡和转变型黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样真菌病和塞扎里综合征)、滤泡性淋巴瘤、淋巴浆细胞淋巴瘤/瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症、边缘区B细胞淋巴瘤、胃黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病/小细胞淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、结外T细胞/NK细胞淋巴瘤(鼻型)以及间变性大细胞淋巴瘤(例如，原发性皮肤间变性大细胞淋巴瘤或系统性间变性大细胞淋巴瘤)。在一些实施方案中，所述癌症是外周T细胞淋巴瘤(PTCL)。
在一方面，本发明提供了一种用于治疗患有癌症的对象的方法的组合物，其包括本文公开的多功能分子或抗体分子。
因此，在一方面，本公开内容的特征在于多功能分子，其包括：
(i)第一抗原结合结构域，其与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)选择性结合，
和
(ii)以下中的一种、两种或全部：
(a)免疫细胞衔接物，其选自NK细胞衔接物(例如，与NKp30、NKp46、NKG2D或CD16结合的分子)、T细胞衔接物(例如，其与除CD3之外的T细胞抗原结合)、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物；
(b)细胞因子分子或细胞因子抑制剂分子；
(c)死亡受体信号衔接物；和
(d)间质修饰部分。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种多功能分子，其包括：
(i)第一抗原结合结构域，其选择性靶向表达(例如，在其表面上表达，例如，展示)包括T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)的T细胞受体、TRBC1、包括T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)的T细胞受体或TRBC2的淋巴细胞，和
(ii)以下中的一种、两种或全部：
(a)免疫细胞衔接物，其选自NK细胞衔接物(例如，与NKp30、NKp46、NKG2D或CD16结合的分子)、T细胞衔接物(例如，其与除CD3之外的T细胞抗原结合)、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物；
(b)细胞因子分子或细胞因子抑制剂分子；
(c)死亡受体信号衔接物；和
(c)间质修饰部分。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种多功能分子，其包括：
(i)第一抗原结合结构域，其优先与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原(例如，包括T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)的T细胞受体、TRBC1、包括T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)的T细胞受体或TRBC2)结合，和
(ii)以下中的一种、两种或全部：
(a)免疫细胞衔接物，其选自NK细胞衔接物(例如，与NKp30、NKp46、NKG2D或CD16结合的分子)、T细胞衔接物(例如，其与除CD3之外的T细胞抗原结合)、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物；
(b)细胞因子分子或细胞因子抑制剂分子；
(c)死亡受体信号衔接物；和
(d)间质修饰部分。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种抗体分子，例如，IgM抗体分子，其包括：
(i)第一抗原结合结构域，其与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)选择性结合，和
(ii)补体激活结构域，其激活补体途径，例如，通过结合C1q激活补体途径。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种核酸分子，其编码本文公开的多功能分子。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种载体，例如，表达载体，其包括本文公开的核酸分子。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种宿主细胞，其包括本文公开的核酸分子或载体。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种制备(例如，产生)本文公开的多功能分子的方法，其包括在合适的条件下(例如，适合基因表达和/或同源二聚化或异源二聚化的条件下)培养本文公开的宿主细胞。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种药物组合物，其包括本文公开的多功能分子。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种治疗癌症的方法，包括向有此需要的对象施用本文公开的多功能分子，其中所述多功能分子以有效治疗所述癌症的量施用。在一些实施方案中，所述癌症是T细胞恶性肿瘤，例如，T细胞淋巴瘤或T细胞白血病。在一些实施方案中，所述癌症选自：T细胞幼淋巴细胞白血病、T细胞大颗粒淋巴细胞白血病、系统性EBV阳性的儿童T细胞淋巴增生性疾病、种痘水疱病样淋巴瘤、PTCL、PTCL-NOS(非特指型)、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)、ALK阳性和ALK阴性的间变性大细胞淋巴瘤(ALCT)、原发性皮肤间变性大细胞淋巴瘤、原发性皮肤gd T细胞淋巴瘤，原发性皮肤CD8阳性侵袭性亲表皮细胞毒性T细胞淋巴瘤、原发性皮肤CD4阳性小/中T细胞淋巴瘤、结外T细胞淋巴瘤、肠病相关T细胞淋巴瘤(EATL)、肝脾型T细胞淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)(包括CD30阳性T细胞淋巴增殖性病症)、皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤、蕈样肉芽肿、塞扎里综合征、淋巴瘤样丘疹病、T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)、成人T细胞淋巴瘤、意义不明的单克隆T细胞增殖、间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)；血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤；非特指型(NOS)外周T细胞淋巴瘤(PTCL)；皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)；NKT细胞淋巴瘤；塞扎里综合征；T急性淋巴母细胞性白血病或淋巴瘤；成人T细胞白血病或淋巴瘤；T幼淋巴细胞白血病；和T大颗粒白血病。在一些实施方案中，所述癌症是PTCL。在一些实施方案中，TRBC亚型的表达通过对例如新鲜肿瘤组织的流式细胞术分析，或通过对固定组织(例如，FFPE组织)的免疫组化(IHC)来分析。在一些实施方案中，所述多功能分子与第二药剂组合使用。在一些实施方案中，所述第二药剂是组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂，例如，罗米地辛或贝立司他。在一些实施方案中，所述第二药剂是激酶或酶抑制剂。在一些实施方案中，所述第二药剂是PI3K抑制剂，例如，杜韦利西布。在一些实施方案中，所述第二药剂是法呢基转移酶抑制剂，例如，替吡法尼。在一些实施方案中，所述第二药剂是SYK/JAK抑制剂，例如，赛度替尼。在一些实施方案中，所述第二药剂是化疗。在一些实施方案中，所述第二药剂是抗CD30抗体。在一些实施方案中，所述第二药剂是IMiD。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种鉴定需要使用本文公开的多功能分子治疗癌症的对象的方法，其包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞，其中：
响应于确定所述对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并且任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，和响应于确定所述对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并且任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者。
在另一方面，本公开内容的特征在于一种评价需要治疗癌症(例如，淋巴瘤)的对象的方法，包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞。
示例性实施方案5
1.一种多功能分子，其包括：
(i)第一抗原结合结构域，其优先与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原结合，其中所述肿瘤抗原是T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)，
和
(ii)以下中的一种、两种或全部：
(a)免疫细胞衔接物，其选自NK细胞衔接物(例如，与NKp30、NKp46、NKG2D或CD16结合的分子)、T细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物；
(b)细胞因子分子或细胞因子抑制剂分子；
(c)死亡受体信号衔接物；和
(d)间质修饰部分。
1A.一种多功能分子，其包括：
(i)第一抗原结合结构域，其与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)选择性结合，
和
(ii)以下中的一种、两种或全部：
(a)免疫细胞衔接物，其选自NK细胞衔接物(例如，与NKp30、NKp46、NKG2D或CD16结合的分子)、与除CD3之外的T细胞抗原结合的T细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物；
(b)细胞因子分子或细胞因子抑制剂分子；
(c)死亡受体信号衔接物；和
(d)间质修饰部分。
2.一种多功能分子，其包括：
(i)第一抗原结合结构域，其选择性靶向表达T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)的淋巴细胞，和
(ii)以下中的一种、两种或全部：
(a)免疫细胞衔接物，其选自NK细胞衔接物(例如，与NKp30、NKp46、NKG2D或CD16结合的分子)、T细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物；
(b)细胞因子分子或细胞因子抑制剂分子；
(c)死亡受体信号衔接物；和
(d)间质修饰部分。
3.根据实施方案1或2所述的多功能分子，其中所述多功能分子：
(i)与TRBC1或TRBC2的表位(例如，与本文所述的抗TRBC1或抗TRBC2抗体分子识别的表位相同或相似的表位)特异性结合；
(ii)显示与本文所述的抗TRBC1或抗TRBC2抗体分子相同或相似的结合亲和力或特异性，或两者；
(iii)抑制(例如，竞争性抑制)本文所述的抗TRBC1或抗TRBC2抗体分子的结合；
(iv)与本文所述的抗TRBC1或抗TRBC2抗体分子结合相同或重叠的表位；或
(v)与本文所述的抗TRBC1或抗TRBC2抗体分子竞争结合和/或结合相同的表位。
4.根据实施方案3所述的多功能分子，其中所述抗TRBC1或抗TRBC2抗体分子包括选自表2-5的一个或多个CDR、框架区、可变结构域、重链或轻链或抗原结合结构域，或与其基本相同的序列。
5.根据实施方案1-4中任一项所述的多功能分子，其中所述抗原或肿瘤抗原是TRBC1。
6.根据实施方案1-4中任一项所述的多功能分子，其中所述抗原或肿瘤抗原是TRBC2。
7.根据实施方案1-4或6中任一项所述的多功能分子，其中所述第一抗原结合结构域包括本文公开的抗TRBC2抗原结合结构域，例如，包括表21-25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
8.根据实施方案1-4、6或7中任一项所述的多功能分子，其中所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对不包括TRBC2的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与不包括TRBC2的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％。
9.根据实施方案1-4或6-8中任一项所述的多功能分子，其中所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对包括TRBC1的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与包括TRBC1的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％。
10.根据任一前述实施方案所述的多功能分子，其中所述第一抗原结合结构域与淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)上的TRBC1或TRBC2或者与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原的结合不激活淋巴瘤细胞或淋巴细胞，例如，T细胞。
11.根据任一前述实施方案所述的多功能分子，其中所述第一抗原结合结构域与淋巴瘤细胞或淋巴细胞例如，T细胞)上的TRBC1或TRBC2或者与淋巴瘤细胞(例如，T细胞)上的肿瘤抗原的结合未明显激活淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如T细胞)(例如，如通过T细胞增殖、T细胞激活标志物(例如，CD69或CD25)的表达和/或细胞因子(例如TNFα和IFNγ)的表达所测量。
12.根据实施方案1或2-11中任一项所述的多功能分子，其中相比于非淋巴瘤细胞，所述多功能分子优先结合淋巴瘤细胞，任选地，其中所述多功能分子与淋巴瘤细胞之间的结合超过所述多功能分子与非淋巴瘤细胞之间的结合的10、20、30、40或50倍。
13.根据实施方案2-9中任一项所述的多功能分子，其中：
(i)所述多功能分子与表达TRBC1的淋巴细胞之间的结合超过所述多功能分子与不表达TRBC1的淋巴细胞之间的结合的10、20、30、40或50倍，或
(ii)所述多功能分子与表达TRBC2的淋巴细胞之间的结合超过所述多功能分子与不表达TRBC2的淋巴细胞之间的结合的10、20、30、40或50倍。
14.根据实施方案1-13中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括免疫细胞衔接物，所述免疫细胞衔接物选自NK细胞衔接物、T细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物。
15.根据实施方案14所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物结合并激活免疫细胞，例如效应细胞。
16.根据实施方案15所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物结合但不激活免疫细胞，例如效应细胞。
17.根据实施方案14-16中任一项所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物是T细胞衔接物，例如，介导结合并激活T细胞的T细胞衔接物，或介导结合但不介导激活T细胞的T细胞衔接物。
