SK4272001A3 - Methods for therapeutic vaccination - Google Patents

Methods for therapeutic vaccination Download PDF

Info

Publication number
SK4272001A3
SK4272001A3 SK427-2001A SK4272001A SK4272001A3 SK 4272001 A3 SK4272001 A3 SK 4272001A3 SK 4272001 A SK4272001 A SK 4272001A SK 4272001 A3 SK4272001 A3 SK 4272001A3
Authority
SK
Slovakia
Prior art keywords
cell
epitope
analog
polypeptide antigen
antigen
Prior art date
Application number
SK427-2001A
Other languages
English (en)
Inventor
Lucilla Steinaa
Soren Mouritsen
Anand Gautam
Iben Dalum
Jesper Haaning
Dana Leach
Klaus Gregorius Nielsen
Gunilla Karlsson
Peter Birk Rasmussen
Original Assignee
Pharmexa As
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=26065489&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=SK4272001(A3) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Pharmexa As filed Critical Pharmexa As
Publication of SK4272001A3 publication Critical patent/SK4272001A3/sk

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • C07K16/3069Reproductive system, e.g. ovaria, uterus, testes, prostate
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4615Dendritic cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/462Cellular immunotherapy characterized by the effect or the function of the cells
    • A61K39/4622Antigen presenting cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464402Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K39/464403Receptors for growth factors
    • A61K39/464406Her-2/neu/ErbB2, Her-3/ErbB3 or Her 4/ ErbB4
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P15/00Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/50Fibroblast growth factors [FGF]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70539MHC-molecules, e.g. HLA-molecules
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/71Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for growth factors; for growth regulators
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/34Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2799/00Uses of viruses
    • C12N2799/02Uses of viruses as vector
    • C12N2799/021Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Description

