JP2023540248A - Trbc1またはtrbc2を検出する方法 - Google Patents
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Abstract
TRBC1またはTRBC2に結合する抗体分子が開示される。TRBC1またはTRBC2を検出する方法、対象または障害を評価する方法、および前記抗体分子を使用するキットがさらに開示される。【選択図】図1B
Description
相互参照
[0001]本出願は、2020年8月26日に出願された米国仮出願第63/070,793号の利益を主張しており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
[0001]本出願は、2020年8月26日に出願された米国仮出願第63/070,793号の利益を主張しており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
[0002]リンパ腫は、リンパ球に起因するがんである。T細胞リンパ腫(TCL)は、T細胞に起因するリンパ腫であり、米国では、これがすべての非ホジキンリンパ腫のおよそ7%を占める。TCLの一般的なサブタイプは、特定不能の末梢T細胞リンパ腫(PTCLNOS)、未分化大細胞リンパ腫(ALCL)、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫(AITL)、および皮膚T細胞リンパ腫(CTCL)を含む。TCLの各タイプは、それそのものの病理および症状を有する。TCLなどのリンパ腫の改善された処置への現在の必要性を考えれば、リンパ腫、例えばTCLを標的化した新しい組成物および処置が極めて望ましい。
[0003]とりわけ、一態様では、がん、例えばリンパ腫または白血病、例えばT細胞リンパ腫または白血病の処置を必要とする対象を、(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメインを含むポリペプチド分子を含む組成物を使用して同定する方法であって、例えば、TRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を対象が有するか否かを決定するステップ(例えば、それに関する情報を直接決定または間接的に決定する、例えば、情報を得るステップ);対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するという決定に応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用して対象を処置の候補として、場合によっては、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補ではないとして、特定するステップを含む方法が本明細書で提供される。
[0004]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、多機能性ポリペプチド分子である。
[0005]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、多重特異性ポリペプチド分子である。
[0006]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、第1の抗原結合性ドメインは、表21~25いずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。
[0007]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、第1の抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7441、201、および7442のアミノ酸配列を含み;またはVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7443、224および225のアミノ酸配列を含む。
[0008]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7422、201、および7403;それぞれ配列番号7401、201、および7403;それぞれ配列番号7394、201、および7396;それぞれ配列番号7346、201、および7398;それぞれ配列番号7346、201、および7400;それぞれ配列番号7405、201、および7403;それぞれ配列番号7407、201、および7403;それぞれ配列番号7427、201、および7403;またはそれぞれ配列番号7430、201、および7403のアミノ酸配列を含む。
[0009]一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7410、224、および225;またはそれぞれ、配列番号7409、224、および225のアミノ酸配列を含む。
[0010]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7422、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7401、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7394、201、7396、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7398、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7400、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7405、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7407、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7427、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7430、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7422、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7401、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7394、201、7396、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7398、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7400、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7405、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7407、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7427、201、7403、7409、224、および225;またはそれぞれ、配列番号7430、201、7403、7409、224、および225のアミノ酸配列を含む。
[0011]一部の実施形態では、VHは、配列番号7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428、および7431からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含み、および/またはVLは、配列番号7419および7418からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。
[0012]一部の実施形態では、このVHおよびVLは、それぞれ、配列番号7420および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7423および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7411および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7412および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7413および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7414および7419、それぞれ(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7415および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7416および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7417および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7425および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7428および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7431および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7420および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7423および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7411および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7412および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7413および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7414および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7415および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7416および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7417および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7425および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7428および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);またはそれぞれ、配列番号7431および7418、(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[0013]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、(i)第1の抗原結合性ドメインは、TRBC2を含まないT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対してより高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合に対するKDは、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2を含まないT細胞受容体との間の結合に対する、KDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である、(ii)第1の抗原結合性ドメインは、TRBC1を含むT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対してより高い親和性を有し、場合により、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合に対するKDは、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1を含むT細胞受容体との間の結合に対するKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である、または(iii)リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞における第1の抗原結合性ドメインのTRBC2への結合は、例えば、T細胞の増殖、T細胞活性化マーカー(例えば、CD69またはCD25)の発現、および/またはサイトカイン(例えば、TNFαおよびIFNγ)の発現によって測定したときに、リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞をほとんど活性化しない。
[0014]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、ポリペプチド分子は、TRBC2に一価で結合する。
[0015]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、図30A~30Dのいずれかに示される構成を含み、必要に応じて、(i)ポリペプチド分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図30Aに示される構成を含むか;(ii)ポリペプチド分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 Fabを含み、例えば、図30Bに示される構成を含むか;(iii)ポリペプチド分子が、抗NKp30 Fabおよび抗TRBC2 scFvを含み、例えば、図30Cに示される構成を含むか;または(iv)ポリペプチド分子が、抗TRBC2 scFvおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図30Dに示される構成を含む。
[0016]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換の1つまたは複数を含む1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)を含む二量体化モジュールをさらに含む。
[0017]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、表21~25のいずれかに開示の抗TRBC2アミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列、および/または表7、8、8A、8B、9、10、18および25のいずれかに開示される抗NKp30アミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[0018]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、(i)配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);(ii)配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);または(iii)配列番号7438、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。
[0019]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、(i)配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);(ii)配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列);または(iii)配列番号7440、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。
[0020]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合し、第1の抗原結合性ドメインは、表3A~3Bまたは4のいずれかに開示の1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[0021]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合し、第2の抗原結合性ドメインは、表8A~8B、9および10のいずれか1つに開示の1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号C001~C128のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[0022]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表7、8、8A、8B、9、10、18および25のいずれか1つに開示の1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[0023]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7313、6001、および7315;それぞれ配列番号7313、6001、および6002;それぞれ配列番号7313、6008、および6009;それぞれ配列番号7313、7385、および7315;それぞれ配列番号7313、7318、および6009;それぞれ配列番号C019、C021、およびC023;それぞれ配列番号C033、C035、およびC037;それぞれ配列番号C047、C049、およびC051;それぞれ配列番号C061、C063、およびC065;それぞれ配列番号C075、C077、およびC079;それぞれ配列番号C089、C091、およびC093;それぞれ配列番号C103、C105、およびC107;またはそれぞれ配列番号C116、C118およびC120のアミノ酸配列を含む。
[0024]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7326、7327、および7329;それぞれ配列番号6063、6064、および7293;それぞれ配列番号6070、6071、および6072;それぞれ配列番号6070、6064、および7321;それぞれ配列番号C026、C028、およびC030;それぞれ配列番号C040、C042、およびC044;それぞれ配列番号C054、C056、およびC058;それぞれ配列番号C068、C070、およびC072;それぞれ配列番号C082、C084、およびC086;それぞれ配列番号C096、C098、およびC100;それぞれ配列番号C110、C112およびC113;またはそれぞれ配列番号C123、C125、C127のアミノ酸配列を含む。
[0025]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7313、6001、7315、7326、7327、および7329;それぞれ配列番号7313、6001、6002、6063、6064、および7293;それぞれ配列番号7313、6008、6009、6070、6071、および6072;それぞれ配列番号7313、7385、7315、6070、6064、および7321;それぞれ配列番号7313、7318、6009、6070、6064、および7321;それぞれ配列番号C019、C021、C023、C026、C028、およびC030;それぞれ配列番号C033、C035、C037、C040、C042およびC044;それぞれ配列番号C047、C049、C051、C054、C056、およびC058;それぞれ配列番号C061、C063、C065、C068、C070およびC072;それぞれ配列番号C075、C077、C079、C082、C084、およびC086;それぞれ配列番号C089、C091、C093、C096、C098、およびC100;それぞれ配列番号C103、C105、C107、C110、C112、およびC113;またはそれぞれ配列番号C116、C118、C120、C123、C125、およびC127のアミノ酸配列を含む。
[0026]一部の実施形態では、(i)第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号7302、7298、7300、7301、7303、および7304からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/または第2の抗原結合性ドメインのVLは、配列番号7309、7305、7299、および7306~7308からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、(ii)第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号6121および6123~6128からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/または第2の抗原結合性ドメインVLは、配列番号7294もしくは6137~6141からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み;あるいは(iii)第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号6122および6129~6134からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/または第2の抗原結合性ドメインのVLは、配列番号6136もしくは6142~6147からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み;あるいは(iv)第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号C001~C008からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/または第2の抗原結合性ドメインのVLは、配列番号C009~C016からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[0027]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHおよびVLは、それぞれ配列番号7302および7309のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);またはそれぞれ配列番号7302および7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[0028]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、配列番号7311もしくは7310のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);配列番号6187もしくは6188(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);配列番号6189もしくは6190(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);または配列番号C017~C024のいずれかを含む。
[0029]一部の実施形態では、本明細書に記載されるような方法は、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用して処置するための候補として対象を特定することに応答して、対象を本明細書に記載されるような多機能性分子を用いて処置すること(例えば、対象に投与すること)をさらに含む。
[0030]一部の実施形態では、がんは、白血病またはリンパ腫である。
[0031]一部の実施形態では、がんは、後天性免疫不全症候群(AIDS)関連リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、成人T細胞性白血病/リンパ腫、バーキットリンパ腫、中枢神経系(CNS)リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、リンパ芽球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫(MCL)、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)(例えば、肝脾T細胞リンパ腫(HSGDTCL)、皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫、または腸症関連T細胞リンパ腫)、形質転換した濾胞性リンパ腫および形質転換した粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫(菌状息肉腫およびセザリー症候群)、濾胞性リンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫/ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症、辺縁帯B細胞リンパ腫、胃粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、慢性リンパ球性白血病/小細胞型リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、節外性T/NK細胞リンパ腫(鼻型)、および未分化大細胞リンパ腫(例えば、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫または全身性未分化大細胞リンパ腫)から選択される。
[0032]一部の実施形態では、がんは、末梢のT細胞リンパ腫(PTCL)である。
[0033]別の態様では、試料または対象においてTRBC1またはTRBC2を検出する方法であって、試料または対象を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および抗体分子と試料または対象との間の複合体の形成を検出し、これによって、TRBC1またはTRBC2を検出するステップを含む方法が、本明細書で提供される。
[0034]一部の実施形態では、TRBC1またはTRBC2は、in vitroまたはin vivoで検出される。
[0035]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、参照試料または参照対象を抗体分子と接触させるステップ、および抗体分子と参照試料または参照対象との間の複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または参照対象と比較した、試料または対象における複合体の形成の変化、例えば、統計上有意な変化が、試料または対象におけるTRBC1またはTRBC2の存在を示す。
[0036]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、対象から試料を得るステップをさらに含む。
[0037]一部の実施形態では、試料は、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えば、リンパ節の1つまたは複数を含み、試料が、凍結および/または固定されていない、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ性のうち1つまたは複数を含み、試料が、凍結(例えば、スナップ凍結)および/または固定されている(例えば、ホルマリン固定され、パラフィン包埋されている(FFPE))、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ性のうち1つまたは複数を含み、対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、リンパ腫、例えば、T細胞リンパ腫)を有するかまたは有するリスクがある、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ性のうち1つまたは複数を含む。
[0038]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、例えば、マルチパネル法を使用してフロー分析を行うステップをさらに含む。
[0039]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、T細胞のクローナリティーを評価して、例えば、T細胞悪性腫瘍の存在および/またはレベルを決定するステップをさらに含む。
[0040]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、生体試料から得たTRBC1+細胞またはTRBC2+細胞のレベルを測定する(例えば、参照試料または参照対象に対して、例えば、TRBC1+またはTRBC2+細胞が枯渇しているか否かを決定する)ステップをさらに含む。
[0041]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、TRBC1またはTRBC2の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む。
[0042]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、TRBC1またはTRBC2の膜レベルを測定するステップをさらに含む。
[0043]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、例えば、処置(例えば、本明細書に記載される抗体分子を用いる)後に、対象を、疾患または障害(例えば、がん)の予後、重症度、または存在もしくは不存在における変化について評価するステップをさらに含む。
[0044]一部の実施形態では、抗体分子は、検出可能に標識される。
[0045]別の態様では、対象を評価する方法であって、対象から得た試料(例えば、本明細書で記載される試料)を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および抗体分子と試料との間の複合体の形成を検出し、これによって、対象を評価するステップを含む、方法が本明細書で提供される。
[0046]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、リンパ腫、例えば、T細胞リンパ腫)を有するかまたは有するリスクがある。
[0047]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されていない。
[0048]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されている。
[0049]別の態様では、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または抗TRBC2抗体を含むキットが本明細書において提供される。
[0050]別の態様では、がんの処置を必要とする対象を特定する方法であって、対象から得られた末梢血単核球(PBMC)由来のT細胞集団が、TRBC1またはTRBC2に対する単型性(monotypia)および特異性を有することを決定するステップを含み、PBMC由来のT細胞集団におけるTRBC1またはTRBC2に対する単型性および特異性が、対象がT細胞悪性腫瘍を有することを示し、これによって、がんの処置の候補として対象を同定する、方法が本明細書において提供される。
[0051]別途定義されない限り、本明細書において使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって広く理解されているものと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものに類似またはそれと同等の方法および材料を、本発明の実施または試験において使用することができるが、好適な方法および材料が、以下に記載されている。本明細書に記載されるすべての刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献は、参照によりその全体が組み込まれる。矛盾が生じた場合には、定義を含め、本明細書が優先される。加えて、材料、方法、および実施例は、例示に過ぎず、限定することを意図するものではない。
[0052]本発明の他の特性および利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲から明らかであろう。
[0097]複数の(例えば、2つ以上の)機能性(または結合特異性)を含む多機能性分子(本明細書において「多特異性分子」とも称される)であって、(i)TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメイン、ならびに(ii)(a)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、(b)サイトカイン分子および(c)間質改変部分のうちの1つ、2つ、またはすべてを含む、多機能性分子が本明細書に開示される。TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含む抗体分子もまた、本明細書に開示される。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表2、3、3A、3B、4、5、6に見られる配列または配列の一部を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインは、表21~24に見られる配列または配列の一部を含む。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、表7、8、8A、8B、9、10および18に見られる配列または配列の一部を含むNK細胞エンゲージャーを含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、表2、3、3A、3B、4、5、6に見られる配列または配列の一部を含み、免疫細胞エンゲージャーは、表7、8、8A、8B、9、10および18に見られる配列または配列の一部を含むNK細胞エンゲージャーを含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、表21~24に見られる配列または配列の一部を含み、免疫細胞エンゲージャーは、表7、8、8A、8B、9、10および18に見られる配列または配列の一部を含むNK細胞エンゲージャーを含む。
[0098]一実施形態では、多特異性または多機能性分子は、二特異性(または二機能性)分子、三特異性(または三機能性)分子、または四特異性(または四機能性)分子である。
[0099]一部の実施形態では、多機能性分子は、TRBC1標的免疫細胞を含むT細胞受容体の表面上の腫瘍抗原を(例えば、免疫細胞エンゲージャーを介して)、TRBC1を含むT細胞受容体を示すリンパ腫細胞(例えば、T細胞)に結合する抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、TRBC2を含むT細胞受容体を示すリンパ腫細胞(例えば、T細胞)に対してTRBC2標的免疫細胞を含むT細胞受容体の表面上の腫瘍抗原に結合する(例えば、免疫細胞エンゲージャーを介して)抗原結合性ドメインを含む。
[00100]理論に拘泥するものではないが、本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、例えば、表面上にTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現する細胞(例えば、がん細胞、例えば、リンパ腫細胞、例えば、T細胞)の存在下で、免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞またはマクロファージから選択される免疫エフェクター細胞)を局在化(例えば、架橋)および/または活性化すると予想される。TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現する細胞(例えば、がん細胞、例えば、リンパ腫細胞、例えば、T細胞)の存在下で、免疫細胞の近接性および/または活性を増加させ、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子を使用することにより、標的細胞に対する免疫応答を増強すると予想され、それにより、より効果的な療法を提供する。
[00101]理論に拘泥するものではないが、T細胞は、通常、TRBC1を含むT細胞受容体およびTRBC2を含むT細胞受容体を発現しないと考えられる。一部の実施形態では、TRBC1を含むT細胞受容体またはTRBC2を含むT細胞受容体に特異的であるが、両方のタイプのT細胞受容体に対して特異性を有さない多重特異性または多機能性分子を利用することによって、免疫細胞のT細胞に向けた近接性または活性を増大する有害な影響が、全般的に軽減され得ることがと予想される。このように、本明細書に開示される多重特異性または多機能性分子の使用は、一般に、T細胞に対する免疫細胞の近接性または活性を必ずしも増加させることなく、がん細胞(例えば、リンパ腫細胞、例えば、T細胞)に向けた免疫細胞の近接性または活性を増大できると考えられる。
[00102](i)間質改変部分および(ii)リンパ腫細胞(例えば、T細胞)、例えば、TRBC1を含むT細胞受容体またはTRBC2を含むT細胞受容体上の腫瘍抗原に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含む、新規の多機能性、例えば、多特異性分子が開示される。理論に拘泥するものではないが、本明細書に開示される多機能性分子は、とりわけ、がん部位を標的とする(例えば、それに局在する)、および腫瘍間質を変更する、例えば、がん部位付近の腫瘍微小環境を変更すると考えられる。多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーのうちの1つ、2つ、3つまたはすべてから選択される)および/またはサイトカイン分子のうちの一方または両方をさらに含み得る。したがって、とりわけ、前述の部分を含む多機能性、例えば、多特異性分子、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、および前述の分子を使用してがんを処置する方法が本明細書で提供される。
[00103]したがって、とりわけ、前述の部分を含む多特異性または多機能性分子(例えば、多特異性または多機能性抗体分子)、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、および前述の分子を使用して疾患または障害、例えば、がんを処置する方法が本明細書で提供される。
定義
[00104]一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャーを含む。「免疫細胞係合体」とは、免疫細胞、例えば、免疫応答に関与する細胞に結合および/または活性化する1つまたは複数の結合特異性を指す。実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、および/またはマクロファージ細胞から選択される。免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、受容体分子(例えば、全長受容体、受容体断片、またはそれらの融合体(例えば、受容体-Fc融合体))、または免疫細胞抗原(例えば、T細胞、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合するリガンド分子(例えば、全長リガンド、リガンド断片、またはそれらの融合体(例えば、リガンド-Fc融合体))であり得る。実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、標的免疫細胞に特異的に結合し、例えば、標的免疫細胞に優先的に結合する。例えば、免疫細胞エンゲージャーが抗体分子である場合、それは、約10nM未満の解離定数で、免疫細胞抗原(例えば、T細胞抗原、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合する。
[00104]一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャーを含む。「免疫細胞係合体」とは、免疫細胞、例えば、免疫応答に関与する細胞に結合および/または活性化する1つまたは複数の結合特異性を指す。実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、および/またはマクロファージ細胞から選択される。免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、受容体分子(例えば、全長受容体、受容体断片、またはそれらの融合体(例えば、受容体-Fc融合体))、または免疫細胞抗原(例えば、T細胞、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合するリガンド分子(例えば、全長リガンド、リガンド断片、またはそれらの融合体(例えば、リガンド-Fc融合体))であり得る。実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、標的免疫細胞に特異的に結合し、例えば、標的免疫細胞に優先的に結合する。例えば、免疫細胞エンゲージャーが抗体分子である場合、それは、約10nM未満の解離定数で、免疫細胞抗原(例えば、T細胞抗原、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合する。
[00105]一部の実施形態では、多機能性分子は、サイトカイン分子を含む。本明細書で使用される場合、「サイトカイン分子」とは、サイトカインの全長、断片またはバリアント;さらに、受容体ドメイン、例えば、サイトカイン受容体二量化ドメインを含むサイトカイン;または、天然に存在するサイトカインの少なくとも1つの活性化を誘発する、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、サイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)を指す。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、もしくはインターフェロンγ、またはこれらの断片もしくはバリアント、または前述のサイトカインのいずれかの組合せから選択される。サイトカイン分子は、モノマーまたは二量体であり得る。実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体二量体化ドメインをさらに含むことができる。他の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、IL-15RaまたはIL-21Rから選択されるサイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)である。
[00106]本明細書で使用される場合、例えば、抗体分子、サイトカイン分子、受容体分子において使用される用語「分子」は、改変されていない(例えば、天然に存在する)分子の少なくとも1つの機能および/または活性化が残る限り、全長の天然に存在する分子、ならびにバリアント、例えば、機能的バリアント(例えば、切断、断片、突然変異(例えば、実質的に類似の配列)またはその誘導体化された形態)を含む。
[00107]一部の実施形態では、多機能性分子は、間質改変部分を含む。「間質改変部分」とは、本明細書で使用される場合、間質の成分を変更、例えば、分解することができる薬剤、例えば、タンパク質(例えば、酵素)を指す。実施形態では、間質の成分は、例えば、ECM成分、例えば、グリコサミノグリカン、例えば、ヒアルロナン(ヒアルロン酸またはHAとしても公知である)、コンドロイチン硫酸、コンドロイチン、デルマタン硫酸、ヘパリン硫酸、ヘパリン、エンタクチン、テネイシン、アグリカンおよびケラチン硫酸;または細胞外タンパク質、例えば、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、およびビトロネクチンから選択される。
[00108]特定の用語を以下に定義する。
[00109]本明細書で使用される場合、冠詞「ある(a)」および「ある(an)」は、冠詞の文法的対象物の1つまたは複数、例えば、少なくとも1つを指す。用語「ある(a)」または「ある(an)」の使用は、本明細書における用語「含んでいる」と共に使用される場合、「1つ」を意味し得るが、「1つまたは複数」、「少なくとも1つ」および「1または1を超える」の意味とも一致する。
[00110]本明細書で使用される場合、「約」および「ほぼ」は、一般に、測定の性質または精度を与えられて測定された量についての許容可能な誤差の程度を意味する。誤差の例示的な程度は、所定の範囲の値の20パーセント(%)以内であり、典型的には10%以内であり、より典型的には5%以内である。
[00111]本明細書で使用される「抗体分子」とは、少なくとも1つの免疫グロブリン可変ドメイン配列を含む、タンパク質、例えば、免疫グロブリン鎖またはその断片を指す。抗体分子は、抗体(例えば、全長抗体)および抗体断片を包含する。ある実施形態では、抗体分子は、全長抗体の抗原結合もしくは機能的断片、または全長免疫グロブリン鎖を含む。例えば、全長抗体は、天然に存在するか、または正常な免疫グロブリン遺伝子断片の組換えプロセスによって形成される免疫グロブリン(Ig)分子(例えば、IgG抗体)である。実施形態では、抗体分子は、免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な抗原結合部分、例えば、抗体断片を指す。抗体断片、例えば、機能性断片は、抗体の一部、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)2、F(ab)2、可変断片(Fv)、ドメイン抗体(dAb)、または一本鎖可変断片(scFv)である。機能性抗体断片は、インタクトな(例えば、全長)抗体によって認識されるものと同じ抗原に結合する。用語「抗体断片」または「機能性断片」はまた、重鎖および軽鎖の可変領域からなる「Fv」断片、または軽鎖および重鎖の可変領域がペプチドリンカーによって連結されている組換え一本鎖ポリペプチド分子(「scFvタンパク質」)などの可変領域からなる単離された断片を含む。一部の実施形態では、抗体断片は、抗原結合活性を有さない抗体の部分、例えば、Fc断片または単一アミノ酸残基を含まない。例示的な抗体分子は、全長抗体および抗体断片、例えば、dAb(ドメイン抗体)、一本鎖、Fab、Fab’、およびF(ab’)2断片、ならびに一本鎖可変断片(scFv)を含む。
[00112]本明細書で使用される場合、「免疫グロブリン可変ドメイン配列」とは、免疫グロブリン可変ドメインの構造を形成することができるアミノ酸配列を指す。例えば、配列は、天然に存在する可変ドメインのアミノ酸配列の全部または一部を含み得る。例えば、配列は、1個、2個、もしくはそれ以上のN末端またはC末端アミノ酸を含むかまたは含まない場合があり、あるいはタンパク質構造の形成に適合する他の改変を含む場合がある。
[00113]実施形態では、抗体分子は、単一特異性であり、例えば、単一のエピトープに対する結合特異性を含む。一部の実施形態では、抗体分子は、多特異性であり、例えば、それは、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第1のエピトープに対して結合特異性を有し、第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第2のエピトープに対して結合特異性を有する。一部の実施形態では、抗体分子は、二特異性抗体分子である。「二特異性抗体分子」とは、本明細書で使用される場合、1を超える(例えば、2、3、4、またはそれを超える)エピトープおよび/または抗原に対する特異性を有する抗体分子を指す。
[00114]本明細書で使用される「抗原」(Ag)とは、例えば、ある種の免疫細胞の活性化および/または抗体生成を伴う、免疫応答を引き起こすことができる分子を指す。ほとんどすべてのタンパク質またはペプチドを含む任意の高分子は、抗原であり得る。抗原はまた、ゲノム組換え体またはDNAから誘導され得る。例えば、免疫応答を誘導することができるタンパク質をコードするヌクレオチド配列または部分的ヌクレオチド配列を含む任意のDNAは、「抗原」をコードする。実施形態では、抗原は、遺伝子の全長ヌクレオチド配列によってのみコードされる必要はなく、また、抗原は、遺伝子によって全くコードされる必要もない。実施形態では、抗原は、生体試料、例えば、組織試料、腫瘍試料、細胞、または他の生体成分を有する流体から合成することができ、または誘導することができる。本明細書で使用される場合、「腫瘍抗原」または同義的に、「がん抗原」は、がん、例えば、がん細胞、または免疫応答を引き起こすことができる腫瘍微小環境上に存在するか、またはそれと関連する任意の分子を含む。本明細書で使用される場合、「免疫細胞抗原」とは、免疫応答を引き起こすことができる免疫細胞上に存在するか、またはそれと関連する任意の分子を含む。
[00115]抗体分子の「抗原結合部位」または「結合部位」とは、抗原結合に関与する抗体分子、例えば、免疫グロブリン(Ig)分子の一部を指す。実施形態では、抗原結合部位は、重鎖(H)および軽鎖(L)の可変領域(V)のアミノ酸残基によって形成される。超可変領域と呼ばれる、重鎖および軽鎖の可変領域内の3つの高度に分岐ストレッチは、「フレームワーク領域」(FR)と呼ばれる、より保存された隣接領域間に配置される。FRは、免疫グロブリン中の超可変領域の間で、およびそれに隣接して天然に見出されるアミノ酸配列である。実施形態では、抗体分子において、軽鎖の3つの超可変領域および重鎖の3つの超可変領域は、三次元空間において互いに対して配置されて、結合抗原の三次元表面に相補的な抗原結合表面を形成する。重鎖および軽鎖のそれぞれの3つの超可変領域は、「相補性決定領域」または「CDR」と呼ばれる。フレームワーク領域およびCDRは、例えば、Kabat,E.A.ら(1991年)Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、U.S.Department of Health and Human Services、NIH公開番号91-3242、およびChothia,C.ら(1987年)J.Mol.Biol.196巻:901~917ページにおいて定義され、記載されている。各可変鎖(例えば、可変重鎖および可変軽鎖)は、典型的には、3つのCDRおよび4つのFRから構成され、アミノ酸の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、およびFR4でアミノ末端からカルボキシ末端に配列される。
[00116]「がん」は、本明細書で使用される場合、すべてのタイプの発がんプロセスおよび/またはがん性増殖を包含することができる。実施形態では、がんは、原発性腫瘍、ならびに転移性組織、または悪性に形質転換された細胞、組織、もしくは臓器を含む。実施形態では、がんは、がんのすべての組織病理学および病期、例えば、浸潤性/重症度の病期を包含する。実施形態では、がんは、再発がんおよび/または抵抗性がんを含む。用語「がん」および「腫瘍」は、互換的に使用することができる。例えば、両方の用語は、固形腫瘍および液体腫瘍を包含する。本明細書で使用される場合、用語「がん」または「腫瘍」は、前がん、ならびに悪性がんおよび腫瘍を含む。
[00117]本明細書で使用される場合、「免疫細胞」とは、免疫系において機能する、例えば、感染および異物の作用物質に対して防御する、種々の細胞のいずれかを指す。実施形態では、この用語は、白血球、例えば、好中球、好酸球、好塩基球、リンパ球、および単球を含む。先天性白血球には、食細胞(例えば、マクロファージ、好中球、および樹状細胞)、肥満細胞、好酸球、好塩基球、およびナチュラルキラー細胞が含まれる。先天性白血球は、接触を通じてより大きな病原体を攻撃するか、微生物を飲み込んで殺滅させることによって病原体を特定し、排除し、適応免疫応答の活性化のメディエーターである。適応免疫系の細胞は、リンパ球と呼ばれる特殊なタイプの白血球である。B細胞およびT細胞は、重要なタイプのリンパ球であり、骨髄の造血幹細胞に由来する。B細胞は、体液性免疫応答に関与し、T細胞は、細胞性免疫応答に関与する。用語「免疫細胞」は、免疫エフェクター細胞を含む。
[00118]「免疫エフェクター細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、免疫応答、例えば、免疫エフェクター応答の促進に関与する細胞を指す。免疫エフェクター細胞の例は、限定されないが、T細胞、例えば、アルファ/ベータT細胞およびガンマ/デルタT細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT細胞、および肥満細胞を含む。
[00119]用語「エフェクター機能」または「エフェクター応答」は、細胞の特殊化された機能を指す。T細胞のエフェクター機能は、例えば、細胞溶解活性、またはサイトカインの分泌を含むヘルパー活性であり得る。
[00120]本発明の組成物および方法は、特定の配列、またはそれに対して実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、特定の配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%同一である、またはそれ以上同一である配列を有するポリペプチドおよび核酸を包含する。アミノ酸配列との関連で、用語「実質的に同一」が本明細書において使用され、第1および第2のアミノ酸配列が共通の構造ドメインおよび/または共通の機能活性を有し得るように、i)第2のアミノ酸配列と同一であるか、あるいはii)第2アミノ酸配列における整列されたアミノ酸残基の保存的置換である、十分な数または最小限の数のアミノ酸残基を含有する第1アミノ酸を指す。例えば、共通の構造ドメインを含有するアミノ酸配列は、参照配列、例えば、本明細書で提供される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有する。
[00121]ヌクレオチド配列との関連で、用語「実質的に同一」が本明細書において使用され、第1および第2ヌクレオチド配列が、共通の機能活性を有するポリペプチドをコードする、または共通のポリペプチド構造ドメインまたは共通のポリペプチド機能活性をコードするように、第2核酸配列におけるアラインされたヌクレオチドと同一である、十分な数または最小限の数のヌクレオチドを含有する第1核酸配列を指す。例えば、参照配列、例えば本明細書で提供される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するヌクレオチド配列。
[00122]用語「バリアント」とは、参照アミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するか、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドを指す。一部の実施形態では、バリアントは、機能的バリアントである。
[00123]用語「機能的バリアント」とは、参照アミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされ、参照アミノ酸配列の1つまたは複数の活性化を有し得るポリペプチドを指す。
[00124]配列間の相同性または配列同一性(これらの用語は本明細書において互換的に使用される)の計算は以下のように行われる。
[00125]2つのアミノ酸配列または2つの核酸配列の同一性パーセントを決定するため、最適な比較目的のために配列がアラインメントされる(例えば、最適アラインメントのために、第1および第2アミノ酸または核酸配列の1つまたは両方にギャップが導入され得、非相同配列は比較目的のために無視され得る)。好ましい実施形態では、比較目的のためにアラインされた参照配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、好ましくは少なくとも40%、さらに好ましくは少なくとも50%、60%、なおさらに好ましくは少なくとも70%、80%、90%、100%である。次に、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第1配列の位置が、第2配列での対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占められる場合、分子は、その位置にて同一である(本明細書で使用される場合、アミノ酸または核酸「同一性」は、アミノ酸または核酸「相同性」と等しい)。
[00126]2つの配列間の同一性パーセントは、配列によって共有される同一位置の数の関数であり、2つの配列の最適アラインメントのために導入する必要がある、ギャップ数および各ギャップの長さが考慮に入れられる。
[00127]配列の比較および2つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成することができる。好ましい実施形態では、2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、Blossum62マトリックスまたはPAM250マトリックス、および16、14、12、10、8、6、または4のギャップの重みおよび1、2、3、4、5、または6の長さの重みのいずれかを用いて、GCGソフトウェアパッケージ(gcg.comにて入手可能である)のGAPプログラムに組み込まれているNeedlemanおよびWunsch((1970年)J.Mol.Biol.48巻:444~453ページ)アルゴリズムを用いて決定される。さらに別の好ましい実施形態では、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、GCGソフトウェアパッケージ(gcg.comにて入手可能である)のGAPプログラムを使用して、NWSgapdna.CMPマトリックスおよび40、50、60、70、または80のギャップの重みおよび1、2、3、4、5、または6の長さの重みを用いて決定される。特に好ましいセットのパラメータ(および別段の指定がない限り使用されるべきであるもの)は、ギャップペナルティ12、ギャップ伸張ペナルティ4、およびフレームシフトギャップペナルティ5を有するBlossum62スコアマトリックスである。
[00128]2つのアミノ酸配列間またはヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、PAM120残基重み付け表、ギャップ長ペナルティ12およびギャップペナルティ4を用いて、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれたE.MeyersおよびW.Miller((1989年)CABIOS、4巻:11~17ページ)のアルゴリズムを使用して決定することができる。
[00129]本明細書に記載される核酸およびタンパク質配列は、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定するために、公開データベースに対する検索を行うための「クエリー配列」として用いることができる。このような検索は、Altschulら(1990年)J.Mol.Biol.215巻:403~10ページのNBLASTおよびXBLASTプログラム(バージョン2.0)を用いて行うことができる。BLASTヌクレオチド検索は、本発明の核酸分子と相同なヌクレオチド配列を得るために、NBLASTプログラム、スコア=100、ワードレングス=12を用いて行うことができる。BLASTタンパク質検索は、本発明のタンパク質分子と相同なアミノ酸配列を得るために、XBLASTプログラム、スコア=50、ワードレングス=3を用いて行うことができる。比較目的のためのギャップドアラインメントを得るために、ギャップドBLASTは、Altschulら(1997年)Nucleic Acids Res.25巻:3389~3402ページに記載されているように利用することができる。BLASTおよびギャップドBLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメーターを使用することができる。ncbi.nlm.nih.govを参照。
[00130]本発明の分子は、それらの機能に実質的な影響を及ぼさない、さらなる保存的または非必須アミノ酸置換を有し得ることが理解される。
[00131]用語「アミノ酸」は、天然または合成のいずれであっても、アミノ官能性と酸官能性の両方を含み、天然に存在するアミノ酸のポリマーに含まれ得るすべての分子を包含することを意図する。例示的なアミノ酸には、天然に存在するアミノ酸;そのアナログ、誘導体および同族体;バリアント側鎖を有するアミノ酸アナログ;ならびに先述のいずれかのすべての立体異性体が含まれる。本明細書で使用される場合、用語「アミノ酸」は、DまたはL光学異性体とペプチド模倣体の両方を含む。
[00132]「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されるものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野において定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、ベータ分枝側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が含まれる。
[00133]用語「ポリペプチド」、「ペプチド」および「タンパク質」(一本鎖の場合)は、本明細書において互換的に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。ポリマーは、直鎖状または分枝鎖状であり得て、修飾アミノ酸を含み得、非アミノ酸により割り込まれ得る。これらの用語はまた、修飾されているアミノ酸ポリマー;例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、または標識成分とのコンジュゲーションなどの任意の他の操作を包含する。ポリペプチドは、天然源から単離することができ、真核生物もしくは原核生物宿主からの組換え技術により産生することができ、または合成手法の産生物であり得る。
[00134]用語「核酸」、「核酸配列」、「ヌクレオチド配列」、または「ポリヌクレオチド配列」、および「ポリヌクレオチド」は、互換的に使用される。それらは、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド、またはそれらのアナログのいずれかの長さのヌクレオチドのポリマー形態を指す。ポリヌクレオチドは、一本鎖または二本鎖のいずれかであり得、一本鎖である場合、コード鎖または非コード(アンチセンス)鎖であり得る。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドおよびヌクレオチドアナログなどの修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチドの配列は、非ヌクレオチド成分によって割り込まれ得る。ポリヌクレオチドは、重合後、例えば、標識成分とのコンジュゲーションによってさらに修飾され得る。核酸は、組換えポリヌクレオチド、またはゲノム、cDNA、天然に存在しないかもしくは非天然配列で別のポリヌクレオチドに連結されている半合成、または合成起源のポリヌクレオチドであり得る。
[00135]用語「単離された」とは、本明細書で使用される場合、その元の環境または天然の環境(例えば、天然に存在する場合には自然環境)から取り出される材料を指す。例えば、生きている動物に存在する天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されないが、天然系の共存物質の一部または全部からヒトの介入によって分離された同一のポリヌクレオチドまたはポリペプチドが単離される。このようなポリヌクレオチドは、ベクターの一部であり得、および/またはこのようなポリヌクレオチドもしくはポリペプチドは、組成物の一部であり得、このようなベクターまたは組成物は、天然に見出される環境の一部ではないという点で依然として単離され得る。
[00136]本発明の種々の態様を以下にさらに詳細に説明する。追加の定義は、明細書全体にわたって記載される。
抗体分子
[00137]一実施形態では、抗体分子は、がん抗原、例えば、腫瘍抗原または間質抗原に結合する。一部の実施形態では、がん抗原は、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトのがん抗原である。他の実施形態では、抗体分子は、免疫細胞抗原、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトの免疫細胞抗原に結合する。例えば、抗体分子は、がん抗原または免疫細胞抗原上のエピトープ、例えば、線形エピトープまたは立体構造エピトープに特異的に結合する。
[00137]一実施形態では、抗体分子は、がん抗原、例えば、腫瘍抗原または間質抗原に結合する。一部の実施形態では、がん抗原は、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトのがん抗原である。他の実施形態では、抗体分子は、免疫細胞抗原、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトの免疫細胞抗原に結合する。例えば、抗体分子は、がん抗原または免疫細胞抗原上のエピトープ、例えば、線形エピトープまたは立体構造エピトープに特異的に結合する。
[00138]一実施形態では、抗体分子は単一特異性抗体分子であり、単一のエピトープに結合する。例えば、単一特異性抗体分子は、それぞれが同じエピトープに結合する複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を有する。
[00139]一実施形態では、抗体分子は、多特異性または多機能性抗体分子であり、例えば、それは複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列のうちの第1のものは第1のエピトープに対する結合特異性を有し、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列のうちの第2のものは第2のエピトープに対する結合特異性を有する。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップする。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップしない。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、多特異性抗体分子は、第3、第4または第5の免疫グロブリン可変ドメインを含む。一実施形態では、多特異性抗体分子は、二特異性抗体分子、三特異性抗体分子、または四特異性抗体分子である。
[00140]一実施形態では、多特異性抗体分子は二特異性抗体分子である。二特異性抗体は、2つだけの抗原に対して特異性を有する。二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列および第2のエピトープに対して結合特異性を有する第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列により特徴付けられる。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップする。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップしない。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列ならびに第2のエピトープに対して結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体および第2のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体、またはその断片、および第2のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体、またはその断片を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有するscFvもしくはFab、またはその断片、および第2のエピトープに対して結合特異性を有するscFvもしくはFab、またはその断片を含む。
[00141]一実施形態では、抗体分子は、ダイアボディ、および一本鎖分子の他に、抗体の抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、およびFv)を含む。例えば、抗体分子は、重(H)鎖可変ドメイン配列(本明細書でVHと略記される)、および軽(L)鎖可変ドメイン配列(本明細書でVLと略記される)を含むことができる。一実施形態では、抗体分子は、重鎖および軽鎖を含むかまたはからなる(本明細書で半抗体と称される。別の例では、抗体分子は、2つの重(H)鎖可変ドメイン配列および2つの軽(L)鎖可変ドメイン配列を含み、それによって、2つの抗原結合性部位、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fc、Fd、Fd’、Fv、一本鎖抗体(例えばscFv)、単一可変ドメイン抗体、ダイアボディ(Dab)(二価および二特異性)、ならびにキメラ(例えば、ヒト化)抗体を形成し、これらは全長抗体の修飾によって産生されるか、または組換えDNA技術を使用してde novoで合成されるものであってもよい。これらの機能的抗体断片は、それらの各々の抗原または受容体と選択的に結合する能力を保持する。抗体および抗体断片は、IgG、IgA、IgM、IgD、およびIgEが挙げられるがそれに限定されない抗体の任意のクラスから、ならびに抗体の任意のサブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4)からのものであり得る。抗体分子の調製物は、モノクローナルまたはポリクローナルであり得る。抗体分子はまた、ヒト、ヒト化、CDRグラフト化、またはin vitroで生成された抗体であり得る。抗体は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4から選択される重鎖定常領域を有し得る。抗体はまた、例えば、カッパまたはラムダから選択される軽鎖を有し得る。「免疫グロブリン」(Ig)という用語は、本明細書で「抗体」という用語と交換可能に使用される。
[00142]抗体分子の抗原結合性断片の例としては、(i)VL、VH、CLおよびCH1ドメインからなる一価断片である、Fab断片、(ii)ヒンジ領域においてジスルフィド架橋によって連結された2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab’)2断片、(iii)VHおよびCH1ドメインからなる、Fd断片、(iv)抗体の単一のアームのVLおよびVHドメインからなる、Fv断片、(v)VHドメインからなる、ダイアボディ(dAb)断片、(vi)ラクダまたはラクダ化可変ドメイン、(vii)一本鎖Fv(scFv)、例えば、Birdら、(1988) Science 242:423~426ページ;およびHustonら、(1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879~5883ページを参照)、(viii)単一ドメイン抗体が挙げられる。これらの抗体断片は、当業者に公知の従来技術を使用して得られ、断片は、インタクトな抗体と同じ方式で有用性についてスクリーニングされる。
[00143]抗体分子としては、インタクトな分子の他に、その機能的断片が挙げられる。抗体分子の定常領域は、抗体の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異され得る。
[00144]抗体分子はまた単一ドメイン抗体であり得る。単一ドメイン抗体は、その相補性(complementary)決定領域が単一ドメインポリペプチドの部分である抗体を含むことができる。例としては、重鎖抗体、軽鎖を天然に欠いている抗体、従来の4鎖抗体に由来する単一ドメイン抗体、操作された抗体および抗体に由来するもの以外の単一ドメインスキャフォールドが挙げられるがそれに限定されない。単一ドメイン抗体は、当該技術分野における任意のもの、または任意の将来的な単一ドメイン抗体であってもよい。単一ドメイン抗体は、マウス、ヒト、ラクダ、ラマ、魚、サメ、ヤギ、ウサギ、およびウシが挙げられるがそれに限定されない任意の種に由来してもよい。本発明の別の態様によれば、単一ドメイン抗体は、軽鎖を欠いている重鎖抗体として公知の天然に存在する単一ドメイン抗体である。そのような単一ドメイン抗体は、例えば、WO9404678に開示されている。明確性の理由から、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体に由来するこの可変ドメインは、4鎖免疫グロブリンの従来のVHからそれを区別するためにVHHまたはナノボディとして本明細書で知られる。そのようなVHH分子は、ラクダ科の種、例えば、ラクダ、ラマ、ヒトコブラクダ、アルパカおよびグアナコにおいて産生された抗体に由来することができる。ラクダ科以外の他の種が、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体を産生することがあり、そのようなVHHは本発明の範囲内である。
[00145]VHおよびVL領域は、「フレームワーク領域」(FRまたはFW)と称されるより保存された領域が差し挟まれた、「相補性決定領域」(CDR)と称される超可変性の領域にさらに分割することができる。
[00146]フレームワーク領域およびCDRの範囲は、多数の方法によって精密に定義されている(Kabat, E. A.ら、(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、U.S. Department of Health and Human Services、NIH Publication No. 91-3242;Chothia, C.ら、(1987) J. Mol. Biol. 196:901~917ページ;およびOxford MolecularのAbM抗体モデリングソフトウェアによって使用されるAbMの定義を参照。一般に、例えば、「Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains」、Antibody Engineering Lab Manual(Duebel, S.およびKontermann, R.編、Springer-Verlag、Heidelberg)を参照)。
[00147]「相補性決定領域」、および「CDR」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原特異性および結合親和性を付与する抗体可変領域内のアミノ酸の配列を指す。一般に、各重鎖可変領域中に3つのCDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)および各軽鎖可変領域中に3つのCDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)がある。
[00148]所与のCDRの精密なアミノ酸配列の境界は、Kabatら、(1991)、「Sequences of Proteins of Immunological Interest」、第5版、Public Health Service、National Institutes of Health、Bethesda、MD(「Kabat」番号付けスキーム)、Al-Lazikaniら、(1997) JMB 273、927~948ページ(「Chothia」番号付けスキーム)に記載のものを含む、多数の公知のスキームのいずれかを使用して決定することができる。本明細書で使用される場合、「Chothia」番号スキームに従って定義されるCDRは、「超可変ループ」と称されることもある。
[00149]例えば、Kabatの下で、重鎖可変ドメイン(VH)中のCDRアミノ酸残基は、31~35(HCDR1)、50~65(HCDR2)、および95~102(HCDR3)と番号付けされ、軽鎖可変ドメイン(VL)中のCDRアミノ酸残基は、24~34(LCDR1)、50~56(LCDR2)、および89~97(LCDR3)と番号付けされる。Chothiaの下で、VH中のCDRアミノ酸は、26~32(HCDR1)、52~56(HCDR2)、および95~102(HCDR3)と番号付けされ、VL中のアミノ酸残基は、26~32(LCDR1)、50~52(LCDR2)、および91~96(LCDR3)と番号付けされる。
[00150]各VHおよびVLは、典型的には、以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4でアミノ末端からカルボキシ末端へと並んだ3つのCDRおよび4つのFRを含む。
[00151]抗体分子は、ポリクローナルまたはモノクローナル抗体であり得る。
[00152]「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」という用語は、本明細書で使用される場合、単一の分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性および親和性を表し示す。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術によって、またはハイブリドーマ技術を使用しない方法(例えば、組換え法)によって作製することができる。
[00153]抗体は、組換えによって産生することができ、例えば、ファージディスプレイまたはコンビナトリアル法によって産生することができる。
[00154]抗体を生成するためのファージディスプレイおよびコンビナトリアル法は、当該技術分野において公知である(例えば、Ladnerら、米国特許第5,223,409号;Kangら、国際公開WO92/18619;Dowerら、国際公開WO91/17271;Winterら、国際公開WO92/20791;Marklandら、国際公開WO92/15679;Breitlingら、国際公開WO93/01288;McCaffertyら、国際公開WO92/01047;Garrardら、国際公開WO92/09690;Ladnerら、国際公開WO90/02809;Fuchsら、(1991) Bio/Technology 9:1370~1372ページ;Hayら、(1992) Hum Antibod Hybridomas 3:81~85ページ;Huseら、(1989) Science 246:1275~1281ページ;Griffthsら、(1993) EMBO J 12:725~734ページ;Hawkinsら、(1992) J Mol Biol 226:889~896ページ;Clacksonら、(1991) Nature 352:624~628ページ;Gramら、(1992) PNAS 89:3576~3580ページ;Garradら、(1991) Bio/Technology 9:1373~1377ページ;Hoogenboomら、(1991) Nuc Acid Res 19:4133~4137ページ;およびBarbasら、(1991) PNAS 88:7978~7982ページ(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載される通りである)。
[00155]一実施形態では、抗体は、完全ヒト抗体(例えば、ヒト免疫グロブリン配列からの抗体を産生するように遺伝子操作されたマウスにおいて作製される抗体)、または非ヒト抗体、例えば、齧歯動物(マウスもしくはラット)、ヤギ、霊長動物(例えば、サル)、ラクダ抗体である。好ましくは、非ヒト抗体は齧歯動物(マウスまたはラット抗体)である。齧歯動物抗体を産生する方法は当該技術分野において公知である。
[00156]ヒトモノクローナル抗体は、マウス系ではなくヒト免疫グロブリン遺伝子を持つトランスジェニックマウスを使用して生成することができる。目的の抗原を用いて免疫化されたこれらのトランスジェニックマウスからの脾臓細胞を使用して、ヒトタンパク質からのエピトープに対して特異的親和性を有するヒトmAbを分泌するハイブリドーマが産生される(例えば、Woodら、国際出願WO91/00906、Kucherlapatiら、PCT国際公開WO91/10741;Lonbergら、国際出願WO92/03918;Kayら、国際出願92/03917;Lonberg, N.ら、1994 Nature 368:856~859ページ;Green, L.L.ら、1994 Nature Genet. 7:13~21ページ;Morrison, S.L.ら、1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851~6855ページ;Bruggemanら、1993 Year Immunol 7:33~40ページ;Tuaillonら、1993 PNAS 90:3720~3724ページ;Bruggemanら、1991 Eur J Immunol 21:1323~1326ページを参照)。
[00157]抗体分子は、可変領域、またはその部分、例えば、CDRが、非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスにおいて生成されたものであり得る。キメラ、CDRグラフト化、およびヒト化抗体は、本発明の範囲内である。非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスにおいて生成され、次に、ヒトにおける抗原性を減少させるために、例えば、可変フレームワークまたは定常領域において修飾された抗体分子は、本発明の範囲内である。
[00158]「有効ヒト」タンパク質は、中和抗体応答、例えば、ヒト抗マウス抗体(HAMA)応答を実質的に誘起しないタンパク質である。HAMAは、多数の状況において、例えば、例えば慢性または再発性の疾患状態の処置において、抗体分子が繰り返し投与される場合に、問題となり得る。HAMA応答は、血清からの抗体クリアランスの増加(例えば、Salehら、Cancer Immunol. Immunother.、32:180~190ページ(1990)を参照)のため、そしてまた潜在的なアレルギー性反応(例えば、LoBuglioら、Hybridoma、5:5117~5123ページ(1986)を参照)のため、繰返しの抗体投与を潜在的に有効でないものとさせることがある。
[00159]キメラ抗体は、当該技術分野において公知の組換えDNA技術によって産生することができる(Robinsonら、国際公開PCT/US86/02269;Akiraら、欧州特許出願第184,187号;Taniguchi, M.、欧州特許出願第171,496号;Morrisonら、欧州特許出願第173,494号;Neubergerら、国際出願WO86/01533;Cabillyら、米国特許第4,816,567号;Cabillyら、欧州特許出願第125,023号;Betterら、(1988 Science 240:1041~1043ページ);Liuら、(1987) PNAS 84:3439~3443ページ;Liuら、1987、J. Immunol. 139:3521~3526ページ;Sunら、(1987) PNAS 84:214~218ページ;Nishimuraら、1987、Canc. Res. 47:999~1005ページ;Woodら、(1985) Nature 314:446~449ページ;およびShawら、1988、J. Natl Cancer Inst. 80:1553~1559ページを参照)。
[00160]ヒト化またはCDRグラフト化抗体は、ドナーCDRで置き換えられた(重およびまたは軽免疫グロブリン(immuoglobulin)鎖のうちの)少なくとも1つまたは2つであるが一般に3つすべてのレシピエントCDRを有する。抗体は、非ヒトCDRの少なくとも部分で置き換えられていてもよく、またはCDRの一部のみが非ヒトCDRで置き換えられていてもよい。抗原への結合のために要求されるCDRの数を置き換えることのみが必要である。好ましくは、ドナーは、齧歯動物抗体、例えば、ラットまたはマウス抗体であり、レシピエントは、ヒトフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークである。典型的には、CDRを提供する免疫グロブリンは「ドナー」と呼ばれ、フレームワークを提供する免疫グロブリンは「アクセプター」と呼ばれる。一実施形態では、ドナー免疫グロブリンは非ヒト(例えば、齧歯動物)である。アクセプターフレームワークは、天然に存在する(例えば、ヒト)フレームワークもしくはコンセンサスフレームワーク、またはそれに対して約85%もしくはより高い、好ましくは、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一である配列である。
[00161]本明細書で使用される場合、「コンセンサス配列」という用語は、関連配列のファミリーにおいて最も頻繁に生じるアミノ酸(またはヌクレオチド)から形成される配列を指す(例えば、Winnaker、From Genes to Clones(Verlagsgesellschaft、Weinheim、Germany 1987)を参照。タンパク質のファミリーにおいて、コンセンサス配列中の各位置は、ファミリーにおいてその位置において最も頻繁に生じるアミノ酸によって占有される。2つのアミノ酸が等しく頻繁に生じる場合、いずれかをコンセンサス配列に含めることができる。「コンセンサスフレームワーク」は、コンセンサス免疫グロブリン配列中のフレームワーク領域を指す。
[00162]抗体分子は、当該技術分野において公知の方法によってヒト化させることができる(例えば、Morrison, S. L.、1985、Science 229:1202~1207ページ、Oiら、1986、BioTechniques 4:214、ならびにQueenら、米国特許第5,585,089号、米国特許第5,693,761号および米国特許第5,693,762号(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00163]ヒト化またはCDRグラフト化抗体分子は、CDRグラフト化またはCDR置換によって産生することができ、それにおいて免疫グロブリン鎖の1つ、2つ、またはすべてのCDRを置き換えることができる。例えば、米国特許第5,225,539号;Jonesら、1986 Nature 321:552~525ページ;Verhoeyanら、1988 Science 239:1534;Beidlerら、1988 J. Immunol. 141:4053~4060ページ;Winter、米国特許第5,225,539号(これらのすべての内容はこれにより明示的に参照により本明細書に組み込まれる)を参照。Winterは、本発明のヒト化抗体を調製するために使用され得るCDRグラフト化方法を記載する(1987年3月26日に出願された英国特許出願第2188638A号;Winter、米国特許第5,225,539号)(その内容は明示的に参照により本明細書に組み込まれる)。
[00164]具体的なアミノ酸が置換、欠失または付加されたヒト化抗体分子もまた本発明の範囲である。ドナーからのアミノ酸を選択する基準は、米国特許第5,585,089号、例えば、米国特許第5,585,089号の第12~16欄、例えば、米国特許第5,585,089号の第12~16欄に記載されている(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)。抗体をヒト化する他の技術は、1992年12月23日に公開されたPadlanら、EP519596A1に記載されている。
[00165]抗体分子は一本鎖抗体であり得る。一本鎖抗体(scFV)は操作されていてもよい(例えば、Colcher, D.ら、(1999) Ann N Y Acad Sci 880:263~80ページ;およびReiter, Y.、(1996) Clin Cancer Res 2:245~52ページを参照)。一本鎖抗体は、二量体化または多量体化して、同じ標的タンパク質の異なるエピトープに対して特異性を有する多価抗体を生成することができる。
[00166]さらに他の実施形態では、抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の(例えば、ヒト)重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域を有する。別の実施形態では、抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダの(例えば、ヒト)軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。定常領域は、抗体の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、および/または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異され得る。一実施形態では、抗体は、エフェクター機能を有し、かつ補体を固定することができる。他の実施形態では、抗体は、エフェクター細胞をリクルートせず、かつ補体を固定しない。別の実施形態では、抗体は、Fc受容体に結合する低減した能力を有し、または該能力を有しない。例えば、それは、Fc受容体への結合をサポートしないアイソタイプまたはサブタイプ、断片または他の突然変異体であり、例えば、それは、突然変異誘発されたFc受容体結合性領域を有し、またはそれを欠失している。
[00167]抗体定常領域を変更する方法は当該技術分野において公知である。変更された機能、例えば、エフェクターリガンド、例えば、細胞上のFcR、または補体のC1成分に対する変更された親和性を有する抗体は、抗体の定常部分中の少なくとも1つのアミノ酸残基を異なる残基で置き換えることによって産生することができる(例えば、EP388,151A1、米国特許第5,624,821号および米国特許第5,648,260号(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。マウス、または他の種の免疫グロブリンに応用された場合にこれらの機能を低減または排除する類似の種類の変更が記載され得る。
[00168]抗体分子は、誘導体化または別の機能分子(例えば、別のペプチドもしくはタンパク質)に連結させることができる。本明細書で使用される場合、「誘導体化」された抗体分子は、修飾された抗体分子である。誘導体化の方法としては、蛍光部分、放射性ヌクレオチド、毒素、酵素または親和性リガンド、例えば、ビオチンの付加が挙げられるがそれに限定されない。よって、本発明の抗体分子は、免疫接着分子を含む、本明細書に記載の抗体の誘導体化および他に修飾された形態を含むことが意図される。例えば、抗体分子は、1つまたは複数の他の分子実体、例えば、別の抗体(例えば、二特異性抗体もしくはダイアボディ)、検出可能な剤、細胞傷害剤、医薬剤、および/または抗体もしくは抗体部分の別の分子(例えば、ストレプトアビジンコア領域もしくはポリヒスチジンタグ)との会合を媒介することができるタンパク質もしくはペプチドに(化学的カップリング、遺伝子融合、非共有結合的会合またはその他によって)機能的に連結させることができる。
[00169]1つの種類の誘導体化された抗体分子は、(例えば、二特異性抗体を作出するために、同じ種類または異なる種類の)2つまたはより多くの抗体を架橋することによって産生される。好適なクロスリンカーとしては、適切なスペーサー(例えば、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル)またはホモ二官能性(例えば、スベリン酸ジサクシンイミジル)によって分離された2つの別個に反応性の基を有するヘテロ二官能性のものが挙げられる。そのようなリンカーは、Pierce Chemical Company、Rockford、Illから入手可能である。
多特異性または多機能性抗体分子
[00170]本明細書で定義される多特異性および多機能性分子の例示的な構造は、全体を通じて記載されている。例示的な構造は、Weidle Uら、(2013) The Intriguing Options of Multispecific Antibody Formats for Treatment of Cancer. Cancer Genomics & Proteomics 10: 1~18ページ(2013);およびSpiess Cら、(2015) Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Molecular Immunology 67: 95~106ページ(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)にさらに記載されている。
[00170]本明細書で定義される多特異性および多機能性分子の例示的な構造は、全体を通じて記載されている。例示的な構造は、Weidle Uら、(2013) The Intriguing Options of Multispecific Antibody Formats for Treatment of Cancer. Cancer Genomics & Proteomics 10: 1~18ページ(2013);およびSpiess Cら、(2015) Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Molecular Immunology 67: 95~106ページ(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)にさらに記載されている。
[00171]実施形態では、多特異性抗体分子は、異なる部位が異なる抗原に特異的である1つより多くの抗原結合性部位を含むことができる。実施形態では、多特異性抗体分子は、同じ抗原上の1つより多く(例えば、2つまたはより多く)のエピトープに結合することができる。実施形態では、多特異性抗体分子は、標的細胞(例えば、がん細胞)に特異的な抗原結合性部位および免疫エフェクター細胞に特異的な異なる抗原結合性部位を含む。一実施形態では、多特異性抗体分子は二特異性抗体分子である。二特異性抗体分子は、5つの異なる構造群:(i)二特異性免疫グロブリンG(BsIgG)、(ii)追加の抗原結合性部分を付加されたIgG、(iii)二特異性抗体断片、(iv)二特異性融合タンパク質、および(v)二特異性抗体コンジュゲートに分類することができる。
[00172]BsIgGは、各抗原について一価のフォーマットである。例示的なBsIgGフォーマットとしては、crossMab、DAF(two-in-one)、DAF(four-in-one)、DutaMab、DT-IgG、ノブ・イン・ホール(knobs-in-holes)共通LC、ノブ・イン・ホールアセンブリー、電荷対、Fabアーム交換、SEEDボディ、triomab、LUZ-Y、Fcab、κλボディ、直交Fabが挙げられるがそれに限定されない。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。例示的なBsIgGとしては、抗CD3アームおよび抗EpCAMアームを含有するカツマキソマブ(Fresenius Biotech、Trion Pharma、Neopharm)、ならびにCD3およびHER2を標的化するエルツマキソマブ(Neovii Biotech、Fresenius Biotech)が挙げられる。一部の実施形態では、BsIgGは、ヘテロ二量体化のために操作された重鎖を含む。例えば、重鎖は、「ノブ・イントゥー・ホール」(knobs-into-holes)戦略、SEEDプラットフォーム、(例えば、κλボディ中の)共通重鎖、およびヘテロ二量体Fc領域の使用を使用してヘテロ二量体化のために操作することができる。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。BsIgGにおけるホモ二量体の重鎖対合を回避するために使用されてきた戦略としては、ノブ・イン・ホール、デュオボディ(duobody)、アジメトリック(azymetric)、電荷対、HA-TF、SEEDボディ、および差次的なプロテインA親和性が挙げられる。同文献を参照。BsIgGは、異なる宿主細胞中での成分抗体の別々の発現およびその後の精製/BsIgGへのアセンブリーによって産生することができる。BsIgGはまた、単一の宿主細胞中での成分抗体の発現によって産生することができる。BsIgGは、例えば、プロテインAおよび逐次的pH溶出を使用する、親和性クロマトグラフィーを使用して精製することができる。
[00173]追加の抗原結合性部分を付加されたIgGは、二特異性抗体分子の別のフォーマットである。例えば、単一特異性IgGは、例えば、重鎖または軽鎖のいずれかのNまたはC末端において、追加の抗原結合性単位を単一特異性IgGに付加することによって二特異性を有するように操作することができる。例示的な追加の抗原結合性単位としては、単一ドメイン抗体(例えば、可変重鎖または可変軽鎖)、操作されたタンパク質スキャフォールド、および対合した抗体可変ドメイン(例えば、単鎖可変断片または可変断片)が挙げられる。同文献を参照。付加されたIgGフォーマットの例としては、二重可変ドメインIgG(DVD-Ig)、IgG(H)-scFv、scFv-(H)IgG、IgG(L)-scFv、scFv-(L)IgG、IgG(L,H)-Fv、IgG(H)-V、V(H)-IgG、IgG(L)-V、V(L)-IgG、KIH IgG-scFab、2scFv-IgG、IgG-2scFv、scFv4-Ig、ザイボディ(zybody)、およびDVI-IgG(4-in-1)が挙げられる。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。IgG-scFvの例は、IGF-1RおよびHER3に結合するMM-141(Merrimack Pharmaceuticals)である。DVD-Igの例としては、IL-1αおよびIL-1βに結合するABT-981(AbbVie)、ならびにTNFおよびIL-17Aに結合するABT-122(AbbVie)が挙げられる。
[00174]二特異性抗体断片(BsAb)は、抗体定常ドメインの一部またはすべてを欠いた二特異性抗体分子のフォーマットである。例えば、一部のBsAbはFc領域を欠いている。実施形態では、二特異性抗体断片は、単一の宿主細胞中でのBsAbの効率的な発現を許容するペプチドリンカーによって接続された重鎖および軽鎖領域を含む。例示的な二特異性抗体断片としては、ナノボディ、ナノボディ-HAS、BiTE、ダイアボディ、DART、TandAb、scDiabody、scDiabody-CH3、ダイアボディ-CH3、トリプルボディ、ミニ抗体、ミニボディ、TriBiミニボディ、scFv-CH3 KIH、Fab-scFv、scFv-CH-CL-scFv、F(ab’)2、F(ab’)2-scFv2、scFv-KIH、Fab-scFv-Fc、四価HCAb、scDiabody-Fc、ダイアボディ-Fc、タンデムscFv-Fc、およびイントラボディが挙げられるがそれに限定されない。同文献を参照。例えば、BiTEフォーマットはタンデムscFvを含み、成分scFvは、T細胞上のCD3およびがん細胞上の表面抗原に結合する。
[00175]二特異性融合タンパク質としては、例えば、追加の特異性および/または機能性を加えるために、他のタンパク質に連結された抗体断片が挙げられる。二特異性融合タンパク質の例は、HLA提示ペプチドを認識する親和性成熟したT細胞受容体に連結された抗CD3 scFvを含むimmTACである。実施形態では、より高い価数を有する二特異性抗体分子を生成するためにドック-アンド-ロック(dock-and-lock)(DNL)法を使用することができる。また、アルブミン結合性タンパク質またはヒト血清アルブミンへの融合は、抗体断片の血清半減期を延長させることができる。同文献を参照。
[00176]実施形態では、BsAb分子を作出するために化学的コンジュゲーション、例えば、抗体および/または抗体断片の化学的コンジュゲーションを使用することができる。同文献を参照。例示的な二特異性抗体コンジュゲートとしては、CovXボディフォーマットが挙げられ、該フォーマットでは、低分子量薬物が、各Fabアームまたは抗体もしくはその断片中の単一の反応性リシンに部位特異的にコンジュゲートしている。実施形態では、コンジュゲーションは、低分子量薬物の血清半減期を向上させる。例示的なCovXボディは、VEGFまたはAng2のいずれかを阻害する2つの短いペプチドにコンジュゲートした抗体を含むCVX-241(NCT01004822)である。同文献を参照。
[00177]抗体分子は、例えば、宿主系中での少なくとも1つまたは複数の成分の、組換え発現によって産生することができる。例示的な宿主系としては、真核細胞(例えば、哺乳動物細胞、例えば、CHO細胞、または昆虫細胞、例えば、SF9もしくはS2細胞)および原核細胞(例えば、E. coli)が挙げられる。二特異性抗体分子は、異なる宿主細胞中での成分の別々の発現およびその後の精製/アセンブリーによって産生することができる。代替的に、抗体分子は、単一の宿主細胞中での成分の発現によって産生することができる。二特異性抗体分子の精製は、例えば、プロテインAおよび逐次的pH溶出を使用する、親和性クロマトグラフィーなどの、様々な方法によって行うことができる。他の実施形態では、親和性タグ、例えば、ヒスチジン含有タグ、mycタグ、またはストレプトアビジンタグを精製のために使用することができる。
CDRグラフト化スキャフォールド
[00178]実施形態では、抗体分子は、CDRグラフト化スキャフォールドドメインである。実施形態では、スキャフォールドドメインは、フィブロネクチンドメイン、例えば、フィブロネクチンIII型ドメインに基づく。フィブロネクチンIII型(Fn3)ドメインの全体的なフォールドは、最小の機能的抗体断片、抗体重鎖の可変ドメインのそれに密接に関係する。Fn3の末端には3つのループがあり、BC、DEおよびFGループの位置は、抗体のVHドメインのCDR1、2および3のそれにおおよそ対応する。Fn3はジスルフィド結合を有さず、したがって、Fn3は、抗体およびそれらの断片とは異なり、還元条件下で安定である(例えば、WO98/56915、WO01/64942、WO00/34784を参照)。Fn3ドメインは、例えば、本明細書に記載の抗原/マーカー/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、本明細書に記載のCDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。
[00178]実施形態では、抗体分子は、CDRグラフト化スキャフォールドドメインである。実施形態では、スキャフォールドドメインは、フィブロネクチンドメイン、例えば、フィブロネクチンIII型ドメインに基づく。フィブロネクチンIII型(Fn3)ドメインの全体的なフォールドは、最小の機能的抗体断片、抗体重鎖の可変ドメインのそれに密接に関係する。Fn3の末端には3つのループがあり、BC、DEおよびFGループの位置は、抗体のVHドメインのCDR1、2および3のそれにおおよそ対応する。Fn3はジスルフィド結合を有さず、したがって、Fn3は、抗体およびそれらの断片とは異なり、還元条件下で安定である(例えば、WO98/56915、WO01/64942、WO00/34784を参照)。Fn3ドメインは、例えば、本明細書に記載の抗原/マーカー/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、本明細書に記載のCDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。
[00179]実施形態では、スキャフォールドドメイン、例えば、フォールディングしたドメインは、抗体、例えば、モノクローナル抗体の重鎖可変ドメインから3つのベータ鎖を欠失させることにより作出される「ミニボディ」スキャフォールドに基づく(例えば、Tramontanoら、1994、J Mol. Recognit. 7:9、およびMartinら、1994、EMBO J. 13:5303~5309ページを参照)。「ミニボディ」は、2つの超可変ループを提示するために使用することができる。実施形態では、スキャフォールドドメインは、V様ドメイン(例えば、Coiaら、WO99/45110を参照)、または2つのジスルフィド結合によって一緒に保持された74残基の6鎖ベータシートサンドイッチであるテンダミスタチン(tendamistatin)に由来するドメインである(例えば、McConnellおよびHoess、1995、J Mol. Biol. 250:460を参照)。例えば、テンダミスタチンのループは、例えば、本明細書に記載のマーカー/抗原/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、CDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。別の例示的なスキャフォールドドメインは、CTLA-4の細胞外ドメインに由来するベータ-サンドイッチ構造である(例えば、WO00/60070を参照)。
[00180]他の例示的なスキャフォールドドメインとしては、T細胞受容体、MHCタンパク質、細胞外ドメイン(例えば、フィブロネクチンIII型リピート、EGFリピート)、プロテアーゼ阻害剤(例えば、Kunitzドメイン、エコチン、およびBPTIなど)、TPRリピート、トリフォイル(trifoil)構造、ジンクフィンガードメイン、DNA結合性タンパク質、特に、単量体DNA結合性タンパク質、RNA結合性タンパク質、酵素、例えば、プロテアーゼ(特に、不活性化プロテアーゼ)、RNase、シャペロン、例えば、チオレドキシン、および熱ショックタンパク質、ならびに細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、SH2およびSH3ドメイン)が挙げられるがそれに限定されない。例えば、米国特許出願公開第20040009530号および米国特許第7,501,121号(参照により本明細書に組み込まれる)を参照。
[00181]実施形態では、スキャフォールドドメインは、例えば、以下の基準:(1)アミノ酸配列、(2)いくつかの相同ドメインの配列、(3)三次元構造、および/または(4)pH、温度、塩分、有機溶媒、酸化剤濃度の範囲にわたる安定性データのうちの1つまたは複数によって評価および選択される。実施形態では、スキャフォールドドメインは、小さい、安定なタンパク質ドメイン、例えば、100個、70個、50個、40個または30個未満のアミノ酸のタンパク質である。ドメインは、1つもしくは複数のジスルフィド結合を含んでもよく、または金属、例えば、亜鉛をキレートしてもよい。
抗体ベースの融合物
[00182]抗体のNまたはC末端に取り付けられた追加の結合性実体を含有する様々なフォーマットを生成することができる。単鎖またはジスルフィド安定化FvもしくはFabを有するこれらの融合物は、各抗原に対して二価の結合特異性を有する四価分子の生成をもたらす。IgGとのscFvおよびscFabの組合せは、3つまたはより多くの異なる抗原を認識することができる分子の産生を可能にする。
[00182]抗体のNまたはC末端に取り付けられた追加の結合性実体を含有する様々なフォーマットを生成することができる。単鎖またはジスルフィド安定化FvもしくはFabを有するこれらの融合物は、各抗原に対して二価の結合特異性を有する四価分子の生成をもたらす。IgGとのscFvおよびscFabの組合せは、3つまたはより多くの異なる抗原を認識することができる分子の産生を可能にする。
抗体-Fab融合物
[00183]抗体-Fab融合物は、第1の標的に対する伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した第2の標的に対するFabを含む二特異性抗体である。一般的に、抗体およびFabは共通の軽鎖を有する。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
[00183]抗体-Fab融合物は、第1の標的に対する伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した第2の標的に対するFabを含む二特異性抗体である。一般的に、抗体およびFabは共通の軽鎖を有する。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
抗体-scFv融合物
[00184]抗体-scFv融合物は、伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した特有の特異性のscFvを含む二特異性抗体である。scFvは、直接的にまたはリンカーペプチドを通じてscFvの重鎖を通じてC末端に融合させることができる。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
[00184]抗体-scFv融合物は、伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した特有の特異性のscFvを含む二特異性抗体である。scFvは、直接的にまたはリンカーペプチドを通じてscFvの重鎖を通じてC末端に融合させることができる。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
可変ドメイン免疫グロブリンDVD
[00185]関連するフォーマットは、より短いリンカー配列によってVドメインのN末端に配置された第2の特異性のVHおよびVLドメインから構成される二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)である。
[00185]関連するフォーマットは、より短いリンカー配列によってVドメインのN末端に配置された第2の特異性のVHおよびVLドメインから構成される二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)である。
[00186]他の例示的な多特異性抗体フォーマットとしては、例えば、以下:米国特許出願公開第20160114057A1号、米国特許出願公開第20130243775A1号、米国特許出願公開第20140051833号、米国特許出願公開第20130022601号、米国特許出願公開第20150017187A1号、米国特許出願公開第20120201746A1号、米国特許出願公開第20150133638A1号、米国特許出願公開第20130266568A1号、米国特許出願公開第20160145340A1号、WO2015127158A1、米国特許出願公開第20150203591A1号、米国特許出願公開第20140322221A1号、米国特許出願公開第20130303396A1号、米国特許出願公開第20110293613号、米国特許出願公開第20130017200A1号、米国特許出願公開第20160102135A1号、WO2015197598A2、WO2015197582A1、米国特許第9359437号、米国特許出願公開第20150018529号、WO2016115274A1、WO2016087416A1、米国特許出願公開第20080069820A1号、米国特許第9145588B号、米国特許第7919257号、および米国特許出願公開第20150232560A1号に記載のものが挙げられる。全長抗体-Fab/scFabフォーマットを利用する例示的な多特異性分子としては、以下:米国特許第9382323B2号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20140308285A1号、米国特許出願公開第20130165638A1号、米国特許出願公開第20130267686A1号、米国特許出願公開第20140377269A1号、米国特許第7741446B2号、およびWO1995009917A1に記載のものが挙げられる。ドメイン交換フォーマットを利用する例示的な多特異性分子としては、以下:米国特許出願公開第20150315296A1号、WO2016087650A1、米国特許出願公開第20160075785A1号、WO2016016299A1、米国特許出願公開第20160130347A1号、米国特許出願公開第20150166670号、米国特許第8703132B2号、米国特許出願公開第20100316645号、米国特許第8227577B2号、米国特許出願公開第20130078249号に記載のものが挙げられる。
Fc含有実体(ミニ抗体)
[00187]ミニ抗体としても公知のFc含有実体は、scFvを定常重鎖領域ドメイン3のC末端(CH3-scFv)および/または異なる特異性を有する抗体のヒンジ領域(scFv-ヒンジ-Fc)に融合させることにより生成することができる。IgGのCH3ドメインのC末端に融合した(ペプチドリンカーを有さない)ジスルフィド安定化可変ドメインを有する三価の実体もまた作製することができる。
[00187]ミニ抗体としても公知のFc含有実体は、scFvを定常重鎖領域ドメイン3のC末端(CH3-scFv)および/または異なる特異性を有する抗体のヒンジ領域(scFv-ヒンジ-Fc)に融合させることにより生成することができる。IgGのCH3ドメインのC末端に融合した(ペプチドリンカーを有さない)ジスルフィド安定化可変ドメインを有する三価の実体もまた作製することができる。
Fc含有多特異性分子
[00188]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)を含む。例示的なFc領域は、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4の重鎖定常領域、より特には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択することができる。
