CN110494452A - 结合steap-1的抗体 - Google Patents
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Abstract
本发明一般涉及结合STEAP‑1的抗体,包括双特异性抗原结合分子,例如用于活化T细胞。另外,本发明涉及编码此类抗体的多核苷酸,以及包含此类多核苷酸的载体和宿主细胞。本发明进一步涉及用于生成该抗体的方法,以及在疾病的治疗中使用它们的方法。
Description
发明领域
本发明一般涉及结合STEAP-1的抗体,包括双特异性抗原结合分子,例如用于活化T细胞。另外,本发明涉及编码此类抗体的多核苷酸,以及包含此类多核苷酸的载体和宿主细胞。本发明进一步涉及用于生成该抗体的方法,以及在疾病的治疗中使用它们的方法。
发明背景
STEAP-1(前列腺六次跨膜上皮抗原-1)是一种339个氨基酸的细胞表面蛋白,它在正常组织中主要在前列腺细胞中表达。STEAP-1蛋白质表达在前列腺癌的各个阶段间维持于高水平,而且STEAP-1还在其它人癌症中高度过表达,诸如肺和结肠。STEAP-1在正常和癌组织中的表达概况提示它作为治疗靶的潜在用途,例如用于免疫疗法。WO 2008/052187报告抗STEAP-1抗体及其免疫缀合物。WO 2014/165818描述STEAP-1/CD3(scFv)2双特异性抗体。
对用于治疗前该列腺,肺和结肠中的各种癌症和癌症转移的另外的药物存在需要。对这种目的特别有用的药物包括结合STEAP-1的抗体,特别是结合靶细胞上的STEAP-1并活化T细胞上的T细胞抗原诸如CD3的双特异性抗体。此类抗体对它的两种靶物的同时结合会迫使靶细胞和T细胞之间的暂时相互作用,引起任何细胞毒性T细胞激活和随后的靶细胞裂解。
为了治疗目的,抗体不得不满足的一项重要要求是足够的体外(用于药物贮存)和体内(在施用于患者后)稳定性。修饰(像天冬酰胺脱酰胺,天冬氨酸异构化,琥珀酰亚胺形成,和色氨酸氧化)是重组抗体的典型降解且能影响体外稳定性和体内生物学功能二者。
本发明提供新颖的抗体,包括双特异性抗体,其结合STEAP-1且对通过例如琥珀酰亚胺形成的降解有抗性且如此显示优秀的稳定性。所提供的(双特异性)抗体进一步组合优秀的功效和生产力与低的毒性和有利的药动学特性。
发明概述
本发明人开发了新颖的结合STEAP-1的抗体,其具有出乎意料的,改善的特性。特别地,该抗体对例如通过琥珀酰亚胺形成的降解有抗性,因此特别稳定,如治疗目的所需要的。而且,发明人开发了结合STEAP-1和激活性T细胞抗原的双特异性抗原结合分子,掺入该新颖的STEAP-1抗体。
如此,在第一个方面,本发明提供一种结合STEAP-1的抗体,其中该抗体显示于pH7.4,37℃达4周后少于约5%琥珀酰亚胺降解,和/或于pH 6.0,40℃达4周后少于约10%琥珀酰亚胺降解,如通过质谱术测定的。
在又一个方面,本发明提供一种结合STEAP-1的抗体,其中该抗体包含包含SEQ IDNO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ IDNO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)。在一个实施方案中,该VH包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且该VL包含与SEQ IDNO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。在一个实施方案中,该抗体是IgG,特别是IgG1抗体。在一个实施方案中,该抗体是全长抗体。在另一个实施方案中,该抗体是选自Fv分子,scFv分子,Fab分子,和F(ab')2分子的组的抗体片段。在一个实施方案中,该抗体是多特异性抗体。
本发明还提供一种双特异性抗原结合分子,其包含(a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中该第一抗原是STEAP-1且该第一抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ IDNO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL),和(b)特异性结合第二抗原的第二抗原结合模块。在一个实施方案中,该第一抗原结合模块的VH包含与选自SEQID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且该第一抗原结合模块的VL包含与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。在一个实施方案中,该第二抗原是CD3,特别是CD3ε。在一个实施方案中,该第二抗原结合模块包含包含SEQ IDNO:15的HCDR 1,SEQ ID NO:16的HCDR 2,和SEQ ID NO:17的HCDR 3的VH,和包含SEQ IDNO:18的LCDR 1,SEQ ID NO:19的LCDR2和SEQ ID NO:20的LCDR 3的VL。在一个实施方案中,该第二抗原结合模块的VH包含与SEQ ID NO:21的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且该第二抗原结合模块的VL包含与SEQ ID NO:22的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。在一个实施方案中,该第一和/或该第二抗原结合模块是Fab分子。在一个实施方案中,该第二抗原结合模块是Fab分子,其中Fab轻链且Fab重链的可变域VL和VH或恒定域CL和CH1,特别是可变域VL和VH是彼此替换的。在一个实施方案中,该第一抗原结合模块是Fab分子,其中在恒定域中位置124处的氨基酸是用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代的(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸是用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代的(编号方式依照Kabat),且在恒定域CH1中位置147处的氨基酸是用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代的(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸是用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代的(编号方式依照Kabat EU索引)。在一个实施方案中,该第一和该第二抗原结合模块彼此融合,任选经由肽接头。在一个实施方案中,该第一和该第二抗原结合模块各自是Fab分子且或是(i)该第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第一抗原结合模块的Fab重链的N端,或是(ii)该第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第二抗原结合模块的Fab重链的N端。在一个实施方案中,该双特异性抗原结合分子包含第三抗原结合模块。在一个实施方案中,该第三抗原模块与该第一抗原结合模块同一。在一个实施方案中,该双特异性抗原结合分子包含由第一和第二亚基构成的Fc域。在一个实施方案中,该第一,该第二和,在存在的情况中,该第三抗原结合模块各自是Fab分子;且或是(i)该第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第一抗原结合模块的Fab重链的N端且该第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该Fc域的第一亚基的N端,或是(ii)该第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第二抗原结合模块的Fab重链的N端且该第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该Fc域的第一亚基的N端;且该第三抗原结合模块,在存在的情况中,在Fab重链的C端融合至该Fc域的第二亚基的N端。在一个实施方案中,该Fc域是IgG,特别是IgG1Fc域。在一个实施方案中,该Fc域是人Fc域。在一个实施方案中,该Fc域的第一亚基的CH3域中的一个氨基酸残基用具有更大侧链体积的氨基酸残基替换,由此在第一亚基的CH3域内生成隆起,该隆起可安置于第二亚基的CH3域内的空腔中,且该Fc域的第二亚基的CH3域中的一个氨基酸残基用具有更小侧链体积的氨基酸残基替换,由此在第二亚基的CH3域内生成空腔,该空腔内可安置第一亚基的CH3域内的隆起。在一个实施方案中,该Fc域包含一处或多处降低对Fc受体的结合和/或效应器功能的氨基酸替代。
依照本发明的另一个方面,提供有一种或多种分离的多核苷酸,其编码本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。本发明进一步提供一种或多种表达载体,其包含本发明的分离的多核苷酸,和一种宿主细胞,其包含本发明的分离的多核苷酸或表达载体。在一些实施方案中,该宿主细胞是真核细胞,特别是哺乳动物细胞。
在另一个方面提供一种生成结合STEAP-1的抗体的方法,其包含下述步骤:a)在适合于该抗体表达的条件下培养本发明的宿主细胞,并b)回收该抗体。本发明还涵盖一种结合STEAP-1的抗体,其通过本发明的方法生成。
本发明进一步提供一种药学组合物,其包含本发明的抗体或双特异性抗原结合分子和药学可接受载剂。
本发明还涵盖的是使用本发明的抗体,双特异性抗原结合分子和药学组合物的方法。在一个方面,本发明提供依照本发明的抗体,双特异性抗原结合分子或药学组合物,其用作药物。在一个方面提供依照本发明的抗体,双特异性抗原结合分子或药学组合物,其用于治疗疾病。在一个具体实施方案中,该疾病是癌症。
还提供的是依照本发明的抗体或双特异性抗原结合分子制造用于治疗疾病的药物的用途;以及一种治疗个体中的疾病的方法,其包含对所述个体施用治疗性有效量的包含药学可接受形式的依照本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的组合物。在一个具体实施方案中,该疾病是癌症。在任何上述实施方案中,该个体优选是哺乳动物,特别是人。
附图简述
图1。本发明的双特异性抗原结合分子的例示性构造。(A,D)“1+1CrossMab”分子的示图。(B,E)“2+1IgG Crossfab”分子的示图,其具有备选(alternative)次序的Crossfab和Fab构件(“倒转的”)。(C,F)“2+1IgG Crossfab”分子的示图。(G,K)“1+1IgG Crossfab”分子的示图,其具有备选(alternative)次序的Crossfab和Fab构件(“倒转的”)。(H,L)“1+1IgGCrossfab”分子的示图。(I,M)“2+1IgG Crossfab”分子的示图,其具有两个CrossFab。(J,N)“2+1IgG Crossfab”分子的示图,其具有两个CrossFab和备选(alternative)次序的Crossfab和Fab构件(“倒转的”)。(O,S)“Fab-Crossfab”分子的示图。(P,T)“Crossfab-Fab”分子的示图。(Q,U)“(Fab)2-Crossfab”分子的示图。(R,V)“Crossfab-(Fab)2”分子的示图。(W,Y)“Fab-(Crossfab)2”分子的示图。(X,Z)“(Crossfab)2-Fab”分子的示图。黑点:任选的Fc域中促进异二聚化的修饰。++,--:CH1和CL域中任选引入的相反电荷的氨基酸。Crossfab分子描绘为包含VH和VL区交换,但是在其中在CH1和CL域中没有引入电荷修饰的实施方案中可以备选地包含CH1和CL域的交换。
图2。实施例中制备的T细胞双特异性(TCB)抗体分子的图示。作为有电荷修饰的“2+1IgG CrossFab,倒转的”(CD3结合物中的VH/VL交换,STEAP1结合物中的电荷修饰,EE=147E,213E;RK=123R,124K)制备所有测试的TCB抗体分子。
图3。凡多珠单抗(vandortuzumab)的可变域的序列分析。(A)序列中的热点位置的预测。(B)凡多珠单抗的可变域序列中CDR区和预测热点的注解。
图4。由不同STEAP-1TCB抗体分子诱导的,24小时(A)或48小时(B)后T细胞介导的STEAP-1表达性LnCAP细胞裂解(E:T=10:1,人PBMC效应细胞)。描绘的是一式三份及SD。
图5。不同STEAP-1TCB抗体分子同时结合Jurkat-NFAT报告细胞上的人CD3和LnCAP(A)或22Rv1(B)细胞上的人STEAP-1后的Jurkat激活,如通过发光测定的。充当对照的STEAP-1阴性CHO-K1细胞系(C)。描绘的是一式三份及SD。
图6。STEAP-1TCB抗体分子对人STEAP-1表达性CHO-hSTEAP1细胞(A)和CD3表达性Jurkat NFAT细胞(B)的结合。
发明详述
定义
除非在下文另外定义,术语在本文中如本领域中一般使用的那样使用。
如本文中使用的,术语“抗原结合分子”在其最广义上指特异性结合抗原性决定簇的分子。抗原结合分子的例子是免疫球蛋白及其衍生物,例如片段。
术语“双特异性”意指抗原结合分子能够特异性结合至少两种不同的抗原性决定簇。通常,双特异性抗原结合分子包含两种抗原结合位点,其中每种特异于不同的抗原性决定簇。在某些实施方案中,所述双特异性抗原结合分子能够同时结合两种抗原性决定簇,特别是在两种不同的细胞上表达的两种抗原性决定簇。
如本文中使用的,术语“价”指抗原结合分子中规定数目的抗原结合位点的存在。因而,术语“对抗原的单价结合”指抗原结合分子中一个(且不超过一个)特异于抗原的抗原结合位点的存在。
“抗原结合位点”指抗原结合分子上提供与抗原相互作用的位点,即一个或多个氨基酸残基。例如,抗体的抗原结合位点包含来自互补性决定区(CDR)的氨基酸残基。天然的免疫球蛋白分子通常具有两个抗原结合位点,Fab分子通常具有单个抗原结合位点。
如本文中使用的,术语“抗原结合模块”指特异性结合抗原性决定簇的多肽分子。在一个实施方案中,抗原结合模块能够将与其附接的实体(例如第二抗原结合模块)引导至靶部位,例如至特定类型的携有抗原性决定簇的肿瘤细胞。在另一个实施方案中,抗原结合模块能够经由其靶抗原例如T细胞受体复合物抗原来激活信号传导。抗原结合模块包括如本文中另外定义的抗体及其片段。具体的抗原结合模块包括抗体的抗原结合域,其包含抗体重链可变区和抗体轻链可变区。在某些实施方案中,抗原结合模块可以包含抗体恒定区,如本文中另外定义和本领域中已知的。可用的重链恒定区包括以下5种同种型中的任何一种:α,δ,ε,γ或μ。可用的轻链恒定区包括以下2种同种型中的任何一种:κ和λ。
如本文中使用的,术语“抗原性决定簇”与“抗原”和“表位”同义,并且指多肽大分子上与抗原结合模块结合,从而形成抗原结合模块-抗原复合物的位点(例如氨基酸的连续区段或由不连续氨基酸的不同区构成的构象性构造)。可用的抗原性决定簇可以在例如肿瘤细胞表面上,病毒感染的细胞的表面上,其它患病细胞的表面上,免疫细胞的表面上,游离在血液血清中和/或在胞外基质(ECM)中找到。除非另外指示,本文中称作抗原的蛋白质(例如STEAP-1,CD3)可以是来自任何脊椎动物来源,包括哺乳动物如灵长类(例如人),非人灵长类(例如食蟹猴)和啮齿类(例如小鼠和大鼠)的任何天然形式的蛋白质。在一个具体的实施方案中,抗原是人蛋白。在对本文中的特定蛋白质进行提述的情况下,该术语涵盖“全长”,未加工的蛋白质以及起因于细胞中加工的蛋白质的任何形式。该术语还涵盖蛋白质的天然存在变体,例如剪接变体或等位变体。可用作抗原的一种例示性人蛋白是CD3,特别是CD3的ε亚基(对于人序列,参见UniProt no.P07766(版本185),NCBI RefSeq no.NP_000724.1,SEQ ID NO:24;或对于食蟹猴[Macaca fascicularis]序列,参见UniProtno.Q95LI5(版本69),NCBI GenBank no.BAB71849.1,SEQ ID NO:25),或STEAP-1(前列腺六次跨膜上皮抗原1;对于人序列,参见UniProt no.Q9UHE8(版本137);NCBI RefSeq no.NP_036581.1,SEQ ID NO:23)。在某些实施方案中,本发明的抗体或双特异性抗原结合分子结合在来自不同物种的CD3或STEAP-1抗原间保守的CD3或STEAP-1的表位。在具体的实施方案中,本发明的抗体或双特异性抗原结合分子结合人STEAP-1。
“特异性结合”意指结合对于抗原是选择性的,并且能与不想要的或非特异性的相互作用区别开来。抗原结合模块结合特定抗原性决定簇的能力能经由酶联免疫吸附测定法(ELISA)或本领域技术人员熟知的其它技术,例如表面等离振子共振(SPR)技术(例如在BIAcore仪上分析)(Liljeblad等,Glyco J 17,323-329(2000)),以及传统的结合测定法(Heeley,Endocr Res 28,217-229(2002))来测量。在一个实施方案中,抗原结合模块对无关蛋白质的结合程度是该抗原结合模块对抗原结合的小于约10%,如例如通过SPR测量的。在某些实施方案中,结合抗原的抗原结合模块,或包含该抗原结合模块的抗原结合分子具有≤1μM,≤100nM,≤10nM,≤1nM,≤0.1nM,≤0.01nM,或≤0.001nM(例如10-8M或更少,例如10-8M至10-13M,例如10-9M至10-13M)的解离常数(KD)。
“亲和力”指分子(例如受体)的单一结合位点与其结合配偶体(例如配体)之间非共价相互作用总和的强度。除非另外指示,如本文中使用的,“结合亲和力”指反映结合对的成员(例如抗原结合模块和抗原,或受体及其配体)之间1:1相互作用的固有结合亲和力。分子X对其配偶体Y的亲和力通常可以以解离常数(KD)来表述,其为解离与结合速率常数(分别为K解离和K结合)的比率。如此,相等的亲和力可能包含不同的速率常数,只要速率常数的比率保持相同。亲和力可以通过本领域知道的确立方法来测量,包括本文中描述的那些方法。用于测量亲和力的一种具体方法是表面等离振子共振(SPR)。
“降低的结合”,例如降低的对Fc受体的结合,指相应相互作用的亲和力降低,如例如通过SPR测量的。为了清楚,该术语还包括亲和力降低至0(或低于分析方法的检测限),即完全消除相互作用。相反,“升高的结合”指相应相互作用的结合亲和力升高。
如本文中使用的,“活化性T细胞抗原”指在T淋巴细胞,特别是细胞毒性T淋巴细胞的表面上表达的抗原性决定簇,其在与抗原结合分子相互作用后能诱导T细胞活化。特定地,抗原结合分子与活化性T细胞抗原的相互作用可诱导T细胞活化,其通过触发T细胞受体复合物的信号传导级联进行。在一个具体的实施方案中,所述活化性T细胞抗原是CD3,特别是CD3的ε亚基(对于人序列,参见UniProt no.P07766(版本144),NCBI RefSeq no.NP_000724.1,SEQ ID NO:24;或对于食蟹猴[Macaca fascicularis]序列,参见UniProtno.Q95LI5(版本49),NCBI GenBank no.BAB71849.1,SEQ ID NO:25)。
如本文中使用的,“T细胞活化”指T淋巴细胞,特别是细胞毒性T淋巴细胞的一种或多种细胞应答,其选自:增殖,分化,细胞因子分泌,细胞毒性效应分子释放,细胞毒性活性和活化标志物的表达。合适的测量T细胞活化的测定法是本领域已知的且在本文中有描述。
如本文中使用的,“靶细胞抗原”指靶细胞表面上呈现的抗原性决定簇,所述靶细胞例如肿瘤中的细胞如癌细胞或肿瘤基质的细胞。在一个特别的实施方案中,所述靶细胞抗原是STEAP-1,特别是人STEAP-1。
如本文中使用的,术语“第一”,“第二”或“第三”就Fab分子等而言为了在有超过一个每类模块时便于区分而使用。除非明确如此陈述,这些术语的使用不意图赋予双特异性抗原结合分子的特定次序或取向。
“融合”意指构件(例如Fab分子和Fc域亚基)直接地或经由一种或多种肽接头通过肽键连接。
“Fab分子”指由免疫球蛋白的重链(“Fab重链”)的VH和CH1域以及轻链(“Fab轻链”)的VL和CL域组成的蛋白质。
“交换”Fab分子(也称作“Crossfab”)意指其中Fab重链和轻链的可变域或恒定域交换(即彼此替换)的Fab分子,即交换Fab分子包含由轻链可变域VL和重链恒定域1CH1构成的肽链(VL-CH1,N至C端方向),和由重链可变域VH和轻链恒定域CL构成的肽链(VH-CL,N至C端方向)。为了清楚,在其中Fab轻链和Fab重链的可变域交换的交换Fab分子中,包含重链恒定域1CH1的肽链在本文中称作(交换)Fab分子的“重链”。相反,在其中Fab轻链和Fab重链的恒定域交换的交换Fab分子中,包含重链可变域VH的肽链在本文中称作(交换)Fab分子的“重链”。
与之相反,“常规”Fab分子意指处于它的天然型式的Fab分子,即包含由重链可变和恒定域构成的重链(VH-CH1,N至C端方向),和由轻链可变和恒定域构成的轻链(VL-CL,N至C端方向)。
术语“免疫球蛋白分子”指具有天然存在的抗体结构的蛋白质。例如,IgG类的免疫球蛋白是约150,000道尔顿的异四聚体糖蛋白,其由二硫键连接的两条轻链和两条重链构成。从N端至C端,每条重链具有可变域(VH),也称作可变重域或重链可变区,接着是3个恒定域(CH1,CH2和CH3),也称作重链恒定区。类似地,从N端至C端,每条轻链具有可变域(VL),也称作可变轻域或轻链可变区,接着是恒定轻(CL)域(也称作轻链恒定区)。免疫球蛋白的重链可以归入称作α(IgA),δ(IgD),ε(IgE),γ(IgG)或μ(IgM)的5类之一,其中一些可以进一步分成亚类,例如γ1(IgG1),γ2(IgG2),γ3(IgG3),γ4(IgG4),α1(IgA1)和α2(IgA2)。基于其恒定域的氨基酸序列,免疫球蛋白的轻链可以归入称作卡帕(κ)和拉姆达(λ)的两类之一。免疫球蛋白基本由经由免疫球蛋白铰链区连接的两个Fab分子和Fc域组成。
术语“抗体”在本文中以最广义使用且涵盖各种抗体结构,包括但不限于单克隆抗体,多克隆抗体,多特异性抗体(例如双特异性抗体),和抗体片段,只要它们展现出期望的抗原结合活性。
在用于本文时,术语“单克隆抗体”指从一群基本上同质的抗体获得的抗体,即群体中包含的各个抗体是相同的和/或结合相同表位,除了例如含有天然存在的突变或在单克隆抗体制备物的生成期间发生的可能的变体抗体外,此类变体一般以极小量存在。与通常包含针对不同决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制备物不同,单克隆抗体制备物的每个单克隆抗体针对抗原上的单一决定簇。如此,修饰语“单克隆”指示抗体自一群基本上同质的抗体获得的特征,而不应解释为要求通过任何特定方法来生成抗体。例如,可以通过多种技术来生成要依照本发明使用的单克隆抗体,包括但不限于杂交瘤方法,重组DNA方法,噬菌体展示方法,和利用含有所有或部分人免疫球蛋白基因座的转基因动物的方法,本文中描述了用于生成单克隆抗体的此类方法和其它例示性方法。
“分离的”抗体指已经与其天然环境的组分分开,即并不处于它的天然环境中的抗体。不需要特定水平的纯化。例如,分离的抗体可以从其天然或自然环境中取出。就本发明的目的而言,在宿主细胞中表达的重组生成的抗体被视为分离的,已通过任何合适的技术分开,分级,或部分或基本上纯化的天然的或重组的抗体也是如此。因此,本发明的抗体和双特异性抗原结合分子是分离的。在一些实施方案中,抗体纯化至大于95%或99%的纯度,如通过例如电泳(例如SDS-PAGE,等电聚焦(IEF),毛细管电泳)或层析(例如离子交换或反相HPLC)方法测定的。关于用于评估抗体纯度的方法的综述,见例如Flatman et al.,J.Chromatogr.B 848:79-87(2007)。
术语“全长抗体”,“完整抗体”,和“全抗体”在本文中可互换使用,指与天然抗体结构具有基本上类似的结构的抗体。
“抗体片段”指完整抗体以外的分子,其包含完整抗体中结合与完整抗体结合的抗原的一部分。抗体片段的例子包括但不限于Fv,Fab,Fab’,Fab’-SH,F(ab’)2,双抗体,线性抗体,单链抗体分子(例如scFv),和单域抗体。对于某些抗体片段的综述,参见Hudson等,Nat Med 9,129-134(2003)。对于scFv片段的综述,参见例如Plückthun,于ThePharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg和Moore编,Springer-Verlag,New York,pp.269-315(1994);亦参见WO 93/16185;和美国专利No.5,571,894和5,587,458。关于包含补救受体结合表位残基且具有延长的体内半衰期的Fab和F(ab’)2片段的论述,参见美国专利No.5,869,046。双抗体是具有两个抗原结合位点的抗体片段,其可以是二价或双特异性的。参见例如EP 404,097;WO 1993/01161;Hudson等,Nat Med 9,129-134(2003);和Hollinger等,Proc Natl Acad Sci USA 90,6444-6448(1993)。三抗体和四抗体也记载于Hudson等,Nat Med 9,129-134(2003)。单域抗体是包含抗体的整个或部分重链可变域,或整个或部分轻链可变域的抗体片段。在某些实施方案中,单域抗体是人单域抗体(Domantis,Inc.,Waltham,MA;参见例如美国专利No.6,248,516B1)。可以通过各种技术来制备抗体片段,包括但不限于对完整抗体的蛋白水解消化以及通过重组宿主细胞(例如大肠杆菌或噬菌体)产生,如本文中描述的。
术语“抗原结合域”指包含特异性结合部分或整个抗原且与其互补的区域的抗体部分。抗原结合域可由例如一个或多个抗体可变域(也称作抗体可变区)提供。具体地,抗原结合域包含抗体轻链可变域(VL)和抗体重链可变域(VH)。
术语“可变区”或“可变域”指抗体重链或轻链中牵涉使抗体结合抗原的域。天然抗体的重链和轻链的可变域(分别为VH和VL)一般具有类似的结构,每个域包含4个保守的框架区(FR)和3个高变区(HVR)。参见例如Kindt等,Kuby Immunology,第6版,W.H.Freemanand Co.,第91页(2007)。单个VH或VL域可能足以赋予抗原结合特异性。如本文中结合可变区序列使用的,“Kabat编号方式”指由Kabat等,Sequences of Proteins ofImmunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes ofHealth,Bethesda,MD(1991)提出的编号系统。
如本文中使用的,所有重和轻链的恒定区和域的氨基酸位置是依照Kabat,etal.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th ed.,Public HealthService,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)中描述的Kabat编号系统编号的,在本文中称作“依照Kabat的编号方式”或“Kabat编号方式”。具体而言,将Kabat编号系统(参见Kabat等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)的第647-660页)用于卡帕和拉姆达同种型的轻链恒定域CL并将Kabat EU索引编号系统(参见第661-723页)用于重链恒定域(CH1,铰链,CH2和CH3),在这种情况中在本文中通过提到“依照Kabat EU索引的编号方式”来进一步澄清。
如本文中使用的,术语“高变区”或“HVR”指抗体可变域中在序列上高变的(“互补决定区”或“CDR”)和/或形成结构上限定的环(“高变环”)和/或含有抗原接触残基(“抗原接触”)的每个区。一般地,抗体包含6个HVR:三个在VH中(H1,H2,H3),且三个在VL中(L1,L2,L3)。本文中的例示性HVR包括:
(a)高变环,存在于氨基酸残基26-32(L1),50-52(L2),91-96(L3),26-32(H1),53-55(H2),和96-101(H3)(Chothia and Lesk,J.Mol.Biol.196:901-917(1987));
(b)CDR,存在于氨基酸残基24-34(L1),50-56(L2),89-97(L3),31-35b(H1),50-65(H2),和95-102(H3)(Kabat et al.,Sequences of Proteins of ImmunologicalInterest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991));
(c)抗原接触,存在于氨基酸残基27c-36(L1),46-55(L2),89-96(L3),30-35b(H1),47-58(H2),和93-101(H3)(MacCallum et al.J.Mol.Biol.262:732-745(1996));和
(d)(a),(b),和/或(c)的组合,包括HVR氨基酸残基46-56(L2),47-56(L2),48-56(L2),49-56(L2),26-35(H1),26-35b(H1),49-65(H2),93-102(H3),和94-102(H3)。
除非另有指示,可变域中的HVR残基和其它残基(例如FR残基)在本文中依照Kabat等,见上文编号。
“框架”或“FR”指除高变区(HVR)残基外的可变域残基。可变域的FR一般由4个FR域组成:FR1,FR2,FR3和FR4。因而,HVR和FR序列一般以下列次序出现在VH(或VL)中:FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
“人源化”抗体指包含来自非人HVR的氨基酸残基和来自人FR的氨基酸残基的嵌合抗体。在某些实施方案中,人源化抗体会包含至少一个,通常两个基本上整个可变域,其中所有或基本上所有HVR(例如,CDR)对应于非人抗体的那些,且所有或基本上所有FR对应于人抗体的那些。此类可变域在本文中称作“人源化可变区”。任选地,人源化抗体可以至少包含自人抗体衍生的抗体恒定区的一部分。在一些实施方案中,将人源化抗体中的一些FR残基用来自非人抗体(例如衍生HVR残基的抗体)的相应残基替代,例如为了恢复或改善抗体特异性或亲和力。抗体(例如非人抗体)的“人源化形式”指已经经历人源化的抗体。本发明涵盖的“人源化抗体”的其它形式是那些其中的恒定区已经另外自初始抗体的恒定区进行过修饰或改变以生成依照本发明的特性(特别地关于C1q结合和/或Fc受体(FcR)结合)的。
“人抗体”指拥有与由人或人细胞生成的或利用人抗体全集或其它人抗体编码序列自非人来源衍生的抗体的氨基酸序列对应的氨基酸序列的抗体。人抗体的此定义明确排除包含非人抗原结合残基的人源化抗体。在某些实施方案中,人抗体衍生自非人转基因哺乳动物,例如小鼠,大鼠,或家兔。在某些实施方案中,人抗体衍生自杂交瘤细胞系。自人抗体文库分离的抗体或抗体片段在本文中也认为是人抗体或人抗体片段。
抗体或免疫球蛋白的“类”指其重链拥有的恒定域或恒定区的类型。抗体有5种主要的类:IgA,IgD,IgE,IgG和IgM,并且这些中数种可以进一步分成亚类(同种型),例如IgG1,IgG2,IgG3,IgG4,IgA1和IgA2。对应于不同免疫球蛋白类的重链恒定域分别称作α,δ,ε,γ和μ。
本文中术语“Fc域”或“Fc区”用于定义免疫球蛋白重链中至少含有恒定区的一部分的C端区域。该术语包括天然序列Fc区和变体Fc区。虽然IgG重链的Fc区的边界可以略微变化,但是人IgG重链Fc区通常定义为自Cys226或Pro230延伸至重链的羧基端。然而,由宿主细胞生成的抗体可能经历翻译后切割,自重链的C端切除一个或多个,特别是一个或两个氨基酸。因此,通过表达编码全长重链的特定核酸分子由宿主细胞生成的抗体可包括全长重链,或者它可包括全长重链的切割变体(在本文中也称作“切割变体重链”)。当重链的最终两个C端氨基酸是甘氨酸(G446)和赖氨酸(K447,编号方式依照Kabat EU索引)时可能就是这种情况。因此,Fc区的C端赖氨酸(Lys447),或C端甘氨酸(Gly446)和赖氨酸(K447)可以存在或不存在。如果没有另外指明的话,包括Fc域(或本文中定义的Fc域的亚基)的重链的氨基酸序列在本文中表示无C端甘氨酸-赖氨酸二肽的。在本发明的一个实施方案中,依照本发明的抗体或双特异性抗原结合分子中包含的包括本文中规定的Fc域的一个亚基的重链包含另外的C端甘氨酸-赖氨酸二肽(G446和K447,编号方式依照Kabat的EU索引)。在本发明的一个实施方案中,依照本发明的抗体或双特异性抗原结合分子中包含的包括本文中规定的Fc域的一个亚基的重链包含另外的C端甘氨酸残基(G446,编号方式依照Kabat的EU索引)。本发明的组合物,诸如本文所述药学组合物,包含本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的群体。抗体或双特异性抗原结合分子的群体可包含具有全长重链的分子和具有切割变体重链的分子。抗体或双特异性抗原结合分子的群体可以由具有全长重链的分子和具有切割变体重链的分子的混合物组成,其中至少50%,至少60%,至少70%,至少80%或至少90%的抗体或双特异性抗原结合分子具有切割变体重链。在本发明的一个实施方案中,包含本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的群体的组合物包含如下的抗体或双特异性抗原结合分子,其包含包括本文中规定的Fc域的一个亚基及另外的C端甘氨酸-赖氨酸二肽(G446和K447,编号方式依照Kabat的EU索引)的重链。在本发明的一个实施方案中,包含本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的群体的组合物包含如下的抗体或双特异性抗原结合分子,其包含包括本文中规定的Fc域的一个亚基及另外的C端甘氨酸残基(G446,编号方式依照Kabat的EU索引)的重链。在本发明的一个实施方案中,此类组合物包含由如下分子构成的抗体或双特异性抗原结合分子的群体:包含包括本文中规定的Fc域的一个亚基的重链的分子;包含包括本文中规定的Fc域的一个亚基及另外的C端甘氨酸残基(G446,编号方式依照Kabat的EU索引)的重链的分子,和包含包括本文中规定的Fc域的一个亚基及另外的C端甘氨酸-赖氨酸二肽(G446和K447,编号方式依照Kabat的EU索引)的重链的分子。除非本文中另外指定,Fc区或恒定区中氨基酸残基的编号方式依照EU编号系统,也称作EU索引,如记载于Kabat等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版PublicHealth Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD,1991(也参见上文)。如本文中使用的,Fc域的“亚基”指形成二聚体Fc域的两个多肽之一,即包含免疫球蛋白重链中能够稳定自身联合的C端恒定区的多肽。例如,IgG Fc域的亚基包含IgG CH2和IgG CH3恒定域。
“促进Fc域的第一亚基和第二亚基联合的修饰”是降低或防止包含Fc域亚基的多肽与相同多肽联合以形成同二聚体的肽主链操作或Fc域亚基的翻译后修饰。如本文中使用的,具体地,促进联合的修饰包括对期望联合的两个Fc域亚基(即Fc域的第一亚基和第二亚基)中的每一个进行的分开的修饰,其中所述修饰彼此互补,从而促进两个Fc域亚基的联合。例如,促进联合的修饰可以改变一种或两种Fc域亚基的结构或电荷,从而在立体或静电上分别促进它们的联合。如此,(异)二聚化在包含第一Fc域亚基的多肽和包含第二Fc域亚基的多肽之间发生,其在融合至每个亚基的别的构件(例如抗原结合模块)不同这一意义上讲可能是不相同的。在一些实施方案中,促进联合的修饰包含在Fc域中的氨基酸突变,具体为氨基酸替代。在一个具体的实施方案中,促进联合的修饰包含Fc域的两个亚基的每一个中分开的氨基酸突变,具体为氨基酸替代。
术语“效应器功能”指那些可归于抗体Fc区且随抗体同种型而变化的生物学活性。抗体效应器功能的例子包括:C1q结合和补体依赖性细胞毒性(CDC),Fc受体结合,抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC),抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP),细胞因子分泌,免疫复合物介导的抗原呈递细胞的抗原摄取,细胞表面受体(例如B细胞受体)下调和B细胞活化。
如本文中使用的,术语“工程化”视为包括对肽主链的任何操作或对天然存在或重组的多肽或其片段的翻译后修饰。工程化包括对氨基酸序列,糖基化模式或各氨基酸侧链基团的修饰,以及这些办法的组合。
如本文中使用的,术语“氨基酸突变”意为涵盖氨基酸替代,缺失,插入和修饰。可以进行替代,缺失,插入和修饰的任意组合来实现最终构建体,只要最终构建体拥有期望的特性,例如降低的对Fc受体的结合,或与另一种肽的增加的联合。氨基酸序列缺失和插入包括氨基和/或羧基端缺失和氨基酸插入。具体的氨基酸突变是氨基酸替代。为了改变例如Fc区的结合特征,特别优选非保守性的氨基酸替代,即将一个氨基酸用具有不同结构和/或化学特性的另一种氨基酸替换。氨基酸替代包括由非天然存在的氨基酸或由20种标准氨基酸的天然存在的氨基酸衍生物(例如4-羟脯氨酸,3-甲基组氨酸,鸟氨酸,高丝氨酸,5-羟赖氨酸)替换。可以使用本领域中公知的遗传或化学方法生成氨基酸突变。遗传方法可以包括定点诱变,PCR,基因合成等。认为通过遗传工程以外的方法如化学修饰来改变氨基酸侧链基团的方法也可能可用。本文中可使用各种名称来指示同一氨基酸突变。例如,从Fc域第329位脯氨酸到甘氨酸的替代可指示为329G,G329,G329,P329G或Pro329Gly。
关于参照多肽序列的“百分比(%)氨基酸序列同一性”定义为比对序列并在必要时引入缺口以获取最大百分比序列同一性后,且不将任何保守性替代视为序列同一性的一部分时,候选序列中与参照多肽序列中的氨基酸残基相同的氨基酸残基的百分率。为测定百分比氨基酸序列同一性目的的对比可以以本领域技术范围内的多种方式进行,例如使用公众可得到的计算机软件,诸如BLAST,BLAST-2,Clustal W,Megalign(DNASTAR)软件或FASTA程序包。本领域技术人员可以决定用于比对序列的合适参数,包括对所比较序列全长获得最大对比所需的任何算法。然而,为了本文中的目的,%氨基酸序列同一性值是使用36.3.8c或更晚的版本FASTA包的ggsearch程序及BLOSUM50比较矩阵生成的。FASTA程序包由W.R.Pearson and D.J.Lipman(1988)“Improved Tools for Biological SequenceAnalysis”,PNAS 85:2444-2448;W.R.Pearson(1996)“Effective protein sequencecomparison”Meth.Enzymol.266:227-258;和Pearson et al.(1997)Genomics 46:24-36撰写且自http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_down.shtml公众可得。或者,可使用在http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/index.cgi处可及的公共服务器来比较序列,使用ggsearch(全局蛋白质:蛋白质)程序和默认选项(BLOSUM50;打开:-10;延伸:-2;Ktup=2)以确保实施全局而非局部比对。百分比氨基酸同一性在输出比对标题中给出。