Imunogénna kompozícia a spôsob selekcie imunogénneho analógu
Oblasť techniky
Predkladaný vynález sa týka nových spôsobov boja proti chorobám, napríklad rakovine, pre ktoré je charakteristická prítomnosť produktov bunkovej génovej expresie, ktoré nevyvolávajú žiadnu alebo len slabú imunitnú reakciu. Predovšetkým sa vynález týka spôsobov indukovania imunitnej odpovedi organizmu riadenej cytotoxickými T-lymfocytmi (CTL), pomocou ktorej sú bunky nesúce epitopy z produktov génovej expresie napadané a hubené CT lýmfocytmi. Vynález sa tiež týka spôsobu prípravy imunogénnych modifikovaných polypeptídových antigénov, ktoré sú odvodené zo slabých imunogénnych antigénov.
Vynález sa ďalej týka sérií aplikácií technológie autovakcinácie (Applicants AutoVac technology, ktorá je predmetom patentu WO 95/05849) V oblasti terapeutickej vakcinácie proti rakovine.
Doterajší stav techniky
Myšlienka uskutočniť očkovanie proti rakovine je stará viac než sto rokov a v priebehu celého tohoto obdobia, zvlášť od konca dvadsiateho storočia, sa jej venuje opakovane až výbušná aktivita.
Behom posledných 10 rokov však došlo k výraznému rozvoju porozumenia základným molekulovým mechanizmom imunitnej odozvy. Medzi najdôležitejšie medzníky tohoto obdobia patria objavy stále sa rozširujúceho zoznamu cytokínov a rastových faktorov, pochopenie mechanizmu interakcie medzi T a B bunkami, ako aj určenie ciest spracovávania bunkového antigénu, vrátane úlohy a štruktúry molekúl MHC triedy I a II pri prezentácii antigénu. Dôležitým objavom v oblasti nádorovej imunológie, aj keď dodnes nie celkom pochopeným, bolo vysvetlenie mechanizmov tvoriacich základ indukcie imunologickej tolerancie v hostiteľovi. Všetky tieto výskumy vychádzali z obrovského úsilia vyvinúť nové liečebné postupy pre rakovinu.
Podľa toho, ako pacient získava nádorovú imunitu, sa režim imunoterapie delí na pasívny a aktívny. Pri pasívnych imunoterapeutických režimoch pacient dostáva imúnitné zložky, napríklad cytokíny, protilátky, cytotoxické T-bunky alebo lymfocytmi aktivované usmrcovacie bunky (LAK). Naproti tomu protokoly pre aktívnu špecifickú imunoterapiu zahrnujú aktívnu indukciu nádorovej imunity vakcináciou nádorovej bunky alebo jej antigénových zložiek. Táto forma liečenia je výhodná, pretože imunita trvá dlhšie.
Pasívne a aktívne nádorové vakcíny sa zameriavali na indukciu buď humorálnej alebo celulárnej imunitnej odozvy. Pre aktívne vakcíny je spoľahlivo určené, že indukcia CD4 pozitívnych T pomocných buniek je potrebná, aby sa sekundárne indukovali buď protilátky alebo cytotoxické CD8 pozitívne T bunky.
Pasívna vakcinácia protilátkami
Od objavu technológie monoklonovej protilátky v polovine sedemdesiatych rokov sa vyvinul celý rad terapeutických monoklonových protilátok namierených proti špecifickému nádoru alebo s ním spojeným antigénom. Monoklonová protilátková terapia však so sebou prináša niekolko vážnych problémov:
- Injekčná aplikácia cudzích látok vyvolá u pacienta imunitnú reakciu na vpichnuté protilátky, ktorá môže viesť ku zníženiu liečebného účinku, rovnako ako aj k vážnym alergickým vedľajším účinkom.
- Monoklonové protilátky sa musia obvykle podávať vo veľkom množstve. To je problém, pretože výrobné ceny monoklonových protilátok sú obrovské.
- Monoklonové protilátky sa musia podávať parenterálne a vzhladom k tomu, že je potrebné relatívne veľké množstvo, pacienti musia byť behom liečby často hospitalizovaný.
- Injekčná aplikácia monoklonových protilátok sa musí opakovať v relatívne krátkom intervale (týždne), aby sa zachoval liečebný účinok.
- Monoklonové protilátky nie sú obvykle schopné aktivovať sekundárne efektorové systémy imunitného systému, napríklad komplement, NK-bunky alebo makrofágy usmrcujúce nádorové bunky.
Posledne menovaná nevýhoda je zvlášť dôležitá pri terapii rakoviny a môže byť významnou príčinou toho, prečo nie je monoklonová protilátková terapia rakoviny v niektorých prípadoch práve úspešná. Takzvané „poľudštené monoklonové protilátky používané v súčasnosti mnohými spoločnosťami sú menej imunogénne, ale bohužiaľ sú aj menej schopné aktivovať sekundárne imunitné efektorové systémy. Naviac sa vyskytli príklady sekundárneho rastu nádorov, ktoré nemali antigén pôvodného nádoru, pretože tieto protilátky rozhodne nie sú z hľadiska pôsobenia na nádorové bunky „neškodnými divákmi, ktorý by neniesli nádorový antigén.
Nízka efektorová schopnosť monoklonových protilátok viedla k vývoju monoklonových protilátok chemicky viazaných na rôzne toxíny a rádioizotopy. Spoločnosť Pharmacia Upjohn AB napríklad vyvinula konjugát medzi nádorovo špecifickou monoklonovou protilátkou a toxínom A Staphylococcus aureus s cieľom aktivovať T bunky v nádore. Medarex Inc. vyvinul bišpecifické monoklonové protilátky obsahujúce nádorovo špecifický fragment Fab, ako aj fragment protilátky špecifický k Fc-receptoru, s cielom aktivovať makrofág hubiaci nádorové bunky. Obidva prípravky sú účinnejšie než samotná monoklonová protilátka, ale sú tiež drahšie a viac imunogénne. Protilátky konjugované na rádioizotopy sú tiež drahé a imunogénne, naviac sa u nich prejavujú iné obecne toxické vedľajšie účinky.
Objavenie technológie monoklonovéj protilátky bolo významným krokom vpred, ktorý umožnil výrobu dobre definovaných molekúl s vysokou väzobnou afinitou. Vzhľadom k tomu, že sú tieto protilátky monoklonové, reagujú len s jedným typom epitopu na nádorovom antigéne. To je hlavná príčina, prečo nie sú obvykle schopné aktivovať systém komplementu alebo sa viazať na Fc-receptory NK-buniek a makrofágov. Tieto velmi mocné systémy efektorov obvykle vyžadujú spoločné umiestenie rozmanitých fragmentov Fc protilátok vystupujúcich z antigénu.
Iný výskumný pracovníci sa pokúsili použiť kombináciu dvoch monoklonových protilátok, čo viedlo ku zlepšeniu účinnosti postupu. Miesto napadania nádorových buniek vysoko špecifickými polyklonovými protilátkami sa však zdá oveľa rozumnejšie sa zamerať na vlastné zvláštnosti nádoru alebo na nádorové antigény (so zvýšenou expresiou) alebo na receptory rastového faktoru. Takéto protilátky by boli schopné naplno aktivovať už zmienené sekundárne efektorové systémy. Okrem toho je pravdepodobné, že lokálna zápalová reakcia indukovaná týmito efektorovými systémami môže viesť 1 k sekundárnym účinkom na bunkách („neškodných divákoch), expresiu príslušného nádorového antigénu, k aktivácii nádorovo špecifických TIL (nádor prestupujúcich lymfocytov) v nádorovom tkanive. Takéto účinky zaznamenali u Medarex Inc. pri použití svojich bi-špecifických konjugátov monoklonových protilátok.
ktoré nemajú rovnako ako
Od objavu technológie monoklonovej protilátky sa potencionálne využitie polyklonových protilátok k liečbe rakoviny príliš nerozvíjalo (s výnimkou nižšie opísaných antigénov). Jedným z hlavných dôvodov je, že dobre definované nádorové špecifiky alebo s nádorom spojené povrchové antigény boli charakterizovane až v posledných rokoch, ale hlavne u mnohých z nich sa ukázalo, že sú vlastnými antigénmi, a preto sú neimunogénne. Preto by sa mali xenogénne polyklonové protilátky nevyhnutne používať pre štúdium týchto účinkov. Avšak takéto protilátky indukujú silnú imunitnú odozvu proti injektovaným cudzím polyklonovým protilátkam, ktorá rýchlo odstraňuje terapeutické účinky.
Aktívna vakcinácia pre indukciu protilátok
Nedávne pokusy indukovať terapeutické polyklonové protilátky aktívnou vakcináciou pacientov s rakovinou boli úspešné. Boli vyvinuté vakcíny proti vlastným uhľovodíkovým antigénom viazaným na membráne (napríklad cez kyslík viazané anomálne exprimované antigény Tn a sTn a gangliové liposacharidy GM2 a GD3). Tieto malé uhľovodíkové štruktúry sú však veľmi slabými antigénmi, preto sa musia použiť konjugáty týchto molekúl s nosičovými molekulami, ako je hemokyanín kliešťov (KHL) alebo ovčie mucíny (obsahujúce Tn a sTn) . U pacientov s melanómom viedla indukcia anti-GM2 protilátok k predĺženiu obdobia bez choroby a celkové prežitie potom dosiahlo minimálne 51 mesiacov. Tiež štúdie fáze II uskutočnené na náhodne vybraných pacientkách s rakovinou prsníka s použitím konjugátu sTn a KLH v adjuvans DETOX-B (BIOMIRA, Inc.) ukázali, že sTn imúnne pacientky mali výrazne dlhší priemerný čas prežitia než kontrolné pacientky. Ďalším príkladom aktívnej indukcie polyklonových protilátok proti rakovine je použitie idiotypickej špecifickej vakcinácie proti B-bunkovým lymfómom, ktoré, akokoľvek slubné, je účinné len proti tomuto typu rakoviny.
Konečne americká spoločnosť Aphton Inc. vyvinula aktívnu konjugovanú vakcínu proti hormónu uvoľňujúcemu gonadotropín (GnRH) a gastrínu. Ukázalo sa, že táto vakcína je schopná regulovať biologickú aktivitu uvedených hormónov, ktoré môžu tiež fungovať ako autokrinné rastové faktory pre určité nádorové bunky. Úspešná II. fáza klinických skúšok sa uskutočňovala na pacientoch s gastrointestinálnou rakovinou a III. fáza klinických skúšok prebieha.
Cytotoxické T-bunky
Niekolko skupín jasne demonštrovalo, že nádorovo špecifické cytotoxické T bunky (CTL*) sú prítomné v mnohých nádoroch. Tieto CT lymfocyty sa nazývajú nádor prestupujúce lymfocyty (TIL). Avšak tieto bunky prejavujú akúsi necitlivosť alebo sú anergické pri niektorých odlišných možných mechanizmoch, vrátane sekrécie imunosupresívnych cytokínov nádorovými bunkami, nedostatku spolustimulujúcich signálov, zníženia (down-regulation) počtu molekúl MHC triedy I atd.
Uskutočnilo sa veľa pokusov izolovať nádorovo špecifické peptidy viazané HLA triedy I rozpoznané TIL lymfocytmi, a niektoré z nich boli úspešné (napr. peptidy z melanómových antigénov). Takéto peptidy sa používajú k indukcii
I nádorovo špecifickej imunitnej odozvy v tele hostiteľa, ale praktické využitie nádorovo špecifických peptidov vo vakcínach sa obmedzuje na ohraničenú časť populácie, vzhľadom k tomu, že HLA triedy I sú z hľadiska väzby peptidov úzko špecifické. Naviac je obvykle relatívne obtiažne vyvolať CTL odozvu in vivo použitím syntetických peptidov, pretože tieto látky majú malý biologický polčas, ako aj kvôli ťažkostiam s exogénnou iniciáciou molekúl MHC triedy I.
Rad iných prístupov sa zameral na vyvolanie nádorovo špecifickej imunitnej odozvy CTL, vrátane použitia cytokínov (napr. IL-2, IFN-γ, IL-6, IL-4, IL-10 alebo GM-CSF) alebo spolustimulujúcich molekúl (B7), či už v rozpustnej forme alebo expresiou transfektovanej nádorovej bunky. S rôznym úspechom sa ďalej použila imunizácia celými alogénnymi alebo autológnymi bunkami alebo nádorovými antigénmi pripravenými vo špeciálnych adjuvans určenými pre prezentáciu antigénu spôsobom prezentácie antigénu cez MHC triedy I alebo nádorovými antigénmi exprimovanými v napr. vektoroch kiahní atd. Medzi nádorovými imunológmi preto stále prevláda presvedčenie, že jedna z najlepších ciest eliminácie nádorov je vyvolať silnú špecifickú proti nádorovú odozvu CTL.
Odhliadnuc od toho, že tieto liečby sú obvykle velmi drahé a obtiažne reprodukovateľné, ukazuje sa tiež, že je ťažké získať dobrú imunitnú odozvu proti nádoru, pretože mnohé nádorové antigény sú pravé vlastné proteíny, voči ktorým sa zdá byť väčšina T buniek tolerantná. Zdá sa preto nevyhnutné indukovať v pacientovi riadený bunkový autoimunitný stav.
Podstata vynálezu
Predmetom predkladaného vynálezu je poskytnutie vylepšených spôsobov a činidiel pre indukciu imunitných reakcií v organizme hostitela proti nežiadúcim antigénom, napr. nádorovým antigénom. Ďalej je predmetom vynálezu spôsob prípravy polypeptidových analógov takýchto nežiaducich antigénov, analógov, ktoré sú schopné indukovať účinnú imunitnú odozvu práve proti nežiadúcemu antigénu.
Súhrn
Antigény sa do istej miery dogmaticky predstavujú dvomi úplne oddelenými cestami: exogénnou (trieda II) a endogénnou (trieda I) .
Stručne povedané, cudzí proteín z vonkajšieho priestoru bunky alebo z bunkovej membrány sa absorbuje na APC ako endozóme, ktorý fúzuje s intracelulárnym kompartmentom, ktorý obsahuje proteolytické enzýmy a molekuly MHC triedy II. Niektoré z produkovaných peptidov sa viažu k triede II, ktoré sa potom premiestnia do bunkovej membrány.
Pre endogénnu cestu triedy I je charakteristická prevaha prezentácie cytosolických proteínov. Predpokladá sa, že dochádza k štiepaniu sprostredkovanému proteázou a následnému transportu peptidov do endoplazmatického retikula (ER) prostredníctvom molekúl TAP umiestnených v membráne ER. V ER sa peptidy viažu k triede I a následne sa transportujú do plazmatickej membrány.
Tieto dve cesty však nie sú úplne odlišné. Napríklad je známe, že dendritické bunky, a do určitej miery makrofágy, sú schopné endocytózy (pinocytózy) extracelulárnych proteínov a následne ich prezentovať v kontexte s MHC triedy I. Skôr sa tiež ukázalo, že použitím špecifických spôsobov podania, napríklad spojením s peletkami oxidu železitého, sú exogénne antigény schopné postupovať cestou triedy I (Rock, 1996). Tento mechanizmus sa zdá byť ústredný vzhladom k dôležitosti sprievodnej expresie tak triedy I ako aj triedy II na rovnakej APC na vyvolanie klastra troch bunkových typov. Interakcie tohoto klastra troch bunkových typov navrhol Mitchison (1987) a pozdnejšie iný autori. Ukázali dôležitosť súbežnej prezentácie epitopov triedy I a triedy II na tej istej APC. Podľa nedávno opísaného mechanizmu aktivácie CTL (porovnaj Lanzavecchia: Náture, 393, 1998, 413; Matzinger:
Náture Med., 5, 1999, 616; Ridge et al.: Náture, 393, 1998,
478; Schoenberger et al.: Náture, 393, 1998, 480; Ossendrop et al. : J. Exp. Med., 187, 1998, 693 a Mackey et al.: J. Immunol., 161, 1998, 2094) sú špecializované APC prezentujúce antigén na MHC triedy II rozpoznané T pomocnými bunkami. Výsledkom je aktivácia ACP (sprostredkovaná interakciou CD40L na T pomocnej .bunke a CD40 na APC). To umožňuje APC priamo stimulovať CT lymfocyty, ktoré sa týmto aktivujú (porovnaj tiež obr. 2).
Už skôr bolo demonštrované, že vloženie cudzej MHC triedy II, ktoré obmedzuje epitop T pomocnej bunky na vlastný antigén, poskytuje antigén schopný indukovať silné odozvy krížovo reagujúcich protilátok zamerané proti nemodifikovanému vlastnému antigénu (porovnaj patent žiadateľa WO 95/05849). Ukázalo sa, že indukcia autoprotilátok je spôsobená pomocou špecifickej T bunky indukovanej vloženým cudzím epitopom.
Dospeli sme však k záveru, že modifikované vlastné antigény by mali byť schopné - pomocou vhodných adjuvans - tiež indukovať silné odozvy CTL proti vlastným epitopom obmedzeným MHC triedy I, a preto sa technológia opísaná v patente WO 95/05849 môže tiež použiť pre uskutočnenie vakcinácie proti intracelulárnym a iným bunkovým antigénom, ktorých epitopy sa prezentujú v kontexte MHC triedy I.
Technológia autovakcinácie opísaná v patente WO 95/05849 má účinok, že pri aplikácii modifikovaného vlastného antigénu na vyvolanie cesty spracovávania antigénu cez MHC triedy II, je poskytnutá pomoc .špecifickej T bunky samoreaktivným B bunkám, (porovnaj obr. 1 a Dalum I. et al.: J. Immunol., 157, 1996, 4796-4804, a tiež Dalum I. et al.: Náture Biotechnol., 17, 1999, 666-669). Bolo ukázané, že potencionálne samoreagujúce B lymfocyty rozoznávajúce vlastné proteíny sú fyziologicky prítomné u normálnych jedincov. K tomu, aby tieto B lymfocyty boli indukované k skutočnej produkcii protilátok, ktoré reagujú s relevantnými vlastnými proteínmi, je však potrebná asistencia T-pomocných lymfocytov produkujúcich cytokín (THbunky alebo TH-lymfocyty). Obyčajne sa táto pomoc neuskutoční, pretože T-lymfocyty obecne nerozoznajú epitopy T-buniek odvodené z vlastných proteínov, keď sú prezentované bunkami prezentujúcimi antigén (APC). Zavedením „cudzieho elementu do vlastného proteínu (to je zavedením imunologický signifikantnej modifikácie) sa však T-bunky rozoznávajúce cudzí prvok aktivujú práve rozpoznaním cudzieho epitopu na APC (sprvu napríklad mononukleárnej bunky). Polyklonové Blymfocyty (prezentujúce T-bunkový epitop) schopné rozpoznať vlastné epitopy na modifikovanom vlastnom proteíne si tiež internalizujú antigén a následne prezentujú jeho epitop alebo jeho epitopy cudzej T-bunky a aktivované T-lymfocyty potom zaistia cytokínovú pomoc týmto samoreaktivným polyklonovým Blymfocytom. Vzhladom k tomu, že protilátky produkované týmito polyklonovými B-lymfocytmi reagujú s rôznymi epitopmi na modifikovanom polypeptide, aj s tými, ktoré sú obsiahnuté v natívnom polypeptide, indukuje sa protilátka krížovo reaktívna s nemodifikovaným vlastným proteínom. Záverom, Tlymfocyty je možné viesť k tomu, aby jednali akoby populácia polyklonových B-lymfocytov rozpoznávala úplne cudzí antigén, aj keď vo skutočnosti len vložený epitop/epitopy je/sú cudzie pre hostiteľa. Tým sa indukujú protilátky schopné krížovej reakcie s nemodifikovanými vlastnými antigénmi.
Ako už bolo povedané,. CTL* lymfocyty tiež vyžadujú pomoc špecifickej T-bunky, ale mechanizmus tohoto procesu nie je dosial objasnený.
Predkladaný vynález vychádza z našej novej teórie, že vlastné proteíny obsahujúce cudzie epitopy MHC triedy II, následkom exogénnej absorpcie, môžu získať prístup k ceste spracovávania antigénu MHC triedy I, napríklad ceste makrofágov a dendritických .búniek. Týmto spôsobom by sa mohla indukovať silná odozva CTL proti subdominantným epitopom vo vlastnom proteíne. Alebo sa môžu aplikovať gény kódujúce modifikované nádorové antigény ako vakcíny nukleových kyselín, ktoré nakoniec tiež vedú k imunitným odozvám sprostredkovaným MHC triedy II, ako aj MHC triedy I.
Nádorové bunky sú velmi slabými bunkami prezentujúcimi antigén v dôsledku nedostatočnej expresie MHC triedy I, nedostatku spolustimulačných molekúl alebo sekrécie imunosupresívnych cytokínov apod. Použitím autovakcinačných prípravkov a vakcinačného protokolu zmieneného vyššie môže byť modifikovaný nádorový antigén prezentovaný molekulami MHC triedy I ako aj MHC triedy II na špecializovaných bunkách prezentujúcich antigén. Spoločná prezentácia subdominantných vlastných epitopov na molekulách MHC triedy I a imunodominantných cudzích epitopov na molekulách MHC triedy II by sprostredkovala priamu cytokínovú pomoc od T-pomocných buniek obmedzených aktivovanými MHC triedy I až po ČT lymfocyty obmedzené MHC triedy II (obr. 2) . Podlá nášho názoru to povedie ku špecifickému narušeniu autotolerancie T-bunky voči nádorovému antigénu, čím sa dosiahne presne to, čo vyžaduje imunoterapia rakoviny.
Záverom je možné povedať, že vakcína pripravená vyššie naznačenou technológiou indukuje odozvu humorälnych autoprotilátok so sekundárnou aktiváciou komplementu a na protilátke závislú bunkovú cytotoxickú aktivitu (ADCC) . Tiež sa očakáva, že sa indukuje odozva cytotoxickéj T-bunky namierená proti napr. nádorovo špecifickému membránovému antigénu.
Predmetom predloženého vynálezu je preto v najširšom a najobecnejšom rámci spôsob indukovania imunitnej reakcie proti polypeptidovému antigénu u živočícha, vrátane človeka, pričom zmienený polypeptidový antigén je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny, spôsob zahrnujúci účinnú simultánnu prezentáciu v imunologický účinnom množstve
1) aspoň jedného CTL epitopu odvodeného z polypeptidového antigénu a/alebo aspoň jedného B-bunkového epitopu odvodeného z bunkového polypeptidového antigénu a
2) aspoň jedného epitopu prvej pomocnej T-bunky (THepitopu), ktorý je pre živočícha cudzí, pomocou buniek prezentujúcich antigén (APC), ktoré sú prítomné v imunologickom systéme živočícha.
Vo špecifickejšom variante nového spôsobu je predmetom vynálezu spôsob zníženia zastúpenia bunkového polypeptidového človeka, pričom zmienený je v živočíchovi slabo pomocou indukcie odozvy antigénu v živočíchovi, vrátane bunkový polypeptidový antigén imunogénny alebo neimunogénny, špecifického cytotoxického T-lymfocytu (CTL) proti bunkám nesúcim bunkový polypeptidový antigén na svojom povrchu alebo skrývajúcim bunkový polypeptidový antigén vo svojom intracelulárnom kompartmente, spôsob zahrnujúci uskutočnenie simultánnej prezentácie
1) aspoň jedného CTL epitopu odvodeného z bunkového polypeptidového antigénu a
2) aspoň jedného epitopu prvého T-pomocného lymfocytu (TH), ktorý je pre živočícha cudzí, v živočíchovi pomocou vhodnej, bunky prezentujúcej antigén (APC) .
Súčasťou predkladaného vynálezu je tiež nová stratégia prípravy imunogénnych činidiel. Táto nová stratégia zahrnuje výber a výrobu analógov slabých bunkových antigénov, kde cieľom je zachovať podstatnú časť známych a predpovedaných CTL epitopov a súčasne zaviesť aspoň jeden cudzí TH epitop.
Predmetom vynálezu sú ďalej určité špecifické imunogénne prípravky založené na známych nádorových antigénoch ako aj zloženie týchto prípravkov.
Konečne, predmetom vynálezu sú fragmenty nukleových kyselín, vektory, transformované bunky a iné nástroje molekulárne biologických postupov pre prípravu analógov nádorových antigénov.
Podrobný opis vynálezu
Definície
Pre objasnenie možností predkladaného vynálezu sa ďalej podrobne definuje a vysvetľuje rad pojmov používaných v predkladanom opise vynálezu a v patentových nárokoch.
„Bunkový polypeptidový antigén znamená v opise vynálezu a v patentových nárokoch polypeptid obmedzený na bunku, ktorá sa akosi vzťahuje k patologickému procesu. Okrem toho bunka prezentuje na svojom povrchu CTL epitopy polypeptidového antigénu viazaného na molekuly MHC triedy I. Bunkové polypeptidové antigény môžu byť preto skutočnými intracelulárnymi antigénmi (a tým sú nedostupné pre humorálnu imunologickú odozvu) alebo antigénmi viazanými na povrch buniek. Bunkový polypeptidový antigén môže byť produktom expresie génu vlastnej bunky, intracelulárneho parazita, vírusu alebo inej bunky. V posledne menovanou prípade je polypeptidový antigén následne spojený s bunkou, ktorá je súčasťou patologického procesu.
Výrazy „T-lymfocyt a „T-bunka sa používajú zameniteľné pre lymfocyty pochádzajúce z týmusu, ktoré odpovedajú za rôzne bunkou sprostredkované imunitné odozvy a tiež za efektorové funkcie, akou je napríklad pomocná aktivita v humorálnej imunitnej odozve. Obdobne sa výrazy „B-lymfocyt a „B-bunka používajú zameniteľné pre lymfocyty produkujúce protilátky.
„Bunka prezentujúca antigén (APC) je bunka, ktorá prezentuje epitopy T-bunkám. Typickými bunkami prezentujúcimi antigén sú makrofágy, dendritické bunky a iné fagocytické a pinocytické bunky. Malo by sa uviesť, že B-bunky tiež fungujú ako APC tým, že prezentujú TH epitopy viazané na molekuly MHC triedy II TH bunkám, ale keď sa obecne vo špecifikácii a v patentových nárokoch používa výraz APC, znamená to vyššie uvedené fagocytické a pinocytické bunky.
„Pomocné T-lymfocyty alebo „TH bunky označujú CD4 pozitívne T-bunky, ktoré pomáhajú B-bunkám a cytotoxickým Tbunkám rozpoznať TH epitopy viazané na molekuly MHC triedy II na bunkách prezentujúcim antigén.
Výraz „cytotoxický T-lymfocyt (CTL) sa použije pre CD8 pozitívne T-bunky, ktoré vyžadujú k aktivácii asistenciu TH buniek.
„Špecifická imunitná odozva označuje v predkladanom kontexte polyklonovú imunitnú odozvu prevážne zameranú proti molekule alebo skupine kváziidentických molekúl alebo alternatívne proti bunkám prezentujúcim CTL epitopy molekuly alebo skupiny kváziidentických molekúl.
„Slabo imunogénny alebo neimunogénny polypetidový antigén sa tu používa na označenie polypeptidov, ktoré majú aminokyselinovú sekvenciu slabých bunkových proteínových antigénov odvodených z príslušného živočícha (napr. človeka), ale tento výraz tiež zahŕňa polypeptidy s identickou aminokyselinovou sekvenciu ako majú analógy takýchto proteínov izolovaných z iných druhov. Pod tento výraz spadajú aj formy polypeptidov, ktoré majú odlišné glykozylačné profily, pretože sa produkujú v heterológnych systémoch (napr. v kvasinkách alebo v iných než cicavčích eukaryotických systémoch expresie alebo dokonca v prokaryotických systémoch). Malo by sa však uviesť, že použitím tohoto výrazu sa r myslí, že diskutovaný polypeptid je obyčajne neimunogénny alebo len slabo imunogénny vo svojej prirodzenej lokalite v tele živočícha, ktorý sa má liečiť.
Výrazom „polypeptid sa v predloženom kontexte označujú tak krátke polypeptidy s 2 až 10 aminokyselinovými zvyškami, oligopeptidy s 11 až 100 aminokyselinovými zvyškami, ako aj polypeptidy s viac ako 100 aminokyselinovými zvyškami. Okrem toho sa tiež pod tento výraz zahrnujú proteíny, t.j. funkčné biomolekuly obsahujúce aspoň jeden polypeptid; keď obsahujú aspoň dva polypeptidy, môžu tvoriť komplexy viazané kovalentne alebo nekovalentne. Polypeptid (polypeptidy) v proteíne je glykozylovaný a/alebo lipidovaný a/alebo obsahuje protetické skupiny.
Výraz „subsekvencia znamená akýkoľvek spojitý úsek aspoň 3 aminokyselín alebo prípadne aspoň troch nukleotidov, odvodených priamo z prírodnej aminokyselinovej sekvencie, resp. sekvencie nukleových kyselín.
Výraz „živočích v predkladanom kontexte obecne označuje živočíšne druhy (predovšetkým cicavcov), napr. Homo sapiens, Canis domesticus atd. a nie jednotlivého živočícha. Výraz však tiež označuje populáciu takýchto živočíšnych druhov, pretože je dôležité, že všetci jednotlivci imunizovaný spôsobom podľa tohto vynálezu prechovávajú u seba v podstate rovnaký slabý bunkový polypeptidový antigén umožňujúci imunizáciu živočíchov rovnakým imunogénom (imunogénmi). Keď sa napríklad vyskytujú genetické varianty polypeptidov v rozdielnych ľudských populáciách, môže byť potrebné použiť pre tieto populácie odlišné imunogény, aby sa podarilo v každej populácii narušiť autotoleranciu voči slabému bunkovému polypeptidovému antigénu.
Výrazom „zníženie (down-regulation) bunkového polypeptidového antigénu sa v tomto dokumente rozumie pokles množstva a/alebo aktivity príslušného antigénu v živom organizme. Zníženie je možné docieliť niekoľkými mechanizmami. Najjednoduchší z nich je prostý zásah do aktívneho miesta väzbou protilátky. Do rámca predloženého vynálezu tiež spadá, že výsledkom väzby protilátky je odstránenie polypeptidu pomocou čistiacich buniek (napr. makrofágov a iných fagocytických buniek), a čo je ešte dôležitejšie, že bunky nesúce alebo skrývajúce antigén sú likvidované živočíšnymi CT lymfocytmi.
Vyjadrenie „uskutočnenie simultánnej prezentácia vhodnou APC znamená, že živočíšny imunitný systém podlieha riadenej imunitnej výzve, výsledkom ktorej je simultánna prezentácia príslušných epitopov pomocou APC. Ako sa ukáže ďalej, takéto vyprovokovanie imunitného systému sa môže uskutočniť mnohými spôsobmi, z ktorých je najdôležitejšia vakcinácia polypeptidom obsahujúcim „farmacíny (t.j. vakcína, ktorá sa podáva pre liečbu alebo na zlepšeniu prebiehajúcej choroby) alebo „farmacínom nukleovej kyseliny. Dôležité je dosiahnuť, aby sa imunitné kompetentné bunky v živočíchovy konfrontovali s APC bunkami, ktoré zobrazujú príslušné epitopy imunologický účinným spôsobom.
Výraz „imunologický účinné množstvo má bežný význam v obore, t.j. množstvo imunogénu schopné indukovať imunitnú odozvu, ktorá významne angažuje patogénnych činiteľov, ktorý sa spoločne s imunogénom podieľajú na imunologických rysoch.
Keď sa použije výraz, že sa slabé bunkové polypeptidové antigény „modifikujú, myslí sa chemická modifikácia toho polypeptidu, ktorý tvorí hlavný reťazec príslušného polypeptidu. Takouto modifikáciu môže byť napr. derivatizácia (napr.
alkylácia) kyselinovej modifikácie kyselinovej určitých sekvencii, zahŕňajú sekvencie.
aminokyselinových zvyškov v aminoako sa však ukáže ďalej, výhodné zmeny primárnej štruktúry aminoKeď sa hovorí o „tolerancii a „autotolerancii, rozumie sa tým, že priemerný jedinec v populácii nezaháji imunitnú odozvu proti polypeptidu, pretože polypeptidy, ktoré sú terčmi spôsobu podía predkladaného vynálezu, sú vlastné proteíny populácie, ktorá má byť vakcinovaná alebo proteíny, ktoré nevyvolávajú účinnú imunitnú odozvu. Nie je však možné vylúčiť, že tu a tam niektorý jednotlivci v živočíšnej populácii môžu byť schopný produkovať protilátky proti natívnemu polypeptidovému antigénu, napr. ako súčasť poruchy autoimunity. V každom prípade, obyčajne bude živočích autotolerantný len voči vlastnému polypeptidovému antigénu, ale nie je možné vylúčiť, že bude tiež tolerantný aj k analógom odvodeným z iných živočíšnych druhov alebo z populácie s rozdielnym fenotypom.
„Cudzí T-bunkový epitop je peptid schopný sa viazať na molekulu MHC a stimulovať T-bunky v živočíšnom druhu. Výhodnými cudzími epitopmi sú „promiskuitné epitopy, t.j. tie epitopy, ktoré sa viažu k prevážnej časti molekúl MHC triedy II v živočíšnom druhu alebo populácii. Týchto promiskuitných epitopov je známy len velmi obmedzený počet a budú detailne diskutované ďalej. K tomu, aby boli imunogény, ktoré sa používajú podía predloženého vynálezu, účinné v čo možná najväčšej časti živočíšnej populácie, môže byť potrebné 1) vložiť niekolko cudzích T-bunkových epitopov do jedného analógu alebo 2) pripraviť niekolko analógov, kde každý z nich má vložený iný promiskuitný epitop. Koncepcia cudzích T-bunkových epitopov zahrnuje aj použitie kryptických
T-bunkových epitopov, t.j. epitopov, ktoré sú odvodené od vlastného proteinu a ktoré sa imunologický prejavujú len vtedy, keď existujú v izolovanej forme a nie ako súčasť príslušného vlastného proteinu.
„Cudzí epitop T pomocného lymfocytu (cudzí TH epitop) je cudzí T bunkový epitop, ktorý sa viaže na molekulu MHC triedy II a môže byť prezentovaný na povrchu bunky prezentujúcej antigén (APC) vzťahujúcej sa k molekule MHC triedy II.
„CTL epitop je peptid schopný sa viazať na molekulu MHC triedy I.
„Funkčnou časťou (bio)molekuly sa v predloženom kontexte myslí časť molekuly, ktorá je zodpovedná za aspoň jeden biochemický alebo fyziologický účinok molekuly. V obore je dobre známe, že mnoho enzýmov a iných efektorových molekúl obsahuje aktívne miesto, ktoré je zodpovedné za účinky príslušnej molekuly. Ostatné časti molekuly môžu mať stabilizačnú úlohu alebo zvyšujú rozpustnosť, a nemusia sa brať do úvahy, ak táto ich úloha nie je relevantná v kontexte určitého uskutočnenia predloženého vynálezu. Napríklad je možné použiť určité cytokíny ako modifikujúci podiel analógu (porovnaj nižšie uvedenú podrobnú diskusiu) a v tamto prípade je otázka stability nepodstatná, pretože potrebnú stabilitu' poskytuje spojenie s analógom.
Výraz „adjuvans má svoj obvyklý význam v obore vakcinačnej technológie, t.j. ide o látku alebo zmes látok, ktoré 1) nie sú samy o sebe schopné zvyšovať špecifickú imunitnú odozvu proti imunogénu vakcíny, ale ktoré 2) sú však schopné posilovať imunitnú odozvu proti imunogénu. Alebo ináč povedané, vakcinácia samotným adjuvans nemôže vyvolať imunitnú odozvu proti imunogénu, vakcinácia imunogénom môže alebo nemusí vyvolať imunitnú odozvu voči imunogénu, ale kombinovaná vakcinácia imunogénu s adjuvans indukuje imunitnú odozvu proti imunogénu, ktorá je silnejšia než odozva vyvolaná samotným imunogénom.
„Zacielenie molekuly v predloženom kontexte znamená, že sa molekula po zavedení do živočíšneho organizmu prednostne objaví v určitom tkanive (tkanivách) alebo sa prednostne spojí s určitými bunkami alebo typmi buniek. Tento účinok je možné dosiahnuť radom spôsobov, vrátane prípravy molekuly v zmesi, ktorá uľahčuje zacielenie alebo, že sa do molekuly vložia skupiny, ktoré uľahčujú zacielenie. Tieto otázky budú detailne diskutované ďalej.
„Stimulácia imunitného systému znamená, že látka alebo zmes vykazuje všeobecný, nešpecifický imunostimulačný účinok. Rad adjuvans a predpokladaných adjuvans (napr. určité cytokíny) sa podieľa na schopnosti stimulovať imunitný systém. Výsledkom použitia imunostimulačného · činidla je zvýšená „pohotovosť imunitného systému, čo znamená, že súčasná alebo následná imunizácia imunogénom indukuje podstatne účinnejšiu imunologickú odozvu v porovnaní s použitím samotného imunogénu.
Výhodné prípady uskutočnenia
Pre indukciu odozvy CTL proti bunke prezentujúcej na svojom povrchu epitopy odvodené z polypeptidového antigénu je obyčajne potrebné, aby sa aspoň jeden CTL epitop, ak je prítomný, spojil s molekulou MHC triedy I na povrchu APC. Ďalej je výhodné, aby sa aspoň jeden prvý cudzí TH epitop, ak je prítomný, spojil s molekulou MHC triedy II na povrchu APC.
Výhodnými APC bunkami prezentujúcimi epitopy sú dendritické bunky a makrofágy, ale podľa predloženého vynálezu sa dáva prednosť pino- alebo fágocytickým APC, ktoré sú schopné simultánne prezentovať 1) CTL epitopy viazané na molekuly MHC triedy I a 2) TH epitopy viazané na molekuly MHC triedy II.
Podľa predloženého vynálezu je bunkový polypeptidový antigén výhodne vybraný z nádorových antigénov a iných vlastných proteínov, ktoré súvisia s patologickými procesmi, ale tiež z vírusových antigénov a antigénov odvodených z intracelulárnych parazitov alebo baktérie will. V obore je dobre známe, že práve tieto patogénne antigény sú často relatívne slabými imunogénmi (napr. antigény z mykobaktérií, ako Mycobacterium tuberculosis a Mycobacterium leprae, ale tiež z prvokov, napr. Plasmodium spp.) Veríme, že spôsob podľa vynálezu, odhliadnuc od toho, že zavádza možnosť tvorby protilátky a odozvy CTL proti pravým vlastným antigénom, je schopný zvýšiť často nedostatočnú imunitnú odozvu vedenú organizmom proti takýmto intracelulárnym antigénom.
Obyčajne je výhodné konfrontovať imunitný systém s velkou frakciou aminokyselinovej sekvencie polypeptidového antigénu, ktorý je terčom vakcíny. Preto vo výhodnom uskutočnení vynálezu sa prezentácia CTS epitopu a prvého cudzieho TH epitopu pomocou APC uskutočňuje tým, že sa živočíšnemu imunitnému systému prezentuje aspoň jeden prvý analóg bunkového polypeptidového antigénu, pričom tento prvý analóg obsahuje obmenu aminokyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu, pričom tato obmena obsahuje aspoň CTL epitop a prvý cudzí TH epitop. To je v kontraste napr. so stratégiou vakcinácie DNA, kde je expresia CTL a TH epitopov na jednej a tej istej bunke, ale ako častí oddelených polypeptidov; takáto DNA stratégia vakcinácie je tiež predmetom uskutočnenia tohoto vynálezu, ale veríme, že dva epitopy ako súčasť toho istého polypeptidu obvykle zvýšia imunitnú odozvu a že každopádne bude potrebné zaistiť len jeden produkt expresie.
Pre maximalizáciu šancí zahájenia účinnej imunitnej odozvy je výhodné, aby vyššie zmienený prvý analóg obsahoval podstatný podiel známych a predpokladaných CTL epitopov bunkového polypeptidového antigénu, t.j. podiel známych a predpovedaných CTL epitopov, ktoré viažu dostatočné podiely molekúl MHC triedy I zastúpené v populácii. Napríklad je výhodné, keď podstatný podiel známych a predpokladaných CTL epitopov v aminokyselinovéj sekvencií analógu je rozpoznaný aspoň 50-tými percentami MHC-I haplotypmi, ktoré rozpoznávajú všetky známe a predpokladané CTL epitopy v bunkovom polypeptidovom antigéne, ale ešte výhodnejšie je vyššie percento, napríklad aspoň 60, 70, 80 a aspoň 90 %. Zvlášť výhodné je použitie analógov, v ktorých sú prítomné všetky známe CTL epitopy bunkového polypeptidového antigénu, t.j. blízko 100 % známych CTL epitopov. Preto je tiež zvlášť výhodné, keď v podstate všetky predpovedané CTL epitopy bunkového polypeptidového antigénu sú prítomné v aspoň prvom analógu.
Metódy prognózy prítomnosti CTL epitopov sú v obore dobré známe (porovnaj napr. Rothbard et al.: EMBO J., 7 (1988), 93100) .
Ako bude zrejmé z tejto špecifikácie a patentových nárokov, očakáva sa, že tu popisované nové spôsoby umožnia účinnú indukciu odoziev CTL proti bunkovým polypeptidovým antigénom.
V prípadoch čisto intracelulárneho bunkového polypeptidového antigénu je indukcia odoziev CTL proti bunkám skrývajúcim antigén jedinou cestou k dosiahnutiu ich zníženia špecificky imunologickými prostriedkami. V prípade membránových antigénov je však výhodné indukovať odozvu proti slabému bunkovému polypeptidovému antigénu. Keď sa však zvýši humorálna imunitná odozva proti slabému bunkovému antigénu, je výhodné podstatne obmedziť protilátkovú odozvu na interakciu s tými časťami antigénu, ktoré sú obyčajne vystavené možnej interakcii s protilátkami. Ináč by to najskôr viedlo k indukcii protilátkovej odozvy proti častiam antigénu, ktoré obyčajne nezamestnávajú humorálny imunitný systém, ale to opäť zvyšuje riziko zavedenia krížovej reaktivity s antigénmi, ktoré nemajú nič spoločného s žiadnou patológiou. Jednou elegantnou cestou k dosiahnutiu tohto obmedzenia je vakcinácia nukleovou kyselinou s analôgom slabého bunkového antigénu, ktorého extracelulárna časť je buď nezmenená alebo obsahuje TH epitop, ktorý zásadne nemení trojrozmernú štruktúru extracelulárnej časti antigénu. Imunizácia sa môže, ako jedna možná alternatíva, uskutočniť tak s imunogénom adresovaným CTL, ako aj s imunogénom adresovaným B-bunke, pričom imunogén adresovaný B-bunke nie je v podstate schopný ovplyvniť imunizáciu proti intracelulárnej časti terčového antigénu (imunogén adresovaný B-bunke by napríklad nemusel mať žiadnu neextracelulárnu látku z antigénu).
Indukcia odozvy protilátok sa môže dosiahnuť radom spôsobov dobre známych odborníkom v technike. Napríklad aspoň jeden prvý analóg môže obsahovať časť skladajúcu sa z modifikácie štruktúry bunkového polypeptidového antigénu, pričom v dôsledku tejto modifikácie imunizácia živočícha prvým analôgom indukuje v živočíchovy tvorbu protilátok proti bunkovému polypeptidovému antigénu - tento variant je zvlášť vhodný pri vakcinácii nukleovej kyseliny, ako sa uvádza vyššie. Alternatívne môže spôsob podía tohto vynálezu zahrnovať prezentáciu imunitnému systému živočícha imunogenicky účinného množstva aspoň jedného druhého analógu bunkového polypeptidového antigénu, ktorý obsahuje takúto modifikáciu. Vyhovujúci spôsob k dosiahnutiu žiaduceho účinku modifikácie je zahrnutie aspoň jedného druhého cudzieho TH epitopu do druhého analógu, t.j. stratégia podobná tej, ktorá sa použila pre prvý analóg.
V prípadoch, v ktorých je žiaduce tiež zahájiť účinnú humorálnu imunitnú odozvu, je výhodné, keď prvý a/alebo druhý analóg(y) obsahuje podstatný podiel epitopov B-bunky bunkového polypeptidového antigénu, zvlášť podstatný podiel takých epitopov B-bunky, ktoré sú v prirodzenej forme antigénu v príslušnom živočíchovi extracelulárne.
Vyššie diskutované obmeny a modifikácie slabého antigénu bunkového polypeptidu sa môžu vyskytovať v rôznych formách. Je výhodné, keď obmena a/alebo modifikácia zahrnuje substitúciu a/alebo odstránenie a/alebo vloženie a/alebo adíciu aminokyseliny. Tieto základné operácie vzťahujúce sa k manipulácii, s aminokyselinovou sekvenciou by mali pokryť tak zmeny jednotlivých aminokyselín, ako aj operácie zahŕňajúce väčšie úseky aminokyselín (ako je posúvanie amínokyselinových úsekov vnútri polypeptidového antigénu; to je zvlášť zaujímavé, keď antigén je pravý intracelulárny antigén, pretože len úvahy týkajúce sa zachovania CTL epitopov sú relevantné). Pochopíme, že zavedenie jednej samotnej aminokyseliny, napr. vložením alebo odstránením, môže spôsobiť, že sa objaví cudzí TH epitop v sekvencii analógu, t.j. objavenie sa sekvencie, ktorá viaže molekulu MHC triedy II. Väčšinou je však výhodné (a dokonca potrebné) zaviesť známy cudzí TH epitop a takáto operácia bude vyžadovať substitúciu a/alebo vloženie kyseliny (alebo niekedy adíciu formou buď konjugácie k nosnému proteínu alebo fúzie polypeptidu pomocou metód molekulárnej biológie). Je výhodné, aby počet aminokyselinových vložení, odstránení, substitúcií alebo adícií bol najmenej 2, napríklad 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 a 25 vložení, substitúcií, adícií alebo odstránení. Ďalej je výhodné, aby počet aminokyselinových substitúcií nepresahoval 150, napríklad najviac 100, 90, 80 a najviac 70. Zvlášť je výhodné, aby počet substitúcií, vložení, odstránení' alebo adícií nepresahoval 60 a obzvlášť by počet nemal presiahnuť 50 alebo dokonca 40. . Najvýhodnejší je počet, ktorý nepresahuje 30.
Výhodné prípady uskutočnenia vynálezu zahrnujú modifikáciu zavedením prinajmenšom jedného cudzieho imunodominantného TH epitopu. Pochopíme, že otázka imunitnej dominancie epitopu Tbunky závisí na príslušnom živočíšnom druhu. Výraz „imunodominancia, ako je tu požitý, jednoducho označuje epitopy, ktoré u vakcinovaného jedinca alebo populácie spôsobia významnú imunitnú odozvu, ale je dostatočne známe, že epitop T-bunky, ktorý je imunodominantný u jedného jedinca, nie je nutne imunodominantný u iného jedinca toho istého druhu, aj napriek tomu, že v ňom môže byť schopný viazať molekuly MHCII. Ideálne imunodominantné TH epitopy sú tie, ktoré nezávisle na polypeptide, na ktorom vytvárajú subsekvenciu, spôsobia aktiváciu TH buniek - inými slovami, pravým rysom niektorých TH epitopov je to, že v podstate nikdy nie sú skryté, pretože takmer vždy sú spracované bunkami APC a prezentované v kontexte molekuly MHC-II na povrchu APC.
Iným dôležitým bodom je problém MHC reštrikcie epitopov Tbunky. Prirodzene sa vyskytujúce epitopy T-bunky sú obecne obmedzené MHC, t.j. určité peptidy tvoriace epitop T-bunky sa účinne viažu iba k podskupine molekúl MHC triedy II. To má zase ten účinok, že v mnohých prípadoch použitie jedného špecifického epitopu T-bunky poskytne vakcinačnú zložku, ktorá je účinná iba na časť populácie a podía velkosti tejto časti môže byť potrebné začleniť viac T-bunkových epitopov do tej istej molekuly, alebo alternatívne pripraviť multikomponentnú vakcínu, v ktorej sú zložky obmenami antigénu, ktoré sú jedna od druhej odlíšitelné povahou zavádzaného Tbunkového epitopu.
Keď je MHC reštrikcia použitých T-buniek úplne neznáma (napr. pri nedostatočne definovanom zložení MHC u vakcinovaného živočícha), podiel populácie pokrytý zložením špecifickej vakcíny sa môže určiť podľa vzorca n
f popuká i=l kde pi je početnosť jedincov v populácii s odozvou na i-tý cudzí epitop T-bunky prítomný v zložení vakcíny a n je celkový počet cudzích epitopov T-bunky v zložení vakcíny. Potom vakcína, ktorá obsahuje 3 cudzie T-bunkové epitopy a má početnosť odozvy v populácii 0,8, 0,7 a 0,6 dáva
- 0,2 x 0,3 x 0,4 = 0,976
t.j. 97,6 % populácie štatisticky vykáže odozvu na vakcínu sprostredkovanú MHC-II.
Vyššie uvedený vzorec nie je upotrebiteľný v situáciách, kde je viac či menej presne známy profil MHC reštrikcie použitých peptidov. Ak napríklad určitý peptid viaže iba molekuly ludskej MHC-II kódované HLA-DR alelami DRI, DR3, DR5 a DR7, potom sa pri použití tohoto peptidu spoločne s iným peptidom, ktorý viaže zvyšné molekuly MHC-II kódované HLA-DR alelami, dosiahne 100 % pokrytie v danej populácii. Podobne, ak druhý peptid viaže len DR3 a DR5, jeho pridaním sa pokrytie danej populácie vôbec nezvýši. Ak sa výpočet citlivosti populácie založí čisto na MHC reštrikcii epitopov T-bunky vo vakcíne, potom sa podiel populácie pokrytý kompozíciou špecifickej vakcíny určí podía vzorca:
(III) kde cpj je suma početností alelických haplotypov kódujúcich MHC molekuly v populácii, ktoré viažu každý ' jeden z epitopov T-bunky vo vakcíne a ktoré náležia k j-tému z 3 známych HLA miest (DP, DR a DQ) ; v praxi sa najprv určí, ktoré molekuly MHC rozpoznajú každý epitop T-bunky vo vakcíne a potom sa tieto molekuly zaradia podía typu (DP, DR a DQ) následne sa jednotlivé početnosti odlišne zaradených alelických haplotypov sčítajú pre každý typ, čím sa získajú epi, <p2 a φ3.
Môže dôjsť k tomu, že hodnota pi vo vzorci II prevyšuje odpovedajúcu teoretickú hodnotu Πχ:
(IV) kde Vj je suma početností alelického haplotypu kódujúceho MHC molekuly v populácii, ktoré viažu i-tý epitop T-bunky vo vakcíne a ktoré náležia k j-tému z 3 známych HLA miest (DP, DR a DQ) . Znamená to, že u l-m populácie je početnosť respondentov fZbyt*. i = (Pi - Πχ)/(1- πχ) . Vzorec III je potom (V) možné previesť na tvar V:
' n f populácie = 1 Π (1 “ P, )+ 1 “ Π (1 “ ftbytk.i ) ;=i /=1 kde sa výraz 1 - fZbytk. í položí = 0, ak má zápornú hodnotu. Je zrejmé, že vzorec V vyžaduje, aby boli všetky epitopy z hľadiska haplotypu zmapované voči identickým skupinám haplotypov.
Keď sa teda majú vybrané T-bunkové epitopy zaradiť do analógu, je dôležité pracovať so všetkými dostupnými znalosťami o epitopoch: 1) populačná početnosť respondentov pre každý epitop, 2) údaje o MHC reštrikcii a 3) populačná početnosť relevantných haplotypov.
Existuje rad prírodných „promiskuitných T-bunkových epitopov, ktoré sú aktívne u mnohých jedincov nejakého živočíšneho druhu alebo živočíšnej populácie a ich použitie vo vakcíne je výhodné, pretože sa zníži potreba veľkého množstva rôznych analógov v jednej a tej istej vakcíne.
Promiskuitný epitop môže byť podlá vynálezu prírodné sa vyskytujúci ludský T-bunkový epitop, ako sú epitopy z tetanového toxoidu (napr. epitopy P2 a P30), záškrtový toxoid, chrípkový vírus hemaglutinínu (HA) a P. falciparum CS antigén.
V priebehu rokov sa identifikoval rad iných promiskuitných T-bunkových epitopov. Zvlášť peptidy schopné viazať vo velkom rozsahu molekuly HLA-DR kódované rozdielnymi alelami HLA-DR, ktoré všetky predstavujú možné T-bunkové epitopy pre zavedenie do analógov použitých podlá predloženého vynálezu.
Porovnaj tiež epitopy diskutované v nasledujúcich odkazoch, ktoré sú tu všetky zahrnuté ako referencie: WO 98/23635 (Frazer I.H. et al., prihlásený na univerzite v Queenslande) ; Southwood S. et al., J. Immunol. 160 (1998), 33633373; Sinigaglia F. et al., . Náture 336 (1988), 778-780;
Rammensee H.G. et al., Immunogenetics 41:4 (1995), 178-228;
Chicz R.M. et al., J.Exp. Med. 178 (1993), 27-47; Hanuner J. et al., Celí 14 (1993), 197-203; Falk K. et al.,
Immunogenetics 39 (1994), 230-242. Ďalšie odkazy sa zaoberajú tiež HLA-DQ a -DP ligandmi. Všetky epitopy zahrnuté v týchto piatych odkazoch sú relevantné ako kandidáti prírodných epitopov pre použitie v predkladanom vynáleze, pretože sa jedná o epitopy so spoločným námetom.
Alternatívne epitopom môže byť akýkolvek umelý T-bunkový epitop, ktorý je schopný viazať vo veľkom rozsahu haplotypy. V tejto súvislosti peptidy pan DR epitopu („PÄDRE) opísané v patente WO 95/07707 a v odpovedajúcom článku Alexander, J. et al., ' Immunity 1 (1994), 751-761 (obidve práce sú tu zahrnuté ako odkazy) sú zaujímavými kandidátmi na použitie podľa predloženého vynálezu. Za pozornosť stojí, že najúčinnejšie PADRE peptidy objavené v zmienených textoch nesú D-aminokyseliny s C- a N-koncami, aby sa zlepšila stabilita pri podaní. Cieľom predkladaného vynálezu je však predovšetkým začlenenie relevantných epitopov ako častí modifikovaného antigénu, ktorý by sa potom následne mal enzymaticky rozštiepiť vnútri lyzozómového kompartmentu APC, aby umožnil následnú prezentáciu v súvislosti s molekulou MHC-II, a preto nie je výhodné začleňovať D-aminokyseliny k epitopom používaným v tomto vynáleze.
Jedným zvlášť výhodným peptidom PADRE je ten, ktorý má aminokyselinovú sekvenciu ÄKFVAAWTLKAAA alebo jej imunologický účinnú subsekvenciu. Tento a iné epitopy, ktoré rovnako nemajú MHC reštrikciu sú výhodné T-bunkové epitopy, ktoré by mali byť prítomné v analógoch použitých vo spôsoboch podlá tohoto vynálezu. Takéto superpromiskuitné epitopy umožnia najjednoduchšie prípady uskutočnenia vynálezu, kedy sa len jeden samotný analóg prezentuje vakcinovanému živočíšnemu imunitnému systému.
Charakteristika vyššie uvedenej obmeny alebo modifikácie výhodne zahrnuje, že:
- aspoň jeden prvý podiel je zahrnutý do prvého a/alebo druhého analógu/analógov, pričom tento prvý podiel zacieli analóg na bunku prezentujúcu antigén (APC) a/alebo
- aspoň jeden 'druhý podiel je zahrnutý do prvého a/alebo druhého analógu/analógov, pričom tento druhý podiel stimuluje imunitný systém a/alebo
- aspoň jeden tretí podiel je zahrnutý do prvého a/alebo druhého analógu/analógov, pričom tento tretí podiel optimalizuje prezentáciu analógu imunitnému systému.
funkčných a štrukturálnych rysoch týchto prvých, druhých a tretích podielov je možné povedať, že môžu byť prítomné ako postranné skupiny viazané kovalentne alebo nekovalentne k vhodným chemickým skupinám v aminokyselinovej sekvencií bunkového polypeptidového antigénu alebo v jej subsekvencii. Je dôležité, aby úseky aminokyselinových zvyškov odvodené z polypeptidového antigénu boli derivatizované bez zmeny primárnej aminokyselinovej sekvencie alebo pri najmenšom bez zavedenia zmien do peptidových väzieb medzi jednotlivými aminokyselinami v reťazci.
Podiely tiež môžu byť vo forme fúznych partnerov amino31 kyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu. V tejto súvislosti je treba zmieniť, že obidve možnosti zahrnujú možnosť konjugácie aminokyselinovéj sekvencie k nosičovi (porovnaj nižšie uvedenú diskusiu). Inými slovami, v predloženom kontexte výraz „fúzny proteín nie je vyhradený len fúznemu konštruktu pripravenému pomocou expresie DNA fragmentu kódujúceho tento konštrukt, ale tiež konjugátu medzi dvomi proteínmi, ktoré sú spojené pomocou peptidovej väzby v následnej chemickej reakcii.
Ako už bolo povedané, analóg môže tiež zahrnovať zavedenie prvého podielu, ktorý smeruje analóg k APC alebo k Blymfocytu. Napríklad, prvý podiel môže byť špecificky viazaný partner pre B-lymfocytový špecifický povrchový antigén alebo pre APC špecifický povrchový antigén. V technike je známych vela takýchto špecifických povrchových antigénov. Podielom môže byť napríklad uhlovodík, pre ktorý existuje receptor na B-lymfocyte alebo na APC (napr. manán alebo manóza). Inokedy druhým podielom môže byť haptén. Ako prvý podiel sa tiež môže použiť fragment protilátky, ktorá špecificky rozpoznáva povrchové molekuly na APC bunkách alebo lymfocytoch (povrchovou molekulou môže byt napr. FCy receptor makrofágov a monocytov, napríklad FCy RI , alebo inokedy každý iný špecifický povrchový marker, napríklad CD40 alebo CTLA-4). Je dobré si uvedomiť, že všetky tieto príkladné zacielené molekuly sa môžu použiť ako súčasť adjuvans (viď ďalej) . CD40 ligand, protilátky proti CD40 alebo ich varianty, ktoré viažu CD40, smerujú analóg k dendritickým bunkám. Posledné výsledky súčasne ukázali, že interakcia s molekulou CD40 spôsobí, že pre získanie odozvy CTL nie sú TH bunky podstatné. Z toho vyplýva predpoklad, že obecné použitie molekúl, ktoré viažu CD40, ako prvý podiel (alebo ako adjuvans, viď ďalej) podstatne zvýši odozvu CTL; použitie takýchto molekúl viazajúcich CD40 ako adjuvans a ako „prvých podielov vo zmysle predkladaného vynálezu považujeme za pôvodný, úplne nový prínos.
Ako alternatívu alebo doplnok k zacieleniu analógu k určitému typu bunky pre dosiahnutie zvýšenej imunitnej odozvy je možné zvýšiť úroveň citlivosti imunitného systému zahrnutím vyššie zmieneného druhého podielu, ktorý stimuluje imunitný systém. Typickými príkladmi takýchto druhých podielov sú cytokíny, proteíny tepelného šoku a hormóny, vrátane ich účinných zložiek.
Vhodnými cytokínmi pre použitie podlá vynálezu sú tie, ktoré v zložení vakcíny obvykle poslúžia tiež ako adjuvans, napr. interferón y (IFN-γ), Flt3 ligand ,(Flt3L), interleukín 1 (IL-1), interleukín 2 (IL-2), interleukín 4 (IL-4), interleukín 6 (IL-6), interleukín 12 (IL-12), interleukín 13 (IL-13), interleukín 15 (IL-15) a faktor stimulujúci granulocyto.vo-makrofágovú kolóniu (GM-CSF) ; ako druhý podiel ináč stačí aj funkčná časť cytokínovej molekuly. Otázka využitia týchto cytokínov ako adjuvans sa diskutuje ďalej.
Druhým podielom môže byť tiež toxín, ako napríklad listeriolycín (LLO) ,. lipid A a tepelne nestály enterotoxín. Zaujímavé možnosti poskytuje tiež rad mykobakteriálnych derivátov, napríklad MDP (muramyl dipeptid), CFA (úplné Freundové adjuvans) a diestery trihalózy TDM a TDE.
Vhodné proteíny tepelného šoku použité ako druhé podiely podlá tohoto vynálezu môžu byť HSP70, HSP90, HSC70, GRP94 a kalretikulín (CRT).
Dôležitým prípadom uskutočnenia tohoto vynálezu je tiež možnosť zavedenia tretieho podielu, ktorý posiluje prezentáciu analógu imunitnému systému. V technike bolo opísaných niekolko príkladov tohoto princípu. Napríklad sa vie, že lipidačné ukotvenie palmitoylu v proteíne OspA Borrelia burgdorferi sa môže využiť tak, aby poskytlo seba posilujúce polypeptidy (viď napr. WO 96/40718) . Zdá sa, že lipidované proteíny tvoria štruktúry podobné micelám s jadrom skladajúcim sa z lipidačné ukotvených časti polypeptídov a zvyšných časti molekuly z neho vyčnievajúcich, výsledkom čoho sú násobné prezentácie antigénových determinantov. Toto použitie a s ním súvisiace prístupy využívajúce rôzne lipidačné ukotvenia (napr. skupiny myristylu, farnezylu, geranyl-geranylu, N-acyl diglyceridu a GPI ukotvenie) sú preto výhodnými prípadmi uskutočnenia vynálezu, zvlášť preto, že získanie takéhoto lipidačného ukotvenia v rekombinantne pripravovanom proteíne je dosť priamočiare a vyžaduje len napríklad prírodné sa vyskytujúcu signálnu sekvenciu ako fúzneho partnera pre analóg. Inou možnosťou je použitie C3d fragmentu komplementového faktoru C3 alebo samotného C3 (porovnaj Dempsey et al.: Science 271 (1996), 348-350 a Lou a Kohler: Náture Biotechnology 16 (1998), 458-462).
Je dôležité poznamenať, že pri pokuse použiť spôsob podía tohoto vynálezu proti napr. membránovo viazaným polypeptidovým antigénom, ktoré sú vystavené extracelulárnemu kompartmentu, je najvýhodnejšie, aby prvý a/alebo druhý analóg (analógy) mal celkovú terciárnu štruktúru bunkového polypeptidového antigénu. V predkladanom popise a v patentových nárokoch to znamená, že celková terciárna štruktúra tej časti polypeptidového antigénu, ktorá je extracelulárne vystavená sa zachováva, pretože, ako sa uvádza vyššie, terciárna štruktúra obligátnych intracelulárnych polypeptídov neangažuje humorálny imunitný systém. Vo skutočnosti, ako súčasť vakcinačnej stratégie je často žiaduce sa vyhnúť tomu, aby bol extracelulárnemu kompartmentu vystavený predpokladaný B-bunkový epitopu odvodený od intracelulárnej časti polypeptidových antigénov; týmto spôsobom sa minimalizujú potencionálne nepriaznivé účinky spôsobené krížovou reaktivitou s inými antigénmi.
Pre účely predloženého vynálezu je však dostačujúce, keď obmena/modifikácia (či už zaradenie, adícia, odstránenie alebo substitúcia) vedie k vzniku cudzieho T-bunkového epitopu a súčasne zachová podstatný počet CTL epitopov v polypeptidovom antigéne (a niekedy tiež podstatný počet Bbunkových epitopov).
Nasledujúci vzorec opisuje konštrukty obecne pokryté týmto vynálezom:
(MODi) sl ( PAGel) nl (MOD2) s2 (PAGe2) n2........... (MODX) sx (PAGex) nx (I) kde PAGei-PAGex sú x-té GTL a/alebo B-bunkové epitopy obsahujúce sekvencie dôležitého polypeptidového antigénu, ktoré nezávisle môžu a nemusia byť identické a ktoré obsahujú alebo neobsahujú cudzie postranné skupiny, x je celé číslo > 3, nl - nx sú x-té celé čísla > 0 (aspoň jedno > 1), MODi-MODx sú xté modifikácie zaradené medzi zachované epitopy a sl-sx sú xté celé čísla £ 0 (aspoň jedno je >1, keď sa žiadna postranná skupina nezaradí do sekvencií). Vymedzením obecných funkčných obmedzení imunogenity konštruktov vynález pamätá na všetky druhy permutácií pôvodnej antigénovej sekvencie aj na ich všetky modifikácie. Do vynálezu sú takto zahrnuté analógy získané vypustením častí sekvencie polypeptidového antigénu, ktoré napríklad vykazujú nepriaznivé účinky in vivo alebo vypustením častí, ktoré sú obyčajne íntracelulárne, a tak môžu spôsobiť nežiaduce imunologické reakcie (viď detailnú diskusiu ďalej).
Ďalšie rozpracovanie vyššie uvedeného princípu zahrnuje použitia CTL a/alebo B-bunkových epitopov s viac než jedným antigénom súvisiacim s patológiou. Existuje napríklad niekolko antigénov súvisiacich s rakovinou, ktoré prejavujú svoje onkogenické účinky len v mutovanej forme - príkladom sú mutované K-ras a P53, ktoré obidva patria k základným proteínom regulácie normálneho bunkového cyklu a ktoré obidva sú produktmi, expresie v absolútne normálnych bunkách. V niektorých prípadoch sa ukázalo, že CTL rozoznajú mutované peptidy z týchto antigénov. Preto je dôležité, že imunitný systém reaguje len na mutované peptidy a nie na nemutované časti, ak sa ponúka antigénová špecifická imunoterapia.
Navrhli sme stratégiu, pri ktorej sa sekvencie 8-25 aminokyselín proteínov súvisiacich s ochorením môžu použiť ako ďalšie epitopy v konštrukte autovakcíny - vo výhodnom prípade uskutočnenia vložené epitopy súčasne umožňujú vznik TH epitopov v konečnom konštrukte, viď vyššie uvedenú diskusiu. Epitopy použité k tomuto účelu by mali obsahovať mutovanú oblasť proteínu súvisiaceho s ochorením. Použitím takéhoto prístupu by malo byť možné generovať CTL lymfocyty (a eventuálne protilátky, kde je to vhodné) len proti mutovanej forme antigénu súvisiaceho s ochorením. V prípadoch, kedy antigén súvisiaci s ochorením umožňuje tvorbu TH epitopu, použitie skutočne cudzieho TH epitopu sa môže úplne vynechať. Uskutočnením tohto princípu môže byť napr. vakcinácia vakcínou nukleovej' kyseliny, ktorá kódujú analóg polypeptidového antigénu (napr. Her2 alebo PSM), do ktorej sa zaraďuje aspoň jeden TH epitop a aspoň jeden peptid odvodený z iného antigénu súvisiaceho s ochorením (napr.
peptid z mutovanej časti nejakého onkogénneho proteínu). Vo výhodnom uskutočnení sa zavedie aspoň jeden TH epitop, ako dôsledok zavedenia peptidu.
Ďalej je výhodné, keď obmena a/alebo modifikácia obsahuje aplikovateľnú duplicitu, keď je to vhodné, aspoň jedného Bbunkového epitopu alebo aspoň jedného CTL epitopu bunkového polypeptidového antigénu. Výsledkom tejto stratégie je, že sa imunitnému systému prezentujú násobné kópie výhodných epitopických oblastí, a takto maximalizujú pravdepodobnosť účinnej imunitnej odozvy. Toto uskutočnenie vynálezu teda zužitkováva početných prezentácií epitopov odvodených z polypeptidového antigénu (t.j. vzorec I, kde sa aspoň jeden B-bunkový epitop vyskytuje vo dvoch polohách).
Tohoto účinku sa dosiahne radom postupov, napríklad jednoducho prípravou fúznych polypeptidov obsahujúcich štruktúru (PAG) m, kde m je celé číslo > 2, a potom zavedením vyššie diskutovaných modifikácii do aspoň jednej zo sekvencií polypeptidového antigénu.
Alternatívnym uskutočnením vynálezu, ktorého výsledkom je tiež výhodná prezentácia viacerých (napr. aspoň dvoch) kópií dôležitých epitopických oblastí antigénu imunitnému systému, je kovalentné párovanie antigénu, jeho subsekvencie alebo jeho obmien s určitými molekulami. Môžu sa použiť napríklad polyméry, ako uhľovodíky, napr. dextrán (viď Lees A. et al.·. Vaccine 12 (1994), 1160-1166; Lees A. et al. : J. Tmmunol. 145 (1990), 3594-3600), ale tiež manóza a manán sú vhodnými alternatívami. Integrálne membránové proteíny z napr. E. coli a iných baktérii sú tiež užitočnými konjugačnými partnermi. Výhodnými a užitočnými konjugačnými partnermi sú aj tradičné molekuly nosičov, ako kliešťový hemokyanín (KLH), tetanový toxín, záškrtový toxín a hovädzie albumínové sérum (BSA) .
Zachovanie niekedy prospešnej podstatnej časti B-bunkových epitopov alebo dokonca celkovej terciárne štruktúry proteínu, ktorý je predmetom modifikácie, ako sa tu popisuje, je možné dosiahnuť niekoľkými spôsobmi. Jednou z možností je jednoducho pripraviť polyklonové antisérum smerované proti polypeptidovému antigénu (napr. antisérum pripravené v králikovi) a potom ho použiť ako testovací reagent (napr. v konkurenčnej ELISA) proti modifikovaným proteinom, ktoré sa produkujú. Modifikované verzie (analógy), ktoré reagujú s antisérom v rovnakom rozsahu ako polypeptidový antigén, sú považované za tie, ktoré majú zachovanú tú istú celkovú ťerciárnu štruktúru ako polypeptidový antigén, zatiaľ čo analógy vykazujúce obmedzenú (ale stále významnú a špecifickú) reaktivitu s takýmto antisérom sú považované za také, ktoré majú zachovanú podstatnú časť pôvodných Bbunkových epitopov.
Alebo sa môže pripraviť a použiť testovacia tabulka na základe výberu monoklonových protilátok reaktívnych s rozdielnymi epitopmi na polypeptidovom antigéne. Tento postup má výhodu v tom, že umožňuje 1) epitopické mapovanie príslušného polypeptidového antigénu, a 2) mapovanie epitopov, ktoré sa udržujú v pripravených analógoch.
Treťou možnosťou by samozrejme bolo vylúštiť trojrozmernú štruktúru polypeptidového antigénu alebo jeho biologicky aktívnej skrátenej časti (viď vyššie) a toto porovnať s rozriešenou trojrozmernou štruktúrou pripravených analógov. Trojrozmerná štruktúra sa môže určiť štúdiom RTG difrakcií a NMR spektroskopiou. Ďalšie informácie týkajúce sa trojrozmernej štruktúry sa môžu do istej miery získať štúdiom cirkulárneho dichroizmu, ktorého výhodou je potreba len malého množstva čistého polypeptidu (zatiaľ čo RTG difrakcia vyžaduje kryštalický polypeptid a NMR vyžaduje obstaranie izotopových variant polypeptidu) na získanie užitočných informácií o terciárnej štruktúre danej molekuly. Pre získanie rozhodujúcich údajov je však potrebná RTG difrakčná analýza a/alebo NMR spektroskopia, pretože cirkulárny dichroizmus môže poskytnúť len neprime potvrdenie správnej trojrozmernej Štruktúry prostredníctvom informácií o sekundárnych štruktúrnych prvkoch.
V súčasnosti existujú v zásade tri uskutočniteľné spôsoby ako získať prezentáciu relevantných epitopov imunitnému systému: tradičná podjednotková vakcinácia polypeptidovými antigénmi, aplikácia geneticky modifikovanej živej vakcíny a vakcinácia nukleovej kyseliny. Tieto tri možnosti sa diskutujú oddelene v nasledujúcom texte.
.1
Polypeptidová vakcinácia
Tento spôsob , vyžaduje aplikovať do príslušného živočícha imunologický účinné množstvo aspoň jedného prvého analógu a pokiaľ je to relevantné, aj imunologický účinné množstvo aspoň jedného druhého analógu. Je výhodné, keď sa aspoň jeden prvý a/alebo druhý analóg/analógy formulujú spoločne s farmaceutický, a imunologický prijateľným nosičom a/alebo vehikulom a voliteľne s adjuvans.
Pri uskutočňovaní prezentácie analógu živočíšnemu imunitnému systému pomocou jeho podania živočíchovi, prebieha príprava polypeptidu podľa obecne uznávaných princípov v technike.
Príprava vakcín, ktoré obsahujú peptidové sekvencie ako aktívne zložky, je v technike obecne dobre známa, príkladom čoho sú US patenty 4608251; 6601903; 4599231; 4599230; 4596792 a 4578770, ktoré všetky sú tu zahrnuté ako odkazy. Typicky sa tieto vakcíny pripravujú k injekčnej aplikácii buď ako roztoky alebo ako suspenzie, ale tiež sa môžu pripraviť v pevnej forme vhodnej pre rozpustenie alebo suspendovanie v kvapaline pred vlastnou aplikáciu injekcie. Preparáty môžu byť tiež emulziíikované. Aktívna imunogénna zložka sa často mieša s farmaceutický prijateľným základom, ktorý je s ňou kompatibilný. Vhodnými základmi sú napríklad voda, fyziologický roztok, dextróza, glycerol, etanol a ich kombinácia. Naviac, ak je to žiaduce, vakcína môže obsahovať malé množstvo pomocných látok, ako sú zvlhčovadlá a emulgátory, pH pufre alebo adjuvans podporujúce účinok vakcíny (viď detailnú diskusiu o adjuvans ďalej).
