SK114295A3 - Dna construction and pharmaceutical agent containing them - Google Patents
Dna construction and pharmaceutical agent containing them Download PDFInfo
- Publication number
- SK114295A3 SK114295A3 SK1142-95A SK114295A SK114295A3 SK 114295 A3 SK114295 A3 SK 114295A3 SK 114295 A SK114295 A SK 114295A SK 114295 A3 SK114295 A3 SK 114295A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- seq
- dna
- influenza virus
- gene
- mice
- Prior art date
Links
- 238000010276 construction Methods 0.000 title claims description 25
- 239000008177 pharmaceutical agent Substances 0.000 title 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 195
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 claims abstract description 118
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 83
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims abstract description 62
- 108010061100 Nucleoproteins Proteins 0.000 claims description 176
- 102000011931 Nucleoproteins Human genes 0.000 claims description 173
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 claims description 154
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 claims description 154
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 claims description 154
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 claims description 154
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 claims description 146
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 102
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 claims description 87
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 76
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 76
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 76
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 69
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 57
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 claims description 55
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 49
- 230000007123 defense Effects 0.000 claims description 42
- 241000845082 Panama Species 0.000 claims description 33
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 27
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 24
- 241000252870 H3N2 subtype Species 0.000 claims description 23
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 23
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 22
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims description 19
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 claims description 18
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 18
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims description 16
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 15
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 14
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 claims description 11
- 101710128560 Initiator protein NS1 Proteins 0.000 claims description 10
- 101710144127 Non-structural protein 1 Proteins 0.000 claims description 10
- 238000013461 design Methods 0.000 claims description 8
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 8
- 108700001237 Nucleic Acid-Based Vaccines Proteins 0.000 claims description 7
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 claims description 6
- 108060003393 Granulin Proteins 0.000 claims description 5
- 239000002502 liposome Substances 0.000 claims description 4
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 claims description 4
- 238000001890 transfection Methods 0.000 claims description 3
- 241000831652 Salinivibrio sharmensis Species 0.000 claims description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 2
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 claims description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 claims description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 2
- 101710199771 Matrix protein 1 Proteins 0.000 claims 1
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 claims 1
- 229940126534 drug product Drugs 0.000 claims 1
- 238000010359 gene isolation Methods 0.000 claims 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 abstract description 59
- 239000007924 injection Substances 0.000 abstract description 59
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract description 58
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 5
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 abstract description 3
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 201
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 126
- 241000282339 Mustela Species 0.000 description 78
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 76
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 74
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 36
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 35
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 34
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 34
- 230000004044 response Effects 0.000 description 34
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 33
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 30
- 239000000047 product Substances 0.000 description 26
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 22
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 21
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 20
- 208000037797 influenza A Diseases 0.000 description 20
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 20
- 241000894007 species Species 0.000 description 18
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 18
- 108010006025 bovine growth hormone Proteins 0.000 description 17
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 17
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 17
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 17
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 15
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 14
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 14
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 13
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 13
- 101710102873 Polymerase basic protein 2 Proteins 0.000 description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 13
- 102100037516 Protein polybromo-1 Human genes 0.000 description 12
- 101710085035 RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit Proteins 0.000 description 12
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 12
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 12
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 12
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 12
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 11
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 11
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 11
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 11
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 11
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 11
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 11
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 11
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 10
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 10
- 210000000663 muscle cell Anatomy 0.000 description 10
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 9
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 9
- 101150118742 NP gene Proteins 0.000 description 9
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 9
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 9
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 description 9
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 9
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 9
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 9
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 9
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 9
- 206010002091 Anaesthesia Diseases 0.000 description 8
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 8
- 230000037005 anaesthesia Effects 0.000 description 8
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 8
- 230000034994 death Effects 0.000 description 8
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 8
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 8
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 8
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 8
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 8
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 8
- 101150039660 HA gene Proteins 0.000 description 7
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 7
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 7
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 7
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 7
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 7
- 108700010900 influenza virus proteins Proteins 0.000 description 7
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 7
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 7
- 241000726103 Atta Species 0.000 description 6
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 6
- OOFLZRMKTMLSMH-UHFFFAOYSA-N H4atta Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CC1=CC=CC(C=2N=C(C=C(C=2)C=2C3=CC=CC=C3C=C3C=CC=CC3=2)C=2N=C(CN(CC(O)=O)CC(O)=O)C=CC=2)=N1 OOFLZRMKTMLSMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 6
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 6
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 6
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 6
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 6
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 6
- 229960003971 influenza vaccine Drugs 0.000 description 6
- 210000003098 myoblast Anatomy 0.000 description 6
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 6
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 6
- 210000002345 respiratory system Anatomy 0.000 description 6
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 6
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 5
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 5
- 101710158312 DNA-binding protein HU-beta Proteins 0.000 description 5
- 241000712431 Influenza A virus Species 0.000 description 5
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 5
- 241000282341 Mustela putorius furo Species 0.000 description 5
- 108091092724 Noncoding DNA Proteins 0.000 description 5
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 description 5
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 5
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 5
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 5
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 5
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 5
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 5
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 5
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 5
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 5
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 5
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 5
- 108010062580 Concanavalin A Proteins 0.000 description 4
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 4
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 4
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 4
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 4
- 101150109178 M1 gene Proteins 0.000 description 4
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 description 4
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 4
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 4
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 description 4
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 4
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 4
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 4
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 4
- 230000006870 function Effects 0.000 description 4
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 4
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 4
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 4
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 4
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 4
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 4
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 description 4
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 4
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 4
- 235000003930 Aegle marmelos Nutrition 0.000 description 3
- 244000058084 Aegle marmelos Species 0.000 description 3
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 3
- 102100029241 Influenza virus NS1A-binding protein Human genes 0.000 description 3
- 229940124873 Influenza virus vaccine Drugs 0.000 description 3
- 208000032376 Lung infection Diseases 0.000 description 3
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 3
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 206010057190 Respiratory tract infections Diseases 0.000 description 3
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 3
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 3
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 3
- 108010003533 Viral Envelope Proteins Proteins 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 3
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 3
- 244000309466 calf Species 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 230000037029 cross reaction Effects 0.000 description 3
- 230000004665 defense response Effects 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 3
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 3
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 3
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 3
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 3
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 3
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 3
- -1 neuroamidase Proteins 0.000 description 3
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 3
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 3
- 229940124276 oligodeoxyribonucleotide Drugs 0.000 description 3
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 3
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 210000003314 quadriceps muscle Anatomy 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 3
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- 101150002210 34 gene Proteins 0.000 description 2
- 101150044182 8 gene Proteins 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 101100268670 Caenorhabditis elegans acc-3 gene Proteins 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 2
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 2
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 2
- 101001002657 Homo sapiens Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- 241000282567 Macaca fascicularis Species 0.000 description 2
- 241000282560 Macaca mulatta Species 0.000 description 2
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 2
- 101150076514 NS gene Proteins 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 2
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 2
- 238000000540 analysis of variance Methods 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 2
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 2
- 230000002457 bidirectional effect Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 2
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 2
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000007969 cellular immunity Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 230000004727 humoral immunity Effects 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 2
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 230000021633 leukocyte mediated immunity Effects 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 210000000107 myocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 2
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 2
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 2
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 description 2
- 231100000272 reduced body weight Toxicity 0.000 description 2
- 238000012770 revaccination Methods 0.000 description 2
- 201000009410 rhabdomyosarcoma Diseases 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 238000012353 t test Methods 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 2
- 238000007492 two-way ANOVA Methods 0.000 description 2
- 239000013026 undiluted sample Substances 0.000 description 2
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 2
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 2
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 2
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 102100022524 Alpha-1-antichymotrypsin Human genes 0.000 description 1
- 101100405319 Arabidopsis thaliana NSI gene Proteins 0.000 description 1
- AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N Arg-Thr-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 201000001178 Bacterial Pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108010072454 CTGCAG-specific type II deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 1
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N Calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 241001185363 Chlamydiae Species 0.000 description 1
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- FCKYPQBAHLOOJQ-UHFFFAOYSA-N Cyclohexane-1,2-diaminetetraacetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)C1CCCCC1N(CC(O)=O)CC(O)=O FCKYPQBAHLOOJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710118188 DNA-binding protein HU-alpha Proteins 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 102000025850 HLA-A2 Antigen Human genes 0.000 description 1
- 108010074032 HLA-A2 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 101710082439 Hemagglutinin A Proteins 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 108010088652 Histocompatibility Antigens Class I Proteins 0.000 description 1
- 102000008949 Histocompatibility Antigens Class I Human genes 0.000 description 1
- 101000678026 Homo sapiens Alpha-1-antichymotrypsin Proteins 0.000 description 1
- 108010000521 Human Growth Hormone Proteins 0.000 description 1
- 102000002265 Human Growth Hormone Human genes 0.000 description 1
- 239000000854 Human Growth Hormone Substances 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 241000713196 Influenza B virus Species 0.000 description 1
- 208000002979 Influenza in Birds Diseases 0.000 description 1
- 102000003996 Interferon-beta Human genes 0.000 description 1
- 108090000467 Interferon-beta Proteins 0.000 description 1
- 102100024319 Intestinal-type alkaline phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 101710184243 Intestinal-type alkaline phosphatase Proteins 0.000 description 1
- YQEZLKZALYSWHR-UHFFFAOYSA-N Ketamine Chemical compound C=1C=CC=C(Cl)C=1C1(NC)CCCCC1=O YQEZLKZALYSWHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150046652 M2 gene Proteins 0.000 description 1
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 description 1
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 1
- 101001091370 Mus musculus Kallikrein-8 Proteins 0.000 description 1
- 101150080862 NA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150033828 NS1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150095629 NS2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710144128 Non-structural protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101710199667 Nuclear export protein Proteins 0.000 description 1
- 108090001074 Nucleocapsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000008896 Opium Substances 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 101150084044 P gene Proteins 0.000 description 1
- 101150103639 PB1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150030427 PB2 gene Proteins 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010035737 Pneumonia viral Diseases 0.000 description 1
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 101150016222 SNAT1 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 1
- 102100036049 T-complex protein 1 subunit gamma Human genes 0.000 description 1
- WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N Thr-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 206010046306 Upper respiratory tract infection Diseases 0.000 description 1
- 241001672648 Vieira Species 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229940035674 anesthetics Drugs 0.000 description 1
- 230000003466 anti-cipated effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 229940038444 antibody-based vaccine Drugs 0.000 description 1
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000436 anus Anatomy 0.000 description 1
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 206010064097 avian influenza Diseases 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 210000002449 bone cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000010805 cDNA synthesis kit Methods 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 235000021236 calorie-restricted diet Nutrition 0.000 description 1
- 210000004413 cardiac myocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 101150062912 cct3 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N chloroform;phenol Chemical compound ClC(Cl)Cl.OC1=CC=CC=C1 YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019365 chlortetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 230000001010 compromised effect Effects 0.000 description 1
- 108091036078 conserved sequence Proteins 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 1
- 230000000139 costimulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 210000000172 cytosol Anatomy 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental effect Effects 0.000 description 1
- 239000005546 dideoxynucleotide Substances 0.000 description 1
- 108020001096 dihydrofolate reductase Proteins 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 239000013583 drug formulation Substances 0.000 description 1
- 230000002888 effect on disease Effects 0.000 description 1
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 238000012869 ethanol precipitation Methods 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000011832 ferret model Methods 0.000 description 1
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 239000003193 general anesthetic agent Substances 0.000 description 1
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N guanidinium thiocyanate Chemical compound SC#N.NC(N)=N ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000008076 immune mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 230000007233 immunological mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000006054 immunological memory Effects 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 229940031551 inactivated vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 229940033326 influenza DNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000016507 interphase Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 229940065638 intron a Drugs 0.000 description 1
- 230000002262 irrigation Effects 0.000 description 1
- 238000003973 irrigation Methods 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 229960003299 ketamine Drugs 0.000 description 1
- 101150109249 lacI gene Proteins 0.000 description 1
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 1
- 231100000636 lethal dose Toxicity 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 230000005923 long-lasting effect Effects 0.000 description 1
- 230000007787 long-term memory Effects 0.000 description 1
- 230000004904 long-term response Effects 0.000 description 1
- 238000002794 lymphocyte assay Methods 0.000 description 1
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000005075 mammary gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 1
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 210000004165 myocardium Anatomy 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- GQPLMRYTRLFLPF-UHFFFAOYSA-N nitrous oxide Inorganic materials [O-][N+]#N GQPLMRYTRLFLPF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001027 opium Drugs 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000035778 pathophysiological process Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 101150027243 pb gene Proteins 0.000 description 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 1
- 229940023041 peptide vaccine Drugs 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 229940023143 protein vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 description 1
- 230000009711 regulatory function Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 description 1
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 229940031626 subunit vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000003319 supportive effect Effects 0.000 description 1
- 230000020382 suppression by virus of host antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 210000003437 trachea Anatomy 0.000 description 1
- 238000012549 training Methods 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 244000052613 viral pathogen Species 0.000 description 1
- 208000009421 viral pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 230000007482 viral spreading Effects 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
- BPICBUSOMSTKRF-UHFFFAOYSA-N xylazine Chemical compound CC1=CC=CC(C)=C1NC1=NCCCS1 BPICBUSOMSTKRF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001600 xylazine Drugs 0.000 description 1
- 229910000859 α-Fe Inorganic materials 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/16—Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2760/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses negative-sense
- C12N2760/00011—Details
- C12N2760/16011—Orthomyxoviridae
- C12N2760/16111—Influenzavirus A, i.e. influenza A virus
- C12N2760/16122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Virology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Public Health (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Oncology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
Oblasť techniky <>
* 4 Tento vynález sa vzťahuje na výrobu a použitie nových liečivých prípravkov, nukleových kyselín, ktoré pri priamej
Λ aplikácii do živého tkaniva stavovcov indukujú imunitnú reakciu špecificky zameranú na ľudský chrípkový vírus.
Doterajší stav techniky
Chrípka je akútne horúčkovité ochorenie spôsobené * infekciou respiračného traktu chrípkovým vírusom typu A alebo B. Na celom svete dochádza takmer každý rok k hromadnému výskytu chrípky vo forme opakujúcich sa epidémií alebo pandémií. Chrípka môže spôsobiť vážne poruchy systémov ľudského organizmu, vážne ochorenie (ako vírusový zápal pľúc) vyžadu. júci hospitalizáciu a komplikácie takého typu, ako je druhotný bakteriálny zápal pľúc. Nedávne epidémie v Spojených . štátoch amerických viedli pravdepodobne k viac než 10 000 (až k 40 000) úmrtiam ročne a k 5 000 až 10 000 úmrtiam ročne v rokoch bez epidémií. Najlepšou stratégiou v prevencii vysokej úmrtnosti a v ochorení spojenom s chrípkou je očkovanie. Súčasné vakcíny sú odvodené od vírusov pestovaných na kuracích zárodkoch a potom inaktivovaných. Tieto vakcíny zahrňujú tri kmene chrípkových vírusov (dva kmene A a jeden B kmeň). V súčasnej dobe sú k dispozícii tri typy dosiaľ patentovaných vakcín: Vakcíny obsahujúce celý vírus, vírusové segmenty alebo samotný povrchový antigén. Na očkovanie 'ti detí sa používajú len vakcíny obsahujúce len vírusové segs ? menty alebo povrchové antigény vzhľadom na búrlivé horúčkovité reakcie detského organizmu na vakcíny obsahujúce celé vírusy. U detí mladšie ako 9 rokov je nutné vykonať dvojité očkovanie, u dospelých stačí len jednorázová aplikácia vakcíny. Bolo však navrhnuté (viď. Medical Letter 32: 89 až 90,
17. september 1993), že by bola pre pacientov, očkovaných na jeseň výhodná ďalšia dávka vakcíny v zime alebo na začiatku jari, vzhľadom na zistenia u niektorých starších « pacientov, ktoré ukazujú, že titer protilátok po očkovaní sa
4, môže počas štyroch mesiacov alebo aj menej znížiť pod hladií nu obranyschopnosti. Tieto vakcíny sú zostavované každý rok . podľa predpokladu, ktorý kmeň vírusu bude v tom roku klinicky cirkulovať a na základe odhadu, ktorý z vírusov bude , v nadchádzajúcom období prevládať. Preočkovanie sa doporučuje vykonávať každý rok.
A. Obmedzenia vyrábaných vakcín sú nasledujúce:
'N
1) Variabilita vedie zvlášť u chrípkového kmeňa A k vzniku í vírusov, ktoré nie sú neutralizované protilátkami vytvorenými predchádzajúcim očkovaním (alebo predchádzajúcou infekciou) . Nové kmene vznikajú bodovou mutáciou (driftom antigénov) a preskupením (shiftom antigénov), kódujúcich povrchové ‘ glykoproteíny (hemaglutinín [HA] a neuroamidázu), zatiaľ čo vnútorné proteíny sú vo veľkej miere konzervované v driftovaných a shiftovaných kmeňoch. Očkovanie vyvoláva imunitu na základe homológnych kmeňovo špecifických protilátok a nie na základe heterológnej” skupinovej imunity sprostredkovanej bunkami.
2) Aj keď prevládajúci kmeň vírusu počas roka nijako významne nedriftuje ani neshiftuje musí sa očkovanie vykonávať každý rok znova, pretože titer protilátok sa znižuje. Hoci niektoré zdroje uvádzajú, že protilátky inhibujúce hemaglutinín (Hl) a neutralizujúce protilátky vydržia od niekoľkých mesiacov až po niekoľko rokov, kedy sa potom ich titer postupne znižuje, predpisy Advisory Committee on Iramunization Practices uvádzajú pokles titra protilátok v roku po očkovaní ako dôvod na každoročné preočkovanie, a to aj vtedy, ak nedošlo k žiadnemu významnému driftu alebo shiftu. (Hl protilátky znižujú schopnosť chrípkového vírusu aglutinovať červené krvinky. Podobne ako neutralizujúce protilátky sú tieto Hl protilátky namierené proti antigénu HA. Testy inhibície hemaglutinínu sú ľahšie na vykonanie a lacnejšie než testy na neutralizáciu, takže sú častejšie používané ako metódy na vyhodnocovanie schopnosti protilátok vytvorených proti jednému kmeňu chrípkového vírusu reagovať s odlišným kmeňom). Ako už bolo vyššie uvedené, viď. Medical Letter, mali by byť vysoko rizikoví starší pacienti očkovaní dvakrát za sezónu vzhľadom na ich krátkodobý titer obranných protilátok.
3) Účinnosť očkovania nie je optimálna. Vytvorenie vakcíny na ďalšie obdobie je založené na odhade prichádzajúceho cirkulujúceho kmeňa (prostredníctvom vyhodnocovania vzoriek v Ázii), čo je nepresné a môže viesť k neúplnej zhode medzi kmeňmi použitými pre vakcínu a medzi tými, ktoré potom v teréne skutočne kolujú. Naviac môžu nastať situácie, ako počas chrípkovej sezóny roku 1992 až 1993, kedy sa nový kmeň H3N2 (A/Beijing/92) klinicky prejavil až na konci chrípkovej sezóny. Jeho výskyt vyvolal okamžitú zmenu zloženia vakcíny pre rok 1993 až 1994, pretože krížová reakcia A/Beijing/92 s protilátkami, vytvorenými podľa predchádzajúceho kmeňa H3N2 (A/Beijing/89) bola veľmi slabá práve z dôvodu prebehnutého antigénneho shiftu. Avšak vzhľadom na dĺžku doby potrebnú na prípravu a formuláciu súčasnej patentovanej vakcíny, nemohla byť vakcína proti novému kmeňu zavedená počas sezóny 1992 až 1993 aj napriek početným dôkazom slabej ochrany poskytovanej používanou vakcínou a aj napriek zvyšujúcej sa virulencii nového kolujúceho vírusu kmeňa H3N2.
Aj keď táto vakcína súhlasí s kmeňom vírusu, proti ktorému je vytvorená, poskytuje súčasná patentovaná vakcína ochranu len pred približne 70 % ochorení zdravých detí ξ
i ι rf a dospelých v mladom veku a 30 až 40 % oslabených starších ' dospelých osôb. Preto sú na vyhodnotenie účinnosti vakcíny vytvorenej proti kmeňu, ktorý v populácii koluje, používané iné kritéria. Tieto kritéria zahrňujú prevenciu vážneho ochorenia a druhotných komplikácii, ktoré sa odrážajú v prevencii hospitalizácie (70 % starších osôb, žijúcich vo svojich domovoch proti 50 až 60 % starších osôb, žijúcich v domovoch dôchodcov) a v prevencii úmrtia (80 % pre obyvateľov domovov dôchodcov). Hromadná imunita vedúca k znižovaniu
- rozšírenia infekcie v domovoch dôchodcov je taktiež považovaná za ďalší prínos očkovania.
V
B. Charakteristika ideálnej univerzálnej vakcíny proti chrípkovému vírusu (predmet vynálezu):
1) Vytvorenie obrany proti skupine vírusov (heterológna obrana). Univerzálna vakcína by bola schopná ochrániť proti rôznym kmeňom vírusu, napríklad v rozmedzí subtypov H3N2 a možno aj proti všetkým subtypom, ako nap. od H1N1 k H3N2.
' Obrana by bola pravdepodobne sprostredkovaná cytotoxickými
T-lymfocytmi (CTL) rozpoznávajúcimi antigény z vnútorných konzervovaných vírusových proteínov aj keď určitú úlohu by mohli hrať aj neutralizujúce protilátky vytvorené proti konzervovanej časti proteínov viazaných na membrány.
2) Rozšírená reakcia protilátok. Pretože sa predpokladá, že CTL majú vplyv na uzdravenie z choroby, mala by vakcína založená výhradne na odpovedi CTL skracovať dobu choroby (snáď až do zachytenia subklinických prejavov choroby), ale neposkytovala by kompletnú ochranu proti ochoreniu. Experimenty ukázali, že súčasný výrobný postup pre vakcínu proti chrípkovému vírusu pasážovaním v kuracích zárodkoch má schopnosť selekcie vírusovej subpopulácie,, ktorá zmenila svoje HA antigény. Tak môže byť znížená účinnosť vakcíny, pretože protilátky vyvolané takouto vakcínou nemusia byť celkom účinné proti práve prevládajúcemu kmeňu. Preto by bolo výhodné vytvoriť protilátky, ktoré by mali v porovnaní (so súčasnými vakcínami rozšírený záber imunitnej odpovede.
Chrípková sezóna 1992 až 1993 poskytla výborný príklad obmedzenia súčasných vakcín a to na vakcíne využívajúcej na tvorbu protilátok kmeň A/Beijing/89. Takto vytvorené protilátky potom zle reagovali v krížovej reakcii (a mali preto slabé ochranné účinky) s novým a ovela virulentnejším kmeňom A/Beijing/92. Oba kmene sú typy H3N2, t.j. rovnaký subtyp. Pokiaľ sa však jedná o sekvenciu aminokyselín, líšia sa kmene podobné A/Beijing/92 od kmeňov podobných A/Beijing/89 s len v 11 bodových mutáciách (miesta 133, 135, 145, 156, 157,
186, 190, 191, 193, 226 a 262) v oblasti ΗΑ1. Nie je známe, či súčasný výrobný postup ovplyvnil nedostatočnú odpoveď i
v krížovej reakcii, ale je celkom jasné, že je potrebné rozšíriť rozsah reakcie protilátok.
3) Predĺžené trvanie protilátkovej odpovede. Pretože skupiny, ktoré sú v najväčšom nebezpečenstve, pokiaľ ide o ochorenie chrípkovým vírusom a úmrtnosť, (t.j. starší ľudia), sú [ taktiež skupiny, v ktorých titer obranných protilátok klesá [t príliš prudko na to, aby bolo očkovanie raz ročne účinné, mala by vylepšená vakcína vytvoriť protilátky, ktorých titer by vydržal dlhšie.
C. Polynukleotidy ako vakcína
I
Ukázalo sa, že vnútrosvalová aplikácia polynukleotidových konštrukcií, t.j. DNA plazmidov kódujúcich proteíny, vedie in situ k tvorbe týchto proteínov v svalových bunkách. Použitím plazmidov cDNA kódujúcich vírusové proteíny sa dosiahla tak tvorba protilátok, ako aj tvorba CTL, ktoré poskytovali homológnu a heterológnu ochranu proti následnému útoku niektorého homológneho alebo kríženého kmeňa. Každý typ imunitnej odpovede poskytuje nejakú potenciálnu výhodu proti súčasným očkovacím stratégiám. Použitie PNV na produkciu protilátok môže viesť k predĺženiu doby imunitnej odpovede a k poskytovaniu antigénov, ktoré môžu obsahovať nielen presnú sekvenciu klinicky kolujúceho kmeňa vírusu, ale aj vhodné post-translačné úpravy a konformácie natívneho proteínu (viď. rekombinantný proteín). Vznik odpovede CTL týmto spôsobom prináša výhodu v podobe ochrany pred kríženými kmeňmi bez použitia živých a potenciálne patogénnych vektorov alebo oslabených vírusov.
D. Preto hlavným nepriateľom vývoja vakcín proti takýmto vírusom ako je chrípkový vírus (t.j. vírusom, proti ktorým sa vytvárajú neutralizujúce protilátky), je rôznorodosť proteínov vírusových obalov rôznych izolovaných vírusov alebo kmeňov. Pretože tak myši, ak aj ľudské cytotoxické T-lymfocyty, majú schopnosť rozpoznávať epitopy odvodené od konzervovaných vnútorných vírusových proteínov [J. V. Yewdell a kol., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 82, 1785 (1985); A. R. M. Townsend a kol., Celí 49, 959 (1986); A. J. McMichael a kol., J. Gen. Virol. 67, 719 (1986); J. Bastin a kol., J. Exp. Med. 165, 1508 (1987); A. R. M. Townsend a H. Bodmer, Annu. Rev. Immunol. 7, 601 (1989)] a hrajú zrejme významnú úlohu v imunitnej reakcii na vírusy [Y. L. Lin a B. A. Askonas, J. Exp. Med. 154, 225 (1981); I.
Gardner a kol., Eur. J.
a G. L. Ada, Náture 273,
New Engl. J. Med. 309,
Immunol. 4, 68 (1974); K. L. Yap
238 (1978); A. J. McMichael a kol., (1983); P. M. Taylor a B. A.
Askonas. Immunol. 58, 417 (1986)], bolo úsilie zamerané na vývoj CTL vakcín schopných poskytovať heterológnu obranu proti rôznym vírusovým kmeňom.
CD8+ CTL bunky zabíjajú bunky infikované vírusom, ak receptory týchto T-lymfocytov rozpoznávajú vírusové peptidy, pripojené na MHC proteíny I. triedy [R. M. Zinkernagel a P. C. Doherty, tiež tam 141, 1427 (1975); R. N. Germain, Náture 353, 605 (1991)]. Tieto peptidy sú odvodené od endogénne syntetizovaných vírusových proteínov bez ohľadu na umiestnenie a funkciu proteínu vo víruse. Tak môžu CTL poskytnúť ochranu pred skríženými kmeňmi tým, že rozpoznávajú epitopy konzervovaných vírusových proteínov. Peptidy majúce schopnosť spojenia s MHC proteínmi I. triedy, ktoré je dôležité na ďalšie rozpoznávanie cytotoxickými T-lýmfocytmi, sú odvo'í >(
Λdené od proteínov, ktoré sú prítomné v cytoplazme alebo endoplazmatickom retikule alebo nimi prechádzajú [J. V. Yewdell a J. R. Bennink, Science 244, 1072 (1989); A. R. M. Townsend a kol., Náture 340, 443 (1989); J, G. Nuchtern a kol., Náture 339, 223 (1989)]. Všeobecne povedané nie sú teda exogénne proteíny, ktoré vstupujú do endozomálneho procesu (ako v prípade MHC proteínov 2. triedy), účinné na vyvolávanie CD8+ CTL odpovede.
Úsilie o vyvolanie CTL reakcie bolo väčšinou zamerané na použitie buď replikačných faktorov na tvorbu proteínov antigénu v bunke [J. R. Bennink a kol, tiež tam 311, 578 (1984); J. R. Bennink a J. V. Yewdell, Curr. Top. Microbiol. Immunol. 163, 153 (1990); C. K. Stover a kol, Náture 351, 456 (1991); A. Aldovini a R. A. Young, Náture 351, 479 (1991); R. Schafer a kol., J. Immunol. 149, 53 (1992); C. S. Hahn a kol., Proc. Natl. Acad. Sci (USA) 89, 2679 (1992)] alebo sa zameralo na zavedenie peptidov do cytozolu [F. R. Carbone a M. J. Bevan, J. Exp. Med. 169, 603 (1989); K. Dereš a kol., Náture 342, 561 (1989); H. Takahashi a kol., tiež tam, 344, 873 (1990); D. S. Collins a kol., J. Immunol. 148, 3336 (1992); M. J. Newman a kol. tiež tam, 148, 2357 (1992)]. Oba tieto prístupy majú svoje obmedzenia, ktoré môžu znižovať ich využitie na vakcináciu. Retrovírusové vektory sú obmedzené vo svojej veľkosti a štruktúre polypeptidov, ktoré môžu byť exprimované ako fúzne proteíny pri zachovaní schopnosti replikácie rekombinantného vírusu [A. D. Miller, Curr. Top. Microbiol. Immunol. 158, 1 (1992)] a účinnosť takýchto vektorov ako je vakcínia pre následnú imunizáciu môže byť ohrozená imunitnými reakciami proti samotným vektorom [E. L. Cooney a kol., Lancet 337, 567 (1991)]. Vírusové vektory a upravované patogény so sebou nesú riziká, ktoré môžu byť prekážkou ich použitia pre ľudské organizmy [R. R. Redfield a kol., New Engl. J. Med. 316, 673 (1987); L. Mascola a kol., Árch. Intern. Med. 149, 1569 (1989)]. Výber epitopov, ktoré majú byť vystavené, je závislý na štruktúre jednotlivých MHC proteínov, takže účinnosť peptidovej vakcíny môže byť limitovaná vzhľadom na rôznorodosť MHC haplotypov v outbredných populáciách. Benvenisty, N. a Reshef, L. [PNAS 83, 9551 až 9555, (1986)] ukázali, že DNA precipitovaná CaC12 a zavedená do myší intraperitoneálne, vnútrožilovo alebo vnútrosvalovo, sa môže exprimovať. Vnútrosvalové injekcie (i.m.) DNA expresívnych vektorov aplikované na myšiach viedli k príjmu DNA svalovými bunkami a k expresii génov nesených danou DNA [J. A. Volff a kol., Science 247, 1465 (1990); G. Ascadi a kol., Náture 352, 815 (1991)]. Ukázalo sa, že plazmidy boli udržované epizomálne a nereplikovali sa. Ďalšia vytrvalá expresia bola pozorovaná po vnútrosvalovej injekcii do kostrového svalstva laboratórnych potkanov, rýb a primátov a ďalej do srdcového svalstva laboratórnych potkanov [H. Lin a kol., Circulation 82, 2217 (1990); R. N. Kitsis a kol., Proc.
Natl. Acad. Sci (USA) 88, 4138 (1991); E. Hansen a kol.,
FEBS Lett. 290, 73 (1991); S. Jiao a kol., Hum. Gene Therapy 3, 21 (1992); J. A, Volff a kol., Huraan Mol. Genet. 1, 363 (1992)]. Techniky na využitie nukleových kyselín ako liečivých prostriedkov boli opísané vo V090/11092 (4. októbra 1990). V tomto projekte boli nukleové kyseliny použité na očkovanie stavovcov.
Pre úspešnosť metódy nie je bezpodmienečne nutná vnútrosvalová aplikácia vakcíny. Táng a kol. [Náture 356, 152 až 154 (1992)] opísali zavedenie zlatých mikroprojektílov obalených DNA kódujúcou rastový hormón hovädzieho dobytka (BGH) do kože myší, ktoré u týchto myší viedlo k produkcii protilátok anti-BGH. Furth a kol. [Analytical Biochemistry, 205, 365 až 368, (1992)] dokázal, že na transfekcíu kože, svalu, tuku a tkaniva mliečnych žliaz u živých zvierat môžu byť použité tryskové injekcie. V poslednej dobe Friedman, T., [Science. 244, 1275 až 1281 (1989)] opísal rôzne metódy zavádzania nukleových kyselín. Viď. napríklad Robinson a kol., Súbor abstraktov, uvedených pri príležitosti stretnutia 1992 Modern Approaches to New Vaccines, Including Prevention of AIDS, Cold Spring Harbor, str. 92, ktoré opisujú vnútrosvalovú, vnútrožilovú a intraperitoneálnu aplikáciu DNA vtáčej chrípky do kurčiat, ktorá viedla k údajnej obrane proti smrteľnému vývoju ochorenia. Tieto materiály však neopisujú, ktoré gény vírusu vtáčej chrípky boli použité a naviac sa tu uvádzajú len špecifické imunitné odpovede H7 bez akejkoľvek zmienky o indukcii obrany proti kríženým kmeňom.
Podstata vynálezu
Tento vynález teda nie je založený na žiadnej zo známych metód na zavádzanie nukleových kyselín do živého tkaniva za účelom vyvolania expresie proteínov. Tento vynález opisuje metódu zavádzania spracovania antigénov za T-lymfocytov špecifických vynález uspokojuje potrebu vírusových proteínov do dráhy účelom vytvorenia cytotoxických pre určitý vírus. Preto tento volajúcu po špecifických liečeb ných prostriedkoch proti chrípkovému vírusu, ktoré by mali schopnosť vyvolávať požadovanú profylaktickú imunitnú odpo veď na vírusové patogény. Zvlášť dôležitou časťou tohto liečebného postupu je možnosť indukcie imunitnej odpovede prostredníctvom T buniek, ktorá môže zabrániť infekcii aj v takých prípadoch, kedy je kmeň heterológny s kmeňom, z ktorého bol antigén konštrukcie kódujúce ľudského chrípkového získaný. Tento vynález opisuje DNA vírusové proteíny nukleoproteínu vírusu (NP), hemaglutinínu (HA), neuro-amidázy (NM), matricového proteínu (M), neštruktúrny proteín (NS), polymerázu (PB1 a PB2 = bázické polymerázy a 2; PA = kyslá polymeráza) alebo ďalšie gény chrípkového vírusu kódujúce produkty, ktoré vyvolávajú tvorbu špecifických CTL.