[00188]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)を含む。例示的なFc領域は、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4の重鎖定常領域、より特には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択することができる。
[00189]一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるために、変更、例えば、突然変異される。
[00190]他の実施形態では、第1および第2の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、第1および第2のFc領域)の境界部は、例えば、操作されていない境界部、例えば、天然に存在する境界部と比較して、二量体化を増加または減少させるために、変更、例えば、突然変異される。例えば、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)の二量体化は、第1および第2のFc領域のFc境界部に、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を提供し、それによって、例えば、操作されていない境界部と比較して、より高い比のヘテロ多量体:ホモ多量体が形成されることにより、増強させることができる。
[00191]一部の実施形態では、多特異性分子は、例えば、ヒトIgG1のFc領域の、347、349、350、351、366、368、370、392、394、395、397、398、399、405、407、または409のうちの1つまたは複数から選択される位置において、対になったアミノ酸置換を含む。例えば、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、T366S、L368A、またはY407V(例えば、孔またはホールに対応する)、およびT366W(例えば、突起またはノブに対応する)から選択される対になったアミノ酸置換を含むことができる。
[00192]他の実施形態では、多機能性分子は、半減期延長剤、例えば、ヒト血清アルブミンまたはヒト血清アルブミンに対する抗体分子を含む。
ヘテロ二量体化抗体分子および作製方法
[00193]正しくない重鎖対合の問題に対処するために多特異性抗体を産生する様々な方法が開示されてきた。例示的な方法は以下に記載される。例示的な多特異性抗体フォーマットおよび前記多特異性抗体を作製する方法もまた、例えば、Speissら、Molecular Immunology 67(2015)95~106ページ、およびKleinら、mAb 4:6、653~663ページ、2012年11月/12月(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00193]正しくない重鎖対合の問題に対処するために多特異性抗体を産生する様々な方法が開示されてきた。例示的な方法は以下に記載される。例示的な多特異性抗体フォーマットおよび前記多特異性抗体を作製する方法もまた、例えば、Speissら、Molecular Immunology 67(2015)95~106ページ、およびKleinら、mAb 4:6、653~663ページ、2012年11月/12月(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00194]ヘテロ二量体化二特異性抗体は天然のIgG構造に基づき、2つの結合性アームが異なる抗原を認識する。定義された一価(および同時の)抗原結合を可能にするIgG由来のフォーマットは、軽鎖誤対合を最小化する技術(例えば、共通軽鎖)と組み合わせた強制的な重鎖ヘテロ二量体化により生成される。強制的な重鎖ヘテロ二量体化は、例えば、ノブ・イン・ホールまたは鎖交換操作ドメイン(SEED)を使用して、得ることができる。
[00195]ノブ・イン・ホール
[00196]米国特許第5,731,116号、米国特許第7,476,724号およびRidgway, Jら、(1996)Prot. Engineering 9(7):617~621ページに記載されるノブ・イン・ホールは、概して、(1)1つまたは両方の抗体のCH3ドメインを突然変異させてヘテロ二量体化を促進すること、および(2)ヘテロ二量体化を促進する条件下で突然変異した抗体を組み合わせることを伴う。「ノブ」または「突起」は、典型的には、親抗体中の小さいアミノ酸をより大きいアミノ酸で置き換えること(例えば、T366YまたはT366W)により作出され、「ホール」または「孔」は、親抗体中のより大きい残基をより小さいアミノ酸で置き換えること(例えば、Y407T、T366S、L368Aおよび/またはY407V)により作出される。
[00196]米国特許第5,731,116号、米国特許第7,476,724号およびRidgway, Jら、(1996)Prot. Engineering 9(7):617~621ページに記載されるノブ・イン・ホールは、概して、(1)1つまたは両方の抗体のCH3ドメインを突然変異させてヘテロ二量体化を促進すること、および(2)ヘテロ二量体化を促進する条件下で突然変異した抗体を組み合わせることを伴う。「ノブ」または「突起」は、典型的には、親抗体中の小さいアミノ酸をより大きいアミノ酸で置き換えること(例えば、T366YまたはT366W)により作出され、「ホール」または「孔」は、親抗体中のより大きい残基をより小さいアミノ酸で置き換えること(例えば、Y407T、T366S、L368Aおよび/またはY407V)により作出される。
[00197]Fcドメインを含む二特異性抗体のために、Fc部分の正しいヘテロ二量体化を促進するための重鎖の定常領域への特定の突然変異の導入を利用することができる。いくつかのそのような技術は、Kleinら(mAb(2012)4:6、1~11ページ)(その内容はこれにより参照により全体が本明細書に組み込まれる)において総説されている。これらの技術としては、抗体重鎖のうちの1つのCH3ドメインのうちの1つへのバルク残基の導入を伴う「ノブ・イントゥー・ホール」(KiH)アプローチが挙げられる。このバルク残基は、対になった重鎖の他のCH3ドメイン中の相補的な「ホール」にフィットし、それによって、重鎖の正しい対合が促進される(例えば、米国特許第7642228号を参照)。
[00198]例示的なKiH突然変異としては、「ノブ」重鎖中のS354C、T366Wおよび「ホール」重鎖中のY349C、T366S、L368A、Y407Vが挙げられる。他の例示的なKiH突然変異は、追加の必要に応じた安定化性Fcシステイン突然変異と共に、表1において提供される。
[00200]多特異性抗体のヘテロ二量体化を促進するための他の例示的なFc突然変異としては、以下の参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる):WO2016071377A1、米国特許出願公開第20140079689A1号、米国特許出願公開第20160194389A1号、米国特許出願公開第20160257763号、WO2016071376A2、WO2015107026A1、WO2015107025A1、WO2015107015A1、米国特許出願公開第20150353636A1号、米国特許出願公開第20140199294A1号、米国特許第7750128B2号、米国特許出願公開第20160229915A1号、米国特許出願公開第20150344570A1号、米国特許第8003774A1号、米国特許出願公開第20150337049A1号、米国特許出願公開第20150175707A1号、米国特許出願公開第20140242075A1号、米国特許出願公開第20130195849A1号、米国特許出願公開第20120149876A1号、米国特許出願公開第20140200331A1号、米国特許第9309311B2号、米国特許第8586713号、米国特許出願公開第20140037621A1号、米国特許出願公開第20130178605A1号、米国特許出願公開第20140363426A1号、米国特許出願公開第20140051835A1号および米国特許出願公開第20110054151A1号に記載のものが挙げられる。
[00201]安定化性システイン突然変異もまた、KiHおよび他のFcヘテロ二量体化促進性バリアントと組み合わせて使用されている(例えば、米国特許第7183076号を参照)。他の例示的なシステイン修飾としては、例えば、米国特許出願公開第20140348839A1号、米国特許第7855275B2号、および米国特許第9000130B2号に開示されるものが挙げられる。
[00202]鎖交換操作ドメイン(SEED)
[00203]鎖交換操作ドメイン(SEED)C(H)3ヘテロ二量体を工作することによって二特異性かつ非対称性の融合タンパク質の設計をサポートするヘテロ二量体Fcプラットフォームが公知である。ヒトIgGおよびIgA C(H)3ドメインのこれらの誘導体は、ヒトIgAおよびIgG C(H)3配列の交互のセグメントから構成される相補的なヒトSEED C(H)3ヘテロ二量体を作出する。もたらされるSEED C(H)3ドメインの対は、哺乳動物細胞中で発現された場合に優先的に会合してヘテロ二量体を形成する。SEEDボディ(Sb)融合タンパク質は、1つまたは複数の融合パートナーに遺伝子連結されていてもよい[IgG1ヒンジ]-C(H)2-[SEED C(H)3]からなる(例えば、Davis JHら、「SEEDbodies: fusion proteins based on strand exchange engineered domain (SEED) CH3 heterodimers in an Fc analogue platform for asymmetric binders or immunofusions and bispecific antibodies.」、Protein Eng Des Sel 2010;23:195~202ページ;PMID:20299542および米国特許第8871912号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00203]鎖交換操作ドメイン(SEED)C(H)3ヘテロ二量体を工作することによって二特異性かつ非対称性の融合タンパク質の設計をサポートするヘテロ二量体Fcプラットフォームが公知である。ヒトIgGおよびIgA C(H)3ドメインのこれらの誘導体は、ヒトIgAおよびIgG C(H)3配列の交互のセグメントから構成される相補的なヒトSEED C(H)3ヘテロ二量体を作出する。もたらされるSEED C(H)3ドメインの対は、哺乳動物細胞中で発現された場合に優先的に会合してヘテロ二量体を形成する。SEEDボディ(Sb)融合タンパク質は、1つまたは複数の融合パートナーに遺伝子連結されていてもよい[IgG1ヒンジ]-C(H)2-[SEED C(H)3]からなる(例えば、Davis JHら、「SEEDbodies: fusion proteins based on strand exchange engineered domain (SEED) CH3 heterodimers in an Fc analogue platform for asymmetric binders or immunofusions and bispecific antibodies.」、Protein Eng Des Sel 2010;23:195~202ページ;PMID:20299542および米国特許第8871912号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00204]デュオボディ
[00205]正しい重鎖対合を有する二特異性抗体を産生するための「デュオボディ」技術は公知である。DuoBodyテクノロジーは、生産後の交換反応で安定した二重特異性ヒトIgG1抗体を生成するための3つの基本ステップを伴う。第1のステップにおいて、第3の定常(CH3)ドメイン中に単一のマッチした突然変異をそれぞれ含有する2つのIgG1が、標準的な哺乳動物組換え細胞系を使用して別々に産生される。その後に、これらのIgG1抗体は、回収および精製のための標準的な方法に従って精製される。産生および精製後(産生後)、2つの抗体は調整された実験室条件下で組み換えられて、非常に高い収率(典型的には>95%)で二特異性抗体産物をもたらす(例えば、Labrijnら、PNAS 2013;110(13):5145~5150ページおよびLabrijnら、Nature Protocols 2014;9(10):2450~63ページ(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00205]正しい重鎖対合を有する二特異性抗体を産生するための「デュオボディ」技術は公知である。DuoBodyテクノロジーは、生産後の交換反応で安定した二重特異性ヒトIgG1抗体を生成するための3つの基本ステップを伴う。第1のステップにおいて、第3の定常(CH3)ドメイン中に単一のマッチした突然変異をそれぞれ含有する2つのIgG1が、標準的な哺乳動物組換え細胞系を使用して別々に産生される。その後に、これらのIgG1抗体は、回収および精製のための標準的な方法に従って精製される。産生および精製後(産生後)、2つの抗体は調整された実験室条件下で組み換えられて、非常に高い収率(典型的には>95%)で二特異性抗体産物をもたらす(例えば、Labrijnら、PNAS 2013;110(13):5145~5150ページおよびLabrijnら、Nature Protocols 2014;9(10):2450~63ページ(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00206]静電相互作用
[00207]ホモ二量体形成が静電気的に不都合であるように荷電性アミノ酸を有するCH3アミノ酸変化を使用して多特異性抗体を作製する方法が開示されている。EP1870459およびWO2009089004は、宿主細胞中での異なる抗体ドメインの共発現の際のヘテロ二量体形成に有利に働くための他の戦略を記載する。これらの方法において、重鎖定常ドメイン3(CH3)、両方のCH3ドメイン中のCH3-CH3境界部を作り上げる1つまたは複数の残基は、ホモ二量体形成が静電気的に不都合であり、かつヘテロ二量体化が静電気的に好都合であるように荷電性アミノ酸で置き換えられる。静電相互作用を使用して多特異性分子を作製する追加の方法は、米国特許出願公開第20100015133号、米国特許第8592562B2号、米国特許第9200060B2号、米国特許出願公開第20140154254A1号、および米国特許第9358286A1号を含む参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
[00207]ホモ二量体形成が静電気的に不都合であるように荷電性アミノ酸を有するCH3アミノ酸変化を使用して多特異性抗体を作製する方法が開示されている。EP1870459およびWO2009089004は、宿主細胞中での異なる抗体ドメインの共発現の際のヘテロ二量体形成に有利に働くための他の戦略を記載する。これらの方法において、重鎖定常ドメイン3(CH3)、両方のCH3ドメイン中のCH3-CH3境界部を作り上げる1つまたは複数の残基は、ホモ二量体形成が静電気的に不都合であり、かつヘテロ二量体化が静電気的に好都合であるように荷電性アミノ酸で置き換えられる。静電相互作用を使用して多特異性分子を作製する追加の方法は、米国特許出願公開第20100015133号、米国特許第8592562B2号、米国特許第9200060B2号、米国特許出願公開第20140154254A1号、および米国特許第9358286A1号を含む参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
[00208]共通軽鎖
[00209]軽鎖誤対合は、二特異性IgGの均質な調製物を生成するために回避される必要がある。これを達成する1つのやり方は、共通軽鎖の原理、すなわち、1つの軽鎖を共有するが依然として別々の特異性を有する2つのバインダーを組み合わせることの使用を通じたものである。単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変重鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変軽鎖を提供することによる。共通軽鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許第7183076B2号、米国特許出願公開第20110177073A1号、EP2847231A1、WO2016079081A1、およびEP3055329A1(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00209]軽鎖誤対合は、二特異性IgGの均質な調製物を生成するために回避される必要がある。これを達成する1つのやり方は、共通軽鎖の原理、すなわち、1つの軽鎖を共有するが依然として別々の特異性を有する2つのバインダーを組み合わせることの使用を通じたものである。単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変重鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変軽鎖を提供することによる。共通軽鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許第7183076B2号、米国特許出願公開第20110177073A1号、EP2847231A1、WO2016079081A1、およびEP3055329A1(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00210]CrossMab
[00211]軽鎖誤対合を低減するための別のオプションはCrossMab技術であり、これは、二特異性抗体の1つの半分のFab中のCH1およびCLドメインを交換することによって非特異的L鎖誤対合を回避する。そのようなクロスオーバーバリアントは結合特異性および親和性を保持するが、L鎖誤対合が予防されるように2つのアームを異なるものとさせる。(Kleinら、上掲に総説されるように)CrossMab技術は、正しい対合の形成を促進するように重鎖と軽鎖との間のドメインスワッピングを伴う。簡潔に述べれば、2つの別個の軽鎖-重鎖対を使用することによって2つの抗原に結合し得る二特異性IgG様CrossMab抗体を構築するために、2ステップ修飾プロセスが応用される。最初に、二量体化境界部は、ヘテロ二量体化アプローチ、例えば、ノブ・イントゥー・ホール(KiH)技術を使用して各重鎖のC末端中に操作されて、1つの抗体(例えば、抗体A)および第2の抗体(例えば、抗体B)からの2つの別個の重鎖のヘテロ二量体のみが効率的に形成されることが確実にされる。次に、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)ドメインを一貫したままに保って、1つの抗体の定常重鎖1(CH1)および定常軽鎖(CL)ドメインが交換される(抗体A)。CH1およびCLドメインの交換は、修飾抗体(抗体A)軽鎖は修飾抗体(抗体A)重鎖とのみ効率的に二量体化し、非修飾抗体(抗体B)軽鎖は非修飾抗体(抗体B)重鎖とのみ効率的に二量体化するため、所望の二特異性CrossMabのみが効率的に形成されることを確実にした(例えば、Cain, C.、SciBX 4(28);doi:10.1038/scibx.2011.783(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00211]軽鎖誤対合を低減するための別のオプションはCrossMab技術であり、これは、二特異性抗体の1つの半分のFab中のCH1およびCLドメインを交換することによって非特異的L鎖誤対合を回避する。そのようなクロスオーバーバリアントは結合特異性および親和性を保持するが、L鎖誤対合が予防されるように2つのアームを異なるものとさせる。(Kleinら、上掲に総説されるように)CrossMab技術は、正しい対合の形成を促進するように重鎖と軽鎖との間のドメインスワッピングを伴う。簡潔に述べれば、2つの別個の軽鎖-重鎖対を使用することによって2つの抗原に結合し得る二特異性IgG様CrossMab抗体を構築するために、2ステップ修飾プロセスが応用される。最初に、二量体化境界部は、ヘテロ二量体化アプローチ、例えば、ノブ・イントゥー・ホール(KiH)技術を使用して各重鎖のC末端中に操作されて、1つの抗体(例えば、抗体A)および第2の抗体(例えば、抗体B)からの2つの別個の重鎖のヘテロ二量体のみが効率的に形成されることが確実にされる。次に、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)ドメインを一貫したままに保って、1つの抗体の定常重鎖1(CH1)および定常軽鎖(CL)ドメインが交換される(抗体A)。CH1およびCLドメインの交換は、修飾抗体(抗体A)軽鎖は修飾抗体(抗体A)重鎖とのみ効率的に二量体化し、非修飾抗体(抗体B)軽鎖は非修飾抗体(抗体B)重鎖とのみ効率的に二量体化するため、所望の二特異性CrossMabのみが効率的に形成されることを確実にした(例えば、Cain, C.、SciBX 4(28);doi:10.1038/scibx.2011.783(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00212]共通重鎖
[00213]単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変軽鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変重鎖を提供することによる。共通重鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許出願公開第20120184716号、米国特許出願公開第20130317200号、および米国特許出願公開第20160264685A1号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00213]単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変軽鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変重鎖を提供することによる。共通重鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許出願公開第20120184716号、米国特許出願公開第20130317200号、および米国特許出願公開第20160264685A1号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00214]アミノ酸修飾
[00215]正しい軽鎖対合を有する多特異性抗体の代替的な組成物およびその産生方法としては、様々なアミノ酸修飾が挙げられる。例えば、Zymeworksは、軽鎖と重鎖との間の境界部の部分であり、各重鎖と所望の軽鎖との優先的な対合を作製する、CH1および/もしくはCLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、VHおよび/もしくはVLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、またはこれらの組合せを有し、それによって、ヘテロ二量体対の2つの重鎖および2つの軽鎖が細胞中で共発現された場合に、第1のヘテロ二量体の重鎖が、他のものよりも軽鎖の1つと優先的に対合する、ヘテロ二量体を記載する(例えば、WO2015181805を参照)。他の例示的な方法は、WO2016026943(Argen-X)、米国特許出願公開第20150211001号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20160039947A1号、および米国特許出願公開第20150368352号に記載されている。
[00215]正しい軽鎖対合を有する多特異性抗体の代替的な組成物およびその産生方法としては、様々なアミノ酸修飾が挙げられる。例えば、Zymeworksは、軽鎖と重鎖との間の境界部の部分であり、各重鎖と所望の軽鎖との優先的な対合を作製する、CH1および/もしくはCLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、VHおよび/もしくはVLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、またはこれらの組合せを有し、それによって、ヘテロ二量体対の2つの重鎖および2つの軽鎖が細胞中で共発現された場合に、第1のヘテロ二量体の重鎖が、他のものよりも軽鎖の1つと優先的に対合する、ヘテロ二量体を記載する(例えば、WO2015181805を参照)。他の例示的な方法は、WO2016026943(Argen-X)、米国特許出願公開第20150211001号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20160039947A1号、および米国特許出願公開第20150368352号に記載されている。
[00216]ラムダ/カッパフォーマット
[00217]ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む多特異性分子(例えば、多特異性抗体分子)は、ヘテロ二量体化を可能とするために使用することができる。ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む二特異性抗体分子を生成する方法は、2017年9月22日に出願されたPCT/US17/53053に開示され、これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる。
[00217]ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む多特異性分子(例えば、多特異性抗体分子)は、ヘテロ二量体化を可能とするために使用することができる。ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む二特異性抗体分子を生成する方法は、2017年9月22日に出願されたPCT/US17/53053に開示され、これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる。
[00218]実施形態では、多特異性分子は、多特異性抗体分子、例えば、2つの結合特異性を含む抗体分子、例えば、二特異性抗体分子を含む。多特異性抗体分子は、
第1のエピトープに特異的なラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)、
第1のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド1(HCP1)、
第2のエピトープに特異的なカッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)、および
第2のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド2(HCP2)
を含む。
第1のエピトープに特異的なラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)、
第1のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド1(HCP1)、
第2のエピトープに特異的なカッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)、および
第2のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド2(HCP2)
を含む。
[00219]「ラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイト重鎖可変領域と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な軽鎖(LC)配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、LLCP1は、LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、およびCH1、またはそのエピトープの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する(KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する)。本明細書の他の箇所に記載されるように、LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
[00220]「カッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイト重鎖可変領域と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP2と複合体化することができる十分な軽鎖(LC)配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、KLCP2は、LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、およびCH1、またはそのエピトープの特異的結合を媒介し、HCP2と複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する(LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する)。
[00221]「重鎖ポリペプチド1(HCP1)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイトLLCP1と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な重鎖(HC)配列、例えば、HC可変領域配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、それは、CH2および/またはCH3領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、HCP1は、HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2、およびCH3、または(i)そのエピトープの特異的結合を媒介し、LLCP1と複合体化し、(ii)本明細書に記載されるように、KLCP2とは対照的にLLCP1に対して優先的に複合体化し、かつ(iii)本明細書に記載されるように、HCP1の別の分子とは対照的にHCP2に対して優先的に複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。HCP1は、そのLLCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する(KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する)。
[00222]「重鎖ポリペプチド2(HCP2)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイトLLCP1と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な重鎖(HC)配列、例えば、HC可変領域配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、それは、CH2および/またはCH3領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、HCP1は、HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2、およびCH3、または(i)そのエピトープの特異的結合を媒介し、KLCP2と複合体化し、(ii)本明細書に記載されるように、LLCP1とは対照的にKLCP2に対して優先的に複合体化し、かつ(iii)本明細書に記載されるように、HCP2の別の分子とは対照的にHCP1に対して優先的に複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。HCP2は、そのKLCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する(LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する)。
[00223]本明細書に開示される多特異性抗体分子の一部の実施形態では、
LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有し、かつ/または
KLCP2は、HCP1に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有する。
LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有し、かつ/または
KLCP2は、HCP1に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有する。
[00224]実施形態では、HCP1に対するLLCP1の親和性は、HCP2に対するその親和性より十分に高く、それによって、予め選択された条件下、例えば、例えばpH7の水性緩衝液中、例えばpH7の生理食塩水中、または生理的条件下で、多特異性抗体分子の少なくとも75、80、90、95、98、99、99.5、または99.9%は、HCP1と複合体化した、または結び付けられたLLCP1を有する。
[00225]本明細書に開示される多特異性抗体分子の一部の実施形態では、
HCP1は、HCP1の第2の分子に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有し、かつ/または
HCP2は、HCP2の第2の分子に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
HCP1は、HCP1の第2の分子に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有し、かつ/または
HCP2は、HCP2の第2の分子に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
実施形態では、HCP2に対するHCP1の親和性は、HCP1の第2の分子に対するその親和性より十分に高く、それによって、予め選択された条件下、例えば、例えばpH7の水性緩衝液中、例えばpH7の生理食塩水中、または生理的条件下で、多特異性抗体分子の少なくとも75%、80、90、95、98、99 99.5または99.9%は、HCP2と複合体化した、または結び付けられたHCP1を有する。
[00226]別の態様では、多特異性抗体分子を作製、または産生する方法が本明細書に開示される。方法は、(i)~(iv)が会合する条件下で、
(i)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLλ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLλ)、または両方)を提供するステップ、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLκ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLκ)、または両方)を提供するステップ
を含む。
(i)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLλ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLλ)、または両方)を提供するステップ、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLκ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLκ)、または両方)を提供するステップ
を含む。
[00227]実施形態では、第1および第2の重鎖ポリペプチドは、ヘテロ二量体化を増強するFc境界部を形成する。
[00228]実施形態では、(i)~(iv)(例えば、(i)~(iv)をコードする核酸)は、単一の細胞、例えば、単一の哺乳動物細胞、例えば、CHO細胞に導入される。実施形態では、(i)~(iv)は、細胞中で発現される。
[00229]実施形態では、(i)~(iv)(例えば、(i)~(iv)をコードする核酸)は、異なる細胞、例えば、異なる哺乳動物細胞、例えば、2つまたはより多くのCHO細胞に導入される。実施形態では、(i)~(iv)は、細胞中で発現される。
[00230]一実施形態では、方法は、例えば、ラムダおよび/またはカッパ特異的精製、例えば、親和性クロマトグラフィーを使用して、細胞発現抗体分子を精製するステップをさらに含む。
[00231]実施形態では、方法は、細胞発現多特異性抗体分子を評価することをさらに含む。例えば、精製された細胞発現多特異性抗体分子は、質量分析を含む、当該技術分野において公知の技術によって分析することができる。一実施形態では、精製された細胞発現抗体分子は、切断、例えば、パパインを用いて消化されて、Fab部分をもたらし、質量分析を使用して評価される。
[00232]実施形態では、方法は、高い収率、例えば、少なくとも75%、80、90、95、98、99 99.5または99.9%で、正しく対になったカッパ/ラムダ多特異性の、例えば、二特異性の抗体分子を産生する。
[00233]他の実施形態では、多特異性の、例えば、二特異性の、抗体分子は、
(i)第1の重鎖ポリペプチド(HCP1)(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、HCP1、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(HCP2)(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、HCP2、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ軽鎖ポリペプチド(LLCP1)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLl)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLl)、または両方)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、LLCP1、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ軽鎖ポリペプチド(KLCP2)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLk)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLk)、または両方)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、KLCP2
を含む。
(i)第1の重鎖ポリペプチド(HCP1)(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、HCP1、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(HCP2)(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、HCP2、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ軽鎖ポリペプチド(LLCP1)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLl)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLl)、または両方)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、LLCP1、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ軽鎖ポリペプチド(KLCP2)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLk)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLk)、または両方)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、KLCP2
を含む。
[00234]実施形態では、第1および第2の重鎖ポリペプチドは、ヘテロ二量体化を増強するFc境界部を形成する。実施形態では、多特異性抗体分子は、Fc定常、CH2-CH3ドメイン(ノブ修飾を有する)に接続された第1の重鎖可変領域にヘテロ二量体化したハイブリッドVLl-CLlを含む第1の結合特異性、およびFc定常、CH2-CH3ドメイン(ホール修飾を有する)に接続された第2の重鎖可変領域にヘテロ二量体化したハイブリッドVLk-CLkを含む第2の結合特異性を有する。
TRBC1およびTRBC2抗原結合性ドメイン
[00235]本開示は、とりわけ、リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に結合する1つまたは複数の抗原結合性ドメインを含む、例えば、それらを含有するように操作されている、抗体分子、例えば、多特異性(例えば、二特異性、三特異性、四特異性)または多機能性分子を提供する。一部の実施形態では、腫瘍抗原はTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、TRBC1を含むT細胞受容体に(例えば、TRBC2を含むT細胞受容体と比べて)優先的に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、TRBC2を含むT細胞受容体に(例えば、TRBC1を含むT細胞受容体と比べて)優先的に結合する。一部の実施形態では、多機能性分子は、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ球を選択的に標的とする1つまたは複数の抗原結合性ドメインを含む、例えば、それらを含有するように操作されている。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、TRBC1を含むT細胞受容体またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するリンパ球を選択的に標的とする。
[00235]本開示は、とりわけ、リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に結合する1つまたは複数の抗原結合性ドメインを含む、例えば、それらを含有するように操作されている、抗体分子、例えば、多特異性(例えば、二特異性、三特異性、四特異性)または多機能性分子を提供する。一部の実施形態では、腫瘍抗原はTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、TRBC1を含むT細胞受容体に(例えば、TRBC2を含むT細胞受容体と比べて)優先的に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、TRBC2を含むT細胞受容体に(例えば、TRBC1を含むT細胞受容体と比べて)優先的に結合する。一部の実施形態では、多機能性分子は、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ球を選択的に標的とする1つまたは複数の抗原結合性ドメインを含む、例えば、それらを含有するように操作されている。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、TRBC1を含むT細胞受容体またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するリンパ球を選択的に標的とする。
[00236]T細胞受容体(TCR)は、リンパ球の表面上、具体的には、Tリンパ球(T細胞)上に見られる受容体である。TCRは、関連するCD3を介してシグナル伝達し、T細胞を活性化することによって他の免疫細胞(例えば、B細胞)上の主要組織適合性複合体(MHC)分子によって提示された抗原断片を認識するのに関与する。ヒトにおけるTCRの大部分は、アルファ鎖およびベータ鎖を含むヘテロ二量体である。TCRのアルファ鎖およびベータ鎖の両方は可変領域および定常領域を含む。アルファ鎖およびベータ鎖の可変領域は、別個のDNAエレメント(ベータ鎖についてV、D、およびJエレメント;アルファ鎖についてVおよびJエレメント)によってコードされる。これらのエレメントの間の組換えは、大部分において、TCRの抗原結合特異性の変化をもたらす。TCRベータ鎖定常領域は、2つの異なるドメインである、ベータ定常ドメイン1およびベータ定常ドメイン2から選択される。理論に拘泥するものではないが、ベータ鎖を含むTCRの大部分は、ベータ定常ドメイン1またはベータ定常ドメイン2を含むベータ鎖を含むが、定常ドメイン1および定常ドメイン2の両方は含まないと考えられる。
[00237]一部の実施形態では、本出願の多機能性または多特異性分子または抗体分子は、リンパ腫細胞(例えば、T細胞)、例えば、TRBC1を含むT細胞受容体、TRBC1、TRBC2を含むT細胞受容体、またはTRBC2上の腫瘍抗原に結合する抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、本出願の多機能性または多特異性分子または抗体分子は、TRBC1を含むT細胞受容体、TRBC1、TRBC2を含むT細胞受容体、またはTRBC2を発現するリンパ球を選択的に標的とする抗原結合性ドメインを含む。TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を提示するリンパ球またはリンパ腫細胞はT細胞であることが最も典型的であるが、がんは、非疾患発現パターンにおいて多くの崩壊を引き起こす。したがって、一部の実施形態では、リンパ腫細胞またはリンパ球はT細胞でなくてもよい。一部の実施形態では、リンパ腫細胞またはリンパ球はB細胞である。一部の実施形態では、リンパ腫細胞またはリンパ球はナチュラルキラー細胞である。
[00238]一部の実施形態では、抗原結合性ドメイン(例えば、第1の抗原結合性ドメイン)は、当該技術分野において公知の抗TRBC1抗体の任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、CDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列はJOVI.1から選択される。
TRBC1抗原結合性ドメイン
[00239]一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表2、表6または表3に開示される1つまたは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表2、表6または表3に開示される1つまたは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表4に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表5に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00239]一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表2、表6または表3に開示される1つまたは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表2、表6または表3に開示される1つまたは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表4に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表5に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00240]一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表3Aおよび/または3Bに開示される1つ以上のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表3Aおよび/または3Bに開示される1つまたは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、表4に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00241]一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含む。
[00242]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7346、7355、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7346、201、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7354、201、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7354、7355、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00243]一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00244]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7346、7355、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7346、201、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7346、7355、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、7355、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、7355、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、7355、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);またはそれぞれ、配列番号7354、7355、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは、99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00245]一部の実施形態では、VHは、配列番号7351、253、250~252、254、7343、7344、7350、および7352(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、および/またはVLは、配列番号258、255~257、259、260、および7357~7360(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7351および258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号253および258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00246]一部の実施形態では、リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に結合する抗原結合性ドメイン(例えば、第1の抗原結合性ドメイン)、例えば、TRBC1を含むT細胞受容体、TRBC1、TRBC2を含むT細胞受容体、またはTRBC2は、任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列表2、3、3A、3B、4、5、または6を含む。一部の実施形態では、リンパ腫細胞(例えば、T細胞)、例えば、TRBC1を含むT細胞受容体、TRBC1、TRBC2を含むT細胞受容体、またはTRBC2上の腫瘍抗原に結合する抗原結合性ドメイン(例えば、第1の抗原結合性ドメイン)は、表5の重鎖および/または軽鎖アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメイン(例えば、第1の抗原結合性ドメイン)であって、TRBC1を含むT細胞受容体、TRBC1、TRBC2を含むT細胞受容体、またはTRBC2を発現するリンパ球を選択的に標的とする抗原結合性ドメインは、表2、3、3A、3B、4、5または6に開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1を含むT細胞受容体、TRBC1、TRBC2を含むT細胞受容体、またはTRBC2を発現するリンパ球を選択的に標的とする抗原結合性ドメイン(例えば、第1の抗原結合性ドメイン)は、表5の重鎖および/または軽鎖アミノ酸配列を含む。TRBC1を含む腫瘍抗原に結合するか、またはTRBC1を発現するリンパ球を選択的に標的とする抗原結合性ドメインは、TRBC1を標的とする(すなわち、TRBC1標的化抗原結合性ドメイン)と言うことができる。TRBC2を含む腫瘍抗原に結合するか、またはTRBC2を発現するリンパ球を選択的に標的とする抗原結合性ドメインは、TRBC2を標的とする(すなわち、TRBC2標的化抗原結合性ドメイン)と言うことができる。
[00247]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号200の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号201のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号202のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、TRBC1抗原結合性ドメインは、配列番号200のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号201のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号202のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00248]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号223の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号224のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号225のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号223のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号224のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号225のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00249]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号203の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号204のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号205のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号206のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00250]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号226の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号227のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号228のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号229のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00251]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号203のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号204のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号205のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号206のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00252]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号226のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号227のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号228のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号229のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00253]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号207の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号208のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号209のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号210のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00254]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号207のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号208のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号209のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号210のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00255]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号211の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号212のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号213のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号214のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00256]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号211のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号212のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号213のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号214のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00257]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号215の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号216のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号217のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号218のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00258]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号215のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号216のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号217のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号218のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00259]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号219の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号220のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号221のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号222のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00260]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号219のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号220のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号221のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号222のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00261]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号230の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号231のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号232のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号233のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00262]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号230のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号231のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号232のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号233のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00263]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号234の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号235のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号236のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号237のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00264]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号234のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号235のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号236のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号237のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00265]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号239のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号240のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号241のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00266]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号238のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号239のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号240のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号241のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00267]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号242の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号243のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号244のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号245のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00268]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号242のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号243のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号244のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号245のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00269]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号246の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号247のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号248のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号249のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00270]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号246のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号247のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号248のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号249のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00271]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号250のアミノ酸配列(または配列番号250に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号255のアミノ酸配列(または配列番号255に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号255のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00272]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号255のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00273]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号251のアミノ酸配列(または配列番号251に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号251のアミノ酸配列を含むVHを含む。
[00274]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号252のアミノ酸配列(または配列番号252に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号252のアミノ酸配列を含むVHを含む。
[00275]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号253のアミノ酸配列(または配列番号253に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号253のアミノ酸配列を含むVHを含む。
[00276]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号254のアミノ酸配列(または配列番号254に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号254のアミノ酸配列を含むVHを含む。
[00277]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号256のアミノ酸配列(または配列番号256に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号256のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00278]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号257のアミノ酸配列(または配列番号257に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号257のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00279]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号258のアミノ酸配列(または配列番号258に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号258のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00280]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号259のアミノ酸配列(または配列番号259に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号259のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00281]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号260のアミノ酸配列(または配列番号260対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号260のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00282]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6154のアミノ酸配列(または配列番号6154に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6154のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
[00283]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6155のアミノ酸配列(または配列番号6155に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6155のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
[00284]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6156のアミノ酸配列(または配列番号6156に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6156のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
[00285]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6167のアミノ酸配列(または配列番号6167に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6167のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
[00286]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6168のアミノ酸配列(または配列番号6168に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6168のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
[00287]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6169のアミノ酸配列(または配列番号6169に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6169のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
[00288]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6154のアミノ酸配列(または配列番号6154に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および配列番号6156のアミノ酸配列(または配列番号6156に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6154のアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号6156のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
[00289]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6155のアミノ酸配列(または配列番号6155に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および配列番号6156のアミノ酸配列(または配列番号6156に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6155のアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号6156のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
[00290]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6167のアミノ酸配列(または配列番号6167に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および配列番号6169のアミノ酸配列(または配列番号6169に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6167のアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号6169のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
[00291]一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6168のアミノ酸配列(または配列番号6168に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および配列番号6169のアミノ酸配列(または配列番号6169に対して少なくとも約93%、95%、または99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6168のアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号6169のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
[00292]一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインは、表21または表22に開示される1つもしくは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインは、表21もしくは表22に開示される1つまたは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインは、表23に開示されるVHおよび/またはVL、あるいはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインは、表24に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列を含む。
[00293]一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含む。
[00294]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7441、201、および7442のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7422、201、および7403のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7401、201、および7403のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7394、201、および7396のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7346、201、および7398のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7346、201、および7400のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7405、201、および7403のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7407、201、および7403のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7427、201、および7403のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7430、201、および7403のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。
[00295]一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7443、224、および225のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7410、224、および225のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7409、224、および225のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。
[00296]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7441、201、7442、7443、224、および225のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7422、201、7403、7410、224、および225のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7401、201、7403、7410、224、および225のアミノ酸配列(またはそれと、少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7394、201、7396、7410、224、および225のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7398、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7400、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7405、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7407、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7427、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7430、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7422、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7401、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7394、201、7396、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7398、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7400、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7405、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7407、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7427、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列);あるいはそれぞれ、配列番号7430、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00297]一部の実施形態では、VHは、配列番号7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428、および7431からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/あるいはVLは、配列番号7419および7418からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7420および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7423および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7411および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7412および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7413および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7414および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7415および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7416および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7417および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7425および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7428および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7431および7419のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7420および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7423および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7411および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7412および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7413および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7414および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7415および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7416および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7417および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7425および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7428および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7431および7418のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。
[00298]一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインは、配列番号7433、7434、7435、7436、および7437からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、または99%の同一性を有する配列)を含む。
[00299]一部の実施形態では、本開示は、TRBC1およびNKp30に結合する多機能性抗体分子を特徴とする。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は図29A~29Dのいずれかに示される構成を含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は抗TRBC1 Fabを含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は抗TRBC1 scFvを含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は抗NKp30 Fabを含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、抗TRBC1 scFvを含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、抗NKp30 Fabを含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、抗TRBC1 Fabおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図29Aに示される構成を含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、抗TRBC1 Fabおよび抗NKp30 Fabを含み、例えば、図29Bに示される構成を含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、抗NKp30 Fabおよび抗TRBC1 scFvを含み、例えば、図29Cに示される構成を含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、抗TRBC1 scFvおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図29Dに示される構成を含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、本明細書に開示される抗TRBC1抗原結合性ドメイン、例えば、表2、3、3A、3B、4、5または6に開示される抗TRBC1抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、本明細書に開示される抗NKp30抗原結合性ドメイン、例えば、表7、8、8A、8B、9、10および18に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインを含む。
[00300]一部の実施形態では、TRBC1およびNKp30に結合する例示的な多機能性抗体分子は表19に開示される。
[00301]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VLを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7311(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号7382、7380、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00302]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VLを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7311(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号7379、7380、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00303]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VLを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号7382、7380、および7384(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00304]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VLを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1/NKp30抗体分子は、配列番号7379、7380、および7384(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00306]一部の実施形態では、TRBC2およびNKp30に結合する例示的な多機能性抗体分子が表25に開示される。
[00307]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7438、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00308]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7440、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00309]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7305の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7310の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7438、7439、および7384(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00310]一部の実施形態では、多機能性抗体分子は、配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7305の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7310の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、抗TRBC2/NKp30抗体分子は、配列番号7440、7439、および7384(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00311]一部の実施形態では、本明細書に開示される多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は、例えば、本明細書に記載されるFc領域を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、野生型Fc領域、例えば、野生型ヒトFc領域である。一部の実施形態では、Fc領域は、バリアント、例えば、Fc領域において少なくとも1個のアミノ酸残基の付加、置換または欠失を含むFc領域を含み、これは、例えば、少なくとも1つのFc受容体に対する親和性の低減または除去をもたらす。
[00312]抗体のFc領域は、Fc受容体(例えば、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIIA)、補体タンパク質CIq、およびプロテインAおよびGなどの他の分子を含むいくつかの受容体またはリガンドと相互作用する。これらの相互作用は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞性ファゴサイトーシス(ADCP)および補体依存性細胞傷害(CDC)を含む様々なエフェクター機能および下流シグナル伝達事象にとって必須である。
[00313]一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は、Fc受容体、例えば、本明細書に記載されるFc受容体に対する親和性が低減、例えば、除去されている。一部の実施形態では、低減された親和性は、野生型Fc領域とその他は類似の抗体と比較される。
[00314]一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は以下の特性のうちの1つまたは複数を有する:(1)低減したエフェクター機能(例えば、低減したADCC、ADCPおよび/またはCDC);(2)1つもしくは複数のFc受容体への低減した結合;および/または(3)C1q補体への低減した結合。一部の実施形態では、特性(1)~(3)のうちのいずれか1つ、またはすべての低減は、野生型Fc領域とその他は類似の抗体と比較される。
[00315]一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は、ヒトFc受容体、例えば、FcγR I、FcγR IIおよび/またはFcγR IIIへの親和性が低減している。一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は、ヒトIgG1領域またはヒトIgG4領域を含む。
[00316]例示的なFc領域バリアントは表20に提供され、Saunders O、(2019) Frontiers in Immunology;vol 10、article 1296にも開示されており、その全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
[00317]一部の実施形態では、多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は、Fc領域バリアント、例えば、表20に開示される突然変異のいずれか1つもしくはすべて、または任意の組合せを含む。一部の実施形態では、多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は、Asn297Ala(N297A)突然変異を含む。一部の実施形態では、多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体分子または抗TRBC2/NKp30抗体分子)は、Leu234Ala/Leu235Ala(LALA)突然変異を含む。
[00319]一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗体分子またはその断片は、表2、表6、もしくは表3に開示される1つもしくは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗体分子またはその断片は、表2、表6、もしくは表3に開示される1つもしくは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗体分子、またはその断片は、表4に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗体分子、またはその断片は、表5に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00320]一部の実施形態では、TRBC1に結合する抗体分子、またはその断片は、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含む。
[00321]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7346、7355、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7346、201、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7354、201、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7354、7355、および202(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00322]一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00323]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7346、7355、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7346、201、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7346、7355、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、7355、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、7355、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、7355、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、201、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、223、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、7367、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、223、7368、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7354、7355、202、223、224、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);またはそれぞれ、配列番号7354、7355、202、7367、7368、および7369(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00324]一部の実施形態では、VHは、配列番号7351、253、250~252、254、7343、7344、7350、および7352(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、ならびに/またはVLは、配列番号258、255~257、259、260、および7357~7360(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7351および258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号253および258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00325]一部の実施形態では、抗体分子またはその断片は、
配列番号215の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号216のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号217のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号218のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
配列番号238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号239のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号240のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号241のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
配列番号215の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号216のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号217のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号218のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
配列番号238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号239のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号240のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号241のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[00326]一部の実施形態では、抗体分子またはその断片は、配列番号200のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号201のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号202のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00327]一部の実施形態では、抗体分子またはその断片は、配列番号223のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号224のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号225のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00328]一部の実施形態では、抗体分子またはその断片は、配列番号253のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または配列番号258のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、抗体分子またはその断片は、配列番号253および/または258と実質的に相同であるVHおよび/またはVLを含む。
TRBC2を標的とする抗体分子
[00329]別の態様では、本開示は、抗体分子、例えば、TRBC2に結合するモノクローナル抗体分子、またはその断片を特徴とする。
[00329]別の態様では、本開示は、抗体分子、例えば、TRBC2に結合するモノクローナル抗体分子、またはその断片を特徴とする。
[00330]一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子、またはその断片は、表21もしくは表22に開示される1つもしくは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子、またはその断片は、表21もしくは表22に開示される1つもしくは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子、またはその断片は、表23に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子、またはその断片は、表24に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00331]一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子、またはその断片は、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含む。