Vakcíny sa obvykle aplikujú parenterálne pomocou injekcie, napríklad buď subkutánne, intradermálne, subdermálne alebo intramuskulárne. Ďalšou vhodnou aplikačnou formou sú čipky a v niektorých prípadoch orálne, . bukálne, podjazykové, intraperitoneálne, intravaginálne, análne a intrakraniálne formy. Tradičné vehikulá a nosiči pre čipky môžu zahrnovať napríklad polyalkalénové glykoly alebo triglyceridy; čipky sa môžu pripraviť zo zmesí obsahujúcich 0,5 až 10 % aktívnej zložky, výhodne 1-2 %. Orálne formy obsahujú obvykle používané základy, ako napríklad farmaceutický čistý manit, laktózu, škrob,. stearát horečnatý, sacharín sodný, celulózu, uhličitan horečnatý a pod. Tieto zmesi majú formu roztokov, suspenzií, tabliet, piluliek, kapsúl, spojito sa uvoľňujúcich látok a práškov a obsahujú 10-95 % aktívnej zložky, výhodne 25-70 %. Pre orálne prípravky je zaujímavým partnerom toxín cholery (a tiež možným konjugačným partnerom). Polypeptidy pre vakcíny môžu byť v neutrálnej forme alebo ako soli.
Farmaceutický prijateľné soli zahrnujú adičné soli kyselín (utvorené s voľnými aminoskupinami peptidu), ktoré sú pripravené s anorganickými kyselinami, ako napríklad kyselina chlorovodíková alebo fosforečná, alebo s organickými kyselinami, ako octová, šťavelóvá, vínna, mandlová a podobne. Soli tvorené s voľnými karboxylovými skupinami sa tiež môžu získať z anorganických zásad, napríklad hydroxidu sodného, draselného, amónneho, vápenatého alebo železitého a z organických zásad, ako sú izopropylamín, trimetylamín, 2etylamino etanol, histidín, prokain a podobne.
Vakcíny sa aplikujú spôsobom, ktorý odpovedá dávkovanému prípravku a v takom množstve, ktoré bude terapeuticky účinné a imunogénne. Velkosť aplikovanej dávky závisí na liečenom subjekte, vrátane napríklad schopnosti imunitného systému jednotlivca zahájiť imunitnú odozvu alebo vrátane stupňa požadovanej ochrany. Vhodné dávkovanie sa pohybuje v rozsahu niekolko stoviek mikrogramov aktívnej zložky na vakcináciu, prednostne v rozsahu okolo 0,1 až 2000 pg (dokonca sa zvažujú vyššie množstvá v rozsahu 1-10 mg), napríklad v rozsahu asi 0,5 až 1000 pg, výhodne v rozsahu 1 až 500 pg a najmä v rozmedzí 10 až 100 pg. Vhodné režimy pre prvé podanie a druhé injekcie sú tiež variabilné, ale je ich možné odhadnúť pomocou prvej aplikácie nasledovanou postupnými očkovaniami alebo inými aplikáciami.
Spôsob aplikácie sa môže široko meniť. Použiteľný je každý z obvyklých spôsobov aplikácie vakcíny. Zahrnuje orálne podanie fyziologicky prijateľnej pevnej látky alebo fyziologicky prijateľnej disperzie, parenterálne podanie, pomocou injekcie a podobne. Dávkovanie vakcíny závisí na aplikačnej ceste a bude sa meniť s vekom osoby, ktorá má byť vakcinovaná a na formulácii antigénu.
Niektoré polypeptidy vakcíny sú vo vakcíne dostatočne imunogénne, ale u niektorých iných sa zvýši imunitná odozva pridaním adjuvans. Zvlášť výhodný je adjuvans, ktorý preukázateľne uľahčuje narušenie autotolerancie k vlastným antigénom.
Sú známe rôzne spôsoby, ktorými sa docieľuje posilujúceho účinku vakcíny. Obecné princípy a spôsoby sa detailne popisujú v The Theory and Practical Application of Adjuvants, Duncan E.S. Stewart-Tull (red.), Jon Wiley & Sons, Ltd., 1995, ISBN 0-471-95170-6, a tiež v Vaccines: New Generation Immunological Adjuvats, Gregoriadis G. et al. (red.), Plénum Press, New York, 1995, ISBN 0-306-45283-9; obidve publikácie sú tu týmto zahrnuté ako odkazy.
Výhodné adjuvans uľahčujú absorpciu vakcínových molekúl APC bunkami, ako sú dendritické bunky a ich aktiváciu. Príklady, ktoré nemajú byť obmedzujúce, sú vybrané zo skupiny zahrnujúcej adjuvans: zameraných na imunitu; imunomodulačné .adjuvans, · napríklad toxín, cytokín · a mykobakteriálne deriváty;' olejový prípravok; polymér; adjuvans tvoriaci micely; saponín; matrix imunostimulačného komplexu (ISCOM matrix); častice; DDA; hliníkový adjuvans; DNA adjuvans; γinulín; a obalové adjuvans. Obecne by malo byť zaznamenané, že vyššie uvedené popisy, ktoré sa týkajú zlúčenín a činidiel užitočných ako prvý, druhý a tretí podiel v analógoch tiež odkazuje mutatis mutandis na ich využitie v adjuvans vakcíny tohoto vynálezu.
Aplikácia adjuvans zahrnuje použitie činidiel ako sú hydroxid hlinitý alebo fosforečnan hlinitý (alum), obyčajne používané ako 0,05 až 0,1 percentný roztok v pufrujúcom fyziologickom roztoke, s primiešanými syntetickými polymérmi cukrov (napr. Carbopol®) používanými v 0,25 % roztoke, agregácia proteínu vo vakcíne zahrievaním pri teplote 70 101 °C po dobu od 30 sekúnd do 2 minút a tiež agregácia prostredníctvom sieťovacích činidiel. Tiež sa môže využiť agregácia k albumínu pomocou reaktivácie s protilátkami upravenými pepsínom (Fab fragmenty), zmes s bakteriálnymi bunkami, napríklad C. parvum alebo endoxíny alebo liposacharidové zložky gramnegatívnych baktérii, emulzia vo fyziologicky prijateľnom olejovom vehikule, napríklad manid monooleát (Aracel A) alebo emulzia s 20 % roztokom perfluóruhlíka (Fluosol-DA) používaným ako bloková náhrada. Prímesky s olejmi, napr. skvalénom a IFA sú tiež výhodné.
Podlá tohoto vynálezu sú zaujímavými kandidátmi na adjuvans DDA (dimetyldioktadecylamónium bromid), DNA a γ-inulín, ale tiež Freundové úplné a neúplné adjuvans, rovnako ako saponíny z druhu Quillaja, ako QuilA a QS21. Ďalšími možnosťami sú monofosforyl lipid A (MPL) a vyššie uvedené C3 a C3d.
Aj o lipozómových prípravkoch sa vie, že majú posilujúce účinky, preto patria podľa tohoto vynálezu k výhodným adjuvans.
Ďalšími výhodnými volbami adjuvans podľa tohto vynálezu sú matrixy imunostimulačných komplexov (ISCOM® matrix) zvlášť preto, že bolo ukázané, že tieto typy adjuvans sú schopné zvyšovať aktiváciu expresie MHC triedy II pomocou APC buniek. Matrix ISCOM® sa skladá z (voliteľne frakcionovaných) saponínov (triterpénoidov) z Quillaja saponaria, cholesterolu a fosfolipidu. Po zmiešaní s imunogénnym proteínom vzniká časticový prípravok, známy ako ISCOM častica, kde saponín tvorí podľa hmotnosti 60-70 %, cholesterol a fosfolipid 10-15 % a proteín 10-15 %. Detaily týkajúce sa zloženia a využitia imunostimulačných komplexov je možno nájsť v už zmienených publikáciách týkajúcich sa adjuvans, ale aj v Morein B. et al.: Clin Immunother. 3 (1995), 461-475, alebo v Bar I.G. and Mitchell G.F.: Immunol. And Celí Biol. 74 (1996), 8-25 (obidve sú tu zahrnuté ako referencie), kde sú užitočné inštrukcie k príprave úplných imunostimulačných komplexov.
Ďalšou velmi zaujímavou (a teda výhodnou) možnosťou, ako dosiahnuť posilujúceho účinku, je použitie techniky opísanej v Gosselin · et al., 1992 (ktorá je tu zahrnutá ako odkaz). Stručne povedané, prezentácia relevantného antigénu, ako je antigén predloženého vynálezu, sa môže zvýšiť konjugáciou antigénu s protilátkou (alebo antigénom, ktorý viaže fragmenty protilátky) proti Fcy receptorom na monocytoch/makrofágoch. Zvlášť u konjugátov medzi antigénom a anti-FcyRI bolo. ukázané, že zvyšujú imunogenicitu pre vakcinačné účely.
Iné možnosti sa týkajú použitia zacielených a imunomodulačných látok (t.j. cytokínov), zmienených vyššie, ako kandidátov na prvé a druhé podiely v modifikovaných analógoch. V tejto súvislosti do úvahy tiež prichádzajú syntetické činidlá indukujúce cytokíny, ako poly I:C.
Vhodné mykobakteriálne deriváty sa vyberajú zo skupiny zloženej z muramyl dipeptidov, úplného Freundovho adjuvans, RIBI a diesteru trihalózy, napríklad TDM a TDE.
Vhodnými, na imunitu zameranými adjuvans sú látky zo skupiny pozostávajúcej z CD40 ligandu a CD40 protilátok alebo ich špecificky viazaných fragmentov (porovnaj vyššie uvedenú diskusiu), manózy, Fab fragmentu a CTLA-4.
Vhodné polymérne adjuvans sú zo skupiny pozostávajúcej z uhlovodíkov, ako je dextrán> PEG, škrob, manán a manóza, plastických polymérov a latexu, ako sú latexové guličky.
Ďalším iným zaujímavým spôsobom modulácie imunitnej odozvy je začlenenie imunogénu (volitelne spolu s adjuvans a farmaceutický prijatelnými nosičmi a vehikulmi) do „virtuálnej lymfatickej uzliny (VLN) (patentované lekárske zariadenie vyvinuté ImmunoTherapy, Inc., 360 Lexington Avenue, New York, NY 10017-6501). VLN (tenučké trubičkovité zariadenie) napodobuje štruktúru a funkciu lymfatickej uzliny. Vložením VLN pod kožu sa vytvorí lokálny sterilný zápal s prudkým vzrastom cytokínov a chemokínov. T- a B-bunky, rovnako ako APC bunky, rýchlo reagujú na signály nebezpečenstva, presťahujú sa do zapáleného miesta a hromadia sa vnútri pórovitého matrixu VLN. Ukázalo sa, že potrebná dávka antigénu na zahájenie imunitnej odozvy voči antigénu sa pri použití VLN zníži a že vakcináciou poskytnutá imunitná ochrana prevyšuje konvenčnú imunizáciu s použitím RIBI ako adjuvans. Technológia sa stručne popisuje v Gelber C. et al.: Elicitation o f Robust Cellular and Humoral Immune Responses to Small Amounts of Immunogens Using a Novel Medical Device Designated the Virtual Lymph Node, v „From the Laboratory to the Clinic, Book of Abstracts, October 12th - 15th 1998, Seascape Resort, Aptos, Kalifornia.
Posledné výsledky výskumu ukázali, že spolupodávanie H2 agonistov zvyšuje prežitie NK buniek a CT lymfocytov v nádore. Preto sa zvažuje zahrnúť H2 agonistov ako adjuvans do spôsobov tohoto vynálezu.
Predpokladá sa, že by sa vakcína mala aplikovať aspoň raz za rok, napríklad aspoň 1, 2, 3, 4, 5, 6 a 12-krát ročne.
Špecifickejšie sa očakáva 1-12 krát ročne, napríklad 1, 2,
3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 alebo 12-krát za rok jedincovi, ktorý to potrebuje. Skôr bolo ukázané, že imunitná pamäť indukovaná použitím výhodných autovakcín podľa tohto vynálezu nie je trvalá, a preto sa imunitný systém musí periodicky podnecovať analógmi.
Vzhladom ku genetickej variabilite môže imunitný systém rôznych jedincov reagovať na ten istý peptid odlišne. Vakcína podía tohoto vynálezu preto môže zahrnovať niekolko rozdielnych polypeptídov, aby sa zvýšila imunitná odozva (porovnaj tiež vyššie uvedenú diskusiu o volbe pri zavádzaní cudzích T-bunkových epitopov). Vakcína môže obsahovať dva alebo viacej polypeptídov, ako boli definované vyššie.
Vakcíny môžu preto obsahovať 3 až 20 rôznych modifikovaných alebo nemodifikovaných polypeptídov, napríklad 3-10 rôznych polypeptídov. Obvykle je však snaha udržať počet peptidov na minimu, napríklad 1 alebo 2 peptidy.
Živé vakcíny
Druhou alternatívou, ako uskutočniť prezentáciu imunitnému systému, je technológia živej vakcíny. Pri živej vakcinácii sa prezentácia imunitnému systému uskutoční tým, že sa živočíchovi podá nepatogénny mikroorganizmus, ktorý sa transformuje fragmentom nukleovej kyseliny, ktorý kóduje potrebné epitopické oblasti alebo kompletný prvý a/alebo druhý analóg. Inou možnosťou je transformácia mikroorganizmus vektorom, ktorý obsahuje takýto fragment nukleovej kyseliny. Nepatogénnym organizmom môže byť akýkoľvek vhodne oslabený bakteriálny druh (oslabený pomocou vynechania alebo pomocou odstránenia produktov patogénnej expresie technológiou rekombinantnej DNA), napr. Myco-bacterium bovis BCG., nepatogénny Streptococcus spp., E. coli, Salmonella spp., Vibrio cholerae, Shigella atd. Prehľady, ktoré pojednávajú o príprave známych živých vakcín, je možné napríklad nájsť v Saliou P.: Rev. Prat. 45 (1995), 1492-1496 a Walker P.D.:
I
Vaccine 10 (1992), 977-990, ktoré sú tu obidva zahrnuté ako odkazy. Detaily týkajúce sa fragmentov nukleových kyselín a vektorov používaných v tomto vynáleze sa diskutujú ďalej.
U polypeptidovej vakcíny môžu býť TH epitop a/alebo prvý a/alebo druhý á/alebo tretí podiel, ak sú prítomné, vo forme fúznych partnerov aminokyselinovej sekvencie odvodenej z bunkového polypeptidového antigénu.
Ako alternatíva k bakteriálnym živým vakcínam sa môže fragment nukleovej kyseliny vynálezu, diskutovaný ďalej, začleniť do nezhubného vírusového vektora vakcíny. Jednou z možností je kiahňový vírus, napr. ovčie kiahne, MVA (modifikovaný vírus ovčích kiahní), kiahne kanárikov, vtáctva, kurčiat atd. Alebo sa môže použiť, obmena vírusu prostého oparu.
Obvykle sa-nepatogénny mikroorganizmus alebo vírus aplikuje živočíchovi iba raz, ale v niektorých prípadoch môže byť potrebná viac ako jedna aplikácia za život.
Mikroorganizmus sa tiež môže transformovať nukleovou kyselinou (kyselinami), ktorá obsahujú oblasti kódujúce prvé, druhé a/alebo tretie podiely, napr. vo forme imunomodulačných látok popísaných vyššie, ako sú cytokíny diskutované ako užitočné adjuvans. Výhodný prípad tohto uskutočnenia je, keď kódovaná oblasť pre analóg a kódovaná oblasť pre imunomodulátor majú rozdielne úseky otvoreného záznamu alebo sú aspoň riadené rozdielnymi promótormi. Tým je vylúčené, aby sa analóg alebo epitopy produkovali ako fúzny partneri k imunomodulátoru. Alebo sa ako transformačné činidlá môžu použiť dva rozdielne nukleotidová fragmenty.
Vakcinácia nukleovej kyseliny
Technológia vakcinácie nukleovej kyseliny (známa tiež ako „imunizácia nukleovou kyselinou, „genetická imunizácia, „génová imunizácia a „DNA vakcinácia) ponúka, ako alternatíva ku klasickej aplikácii peptidovej vakcíny, rad atraktívnych rysov.
Predne, na rozdiel od tradičnej vakcinácie, vakcinácia nukleovou kyselinou nevyžaduje zdroj spotrebovávajúci veľké množstvo pripravovaných imunogénnych činidiel (napríklad vo forme priemyslovo fermentovaných mikroorganizmov produkujúcich analógy potrebné k polypeptidovej vakcinácii). Okrem toho nie je potrebné zariadenie na čistenie a posttranslačnú úpravu imunogénu. A nakoniec, pretože vakcinácia nukleovou kyselinou sa opiera o biochemickú výbavu .vakcinovaného jedinca, aby produkovala expresný produkt zavedenej nukleovej kyseliny, očakáva sa, že nastane optimálna posttranslačná úprava produktu expresie; to je zvlášť dôležité pri autovakcinácii, pretože, ako sa uvádza vyššie, by sa mala zachovať podstatná časť pôvodných B-bunkových epitopov v analógoch odvodených z polypeptidových sekvencii vystavených extracelulárnemu vplyvu, a pretože B-bunkové epitopy sa spravidla môžu vytvárať z častí lubovolných (bio)molekúl (napr. uhľovodíkov, lipidov, proteínov atd.). Preto natívne glykozylačné a lipidačné profily imunogénu môžu byť dosť dôležité pre celkovú imunogenicitu a to je najlepšie zaistené hostiteľom produkujúcim imunogén.
Dôležitá forma uskutočnenie spôsobu podlá vynálezu sa preto týka uskutočnenia prezentácia tým, že sa do APC zavedie in vivo aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje aspoň jeden CTL epitop a/alebo aspoň jeden Bbunkový epitop a aspoň jeden prvý cudzí Th epitop (alternatívne sa aplikujú aspoň dva rozdielne fragmenty nukleovej kyseliny, kde jeden kóduje aspoň jeden CTL epitop a druhý aspoň jeden cudzí TH epitop). Výhodne sa to urobí použitím fragmentu nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje vyššie diskutovaný prvý analóg. Ak je prvý analóg vybavený už detailne opísanými TH epitopmi a/alebo prvým a/alebo druhým a/alebo tretím podielom, potom sú tieto vo forme fúznych partnerov k aminokyselinovej sekvencii odvodenej z bunkového polypeptidového antigénu a fragmentom nukleovej kyseliny bude kódovaný tento fúzny konštrukt.
Podobne, ako u tradičného vakcinačného prístupu, sa vakcinácia nukleovou kyselinou môže kombinovať s tým, že sa do APC zavedie in vivo aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje druhý analóg. Úvahy týkajúce sa prvého, druhého a tretieho podielu a TH epitopov sa vzťahujú aj na tento prípad.
Zavádzanou nukleovou kyselinou je pri tejto forme uskutočnenia vynálezu výhodne DNA, ktorá môže byť vo forme prostej DNA, DNA s nabitými alebo elektroneutrálnymi lipidmi, DNA tvorenej v lipozómoch, DNA zahrnutej do vírusového vektora, DNA pripravenej s proteínom alebo polypeptidom uľahčujúcim indikáciu, DNA pripravenej s zacieleným proteínom alebo polypeptidom, DNA pripravenej s činidlami zrážajúcimi vápnik, DNA spojenej s molekulou inertného nosiča a DNA pripravenej s adjuvans. V tejto súvislosti stojí za zmienku, že prakticky všetky úvahy týkajúce sa použitia adjuvans v tradičnom vakcinačnom prípravku platia pre prípravu DNA vakcín. Preto všetky tu opísané význaky, ktoré sa týkajú použitia adjuvans v súvislosti s polypeptidovými vakcínami, platia mutatis mutandis pri ich použití v technológii vakcinácie nukleovej kyseliny. To isté platí pre ostatné úvahy týkajúce sa prípravy, formy a spôsobu aplikácie vakcíny, a preto tiež vyššie uvedené úvahy v súvislosti s tradičnou vakcináciou platia mutatis mutandis na ich použitie v technológii vakcinácie nukleovej kyseliny.
Zvlášť výhodným typom prípravku vakcíny nukleovej kyseliny sú mikročastice obsahujúce DNA. Vhodné mikročastice sú napr. opísané v WO 98/31398.
Okrem toho môže nukleová kyselina (nukleové kyseliny) použitá ako imunizačné činidlo obsahovať oblasti kódujúce prvé, druhé a/alebo tretie podiely, napr. vo forme imunomodulačných látok opísaných vyššie, napríklad cytokíny, diskutované ako užitočné adjuvans. Výhodná forma tohoto uskutočnenia je, keď kódovaná oblasť pre analóg a kódovaná oblasť pre imunomodulátor majú rozdielne úseky otvoreného záznamu alebo sú aspoň riadené rozdielnymi promótormi. Tým je vylúčené, aby sa analóg alebo epitopy produkovali ako fúzny partneri imunomodulátora. Alebo sa môžu použiť dva rozdielne nukleotidové fragmenty, ale to je menej výhodné vzhľadom k výhode, ktorú má spoločná expresia, keď sú obidve kódujúce oblasti obsiahnuté v jednej a tej istej molekule.
Obvykle sa nukleová kyselina vakcíny zavádza ako vektor, v ktorom je expresia riadená vírusovým promótorom. Detailnejšia diskusia týkajúca sa vektorov podía tohto vynálezu sa uvádza ďalej. Podrobnejšie závery týkajúce sa formy a použitia vakcín nukleových kyselín sú dostupné napr.
v Donnelly J. J. et al: Annu. Rev. Immunol. 15 (1997) , 6187648 a Donnelly J.J. et al: Life Sciences 60 (1997), 163-172. Obidva tieto odkazy sú tu zahrnuté ako odkazy.
Dôležitá časť tohoto vynálezu patrí novému spôsobu výberu vhodných imunogénnych analógov bunkového polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny, pričom imunogénny analóg je schopný v živočíchovi indukovať odozvu CTL proti bunkám zobrazujúcim MHC molekulu triedy I viazanú na epitop odvodený z bunkového polypeptidového antigénu. Tento spôsob zahrnuje kroky:
a) identifikáciu aspoň jednej subsekvencie aminokyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu, kde príslušná subsekvencia neobsahuje známe alebo predpokladané CTL epitopy,
b) prípravu aspoň jedného predpokladaného imunogénneho analógu bunkového polypeptidového antigénu vložením do aminokyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu aspoň jedného pre živočícha cudzieho TH epitopu vo vnútri aspoň jednej subsekvencie určenej v kroku a) a
c) výber analógu alebo analógov pripravených v kroku b) , u ktorých sa overila schopnosť indukcie CTL odozvy v živočíchovi.
Ináč, uvedený spôsob výberu zahrnuje prípravu fragmentu nukleovej kyseliny pre účely vakcinácie nukleovou kyselinou. Za tejto situácie sa požaduje, aby kódovaný peptid obsahoval aspoň jeden TH epitop.
Keď je analóg odvodený z antigénu, ktorý je vystavený extracelulárnej fázy, je výhodné, aby sekvencia určená v kroku a) ďalej neobsahovala cysteínové zvyšky alebo ináč, aby TH epitop vložený v kroku b) podstatne nemenil charakter cysteínových zvyškov. Tento prístup uľahčuje zachovanie priestorových B-bunkových epitopov vo výslednom prípravku, ktoré sú podobné B-bunkovým epitopom v slabom bunkovom polypeptidovom antigéne.
Z rovnakých dôvodov je výhodné, aby subsekvencia určená v kroku a) ďalej neobsahovala známe alebo predpokladané glyk'ozýlačné miesta alebo ináč, aby TH epitop vložený v kroku b) podstatne nemenil glykozylačný charakter.
Určité slabé bunkové polypeptidové antigény uplatňujú nežiaduce účinky patofyziologickou funkciou. Je žiaduce, aby sa tieto účinky neprejavovali u vakcinačných prípravkov, a preto je výhodné, aby subsekvencia identifikovaná v kroku a) podstatne prispievala k patofyziologickému účinku bunkového polypeptidového antigénu a aby zavedenie TH epitopu v kroku b) redukovalo alebo eliminovalo zmienený patofyziologický účinok. Príkladom tohto prístupu je odstránenie aktívneho miesta v enzýme, v hormóne alebo v cytokíne a jeho zámena za cudzí TH epitop.
Ďalšia dôležitá úvaha patrí otázke imunologickej krížovej reaktivite polypeptidového produktu vakcíny s inými vlastnými proteínmi, ktoré nesúvisia s patológiou. Tejto krížovej reaktivite je lepšie sa vyhnúť, preto jedno dôležité uskutočnenie spôsobu tohto vynálezu je to, kde subsekvencia určená v kroku a) je homologická k aminokyselinovej sekvencií odlišného proteínového antigénu živočícha a kde zavedenie TH epitopu v kroku b) tuto homológiu reálne odstraňuje.
S týmto uskutočnením súvisí uskutočnenie, kde akékoľvek aminokyselinové sekvencie, ktoré 1) nie sú obvykle vystavené extracelulárnej fázy a 2) ktoré môžu tvoriť B-bunkové epitopy slabého bunkového polypeptidového antigénu, nie sú zachované v analógu. Môže sa to dosiahnuť výmenou takýchto aminokyselinových sekvencií za Th epitopy, ktoré netvoria Bbunkové epitopy, ich úplným odstránením alebo ich čiastočným odstránením.
Na druhej strane je výhodné, aby sa všetky „pravé Bbunkové epitopy slabého bunkového polypeptidového antigénu čo najviac zachovali, a preto dôležité uskutočnenie spôsobu výberu podlá vynálezu sa týka toho, aby zavedenie cudzieho TH epitopu v kroku b) malo za výsledok zachovanie podstatného podielu B-bunkových epitopov bunkového polypeptidového antigénu. Zvlášť je výhodné, keď si analóg uchová celkovú terciárnu štruktúru bunkového polypeptidového antigénu.
Príprava v kroku b) sa výhodne uskutočňuje prostriedkami molekulárnej biológie alebo syntézou peptidov v pevnej alebo kvapalnej fázy. Kratšie peptidy sa výhodne pripravujú bežnými technológiami syntézy v pevnej alebo kvapalnej fázy. Súčasný pokrok v tejto technológii však umožňuje týmito prostriedkami vyrobiť polypeptidy a proteíny v plnej dĺžke, a preto spadá do rámca predloženého vynálezu tiež príprava dlhých konštruktov syntetickými prostriedkami.
Potom, čo boli vyššie diskutovaným spôsobom identifikované užitočné analógy, je potrebné vyrábať analóg vo veľkom merítku. Polypeptidy sa pripravujú spôsobmi dobre známymi v technike.
Je to možné uskutočniť prostriedkami molekulárnej biológie, ktoré v prvom kroku zahrnujú prípravu transformovanej bunky tak, že sa do vektora zavedie šekvencia nukleovej kyseliny kódujúca analóg, ktorý bol vybraný uvedeným spôsobom, a že sa vektorom transformuje vhodná hostitelská bunka. Nasledujúcim krokom je kultivácia transformovanej bunky za podmienok ulahčujúcich expresiu fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho analóg bunkového antigénu a následne spätné získanie analógu z kultivačného supernatantu alebo priamo z buniek, napríklad vo forme lyzátu. Ináč sa môže analóg pripraviť vo velkom rozsahu syntézou peptidov v pevnej alebo kvapalnej fázy.
Nakoniec sa produkt môže podía zvolenej hostitelské bunky alebo podía použitej metódy syntézy podrobiť umelým posttranslačným modifikáciám. Tými môžu byť schémy „refolding (nariasenia) známe v technike, spracovanie s enzýmami (aby sa dosiahlo glykozylácie alebo odstránenie nežiaducich fúznych partnerov), chemická modifikácia (opäť je možná glykozylácia) a konjugácia, napr. s tradičnými nosičovými bunkami.
Malo by sa poznamenať,,že výhodné analógy tohoto vynálezu (a tiež relevantné analógy používané v spôsoboch tohto vynálezu) zahrnujú modifikácie, ktorých výsledkom sú peptidy aspoň zo 70 % sekvenčne identické s polypeptidovým antigénom alebo s jeho subsekvenciou o dĺžke aspoň 10 aminokyselín. Vyššia sekvenčná identita je výhodnejšie, napríklad aspoň 75 % alebo dokonca aspoň 80 % alebo 85 %. Sekvenčná identita proteínov a nukleových kyselín sa môže vypočítať ako (Nref-Ndi.f) * 100/Nref, kde Ndif je celkový počet neidenťických zvyškov vo dvoch zoradených sekvenciách a Nref je počet zvyškov v jednej zo sekvencií. Podľa toho DNA sekvencia AGTCAGTC je zo 75 % sekvenčne identická so sekvenciou AATCAATC (Ndif=2 a Nref=8) .
Príklady špecifických cieľov pre spôsob podľa vynálezu
Ako už bolo povedané, výhodnými slabými bunkovými polypeptidovými antigénmi sú nádorové antigény. Ich zoznam, ktorý nie je obmedzujúci, uvádza nasledujúca tabulka.
Antigén Odkazy
5-a reduktáza Délos, S., Carsol, J.L., Fina, F.,
Raynaud, J.P., Martin, P.M.: 5alphareductase and 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase expression in epithelial cells from hyperplastic and malignant human prostate. Int. J. Cancer, Mar 16, 75:6 (1998), 840-846.
a -fetoproteín Esteban, C., Terrier, P., Frayssinet,
C., Uriel, J.: Expression of the a -
fetoproteín gene in human breast
cancer. Tumour. Biol., 17:5 (1996),
2999-305.
Harada, Y., Ohuchi, N. , Masuko, T.,
Funaki, Y., Mori, S ., Satomi, S.,
Hasimoto, Y.: Characterization of a new breast cancer-associated antigén and its relationship to MUC1 and TAG-
72 antigéns. Toho ku J. Exp. Med., Nov
180:3 (1996), 273-288.
Dihlmann, S., Amler, L.C., Schwab, M.,
Wenzel, A. : Variations in the
expression of the adenomatous
polyposis coli (APC) tumor suppressor
9:3 (1997), 119-127.
gene in human cancer celí lines of different tissue origin. Oncol. Res.,
APRÍL
BAGE β-katenín
Bcl2
Bcr-abl (b3a2)
L.E., Sordat, B., Rimoldi, D., Tschopp, J. : APRÍL, a new ligand of the tumor necrosos factor family, stimulates tumor celí growth. J. Exp. Med., Sep 21, 188:6 (1998), 1185-1190. Bôel, P., Wildmann, C., Sensi, M.L., Brasseur, R., Renauld, J.C., Coulie, P., Boon, T and Van der Bruggen, P.: BAGE: a new gene encoding an antigén recognized on human melanomas by čytolytic lymphocytes. Immunity, 2 (1995), 167-175.
Hugh, TJ., Dillon, S.A., O'Dowd, G., Getty, B., Pignatelli, M.,Poston,
G.J., Kinsela, A.R.: beta-catenin expression in primary and metastatic colorectal carcinoma. Int. J. Cancer, Aug 12, 82:4 (1999), 504-511.
Kóty, P.P., Zhang, H., Levitt, M.L.: Antisense . bcl-2 treatment increases programmed celí death in non-small celí lung cancer celí lines. Lung Cancer, Feb 23:2 (1999), 115-127. Verfaillie, C.M., Bhatia, R., Miller, W., Mortari, F., Roy, V., Burger, S., Mc Cullough, J., Stieglbauer, K., Dewald, G.,Heimfeld, S., Miller, J.S., Mc Glave, P.B.: BCR/ABL-negative promitive progenitors suitable for.
transplantation can be selected from the marrow of most early-chronic phase but not accelerated-phase chronic myelogenous leukémia patiens. Blood,
CA-125
CASP-8/FLICE
Katepsíny
CD19
CD20
Jun 1, 87:11 (1996), 4770-4779.
Bast, R.C, Jr., Xu, F.J., Yu Y.H., Barnhill, S., Zhang, Z., Mills, G.B.: CA 125: the pást and the future. Int. J. Biol. Markers, Oct-Dec 13:4 (1998),
179-187.
Mandruzzato, S., Brasseur, F., Andry, G., Boon, T., van der Bruggen, P.: A CASP-8 mutation recognized by cytolytic T lymphocytes on a human head and neck carcinoma. J. Exp. Med., Aug 29, 186:5 (1997), 785-793.
Thomssen, C., Schmitt, M., Goretzki, L., Oppelt, P., Pache, L., Dettmar, P., Jänicke, F., Graeff, H.: Prognostic value of the cysteine proteases cathepsins B.and cathepsin L in human breast cancer. Clin. Cancer Res., Jul 1:7 (1995), 741-746. Scheuermann, R.H., Racila, E.: CD19 antigén in leukémia and lymphoma diagnosis and immunotherapy. Leuk. Lymphoma, Aug 18:5-6 (1995), 385-397. Knox, S.J., Goris, M.L., Trisler, K., Negrin, R., Davis, T., Liles, T.M., Grillo-López, A., Chinn, P., Varns, C., Ning, S.C., Fowler, S., Deb, N., Becker, M., Marquez, C., Levy, R.: Yttrium-90-labeled anti-CD20 monoclonal antibody therapy of recurrent B-cell lymphoma. Clin.
Cancer res., Mar 2:3 (1996), 457-470.
Shubinsky, G., Schlesinger, M.,
CD21
CD23
CD22
CD33
CD35
Polliack, A., Rabinowitz, R.: Pathways controlling the expression of surface CD21 (CR2) and CD23 (Fc (epsilon) IIR) proteins in human malignant B cells. Leuk. Lymphoma, May 25:5-6 (1997),
521-530.
Shubinsky, G., Schlesinger, M., Polliack, A., Rabinowitz, R.: Pathways controlling the expression of surface CD21 (CR2) and CD23 (Fc (epsilon) IIR) proteins in human malignant B cells. Leuk. Lymphoma, May 25:5-6 (1997),
521-530.
French, R.R., Penney, C.A., Browning, A.C., Stirpe, F., George, A.J., Glennie, M.'J.: Delivery of the ribosome-inactivating protein, gelonin, tolymphoma cells via CD22 and CD38 using bispecific antibodies. Br. J. Cancer, May 71:5 (1995), 986-994. Nakase, K., Kita, K., Shiku, H., Tanaka, I., Našu, k., Dohy, H., Kyo, T., Tsutani, H., Kamada, N.: Myeloid antigén, CD13,CD14, and/or CD33 expression is restricted to certain lymphoid neoplasms. Am. J. Clin. Pathol., Jun 105:6 (1996), 761-768. Yamakawa, M., Yamada, K., Tsuge, T., Ohrui, H., Ogata, T., Dobashi, M., Imai, Y.: Protection of thyroid cancer cells by complement-regulatory factors. Cancer, Jun 1 73:11 (1994),
2808-2817.
CD4 4
CD4 5
CD4 6
CD5
Naot, D., Sionov, R.V., Ish-Shalom,
D.: CD44: structure, function, and association with the malignant process. Adv. Cancer Res., 71 (1997),
241-319.
Buzzi, M., Lu, L., Lombardi, A. J. Jr., Posner, M.R., Brautigan, D.L.,
Fast, L. D., Frackelton, A.R. Jr. : Dif ferent iation-induced changes in proteintyrosin phosphatase activity and commensurate expression of CD45. in human. leukémia celí lines. Cancer Res., Jul 15, 52:14 (1992), 4027-4035. Yamakawa, M., Yamada, K., Tsuge, T., Ohrui, H., Ogata, T., Dobashi, M., Imai, Y.: Protection of thyroid cancer cells by complement-regulatory factors. Cancer, Jun 1 73:11 (1994),
2808-2817.
Stein, R., Witz, I.P., Ovadia, J., Goldenberg, D.M., Yron, I.: CD5+B cells and naturally occurring autoantibodies in cancer patiens. Clin. Exp. Immunol., Sep 85:3 (1991),
418-423.
CD52
Ginaldi, L., De Martinis, M., Matutes,
E., Farahat, N., Morilla, R., Dyer,
M.J., Catovsky, D.: Levels of expression of CD52 in normál and leukémie B and T cells: correlation with in vivo therapeutic responses to
Campath-1H. Leuk. Res., Feb 22:2 (1998), 185-191.
CD55
CD59
CDC27
CDK4
CEA (791Tgp72) Spendlove, I., Li, L., Carmichael, J.
and Durrant, L.G.: Decay accelerating factor (CD55): A target for cancer vaccine? Cancer Res., 59 (1999), 22822286.
Jarvis, G.A., Li, J., Hakulinen, J., Brady, K.A., Nordling, S., Dahyia, R., Meri, S.: Expression and function of the complement membráne attack complex inhibitor protectin (CD59) in human prostate cancer. Int. J. Cancer, Jun 11, 71:6 (1997), 1049-1055.
Wang, R. F., Wang, X., Atwood, A. C., Topalian, S.L., Rosenberg, S.A.: Cloning genes encoding MHC class IIrestricted antigens: mutated CDC27 as a tumor antigén. Science, May 21, 284:5418 (1999), 1351-1354.
Wôlfel, T., Hauer, M., Schneider, J., Serrano, M., Wôlfel, C., KlehmannHieb, .E., de Plaen, E.,Hankeln, T., Meyer zum Btischenfelde, K., and Beach, D. : A pl6lNK4a-insensitive CDK4 mutant targeted by cytolytic T lymphocytes in a. human melanoma. Science, Sep 1, 269:5228 (1995), 1281-1284.
Kass, E., Schlom, J., Thompson, J,, Guadagni, F., Graziano, P., Greiner, J.W. : Induction of protective host immunity to carcinoembryonic antigén (CEA), a self-antigen in CEA transgenic mice, by immunizing with a recombinant vaccinia-CEA virus. Cancer c-myc
Cox-2
DCC
DcR3
E6 / E7
Res., Feb 1, 59:3 (1999), 676-683. Watson, P.H., Pon, R.T., Shiu, R.P.: Inhibition of c-myc expression by phpsphorothioate antisense oligonucleotide identifies a critical role for c-myc in the growth of human breast cancer. Cancer Res., Aug 1, 51:15, (1991), 3996-4000.
Tsujii, M. et al.: Cycloxygenase regulates antiogenesis induced by colon cancer cells. Celí, 93 (1998),
705-716.
Gotley, D.C., Reeder, J.A., Fawcett, J., Walsh, M.D., Bates, P., Simmons, D.L., Antalis, T.M.: The deleted in colon cancer (DDC) gene i.s consistently expressed in colorectal cancers and metastases. Oncogene, Aug 15, 13:4 (1996), 787-795.
Pitti, R. et al.: Genomic amplif ication of a decoy receptor for Fas ligand in lung and colon cancer. Náture, .396 (1998), 699-703.
Steller, M.A., Zou, Z., Schiller, J.T., Baserga, R.: Transformation by human papillomavirus 16 E6 and E7: role of the insulin-like growth factor 1 receptor. Cancer Res., Nov 1, 56:21 (1996), 5087-5091.
Yang, X.D., Jia, X.C., Corvalan, J.R.,
Wang, P., Davis, C.G., Jakobovits, A.:
Eradication of established tumors by a fully human monoclonal antibody to the
EGFR
ΕΜΒΡ
Ena78 farsyl transferáza
FGF8b a FGF8a
FLK-l/KDR epidermal growth factor receptor without comcomitant chemotherapy. Cancer Res., 59 (6), 1999, 1236-1243. Shiina, H., Igawa, M., Ishibe, T.: Clinical study on estramustine binding protein (EMBP) in human prostate. Prostate, Sep29:3 (1996), 169-176. Arenberg, D.A. et al.: Epithelialneutrophil activating peptide (ENA-78) is an important angiogenic factor in
non-small celí lung cancer. J. Clin.
Invest., 102 (1998), 465· -472.
Dorkin, TJ., Robinson, M.C. Z Marsh,
C.,
Bjartell, A., Neal, D.E. , Leung, H.Y. :
FGF8 over-expression in prostate
cancer is associated with decreased patient survival and. persists in androgen independent disease. Oncogene, Apr 29, 18:17 (1999), 27552761.
Fong, T. Annie, T. et al.: SU5416 is a potent and selective inhibítor of the vascular endothelial growth factor receptor. (Flk-1/KDR) that inhibits tyrosine kinase catalysis, tumor vacularization and growth of multiple tumor type. Cancer Res., 59 (1999),
99-106.
Kys. listová
Dixon, K.H., Mulligan, T., Chung,
K.N., Elwood, P.C., Cowan, K.H.:
Effects of folate receptor expression following stable -transfection into
G250
Skupina GAGE
Gastrín 17 wild type and methotrexatetransport deficient ZR- human breast cancer cells. J. Biol. Chem.z Nov 25, 267:33 (1992), 24140-24147.
Divgi, C.R., Bander, N.H., Scott, A.M., O'Donoghue, J.A., Sgouros, G., Welt, S., Finn, R.D., Morrissey, F., Capitelli, P., Williams, J.M., Deland, D., Nakhre, A., Oosterwijk, E., Gulec, S.,Graham, M.C., Larson, S.M., Old, L.J.: Phase I/II radioimmunotherapy trial with iodine-131-labeled monoclonal antibody G250 in metastatic renal celí carcinoma. Clin. Cancer Res., Nov 4:11 (1998), 2729-2739.
De Backer, O., 10 others,Boon, T., van der Bruggen, P.: Characterization of the GAGE genes that are expressed in various human cancers and in normál testis. Cancer Res., Jul 1:59 (13) (1999), 3157-3165.
Watson, S.A., Michaeli, D., Grimes,
S., Morris, T.M., Crosbee, D.,
Wilkinson, M., Robinson, ' G.,
Robertson, J.F., Steele, R.J.,
Hardcastle, J.D. : Anti-gastrin
antibodies raised by gastrimmune
inhibit growth of the human colorectal
tumour AP5. Int. J. Cancer, Apr 10,
Hormón uvolňujúci Gastrín
61:2 (1995), 233-240.
Wang, Q.J., Knezetic, J.A., Schally,
A.V., Pour, P.M., Adrián, T.E.:
(Bombesin)
GD2 / GD3
GM2
GnRH
GnTV
Bombesin may> stimulate proliferation of human pancreatic cancer cells through an autocrine pathway. Int. J. Cancer, Nov 15, 68:4 (1996), 528-534.
Wiesner, D.A., Sweeley, C.C. : Circulating gangliosides of breastcancer patiens. Int. J. Cancer, Jan 27, 60:3 (1995), 294-299.
Bahk, J. Y., Hyun, J. S., Lee, H., Kim, M.O.,Cho, G.J., Lee, B.H., Choi, W.S.: Expression of gonadotropin-releasing hormone (GnRH) and GnRH receptor mRNA in prostate'cancer cells and effect of GnRH on the proliferation of prostate cancer cells. Urol. Res., 26:4 (998), 259-264.
Hengstler, J.G., Arand, M., Herero, M.E.,Oesch, F.: Polymorphism of Nacetyltransferases, glutathione, Stransferases, microsomal epoxide hydrolase and sulfotransferases: influence of cancer susceptibility. Recent Results Cancer Res., 154 (1998), 47-85.
GP1 gplOO/Pmel g
Wagner, S.N., Wagner, C.,
Schulterwolter, T., Goos, M.: Analysis of Pmel 17/gpl00 expression in primary human tissue specimens: implications for melanoma immuno- and gene-therapy. Cancer Immunol. Immunother., Jun 44:4 (1997), 239-247.
Kirkin, A.F., Dzhandzhugazyan, K.,
Zeuthen, J.:
gp-100-in4
Melanoma-associated gpl5 gp75 / TRP-1 antigens recognized by cytotoxic Tlymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998),
665-679.
Maeurer, M. J. et al.: New treatment options for patients with melanoma: review of melanoma-derived T-cell epitope-based peptide vaccines.
Melanoma Res., Feb 6 (1), 1996, 11-24. Lewis, J.J., Houghton, A.N.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine construction. Semin. Cancer Biol., Dec 6:6 (1995), 321-327.
hCG
Hoermann, R., Gerbes, A.L., Spoettl,
G., JUungst, D., Mann, K.: Immunoreactive human chorionic gonadotropin and its free beta subunit in sérum and ascites of patiens with malignant tumors. Cancer Res., Mar 15,
52:6 (1992), 1520-1524.
Heparanáza
Vlodavsky, I., Friedmann, Y., Elkin, M., Aingorn, H., Atzmon, R., IshaiMichaeli, R., Bitan, M., Pappo, O., Peretz, T., Michal, I., Spector, L., Pecker, I.: Mammalian heparanase:
gene cloning, expression and function in tumor progression and metastasis (viz poznámky). Nat.Med., Jul 5:7 (1999), 793-802.
Her2 / neu
6:6 (1995), 321-327.
Lewis, J.J., Houghton, A.N.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine cinstruction. Semin. Cancer Biol., Dec
HMTV
Hsp70 hTERT(telomeráza)
IGFR1
IL-13R
ÍNOS
Kahl, L.P., Carroll, A.R., Rhodes, P., Wood, J., Read, N.G.: An evaluation of the putative human mammary tumour retrovirus associated with peripheral blood monocytes. Br. J. Cancer, Apr 63:4 (1991), 534-540.
Jaatela, M. et al.: Hsp70 exerts itsanti-apoptotic function downstream of caspase-3-like proteases. EMBO J., Nov 2, 17(21), 1998, 6124-6134. Vonderheide, R.H., Hahn, W.C.,
Schultze, J.L., Ňadier, L.M.:The telomerase catalytic subunit is a widely expressed tumor-associated antigén recognized by cytotoxic Tlymphocytes. Immunity June, 10 (1999),
673-679.
Ellis, M.J. et al.: Insulin-like growth factors in human breast cancer. Breast Cancer Res. Treat., 52 (1998), 175-184. Murata, T., Obiri, N.I., Debinski, W., Puri, R.K. : Structure of IL-13 receptor: analysis of subunit composition in cancer and immune cells. Biochem. Biophys. Res. Commun., Sep 8, 238:1 (1997), 90-94.
Klotz, T., Bloch, W., Volberg, C., Engelmann, U., Addicks, K.: Selective expression of inducible nitric oxide synthase in human prostate carcinoma. Cancer, May 15, 82:10 (1998), 18971903.
Ki 67
KIAA0205
Gerdes, J., Schwab, U., Lemke, H. a Stein, H. : Production of a mouse monoclonal antibody reactive with a human nuclear antigén associated with celí proliferation. Int. J. Cancer, 31 (1983), 13-20.
Gueguen, M., Patard, J.J., Gaugler, B., Brasseur, F., Renauld, J.C., Van Cangh, P.J., Boon, T., Van den Eynde, B.J.: An antigén recognized by autologous CTLs on a human bladder carcinoma. J. Immunol., Jun 15, 160:12 (1998), 61886194.
K-ras,H-ras,N
ras Abrams, S.I., Hand, P.H., Tsang K. Y.,
Schlom, J.: Mutant ras epitopes as
targets for cancer vaccines. Semin.
KSA (C017-1A)
LDLR-FUT
Oncol., Feb 23:1 (1996), 118-134.
Zhang, S., Zhang, H.S., Reuter, V.E., Slovin, S.F., Scher, H.I., Livingston, P.O.: Expression of potential target antigens for immunotherapy on primary and matastatic prostate cancers. Clin. Cancer Res., Feb 4:2 (1998), 295-302. Caruso, M.G., Osella, A.R.,
Notarnicola, M., Berloco, P., Leo, S., Bonfiglio, C., Di Leo, A.: Prognostic value of low density lipoprotein receptor expression in colorectal carcinoma. Oncol. Rep., Jul-Aug 5:4 (1998), 927-930.
Marchand, M. et al.: Tumor regressions observed in patients with (MAGE1,
MAGE3) metastatic melanoma
Skupina MAGE
Mammaglobín
Mapl7
Melan-A / MART-1
Mezotelín
MIC A/B
MT-MMP, ako napr. MMP2, MMP3, MMP7 treated with an antigenic peptide encoded by Gene MAGE-3 and presented by HLA-A1. Int. J. Cancer, Jan 18:80
S., Darrow, Persio, J., (2), 1999, 219-230.
Watson, M.A., Dintzis,
C.M., Voss, L.E., . Di
Jensen, R., Fleming, T.P.: Mammaglobin expression in primary, metastatic and occult breast cancer. Cancer Res., Jul
1, 59:13 (1999), 3028-3031.
Kocher, O., Cheresh, P., Lee, S.W.: Identification and partial characterization of a novel membraneassociated protein (MAP17) up-regulated in human carcinomas and modulating celí replication and tumor growth. Am. J. Pathol., Aug 149:2 (1996), 493-500. Lewis, J.J., Houghton, A.N.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine construction . Semin. Cancer Biol., Dec 6: (1995), 321-327.
Chang, K. et al.: Molecular cloning of mesothelin, a differentiation antigén present on mesothelium, mesotheliomas, and ovarian cancers. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Jan 9:93 (1), 1996, 136-140. Groh, V., Steinle, A., Bauer, S. a Spies, T.: Recognition of stressinduced MHC molecules by intestinal epithelial gammadelta T cells. Science,
279 (1998), 1737-1740.
Sato, H., Seiki, M.: Membrane-type matrix metalloproteinases in a MMP9
Moxl
Mucin ako napr. MUC-1, MUC-2, MUC-3 a MUC-4
MUM1
NY-ESO-1
Osteonektín
Tumormetastasis (MT-MMPs). J.
Biochem. (Tokyo) , Feb 119 (2), 1996, 209-215.
Candia, A.F., Hu, J., Crosby, J., Lalley, P.A., Noden, D.,Nadeau, J.H., Wright, C.V.: Mox-1 and Mox-2 define a novel homeobox gene subfamily and are differentially expressed during early mesodermal patterning in mouse embryos. Development, Dec 116:4 (1992), 1123-1136.
Lewis,J.J., Houghton, Α.Ν.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine construction. Semin. Cancer Biol., Dec 6:6 (1995), 321-327.
Kirkin, A.F., Dzhandzhugazyan, K., Zeuthen, J. : Melanoma- associated antigens recognized by cytotoxic T lymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998), 665-679.
Jáger, E. et al·.: Simultaneous humoral and cellular immune response against cancer-testis antigén NY-ESO-1: definition of human histocompatibility leukocyte antigén (HLA)-A2-binding peptide epitopes. J. Exp. Med., 187 (1998), 265-270.
Graham, J.D., Balleine, R.L., Milliken, J.S., Bilous, A.M., Ckarke, C.L.: Expression of osteonectin mRNA in human breast tumours is inversely correlated with oestrogen receptor p 15
P170 / MDR1 p53 p97 / melanotransferín
PAI-1 content. Eur. J. Cancer, Sep 33:10 (1997), 1654-1660.
Yoshida, S., Todoroki, T., Ichikawa, Y., Hanai, S., Suzuki, H., Hori, M., Fukao, K., Miwa, M., Uchida, K.: Mutations of pl6Ink4/CDKN2 and pl5Ink4B/MTS2 genes in biliary tract cancers. Cancer Res., Jul 1, 55:13 (1995), 2756-60.
Trock, B.J., Leonessa, F., Čiarke, R.: Multidrug resistance in breast cancer: a meta-analysis of MDRl/gpl70 expression and its possible functional significance. J. Natl. Cancer ínst., Jul 2, 89:13 (1997), 917-931.
Roth, J., Dittmer, D., Rea, D.,
Tartaglia, J., Paoletti, E., Levine, A.J.: p53 as a target for cancer vaccines: recombinant canarypox vírus vector expressing p53 protect mice against lethal tumor celí challenge. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, May 14, 93:10 (1996), 4781-4786.
Furukawa, K.S., Furukawa, K., Reál,
F.X., Old,L.J., Lloyd, K.O.: A unuque antigenic epitope of human melanoma is carried on the common melanoma glycoproteingp95/p97. J. Exp. Med., eb 1, 169:2 (1989), 585-590.
Grondahl-Hansen, J., Christensen,
I.J., Rosenquist, C., Brunner, N., Mouridsen, H.T., Dano, K., BlichertToft, M. : High levels of urokinaseΊΟ
PDGF
Plazminogén (uPA)
PRÁME
Probazín
Progenipojetín PSA type plasminogen activator and its inhibítor PAI-1 in cytosolic extracts of breast carcinomas are associated with poor prognosis. Cancer Res., Jun
1, 53:11 (1993), 2513-2521.
Vassbotn, F.S., Andersson, M., Westermark, B., Heldin, C. H., Ostman, A. : Reversion of autocrine transformation by a dominánt negatíve platelet-derived growth factor mutant. Mol.' Celí Biol., Jul 13:7 (1993),
4066-4076.
Naitoh, H., Eguchi, Y., Ueyama, H., Kodama, M., Hattori, T.: Localization of urokinase-type plasminogen activator inhibitor-1, 2 a plasminogen in colon cancer. Jpn. J. Cancer Res., Jan 86:1 (1995), 48-56.
Dzhandzhugazyan, K., Melanoma-associated antigens recognized by cytotoxic T lymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998),
665-679.
Kirkin, A.F., Zeuthen, J.
Matuo, Y., Nishi, N., Muguruma, Y., Yoshitake, Y., Kurata, N., Wada, F.: Localization of prostatic basic protein („probasin) in the rat prostates by use of monoclonala antibody. Biochem. Biophys. Res. Commun., Jul 16, 130:1 (1985), 293300.
Sanda, M.G., Smith, D.C., Charles,
L.G., Hwang, C., Pienta, K.J., Schlom,
PSM
RAGE-1
Rb
RCAS1
J., Milenic,D., Panicali, D., Montie, J. E.: Recombinant vaccinia - PSA (PROSTVAC) can induce a prostatespecific immune response in androgenmodulated human prostate cancer. Urology, Feb 53:2 (1999), 260-266. Kawakami, M., Nakayama, J.: Enhanced expression of prostate-specific membráne antigén gene in prostate cancer as revealed by in situ hybridization. Cancer Res., Jun 15, 57:12 (1997), 2321-2324.
Gaugler, B., 7 ostatní ch, Van den
Eynde, B.J.: A new gene coding for an antigén recognized by autologous cytolytic T lymphocytes on a human renal carcinoma. Immunogenetics, 44(5), 1996, 323-330.
Dosaka-Akita, H., Hu, S.X., Fujino, M., Harada, M., Kinoshita, I.,. Xu,
H. J., Kuzumaki, N., Kawakami, Y., Benedict, W.F.: Altered retinoblastoma protein expression in nonsmall celí lung cancer: its synergistic effects with altered ras and p53 protein status on prognosis. Cancer, Apr 1, 79:7(1997), 1329-1337.
Sonoda, K., Nakashima, M., Kaku, T., Kamura, T., Nakano, H., Watanabe, T.: A novel tumor-associated antigén expressed in human uterine and ovarian carcinomas. Cancer, Apr 15, 77(8),
1996, 1501-1509.
SART-1
Kikuchi M., Nakao, M., Inoue, Y., Matsunaga, K., Shichijo, S., Yamana,
H., Itoh, K·: Identification of a SART-l-derived peptide capable of inducing HLA-A24-restricted and tumorspecific cytotoxic T lymphocytes. Int. J. Cancer, May 5, 81:3 (1999), 459466.
Skupina SSX génu
Gure, A.O., Tuureci, 0., Sahin, U., Tsang, S., Scanlan, M.J., Jäger, E., Knuth, A., Pfreundschuh, M., Old, L.J., Chen, Y.T.: SSX: a multigene family with several .members transcribed in normál testis and human cancer. Int. J. Cancer, Sep 17, 72:6
S TAT 3
STn(skup.mucínu) (1997), 965-971.
Bromberg, J.F., Wrzeszczynska, M.H., Devgan, G., Zhao, Y., Pestell, R.G., Albanese, C., Darnell, J.E. Jr.: Stat3 as an oncogene. Celí, Aug 6, 98(3) , 1999, 295-303.
Sandmaier, B.M., Oparin, D.V.,
Holmberg, L.A., Reddish, M.A., macLean, G.D., Longenecker, B.M.: Evidence of a cellular immune response against sialyl-Tn in breast and ovarian cancer patients after highdose chemotherapy, stem celí rescue, and immunization with Theratope STnKLH cancer vaccine. J. Immunother, Jan
TAG-72
22:1 (1999), 54-66.
Kuroki, M., Fernsten, P.D.,
Wunderlich, D., Colcher, D., Simpson,
TGF-α
TGF-β
J.F., Poole, D.J., Schlom, J.: Serological mapping of the TAG-72 tumor-associated antigén using 19 distinct monoclonal antibodies. Cancer Res., Aug 15, 50:16 (1990), 4872-4879. Imanishi, K., Yamaguchi, K., Suzuki, M., Honda, S., Yanaihara, N., Abe, K.: Production of transforming growth factor-'alpha in human tumour celí lines. Br. J. Cancer, May 59:5 (1989),
761-765.
Picon, A., Gold, L.I., Wang, J., Cohen, A., Friedman, E.: A subset of metastatic human colon cancers elevated growth
Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev., Jun 7:6 (1998), 497-504.
Bao, L., Loda, .M., Janmey, P.A., Stewart, R., Anand-Apte, B., a Zetter, B.R.: Thymosin beta 15: a novel regulátor of tumor celí upregulated in metastatic cancer. Náture Medicíne 2(12), 1996,
1322-1328.
Moradi, M.M., Carson, L.F., Weinberg, A.F., Twiggs, L.B.,
S.: Sérum and ascitic of interleukin-1,
Tymozín β 15 levels of factor betal.
expresses transforming
TNF- a motility prostate
B., Haney, Ramakrishnan, fluid levels interleukin-6 and tumor necrosos factor-alpha in patiens with ovarian epithelial cancer. Cancer, Oct 15,
72:8 (1993), 2433-2440.
ΤΡΑ
ΤΡΙ
TRP-2
Týrozináza
VEGF
ZAG
Maulard, C., Toubert, M.E., Chretien, Y., Delanian, S., Dufour, B., Housset, M.: Sérum tisue polypeptide antigén (S-TPA) in bladder cancer as a tumor marker. A prospective study. Cancer, jan 15, 73:2 (1994), 394-398.
Nishida, Y., Sumi, H., Mihara, H.: Athiol prothease inhibitor released from cultured human malignant melanoma cells. Cancer Res., Aug 44:8 (1984),
3324-3329.
Parkhurst, M.R., Fitzgeald E.B., Southwood, S., Sette, A., Rosenberg S.A., Kawakami, Y.: Identification of a shared HLA-A*0201-restricted T-cell epitope from the melanoma antigén tyrosinase-related protein 2 (TRP2). Cancer Res., Nov 1, 58:21 (1998),
4895-4901.
Kirkin, A.F., Dzhandzhugazyan, K., Zeuthen, J.: Melanoma-associated antigens recognized by cytotoxic T lymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998),
665-679.
Hyodo, I., Doi, T., Endo, H., Hosokawa, Y., Nishikawa, Y., Tanimizu, M., Jinno, K., Kotani, Y.: Clinical significance of plasma vascular endothelial growth factor in gastrointestinal cancer. Eur. J. Cancer, Dec 34:13 (1998), 2041-2045. Sanchez, L.M., Chirino, A.J.,
Bjorkman, P.J.: Crystal structure of pl6lNK4
Glutatión S-transferáza human ZAG, a fat-depleting factor related to MHC molecules. Science, 19, 283 (5409),1999, 1914-1919.
Quelle, D.E., Ashmun, R.A., Hannon,
G. J., Rehberger, P.A., Trono, D., Richter, K.H., Walker, C., Beach, D., Sherr, C.J., Serrano, M.: Cloning and characterization of murine pl6INK4a and pl5INK4b genes. Oncogene, Aug 17, 11(4), 1995, 635-645.
Hengstler, J.G., Arand, M., Herrero,
M.E., Oesch, F.: Polymorphisms of Nacetyltransferases, glutathione Stransfeŕases, microsomal epoxide hydrolase ainfluence on cancer susceptibility. Recent Results Cancer Res., 154 1998, 47-85.
V nasledujúcej časti sa podrobne popisuje rad špecifických nádorových antigénov.
Špecifický membránový antigén prostaty, PSM
V USA je rakovina prostaty druhou najrozšírenejšou príčinou úmrtia následkom rakoviny (približne 40 000 ročne), a 200 tisíc pacientov ročne je diagnostikovaných (Boring 1993) . Asi každý jedenásty muž ochorie rakovinou prostaty. Okrem toho sa približne u 40 - 60 % pacientov rakoviny prostaty nakoniec choroba rozšíri mimo oblasť prostaty (Babaian 1994) . Hlavnou stratégiou v predkladanom vynáleze je využitie terapeutickej vakcinácie ako doplnkovej liečby k prostatektómii, aby sa eliminovalo reziduálne nádorové tkanivo a metastáze.
Niektoré patologické stavy sa lokalizujú v predstojnej žľaze, vrátane benígneho rastu (BPH), infekcie (prostatitis) a neoplazie (rakovina prostaty).
Biologická agresívnosť rakoviny prostaty je premenlivá. U niektorých pacientpv zostáva objavený nádor latentným histologickým tumorom a nikdy sa nestane klinicky významný. U iných pacientov nádor rýchlo rastie, metastázuje a zahubí pacienta v relatívne krátkom čase (2-5 rokov).
Bežnou primárnou liečbou rakoviny prostaty je prostatektómia. Vzhladom k rozsiahlemu rozptylu rakovinných buniek sa však väčšina pacientov s rakovinou prostaty nelieči lokálnym chirurgickým zákrokom. Pacienti s neohraničenou chorobou sa nakoniec liečia systémovou abláciou androgénu, ale ročná úmrtnosť v dôsledku rakoviny prostaty vôbec neklesla v priebehu 50 rokov, od kedy sa ablácia androgénu stala štandardnou terapiou metastazujúcej choroby.
PSM je membránový proteín vysoko špecifický pre prostatické tkanivá, tak benígne ako aj malígne, napriek tomu bola expresia PSM pozorovaná tiež v iných tkanivách, napríklad v obličkovom tkanive a v obličkových tumoroch, v tenkom čreve, v mozgu a v nádorových neovaškularizáciach. Preto, aj keď bola operácia úspešná, by sa u pacientov s odstránenou predstojnou žľazou mohla teoreticky prejaviť expresia PSM na reziduálnom nádorovom tkanive prostaty alebo v metastázach vzniklých z tohoto nádoru. Od vyvolania silnej CTL odozvy a/alebo silnej polyklonovej protilátkovej odozvy proti PSM sa očakáva eliminácia reziduálneho nádorového tkaniva.
Je zaujímavé, že po deprivačnej terapii androgénu pacientov s rakovinou prostaty je následne pozorovaná zvýšená aktivácia expresia PSM (Wright 1996) . Tým by sa po deprivačnej terapii androgénu stala liečba zameraná na PSM velmi vhodnou.
Prvý raz bol PSM identifikovaný v roku 1987 ako výsledok výroby monoklonovej protilátky 7E11-C5.3, použitej proti izolovanej ludskej bunke rakoviny prostaty LNCaP (Horoszewicz 1987). Protilátka rozpoznala tak normálny ako aj malígny prostatický epitel a použila sa v roku 1993 na čistenie a určenie aminokyselinovej sekvencie proteínu PSM a konečne na klonovanie génu (Israeli 1993) .
PSM je transmembránový glykoproteín typu II s molekulovou hmotnosťou 84 kD, ako sa predpokladá zo sekvencie nukleovej kyseliny, zatial čo glykozylovaná forma má pozorovanú molekulovú hmotnosť 100 - 120 kD. Sekvenovanie génu kódujúceho PSM odkrylo predpokladanú membránovú oblasť v súvislosti s tromi zvyškami cytosolického arginínového ukotvenia. Extracelulárnu časť PSM'tvorí 707 z celkových 750 aminokyselín proteínu, zatial čo v cytoplazmatickej doméne sa predpokladá dĺžka 19 aminokyselín (Israeli 1993). Pre PSM špecifická mRNA detegovaná v prostatickom nádorovom tkanive indikuje, že nádorový antigén nie' je nenormálne glykozylovaný proteín, ako tomu je v prípade napr. Tn- alebo sTnnádorových antigénov.
Celá dĺžka PSM cDNA bola transfektovaná do PSM negatívnej ludskej prostatickej rakovinnéj bunkovej línii PC-3 a v nej exprimovaná (Kahn 1994) . Okrem toho sa cDNA v plnej dĺžke (2,65 kilobáz) podrobila transkripcii a translácii in vitro (Kahn 1994) .
Nedávno bolo demonštrované, že PSM má hydrolytickú aktivitu podobnú N-acylovanej α-viazanej kyslej dipeptidáze (NAALADáza) - tým sa vo skutočnosti demonštrovalo, že tieto dva proteíny sú identické. NAALADáza je membránovo viazaná hydroláza nervového systému, ktorá katabolizuje neuropeptid N-acetylaspartyl glutamátu (NAAG), aby ovplyvnila glutamatergické signálne procesy. Zatial nie je známe, či tato aktivita PSM má nejakú relevantnú biologickú funkciu.
Tiež je pomerne dôležité predpovedať, či je možné očakávať nežiaducu krížovú reaktivitu s inými proteínmi dostupnými pre CTL alebo protilátky, ktorá by nasledovala po liečbe autovakcínou, ktorá indukuje PSM špecifické imunitné odozvy. Bolo ukázané, že časť kódujúcej oblasti PSM génu (pozície aminokyselín 418-567) má 54 % homológiu s ľudským receptorom transferínu (Israeli 1993) . Tiež sa našla úplná sekvenčná identita s enzýmom NAALADázy (viď vyššie). Žiadna funkčne relevantná podobnosť s inými známymi peptidázami nebola identifikovaná.
Homológia s receptorom transferínu je veľmi nízka a bude prednostne narušená v niektorom z konštruktov tohoto vynálezu. Neočakáva sa, že pozorovaná sekvenčná identita s ľudskou NAALADázou bude prekážkou pre PSM vakcínu, čiastočne kvôli nízkej schopnosti protilátok a CTL prenikať cez hematoencefalickú bariéru. Vôbec sa teda neočakáva, dokonca ani u konštruktov veľmi podobných PSM, že u pacientov dôjde ku krížovej reaktivite s inými proteínmi, ktorá by znemožnila túto aplikáciu.
Zo skorších štúdií je zrejmé, že PSM má expresiu na väčšine prostatických nádorových bunkách a na testovaných metastázach pochádzajúcich z prostaty. Ďalej, väčšina iných testovaných nádorov, napríklad karcinómy, sarkómy a melanómy rôznych tkanív, ako aj rozsiahly rad neprostatických ľudských nádorových buniek, sa ukázali ako PSM negatívne.
Naviac, velmi mnoho iných tkanív sa tiež ukázalo ako PSM negatívnych. Do tejto skupiny patrí tlsté črevo, prsia, pľúca, vaječníky, pečeň, močový mechúr, deloha, priedušnice, slezina, slinivka, jazyk, pažerák, žalúdok, štítna žľaza a prištítne telieska, nadobličky, lymfatické uzliny, aorta, dutá žila, pokožka, mliečna žľaza a placenta. Metódou RT-PCR sa však objavila existencia PSM mRNA aj u niektorých z uvedených tkanív.
Aj keď sa PSM nachádza prevážne ako molekula membránovo viazaná na prostatickom tkanive, malé množstvo PSM môže byť detegované aj v sére normálnych jedincov a zvýšené hladiny u pacientov s rakovinou prostaty (Rochon 1994, Murphy 1995) . Hladina cirkulujúcej PSM u týchto pacientov preto umožňuje sérologický monitoring účinnosti PSM vakcíny.
.Na základe všetkých dosial dostupných údajov je možné záverom konštatovať, že PSM je velmi špecifický antigén ludského prostatického tkaniva a z neho pochádzajúcich nádorov. To znamená, že u pacientov, ktorý podstúpili prostatektómiu, predstavuje PSM nádorovo kvazišpecifický vlastný antigén. Účinná PSM vakcína preto pravdepodobne zasiahne hlavne prostatické alebo z prostaty pochádzajúce metastázové tkanivo.
Ako bude zrejmé z príkladu 1, spôsob tohoto vynálezu prednostne vyžaduje, aby sa cudzí TH-bunkový epitop zaviedol do časti PSM aminokyselinovej sekvencie definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: dve pozície z 16-52 a/alebo 87-108 a/alebo 210-230 a/alebo 269-289 a/alebo 29880
324 a/alebo 442-465 a/alebo 488-514 a/alebo 598-630 a/alebo 643-662 a/alebo 672-699. Súčasťou vynálezu je okrem toho tiež modifikovaná molekula PSM, ktorá má cudzí TH-epitop vložený v týchto pozíciách.
Podľa toho je predmetom predkladaného vynálezu tiež analóg ľudskej PSM, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom tento analóg zahrnuje podstatnú časť všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov PSM a zahrnuje aspoň jeden cudzí TH epitop, ako sa tu diskutuje. Výhodnými analógmi PSM sú tie, v ktorých aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako vložený do aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako náhrada časti aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako výsledok odstránenia časti aminokyselinovej sekvencie PSM a najvýhodnejšími analógmi sú tie, v ktorých sa cudzí TH— bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie PSM definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: 2 pozície 16-52 a/alebo 87-108 a/alebo 210-230 a/alebo 269-289 a/alebo 298-324 a/alebo 442-465 a/alébo 488-514 a/alebo 598630 a/alebo 643-662 a/alebo 672-699.
Ľudský choriónický gonadotropín (HCG)
Súvislosť medzi embryonálnymi markermi a malígnymi fenotypmi sa diskutuje už po mnoho desaťročí. Narastajúci objem údajov naznačuje,' že aspoň jeden takýto marker, ľudský choriónický gonadotropín beta (hCGP), je súhlasne detegovaný v rakovinných bunkách najrôznejšieho histologického pôvodu, a že expresia týchto proteínov je často v korelácii so vzrastajúcimi metastatickými vlastnosťami. Humorálna imunitná odozva zameraná proti tomuto rozpustnému proteínu môže redukovať riziká šírenie nádoru a/alebo znížiť recidívu nového primárneho rastu v pooperačnom období.
Ľudský choriónický gonadotropín patrí do skupiny glykoproteínových hormónov, vrátane hormónu stimulovaného folikulom (FSH), hormónu stimulovaného štítnou žľazou (TSH) a hormónu žltého telieska (LH), ktoré všetky sú dôležitými regulátormi génovej expresie v reprodukčnom procese a prežitia plodu. Členovia tejto rodiny hormónov sú heterodiméry zdielajúce spoločný a-reťazec. β-reťazec je jedinečný pre každý hormón a dáva mu špecifičnosť, ktorá sa u β-reťazca LH prejavuje najsilnejšou sekvenčnou homológiou k ϊιΟΘβ (okolo 80 %) . Zdanlivá molekulová hmotriosť celého hCG je 37 kD, z ktorej. jednu tretinu tvoria uhľovodíky.· Posttranslačné sacharidové modifikácie zahrnujú uhľovodíky viazané tak cez N, ako aj cez O. Prítomnosť početných zvyškov sialovej kyseliny dáva proteínu silný záporný náboj. Kryštalická štruktúra celkového hCG bola vyriešená (Lapthorn et al.,
1994).
Na základe kryštalickej štruktúry sa ukázalo, že hCG vykazuje homológiu k rodine rastových faktorov vrátane PDGF a ΤβΕβ (Lapthorn et al., 1994). To naznačuje, že expresia hCG môže pomôcť regulovať rast rakovinnej. bunky.
Ľudský choriónický gonadotropín je glykoproteínový hormón produkovaný placentárnymi syncytiotrofoblastmi skoro po oplodnení a je podstatný pre zdarný priebeh tehotenstva u žien.
Patofyziologická úloha embryonálnych markerov pre rozvoj alebo udržaní rakovinnej hmoty nie je známa. Je však zaujímavé si Všimnúť, že trofoblasty (ktoré tieto proteíny obyčajne produkujú) majú tak angiogenické ako aj invazívne vlastnosti, ktoré sú obidve potrebné pre rakovinnú bunku. Ďalej bolo naznačené, že hCG (alebo jeho subjednotky) môžu inhibovať imunitnú reakciu materských buniek na tkanivo plodu. Štúdie napríklad ukázali, že hCG priamo potlačuje odozvy T buniek (Jacoby et al., 1984) a je pravdepodobné, že v dôsledku imunitné potlačeného odčerpávanie (v tomto prípade) primárneho melanómu lymfatickými uzlinami, vzniká priaznivejšie prostredie pre vytváranie nádorových metastáz. V dôsledku toho môže expresia hCG3 napomôcť šíreniu rakovinných buniek do sekundárnych miazgových orgánov. Konečne, ako už bolo zmienené, preukázala sa štruktúrna homológia medzi hCG a radom rastových faktorov. Inou možnosťou preto je, že sekrécia hCG rakovinnými bunkami môže podporovať rast nádoru.
Expresia hCG£ bola pozorovaná u mnohých rôznych typov rakoviny, napríklad: a) adenokarcinóm prostaty: pozitívny nález hCGP v tkanivových sekciách bol pozorovaný u pacientov so špatnou prognózou, bez ohladu na histologický typ nádoru (Sheaff et al., 1996); b) rôzne druhy plúcnych nádorov: dlaždiove bunky (SQCC), adenokarcinóm (AC) a velké bunky (LLC), všetky vykazujú vysoké percento reaktivity voči hCGp (Boucher et al., 1995); c) adenokarcinóm pankreasu (Syrigos et al., 1998); d) neuroblastómy, rakoviny mozgu,, retinoblastómy (Acevedo et al.,. 1997); e) malígny melanóm (Doi et al., 1996); f) rakovina močového mechúra (Lazar et al., 1995). Nedávny článok opisuje DNA prístup, v ktorom sa myši imunizovali prípravkami s expresiou hCG3 (Geissler et al., 1997) . U tohoto modelu in vivo inhibícia rastu nádoru silne súvisela s aktivitou CTL, ale boli tiež detegované aj vysoké hladiny protilátok (ktoré neutralizujú biologický účinok intaktného hCG na jeho bunkový receptor).
Použitie hCG ako imunogénu sa popisuje v niekoľkých publikáciách so zameraním na jeho využitie ako anti83 koncepčnej vakcíny (Talwar et al., 1976 a Talwar et al.,
1994) . Klinická skúška zamedzujúca plodnosti s využitím vakcíny proti celému hCG sa ukázala ako vysoko účinná a spolahlivá (Talwar et al., 1994). Bola tiež uskutočnená prvá fáza klinických skúšok na pacientoch trpiacimi rakovinou s vakcínou proti syntetickému peptidu hCGp ukončenému karboxylovou skupinou konjugovaného na záškrtový toxoid (Triozzi et al., 1994) a druhá fáza skúšok prebieha. Napriek tomu, že myšlienka využiť hCGp ako cielenú vakcínu proti rakovine sa už nejaký čas objavuje, nebola nikdy skúmaná v súvislosti s technológiou äutovakcinácie.
Je známe, že bunky z neembryonálneho tkaniva alebo benígnych nádorov nemajú expresiu hCGp.. Preto by vakcinácia proti tejto molekule nemala mať prípadné vedľajšie účinky (odhliadnuc od účinkov na tehotenstvo) . Pretože má expresiu na toľkých rozdielnych druhoch rakoviny, označuje sa táto molekula ako „rozhodný rakovinný biomarker (Acevedo et al., 1995 a Regelson W., 1995) a ako taká je atraktívnym cieľom ďalšieho výskumu.
Vhodné živočíšne modely pre ďalšie štúdie efektívnosti vakcíny na báze hCG je možné nájsť v Acevedo et al. : Cancer Det. and Prev. Supí. 1, (1987), 477-^48 6 a v Kellen et al. :
Cancer Immunol. Imun. Ther. 13 (1982), 2-4.
Her2
Predpokladá sä, že receptory tyrozín kinázy Her2 a EGFr hrajú zásadnú úlohu v malígnej transformácii normálnych buniek a v pokračujúcom raste rakovinných buniek. Zvýšená expresia väčšinou vedie k špatným prognózam. V priebehu niekoľkých minulých rokov sa veľa publikácií zaoberalo využitím protilátok proti týmto receptorom k liečbe rakoviny pri zvýšenej expresii jedného z nich alebo obidvoch receptorov. Genentech Inc. ukončil niekoľko úspešných klinických skúšok u pacientov s rakovinou prsníka s použitím monoklonovej protilátky proti Her2 a nedávno získal oprávnenie FDA na predaj preparátu monoklonovej protilátky proti Her2, Herceptinu®.