Chrípkový virus má genón tvorený ribonukleovou kyselinou (RNA) zložený z niekoľkých segmentov RNA. Každý segment RNA kóduje aspoň jeden génový produkt. NP génový produkt sa viaže na RNA a sprostredkováva premiestnenie vírusovej RNA do jadra infikovanej bunky. Sekvencia tohto produktu je konzervovaná a za 50 rokov sa v jej sekvencii aminokyselín objavilo len 7 % odchyliek. P génové produkty (PB1, PB2, PA) sú zodpovedné za syntézu nových vírusových RNA. Tieto gény
sú dokonca ešte viac konzervované než gén NP. HA je hlavným produktom vírusového génu pre obal vírusu. Je menej konzervovaný než NP. Viaže bunkový receptor a slúži teda na iniciáciu novej chrípkovej infekcie. Hlavná reakcia neutralizačných protilátok je zameraná proti produktu tohto génu. Zároveň je proti tomuto proteínu zameraná výrazná reakcia T-lýmfocytov. Súčasné vakcíny proti ľudskému chrípkovému vírusu obsahujú tri druhy chrípkového vírusu alebo ich HA proteíny. Avšak vzhľadom na zmienenú variabilitu sekvencie HA proteínov v rôznych druhoch chrípkových vírusov musia byť tieto vakcíny neustále upravované podľa toho druhu patogénneho vírusu, ktorý práve koluje v populácii. Hemaglutinín má však niektoré zakonzervované elementy pre generácie cytotoxických T-lýmfocytov, ak je správne prezentovaný. Biologické funkcie génových produktov NS1 a NS2 nie sú celkom objasnené, ale tieto proteíny môžu hrať významnú úlohu vo vyvolávaní obrannej reakcie CTL. Konečne produkty génov Ml a M2, ktoré sú trochu viac konzervované než HA, vyvolávajú hlavnú reakciu cytotoxických leukocytov. Ml protein je veľmi výdatný produkt vírusových génov.
Účinnosť ochrany vakcínou DNA pred následným napadnutím vírusom sa prejaví očkovaním nereplikujúceho sa plazmidu DNA, kódujúceho jeden alebo viac z vyššie uvedených vírusových proteínov. Tento spôsob je veľmi výhodný, pretože do postupu nie je začlenená žiadna infekčná zložka, nie je potrebné zostavenie žiadnych vírusových partikúl a je umožnený rozhodujúci výber. Pretože sekvencie nukleoproteínu a niekoľkých ďalších vírusových produktov sú konzervované v niekoľkých rôznych druhoch chrípkového vírusu, poskytuje takáto vakcína naviac obranu proti následnému napadnutiu virulentným druhom chrípkového vírusu, ktorý je homológny alebo heterológny s druhom vírusu, z ktorého bol gén získaný a klonovaný.
DNA konštrukcie majúce schopnosť expresie po priamom zavedení buď injekciou alebo iným spôsobom do živočíšneho tkaniva, sú novými profylaktickými liečebnými prípravkami.
Indukuj ú tvorbu špecifických cytotoxických T-lymfocytov, [ ktoré na rozdiel od protilátok, zameraných na jediný druh vírusu rozpoznávajú vírusové antigény a reagujú na rôzne druhy vírusov. Tvorba takýchto CTL in vivo obyčajne vyžaduje
Í í endogénnu expresiu daného antigénu, ako je tomu v prípade vírusovej infekcie. Na tvorbu vírusového antigénu, ktorý by bol prezentovaný imunitným systémom bez obmedzení, daných priamou dopravou peptidu alebo použitím vírusových vektorov, bola plazmidová DNA kódujúca proteíny ľudského chrípkového vírusu injektovaná do štvorhlavého svalu myší BALB/c. Tieto injekcie vyvolali tvorbu vírusovo špecifických CTL a obranu
- proti následnému napadnutiu heterológnym kmeňom chrípkového vírusu. Obranyschopnosť bola zobrazená znižujúcim sa titrom ‘ vírusu v pľúcach, potlačením úbytku telesnej hmotnosti a zvýšeným počtom prežívajúcich. U makakov rhesus sa dosiahol vysoký titer protilátok proti hemaglutinínu a protilátok proti nukleoproteínu a u fretiek bol pozorovaný znížený * titer vírusu v nosnom výplachu po napadnutí homológnymi aj f
j heterológnymi druhmi.
í
I ' Kľúčové pozorovania vzťahujúce sa k vynálezu:
j 1) Dôkaz účinnosti. Po imunizácii DNA pre nukleoproteín (NP) je pozorovateľná heterológna ochrana, ktorá sa prejavuje zvýšeným počtom prežívajúcich, zníženým titrom pľúcnych vírusov a inhibíciou úbytku telesnej hmotnosti u myší napadnutých druhom chrípkového vírusu odlišného od druhu vírusu, ktorý slúžil ako zdroj NP génov. V tomto prípade boli povrchové proteíny týchto dvoch kmeňov značne odlišné (H1N1 vs. H3N2) a súčasný druh vznikol 34 rokov po vzniku počiatočného druhu vírusu. Imunizácia fretiek DNA NP génov a DNA pre matricový proteín (Ml) buď oddelene, spolu alebo v spojení s HA DNA, poskytovala ochranu (znížené šírenie nosných vírusov) proti napadnutiu pozmeneným druhom (klinickým izolátom). Najmä obrana poskytovaná zmesou DNA (NP a Ml DNA, kódujúca proteíny Beijing/89 a HA DNA, kódujúca buď Beijing/89 alebo Hawaii/91 HA) bola u fretiek proti driftovanému druhu (Georgia/93) vyššia, než akú poskytujú patento- 12 Ivané vakcíny (obsahujúce Beijing/89). Ukázalo sa, že zmes obsahujúca HA DNA z Hawaii/91 bolo o niečo účinnejšia než zmes obsahujúca HA DNA z Beijing/89. Ochrana získaná pomocou zmesi zahrňujúcej HA DNA pre Hawaii/91 viedla k ochrane totožnej s tou, ktorá bola pozorovaná u homológnej HA DNA (Georgia/93), zatiaľ čo zmes s HA DNA pre Beijing/89 sa od tejto homológnej ochrany líšila, aj keď bola stále výrazne lepšia než u patentovaných vakcín. Protilátky Hl sa tvorili u všetkých testovaných druhov vrátane myší, fretiek, makakov a afrických opíc.
2) Doba účinnosti. Štúdie používajúce DNA kódujúcu reporté• rový gén opisujú pretrvávanie DNA s expresiu proteínu po dobu najmenej 1,5 roka (najdlhšie pretrvávala v testovaných • myšiach; Volff a kol. Human Mol. Genet., 1992). Takže pokiaľ sú produkty génov chrípkových vírusov taktiež vytrvalo * exprimované, potom by aj výsledná imunitná odpoveď mala
J vydržať. protilátky a CTL (Yankauckas a kol., DNA & Celí í Biol., 1993) a homológna ochranná imunita (údaje MRL) vyvolané injekciami DNA u myší taktiež pretrvávali po dobu dlhšiu než jeden rok. Doterajšie testy makakov dokázali ί pretrvávanie protilátok po dobu najmenej jedného roku. Dĺžka f
’ ‘ reakcie CTL a heterológnej ochrany (vyšší počet prežívajú! cich) je 6 mesiacov (zatiaľ najdlhšia doba). Došlo k miernemu poklesu stupňa heterológnej ochrany, ale táto obrana sa dá zvýšiť.
3) Dávkovanie. Testy vykonávané na opiciach (makak rhesus) <Í ukázali, že dve dávky so 100 pg HA DNA viedli k dobrému titru protilátok Hl, ktoré pretrvávajú dosiaľ po dobu jedného roku. Tvorba obranných látok (zvýšený počet prežívajúcich po následnom heterológnom napadnutí) u myší bola pozorovaná už pri dávkach 6 pg (podané 3 krát) a po jedinej injekcii obsahujúcej 200 pg. Všeobecne sa dá povedať, že vyšší počet injekcií (až na 3) zvyšoval stupeň ochrany. Prvotné štúdie ukázali, že 2 injekcie s 10 pg alebo 100 pg DNA kódujúcej 3 HA, NP a Ml (pre gény H3N2 Beijing/89) viedli k titru Hl í
protilátok podobnému titru vyvolanému dosiaľ patentovanými j vakcínami. Je veľmi dôležité si uvedomiť, že všetky testovali né zvieratá neprišli s chrípkovým vírusom nikdy do styku, í
zatiaľ čo cieľová klinická populácia (starší ľudia) má s chrípkou už skúsenosti. (Nezabudnite, že deti mladšie ako 9 rokov dostávajú 2 injekcie dosial patentovaných vakcín).
Tento vynález opisuje liečebné prípravky z nukleových kyselín, ktoré ak sú zavedené do živočíchov vrátane stavovcov ako cicavcov a človeka, v nich vyvolávajú expresiu proteínov kódovanými týmito kyselinami. Týmito proteínmi sú s tie proteíny, ktoré sa v živočíšnom organizme za normálnych okolností nevyskytujú okrem patologického stavu. Jedná sa ? o proteíny ako chrípkový nukleoprotein, neuroamidázu, hemaglutinín, polymerázu, matricový proteín alebo neštruktúrne proteíny, ale nielen oni. Imunitný systém živočícha je po týchto prípravkoch aktivovaný na tvorbu obrannej reakcie. Pretože tieto exogénne proteíny sú produkované vlastnými tkanivami daného živočícha, sú exprimované proteíny v organizme spracované a prezentované prostredníctvom hlavného histokompatibilného komplexu, MHC. Toto rozpoznávanie je totožné s mechanizmami, ktoré prebiehajú pri skutočnej infekcii daného organizmu. Výsledkom je indukcia imunitnej odpovede, ktorá chráni proti vírusovej infekcii. Dokumentácia k týmto výsledkom je uvedená v prílohe.
Tento vynález opisuje nukleové kyseliny, ktoré po zavedení do tkaniva živočícha in vivo očkovaním, inhaláciou alebo na základe podobného mechanizmu (viď. Doterajší stav . techniky) vyvolajú expresiu génov ľudského chrípkového vírusu. Tak napríklad očkovaním konštrukcie DNA podľa tohto vynálezu do svalu myší vyvolá expresiu kódovaných génových produktov. Podobne tomu je u fretiek a makakov. U živočíchov očkovaných polynukleotidovou vakcínou bola po napadnutí virulentným chrípkovým vírusom v dávkach, ktoré jednoznačne usmrcovali kontrolné zvieratá, dokázaná nižšia chorobnosť aj úmrtnosť. Tento vynález teda opisuje očkovanie použiteľné pre ľudský organizmus a zabraňujúci nákaze chrípkovým vírusom .
Ukázali sme, že DNA konštrukcie kódujúce proteíny chrípkových vírusov vyvolávajú u zvierat imunitnú odpoveď. Ako bude ďalej bližšie vysvetlené, imunitné odpovede myší zahrňovali tvorbu protilátok a CTL, u fretiek a primátov tvorbu protilátok a poskytovali u myší a fretiek obranu proti napadnutiu homológnymi, t.j. driftovanými alebo shiftovanými, kmeňmi chrípkových vírusov. Pravdepodobne naj prekvapujúcejším výsledkom očkovania DNA kódujúcou vírusové proteíny bola schopnosť poskytnúť obranu proti odlišným typom chrípkového vírusu. Z tohto vyplýva, že pridanie zložiek vyvolávajúcich tvorbu CTL do vakcíny by malo slúžiť na potlačenie účinku nových variant vírusov, ktoré sa objavujú v priebehu sezóny alebo ktoré nie sú dobe prípravy vakcíny, ktorá sa pripravuje pre ďalší nasledujúci rok, ešte známe. Dôležitým faktorom je, že očkovanie vektormi cDNA kódujúcimi gény HA, NP a Ml poskytovalo fretkám obranu proti driftovanému druhu vírusu, ktorá bola účinnejšia než u už patentovaných vakcín. Táto skutočnosť hovorí v prospech používaných konštrukcií kódujúcich celé gény v PNV.
Jedným z uskutočnení tohto vynálezu je vakcína, obsahujúca samotné plazmidy DNA, napríklad z troch prevládajúcich klinických kmeňov predstavovaných vírusmi A/H1N1 (A/Texas/91), A/H3N2 (A/Georgia/93) a B (B/Panama/90) a z konštrukcii DNA kódujúcich vnútorné konzervované proteíny NP a Ml (matrix) tak z druhov A (Beijing/89; H3N2), ako aj z kmeňov B, aby tak poskytovali súčasnú obranu proti driftovaným a shiftovaným antigénom. Molekuly HA DNA povedú k tvorbe HA a k výsledným neutralizačným protilátkam proti HA. Toto pôsobenie bude druhovo špecifické so širším záberom obrany proti driftovaným druhom v porovnaní s už patentovanými vakcínami, založenými na proteínoch. Konštrukcie NP a Ml povedú k tvorbe CTL, ktoré budú poskytovať obranu proti rôznym druhom vírusov pri potenciálne nižšom vírusovom zaťažení a s rýchlym priebehom uzdravenia z ochorenia. Predpokladané pretrvávanie DNA konštrukcií (v epizomálnej, nereplikujúcej sa a neintegrujúcej sa forme v svalových bunkách) by malo v porovnaní so súčasnými vakcínami poskytnúť predĺženú ochranu.
Predpokladané výhody oproti súčasným vakcínam zahrňujú: širší záber obrany vzhľadom na tvorbu CTL +/- väčšiu šírku : protilátok, predĺženú dĺžku trvania ochrany. Použitie PNV nevyžaduje vytvorenie, selekciu a rozmnožovanie určitého druhu vírusu, tak ako sa to vykonáva pre súčasné vakcíny, pretože nové konštrukcie DNA môžu byť vytvorené priamo z izolátov z klinickej praxe.
V jednom z uskutočnení tohto vynálezu je nukleoproteín ľudského chrípkového vírusu NP a jeho sekvencia získaný • z druhu A/PR/8/34 a klonovaný do expresívneho vektora. Vektor obsahuje promótor na transkripciu RNA polymerázy a ter: minátor transkripcie sekvenciu kódujúcu NP. V jednom uskutočnení je týmto promótorom LTR časť vírusu RSV (Rous ' sarcoma vírus), ktorá je silným transkripčným promótorom.
Častejším promótorom je promótor cytomegalovírusu s intróno, ’ vou sekvenciou A (CMT-intA). Používaným terminátorom transί kripcie je terminátor hovädzieho rastového hormónu, BGH.
j Zvlášť výhodná je ako terminátor kombinácia oboch terminátorov CMVintA-BGH. Ďalej na uľahčenie farmaceutickej prípravy prípravku je do expresívneho vektora väčšinou zahrnutý signálny znak pre rezistenciu na antibiotiká. Na tieto účely je možné použiť gény na rezistenciu voči ampicilínu, neomycínu alebo akýkoľvek ďalší signálny znak na rezistenciu voči ďalším farmaceutický prijateľným antibiotikám. Vo výhodnom uskutočnení tohto vynálezu kóduje signálny znak na rezistenciu na antibiotiká produkt na neomycínovú rezistenciu. Ďalej je výhodné na účely farmaceutickej výroby v prokaryotických organizmoch, aby vektor obsahoval začiatok replikácie a bol prítomný vo vysokom počte kópií. Tieto vlastnosti má ktorýkoľvek komerčne dostupný prokaryotický klonovací vektor. V uvedenom uskutočnení tohto vynálezu boli tieto funkcie i zabezpečené komerčne dostupnými vektormi označovanými pUC.
Je vhodný odstrániť nedôležité sekvencie DNA, preto sú v jednom z uskutočnení tohto vynálezu z pUC plazmidu odstránené sekvencie kódujúce lacZ a lacl.
V jednom z uskutočnenia tohto vynálezu je použitý ako
J expresívny vektor pnRSV, pričom LTR sekvencia RSV je použitá ‘ ako promótor. V inom uskutočnení tohto vynálezu, VI, je pouf žitý mutovaný vektor pBR322, do ktorého bolí klonované CMV promótor a transkripčný terminátor BGH. Konštrukcia VI-NP bola použitá na očkovanie myší a indukciu CTL, ktoré ochraňujú proti rôznorodej nákaze. Vo zvlášť výhodnom uskutočnení tohto vynálezu boli zložky VI kombinované pri príprave expresívneho vektora označeného VIJ. Do VIJ je klonovaný gén chrípkového vírusu ako napríklad A/PR/8/34 NP, PB1, NS1, HA, PB2 alebo gén Ml. V inom uskutočnení vynálezu je však gén , pre ampicilínovú rezistenciu vo V1J nahradený génom pre neomycínovú rezistenciu, čím vznikol vektor VIJ-neo • (SEKV.ID:18:, obr. 7), do ktorého bolo na účely tohto vynálezu klonovaných niekoľko rôznych génov chrípkových vírusov.
- V ďalšom uskutočnení tohto vynálezu bol použitý vektor
VlJns, ktorý je rovnaký ako VIJ až na to, že do jednoduchého • reštrikčného miesta KpnI v polohe 2114 vo VIJ-neo bolo vložené reštrikčné miesto Sfil. Výskyt miest Sfil v ľudskej í genómovej DNA je veľmi nízky (približne 1 miesto na 100 000 ’ báz). Tak tento vektor umožňuje starostlivé sledovanie 1 integrácie expresívneho vektora do hostiteľskej DNA len , štiepením extrahovanej DNA pomocou reštriktázy Sfil. V ďalK šej úprave je vektorom VÍR. V tomto vektore bolo odstrihnuté čo najväčšie množstvo nepotrebnej DNA, aby sa získal vysoko kompaktný vektor. Tento vektor je odvodený od VlJns a je uvedený ba obrázku 36 (SEKV.ID:45:). Tento vektor umožňuje zavedenie väčších inzertov so zníženým rizikom nežiadúcich kódujúcich sekvencii a optimalizuje príjem bunkami, keď je konštrukcia kódujúca špecifické gény chrípkových vírusov zavedená do okolitého tkaniva. Na obrázku 36 sú časti VIJ-neo (obr. 7), ktoré boli odobraté, označené ako medzera a vložené sekvencie sú uvedené tučnými písmenami, avšak čís;< lovanie VIJ-neo zostáva nezmenené. Pomocou techník známych pre odborníkov danej oblasti techniky je možné dosiahnuť ďalšie úpravy vektora a nových vývojových metód. Tu uvádzané výrobky sú na tie účely, pre ktoré boli vytvorené, obzvlášť vhodné, aj keď boli pripravené pomocou konvenčných pro• - 17 striedkov.
Hoci jedno z uskutočnení tohto vynálezu využíva NP gén chrípkového vírusu z druhu A/PR/8/34, viac uprednostňované uskutočnenia využívajú NP gén, HA gén, NA gén, PB gén, M gén alebo NS gén z nedávnych izolátov chrípkových génov. Uskutočnenie zahrňuje prípravu kópií DNA vírusových génov a následné subklonovanie jednotlivých génov. Sekvencie génov mnohých chrípkových vírusov sú v súčasnej dobe prístupné verejnosti v GENBANK (okolo 509 týchto sekvencií pre gény chrípky A). Preto sú v tomto vynáleze výhodne používané gény klonované za súčasných vírusových izolátov Texas, Beijing alebo Panama, čo sú druhy doporučované Centrom na kontrolu choroby (Center for Disease Control) na použitie v očkovan cích vakcínach proti chrípke (viď. FLI-IMMUNE vakcína proti chrípkovému vírusu Lederle, Physicians Desk Reference, 1993, str. 1232, vakcína s purifikovaným trivalentným povrchovým antigénom chrípkového vírusu obsahujúca hemaglutinínový proteín z A/Texas/36/91, H1N1; A/Beijing/353/89, H3N2;
a B/Panama/45/90). Aby sme používali rovnakú terminológiu, prijali sme pre opisy DNA konštrukcií nasledujúcu konvenciu: označenie vektora - druh chrípky - gén. Tak je konštrukcia, ktorá obsahuje NP gén z kmeňa A/PR/8/34 a ktorá je klonovaná do expresívneho vektora VIJneo označená VIJneo-PR-NP. Avšak pretože sa etiologický druh vírusu mení, môže sa prirodzene zmeniť aj gén, ktorý je na inkorporáciu do farmaceutického prípravku najvhodnejší. Ako však uvádzame ďalej v tomto dokumente, majú indukované imunitné odpovede cytotoxických lymfocytov schopnosť obrany proti heterológnym druhom, takže u nových vakcín podľa tohto vynálezu nie je premenlivosť druhov chrípkových vírusov v porovnaní s doterajšími vakcínami založenými na celých vírusoch alebo ich podjednotkách takým kritickým problémom. V prospech nových vakcín podľa tohto vynálezu naviac hovorí aj skutočnosť, že tieto prípravky sú ľahko použiteľné pri inzercii nových génov a táto ich vlastnosť umožňuje ich ľahké úpravy pomocou štandardných techník molekulárnej biológie .
nukleoproteínu konzervovaná dosiahnutá obrana vírusu chrípky A, bol gén pre nukPretože je v rôznych chrípkových proti následnej nákaze ktorý bol heterológny leoproteín klonovaný. hých druhov chrípky v ich sekundárnej štruktúre [M. Gammelin a kol., Virol. 71, 1989] a v sekvencii zmien [0. T. Gorman a sekvencia vírusoch, bola tak virulentným kmeňom s kmeňom, z ktorého
Porovnanie nukleoproteínov NP z mnoA neukázalo žiadne významné rozdiely 170, aminokyselín bolo zistených len pár kol., J. Virol. 65, 3704, 1991].
V priebehu približne 50-tich rokov sa u nukleoproteínov ľudských chrípkových vírusov objavujú zmeny a aminosekvencii v miere len 0,66 aminokyseliny za rok. Naše výsledky naviac ukazujú, že Α/ΗΚ/68-špecifické CTL rozpoznávajú cieľové bunky pulzované syntetickým peptidom NP (147 až 155) odvodeným od sekvencie nukleoproteínu z A/PR8/34, čo znamená, že tieto H-2K*^-obmedzené epitopy CTL zostali funkčne nedotknuté počas 34 rokov (viď. obr. 2). Je potrebné si taktiež uvedomiť, že tam, kde gény kódujú povrchový antigén vírusu, ako je napríklad hemaglutinín alebo dokonca neuramidáza, vzniká okrem veľmi dôležitej odpovede cytotoxických lymfocytov taktiež aj výrazná imunitná odpoveď neutralizačných humorálnych protilátok .
Vnútrosvalová injekcia expresívneho DNA vektora kódujúceho konzervovaný vnútorný proteín chrípky A viedla k tvorbe výraznej obrannej odpovedi pri následnej vírusovej nákaze. Predovšetkým došlo k tvorbe NP-špecifických protilátok a primárnych cytotoxických lymfocytov. Očkovanie NP DNA viedlo v porovnaní s kontrolnými objektami k zníženým titrom vírusov v pľúcach, potlačeniu úbytku telesnej hmotnosti a zvýšenému počtu prežívajúcich. Nedostatočná účinnosť samotných NP protilátok uvedená v príklade 4 potvrdzuje, že obranná imunitná odpoveď pri boli s vírusovou nákazou nebola sprostredkovaná NP-špecifickými protilátkami, ale skôr prostredníctvom NP-špecifickej bunkovej imunity. Naviac sa vytvorili významné hladiny primárnych cytotoxických leukocytov zameraných proti NP. Obrana bola proti virulentnému dru hu chrípky A, ktorý bol heterológny k druhu, z ktorého bola
I klonovaná DNA. Napadajúci druh vírusu vznikol po viac než tridsiatich rokoch po druhu A/PR/8/34, čo dokazuje, že imu,nitná odpoveď namierená proti konzervovaným proteínom môže byť účinná aj napriek antigénnemu posunu alebo driftu u rôznych proteínov vírusového obalu. Pretože každý génový produkt vírusu vykazuje určitý stupeň konzervácie a pretože sa cytotoxické leukocyty tvoria na základe vnútrobunkovej expresie a spracovania MHC, dá sa predpokladať, že gény ostatných chrípkových vírusov vyvolajú odpoveď analogickú tej, ktorá bola dosiahnutá pre NP. Metódy na rozpoznávanie imunogénnych epitopov sú v súčasnej dobe medzi odborníkmi v danej oblasti techniky dobre známe [viď. napríklad Shirai a kol., J. Immunol. 148, 1657 až 1667, 1992; Choppin a kol., J. Immunol. 147, 575 až 583, 1991; Calin-Laurens a kol.,
Vaccine 11, 974 až 978, 1993], Ako ukazuje klonované a sek: ventované miesto v expresívnom vektore (viď. nižšie), bolo mnoho týchto génov klonovaných tak, aby boli tieto liečebné prípravky k dispozícii vo vhodnej forme.
í ; Tento vynález teda opisuje expresívne vektory kódujúce proteín chrípkového vírusu ako imunogén. Tento vynález post kytuje prostriedky na indukciu obranyschopnosti proti rôznym ž vírusovým kmeňom bez potreby samostatne sa replikujúcej prí< - sady alebo pomocnej látky. Očkovanie DNA naviac poskytuje ! mnoho ďalších výhod. Za prvé, tento očkovací postup by mohol byť použitý pre nádorové ochorenia rovnako ako pre infekciu, pretože imunitná odpoveď CD8+CTL hrá dôležitú úlohu u oboch týchto patofyzio’logických procesoch [K. Tanaka a kol., Annu. Rev. Immunol. 6, 359 (1988)]. Vyvolanie imunitnej odpovede proti proteínu so zásadným významom pre transformačmý proces, môže teda byť účinným prostriedkom v imunoliečbe alebo v obrane proti rakovine. Za druhé, tvorba vysokého titra protilátok proti proteínom exprimovaným po injekcii vírusoví vého proteínu (NP alebo hemaglutinínu) a DNA pre ľudský rastový hormón [viď. napríklad D.-c. Táng a kol., Náture 356, 152, 1992] naznačuje, že toto je jednoduchý a vysoko účinný prostriedok na prípravu vakcín založených na protilátkach buď samostatných alebo v kombinácii s vakcínami cytotoxic20 kých T-lymfocytov zameraných na konzervované antigény.
Jednoduchosť prípravy a purifikácie konštrukcií DNA je porovnateľná zvlášť s tradičnou purifikáciou proteínov a umožňuje prípravu kombinovaných vakcín. Môžu byť tak pripravené násobné konštrukcie, ako napríklad konštrukcie kódujúce NP, HA, Ml, PB1, NS1 alebo ktorékoľvek iné gény chrípkových vírusov, ktoré môžu byť ďalej miešané alebo aplikované spoločne. A konečne, pretože expresia proteínov je vyko návaná po injekcii DNA [H. Lin a kol., Circulation 82, 2217
Kitsis a kol., FEBS Lett. 290, 73 (1991); S.
Hum. Gene Therapy 3, 21 (1992); J. A. Volf
Mol. Genet. 1, 363 (1992)] môže byť zvýšená buniek B a T [D. Gray a P. Matzinger, J. Exp.
(1991); S. Oehen a kol., tiež tam 176, 1273 vytvorená dlhodobá humorálna imunita a imuni(1990) ; R. N. Jiao a kol. , a kol., Human dlhodobá pamäť Med. 174, 969 (1992)] a teda ta sprostredkovaná bunkami.
Obmedzenie súčasných vakcín tým viac zdôrazňuje potrebu rozvoja nových účinných prostriedkov na prevenciu proti infekcii a zmierneniu ochorenia. Staršie vakcíny poskytujú len obmedzenú obranu, sú účinné len proti niekoľkým vybraným kmeňom vírusov a ich účinnosť mizne po krátkej dobe. Preto musia byť súčasné očkovacie látky preformulované pre včasnú inokuláciu, aby mohli byť účinné. Tvorba zvýšenej odpovede CTL proti vnútorným proteínom by pravdepodobne poskytla značnú dlhodobú imunitu proti rôznym kmeňom, ktorú v súčas nej dobe podávané vakcíny zďaleka neposkytujú.
Predviedli sme expresiu proteínov z PNV konštrukcií u myši, fretiek a primátov človeku nepríbuzných pomocou detekcie imunitnej odpovede hostiteľského organizmu namierenej proti antigénom chrípkových vírusov. Očkovanie myši DNA kódujúcou chrípkovej NP viedlo k zvýšeniu počtu prežívajúcich objektov, zníženému pľúcnemu titru vírusov a menšiemu úbytku telesnej hmotnosti v porovnaní s kontrolnými zvieratami vystavenými infekcii subtypov chrípkových vírusov (posunutých kmeňov) odlišných od tých, ktoré boli použité pre DNA konštrukcie. Taktiež sme pozorovali zníženie šírenia vírusu po infekcii posunutými kmeňmi u fretiek, ktoré boli
- 2Í očkované NP DNA. Tieto výsledky ukazujú, že obrana proti hlavným posunom v kmeňoch chrípkových vírusov je sprostredkovaná vakcínou obsahujúcou DNA s génmi kódujúcimi NP. Očkovanie HA DNA a následná infekcia experimentálnych zvierat driftovanými vírusovými kmeňmi viedla k ešte výraznejšiemu zníženiu šírenia vírusu. Pridaním DNA pre vnútorný proteín ešte mierne zvýšilo už aj tak vysoký stupeň obrany pozorovanej po očkovaní samotnou HA DNA.
Imunitná odpoveď na chrípkovú DNA bola u myší pozorovaná ešte šesť mesiacov po aplikácii injekcie spoločne s pretrvávaním protilátok, aktivitou CTL a obranou in vivo. Opakovaná injekcia DNA ešte ďalej zvýšila počet prežívajúcich po následnej infekcii chrípkovým kmeňom odlišného subtypu za 25 týždňov a ukázala možnosť zvýšenia obranyschopnosti sprostredkovanej bunkami. Pretrvávanie protilátok bolo taktiež pozorované po dobu najmenej jedného roka po dvoch injekciách HA DNA, pričom u afrických opíc protilátky pretrvávali po dobu najmenej deviatich mesiacov po jedinej injekcii HA DNA.
Výsledky týchto experimentov vykonávaných na zvieratách ukazujú, že priame injekcie DNA poskytujú modernú metódu ochrany ľudského organizmu proti chrípkovej infekcii a ochoreniu. Experimentálna ochrana pomocou injekcií DNA bola dosiahnutá očkovaním myší a fretiek, ktoré predtým neprišli do styku s infekciou. Ľudia očkovaní DNA budú mať za sebou už predchádzajúce skúsenosti s chrípkou. Tieto osoby budú po očkovaní konštrukciami DNA vykazovať ešte výraznejšiu imunitnú odpoveď a možno aj s dlhším trvaním.
Na optimalizáciu použitej koncentrácie je rozsah dávok porovnaný s imunogenicitou. V pokusoch s malými cicavcami vyvolalo odpovede cytotoxických leukocytov už také malé množstvo ako 1 gg NP DNA. Očkovanie afrických opíc vyvolalo protilátkovú odpoveď u dvoch zvierat z dvoch pri dávkach 100 gg a 1000 gg HA DNA (A/PR/08/34), zatiaľ čo jedno zviera z dvoch reagovalo na samotnú dávku 10 gg. V oddelených experimentoch boli africké opice, ktoré ešte neprišli do . styku s infekciou, očkované zmesou piatich rôznych konštrukcií DNA kódujúcich HA z troch vírusových subtypov spolu s DNA kódujúcou NP a Ml z chrípkového vírusu typu A. Tri z troch opíc v každej skupine reagovali na očkovanie, ktoré obsahovalo 10 gg alebo 100 gg každej z piatich konštrukcii. Na základe týchto zistení je možné predpokladať, že dávky účinné pre ľudský organizmus sú 10, 50, 100 a 200 gg DNA.
Prevencia proti infekcii pomocou súčasných patentovaných inaktivovaných vakcín koreluje so sérom a hladinami sliznicových protilátok proti HA, ale nekoreluje s protilátkovou odpoveďou na vnútorné proteíny chrípkových vírusov. Preto musí byť HA zahrnutý do vývoja protichrípkových DNA vakcín. Imunitná odpoveď na NP však zvyšuje odpoveď protilátok na HA a vnútorné proteíny chrípkových vírusov vyvolávajú odpoveď cytotoxických leukocytov na antigénne odlišné kmene chrípkových vírusov. Ako už bolo uvedené vyššie, experimenty na zvieratách ukázali zvýšenú imunogenicitu a ochranu tam, kde injekcie obsahovali DNA konštrukcie kódujúce vnútorné proteíny chrípkových vírusov súčasne s HA. Začlenenie DNA konštrukcií kódujúcich vnútorné proteíny by pravdepodobne zvýšilo účinnosť DNA vakcín a ľudí. Pretože dávky budú pravdepodobne závisieť na interakcii týchto zložiek, rutinné testovanie umožní odborníkom stanovenie dávky DNA pre zmesi HA, NP a Ml DNA konštrukcii. Odpovede hostiteľov na každú z týchto zložiek môžu byť merané oddelene s pozorovaním zníženia titra hemaglutinínu (Hl) a neutralizačných protilátok proti zložkám HA a odpovede cytotoxických lymfocytov na epitopy Ml a NP. Výsledky sú porovnané s protilátkovou odpoveďou po injekcii, obsahujúcej konštrukcie, ktoré exprimujú len HA. Tieto štúdie umožňujú vyhodnotenie potenciálnej zvýšenej odpovede na vakcínu, obsahujúcu tak DNA kódujúcu HA, tak vnútornú proteíny chrípkových vírusov.
Účinnosť na ľudský organizmus bola vyskúšaná na dobrovoľníkoch, ktorí obdržali. DNA vakcínu proti chrípke, pó ktorej nasledovala intranazálna infekcia, aby sa prejavila účinnosť vakcíny proti podobným kmeňom vírusov a chrípkovým kmeňom rôznych subtypov. Zloženie, dávka a plikácie tejto vakcíny sú založené na už uvedených štúdiách. Klinická účin- 23 ι b ί nosť bola hodnotená podľa miery infekcie, počtu chorých i’ a priebehu choroby. Tieto klinické výsledky boli porovnané
I s laboratórnym vyhodnotením imunitnej odpovede a šírením } vírusu, aby mohli byť určené náhradné signálne znaky, ktoré korelujú s ochranou.
Štandardné techniky molekulárnej biológie na prípravu a purifikáciu DNA konštrukcií umožňujú prípravu DNA liečebných prípravkov, ktoré sú predmetom tohto vynálezu. Zatiaľ čo sú štandardné techniky molekulárnej biológie dostatočne vyhovujúce na prípravu výrobkov, ktoré sú predmetom tohto vynálezu, poskytujú tu opisované špecifické konštrukcie nové liečebné prípravky, ktoré prekvapivo poskytujú ochranu proti , rôznym kmeňom vírusov, čo je výsledok, ktorý sa zatiaľ pomocou dosial patentovaných vakcín nepodarilo dosiahnuť.
s Množstvo exprimovanej DNA, ktoré má byť príjemcovi aplikované, bude závisieť na sile transkripčných a translač• ných promótoroch použitých v DNA konštrukcii a na imunogenicite exprimovaného génového produktu. Všeobecne povedané je . účinná dávka aplikovaná priamo do svalu od 1 gg do 1 mg, lepšie od 10 gg do 300 gg. Podkožné injekcie, vnútrokožné aplikácie zavedené cez pokožku a ďalšie spôsoby aplikácie i
j ako intraperitoneálne, intravenózne alebo inhalácie sú tak• - tiež možné. Taktiež sa predpokladá, že budú poskytované revakcinácie.