术语“多核苷酸”指分离的核酸分子或构建体,例如信使RNA(mRNA),病毒衍生的RNA或质粒DNA(pDNA)。多核苷酸可以包含常规的磷酸二酯键或非常规的键(例如酰胺键,如在肽核酸(PNA)中发现的)。术语“核酸分子”指任何一种或多种存在于多核苷酸中的核酸区段,例如DNA或RNA片段。
“分离的”核酸分子或多核苷酸意指已从其天然环境取出的核酸分子,DNA或RNA。例如,就本发明的目的而言,包含在载体中的编码多肽的重组多核苷酸被视为分离的。分离的多核苷酸的别的例子包括在异源宿主细胞中保持的重组多核苷酸或溶液中的(部分或基本上)纯化的多核苷酸。分离的多核苷酸包括在普遍含有该多核苷酸分子的细胞中含有的多核苷酸分子,但该多核苷酸分子存在于染色体外或在不同于其天然染色体位置的染色体位置处。分离的RNA分子包括本发明的体内或体外RNA转录本,以及正链和负链形式,和双链形式。依照本发明的分离的多核苷酸或核酸还包括合成生成的此类分子。另外,多核苷酸或核酸可以为或可以包括调节元件如启动子,核糖体结合位点或转录终止子。
“分离的编码[例如本发明的抗体或双特异性抗原结合分子]多核苷酸(或核酸)”指编码抗体重和轻链(或其片段)的一种或多种多核苷酸分子,包括在单一载体或分开的载体中的此类多核苷酸分子,和在宿主细胞中的一个或多个位置处存在的此类核酸分子。
术语“表达盒”指重组或合成生成的,具有一系列允许特定核酸在靶细胞中转录的指定核酸元件的多核苷酸。可以将重组表达盒掺入质粒,染色体,线粒体DNA,质体DNA,病毒或核酸片段中。通常,表达载体的重组表达盒部分包含要转录的核酸序列和启动子等。在某些实施方案中,表达盒包含编码本发明的抗体或双特异性抗原结合分子或其片段的多核苷酸序列。
术语“载体”或“表达载体”指用于在细胞中导入与其可操作联合的特定基因及指导其表达的DNA分子。该术语包括作为自主复制核酸结构的载体以及掺入到已经接受其导入的宿主细胞的基因组中的载体。本发明的表达载体包含表达盒。表达载体允许转录大量稳定的mRNA。一旦表达载体在细胞内,就通过细胞转录和/或翻译装置生成基因编码的核糖核酸分子或蛋白质。在一个实施方案中,本发明的表达载体包含表达盒,其包含编码本发明的抗体或双特异性抗原结合分子或其片段的多核苷酸序列。
术语“宿主细胞”,“宿主细胞系”和“宿主细胞培养物”可交换使用并指已引入外源核酸的细胞,包括此类细胞的后代。宿主细胞包括“转化体”和“经转化的细胞”,其包括初始转化的细胞和自其衍生的后代(不考虑传代数)。后代在核酸内含物上可能与亲本细胞不完全相同,但可以含有突变。本文中包括具有如原始转化细胞中筛选或选择的相同的功能或生物学活性的突变体后代。宿主细胞是能用于生成本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的任何类型的细胞系统。宿主细胞包括培养的细胞,例如哺乳动物培养细胞如HEK细胞,CHO细胞,BHK细胞,NS0细胞,SP2/0细胞,YO骨髓瘤细胞,P3X63小鼠骨髓瘤细胞,PER细胞,PER.C6细胞或杂交瘤细胞,酵母细胞,昆虫细胞和植物细胞等,而且还包括在转基因动物,转基因植物或培养的植物或动物组织中包含的细胞。
“激活Fc受体”是一种在抗体的Fc域衔接后,引发刺激携带该受体的细胞实施效应器功能的信号传导事件的Fc受体。人激活Fc受体包括FcγRIIIa(CD16a),FcγRI(CD64),FcγRIIa(CD32)和FcαRI(CD89)。
抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)是一种导致通过免疫效应器细胞对抗体包被的靶细胞裂解的免疫机制。靶细胞是包含Fc区的抗体或其衍生物一般经由Fc区的N端的蛋白质部分特异性结合的细胞。如本文中使用的,术语“降低的ADCC”定义为通过上文定义的ADCC机制,以靶细胞周围介质中给定浓度的抗体,在给定的时间内裂解的靶细胞数目的降低,和/或通过ADCC机制,实现给定时间内给定数目的靶细胞裂解需要的靶细胞周围介质中抗体浓度的增加。ADCC的降低相对于使用相同的标准生产,纯化,配制和贮存方法(其是本领域技术人员已知的),由同一类型的宿主细胞生成但尚未工程化改造的相同抗体介导的ADCC。例如,由在其Fc域包含降低ADCC的氨基酸替代的抗体所介导的ADCC中的降低,是相对于由在Fc域中无此氨基酸替代的相同抗体介导的ADCC而言。测量ADCC的合适测定法是本领域中公知的(参见例如PCT公开文本No.WO 2006/082515或PCT公开文本No.WO 2012/130831)。
药剂的“有效量”指引起接受其施用的细胞或组织中的生理学变化必需的量。
药剂例如药学组合物的“治疗有效量”指有效实现期望的治疗或预防结果的量(以必要的剂量且持续必要的时间)。治疗有效量的药剂例如消除,降低,延迟,最小化或预防疾病的不良作用。
“个体”或“受试者”是哺乳动物。哺乳动物包括但不限于驯养的动物(例如牛,绵羊,猫,犬和马),灵长类(例如人和非人灵长类如猴),家兔和啮齿动物(例如小鼠和大鼠)。特别地,所述个体或受试者是人。
术语“药学组合物”指其形式使得容许其中含有的活性成分的生物学活性有效,且不含对会接受组合物施用的受试者有不可接受的毒性的别的成分的制剂。
“药学可接受载体”指药学组合物中活性成分以外对受试者无毒的成分。药学可接受载体包括但不限于缓冲剂,赋形剂,稳定剂或防腐剂。
如本文中使用的,“治疗/处理”(及其语法变体)指试图改变治疗个体中疾病的自然进程,并且可以是为了预防或在临床病理学的过程期间实施的临床干预。治疗的期望效果包括但不限于预防疾病的发生或复发,缓解症状,降低疾病的任何直接或间接病理学后果,预防转移,减缓疾病进展率,改善或减轻疾病状态,及消退或改善的预后。在一些实施方案中,本发明的抗体或双特异性抗原结合分子用于延迟疾病的形成或延缓疾病的进展。
术语“包装插页”用于指治疗产品的商业化包装中通常含有的说明书,其含有关于适应症,使用,剂量,施用,组合疗法,禁忌症的信息和/或关于使用此类治疗产品的警告。
实施方案的详细描述
本发明提供抗体和双特异性抗原结合分子,其结合STEAP-1,特别是人STEAP-1,而且对例如通过琥珀酰亚胺形成的降解有抗性,因此特别稳定,如治疗目的所需要的。另外,分子还具有其它对于治疗性应用有利的特性,例如就功效和/或安全性以及生产力而言。
STEAP-1抗体
如此,在第一方面,本发明提供一种结合STEAP-1的抗体,其中抗体显示于pH 7.4,37℃达4周后少于约5%琥珀酰亚胺降解,和/或于pH 6.0,40℃达4周后少于约10%琥珀酰亚胺降解,如通过质谱术测定的。在一个实施方案中,抗体显示于pH 7.4,37℃达4周后少于约3%琥珀酰亚胺降解,特别是少于约1%琥珀酰亚胺降解,如通过质谱术测定的。在一个实施方案中,抗体显示于pH 6.0,40℃达4周后少于约7.5%琥珀酰亚胺降解,特别是少于约5%琥珀酰亚胺降解,如通过质谱术测定的。
在又一个方面,本发明提供一种结合STEAP-1的抗体,其中抗体包含包含SEQ IDNO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ IDNO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)。
在一个特定实施方案中,抗体包含包含SEQ ID NO:1的HCDR 1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和SEQ ID NO:6的HCDR 3的VH,和包含SEQ ID NO:7的LCDR 1,SEQ ID NO:8的LCDR2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的VL。
在一些实施方案中,抗体是人源化抗体。在一个实施方案中,VH是人源化VH且/或VL是人源化VL。在一个实施方案中,抗体包含任何上述实施方案中的CDR,而且进一步包含受体人框架,例如人免疫球蛋白框架或人共有框架。
在一个实施方案中,VH包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且VL包含与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。
在一个实施方案中,抗体包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VH序列,和与SEQID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VL序列。
在某些实施方案中,具有至少95%,96%,97%,98%,或99%同一性的VH或VL序列相对于参照序列含有替代(例如保守替代),插入,或删除,但是包含序列的抗体保留结合STEAP-1的能力。在某些实施方案中,在SEQ ID NO:11,12或13中替代,插入和/或删除总共1至10个氨基酸和/或在SEQ ID NO:14中替代,插入和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中,替代,插入,或删除发生在HVR以外的区域中(即在FR中)。任选地,抗体包含SEQID NO:11,12或13中的VH序列和/或SEQ ID NO:14中的VL序列,包括序列的翻译后修饰。
在一个实施方案中,抗体包含包含选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ IDNO:13的组的氨基酸序列的VH,和包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的VL。
在一个实施方案中,抗体包含选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的VH序列和SEQ ID NO:14的VL序列。
在一个特定实施方案中,抗体包含包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列的VH和包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的VL。
在一个特定实施方案中,抗体包含SEQ ID NO:13的VH序列和SEQ ID NO:14的VL序列。
在一个实施方案中,抗体包含人恒定区。在一个实施方案中,抗体是包含人恒定区的免疫球蛋白分子,特别是包含人CH1,CH2,CH3和/或CL域的IgG类免疫球蛋白分子。人恒定域的例示性序列在SEQ ID NO:39和40(分别是人卡帕和拉姆达CL域)和SEQ ID NO:41(人IgG1重链恒定域CH1-CH2-CH3)中给出。在一些实施方案中,抗体包含包含与SEQ ID NO:39或SEQ ID NO:40的氨基酸序列,特别是SEQ ID NO:39的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的轻链恒定区。在一些实施方案中,抗体包含包含与SEQ ID NO:41的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的重链恒定区。特别地,重链恒定区可包含如本文中描述的Fc域中的氨基酸突变。
在一个实施方案中,抗体是单克隆抗体。
在一个实施方案中,抗体是IgG,特别是IgG1抗体。在一个实施方案中,抗体是全长抗体。
在一个实施方案中,抗体包含Fc域,特别是IgG Fc域,更加特别是IgG1Fc域。在一个实施方案中,Fc域是人Fc域。抗体的Fc域可单一地或组合地并入本文中涉及本发明的双特异性抗原结合分子的Fc域描述的任何特征。
在另一个实施方案中,抗体是选自Fv分子,scFv分子,Fab分子,和F(ab’)2分子的组的抗体片段;特别是Fab分子。在另一个实施方案中,抗体片段是双抗体,三抗体或四抗体。
在又一个方面,依照任何上述实施方案的抗体可单一地或组合地并入如下面的节中描述的任何特征。
糖基化变体
在某些实施方案中,改变本文中提供的抗体以提高或降低抗体糖基化的程度。可以通过改变氨基酸序列,使得创建或消除一个或多个糖基化位点来方便地实现抗体的糖基化位点的添加或删除。
在抗体包含Fc区的情况中,可以改变附着于它的寡糖。由哺乳动物细胞生成的天然抗体通常包含分支的,双触角的寡糖,其一般通过N连接附着于Fc区的CH2域的Asn297。见例如Wright et al.,TIBTECH 15:26-32(1997)。寡糖可以包括各种碳水化合物,例如甘露糖,N-乙酰葡糖胺(GlcNAc),半乳糖,和唾液酸,以及附着于双触角寡糖结构“主干”中的GlcNAc的岩藻糖。在一些实施方案中,可以对本发明抗体中的寡糖进行修饰以创建具有某些改善的特性的抗体变体。
在一个实施方案中,提供了抗体变体,其具有附着(直接或间接)于Fc区的非岩藻糖基化寡糖,即缺乏岩藻糖的寡糖结构。此类非岩藻糖基化寡糖(也称作“无岩藻糖基化”寡糖)特别是缺乏附着于双触角寡糖结构的主干中的第一个GlcNAc的岩藻糖残基的N连接的寡糖。在一个实施方案中,提供了具有Fc区中与天然或亲本抗体相比升高比例的非岩藻糖基化寡糖的抗体变体。例如,非岩藻糖基化寡糖的比例可以是至少约20%,至少约40%,至少约60%,至少约80%,或甚至约100%(即不存在岩藻糖基化寡糖)。非岩藻糖基化寡糖的百分比是相对于附着于Asn297的所有寡糖(例如复合的,杂合的和高甘露糖的结构)的总和,缺乏岩藻糖残基的寡糖的(平均)量,如通过MALDI-TOF质谱术测量的,例如如记载于WO2006/082515的。Asn297指位于Fc区中的约第297位(Fc区残基的EU编号方式)的天冬酰胺残基;然而,Asn297也可以由于抗体中的微小序列变异而位于第297位上游或下游约±3个氨基酸,即在第294位和第300位之间。此类具有Fc区中升高比例的非岩藻糖基化寡糖的抗体可以具有改善的FcRγIIIa受体结合和/或改善的效应器功能,特别是改善的ADCC功能。见例如US 2003/0157108;US 2004/0093621。
能够生成具有降低的岩藻糖基化的抗体的细胞系的例子包括蛋白质岩藻糖基化缺陷的Lec13CHO细胞(Ripka et al.,Arch.Biochem.Biophys.249:533-545(1986);US2003/0157108;和WO 2004/056312,尤其在实施例11),和敲除细胞系,诸如α-1,6-岩藻糖基转移酶基因FUT8敲除CHO细胞(见例如Yamane-Ohnuki et al.,Biotech.Bioeng.87:614-622(2004);Kanda,Y.et al.,Biotechnol.Bioeng.,94(4):680-688(2006);和WO 2003/085107),或GDP-岩藻糖合成或转运蛋白活性降低或消除的细胞(见例如US2004259150,US2005031613,US2004132140,US2004110282)。
在又一个实施方案中,提供了具有两分型寡糖的抗体变体,例如其中附着于抗体Fc区的双触角寡糖是通过GlcNAc两分的。此类抗体变体可以具有如上所述降低的岩藻糖基化和/或改善的ADCC功能。此类抗体变体的例子记载于例如Umana et al.,Nat Biotechnol17,176-180(1999);Ferrara et al.,Biotechn Bioeng 93,851-861(2006);WO 99/54342;WO 2004/065540,WO 2003/011878。
还提供了在附着于Fc区的寡糖中具有至少一个半乳糖残基的抗体变体。此类抗体变体可以具有改善的CDC功能。此类抗体变体记载于例如WO 1997/30087;WO 1998/58964;和WO 1999/22764。
经半胱氨酸工程化改造的抗体变体
在某些实施方案中,可以期望创建经半胱氨酸工程化改造的抗体,例如,“thioMAb”,其中抗体的一个或多个残基用半胱氨酸残基替代。在具体的实施方案中,替代的残基存在于抗体的可接近位点。通过用半胱氨酸替代那些残基,反应性硫醇基团由此定位于抗体的可接近位点,并且可以用于将抗体与其它模块,诸如药物模块或接头-药物模块缀合,以创建免疫缀合物,如本文中进一步描述的。可以如例如美国专利No.7,521,541,8,30,930,7,855,275,9,000,130,或WO2016040856所述生成经半胱氨酸工程化改造的抗体。
抗体衍生物
在某些实施方案中,可以进一步修饰本文中提供的抗体以含有本领域知道的且易于获得的额外非蛋白质性质模块。适合于抗体衍生化的模块包括但不限于水溶性聚合物。水溶性聚合物的非限制性例子包括但不限于聚乙二醇(PEG),乙二醇/丙二醇共聚物,羧甲基纤维素,右旋糖苷,聚乙烯醇,聚乙烯吡咯烷酮,聚-1,3-二氧戊环,聚-1,3,6-三噁烷,乙烯/马来酸酐共聚物,聚氨基酸(均聚物或随机共聚物),和右旋糖苷或聚(n-乙烯吡咯烷酮)聚乙二醇,丙二醇均聚物,环氧丙烷/环氧乙烷共聚物,聚氧乙烯化多元醇(例如甘油),聚乙烯醇及其混合物。由于其在水中的稳定性,聚乙二醇丙醛在生产中可能具有优势。聚合物可以是任何分子量,而且可以是分支的或不分支的。附着到抗体上的聚合物数目可以变化,而且如果附着了超过一个聚合物,那么它们可以是相同或不同的分子。一般而言,可根据下列考虑来确定用于衍生化的聚合物的数目和/或类型,包括但不限于抗体要改进的具体特性或功能,抗体衍生物是否将用于指定条件下的治疗等。
在另一个实施方案中,提供了抗体和可以通过暴露于辐射选择性加热的非蛋白质性质模块的缀合物。在一个实施方案中,非蛋白质性质模块是碳纳米管(Kam等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102:11600-11605(2005))。辐射可以是任何波长的,并且包括但不限于对普通细胞没有损害,但是将非蛋白质性质模块加热至抗体-非蛋白质性质模块附近的细胞被杀死的温度的波长。
免疫缀合物
本发明还提供了包含与一种或多种治疗剂,诸如细胞毒剂,化疗剂,药物,生长抑制剂,毒素(例如蛋白质毒素,细菌,真菌,植物或动物起源的酶活性毒素,或其片段),或放射性同位素缀合(成化学键)的如本文描述中的抗STEAP-1抗体的免疫缀合物。
在一个实施方案中,免疫缀合物是抗体-药物缀合物(ADC),其中抗体与一种或多种上文提到的治疗剂缀合。典型地使用接头将抗体与一种或多种治疗剂连接。ADC技术(包括治疗剂和药物和接头的例子)的综述见Pharmacol Review 68:3-19(2016)。
在另一个实施方案中,免疫缀合物包含与酶活性毒素或其片段缀合的如本文中所描述的抗体,酶活性毒素包括但不限于白喉A链,白喉毒素的非结合活性片段,外毒素A链(来自铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)),蓖麻毒蛋白(ricin)A链,相思豆毒蛋白(abrin)A链,蒴莲根毒蛋白(modeccin)A链,α-帚曲霉素(sarcin),油桐(Aleuritesfordii)毒蛋白,香石竹(dianthin)毒蛋白,美洲商陆(Phytolaca americana)蛋白(PAPI,PAPII和PAP-S),苦瓜(Momordica charantia)抑制物,麻疯树毒蛋白(curcin),巴豆毒蛋白(crotin),肥皂草(sapaonaria officinalis)抑制剂,白树毒蛋白(gelonin),丝林霉素(mitogellin),局限曲菌素(restrictocin),酚霉素(phenomycin),依诺霉素(enomycin)和单端孢菌素(tricothecenes)。
在另一个实施方案中,免疫缀合物包含与放射性原子缀合以形成放射性缀合物的如本文中所描述的抗体。多种放射性同位素可用于生成放射性缀合物。例子包括At211,I131,I125,Y90,Re186,Re188,Sm153,Bi212,P32,Pb212和Lu的放射性同位素。在使用放射性缀合物进行检测时,它可以包含供闪烁法研究用的放射性原子,例如tc99m或I123,或供核磁共振(NMR)成像(又称为磁共振成像,mri)用的自旋标记物,诸如再一次的碘-123,碘-131,铟-111,氟-19,碳-13,氮-15,氧-17,钆,锰或铁。
可以使用多种双功能蛋白质偶联剂来生成抗体和细胞毒剂的缀合物,诸如N-琥珀酰亚氨基3-(2-吡啶基二硫代)丙酸酯(SPDP),琥珀酰亚氨基-4-(N-马来酰亚氨基甲基)环己烷-1-羧酸酯(SMCC),亚氨基硫烷(IT),亚氨酸酯(诸如盐酸己二酰亚氨酸二甲酯),活性酯类(诸如辛二酸二琥珀酰亚氨基酯),醛类(诸如戊二醛),双叠氮化合物(诸如双(对-叠氮苯甲酰基)己二胺),双重氮衍生物(诸如双(对-重氮苯甲酰基)-乙二胺),二异硫氰酸酯(诸如甲苯2,6-二异氰酸酯),和双活性氟化合物(诸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)的双功能衍生物。例如,可以如Vitetta等,Science 238:1098(1987)中所述制备蓖麻毒蛋白免疫毒素。碳-14标记的1-异硫氰酸苄基-3-甲基二亚乙基三胺五乙酸(MX-DTPA)是用于将放射性核苷酸与抗体缀合的例示性螯合剂。参见WO94/11026。接头可以是便于在细胞中释放细胞毒性药物的“可切割接头”。例如,可使用酸不稳定接头,肽酶敏感性接头,光不稳定接头,二甲基接头或含二硫化物接头(Chari等,Cancer Res 52:127-131(1992);美国专利No.5,208,020)。
本文中的免疫缀合物或ADC明确涵盖,但不限于用交联试剂制备的此类缀合物,交联试剂包括但不限于BMPS,EMCS,GMBS,HBVS,LC-SMCC,MBS,MPBH,SBAP,SIA,SIAB,SMCC,SMPB,SMPH,sulfo-EMCS,sulfo-GMBS,sulfo-KMUS,sulfo-MBS,sulfo-SIAB,sulfo-SMCC,和sulfo-SMPB,及SVSB(琥珀酰亚氨基-(4-乙烯基砜)苯甲酸酯),它们是商品化的(例如,来自Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL.,U.S.A)。
多特异性抗体
在某些实施方案中,本文中提供的抗体是多特异性抗体,例如双特异性抗体。多特异性抗体是对至少两种不同位点(即不同抗原上的不同表位或相同抗原上的不同表位)具有结合特异性的单克隆抗体。在某些实施方案中,多特异性抗体具有三种或更多种结合特异性。在某些实施方案中,结合特异性之一针对STEAP-1,而其它(两种或更多种)特异性针对任何其它抗原。在某些实施方案中,双特异性抗体可以结合STEAP-1的两种(或更多种)不同表位。也可以使用多特异性(例如双特异性)抗体来将细胞毒性药剂或细胞定位于表达STEAP-1的细胞。多特异性抗体可以以全长抗体或抗体片段制备。
用于生成多特异性抗体的技术包括但不限于具有不同特异性的两对免疫球蛋白重链-轻链的重组共表达(见Milstein and Cuello,Nature 305:537(1983)),和“节-入-穴”工程化(见例如美国专利No.5,731,168和Atwell et al.,J.Mol.Biol.270:26(1997))。也可以通过用于生成抗体Fc-异二聚体分子的工程化静电操纵效应(见例如WO 2009/089004);交联两种或更多种抗体或片段(见例如美国专利No.4,676,980,和Brennan etal.,Science,229:81(1985));使用亮氨酸拉链来生成双特异性抗体(见例如Kostelny etal.,J.Immunol.,148(5):1547-1553(1992)和WO 2011/034605);使用共同轻链技术来规避轻链错配问题(见例如WO 98/50431);使用用于生成双特异性抗体片段的“双抗体”技术(见例如Hollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993));和使用单链Fv(sFv)二聚体(见例如Gruber et al.,J.Immunol.,152:5368(1994));和如例如Tutt etal.J.Immunol.147:60(1991)中所描述的,制备三特异性抗体来生成多特异性抗体。
本文中还包括具有三个或更多个抗原结合位点的工程化改造抗体,包括例如“章鱼抗体”或DVD-Ig(见例如WO 2001/77342和WO 2008/024715)。具有三个或更多个抗原结合位点的多特异性抗体的其它例子可以在WO 2010/115589,WO 2010/112193,WO 2010/136172,WO2010/145792,和WO 2013/026831中找到。双特异性抗体或其抗原结合片段还包括包含结合STEAP-1和另一种不同抗原,或STEAP-1的两种不同表位的抗原结合位点的“双重作用FAb”或“DAF”(见例如US 2008/0069820和WO 2015/095539)。
多特异性抗体还可以以不对称形式提供,其具有一个或多个具有相同抗原特异性的结合臂中的域交换,即通过交换VH/VL域(见例如WO 2009/080252和WO 2015/150447),CH1/CL域(见例如WO 2009/080253)或整个Fab臂(见例如WO 2009/080251,WO 2016/016299,还见Schaefer et al.,PNAS,108(2011)1187-1191,和Klein et al.,MAbs 8(2016)1010-20)。还可以通过将带电荷的或不带电荷的氨基酸突变引入域界面以指导正确的Fab配对来改造不对称Fab臂。见例如WO 2016/172485。
多特异性抗体的各种别的分子型式是本领域知道的且包括在本文中(见例如Spiess et al.,Mol Immunol 67(2015)95-106)。
本文中还包括的一种特定类型的多特异性抗体是设计成同时结合靶细胞,例如肿瘤细胞上的表面抗原和T细胞受体(TCR)复合物的激活性的,不变的构件,诸如CD3,从而再靶向T细胞以杀死靶细胞的双特异性抗体。因此,在某些实施方案中,本文中提供的抗体是多特异性抗体,特别是双特异性抗体,其中结合特异性之一针对STEAP-1且另一针对CD3。
对于这个目的可能有用的双特异性抗体型式的例子包括但不限于所谓的“BiTE”(双特异性T细胞啮合剂)分子,其中通过柔性接头融合两个scFv分子(见例如WO2004/106381,WO2005/061547,WO2007/042261,和WO2008/119567,Nagorsen and ExpCell Res 317,1255-1260(2011));双抗体(Holliger et al.,Prot Eng 9,299-305(1996))及其衍生物,诸如串联双抗体(“TandAb”;Kipriyanov et al.,J Mol Biol 293,41-56(1999));“DART”(双重亲和力再靶向)分子,它们基于双抗体型式但特征在于实现额外稳定化的C端二硫桥(Johnson et al.,J Mol Biol 399,436-449(2010)),和所谓的triomab,它们是完整杂合小鼠/大鼠IgG分子(综述见Seimetz et al.,Cancer Treat Rev36,458-467(2010))。本文中包括的特定T细胞双特异性抗体型式描述于WO 2013/026833,WO2013/026839,WO 2016/020309;Bacac et al.,Oncoimmunology 5(8)(2016)e1203498。
结合STEAP-1和第二抗原的双特异性抗原结合分子
本发明还提供一种双特异性抗原结合分子,即包含能够特异性结合两种截然不同抗原性决定簇(第一和第二抗原)的至少两种抗原结合模块的抗原结合分子。
依照本发明的特定实施方案,双特异性抗原结合分子中包含的抗原结合模块是Fab分子(即由各自包含可变和恒定域的重和轻链构成的抗原结合域)。在一个实施方案中,第一和/或第二抗原结合模块是Fab分子。在一个实施方案中,所述Fab分子是人的。在一个特定实施方案中,所述Fab分子是人源化的。在还有另一个实施方案中,所述Fab分子包含人重和轻链恒定域。
优选地,抗原结合模块中至少一个是交换Fab分子。此类修饰减少来自不同Fab分子的重链和轻链的错误配对,由此改进了重组生产中本发明的双特异性抗原结合分子的产量和纯度。在可用于本发明的双特异性抗原结合分子的一种具体的交换Fab分子中,Fab轻链和Fab重链的可变域(分别是VL和VH)是交换的。然而,甚至在有这种域交换的情况下,由于错配的重和轻链之间所谓的Bence Jones型相互作用,双特异性抗原结合分子的制备物可能包含某些副产物(参见Schaefer et al,PNAS,108(2011)11187-11191)。为了进一步减少来自不同Fab分子的重和轻链的错配及由此提高想要的双特异性抗原结合分子的纯度和产量,可以在结合第一抗原(即STEAP-1)的Fab分子或结合第二抗原(例如活化性T细胞抗原,诸如CD3)的Fab分子的CH1和CL域中的特定氨基酸位置引入具有相反电荷的带电荷的氨基酸,如本文中进一步描述的。在双特异性抗原结合分子中包含的常规Fab分子中(诸如例如图1A-C,G-J中所示)或在双特异性抗原结合分子中包含的VH/VL交换Fab分子中(诸如例如图1D-F,K-N中所示)(但并不在二者中都)进行电荷修饰。在具体的实施方案中,在双特异性抗原结合分子中包含的常规Fab分子(它在具体的实施方案中结合第一抗原,即STEAP-1)中进行电荷修饰。
在依照本发明的一个具体的实施方案中,双特异性抗原结合分子能够同时结合第一抗原(即STEAP-1)和第二抗原(例如活化性T细胞抗原,特别是CD3)。在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子能够通过同时结合STEAP-1和活化性T细胞抗原来交联T细胞和靶细胞。在一个甚至更具体的实施方案中,此类同时结合导致靶细胞(特别是STEAP-1表达性肿瘤细胞)的裂解。在一个实施方案中,此类同时结合导致T细胞的活化。在其它实施方案中,此类同时结合导致T淋巴细胞(特别是细胞毒性T淋巴细胞)的细胞应答,其选自下组:增殖,分化,细胞因子分泌,细胞毒性效应分子释放,细胞毒性活性,和活化标志物的表达。在一个实施方案中,在没有同时结合STEAP-1的情况下双特异性抗原结合分子对活化性T细胞抗原,特别是CD3的结合不导致T细胞活化。
在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子能够将T细胞的细胞毒性活性重定向于靶细胞。在一个具体的实施方案中,所述重定向不依赖于靶细胞的MHC介导的肽抗原呈递和/或T细胞的特异性。
具体地,依照本发明任何实施方案的T细胞是细胞毒性T细胞。在一些实施方案中,T细胞是CD4+或CD8+T细胞,特别是CD8+T细胞。
第一抗原结合模块
本发明的双特异性抗原结合分子包含至少一个结合STEAP-1(第一抗原)的抗原结合模块,特别是Fab分子。在某些实施方案中,双特异性抗原结合分子包含两个结合STEAP-1的抗原结合模块,特别是Fab分子。在一个特定此类实施方案中,每个这些抗原结合模块结合相同的抗原性决定簇。在一个甚至更加特定实施方案中,所有这些抗原结合模块是相同的,即它们包含相同的氨基酸序列,包括与本文中描述的相同的CH1和CL域中氨基酸替代(如果有的话)。在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子包含不超过两个结合STEAP-1的抗原结合模块,特别是Fab分子。
在特定实施方案中,结合STEAP-1的抗原结合模块是常规Fab分子。在此类实施方案中,结合第二抗原的抗原结合模块是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CH1和CL是彼此交换/替换的Fab分子。
在备选实施方案中,结合STEAP-1的抗原结合模块是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CH1和CL是彼此交换/替换的Fab分子。在此类实施方案中,结合第二抗原的抗原结合模块是常规Fab分子。
STEAP-1结合模块能够将双特异性抗原结合分子指导至靶部位,例如特定类型的表达STEAP-1的肿瘤细胞。
双特异性抗原结合分子的第一抗原结合模块可单一地或组合地并入本文中涉及结合STEAP-1的抗体描述的任何特征,除非在科学上明显不合理或不可能。
如此,在一个方面,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含(a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块包含包含SEQ IDNO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ IDNO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL),和(b)结合第二抗原的第二抗原结合模块。
在一个特定实施方案中,第一抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:1的HCDR 1,SEQID NO:2的HCDR 2,和SEQ ID NO:6的HCDR 3的VH,和包含SEQ ID NO:7的LCDR 1,SEQ IDNO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR3的VL。
在一些实施方案中,第一抗原结合模块是(衍生自)人源化抗体。在一个实施方案中,VH是人源化VH且/或VL是人源化VL。在一个实施方案中,第一抗原结合模块包含任何上述实施方案中的CDR,而且进一步包含受体人框架,例如人免疫球蛋白框架或人共有框架。
在一个实施方案中,第一抗原结合模块的VH包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ IDNO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且第一抗原结合模块的VL包含与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。
在一个实施方案中,第一抗原结合模块包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VH序列,和与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VL序列。
在一个实施方案中,第一抗原结合模块包含包含选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列的VH,和包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的VL。
在一个实施方案中,第一抗原结合模块包含选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的VH序列,且SEQ ID NO:14的VL序列。
在一个特定实施方案中,第一抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列的VH和包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的VL。
在一个特定实施方案中,第一抗原结合模块包含SEQ ID NO:13的VH序列且SEQ IDNO:14的VL序列。
在一个实施方案中,第一抗原结合模块包含人恒定区。在一个实施方案中,第一抗原结合模块是包含人恒定区,特别是人CH1和/或CL域的Fab分子。人恒定域的例示性序列在SEQ ID NO:39和40(分别是人卡帕和拉姆达CL域)和SEQ ID NO:41(人IgG1重链恒定域CH1-CH2-CH3)中给出。在一些实施方案中,第一抗原结合模块包含包含与SEQ ID NO:39或SEQID NO:40的氨基酸序列,特别是SEQ ID NO:39的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的轻链恒定区。特别地,轻链恒定区可包含如本文中在“电荷修饰”下描述的氨基酸突变且/或可包含一个或多个(特别是两个)N端氨基酸的删除或替代,如果在交换Fab分子中的话。在一些实施方案中,第一抗原结合模块包含包含与SEQ IDNO:41的氨基酸序列中包含的CH1域序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的重链恒定区。特别地,重链恒定区(具体是CH1域)可包含如本文中在“电荷修饰”下描述的氨基酸突变。
第二抗原结合模块
本发明的双特异性抗原结合分子包含至少一个结合第二抗原(不同于STEAP-1)的抗原结合模块,特别是Fab分子。
在特定实施方案中,结合第二抗原的抗原结合模块是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CH1和CL是彼此交换/替换的Fab分子。在此类实施方案中,结合第一抗原(即STEAP-1)的抗原结合模块优选是常规Fab分子。在双特异性抗原结合分子中包含超过一个结合STEAP-1的抗原结合模块,特别是Fab分子的实施方案中,结合第二抗原的抗原结合模块优选是交换Fab分子且结合STEAP-1的抗原结合模块是常规Fab分子。
在备选实施方案中,结合第二抗原的抗原结合模块是常规Fab分子。在此类实施方案中,结合第一抗原(即STEAP-1)的抗原结合模块是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CH1和CL是彼此交换/替换的Fab分子。在双特异性抗原结合分子中包含超过一个结合第二抗原的抗原结合模块,特别是Fab分子的实施方案中,结合STEAP-1的抗原结合模块优选是交换Fab分子且结合第二抗原的抗原结合模块是常规Fab分子。
在一些实施方案中,第二抗原是激活性T细胞抗原(在本文中也称作“激活性T细胞抗原结合模块,或激活性T细胞抗原结合Fab分子”)。在一个特定实施方案中,双特异性抗原结合分子包含不超过一个能够特异性结合激活性T细胞抗原的抗原结合模块。在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子提供对激活性T细胞抗原的单价结合。
在特定实施方案中,第二抗原是CD3,特别是人CD3(SEQ ID NO:24)或食蟹猴CD3(SEQ ID NO:25),最特别是人CD3。在一个实施方案中,第二抗原结合模块对人和食蟹猴CD3是交叉反应的(即特异性结合)。在一些实施方案中,第二抗原是CD3的厄普西隆亚基(CD3ε)。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含SEQ ID NO:15的HCDR 1,SEQ ID NO:16的HCDR 2,SEQ ID NO:17的HCDR 3,SEQ ID NO:18的LCDR 1,SEQ ID NO:19的LCDR 2和SEQ ID NO:20的LCDR 3。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:15的HCDR 1,SEQ IDNO:16的HCDR 2,和SEQ ID NO:17的HCDR 3的VH,和包含SEQ ID NO:18的LCDR 1,SEQ IDNO:19的LCDR 2和SEQ ID NO:20的LCDR 3的VL。