Technológia autovakcinácie opísaná v tomto vynáleze by pri aplikácii na Her2 vyvolala polyklonové protilátky, ktoré by prevážne reagovali s Her2. Od týchto protilátok sa očakáva, že napadnú a eliminujú nádorové bunky, ako aj zabránia metastatickým bunkám sa rozvinúť do metastáz. Efektorový mechanizmus tohoto protinádorového účinku by bol sprostredkovaný cez komplement a bunkovú cytotoxicitu závislú na protilátke.
V závislosti na výbere prípravkov by vyvolané autoprotilátky mohli tiež inhibovať rast rakovinných buniek pomocou inhibície oligo-dimerizácie závislej na rastovom faktore a internalizáciou receptorov. Čo však je najdôležitejšie, od analógov Her2 sa očakáva, že budú schopné indukovať odozvy CTL proti známym a/alebo predpokladaným Her2 epitopom zobrazeným nádorovými bunkami.
Her2 patrí do skupiny receptorov epidermálnych rastových faktorov (c-erbB), ktorá k dnešku pozostáva zo štyroch rozdielnych receptorov označovaných: c-erbB-Ι (EGFr), c-erbB2 (Her2, c-Neu), c-erbB3 a c-erbB-4 (Salomon et al., 1995). C-erbB-3 a c-erbB-4 nie sú charakterizované tak dobre ako EGFr a Her2. Her2 je integrálny glykoproteín. Hotový protein má molekulovú hmotnosť 185 kD so štruktúrnymi rysmi, ktoré sa veľmi podobajú EGFr receptoru (Prigent et al., 1992). EGFr je tiež integrálny membránový receptor pozostávajúci z jednej subjednotky. Má zdanlivú molekulovú hmotnosť 170 kD a pozostáva z povrchovej ligandy viažucej domény 621 aminokyselín, z jedinej hydrofóbnej transmembránovej domény 23 aminokyselin a z velmi zachovanej cytoplazmatickéj tyrozin kinázovej domény 542 aminokyselín. Proteín je N-glykozylovaný (Prigent et al., 1994).
Všetky proteíny tejto skupiny sú tyrozin kinázy. Interakcia s ligandom vedie k dimerizácii receptora, ktorá zvyšuje katalytickú aktivitu tyrozin kinázy (Bernard, 1995, Chantry,
1995). Proteíny tejto skupiny sú schopné homo- a heterodimerizácie, ktorá je dôležitá pre ich aktivitu. EGFr prenáša účinky podporujúce rast a stimuluje absorpciu glukózy a aminokyselin bunkami (Prigent et al., 1992). Her2 tiež prenáša signály podporujúce rast. Len EGFr viaže EGF a TGF-a. Tieto ligandy sa neviažu na iné receptory z tejto skupiny (Prigent et al., 1992). Ligandy pre Her2 nie sú úplne určené. Bolo však ukázané, že heregulín indukuje fosforyláciu pomocou aktivácie Her2. Nezdá sa, že by to bolo spôsobené priamou väzbou na receptor, ale predpokladá sa, že heregulín je ligandom pre erbB-3 a erbB-4, ktorý potom aktivuje Her2 pomocou oligodimerizácie (Solomon e.t al., 1995).
Homológia medzi proteínmi skupiny EGF receptoru je najvýraznejšia v doméne tyrozin kinázy v cytoplazmatickej časti molekúl (82 % medzi EGFr a Her2). V extracelulárnej oblasti je homológia nižšia - od 41 % do 46 % v rôznych doménach (Prigent et al., 1992).
Epidermálny receptor rastového faktoru je na normálnom tkanive exprimovaný v malom množstve, ale má zvýšenú expresiu u mnohých typov nádorov. EGFr má zvýšenú expresiu u rakoviny prsníka (Earp et al., 1993, Eppenberger, 1994), u gliómov (Schlegel et al., 1994), u rakoviny žalúdka (Tkunaga et al.,
1995), u nádoru horných kožných vrstiev (Fujii 1995), u rakoviny vaječníkov (van Dam et al., 1994) a u iných. Her2 je tiež exprimovaný na niekoľkých normálnych ľudských tkanivách v malom množstve, najtypickejšie na sekrečnom epiteli. Zvýšená expresia Her2 nastáva u asi 30 % rakovín prsníka, žalúdka, slinivky, močového mechúra a vaječníkov.
Expresia týchto receptorov sa mení v závislosti na stupni diferenciácie nádorov a na type nádoru, napr. u rakoviny prsníka majú primárne nádory zvýšenú expresiu obidvoch receptorov, zatial čo u rakoviny žalúdka sa zvýšená expresia objaví až v pozdnejšom štádiu v metastázových nádoroch (Salomon et al., 1995). Počet receptorov so zvýšenou expresiou na rakovinných bunkách je vyšší než 106/bunku pre niekoľko nádorov rakoviny hlavy a krku, vulvy, .prsníka a vaječníkov, ako sa zistilo izoláciou týchto buniek z tkaniva pacientov (Dean et al., 1994).
Existuje niekoľko dôvodov, pre ktoré skupina EGFr receptorov predstavuje vhodný ciel nádorovej imunoterapie. Po prvé, tieto receptory majú zvýšenú expresiu u mnohých typov rakoviny, čo by malo smerovať imunitnú odozvu proti nádoru. Po druhé, nádory často exprimujú alebo zvýšene exprimujú ligandy pre túto skupinu receptorov a niektoré sú hypercitlivé na účinky bujnenia sprostredkované ligandmi. Po tretie, pacienti s nádormi, ktoré majú zvýšenú expresiu receptorov rastového faktoru, majú často velmi špatnú prognózu. Zvýšená expresia je úzko spojené so špatnou prognózou predovšetkým u rakoviny prsníka, pľúc a močového mechúra a zrejme súvisí s invazivnými/metastatickými fenotypmi, ktoré sú prakticky necitlivé na konvenčnú liečbu (Eccles et al., 1994).
Zvýšená expresia Her2 je v niektorých prípadoch výsledkom zosilnenia génu a v iných prípadoch výsledkom zvýšenej transkripcie a translácie. Zvýšená expresia Her2 je spojená so špatnou prognózou u rakoviny prsníka, vaječníkov, žalúdka, močového mechúra, prípadne aj pri rozsiahlejšej rakovine plúc (Solomon et al., 1995).
Fáza I klinických skúšok sa uskutočňovala s bišpecifickou protilátkou u pacientov s pokročilou rakovinou prsníka a vaječníkov. Protilátka bola bišpecifická proti Her2 a FcyRI (Weiner et al., 1995). Účinný rozpad nádorových buniek so zvýšenou expresiou Her2 sa pozoroval u bišpecifickej protilátky proti Her2 a CD3 (Zhu et al., 1995).
Liečba myší so štiepom ludského karcinómu žalúdka monoklonovou protilátkou proti Her2 predĺžila život myší (Ohniski et al., 1995). Protinádorové aktivity monoklonových protilátok proti Her2 in vitro a in vivo neprebiehajú rovnakým mechanizmom; môžu pôsobiť ako čiastočné ligandové agonisty, meniť premenu receptora Her2 a fosforyláciu alebo môžu ovplyvniť dimerizáciu (Lupu et al., 1995).
Podobne bolo ukázané, že protilátky k EGFr tiež narušujú interakcie s rastovým faktorom (Baselga et al., 1994, Modjahedi et al., 1993a, Wu et al., 1995, Modjahedi et al., 1993b, Tosi et al., 1995, Dean et .al., 1994, Bier et al., 1995, Modjahedi et al., 1996, Valone 1995).
Jedno z dôležitých uskutočnení tohoto vynálezu spočíva preto v tom, že sa cudzí T-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie Her2 definovanej pomocou číslovania v sekvenčnom identifikačnom čísle: 3 pozície 5-25 a/alebo 59-73 a/alebo 103-117 a/alebo 149-163 a/alebo 210-224 a/alebo 250-264 a/alebo 325-339 a/alebo 369-383 a/alebo 465479 a/alebo 579-593 a/alebo 632-652 a/alebo 653-667 a/alebo 661-675 a/alebo 695-709 a/alebo 710-730, viď príklady uskutočnenia vynálezu.
Predmetom vynálezu je preto tiež analóg ludského Her2, ktorý je u ludí imunogénny a ktorý zahrnuje podstatnú časť všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov Her2 a obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop, ako sa tu diskutuje. Je výhodné, keď je tento aspoň jeden cudzí TH epitop prítomný ako vložený do aminokyselinovej sekvencie Her2 alebo ako náhrada časti aminokyselinovej sekvencie Her2 alebo ako výsledok odstránenia časti aminokyselinovej sekvencie Her2. Najvýhodnejšími analógmi sú tie, ktoré boli definované vyššie, t.j. v ktorých sa cudzí TH-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie Her2 definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: 3 pozície 5-25 a/alebo 59-73 a/alebo 103-117 a/alebo 149-163 a/alebo 210-224 a/alebo 250-264 a/alebo 325-339 a/alebo 369-383 a/alebo 465479 a/alebo 579-593 a/alebo 632-652 a/alebo 653-667 a/alebo 661-675 a/alebo 695-709 a/alebo 710-730.
FGF8b
Niekolko výskumníkov ukázalo, že FGF8b môže vyvolať bujnenie, transformáciu, diferenciáciu a v niektorých prípadoch silno zvýšiť tvorbu nádorov z materských buniek a tkanív (Tanaka 1992, Kouhara 1994, Lorenzi 195, MacArthur 1995a, Crossley 1996a, 1996b, Ghosh 1996, Ohuchi 1997a, RudraGanguly 1998). Tieto účinky sú primárne sprostredkované väzbou FGF8b k fibroblastovým receptorom rastového faktoru
FGFR2, FGFR3 a FGFR4 (MacArthur 1995b, Blunt 1997, Tanaka
1998) . Ukázalo sa teda, že bunky s expresiou jedného z týchto receptorov a FGF8b poskytujú autokrinnú kaskádu signalizujúcu rast, ktorá vedie k bujneniu'. Najpravdepodobnejšie je biologický účinok FGF8b sprostredkovaný cestou JAK/STAT3, pretože sme my aj iný autori pozorovali, že prídavok FGF8b do rastového média určitých buniek vyvolá fosforyláciu STAT3, rys podozrivý z toho, že urobí bunky odolné, voči zániku (Catlett - Falcone 1999).
K vyššie zmienenému pozorovaniu in vitro bolo naviac nedávno dokázané, že expresia FGF8(b) je významne viac aktivovaná u rakoviny prostaty a prsníka (Marsh 1999, Dorkin
1999) . Veríme preto, že autovakcína proti FGF8(b) bude velmi účinným prostriedkom k liečbe radu nádorov s expresiu FGF8 alebo snáď zvýši ich citlivosť na látky indukujúce ich zánik.
Rakovina prostaty
Biologická agresivita prostatických karcinómov je rôzna. U niektorých pacientov zostane objavený nádor latentným histologickým nádorom a nikdy sa nestane klinicky významným. U iných pacientov má nádor rýchlu progresiu, metastázuje a usmrtí pacienta v relatívne krátkom čase (2-5 rokov).
K diagnostickým účelom a k sledovaniu odozvy na terapiu rakoviny prostaty sa primárne používa stanovenie cirkulujúcich hladín dvoch proteínov: prostatickej kyslej fosfatázy (PAP) a prostatického špecifického antigénu (PSA) (Nguyen 1990, Henntu 1989). Vzhľadom k narušeniu normálnej stavby prostatickej žľazy v dôsledku vývoja karcinómu sa tieto rozpustné proteíny dostanú do obehu, kde môžu byť stanovené ako markery pre napr. šírenie metastáz.
' Bežnou primárnou liečbou rakoviny prostaty je prostatektómia. Vzhladom k rýchlemu šíreniu rakovinných buniek však väčšina pacientov s rakovinou prostaty nie je lokálnym chirurgickým zákrokom vyliečená. Pacienti s neomrzeným priebehom choroby podstúpia liečbu systémovou abláciou androgénu, ale ročná úmrtnosť na rakovinu prostaty za posledných 50 rokov, kedy sa ablácia androgénu stala štandardnou liečbou metastatickej choroby, nepoklesla.
RT-PCR analýza ukázala, že FGF8 mRNA je produkovaná líniami ľudských prostatických epiteliálnych nádorových buniek LNCaP, PC-3, ALVA-31 a DU145, pričom FGF8b je najvýznačnej šou izoformou (Tanaka 1995, Ghosh 1996). Rast LNCaP buniek citlivých na androgén sa stimuluje prídavkom rekombinantného FGF8b (Tanaka 1995), zatial čo rast DU145 buniek by sa mohol inhibovať pomocou transfekcie vírusom s expresiu „antisense FGF8b (Rudra-Ganguly 1998). Toto, spoločne s dôkazom z vývojových štúdií diskutovaným ďalej, ukazuje úlohu FGF8b pri udržiavaní karcinogénneho stavu týchto bunkových línií.
Použitím FGF8a cDNA k hybridizačným experimentom in situ Leung so spolupracovníkmi ukázali, že vysoký podiel (80 % (n=106) a 71 % (n=31)) prostatických karcinómov produkuje FGF8 mRNA a že množstvo FGF8 mRNA koreluje so závažnosťou nádorov (P<0,0016, resp. P<0,05)(Leung 1996, Dorkin 1999). Použitie monoklonovej anti-FGF8b protilátky ukázalo, že práve tato izoforma je zodpovedná za zvýšenú expresiu FGF8b (Dorkin 1999) . Naviac, ľudia s nádormi s expresiou vysokých hladín FGF8 majú horšie vyhliadky na prežitie (P=0,034) a táto expresia FGF8 pretrváva v prostatických nádoroch nezávislých na androgéne (Dorkin 1999). Podía výsledkov uvádzaných Dorkinom a spolupracovníkmi expresia FGF8b v prostatickom karcinóme môže predpovedať pacientovo prežitie.
Imunohistochemická analýza s použitím monoklonovej protilátky proti FGF8 detegovala proteín v 93 % (n=43) ľudských prostatických karcinómoch (Tanaka 1998) . Normálne prostatické. tkanivo alebo benígna prostatická hyperplazia produkuje nízke hladiny FGF8 mRNA a neobsahuje stanovitelné množstvo proteínu FGF8 (Leung 1996, Yoshimura 1996, Ghosh 1996, Tanaka 1998, Dorkin 1999).
Z týchto výsledkov vyplýva, že autovakcína proti FGF8(b) by bola reaktívna proti prostatickému nádorovému tkanivu, a tým nesmierne cenná pre liečbu rakoviny prostaty.
Rakovina prsníka
Bežnou liečbou rakoviny prsníka je chirurgický zákrok. Vzhľadom k rozsiahlemu šírenia buniek rakoviny prsníka nie je však značná časť pacientov s rakovinou prsníka vyliečená lokálnym chirurgickým zákrokom.
Pacienti 's neohraničenou chorobou sa nakoniec liečia abláciou androgénu, chemoterapiou a/alebo ožarovaním. Úmrtnosť pri ochorení rakovinou prsníka je však stále relatívne vysoká.
FGF8 sa pôvodne izoloval z bunkovej línie myšieho karcinómu prsníka (SC-3), z ktorej mohla byť indukovaná expresia pridaním androgénu do média (Nonomura 1990). O proteínu je tiež známe, že vyvoláva bujnenie týchto, aj iných cicavčích buniek. V poslednom čase sa preukázalo, že FGF8b mRNA sa vyskytuje v ôsmych (n=8) bunkových líniách ludského karcinómu prsníka (MDA-MB-231, MDA-MB-415, ZR 75-1, T-47-D, SK-BR-III, PMC-42, HBL-100 a MCF-7) (Tanaka 1995, Payson 1996, Wu 1997, Marsh 1998).
U transgenetických myší Wnt-1 infikovaných vírusom myšieho nádoru prsníka (MMTV) sa rozvinuli prsníkové nádory. Transkripcia FGF8 sa aktivovala v 50 % týchto nádorov (MacArthur 1995c, Kapoun 1997).
Transgenetické myši, ktoré nesú FGF8b cDNA riadenú promótorom velmi špecifického myšieho prsníkového nádorového vírusu (MMTV) vykazovali spontánny rozvoj FGF8b s expresiou prsníkových nádorov (Coombes, osobná diskusia).
Najnovšie údaje ukazujú, že expresia FGF8(b) je u rakoviny prsníka nadmerne aktivovaná (Tanaka 1998, Marsh 1999). Tanaka a spolupracovníci použili v imunohistochemických štúdiách novú monoklonovú protilátku FGF8. Ukázali, že FGF8 sa vyskytoval v 67 % (n=12) prípadov rakoviny, prsníka a že androgénové receptory sa vyskytli v 89 % prípadov ochorenia prsníka pozitívnych na FGF8 (hyperplazia, fibroadenóm, intraduktálny papilóm a karcinómy), čo by umožnilo zapojenie slučky podporujúcej autokrinný rast do progresie karcinómov prsníka (Tanakaka 1998). S použitím semikvantitatívnej metódy RT-PCR sa ukázalo, že zvýšené hladiny FGF8 mRNA sa našli v malígnych pri porovnaní s nemalígnymi tkanivami prsníka. Významne viac malígnych tkanív malo expresiu FGF8 (p=0,019) vo významne vyšších hladinách (p=0,031) (68 karcinómov prsníka a 24 nemalígnych tkanív prsníka) (Marsh 1999).
Funkcia FGF8(b) ako autokrinného rastového faktora sa ešte úplne nepreukázala. Avšak skutočnosť, že velké množstvo nádorov má zvýšenú expresiu FGF8b, hovorí silne pre to, že autovakcína proti FGF8b by mohla byť účinná proti vysokému percentu karcinómov prsníka a prostaty. Údaje uvádzané Marshom, Dorkinom a Tanakom nasvedčujú tomu, že autovakcína proti FGF8(b) by mohla byť použitá pre liečbu rakoviny tak prsníka ako aj prostaty a do istej miery menej presné údaje uvádzané Dorkinom a kol. sú ďalšou podporou názoru, že FGF8 je zapojený do progresívneho rastu ľudských rakovinných buniek.
Popis FGF8b
FGF8 patrí do skupiny fibroblastických rastových faktorov (FGFs). Tieto proteíny regulujúce rast sú proteíny malých amínokyselinových zvyškov «200, ktoré všetky sa podieľajú na vyvolaní bujnenia a diferenciácii širokej oblasti buniek. Posledný prehľad, ako sa podieľajú fibroblastické rastové faktory na vývoji končatín stavovcov, priniesol Johnson 1997. Členovia skupiny FGF sú evolučné príbuzný a zdieľajú identitu aminokyselinovej sekvencie z 20 - 50 %.
FGF8b je strihovým variantom FGF8, pôvodne nazývaným androgénom indukovaný rastový faktor (AIGF). AIGF sa prvýkrát identifikoval ako proteín vylučovaný bunkovou líniou (SC3) myšieho karcinómu prsníka pri stimulácii androgénom (Nonomura 1990). U myší obsahuje gén FGF8· 6 exónov potenciálne kódovaný pre osem rôznych FGF8-izoforiem (FGF8ah), ktoré sa odlišujú len v N-koncoch molekúl (Crossley 1995, MacArthur 1995b). Ľudský FGF8 má rovnakú génovú štruktúru ako gén u čeľadi myšovitých. Avšak kvôli stop kodónu v exóne IB môže ludský FGF8 existovať vo štyroch rôznych izoformách, totiž FGF8a, FGF8b, FGF8e a FGF8f (Gemel 1996). Génové štruktúry a aminokyselinové sekvencie štyroch ľudských izoforiem znázorňuje obrázok 5.
Hotový FGF8b obsahuje 193 aminokyselinových zvyškov a má vypočítanú molekulovú hmotnosť 22,5 kDa. Vysoko zásaditý proteín obsahuje 21 arginínových a 14 lyzínových zvyškov, výsledkom čoho je vypočítaný izoelektrický bod 10,84 a vypočítaný pozitívny náboj 19,8 pri pH « 7,0. Obsahuje dva cysteínové zvyšky a má dve možné N-glykozylačné polohy. Vzhladom k povahe uskutočnených výskumov týkajúcich sa FGF8b sa veľmi málo vie o proteínovej časti FGF8b. Bol však heterológne exprimovaný z baktérie, vyčistený s použitím hexahistidínového značenia s C-koncom a potom in vitro prevedených do rozpustného a biologicky aktívneho stavu (MacArthur 1995a, Blunt 1997).
Biologická aktivita FGF8b
Ako už bolo povedané, FGF8 (b) sa prvý raz izoloval ako faktor uvoľňovaný bunkovou líniou myšieho prsného nádoru závislom na androgéne a bolo ukázané, že tento proteín môže indukovať bujnenie týchto buniek. Morfologické zmeny imitujú tie, ktoré indukuje testosterón, o ktorom sa tiež vie, že indukuje syntézu FGF8(b) mRNA (Tanaka 1992). Bujnenie sa môže inhibovať antisense oligoproteínmi FGF8(b) (Nonomura 1990, Tanaka 1992 a Yamanishi 1994). Skutočne, rast bunkovej línie DU145 ľudského karcinómu prostaty sa môže inhibovať transfekciou vírusom s expresiou antisense FGF8b (RudraGanguly 1998). Najnovšie údaje ukazujú, že FGF8b indukuje fosforyláciu STAT3 - proteínu, o ktorom sa predpokladá, že sa podieľa na obrane proti odumretiu (Catlett-Falcone 1999, Johnston, C.L., nepublikované výsledky).
Niekolko výskumníkov ukázalo, že FGFŠb je velmi účinný pri indukcii transformácie buniek NIH3T3 alebo SC115 (Miyashita 1994, Kouhara 1994, Lorenzi 1995, MacArthur 1995a). Použitím rekombinantne exprimovaných proteínov sa tiež ukázalo, že táto indukcia morfologických zmien je omnoho účinnejšia s FGF8b než s FGF8a alebo FGF8c (MacArthur 1995a, Ghosh
1996). Je zaujímavé, že samotná N-koncová polovica molekuly FGF8b sa ukázala ako dostačujúca pre transformáciu NIH3T3 buniek, a dokonca malý FGF8b špecifický peptid (QVTVQSSPNFT) umožňuje v koncentráciiO,1% séru, aby bunky rástli 2-3krát pomalší odpovedá normálu (Rudra-Ganguly 1998) . Naviac bolo opísané, že NIH3T3 bunky stabilne transfektované vektorom kódujúcim FGF8b sú v prípade vnútroočnej injekčnej aplikácii do holých myší silne nádorotvorné (Kouhara 1994, Ghosh 1996).
Je známe, že in vivo má FGF8b expresiu v určitých štádiách vývoja stavovcov. Biologické úlohy pripisované FGF8b zhrňuje tabuľka 1. Pre prehľad zapojenie FGF8(b) do vývoja stavovcov viď. Goldfarb 1999 a Johnson 1997.
Tabuľka 1: Rozličné miesta/tkanivá produkujúce FGF8 a navrhnutá biologická úloha, prípadne úlohy
Dej/mechanizmus/výskyt (druh)_
Prítomnosť vo vyvíjajúcich sa zárodkoch končatín (myši)
Výrastky krídiel zárodkov (kurčatá)
Indukcia tvorby ektopických končatín z mezodermu (kurčatá)
Indukcia tvorby stredného mozgu z kaudálneho medzimozgu (kurčatá)
Iniciácia výrastkov krídiel u bezkrídelného mutantu (kurčatá)
Úloha pri dorzoventrálnej modelácii gastruly (danio páskované)
Potrebný behom gastrulačného, kardiálneho, kraniofaciálneho, predomozgového, stredomozgového a celeberálneho vývoja (tkanivo špecificky knockoutovaných myší)
Úloha v morfogenézii zubov (myši)
Odkazy
Heikinheimo 1994, Ohuchi 1994
Kuwana 1997,
Xu 1998
Crossley 1996b
Crossley 1996a
Ohuchi 1997a
Furthauer 1997
Meyers 1998
Kettunen 1998
Predpokladá sa, že FGF8b pôsobí prostredníctvom väzieb na receptory fibroblastického rastového faktoru (RGFR). 0 FGF8b je zvlášť známe, že je schopný aktivovať FGFR2c, FGFR3c, FGFR4c a do určitej miery tiež FGFRlc, ale nie FGFRlb, -2b alebo -3b (MacArthur 1995b, Blunt 1997). V prípade indukcie rastu ektopických kuracích končatín to implikuje interakcie FGF10, FGFR2 a FGF8, a že to by mohlo pre rast stačiť (Kuwana 1997, Xu 1998). Tieto výsledky podporujú hypotézu, že FGF8 (b) môže pôsobiť v auto- a parakrinnom režime, ktoré vedie k normálnemu rastu a formovaniu niektorých anatomických štruktúr béhom vývoja stavovcov. Je dôležité, že FGF8 „úplne knokoutovaných myší neprežije najskôr vďaka komplikovanému zapojeniu proteínu v embryonálnom vývoji.
Homológia k iným proteínom
Velmi dôležité je predpovedať, či je možné očakávať nežiaducu krížovú reaktivitu s inými proteínmi prístupnými pre protilátky, ktorá by nastala po liečbe s autovakcínou indukujúcou FGF8 špecifické autoprotilátky. Vďaka vysokej sekvenčnej identite medzi FGF8b a ostatnými molekulami FGF8 je možné očakávať krížové reakcie autovakcíny s týmito proteínmi. Podlá všetkého by to však bolo vhodné, lebo o žiadnom z týchto proteínov nie je známa expresia v tkanivách alebo bunkových líniách, v ktorých už nie je expresia FGF8b.
Aminokyselinové zvyšky 55 - 175 FGF8b ukazujú relatívne nízky, ale významný stupeň sekvenčnej identity s ostatnými FGF. Obecne je prijaté (a niekoľkokrát dokázané), že významný stupeň sekvenčnej identity medzi dvomi proteínovými doménami sa tiež zobrazí vo velmi podobnej terciárnej štruktúre. Predpokladá sa takto, že všetci členovia FGF skupiny sú si obecne štruktúrne blízky. Trojrozmerná štruktúra FGF2 sa vyriešila z kryštalickej formy, ako aj v roztoku (Ago 1991,
Zhang 1991, Zhu 1991, Eriksson 1993, Blaber 1996, Moy 1996) . FGF2 je zložený výhradne z beta-sheet štruktúry zahrnujúcej trojité opakovanie štvoršraubového antiparalelné betameandru. Tato beta-barelová štruktúra je úplne zachovaná medzi interkleukinom 1, FGF2 (alebo bázickým FGF) a FGFl (alebo kyslým FGF). Nukleárna magnetická rezonancia FGF2 v roztoku ukázala, že N-koncová časť molekuly tvorí relatívne flexibilnú štruktúru. Ostávajúca časť FGF8b (aminokyselinové zvyšky 1-54 a 176-215) len ukazuje nízky stupeň sekvenčnej identity k známym proteínom.
Na základe štruktúrnych a iných dostupných údajov je obecne prijímané, že trojrozmerný štruktúrny skelet ostatných fibroblastických rastových faktorov je velmi podobný štruktúre FGFl a FGF2. Tieto štruktúrne úvahy sú dôležitými faktormi nášho návrhu molekúl mutantnej autovakcíny FGF8b.
Dôležité je, že vďaka relatívne nízkej sekvenčnej identite medzi FGF8 a akýmkoľvek iným členom skupiny FGF bude povrch FGF8 veľmi rozdielny od iných FGF, čím sa minimalizujú krížové reakcie autovakcínou FGF8b generovaných protilátok s inými členmi skupiny FGF. Vzhľadom k.veľmi nízkej homológii s inými proteínmi, než sú fibroblastické rastové faktory, neočakávame, že autovakcína proti FGF8b bude krížovo reagovať s akýmikoľvek inými proteínmi.
Je však treba zdôrazniť, že autovakcína proti FGF8b bude pravdepodobne krížovo reagovať so všetkými izoformami FGF8. Nepredpokladá sa, že by to robilo ťažkosti, pretože žiadna z izoforiem FGF8 sa u dospelých jedincov nevyskytuje vo významnom množstve. Je dokonca možné, že tieto krížové reakcie budú prospešné pri liečbe rakoviny, pretože sa ukázalo, že aspoň niektoré rakovinné bunkové línie obsahujú okrem FGF8b ešte iné izoformy.
Rozloženie FGF8b v tkanivách
Bolo by optimálne, keby sa indukované autoprotilátky a následné efektorové mechanizmy, ako aj očakávaná odozva CTL zvýšená autovakcináciou zamerali len na tkanivo, ktoré má byť u pacienta eliminované. Preto je tkanivové rozloženie antigénu, ktorý je terčom autovakcíny, veľmi dôležité z hľadiska bezpečnosti vakcíny.
Tabuľka 2: Expresia FGF8b v rôznych tkanivách a bunkách
Človek
Bunkové línie rakoviny prsníka (MDA-MB-231, MDA-MB-415, ZR 75-1, T-47-D, SK-BR-HI, PMC-42, HBL-100 a MCF-7)
Nádory prsníka
Normálne tkanivo prsníka
Rakovina prostaty (93 %)
Choroby prsníka
Pro statické nádorové bunky (LNCaP,
PC-3, DU145 a ALVA 31)
Obličky plodu
Dospelá prostata, semenníky, obličky, neuróny
Teratokarcinomatické bunky (Tera-2)
Čeľaď myšovitých
Bunkové línie rakoviny prsníka (SC-115, RENCA)
Hypotalamus, semenníky
Nádory prsníka (Wnt-1, transgénny) ((RT-PCR) Tanaka 1995, Payson 1996, Wu 1997,
Marsh 1999) ((mAb) Tanaka 1998, (RT-PCR) Marsh 1999) ((RT-PCR) Wu 1997, Marsh 1999, (mAb) Tanaka 1998) ((in situ hyb.) Leung 1996,
Dorkin 1999, (mAb)
Tanaka 1998) ((mAb) Tanaka 1998) ((RT-PCR) Tanaka 1995, Ghosh 1996, Schmitt 1996) ((NB) Ghosh 1996) ((RT-PCR) Ghosh 1996, Wu
1997, Dorkin 1999) ((RT-PCR) Wu 1997) ((RT-PCR) Yoshimura 1996) ((RT-PCR) Yoshimura 1996) ((NB) MacArthur 1995c)
Mozog embrya
Vaječníky, semenníky
Vývoj tváre a a zárodkov končatín
Gastrula
Kurčatá
Mozog embrya
Vývoj končatín ((in situ hyb.) Crossley 1995, Heikinheimo 1994, Ohuchi 1994, Shimamura 1997, (RT-PCR) Blunt 1997) (NB) Valve 1997) ((pAb) MacÁrthur 1995b, (insitu hyb.) Heikinheimo 1994, Ohuchi 1994, Crossley 1995) ((in situ hyb.) Crossley 1995) ((in situ hyb.) Crossley 1996a) ((in situ hyb.) Ohuchi 1997a,b)
Potkan
Prostata a semenníky ((RT-PCR) Schmitt 1996)
Tabulka ukazuje široký výber tkanivového rozloženia a bunkových línií s expresiou FGF8b. Tiež z nej vyplýva, že väčšina údajov týkajúcich sa rozloženia v tkanivách bolo získaných citlivou metódou RT-PCR. To preto, že NB analýza nezachytí FGF8b mRNA v žiadnom normálnom tkanive s výnimkou obličiek plodu. Z týchto obmedzených údajov sa obecne prijíma, že expresia FGF8b mRNA u dospelých jedincov je velmi obmedzená, a tak autovakcína proti FGF8b by pravdepodobne nemala byť reaktívna proti normálnemu tkanivu. Ďalšie analýzy tkanivového rozloženia proteínu sú potrebné preto, že malé množstvo FGF8b by mohlo mať reakcie v neznámych systémoch u dospelých. Podía nášho názoru však nič nenasvedčuje tomu, že autovakcína proti FGF8b by mala pôsobiť vážne nežiaduce účinky na pacientov.
100
Účinky protilátok proti FGF8b
Doposiaľ neboli publikované žiadne pokusy liečiť rakovinu prostaty použitím monoklonových protilátok. V liečbe rakoviny prsníka monoklonovými protilátkami však prebiehajú klinické skúšky.
Protilátky proti FGF8b budú pravdepodobne blokovať interakcie medzi FGF8b a jeho receptormi, čím budú inhibovať dráždenie bunkových membrán a bujnenie buniek a velmi pravdepodobne znížia pohyblivosť a invazívnosť rakovinných buniek.
Predmetom vynálezu sú preto tiež uskutočnenia tu opísaných spôsobov, kedy sa cudzí T-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: šesť pozícií z 1-54 a/alebo 178215 a/alebo 55-58 a/alebo 63-68 a/alebo 72-76 a/alebo 85-91 a/alebo 95-102 a/alebo 106-111 a/alebo 115-120 a/alebo 128134 a/alebo 138-144 a/alebo 149-154 a/alebo 158-162 a/alebo 173-177. Malo by sa poznamenať, že je zvlášť nevýhodné zaraďovať obmeny alebo modifikácie do pozícií 26-45, a do Ckoncov počínajúc aminokyselinami 186-215, pretože tieto úseky majú najmenšiu homológiu s nedávno objaveným proteínom FGF18, ktorý zrejme má expresiu v rade nenádorových tkanív.
Predmetom vynálezu je preto tiež analóg ludského/myšieho FGF8b, ktorý je u ludí imunogénny a ktorý zahrnuje podstatnú časť všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov FGF8b a obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop, ako sa tu diskutuje. Je výhodné, keď je tento aspoň jeden cudzí TH epitop prítomný ako vložený do aminokyselinovej sekvencie FGF8b alebo ako náhrada časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b alebo ako výsledok odstránenia časti aminokyselinovej
101 sekvencie FGF8b. Najvýhodnejšími analógmi v tomto uskutočnení sú tie, v ktorých sa cudzí TH-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: šesť pozícií z 1-54 a/alebo 178-215 a/alebo 55-58 a/alebo 63-68 a/alebo 72-76 a/alebo 85-91 a/alebo 95-102 a/alebo 106-111 a/alebo 115-120 a/alebo 128-134 a/alebo 138-144 a/alebo 149-154 a/alebo 158162 a/alébo 173-177.
Mucíny
Predmetom vynálezu sú tiež spôsoby vynálezu, ktoré využívajú špecificky modifikované obmeny ľudských mucínov (hlienov), zvlášť ktoréhokoľvek z MUC-1 až MUC-4, výhodne MUC-1. Analógy zahrnujú nasledujúcu štruktúru
TR (-S-P-S-(TR) m) n kde TR je tandemové opakovanie odvodené z prirodzene sa vyskytujúceho mucínu, P je cudzí TH-epitop, ako sa o ňom pojednáva v tomto dokumente, S je inertný vložkový peptid, ktorý má od 0 do 15, aminokyselinových zvyškov, výhodne medzi 0 a 10 aminokyselinovými zvyškami, n je celé číslo od 1 do 30 a m je celé číslo od 1 do 10, výhodne od 3 do 5.
Keď sa takýto mucínový analóg produkuje v napr. línii ľudských buniek alebo prečistením z tkaniva, priamy výsledok obvykle nemá požadovanú glykozylačnú štruktúru, t.j. anomálna mucíne analóg pochádzajúcom rekombinantne a následne produkt glykozylačná štruktúra svedčí o z nádoru. Je však možné pripraviť v napr. E. coli alebo synteticky glykozylovať enzymaticky tak, aby sa dosiahla Tn alebo S-Tn glykozylačná štruktúra špecifická pre expresiu MUC-1
102 v nádoroch. Ináč by polypeptid mohol byť pripravený v cicavčej bunkovej línii alebo bunkovej línii hmyzu, t.j. v bunkách Drosophila, ktorým chýba relevantný enzým, alebo intracelulárnou expresiou proteínu (pri vylúčení sekrečného signálneho peptidu), kde sa nevyskytuje glykozylácia.
Fragmenty nukleových kyselín a vektory vynálezu
Z vyššie uvedeného opisu oceníme, že sa analógy môžu pripravovať technológiou rekombinantných génov, ale tiež chemickými syntézami alebo semisyntézami; druhé dva výbery sú zvlášť relevantné, keď sa modifikácia týka pripojenia k proteínovým nosičom (napr. KLH, záškrtový toxoid, tetanový toxoid a BSA) a k neproteínovým molekulám, napríklad uhľovodíkové polyméry, a samozrejme tiež v prípade, keď modifikácia zahrnuje adíciu postranných reťazcov alebo postranných skupín na peptidový reťazec polypeptidu.
Z hladiska rekombinantnej génovej technológie a samozrejme aj z hladiska imunizácie nukleovou kyselinou sú dôležitými chemickými produktmi fragmenty nukleových kyselín kódujúce potrebné epitopické oblasti a analógy. Preto významná časť tohoto vynálezu sa týka fragmentu nukleovej kyseliny, ktorý kóduje vyššie opísaný analóg každého z relevantných nádorovo špecifických polypeptidov, výhodne polypeptid, do ktorého bol zavedený cudzí TH-bunkový epitop vložením a/alebo adíciou, výhodne substitúciou a/alebo odstránením. Fragmenty nukleových kyselín tohto vynálezu sú buď fragmenty DNA alebo RNA.
Fragmenty nukleových kyselín tohto vynálezu budú obvykle vložené do vhodných vektorov, aby vytvorili vektory nesúceho príslušné fragmenty nukleových kyselín tohto vynálezu pre
103 klonovanie alebo expresiu; takéto nové vektory sú tiež časťou tohoto vynálezu. Detaily, ktoré sa týkajú stavby týchto vektorov tohto vynálezu, sa budú diskutovať v súvislosti s transformovanými bunkami a mikroorganizmami. Vektory môžu byť, podľa účelu a typu aplikácie, vo forme plazmidov, fágov, kozmidov, minichromozómov alebo vírusov, ale dôležitým vektorom je aj prostá DNA, ktorá má v určitých bunkách len prechodnú expresiu. Výhodné klonovacie a expresné vektory tohto vynálezu sú schopné autonómnej replikácie, tým umožňujú velký počet kópii vyžitelných pre vysokú expresiu alebo pre vysokú replikáciu pre následné klonovanie.
Obecný profil vektora tohto vynálezu zahrnuje nasledujúce charakteristické rysy vo smere 5' - 3' a v uskutočniteľnom spojovaní: promótor riadiaci expresiu fragmentu nukleovej kyseliny vynálezu, voliteľne sekvenciu nukleovej kyseliny kódujúcej hlavný peptid, ktorý umožňuje sekréciu fragmentu nukleovej kyseliny vynálezu alebo jeho začlenenie do membrány polypeptidového fragmentu a sekvenciu nukleovej kyseliny, kódujúcej terminátor. Keď sa operuje s expresnými vektormi v producentských kmeňoch alebo bunkových líniách, je z hľadiska génovej stability transformovaných buniek výhodné, aby sa vektor pri zavádzaní do hostiteľskej bunky začlenil do jej genómu. Naopak, keď sa pracuje s vektormi, ktoré ša majú použiť na ovplyvnenie expresie in vivo (t.j. pri použití vektora v DNA vakcinácii), je z bezpečnostných dôvodov výhodnejšie, aby sa vektor nemohol integrovať do genómu hostitelskej bunky; typickým príkladom je použitie prostej DNA alebo neintegrovaných vírusových vektorov, ktorých volba je veľmi dobre známa odborníkovi v technike.
Vektory tohto vynálezu sa používajú k transformácii hostitelských buniek tak, aby produkovali analóg vynálezu.
104
Takéto transformované bunky, ktoré sú tiež predmetom tohoto vynálezu, môžu byť kultivované bunky alebo bunkové línie používané k rozmnožovaniu fragmentov nukleových kyselín a vektorov vynálezu, alebo k produkcii rekombinantných analógov tohoto vynálezu. Ináč transformované bunky môžu byť vhodné živé vakcinačné kmene, do ktorých sa fragment nukleovej kyseliny (jeden jediný alebo násobné kópie) vloží tak, aby ovplyvnil sekréciu alebo integráciu do membrány baktérie alebo bunkovej steny analógu.
Výhodnými transformovanými bunkami vynálezu sú mikroorganizmy, ako baktérie [napríklad druhy Escherichia (napr. E. coli), Bacillus (napr. Bacillus subtilis), Salmonella alebo Mycobacterium (predovšetkým nepatogénne, napr. M. bovis BCG)], kvasinky (napr. Saccharomyces cerevisiae) a prvoci. Ináč sa transformované bunky odvodzujú od multicelulárnych organizmov, ako sú bunky húb, hmyzu, rastlín alebo cicavcov. Najvýhodnejšie sú ľudské bunky, viď diskusiu o bunkových líniách a vektoroch ďalej.
Z hľadiska klonovania a/alebo optimalizovanej expresie je výhodné, aby transformované bunky boli schopné replikovať fragment nukleovej kyseliny tohoto vynálezu. Výhodnými užitočnými uskutočneniami vynálezu sú bunky s expresiou nukleového fragmentu; môžu sa použiť pre prípravu analógu v malom alebo veľkom merítku alebo v prípade nepatogénnej baktérie ako zložky vakcíny pre živú vakcínu.
Pri príprave analógu tohto vynálezu pomocou transformovaných buniek je výhodné, aj keď rozhodne nie podstatné, keď sa produkt expresie buď vyexportuje do kultivačného média alebo sa nanesie na povrch transformovanej bunky.
105
Keď sa identifikuje účinná producentská bunka, je výhodné na jej základe ustaviť stabilnú bunkovú liniu, ktorá nesie vektor vynálezu a ktorá má expresiu fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho analóg. Tato stabilná bunková línia výhodne vylučuje alebo nesie analóg vynálezu, a tým sa uľahčuje jeho čistenie.
Plazmidové vektory obsahujúce replikačné a riadiace sekvencie, ktoré sú odvodené z druhov kompatibilných s hostiteľskou bunkou sa obecne používajú v spojení s hostiteľmi. Vektor obvykle nesie replikačné miesto, rovnako ako značkujúce sekvencie, ktoré sú schopné uskutočniť fenotypovú selekciu v transformovaných bunkách. Napríklad E. coli sa typicky transformuje pomocou pBR322, plazmidom odvodeným z druhov E. coli (viď napr. Bolivar et al., 1977). Plazmid pBR322 obsahuje gény pre rezistenciu voči ampicilínu a tetracyklínu, a tak je jednoduchým prostriedkom k identifikácii transformovaných buniek. Plazmid pBR alebo iný mikrobiálny plazmid alebo fág musí tiež obsahovať alebo sa modifikuje, aby obsahoval, promótory ktoré môžu byť použité prokaryotickými mikroorganizmami pre expresiu.
Najbežnejšie používané promótory pri konštrukcii rekombinantnej DNA zahrnujú B-laktamázu (penicilinázu) a systémy laktózového promótoru (Chang et al., 1978; Itakura et al., 1977; Goeddel et al., 1979) a systém tryptofánového promótoru (trp) (Goeddel et al., 1979; EP-A-0 036 776). Aj keď sú uvedené promótory najčastejšie používané, boli objavené a využité aj ďalšie mikrobiálne promótory a detaily týkajúce sa ich nukleotidových sekvencií boli publikované, čo odborníkovi umožňuje ich funkčne spojiť s plazmidovými vektormi (Siebwenlist et al., 1980). Určité gény z prokaryotických buniek môžu mať účinnú expresiu v E. coli
106 zo svojich vlastných promótorových sekvencii, čím sa dopredu vylúči potreba pridávať umelo iný promótor.
Okrem prokaryotických sa môžu použiť tiež eukaryotické mikróby, napríklad kvasinkové kultúry, kde by promótor bol schopný riadiť expresiu. Saccharomyces cerevisiase alebo bežné pekárske kvasinky sú najčastejšie používané eukaryotické mikroorganizmy, ale rad iných kmeňov je obecne dostupný, napríklad Pichla pastoris. Pre expresiu v Saccharomyces sa obvykle používa napríklad plazmid YRp7 (Stinchcomb et al., 1979; Kingsman et al.,1979; Tschemper et al., 1980). Tento plazmid už obsahuje gén trpí, ktorý poskytuje selekčný markér pre mutantný kmeň kvasiniek, ktorý nie je schopný rásť v tryptofáne, napríklad ATCC č. 44076 alebo PEP4-1 (Jones, 1977). Prítomnosť lézie trpí, ako charakteristického genómu kvasinkovej hostiteľskej bunky, potom poskytuje účinné prostredie pre detegovanie transformačného rastu v neprítomnosti tryptofánu.
Vhodné promótorové sekvencie v kvašinkových vektoroch zahrnujú promótory 3-fosfoglycerát kinázy (Hitzman et al., 1980) alebo iných glykolytických enzýmov (Hess et al., 1968; Holland et al., 1978), ako sú enoláza, glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenáza, hexokináza, pyruvát dekarboxyláza, fosfofruktokináza, glukóza-6-fosfát izomeráza, 3-fosfoglycerát mutáza, pyruvát kináza, trifosfát izomeráza, fosfoglukóza izomeráza a glukokináza. Pri konštruovaní vhodných plazmidov expresie sú terminačné sekvencie súvisiace s týmito génmi tiež napojené do expresného vektora 3' sekvencie, ktorá sa má exprimovať, aby poskytla polyadenyláciu mRNA a termináciu.
Iné promótory, ktoré majú ešte naviac výhodu transkripcie riadenej podmienkami rastu, sú promótorové oblasti pre
107 alkohol dehydrogenázu 2, izocytochrómu C, kyslú fosfatázu, degradačné enzýmy súvisiace s metabolizmom dusíka a skôr zmienenú glyceraldehyd-3-fosfát dehydogenázu a enzýmy zodpovedné za využitie maltózy a galaktózy. Vhodný je každý plazmidový vektor obsahujúci s kvasinkami kompatibilný promótor, začiatok replikácie a terminačné sekvencie.
Okrem mikroorganizmov sa ako hostitelia tiež môžu použiť bunkové kultúry odvodené z mnohobunkových organizmov. V podstate sa dá pracovať s každou takou bunkovou kultúrou, či už zo stavovcov alebo bezstavovcov. Najväčší záujem je však o bunky stavovcov a ich rozmnožovanie v kultúrach (tkanivová kultúra) sa stalo v posledných rokoch rutinným procesom (Tissue Culture, 1973). Príklady takýchto užitočných hostiteľských bunkových línii sú bunky VERO a HeLa, bunkové línie z vaječníkov čínskych chrčkov (CHO) a bunkového línie W138, BHK, COS-7 293 a MDCK.
Expresné vektory pre tieto bunky obvykle zahrnujú (pokial je to potrebné) začiatok replikácie, promótor umiestnený pred génom, o expresiu ktorého ide, spolu s akýmikoľvek potrebnými miestami, ktoré viažu ribosóm, strihové miesta RNA, polyadenylačné miesta a transkripčné terminátorové sekvencie.
Pre využitie . v bunkách cicavcov sú často riadiace funkcie vektorov expresie z vírusového materiálu. Napríklad obecne používané promótory sú odvodené z polyómu, z Adenovírusu 2 a najčastejšie zo Simian vírusu 40 (SV40). Prvotné a pozdnejšie promótory vírusu SV40 sú zvlášť užitočné, pretože sa obidva lahko získajú z vírusu ako fragment, ktorý tiež obsahuje SV40 vírusový začiatok replikácie (Fiers et al., 1978). Tiež sa môžu použiť menšie alebo väčšie fragmenty SV40 za predpokladu, že je zahrnutých približne 250 bp sekvencie
108 rozkladajúcej sa od miesta HindlII smerom k miestu BglI umiestnenému vo vírusovom začiatku replikácie. Ďalej je tiež možné, a často žiaduce, využiť promótorické alebo riadiace sekvencie obvykle súvisiace s požadovanou génovou sekvenciou za predpokladu, že tieto riadiace sekvencie sú kompatibilné so systémami hostiteľskej bunky.
Začiatok replikácie môže byť zaistený buď konštrukciou vektora s vloženým exogénnym začiatkom, ktorý napríklad môže byť získaný z SV40 alebo z iného vírusu (napr. Polyom, Adeno, VSV, BPV), alebo mechanizmom chromozornáInej replikácie hostitelskej bunky. Keď sa vektor integruje do chromozómu hostiteľskej bunky, druhý spôsob často stačí.
Kompozície vynálezu
Predmetom vynálezu je tiež imunogenická kompozícia, ktorá zahrnuje ako účinné imunogénne činidlo aspoň jeden z tu opísaných analógov vo zmesi s farmaceutický a imunologický prijateľným nosičom, · vehikulom, riedidlom, základom a voliteľné adjuvans, porovnaj tiež pojednanie o týchto entitách vo vyššie uvedenom opise spôsobov tohoto vynálezu.
Ďalej je predmetom vynálezu tiež zloženie kompozície pre indukciu produkcie protilátok proti akémukoľvek z vyššie uvedených nádorových antigénov; kompozícia zahrnuje
- fragment nukleovej kyseliny alebo vektor vynálezu a
- farmaceutický a imunologický prijatelné riedidlo a/alebo vehikulum a/alebo nosič a/alebo základ a/alebo adjuvans.
Príprava a iné zvláštnosti týkajúce sa týchto kompozícii sa už vyššie diskutovali v príslušnej časti tákajúcej sa imunizácie nukleovou kyselinou.
109
Prehľad obrázkov na výkresoch
Obr. 1: Tradičné chápanie autóvakcinácie.
A: Tolerančné dominantné vlastné epitopy prezentované na MHC triedy II na nejakej bunke prezentujúcej antigén (APC) sú ignorované v dôsledku vyčerpania repertoáru T-pomocných buniek (Th) (T-pomocné bunky sú vyznačené bodkovanými čiarami). Vložené cudzie imunodominantné T-bunkové epitopy prezentované na MHC triedy II aktivujú T-pomocné bunky a Bbunky.
B: T-pomocné bunky a B- bunky špecifické pre natívne časti vlastného proteínu prezentujúceho cudzie imunodominantné T bunkové epitopy na . MHC triedy II sa aktivujú pomocou cytokínovej pomoci poskytovanej T pomocnou bunkou.
Obr. 2: Princíp autóvakcinácie pre vyvolanie reakcie CTL.
Vložené cudzie imunodominantné T bunkové epi.topy prezentované na MHC triedy II aktivujú T-pomocné bunky. CT lymfocyty rozpoznávaním subdominantných vlastných epitopov prezentovaných na MHC triedy I sa aktivujú priľahlými aktivovanými T-pomocnými bunkami.
Obr. 3: Schematické znázornenie polypeptidu Her2 s vyznačením epitopických oblastí a N-glykozylačných miest.
Sú predstavené 4 extracelulárne domény, transmembránová doména (TM) a 2 intracelulárne domény s vyznačením miest s rôznymi stupňami homológie a miest obsahujúcich predpokladané/určené CTL epitopy.
110
Obr.4: Schematické znázornenie ľudského PSM polypeptidu s vyznačením oblastí pre vloženie epitopov P2 a P30.
i
Obr. 5: FGF gény a proteíny.
A: Exón-intrónová štruktúra génov ľudského a myšieho FGF8.
Dole je znázornených osem rožných strihových foriem (z práce Gemel, 1996).
B: Aminokyselinová sekvencia rôznych izoforiem FGF8.
Polypeptidové časti jedinečné pre FGB8b, FGB8f a FGB8e sú vyznačené tučné, kurzívou alebo podtrhnutím písma. FGF8 je najkratším variantom, ktorý neobsahuje žiadnu z týchto zvýraznených sekvencii. Od signálneho peptidu sa očakáva, že sa pripojí cez C-koniec k Ala22. Dva cysteínové zvyšky nájdené vo hotovom FGF8 (všetky izoformy) sú vyznačené tučným podtrhnutím. Dve miesta možnej N-glykozylácie FGF8b sú označené Ň. Číslovanie odpovedá FGF8b.
Obr.’6: Znázornenie štyroch rôznych variantov FGF8b navrhnutých pre autovakcináciu.
Vrchný panel: Teoretické modely bodov vloženia epitopov používajúce ako chemický vzorec kryštálovú štruktúru FGF2.
Spodný panel: Aminokyselinové sekvencie divokého typu FGF8b (WT) a štyri varianty F30N, F2I, F30I a F2C. Signálny peptid je vyznačený jednoduchým podtrhnutím. Vložené peptidy sú podtrhnuté dvakrát. N-koncová sekvencia (MetAla) všetkých variantov je pre generovanie Kozákovej sekvencie (Kozák 1991) pre lepšiu transláciu v eukaryotických systémoch.
111
Príklady uskutočnenia vynálezu
Príklad 1
Vakcinácia proti PSM
V nasledujúcom texte sa opíše, ako je možné vyvíjať ludskú autovakcína proti PSM modifikáciou molekuly vložením jedného alebo viacerých promiskuitných cudzích T bunkových epitopov, aby sa odkrylo pole imunogenizovaných PSM molekúl.
Prípravky budú testované z hľadiska schopnosti vyvolať špecifické odozvy CTL proti PSM nesúcim nádorové bunky. Ďalej budú prípravky testované z hľadiska schopnosti indukovať protilátky, ktoré sú krížovo reaktívne s natívnymi časťami molekuly PSM. Následne sa Vyhodnotí účinnosť rôznych prípravkov v niekolkých skúškach in vitro a v živočíšnych modeloch in vivo. Indukované protilátky sa budú testovať na ich schopnosť aktivovať komplement klasickou cestou a iniciovať ADCC cez Fc-receptory. Nakoniec sa budú rozdielne molekuly testovať na živočíšnych modeloch ľudského karcinómu prostaty.
Stratégia navrhovania PSM autovakcíny
V krátkosti, vakcinačný plán PSM vyžaduje tieto experimentálne úlohy:
Návrh a vytvorenie tabuľky ludských PSM mutantov
Klonovanie ludských a potkaních/myších PSM sekvencií. Mutačná práca pre vytvorenie imunogenizované hPSM molekúl.
Expresia divokých a imunogenizovaných hPSM molekúl v E. coli a/alebo Pichia pastoris a/alebo cicavčích bunkách a/alebo bunkách hmyzu (ako je bunková línia S2) .
112
Čistenie, refolding a charakterizácia imunogenizovaných hPSM molekúl.
Vakcinácia DNA proti PSM
Vytvorenie hPSM DNA vakcinačných vektorov kódujúcich imunogenizované hPSM molekuly.
Testovanie hPSM vakcinačných vektorov v experimentoch in vitro a in vivo.
Výber kandidátov hPSM
Imunizácia myší/králikov.
- ELISA.
FACS analýza.
V prípade odozvy protilátky: skúška bujnenia nádorovej bunky.
Skúšky T-buniek.
Testovanie hPSM mutantov in vivo
- Model pevný nádor/metastáza v myšiach.
Koncepčná štúdia: indukcia CTL autovakcináciou
Zostavenie imunogenizovaných myších/potkaních PSM odpovedajúcich vybraným hPSM kandidátom (napr. vo forme DNA vakcín).
Testovanie imunitnej odozvy vyvolanej myšími/potkaními PSM mutantmi skúškami in vitro·. imunochemické skúšky, ELISA, FACS analýza, bunkové analýzy, komplementová lýzia buniek nesúcich PSM, skúška ADCC, skúška aktivity CTL, skúška bujnenia nádorovej bunky, skúšky prezentácie T-buniek.
Testovanie mPSM mutantov „in vivo v modeli pevný nádor/metastáza u myší.
113
Názvoslovie konštruktov hPSM
PSM je typom II membránového proteínu 750 aminokyselín, porovnaj sekvenčné identifikačné číslo: 2, ktoré dáva štyri sekvencie divokého typu s výnimkou, že Gly nahradzuje Trp v polohe 2 následkom zavedenia Ncol miesta a Kozákovej sekvencie do sekvenčného identifikačného čísla: 1, kde ggt nahradzuje tgg v polohách 4-6. Pre niektoré prípravky ludskej autovakcíny založenej na PSM sa však môže použiť aj natívny PSM (t.j. PSM majúci Trp v polohe 2).
Extracelulárnu časť PSM tvorí 707 aminokyselín s C-koncom, zatial čo o cytoplazmatickej oblasti sa. predpokladá, že má dĺžku 19 aminokyselín a transmembránová časť proteínu pozostáva z 24 aminokyselín (aminokyseliny 20 - 43) .
Ako východzí bod pre prípravky môže byť tiež použitý strihový variant PSM'. Naša verzia tohto strihového variantu má aminokyselinovú sekvenciu odpovedajúcu zvyškom 58 - 750 v sekvenčnom identifikačnom čísle: 2. Pre jednoduchosť názvoslovia sa oblasti v PSM' číslujú podľa číslovania v PSM (to znamená, že napr. oblasť 2 pozostáva z aminokyselín 87108 v PSM a aminokyselín 30-51 v PSM'), zrovnaj tiež nižšie uvedenú diskusiu týkajúcu sa sekvenčných oblastí.
Všetky genetické prípravky ludského PSM sa označujú hPSM . (alebo hPSM' . , ak sa ako východzí bod použije
PSM'), kde prvá je vstupná oblasť použitá pre vloženie P2 a druhá _ je vstupná oblasť pre P30. Keď P2 a P30 nie sú v proteíne, označuje sa číslom 0 (nula). Úplná dĺžka divokého typu hPSM sa označuje hPSMO.O a divoký typ hPSM bez cytoplazmatickej a transmembránovej časti sa označuje hPSM-^0.0. Trinásť plánovaných imunogenizovaných génov hPSM,
114
ktoré všetky obsahujú jeden P2 epitop a jeden P30 epitop sa
pomenujú hPSMl.l, hPSM6.1, hPSM8.1, hPSMI0.1, hPSMI.6,
hPSMI.8, hPSMI.10, hPSMI.2, hPSMI.3, hPSMI.5, hPSM2.1,
hPSM3.1, hPSMI0.3, hPSM6.3, hPSM'10.3, hPSM'6.3, hPSM8.3,
hPSM'8.3 a hPSM5.1, detaily viď nižšie,
V hPSMl.l sa obidva epitopy P2 a P30 vložili v tandeme do vstupnej oblasti č. 1 (membránu pokrývajúca oblasť) . Teoreticky sa o tomto mutantovi hPSMl.l môže uvažovať ako o veľmi atraktívnom kandidátovi pre indukciu produkcie protilátky, pretože celá extracelulárna doména tejto molekuly je intaktná. Pre indukciu odoziev CTL s použitím imunizácie nukleovou kyselinou sú považované za užitočné také prípravky ako sú hPSM10.3 a hPSM6.3.
Pre uľahčenie postupov klonovania a mutagenézie sa urobilo mnoho molekulárnej konštrukčnej práce za použitia časti buď s N-koncom (aminokyseliny 1-436) alebo s C-koncom (aminokyseliny 437-750) génu hPSM ako východzieho materiálu. Tieto dve časti génu hPSM sa označujú hPSMI a hPSMII kde prvá _ je vstupná oblasť používaná pre vloženie ’P2 a druhá _ je vstupná oblasť pre P30. Opäť, keď P2 alebo P30 nie sú v proteíne, použije sa číslo 0 (nula) a divoké typy sa označujú hPSMIO.O a hPSMIIO.0. Špeciálny variant hPSMlO.O bez cytoplazmatickej časti hPSM sa označuje hPSMI-í-0.0.
Väčšina mutagenéznej práce sa prakticky uskutočnila s použitím hPSMIO.O a hPSMIIO.O ako východzieho materiálu.
Exprimované hPSM mutantné proteíny sa budú označovať
PROS_._, kde; prvá _ je vstupná oblasť používaná pre vloženie P2 a druhá _ je vstupná oblasť pre P30. Keď P2 alebo P30 nie sú v proteíne, označuje sa ako 0 (nula). Divoký
115 typ hPSM sa označujú PROS.O. Pre proteínový produkt hPSM aminokyselín 437-750 je označenie PROSIIO.O. Proteíny s HIS značením sa nazývajú HIS-PROS_._. Ako His značenie sa použilo sekvenčné identifikačné číslo: 21 pre expresiu v kvasinkách a baktériách, zatial čo sekvenčné identifikačné č.: 23 pre expresiu v bunkách cicavcov.
Klonovanie ludskej sekvencie PSM
Bunková línia LNCaP, ktorá má svoj pôvod v metastázových léziách ludského prostatového adenokarcinómu sa zakúpila od American Type Culture Collection (ATCC). Z tejto bunkovej línie sa izoluje mRNA a podrobí sa reverznej transkripcii s použitím štandardnej súpravy, aby sa získala cDNA kódujúca ľudskú PSM sekvenciu. S použitím rozdielnych sád špecifických primerov hPSM sa získajú PCR produkty kódujúce PSM(437-750) a ďalej sa klonujú do pUcl9 (plazmid č. pMR300) a overujú sa sekvenovaním DNA. Tato C-koncová časť divokého typu PSM sa označuje hPSM časť II (hPSMIIO.O).
Podobne sa klonuje divoký typ hPSM časť I (hPSMIO.O) do pUcl9 s použitím primárov pre zosilnenie časti I tak s (hPSMIO.O) ako aj bez (hPSMIIO.O) transmembránových a cytoplazmatických domén. Klony sa riadene sekvenujú a hPSMIO.O a hPSMIIO.O sa fúzujú pomocou ligácie v mieste EcoRI. Výsledné klony hPSMO.O (sekv. id. č.: 2) a hPSMIO.O sa subklonujú do radu prokaryotických a eukaryotických expresných vektorov a sekvencie sa opäť overia. Intracelulárne exprimované formy ľudskej PSM (označené hPSM' - aminokyseliny 58-750 sekv. id. č. : 2) sa tiež konštruujú s použitím cDNA ako východzím materiálom. Tato sekvencia sa tiež subklonuje do cicavčích expresných vektorov a použije sa ako východzí materiál pre
116 niektoré konštrukty hPSM autovakcín, napr. hPSM'10.3 a hPSM'6.3.
Klonovanie potkaních a myších PSM sekvencií
Dva klony EST (expressed sekvence tag) obsahujúce cDNA sekvencie myších PSM (z obličiek plodov myší a myších makrofágov) sa zakúpili od American Type Culture Collection (ATCC). Tieto EST klony spolu pokrývajú myšiu sekvenciu PSM cDNA, a tým tak celú dĺžku myšieho PSM (sekv. id. č.: 7 a 8) ako aj. myší PSM'(sekv. id. č.: 9 a 10) a subklonujú sa do bakteriálnych vektorov a cicavčích expresných vektorov. Myšie PSM autovakcínové konštrukty sa môžu tiež pripraviť vložením P30 do cDNA myšieho PSM.
Expresia divokého typu hPSM v E. coli
C-koncová časť (aminokyseliny 437-750) hPSM, hPSMIIO.O sa klonuje do bakteriálneho expresného vektora pET28b, aby sa získal produkt s N-koncovým polyhistidínovým chvostom (HIS), ktorý ' napomáha jednoduchému čistenie vo veľkom merítku a identifikácii s protilátkami anti-poly-HIS. Proteínový produkt označený poly-HIS, hPSMIIO.O (proteínový produkt budúceho HIS-PROSIIO.0), sa exprimuje v E. coli.
DNA kódujúca skrátený divoký typ ludskej PSM, hPSM-s-cytO.0 sa tiež exprimovala z pET28b kmeňa E. coli BL21(DE3), kde sa produkt expresie lokalizuje v inklúznych telieskach. SDS-PAGE analýza bakteriálneho lyzátu ukázala produkt s očakávanou migráciou a Western blotting analýza s králičím anti-HISPROSIIO.O tiež dáva predpokladaný pás. Ďalej N-koncové sekvenovanie piatych aminokyselín tohoto produktu eluovaného z SDS-PAGE gélu dáva očakávané aminokyselinové sekvencie.
117
Konštrukty divokého typu hPSM, hPSMO.O, hPSMAO.O (rovnako ako dva hPSM mutanty, hPSMl.l a hPSM6.1, viď ďalej)' sa klonovali do rôznych expresných vektorov E. coli, aby sa umožnila účinnejšia expresia a určitý stupeň posttranslačnej úpravy („folding) rekombinantných proteínov v E. coli. Vybrané systémy expresie sú:
PMCT6, ktorý vytvára obmeny N-koncových HIS označených expresných rekombinantných proteínov,
PGH433, ktorý exprimuje rekombinantné proteíny v súvislosti s 22 aminokyselinami pelB vedúcej sekvencie, ktorá by mala smerovať proteín do periplazmatického priestoru baktérie E. coli a
PMal-p2, v ktorom sú rekombinantné proteíny exprimované ako C-koncové fúzie proteínu viažuceho maltózu (MBP) obsahujúce prírodnú MBP periplazmatickú vedúcu sekvenciu. Protilátky proti MBP sa môžu použiť k detekcii fúzie proteínov a uhlovodíkový pripojený stĺpec sa môže použiť na afinitné čistenie produktu.
Avšak experimenty expresie divokých typov proteínov hPSM z týchto vektorov na E. coli ukázali zreteľnú úroveň expresie len z pMCT6. Problémy získania periplazmatickej expresie divokých typov proteínov hPSM nie sú dnes ešte vyriešené.
Expresia divokého typu hPSM v Pichia pastoris
Vzhladom k relatívne vysokej molekulovej hmotnosti proteínu PSM a relatívne vysokému stupňu jeho glykozylácie (približne 16 % molekulovej hmotnosti) a preto, aby sa uľahčilo čistenie bez stabilizačného kroku, rozhodlo sa použiť alternatívnu
118 technológiu pre eukaryotickú expresiu rekombinantných proteínov. Niekolko dobre charakterizovaných eukaryotických expresných systémov sa vyhodnotilo a pre počiatočný screening hPSM mutantov sa vybrali kvasinky Pichia pastoris ako alternatíva k expresii na E. coli.
Systém expresie založený na kvasinkách Pichia pastoris sa aplikuje na PSM konštrukciách. Očakáva sa, že sa glykozylačný profil rekombinantných proteínov exprimovaných v tomto organizme viacej podobá cicavčiemu glykozylačnému profilu než napr. Saccharomyces cerevisiae vzhladom k menej rozvetvenej mänozylácii rekombinantného proteínu. Ukázalo sa, že absorpcia antigénov dendritickými bunkami sprostredkovaná receptormi manózy dáva asi stokrát účinnejšiu prezentáciu T bunkám v porovnaní s endocytickou absorpciou v kvapalnej fázy. Preto manozylácia môže hrať úlohu v antigenicite (a predovšetkým v schopnosti vyvolať CTL odozvu) u hPSM mutantov a iných antigénov, proti ktorým je CTL odozva žiaduca.
Kmeň Pichia pastoris, rovnako ako aj dva rôzne expresné vektory sa zakúpili od Invitrogénu. Vektor pPICZo/A nesie metanolom indukovatelný promótor, ktorý sa nachádza pred polyklonovým miestom, zatial čo vektor pGAPZaA exprimuje proteíny nezávisle. Obidva vektory kódujú sekrečný signál afaktoru, aby sa rekombinantné proteíny exportovali do média. Selekčný systém týchto vektorov je odolný voči zeocínu. Sekvencie kódujúce hPSMO.O a hPSM-^O.O (rovnako ako jeden mutant hPSM, hPSM.l, porovnaj ďalej) sa subklonovali do týchto vektorov (v skladbe s C-koncovým c-myc identifikačným epitopom, sekv. ident. č.: 27).
Štyri kmene Pichia pastoris (X-33, SMD1168, GS115 a KM71) odlišujúce sa napríklad podmienkami rastu sa transformovali
119 s každým z týchto (linearizovaných) plazmidov s využitím elektroporácie. Transformačný proces sa niekoľkokrát opakoval s menšími obmenami, aby sa získal veľký počet klonov rezistentných k zeocínu. Expresia divokého typu hPSM-^0.0 (rovnako ako hPSMl.l, viď ďalej) sa získala v systéme Pichia pastoris. Produkty expresie by sa mohli primárne detegovať vo Western blotting lyzátoch transformantov Pichia pastoris tak s použitím monoklonovej protilátky anti-hPSM, ako aj monoklonovej protilátky anti-c-myc. Rekombinantné produkty sa však detegovali intracelulárne.
Expresia divokého typu hPSM v cicavčích bunkách
Ku konečnému testovaniu a produkcii vybraných molekúl sa tiež zavedie expresný systém CHO (chinese hamster ovary vaječníky čínskych chrčkov) buniek.
Doposiaľ sa CHO. bunky transfektovali typom hPSM a hPSMl.l v rámci hlavných sekvencii (prípadne bez nich) v cicavčom expresnom vektore pcDNA3.1. Získali sa bunky rezistentné voči geneticínu. V bunkách COS prechodne transfektovanými tými istými konštruktmi boli detegované tak hPSMO.O ako aj hPSMl.l vo Western blotting analýze bunkových peliet s použitím monoklonovej protilátky anti-hPSM.
Tkanivové rozloženie hPSM
K určeniu, či hPSM expresia môže byť detegovaná v rôznych ľudských orgánoch, vrátane prostaty, krvi a mozgu, sa kúpil komerčný súbor. Metóda je založená na detekcii bodovej škvrny polyA, ktorá obsahuje mRNA extrahovanú z 50 rôznych ľudských tkanív. Predbežné výsledky neukazujú hyperexpresiu hPSM v tkanivách, ako je krv alebo mozog. Avšak po dátumu priority
120 predloženej prihlášky iný autori demonštrovali prítomnosť PSM v iných tkanivách (porovnaj vyššie).
Návrh hPSM mutantov
Pri navrhovaní mutačného postupu s PSM je velmi dôležité zachovať niektoré oblasti proteínu v modifikovaných konštruktoch, napríklad potencionálne a identifikované T bunkové epitopy, B bunkové epitopy a disulfidové môstiky cysteínových zvyškov. Preto, po určení takýchto „zakázaných oblastí vnútri sekvencie PSM, zostane obmedzený počet „otvorených oblastí 20 alebo viacej aminokyselín, ktoré sú vhodné pre výmenu s cudzími T pomocnými epitopmi P2 a/alebo P30. Podľa definície sa tiež transmembránová oblasť považuje za „otvorenú, pretože autoprotilátky zamerané proti tejto oblasti nie sú relevantné a predpokladá sa, že eliminácia tejto sekvencie zvýši rozpustnosť mutovaných PSM proteínov, ale nie je možné vylúčiť, že tato oblasť obsahuje dôležité CTL epitopy, a preto sa transmembránová oblasť uchováva v napr. hPSM10.3.
Podľa nášho očakávaním, že autovakcína indukuje odozvu CTL, by bolo dôležité identifikovať a zachovať potenciálne subdominantné CTL epitopy v konštruktoch. Dva takéto epitopy sú známe z literatúry: 1) peptid zahrnujúci PSM aminokyseliny
4-12 (LLHETDSAV) môže byť prezentovaný na Iudskej molekule MHC triedy I HLA-A2.1 (Tjoa 1996) a 2) PSM(711-719) (ALFDIESKV) tiež viaže HLA-A2.1 (Earp 1995). Podrobne sme tiež skúmali PSM aminokyselinovú sekvenciu, aby sme hlavne identifikovali zakotvené zvyšky HLA triedy I, ako opisujú Rammensee a kol. (Rammensee 1995), pre najrozšírenejšie typy HLA triedy I (HLA-A1, HLA-A2, HLA-A3, HLA-A23, HLA-A24 a HLAA28), ktoré dovedna tvoria 80 % HLA-A typov v Iudskej
121 populácii. Podobne sa identifikovali potenciálne HLA-B a HLAC epitopy a označili ich ako „zakázané oblasti.
Pretože pôvodným zámerom bolo použiť C57/black x SJL F1 hybridnú myš, po rozhodnutí používať pre testovanie PSM autovakcínových konštruktov transgenetické myši, boli určité T pomocné epitopy potencionálnych myší H-2b a H-2S identifikované a označené ako „zakázané oblasti (Rammensee 1995).
Dôležité je tiež zachovať známe väzobné oblasti protilátok v molekule PSM, pretože by mohli byť dôležité pre indukciu špecifických vlastných protilátok proti PSM. Bolo už opísaných päť takých oblastí: PSM(63-68), PSM(132-137), PSM(482-487) (WO 94/09820), PSM(716-723) a PSM(l-7) (Murphy
1996). S použitím počítačovej metódy Hoppa a Woodsa k prognóze antigénových determinantov bolo predpovedaných päť oblastí: PSM(63-69), PSM(183-191) , PSM(404-414), PSM(479-486) a PSM(716-723) (Hopp 1983), z ktorých sa niektoré prekrývali s experimentálne nájdenými B bunkovými epitopmi. Tieto oblasti sa tiež zachovávajú v molekulách kandidujúcich na PSM vakcínu.
PSM proteín obsahuje 4 cysteínové aminokyselín 22, 196, 466 a 597), ktoré v imunogenizovaných konštruktoch kvôli ich významu pri tvorbe disulfidových môstikov.
zvyšky (pozície budú zachované . potencionálnemu
Na základ vyššie uvedených „zakázaných a „otvorených oblastí v hPSM proteíne sa určilo 10 oblastí vhodných pre vstup cudzích T pomocných epitopov:
Vstupné oblasti v hPSMI (od iniciačného miesta do miesta
122
EcoRI, aminokyseliny (aa) 1-437):
Oblasť 1: aa po 16-52 v PSM (4 TM = 37 aa). aa pred TM, TM (24 aa) a
Oblasť 2: aa 87-108 v PSM, aa 30-51 v PSM' (22 aa)
Oblasť 3: aa 210-230 v PSM, aa 153-173 v PSM' (21 aa)
Oblasť 4: aa 269-289 v PSM, aa 212-232 v PSM' (21 aa)
Oblasť 5: aa 298-324 v PSM, aa 241-267 v PSM' (27 aa)
Vstupné oblasti v hPSMII (od EcoRI do konečného miesta
437-750)
Oblasť 6: aa 442-465 v PSM, aa 385-408 v PSM' (24 aa)
Oblasť 7: aa 488-514 v PSM, aa 431-457 v PSM' (27 aa)
Oblasť 8: aa 598-630 v PSM, aa 541-573 v PSM' (33 aa)
Oblasť 9: aa 643-662 v PSM, aa 586-605 v PSM' (20 aa)
Oblasť 10 : . aa l 672-699 v PSM, aa 615-642 v PSM' (28 aa)
Vstupné oblasti, rovnako ako „zakázané oblasti, znázorňuje obr. 4.
Rad rôznych imunogenizovaných PSM konštruktov sa pripraví substitúciou segmentu aminokyselín z dvoch vyššie uvedených oblastí za P2 alebo P30. Každý mutantný proteín bude teda obsahovať P2 ako aj P30 a hoci takéto konštrukty slúžia len ako príklady - predmetom predkladaného vynálezu sú tiež jednotlivé mutanty. Experimentálne sa mutácie pripravia v klonoch hPSMI, resp. HPSMII cDNA a dve mutované časti budú následne kombinované pomocou ligácie (v polohe EcoRI). Epitopy P2 a P30 sa najprv vložia do vstupných oblastí 1, 2, 3, 5, 6, 8 a 10, aby sa vytvorili mutanty.
P2 a P30 sekvencie sú:
123
Ρ2: QYIKANSKFIGITEL (sekv. id. č.: 12, 15 aminokys.), v tomto prípade kódovanom nukleotidovou sekvenciou cag tac atc aaa get aac tcc aaa ttc atc ggt atc acc gag ctg (sekv. id. č.: 11, 45 nukleotidov), kde tučné vyznačená šekvencia je miesto Sací. V závislosti na voľbe klonového vektora a systému expresie môžu nastať aj iné voľby kodónov.
P30: FNNFTVSFWLRVPKVSASHLE (sekv. id. č.: 14, 21 aminokys.), v tomto prípade kódovanom nukleotidovou sekvenciou ttc aac aac ttc acc gta agc ttc tgg ctg cgt gtt ccg aaa gtt agc gCT AGC cag_gig gaa (sekv. id. č.: 13, 63 nukleotidov), kde tučné označenie odpovedá miestu HindlII, jednoduché podtrhnutie miestu £co47III, veľké písmená miestu BstNI a dvojité podtrhnutie miestu Nhel.
Nasledujúca tabuľka zhrňuje ľudské PSM prípravky používané v tomto vynáleze:
Konštrukt pozícia P2 v proteíné pozícia P30 v proteíne
hPSMO.0 4- 4-
hPSM4-0.0 4- 4-
hPSM'0.0 4- 4-
hPSMl.1 17-31 32-52
hPSM6.1 448-462 21-41
hPSM8.1 606-620 21-41
hPSMl0.1 674-688 21-41
hPSMl.6 24-38 443-463
hPSMl.8 24-38 607-627
hPSMl.10 24-38 673-693
hPSMl.2 24-38 87-107
hPSMl.3 24-38 210-230
hPSMl.5 24-38 301-321
hPSM2.1 91-105 21-41
124
hPSM3.1 213-227 21-41
hPSM5.1 305-319 21-41
hPSM8.0 606-620 -?
hPSMIO.O 674-688
hPSMO.1 -? 21-41
hPSMl.O 24-38
hPSM6.3 448-462 210-230
hPSM8.3 606-620 210-230
hPSM10.3 674-688 210-230
hPSM'6.3 391-405 153-173
hPSM'8.3 549-563 153-173
hPSM'10.3 617-631 153-173
Molekulové konštrukcie hPSM mutantov
Mutácie pre vloženie sekvencií kódujúcich P2 a P30 sa pripravili s použitím tak hPSMIO.O ako aj hPSMIIO.O ako východzieho materiálu.
Pre vytvorenie väčšiny hPSM mutantov sa P2 a P30 najprv vložia do hPSMIO.O vo vstupnej pozícii 1. Výsledný materiál (hPSMIl.O, resp. HPSMIO.l) sa následne použije ako východzí materiál pre mutagenéziu, aby sa P2 a P30 vložili do pozícií 2, 3 a 5 a pre ligáciu s epitopom mutujúcim hPSMII. HPSMIl.O sa konštruoval použitím SOE (single overlap extension) PCR a následným overením sekvencie. hPSMIO.l sa konštruoval použitím technikou „Quick Change a následným overením sekvencie.