DNA môže byť holá, t.j. bez akýchkoľvek asociovaných proteínov, prísad alebo ďalších pomocných látok, ktoré pôsobia na imunitný systém príjemcu. V takomto prípade je žiadúce, aby DNA bola vo fyziologicky prijateľnom roztoku, ako je napríklad sterilný fyziologický roztok alebo fyziologický roztok tlmený fosfátom, avšak výpočet roztokov sa neobmedzuje len na tieto dva roztoky. DNA môže byť alternatívne asociovaná s lipozómami, ako sú lecitínové lipozómy alebo ďal; šie lipozómy známe medzi odborníkmi v danej oblasti techniky, a mať teda formu DNA-lipozomálnej zmesi (viď. napríklad V09324640) alebo môže byť DNA asociovaná s prísadami, ktoré sú odborníkom v danej oblasti techniky známe pre svoje schopnosti zosilniť imunitnú odpoveď, ako sú proteíny alebo iné nosiče. S výhodou môžu byť taktiež použité látky, ktoré prispievajú k príjmu DNA bunkami. Medzi inými to sú vápenaté ióny, vírusové proteíny alebo ďalšie látky sprostredkovávajúce transfekciu. Tieto látky sú všeobecne označované ako transfekciu sprostredkovávajúce látky a ako farmaceutický prijateľné nosiče. V tomto vynáleze označuje termín gén segment nukleovej kyseliny, ktorý kóduje samostatný proteín. Termíny liečebný prípravok a vakcína sú vzájomne zameniteľné a označujú prípravky vhodné Termíny konštrukcia a plazmid Termín vektor je používaný na byť klonované gény použiteľné vynáleze.
na indukciu imunitnej odpovede, sú používané opäť zameniteľné, označenie DNA, do ktorej môžu podľa metód opísaných v tomto
Preto jedným z uskutočnení tohto vynálezu je metóda na použitie génov chrípkových vírusov na indukciu imunitných odpovedí in vivo u takých stavovcov, ako sú cicavci vrátačloveka. Táto metóda zahrňuje:
izoláciu génu, pripojenie génu k regulačným sekvenciám tak, že gén je funkčne pripojený ku kontrolnej sekvencii, ktorá, ak je zavedená do živého tkaniva, riadi iniciáciu a transláciu génu, zavedenie génu do živého tkaniva a voliteľne aj zvýšenie reakcie pridaním ďalšieho vého génu.
Výhodným j úca ochranu Táto ochrana množstva nukleovej kyseliny, top chrípkového vírusu, celý gén chrípkového vírusu sekvencie častí ne
a)
b)
c)
d) následnú chrípkoposkytukmeňom chrípkového vírusu, aplikáciou imunologický účinného ktorá kóduje konzervovaný epiTúto funkciu poskytuje napríklad pre nukleoproteín a predpokladá pre ďalšie gény chrípkových vírutakto kódujúce epitopy konzervované teda poskytujú ochranu proti rôznym kmeňom uskutočnením tohto vynálezu je metóda proti rôznorodým sa docieli sa, že kódujúce sov alebo ich v týchto génoch týchto vírusov.
V ďalšom uskutočnení tohto vynálezu kóduje DNA vo vakcíne neukleoproteín ľudského chrípkového vírusu, hemagluti25
ί.ί í j
I
J nín, matricový protein, neštruktúrne proteíny alebo polymerázový génový produkt. Špecifické príklady uskutočnenia tohto vynálezu sú uvedené nižšie. V týchto uskutočneniach kóduje gén chrípkového vírusu nukleoproteín, bázickú polymerázu 1, neštruktúrny protein 1, hemaglutinín, matrix 1, bázickú polymerázu 2 izolátu ľudského chrípkového vírusu typu A/PR/8/34, nukleoproteín izolátu chrípkového vírusu typu A/Beijing/353/89, hemaglutinínový gén izolátu chrípkového vírusu A/Texas/36/91 alebo hemaglutinínový gén izolátu ľudského chrípkového vírusu B/Panama/46/90.
Špecifické uskutočnenia tohto vynálezu, t.j. DNA konštrukcie kódujúce gény chrípkových vírusov, ktorých DNA konštrukcie majú schopnosť expresie po zavedení do živočíšneho tkaniva in vivo a vyvolávajú imunitnú odpoveď proti exprimovaným produktom týchto génov chrípkových vírusov. Naviac kombinácie obsahujúce takéto konštrukcie s polynukleotidmi, kódujúcimi ďalšie antigény nepríbuzné s chrípkovými vírusmi sú v tomto vynáleze jasne opísané, príklady doporučovaných DNA konštrukcií kódujúcich chrípkové gény:
a)
b)
c)
d)
e)
f)
g)
h)
i)
j)
k)
l)
m) pnRSV-PR-NP,
Vl-PR-NP,
V1J-PR-NP, ktorého 5'koncová sekvencia je SEKV.ID:12 : , V1J-PR-PB1, ktorého 5'koncová sekvencia je SEKV.ID:13:, V1J-PR-NS, ktorého 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:14:, V1J-PR-HA, ktorého 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:15:,
V1J-PR-PB2, ktorého 5'koncová sekvencia je SEKV.ID:16:,
V1J-PR-M1, ktorého 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:17:,
VIJneo-BJ-NP, ktorého 5'koncová sekvencia je SEKV.ID:20: a 3’koncová sekvencia je SEKV.ID:21:,
VIJneo-TX-NP, ktorého 5'koncová sekvencia je SEKV.ID:24: a 3’koncová sekvencia je SEKV.ID:25:,
VIJneo-PA-HA, ktorého 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:26:
a 3'koncová sekvencia je SEKV.ID:27:,
VIJns-GA-HA (A/Georgia/03/93), veľkosť konštrukcie je
6,56 Kb, 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:46: a 3’koncová sekvencia konštrukcie je SEKV.ID:47:,
VlJns-TX-HA (A/Texas/36/91), veľkosť konštrukcie je
6,56 Kb , 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:48: a 3’koncová sekvencia je SEKV.ID:49:,
n) VIJns-PA-HA (B/Panama/45/90), veľkosť konštrukcie je
6.61 Kb, 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:50: a 3'koncová sekvencia je SEKV.ID:51:,
o) VIJns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), veľkosť konštrukcie je
6,42 Kb, 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:52: a 3’koncová sekvencia je SEKV.ID:53:,
p) VlJns-BJ-Ml (A/Beijing/353/89), veľkosť konštrukcie je
5.62 Kb, 5'koncová sekvencia je SEKV.ID:54: a 3’koncová sekvencia je SEKV.ID:55:,
q) VIJns-PA-NP (B/Panama/45/90), veľkosť konštrukcie je 6,54 Kb, 5'koncová sekvencia je SEKV.ID:56: a 3’koncová sekvencia je SEKV.ID:57:,
r) VIJns-PA-Ml (B/Panama/45/90), veľkosť konštrukcie je
5,61 Kb, 5’koncová sekvencia je SEKV.ID:58: a 3’koncová sekvencia je SEKV.ID:59:.
Prehľad obrázkov na výkresoch
Obr. 1 Detekcia NP plazmidu DNA vo svale pomocou techník PCR. Myšiam boli aplikované trikrát (v troch týždňových intervaloch) injekcie obsahujúce RSV-NP DNA alebo prázdny vektor (100 pg/noha) do štvorhlavého svalu myší BALB/c a potom boli myši vystavené chrípkovej infekcii. Po štyroch týždňoch a po konečnej infekcii boli svaly vybraté a zmrazené v tekutom dusíku. Potom boli rozdrvené v lyzovacom pufri [25 mM Tris-H3P04 pH 8, 2 mM trans-1:
2-kyselina diaminocyklohexán-tetra-octová (CDTA), 2 mM DTT, 10% glycerol, 1% Triton X-100] v MIKRODISMEMBRATOrTM (Braun Instruments) a vysokomolekulárna DNA bola extrahovaná fenol-chloroformovou precipitáciou. Na detekciu NP plazmidu vo svale bola použitá 40 cyklová reakcia PCR (PCR reakcia bola používaná podľa návodu súpravy Perkin Elmer Cetus GENEAMpTM) pqr produkt s dĺžkou 772 párov báz (viď. šípka) vedúci od CMV promótora cez väčšinu 5’ časti vloženého NP génu bol vytvorený z negatívneho oligonukleotidu s 18 bázami s počiatkom v promótorovej oblasti, (GTGTGCACCTCAAGCTGG, SEKV.ID:1:) a z pozitívneho oligonukleotidového priméru s dĺžkou 23 báz umiestneného v 5’ časti vloženej NP sekvencie (CCCTTTGAGATGTTGCACATTC, SEKV.ID:2: ). Tento 772 bp dlhý produkt je viditeľný u vybraných vzoriek svalov injektovaných NP DNA a testovaných na agarózovom géli farbenom etidium-bromidom, ale nie je prítomný v prázdnom kontrolnom vektore (600L). Označenie každého prúžku udáva rozlišovacie číslo myši a pravú alebo ľavú končatinu.
Obr. 2 Tvorba NP protilátok u myší, ktorým boli aplikované injekcie NP DNA. Myšiam boli aplikované injekcie, obsahujúce 100 pg (VI-NP DNA do každej končatiny v čase 0, 3 a 6 týždňov. Krv bola odoberaná za 0, 2, 5a 8 týždňov. Prítomnosť anti-NP IgG protilátok v sére bola zisťovaná pomocou ELISA testov (J.J. Donnelly a kol., J. Immunol. 145, 3071 (1990)) za použitia NP purifikovaného z buniek hmyzu transfektovaných baculovírusovým expresívnym vektorom. Výsledky sú zakreslené ako stredná hodnota logtitra ELISA +/- SEM (n = 10) proti času po prvej injekcii NP DNA. Myši imunizované prázdnym vektorom nevytvárali žiadne zistiteľné NP protilátky.
Obr. 3 Percenta špecifickej lýzy, určené štvorhodinovým testom uvoľňovania 34Cr z CTL získaných z myší imunizovaných DNA. Myši boli imunizované 400 pg VI-NP DNA (plné krúžky) alebo prázdnymi vektormi (plné štvorčeky) a po 3 až 4 týždňoch usmrtené. Negatívna kontrola pre CTL bola získaná z neimunizovaných myší (prázdne trojuholníky), ktoré sa zotavili z infekcie A/HK/68 prekonanej 4 týždne pred odberom (plné trojuholníky). Grafy uvádzajú údaje o reprezentačných vzorkách myší. Pre každú sériu podmienok bolo testovaných najmenej 8 myší. Graf A: Slezinové bunky opa28
I kované stimulované bunkami z rovnakého orgánu pulzovanými NP1247-155 a potom vyhodnotené proti bunkám P815 pulzovaným NP147-155. Graf B: Slezinové bunky opakovane stimulované bunkami z rovnakého orgánu pulzovanými NP147-155 a vyhodnotené proti P815 infikovaným chrípkovom vírusom A/Victoria/73 (H3N2) po dobu 6 hodín pred pridaním k CTL. Graf C: Slezinové bunky opakovane stimulované Con A a IL-2 bez ďalšieho antigénu a vyhodnocované proti bunkám P815 pulzovaným NP147-155. Panel D: Myšiam bolo aplikovaných 200 pg Vl-NP DNA alebo prázdny vektor v každej • injekcii trikrát v trojtýždňových intervaloch. Sleziny boli odobraté 4 týždne po poslednej imunizácii, slezinové bunky boli kultivované s IL-2 a Con A po dobu 7 dni. CTL boli vyhodnotené proti P815 cieľovým bunkám infikovaným A/Victoria/73.
Obr. 4 Strata hmotnosti (v gramoch) a uzdravenie u myší imunizovaných DNA po intranazálnej infekcii (bez anestetík) IO^TCID^q A/HK/68. Myši boli imunizované trikrát v trojtýždňových intervaloch Vl-NP DNA alebo prázdnym vektorom alebo im neboli aplikované žiadne • injekcie a boli vystavené infekcii 3 týždne po k
» . poslednom očkovaní. Hmotnosť 10 myší bola stanovená ‘ v dobe styku s infekciou a od 4. dňa každý deň u myší po injekcii NP DNA (plné krúžky), kontrolných myší po injekcii prázdneho vektora (prázdne trojuholníky) a kontrolných myší bez akejkoľvek injekcie (prázdne krúžky). Graf ukazuje stredné hodnoty hmotnosti +/- SEM. Myši, ktorým boli aplikované injekcie NP DNA, vykazovali podľa t-testov výrazne nižší úbytok váhy odo dňa 8 až do dňa 13 v porovnaní s myšami po injekciách prázdneho vektora (p<0,005) a myšami bez injekcií (p<0,01). Medzi kontrolami neboli pozo!
rované žiadne výrazné rozdiely (p =0,8 pomocou t-testu).
’ Obr. 5 Prežívanie myší imunizovaných DNA po intranazálnej : infekcii (pri anestézii) IO^’^TCID^q A/HK/68. Myši
I!
imunizované trikrát v trojtýždňových intervaloch VI-NP DNA (plné krúžky) alebo prázdnym vektorom (prázdne krúžky) a kontrolné myši bez injekcií (prázdne trojuholníky) boli vystavené injekcii tri týždne po poslednom očkovaní. Percento prežívajúcich je uvedené pre skupiny 9-tich alebo 10-tich myší. Počet prežívajúcich bol u myší po injekcii NP DNA značne vyšší než u kontrolných myší (p = 0,0004 podlá analýzy -X štvorcov).
Obr. 6 Sekvencia expresívneho vektora V1J, SEKV.ID:10:.
Obr. 7 Sekvencia expresívneho vektora VIJneo SEKV.ID:18:.
Obr. 8 Sekvencia CMVintA-BGH promótor-terminátorovej sekvencie, SEKV.ID:11:.
Obr. 9 Opičie protilátky anti-NP.
Obr. 10 Inhibícia hemaglutinínu fretiek. Bodkovaná čiara označuje minimálny titer obranných protilátok. Priemerná hodnota je označená preškrtnutým krúžkom.
Obr. 11 IgG protilátky proti NP u fretiek po imunizácii DNA.
Obr. 12 Šírenie vírusu po infekcii chrípkovým vírusom u fretiek po očkovaní a bez očkovania.
Obr. 13 Diagram vektorov pRSV-PR-NP a VI-NP. Písmeno X označuje vloženú kódujúcu oblasť.
Obr. 14 Diagram chrípkových proteínov a kmeňov. Obr. 15 Schéma spracovania očkovanej DNA v bunke.
Obr. 16 Rezistencia fretiek proti chrípke A/RP/8/34 vyvolaná očkovaním HA a génmi pre vnútorné proteíny.
Obr. 17 Schéma vektora VIJns.
Obr. 18 Africké opice boli očkované zmesou DNA pozostávajúcou z HA DNA (A/Beijing/89, B/Panama/90, A/Texas/91), NP DNA (A/PR/34) a Ml DNA (A/PR/34) a Ml DNA (A/PR/34). Každá zložka bola obsiahnutá v množstve buď 10 gg (plné štvorčeky) alebo 100 gg (plné krúžky) aplikovaných dvakrát v šesťtýždňových intervaloch (viď. šípky). Na porovnanie boli ďalšie zvieratá očkované vakcínami so subviriónmi (prázdne štvorčeky) a viriónmi (prázdne krúžky) v plnej dávke určenej pre ľudský organizmus (45 gg ekvivalentných proteínov; 15 gg na HA). Vzorky séra boli odoberané každé dva týždne po dobu 18 týždňov a bol zisťovaný titer Hl proti A/Beijing/89 HA. Údaje sú udané ako stredné geometrické hodnoty Hl +/- SEM, kde n = 3.
Obr. 19 Samice myší BALB/c (4 až 6 týždňov) boli očkované A/PR/34 NP DNA (200 μβ) trikrát v trojtýždňových intervaloch. Skupiny myší pre negatívnu kontrolu zahrňovali myši očkované kontrolnou DNA (200 gg), rekombinantným NP proteínom (10 gg) a neimunizované myši bez očkovania. Na porovnanie boli testované taktiež myši infikované chrípkovým vírusom A/HK/68. CTL boli získané 6 mesiacov po dávke a boli opätovne stimulované in vitro slezinovými syngénnymi bunkami infikovanými vírusom. Potom boli testované proti bunkám P815 pulzovaným NP peptidom v pomere efektor:recipient 10:1. Uvedené čísla predstavujú % špecifickej lýzy +/- sd, kde n = 3.
Obr. 20 Myši C3H/HeN boli očkované normálnymi myoblastami ^2^12 í3· x buniek), rekombinantným NP proteínom (2 gg) alebo myoblastami transformovanými NP (1 x 10 buniek). Toto množstvo NP proteínu (2 gg) bolo dostatočné na vyvolanie tvorby protilátok a rovnalo sa približne stonásobnému množstvu NP proteínu prítomného v transplantovaných myoblastoch transfektovaných NP. CTL boli z týchto myší pripravené šesť týždňov po reakcii a opätovne stimulované in vitro syngénnymi slezinovými bunkami infikovanými chrípkovým vírusom. Ako pozitívna kontrola boli pripravené CTL z myší, ktoré boli infikované chrípkovým vírusom A/HK/68. Ako cieľové bunky boli použité myoblasty transfektované NP (bodkované stĺpce), neošetrené bunky (plné stĺpce) a myoblasty infikované chrípkovým vírusom A/Victoria/73 (prúžkované stĺpce) v pomere e.fektor : recipient 25:1. Údaje sú uvádzané v % špecifickej lýzy +/- sd, kde n = 3.
Obr. 21 Štvortýždňovým samiciam myší BALB/c bolo očkované do svalu 200 gg NP DNA trikrát v trojtýždňových inter valoch. Tri týždne po treťom očkovaní boli myši vystavené v anestézii celkovej infekcii dýchacieho traktu 300 TCID^q A/HK/68. Podiel prežívajúcich myší (10 myší/skupina) je vyznačený bodkovanou čiarou proti dĺžke doby od styku s infekciou.
Obr. 22 Štvortýždňové samice myši BALB/c boli očkované do svalu trikrát dávkou 100 gg NP DNA v trojtýždňových intervaloch. Po treťom očkovaní boli myši podrobené anestézii a aplikácii TCID^q A/HK/68 (napadnutie celkového dýchacieho traktu). Myši boli každý deň vážené a bol počítaný hmotnostný pomer k jej počiatočnej hmotnosti. Stredná hodnota percent z pôvodnej hmotnosti bola potom spočítaná pre každú prežívajúcu myš. Stredná hodnota percent počiatočnej hmotnosti je vyjadrená proti dĺžke doby od vystavenia infekcii +/- SEM.
Obr. 23 Štvortýždňové samice myší BALB/c boli očkované do svalu 200 gg NP DNA trikrát v trojtýždňových intervaloch. Tri týždne po treťom očkovaní boli myši vystavené 2000 TCID^q A/HK/68 aplikovaného bez anestézie (horné cesty dýchacie). Sedem dni po styku s infekciou boli myši utratené, boli im odobrané a homogenizované pľúca. Titer vírusu bol určený sériou titrácii na bunkách MDCK.
Obr. 24 Štvortýždňové samice myší BALB/c boli očkované do svalu dávkami 6,25, 25, 100 alebo 200 gg NP DNA trikrát v trojtýždňových intervaloch. Tri týždne po poslednom očkovaní boli myši vystavené 300 TCID^q A/HK/68 v anestézii (napadnutie celkového dýchacieho traktu) . Podiel prežívajúcich myši (1.0 myší na skupinu) je vyznačený proti dĺžke doby od vykonania infekcie.
Obr. 25 štvortýždňové samice myší BALB/c boli očkované do svalu trikrát v trojtýždňových intervaloch 200 gg A/PR/34 NP DNA, kontrolnou DNA alebo fingovanými injekciami. Myši boli vystavené v anestézii 300 TCID^q A/HK/68 v dobe 6, 12 a 25 týždňov po tretej
I injekcii DNA. Vybrané myši boli opätovne imunizované | 200 pg NP DNA v 22. týždni a potom v 25. týždni
I (Reboost). Stredné hodnoty hmotnosti sú uvedené ako percento počiatočnej celkovej hmotnosti každej skupiny. Uvedená kontrolná hmotnosť je strednou hodnotou hmotnosti všetkých kontrolných skupín od 6.,
12. a 25. týždňa po infekcii, t.j. celkového počtu 6 skupín, ktoré obdržali kontrolnú DNA alebo fiktívne injekcie. Skupiny zo začiatku obsahovali 10 zvierat . Hmotnosť uhynutých zvierat nebola do celkového rozboru zahrnutá.
Obr. 26 Dospelí samci fretiek (vek 22 až 28 týždňov) boli v nultom dni a 42. dni očkovaní do svalu 1 mg DNA kódujúcou NP z A/Beijing/89, 1 mg DNA kódujúcou Ml z A/Beijing/89 alebo 1 mg DNA kombinovanú z oboch typov. Kontrolné fretky dostali nekódujúcu DNA alebo . ’ plnú ľudskú dávku (15 pg/druh) patentovanej vakcíny i' z celých chrípkových vírusov (formulácie 92 až 93) obsahujúce A/Beijing/89. Očkovanie prebehlo v nultom dni a v 42. dni. V 56. dni boli fretky vystavené . · infekcii A/Georgia/93. Šírenie vírusu v nosných sek; rétoch bolo stanovené podľa výšky uvedených metód.
Toto šírenie bolo v dňoch 3 až 5 porovnané metódou dvojsmernej analýzy variancie so šírením nákazy u fretiek, ktorým bola podaná kontrolná DNA. Šírenie vírusov u fretiek, ktorým bola podaná NP DNA, Ml DNA alebo NP+M1 DNA bolo výrazne nižšie (p < 0,0001, . p < 0,0016 a p < 0,0001) než u kontrolných fretiek.
Šírenie vírusu u fretiek, ktorým bola podaná NP (čísla nie sú uvádzané), Ml alebo NP+M1 DNA nebolo nijako výrazne odlišné od šírenia u fretiek, ktorým bola podaná patentovaná vakcína (p=0,104, 0,533 a 0,145). Očkovacia dávka bola vybraná náhodne. Štúdie dávkovania boli vykonané na človeku nepríbuzných primátoch.
Obr. 27 Skupina 8 samcov fretiek vo veku 22 až 25 týždňov bola očkovaná do svalu kontrolnou DNA, fyziologickým !1 roztokom alebo DNA kódujúcou proteíny chrípky | A/PR/8/34 v nultom, 21. a 121. dni. V 148. deň boli t! títo samčí vystavení intranazálnej infekcii 200
TCID^q A/PR/8/34. Očkované zvieratá obdržali 1 mg NP DNA alebo 2 mg NP, NS1, PB1, PB2 a kombinovanej Ml DNA (400 gg každej konštrukcie). Kontrolné zvieratá dostali fyziologický roztok alebo 1 mg kontrolnej DNA v množstve 0,5 ml na jednu končatinu. Na účely ďalšej analýzy boli skupiny, ktoré obdržali fyziologický roztok a kontrolnú DNA, skombinované (Kontrola) rovnako ako skupiny, ktoré dostali samotnú NP DNA alebo v kombinácii s ďalšími génmi pre vnútorné . proteíny (Vnútorné). Graf ukazuje, že infekčnosť nosných sekrétov je vyjadrená titrom TCID^q na 50 ml v 3 ml objemu nazálnej tekutiny. Predpokladalo sa, že neriedená nosná tekutina (testované najmenšie riedenie) je v pomere 1:10 k pôvodnému nosnému výlučku, pozitívna neriedená vzorka bola vyhodnocovaná ako hodnota 1 log. Titre nad 1 log boli vyhodnotené podľa interpolácie Reed-Muench s tromi opakovaniami pri dosiahnutí konečnej infekčnosti 50 %. Vzorkám, ktoré boli negatívne v neriedenom stave, bola priradená hodnota 0 log. Hodnoty p uvedené v grafe sú počítané pre očkované fretky versus kontroly vo vyznačených dňoch pomocou T-testov. Hodnoty ; p pre celkovú krivku boli počítané dvojsmernou analýzou variancie s boli <0,0001 pre NP versus kontro* la a <0,001 pre kombinované DNA versus kontrola.
Obr. 28 Prežitie myší očkovaných DNA a potom vystavených chrípkovému vírusu. Myši boli očkované do svalu 200 gg DNA kódujúcou HA z A/PR/34 alebo kontrolnou (nekódujúcou) DNA trikrát v trojtýždňových intervaloch.
Tri týždne po poslednom očkovaní bolo myšiam v anestézii nakvapkané do celkového dýchacieho traktu 1000 TCID^q A/PR/34. Hodnoty sú uvádzané ako % prežívajúcich proti dĺžke času po zavedení infekcie (n = 9 alebo 10 myší na skupinu).
Obr. 29 Úbytok hmotnosti myší očkovaných DNA a potom vystavených infekcii chrípkovým vané 200 gg DNA kódujúcou trolnou (nekódujúcou) DNA, intervaloch. Tri týždne po vírusom. Myši boli očkoHA z A/PR/34 alebo kontrikrát v trojtýždňových poslednom očkovaní bolo myšiam v anestézii nakvapkané do celkového dýchacieho traktu 1000 TCID^q A/PR/34. Hodnoty sú vyjadrené ako % pôvodnej hmotnosti u každého jednotlivého zvieraťa, urobené priemery pre každú skupinu s vynesené proti času. (Uhynuté zvieratá boli vybraté zo stredných hodnôt).
Obr. 30 Prežívanie myší očkovaných DNA a potom vystavených infekcii chrípkovým vírusom. Myši boli očkované do svalu 1, 10 alebo 100 gg DNA kódujúcou HA z A/PR/34 alebo kontrolnou (nekódujúcou) DNA, trikrát v trojtýždňových intervaloch. Tri týždne po poslednom očkovaní bolo myšiam v anestézii nakvapkané do celkového dýchacieho traktu 1000 TCID^q A/PR/34. Hodnoty sú vyjadrené ako % prežívajúcich proti času po infekcii (n = 9 alebo 10 na skupinu).
Obr. 31 Skupiny 8 samčích fretiek vo veku 22 až 25 týždňov boli v dňoch 0, 21 a 121 očkované do svalu kontrolnou DNA, fyziologickým roztokom alebo DNA kódujúcou proteíny chrípky A/PR/34. 148. deň bolo fretkám aplikované do nosného traktu 200 TCID^q A/PR/34. Očkované zvieratá dostali 1 mg HA DNA alebo 2 mg HA, NP, NS1, PB1, PB2 a Ml DNA kombinovaných v množstvách 330 gg z každej konštrukcie. Kontrolné fretky dostali 0,5 ml/nohu fyziologického roztoku alebo kontrolnej DNA. Na účely analýzy boli skombinované skupiny, ktoré dostali fyziologický roztok alebo kontrolnú DNA (Kontrola), a skupiny, ktoré dostali samotnú HA DNA alebo v kombinácii s génmi pre ostatné vnútorné proteíny (HA, HA+vnútorné). Graf ukazuje titer infekčnosti nosnej tekutiny v TCID^q na 50 gl v 3 ml objemu nosnej tekutiny (po výplachu). Neriedená nosná tekutina (testované najnižšie riedenie)
- 35 bola braná ako riedenie pôvodného nosného výlučku 1: 10 a pozitívnej neriedenej vzorke bola priradená hodnota 1 log. Titre nad 1 log boli priradené podľa interpolácie Reed-Muench medzi tromi opakovaniami na získanie konečnej 50% infekčnosti. Negatívnym vzorkám, testovaným v neriedenom stave bola priradená hodnota 0 log. Hodnoty p pre celé krivky boli počítané dvoj smernou analýzou variancie a boli pre HA versus kontrola <0,0001, pre kombinovanú DNA versus kontrola <0,0001.
Obr. 32 Dospelí samci fretiek vo veku 22 až 28 týždňov boli očkovaní do svalu 1 mg DNA kódujúcou HA z A/Georgia/93 v dňoch 0 a 42. Kontrolné fretky dostali nekódujúcu DNA alebo plnú ľudskú dávku (15 gg/kmeň) patentovanej vakcíny s celými chrípkovými vírusmi (formulácie 92 až 93) obsahujúce
A/Beijing/89 taktiež v dňoch 0 a 42. Fretky boli 56. deň vystavené pôsobeniu A/Georgia/93. Výskyt vírusu v nosnom výplachu bol určený metódami uvedenými vyššie. Koncentrácia vírusu v dňoch 1 až 6 bola porovnaná so stavom vírusu u fretiek, ktorým bola podaná kontrolná DNA, metódou dvojsmernej analýzy
variancie. Výskyt u fretiek, ktoré | dostali HA DNA, | |||
bol výrazne | nižší | (p<0,0001) | než | u kontrolných |
fretiek. | ||||
Obr. 33 Dospelí samci | fretiek | vo veku 22 | až | 28 týždňov boli |
očkovaní do | svalu | 1 mg | DNA | kódujúcou HA |
z A/Hawaii/91 | alebo | A/Beij ing/89 | (neuvádzané údaje) |
v. dňoch 0 a 42. Kontrolné fretky dostali nekódujúcu DNA alebo plnú ľudskú dávku (15 gg/kmeň) patentovanej vakcíny s celými chrípkovými vírusmi (formulácie 92 až 93) obsahujúce A/Beijing/89 taktiež v dňoch 0 a 42. Fretky boli 56. deň vystavené pôsobeniu A/Georgia/93. Výskyt vírusu v nosnom výplachu bol určený metódami uvedenými vyššie. Koncentrácia vírusu v dňoch 1 až 6 bola porovnaná so stavom vírusu u fretiek, ktorým bola podaná kontrolná DNA, metódou
dvojsmernej analýzy variancie. Výskyt u fretiek, ktoré dostali HA DNA z A/Hawaii/91, bol výrazne nižší (p<0,0001) než u kontrolných fretiek. Výskyt u fretiek, ktoré dostali HA DNA z A/Hawaii/91 bol výrazne nižší než u fretiek, ktoré dostali patentované výrobky (p=0,021 pre A/Hawaii/91 HA DNA, dvojsmerná ANOVA pre dni 1 až 6). Výskyt u fretiek, ktoré dostali A/Beijing/89 HA DNA (neuvádzané údaje) neboli nijako výrazne odlišné od hodnôt, získaných u fretiek, ktorým bol aplikovaný patentovaný výrobok (p=0,058, dvojsmerná ANOVA pre dni 1 až 6).
Obr. 34 Dospeli samci fretiek vo veku 22 až 28 týždňov boli očkovaní do svalu 1 mg DNA kódujúcou HA z A/Hawaii/91 (viď. obr. 13) alebo 330 pg každej DNA kódujúcou HA z A/Hawaii/91 a NP a Ml z A/Beijing/89. Očkovanie prebehlo v dňoch 0 a 42. Kontrolné fretky dostali nekódujúcu DNA alebo plnú ľudskú dávku (15 pg/druh) patentovanej vakcíny obsahujúcej celé chrípkové vírusy (formulácie 92 až 93).
Obr. 35 Dospeli samci fretiek vo veku 22 až 28 týždňov boli
očkovaní do | svalu | 1 |
z A/Georgia/93 | alebo | Ρθ |
z A/Hawaii/91, | NP a | Ml |
mg DNA kódujúcou HA
330 pg DNA kódujúcou HA z A/Beijing/89 v dňoch 0 a 42. Kontrolné fretky dostali v deň 0 a 42 nekódujúcu DNA alebo plnú ľudskú dávku (15 pg/druh) patentovanej vakcíny z celých vírusov (formulácie 92 až 93) obsahujúce A/Beijing/89. 56. deň boli fretky vystavené infekcii A/Georgia/93. Výskyt vírusu v nosnom výplachu bol stanovený vyššie uvedenými metódami. Výskyt v dňoch 1 až 6 bol porovnaný s výskytom vírusu u fretiek, ktorým bola podaná kontrolná
DNA, metódou dvojsmernej analýzy variancie. Výskyt u fretiek očkovaných HA+NP+M1 DNA sa príliš nelíšil od hodnôt zistených u fretiek očkovaných homológnou HA DNA (p=0,064).
Obr. 36 Sekvencia VÍR.
Príklady uskutočnenia vynálezu
Uvádzame nasledujúce príklady na ďalšie upresnenie tohto vynálezu, pričom tento vynález neobmedzujeme na špecifické uskutočnenia uvedené v týchto príkladoch.
Príklad 1
Príprava DNA konštrukcií kódujúcich proteíný ľudských chrípkových vírusov
i) pnRSV-PRNP: Izoláty génu A/PR/8/34 boli získané ' z pAPR-501 [J. F. Young a kol., The Origin of Pandemic
Influenza Viruses, V. G. Laver, Ed. (Elsevier Science Publishing Co., Inc., 1983)] ako fragment EcoRI dlhý 1565 párov báz, vyplnený Klenowom a klonovaný do miesta Xbal ; v pRSV-BL, ktoré bolo doplnené Klenowom a ošetrené fosfatái zou. pRSV-BL bol konštruovaný najskôr štiepením vektora | pBL-CAT3 [B. Luckow a C. Schutz, Nuc. Acid. Res. 15, 5490 (1987)] Xhol a Ncol za účelom odstránenia CAT kódujúcej sek; ·· vencie a ďalej ošetrené Klenowom a ligáciou. RSV promótorový ; fragment bol izolovaný ako fragment Ndel a Asp718 z pRšhgrnx [V. Giguere a kol., Náture 330, 624 (1987)], doplnený Klenowom a klonovaný do miesta HindlII intermediátorového vektora uvedeného vyššie (pBL-CAT) bez CAT sekvencie).
ii) Vl-NP: Expresívny vektor VI bol skonštruovaný z pCMVIE-AKI-DHFR [Y. Vhang a kol., J. Virol. 61, 1796 (1987)]. Gény AKI a DHFR boli odstránené štiepením vektora pomocou EcoRI a spätnou ligáciou. Tento vektor neobsahuje intrón A v promótore CMV, takže tam bol tento intrón pridaný ako PCR fragment, ktorý mal deletované vnútorné miesto Sací [v pozícii 1855 podľa číslovania v publikácii B. S. Chapman a kol., Nuc. Acid. Res. 19, 3979 (1991)]. Templátom pre PCR reakciu bol pCMVintA-Lux vytvorený ligáciou fragmentov HindlII a NheI z pCMV6al20 [viď. B. S. Chapman a kol., tiež tam], ktorý obsahuje hCMV-IEl enhancer/promótor a intrón
S A a ich ligáciu do miest HindlII a Xbal v pBL3, čim vznikol pCMVIntBL. Fragment luciferázového génu s dĺžkou 1881 pb (HindlII - Smal doplnenej Klenowom) z RSV-Lux [J. R. de Vet • a kol., Mol. Celí Biol. 7, 725, (1987)] bol klonovaný do • miesta Sali v pCMVIntBL, ktoré bolo doplnené Klenowom t a ošetrené fosfatázou.