[00332]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7441、201、および7442(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7422、201、および7403(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7401、201、および7403(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7394、201、および7396(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7346、201、および7398(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7346、201、および7400(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7405、201、および7403(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7407、201、および7403(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7427、201、および7403(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7430、201、および7403(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00333]一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7443、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00334]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7441、201、7442、7443、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7422、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7401、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7349、201、7396、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7398、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7400、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7405、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7407、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7427、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7430、201、7403、7410、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7422、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7401、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7394、201、7396、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7398、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7346、201、7400、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7405、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7407、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ、配列番号7427、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列);またはそれぞれ、配列番号7430、201、7403、7409、224、および225(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00335]一部の実施形態では、VHは、配列番号7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428、および7431(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、ならびに/またはVLは、配列番号7419および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7420および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7423および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7411および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7412および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7413および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7414および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7415および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7416および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7417および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7425および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7428および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7431および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7420および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7423および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7411および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7412および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7413および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7414および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7415および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7416および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7417および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7425および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7428および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7431および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00336]別の態様では、本開示は、(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に選択的に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および(ii)例えば、C1qに結合することによって、補体経路を活性化する補体活性化ドメインを含む抗体分子、例えば、IgM抗体分子を特徴とする。一部の実施形態では、抗体分子、例えば、IgM抗体分子は、TRBC1を標的とする抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、抗体分子は、例えば、四量体、五量体、および/または六量体に多量体化し、補体経路を活性化することができるIgM抗体分子である。一部の実施形態では、IgM抗体分子は、配列番号6173のアミノ酸配列(または配列番号6173と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含むTRBC1を標的とする抗原結合性ドメインを含む。
METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTGYVMHWVRQAPGQGLEWMGFINPYNDDIQSNERFRGRVTITSDKSTTTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGAGYNFDGAYRFFDFWGQGTLVTVSSGSASAPTLFPLVSCENSPSDTSSVAVGCLAQDFLPDSITFSWKYKNNSDISSTRGFPSVLRGGKYAATSQVLLPSKDVMQGTDEHVVCKVQHPNGNKEKNVPLPVIAELPPKVSVFVPPRDGFFGNPRKSKLICQATGFSPRQIQVSWLREGKQVGSGVTTDQVQAEAKESGPTTYKVTSTLTIKESDWLGQSMFTCRVDHRGLTFQQNASSMCVPDQDTAIRVFAIPPSFASIFLTKSTKLTCLVTDLTTYDSVTISWTRQNGEAVKTHTNISESHPNATFSAVGEASICEDDWNSGERFTCTVTHTDLPSPLKQTISRPKGVALHRPDVYLLPPAREQLNLRESATITCLVTGFSPADVFVQWMQRGQPLSPEKYVTSAPMPEPQAPGRYFAHSILTVSEEEWNTGETYTCVVAHEALPNRVTERTVDKSTGKPTLYNVSLVMSDTAGTCY(配列番号6173)。
METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTGYVMHWVRQAPGQGLEWMGFINPYNDDIQSNERFRGRVTITSDKSTTTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGAGYNFDGAYRFFDFWGQGTLVTVSSGSASAPTLFPLVSCENSPSDTSSVAVGCLAQDFLPDSITFSWKYKNNSDISSTRGFPSVLRGGKYAATSQVLLPSKDVMQGTDEHVVCKVQHPNGNKEKNVPLPVIAELPPKVSVFVPPRDGFFGNPRKSKLICQATGFSPRQIQVSWLREGKQVGSGVTTDQVQAEAKESGPTTYKVTSTLTIKESDWLGQSMFTCRVDHRGLTFQQNASSMCVPDQDTAIRVFAIPPSFASIFLTKSTKLTCLVTDLTTYDSVTISWTRQNGEAVKTHTNISESHPNATFSAVGEASICEDDWNSGERFTCTVTHTDLPSPLKQTISRPKGVALHRPDVYLLPPAREQLNLRESATITCLVTGFSPADVFVQWMQRGQPLSPEKYVTSAPMPEPQAPGRYFAHSILTVSEEEWNTGETYTCVVAHEALPNRVTERTVDKSTGKPTLYNVSLVMSDTAGTCY(配列番号6173)。
[00337]一部の実施形態では、IgM抗体分子は、配列番号6174のアミノ酸配列(または配列番号6174と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含むTRBC1を標的とする抗原結合性ドメインを含む。
[00338]MKNHLLFWGVLAVFIKAVHVKAQEDERIVLVDNKCKCARITSRIIRSSEDPNEDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTRFVYHLSDLCKKCDPTEVELDNQIVTATQSNICDEDSATETCYTYDRNKCYTAVVPLVYGGETKMVETALTPDACYPD(配列番号6174)。
[00339]一部の実施形態では、IgM抗体分子は、配列番号6173および6174のアミノ酸配列(または配列番号6173および6174と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)ならびに本明細書、例えば、表3または表4に提供される軽鎖配列のアミノ酸配列を含むTRBC1を標的とする抗原結合性ドメインを含む。
[00340]一部の実施形態では、補体活性化ドメインは、C1q、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、またはIgEの一部に結合し得るか、またはそれらによって結合され得る抗体分子の一部を含む。一部の実施形態では、補体活性化ドメインは、Ch2、Ch3、またはCh4ドメインを含む。
[00341]理論に拘泥するものではないが、標的細胞(例えば、TRBC1またはTRBC2発現細胞、例えば、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ球、例えば、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ腫細胞)に近接する補体活性化が標的細胞死を誘導し得ると考えられる。一部の実施形態では、本明細書に記載される方法における抗体分子、例えば、IgM抗体分子、または多機能性分子の使用は、標的細胞の補体媒介性細胞死を誘導する。
[00342]別の態様では、本開示は、TRBC1およびNKp30に結合する多特異性抗体分子(例えば、二特異性抗体分子)を特徴とする。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、TRBC1に結合する1つまたは複数の部分、例えば、TRBC1に結合する1つまたは複数のFab、例えば、TRBC1に結合する1つまたは2つのFabを含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、NKp30に結合する1つまたは複数の部分、例えば、NKp30に結合する1つまたは複数のscFv、例えば、NKp30に結合する1つまたは2つのscFvを含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する部分は、本明細書に開示される抗TRBC1配列を含み、例えば、表2~5に開示されるCDR、VH、VL、重鎖、もしくは軽鎖配列、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する部分は、本明細書に開示される抗NKp30配列を含み、例えば、表7、8、8A、8B、9、10に開示されるCDR、VH、VL、重鎖、もしくは軽鎖配列、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00343]一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、図1Aに示される構成を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗TRBC1抗体分子および抗NKp30抗体分子、例えば、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む抗TRBC1抗体分子、ならびに抗TRBC1抗体の重鎖の1つのN末端に融合している抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖は、例えば、ノブ・アンド・ホール(「knob-and-hole」)突然変異によってヘテロ二量体を形成する。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含まない。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、第1の鎖、第2の鎖、第3の鎖、および第4の鎖を含み、第1の鎖は、抗TRBC1軽鎖可変領域(VL)および軽鎖定常領域(CL)を含み、第2の鎖は、抗NKp30 scFv、抗TRBC1重鎖可変領域(VH)、CH1、CH2、およびCH3を含み、第3の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、第4の鎖は、抗TRBC1 VLおよびCLを含む。
[00344]一部の実施形態では、多特異性抗体分子は図1Bに示される構成を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗TRBC1抗体分子および抗NKp30抗体分子を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗TRBC1 Fab、抗NKp30 scFv、および2つのFc鎖を含むFc二量体を含む。一部の実施形態では、抗TRBC1 Fabの重鎖のC末端は一方のFc鎖のN末端に融合し、抗NKp30 scFvは他方のFc鎖のN末端に融合している。一部の実施形態では、2つのFc鎖は、例えば、ノブ・アンド・ホール突然変異によってヘテロ二量体を形成する。一部の実施形態では、2つのFc鎖はN297A突然変異を含む。一部の実施形態では、2つのFc鎖はN297A突然変異を含まない。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、第1の鎖、第2の鎖、および第3の鎖を含み、第1の鎖は、抗TRBC1 VLおよびCLを含み、第2の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、第3の鎖は、抗NKp30 scFv、CH2、およびCH3を含む。
[00345]一部の実施形態では、多特異性抗体分子は図1Cに示される構成を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗TRBC1抗体分子および抗NKp30抗体分子、例えば、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む抗TRBC1抗体分子、ならびに抗TRBC1抗体分子の2つの軽鎖のC末端にそれぞれ融合している2つの抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はホモ二量体を形成する。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含まない。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、第1の鎖、第2の鎖、第3の鎖、および第4の鎖を含み、第1の鎖は、抗TRBC1 VL、CL、および抗NKp30 scFvを含み、第2の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、第3の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、第4の鎖は、抗TRBC1 VL、CL、および抗NKp30 scFvを含む。
[00346]一部の実施形態では、多特異性抗体分子は図1Dに示される構成を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗TRBC1抗体分子および抗NKp30抗体分子、例えば、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む抗TRBC1抗体分子、ならびに抗TRBC1抗体分子の2つの重鎖のN末端にそれぞれ融合している2つの抗NKp30 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はホモ二量体を形成する。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含まない。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、第1の鎖、第2の鎖、第3の鎖、および第4の鎖を含み、第1の鎖は、抗TRBC1 VLおよびCLを含み、第2の鎖は、抗NKp30 scFv、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、第3の鎖は、抗NKp30 scFv、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、第4の鎖は、抗TRBC1 VLおよびCLを含む。
[00347]別の態様では、本開示は、TRBC1に結合する部分およびTRAIL分子(例えば、三量体、二量体、または単量体TRAIL分子)を含む抗体分子を特徴とする。一部の実施形態では、抗体分子は、TRBC1に結合する1つまたは複数の部分、例えば、TRBC1に結合する1つまたは複数のFab、例えば、TRBC1に結合する1つのFabを含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する部分は、本明細書に開示される抗TRBC1配列を含み、例えば、表2~5に開示されるCDR、VH、VL、重鎖、もしくは軽鎖配列、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体分子は、TRAIL分子(例えば、三量体、二量体、または単量体TRAIL分子)を含む。一部の実施形態では、TRAILの各単量体は、ヒトTRAILのアミノ酸残基122~281、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRAILの各単量体は、ヒトTRAILのアミノ酸残基95~281、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00348]一部の実施形態では、抗体分子は図2A~2Fに示される構成を含む。一部の実施形態では、抗体分子は、TRBC1に結合する部分および三量体、二量体、または単量体TRAILを含み、例えば、抗TRBC1 Fab、三量体、二量体、または単量体TRAIL分子、ならびに2つのFc鎖を含むFc二量体を含む。一部の実施形態では、2つのFc鎖は、例えば、ノブ・アンド・ホールド(knob-and-hold)突然変異によってヘテロ二量体を形成する。一部の実施形態では、2つのFc鎖はN297A突然変異を含む。一部の実施形態では、2つのFc鎖はN297A突然変異を含まない。一部の実施形態では、抗TRBC1 Fabの重鎖のC末端は、一方のFc鎖のN末端に融合している。一部の実施形態では、三量体、二量体、または単量体TRAIL分子は、他方のFc鎖のN末端に融合している。一部の実施形態では、抗体分子は、第1の鎖、第2の鎖、および第3の鎖を含む。一部の実施形態では、第1の鎖は、抗TRBC1 VLおよびCLを含み、例えば、配列番号6169、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6167、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第3の鎖は、三量体TRAIL分子、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6159もしくは6162、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第3の鎖は、二量体TRAIL分子、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6158もしくは6161、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第3の鎖は、単量体TRAIL分子、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6157もしくは6160、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。
[00349]別の態様では、本開示は、TRBC1およびDR5に結合する多特異性抗体分子(例えば、二特異性抗体分子)を特徴とする。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、TRBC1に結合する1つまたは複数の部分、例えば、TRBC1に結合する1つまたは複数のFab、例えば、TRBC1に結合する1つのFabを含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、DR5に結合する1つまたは複数の部分、例えば、DR5に結合する1つまたは複数のscFv、例えば、DR5に結合する1つまたは2つのscFvを含む。一部の実施形態では、TRBC1に結合する部分は、本明細書に開示される抗TRBC1配列を含み、例えば、表2~5に開示されるCDR、VH、VL、重鎖、もしくは軽鎖配列、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、DR5に結合する部分は、本明細書に開示される抗DR5配列を含み、例えば、表11に開示されるCDR、VH、VL、重鎖、もしくは軽鎖配列、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00350]一部の実施形態では、多特異性抗体分子は図3Aに示される構成を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗TRBC1 Fab、抗DR5 scFv、および2つのFc鎖を含むFc二量体を含む。一部の実施形態では、2つのFc鎖は、例えば、ノブ・アンド・ホールド突然変異によってヘテロ二量体を形成する。一部の実施形態では、2つのFc鎖はN297A突然変異を含む。一部の実施形態では、2つのFc鎖はN297A突然変異を含まない。一部の実施形態では、抗TRBC1 Fabの重鎖のC末端は、一方のFc鎖のN末端に融合している。一部の実施形態では、抗DR5 scFvは、他方のFc鎖のN末端に融合している。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、第1の鎖、第2の鎖、および第3の鎖を含む。一部の実施形態では、第1の鎖は、抗TRBC1 VLおよびCLを含み、例えば、配列番号6169、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6167、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第3の鎖は、抗DR5、scFv、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6163、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。
[00351]一部の実施形態では、多特異性抗体分子は図3Bに示される構成を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗TRBC1抗体分子および抗DR5抗体分子、例えば、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む抗TRBC1抗体分子、ならびに抗TRBC1抗体の2つの軽鎖のC末端にそれぞれ融合している2つの抗DR5 scFvを含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含む。一部の実施形態では、抗TRBC1抗体の2つの重鎖はN297A突然変異を含まない。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、第1の鎖、第2の鎖、第3の鎖、および第4の鎖を含む。一部の実施形態では、第1の鎖は、抗TRBC1 VL、CL、および抗DR5 scFvを含み、例えば、配列番号6170、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6168、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第4の鎖は、抗TRBC1 VH、CH1、CH2、およびCH3を含み、例えば、配列番号6168、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第1の鎖は、抗TRBC1 VL、CL、および抗DR5 scFvを含み、例えば、配列番号6170、またはそれと少なくとも70、80、90、95、もしくは99%の同一性を有する配列のアミノ酸配列を含む。
[00352]本明細書に開示される抗体分子の使用には、本明細書に開示されるがん(例えば、TRBC1を発現するがん)を処置する方法、本明細書に開示される処置を必要とする対象を同定、評価、または選択する(例えば、対象がTRBC1を発現するがん細胞を有するかどうかを決定する)方法、および実験室または診断分析方法(例えば、TRBC1またはTRBC1発現細胞の存在および/またはレベルを検出することを含む免疫学的アッセイ)が挙げられるが、これらに限定されない。
サイトカイン分子およびサイトカイン阻害剤分子
[00353]サイトカインは、一般に、例えば、シグナル伝達経路を通じて、細胞活性に影響を及ぼすポリペプチドである。よって、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは有用であり、細胞膜の外側からシグナルを伝達して細胞内の応答をモジュレートする受容体媒介性のシグナル伝達と関連付けられ得る。サイトカインは、免疫応答のメディエーターであるタンパク質性のシグナル伝達化合物である。それらは、増殖、分化および細胞生存/アポトーシスを含む多くの異なる細胞機能を制御し、サイトカインはまた、ウイルス感染症および自己免疫疾患を含むいくつかの病態生理学的プロセスに関与する。サイトカインは、自然免疫系(単球、マクロファージ、樹状細胞)ならびに適応免疫系(TおよびB細胞)の両方の様々な細胞によって様々な刺激下で合成される。サイトカインは、炎症促進性および抗炎症性の2つの群に分類することができる。IFNγ、IL-1、IL-6およびTNF-アルファを含む炎症促進性サイトカインは、主に、自然免疫細胞およびTh1細胞に由来する。IL-10、IL-4、IL-13およびIL-5を含む抗炎症性サイトカインは、Th2免疫細胞から合成される。
[00353]サイトカインは、一般に、例えば、シグナル伝達経路を通じて、細胞活性に影響を及ぼすポリペプチドである。よって、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは有用であり、細胞膜の外側からシグナルを伝達して細胞内の応答をモジュレートする受容体媒介性のシグナル伝達と関連付けられ得る。サイトカインは、免疫応答のメディエーターであるタンパク質性のシグナル伝達化合物である。それらは、増殖、分化および細胞生存/アポトーシスを含む多くの異なる細胞機能を制御し、サイトカインはまた、ウイルス感染症および自己免疫疾患を含むいくつかの病態生理学的プロセスに関与する。サイトカインは、自然免疫系(単球、マクロファージ、樹状細胞)ならびに適応免疫系(TおよびB細胞)の両方の様々な細胞によって様々な刺激下で合成される。サイトカインは、炎症促進性および抗炎症性の2つの群に分類することができる。IFNγ、IL-1、IL-6およびTNF-アルファを含む炎症促進性サイトカインは、主に、自然免疫細胞およびTh1細胞に由来する。IL-10、IL-4、IL-13およびIL-5を含む抗炎症性サイトカインは、Th2免疫細胞から合成される。
[00354]本開示は、とりわけ、1つまたは複数のサイトカイン分子、例えば、免疫調節性(例えば、炎症促進性)サイトカインおよびそのバリアント、例えば、機能的バリアントを含む、例えば、それを含有するように操作された多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。したがって、一部の実施形態では、サイトカイン分子は、インターロイキンまたはバリアント、例えば、その機能的バリアントである。一部の実施形態では、インターロイキンは炎症促進性インターロイキンである。一部の実施形態では、インターロイキンは、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、インターロイキン-7(IL-7)、またはインターフェロンガンマから選択される。一部の実施形態では、サイトカイン分子は炎症促進性サイトカインである。
[00355]ある特定の実施形態では、サイトカインは一本鎖サイトカインである。ある特定の実施形態では、サイトカインは、多鎖サイトカインである(例えば、サイトカインは、2つまたはより多くの(例えば、2つの)ポリペプチド鎖を含む。例示的な多鎖サイトカインはIL-12である。
[00356]有用なサイトカインの例には、GM-CSF、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-21、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1β、TGF-β、TNF-α、およびTNFβが挙げられるが、これらに限定されない。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは、GM-CSF、IL-2、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-15、IL-21、IFN-α、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1βおよびTGF-βの群から選択されるサイトカインである。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IFN-α、およびIFN-γの群から選択されるサイトカインである。ある特定の実施形態では、サイトカインは、N-および/またはO-グリコシル化部位を除去するように突然変異される。グリコシル化の排除は、組換え産生において得られ得る製造物の均質性を増加させる。
[00357]一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-2である。詳細な実施形態では、IL-2サイトカインは、活性化Tリンパ球細胞の増殖、活性化Tリンパ球細胞の分化、細胞傷害性T細胞(CTL)活性、活性化B細胞の増殖、活性化B細胞の分化、ナチュラルキラー(NK)細胞の増殖、NK細胞の分化、活性化T細胞またはNK細胞によるサイトカイン分泌、およびNK/リンパ球活性化キラー(LAK)抗腫瘍細胞傷害性からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。別の特定の実施形態では、IL-2サイトカインは、IL-2受容体のアルファ-サブユニットに対して低減した結合親和性を有する突然変異体IL-2サイトカインである。ベータ-およびガンマ-サブユニット(それぞれ、CD122およびCD132としても公知)と一緒に、アルファ-サブユニット(CD25としても公知)はヘテロ三量体高親和性IL-2受容体を形成するが、β-およびγ-サブユニットのみからなる二量体受容体は中親和性IL-2受容体と呼ばれる。PCT特許出願番号PCT/EP2012/051991(これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるように、IL-2受容体のアルファ-サブユニットに対して低減した結合を有する突然変異体IL-2ポリペプチドは、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、制御性T細胞中でIL-2シグナル伝達を誘導する低減した能力を有し、T細胞中でより少ない活性化誘導性細胞死(AICD)を誘導し、かつin vivoでの低減した毒性プロファイルを有する。低減した毒性を有するそのようなサイトカインの使用は、Fcドメインの存在に起因して長い血清半減期を有する本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドにおいて特に有利である。一実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドの突然変異体IL-2サイトカインは、IL-2受容体のアルファ-サブユニット(CD25)に対する突然変異体IL-2サイトカインの親和性を低減しまたは消失させるが、突然変異していないIL-2サイトカインと比較して、中親和性IL-2受容体(IL-2受容体のβおよびγサブユニットからなる)に対する突然変異体IL-2サイトカインの親和性を保存する少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸突然変異はアミノ酸置換である。詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基42、45、および72に対応する位置から選択される1つ、2つまたは3つの位置における1つ、2つまたは3つのアミノ酸置換を含む。より詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基42、45および72に対応する位置における3つのアミノ酸置換を含む。よりいっそう詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、アミノ酸置換F42A、Y45AおよびL72Gを含むヒトIL-2である。一実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の3位に対応する位置におけるアミノ酸突然変異を追加的に含み、これはIL-2のO-グリコシル化部位を排除する。特に、前記追加のアミノ酸突然変異は、スレオニン残基をアラニン残基によって置き換えるアミノ酸置換である。本発明において有用な特定の突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基3、42、45および72に対応する位置における4つのアミノ酸置換を含む。特定のアミノ酸置換は、T3A、F42A、Y45AおよびL72Gである。PCT特許出願番号PCT/EP2012/051991および付加された実施例において実証されるように、前記四重突然変異体IL-2ポリペプチド(IL-2 qm)は、CD25への検出可能な結合を呈さず、T細胞においてアポトーシスを誘導する低減した能力を呈し、制御性T細胞(T.sub.reg cells)においてIL-2シグナル伝達を誘導する低減した能力を呈し、かつin vivoでの低減した毒性プロファイルを呈する。しかしながら、それは、エフェクター細胞においてIL-2シグナル伝達を活性化させ、エフェクター細胞の増殖を誘導し、かつNK細胞により二次的なサイトカインとしてIFN-γを生成させる能力を保持する。
[00358]上記の実施形態のいずれかによるIL-2または突然変異体IL-2サイトカインは、発現または安定性の増加などのさらなる利点を提供する追加の突然変異を含んでもよい。例えば、125位におけるシステインは、ジスルフィド架橋によるIL-2二量体の形成を回避するために、アラニンなどの中性アミノ酸で置き換えられてもよい。そのため、ある特定の実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2または突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基125に対応する位置における追加のアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、前記追加のアミノ酸突然変異はアミノ酸置換C125Aである。
[00359]詳細な実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号7227
[APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。別の詳細な実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号7228[APASSSTKKT QLQLEHLLLD LQMILNGINN YKNPKLTRMLTAKFAMPKKATELKHLQCLE EELKPLEEVLNGAQSKNFHL RPRDLISNIN VIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。
[APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。別の詳細な実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号7228[APASSSTKKT QLQLEHLLLD LQMILNGINN YKNPKLTRMLTAKFAMPKKATELKHLQCLE EELKPLEEVLNGAQSKNFHL RPRDLISNIN VIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。
[00360]別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-12である。詳細な実施形態では、前記IL-12サイトカインは一本鎖IL-12サイトカインである。さらにより詳細な実施形態では、一本鎖IL-12サイトカインは、配列番号7229
[IWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGGSGGGGSGGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-12サイトカインは、NK細胞の増殖、NK細胞の分化、T細胞の増殖、およびT細胞の分化からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[IWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGGSGGGGSGGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-12サイトカインは、NK細胞の増殖、NK細胞の分化、T細胞の増殖、およびT細胞の分化からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[00361]別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-10である。詳細な実施形態では、前記IL-10サイトカインは一本鎖IL-10サイトカインである。さらにより詳細な実施形態では、一本鎖IL-10サイトカインは、配列番号7230
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRNGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSSPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。別の詳細な実施形態では、IL-10サイトカインは単量体IL-10サイトカインである。より詳細な実施形態では、単量体IL-10サイトカインは、配列番号7231
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENGGGSGGKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-10サイトカインは、サイトカイン分泌の阻害、抗原提示細胞による抗原提示の阻害、酸素ラジカル放出の低減、およびT細胞増殖の阻害からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。サイトカインがIL-10である本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドは、例えば、炎症性障害の処置における、炎症の下方調節のために特に有用である。
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRNGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSSPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。別の詳細な実施形態では、IL-10サイトカインは単量体IL-10サイトカインである。より詳細な実施形態では、単量体IL-10サイトカインは、配列番号7231
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENGGGSGGKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-10サイトカインは、サイトカイン分泌の阻害、抗原提示細胞による抗原提示の阻害、酸素ラジカル放出の低減、およびT細胞増殖の阻害からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。サイトカインがIL-10である本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドは、例えば、炎症性障害の処置における、炎症の下方調節のために特に有用である。
[00362]別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-15である。詳細な実施形態では、前記IL-15サイトカインは、IL-15受容体のα-サブユニットに対して低減した結合親和性を有する突然変異体IL-15サイトカインである。理論に拘泥するものではないが、IL-15受容体のアルファ-サブユニットへの低減した結合を有する突然変異体IL-15ポリペプチドは、野生型IL-15ポリペプチドと比較して、身体の全体を通じて線維芽細胞に結合する低減した能力を有し、向上した薬物動態および毒性プロファイルをもたらす。記載される突然変異体IL-2および突然変異体IL-15エフェクター部分などの低減した毒性を有するサイトカインの使用は、Fcドメインの存在に起因して長い血清半減期を有する本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドにおいて特に有利である。一実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドの突然変異体IL-15サイトカインは、突然変異していないIL-15サイトカインと比較して、IL-15受容体のアルファ-サブユニットに対する突然変異体IL-15サイトカインの親和性を低減しまたは消失させるが、中親和性IL-15/IL-2受容体(IL-15/IL-2受容体のベータ-およびガンマ-サブユニットからなる)に対する突然変異体IL-15サイトカインの親和性を保存する少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、アミノ酸突然変異はアミノ酸置換である。詳細な実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、ヒトIL-15の残基53に対応する位置においてアミノ酸置換を含む。より詳細な実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、アミノ酸置換E53Aを含むヒトIL-15である。一実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、ヒトIL-15の79位に対応する位置においてアミノ酸突然変異を追加的に含み、これはIL-15のN-グリコシル化部位を排除する。特に、前記追加のアミノ酸突然変異は、アスパラギン残基をアラニン残基によって置き換えるアミノ酸置換である。さらにより詳細な実施形態では、IL-15サイトカインは、配列番号7232、[NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLASGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGAVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-15サイトカインは、活性化Tリンパ球細胞の増殖、活性化Tリンパ球細胞の分化、細胞傷害性T細胞(CTL)活性、活性化B細胞の増殖、活性化B細胞の分化、ナチュラルキラー(NK)細胞の増殖、NK細胞の分化、活性化T細胞またはNK細胞によるサイトカイン分泌、およびNK/リンパ球活性化キラー(LAK)抗腫瘍細胞傷害性からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[00363]多特異性または多機能性ポリペプチド中のエフェクター部分として有用な突然変異体サイトカイン分子は、当該技術分野において周知の遺伝学的または化学的方法を使用して欠失、置換、挿入または修飾によって調製することができる。遺伝学的方法は、コーディングDNA配列の部位特異的突然変異誘発、PCR、および遺伝子合成などを含んでもよい。正しいヌクレオチド変化は、例えばシークエンシングによって検証することができる。置換または挿入は、天然アミノ酸残基の他に非天然アミノ酸残基を伴ってもよい。アミノ酸修飾としては、グリコシル化部位の付加もしくは除去または炭水化物の取付けなどの化学修飾の周知の方法が挙げられる。
[00364]一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはGM-CSFである。詳細な実施形態では、GM-CSFサイトカインは、顆粒球、単球または樹状細胞において増殖および/または分化を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIFN-αである。詳細な実施形態では、IFN-αサイトカインは、ウイルス感染細胞におけるウイルス複製の阻害、および主要組織適合性複合体I(MHC I)の発現の上方制御からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。別の詳細な実施形態では、IFN-αサイトカインは、腫瘍細胞の増殖を阻害することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIFNγである。詳細な実施形態では、IFN-γサイトカインは、マクロファージ活性の増加、MHC分子の発現の増加、およびNK細胞活性の増加の群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIL-7である。詳細な実施形態では、IL-7サイトカインは、Tおよび/またはBリンパ球の増殖を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIL-8である。詳細な実施形態では、IL-8サイトカインは、好中球において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはMIP-1αである。詳細な実施形態では、MIP-1αサイトカインは、単球およびTリンパ球細胞において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインは、MIP-1βである。詳細な実施形態では、MIP-1βサイトカインは、単球およびTリンパ球細胞において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインは、TGF-βである。詳細な実施形態では、TGF-βサイトカインは、単球における走化性、マクロファージにおける走化性、活性化マクロファージにおけるIL-1発現の上方制御、および活性化B細胞におけるIgA発現の上方制御からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[00365]一実施形態では、本発明の多特異性または多機能性ポリペプチドは、対照サイトカインについてよりも少なくとも約1、1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5または10倍高い解離定数(KD)でサイトカイン受容体に結合する。別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドは、2つまたはより多くのエフェクター部分を含む対応する多特異性または多機能性ポリペプチドについてよりも少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、または10倍高いKDでサイトカイン受容体に結合する。別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドは、2つまたはより多くのサイトカインを含む対応する多特異性または多機能性ポリペプチドについてよりも約10倍高い解離定数KDでサイトカイン受容体に結合する。
[00366]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、サイトカイン分子を含む。実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカインの全長、断片もしくはバリアント;サイトカイン受容体ドメイン、例えば、サイトカイン受容体二量体化ドメイン;またはサイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、サイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)を含む。
[00367]一部の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-7、IL-21、もしくはインターフェロンガンマ、もしくはその断片もしくはバリアント、または上記のサイトカインの任意の組合せから選択される。サイトカイン分子は単量体であってもよいか、または二量体であってもよい。実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体二量体化ドメインをさらに含むことができる。
[00368]他の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、IL-15RaまたはIL-21Rから選択されるサイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)である。
[00369]一実施形態では、サイトカイン分子は、IL-15、例えば、ヒトIL-15である(例えば、アミノ酸配列:
NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(配列番号7017)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7017のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(配列番号7017)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7017のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00370]一部の実施形態では、サイトカイン分子は、受容体二量体化ドメイン、例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメインを含む。一実施形態では、IL15Rアルファ二量体化ドメインは、アミノ酸配列:
MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVL(配列番号7018)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7018のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、例えば、リンカー(例えば、Gly-Serリンカー、例えば、アミノ酸配列SGGSGGGGSGGGSGGGGSLQ(配列番号7019)を含むリンカーを介して共有結合的に連結されている。他の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合的に連結されておらず、例えば、非共有結合的に会合している。
MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVL(配列番号7018)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7018のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、例えば、リンカー(例えば、Gly-Serリンカー、例えば、アミノ酸配列SGGSGGGGSGGGSGGGGSLQ(配列番号7019)を含むリンカーを介して共有結合的に連結されている。他の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合的に連結されておらず、例えば、非共有結合的に会合している。
[00371]他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-2、例えば、ヒトIL-2である(例えば、アミノ酸配列:
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号7020)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7020のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号7020)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7020のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
[00372]他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-18、例えば、ヒトIL-18である(例えば、アミノ酸配列:YFGKLESKLSVIRNLNDQVLFIDQGNRPLFEDMTDSDCRDNAPRTIFIISMYKDSQPRGMAVTISVKCEKISTLSCENKIISFKEMNPPDNIKDTKSDIIFFQRSVPGHDNKMQFESSSYEGYFLACEKERDLFKLILKKEDELGDRSIMFTVQNED(配列番号7021)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7021のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
[00373]他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-21、例えば、ヒトIL-21である(例えば、アミノ酸配列:
QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS(配列番号7022)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7022のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS(配列番号7022)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7022のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
[00374]さらに他の実施形態では、サイトカイン分子は、インターフェロンガンマ、例えば、ヒトインターフェロンガンマである(例えば、アミノ酸配列:
QDPYVKEAENLKKYFNAGHSDVADNGTLFLGILKNWKEESDRKIMQSQIVSFYFKLFKNFKDDQSIQKSVETIKEDMNVKFFNSNKKKRDDFEKLTNYSVTDLNVQRKAIHELIQVMAELSPAAKTGKRKRSQMLFRG(配列番号7023)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7023のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
QDPYVKEAENLKKYFNAGHSDVADNGTLFLGILKNWKEESDRKIMQSQIVSFYFKLFKNFKDDQSIQKSVETIKEDMNVKFFNSNKKKRDDFEKLTNYSVTDLNVQRKAIHELIQVMAELSPAAKTGKRKRSQMLFRG(配列番号7023)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7023のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
TGF-ベータ阻害剤
[00375]本開示は、とりわけ、1つまたは複数のサイトカイン阻害剤分子、例えば、免疫調節(例えば、炎症性)サイトカインの阻害剤およびバリアント、例えば、その機能的バリアントを含む、例えば、それらを含有するように操作されている、多特異性(例えば、二特異性、三特異性、四特異性)または多機能性分子をさらに提供する。したがって、一部の実施形態では、サイトカイン阻害剤分子はTGF-ベータ阻害剤である。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGFベータに結合し、これを阻害する、例えば、TGF-ベータの活性を低減させる。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ1を阻害する(例えば、その活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ2を阻害する(例えば、その活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ3を阻害する(例えば、その活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ1およびTGF-ベータ3を阻害する(例えば、それらの活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ1、TGF-ベータ2、およびTGF-ベータ3を阻害する(例えば、それらの活性を低減させる)。
[00375]本開示は、とりわけ、1つまたは複数のサイトカイン阻害剤分子、例えば、免疫調節(例えば、炎症性)サイトカインの阻害剤およびバリアント、例えば、その機能的バリアントを含む、例えば、それらを含有するように操作されている、多特異性(例えば、二特異性、三特異性、四特異性)または多機能性分子をさらに提供する。したがって、一部の実施形態では、サイトカイン阻害剤分子はTGF-ベータ阻害剤である。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGFベータに結合し、これを阻害する、例えば、TGF-ベータの活性を低減させる。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ1を阻害する(例えば、その活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ2を阻害する(例えば、その活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ3を阻害する(例えば、その活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ1およびTGF-ベータ3を阻害する(例えば、それらの活性を低減させる)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGF-ベータ1、TGF-ベータ2、およびTGF-ベータ3を阻害する(例えば、それらの活性を低減させる)。
[00376]一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGF-ベータ、またはその機能的断片もしくはバリアントを阻害する(例えば、それらの活性を低減させる)ことができるTGF-ベータ受容体の一部(例えば、TGF-ベータ受容体の細胞外ドメイン)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGFBR1ポリペプチド(例えば、TGFBR1の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGFBR2ポリペプチド(例えば、TGFBR2の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤はTGFBR3ポリペプチド(例えば、TGFBR3の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGFBR1ポリペプチド(例えば、TGFBR1の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)およびTGFBR2ポリペプチド(例えば、TGFBR2の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGFBR1ポリペプチド(例えば、TGFBR1の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)およびTGFBR3ポリペプチド(例えば、TGFBR3の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGFBR2ポリペプチド(例えば、TGFBR2の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)およびTGFBR3ポリペプチド(例えば、TGFBR3の細胞外ドメインまたはその機能的バリアント)を含む。
[00377]TGF-ベータ阻害剤として使用され得る例示的なTGF-ベータ受容体ポリペプチドは、米国特許第8993524号、米国特許第9676863号、米国特許第8658135号、米国特許出願公開第20150056199号、米国特許出願公開第20070184052号、およびWO2017037634に開示されており、それらのすべてはそれらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
[00378]一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGFBR1の細胞外ドメインまたはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号95の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号96の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号97の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号104のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号105のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。
[00379]一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGFBR2の細胞外ドメインまたはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号98の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号99の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号100のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号101のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号102のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号103のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。
[00380]一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGFBR3の細胞外ドメインまたはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号106の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号107の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、配列番号108のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列)を含む。
[00381]一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、1つ以下のTGF-ベータ受容体細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、例えば、リンカーを介して一緒に連結されている、2つ以上(例えば、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上)のTGF-ベータ受容体細胞外ドメインを含む。
[00382]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子の免疫細胞エンゲージャーは、免疫細胞、例えば、免疫エフェクター細胞への結合、および/またはそれらの活性化を媒介することができる。一部の実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャー、またはこれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーのうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、またはこれらの組合せから選択される。免疫細胞エンゲージャーは、免疫系のアゴニストであり得る。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、リガンド分子(例えば、免疫グロブリン定常領域、例えば、Fc領域をさらに含むリガンド)、小分子、ヌクレオチド分子であってもよい。
ナチュラルキラー細胞エンゲージャー
[00383]ナチュラルキラー(NK)細胞は、抗体非依存性の方式で腫瘍およびウイルス感染細胞を認識および破壊する。NK細胞の調節は、NK細胞表面上の受容体を活性化および阻害することによって媒介される。活性化受容体の1つのファミリーは、NKp30、NKp44およびNKp46を含む天然細胞傷害性受容体(NCR)である。NCRは、がん細胞上のヘパラン硫酸の認識によって腫瘍標的化を開始させる。NKG2Dは、活性化キラー(NK)細胞において刺激性および共刺激性の両方の自然免疫応答を提供する受容体であり、細胞傷害活性に繋がる。DNAM1は、細胞間接着、リンパ球シグナル伝達、細胞傷害性ならびに細胞傷害性Tリンパ球(CTL)およびNK細胞によって媒介されるリンホカイン分泌に関与する受容体である。DAP10(HCSTとしても公知)は、リンパ球様および骨髄性細胞においてKLRK1と会合して活性化受容体KLRK1-HCSTを形成する膜貫通アダプタータンパク質であり、この受容体は、MHCクラスI鎖関連MICAおよびMICB、ならびにU(必要に応じてL1)6結合性タンパク質(ULBP)などの細胞表面リガンドを発現する標的細胞に対する細胞傷害性の誘発において大きな役割を果たし、KLRK1-HCST受容体は、腫瘍に対する免疫サーベイランスにおいて役割を果たし、腫瘍細胞の細胞溶解のために要求され、実際に、KLRK1リガンドを発現しない黒色腫細胞は、NK細胞によって媒介される免疫サーベイランスを免れる。CD16は、IgGのFc領域に対する受容体であり、複合体化または凝集IgG、そして単量体IgGにも結合し、それによって、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)およびファゴサイトーシスなどの他の抗体依存性応答を媒介する。
[00383]ナチュラルキラー(NK)細胞は、抗体非依存性の方式で腫瘍およびウイルス感染細胞を認識および破壊する。NK細胞の調節は、NK細胞表面上の受容体を活性化および阻害することによって媒介される。活性化受容体の1つのファミリーは、NKp30、NKp44およびNKp46を含む天然細胞傷害性受容体(NCR)である。NCRは、がん細胞上のヘパラン硫酸の認識によって腫瘍標的化を開始させる。NKG2Dは、活性化キラー(NK)細胞において刺激性および共刺激性の両方の自然免疫応答を提供する受容体であり、細胞傷害活性に繋がる。DNAM1は、細胞間接着、リンパ球シグナル伝達、細胞傷害性ならびに細胞傷害性Tリンパ球(CTL)およびNK細胞によって媒介されるリンホカイン分泌に関与する受容体である。DAP10(HCSTとしても公知)は、リンパ球様および骨髄性細胞においてKLRK1と会合して活性化受容体KLRK1-HCSTを形成する膜貫通アダプタータンパク質であり、この受容体は、MHCクラスI鎖関連MICAおよびMICB、ならびにU(必要に応じてL1)6結合性タンパク質(ULBP)などの細胞表面リガンドを発現する標的細胞に対する細胞傷害性の誘発において大きな役割を果たし、KLRK1-HCST受容体は、腫瘍に対する免疫サーベイランスにおいて役割を果たし、腫瘍細胞の細胞溶解のために要求され、実際に、KLRK1リガンドを発現しない黒色腫細胞は、NK細胞によって媒介される免疫サーベイランスを免れる。CD16は、IgGのFc領域に対する受容体であり、複合体化または凝集IgG、そして単量体IgGにも結合し、それによって、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)およびファゴサイトーシスなどの他の抗体依存性応答を媒介する。
[00384]本開示は、特に、NK細胞への結合および/またはNK細胞の活性化を媒介する1または複数のNK細胞エンゲージャーを含むように操作された多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。したがって、一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例えば、CD16a、CD16b、または両方)、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(SLAMF4または2B4としても公知である)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E、またはCD160に結合する(例えば、活性化する)抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。
[00385]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する抗原結合性ドメイン(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現するかまたは提示されるNKp30)であり、表7、8、8A、8B、9もしくは10に開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する抗原結合性ドメイン(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現するかまたは提示されるNKp30)であり、米国特許第6,979,546号、米国特許第9,447,185号、PCT出願公開第2015/121383A1号、PCT出願公開第2016/110468A1号、PCT出願公開第2004/056392A1号、または米国出願公開第20070231322A1号に開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含み、それらの配列は参照により本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャー、例えば、NKp30に結合する抗原結合性ドメインの、NK細胞への結合は、NK細胞を活性化する。NKp30(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現するかまたは提示される、NKp30)に結合する抗原結合性ドメインは、NKp30、NK細胞、またはその両方を標的化すると言うことができる。
[00386]一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表7、表18、もしくは表8に開示される1つもしくは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表7、表18、もしくは表8に開示される1つもしくは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表9に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表10に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00387]一部の実施形態では、NKP30に結合する抗原結合性ドメインは、表8Aおよび/もしくは8Bに開示される1つもしくは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKP30に結合する抗原結合性ドメインは、表8Aおよび/もしくは8Bに開示される1つもしくは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKP30に結合する抗原結合性ドメインは、表9に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00388]一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含む。
[00389]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、および7315(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、および6002(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6008、および6009(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7385、および7315(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7318、および6009(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C019、C021、およびC023(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C033、C035、およびC037(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C047、C049、およびC051(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C061、C063、およびC065(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C075、C077、およびC079(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C089、C091、およびC093(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C103、C105、およびC107(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号C116、C118、およびC120(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00390]一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7326、7327、および7329(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号6063、6064、および7293(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号6070、6071、および6072(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号6070、6064、および7321(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C026、C028、およびC030(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C040、C042、およびC044(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C054、C056、およびC058(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C068、C070、およびC072(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C082、C084、およびC086(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C096、C098、およびC100(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C110、C112、およびC113(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C123、C125、およびC127(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00391]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、7315、7326、7327、および7329(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、6002、6063、6064、および7293(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6008、6009、6070、6071、および6072(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7385、7315、6070、6064、および7321(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7318、6009、6070、6064、および7321(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C019、C021、C023、C026、C028、およびC030(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C033、C035、C037、C040、C042、およびC044(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C047、C049、C051、C054、C056、およびC058(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C061、C063、C065、C068、C070、およびC072(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C075、C077、C079、C082、C084、およびC086(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C089、C091、C093、C096、C098、およびC100(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C103、C105、C107、C110、C112、およびC113(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号C116、C118、C120、C123、C125、およびC127(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00392]一部の実施形態では、VHは、配列番号7298もしくは7300~7304(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、および/またはVLは、配列番号7299もしくは7305~7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7302および7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7302および7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00393]一部の実施形態では、VHは、配列番号6121もしくは6123~6128(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、および/またはVLは、配列番号7294もしくは6137~6141(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHは、配列番号6122もしくは6129~6134(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、および/またはVLは、配列番号6136もしくは6142~6147(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7295および7296のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7297および7296のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号6122および6136(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00394]一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、配列番号7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、配列番号7311(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、配列番号6187、6188、6189または6190(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00395]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6000のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00396]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6063のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00397]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVH、ならびに配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6000のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6063のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00398]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6007のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00399]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6070のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00400]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVH、ならびに配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6007のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6070のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00401]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00402]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00403]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00404]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00405]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6066のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00406]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6066のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00407]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00408]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00409]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00410]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00411]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6073のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列(または、1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00412]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6073のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00413]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6014の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6015のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6016のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6017のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00414]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6014のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6015のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6016のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6017のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00415]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6077の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6078のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6079のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6080のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00416]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6077のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6078のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6079のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6080のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00417]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6018の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6019のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6020のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6021のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00418]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6018のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6019のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6020のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6021のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00419]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6081の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6082のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6083のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6084のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00420]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6081のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6082のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6083のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6084のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00421]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6022の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6023のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6024のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6025のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00422]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6022のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6023のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6024のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6025のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00423]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6085の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6086のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6087のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6088のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00424]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6085のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6086のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6087のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6088のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00425]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6026の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6027のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6028のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6029のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00426]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6026のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6027のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6028のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6029のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00427]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6089の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6090のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6091のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6092のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00428]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6089のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6090のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6091のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6092のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00429]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6030の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6032のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6033のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6034のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00430]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6030のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6032のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6033のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6034のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00431]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6093の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6094のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6095のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6096のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00432]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6093のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6094のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6095のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6096のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00433]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6035の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6036のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6037のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6038のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00434]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6035のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6036のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6037のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6038のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00435]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6039の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6040のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6041のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6042のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00436]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6039のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6040のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6041のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6042のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00437]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6097の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6098のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6099のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6100のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00438]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6097のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6098のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6099のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6100のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00439]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6043の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6044のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6045のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6046のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00440]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6043のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6044のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6045のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6046のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00441]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6101の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6102のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6103のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6104のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00442]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6101のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6102のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6103のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6104のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00443]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6047の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6048のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6049のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6050のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00444]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6047のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6048のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6049のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6050のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00445]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6105の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6106のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6107のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6108のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00446]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6105のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6106のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6107のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6108のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00447]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6051の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6052のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6053のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6054のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00448]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6051のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6052のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6053のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6054のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00449]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6109の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6110のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6111のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6112のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00450]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6109のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6110のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6111のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6112のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00451]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6055の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6056のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6057のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6058のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00452]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6055のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6056のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6057のVHFWR3アミノ酸配列(または1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6058のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00453]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6113の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6114のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6115のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6116のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00454]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6113のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6114のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6115のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6116のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00455]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6059の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6060のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6061のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6062のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00456]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6059のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6060のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6061のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6062のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00457]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6117の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6118のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6119のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6120のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00458]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6117のVLFWR1アミノ酸配列(もしくは1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6118のVLFWR2アミノ酸配列(もしくは1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6119のVLFWR3アミノ酸配列(もしくは1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6120のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00459]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6148のアミノ酸配列(または配列番号6148と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6149のアミノ酸配列(または配列番号6149と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6150のアミノ酸配列(または配列番号6150と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6148のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6149のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6150のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00460]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6148のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6150のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6149のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6150のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00461]