在一些实施方案中,第二抗原结合模块是(衍生自)人源化抗体。在一个实施方案中,VH是人源化VH且/或VL是人源化VL。在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含任何上述实施方案中的CDR,而且进一步包含受体人框架,例如人免疫球蛋白框架或人共有框架。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含与SEQ ID NO:21的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VH序列。在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含与SEQ ID NO:22的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VL序列。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含与SEQ ID NO:21的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VH序列,和与SEQ ID NO:22的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VL序列。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块的VH包含与SEQ ID NO:21的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且第二抗原结合模块的VL包含与SEQ ID NO:22的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH,和包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含SEQ ID NO:21的VH序列,和SEQ IDNO:22的VL序列。
在一个实施方案中,第二抗原结合模块包含人恒定区。在一个实施方案中,第二抗原结合模块是包含人恒定区,特别是人CH1和/或CL域的Fab分子。人恒定域的例示性序列在SEQ ID NO:39和40(分别是人卡帕和拉姆达CL域)和SEQ ID NO:41(人IgG1重链恒定域CH1-CH2-CH3)中给出。在一些实施方案中,第二抗原结合模块包含包含与SEQ ID NO:39或SEQID NO:40的氨基酸序列,特别是SEQ ID NO:39的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的轻链恒定区。特别地,轻链恒定区可包含如本文中在“电荷修饰”下描述的氨基酸突变且/或可包含一个或多个(特别是两个)N端氨基酸的删除或替代,如果在交换Fab分子中的话。在一些实施方案中,第二抗原结合模块包含包含与SEQ IDNO:41的氨基酸序列中包含的CH1域序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的重链恒定区。特别地,重链恒定区(具体是CH1域)可包含如本文中在“电荷修饰”下描述的氨基酸突变。
在一些实施方案中,第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH或恒定域CL和CH1,特别是可变域VL和VH是彼此替换的Fab分子(即依照此类实施方案,第二抗原结合模块是交换Fab分子,其中Fab轻链和Fab重链的可变或恒定域是交换的)。在一个此类实施方案中,第一(和第三,如果有的话)抗原结合模块是常规Fab分子。
在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子中存在不超过一个结合第二抗原(例如激活性T细胞抗原诸如CD3)的抗原结合模块(即双特异性抗原结合分子提供对第二抗原的单价结合)。
电荷修饰
本发明的双特异性抗原结合分子可以在其中包含的Fab分子中包含如下的氨基酸替代,其特别有效地减少轻链与非匹配重链的错配(Bence-Jones型副产物),在它们的一个(或多个,在分子包含超过两个抗原结合Fab分子的情况中)结合臂具有VH/VL交换的基于Fab的双/多特异性抗原结合分子的生产中可发生错配(还可参见PCT公开文本No.WO 2015/150447,特别是其中的实施例,通过援引完整收入本文)。在它们的结合臂之一中具有VH/VL域交换的双特异性抗原结合分子中发生的想要的双特异性抗原结合分子与不想要的副产物,特别是Bence Jones型副产物相比的比率可以通过在CH1和CL域中的特定氨基酸位置处引入具有相反电荷的带电荷的氨基酸来改善(在本文中有时称作“电荷修饰”)。
因而,在其中双特异性抗原结合分子的第一和第二抗原结合模块均是Fab分子,且在抗原结合模块(特别是第二抗原结合模块)之一中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH是彼此替换的一些实施方案中,
i)在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用带正电荷的氨基酸替代(编号方式依照Kabat),且其中在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸或位置213处的氨基酸用带负电荷的氨基酸替代(编号方式依照Kabat EU索引);或
ii)在第二抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用带正电荷的氨基酸替代(编号方式依照Kabat),且其中在第二抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸或位置213处的氨基酸用带负电荷的氨基酸替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
双特异性抗原结合分子没有同时包含i)和ii)下提到的修饰。具有VH/VL交换的抗原结合模块的恒定域CL和CH1没有彼此替换(即保持不交换)。
在一个更加具体的实施方案中,
i)在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸或位置213处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引);或
ii)在第二抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第二抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸或位置213处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个此类实施方案中,在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸或位置213处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在又一个实施方案中,在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个特定实施方案中,在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个更加具体的实施方案中,在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat),且在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个甚至更加具体的实施方案中,在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用精氨酸(R)替代(编号方式依照Kabat),且在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在特定实施方案中,如果在第一抗原结合模块的恒定域CL和恒定域CH1中进行依照上述实施方案的氨基酸替代的话,第一抗原结合模块的恒定域CL是卡帕同种型的。
或者,依照上文实施方案的氨基酸替代可以在第二抗原结合模块的恒定域CL和恒定域CH1中进行,代替在第一抗原结合模块的恒定域CL和恒定域CH1中进行。在特定的此类实施方案中,第二抗原结合模块的恒定域CL是卡帕同种型的。
因而,在一个实施方案中,在第二抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第二抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸或位置213处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在又一个实施方案中,在第二抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第二抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在仍有另一个实施方案中,在第二抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat),且在第二抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个实施方案中,在第二抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat),且在第二抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在另一个实施方案中,在第二抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用精氨酸(R)替代(编号方式依照Kabat),且在第二抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照KabatEU索引)。
在一个特定实施方案中,本发明的双特异性抗原结合分子包含
(a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)的Fab分子,和
(b)结合第二抗原的第二抗原结合模块,其中第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH是彼此替换的Fab分子;
其中在第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat)(在一个特定实施方案中用赖氨酸(K)或精氨酸(R)独立替代)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代(编号方式依照Kabat)(在一个特定实施方案中用赖氨酸(K)或精氨酸(R)独立替代),且在第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
双特异性抗原结合分子型式
依照本发明的双特异性抗原结合分子的各构件可以以多种构造彼此融合。例示性的构造绘于图1中。
在具体的实施方案中,双特异性抗原结合分子中包含的抗原结合模块是Fab分子。在此类实施方案中,第一,第二,第三等抗原结合模块在本文中分别可以称作第一,第二,第三等Fab分子。
在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子的第一和第二抗原结合模块彼此融合,任选经由肽接头。在特定实施方案中,第一和第二抗原结合模块各自是Fab分子。在一个此类实施方案中,第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第一抗原结合模块的Fab重链的N端。在另一个此类实施方案中,第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第二抗原结合模块的Fab重链的N端。在其中或是(i)第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第一抗原结合模块的Fab重链的N端或是(ii)第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第二抗原结合模块的Fab重链的N端的实施方案中,另外地第一抗原结合模块的Fab轻链且第二抗原结合模块的Fab轻链可以彼此融合,任选经由肽接头。
具有单一能够特异性结合靶细胞抗原诸如STEAP-1的抗原结合模块(诸如Fab分子)的双特异性抗原结合分子(例如如图1A,D,G,H,K,L中显示的)是有用的,特别是在预期靶细胞抗原在高亲和力抗原结合模块的结合后内在化的情况中。在此类情况中,存在超过一个对靶细胞抗原特异性的抗原结合模块可增强靶细胞抗原的内在化,由此降低它的利用度。
然而,在其它情况中,包含两个或更多个对靶细胞抗原特异性的抗原结合模块(诸如Fab分子)的双特异性抗原结合分子会是有利的(见图1B,1C,1E,1F,1I,1J,1M或1N中显示的例子),例如为了优化对靶部位的靶向或容许靶细胞抗原的交联。
因而,在特定实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含第三抗原结合模块。
在一个实施方案中,第三抗原结合模块结合第一抗原,即STEAP-1。在一个实施方案中,第三抗原结合模块是Fab分子。
在一个实施方案中,第三抗原模块与第一抗原结合模块相同。
双特异性抗原结合分子的第三抗原结合模块可单一地或组合地并入本文中涉及第一抗原结合模块和/或结合STEAP-1的抗体描述的任何特征,除非在科学上明显不合理或不可能。
在一个实施方案中,第三抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ IDNO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)。
在一个特定实施方案中,第三抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:1的HCDR 1,SEQID NO:2的HCDR 2,和SEQ ID NO:6的HCDR 3的VH,和包含SEQ ID NO:7的LCDR 1,SEQ IDNO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR3的VL。
在一些实施方案中,第三抗原结合模块是(衍生自)人源化抗体。在一个实施方案中,VH是人源化VH且/或VL是人源化VL。在一个实施方案中,第三抗原结合模块包含任何上述实施方案中CDR,而且进一步包含受体人框架,例如人免疫球蛋白框架或人共有框架。
在一个实施方案中,第三抗原结合模块的VH包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ IDNO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且第三抗原结合模块的VL包含与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。
在一个实施方案中,第三抗原结合模块包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VH序列,和与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的VL序列。
在一个实施方案中,第三抗原结合模块包含包含选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列的VH,和包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的VL。
在一个实施方案中,第三抗原结合模块包含选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的VH序列,且SEQ ID NO:14的VL序列。
在一个特定实施方案中,第三抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列的VH和包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的VL。
在一个特定实施方案中,第三抗原结合模块包含SEQ ID NO:13的VH序列和SEQ IDNO:14的VL序列。
在一个实施方案中,第三抗原结合模块包含人恒定区。在一个实施方案中,第三抗原结合模块是包含人恒定区,特别是人CH1和/或CL域的Fab分子。人恒定域的例示性序列在SEQ ID NO:39和40(分别是人卡帕和拉姆达CL域)和SEQ ID NO:41(人IgG1重链恒定域CH1-CH2-CH3)中给出。在一些实施方案中,第三抗原结合模块包含包含与SEQ ID NO:39或SEQID NO:40的氨基酸序列,特别是SEQ ID NO:39的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的轻链恒定区。特别地,轻链恒定区可包含如本文中在“电荷修饰”下描述的氨基酸突变和/或可包含一个或多个(特别是两个)N端氨基酸的删除或替代,如果在交换Fab分子中的话。在一些实施方案中,第三抗原结合模块包含包含与SEQ IDNO:41的氨基酸序列中包含的CH1域序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列的重链恒定区。特别地,重链恒定区(具体是CH1域)可包含如本文中在“电荷修饰”下描述的氨基酸突变。
在特定实施方案中,第三和第一抗原结合模块各自是Fab分子且第三抗原结合模块与第一抗原结合模块相同。如此,在这些实施方案中,第一和第三抗原结合模块包含相同的重和轻链氨基酸序列且具有相同的域排列(即常规的或交换的)。而且,在这些实施方案中,第三抗原结合模块包含与第一抗原结合模块相同的氨基酸替代,如果有的话。例如,会在第一抗原结合模块和第三抗原结合模块中每个的恒定域CL和恒定域CH1中进行本文中作为“电荷修饰”描述的氨基酸替代。或者,可以在第二抗原结合模块(其在特定实施方案中还是Fab分子)的恒定域CL和恒定域CH1中进行,但是在第一抗原结合模块和第三抗原结合模块的恒定域CL和恒定域CH1中不进行所述氨基酸替代。
像第一抗原结合模块一样,第三抗原结合模块特别是常规Fab分子。然而,还涵盖其中第一且第三抗原结合模块是交换Fab分子(且第二抗原结合模块是常规Fab分子)的实施方案。如此,在特定实施方案中,第一和第三抗原结合模块各自是常规Fab分子,且第二抗原结合模块是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CL和CH1是彼此交换/替换的的Fab分子。在其它实施方案中,第一和第三抗原结合模块各自是交换Fab分子且第二抗原结合模块是常规Fab分子。
如果存在第三抗原结合模块的话,在一个特定实施方案中,第一和第三抗原模块结合STEAP-1,且第二抗原结合模块结合第二抗原,特别是激活性T细胞抗原,更加特别是CD3,最特别是CD3ε。
在特定实施方案中,双特异性抗原结合分子包含由第一和第二亚基构成的Fc域。Fc域的第一和第二亚基能够稳定联合。
依照本发明的双特异性抗原结合分子可具有不同的构造,即第一,第二(和任选地第三)抗原结合模块可以以不同方式彼此和与Fc域融合。各构件可以直接或优选地经由一个或多个合适的肽接头彼此融合。在Fab分子融合至Fc域的亚基的N端的情况中,它典型地经由免疫球蛋白铰链区。
在一些实施方案中,第一和第二抗原结合模块各自是Fab分子且第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至Fc域的第一或第二亚基的N端。在此类实施方案中,第一抗原结合模块可以在Fab重链的C端融合至第二抗原结合模块的Fab重链的N端或Fc域的另一亚基的N端。在特定此类实施方案中,所述第一抗原结合模块是常规Fab分子,且第二抗原结合模块是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CL和CH1是彼此交换/替换的Fab分子。在其它此类实施方案中,所述第一Fab分子是交换Fab分子且第二Fab分子是常规Fab分子。
在一个实施方案中,第一和第二抗原结合模块各自是Fab分子,第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至Fc域的第一或第二亚基的N端,且第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第二抗原结合模块的Fab重链的N端。在一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一和第二Fab分子,由第一和第二亚基构成的Fc域,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第一Fab分子在Fab重链的C端融合至第二Fab分子的Fab重链的N端,且第二Fab分子在Fab重链的C端融合至Fc域的第一或第二亚基的N端。此类构造示意性地在图1G和1K中描绘(这些例子中的第二抗原结合域是VH/VL交换Fab分子)。任选地,第一Fab分子的Fab轻链且第二Fab分子的Fab轻链可以另外彼此融合。
在另一个实施方案中,第一和第二抗原结合模块各自是Fab分子且第一和第二抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至Fc域的亚基之一的N端。在一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一和第二Fab分子,由第一和第二亚基构成的Fc域,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第一和第二Fab分子各自在Fab重链的C端融合至Fc域的亚基之一的N端。此类构造示意性地在图1A和1D中描绘(在这些例子中第二抗原结合域是VH/VL交换Fab分子且第一抗原结合模块是常规Fab分子)。第一和第二Fab分子可以直接或经由肽接头融合至Fc域。在一个特定实施方案中,第一和第二Fab分子各自经由免疫球蛋白铰链区融合至Fc域。在一个具体实施方案中,免疫球蛋白铰链区是人IgG1铰链区,特别是在Fc域是IgG1Fc域的情况中。
在一些实施方案中,第一和第二抗原结合模块各自是Fab分子且第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至Fc域的第一或第二亚基的N端。在此类实施方案中,第二抗原结合模块可以在Fab重链的C端融合至第二抗原结合模块的Fab重链的N端或(如上文描述的)Fc域的亚基之另一的N端。在特定此类实施方案中,所述第一抗原结合模块是常规Fab分子,且第二抗原结合模块是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CL和CH1是彼此交换/替换的Fab分子。在其它此类实施方案中,所述第一Fab分子是交换Fab分子且第二Fab分子是常规Fab分子。
在一个实施方案中,第一和第二抗原结合模块各自是Fab分子,第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至Fc域的第一或第二亚基的N端,且第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第一抗原结合模块的Fab重链的N端。在一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一和第二Fab分子,由第一和第二亚基构成的Fc域,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第二Fab分子在Fab重链的C端融合至第一Fab分子的Fab重链的N端,且第一Fab分子在Fab重链的C端融合至Fc域的第一或第二亚基的N端。此类构造示意性地在图1H和1L中描绘(在这例子中第二抗原结合域是VH/VL交换Fab分子且第一抗原结合模块是常规Fab分子)。任选地,第一Fab分子的Fab轻链和第二Fab分子的Fab轻链可以另外彼此融合。
在一些实施方案中,第三抗原结合模块,特别是第三Fab分子在Fab重链的C端融合至Fc域的第一或第二亚基的N端。在特定此类实施方案中,所述第一和第三Fab分子各自是常规Fab分子,且第二Fab分子是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CL和CH1是彼此交换/替换的Fab分子。在其它此类实施方案中,所述第一和第三Fab分子各自是交换Fab分子且第二Fab分子是常规Fab分子。
在一个特定此类实施方案中,第二且第三抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至Fc域的亚基之一的N端,且第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第二Fab分子的Fab重链的N端。在一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一,第二和第三Fab分子,由第一和第二亚基构成的Fc域,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第一Fab分子在Fab重链的C端融合至第二Fab分子的Fab重链的N端,且第二Fab分子在Fab重链的C端融合至Fc域的第一亚基的N端,且其中第三Fab分子在Fab重链的C端融合至Fc域的第二亚基的N端。此类构造示意性地在图1B和1E(在这些例子中第二抗原结合模块是VH/VL交换Fab分子,且第一且第三抗原结合模块是常规Fab分子),和图1J和1N(在这些例子中第二抗原结合模块是常规Fab分子,且第一和第三抗原结合模块是VH/VL交换Fab分子)中描绘。第二和第三Fab分子可以直接或经由肽接头融合至Fc域。在一个特定实施方案中,第二和第三Fab分子各自经由免疫球蛋白铰链区融合至Fc域。在一个具体实施方案中,免疫球蛋白铰链区是人IgG1铰链区,特别是在Fc域是IgG1Fc域的情况中。任选地,第一Fab分子的Fab轻链和第二Fab分子的Fab轻链可以另外彼此融合。
在另一个此类实施方案中,第一和第三抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至Fc域的亚基之一的N端,且第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第一抗原结合模块的Fab重链的N端。在一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一,第二和第三Fab分子,由第一和第二亚基构成的Fc域,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第二Fab分子在Fab重链的C端融合至第一Fab分子的Fab重链的N端,且第一Fab分子在Fab重链的C端融合至Fc域的第一亚基的N端,且其中第三Fab分子在Fab重链的C端融合至Fc域的第二亚基的N端。此类构造示意性地在图1C和1F(在这些例子中第二抗原结合模块是VH/VL交换Fab分子,且第一且第三抗原结合模块是常规Fab分子)和图1I和1M(在这些例子中第二抗原结合模块是常规Fab分子,且第一和第三抗原结合模块是VH/VL交换Fab分子)中描绘。第一和第三Fab分子可以直接或经由肽接头融合至Fc域。在一个特定实施方案中,第一和第三Fab分子各自经由免疫球蛋白铰链区融合至Fc域。在一个具体实施方案中,免疫球蛋白铰链区是人IgG1铰链区,特别是在Fc域是IgG1Fc域的情况中。任选地,第一Fab分子的Fab轻链和第二Fab分子的Fab轻链可以另外彼此融合。
在其中Fab分子在Fab重链的C端经由免疫球蛋白铰链区融合至Fc域的每个亚基的N端的双特异性抗原结合分子的构造中,两个Fab分子,铰链区且Fc域本质上形成免疫球蛋白分子。在一个特定实施方案中,免疫球蛋白分子是IgG类免疫球蛋白。在一个甚至更加特定实施方案中,免疫球蛋白是IgG1亚类免疫球蛋白。在另一个实施方案中,免疫球蛋白是IgG4亚类免疫球蛋白。在又一个特定实施方案中,免疫球蛋白是人免疫球蛋白。在其它实施方案中,免疫球蛋白是嵌合免疫球蛋白或人源化免疫球蛋白。在一个实施方案中,免疫球蛋白包含人恒定区,特别是人Fc区。
在本发明的一些双特异性抗原结合分子中,第一Fab分子的Fab轻链和第二Fab分子的Fab轻链彼此融合,任选经由肽接头。取决于第一和第二Fab分子的构造,第一Fab分子的Fab轻链可以在它的C端融合至第二Fab分子的Fab轻链的N端,或者第二Fab分子的Fab轻链可以在它的C端融合至第一Fab分子的Fab轻链的N端。第一和第二Fab分子的Fab轻链的融合进一步降低不匹配Fab重和轻链的错配,而且还减少表达本发明的一些双特异性抗原结合分子需要的质粒的数目。
抗原结合模块可以直接或经由肽接头融合至Fc域或彼此融合,肽接头包含一个或多个氨基酸,通常约2-20个氨基酸。肽接头是本领域中已知且本文中记载的。合适的,非免疫原性的肽接头包括例如(G4S)n,(SG4)n,(G4S)n或G4(SG4)n肽接头。“n”一般是1至10,通常是2至4的整数。在一个实施方案中,所述肽接头具有至少5个氨基酸的长度,在一个实施方案中5至100个氨基酸的长度,在又一个实施方案中10至50个氨基酸的长度。在一个实施方案中,所述肽接头是(GxS)n或(GxS)nGm,其中G=甘氨酸,S=丝氨酸,且(x=3,n=3,4,5或6,和m=0,1,2或3)或(x=4,n=2,3,4或5和m=0,1,2或3),在一个实施方案中,x=4和n=2或3,在又一个实施方案中,x=4和n=2。在一个实施方案中,所述肽接头是(G4S)2。一种特别适合于将第一和第二Fab分子的Fab轻链彼此融合的肽接头是(G4S)2。一种适合于连接第一和第二Fab片段的Fab重链的例示性肽接头包含序列(D)-(G4S)2(SEQ ID NO 37和38)。另一种合适的此类接头包含序列(G4S)4。另外,接头可包含免疫球蛋白铰链区(的一部分)。特别地,当Fab分子融合至Fc域亚基的N端时,其可以在有或无另外的肽接头的情况下经由免疫球蛋白铰链区或其部分融合。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2)-CH2-CH3(-CH4)),和如下多肽,其中第一Fab分子的Fab重链与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(1)-CH1(1)-CH2-CH3(-CH4))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在某些实施方案中,多肽是共价连接的,例如通过二硫键。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2)-CH2-CH3(-CH4)),和如下多肽,其中第一Fab分子的Fab重链与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(1)-CH1(1)-CH2-CH3(-CH4))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在某些实施方案中,多肽是共价连接的,例如通过二硫键。
在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键,其继而与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2)-VH(1)-CH1(1)-CH2-CH3(-CH4))。在其它实施方案中,双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第一Fab分子的Fab重链与第二Fab分子的Fab轻链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(1)-CH1(1)-VL(2)-CH1(2)-CH2-CH3(-CH4))。
在一些这些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含第二Fab分子的交换Fab轻链多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2)),和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在其它这些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键,其继而与第一Fab分子的Fab轻链多肽分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2)-VL(1)-CL(1)),或如下多肽,其中第一Fab分子的Fab轻链多肽与第二Fab分子的Fab重链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VL(1)-CL(1)-VH(2)-CL(2)),在适宜时。
依照这些实施方案的双特异性抗原结合分子可进一步包含(i)Fc域亚基多肽(CH2-CH3(-CH4)),或(ii)如下多肽,其中第三Fab分子的Fab重链与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(3)-CH1(3)-CH2-CH3(-CH4))和第三Fab分子的Fab轻链多肽(VL(3)-CL(3))。在某些实施方案中,多肽是共价连接的,例如通过二硫键。
在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键,其继而与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2)-VH(1)-CH1(1)-CH2-CH3(-CH4))。在其它实施方案中,双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第一Fab分子的Fab重链与第二Fab分子的Fab重链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(1)-CH1(1)-VH(2)-CL(2)-CH2-CH3(-CH4))。
在一些这些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含第二Fab分子的交换Fab轻链多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2)),和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在其它这些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键,其继而与第一Fab分子的Fab轻链多肽分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2)-VL(1)-CL(1)),或如下多肽,其中第一Fab分子的Fab轻链多肽与第二Fab分子的Fab重链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VL(1)-CL(1)-VH(2)-CL(2)),在适宜时。
依照这些实施方案的双特异性抗原结合分子可进一步包含(i)Fc域亚基多肽(CH2-CH3(-CH4)),或(ii)如下多肽,其中第三Fab分子的Fab重链与Fc域亚基分享羧基末端肽键(VH(3)-CH1(3)-CH2-CH3(-CH4))和第三Fab分子的Fab轻链多肽(VL(3)-CL(3))。在某些实施方案中,多肽是共价连接的,例如通过二硫键。
在某些实施方案中,双特异性抗原结合分子不包含Fc域。在特定此类实施方案中,第一和,如果存在的话第三Fab分子各自是常规Fab分子,且第二Fab分子是如本文中描述的交换Fab分子,即其中Fab重和轻链的可变域VH和VL或恒定域CL和CH1是彼此交换/替换的Fab分子。在其它此类实施方案中,第一和,如果存在的话第三Fab分子各自是交换Fab分子且第二Fab分子是常规Fab分子。
在一个此类实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一和第二抗原结合模块,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第一和第二抗原结合模块均是Fab分子且第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第二抗原结合模块的Fab重链的N端。此类构造示意性地在图1O和1S中描绘(在这些例子中第二抗原结合域是VH/VL交换Fab分子且第一抗原结合模块是常规Fab分子)。
在另一个此类实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一和第二抗原结合模块,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第一和第二抗原结合模块均是Fab分子且第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至第一抗原结合模块的Fab重链的N端。此类构造示意性地在图1P和1T中描绘(在这些例子中第二抗原结合域是VH/VL交换Fab分子且第一抗原结合模块是常规Fab分子)。
在一些实施方案中,第一Fab分子在Fab重链的C端融合至第二Fab分子的Fab重链的N端,且双特异性抗原结合分子进一步包含第三抗原结合模块,特别是第三Fab分子,其中所述第三Fab分子在Fab重链的C端融合至第一Fab分子的Fab重链的N端。在某些此类实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一,第二和第三Fab分子,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第一Fab分子在Fab重链的C端融合至第二Fab分子的Fab重链的N端,且第三Fab分子在Fab重链的C端融合至第一Fab分子的Fab重链的N端。此类构造示意性地在图1Q和1U(在这些例子中第二抗原结合域是VH/VL交换Fab分子且第一和第三抗原结合模块各自是常规Fab分子),或图1X和1Z(在这些例子中第二抗原结合域是常规Fab分子且第一和第三抗原结合模块各自是VH/VL交换Fab分子)中描绘。