18.根据实施方案17所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物结合TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2或CD226，例如，所述T细胞衔接物是抗TCRβ抗体分子。
19.根据实施方案14-16中任一项所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物是NK细胞衔接物，例如，介导结合并激活NK细胞的NK细胞衔接物，或介导结合但不激活NK细胞的NK细胞衔接物。
20.根据实施方案19所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物选自抗体分子(例如，抗原结合结构域)或配体，所述抗体分子或配体结合(例如，激活)：NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例如，CD16a、CD16b或两者)、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(也称为SLAMF4或2B4)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E或CD160，例如，所述NK细胞衔接物是结合(例如，激活)NKp30的抗体分子或配体。
21.根据实施方案19所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是抗体分子，例如，抗原结合结构域。
22.根据实施方案20或21中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物能够衔接NK细胞。
23.根据实施方案19-22中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是结合NKp30、NKp46、NKG2D或CD16的抗体分子，例如，抗原结合结构域。
24.根据任一前述实施方案所述的多功能分子，其中所述多功能分子：
(i)特异性结合NKp30、NKp46、NKG2D或CD16的表位，例如，与被本文所述的抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子识别的表位相同或相似的表位；
(ii)显示与本文所述的抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子相同或相似的结合亲和力或特异性，或两者；
(iii)抑制(例如，竞争性抑制)本文所述的抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子的结合；
(iv)结合与本文所述的抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子相同或重叠的表位；或
(v)与本文所述的抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16分子竞争结合和/或结合相同的表位。
25.根据实施方案19-24中任一项所述的多功能分子，其中所述抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子包括选自表7、8、8A、8B、9、10或15的一个或多个CDR、框架区、可变结构域、重链或轻链或抗原结合结构域，或与其基本相同的序列。
26.根据实施方案19-25中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是结合NKp30的抗体分子，例如，抗原结合结构域。
27.根据实施方案19-26中任一项所述的多功能分子，其中所述淋巴瘤细胞或淋巴细胞的裂解由NKp30介导。
28.根据实施方案19-27中任一项所述的多功能分子，其中在淋巴瘤细胞上不存在肿瘤抗原或淋巴细胞上不存在TRBC1或TRBC2的情况下，所述多功能分子在与NK细胞一起孵育时不激活NK细胞。
29.根据实施方案19-28中任一项所述的多功能分子，其中当所述NK细胞是表达NKp30的NK细胞并且：或者(1)淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在或者(2)淋巴细胞上的TRBC1或TRBC2也存在时，所述多功能分子激活NK细胞。
30.根据实施方案19-29中任一项所述的多功能分子，其中当所述NK细胞不是表达NKp30的NK细胞并且：或者(1)淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在或者(2)淋巴细胞上的TRBC1或TRBC2也存在时，所述多功能分子不激活NK细胞。
31.根据实施方案19-30中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括本文公开的抗NKp30抗原结合结构域，例如包括表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
32.根据实施方案19-25中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是与NKp46结合的抗体分子，例如，抗原结合结构域。
33.根据实施方案32所述的多功能分子，其中所述淋巴瘤细胞的裂解由NKp46介导。
34.根据实施方案32或33中任一项所述的多功能分子，其中在淋巴瘤细胞上不存在肿瘤抗原的情况下，所述多功能分子在与NK细胞一起孵育时不激活NK细胞。
35.根据实施方案32-34中任一项所述的多功能分子，其中当NK细胞是表达NKp46的NK细胞并且淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在时，所述多功能分子激活NK细胞。
36.根据实施方案32-35中任一项所述的多功能分子，其中当NK细胞不是表达NKp46的NK细胞并且淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在时，所述多功能分子不激活NK细胞。
37.根据实施方案32-36中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6182的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6182具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
38.根据实施方案32-37中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6183的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6183具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
39.根据32-38所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括scFV，所述scFV包括SEQ ID NO:6181的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6181具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
40.根据实施方案19-25中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是与NKG2D结合的抗体分子，例如，抗原结合结构域。
41.根据实施方案40所述的多功能分子，其中所述淋巴瘤细胞的裂解由NKG2D介导。
42.根据实施方案40或41中任一项所述的多功能分子，其中在淋巴瘤细胞上不存在肿瘤抗原的情况下，所述多功能分子在与NK细胞一起孵育时不激活NK细胞。
43.根据实施方案40-42中任一项所述的多功能分子，其中当NK细胞是表达NKG2D的NK细胞并且淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在时，所述多功能分子激活NK细胞。
44.根据实施方案40-43中任一项所述的多功能分子，其中当NK细胞不是表达NKG2D的NK细胞并且淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在时，所述多功能分子不激活NK细胞。
45.根据实施方案40-44中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6176的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6176具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
46.根据实施方案40-45中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6177的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6177具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
47.根据实施方案40-46中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括scFV，所述scFV包括SEQ ID NO:6175的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6175具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
48.根据实施方案40-44中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6179的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6179具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
49.根据实施方案40-44或48中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6180的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6180具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
50.根据实施方案40-44、48或49中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括scFV，所述scFV包括SEQ ID NO:6178的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6178具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
51.根据实施方案19-25中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是与CD16结合的抗体分子，例如，抗原结合结构域。
52.根据实施方案51所述的多功能分子，其中所述淋巴瘤细胞的裂解由CD16介导。
53.根据根据实施方案51或52中任一项所述的多功能分子，其中在淋巴瘤细胞上不存在肿瘤抗原的情况下，所述多功能分子在与NK细胞一起孵育时不激活NK细胞。
54.根据实施方案51-53中任一项所述的多功能分子，其中当NK细胞是表达CD16的NK细胞并且淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在时，所述多功能分子激活NK细胞。
55.根据实施方案51-54中任一项所述的多功能分子，其中当NK细胞不是表达CD16的NK细胞并且淋巴瘤细胞上的肿瘤抗原也存在时，所述多功能分子不激活NK细胞。
56.根据实施方案51-55中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:6185的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6185具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
57.根据实施方案51-56中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:6186的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6186具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
58.根据实施方案51-57中任一项所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括scFV，所述scFV包括SEQ ID NO:6184的氨基酸序列(或与SEQ ID NO:6184具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
59.根据实施方案19所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是配体，任选地，所述配体进一步包括免疫球蛋白恒定区，例如，Fc区。
60.根据实施方案59所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是NKp44或NKp46的配体，例如，病毒HA。
61.根据实施方案59所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是DAP10的配体，例如，NKG2D的共同受体。
62.根据实施方案59所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物是CD16的配体，例如，CD16a/b配体，例如，进一步包括抗体Fc区的CD16a/b配体。
63.根据实施方案14-16中任一项所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物介导结合或激活或结合并且激活B细胞、巨噬细胞和/或树突状细胞中的一种或多种。
64.根据实施方案63所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物包括B细胞、巨噬细胞和/或树突状细胞衔接物，其选自以下的一种或多种：CD40配体(CD40L)或CD70配体；与CD40或CD70结合的抗体分子；OX40的抗体分子；OX40配体(OX40L)；Toll样受体激动剂(例如，TLR4，例如，组成型活性TLR4(caTLR4)或TLR9激动剂)；41BB；CD2激动剂；CD47；或STING激动剂，或其组合。
65.根据实施方案14-16中任一项所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物是B细胞衔接物，例如，CD40L、OX40L或CD70配体，或结合OX40、CD40或CD70的抗体分子。
66.根据实施方案14-16中任一项所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物是巨噬细胞衔接物，例如，CD2激动剂；CD40L；OX40L；与OX40、CD40或CD70结合的抗体分子；Toll样受体(TLR)激动剂(例如，TLR4，例如，组成型活性TLR4(caTLR4)或TLR9激动剂)；CD47；或STING激动剂。
67.根据实施方案14-16中任一项所述的多功能分子，其中所述免疫细胞衔接物是树突状细胞衔接物，例如，CD2激动剂、OX40抗体、OX40L、41BB激动剂、Toll样受体激动剂或其片段(例如，TLR4，例如，组成型活性TLR4(caTLR4))、CD47激动剂或STING激动剂。
68.根据实施方案66或67所述的多功能分子，其中所述STING激动剂包括环二核苷酸，例如，环二GMP(cdGMP)、环二AMP(cdAMP)或其组合，任选地，具有2’,5’或3’,5’磷酸键，例如，其中所述STING激动剂与所述多功能分子共价偶联。