[00462]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列(または配列番号6151と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列(または配列番号6152と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6153のアミノ酸配列(または配列番号6153と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6153のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00462]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列(または配列番号6151と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列(または配列番号6152と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6153のアミノ酸配列(または配列番号6153と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6153のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00463]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6153のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6153のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00464]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインはscFvを含む。一部の実施形態では、scFvは、配列番号6187~6190から選択されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[00466]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKG2D(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるNKG2D)に結合する抗原結合性ドメインであり、表15において開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NK細胞へのNK細胞エンゲージャー、例えば、NKG2Dに結合する抗原結合性ドメインの結合はNK細胞を活性化させる。NKG2D(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるNKG2D)に結合する抗原結合性ドメインは、NKG2D、NK細胞、または両方を標的化すると言及され得る。
[00467]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるCD16)に結合する抗原結合性ドメインであり、表15において開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NK細胞へのNK細胞エンゲージャー、例えば、CD16に結合する抗原結合性ドメインの結合はNK細胞を活性化させる。CD16(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるCD16)に結合する抗原結合性ドメインは、CD16、NK細胞、または両方を標的化すると言及され得る。
DLKVEMMAGGTQITPLNDNVTIFCNIFYSQPLNITSMGITWFWKSLTFDKEVKVFEFFGDHQEAFRPGAIVSPWRLKSGDASLRLPGIQLEEAGEYRCEVVVTPLKAQGTVQLEVVASPASRLLLDQVGMKENEDKYMCESSGFYPEAINITWEKQTQKFPHPIEISEDVITGPTIKNMDGTFNVTSCLKLNSSQEDPGTVYQCVVRHASLHTPLRSNFTLTAARHSLSETEKTDNFS(配列番号7233)のアミノ酸配列、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7233のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00469]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、ウイルスHAである、NKp44またはNKp46のリガンドである。ウイルスヘマグルチニン(HA)は、ウイルスの表面上にある糖タンパク質である。HAタンパク質は、シアル酸糖部分を介してウイルスが細胞の膜に結合することを可能とし、これは細胞膜とのウイルス膜の融合に寄与する(例えば、Eur J Immunol. 2001 Sep;31(9):2680~9ページ、「Recognition of viral hemagglutinins by NKp44 but not by NKp30」;およびNature 2001 Feb 22;409(6823):1055~60ページ、「Recognition of haemagglutinins on virus-infected cells by NKp46 activates lysis by human NK cells」(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00470]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、MICA、MICB、またはULBP1から選択されるNKG2Dのリガンドであり、例えば、
(i)MICAは、アミノ酸配列:
EPHSLRYNLTVLSWDGSVQSGFLTEVHLDGQPFLRCDRQKCRAKPQGQWAEDVLGNKTWDRETRDLTGNGKDLRMTLAHIKDQKEGLHSLQEIRVCEIHEDNSTRSSQHFYYDGELFLSQNLETKEWTMPQSSRAQTLAMNVRNFLKEDAMKTKTHYHAMHADCLQELRRYLKSGVVLRRTVPPMVNVTRSEASEGNITVTCRASGFYPWNITLSWRQDGVSLSHDTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRICQGEEQRFTCYMEHSGNHSTHPVPSGKVLVLQSHW(配列番号7234)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7234のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、
(ii)MICBは、アミノ酸配列:
AEPHSLRYNLMVLSQDESVQSGFLAEGHLDGQPFLRYDRQKRRAKPQGQWAEDVLGAKTWDTETEDLTENGQDLRRTLTHIKDQKGGLHSLQEIRVCEIHEDSSTRGSRHFYYDGELFLSQNLETQESTVPQSSRAQTLAMNVTNFWKEDAMKTKTHYRAMQADCLQKLQRYLKSGVAIRRTVPPMVNVTCSEVSEGNITVTCRASSFYPRNITLTWRQDGVSLSHNTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRIRQGEEQRFTCYMEHSGNHGTHPVPSGKVLVLQSQRTD(配列番号7235)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7235のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(iii)ULBP1は、アミノ酸配列:
GWVDTHCLCYDFIITPKSRPEPQWCEVQGLVDERPFLHYDCVNHKAKAFASLGKKVNVTKTWEEQTETLRDVVDFLKGQLLDIQVENLIPIEPLTLQARMSCEHEAHGHGRGSWQFLFNGQKFLLFDSNNRKWTALHPGAKKMTEKWEKNRDVTMFFQKISLGDCKMWLEEFLMYWEQMLDPTKPPSLAPG(配列番号7236)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7236のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
(i)MICAは、アミノ酸配列:
EPHSLRYNLTVLSWDGSVQSGFLTEVHLDGQPFLRCDRQKCRAKPQGQWAEDVLGNKTWDRETRDLTGNGKDLRMTLAHIKDQKEGLHSLQEIRVCEIHEDNSTRSSQHFYYDGELFLSQNLETKEWTMPQSSRAQTLAMNVRNFLKEDAMKTKTHYHAMHADCLQELRRYLKSGVVLRRTVPPMVNVTRSEASEGNITVTCRASGFYPWNITLSWRQDGVSLSHDTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRICQGEEQRFTCYMEHSGNHSTHPVPSGKVLVLQSHW(配列番号7234)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7234のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、
(ii)MICBは、アミノ酸配列:
AEPHSLRYNLMVLSQDESVQSGFLAEGHLDGQPFLRYDRQKRRAKPQGQWAEDVLGAKTWDTETEDLTENGQDLRRTLTHIKDQKGGLHSLQEIRVCEIHEDSSTRGSRHFYYDGELFLSQNLETQESTVPQSSRAQTLAMNVTNFWKEDAMKTKTHYRAMQADCLQKLQRYLKSGVAIRRTVPPMVNVTCSEVSEGNITVTCRASSFYPRNITLTWRQDGVSLSHNTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRIRQGEEQRFTCYMEHSGNHGTHPVPSGKVLVLQSQRTD(配列番号7235)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7235のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(iii)ULBP1は、アミノ酸配列:
GWVDTHCLCYDFIITPKSRPEPQWCEVQGLVDERPFLHYDCVNHKAKAFASLGKKVNVTKTWEEQTETLRDVVDFLKGQLLDIQVENLIPIEPLTLQARMSCEHEAHGHGRGSWQFLFNGQKFLLFDSNNRKWTALHPGAKKMTEKWEKNRDVTMFFQKISLGDCKMWLEEFLMYWEQMLDPTKPPSLAPG(配列番号7236)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7236のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00471]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NECTIN2またはNECL5から選択されるDNAM1のリガンドであり、例えば、
(i)NECTIN2は、アミノ酸配列:
QDVRVQVLPEVRGQLGGTVELPCHLLPPVPGLYISLVTWQRPDAPANHQNVAAFHPKMGPSFPSPKPGSERLSFVSAKQSTGQDTEAELQDATLALHGLTVEDEGNYTCEFATFPKGSVRGMTWLRVIAKPKNQAEAQKVTFSQDPTTVALCISKEGRPPARISWLSSLDWEAKETQVSGTLAGTVTVTSRFTLVPSGRADGVTVTCKVEHESFEEPALIPVTLSVRYPPEVSISGYDDNWYLGRTDATLSCDVRSNPEPTGYDWSTTSGTFPTSAVAQGSQLVIHAVDSLFNTTFVCTVTNAVGMGRAEQVIFVRETPNTAGAGATGG(配列番号7237)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7237のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(ii)NECL5は、アミノ酸配列:
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号7238)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7238のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
(i)NECTIN2は、アミノ酸配列:
QDVRVQVLPEVRGQLGGTVELPCHLLPPVPGLYISLVTWQRPDAPANHQNVAAFHPKMGPSFPSPKPGSERLSFVSAKQSTGQDTEAELQDATLALHGLTVEDEGNYTCEFATFPKGSVRGMTWLRVIAKPKNQAEAQKVTFSQDPTTVALCISKEGRPPARISWLSSLDWEAKETQVSGTLAGTVTVTSRFTLVPSGRADGVTVTCKVEHESFEEPALIPVTLSVRYPPEVSISGYDDNWYLGRTDATLSCDVRSNPEPTGYDWSTTSGTFPTSAVAQGSQLVIHAVDSLFNTTFVCTVTNAVGMGRAEQVIFVRETPNTAGAGATGG(配列番号7237)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7237のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(ii)NECL5は、アミノ酸配列:
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号7238)、その断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7238のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00472]さらに他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKG2Dのアダプターである、DAP10のリガンドである(例えば、Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 May 24;102(21):7641~7646ページ;およびBlood、15 September 2011 Volume 118、Number 11(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00473]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16のリガンドであり、これは、CD16a/bリガンド、例えば、抗体Fc領域をさらに含むCD16a/bリガンドである(例えば、Front Immunol.2013;4:76を参照、これは、CD16を通じてNK細胞を誘発するために抗体がFcをどのように使用するのかを議論しており、その内容の全体は本明細書に組み込まれる)。
[00474]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CRTAMのリガンドであり、これはNECL2であり、例えば、NECL2は、アミノ酸配列:
QNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTTILTIITDSRAGEEGSIRAVDH(配列番号7239)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7239のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
QNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTTILTIITDSRAGEEGSIRAVDH(配列番号7239)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7239のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00475]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD27のリガンドであり、これはCD70であり、例えば、CD70は、アミノ酸配列:
QRFAQAQQQLPLESLGWDVAELQLNHTGPQQDPRLYWQGGPALGRSFLHGPELDKGQLRIHRDGIYMVHIQVTLAICSSTTASRHHPTTLAVGICSPASRSISLLRLSFHQGCTIASQRLTPLARGDTLCTNLTGTLLPSRNTDETFFGVQWVRP(配列番号7240)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7240のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
QRFAQAQQQLPLESLGWDVAELQLNHTGPQQDPRLYWQGGPALGRSFLHGPELDKGQLRIHRDGIYMVHIQVTLAICSSTTASRHHPTTLAVGICSPASRSISLLRLSFHQGCTIASQRLTPLARGDTLCTNLTGTLLPSRNTDETFFGVQWVRP(配列番号7240)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7240のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00476]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、PSGL1のリガンドであり、これはL-セレクチン(CD62L)であり、例えば、L-セレクチンは、アミノ酸配列:
WTYHYSEKPMNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSGHGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSCSEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTFICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYN(配列番号7241)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7241のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
WTYHYSEKPMNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSGHGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSCSEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTFICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYN(配列番号7241)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7241のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00477]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD96のリガンドであり、これはNECL5であり、例えば、NECL5は、アミノ酸配列:
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号7238)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7238のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号7238)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7238のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00478]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD100(SEMA4D)のリガンドであり、これはCD72であり、例えば、CD72は、アミノ酸配列:
RYLQVSQQLQQTNRVLEVTNSSLRQQLRLKITQLGQSAEDLQGSRRELAQSQEALQVEQRAHQAAEGQLQACQADRQKTKETLQSEEQQRRALEQKLSNMENRLKPFFTCGSADTCCPSGWIMHQKSCFYISLTSKNWQESQKQCETLSSKLATFSEIYPQSHSYYFLNSLLPNGGSGNSYWTGLSSNKDWKLTDDTQRTRTYAQSSKCNKVHKTWSWWTLESESCRSSLPYICEMTAFRFPD(配列番号7242)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7242のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
RYLQVSQQLQQTNRVLEVTNSSLRQQLRLKITQLGQSAEDLQGSRRELAQSQEALQVEQRAHQAAEGQLQACQADRQKTKETLQSEEQQRRALEQKLSNMENRLKPFFTCGSADTCCPSGWIMHQKSCFYISLTSKNWQESQKQCETLSSKLATFSEIYPQSHSYYFLNSLLPNGGSGNSYWTGLSSNKDWKLTDDTQRTRTYAQSSKCNKVHKTWSWWTLESESCRSSLPYICEMTAFRFPD(配列番号7242)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7242のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00479]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp80のリガンドであり、これはCLEC2B(AICL)であり、例えば、CLEC2B(AICL)は、アミノ酸配列:
KLTRDSQSLCPYDWIGFQNKCYYFSKEEGDWNSSKYNCSTQHADLTIIDNIEEMNFLRRYKCSSDHWIGLKMAKNRTGQWVDGATFTKSFGMRGSEGCAYLSDDGAATARCYTERKWICRKRIH(配列番号7243)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7243のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
KLTRDSQSLCPYDWIGFQNKCYYFSKEEGDWNSSKYNCSTQHADLTIIDNIEEMNFLRRYKCSSDHWIGLKMAKNRTGQWVDGATFTKSFGMRGSEGCAYLSDDGAATARCYTERKWICRKRIH(配列番号7243)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7243のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00480]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD244のリガンドであり、これはCD48であり、例えば、CD48は、アミノ酸配列:
QGHLVHMTVVSGSNVTLNISESLPENYKQLTWFYTFDQKIVEWDSRKSKYFESKFKGRVRLDPQSGALYISKVQKEDNSTYIMRVLKKTGNEQEWKIKLQVLDPVPKPVIKIEKIEDMDDNCYLKLSCVIPGESVNYTWYGDKRPFPKELQNSVLETTLMPHNYSRCYTCQVSNSVSSKNGTVCLSPPCTLARS(配列番号7244)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7244のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
QGHLVHMTVVSGSNVTLNISESLPENYKQLTWFYTFDQKIVEWDSRKSKYFESKFKGRVRLDPQSGALYISKVQKEDNSTYIMRVLKKTGNEQEWKIKLQVLDPVPKPVIKIEKIEDMDDNCYLKLSCVIPGESVNYTWYGDKRPFPKELQNSVLETTLMPHNYSRCYTCQVSNSVSSKNGTVCLSPPCTLARS(配列番号7244)、その断片、またはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7244のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00481]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーはウイルスヘマグルチニン(HA)であり、HAは、インフルエンザウイルスの表面上に見出される糖タンパク質である。それは、上気道中の細胞または赤血球などの膜上にシアル酸を有する細胞へのウイルスの結合の原因となる。HAは、少なくとも18の異なる抗原を有する。これらのサブタイプは、H1~H18と命名されている。NCRはウイルスタンパク質を認識することができる。NKp46は、インフルエンザのHAならびにセンダイウイルスおよびニューカッスル病ウイルスを含むパラミクソウイルスのHA-NAと相互作用できることが示されている。NKp46の他に、NKp44もまた、異なるインフルエンザサブタイプのHAと機能的に相互作用することができる。
細胞死受容体シグナルエンゲージャー
[00482]細胞死受容体、例えば、細胞死受容体4および5(それぞれ、TRAIL-R1およびTRAIL-R2としても公知であるDR4およびDR5)は、正常なヒト組織において広範に発現される三量体I型膜貫通タンパク質である。細胞死受容体の活性化は、細胞死を誘導する細胞内シグナル伝達を引き起こす。TNF関連アポトーシス誘導リガンド(TRAIL)(Apo2Lとしても公知)は、細胞死受容体に結合する三量体タンパク質であり、それらの細胞死誘導シグナル伝達を活性化する(Amarante-MendesおよびGriffith. Pharmacol Ther. 2015 Nov;155:117~31)。
[00482]細胞死受容体、例えば、細胞死受容体4および5(それぞれ、TRAIL-R1およびTRAIL-R2としても公知であるDR4およびDR5)は、正常なヒト組織において広範に発現される三量体I型膜貫通タンパク質である。細胞死受容体の活性化は、細胞死を誘導する細胞内シグナル伝達を引き起こす。TNF関連アポトーシス誘導リガンド(TRAIL)(Apo2Lとしても公知)は、細胞死受容体に結合する三量体タンパク質であり、それらの細胞死誘導シグナル伝達を活性化する(Amarante-MendesおよびGriffith. Pharmacol Ther. 2015 Nov;155:117~31)。
[00483]本開示は、とりわけ、標的細胞(例えば、腫瘍抗原提示細胞(例えば、がん細胞、例えば、リンパ腫細胞)、またはTRBC1もしくはTRBC2を発現するリンパ球)上で細胞死受容体への結合および/または細胞死受容体シグナル伝達の活性化を媒介する1つまたは複数の細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含有するように操作されている、多特異性(例えば、二特異性、三特異性、四特異性)または多機能性分子を提供する。したがって、一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、1つもしくは複数のTRAILポリペプチドもしくはその断片(TRAIL分子)、1つもしくは複数の細胞死受容体もしくはその断片(細胞死受容体分子)、または細胞死受容体に特異的に結合する(例えば、かつ細胞死受容体シグナル伝達を活性化する)1つもしくは複数の抗原結合性ドメインを含む。理論に拘泥するものではないが、標的細胞上で細胞死受容体シグナル伝達を活性化することができる細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、標的細胞、例えば、標的疾患細胞、例えば、標的がん細胞の死を誘導することができると考えられる。
[00484]細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、当業者に公知のTRAILおよび細胞死受容体のバージョンからのまたはそれらに由来するTRAIL分子および/または細胞死受容体分子を含むことができる。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、ヒトTRAIL分子または細胞死受容体分子を含む。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、マウスTRAIL分子または細胞死受容体分子を含む。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、哺乳動物TRAIL分子または細胞死受容体分子を含む。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、(例えば、野生型TRAIL分子または細胞死受容体分子と比べて)短縮されたTRAIL分子または細胞死受容体分子を含む。
[00485]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、ヒトTRAILのアミノ酸95~281に対応する残基を少なくとも含む短縮されたTRAIL分子、例えば、ヒトTRAILのアミノ酸95~281に対応する残基を含む短縮されたTRAIL分子を含む。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、ヒトTRAILの95~281の残基を含む短縮されたTRAIL分子を含む。
[00486]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、ヒトTRAILのアミノ酸122~281に対応する残基を少なくとも含む短縮されたTRAIL分子、例えば、ヒトTRAILのアミノ酸122~281に対応する残基を含む短縮されたTRAIL分子を含む。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、ヒトTRAILの122~281の残基を含む短縮されたTRAIL分子を含む。
[00487]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、1つ、2つ、または3つのTRAIL分子を含む(例えば、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、それぞれ、単量体、二量体、または三量体のTRAIL分子である)。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、1つ、2つ、または3つの細胞死受容体分子を含む(例えば、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、それぞれ、単量体、二量体、または三量体の細胞死受容体分子である)。一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、細胞死受容体(例えば、1つまたは複数の細胞死受容体、例えば、同じまたは異なる細胞死受容体)に特異的に結合する1つ、2つ、または3つの抗原結合性ドメインを含む。
[00488]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、表11から選択されるアミノ酸配列(または表11から選択される配列と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00489]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6157のアミノ酸配列(または配列番号6157と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00490]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6158のアミノ酸配列(または配列番号6158と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00491]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6159のアミノ酸配列(または配列番号6159と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00492]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6160のアミノ酸配列(または配列番号6160と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00493]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6161のアミノ酸配列(または配列番号6161と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00494]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6162のアミノ酸配列(または配列番号6162と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00495]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6163のアミノ酸配列(または配列番号6163と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00496]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6164のアミノ酸配列(または配列番号6164と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00497]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、配列番号6165のアミノ酸配列(または配列番号6165と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00498]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、本開示の多機能性分子の別の成分と同じポリペプチド鎖上に含まれる、例えば、細胞死受容体シグナルエンゲージャーは、リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインの重鎖および/または軽鎖と同じポリペプチド鎖上に含まれ、腫瘍抗原は、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)もしくはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)もしくはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を発現するリンパ球を選択的に標的とする第1の抗原結合性ドメインの重鎖および/もしくは軽鎖、免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、または例えば、融合タンパク質としての間質改変部分である。一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーおよびリンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖を含む融合タンパク質を含み、腫瘍抗原は、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)である。一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーおよびT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を発現するリンパ球を選択的に標的とする第1の抗原結合性ドメインの軽鎖を含む融合タンパク質を含む。
[00499]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーおよびTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖を含む融合タンパク質は、配列番号6170のアミノ酸配列(または配列番号6170と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00500]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーおよびTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖を含む融合タンパク質は、配列番号6171のアミノ酸配列(または配列番号6171と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00501]一部の実施形態では、細胞死受容体シグナルエンゲージャーおよびTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖を含む融合タンパク質は、配列番号6172のアミノ酸配列(または配列番号6172と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[00502]一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーならびに配列番号6170のアミノ酸配列(または配列番号6170と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖、および配列番号6167のアミノ酸配列(または配列番号6167と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの重鎖を含む融合タンパク質を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーならびに配列番号6170のアミノ酸配列(または配列番号6170と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖、および配列番号6168のアミノ酸配列(または配列番号6168と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの重鎖を含む融合タンパク質を含む。
[00503]一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーならびに配列番号6171のアミノ酸配列(または配列番号6171と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖、および配列番号6167のアミノ酸配列(または配列番号6167と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの重鎖を含む融合タンパク質を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーならびに配列番号6171のアミノ酸配列(または配列番号6171と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖、および配列番号6168のアミノ酸配列(または配列番号6168と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの重鎖を含む融合タンパク質を含む。
[00504]一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーならびに配列番号6172のアミノ酸配列(または配列番号6172と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖、および配列番号6167のアミノ酸配列(または配列番号6167と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの重鎖を含む融合タンパク質を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、細胞死受容体シグナルエンゲージャーならびに配列番号6172のアミノ酸配列(または配列番号6172と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの軽鎖、および配列番号6168のアミノ酸配列(または配列番号6168と少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むTRBC1を標的化する第1の抗原結合性ドメインの重鎖を含む融合タンパク質を含む。
[00505]本開示は、とりわけ、T細胞への結合および/またはその活性化を媒介する1つまたは複数のT細胞エンゲージャーを含有するように操作されている多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。したがって、一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、CD3、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-4BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2またはCD226のうちの1つまたは複数に結合する(例えば、一部の実施形態では、それを活性化させる)抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。他の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、CD3、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-4BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2またはCD226のうちの1つまたは複数に結合し、かつそれを活性化させない抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。
TCRベータV抗原結合性ドメイン
[00506]一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、TCRβに結合する(例えば、かつ一部の実施形態ではこれを活性化する)抗原結合性ドメイン(例えば、抗体分子またはその断片)である。本開示は、例えば、本明細書に記載されるように、例えば、ヒトTCRベータV鎖(TCRβV)、例えば、TCRβV遺伝子ファミリー、例えば、TCRβVサブファミリーに結合する、例えば、特異的に結合する、とりわけ、抗体分子およびその断片を提供する。TCRベータVファミリーおよびサブファミリーは、当該技術分野において公知であり、例えばYassaiら(2009年)Immunogenetics 61巻(7号)493~502ページ;Wei S.およびConcannon P.(1994年)Human Immunology 41巻(3号)201~206ページに記載されている。本明細書に記載される抗体は、組換え抗体、例えば、組換え非マウス抗体、例えば、組換えヒトまたはヒト化抗体であり得る。本開示全体にわたって、TCRβVおよびTCRBVは互換的に使用される。
[00506]一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、TCRβに結合する(例えば、かつ一部の実施形態ではこれを活性化する)抗原結合性ドメイン(例えば、抗体分子またはその断片)である。本開示は、例えば、本明細書に記載されるように、例えば、ヒトTCRベータV鎖(TCRβV)、例えば、TCRβV遺伝子ファミリー、例えば、TCRβVサブファミリーに結合する、例えば、特異的に結合する、とりわけ、抗体分子およびその断片を提供する。TCRベータVファミリーおよびサブファミリーは、当該技術分野において公知であり、例えばYassaiら(2009年)Immunogenetics 61巻(7号)493~502ページ;Wei S.およびConcannon P.(1994年)Human Immunology 41巻(3号)201~206ページに記載されている。本明細書に記載される抗体は、組換え抗体、例えば、組換え非マウス抗体、例えば、組換えヒトまたはヒト化抗体であり得る。本開示全体にわたって、TCRβVおよびTCRBVは互換的に使用される。
[00507]一部の実施形態では、本開示は、ヒトTCRβV、例えば、TCRβVファミリー、例えば、遺伝子ファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を含むT細胞エンゲージャーを提供する。一部の実施形態では、TCRBV遺伝子ファミリーは、例えば、本明細書、例えば、図6に記載される、1つまたは複数のサブファミリーを含む。一部の実施形態では、TCRβV遺伝子ファミリーは、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、またはTCRβ V29サブファミリーを含むサブファミリーを含む。
[00508]一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーはまた、TCRβ V13.1としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01を含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-5*01を含む。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-5*01は、配列番号1および/または配列番号2によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-5*01は、配列番号9および/または配列番号10によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6は、配列番号9および/または配列番号11によって認識され、例えば結合される。
[00509]一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーはまた、TCRβ V12としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01またはTCRβ V10-2*01を含む。
[00510]一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはまた、TCRβ V8.1としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーは、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01を含む。一部の実施形態では、TCRβ V12は、配列番号15および/または配列番号16によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V12は、配列番号23~25のいずれか1つ、および/または配列番号26~30のいずれか1つによって認識され、例えば結合される。
[00511]一部の実施形態では、TCRβ V5サブファミリーは、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01から選択される。
[00512]一部の実施形態では、TCRβ V7サブファミリーは、TCRβ V7-7*01、TCRβ V7-6*01、TCRβ V7-8*02、TCRβ V7-4*01、TCRβ V7-2*02、TCRβ V7-2*03、TCRβ V7-2*01、TCRβ V7-3*01、TCRβ V7-9*03、またはTCRβ V7-9*01を含む。
[00513]一部の実施形態では、TCRβ V11サブファミリーは、TCRβ V11-1*01、TCRβ V11-2*01またはTCRβ V11-3*01を含む。
[00514]一部の実施形態では、TCRβ V14サブファミリーは、TCRβ V14*01を含む。
[00515]一部の実施形態では、TCRβ V16サブファミリーは、TCRβ V16*01を含む。
[00516]一部の実施形態では、TCRβ V18サブファミリーは、TCRβ V18*01を含む。
[00517]一部の実施形態では、TCRβ V9サブファミリーは、TCRβ V9*01またはTCRβ V9*02を含む。
[00518]一部の実施形態では、TCRβ V13サブファミリーは、TCRβV13*01を含む。
[00519]一部の実施形態では、TCRβ V4サブファミリーは、TCRβ V4-2*01、TCRβ V4-3*01、またはTCRβ V4-1*01を含む。
[00520]一部の実施形態では、TCRβ V3サブファミリーは、TCRβ V3-1*01を含む。
[00521]一部の実施形態では、TCRβ V2サブファミリーは、TCRβ V2*01を含む。
[00522]一部の実施形態では、TCRβ V15サブファミリーは、TCRβ V15*01を含む。
[00523]一部の実施形態では、TCRβ V30サブファミリーは、TCRβ V30*01、またはTCRβ V30*02を含む。
[00524]一部の実施形態では、TCRβ V19サブファミリーは、TCRβ V19*01、またはTCRβ V19*02を含む。
[00525]一部の実施形態では、TCRβ V27サブファミリーは、TCRβ V27*01を含む。
[00526]一部の実施形態では、TCRβ V28サブファミリーは、TCRβ V28*01を含む。
[00527]一部の実施形態では、TCRβ V24サブファミリーは、TCRβ V24-1*01を含む。
[00528]一部の実施形態では、TCRβ V20サブファミリーは、TCRβ V20-1*01、またはTCRβ V20-1*02を含む。
[00529]一部の実施形態では、TCRβ V25サブファミリーは、TCRβ V25-1*01を含む。
[00530]一部の実施形態では、TCRβ V29サブファミリーは、TCRβ V29-1*01を含む。
[00531]一態様では、本開示は、例えば、本明細書に、例えば、図6に記載される、ヒトTCRβV、例えば、TCRβV遺伝子ファミリー、例えば、TCRβVサブファミリーのうちの1つまたは複数に結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、またはTCRβ V29サブファミリーから選択される1つまたは複数のTCRβVサブファミリーに結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーに結合する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01、またはTCRβ V10-2*01を含むTCRβ V10サブファミリーに結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01を含むTCRβ V12サブファミリーに結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01を含むTCRβ V5サブファミリーに結合する。
[00532]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しないか、または米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体もしくはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍低い)親和性および/もしくは結合特異性でTCRβ V12に結合する。
[00533]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V12に結合する。
[00534]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V12以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
[00535]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合せず、または米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体もしくはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%もしくは約2、5、もしくは10倍低い)親和性および/もしくは結合特異性でTCRβ V5-5*01もしくはTCRβ V5-1*01に結合する。
[00536]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。
[00537]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
抗TCRβ V6抗体
[00538]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01を含む。
[00538]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01を含む。
[00539]一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号43の核酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有する配列によってコードされる。
[00540]配列番号43
[00541]ATGAGCATCGGCCTCCTGTGCTGTGCAGCCTTGTCTCTCCTGTGGGCAGGTCCAGTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCCAAAATTCCAGGTCCTGAAGACAGGACAGAGCATGACACTGCAGTGTGCCCAGGATATGAACCATGAATACATGTCCTGGTATCGACAAGACCCAGGCATGGGGCTGAGGCTGATTCATTACTCAGTTGGTGCTGGTATCACTGACCAAGGAGAAGTCCCCAATGGCTACAATGTCTCCAGATCAACCACAGAGGATTTCCCGCTCAGGCTGCTGTCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCAGCAGTTACTC
[00542]一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号44のアミノ酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[00541]ATGAGCATCGGCCTCCTGTGCTGTGCAGCCTTGTCTCTCCTGTGGGCAGGTCCAGTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCCAAAATTCCAGGTCCTGAAGACAGGACAGAGCATGACACTGCAGTGTGCCCAGGATATGAACCATGAATACATGTCCTGGTATCGACAAGACCCAGGCATGGGGCTGAGGCTGATTCATTACTCAGTTGGTGCTGGTATCACTGACCAAGGAGAAGTCCCCAATGGCTACAATGTCTCCAGATCAACCACAGAGGATTTCCCGCTCAGGCTGCTGTCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCAGCAGTTACTC
[00542]一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号44のアミノ酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[00543]配列番号44
[00544]MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSY
[00545]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。
[00544]MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSY
[00545]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。
[00546]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、単離されているか、または組換えである。
[00547]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体からの、または表13中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つの抗原結合性領域、例えば、その可変領域または抗原結合性断片を含む。
[00548]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体からの、または表13中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つの可変領域を含む。
[00549]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体からの、または表13中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つまたは2つの重鎖可変領域を含む。
[00550]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体からの、または表13中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つまたは2つの軽鎖可変領域を含む。
[00551]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4についての重鎖定常領域を含む。さらに別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1についての重鎖定常領域を含む。一実施形態では、重鎖定常領域は、表17に示されるアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00552]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。一実施形態では、軽鎖定常領域は、表17に示されるアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00553]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体の、または表13中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
[00554]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表13に示されるか、または表13に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表13に示されるか、または表13に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00555]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体の、または表13中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
[00556]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表13に示されるか、または表13に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表13に示されるか、または表13に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00557]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表13に示されるか、または表13に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表13に示されるか、または表13に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00558]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体からの、または表13中のヌクレオチド配列によってコードされる、6つすべてのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、同一であるか、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが2つ、3つもしくは4つ以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00559]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択されるか、もしくは表13に記載される抗体の重鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表13に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表13に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00560]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択されるか、もしくは表13に記載される抗体の軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表13に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表13に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00561]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体の、または表13におけるヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表13に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または表13に示されるKabatらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00562]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体の、または表13中のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる6つすべてのCDR(例えば、表13に示されるKabatの定義による6つすべてのCDR);または表13に示されるKabatらによる6つすべてのCDRと比べて少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00563]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体の対応する超可変ループと同じカノニカルな構造、例えば、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じカノニカルな構造を有する少なくとも1つ、2つ、または3つの超可変ループを含む。例えば、超可変ループのカノニカルな構造の記載についてChothiaら、(1992) J. Mol. Biol. 227:799~817ページ;Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776~798ページを参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載の表の検査によって決定することができる。
[00564]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択されるか、もしくは表13に記載される抗体の重鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表13に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表13に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00565]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択されるか、もしくは表13に記載される抗体の軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表13に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表13に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00566]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体の、または表13におけるヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表30に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または表13に示されるChothiaらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00567]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択される抗体、もしくは表13に記載される抗体の、または表13中のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる6つすべてのCDR(例えば、表13に示されるChothiaの定義による6つすべてのCDR);または表13に示されるChothiaらによる6つすべてのCDRと比べて少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00568]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatら、Chothiaらに従って定義されるか、または表13に記載されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。
[00569]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、KabatおよびChothiaの定義によるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00570]一部の実施形態では、表13に示される組合せCDRは、Kabat CDRおよびChothia CDRを含むCDRである。
[00571]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表13において組合せCDRとして同定されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表13に記載される「組合せ」CDRによるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00572]一実施形態、例えば、可変領域、CDR(例えば、組合せCDR、Chothia CDRもしくはKabat CDR)、または本明細書、例えば、表13において言及される他の配列を含む一実施形態では、抗体分子は、単一特異性抗体分子、二特異性抗体分子、二価抗体分子、二重パラトープ性抗体分子、または抗体の抗原結合性断片を含む抗体分子、例えば、半抗体もしくは半抗体の抗原結合性断片である。ある特定の実施形態では、抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子を含む。
[00573]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00574](i)配列番号2、配列番号10もしくは配列番号11の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
[00575](ii)配列番号1もしくは配列番号9の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて
を含む。
[00574](i)配列番号2、配列番号10もしくは配列番号11の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
[00575](ii)配列番号1もしくは配列番号9の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて
を含む。
[00576]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号2のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号1のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
[00577]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号10のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号9のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
[00578]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号11のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号9のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
[00579]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00580](i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00581](ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00580](i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00581](ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00582]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00583](i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00584](ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00583](i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00584](ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00585]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00586](i)配列番号51のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00587](ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00586](i)配列番号51のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00587](ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00588]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00589](i)配列番号51のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00590](ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00589](i)配列番号51のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00590](ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00591]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00592](i)配列番号54のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00593](ii)配列番号48のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00592](i)配列番号54のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00593](ii)配列番号48のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00594]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00595](i)配列番号54のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00596](ii)配列番号48のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00595](i)配列番号54のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00596](ii)配列番号48のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00597]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3、および必要に応じてFR4を包含する領域)は、(a)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基のうちの少なくとも80%、85%、87% 90%、92%、93%、95%、97%、98%、もしくは100%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(b)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基の20%~80%、40%~60%、60%~90%、もしくは70%~95%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯動物フレームワーク)、または(d)例えば抗原性もしくは細胞傷害性決定因子を除去するように、修飾されている、例えば、脱免疫化(deimmunized)、もしくは部分的にヒト化されている非ヒトフレームワークから選択することができる。一実施形態では、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特に、FR1、FR2および/またはFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVLまたはVHセグメントのフレームワークに対して少なくとも70、75、80、85、87、88、90、92、94、95、96、97、98、99%同一のまたは同一の軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
[00598]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、BHM1709またはBHM1710のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図4A、または配列番号9に示される、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。
[00599]代替的に、または本明細書に記載の重鎖置換と組み合わせて、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、BHM1709またはBHM1710のアミノ酸配列からの、例えば図4B、または配列番号10もしくは配列番号11に示される、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くのアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。
[00600]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、図4Aに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの重鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
[00601]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、図4Bに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの軽鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
[00602]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図4Bに示される、BHM1709またはBHM1710の軽鎖フレームワーク領域1を含む。
[00603]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図4Bに示される、BHM1709またはBHM1710の軽鎖フレームワーク領域2を含む。
[00604]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図4Bに示される、BHM1709またはBHM1710の軽鎖フレームワーク領域3を含む。
[00605]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図4Bに示される、BHM1709またはBHM1710の軽鎖フレームワーク領域4を含む。
[00606]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、Kabatの番号付けによる10位における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR1は、10位におけるフェニルアラニン、例えば、セリンからフェニルアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00607]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置において変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域2(FR2)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR2は、Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR2は、Kabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00608]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置において変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00609]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号10のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる10位におけるフェニルアラニン、例えば、10位における置換、例えば、セリンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、(b)Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、およびKabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含むフレームワーク領域2(FR2)、ならびに(c)Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00610]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号11のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、およびKabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含むフレームワーク領域2(FR2)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00611]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、(a)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域1(FR1)、(b)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域2(FR2)および(c)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00612]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図4Aに示されるように、BHM1709またはBHM1710の重鎖フレームワーク領域1を含む。
[00613]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図4Aに示されるように、BHM1709またはBHM1710の重鎖フレームワーク領域2を含む。
[00614]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図4Aに示されるように、BHM1709またはBHM1710の重鎖フレームワーク領域3を含む。
[00615]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図4Aに示されるように、BHM1709またはBHM1710の重鎖フレームワーク領域4を含む。
[00616]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる73位におけるスレオニン、例えば、73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる94位におけるグリシン、例えば、94位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列重鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00617]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号10のアミノ酸配列に示されるように、Kabatの番号付けによる73位におけるスレオニン、例えば、73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換、およびKabatの番号付けによる94位におけるグリシン、例えば、94位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む重鎖可変ドメインを含む。
[00618]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、BHM1709またはBHM1710の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号9、または図4Aおよび図4Bに示されるものを含む。
[00619]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、BHM1709の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号10のもの、または図4Aおよび図4Bに示されるものを含む。
[00620]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、BHM1710の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号11、または図4Aおよび図4Bに示されるものを含む。
[00621]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、BHM1709の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号9、およびBHM1709の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号10、または図4Aおよび図4Bに示されるものを含む。
[00622]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、BHM1710の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号9、およびBHM1710の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号11、または図4Aおよび図4Bに示されるものを含む。
[00623]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の重鎖もしくは軽鎖可変ドメイン、または両方は、本明細書に開示されるアミノ酸に対して実質的に同一である、例えば、本明細書に記載の抗体、例えば、BHM1709もしくはBHM1710から選択されるか、もしくは表13に記載される抗体の、または表13中のヌクレオチド配列によってコードされる可変領域に対して少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一である、または本明細書に記載の抗体の可変領域から少なくとも1個もしくは5個の残基、かつ40個、30個、20個、もしくは10個未満の残基が異なる、アミノ酸配列を含む。
[00624]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表13に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一である、もしくは表13に示される配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なる配列を有する少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つの抗原結合性領域、例えば、可変領域を含む。別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表13に示されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表13に示される配列から3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが異なる配列を有する核酸によってコードされるVHおよび/またはVLドメインを含む。
[00625]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00626]配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
[00627]配列番号10のアミノ酸配列、配列番号10のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号10のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00626]配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
[00627]配列番号10のアミノ酸配列、配列番号10のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号10のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00628]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
[00629]配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
[00630]配列番号11のアミノ酸配列、配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号11のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00629]配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
[00630]配列番号11のアミノ酸配列、配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号11のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00631]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、全長抗体またはその断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、もしくは一本鎖Fv断片(scFv))である。実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、モノクローナル抗体または単一の特異性を有する抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子はまた、ヒト化、キメラ、ラクダ、サメ、またはin vitroで生成された抗体分子であり得る。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の重鎖および軽鎖は、全長であり得(例えば、抗体は、少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全重鎖、および少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全軽鎖を含むことができる)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fv断片、単一ドメイン抗体、ダイアボディ(dAb)、二価抗体、もしくは二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、もしくはラクダ抗体)を含むことができる。
[00632]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子の形態である。
[00633]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域(Fc)を有する。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1またはIgG2(例えば、ヒトIgG1、またはIgG2)の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、重鎖定常領域はヒトIgG1である。
[00634]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダ、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)の軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。一実施形態では、定常領域は、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異されている。例えば、定常領域は、例えば、ヒトIgG1と比較して、Fc受容体結合を変更するために296位(MからYへ)、298位(SからTへ)、300位(TからEへ)、477位(HからKへ)および478位(NからFへ)において突然変異されている(例えば、突然変異した位置は、配列番号212もしくは214の132位(MからYへ)、134位(SからTへ)、136位(TからEへ)、313位(HからKへ)および314位(NからFへ)、または配列番号215、216、217もしくは218の135位(MからYへ)、137位(SからTへ)、139位(TからEへ)、316位(HからKへ)および317位(NからFへ)に対応する)。
[00635]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01またはTCRβ V12-5*01を含むTCRβ V12サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-4*01を含む。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-3*01を含む。
[00636]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト化抗体分子である。
[00637]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、単離されているか、または組換えである。
[00638]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体からの、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つの抗原結合性領域、例えば、可変領域もしくはその抗原結合性断片を含む。
[00639]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体からの、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つ、2つ、3つもしくは4つの可変領域を含む。
[00640]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体からの、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つもしくは2つの重鎖可変領域を含む。
[00641]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体からの、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、少なくとも1つもしくは2つの軽鎖可変領域を含む。
[00642]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域を含む。さらに別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。一実施形態では、重鎖定常領域は、表17に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00643]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。一実施形態では、軽鎖定常領域は、表17に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00644]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載されるか、もしくは表14中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、もしくは3つの相補性決定領域(CDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00645]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表14に示されるか、または表14に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表14に示されるか、または表14に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00646]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載されるか、もしくは表14中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、もしくは3つの相補性決定領域(CDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00647]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表14に示されるか、または表14に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表14に示されるか、または表14に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00648]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表14に示されるか、または表14に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表14に示されるか、または表14に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00649]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載されるか、もしくは表14中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの6つすべてのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、同一であるか、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが2つ、3つもしくは4つ以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00650]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表14に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表14に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00651]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表14に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表14に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00652]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表14に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または表14に示されるKabatらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00653]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の、もしくは表14中のヌクレオチド配列によってコードされる、もしくは表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる6つすべてのCDR(例えば、表14に示されるKabatの定義による6つすべてのCDR)、または表14に示されるKabatらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00654]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載の抗体の対応する超可変ループと同じカノニカルな構造、例えば、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じカノニカルな構造を有する少なくとも1つ、2つ、または3つの超可変ループを含む。例えば、超可変ループのカノニカルな構造の記載についてChothiaら、(1992) J. Mol. Biol. 227:799~817ページ;Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776~798ページを参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載の表の検査によって決定することができる。
[00655]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表14に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表14に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00656]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表14に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表14に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00657]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表14に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または表14に示されるChothiaらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00658]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の、または表14中のヌクレオチド配列によってコードされる、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる6つすべてのCDR(例えば、表14に示されるChothiaの定義による6つすべてのCDR)、または表14に示されるChothiaらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00659]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表14に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表14に示される組合せCDRによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00660]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の軽鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表14に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列、または表14に示される組合せCDRによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00661]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の、または表14におけるヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる重鎖および軽鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表14に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または表14に示される組合せCDRによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。