在一些实施方案中,第二Fab分子在Fab重链的C端融合至第一Fab分子的Fab重链的N端,且双特异性抗原结合分子进一步包含第三抗原结合模块,特别是第三Fab分子,其中所述第三Fab分子在Fab重链的N端融合至第一Fab分子的Fab重链的C端。在某些此类实施方案中,双特异性抗原结合分子本质上由第一,第二和第三Fab分子,和任选地一个或多个肽接头组成,其中第二Fab分子在Fab重链的C端融合至第一Fab分子的Fab重链的N端,且第三Fab分子在Fab重链的N端融合至第一Fab分子的Fab重链的C端。此类构造示意性地在图1R和1V(在这些例子中第二抗原结合域是VH/VL交换Fab分子且第一和第三抗原结合模块各自是常规Fab分子),或图1W和1Y(在这些例子中第二抗原结合域是常规Fab分子且第一和第三抗原结合模块各自是VH/VL交换Fab分子)中描绘。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第一Fab分子的Fab重链与第二Fab分子的Fab轻链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链)(VH(1)-CH1(1)-VL(2)-CH1(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2)-VH(1)-CH1(1))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2)-VH(1)-CH1(1))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2)-VH(1)-CH1(1))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab重链与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab轻链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链)(VH(3)-CH1(3)-VH(1)-CH1(1)-VL(2)-CH1(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含第三Fab分子的Fab轻链多肽(VL(3)-CL(3))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab重链与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab重链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链)(VH(3)-CH1(3)-VH(1)-CH1(1)-VH(2)-CL(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含第三Fab分子的Fab轻链多肽(VL(3)-CL(3))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键,其继而与第三Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2)-VH(1)-CH1(1)-VH(3)-CH1(3))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含第三Fab分子的Fab轻链多肽(VL(3)-CL(3))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链可变区与第二Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第二Fab分子包含重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键,其继而与第三Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键(VH(2)-CL(2)-VH(1)-CH1(1)-VH(3)-CH1(3))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab轻链可变区与第二Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(2)-CH1(2))和第一Fab分子的Fab轻链多肽(VL(1)-CL(1))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含第三Fab分子的Fab轻链多肽(VL(3)-CL(3))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链与第一Fab分子的Fab轻链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第一Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第一Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与第三Fab分子的Fab轻链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第三Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第三Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链)(VH(2)-CH1(2)-VL(1)-CH1(1)-VL(3)-CH1(3))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第一Fab分子的Fab重链可变区与第一Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(1)-CL(1))和第二Fab分子的Fab轻链多肽(VL(2)-CL(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab重链可变区与第三Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(3)-CL(3))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第二Fab分子的Fab重链与第一Fab分子的Fab重链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第一Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第一Fab分子包含重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与第三Fab分子的Fab重链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第三Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第三Fab分子包含其中重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链)(VH(2)-CH1(2)-VH(1)-CL(1)-VH(3)-CL(3))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第一Fab分子的Fab轻链可变区与第一Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(1)-CH1(1))和第二Fab分子的Fab轻链多肽(VL(2)-CL(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab轻链可变区与第三Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(3)-CH1(3))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab轻链可变区与第三Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第三Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab轻链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第一Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(即第一Fab分子包含其中重链可变区用轻链可变区替换的交换Fab重链),其继而与第二Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键(VL(3)-CH1(3)-VL(1)-CH1(1)-VH(2)-CH1(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第一Fab分子的Fab重链可变区与第一Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(1)-CL(1))和第二Fab分子的Fab轻链多肽(VL(2)-CL(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab重链可变区与第三Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(VH(3)-CL(3))。
在某些实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab重链可变区与第三Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第三Fab分子包含其中重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与第一Fab分子的Fab重链可变区分享羧基末端肽键,其继而与第一Fab分子的Fab轻链恒定区分享羧基末端肽键(即第一Fab分子包含其中重链恒定区用轻链恒定区替换的交换Fab重链),其继而与第二Fab分子的Fab重链分享羧基末端肽键(VH(3)-CL(3)-VH(1)-CL(1)-VH(2)-CH1(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第一Fab分子的Fab轻链可变区与第一Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(1)-CH1(1))和第二Fab分子的Fab轻链多肽(VL(2)-CL(2))。在一些实施方案中,双特异性抗原结合分子进一步包含如下多肽,其中第三Fab分子的Fab轻链可变区与第三Fab分子的Fab重链恒定区分享羧基末端肽键(VL(3)-CH1(3))。
在一个实施方案中,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含
a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)的Fab分子;
b)结合第二抗原的第二抗原结合模块,其中第二抗原是激活性T细胞抗原,特别是CD3,更加特别是CD3ε,且第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH或恒定域CL和CH1是彼此替换的Fab分子;
c)由第一和第二亚基构成的Fc域;
其中
(i)在a)下的第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在b)下的第二抗原结合模块的Fab重链的N端,且在b)下的第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在c)下的Fc域的亚基之一的N端,或
(ii)在b)下的第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在a)下的第一抗原结合模块的Fab重链的N端,且在a)下的第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在c)下的Fc域的亚基之一的N端。
在一个特定实施方案中,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含
a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)的Fab分子;
b)结合第二抗原的第二抗原结合模块,其中第二抗原是激活性T细胞抗原,特别是CD3,更加特别是CD3ε,且第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH或恒定域CL和CH1是彼此替换的Fab分子;
c)结合第一抗原且与第一抗原结合模块相同的第三抗原结合模块;和
d)由第一和第二亚基构成的Fc域;
其中
(i)在a)下的第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在b)下的第二抗原结合模块的Fab重链的N端,且在b)下的第二抗原结合模块和在c)下的第三抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至在d)下的Fc域的亚基之一的N端,或(ii)在b)下的第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在a)下的第一抗原结合模块的Fab重链的N端,且在a)下的第一抗原结合模块和在c)下的第三抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至在d)下的Fc域的亚基之一的N端。
在另一个实施方案中,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含
a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)的Fab分子;
b)结合第二抗原的第二抗原结合模块,其中第二抗原是激活性T细胞抗原,特别是CD3,更加特别是CD3ε,且第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH或恒定域CL和CH1是彼此替换的Fab分子;
c)由第一和第二亚基构成的Fc域;
其中
(i)在a)下的第一抗原结合模块和在b)下的第二抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至在c)下的Fc域的亚基之一的N端。
在依照本发明的双特异性抗原结合分子的所有不同构造中,本文中描述的氨基酸替代,如果存在的话,可以在第一和(如果存在的话)第三抗原结合模块/Fab分子的CH1和CL域中,或在第二抗原结合模块/Fab分子的CH1和CL域中。优选地,它们在第一和(如果存在的话)第三抗原结合模块/Fab分子的CH1和CL域中。依照本发明的概念,如果在第一(和,如果存在的话,第三)抗原结合模块/Fab分子中进行如本文中描述的氨基酸替代的话,在第二抗原结合模块/Fab分子中不进行此类氨基酸替代。相反,如果在第二抗原结合模块/Fab分子中进行如本文中描述的氨基酸替代的话,在第一(和,如果存在的话,第三)抗原结合模块/Fab分子中不进行此类氨基酸替代。特别是在包含其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH1是彼此替换的Fab分子的双特异性抗原结合分子中进行氨基酸替代。
在依照本发明的双特异性抗原结合分子的特定实施方案中,特别是其中在第一(和,如果存在的话,第三)抗原结合模块/Fab分子中进行如本文中描述的氨基酸替代,第一(和,如果存在的话,第三)Fab分子的恒定域CL是卡帕同种型的。在依照本发明的双特异性抗原结合分子的其它实施方案中,特别是其中在第二抗原结合模块/Fab分子中进行如本文中描述的氨基酸替代,第二抗原结合模块/Fab分子的恒定域CL是卡帕同种型的。在一些实施方案中,第一(和,如果存在的话,第三)抗原结合模块/Fab分子的恒定域CL和第二抗原结合模块/Fab分子的恒定域CL是卡帕同种型的。
在一个实施方案中,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含
a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)的Fab分子;
b)结合第二抗原的第二抗原结合模块,其中第二抗原是激活性T细胞抗原,特别是CD3,更加特别是CD3ε,且第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH是彼此替换的Fab分子;
c)由第一和第二亚基构成的Fc域;
其中在a)下的第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K)或精氨酸(R)替代(编号方式依照Kabat)(最特别是用精氨酸(R)),且其中在a)下的第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引);且
其中
(i)在a)下的第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在b)下的第二抗原结合模块的Fab重链的N端,且在b)下的第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在c)下的Fc域的亚基之一的N端,或
(ii)在b)下的第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在a)下的第一抗原结合模块的Fab重链的N端,且在a)下的第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在c)下的Fc域的亚基之一的N端。
在一个特定实施方案中,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含
a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)的Fab分子;
b)结合第二抗原的第二抗原结合模块,其中第二抗原是激活性T细胞抗原,特别是CD3,更加特别是CD3ε,且第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH是彼此替换的Fab分子;
c)结合第一抗原且与第一抗原结合模块相同的第三抗原结合模块;和
d)由第一和第二亚基构成的Fc域;
其中在a)下的第一抗原结合模块和在c)下的第三抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K)或精氨酸(R)替代(编号方式依照Kabat)(最特别是通过精氨酸(R)),且其中在a)下的第一抗原结合模块和在c)下的第三抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引);且
其中
(i)在a)下的第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在b)下的第二抗原结合模块的Fab重链的N端,且在b)下的第二抗原结合模块和在c)下的第三抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至在d)下的Fc域的亚基之一的N端,或
(ii)在b)下的第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在a)下的第一抗原结合模块的Fab重链的N端,且在a)下的第一抗原结合模块和在c)下的第三抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至在d)下的Fc域的亚基之一的N端。
在另一个实施方案中,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含
a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,其中第一抗原是STEAP-1且第一抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)的Fab分子;
b)结合第二抗原的第二抗原结合模块,其中第二抗原是激活性T细胞抗原,特别是CD3,更加特别是CD3ε,且第二抗原结合模块是其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH是彼此替换的Fab分子;
c)由第一和第二亚基构成的Fc域;
其中在a)下的第一抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K)或精氨酸(R)替代(编号方式依照Kabat)(最特别通过精氨酸(R)),且其中在a)下的第一抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引);且
其中在a)下的第一抗原结合模块和在b)下的第二抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至在c)下的Fc域的亚基之一的N端。
依照任何上述实施方案,双特异性抗原结合分子的各构件(例如Fab分子,Fc域)可直接或经由本文中描述的或本领域已知的各种接头(特别是包含一个或多个氨基酸,通常约2-20个氨基酸的肽接头)融合。合适的,非免疫原性的肽接头包括例如(G4S)n,(SG4)n,(G4S)n或G4(SG4)n肽接头,其中n一般是1至10,典型地2至4的整数。
在一个特定方面,本发明提供一种双特异性抗原结合分子,其包含
a)结合第一抗原的第一和第三抗原结合模块;其中第一抗原是STEAP-1且其中第一和第二抗原结合模块各自是包含包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的轻链可变区的(常规)Fab分子;
b)结合第二抗原的第二抗原结合模块;其中第二抗原是CD3且其中第二抗原结合模块是包含包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的轻链可变区的其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH是彼此替换的Fab分子;
c)由第一和第二亚基构成的Fc域;
其中
在a)下的第一和第三抗原结合模块的恒定域CL中位置124处的氨基酸用赖氨酸(K)替代(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸用赖氨酸(K)或精氨酸(R)替代(编号方式依照Kabat)(最特别通过精氨酸(R)),且其中在a)下的第一和第三抗原结合模块的恒定域CH1中位置147处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸用谷氨酸(E)替代(编号方式依照Kabat EU索引);
且其中进一步地
在a)下的第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至在b)下的第二抗原结合模块的Fab重链的N端,且在b)下的第二抗原结合模块和在a)下的第三抗原结合模块各自在Fab重链的C端融合至在c)下的Fc域的亚基之一的N端。
在一个实施方案中,依照本发明的这个方面,在Fc域的第一亚基中位置366处的苏氨酸残基用色氨酸残基替换(T366W),且在Fc域的第二亚基中位置407处的酪氨酸残基用缬氨酸残基替换(Y407V)且任选地位置366处的苏氨酸残基用丝氨酸残基替换(T366S)且位置368处的亮氨酸残基用丙氨酸残基替换(L368A)(编号方式依照Kabat EU索引)。
在又一个实施方案中,依照本发明的这个方面,在Fc域的第一亚基中另外地位置354处的丝氨酸残基用半胱氨酸残基替换(S354C)或位置356处的谷氨酸残基用半胱氨酸残基替换(E356C)(特别是位置354处的丝氨酸残基用半胱氨酸残基替换),且在Fc域的第二亚基中另外地位置349处的酪氨酸残基用半胱氨酸残基替换(Y349C)(编号方式依照Kabat EU索引)。
在依照本发明的这个方面的仍有又一个实施方案中,在Fc域的第一和第二亚基中每个中位置234处的亮氨酸残基用丙氨酸残基替换(L234A),位置235处的亮氨酸残基用丙氨酸残基替换(L235A)且位置329处的脯氨酸残基用甘氨酸残基替换(P329G)(编号方式依照Kabat EU索引)。
在依照本发明的这个方面仍有又一个实施方案中,Fc域是人IgG1Fc域。
在特定具体实施方案中,双特异性抗原结合分子包含包含与SEQ ID NO:32的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,包含与SEQ ID NO:33的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,包含与SEQ ID NO:34的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,和包含与SEQ ID NO:35的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽。在又一个特定具体实施方案中,双特异性抗原结合分子包含包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列的多肽,包含SEQ IDNO:33的氨基酸序列的多肽,包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列的多肽和包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列的多肽。
在另一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子包含包含与SEQ ID NO:28的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,包含与SEQ ID NO:29的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,包含与SEQ ID NO:34的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,和包含与SEQ ID NO:35的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽。在又一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子包含包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列的多肽,包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列的多肽,包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列的多肽和包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列的多肽。
在仍有另一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子包含包含与SEQ ID NO:30的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,包含与SEQ ID NO:61的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,包含与SEQ ID NO:34的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽,和包含与SEQ ID NO:35的序列至少95%,96%,97%,98%,或99%同一的氨基酸序列的多肽。在又一个具体实施方案中,双特异性抗原结合分子包含包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列的多肽,包含SEQ IDNO:31的氨基酸序列的多肽,包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列的多肽和包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列的多肽。
Fc域
在特定实施方案中,本发明的双特异性抗原结合分子包含由第一和第二亚基构成的Fc域。理解的是,本文中涉及双特异性抗原结合分子描述的Fc域的特征可同等应用于本发明的抗体中包含的Fc域。
双特异性抗原结合分子的Fc域由一对包含免疫球蛋白分子重链域的多肽链组成。例如,免疫球蛋白G(IgG)分子的Fc域是二聚体,其每个亚基包含CH2和CH3IgG重链恒定域。Fc域的两个亚基能够彼此稳定联合。在一个实施方案中,本发明的双特异性抗原结合分子包含不超过一个Fc域。
在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子的Fc域是IgG Fc域。在一个具体的实施方案中,Fc域是IgG1Fc域。在另一个实施方案中,Fc域是IgG4Fc域。在一个更加具体的实施方案中,Fc域是包含位置S228(Kabat EU索引编号方式)处的氨基酸替代,特别是氨基酸替代S228P的IgG4Fc域。此氨基酸替代降低IgG4抗体的体内Fab臂交换(参见Stubenrauch等,Drug Metabolism and Disposition 38,84-91(2010))。在又一个具体的实施方案中,Fc域是人Fc域。在一个甚至更加具体的实施方案中,Fc域是人IgG1Fc域。人IgG1Fc区的一种例示性序列在SEQ ID NO:36中给出。
促进异二聚化的Fc域修饰
依照本发明的双特异性抗原结合分子包含不同的抗原结合模块,其可以融合至Fc域的两个亚基之一个或另一个,如此Fc域的两个亚基通常包含在两条不相同的多肽链中。这些多肽的重组共表达和随后二聚化导致两种多肽的数种可能组合。为了改进重组生产中双特异性抗原结合分子的产量和纯度,如此在双特异性抗原结合分子的Fc域中引入促进期望多肽联合的修饰会是有利的。
因而,在具体的实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子的Fc域包含促进Fc域的第一和第二亚基联合的修饰。人IgG Fc域的两个亚基之间最广泛的蛋白质-蛋白质相互作用的位点在Fc域的CH3域中。如此,在一个实施方案中,所述修饰在Fc域的CH3域中。
有数种办法来修饰Fc域的CH3域以加强异二聚化,它们详细记载于例如WO 96/27011,WO 98/050431,EP 1870459,WO 2007/110205,WO 2007/147901,WO 2009/089004,WO2010/129304,WO 2011/90754,WO 2011/143545,WO 2012058768,WO 2013157954,WO2013096291。典型地,在所有此类办法中,Fc域的第一亚基的CH3域和Fc域的第二亚基的CH3域二者以互补方式进行工程化改造使得每个CH3域(或包含它的重链)不再能与其自身同二聚化但被迫与互补工程化改造的其它CH3域异二聚化(使得第一和第二CH3域异二聚化且两个第一CH3域或两个第二CH3域之间不形成同二聚体)。涵盖这些用于改善重链异二聚化的不同办法作为不同备选,与双特异性抗原结合分子中的减少重/轻链错配和Bence Jones型副产物的重-轻链修饰(例如一个结合臂中的VH和VL交换/替换及在CH1/CL界面中引入具有相反电荷的带电荷的氨基酸的替代)组合。
在一个特定的实施方案中,所述促进Fc域的第一亚基和第二亚基联合的修饰是所谓的“节-入-穴”修饰,其包含在Fc域的两个亚基之一中的“节”修饰和在Fc域的两个亚基之另一中的“穴”修饰。
节-入-穴技术记载于例如US 5,731,168;US 7,695,936;Ridgway等,Prot Eng 9,617-621(1996)和Carter,J Immunol Meth 248,7-15(2001)。一般地,方法牵涉在第一多肽的界面处引入隆起(“节”)并在第二多肽的界面中引入相应的空腔(“穴”),使得隆起可以置于空腔中从而促进异二聚体形成并阻碍同二聚体形成。通过将来自第一多肽界面的小氨基酸侧链用更大的侧链(例如酪氨酸或色氨酸)替换来构建隆起。在第二多肽的界面中创建具有与隆起相同或相似大小的互补性空腔,其通过将大氨基酸侧链用更小的氨基酸侧链(例如丙氨酸或苏氨酸)替换进行。
因而,在一个具体的实施方案中,在双特异性抗原结合分子的Fc域的第一亚基的CH3域中,一个氨基酸残基用具有更大侧链体积的氨基酸残基替换,由此在第一亚基的CH3域内生成隆起,其可安置于第二亚基的CH3域内的空腔中,而且在Fc域的第二亚基的CH3域中,一个氨基酸残基用具有更小侧链体积的氨基酸残基替换,由此在第二亚基的CH3域内生成空腔,其中可安置第一亚基的CH3域内的隆起。
优选地,所述具有更大侧链体积的氨基酸残基选自下组:精氨酸(R),苯丙氨酸(F),酪氨酸(Y),和色氨酸(W)。
优选地,所述具有更小侧链体积的氨基酸残基选自下组:丙氨酸(A),丝氨酸(S),苏氨酸(T),和缬氨酸(V)。
可以通过改变编码多肽的核酸,例如通过位点特异性诱变或通过肽合成来生成隆起和空腔。
在一个特定的实施方案中,在Fc域第一亚基(的CH3域)(“节”亚基)中,第366位的苏氨酸残基用色氨酸残基替换(T366W),而在Fc域第二亚基(的CH3域)(“穴”亚基)中,第407位的酪氨酸残基用缬氨酸残基替换(Y407V)。在一个实施方案中,在Fc域第二亚基中,另外,第366位的苏氨酸残基用丝氨酸残基替换(T366S)且第368位的亮氨酸残基用丙氨酸残基替换(L368A)(编号方式依照Kabat EU索引)。
在还有又一个实施方案中,在Fc域的第一亚基中,另外,第354位的丝氨酸残基用半胱氨酸残基替换(S354C)或第356位的谷氨酸残基用半胱氨酸残基替换(E356C)(特别是,第354位的丝氨酸残基用半胱氨酸残基替换),而在Fc域的第二亚基中,另外,第349位的酪氨酸残基用半胱氨酸残基替换(Y349C)(编号方式依照Kabat EU索引)。这两个半胱氨酸残基的引入导致在Fc域的两个亚基之间形成二硫桥,进一步稳定了二聚体(Carter,JImmunol Methods 248,7-15(2001))。
在一个具体的实施方案中,Fc域的第一亚基包含氨基酸替代S354C和T366W,且Fc域的第二亚基包含氨基酸替代Y349C,T366S,L368A和Y407V(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个具体的实施方案中,将结合第二抗原(例如激活性T细胞抗原)的抗原结合模块融合(任选地经由结合STEAP-1的第一抗原结合模块和/或肽接头)至Fc域的第一亚基(其包含“节”修饰)。不希望受理论束缚,结合第二抗原,诸如激活性T细胞抗原的抗原结合模块与Fc域的含节的亚基的融合会(进一步)使包含两个结合激活性T细胞抗原的抗原结合模块的抗原结合分子的生成最小化(两条含节的多肽的空间碰撞)。
涵盖修饰CH3以增强异二聚化的其它技术作为依照本发明的备选,它们记载于例如WO 96/27011,WO 98/050431,EP 1870459,WO 2007/110205,WO 2007/147901,WO 2009/089004,WO 2010/129304,WO 2011/90754,WO 2011/143545,WO 2012/058768,WO 2013/157954,WO 2013/096291。
在一个实施方案中,备选地使用EP 1870459中记载的异二聚化办法。这种办法基于在Fc域的两个亚基之间的CH3/CH3域界面中的特定氨基酸位置引入具有相反电荷的带电荷的氨基酸。本发明的双特异性抗原结合分子的一个优选的实施方案是(Fc域的)两个CH3域之一中的氨基酸突变R409D;K370E和Fc域的CH3域之另一中的氨基酸突变D399K;E357K(编号方式依照Kabat EU索引)。
在另一个实施方案中,本发明的双特异性抗原结合分子包含Fc域的第一亚基的CH3域中的氨基酸突变T366W和Fc域的第二亚基的CH3域中的氨基酸突变T366S,L368A,Y407V,和另外的Fc域的第一亚基的CH3域中的氨基酸突变R409D;K370E和Fc域的第二亚基的CH3域中的氨基酸突变D399K;E357K(编号方式依照Kabat EU索引)。
在另一个实施方案中,本发明的双特异性抗原结合分子包含Fc域的第一亚基的CH3域中的氨基酸突变S354C,T366W和Fc域的第二亚基的CH3域中的氨基酸突变Y349C,T366S,L368A,Y407V,或所述双特异性抗原结合分子包含Fc域的第一亚基的CH3域中的氨基酸突变Y349C,T366W和Fc域的第二亚基的CH3域中的氨基酸突变S354C,T366S,L368A,Y407V和另外的Fc域的第一亚基的CH3域中的氨基酸突变R409D;K370E和Fc域的第二亚基的CH3域中的氨基酸突变D399K;E357K(所有编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个实施方案中,备选地使用WO 2013/157953中记载的异二聚化办法。在一个实施方案中,第一CH3域包含氨基酸突变T366K且第二CH3域包含氨基酸突变L351D(编号方式依照Kabat EU索引)。在又一个实施方案中,第一CH3域进一步包含氨基酸突变L351K。在又一个实施方案中,第二CH3域进一步包含选自Y349E,Y349D和L368E的氨基酸突变(优选L368E)(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个实施方案中,备选地使用WO 2012/058768中记载的异二聚化办法。在一个实施方案中,第一CH3域包含氨基酸突变L351Y,Y407A且第二CH3域包含氨基酸突变T366A,K409F。在又一个实施方案中,第二CH3域进一步包含位置T411,D399,S400,F405,N390,或K392处的氨基酸突变,例如选自a)T411N,T411R,T411Q,T411K,T411D,T411E或T411W,b)D399R,D399W,D399Y或D399K,c)S400E,S400D,S400R,或S400K,d)F405I,F405M,F405T,F405S,F405V或F405W,e)N390R,N390K或N390D,f)K392V,K392M,K392R,K392L,K392F或K392E(编号方式依照Kabat EU索引)。在又一个实施方案中,第一CH3域包含氨基酸突变L351Y,Y407A且第二CH3域包含氨基酸突变T366V,K409F。在又一个实施方案中,第一CH3域包含氨基酸突变Y407A且第二CH3域包含氨基酸突变T366A,K409F。在又一个实施方案中,第二CH3域进一步包含氨基酸突变K392E,T411E,D399R和S400R(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个实施方案中,备选地使用WO 2011/143545中记载的异二聚化办法,例如进行选自下组的位置处的氨基酸修饰:368和409(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个实施方案中,备选地使用WO2011/090762中记载的异二聚化办法,它也使用上文所述节-入-穴技术。在一个实施方案中,第一CH3域包含氨基酸突变T366W且第二CH3域包含氨基酸突变Y407A。在一个实施方案中,第一CH3域包含氨基酸突变T366Y且第二CH3域包含氨基酸突变Y407T(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个实施方案中,双特异性抗原结合分子或它的Fc域是IgG2亚类的且备选地使用WO 2010/129304中记载的异二聚化办法。