P2 epitop sa vloží do hPSMIl.O v polohách 2, 3 a 5 s použitím SOE-PCR za vzniku hPSMI1.2, hPSMI1.3 a hPSMI1.5. Tieto konštrukcie sa kombinujú s hPSMIIO.O za vzniku hPSM1.2,
125 hPSM1.3 a hPSM1.5.
HPSMI2.1, hPSMI3.1 a hPSMI5.1 sa konštruovali pomocou SOEPCR s použitím hPSMIO.l ako východzím materiálom. Tento materiál sa zhromaždil s hPSMIO.O pomocou ligácie v mieste
EcoRI, aby sa vytvorili mutanty s úplnou dĺžkou hPSM2.1, hPSM3.1 a hPSM5.1.
P2 epitop sa vložil do troch rôznych pozícií hPSMIIO.O, aby sa vytvorili hPSMII6.0, hPSMII8.0 a hPSMIIlO.O technikou „Quick Change a sled týchto klonov sa následne overil.
Následne bol hPSMIO.l spojený s hPSMII6.0, hPSMII8.0 a hPSMIIlO.O, aby sa získali hPSM6.1, hPSM8.1 a hPSMIO.l a klony boli sekvenčne overené.
Zaradenie P30 epitopu do hPSMII sa uskutoční súčastne, aby sa vytvorili hPSMII0.6, hPSMII0.8 a hPSMIIO.10 s použitím SOE-PCR.
HPSM1.1 bol konštruovaný použitím dvoch dvoj krokových mutácií PCR nasledovaných ligáciou na HindlII mieste vnútri sekvencie epitopu. Úplná dĺžka konštruktu sa sekvenčne overila.
hPSM10.3, hPSM'10.3 a hPSM6.3 sa zostavujú s použitím SOEPCR. Niektoré iné varianty hPSM s P2 a P30 zaradenými do extracelulárnej časti hPSM sa bežne konštruujú (hPSM'6.3, hPSM8.3, hPSM'8.3).
Okrem pôvodne uvažovaných mutantov, z ktorých každý obsahuje tak P2 ako aj P30, sa zostavili štyri mutanty obsahujúce len jeden cudzí epitop a ich sled sa overil:
126 hPSMl.O, hPSM8.0, hPSMIO.O a hPSMO.1.
Expresia hPSM mutantov v E. coli
V experimentoch v malom merítku sa podrobilo sedem hPSM mutantov, hPSMl.l, hPSM6.1, hPSM8.1, hPSMIO.l, hPSM2.1, hPSM3.1 a hPSM5.1 expresii z pET28b v kmeni E. coli BL21 (DE3) a IPTG indukovatelné produkty s očakávanou veľkosťou boli identifikované pomocou Coomassie Blue zafarbenými SDSPAGE gélmi. Produkt hPSMl.l však nebol detegovatelný. Hladiny expresie týchto mutantov boli veľmi nízke pri porovnaní s produktmi konštruktu divokého typu hPSMri-0.0. Z tohoto dôvodu sa nedá očakávať uspokojujúca úroveň expresie hPSM mutantov s použitím pET systému v E. coli, preto je potrebné použiť iné systémy expresie E. coli a/alebo iný hostiteľský organizmus.
Ako sa uvádza vyššie, hPSM6.1 a hPSMl.l sa subklonujú do rozdielnych expresných vektorov E.coli, aby sa vytvorili
- N-konové His-značkované obmeny exprimovaných rekombinantných proteínov s použitím vektora pMCT6,
- obmeny proteínov exprimované s pelB vedúcou sekvenciou, ktorá smeruje proteín do periplazmického priestoru baktérie E. coli s použitím vektora pGH433 a
- obmeny rekombinantných proteínov exprimovaných ako Ckoncový fúzny proteín k proteínu viažucemu maltózu (MBP) s použitím vektora pMal-p2.
Doposiaľ sa nepodarilo získať dostatočnú úroveň expresie zo žiadneho z týchto prípravkov.
Pretože hPSMO.0 má zreteľnú expresiu v E. coli, zatial čo podobná úroveň expresie hPSMO.0 s úplnou dĺžkou alebo hPSM
127 mutantov nebola pozorovaná, je možné, že prítomnosť cytoplazmatickej časti hPSM molekuly môže nejakým spôsobom „inhibovať expresiu prípravkov hPSM s úplnou dĺžkou v E. coli. Pre overenie tejto hypotézy sme najprv pripravili dva genetické prípravky hPSMl.1 a hPSM6.1 bez cytoplazmatických domén. Pri experimentoch v E. coli však tieto -^cyt génové produkty mali len slabú expresiu.
Expresia mutantov hPSM v Pichia pastoris
Pre expresiu hPSMl.1 mutantného proteín z kvasiniek Pichia pastoris, sa sekvencia hPSMl.l subklonuje (v rámci s c-myc Ckoncovým identifikačným epitopom, sekv. id. č: 27) do dvoch rôznych expresných vektorov pPICZaA a pGAPZaA a sekvencie sa overia. Expresia hPSMl.l (ako aj hPSM+O.O, viď vyššie) sa deteguje intracelulárne v transformantoch Pichia pastoris.
Expresia mutantov hPSM v cicavčích bunkách
Ako už bolo zmienené vyššie, hPSMl.l sa subklonoval do cicavčích expresných vektorov pcDNA3.1(+) a pZeoSV2 a tieto (aj iné) prípravky môžu byť použité pre expresiu v napr. CHO bunkách. Prechodná expresia hPSMl.l ako aj hPSMO.O bola získaná v COS bunkách, ako sa overilo metódou Western blotting.
DNA vakcinácia
DNA vakcinácia, pokial je účinná, sa velmi dobre hodí pre PSM autovakcínu - zvlášť preto, lebo sa ukázalo, že táto forma podania podporuje tak imunitné reakcie sprostredkované CTL, ako aj tvorbu protilátok. Preto bolo zámerom uskutočniť paralelnú štúdiu s cieľom vyskúmať účinok DNA vakcinácie myší
128 s vhodnými vektormi kódujúcimi ubiquitín imunogenizovaných myší a/alebo myší TNFoí. DNA vakcinácia s hPSM (a/alebo s mutantmi) kódujúca DNA ako takú sa tiež uskutoční.
Štúdium uskutočnitelnosti s použitím imunogenizovaného ubiquitínu pre DNA vakcináciu
Štúdium uskutočniteľnosti stanovujúce účinok DNA vakcinácie s imunogenizovaným vlastným proteínom sa uskutočnila s použitím ubiquitínu s vloženým T pomocným epitopom z vaječného albumínu (UbiOVA) ako modelovým proteínom. Sekvencie kódujúce UbiOVA ako aj divoký typ ubiquitínu sa subklonovali do cicavčieho expresného vektora pcDNA3.1(-).
Skupiny myší 5 BALB/c sa imunizovali 40 pg pcDNA-UbiOVA alebo pcDNA-ubiquitínového prípravku buď intramuskulárne do kvadriceptu alebo intradermálne. Kontrolná skupina dostávala proteín UbiOVA v úplnom Freundovom adjuvans. Po troch a šiestych týždňoch sa imunizácia opakovala len s tým rozdielom, že UbiOVA proteín sa emulgoval v neúplnom Freudovom adjuvans.
Myšiam sa pravidelne odoberala krv a stanovoval sa titer protilátky proti ubiquitínu. Vo skupine UbiOVA vakcinovanej DNA sa získal len veľmi slabý titer protilátky proti ubiquitínu. Následne boli všetky skupiny podporené UbiOVA proteínom v neúplnom Freundovom adjuvans a odoberali sa vzorky krvi, aby sa zistilo, či vakcinácia UbiOVA a (a nie ubiquitínom) znásobí odozvu protilátok proti UbiOVA proteínu. Výsledky tohoto experimentu ukázali, žé nie je podstatný rozdiel medzi UbiOVA skupinou a kontrolnou skupinou, u všetkých myší sa silno vyvíjali protilátky proti ubiquitínu na základe tejto jedinej podpory UbiOVA/FIA.
129
DNA vakcinácia s použitím hPSM prípravkov
Priebežne sa uskutočňujú rôzne experimenty s použitím hPSM prípravkov. Rôzne divoké typy ľudskej PSM a autovakcinačných prípravkov (ako napr. hPSMO.O, hPSM-?0.0, hPSM'0.0, hPSMl.l, hPSM10.3) sa subklonovali do DNA vakcinačných vektorov (ako pcDNA3.1( + ), pcDNA3.1(-), pVAX a p'ZeoSV2). Do niektorých konštrukcií sa zahrnuli rôzne vedúce sekvencie (ako CDlla, tPA a IL5 vedúca sekvencia; sekv. id. č: 29, 25 a 31) priamo cez N-konce a do kostry, aby sa umožnila sekrécia exprimovaných hPSM proteínov in vivo. Všetky konštrukcie v DNA vakcinačných vektoroch sa overili sekvenovaním DNA a transláciou in vitro.
Rôzne druhy myší (ako Balb/cA, Balb/cJ, DBA/2 a A/J) boli naočkované vyššie opísanou hPSM DNA vakcínou buď intradermálne alebo intramuskulárne a vakcinácia sa niekoľkokrát podporila rovnakými prípravkami.
Vzorky séra sa odoberajú behom imunizačnej doby a skladujú sa pri -20 °C. Tieto vzorky sa potom budú analyzovať na prítomnosť protilátok reaktívnych s divokým typom hPSM.
U týchto myší sa tiež zaviedla skúška na monitorovanie rýchlosti množenia CTL a T pomocných buniek.
Predbežné výsledky naznačujú, že vyvolanie odoziev tak CTL ako aj protilátok proti PSM je možné uskutočniť.
130
Čistenie/charakterizácia hPSM s HIS-značkovaním (437-750) (HIS-PROSIIO.0)
Divoké hPSMII s HIS-značkovaním (HIS-PROSIIO.0), sú exprimované z pET28b a solubilizované inklúzne telieska sa nanesú na stĺpec FPLC gélovej filtrácie a eluujú sa pufrom, ktorý obsahuje 8 M močovinu. Pre optimalizáciu postupu sa frakcie, ktoré prevážne obsahujú hPSM, podrobia rôznym refolding podmienkam. U rozpusteného produktu dialyzovaného proti Tris pufru sa s použitím strieborne zafarbenej SDS-PAGE určila čistota vyššia než 90 %.
Králiky sa imunizovali prečisteným HIS-PROSIIO.0, aby sa výsledné antisérum použilo k pozdnejšej detekcii a prípadnému afinitnému čisteniu hPSM mutantov.
Čistenie/charakterizácia rozpustných hPSM (PROS-ŕO.O)
Divoký typ hPSM bez cytoplazmatickej a transmembránovej časti, PROS+0.0, sa exprimuje v kmeni E. coli BL21 (DE3) na základe indukcie s IPTG a mohol byť detegovaný v inklúznych telieskach. SDS-PAGE tohoto bakteriálneho lyzátu a následná Western blotting s králičím anti-HIS-PROSIIO.0 ukázali produkt s očakávanou migráciu. N-koncové sekvenovanie prvých piatych aminokyselín tohoto produktu eluovaného z SDS-PAGE gélu ukázalo očakávanú sekvenciu odpovedajúcu ľudskému PSM. Produkt sa podrobil rozsiahlym sériám solubilizačných a refolding experimentov. Produkt, ktorý zostane v roztoku, sa môže získať v Tris pufri bez denaturantov alebo reduktantov, ale SDS-PAGE analýza odhalila, že materiál pravdepodobne vytvára velké agregáty. Myši a králičí sa imunizovali týmto materiálom, aby sa získala protilátka proti hPSM, napríklad pre analytické účely - antiséra nereagujú
131 s LNCap hPSM.
Pripravila sa dávka premytých inklúznych teliesok E. coli k imunizácii králikov, aby sa vytvorilo polyklonálne antisérum proti PSM. Približne 50 % obsahu proteínu vo vlhkom peletizovanom materiále tvoril PROSTO.0. Antiséra nereagujú s LNCap hPSM vo Western blotting.
Príprava peptidov hPSM konjugovaných s KLH pre imunizáciu
Tri pentadekamérne peptidy sa syntetizovali, aby sa pripravili imunogénne konjugáty B bunkových epitopov známeho hPSM s molekulou imunologického nosiča, a tak sa získalo polyklonálne antisérum schopné rozpoznať hPSM. Tieto peptidy obsahujú na každom konci B-bunkový epitop PSM a 5-6 ohraničujúcich PSM aminokyselín.
Peptidy sa pripravujú automatickou syntézou, HPLC čistením a kontrolným sekvenovaním Edmanovou degradáciu.
Chemicky viazané konjugáty sa pripravujú sieťovaním epitopu B bunky obsahujúceho hPSM peptidy KLH v štandardnom jednokrokovom procese s glutáraldehydom ako sieťovadlom.
Syntéza peptidov P2 a P30 s ohraničujúcimi hPSM sekvenciami
Bolo navrhnutých šesť peptidov, ktoré odpovedajú P2 a P30 epitopom s 5 ohraničujúcimi hPSM aminokyselinami na každom konci. Ohraničujúce aminokyseliny odpovedajú vstupným miestam epitopu 6, 8 a 10. Peptidy sa použijú napríklad v testoch množenia T-buniek, ale tiež pre iné účely, ako ELISA a iné skúšky in vitro. Peptidové sekvencie sú:
132
PSMpep007 P2 vložený v pozícii 6
QERGVQYIKANSKFIGITELRVDCT (sekv. id. č. : 15)
PSMpepOO8 P2 vložený v pozícii 8 AWLRQYIKANSKFIGITELEMKTY (sekv. id. č.: 16)
PSMpep009 P2 vložený v pozícii 10 MFLERQYIKANSKFIGITELHVIYA (sekv. id. č.: 17)
PSMpepOlO P30 vložený v pozícii 6 NSRLLFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEVDCTP (sekv. id . č. :
PSMpepOll 18) P30 vložený v pozícii 8 WLRKFNN FTVŠ FWLRVPKVS AS HLE S FDS L (sekv. id . č. :
PSMpep012 19) P30 vložený v pozícii 10 LMFLEFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEPSSHN (sekv. id . č:
Epitopy P2 20) a P30 sú podtrhnuté. Peptidy sa pripravili
automatickou syntézou a podrobili sa procesu HPLC čistenia,
po ktorom nasledovalo kontrolné sekvenovanie Edmanovou
degradáciou.
Testy imunogenity
Rôzne experimentálne projekty boli iniciované pre výrobu materiálu a pre zavedenie skúšok imunogenicity určené pre budúce testovanie a výber medzi mutovanými PSM prípravkami.
Vytváranie polyklonových králičích anti-HIS-PROSIIO.0 a antiKHL-PSM-peptidových konjugovaných antisér
Dva králiky sa imunizovali prečisteným HIS-PROSIIO.0, Ckoncovou časťou hPSM proteinu s HIS-značkovaním
133 (aminokyseliny 437-750) emulgovanou 1:1 s kompletným Freundovým adjuvans a dvakrát, podporenou (v 28. a 55. dni) rovnakým antigénom emulgovaným v neúplnom Freundovom adjuvans.
Dva králičí sa imunizovali koktailom pozostávajúcim z konjugátu peptidu KLH-PSM plus každý z troch volných peptidov. Každý z týchto volných peptidov obsahoval skôr definovaný Bbunkový epitop hPSM. Koktail sa emulgoval 1:1 s úplným Freundovým adjuvans. Králičí sa preočkovali dvakrát (v 28. a
55. dni) rovnakým antigénom emulgovaným v neúplnom Freundovom adjuvans.
Krížová reaktivita medzi anti-HIS-PROSIIO.0 a PSMpepOO5 a krížová reaktivita medzi konjugátom anti-KLH-PSM peptidu plus peptidmi a HIS-PROSIIO.0 sa demonštrovala testom ELISA. AntiHIS-PROSIIO . 0 protilátka má schopnosť rozpoznať prirodzené hPSM v lyzátoch buniek LNCaP vo Western blotting.
Imunizácia myší retrovírusovo exprimovaným hPSMO.O
V súčasnom stave PSM projektu je stále vážnou prekážkou nedostatok protilátok, ktoré sú schopné rozpoznať správne posttranslačne upravené natívne hPSM. Preto sa uskutočnil imunizačný experiment s použitím retrovírusovo exprimovaného hPSMO.O.
Šesť skupín Balb/c myší sa imunizovalo buď: 1) mitomycínom C spracovaným BALB/c bunkami 'f ibrosarkómu (79.24.H8), prenášaným hPSMO.O cDNA (CMV-Koz-hPSM), 2) mitomycínom C spracovaným BALB/c bunkami fibrosarkómu (79.24.H8), prenášaným prázdnym vektorom (CMVBipep) , 3) bunkami v balení BOSC transfektovanými hPSMO.O cDNA (CMV-Koz-hPSM), 4) bunkami
134 v balení BOSC transfektovanými prázdnym vektorom (CMVBipep), 5) retrovírusovým kmeňom exprimujúcim hPSMO.O cDNA (CMV-KozhPSM ) , alebo 6) retrovírusový kmeň, prázdny vektor (CMVBipep). 1
V niekolkých časových intervaloch sa myšiam odobrala krv a získané séra sa testovali na reaktivitu proti HIS-PROIIO.O (ELISA). Bohužiaľ, žiadna z myší nevyvíjala protilátky schopné špecificky rozpoznať preparát HIS-PROSIIO.0.
Zavedenie anti-hPSM metódy ELISA
Prečistený HIS-PROSIIO.0 sa použil na potiahnutie polystyrénových mikrotitračných doštičiek (Maxisorp) pre vytvorenie skúšky ELISA pre testovanie napr. supernatantu hybridómu alebo myšie a králičie antiséra. Séra z BALB/c myší imunizovaných rovnakým preparátom HIS-PROSIIO.0 reagovali s imobilizovaným HIS-PROSIIO.0 pri 0,5 pg na často používaný chrenovou peroxidázou označený králičí anti-myší Ig ako sekundárnou protilátkou.
Použitím tejto ELISA analýzy sa demonštrovala už zmienená schopnosť antiséra, vyvolaná u králikov proti konjugátu KHLPSMpep004-PSMpep005-PSMpep006 vo zmesi s voľnými peptidmi, reagovať s imobilizovaným HIS-PROSIIO.
Použití AquaBind® mikrotitračných doštičiek (viď údaje v patente WO 94/03530, kde sa opisujú mikrotitračné povrchy potiahnuté trezylom aktivovaným dextránom, ktoré sa teraz označujú registrovanou ochrannou známkou AquaBind), sa ELISA analýzou stanovili imobilizované PSM peptidy (PSMpep004, PSMpep005 a PSMpep006). AquaBind® doštičky potiahnuté týmito peptidmi môžu detegovať králičie antisérum vyvolané proti
135 rovnakému antigénovému preparátu. Ako sa uvádza vyššie, králičie anti-HIS-PROSIIO.0 sa môže detegovat na AquaBind® doštičkách potiahnutých PSMpep005.
Zavedenie anti-hPSM „Western blot použitím LNCaP buniek a monoklonovej protilátky 7E11C5
B bunkový hybridom 7E11C5, ktorý vylučuje myšiu monoklonovú protilátku IgG2a proti intracelulárnemu epitopu ludského PSM, bol kúpený od ATCC. Kultivačný supernatant z asi 90 % mŕtvych buniek sa zozbieral a použil v metóde Western blotting pre detekciu ľudského PSM tak v membránovo obohatených preparátoch LNCaP buniek, ako aj v bunkových lyzátoch LNCaP. Tato protilátka sa čistila za použitia proteínových G stĺpcov a jej reaktivita s LNCaP sa overovala metódou Western blotting.
Zavedenie metódy FACS k detekcii hPSM na LNCaP bunkách
Zaviedli sme dve vzájomne nezávislé FACS metódy pre detekciu hPSM na LNCaP bunkách. Bolo potrebné sa vyrovnať s niekoľkými problémami: LNCaP bunky rastú velmi pomaly a v nepravidelných zhlukoch, preto musela byť optimalizovaná metóda prípravy suspenzií jednotlivých buniek. Po druhé, epitop rozpoznaný mAb 7E11C5 sa v literatúre definuje ako súčasť cytoplazmatickej domény hPSM. Bol preto vyvinutý spôsob fixácie a permeabilizácie buniek. Za týmto účelom sa proteín G prečistený protilátkou 7E11C5 konjugoval s FITC a potom sa mohol použiť v FACS analýze bez sekundárnej protilátky.
Bola tiež zavedená metóda FACS využívajúca anti-hPSM monoklonovú protilátku J591, ktorá rozoznáva epitop na
136 extracelulárnej časti hPSM. Protilátka sa získala od BZL Biologicals and FITS konjugated a následne sa použila k FACS analýze a triedeniu napríklad LNCaP buniek a hPSM transfektantov (viď ďalej).
Zavedenie testov cytotoxicity
Zaviedol sa spôsob čistenia dendritických buniek z kostnej dréne myší. S použitím modelových proteínov sa optimalizovala imunizácia myší dendritickými bunkami s modelovými peptidmi triedy I, ako aj proteín. Okrem toho sa myši tiež imunizovali modelovým proteínom (β-galaktozidázou) vo forme ISCOMS. Prečistené T-bunky z imunizovaných myší sa in vitro restimulovali rôznymi formami odpovedajúcich antigénov. Následne sa u týchto restimulovaných CT lymfocytov merala schopnosť lýzie rôznych druhov delových buniek (vrátane dendritických buniek s modelovými peptidmi triedy I, rovnako ako transfektantov exprimujúcich retrovírusovo exprimovaný cytozólický peptid triedy I). Zaviedli sa dve rôzne in vitro skúšky na meranie CTL aktivity s použitím buď uvolňovania chrómu alebo DNA fragmentácie (metóda JAM) ako miery cytotoxicity. Velmi pekné výsledky sa získali s modelovým proteínom β-galaktózidázy a s rôznymi kombináciami MHC triedy I a triedy II viažucimi modelové peptidy.
Zavedenie nástrojov narušujúcich autotoleranciu voči myšiemu PSM v myšiach
Zámerom je študovať, či sa môže narušiť autotolerancia k myšiemu PSM v myšiach pomocou imunizácie a/alebo DNA vakcinácie proti myšovitým PSM použitím autovakcinačných myšovitých PSM molekúl.
137
Ako sa uvádza vyššie, bola získaná cDNA kódujúca PSM myšovitých (mPSM) a DNA sekvenovaná. Vytvorili sa štyri varianty mPSM molekúl vložením P30 do dobre definovaných pozícii buď do mPSM s úplnou dĺžkou alebo do mPSM'. Prípravky sú uvedené v nasledujúcej tabulke:
mPSM aminokyseliny dĺžka molekuly substituované P30 (počet aminokyselín)
mPSMO.0 4- 752
mPSM'0.0 4- 694
mPSMX 255-271 (sekv. id. č. : 8) 756
mPSMY 689-700 (sekv. id. č. : 8) 760
mPSM'X 197-213 (sekv. id. č.: 10) 698
mPSM'Y 631-642 (sekv. id. č.: 10) 702
Najprv sa divoký typ mPSM a analógové molekuly subklonujú
do DNA vakcinačných vektorov a použijú sa k DNA vakcinácii myší.
Úmyslom je analyzovať imunitné odozvy, napríklad odozvy CTL a eliminovať nádor u myši. Preto budú nádorové bunkové línie myšovitých transfektované s divokým typom PSM myšovitých (fúzovaných spolu s identifikačným značením, napr. c-myc epitop, sekv. id. č.: 27, pre detekčné účely).
PSM nádorové modely in vivo
Skúšky množenia T buniek s P2 a P30 u myší
Uskutočnili sa série experimentov množenia T buniek, aby sa určila T bunková imunogenicita P2 a P30 peptidov u rôznych druhov myší (BALB/cA (H-2d) , C3H/Hen (H-2k) , DBA/1 (H-2q) a
138
C57BL/6 (H-2b) ) . Je dobre známe, že tieto epitopy sú u ludi promiskuitné, ale promiskuitu T buniek bolo potrebné tiež potvrdiť použitím M&Es experimentálneho usporiadania. Týmto sa ukázalo, že P30 je imunogénny k T bunkám u druhov BALB/cA a C57BL/6, zatial čo ani P2 ani P30 nie sú imunogénne pre T bunky u C3H/Hen. U DBA/1 je možné vyvolať T bunky proti P2.
Vytvorenie hPSM exprimujúceho myšie nádorové bunky
Vytvorila sa tabulka hPSM exprimujúcich nádorové bunky pre použitie hPSM špecifického nádorového modelu u myší, ako aj pre skúšky množenia nádorových buniek.
Jedným prístupom je vytvorenie bunkových línii prenosom nádorových bunkových línii myšovitých s retrovírusovými vektormi kódujúcimi úplný divoký typ hPSMO.O cDNA.
Skonštruovali sa tri rôzne prípravky kódujúce úplný divoký typ cDNA kódujúcej ludský PSM vložený do polyklonálneho miesta retrovírusového vektora CMVBipep. Z týchto prípravkov dva obsahovali krátku Kozákovu sekvenciu umiestnenú pred východzím kodónom.
Tieto prípravky sa preniesli do troch rôznych myších nádorových bunkových línií: P815 (mastocytóm, H-2d) , B16-F10 (melanóm, H-2b) a 79.24.H8 (fibrosarkóm, H-2d) s použitím bunkovej línie v balení BOSC. Zo všetkých troch typov buniek sa získali klony rezistentné voči geneticínu a PCR analýzou génomickej vzorky DNA sa overilo, že retrovírusové prípravky boli integrované do hostitelských buniek. Dosial nebolo možné detegovať exprimovaný PSM génový produkt metódou Western blot alebo FACS analýzou s použitím 7E11C5 monoklonovej protilátky.
139
Transfekciou sa vytvorili dve stabilné myšie nádorové bunkové línie uchovávajúce membránovo viazaný divoký typ ludského PSM. Ta sa uskutočnila pomocou hPSMO.O cDNA subklonovanej do cicavčieho expresného vektora pcDNA3.1(-?) . riadeného CMV promótorom a obsahujúceho Kozákovu sekvenciu umiestnenú pred východzím kodónom.
Výsledný plazmid sa transfektoval do dvoch rôznych myších línií nádorových buniek: 79.24.H8 (fibrosarkóm odvodený z BALB/c) a SalN (fibrosarkóm odvodený z A/J) . Získali sa kultúry rezistentné voči geneticínu a podrobili sa Western blotting a FACS analýzami s použitím J591 a 7E11C5 anti-hPSM monoklonových protilátok. Použitím J591 pri FACS boli bunky triedené niekoľkokrát, až sa získala hPSM pozitívna populácia. Expresia hPSM sa opäť overila intracelulárnym FACS farbením s použitím 7E11C5 protilátky. FACS analýzou sa tiež kontrolovalo, že hladiny expresie MHC triedy I sú rovnaké ako hladiny materských bunkových línií.
Kultúry 79.24.H8 a SalN bunkových línií exprimujúce hPSM sa klonovali pri obmedzenom riedení. Získalo sa niekoľko klonov a tie boli testované pre rozdielne hladiny hPSM expresie FACS analýzou s použitím anti-hPSM monoklonovej protilátky J591.
Bunky 79.24.H8 s expresiou kódujúcim B7.1 pre použitie pre monitorovanie špecifických uvoľňovania gama-interferónu.
pomocou FACS s použitím anti-B7.1
Zavedenie špecifických nádorových hPSM sa transfektovali génom v napr. analýzach in vitro CTL odoziev na hPSM a/alebo Bunky sa raz roztriedili antiséra.
modelov hPSM u myší
Bolo rozhodnuté zaviesť aspoň dva nádorové modely in vivo u
140 imunitné vyhovujúcich myší, aby sa určil protinádorový účinok protilátok vzniklých v myšiach proti molekulám imunogenizovaného hPSM. Dúfajme, že sa to podarí injektovaním syngenetických myších nádorových bunkových línií modifikovaných, aby exprimovali divoký typ hPSM na povrch membrány. Použijú sa bunky tvoriace pevné nádory a/alebo tie, o ktorých sa vie, že metastázujú. V modelu sa použijú bunkové línie, ktoré sa môžu implantovať do syngenetických myší bez toho, aby boli odmietnuté kvôli prítomnosti cudzích hPSM molekúl. Schopnosť hPSM vakcín eliminovať takéto nádorové bunky sa využije pre výber kandidátov na hPSM vakcínu.
Pre vyhodnotenie rastu SalN buniek transfekovaných úplným ludským PSM, sa rôzne dávky (2.106 a 5.106) hPSM transfektujúce SalN bunky (S-PSM, päťkrát triedené) injektovali subkutánne do dolnej časti pravej slabiny skupiny myší A/J. Pevné nádory sa však nezistili. Následne sa injektovali tri klony S-PSM buniek s rôznou úrovňou expresie hPSM subkutánne do troch skupín A/J myší v dávke 107 buniek na 1 myš. Veľkosť zistených nádorov sa merala dvojrozmerne, a tak sa vo výsledku získala veľkosť nádoru v mm2. Tieto hodnoty sa porovnali pre tri sledované skupiny. V rozmedzí 3 - 6 dní sa u všetkých myší vyvinula štruktúra podobná pevnému nádoru, ktorá približne do 15 dní zase zmizla. Je to zrejme dané prítomnosťou ľudského PSM na povrchu nádorových buniek, aj keď to zatiaľ nebolo overené. Bunky SalN transfektované iba pcDNA3.1 vektorom pokračujú u myší v raste ako pevné nádory.
Podobný priebeh sa pozoroval u myší injektovaných ΙΟ6, 5.106 alebo ΙΟ7 79.24.H8 buniek transfektovaných hPSM a niekoľkokrát triedených z hľadiska expresie hPSM. Tieto bunky (nazývané 79-PSM) tiež netvoria nádor ani u Balb/c, ani
141 u DBA/2. Ak sa však klonom hPSM transfektované 79.24.H8 bunky, 79-PSM.3, injektujú do myší Balb/c alebo DBA/2, vyvíjajú myši štruktúry podobné pevným nádorom, ktoré behom 10-20 dní zase.zmizli. Vektorom transfektované bunky 79.24.H8 rastú v myšiach Balb/c ďalej.
Zostáva ešte zhodnotiť, či sú tieto „nádory liečiteľné, alebo či sa zavedie lepší nádorový model založený na opísaných S-PSM a 79-PSM bunkových líniách a klonoch.
Závery
Pri molekulárne konštrukčnej práci sme boli úspešný pri klonovaní ľudského génu PSM a pri získaní myšieho PSM cDNA. Vyrobila sa séria úplne sekvenovaných imunogenizovaných hPSM autovakcínových prípravkou. Mutanty hPSM, rovnako ako rôzne divoké typy molekúl hPSM, boli exprimované v E. coli a zistilo sa, a tiež overilo, že úroveň expresie v E. coli je veľmi nízka. Polyklonálne protilátky proti polovine hPSM s Ckoncom sa indukovali u králikov. Značné úsilie sa venovalo realizácii rôznych expresných značení (His značenie a proteínová fúzia viažuca maltózu), rovnako ako alternatívnym expresným Systémom k E. coli. Rekombinantný divoký typ a/alebo autovakcína hPSM boli detegované v transfektovanej Pichia . pastoris a v.bunkách cicavcov. Urobili sa užitočné úvahy týkajúce sa technológie DNA vakcinácie a uskutočnili sa predbežné štúdie uskutočniteľnosti. Prebiehajúce experimenty DNA vakcinácie s auto-vakcinačnými molekulami hPSM ukazujú sľubné predbežné výsledky. Zaviedli sa rôzne skúšky in vitro užitočné pre testovanie a výber medzi mutovanými PSM prípravkami, vrátane imunochemických skúšok a FACS analýz. Myšie nádorové bunky sa stabilne transfektovali úplným divokým typom . hPSM a pomocou FACS sa roztriedili podľa
142 povrchovej expresie hPSM. Získali sa klony týchto bunkových línii. Xenogénne nádorové modely in vivo u myší sa vyhodnocujú s použitím týchto hPSM nesúcich syngenetické myšie nádorové bunky. Uskutočnila sa séria skúšok množenia T buniek, aby sa vybrali druhy myší vhodné pre nádorové modely. Optimalizovali sa skúšky CTL a získali sa uspokojivé výsledky s modelovými antigénmi pri použití rôznych imunizačných spôsobov a podmienok týchto skúšok. Okrem toho sa zaviedli nástroje potrebné pre štúdium narušovania tolerancie k myšiemu PSM pomocou imunizácie proti myším PSM autovakcínam.
Príklad 2
Výroba autovakcíny Her2
Ľudská autovakcína proti Her2 sa môže vyvinúť modifikáciou molekuly vložením jedného alebo viacerých promiskuitných cudzích T bunkových epitopov, aby sa odkryl úsek imunogenízovaných Her2 molekúl. Tieto modifikované proteíny sa testujú na schopnosť indukovať, protilátky, ktoré sú krížovo reaktívne s natívnymi časťami molekuly Her2. Následne sa v niekoľkých skúškach in vitro a v živočíšnych modeloch in vivo vyhodnotí efektívnosť rôznych konštruktov (to sa môže týkať DNA vakcinácie) a modifikovaných proteínov. Bude sa analyzuje indukcia špecifických CTL odoziev proti Her2 nesúcemu nádorové bunky. Bude sa tiež testovať schopnosť indukovaných protilátok aktivovať komplement klasickou cestou a iniciovať ADCC prostredníctvom Fc-receptorov. Nakoniec sa rôzne modifikované molekuly budú testovať v živočíšnych /
modeloch ľudskej rakoviny prsníka, aby sa vyskúšala ich účinnosť pri liečbe nádorov.
Imunogénne potkanie a ľudské molekuly sa budú konštruovať
143 s promiskuitnými T-bunkovými epitopmi v rôznych polohách v molekule.
Behom vakcinácie proti celej extracelulárnej doméne Her2 môže do určitej miery dochádzať ku krížovým reakciám protilátok s inými EGFr receptormi, pretože niektoré z týchto receptorov sú v extracelulárnej doméne homologické až zo 4046 %. Preto sa plánuje, že sa zachované oblasti Her2 porušia vložením cudzích T bunkových epitopov aspoň L do niektorých modifikovaných proteínov (detaily viď ďalej).
Oblasti Her2, ktoré môžu byť potencionálne CTL alebo Bbunkovými epitopmi, zostanú pri navrhovaní konštruktov zachované a sú ukázané na obr. 3. Odôvodnenie pre využitie týchto polôh je nasledujúce:
Sekvencie ludského Her2 je možné rozdeliť na rad domén, základom ktorých je výhradne primárna štruktúra proteínu.
Extracelulárna (receptorová) časť:
1-173: Doména I (N-koncová doména hotového polypeptidu).
174-323: Doména II (doména bohatá na cysteín, 24 cysteínových zvyškov).
324-483: Doména III (doména, ktorá viaže ligand v homologickom EGF receptore).
484-623: Doména IV (doména bohatá na cysteín, 20 cysteínových zvyškov).
624-654: Transmembránová doména (TM zvyšky 654-675).
Intracelulárna (kinázová) časť:
144
655-1010: Doména tyrosín kinázy (jadro TK domény 725992) .
1011-1235: Doména C-koncov.
Výber miest v aminokyselinovej sekvencii Her2, ktoré majú byt nahradené buď P2 alebo P30 ľudskými T pomocnými epitopmi berie do úvahy nasledujúce parametre (bez ohladu na prioritu):
1. Známe a predpokladané CTL epitopy
2. Homológia príbuzných receptorov (zvlášť EGFR)
3. Zachovanie cysteínových zvyškov
4. Predpovedané špirálové, α-helixové a β-sheet štruktúry·
5. Potencionálne miesta N-glykozylácie
6. Predikcia exponovaných a skrytých aminokyselinových' zvyškov
7. Organizácia domény
CTL epitopy sa vyskytujú ako klastry v doménach I, III, TM, a vo dvoch alebo troch „horúcich bodoch v doméne TK. V súlade s vynálezom sa majú tieto domény z veľkej časti zachovať.
Oblasti s vysokým stupňom homológie s inými receptormi sú pravdepodobne štruktúrne významné pre „celkovú terciárnu štruktúru Her2, a teda pre rozpoznanie protilátkou, zatial čo oblasti s nízkou homológiou je preto potencionálne možné obmeňovať len lokálnymi zmenami štruktúry.
Cysteínové zvyšky sa často zapojujú do intramolekulárnych disulfidových môstikov, a sú preto velmi dôležité pre
145 terciárnu štruktúru a nemali by sa meniť. Oblasti, u ktorých sa predpokladá, že tvoria a-helixovú a β-sheet štruktúru, je výhodné nevyužívať ako vstupné body pre cudzie epitopy, pretože tieto oblasti sú pravdepodobne dôležité pre posttranslačnú úpravu proteínu (folding).
Tiež by sa prednostne mali zachovať potenciálne Nglykozylačné miesta, pretože je velmi žiaduca manozylácia proteínu (napríklad expresiou v kvasinkách), porovnaj prítomnosť receptorov manózy na APC bunkách.
Oblasti, u ktorých sa predpokladá (podľa ich hydrofóbnych vlastností), že sú vnútri molekuly, by bolo výhodné zachovať, pretože by mohli byť zapojené do posttranslačnej úpravy (folding). Na rozdiel od toho oblasti vystavené rozpúšťadlu ponúkajú polohy pre vstup modelových TH epitopov P2 a P30.
A konečne sa berie do úvahy tiež organizácia proteínových domén, pretože je relevantná pre štruktúru a funkciu proteínu.
Stratégia sa zameriava na zachovanie štruktúry extracelulárnej časti Her2, ako je len možné, pretože sa jedná o tú časť proteínu, ktorá je relevantná ako ciel pre neutralizáciu protilátok. Naproti tomu intracelulárna časť natívnej membrány, ktorá viaže Her2 na povrchu rakovinných buniek, je pre humorálny imunitný systém nedostupná.
Dôvodom pre začlenenie tejto časti do vakcíny je preto len prítomnosť CTL epitopov. Je preto pochopiteľné, že sem sa umiestni jeden alebo viacej epitopov. Keď sa ukáže, že nie je možné exprimovať úplnú molekulu Her2 v E. coli alebo v kvasinkách, intracelulárna časť sa môže skrátiť za prvým
146 „horúcim bodom CTL epitopu (okolo polohy 800) . Ďalšie CTL epitopy sa potom môžu pridať k C-koncovej časti skrátenej molekuly.
Transmembránová oblasť je pravdepodobne nezávislá jednotka posttranslačnéj úpravy a jej nahradenie TH epitopmi, napríklad P2 alebo P30, pravdepodobne neovplyvní štruktúru Her2 a posttranslačnú úpravu. Naviac TM doména môže pôsobiť velké problémy pre expresiu v kvasinkách a E. coli a mala by byť v každom prípade substituovaná. Vo všetkých prípravkoch by sa preto mal epitop prednostne umiestniť do tejto domény (možná ju nechať nedotknutú v konštrukcii 1, pretože obsahuje niekolko CTL epitopov a pretože je akýmsi spôsobom zapojený do prenosu signálov na viazanie ligandu).
Extracelulárna doména sa v princípe môže držať nezmenená tým, že sa P2 a P30 umiestnia do intracelulárnych a transmembránových domén, čím sa maximalizuje počet potenciálnych Bbunkových epitopov a interferencia so štruktúrou je čo možná najmenšia. Vysoký stupeň homológie k EGFR, Her-3 a Her-4 však vytvára riziko krížovej reaktivity k týmto receptorom, 'ktorá môže (i keď nemusí) byť nežiaduca. Naviac boli opísané niektoré monoklonové protilátky, ktoré fungujú ako antagonisty receptorov (pravdepodobne stimuláciou heterodimerizácie alebo ligandovej väzby) a zväčšujú velkost nádoru in vivo. Preto sa v extracelulárnej doméne vyberajú také pozície, u ktorých je nádej, že znížia tieto riziká.
Výber zahrnuje všetky už skôr zmienené parametre a zakladá sa na dvoch rôznych predpokladoch:
(i) Zaradenie do oblastí, ktoré sa nezachovávajú (s ohľadom na príslušné receptory), pomôže udržať terciárnu štruktúru a môže znižovať nechcenú aktiváciu protilátkami.
147 (ii) Zaradenie do zachovaných oblastí môže zmeniť štruktúru, ale súčasne môže znížiť riziko krížovej reaktivity narušením sekvencií, ktoré s ňou najviac súvisia.
Obidva predpoklady sú špekulatívne, ale pretože je veľmi ťažké predpovedať účinok umiestnenia epitopu v každej pozícii proteínu, niektoré z týchto pozícií byli zahrnuté do prípravkov.
Uvažovalo sa o tom, že by mohlo byť výhodné úplne odstrániť dve domény bohaté na cysteín. Predpovedalo sa vytvorenie špirálovitej štruktúry vystavenej rozpúšťadlu a možnosť vytvoriť nezávislé jednotky posttranslačnej úpravy (folding) zrejme zapojené do dimerizácie (ako svedčí veľa cysteínov, ktoré mohli slúžiť na udržanie pevnej štruktúry potrebnej pre vytvorenie dimerizačnej domény). Odstránenie týchto štruktúr môže preto eliminovať riziko aktivácie protilátkami, ako aj znížiť počet krížovo reagujúcich protilátok, pretože tieto domény sú najlepšie zachovanou extracelulárnou časťou proteínu.' Produkcia takýchto domén bohatých na cysteín by mohla byť naviac problematická v E. coli alebo kvasinkových bunkách.
Nasledujúce podrobnosti konštruktov, ktoré používajú P2 a P30 epitopy, nie sú obmedzujúcimi príkladmi: P2 epitop sa primárne umiestni do extracelulárnej domény Her2 v kombinácii s P30 epitopom, ktorý substituuje časť alebo celú membránovú oblasť. P2 epitop sa umiestni podľa vyššie uvedených
kritérií. Výhodné konštrukty majú nasledujúcu štruktúru:
Názov konštruktov Poloha P2 Poloha P30 Dĺžka
hHER2MA2-lA 59-73 632-652 795
hHER2MA2-2A 103-117 632-652 795
hHER2MA2-3A 149-163 632-652 795
148
hHER2MA2-4A 210-224 632-652 795
hHER2MA2-5A 250-264 632-652 795
hHER2MA2-6A 325-339 632-652 795
hHER2MA2-7A 369-383 632-652 795
hHER2MA2-8A 465-489 632-652 795
hHER2MA2-9A 579-593 632-652 795
hHER2MA2-lB 59-73 661-675 795
hHER2MA2-2B 103-117 661-675 795
hHER2MA2-3B 149-163 661-675 795
hHER2MA2-4B 210-224 661-675 795
hHER2MA2-5B 250-264 661-675 795
hHER2MA2-6B 325-339 661-675 795
hHER2MA2-7B 369-383 661-675 795
hHER2MA2-8B 465-479 661-675 795
hHER2MA2-9B 579-593 661-675 795
hHER2MA2-lY 59-73 710-730 795
hHER2MA2-2Y 103-117 710-730 795
hHER2MA2-3Y 149-163 710-730 795
hHER2MA2-4Y 210-224 710-730 795
hHER2MA2-5Y 250-264 710-730 795
hHER2MA2-6Y 325-339 710-730 795
hHER2MA2-7Y 369-383 710-730 795
hHER2MA2-8Y 465-479 710-730 795
hHER2MA2-9Y 579-593 710-730 795
hHER2MA2-Z 695-709 710-730 795
hHER2MA2-C 653-667 632-652 795
hHER2MA2-BX 695-709 661-675 795
hHER2MA2-AX 695-709 632-652 795
hHER2MA2-4E 210-224 5-25 795
hHER2MA2-6E 325-339 5-25 795
hHER2MA2-8E 465-479 5-25 795
hHER2MA5-4D 210-224 632-652* 666
hHER2MA5-6D 325-339 632-652* 666
149 hHER2MA5-8D hHER2MA6-C
465-479
632-652
666
653-667
632-652 702
Poloha epitopu označuje prvú a poslednú aminokyselinovú polohu epitopu vzhladom k východziemu bodu zrelého Her2. DÍžka znamená dĺžku aminokyselín úplného konštruktu. Vo všetkých prípravkov, okrem tých, ktorých pozícia je označená *, epitop nahradzuje úsek aminokyseliny s rovnakou dĺžkoú.
znamená, že epitop je skôr vložený do Her2, než aby substituoval jeho časť. Všetky vyššie uvedené konštrukty sú preto skrátené obdoby zrelého Her2, kde vynechaná časť je z C-konca.
Väčšina prípravkov existuje v rôznych obmenách, napríklad vo vektore pcDNA3.1+, vo fúzii s prírodnou signálnou peptidovou sekvenciou Her2, vo vektore pMT/BiP/V5-His-A ako fúzia s BiP hlavným peptidom pre expresiu v bunkách Drosophila a bez vedúcej sekvencie vo vektore pET28b pre expresiu v bunkách E. coli.
Nižšie sa opisujú modely, ktoré majú slúžiť pre screening a výber modifikovaných Her2 proteínov.
1. Indukcia protilátok v transgenetickej myši s potkaním Her2 a v králikoch vzhladom k potkaniemu a ľudskému Her2 sa bude skúmať konvenčnou technológiou ELISA po aspoň troch imunizáciách. Komerčne dostupné protilátky k ľudskému a potkaniemu Her2 budú použité ako pozitívne kontroly.
2. Tieto králičie protilátky sa použijú na štúdium predpokladanej inhibície rastu ľudských a transgenetikých myších nádorových buniek so zvýšenou expresiou Her2 v in vitro modeli.
3. T bunkové množenie PBL od pacientov imunizovaných tetanom
150 smerom k vybraným ľudským molekulám Her2 bude skúmané konvenčnými spôsobmi.
4. Schopnosť modifikovaných potkaních molekúl Her2 indukovať odozvy CTL v transgenetických myšiach s potkaním Her2 sa bude študovať použitím nádorov z týchto myší, ako cielov.
5. Zamýšľa sa syntéza vybranej sady peptidov, ktorá v transmembránovej oblasti ľudského Her2 zahrnuje P2 a P30 epitopy. Tieto peptidy sa budú testovať z hľadiska množenia PBL získaných z ludí dopredu imunizovaných tetanovým toxoidom, aby sa zistilo, či P2 a P30 epitopy sa môžu účinne spracovávať mimo sekvencie vnútri Her2 a prezentovať sa T bunkám.
6. Je dosť možné, že vybrané ľudské modifikované proteíny Her2 sa budú testovať na tvorbu neutralizačných protilátok v myši, ktorá sa geneticky vybaví tak, aby exprimovala len ludské VDJ gény. Taká myš je dostupná u spolupracujúcej firmy Abdenix, Fremont, CA, USA.
Boli opísané štyri dobre definované transgenetické myšie modely pre rakovinu prsníka, ktoré obsahujú potkaní onkogén Her2. Prvé tri skupiny transgenetických myší exprimujú aktivovaný onkogén Her2, zatial čo štvrtý model využíva neaktivovaný Her2. Všetky modely používajú MMTV promótor na riadenie expresie v prsníkových žľazách.
Rozhodli sme sa použiť dva modely transgenetických myší: 1) model agresívnejšieho nádoru opísaného Mullerom a spol., ktorý vyžíva aktivovaný onkogén Her2 (Muller et al, 1989) a 2) model menej agresívneho nádoru, v ktorom inaktivovaný Her2 tvorí ložisko nádorov prsníkovej žľazy s dlhou latenciou (Guy et al, 1992). Obidve skupiny transgenetických myší boli kúpené od Jackson a/alebo Charles Rivers Laboratories.
151
V počiatočných experimentoch sa tieto myši ponechajú, aby produkovali protilátky a CTL odozvy pomocou imunizácie a podporou modifikovanými potkaními Her2 proteínmi. Incidencia nádorov sa potom búde sledovať opísanými postupmi (Muller et al, 1989; Guy et al, 1992; Katsumata et al, 1995). Hladina protilátok sa zmeria ELISA analýzou. Aktivita CTL sa určí pomocou vytvorenia delových buniek exprimujúcich potkaní Her2, ako bolo uvedené vyššie.
Alternatívne sa pre pokusy pasívnej vakcinácie môže použiť model xenograftu karcinómu u holých myší. Holým myšiam sa môžu transplantovať ľudské nádory a ich inhibíciu sa je možné pokúsiť pasívnym prenosom séra z normálnych alebo humanizovaných myší imunizovaných modifikovanými Her2 proteínmi. Zatiaľ čo toto by mohlo byť užitočné pre štúdium úlohy protilátok na potlačenie nádorov, aktivitu CTL nie je možné v tomto systéme priamo merať.
.V druhom modeli in vivo by sa nádory v myšiach tiež vytvárali pomocou transplantácie bunkových línií z nádorov transgenetických myší opísaných vyššie. Bunkové línie generované z týchto myší by sa preniesli do odpovedajúceho druhu myší a boli by lokalizované podľa štandardných protokolov.
Prenos myších nádorových buniek so zvýšenou expresiou potkanieho Her2:
V tomto systéme sa budú bunky transfektovať potkaními génmi a prenesú sa do MHC kompatibilných myší. Inhibícia rastu nádoru by sa dosiahla vytvorením odoziev proti Her2.
V týchto systémoch modifikované Her2 proteíny by sa použili
152 ako vakcína v adjuvans pre vytvorenie protilátok a CTL odoziev.
DNA vakcinácia sa môže úspešne použiť v niekoľkých systémoch na zahájenie účinnej imunitnej odozvy. Priebežne sme sledovali prostriedky uvoľňovania DNA použitím modifikovaných vlastných proteínov. Našim zámerom je využiť prístup DNA vakcinácie na stanovenie účinkov modifikovaných Her2 konštruktov na inhibíciu nádorov v transgenetických myších modeloch rakoviny prsníka. Podobný prístup môže byť potom aplikovaný na liečenie tohoto ochorenia u ludí.
Príklad 3
Výroba vakcíny proti FGF8b
Nasledujúca časť popisuje ako je možné vyvinúť ludskú autovakcínu proti FGF8b modifikáciou molekuly vložením jedného alebo viacerých promiskuitných cudzích T bunkových epitopov, aby sa odkrylo pole imunogenizovaných „FGF8b molekúl. Prípravky sa budú testovať z hľadiska schopnosti indukovať protilátky, ktoré sú krížovo reaktívne s autentickými časťami molekuly FGF8b. Následne sa v niekoľkých skúškach in vitro a v živočíšnych modeloch in vivo vyhodnotí účinnosť rôznych 'konštruktov. Indukované protilátky sa budú testovať z hľadiska ich schopnosti aktivovať komplement klasickou cestou a iniciovať ADCC cez Fc-receptory. Nakoniec sa budú rôzne molekuly testovať v živočíšnych modeloch ľudskej rakoviny prostaty a prsníka.
153
Konštrukcia autovakcíny proti FGF8b
Vďaka úplnej identite myších a ľudských FGF8b polypeptidov sa všetky prípravky môžu použiť k experimentom tak u ľudí ako aj u myší.
Promiskuitný tetanový toxoid T pomocných bunkových epitopov P2 a P30 úspešne používaný v ludskej TNFa vakcíne sa vloží do FGF8b polypeptidu. Vzhľadom k malej veľkosti FGF8b budú prípravky vyrobené s jedným epitopom na molekulu. Iné promiskuitné T pomocné bunkové epitopy, ako je chrípkový hemoglutinínový epitop HA (307-319) a iné tu diskutované Tbunkové epitopy je možné tiež vziať do úvahy (O'Sullivan 1991).
Pripravili sa 4 rôzne imunogenizované FGF8b konštrukty s epitopmi rozmiestenými pozdĺž molekuly. Tieto štyri prípravky sa urobia na základe viacnásobných a párových zoradení FGF skupiny proteínov. Párové zoradenie FGF2 a FGF8b sa použije ako základ pre analýzu predpokladanej sekundárnej štruktúry v celej molekule FGF8b (t.j. β-sheet rozloženie). Zvyšky, ktoré sa zachovajú medzi FGF2 a FGF8b, netvoria klastry na žiadnom mieste trojrozmernej štruktúry, čo indikuje, že molekula nemá žiadne jednotlivé oblasti, ktoré nie je možné nahradiť bez zhubných účinkov na schopnosť posttranslačných úprav. Aminokyselinové zvyšky v FGF2, ktoré sú v jednej línií s cysteínovými zvyškami v FGF8b, sú trojrozmerne umiestnené veľmi tesne jeden k druhému, čo naznačuje, že tvoria v FGF8b disulfidovú väzbu, a že zoradenie je správne. Tiež sa počíta s flexibilitou Nkoncovej časti FGF2.
Obmena FGF8b s P30 epitopom v N-konci (F30N) sa navrhla,
154 aby nezostala medzera v zoradení aminokyselinových zvyškov FGF8b proteínu a P30 epitopu (sekv. id. č: 14) a na základe vyhodnotenia rôznych pozícii s ohladom na chemické vlastnosti každého aminokyselinového zvyšku. Uvažovali sa len N-koncové oblasti predpokladanej β-barrelovej štruktúry. V prípade F30N je podobných 9 z 21 zvyškov. S využitím tohoto pseudoalgoritmu je možné očakávať, že substitúciami dôjde k minimálnym zmenám celkovej štruktúry. Sekvencie štyroch rôznych prípravkov, rovnako ako aj trojrozmerné znázornenia nahradených aminokyselín ukazuje obr. 6.
Obmena FGF8b s epitopom P2 (sekv. id. č: 12) v C-konci (F2C) bola pôvodne navrhovaná ako F30N. Tam však už existuje predpokladaný dobrý epitop Kd v pozíciách 195-203. Preto sa P2 epitop vkladá presne do C-konca tohto epitopu. Do úvahy opäť prichádzajú len C-koncové oblasti predpokladanej βbarrelovej štruktúry.
Vnútorné obmeny FGF8b (F30I a F2I) boli konštruované nahradením vonkajších špirál v štruktúre FGF2 epitopmi P2 a P30, pričom β-barrelová štruktúrna podstata FGF zostane podía všetkého nezmenená.
Imunogenizované molekuly FGF8b boli exprimované v Eschericia coli, čo uľahčuje produkciu proteínov vo velkom merítku za minimálnu cenu. Aj keď FGF8b obsahuje dve potenciálne glykozylačné miesta (Asn31 a Asnl77), bakteriálne exprimovaný rekombinantný FGF8b sa ukázal ako biologicky aktívny (MacArthur, 1995a; Blunt, 1997).
čistenia a posttranslačnej úpravy boli pripravované v His označenej verzii, čo umožňuje väzbu k Ninabitej kolóne.
Pre uľahčenie obmeny FGF8b
155
Čistenie molekúl sa uskutočňuje využívaním vysokého kladného náboja proteínových molekúl alebo His značenia a refolding sa uskutoční štandardnými postupmi, ktoré počítajú s tvorbou disulfidových môstikov.
I
Štyri imunogenizované molekuly sa môžu tiež spoločne s divokým typom FGF8b cDNA vložiť do DNA vakcinačných vektorov.
Mapovanie a výber modifikovaných molekúl FGF8b
Štyri imunogenizované molekuly FGF8 boli exprimované v baktériách a následne sa čistili od inklúznych teliesok. Paralelne sa prípravky použijú ako DNA vakcíny. Rozdielne prípravky sa potom porovnajú z hladiska ich schopnosti indukovať rôzne účinky, ktoré sú žiadané pre liečbu pacientov s rakovinou prostaty a prsníka. Tento výskum sa uskutoční s využitím niekoľkých rozdielnych skúšok in vitro a in vivo. Experimentálne výsledky nakoniec vytvoria základ pre konečný výber jedného alebo dvoch kandidátov pre ľudskú FGF8b vakcínu.
Modely in vitro
Analýzy v systéme myšovitých
Myši rôznych haplotypov, ako aj králiky sa imunizujú rôznymi konštruktmi FGF8b v kompletnom Freundovom adjuvans a následne sa podporia aspoň dvakrát rovnakým antigénom emulzifikovaným v neúplnom Freundovom adjuvans. Tým sa môže porovnať schopnosť rôznych konštruktov narušiť B-bunkovú toleranciu. DNA vakcinácia sa uskutoční na iných živočíchoch s použitím prečistenej DNA v úplnom Freundovom adjuvans/
156 neúplnom Freundovom adjuvans intramuskulárnou injekciou v 14 denných intervaloch.
Vzorky séra sa získajú v niekoľkých časových etapách behom imunizačného rozvrhu a schopnosť rozdielnych konštruktov indukovať protilátky špecifické pre FGF8b sa určí konvenčnou ELISA metódou (Rochon, 1994). Komerčné polyklonové antisérum, ako aj komerčná monoklonová protilátka vyvolaná proti FGF8b (R&D) by sa použili pre pozitívnu kontrolu. Proteín FGF8b je komerčne dostupný (R&D), ale tiež sa bude vyrábať vedia s inými FGF8b konštruktmi a následným čistením/refolding. Tento produkt sa potom použije na potiahnutie platničiek v priamej ELISA metóde pre testovanie myšieho/králičieho séra imunizovaného obmenami FGF8b proteínu.
Cenným nástrojom pre skúmanie účinkov vakcinácie proti FGF8b bude rakovinná bunková línia závislá na FGF8b. Niekolko pozitívnych FGF8b rakovinných bunkových línií, napr. MCF-7 alebo SC-3 sa opisujú v literatúre. Taká myšia rakovinná bunková línia závislá na FGF8b bude identifikovaná použitím kvantitatívnej RT-PCR, experimentmi bunkového množenia a skúškami fosforylácie STAT-3.
Prítomnosť FGF8b viazaných na FGF receptor na bunkovom povrchu sa bude detegovať s protilátkami špecifickými na FGF8b v FACS alebo ELISA analýzach. Protilátky zamerané proti niekoľkým rôznym FGF receptorom sú komerčne dostupné (R&D).
Konštrukty budú porovnané s ohľadom na ich schopnosť indukovať protilátky schopné aktivovať komplementovú lýziu buniek produkujúcich/nesúcich FGF8b. Môže to byť detegované jednou z myších nádorových bunkových línií, ktorá má skôr opísanú expresiu FGF8b alebo alternatívne použitím buniek
157 osmoticky naplnených FGF8b. Séra z normálnych alebo transgenetických myši (viď ďalej) imunizovaných ľudskými FGF8b konštruktmi budú inkubované s bunkovou líniou a následne s čerstvým komplementom morčaťa. Protilátka sprostredkujúca komplementovú lýziu buniek môže byť detegovaná štandardnými postupmi. Schopnosť indukovaných protilátok sprostredkovať ADCC sa môže študovať meraním uvoľňovania 51Cr z označených buniek exprimujúcich FGF8b. Efektorovými bunkami budú PBMC zo syngenetických myší. Pre zavedenie skúšky môže byť vhodná myšia bunková línia schopná sprostredkováť ADCC (pozitívna ná Fc-receptory) ako efektorová bunka s protilátkou proti ludskému FGF8b.
Uskutočníme tiež skúšku šírenia nádoru, aby sa ukázalo, že kandidáti na FGF8b vakcíny nijak nepodporujú autoprotilátkou indukovaný rast nádoru. Vzorky séra z imunizovaných myší budú inkubované s FGF8b exprimujúceho nádorové bunky. Šírenie nádorových buniek sa potom môže detegovať podlá ich schopnosti inkorporovať 3H-tymidín, ktorý sa následne pridá k bunkám.
Pretože FGF8b je známy tým, že indukuje množenie radu buniek cicavcov, bude tiež potrebné vyskúšať rast podporujúce účinky rôznych proteínov. To sa môže uskutočnilo použitím proliferačných skúšok, ktoré použil Marsh, 1999.
Biologický účinok FGF8b na bunky cicavcov by sa mal neutralizovať autoprotilátkami. To je možné demonštrovať použitím rekombinantného FGF8b a napr. NIH3T3 v štúdiách množenia buniek (a ich morfologických zmien). Prídavok autoprotilátok by mal odstrániť transformačnú aktivitu FGF8b.
158
Imunizačný protokol
Počet živočíchov, ktorý sa zúčastní FGF8b autovakcinačného imunizačného experimentu, musí závisieť na očakávanej penentrácii choroby v modeli, a tým na počtu potrebnému na získanie štatisticky významnej informácie. Imunizačný protokol musí byť založený na skúsenosti, ktorú máme z projektu TNFa autovakcinácie. Rôzne imunizačné protokoly sa používali k imunizácii myší s rôznymi TNFa analógmi pré špecifické účely, ale najviac pokusov sa uskutočnilo s nasledujúcim protokolom:
1. Myši by sa mali individuálne označiť značkou buď v uchu alebo transpondérmi, 10 zvierat v každej klietke. Samce a samičky sa podlá všetkého musia vyhodnocovať oddelene, ale my v žiadnom prípade nebudeme mať obidve pohlavia v jednej a tej istej klietke. Zvieratá by sa mali ponechať v kľude aspoň 3 dni po transporte a,značkovaniu.
2. Antigén o koncentrácii 1 mg/ml v PBS pufri sa emulzifikuje s rovnakým objemom Freundovho kompletného antigénu (CFA) (Difco alebo Sigma). Emulzia sa kontroluje umiestnením kvapky emulzie na vodnú hladinu a sledovaním, či kvapka drží pohromade alebo disperguje. V miešaní sa pokračuje dokiaľ kvapka nedisperguje.
3. Štandardnou imunizačnou dávka je 100 pg antigénu y objeme 100 μΐ + 100 μΐ adjuvans. Tak celkový imunizačný objem je 200 μΐ, podávaný subkutánne (s.c.), do chrbta zvieraťa.
4. Podpory sa aplikovali v 2 - 3 týždenných intervaloch.
Podporný imunizačný materiál sa pripravuje presne rovnako ako imunizačný, ale použije sa Freundov neúplný adjuvans. Asi tri podporné dávky indukujú maximálny titer. A tak sa najvyššie titry získajú po 6 - 9 týždňoch od prvej imunizácie.
159
5. Krv sa odoberá kapilárne z oka v množstve 50 - 100 μΐ, obvykle pred prvou iminuzáciou a týždeň po každej podpore. Tiež sa môže použiť krv z chvosta a pre stanovenia titru môže stačiť 10 - 20 μΐ.
Počiatok imunizačného programu závisí na vývoji choroby a na prijatej stratégii. Pôvodne sme sa chceli pokúsiť vytvoriť maximálnu imunitu čo najskôr, ale je obtiažne zahájiť imunizácie skôr, ako vo veku asi 5 týždňov. Potom by sa mali vysoké titre udržovať podporou v 6 - 8 týždenných intervaloch, po troch počiatočných podporách. Je tu však potencionálny problém, ak je FGF8b potrebný pre normálný vývoj mladej myši, a to hovorí v prospech pozdnejšieho zahájenia imunizácie u dospelej myši.
Analýzy v ludskom systéme
Pri výbere medzi rôznymi FGF8b konštruktmi sa bude skúmať schopnosť ľudských buniek prezentujúcich antigén prezentovať vložené imunogénne T-bunkové epitopy ľudským T bunkám. To sa uskutoční použitím rovnakých in vitro skúšok pre P2 a P30, ako sa použili pre TNFa vakcínu. Ľudské T bunkové línie, ktoré sú špecifické pre P2 a P30, sa získajú od donorov vakcinovaných proti tetanu. Antigén prezentujúce bunky (PBMC) z tých' istých donorov sa budú inkubovať s rôznymi konštruktmi a pridajú sa T bunkové línie. Úroveň prezentácie vložených T bunkových epitopov sa potom môže porovnať meraním stimulácie T bunkových línií.
Živočíšne modely in vivo
Aspoň tri rozdielne systémy môžu byť použité pre monitorovanie, či sú indukované FGF8b protilátky schopné
160 riadiť na FGF8b závislý účinok in vivo.
Myšiam sa bude transplantovať myší FGF8 exprimujúci nádorové bunky a inhibícia progresie nádoru sa bude skúšať akutovakcináciou používajúcou modifikované FGF8b proteíny alebo FGF8b DNA vakcíny. Ideálny systém zahrnuje použitie buniek izolovaných z myších nádorov. Alternatívne použijeme iné bunkové línie myšovitých (napr. Balb/3T3) trvalo transfektovaných s FGF8b DNA v expresnom vektore.
Na experimenty s pasívnou vakconáciou sa použije model myšieho xenograftového karcinómu. Holým myšiam sa budú transplantovať ludské nádory a o inhibíciu nádorov sa budeme pokúšať prenosom séra z normálnych alebo humanizovaných myší imunizovaných modifikovanými FGF8b proteínmi alebo FGF8b DNA vakcínami. Mohlo by to byť veľmi užitočné pre štúdium schopnosti vyvolanie protilátok na potlačenie nádorov.
Iný prístup pre overenie koncepcie zahrnuje použitie myši transgenetickej pre FGF8b. U týchto myši, ktoré nesú FGF8b cDNA riadenú velmi špecifickým promótorom myšieho prsníkového nádorového vírusu (MMTV), sa ukázalo, že spontánne vyvíjajú FGF8b exprimujúci prsníkové nádory (Coombes, osobná diskusia). Autovakcinácia týchto myší rôzne obmenenými FGF8b proteínmi alebo FGF8b DNA vakcínami nám ukáže, či autovakcína umožní myši potlačiť alebo odmietnuť nádory.
Možnou cestou pre overenie koncepcie by bolo použitie Wnt-1 transgenetickej myši (MacArthur, 1995c). O indukcii rakoviny prsníku vírusom MMTV sa uvádza, že aktivuje expresiu FGF8 vo viac ako polovine myších vyvíjajúcich sa nádorov. Závislosť nádorov na FGF8b by sa mohla zaviesť, keď naša autovakcína (autovakcíny) potlačí výskyt alebo rýchlosť rastu nádorov.
161
Skutočnosť, že transgenetické myši často vykazujú nefyziologické imunologické obrazy tolerancie, neovplyvní príliš tento projekt, pretože FGF8b polypeptidy sú u ľudí a myší identické.
Keby sa nakoniec ukázal priaznivý účinok FGF8b imunizácie na myšom modeli a vybrali sa vhodný kandidáti pre ľudskú vakcínu, bolo by možné uskutočniť obmedzený počet toxikologických štúdii. Pre získanie konečného potvrdenia koncepcie sa môžu následne uskutočniť vakcinačné štúdie u pacientov s rakovinou prsníka a prostaty.
Významné je to, že v prípade pozitívnych výsledkov experimentov na modeloch in vivo, sa na základe dostupných údajov zostaví viacej mutantov.
Príklad 4
Príprava analógu MUC-1
Pripravila sa len jedna autovakcinačná molekula MUC-1. Ta obsahuje celkom deväť opakovaní mucínu, z ktorých každé má sekvenciu sekv. id. č: 33. Prípravok začína tromi týmito sekvenciami, , nasleduje P2 epitop, tri ' ďalšie mucínové sekvencie, P30 epitop a ukončujú ho tri mucínové sekvencie.
Prípravok sa pripravil s N-koncom označeným UNI-HIS (sekv. id. č: 23) alebo bez neho. Obidve varianty boli exprimované v E. coli. Identita exprimovaných proteínov sa potvrdila tak Western blotting ako aj N-koncovým sekvenovaním. Proteín sa exprimujú v rozpustnej forme, ale ako dimér, čo je trochu prekvapujúce.
162 f
HIS označená MUC-1 molekula sa prečistila kovovou afinitnou chromatografiou. Množstvo čistého proteínu a jeho čistota nie sú v súčasnosti známe.
Príklad 5
Narušenie autotolerancie v modelovom systéme myšovitých
V CTL experimentoch, v ktorých sa myši imunizujú dendritickými bunkami pulzujúcimi s epitopmi tak triedy I ako aj triedy II, bola predbežne vykázaná zvýšená CTL indukcia, keď sa imunizujú ako aj restimulujú in vitro peptidom triedy
I a triedy II, v porovnaní s imunizáciou a restimuláciou iba s epitopom triedy I. Táto situácia je porovnateľná s imunizáciou autovakcínou, u ktorej sa cudzí epitop triedy
II vloží do vlastného proteínu. Absorpcia a spracovanie týchto molekúl špecializovanými bunkami prezentujúcimi antigén, napríklad dendritickými bunkami, vedie k prezentácii cudzieho epitopu triedy II spoločne s niektorými vlastným epitopmi triedy I. Je známe, že je možné vyvolať autoreaktívne CT lymfocyty, ale prítomnosť cudzích pomocných epitopov triedy II môže velmi pravdepodobne zvýšiť túto CTL indukciu.
Potenciálna výhoda predkladaného vynálezu spočívajúca v indukcii vlastných reaktívnych CTL sa v súčasnosti skúma vo vaječnom albumíne transgenetických myši. Existujú štyri rôzne transgenetické línie s rozdielnou úrovňou expresie vaječného albumínu a tolerančných stavov, porovnaj Kurts C et alz J. Exp. Med. 186 (1997), 239-245, ktorý opisujú RIP-mOVA transgenetické myši (exprimujúce vaječný albumín v pankrease, obličke a týmuse, a ktoré majú vysoký stupeň tolerancie)
163 a Kurts C et al: J. Exp. Med. 188 (1998), 409-414, opisujúci RIP-0VAnízky a RIP-OVAvysoký transgenetické myší s nízkou a vysokou expresiou vaječného albumínu. Posledná línia, RIP0VAstredný, ktorá exprimuje vaječný albumín na prostrednej úrovni sa získala od Dr. Williama R. Heatha, spoluautora dvoch vyššie uvedených odkazov.
V tele sa vyskytujú rôzne stupne tolerancie voči rôznym antigénom. Jeden z najmenších stupňov tolerancie sa našiel vo veľkom množstve na cirkulujúcich antigénoch. Tieto antigény všetky vstúpia do týmusu, kde sa odstránia vlastné reaktívne T-bunky. Tieto antigény spadajú pod „centrálnu toleranciu. Na druhej strane tkanivovo špecifické antigény nevstupujú priamo do týmusu a sú obecne pod „periférnou toleranciou, ktorá sa napríklad prejavuje T-bunkovou anergiou.
Vyrábajú sa dva autovakcinačné prípravky vaječného albumínu. Obidve sa vzťahujú k sekvencií s prístupovým č: J00845 v EMBL, kde sa sekvencie z P30 (sekv. id. č: 14) vkladajú do dvoch rôznych pozícií.
V prípravku „0VA3.1 sa P30 vkladá do pozície odpovedajúcej aminokyseline č. 272-292 vo vaječnom albumíne. V prípravku „OVA3.2 sa P30 vkladá do pozície odpovedajúcej aminokyseline č. 321-341 vo vaječnom albumíne. Tieto prípravky sa vložili do vektora pVaxl a použili k DNA imunizácii.
Myši sa imunizujú intradermálne raz, každá so 100 pg DNA. Tri týždne po tejto imunizácii sa odstráni slezina a urobia sa CTL skúšky s použitím delových buniek exprimujúcich dominantný epitop vaječného albumínu SIINFEKL a zmiešaný peptid FILKSINE ako kontrola. Imunizácie podlá očakávania poskytujú zreteľnú indukciu CTL v divokom type C57BL/6 myší,
164 pretože tak vaječný albumín, ako aj P30 sú v týchto myšiach cudzie.
Teraz máme v úmysle imunizovať 4 línie vaječných albumínových transgenetických myší týmito autovakcinačnými konštruktmi. RIP-OVAnizky, RIP-OVAstredný a RIP-OVAvysoký exprimujú zvyšujúce sa množstvá vaječného albumínu a majú rôzne stupne tolerancie a ako už bolo povedané, RIP-mOVA má vysoký stupeň tolerancie.
V týchto štyroch líniách transgenetických myší bude cudzí len P30. Vaječný albumín je u týchto myší vlastným antigénom, a preto sa jedná o pravú autovakcináciu pre indukciu CTL voči vaječnému albumínu.
Predbežné výsledky získané pre myši RIP-OVAnizky, ktoré majú najnižší stupeň „periférnej tolerancie k vaječnému albumínu, ukazujú, že tak vaječný albumín s vloženým P30 ako aj prírodné sa vyskytujúce molekuly vaječného albumínu sú schopné indukovať odozvy CTL - očakáva, sa, že len transgenetické myši majúce vysoký stupeň tolerancie budú schopné pozdvihnúť odozvu CTL proti modifikovaným molekulám vaječného albumínu a nie proti prírodnej forme.
Zoznam publikácii
Ago H et al. (1991) J. Biochem (Tokyo), 110, 360-3
Abdel-Nabi H et al. (1992) Sem. Urol. 10, 45-54
Acevedo et al. (1995) Cancer 76, 1467-1475
Acavedo et al. (1997) Cancer Detect. Prev. 21, 295-303 Adelstein S et al. (1991) Science 251, 1223-1225
Babian RJ et al. (1994) J. Urol. 152, 1952-1955 Bernard JA et al. (1995) Gastroenterol. 108 (2) 564-580
165
Bier H et al. (1995) Eur. Árch. Otorhinolaryngol. 252 (7)
433-439
Bouchard L et al. (1989) Celí 57 (6) 931-36
Blaber M et al. (1996) Biochemistry 35, 2086-94
Blunt AG et al. (1997) J. Biol. Chem. 272, 3733-8
Boring CC et al. (1993) CA Cancer J. Clin. 43, 7-26
Boucher et al. (1995) Hum. Pathol. 26, 1201-1206
Callahan R (1996) Breast Cancer Res. Treat. 39, 33-44 Carter RE (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93, 749-753 Chang et al. (1981) Fertil. Steril. 36, 659-663
Chantry A (1995) J. Biol. Chem. 270 (7) 3068-73
Crossley PH et al. (1996b) Celí 84, 127-36
Crossley PH et al. (1995) Development 121, 439-51
Crossley PH, Martinez, S. and Martin, G.R. (1996a) Midbrain development induced by FGF8 in chick embryo. Náture 380, 66-8
Dean C et al. (1994) Int. J. Cancer, suppl 8, 103-107
Dillioglugil Q et al. (1995) Eur. Urol. 28, 85-101
Doi et al. (1996) Int. J. Cancer 65, 454-459
Douglas TH et al. (1995) J. Surg. Oncol. 59 (4) 246-250 .
Earp HS et al. (1995) Breast Cancer Res. Treat 35 (1) 115-32
Eccles SA (1994) Invasion Metastasis 14 (1-6) 337-48
Eppenberger U et al. (1994) J. Neurooncol. 22 (3) 249-54
Dorkin TJ et al. (1999) Oncogene 18, 2755-2761
Eriksson AE et al. (1993) Protein. Sci. 2, 1274-84
Fernadez-Teran M et al. (1997) Dev. Biol. 189, 246-55
Fujii K et al. (1995) Exp. Celí. Res. 216 (1) 261-72
Furst J et al. (1994) Urol. Res. 22, 107-113
Furthauer et al. (1997) Development 124, 4253-64
Geissler et al. (1997) Lab. Invest. 76, 859-871
Gemel J et al. (1996) Genomics 35, 253-7
Ghosh AK et al. (1996) Celí Growth Differ 7, 1425-34
Goldfarb M et al. (1996) Cytokine Growth Factor Rev 7, 311166
325
Goodnow CC et al
Goodnow CC et al
Greenberg NM et
(1988) Náture 334, 676-682 (1991) Náture 352, 532-536 il. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92
3439-3443
Guy CT et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 10578-82
Heikinheimo M et al. (1994) Mech. Dev. 48, 129-138
Henttu P and Vihko P (1989) Bioch. Biophys. Res. Com. 160
903-910
Hop TP and Woods KR (1983) Mol. Immunol. 20, 483-489 Horoszewicz JSH et al. (1983) Cancer Res. 43, 1803-1818 Horoszewicz JSH et al. (1987) Anticancer Res. 7, 927-936 Hishikawa M et al. (1998) Biochem. Biophys. Res. Com. 244
258
'-191 al. (1996) Cytokine Growth Factor Rev. 7,
I et
RS et al. (1994) Cancer Res. 54, 1807-1811
RS et al. (1993) Cancer Res. 53, 227-230
RS ét al. (1994) Cancer Res. 54, 6306-6310
Jacoby et al. (1984) Adv. Immunol. 35, 157-208
Johnosn RL and Tabin CJ (1997) Celí 90, 979-990
Kahn D et al. (1994) J. Urol. 152, 1490-1495
Kapoun AM and Shackleford GM (1997) Oncogene 14, 2985-9 Kettunen P and Thesleff I (1998) Dev. Dyn. 211, 256-268 Koga M et al. (1995) J. Steroid Biiochem. Mol. Biol. 54, 1-6 Kouhara H et al. (1994) Oncogene 9, 455-462
Kozák M (1991) J. Celí Biol. 115, 887-903
Lapthorn et al. (1994) Náture 369, 455-461
Lazar et al. (1995) Cancer Res. 55, 3735-3738
Leek J et al. (1995) British j. Cancer 72, 583-588
Leung HY et al. (1996) Oncogene 12, 1833-1835
Lopes AD (1990) Cancer Res. 50, 6423-6429
Loric S et al. (1995) Clin. Chem. 41 (12) 1698-1704
167
Lupu R et al. (1995) Semin. Cancer. Biol. 6, 135-145
MacArthur CA et al. (1995a) Celí Growth Differ. 6, 817-825
MacArthur CA et al. (1995b) Development 121, 3603-3613
MacArthur CA et al. (1995c) J Virol 69, 2501-7
Manabe et al. (1985) Gastroenterology 89, 1319-1325
Marsh SK et al. (1999) Oncogene 18, 1053-1060
Martin L et al. (1993) J. Immunol. 150 (49) 1234-43
Mattei MG et al. (1995) Mamm Genome 6, 196-197
McDonnell WM and Askari FD (1996) New Engl. J. Med. 334, 4245
Meyers EN et al. (1998) Nat. Genet 18, 136-141
Milich DR et al. (1994) J. Immunol. 153 (1) 429-435
Milner PG et al. (1989) Biochem Biophys. Res. Comm. 165, 1096-1103
Miyashita Y et al. (1994) Jpn. J. Cancer Res. 85, 1117-1123 (1993a) Br. J. Cancer 67 (2) 254-261 (1993b) Celí. Biophys. 22 (1-3) 129-146 (1996) Br. J. Cancer 73 (2) 228-235