[00662]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載される抗体の、または表14中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からの組合せCDRによる6つすべてのCDR(例えば、表14に示される組合せCDRの定義による6つすべてのCDR)、または表14に示される組合せCDRによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00663]一部の実施形態では、表13に示される組合せCDRは、Kabat CDRおよびChothia CDRを含むCDRである。
[00664]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表13において組合せCDRとして同定されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表13に記載される「組合せ」CDRによるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00665]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、KabatらおよびChothiaらに従って定義されるか、または表13に記載されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。
[00666]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、KabatおよびChothiaの定義によるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00667]一実施形態では、例えば、本明細書、例えば、表14において言及される可変領域、CDR(例えば、組合せCDR、Chothia CDRもしくはKabat CDR)、または他の配列を含む一実施形態では、抗体分子は、単一特異性抗体分子、二特異性抗体分子、二価抗体分子、二重パラトープ性抗体分子、または抗体の抗原結合性断片を含む抗体分子、例えば、半抗体もしくは半抗体の抗原結合性断片である。ある特定の実施形態では、抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子を含む。
[00668]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00669](i)配列番号16、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
[00670](ii)配列番号15、配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべてを含む。
[00669](i)配列番号16、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
[00670](ii)配列番号15、配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべてを含む。
[00671]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00672](i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号22のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00673](ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00672](i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号22のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00673](ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00674]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00675](i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列、および配列番号2のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
[00676](ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列、および配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00675](i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列、および配列番号2のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
[00676](ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列、および配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00677]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00678](i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00679](ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00678](i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00679](ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00680]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00681](i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、および配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
[00682](ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、および配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00681](i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、および配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
[00682](ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、および配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00683]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00684](i)配列番号66のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号67のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号68のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00685](ii)配列番号60のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号61のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号62のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00684](i)配列番号66のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号67のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号68のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
[00685](ii)配列番号60のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号61のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号62のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00686]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00687](i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00688](ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00687](i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
[00688](ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00689]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3、および必要に応じてFR4を包含する領域)は、(a)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基のうちの少なくとも80%、85%、87% 90%、92%、93%、95%、97%、98%、もしくは100%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(b)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基の20%~80%、40%~60%、60%~90%、もしくは70%~95%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯動物フレームワーク)、または(d)例えば抗原性もしくは細胞傷害性決定因子を除去するように、修飾されている、例えば、脱免疫化、もしくは部分的にヒト化されている非ヒトフレームワークから選択することができる。一実施形態では、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特に、FR1、FR2および/またはFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVLまたはVHセグメントのフレームワークに対して少なくとも70、75、80、85、87、88、90、92、94、95、96、97、98、99%同一のまたは同一の軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
[00690]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表14に記載のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図5Aおよび図5Bに示されるか、または配列番号23~25における、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。
[00691]代替的に、または本明細書に記載の重鎖置換と組み合わせて、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図5Aおよび図5Bに示されるか、または配列番号26~30における、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くのアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。
[00692]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、図5Aに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの重鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
[00693]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、図5Bに示される1つ、2つ、3つ、または4つの軽鎖フレームワーク領域、またはそれと実質的に同一である配列を含む。
[00694]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Bに示される、軽鎖フレームワーク領域1を含む。
[00695]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Bに示される、軽鎖フレームワーク領域2を含む。
[00696]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Bに示される、軽鎖フレームワーク領域3を含む。
[00697]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Bに示される、軽鎖フレームワーク領域4を含む。
[00698]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数の、例えば、すべての、位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる1位におけるアスパラギン酸、例えば、1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる2位におけるアスパラギン、例えば、2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる4位におけるロイシン、例えば、4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含む。
[00699]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00700]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数の、例えば、すべての、位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる66位におけるグリシン、例えば、66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる69位におけるアスパラギン、例えば、69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる71位におけるチロシン、例えば、71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含む。
[00701]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、およびKabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00702]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号26のアミノ酸配列に示されるように、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびにKabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00703]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号27のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00704]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号28のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、セリンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00705]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号29のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、セリンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リジンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、アラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00706]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号29のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、セリンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、アラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00707]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、(a)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域1(FR1)、および(b)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00708]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Aに示される、重鎖フレームワーク領域1を含む。
[00709]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Aに示される、重鎖フレームワーク領域2を含む。
[00710]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Aに示される、重鎖フレームワーク領域3を含む。
[00711]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図5Aに示される、重鎖フレームワーク領域4を含む。
[00712]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号20~23、または図5Aに示されるものを含む。
[00713]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号26~30、または図5Bに示されるものを含む。
[00714]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号23~25、ならびに軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号26~30、または図5Aおよび図5Bに示されるものを含む。
[00715]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の重鎖もしくは軽鎖可変ドメイン、または両方は、本明細書に開示されるアミノ酸に対して実質的に同一である、例えば、本明細書に記載の抗体、例えば、表14に記載されるか、もしくは表14中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の可変領域に対して少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一である、または本明細書に記載の抗体の可変領域から少なくとも1個もしくは5個の残基、かつ40個、30個、20個、もしくは10個未満の残基が異なるアミノ酸配列を含む。
[00716]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表14に示されるアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表14に示される配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なる配列を有する、少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つの抗原結合性領域、例えば、可変領域を含む。別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表14に示されるヌクレオチド配列、またはそれと実質的に同一である配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表14に示される配列から3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが異なる配列を有する核酸によってコードされるVHおよび/またはVLドメインを含む。
[00717]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00718]配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列、配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
[00719]配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00718]配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列、配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
[00719]配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00720]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00721]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00722]配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00721]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00722]配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00723]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00724]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00725]配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00724]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00725]配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00726]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00727]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00728]配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00727]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00728]配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00729]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00730]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00731]配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00730]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00731]配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00732]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00733]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00734]配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00733]配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00734]配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00735]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00736]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00737]配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00736]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00737]配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00738]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00739]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00740]配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00739]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00740]配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列と1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00741]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00742]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00743]配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00742]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00743]配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
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[00744]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00745]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00746]配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
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[00745]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00746]配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
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[00747]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00748]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00749]配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
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[00748]配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00749]配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
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[00750]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00751]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00752]配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00751]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00752]配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00753]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00754]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00755]配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00754]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00755]配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00756]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00757]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00758]配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00757]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00758]配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00759]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00760]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00761]配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00760]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00761]配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00762]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
[00763]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00764]配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00763]配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
[00764]配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00765]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、全長抗体またはその断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、もしくは一本鎖Fv断片(scFv))である。実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、モノクローナル抗体または単一の特異性を有する抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はまた、ヒト化、キメラ、ラクダ、サメ、またはin vitroで生成された抗体分子であり得る。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト化抗体分子である。抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の重鎖および軽鎖は、全長であり得(例えば、抗体は、少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全重鎖、および少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全軽鎖を含むことができる)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fv断片、単一ドメイン抗体、ダイアボディ(dAb)、二価抗体、もしくは二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、もしくはラクダ抗体)を含むことができる。
[00766]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子の形態である。
[00767]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域(Fc)を有する。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1またはIgG2(例えば、ヒトIgG1、またはIgG2)の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、重鎖定常領域はヒトIgG1である。
[00768]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダ、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)の軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。一実施形態では、定常領域は、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異されている。例えば、定常領域は、Fc受容体結合を変更するために296位(MからYへ)、298位(SからTへ)、300位(TからEへ)、477位(HからKへ)および478位(NからFへ)において突然変異されている(例えば、突然変異した位置は、配列番号212もしくは214の132位(MからYへ)、134位(SからTへ)、136位(TからEへ)、313位(HからKへ)および314位(NからFへ)、または配列番号215、216、217もしくは218の135位(MからYへ)、137位(SからTへ)、139位(TからEへ)、316位(HからKへ)および317位(NからFへ)に対応する)。
[00769]概括的に言えば、Bリンパ球としても公知のB細胞は、リンパ球サブタイプの白血球の一種である。それらは、抗体を分泌することによって適応免疫系の液性免疫成分において機能する。追加的に、B細胞は、抗原を提示し(それらはまた、プロフェッショナル抗原提示細胞(APC)として分類される)、サイトカインを分泌する。マクロファージは、ファゴサイトーシスを介して細胞残屑、外来物質、微小生物、がん細胞を貪食および消化する白血球の一種である。ファゴサイトーシスの他に、それらは非特異的な防御(自然免疫)において重要な役割を果たし、そしてまた、リンパ球などの他の免疫細胞を動員することによって特異的な防御機構(適応免疫)の開始を助ける。例えば、それらは、T細胞への抗原提示主体として重要である。炎症の増加および免疫系の刺激の他に、マクロファージはまた、重要な抗炎症性の役割を果たし、サイトカインの放出を通じて免疫反応を減少させることができる。樹状細胞(DC)は、抗原材料のプロセシングにおいて機能し、それを細胞表面上で免疫系のT細胞に対して提示する抗原提示細胞である。
[00770]本開示は、とりわけ、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞への結合および/またはその活性化を媒介する1つまたは複数のB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む、例えば、含有するように操作されている、多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。
[00771]よって、一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体のアゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの、例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)、もしくはTLR9アゴニスト);41BB;CD2;CD47;もしくはSTINGアゴニスト、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択されるB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む。
[00772]一部の実施形態では、B細胞エンゲージャーは、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子である。
[00773]一部の実施形態では、マクロファージエンゲージャーはCD2アゴニストである。一部の実施形態では、マクロファージエンゲージャーは、CD40LもしくはCD40に結合する抗原結合性ドメインもしくはリガンド、Toll様受容体(TLR)アゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの)、例えば、TLR9もしくはTLR4(例えば、caTLR4(構成的活性型TLR4)、CD47、またはSTINGアゴニストに結合する抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)またはサイクリックジAMP(cdAMP)である。一部の実施形態では、STINGアゴニストはビオチン化されている。
[00774]一部の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーはCD2アゴニストである。一部の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーは、OX40L、41BB、TLRアゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの)(例えば、TLR9アゴニスト、TLR4(例えば、caTLR4(構成的活性型TLR4))、CD47、またはおよびSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数に結合するリガンド、受容体アゴニスト、または抗体分子である。一部の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)またはサイクリックジAMP(cdAMP)である。一部の実施形態では、STINGアゴニストはビオチン化されている。
[00775]他の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞のうちの1つまたは複数への結合、またはその活性化を媒介する。例示的なB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーは、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体アゴニスト(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)もしくはTLR9アゴニスト);41BBアゴニスト;CD2;CD47;もしくはSTINGアゴニスト、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択することができる。
[00776]一部の実施形態では、B細胞エンゲージャーは、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子のうちの1つまたは複数から選択される。
[00777]他の実施形態では、マクロファージ細胞エンゲージャーは、CD2アゴニスト;CD40L;OX40L;OX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;Toll様受容体アゴニストもしくはその断片(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4));CD47アゴニスト;またはSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数から選択される。
[00778]他の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーは、CD2アゴニスト、OX40抗体、OX40L、41BBアゴニスト、Toll様受容体アゴニストもしくはその断片(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4))、CD47アゴニスト、またはSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数から選択される。
[00779]一実施形態では、OX40Lは、アミノ酸配列:
QVSHRYPRIQSIKVQFTEYKKEKGFILTSQKEDEIMKVQNNSVIINCDGFYLISLKGYFSQEVNISLHYQKDEEPLFQLKKVRSVNSLMVASLTYKDKVYLNVTTDNTSLDDFHVNGGELILIHQNPGEFCVL(配列番号7245)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7245のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
QVSHRYPRIQSIKVQFTEYKKEKGFILTSQKEDEIMKVQNNSVIINCDGFYLISLKGYFSQEVNISLHYQKDEEPLFQLKKVRSVNSLMVASLTYKDKVYLNVTTDNTSLDDFHVNGGELILIHQNPGEFCVL(配列番号7245)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7245のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00780]別の実施形態では、CD40Lは、アミノ酸配列:
MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL(配列番号7246)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7246のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL(配列番号7246)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7246のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00781]さらに他の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)、サイクリックジAMP(cdAMP)、またはこれらの組合せを含み、必要に応じて2’,5’または3’,5’リン酸連結を有する。
[00782]一実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、41BBリガンド、例えば、アミノ酸配列:
ACPWAVSGARASPGSAASPRLREGPELSPDDPAGLLDLRQGMFAQLVAQNVLLIDGPLSWYSDPGLAGVSLTGGLSYKEDTKELVVAKAGVYYVFFQLELRRVVAGEGSGSVSLALHLQPLRSAAGAAALALTVDLPPASSEARNSAFGFQGRLLHLSAGQRLGVHLHTEARARHAWQLTQGATVLGLFRVTPEIPAGLPSPRSE(配列番号7247)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7247のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む41BBリガンドを含む。
ACPWAVSGARASPGSAASPRLREGPELSPDDPAGLLDLRQGMFAQLVAQNVLLIDGPLSWYSDPGLAGVSLTGGLSYKEDTKELVVAKAGVYYVFFQLELRRVVAGEGSGSVSLALHLQPLRSAAGAAALALTVDLPPASSEARNSAFGFQGRLLHLSAGQRLGVHLHTEARARHAWQLTQGATVLGLFRVTPEIPAGLPSPRSE(配列番号7247)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7247のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む41BBリガンドを含む。
Toll様受容体
[00783]Toll様受容体(TLR)は、ショウジョウバエTollタンパク質のホモログである進化的に保存された受容体であり、微生物病原体によって排他的に発現される病原体関連微生物パターン(PAMP)、または壊死性のもしくは死にゆく細胞から放出される内因性分子である危険関連分子パターン(DAMP)として公知の高度に保存された構造モチーフを認識する。PAMPは、リポ多糖(LPS)、ペプチドグリカン(PGN)およびリポペプチドなどの様々な細菌細胞壁成分の他に、フラジェリン、細菌DNAおよびウイルス二本鎖RNAを含む。DAMPは、熱ショックタンパク質などの細胞内タンパク質の他に、細胞外基質からのタンパク質断片を含む。対応するPAMPまたはDAMPによるTLRの刺激は、シグナル伝達カスケードを開始させて、AP-1、NF-κBおよびインターフェロン調節因子(IRF)などの転写因子の活性化に繋がる。TLRによるシグナル伝達は、インターフェロン(IFN)、炎症促進性サイトカインおよび適応免疫応答を指令するエフェクターサイトカインの産生を含む、様々な細胞応答をもたらす。TLRは、多数の炎症性および免疫障害に結び付けられており、がんにおいて役割を果たす(Rakoff-Nahoum S.およびMedzhitov R.、2009. Toll-like receptors and cancer. Nat Revs Cancer 9:57-63ページ)。
[00783]Toll様受容体(TLR)は、ショウジョウバエTollタンパク質のホモログである進化的に保存された受容体であり、微生物病原体によって排他的に発現される病原体関連微生物パターン(PAMP)、または壊死性のもしくは死にゆく細胞から放出される内因性分子である危険関連分子パターン(DAMP)として公知の高度に保存された構造モチーフを認識する。PAMPは、リポ多糖(LPS)、ペプチドグリカン(PGN)およびリポペプチドなどの様々な細菌細胞壁成分の他に、フラジェリン、細菌DNAおよびウイルス二本鎖RNAを含む。DAMPは、熱ショックタンパク質などの細胞内タンパク質の他に、細胞外基質からのタンパク質断片を含む。対応するPAMPまたはDAMPによるTLRの刺激は、シグナル伝達カスケードを開始させて、AP-1、NF-κBおよびインターフェロン調節因子(IRF)などの転写因子の活性化に繋がる。TLRによるシグナル伝達は、インターフェロン(IFN)、炎症促進性サイトカインおよび適応免疫応答を指令するエフェクターサイトカインの産生を含む、様々な細胞応答をもたらす。TLRは、多数の炎症性および免疫障害に結び付けられており、がんにおいて役割を果たす(Rakoff-Nahoum S.およびMedzhitov R.、2009. Toll-like receptors and cancer. Nat Revs Cancer 9:57-63ページ)。
[00784]TLRは、ロイシンリッチリピート(LRR)およびToll/IL-1受容体(TIR)ドメインと呼ばれる保存された領域を含有する細胞質テイルを含有する細胞外ドメインによって特徴付けられるI型膜貫通タンパク質である。10個のヒトおよび12個のマウスTLRが特徴付けられており、それらは、ヒトにおけるTLR1~TLR10、ならびにマウスにおけるTLR1~TLR9、TLR11、TLR12およびTLR13であり、TLR10のホモログは偽遺伝子である。TLR2は、細菌リポタンパク質、リポマンナンおよびリポタイコ酸を含む、グラム陽性細菌からの様々なPAMPの認識のために必須である。TLR3は、ウイルス由来の二本鎖RNAに結び付けられている。TLR4は、主に、リポ多糖によって活性化される。TLR5は細菌フラジェリンを検出し、TLR9は、非メチル化CpG DNAに対する応答のために要求される。最後に、TLR7およびTLR8は、小さい合成の抗ウイルス分子を認識し、一本鎖RNAはそれらの天然リガンドであることが報告された。TLR11は、尿路病原性E. coliおよびToxoplasma gondiiからのプロフィリン様タンパク質を認識することが報告されている。TLRの特異性のレパートリーは、互いとヘテロ二量体化するTLRの能力によって拡張されるようである。例えば、TLR2およびTLR6の二量体は、ジアシル化リポタンパク質に対する応答のために要求され、TLR2およびTLR1は、相互作用してトリアシル化リポタンパク質を認識する。TLRの特異性はまた、LPSに応答してTLR4と複合体を形成するMD-2およびCD14などの、様々なアダプターおよびアクセサリー分子によって影響される。
[00785]TLRシグナル伝達は、炎症性サイトカインの産生に繋がるMyD88依存性経路、ならびにIFN-βの刺激および樹状細胞の成熟と関連付けられるMyD88非依存性経路という少なくとも2つの別個の経路からなる。MyD88依存性経路は、TLR3を除いてすべてのTLRに共通である(Adachi Oら、1998、「Targeted disruption of the MyD88 gene results in loss of IL-1- and IL-18-mediated function.」、Immunity、9(1):143~50ページ)。PAMPまたはDAMPによって活性化されると、TLRは、ヘテロまたはホモ二量体化して、細胞質TIRドメインを介してアダプタータンパク質の動員を誘導する。個々のTLRは、異なるアダプター分子の使用によって異なるシグナル伝達応答を誘導する。TLR4およびTLR2シグナル伝達は、MyD88依存性経路に関与するアダプターTIRAP/Malを要求する。TLR3は、アダプターTRIF/TICAM-1を通じて、MyD88非依存性の方式で、二本鎖RNAに応答してIFN-βの産生を誘発する。TRAM/TICAM-2は、その機能がTLR4経路に制限されたMyD88非依存性経路に関与する別のアダプター分子である。
[00786]TLR3、TLR7、TLR8およびTLR9は、ウイルス核酸を認識し、I型IFNを誘導する。I型IFNの誘導に繋がるシグナル伝達の機序は、活性化されるTLRに依存して異なる。それらは、抗ウイルス防御、細胞成長および免疫調節において不可欠な役割を果たすことが公知の転写因子のファミリー、インターフェロン調節因子、IRFを伴う。3つのIRF(IRF3、IRF5およびIRF7)は、ウイルス媒介性のTLRシグナル伝達の直接的なトランスデューサーとして機能する。TLR3およびTLR4はIRF3およびIRF7を活性化させ、TLR7およびTLR8はIRF5およびIRF7を活性化させる(Doyle Sら、2002、「IRF3 mediates a TLR3/TLR4-specific antiviral gene program.」、Immunity、17(3):251~63ページ)。さらには、TLR9リガンドCpG-Aによって刺激されるI型IFN産生は、PI(3)KおよびmTORによって媒介されることが示されている(Costa-Mattioli M.およびSonenberg N. 2008、「RAPping production of type I interferon in pDCs through mTOR.」、Nature Immunol. 9:1097~1099ページ)。
[00787]TLR-9
[00788]TLR9は、DNA分子中の非メチル化CpG配列を認識する。CpG部位は、細菌ゲノムまたはウイルスDNAと比較して脊椎動物ゲノム上で比較的希少(約1%)である。TLR9は、Bリンパ球、単球、ナチュラルキラー(NK)細胞、および形質細胞性樹状細胞などの免疫系の多数の細胞によって発現される。TLR9は、細胞内、エンドソーム区画内において発現され、CpGモチーフリッチなDNAへの結合によって免疫系にウイルスおよび細菌感染を警告するように機能する。TLR9シグナルは、炎症促進性反応を開始させる細胞の活性化に繋がり、I型インターフェロンおよびIL-12などのサイトカインの産生をもたらす。
[00788]TLR9は、DNA分子中の非メチル化CpG配列を認識する。CpG部位は、細菌ゲノムまたはウイルスDNAと比較して脊椎動物ゲノム上で比較的希少(約1%)である。TLR9は、Bリンパ球、単球、ナチュラルキラー(NK)細胞、および形質細胞性樹状細胞などの免疫系の多数の細胞によって発現される。TLR9は、細胞内、エンドソーム区画内において発現され、CpGモチーフリッチなDNAへの結合によって免疫系にウイルスおよび細菌感染を警告するように機能する。TLR9シグナルは、炎症促進性反応を開始させる細胞の活性化に繋がり、I型インターフェロンおよびIL-12などのサイトカインの産生をもたらす。
[00789]TLRアゴニスト
[00790]TLRアゴニストは、1つまたは複数のTLR、例えば、ヒトTLR-1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10のうちの1つまたは複数をアゴナイズすることができる。一部の実施形態では、本明細書に記載の付属的剤はTLRアゴニストである。一部の実施形態では、TLRアゴニストは、ヒトTLR-9を特異的にアゴナイズする。一部の実施形態では、TLR-9アゴニストはCpG部分である。本明細書で使用される場合、CpG部分は、配列:5’-C-ホスフェート-G-3’、すなわち、1つのみのホスフェートによって分離されたシトシンおよびグアニンを有する直鎖状ジヌクレオチドである。
[00790]TLRアゴニストは、1つまたは複数のTLR、例えば、ヒトTLR-1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10のうちの1つまたは複数をアゴナイズすることができる。一部の実施形態では、本明細書に記載の付属的剤はTLRアゴニストである。一部の実施形態では、TLRアゴニストは、ヒトTLR-9を特異的にアゴナイズする。一部の実施形態では、TLR-9アゴニストはCpG部分である。本明細書で使用される場合、CpG部分は、配列:5’-C-ホスフェート-G-3’、すなわち、1つのみのホスフェートによって分離されたシトシンおよびグアニンを有する直鎖状ジヌクレオチドである。
[00791]一部の実施形態では、CpG部分は、少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、30個、またはより多くのCpGジヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、CpG部分は、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、または30個のCpGジヌクレオチドからなる。一部の実施形態では、CpG部分は、1~5個、1~10個、1~20個、1~30個、1~40個、1~50個、5~10個、5~20個、5~30個、10~20個、10~30個、10~40個、または10~50個のCpGジヌクレオチドを有する。
[00792]一部の実施形態では、TLR-9アゴニストは合成ODN(オリゴデオキシヌクレオチド)である。CpG ODNは、特定の配列状況(CpGモチーフ)において非メチル化CpGジヌクレオチドを含有する短い合成の一本鎖DNA分子である。CpG ODNは、ゲノム細菌DNA中に見出される天然のホスホジエステル(PO)骨格とは対照的に、部分的または完全にホスホロチオエート化(PS)した骨格を持つ。クラスA、BおよびCというCpG ODNの3つの主要なクラスがあり、これらは免疫賦活活性において異なる。CpG-A ODNは、PO中央CpG含有パリンドロームモチーフおよびPS修飾3’ポリ-Gストリングによって特徴付けられる。それらは、pDCからの高いIFN-α産生を誘導するが、TLR9依存性NF-κBシグナル伝達および炎症促進性サイトカイン(例えば、IL-6)産生の弱い刺激因子である。CpG-B ODNは、1つまたは複数のCpGジヌクレオチドを有する全長PS骨格を含有する。それらは、B細胞およびTLR9依存性NF-κBシグナル伝達を強く活性化させるが、IFN-α分泌を弱く刺激する。CpG-C ODNは、クラスAおよびBの両方の特徴を兼ね備える。それらは、完全なPS骨格およびCpG含有パリンドロームモチーフを含有する。CクラスCpG ODNは、pDCからの強いIFN-α産生の他に、B細胞刺激を誘導する。
間質改変部分
[00793]固形腫瘍は、実質(新生細胞)、および新生細胞により誘導され、新生細胞が分散される、間質という、正常組織のものを模倣した、異なっているが相互依存性の2つのコンパートメントを含む別個の構造を有する。すべての腫瘍は、間質を有し、栄養サポートおよび老廃物の除去のために、間質を必要とする。細胞懸濁液として成長する腫瘍(例えば、白血病、腹水腫瘍)の場合、血漿が間質としての機能を果たす(Connolly JL et al. Tumor Structure and Tumor Stroma Generation. In: Kufe DW et al., editors. Holland-Frei Cancer Medicine. 6th edition. Hamilton: BC Decker; 2003)。間質には、細胞外マトリックス(ECM)および細胞外分子とともに、線維芽細胞/筋線維芽細胞、膠細胞、上皮細胞、脂肪細胞、血管細胞、平滑筋細胞、および免疫細胞を含む様々な細胞型が含まれる(Li Hanchen et al. Tumor Microenvironment: The Role of the Tumor Stroma in Cancer. J of Cellular Biochemistry 101: 805-815 (2007))。
[00793]固形腫瘍は、実質(新生細胞)、および新生細胞により誘導され、新生細胞が分散される、間質という、正常組織のものを模倣した、異なっているが相互依存性の2つのコンパートメントを含む別個の構造を有する。すべての腫瘍は、間質を有し、栄養サポートおよび老廃物の除去のために、間質を必要とする。細胞懸濁液として成長する腫瘍(例えば、白血病、腹水腫瘍)の場合、血漿が間質としての機能を果たす(Connolly JL et al. Tumor Structure and Tumor Stroma Generation. In: Kufe DW et al., editors. Holland-Frei Cancer Medicine. 6th edition. Hamilton: BC Decker; 2003)。間質には、細胞外マトリックス(ECM)および細胞外分子とともに、線維芽細胞/筋線維芽細胞、膠細胞、上皮細胞、脂肪細胞、血管細胞、平滑筋細胞、および免疫細胞を含む様々な細胞型が含まれる(Li Hanchen et al. Tumor Microenvironment: The Role of the Tumor Stroma in Cancer. J of Cellular Biochemistry 101: 805-815 (2007))。
[00794]本明細書に記載される間質改変部分としては、間質の成分、例えば、ECM成分、例えば、グリコサミノグリカン、例えば、ヒアルロナン(ヒアルロン酸もしくはHAとしても知られる)、コンドロイチン硫酸塩、コンドロイチン、デルマタン硫酸塩、ヘパリン硫酸塩、ヘパリン、エンタクチン、テネイシン、アグリカン、およびケラチン硫酸塩;または細胞外タンパク質、例えば、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、およびビトロネクチンを分解することができる部分(例えば、タンパク質、例えば、酵素)が挙げられる。
間質改変酵素
[00795]一部の実施形態では、間質改変部分は酵素である。例えば、間質改変部分としては、ヒアルロニダーゼ、コラゲナーゼ、コンドロイチナーゼ、マトリックスメタロプロテイナーゼ(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)を挙げることができるが、これらに限定されない。
[00795]一部の実施形態では、間質改変部分は酵素である。例えば、間質改変部分としては、ヒアルロニダーゼ、コラゲナーゼ、コンドロイチナーゼ、マトリックスメタロプロテイナーゼ(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)を挙げることができるが、これらに限定されない。
[00796]ヒアルロニダーゼ
[00797]ヒアルロニダーゼは動物界全体に見られる中性および酸性活性酵素の群である。ヒアルロニダーゼは基質特異性および作用の機序に関して多様である。ヒアルロニダーゼには3つの一般的なクラスがある:(1)主要な最終生成物として四糖および六糖を有するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼである、哺乳動物型ヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.35)。これらは、加水分解活性およびトランスグリコシダーゼ活性の両方を有し、ヒアルロナンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解することができ;(2)細菌ヒアルロニダーゼ(EC 4.2.99.1)は、ヒアルロナンを分解し、様々な程度で、コンドロイチン硫酸塩およびデルマタン硫酸塩を分解する。これらは、主として二糖の最終生成物をもたらすベータ脱離反応によって作動するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼであり;(3)ヒル、他の寄生虫、および甲殻類に由来するヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.36)は、ベータ1-3連結の加水分解を通じて四糖および六糖の最終生成物をもたらす、エンド-ベータ-グルクロニダーゼである。
[00797]ヒアルロニダーゼは動物界全体に見られる中性および酸性活性酵素の群である。ヒアルロニダーゼは基質特異性および作用の機序に関して多様である。ヒアルロニダーゼには3つの一般的なクラスがある:(1)主要な最終生成物として四糖および六糖を有するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼである、哺乳動物型ヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.35)。これらは、加水分解活性およびトランスグリコシダーゼ活性の両方を有し、ヒアルロナンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解することができ;(2)細菌ヒアルロニダーゼ(EC 4.2.99.1)は、ヒアルロナンを分解し、様々な程度で、コンドロイチン硫酸塩およびデルマタン硫酸塩を分解する。これらは、主として二糖の最終生成物をもたらすベータ脱離反応によって作動するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼであり;(3)ヒル、他の寄生虫、および甲殻類に由来するヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.36)は、ベータ1-3連結の加水分解を通じて四糖および六糖の最終生成物をもたらす、エンド-ベータ-グルクロニダーゼである。
[00798]哺乳動物ヒアルロニダーゼは、さらに2つの群に分けることができる:(1)中性活性酵素および(2)酸性活性酵素。ヒトゲノムには、HYAL1、HYAL2、HYAL3、HYAL4、HYALP1、およびPH20/SPAM1の6つのヒアルロニダーゼ様遺伝子がある。HYALP1は偽遺伝子であり、HYAL3はいずれの公知の基質に対しても酵素活性を有することが示されていない。HYAL4は、コンドロイチナーゼであり、ヒアルロナンに対する活性が欠如している。HYAL1は原型の酸性活性酵素であり、PH20は原型の中性活性酵素である。酸性活性ヒアルロニダーゼ、例えば、HYAL1およびHYAL2は、中性pHでは触媒活性が欠如している。例えば、HYAL1は、in vitroにおいて、pH4.5を超えると触媒活性を有さない(Frost and Stern, “A Microtiter-Based Assay for Hyaluronidase Activity Not Requiring Specialized Reagents”, Analytical Biochemistry, vol. 251, pp. 263-269 (1997)。HYAL2は酸性活性酵素であり、in vitroでの特異性活性は非常に低い。
[00799]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは哺乳動物ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは組換えヒトヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは中性活性ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは中性活性可溶性ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは組換えPH20中性活性酵素である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは組換えPH20中性活性可溶性酵素である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼはグリコシル化されている。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは少なくとも1つのN結合型グリカンを有する。組換えヒアルロニダーゼは、当業者に公知の従来的な方法、例えば、米国特許第7767429号におけるものを使用して、産生することができ、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
[00800]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼはrHuPH20である(Hylenex(登録商標)とも称され;現在Halozymeによって製造されており;2005年にFDAにより承認されている(例えば、Scodeller P (2014)Hyaluronidase and other Extracellular Matrix Degrading Enzymes for Cancer Therapy: New Uses and Nano- Formulations. J Carcinog Mutage 5:178;米国特許第7767429号;同第8202517号;同第7431380号;同第8450470号;同第8772246号;同第8580252号を参照されたく、これらのそれぞれのすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる)。rHuPH20は、ヒトヒアルロニダーゼPH20の可溶性断片をコードするDNAプラスミドを含む、遺伝子操作されたCHO細胞によって産生される。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼはグリコシル化されている。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは少なくとも1つのN結合型グリカンを有する。組換えヒアルロニダーゼは、当業者に公知の従来的な方法、例えば、米国特許第7767429号におけるものを使用して、産生することができ、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、rHuPH20は、
LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号7248)
のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一の配列を有する。
LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号7248)
のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一の配列を有する。
[00801]本明細書において提供される方法のうちのいずれかにおいて、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナンを分解する薬剤であり得るか、またはヒアルロナンの合成を阻害する薬剤であり得る。例えば、抗ヒアルロナン剤はヒアルロナン分解酵素であり得る。別の例では、抗ヒアルロナン剤はヒアルロナンの合成を阻害する薬剤である。例えば、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナンの合成を阻害する薬剤、例えば、HAシンターゼに対するセンスもしくはアンチセンス核酸分子であるか、または小分子薬である。例えば、抗ヒアルロナン剤は、4-メチルウンベリフェロン(MU)もしくはその誘導体、またはレフルノミドもしくはその誘導体である。そのような誘導体としては、例えば、6,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンまたは5,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンである、4-メチルウンベリフェロン(MU)の誘導体が挙げられる。
[00802]本明細書において提供される方法のさらなる例では、ヒアルロナン分解酵素はヒアルロニダーゼである。一部の例では、ヒアルロナン分解酵素は、PH20ヒアルロニダーゼ、またはC末端グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合部位もしくはGPI結合部位の一部分が欠如したその短縮形態である。特定の例では、ヒアルロニダーゼは、ヒト、サル、ウシ、ヒツジ、ラット、マウス、またはモルモットPH20から選択されるPH20である。例えば、ヒアルロナン分解酵素は、中性活性であり、N-グリコシル化されている、ヒトPH20ヒアルロニダーゼであり、これは、(a)全長PH20もしくはPH20のC末端短縮形態であるヒアルロニダーゼポリペプチドであって、短縮形態が配列番号7248の少なくともアミノ酸残基36~464、例えば、36~481、36~482、36~483を含み、全長PH20が配列番号7248に記載されるアミノ酸配列を有する、ヒアルロニダーゼポリペプチド;または(b)配列番号7248に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくは短縮形態と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ヒアルロニダーゼポリペプチド;または(c)アミノ酸置換を含み、それによって、ヒアルロニダーゼポリペプチドが配列番号7248に記載されるポリペプチドもしくはその対応する短縮形態と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、(a)もしくは(b)のヒアルロニダーゼポリペプチドから選択される。例示的な例では、ヒアルロナン分解酵素は、rHuPH20と表記される組成物を含むPH20である。
[00803]他の例では、抗ヒアルロナン剤は、ポリマーへのコンジュゲーションによって改変されたヒアルロナン分解酵素である。ポリマーはPEGであってもよく、抗ヒアルロナン剤はPEG化ヒアルロナン分解酵素である。したがって、本明細書において提供される方法の一部の例では、ヒアルロナン分解酵素はポリマーへのコンジュゲーションによって改変されている。例えば、ヒアルロナン分解酵素はPEGにコンジュゲートされており、したがって、ヒアルロナン分解酵素はPEG化されている。例示的な例では、ヒアルロナン分解酵素はPEG化PH20酵素(PEGPH20)である。本明細書において提供される方法では、コルチコステロイドは、コルチゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾロン、およびプレドニゾンの中から選択されるグルココルチコイドであり得る。
[00804]コンドロイチナーゼ
[00805]コンドロイチナーゼは、エンドグリコシダーゼ反応を通じてグリコサミノグリカン、特に、コンドロイチンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解する、動物界全体に見られる酵素である。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは哺乳動物コンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは組換えヒトコンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼはHYAL4である。他の例示的なコンドロイチナーゼとしては、コンドロイチナーゼABC(プロテウス・ブルガリス由来;日本特許出願公開第6-153947号、T. Yamagata et al. J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968)、S. Suzuki et al, J. Biol. Chem., 243, 1543 (1968))、コンドロイチナーゼAC(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;T. Yamagata et al., J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968))、コンドロイチナーゼAC II(アルスロバクター・アウレッセンス由来;K. Hiyama, and S. Okada, J. Biol. Chem., 250, 1824 (1975)、K. Hiyama and S. Okada, J. Biochem. (Tokyo), 80, 1201 (1976))、ヒアルロニダーゼACIII(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al., Seikagaku, 61, 1023 (1989))、コンドロイチナーゼB(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. Biophys. Res. Commun., 56, 973 (1974)、Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. J., 151, 121 (1975)、Kenichi Maeyama et al, Seikagaku, 57, 1189 (1985))、コンドロイチナーゼC(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al, Seikagaku, 61, 1023 (1939))などが挙げられる。
[00805]コンドロイチナーゼは、エンドグリコシダーゼ反応を通じてグリコサミノグリカン、特に、コンドロイチンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解する、動物界全体に見られる酵素である。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは哺乳動物コンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは組換えヒトコンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼはHYAL4である。他の例示的なコンドロイチナーゼとしては、コンドロイチナーゼABC(プロテウス・ブルガリス由来;日本特許出願公開第6-153947号、T. Yamagata et al. J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968)、S. Suzuki et al, J. Biol. Chem., 243, 1543 (1968))、コンドロイチナーゼAC(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;T. Yamagata et al., J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968))、コンドロイチナーゼAC II(アルスロバクター・アウレッセンス由来;K. Hiyama, and S. Okada, J. Biol. Chem., 250, 1824 (1975)、K. Hiyama and S. Okada, J. Biochem. (Tokyo), 80, 1201 (1976))、ヒアルロニダーゼACIII(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al., Seikagaku, 61, 1023 (1989))、コンドロイチナーゼB(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. Biophys. Res. Commun., 56, 973 (1974)、Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. J., 151, 121 (1975)、Kenichi Maeyama et al, Seikagaku, 57, 1189 (1985))、コンドロイチナーゼC(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al, Seikagaku, 61, 1023 (1939))などが挙げられる。
[00806]マトリックスメタロプロテイナーゼ
[00807]マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)は、細胞外マトリックス(ECM)分解に関与する主要なプロテアーゼである亜鉛依存性エンドペプチダーゼである。MMPは、広範な細胞外分子およびいくつかの生体活性分子を分解することができる。ヒトにおいて、24個のMMP遺伝子が特定されており、これらは、ドメイン構成および基質優先性に基づいて、6つの群に分類することができる:コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)、ゼラチナーゼ(MMP-2およびMMP-9)、ストロメライシン(MMP-3、-10、および-11)、マトリライシン(MMP-7およびMMP-26)、膜型(MT)-MMP(MMP-14、-15、-16、-17、-24、および-25)、ならびにその他(MMP-12、-19、-20、-21、-23、-27、および-28)。一部の実施形態では、間質改変部分はヒト組換えMMP(例えば、MMP-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、10、-11、-12、-13、-14、15、-15、-17、-18、-19、20、-21、-22、-23、または-24)である。
[00807]マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)は、細胞外マトリックス(ECM)分解に関与する主要なプロテアーゼである亜鉛依存性エンドペプチダーゼである。MMPは、広範な細胞外分子およびいくつかの生体活性分子を分解することができる。ヒトにおいて、24個のMMP遺伝子が特定されており、これらは、ドメイン構成および基質優先性に基づいて、6つの群に分類することができる:コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)、ゼラチナーゼ(MMP-2およびMMP-9)、ストロメライシン(MMP-3、-10、および-11)、マトリライシン(MMP-7およびMMP-26)、膜型(MT)-MMP(MMP-14、-15、-16、-17、-24、および-25)、ならびにその他(MMP-12、-19、-20、-21、-23、-27、および-28)。一部の実施形態では、間質改変部分はヒト組換えMMP(例えば、MMP-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、10、-11、-12、-13、-14、15、-15、-17、-18、-19、20、-21、-22、-23、または-24)である。
[00808]コラゲナーゼ
[00809]3つの哺乳動物コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)は、コラーゲン性細胞外マトリックスを切断することができる主要な分泌型エンドペプチダーゼである。線維性コラーゲンに加えて、コラゲナーゼは、成長因子を含む複数の他のマトリックスおよび非マトリックスタンパク質を切断することができる。コラゲナーゼは、不活性な代替形態として合成され、一旦活性化されると、それらの活性は、特異的組織メタロプロテイナーゼ阻害剤、TIMPによって、ならびに非特異的プロテイナーゼ阻害剤によって阻害される(Ala-aho R et al. Biochimie. Collagenases in cancer. 2005 Mar-Apr;87(3-4):273-86)。一部の実施形態では、間質改変部分はコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはヒト組換えコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-1である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-8である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-13である。
[00809]3つの哺乳動物コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)は、コラーゲン性細胞外マトリックスを切断することができる主要な分泌型エンドペプチダーゼである。線維性コラーゲンに加えて、コラゲナーゼは、成長因子を含む複数の他のマトリックスおよび非マトリックスタンパク質を切断することができる。コラゲナーゼは、不活性な代替形態として合成され、一旦活性化されると、それらの活性は、特異的組織メタロプロテイナーゼ阻害剤、TIMPによって、ならびに非特異的プロテイナーゼ阻害剤によって阻害される(Ala-aho R et al. Biochimie. Collagenases in cancer. 2005 Mar-Apr;87(3-4):273-86)。一部の実施形態では、間質改変部分はコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはヒト組換えコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-1である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-8である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-13である。
[00810]マクロファージメタロエラスターゼ
[00811]MMP-12としても知られるマクロファージメタロエラスターゼ(MME)は、MMPのストロメライシンサブグループのメンバーであり、可溶性および不溶性エラスチン、ならびにIV型コラーゲン、フィブロネクチン、ラミニン、ビトロネクチン、エンタクチン、ヘパラン、およびコンドロイチン硫酸塩を含む広範なマトリックスおよび非マトリックス基質の加水分解を触媒する(Erja Kerkela et al. Journal of Investigative Dermatology (2000)114, 1113-1119; doi:10.1046/j.1523-1747.2000.00993)。一部の実施形態では、間質改変部分はMMEである。一部の実施形態では、MMEはヒト組換えMMEである。一部の実施形態では、MMEはMMP-12である。
[00811]MMP-12としても知られるマクロファージメタロエラスターゼ(MME)は、MMPのストロメライシンサブグループのメンバーであり、可溶性および不溶性エラスチン、ならびにIV型コラーゲン、フィブロネクチン、ラミニン、ビトロネクチン、エンタクチン、ヘパラン、およびコンドロイチン硫酸塩を含む広範なマトリックスおよび非マトリックス基質の加水分解を触媒する(Erja Kerkela et al. Journal of Investigative Dermatology (2000)114, 1113-1119; doi:10.1046/j.1523-1747.2000.00993)。一部の実施形態では、間質改変部分はMMEである。一部の実施形態では、MMEはヒト組換えMMEである。一部の実施形態では、MMEはMMP-12である。
さらなる間質改変部分
[00812]一部の実施形態では、間質改変部分は、間質もしくは細胞外マトリックス(ECM)成分のレベルもしくは産生の減少;腫瘍線維形成の減少;間質腫瘍輸送の増加;腫瘍灌流の改善;腫瘍微小血管の拡大;腫瘍における間質液圧(IFP)の減少;または薬剤、例えば、がん治療薬もしくは細胞療法の、腫瘍もしくは腫瘍血管への浸透もしくは拡散の減少もしくは増強のうちの1つまたは複数を引き起こす。
[00812]一部の実施形態では、間質改変部分は、間質もしくは細胞外マトリックス(ECM)成分のレベルもしくは産生の減少;腫瘍線維形成の減少;間質腫瘍輸送の増加;腫瘍灌流の改善;腫瘍微小血管の拡大;腫瘍における間質液圧(IFP)の減少;または薬剤、例えば、がん治療薬もしくは細胞療法の、腫瘍もしくは腫瘍血管への浸透もしくは拡散の減少もしくは増強のうちの1つまたは複数を引き起こす。
[00813]一部の実施形態では、減少される間質またはECM成分は、グリコサミノグリカンもしくは細胞外タンパク質、またはそれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、グリコサミノグリカンは、ヒアルロナン(ヒアルロン酸もしくはHAとしても知られる)、コンドロイチン硫酸塩、コンドロイチン、デルマタン硫酸塩、ヘパリン、ヘパリン硫酸塩、エンタクチン、テネイシン、アグリカン、およびケラチン硫酸塩から選択される。一部の実施形態では、細胞外タンパク質は、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはビトロネクチンから選択される。一部の実施形態では、間質改変部分は、腫瘍間質または細胞外マトリックス(ECM)を分解する酵素分子を含む。一部の実施形態では、酵素分子は、ヒアルロニダーゼ分子、コラゲナーゼ分子、コンドロイチナーゼ分子、マトリックスメタロプロテイナーゼ分子(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)、または前述のもののいずれかのバリアント(例えば、断片)から選択される。「酵素分子」という用語には、酵素の全長、その断片、またはバリアント、例えば、天然に存在する酵素の少なくとも1つの機能的特性を保持する酵素バリアントが含まれる。
[00814]一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロン酸のレベルまたは産生を減少させる。他の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナン分解酵素、ヒアルロナン合成を阻害する薬剤、またはヒアルロン酸に対する抗体分子を含む。
[00815]一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、ヒアルロニダーゼ分子、例えば、全長またはそのバリアント(例えば、その断片)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、中性または酸性のpH、例えば、約4~5のpHにおいて活性である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、哺乳動物ヒアルロニダーゼ分子、例えば、組換えヒトヒアルロニダーゼ分子、例えば、全長またはそのバリアント(例えば、その断片、例えば、短縮形態)である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、HYAL1、HYAL2、もしくはPH-20/SPAM1、またはそのバリアント(例えば、その短縮形態)から選択される。一部の実施形態では、短縮形態は、C末端グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合部位またはGPI結合部位の一部分が欠如している。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、グリコシル化されている、例えば、少なくとも1つのN結合型グリカンを含む。
[00816]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号7256)、またはその断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7256のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00817]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、
(i)配列番号7256の36~464のアミノ酸配列;
(ii)PH20の36~481、36~482、もしくは36~483のアミノ酸配列、ここで、PH20は配列番号7256に記載されるアミノ酸配列を有する;
(iii)配列番号7256に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくはその短縮形態に対して少なくとも95%~100%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または
(iv)配列番号7256に記載されるアミノ酸配列に対して30個、20個、10個、5つ、もしくはそれよりも少ないアミノ酸置換を有するアミノ酸配列
を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号7256のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、100%)同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号7256のヌクレオチド配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一のヌクレオチド配列によってコードされる。
(i)配列番号7256の36~464のアミノ酸配列;
(ii)PH20の36~481、36~482、もしくは36~483のアミノ酸配列、ここで、PH20は配列番号7256に記載されるアミノ酸配列を有する;
(iii)配列番号7256に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくはその短縮形態に対して少なくとも95%~100%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または
(iv)配列番号7256に記載されるアミノ酸配列に対して30個、20個、10個、5つ、もしくはそれよりも少ないアミノ酸置換を有するアミノ酸配列
を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号7256のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、100%)同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号7256のヌクレオチド配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一のヌクレオチド配列によってコードされる。
[00818]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、PH20、例えば、rHuPH20である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子はHYAL1であり、アミノ酸配列:
FRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW(配列番号7253)、またはその断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7253のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
FRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW(配列番号7253)、またはその断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7253のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00819]一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、ポリマーをさらに含み、例えば、ポリマー、例えば、PEGにコンジュゲートされている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素はPEG化PH20酵素(PEGPH20)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域、より具体的には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択される、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)をさらに含む。一部の実施形態では、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)は、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子に連結、例えば、共有結合的に連結されている。一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、Fc受容体の結合、抗体のグリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞の機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるように、変更、例えば、突然変異されている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、二量体を形成する。
[00820]一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナンの合成、例えば、HAシンターゼの阻害剤を含む。一部の実施形態では、阻害剤は、HAシンターゼに対するセンスもしくはアンチセンス核酸分子を含むか、または小分子薬である。一部の実施形態では、阻害剤は、4-メチルウンベリフェロン(MU)もしくはその誘導体(例えば、6,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンもしくは5,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリン)、またはレフルノミドもしくはその誘導体である。
[00821]一部の実施形態では、間質改変部分はヒアルロン酸に対する抗体分子を含む。
[00822]一部の実施形態では、間質改変部分は、コラゲナーゼ分子、例えば、哺乳動物コラゲナーゼ分子、またはそのバリアント(例えば、断片)を含む。一部の実施形態では、コラゲナーゼ分子は、例えば、
YNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC(配列番号7254)のアミノ酸配列、またはその断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7254のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む、コラゲナーゼ分子IVである。
YNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC(配列番号7254)のアミノ酸配列、またはその断片、もしくはそれと実質的に同一である(例えば、それと95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号7254のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む、コラゲナーゼ分子IVである。
リンカー
[00823]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、リンカー、例えば、抗原結合性ドメインとサイトカイン分子との間、抗原結合性ドメインと免疫細胞エンゲージャーとの間、抗原結合性ドメインと間質改変部分との間、サイトカイン分子と免疫細胞エンゲージャーとの間、サイトカイン分子と間質改変部分との間、免疫細胞エンゲージャーと間質改変部分との間、抗原結合性ドメインと免疫グロブリン鎖定常領域との間、サイトカイン分子と免疫グロブリン鎖定常領域との間、免疫細胞エンゲージャーと免疫グロブリン鎖定常領域との間、または間質改変部分と免疫グロブリン鎖定常領域との間のうちの1つまたは複数におけるリンカーをさらに含み得る。実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、もしくは非ヘリックスリンカー、またはこれらの組合せから選択される。
[00823]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、リンカー、例えば、抗原結合性ドメインとサイトカイン分子との間、抗原結合性ドメインと免疫細胞エンゲージャーとの間、抗原結合性ドメインと間質改変部分との間、サイトカイン分子と免疫細胞エンゲージャーとの間、サイトカイン分子と間質改変部分との間、免疫細胞エンゲージャーと間質改変部分との間、抗原結合性ドメインと免疫グロブリン鎖定常領域との間、サイトカイン分子と免疫グロブリン鎖定常領域との間、免疫細胞エンゲージャーと免疫グロブリン鎖定常領域との間、または間質改変部分と免疫グロブリン鎖定常領域との間のうちの1つまたは複数におけるリンカーをさらに含み得る。実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、もしくは非ヘリックスリンカー、またはこれらの組合せから選択される。
[00824]一実施形態では、多特異性分子は、1つ、2つ、3つ、または4つのリンカー、例えば、ペプチドリンカーを含み得る。一実施形態では、ペプチドリンカーは、GlyおよびSerを含む。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、GGGGS(配列番号7249);GGGGSGGGGS(配列番号7250);GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号7251);およびDVPSGPGGGGGSGGGGS(配列番号7252)から選択される。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、A(EAAAK)nA(配列番号7255)ファミリーのリンカー(例えば、Protein Eng. (2001) 14 (8): 529-532に記載される)である。これらは、nが2~5の範囲である剛直なヘリックスリンカーである。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、AEAAAKEAAAKAAA(配列番号75);AEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号76);AEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号77);およびAEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号78)から選択される。
核酸
[00825]前述の多特異性または多機能性分子をコードする核酸もまた、開示される。
[00825]前述の多特異性または多機能性分子をコードする核酸もまた、開示される。
[00826]ある特定の実施形態では、本発明は、本明細書に記載される抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域およびCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を特徴とする。例えば、本発明は、本明細書に開示される抗体分子のうちの1つまたは複数から選択される抗体分子の、重鎖および軽鎖可変領域をそれぞれコードする、第1および第2の核酸を特徴とする。核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一であるか、または3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが、本明細書の表に示される配列と異なる配列を含む。
[00827]ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。他の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。なおも別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する重鎖および軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。
[00828]ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、それに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。なおも別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する重鎖および軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。
[00829]ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書に開示されるサイトカイン分子、免疫細胞エンゲージャー、または間質改変部分をコードするヌクレオチド配列を含み得る。
[00830]別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、本明細書において以下により詳細に記載されるように、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。
ベクター
[00831]さらに、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチド配列を含むベクターが本明細書で提供される。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチドを含む。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載されるヌクレオチド配列を含む。ベクターとしては、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージ、または酵母人工染色体(YAC)が挙げられるが、これらに限定されない。
[00831]さらに、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチド配列を含むベクターが本明細書で提供される。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチドを含む。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載されるヌクレオチド配列を含む。ベクターとしては、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージ、または酵母人工染色体(YAC)が挙げられるが、これらに限定されない。
[00832]多数のベクター系を用いることができる。例えば、1つのクラスのベクターは、動物ウイルス、例えば、ウシパピローマウイルス、ポリオーマウイルス、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、バキュロウイルス、レトロウイルス(ラウス肉腫ウイルス、MMTV、もしくはMOMLV)、またはSV40ウイルスなどに由来するDNAエレメントを利用する。別のクラスのベクターは、RNAウイルス、例えば、セムリキ森林ウイルス、東部ウマ脳炎ウイルス、およびフラビウイルスに由来するRNAエレメントを利用する。
[00833]加えて、DNAが染色体に安定に組み込まれた細胞を、トランスフェクトされた宿主細胞の選択を可能にする1つまたは複数のマーカーを導入することによって、選択することができる。マーカーは、例えば、栄養要求性宿主に対するプロトトロピー、殺生物剤耐性(例えば、抗生物質)、または重金属、例えば、銅に対する耐性などを提供し得る。選択可能なマーカー遺伝子は、発現させようとするDNA配列に直接的に連結させるか、または共形質転換によって同じ細胞に導入するかのいずれかを行うことができる。最適なmRNAの合成には、追加のエレメントも必要とされ得る。これらのエレメントとしては、スプライスシグナル、ならびに転写プロモーター、エンハンサー、および終結シグナルを挙げることができる。
[00834]構築物を含む発現ベクターまたはDNA配列を、発現のために調製した後、発現ベクターを、適切な宿主細胞にトランスフェクトまたは導入することができる。例えば、プロトプラスト融合、リン酸カルシウム沈降、エレクトロポレーション、レトロウイルス形質導入、ウイルストランスフェクション、遺伝子銃、脂質に基づくトランスフェクション、または他の従来的な技法など、様々な技法を用いてこれを達成することができる。プロトプラスト融合の場合、細胞を、培地において成長させ、適切な活性に関してスクリーニングする。結果として得られたトランスフェクトした細胞の培養、および産生される抗体分子の回収のための方法および条件は、当業者に公知であり、本明細書に基づいて、用いられる具体的な発現ベクターおよび哺乳動物宿主細胞に応じて変更または最適化することができる。
細胞
[00835]別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。宿主細胞は、真核生物細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、または原核生物細胞、例えば、大腸菌であってもよい。例えば、哺乳動物細胞は、培養した細胞または細胞系であり得る。例示的な哺乳動物細胞としては、リンパ球細胞系(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞、およびトランスジェニック動物に由来する細胞、例えば、乳腺上皮細胞が挙げられる。
[00835]別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。宿主細胞は、真核生物細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、または原核生物細胞、例えば、大腸菌であってもよい。例えば、哺乳動物細胞は、培養した細胞または細胞系であり得る。例示的な哺乳動物細胞としては、リンパ球細胞系(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞、およびトランスジェニック動物に由来する細胞、例えば、乳腺上皮細胞が挙げられる。
[00836]本発明はまた、本明細書に記載される抗体分子をコードする核酸を含む宿主細胞も提供する。
[00837]一実施形態では、宿主細胞は、抗体分子をコードする核酸を含むように遺伝子操作されている。
[00838]一実施形態では、宿主細胞は、発現カセットを使用することによって遺伝子操作されている。「発現カセット」という語句は、ヌクレオチド配列を指し、そのような配列と適合性のある宿主における遺伝子の発現を達成することができる。そのようなカセットとしては、プロモーター、イントロンありまたはなしのオープンリーディングフレーム、終結シグナルを挙げることができる。例えば、誘導性プロモーターなど、発現を達成するのに必要であるかまたは役に立つ追加の因子もまた、使用することができる。
[00839]本発明はまた、本明細書に記載されるベクターを含む宿主細胞も提供する。
[00840]細胞は、真核生物細胞、細菌細胞、昆虫細胞、またはヒト細胞であり得るが、これらに限定されない。好適な真核生物細胞としては、Vero細胞、HeLa細胞、COS細胞、CHO細胞、HEK293細胞、BHK細胞、およびMDCKII細胞が挙げられるが、これらに限定されない。好適な昆虫細胞としては、Sf9細胞が挙げられるが、これに限定されない。
使用および組合せ治療
[00841]本明細書に記載される方法は、本明細書に記載される多特異性分子を使用して、例えば、本明細書に記載される医薬組成物を使用して、対象におけるがんを処置するステップを含む。また、対象におけるがんの症状を低減または改善する方法、ならびにがんの成長を阻害するおよび/または1つもしくは複数のがん細胞を殺滅させる方法が、提供される。実施形態では、本明細書に記載される方法は、本明細書に記載されるものまたは本明細書に記載される医薬組成物が投与された対象において、腫瘍のサイズを減少させ、かつ/またはがん細胞の数を減少させる。
[00841]本明細書に記載される方法は、本明細書に記載される多特異性分子を使用して、例えば、本明細書に記載される医薬組成物を使用して、対象におけるがんを処置するステップを含む。また、対象におけるがんの症状を低減または改善する方法、ならびにがんの成長を阻害するおよび/または1つもしくは複数のがん細胞を殺滅させる方法が、提供される。実施形態では、本明細書に記載される方法は、本明細書に記載されるものまたは本明細書に記載される医薬組成物が投与された対象において、腫瘍のサイズを減少させ、かつ/またはがん細胞の数を減少させる。