在一个备选的实施方案中,促进Fc域的第一和第二亚基联合的修饰包含介导静电操纵效应(electrostatic steering effect)的修饰,例如如记载于PCT公开文本WO 2009/089004的。一般地,此方法涉及将在两个Fc域亚基界面处的一个或多个氨基酸残基替换为带电荷的氨基酸残基,从而在静电上不利于同二聚体形成而在静电上有利于异二聚化。在一个此类实施方案中,第一CH3域包含带负电荷的氨基酸(例如谷氨酸(E),或天冬氨酸(D))对K392或N392的氨基酸替代(优选K392D或N392D)且第二CH3域包含带正电荷的氨基酸(例如赖氨酸(K)或精氨酸(R))对D399,E356,D356,或E357的氨基酸替代(优选D399K,E356K,D356K,或E357K,更优选D399K和E356K)。在又一个实施方案中,第一CH3域进一步包含带负电荷的氨基酸(例如谷氨酸(E),或天冬氨酸(D))对K409或R409的氨基酸替代,优选K409D或R409D。在又一个实施方案中,第一CH3域进一步或二选一地包含带负电荷的氨基酸(例如谷氨酸(E),或天冬氨酸(D))对K439和/或K370的氨基酸替代(所有编号方式依照Kabat EU索引)。
在还有又一个实施方案中,备选地使用WO 2007/147901中记载的异二聚化办法。在一个实施方案中,第一CH3域包含氨基酸突变K253E,D282K,和K322D且第二CH3域包含氨基酸突变D239K,E240K,和K292D(编号方式依照Kabat EU索引)。
在仍有另一个实施方案中,可以备选地使用WO 2007/110205中记载的异二聚化办法。
在一个实施方案中,Fc域的第一亚基包含氨基酸替代K392D和K409D,且Fc域的第二亚基包含氨基酸替代D356K和D399K(编号方式依照Kabat EU索引)。
降低Fc受体结合和/或效应器功能的Fc域修饰
Fc域赋予双特异性抗原结合分子(或抗体)以有利的药动学特性,包括长血清半衰期,其有助于在靶组织中的较好积累和有利的组织-血液分配比。然而,同时它可能导致不想要的双特异性抗原结合分子(或抗体)对表达Fc受体的细胞而非优选的携带抗原的细胞的靶向。此外,Fc受体信号传导途径的共激活可能导致细胞因子释放,其与双特异性抗原结合分子的T细胞活化特性(例如在其中第二抗原结合模块结合激活性T细胞抗原的双特异性抗原结合分子的实施方案中)和长半衰期组合,在系统性施用后引起细胞因子受体的过度活化和严重的副作用。(携带Fc受体的)免疫细胞而非T细胞的活化甚至可能降低双特异性抗原结合分子(特别是其中第二抗原结合模块结合激活性T细胞抗原的双特异性抗原结合分子)的功效,原因是例如通过NK细胞对T细胞的潜在破坏。
因而,在具体的实施方案中,依照本发明的双特异性抗原结合分子的Fc域展现出与天然IgG1Fc域相比降低的对Fc受体的结合亲和力和/或降低的效应器功能。在一个此类实施方案中,Fc域(或包含所述Fc域的双特异性抗原结合分子)展现出与天然IgG1Fc域(或包含天然IgG1Fc域的双特异性抗原结合分子)相比少于50%,优选少于20%,更优选少于10%且最优选少于5%的对Fc受体的结合亲和力,和/或与天然IgG1Fc域(或包含天然IgG1Fc域的双特异性抗原结合分子)相比少于50%,优选少于20%,更优选少于10%且最优选少于5%的效应器功能。在一个实施方案中,Fc域(或包含所述Fc域的双特异性抗原结合分子)没有实质性结合Fc受体和/或诱导效应器功能。在一个具体的实施方案中,Fc受体是Fcγ受体。在一个实施方案中,Fc受体是人Fc受体。在一个实施方案中,Fc受体是活化性Fc受体。在一个特定的实施方案中,Fc受体是活化性人Fcγ受体,更具体地是人FcγRIIIa,FcγRI或FcγRIIa,最具体地是人FcγRIIIa。在一个实施方案中,效应器功能是选自下组的一项或多项:CDC,ADCC,ADCP,和细胞因子分泌。在一个具体的实施方案中,效应器功能是ADCC。在一个实施方案中,Fc域展现出与天然IgG1Fc域相比基本相似的对新生儿Fc受体(FcRn)的结合亲和力。当Fc域(或包含所述Fc域的双特异性抗原结合分子)展现出超过约70%,特别是超过约80%,更特别是超过约90%的天然IgG1Fc域(或包含天然IgG1Fc域的双特异性抗原结合分子)对FcRn的结合亲和力时,实现基本相似的对FcRn的结合。
在某些实施方案中,Fc域工程化改造为具有与非工程化Fc域相比降低的对Fc受体的结合亲和力和/或降低的效应器功能。在具体的实施方案中,双特异性抗原结合分子的Fc域包含一处或多处降低Fc域对Fc受体的结合亲和力和/或效应器功能的氨基酸突变。通常,Fc域的两个亚基的每一个中存在相同的一处或多处氨基酸突变。在一个实施方案中,氨基酸突变降低Fc域对Fc受体的结合亲和力。在一个实施方案中,氨基酸突变将Fc域对Fc受体的结合亲和力降低至少2倍,至少5倍,或至少10倍。在有超过一处降低Fc域对Fc受体的结合亲和力的氨基酸突变的实施方案中,这些氨基酸突变的组合可以将Fc域对Fc受体的结合亲和力降低至少10倍,至少20倍,或甚至至少50倍。在一个实施方案中,包含工程化Fc域的双特异性抗原结合分子展现出与包含非工程化Fc域的双特异性抗原结合分子相比少于20%,特别是少于10%,更特别是少于5%的对Fc受体的结合亲和力。在一个具体的实施方案中,Fc受体是Fcγ受体。在一些实施方案中,Fc受体是人Fc受体。在一些实施方案中,Fc受体是活化性Fc受体。在一个特定的实施方案中,Fc受体是活化性人Fcγ受体,更特别是人FcγRIIIa,FcγRI或FcγRIIa,最特别是人FcγRIIIa。优选地,对这些受体的每一种的结合是降低的。在一些实施方案中,对补体成分的结合亲和力,特别是对C1q的结合亲和力也是降低的。在一个实施方案中,对新生儿Fc受体(FcRn)的结合亲和力没有降低。当Fc域(或包含所述Fc域的双特异性抗原结合分子)展现出非工程化形式的Fc域(或包含所述非工程化形式的Fc域的双特异性抗原结合分子)对FcRn的结合亲和力的超过约70%时,实现基本相似的对FcRn的结合,即保留Fc域对所述受体的结合亲和力。Fc域或包含所述Fc域的本发明的双特异性抗原结合分子可以展现出超过约80%和甚至超过约90%的此类亲和力。在某些实施方案中,双特异性抗原结合分子的Fc域工程化改造为具有与非工程化Fc域相比降低的效应器功能。降低的效应器功能可包括但不限于下列一项或多项:降低的补体依赖性细胞毒性(CDC),降低的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC),降低的抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP),降低的细胞因子分泌,降低的免疫复合物介导的抗原呈递细胞的抗原摄取,降低的对NK细胞的结合,降低的对巨噬细胞的结合,降低的对单核细胞的结合,降低的对多形核细胞的结合,降低的诱导凋亡的直接信号传导,降低的靶物结合的抗体的交联,降低的树突细胞成熟,或降低的T细胞引发。在一个实施方案中,降低的效应器功能是选自下组的一项或多项:降低的CDC,降低的ADCC,降低的ADCP,和降低的细胞因子分泌。在一个具体的实施方案中,降低的效应器功能是降低的ADCC。在一个实施方案中,降低的ADCC是小于20%的由非工程化Fc域(或包含非工程化Fc域的双特异性抗原结合分子)诱导的ADCC。
在一个实施方案中,降低Fc域对Fc受体的结合亲和力和/或效应器功能的氨基酸突变是氨基酸替代。在一个实施方案中,Fc域包含在选自下组的位置处的氨基酸替代:E233,L234,L235,N297,P331和P329(编号方式依照Kabat EU索引)。在一个更特定的实施方案中,Fc域包含在选自下组的位置处的氨基酸替代:L234,L235和P329(编号方式依照KabatEU索引)。在一些实施方案中,Fc域包含氨基酸替代L234A和L235A(编号方式依照Kabat EU索引)。在一个此类实施方案中,Fc域是IgG1Fc域,特别是人IgG1Fc域。在一个实施方案中,Fc域包含在位置P329处的氨基酸替代。在一个更加特定的实施方案中,氨基酸替代是P329A或P329G,特别是P329G(编号方式依照Kabat EU索引)。在一个实施方案中,Fc域包含在位置P329处的氨基酸替代和又一处在选自以下位置处的氨基酸替代:E233,L234,L235,N297和P331(编号方式依照Kabat EU索引)。在一个更加特定的实施方案中,又一处氨基酸替代是E233P,L234A,L235A,L235E,N297A,N297D或P331S。在具体的实施方案中,Fc域包含在位置P329,L234和L235处的氨基酸替代(编号方式依照Kabat EU索引)。在更具体的实施方案中,Fc域包含氨基酸突变L234A,L235A和P329G(“P329G LALA”,“PGLALA”或“LALAPG”)。具体而言,在具体的实施方案中,Fc域的每个亚基包含氨基酸替代L234A,L235A和P329G(Kabat EU索引编号方式),即在Fc域的第一和第二亚基每个中,第234位的亮氨酸残基用丙氨酸残基替换(L234A),第235位的亮氨酸残基用丙氨酸残基替换(L235A)且第329位的脯氨酸残基用甘氨酸残基替换(P329G)(编号方式依照Kabat EU索引)。
在一个此类实施方案中,Fc域是IgG1Fc域,特别是人IgG1Fc域。氨基酸替代组合“P329G LALA”几乎完全消除了人IgG1Fc域的Fcγ受体(以及补体)结合,如记载于PCT公开文本no.WO 2012/130831,其通过提述完整并入本文。WO 2012/130831还描述了制备此类突变体Fc域的方法和用于测定其特性(诸如Fc受体结合或效应器功能)的方法。
IgG4抗体展现出与IgG1抗体相比降低的对Fc受体的结合亲和力和降低的效应器功能。因此,在一些实施方案中,本发明的双特异性抗原结合分子的Fc域是IgG4Fc域,特别是人IgG4Fc域。在一个实施方案中,IgG4Fc域包含在位置S228处的氨基酸替代,具体是氨基酸替代S228P(编号方式依照Kabat EU索引)。为了进一步降低其对Fc受体的结合亲和力和/或其效应器功能,在一个实施方案中,IgG4Fc域包含在位置L235处的氨基酸替代,具体是氨基酸替代L235E(编号方式依照Kabat EU索引)。在另一个实施方案中,IgG4Fc域包含在位置P329处的氨基酸替代,具体是氨基酸替代P329G(编号方式依照Kabat EU索引)。在一个具体的实施方案中,IgG4Fc域包含在位置S228,L235和P329处的氨基酸替代,具体是氨基酸替代S228P,L235E和P329G(编号方式依照Kabat EU索引)。此类IgG4Fc域突变体及其Fcγ受体结合特性记载于PCT公开文本No.WO 2012/130831,其通过提述完整并入本文。
在一个具体的实施方案中,展现出与天然IgG1Fc域相比降低的对Fc受体的结合亲和力和/或降低的效应器功能的Fc域是包含氨基酸替代L234A,L235A和任选地P329G的人IgG1Fc域,或包含氨基酸替代S228P,L235E和任选地P329G的人IgG4Fc域(编号方式依照Kabat EU索引)。
在某些实施方案中,已消除Fc域的N-糖基化。在一个此类实施方案中,Fc域包含在位置N297处的氨基酸突变,特别是用丙氨酸(N297A)或天冬氨酸(N297D)替换天冬酰胺的氨基酸替代(编号方式依照Kabat EU索引)。
在上文和PCT公开文本no.WO 2012/130831中描述的Fc域以外,具有降低的Fc受体结合和/或效应器功能的Fc域还包括那些具有Fc域残基238,265,269,270,297,327和329中一个或多个的替代的(美国专利No.6,737,056)(编号方式依照Kabat EU索引)。此类Fc突变体包括具有在氨基酸位置265,269,270,297和327的两个或更多个处的替代的Fc突变体,包括所谓的“DANA”Fc突变体,其具有残基265和297到丙氨酸的替代(美国专利No.7,332,581)。
可以使用本领域中公知的遗传或化学方法通过氨基酸删除,替代,插入或修饰来制备突变体Fc域。遗传方法可以包括编码DNA序列的位点特异性诱变,PCR,基因合成等。正确的核苷酸变化可以通过例如测序来验证。
可以容易地测定对Fc受体的结合,例如通过ELISA或通过使用标准仪器诸如BIAcore仪(GE Healthcare)的表面等离振子共振(SPR)进行,并且Fc受体诸如可通过重组表达获得。或者,可使用已知表达特定Fc受体的细胞系,如表达FcγIIIa受体的人NK细胞来估测Fc域或包含Fc域的双特异性抗原结合分子对Fc受体的结合亲和力。
可通过本领域中已知的方法来测量Fc域或包含Fc域的双特异性抗原结合分子的效应器功能。评估感兴趣分子的ADCC活性的体外测定法的例子记载于美国专利No.5,500,362;Hellstrom等,Proc Natl Acad Sci USA 83,7059-7063(1986)和Hellstrom等,ProcNatl Acad Sci USA 82,1499-1502(1985);美国专利No.5,821,337;Bruggemann等,J ExpMed 166,1351-1361(1987)。或者,可采用非放射性测定方法(参见例如用于流式细胞术的ACTITM非放射性细胞毒性测定法(CellTechnology,Inc.Mountain View,CA);和CytoTox非放射性细胞毒性测定法(Promega,Madison,WI))。对于此类测定法有用的效应细胞包括外周血单个核细胞(PBMC)和天然杀伤(NK)细胞。或者/另外,可体内评估感兴趣分子的ADCC活性,例如在动物模型中,诸如披露于Clynes等,Proc Natl Acad Sci USA 95,652-656(1998)的。
在一些实施方案中,Fc域对补体成分(特别是对C1q)的结合是降低的。因而,在其中Fc域工程化为具有降低的效应器功能的一些实施方案中,所述降低的效应器功能包括降低的CDC。可实施C1q结合测定法来测定Fc域或包含Fc域的双特异性抗原结合分子是否能够结合C1q并因此具有CDC活性。参见例如WO 2006/029879和WO 2005/100402中的C1q和C3c结合ELISA。为了评估补体激活,可实施CDC测定法(参见例如Gazzano-Santoro等,J ImmunolMethods 202,163(1996);Cragg等,Blood 101,1045-1052(2003);以及Cragg和Glennie,Blood 103,2738-2743(2004))。
还可以使用本领域已知的方法来实施FcRn结合和体内清除/半衰期测定(参见例如Petkova,S.B.et al.,Int’l.Immunol.18(12):1759-1769(2006);WO 2013/120929)。
多核苷酸
本发明还提供分离的多核苷酸,其编码如本文中描述的抗体或双特异性抗原结合分子或其片段。在一些实施方案中,所述片段是抗原结合片段。
可以将编码本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的多核苷酸以编码完整抗体或双特异性抗原结合分子的单一多核苷酸表达,或以共表达的多种(例如两种或更多种)多核苷酸表达。由共表达的多核苷酸编码的多肽可以经由例如二硫键或其它手段联合以形成功能性抗体或双特异性抗原结合分子。例如,抗体或双特异性抗原结合分子的轻链部分可以与抗体或双特异性抗原结合分子中包含抗体或双特异性抗原结合分子重链的部分由分开的多核苷酸编码。当共表达时,重链多肽会与轻链多肽联合以形成抗体或双特异性抗原结合分子。在另一个例子中,抗体或双特异性抗原结合分子中包含两个Fc域亚基之一和任选地(部分的)一个或多个Fab分子的部分可以与抗体或双特异性抗原结合分子中包含两个Fc域亚基中另一个和任选地(部分的)Fab分子的部分由分开的多核苷酸编码。当共表达时,Fc域亚基会联合以形成Fc域。
在一些实施方案中,分离的多核苷酸编码整个依照本文所述发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在其它实施方案中,分离的多核苷酸编码依照本文所述发明的抗体或双特异性抗原结合分子中包含的多肽。
在某些实施方案中,多核苷酸或核酸是DNA。在其它实施方案中,本发明的多核苷酸是RNA,例如以信使RNA(mRNA)的形式。本发明的RNA可以是单链或双链的。
重组方法
可以获得本发明的抗体或双特异性抗原结合分子,例如通过固相肽合成(例如Merrifield固相合成)或重组生成进行。对于重组生成,分离一种或多种编码抗体或双特异性抗原结合分子(片段)的多核苷酸(例如如上文描述的),并将其插入一种或多种载体中用于在宿主细胞中进一步克隆和/或表达。可以使用常规规程容易分离并测序此类多核苷酸。在一个实施方案中,提供包含一种或多种本发明的多核苷酸的载体(优选为表达载体)。可以使用本领域技术人员公知的方法来构建含有抗体或双特异性抗原结合分子(片段)的编码序列以及适宜的转录/翻译控制信号的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术,合成技术和体内重组/遗传重组。参见例如记载于Maniatis等,MOLECULAR CLONING:ALABORATORY MANUAL,Cold Spring Harbor Laboratory,N.Y.(1989);和Ausubel等,CURRENTPROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY,Greene Publishing Associates and Wiley Interscience,N.Y(1989)的技术。表达载体可以是质粒,病毒的一部分或可以是核酸片段。表达载体包含表达盒,其中在与启动子和/或其它转录或翻译控制元件的可操作联合中克隆编码抗体或双特异性抗原结合分子(片段)的多核苷酸(即编码区)。如本文中使用的,“编码区”是核酸中由翻译成氨基酸的密码子组成的一部分。尽管“终止密码子”(TAG,TGA或TAA)不翻译成氨基酸,但可将其视为编码区的一部分(若存在的话),但任何侧翼序列例如启动子,核糖体结合位点,转录终止子,内含子,5’和3’非翻译区等,不是编码区的一部分。两个或更多个编码区可以存在于单一多核苷酸构建体中(例如单一载体上),或存在于分开的多核苷酸构建体中,例如在分开的(不同的)载体上。此外,任何载体可含有单个编码区,或可包含两个或更多个编码区,例如本发明的载体可以编码一种或多种多肽,其经由蛋白水解切割在翻译后或共翻译分开成最终蛋白质。另外,本发明的载体,多核苷酸或核酸可以编码异源编码区,其与编码本发明的抗体或双特异性抗原结合分子(片段)或其变体或衍生物的多核苷酸融合或未融合。异源编码区包括但不限于特殊化的元件或基序,如分泌信号肽或异源功能域。当基因产物例如多肽的编码区与一种或多种调节序列以某种方式联合从而使得基因产物的表达置于调节序列的影响或控制下时,即为可操作联合。若诱导启动子功能导致编码期望的基因产物的mRNA的转录并且如果两个DNA片段之间的连接的性质不干扰表达调节序列指导基因产物表达的能力或不干扰DNA模板被转录的能力,则两个DNA片段(如多肽编码区和与其联合的启动子)为“可操作联合的”。如此,如果启动子能够实现编码多肽的核酸的转录,那么启动子区将是与该核酸可操作联合。启动子可以是细胞特异性启动子,其仅在预先确定的细胞中指导DNA的实质性转录。除启动子以外,其它转录控制元件例如增强子,操纵基因,阻遏物和转录终止信号能与多核苷酸可操作联合以指导细胞特异性转录。在本文中公开了合适的启动子和其它转录控制区。多种转录控制区是本领域技术人员已知的。这些包括但不限于在脊椎动物细胞中发挥功能的转录控制区,如但不限于来自巨细胞病毒的启动子和增强子区段(例如立即早期启动子,以及内含子-A),猿病毒40(例如早期启动子)和逆转录病毒(如例如劳斯(Rous)肉瘤病毒)。其它转录控制区包括那些自脊椎动物基因如肌动蛋白,热休克蛋白,牛生长激素和家兔β-珠蛋白衍生的,以及能够控制真核细胞中基因表达的其它序列。另外的合适的转录控制区包括组织特异性启动子和增强子以及诱导型启动子(例如四环素诱导型启动子)。类似地,多种翻译控制元件是本领域普通技术人员已知的。这些包括但不限于核糖体结合位点,翻译起始和终止密码子以及自病毒系统衍生的元件(具体地,内部核糖体进入位点或IRES,也称作CITE序列)。表达盒还可以包含其它特征,如复制起点和/或染色体整合元件,如逆转录病毒长末端重复(LTR)或腺伴随病毒(AAV)反向末端重复(ITR)。
本发明的多核苷酸和核酸编码区可以与编码分泌或信号肽的另外的编码区联合,分泌或信号肽指导由本发明的多核苷酸编码的多肽的分泌。例如,如果期望分泌抗体或双特异性抗原结合分子,那么可以将编码信号序列的DNA置于编码本发明抗体或双特异性抗原结合分子或其片段的核酸上游。依照信号假说,由哺乳动物细胞分泌的蛋白质具有信号肽或分泌前导序列,一旦启动将生长的蛋白质链跨越粗面内质网输出,就将信号肽或分泌前导序列从成熟的蛋白质切去。本领域中普通技术人员知晓由脊椎动物细胞分泌的多肽一般具有融合至多肽N端的信号肽,其从所翻译的多肽切去以生成分泌性或“成熟”形式的多肽。在某些实施方案中,使用天然的信号肽,例如免疫球蛋白重链或轻链信号肽,或序列的保留指导与其可操作联合的多肽分泌的能力的功能性衍生物。或者,可以使用异源哺乳动物信号肽或其功能性衍生物。例如,可以将野生型前导序列用人组织血纤维蛋白溶酶原激活剂(TPA)或小鼠β-葡糖醛酸糖苷酶的前导序列替代。
可以将编码能用于促进后期纯化(例如组氨酸标签)或辅助标记抗体或双特异性抗原结合分子的短蛋白序列的DNA纳入抗体或双特异性抗原结合分子(片段)编码多核苷酸内或其末端。
在一个别的实施方案中,提供包含本发明的一种或多种多核苷酸的宿主细胞。在某些实施方案中,提供包含本发明的一种或多种载体的宿主细胞。多核苷酸和载体可以单独地或组合地掺入本文中分别关于多核苷酸和载体所描述的任何特征。在一个此类实施方案中,宿主细胞包含一种或多种载体(例如已用载体转化或转染),一种或多种载体包含编码本发明抗体或双特异性抗原结合分子(的部分)的一种或多种多核苷酸。如本文中使用的,术语“宿主细胞”指任何能工程化以生成本发明的抗体或双特异性抗原结合分子或其片段的细胞系统种类。适用于复制并支持抗体或双特异性抗原结合分子表达的宿主细胞是本领域中公知的。在适当时,可用特定的表达载体转染或转导此类细胞,并且可以培养大量的含载体细胞以用于接种大规模发酵罐,从而获得充足量的抗体或双特异性抗原结合分子用于临床应用。合适的宿主细胞包括原核微生物如大肠杆菌,或各种真核细胞,如中国仓鼠卵巢细胞(CHO),昆虫细胞等。例如,可以在细菌中生成多肽,尤其在不需要糖基化时。在表达后,可以将多肽在可溶性级分中从细菌细胞糊分离并可以进一步纯化。除了原核生物外,真核微生物如丝状真菌或酵母也是适合编码多肽的载体的克隆或表达宿主,包括其糖基化途径已被“人源化”,导致生成具有部分或完全人的糖基化样式的多肽的真菌和酵母菌株。参见Gerngross,Nat Biotech 22,1409-1414(2004),和Li等,Nat Biotech 24,210-215(2006)。适用于表达(糖基化)多肽的宿主细胞还自多细胞生物体(无脊椎动物和脊椎动物)衍生。无脊椎动物细胞的例子包括植物和昆虫细胞。已鉴定出可与昆虫细胞一起使用的大量杆状病毒株,特别是用于转染草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)细胞。也可以将植物细胞培养物用作宿主。参见例如美国专利No.5,959,177,6,040,498,6,420,548,7,125,978和6,417,429(描述用于在转基因植物中生成抗体的PLANTIBODIESTM技术)。脊椎动物细胞也可以用作宿主。例如,适应于在悬液中生长的哺乳动物细胞系可以是有用的。可用的哺乳动物宿主细胞系的其它例子是由SV40转化的猴肾CV1系(COS-7);人胚肾系(293或293T细胞,如例如记载于Graham等,J Gen Virol 36,59(1977)),幼仓鼠肾细胞(BHK),小鼠塞托利(sertoli)细胞(TM4细胞,如例如记载于Mather,Biol Reprod 23,243-251(1980)的),猴肾细胞(CV1),非洲绿猴肾细胞(VERO-76),人宫颈癌细胞(HELA),犬肾细胞(MDCK),牛鼠(buffalo rat)肝细胞(BRL 3A),人肺细胞(W138),人肝细胞(Hep G2),小鼠乳房肿瘤细胞(MMT 060562),TRI细胞(如例如记载于Mather等,Annals N.Y.Acad Sci 383,44-68(1982)的),MRC 5细胞和FS4细胞。其它可用的哺乳动物宿主细胞系包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,包括dhfr-CHO细胞(Urlaub等,Proc Natl Acad Sci USA 77,4216(1980));和骨髓瘤细胞系如YO,NS0,P3X63和Sp2/0。对于某些适用于蛋白质生产的哺乳动物宿主细胞系的综述,参见例如Yazaki和Wu,Methods in Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,HumanaPress,Totowa,NJ),pp.255-268(2003)。宿主细胞包括培养的细胞,例如哺乳动物培养细胞,酵母细胞,昆虫细胞,细菌细胞和植物细胞等,但还包括在转基因动物,转基因植物或培养的植物或动物组织中包含的细胞。在一个实施方案中,宿主细胞是真核细胞,优选为哺乳动物细胞如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,人胚肾(HEK)细胞或淋巴样细胞(例如Y0,NS0,Sp20细胞)。
本领域中已知在这些系统中表达外来基因的标准技术。可以将表达包含抗原结合域如抗体的重链或轻链的多肽的细胞工程化改造为使得还表达另一抗体链,从而使得表达的产物是具有重链和轻链两者的抗体。
在一个实施方案中,提供了生成依照本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的方法,其中方法包括在适合于抗体或双特异性抗原结合分子表达的条件下培养包含编码抗体或双特异性抗原结合分子的多核苷酸的宿主细胞(如本文中提供的),并任选从宿主细胞(或宿主细胞培养基)回收抗体或双特异性抗原结合分子。
本发明的双特异性抗原结合分子(或抗体)的各构件可以彼此遗传融合。双特异性抗原结合分子可设计为使其构件直接彼此融合或经由接头序列间接融合。可依照本领域中公知的方法测定接头的组成和长度,并可以测试功效。双特异性抗原结合分子不同构件之间的接头序列的例子在本文中提供。还包含另外的序列以纳入切割位点来分开融合的各个构件(若期望的话),例如内肽酶识别序列。
本发明的抗体或双特异性抗原结合分子一般至少包含能结合抗原性决定簇的抗体可变区。可变区可形成天然或非天然存在的抗体及其片段的一部分和自其衍生。生成多克隆抗体和单克隆抗体的方法是本领域中公知的(参见例如Harlow和Lane,“Antibodies,alaboratory manual”,Cold Spring Harbor Laboratory,1988)。非天然存在的抗体可以使用固相肽合成构建,可以重组生成(例如如记载于美国专利No.4,186,567的)或可通过例如筛选包含可变重链和可变轻链的组合文库获得(参见例如McCafferty的美国专利No.5,969,108)。
可以将任何动物种类的抗体,抗体片段,抗原结合域或可变区用于本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。可用于本发明的非限制性抗体,抗体片段,抗原结合域或可变区可以是鼠,灵长类或人起源的。如果抗体或双特异性抗原结合分子意图供人使用,那么可以使用嵌合形式的抗体,其中抗体的恒定区来自人。也可以依照本领域中公知的方法制备人源化或全人形式的抗体(参见例如Winter的美国专利No.5,565,332)。人源化可以通过各种方法实现,包括但不限于(a)将非人(例如供体抗体)CDR嫁接到人(例如受体抗体)框架和恒定区上,保留或不保留关键的框架残基(例如那些对于保留较好的抗原结合亲和力或抗体功能重要的残基),(b)仅将非人特异性决定区(SDR或a-CDR;对于抗体-抗原相互作用关键的残基)嫁接到人框架和恒定区上,或(c)移植完整的非人可变域,但通过替换表面残基用人样部分来“掩饰(cloak)”它们。人源化抗体及其生成方法综述于例如Almagro andFransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008),并且进一步记载于例如Riechmann etal.,Nature 332:323-329(1988);Queen et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 86:10029-10033(1989);美国专利No.5,821,337,7,527,791,6,982,321和7,087,409;Kashmiri etal.,Methods 36:25-34(2005)(描述了特异性决定区(SDR)嫁接);Padlan,Mol.Immunol.28:489-498(1991)(描述了“重修表面”);Dall’Acqua et al.,Methods 36:43-60(2005)(描述了“FR改组”);和Osbourn et al.,Methods 36:61-68(2005)和Klimkaet al.,Br.J.Cancer 83:252-260(2000)(描述了FR改组的“引导选择”方法)。可以用于人源化的人框架区包括但不限于:使用“最佳拟合(best-fit)”方法选择的框架区(见例如Sims et al.,J.Immunol.151:2296(1993));自轻或重链可变区的特定亚组的人抗体的共有序列衍生的框架区(见例如Carter et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992);和Presta et al.,J.Immunol.,151:2623(1993));人成熟的(体细胞突变的)框架区或人种系框架区(见例如Almagro and Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008));和通过筛选FR文库衍生的框架区(见例如Baca et al.,J.Biol.Chem.272:10678-10684(1997)和Rosoket al.,J.Biol.Chem.271:22611-22618(1996))。
可以使用本领域中已知的多种技术来生成人抗体。一般地,人抗体记载于vanDijk and van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368-74(2001)和Lonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450-459(2008)。可以通过对转基因动物施用免疫原来制备人抗体,转基因动物已经修饰为响应抗原性攻击而生成完整人抗体或具有人可变区的完整抗体。此类动物通常含有所有或部分人免疫球蛋白基因座,其替换内源免疫球蛋白基因座,或者其在染色体外存在或随机整合入动物的染色体中。在此类转基因小鼠中,一般已经将内源免疫球蛋白基因座灭活。关于自转基因动物获得人抗体的方法的综述,见Lonberg,Nat.Biotech.23:1117-1125(2005)。还可见例如美国专利No.6,075,181和6,150,584,其描述了XENOMOUSETM技术;美国专利No.5,770,429,其描述了技术;美国专利No.7,041,870,其描述了K-M技术,和美国专利申请公开文本No.US 2007/0061900,其描述了技术)。可以例如通过与不同人恒定区组合进一步修饰来自由此类动物生成的完整抗体的人可变区。
也可以通过基于杂交瘤的方法生成人抗体。已经描述了用于生成人单克隆抗体的人骨髓瘤和小鼠-人异源骨髓瘤细胞系(见例如Kozbor,J.Immunol.,133:3001(1984);Brodeur et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,第51-63页(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987);和Boerner et al.,J.Immunol.,147:86(1991))。经由人B细胞杂交瘤技术生成的人抗体也记载于Li et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,103:3557-3562(2006)。其它方法包括那些例如记载于美国专利No.7,189,826(其描述了自杂交瘤细胞系生成单克隆人IgM抗体)和Ni,XiandaiMianyixue,26(4):265-268(2006)(其描述了人-人杂交瘤)的。人杂交瘤技术(Trioma技术)也记载于Vollmers and Brandlein,Histology and Histopathology,20(3):927-937(2005)和Vollmers and Brandlein,Methods and Findings in Experimental andClinical Pharmacology,27(3):185-91(2005)。
也可以通过自人抗体文库分离来生成人抗体,如本文中描述的。
可以通过对组合文库筛选具有期望的一种或多种活性的抗体来分离在本发明中有用的抗体。用于筛选组合文库的方法综述于例如Lerner et al.,Nature Reviews 16:498-508(2016)。例如,用于生成噬菌体展示文库并对此类文库筛选拥有期望结合特征的抗体的多种方法是本领域中已知的。此类方法综述于例如Frenzel et al.,mAbs 8:1177-1194(2016);Bazan et al.,Human Vaccines and Immunotherapeutics 8:1817-1828(2012)和Zhao et al.,Critical Reviews in Biotechnology 36:276-289(2016)和Hoogenboom et al.,于Methods in Molecular Biology 178:1-37(O’Brien等编,HumanPress,Totowa,NJ,2001)和Marks and Bradbury,于Methods in Molecular Biology 248:161-175(Lo编,Human Press,Totowa,NJ,2003)。
在某些噬菌体展示方法中,将VH和VL基因的全集分别通过聚合酶链式反应(PCR)克隆,并在噬菌体文库中随机重组,然后可以对噬菌体文库筛选抗原结合噬菌体,如记载于Winter et al.,Annual Review of Immunology 12:433-455(1994)的。噬菌体通常以单链Fv(scFv)片段或以Fab片段展示抗体片段。来自经免疫的来源的文库提供针对免疫原的高亲和力抗体,而不需要构建杂交瘤。或者,可以(例如自人)克隆未免疫全集以在没有任何免疫接种的情况中提供针对一大批非自身和还有自身抗原的抗体的单一来源,如由Griffiths et al.,EMBO Journal 12:725-734(1993)描述的。最后,也可以通过自干细胞克隆未重排的V基因区段,并使用含有随机序列的PCR引物编码高度可变的CDR3区并在体外实现重排来合成生成未免疫文库,如由Hoogenboom and Winter,Journal of MolecularBiology 227:381-388(1992)所描述的。描述人抗体噬菌体文库的专利公开文本包括例如:美国专利No.5,750,373;7,985,840;7,785,903和8,679,490和美国专利公开文本No.2005/0079574,2007/0117126,2007/0237764和2007/0292936。本领域知道的用于对组合文库筛选具有一种或多种期望活性的抗体的方法的别的例子包括核糖体和mRNA展示,以及用于在细菌,哺乳动物细胞,昆虫细胞或酵母细胞上展示和选择抗体的方法。用于酵母表面展示的方法的综述见例如Scholler et al.,Methods in Molecular Biology 503:135-56(2012)和Cherf et al.,Methods in Molecular biology 1319:155-175(2015)以及Zhao etal.,Methods in Molecular Biology 889:73-84(2012)。用于核糖体展示的方法的记载见例如He et al.,Nucleic Acids Research 25:5132-5134(1997)和Hanes et al.,PNAS94:4937-4942(1997)。
可以通过本领域已知的技术来纯化如本文中描述的那样制备的抗体或双特异性抗原结合分子,技术如高效液相层析,离子交换层析,凝胶电泳,亲和层析,大小排阻层析等。用于纯化具体蛋白质的实际条件将部分取决于因素,如净电荷,疏水性,亲水性等,而且对于本领域中的技术人员将是明显的。对于亲和层析纯化,能使用抗体或双特异性抗原结合分子结合的抗体,配体,受体或抗原。例如,对于本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的亲和层析纯化,可以使用具有蛋白A或蛋白G的基质。可以使用连续的蛋白A或G亲和层析和大小排阻层析来分离抗体或双特异性抗原结合分子,基本如实施例中描述的。可以通过多种公知的分析方法中的任一种来测定抗体或双特异性抗原结合分子的纯度,包括凝胶电泳,高压液相层析等。
测定法
通过本领域中已知的各种测定法,可以鉴定,筛选或表征本文中提供的抗体或双特异性抗原结合分子的物理/化学特性和/或生物学活性。
亲和力测定法
可以例如使用标准的仪器如BIAcore仪(GE Healthcare)通过表面等离振子共振(SPR)测定抗体或双特异性抗原结合分子对Fc受体或靶抗原的亲和力,而且可以诸如通过重组表达获得受体或靶蛋白。或者,可以例如通过流式细胞术(FACS),使用表达特定受体或靶抗原的细胞系来评估抗体或双特异性抗原结合分子对不同受体或靶抗原的结合。一个用于测量结合亲和力的特定的说明性和例示性实施方案记载于下文。
依照一个实施方案,通过表面等离振子共振使用T100仪(GEHealthcare)于25℃测量KD。
为了分析Fc部分与Fc受体之间的相互作用,通过固定化于CM5芯片上的抗五His抗体(Qiagen)来捕捉带His标签的重组Fc受体并将双特异性构建体用作分析物。简言之,将羧甲基化的葡聚糖生物传感器芯片(CM5,GE Healthcare)依照供应商说明书用N-乙基-N’-(3-二甲基氨丙基)-碳二亚胺氢氯化物(EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化。将抗五His抗体用10mM醋酸钠pH 5.0稀释至40μg/ml,接着以5μl/分钟的流速注射以实现约6500响应单位(RU)的偶联蛋白。在注射配体后,注射1M乙醇胺以封闭未反应的基团。然后,在4或10nM捕捉Fc受体60秒。对于动力学测量,将抗体或双特异性抗原结合分子的4倍连续稀释液(范围为约500nM至4000nM)在HBS-EP(GE Healthcare,10mM HEPES,150mM NaCl,3mM EDTA,0.05%表面活性剂P20,pH 7.4)中于25℃以30μl/分钟的流速注射120秒。