69.根据实施方案1-13中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括细胞因子分子。
70.根据实施方案69所述的多功能分子，其中所述细胞因子分子选自白介素-2(IL-2)、白介素-7(IL-7)、白介素-12(IL-12)、白介素-15(IL-15)、白介素-18(IL-18)、白介素-21(IL-21)或干扰素γ，或其片段或变体，或任何上述细胞因子的组合。
71.根据实施方案70所述的多功能分子，其中所述细胞因子分子是白介素-2(IL-2)。
72.根据实施方案69-71中任一项所述的多功能分子，其中所述细胞因子分子是单体或二聚体。
73.根据实施方案69-72中任一项所述的多功能分子，其中所述细胞因子分子进一步包括受体二聚化结构域，例如，IL15Rα二聚化结构域。
74.根据实施方案73所述的多功能分子，其中所述细胞因子分子(例如，IL-15)和所述受体二聚化结构域(例如，IL15Rα二聚化结构域)不共价连接，例如，非共价缔合。
75.根据实施方案1-13中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括细胞因子抑制剂分子。
76.根据实施方案75所述的多功能分子，其中所述细胞因子抑制剂分子是TGF-β抑制剂。
77.根据实施方案75或76所述中任一项所述的多功能分子，其中所述TGF-β抑制剂抑制以下(例如，降低以下的活性)：(i)TGF-β1；(ii)TGF-β2；(iii)TGF-β3；(iv)(i)和(ii)；(v)(i)和(iii)；(vi)(ii)和(iii)；或(vii)(i)、(ii)和(iii)。
78.根据实施方案75-77中任一项所述的多功能分子，其中所述TGF-β抑制剂包括能够抑制TGF-β(例如，降低TGF-β活性)的TGF-β受体的一部分(例如，TGF-β受体的胞外结构域)，或其功能片段或变体。
79.根据实施方案78所述的多功能分子，其中所述TGF-β抑制剂包括以下的一部分：(i)TGFBR1；(ii)TGFBR2；(iii)TGFBR3；(iv)(i)和(ii)；(v)(i)和(iii)；(vi)(ii)和(iii)；或(vii)(i)、(ii)和(iii)。
80.根据实施方案75-79中任一项所述的多功能分子，其中所述TGF-β抑制剂包括选自表16的氨基酸序列，或与其具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
81.根据实施方案1-13中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括死亡受体信号衔接物，所述死亡受体信号衔接物选自TNF相关凋亡诱导配体(TRAIL)分子、死亡受体分子或特异性结合死亡受体的抗原结合结构域。
82.根据实施方案81所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物激活淋巴瘤细胞(例如，T细胞)或者表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞中的死亡受体信号传导，并且例如诱导所述细胞中的凋亡或细胞死亡。
83.根据实施方案81或82中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物不激活在非淋巴瘤细胞和不表达TRBC1或不表达TRBC2的淋巴细胞上的死亡受体信号传导。
84.根据实施方案81-83中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括TRAIL分子，例如，一种或多种TRAIL多肽或其片段。
85.根据实施方案84所述的多功能分子，其中所述TRAIL分子特异性结合死亡受体4(DR4)或死亡受体5(DR5)。
86.根据实施方案84或85中任一项所述的多功能分子，其中所述TRAIL分子包括截短TRAIL多肽，例如，相对于野生型TRAIL多肽的截短TRAIL多肽。
87.根据实施方案86所述的多功能分子，其中所述TRAIL分子至少包括对应于人TRAIL的氨基酸95-281的残基，例如，包括对应于人TRAIL的氨基酸95-281的残基的截短TRAIL分子。
88.根据实施方案87所述的多功能分子，其中所述TRAIL分子包括截短TRAIL多肽，所述截短TRAIL多肽包括人TRAIL的氨基酸95-281，并且例如不是人TRAIL的氨基酸1-94。
89.根据实施方案86所述的多功能分子，其中所述TRAIL分子至少包括对应于人TRAIL的氨基酸122-281的残基，例如，包括对应于人TRAIL的氨基酸122-281的残基的截短TRAIL分子。
90.根据实施方案89所述的多功能分子，其中所述TRAIL分子包括截短TRAIL多肽，所述截短TRAIL多肽包括人TRAIL的氨基酸122-281，并且例如不是人TRAIL的氨基酸1-121。
91.根据实施方案84-90中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括一种、两种或三种TRAIL分子。
92.根据实施方案81-83中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括特异性结合死亡受体(例如，死亡受体4(DR4)或死亡受体5(DR5))的抗原结合结构域。
93.根据实施方案92所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括一个、两个或三个特异性结合死亡受体的抗原结合结构域。
94.根据实施方案92或93中任一项所述的多功能分子，其中所述特异性结合死亡受体的抗原结合结构域与DR5结合。
95.根据实施方案92-94中任一项所述的多功能分子，其中所述特异性结合死亡受体的抗原结合结构域包括替加珠单抗、曲齐妥单抗或可那木单抗。
96.根据实施方案81-95中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括选自表11的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
97.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6157的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
98.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6158的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
99.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6159的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
100.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6160的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
101.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6161的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
102.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6162的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
103.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6163的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
104.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6164的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
105.根据实施方案81-96中任一项所述的多功能分子，其中所述死亡受体信号衔接物包括SEQ ID NO:6165的氨基酸序列，或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列。
106.根据实施方案18所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物与TCRβ结合，例如，与TCRβV链(TCRBV)结合。
107.根据实施方案106所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物包括与TCRβ结合(例如，并且在一些实施方案中激活TCRβ)的抗原结合结构域(例如，抗体分子或其片段)。
108.根据实施方案106或107中任一项所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物包括例如特异性结合人TCRβV链(TCRβV)的抗TCRβV抗体分子。
109.根据实施方案106-108中任一项所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物不结合淋巴瘤细胞或表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞。
110.根据实施方案106-108中任一项所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物能够结合淋巴瘤细胞或者表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞，或与淋巴瘤细胞或者表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞结合。
111.根据实施方案106-110中任一项所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物不激活淋巴瘤细胞或表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞。
112.根据实施方案106-110中任一项所述的多功能分子，其中所述T细胞衔接物包括特异性结合表12的TCRβV亚家族或亚家族成员的抗TCRβV抗体分子。
113.根据实施方案112所述的多功能分子，其中所述抗TCRβV抗体分子特异性结合TCRβV6，例如，TCRβV6亚家族，其包括：TCRβV6-4*01、TCRβV6-4*02、TCRβV6-9*01、TCRβV6-8*01、TCRβV6-5*01、TCRβV6-6*02、TCRβV6-6*01、TCRβV6-2*01、TCRβV6-3*01或TCRβV6-1*01。
114.根据实施方案113所述的多功能分子，其中所述抗TCRβV抗体分子包括表13中提供的一个或多个CDR、框架区或可变重链区和/或可变轻链区，或与其具有至少约93％、95％或99％序列同一性的序列。
115.根据实施方案112所述的多功能分子，其中所述抗TCRβV抗体分子特异性结合TCRβV12，例如，TCRβV12亚家族，其包括：TCRβV12-4*01、TCRβV12-3*01或TCRβV12-5*01。
116.根据实施方案115所述的多功能分子，其中所述抗TCRβV抗体分子包括表14中提供的一个或多个CDR、框架区或可变重链区和/或可变轻链区，或与其具有至少约93％、95％或99％序列同一性的序列。
117.根据实施方案1-13中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括间质修饰部分。
118.根据实施方案117所述的多功能分子，其中所述间质修饰部分导致以下中的一种或多种：减少间质或细胞外基质(ECM)组分的水平或产生；减少肿瘤纤维化；增加组织间隙肿瘤运输；改善肿瘤灌注；扩大肿瘤微脉管系统；降低肿瘤中的组织间隙液压(IFP)；或减少或增强药剂(例如，癌症治疗剂或细胞疗法)进入肿瘤或肿瘤脉管系统的渗透或扩散。
119.根据实施方案118所述的多功能分子，其中减少的间质或ECM组分选自糖胺聚糖或细胞外蛋白，或其组合。
120.根据实施方案1-119中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括：
(i)免疫细胞衔接物(例如，T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物)和细胞因子分子，
(ii)免疫细胞衔接物(例如，T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物)和细胞因子抑制剂分子，
(iii)免疫细胞衔接物(例如，T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物)和死亡受体信号衔接物，
(iv)免疫细胞衔接物(例如，T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物)和间质修饰部分，
(v)细胞因子分子和间质修饰部分，
(vi)细胞因子分子和死亡受体信号衔接物，
(vii)细胞因子抑制剂分子和间质修饰部分，
(viii)细胞因子抑制剂分子和死亡受体信号衔接物，
(ix)免疫细胞衔接物(例如，T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物)、细胞因子分子、死亡受体信号衔接物和间质修饰部分，或
(x)免疫细胞衔接物(例如，T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物)、细胞因子抑制剂分子、死亡受体信号衔接物和间质修饰部分。
121.根据实施方案1-120中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括以下构型：
A,B-[二聚模块]-C,-D，其中：
(a)所述二聚模块包括免疫球蛋白恒定结构域，例如，重链恒定区(例如，同源二聚或异源二聚重链恒定区，例如，Fc区)或免疫球蛋白可变区的恒定结构域(例如，Fab区)；和
(b)A、B、C和D独立地为不存在；(i)优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域；(ii)选自T细胞衔接物、NK细胞衔接物、B细胞衔接物、树突状细胞衔接物或巨噬细胞衔接物的免疫细胞衔接物；(iii)细胞因子分子或细胞因子抑制剂分子；(iv)死亡受体信号衔接物；或(v)间质修饰部分，前提是：
A、B、C和D中的至少一个、两个或三个包括优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域，并且剩余的A、B、C和D中的任一个为不存在或者包括免疫细胞衔接物、细胞因子分子、细胞因子抑制剂分子、死亡受体信号衔接物或间质修饰部分中的一种。
122.根据实施方案121所述的多功能分子，其中：
(1)A包括优先与包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域，并且B、C或D包括免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子；
(2)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域，并且B、C或D包括免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30或抗NKp46抗体分子；
(3)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域，并且B、C或D包括细胞因子分子；
(4)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域，并且B、C或D包括细胞因子抑制剂分子；
(5)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域，并且B、C或D包括死亡受体信号衔接物；
(6)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的抗原结合结构域，并且B、C或D包括间质修饰部分；