[00842]実施形態では、がんは、血液がんである。実施形態では、血液がんは、白血病またはリンパ腫である。本明細書で使用される場合、「血液がん」は、造血系またはリンパ系組織の腫瘍、例えば、血液、骨髄、またはリンパ節に罹患する腫瘍を指す。例示的な血液悪性腫瘍としては、白血病(例えば、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、有毛細胞性白血病、急性単球性白血病(AMoL)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、若年性骨髄単球性白血病(JMML)、もしくは大顆粒リンパ球性白血病)、リンパ腫(例えば、AIDS関連リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫(例えば、古典的なホジキンリンパ腫もしくは結節性リンパ球優位型ホジキンリンパ腫)、菌状息肉腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞非ホジキンリンパ腫(例えば、バーキットリンパ腫、小リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、免疫芽球性大細胞型リンパ腫、前駆Bリンパ芽球性リンパ腫、もしくはマントル細胞リンパ腫)、またはT細胞非ホジキンリンパ腫(菌状息肉腫、未分化大細胞リンパ腫、もしくは前駆Tリンパ芽球性リンパ腫))、原発性中枢神経系リンパ腫、セザリー症候群、ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症)、慢性骨髄増殖性新生物、ランゲルハンス細胞組織球症、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、または骨髄異形成性/骨髄増殖性新生物が挙げられるが、これらに限定されない。
[00843]実施形態では、がんは固形がんである。例示的な固形がんには、卵巣がん、直腸がん、胃がん、精巣がん、肛門領域のがん、子宮がん、結腸がん、直腸がん、腎細胞癌、肝臓がん、非小細胞肺癌、小腸がん、食道がん、黒色腫、カポジ肉腫、内分泌系がん、甲状腺がん、副甲状腺がん、副腎がん、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部がん、皮膚または眼内悪性黒色腫、子宮がん、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、類表皮がん、頸部扁平上皮がんの癌腫、卵管癌、子宮内膜癌、膣癌、軟部組織の肉腫、尿道がん、外陰部癌、陰茎がん、膀胱がん、腎臓または尿管のがん、腎盂癌、脊椎軸腫瘍、中枢神経系(CNS)の新生物、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、前述のがんの転移病変、またはそれらの組合せが含まれるが、これらに限定されない。
[00844]ある特定の実施形態では、がんは上皮性、間葉性または血液悪性腫瘍である。ある特定の実施形態では、処置されるがんは、固形腫瘍(例えば、カルチノイド、癌腫または肉腫)、軟部組織腫瘍(例えば、ヘム悪性腫瘍)、および転移病変、例えば、本明細書に開示されるがんのいずれかの転移病変である。一実施形態では、処置されるがんは、線維性または線維形成性固形腫瘍、例えば、限られた腫瘍灌流、圧迫血管、線維性腫瘍間質、または間質液圧の増加のうちの1つまたは複数を有する腫瘍である。一実施形態では、固形腫瘍は、膵臓(例えば、膵臓腺癌または膵管腺癌)、乳房、結腸、結腸直腸、肺(例えば、小細胞肺がん(SCLC)または非小細胞肺がん(NSCLC))、皮膚、卵巣、肝臓のがん、食道がん、子宮内膜がん、胃がん、頭頸部がん、腎臓、または前立腺がんのうちの1つまたは複数から選択される。
[00845]がんの例には、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、および白血病またはリンパ性悪性腫瘍が含まれるが、これらに限定されない。そのようながんのより具体的な例は以下に記載されており、扁平上皮がん(例えば、上皮扁平上皮がん)、小細胞肺がんを含む肺がん、非小細胞肺がん、肺腺癌および肺扁平上皮癌、腹膜がん、肝細胞がん、胃腸がんを含む胃(gastric)または胃(stomach)がん、膵臓がん、膠芽腫、子宮頸がん、卵巣がん、肝臓がん、膀胱がん、肝細胞腫、乳がん、結腸がん、直腸がん、結腸直腸がん、子宮内膜がんまたは子宮癌、唾液腺癌、腎臓がんまたは腎がん、前立腺がん、外陰がん、甲状腺がん、肝癌、肛門癌、陰茎癌、ならびに頭頸部がんを含む。「がん」という用語には、原発性悪性細胞または腫瘍(例えば、元の悪性腫瘍または腫瘍の部位以外の対象の体内の部位に細胞が移動していないもの)および二次悪性細胞または腫瘍(例えば、転移から生じるもの、悪性細胞または腫瘍細胞の、元の腫瘍の部位とは異なる二次部位への移動)が含まれる。
[00846]がんまたは悪性腫瘍の他の例には、急性小児リンパ芽球性白血病、急性リンパ芽球性白血病、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、副腎皮質癌、成人(原発性)肝細胞がん、成人(原発性)肝臓がん、成人急性リンパ球性白血病、成人急性骨髄性白血病、成人ホジキン病、成人ホジキンリンパ腫、成人リンパ球性白血病、成人非ホジキンリンパ腫、成人原発性肝臓がん、成人軟部組織肉腫、エイズ関連リンパ腫、エイズ関連悪性腫瘍、肛門がん、星状細胞腫、胆管がん、膀胱がん、骨がん、脳幹神経膠腫、脳腫瘍、乳がん、腎盂および尿管のがん、中枢神経系(原発性)リンパ腫、中枢神経系リンパ腫、小脳星状細胞腫、大脳星状細胞腫、子宮頸がん、小児(原発性)肝細胞がん、小児(原発性)肝臓がん、小児急性リンパ芽球性白血病、小児急性骨髄性白血病、小児脳幹神経膠腫、小児小脳星状細胞腫、小児大脳星状細胞腫、小児頭蓋外胚細胞腫瘍、小児ホジキン病、小児ホジキンリンパ腫、小児視床下部および視覚経路神経膠腫、小児リンパ芽球性白血病、小児髄芽腫、小児非ホジキンリンパ腫、小児松果体およびテント上原始神経外胚葉性腫瘍、小児原発性肝臓がん、小児横紋筋肉腫、小児軟部組織肉腫、小児視覚経路および視床下部神経膠腫、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、結腸がん、皮膚T細胞リンパ腫、膵臓内分泌膵島細胞癌、子宮内膜がん、上衣腫、上皮がん、食道がん、ユーイング肉腫および関連腫瘍、外分泌膵がん、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管がん、眼がん、女性乳がん、ゴーシェ病、胆嚢がん、胃がん、消化管カルチノイド腫瘍、消化管腫瘍、胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛腫瘍、有毛細胞白血病、頭頸部がん、肝細胞がん、ホジキン病、ホジキンリンパ腫、高ガンマグロブリン血症、下咽頭がん、腸がん、眼内黒色腫、膵島細胞癌、膵島細胞膵がん、カポジ肉腫、腎臓がん、喉頭がん、口唇および口腔がん、肝臓がん、肺がん、リンパ増殖性障害、マクログロブリン血症、男性乳がん、悪性中皮腫、悪性胸腺腫、髄芽腫、黒色腫、中皮腫、転移性潜在性原発性扁平上皮頸部がん、転移性原発性扁平上皮頸部がん、転移性扁平上皮頸部がん、多発性骨髄腫、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、骨髄性白血病(Myelogenous Leukemia)、骨髄性白血病(Myeloid Leukemia)、骨髄増殖性障害、鼻腔および副鼻腔がん、鼻咽頭がん、神経芽細胞腫、妊娠中の非ホジキンリンパ腫、非黒色腫皮膚がん、非小細胞肺がん、潜在性原発性転移性扁平上皮頸部がん、中咽頭がん、骨/悪性線維肉腫、骨肉腫/悪性線維性組織球腫、骨肉腫/骨の悪性線維性組織球腫、卵巣上皮がん、卵巣胚細胞腫瘍、卵巣低悪性度腫瘍、膵臓がん、パラプロテイン血症、紫斑病、副甲状腺がん、陰茎がん、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、形質細胞新生物/多発性骨髄腫、原発性中枢神経系リンパ腫、原発性肝臓がん、前立腺がん、直腸がん、腎細胞がん、腎盂および尿管がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺がん、サルコイドーシス肉腫、セザリー症候群、皮膚がん、小細胞肺がん、小腸がん、軟部組織肉腫、扁平上皮頸部がん、胃がん、テント上原始神経外胚葉性および松果体腫瘍、T細胞リンパ腫、精巣がん、胸腺腫、甲状腺がん、腎盂および尿管の移行上皮細胞がん、移行性腎盂および尿管がん、絨毛腫瘍、尿管および腎盂細胞がん、尿道がん、子宮がん、子宮肉腫、膣がん、視覚経路および視床下部神経膠腫、外陰がん、ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症、ウィルムス腫瘍、および上記の臓器系に存在する新生物以外の他のいずれかの過増殖性疾患が含まれるが、これらに限定されない。
[00847]他の実施形態では、上記および本明細書に記載される多特異性分子は、過剰増殖性障害、例えば、過剰増殖性結合組織障害(例えば、過剰増殖性線維性疾患)を処置するために使用される。一実施形態では、過剰増殖性線維性疾患は、多全身性または臓器特異的である。例示的な過剰増殖性線維性疾患には、多全身性(例えば、全身性硬化症、多病巣性線維硬化症、骨髄移植レシピエントにおける強皮腫移植片対宿主病、腎性全身性線維症、強皮症)、および臓器特異的障害(例えば、眼、肺、肝臓、心臓、腎臓、膵臓、皮膚およびその他の臓器の線維症)が含まれるが、これらに限定されない。他の実施形態では、障害は肝硬変または結核から選択される。他の実施形態では、障害はハンセン病である。
[00848]実施形態では、多特異性分子(または医薬組成物)は、処置または予防される疾患に適した様式で投与される。投与の回数および頻度は、患者の状態、ならびに患者の疾患の種類および重症度などの因子によって決定される。適切な投薬量は、臨床試験によって決定され得る。例えば、「有効量」または「治療量」が示される場合、投与される医薬組成物(または多特異性分子)の正確な量は、腫瘍の大きさ、感染または転移の程度、年齢、体重、および対象の状態の個人差を考慮して医師により決定され得る。実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、104~109個の細胞/体重kg、例えば、105~106個の細胞/体重kgの投薬量で投与され得、これらの範囲内のすべての整数値が含まれる。実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、これらの投薬量で複数回投与されてもよい。実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、免疫療法において説明されている注入技法を使用して投与してもよい(例えば、Rosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988を参照されたい)。
[00849]実施形態では、がんは、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)である。実施形態では、がんは、骨髄線維症である。実施形態では、対象は、骨髄線維症を有する。実施形態では、対象は、カルレティキュリン突然変異、例えば、本明細書に開示されるカルレティキュリン突然変異を有する。実施形態では、対象は、JAK2-V617F突然変異を有さない。実施形態では、対象は、JAK2-V617F突然変異を有する。実施形態では、対象は、MPL突然変異を有する。実施形態では、対象は、MPL突然変異を有さない。
[00850]実施形態では、がんは、固形がんである。例示的な固形がんとしては、卵巣がん、直腸がん、胃がん、精巣がん、肛門領域のがん、子宮がん、結腸がん、直腸がん、腎細胞癌、肝臓がん、肺の非小細胞癌、小腸のがん、食道のがん、黒色腫、カポジ肉腫、内分泌系のがん、甲状腺のがん、副甲状腺のがん、副腎のがん、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部のがん、皮膚もしくは眼球の悪性黒色腫、子宮がん、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、類表皮がん、子宮頸の癌 扁平上皮細胞がん、卵管の癌、子宮内膜の癌、膣の癌、軟部組織の肉腫、尿道のがん、外陰部の癌、陰茎のがん、膀胱のがん、腎臓もしくは尿管のがん、腎盂の癌、脊髄軸腫瘍、中枢神経系(CNS)の新生物、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、前記がんの転移病変、またはこれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されない。
[00851]実施形態では、多特異性分子または医薬組成物は、対象に非経口投与される。実施形態では、細胞は、静脈内、皮下、腫瘍内、節内(intranodally)、筋肉内、皮内、または腹腔内で、対象に投与される。実施形態では、細胞は、腫瘍またはリンパ節に直接的に、投与される、例えば、注射される。実施形態では、細胞は、注入(例えば、Rosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988に記載される)または静脈内プッシュ(intravenous push)として投与される。実施形態では、細胞は、注射可能なデポー製剤として投与される。
[00852]実施形態では、対象は、哺乳動物である。実施形態では、対象は、ヒト、サル、ブタ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、ラット、またはマウスである。実施形態では、対象は、ヒトである。実施形態では、対象は、例えば、18歳未満、例えば、17歳未満、16歳未満、15歳未満、14歳未満、13歳未満、12歳未満、11歳未満、10歳未満、9歳未満、8歳未満、7歳未満、6歳未満、5歳未満、4歳未満、3歳未満、2歳未満、1歳未満、またはそれ未満の小児対象である。実施形態では、対象は、成人、例えば、少なくとも18歳、例えば、少なくとも19歳、20歳、21歳、22歳、23歳、24歳、25歳、25~30歳、30~35歳、35~40歳、40~50歳、50~60歳、60~70歳、70~80歳、または80~90歳である。
併用療法
[00853]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、第2の治療剤または手法と併用して使用することができる。
[00853]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、第2の治療剤または手法と併用して使用することができる。
[00854]実施形態では、多特異性または多機能性分子および第2の治療剤または手法は、対象ががんと診断された後、例えば、がんが対象から除去される前に、投与される/行われる。実施形態では、多特異性または多機能性分子、および第2の治療剤または手法は、同時にまたは並行して投与される/行われる。例えば、1つの処置の送達は、第2の送達を開始する場合、例えば、処置の投与に重複がある場合、なおも生じている。他の実施形態では、多特異性または多機能性分子、および第2の治療剤または手法は、連続的に投与される/行われる。例えば、一方の処置の送達は、他方の処置の送達が開始する前に停止する。
[00855]実施形態では、併用療法は、いずれかの薬剤単独による単独療法よりも、より効果的な処置をもたらすことができる。実施形態では、第1および第2の処置の併用は、第1または第2の処置単独よりも有効である(例えば、症状および/またはがん細胞のより大きな減少をもたらす)。実施形態では、併用療法は、単独療法として投与された場合に類似の効果を達成するために通常必要とされる第1または第2の処置の用量と比較して、第1または第2の処置のより低い用量の使用を可能にする。実施形態では、併用療法は、部分的な相加効果、完全な相加効果、または相加効果より大きい効果を有する。
[00856]一実施形態では、多特異性または多機能性分子は、療法、例えば、がん療法(例えば、抗がん剤、免疫療法、光線力学的療法(PDT)、外科手術および/または放射線の1つまたは複数)と併用して投与される。用語「化学療法薬」、「化学療法剤」、および「抗がん剤」は、本明細書において互換的に使用される。多特異性または多機能性分子の投与および療法、例えば、がん療法は、連続的(重複を伴うまたは伴わない)であるかまたは同時であり得る。多特異性または多機能性分子の投与は、療法(例えば、がん療法)の経過中、連続的または断続的であり得る。本明細書に記載される特定の療法は、がんおよび非がん性疾患を処置するために使用することができる。例えば、PDTの有効性は、本明細書に記載された方法および組成物を用いて、がん性および非がん性状態(例えば、結核)において増強され得る(例えば、Agostinis,P.ら(2011年)CA Cancer J.Clin.61巻:250~281ページに概説される)。
抗がん療法
[00857]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、低分子量または小分子量の化学療法剤と併用して投与される。例示的な低分子量または小分子量の化学療法剤には、限定されないが、13-シス-レチノイン酸(イソトレチノイン、ACCUTANE(登録商標))、2-CdA(2-クロロデオキシアデノシン、クラドリビン、LEUSTATIN(商標))、5-アザシチジン(アザシチジン、VIDAZA(登録商標))、5-フルオロウラシル(5-FU、フルオロウラシル、ADRUCIL(登録商標))、6-メルカプトプリン(6-MP、メルカプトプリン、PURINETHOL(登録商標))、6-TG(6-チオグアニン、チオグアニン、THIOGUAN TABLOID(登録商標))、アブラキサン(パクリタキセルタンパク質-結合)、アクチノマイシン-D(ダクチノマイシン、COSMEGEN(登録商標))、アリトレチノイン(PANRETIN(登録商標))、オールトランスレチノイン酸(ATRA、トレチノイン、VESANOID(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン、HMM、HEXALEN(登録商標))、アメトプテリン(メトトレキサート、メトトレキサートナトリウム、MTX、TREXALL(商標)、RHEUMATREX(登録商標))、アミフォスチン(ETHYOL(登録商標))、アラビノシルシトシン(Ara-C、シタラビン、CYTOSAR-U(登録商標))、三酸化ヒ素(TRISENOX(登録商標))、アスパラギナーゼ(エルウィニアL-アスパラギナーゼ、L-アスパラギナーゼ、ELSPAR(登録商標)、KIDROLASE(登録商標))、BCNU(カルムスチン、BiCNU(登録商標))、ベンダムスチン(TREANDA(登録商標))、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))、ブレオマイシン(BLENOXANE(登録商標))、ブスルファン(BUSULFEX)(登録商標)、MYLERAN(登録商標))、カルシウムロイコボリン(シトロボラムファクター、フォリン酸、ロイコボリン)、カンプトテシン-11(CPT-11、イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、カルボプラチン(PARAPLATIN(登録商標))、カルムスチンウエハー(カルムスチンインプラントを有するプロリフェプロスパン20、GLIADEL(登録商標)ウエハー)、CCI-779(テムシロリムス、TORISEL(登録商標))、CCNU(ロムスチン、CeeNU)、CDDP(シスプラチン、PLATINOL(登録商標)、PLATINOL-AQ(登録商標))、クロラムブシル(ロイケラン)、シクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標)、NEOSAR(登録商標))、ダカルバジン(DIC、DTIC、イミダゾールカルボキサミド、DTIC-DOME(登録商標))、ダウノマイシン(ダウノルビシン、ダウノルビシン塩酸塩、ルビドマイシンハイドロクロライド、CERUBIDINE(登録商標))、デシタビン(DACOGEN(登録商標))、デキサゾキサン(ZINECARD(登録商標))、DHAD(ミトキサントロン、NOVANTRONE(登録商標))、ドセタキセル(TAXOTERE(登録商標))、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、RUBEX(登録商標))、エピルビシン(ELLENCE(商標))、エストラムスチン(EMCYT(登録商標))、エトポシド(VP-16、リン酸エトポシド、TOPOSAR(登録商標)、VEPESID(登録商標)、ETOPOPHOS(登録商標))、フロクスウリジン(FUDR(登録商標))、フルダラビン(FLUDARA(登録商標))、フルオロウラシル(クリーム)(CARAC(商標)、EFUDEX(登録商標)、FLUOROPLEX(登録商標))、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、ヒドロキシ尿素(HYDREA(登録商標)、DROXIA(商標)、MYLOCEL(商標))、イダルビシン(IDAMYCIN(登録商標))、イフォスファミド(IFEX(登録商標))、イキサベピロン(IXEMPRA(商標))、LCR(ロイロクリスチン、ビンクリスチン、VCR、ONCOVIN(登録商標)、VINCASAR PFS(登録商標))、L-PAM(L-サルコリシン、メルファラン、フェニルアラニンマスタード、ALKERAN(登録商標))、メクロレタミン(塩酸メクロレタミン、ムスチン、ナイトロジェンマスタード、MUSTARGEN(登録商標))、メスナ(MESNEX(商標))、マイトマイシン(マイトマイシン-C、MTC、MUTAMYCIN(登録商標))、ネララビン(ARRANON(登録商標))、オキサリプラチン(ELOXATIN(商標))、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、ONXAL(商標))、ペガスパルガーゼ(PEG-L-アスパラギナーゼ、ONCOSPAR(登録商標))、PEMETREXED(ALIMTA(登録商標))、ペントスタチン(NIPENT(登録商標))、プロカルバジン(MATULANE(登録商標))、ストレプトゾシン(ZANOSAR(登録商標))、テモゾロミド(TEMODAR(登録商標))、テニポシド(VM-26、VUMON(登録商標))、TESPA(チオホスホアミド、チオテパ、TSPA、THIOPLEX(登録商標))、トポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、ビンブラスチン(硫酸ビンブラスチン、ビンカロイコブラスチン、VLB、ALKABAN-AQ(登録商標)、VELBAN(登録商標))、ビノレルビン(酒石酸ビノレルビン、NAVELBINE(登録商標))、およびボリノスタット(ZOLINZA(登録商標))が含まれる。
[00857]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、低分子量または小分子量の化学療法剤と併用して投与される。例示的な低分子量または小分子量の化学療法剤には、限定されないが、13-シス-レチノイン酸(イソトレチノイン、ACCUTANE(登録商標))、2-CdA(2-クロロデオキシアデノシン、クラドリビン、LEUSTATIN(商標))、5-アザシチジン(アザシチジン、VIDAZA(登録商標))、5-フルオロウラシル(5-FU、フルオロウラシル、ADRUCIL(登録商標))、6-メルカプトプリン(6-MP、メルカプトプリン、PURINETHOL(登録商標))、6-TG(6-チオグアニン、チオグアニン、THIOGUAN TABLOID(登録商標))、アブラキサン(パクリタキセルタンパク質-結合)、アクチノマイシン-D(ダクチノマイシン、COSMEGEN(登録商標))、アリトレチノイン(PANRETIN(登録商標))、オールトランスレチノイン酸(ATRA、トレチノイン、VESANOID(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン、HMM、HEXALEN(登録商標))、アメトプテリン(メトトレキサート、メトトレキサートナトリウム、MTX、TREXALL(商標)、RHEUMATREX(登録商標))、アミフォスチン(ETHYOL(登録商標))、アラビノシルシトシン(Ara-C、シタラビン、CYTOSAR-U(登録商標))、三酸化ヒ素(TRISENOX(登録商標))、アスパラギナーゼ(エルウィニアL-アスパラギナーゼ、L-アスパラギナーゼ、ELSPAR(登録商標)、KIDROLASE(登録商標))、BCNU(カルムスチン、BiCNU(登録商標))、ベンダムスチン(TREANDA(登録商標))、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))、ブレオマイシン(BLENOXANE(登録商標))、ブスルファン(BUSULFEX)(登録商標)、MYLERAN(登録商標))、カルシウムロイコボリン(シトロボラムファクター、フォリン酸、ロイコボリン)、カンプトテシン-11(CPT-11、イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、カルボプラチン(PARAPLATIN(登録商標))、カルムスチンウエハー(カルムスチンインプラントを有するプロリフェプロスパン20、GLIADEL(登録商標)ウエハー)、CCI-779(テムシロリムス、TORISEL(登録商標))、CCNU(ロムスチン、CeeNU)、CDDP(シスプラチン、PLATINOL(登録商標)、PLATINOL-AQ(登録商標))、クロラムブシル(ロイケラン)、シクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標)、NEOSAR(登録商標))、ダカルバジン(DIC、DTIC、イミダゾールカルボキサミド、DTIC-DOME(登録商標))、ダウノマイシン(ダウノルビシン、ダウノルビシン塩酸塩、ルビドマイシンハイドロクロライド、CERUBIDINE(登録商標))、デシタビン(DACOGEN(登録商標))、デキサゾキサン(ZINECARD(登録商標))、DHAD(ミトキサントロン、NOVANTRONE(登録商標))、ドセタキセル(TAXOTERE(登録商標))、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、RUBEX(登録商標))、エピルビシン(ELLENCE(商標))、エストラムスチン(EMCYT(登録商標))、エトポシド(VP-16、リン酸エトポシド、TOPOSAR(登録商標)、VEPESID(登録商標)、ETOPOPHOS(登録商標))、フロクスウリジン(FUDR(登録商標))、フルダラビン(FLUDARA(登録商標))、フルオロウラシル(クリーム)(CARAC(商標)、EFUDEX(登録商標)、FLUOROPLEX(登録商標))、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、ヒドロキシ尿素(HYDREA(登録商標)、DROXIA(商標)、MYLOCEL(商標))、イダルビシン(IDAMYCIN(登録商標))、イフォスファミド(IFEX(登録商標))、イキサベピロン(IXEMPRA(商標))、LCR(ロイロクリスチン、ビンクリスチン、VCR、ONCOVIN(登録商標)、VINCASAR PFS(登録商標))、L-PAM(L-サルコリシン、メルファラン、フェニルアラニンマスタード、ALKERAN(登録商標))、メクロレタミン(塩酸メクロレタミン、ムスチン、ナイトロジェンマスタード、MUSTARGEN(登録商標))、メスナ(MESNEX(商標))、マイトマイシン(マイトマイシン-C、MTC、MUTAMYCIN(登録商標))、ネララビン(ARRANON(登録商標))、オキサリプラチン(ELOXATIN(商標))、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、ONXAL(商標))、ペガスパルガーゼ(PEG-L-アスパラギナーゼ、ONCOSPAR(登録商標))、PEMETREXED(ALIMTA(登録商標))、ペントスタチン(NIPENT(登録商標))、プロカルバジン(MATULANE(登録商標))、ストレプトゾシン(ZANOSAR(登録商標))、テモゾロミド(TEMODAR(登録商標))、テニポシド(VM-26、VUMON(登録商標))、TESPA(チオホスホアミド、チオテパ、TSPA、THIOPLEX(登録商標))、トポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、ビンブラスチン(硫酸ビンブラスチン、ビンカロイコブラスチン、VLB、ALKABAN-AQ(登録商標)、VELBAN(登録商標))、ビノレルビン(酒石酸ビノレルビン、NAVELBINE(登録商標))、およびボリノスタット(ZOLINZA(登録商標))が含まれる。
[00858]別の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、生物製剤と併用して投与される。がんの処置に有用な生物製剤は、当該技術分野において公知であり、本発明の結合分子は、例えば、このような公知の生物製剤と組み合わせて投与することができる。例えば、FDAは、乳がんの処置のために次の生物製剤を承認している:HERCEPTIN(登録商標)(トラスツズマブ、Genentech Inc.、South San Francisco、Calif.;HER2陽性乳がんで抗腫瘍活性化を有するヒト化モノクローナル抗体);FASLODEX(登録商標)(フルベストラント、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP、Wilmington、Del.;乳がんの処置に使用されるエストロゲン受容体拮抗薬);ARIMIDEX(登録商標)(アナストロゾール、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP;エストロゲンの作製に必要な酵素であるアロマターゼを遮断する非ステロイド性アロマターゼ阻害剤);アロマシン(登録商標)(エキセメスタン、Pfizer Inc.、New York、N.Y.;乳がんの処置に使用される不可逆的なステロイド性アロマターゼ不活性化剤);FEMARA(登録商標)(レトロゾール、Novartis Pharmaceuticals、East Hanover、N.J.;FDAにより乳がんを処置するために承認された非ステロイドアロマターゼ阻害剤);およびNOLVADEX(登録商標)(タモキシフェン、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP;FDAにより乳がんを処置するために承認された非ステロイド性抗エストロゲン剤)。本発明の結合分子と組み合わせることができる他の生物製剤には、以下が含まれる:AVASTIN(登録商標)(ベバシズマブ、Genentech Inc.;血管新生を阻害するように設計された最初のFDA承認療法);およびZEVALIN(登録商標)(イブリツモマブチウキセタン、Biogen Idec、Cambridge、Mass;B細胞リンパ腫の処置のために現在承認されている放射性標識モノクローナル抗体)。
[00859]さらに、FDAは、結腸直腸がんの処置のために以下の生物製剤を承認した:AVASTIN(登録商標);ERBITUX(登録商標)(セツキシマブ、ImClone Systems Inc.、New York、N.Y.、およびBristol-Myers Squibb、New York、N.Y.;上皮成長因子受容体(EGFR)に対して指向されるモノクローナル抗体);GLEEVEC(登録商標)(メシル酸イマチニブ;プロテインキナーゼ阻害剤);およびERGAMISOL(登録商標)(レバミゾール塩酸塩、Janssen Pharmaceutica Products、LP、Titusville、N.J.;デュークスのステージC結腸がんを有する患者の外科的切除後に5-フルオロウラシルと併用するアジュバント療法として1990年にFDAにより承認された免疫調節薬)。
[00860]肺がんの処置のために、例示的な生物製剤には、TARCEBA(登録商標)(エルロチニブHCL、OSI Pharmaceuticals Inc.、Melville、N.Y.;ヒト上皮成長因子受容体1(HER1)経路を標的とするように設計された小分子)が含まれる。
[00861]多発性骨髄腫の処置のために、例示的な生物製剤には、VELCADE(登録商標)ベルケイド(ボルテゾミブ、Millennium Pharmaceuticals、Cambridge Mass.、プロテアソーム阻害剤)が含まれる。追加の生物製剤には、THALIDOMID(登録商標)(サリドマイド、Clegene Corporation、Warren、N.J.;免疫調節剤であり、骨髄腫細胞の成長と生存を阻害する能力、および抗血管新生を含む複数の作用があるようである)が含まれる。
[00862]追加の例示的ながん療法用抗体には、限定されないが、3F8、アバゴボマブ、アデカツマブ、アフツズマブ、アラシズマブペゴル、アレムツズマブ(CAMPATH(登録商標)、MABCAMPATH(登録商標))、アルツモマブペンテテート(HYBRI-CEAKER(登録商標))、アナツモマブマフェナトックス、アンルキンズマブ(IMA-638)、アポリズマブ、アルシツモマブ(CEA-SCAN(登録商標))、バビツキシマブ、ベクツモマブ(LYMPHOSCAN(登録商標))、ベリムマブ(BENLYSTA(登録商標)、LYMPHOSTAT-B(登録商標))、ベシレソマブ(SCINTIMUN(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、ビバツズマブマータンシン、ブリナツモマブ、ブレンツキシマブベドチン、カンツズマブメルタンシン、カプロマブペンデチド(PROSTASCINT(登録商標))、カツマキソマブ(REMOVAB(登録商標))、CC49、セツキシマブ(C225、ERBITUX(登録商標))、シタツズマブボガトックス、シクスツムマブ、クリバツズマブテトラキセタン、コナツムマブ、デセツズマブ、デノスマブ(PROLIA(登録商標))、デツモマブ、エクロメキシマブ、エドレコロマブ(PANOREX(登録商標))、エロツズマブ、エピツモマブシツキセタン、エプラツズマブ、エルツマキソマブ(REXOMUN(登録商標))、エタラシズマブ、ファルレツズマブ、フィギツムマブ、フレソリムマブ、ガリキシマブ、ゲムツズマブオゾガミシン(MYLOTARG(登録商標))、ギレンツキシマブ、グレンバツムマブベドチン、イブリツモマブ(イブリツモマブチウキセタン、ZEVALIN(登録商標))、イゴボマブ(INDIMACIS-125(登録商標))、インテツムマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、イラツムマブ、ラベツズマブ(CEA-CIDE(登録商標))、レキサツムマブ、リンツズマブ、ルカツムマブ、ルミリキシマブ、マパツムマブ、マツズマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミツモマブ、ナコロマブタフェナトックス、ナプツモマブエスタフェナトックス、ネシツムマブ、ニモツズマブ(THERACIM(登録商標)、THERALOC(登録商標))、ノフェツモマブメルペンタン(VERLUMA(登録商標))、オファツムマブ(ARZERRA(登録商標))、オララツマブ、オポルツズマブモナトックス、オレゴボマブ(OVAREX(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ペムツモマブ(THERAGYN(登録商標))、パーツズマブ(OMNITARG(登録商標))、ピンツモマブ、プリツムマブ、ラムシルマブ、ラニビズマブ(LUCENTIS(登録商標))、リロツムマブ、リツキシマブ(MABTHERA(登録商標)、RITUXAN(登録商標))、ロバツムマブ、サツモマブペンデチド、シブロツズマブ、シルツキシマブ、ソンツズマブ、タカツズマブテトラキセタン(AFP-CIDE(登録商標))、タプリツモマブパプトックス、テナツモマブ、TGN1412、チシリムマブ(トレメリムマブ)、チガツズマブ、TNX-650、トシツモマブ(BEXXAR(登録商標))、トラスツズマブ(HERCEPTIN(登録商標))、トレメリムマブ、ツコツズマブセルモロイキン、ベルツズマブ、ボロシキシマブ、ボツムマブ(HUMASPECT(登録商標))、ザルツムマブ(HUMAX-EGFR(登録商標))、およびザノリムマブ(HUMAX-CD4(登録商標))が含まれる。
[00863]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、ウイルスがん治療剤と併用して投与される。例示的なウイルスがん治療剤には、限定されないが、ワクシニアウイルス(vvDD-CDSR)、がん胎児性抗原発現麻疹ウイルス、組換えワクシニアウイルス(TK-欠失+GM-CSF)、セネカバレーウイルス-001、ニューカッスルウイルス、コクサッキーウイルスA21、GL-ONC1、EBNA1 C末端/LMP2キメラタンパク質発現組換え修飾ワクシニアアンカラワクチン、がん胎児性抗原発現麻疹ウイルス、G207腫瘍溶解性ウイルス、p53を発現する修飾ワクシニアウイルスアンカラワクチン、OncoVEX GM-CSF修飾ヘルペスシンプレックス1ウイルス、鶏痘ウイルスワクチンベクター、組換えワクシニア前立腺特異抗原ワクチン、ヒトパピローマウイルス16/18 L1ウイルス様粒子/AS04ワクチン、MVA-EBNA1/LMP2 Inj.ワクチン、4価HPVワクチン、4価ヒトパピローマウイルス(タイプ6、11、16、18)組換えワクチン(GARDASIL(登録商標))、組換え鶏痘-CEA(6D)/TRICOMワクチン;組換えワクシニア-CEA(6D)-TRICOMワクチン、組換え修飾ワクシニアAnkara-5T4ワクチン、組換え鶏痘-TRICOMワクチン、腫瘍崩壊性ヘルペスウイルスNV1020、HPV L1 VLPワクチンV504、ヒトパピローマウイルス二価(タイプ16および18)ワクチン(CERVARIX(登録商標))、単純ヘルペスウイルスHF10、Ad5CMV-p53遺伝子、組換えワクシニアDF3/MUC1ワクチン、組換えワクシニア-MUC-1ワクチン、組換えワクシニア-TRICOMワクチン、ALVAC MART-1ワクチン、ヒトプレプロエンケファリン(NP2)を発現する複製欠損単純ヘルペスウイルスI型(HSV-1)ベクター、野生型レオウイルス、レオウイルスタイプ3ディアリング(REOLYSIN(登録商標))、腫瘍溶解性ウイルスHSV1716、エプスタイン・バーウイルス標的抗原をコードする組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ベースのワクチン、組換え鶏痘前立腺特異抗原ワクチン、組換えワクシニア前立腺特異抗原ワクチン、組換えワクシニア-B7.1ワクチン、rAd-p53遺伝子、Ad5-delta24RGD、HPVワクチン580299、JX-594(チミジンキナーゼ欠失ワクシニアウイルス+GM-CSF)、HPV-16/18 L1/AS04、鶏痘ウイルスワクチンベクター、ワクシニアチロシナーゼワクチン、MEDI-517 HPV-16/18 VLP AS04ワクチン、単純ヘルペスウイルスTK99UNのチミジンキナーゼを含むアデノウイルスベクター、HspE7、FP253/フルダラビン、ALVAC(2)黒色腫多抗原治療ワクチン、ALVAC-hB7.1、カナリア痘-hIL-12黒色腫ワクチン、Ad-REIC/Dkk-3、rAd-IFN SCH 721015、TIL-Ad-INFg、Ad-ISF35、およびコクサッキーウイルスA21(CVA21、CAVATAK(登録商標))が含まれる。
[00864]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、ナノ医薬品と併用して投与される。例示的ながんナノ医薬品には、限定されないが、ABRAXANE(登録商標)(パクリタキセル結合アルブミンナノ粒子)、CRLX101(直鎖シクロデキストリンベースのポリマーにコンジュゲートしたCPT)、CRLX288(ドセタキセルを生分解性ポリマーポリ(乳酸-co-グリコール酸)にコンジュゲートしている)、シタラビンリポソーム(リポソームAra-C、DEPOCYT(商標))、ダウノルビシンリポソーム(DAUNOXOME(登録商標))、ドキソルビシンリポソーム(DOXIL(登録商標)、CAELYX(登録商標))、カプセル化ダウノルビシンクエン酸リポソーム(DAUNOXOME(登録商標))、およびPEG抗VEGFアプタマー(MACUGEN(登録商標))が含まれる。
[00865]一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、パクリタキセルまたはパクリタキセル製剤、例えば、TAXOL(登録商標)、タンパク質結合パクリタキセル(例えば、ABRAXANE(登録商標))と併用して投与される。例示的なパクリタキセル製剤には、限定されないが、ナノ粒子アルブミン結合パクリタキセル(ABRAXANE(登録商標)、Abraxis Bioscienceにより販売される)、ドコサヘキサエン酸結合パクリタキセル(DHA-パクリタキセル、タキソプレキシン、Protargaにより販売される)、ポリグルタミン酸結合パクリタキセル(PG-パクリタキセル、パクリタキセル・ポリグルメックス、CT-2103、XYOTAX、Cell Therapeuticにより販売される)、腫瘍活性化プロドラッグ(TAP)、ANG105(Angiopep-2はパクリタキセルの3つの分子に結合し、ImmunoGenにより販売される)、パクリタキセル-EC-1(パクリタキセルはerbB2認識ペプチドEC-1に結合する;Liら、Biopolymers(2007年)87巻:225~230ページを参照)、およびグルコースをコンジュゲートしたパクリタキセル(例えば、2’-パクリタキセルメチル2-グルコピラノシルスクシナート、Liuら、Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters(2007年)17巻:617~620ページを参照)が含まれる。
[00866]がんを処置するための例示的なRNAiおよびアンチセンスRNA剤には、限定されないが、CALAA-01、siG12D LODER(Local Drug EluteR)、およびALN-VSP02が含まれる。
[00867]他のがん治療剤には、限定されないが、サイトカイン(例えば、アルデスロイキン(IL-2、インターロイキン-2、PROLEUKIN(登録商標))、アルファインターフェロン(IFN-アルファ、インターフェロンアルファ、INTRON(登録商標)A(インターフェロンアルファ-2b)、ROFERON-A(登録商標)(インターフェロンアルファ-2a))、エポエチンアルファ(PROCRIT(登録商標))、フィルグラスチム(G-CSF、顆粒球-コロニー刺激因子、NEUPOGEN(登録商標))、GM-CSF(顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、サルグラモスチム、LEUKINE(商標))、IL-11(インターロイキン-11、オプレルベキン、NEUMEGA(登録商標))、インターフェロンアルファ-2b(PEGコンジュゲート)(PEGインターフェロン、PEG-INTRON(商標))、およびペグフィルグラスチム(NEULASTA(商標))、ホルモン療法剤(例えば、アミノグルテチミド(CYTADREN(登録商標))、アナストロゾール(ARIMIDEX(登録商標))、ビカルタミド(CASODEX(登録商標))、エキセメスタン(AROMASIN(登録商標))、フルオキシメステロン(HALOTESTIN(登録商標))、フルタミド(EULEXIN(登録商標))、フルベストラント(FASLODEX(登録商標))、ゴセレリン(ZOLADEX(登録商標))、レトロゾール(FEMARA(登録商標))、リュープロリド(ELIGARD(商標)、LUPRON(登録商標)、LUPRON DEPOT(登録商標)、VIADUR(商標))、メゲストロール(酢酸メゲストロール、MEGACE(登録商標))、ニルタミド(ANANDRON(登録商標)、NILANDRON(登録商標))、オクトレオチド(酢酸オクトレオチド、SANDOSTATIN(登録商標)、SANDOSTATIN LAR(登録商標))、ラロキシフェン(EVISTA(登録商標))、ロミプロスチム(NPLATE(登録商標))、タモキシフェン(NOVALDEX(登録商標))、およびトレミフェン(FARESTON(登録商標)))、ホスホリパーゼA2阻害剤(例えば、アナグレリド(AGRYLIN(登録商標)))、生物応答改変剤(例えば、BCG(THERACYS(登録商標)、TICE(登録商標))、およびダルベポエチンアルファ(ARANESP(登録商標)))、標的治療薬(例えば、ボルテゾミブ(VELCADE(登録商標))、ダサチニブ(SPRYCEL(商標))、デニロイキンジフチトックス(ONTAK(登録商標))、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、エベロリムス(AFINITOR(登録商標))、ゲフィチニブ(IRESSA(登録商標))、メシル酸イマチニブ(STI-571、GLEEVEC(商標))、ラパチニブ(TYKERB(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、およびSU11248(スニチニブ、SUTENT(登録商標)))、免疫調節薬および抗血管新生薬(例えば、CC-5013(レナリドマイド、REVLIMID(登録商標))、およびサリドマイド(THALOMID(登録商標)))、グルココルチコステロイド(例えば、コルチゾン(ヒドロコルチゾン、ヒドロコルチゾンリン酸ナトリウム、ヒドロコルチゾンコハク酸ナトリウム、ALA-CORT(登録商標)、HYDROCORT ACETATE(登録商標)、リン酸ヒドロコルトン LANACORT(登録商標)、SOLU-CORTEF(登録商標))、デカドロン(デキサメタゾン、デキサメタゾン酢酸塩、デキサメタゾンリン酸ナトリウム、DEXASONE(登録商標)、DIODEX(登録商標)、HEXADROL(登録商標)、MAXIDEX(登録商標))、メチルプレドニゾロン(6-メチルプレドニゾロン、酢酸メチルプレドニゾロン、メチルプレドニゾロンコハク酸ナトリウム、DURALONE(登録商標)、MEDRALONE(登録商標)、MEDROL(登録商標)、M-PREDNISOL(登録商標)、SOLU-MEDROL(登録商標))、プレドニゾロン(DELTA-CORTEF(登録商標)、ORAPRED(登録商標)、PEDIAPRED(登録商標)、PRELONE(登録商標))、およびプレドニゾン(DELTASONE(登録商標)、LIQUID PRED(登録商標)、METICORTEN(登録商標)、ORASONE(登録商標)))、およびビスホスホネート(例えば、パミドロネート(AREDIA(登録商標))、およびゾレドロン酸(ZOMETA(登録商標))が含まれる。
[00868]一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、受容体チロシンキナーゼ(RTK)阻害剤)と併用して使用される。例示的なチロシンキナーゼ阻害剤には、限定されないが、上皮成長因子(EGF)経路阻害剤(例えば、上皮成長因子受容体(EGFR)阻害剤)、血管内皮成長因子(VEGF)経路阻害剤(例えば、VEGFに対する抗体、VEGFトラップ、血管内皮成長因子受容体(VEGFR)阻害剤(例えば、VEGFR-1阻害剤、VEGFR-2阻害剤、VEGFR-3阻害剤))、血小板由来成長因子(PDGF)経路阻害剤(例えば、血小板由来成長因子受容体(PDGFR)阻害剤(例えば、PDGFR-β阻害剤))、RAF-1阻害剤、KIT阻害剤およびRET阻害剤が含まれる。一部の実施形態では、AHCM剤と併用して使用される抗がん剤は、アキシチニブ(AG013736)、ボスチニブ(SKI-606)、セジラニブ(RECENTIN(商標)、AZD2171)、ダサチニブ(SPRYCEL(登録商標)、BMS-354825)、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、ゲフィチニブ(IRESSA(登録商標))、イマチニブ(Gleevec(登録商標)、CGP57148B、STI-571)、ラパチニブ(TYKERB(登録商標)、TYVERB(登録商標))、レスタウルチニブ(CEP-701)、ネラチニブ(HKI-272)、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、セマキサニブ(セマキシニブ、SU5416)、スニチニブ(SUTENT(登録商標)、SU11248)、トセラニブ(PALLADIA(登録商標))、バンデタニブ(ZACTIMA(登録商標)、ZD6474)、バタラニブ(PTK787、PTK/ZK)、トラスツズマブ(HERCEPTIN(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、リツキシマブ(RITUXAN(登録商標))、セツキシマブ(ERBITUX(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ラニビズマブ(Lucentis(登録商標))、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、アレムツズマブ(CAMPATH(登録商標))、ゲムツズマブオゾガマイシン(MYLOTARG(登録商標))、ENMD-2076、PCI-32765、AC220、乳酸ドビチニブ(TKI258、CHIR-258)、BIBW 2992(TOVOK(商標))、SGX523、PF-04217903、PF-02341066、PF-299804、BMS-777607、ABT-869、MP470、BIBF 1120(VARGATEF(登録商標))、AP24534、JNJ-26483327、MGCD265、DCC-2036、BMS-690154、CEP-11981、チボザニブ(AV-951)、OSI-930、MM-121、XL-184、XL-647、XL228、AEE788、AG-490、AST-6、BMS-599626、CUDC-101、PD153035、ペリチニブ(EKB-569)、バンデタニブ(ザクティマ)、WZ3146、WZ4002、WZ8040、ABT-869(リニファニブ)、AEE788、AP24534(ポナチニブ)、AV-951(チボザニブ)、アキシチニブ、BAY 73-4506(レゴラフェニブ)、ブリバニブアラニネート(BMS-582664)、ブリバニブ(BMS-540215)、セジラニブ(AZD2171)、CHIR-258(ドビチニブ)、CP 673451、CYC116、E7080、Ki8751、マシチニブ(AB1010)、MGCD-265、モテサニブ二リン酸(AMG-706)、MP-470、OSI-930、パゾパニブ塩酸塩、PD173074、ソラフェニブトシレート(Bay 43-9006)、SU 5402、TSU-68(SU6668)、バタラニブ、XL880(GSK1363089、EXEL-2880)からなる群から選択される。選択されたチロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、またはソラフェニブから選択される。一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブである。
[00869]一実施形態では、多特異性または多機能性分子は、抗血管新生剤、または血管標的剤または血管破壊剤のうちの1つまたは複数と併用して投与される。例示的な抗血管新生剤には、限定されないが、とりわけ、VEGF阻害剤(例えば、抗VEGF抗体(例えば、ベバシズマブ);VEGF受容体阻害剤(例えば、イトラコナゾール);細胞増殖および/または内皮細胞移動の阻害剤(例えば、カルボキシアミドトリアゾール、TNP-470);血管新生刺激剤の阻害剤(例えば、スラミン)が含まれる。血管標的剤(VTA)または血管破壊剤(VDA)は、中枢壊死を引き起こすがん腫瘍の血管系(血管)を損傷するように設計されている(例えば、Thorpe,P.E.(2004年)Clin.Cancer Res.Vol.10巻:415~427ページに概説される)。VTAは、小分子であり得る。例示的な小分子VTAには、限定されないが、微小管不安定化剤(例えば、コンブレタスタチンA-4リン酸二ナトリウム(CA4P)、ZD6126、AVE8062、Oxi 4503);およびバジメザン(ASA404)が含まれる。
免疫チェックポイント阻害剤
[00870]他の実施形態では、本明細書に記載される方法は、多特異性または多機能性分子と併用した免疫チェックポイント阻害剤の使用を含む。この方法は、in vivoの治療プロトコールにおいて使用することができる。
[00870]他の実施形態では、本明細書に記載される方法は、多特異性または多機能性分子と併用した免疫チェックポイント阻害剤の使用を含む。この方法は、in vivoの治療プロトコールにおいて使用することができる。
[00871]実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、チェックポイント分子を阻害する。例示的なチェックポイント分子には、限定されないが、CTLA4、PD1、PD-L1、PD-L2、TIM3、LAG3、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、BTLA、KIR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、およびA2aRが含まれる。例えば、参照により本明細書に組み込まれるPardoll.Nat.Rev.Cancer 12.4(2012年):252~64ページを参照されたい。
[00872]実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1阻害剤、例えば、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピジリズマブなどの抗PD-1抗体である。ニボルマブ(MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538、またはBMS-936558とも呼ばれる)は、PD1を特異的に阻害する完全ヒトIgG4モノクローナル抗体である。例えば、米国特許第8,008,449号および国際公開第2006/121168号を参照されたい。ペンブロリズマブ(Lambrolizumab、MK-3475、MK03475、SCH-900475、またはKEYTRUDA(登録商標)とも呼ばれる;Merck)は、PD-1に結合するヒト化IgG4モノクローナル抗体である。例えば、Hamid,O.ら(2013年)New England Journal of Medicine 369巻(2号):134~44ページ、米国特許第8,354,509号および国際公開第2009/114335号を参照されたい。ピジリズマブ(CT-011またはCure Techとも呼ばれる)は、PD1に結合するヒト化IgG1kモノクローナル抗体である。例えば、国際公開第2009/101611号を参照されたい。一実施形態では、PD-1の阻害剤は、実質的に同一または類似の配列、例えば、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピジリズマブの配列に対して少なくとも85%、90%、95%同一であるまたはそれを超える配列を有する抗体分子である。追加の抗PD1抗体、例えば、AMP 514(Amplimmune)は、例えば、米国特許第8,609,089号、米国特許出願公開第2010/028330号、および/または米国特許出願公開第2012/0114649号に記載されている。
[00873]一部の実施形態では、PD-1阻害剤は、イムノアドヘシン、例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリンのFc領域)に融合されたPD-1リガンド(例えば、PD-L1またはPD-L2)の細胞外/PD-1結合部分を含むイムノアドヘシンである。実施形態では、PD-1阻害剤は、B7-H1とPD-1の間の相互作用を遮断するPD-L2 Fc融合可溶性受容体であるAMP-224(B7-DCIg、例えば、国際公開第2011/066342号および国際公開第2010/027827号に記載される)である。
[00874]実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-L1阻害剤、例えば、抗体分子である。一部の実施形態では、PD-L1阻害剤は、YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C、またはMDX-1105である。一部の実施形態では、抗PD-L1抗体は、MSB0010718C(A09-246-2とも呼ばれる;Merck Serono)であり、PD-L1に結合するモノクローナル抗体である。例示的なヒト化抗PD-L1抗体は、例えば、国際公開第2013/079174号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、抗PD-L1抗体、例えば、YW243.55.S70である。YW243.55.S70抗体は、例えば、国際公開第2010/077634号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、MDX-1105(BMS-936559とも呼ばれる)であり、例えば、国際公開第2007/005874号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、MDPL3280A(Genentech/Roche)であり、PD-L1に対するヒトFc最適化IgG1モノクローナル抗体である。例えば、米国特許第7,943,743号および米国特許出願公開第2012/0039906号を参照されたい。一実施形態では、PD-L1の阻害剤は、実質的に同一または類似の配列、例えば、YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C、またはMDX-1105の配列に対して少なくとも85%、90%、95%同一であるまたはそれを超える配列を有する抗体分子である。
[00875]実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-L2阻害剤、例えば、AMP-224(PD1とB7-H1の間の相互作用を遮断するPD-L2 Fc融合可溶性受容体である)である。例えば、国際公開第2010/027827号および国際公開第2011/066342号を参照されたい。
[00876]一実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、LAG-3阻害剤、例えば、抗LAG-3抗体分子である。実施形態では、抗LAG-3抗体は、BMS-986016(BMS986016とも呼ばれる、Bristol-Myers Squibb)である。BMS-986016および他のヒト化抗LAG-3抗体は、例えば、米国特許出願公開第2011/0150892号、国際公開第2010/019570号、および国際公開第2014/008218号に記載されている。
[00877]実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、例えば、米国特許第8,552,156号、国際公開第2011/155607号、欧州特許第2581113号および米国特許出願公開第2014/044728号に記載される、抗TIM3抗体分子などのTIM-3阻害剤である。
[00878]実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、CTLA-4阻害剤、例えば、抗CTLA-4抗体分子である。例示的な抗CTLA4抗体には、トレメリムマブ(以前はチシリムマブ、CP-675,206として公知であるPfizerのIgG2モノクローナル抗体)、およびイピリムマブ(MDX-010とも呼ばれる、CAS No.477202-00-9)が含まれる。他の例示的な抗CTLA-4抗体は、例えば、米国特許第5,811,097号に記載されている。
診断的使用
[00879]本明細書に記載の抗体分子は、一部の実施形態では、診断的方法において、例えば、対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、リンパ腫、例えば、T細胞リンパ腫、例えば、T細胞悪性腫瘍)を有するかまたは有するリスクがあるか否かを決定するために使用できる。一部の実施形態では、抗体分子は、例えば、対象が、例えば、処置(例えば、本明細書に記載される抗体分子を用いる)後に、疾患または障害(例えば、がん)の予後、重症度、または存在もしくは不存在における変化を示すか否かを決定するために、コンパニオン診断において使用される。
[00879]本明細書に記載の抗体分子は、一部の実施形態では、診断的方法において、例えば、対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、リンパ腫、例えば、T細胞リンパ腫、例えば、T細胞悪性腫瘍)を有するかまたは有するリスクがあるか否かを決定するために使用できる。一部の実施形態では、抗体分子は、例えば、対象が、例えば、処置(例えば、本明細書に記載される抗体分子を用いる)後に、疾患または障害(例えば、がん)の予後、重症度、または存在もしくは不存在における変化を示すか否かを決定するために、コンパニオン診断において使用される。
[00880]一般に、診断法は、本明細書に記載される抗体分子を生体試料(例えば、組織または細胞、またはその一部もしくは成分を含む)と接触させるステップを含む。一部の実施形態では、方法は、例えば、マルチパネル法を使用するフロー分析を含む。一部の実施形態では、方法は、免疫組織化学(例えば、発色法または蛍光法)を含む。一部の実施形態では、方法は、免疫組織化学(例えば、固定された組織、例えば、FFPE組織の)を含む。一部の実施形態では、方法は、例えば、T細胞悪性腫瘍の存在および/またはレベルを決定するためのT細胞のクローナリティーを評価するステップを含む。一部の実施形態では、方法は、生体試料から得たTRBC1+細胞のレベルを測定する(例えば、例えば、健康な対象または本明細書に記載の抗体分子で処置されていない対象から得た、例えば、参照試料に対して、TRBC1+細胞が枯渇しているか否かを決定する)ステップを含む。一部の実施形態では、方法は、生体試料から得たTRBC2+細胞のレベルを測定する(例えば、対象または本明細書に記載の抗体分子で処置されていない対象から得た、例えば、参照試料に対して、例えば、TRBC2+細胞が枯渇しているか否かを決定する)ステップを含む。一部の実施形態では、方法は、TRBC1の細胞内レベル(例えば、細胞内発現)を測定するステップを含む。一部の実施形態では、方法は、TRBC1の膜レベル(例えば、膜発現)を測定するステップを含む。一部の実施形態では、方法は、TRBC2の細胞内レベル(例えば、細胞内発現)を測定するステップを含む。一部の実施形態では、方法は、TRBC2の膜レベル(例えば、膜発現)を測定するステップを含む。
[00881]一態様では、本開示は、in vitroで(例えば、対象に由来する、例えば、生体試料、例えば、組織生検(例えば、がん性組織由来の)または血液試料において)またはin vivoで(例えば、対象におけるin vivoイメージング)TRBC1またはTRBC2タンパク質の存在を検出するための診断法を提供する。方法は、(i)試料を、本明細書に記載の抗体分子と接触させるステップ、または対象に本明細書に記載の抗体分子を投与するステップ、(任意選択で)(ii)例えば、健康な対象または本明細書に記載の抗体分子で処置されていない対象から得た参照試料(例えば、対照試料)または参照対象(例えば、対照対象)、例えば、健康な対象または本明細書に記載の抗体分子で処置されていない対象)を接触させるステップ、および(iii)抗体分子と試料または対象および(任意選択で)参照試料または参照対象との間の複合体の形成を検出するステップを含む。一部の実施形態では、参照試料または参照対象と比較した、試料または対象における複合体の形成の変化、例えば、統計上有意な変化は、試料または対象におけるTRBC1またはTRBC2の存在を示す。
[00882]一部の実施形態では、生体試料は、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えば、リンパ節の1つまたは複数を含む。一部の実施形態では、生体試料は、対象から新たに得られる(例えば、凍結および/または固定されていない)。一部の実施形態では、生体試料は、凍結(例えば、瞬間凍結)されている。一部の実施形態では、生体試料は、固定されている(例えば、ホルマリン固定パラフィン包埋されている(FFPE)試料)。
[00883]結合された抗体または結合していない抗体の検出を促進するために、抗体分子を、検出可能な物質を用いて直接的または間接的に標識できる。適した検出可能な物質として、例えば、上記のような、また以下により詳細に記載される、例えば、種々の酵素、補欠分子族、蛍光材料、発光物質および放射性物質が挙げられる。
[00884]「試料」という用語は、ポリペプチドを検出するために使用される試料を指す場合には、細胞、細胞溶解物、細胞のタンパク質または膜抽出物、体液または組織試料を含むが、これらに限定されない。
[00885]抗体分子とTRBC1またはTRBC2いずれかとの間の複合体形成は、TRBC1またはTRBC2抗原に結合した結合分子または結合していない結合分子のいずれかを測定または可視化することによって検出できる。従来の検出アッセイ、例えば、組織免疫組織化学、フロー分析、免疫細胞化学分析、蛍光顕微鏡、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、および/またはラジオイムノアッセイ(RIA)を使用できる。抗体分子を標識する代わりに、検出可能な物質で標識された標準および非標識抗体分子を利用する競合イムノアッセイによって、試料中のTRBC1またはTRBC2の存在をアッセイできる。このアッセイでは、生体試料、標識された標準および抗体分子を組合せ、非標識結合分子に結合した標識された標準の量を決定する。試料中のTRBC1またはTRBC2の量は、抗体分子に結合した標識された標準の量に反比例する。
実施例1:抗NKp30抗体を生成するためのアルメニアンハムスターの免疫化
[00886]簡単に述べると、アルメニアンハムスターを、フロイントの完全アジュバント中のヒトNKp30タンパク質の細胞外ドメインを用いて免疫化し、フロイントの不完全アジュバント(IFA)中のNKp30を用いて、14日目および28日目に2回追加免疫した。56日目にさらに1回のIFA中のブーストを与え、3日後に動物を回収した。脾臓を収集し、P3X63Ag8.653マウス骨髄腫細胞系と融合させた。125ul中の0.9×105細胞/ウェルを96ウェルプレートに入れ、選択用のHATまたはHT、ならびに必要に応じて7日目、11日目およびその後のHybridoma Cloning Factor(最終1%)の非存在または存在下で20%のウシ胎仔血清、4mMのL-グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、50Uのペニシリン、50μgのストレプトマイシンおよび50μMの2-MEを補足した125μlのI-20+2ME+HAT(IMDM(4g/Lグルコース)を与えた。融合の約2週後(細胞は約50%コンフルエント)に上清を収集し、結合についてアッセイした。
[00886]簡単に述べると、アルメニアンハムスターを、フロイントの完全アジュバント中のヒトNKp30タンパク質の細胞外ドメインを用いて免疫化し、フロイントの不完全アジュバント(IFA)中のNKp30を用いて、14日目および28日目に2回追加免疫した。56日目にさらに1回のIFA中のブーストを与え、3日後に動物を回収した。脾臓を収集し、P3X63Ag8.653マウス骨髄腫細胞系と融合させた。125ul中の0.9×105細胞/ウェルを96ウェルプレートに入れ、選択用のHATまたはHT、ならびに必要に応じて7日目、11日目およびその後のHybridoma Cloning Factor(最終1%)の非存在または存在下で20%のウシ胎仔血清、4mMのL-グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、50Uのペニシリン、50μgのストレプトマイシンおよび50μMの2-MEを補足した125μlのI-20+2ME+HAT(IMDM(4g/Lグルコース)を与えた。融合の約2週後(細胞は約50%コンフルエント)に上清を収集し、結合についてアッセイした。
実施例2:NKp30 mAbについてのハイブリドーマスクリーニング
[00887]Expi293細胞にBG160(hNKp30細胞抗原)をトランスフェクトし、18時間後にスクリーニングを行った。スクリーニングの日に、トランスフェクトされた細胞を0.05×106/mLに希釈し、抗アルメニアンハムスターFc Alexa Fluor 488を0.4ug/mLの最終濃度まで加えた。50uL(2,500細胞)のこの混合物を384ウェルプレートの各ウェルに加えた。二次(secondary)と共に同じ密度の非トランスフェクト293細胞を陰性対照として使用した。5uLのハイブリドーマ上清を細胞混合物に加え、プレートを37℃で1時間インキュベートした。プレートを次にMirrorball上でイメージングした。陽性クローンを同定し、段階希釈によりサブクローニングしてクローン選択ハイブリドーマを得た。同じプロトコールを使用した再確認後にハイブリドーマ細胞を回収し、対応する重鎖および軽鎖配列を取得した。対応する抗体のその後の発現およびさらなる検証のためにDNAをpcDNA3.4にサブクローニングした。
[00887]Expi293細胞にBG160(hNKp30細胞抗原)をトランスフェクトし、18時間後にスクリーニングを行った。スクリーニングの日に、トランスフェクトされた細胞を0.05×106/mLに希釈し、抗アルメニアンハムスターFc Alexa Fluor 488を0.4ug/mLの最終濃度まで加えた。50uL(2,500細胞)のこの混合物を384ウェルプレートの各ウェルに加えた。二次(secondary)と共に同じ密度の非トランスフェクト293細胞を陰性対照として使用した。5uLのハイブリドーマ上清を細胞混合物に加え、プレートを37℃で1時間インキュベートした。プレートを次にMirrorball上でイメージングした。陽性クローンを同定し、段階希釈によりサブクローニングしてクローン選択ハイブリドーマを得た。同じプロトコールを使用した再確認後にハイブリドーマ細胞を回収し、対応する重鎖および軽鎖配列を取得した。対応する抗体のその後の発現およびさらなる検証のためにDNAをpcDNA3.4にサブクローニングした。
実施例3:NK92細胞へのNKp30抗体の結合
[00888]0.5%のBSAおよび0.1%のアジ化ナトリウムを含有するPBS(染色緩衝液)を用いてNK-92細胞を洗浄し、200,000細胞/ウェルで96ウェルV底プレートに加えた。ハムスターNKp30抗体を2.0倍段階希釈で細胞に加え、室温で1時間インキュベートした。染色緩衝液を用いてプレートを2回洗浄した。AF647に共役したハムスターFcに対する二次抗体(Jackson、127-605-160)を1:100希釈(1.4mg/mlストック)で加え、細胞と共に4℃で30分間インキュベートし、続いて染色緩衝液を用いて洗浄した。細胞をその後に、4%のパラホルムアルデヒドを用いて室温で10分間固定した。プレートをCytoFLEX LS(Beckman Coulter)上で読み取った。パーセント-AF747陽性集団としてデータを算出した(図9)。
[00888]0.5%のBSAおよび0.1%のアジ化ナトリウムを含有するPBS(染色緩衝液)を用いてNK-92細胞を洗浄し、200,000細胞/ウェルで96ウェルV底プレートに加えた。ハムスターNKp30抗体を2.0倍段階希釈で細胞に加え、室温で1時間インキュベートした。染色緩衝液を用いてプレートを2回洗浄した。AF647に共役したハムスターFcに対する二次抗体(Jackson、127-605-160)を1:100希釈(1.4mg/mlストック)で加え、細胞と共に4℃で30分間インキュベートし、続いて染色緩衝液を用いて洗浄した。細胞をその後に、4%のパラホルムアルデヒドを用いて室温で10分間固定した。プレートをCytoFLEX LS(Beckman Coulter)上で読み取った。パーセント-AF747陽性集団としてデータを算出した(図9)。
実施例4:NK92細胞系を使用するNKp30抗体の活性を測定するためのバイオアッセイ
[00889]NKp30抗体をPBS中で3倍段階希釈し、平底96ウェルプレート中2~8℃で終夜インキュベートした。プレートをPBS中で2回洗浄し、IL-2を含有する増殖培地に40,000個のNK-92細胞を加えた。37℃、5%のCO2の加湿されたインキュベーターでプレートを16~24時間インキュベートした後に上清を収集した。MSDアッセイの使用説明書にしたがって上清中のIFNγレベルを測定した(図10)。ハムスターアイソタイプIgGとインキュベートされた細胞から収集した上清を陰性対照として使用し、NKp30モノクローナル抗体(R&D、クローン210847)とインキュベートされた細胞からの上清を陽性対照として利用した。ハムスター抗NKp30 mABを使用してデータを生成した。
[00889]NKp30抗体をPBS中で3倍段階希釈し、平底96ウェルプレート中2~8℃で終夜インキュベートした。プレートをPBS中で2回洗浄し、IL-2を含有する増殖培地に40,000個のNK-92細胞を加えた。37℃、5%のCO2の加湿されたインキュベーターでプレートを16~24時間インキュベートした後に上清を収集した。MSDアッセイの使用説明書にしたがって上清中のIFNγレベルを測定した(図10)。ハムスターアイソタイプIgGとインキュベートされた細胞から収集した上清を陰性対照として使用し、NKp30モノクローナル抗体(R&D、クローン210847)とインキュベートされた細胞からの上清を陽性対照として利用した。ハムスター抗NKp30 mABを使用してデータを生成した。
実施例5:ヒト化JOVI.1バリアントのヒトTRBC1への結合を測定するためのELISA
[00890]ヒト化JOVI.1バリアントのヒトTRBC1への結合をアッセイするためにELISAアッセイを実施した。マイクロプレートを、100uL中の各JOVI.1バリアント1ug/mLで別々に被覆し、2%BSAで遮断した。hTRBC1、BIM0444(7点、5倍希釈、100nM~6.4pM)の連続希釈物を、100uL/ウェルで被覆し、遮断したプレートに移し、室温で1時間インキュベートした。プレートを3回洗浄し、抗hisタグFc西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲートと30分間インキュベートし、続いてHRPの基質であるTMBを添加した。プレートを5分間現像し、1M HCLで停止し、450nmの波長で読み取った。ELISAデータにより、抗TRBC1 mAb(二価)のヒトTRBC1への直接結合が示される(図7)。
[00890]ヒト化JOVI.1バリアントのヒトTRBC1への結合をアッセイするためにELISAアッセイを実施した。マイクロプレートを、100uL中の各JOVI.1バリアント1ug/mLで別々に被覆し、2%BSAで遮断した。hTRBC1、BIM0444(7点、5倍希釈、100nM~6.4pM)の連続希釈物を、100uL/ウェルで被覆し、遮断したプレートに移し、室温で1時間インキュベートした。プレートを3回洗浄し、抗hisタグFc西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲートと30分間インキュベートし、続いてHRPの基質であるTMBを添加した。プレートを5分間現像し、1M HCLで停止し、450nmの波長で読み取った。ELISAデータにより、抗TRBC1 mAb(二価)のヒトTRBC1への直接結合が示される(図7)。
実施例6:ヒト化JOVI.1バリアントのヒトTRBC1への結合を測定するためのアッセイ
[00891]JOVI.1ヒト化バリアントの結合を確認するためにオクテットアッセイを実施した。プロテインAバイオセンサーを25℃にてPBS中で平衡化した。1.5nMの応答に対してPBS中で20ug/mLにてhTRBC1、BIM0444、続いて連続希釈のJOVI1.1 fab、BIM0446およびBIM0460(7点、2倍希釈、50nM~0.78nM)をセンサーにロードした。
[00891]JOVI.1ヒト化バリアントの結合を確認するためにオクテットアッセイを実施した。プロテインAバイオセンサーを25℃にてPBS中で平衡化した。1.5nMの応答に対してPBS中で20ug/mLにてhTRBC1、BIM0444、続いて連続希釈のJOVI1.1 fab、BIM0446およびBIM0460(7点、2倍希釈、50nM~0.78nM)をセンサーにロードした。
[00892]さらなるオクテットパラメーターは以下を含む:
ベースライン:PBS中で30秒
ロード:1.5nmの応答に対して20秒
ベースライン:60秒
会合:60秒
解離:PBS中で60秒
[00893]オクテットデータにより、抗TRBC1 FabのhTRBC1への結合が示された(図8)。hTRBC1をセンサーチップ上で捕捉し、異なる濃度の一価Fabを含有する溶液中に浸漬した。
ベースライン:PBS中で30秒
ロード:1.5nmの応答に対して20秒
ベースライン:60秒
会合:60秒
解離:PBS中で60秒
[00893]オクテットデータにより、抗TRBC1 FabのhTRBC1への結合が示された(図8)。hTRBC1をセンサーチップ上で捕捉し、異なる濃度の一価Fabを含有する溶液中に浸漬した。
実施例7:ヒト化抗NKp30抗体の生成および特徴付け
[00894]一連のハムスター抗NKp30抗体を選択した。これらの抗体は、ヒトNKp30およびカニクイザルNKp30に結合し、NK-90細胞からのIFNγ産生を誘導することが示された(データ示さず)。例示的なハムスター抗NKp30抗体15E1、9G1、15H6、9D9、3A12、および12D10のVHおよびVL配列を表9に開示する。15E1、9G1、および15H6に基づく例示的なヒト化抗NKp30抗体のVHおよびVL配列も表9に開示する。これらの抗体のKabat CDRを表18および表8に開示する。
[00894]一連のハムスター抗NKp30抗体を選択した。これらの抗体は、ヒトNKp30およびカニクイザルNKp30に結合し、NK-90細胞からのIFNγ産生を誘導することが示された(データ示さず)。例示的なハムスター抗NKp30抗体15E1、9G1、15H6、9D9、3A12、および12D10のVHおよびVL配列を表9に開示する。15E1、9G1、および15H6に基づく例示的なヒト化抗NKp30抗体のVHおよびVL配列も表9に開示する。これらの抗体のKabat CDRを表18および表8に開示する。
[00895]15E1に基づく2つのヒト化された構築物を選択した。第1の構築物BJM0407は、配列番号7302のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号7305のアミノ酸配列を含むラムダ軽鎖可変領域を含むFabである。その対応するscFv構築物BJM0859は配列番号7310のアミノ酸配列を含む。第2の構築物BJM0411は、配列番号7302のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号7309のアミノ酸配列を含むカッパ軽鎖可変領域を含むFabである。その対応するscFv構築物BJM0860は配列番号7311のアミノ酸配列を含む。BJM0407およびBJM0411は、同等の生物物理学的特徴、例えば、NKp30に対する結合親和性および熱安定性を示した。scFv構築物BJM0859およびBJM0860もまた同等の生物物理学的特性を示した。
実施例8:ヒト化抗TRBC1抗体の生成および特徴付け
[00896]マウス抗TRBC1抗体JOVI.1をヒト化し、複数のヒト化バリアントを得た。例示的なヒト化バリアントのVHおよびVL配列を表4に開示する。1つのヒト化バリアントBIM0460を選択し、これは、配列番号253のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号258のアミノ酸配列を含むVLを含む。BIM0460を生殖系列化によってさらに改変し、複数の生殖系列化バリアントを得た。例示的な生殖系列化バリアントのVHおよびVL配列もまた、表4に開示する。1つの生殖系列化バリアントBJM0578を選択し、これは、配列番号7351のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号258のアミノ酸配列を含むVLを含む。これらのヒト化および生殖系列化バリアントのKabat CDRを表6および表3に開示する。BIM0460は17nMの親和性でヒトTRBC1に結合することが示された。BJM0578は110nMの親和性でヒトTRBC1に結合することが示された。
[00896]マウス抗TRBC1抗体JOVI.1をヒト化し、複数のヒト化バリアントを得た。例示的なヒト化バリアントのVHおよびVL配列を表4に開示する。1つのヒト化バリアントBIM0460を選択し、これは、配列番号253のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号258のアミノ酸配列を含むVLを含む。BIM0460を生殖系列化によってさらに改変し、複数の生殖系列化バリアントを得た。例示的な生殖系列化バリアントのVHおよびVL配列もまた、表4に開示する。1つの生殖系列化バリアントBJM0578を選択し、これは、配列番号7351のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号258のアミノ酸配列を含むVLを含む。これらのヒト化および生殖系列化バリアントのKabat CDRを表6および表3に開示する。BIM0460は17nMの親和性でヒトTRBC1に結合することが示された。BJM0578は110nMの親和性でヒトTRBC1に結合することが示された。
実施例9:サイトカイン分泌およびT細胞活性化プロファイリング。
[00897]この実施例は、ADCCが無効なフォーマットが、TRBC1およびNKp30に結合する抗体に望ましいかどうかを調べる。プレート被覆時またはFcエンゲージメント時の溶液中のJOVI.1エンゲージメントはT細胞増殖および活性化を誘導した(データは示さず)。これは、T細胞リンパ腫を有する患者、例えば、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)を有する患者を処置する上での障害であり得る。
[00898]図11A~11Eに示すように5つの構築物を生成した。BJM1052は、抗TRBC1 Fab(BIM0460に基づく)および抗NKp30 scFv(BJM0407に基づく)を含む二特異性抗体である(図11A)。BJM1052は、配列番号7379(抗TRBC1 HC)、配列番号7380(抗TRBC1 LC)、および配列番号7383(抗NKp30 scFv-Fc)のアミノ酸配列を含む。BJM1052はそのFc領域においてN297A突然変異を含む。BJM1042は、抗TRBC1 Fab(BJM0578に基づく)および抗NKp30 scFv(BJM0407に基づく)を含む二特異性抗体である(図11B)。BJM1042は、配列番号7382(抗TRBC1 HC)、配列番号7380(抗TRBC1 LC)、および配列番号7383(抗NKp30 scFv-Fc)のアミノ酸配列を含む。BJM1042はそのFc領域においてN297A突然変異を含む。BJM0889は抗TRBC1 Fab(BIM0460に基づく)を含む単一アーム抗体である(図11C)。BJM1083は抗TRBC1 Fab(BJM0578に基づく)を含む単一アーム抗体である(図11D)。BJM0889およびBJM1083の両方はそのFc領域においてN297A突然変異を含む。BJM1053が、ADCCが有効なFc領域を有することを除いて、BJM1053はBJM1052と類似している。
[00899]図12Aおよび12Bに示すように、Fcが有効な抗体BJM1053およびhIgG1は、Fcγ受容体を発現するTHP1細胞に結合したが、N297A突然変異抗体(BJM1052、BJM1042、およびBJM0889)は有意な結合を示さなかった。
[00900]N297A突然変異(Fcが無効)を有する抗体が安全であるかどうかを試験するために、抗TRBC1/NKp30抗体および対照分子を、100、10または1nMにて溶液中のPBMCに添加し、T細胞増殖を1日目および5日目に測定した。Fcが無効な抗体BJM1052およびBJM1042は、Fcが有効な抗体BJM1053より少ないリンパ球クラスター化を示した(データは示さず)。T細胞活性化は、増殖T細胞のパーセンテージ(図13Aおよび13B)およびCD69-CD25+T細胞のパーセンテージ(図13Cおよび13D)によって実証されるように、5日目にBJM1052およびBJM1042で処理したPBMCにおいて有意に低減した。
実施例10:TRBC1およびNKp30へのin vitro結合
[00901]図14A~14Dに示すように種々の構築物を生成した。抗TRBC1 Fab(BIM0460またはBJM0578に基づく)および抗NKp30 scFv(BJM0407またはBJM0411に基づく)を含む二特異性抗体を図14Aに示す。二特異性抗体は、それらのFc領域においてN297A突然変異を有していても、有していなくてもよい。図14Bに記載した分子は図14Aに示す構成を有する。
[00901]図14A~14Dに示すように種々の構築物を生成した。抗TRBC1 Fab(BIM0460またはBJM0578に基づく)および抗NKp30 scFv(BJM0407またはBJM0411に基づく)を含む二特異性抗体を図14Aに示す。二特異性抗体は、それらのFc領域においてN297A突然変異を有していても、有していなくてもよい。図14Bに記載した分子は図14Aに示す構成を有する。
[00902]図14Cは、抗TRBC1 Fab(BIM0460またはBJM0578に基づく)および抗NKp30 Fab(BJM0407またはBJM0411に基づく)を含む二特異性抗体を示す。二特異性抗体は、それらのFc領域においてN297A突然変異を有していても、有していなくてもよい。図14Dに記載した分子は図14Cに示す構成を有する。
[00903]試験したすべての抗TRBC1/NKp30抗体は、NK細胞系KHYG-1(図15Aおよび15D)およびTRBC1+Jurkat細胞(図15Bおよび15D)への結合を示した。
実施例11:TRBC1+細胞系のin vitro細胞溶解
[00904]この実施例では、抗TRBC1/NKp30抗体を、NK細胞の存在下でTRBC1発現細胞の殺滅を誘導するそれらの能力について試験した。この実施例において試験した抗体を図11A~11Eに示す。
[00904]この実施例では、抗TRBC1/NKp30抗体を、NK細胞の存在下でTRBC1発現細胞の殺滅を誘導するそれらの能力について試験した。この実施例において試験した抗体を図11A~11Eに示す。
[00905]第1の研究において、NK-92エフェクター細胞を、CFSE標識化標的細胞と5:1の比において4時間培養した。フローサイトメトリーを使用して標的細胞溶解を測定し、死んだ標的細胞でゲーティングした。抗TRBC1/NKp30二特異性抗体BJM1052およびBJM1042は、NK-92エフェクター細胞の存在下で、TRBC1+Jurkat細胞(図16A)およびH9細胞(図16B)の殺滅を誘導したが、TRBC2+HPB-ALL細胞(図16C)の殺滅を誘導しなかった。
[00906]第2の研究において、初代NK細胞を、CFSE標識化標的細胞と5:1の比において4時間培養した。H9細胞に関しては、10:1のE:T比を使用した。フローサイトメトリーを使用して標的細胞溶解を測定した。抗TRBC1/NKp30二特異性抗体BJM1052およびBJM1042は、初代NK細胞の存在下で、TRBC1+Jurkat細胞(図17A)およびH9細胞(図17B)の殺滅を誘導したが、TRBC2+HPB-ALL細胞(図17C)の殺滅を誘導しなかった。
[00907]第3の研究において、NK細胞および標的細胞を、抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052およびBJM1042の存在下で4時間共培養し、上清を回収し、MSDを使用してサイトカインレベルを測定した。CD69+CD107a+NK細胞(図18A)、IFNγ分泌(図18B)、およびTNFα分泌(図18C)のパーセンテージによって実証されるように、標的細胞溶解はNK細胞活性化と相関した。
[00908]次の研究は、抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052およびBJM1042が、標的細胞の不在下でNK細胞を活性化するかどうかを調べる。初代NK細胞を、標的細胞の不在下で50nMの抗体と4時間インキュベートし、次いで上清を回収してIFNγおよびTNFαレベルを測定した。図19Aおよび19Bに示すように、抗TRBC1/NKp30抗体によって媒介されるNK細胞活性化は、NK細胞および標的細胞の両方の存在を必要とした。
[00909]最後に、抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052およびBJM1042は、標的細胞の存在下でNK細胞死を誘導しなかった(図20)。
実施例12:患者由来TRBC1+またはTRBC2+PDXの選択的in vitro細胞溶解
[00910]T細胞リンパ腫の一般的なサブタイプには、末梢T細胞リンパ腫、非特定型(PTCL-NOS);未分化大細胞リンパ腫(ALCL);血管免疫芽球性T細胞リンパ腫(AITL);および皮膚T細胞リンパ腫(CTCL)が含まれる。T細胞リンパ腫の稀なサブタイプには、成人T細胞白血病/リンパ腫(ATLL);T細胞リンパ芽球性リンパ腫;肝脾ガンマ・デルタT細胞リンパ腫;腸症型T細胞リンパ腫;鼻NK/T細胞リンパ腫;処置関連T細胞リンパ腫が含まれる。TRBC1の類似の頻度および発現が、健康なドナーから単離されたPBMCおよびPTCL患者から単離されたPBMCにおいて観察された(データは示さず)。
[00910]T細胞リンパ腫の一般的なサブタイプには、末梢T細胞リンパ腫、非特定型(PTCL-NOS);未分化大細胞リンパ腫(ALCL);血管免疫芽球性T細胞リンパ腫(AITL);および皮膚T細胞リンパ腫(CTCL)が含まれる。T細胞リンパ腫の稀なサブタイプには、成人T細胞白血病/リンパ腫(ATLL);T細胞リンパ芽球性リンパ腫;肝脾ガンマ・デルタT細胞リンパ腫;腸症型T細胞リンパ腫;鼻NK/T細胞リンパ腫;処置関連T細胞リンパ腫が含まれる。TRBC1の類似の頻度および発現が、健康なドナーから単離されたPBMCおよびPTCL患者から単離されたPBMCにおいて観察された(データは示さず)。
[00911]2つの患者由来の異種移植片(PDX)試料を試験するとTRBC1陽性であった:PDX3は急性リンパ性白血病(T-ALL)を有する患者に由来し、PDX6は原発性皮膚CD30+T細胞リンパ増殖性障害(CTCL)を有する患者に由来した。
[00912]図21Aおよび21Bに示した抗体を機能的殺滅アッセイにおいて使用した。BJM0145は単一アーム抗TRBC1抗体である。BJM0773は、抗TRBC1 Fabおよび抗NKp30 scFvを含む二特異性抗体である。PDX試料をCFSEで標識化し、BJM0145またはBJM0773(0.01~10nM)の存在下で5:1の比のE:Tにおいて初代NK細胞またはKHYG1細胞と5時間培養した。以下の計算:
[死んだ処理した(PDX+NK)%-死んだPDX%]/[100%(最大殺滅)-死んだPDX%]
を使用して特異的殺滅を測定した。
[死んだ処理した(PDX+NK)%-死んだPDX%]/[100%(最大殺滅)-死んだPDX%]
を使用して特異的殺滅を測定した。
[00913]図22A~22Dに示すように、抗TRBC1/NKp30抗体BJM0773は、TRBC1陽性PDX3およびPDX6を効果的に殺滅した。単一アームの抗TRBC1抗体BJM0145は、ADCCに起因して初代NK細胞の存在下で弱い殺滅を示したが(図22Aおよび22C)、CD16欠損NK細胞であるKHYG1細胞の存在下では示さなかった(図22Bおよび22D)。単一アームの抗TRBC1抗体または二特異性抗TRBC1/NKp30抗体は、TRBC1陰性PDXを殺滅しなかった(データは示さず)。
実施例13:PTCL患者由来のNK細胞を使用したTRBC1+Jurkat細胞のin vitro細胞溶解
[00914]この実施例は、抗TRBC1/NKp30抗体が、PTCL患者から単離したNK細胞の存在下でTRBC1+標的細胞の殺滅を媒介することができるかどうかを調べる。
[00914]この実施例は、抗TRBC1/NKp30抗体が、PTCL患者から単離したNK細胞の存在下でTRBC1+標的細胞の殺滅を媒介することができるかどうかを調べる。
[00915]NK細胞およびNKp30+NK細胞は、PTCL患者のPBMCの正常な割合内に存在する(データは示さず)。NK細胞を陰性選択によりPTCL患者および健康なドナーのPBMCから富化し、次いで200U/mlのIL-2と一晩インキュベートした。翌日に、NK細胞を、10nM抗体の存在下でJurkat細胞と4時間共培養した。
[00916]図23に示すように、PTCL患者由来のNK細胞は、抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042の存在下でTRBC1+Jurkat細胞を殺滅した。CD69+CD107+NK細胞のパーセンテージによって実証されるように、NK細胞を殺滅アッセイの間、活性化した(図24)。二特異性抗TRBC1/NKp30抗体BJM1052およびBJM1042は、単一アームの抗TRBC1抗体FJM0889より高いレベルのIFNγ(図25A)およびTNFα(図25B)を誘導した。
実施例14:NKp30に対する天然リガンドである、B7-H6との競合
[00917]NKp30の天然リガンドには、B7-H6、pp65、BAT3、およびBAG6が含まれる。B7-H6は、多くのがん細胞系および初代がん細胞(例えば、T細胞およびB細胞リンパ腫、白血病、および黒色腫)で見られる。膜結合型B7-H6は、初代ヒトNK細胞の活性化および標的細胞の殺滅を媒介することができる。他方で、可溶性B7-H6は血清または腫瘍微小環境内で見られ、抗NKp30 mAbの結合を阻害し、NKp30発現を下方制御し、NKp30媒介活性化および標的細胞殺滅を抑制し得る。
[00917]NKp30の天然リガンドには、B7-H6、pp65、BAT3、およびBAG6が含まれる。B7-H6は、多くのがん細胞系および初代がん細胞(例えば、T細胞およびB細胞リンパ腫、白血病、および黒色腫)で見られる。膜結合型B7-H6は、初代ヒトNK細胞の活性化および標的細胞の殺滅を媒介することができる。他方で、可溶性B7-H6は血清または腫瘍微小環境内で見られ、抗NKp30 mAbの結合を阻害し、NKp30発現を下方制御し、NKp30媒介活性化および標的細胞殺滅を抑制し得る。
[00918]この実施例は、二特異性抗TRBC1/NKp30抗体がNKp30への結合についてB7-H6と競合するかどうかを調べる。
[00919]図26Aおよび26Bに示すように、二特異性抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042はB7-H6より強くNKp30に結合した。競合アッセイにおいて、B7H6(4μg/ml、約143nM)および様々な濃度の抗体(BJM1042、抗NKp30または抗NKp46)をNKp30で被覆したELISAプレートに同時に添加した。図26Cに示すように、B7H6結合シグナルは、競合する抗体の濃度の増加と共に減少した。BJM1042は、陽性対照である抗NKp30抗体と同様のレベルまで、NKp30との結合についてB7-H6と競合した(図26C)。陰性対照である抗NKp46抗体はNKp30へのB7-H6結合を妨げず、このELISAにおいて観察された干渉は特異的であることが示唆された(図26C)。
実施例15:TRBC1細胞系由来モデルのin vivo殺滅
[00920]この実施例は、in vivoモデルにおいて抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042の抗腫瘍活性を調べる。
[00920]この実施例は、in vivoモデルにおいて抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042の抗腫瘍活性を調べる。
[00921]0日目に、NOG-IL-15マウスにH9腫瘍細胞を皮下移植した。腫瘍移植の16日後、in vitroで拡大した初代NK細胞をマウスに移植した。NK移植の2週間後(腫瘍移植の31日後)、マウスを腫瘍体積によって無作為化し、1mg/kgのBJM1042または関連する対照を投与した。試験物への曝露後、腫瘍体積および体重を毎日測定した。
[00922]抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042は、初代NK細胞を移植したNOG IL-15マウスにおいて皮下H9腫瘍の退縮を誘導した(図27Bおよび27C)。BJM1042はまた、NK細胞の不在下で腫瘍成長を阻害したが、NK細胞の存在下での処置と比較して、より少ない程度であった(図27Bおよび27C)。同様の結果を、抗TRBC1対照抗体BJM1083で観察した(図27Bおよび27C)。
実施例16:TRBC1についてのin vivo特異性
[00923]この実施例では、初代NK細胞を移植したNOG-IL-15マウスにおいてTRBC2発現HPB-ALL異種移植片を使用してBJM1042の特異性を評価した。
[00923]この実施例では、初代NK細胞を移植したNOG-IL-15マウスにおいてTRBC2発現HPB-ALL異種移植片を使用してBJM1042の特異性を評価した。
[00924]0日目に、5e6のTRBC2+HPB-ALL細胞をNOG-IL-15マウスに皮下移植した。腫瘍移植の12日後、2e6のin vitroで拡大した初代NK細胞をマウスに移植した。NK移植の2日後(腫瘍移植の14日後)、マウスを腫瘍体積によって無作為化し、0.5mg/kgのBJM1042または関連する対照を投与した。マウスを1週間に2回治療薬により処置した。腫瘍体積を1週間に2回キャリパーによって定量した。体重を1週間に2回測定した。
[00925]TRBC1発現H9およびJurkat腫瘍の退縮を誘導した、抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042は、TRBC2発現HPB-ALL腫瘍の成長に影響を及ぼさなかった(図28B)。分子は、使用した用量で良好な耐容性であり、体重減少またはいかなる他の明らかな有害事象も生じなかった(データは示さず)。
実施例17:抗TRBC1/NKp30抗体の生物物理学的分析
[00926]抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042およびBJM1052を生物物理学的特性について分析した。BJM1042およびBJM1052は、高い安定性および低い凝集傾向を示した。BJM1042およびBJM1052は、FcRnへの結合を保持し、Fcγ受容体への結合を低減させたか、またはFcγ受容体への結合がごくわずかであることを示した。
[00926]抗TRBC1/NKp30抗体BJM1042およびBJM1052を生物物理学的特性について分析した。BJM1042およびBJM1052は、高い安定性および低い凝集傾向を示した。BJM1042およびBJM1052は、FcRnへの結合を保持し、Fcγ受容体への結合を低減させたか、またはFcγ受容体への結合がごくわずかであることを示した。
実施例18:例示的な抗TRBC1抗体分子のBiacore分析
[00927]この実施例では、一連の例示的な抗TRBC1抗体分子を、TRBC1に対するそれらの結合親和性について分析した。簡単に述べると、表面プラズモン共鳴(SPR)測定を、BIAcore T200を使用することによって実施した。例示的な抗TRBC1抗体構築物の各々を、50RUの応答に対する抗ヒトFc抗体を介してCM5チップ上に固定化した。ヒトTRBC1(BIM0443)を、15.6、31.2、62.5、125、250、および500nMの濃度、20μl/分の流量で、各抗体構築物が固定化された表面上に注入した。データは、1:1結合モデルを使用して適合した。
[00927]この実施例では、一連の例示的な抗TRBC1抗体分子を、TRBC1に対するそれらの結合親和性について分析した。簡単に述べると、表面プラズモン共鳴(SPR)測定を、BIAcore T200を使用することによって実施した。例示的な抗TRBC1抗体構築物の各々を、50RUの応答に対する抗ヒトFc抗体を介してCM5チップ上に固定化した。ヒトTRBC1(BIM0443)を、15.6、31.2、62.5、125、250、および500nMの濃度、20μl/分の流量で、各抗体構築物が固定化された表面上に注入した。データは、1:1結合モデルを使用して適合した。
[00928]表26に示すように、例示的な抗体は、親抗体と比較して、ヒトTRCB1に対する保存された親和性を示した。
[00929]この実施例では、一連の例示的な抗NKp30抗体分子を、NKp30に対するそれらの結合親和性について分析した。簡単に述べると、表面プラズモン共鳴(SPR)測定を、BIAcore T200を使用することによって実施した。ヒトNKp30(BKM0179)を、50RUの応答に対する抗マウスFc抗体を介してCM5チップ上に固定化した。各例示的な抗体構築物を、3.9、7.8、15.6、31.2、62.5、および125nMの濃度、ならびに20μl/分の流速で、ヒトNKp30が固定化された表面上に注入した。データは、1:1結合モデルを使用して適合した。
[00930]表27に示すように、例示的な抗体のほとんどは、親抗体と比較して、ヒトNKp30に対する保存された親和性を示した。
[00931]抗TRBC1抗体を、ディスプレイベースのアプローチを使用してTRBC2に特異性を導入するように操作した。複数のサイクルの分子進化を経て、抗TRBC1抗体は突然変異して、TRBC2結合を達成し、TRBC1結合を喪失した。この目的のために、scFvライブラリーを、ランダム突然変異誘発(1)またはKunkel突然変異誘発の改変バージョン(2)を使用して構築した。ヒトTRBC2に対するライブラリー選択を、標準的なファージディスプレイ(3)および酵母ディスプレイ技術(4)を使用して実施した。選択の間、様々な濃度の競合相手である非標識化TRBC1を添加して、TRBC1に結合しない突然変異体を濃縮した。選択の後に、ELISAおよびフローサイトメトリーなどの標準的なスクリーニング法を実施して、TRBC2に特異的に結合する個々のクローンを同定した。ヒットシークエンシングおよび突然変異-活性相関の分析後、特異的なTRBC2結合を改善し、潜在的なCDR脱アミド部位を除去し、最も近い生殖系列アラインメントに基づいてCDRをヒト化するために、上記と同じ方法を使用して第2世代のライブラリーを構築した。増強したが、特異的なTRBC2親和性を有するクローンを選択するために、よりストリンジェントな条件を適用した変更を加えて、ライブラリー選択および個々のクローンのスクリーニングを上記のように繰り返した。ヒットシークンス後、scFv遺伝子を、発現、精製、およびトリアージのために、生物学的に関連した抗体フォーマットに再フォーマット化した。
実施例21.T細胞悪性腫瘍におけるTRBC1対TRBC2単型性の診断のためにフローベースのアッセイにおいて利用されるTRBC1およびTRBC2抗体
[00932]健康なヒトドナーのPBMC由来のT細胞集団は、TRBC1+およびTRBC2+の両方のコンパートメントを含有するが、T細胞悪性腫瘍は主に単型である。フロー法を適用して、1つの健康ドナーPBMCおよびT悪性腫瘍であると事前に診断された4つのPBMC試料においてTRBC1対TRBC2の単型性および特異性について試験した。患者からのヘパリン処理した全血をACK溶解緩衝液で溶解し、続いて20分間Fc遮断した。患者からの血液をJovi.1(TRBC1抗体)またはBKM0213(TRBC2抗体)で染色した。細胞をPBS中で洗浄した後、CD56-PE(NKマーカー)、CD3-AF700(T細胞マーカー)、CD4-BV421(T細胞マーカー)、CD8-Percp cy5.5(T細胞マーカー)および生/死染色を含有する抗体カクテルで染色した。次いで細胞を固定し、CytoFLEX LXでフロー評価を取得した。
参考文献による組み込み
[00933]本明細書に記載されるすべての刊行物および特許は、個々の刊行物または特許の各々が、参照により組み込まれるように具体的におよび個別に指示されているかのように、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
[00933]本明細書に記載されるすべての刊行物および特許は、個々の刊行物または特許の各々が、参照により組み込まれるように具体的におよび個別に指示されているかのように、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
均等物
[00934]当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を、日常的な実験のみを用いて認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることが意図される。
[00934]当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を、日常的な実験のみを用いて認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることが意図される。
例示的な実施形態
[00935]前述の多機能性分子、核酸、ベクター、宿主細胞、または方法のいずれかの追加の特徴は、以下の例示的な実施形態の1つまたは複数を含む。
[00935]前述の多機能性分子、核酸、ベクター、宿主細胞、または方法のいずれかの追加の特徴は、以下の例示的な実施形態の1つまたは複数を含む。
[00936]当業者であれば、本明細書に記載される本発明の特定の実施形態に対する多数の同等物を、日常的な実験のみを使用して認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の例示的な実施形態によって包含されることが意図される。
例示的な実施形態1
[00937]本開示は、とりわけ、(i)リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に結合する抗原結合性ドメイン、例えば、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)を含むT細胞受容体またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を含むT細胞受容体、ならびに(ii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、NK細胞エンゲージャー、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される)、(iii)サイトカイン分子、および/または(iv)間質改変部分のうちの1つ、2つまたはすべて、を含む新規多重特異性または多機能性分子に関する。「多特異性」または「多機能性」という用語は、本明細書では交換可能に使用される。
[00937]本開示は、とりわけ、(i)リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に結合する抗原結合性ドメイン、例えば、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)を含むT細胞受容体またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を含むT細胞受容体、ならびに(ii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、NK細胞エンゲージャー、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される)、(iii)サイトカイン分子、および/または(iv)間質改変部分のうちの1つ、2つまたはすべて、を含む新規多重特異性または多機能性分子に関する。「多特異性」または「多機能性」という用語は、本明細書では交換可能に使用される。
[00938]理論に拘泥するものではないが、本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、免疫細胞(例えば、NK細胞、T細胞、B細胞、樹状細胞またはマクロファージから選択される免疫エフェクター細胞)を、TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現する標的細胞、例えば、がん細胞(例えば、リンパ腫細胞)に標的化する(例えば、局所化、架橋化および/または活性化)、および/または腫瘍間質を変更する、例えば、がん部位に近い腫瘍微小環境を変更することが期待される。本明細書に記載される多特異性分子を使用して免疫細胞の近接性および/または活性を増加させることは、標的細胞(例えば、がん細胞、例えば、リンパ腫細胞)に対する免疫応答を増強し、それによって、より有効な療法(例えば、より有効ながん療法)を提供することが期待される。理論に拘泥するものではないが、標的細胞(例えば、がん細胞)に対する標的化され、局在化された免疫応答は、本明細書に記載される多特異性分子の全身毒性の効果を低下させると考えられる。さらに、標的がん細胞がT細胞(例えば、TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するT細胞)である場合において、非がん性T細胞をより少ない程度で標的とする(例えば、非がん性T細胞を標的としない)がん性T細胞集団に対する標的化免疫応答は、すべてのT細胞の全身性アブレーションよりも有害作用が少ないと考えられる。
[00939]理論に拘泥するものではないが、クローン由来のT細胞リンパ腫は、TRBC1またはTRBC2のいずれかに対して陽性であるが、両方に対して陽性ではない。TRBC1+T細胞悪性腫瘍の場合において、本明細書に開示される抗TRBC1分子(例えば、TRBC1およびNKp30に結合する多機能性分子)は、TRBC2+非悪性T細胞を節約しながらTRBC1+細胞を枯渇させることができる。同様に、TRBC2+T細胞悪性腫瘍の場合において、本明細書に開示される抗TRBC2分子(例えば、TRBC2およびNKp30に結合する多機能性分子)は、TRBC1+非悪性T細胞を節約しながらTRBC2+細胞を枯渇させることができる。
[00940]理論に拘泥するものではないが、一部の実施形態では、本明細書に開示される多機能性分子(例えば、抗TRBC1/NKp30抗体)は、TRBC1を発現する細胞の存在下でNK細胞のみを活性化する。理論に拘泥するものではないが、一部の実施形態では、本明細書に開示される多機能性分子(例えば、抗TRBC2/NKp30抗体)は、TRBC2を発現する細胞の存在下でNK細胞のみを活性化する。
[00941]したがって、前述の部分を含む多特異性分子(例えば、多特異性または多機能性抗体分子)、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、および前述の分子を使用してがんを処置する方法が、とりわけ、本明細書で提供される。
[00942]一態様では、本開示は、試料または対象においてTRBC1またはTRBC2を検出する方法であって、試料または対象を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および抗体分子と試料または対象の間の複合体の形成を検出し、これによって、TRBC1またはTRBC2を検出するステップを含む、方法を特徴とする。
[00943]一部の実施形態では、TRBC1またはTRBC2は、in vitroまたはin vivoで検出される。
[00944]一部の実施形態では、方法は、参照試料または参照対象を抗体分子と接触させるステップ、および抗体分子と参照試料または参照対象との間の複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または参照対象と比較した、試料または対象における複合体の形成の変化、例えば、統計上有意な変化が、試料または対象におけるTRBC1またはTRBC2の存在を示す。
[00945]一部の実施形態では、方法は、対象から試料を得るステップをさらに含む。
[00946]一部の実施形態では、試料は、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えば、リンパ節の1つまたは複数を含む。一部の実施形態では、試料は、凍結および/または固定されていない。一部の実施形態では、試料は、ホルマリン固定されている(例えば、ホルマリン固定され、パラフィン包埋されている(FFPE)。一部の実施形態では、試料は、染色されている(例えば、免疫組織化学による分析のために)。一部の実施形態では、試料は、凍結および/または固定されている。
[00947]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、リンパ腫、例えば、T細胞リンパ腫)を有するかまたは有するリスクがある。
[00948]一部の実施形態では、方法は、例えば、マルチパネル法を使用してフローサイトメトリー分析を実施するステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、免疫組織化学(IHC)分析を、例えば、単色または多重フォーマットで行うことをさらに含む。一部の実施形態では、IHC法は、明視野発色IHCを含む。実施形態では、明視野発色IHC法は、例えば、異なる色素原で直接的に標識された一次抗体による抗原の直接検出を含む。一部の実施形態では、IHC法は、蛍光IHCを含む。実施形態では、蛍光IHC法は、異なるフルオロフォアで直接的に標識された一次抗体による抗原の直接検出を含む。一部の実施形態では、方法は、試料、例えば、固定された試料、例えば、FFPE試料で免疫組織化学を実施するステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、例えば、T細胞悪性腫瘍の存在および/またはレベルを決定するためのT細胞のクローナリティーを評価するステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、生体試料から得たTRBC1+細胞またはTRBC2+細胞のレベルを測定する(例えば、参照試料または対象に対して、例えば、TRBC1+またはTRBC2+細胞が枯渇しているか否かを決定する)ステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、TRBC1またはTRBC2の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、TRBC1またはTRBC2の膜レベルを測定するステップをさらに含む。