Priméry na preklenutie intrónu:
5’primér, SEKV.ID.-5:
5’CTATATAAGCAGA CTAGTTTAG-3’.
3’primér, SEKV.ID:6:
’ 5 ’ -GTAGCAAAGATCTAAGGACGGTGA CTGCAG-3 ’ .
Priméry použité na odstránenie Sací miesta:
negatívny primér, SEKV.ID:7:
5’-GTATGTGTCTGAAAATGAGCGTGGAGATTGGGCTCGCAC-3’ a pozitívny primér, SEKV.ID:8:
5’-GTGCGAGCCCAATCTCCACGCTCATTTTCAGACACATAC-3’.
š PCR fragment bol štiepený Sací a BglII a vložený do vektora, ktorý bol naštiepený rovnakými enzýmami. NP gén z chrípky A (A/PR/8/34) bol vyštiepený z pAPR501 [J. F.
; Young a kol., The Origin of Pandemic Influenza Viruses, ’ΐ · V. G. Laver, ed. (Elsevier Science Publishing Co. , Inc. , j 1983)] ako fragment EcoRI s 1565 pb, jeho konce boli zarovt nané. Vložením do VI v mieste BglII so zarovnanými koncami vznikol VI-NP. Plazmid bol rozmnožený v E. coli a purifikovaný metódou alkalickej lýzy [J. Sambrook, E. F. Tritsch a T. Maniatis, Molecular Clloning, A Laboratory Manual, druhé vydanie (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)]. DNA .. rozdelená CsCl bola precipitovaná etanolom a resuspendovaná v 0,9%-nom fyziologickom roztoku do injekcie 2 mg/ml.
Príklad 2 ’ Test na cytotoxické T-lymfocyty proti ľudskému chrípkovému vírusu.
.i ‘i t
’jl Cytotoxické T-lymfocyty boli získané z myší, ktoré boli i imunizované DNA, alebo ktoré sa zotavili z nákazy A/HK/68.
IF v ϊ
Kontrolné kultúry bolí odobrané z myší, ktoré boli očkované kontrolnou DNA a z myší bez očkovania. Boli pripravené suspenzie jednotlivých buniek, červené krvinky boli odstránené lýzou chloridom amónnym a slezinové bunky boli pestované v RPMI 1640 s prídavkom 10% hovädzieho fetálneho séra (FBS), penicilínom v množstve 1000 U/ml, streptomycínom v množstve 100 gg/ml, 0,01 M HEPES (pH 7,5) a 2 mM 1-glutamínom. K rovnakým množstvám totožných ožiarených stimulujúcich buniek, ktoré boli pulzované po dobu 60 minút epitopom NP147-155 prístupným v mieste H-2K*^ (Thr Tyr Gin Arg Thr Arg Ala Leu Val, SEKV.ID:9:) v koncentrácii 10 μΜ alebo infikovanými chrípkou A(PR/8/34 (H1N1), bolo pridaných 10 U/ml rekombinantného ľudského IL-2 (Cellular Products, Buffalo, NY) a kultúry boli pestované po dobu 7 dní pri teplote 37 °C v atmosfére 5% CO2 a v 100% relatívnej vlhkosti. Vo vybraných experimentoch boli na miesto autológnych stimulátorových buniek pridané rhIL-2 (20 U/ml) a Con A (2 gg/ml). Efektorová aktivita cytotoxických T-buniek bola určená bunkami P815 značenými 3 h izotopom ^^Cr v intenzite 60 gCi na 10^ buniek a pulzovaním NP147-155 podľa vyššie uvedeného postupu alebo infekciou chrípkou A/Victoria/73 (H3N2). Kontrolné bunky (označené bunky P815 bez peptidu alebo vírusu) neboli lyzované. Recipientné bunky boli umiestnené do misiek s 96 oddeleniami v množstve 1 x 104 na kruhovú komôrku a inkubované s efektormi po dobu 4 hodiny v troch uskutočneniach. Supernatant (30 μΐ) bol odobratý z každej komôrky a spočítaný na scintilačnom odčítači Bateplate (LKB-Vallac, Turku, Finland). Pre každú konečnú prípravu boli určené maximálne impulzy uvoľnené pridaním 6 M HC1 a spontánne impulzy uvoľnené bez CTL. Percenta špecifickej lýzy boli počítané následovne:
[(experimentálne-spontánne)/(maximálne-spontánne)] x 100
Príklad 3
Príprava NP-špecifických cytotoxických T-lymfocytov in vivo:
Myši BALB/c boli očkované do štvorhlavého svalu na oboch končatinách plazmidom cDNA kódujúcim A/PR/8/34 nukleoproteín odvodený od promótora buď z Rous sarcoma vírusu alebo cytomegalovírusu.
Boli použité tieto expresívne vektory:
1) pnRSV-PRNP, viď. príklad 1, ii) Vl-NP, viď príklad 1.
Použitými laboratórnymi zvieratami boli myši BALB/c získané z laboratória Charles River Laboratories, Raleigh, NC. Myši boli získané vo veku 4 až 5 týždňov a boli prvýkrát očkované DNA vo veku 5 až 6 týždňov. Pokiaľ nie je uvedené inak, bola DNA vždy aplikovaná do štvorhlavého svalu oboch končatín, pričom každá končatina obdržala 50 μΐ sterilného fyziologického roztoku obsahujúceho 100 pg DNA. Myši dostali 1, 2 alebo 3 sady očkovania v trojtýždňových intervaloch. Negatívne zvieracie kontroly neboli buď vôbec očkované alebo boli očkované vhodným prázdnym vektorom, do ktorého nebol vložený gén NP.
Prítomnosť alebo absencia NP plazmidu DNA vo svaloch vybratých zvierat bola zisťovaná metódami PCR (obr. 1). Plazmidovéi DNA (buď NP alebo luciferázy) bola nájdená u 44 zo 48 očkovaných svalov. U myší, očkovaných DNA pre luciferázu bola určená expresia proteínu aktivitou luciferázy v extraktoch zo svalov získaných podľa metód odborníkom v danej oblasti techniky dostatočne známych [J. A. Volff a kol., Science 247, 1465 (1990); G. Ascadi a kol., Náture 352, 815 (1991); H. Lin a kol., Circulation 82, 2217 (1990); R. N. Kitsis a kol., Proc. Natl. Acad. Sci (USA) 88, 4138 (1991); E. Hansen a kol., FEBS Lett. 290, 73 (1991); S. Jiao a kol., Hum. Gene Therapy 3, 21 (1992); J. A. Volff a kol., Human Mol. Genet. 1, 363 (1992)].
Expresia NP vo svaloch po injekcii NP DNA bola pod hladinou detekovatelnosti analýzou Vestern blot (< 1 ng), ale bola zistená tvorbou NP-špecifických protilátok (viď. obr.
2) . Na analýzu tvorby NP-špecifických cytotoxických
T-lýmfocytov boli 1 až 4 týždne po imunizácií odobraté pokusným zvieratám sleziny a slezinové bunky boli restimulované autológnymi slezinovými bunkami, ktoré boli buď indikované chrípkou A (A/PR/8/34) alebo pulzované peptidovým epitopom H-2K^_ (NP zvyšok 147 až 155, viď. 0. K. Rotzscke a kol., Náture 348, 252 (1990)), plus rekombinantným ľudským IL-2. Slezinové bunky, ktoré boli restimulované syngénnymi bunkami infikovanými vírusom alebo pulzovanými epitopom, boli schopné zabíjať recipientné bunky pulzované nukleoproteínovým epitopom (obr. 3A). To naznačuje, že vnútrosvalové injekcie NP DNA vytvorili peptid odvodený od NP v asociácii s MHC proteínmi Γ. triedy vhodný na indukciu odpovede špecifických cytotoxických T-lýmfocytov. Tieto CTL boli schopné rozpoznať a lyžovať cieľové bunky nakazené vírusom, (obr. 3B) alebo bunky pulzované peptidovým epitopom nukleoproteínu H-2K*^- a vírusom infikované bunky. To dokazuje ich špecifickosť a ich schopnosť rozpoznať epitop vytvorený prirodzenou cestou v infikovaných bunkách.
Oveľa prísnejším meraním imunogenicity NP DNA vakcíny bolo hodnotenie odpovedí primárnych CTL. Slezinové bunky odobrané myšiam očkovaným NP DNA boli aktivované stykom s Con A a IL-2, ale neprekonali pred testom na ich schopnosť zabíjať patričné cieľové bunky restimuláciu in vitro bunkami exprimujúcimi antigén. Slezinové bunky myší, očkovaných NP DNA boli po in vitro aktivácii pomocou ConA a IL-2 bez restimulácie na špecifický antigén schopný lyžovať tak cieľové bunky pulzované epitopom, ako aj bunky infikované vírusom (obr. 3C a D). Táto lytická aktivita restimulovaných a aktivovaných slezinových buniek je porovnateľná s podobným spôsobom spracovanými slezinovými bunkami myší, ktoré boli vopred infikované chrípkou A/HK/68 a virulentným kmeňom H3N2 prispôsobeným pre myši, ktorý sa objavil 34 rokov po A/PR/8/34 (H1N1). Takže očkovanie NP DNA vyvolalo tvorbu cytotoxických T-lýmfocytov, ktoré boli špecifické pre epitop nukleoproteínu a ktoré boli schopné rozpoznať prirodzenou cestou spracovaný antigén (t.j. mohli zabíjať bunky infikované vírusom). NP CTL boli taktiež vytvorené v transgénnych myšiach C3H a B6 exprimujúcich ľudský HLA-A2.
NP CTL boli zistené v slezinách myší BALB/c očkovaných takými malými dávkami ako je 1 dávka 1 pg NP DNA (najmenšia testovaná dávka) (tabuľka 3-IV).
Tabuľka 3-IV
Odpovede cytotoxických T-lymfocytov u myši po jedinej injekcii NP DNA.
inokulum | dávka(pg) | % Špecifickej lýzy | sd |
NP DNA | 400 | 52,5 | 10,7 |
400 | 80,4 | 10,3 | |
NP DNA | 200 | 75,6 | 5,4 |
200 | 44,6 | 4,4 | |
NP DNA | 100 | 76,7 | 2,9 |
100 | 35,6 | 8,9 | |
NP DNA | 50 | 62,9 | 0,6 |
50 | 76,7 | 7,4 | |
NP DNA | 10 | 83,2 | 10,1 |
10 | 37,7 | 2,5 | |
NP DNA | 1 | 44,2 | 0,3 |
1 | 13 | 2 | |
Kontrolná DNA | 100 | 4,9 | 1 |
Chrípka | 79,3 | 8,3 |
Tabuľka 3-IV: Samice myší BALB/c (4 až 6 týždňov) boli očkované jedinou dávkou A/PR/34 NP DNA (V1JNP) alebo kontrolnou DNA (V1JNP) v dávkach vyznačených v tabuľke. Na porovnanie boli myši infikované chrípkovým vírusom A/PR/34. Po ôsmich týždňoch boli získané CTL, restimulované in vitro syngénnymi slezinovými bunkami pulzovanými NP peptidom a testované proti bunkám P815 pulzovanými NP peptidom v pomere efektor:cieľová bunka 50:1. Výsledky sú uvedené ako špecifická lýza pre jednotlivých zástupcov myší.
Nasledujúce experimenty ukázali, že myší, ktoré obdržali jedinú dávku 1 pg NP DNA, si udržovali NP CTL počas najmenej 4,5 mesiaca (najdlhšie testované obdobie). Sila odpovede CTL po injekcii DNA bola porovnateľná s odpoveďou u myší infikovaných chrípkou. Je však potrebné upozorniť, že analýza CTL po antigénnej restimulácii in vitro nie je celkom kvantitatívna. Preto v súčasnej dobe vyvíjame testy s obmedzenými riedeniami, aby sme mohli presnejšie určiť hladiny NP-špecifických CTL u myší. Myši, ktoré boli očkované 3 dávkami NP DNA po 100 pg, vykazovali prítomnosť odpovedi CTL ešte najmenej 6 mesiacov po očkovaní (obr. 19). Chrípková PNV má teda schopnosť vyvolať dlhodobé odpovede
CTL namierené proti konzervovaným antigénom chrípkových vírusov.
Očkovanie protilátok IgG myší NP DNA viedlo k vzniku veľkého titra anti-NP (obr. 2). Tvorba vysokého titra IgG protilátok u myší teda vyžaduje CD4+T pomocné bunky (P.
Vieira a K. Rajewsky, Int. Immunol. 2, 487 (1990)). To dokazuje, že NP exprimovaný z plazmidu in situ bol spracovaný oboma triedami MHC, t.j. trieda I a II.
Príklad 4
Obrana myší pri nákaze virulentným vírusom ľudskej chrípky:
Úloha NP protilátok v obrannej imunite pri chrípke je demonštrovaná na dvoch prístupoch: po prvé, titer vírusu v pľúcach bol určený v experimentoch pasívneho prenosu. Samice myší BALB/c vo veku lo týždňov alebo mladšie boli očkované intraperitoneálne 0,5 ml séra (riedeného v 2,0 ml PBS) odobratého od myší, ktoré boli trikrát očkované 200 gg NP DNA. Kontrolné myši boli očkované rovnakým množstvom (tiež riedeným v 2,0 ml PBS) zobratého normálneho myšieho séra alebo sérom odobraným od myší, ktoré prekonali infekciu A/HK/68. Dávka imunného séra proti A/HK/68 bola upravená tak, aby bol titer anti-NP protilátok v ELISA teste rovnaký s titrom u séra myší očkovaných NP DNA. Myši boli infikované . - 44 í i bez anestézie 104 TCID^q z A/HK/68 2 hodiny po injekcii séra
Ia ďalšie injekcie rovnakého množstva séra im boli aplikované o 3 dni neskoršie. Myši boli utratené 6 a 7 dní po infekcii ! a bol zmeraný pľúcny titer vírusu v TCID^q na ml metódou opísanou vyššie [J. Immunol. 146, 321, 1991].
Myšiam, ktoré ešte neprišli do styku s infekciou, bolo infúziou aplikované anti-NP sérum a potom boli vystavené infekcii A/HK/68. Pre vírusovú infekciu bol vybratý kmeň A/HK/68 upravený pre myši a následne udržovaný pasážovanim v myšiach in vivo (Dr. I. Mbawuike, osobný rozhovor). Použitý zdroj nákazy bol homogenát pľúc infikovaných myší majúci titer infekčnosti 5 x 10® TCID^g/ml na bunkách MDCK. Na : určenie pľúcneho titra vírusu a štúdie úbytku telesnej hmotnosti bola nákaza vykonávaná na slepo intranazálnym zavede* ním 20 μΐ obsahujúcich 104 TCID^q do nozdier neuspaných myší, čo vedie k progresívnej infekcii pľúc vírusom, ale nie í. ' je pre myší BALB/c smrteľná [Yetter, R. A. a kol. , Infect.
Immunity 29, 654, 1980]. V experimentoch s počtami prežíva| júcich myší boli myši vystavené infekcii 20 μΐ obsahujúcimi ) 10 ’ TCID^q zavedenými do nozdier myší pri totálnej aneste; - zii ketamínom a xylazínom. Nákaza uspaných myší touto dávkou í spôsobuje rýchlu infekciu pľúc s úmrtnosťou 90 až 100 % ‘ ‘ u neimunizovaných myší [J. L. Schulman a E. D. Kilnourne, J.
Exp. Med. 118, 257, 1963; G. H. Scott a R. J. Sydiskis,
Infect. Immunity 29, 654, 1980)]. Titer vírusu v pľúcach bol určený sériou titrácií na bunkách MDCK získaných z ATCC, Rockville, MD) v 96-komôrkových doštičkách podľa metódy opí, sanej Moranom a kol., (tiež tam).
U myší, ktoré obdržali anti-NP antisérum (6,3 +/-0,2; stredná hodnota +/- SEM; n = 4), nebolo zistené žiadne zníženie titra v pľúcach v porovnaní s kontrolnými myšami, ktoré obdržali normálne sérum (6,1 +/- 0,3; stredná hodnota
J +/- SEM; n =4). Ako pozitívna kontrola bolo myšiam, ktoré boli infikované A/HK/68, odobraté sérum a pasívne prenesené do myší, ktoré ešte neprišli do styku s infekciou. Po infekcii A/HK/68 nebola v ich pľúcach nájdená žiadna vírusová infekcia, čo naznačuje, že toto sérum proti celým vírusom
poskytovalo kompletnú ochranu vírusmi. V druhom prístupe boli proti infekcii homológnymi myši, ktoré ešte neprišli do styku s infekciou, očkované purifikovaným NP (5 gg/sval, 3 krát v priebehu 6 týždňov) aplikovaným vnútrosvalovou injekciou. Tieto myši vykazovali vysoký titer NP-špecifických protilátok, avšak nevytvorili NP-špecifické CTL a neboli chránené proti smrteľným dávkam vírusov. Kolujúce IgG anti-NP protilátky, na rozdiel od neutralizačného účinku protilátok na celý vírus, neposkytujú myšiam obrannú imunitu.
Obranná účinnosť očkovania NP DNA in vivo bola vyhodnotená preto, aby ukázala, či imunitná odpoveď sprostredkovaná bunkami mala nejakú funkčnú významnosť. Jedným priamym meraním účinnosti imunitnej odpovede bola schopnosť myší prvýkrát imunizovaných NP DNA vyčistiť sa od progresívnej subletálnej infekcie pľúc heterológnym kmeňom chrípky (A/HK/68; H3N2). Vírusové infekcie boli vykonávané postupom uvedeným vyššie. Myši očkované NP DNA mali 7. deň po nákaze titer vírusu v pľúcach (1,0 +/-1,0; stredná hodnota .+/- SEM; n = 4) alebo u myší, ktoré boli očkované prázdnym vektorom (4,5 +/- 0,0; stredná hodnota +/- SEM; n = 4). V skutočnosti mali tri zo štyroch očkovaných myší nezistiteľný titer vírusu v pľúcach, zatiaľ čo žiadna z kontrolných myší sa v tejto dobe vírusu nezbavila. Výrazný rozdiel v titre vírusu v pľúcach pozorovaný v tomto experimente a šiestich ďalších ukazuje, že imunitná odpoveď urýchľuje odstránenie vírusu z organizmu. Nedostatočný obranný účinok kontroly s prázdnym vektorom potvrdzuje, že DNA sama osebe nebola za imunitnú odpoveď zodpovedaná. Naviac, pretože napádajúci kmeň vírusu A/HK/68 (virulentný H3N2 kmeň prispôsobený pre myši) bol heterológny ku kmeňu A/PR/8/34 (H1N1), z ktorého bol NP gén klonovaný, bola imunita jasna heterotypová.
Ako meradlo úmrtnosti spôsobené vírusom bol sledovaný úbytok hmotnosti chrípkou A/HK/68 myši (alebo myši u myší, ktoré boli subletálne nakazené po očkovaní NP DNA (obr. 4). Neočkované očkované prázdnym vektorom) boli použité ako kontrola. Myši imunizované NP DNA vykazovali v porovnaní í
í i;
Is kontrolnými myšami menši úbytok telesnej hmotnosti a rýchlejšie sa po infekcii vracali k svojej pôvodnej hmotnosti pred očkovaním.
/ Intranazálna infekcia myší pri totálnej anestézii spôsobí rýchle rozšírenie replikujúcich sa vírusov v pľúcach a smrť za 6 až 8 dní, pokiaľ nie je táto infekcia pod kontrolou (R. A. Yetter a kol., Infect. Immunity 29, 654 (1980)). Prežívanie myší vystavených tejto metóde odráža ich schopnosť obmedzovať nebezpečnosť akútnej infekcie pľúc. Bola študovaná schopnosť myší prežiť infekciu dvoma rôznymi ; kmeňmi chrípky, A/HK/68 (viď. obr. 5) a A/PR/8/34. Myši vopred očkované NP DNA vykazovali 90 % prežívajúcich jedincov ; v porovnaní s 0 % prežívajúcich myší očkovaných prázdnym vektorom a 20 % u neočkovaných myší (obr. 5). V celkovom ‘ počte 14 týchto štúdií vykazovali myši očkované NP DNA prinajmenšom o 50 % vyšší počet prežívajúcich zvierat než kon; ’ trolné skupiny. Takže imunitná odpoveď vyvolaná NP DNA účin| ne urýchľuje uzdravenie a zmierňuje ochorenie spôsobené b
' vírusom iného kmeňa vzniknutého až o 34 rokov neskoršie, i
‘ podporuje princíp zamerania na konzervované proteíny za účeI . lom tvorby odpovede cytotoxických T-lymfocytov.
Príklad 5
Izolácia génov z izolátov chrípkových vírusov
V ATCC je uložených mnoho starších kmeňov chrípkových vírusov (Katalóg živočíšnych vírusov a ntisér 1990, Chlamydiae & Rickettsiae, 6. vyd., uvádza 20 chrípok kmeňa A a 14 chrípok kmeňa B).
A. Kmene vírusov a purifikácia
Chrípkové kmene, ktoré zahrňujú súčasnú vakcínu chrípkovej sezóny 1992, boli získané od Dr. Nancy J. Cox ; z Division of Viral and Reckettsial Diseases, Center of
Disease Control, Atlanta, GA. Sú to tieto kmene: (1)
- 47 i j A/Beijing/353/89 (H3N2); (2) A/Texas/36/91 (H1N1); (3)
B/Panama/45/90 a (4) A/Georgia/03/93.
Všetky tieto vírusy boli pestované pasážovaním v 9 až
I 11 týždňových kuracích zárodkoch (okrem A/Georgia, ktorý bol pestovaný v bunkách MDCK) v množstve 100 až 200 na vírusový prípravok a čistené upravenou metódou opisovanou Massicotom a kol., (Virology 101, 242 až 249 (1980)). Stručne povedané, suspenzie vírusov boli purifikované centrifugáciou pri 8000 οΐ/min (centrifúga Sorwall RC5C, rotor GS-3), a potom peletované centrifugáciou pri 18 000 ot/min po dobu 2 hodín i v centrifúge Beckman rotor 19. Peletovaný vírus bol resuspendovaný v STE (0,1 M NaCl, 20 mM Tris, pH 7,4, 1 mM EDTA) * a centrifugovaný pri 4 000 οΐ/min (centrifúga Hermle Z 360), aby sa odstránili agregáty. 2 ml supernatantu boli navrstve4 né na nespojitý sacharózový gradient obsahujúci 2 ml ' 60%-nej sacharózy prevrstvenej 7 ml 30%-nej saicharózou tlmeŕ ’ nou STE a centrifugované pri 36 000 οΐ/min (rotor SV-40,
L ) centrifúga Beckman) po dobu 90 minút. Viazaný vírus sa í nazhromaždil na medzifáze, bol rozpustený v desaťnásobku STE , a peletovaný pri 30 000 οΐ/min po dobu 2 hodiny (Beckman,
- rotor Ti45). Vyzrážaný vírus bol potom zmrazený pri -70 ’C.
• j i
í * B. Extrakcia vírusovej RNA a syntéza cDNA
Vírusová RNA bola purifikovaná zo zmrazeného vírusu pomocou guanidíntiokyanátovej extrakcie za použitia komerčne dodávaného setu (Strategene, La Jolla, CA) používajúci metódu Chomczynského a Sacchi (Anál. Biochem. 162, 156 až 159 (1987)). Dvoj vláknová cDNA bola pripravená z vírusovej RNA za použitia komerčne dodávanej súpravy cDNA synthesis kit . (Pharmacia) podľa návodu dodávateľa s niekoľkými úpravami.
Prvý reťazec cDNA bol pripravený za použitia syntetického
:.j oligodeoxyribonukleotidu, 5 ’ -AGCAAAAGCAGG-3 ’ , SEKV.ID:30:,
- ktorý je komplementárny ku konzervovanej sekvencii umiestne! nej na 3’-konci vírusovej RNA génov kmeňa A. Táto sekvencia je bežná u všetkých RNA chrípkových vírusov typu A a teda poskytuje metódu na klonovanie génov akéhokoľvek chrípkového
I vírusu typu A. Po skončení syntézy prvého a druhého reťazca cDNA reakcia pokračovala skôr fenol/chloroformovou extrakciou a precipitáciou etanolom než podľa inštrukcií v návode súpravy. Zarovnané konce molekúl cDNA boli ligované priamo do vektora VIJneo alebo VIJns, ktoré boli štiepené reštrikčným enzýmom BglII, ich konce zatupené T4 DNA a vystavené reakcii teľacej intestinálnej alkalickej fosfatázy.
Na vyhľadanie určitých vírusových génov v plnej dĺžke sú použité syntetické oligodeoxyribonukleotidy, ktoré boli navrhnuté tak, aby komplementovali 3’-koniec konca translač1 ného otvoreného čítacieho rámca daného vírusového génu.
Vzorky, ktoré sa zdali byť celými génmi pomocou reštrikčného ’ mapovania a určenia veľkosti v elektroforéze na agarózovom géli boli overené sekventovanim dideoxynukleotidmi oboch s spojov každého vírusového génu s VIJneo. Sekvencie spojov každého tohto génu klonovaného z týchto vírusov sú uvedené nižšie v príklade 8.
Podobná stratégia bola použitá na klonovanie cDNA iä z každého vírusu uvedeného vyššie okrem B/Panama/45/90, kto§ rý nemá túto spoločnú sekvenciu na každom konci vírusovej t
Ij RNA. Na syntézu prvého reťazca cDNA bola použitá zmes oligo• deoxyribonukleotidov. Toto sú použité priméry:
(1) | 5’-AGCAGAAGCGGAGC-3’, | SEKV.ID:31: | pre PB1 a PB2, | |
(2) | 5’-AGCAGAAGCAGAGCA-3’ | , SEKV.ID:19: | : pre NS a HA, | |
(3) | 5’-AGCAGAAGCACGCAC-3’ | , SEKV.ID:22: | pre M a | |
(4) | 5’-AGCAGAAGCACAGCA-3’ | , SEKV.ID:23: | pre NP. |
Pre gény klonované PCR bol ako templátová DNA použitý DNA roztok cDNA so zatupenými koncami priamo na použitie v PCR reakcii. Priméry použité na klonovanie 6 chrípkových génov získaných PCR sú nasledujúce:
1. HA gén z A/Georgia/03/93 negatívny primér: SEKV.ID:33: 5’GCT ACA ACC ATG AAG ACT ATC ATT GCT TTG AGC 3’ pozitívny primér: SEKV.ID:34:
5’CCA CAT AGA TCT TCA AAT GCA AAT GTT GCA CCT AAT G 3’ !
- 49 ιϊ j 2. HA gén z A/Texas/36/91 í negatívny primér: SEKV.ID:35:
t 5’GGT ACA ACC ATG AAA GCA AAA CTA CTA GTC CTG TTA TG 3’ pozitívny primér: SEKV.ID:36:
5’CCA CAT TCA GAT GCA TAT TCT ACA CTG CAA AG 3’
Všetky chrípkové gény, či už cDNA alebo vytvorené PCR, boli overené sekventovaním v ligačných miestach v génoch a gény boli exprimované v transfektovaných RD bunkách.
: Expresia bola zisťovaná imunoblotmi.
«
Konštrukcie NP a Ml pre kmeň A/H3N2 (vektory 4 a 5) bo1 li vytvorené z génu z A/Beijing/353/89. Tieto gény boli vybraté z dôvodu ich dostupnosti a na základe predpokladu vy'· sokej konzervácie oboch NP a Ml génov.
Z predchádzajúceho výskumu bola vybratá skupina 7 s zvlášť vhodných expresívnych vektorov, ktoré sú kombinované
pri | príprave | vakcíny: | ||
1. | VIJns-HA | (A/Georgia/03/93) | 6,56 | Kb |
2. | VIJns-HA | (A/Texas/36/91) | 6,56 | Kb |
3 . | VIJns-HA | (B/Panama/45/90) | 6,61 | Kb |
4. | VIJns-NP | (A/Beij ing/353/89) | 6,42 | Kb |
5 . | VIJns-Ml | (A/Beij ing/353/89) | 5,62 | Kb |
6. | VIJns-NP | (B/Panama/45/90) | 6,54 | Kb |
7. | VIJns-Ml | (B/Panama/45/90) | 5,61 | Kb |
Dôležité | sekvencie spojenia týchto génov v daných |
expresívnych vektoroch sú uvedené ďalej. Len malá časť konštrukcií vyžadovala sekventovanie na potvrdenie správnosti génu, ktorý bol klonovaný. Porovnaním s podobnými známymi génmi bolo ľahké potvrdiť, či daný gén je NP gén, HA gén alebo Ml gén, atď. Napríklad sekvencia HA génu A/Texas je veľmi podobná sekvencii HA génu z A/Kiev/59/79, ktorá je k dispozícii v GENBANK pod registračným číslom M38353. Podobne HA sekvencia z B/Panama je veľmi podobná HA sekvencii z B/England/222/82, ktorá je v GENBANK dostupná po registračným číslom M18384. Podobným spôsobom bola potvrdená totožnosť akejkoľvek sekvencie daných génov z ktoréhokoľvek
- 50 r.
ľudského chrípkového vírusu. V každej z nižšie príkladov boli potvrdené tak 3’sekvencie, aby bolo zaručené, že V každom prípade označuje tučné ATG uvedených ako aj celý gén.
5’sekvencie, je prítomný počiatočný kodón chrípkového génu, zatial čo tučná sekvencia na 3'konci označuje terminačný kodón:
1. VlJns-HA (A/Georgia/03/93) 6,56 Kb:
5'sekvencia: (SEKV.ID:46:)
...TCA CCG TCC TTA GAT C/GG TAC AAC CAT GAA GAC TAT CAT TGC TTT GAG CTA CAT TTT ATG TCT GGT ttt m r í; j ) l i i i
3'sekvencia: (SEKV.ID:47:)
...TCA TGC TTT TTG CTT TGT GTT GTT TTG CTG GGG TTC ATC ATG TGG GCC TGC CAA AAA GGC AAC ATT AGG TGC AAC ATT TGC ATT TGA A/GA TCT ATG TGG GAT CTG CTG TGC...
2. VlJns-HA (A/Texas/36/91) 6,56 Kb:
5’sekvencia: (SEKV.ID:48:)
... TTA GAT C/GG AAC ATG AAA GCA AAA CTA CTA GTC CTG TTA TGT GCA TTT ACA GCT ACA TAT GCA ....
3'sekvencia: (SEKV.ID:49:)
...CTG GTG CTT TTG GTC TCC CTG GGG GCA ATC AGC TTC TGG ATG TGT TCT AAT GGG TCT TTG CAG TGT AGA ATA TGC ATC TGA ATG TGG /GAT CTG CTG TGC CTT....
3. VlJns-HA (B/Panama/45/90) 6,61 Kb:
5’sekvencia: (SEKV.ID:50:)
...CCT TAG ATC/ GGT ACA. ACC ATG AAG GCA ΑΤΑ ATT GTA CTA CTC ATG GTA GTA ACA TCC AAC GCA GAT CGA ATC TGC ACT GGG ATA ACA TCT TCA AAC TCA CCT CAT GTG....
3’sekvencia: (SEKV.ID:51:)
...TTG GCT GTA ACA TTG ATG ATA GCT ATT TTT ATT GTT TAT ATG GTC TCC AGA GAC AAT GTT TCT TGC TCC ATC TGT CTA TAA ATG TGG /GAT CTG CTG TGC CTT...
4. VIJns-NP (A/Beijing/353/89) 6,42 Kb:
5’sekvencia: (SEKV.ID:52:)
...GTC CTT AGA TC/C ACC ATG GCG TCC CAA GGC ACC AAA CGG TCT TAT GAA CAG ATG GAA ACT GAT GGG GAA CGC CAG AAT GCA ACT ...
3’sekvencia: (SEKV.ID:53:)
...GAA AAG GCA ACG AAC CCG ATC GTG CCC TCT TTT GAC ATG AGT AAT GAA GGA TCT TAT TTC TTC GGA GAC AAT GCA GAA GAG TAC GAC AAT TAA G/GA TCT GCT GTG CCT...
5. VIJns-Ml (A/Beijing/353/89) 5,62 Kb:
5’sekvencia: (SEKV.ID:54:)
...CTT AGA TC/C AGA TCT ACC ATG AGT CTT CTA ACC GAG GTC GAA ACG TAT GTT CTC TCT ATC GTT CCA TCA GGC CCC CTC AAA GCC GAA ATC GCG CAG AGA CTT GAA GAT GTC TTT GCT GGG AAA AAC ACA GAT...
j 3'sekvencia: (SEKV.ID:55:)
I GGG ACT CAT CCT AGC TCC AGT ACT GGT CTA AAA GAT í GAT CTT CTT GAA AAT TTG CAG ACC TAT CAG AAA CGA '' ATG GGG GTG CAG ATG CAA CGG TTC AAG TGA AGA TCT
ATG TGG/ GAT CTG CTG ŤGC CTT...
6. VIJns-NP (B/Panama/45/90) 6,54 Kb:
5'sekvencia: (SEKV.ID:56:)
...CTT AGA TC/C ACC ATG TCC AAC ATG GAT ATT GAC GGT ATC AAC ACT GGG ACA ATT GAC AAA ACA CCG GAA GAA ATA ACT TCT...
3'sekvencia: (SEKV.ID:57:)
...GTT GAA ATT CCA ATT AAG CAG ACC ATC CCC AAT TTC TTC TTT GGG AGG GAC ACA GCA GAG GAT TAT GAT GAC CTC GAT TAT TAA G/GA TCT GCT GTG...
7. VIJns-Ml (B/Panama/45/90) 5,61 Kb:
5'sekvencia: (SEKV.ID:58:)
...CTT AGA TC/C ACC ATG TCG CTG TTT GGA GAC ACA ATT GCC TAC CTG CTT TCA TTG ACA GAA GAT GGA GAA GGC AAA GCA GAA CTA GCA GAA AAA TTA ...
3'sekvencia: (SEKV.ID:59:)
...AGA TCT CTT GGG GCA AGT CAA GAG AAT GGG GAA GGA ATT GCA AAG GAT GTG ATG GAA GTG CTA AAG CAG AGC TCT ATG GGA AAT TCA GCT CTT GTG AAG AAA TAC CTA TAA G/GA TCT GCT GTG...
j Príklad 6 | VIJ expresívny vektor, SEKV.ID.10:
Našim zámerom pri konštrukcii V1J bolo odstrániť z nášho vektora VI promótor a terminátor transkripcie, aby sme ich mohli umiestniť na výhodnejšie pozície a vytvoriť tak celistvej ši vektor a získať vyššie výťažky pri jeho purifikácii.