Moy FJ et al. (1996) Biochemistry 35, 13552-13561 Muller WJ et al. (1988) Celí 54 (1) 105-115 (1996) Prostate 28, 266-271 (1995) Prostate 26, 164-168 (1995) Anticancer Research 15 (4) 1473-79 :1990) Clin. Chem. 35, 1450-1455
Nonomura N et al. (1990) Cancer Res. 50, 2316-21 O'Sullivan D et al. (1991) J. Immunology 147, 2663-9 Ohnishi Y et al. (1995) Br. J. Cancer 71 (5) 969-73 Ohuchi H et al. (1997a) Development 124, 2235-44 Ohuchi H et al. (1997b) Mech. Dev. 62, 3-13
Ohuchi H et al. (1994) Biochem Biophys Res. Commun. 204, 8828
Payson RA et al. (1996) Oncogene 13, 47-53
Pillai et al. (1996) FEBS Lett. 387, 23-26
Modjtahedi H et al. Modjtahedi H et al. Modjtahedi H et al.
Murphy GP et al. Murphy GP et al. Murphy GP et al. Nguyen L et al.
168
Pollard M and Luckert PH (1994) Anticancer Res. 14, 901-903 Prigent SA and Lemoine NR (1992) Progress in Growth Factor
Research 4, 1-24
R&D focus, Drug News (1966) 5, 21, 9 1
Rammensee H-G et al. (1995) Immunogenetics 41, 178-228 Regelson W (1995) Cancer 76, 1299-1301
Rieš LAG et al. (1996) SEER Cancer Statistics Review, 1973 1993: Tables and Graphs, National Cancer Inštitúte,
Bethesda, MD
Rinker-Schaeffer CW et al. (1995) Genomics 30 (1) 105-108
Rochon YP et al. (1994) Prostate 25, 219-223
Rock KL et al. (1996). Vaccine 14, 1560-1568
Rock KL and Clark K (1996) J. Immunol. 156, 3721-3726
Rudra-Ganguly N et al. (1998) Oncogene 16, 1487-92
Salomon DS et al. (1995) Critical reviews in
Oncology/Hematology 19, 183-232
Sato B et al. (1993) J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 47, 91-98 Schlegel J et al. (1994) J. Neurooncol. 22 (3) 249-254
Schmitt JF et al. (1996) J. Steroid Biochem. Mol. Bio. 57,
173-178
Sheaff et al. (1996) J. Clin. Pathol. 49, 329-332
Sherman L et al. (1998) Genes Dev. 12, 1058-71
Shimamura K and Rubenstein JL (1997) Development 124, 27092718
Shirai A and Klinman DM (1993) AIDS Res. Hum. Retroviruses 9, 979-983
Sokoloff M et al. (1996) Cancer 77 (9) 1862-1872
Steinhoff U et al. (1994) Eur. J. Immunol. 24 (3) 773-776
Stevens VC (1986) Ciba Found. Symp. 119, 200-225 Su SL et al. (1995) Cancer Res. 55, 1441-1443
Syrigos et al. (1998) 1 Gut 42, 88-91
Talwar et al. (1976) PNAS 73, 218-222
Talwar et al. (1994) PNAS 91, 8532-8536
169
Tanaka A et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 89288932
Tanaka A et al. (1998) Cancer Research 58, 2053-2056
Tanaka A et al. (1995) FEBS Lett. 363, 226-230
Thomas H et al. (1996) Br. J. Cancer 73 (1) 65-72
Tjoa B et al. (1996) Prostate 28, 65-69
Tjoa B et al. (1995) Prostate 27, 63-69
Tokunaga A et al. (1995) Cancer 75 (6 suppl.) 1418-1425 Tosi E et al. (1995) Int. J. Cancer 62 (5) 643-650 Triozzi et al. (1994) Int. J. One. 5, 1447-1453 Troyer JK et al. (1995) Int. J. Cancer 62, 552-558 Valone FH et al. (1995) J. Clin. Oncol. 13 (9) 2281-2292 Valve E et al. (1997) Biochem Biophys Res. Commun. 232, 173177 van Dam PA et al. (1994) J. Clin. Pathol. 47 (10) 914-919 Weiner LM et al. (1995) Cancer Res. 55 (20) 4586-4593 Wright GL Jr et al. (1996) Urology 48, 326-334
Wu J et al. (1997) J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 62, 1-10
Wu X, Fan Z, Masui H, Rosen N, Mandelsohn J. : Apoptosis induced by an anti-epidermal growth factor receptor monoclonal antibody in a human colorectal carcinoma celí line and its delay by insulin
Wynant GE et al. (1991) Prostate 18, 229-241
Xu X et al. (1998) Development 125, 753-765
Yamanishi H et al. (1995) J'. Steroid Biochem. Mol. Biol. 52, 49-53
Yoshimura K et al. Yoshimura K et al.
Yogeeswaran and Salk (1981) Science 212, 1514-1516 Yokoyama H et al. (1998) Dev. Biol. 196, 1-10 (1996) Cancer Lett 103, 91-97 (1997) Am. J. Med. Genet. 72, 354-362
Yung RA and Davis RW (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 1194-1198
Zhang JD et al. (1991) [published erratum appears in Proc.
170
Natl. Acad. Sci USA 88 (12): 5477], Proc. Natl. Acad
Sci. USA 88, 3446-3450
Zhu Z et al. (1995) Int. J. Cancer 62 (3) 319-324
Zhu X et al. (1991) Science 251, 90-93
171
ZOZNAM SEKVENCII <110> M&E Biotech A/S STEINAA, Lucilla NIELSEN, Klaus Gregorius DALUM, Iben HAANING, Jesper LEÁCH, Dana .BIRK, Peter MOURITSEN, Soren GAUTAM, Anand KARLSSON, Gunilla <120> NOVÉ SPÔSOBY TERAPEUTICKEJ VAKCINÁCIE <130> 22113 PC 1 <140>
<141>
<160> 33 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 2253 <212> DNA <213> Horno sapiens <220>
<221> CDS . .
<222> (1)..(2253) <220>, <221> misc_feature <222> (58)..(2253) <223 > Ľudská PSM' <220> ' .
<221> misc^feature <222> (4). . .(6) , ,, <223> Ggt alebo tgg kódujúci Gly, resp. Trp <400> 1 atg ggt aat ctc ctt cac gaa acc gac tcg get gtg gcc acc gcg ege
172
Met Gly 1 - Asn Leu Leu His 5 Glu Thr Asp Ser 10 Ala.Val Ala Thr Ala 15 Arg
cgc ccg cgc tgg ctg tgc get ggg gcg ctg gtg ctg gcg ggt ggc ttc 96
Arg Pro Arg Trp Leu Cys Ala Gly Ala Leu Val. Leu Ala Gly Gly Phe
20 25 30
ttt ctc ctc ggc ttc ctc ttc ggg tgg ttt ata aaa tcc tcc aat gaa 144
Phe Leu Leu Gly Phe Leu Phe Gly Trp Phe íle Lys Ser Ser Asn Glu
35 40 45
get act aac att act cca aag cat aat atg aaa gca ttt ttg gat gaa 192
Ala Thr Asn íle Thr Pro Lys His Asn Met Lys Ala Phe Leu Asp Glu
50 55 60
ttg aaa get gag aac atc aag aag ttc tta tat aat ttt aca cag· ata 240
Leu Lys Ala Glu Asn íle Lys Lys Phe Leu Tyr Asn Phe Thr Gin íle
65 70 75 80
cca cat tta gca gga aca gaa caa aac ttt cag ctt gca aag caa att 288
Pro His Leu Ala Gly Thr Glu Gin Asn Phe Gin Leu Ala Lys Gl'n íle
85 90 95
.caa tcc cag tgg aaa gaa ttt ggc ctg gat tct gtt gag cta gca cat 336
Glň Ser Gin Trp Lys Glu Phe Gly Leu Asp Ser Val Glu Leu Alá His
100 105 110
tat gat gtc ctg ttg tcc tac cca aat aag act cat ccc aac' tac atc 384
Tyr Asp Val Leu Leu Ser Tyr Pro Asn Lys Thr His Pro Asn Tyr íle
115 120 125
tca ata att aat gaa gat gga aat gag att ttc aac aca tca tta ttt 432
Ser íle íle Asn Glu Asp Gly Asn Glu íle Phe Asn Thr Ser Leu Phe
130 135 140
gaa cca cct cct cca gga tat gaa aat gtt tcg gat att gta cca cct 480
Glu Pro. Pro Pro Pro Gly Tyr Glu Asn Val Ser Asp íle Val Pro Pro '
.145 150 155 160
ttc agt get ttc tct cct caa gga atg cca gag ggc gat cta gtg tat 528
Phe Ser Alá Phe Ser Pro Gin Gly Met Pro Glu Gly Asp Leu val Tyr
165 170 175
gtt aac tat gca ega act gaa gac ttc ttt aaa ttg gaa cgg gac atg 57 6
Val Asn Tyr- Ala Arg Thr . Glu Asp Phe Phe Lys Leu Glu •Arg Asp Met
173
180 185 190
aaa atc aat tgc Cys tct Ser ggg aaa att íle 200 gta Val att íle gcc . Ala aga tat ggg aaa Lys gtt Val 624
Lys íle Asn 195 Gly Lys Arg Tyr 205 Gly
ttc aga gga aat aag gtt aaa aat gcc cag ctg gca ggg gcc aaa gga 672
Phe Arg. Gly Asn Lys Val Lys Asn Ala Gin Leu Ala Gly Ala Lys Gly
210 215 220
gtc att ctc tac tcc gac cct get gac tac ttt get cct ggg gtg aag 720
Val íle Leu Tyr Ser Asp Pro Ala Asp Tyr Phe Ala Pro Gly Val Lys
225 230 235 240
tcc tat cca gat ggt tgg aat ctt cct gga ggt ggt gtc cag cgt gga 768
Ser Tyr Pro Asp Gly Trp Asn Leu Pro Gly Gly Gly Val Gin Arg Gly
245 250 255
aat atc cta aat ctg aat ggt gca gga gac cct ctc aca cca ggt tac 816
Asn íle Leu Asn Leu Asn Gly Ala Gly Asp Pro Leu Thr Pro Gly Tyr .
260 265 270
cca gca aat gaa tat get tat agg cgt gga att gca gag get gtt ggt 864
Pro Ala Asn Glu Tyr Ala Tyr Arg Arg Gly íle Ala Glu Ala Val Gly
275 280 285
ctt cca agt att cct gtt cat cca att gga tac tat gat gca cag aag 912
Leu Pro Ser íle Pro Val His Pro íle Gly Tyr Tyr Asp Ala Gin Lys
290 295 300
ctc cta gaa aaa atg ggt ggc tca gca cca cca. gat . agc agc tgg aga 960
Leu Leu Glu Lys Met Gly Gly Ser Ala Pro. Pro Asp Ser Ser Trp Arg
305 310 315 320
gga agt ctc aaa gtg ccc tac aat gtt gga cct ggc ttt act gga aac 1008
Gly Ser Leu Lys Val Pro Tyr Asn Val Gly ' Pro Gly Phe Thr Gly Asn
325 330 335
ttt tct aca caa aaa gtc aag atg cac atc cac tct acc aat gaa gtg 1056
Phe Ser Thr Gin Lys Val Lys Met His íle His Ser Thr Asn Glu Val
340 345 350
aca aga att tac aat gtg ata ggt act ctc aga gga gca .gtg gaa cca 1104
Thr Arg íle Tyr Asn Val íle Gly Thr Leu Arg Gly Ala Val Glu Pro
355 360 365
gac aga tat gtc att ctg gga ggt cac cgg gac tca tgg gtg ttt ggt 1152
Asp Arg Tyr Val íle Leu Gly Gly His Arg Ásp ' Ser Trp Val Phe Gly
370 375 380
174
ggt Gly 385 att íle gac cct cag Gin agt Ser 390 gga Gly gca get Ala Ala gtt Val g t ť. Val 395 cat His gaa Glu att íle gtg Val agg Arg 40Ô . 1200
Asp Pro
age ttt gga aca ctg aaa aag gaa ggg tgg aga' cct aga aga aca att 1248
Ser Phe Gly Thr Leu Lys Lys Glu Gly Trp Arg Pro Arg Arg Thr íle
405 410 415
ttg ttt gca age tgg. gat gca gaa gaa ttt ggt ctt. ctt ggt tet act 1296
Leu Phe Ala Ser Trp Asp Ala Glu Glu Phe Gly Leu Leu Gly Ser Thr
420 425 430
gag tgg gca gag gag aat tca aga ctc ctt caa gag cgt ggc gtg get 1344
Glu Trp Ala Glu Glu Asn Ser Arg Leu Leu Gin Glu Arg Gly Val Ala
435 440 445
tat att aat get gac tca tet ata gaa gga aac tac act ctg' aga gtt 1392
Tyr íle Asn Ala Asp Ser Ser íle .Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val
450 455 460
gat tgt aca. ccg ctg atg tac age ttg gta cac aac cta aca aaa gag 1440
Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser Leu Val His Asn Leu Thr Lys Glu
465 470 475 480
ctg aaa age cct gat gaa ggc ttt gaa ggc aaa tet ctt tat . gaa agt 1488
Leu Lys Ser Pro Asp Glu Gly Phe Glu Gly Lys Ser Leu Tyr Glu. Ser
485 490 495
tgg act aaa aaa agt cct tcc cca gag ttc agt ggc atg ccc agg ata 1536
Trp Thr Lys Lys Ser Pro Ser Pro Glu Phe Ser Gly Met Pro Arg íle
500 505 510
age aaa ttg gga tet gga aat gat ttt gag gtg ttc ttc caa ega ctt 1584
Ser Lys Leu Gly Ser Gly Asn Asp Phe Glu Val Phe Phe Gin Arg Leu .
' 515 520 525
gga att get tca. ggc. aga gca cgg tat act aaa aat tgg gaa aca aac 1632
Gly íle Ala Ser Gly Arg Ala Arg Tyr Thr Lys Asn Trp Glu Thr Asn
530 535 540
aaa ttc age ggc tat cca ctg tat cac. agt. gtc- tat .gaa aca tá t gag 1680
Lys Phe Ser Gly Tyr Pro Leu Tyr His Ser Val Tyr' Glu •.Thr Tyr Glu .
545: 550 555 ' 560
ttg gtg gaa aag ttt tat gat cca atg ttt aaa tat cac ctc act gtg 1728
Leu Val Glu Lys Phe Tyr Asp Pro . Met Phe Lys Tyr His Leu Thr Val
565 570 575
175
gcc Ala. cág gtt ega Arg 580 gga Gly ggg Gly atg gtg ttt Phe 585 gag Glu cta gcc aat tcc Ser 590 ata íle gtg Val 1776
Gin Val Met Val Leu Ala Asn
ctc cct ttt gat tgt ega gat tat get gta gtt tta aga aag . tat get 1824
Leu Pro Phe Asp Cys. Arg Asp Tyr Ala Val Val Leu Arg. Lys Tyr. Ala
595 600 605
gac aaa atc tac agť att tet atg aaa cat cca cag gaa atg aag aca 1872
Asp Lys íle Tyr Ser íle Ser Met Lys His Pro Gin Glu Met Lys Thr
610 615 620
tac agt gta tca ttt gat tca ctt ttt tet gca gta aag aat ttt aca 1920
Tyr'. Ser Val Ser Phe Asp Ser. Leu Phe, Ser Ala Val Lys Asn Phe' Thr
625 630 635 640
gaa att get tcc aag ttc agt gag aga ctc cag gac ttt gac aaa age 1968
Glu íle Ala Ser Lys Phe Ser Glu Arg Leu Gin Asp Phe Asp Lys Ser
645 650 655
aac cca ata gta tta aga atg atg aat gat caa ctc atg ttt ctg gaa 2016
Asn Pro íle Val Leu Arg Met Met Asn Asp Gin Leu Met Phe Leu Glu
660 665 670
aga gca ttt att gat cca tta ggg tta cca gac agg cct ttt tat agg 2064
Arg Ala Phe íle Asp Pro Leu Gly Leu Pro Asp Arg· Pro Phe Tyr Arg
675 680 685
cat gtc atc tat get cca age age cac aac aag tat gca . ggg gag tca 2112
His Val íle Tyr Ala Pro Ser Ser His Asn Lys Tyr Ala Gly Glu Ser
690 695 700
ttc cca gga att tat gat get ctg ttt gat att gaa. age aaa gtg gac 2160
Phe Pro Gly íle Tyr Asp Ala Leu Phe Asp íle Glu Ser Lys Val Asp
705 710 715 720
cct tcc aag gcc tgg . gga gaa gtg aag aga 'cag att tat gtt gca gcc 2208
Pro Ser Lys Ala Trp Gly Glu Val Lys Arg. Gin íle' Tyr Val Ala Ala
725 730 73.5
ttc aca gtg' cag gca get gca •gag .act ttg agt gaa gta gcc. taa 225 3
Phe Thr Val Gin Ala Ala Ala Glu Thr Leu Ser Glu Val Ala
740 745 750
176 <210> 2 <211> 750 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2
Met Gly Asn Leu Leu His Glu Thr Asp Ser Ala Val Ala Thr Ala Arg
1 5 10 15
Arg Pro Arg Trp Leu Cys Ala Gly Ala Leu Val Leu Ala Gly Gly Phe
20 25 30
Phe Léu Leu Gly Phe Leu Phe Gly Trp Phe íle Lys Ser Ser Asn Glu
35 40 45
Ala Thr Asn íle Thr Pro Lys His Asn Met Lys Ala Phe . Leu Asp Glu
50 55 60
Leu Lys Ala Glu Asn íle Lys Lys Phe Leu Tyr Asn Phe Thr Gin íle
65 70 75 80
Pro His Leu Ala Gly Thr Glu Gin Asn Phe Gin Leu Ala Lys Gin íle
85 90 95
Gin Ser Gin Trp Lys Glu Phe Gly Leu Asp Ser Val Glu Leu Ala His
100 105 110
Tyr Asp Val Leu Lev Ser Tyr Pro Asn Lys Thr His Pro Asn Tyr íle
115 120 125
Ser . íle íle Asn Glu Asp Gly Asn Glu íle Phe Asn Thr Sér Leu Phe
130 135 140
Glu Pro Pro Pro Pro Gly Tyr Glu Asn Val Ser Asp íle Val Pro Pro
145 150 155 160
Phe Ser Ala Phe Ser Pro Gin Gly Met Pro Glu Gly Asp Leu Val Tyr
165 170 175
Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp Phe Phe Lys Leu Glu Arg· Asp Met
180 185 190
Lys íle Asn Cys Ser Gly Lys íle Val íle Ala- Arg Tyr Gly Lys Val
195 200 205
Phe Arg Gly Asn Lys Val Lys Asn Ala Gin Leu Ala Gly Ala Lys Gly
210 215 2.20
Val íle Leu Tyr: Ser Asp Pro Ala Ašp. Tyr Phe Ala Pro Gly Val Lys
177
225
230
235 240
Ser Tyr Pro Asp Gly 245 Trp Asn Leu Pro Gly 250 Gly Gly Val Gin Arg 255 Gly
Asn íle Leu Asn 260 Leu Asn Gly Ala Gly 265 Asp Pro Leu Thr Pro 270 Gly Tyr
Pro Ala Asn 275 Glu Tyr Ala Tyr Arg 280 Arg Gly íle Ala Glu 285. Ala Val Gly
Leu Pro 290 Ser íle Pro Val His 295 Pro íle Gly Tyr Tyr 300 Asp Ala Gin Lys
Leu 305 Leu Glu Lys Met Gly 310 Gly Ser Ala Pro Pro 315 Asp Ser Ser Trp Arg 320.
Gly Ser Leu Lys Val 325 Pro Tyr Asn Val Gly 330 Pro Gly Phe Thr Gly 335 Asn
Phe Ser Thr Gin 340 Lys Val Lys Met His 345 íle His Ser Thr Asn 350 Glu Val
Thr Arg He 355' Tyr Asn Val íle Gly 360 Thr Leu Arg Gly Ala 365 Val Glu Pro
Asp. Arg . 370 Tyr Val íle Leu Gly 375 Gly His Arg Asp Ser .380 Trp Val Phe Gly
Gly 385 íle Asp Pro Gin Ser 390 Gly Ala Ala Val Val 395 His Glu íle Val Arg 400
Ser Phe' Gly Thr Leu 405 Lys Lys Glu Gly. Trp 410 Arg Pro Arg Arg Thr 415 íle
Leu Phé Ala Ser. 420 Trp Asp; Ala Glu Glu 425 Phe Gly Leu Leu Gly 430 Ser Thr
Glu. Trp Ala 435. Glu Glu Asn Sér Arg 4 40 Leu Leu Gin Glu Arg 445 Gly Val Ala
Tyr íle .450 Asn Ala Asp Ser Ser 455 íle Glu Gly Asn Tyr 460 . Thr Leu Arg Val
Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser Leu Val His. Asn Leu Thr Lys Glu
465
470 475 480
178
Leu Lys Ser Pro Asp 485 Glu Gly Phe Glu Gly 490 Lys Ser Leu Tyr Glu 495 Ser
Trp Thr Lys Lys Ser Pro Ser Pro Glu Phe Ser Gly Met Pro Arg íle
500 505 510
Ser Lys Leu. Gly Ser Gly Asn Asp Phe Glu Val Phe Phe Gin Arg Leu
515 520 525
Gly íle Ala Ser Gly Arg Ala Arg Tyr Thr Lys Asn Trp Glu Thr Asn
530 535 540
Lys Phe Ser Gly Tyr ,Pro Leu Tyr His Ser Val Tyr Glu Thr Tyr Glu
545 550 555 560
Leu Val- Glu Lys Phe Tyr Asp Pro Met Phe Lys Tyr His Leu Thr Val
565 570 575
Ala Gin Val Arg Gly Gly Met Val Phe Glu Leu Ala Asn Ser íle Val
580 585 590
Leu Pro Phe Asp Cys Arg Asp Tyr Ala Val Val Leu Arg Lys Tyr Ala
595 600 605
Asp Lys íle Tyr Ser íle Ser Met Lys His Pro Gin Glu Met Lys Thr
610 615 620.
Tyr Ser Val Ser Phe Asp Ser Leu Phe Ser Ala Val· Lys Asn Phe. Thr
625 630 635 640
Glu íle Ala Ser Lys Phe Ser Glu Arg Leu Gin Asp Phe Asp Lys Ser
645 650 655
Asn Pro íle Val Leu Arg Met Met Asn Asp Gin Leu Met Phe Leu Glu
660 665 670
Arg Ala Phe íle Asp Pro Leu·: Gly. Leu Pro Asp Arg Pro Phe TyX Arg
675 680 685
His Val íle Tyr Ala Pro Ser Ser His Asn Lys Tyr Ala Gly ' Gl.u' Ser
.690 695 700.
Phe Pro. Gly íle Tyr Asp Ala Leu Phe Asp íle Glu Ser .Lys Val Asp
705 710 715 720
Pro. Ser- Lys Ala Trp. . Gly Glu vár Lys Arg Gin íle Tyr Val Ala Ala
;725. 730 735
Phé .Thr Val Gin Ala .Ala .Ala Glu Thr Leu Ser Gl.u Val. Ala
179
740 745 750
<210> 3
<211> 3768
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> CDS
<222>.(1)..ι 13768):
<400> 3
atg gag ctg gcg. gcc ttg tgc ege tgg ggg ctc ctc ctc· gcc ctc ttg 4.8
Met Glu Leu Ala Ala Leu Cys Arg Trp Gly Leu Leu Leu Ala Leu Leu
-20 -15 -10
ccc ccc gga gcc gcg age acc caa gtg tgc acc .ggc aca gac atg aag 96
Pro Pro Gly Ala Ala Ser Thr Gin Val Cys Thr Gly Thr Asp Met Lys
-5 -1 ľ 5
ctg cgg ctc cct gcc agt ccc gag acc cac ctg gac atg ctc ege cac .. 144
Leu Arg Leu Pro Ala Ser Pro Glu Thr His Leu Asp Met Leu Arg His
10 . 15 '20 25
ctc tac cag ggc tgc cag gtg gtg cag gga aac ctg gaa ctc acc tac 192
Leu Tyr Gin- Gly Cys Gin Val Val Gin Gly Asn. Leu Glu Leu Thr Tyr
30 35 40
ctg ccc acc aat gcc age ctg .tcc ttc ctg. cag gat atc cag gag gtg 240
Leu Pro Thr Asn Ala Ser Léu Ser Phe Leu Gin. Asp . íle Gin Glu' Val
45 . 50 . 55
cag ggc tac gtg ctc atc get cac áac caa gtg agg cag. gtc cca ctg 288
Gin Gly Tyr Val. Leu íle Ala His Ašn Gin Val Arg Gin Val Pro. Leu'
60 65 70
cag agg ctg cgg att gtg ega ggc acc cag ctc ttť gag. gac aac '.t á t 336
Gin Arg Léu. Arg íle. Val: Arg Gly. Thr Gin Leu Phé: Glu Asp Asn Tyr
75 .80 85.
gcc' čtg gcc gtg cta gac aat gga gac ccg ctg aac aat acc acc cct 384
Ala Leu 'Ala Val.·. Leu' Asp Asn Gly Asp Pro Leu Asn Asn Thr Thr Pro
90 . '95 100 . 105
180
gtc Val aca ggg gcc Thr Gly Ala tcc Ser .110 cca Pro gga ggc ctg cgg gag Glu ctg cag ctt' Leu ega Arg 120 agc Ser 432
Gly Gly Leu Arg 115 Leu Gin
ctc aca gag atc ttg aaa gga ggg gtc ttg. atc cag cgg aac ccc cag 480
Leu Thr Glu íle Leu Lys Gly Gly Val Leu íle Gin Arg. Asn Pro Gin
125 130 135
ctc tgc tac cag gac acg att ttg tgg aag gac atc ttc cac aag aac 528
Leu Cys Tyr Gin Asp Thr íle Leu Trp Lys Asp íle Phe His Lys Asn
140 145 150
aac cag ctg get ctc aca ctg ata gac acc aac ege tet cgg gcc tgc 576
Asn Gin Leu Ala Leu Thr Leu íle Asp Thr Asn Arg Ser Arg Ala Cys
155 160 165
cac ccc tgt tet ccg atg tgt aag ggc tcc. ege tgc tgg gga gag agt 624
His Pro Cys Ser Pro Met Cys. Lys. Gly Ser Arg Cys Trp Gly Glu Ser
170. 175 180 185
tet gag gat tgt cag agc ctg acg ege act gtc tgt gcc ggt ggc tgt 672
Ser . Glu Asp Cys, Gin Ser. Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Gly Gly Cys
190 195 200
gcc ege tgc aag ggg cca ctg ccc act gac .tgc .tgc cat gag cag tgt 720
Ala . Arg Cys Lys Gly Pro Leu Pro Thr. Asp Cys Cys His Glu Gin Cys
205 ·?’ 210 215
get gcc ,ggc tgc acg ggc ccc aag cac tet gac tgc ctg gcc tgc ctc 7 68'
Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu
.220 225 230
cac ttc aac cac agt ggc atc tgt gag ctg cac tgc cca gcc ctg gtc .816.
His Phe Asn His Ser Gly Tie Cys Glu Leu. His Cys Pro' Ala Leu Val
235 240 245
acc tac aac aca gac acg ttt gag tcc . atg' ccc aat cc.c gag ggc. cgg . 864
Thr Tyr Asn Thr Asp Thr Phe Glu Ser Meť Pro Asn Pro Glú Gly Arg·
250 255 260 265
tat' aca ttc ggc gcč agc tgt gtg act gcc tgt ccc tac aac tac ctt 912
Tyr Thr . Phe Gly' Ala Ser Cys Val Thr Ala Cys Pro Tyr Ásn Tyr Leu ·
270 275 280
tet acg gac gtg gga tcc tgc acc ctc gtc tgc ccc ctg Cac aac caa 960.
Ser T.hr Asp Val Gly Ser Cys Thr. Leu Vaľ Cys Pro Leu His Asn Gin-
285. 290 295
181
gag gtg aca gca Ala gag Glu gat Asp gga aca Gly Thr 305 cag cgg Gin Arg tgt gag aag Cys Glu Lys 310 tgc Cys age Ser aag Lys 1008
Glu Val Thr. 300.
ccc tgt gcc ega gtg tgc tat ggt- ctg' ggc atg gag cac ttg ega gag 1056
Pro Cys Ala- Arg Val Cys Tyr Gly Leu Gly Met Glu His Leu Arg Glu
315 320 325
gtg agg gca gtt acc agt gcc aat atc cag gag ttt get ggc. tgc aag 1104
Val Arg Ala Val Thr Ser Ala Asn íle Gin Glu Phe Ala Gly Cys Lys
330 335 340 345
aag atc ttt. ggg age ctg gca ttt ctg ccg gag age ttt gat ggg gac 1152
Lys .íle Phe Giy Ser Leu Ala. Phe Leu Pro Glu Ser Phe Asp Gly Asp
350 355 360
cca gcc tcc aac act gcc ccg ctc cag cca gag cag ctc caa gtg ttt 1200
Pro Ala Ser Asn Thr Ala Pro Leu Gin Pro Glu Gin Leu Gin Val Phe
365 370 375
gag act ctg gaa gag atc aca ggt tac cta tac atc tca gca tgg ccg 1248
Glu Thr Leu Glu Glu He Thr Gly Tyr Leu Tyr íle Ser Ala Trp Pro
380 385 390
gac age ctg cct. gac ctc age gtc. ttc cag aac ctg caa .gta atc cgg 1296
Asp Ser Leu Pro Asp Leu Ser val Phe Gin Asn Leu Gin Val íle Arg
395 '400 405
gga ega att ctg cac aat ggc gcc tac tcg ctg acc ctg caa ggg ctg 1344
Gly Arg íle Leu His Asn Gly Ala TyX Ser Leu Thr Leu .Gin Gly Leu
410 415 420 425
ggc atc age tgg cťg ggg ctg ege tca ctg agg gaa ctg ggc ágt gga 1392
Gly íle’ Ser Trp Leu Gly. Leu Arg Ser Leu Arg Glu Leu Gly Ser Gly
430 435 •4 40.
ctg gcc ctc atc cac cat aac acc cac ctc; tgc ttc· gtg cac .acg gtg 1440
Leu Ala; Leu íle. His' His Asn Thr His Leu Cýs. Phe Val His. Thr Val
• 'i 445 450 455
CCC tgg gac cag ctc ttt cgg aac ccg cac caa get ctg čtc cac act '.1488
Pro Trp Äšp Gin Leu Ph.e Arg Asn Pro His Gin 'Ala Leu Leu His Thr'
460 .4 65 470
gcc aac cgg cca .gag gac gag tgt gtg ggc gág. ggc ' čtg gcc tgc cac 1536
182
1584 atc íle 650 ·
Ala cag
Gin
490 gtc
Val ega
Arg ttg
Leu ttt
Phe cct
Pro
570 tcc
Ser' cct
Pro ggc
Glý gcg
Ala-
Asn 475 Arg Pro Glu Asp Glu Cys Val Gly 480 Glu Gly 485 Leu Ala Cys His
ctg tgc gcc ega ggg cac tgc tgg ggt cca ggg ccc áčc cag tgt
Leu Cys Ala Arg Gly . His Cys Trp . Gly Pro Gly Pro Thr Gin Cys
495 500 505
aac tgc agc cag ttc Ctt cgg ggc cag gag tgc gtg gag gaa tgc
Asn Cys Ser Gin Phe Leu Arg Gly Gin Glu Cys Val Glu Glu Cys
510 515 520
gta ctg cag ggg ctc ccc agg gag tat gtg aat gcc agg cac tgt
Val Leu Gin Gly Leu Pro Arg Glu Tyr Val Asn Ala Arg His Cys.
525 530 v*.- 535
ccg tgc cac. cct gag tgt cag ccc cag aat ggc tca gtg acc tgt
Pro Cys His Pro Glu Cys Gin Pro Gin Asn Gly Ser Val Thr Cys
540 545 550
gga Gly ccg . gag get gac cag tgt gtg gcc tgt gcc cac tat aag gac
Pro 'r'Glu Ala Asp Gin Cys Val Ala Cys Ala. His Tyr Lys Asp
555 560 565
ccc ttc tgc- gtg gcc ege tgc ccc agc ggt gtg aaa cct gac ctc.
Pro Phe Cys Val Ala Arg Cys Pro Ser Gly Val Lys Pro Asp Leu
.575 580 585
tac Tyr atg ccc atc tgg aag ttt cca gat gag gag ggc gca tgc cag
Met Pro íle Trp Lys Phe Pro Asp Glu Glu. Gly Ala Cys Gin
590 595 600
tgc ccc atc aac tgc acc cac tcc tgt gtg gac ctg gat gac aag
Cys .Pro íle A^h;, •Cys Thr His Ser. Cys Val Asp Leu Asp Asp Lýs
605 610 615.
tgc ccc gcc gag- cag aga gcc . agc cct ctg acg tcc atc gtc tet :
Cys Pro Ala Glu Gin Arg Ala Ser. Pro Leu Thr · Ser íle Vaľ· Ser
620 625 .63.0
gtg gtt ' ggc- att ctg. ctg gtc gtg.. gtc ttg ggg' gtg gtc: ttt; ggg
Val .Val Gly íle Leu Leu ' Val: Val. Val Leu· Glý. Val · Val Phé: Gly
.635 640 645 .
ctc atc aag' ega. cgg cag cag aag . atc cgg aag tac acg atg cgg
Leu íle. Lys ' Arg Arg.i Gin ; Gin-Lys íle , Arg Lýs Tyr.. Thr Met Arg'
655 . · 660 ·. 665
163.2
1680
1728
1776
1824
1872
1920
1968
2064
2016 aga ctg ctg cag gaa acg gag ctg .gtg gag . Arg. Leu Leu Gin Glu Thr Glu Leu -.Vaľ Glu ccg ctg· aca cct acc ega Pro Leu Thr Pro Ser Gly .
. 2112
183
670 675 680
gcg atg ccc aac cag gcg cag atg cgg atc ctg aaa gag Glu. acg Thr 695 ' gag Glu ctg Leu 2160
Ala Met Pro Asn 685 Gin Ala Gin Met Arg íle 690 ' Leu Lys
agg aag gtg aag. gtg ctt gga tet ggc get ttt ggc aca gtč tac aag 2208.
Arg ..Lýs Val Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys
700 705 710
ggc atc tgg atc cct gat ggg gag aat gtg aaa att cca gtg gcc atc 2256
Gly íle. Trp íle. Pro Asp Gly Glu Asn Val Lys íle Pro Val Ala íle.
715 720 725
aaa gtg ttg agg gaa aac aca tcc ccc aaa gcc aac aaa gaa. atc tta 2304
Lys Val Leu Arg. Glu Asn Thr Ser' Pro Lys Ala Asn Lys Glu íle Leu
730 735 740 745
gac gaa gca tac gtg atg get ggt gtg ggc tcc cca tat gtc tcc ege • 2352
Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Gly Val Gly Ser Pro Tyr Val Ser Arg
750 755 760
ctt. ctg ggc atc tgc ctg aca tcc acg gtg cag ctg gtg aca cág ctt 2400
Leu Leu Gly íle. Cys Leu Thr Ser Thr Val Gin Leu Val Thr Gin Leu
765 770 775
atg ccc tat ggc tgc ctc tta gac cat gtc cgg gaa aac ege gga. ege 2448
Met Pro Tyr Gly Cys Leu Leu Äsp His Val Arg Glu Asn Arg Gly. Arg
780 785 790
ctg ggc tcc cag gac ctg ctg aac tgg tgt. atg cag att gcc aag ggg. 2496
Leu Gly Ser Gin Asp Leu Leu Asn Trp Cys Met Gin. íle Ala Lys Gi.y
'795 800 805
atg age tác . ctg gag gat gtg cgg ctc gta cac agg gac ttg gcc get 2544
Met Ser Tyr Leu Glu Asp Val Arg· Leu Val His Arg Asp Leu’ Ala Ala
81Ó 815 820 825
cgg aac gtg ctg gtc aag agt ccc aac cat gtc aaa att aca gac ttc 2592
Arg Asn Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val Lys íle Thr Asp' Phe
830 835 840
ggg. ctg get cgg ctg ctg gac att gac gag aca gag tac cat gca gat . 2640
Gly- Leu Ala Arg Leu Leu Asp íle Asp Glu Thr Glu Tyr His. Ala Asp
8 45 850 855
184
ggg ggc aag gtg ccc Pro atc íle aag Lys tgg atg gcg ctg gag tcc att ctc cgc Arg 2688
Gly Gly Lys Val 860 Trp 865 Met Ala Leu Glu Ser 870. íle Leu
cgg cgg ttc acc cac cag agt gat gtg tgg agt tat ggt· gtg act gtg 2736
Arg Arg 875 Phe Thr His Gin Ser 880 Asp Val Trp Ser Tyr 885 Gly Val Thr Val
tgg gag ctg atg act ttt ggg gcc aaa cct tac gat ggg atc cca gcc 2784
.Trp 890 Glu Leu Met Thr Phe 895 Gly Ala Lys Pro Tyr 900 Asp Gly íle Pro Ala 905
cgg gag atc cct gac ctg ctg gaa aag ggg gag cgg ctg ccc cag ccc 2832
Arg Glu íle Pro Asp 910 Leu Leu Glu Lys Gly 915 Glu Arg Leu Pro Gin 920 Pro
ccc atc tgc acc att gat gtc tac atg atc atg gtc aaa tgt tgg atg 2880
Pró íle Cys Thr ' 925 íle Asp Val Tyr Met 930 íle Met Val Lys Cys 935 Trp Met
att gac tet gaa tgt cgg cca aga ttc cgg gag ttg gtg tet gaa ttc 2928
íle Asp Ser Glu 940 Cys Arg Pro Arg 945 Phe Arg Glu Leu Val 950 Ser Glu Phe
tcc cgc atg gcc agg gac ccc cag cgc ttt gtg gtc atc cag aat gag 2976
Ser Arg 955 Met Ala Arg Asp Pro 960 Gin Arg Phe Val Val 965 íle Gin Asn Glu
gac ttg ggc cca gcc agt ccc ttg gac age acc ttc tac cgc tca ctg ' 3024
Asp 970 Leu Gly. Pro Ala Ser 975 Pro Leu Asp Ser Thr 980 Phe Tyr Arg Ser Leu 985 ..·
ctg gag gac gat gac atg ggg gac. ctg gtg gat get gag gag tat. ctg 3072
Leu Glu Asp Asp Asp 990 Met Gly Asp Leu Val 995 Asp Ala Glu Glu Tyr 1000 Leu
gta ccc cag cag. ggc ttc. ttc tgt cca gac cct gcc. ccg ggc. get ggg 3120
Val Pro Gin Gin 1005 Gly Phe Phe Cys Pro . 1010 Asp Pro Ala Pro Gly 1015 Ala Gly
ggc atg gtc cac cac agg cac cgc age tca- tet acc agg' agt ggc ggt. 3168
Gly Met Val His. 1020 His Arg His Arg . . 1025 Ser Ser Sér Thr Arg 1030 •Ser Gly Gly ·
ggg gac ctg aca cta ggg ctg gag ccc tet gaá- gag i gag gcc ccc agg 3216
Gly Asp L035 Leu Thr Leu Gly Leu 1040 Glu Pro Ser Glu Glu L045 Glu Ala . Pro Arg
185
·. tet cca Ser Pro 1050 ctg Leu gca Ala ccc tcc Pro Ser 1055 gaa Glu ggg Gly get Ala ggc tcc Gly Ser 1060 gat Asp gta Val ttť Phe gat ggt Asp Gly ' 1065 3264.
gac ctg gga atg ggg gca gcc aag .999 ctg caa age ctc ccc aca cat 3312
Asp Leu Gly Meť Gly Ala Ala Lys Gly Leu Gin Ser Leu Pro Thr His
1070' 1075 1080
gac ccc age cct cta cag cgg tac agt gag gac CCC aca gta ccc ctg 3360
Asp Pro Ser Pro Leu Gin Arg Tyr Ser Glu Asp Pro Thr Val Pro Leu
1085 1090 1095
ccc tet. gag act gat ggc tac gtt gcc ccc ctg acc tgc age ccc cag 3408
.Pro Ser Glu Thr. Asp Gly Tyr Val. Ala Pro Leu Thr Cys Ser Pro Gin
1100 ' 1105 1110
•cct gaa' tat gtg aac cag cca gat gtt cgg ccc cag ccc ccť tcg ccc 3456
Pro Glu Tyr Val Asn:Gin Pro Asp Val Arg Pro Gin Pro Pro Ser Pro
1115 1120 1125
ega gag ggc cct ctg cct get gcc ega cct get ggt. gcc act ctg gaa 3504
Arg Glu Gly Pro Leu Pro Ala Ala Arg Pro Ala Gly Ala Thr Leu Glu
1130 . 1135 1140 1145
agg.gcc aag act ctc tcc cca ggg aag aat ggg gtc gtc. aaa gac gtt 3552
Arg Ala Lys Thr Leu Ser Pro Gly Lys Asn Gly Val Val Lys Asp'Val
.1150 1155 : 160. .
ttt gcc ttt ggg ggt gcc gtg gag aac ccc gag tac ttg aca ccc cag 3600
Phe Ala Phe Gly Gly Ala Val Glu Asn Pro Glu Tyr Leu- Thr Pro Gin .
1165 1170 1175
gga gga get gcc cct cag ccc cac cct ccť· cct gcc ttc agč cca gcc 3648
. Gly Gly Ala Ala Pro Gin Pro His Pro. Pro Pro Ala Phe Ser Pro: Ala
1180 1185 1190
ttc gac aac ctc tat tac . tgg gac cag gac.· cca cca gag cgg ggg get 3696
Phe Ásp Asn Leu Tyr Tyr Trp Asp Gin Asp Pro • Pró Glu Arg ’Gly Ala
1195 1200 ' 1205
cca ccc age •acc ttc .aaa ggg aca cct acg gca . gag aac cca gag tac' 37 4 4
P-ro Pro Ser Thr· Phe Lys' Gly Thr Pro •Thr Ala Glu Asn. Pro Glu Tyr
.1210 1215 1220 ' 1225
ctg ggt ctg gac gtg cca gtg tga 3768
Leu Gly Leu Asp Val Pro Val
1230
186 <210> 4 <211> 1255 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4
Met Glu Leu Ala Ala • 1 5
Pro'Pro Gly Ala Ala 20
Leu Arg Leu Pro Ala 35
Leu Tyr Gin Gly Cys 50
Leu Pro Thr Asn Ala 65
Gin Gly Tyr Val Leu 85
Gin Arg Leu Arg íle 100
Ala Leu Ala Val Leu 115
Val Thr Gly Ala Ser 130
Leu Thr Glu íle Leu 145
Leu Cys Tyr Gin Asp 165
Asn Gin Leu Ala Leu 180- .
His Pro Cys Ser Pro .195
Leu Cys Arg Trp Gly Leu Leu Leu Ala Leu Leu 10 15
Ser Thr Gin Val Cys Thr Gly Thr Asp Met Lys 25 30
Ser Pro Glu Thr His Leu Asp Met Leu Arg His 40' 45
Gin Val Val Gin Gly Asn Leu Glu Leu Thr Tyr 55 60
Ser Leu Ser Phe Leu Gin Asp íle Gin Glu Val 70 ' 75 80 íle Ala His Asn Gin Val Arg Gin Val Pro. Leu
95
Val Arg Gly Thr Gin Leu Phe Glu Asp Asn Tyr . 105 110
Asp Asn Gly Asp Pro Leu Asri Asn Thr Thr Pro 120 . 125
Pro Gly Gly Leu Arg Glu Leu Gin Leu Arg Ser 135 . 140 .
Lys Gly Gly Val Leu íle Gln; Arg Asn Pro Gin 150 155. 160
Thr íle Leu Trp Lys Asp íle Phe His Lys Asn 170 175
Thr. Leu íle Asp Thr Asn Arg Ser Arg Ala-Cys 185 190 . Met Cys Lys Gly Ser Arg Cys Trp Gly Glu Ser
200 . 205
187
Ser Glu Asp Cys Gin Ser Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Gly Gly Cys
210 215 220
Ala Arg Cys Lys Gly Pro Leu Pro Thr Asp Cys Cys His Glu Gin Cys'
225 230 235 240
Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu
245 250 255
His Phe Asn His Ser Gly íle Cys Glu Leu His Cys Pro Ala Leu Val
260 265 270
Thr Tyr Asn Thr Asp· Thr Phe Glu Ser Met Pro Asn Pro Glu Gly Arg
275 280 285
Tyr Thr' .Phe Gly Ala Ser Cys Val Thr Ala Cys Pro Tyr Asn Tyr Leu
290 295 300
Ser Thr Asp Val Gly Ser Cys Thr Leu Val Cys Pro' Leu His Asn Gin
305 .310 315 320·
Glu Val Thr Ala Glu Asp Gly Thr Gin Arg Cys Glu Lys Cys Ser Lys
325 330 335
Pro Cys Ala Arg Val Cys Tyr Gly Leu Gly Met Glu His Leu Arg Glu
340 345 350
Val Arg Ala Val Thr Ser Ala Asn íle Gin Glu Phe Ala Gly Cys Lys
355 360 365
Lys íle Phe Gly Ser Leu Ala Phe Leu Pro Glu Ser Phe Asp. Gly Asp
370 375 380
Pro Ala Ser Asn Thr Ala Pro Leu Gin Pro Glu Gin Leu Gin Val Phe
385 390 395 400
Glu Th'r Leu Glu Glu íle Thr Gly Tyr Leu Tyr dle Ser Ala Trp Pro
405 410 415
Asp Ser Leu Pro Asp Leu Ser Val Phe Gin Asn Leu Gin Val Iíe Arg
420 425 430
Gly Arg íle Leu His Asn Gly Ala Tyr Ser Leu Thr Leu Gin Gly Leu
435 4 4 0. .4 45
Gly íle Ser Trp Leu Gly Leu. Arg Ser Leu Arg Glu Leu Gly Ser Gly
450 455 460
Leu Ala Leu íle His His Asn Thr His Leu Cys Phe Val His Thr Val
465 470 475 480
188
Pro Trp Asp Gin Leu Phe Arg Asn Pro His Gin Ala Leu Leu His Thr
485 490 495
Ala Asn Arg Pro Glu Asp Glu Cys Val Gly Glu Gly Leu Ala Cys His
500 505 510
Gl.n Leu Cys Ala Arg Gly His Cys Trp Gly Pro Gly Pro Thr Gin Cys
515 520 525
Val Asn Cys Ser Gin Phe Leu Arg Gly Gin Glu Cys Val Glu Glu Cys
530 535 540
Arg Val Leu Gin Gly Leu Pro Arg Glu . Tyr Val Asn Ala Arg His Cys
545 550 555 560
Leu Pro Cys His Pro Glu Cys Gin Pro Gin Asn Gly Ser Val Thr Cys
565 570 575
Phe Gly Pro Glu Ala Asp Gin Cys Val Ala Cys Ala His Tyr Lys Asp
580 585 590
Pro Pro Phe Cys Val Ala Arg Cys Pro Ser Gly Val Lys pro Asp Leu
595 600 605
Ser Tyr Met. Pro íle Trp Lys Phe· Pro Asp Glu Glu Gly Ala Cys Gin
610 615 620
Pro Cys Pro íle Asn Cys Thr His Ser Cys Val Asp Leu Asp Asp Lys
625 630 635 640
Gly Cys Pro. Ala Glu Gin Arg Ala Ser Pro Leu Thr' Ser íle Val Ser
645· 650 655
Ala Val Val Gly íle Leu Leu Val Val Val Leu Gly Val Val Phe Gly
660 665 670
íle Leu íle Lys Arg Arg Gin Gin Lys íle Arg Lys Tyr Thr Met Arg
675 680 685.
Arg Leu Leu Gin Glu Thr Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr P.ro Ser Gly
690 695 700
Ala Met Pro Asn Gin Ala Gin Met' Arg íle Leu Lys Glu Thr Glu Leu
705 710 .715 720
189
Arg Lys Val Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala 730 Phe Gly Thr Vaľ Tyr 735 Lys
725
Gly íle Trp íle Pro Asp Gly Glu Asn Val Lys íle Pro Val Ala íle
740 745 750
Lys Val. Leu Arg Glu Asn Thr Ser Pro Lys Ala Asn Lys Glu íle Leu
755 760 765
Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Gly Val Gly Ser Pro Tyr Val Ser Arg
770 775 780
Leu Leu Gly íle Cys Leu Thr Ser Thr Val Gin Leu Val Thr Gin Leu
785 790 795 800
Met Pro Tyr Gly Cys Leu Leu Asp. His Val Arg Glu Asn Arg Gly Arg
805 810 815
Leu Gly Ser Gin Asp Leu Leu Asn Trp Cys Met Gin íle Ala Lys Gly
820 825 830
Met Ser Tyr Leu Glu Asp Val Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala
835 840 845
Arg Asn Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val Lys íle Thr Asp Phe
850 855 860
Gly Leu Ala Arg Leu Leu Asp íle Asp Glu Thr Glu Tyr. His Ala Ásp
865 870 875 880
Gly Gly Lys Val Pro íle. Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser íle Leu Arg
885 890. 895
Arg Arg Phe .Thr His Gin Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val
900 905 910
Trp Glu Leu Met Thr- Phe Gly Ala Lys Pro Tyr Asp Gly He Pro Ala
915 920 925
Arg Glu íle Pro Asp Leu Leu Glu Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gin Pro
930 935 940
Pro íle Cys Thr íle Asp Val Tyr Met íle Met Val Lys Cys Trp Met
945 950 955 960
íle Asp Ser Glu Cys Arg Pro Arg Phe Arg Glu Leu Val Sér Glu Phe
965 970 975
Ser Arg Met- Ala Arg Asp Pro Gin Arg Phe Val Val íle. Gin Asn Glu
980 985 . ' 990
190
Asp Leu Gly Pro Ala Ser Pro Leu Asp . 1000 Ser Thr Phe Tyr 1005 Arg Ser Leu
995
Leu Glu Asp Asp Asp Met Gly Asp Leu Val Asp Ala Glu Glu Tyr Leu
1010 1015 1020
Val Pro Gin Gin Gly Phe Phe Cys Pro Asp Pro Ala Pro Gly Ala Gly
025 1030 1035 1040
Gly Met Val His His Arg His Arg Ser . Ser Ser Thr Arg Ser Gly. Gly
1045 1050 1055
Gly Asp Leu Thr. Leu Gly Leu Glu Pro Ser Glu Glu Glu Ala Pro Arg
1060 1065 1070
Ser Pro Leu Ala Pro Ser Glu Gly Ala Gly Ser Asp Val Phe Asp Gly
1075 1080 1085.
Asp Leu Gly Met Gly Ala Ala Lys Gly Leu Gin Ser Leu Pro Thr His
1090 ' 1095 1100
Asp Pro Ser Pro Leu Gin Arg Tyr Ser Glu Asp ’Pro Thr Val Pro Leu
105 1110 1115 1120
Pro Ser Glu Thr Asp Gly Tyr Val Ala Pro Leu Thr Cys Ser Pro Gin
1125 1130 1135
Pro.Glu Tyr '.Val Asn Gin Pro Asp Val Arg Pro Gin Pro Pro Ser Pro
114 0 1145 1150
Arg Glu Gly Pro Leu Pro Ala Ala Arg Pro . Ala Gly Ala Thr Leu' Glu
1155 1160 1165
Arg Ala Lys Thr Leu Ser Pro Gly Lys Asn •Gly Val Val Lys. Asp Val
1170 1175 1180
Phe Ala Phe Gly Gly Ala Val Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Thr Pro Gin
185 1190 • 1195 1200
Gly Gly Ala Alä Pro Gin Pro'·His Pro Pro Pro Ala Phe Ser Pro. Ala
1205 1210. 1215
Phe Asp Asn Leu Tyr Tyr Trp Asp Gin Asp Pro Pro Glu Arg Gly Äla
1220 1225 1230.
191
Pro Pro Ser Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr 1235 1240 1245
Leu Gly Leu Asp Val Pro Val 1250 1255 <210> 5 <211> 648 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS <222> (1)..(648) <400> 5
atg ggc agc ccc cgc Arg 5 tcc gcg ctg Leu agc Ser tgc Cys 10 ctg ctg ttg cac ttg ctg Leu 48
Met 1 Gly Ser Pro Ser Ala Leu Leu Leu His Leu 15
gtt ctc tgc ctc caa gcc cag gta act gtt cag tcc tca cct aat ttt 96
Val Leu Cys Leu Gin Ala Gin Val Thr Val .Gin Ser Ser Pro Asn Phe
20 25 30
aca cag cat gtg. agg gag cag agc ctg gtg acg gat cag ctc agc cgc 144
Thr Gin His Val Arg Glu Gin Ser Leu Val Thr Asp Gin Leu Ser Arg
35 40 45
cgc ctc atc cgg acc tac cag ctc tac agc cgc acc agc ggg aag cac 192
Arg Leu íle Arg Thr Tyr Gin Leu Tyr Ser Arg Thr Ser Gly Lys His
50 55 . 60
'gtg cag . gtc ctg gcc aac aag cgc atc aac gcc. atg gca gaa gac gga 240
Val Gin Val Leu Ala Asn Lys Arg íle Asn AÍa Met Ala 'Glu Asp Gly
65 70 75 80
gac ccc ttc gcg aag ctc att gtg gag .acc gat act ttt gga agc aga 288
Asp Pro Phe Ala Lys Leu íle Val Glu Thr Asp Thr Phe Gly Ser Arg
v 85 90 95
gtc ega gtt cgc ggc gca gag aca ggt ctc tac atc tgc atg aac aag 336
Val Arg Val Arg Gly Ala Glu Thr Gly Leu Tyr íle Cys Met Asn Lys
100 105 110
aag ggg aag cta att gcc aág agc aac ggc aaa ggc aag gac tgc gta 384
Lys Gly Lys Leu íle Ala Lys Ser . Asn Gly Lys Gly Lys Asp Čys Val
115 120 125
192
ttc Phe aca Thr 130 gag Glu atc íle gtg Val ctg Leu gag Glu 135 aac Asn aac Asn tac Tyr acg Thr gcg Ala 140- ctg. Leu cag Gin aac Asn gcc Ala 432
aag tac gag ggc tgg tac atg gcc ttt acc cgc aag ggc cgg ccc cgc 480
Lys Tyr Glu Gly Trp Tyr Met Ala Phe Thr Arg Lys Gly Arg Pro Arg
145 150 155 160
aag ggc tcc aag acg cgc cag cat cag cgc gag gtg cac ttc atg aag 528
Lys Gly Ser Lys Thr Arg Gin His Gin Arg Glu Val His Phe Met Lys
165 170 175
cgc ctg ccg cgg ggc cac cac acc acc gag cag agc ctg cgc ttc gag 576
Arg Leu Pro Arg Gly His His Thr Thr Glu Gin Ser Leu Arg Phe Glu
180 185 190
ttc ctc aac tac ccg ccc ttc acg cgc agc ctg cgc ggc agc cag agg . 624
Phe Leu Asn Tyr Pro Pro Phe Thr Arg Ser Leu Arg Gly Ser Gin Arg
195 200 205
act tgg gcc ccg gag ccc ega tag 648
Thr Trp Ala Pro Glu Pro Arg
210. 215 <210> 6 <211> 215’ <212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 6.
Met Gly Ser Pro Arg Ser Ala Leu Ser Cys Leu· Leu Leu His Leu Leu
' 1 5' 10 15
Val Leu Cys Leu Gin Ala Gin Val Thr Val Gin. Ser Ser Pro Asn Phe
20 25 30.
Thr Gin His Val Arg Glu Gin Ser Leu Val Thr Asp Gin Leu Ser Arg
35 40 45
Arg Leu íle Arg Thr Tyr Gin Leu Tyr Ser Arg Thr Ser Gly Lys His
50 55 . 60
Val Gin Val Leu Ala Asn Lys Arg Tie Asn Ala Met Ala Glu Asp Gly
193
65 70 . . 75 .80
Asp Pro Phe Ala Lys Leu íle Val Glu Thr Asp Thr Phe Gly Ser Arg
85 90 95
Val Arg Val Arg Gly Ala Glu Thr Gly Leu Tyr íle Cys Met Asn Lys
100 105 110
Lys Gly Lys Leu íle Ala Lys Ser Asn Gly Lys Gly Lys Asp Cys Val
115 120 125
Phe Thr Glu íle Val Leu Glu Asn Asn Tyr Thr Ala Leu Gin Asn Ala
130 135 140
Lys Tyr Glu Gly Trp Tyr Met Ala Phe Thr Arg Lys Gly Arg Pro Arg
145 150 '155 160
Lys Gly Ser Lys Thr Arg Gin His Gin Arg Glu Val His Phe Met Lys
165 170 175
Arg. Leu Pro Arg Gly His His Thr Thr Glu Gin Ser Leu Arg Phe Glu
180 185 190
Phe Leu Asn Tyr Pro Pro Phe Thr Arg Ser Leu Arg Gly Ser Gin Arg
195 200 205
Thr Trp Ala Pro .Glu Pro Arg
210 215
<210> 7
<211> 2256
<212> DNA
<213> Mus musculus
<220>
<221> CDS
<222> (D · . (225.6)
<400> 7 ··.
atg tgg aac gca ctg cag gac aga gac tcc gcg gag gtc ctg gga cac
Met Trp Asn Ala Leu Gin Asp Arg Asp Ser Ala Glu Val Leu Gly His
1 5 10 15
cgc cag cgc tgg ctc cgt gtt· ggg aca ctg gtg ctg- get tta acc gga
194
Arg Gin Arg Trp 20 Leu Arg Val Gly Thr 25 Leu Val Leu Ala Leu 30 Thr Gly
acc ttc ctc att ggc ttc ctc ttt ggg tgg ttt ata aaa cct tcc aat 144
Thr Phe Leu íle Gly Phe Leu Phe Gly Trp Phe íle Lys Pro Ser Asn
35 40 45
gaa get ačt ggt aat gtt tcc cat tet ggc· atg aag aag gag ttt ttg 192
Glu Ala Thr Gly Asn Val Ser His Ser Gly Met Lys Lys Glu Phe Leu
50 55 60
cat gaa ttg aag . get gag aac atc aaa aaa ttt tta tác aat ttc aca 240
His Glu Leu Lys Ala Glu Asn íle Lys Lys Phe Leu Tyr Asn Phe Thr
65 70 75 80
cgg aca' cca cac ttg gca gga aca caa aat aat ttt gag ctt gca aag 288
Arg Thr Pro His Leu Ala Gly Thr Gin Asn Asn Phe Glu Leu Ala Lys
85 90 95
caa att cat gac cag tgg aaa gaa ttt ggc ctg gat ttg gtt gag tta 336
Gin íle His Asp Gin Trp Lys Glu Phe Gly Leu Asp. Leu Val Glu Leu
100 105 110
teč cat tac gat gtc ttg ctg tcc tat cca aat aaa act cat cct aac 384
Ser His Tyr Asp Val Leu Leu Ser Tyr Pro Asn Lys Thr His Pro Asn
115 120 125
tat atc tca ata att aat gaa gat gga aat gag att ttc aaa. aca tca 432
Tyr íle Ser íle íle Asn Glu Asp Gly Asn Glu íle Phe Lys Thr Ser
130 135 140·
tta tet gaa cag cca ccc cca gga tat·' gag aat ata tca gat gta gtg 480
Leu Ser Glu Gin Pro Pro Pro Gly Tyr Glu Asn íle Ser Asp Val Val
145 150 1 155 160
cca cca tac agt gcc ttc tet cca caa ggg aca cca gag ggt gat cta 528
Pro Pro Tyr Ser Ala Phe Ser Pro Gin Gly Thr. Pro Glu Gly Asp Leu
165 170 175
gtg tat gtc aac tat gca ega act gaa gac ttc ttt aaa ctg gaa cgg 576
Val. Tyr Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp Phe Phe Lys Leu Glu Arg .
180 185 190
gaa atg aag atc agt tgt tet ggg aag att gtg att gcc aga tat ggg 624
Glu Met Lys' íle Ser Cys Ser Gly Lys íle Val íle Ala Arg Tyr Gly
195 200 205
aaa gtg ttc aga gga aat atg gtt aaa aat get caa ctg gca ggg gca 672
Lys Val Phe Arg Gly Asn Met· Val Lys Asn Ala Gin Leu Ala Gly Ala
195
210 215 220
aaa gga atg att ctg tac tca gac cct get gac tac ttt gtt cct gcg 720
Lys Gly Met íle Leu Tyr Ser Asp Pro Ala Asp Tyr Phe Val Pro Alä
225 230 235 240
gtg aag tcc tat cca gat ggc tgg aac ctc cct' gga ggt ggt gtc caa 768
Val Lys Ser Tyr Pro Asp Gly Trp Asn Leu Pro Gly Gly Gly Val Gin
245 250 255
cgt gga aat gtc tta aat ctt aat ggt gca ggt gac ccg ctc aca cca 816
Arg Glý Asn Val Leu Asn Leu Asn Gly Ala Gly Asp Pro Leu Thr Pro
260 265 270
ggt tac cca gca aat gaa cat get tat agg cat; gag ttg aca aac get 864
Gly Tyr Pro Ala Asn Glu His Ala Tyr Arg His Glu Leu Thr Asn Ala
275 280 285
gtt ggc ctt . cca agt att cct gtc cat cct att gga tat gat gat gca 912
Val Gly Leu Pro Ser íle Pro Val His Pro íle Gly Tyr Asp Asp Ala
290 295 300
cag aaa ctc tta gaa cac atg ggt ggt cca gca ccc cct gac agt agc 960
Gin Lys Leu Leu Glu His Met Gly Gly Pro Ala Pro Pro Asp Ser Ser
305 310 315 320
tgg. aag gga gga tťá aaa gtg cct tac aac gtg gga cct ggc ttt get 1008
Trp Lys Gly Gly Leu Lys Val Pro Tyr Asn Val Gly Pro Gly Phe Ala
325 330 335
gga aac ttt tca aca caa aag gtc aag atg cat att cac· tet tac act 1056
Gly Asn Phe Ser Thr Gin Lys Val Lys Met His íle. His . Ser Tyr Thr
340 345 350
aaa gtg aca aga atc tat aat gtc att ggc acc ctc aaa gga get ctg .· 1104
Lys Val Thr Arg íle Tyr Asn Val íle Gly Thr Leu Lys Gly Ala Leu
355 360 365
gaa cca gac aga tat gtt att ctt gga ggt cac ega. gac. get tgg gta 1152
Glu Pro Asp Arg Tyr Val íle Leu Gly Gly His. Arg Asp Ala Trp Val
370. 375 380
ttt ggt ggc att gac cct cag agť gga gca. get gtt gtt cat gaa att 1200
Phe Gly Gly íle Asp Pro Gin. Ser Gly Ala Ala Val Val His Glu íle
385 390 395 400
196
gtg cgg agc ttt Phe gga Gly 405 acc Thr ctg Leu aag aag aaa gga Gly cgg Arg agg Arg cct Pro aga Arg 415 agg Arg 1248
Val Arg Ser Lys Lys Lys 410
aca att ttg ttt' gca agc tgg gat gca gaa gaa ttt ggc ctt ctt ggt 1296
Thr íle Leu Phe Ala Ser Trp Asp Ala Glu Glu Phe Gly Leu Leu Gly
420 425 430
tet act gag tgg gca gag gaa cat tca aga ctc cta caa gag ega ggt 1344
Ser Thr Glu Trp Ala Glu Glu His Ser Arg Leu Leu Gin Glu Arg Gly
435 440 445
gtg get tat att aat get gat tet tcc ata gaa gga aat tac act cta. 1392
Val Ala Tyr íle Asn Ala Asp Ser Ser íle Glu' Gly Asn Tyr Thr Leu
450 455 460
aga gtt gat tgc aca cca ctg atg tac agc tta gtg tac aac cta aca 1440
Arg Val Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser Léu Val Tyr Asn Leu Thr
465 470 475 480
aaa gag ctg caa agc cca gat gaa ggt ttt gaa gga aaa tet ctt tat 1488
Lys Glu Leu Gin Ser Pro Asp Glu Gly Phe Glu Gly Lys Ser Leu Tyr
485 490 495
gac agc tgg aaa gaa aag agt cct tca cct gag ttc att gga atg ccc 1536
Asp Ser Trp Lys Glu Lys Ser Pro Ser Pro Glu Phe íle Gly Met Pro
500 505 510
aga att agc aag ctg ggg tet ggc aat gat ttt gaa gtg . ttc ttc caa '· 1584
Arg íle Ser Lys Leu Gly Ser Gly Asn Asp Phe Glu Val Phe Phe Gin
515 520 525
aga ctt. gga att get tca ggc aga gcc ega tat act aaa aat tgg aaa 1632
Arg Leu Čly íle Ala Ser Gly Arg Ala Arg Tyr Thr Lys Asn Trp Lys
530 535 540
act aac aaa gtc agc agc tat cct ctc tat cac agt gtc tat gaa aca.' .. . 1680
Thr Asn Lyš Val Ser Ser Tyr Pro Leu Tyr His Ser Val Tyr Glu Thr
5 45 550 '555 560
tat gag ctg gta gta aaa ttt tat gac cca aca ttt aaa tac cac ctc 1728
Tyr Glu Leu Val Val Lys Phe Tyr Asp Pro Thr Phe Lys' Tyr His Leu
565 570 575
act gtg gcc cag gtt ega gga gcg atg gta ttt .gaa ctt gcc aat tet.. 177 6
Thr Val Ala Gin Val Arg· Gly Ala Me.t Val Phe Glu Leu Ala Asn Ser
580 ' 585· . 590
197
ata íle gtg Val ctt ccc ttt Phe gac Asp tgc Cys caa Gin 600 agt Ser tat Tyr get gta get Ala 605 ctg Leu aag Lys aag Lys 1824
Leu 595 Pro Ala Val
tat get gac act atc tac aat att tca atg aaa cat cca caa gaa atg 1872
Tyr Ala Asp Thr íle Tyr Asn íle Ser Met Lys His Pro Gin Glu Met
610 61.5 620
aag get tac atg ata tca ttt gat tca ctg ttt tet gca gtc aat aat 1920
Lys Ala Tyr Met íle Ser Phe Asp Ser Leu Phe Ser Ala Val Asn Asn
625 630 635 640
ttt aca gat gtt gca tet aag ttc aat cag aga ctg caa gag tta gac 1968
Phe Thr Asp Val Ala Ser Lys Phe Asn Gin Arg Leu Gin Glu Leu Asp
645 650 655
aaa. age aac ccc ata tta ctg aga att atg aat gac cag ctg atg tat 2016
Lys Ser Asn Pro íle Leu Leu Arg íle Met Asn Asp Gin Leu Met Tyr
660 665 670
ctg gaa cgt gca ttc att gat cct tta ggc tta cca gga agg cct ttc 2064
Leu Glu Arg Ala Phe íle Asp Pro Leu Gly Leu Pro Gly Arg Pro Phe.
675 680 685
tac . agg cat acc atc tat get cca age age cac aac aag tat gča gga 2112
Tyr Arg His Thr íle Tyr Ala Pro Ser Ser His Asn Lys Tyr Ala Glý
690 695 700
gaa tca ttc cct ggg att tat gat gcc ctt ttt gät ata agt age aaa 2160
Glu Ser Phe Pro Gly íle Tyr Asp Ala Leu Phe Asp íle Ser Ser Lys'
705 710 715 720
gtc aat get tet aag gcc tgg aac gaa gtg aag aga cag att tet att 2208
Val Asn Ala Ser Lys Ala Trp Asn Glu Val Lys Arg Gin íle Ser íle
725 730 735
gca acc ttt aca gtg caa get gca gca gag act ctg agg gaa gta. get 2256
Ala Thr Phe Thr Val Gin Ala Ala Ala Glu Thr Leu Arg Glu Val Ala
740 745 750
<210> 8 <211> 752 <212> FRT <213> Mus musculus <400> 8
Met Trp Asn Ala Leu Gin Asp Arg Asp Ser Ala Glu Val Leu Gly His 1 5 . 10 15 '
198
Arg Gin Arg Trp Leu. Arg Val Gly Thr Leu Val Leu Ala Leu Thr Gly
20 25 30
Thr Phe Leu íle Gly Phe Leu Phe Gly Trp Phe íle Lys Pro Ser Asn
35 40 45
Glu Ala Thr Gly Asn Val Ser His Ser Gly Met Lys Lys Glu Phe Leu
50 55 60
His Glu Leu Lys Ala Glu Asn íle Lys Lys Phe Leu Tyr Asn Phe Thr
65 70 75 80
Arg Thr Pro His Leu Ala Gly Thr Gin Asn Asn Phe Glu Leu Ala Lys
85 90 95
Gin íle His Asp Gin Trp Lys Glu Phe Gly Leu Asp Leu Val Glu Leu
100 105 110
Ser His Tyr Asp Val Leu Leu Ser Tyr Pro Asn Lys Thr His Pro Asn
115 120 125
Tyr íle Ser íle íle Asn Glu Asp Gly Asn Glu íle Phe Lys Thr Ser
130 135 140
Leu Ser Glu Gin Pro Pro Pro Gly Tyr Glu Asn íle Ser Asp Val Val
145 150 155 160
Pro Pro Tyr Ser Ala Phe Ser Pro. Gin Gly Thr Pro Glu Gly Asp Leu
165 170 175
Val Tyr Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp Phe Phe Lys Leu Glu Arg
180 185 190.
Glu Met Lys íle Ser Cys Ser Gly. Lys íle Val He Äla Arg. Tyr Gly
195 200 205
Lys Val Phe Arg Gly Asn Met Val Lys Asn Ala Gin· Leu Ala Gly Ala
210 215 22 0
Lys Gly Met .íle Leu Tyr Ser Asp Pro Ala Asp Tyr. Phe Val Pro Ala
225 230 235 240
Val Lys Ser Tyr Pro Asp Gly Trp Asn Leu Pro Gly Gly Gly Val Gin
245 250 255
199
Arg Gly Asn Val 260 Leu Asn Leu Asn Gly , 2 65 Ala Gly Asp Pro Leu 270 Thr Pro
Gly Tyr Pro Ala Asn Glu His Ala Tyr Arg His. Glu Leu Thr Asn Ala
275. 280 285 1 -
Val Gly Leu Pro Ser íle Pro Val His Pro íle Gly Tyr Asp Asp Ala
290 295 300
Gin Lys Leu Leu Glu His Met Gly Gly Pro Ala Pro Pro Asp Ser Ser
305 310 315 320
Trp Lys Gly Gly Leu Lys Val Pro Tyr Asn Val Gly Pro Gly Phe Ala
325 330 335
Gly Asn Phe Ser Thr. Gin Lys Val Lys Met His íle His Ser Tyr Thr
340 345 350
Lys Val Thr Arg íle Tyr Asn Val íle Gly Thr Leu Lys Gly Ala Leu
355 360 365
Glu Pro Asp Arg Tyr Val íle Leu Gly Gly His Arg Asp Ala Trp Val
370 375 380
Phe Gly Gly íle Asp Pro Gin Ser Gly Ala Ala Val Val His Glu íle
385 390 395 400
Val Arg Ser Phe Gly Thr Leu Lys Lys Lys Gly Arg Arg Pro Arg Arg
405 410 415
Thr íle Leu Phe Ala Ser Trp Asp Ala Glu Glu Phe Gly Leu Leu Gly
420 425 43Ó
Ser Thr Glu Trp Ala Glu Glu His Ser Arg Leu Leu Gin Glu Arg Gly
435 440 4 45
Val Ala Tyr íle' Asn Ala Asp Ser Ser .Iie Glu Gly Asn Tyr Thr Leu
450 455 460
Arg Val Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser Leu Val Tyr Asn Leu- .Thr
465 470 475 480
Lys Glu Leu Gin Ser Pro Asp Glu Gly Phe Glu Gly Lys Ser Leu Tyr
485 490 495
Asp Ser Trp Lys Glu Lys Ser Pro Ser Pro Glu Phe íle Gly Met Pro
500 505 510
Arg íle Ser Lys Leu Gly Ser Gly Asn Asp Phe Glu Val Phe Phe Gin
515 520 525
200
Arg Leu Gly íle Ala .530
Thr Asn Lys Val Ser 549
Tyr Glu Leu Val Val 565
Thr Val Ala Gin Val 580 íle Val Leu Pro Phe 595
Tyr Ala Asp Thr íle 610
Lys Ala Tyr Met íle 625
Phe Thr· Asp Val Ala 645
Lys Ser Asn Pro íle 660
Leu Glu Arg Ala Phe 675
Tyr Arg His Thr íle 690
Glu Ser Phe Pro Gly 705 . . Val Asn Ala Ser Lys 725
Ala- Thr Phe Thr Val 740
Ser Gly Arg Ala Arg Tyr Thr Lys Asn Trp 535 540
Ser Tyr Pro Leu Tyr His Ser Val Tyr Glu 550 555
Lys Phe Tyr Asp Pro Thr Phe Lys Tyr His 570 ' 575
Arg Gly Ala Met Val Phe Glu Leu Ala. Asn 585 590
Asp Cys Gin Ser Tyr Ala Val Ala Leu Lys 600 605
Tyr Asn íle Ser Met Lys His Pro Gin Glu 615 620
Ser Phe Asp Ser Leu Phe Ser Ala Val Asn 630 635
Ser Lys Phe Asn Gin Arg Leu Gin Glu Leu 650 655
Leu Leu Arg íle Met Asn Äsp Gin Leu Met 665 670 íle Asp Pro Leu Gly Leu Pro Gly Arg Pro .680 685
Tyr Ala Pro Ser Ser His Asn Lys Tyr Ala 695 700 íle Tyr Asp Ala Leu Phe Asp íle Ser Ser 710 715 '
Ala.Trp Asn Glu Val Lys Arg Gin íle Ser 730 7.35
Gin Ala Ala Ala Glu Thr Leu Arg Glu Val 745 -750.
Lys
Thr 5 60··
Leu
Ser
Lys
Met
Asn
640
Asp
Tyr .Phe
Gly
Lys
720 íle
Ala
201 <210> 9 <211Χ 2082 .
<212> DNA <213> Mus musculus ,<220>
<221> CDS <222> (1)..(2082) <400> 9
atg Met 1 aag Lys aag gag ttt ttg cat Leu His gaa Glu ttg Leu aag get gag aac atc aaa aaa Lys 48
Lys Glu Phe 5 Lys 10 Ala Glu Asn íle Lys 15
ttt tta tac aat ttc. aca cgg aca cca cac ttg gca gga aca caa aat 96
Phe Leu Tyr Asn Phe Thr Arg Thr Pro His Leu · Ala Gly Thr Gin Asn
20 25 . .30
aat ttt gag- ctt gca aag caa att cat gac cag tgg aaa gaa ttt ggc 144
Asn Phe Glu Leu Ala Lys Gin íle His Asp Gin Trp Lys Glu Phe Gly
35 40 45
ctg gat ttg gtt gag tta tcc cat tac gat gtc ttg ctg tcc tat. cca 192
Leu Asp Leu. Val Glu Leu Ser His Tyr Asp Val Leu Leu Ser Tyr Pro
50 55 60
aat aaa act cat ccť aac tat atc tca ata att aat gaa gat gga aat 240
Asn Lys Thr His Pro Asn Tyr íle . Ser íle íle Asn Glu Asp Gly Asn
65 70 75 80
gag att ttc aaa aca tca tta tet gaa cag cca ccc cca gga tat gag 288.
Glu íle' Phe Lys Thr Ser Leu· Ser Glu Gin Pro Pro Pro Gly Tyr Glu
85 90 9.5
aat ata tca gat gta gtg cca cca tac agt gcc ttc tet cca caa ggg 336
Asn íle Ser Asp Val Val Pro Pro Tyr Ser Ala Phe Ser Pro Gin Gly
100 105 110
aca cca gag ggt gat cta gtg tat gtc aac tat gca ega act gaa. gac 38.4
Thr Pro Glu Gly Asp Leu Val Tyr Val Asn Ty.r Ala Arg Thr Glu Asp
115 120 125 ' '.
ttc ttt aaa ctg gaa cgg gaa atg ' aag atc agt tgt tet . ggg aag . att 432
Phe Phe Lys Leu Glu Arg Glu Met Lys' íle Šer Cys Ser Gly. Lys íle
130 135 '140
gtg att gcc aga tat ggg aaa gtg ttc aga gga aat atg gtt aaa aat . 480
Val íle Ala Arg Tyr Gly Lys Val Phe Arg Gly Asn Met Val Lys Asn
145 150 155 160
202
get Ala caa Gin ctg gca ggg gca aaa Lys gga Gly atg Met att íle 170 ctg Leu tac Tyr tca Ser gac Asp cct Pro 175 get Ala i 528
Leu Ala Gly 165 Ala
gac tac ttt gtt cct gcg gtg aag tcc tat cca gat ggc tgg aac ctc 576
Asp Tyr Phe Val Pro Ala Val Lys Ser Tyr Pro Asp Gly Trp Asn Leu
180 185 190
cct gga ggt ggt gtc caa cgt gga aat gtc tta aat ctt aat ggt gca 624
Pro' Gly Gly Gly Val Gin Arg Gly Asn Val Leu Asn Leu Asn Gly. Ala
195 200 205
ggt gac' ccg ctc aca cca ggt tac Cca gca aat gaa cat get tat agg 672
Gly Asp Pro Leu Thr Pro Gly Tyr Pro Ala Asn Glu His Ala Tyr Arg .
210 215 220
cat gag ttg aca aac get gtt ggc ctt cca agt att cct gtc cat cct 720
His Glu Leu Thr Asn Ala Val Gly Leu Pro Ser íle Pro Val His Pro
225 230 235 240
att gga tat gat gat gca cag aaa ctc tta gaa' cac atg ggt ggt cca 768
íle Gly Tyr Asp Asp Ala Gin Lys Leu Leu Glu His Met Gly Gly Pro
245 250 255
gca ccc cct gac agt agc tgg aag gga gga tta aaa gtg cct . tac aac 816
Ala Pro Pro Asp Ser Ser Trp Lys Gly Gly Leu Lys Val Pro Tyr Asn
260 265 270
gtg gga cct ggc . ttt. get gga aac ttt tca aca caa aag gtc aag atg 864
Val Gly Pro. Gly Phe Ala Gly Asn Phe Ser. Thr Gin Lys Val Lys Met.
275 280 285
cat att cac tct tac act aaa gtg. aca aga atc tat aat gtc att ggc 912
His íle His Ser Tyr Thr Lys Val Thr Arg íle Tyr Asn Val íle Gly
290 295 300
acc ctc aaa gga get ctg gaa cca gac aga tat g t.ť att ctt gga ggt . 960
Thr Leu Lys Gly Ala Leu Glu Pro Asp- Arg Tyr Val íle Leu Gly Gly
305 31Ό 315 320
cac ega gac get tgg gta ttt ggt ggc att gac cct cag agt gga gca 1008
His Arg Asp Ala Trp Val Phe Gly Gly íle Asp Pro Gin Ser Gly Ala.
325 330 335
203
get Ala gtt.gtt cat His 340 gaa Glu att íle gtg cgg Val Arg age Ser 345 ttt Phe gga Gly acc Thr ctg aag aag aaa Lys 1056
Val Val Leu Lys 350 Lys
gga. cgg agg cct aga agg aca att ttg ttt. gca age tgg gat gca gaa 1104
Gly Arg Arg Pro Arg Arg Thr íle Leu Phe Ala Ser Trp Asp Ala Glu
355 360 365
gaa ttt ggc ctt ctt ggt tet act gag tgg gca gag gaa cat tca aga. 1152
Glu Phe Gly Leu Leu Gly Ser Thr Glu Trp Ala Glu Glu His Ser Arg
370 375 380
ctc cta caa gag ega ggt gtg get tat att aat get gat tet tcc ata 1200
Leu Leu Gin Glu Arg Gly Val Ala Tyr íle Asn Ala Asp Ser Ser íle
385 390 395 400
gaa gga aat tac act cta aga gtt gat tgc aca cca ctg atg tac age 1248
Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser
405 410 415
tta gtg tac aac cta aca aaa gag ctg caa age cca gat gaa ggt ttt 1296
Leu Val Tyr Asn Leu Thr Lys Glu Leu Gin Ser Pro Asp Glu Gly Phe
420 425 430
gaa gga aaa tet ctt tat gac age tgg aaa gaa aag agt cct tča. cct. . 1344
Glu Gly Lys Ser Leu Tyr Asp Ser Trp Lys Glu Lys Ser Pro Ser Pro ·
435 440 445
gag ttc att gga atg ccc aga att age aag ctg ggg tet ggc aat gat 1392
Glu Phe íle Gly Met Pro Arg íle Ser Lys Leu Gly Ser Gly Asn Asp
450 455 460
ttt gaa gtg ttc ttc caa aga ctt gga att get tca ggc aga gcc ega 1440
Phe Glu Val Phe Phé Gin Arg Leu Gly íle Ala Ser Gly Arg Ala Arg
465 470 475. 480'
tat act aaa aat tgg aaa act aac aaa gtc age age tat cct ctc tat 14 88
Tyr Thr Lys Asn Trp Lys Thr Asn Lys Val Ser Ser Tyr Pro Leu Tyr
4 85 490 495
cac agt gtc tat gaa aca tat gag ctg gta gta aaa ttt tat gac cca 1536
His . Ser Val Tyr Glu Thr Tyr . Glu Leu Val Val Lys Phe Tyr Asp Pro
500 505 510
aca ttt aaa tac cac ctc act gtg gcc cag gtt ega gga gcg atg gta 1584
Thr Phe Lys Tyr His Leu Thr Val Ala Gin Val Arg Gly Ala Met Val’
515 520 525
ttt gaa ctt gcc aat tet ata gtg ctt ccc ttt gac tgc caa agt tat 1632
204
Phe Glu Leu 530 Ala Asn Ser íle 535 Val Leu Pro Phe Asp 540 Cys Gin Ser Tyr
get gta get ctg aag aag tat get gac act atc tac aat · att. tca atg 1680
Ala Val Ala Leu Lys Lys Tyr Ala Asp Thr íle Tyr Asn íle· Ser Met
545 550 555 560
aaa cat cca caa gaa atg aag get tac atg ata tca ttt gat tca ctg 1728
Lys His Pro Gin Glu Met Lys Ala Tyr Met íle Ser Phe Asp Ser Leu
565 570 575
ttt tet gca gtc aat aat ttt aca gat gtt gca tet aag ttc aat Cag 1776
Phe Ser Ala Val Asn Asn Phe Thr Asp Val Ala Ser Lys Phe Asn' Gin
580 585 590
aga ctg caa gag tta gac aaa agc aac ccc ata tta ctg aga att atg 1824
Arg Leu Gin Glu Leu Asp Lys Ser Asn Pro íle Leu Leu Arg íle Met
595 600 605
aat gac cag ctg . atg tat ctg gaa cgt gca ttc att gat· cct tta ggc 1872
Asn Asp Gin Leu, Met Tyr Leu Glu Arg Ala Phe íle Asp Pro Leu Gly
610 615 620
tta cca gga agg cct ttc tac agg cat acc atc tat get cca agc agc 1920
Leu Pro Gly Arg Pro Phe Tyr Arg His Thr íle Tyr Ala Pro Ser Ser
625 630 635 640
cac aac aag tat gca gga gaa tca ttc cct ggg att tat gat gcc ctt 1968
His Asn Lys ' Tyr Ala Gly Glu Ser Phe Pro Gly íle Tyr Asp Ala Leu
645 650 655
ttt gat ata agt agc aaa gtc aat get tet aag gcc tgg aac gaa gtg 2016
Phe Asp íle Ser Ser Lys Vaľ Asn Ala Ser Lys Ala Trp Asn Glu Val
660 665 670
aag aga cag att tet att gca acc ttt aca gtg caa get gca' gča gag 2064
Lys Arg Gin íle Ser íle Ala Thr Phe Thr Val Gin. Ala Ala Ala Glu
675 680 685
act ctg agg gaa gta get 2082
Thr Leu Arg Glu Val Ala
690 <210> 10
205
<211> 694 <212> PRT <213> Mus musculus
<400> 10
Met Lys Lys Glu Phe Leu His Glu Leu Lys 'Ala Glu Asn íle Lys Lys
1 5 10 15
Phe Leu Tyr Asn Phe Thr Arg Thr Pro His Leu Ala Gly Thr Gin Asn
20 25 30
Asn Phe Glu Leu Ala Lys Gin íle His Asp Gin Trp Lys Glu Phe Gly
35 40 45
Leu Asp Leu Val Glu Leu Ser His Tyr Asp Val Leu Leu Ser Tyr Pro
50' 55 60
Asn Lys Thr His Pro Asn Tyr íle Ser íle íle Asn Glu Asp Gly Asn
65 70 75 80
Glu íle Phe Lys Thr Ser Leu Ser Glu Gin Pro Pro Pro Gly Tyr Glu
Λ 85 90 95
Asn íle Ser Asp Val Val Pro Pro Tyr Ser Ala Phe Ser Pro Gin Gly
- 100 105 110
Thr Pro Glu Gly Asp Leu Val Tyr Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp
115 120 125
Phe Phe Lys Leu Glu Arg Glu Met Lys íle Ser Cys Ser Gly Lys íle
130 135 140
Val íle Ala Arg Tyr Glý Lys Val Phe Arg Gly Asn Met Val Lys Asn
145 150 155 160
Ala Gin Leu Ala Gly Ala Lys Gly Met Tie’ Leu Tyr Ser Asp Pro Ala
165 170 175
Asp Tyr Phe Val Pro Ala Val Lys Ser Tyr Pro Asp Gly Trp Asn Leu
180 185 190
Pro Gly Gly Gly Val Gin Arg Gly Asn Val Leu Asn Leu Asn Gly Ala
195 200 205
Gly Asp Pro Leu Thr Pro Gly Tyr Pro Ala Asn Glu His Ala Tyr Arg
210 215 220
His Glu Leu Thr Asn Ala Val Gly Leu Pro Ser íle Pro Val His Pro
225 230' 235 240
206
íle Gly Tyr Asp Asp Ala Gin Lys Leu Leu'Glu His Met Gly Gly Pro
245 250 . 255
Ala Pro Pro Asp Ser Ser Trp Lys Gly Gly Leu Lys Val Pro Tyr Asn
260 265 270
Val Gly Pro Gly Phe Ala Gly Asn Phe Ser Thr Gin Lys Val Lys Met
275 280 285
His íle His' Ser Tyr Thr Lys Val Thr Arg Tie Tyr Asn Val íle Gly
290 295 300
Thr Leu Lys Gly Ala Leu Glu Pro Asp Arg Tyr Val íle Leu Gly Gly
305 310 315 320
His Arg Asp Ala Trp Val Phe Gly Gly íle Asp Pro Gin Ser Gly Ala
325 330 335
Ala Val Val His Glu íle Val Arg Ser Phe Gly Thr Leu Lys Lys Lys
340 345 350
Gly Arg Arg Pro Arg Arg Thr . íle Leu Phe Ala Ser Trp Asp Ala Glu
355' 360 365
Glu Phe Gly Leu Leu Gly Ser Thr Glu Trp Ala Glu Glu His Ser Arg
370 375 380
Leu Leu Gin Glu Arg Gly Val Ala Tyr íle. Asn Ala Asp Ser Ser íle
385 390 395 400
Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser
405 410 415
Leu Val Tyr Asn Leu Thr Lys Glu Leu Gin Ser Pro Asp Glu Gly Phe
420 425' 430
Glu Gly Lys Ser Leu Tyr Asp Ser Trp Lys Glu Lys Ser Pro Ser Pro
435 440 445
Glu Phe íle Gly Met Pro Arg íle Ser Lys: Leu Giy . Ser Gly Asn Asp
450 455 460
Phe Glu Val Phe Phe Gin Arg Leu Gly íle Ala Ser Gly Arg Ala Arg
465 470 475 4 80
207
Tyr Thr Lys Asn Trp 485 Lys Thr Asn Lys Val 490 Ser Ser Tyr Pro Leu . 495 Tyr
His Ser Val Tyr Glu Thr Tyr Glu Leu Val Val Lys Phe Tyr Asp· Pro
500 505 510
Thr Phe Lys Tyr His Leu Thr Val Ala Gin Val Arg Gly Ala Met Val
515 520 525
Phe Glu Leu Ala Asn Ser íle Val Leu Pro Phe Asp Cys Gin Ser Tyr
.530 535 540
Ala Val Ala Leu Lys Lys Tyr Ala Asp Thr íle Tyr Asn íle Ser Met
545 550 555 560
Lys His Pro Gin Glu Met Lys Ala Tyr Met íle Ser Phe Asp Ser Leu
565 570 575
Phe Ser Ala Val Asn Asn Phe Thr Asp Val Alá Ser Lys Phe Asn Gin
580 585 590
Arg Leu Gin Glu Leu Asp Lys Ser Asn Pro Tie Leu Leu Arg íle Met
595 600 605
Asn Asp Gin Leu Met Tyr Leu Glu Arg Ala Phe íle Asp Pro Leu Gly
610 615 620
Leu Pro Gly Arg Pro Phe Tyr Arg His Thr íle Tyr Ala Pro Ser Ser
625 630 635 640
His Asn Lys Tyr Ala Gly Glu Ser Phe Pro Gly íle Tyr Asp Ala Leu
645 650 655
Phe Asp íle Ser Ser Lys Val Asn Ala Ser. Lys Ala Trp Asn Glu Val
660 665 670
Lys Arg Gin íle Ser íle Ala Thr Phe Thr Val Gin Ala Ala Ala Glu
675 680 685
Thr Leu Arg Glu Val Ala . 690 <210> 11 <211>.45 <212> DNA <213> Clostridium tetani <220>
208
<221> CDS ·
<222> (l)..i (45)
<400> 11
cag tac atc aaa get aac tcc aaa ttc atc ggt atc acc gag ctg 45
Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly íle Thr Glu Leu
1 5 10 15
<210> <211> 12 15
<212> PRT
<213> Clostridium tetani
<400> 12
Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly íle Thr Glu Leu
1 5 .10 15
<210> 13
<211> 63
<212> DNA
<213> Clostridium tetani· <220>
<221> CDS
<222> (1)..(63)
<4Ó0> 13
ttc aac.aac ttc acc gta agc ttc tgg ctg. cgt gtt ccg aaa gtt agc
Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys. Val Ser
1 5 10 . 15
get agc cac ctg gaa 63
Ala Ser His Leu Glu_. _
20
<210> 14
<211> 21
<212> PRT
<213> Clostridium tetani
<400> 14
209
Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys Val Ser 1 5 10' 15
Ala Ser His Leu Glu 20 <210> 15 <211> 25 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu a PMS <400> 15
Gin Glu Arg Gly Val Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly 1 5. 10 15 íle Thr Glu Leu Arg Val Asp Cys Thr 20 25 <210> 16 <211>. 25 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu a PMS <400> 16 .
Ala Val Val Leu Arg Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly 1 5 .10 15 .
íle Thr.Glu Leu Glu Met Lys Thr Tyr 20 25 <210> 17
210
PMS <211> 25 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu <400> 17
Met Phe Leu Glu Arg Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly 1 5 10 ' '15 íle Thr Glu Leu His Val íle Tyr Ala 20 25 <210> 18 <211> 31 <212> PRT .
<213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu <400> 18
Asn Ser . Arg Leu Leu Phe Asn Asn Phe Thr Val . Ser. Phe Trp Leu Arg 15 10 .15
Val Pro Lys Val Ser Ala Ser His Leu Glu Val Asp Cys Thr Pro 20 25 30 <210> 19 <211> 31' <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu <400> 19
Val Val .Leu Arg Lys Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg 1 ... 5 10 15
PMS
PMS
Val Pro Lys Val
Ser Ala Ser His Leu Glu Ser.Phe Asp Ser Leu
211
25 30 <210> 20 <211> 31 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu a PMS <400> 20
Leu Met Phe Leu Glu Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg
5 10 15
Val. Pro Lys Val Ser Ala Ser His Leu Glu Pro Ser Ser His Asn
25 30 .
<210> 21 <211> 18 <212> DNA <213> Umelá sekvencia <220>.
<223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <220>
<221> CDS <222> (1) . . (18) <400> 21 cat čat cat cat cat cat 18
His His His His His His
1 5
<210> 22
<211> 6
<212> PRT <213> Umelá sekvencia
212 <223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <400> 22
His His His His His His 1 5 <210> 23 <211> 42 <212> DNA <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <220>
<221> CDS <222> (1)..(42) <400> 23 atg aaa cac caa cac caa cat caa cat caa cat caa cat caa 42
Met Lys His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin '5 10 <210> 24 <211> 14 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <400> 24 . .
Met Lys His. Gin His Gin' His Gin His Gin His Gin His Gin 1., 5' 10 <210> 25 <211> 69 <212> DNA <213> MuS' musculuš
213 <220>
<221> CDS <222> (1)..(69) <400> 25 atg gat gca atg aag aga ggg ctc tgc tgt gtg ctg ctg ctg tgt gga. 48
Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu. Leu Cys Gly
5 10 15 gca gtc ttc gtt tcg Ala Val Phe Val Ser ccc agc Pro Ser <210> 26 <211> 23 <212> PRT <213> Mus- musculus <400> 26
Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu Leu Cys Gly 1 5 10 15
Ala Val Phe Val Ser. Pro Ser . . 20
<210> 27 <211> 33
<212> DNA <213> Homo sapiens
<220> <221> CDS <222> (1).. .(33)
<400> 27
gaa caa aaa ctc atc Glu Gin Lys Leu íle
5 tca gaa gag gat ctg aat Ser.Glu Glu Asp Leu Asn <210> 28
214 <211> 11 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 28
Glu Gin Lys Leu íle Ser Glu Glu Asp Leu Asn 1 5 10 <210> 29 <211> 75 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS
<222> (1).. (75)
<400> 29
atg aag gat tcc tgc atc act gtg atg gcc atg gcg ctg ctg tet
Met Lys Asp Ser Cys íle Thr Val Met Ala Met Ala Leu Leu Ser
1 5 10 15
ttc ttt ttc ttc gcg ccg gcc tcg age
Phe Phe Phe Phe. Ala Pro Ala Ser Ser
20 25
<210> 30 <211> 25 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 30
Met Lys Asp Ser Cys íle Thr Val Met Ala· Met Ala Leu Leu Ser Gly 1 5 10 15
Phe Phe Phe Phe Ala Pro Ala Ser Ser
20
<210> 31
<211> 60
<212> DNA
<213> Mu s musculus
<220>
215
t- <221> CDS
<222> {1)..( [60)
<400> 31
atg aga agg atg ctt ctg cac ttg agt gtt ctg act ctc age tgt gtc
Met Arg Arg Met Leu Leu His Leu Ser Val Leu Thr Leu Ser Cys Val
1 5 10 15
tgg gcc act gcc 60.
Trp Ala Thr Ala <210> 32 <211> 20 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 32
Met Arg Arg Met Leu Leu His Leu Ser Val Leu Thr Leu Ser Cys Val 1 5 10 . 15
Trp Ala Thr Ala 20 <210> 33 <211> 20 <212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 33
Pro Ala Pro Gly Ser Thr Ala Pro Pro Ala His Gly Val Thr Ser Ala
1 5 10 15
Pro Asp Thr Arg