[00949]一部の実施形態では、方法は、本明細書に記載の検出方法の2つまたはそれより多くを組み合わせることを含む。実施形態では、方法は、核酸ベースの方法および抗体ベースの方法を含む。
[00950]一部の実施形態では、方法は、例えば、処置(例えば、本明細書に記載される抗体分子を用いる)後に、対象を、疾患または障害(例えば、がん)の予後、重症度、または存在もしくは不在における変化について評価するステップをさらに含む。
[00951]一部の実施形態では、抗体分子は、検出可能に標識される。一部の実施形態では、抗体分子は、抗TRBC1抗体分子である。一部の実施形態では、抗体分子は、抗TRBC2抗体分子である。
[00952]一態様では、本開示は、対象からの試料(例えば、本明細書に記載の試料)を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、
および
[00953]抗体分子と試料の間の複合体の形成を検出し、それによって、対象を評価するステップ
を含む、対象を評価する(例えば、同定する)方法を特徴とする。
および
[00953]抗体分子と試料の間の複合体の形成を検出し、それによって、対象を評価するステップ
を含む、対象を評価する(例えば、同定する)方法を特徴とする。
[00954]一部の実施形態では、対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、リンパ腫、例えば、T細胞リンパ腫)を有するかまたは有するリスクがある。一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されていない。一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されている。
[00955]一態様では、本開示は、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子および例えば、本明細書に記載の方法に従って、試料または対象においてTRBC1またはTRBC2を検出する方法において使用するための使用説明書を含むキットを特徴とする。
例示的な実施形態2
[00956]一態様では、(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメインを含む多機能性分子が本明細書で提供される。
[00956]一態様では、(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメインを含む多機能性分子が本明細書で提供される。
[00957]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、TRBC2に結合する。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、表21~25のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7441、201、および7442のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7443、224、および225のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7441、201、7442、7443、224、および225のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7422、201、および7403;それぞれ配列番号7401、201、および7403;それぞれ配列番号7394、201、および7396;それぞれ配列番号7346、201、および7398;それぞれ配列番号7346、201、および7400;それぞれ配列番号7405、201、および7403;それぞれ配列番号7407、201、および7403;それぞれ配列番号7427、201、および7403;またはそれぞれ配列番号7430、201、および7403のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7410、224、および225;またはそれぞれ、配列番号7409、224、および225のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7422、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7401、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7394、201、7396、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7398、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7400、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7405、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7407、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7427、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7430、201、7403、7410、224、および225;それぞれ、配列番号7422、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7401、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7394、201、7396、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7398、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7346、201、7400、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7405、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7407、201、7403、7409、224、および225;それぞれ、配列番号7427、201、7403、7409、224、および225;またはそれぞれ、配列番号7430、201、7403、7409、224、および225のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHは、配列番号7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428、および7431からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VLは、配列番号7419および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ配列番号7420および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7423および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7411および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7412および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7413および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7414および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7415および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7416および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7417および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7425および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7428および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7431および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7420および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7423および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7411および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7412および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7413および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7414および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7415および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7416および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7417および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7425および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7428および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);それぞれ配列番号7431および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)のアミノ酸配列を含む。
[00958]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、TRBC2を含まないT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対してより高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合に対するKDは、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2を含まないT細胞受容体との間の結合に対するKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、TRBC1を含むT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対してより高い親和性を有し、場合により、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合に対するKDは、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1を含むT細胞受容体との間の結合に対するKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である。一部の実施形態では、リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞における第1の抗原結合性ドメインのTRBC2への結合は、例えば、T細胞の増殖、T細胞活性化マーカー(例えば、CD69またはCD25)の発現、および/またはサイトカイン(例えば、TNFαおよびIFNγ)の発現によって測定したときに、リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞をほとんど活性化しない。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞を活性化しない、またはTRBC2を発現する細胞の不在下でNK細胞を実質的に活性化しない。
[00959]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、TRBC1に結合する。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、表2、3、3A、3B、4、5、6および19のいずれかに開示される、1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7346、7355、および202;それぞれ配列番号7346、201、および202;それぞれ配列番号7354、201、および202;またはそれぞれ配列番号7354、7355、および202のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号223、224、および225;それぞれ配列番号7367、224、および225;それぞれ配列番号223、7368、および225;それぞれ配列番号223、224、および7369;またはそれぞれ配列番号7367、7368、および7369のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7346、7355、202、223、224、および225;それぞれ配列番号7346、201、202、223、224、および225;それぞれ配列番号7346、7355、202、7367、224、および225;それぞれ配列番号7346、7355、202、223、7368、および225;それぞれ配列番号7346、7355、202、223、224、および7369;それぞれ配列番号7346、7355、202、7367、7368、および7369;それぞれ配列番号7346、201、202、7367、224、および225;それぞれ配列番号7346、201、202、223、7368、および225;それぞれ配列番号7346、201、202、223、224、および7369;それぞれ配列番号7346、201、202、7367、7368、および7369;それぞれ配列番号7354、201、202、223、224、および225;それぞれ配列番号7354、201、202、7367、224、および225;それぞれ配列番号7354、201、202、223、7368、および225;それぞれ配列番号7354、201、202、223、224、および7369;それぞれ配列番号7354、201、202、7367、7368、および7369;それぞれ配列番号7354、7355、202、223、224、および225;それぞれ配列番号7354、7355、202、7367、224、および225;それぞれ配列番号7354、7355、202、223、7368、および225;それぞれ配列番号7354、7355、202、223、224、および7369;またはそれぞれ配列番号7354、7355、202、7367、7368、および7369のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHは、配列番号7351、253、250~252、254、7343、7344、7350、および7352(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、および/またはVLは、配列番号258、255~257、259、260、および7357~7360(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、アミノ酸配列:それぞれ配列番号7351および258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列);またはそれぞれ配列番号253および258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00960]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、TRBC1を含まないT細胞受容体よりもTRBC1を含むT細胞受容体に対してより高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1との間の結合に対するKDは、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1を含まないT細胞受容体との間の結合に対するKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、TRBC2を含むT細胞受容体よりもTRBC1を含むT細胞受容体に対してより高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1との間の結合に対するKDは、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2を含むT細胞受容体との間の結合に対するKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である。一部の実施形態では、リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞における第1の抗原結合性ドメインのTRBC1への結合は(例えば、T細胞の増殖、T細胞活性化マーカー(例えば、CD69またはCD25)の発現、および/またはサイトカイン(例えば、TNFαおよびIFNγ)の発現によって測定したときに)、リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞をほとんど活性化しない。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞を活性化しない、またはTRBC1を発現する細胞の不在下でNK細胞を実質的に活性化しない。
[00961]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表7、8、8A、8B、9、10、18、および25のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメインまたはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ配列番号7313、6001、および7315;それぞれ配列番号7313、6001、および6002;それぞれ配列番号7313、6008、および6009;それぞれ配列番号7313、7385、および7315;それぞれ配列番号7313、7318、および6009;それぞれ配列番号C019、C021、およびC023;それぞれ配列番号C033、C035、およびC037;それぞれ配列番号C047、C049、およびC051;それぞれ配列番号C061、C063、およびC065;それぞれ配列番号C075、C077、およびC079;それぞれ配列番号C089、C091、およびC093;それぞれ配列番号C103、C105、およびC107;またはそれぞれ配列番号C116、C118およびC120のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7326、7327、および7329;それぞれ配列番号6063、6064、および7293;それぞれ配列番号6070、6071、および6072;それぞれ配列番号6070、6064、および7321;それぞれ配列番号C026、C028、およびC030;それぞれ配列番号C040、C042、およびC044;それぞれ配列番号C054、C056、およびC058;それぞれ配列番号C068、C070、およびC072;それぞれ配列番号C082、C084、およびC086;それぞれ配列番号C096、C098、およびC100;それぞれ配列番号C110、C112およびC113;またはそれぞれ配列番号C123、C125、C127のアミノ酸配列を含む。
[00962]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3は、それぞれ配列番号7313、6001、7315、7326、7327、および7329;それぞれ配列番号7313、6001、6002、6063、6064、および7293;それぞれ配列番号7313、6008、6009、6070、6071、および6072;それぞれ配列番号7313、7385、7315、6070、6064、および7321;それぞれ配列番号7313、7318、6009、6070、6064、および7321;それぞれ配列番号C019、C021、C023、C026、C028、およびC030;それぞれ配列番号C033、C035、C037、C040、C042およびC044;それぞれ配列番号C047、C049、C051、C054、C056、およびC058;それぞれ配列番号C061、C063、C065、C068、C070およびC072;それぞれ配列番号C075、C077、C079、C082、C084、およびC086;それぞれ配列番号C089、C091、C093、C096、C098、およびC100;それぞれ配列番号C103、C105、C107、C110、C112、およびC113;またはそれぞれ配列番号C116、C118、C120、C123、C125、およびC127のアミノ酸配列を含む。
[00963]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号7302、7298、7300、7301、7303、および7304からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/または第2の抗原結合性ドメインのVLは、配列番号7309、7305、7299、7306~7308からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号6121もしくは6123~6128からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/または第2の抗原結合性ドメインのVLは、配列番号7294もしくは6137~6141からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号6122もしくは6129~6134からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/または第2の抗原結合性ドメインのVLは、配列番号6136もしくは6142~6147からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHは、配列番号C001~C008からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/または第2の抗原結合性ドメインのVLは、配列番号C009~C016からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインのVHおよびVLは、それぞれ配列番号7302および7309のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、またはそれぞれ配列番号7302および7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、配列番号7311または7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号6187または6188(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号6189または6190(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号C017~C024のいずれかのアミノ酸配列を含む。
[00964]一部の実施形態では、多機能性分子は、TRBC2に一価で結合する。一部の実施形態では、多機能性分子は、図30A~30Dのいずれかに示される構成を含み、必要に応じて、(i)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図30Aに示される構成を含むか;(ii)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 Fabを含み、例えば、図30Bに示される構成を含むか;(iii)多機能性抗体分子が、抗NKp30 Fabおよび抗TRBC2 scFvを含み、例えば、図30Cに示される構成を含むか;または(iv)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 scFvおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図30Dに示される構成を含む。
[00965]一部の実施形態では、多機能性分子は、TRBC1に一価で結合する。一部の実施形態では、多機能性分子は、図29A~29Dのいずれかに示される構成を含み、必要に応じて、(i)多機能性抗体分子が、抗TRBC1 Fabおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図29Aに示される構成を含むか;(ii)多機能性抗体分子が、抗TRBC1 Fabおよび抗NKp30 Fabを含み、例えば、図29Bに示される構成を含むか;(iii)多機能性抗体分子が、抗NKp30 Fabおよび抗TRBC1 scFvを含み、例えば、図29Cに示される構成を含むか;または(iv)多機能性抗体分子は、抗TRBC1 scFvおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図29Dに示される構成を含む。
[00966]一部の実施形態では、本明細書に開示される多機能性分子は、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換の1つまたは複数を含む1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)を含む二量体化モジュールをさらに含む。
[00967]一部の実施形態では、多機能性分子は、表21~25のいずれかに開示の抗TRBC2アミノ酸配列、もしくはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列、ならびに/または、表7、8、8A、8B、9、10、18、および25のいずれかに開示の抗NKp30アミノ酸配列、もしくはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、配列番号7438、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、配列番号7440、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00968]一部の実施形態では、多機能性分子は、表2、3、3A、3B、4、5、6および19のいずれかに開示される抗TRBC1アミノ酸配列、もしくはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列、および/または表7、8、8A、8B、9、10、18、および19のいずれかに開示される抗NKp30アミノ酸配列、もしくはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、(i)配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VL;(ii)配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7311(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFv;または(iii)配列番号7382、7380、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、(i)配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VL;(ii)配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7311(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFv;または(iii)配列番号7379、7380、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、(i)配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VL;(ii)配列番号7351(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFv;または(iii)配列番号7382、7380、および7384(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、(i)配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、配列番号7302(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VH、および配列番号7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 VL;(ii)配列番号253(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VH、配列番号258(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗TRBC1 VL、および配列番号7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)の抗NKp30 scFv;または(iii)配列番号7379、7380、および7384(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00969]一部の実施形態では、多機能性分子は、少なくとも1つのFc受容体に対する親和性の低減または除去をもたらす1つまたは複数の突然変異を含む重鎖定常領域バリアント、例えばFc領域バリアントを含み、必要に応じて、1つまたは複数の突然変異は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞食作用(ADCP)、または補体依存性細胞傷害(CDC)の低減または除去をもたらす。一部の実施形態では、Fc領域バリアントは、表20に開示される1つまたは複数の突然変異を含み、必要に応じて、Fc領域バリアントは、N297A突然変異を含む。
例示的な実施形態3
[00970]一態様では、本開示は、
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含む多機能性分子であって、
第1の抗原結合性ドメインは、表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子を特徴とする。
[00970]一態様では、本開示は、
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含む多機能性分子であって、
第1の抗原結合性ドメインは、表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子を特徴とする。
[00971]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、本明細書に開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメインを含む。
[00972]別の態様では、本開示は、
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含む多機能性分子であって、
第2の抗原結合性ドメインは、表8A~8B、9もしくは10のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号C001~C128のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子を特徴とする。
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含む多機能性分子であって、
第2の抗原結合性ドメインは、表8A~8B、9もしくは10のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号C001~C128のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子を特徴とする。
[00973]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、本明細書に開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメインを含む。
[00974]一態様では、本開示は、
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン,
を含む多機能性分子であって、
第1の抗原結合性ドメインは、表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含み;および
第2の抗原結合性ドメインは、表8A~8B、9もしくは10のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号C001~C128のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子を特徴とする。
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン,
を含む多機能性分子であって、
第1の抗原結合性ドメインは、表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含み;および
第2の抗原結合性ドメインは、表8A~8B、9もしくは10のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号C001~C128のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子を特徴とする。
例示的な実施形態4
[00975]一態様では、表21~25のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、TRBC2に結合する抗体分子が本明細書で提供される。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表21または表22に開示される1つまたは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表21または表22に開示される1つまたは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表23に開示されるVHおよび/またはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表24に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00975]一態様では、表21~25のいずれかに開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、TRBC2に結合する抗体分子が本明細書で提供される。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表21または表22に開示される1つまたは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表21または表22に開示される1つまたは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表23に開示されるVHおよび/またはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、TRBC2に結合する抗体分子は、表24に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00976]一態様では、表7、8、8A、8B、9、10、18および25のいずれかに開示される、1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含む、NKp30に結合する抗体分子が本明細書で提供される。
[00977]一態様では、表2、3、3A、3B、4、5、6および19に開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%もしくは99%の同一性を有する配列を含むTRBC1に結合する抗体分子が、本明細書で提供される。
[00978]一部の実施形態では、抗体分子は、少なくとも1つのFc受容体に対する親和性の低減または除去をもたらす1つまたは複数の突然変異を含む重鎖定常領域バリアント、例えばFc領域バリアントを含み、必要に応じて、1つまたは複数の突然変異は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞食作用(ADCP)、または補体依存性細胞傷害(CDC)の低減または除去をもたらす。一部の実施形態では、Fc領域バリアントは、表20に開示される1つまたは複数の突然変異を含み、必要に応じて、Fc領域バリアントは、N297A突然変異を含む。
[00979]一部の実施形態では、本明細書に開示されるアミノ酸配列は、METDTLLLWVLLLWVPGSTG(配列番号配列番号7444)のシグナルペプチドを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示されるアミノ酸配列は、METDTLLLWVLLLWVPGSTG(配列番号:配列番号:7444)のシグナルペプチドを含まない。
[00980]一態様では、本明細書に開示される多機能性分子をコードする核酸分子または本明細書に開示される抗体分子が、本明細書で提供される。一態様では、本明細書に開示される核酸分子を含むベクター、例えば発現ベクターが本明細書で提供される。一態様では、本明細書に開示される核酸分子または本明細書に開示されるベクターを含む細胞が本明細書で提供される。一態様では、本明細書に開示される多機能性分子または本明細書に開示される抗体分子と、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤とを含む医薬組成物が本明細書で提供される。
[00981]一態様では、本明細書に開示される多機能性分子または本明細書に開示される抗体分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件下、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に適した条件下で、本明細書に開示される細胞を培養するステップを含む、方法が本明細書で提供される。
[00982]一態様では、がんを処置する方法であって、本明細書に開示される多機能性分子または本明細書に開示される抗体分子を、それを必要とする対象に投与するステップを含み、多機能性分子または抗体分子が、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法が本明細書で提供される。一部の実施形態では、本方法は、処置を必要とする対象を、特定し、評価し、または選択するステップをさらに含み、特定し、評価し、または選択するステップは、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含む。一部の実施形態では、本方法は、対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、必要に応じて、TRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子での処置について対象を選択するステップ、およびTRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む本明細書に開示される多機能性分子を投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、この方法はさらに、対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するという決定に応答して、必要に応じて、TRBC1を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子による処置のために対象を選択するステップと、TRBC1を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む本明細書に開示される多機能性分子を投与するステップとを含む。
[00983]一態様では、がん、例えば、リンパ腫または白血病、例えば、T細胞リンパ腫または白血病を処置する方法が提供され、この方法は、対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を対象が有するという決定に応答して、本明細書に開示される多機能性分子をこの対象に投与するステップを含み、この多機能性分子の第1の抗原結合性ドメインはTRBC2に結合し、多機能性分子はがんを処置するのに有効な量で投与される。一態様では、がん、例えばリンパ腫または白血病、例えばT細胞リンパ腫または白血病を処置する方法であって、対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、対象に、本明細書に開示される多機能性分子を投与するステップを含み、多機能性分子の第1の抗原結合性ドメインは、TRBC1に結合し、多機能性分子は、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法が本明細書で提供される。
[00984]一態様では、がん、例えばリンパ腫または白血病、例えばT細胞リンパ腫または白血病の処置を必要とする対象を、本明細書に開示される多機能性分子を使用して特定する方法であって、例えば、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含み、
対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するという決定に応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として、必要に応じて、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補ではないとして、対象を特定し、または、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するという決定に応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として、場合によっては、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補ではないとして、対象を特定する
方法が、本明細書で提供される。
対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するという決定に応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として、必要に応じて、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補ではないとして、対象を特定し、または、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するという決定に応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として、場合によっては、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補ではないとして、対象を特定する
方法が、本明細書で提供される。
[00985]一部の実施形態では、本方法は、
TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定することに応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置するステップ(例えば、それを対象に投与するステップ)、または、
TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定することに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置するステップ(例えば、それを対象に投与するステップ)
をさらに含む。
TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定することに応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置するステップ(例えば、それを対象に投与するステップ)、または、
TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定することに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置するステップ(例えば、それを対象に投与するステップ)
をさらに含む。
[00986]前記の方法の一部の実施形態では、がんは、白血病またはリンパ腫である。一部の実施形態では、がんは、後天性免疫不全症候群(AIDS)関連リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、成人T細胞性白血病/リンパ腫、バーキットリンパ腫、中枢神経系(CNS)リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、リンパ芽球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫(MCL)、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)(例えば、肝脾T細胞リンパ腫(HSGDTCL)、皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫、または腸症関連T細胞リンパ腫)、形質転換した濾胞性リンパ腫および形質転換した粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫(菌状息肉腫およびセザリー症候群)、濾胞性リンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫/ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症、辺縁帯B細胞リンパ腫、胃粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、慢性リンパ球性白血病/小細胞型リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、節外性T/NK細胞リンパ腫(鼻型)、および未分化大細胞リンパ腫(例えば、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫または全身性未分化大細胞リンパ腫)から選択される。一部の実施形態では、がんは、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)である。
[00987]一態様では、この発明は、がんを有する対象を処置する方法における使用のための本明細書に開示される多機能性分子または抗体分子を含む組成物を提供する。
[00988]したがって、一態様では、本開示は、
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)と選択的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
[00989](ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー(例えば、CD3以外のT細胞抗原に結合するもの)、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)と選択的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
[00989](ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー(例えば、CD3以外のT細胞抗原に結合するもの)、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
[00990]別の態様では、本開示は、
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)を含むT細胞受容体、TRBC1、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を含むT細胞受容体、またはTRBC2を発現する(例えば、その表面上で、例えば、それを提示する)リンパ球を選択的に標的化する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー(例えば、CD3以外のT細胞抗原に結合するもの)、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(c)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)を含むT細胞受容体、TRBC1、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を含むT細胞受容体、またはTRBC2を発現する(例えば、その表面上で、例えば、それを提示する)リンパ球を選択的に標的化する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー(例えば、CD3以外のT細胞抗原に結合するもの)、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(c)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
[00991]別の態様では、本開示は、
(i)リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原、例えば、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)を含むT細胞受容体、TRBC1、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を含むT細胞受容体、またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー(例えば、CD3以外のT細胞抗原に結合するもの)、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
(i)リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原、例えば、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)を含むT細胞受容体、TRBC1、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を含むT細胞受容体、またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー(例えば、CD3以外のT細胞抗原に結合するもの)、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
[00992]別の態様では、本開示は、
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)と選択的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)例えばC1qと結合することによって補体経路を活性化する補体活性化ドメインと
を含む、抗体分子、例えば、IgM抗体分子を特徴とする。
(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)と選択的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)例えばC1qと結合することによって補体経路を活性化する補体活性化ドメインと
を含む、抗体分子、例えば、IgM抗体分子を特徴とする。
[00993]別の態様では、本開示は、本明細書で開示される多機能性分子をコードする核酸分子を特徴とする。
[00994]別の態様では、本開示は、本明細書に開示される核酸分子を含むベクター、例えば、発現ベクターを特徴とする。
[00995]別の態様では、本開示は、本明細書で開示される核酸分子またはベクターを含む宿主細胞を特徴とする。
[00996]別の態様では、本開示は、本明細書に開示される多機能性分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件下で、例えば、遺伝子発現および/またはホモまたはヘテロ二量体化に適切な条件下で、本明細書に開示される宿主細胞を培養するステップを含む、方法を特徴とする。
[00997]別の態様では、本開示は、本明細書に開示される多機能性分子を含む医薬組成物を特徴とする。
[00998]別の態様では、本開示は、がんを処置する方法であって、それを必要とする対象に、本明細書に開示される多機能性分子を投与するステップを含み、多機能性分子が、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法を特徴とする。一部の実施形態では、がんは、T細胞悪性腫瘍、例えば、T細胞リンパ腫またはT細胞性白血病である。一部の実施形態では、がんは、T細胞前リンパ球性白血病、T細胞大顆粒リンパ球性白血病、小児の全身性EBV陽性T細胞リンパ増殖性疾患、種痘様水疱症様リンパ腫、PTCL、PTCL-NOS(他に特定されていない)、血管免疫芽球性癌T細胞リンパ腫(AITL)、未分化大細胞型リンパ腫(ALCT)ALK陽性およびALK陰性、原発性皮膚未分化大細胞型リンパ腫、原発性皮膚gdT細胞リンパ腫、原発性皮膚CD8陽性進行性表皮向性細胞傷害性T細胞リンパ腫、原発性皮膚CD4陽性小/中細胞型T細胞リンパ腫、節外性T細胞リンパ腫、腸疾患関連T細胞リンパ腫(EATL)、肝硬化性T細胞リンパ腫、CD30陽性T細胞リンパ増殖性障害を含む皮膚T細胞リンパ腫(CTCL)、皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫、菌状息肉腫、セザリー症候群、リンパ腫様丘疹症、T細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)、成人T細胞リンパ腫、意義不明のモノクローナルT細胞増殖、未分化大細胞リンパ腫(ALCL)、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、特定不能の(NOS)末梢T細胞リンパ腫(PTCL)、皮膚T細胞リンパ腫(CTCL)、NKT細胞リンパ腫、セザリー症候群、T急性リンパ芽球性白血病またはリンパ腫、成人T細胞性白血病またはリンパ腫、T前リンパ球性白血病、およびT細胞大顆粒白血病(T large granular leukemia)から選択される。一部の実施形態では、がんはPTCLである。一部の実施形態では、TRBCサブタイプ発現は、例えば新鮮な腫瘍組織のフローサイトメトリー分析によって、または固定された組織(例えば、FFPE組織)での免疫組織化学(IHC)によって分析される。一部の実施形態では、多機能性分子は、第2の薬剤を組み合わせて使用される。一部の実施形態では、第2の薬剤は、ヒストンデアセチラーゼ(HDAC)阻害剤、例えば、ロミデプシンまたはベリノスタットである。一部の実施形態では、第2の薬剤は、キナーゼまたは酵素阻害剤である。一部の実施形態では、第2の薬剤は、PI3K阻害剤、例えば、デュベリシブである。一部の実施形態では、第2の薬剤は、ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、例えば、ティピファニブである。一部の実施形態では、第2の薬剤は、SYK/JAK阻害剤、例えば、セルデュラチニブである。一部の実施形態では、第2の薬剤は、化学療法剤である。一部の実施形態では、第2の薬剤は抗CD30抗体である。一部の実施形態では、第2の薬剤はIMiDである。
[00999]別の態様では、本開示は、本明細書に開示される多機能性分子を使用して、がんの処置を必要とする対象を特定する方法であって、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含み、
対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定せず、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定しない
方法を特徴とする。
対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定せず、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定しない
方法を特徴とする。
[001000]別の態様では、本開示は、がん、例えばリンパ腫の処置を必要とする対象を評価する方法であって、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含む、方法を特徴とする。
例示的な実施形態5
[001001]1.(i)リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、腫瘍抗原は、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)である、第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー;
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子;
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー;および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子。
[001001]1.(i)リンパ腫細胞(例えば、T細胞)上の腫瘍抗原に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、腫瘍抗原は、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)である、第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー;
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子;
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー;および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子。
[001002]1A.(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に選択的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、CD3以外のT細胞抗原に結合するT細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体(death receptor)シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子。
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、CD3以外のT細胞抗原に結合するT細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体(death receptor)シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子。
[001003]2.(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)を発現するリンパ球を選択的に標的化する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子。
(ii)(a)NK細胞エンゲージャー(例えば、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する分子)、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、
(b)サイトカイン分子またはサイトカイン阻害剤分子、
(c)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および
(d)間質改変部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む、多機能性分子。
[001004]3.実施形態1または2の多機能性分子であって、この多機能性分子が:
(i)TRBC1もしくはTRBC2のエピトープ、例えば、本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子によって認識されるエピトープと同一もしくは類似のエピトープに特異的に結合するか;
(ii)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子と同一もしくは類似の結合親和性もしくは特異性、またはその両方を示すか;
(iii)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子の結合を阻害する、例えば競合的に阻害するか;
(iv)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子と同一もしくは重複するエピトープに結合するか;あるいは
(v)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子と結合について競合する、および/または同じエピトープに結合する、多機能性分子。
(i)TRBC1もしくはTRBC2のエピトープ、例えば、本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子によって認識されるエピトープと同一もしくは類似のエピトープに特異的に結合するか;
(ii)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子と同一もしくは類似の結合親和性もしくは特異性、またはその両方を示すか;
(iii)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子の結合を阻害する、例えば競合的に阻害するか;
(iv)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子と同一もしくは重複するエピトープに結合するか;あるいは
(v)本明細書に記載の抗TRBC1もしくは抗TRBC2抗体分子と結合について競合する、および/または同じエピトープに結合する、多機能性分子。
[001005]4.抗TRBC1または抗TRBC2抗体分子が、表2~5から選択される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変ドメイン、重鎖もしくは軽鎖、または抗原結合性ドメイン、あるいはそれと実質的に同一の配列を含む、実施形態3に記載の多機能性分子。
[001006]5.抗原または腫瘍抗原がTRBC1である、実施形態1から4のいずれかに記載の多機能性分子。
[001007]6.抗原または腫瘍抗原がTRBC2である、実施形態1から4のいずれかに記載の多機能性分子。
[001008]7.第1の抗原結合性ドメインが、本明細書に開示される抗TRBC2抗原結合性ドメインを含み、例えば、表21~25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、実施形態1から4または6のいずれかに記載の多機能性分子。
[001009]8.第1の抗原結合性ドメインが、TRBC2を含まないT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対して高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合のKDが、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2を含まないT細胞受容体との間の結合のKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である、実施形態1から4、6、または7のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001010]9.第1の抗原結合性ドメインが、TRBC1を含むT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対して高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合のKDが、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1を含むT細胞受容体との間の結合のKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である、実施形態1から4または6~8のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001011]10.リンパ腫細胞またはリンパ球(例えば、T細胞)におけるTRBC1またはTRBC2への、またはリンパ腫細胞(例えば、T細胞)における腫瘍抗原への第1の抗原結合性ドメインの結合が、リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞を活性化しない、先行するいずれかの実施形態の多機能性分子。
[001012]11.リンパ腫細胞またはリンパ球(例えば、T細胞)におけるTRBC1またはTRBC2、またはリンパ腫細胞(例えばT細胞)における腫瘍抗原への第1の抗原結合性ドメインの結合が、例えば、T細胞の増殖、T細胞活性化マーカー(例えば、CD69またはCD25)の発現、および/またはサイトカイン(例えば、TNFαおよびIFNγ)の発現によって測定したときに、リンパ腫細胞またはリンパ球、例えばT細胞をほとんど活性化しない、先行するいずれかの実施形態の多機能性分子。
[001013]12.多機能性分子が、非リンパ腫細胞と比べてリンパ腫細胞に優先的に結合し、必要に応じて、多機能性分子とリンパ腫細胞との間の結合が、多機能性分子と非リンパ腫細胞との間の結合よりも10、20、30、40、または50倍を超えて大きい、実施形態1または2~11のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001014]13.(i)多機能性分子とTRBC1を発現するリンパ球との間の結合が、多機能性分子とTRBC1を発現しないリンパ球との間の結合よりも10、20、30、40、または50倍を超えて大きい、または
(ii)多機能性分子とTRBC2を発現するリンパ球との間の結合が、多機能性分子とTRBC2を発現しないリンパ球との間の結合よりも10、20、30、40、または50倍を超えて大きい、実施形態2から9のいずれか1つの多機能性分子。
(ii)多機能性分子とTRBC2を発現するリンパ球との間の結合が、多機能性分子とTRBC2を発現しないリンパ球との間の結合よりも10、20、30、40、または50倍を超えて大きい、実施形態2から9のいずれか1つの多機能性分子。
[001015]14.多機能性分子が、NK細胞エンゲージャー、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャーを含む、実施形態1から13のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001016]15.免疫細胞エンゲージャーが、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合し、活性化する、実施形態14に記載の多機能性分子。
[001017]16.免疫細胞エンゲージャーが、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合するが活性化しない、実施形態15に記載の多機能性分子。
[001018]17.免疫細胞エンゲージャーが、T細胞エンゲージャー、例えば、T細胞への結合およびその活性化を媒介するT細胞エンゲージャー、またはT細胞への結合を媒介するが、活性化を媒介しないT細胞エンゲージャーである、実施形態14から16のいずれか1つの多機能性分子。
[001019]18.T細胞エンゲージャーが、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2、またはCD226に結合し、例えば、T細胞エンゲージャーが抗TCRβ抗体分子である、実施形態17に記載の多機能性分子。
[001020]19.免疫細胞エンゲージャーが、NK細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞への結合および活性化を媒介するNK細胞エンゲージャー、またはNK細胞への結合を媒介するが、活性化を媒介しないNK細胞エンゲージャーである、実施形態14~16のいずれか1つの多機能性分子。
[001021]20.NK細胞エンゲージャーが、NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例えば、CD16a、CD16b、またはその両方)、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(SLAMF4または2B4としても公知である)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E、またはCD160に結合する(例えば、活性化する)、抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択され、例えば、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する(例えば、活性化する)抗体分子またはリガンドである、実施形態19に記載の多機能性分子。
[001022]21.NK細胞エンゲージャーが、抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである、実施形態19に記載の多機能性分子。
[001023]22.NK細胞エンゲージャーが、NK細胞とエンゲージすることができる、実施形態20または21のいずれかに記載の多機能性分子。
[001024]23.NK細胞エンゲージャーが、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである、実施形態19から22のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001025]24.多機能性分子が、
(i)NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16のエピトープ、例えば、本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子によって認識されるエピトープと同一または類似のエピトープに特異的に結合し、
(ii)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子と同一または類似の結合親和性もしくは特異性またはその両方を示し、
(iii)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子の結合を阻害し、例えば、競合的に阻害し、
(iv)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子と同一または重複するエピトープを結合し、あるいは
(v)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16分子との結合に競合し、および/または同一のエピトープを結合する、
先行するいずれかの実施形態に記載の多機能性分子。
(i)NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16のエピトープ、例えば、本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子によって認識されるエピトープと同一または類似のエピトープに特異的に結合し、
(ii)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子と同一または類似の結合親和性もしくは特異性またはその両方を示し、
(iii)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子の結合を阻害し、例えば、競合的に阻害し、
(iv)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子と同一または重複するエピトープを結合し、あるいは
(v)本明細書に記載されるように、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16分子との結合に競合し、および/または同一のエピトープを結合する、
先行するいずれかの実施形態に記載の多機能性分子。
[001026]25.抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子が、表7、8、8A、8B、9、10、または15から選択される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変ドメイン、重鎖もしくは軽鎖、または抗原結合性ドメイン、あるいはそれと実質的に同一の配列を含む、実施形態19から24のいずれかに記載の多機能性分子。
[001027]26.NK細胞エンゲージャーが、NKp30に結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである、実施形態19から25のいずれかの多機能性分子。
[001028]27.リンパ腫細胞またはリンパ球の溶解が、NKp30によって媒介される、実施形態19から26のいずれかに記載の多機能性分子。
[001029]28.リンパ腫細胞上の腫瘍抗原またはリンパ球上のTRBC1もしくはTRBC2の非存在下でNK細胞とインキュベートした場合、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態19から27のいずれかに記載の多機能性分子。
[001030]29.NK細胞が、NKp30を発現するNK細胞であり、(1)リンパ腫細胞上の腫瘍抗原がまた存在するか、または(2)リンパ球上のTRBC1もしくはTRBC2がまた存在するかのいずれかの場合に、多機能性分子がNK細胞を活性化する、実施形態19から28のいずれかに記載の多機能性分子。
[001031]30.NK細胞が、NKp30を発現するNK細胞ではなく、(1)リンパ腫細胞上の腫瘍抗原がまた存在するか、または(2)リンパ球上のTRBC1もしくはTRBC2がまた存在するかのいずれかの場合に、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態19から29のいずれかに記載の多機能性分子。
[001032]31.NK細胞エンゲージャーが、本明細書に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインを含み、例えば、表7、8、8A、8B、9、10、18、および25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、実施形態19から30のいずれかに記載の多機能性分子。
[001033]32.NK細胞エンゲージャーが、NKp46に結合する抗体分子、例えば抗原結合性ドメインである、実施形態19から25のいずれかの多機能性分子。
[001034]33.リンパ腫細胞の溶解が、NKp46によって媒介される、実施形態32に記載の多機能性分子。
[001035]34.リンパ腫細胞上の腫瘍抗原の非存在下でNK細胞とともにインキュベートした場合、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態32または33のいずれかに記載の多機能性分子。
[001036]35. NK細胞が、NKp46を発現するNK細胞であり、さらにリンパ腫細胞上の腫瘍抗原がまた存在する場合、多機能性分子がNK細胞を活性化する、実施形態32から34のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001037]36. NK細胞が、NKp46を発現するNK細胞ではなく、さらにリンパ腫細胞上の腫瘍抗原もまた存在する場合、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態32から35のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001038]37. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6182のアミノ酸配列(または配列番号6182と少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む、実施形態32から36のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001039]38. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6183のアミノ酸配列(または配列番号6183と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む、実施形態32から37のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001040]39. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6181のアミノ酸配列(または配列番号6181と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFVを含む、32~38に記載の多機能性分子。
[001041]40. NK細胞エンゲージャーが、NKG2Dに結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである、実施形態19から25のいずれかに記載の多機能性分子。
[001042]41.リンパ腫細胞の溶解が、NKG2Dによって媒介される、実施形態40に記載の多機能性分子。
[001043]42.リンパ腫細胞上の腫瘍抗原の非存在下でNK細胞とともにインキュベートした場合、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態40または41のいずれかに記載の多機能性分子。
[001044]43. NK細胞が、NKG2Dを発現するNK細胞であり、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原もまた存在する場合、多機能性分子がNK細胞を活性化する、実施形態40から42のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001045]44. NK細胞が、NKG2Dを発現するNK細胞ではなく、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原もまた存在する場合、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態40から43のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001046]45. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6176のアミノ酸配列(または配列番号6176と少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む、実施形態40から44のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001047]46. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6177のアミノ酸配列(または配列番号6177と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む、実施形態40から45のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001048]47. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6175のアミノ酸配列(または配列番号6175と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFVを含む、実施形態40から46のいずれかに記載の多機能性分子。
[001049]48. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6179のアミノ酸配列(または配列番号6179と少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む、実施形態40から44のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001050]49.NK細胞エンゲージャーが、配列番号6180のアミノ酸配列(または配列番号6180と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む、実施形態40から44または48のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001051]50. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6178のアミノ酸配列(または配列番号6178と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFVを含む、実施形態40から44、48、または49のいずれかに記載の多機能性分子。
[001052]51.NK細胞エンゲージャーが、CD16に結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである、実施形態19から25のいずれかの多機能性分子。
[001053]52.リンパ腫細胞の溶解が、CD16によって媒介される、実施形態51に記載の多機能性分子。
[001054]53.リンパ腫細胞上の腫瘍抗原の非存在下でNK細胞とともにインキュベートした場合、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態51または52のいずれかに記載の多機能性分子。
[001055]54. NK細胞が、CD16を発現するNK細胞であり、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原もまた存在する場合、多機能性分子がNK細胞を活性化する、実施形態51から53のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001056]55. NK細胞が、CD16を発現するNK細胞ではなく、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原もまた存在する場合、多機能性分子がNK細胞を活性化しない、実施形態51から54のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001057]56. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6185のアミノ酸配列(または配列番号6185と少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む、実施形態51から55のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001058]57. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6186のアミノ酸配列(または配列番号6186と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む、実施形態51から56のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001059]58. NK細胞エンゲージャーが、配列番号6184のアミノ酸配列(または配列番号6184と少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFVを含む、実施形態51から57のいずれかに記載の多機能性分子。
[001060]59.NK細胞エンゲージャーが、リガンドであり、必要に応じてリガンドが、免疫グロブリン定常領域、例えば、Fc領域をさらに含む、実施形態19に記載の多機能性分子。
[001061]60.NK細胞エンゲージャーが、NKp44またはNKp46のリガンド、例えば、ウイルスHAである、実施形態59に記載の多機能性分子。
[001062]61.NK細胞エンゲージャーが、DAP10のリガンド、例えば、NKG2Dの共受容体である、実施形態59に記載の多機能性分子。
[001063]62.NK細胞エンゲージャーが、CD16のリガンド、例えば、CD16a/bリガンド、例えば、抗体Fc領域をさらに含むCD16a/bリガンドである、実施形態59に記載の多機能性分子。
[001064]63.免疫細胞エンゲージャーが、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞のうちの1つまたは複数への結合、もしくはその活性化、またはその両方を媒介する、実施形態14から16のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001065]64.免疫細胞エンゲージャーが、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体のアゴニスト(例えば、TLR4、例えば、恒常的活性なTLR4(caTLR4)またはTLR9アゴニスト);41BB;CD2アゴニスト;CD47;またはSTINGアゴニスト、またはそれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択される、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む、実施形態63に記載の多機能性分子。
[001066]65.免疫細胞エンゲージャーが、B細胞エンゲージャー、例えば、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子である、実施形態14から16のいずれか1つの多機能性分子。
[001067]66.免疫細胞エンゲージャーが、マクロファージ細胞エンゲージャー、例えば、CD2アゴニスト;CD40L;OX40L;OX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;Toll様受容体(TLR)のアゴニスト(例えば、TLR4、例えば、恒常的活性なTLR4(caTLR4)またはTLR9アゴニスト);CD47;またはSTINGアゴニストである、実施形態14から16のいずれか1つの多機能性分子。
[001068]67.免疫細胞エンゲージャーが、樹状細胞エンゲージャー、例えば、CD2アゴニスト、OX40抗体、OX40L、41BBアゴニスト、Toll様受容体アゴニストまたはその断片(例えば、TLR4、例えば、恒常的活性なTLR4(caTLR4))、CD47アゴニスト、またはSTINGアゴニストである、実施形態14から16のいずれか1つの多機能性分子。
[001069]68.STINGアゴニストが、と共に、サイクリックジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)、サイクリックジAMP(cdAMP)、またはそれらの組合せを含み、必要に応じて、2‘,5‘または3‘,5‘リン酸連結を有するものであり、例えば、STINGアゴニストが多機能性分子と共有結合的にカップリングされている、実施形態66または67の多機能性分子。
[001070]69.多機能性分子がサイトカイン分子を含む、実施形態1から13のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001071]70.サイトカイン分子が、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、もしくはインターフェロンガンマ、またはそれらの断片もしくはバリアント、または前述のサイトカインのいずれかの組合せから選択される、実施形態69に記載の多機能性分子。
[001072]71.サイトカイン分子が、インターロイキン-2(IL-2)である、実施形態70に記載の多機能性分子。
[001073]72.サイトカイン分子が単量体または二量体である、実施形態69から71のいずれかの多機能性分子。
[001074]73.サイトカイン分子が、受容体二量体化ドメイン、例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメインをさらに含む、実施形態69から72のいずれか1つの多機能性分子。
[001075]74.サイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)が共有結合的に連結されず、例えば、非共有結合的に会合している、実施形態73に記載の多機能性分子。
[001076]75.多機能性分子がサイトカイン阻害剤分子を含む、実施形態1から13のいずれかに記載の多機能性分子。
[001077]76.サイトカイン阻害剤分子がTGF-ベータ阻害剤である、実施形態75に記載の多機能性分子。
[001078]77.TGF-ベータ阻害剤が、(i)TGF-ベータ1;(ii)TGF-ベータ2;(iii)TGF-ベータ3;(iv)(i)および(ii);(v)(i)および(iii);(vi)(ii)および(iii);または(vii)(i)、(ii)、および(iii)を阻害する(例えば、その活性を低減する)、実施形態75または76のいずれかの多機能性分子。
[001079]78.TGF-ベータ阻害剤が、TGF-ベータを阻害する(例えば、その活性を低減する)ことができるTGF-ベータ受容体(例えば、TGF-ベータ受容体の細胞外ドメイン)の一部、または機能的断片もしくはバリアントを含む、実施形態75から77のいずれかの多機能性分子。
[001080]79. TGFベータ阻害剤が、(i)TGFBR1、(ii)TGFBR2、(iii)TGFBR3、(iv)(i)および(ii)、(v)(i)および(iii)、(vi)(ii)および(iii)、または(vii)(i)、(ii)、および(iii)の一部を含む、実施形態78に記載の多機能性分子。
[001081]80. TGF-ベータ阻害剤が、表16から選択されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態75から79のいずれかに記載の多機能性分子。
[001082]81.多機能性分子が、TNF関連アポトーシス誘導リガンド(TRAIL)分子、細胞死受容体分子、または細胞死受容体に特異的に結合する抗原結合性ドメインから選択される細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含む、実施形態1から13のいずれかに記載の多機能性分子。
[001083]82.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、例えば、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ腫細胞(例えば、T細胞)またはリンパ球における細胞死受容体シグナル伝達を活性化し、例えば、前記細胞におけるアポトーシスまたは細胞死を誘導する、実施形態81に記載の多機能性分子。
[001084]83.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、TRBC1を発現しない、またはTRBC2を発現しない非リンパ腫細胞およびリンパ球上の細胞死受容体シグナル伝達を活性化しない、実施形態81または82のいずれかに記載の多機能性分子。
[0101085]84.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、TRAIL分子、例えば、1つまたは複数のTRAILポリペプチドまたはその断片を含む、実施形態81から83のいずれかの多機能性分子。
[001086]85. TRAIL分子が、細胞死受容体4(DR4)または細胞死受容体5(DR5)に特異的に結合する、実施形態84に記載の多機能性分子。
[001087]86.TRAIL分子が、例えば野生型TRAILポリペプチドに対して、短縮されたTRAILポリペプチドを含む、実施形態84または85のいずれかの多機能性分子。
[001088]87.TRAIL分子が、ヒトTRAILの少なくともアミノ酸95~281に対応する残基、例えば、ヒトTRAILのアミノ酸95~281に対応する残基を含む短縮化されたTRAIL分子を含む、実施形態86に記載の多機能性分子。
[001089]88.TRAIL分子が、ヒトTRAILのアミノ酸95~281を含み、例えば、ヒトTRAILのアミノ酸1~94を含まない短縮されたTRAILポリペプチドを含む、実施形態87に記載の多機能性分子。
[001090]89.TRAIL分子が、ヒトTRAILの少なくともアミノ酸122~281に対応する残基、例えば、ヒトTRAILのアミノ酸122~281に対応する残基を含む短縮されたTRAIL分子を含む、実施形態86に記載の多機能性分子。
[001091]90.TRAIL分子が、ヒトTRAILのアミノ酸122~281を含み、例えばヒトTRAILのアミノ酸1~121を含まない短縮されたTRAILポリペプチドを含む、実施形態89に記載の多機能性分子。
[001092]91.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、1つ、2つ、または3つのTRAIL分子を含む、実施形態84から90のいずれかに記載の多機能性分子。
[001093]92.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、細胞死受容体、例えば、細胞死受容体4(DR4)または細胞死受容体5(DR5)に特異的に結合する抗原結合性ドメインを含む、実施形態81から83のいずれかの多機能性分子。
[001094]93.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、細胞死受容体に特異的に結合する1つ、2つ、または3つの抗原結合性ドメインを含む、実施形態92に記載の多機能性分子。
[001095]94.細胞死受容体に特異的に結合する抗原結合性ドメインがDR5に結合する、実施形態92または93のいずれかに記載の多機能性分子。
[001096]95.細胞死受容体に特異的に結合する抗原結合性ドメインが、チガツズマブ、ドロジツマブ、またはコナツムマブを含む、実施形態92から94のいずれかに記載の多機能性分子。
[001097]96.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、表11から選択されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から95のいずれかに記載の多機能性分子。
[001098]97.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6157のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001099]98.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6158のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001100]99.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6159のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001101]100.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6160のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001102]101.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6161のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001103]102.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6162のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001104]103.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6163のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001105]104.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6164のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001106]105.細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、配列番号6165のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態81から96のいずれかに記載の多機能性分子。
[001107]106.T細胞エンゲージャーがTCRβ、例えば、TCRベータV鎖(TCRBV)に結合する、実施形態18に記載の多機能性分子。
[001108]107.T細胞エンゲージャーが、TCRβに結合する(例えば、一部の実施形態では、活性化する)抗原結合性ドメイン(例えば、抗体分子またはその断片)を含む、実施形態106に記載の多機能性分子。
[001109]108.T細胞エンゲージャーが、抗TCRβV抗体分子、例えば、ヒトTCRベータV鎖(TCRβV)に特異的に結合する抗TCRβV抗体分子を含む、実施形態106または107のいずれかの多機能性分子。
[001110]109. T細胞エンゲージャーが、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ腫細胞またはリンパ球に結合しない、実施形態106から108のいずれかに記載の多機能性分子。
[001111]110. T細胞エンゲージャーが、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ腫細胞またはリンパ球に結合することができる、またはそれに結合する、実施形態106から108のいずれかに記載の多機能性分子。
[001112]111. T細胞エンゲージャーが、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ腫細胞またはリンパ球を活性化しない、実施形態106から110のいずれかに記載の多機能性分子。
[001113]112. T細胞エンゲージャーが、TCRβVサブファミリーまたは表12のサブファミリーメンバーに特異的に結合する抗TCRβV抗体分子を含む、実施形態106から111のいずれかに記載の多機能性分子。
[001114]113.抗TCRβV抗体分子が、TCRβV6、例えば、TCRβV6-4*01、TCRβV6-4*02、TCRβV6-9*01、TCRβV6-8*01、TCRβV6-5*01、TCRβV6-6*02、TCRβV6-6*01、TCRβV6-2*01、TCRβV6-3*01またはTCRβV6-1*01を含むTCRβV6サブファミリーに特異的に結合する、実施形態112に記載の多機能性分子。
[001115]114.抗TCRβV抗体分子が、表13に提供される、またはそれと少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する、1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、または可変重鎖および/もしくは軽鎖領域を含む、実施形態113に記載の多機能性分子。
[001116]115.抗TCRβV抗体分子が、TCRβV12、例えば、TCRβV12-4*01、TCRβV12-3*01またはTCRβV12-5*01を含むTCRβV12サブファミリーに特異的に結合する、実施形態112に記載の多機能性分子。
[001117]116.抗TCRβV抗体分子が、表14に提供される、またはそれと少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する、1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、または可変重鎖および/もしくは軽鎖領域を含む、実施形態115に記載の多機能性分子。
[001118]117.多機能性分子が、間質改変部分を含む、実施形態1から13のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001119]118.間質改変部分が、間質もしくは細胞外マトリックス(ECM)成分のレベルもしくは産生を減少させること、腫瘍線維症を減少させること、間質における腫瘍の輸送を増加させること、腫瘍の灌流を改善すること、腫瘍の微小血管系を拡張すること、腫瘍における間質液圧力(IFP)を減少させること、または腫瘍もしくは腫瘍血管系への薬剤、例えばがん治療剤もしくは細胞療法剤の浸透もしくは拡散を減少させるかもしくは増強することのうちの1つまたは複数をもたらす、実施形態117に記載の多機能性分子。
[001120]119.減少した間質またはECM成分が、グリコサミノグリカンもしくは細胞外タンパク質、またはそれらの組合せから選択される、実施形態118に記載の多機能性分子。
[001121]120.多機能性分子が、
(i)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)およびサイトカイン分子、
(ii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)およびサイトカイン阻害剤分子、
(iii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)および細胞死受容体シグナルエンゲージャー、
(iv)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)および間質改変部分、
(v)サイトカイン分子および間質改変部分、
(vi)サイトカイン分子および細胞死受容体シグナルエンゲージャー、
(vii)サイトカイン阻害剤分子および間質改変部分、
(viii)サイトカイン阻害剤分子および細胞死受容体シグナルエンゲージャー、
(ix)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)、サイトカイン分子、細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および間質改変部分、または
(x)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)、サイトカイン阻害剤分子、細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および間質改変部分
を含む、実施形態1~119のいずれかの多機能性分子。
(i)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)およびサイトカイン分子、
(ii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)およびサイトカイン阻害剤分子、
(iii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)および細胞死受容体シグナルエンゲージャー、
(iv)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)および間質改変部分、
(v)サイトカイン分子および間質改変部分、
(vi)サイトカイン分子および細胞死受容体シグナルエンゲージャー、
(vii)サイトカイン阻害剤分子および間質改変部分、
(viii)サイトカイン阻害剤分子および細胞死受容体シグナルエンゲージャー、
(ix)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)、サイトカイン分子、細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および間質改変部分、または
(x)免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)、サイトカイン阻害剤分子、細胞死受容体シグナルエンゲージャー、および間質改変部分
を含む、実施形態1~119のいずれかの多機能性分子。
[001122]121.多機能性分子が、以下の構成:
A,B-[二量体化モジュール]-C,-D
を含み、式中:
(a)二量体化モジュールは、免疫グロブリン定常ドメイン、例えば、重鎖定常ドメイン(例えば、ホモ二量体もしくはヘテロ二量体重鎖定常領域、例えば、Fc領域)、または免疫グロブリン可変領域(例えば、Fab領域)の定常ドメインを含み、
(b)A、B、C、およびDは、独立して、不在であるか、(i)TRBC1もしくはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメイン、(ii)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、(iii)サイトカイン分子もしくはサイトカイン阻害剤分子、(iv)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、または(v)間質改変部分であり、ただし、
A、B、C、およびDのうちの少なくとも1つ、2つ、または3つは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、
残りのA、B、C、およびDのいずれかは、不在であるか、または免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、サイトカイン阻害剤分子、細胞死受容体シグナルエンゲージャー、もしくは間質改変部分のうちの1つを含む、
実施形態1から120のいずれか1つに記載の多機能性分子。
A,B-[二量体化モジュール]-C,-D
を含み、式中:
(a)二量体化モジュールは、免疫グロブリン定常ドメイン、例えば、重鎖定常ドメイン(例えば、ホモ二量体もしくはヘテロ二量体重鎖定常領域、例えば、Fc領域)、または免疫グロブリン可変領域(例えば、Fab領域)の定常ドメインを含み、
(b)A、B、C、およびDは、独立して、不在であるか、(i)TRBC1もしくはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメイン、(ii)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、(iii)サイトカイン分子もしくはサイトカイン阻害剤分子、(iv)細胞死受容体シグナルエンゲージャー、または(v)間質改変部分であり、ただし、
A、B、C、およびDのうちの少なくとも1つ、2つ、または3つは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、
残りのA、B、C、およびDのいずれかは、不在であるか、または免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、サイトカイン阻害剤分子、細胞死受容体シグナルエンゲージャー、もしくは間質改変部分のうちの1つを含む、
実施形態1から120のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001123]122.(1)Aは、TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子を含み;
(2)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30または抗NKp46抗体分子を含み;
(3)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、サイトカイン分子を含み;
(4)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、サイトカイン阻害剤分子を含み;
(5)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(6)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、間質改変部分を含み;
(7)Aは、TRBC1またはTRBC2に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子を含み;
(8)Aは、TRBC1またはTRBC2に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子を含み;
(9)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、サイトカイン分子を含み;
(10)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、サイトカイン阻害剤分子を含み;
(11)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(12)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、間質改変部分を含み;
(13)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子を含み;
(14)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子を含み;
(15)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、サイトカイン分子を含み;
(16)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、サイトカイン阻害剤分子を含み;
(17)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(18)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、間質改変部分を含み;
(19)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(20)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(21)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(22)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(23)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(24)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(25)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(26)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(27)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含み;
(28)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(29)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)間質改変部分を含み;