V1J je odvodený od vektora VI (viď. príklad 1) a pUC18, ktorý je bežným komerčne dodávaným plazmidom. VI bol štiepený reštrikčnými enzýmami SspI a EcoRI dávajúcimi dva fragmenty DNA. Menší z týchto fragmentov obsahujúci promótor CMVintA a terminátor hovädzieho rastového hormónu (BGH), s ktoré kontrolujú expresiu heterológnych génov (SEKV.ID:11:), bol získaný elektroforézou v agarózovom géli a následnou purifikáciou. Konce tohto fragmentu boli potom zarovnané T4 i DNA polymerázou, aby mohli byť ligované so zarovnanými koncami iného DNA fragmentu.
pUC18 bol zvolený, aby vytvoril chrbticu expresívneho | vektora. Je známy pre vysoké výťažky, ktoré poskytuje, jeho i sekvencie a funkcie sú dobre preštudované a má minimálnu veľkosť. Z tohto vektora sme čiastočným štiepením reštrikčným enzýmom HaelI odstránili celý lac operon, čo nebolo pre naše účely nevyhnutné a môže byť na škodu pre výťažky plazmidu a expresiu heterológnych génov. Zvyšný plazmid bol purif ikovaný a agarózového gélu, jeho konce boli zatupené T4 .. DNA polymerázou, bol podrobený reakcii s intestinálnou teľacou fosfatázou a ligovaný k vyššie opísanej CMVintA/BGH časti. Získali sme tak plazmidy, ktoré vykazovali niektorú z možných orientácií promótorových častí v chrbtici pUC. Jeden z týchto plazmidov dával oveľa vyššie výťažky DNA v E.
i coli a bol označený VIJ (SEKV.ID:10:). Štruktúra tohto plazmidu bola overená sekvenčnou analýzou oblastí spojov. Tento plazmid potom v porovnaní s VI vykazoval porovnateľnú alebo ' vyššiu expresiu heterológnych génov.
- §4 í Príklad 7 | Konštrukcie génov chrípkového vírusu vo vektore V1J
Z chrípkového vírusu kmeňa A/PR/8/34 bolo do expresívneho vektora V1J klonovaných mnoho týchto génov, čím, ako uvádza príklad 4, sa zvýšila hladina expresie na rovnakú alebo aj vyššiu úroveň než u vektora VI. Sekvencie génu PR8 sú dostupné v databáze GENBANK. U všetkých fragmentov nižšie uvedených klonovaných génov bola ich veľkosť overená gélovou elektroforézou a u každej sekvencie je uvedené registračné číslo sekvencie v GENBANK, podľa ktorej boli fragmenty ‘ porovnávané. Metódy získania génov z vírusových kmeňov ako napríklad u vírusu získaného z ATCC (A/PR/8/34 je ATCC ’ VR-95; v ATCC je k dispozícii mnoho ďalších kmeňov) sú uvei; dené v príklade 5 .
t í A. Subklonovanie génov PR8 do VIJ
1. NP gén
NP gén bol subklonovaný z pAPR501 (J. F. Young, U.
t j Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Shatzman a M. Rosenberg (1983) v The Origins of Pandemic Influenza Viruses, vyd. V. G. Laver (Elsevier, Amsterdam) str. 129 až 138). Gén bol získaný excíziou pAPR501 pomocou EcoRI, fragment bol purifikovaný a konce zarovnané T4 DNA polymerázou. Zatupený . fragment bol vložený do VIJ štiepeného BglII a taktiež zatupeného T4 DNA polymerázou. Klonovaný fragment bol dlhý 1,6 kb.
2. NS
NS gén bol subklonovaný z pAPR801 (J. F. Young, U, l
j Desselberber, P. Graves, P, Palese, A, Shatzman a M. Rosen·, berg (1983) v The origins of Pandemic Influenza Viruses, i vyd. V. G. Laver (Elsevier, Amsterdam) str. 129 až 138), ΐ
excíziou pAR801 pomocou EcoRI, fragment bol purifíkovaný z gélu a zatupený T4 DNA polymerázou. Zatupený vložený do VIJ taktiež štiepeného BglII fragment bol a taktiež zarovnaného T4 DNA polymerázou. Klonovaný fragment bol dlhý
0,9 kb (kompletná kódujúca oblasť NS obsahuje NS1 a NS2).
3. HA
HA gén bol suklonovaný z pJZ102 (J. F. Young, U. Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Shatzman a M. Rosen. berg (1983) v The Origins of Pandemic Influenza Viruses, vyd. E. G. Laver (Elsevier, Amsterdam) str. 129 až 138) . excíziou pJZ102 pomocou HindlII, fragment bol purifikovaný z gélu a zatupený T4 DNA polymerázou. Zatupený fragment bol a vložený do V1J taktiež štiepeného BglII a taktiež zarovnaného T4 DNA polymerázou. Klonovaný fragment bol dlhý 1,75 kb.
j j 4. PB1
PB1 gén bol subklonovaný z pGeml-PBl (5'koncové | a 3'koncové spoje týchto génov s vektorom boli sekventované, | aby sa potvrdila ich totožnosť, viď. J. F. Young, U. DesselK * berber, P. Graves, P. Palese, A. Shatzman a M. Rosenberg (1983) v The Origins of Pandemic Influenza Viruses, vyd. V.
G. Laver (Elsevier, Amsterdam) str. 129 až 138). Excíziou s pGem-PBl pomocou HindlII bol získaný fragment, ktorý bol purifikovaný z gélu a zatupený T4 DNA polymerázou. Zatupený 5 fragment bol vložený do V1J taktiež štiepeného BglII a taktiež zarovnaného T4 DNA polymerázou. Klonovaný fragment bol dlhý 2,3 kb.
5. PB2 i
PB2 gén bol subklonovaný z pGeml-PB2 (5'koncové í' a 3 ’ koncové sekvencie spojov týchto génov s vektormi boli l sekventované, aby sa overila ich totožnosť, viď. , J. F.
! Young, U. Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Shatzman a M. Rosenberg (1983) v The Origins of Pandemic influenza Viruses, vyd. V. G. Laver (Elsevier, Amsterdam) str. 129 až 138). Excíziou pGem-PB2 pomocou BamHI, fragment bol purifikovaný z gélu. Fragment s presahujúcimi koncami bol vložený do VIJ taktiež štiepeného BglII. Klonovaný fragment bol dlhý 2,3 kb.
6. Ml
Ml gén bol vytvorený technikami PCR z plazmidu p8901 ΜΙΤΕ. M sekvencie v tomto plazmide boli vytvorené PCR z pAPR701 (J. F. Young, U. Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Shatzman a M. Rosenberg (1983) v The Origins of Pandemic Influenza Viruses, vyd. V. G. Laver (Elsevier, Amsterdam) str. 129 až 138) za použitia oligoméru 5’-GGT ACA AGA TCT ACC ATG CTT CTA ACC GAG GTC -3’, SEKV.ID:3: pre negatívny primér a oligoméru 5’-CCA CAT AGA TCT TCA CTT GAA CCG TTG CAT CTG CAC -3’, SEKV.ID:4: pre pozitívny primér. PCR fragment bol purifikovaný gélovou elektroforézou, štiepený BglII a ligovaný do V1J štiepeného taktiež BglII. Klonovaný fragment bol dlhý 0,7 kb. Konečná aminokyselina kódovaná Ml je v negatívnom primére uvedená ako ATG kodón, zatiaľ čo terminačný kodón translácie Ml je kódovaný obráteným kodónom TCA, ktorý je v negatívnom smere terminačným kodónom TGA.
B. Expresívne konštrukcie V1J chrípkového génu
V každom prípade sú uvedené spojové sekvencie z oblasti 5’-koncového promótora (CMVintA). Sekvencie boli vytvorené sekventovaním primárov:
CMVintA primér 5’-CTA ACA GAC TGT TCC TTT CCA TG -3’, SEKV.ID:28:, ktorý tvorí sekvenciu kódujúcu sekvencie. Poloha, v ktorej sa toto spojenie vyskytuje, je označená /, toto označenie neznamená žiadnu nespojitosť v danej sekvencii. Spôsob prípravy týchto konštrukcií je uvedený za zoznamom všetkých daných sekvencií. Každá vytvorená sekvencia
F
- 57 j predstavuje kompletnú, prístupnú, exprimovanú konštrukciu DNA pre žiadaný chrípkový gén.
Každou konštrukciou boli transfektované bunky RD (ATCC J 1 CCL136), bunková línia ľudského rabdomyosarkómu v kultúre.
Štyridsať hodín po transfekcii boli bunky zobraté, lyzované a vykonaný Vestern blot (okrem konštrukcie V1J-PR-HA, ktorý bol testovaný na myšiach a poskytol anti-HA špecifické protilátky ešte pred vykonaním Vestern blotu, čím zanikla potreba vykonávať blot, pretože expresia bola pozorovaná in vivo). Špecifické protilátky proti PB1, PB2 a NS proteínom boli dodané pánom Stephenom Inglisom z University of Cambridge, ktorý pri príprave polyklonálneho antiséra použí. val purifikované proteíny exprimované ako β-galaktozidázové fúzne proteíny. Anti-NP polyklonálne antisérum bolo vytvorené imunizáciou králikov celými vírusmi A/PR/8/34. Protilátky anti-Ml sú komerčne dodávané z Biodesign v podobe kozieho , anti-chrípka A antiséra pod katalógovým číslom B65245G.
) i V každom prípade bol pozorovaný proteín predpokladanej dĺžky potvrdzujúci expresiu kódovaného chrípkového proteíriu prebiehajúceho in vitro.
Nomenklatúra týchto konštrukcií sa riadi konvenciami:
: názov vektora - kmeň chrípky - gén. V každom prípade bola sekvencia klonovaných a sekventovaných génových sekvencií A/PR/8/34 porovnávaná so známymi sekvenciami z GENBANK. Biologická účinnosť každej z týchto konštrukcií je uvedená s v predchádzajúcich príkladoch 2, 3 a 4.
Sekvencia 5’spojov CMVintA a chrípkových génov z A/PR/8/34:
’ 1. V1J-PR-NP, SEKV.ID:12:, GENBANK registračné číslo:
M38279
5' GTC ACC GTC CTT AGA TC/A ATT CCA GCA AAA GCA GGG CMVintA NP....
TAG ATA ATC ACT CAC TGA GTG ACA TCA AAA TCA TG
2. V1J-PR-PB1, SEKV.ID:13:, GENBANK registračné číslo: J02151 í
5' ACC GTC CTT AGA TC/A GCT TGG CAA AAG CAG GCA AAC CMVintA PB1....
CAT TTG AAT GGA TGT CAA TCC GAC CTT ACT TTT CTT AAA AGT GCC AGC ACA AAA TGC TAT AAG CAC AAC TTT CCC TTA TAC
3. V1J-PR-NS, SEKV.ID:14:, GENBANK registračné číslo:
J02150
5’ GTC ACC GTC CTT AGA TC/A ATT CCA GCA AAA GCA GGG
CMVintA NS....
TGA CAA AAA CAT AAT GGA TCC AAA CAC TGT GTC AAG CTT TCA GGT AGA TTG CTT TCT TTG GCA TGT CCG CAA ACG AGT TGC AGA CCA AGA ACT AGG TGA T....
4. V1J-PR-HA, SEKV.ID:15:, GENBANK registračné číslo:
J02143
5’ TCT GCA GTC ACC GTC CTT AGA TC/ A GCT TGG AGC AAA CMVintA HA...
AGCAGG GGA AAA TAA AAA CAA CCA AAA TGA AGG CAA ACC TAC TGG TCC TGT TAA GTG CAC TTG CAG CTG CAG ATG CAG ACA CAA TAT GTA TAG GCT ACC ATG CGA ACA ATT CAA CC...
5. V1J-PR-PB2, SEKV.ID:16:, GENBANK registračné číslo: J02153
5ΤΤΤ TCT GCA GTC ACC GTC CTT AGA TC/ C CGA ATT CCA CMVintA PB2....
GCA AAA GCA GGT CAA TTA TAT TCA ATA TGG AAA GAA TAA AAG AAC TAA GAA ATC TAA TGT CGC AGT CTG CCA CCC CGG AGA TAC TCA CAA AAA CCA CCG TGG ACC ATA TGG CCA TAA TCA AGA AGT...
6. V1J-PR-M1, SEKV.ID:17:, GENBANK registračné číslo J02145
5' GTC ACC GTC CTT AGA TCT/ ACC ATG AGT CTT CTA ACC CMVINTA Ml.....
GAG GTC GAA ACG TAC GTA CTC TCT ATC ATC CCG TCA GGC CCC CTC AAA GCC GAG ATC GCA CAG AGA CTT GAA GAG TTG ACG GAA GA...
Ďalej uvádzame, ako boli
1. V1J-PR-NP: zatupený BglII EcoRI koncu (NP).
2. V1J-PR-PB1: zatupený BglII HindlII (PB1).
3. V1J-PR-NS: zatupený BglII EcoRI koncu (NS1).
4. V1J-PR-HA: zatupený BglII HindlII koncu (HA).
5. V1J-PR-PB2: presahujúci júcemu koncu BamHI (PB2).
tieto fragmenty pospájané:
(vektor) koniec k zatupenému (vektor) koniec k zatupenému (vektor) koniec k zatupenému (vektor) koniec k zatupenému koniec
BglII (vektor) k presahu- 60 6. V1J-PR-M1: presahujúci koniec BglII (vektor) k presahujúcemu koncu BglII (Ml). Ml bol získaný technikami PCR za použitia p8901-MlTE ako templátu a primérov, ktoré pridávajú BglII miesta na oba konce, začínajú 3 bázy pred ATG a končia hneď za terminačným kodónom pre Ml (TGA).
Príklad 8
Expresívny vektor VlJneo,’ SEKV.ID:18:
Bolo nutné z baktérií nesúcich V1J odstrániť gén ampr na selekciu na rezistenciu na antibiotiká, pretože ampicilín nie je možné použiť vo veľkoobjemových fermentátoroch. Gén ampr bol odstránený z pUC chrbtice vektora V1J štiepením reštrikčnými enzýmami AspI a Eamll051. Zvyšok plazmidu bol purifikovaný elektroforézou na agarózovom géli, jeho konce boli zarovnané pôsobením T4 DNA polymerázy a potom k nim bola pridaná teľacia intestinálna fosfatáza. Komerčne dodávaný gén kanr odvodený od transpozónu 903 a obsiahnutý v plazmide pUC4J bol vyštiepený pomocou reštrikčného enzýmu PstI, purifikovaný elektroforézou na agarózovom géli a jeho konce boli zarovnané T4 DNA polymerázou. Tento fragment bol ligovaný s kostrou V1J, čím vznikli plazmidy s génom kanr v oboch možných orientáciách. Tieto plazmidy boli označené VlJneo č. 1 a 3. Každý tento plazmid bol potvrdený analýzou štiepenia reštrikčnými enzýmami, sekventovaním DNA spájaných oblastí. Tieto plazmidy dávali podobné výťažky ako V1J. Expresia produktov heterológnych génov vektorov VlJneo bola taktiež porovnateľná s expresiou u V1J. Vybrali sme vektor VlJneo#3, ktorý je ďalej označovaný ako VlJneo (SEKV.ID:18:) a ktorý obsahuje gén kanr v rovnakej orientácii ako je gén ampr v expresívnej konštrukcii V1J.
Gény z každého kmeňa A/Beijing/353/89, A/Texas/36/91 a B/Panama/46/90 boli klonované ako cDNA do vektora VlJneo. V každom prípade boli spojové sekvencie z 5’-promótorovej oblasti (CMVintA) klonovaného génu sekventované za použitia
Ipriméru:
CMVintA primér 5’-CTA ACA GAC TGT TCC TTT CCA TG -3’, SEKV.ID:28:, ktorý tvorí sekvenciu tejto kódujúcej sekven; cie. Táto sekvencia prilieha k sekvencii kódujúcej terminátor, ktorého sekvencia je tu taktiež uvedená. Táto sekvencia bola vytvorená použitím priméru: BGH primér 5’-GGA GTG GCA CCT TCC AGG -3’, SEKV.ID:29:, ktorý vytvára sekvenciu nekódujúceho reťazca. Každá sekvencia génov klonovaných a sekventovaných z izolátov týchto alebo iných chrípkových vírusov bola skontrolovaná proti známym sekvenciám z GENBANK. Pozícia, v ktorej sa objavuje spoj, je označená /> čo neoznačuje žiadnu nespojitosť v sekvencii. V prípade spoja VIJneo-TX-HA bol sekvenačný gél stlačený a bol ťažké počítať počiatočnú sekvenciu. Preto je prvých 8 báz tohto spoja označených ako N. Tieto nukleotidy boli potvrdené a uvá dzame tu určené nukleotidy. Prvý ATG, objavujúci sa v kažíl li dej sekvencii, je iniciačným kodónom translácie pre prísluš| ný klonovaný gén. Každá uvedená sekvencia predstavuje kompletnú, ľahko dostupnú, exprimujúcu sa konštrukciu DNA pre určitý chrípkový gén. Nomenklatúra sa riadi konvenciou: názov vektora - kmeň chrípky - gén. Biologická účinnosť kaž| dej tejto konštrukcie je uvedená rovnakým spôsobom ako vo í vyššie uvedených príkladoch 2, 3 a 4.
Sekvencie 5’-spoja medzi CMVintA a génmi chrípky a 3’-spoja chrípkových génov a konštrukciou BGH terminátora expresie za ; použitia rôznych chrípkových kmeňov a proteínov:
- I. A/Beijing/353/89
A. VIJneo-BJ-NP:
Promótor, SEKV.ID:20:
5' TCA CCG TCC TTA GAT C/ AA GCA GGG TTA ATA ATC CMVintA NP....
ACT CAC TGA GTG ACA TCA AAA TC ATG GCG TCC CAA GGC ACC AAA CGG TCT TAT GAA CAG ATG GAA ACT GAT GGG GAA CGC CAG ATT
Terminátor, SEKV.ID:21:
5' GAG GGG CAA ACA ACA GAT GGC TGG CAA CTA GAA GGC ACA GCA GAT / ATT TTT TCC TTA ATT GTC GTA C...
BGH NP....
II. A/Texas/36/91
A. VIJneo-TX-HA:
Promótor, SEKV.ID:24:
5' CCT TAG ATC / GGA AAT AAA AAC AAC CAA AAT GAA CMVINTA HA....
AGC AAA ACT ACT AGT CC...
Terminátor, SEKV.ID:25:
5’ GCA GAT C/ CT TAT ATT TCT GAA ATT CTG GTC...
BGH HA....
TCA GAT...
III. B/Panama/46/90
A. VIJneo-PA-HA:
Promótor, SEKV.ID:26: (prvých 1080 báz tejto sekvencie je dostupných v GENBANK pod registračným číslom M65171); nižšie uvedená sekvencia je totožná so známou sekvenciou; 3’sekvencia SEKV.ID:27: nižšie nebola vopred zaznamenaná.
5’ACC GTC CTT AGA TC/ C AGA AGC AGA GCA TTT TCT AAT
CMVintA HA....
ATC CAC AAA ATG AAG GCA ATA ATT GTA CTA CTC ATG GTA GTA ACA TCC AAC GCA GAT CGA ATC TGC...
Terminátor, SEKV.ID:27:
5' GGC ACA GCA GAT C/ TT TCA ATA ACG TTT CTT TGT
BGH HA....
AAT GGT AAC...
Príklad 9
Vnútrokožné injekcie chrípkových génov
Postup vnútrokožnej aplikácie génov bol rovnaký ako pre vnútrosvalové injekcie: tri injekcie Vl-PR-NP každá po 200 pg, v intervaloch po troch týždňoch. Slezinové bunky boli na testovanie in vitro vzaté 55 dní po tretej injekcii a restimulované nonapeptidom epitopu nukleoproteínu 147 až 155, SEKV.ID:9:. Cieľové bunky (bunky P815, myšací mastocym, syngénny s myšami BALB/c H2^) boli infikované heterológnym vírusom A/Victoria/73, pri lýze bol použitý pomer medzi efektorom a cieľovou bunkou v rozsahu medzi 5:1a 40:1. Negatívne kontroly boli vykonané meraním lýzy cieľových buniek, ktoré neboli chrípkovým vírusom infikované. Pozitívne kontroly boli vykonané meraním lýzy cieľových buniek infikovaných chrípkovým vírusom prostredníctvom slezinových buniek získaných z myši, ktorá bola trikrát očkovaná 130 pg Vl-PR-NP a ktorá prežila infekciu chrípkovým vírusom kmeňa A/HK/68.
Výsledky: špecifická lýza sa dosiahla použitím slezinových buniek z myší očkovaných vnútrokožné vo všetkých možných pomeroch efektor:cieľová bunka. U slezinových buniek použitých ako efektor získaných z myši, ktoré neboli očkované alebo boli očkované vektorom VI bez PR-NP génu, nebola pozorovaná žiadna lýza. Špecifická lýza dosiahnutá použitím vnútrosvalovej aplikácie. U myší očkovaných vnútrokožné alebo vnútrosvalovo bol zmeraný titer vírusu v pľúcach. Výsledky experimentov používajúcich 5 myší v skupine, dávky 3 x 200 pg aplikované po trojtýždňových intervaloch a násled nou infekciou 3 týždne po poslednej dávke boli nasledujúce:
Vakcína Spôsob aplikácie Titer v pľúcach myši*
5. deň 7. deň
Vl-PR-NP | vnútrokožná | 5,2 | ± | 0,2 | 4,1 | ± | 1** |
VI | vnútrokožná | 5,9 | ± | 1 | 6,6 | ± | 0,3 |
Vl-PR-NP | vnútrosvalová | 4,6 | ± | 0,4 | 4,5 | ± | 1,1 |
žiadna | 6,2 | ± | 0,3 | 5,9 | ± | 0,3 |
* stredný log titra ± SEM ** jedna z myší nemala žiadny vírus
Percento prežívajúcich myší bolo hodnotené až do 28. dňa. Do 28. dňa prežilo 89 % príjemcov očkovaných Vl-NP-PR do svalu a 50 % očkovaných vnútrokožne. Z myši očkovaných vektorom VI neprežila žiadna a z neočkovaných myší prežilo 30 %. Tieto pokusy ukazujú, že DNA kódujúca nukleoproteín z kmeňa A/PR/8/34 mala schopnosť indukovať CTL rozpoznávajúci nukleoproteín z heterológneho kmeňa A/Victoria/73 a vyvolávajúci obrannú imunitnú odpoveď proti heterológnemu kmeňu A/HK/68.
Príklad 10
Polynukleotidová vakcína pre primáty
1. Protilátky proti NP u makakov: mamakovia (006 NP, 009 NP alebo kontrola 101; 021) boli očkovaní vnútrosvalovo RSV-NP 1 mg/miesto do troch miest 1. deň. Injekcie obsahujúce každá 1 mg RSV-LUX a CMV-int-LUX, konštrukcie na expresiu luciferázy svätojánskych mušiek, boli zvieratám aplikované v rovnaký deň do iných miest. Pätnásty deň boli zvieratá očkované rovnakou DNA ako predtým a zároveň pD5-CAT v dávkach 1 mg do každého miesta, čo je konštrukcia pre reportérový gén na expresiu chloramfenykol-acetyl transferázy. Svaly obsahujúce reportérové gény boli testované na aktivitu týchto reporté65 rových génov. V období 3, 5, 9, 11, 13 a 15 týždňov po prvej injekcii bolo vzaté sérum. Prvé pozitívne vzorky anti-NP protilátok boli odobraté v 11. týždni, ďalšie pozitívne vzorky boli z 13. a 15. týždňa. Anti-NP protilátky boli stanovené ELISA testom.
2. Hemaglutinín inhibujúce (Hl) protilátky u makakov: Opice boli v 1. deň očkované do svalu injekciami V1J-PR-HA. Každé z dvoch zvierat obdržalo 1 mg, 100 pg ALEBO 10 mg DNA do každého štvorhlavého svalu. Každá injekcia bola podaná v objeme 0,5 ml. Zvieratám bola odobratá krv pred aplikáciou prvej injekcie. Všetky zvieratá boli preočkované DNA 15 deň a krv im bola potom odoberaná v 2 až 4 týždňových intervaloch. Titer inhibície hemaglutinínu (Hl) proti A/PR/8!34 bol pozitívny za 5 týždňov, 9 týždňov a 12 týždňov po prvej injekcii V1J-PR-HA DNA. Výsledky sú uvedené v tabuľke 10-1:
Tabuľka 10-I
Titer Hl protilátok u makakov očkovaných
V1J-PR-HA DNA
makak č. | dávka | Titer Hl protilátok v týždni č. | ||||
pred | 3 | 5 | 9 | 12 | ||
88-010 | 1 MG | < 10 | < 10 | 320 | 320 | 320 |
88-0200 | < 10 | < 10 | < 10 | 40 | 40 | |
88-021 | 100 UG | < 10 | < 10 | < 10 | 40 | 20 |
90-026 | < 10 | < 10 | 20 | 20 | 40 | |
88-084 | < 10 | 20 | 40 | 20 | 10 | |
90-028 | < 10 | < 10 | 20 | < 10 | < 10 |
Príkladll
Štúdie polynukleotidovej vakcíny pre fretky
1. Výskum polynukleotidového očkovania fretiek bol začatý s úmyslom určiť, či by mohli byť zvieratá chránené pred chrípkou A očkovaním génmi kódujúcimi buď HA (povrchový proteín schopný indukovať kmeňovo-špecifické neutralizujúce protilátky) alebo vnútorné proteíny NP, NSI, PB1, M (zrejme schopných indukovať imunitnú na kmeni nezávislú odpoveď sprostredkovanú bunkami). Zvieratá boli očkované DNA kódujúcou rôzne chrípkové gény v našom VIJ-vektore:
Tabuľka 11-I
skupina | konštruk- cia | dávka | počet očkovan. zvierat | infekcia H1N1 | infekcia H3N2 |
1 | V1J-HA | 1000 mg | 16 | 8 | 8 |
2 | V1J-NP | 1000 mg | 16 | 8 | 8 |
3 | V1J+NP+ NS1+PB1 +PB2+M | celkom 2000 mg | 16 | 8 | 8 |
4 | V1J-HA+ NP+NS1+ PB1+PB2 +M | celkom 2000 mg | 16 | 8 | 8 |
5 | V1J- | 1000 mg | 16 | 8 | 8 |
6 | žiadna | žiadna | 10 | 5 | 5 |
celkom | 90 | 45 | 45 |
2. Od očkovaných zvierat bolo odobraté 22. a 43. deň po imunizácii sérum a testované ELISA testom na neutralizujúce protilátky (inhibujúce hemaglutinín - Hl) a na protilátky na nukleoproteín (NP). Zvieratá očkované DNA exprimovali protilátky na zodpovedajúce gény. Tieto údaje sú uvedené na obrázkoch 10, 11 a 16.
3. Vybrané očkované zvieratá boli 128. deň infikované 1200 TCID5q chrípky A/HK/68. Tento kmeň je heterológny s kmeňom A/PR/8/34, ktorý bol zdrojom kódujúcich sekvencii použitých pri očkovaní a teda ochrana predstavuje imunitu založenú na mechanizme imunity sprostredkovanej bunkami a nezávislej na druhu kmeňa. Obrázok 12 ukazuje štatisticky významné zníženie šírenia vírusu v organizme v porovnaní s kontrolnými zvieratami u zvierat očkovaných DNA kódujúcou vnútorné proteíny, čím sa potvrdilo, že očkovanie polynukleotidmi vyvoláva u fretiek imunitnú odpoveď a že táto odpoveď je ochranného charakteru.
4. Homológna infekcia A/PR/8/34 bola testovaná podobne a podobne je tu aj demonštrovaná účinnosť ochrany neutralizujúcimi protilátkami indukovanými polynukleotidovou vakcináciou .
Príklad 12
Príprava VIJns
Na vykonanie pokusov s integráciou génov bolo do VIJneo pridané reštrikčné miesto Sfil. Komerčne dodávaný spojovník Sfil dlhý 13 báz (New England BioLabs) bol pridaný do miesta KpnI v sekvencii BGH daného vektora. VIJneo bol linearizovaný KpnI, purifikovaný gélovou elektroforézou, konce zarovnané T4 DNA polymerázou a ligovaný so zatupeným spojovníkom Sfil. Izoláty na klonovanie boli vybraté reštrikčným mapovaním a overené sekventovaním cez spojovník Nový vektor označený VIJns (obr. 17). Expresia heterológnych kmeňov vo VIJns (s Sfil) bola porovnateľná s expresiou rovnakých génov vo VlJneo (s KpnI).
Príklad 13
Imunogenicita
1. Humorálna imunitná odpoveď
Injekcia DNA, kódujúca chrípkové HA, NP a Ml viedla u myší, fretiek alebo človeku nepríbuzných primátov (vrátane afrických zelených opíc a maniakov) k humorálnej imunitnej odpovedi. Do dnešného dňa bolo dokázané, že tvorbu protilátok vyvoláva PNV obsahujúce gény HA klonované z A/PR/34, B/Panama/90, A/Beijing/89, A/Texas/91, A/Hawaii/91 a A/Georgia/93.
a) Myši: ELISA testami boli stanovené protilátky na NP a Ml v sére myší po očkovaní DNA. Výrazné titre protilátok (10 až 10°) sa u myší vytvorili už po takých nízkych dávkach, ako je 1 pg NP DNA (A/PR/34) aplikovaných raz (najmenšia testovaná dávka) a už po 2 týždňoch po injekcii (najčastejší testovaný termín) a neznižovali sa po dobu najmenej 6 mesiacov. Tieto NP protilátky nie sú neutralizujúce a nezúčastňujú sa obrany. Avšak po injekcii DNA vykazujú in vivo expresiu NP proteínu. Naproti tomu protilátky na HA poskytujú obrannú imunitu proti homológnym kmeňom chrípkového vírusu. Injekcia HA DNA klonovaný z kmeňa A/PR/34 viedla k tvorbe neutralizujúcich protilátok, ktoré boli overené in vitro testami inhibície hemaglutinínu (Hl). U mnohých myši bol po troch dávkach 100 pg HA DNA nameraný titer Hl > 1280 a u niektorých zvierat, ktoré obdržali len dve dávky 0,1 pg, bol zistiteľný titer protilátok. Bola zistená súvislosť medzi dávkami DNA a výškou titru Hl protilátok a zároveň medzi Hl Litrom a počtom injekcií (tabuľka 13-1):
Tabuľka 13 í
I Tvorba humorálnej imunitnej odpovede u myší
dávka (μ§) | GMT Hl | ||
počet dávok | |||
1 | 2 | 3 | |
HA DNA (100) | 75 | 106 | 260 |
HA DNA (10) | 37 | 69 | 86 |
HA DNA (1) | < 10a | 13 | 24 |
HA DNA (0,1) | < 10b | < 10a | <10a |
kontrolná DNA (100) | < 10b | < 10b | <10b |
bez očkovania | < 10b |
Tabuľka 13-1: Samice myší BALB/c (4 až 6 týždňov) boli očkované A/PR/34 HA DNA (V12JHA) uvedenými dávkami buď raz, dvakrát alebo trikrát v trojtýždňových intervaloch. Negatívnou kontrolou boli myši očkované kontrolnou DNA pozostávajúcou z vektora bez inzertu génu (VIJ) a neočkované a dosiaľ nenakazené myši. Vzorky séra boli odoberané 7 týždňov po dávke a boli testované na prítomnosť hemaglutinín inhibujúcich protilátok (Hl). Tieto údaje sú uvedené ako geometrická stredná hodnota titru Hl, kde n = 10.
a niektoré z testovaných myší mali pozitívny titer Hl b všetky myši
Vo všetkých testovaných myšiach korelovala prítomnosť Hl protilátok s obranou v modeli s rovnakou infekciou. Hl protilátok u myší očkovaných HA DNA (A/PR/34) zostali bez podstatných zmien po dobu najmenej 6 mesiacov. HA protilátky sa podľa merania ELISA testami taktiež tvorili u myší, na ktorých bola použitá HA DNA z A/Beijing/89, B/Panama/90 a A/Texas/91 kmeňov chrípkového vírusu.
Na základe informácii z literatúry, uvádzajúcich nižšie expresie reportérových génov u starších myší po injekciách
I
DNA, sme taktiež testovali vplyv veku na humorálnu imunitnú
- 70 odpoveď na HA. Z dôvodu nedostatku starších dosial neoplodnených myších samíc boli použité odrastené matky vo veku približne 10 mesiacov. Boli porovnané odrastené matky so 4 až 6 týždennými dosial neoplodnenými samicami vzhľadom na ich schopnosť vytvárať HA protilátky. Staršie myši boli schopné vytvárať protilátky už po takých nízkych dávkach HA DNA ako je 1 gg (najnižšia testovaná dávka), aj keď mali nižší liter protilátok než mladé myši (tabuľka 13-11):
Tabuľka 13-II
Vplyv veku na humorálnu imunitnú odpoveď
inokulum | dávka (pg) | GMT (4-6 týždňov) | GMT (10 mesiacov) |
HA DNA | 100 | 1,034 | 110 |
HA DNA | 10 | 338 | 68 |
HA DNA | 1 | 80 | 20 |
kontr. DNA | 100 | < 5a | < 5a |
neočkované | - | < 5a | < 5a |
chrípka | - | 538 | 36 |
Tabulka 13-11: Samice myší BALB/c (4 až 6 týždňové nikdy neoplodnené samice a 10 mesačné odrastené chovné samice) boli očkované A/PR/34 HA DNA (V1JHA) uvedenými dávkami trikrát v trojtýždňových intervaloch. Negatívne kontroly zahrňovali myši očkované kontrolnými DNA (V1J) a myši neočkované, ktoré neprišli do styku s chrípkou. Na porovnanie boli ďalšie myši infikované subletálnou dávkou chrípky A/PR/34. Za devät týždňov po prvej dávke bolo myšiam odobraté sérum, ktoré bolo potom testované na titer Hl. Údaje sú uvádzané ako geometrická stredná hodnota Hl titra, kde n = 15.