Claims (5)

  1. PATENTOVÉ
    NÁROKY
    1. Použitie
    1) aspoň jedného CTL epitopu odvodeného od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny a
  2. 2) aspoň jedného prvého T-pomocného lymfocytického (TH) epitopu, ktorý je pre živočícha cudzí, alebo
    1) aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho CTL epitop odvodený od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny a
    2) aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho T-pomocný lymfocytický (TH) epitop, ktorý je pre živočícha cudzí alebo nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie fragment nukleovej kyseliny kódujúci alebo exprimujúci
    1) aspoň jeden CTL epitop odvodený od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny a
    2) aspoň jeden prvý T-pomocný lymfocytický (TH) epitop, ktorý je pre živočícha cudzí, prvého TH cytotoxická na prípravu imunogénnej kompozície na negatívnu reguláciu buniek exprimujúcich s bunkou asociovaný polypeptídový antigén tým, že sa prostredníctvom vhodnej antigénprezentujúcej bunky (APC) v živočíchovi vyvolá simultánna prezentácia aspoň jedného CTL epitopu a aspoň jedného epitopu, a tým sa indukuje špecifická T-lymfocytová (CTL) odpoveď v živočíchovi
    216 proti bunkám nesúcim na svojom povrchu s bunkou asociovaný polypeptidový antigén alebo obsahujúcim s bunkou asociovaný antigén vo svojom intracelulárnom kompartmente.
    2. Použitie podľa nároku 1, kde živočích je človek.
    3. Použitie podľa nároku 1 alebo, kde uvedený aspoň jeden CTL epitop, ak je prezentovaný, je spojený s molekulou MHC typu I na povrchu APC a/alebo kde uvedený aspoň jeden prvý cudzí TH epitop, ak je prezentovaný, je spojený s molekulou MHC typu II na povrchu APC.
    4. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde APC je dendritická bunka alebo makrofág.
    5. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde polypeptidový antigén je vybraný z nádorového polypeptidového antigénu, vlastného proteínu, vírusového polypeptidového antigénu a polypeptidového antigénu, ktorý pochádza z vnútrobunkového parazita alebo baktérie.
    6. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde rezentácia CTL epitopu a prvého cudzieho TH epitopu prostredníctvom APC sa uskutočňuje tým, že sa imunitnému systému živočícha prezentuje aspoň jeden prvý analóg polypeptidového antigénu, pričom menovaný prvý analóg obsahuje obmenu aminokyselinovej sekvencie polypeptidového antigénu, pričom uvedená obmena obsahuje aspoň CTL epitop a prvý cudzí TH epitop.
    7. Použitie podľa nároku 6, kde aspoň prvý analóg obsahuje podstatnú časú známych a predpokladaných CTL epitopov s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.
    217
    8. Použitie podľa nároku 7, kde podstatná časť známych a predpokladaných CTL epitopov v aminokyselinovéj sekvencii aspoň jedného prvého analógu je rozpoznávaná aspoň 90 % haplotypov MHC-I, ktoré rozpoznávajú všetky známe a predpokladané CTL epitopy v s bunkou asociovanom polypeptídovom antigéne.
    9. Použitie podľa ktoréhokolvek z nárokov 6 až 8, kde v podstate všetky známe CTL epitopy s bunkou asociovaného polypeptídového antigénu sú prítomné v aspoň jednom prvom analógu a/alebo kde v podstate všetky predpokladané CTL epitopy s bunkou asociovaného polypeptídového antigénu sú prítomné v aspoň jednom prvom analógu.
    10. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 9, kde aspoň jeden prvý analóg ďalej modifikovanej štruktúry polypeptídového modifikácie je, vyvolá v tele pozostávajúcu z asoc iovaného zahŕňa čast s bunkou antigénu, pričom výsledkom tejto že imunizácia živočícha prvým analógom živočícha produkciu protilátok proti s bunkou asociovanému polypeptídovému antigénu.
    11. Použitie podľa ktoréhokolvek z predchádzajúcich nárokov, ktoré ďalej zahŕňa použitie aspoň jedného druhého analógu polypeptídového antigénu alebo fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho druhý analóg polypeptídového antigénu alebo aspoň jedného nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu nesúceho fragment nukleovej kyseliny kódujúci aspoň jeden druhý analóg polypeptídového antigénu na prípravu imunogénnej kompozície na zaistenie prezentácie imunogenicky účinného množstva aspoň jedného druhého analógu polypeptídového antigénu imunitnému systému
    218 živočícha, pričom tento druhý analóg obsahuje modifikáciu štruktúry polypeptidového antigénu a výsledkom tejto modifikácie je, že imunizácia živočícha druhým analógom vyvolá produkciu protilátok proti s bunkou asociovanému polypeptídovému antigénu.
    12. Použitie podľa nároku 11, kde sa pri modifikácii do druhého analógu včlení aspoň jeden druhý cudzí TH epitop.
    13. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 12, kde prvý a/alebo druhý analóg (analógy) obsahuje (obsahujú) podstatnú časť B-bunkového epitopu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.
    14. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 13, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa substitúciu a/alebo deléciu a/alebo inzerciu a/alebo adíciu aminokyseliny.
    15. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 14, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa začlenenie aspoň jednej prvej časti do prvého a/alebo druhého analógu (analógov), pričom uvedená prvá časť efektívne smeruje analóg k bunke prezentujúcej antigén (APC) a/alebo začlenenie aspoň jednej druhej časti do prvého a/alebo druhého analógu (analógov), pričom uvedená druhá časť stimuluje imunitný systém, a/alebo začlenenie aspoň jednej tretej časti do prvého a/alebo druhého analógu (analógov), pričom zmienená tretia časť optimalizuje prezentáciu analógu imunitnému systému.
    219
    16. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 15, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa duplikáciu aspoň jedného B-bunkového epitopu alebo aspoň jedného CTL epitopu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.
    17. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 16, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa zavedenie hapténu.
    18. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde prvý a/alebo druhý cudzí TH epitop (epitopy) je (sú) imunodominantný (imunodominantné).
    19. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde prvý a/alebo druhý cudzí TH epitop (epitopy) je (sú) promiskuitný (promiskuitné).
    20. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 12 až 19, kde prvý a/alebo druhý cudzí TH epitop (epitopy) sa vyberie (vyberú) z prírodného TH epitopu a umelej peptídovej sekvencie, ktorá viaže MHC-II.
    21. Použitie podľa nároku 20, kde. prírodný TH epitop sa vyberie z epitopu tetanového toxoidu, ako je P2 alebo P30, epitopu záškrtového toxoidu, hemaglutinínového epitopu vírusu chrípky a CS epitopu P. falciparum.
    22. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 12 až 21, kde prvý a/alebo druhý TH epitop (epitopy) a/alebo prvá a/alebo druhá a/alebo tretia časť je prítomná vo forme vedľajších skupín viazaných kovalentnou alebo nekovalentnou väzbou k vhodným chemickým skupinám v amínokyselinovej sekvencií s bunkou asociovaného
    220 polypeptidového antigénu alebo jej subsekvencii a/alebo fúznych partnerov aminokyselinovéj sekvencie odvodených s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.
    23. Použitie podľa nároku 22, kde je prvá častí v podstate špecifickým väzbovým partnerom pre APC špecifický povrchový antigén, ako sacharid, pre ktorý na APC existuje špecifický receptor, napr. manán alebo manóza.
    24. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 23, kde druhá je cytokín vybraný z interferónu γ (IFN-γ) , Flt3L, interleukínu 1 (IL-1), interleukínu 2 (IL-2), interleukínu
    4 (IL-4), interleukínu 6 (IL-6), interleukínu 12 (IL-12), interleukínu 13 (IL-13), interleukínu 15 (IL-15) a faktoru stimulujúceho granulocyt-makrofágové kolónie (GM-CSF) alebo jeho účinná časť; proteín tepelného šoku vybraný z HSP70, HSP90, HSC70, GRP94 a kalretikulínu (CRT) alebo jeho účinná častí; alebo, hormón.
    25. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 24, kde je tretia častí lipid, ako napríklad palmitoylová skupina, myristylová skupina, farnezylová skupina, geranylgeranylová skupina, GPI-kotva a N-acyl diglyceridová skupina.
    26. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 25, kde prvý a/alebo druhý analóg (analógy) má (majú) v podstate výslednú celkovú terciárnu štruktúru s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.
    221
    27. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 26, kde sa prezentácia prostredníctvom APC uskutoční podaním imunogénne účinného množstva aspoň jedného prvého analógu živočíchovi.
    28. Použitie podľa nároku 27, kde sa tiež podáva imunologický účinné množstvo aspoň jedného druhého analógu.
    29. Použitie podľa nároku 27 alebo 28, kde menovaný aspoň jeden prvý a/alebo druhý analóg (analógy) je formulovaný spoločne s farmaceutický a imunologický vhodným nosičom a/alebo vehikulom a prípadne adjuvantom.
    30. Použitie podľa nároku 29, kde zmienený adjuvant umožňuje príjem aspoň prvého a/alebo druhého analógu (analógov) APC bunkami, ktorými sú napríklad dendritické bunky.
    31. Použitie podľa nároku 30, kde je zmienený adjuvant zvolený zo skupiny pozostávajúcej z adjuvantu zameraného na imunitu; adjuvantu modulujúceho imunitu, ako je toxín, cytokín a mykobakteriálny derivát; olejového preparátu; polyméru; adjuvantu formujúceho micely; saponínu; imunostimulačný komplexný matrix (ISCOM matrix); častice; DDA; alumíniových adjuvantov; DNA adjuvantov; γ-inulínu a zapuzdrujúceho adjuvantu.
    32. Použitie podľa nároku 31, kde cytokínom je cytokín definovaný v nároku 24 alebo jeho účinná časú, kde toxín je zvolený zo skupiny pozostávajúcej z listeriolycínu (LLO), lipidu A (MPL, L180.5/RaILPS) a tepelne nestáleho enterotoxínu a ďalej kde mykobakteriálny derivát je zvolený zo skupiny pozostávajúcej z muramyl · dipeptídu,
    222 úplného Freundovho adjuvans, RIBI a diesteru trehalózy, ako TDM a TDE, a ďalej kde adjuvant zameraný na imunitu je zvolený zo skupiny pozostávajúcej z ligandu CD40, protilátky CD40 alebo ich špecificky sa viažúcich fragmentov, manózy, Fab fragmentu a CTLA-4 a ďalej kde olejový preparát obsahuje skvalén alebo neúplné Freundovo adjuvans, a ďalej kde polymér je zvolený zo skupiny pozostávajúcej zo sacharidu, ako dextránu, PEG, škrobu, manánu a manózy, plastického polyméru, ako latexu, ako latexových guličiek, a ďalej kde saponín je z Quillaja saponaria, Quil A a QS21, a kde častice obsahujú latex alebo dextŕán.
    33. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 27 až 32 zahŕňajúce podanie lieku formou vybranou z orálnej, parenterálnej, intradermálnej, subdermálnej, intrakutánnej, subkutánnej, peritoneálnej, bukálnej, sublingválnej , epidurálnej, spinálnej, análnej a intrakraniálnej formy.
    34. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 27 až 33 zahŕňajúce aspoň jedno podanie ročne, ako aspoň 2, 3, 4, 5, 6 a 12 podaní ročne.
    35. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 5, kde sa prezentácia uskutoční podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu nesúceho fragment nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje aspoň jeden CTL epitop a aspoň jeden TH epitop živočíchovi.
    36. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 14, kde sa prezentácia uskutočni podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie aspoň jeden fragment nukleovej
    223 kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje aspoň prvý analóg živočíchovi.
    37. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 26, kde TH epitop a/alebo prvá a/alebo druhá a/alebo tretia časé (časti) sú vo forme fúznych partnerov aminokyselinových sekvencií odvodených od s bunkou asociovaného polypeptídového antigénu, a ďalej kde sa prezentácia uskutoční podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny kódujúci a exprimujúci prvý a/alebo druhý analóg živočíchovi.
    38. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 11 až 14 alebo 36, kde sa prezentácia uskutoční podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny kódujúci a exprimujúci aspoň druhý analóg živočíchovi.
    39. Použitie podľa nároku 38, kde sa nepatogénny mikroorganizmus alebo vírus podá živočíchovi raz.
    40. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 5, kde sa prezentácia uskutoční in vivo zavedením do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny.
    41. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 14, kde sa prezentácia uskutoční in vivo zavedením do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho prvý analóg.
    42. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 26, kde TH epitop a/alebo prvá a/alebo druhá a/alebo tretia čast
    224 (časti) sú vo forme fúznych partnerov aminokyselinových sekvencii odvodených od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, a ďalej kde sa prezentácia uskutoční in vivo zavedením do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho prvý a/alebo druhý analóg.
    43. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 11 až 14 a 41, ktoré ďalej zahŕňa použitie aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho druhý analóg na výrobu farmaceutickej kompozície na in vivo zavedenie do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho druhý analóg.
    44. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 5, kde sa prezentácia uskutoční in vivo spoločným zavedením do APC aspoň dvoch fragmentov nukleovej kyseliny, kde jeden kóduje a exprimuje aspoň jeden CTL epitop a kde druhý kóduje a exprimuje aspoň jeden prvý cudzí TH epitop, a ďalej kde prvý cudzí TH epitop sa definuje podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1, 2 a 21 až 24.
    45. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 40 až 44, kde sa zavádzaný fragment (fragmenty) nukleovej kyseliny vyberá (vyberajú) z čistej DNA, DNA formulovanej s nabitými alebo nenabitými lipidmi, DNA formulovanej v lipozómoch, DNA obsiahnutej vo vírusovom vektore, DNA formulovanej s proteínom alebo polypeptídom, ktorý umožňuje transfekciu, DNA formulovanej so zameriavacím proteínom alebo polypeptídom, DNA formulovanej so zameriavacím sacharidom, DNA formulovanej so zrážadlom vápnika, DNA kopulovanej s molekulou inertného nosiča a DNA formulovanej s adjuvantom.
    225
    46. Použitie podľa nároku 45, kde je adjuvant zvolený zo skupiny pozostávajúcej z adjuvantov uvedených v ktoromkoľvek z nárokov 30 až 32.
    47. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 40 až 46, kde spôsob podávania je definovaný v nárokoch 33 alebo 34.
    48. Spôsob výberu imunogénneho analógu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny, kde zmienený imunogénny analóg je schopný vyvolať v živočíchovi reakciu CTL proti bunkám vykazujúcim molekulu MHC typu I viazanú na epitop odvodený od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa
    a) identifikáciu aspoň jednej subsekvencie amínokyselinovej sekvencie s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý neobsahuje známe alebo predpokladané CTL epitopy,
    b) prípravu aspoň jedného predpokladaného imunogénneho analógu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu zavedením aspoň jedného TH epitopu cudzieho pre živočícha do aminokyselinovej sekvencie s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu v polohe ležiacej v aspoň jednej subsekvencie identifikovanej v bode a) , a
    c) selekciu toho (tých) analógu (analógov) pripravených v bode b) , ktorý je (sú) preukázateľne schopný vyvolať reakciu CTL u živočíchov.
    226
    4 9. Spôsob podľa nároku 48 vyznačujúci sa tým, že
    1) subsekvencia identifikovaná v bode a) ďalej neobsahuje cysteínové zvyšky alebo alternatívne, TH epitop zavedený v bode b) v podstate nemení usporiadanie cysteínovych zvyškov a/alebo
    2) subsekvencia identifikovaná v bode a) ďalej neobsahuje známe alebo predpokladané glykozylačné miesta, alebo alternatívne, TH epitop zavedený v bode b) v podstate nemení charakter glykozylácie a/alebo
  3. 3) subsekvencia , identifikovaná v bode a) sa významne podieľa na patofyziologickom efekte spôsobenom s bunkou asociovaným polypeptídovým antigénom a kde zavedenie cudzieho TH epitopu v bode b) redukuje alebo ruší zmienený patofyziologický efekt a/alebo
  4. 4) subsekvencia identifikovaná v bode a) je homologická k aminokyselinovéj sekvencii rozdielneho proteínového antigénu živočícha a zavedenie TH epitopu v bode b) v podstate odstráni homológiu a/alebo
  5. 5) zavedenie cudzieho TH epitopu v bode b) má za následok zachovanie podstatnej časti B-bunkových epitopov s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.
    50. Spôsob podľa nároku 49, variantu 5, vyznačuj úci sa tým, že analóg má celkovú terciárnu štruktúru s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.
    51. Spôsob prípravy bunky produkujúcej analóg s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, vyznačuj ú ci sa tým, že zahŕňa zavedenie sekvencie nukleovej kyseliny kódujúcej analóg do vektoru, pričom analóg sa
    227 volí spôsobom opísaným v ktoromkoľvek z nárokov 48 až 50, a vhodná hostiteľská bunka sa transformuje týmto vektorom.
    52. Spôsob prípravy analógu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa kultiváciu bunky získanej metódou podľa nároku 51 za podmienok uľahčujúcich expresiu sekvencie nukleovej kyseliny kódujúcej s bunkou asociovaný polypeptidový antigén a získanie analógu z kultivačného supernatantu alebo z buniek.
    53. Spôsob podľa nároku 52, vyznačujúci sa tým, že ďalej zahŕňa krok čistenia získaného analógu a prípadne podrobenie prečisteného produktu umelým posttranslačným modifikáciám ako je refolding, úprava enzýmami, chemická modifikácia a konjugácia.
    54. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 47 alebo spôsob podľa ktoréhokoľvek z nárokov 48 až 53, kde slabý s bunkou asociovaný antigén sa vyberie zo skupiny skladajúcej sa z 5-a-reduktázy, α-fetoproteínu, AM-1, APC, APRÍL, BAGE, β-katenínu, Bcl2, bcr-abl (b3a2), CA-125,
    CASP-8/FLICE, katepsínov, CD19, CD20, CD21, CD23, CD22,
    CD33, CD35, CD44, CD45, CD46, CD5, CD52, CD55 (791Tgp72), CD59, CDC27, CDK4, CEA, c-myc, Cox-2, DCC, DcR3, E6/E7, EGFR, EMBP, Ena78, farzyl transferázy, FGF8a alebo FGF8b, FLK-l/KDR, receptora kyseliny listovej, G250, rodiny GAGE, gastrínu 17, hormónu uvoľňujúceho gastrín (Bombezín), GD2/GD3/GM2, GnRH, GnTV, GP1, gplOO/Pmel 17, gpl00-in4, gpl5, gp75/TRP-l, hCG, heparanázy, Her2/neu, HMTV, Hsp70, hTERT (telomerázy), IGFR1, IL-13R, iNOS, Ki 67, KIAA0205,
    K-ras, H-ras, N-ras, KSA (CO17-1A), LDLR-FUT, rodiny MAGE (MAGE-1, MAGE-2, MAGE-3 atď.), mamaglobínu, MAP17, Melan228
    A/MART-1, mezotelínu, MIC A/B, MT-MPP, Moxl, mucínu, ako je MUC-1, MUC-2, MUC-3 a MUC-4, ktoré sú anomálne glykozylované, MUM-1, NY-ESO-1, osteonektínu, pl5, P170/MDR1, p53, p97/ melanotransferínu, PAI-1, PDGF, plazminogénu (uPA), PRÁME, probazínu, , progenipoietínu, PSA, PSM, RAGE-1, Rb, RCAS1, SART-1, génovej rodiny SSX, STAT3, STn (asociovaného s mucínom), TAG-72, TGF-a, TGF-β, tymozínu β 15, TNF-a, TPA, TPI, TRP2, tyrozinázy, VEGF, ZAG, pl6INK4 a glutatión S-transferázy.
    55. Použitie alebo spôsob podľa nároku 54, kde s bunkou asociovaný polypeptídový antigén je ľudský PSM.
    56. Použitie alebo spôsob podľa nároku 55, kde cudzí T-bunkový epitop sa zavádza v oblasti aminokyselinovej sekvencie PSM definovanej ako SEQ ID č. 2, pozície 16-52 a/alebo 87-108 a/alebo 210-230 a/alebo 269-289 a/alebo 298-324 a/alebo 442-465 a/alebo 488-514 a/alebo 598-630 a/alebo 643-662 a/alebo 672 - 699.
    57. Použitie podľa nároku 55 alebo 56, kde sa farmaceutická kompozícia používa na liečbu alebo zlepšenie stavu rakoviny prostaty.
    58. Použitie alebo spôsob podľa nároku 54, kde s bunkou asociovaný polypeptídový antigén je fibroblastový rastový faktor 8b (FGF8b).
    59. Použitie alebo spôsob podľa nároku 58, kde sa cudzí Tbunkový epitop zavádza v oblasti aminokyselinovej sekvencie FGF8b definovanej ako SEQ ID č. 6, pozície 1-54 a/alebo 178-215 a/alebo 55-58 a/alebo 63-68 a/alebo 72-76 a/alebo 85-91 a/alebo 95-102 a/alebo 106-111 a/alebo 115120 a/alebo 128-134 a/alebo 138-144 a/alebo 149-154 a/alebo 158-162 a/alebo 173-177, pričom toto zavedenie
    229 prednostne nepostihuje aminokyseliny 26-45 a aminokyseliny 186-215.
    60. Použitie podľa nároku 58 alebo 59, kde sa farmaceutická kompozícia používa na liečbu alebo zlepšenie stavu rakoviny, ako je rakovina prostaty a rakovina prsníka.
    61. Použitie alebo spôsob podľa nároku 54, kde s bunkou asociovaný polypeptídový antigén je Her2.
    62. Použitie alebo spôsob podľa nároku 61, kde sa cudzí Tbunkový epitop zavádza v oblasti aminokyselinovéj sekvencie Her2 definovanej ako SEQ ID č. 3, pozície 5-25 a/alebo 59-73 a/alebo 103-117 a/alebo 149-163 a/alebo 210224 a/alebo 250-264 a/alebo 325-339 a/alebo 369-383 a/alebo 465-479 a/alebo 579-593 a/alebo 632-652 a/alebo 653-667 a/alebo 661-675 a/alebo 695-709 a/alebo 710-730.
    63. Použitie alebo spôsob podľa nároku 61 alebo 62, kde sa farmaceutická kompozícia používa na liečbu alebo zlepšenie stavu rakoviny prsníka.
    64. Analóg ľudského PSM, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom tento analóg obsahuje podstatnú čast všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov PSM a ďalej obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop definovaný podľa ktoréhokoľvek z nárokov 18 až 21.
    65. Analóg podľa nároku 64, kde aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako inzert do aminokyselinovéj sekvencie PSM alebo ako substitúcia časti aminokyselinovéj sekvencie PSM alebo ako výsledok delécie časti aminokyselinovéj sekvencie PSM.
    66. Analóg podľa nároku 65, kde je cudzí TH epitop zavedený v pozíciách definovaných v nároku 56.
    230
    67. Analóg ľudského Her2, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom tento analóg obsahuje podstatnú čast všetkých známych a predpokladaných CTL· a B-bunkových epitopov Her2 a ďalej obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop definovaný podľa ktoréhokoľvek z nárokov 18 až 21.
    68. Analóg podľa nároku 67, kde aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako inzert do aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako substitúcia časti aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako výsledok delécie časti aminokyselinovej sekvencie PSM.
    69. Analóg podľa nároku 68, kde je cudzí TH epitop zavedený v pozíciách definovaných v nároku 62.
    70. Analóg ľudského/myšacieho FGF8b, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom obsahuje podstatnú čast všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov FGF8b a ďalej obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop definovaný v ktoromkoľvek z nárokov 18 až 21.
    71. Analóg podľa nároku 70, kde aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako inzert v aminokyselinovej sekvencií FGF8b alebo ako substitúcia časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b alebo ako výsledok delécie časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b.
    72. Analóg podľa nároku 71, kde je cudzí TH epitop zavedený v pozíciách definovaných v nároku 59.
    73. Imunogénna kompozícia, vyznačujúca sa tým, že ako účinné imunogénne činidlo obsahuje analóg podľa ktoréhokoľvek z nárokov 64 až 72 v zmesi s farmaceutický a imunologický vhodným nosičom alebo vehikulom a prípadne adjuvantom.
    231
    Ί4. Fragment nukleovej kyseliny kódujúci analóg podľa ktoréhokoľvek z nárokov 64 až 72.
    75. Vektor nesúci fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74.
    76. Vektor podľa nároku 75, ktorý je schopný autonómnej replikácie.
    77. Vektor podľa nároku 75 alebo 76 zvolený zo skupiny pozostávajúcej z plazmidu, fágu, kozmidu, minichromozómu a vírusu.
    78. Vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 77, ktorý obsahuje v smere 5'-> 3' a v operabilnom spojení promotor na poháňanie expresie fragmentu nukleovej kyseliny podľa nároku 74, prípadne sekvenciu nukleovej kyseliny kódujúcu vedúci peptid, ktorý umožňuje sekréciu polypeptidového fragmentu alebo jeho integráciu do membrány, fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74 a prípadne sekvenciu nukleovej kyseliny kódujúcej terminátor.
    79. Vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 78, ktorý sa, zavedený do hostiteľskej bunky, integruje do genómu hostiteľskej bunky alebo nie je schopný integrácie do genómu hostiteľskej bunky.
    80. Transformovaná bunka nesúca vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79.
    81. Kompozícia na indukciu produkcie protilátok proti PSM, Her2 alebo FGF8b, vyznačujúca sa tým, že obsahuj e
    1) fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74 alebo vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79 a
    2) farmaceutický a imunologický vhodné riedidlo a/alebo vehikulum a/alebo adjuvans.
    232
    82. Stabilná bunková línia nesúca vektor podl'a ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79, ktorá exprimuje fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74 a ktorá prípadne na svojom povrchu vylučuje alebo nesie analóg podľa ktoréhokoľvek z nárokov 64 až 72.
    83. Spôsob prípravy bunky podľa nároku 80, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa transformáciu hostiteľskej bunky fragmentom nukleovej kyseliny podľa nároku 74 alebo vektorom podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79.
SK427-2001A 1998-10-05 1999-10-05 Methods for therapeutic vaccination SK4272001A3 (en)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DKPA199801261 1998-10-05
US10501198P 1998-10-20 1998-10-20
PCT/DK1999/000525 WO2000020027A2 (en) 1998-10-05 1999-10-05 Methods for therapeutic vaccination