(30)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(31)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)細胞死受容体シグナルエンゲージャーおよび(b)間質改変部分を含み;
(32)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(33)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(34)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(35)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(36)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(37)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(38)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(39)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(40)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分;例えばCD137を含み;
(41)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(42)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)間質改変部分を含み;
(43)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(44)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)間質改変部分および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(45)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(46)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(47)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(48)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(49)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(50)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(51)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(52)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(53)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含み;
(54)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(55)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)間質改変部分を含み;
(56)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;または
(57)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)間質改変部分および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含む、実施形態121に記載の多機能性分子。
(2)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30または抗NKp46抗体分子を含み;
(3)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、サイトカイン分子を含み;
(4)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、サイトカイン阻害剤分子を含み;
(5)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(6)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、間質改変部分を含み;
(7)Aは、TRBC1またはTRBC2に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子を含み;
(8)Aは、TRBC1またはTRBC2に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子を含み;
(9)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、サイトカイン分子を含み;
(10)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、サイトカイン阻害剤分子を含み;
(11)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(12)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、間質改変部分を含み;
(13)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子を含み;
(14)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子を含み;
(15)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、サイトカイン分子を含み;
(16)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、サイトカイン阻害剤分子を含み;
(17)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(18)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、間質改変部分を含み;
(19)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(20)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(21)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(22)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(23)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(24)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(25)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(26)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(27)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含み;
(28)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(29)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)間質改変部分を含み;
(30)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(31)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、またはDは、(a)細胞死受容体シグナルエンゲージャーおよび(b)間質改変部分を含み;
(32)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(33)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(34)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(35)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(36)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(37)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(38)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(39)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(40)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分;例えばCD137を含み;
(41)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(42)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)間質改変部分を含み;
(43)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(44)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Bは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、CまたはDは、(a)間質改変部分および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(45)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(46)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(47)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(48)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(49)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン分子を含み;
(50)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)サイトカイン阻害剤分子を含み;
(51)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(52)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗TCRβV抗体分子、および(b)間質改変部分を含み;
(53)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含み;
(54)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;
(55)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)間質改変部分を含み;
(56)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)サイトカイン阻害剤分子および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含み;または
(57)Aは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインを含み、Cは、TRBC1またはTRBC2に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインを含み、BまたはDは、(a)間質改変部分および(b)細胞死受容体シグナルエンゲージャーを含む、実施形態121に記載の多機能性分子。
[001124]123.二量体化モジュールが、対になった孔-突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換の1つまたは複数を含む1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)を含む、実施形態121または122に記載の多機能性分子。
[001125]124.1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)が、例えばヒトIgG1のFc領域の、347、349、350、351、366、368、370、392、394、395、397、398、399、405、407、または409のうちの1つまたは複数から選択される位置でのアミノ酸置換を含み、必要に応じて1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)が、T366S、L368A、もしくはY407V(例えば、孔またはホールに対応する)、またはT366W(例えば、突起またはノブに対応する)、またはそれらの組合せから選択されるアミノ酸置換を含む、実施形態123に記載の多機能性分子。
[001126]125.リンカー、例えば、抗原結合性ドメインと免疫細胞エンゲージャー、抗原結合性ドメインとサイトカイン分子、抗原結合性ドメインと間質改変部分、免疫細胞エンゲージャーとサイトカイン分子、免疫細胞エンゲージャーと間質改変部分、サイトカイン分子と間質改変部分、抗原結合性ドメインと二量体化モジュール、免疫細胞エンゲージャーと二量体化モジュール、サイトカイン分子と二量体化モジュール、または間質改変部分と二量体化モジュールのうちの1つまたは複数の間にリンカーをさらに含む、実施形態1から124のいずれか1つの多機能性分子。
[001127]126.リンカーが、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される、実施形態125に記載の多機能性分子。
[001128]127.リンカーがペプチドリンカーである、実施形態125または126に記載の多機能性分子。
[001129]128.ペプチドリンカーが、GlyおよびSerを含む、実施形態127に記載の多機能性分子。
[001130]129.ペプチドリンカーが、配列番号7249~7252または75~78から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態128に記載の多機能性分子。
[001131]130.(i)TRBC1に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30抗体分子、抗NKp46抗体分子、抗NKG2D抗体分子、または抗CD16抗体分子と
を含む多機能性分子。
(ii)NK細胞エンゲージャー、例えば、抗NKp30抗体分子、抗NKp46抗体分子、抗NKG2D抗体分子、または抗CD16抗体分子と
を含む多機能性分子。
[001132]131. NK細胞エンゲージャーが、抗NKp30抗体分子を含む、実施形態130に記載の多機能性分子。
[001133]132. NK細胞エンゲージャーが、抗NKp46抗体分子を含む、実施形態130に記載の多機能性分子。
[001134]133. NK細胞エンゲージャーが、抗NKG2D抗体分子を含む、実施形態130に記載の多機能性分子。
[001135]134. NK細胞エンゲージャーが、抗CD16抗体分子を含む、実施形態130に記載の多機能性分子。
[001136]135.(i)TRBC1に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)細胞死受容体シグナルエンゲージャーと
を含む多機能性分子。
(ii)細胞死受容体シグナルエンゲージャーと
を含む多機能性分子。
[001137]136.(i)TRBC1に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)T細胞エンゲージャー、例えば、TCRベータV鎖(TCRBV)に結合する抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子。
(ii)T細胞エンゲージャー、例えば、TCRベータV鎖(TCRBV)に結合する抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子。
[001138]137.(i)TRBC1に優先的に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)サイトカイン阻害剤分子、例えば、TGF-ベータ阻害剤と
を含む多機能性分子。
(ii)サイトカイン阻害剤分子、例えば、TGF-ベータ阻害剤と
を含む多機能性分子。
[001139]138.多機能性分子が、TRBC1、TRBC2、または腫瘍抗原に一価で結合する、実施形態1または3~137のいずれかに記載の多機能性分子。
[001140]139.多機能性分子が、多価で、例えば、二価、三価、四価、五価、六価、七価、八価、九価、または十価で、TRBC1、TRBC2、または腫瘍抗原に結合する、実施形態1または3から137のいずれか1つの多機能性分子。
[001141]140.多機能性分子が、TRBC1、TRBC2、またはTRBC1もしくはTRBC2を発現するリンパ球に一価で結合する、実施形態2から137のいずれかに記載の多機能性分子。
[001142]141.多機能性分子が、多価で、例えば、二価、三価、四価、五価、六価、七価、八価、九価、または十価で、TRBC1またはTRBC2を発現するリンパ球に結合する、実施形態2から137のいずれかの多機能性分子。
[001143]142.多機能性分子が、例えば免疫細胞エンゲージャーを介して、免疫細胞に一価で結合する、先行するいずれかの実施形態の多機能性分子。
[001144]143.多機能性分子が、例えば免疫細胞エンゲージャーを介して、多価で、例えば、二価、三価、四価、五価、六価、七価、八価、九価、または十価で、免疫細胞に結合する、実施形態1から141のいずれか1つの多機能性分子。
[001145]144.抗体依存性細胞傷害(ADCC)を媒介する重鎖定常領域、例えば、Fc領域をさらに含む、先行するいずれかの実施形態の多機能性分子。
[001146]145.抗体依存性細胞食作用(ADCP)を媒介する重鎖定常領域、例えば、Fc領域をさらに含む、先行するいずれかの実施形態の多機能性分子。
[001147]146. TRBC1またはTRBC2を結合する第1の抗原結合性ドメインが、IgG2重鎖定常領域を含むか、または免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン阻害剤分子、もしくは細胞死受容体シグナルエンゲージャーが、IgG2重鎖定常領域を含む、実施形態145に記載の多機能性分子。
[001148]147.補体依存性細胞傷害(例えば、C1qを介して)を媒介する重鎖定常領域、例えば、Fc領域をさらに含む、先行するいずれかの実施形態の多機能性分子。
[001149]148.表2~5から選択される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変ドメイン、重鎖もしくは軽鎖、または抗原結合性ドメイン、あるいはそれと実質的に同一の配列を含む、TRBC1を結合する抗体分子。
[001150]149.配列番号215の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号216のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号217のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、または配列番号218のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む、実施形態148に記載の抗体分子。
[001151]150.配列番号238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号239のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号240のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、または配列番号241のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、実施形態148または149に記載の抗体分子。
[001152]151.配列番号253のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む、実施形態148から150のいずれかに記載の抗体分子。
[001153]152.配列番号258のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む、実施形態148から151のいずれかに記載の抗体分子。
[001154]153.実施形態1から152のいずれか1つに記載の多機能性分子または抗体分子をコードする核酸分子。
[001155]154.実施形態153に記載の核酸分子を含むベクター、例えば発現ベクター。
[001156]155.実施形態153に記載の核酸分子または実施形態154に記載のベクターを含む宿主細胞。
[001157]156.実施形態1から152のいずれか1つの多機能性分子または抗体分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件、例えば、遺伝子発現および/またはホモまたはヘテロ二量体化に適した条件下で、実施形態155に記載の宿主細胞を培養するステップを含む、方法。
[001158]157.実施形態1から152のいずれか1つに記載の多機能性分子と、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤とを含む、医薬組成物。
[001159]158.がんを処置する方法であって、実施形態1から152のいずれか1つに記載の多機能性分子を、それを必要とする対象に投与するステップを含み、多機能性分子が、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
[001160]159.処置を必要とする対象を、特定し、評価し、または選択するステップをさらに含み、特定し、評価し、または選択するステップは、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含む、実施形態158に記載の方法。
[001161]160.対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、
必要に応じて、TRBC1を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子での処置について対象を選択するステップ、および
TRBC1を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与するステップ
をさらに含む、実施形態159に記載の方法。
必要に応じて、TRBC1を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子での処置について対象を選択するステップ、および
TRBC1を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与するステップ
をさらに含む、実施形態159に記載の方法。
[001162]161. TRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与しないステップをさらに含む、実施形態160に記載の方法。
[001163]162.がん、例えばリンパ腫または白血病を処置する方法であって、
[001164]対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、実施形態1から152のいずれか1つに記載の多機能性分子を、それを必要とする対象に投与するステップを含み、多機能性分子が、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
[001164]対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、実施形態1から152のいずれか1つに記載の多機能性分子を、それを必要とする対象に投与するステップを含み、多機能性分子が、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
[001165]163.対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、
必要に応じて、TRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子での処置について対象を選択するステップ、および
TRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与するステップ
をさらに含む、実施形態162に記載の方法。
必要に応じて、TRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子での処置について対象を選択するステップ、および
TRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与するステップ
をさらに含む、実施形態162に記載の方法。
[001166]164. TRBC1を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与しないステップをさらに含む、実施形態163に記載の方法。
[001167]165.対象が、TRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有する、実施形態158から162のいずれかに記載の方法。
[001168]166.対象が、TRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有する、実施形態158、159、163、または164のいずれかに記載の方法。
[001169]167.実施形態1から152のいずれかに記載の多機能性分子または抗体分子を使用して、がんの処置を必要とする対象を特定する方法であって、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含み、対象がTRBC1を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定せず、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定しない、方法。
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定しない、方法。
[001170]168. TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定したことに応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置する(例えば、それを対象に投与する)ステップ、または
TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置する(例えば、それを対象に投与する)ステップ
をさらに含む、実施形態167に記載の方法。
TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置する(例えば、それを対象に投与する)ステップ
をさらに含む、実施形態167に記載の方法。
[001171]169.がん、例えばリンパ腫の処置を必要とする対象を評価する方法であって、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含む、方法。
[001172]170.評価に応答して、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子またはTRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子で対象を処置する(例えば、それを対象に投与する)ステップをさらに含む、実施形態169に記載の方法。
[001173]171.がんが血液がんである、実施形態158から170のいずれか1つに記載の方法。
[001174]172.血液がんが、白血病またはリンパ腫である、実施形態171に記載の方法。
[001175]173.血液がんが、白血病(例えば、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、ヘアリーセル白血病、急性単球性白血病(AMoL)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、若年性骨髄単球性白血病(JMML)、または大顆粒リンパ球性白血病)、リンパ腫(例えば、AIDS関連リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫(例えば、古典的ホジキンリンパ腫または結節性リンパ球優位型ホジキンリンパ腫)、菌状息肉腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞非ホジキンリンパ腫(例えば、バーキットリンパ腫、小リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、免疫芽球性大細胞型リンパ腫、前駆Bリンパ芽球性リンパ腫、またはマントル細胞リンパ腫)またはT細胞非ホジキンリンパ腫(菌状息肉腫、未分化大細胞型リンパ腫、または前駆体T-リンパ芽球性リンパ腫))、中枢神経系原発リンパ腫、セザリー症候群、ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症)、慢性骨髄増殖性新生物、ランゲルハンス細胞組織球症、多発性骨髄腫/形質細胞腫、骨髄異形成症候群、または骨髄異形成の/骨髄増殖性新生物から選択される、実施形態172に記載の方法。
[001176]174.リンパ腫が、後天性免疫不全症候群(AIDS)関連リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、成人T細胞性白血病/リンパ腫、バーキットリンパ腫、中枢神経系(CNS)リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、リンパ芽球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫(MCL)、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)(例えば、肝脾T細胞リンパ腫(HSGDTCL)、皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫、または腸症関連T細胞リンパ腫)、形質転換した濾胞性リンパ腫および形質転換した粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫(菌状息肉腫およびセザリー症候群)、濾胞性リンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫/ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症、辺縁帯B細胞リンパ腫、胃粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、慢性リンパ球性白血病/小細胞型リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、節外性T/NK細胞リンパ腫(鼻型)、または未分化大細胞型リンパ腫(例えば、原発性皮膚未分化大細胞型リンパ腫または全身性未分化大細胞型リンパ腫)から選択される、実施形態172に記載の方法。
[001177]175.がんが、固形腫瘍がんである、実施形態158から170のいずれか1つに記載の方法。
[001178]176.第2の治療的処置を施すステップをさらに含む、実施形態158から175のいずれかに記載の方法。
[001179]177.第2の治療的処置が、治療剤(例えば、化学療法剤、生物剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む、実施形態176に記載の方法。
[001180]178.治療剤が、化学療法剤または生物剤から選択される、実施形態177に記載の方法。
例示的な実施形態6
[001181]A1.(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含む多機能性分子であって、第1の抗原結合性ドメインが、表21~25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子。
[001181]A1.(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含む多機能性分子であって、第1の抗原結合性ドメインが、表21~25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、多機能性分子。
[001182]A2.第1の抗原結合性ドメインが、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、
VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3が、それぞれ、配列番号7441、201、および7442のアミノ酸配列を含むか、または
VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、それぞれ、配列番号7443、224、および225のアミノ酸配列を含む、
実施形態A1に記載の多機能性分子。
VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3が、それぞれ、配列番号7441、201、および7442のアミノ酸配列を含むか、または
VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、それぞれ、配列番号7443、224、および225のアミノ酸配列を含む、
実施形態A1に記載の多機能性分子。
[001183]A3. VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3が、
それぞれ配列番号7422、201、および7403、
それぞれ配列番号7401、201、および7403、
それぞれ配列番号7394、201、および7396、
それぞれ配列番号7346、201、および7398、
それぞれ配列番号7346、201、および7400、
それぞれ配列番号7405、201、および7403、
それぞれ配列番号7407、201、および7403、
それぞれ配列番号7427、201、および7403、または
それぞれ配列番号7430、201、および7403
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2に記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7422、201、および7403、
それぞれ配列番号7401、201、および7403、
それぞれ配列番号7394、201、および7396、
それぞれ配列番号7346、201、および7398、
それぞれ配列番号7346、201、および7400、
それぞれ配列番号7405、201、および7403、
それぞれ配列番号7407、201、および7403、
それぞれ配列番号7427、201、および7403、または
それぞれ配列番号7430、201、および7403
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2に記載の多機能性分子。
[001184]A4. VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7410、224、および225、または
それぞれ配列番号7409、224、および225
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2またはA3に記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7410、224、および225、または
それぞれ配列番号7409、224、および225
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2またはA3に記載の多機能性分子。
[001185]A5. VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7422、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7401、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7394、201、7396、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7398、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7400、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7405、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7407、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7427、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7430、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7422、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7401、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7394、201、7396、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7398、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7400、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7405、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7407、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7427、201、7403、7409、224、および225、または
それぞれ配列番号7430、201、7403、7409、224、および225
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2~A4のいずれかに記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7422、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7401、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7394、201、7396、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7398、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7400、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7405、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7407、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7427、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7430、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7422、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7401、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7394、201、7396、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7398、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7400、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7405、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7407、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7427、201、7403、7409、224、および225、または
それぞれ配列番号7430、201、7403、7409、224、および225
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2~A4のいずれかに記載の多機能性分子。
[001186]A6. VHが、配列番号7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428、および7431からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/または、VLが、配列番号7419および7418からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む、実施形態A2~A5のいずれかに記載の多機能性分子。
[001187]A7. VHおよびVLが、
それぞれ配列番号7420および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7423および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7411および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7412および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7413および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7414および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7415および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7416および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7417および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7425および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7428および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7431および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7420および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7423および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7411および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7412および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7413および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7414および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7415および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7416および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7417および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7425および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7428および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7431および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2~A6のいずれかに記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7420および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7423および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7411および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7412および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7413および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7414および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7415および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7416および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7417および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7425および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7428および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7431および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7420および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7423および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7411および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7412および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7413および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7414および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7415および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7416および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7417および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7425および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7428および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7431および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
のアミノ酸配列を含む、実施形態A2~A6のいずれかに記載の多機能性分子。
[001188]A8.(i)第1の抗原結合性ドメインが、TRBC2を含まないT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対して高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合のKDが、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2を含まないT細胞受容体との間の結合のKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、もしくは0.01%以下である、
(ii)第1の抗原結合性ドメインが、TRBC1を含むT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対して高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合のKDが、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1を含むT細胞受容体との間の結合のKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、もしくは0.01%以下である、または
(iii)リンパ腫細胞もしくはリンパ球上、例えばT細胞上のTRBC2への第1の抗原結合性ドメインの結合が、例えばT細胞の増殖、T細胞活性化マーカー(例えば、CD69もしくはCD25)の発現、および/もしくはサイトカイン(例えば、TNFαおよびIFNγ)の発現によって測定したときに、リンパ腫細胞もしくはリンパ球、例えばT細胞をほとんど活性化しない、
実施形態A1~A7のいずれかに記載の多機能性分子。
(ii)第1の抗原結合性ドメインが、TRBC1を含むT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対して高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合のKDが、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1を含むT細胞受容体との間の結合のKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、もしくは0.01%以下である、または
(iii)リンパ腫細胞もしくはリンパ球上、例えばT細胞上のTRBC2への第1の抗原結合性ドメインの結合が、例えばT細胞の増殖、T細胞活性化マーカー(例えば、CD69もしくはCD25)の発現、および/もしくはサイトカイン(例えば、TNFαおよびIFNγ)の発現によって測定したときに、リンパ腫細胞もしくはリンパ球、例えばT細胞をほとんど活性化しない、
実施形態A1~A7のいずれかに記載の多機能性分子。
[001189]A9.第2の抗原結合性ドメインが、表7、8、8A、8B、9~10、18、および25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、実施形態A1~A8のいずれかに記載の多機能性分子。
[001190]A10.第2の抗原結合性ドメインが、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3が、
それぞれ配列番号7313、6001、および7315、
それぞれ配列番号7313、6001、および6002、
それぞれ配列番号7313、6008、および6009、
それぞれ配列番号7313、7385、および7315、または
それぞれ配列番号7313、7318、および6009、
それぞれ配列番号C019、C021、およびC023、
それぞれ配列番号C033、C035、およびC037、
それぞれ配列番号C047、C049、およびC051、
それぞれ配列番号C061、C063、およびC065、
それぞれ配列番号C075、C077、およびC079、
それぞれ配列番号C089、C091、およびC093、
それぞれ配列番号C103、C105、およびC107、または
それぞれ配列番号C116、C118、およびC120
のアミノ酸配列を含む、実施形態A1~A9のいずれかに記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7313、6001、および7315、
それぞれ配列番号7313、6001、および6002、
それぞれ配列番号7313、6008、および6009、
それぞれ配列番号7313、7385、および7315、または
それぞれ配列番号7313、7318、および6009、
それぞれ配列番号C019、C021、およびC023、
それぞれ配列番号C033、C035、およびC037、
それぞれ配列番号C047、C049、およびC051、
それぞれ配列番号C061、C063、およびC065、
それぞれ配列番号C075、C077、およびC079、
それぞれ配列番号C089、C091、およびC093、
それぞれ配列番号C103、C105、およびC107、または
それぞれ配列番号C116、C118、およびC120
のアミノ酸配列を含む、実施形態A1~A9のいずれかに記載の多機能性分子。
[001191]A11.第2の抗原結合性ドメインのVLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7326、7327、および7329、
それぞれ配列番号6063、6064、および7293、
それぞれ配列番号6070、6071、および6072、または
それぞれ配列番号6070、6064、および7321、
それぞれ配列番号C026、C028、およびC030、
それぞれ配列番号C040、C042、およびC044、
それぞれ配列番号C054、C056、およびC058、
それぞれ配列番号C068、C070、およびC072、
それぞれ配列番号C082、C084、およびC086、
それぞれ配列番号C096、C098、およびC100、
それぞれ配列番号C110、C112、およびC113、
それぞれ配列番号C123、C125、およびC127
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10に記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7326、7327、および7329、
それぞれ配列番号6063、6064、および7293、
それぞれ配列番号6070、6071、および6072、または
それぞれ配列番号6070、6064、および7321、
それぞれ配列番号C026、C028、およびC030、
それぞれ配列番号C040、C042、およびC044、
それぞれ配列番号C054、C056、およびC058、
それぞれ配列番号C068、C070、およびC072、
それぞれ配列番号C082、C084、およびC086、
それぞれ配列番号C096、C098、およびC100、
それぞれ配列番号C110、C112、およびC113、
それぞれ配列番号C123、C125、およびC127
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10に記載の多機能性分子。
[001192]A12.第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7313、6001、7315、7326、7327、および7329、
それぞれ配列番号7313、6001、6002、6063、6064、および7293、
それぞれ配列番号7313、6008、6009、6070、6071、および6072、
それぞれ配列番号7313、7385、7315、6070、6064、および7321、または
それぞれ配列番号7313、7318、6009、6070、6064、および7321、
それぞれ配列番号C019、C021、C023、C026、C028、およびC030、
それぞれ配列番号C033、C035、C037、C040、C042、およびC044、
それぞれ配列番号C047、C049、C051、C054、C056、およびC058、
それぞれ配列番号C061、C063、C065、C068、C070、およびC072、
それぞれ配列番号C075、C077、C079、C082、C084、およびC086、
それぞれ配列番号C089、C091、C093、C096、C098、およびC100、
それぞれ配列番号C103、C105、C107、C110、C112、およびC113、または
それぞれ配列番号C116、C118、C120、C123、C125、およびC127
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10またはA11に記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7313、6001、7315、7326、7327、および7329、
それぞれ配列番号7313、6001、6002、6063、6064、および7293、
それぞれ配列番号7313、6008、6009、6070、6071、および6072、
それぞれ配列番号7313、7385、7315、6070、6064、および7321、または
それぞれ配列番号7313、7318、6009、6070、6064、および7321、
それぞれ配列番号C019、C021、C023、C026、C028、およびC030、
それぞれ配列番号C033、C035、C037、C040、C042、およびC044、
それぞれ配列番号C047、C049、C051、C054、C056、およびC058、
それぞれ配列番号C061、C063、C065、C068、C070、およびC072、
それぞれ配列番号C075、C077、C079、C082、C084、およびC086、
それぞれ配列番号C089、C091、C093、C096、C098、およびC100、
それぞれ配列番号C103、C105、C107、C110、C112、およびC113、または
それぞれ配列番号C116、C118、C120、C123、C125、およびC127
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10またはA11に記載の多機能性分子。
[001193]A13.(i)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号7302、7298、7300、7301、7303、および7304からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号7309、7305、7299、および7306~7308からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む、
(ii)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号6121もしくは6123~6128からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号7294もしくは6137~6141からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、あるいは
(iii)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号6122もしくは6129~6134(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号6136もしくは6142~6147からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、あるいは
(iv)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号C001~C008からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号C009~C016からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む、
実施形態A10~A12のいずれかに記載の多機能性分子。
(ii)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号6121もしくは6123~6128からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、および/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号7294もしくは6137~6141からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、あるいは
(iii)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号6122もしくは6129~6134(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号6136もしくは6142~6147からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、あるいは
(iv)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号C001~C008からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号C009~C016からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む、
実施形態A10~A12のいずれかに記載の多機能性分子。
[001194]A14.第2の抗原結合性ドメインのVHおよびVLが、
それぞれ配列番号7302および7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
それぞれ配列番号7302および7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10~A13のいずれかに記載の多機能性分子。
それぞれ配列番号7302および7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
それぞれ配列番号7302および7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10~A13のいずれかに記載の多機能性分子。
[001195]A15.第2の抗原結合性ドメインが、
配列番号7311または7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
配列番号6187または6188(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
配列番号6189または6190(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
配列番号C017~C024のいずれか
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10~A14のいずれかに記載の多機能性分子。
配列番号7311または7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
配列番号6187または6188(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
配列番号6189または6190(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
配列番号C017~C024のいずれか
のアミノ酸配列を含む、実施形態A10~A14のいずれかに記載の多機能性分子。
[001196]A16.多機能性分子が、TRBC2に一価で結合する、実施形態A1~A15のいずれかに記載の多機能性分子。
[001197]A17.多機能性分子が、図30A~30Dのいずれかで示される構成を含み、必要に応じて、
(i)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図30Aに示す構成を含む、
(ii)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 Fabを含む、例えば、図30Bに示す構成を含む、
(iii)多機能性抗体分子が、抗NKp30 Fabおよび抗TRBC2 scFvを含む、例えば、図30Cに示す構成を含む、または
(iv)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 scFvおよび抗NKp30 scFvを含む、例えば、図30Dに示す構成を含む、
実施形態A1~A16のいずれかに記載の多機能性分子。
(i)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 scFvを含み、例えば、図30Aに示す構成を含む、
(ii)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 Fabを含む、例えば、図30Bに示す構成を含む、
(iii)多機能性抗体分子が、抗NKp30 Fabおよび抗TRBC2 scFvを含む、例えば、図30Cに示す構成を含む、または
(iv)多機能性抗体分子が、抗TRBC2 scFvおよび抗NKp30 scFvを含む、例えば、図30Dに示す構成を含む、
実施形態A1~A16のいずれかに記載の多機能性分子。
[001198]A18.対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を含む1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)を含む二量体化モジュールをさらに含む、実施形態A1からA17のいずれかに記載の多機能性分子。
[001199]A19.表21~25のいずれかに開示される抗TRBC2アミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列、ならびに/あるいは、表7、8、8A、8B、9~10、18、および25のいずれかに開示される抗NKp30アミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、実施形態A1~A18のいずれかに記載の多機能性分子。
[001200]A20.(i)配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
(ii)配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
(iii)配列番号7438、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
を含む、実施形態A1~A19のいずれかに記載の多機能性分子。
(ii)配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
(iii)配列番号7438、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
を含む、実施形態A1~A19のいずれかに記載の多機能性分子。
[001201]A21.(i)配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
(ii)配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
(iii)配列番号7440、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
を含む、実施形態A1~A19のいずれかに記載の多機能性分子。
(ii)配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
(iii)配列番号7440、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
を含む、実施形態A1~A19のいずれかに記載の多機能性分子。
[001202]A22.(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含み、
第1の抗原結合性ドメインが、表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、
多機能性分子。
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含み、
第1の抗原結合性ドメインが、表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、
多機能性分子。
[001203]A23.第2の抗原結合性ドメインが、本明細書に開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメインを含む、実施形態A22に記載の多機能性分子。
[001204]A24.(i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含み、
第2の抗原結合性ドメインが、表8A~8B、9、もしくは10のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号C001~C128のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、
多機能性分子。
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含み、
第2の抗原結合性ドメインが、表8A~8B、9、もしくは10のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号C001~C128のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、
多機能性分子。
[001205]A25.第1の抗原結合性ドメインが、本明細書に開示される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、または抗原結合性ドメインを含む、実施形態A24に記載の多機能性分子。
[001206]A26.表21~25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、TRBC2に結合する抗体分子。
[001207]A27.表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン(例えば、配列番号B001~B095のいずれか)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、TRBC1に結合する抗体分子。
[001208]A28.少なくとも1つのFc受容体に対する親和性の低減または除去をもたらす1つまたは複数の突然変異を含む重鎖定常領域バリアント、例えばFc領域バリアントをさらに含み、必要に応じて、1つまたは複数の突然変異が、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞食作用(ADCP)、または補体依存性細胞傷害(CDC)の低減または除去をもたらす、実施形態A1~A25のいずれかに記載の多機能性分子または実施形態A26もしくはA27に記載の抗体分子。
[001209]A29. Fc領域バリアントが、表20に開示される1つまたは複数の突然変異を含み、必要に応じて、Fc領域バリアントが、N297A突然変異を含む、実施形態A1~A25およびA28のいずれかに記載の多機能性分子、または実施形態A26~A28のいずれかに記載の抗体分子。
[001210]A30.実施形態A1~A25、A28、およびA29のいずれかに記載の多機能性分子または実施形態A26~A29のいずれかに記載の抗体分子をコードする核酸分子。
[001211]A31.実施形態A30に記載の核酸分子を含むベクター、例えば発現ベクター。
[001212]A32.実施形態A30に記載の核酸分子または実施形態A31のベクターを含む細胞。
[001213]A33.実施形態A1~A25、A28、およびA29のいずれかに記載の多機能性分子または実施形態A26~A29のいずれかに記載の抗体分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件下で、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に適切な条件下で、実施形態A32に記載の細胞を培養するステップを含む、方法。
[001214]A34.実施形態A1~A25、A28、およびA29のいずれかに記載の多機能性分子、または実施形態A26~A29のいずれかに記載の抗体分子と、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤とを含む、医薬組成物。
[001215]A35.がんを処置する方法であって、実施形態A1~A25、A28、およびA29のいずれかに記載の多機能性分子を、それを必要とする対象に投与するステップを含み、多機能性分子が、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
[001216]A36.処置を必要とする対象を、特定し、評価し、または選択するステップをさらに含み、特定し、評価し、または選択するステップが、対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含む、実施形態A35に記載の方法。
[001217]A37.対象がTRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、
必要に応じて、TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子での処置について対象を選択するステップ、および
TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与するステップ
をさらに含む、実施形態A35に記載の方法。
必要に応じて、TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子での処置について対象を選択するステップ、および
TRBC1またはTRBC2を含むT細胞受容体に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を投与するステップ
をさらに含む、実施形態A35に記載の方法。
[001218]A38.対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、対象に、実施形態A1~A25、A28、およびA29のいずれかに記載の多機能性分子を投与するステップを含む、がん、例えばリンパ腫または白血病、例えばT細胞リンパ腫または白血病を処置する方法であって、多機能性分子が、がんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
例示的な実施形態7
[001219]1.実施形態1から21D、23、または24のいずれかに記載の多機能性分子を使用して、がん、例えばリンパ腫または白血病、例えばT細胞リンパ腫または白血病の処置を必要とする対象を特定する方法であって、対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含み、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定しない、
方法。
[001219]1.実施形態1から21D、23、または24のいずれかに記載の多機能性分子を使用して、がん、例えばリンパ腫または白血病、例えばT細胞リンパ腫または白血病の処置を必要とする対象を特定する方法であって、対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップ(例えば、それを直接的に決定するか、または間接的に決定するステップ、例えば、それに関する情報を得るステップ)を含み、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有すると決定したことに応答して、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として特定しない、
方法。
[001220]2. TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定したことに応答して、本明細書に記載の多機能性分子で対象を処置する(例えば、それを対象に投与する)ステップを含む、実施形態1に記載の方法。
[001221]3.がんが、白血病またはリンパ腫である、実施形態1または2に記載の方法。
[001222]4.がんが、後天性免疫不全症候群(AIDS)関連リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、成人T細胞性白血病/リンパ腫、バーキットリンパ腫、中枢神経系(CNS)リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、リンパ芽球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫(MCL)、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)(例えば、肝脾T細胞リンパ腫(HSGDTCL)、皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫、または腸症関連T細胞リンパ腫)、形質転換した濾胞性リンパ腫および形質転換した粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫(菌状息肉腫およびセザリー症候群)、濾胞性リンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫/ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症、辺縁帯B細胞リンパ腫、胃粘膜関連リンパ系組織(MALT)リンパ腫、慢性リンパ球性白血病/小細胞型リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、節外性T/NK細胞リンパ腫(鼻型)、および未分化大細胞リンパ腫(例えば、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫または全身性未分化大細胞リンパ腫)から選択される、実施形態1から3のいずれかに記載の方法。
[001223]5.がんが、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)である、実施形態1から4のいずれかに記載の方法。
[001224]6.試料または対象においてTRBC1またはTRBC2を検出する方法であって、
試料または対象を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および
抗体分子と試料または対象との間の複合体の形成を検出し、これによって、TRBC1またはTRBC2を検出するステップ
を含む、方法。
試料または対象を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および
抗体分子と試料または対象との間の複合体の形成を検出し、これによって、TRBC1またはTRBC2を検出するステップ
を含む、方法。
[001225]7. TRBC1またはTRBC2が、in vitroまたはin vivoで検出される、実施形態6に記載の方法。
[001226]8.参照試料または参照対象を抗体分子と接触させるステップ、および抗体分子と参照試料または参照対象との間の複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または参照対象と比較した、試料または対象における複合体の形成の変化、例えば統計上有意な変化が、試料または対象におけるTRBC1またはTRBC2の存在を示す、実施形態6または7に記載の方法。
[001227]9.対象から試料を得るステップをさらに含む、実施形態6から8のいずれかに記載の方法。
[001228]10.試料が、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えばリンパ節の1つまたは複数を含む、実施形態6から9のいずれかに記載の方法。
[001229]11.試料が、凍結および/または固定されていない、実施形態6から10のいずれかに記載の方法。
[001230]12.試料が凍結(例えば、瞬間凍結)されているおよび/または固定されている(例えば、ホルマリン固定パラフィン包埋されている(FFPE))、実施形態6から10のいずれかに記載の方法。
[001231]13.対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えばがん、例えばリンパ腫、例えばT細胞リンパ腫)を有するかまたは有するリスクがある、実施形態6から12のいずれかに記載の方法。
[001232]14.例えばマルチパネル方法を使用するフロー分析を行うステップをさらに含む、実施形態6から13のいずれかに記載の方法。
[001233]15.例えばT細胞悪性腫瘍の存在および/またはレベルを決定するための、T細胞のクローナリティーを評価するステップをさらに含む、実施形態6から14のいずれかに記載の方法。
[001234]16.生体試料から得たTRBC1+細胞またはTRBC2+細胞のレベルを測定するステップ(例えば参照試料または参照対象と比較して、TRBC1+細胞またはTRBC2+細胞が枯渇しているかどうかを例えば決定するステップ)をさらに含む、実施形態6から15のいずれかに記載の方法。
[001235]17. TRBC1またはTRBC2の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む、実施形態6から16のいずれかに記載の方法。
[001236]18. TRBC1またはTRBC2の膜レベルを測定するステップをさらに含む、実施形態6から17のいずれかに記載の方法。
[001237]19.例えば、(例えば本明細書に記載の抗体分子での)処置の後に、疾患または障害(例えば、がん)の予後、重症度、または存在もしくは不存在における変化について対象を評価するステップをさらに含む、実施形態6から18のいずれかに記載の方法。
[001238]20.抗体分子が、検出可能に標識される、実施形態6から19のいずれかに記載の方法。
[001239]21.対象を評価する方法であって、対象から得た試料(例えば、本明細書に記載の試料)を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および
抗体分子と試料との間の複合体の形成を検出し、これによって、対象を評価するステップ
を含む、方法。
抗体分子と試料との間の複合体の形成を検出し、これによって、対象を評価するステップ
を含む、方法。
[001240]22.対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えばがん、例えばリンパ腫、例えばT細胞リンパ腫)を有するかまたは有するリスクがある、実施形態21に記載の方法。
[001241]23.対象が、本明細書に記載の抗体分子で処置されていない、実施形態21または22に記載の方法。
[001242]24.対象が、本明細書に記載の抗体分子で処置されている、実施形態21または22に記載の方法。
[001243]25.本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子、および試料または対象においてTRBC1またはTRBC2を検出する方法を使用するための指示を含む、キット。
Claims (51)
- (i)T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)またはT細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン
を含むポリペプチド分子を含む組成物を使用して、がんの処置を必要とする対象を特定する方法であって、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するかどうかを決定するステップを含み、
対象がTRBC2を含むT細胞受容体を発現するがん細胞を有するという決定が、TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定し、必要に応じて、TRBC1に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補ではないと対象を特定する、方法。 - ポリペプチド分子が多機能性ポリペプチド分子である、請求項1に記載の方法。
- ポリペプチド分子が多重特異的ポリペプチド分子である、請求項1または2に記載の方法。
- 第1の抗原結合性ドメインが、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、第1の抗原結合性ドメインが、表21~25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、請求項1から3のいずれか1項に記載の方法。
- 第1の抗原結合性ドメインが、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、第1の抗原結合性ドメインが、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、
VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3が、それぞれ配列番号7441、201、および7442のアミノ酸配列を含むか、または
VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、それぞれ配列番号7443、224、および225のアミノ酸配列を含む、請求項1から4のいずれか1項に記載の方法。 - VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3が、
それぞれ配列番号7422、201、および7403、
それぞれ配列番号7401、201、および7403、
それぞれ配列番号7394、201、および7396、
それぞれ配列番号7346、201、および7398、
それぞれ配列番号7346、201、および7400、
それぞれ配列番号7405、201、および7403、
それぞれ配列番号7407、201、および7403、
それぞれ配列番号7427、201、および7403、または
それぞれ配列番号7430、201、および7403
のアミノ酸配列を含む、請求項5に記載の方法。 - VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7410、224、および225、または
それぞれ配列番号7409、224、および225
のアミノ酸配列を含む、請求項5または6に記載の方法。 - VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7422、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7401、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7394、201、7396、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7398、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7400、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7405、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7407、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7427、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7430、201、7403、7410、224、および225、
それぞれ配列番号7422、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7401、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7394、201、7396、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7398、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7346、201、7400、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7405、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7407、201、7403、7409、224、および225、
それぞれ配列番号7427、201、7403、7409、224、および225、または
それぞれ配列番号7430、201、7403、7409、224、および225
のアミノ酸配列を含む、請求項5から7のいずれか1項に記載の方法。 - VHが、配列番号7420、7423、7411、7412、7413、7414、7415、7416、7417、7425、7428、および7431からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/あるいは、VLが、配列番号7419および7418からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む、請求項5から8のいずれか1項に記載の方法。
- VHおよびVLが、
それぞれ配列番号7420および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7423および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7411および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7412および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7413および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7414および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7415および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7416および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7417および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7425および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7428および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7431および7419(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7420および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7423および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7411および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7412および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7413および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7414および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7415および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7416および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7417および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7425および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
それぞれ配列番号7428および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
それぞれ配列番号7431および7418(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
のアミノ酸配列を含む、請求項5から9のいずれか1項に記載の方法。 - 第1の抗原結合性ドメインが、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、
(i)第1の抗原結合性ドメインが、TRBC2を含まないT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対して高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合のKDが、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2を含まないT細胞受容体との間の結合のKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、もしくは0.01%以下であるか、
(ii)第1の抗原結合性ドメインが、TRBC1を含むT細胞受容体よりもTRBC2を含むT細胞受容体に対して高い親和性を有し、必要に応じて、第1の抗原結合性ドメインとTRBC2との間の結合のKDが、第1の抗原結合性ドメインとTRBC1を含むT細胞受容体との間の結合のKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、もしくは0.01%以下であるか、または
(iii)リンパ腫細胞もしくはリンパ球上のTRBC2への第1の抗原結合性ドメインの結合が、リンパ腫細胞もしくはリンパ球によるT細胞活性化マーカーの発現および/もしくはサイトカインの発現をほとんど活性化しない、
請求項1から10のいずれか1項に記載の方法。 - 第1の抗原結合性ドメインが、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン2(TRBC2)に結合し、ポリペプチド分子が、TRBC2に一価で結合する、請求項1から11のいずれか1項に記載の方法。
- ポリペプチド分子が、図30A~30Dのいずれかで示される構成を含み、必要に応じて、
(i)ポリペプチド分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 scFvを含み、
(ii)ポリペプチド分子が、抗TRBC2 Fabおよび抗NKp30 Fabを含み、
(iii)ポリペプチド分子が、抗NKp30 Fabおよび抗TRBC2 scFvを含み、または
(iv)ポリペプチド分子が、抗TRBC2 scFvおよび抗NKp30 scFvを含む、
請求項1から12のいずれか1項に記載の方法。 - ポリペプチド分子が、対になった孔-突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換の1つまたは複数を含む1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域を含む二量体化モジュールをさらに含む、請求項1から13のいずれか1項に記載の方法。
- ポリペプチド分子が、表21~25のいずれかに開示される抗TRBCのアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列、ならびに/あるいは、表7、8、8A、8B、9、10、18、および25のいずれか1つに開示される抗NKp30アミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、請求項1から14のいずれか1項に記載の方法。
- ポリペプチド分子が、
(i)配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
(ii)配列番号7420の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
(iii)配列番号7438、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
を含む、請求項1から15のいずれか1項に記載の方法。 - ポリペプチド分子が、
(i)配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7302の抗NKp30 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7309の抗NKp30 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
(ii)配列番号7423の抗TRBC2 VH(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、配列番号7419の抗TRBC2 VL(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、および配列番号7311の抗NKp30 scFv(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
(iii)配列番号7440、7439、および7383(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
を含む、請求項1から15のいずれか1項に記載の方法。 - 第1の抗原結合性ドメインが、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合し、第1の抗原結合性ドメインが、表3A~3Bもしくは4のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、請求項1から3のいずれか1項に記載の方法。
- 第1の抗原結合性ドメインが、T細胞受容体ベータ鎖定常ドメイン1(TRBC1)に結合し、第2の抗原結合性ドメインが、表8A~8B、9、および10のいずれか1つに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、請求項1から3のいずれか1項に記載の方法。
- 第2の抗原結合性ドメインが、表7、8、8A、8B、9、10、18、および25のいずれかに開示される1つもしくは複数のCDR、フレームワーク領域、可変領域、もしくは抗原結合性ドメイン、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む、請求項1から19のいずれか1項に記載の方法。
- 第2の抗原結合性ドメインが、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含み、第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3が、
それぞれ配列番号7313、6001、および7315、
それぞれ配列番号7313、6001、および6002、
それぞれ配列番号7313、6008、および6009、
それぞれ配列番号7313、7385、および7315、
それぞれ配列番号7313、7318、および6009、
それぞれ配列番号C019、C021、およびC023、
それぞれ配列番号C033、C035、およびC037、
それぞれ配列番号C047、C049、およびC051、
それぞれ配列番号C061、C063、およびC065、
それぞれ配列番号C075、C077、およびC079、
それぞれ配列番号C089、C091、およびC093、
それぞれ配列番号C103、C105、およびC107、または
それぞれ配列番号C116、C118、およびC120
のアミノ酸配列を含む、請求項1から20のいずれか1項に記載の方法。 - 第2の抗原結合性ドメインのVLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7326、7327、および7329、
それぞれ配列番号6063、6064、および7293、
それぞれ配列番号6070、6071、および6072、
それぞれ配列番号6070、6064、および7321、
それぞれ配列番号C026、C028、およびC030、
それぞれ配列番号C040、C042、およびC044、
それぞれ配列番号C054、C056、およびC058、
それぞれ配列番号C068、C070、およびC072、
それぞれ配列番号C082、C084、およびC086、
それぞれ配列番号C096、C098、およびC100、
それぞれ配列番号C110、C112、およびC113、または
それぞれ配列番号C123、C125、およびC127
のアミノ酸配列を含む、請求項21に記載の方法。 - 第2の抗原結合性ドメインのVHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3が、
それぞれ配列番号7313、6001、7315、7326、7327、および7329、
それぞれ配列番号7313、6001、6002、6063、6064、および7293、
それぞれ配列番号7313、6008、6009、6070、6071、および6072、
それぞれ配列番号7313、7385、7315、6070、6064、および7321、
それぞれ配列番号7313、7318、6009、6070、6064、および7321、
それぞれ配列番号C019、C021、C023、C026、C028、およびC030、
それぞれ配列番号C033、C035、C037、C040、C042、およびC044、
それぞれ配列番号C047、C049、C051、C054、C056、およびC058、
それぞれ配列番号C061、C063、C065、C068、C070、およびC072、
それぞれ配列番号C075、C077、C079、C082、C084、およびC086、
それぞれ配列番号C089、C091、C093、C096、C098、およびC100、
それぞれ配列番号C103、C105、C107、C110、C112、およびC113、または
それぞれ配列番号C116、C118、C120、C123、C125、およびC127
のアミノ酸配列を含む、請求項21または22に記載の方法。 - (i)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号7302、7298、7300、7301、7303、および7304からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号7309、7305、7299、および7306~7308からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、
(ii)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号6121および6123~6128からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号7294もしくは6137~6141からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、あるいは
(iii)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号6122および6129~6134からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号6136もしくは6142~6147からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、あるいは
(iv)第2の抗原結合性ドメインのVHが、配列番号C001~C008からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含み、ならびに/あるいは、第2の抗原結合性ドメインのVLが、配列番号C009~C016からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む、
請求項21から23のいずれか1項に記載の方法。 - 第2の抗原結合性ドメインのVHおよびVLが、
それぞれ配列番号7302および7309(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
それぞれ配列番号7302および7305(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)
のアミノ酸配列を含む、請求項21から24のいずれか1項に記載の方法。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
配列番号7311もしくは7310(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
配列番号6187もしくは6188(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、
配列番号6189もしくは6190(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)、あるいは
配列番号C017~C024のいずれか
のアミノ酸配列を含む、請求項21から25のいずれか1項に記載の方法。 - TRBC2に結合する抗原結合性ドメインを含む多機能性分子を使用する処置の候補として対象を特定したことに応答して、本明細書に記載の多機能性分子で対象を処置するステップ
をさらに含む、請求項1から26のいずれか1項に記載の方法。 - がんが、白血病またはリンパ腫である、請求項1から27のいずれか1項に記載の方法。
- がんが、後天性免疫不全症候群(AIDS)関連リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、成人T細胞白血病/リンパ腫、バーキットリンパ腫、中枢神経系(CNS)リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、リンパ芽球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫(MCL)、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)、形質転換した濾胞性リンパ腫および形質転換した粘膜関連リンパ組織(MALT)リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫(菌状息肉腫およびセザリー症候群)、濾胞性リンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫/ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、辺縁帯B細胞リンパ腫、胃粘膜関連リンパ組織(MALT)リンパ腫、慢性リンパ球性白血病/小細胞型リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、節外性T/NK細胞リンパ腫(鼻型)、および未分化大細胞リンパ腫から選択される、請求項1から28のいずれか1項に記載の方法。
- がんが、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)である、請求項1から29のいずれか1項に記載の方法。
- 試料または対象においてTRBC1またはTRBC2を検出する方法であって、
試料または対象を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および
抗体分子と試料または対象との間の複合体の形成を検出し、これによって、TRBC1またはTRBC2を検出するステップ
を含む、方法。 - TRBC1またはTRBC2が、in vitroまたはin vivoで検出される、請求項31に記載の方法。
- 参照試料または参照対象を抗体分子と接触させるステップ、および抗体分子と参照試料または参照対象との間の複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または参照対象と比較した、試料または対象における複合体の形成の変化が、試料または対象におけるTRBC1またはTRBC2の存在を示す、請求項31または32に記載の方法。
- 対象から試料を得るステップをさらに含む、請求項31から33のいずれか1項に記載の方法。
- 試料が、血漿、組織、生検、血液、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織の1つまたは複数を含む、請求項31から34のいずれか1項に記載の方法。
- 試料が、凍結および/または固定されていない、請求項31から35のいずれか1項に記載の方法。
- 試料が、凍結および/または固定されている、請求項31から35のいずれか1項に記載の方法。
- 対象が、本明細書に記載の疾患または障害を有するかまたは有するリスクがある、請求項31から37のいずれか1項に記載の方法。
- フロー分析を行うステップをさらに含む、請求項31から38のいずれか1項に記載の方法。
- T細胞のクローナリティーを評価するステップをさらに含む、請求項31から39のいずれか1項に記載の方法。
- 生体試料から得たTRBC1+細胞またはTRBC2+細胞のレベルを測定するステップをさらに含む、請求項31から40のいずれか1項に記載の方法。
- TRBC1またはTRBC2の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む、請求項31から41のいずれか1項に記載の方法。
- TRBC1またはTRBC2の膜レベルを測定するステップをさらに含む、請求項31から42のいずれか1項に記載の方法。
- 対象を、疾患または障害の予後、重症度、または存在もしくは不存在における変化について評価するステップをさらに含む、請求項31から43のいずれか1項に記載の方法。
- 抗体分子が、検出可能に標識される、請求項31から44のいずれか1項に記載の方法。
- 対象を評価する方法であって、
対象から得た試料を、本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子と接触させるステップ、および
抗体分子と試料との間の複合体の形成を検出し、これによって、対象を評価するステップ
を含む、方法。 - 対象が、本明細書に記載の疾患または障害を有するかまたは有するリスクがある、請求項46に記載の方法。
- 対象が、本明細書に記載の抗体分子で処置されていない、請求項46または47に記載の方法。
- 対象が、本明細書に記載の抗体分子で処置されている、請求項46または47に記載の方法。
- 本明細書に記載の抗TRBC1抗体分子または本明細書に記載の抗TRBC2抗体分子、および試料または対象においてTRBC1またはTRBC2を検出する方法を使用するための指示を含む、キット。
- がんの処置を必要とする対象を特定する方法であって、対象から得られた末梢血単核球(PBMC)由来のT細胞集団が、TRBC1またはTRBC2に対する単型性(monotypia)および特異性を有することを決定するステップを含み、
PBMC由来のT細胞集団におけるTRBC1またはTRBC2に対する単型性および特異性が、対象がT細胞悪性腫瘍を有することを示し、これによって、がんの処置の候補として対象を同定する、方法。
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