- 71 a všetky testované myši s negatívnym Hl Litrom
Toto však nebolo výsledkom samotnej PNV, ale skôr zníženou schopnosťou starších myší tvoriť humorálnu imunitnú odpoveď všeobecne, pretože staršie myši taktiež vykazovali po infekcii živým vírusom A/PR/34 nižšiu Hl odpoveď než mladšie myši. V skutočnosti boli Hl protilátky u starších myší očkovaných DNA menej potlačené než u starších myší infikovaných chrípkou. Staršie chovné samice použité v týchto pokusoch boli naviac približne o 50 % ťažšie než typické rovnako staré nikdy neoplodnené samice, čo mohlo mať podľa štúdií o využití diét na obmedzenie kalórií u myší neblahý účinok na imunitnú odpoveď týchto zvierat. Z týchto aj z ďalších dôvodov možno nebola imunitná odpoveď týchto zvierat charakteristická. Napriek tomu vek (až do najmenej 10 mesiacov veku) nijako významne neznižoval schopnosť polynukleotidovej vakcinácie indukovať humorálnu imunitnú odpoveď a to aj v takých nízkych dávkach ako je 1 pg.
b) Fretky: humorálna imunitná odpoveď sa vytvorila u fretiek očkovaných HA DNA z kmeňov chrípkových vírusov A/PR/34, A/Beijing/89, A/Hawaii/91 a A/Georgia/93. Hl protilátky proti A/PR/34 a ELISA protilátky proti HA z iných kmeňov boli vytvorené príslušnou PNV. Zistilo sa, že v sérach fretiek očkovaných HA DNA z A/Beijing/89, A/Hawaii/91 a A/Georgia/93 sú Hl protilátky a neutralizujúce protilátky, pretože tieto zvieratá boli chránené pred vírusovou nákazou.
c) Primáty nepríbuzné človeku: (viď napríklad príklad 10) Makakovia boli dvakrát imunizovaní HA DNA (A/PR/34) dávkami 10, 100 a 1000 pg na každú nohu. Bol nameraný titer Hl až do 320 u zvierat, ktoré obdržali dávky 100 alebo 1000 pg a jedno zviera zo skupiny s dávkami 10 pg malo titer Hl 80. Až do tejto doby bolo testované sérum až do doby 13 mesiacov, Hl titer sa neznižoval približne od 6 do 13 mesiacov (tabuľka 13-III):
Tabuľka 13-11I ;ι '*( j
j < Tvorba Hl protilátok u makakov
dávka mg | pred | 1 mesiac | 2mesiace | 5,5 mes. | 13 mes. |
2000 | < 10 | 640 | 320 | 160 | 80 |
2000 | < 10 | 40 | 40 | 20 | 20 |
200 | < 10 | 80 | 40 | 40 | 80 |
200 | < 10 | 80 | 80 | 40 | 20 |
20 | < 10 | 40 | 20 | 20 | 20 |
20 | < 10 | < 10 | < 10 | < 10 | < 10 |
Tabuľka 13-III: Makakovia (samci aj samice) s veľkosťou od 4,3 do 8,8 kg boli očkovaní HA DNA z A/PR/34 (V1JHA) v uvedených dávkach v nultom a v 2. týždni. Vzorky séra boli odoberané vo vyznačených dňoch po dávkach a testované na titer Hl. Údaje predstavujú titer Hl u jednotlivých zvierat.
Africké zelené opice očkované kombinovanou PNV obsahugg HA DNA (A/Beijing/89). Vyhodnotenie séra 4 až ukázalo GMT u oboch pre 5/6) pri rovnakých po sú júcou 100 týždňov výsledky subviriónových vírusmi (GMT = prvej dávke lepšie než vakcín (GMT
36, 6/6) (8/9) . Tieto dosiaľ dodávaných a vakcín s celými testoch (obr. 18).
Značný vylepšovací účinok druhého očkovania bol pozorovaný u zvierat s dávkami 10 gg HA DNA (GMT = 1,9 po jednej dávke a 199 po druhej dávke). Patentované vakcíny s celými vykazovali podobný vytvorené druhou len prechodné. Až hladiny Hl protilátok očkovaných dávkami tak porovnaní s dosiaľ dodávanými vakcínami podporný účinok, dávkou vakcíny dňa do dnešného až do viriónmi zatiaľ čo subviriónov titre Hl boli boli merané gg .
ako podobné zvierat týždňa a u aj 100 gg HA DNA v (s celými vírusmi).
Tieto výsledky ukazujú, že PNV bola prinajmenšom rovnako účinná pri tvorbe protilátok ako vakcína s celými vírusmi, ktorá predchádzala subviriónovej vakcíne. Imunogenicita purifikovaných subjednotkovaných vakcín nebola u myší
- 73 zistiteľná, takže sa u primátov netestovala. V tomto pokuse $ obsahovala PNV päťvalentnú zmes DNA, kódujúcu HA z j A/Beij ing/89, B/Panama/90 a A/Texas/91 a NPa Ml z A/PR/34, aby pripomínali skúšanú vakcínu. Takisto sme testovali zvieratá na tvorbu humorálnej imunitnej odpovede proti ostatným zložkám vakcíny a zistili sme protilátky na HA z B/panama/90 a NP z A/PR/34. V oddelených experimentoch boli indukované proti A/Texas/91 tak Hl, ako aj neutralizujúce protilátky indukované injekciami dvoch dávok HA DNA klonované PCR.
a
2. Imunitná odpoveď sprostredkovaná bunkami
Viď vyššie uvedený príklad 3.
i 3. Tvorba imunitnej odpovede
a) Humorálna imunita: mechanizmy, vyvolávajúce po injekcii DNA tvorbu humorálnej a bunkovej imunitnej odpovede ešte neboli objasnené. Pri tvorbe neutralizačných protilátok • (napríklad prori HA chrípkového vírusu) musiži bunky pravdei podobne exprimovať antigén na plazmatickej membráne alebo j ' ho sekrétovať do mimobunkového prostredia. Transfektované : bunky by mali naviac exprimovať HA v sekundárnej, terciárnej a kvartérnej štrukrúre podobnej HA vo virióne. V rozetových restoch bola povrchová expresia HA ukázaná na RD bunkách (rabdomyosarkóm, myoblastický pôvod) prechodne transfektovaných HA DNA. Červené krvinky aglutinovali s povrchom buniek transfektovaných HA, ale nie s povrchom buniek transfektovaných imitáciou HA, čím sa dokázalo, že HA nebol len exprimovaný na povrchu, ale ponechal si taktiež patričnú konformáciu nutnú na väzbu na proteín obsahujúci sialovú kyselinu.
. j
b) Bunková imunita: tvorba bunkovej imunitnej odpovede (napr. na NP chrípkového vírusu) vyžaduje proteolytické , v .·; spracovanie a prezentáciu odvodených peptidov v spojení : s MHC triedy I. Povaha buniek prezentujúcich antigén vedúci
Ik tvorbe imunitnej odpovede po injekcii DNA nie je dosiaľ známa. Svalové bunky exprimujú nízke hladiny MHC triedy I a predpokladá sa o nich, že na svojich povrchoch neexprimujú kostimulačné molekuly. Svalové bunky nie sú teda považované za bunky, ktoré by prezentovali antigény. Napriek tomu, niekoľko pokusov ukazuje, že svalové bunky sa zúčastňujú tvorby imunitnej odpovede po vnútrosvalovej injekcii DNA. V prvom rade to bolo limitované testovanie tkanív, schopných internalizovať holú plazmidovú DNA do expresie proteínov in situ, ktoré ukázalo, že veľa typov buniek môže ľ exprimovať reportérové gény po injekcii plazmidu priamo do tkaniva, ale všetky bunky boli všeobecne menej účinné než * svalové bunky. Kompletná analýza príjmu DNA inými než svalovými bunkami po vnútrosvalovej injekcii nebolel ešte publiko4 vaná, ale je pravdepodobné, že takýto príjem by mal ešte i nižšiu účinnosť. Po druhé bola dokázaná expresia reportéroí .
vých génov po vnútrosvalovej injekcii DNA do kostných buniek t
! a buniek srdcovej svaloviny u rôznych živočíchov. V treťom | prípade bolo zistené, že hoci odpovede CTL sa môžu vytvoriť | po injekcii DNA inými cestami (intravenózna a vnútrokožná), boli najlepšie imunitné odpovede u myší vytvorené po vnútro| svalovej injekcii DNA. Po štvrté, CTL môžu rozpoznávať ii a lýzovať myoblasty a myocyty in vitro a táto lýza môže byť ' posilnená predchádzajúcou reakciou s ^-interferónom, ktorý priaznivo reguluje expresiu proteínov MHC I. triedy. A konečne transplantácia stabilne transfektovaných myoblastov exprimujúcich NP do nikdy neinfikovaných syngénnych myší - viedlo k tvorbe obrannej bunkovej imunitnej odpovede in vivo (obr. 20). Takže expresia antigénov svalovými bunkami je dostatočná na indukciu obrannej imunitnej odpovede pozorovanej po injekcii DNÁ. Naviac príjem a expresia DNA inými než svalovými bunkami nemusí byť požadovaným príspevkom pri vy( tvorení obrannej imunity. Z hľadiska polynukleotidových vakcín by bolo do budúcna výhodné obmedziť príjem DNA bunkami. V prvom rade pretože sú myocyty diferencované a nedelia sa. Táto skutočnosť môže byť dôležitá pri znižovaní možnosti integrácie plazmidovej DNA do chromozomálnej DNA a udržaní
I permanentnej prezentácie antigénu, ktorá vedie k dlhotrvajúcej imunitnej odpovedi. Po druhé sú myocyty veľké bunky s násobnými jadrami, ktoré je možné vytvoriť fúziou myoblas.1 tov. Tým sa môže vysvetliť prečo vedú injekcie DNA k expresii proteínov, ktorá môže trvať po dlhé časové obdobie bez žiadneho dôkazu o cytolytickej deštrukcii CTL.
Príklad 14
Štúdie ochrany
Očkovanie DNA kódujúcou antigény chrípkového vírusu poskytovalo ochranu pred ochorením a úmrtím a znižovalo vírusové zaťaženie u početných kombinácií chrípkových kmeňov s pri použití dvoch všeobecne prijímaných modelov pre nákazu ; ľudskou chrípkou (myši a fretky).
j.
í >
L 1. Heterológna (heterotypická, skupinová) ochrana : súčasnými patentovanými vakcínami s usmrtenými vírusmi nie je
I poskytovaná dostatočná heterológna ochrana, ale je poskyto’ vaná očkovaním DNA vykonávaným na živočíšnych modeloch. Táto | ochrana sa prejavila u laboratórnych zvierat očkovaných DNA / * kódujúcich NP alebo Ml. Bunková imunitná krížová (CMI) odpoveď indukovaná očkovaním DNA vyvolávala ochranné odpovede.
a) Myši: BALB/c a C3H očkované do svalu injekciami DNA kódujúcou NP z A/PR/34 boli ochránené pred úmrtím a rozvinutím choroby (hodnotené podľa zníženého úbytku telesnej hmotnosti) po kompletnej infekcii dýchacieho traktu LD^q z A/HongKong/68 (H3N2) a heterotypickým kmeňom (H3 vs Hl pre A/PR/34). Obr. 21 ukazuje počty prežívajúcich myší BALB/c očkovaných trikrát NP DNA (200 pg/dávka) v trojtýždňových í intervaloch a infikovaných 3 týždne po poslednom očkovaní.
Obrázok 22 ukazuje potlačenie úbytku telesnej hmotnosti po nákaze u očkovaných myší porovnaný so značnými stratami telesnej hmotnosti zaznamenanými u kontrolných myší. Obr.
ukazuje zníženie vírusovej záťaže v pľúcach myší očkova76 '< ' k ι ( ných NP DNA 7 dní po infekcii horného dýchacieho traktu l
v porovnaní s myšami, ktorým bola očkovaná kontrolná nekódu·! júca DNA. Myši očkované NP DNA boli kompletne chránené pred smrťou, vykazovali znížené úbytky telesnej hmotnosti a nižšie vírusové zaťaženie v pľúcach v porovnaní s kontrolnými myšami. Množstvo NP DNA potrebné na ochranu myši a na zníženie úbytku telesnej hmotnosti bolo stanovené na <6,25 gg na jednu injekciu pri počte troch injekcií DNA (obr. 24). Ochrana poskytovaná očkovaním NP DNA trvala u očkovaných myší bez významných zmien po dobu najmenej 3 mesiacov. Hladina obranných látok pretrvávala do 6-tich mesiacov, ale mierne sa znižovala medzi 3. a 6. mesiacom po poslednom očkovaní. Avšak jediná injekcia NP DNA opakovaná v 22. týždni, t.j. tri týždne pred infekciou v 25. týždni, obnovila plnú ochranu (obr. 25). Toto očkovanie myši NP DNA vytvorilo dlhodobú, zvyšovateľnú heterológnu obranu. Schopnosť vytvo; riť predchorobnú odpoveď pri revakcinácii týchto zvierat ! naznačuje, že imunologická pamäť bola indukovaná očkovaním j NP DNA.
i
I i b) Fretky: Fretky sú všeobecne používaným modelom na infekí ciu ľudskou chrípkou, pretože sú citlivé na infekciu veľkou e
škálou izolátou ľudských chrípkových vírusov. Replikácia vírusu u fretiek prebieha predovšetkým v nozdrách a tracheách, v menšej miere tiež v pľúcach, na rozdiel od myší, . u ktorých dochádza k značnému zaťaženiu pľúc vírusmi. Infekcia u fretiek sa dá ľahko pozorovať titráciou vírusu v nosi nom výplachu u fretiek. Fretky imunizované NP DNA alebo Ml
DNA, samostatnou alebo v kombinácii, z kmeňa získaného v nedávnej dobe od ľudí (A/Beijing/89, H3N2) vykazovali značné zníženie šírenia vírusu v dňoch 1 až 6 od infekcie izolátu z terénu, A/Georgia/93 (H3N2) (obr. 26). U tohto í izolátu z terénu došlo k antigénnemu driftu od kmeňa typu
A/Beijing/89, takže patentovaná vakcína proti A/Beijing/89 poskytovala ľuďom len malú alebo žiadnu ochranu proti ochoI reniu spôsobenému A/Georgia/93. Fretky očkované DNA kódujúcou vnútorné proteíny z A/PR/34 vykazovali značné šírenie •j vírusu v nosnom výplachu 5. a 6. deň po infekcii rovnakým ä
| kmeňom A/PR/34 (obr. 27). Zníženie šírenia vírusu bolo pozod rované po infekcii A/Georgia/93 krátko po nej aj v dlhšom časovom odstupe, zatiaľ čo u nákazy A/PR/34 bolo pozorované neskoré zníženie šírenia vírusu, čo mohlo byť spôsobené rozdielnou virulenciou týchto dvoch kmeňov pre fretky.
2. Homológna (homotypická, typovo špecifická) obrana bola ľahko zistiteľná tak u myší ako aj u fretiek očkovaných HA DNA.
a) Myši: BALB/c myši očkované HA DNA (A/PR/34) boli plne chránené proti nákaze LD^q z A/PR/34. U očkovaných myší sa po infekcii neobjavovalo ani úmrtie (obr. 28), ani úbytky telesnej váhy vyššie než 5 % (obr. 29), zatiaľ čo 90 až 100 % kontrolných myší umieralo a vykazovalo veľké straty telesj. nej hmotnosti. Titrácia dávok HA DNA potrebných na dosiahnuí tie ochrany ukázali, že tri injekcie obsahujúce 1 pg HA DNA boli dostatočné na dosiahnutie plnej ochrany (obr. 30).
B ' b) Fretky: Fretky očkované DNA kódujúcou HA z A/PR/34 mali |i značne nižšie šírenie vírusu 1. až 6. deň po nákaze homológlí nou infekciou než fretky, ktorým bola očkovaná kontrolná DNA (obr. 31). Podobne fretky očkované A/Georgia/93 HA DNA mali 1. deň a potom 3. až 7. deň znížené šírenie vírusu po infek. cii homológnym kmeňom (obr. 32). U oboch príslušných kmeňov bola v sére všetkých očkovaných fretiek pozorovaná prítom5 nosť Hl protilátok proti týmto kmeňom (vide supra). Tak očkovanie HA DNA vytvorilo homológnu ochranu.
3. Kombinácia vakcín: Na fretkách bola otestovaná schopnosť HA DNA poskytnúť rozsiahlu ochranu, ak je táto kombinovaná ! s NP a Ml DNA. i _ . i
a) Šírka ochrany proti variantom s antigénnym driftom: antigénny drift, ku ktorému došlo medzi kmeňmi A/Beijing/89 a A/Beijing/92, mal taký rozsah, že ľudia očkovaní vakcínou obsahujúcou A/Beijing/89 neboli chránení proti ochoreniu spôsobenému kmeňom A/Beijing/92. S Severnej Amerike bolo rozšírenie ochorenia spôsobené A/Beijing/92 podobnému izolátom z terénu, napríklad A/Georgia/93. Izoláty zo Severnej Ameriky majú antigény podobné kmeňu typu A/Beijing/92, ale líšia sa geografickým miestom izolácie a históriou pasážovania, pretože boli pasážované skôr v cicavčích organizmoch než v kuracích zárodkoch. Pokiaľ ide o aminosekvenciu HA sú však kmene podobné A/Beijing/92 odlišné od kmeňov A/Beijing/89 len v 11 bodových mutáciách (polohy 133, 135, 145, 156, 157, 186, 190, 191, 193, 226 a 262) v oblasti HA1. Snažili sme sa teda určiť, či by kombinovanie homotypických imunitných odpovedí indukovaných HA DNA s krížom reagujúcimi odpoveďami CMI indukovanými DNA pre NP a Ml poskytovalo vyšší stupeň ochrany proti variantom s antigénnym driftom. Očkovanie fretiek patentovanými vakcínami obsahujúcimi kmeň A/Beijing/89 alebo s HA DNA buď z A/Beijing/89 alebo izolát z terénu podobný Beijing 89 (A/Hawaii/91) prinieslo zníženie šírenia vírusu po infekcii fretiek A/Georgia/93 (obr. 33). U fretiek, ktoré boli očkované kombinovanou PNV obsahujúcou NP, Ml a HA DNA sa významnou mierou znížilo šírenie vírusu v porovnaní s fretkami očkovanými dosiaľ patentovanou vakcínou alebo vakcínou obsahujúcou samotnú HA DNA (obr. 34). V prípade HA DNA z A/Hawaii/91 kombinovanej s NP a Ml DNA z A/Beijing/89 nebola výsledná ochrana výrazne odlišná od maximálnej ochrany poskytovanej homológnou HA DNA z A/Georgia/93 (obr; 35). Tak kombinácia HA, NP a Ml DNA poskytovala zvýšenú ochranu
proti variantom s patentované vakcíny. | antigénnym | driftom vzhľadom | na dosiaľ | |
b) Účinok | histórie | pasážovania | antigénu vakcíny: | fretky, |
ktoré boli | očkované | vakcínou obsahujúcou sekvencie HA DNA | ||
odvodené z | izolátu | z terénu z | USA pasážovaného | v bunkách |
MDCK v tkanivovej kultúre (A/Hawaii/91) preukazovali nižšie
I (p=0,021 dvoj cestným ANOVA testom) šírenie vírusu než fretky, ktorým bola podaná patentovaná vakcína obsahujúca usmrtené vírusy A/Beijing/89 pasážované v kuracích zárodkoch po nákaze kmeňom A/Georgia/93 s antigénnym driftom (obr. 35). Oproti tomu fretky, ktorým bola aplikovaná HA DNA z A/Beijing/89, neukazovali odlišné šírenie vírusu (p=0,058) po nákaze A/Georgia/93 v porovnaní s fretkami, ktorým bola aplikovaná dosiaľ patentovaná vakcína obsahujúca rovnaký vírus. Kmene pestované na kuracích zárodkoch a pasážované v cicavcoch sa líšia v dvoch oblasť HA (pozícia 186 a v antigénnom mieste B blízko bodových mutáciách v HA1 časti 193), ktoré sú obe umiestnené vrcholu HA monoméru v oblasti, ktorá je pravdepodobne dôležitá pre väzbu Hl a neutralizujú cich protilátok. V niektorých prípadoch je schopnosť niekto rých izolátov ľudskej chrípky viazať sa na kurací RBC spočiatku veľmi nízka, ale zvýši sa následným pasážovaním v kuracích zárodkoch, čo môže znamenať, že oblasť HA pre väzbu receptora môže prechádzať rastom vo vtáčích bunkách značnou selekciou. Vplyv malých sekvenčných variácií na úči nok chrípkových vakcín založených na HA na laboratórne zvieratá podtrhuje možnú dôležitú požiadavku držať sa pri príprave vakcíny čo najbližšie sekvencii divokého1 typu vírusu.
c) Primáty nepríbuzné človeku: Primáty nepríbuzné človeku nie sú pre svoje nízke klinické odpovede na infekciu všeobecne používané ako modely pre chrípkové nákazy. My sme však preskúmali imunogenicitu kombinácie vakcíny PNV u primátov nepríbuzných človeku v porovnaní s dosiaľ patentovanými vakcínami obsahujúcimi usmrtený vírus. Titer protilátok vyvolaných kombináciou PNV obsahujúcej gény pre HA a vnútorné proteíny bol prinajmenšom totožný s titrom Hl protilátok a s dĺžkou odpovede (vide supra).
Africké zelené opice, ktoré boli očkované PNV odpovedali na HA PNV pre varianty s antigénnym driftom, čím sa ukázalo, že typovo-špecifické odpovede na PNV môžu byť vytvorené u vopred očkovaných subjektov.
Opice, ktoré boli očkované PNV, taktiež odpovedali na následné očkovanie konvenčnými vakcínami s usmrtenými vírusJ mi .
4. Záver: Polynukleotidové vakcíny proti chrípke sú účinné na modeloch laboratórnych zvierat pre chrípkové ochorenia. Homológna ochrana môže byť dosiahnutá použitím DNA vektorov kódujúcich HA najskôr imunologickými mechanizmami analogickými s mechanizmami indukovanými HA proteínom použitým v súčasnej dobe používaných chrípkových vakcínach. Heterológna ochrana môže byť dosiahnutá proti kmeňom s antigénnym driftom aj posunom taktiež súčasným použitím DNA kódujúcou konzervované vnútorné proteíny chrípkových vírusov. Kombinácia týchto prístupov v jedinom očkovaní poskytuje v porovnaní so súčasnými patentovanými vakcínami zvýšenú ochranu proti variantom s antigénnym shiftom aj driftom v modeloch na fretkách.
Príklad 15
Príprava VÍR vektora
V snahe pokračovať v optimalizácii základných vektorov na očkovanie sme pripravili derivát VIJns, ktorý bol navrhnutý ako VÍR. Účelom konštrukcie tohto vektora bolo získať očkovací vektor o minimálnej veľkosti, t.j. bez nevyhnutných sekvencii DNA, ktorý by si stále ponechával celkové vlastnosti na expresiu rôznorodých génov a rovnaké výťažky plazmidu ako boli získané u V1J a VIJns. Na základe literatúry a vlastných zistení sme určili, že (1) oblasť v základnej kostre pUC, obsahujúce počiatok replikácie v E. coli môže byť odstránená bez toho, aby to nejako ovplyvnilo výťažok plazmidu v baktériách, (2) oblasť 3’-génu kanr nasledujúca po otvorenom čítacom rámci pre kanamycín môže byť taktiež odstránená a namiesto nej vložený terminačný kodón pre baktérie a že (3) = 300 bp z 3’-polovice terminačného kodónu BGH môže byť odstránených bez toho, aby bola ovplyvnená jeho regulačná funkcia (nasledujúca po pôvodnom mieste pre reštrikčný enzým KpnI v rámci časti BGH).
VÍR bol skonštruovaný za použitia techník PCR na syntézu troch fragmentov DNA z VIJns reprezentujúcich CM/intA promótor/BGH terminátor, počiatok replikácie a prvky rezistencie na kanamycín. Ku každému koncu segmentu boli za použitia PCR oligomérov pridané unikátne miesta pre reštrikčné enzýmy: SspI a Xhol pre CMVintA/BGH, EcoRI a BamHI pre gén kanr a Beli a Sali pre orir. Tieto miesta pre reštrikčné enzýmy boli vybraté, pretože umožňujú priamu ligáciu každého tohto DNA segmentu odvodeného PCR s následnou stratou každého tohto miesta: EcoRI a SspI zanechávajú DNA so zarovnanými koncami, ktoré sú kompatibilné pre ligáciu, zatiaľ čo BamHI a Beli zanechávajú komplementárne presahujúce konce ako Sali a Xhol. Po obdržaní týchto segmentov technikami PCR bol každý segment štiepený príslušnými reštrikčnými enzýmami uvedenými vyššie a potom boli segmenty ligované spolu v jednoduchej reakčnej zmesi obsahujúcej všetky tri segmenty DNA. 5’-koniec orir bol navrhnutý tak, aby obsahoval T2 rho nezávislú sekvenciu terminátora, ktorá sa normálne v tejto oblasti vyskytuje, aby poskytoval informáciu na termináciu génu na rezistenciu na kanamycín. Ligovaný produkt bol potvrdený digesciou reštrikčným enzýmom (> 8 enzýmov) a sekventovaním DNA v miestach ligačných spojov. Výťažky DNA plazmidov a heterológnej expresie za použitia vírusových génov v rámci VÍR sa zdajú byť podobné výťažkom u VIJns. Čistá dosiahnutá redukcia s veľkosťou vektora bola 1346 bp (VIJns = 4,86 kb; VÍR = 3,52 kb), viď obr. 36, SEKV.ID:45:.
Sekvencie PCR oligoméru použitého na syntézu VÍR (reštrikčné miesta sú podtrhnuté a vyznačené v zátvorke zá sekvenciou):
(1) 5’-GGT ACA AAT ATT GG CTA TTG GCC ATT GCA TAC G-3’ [SspI]
SEKV.ID:60:, (2) 5’-CCA CAT CTC GAG GAA CCG GGT CAA TTC TTC AGC ACC >ACC -3’ [Xhol]
SEKV.ID:61:, (pre CMVintA/BGH segment) ! (3) 5’-GGT ACA GAT ATC GGA AAG CCA CGT TGT GTC TCA AAA TC-3’ [EcoRI] ‘
SEKV.ID:62:, (4) 5’-CCA CAT GGA TCC G TAA TGC TCT GCC AGT GTT ACA ACC-3’ [BamHI]
SEKV.ID:63:, (pre segment génu na rezistenciu na kanamycín) (5) 5’-GGT ACA TGA TCA CGT AGA AAA GAT CAA AGG ATC TTC TTG-3’ [Beli]
SEKV.ID:64:, (6) 5’-CCA CAT GTC GAC CC GTA AAA AGG CCG CGT TGC TGG-3’ [Sali]
SEKV.ID:32:
(pre počiatok replikácie v E. coli)
Zoznam sekvencii (1) Všeobecné informácie (i) Žiadateľ: Donnelly John J.
Dwarki Varavani J
Liu Margarét A. Montgomery Donna L.
Parker Suezanne E
Shiver John V.
(ii) Názov vynálezu: Konštrukcie DNA, obsahujúce nukleovú kyselinu (iii) Počet sekvencii: 64 (iv) Adresa na korešpondenciu:
(A) | Adresát: | Merck & | Co. , | Inc |
(B) | Ulica: | P.0.Box | 2000 | |
(C) | Mesto: | Rahway | ||
(D) | Štát: | New Yersey | ||
(E) | Kraj ina: | Spoj ené | štáty | americké |
(F) | PSČ: | 07065 |
(v) Počítačový formát:
(A) Typ média: pružný disk (B) Počítač: IBM PC kompatibilný (C) Oper, systém:PC-DOS/MS-DOS (D) Software: Pantentln Release # 1.0.
.:
!!
verzia # 1.25
(vi) | Údaj e | súčasnej prihlášky: | |
(A) | Číslo prihlášky: | ||
(B) | Dátum registrácie: | ||
(C) | Klasifikácia: | ||
(vii) | Údaj e | o predchádzaj úcej pr | ihláške: |
(A) | Číslo prihlášky: US | 08/089,985 | |
(B) | Dátum registrácie: 8 | . júla 1993 | |
(viii) | Informácie o právnom zástupcovi/agentovi: | ||
(A) | Meno: | Bencen Gerard | |
(B) | Registračné číslo: | 35,746 | |
(C) | Odkazové/jedn. číslo | : 18972Y |
(ix) Informácie o spojení:
(A) | Telefón: | (908) | 594 - | 3901 | |
(B) | Telefax: | (908) | 594 - | 4720 | |
(2) | Informácie o SEKV.ID. | Č. 1: |
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 18 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 1:
GTGTGCACCT CAAGCTGG (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 2:
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
(A) | dĺžka: | 23 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | j eden | ||
(D) | topológia: | lineárna | ||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie |
(iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 2:
CCCTTTGAGA ATGTTGCACA TTC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 3:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 33 párov | báz |
(B) | typ; | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 3:
GGTACAAGAT CTACCATGCT TCTAACCGAG GTC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 4:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 36 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: áno (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 4:
Ί
CCACATAGAT CTTCACTTGA ACCGTTGCAT CTGCAC
(2) | Informácie | o SEKV.ID. Č. 5: | |||
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||||
(A) | dĺžka: | 23 párov | báz | ||
(B) | typ: | nukleová | kyselina | ||
(C) | počet reťazcov: | j eden | |||
(D) | topológia: | lineárna |
J i | (ii) | Typ molekuly: | cDNA |
í J | (iii) | Hypotetická: | nie |
1 | (iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) | Opis sekvencie | SEKV.ID. Č. 5 |
CTATATAAGC AGAGCTCGTT TAG (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 6:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 30 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: áno (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 6:
P.