为了测定对靶抗原的亲和力,通过固定化于活化CM5传感器芯片表面上的抗人Fab特异性抗体(GE Healthcare)来捕捉抗体或双特异性抗原结合分子,如对于抗五-His抗体所描述的。偶联蛋白质的最终量为约12000RU。抗体或双特异性抗原结合分子在300nM捕捉90秒。使靶抗原在从250至1000nM的浓度范围以30μl/min的流速通过流动池达180秒。监测解离达180秒。
通过扣除在参照流动池上获得的响应来校正批量折射率(bulk refractiveindex)差异。使用稳定态响应通过Langmuir结合等温线的非线性曲线拟合来导出解离常数KD。使用简单的1对1Langmuir结合模型(BIACORET100评估软件版本1.1.1)通过同时拟合结合和解离传感图来计算结合速率(k结合)和解离速率(k解离)。平衡解离常数(KD)计算为比率k解离/k结合。参见例如Chen等,J Mol Biol 293,865-881(1999)。
活性测定法
可以通过各种测定法来测量本发明的双特异性抗原结合分子(或抗体)的生物学活性,如实施例中描述的。生物学活性可例如包括诱导T细胞的增殖,诱导T细胞中的信号传导,诱导T细胞中活化标志物的表达,诱导通过T细胞的细胞因子分泌,诱导靶细胞如肿瘤细胞的裂解,和诱导肿瘤消退和/或改善存活。
组合物,配制剂和施用路径
在一个别的方面,本发明提供包含本文中提供的任一种抗体或双特异性抗原结合分子的药学组合物,例如用于以下任一种治疗方法。在一个实施方案中,药学组合物包含本文中提供的任一种抗体或双特异性抗原结合分子以及药学可接受载体。在另一个实施方案中,药学组合物包含本文中提供的任一种抗体或双特异性抗原结合分子以及至少一种另外的治疗剂,例如如下文描述的。
还提供以适于体内施用的形式生成本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的方法,方法包括(a)获得依照本发明的抗体或双特异性抗原结合分子,并(b)将抗体或双特异性抗原结合分子与至少一种药学可接受载体配制在一起,由此配制成用于体内施用的抗体或双特异性抗原结合分子制剂。
本发明的药学组合物包含治疗有效量的在药学可接受载体中溶解或分散的抗体或双特异性抗原结合分子。短语“药学或药理学可接受的”指在所采用的剂量和浓度一般对接受者无毒性,即在适当时对动物如例如人施用时不产生不利,变应性或其它不当反应的分子实体和组合物。根据本公开,制备含有抗体或双特异性抗原结合分子以及任选地另外的活性成分的药学组合物将是本领域技术人员已知的,如由Remington’s PharmaceuticalSciences,18th Ed.Mack Printing Company,1990例示的,其通过提述并入本文。此外,对于动物(例如人)施用,会理解制剂应当满足FDA生物标准部门(FDA Office of BiologicalStandards)或其它国家的相应机构要求的无菌性,热原性(pyrogenicity),一般安全性和纯度标准。优选的组合物是冻干配制剂或水性溶液。如本文中使用的,“药学可接受载体”包括任何和所有的溶剂,缓冲剂,分散介质,涂料材料,表面活性剂,抗氧化剂,防腐剂(例如抗细菌剂,抗真菌剂),等张剂,吸收延缓剂,盐,防腐剂,抗氧化剂,蛋白质,药物,药物稳定剂,聚合物,凝胶,粘合剂,赋形剂,崩解剂(disintegration agent),润滑剂,甜味剂,芳香剂,染料,此类类似的材料及其组合,如本领域普通技术人员将已知的(参见例如Remington’sPharmaceutical Sciences,18th Ed.Mack Printing Company,1990,pp.1289-1329,通过提述并入本文)。除非任何常规载体与活性成分不相容,涵盖其在治疗或药学组合物中的使用。
可以通过任何合适的手段,包括胃肠外,肺内,和鼻内,及若期望用于局部治疗的话,损伤内施用来施用本发明的抗体或双特异性抗原结合分子(和任何别的治疗剂)。胃肠外输注包括肌肉内,静脉内,动脉内,腹膜内,或皮下施用。部分根据施用是短暂的还是长期的,剂量给药可以通过任何合适的路径,例如通过注射,诸如静脉内或皮下注射进行。
胃肠外组合物包括那些设计用于通过注射施用,例如皮下,皮内,损伤内,静脉内,动脉内,肌内,鞘内或腹膜内注射施用的组合物。对于注射,可以将本发明的抗体或双特异性抗原结合分子在水性溶液,优选地在生理学相容的缓冲液中配制,生理学相容的缓冲液如汉克(Hanks)氏溶液,林格(Ringer)氏溶液或生理学盐水缓冲液。溶液可以含有配制剂如悬浮剂,稳定剂和/或分散剂。或者,抗体或双特异性抗原结合分子可以为粉末形式,用于在使用前用合适的媒介物例如无菌无热原水构成。根据需要,通过将本发明的抗体或双特异性抗原结合分子以需要的量掺入到具有下文列举的各种其它成分的合适溶剂中来制备无菌可注射溶液。可以容易地实现无菌,例如通过过滤流过无菌过滤膜进行。一般地,通过将各种无菌活性成分掺入到无菌媒介物中来制备分散剂,无菌媒介物含有基础分散介质和/或其它成分。在制备无菌可注射溶液,悬液或乳剂的无菌粉末的情况中,优选的制备方法是真空干燥或冷冻干燥技术,其将活性成分以及任何另外的期望成分的粉末从其先前无菌过滤的液体介质产生。液体介质在必要时应当是适当缓冲的,并且在用充足的盐水或葡萄糖注射前首先使液体稀释液等张。组合物在制备和贮存条件下必须是稳定的,并且针对微生物如细菌和真菌的污染作用提供保护。会领会的是,应当将内毒素污染最少保持于安全水平,例如低于0.5ng/mg蛋白质。合适的药学可接受载体包括但不限于:缓冲剂如磷酸盐,柠檬酸盐和其它有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸和甲硫氨酸;防腐剂(如十八烷基二甲基苄基氯化铵;氯化六甲双铵(hexamethonium chloride);苯扎氯铵;苄索氯铵;酚,丁醇或苯甲醇;烷基对羟基苯甲酸酯如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯;儿茶酚;间苯二酚;环己醇;3-戊醇;和间甲酚);低分子量(低于约10个残基)多肽;蛋白质,如血清清蛋白,明胶,或免疫球蛋白;亲水性聚合物如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸如甘氨酸,谷氨酰胺,天冬酰胺,组氨酸,精氨酸或赖氨酸;单糖,二糖,和其它碳水化合物,包括葡萄糖,甘露糖或糊精;螯合剂如EDTA;糖如蔗糖,甘露醇,海藻糖或山梨糖醇;形成盐的反荷离子如钠;金属复合物(例如Zn-蛋白质复合物);和/或非离子型表面活性剂如聚乙二醇(PEG)。水性注射悬液可以含有提高悬液粘度的化合物,如羧甲基纤维素钠,山梨糖醇,葡聚糖等。任选地,悬液还可以含有合适的稳定剂或增加化合物溶解度以允许制备高度浓缩的溶液的试剂。另外,可以将活性化合物的悬液制备为合适的油性注射悬液。合适的亲脂溶剂或媒介物包括脂肪油如芝麻油或合成的脂肪酸酯,如乙基cleats或甘油三酯或脂质体。
可以将活性成分在例如分别通过凝聚技术或通过界面聚合作用制备的微囊剂,例如羟甲基纤维素或明胶微囊剂和聚-(甲基丙烯酸酯)微囊剂中,在胶体药物投递系统(例如脂质体,清蛋白微球,微乳剂,纳米颗粒和纳米胶囊)或在粗乳液(macroemulsion)中包载。此类技术披露于Remington’s Pharmaceutical Sciences(18th Ed.Mack PrintingCompany,1990)。可以制备持续释放的制剂。合适的持续释放制剂的例子包括含多肽的固体疏水性聚合物的半透性基质,基质为成形制品例如膜或微囊剂的形式。在具体的实施方案中,可以通过在组合物中使用吸收延迟剂如例如单硬脂酸铝,明胶或其组合,来产生可注射组合物的延长吸收。
在先前描述的组合物外,抗体或双特异性抗原结合分子还可以配制为贮存(depot)制剂。可以通过植入(例如皮下或肌内)或通过肌内注射来施用此类长效配制剂。如此,例如抗体或双特异性抗原结合分子可以用合适的聚合或疏水性材料(例如作为可接受油中的乳剂)或离子交换树脂配制,或配制为微溶性衍生物,例如微溶性盐。
可以通过常规的混合,溶解,乳化,包囊,包载或冻干过程来制备包含本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的药学组合物。可以以常规方式配制药学组合物,其使用一种或多种有助于将蛋白质加工成可药学使用的制剂的生理学可接受载体,稀释剂,赋形剂或辅助剂。合适的配制剂依赖于选择的施用路径。
可以将抗体或双特异性抗原结合分子以游离酸或碱,中性或盐形式配制成组合物。药学可接受盐是基本保留游离酸或碱的生物学活性的盐。这些包括酸加成盐(acidaddition salt),例如与蛋白质性组合物的游离氨基基团形成的那些,或与无机酸(如例如氢氯酸或磷酸)或与有机酸如乙酸,草酸,酒石酸或扁桃酸形成的。与游离羧基基团形成的盐还可以自无机碱如例如氢氧化钠,钾,铵,钙或铁;或有机碱如异丙胺,三甲胺,组氨酸或普鲁卡因(procaine)衍生。药用盐倾向于比相应的游离碱形式更可溶于水性溶剂和其它质子溶剂中。
治疗方法和组合物
可以将本文中提供的任一种抗体或双特异性抗原结合分子用在治疗方法中。本发明的抗体或双特异性抗原结合分子可用作免疫治疗剂,例如在癌症的治疗中。
对于在治疗方法中的使用,将以与优良医学实践一致的方式配制,给药和施用本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在此背景中考虑的因素包括治疗的特定病症,治疗的特定哺乳动物,个体患者的临床状况,病症的起因,药剂的投递部位,施用方法,施用时间安排以及医学从业人员已知的其它因素。
在一个方面,提供用作药物的本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在别的方面,提供用于治疗疾病的本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在某些实施方案中,提供用于治疗方法的本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在一个实施方案中,本发明提供如本文中描述的抗体或双特异性抗原结合分子,用于治疗有此需要的个体中的疾病。在某些实施方案中,本发明提供抗体或双特异性抗原结合分子,用于治疗患有疾病的个体的方法,方法包括对个体施用治疗有效量的抗体或双特异性抗原结合分子。在某些实施方案中,待治疗的疾病是增殖性病症。在一个具体的实施方案中,疾病是癌症。在某些实施方案中,方法进一步包括对个体施用治疗有效量的至少一种另外的治疗剂,例如抗癌剂(如果待治疗的疾病是癌症的话)。在别的实施方案中,本发明提供如本文中描述的抗体或双特异性抗原结合分子,用于诱导靶细胞,特别是肿瘤细胞的裂解。在某些实施方案中,本发明提供抗体或双特异性抗原结合分子,用于在个体中诱导靶细胞,特别是肿瘤细胞裂解的方法,方法包括对个体施用有效量的抗体或双特异性抗原结合分子以诱导靶细胞的裂解。依照上文任何实施方案的“个体”是哺乳动物,优选是人。
在一个别的方面,本发明提供本发明的抗体或双特异性抗原结合分子在制造或制备药物中的用途。在一个实施方案中,药物用于治疗有此需要的个体中的疾病。在一个别的实施方案中,药物用于治疗疾病的方法,方法包括对患疾病的个体施用治疗有效量的药物。在某些实施方案中,待治疗的疾病是增殖性病症。在一个具体的实施方案中,疾病是癌症。在一个实施方案中,方法进一步包括对个体施用治疗有效量的至少一种另外的治疗剂,例如抗癌剂(如果待治疗的疾病是癌症的话)。在一个别的实施方案中,药物用于诱导靶细胞,特别是肿瘤细胞的裂解。仍在别的实施方案中,药物用于在个体中诱导靶细胞,特别是肿瘤细胞裂解的方法,方法包括对个体施用有效量的药物以诱导靶细胞的裂解。依照上文任何实施方案的“个体”可以是哺乳动物,优选是人。
在一个别的方面,本发明提供用于治疗疾病的方法。在一个实施方案中,方法包括对患有此类疾病的个体施用治疗有效量的本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在一个实施方案中,对所述个体施用组合物,其包含药学可接受的形式的本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在某些实施方案中,待治疗的疾病是增殖性病症。在一个具体的实施方案中,疾病是癌症。在某些实施方案中,方法进一步包括对个体施用治疗有效量的至少一种另外的治疗剂,例如抗癌剂(如果待治疗的疾病是癌症的话)。依照上文任何实施方案的“个体”可以是哺乳动物,优选是人。
在一个别的方面,本发明提供一种用于诱导靶细胞,特别是肿瘤细胞裂解的方法。在一个实施方案中,方法包括在存在T细胞,特别是细胞毒性T细胞的情况下使靶细胞与本发明的抗体或双特异性抗原结合分子接触。在一个别的方面,提供一种用于在个体中诱导靶细胞,特别是肿瘤细胞裂解的方法。在一个此类实施方案中,方法包括对个体施用有效量的抗体或双特异性抗原结合分子以诱导靶细胞裂解。在一个实施方案中,“个体”是人。
在某些实施方案中,待治疗的疾病是增殖性病症,特别是癌症。癌症的非限制性例子包括膀胱癌,脑癌,头和颈癌,胰腺癌,肺癌,乳腺癌,卵巢癌,子宫癌,宫颈癌,子宫内膜癌,食道癌,结肠癌,结肠直肠癌,直肠癌,胃癌,前列腺癌,血液癌,皮肤癌,鳞状细胞癌,骨癌和肾癌。其它可使用本发明的抗体或双特异性抗原结合分子治疗的细胞增殖病症包括但不限于位于下列各项中的新生物:腹部,骨,乳房,消化系统,肝,胰,腹膜,内分泌腺(肾上腺,副甲状腺,垂体,睾丸,卵巢,胸腺,甲状腺),眼,头和颈,神经系统(中枢和外周),淋巴系统,骨盆,皮肤,软组织,脾,胸区,和泌尿生殖系统。还包括癌症前期状况或损伤以及癌症转移。在某些实施方案中,癌症选自由肾癌,膀胱癌,皮肤癌,肺癌,结肠直肠癌,乳腺癌,脑癌,头和颈癌和前列腺癌组成的组。在一个实施方案中,癌症是前列腺癌。熟练技术人员容易地认可在许多情况下,抗体或双特异性抗原结合分子可能不提供治愈而仅可以提供部分益处。在一些实施方案中,具有一些益处的生理学变化也被视为治疗有益的。如此,在一些实施方案中,提供生理学变化的抗体或双特异性抗原结合分子的量被视为“有效量”或“治疗有效量”。需要治疗的受试者,患者或个体通常为哺乳动物,更特定地为人。
在一些实施方案中,对细胞施用有效量的本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。在其它实施方案中,对个体施用治疗有效量的本发明的抗体或双特异性抗原结合分子以治疗疾病。
为了预防或治疗疾病,本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的合适剂量(当单独或与一种或多种其它另外的治疗剂组合使用时)将取决于待治疗的疾病的类型,施用路径,患者的体重,抗体或双特异性抗原结合分子的类型,疾病的严重程度和进程,施用抗体或双特异性抗原结合分子是为了预防还是治疗目的,先前或同时的治疗干预,患者的临床史和对抗体或双特异性抗原结合分子的响应,以及主治医师的判断。负责施用的从业人员将在任何事件中确定组合物中活性成分的浓度和用于个体受试者的合适剂量。本文中涵盖各种给药进度表,包括但不限于在各个时间点的单次或多次施用,推注施用,和脉冲输注。
抗体或双特异性抗原结合分子适宜地在一次或一系列治疗里对患者施用。根据疾病的类型和严重程度,约1μg/kg至15mg/kg(例如0.1mg/kg-10mg/kg)的抗体或双特异性抗原结合分子可以是用于对患者施用的起始候选剂量,不管是例如通过一次或多次分开的施用,还是通过连续输注进行。根据上文提及的因素,一种典型的每日剂量的范围可以从约1μg/kg至100mg/kg或更多。对于在数天或更长时间里的重复施用,根据状况,治疗一般将持续直至发生对疾病症状的期望的抑制。抗体或双特异性抗原结合分子的一种例示性剂量将在约0.005mg/kg至约10mg/kg的范围内。在其它非限制性例子中,剂量还可包括每次施用从约1微克/kg体重,约5微克/kg体重,约10微克/kg体重,约50微克/kg体重,约100微克/kg体重,约200微克/kg体重,约350微克/kg体重,约500微克/kg体重,约1毫克/kg体重,约5毫克/kg体重,约10毫克/kg体重,约50毫克/kg体重,约100毫克/kg体重,约200毫克/kg体重,约350毫克/kg体重,约500毫克/kg体重,至约1000mg/kg体重或更多,以及其中可导出的任何范围。在从本文列出的数量可导出的范围的非限制性例子中,基于上文描述的数目,可以施用约5mg/kg体重至约100mg/kg体重的范围,约5微克/kg体重至约500毫克/kg体重的范围等。如此,可以对患者施用一剂或多剂的约0.5mg/kg,2.0mg/kg,5.0mg/kg或10mg/kg(或其任意组合)。可以间歇地施用此类剂量,例如每周或每3周(例如使得患者接受约2至约20,或例如约6剂的抗体或双特异性抗原结合分子)。可以施用起始较高的加载剂量,继之以一剂或多剂较低剂量。然而,可以使用其它剂量方案。通过常规技术和测定法容易监测此疗法的进展。
本发明的抗体或双特异性抗原结合分子一般将以对于实现意图的目的有效的量使用。对于治疗或预防疾病状况的用途,以治疗有效量施用或应用本发明的抗体或双特异性抗原结合分子,或其药学组合物。治疗有效量的确定完全在本领域技术人员的能力以内,尤其根据本文中提供的详细公开内容。
对于系统性施用,能从体外测定法如细胞培养测定法初步估算出治疗有效剂量。然后可以在动物模型中配制剂量以达到包含如在细胞培养中测定的IC50的循环浓度范围。可以将此类信息用于更准确地确定人中的可用剂量。
使用本领域中公知的技术,还能从体内数据例如动物模型估算出初始剂量。本领域中的普通技术人员能容易地基于动物数据优化对人的施用。
可以分别调整剂量量和时间间隔以提供足以维持治疗效果的抗体或双特异性抗原结合分子的血浆水平。通过注射施用的可用患者剂量的范围为从约0.1至50mg/kg/天,通常约0.5至1mg/kg/天。可以通过每日施用多剂实现治疗有效的血浆水平。可以例如通过HPLC测量血浆中的水平。
在局部施用或选择性摄取的情况中,抗体或双特异性抗原结合分子的有效局部浓度可能与血浆浓度无关。本领域技术人员会能够在无需过度实验的情况下优化治疗有效的局部剂量。
本文中描述的抗体或双特异性抗原结合分子的治疗有效剂量一般将提供治疗益处,而不导致实质性毒性。可以通过在细胞培养物或实验动物中的标准药学规程来测定抗体或双特异性抗原结合分子的毒性和治疗功效。可以使用细胞培养测定法和动物研究来测定LD50(对50%的群体致命的剂量)和ED50(在50%的群体中治疗有效的剂量)。毒性和治疗效果之间的剂量比率为治疗指数,其可以表述为LD50/ED50比。优选展现出较大治疗指数的抗体或双特异性抗原结合分子。在一个实施方案中,依照本发明的抗体或双特异性抗原结合分子展现出高治疗指数。可以将从细胞培养测定法和动物研究获得的数据用来制定适用于人的剂量范围。优选地,剂量处于具有很小或无毒性的循环浓度(包含ED50)的范围内。剂量在此范围内可以随多种因素,例如采用的剂量形式,利用的施用路径,受试者的状况等而变化。鉴于患者的状况,各个内科医生可以选择确切的配制剂,施用路径和剂量(参见例如Fingl等,1975,于:The Pharmacological Basis of Therapeutics,Ch.1,p.1,通过提述完整并入本文)。
用本发明的抗体或双特异性抗原结合分子治疗的患者的主治内科医生将知晓如何及何时终止,中断或调整施用(由于毒性,器官功能障碍等)。相反,如果临床应答不适当(排除毒性),主治内科医生还将知晓如何将治疗调整至更高水平。在感兴趣的病症的管理中的施用剂量的量级将随待治疗的状况的严重程度,施用路径等而变化。可以例如部分地通过标准的预后评估方法来评估状况的严重程度。另外,剂量以及可能的给药频率也将随个体患者的年龄,体重和应答而变化。
其它药剂和治疗
本发明的抗体或双特异性抗原结合分子可以与一种或多种其它药剂在疗法中组合施用。例如,本发明的抗体或双特异性抗原结合分子可以与至少一种另外的治疗剂共施用。术语“治疗剂”涵盖施用以治疗需要此类治疗的个体中的症状或疾病的任何药剂。此类另外的治疗剂可以包含任何适用于所治疗的特定适应征的活性成分,优选地具有不会彼此不利影响的互补活性的那些活性成分。在某些实施方案中,另外的治疗剂是免疫调控剂,细胞抑制剂,细胞粘着的抑制剂,细胞毒剂,细胞凋亡的激活剂,或提高细胞对凋亡诱导剂的敏感性的药剂。在一个具体的实施方案中,另外的治疗剂是抗癌剂,例如微管破坏物,抗代谢物,拓扑异构酶抑制剂,DNA嵌入剂,烷化剂,激素疗法,激酶抑制剂,受体拮抗剂,肿瘤细胞凋亡的激活剂,或抗血管生成剂。
此类其它药剂以对意图目的有效的量适宜地组合存在。此类其它药剂的有效量取决于使用的抗体或双特异性抗原结合分子的量,病症或治疗的类型以及上文讨论的其它因素。抗体或双特异性抗原结合分子一般以与本文中描述的相同的剂量和施用路径,或以本文中描述的剂量的约1至99%,或通过凭经验/临床上确定为合适的任何剂量和任何路径使用。
上文记载的此类组合疗法涵盖组合施用(其中在同一组合物或分开的组合物中包含两种或更多种治疗剂)和分开施用,在该情况中,本发明的抗体或双特异性抗原结合分子的施用可以在施用另外的治疗剂和/或辅助剂之前,同时和/或之后发生。本发明的抗体或双特异性抗原结合分子还可以与放射疗法组合使用。
制品
在本发明的另一个方面,提供含有可用于治疗,预防和/或诊断上文描述的病症的材料的制品。制品包含容器和容器上或与容器联合的标签或包装插页。合适的容器包括例如瓶,管形瓶,注射器,IV溶液袋等。容器可从多种材料如玻璃或塑料形成。容器容纳组合物,其自身或与另一组合物组合对于治疗,预防和/或诊断状况是有效的,并且可以具有无菌的存取口(例如,容器可以是具有由皮下注射针可刺穿的塞子的静脉内溶液袋或管形瓶)。组合物中至少一种活性成分是本发明的抗体或双特异性抗原结合分子。标签或包装插页指示组合物用于治疗选择的状况。此外,制品可以包含(a)其中含有组合物的第一容器,其中组合物包含本发明的抗体或双特异性抗原结合分子;和(b)其中含有组合物的第二容器,其中组合物包含另外的细胞毒性或其它方面治疗剂。本发明的这一实施方案中的制品还可以包含包装插页,其指示组合物可用于治疗特定状况。或者/另外,制品还可以包含第二(或第三)容器,其包含药学可接受缓冲液,如抑菌性注射用水(BWFI),磷酸盐缓冲盐水,林格(Ringer)氏溶液和右旋糖溶液。它可以进一步包含从商业和用户观点看期望的其它材料,包括其它缓冲液,稀释剂,滤器,针,和注射器。
用于诊断和检测的方法和组合物
在某些实施方案中,本文中提供的任何抗STEAP-1抗体可用于检测生物学样品中STEAP-1的存在。在用于本文时,术语“检测”涵盖定量或定性检测。在某些实施方案中,生物学样品包含细胞或组织,诸如前列腺组织。
在一个实施方案中,提供了在诊断或检测方法中使用的抗STEAP-1抗体。在又一方面,提供了检测生物学样品中STEAP-1的存在的方法。在某些实施方案中,方法包括在容许抗STEAP-1抗体结合STEAP-1的条件下使生物学样品与抗STEAP-1抗体接触,如本文中所描述的,并检测是否在抗STEAP-1抗体与STEAP-1之间形成复合物。此类方法可以是体外或体内方法。在一个实施方案中,使用抗STEAP-1抗体来选择适合用抗STEAP-1抗体治疗的受试者,例如其中STEAP-1是用于选择患者的生物标志物。
可使用本发明的抗体来诊断的例示性病症包括癌症,特别是前列腺癌。
在某些实施方案中,提供了经标记的抗STEAP-1抗体。标记物包括但不限于直接检测的标记物或模块(诸如荧光,发色,电子致密,化学发光,和放射性标记物),和例如经由酶反应或分子相互作用间接检测的模块,诸如酶或配体。例示性的标记物包括但不限于放射性同位素32P,14C,125I,3H,和131I,荧光团诸如稀土螯合物或荧光素及其衍生物,罗丹明(rhodamine)及其衍生物,丹酰,伞形酮,萤光素酶,例如萤火虫萤光素酶和细菌萤光素酶(美国专利No.4,737,456),萤光素,2,3-二氢酞嗪二酮,辣根过氧化物酶(HRP),碱性磷酸酶,β-半乳糖苷酶,葡糖淀粉酶,溶菌酶,糖类氧化酶,例如葡萄糖氧化酶,半乳糖氧化酶,和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶,杂环氧化酶诸如尿酸酶和黄嘌呤氧化酶(其与采用过氧化氢氧化染料前体的酶诸如HRP偶联),乳过氧化物酶,或微过氧化物酶,生物素/亲合素,自旋标记物,噬菌体标记物,稳定的自由基,等等。
氨基酸序列
实施例
下面是本发明的方法和组合物的实施例。应当理解,鉴于上文提供的一般性描述,可以实践各种其他实施方案。
实施例1
构建物和工具的生成
重组DNA技术
使用标准方法操作DNA,如Sambrook,J.et al.,Molecular cloning:Alaboratory manual;Cold Spring Harbor Laboratory press,Cold spring Harbor,NewYork,1989中描述的。依照制造商的说明书使用分子生物学试剂。
关于人免疫球蛋白轻和重链的核苷酸序列的一般信息参见:Kabat,E.A.et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th ed.,Public HealthService,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)。
基因合成
在需要的情况下,期望的基因区段使用适宜的模板通过PCR来生成或在GeneartAG(Regensburg,Germany)通过自动化基因合成从合成的寡核苷酸和PCR产物合成。将侧翼为单一限制性内切核酸酶切割位点的基因区段克隆入标准的克隆/测序载体。从经转化的细菌纯化质粒DNA,并通过UV分光术测定浓度。通过DNA测序确认亚克隆的基因片段的DNA序列。基因区段设计为具有合适的限制性位点以允许亚克隆入相应的表达载体。所有构建体均设计为具有编码前导肽的5’端DNA序列,该前导肽在真核细胞中将蛋白质靶向分泌。
DNA测序
通过双链测序来测定DNA序列。
抗STEAP1/抗CD3T细胞双特异性(TCB)抗体的克隆
使用凡多珠单抗的可变域生成多种STEAP1特异性T细胞双特异性(TCB)抗体变体。为了生成相应的表达质粒,使用凡多珠单抗(SEQ ID NO:10和14)或其变体的可变区序列并与在相应的受体哺乳动物表达载体中预先插入的相应的恒定区同框亚克隆。所得分子的示意图在图2中显示。
抗STEAP1/抗CD3T细胞双特异性(TCB)抗体的制备
制备了下述分子,它们的示意图在图2中提供:
A.分子A:2+1IgG CrossFab“倒转的”(CD3结合物在STEAP1结合物的C端),有电荷修饰(CD3结合物中的VH/VL交换,STEAP1结合物中的电荷修饰)(SEQ ID NO:26,27,34和35)
B.分子B:2+1IgG CrossFab“倒转的”(CD3结合物在STEAP1结合物的C端),有电荷修饰(CD3结合物中的VH/VL交换,STEAP1结合物中的电荷修饰;两个STEAP1结合模块中均有D100aE突变)(SEQ ID NO:28,29,34和35)
C.分子C:2+1IgG CrossFab“倒转的”(CD3结合物在STEAP1结合物的C端),有电荷修饰(CD3结合物中的VH/VL交换,STEAP1结合物中的电荷修饰;两个STEAP1结合模块中均有D100bE突变)(SEQ ID NO:30,31,34和35)
D.分子D:2+1IgG CrossFab“倒转的”(CD3结合物在STEAP1结合物的C端),有电荷修饰(CD3结合物中的VH/VL交换,STEAP1结合物中的电荷修饰;两个STEAP1结合模块中均有D100aE/D100bE突变)(SEQ ID NO:32,33,34和35)
上文提到的分子的表达受嵌合MPSV启动子或CMV启动子驱动。聚腺苷酸化受到位于CDS的3’端的合成的polyA信号序列驱动。另外,每种载体含有用于自主复制的EBV OriP序列。
为了生成所有构建物,使用聚乙烯亚胺作为转染试剂用相应表达载体共转染悬浮生长的HEK293-EBNA细胞。因此,为了生成所有“2+1IgG CrossFab”构建物,以1:2:1:1比率(“载体重链(VH-CH1-VL-CH1-CH2-CH3)”:“载体轻链(VL-CL)”:“载体重链(VH-CH1-CH2-CH3)”:“载体轻链(VH-CL)”)共转染相应的表达载体。
在含有6mM L-谷氨酰胺和250mg/L G418的无血清Excell培养基中悬浮培养HEK293EBNA细胞。为了600ml管式转瓶(最大工作体积400mL)中的生成,在转染前24小时接种600x106个HEK293EBNA细胞。在转染前,将细胞以210xg离心5分钟并用预温热的20ml CDCHO培养基替换上清液。在20ml CD CHO培养基中混合表达载体至400μg DNA的最终量。在添加1080μl PEI溶液(2.7μg/ml)后,将培养基漩涡震荡15秒并随后于室温温育10分钟。之后,混合细胞与DNA/PEI溶液,转移至600ml管式转瓶并在具有增湿5%CO2气氛的温箱中于37℃温育3小时。在这个温育步骤后,添加360ml含有6mM L-谷氨酰胺,5g/L Pepsoy,和1.0mMVPA的Excell培养基并将细胞培养24小时。转染后1天,添加7%补料7。培养7天后,收集上清液用于纯化,其通过以3600xg(Sigma 8K离心机)离心20-30分钟,将溶液无菌过滤(0.22μm滤器)并添加叠氮化钠至0.01%w/v的终浓度,并保持于4℃。
自细胞培养物上清纯化所有分子,其通过蛋白A亲和层析,继之以大小排阻层析步骤进行。对于亲和层析,将上清液加载到用25ml 20mM磷酸钠,20mM柠檬酸钠,pH 7.5平衡的HiTrap蛋白A HP柱(CV=5ml,GE Healthcare)上。通过用至少10个柱体积的20mM磷酸钠,20mM柠檬酸钠,pH 7.5清洗来去除未结合的蛋白质。在6个柱体积的20mM柠檬酸钠,100mM氯化钠,100mM甘氨酸,pH 3.0中洗脱靶蛋白。通过添加1/10体积的0.5M磷酸钠pH 8.0来中和蛋白质溶液。对于蛋白A层析后的联机分析,通过还原剂缺失下的SDS-PAGE和考马斯(InstantBlueTM,来自Expedeon)染色来分析单一级分中分子的纯度和分子量。依照制造商的说明书使用预制凝胶系统(4-12%Bis-Tris,Invitrogen,USA)。将靶蛋白的选定级分浓缩并过滤,之后加载到用20mM组氨酸,140mM氯化钠,pH 6.0,0.01%Tween-20平衡的HiLoad Superdex 200柱(GE Healthcare)上。
通过280nm处的光密度(OD)来测定经过纯化的蛋白质样品的蛋白质浓度,其使用基于氨基酸序列计算的摩尔消光系数进行。另外,实施所有分子的质谱术分析以确认它们的身份。
STEAP1表达性CHO-K1细胞系的生成
将编码全长人STEAP1的基因亚克隆入哺乳动物表达载体。使用LipofectamineLTX试剂依照制造商的方案(Invitrogen,#15338100)将质粒转染入CHO-K1(ATCC CRL-9618)细胞。在补充有10%胎牛血清(Gibco,#16140063)和1%GlutaMAX补充物(Gibco;#31331-028)的DMEM/F-12培养基(Gibco,#11320033)中维持稳定转染的STEAP1阳性CHO细胞。转染后2天,将嘌呤霉素(Invivogen;#ant-pr-1)添加至6μg/mL并将细胞培养数代。初步选择后,通过BD FACSAria II细胞分选仪(BD Biosciences)分选具有最高STEAP1细胞表面表达的细胞并培养以建立稳定细胞克隆。在4周的时段里使用凡多珠单抗和PerCP缀合的Fcγ特异性山羊抗人IgG(Jackson ImmunoResearch,#109-126-097)作为二抗通过FACS分析确认表达水平和稳定性。
实施例2
基于凡多珠单抗的序列变体的生成和表征
凡多珠单抗的序列分析
修饰(像天冬酰胺脱酰胺,天冬氨酸异构化,琥珀酰亚胺形成,和色氨酸氧化)是重组抗体的典型降解且能影响体外稳定性和体内生物学功能二者。实施凡多珠单抗CDR序列(SEQ ID NO:1,2,3,7,8和9,依照Kabat)的计算分析以筛选潜在的倾向于天冬氨酸异构化,天冬酰胺脱酰胺或琥珀酰亚胺形成的氨基酸序列样式的存在。而且,对CDR区分析有潜力氧化的色氨酸的存在。如图3中显示的,对凡多珠单抗序列的分析揭示重和轻链二者的可变域的CDR区中的潜在热点。
凡多珠单抗序列的变体(分子B-D)的生成
为了制备具有最小限度异天冬氨酸和琥珀酰亚胺形成和最佳稳定性的抗STEAP1抗体,用经修饰的HCDR3序列生成凡多珠单抗序列的数种变体。特别地,个别地或组合地用谷氨酰胺替换位置100a和100b(Kabat编号方式)处的天冬氨酸残基(SEQ ID NO:4,5和6)并生成所得质粒(SEQ ID NO:28,29,34和35(突变D100aE,分子B);SEQ ID NO:30,31,34和35(突变D100bE,分子C);SEQ ID NO:32-35(突变D100aE/D100bE,分子D))来表达相应的TCB抗体分子。
化学降解测试
为了确认所引入的突变对抗STEAP1抗体消除HCDR3中的预测热点,提高稳定性及防止结合效力丧失,将所有构建物(分子A-D)拆分成两份小样,分别交换缓冲液入20mMHis/HisCl,140mM NaCl,pH 6.0或PBS,pH 7.4,并于40℃(His/NaCl)或37℃(PBS)温育。另外,将对照样品保存于-80℃。于pH 7.4温育反映分子暴露于血浆中的情形并容许得出关于体内分子稳定性的结论。与之对比,具有降低的pH(这里是pH 6)的缓冲剂配制剂更加适合于基于抗体的构建物的长期贮存,而且这些条件下的应力测试预示分子的保质期。
28天的温育时段后,分析样品并比较STEAP1结合模块的结合效力(相对活跃浓度)。通过质谱术和基于细胞的ELISA间接实施这项分析。
通过质谱术对受应力分子A-D的表征
为了鉴定凡多珠单抗及其变体的CDR内预测位置处应力诱导的蛋白质降解,实施分子A-D的质谱术。将80μg参照和受应力蛋白质样品在124.5μl100mM Tris,5.6M盐酸胍,10mM TCEP(三(2-羧基乙基)膦(Pierce Protein Biology Products),pH 6.0中于37℃变性和还原1小时。在0.5mL Zeba旋转脱盐柱(Pierce Protein Biology Products)中缓冲液交换至20mM组氨酸氯化物,0.5mM TCEP,pH 6.0。在140μL的终体积中在添加0.05μg胰蛋白酶(Promega)每μg蛋白质后将蛋白质样品于37℃消化过夜。通过添加7μL 10%甲酸(FA)溶液来停止消化。
将经过消化的样品保存于-80℃直至使用。使用nanoAcquity UPLC(Waters)和Orbitrap Fusion质谱仪(Thermo Fisher Scientific)通过UHPLC-MS/MS实施分析。在5μL中注射约2.4μg经过消化的融合蛋白。使用60μL/min的流速在Acquity BEH300C18柱,1x150mm,1.7μm,(Waters)上通过反相实施层析分离。流动相A和B分别在UPLC级水和乙腈中含有0.1%(v/v)甲酸。使用50℃的柱温度并在90分钟里应用1%至40%流动相B的梯度。以数据依赖性模式使用Orbitrap Fusion。本质的MS设置是:电离(喷射电压:3.6kV,离子转移管:250℃,汽化器:100℃),完整MS(AGC:2x105,分辨率:12x104,m/z范围:300-2000,最大注射时间:100ms);MS/MS(AGC:1x104,最大注射时间:100ms,分离宽度:2Da)。标准化碰撞能量设置为35%。
应用肽作图来量化分子A-D的预测热点(N53(HCDR2),N97(HCDR3),D100a(HCDR3)和W50(LCDR2)(Kabat编号方式))的脱酰胺,异构化和氧化水平。
在包含HCDR3区的肽中,在任一分子A-D中以任一条件没有检测到位置N97处的脱酰胺或琥珀酰亚胺形成(数据未显示)。然而,于pH 6的应力暴露在还包含预测热点天冬氨酸100a的相同HCDR3肽中导致不同水平的天冬氨酸降解。于40℃在His/NaCl pH 6.0中4周后在四种测试的分子的相应胰酶肽中检测到不同水平的琥珀酰亚胺和异天冬氨酸形成(表1)。于pH 6.0的应力暴露后,在分子A中检测到最高总水平。分子B中的D100a→E100a以及分子C中的D100b→E100b突变引入导致琥珀酰亚胺水平显著降低。然而,两种突变的组合(D100aE/D100bE)(分子D)强烈降低琥珀酰亚胺水平至3%,对于这种长时段的应力暴露可忽略的量。而且,在分子D中没有检测到异天冬氨酸。结果指示分子A中的两个天冬氨酸(D100a和D100b)和分子C或B中的任一个天冬氨酸(D100a或D100b)有助于在应力后找到的总琥珀酰亚胺和异天冬氨酸水平。另外,在于pH 7.4的应力暴露后在分子D的HCDR3中根本没有检测到蛋白质降解,确认这种新设计的序列变体的完整性。
表1:HCDR3中的蛋白质降解的相对量化
*突变位置为粗体且标有下划线
对包含STEAP1结合物的重链(HCDR2)中的位置N53的肽的分析揭示于37℃在PBS,pH 7.4中4周后在所有构建物中N53脱酰胺少量增加,而于pH 6没有检测到显著增加(表2)。所有样品的W50(LCDR2)的氧化低于2%(表3)。因此,没有实施关于这些推定热点的分子优化。
表2:位置N53(HCDR2)处的蛋白质降解的相对量化
*预测热点N53的位置为粗体且标有下划线
表3:位置W50(LCDR2)处的蛋白质降解的相对量化
样品 | 胰酶肽* | 氧化产物[%] |
分子A | LLIY<u>W</u>ASTR | 1.7 |
分子B | LLIY<u>W</u>ASTR | 1.2 |
分子C | LLIY<u>W</u>ASTR | 0.7 |
分子D | LLIY<u>W</u>ASTR | 1.0 |
*预测热点W50的位置为粗体且标有下划线
应力后的结合效力使用基于细胞的ELISA的表征
为了量化由于pH 7.4或6.0的1-4周应力引起的结合效力的降低,采用使用稳定表达人STEAP1的CHO-K1细胞的基于细胞的ELISA。为了这种基于细胞的ELISA,96孔板的每个孔接种10,000个细胞并于37℃,5%CO2温育18小时。使用自动化清洗仪(BIOTEK)去除上清液,并将100μl抗体构建物在生长培养基中的稀释系列(10pM至30nM)添加至每个孔。于4℃温育1小时后,清空孔并添加100μl含0.05%戊二醛的PBS,于室温10分钟。用PBS/0.025%Tween20(PBST)清洗4次后,添加100μl在封闭缓冲液(Roche)中1:20000稀释的抗人IgG-HRP(Jackson)并将板于室温(RT)温育1小时。将孔用PBST清洗6次并使用100μl TMB每孔生成信号,10分钟后用50μl 1M HCl停止反应并于450nm测量吸光度。数据(表4)表述为“%结合”,将受应力样品的结合EC50除以未处理样品的结合EC50,乘以100。
鉴于所有测试的TCB抗体均包含两个STEAP1结合模块每个分子并考虑到对STEAP1的单价结合的亲和力在40-60nM的范围中,能想到在这种ELISA中只能检测到具有两个功能性STEAP1结合模块的分子。与之对比,只有一个功能性STEAP1结合模块的分子假设在这种方案中描述的清洗步骤期间被洗掉。因此,具有升高的琥珀酰亚胺水平的分子的结合损失的累积百分比比在HCDR3(分子A-C)中检测到的蛋白质降解要高。
表4:于40℃,pH 6达28天后对STEAP1的蛋白质结合效力的量化