(7)A包括与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子；
(8)A包括与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子；
(9)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括细胞因子分子；
(10)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括细胞因子抑制剂分子；
(11)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括死亡受体信号衔接物；
(12)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括间质修饰部分；
(13)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子；
(14)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子；
(15)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括细胞因子分子；
(16)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括细胞因子抑制剂分子；
(17)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括死亡受体信号衔接物；
(18)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括间质修饰部分；
(19)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如,抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)细胞因子分子；
(20)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)细胞因子抑制剂分子；
(21)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)死亡受体信号衔接物；
(22)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)间质修饰部分；
(23)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)细胞因子分子；
(24)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)细胞因子抑制剂分子；
(25)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)死亡受体信号衔接物；
(26)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)间质修饰部分；
(27)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)细胞因子分子和(b)间质修饰部分；
(28)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)细胞因子分子和(b)死亡受体信号衔接物；
(29)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)细胞因子抑制剂分子和(b)间质修饰部分；
(30)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)细胞因子抑制剂分子和(b)死亡受体信号衔接物；
(31)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，并且B、C或D包括(a)死亡受体信号衔接物和(b)间质修饰部分；
(32)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)细胞因子分子；
(33)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)细胞因子抑制剂分子；
(34)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)死亡受体信号衔接物；
(35)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)间质修饰部分；
(36)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)细胞因子分子；
(37)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)细胞因子抑制剂分子；
(38)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)死亡受体信号衔接物；
(39)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)间质修饰部分；
(40)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)细胞因子分子和(b)间质修饰部分；
(41)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)细胞因子分子和(b)死亡受体信号衔接物；
(42)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)细胞因子抑制剂分子和(b)间质修饰部分；
(43)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)细胞因子抑制剂分子和(b)死亡受体信号衔接物；
(44)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，B包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且C或D包括(a)间质修饰部分和(b)死亡受体信号衔接物；
(45)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)细胞因子分子；
(46)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)细胞因子抑制剂分子；
(47)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)死亡受体信号衔接物；
(48)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，NK细胞衔接物，例如，抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D或抗CD16抗体分子，和(b)间质修饰部分；
(49)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)细胞因子分子；
(50)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)细胞因子抑制剂分子；
(51)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)死亡受体信号衔接物；
(52)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)免疫细胞衔接物，例如，T细胞衔接物，例如，抗TCRβV抗体分子，和(b)间质修饰部分；
(53)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)细胞因子分子和(b)间质修饰部分；
(54)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)细胞因子分子和(b)死亡受体信号衔接物；
(55)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)细胞因子抑制剂分子和(b)间质修饰部分；
(56)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)细胞因子抑制剂分子和(b)死亡受体信号衔接物；或
(57)A包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第一抗原结合结构域，C包括优先与TRBC1或TRBC2结合的第二抗原结合结构域，并且B或D包括(a)间质修饰部分和(b)死亡受体信号衔接物。
123.根据实施方案121或122所述的多功能分子，其中所述二聚模块包括一个或多个免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)，所述免疫球蛋白链恒定区包括以下中的一种或多种：成对的腔-突起(“杵臼结构”)、静电相互作用或链交换。
124.根据实施方案123所述的多功能分子，其中所述一个或多个免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)在例如人IgG1的Fc区的选自347、349、350、351、366、368、370、392、394、395、397、398、399、405、407或409中的一个或多个的位置处包括氨基酸取代，任选地其中所述一个或多个免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)包括选自以下的氨基酸取代：T366S、L368A或Y407V(例如，对应于腔或臼)，或T366W(例如，对应于突起或杵)，或其组合。
125.根据实施方案1-124中任一项所述的多功能分子，其进一步包括接头，例如，在以下一种或多种之间的接头：抗原结合结构域与免疫细胞衔接物、抗原结合结构域与细胞因子分子、抗原结合结构域与间质修饰部分、免疫细胞衔接物与细胞因子分子、免疫细胞衔接物与间质修饰部分、细胞因子分子与间质修饰部分、抗原结合结构域与二聚模块、免疫细胞衔接物与二聚模块、细胞因子分子与二聚模块或间质修饰部分与二聚模块。
126.根据实施方案125所述的多功能分子，其中所述接头选自：可裂解接头、不可裂解接头、肽接头、柔性接头、刚性接头、螺旋接头或非螺旋接头。
127.根据实施方案125或126所述的多功能分子，其中所述接头是肽接头。
128.根据实施方案127所述的多功能分子，其中所述肽接头包括Gly和Ser。
129.根据实施方案128所述的多功能分子，其中所述肽接头包括选自SEQ ID NO:7249-7252或75-78的氨基酸序列。
130.一种多功能分子，其包括：
(i)优先与TRBC1结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)NK细胞衔接物，例如，抗NKp30抗体分子、抗NKp46抗体分子、抗NKG2D抗体分子或抗CD16抗体分子。
131.根据实施方案130所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括抗NKp30抗体分子。
132.根据实施方案130所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括抗NKp46抗体分子。
133.根据实施方案130所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括抗NKG2D抗体分子。
134.根据实施方案130所述的多功能分子，其中所述NK细胞衔接物包括抗CD16抗体分子。
135.一种多功能分子，其包括：
(i)优先与TRBC1结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)死亡受体信号衔接物。
136.一种多功能分子，其包括：
(i)优先与TRBC1结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)T细胞衔接物，例如，与TCRβV链(TCRBV)结合的抗原结合结构域。
137.一种多功能分子，其包括：
(i)优先与TRBC1结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)细胞因子抑制剂分子，例如，TGF-β抑制剂。
138.根据实施方案1或3-137中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子与TRBC1、TRBC2或肿瘤抗原单价结合。
139.根据实施方案1或3-137中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子与TRBC1、TRBC2或肿瘤抗原多价结合，例如，二价、三价、四价、五价、六价、七价、八价、九价或十价结合。
140.根据实施方案2-137中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子与TRBC1、TRBC2或表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞单价结合。
141.根据实施方案2-137中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子与表达TRBC1或TRBC2的淋巴细胞多价结合，例如，二价、三价、四价、五价、六价、七价、八价、九价或十价结合。
142.根据任一前述实施方案所述的多功能分子，其中所述多功能分子例如经由免疫细胞衔接物与免疫细胞单价结合。
143.根据实施方案1-141中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子例如经由免疫细胞衔接物与免疫细胞多价结合，例如，二价、三价、四价、五价、六价、七价、八价、九价或十价结合。
144.根据任一前述实施方案所述的多功能分子，其进一步包括介导抗体依赖性细胞毒性(ADCC)的重链恒定区，例如，Fc区。
145.根据任一前述实施方案所述的多功能分子，其进一步包括介导抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)的重链恒定区，例如，Fc区。
146.根据实施方案145所述的多功能分子，其中结合TRBC1或TRBC2的第一抗原结合结构域包括IgG2重链恒定区或免疫细胞衔接物，细胞因子抑制剂分子或死亡受体信号衔接物包括IgG2重链恒定区。
147.根据任一前述实施方案所述的多功能分子，其进一步包括介导补体依赖性细胞毒性(例如，经由C1q)的重链恒定区，例如，Fc区。
148.一种结合TRBC1的抗体分子，其包括选自表2-5的一个或多个CDR、框架区、可变结构域、重链或轻链或抗原结合结构域，或与其基本相同的序列。
149.根据实施方案148所述的抗体分子，其包括重链可变区(VH)，所述重链可变区包括SEQ ID NO:215的重链框架区1(VHFWR1)氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:216的VHFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:217的VHFWR3氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)或218的VHFWR4氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。
150.根据实施方案148或149中任一项所述的抗体分子，其包括轻链可变区(VL)，所述轻链可变区包括SEQ ID NO:238的轻链框架区1(VLFWR1)氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ ID NO:239的VLFWR2氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)、SEQ IDNO:240的VLFWR3氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)或241的VLFWR4氨基酸序列(或与其具有不超过1、2、3、4、5或6个突变(例如，取代、添加或缺失)的序列)。