GTAGCAAAGA TCTAAGGACG GTGACTGCAG (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 7:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 39 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: jeden (D) topológia: lineárna
(ii) | Typ molekuly: | cDNA | |
a | (iii) | Hypotetická : | nie |
(iv) | Pozitívna: | nie | |
(ix) | Opis sekvencie | :: SEKV.ID. Č. 7 |
GTATGTGTCT GAAAATGAGC GTGGAGATTG GGCTCGCAC | 39 | ||
(2) | Informácie o SEKV.ID. | Č. 8: | |
(i) Charakteristika | sekvencie: | ||
(A) dĺžka: | 39 párov | báz | |
(B) typ: | nukleová | kyselina |
(C) počet reťazcov: jeden (D) topológia: lineárna
(ii) | Typ molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie |
(iv) | Pozitívna: | áno |
(ix) | Opis sekvencie | SEKV.ID. Č. 8 |
GTGCGAGCCC AATCTCCACG CTCATTTTCA GACACATAC 39 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 9:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 9 aminokyselín |
(B) | typ: | aminokyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden |
(D) | topológia: | lineárna |
(ii) Typ | molekuly: peptid |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (v) Typ fragmentu: vnútorný (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 9:
Thr Tyr Gin Arg Thr Arg Ala Leu Val 1 5 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 10:
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
(A) | dĺžka: | 4432 | párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | ||
(C) | počet reťazcov: | dva | ||
(D) | topológia: | oba | ||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Poži | tívna: nie | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. | 10: |
TCGCGCGTTT | CGGTGATGAC | GGTGAAAACC | TCTGACACAT | GCAGCTCCCG | GAGACGGTCA | 60 |
CAGCTTGTCT | GTAAGCGGAT | GCCGGGAGCA | GACAAGCCCG | TCAGGGCGCG | TCAGCGCGTG | 120 |
TTGGCGGGTG | TCGGGGCTGG | CTTAACTATG | CGGCATCAGA | GCAGATTGTA | CTGAGAGTGC | 180· |
ACCATATGCG | GTGTGAAATA | CCGCACAGAT | GCGTAAGGAG | AAAAŤACCGC | ATCAGATTGG | 240 |
CTATTGGCCA | TTGCATACGT | TGTATCCATA | TCATAATATG | TACATTTATA | TTGGCTCATG | 300' |
í
TCCAACATTA | CCGCCATGTT | GACATTGATT | ATTGACTAGT | TATTAATAGT | AATCAATTAC | 360 |
CGGGTCATTA | GTTCATAGCC | CATATATGGA | gttccgcgtt | ACATAACTTA | CGGTÄAATGG | ' 420 |
CCCGCCTGGC | TGACCGCCCA | ACGACCCCCG | CCCATTGACG | TCAATAATGA | CGTATGTTCC | 480 |
CATAGTAACG | CCAATAGGGA | CTTTCCATTG | ACGTCAATGG | GTGGAGTATT | TACGGTAAAC | 540 |
TGCCCACTTG | GCAGTACATC | AAGTGTATCA | TATGCCAAGT | ACGCCCCCTA | TTGACGTCAA | 600 |
TGACGGTAAA | TGGCCCGCCT | GGCATTATGC | CCAGTACATG | ACCTTATGGG | ACTTTCCTAC | 660 |
TTGGCAGTAC | ATCTACGTAT | TAGTCATCGC | TATTACCATC | GTGATGCGGT | TTTGGCAGTA | 720 |
CATCAATGGG | CGTGGATAGC | GGTTTGACTC | ACGGGGATTT | CCAAGTCTCC | ACCCCAŤTGA | 780 |
CGTCAATGGG | AGTTTGTTTT | GGCACCAAAA | TCAACGGGAC | TTTCCAAAAT | GTCGTAACAA | 840 |
CTCCGCCCCA | TTGACGCAAA | TGGGCGGTAG | GCGTGTACGG | TGGGAGGTCT | ATATAAGCAG | 900 |
AGCTCGŤTTA | GTGAACCGTC | AGATCGCCTG | GAGACGCCAT | CCACGCTGTT | TTGACCTCCA | . 960 |
TAGAAGACAC | CGGGACCGAT | CCAGCCTCCG | CGGCCGGGAA | CGGTGCATTG | GAACGCGGAT | 1020 |
TCCCCGTGCC | AAGAGTGACG | TAAGTACCGC | CTATAGAGTC | TATAGGCCCA | CCCCCTTGGC | 1080 |
TTCTTATGCA | TGCTATACTG | TTTTTGGCTT | GGGGTCTATA | CACCCCCGCT | TCCTCATGTT | 1140 |
ATAGGTGATG | GTATAGCTTA | GCCTATAGGT | GTGGGTTATT | GACCATTATT | GACCACTCCC | 1200 |
CTATTGGTGA | CGATACTTTC | CATTACTAAT | CCATAACATG | gctctttgcc | ACAACTCTCT | 1260 |
TTATTGGCTA | TATGCCAATA | CACTGTCCTT | CAGAGACTGA | CACGGACTCT | GTATTTTTAC | 1320 |
AGGATGGGGT | CTCATTTATT | ATTTACAAAT | TCACATATAC | AACACCACCG | TCCCCAGTGC | 1380 |
CCGCAGTTTT | TATTAAACAT | AACGTGGGAT | CTCCACGCGA | ATCTCGGGTA | CGTGTTCCGG | 1440 |
ACATGGGCTC | TTCTCCGGTA | GCGGCGGAGC | TTCTACATCC | GAGCCCTGCT | CCCATGCCTC | 1500 |
CAGCGACTCA | TGGTCGCTCG | GCAGCTCCTT | GCTCCTAACA | GTGGAGGCCA | GACTTAGGCA | 1560 |
CAGCACGATG | CCCACCACCA | CCAGTGTGCC | GCACAAGGCC | GTGGCGGTAG | GGTATGTGTC | 1620 |
TGAAAATGAG | CTCGGGGAGC | GGGCTTGCAC | CGCTGACGCA | TTTGGAAGAC | TTAAGGCAGC | 1680 |
GGCAGAAGAA | GATGCAGGCA | GCTGAGTTGT | TGTGTTCTGA | TAAGAGTCAG | AGGTAACTCC | 1740 |
CGTTGCGGTG | CTGTTAACGG | TGGAGGGCAG | TGTAGTCTGA | GCAGTACTCG | TTGCTGCCGC | 1800 |
GCGCGCCACC | ACACATAATA | GCTGACAGAC | TAACAGACTG | TTCCTTTCCA | TGGGTCTTTT | 1860 |
CTGCAGTCAC | CGTCCTTAGA | TCTGCTGTGC | CTTCTAGTTG | CCÄGCCATCT | GTTGTTTGCC | 1920 |
CCTCCCCCGT | GCCTTCCTTG | ACCCTGGAAG | GTGCCACTCC | CACTGTCCTT | TCCTAATAAA | 1980 |
ATGAGGAAAT | TGCATCGCAT | TGTCTGAGTA | GGTGTCATTC | TATTCTGGGG | CGTGGGGTGG | 2040 |
GGCAGCACAG | CAAGGGGGAG | GATTGGGAAG | ACAATAGCAG | GCATGCTGGG | GATGCGGTGG | 2100 |
GCTCTATGGG | TACCCAGGTG | CTGAAGAATT | GACCCGGTTC | CTCCTGGGCC | AGAAAGAAGC | 2160 |
AGGCACATCC | CCTTCTCTGT | GACACACCCT | GTCCACGCCC | CTGGTTCTTA | GTTCCAGCCC | 2220 |
CACTCATAGG | ACACTCATAG | CTCAGGAGGG | CTCCGCCTTC | AATCCCACCC | GCTAAAGTAC | 2280 |
TTGGAGCGGT | CTCTCCCTCC | CTCATCAGCC | CACCAAACCA | AACCTAGCCT | CCAAGAGTCG | 2340 |
GAAGAAATTA | AAGCAAGATA | GGCTATTAAG | TGCAGAGGGA | GAGAAAATGC | CTCCAACATG | 2400 |
TGAGGAAGTA | ATGAGAGAAA | TCATAGAATT | TCTTCCGCTT | CCTCGCTCAC | TGACTCGCTG | 2460 | |
CGCTCGGTCG | TTCGGCTGCG | GCGAGCGGTA | TCAGCTCACT | CAAAGGCGGT | AATACGGTTA | 2520 | |
TCCACÁGAAT | CAGGGGATAA | CGCAGGAAAG | AACATGTGAG | CAAAAGGCCA | GCAAAAGGCC | 2580 | |
AGGAACCGTA | AAAAGGCCGC | GTTGCTGGCG | TTTTTCCATA | GGCTCCGCCC | CCCTGACGAG | 2640 | |
CATCACAAAA | ATCGACGCTC | AAGTCAGAGG | TGGCGAAACC | CGACAGGACT | ATAAAGATAC | 2700 | |
CAGGCGTTTC | CCCCTGGAAG | CTCCCTCGTG | CGCTCTCCTG | TTCCGACCCT | GCCGCTTACC | 2760 | |
GGATACCTGT | CCGCCTTTCT | CCCTTCGGGA | AGCGTGGCGC | TTTCTCAATG | CTCACGCTGT | 2820 | |
AGGTATCTCA | GTTCGGTGTA | GGTCGTTCGC | TCCAAGCTGG | GCTGTGTGCA | CGAACCCCCC | 2880 | |
GTTCAGCCCG | ACCGCTGCGC | CTTATCCGGT | AACTATCGTC | TTGAGTCCAA | CCCGGTAAGA | 2940 | |
CACGACTTAT | CGCCACTGGC | AGCAGCCACT | GGTAACAGGA | TTAGCAGAGC | GAGGTATGTA | 3000 | |
• | GGCGGTGCTA | CAGAGTTCTT | GAAGTGGTGG | CCTAACTACG | GCTACACTAG | AAGGACAGTA | 3060 |
- | TTTGGTATCT | GCGCTCTGCT | GAAGCCAGTT | ACCTTCGGAA | AAAGAGTTGG | TAGCTCTTGA | 3120 |
* | TCCGGCAAAC | AAACCACCGC | TGGTAGCGGT | GGTTTTTTTG | TTTGCAAGCA | GCAGATTACG | 3180 |
• | CGCAGAAAAA | AAGGATCTCA | AGAAGATCCT | TTGATCTTTT | CTACGGGGTC | TGACGCTCAG | 3240 |
TGGAACGAAA | ACTCACGTTA | AGGGATTTTG | GTCATGAGAT | TATCAAAAAG | GATCTTCACC | 3300 | |
« | TAGATCCTTT | TAAATTAAAA | ATGAAGTTTT | AÄATCAATCT | AAAGTATATA | TGAGTAAACT | 3360 |
TGGTCTGACA | GTTACCAATG | CTTAATCAGT | GAGGCACCTA | TCTCAGCGAT | CTGTCTATTT | 3420 | |
CGTTCATCCA | TAGTTGCCTG | ACTCCCCGTC | GTGTAGATAA | CTACGATACG | GGAGGGCTTA | 3480 | |
CCATCTGGCC | CCAGTGCTCC | AATGATACCG | CGAGACCCAC | GCTCACCGGC | TCCAGATTTA | 3540 | |
TCAGCAATAA | ACCAGCCAGC | CGGAAGGGCC | GAGCGCAGAA | GTGGTCCTGC | AACTTTATCC | 3600 | |
t | GCCTCCATCC | AGTCTATTAA | TTGTTGCCCG | GAAGCTAGAG | TAAGTAGTTC | GCCAGTTAAT | 3660 |
< | AGTTTGCGCA | ACGTTGTTGC | CATTGCTACA | GGCATCGTGG | TGTCACGCTC | gtcgtttggt | 3720 |
ATGGCTTCAT | TCAGCTCCGG | TTCCCAACGA | TCAAGGCGAG | TTACATGATC | CCCCATGTTG | 3780 | |
TGCAAAAAAG | CGGTTAGCTC | CTTCGGTCCT | CCGATCGTTG | TCAGAAGTAA | GTTGGCCGCA | 3840 | |
GTGTTATCAC | TCATGGTTAT | GGCAGCACTG | CATAATTCTC | TTACTGTCAT | GCCATCCGTA | 3900 | |
- | AGATGCTTTT | CTGTGACTGG | TGAGTACTCA | ACCAAGTCAT | TCTGAGAATA | GTCTATGCGG | 3960 |
CGACCGAGTT | gctcttgccc | GGCGTCAATA | CGGGATAATA | CCGCGCCACA | TAGCAGAACT | 4020 | |
TTAAAAGTGC | TCATCATTGG | AAAACGTTCT | TCGGGGCGAA | AACTCTCAAG | GATCTTACCG | 4080 | |
CTGTTGAGAT | CCAGTTCGAT | GTAACCCACT | CGTGCACCCA | ACTGATCTTC | AGCATCTTTT | 4140 | |
i | actttcacca | GCGTTTCTGG | GTGAGCAAAA | ACAGGAAGGC | AAAATGCCGC | AAAAAAGGGA | 4200 |
ATAAGGGCGA | CACGGAAATG | TTGAATACTC | ATACTCTTCC | TTTTTCAATA | TTATTGAAGC | 4260 | |
ATTTATCAGG | gttattgtct | CATGAGCGGA | TACATATTTG | AATGTATTTA | GAAAAATAAA | 4320 | |
CAAATAGGGG | TTCCGCGCAC | ATTTCCCCGA | AAAGTGCCAC | CTGACGTCTA | AGAAACCATT | 4380 |
ATTATCATGA CATTAACCTA TAAAAATACG CGTATCACGA GGCCCTTTCG TC
4432
(2) Informácie o SEKV.ID. Č. 11:
(i) Charakteristika sekvencie: 2196 párov báz nukleová kyselina dva oba
(A) | dĺžka: | ||
(B) | typ: | ||
(C) | počet r | eťazcov | |
(D) | topológia: | ||
(ii) | Typ | molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie | |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 11:
ATTGGCTATT | GGCCATTGCA | TACGTTGTAT | CCATATCATA | ATATGTACAT | TTATATTGGC | 60 | |
* | TCATGTCCAA | CATTACCGCC | ATGTTGACAT | TGATTATTGA | CTAGTTATTA | ATAGTAATCA | 120 |
ATTACGGGGT | CATTAGTTCA | TAGCCCATAT | ATGGAGTTCC | GCGTTACATA | ACTTACGGTA | 180 | |
i | AATGGCCCCC | CTGGCTGACC | GCCCAACGAC | CCCCGCCCAT | TGACGTCAAT | AATGACGTAT | 240 |
GTTCCCATAG | TAACGCCAAT | AGGGACTTTC | CATTGACGTC | AATGGGTGGA | GTATTTACGG | 300 | |
TAAACTGCCC | ACTTGGCAGT | ACATCAAGTG | TATCATATGC | CAAGTACGCC | CCCTATTGAC | 360 | |
GTCAATGACG | GTAAATGGCC | CGCCTGGCAT | TATGCCCAGT | ACATGACCTT | ATGGGACTTT | 420 | |
CCTACTTGGC | AGTACATCTA | CGTATTAGTC | ATCGCTATTA | CCATGGTGAT | GCGGTTTTGG | 480 | |
CAGTACATCA | ATGGGCGTGG | ATAGCGGTTT | GACTCACGGG | GATTTCCAAG | TCTCCACCCC | S40 | |
ATTGACGTCA | ATGGGAGTTT | GTTTTGGCAC | CAAAATCAAC | GGGACTTTCC | AAAATGTCGT | 600 | |
AACAACTCCG | CCCCATTGAC | GCAAATGGGC | GGTAGGCGTG | TACGGTCGGA | GGTCTATATA | 660 | |
AGCAGAGCTC | GTTTAGTGAA | CCGTCAGATC | GCCTGGAGAC | GCCATCCACG | CTGTTTTGAC | 720 | |
CTCCATAGAA | GACACCGGGA | CCGATCCAGC | CTCCGCGGCC | GGGAACGGTG | CATTGGAACG | 780 | |
♦ | CGGATTCCCC | GTGCCAAGAG | TGACGTAAGT | ACCGCCTATA | GAGTCTATAG | GCCCACCCCC | 840 |
TTGGCTTCTT | ATGCATGCTA | TACTGTTTTT | GGCTTGGGGT | CTATACACCC | CCGCTTCCTC | 900 | |
ATGTTATAGG | TGATGGTATA | GCTTAGCCTA | TAGGTGTGGG | TTATTGACCA | TTATTGACCA | 960 | |
CTCCCCTATT | GGTGACGATA | CTTTCCATTA | CTAATCCATA | ACATGGCTCT | TTGCCACAAC | 1020 | |
TCTCTTTATT | GGCTATATGC | CAATACACTG· | TCCTTCAGAG | ACTGACACGG | ACTCTGTATT | 1080 | |
TTTACAGGAT | GGGGTCTCAT | TTATTATTTA | CAAATTCACA | TATACAACAC | CACCGTCCCC | 1140 | |
AGTGCCCGCA | GTTTTTATTA | AACATAACGT | GGGATCTCCA | CGCGAATCTC | GGGTACGTGT | 1200 | |
TCCGGACATG | GGCTCTTCTC | CGGTAGCGGC | GGAGCTTCTA | CATCCGAGCC | CTGCTCCCAT | 1260 | |
GCCTCCAGCG | ACTCATGGTC | GCTCGGCAGC | TCCTTGCTCC | TAACAGTGGA | GGCCAGACTT | 1320 | |
AGGCACAGCA | CGATGCCCAC | CACCACCAGT | GTGCCGCACA | AGGCCGTGGC | GGTAGGGTAT | 1380 | |
GTGTCTGAAA | ATGAGCTCGG | GGAGCGGGCT | TGCACCGCTG | ACGCATTTGG | AAGACTTA-AG | 1440 |
GCAGCGGCAG | AAGAAGATGC | AGGCAGCTGA | GTTGTTGTGT | TCTGATAAGA | GTCAGAGGTA | 1500 |
ACTCCCGTTG | CGGTGCTGTT | AACGGTGGAG | GGCAGTGTAG | TCTGAGCAGT | ACTCGTTGCT | 1560 |
GCCGCGCGCG | CCACCAGACA | TAATAGCTGA | CAGACTAACA | GACTGTTCCT | TTCCATGGGT | 1620 |
CTTTTCTGCA | GTCACCGTCC | TTAGATCTGC | TGTGCCTTCT | AGTTGCCAGC | CATCTGTTGT | 1680 |
TTGCCCCTCC | CCCGTGCCTT | CCTTGACCCT | GGAAGGTGCC | ACTCCCACTG | TCCTTTCCTA | 1740 |
ATAAAATGAG | GAAATTGCAT | CGCATTGTCT | GAGTAGGTGT | CATTCTATTC | TCGGGGGTGG | 1800 |
GGTGGGGCAG | CACAGCAAGG | GGGAGGATTG | GGAAGACAAT | AGCAGGCATG | CTGGGGATGC | 1860 |
GGTGGGCTCT | ATGGGTACCC | AGGTGCTGAA | GAATTGACCC | GGTTCCTCCT | GGGCCAGAAA | 1920 |
GAAGCAGGCA | CATCCCCTTC | TCTGTGACAC | ACCCTGTCCA | CGCCCCTGGT | TCTTAGTTCC | 1980 |
AGCCCCACTC | ATAGGACACT | CATAGCTCAG | GAGGGCTCCG | CCTTCAATCC | CACCCGCTAA | 2040 |
AGTACTTGGA | GCGGTCTCTC | CCTCCCTCAT | CAGCCCACCA | AACCAAACCT | AGCCTCCAAG | 2100 |
AGTGGGAAGA | AATTAAAGCA | AGATAGGCTA | TTAAGTGCAG | AGGGAGAGAA | AATGCCTCCA | 2160 |
ACATGTGAGG | AAGTAATGAG | AGAAATCATA | GAATTC | 2196 |
(2)
Informácie o SEKV.ID. Č. 12:
i'
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
(A) | dĺžka: | 71 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | j eden | ||
(D) | topológia: | lineárna | ||
(ii) | Typ ' | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Pozitívna: nie | |||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 12: |
GTCACCGTCC TTAGATCAAT TCCAGCAAAA GCAGGGTAGA 40
TAATCACTCA CTGAGTGACA TCAAAATCAT G 71 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 13:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 117 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: dva (D) topológia: oba
I
j (ii) | Typ molekuly: cDNA |
(iii) | Hypotetická: nie |
Í (iv) | Pozitívna: nie |
’ (ix) | Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 13 |
ACCGTCCTTA GATCAGCTTG GCAAAAGCAG GCAAACCATT 40
TGAATGGATG TCAATCCGAC CTTACTTTTC TTAAAAGTGC 80
CAGCACAAAA TGCTATAAGC ACAACTTTCC CTTATAC 117 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 14:
(i) Charakteristika sekvencie:
136 párov báz nukleová kyselina dva oba
(A) | dĺžka: | ||
(B) | typ: | ||
(C) | počet | reťazcov | |
(D) | topológia: | ||
(ii) | Typ | molekuly | : cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie | |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 14:
Í' . GTCACCGTCC TTAGATCAAT TCCAGCAAAA GCAGGGTGAC40
AAAAACATAA TGGATCCAAA CACTGTGTCA AGCTTTCAGG80
TAGATTGCTT TCTTTGGCAT GTCCGCAAAC GAGTTGCAGA120
CCAAGAACTA CGTGAT (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 15:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 152 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: dva (D) topológia: oba
(ii) | Typ molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) | Opis sekvencie | :: SEKV.ID. Č. 15 |
TCTGCAGTCA CCGTCCTTAG ATCAGCTTGG AGCAAAAGCA40
GGGGAAAATA AAAACAACCA AAATGAAGGC AAACCTACTG80
GTCCTGTTAA GTGCACTTGC AGCTGCAGAT GCAGACACAA120
TATGTATAGG CTACCATGCG AACAATTCAA CC152 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 16:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 162 párov báz | |
(B) | xyp: | nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | dva | |
(D) | topológia: | oba | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Poži | tívna: nie | |
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 16: |
TTTTCTGCAG TCACCGTCCT TAGATCCCGA ATTCCAGCAA 40
AAGCAGGTCA ATTATATTCA ATATGGAAAG AATAAAAGAA. 80
CTAAGAAATC TAATGTCGCA GTCTGCCACC CCGGAGATAC 120
TCACAAAAAC CACCGTGGAC CATATGGCCA TAATCAAGAA GT 162 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 17:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 122 párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | dva | |
(D) | topológia: | oba | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Pozitívna: nie | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 17: |
TCGAAACGTA CGTACTCTCT ATCATCCCGT CAGGCCCCCT 80
CAAAGCCGAG ATCGCACAGA GACTTGAAGA GTTGACGGAA GA 122
- 93 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 18:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 4864 párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | dva | |
(D) | topológia: | oba | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Poži | tívna: nie | |
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 18: |
TCGCGCGTTT | CGGTGATGAC | GGTGAAAACC | TCTGACACAT | GCAGCTCCCG | GAGACGGTCA | 60 |
CAGCTTGTCT | GTAAGCGGAT | GCCGGGAGCA | GACAAGCCCG | TCAGCCCCCG | TCAGCGGGTC | 120 |
TTGGCGGGTG | TCGGGGCTCG | CTTAACTATG | CGGCATCAGA | GCAGATTGTA | CTGAGAGTGC | 180 |
ACCATATGCG | GTGTGAAATA | CCGCACAGAT | GCGTAAGGAG | AAAATACCGC | ATCAGATTGG | 240 |
CTATTGGCCA | TTGCATACGT | TGTATCCATA | TCATAATATG | TACATTTATA | TTGGCTCATG | 300 |
TCCAACATTA | CCGCCATGTT | GACATTGATT | ATTGACTAGT | TATTAATAGT | AATCAATTAC | 360 |
GGGGTCATTA | GTTCATAGCC | CATATATGGA | GTTCCGCGTT | ACATAACTTA | CGGTAAATGG | 420 |
CCCGCCTGGC | TGACCGCCCA | ACGACCCCCG | CCCATTGACG | TCAATAATGA | CGTATGTTCC | 480 |
CATAGTAACG | CCAATAGGGA | CTTTCCATTG | ACGTCAATGG | GTGGAGTATT | TACGGTAAAC | 540 |
TGCCCACTTG | GCAGTACATC | AAGTGTATCA | TATGCCAAGT | ACGCCCCCTA | TTGACGTCAA | 600 |
TGACCGTAAA | TGGCCCGCCT | GGCATTATGC | CCAGTACATG | ACCTTATGGG | ACTTTCCTAC | 660 |
TTGGCAGTAC | ATCTACGTAT | TAGTCATCGC | TATTACCATG | GTGATGCGGT | TTTGGCAGTA | 720 |
CATCAATGGG | CGTGGATAGC | GGTTTGACTC | ACGGGGATTT | CCAAGTCTCC | ACCCCATTGA | 780 |
CGTCAATGGG | AGTTTGTTTT | GGCACCAAAA | TCAACGGGAC | TTTCCAAAAT | GTCGTAACAA | 840 |
CTCCGCCCCA | TTGACCCAAA | TGGGCGGTAG | GCGTGTACGG | TGGGAGGTCT | ATATAAGCAG | 900 |
AGCTCGTTTA | GTGAACCGTC | AGATCGCCTG | GAGACGCCAT | CCACGCTGTT | TTGACCTCCA | 960 |
TAGAAGACAC | CGGGACCGAT | CCAGCCTCCG | CGGCCGGGAA | CGGTGCATTG | GAACGCGGAT | 1020 |
TCCCCGTCCC | AAGAGTGACG | TAAGTACCGC | CTATAGAGTC | TATAGGCCCA | CCCCCTTCG·.? | 10$·'.' |
TTCTTATGCA | TGCTATACTG | TTTTTGGCTT | GGGGTCTATA | CACCCCCGCT | TCCTCATGTT | 1140 |
ATAGGTGATG | GTATAGCTTA | GCCTATAGGT | GTGGGTTATT | GACCATTATT | GACCACTCCC | 1200 |
CTATTGGTGA | CGATACTTTC | CATTACTAAT | CCATAACATG | GCTCTTTGCC | ACAACTCTCT | 1260 |
TTATTGGCTA | TATGCCAATA | CACTGTCCTT | CAGAGACTGA | CACGGACTCT | GTATTTTTAC | 1320 |
AGGATGGGGT | CTCATTTATT | ATTTACAAAT | TCACATATAC | AACACCACCG | TCCCCAGTGC | 1380 |
CCGCAGTTTT | TATTAAACAT | AACGTGGGAT | CTCCACGCGA | ATCTCGGGTA | CGTGTTCCGG | 1440 |
ACATGGGCTC | TTCTCCGGTA | GCGGCGGAGC | TTCTACATCC | GAGCCCTGCT | CCCATGCCTC | 1500 |
CAGCGACTCA | TGGTCGCTCG | GCAGCTCCTT | GCTCCTAACA | GTGGAGGCCA | GACTTAGGCA | 1560 |
CAGCACGATG | CCCACCACCA | ČCAGTGTGCC | GCACAAGGCC | GTGGCGGTAG | GGTATGTGTC | 1620 |
TGAAAATGAG | CTCGGGGAGC | GGGCTTGCAC | CGCTGACGCA | TTTGGAAGAC | TTAAGGCAGC | 1680 |
GGCAGAAGAA | GATGCAGGCA | GCTGAGTTGT | TGTGTTCTGA | TAAGAGTCAG | AGGTAACTCC | 1740 |
CGTTGCGGTG | CTGTTAACGG | TGGAGGGCAG | TGTAGTCTGA | GCAGTACTCG | TTGCTGCCGC | 1800 |
GCGCGCCACC | AGACATAATA | GCTGACAGAC | TAACAGACTG | TTCCTTTCCA | TGGGTCTTTT | 1860 |
CTGCAGTCAC | CGTCCTTAGA | TCTGCTGTGC | CTTCTAGTTG | CCAGCCATCT | GTTGTTTGCC | 1920 |
CCTCCCCCGT | GCCTTCCTTG | ACCCTGGAAG | GTGCCACTCC | CACTGTCCTT | TCCTAATAAA | 1980 |
ATGAGGAAAT | TGCATCGCAT | TGTCTGAGTA | GGTGTCATTC | TATTCTGGGG | GGTGGGGTGG | 2040 |
GGCAGCACAG | CAAGGGGGAG | GATTGGGAAG | ACAATAGCAG | GCATGCTGGG | GATGCGGTGG | 2100 |
GCTCTATGGG | TACCCAGGTG | CTGAAGAATT | GACCCGGTTC | CTCCTGGGCC | AGAAAGAAGC | 2160 |
AGGCACATCC | CCTTCTCTGT | GACACACCCT | GTCCACGCCC | CTGGTŤCTTA | GTTCCAGCCC | .2220 |
CACTCATAGG | ACACTCATAG | CTCAGGAGGG | CTCCGCCTTC | AATCCCACCC | GCTAAAGTAC | 2280 |
TTGGAGCGGT | CTCTCCCTCC | CTCATCAGCC | CACCAAACCA | AACCTAGCCT | CCAAGAGTGG | 2340 |
GAAGAAATTA | AAGCA.AGATA | GGCTATTAAG | TGCAGAGGGA | GAGAAAATGC | CTCCAACATC | 2400 |
TGAGGAAGTA | ATGAGAGAAA | TCATAGAATT | TCTTCCGCTT | CCTCGCTCAC | TGACTCGCTG | 24 60 |
CGCTCGGTCG | TTCGGCTGCG | GCGAGCGGTA | TCAGCTCACT | CAAAGGCGGT | AATACGGTTA | 2520 |
TCCACAGAAT | CAGGGGATAA | CGCAGGAAAG | AACATGTGAG | CAAAAGGCCA | GCAAAAGGCC | 2580 |
AGGAACCGTA | AAAAGGCCGC | GTTGCTGGCG | TTTTTCCATA | GGCTCCGCCC | CCCTGACGAG | 2640 |
CATCACAAAA | ATCGACGCTC | AAGTCAGAGG | TGGCGAAACC | CGACAGGACT | ATAAAGATAC | 2700 |
CAGGCGTTTC | CCCCTGGAAG | CTCCCTCGTG | CGCTCTCCTG | TTCCGACCCT | GCCGCTTACC | 27 60 |
GGATACCTGT | CCGCCTTTCT | CCCTTCGGGA | AGCGTGGCGC | TTTCTCAATG | CTCACGCTGT | 2820 |
AGGTATCTCA | GTTCGGTGTA | GGTCGTTCGC | TCCAAGCTGG | GCTGTGTGCA | CGAACCCCCC | 2880 |
GTTCAGCCCG | ACCGCTGCGC | CTTATCCGGT | AACTATCGTC | TTGAGTCCAA | CCCGGTAAGA | 2940 |
CACGACTTAT | CGCCACTGGC | AGCAGCCACT | GGTAACAGGA | TTAGCAGAGC | GAGGTATGTA | 3000 |
GGCGGTGCTA | CAGAGTTCTT | GAAGTGGTGG | CCTAACTACG | GCTACACTAG | AAGGACAGTA | 3060 |
TTTGGTATCT | GCGCTCTGCT | GAAGCCAGTT | ACCTTCGGAA | AAAGAGTTGG | TAGCTCTTGA | 3120 | |
j | TCCGGCAAAC | AAACCACCGC | TGGTAGCGGT | GGTTTTTTTG | TTTGCAAGCA | GCACATTACG | 3180 |
í | CGCAGAAAAA | AAGGATCTCA | AGAAGATCCT | TTGATCTTTT | CTACGGGGTC | TGACGCTCAG | 3240 |
1 | TGGAACGAAA | ACTCACGTTA | AGGGATTTTG | GTCATGAGAT | TATCAAAAAG | GATCTTCACC | 3300 |
TAGATCCTTT | TAAATTAÁAA | ATGAAGTTTT | AAATCAATCT | AAAGTATATA | TGAGTAAACT | 3360 | |
TGGTCTGACA | GTTACCAATG | CTTAATCAGT | GAGGCACCTA | TCTCAGCGAT | CTGTCTATTT | 3420 | |
CGTTCATCCA | TAGTTGCCTG | ACTCCGGGGG | GGGGGGGCGC | TGAGGTCTGC | CTCGTGAAGA | 3480 | |
AGGTGTTGCT | GACTCATACC | AGGCCTGAAT | CGCCCCATCA | TCCAGCCAGA | AAGTGAGGGA | 3540 | |
GCCACGGTTG | ATGAGAGCTT | TGTTGTAGGT | GGACCAGTTG | GTGATTTTGA | acttttgctt | 3600 | |
* » | TGCCACGGAA | CGGTCTGCGT | TGTCGGGAAG | ATGCGTGATC | TGATCCTTCA | ACTCAGCAAA | 3660 |
AGTTCGATTT | ATTCAACAAA | GCCGCCGTCC | CGTCAAGTCA | GCGTAATGCT | CTGCCAGTGT | 3720 | |
• | TACAACCAAT | TAACCAATTC | TGATTAGAAA | AACTCATCGA | GCATCAAATG | AAACTGCAAT | 3780 |
TTATTCATAT | CAGGATTATC | AATACCATAT | TTTTGAAAAA | gccgtttctg | TAATGAAGGA | 3840 | |
GAAAACTCAC | CGAGGCAGTT | CCATAGGATG | GCAAGATCCT | GGTATCGGTC | TGCGATTCCG | 3900 | |
1 | actcgtccaa | CATCAATACA | ACCTATTAAT | TTCCCCTCGT | CAAAAATAAG | GTTATCAAGT | 3960 |
1 t j | GAGAAATCAC | CATGAGTGAC | GACTGAATCC | GGTGAGAATG | GCAAAAGCTT | ATGCATTTCT | 4020 |
! | TTCCAGACTT | GTTCAACAGG | CCAGCCATTA | CGCTCGTCAT | CAAAATCACT | CGCATCAACC | 4080 |
AAACCGTTAT | TCATTCGTGA | TTGCCCCTGA | GCGAGACGAA | ATACGCGATC | GCTGTTAAAA | 4140 | |
GGACAATTAC | AAACAGGAAT | CGAATGCAAC | CGGCGCAGGA | ACACTGCCAG | CGCATCAACA | 4200 | |
ATATT.TTCAC | CTGAATCAGG | ATATTCTTCT | AATACCTGGA | ATGCTGTTTT | CCCGGGGATC | 4260 | |
GCAGTGGTGA | GTAACCATGC | ATCATCAGGA | GTACGGATAA | AATGCTTGAT | GGTCCGAAGA | 4320 | |
GCCATAAATT | CCGTCAGCCA | GTTTAGTCTG | ACCATCTCAT | CTGTAACATC | ATTGGCAACG | 4380 | |
CTACCTTTGC | CATGTTTCAG | AAACAACTCT | GGCGCATCGG | GCTTCCCATA | CAATCGATAG | 4440 | |
ATTGTCCCAC | CTGATTGCCC | GACATTATCG | CGAGCCCATT | TATACCCATA | TAAATCAGCA | 4500 | |
- | TCCATGTTGG | AATTTAATCG | CGGCCTCGAG | CAAGACGTTT | CCCGTTGAAT | ATGGCTCATA | 4560 |
ACACCCCTTG | TATTACTGTT | TATGTAAGCA | GACAGTTTTA | TTGTTCATGA | TGATATATTT | 4620 | |
TTATCTTGTG | CAATGTAACA | TCAGAGATTT | TGAGACACAA | CGTGGCTTTC | cccccccccc | 4680 | |
CATTATTGAA | GCATTTATCA | GGGTTATTGT | CTCATGAGCG | GATACATATT | TGAATGTATT | 4740 | |
TAGAAAAATA | AACAAATAGG | GGTTCCGCGC | ACATTTCCCC | GAAAAGTGCC | ACCTGACGTC | 4800 | |
TAAGAAACCA | TTATTATCAT | GACATTAACC | TATAAAAATA | GGCGTATCAC | GAGGCCCTTT | 4860 |
4864
CCTC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 19:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 15 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárny | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 19:
AGCAGAAGCA GAGCA (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 20:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 119 párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | dva | |
(D) | topológia: | oba | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Pozitívna: nie | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 20: |
TCACCGTCCT TAGATCAAGC AGGGTTAATA ATCACTCACT GAGTGACATC AAAATCATGG CGTCCCAAGG CACCAAACGG TCTTATGAAC AGATGGAAAC TGATGGGGAA CGCCAGATT
119 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 21:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||||
(A) | dĺžka: | 67 párov | báz | ||
(B) | typ: | nukleová | kyselina | ||
(C) | počet | reťazcov: | dva | ||
(D) | topológia: | oba | |||
(ii) | Typ | molekuly | : cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: | nie | |||
(iv) | Pozitívna: | áno |
I (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 21:
GAGGGGCAAA CAACAGATGG CTGGCAACTA GAAGGCACAG CAGATATTTT TTCCTTAATT GTCGTAC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 22:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 15 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: áno (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 22:
AGCAGAAGCA CGCAC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 23:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 15 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 23:
AGCAGAAGCA CAGCA (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 24:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 33 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: dva (D) topológia: oba
F
Ĺ t’ r'
I •a
- 98 - | ||
(ii) | Typ molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) | Opis sekvencie | >: SEKV |
CCTTAGATCG GAAATAAAAA CAACCAAAAT GAA (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 25:
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
(A) | dĺžka: | 36 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | dva | ||
(D) | topológia: | oba | ||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Poži | tívna: áno | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 25: |
i GCAGATCCTT ATATTTCTGA AATTCTGGTC TCAGAT (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 26:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 102 párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | : dva | |
(D) | topológia: | oba | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Pozitívna: nie | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 26: |
ACCGTCCTTA GATCCAGAAG CAGAGCATTT TCTAATATCC 40 ACAAAATGAA GGCAATAATT GTACTACTCA TGGTAGTAAC 80 ATCCAACGCA GATCGAATCT GC 1θ (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 27:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 42 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | dva | ||
(D) | topológia: | oba | ||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Poži | tívna: áno | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 27: |
ggcacagcag ATCTTTCAAT AACGTTTCTT tgtaatggta ac (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 28:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 23 párov | báz |
(B) | typ; | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 28:
CTAACAGACT GTTCCTTTCC ATG (2) Informácie o SEKV.ID. Č.' 29:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 18 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: áno (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 29:
GGAGTGGCAC CTTCCAGG ίόο -
u i
(2) Informácie o SEKV.ID. Č. 30:
(i)
Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 12 párov | báz | ||
(B) | typ: | nukleová | kyselina | ||
(C) | počet r | eťazcov: | jeden | ||
(D) | topológia: | lineárna | |||
(ϋ) | Typ | molekuly: | cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: | nie | |||
(iv) | Pozitívna: | nie | |||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 30: |
agcaaaagca gg (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 31:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 14 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden |
(D) | topológia: | lineárna |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
t- (iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 31:
agcagaagcg gagc
Č. 32:
(2) Informácie o SEKV.ID.