探针 | 相对结合效力(%)(于40℃,pH 6达28天后) |
分子A | 66 |
分子B | 79 |
分子C | 69 |
分子D | 100 |
基于凡多珠单抗的TCB抗体变体(分子A-D)的生化表征
为了表征和比较它们的生物化学和生物物理特性,分析所有具有新抗STEAP-1抗体序列变体的TCB(分子B-D)并与包含凡多珠单抗序列的TCB抗体(分子A)比较。结果在表5中汇总:
疏水相互作用层析(HIC)
如下测定表观疏水性,即将20μg样品注射到用25mM磷酸钠,1.5M硫酸铵,pH 7.0平衡的HIC-Ether-5PW(Tosoh)柱上。用60分钟内0至100%缓冲液B(25mM磷酸钠,pH 7.0)的线性梯度实施洗脱。与具有已知疏水性的蛋白质标准品比较保留时间。
热稳定性
在20mM组氨酸/盐酸组氨酸,140mM NaCl,pH 6.0中以1mg/mL的浓度制备样品,通过穿过0.4μm滤板离心来转移入光学384孔板并覆盖石蜡油。在DynaPro读板仪(Wyatt)上通过动态光散射重复测量流体动力学半径,同时以0.05℃/min的速率将样品自25℃加热至80℃。
FcRn亲和层析
如描述地表达FcRn,纯化并生物素化(Schlothauer et al.,MAbs(2013)5(4),576-86)。为了偶联,将制备的受体添加至链霉亲合素-Sepharose(GEHealthcare)。在柱壳(column housing)中填充所得FcRn-Sepharose基质。以0.5ml/min流速用20mM 2-(N-吗啉)-乙磺酸(MES),140mM NaCl,pH 5.5(洗脱液A)平衡柱。以1:1的体积比用洗脱液A稀释30μg抗体样品并应用于FcRn柱。用5个柱体积的洗脱液A清洗柱,继以用35个柱体积中的20至100%20mM Tris/HCl,140mM NaCl,pH 8.8(洗脱液B)的线性梯度洗脱。于25℃用柱烘箱实施分析。通过于280nm连续测量吸光度来监测洗脱概况。与具有已知亲和力的蛋白质标准品比较停留时间。
肝素亲和层析
如下测定肝素亲和力,将30-50μg样品注射到用50mM Tris,pH 7.4平衡的TSKgel肝素-5PW(Tosoh)柱上。用37分钟内的0至100%缓冲液B(50mM Tris,1M NaCl,pH 7.4)的线性梯度实施洗脱。与具有已知亲和力的蛋白质标准品比较停留时间。
就所有测试的生物物理和生物化学特性而言,在任何测试的具有新的抗STEAP-1抗体序列变体的TCB(分子B-D)和包含凡多珠单抗序列的分子(分子A)之间没有发现显著差异(表5)。所有样品在应力后仅仅显示边缘性的聚集和片段化,支持于pH 6的应力暴露后观察到的活性损失(分子A-C)是由于在HCDR3区中的鉴定的位置处的化学蛋白质降解。
表5:测试的变体的生物物理和生物化学特性
样品 | 热稳定性(℃) | 表观疏水性 | FcRn亲和力 | 肝素亲和力 |
分子A | 58 | 0.10 | 0.61 | 0.85 |
分子B | 58 | 0.16 | 0.69 | 0.85 |
分子C | n.d. | n.d. | n.d. | n.d. |
分子D | 58 | 0.11 | 0.65 | 0.85 |
n.d.:未测定
实施例3
STEAP-1TCB抗体变体的功能表征
由STEAP-1TCB抗体变体诱导的,T细胞介导的肿瘤裂解
在STEAP-1表达性LnCAP细胞上评估由不同STEAP-1TCB抗体变体(分子A-D)介导的T细胞杀伤。使用人外周血单个核细胞(PBMC)作为效应细胞并在与双特异性抗体一起温育24小时和48小时时检测杀伤。用胰蛋白酶/EDTA收获贴壁靶细胞,清洗,并使用平底96孔板以30,000个细胞/孔的密度分配。让细胞静置贴壁过夜。通过自健康人供体获得的肝素化血液的经过富集的淋巴细胞制备物的Histopaque密度离心制备PBMC。用无菌PBS稀释新鲜血液并在Histopaque梯度(Sigma,#H8889)上分层。离心(450xg,30分钟,室温)后,丢弃含有PBMC的界面上方的血浆并将PBMC转移至一个新的Falcon管,随后装填50ml PBS。将混合物离心(400xg,10分钟,室温),丢弃上清液并将PBMC团粒用无菌PBS清洗两次(离心步骤,350xg,10分钟)。对所得PBMC群体自动计数(ViCell)并在含有10%FCS和1%L-丙氨酰基-L-谷氨酰胺(Biochrom,K0302)的RPMI1640培养基中保存于37℃,5%CO2的细胞温箱中直至进一步使用(不超过24小时)。
对于杀伤测定法,以所示浓度(范围为0.01pM至1nM,一式三份)添加抗体。将PBMC添加至靶细胞以获得10:1的最终E:T比。于37℃,5%CO2温育24小时和48小时后通过量化由凋亡/坏死细胞释放入细胞上清液的LDH(LDH检测试剂盒,Roche Applied Science,#11644 793 001)来评估靶细胞杀伤。通过将靶细胞与1%Triton X-100一起温育来实现最大靶细胞裂解(=100%)。最小裂解(=0%)指在没有双特异性构建物的情况下与效应细胞共温育的靶细胞。24小时(图4A)和48小时(图4B)后的结果显示测试的分子相似地诱导T细胞介导的肿瘤裂解,而且分子B-D中STEAP-1结合物的修饰对分子的杀伤效力没有负面影响。
由STEAP-1TCB抗体变体诱导的T细胞激活(Jurkat-NFAT激活测定法)
使用肿瘤抗原阳性靶细胞(LnCAP,22RV1)和Jurkat-NFAT报告细胞(一种具有NFAT启动子的CD3表达性人急性淋巴性白血病报告细胞系;GloResponse Jurkat NFAT-RE-luc2P,Promega#CS176501)的共培养物评估STEAP-1TCB抗体变体在同时结合细胞上的CD3和人STEAP-1后诱导CD3介导的效应细胞激活的能力。在TCB分子同时结合STEAP-1抗原(在靶细胞上表达的)和CD3抗原(在Jurkat-NFAT报告细胞上表达的)后,NFAT启动子被激活并导致活性萤火虫萤光素酶表达。发光信号(在添加萤光素酶底物后获得的)的强度与CD3激活和信号传导的强度成比例。
对于该测定法,收获人肿瘤细胞并使用ViCell测定存活力。在平底白壁96孔板(#655098,greiner bio-one)中分配20,000个细胞/孔并添加稀释的抗体或培养基(用于对照)(2.6pM至200nM的范围)。
随后,收获Jurkat-NFAT报告细胞并使用ViCell评估存活力。在细胞培养基中重悬浮细胞并添加至肿瘤细胞以获得5:1的最终效应对靶(E:T)比和100μl每孔的终体积。将细胞在增湿温箱中于37℃温育6小时。在温育时间结束时,将100μl/孔ONE-Glo溶液(Promega;1:1ONE-Glo和测定培养基体积每孔)添加至孔并在黑暗中于室温温育10分钟。使用WALLACVictor3ELISA读数仪(PerkinElmer2030)检测发光,5秒/孔作为检测时间。
如图5中显示的,所有评价的STEAP-1TCB抗体分子均在STEAP-1表达性LnCAP(图5A)和22Rv1(图5B)细胞上诱导经由CD3的T细胞交联和随后的T细胞激活。在STEAP1阴性CHO-K1细胞上(图5C),观察不到T细胞激活。
STEAP-1TCB抗体变体对STEAP-1和CD3表达性细胞的结合
使用STEAP-1表达性CHO-hSTEAP1细胞(一种经转染以稳定过表达人STEAP-1的自仓鼠卵巢衍生的上皮细胞系)和CD3表达性Jurkat-NFAT报告细胞(Promega#CS176501)测试STEAP-1TCB抗体变体(分子A-D)的结合。
简言之,使用细胞解离缓冲液(Gibco,#13151014)收获贴壁CHO-hSTEAP1细胞,计数,检查存活力并以2x106个细胞/ml在FACS缓冲液(100μl PBS 0.1%BSA)中重悬浮。还收获Jurkat悬浮细胞,计数并检查存活力。将100μl细胞悬浮液(含有0.2x106个细胞)在圆底96孔板中与渐增浓度的STEAP-1TCB抗体(31pM至1000nM)一起于4℃温育30分钟,用冷的含有0.1%BSA的PBS(FACS缓冲液)清洗两次,与1:50预稀释的Alexa Fluor 647缀合的AffiniPure F(ab’)2片段山羊-人IgG Fcγ片段特异性二抗(Jackson Immuno ResearchLab,Alexa Fluor 647#109-606-008,在FACS缓冲液中稀释)一起于4℃再温育另外30分钟并用冷的PBS 0.1%BSA清洗两次。
在100μL 2%含低聚甲醛FACS缓冲液中重悬浮经过染色的细胞并于4℃温育30分钟以固定染色。最终,将细胞于4℃以350xg离心4分钟,丢弃上清液并在200μl FACS缓冲液中重悬浮细胞团粒。使用FACS Canto II(Software FACS Diva)通过FACS分析染色。使用GraphPadPrism6获得结合曲线(图6A,对CHO-hSTEAP1细胞的结合;图6B,对Jurkat细胞的结合)。
如图6中显示的,所有评估的STEAP-1TCB抗体分子均显示浓度依赖性对表达人STEAP-1的人CHO细胞(图6A)和在Jurkat NFAT细胞上表达的人CD3(图6B)的结合,指示分子B-D中STEAP-1结合物的修饰对它们对细胞上的STEAP-1的结合没有负面影响。
***
尽管为了理解清楚的目的已经通过举例说明较为详细地描述了前述发明,但是该描述和实施例不应解释为限制本发明的范围。通过提述明确完整收录本文中引用的所有专利和科学文献的公开内容。
序列表
<110> 豪夫迈·罗氏有限公司(F. Hoffmann-La Roche AG)
<120> 结合STEAP-1的抗体
<130> P34188
<160> 41
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 HCDR1
<400> 1
Ser Asp Tyr Ala Trp Asn
1 5
<210> 2
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 HCDR2
<400> 2
Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 HCDR3 (DD)
<400> 3
Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
1 5 10 15
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 HCDR3 (ED)
<400> 4
Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Glu Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 HCDR3 (DE)
<400> 5
Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Glu Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
1 5 10 15
<210> 6
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 HCDR3 (EE)
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Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Glu Glu Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
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<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 LCDR1
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Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Arg Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu
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Ala
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<213> 人工序列
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<223> STEAP-1 LCDR2
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<213> 人工序列
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<223> STEAP-1 LCDR3
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Gln Gln Tyr Tyr Asn Tyr Pro Arg Thr
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<213> 人工序列
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Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 VH (ED)
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
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Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
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Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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100 105 110
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<213> 人工序列
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<223> STEAP-1 VH (DE)
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Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
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Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
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Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
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Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Glu Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
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Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> STEAP-1 VH (EE)
<400> 13
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
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Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
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<213> 人工序列
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Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Arg
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Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys
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Gly Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser Asn Tyr Ala Asn
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Ala Leu Trp Tyr Ser Asn Leu Trp Val
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<212> PRT
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<220>
<223> CD3 VH
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
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<213> 人工序列
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<223> CD3 VL
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Gln Ala Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly
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Thr Val Thr Leu Thr Cys Gly Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser
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Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Glu Lys Pro Gly Gln Ala Phe Arg Gly
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<212> PRT
<213> 人(Homo sapiens)
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Met Glu Ser Arg Lys Asp Ile Thr Asn Gln Glu Glu Leu Trp Lys Met
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Gly Glu Thr Ser Met Leu Lys Arg Pro Val Leu Leu His Leu His Gln
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Thr Ala His Ala Asp Glu Phe Asp Cys Pro Ser Glu Leu Gln His Thr
50 55 60
Gln Glu Leu Phe Pro Gln Trp His Leu Pro Ile Lys Ile Ala Ala Ile
65 70 75 80
Ile Ala Ser Leu Thr Phe Leu Tyr Thr Leu Leu Arg Glu Val Ile His
85 90 95
Pro Leu Ala Thr Ser His Gln Gln Tyr Phe Tyr Lys Ile Pro Ile Leu
100 105 110
Val Ile Asn Lys Val Leu Pro Met Val Ser Ile Thr Leu Leu Ala Leu
115 120 125
Val Tyr Leu Pro Gly Val Ile Ala Ala Ile Val Gln Leu His Asn Gly
130 135 140
Thr Lys Tyr Lys Lys Phe Pro His Trp Leu Asp Lys Trp Met Leu Thr
145 150 155 160
Arg Lys Gln Phe Gly Leu Leu Ser Phe Phe Phe Ala Val Leu His Ala
165 170 175
Ile Tyr Ser Leu Ser Tyr Pro Met Arg Arg Ser Tyr Arg Tyr Lys Leu
180 185 190
Leu Asn Trp Ala Tyr Gln Gln Val Gln Gln Asn Lys Glu Asp Ala Trp
195 200 205
Ile Glu His Asp Val Trp Arg Met Glu Ile Tyr Val Ser Leu Gly Ile
210 215 220
Val Gly Leu Ala Ile Leu Ala Leu Leu Ala Val Thr Ser Ile Pro Ser
225 230 235 240
Val Ser Asp Ser Leu Thr Trp Arg Glu Phe His Tyr Ile Gln Ser Lys
245 250 255
Leu Gly Ile Val Ser Leu Leu Leu Gly Thr Ile His Ala Leu Ile Phe
260 265 270
Ala Trp Asn Lys Trp Ile Asp Ile Lys Gln Phe Val Trp Tyr Thr Pro
275 280 285
Pro Thr Phe Met Ile Ala Val Phe Leu Pro Ile Val Val Leu Ile Phe
290 295 300
Lys Ser Ile Leu Phe Leu Pro Cys Leu Arg Lys Lys Ile Leu Lys Ile
305 310 315 320
Arg His Gly Trp Glu Asp Val Thr Lys Ile Asn Lys Thr Glu Ile Cys
325 330 335
Ser Gln Leu
<210> 24
<211> 207
<212> PRT
<213> 人(Homo sapiens)
<400> 24
Met Gln Ser Gly Thr His Trp Arg Val Leu Gly Leu Cys Leu Leu Ser
1 5 10 15
Val Gly Val Trp Gly Gln Asp Gly Asn Glu Glu Met Gly Gly Ile Thr
20 25 30
Gln Thr Pro Tyr Lys Val Ser Ile Ser Gly Thr Thr Val Ile Leu Thr
35 40 45
Cys Pro Gln Tyr Pro Gly Ser Glu Ile Leu Trp Gln His Asn Asp Lys
50 55 60
Asn Ile Gly Gly Asp Glu Asp Asp Lys Asn Ile Gly Ser Asp Glu Asp
65 70 75 80
His Leu Ser Leu Lys Glu Phe Ser Glu Leu Glu Gln Ser Gly Tyr Tyr
85 90 95
Val Cys Tyr Pro Arg Gly Ser Lys Pro Glu Asp Ala Asn Phe Tyr Leu
100 105 110
Tyr Leu Arg Ala Arg Val Cys Glu Asn Cys Met Glu Met Asp Val Met
115 120 125
Ser Val Ala Thr Ile Val Ile Val Asp Ile Cys Ile Thr Gly Gly Leu
130 135 140
Leu Leu Leu Val Tyr Tyr Trp Ser Lys Asn Arg Lys Ala Lys Ala Lys
145 150 155 160
Pro Val Thr Arg Gly Ala Gly Ala Gly Gly Arg Gln Arg Gly Gln Asn
165 170 175
Lys Glu Arg Pro Pro Pro Val Pro Asn Pro Asp Tyr Glu Pro Ile Arg
180 185 190
Lys Gly Gln Arg Asp Leu Tyr Ser Gly Leu Asn Gln Arg Arg Ile
195 200 205
<210> 25
<211> 198
<212> PRT
<213> 食蟹猴(Macaca fascicularis)
<400> 25
Met Gln Ser Gly Thr Arg Trp Arg Val Leu Gly Leu Cys Leu Leu Ser
1 5 10 15
Ile Gly Val Trp Gly Gln Asp Gly Asn Glu Glu Met Gly Ser Ile Thr
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Met Glu Gln Ser Gly Tyr Tyr Val Cys Tyr Pro Arg Gly Ser Asn Pro
85 90 95
Glu Asp Ala Ser His His Leu Tyr Leu Lys Ala Arg Val Cys Glu Asn
100 105 110
Cys Met Glu Met Asp Val Met Ala Val Ala Thr Ile Val Ile Val Asp
115 120 125
Ile Cys Ile Thr Leu Gly Leu Leu Leu Leu Val Tyr Tyr Trp Ser Lys
130 135 140
Asn Arg Lys Ala Lys Ala Lys Pro Val Thr Arg Gly Ala Gly Ala Gly
145 150 155 160
Gly Arg Gln Arg Gly Gln Asn Lys Glu Arg Pro Pro Pro Val Pro Asn
165 170 175
Pro Asp Tyr Glu Pro Ile Arg Lys Gly Gln Gln Asp Leu Tyr Ser Gly
180 185 190
Leu Asn Gln Arg Arg Ile
195
<210> 26
<211> 452
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子A (STEAP-1 VH-CH1(EE)-Fc(节, PGLALA))
<400> 26
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120 125
Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly
130 135 140
Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Glu Asp Tyr Phe Pro Glu Pro
145 150 155 160
Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr
165 170 175
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180 185 190
Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn
195 200 205
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210 215 220
Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu
225 230 235 240
Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
245 250 255
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
260 265 270
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
275 280 285
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn
290 295 300
Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
305 310 315 320
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly
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Ser Leu Ser Pro
450
<210> 27
<211> 677
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子A (STEAP-1 VH-CH1(EE)-CD3 VL-CH1-Fc(节, PGLALA))
<400> 27
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120 125
Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly
130 135 140
Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Glu Asp Tyr Phe Pro Glu Pro
145 150 155 160
Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr
165 170 175
Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val
180 185 190
Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn
195 200 205
Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Glu Lys Val Glu Pro
210 215 220
Lys Ser Cys Asp Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ala
225 230 235 240
Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly Thr Val
245 250 255
Thr Leu Thr Cys Gly Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser Asn Tyr
260 265 270
Ala Asn Trp Val Gln Glu Lys Pro Gly Gln Ala Phe Arg Gly Leu Ile
275 280 285
Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly
290 295 300
Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Leu Ser Gly Ala Gln Pro
305 310 315 320
Glu Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser Asn Leu Trp
325 330 335
Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Ser Ser Ala Ser Thr
340 345 350
Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser
355 360 365
Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu
370 375 380
Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His
385 390 395 400
Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser
405 410 415
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420 425 430
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435 440 445
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450 455 460
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485 490 495
Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp
500 505 510
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr
515 520 525
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
530 535 540
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu
545 550 555 560
Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
565 570 575
Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys
580 585 590
Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp
595 600 605
Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
610 615 620
Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser
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Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser
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Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser
660 665 670
Leu Ser Leu Ser Pro
675
<210> 28
<211> 452
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子B (STEAP-1 VH-CH1(EE)-Fc(节, PGLALA))
<400> 28
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Glu Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120 125
Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly
130 135 140
Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Glu Asp Tyr Phe Pro Glu Pro
145 150 155 160
Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr
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Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn
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Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
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435 440 445
Ser Leu Ser Pro
450
<210> 29
<211> 677
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子B (STEAP-1 VH-CH1(EE)-CD3 VL-CH1-Fc(节, PGLALA))
<400> 29
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Glu Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120 125
Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly
130 135 140
Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Glu Asp Tyr Phe Pro Glu Pro
145 150 155 160
Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr
165 170 175
Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val
180 185 190
Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn
195 200 205
Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Glu Lys Val Glu Pro
210 215 220
Lys Ser Cys Asp Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ala
225 230 235 240
Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly Thr Val
245 250 255
Thr Leu Thr Cys Gly Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser Asn Tyr
260 265 270
Ala Asn Trp Val Gln Glu Lys Pro Gly Gln Ala Phe Arg Gly Leu Ile
275 280 285
Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly
290 295 300
Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Leu Ser Gly Ala Gln Pro
305 310 315 320
Glu Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser Asn Leu Trp
325 330 335
Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Ser Ser Ala Ser Thr
340 345 350
Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser
355 360 365
Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu
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Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His
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Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser
405 410 415
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Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu
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Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
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485 490 495
Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp
500 505 510
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr
515 520 525
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
530 535 540
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu
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Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
565 570 575
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580 585 590
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595 600 605
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625 630 635 640
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645 650 655
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660 665 670
Leu Ser Leu Ser Pro
675
<210> 30
<211> 452
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子C (STEAP-1 VH-CH1(EE)-Fc(节, PGLALA))
<400> 30
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
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Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
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Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu
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275 280 285
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290 295 300
Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
305 310 315 320
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly
325 330 335
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu
340 345 350
Pro Gln Val Cys Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn
355 360 365
Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
370 375 380
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
385 390 395 400
Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys
405 410 415
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
420 425 430
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
435 440 445
Ser Leu Ser Pro
450
<210> 31
<211> 677
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子C (STEAP-1 VH-CH1(EE)-CD3 VL-CH1-Fc(节, PGLALA))
<400> 31
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Glu Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120 125
Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly
130 135 140
Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Glu Asp Tyr Phe Pro Glu Pro
145 150 155 160
Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr
165 170 175
Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val
180 185 190
Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn
195 200 205
Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Glu Lys Val Glu Pro
210 215 220
Lys Ser Cys Asp Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ala
225 230 235 240
Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly Thr Val
245 250 255
Thr Leu Thr Cys Gly Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser Asn Tyr
260 265 270
Ala Asn Trp Val Gln Glu Lys Pro Gly Gln Ala Phe Arg Gly Leu Ile
275 280 285
Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly
290 295 300
Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Leu Ser Gly Ala Gln Pro
305 310 315 320
Glu Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser Asn Leu Trp
325 330 335
Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Ser Ser Ala Ser Thr
340 345 350
Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser
355 360 365
Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu
370 375 380
Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His
385 390 395 400
Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser
405 410 415
Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys
420 425 430
Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu
435 440 445
Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro
450 455 460
Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
465 470 475 480
Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val
485 490 495
Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp
500 505 510
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr
515 520 525
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
530 535 540
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu
545 550 555 560
Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
565 570 575
Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys
580 585 590
Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp
595 600 605
Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
610 615 620
Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser
625 630 635 640
Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser
645 650 655
Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser
660 665 670
Leu Ser Leu Ser Pro
675
<210> 32
<211> 452
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子D (STEAP-1 VH-CH1(EE)-Fc(节, PGLALA))
<400> 32
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Glu Glu Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120 125
Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly
130 135 140
Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Glu Asp Tyr Phe Pro Glu Pro
145 150 155 160
Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr
165 170 175
Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val
180 185 190
Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn
195 200 205
Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Glu Lys Val Glu Pro
210 215 220
Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu
225 230 235 240
Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
245 250 255
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
260 265 270
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
275 280 285
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn
290 295 300
Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
305 310 315 320
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly
325 330 335
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu
340 345 350
Pro Gln Val Cys Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn
355 360 365
Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
370 375 380
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
385 390 395 400
Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys
405 410 415
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
420 425 430
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
435 440 445
Ser Leu Ser Pro
450
<210> 33
<211> 677
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子D (STEAP-1 VH-CH1(EE)-CD3 VL-CH1-Fc(节, PGLALA))
<400> 33
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Glu Glu Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120 125
Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly
130 135 140
Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Glu Asp Tyr Phe Pro Glu Pro
145 150 155 160
Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr
165 170 175
Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val
180 185 190
Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn
195 200 205
Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Glu Lys Val Glu Pro
210 215 220
Lys Ser Cys Asp Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ala
225 230 235 240
Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly Thr Val
245 250 255
Thr Leu Thr Cys Gly Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser Asn Tyr
260 265 270
Ala Asn Trp Val Gln Glu Lys Pro Gly Gln Ala Phe Arg Gly Leu Ile
275 280 285
Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly
290 295 300
Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Leu Ser Gly Ala Gln Pro
305 310 315 320
Glu Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser Asn Leu Trp
325 330 335
Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Ser Ser Ala Ser Thr
340 345 350
Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser
355 360 365
Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu
370 375 380
Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His
385 390 395 400
Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser
405 410 415
Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys
420 425 430
Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu
435 440 445
Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro
450 455 460
Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
465 470 475 480
Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val
485 490 495
Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp
500 505 510
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr
515 520 525
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
530 535 540
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu
545 550 555 560
Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
565 570 575
Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys
580 585 590
Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp
595 600 605
Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
610 615 620
Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser
625 630 635 640
Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser
645 650 655
Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser
660 665 670
Leu Ser Leu Ser Pro
675
<210> 34
<211> 220
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子A-D (STEAP-1 VL-CL(RK))
<400> 34
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Arg
20 25 30
Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys
35 40 45
Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln
85 90 95
Tyr Tyr Asn Tyr Pro Arg Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp
115 120 125
Arg Lys Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn
130 135 140
Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu
145 150 155 160
Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp
165 170 175
Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr
180 185 190
Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser
195 200 205
Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215 220
<210> 35
<211> 232
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 分子A-D (CD3 VH-CL)
<400> 35
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Val Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Val
115 120 125
Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys
130 135 140
Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg
145 150 155 160
Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn
165 170 175
Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser
180 185 190
Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys
195 200 205
Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr
210 215 220
Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
225 230
<210> 36
<211> 225
<212> PRT
<213> 人(Homo sapiens)
<400> 36
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro
225
<210> 37
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 接头
<400> 37
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10
<210> 38
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 接头
<400> 38
Asp Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10
<210> 39
<211> 107
<212> PRT
<213> 人(Homo sapiens)
<400> 39
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
1 5 10 15
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
20 25 30
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
35 40 45
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
50 55 60
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
65 70 75 80
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
85 90 95
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
100 105
<210> 40
<211> 105
<212> PRT
<213> 人(Homo sapiens)
<400> 40
Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser Glu
1 5 10 15
Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp Phe
20 25 30
Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro Val
35 40 45
Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn Lys
50 55 60
Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys Ser
65 70 75 80
His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val Glu
85 90 95
Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 41
<211> 328
<212> PRT
<213> 人(Homo sapiens)
<400> 41
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu
225 230 235 240
Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
Claims (37)
1.一种结合STEAP-1的抗体,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ IDNO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL)。
2.权利要求1的抗体,其中该VH包含与选自SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且该VL包含与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。
3.权利要求1或2的抗体,其中该抗体是IgG,特别是IgG1抗体。
4.权利要求1至3中任一项的的抗体,其中该抗体是全长抗体。
5.权利要求1至3中任一项的的抗体,其中该抗体是选自Fv分子,scFv分子,Fab分子,和F(ab')2分子的组的抗体片段。
6.权利要求1至5中任一项的的抗体,其中该抗体是多特异性抗体。
7.一种双特异性抗原结合分子,其包含
(a)结合第一抗原的第一抗原结合模块,
其中该第一抗原是STEAP-1且该第一抗原结合模块包含包含SEQ ID NO:1的重链互补决定区(HCDR)1,SEQ ID NO:2的HCDR 2,和选自由SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成的组的HCDR 3的重链可变区(VH),和包含SEQ ID NO:7的轻链互补决定区(LCDR)1,SEQ ID NO:8的LCDR 2和SEQ ID NO:9的LCDR 3的轻链可变区(VL),和
(b)特异性结合第二抗原的第二抗原结合模块。
8.权利要求7的双特异性抗原结合分子,其中该第一抗原结合模块的VH包含与选自SEQID NO:11,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13的组的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且该第一抗原结合模块的VL包含与SEQ ID NO:14的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。
9.权利要求8的双特异性抗原结合分子,其中该第二抗原是CD3,特别是CD3ε。
10.权利要求9的双特异性抗原结合分子,其中该第二抗原结合模块包含包含SEQ IDNO:15的HCDR 1,SEQ ID NO:16的HCDR 2,和SEQ ID NO:17的HCDR 3的VH,和包含SEQ IDNO:18的LCDR 1,SEQ ID NO:19的LCDR 2和SEQ ID NO:20的LCDR 3的VL。
11.权利要求10的双特异性抗原结合分子,其中该第二抗原结合模块的VH包含与SEQID NO:21的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列,且该第二抗原结合模块的VL包含与SEQ ID NO:22的氨基酸序列至少约95%,96%,97%,98%,99%或100%同一的氨基酸序列。
12.权利要求7至11中任一项的双特异性抗原结合分子,其中该第一和/或该第二抗原结合模块是Fab分子。
13.权利要求7至12中任一项的双特异性抗原结合分子,其中该第二抗原结合模块是Fab分子,其中Fab轻链和Fab重链的可变域VL和VH或恒定域CL和CH1,特别是可变域VL和VH是彼此替换的。
14.权利要求7至13中任一项的双特异性抗原结合分子,其中该第一抗原结合模块是Fab分子,其中在恒定域中位置124处的氨基酸是用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代的(编号方式依照Kabat)且位置123处的氨基酸是用赖氨酸(K),精氨酸(R)或组氨酸(H)独立替代的(编号方式依照Kabat),且在恒定域CH1中位置147处的氨基酸是用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代的(编号方式依照Kabat EU索引)且位置213处的氨基酸是用谷氨酸(E),或天冬氨酸(D)独立替代的(编号方式依照Kabat EU索引)。
15.权利要求7至14中任一项的双特异性抗原结合分子,其中该第一和该第二抗原结合模块彼此融合,任选经由肽接头。
16.权利要求7至15中任一项的双特异性抗原结合分子,其中该第一和该第二抗原结合模块各自是Fab分子且其中或是(i)该第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第一抗原结合模块的Fab重链的N端,或是(ii)该第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第二抗原结合模块的Fab重链的N端。
17.权利要求7至16中任一项的双特异性抗原结合分子,其包含第三抗原结合模块。
18.权利要求17的双特异性抗原结合分子,其中该第三抗原模块与该第一抗原结合模块相同。
19.权利要求7至18中任一项的双特异性抗原结合分子,其包含由第一和第二亚基构成的Fc域。
20.权利要求19的双特异性抗原结合分子,其中该第一,该第二和,在存在的情况中,该第三抗原结合模块各自是Fab分子;
且其中或是(i)该第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第一抗原结合模块的Fab重链的N端且该第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该Fc域的第一亚基的N端,或是(ii)该第一抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该第二抗原结合模块的Fab重链的N端且该第二抗原结合模块在Fab重链的C端融合至该Fc域的第一亚基的N端;
且其中该第三抗原结合模块,在存在的情况中,在Fab重链的C端融合至该Fc域的第二亚基的N端。
21.权利要求19或20的双特异性抗原结合分子,其中该Fc域是IgG,特别是IgG1 Fc域。
22.权利要求19-21任一项的双特异性抗原结合分子,其中该Fc域是人Fc域。
23.权利要求19至22中任一项的双特异性抗原结合分子,其中该Fc域的第一亚基的CH3域中的一个氨基酸残基用具有更大侧链体积的氨基酸残基替换,由此在第一亚基的CH3域内生成隆起,该隆起可安置于第二亚基的CH3域内的空腔中,且该Fc域的第二亚基的CH3域中的一个氨基酸残基用具有更小侧链体积的氨基酸残基替换,由此在第二亚基的CH3域内生成空腔,该空腔内可安置第一亚基的CH3域内的隆起。
24.权利要求19至22中任一项的双特异性抗原结合分子,其中该Fc域包含一处或多处降低对Fc受体的结合和/或效应器功能的氨基酸替代。
25.一种或多种分离的多核苷酸,其编码权利要求1-24任一项的抗体或双特异性抗原结合分子。
26.一种或多种载体,特别是表达载体,其包含权利要求25的多核苷酸。
27.一种宿主细胞,其包含权利要求25的多核苷酸或权利要求26的载体。
28.一种生成结合STEAP-1的抗体的方法,其包含下述步骤:
a)在适合于表达该抗体的条件下培养权利要求27的宿主细胞,并
b)任选回收该抗体。
29.一种结合STEAP-1的抗体,其通过权利要求28的方法生成。
30.一种药学组合物,其包含权利要求1-24或29任一项的抗体或双特异性抗原结合分子和药学可接受载剂。
31.权利要求1-24或29任一项的抗体或双特异性抗原结合分子或权利要求30的药学组合物,其用作药物。
32.权利要求1-24或29任一项的抗体或双特异性抗原结合分子或权利要求30的药学组合物,其用于治疗疾病。
33.权利要求32的抗体,双特异性抗原结合分子或药学组合物,其中该疾病是癌症。
34.权利要求1-24或29任一项的抗体或双特异性抗原结合分子制造用于治疗疾病的药物的用途。
35.一种治疗个体中的疾病的方法,其包含对所述个体施用治疗有效量的组合物,该组合物包含药学可接受形式的权利要求1-24或29任一项的抗体或双特异性抗原结合分子。
36.权利要求34的用途或权利要求35的方法,其中所述疾病是癌症。
37.如说明书所述的发明。
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