151.根据实施方案148-150中任一项所述的抗体分子，其中所述抗体分子包括VH，所述VH包括SEQ ID NO:253的氨基酸序列(或与其具有至少约75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
152.根据实施方案148-151中任一项所述的抗体分子，其中所述抗体分子包括VL，所述VL包括SEQ ID NO:258的氨基酸序列(或与其具有至少约93％、95％或99％序列同一性的氨基酸序列)。
153.一种核酸分子，其编码根据实施方案1-152中任一项所述的多功能分子或抗体分子。
154.一种载体，例如，表达载体，其包括根据实施方案153所述的核酸分子。
155.一种宿主细胞，其包括根据实施方案153所述的核酸分子或根据实施方案154所述的载体。
156.一种制备(例如，产生)根据实施方案1-152中任一项所述的多功能分子或抗体分子的方法，其包括在合适的条件下(例如，适合基因表达和/或同源二聚化或异源二聚化的条件下)培养根据实施方案155所述的宿主细胞。
157.一种药物组合物，其包括根据实施方案1-152中任一项所述的多功能分子和药学上可接受的载剂、赋形剂或稳定剂。
158.一种治疗癌症的方法，其包括向有此需要的对象施用根据实施方案1-152中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子以有效治疗癌症的量施用。
159.根据实施方案158所述的方法，其进一步包括鉴定、评价或选择需要治疗的对象，其中鉴定、评价或选择包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞。
160.根据实施方案159所述的方法，其进一步包括：响应于确定对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞，
任选地，选择所述对象用多功能分子治疗，所述多功能分子包括与包括TRBC1的T细胞受体结合的抗原结合结构域；和
施用包括与包括TRBC1的T细胞受体结合的抗原结合结构域的多功能分子。
161.根据实施方案160所述的方法，其进一步包括不施用包括与包括TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域的多功能分子。
162.一种治疗癌症(例如，淋巴瘤或白血病)的方法，其包括：
响应于确定对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞，向有此需要的对象施用根据实施方案1-152中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子以有效治疗所述癌症的量施用。
163.根据实施方案162所述的方法，其进一步包括：响应于确定对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，
任选地，选择所述对象用多功能分子治疗，所述多功能分子包括与包括TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域，和施用包括与包括TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域的多功能分子。
164.根据实施方案163所述的方法，其进一步包括不施用包括与包括TRBC1的T细胞受体结合的抗原结合结构域的多功能分子。
165.根据实施方案158-162中任一项所述的方法，其中所述对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞。
166.根据实施方案158、159、163或164中任一项所述的方法，其中所述对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞。
167.一种鉴定需要使用根据实施方案1-152中任一项所述的多功能分子或抗体分子治疗癌症的对象的方法，其包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞，其中：
响应于确定所述对象具有表达包括TRBC1的T细胞受体的癌细胞，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并且任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，和响应于确定所述对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并且任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者。
168.根据实施方案167所述的方法，其进一步包括：
响应于将所述对象鉴定为使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，用(例如，向对象施用)包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗所述对象，或响应于将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，用(例如，向对象施用)包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗所述对象。
169.一种评价需要治疗癌症(例如，淋巴瘤)的对象的方法，其包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞。
170.根据实施方案169所述的方法，其进一步包括响应于所述评价，用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子或包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗所述对象(例如，向所述对象施用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子或包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子)。
171.根据实施方案158-170中任一项所述的方法，其中所述癌症是血液学癌症。
172.根据实施方案171所述的方法，其中所述血液学癌症是白血病或淋巴瘤。
173.根据实施方案172所述的方法，其中所述血液学癌症选自白血病(例如，急性淋巴母细胞性白血病(ALL)、急性髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性髓细胞性白血病(CML)、毛细胞白血病、急性单核细胞白血病(AMoL)、慢性骨髓单核细胞性白血病(CMML)、幼年型骨髓单核细胞白血病(JMML)或大颗粒淋巴细胞白血病)、淋巴瘤(例如，艾滋病相关淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤(例如，经典霍奇金淋巴瘤或结节性淋巴细胞为主型霍奇金淋巴瘤)、蕈样真菌病、非霍奇金淋巴瘤(例如，B细胞非霍奇金淋巴瘤(例如，伯基特淋巴瘤、小淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、免疫母细胞性大细胞淋巴瘤、前体B淋巴母细胞性淋巴瘤或套细胞淋巴瘤)或T细胞非霍奇金淋巴瘤(蕈样真菌病、间变性大细胞淋巴瘤或前体T淋巴母细胞性淋巴瘤))、原发性中枢神经系统淋巴瘤、塞扎里综合征、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症)、慢性骨髓增生性肿瘤、朗格汉斯细胞组织细胞增多症、多发性骨髓瘤/浆细胞肿瘤、骨髓增生异常综合征或骨髓增生异常/骨髓增生性肿瘤。
174.根据实施方案172所述的方法，其中所述淋巴瘤选自获得性免疫缺陷综合征(AIDS)相关淋巴瘤、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、成人T细胞白血病/淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、中枢神经系统(CNS)淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、淋巴母细胞性淋巴瘤、套细胞淋巴瘤(MCL)、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)(例如，肝脾T细胞淋巴瘤(HSGDTCL)、皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤或肠病相关T细胞淋巴瘤)、转变型滤泡和转变型黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样真菌病和塞扎里综合征)、滤泡性淋巴瘤、淋巴浆细胞淋巴瘤/瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症、边缘区B细胞淋巴瘤、胃黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病/小细胞淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、结外T细胞/NK细胞淋巴瘤(鼻型)或间变性大细胞淋巴瘤(例如，原发性皮肤间变性大细胞淋巴瘤或系统性间变性大细胞淋巴瘤)。
175.根据实施方案158-170中任一项所述的方法，所述癌症是实体瘤癌症。
176.根据实施方案158-175中任一项所述的方法，其进一步包括施用第二治疗性治疗。
177.根据实施方案176所述的方法，其中所述第二治疗性治疗包括治疗剂(例如，化疗剂、生物剂、激素疗法)、放射或手术。
178.根据实施方案171所述的方法，其中所述治疗剂选自：化疗剂或生物剂。
示例性实施方案6
A1.一种多功能分子，其包括：
(i)与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，
其中所述第一抗原结合结构域包括表21-25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
A2.根据实施方案A1所述的多功能分子，其中所述第一抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3；所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中：
所述VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201和7442的氨基酸序列；或所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7443、224和225的氨基酸序列。
A3.根据实施方案A2所述的多功能分子，其中所述VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7422、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7401、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7394、201和7396；
分别包括SEQ ID NO:7346、201和7398；
分别包括SEQ ID NO:7346、201和7400；
分别包括SEQ ID NO:7405、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7407、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7427、201和7403；或
分别包括SEQ ID NO:7430、201和7403的氨基酸序列。
A4.根据实施方案A2或A3所述的多功能分子，其中所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7410、224和225；或
分别包括SEQ ID NO:7409、224和225的氨基酸序列。
A5.根据实施方案A2-A4中任一项所述的多功能分子，其中所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7409、224和225；或
分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7409、224和225的氨基酸序列。
A6.根据实施方案A2-A5中任一项所述的多功能分子，其中所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428和7431(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7419和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
A7.根据实施方案A2-A6中任一项所述的多功能分子，其中所述VH和VL：
分别包括SEQ ID NO:7420和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7423和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7411和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7412和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7413和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7414和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7415和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7416和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7417和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7425和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7428和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7431和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7420和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7423和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7411和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7412和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7413和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7414和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7415和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7416和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7417和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7425和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7428和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7431和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