Publications (1)

Publication Number Publication Date
SK4272001A3 true SK4272001A3 (en) 2003-02-04

Family

ID=26065489

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SK427-2001A SK4272001A3 (en) 1998-10-05 1999-10-05 Methods for therapeutic vaccination

Country Status (25)

Country Link
US (3) US7005498B1 (sk)
EP (1) EP1117421B2 (sk)
JP (1) JP2002526419A (sk)
KR (1) KR100731820B1 (sk)
CN (1) CN1325115C (sk)
AT (1) ATE269100T1 (sk)
AU (1) AU751709B2 (sk)
CA (1) CA2345817C (sk)
CZ (1) CZ20011049A3 (sk)
DE (1) DE69918146T2 (sk)
EA (1) EA003634B1 (sk)
EE (1) EE200100203A (sk)
ES (1) ES2222728T3 (sk)
HK (1) HK1039749B (sk)
HR (1) HRP20010319A2 (sk)
HU (1) HUP0103976A3 (sk)
IL (1) IL141868A0 (sk)
MX (1) MXPA01003503A (sk)
NO (1) NO20011586L (sk)
NZ (1) NZ511055A (sk)
PL (1) PL202399B1 (sk)
PT (1) PT1117421E (sk)
SK (1) SK4272001A3 (sk)
TR (1) TR200100936T2 (sk)
WO (1) WO2000020027A2 (sk)

Families Citing this family (144)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0866805A1 (en) 1995-12-12 1998-09-30 Karolinska Innovations AB PEPTIDE BINDING THE KLVFF-SEQUENCE OF AMYLOID $g(b)
US20080050367A1 (en) 1998-04-07 2008-02-28 Guriq Basi Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide
US7790856B2 (en) 1998-04-07 2010-09-07 Janssen Alzheimer Immunotherapy Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide
TWI239847B (en) 1997-12-02 2005-09-21 Elan Pharm Inc N-terminal fragment of Abeta peptide and an adjuvant for preventing and treating amyloidogenic disease
US7964192B1 (en) 1997-12-02 2011-06-21 Janssen Alzheimer Immunotherapy Prevention and treatment of amyloidgenic disease
SK4272001A3 (en) 1998-10-05 2003-02-04 Pharmexa As Methods for therapeutic vaccination
US6913749B2 (en) 1998-11-02 2005-07-05 Resistentia Pharmaceuticals Ab Immunogenic polypeptides for inducing anti-self IgE responses
US7198920B1 (en) * 1999-01-29 2007-04-03 Corika Corporation HER-2/neu fusion proteins
KR20020084841A (ko) * 1999-04-23 2002-11-11 파멕사 에이/에스 Il5 활성을 다운-조절하는 방법
US7060670B1 (en) 1999-05-05 2006-06-13 Neurochem (International) Limited Stereoselective antifibrillogenic peptides and peptidomimetics thereof
KR100773109B1 (ko) * 1999-05-06 2007-11-02 웨이크 포리스트 유니버시티 면역 반응을 유발하는 항원을 동정하기 위한 조성물과 방법
MXPA02007796A (es) * 2000-02-21 2003-12-08 Pharmexa As Metodo novedoso para la disminucion de cuerpos amiloides.
ATE306933T1 (de) * 2000-02-21 2005-11-15 Pharmexa As Verfahren zur herabregulierung von amyloid
US7229623B1 (en) 2000-08-03 2007-06-12 Corixa Corporation Her-2/neu fusion proteins
DE10042598A1 (de) * 2000-08-30 2002-03-28 Gsf Forschungszentrum Umwelt Rekombinantes MVA mit der Fähigkeit zur Expression des HER-2/Neu-GENS
US8435939B2 (en) 2000-09-05 2013-05-07 Biokine Therapeutics Ltd. Polypeptide anti-HIV agent containing the same
CA2421274A1 (en) * 2000-09-06 2002-03-14 Pharmexa A/S Method for down-regulating ige
WO2002034287A2 (en) * 2000-10-27 2002-05-02 Pharmexa A/S Therapeutic vaccine formulations containing chitosan
US7700751B2 (en) 2000-12-06 2010-04-20 Janssen Alzheimer Immunotherapy Humanized antibodies that recognize β-amyloid peptide
CA2440197A1 (en) * 2001-02-19 2002-08-29 Pharmexa A/S Synthetic vaccines comprising polyhydroxypolymer carriers
US7097837B2 (en) 2001-02-19 2006-08-29 Pharmexa A/S Synthetic vaccine agents
US7604955B2 (en) 2001-08-13 2009-10-20 Swey-Shen Alex Chen Immunoglobulin E vaccines and methods of use thereof
MY144532A (en) 2001-08-20 2011-09-30 Lundbeck & Co As H Novel method for down-regulation of amyloid
EP1467751A2 (en) * 2002-01-17 2004-10-20 Pharmexa A/S Immunogenic cea
CA2513044A1 (en) 2002-03-01 2004-08-05 Dyax Corp. Kdr and vegf/kdr binding peptides and their use in diagnosis and therapy
US7794693B2 (en) 2002-03-01 2010-09-14 Bracco International B.V. Targeting vector-phospholipid conjugates
US7261876B2 (en) 2002-03-01 2007-08-28 Bracco International Bv Multivalent constructs for therapeutic and diagnostic applications
US8623822B2 (en) 2002-03-01 2014-01-07 Bracco Suisse Sa KDR and VEGF/KDR binding peptides and their use in diagnosis and therapy
MY139983A (en) 2002-03-12 2009-11-30 Janssen Alzheimer Immunotherap Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide
CA2480128A1 (en) * 2002-03-26 2003-10-09 Immunex Corporation Methods of using flt3-ligand in immunization protocols
US9200036B2 (en) 2002-07-12 2015-12-01 The Johns Hopkins University Mesothelin vaccines and model systems
US20090110702A1 (en) 2002-07-12 2009-04-30 The Johns Hopkins University Mesothelin Vaccines and Model Systems and Control of Tumors
WO2004006837A2 (en) * 2002-07-12 2004-01-22 The Johns Hopkins University Mesothelin vaccines and model systems
KR100555211B1 (ko) * 2002-07-16 2006-03-03 주식회사 팬제노믹스 항암효과를 갖는 Her-2/neu DNA 백신
ES2403932T3 (es) 2002-08-27 2013-05-22 Biokine Therapeutics Ltd. Antagonista de CXCR4 y uso del mismo
GB0228796D0 (en) * 2002-12-11 2003-01-15 Adjuvantix Ltd Valency
SE0301109D0 (sv) * 2003-04-14 2003-04-14 Mallen Huang Nucleotide vaccine composition
CA2524305C (en) * 2003-05-01 2015-12-08 Imclone Systems Incorporated Fully human antibodies directed against the human insulin-like growth factor-1 receptor
TWI374893B (en) 2003-05-30 2012-10-21 Janssen Alzheimer Immunotherap Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide
ATE429447T1 (de) 2003-06-25 2009-05-15 Bn Immunotherapeutics Inc Aufreinigung von her-2-varianten
CN101094864A (zh) * 2003-06-25 2007-12-26 法麦克萨有限公司 Her-2变体的纯化
EP1670509A4 (en) * 2003-09-03 2007-10-31 Dendritherapeutics Inc MULTIPLEX VACCINES
WO2005033278A2 (en) * 2003-09-30 2005-04-14 Ludwig Institute For Cancer Research In vivo efficacy of ny-eso-1 plus iscom
EP1687333A2 (en) * 2003-10-30 2006-08-09 Pharmexa A/S Method for down-regulation of vegf
JP2007528838A (ja) * 2003-12-24 2007-10-18 ライデン ユニバーシティ メディカル センター 腫瘍特異的ワクチンとしての合成タンパク質
US7674456B2 (en) * 2004-06-14 2010-03-09 Charles Wiseman Breast cancer cell lines and uses thereof
US20070190072A1 (en) * 2004-09-30 2007-08-16 Csl Limited Ludwig Institute For Cancer Research In vivo efficacy of ny-eso-1 plus adjuvant
WO2007001448A2 (en) 2004-11-04 2007-01-04 Massachusetts Institute Of Technology Coated controlled release polymer particles as efficient oral delivery vehicles for biopharmaceuticals
CA2590337C (en) 2004-12-15 2017-07-11 Neuralab Limited Humanized amyloid beta antibodies for use in improving cognition
AU2006228872A1 (en) * 2005-03-31 2006-10-05 Pharmexa A/S Immunogenic EGFR peptides comprising foreign Tcell stimulating epitope
CN100354002C (zh) * 2005-05-31 2007-12-12 中国人民解放军第三军医大学第一附属医院 一种新的以异种免疫细胞为细胞载体的细胞疫苗及其制备方法
PT2100618E (pt) 2005-06-17 2014-04-07 Philadelphia Health & Educatio Um anticorpo anti-pdgfr-alfa para o tratamento de cancro ósseo metastático
WO2006138567A2 (en) * 2005-06-17 2006-12-28 Mannkind Corporation Methods and compositions to elicit multivalent immune responses against dominant and subdominant epitopes, expressed on cancer cells and tumor stroma
WO2007070682A2 (en) 2005-12-15 2007-06-21 Massachusetts Institute Of Technology System for screening particles
EP1982176A1 (en) * 2006-01-30 2008-10-22 Dako Denmark A/S High-speed quantification of antigen specific t-cells in whole blood by flow cytometry
AP2008004569A0 (en) * 2006-02-03 2008-08-31 Imclone Systems Inc IGR-IR antagonists as adjuvants for treatment of prostrate cancer
NZ569545A (en) * 2006-02-09 2011-11-25 Transtech Pharma Inc Rage fusion proteins and methods of use for treating inflammation
CA2648099C (en) 2006-03-31 2012-05-29 The Brigham And Women's Hospital, Inc System for targeted delivery of therapeutic agents
WO2009017467A1 (en) 2007-07-27 2009-02-05 Elan Pharma International Limited Treatment of amyloidogenic diseases
US8784810B2 (en) 2006-04-18 2014-07-22 Janssen Alzheimer Immunotherapy Treatment of amyloidogenic diseases
WO2007130302A2 (en) * 2006-05-05 2007-11-15 Transtech Pharma, Inc. Rage fusion proteins, formulations, and methods of use thereof
CA2652280C (en) 2006-05-15 2014-01-28 Massachusetts Institute Of Technology Polymers for functional particles
WO2007137586A2 (en) * 2006-05-31 2007-12-06 Pharmexa A/S Random insertion of peptides
WO2007150030A2 (en) * 2006-06-23 2007-12-27 Massachusetts Institute Of Technology Microfluidic synthesis of organic nanoparticles
CA2665068C (en) * 2006-10-06 2016-01-05 Bn Immunotherapeutics Inc. Methods for treating cancer with mva
EP2759302A3 (en) * 2006-12-21 2014-11-05 Biokine Therapeutics LTD. 4F-benzoyl-TN14003 combined with rituximab for use in the treatment of a tumour
EP2134830A2 (en) 2007-02-09 2009-12-23 Massachusetts Institute of Technology Oscillating cell culture bioreactor
WO2008100470A2 (en) * 2007-02-15 2008-08-21 Transtech Pharma, Inc. Rage - immunoglobulin fusion proteins
EP2155782A2 (en) 2007-03-26 2010-02-24 Dako Denmark A/S Mhc peptide complexes and uses thereof in infectious diseases
WO2008124639A2 (en) * 2007-04-04 2008-10-16 Massachusetts Institute Of Technology Poly (amino acid) targeting moieties
US8003097B2 (en) 2007-04-18 2011-08-23 Janssen Alzheimer Immunotherapy Treatment of cerebral amyloid angiopathy
EP2167537A2 (en) * 2007-07-03 2010-03-31 Dako Denmark A/S Compiled methods for analysing and sorting samples
WO2009023266A1 (en) * 2007-08-14 2009-02-19 Ludwig Institute For Cancer Research Generation of antibodies to cell-surface receptors and cancer-associated proteins including egfr family members
EP2853267B1 (en) * 2007-09-21 2016-12-07 The Regents of the University of California Targeted interferon demonstrates potent apoptotic and anti-tumor activities
EP2197908A2 (en) 2007-09-27 2010-06-23 Dako Denmark A/S Mhc multimers in tuberculosis diagnostics, vaccine and therapeutics
ES2627292T3 (es) 2007-10-12 2017-07-27 Massachusetts Institute Of Technology Nanotecnología de vacunas
JO3076B1 (ar) 2007-10-17 2017-03-15 Janssen Alzheimer Immunotherap نظم العلاج المناعي المعتمد على حالة apoe
RU2499606C2 (ru) * 2007-10-18 2013-11-27 Бавэариан Нордик Инк. Применение mva (модифицированный вирус коровьей оспы анкара) для лечения рака простаты
US10968269B1 (en) 2008-02-28 2021-04-06 Agilent Technologies, Inc. MHC multimers in borrelia diagnostics and disease
US10722562B2 (en) * 2008-07-23 2020-07-28 Immudex Aps Combinatorial analysis and repair
US20110274713A1 (en) * 2008-08-05 2011-11-10 The University Of Queensland Antigen-presenting scaffolds
GB0817244D0 (en) * 2008-09-20 2008-10-29 Univ Cardiff Use of a protein kinase inhibitor to detect immune cells, such as T cells
WO2010037402A1 (en) 2008-10-02 2010-04-08 Dako Denmark A/S Molecular vaccines for infectious disease
US8591905B2 (en) 2008-10-12 2013-11-26 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Nicotine immunonanotherapeutics
US8343498B2 (en) 2008-10-12 2013-01-01 Massachusetts Institute Of Technology Adjuvant incorporation in immunonanotherapeutics
US8277812B2 (en) 2008-10-12 2012-10-02 Massachusetts Institute Of Technology Immunonanotherapeutics that provide IgG humoral response without T-cell antigen
US8343497B2 (en) 2008-10-12 2013-01-01 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Targeting of antigen presenting cells with immunonanotherapeutics
US9067981B1 (en) 2008-10-30 2015-06-30 Janssen Sciences Ireland Uc Hybrid amyloid-beta antibodies
US7998488B2 (en) * 2008-11-14 2011-08-16 Baxter International Inc. Vaccine formulations and uses thereof
US9249187B2 (en) 2009-01-28 2016-02-02 Epimmune Inc. Pan-DR binding polypeptides and uses thereof
BRPI1016133A2 (pt) 2009-04-01 2016-04-19 Univ Miami vacina, método para dispensar um antígeno a um mamífero, composição, métodos para dispensar sirna dentro de células que apresentam antígeno profissionais, para inibir a proliferação de células de tumor, e para dispensar um ácido nucleico a uma célula.
US20120129199A1 (en) * 2009-05-19 2012-05-24 University Of Miami Compositions, kits and methods for in vitro antigen presentation, assessing vaccine efficacy, and assessing immunotoxicity of biologics and drugs
BRPI1009663A2 (pt) 2009-06-14 2016-10-11 Biokine Therapeutics Ltd "método para elevação dos níveis plaquetários em um indivíduo com essa necessidade, método de inibição de hemorragia em um indivíduo que a necessite e composição farmacêutica"
JP5946766B2 (ja) 2009-07-03 2016-07-06 ビオノール イミュノ エーエスBionor Immuno As Hivワクチン組成物における使用又は診断手段としての使用のためのhiv関連ペプチドの組合せ又は融合物
BR112012003977A2 (pt) * 2009-08-26 2017-06-06 Selecta Biosciences Inc composições que induzem ajuda de célula t
AU2010291900A1 (en) * 2009-09-14 2012-03-22 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Vaccines and immunotherapeutics comprising IL-15 receptor alpha and/or nucleic acid molecules encoding the same, and methods for using the same
EP4012714A1 (en) * 2010-03-23 2022-06-15 Iogenetics, LLC. Bioinformatic processes for determination of peptide binding
JP6294666B2 (ja) * 2010-04-13 2018-03-14 イミュノバティブ セラピーズ,リミテッド 制御性t細胞の阻害のための方法および組成物
CA2798323A1 (en) 2010-05-26 2011-12-01 Selecta Biosciences, Inc. Dose selection of adjuvanted synthetic nanocarriers
US9994443B2 (en) 2010-11-05 2018-06-12 Selecta Biosciences, Inc. Modified nicotinic compounds and related methods
BR112013011705B1 (pt) * 2010-11-12 2022-04-05 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Antígenos de próstata de consenso, molécula de ácido nucleico quecodifica os mesmos e vacina e usos compreendendo os mesmos
MX346475B (es) 2011-01-06 2017-03-22 Bionor Immuno As Peptidos inmunogenicos monomericos y multimericos.
CN102716472A (zh) * 2011-03-31 2012-10-10 李光辉 一种肿瘤疫苗及其合成方法
CN103517707A (zh) 2011-04-29 2014-01-15 西莱克塔生物科技公司 从合成纳米载体中控制释放免疫抑制剂
CN103906531A (zh) * 2011-05-26 2014-07-02 金纽斯生物科技投资有限责任公司 调节的免疫优势疗法
US20130028857A1 (en) 2011-07-29 2013-01-31 Selecta Biosciences, Inc. Synthetic nanocarriers comprising polymers comprising multiple immunomodulatory agents
EP2755679B1 (en) * 2011-09-13 2017-08-02 Immunotope, Inc. Cytotoxic t-lymphocyte-inducing immunogens for prevention, treatment, and diagnosis of cancer
CN103063836B (zh) * 2011-10-18 2016-03-30 复旦大学附属华山医院 检测分枝杆菌感染的试剂、方法和试剂盒
AU2013221309B2 (en) 2012-02-17 2017-03-30 Mayo Foundation For Medical Education And Research Methods and materials for generating CD8+ T cells having the ability to recognize cancer cells expressing a HER2/neu polypeptide
WO2013160895A1 (en) 2012-04-24 2013-10-31 Biokine Therapeutics Ltd. Peptides and use thereof in the treatment of large cell lung cancer
MX359257B (es) 2012-05-04 2018-09-19 Pfizer Antígenos asociados a próstata y regímenes de inmunoterapia basados en vacuna.
US10335482B2 (en) 2012-06-06 2019-07-02 Bionor Immuno As Method of inducing an anti-HIV-1 immune response comprising administering a C5/TM-GP41 peptide dimer
NZ702146A (en) 2012-06-06 2016-11-25 Bionor Immuno As Peptides derived from viral proteins for use as immunogens and dosage reactants
US10092634B2 (en) 2012-09-11 2018-10-09 Oncotherapy Science, Inc. UBE2T peptides and vaccines containing the same
CA2888367A1 (en) 2012-10-19 2014-04-24 Bavarian Nordic, Inc. Methods and compositions for the treatment of cancer
US9803021B2 (en) 2012-12-07 2017-10-31 The Regents Of The University Of California CD138-targeted interferon demonstrates potent apoptotic and anti-tumor activities
JP6431484B2 (ja) * 2012-12-28 2018-11-28 セルスティス リミテッド 細胞媒介免疫応答アッセイ
WO2014194100A1 (en) 2013-05-29 2014-12-04 The Regents Of The University Of California Anti-cspg4 fusions with interferon for the treatment of malignancy
WO2015007337A1 (en) 2013-07-19 2015-01-22 Bionor Immuno As Method for the vaccination against hiv
WO2015175340A1 (en) 2014-05-13 2015-11-19 Bavarian Nordic, Inc. Combination therapy for treating cancer with a poxvirus expressing a tumor antigen and a monoclonal antibody against tim-3
WO2016005508A1 (en) 2014-07-11 2016-01-14 Bionor Immuno As Method for reducing and/or delaying pathological effects of human immunodeficiency virus i (hiv) or for reducing the risk of developing acquired immunodeficiency syndrome (aids)
US20210260181A1 (en) * 2014-09-16 2021-08-26 Altimmune, Inc Coronavirus immunogenic compositions and uses thereof
US9616114B1 (en) 2014-09-18 2017-04-11 David Gordon Bermudes Modified bacteria having improved pharmacokinetics and tumor colonization enhancing antitumor activity
EP3267980A4 (en) * 2015-03-11 2018-08-01 Board of Regents of the University of Nebraska Conformationally stable analogs of the response selective c5a agonist ep67
WO2016154112A1 (en) * 2015-03-20 2016-09-29 Children's National Medical Center Generating virus or other antigen-specific t cells from a naive t cell population
WO2016177833A1 (en) 2015-05-04 2016-11-10 Bionor Immuno As Dosage regimen for hiv vaccine
AU2016260540B2 (en) 2015-05-13 2021-01-07 Agenus Inc. Vaccines for treatment and prevention of cancer
WO2017009842A2 (en) 2015-07-16 2017-01-19 Biokine Therapeutics Ltd. Compositions and methods for treating cancer
JP7000314B2 (ja) * 2015-10-06 2022-02-10 アンヴェクティ 免疫療法における使用のためのポリエピトープ構築物
CN109310733A (zh) 2016-02-23 2019-02-05 百欧林纳克斯有限公司 治疗急性骨髓性白血病的方法
CN105879058B (zh) * 2016-05-10 2017-11-14 华中科技大学 一种结核病基因药物及其制备方法
US11129906B1 (en) 2016-12-07 2021-09-28 David Gordon Bermudes Chimeric protein toxins for expression by therapeutic bacteria
US11180535B1 (en) 2016-12-07 2021-11-23 David Gordon Bermudes Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria
WO2019061297A1 (zh) * 2017-09-29 2019-04-04 苏州工业园区唯可达生物科技有限公司 一种cd4辅助性t细胞表位融合肽及其疫苗
US11065317B2 (en) 2018-04-26 2021-07-20 Agenus Inc. Heat shock protein-binding peptide compositions and methods of use thereof
CA3113818A1 (en) 2018-10-05 2020-04-09 Bavarian Nordic A/S Combination therapy for treating cancer with an intravenous administration of a recombinant mva and an immune checkpoint antagonist or agonist
CN111068069B (zh) * 2018-10-18 2022-05-20 中国医学科学院药物研究所 一种免疫靶向功能性脂质体及其制备方法与用途
BR112021009856A8 (pt) 2018-11-20 2021-09-08 Bavarian Nordic As Terapia para tratamento do câncer com uma administração intratumoral e / ou intravenosa de um mva recombinante que codifica 4-1bbl (cd137l) e / ou cd40l
EP4061406A1 (en) 2019-11-20 2022-09-28 Bavarian Nordic A/S Recombinant mva viruses for intratumoral and/or intravenous administration for treating cancer
US20230109142A1 (en) 2020-02-14 2023-04-06 Immunor As Corona virus vaccine
JP2023514249A (ja) * 2020-02-14 2023-04-05 アルティミューン インコーポレーティッド コロナウイルス免疫原性組成物およびその使用
CN112980857A (zh) * 2021-04-26 2021-06-18 重庆医科大学附属儿童医院 一种编码分泌性野生型gaa蛋白的核苷酸组合物、腺相关病毒载体及其药物和应用
WO2023118563A1 (en) 2021-12-23 2023-06-29 Bavarian Nordic A/S Therapy for modulating immune response with recombinant mva encoding il-12
WO2023118508A1 (en) 2021-12-23 2023-06-29 Bavarian Nordic A/S Recombinant mva viruses for intraperitoneal administration for treating cancer

Family Cites Families (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1986007383A1 (en) 1985-06-04 1986-12-18 Biotechnology Research Partners, Ltd. Autoantigen vaccines
US4772685A (en) * 1985-10-02 1988-09-20 Merck & Co., Inc. Immunogenic peptides of human interleukin-1 and the corresponding anti-peptide antibodies
US5126399A (en) * 1986-04-30 1992-06-30 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods and compositions for the preparation and use of site-directed immunologic reagents
ATE130197T1 (de) * 1988-06-14 1995-12-15 Cell Med Inc Heterofunktionelle zellular immunologische reagenzien, impfstoffe daraus und verwendungsverfahren.
EP0378881B1 (en) * 1989-01-17 1993-06-09 ENIRICERCHE S.p.A. Synthetic peptides and their use as universal carriers for the preparation of immunogenic conjugates suitable for the development of synthetic vaccines
IT1237764B (it) * 1989-11-10 1993-06-17 Eniricerche Spa Peptidi sintetici utili come carriers universali per la preparazione di coniugati immunogenici e loro impiego per lo sviluppo di vaccini sintetici.
DK96493D0 (da) * 1993-08-26 1993-08-26 Mouritsen Og Elsner Aps Fremgangsmaade til at inducere antistofresponser mod selvproteiner og autovaccine fremstillet ved fremgangsmaaden
JP3926839B2 (ja) 1993-09-14 2007-06-06 エピミューン,インコーポレイティド 万能dr−結合性ペプチドを用いる免疫応答の改変
US5501063A (en) 1994-09-06 1996-03-26 Kimberly-Clark Corporation Apparatus and method of reducing the force to expel a tampon from a tampon applicator and the applicator itself
AUPN015794A0 (en) 1994-12-20 1995-01-19 Csl Limited Variants of human papilloma virus antigens
US6410690B1 (en) * 1995-06-07 2002-06-25 Medarex, Inc. Therapeutic compounds comprised of anti-Fc receptor antibodies
AU721729B2 (en) 1996-05-01 2000-07-13 Avant Immunotherapeutics, Inc. Plasmid-based vaccine for treating atherosclerosis
CA2261990A1 (en) * 1996-07-25 1998-02-05 Therion Biologics Corporation Recombinant pox virus for immunization against tumor-associated antigens
AUPO390396A0 (en) 1996-11-29 1996-12-19 Csl Limited Novel promiscuous T helper cell epitopes
US6328969B1 (en) * 1996-12-10 2001-12-11 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Method and compositions for stimulation of an immune response to a differentiation antigen stimulated by an altered differentiation antigen
ES2286845T3 (es) 1997-01-22 2007-12-01 Mgi Pharma Biologics, Inc. Microparticulas para suministrar acidos nucleicos.
GB9711957D0 (en) 1997-06-09 1997-08-06 Isis Innovation Methods and reagents for vaccination
GB9717953D0 (en) 1997-08-22 1997-10-29 Smithkline Beecham Biolog Vaccine
ES2255248T3 (es) 1998-02-05 2006-06-16 Glaxosmithkline Biologicals S.A. Derivados de antigenos asociados a tumor de la familia mage, y secuencias de acidos nucleicos que los codifican, usados para la preparacion de proteinas de fusion y de composiciones para vacunas.
WO1999056919A1 (de) 1998-04-30 1999-11-11 Manfred Schneider Werkzeugmaschine mit werkzeugwechsel
SK4272001A3 (en) * 1998-10-05 2003-02-04 Pharmexa As Methods for therapeutic vaccination

Also Published As

Publication number Publication date
ATE269100T1 (de) 2004-07-15
US7005498B1 (en) 2006-02-28
HK1039749A1 (en) 2002-05-10
HUP0103976A3 (en) 2008-04-28
EP1117421A2 (en) 2001-07-25
CZ20011049A3 (cs) 2002-08-14
HUP0103976A2 (hu) 2002-02-28
PT1117421E (pt) 2004-11-30
AU751709B2 (en) 2002-08-22
HK1039749B (zh) 2007-10-05
CA2345817C (en) 2013-02-12
PL202399B1 (pl) 2009-06-30
MXPA01003503A (es) 2005-01-14
KR20010085894A (ko) 2001-09-07
EA200100425A1 (ru) 2001-10-22
US20040141958A1 (en) 2004-07-22
DE69918146D1 (de) 2004-07-22
DE69918146T2 (de) 2005-07-07
AU5851099A (en) 2000-04-26
US7820633B2 (en) 2010-10-26
CN1325115C (zh) 2007-07-11
ES2222728T3 (es) 2005-02-01
WO2000020027A2 (en) 2000-04-13
JP2002526419A (ja) 2002-08-20
NZ511055A (en) 2003-10-31
HRP20010319A2 (en) 2002-06-30
NO20011586D0 (no) 2001-03-28
CN1323217A (zh) 2001-11-21
IL141868A0 (en) 2002-03-10
WO2000020027A3 (en) 2000-10-12
TR200100936T2 (tr) 2001-08-21
KR100731820B1 (ko) 2007-06-25
EP1117421B1 (en) 2004-06-16
NO20011586L (no) 2001-05-31
US7807441B2 (en) 2010-10-05
PL347977A1 (en) 2002-05-06
EP1117421B2 (en) 2014-03-19
EE200100203A (et) 2002-10-15
EA003634B1 (ru) 2003-08-28
CA2345817A1 (en) 2000-04-13
US20060008465A1 (en) 2006-01-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU751709B2 (en) Novel methods for therapeutic vaccination
US10251912B2 (en) MHC class II restricted T cell epitopes from the cancer antigen, NY ESO-1
US10166276B2 (en) Compositions and methods for treatment of non-hodgkins lymphoma
EP1502602A2 (en) Methods for therapeutic vaccination
EP3542814B1 (en) Novel peptide-based compounds for use in the prevention, treatment and/or detection of cancer

Legal Events

Date Code Title Description
FB9A Suspension of patent application procedure