A8.根据实施方案A1-A7中任一项所述的多功能分子，其中：
(i)所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对不包括TRBC2的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与不包括TRBC2的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％；
(ii)所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对包括TRBC1的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与包括TRBC1的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％；或
(iii)所述第一抗原结合结构域与淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)上的TRBC2的结合未明显激活淋巴瘤细胞或淋巴细胞(例如，T细胞)例如如通过T细胞增殖、T细胞激活标志物(例如，CD69或CD25)的表达和/或细胞因子(例如，TNFα和IFNγ)的表达所测量的。
A9.根据实施方案A1-A8中任一项所述的多功能分子，其中所述第二抗原结合结构域包括表7、8、8A、8B、9、-10、18和25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
A10.根据实施方案A1-A9中任一项所述的多功能分子，其中所述第二抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7313、6001和7315；
分别包括SEQ ID NO:7313、6001和6002；
分别包括SEQ ID NO:7313、6008和6009；
分别包括SEQ ID NO:7313、7385和7315；或
分别包括SEQ ID NO:7313、7318和6009；
分别包括SEQ ID NO:C019、C021和C023；
分别包括SEQ ID NO:C033、C035和C037；
分别包括SEQ ID NO:C047、C049和C051；
分别包括SEQ ID NO:C061、C063和C065；
分别包括SEQ ID NO:C075、C077和C079；
分别包括SEQ ID NO:C089、C091和C093；
分别包括SEQ ID NO:C103、C105和C107；或
分别包括SEQ ID NO:C116、C118和C120的氨基酸序列。
A11.根据实施方案A10所述的多功能分子，其中所述第二抗原结合结构域的VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7326、7327和7329；
分别包括SEQ ID NO:6063、6064和7293；
分别包括SEQ ID NO:6070、6071和6072；或
分别包括SEQ ID NO:6070、6064和7321；
分别包括SEQ ID NO:C026、C028和C030；
分别包括SEQ ID NO:C040、C042和C044；
分别包括SEQ ID NO:C054、C056和C058；
分别包括SEQ ID NO:C068、C070和C072；
分别包括SEQ ID NO:C082、C084和C086；
分别包括SEQ ID NO:C096、C098和C100；
分别包括SEQ ID NO:C110、C112和C113；
分别包括SEQ ID NO:C123、C125和C127的氨基酸序列。
A12.根据实施方案A10或A11所述的多功能分子，其中所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7313、6001、7315、7326、7327和7329；
分别包括SEQ ID NO:7313、6001、6002、6063、6064和7293；
分别包括SEQ ID NO:7313、6008、6009、6070、6071和6072；
分别包括SEQ ID NO:7313、7385、7315、6070、6064和7321；或
分别包括SEQ ID NO:7313、7318、6009、6070、6064和7321；
分别包括SEQ ID NO:C019、C021、C023、C026、C028和C030；
分别包括SEQ ID NO:C033、C035、C037、C040、C042和C044；
分别包括SEQ ID NO:C047、C049、C051、C054、C056和C058；
分别包括SEQ ID NO:C061、C063、C065、C068、C070和C072；
分别包括SEQ ID NO:C075、C077、C079、C082、C084和C086；
分别包括SEQ ID NO:C089、C091、C093、C096、C098和C100；
分别包括SEQ ID NO:C103、C105、C107、C110、C112和C113；或
分别包括SEQ ID NO:C116、C118、C120、C123、C125和C127的氨基酸序列。
A13.根据实施方案A10-A12中任一项所述的多功能分子，其中：
(i)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7302、7298、7300、7301、7303和7304(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7309、7305、7299和7306-7308(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
(ii)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6121或6123-6128(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7294或6137-6141(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
(iii)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6122或6129-6134(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6136或6142-6147(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
(iv)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C001-C008(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C009-C016(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
A14.根据实施方案A10-A13中任一项所述的多功能分子，其中所述第二抗原结合结构域的VH和VL：
分别包括SEQ ID NO:7302和7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
分别包括SEQ ID NO:7302和7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)氨基酸序列。
A15.根据实施方案A10-A14中任一项所述的多功能分子，其中所述第二抗原结合结构域包括：
SEQ ID NO:7311或7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
SEQ ID NO:6187或6188(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
SEQ ID NO:6189或6190(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
SEQ ID NO:C017-C024中的任一个的氨基酸序列。
A16.根据实施方案A1-A15中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子与TRBC2单价结合。
A17.根据实施方案A1-A16中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子包括图30A-30D中任一个所示的构型，任选地，其中：
(i)所述多功能抗体分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 scFv，例如，包括图30A所示的构型；
(ii)所述多功能抗体分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 Fab，例如，包括图30B所示的构型；
(iii)所述多功能抗体分子包括抗NKp30 Fab和抗TRBC2 scFv，例如，包括图30C所示的构型；或
(iv)所述多功能抗体分子包括抗TRBC2 scFv和抗NKp30 scFv，例如，包括图30D所示的构型。
A18.根据实施方案A1-A17中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子进一步包括二聚模块，所述二聚模块包括一个或多个免疫球蛋白链恒定区(例如，Fc区)，所述免疫球蛋白链恒定区包括以下中的一种或多种：成对的腔-突起(“杵臼结构”)、静电相互作用或链交换。
A19.根据实施方案A1-A18中任一项所述的多功能分子，其包括表21-25的任一个中公开的抗TRBC2氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列；和/或表7、8、8A、8B、9、-10、18和25的任一个中公开的抗NKp30氨基酸序列，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
A20.根据实施方案A1-A19中任一项所述的多功能分子，其包括：
(i)SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；
(ii)SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv；或(iii)SEQ ID NO:7438、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
A21.根据实施方案A1-A19中任一项所述的多功能分子，其包括：
(i)SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；
(ii)SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 scFv；或
(iii)SEQ ID NO:7440、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
A22.一种多功能分子，其包括：
(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，
其中所述第一抗原结合结构域包括表3A-3B或4的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:B001-B095中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
A23.根据实施方案A22的多功能分子，其中所述第二抗原结合结构域包括本文公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域。
A24.一种多功能分子，其包括：
(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，
其中所述第二抗原结合结构域包括表8A-8B、9或10的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:C001-C128中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
A25.根据实施方案A24所述的多功能分子，其中所述第一抗原结合结构域包括本文公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域。
A26.一种与TRBC2结合的抗体分子，其包括表21-25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
A27.一种与TRBC1结合的抗体分子，其包括表3A-3B或4的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域(例如，SEQ ID NO:B001-B095中的任一个)，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
A28.根据实施方案A1-A25中任一项所述的多功能分子或根据实施方案A26或A27所述的抗体分子，其进一步包括重链恒定区变体，例如，Fc区变体，其包括导致对至少一种Fc受体的亲和力降低或消除的一个或多个突变，任选地其中所述一个或多个突变导致抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)、抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)或补体依赖性细胞毒性(CDC)降低或消除。
A29.根据实施方案A1-A25和A28中任一项所述的多功能分子或根据实施方案A26-A28中任一项所述的抗体分子，其中所述Fc区变体包括表20中公开的一个或多个突变，任选地其中所述Fc区变体包括N297A突变。
A30.一种核酸分子，其编码根据实施方案A1-A25、A28和A29中任一项所述的多功能分子或根据实施方案A26-A29中任一项所述的抗体分子。
A31.一种载体，例如，表达载体，其包括根据实施方案A30所述的核酸分子。
A32.一种细胞，其包括根据实施方案A30所述的核酸分子或根据实施方案A31所述的载体。
A33.一种制备(例如，产生)根据实施方案A1-A25、A28和A29中任一项所述的多功能分子或根据实施方案A26-A29中任一项所述的抗体分子的方法，其包括在合适的条件下(例如，适合基因表达和/或同源二聚化或异源二聚化的条件下)培养所述实施方案A32所述的细胞。
A34.一种药物组合物，其包括根据实施方案A1-A25、A28和A29中任一项所述的多功能分子或根据实施方案A26-A29中任一项所述的抗体分子以及药学上可接受的载剂、赋形剂或稳定剂。
A35.一种治疗癌症的方法，其包括向有此需要的对象施用根据实施方案A1-A25、A28和A29中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子以有效治疗所述癌症的量施用。
A36.根据实施方案A35所述的方法，其进一步包括鉴定、评价或选择需要治疗的对象，其中鉴定、评价或选择包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞。
A37.根据实施方案A35所述的方法，其进一步包括：响应于确定对象具有表达包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体的癌细胞：
任选地，选择所述对象用多功能分子治疗，所述多功能分子包括与包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域，和施用包括与包括TRBC1或TRBC2的T细胞受体结合的抗原结合结构域的多功能分子。
A38.一种治疗癌症(例如，淋巴瘤或白血病，例如，T细胞淋巴瘤或白血病)的方法，其包括：
响应于确定对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，向所述对象施用根据实施方案A1-A25、A28和A29中任一项所述的多功能分子，其中所述多功能分子以有效治疗所述癌症的量施用。
示例性实施方案7
1.一种鉴定需要使用根据实施方案1-21D、23或24中任一项所述的多功能分子治疗癌症(例如，淋巴瘤或白血病，例如，T细胞淋巴瘤或白血病)的对象的方法，其包括确定(例如，直接确定或间接确定，例如，获得关于以下的信息)对象是否具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，其中：
响应于确定所述对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并且任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者。
2.根据实施方案1所述的方法，其进一步包括：
响应于将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，用本文所述的多功能分子治疗所述对象(例如，向所述对象施用本文所述的多功能分子)。
3.根据实施方案1或2所述的方法，其中所述癌症是白血病或淋巴瘤。
4.根据实施方案1-3中任一项所述的方法，其中所述癌症选自获得性免疫缺陷综合征(AIDS)相关淋巴瘤、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、成人T细胞白血病/淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、中枢神经系统(CNS)淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、淋巴母细胞性淋巴瘤、套细胞淋巴瘤(MCL)、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)(例如，肝脾T细胞淋巴瘤(HSGDTCL)、皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤或肠病相关T细胞淋巴瘤)、转变型滤泡和转变型黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样真菌病和塞扎里综合征)、滤泡性淋巴瘤、淋巴浆细胞淋巴瘤/瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症、边缘区B细胞淋巴瘤、胃黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病/小细胞淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、结外T细胞/NK细胞淋巴瘤(鼻型)以及间变性大细胞淋巴瘤(例如，原发性皮肤间变性大细胞淋巴瘤或系统性间变性大细胞淋巴瘤)。
5.根据实施方案1-4中任一项所述的方法，其中所述癌症是外周T细胞淋巴瘤(PTCL)。
6.一种检测样品或对象中TRBC1或TRBC2的方法，其包括：使所述样品或对象与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及
检测所述抗体分子与所述样品或对象之间的复合物的形成，从而检测TRBC1或TRBC2。
7.根据实施方案6所述的方法，其中在体外或体内检测TRBC1或TRBC2。
8.根据实施方案6或7所述的方法，其进一步包括使参考样品或对象与所述抗体分子接触；以及检测所述抗体分子与所述参考样品或对象之间的复合物的形成，其中所述样品或对象中所述复合物的形成相对于所述参考样品或对象的变化表明所述样品或对象中存在TRBC1或TRBC2。
9.根据实施方案6-8中任一项所述的方法，其进一步包括从对象获得样品。
10.根据实施方案6-9中任一项所述的方法，其中所述样品包括血浆、组织(例如，癌组织)、活检、血液(例如，全血)、PBMC、骨髓和/或淋巴组织(例如，淋巴结)中的一种或多种。
11.根据实施方案6-10中任一项所述的方法，其中所述样品未被冷冻和/或固定。
12.根据实施方案6-10中任一项所述的方法，其中所述样品已被冷冻(例如，急冻)和/或固定(例如，福尔马林固定石蜡包埋(FFPE))。
13.根据实施方案6-12中任一项所述的方法，其中所述对象患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)或处于患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)的风险中。
14.根据实施方案6-13中任一项所述的方法，其进一步包括进行流式分析，例如使用多组方法进行流式分析。
15.根据实施方案6-14中任一项所述的方法，其进一步包括评估T细胞克隆性，例如以确定T细胞恶性肿瘤的存在和/或水平。
16.根据实施方案6-15中任一项所述的方法，其进一步包括测量来自所述生物样品的TRBC1+或TRBC2+细胞的水平(例如，确定TRBC1+或TRBC2+细胞是否例如相对于参考样品或对象耗尽)。
17.根据实施方案6-16中任一项所述的方法，其进一步包括测量TRBC1或TRBC2的细胞内水平。
18.根据实施方案6-17中任一项所述的方法，其进一步包括测量TRBC1或TRBC2的膜水平。
19.根据实施方案6-18中任一项所述的方法，其进一步包括评价所述对象例如在治疗后(例如，在用本文所述的抗体分子治疗后)的疾病或病症(例如，癌症)的预后、严重程度或存在或不存在的变化。
20.根据实施方案6-19中任一项所述的方法，其中所述抗体分子被可检测地标记。
21.一种评价对象的方法，其包括：
使来自所述对象的样品(例如，本文所述的样品)与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及
检测所述抗体分子和所述样品之间的复合物的形成，
从而评价所述对象。
22.根据实施方案21所述的方法，其中所述对象患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)或处于患有本文所述的疾病或病症(例如癌症，例如淋巴瘤，例如T细胞淋巴瘤)的风险中。
23.根据实施方案21或22所述的方法，其中所述对象尚未用本文所述的抗体分子治疗。
24.根据实施方案21或22所述的方法，其中所述对象已用本文所述的抗体分子治疗。
25.一种试剂盒，其包括本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子和用于检测样品或对象中TRBC1或TRBC2的方法的说明。

Claims (51)

1.一种使用包括多肽分子的组合物鉴定需要治疗癌症的对象的方法，所述多肽分子包括：
(i)与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)或T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合的第一抗原结合结构域，和
(ii)与NKp30结合的第二抗原结合结构域，
所述方法包括确定对象是否具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞，其中：
所述对象具有表达包括TRBC2的T细胞受体的癌细胞的确定，将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，并任选地将所述对象鉴定为不是使用包括与TRBC1结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述多肽分子是多功能多肽分子。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述多肽分子是多特异性多肽分子。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且所述第一抗原结合结构域包括表21-25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且所述第一抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中：
所述VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3分别包括SEQ ID NO:7441、201和7442的氨基酸序列；或
所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3分别包括SEQ ID NO:7443、224和225的氨基酸序列。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7422、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7401、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7394、201和7396；
分别包括SEQ ID NO:7346、201和7398；
分别包括SEQ ID NO:7346、201和7400；
分别包括SEQ ID NO:7405、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7407、201和7403；
分别包括SEQ ID NO:7427、201和7403；或
分别包括SEQ ID NO:7430、201和7403的氨基酸序列。
7.根据权利要求5或6所述的方法，其中所述VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7410、224和225；或
分别包括SEQ ID NO:7409、224和225的氨基酸序列。
8.根据权利要求5-7中任一项所述的方法，其中所述VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7410、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7422、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7401、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7394、201、7396、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7398、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7346、201、7400、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7405、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7407、201、7403、7409、224和225；
分别包括SEQ ID NO:7427、201、7403、7409、224和225；或
分别包括SEQ ID NO:7430、201、7403、7409、224和225的氨基酸序列。
9.根据权利要求5-8中任一项所述的方法，其中所述VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428和7431(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7419和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
10.根据权利要求5-9中任一项所述的方法，其中所述VH和VL：
分别包括SEQ ID NO:7420和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7423和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7411和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7412和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7413和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7414和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7415和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7416和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7417和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7425和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7428和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7431和7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7420和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7423和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7411和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7412和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7413和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7414和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7415和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7416和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7417和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7425和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
分别包括SEQ ID NO:7428和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
分别包括SEQ ID NO:7431和7418(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且其中：
(i)所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对不包括TRBC2的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与不包括TRBC2的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％；
(ii)所述第一抗原结合结构域对包括TRBC2的T细胞受体的亲和力高于对包括TRBC1的T细胞受体的亲和力，任选地，其中所述第一抗原结合结构域与TRBC2之间的结合的KD不超过所述第一抗原结合结构域与包括TRBC1的T细胞受体之间的结合的KD的40％、30％、20％、10％、1％、0.1％或0.01％；或
(iii)所述第一抗原结合结构域与淋巴瘤细胞或淋巴细胞上的TRBC2的结合未明显激活淋巴瘤细胞或淋巴细胞对T细胞激活标志物的表达和/或对细胞因子的表达。
12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域2(TRBC2)结合，并且所述多肽分子与TRBC2单价地结合。
13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法，其中所述多肽分子包括图30A-30D中任一个所示的构型，任选地，其中：
(i)所述多肽分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 scFv；
(ii)所述多肽分子包括抗TRBC2 Fab和抗NKp30 Fab；
(iii)所述多肽分子包括抗NKp30 Fab和抗TRBC2 scFv；或
(iv)所述多肽分子包括抗TRBC2 scFv和抗NKp30 scFv。
14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中所述多肽分子进一步包括二聚模块，所述二聚模块包括一个或多个免疫球蛋白链恒定区，所述免疫球蛋白链恒定区包括以下中的一种或多种：成对的腔-突起(“杵臼结构”)、静电相互作用或链交换。
15.根据权利要求1-14中任一项所述的方法，其中所述多肽分子包括表21-25的任一个中公开的抗TRBC2氨基酸序列或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列，和/或表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个中公开的抗NKp30氨基酸序列或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
16.根据权利要求1-15中任一项所述的方法，其中所述多肽分子包括：
(i)SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；
(ii)SEQ ID NO:7420(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30scFv；或
(iii)SEQ ID NO:7438、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
17.根据权利要求1-15中任一项所述的方法，其中所述多肽分子包括：
(i)SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL、SEQ ID NO:7302(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30VH和SEQ ID NO:7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30 VL；
(ii)SEQ ID NO:7423(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VH、SEQ ID NO:7419(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗TRBC2 VL和SEQ ID NO:7311(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的抗NKp30scFv；或
(iii)SEQ ID NO:7440、7439和7383(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
18.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合，并且其中所述第一抗原结合结构域包括表3A-3B或4的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
19.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述第一抗原结合结构域与T细胞受体β链恒定结构域1(TRBC1)结合，并且其中所述第二抗原结合结构域包括表8A-8B、9和10的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
20.根据权利要求1-19中任一项所述的方法，其中所述第二抗原结合结构域包括表7、8、8A、8B、9、10、18和25的任一个中公开的一个或多个CDR、框架区、可变区或抗原结合结构域，或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列。
21.根据权利要求1-20中任一项所述的方法，其中所述第二抗原结合结构域包括VH和VL，所述VH包括重链互补决定区1(VHCDR1)、VHCDR2和VHCDR3，所述VL包括轻链互补决定区1(VLCDR1)、VLCDR2和VLCDR3，其中所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2和VHCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7313、6001和7315；
分别包括SEQ ID NO:7313、6001和6002；
分别包括SEQ ID NO:7313、6008和6009；
分别包括SEQ ID NO:7313、7385和7315；
分别包括SEQ ID NO:7313、7318和6009；
分别包括SEQ ID NO:C019、C021和C023；
分别包括SEQ ID NO:C033、C035和C037；
分别包括SEQ ID NO:C047、C049和C051；
分别包括SEQ ID NO:C061、C063和C065；
分别包括SEQ ID NO:C075、C077和C079；
分别包括SEQ ID NO:C089、C091和C093；
分别包括SEQ ID NO:C103、C105和C107；或
分别包括SEQ ID NO:C116、C118和C120的氨基酸序列。
22.根据权利要求21所述的方法，其中所述第二抗原结合结构域的VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7326、7327和7329；
分别包括SEQ ID NO:6063、6064和7293；
分别包括SEQ ID NO:6070、6071和6072；
分别包括SEQ ID NO:6070、6064和7321；
分别包括SEQ ID NO:C026、C028和C030；
分别包括SEQ ID NO:C040、C042和C044；
分别包括SEQ ID NO:C054、C056和C058；
分别包括SEQ ID NO:C068、C070和C072；
分别包括SEQ ID NO:C082、C084和C086；
分别包括SEQ ID NO:C096、C098和C100；
分别包括SEQ ID NO:C110、C112和C113；或
分别包括SEQ ID NO:C123、C125和C127的氨基酸序列。
23.根据权利要求21或22所述的方法，其中所述第二抗原结合结构域的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2和VLCDR3：
分别包括SEQ ID NO:7313、6001、7315、7326、7327和7329；
分别包括SEQ ID NO:7313、6001、6002、6063、6064和7293；
分别包括SEQ ID NO:7313、6008、6009、6070、6071和6072；
分别包括SEQ ID NO:7313、7385、7315、6070、6064和7321；
分别包括SEQ ID NO:7313、7318、6009、6070、6064和7321；
分别包括SEQ ID NO:C019、C021、C023、C026、C028和C030；
分别包括SEQ ID NO:C033、C035、C037、C040、C042和C044；
分别包括SEQ ID NO:C047、C049、C051、C054、C056和C058；
分别包括SEQ ID NO:C061、C063、C065、C068、C070和C072；
分别包括SEQ ID NO:C075、C077、C079、C082、C084和C086；
分别包括SEQ ID NO:C089、C091、C093、C096、C098和C100；
分别包括SEQ ID NO:C103、C105、C107、C110、C112和C113；或
分别包括SEQ ID NO:C116、C118、C120、C123、C125和C127的氨基酸序列。
24.根据权利要求21-23中任一项所述的方法，其中：
(i)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7302、7298、7300、7301、7303和7304(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7309、7305、7299和7306-7308(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
(ii)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6121和6123-6128(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7294或6137-6141(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
(iii)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6122和6129-6134(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:6136或6142-6147(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
(iv)所述第二抗原结合结构域的VH包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C001-C008(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)并且/或者所述第二抗原结合结构域的VL包括选自以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:C009-C016(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)。
25.根据权利要求21-24中任一项所述的方法，其中所述第二抗原结合结构域的VH和VL：
分别包括SEQ ID NO:7302和7309(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
分别包括SEQ ID NO:7302和7305(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)的氨基酸序列。
26.根据权利要求21-25中任一项所述的方法，其中所述第二抗原结合结构域包括：
SEQ ID NO:7311或7310(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
SEQ ID NO:6187或6188(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；
SEQ ID NO:6189或6190(或与其具有至少85％、90％、95％或99％同一性的序列)；或
SEQ ID NO:C017-C024中的任一个的氨基酸序列。
27.根据权利要求1-26中任一项所述的方法，其进一步包括：
响应于将所述对象鉴定为使用包括与TRBC2结合的抗原结合结构域的多功能分子治疗的候选者，用本文所述的多功能分子治疗所述对象。
28.根据权利要求1-27中任一项所述的方法，其中所述癌症是白血病或淋巴瘤。
29.根据权利要求1-28中任一项所述的方法，其中所述癌症选自获得性免疫缺陷综合征(AIDS)相关淋巴瘤、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、成人T细胞白血病/淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、中枢神经系统(CNS)淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、淋巴母细胞性淋巴瘤、套细胞淋巴瘤(MCL)、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)、转变型滤泡和转变型黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样真菌病和塞扎里综合征)、滤泡性淋巴瘤、淋巴浆细胞淋巴瘤/瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症、边缘区B细胞淋巴瘤、胃黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病/小细胞淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、结外T细胞/NK细胞淋巴瘤(鼻型)以及间变性大细胞淋巴瘤。
30.根据权利要求1-29中任一项所述的方法，其中所述癌症是外周T细胞淋巴瘤(PTCL)。
31.一种检测样品或对象中TRBC1或TRBC2的方法，其包括：
使所述样品或对象与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及
检测所述抗体分子与所述样品或对象之间的复合物的形成，
从而检测TRBC1或TRBC2。
32.根据权利要求31所述的方法，其中在体外或体内检测TRBC1或TRBC2。
33.根据权利要求31或32所述的方法，其进一步包括使参考样品或对象与所述抗体分子接触；以及检测所述抗体分子与所述参考样品或对象之间的复合物的形成，其中所述样品或对象中所述复合物的形成相对于所述参考样品或对象的变化表明所述样品或对象中存在TRBC1或TRBC2。
34.根据权利要求31-33中任一项所述的方法，其进一步包括从对象获得样品。
35.根据权利要求31-34中任一项所述的方法，其中所述样品包括血浆、组织、活检、血液、PBMC、骨髓和/或淋巴组织中的一种或多种。
36.根据权利要求31-35中任一项所述的方法，其中所述样品未被冷冻和/或固定。
37.根据权利要求31-35中任一项所述的方法，其中所述样品已被冷冻和/或固定。
38.根据权利要求31-37中任一项所述的方法，其中所述对象患有本文所述的疾病或病症或处于患有本文所述的疾病或病症的风险中。
39.根据权利要求31-38中任一项所述的方法，其进一步包括进行流式分析。
40.根据权利要求31-39中任一项所述的方法，其进一步包括评估T细胞克隆性。
41.根据权利要求31-40中任一项所述的方法，其进一步包括测量来自所述生物样品的TRBC1+或TRBC2+细胞的水平。
42.根据权利要求31-41中任一项所述的方法，其进一步包括测量TRBC1或TRBC2的细胞内水平。
43.根据权利要求31-42中任一项所述的方法，其进一步包括测量TRBC1或TRBC2的膜水平。
44.根据权利要求31-43中任一项所述的方法，其进一步包括评价所述对象的疾病或病症的预后、严重程度或存在或不存在的变化。
45.根据权利要求31-44中任一项所述的方法，其中所述抗体分子被可检测地标记。
46.一种评价对象的方法，其包括：
使来自所述对象的样品与本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子接触；以及
检测所述抗体分子和所述样品之间的复合物的形成，
从而评价所述对象。
47.根据权利要求46所述的方法，其中所述对象患有本文所述的疾病或病症或处于患有本文所述的疾病或病症的风险中。
48.根据权利要求46或47所述的方法，其中所述对象尚未用本文所述的抗体分子治疗。
49.根据权利要求46或47所述的方法，其中所述对象已用本文所述的抗体分子治疗。
50.一种试剂盒，其包括本文所述的抗TRBC1抗体分子或本文所述的抗TRBC2抗体分子和用于检测样品或对象中TRBC1或TRBC2的方法的说明。
51.一种鉴定需要治疗癌症的对象的方法，其包括确定从所述对象获得的外周血单核细胞(PBMC)衍生的T细胞群体对TRBC1或TRBC2具有单型性和特异性，
其中所述PBMC衍生的T细胞群体中对TRBC1或TRBC2的所述单型性和特异性表明所述对象患有T细胞恶性肿瘤，从而将所述对象鉴定为治疗所述癌症的候选者。
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