1 | (i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 35 párov | ||
(B) | typ: | nukleová | ||
(C) | počet reťazcov: | j eden a i | ||
(D) | topológia: | lineárna | ||
,Ί | (ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Pozitívna: nie | |||
Λ í | (ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 32 |
ť r | CCACATGTCG ACCCGTAAAA AGGCCGCGTT GCTGG |
báz kyselina dva
101 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 33:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 33 párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | j eden a d va | |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Pozitívna: nie | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 33: |
GGTACAACCA TGAAGACTAT CATTGCTTTG AGC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 34:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 37 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a < | dva |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 34:
CCACATAGAT CTTCAAATGC AAATGTTGCA CCTAATG 37 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 35:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 38 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: jeden a dva (D) topológia: lineárna
(ii) | Typ molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) | Opis sekvencie | : SEKV.ID. Č. 35 |
GGTACAACCA TGAAAGCAAA ACTACTAGTC CTGTTATG
102 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 36:
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
(A) | dĺžka: | 32 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | j eden a < | dva | |
(D) | topológia: | lineárna | ||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Pozitívna: nie | |||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 36 |
CCACATTCAG ATGCATATTC TACACTGCAA AG (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 37:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 36 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a i | dva |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 37:
GGTACAACCA TGAAGGCAAT AATTGTACTA CTCATG (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 38:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 36 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a i | dva |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie j (iv) Pozitívna: nie j (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 38: J i
CCACATTTAT AGACAGATGG AGCAAGAAAC ATTGTC 36 : - io3 :'ί j (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 39:
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
(A) | dĺžka: | 33 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | j eden a i | dva | |
(D) | topológia: | lineárna | ||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Pozitívna: nie | |||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 39 |
GGTACAAGAT CTACCATGCT TCTAACCGAG GTC
(2) Informácie | o SEKV.ID. Č. 40 | |||
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
(A) | dĺžka: | 36 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | jeden a < | dva | |
(D) | topológia: | lineárna | ||
(ii) | Typ molekuly: cDNA | |||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Pozitívna: nie | |||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 40 | |
CCACATAGAT CTTCACTTGA ACCGTTGCAT CTGCAC | 36 |
(2) | Informácie | o SEKV.ID. Č. 41 | |||
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||||
(A) | dĺžka: | 39 párov | báz | ||
(B) | typ: | nukleová | kyselina | ||
(C) | počet reťazcov: | jeden a < | dva | ||
(D) | topológia: | lineárna | |||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |||
(iii) | Hypotetická: nie | ||||
(iv) | Pozitívna: nie | ||||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 41 |
GGTACAGGAT CCACCATGTC CAACATGGAT ATTGACGGC
104 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 42:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 39 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a < | dva |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 42:
CCACATGGAT CCTTAATAAT CGAGGTCATC ATAATCCTC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 43:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 42 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a < | dva |
(D) | topológia: | lineárna | |
(ϋ) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 43:
GGTACAGGAT CCACCATGTC GCTGTTTGGA GACACAATTG CC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 44:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 38 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: jeden a dva (D) topológia: lineárna
(ii) | Typ molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) | Opis sekvencie | : SEKV.ID. Č. 44 |
CCACATGGAT CCTTATAGGT ATTTCTTCAC AAGAGCTG
105
f (2) | Informácie | o SEKV.ID. Č. 45: | ||
(i) | Charakteristika sekvencie: | |||
> | (A) | dĺžka: | 3553 párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | ||
(C) | počet reťazcov: | dva | ||
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie
(ix) GATATTGGCT GGCTCATGTC | Opis sekvencie: | SEKV.ID TATCCATATC CATTGATTAT | . Č. 45: ATAATATGTA TGACTAGTTA | CATTTATATT TTAATAGTAA | 60 120 | |
ATTGGCCATT ČAACATTACC | GCATACGTTG GCCATGTTGA | |||||
TCAATTACGG | GGTCATTAGT | TCATAGCCCA | TATATGGAGT | TCCGCGTTAC | ATAACTTACG | 180 |
GTAAATGGCC | CGCCTGGCTG | ACCGCCCAAC | GACCCCCGCC | CATTGACGTC | AATAATGACG | ; 240 |
TATGTTCCCA | TAGTAACGCC | AATAGGGACT | TTCCATTGAC | GTCAATGGGT | GGAGTATTTA | 300 |
CGGTAAACTG | CCCACTTGGC | AGTACATCAA | GTGTATCATA | TGCCAAGTAC | GCCCCCTATT | 360 |
GACGTCAATG | ACGGTAAATG | GCCCGCCTGG | CATTATGCCC | AGTACATGAC | CTTATGGGAC | 420 |
TTTCCTACTT | GGCAGTACAT | CTACGTATTA | GTCATCGCTA | TTACCATGGT | GATGCGGTTT | : 480 |
TGGCAGTACA | TCAATGGGCG | TGGATAGCGG | TTTGACTCAC | GGGGATTTCC | AAGTCTCCAC | 540 |
CCCATTGACG | TCAATGGGAG | TTTGTTTTGG | CACCAAAATC | AACGGGACTT | TCCAAAATGT | 600 |
CGTAACAACT | CCGCCCCATT | GACGCAAATG | GGCGGTAGGC | GTGTACGGTG | GGAGGTCTAT | 660 |
ATAAGCAGAG | CTCGTTTAGT | GAACCGTCAG | ATCGCCTGGA | GACGCCATCC | ACGCTGTTTT | 720 |
GACCTCCATA | GAAGACACCG | GGACCGATCC | AGCCTCCGCG | GCCGGGAACG | GTGCATTGGA | ' 780 |
ACGCGGATTC | CCCGTGCCAA | GAGTGACGTA | AGTACCGCCT | ATAGAGTCTA | TAGGCCCACC | 840 |
CCCTTGGCTT | CTTATGCATG | CTATACTGTT | TTTGGCTTGG | GGTCTATACA | CCCCCGCTTC | 900 |
CTCATGTTAT | AGGTGATGGT | ATAGCTTAGC | CTATAGGTGT | GGGTTATTGA | CCATTATTGA | 960 |
CCACTCCCCT | ATTGGTGACG | ATACTTTCCA | TTACTAATCC | ATAACATGGC | TCTTTGCCAC | 1020 |
AACTCTCTTT | ATTGGCTATA | TGCCAATACA | CTGTCCTTCA | GAGACTGACA | CGGACTCTGT | • 1080 |
ATTTTTACAG | GATGGGGTCT | CATTTATTAT | TTACAAATTC | ACATATACAA | CACCACCGTC | 1140 |
CCCAGTGCCC | GCAGTTTTTA | TTAAÄCATGC | TAACGTGGGA | TCTCCACGCG | AATCTCGGGT | 1200 |
ACGTGTTCCG | GACATGGGCT | CTTCTCCGGT | AGCGGCGGAG | CTTCTACATC | CGAGCCCTGC | '1260 |
TCCCATGCCT | CCAGCCACTC | ATGGTCGCTC | GGCAGCTCCT | TGCTCCTAAC | AGTGGAGGCC | 1320 |
AGACTTAGGC | ACAGCACGAT | GCCCACCACC | ACCAGTGTGC | CGCACAAGGC | CGTGGCGGTA | 1380 |
GGGTATGTGT | CTGAAAATGA | GCTCGGGGAG | CGGGCTTGCA | CCGCTGACGC | ATTTGGAAGA | 1440 1 |
CTTAAGGCAG | CGGCAGAAGA | AGATGCAGGC | AGCTGAGTTG | TTGTGTTCTG | ATAAGAGTCA | '1500 |
GAGGTAACTC | CCGTTGCGGT | GCTGTTAACG | GTGGAGGGCA | GTGTAGTCTG | AGCAGTACTC | 1560 |
106
GTTGCTGCCG | CGCGCGCCAC | CAGACATAAT | AGCTGACAGA | CTAACAGACT | GTTCCTTTCC | .1620 |
ATGGGTCTTT | TCTGCAGTCA | CCGTCCTTAG | ATCTGCTGTG | CCTTCTAGTT | GCCAGCCATC | 1680 |
TGTTGTTTGC | CCCTCCCCCG | TGCCTTCCTT | GACCCTGGAA | GGTGCCACTC | CCACTGTCCT | 'A740 |
TTCCTAATAA | AATGAGGAAA | TTGCATCGCA | TTGTCTGAGT | AGGTGTCATT | CTATTCTGGG | : 1800 |
GGGTGGGGTG | GGGCAGCACA | GCAAGGGGGA | GGATTGGGAA | GACAATAGCA | GGCATGCTGG | 1860 |
GGATGCGGTG | GGCTCTATGG | GTACGGCCGC | AGCGGCCGTA | CCCAGGTGCT | GAAGAATTGA | 1920 |
CCCGGTTCCT | CGACCCGTAA | AAAGGCCGCG | TTGCTGGCGT | TTTTCCATAG | GCTCCGCCCC | 1980 |
CCTGACGAGC | ATCACAAAAA | TCGACGCTCA | AGTCAGAGGT | GGCGAAACCC | GACAGGACTA | 2040 |
TAAAGATACC | AGGCGTTTCC | CCCTGGAAGC | TCCCTCGTGC | GCTCTCCTGT | TCCGACCCTG | .2100 |
CCGCTTACCG | GATACCTGTC | CGCCTTTCTC | CCTTCGGGAA | GCGTGGCGCT | TTCTCAATGC | '2160 |
TCACGCTGTA | GGTATCTCAG | TTCGGTGTAG | GTCGTTCGCT | CCÁAGCTGGG | CTGTGTGCAC | 2220 |
GAACCCCCCG | TTCACCCCGA | CCGCTGCGCC | TTATCCGGTA | ACTATCGTCT | TGACTCCAAC | 2280 |
CCGGTAAGAC | ACGACTTATC | GCCACTGGCA | GCAGCCACTG | GTAACAGGAT | TAGCAGAGCG | 2340 |
AGGTATGTAG | GCGGTGCTAC | AGAGTTCTTG | AAGTGGTGGC | CTAACTACGG | CTACACTAGC | 2400 |
TGAAGGACAG | TATTTGGTAT | CTGCGCTCTG | CTGAAGCCAG | TTACCTTCGG | AAAAAGAGTT | 2460 |
GGTAGCTCTT | GATCCGGCAA | ACAAACCACC | GCTGGTAGCG | GTGGTTTTTT | TGTTTGCAAG | 2520 |
CAGCAGATTA | CGCGCAGAAA | AAAAGGATCT | CAAGAAGATC | CTTTGATCTT | TTCTACGTGA | 2580 |
TCCCGTAATG | CTCTGCCAGT | GTTACAACCA | AT-TAACCAAT | TCTGATTAGA | AAAACTCATC | '2640 |
GAGCATCAAA | TGAAACTGCA | ATTTATTCAT | ATCAGGATTA | TCAATACCAT | ATTTTTGAAA | 2700 |
AAGCCGTTTC | TGTAATGAAG | GAGAAAACTC | ACCGAGGCAG | TTCCATAGGA | TGGCAAGATC | 2760 |
CTGGTATCGG | TCTGCGATTC | CGACTCGTCC | AACATCAATA | CAACCTATTA | ATTTCCCCTC | 2820 |
GTCAAAAATA | AGGTTATCAA | GTGAGAAATC | ACCATGAGTG | ACGACTGAAT | CCGGTGAGAA | 2880 |
TGGCAAAAGC | TTATGCATTT | CTTTCCAGAC | TTGTTCAACA | GGCCAGCCAT | TACGCTCGTC | 2940 |
ATCAAAATCA | CTCGCATCAA | CCAAACCGTT | ATTCATTCGT | GATTGCGCCT | GAGCGAGACG | 3000 |
AAATACGCGA | TCGCTGTTAA | AAGGACAATT | ACAAACAGGA | ATCGAATGCA | ACCGGCGCAG | 3060 |
GAACACTGCC | AGCGCATCAA | CAATATTTTC | ACCTGAATCA | GGATATTCTT | CTAATACCTG | 3120 |
GAATGCTGTT | TTCCCGGGGA | TCGCAGTGGT | GAGTAACCAT | GCATCATCAG | GAGTAČGGAT | 3180 |
AAAATGCTTG | ATGGTCGGAA | GAGGCATAAA | TTCCGTCAGC | CAGTTTAGTC | TGACCATCTC | 3240 |
ATCTGTAACA | TCATTGGCAA | CGCTACCTTT | GCCATGTTTC | AGAAACAACT | CTGGCGCATC | 3300 |
GGGCTTCCCA | TACAATCGAT | AGATTGTCGC | ACCTGATTGC | CCGACATTAT | CGCGAGCCCA | 3360 |
TTTATACCCA | TATA-AATCAG | CATCCATGTT | GGAATTTAAT | CGCGGCCTCG | AGCAAGACGT | 3420 1 |
TTCCCGTTGA | ATATGGCTCA | TAACACCCCT | TGTATTACTG | TTTATGTAAG | CAGACAGTTT | 3480 |
TATTGTTCAT | GATGATATAT | TTTTATCTTG | TGCAATGTAA | CATCAGAGAT | TTTGAGACAC | 1 3540 |
AACGTGGCTT TCC
3553
107 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 46:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 72 párov | báz | ||
(B) | typ: | nukleová | kyselina | ||
(C) | počet | reťazcov: | : j eden a i | dva | |
(D) | topológia: | oba | |||
(ii) | Typ | molekuly | : cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: | nie | |||
(iv) | Pozitívna: | nie | |||
(ix) | Opis sekvencie: SEKV. | ID. Č. 46 |
TCACCGTCCT TAGATCGGTA CAACCATGAA GACTATCATT GCTTTGAGCT ACATTTTATG TCTGGTTTTC GC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 47:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 111 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 47:
TCATGCTTTT TGCTTTGTGT TGTTTTGCTG GGGTTCATCA40
TGTGGGCCTG CCAAAAAGGC AACATTAGGT GCAACATTTG80
CATTTGAAGA TCTATGTGGG ATCGCTGTG CHl
(2) | Informácie | o SEKV.ID. Č. 48 | |||
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||||
(A) | dĺžka: | 63 párov | báz | ||
(B) | typ: | nukleová | kyselina | ||
(C) | počet reťazcov: | j eden a | dva | ||
(D) | topológia: | oba | |||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |||
(iii) | Hypotetická: nie |
108 (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 48:
TTAGATCGGA ACATGAAAGC AAAACTACTA GTCCTGTTAT GTGCATTTAC AGCTACATAT GCA (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 49:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) (B) | dĺžka: typ: | 102 párov báz nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | dva | |
(D) | topológia: | oba | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Poži | tívna: nie | |
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 49: |
CTGGTGCTTT TGGTCTCCCT GGGGGCAATC AGCTTCTGGA TGTGTTCTAA TGGGTCTTTG CAGTGTAGAA TATGCATCTG AATGTGGGAT CTGCTGTGCC TT (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 50:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 108 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 50:
CCTTAGATCG GTACAACCAT GAAGGCAATA ATTGTACTAC40
TCATGGTAGT AACATCCAAC GCAGATCGAA TCTGCACTGG80
GATAACATCT TCAAACTCAC CTCATGTG108
I (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 51:
- 109 I (i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 102 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 51:
TTGGCTGTAA CATTGATGAT AGCTATTTT ATTGTTTATA40
TGGTCTCCAG AGACAATGTT TCTTGCTCCA TCTGTCTATA80
AATGTGGGAT CTGCTGTGCC TT102 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 52:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 84 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 52:
GTCCTTAGAT CCACCATGGC GTCCAAGGC ACCAAACGGT40
CTTATGAACA GATGGAAACT GATGGGGAAC GCCAGAATGC AACT 84 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 53:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 108 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie
110 ι
í g
j (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 53:
I GAAAAGGCAA CGAACCCGAT CGTGCCCTCT TTTGACATGA
J GTAATGAAGG ATCTTATTTC TTCGGAGACA ATGCAGAAGA ! GTACGACAAT TAAGGATCTG CTGTGCCT
108 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 54:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 132 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(íi) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 54:
CTTAGATCCA GATCTACCAT GAGTCTTCTA ACCGAGGTCG40
AAACGTATGT TCTCTCTATC GTTCCATCAG GCCCCCTCAA80
AGCCGAAATC GCGCAGAGAC TTGAAGATGT CTTTGCTGGG120
AAAAACACAG AT132 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 55:
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||
(A) | dĺžka: | 129 párov báz | |
(B) | typ: | nukleová kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | : jeden a dva | |
(D) | topológia: | oba | |
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |
(iii) | Hypotetická: nie | ||
(iv) | Pozitívna: nie | ||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 55: |
GGGACTCATC CTAGCTCCAG TACTGGTCTA AAAGATGATC 40
TTCTTGAAAA TTTGCAGACC TATCAGAAAC GAATGGGGGT 80 í GCAGATGCAA CGGTTCAAGT GAAGATCTAT GTGGGATCTG 120 ,1 CTGTGCCTT 129
111 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 56:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 81 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 56:
CTTAGATCCA CCATGTCCAA CATGGATATT GACGGTATCA ACACTGGGAC AATTGACAAA ACACCGGAAG AAATAACTTC T (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 57:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 96 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 57:
GTTGAAATTC CAATTAAGCA GACCATCCCC AATTTCTTCT TTGGGAGGGA CACAGCAGAG GATTATGATG ACCTCGATTA TTAAGGATCT GCTGTG
(2) | Informácie o SEKV.ID. Č. 58: | ||||
(i) | Charakteristika sekvencie: | ||||
(A) | dĺžka: | 96 párov | báz | ||
(B) | typ: | nukleová | kyselina | ||
(C) | počet reťazcov: | j eden a i | dva | ||
(D) | topológia: | oba | |||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | |||
(iii) | Hypotetická: nie |
- Í12 (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 58:
CTTAGATCCA CCATGTCGCT GTTTGGAGAC ACAATTGCCT40
ACCTGCTTTC ATTGACAGAA GATGGAGAAG GCAAAGCAGA80
ACTAGCAGAA AAATTA (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 59:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 123 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ii) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 59:
AGATCTCTTG GGGCAAGTCA AGAGAATGGG GAAGGAATTG CAAAGGATGT GATGGAAGTG CTAAAGCAGA GCTCTATGGG AAATTCAGCT CTTGTGAAGA AATACCTATA AGGATCTGCT GTG (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 60:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 33 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: jeden a dva (D) topológia: oba
(i i) | Typ molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) | Opis sekvencie | : SEKV.ID. Č. 60 |
GGTACAAATA TTGGCTATG GCCATTGCAT ACG 33 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 61:
(i) Charakteristika sekvencie:
113
(A) | dĺžka: | 36 párov | báz | |
(B) | typ: | nukleová | kyselina | |
(C) | počet reťazcov: | jeden a dva | ||
(D) | topológia: | oba | ||
(ii) | Typ | molekuly: cDNA | ||
(iii) | Hypotetická: nie | |||
(iv) | Pozitívna: nie | |||
(ix) | Opis | sekvencie: SEKV. | ID. Č. 61 |
CCACATCTCG AGGAACCGGG TCAATTCTTC AGCACC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 62:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) dĺžka: 38 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) počet reťazcov: jeden a dva (D) topológia: oba
(ii) | Typ molekuly: | cDNA |
(iii) | Hypotetická: | nie |
(iv) | Pozitívna: | nie |
(ix) | Opis sekvencie | SEKV.ID. Č. 62: |
GGTACAGATA TCGGAAAGCC ACGTTGTGTC TCAAAATC (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 63:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 37 párov | báz |
(B) | typ: | nukleová | kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a < | dva |
(D) | topológia: | oba | |
(ϋ) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie (ix) Opis sekvencie: SEKV.ID. Č. 63:
CCACATGGAT CCGTAATGCT CTGCCAGTGT TACAACC
114 (2) Informácie o SEKV.ID. Č. 64:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | dĺžka: | 39 párov báz |
(B) | typ: | nukleová kyselina |
(C) | počet reťazcov: | j eden a dva |
(D) | topológia: | oba |
(ϋ) Typ | molekuly: cDNA |
(iii) Hypotetická: nie (iv) Pozitívna: nie
Claims (25)
1. DNA konštrukcia, vyznačujúca satým, že obsahuje nukleovú kyselinu kódujúcu gén chrípkového vírusu, pričom uvedená konštrukcia DNA je schopná vyvolať expresiu antigénneho produktu génu chrípkového vírusu, ktorý pri aplikácii DNA konštrukcie do živočíšneho tkaniva in vivo indukuje špecifickú imunitnú odpoveď a výsledný príjem tejto DNA konštrukcie bunkami exprimujúcimi kódovaný chrípkový gén.
2. DNA konštrukcia podľa nároku 1, vyznačuj ú c a sa tým, že gén chrípkového vírusu kóduje nukleoproteín, hemaglutinín, polymerázu, matrix alebo neštruktúrny génový produkt chrípkového vírusu.
’
3. Polynukleotidová vakcína, obsahujúca konštrukciu DNA j· í vyznačujúca sa tým, že indukuje neutralizujúi ; ce protilátky proti ľudskému chrípkovému vírusu, cytotoxické
T-lymfocyty špecifické proti chrípkovému vírusu alebo obranné imunitné odpovede pri in vivo aplikácii DNA liečebného prípravku, pričom živočíchom je stavovec a polynukleotidová vakcína kóduje gén chrípkového vírusu, ktorý je po zavedení do tkaniva uvedených živočíchov exprimovaný in vivo.
?
4. Polynukleotidová vakcína podľa nároku 3, vyznačujúca sa tým, že obsahuje DNA konštrukciu zvolenú z jedného alebo viacerých nasledujúcich konštrukcií:
a) pnRSV-PR-NP,
b) Vl-PR-NP,
c) V1J-PR-NP, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:12:,
d) V1J-PR-PB1, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:13:,
e) V1J-PR-NS, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:14:,
f) V1J-PR-HA, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:15:,
g) V1J-PR-PB2, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:16:, ‘
h) V1J-PR-M1, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:17:,
i) VIJneo-BJ-NP, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:20:
116
6.61 Kb, 5'koncom je SEKV.ID:50: 51: ,
o) VlJns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), 6,42Kb, 5'koncom je SEKV.ID:52: 53 : ,
p) VIJns-BJ-Ml (A/Beijing/353/89),
5.62 Kb, 5’koncom je SEKV.ID:54:
6,56 Kb, 5'koncom je SEKV.ID:46: a 3’koncom je SEKV.ID: 47: ,
m) VlJns-TX-HA (A/Texas/36/91), veľkosť konštrukcie je
6,56 Kb, 5'koncom je SEKV.ID:48: a 3'koncom je SEKV.ID: 49: ,
n) VIJns-PA-HA (B/Panama/45/90), veľkosť konštrukcie je a 3'koncom je SEKV.ID:
veľkosť konštrukcie je a 3’koncom je SEKV.ID:
veľkosť konštrukcie je a 3’koncom je SEKV.ID:
55 : ,
q) VIJns-PA-NP (B/Panama/45/90), veľkosť konštrukcie je 6,54 Kb, 5'koncom je SEKV.ID:56: a 3’koncom je SEKV.ID: 57: ,
r) VIJns-PA-Ml (B/Panama/45/90), veľkosť konštrukcie je
5,61 Kb, 5'koncom je SEKV.ID:58: a 3’koncom je SEKV.ID: 59: .
5. Expresívny vektor V1J, vyznačujúci sa tým, že obsahuje SEKV.ID:10:.
6. Expresívny vektor VIJ-neo, vyznačuj úci sa t ý m, že obsahuje SEKV.ID:18:.
7. Spôsob ochrany proti nákaze ľudským chrípkovým vírusom, vyznačujúci sa tým, že spočíva v očkovaní profylaktický účinným množstvom DNA podľa nároku 1.'
117
8. Spôsob ochrany proti nákaze ľudským chrípkovým vírusom, vyznačujúci sa tým, že spočíva v očkovaní profylaktický účinným množstvom DNA podľa nároku 3.
9. Spôsob ochrany proti nákaze ľudským chrípkovým vírusom, vyznačujúci sa tým, že spočíva v očkovaní profylaktický účinným množstvom DNA podľa nároku 4.
10. Spôsob ochrany podľa nároku 7, vyznačuj ú c i sa tým, že spočíva v priamej aplikácii DNA do tkaniva in vivo.
11. Spôsob ochrany podľa nároku 10, vyznačuj úci sa tým, že DNA je aplikovaná buď ako holá DNA vo fyziologicky prijateľnom roztoku bez nosiča alebo ako zmes DNA a lipozómu alebo ako zmes s prídavnou látkou alebo prísadou napomáhajúcou transfekcii.
12. Spôsob využitia génu chrípkového vírusu na indukciu imunitnej odpovede in vivo, vyznačujúci sa tým, že obsahuje:
a) izoláciu génu,
b) pripojenie génu k regulačnej sekvencii tak, že gén je funkčne pripojený ku kontrolnej sekvencii, ktorá po zavedení do živého tkaniva, riadi iniciáciu transkripcie a následné translácie tohto génu a
c) zavedenie génu do živého tkaniva.
13. Spôsob podľa nároku 12, vyznačujúci sa tým, že ďalej obsahuje zvýšenie indukovanej imunitnej odpovede niekoľkonásobným zavedením génu chrípkového vírusu.
14. Spôsob podľa nároku 12, vyznačujúci sa tým, že gén chrípkového vírusu kóduje nukleopróteín, hemaglutinín, matrix, neštruktúrny alebo polymerázový génový produkt vírusu ľudskej chrípky.
118
15. Spôsob podľa nároku 14, vyznačujúci sa tým, že gén vírusu ľudskej chrípky kóduje neukleoproteín, bázickú polymerázu 1, neštruktúrny proteín 1, hemaglutinín, matricový proteín 1 alebo bázickú polymerázu 2 jedného alebo viacerých izolátov vírusu ľudskej chrípky A/PR/8/34, A/Beijing/353/89, A/Texas/36/91, A/Georgia/03/93 a B/Panama/45/90.
16. Spôsob indukcie imunitnej odpovede proti nákaze alebo ochoreniu spôsobenému kmeňmi chrípkového vírusu, vyznačujúci sa tým, že spočíva v zavedení nukleovej kyseliny do stavovcov kódujúcou konzervovaný epitop chrípkového vírusu špecifický pre prvý kmeň chrípkového vírusu tak, že indukovaná imunitná odpoveď ochraňuje nielen proti nákaze či ochoreniu prvým kmeňom chrípkového vírusu ale ochraňuje aj proti nákaze či ochoreniu kmeňmi, ktoré sa od prvého uvedeného kmeňa líšia.
17. Spôsob podľa ktoréhokoľvek júci sa tým, že je ľudský.
v y z n a c u touto metódou
a)
b)
c)
d)
e)
f)
g)
h) nárokov 7 až 16, z
organizmus ošetrovaný
18. DNA, pnRSV-PR-NP, Vl-PR-NP, V1J-PR-NP, ktorej 5’koncom je SEKV.ID:12:, V1J-PR-PB1, ktorej 5’koncom je SEKV.ID:13:, V1J-PR-NS, ktorej 5'koncom je SEKV.ID:14:, V1J-PR-HA, ktorej 5'koncom je SEKV.ID:15:, V1J-PR-PB2, ktorej 5’koncom je SEKV.ID:16:, V1J-PR-M1, ktorej 5'koncom je vyznačujúci s a t ý m, že je:
SEKY.ID:17:,
je SEKY.ID:27:,
119
19. Prípravok konštrukcií nukleovej kyseliny, vyznačujúci sa tým, že kóduje gény chrípkových vírusov z oboch typov A aj B ľudských chrípkových vírusov.
20. Prípravok podľa nároku 19, obsahujúci konštrukcie nukleových kyselín, vyznačujúci sa tým, že kóduje gén hemaglutinínu najmenej troch kmeňov chrípkového vírusu, gén pre nukleoprotein najmenej dvoch kmeňov chrípkového vírusu a gén pre matricový proteín najmenej dvoch kmeňov chrípkového vírusu.
21. Prípravok podľa nároku 19, vyznačujúci sa t ý m, že uvedené gény chrípkového vírusu sú odvodené od chrípkových vírusov H1N1, H2N2 a H3N2 kmeňa B chrípkového vírusu. i
120
22. Prípravok podľa nároku 19, vyznačuj úci sa tým, že obsahuje:
a) VIJns-GA-HA (A/Georgia/03/93), s veľkosťou konštrukcie
6,56 Kb, ktorého 5'koncom je SEKV.ID:46: a 3'koncom je SEKV.ID:47:,
b) VIJns-TX-HA (A/Texas/36/91), s veľkosťou konštrukcie
6,56 Kb, ktorého 5'koncom je SEKV.ID:48: a 3’koncom je SEKV.ID:49:,
c) VlJns-PA-HA (B/Panama/45/90), s veľkosťou konštrukcie
6,61 Kb, ktorého 5'koncom je SEKV.ID:50: a 3'koncom je
SEKV.ID:51:,
d) VIJns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), s veľkosťou konštrukcie
6,42 Kb, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:52: a 3’koncom je SEKV.ID:53:, j
e) VIJns-BJ-Ml (A/Beijing/353/89), s veľkosťou konštrukcie
5,62 Kb, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:54: a 3'koncom je
SEKV.ID:55:,
f) VIJns-PA-NP (B/Panama/45/90), s veľkosťou konštrukcie 6,54 Kb, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:56: a 3'koncom je SEKV.ID:57:,
g) VIJns-PA-Ml (B/Panama/45/90), s veľkosťou konštrukcie 5,61 Kb, ktorého 5’koncom je SEKV.ID:58: a 3'koncom je SEKV.ID:59:.
23. Expresívny vektor VIJns.
24. Expresívny vektor V1JR, vyznačuj úci sa tým, že má SEKV.ID:45:.
25. Použitie izolovaných génov ľudských chrípkových ví- rusov, vyznačujúce sa tým, že gény chrípkových vírusov sú na začlenenie do vakcíny funkčne pripojené k jednej alebo viacerým kontrolným sekvenciám a vakcína je používaná na očkovanie proti nákaze ľudskými chrípkovými vírusmi . ;
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US3238393A | 1993-03-18 | 1993-03-18 | |
US8998593A | 1993-07-08 | 1993-07-08 | |
PCT/US1994/002751 WO1994021797A1 (en) | 1993-03-18 | 1994-03-14 | Nucleic acid pharmaceuticals |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK114295A3 true SK114295A3 (en) | 1996-02-07 |
Family
ID=26708344
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK1142-95A SK114295A3 (en) | 1993-03-18 | 1994-03-14 | Dna construction and pharmaceutical agent containing them |
Country Status (22)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0620277A1 (sk) |
JP (2) | JP2812352B2 (sk) |
CN (1) | CN1119458A (sk) |
AU (1) | AU676258B2 (sk) |
BG (1) | BG63126B1 (sk) |
BR (1) | BR9406007A (sk) |
CA (1) | CA2119175A1 (sk) |
CZ (1) | CZ290315B6 (sk) |
DZ (1) | DZ1759A1 (sk) |
FI (1) | FI954329A (sk) |
HR (1) | HRP940175A2 (sk) |
HU (1) | HUT73397A (sk) |
IL (1) | IL108915A0 (sk) |
NO (1) | NO953649L (sk) |
NZ (1) | NZ263680A (sk) |
PL (1) | PL178626B1 (sk) |
RO (1) | RO117710B1 (sk) |
SI (1) | SI9420014A (sk) |
SK (1) | SK114295A3 (sk) |
UA (1) | UA42715C2 (sk) |
WO (1) | WO1994021797A1 (sk) |
YU (1) | YU12894A (sk) |
Families Citing this family (69)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5849719A (en) * | 1993-08-26 | 1998-12-15 | The Regents Of The University Of California | Method for treating allergic lung disease |
US6911216B1 (en) | 1994-10-12 | 2005-06-28 | Genzyme Corporation | Targeted delivery via biodegradable polymers |
US5736524A (en) | 1994-11-14 | 1998-04-07 | Merck & Co.,. Inc. | Polynucleotide tuberculosis vaccine |
DE19512142A1 (de) * | 1995-03-31 | 1996-10-02 | Immuno Ag | Infektiöser cDNA-Klon des Tick-Borne Enzephalitis (TBE)-Virus, davon abgeleiteter rekombinanter Impfstoff und Herstellung desselben sowie ein pharmazeutisches Produkt, das eine replizierbare Nukleinsäure enthält |
US6019980A (en) | 1995-06-07 | 2000-02-01 | Connaught Laboratories Limited | Nucleic acid respiratory syncytial virus vaccines |
US6017897A (en) * | 1995-06-07 | 2000-01-25 | Pasteur Merieux Connaught Canada | Nucleic acid respiratory syncytial virus vaccines |
US6083925A (en) * | 1995-06-07 | 2000-07-04 | Connaught Laboratories Limited | Nucleic acid respiratory syncytial virus vaccines |
US6537776B1 (en) | 1999-06-14 | 2003-03-25 | Diversa Corporation | Synthetic ligation reassembly in directed evolution |
FR2751225B1 (fr) * | 1996-07-19 | 1998-11-27 | Rhone Merieux | Formule de vaccin polynucleotidique aviaire |
US6204250B1 (en) | 1996-11-22 | 2001-03-20 | The Mount Sinai Medical Center Of The City Of New York | Immunization of infants |
EP1017283B1 (en) * | 1997-02-14 | 2004-12-15 | Merck & Co., Inc. | Polynucleotide vaccine formulations |
US6517843B1 (en) | 1999-08-31 | 2003-02-11 | Merial | Reduction of porcine circovirus-2 viral load with inactivated PCV-2 |
UA78180C2 (uk) | 1997-10-03 | 2007-03-15 | Меріаль | Кільцевий вірус свині типу ii, вакцини та діагностичні реагенти |
FR2772047B1 (fr) | 1997-12-05 | 2004-04-09 | Ct Nat D Etudes Veterinaires E | Sequence genomique et polypeptides de circovirus associe a la maladie de l'amaigrissement du porcelet (map), applications au diagnostic et a la prevention et/ou au traitement de l'infection |
CA2340330A1 (en) | 1998-08-20 | 2000-03-02 | Aventis Pasteur Limited | Nucleic acid molecules encoding inclusion membrane protein c of chlamydia |
US6686339B1 (en) | 1998-08-20 | 2004-02-03 | Aventis Pasteur Limited | Nucleic acid molecules encoding inclusion membrane protein C of Chlamydia |
US6693087B1 (en) | 1998-08-20 | 2004-02-17 | Aventis Pasteur Limited | Nucleic acid molecules encoding POMP91A protein of Chlamydia |
US6881723B1 (en) | 1998-11-05 | 2005-04-19 | Powderject Vaccines, Inc. | Nucleic acid constructs |
US7691389B2 (en) | 1998-12-22 | 2010-04-06 | Pfizer Inc | Infectious cDNA clone of north american porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus and uses thereof |
US7618797B2 (en) | 1998-12-22 | 2009-11-17 | Pfizer Inc | Infectious cDNA clone of North American porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus and uses thereof |
AU3593200A (en) | 1999-02-09 | 2000-08-29 | Powderject Vaccines, Inc. | (mycobacterium tuberculosis), immunization |
US6943152B1 (en) | 1999-06-10 | 2005-09-13 | Merial | DNA vaccine-PCV |
JP2001151698A (ja) * | 1999-09-10 | 2001-06-05 | Nichiko Pharmaceutical Co Ltd | インフルエンザワクチン |
WO2001030847A1 (en) | 1999-10-22 | 2001-05-03 | Aventis Pasteur Limited | Modified gp100 and uses thereof |
US7196066B1 (en) | 1999-11-03 | 2007-03-27 | Powderject Vaccines, Inc. | DNA-vaccines based on constructs derived from the genomes of human and animal pathogens |
US6852705B2 (en) | 2000-01-21 | 2005-02-08 | Merial | DNA vaccines for farm animals, in particular bovines and porcines |
US7078388B2 (en) | 2000-01-21 | 2006-07-18 | Merial | DNA vaccines for farm animals, in particular bovines and porcines |
EP1792995A3 (en) | 2000-05-08 | 2007-06-13 | Sanofi Pasteur Limited | Chlamydia secretory locus orf and uses thereof |
AU5810201A (en) | 2000-05-10 | 2001-11-20 | Aventis Pasteur | Immunogenic polypeptides encoded by mage minigenes and uses thereof |
AU2005248361B2 (en) | 2004-05-18 | 2010-03-11 | Vical Incorporated | Influenza virus vaccine composition and methods of use |
US8202967B2 (en) | 2006-10-27 | 2012-06-19 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | H5 proteins, nucleic acid molecules and vectors encoding for those, and their medicinal use |
WO2008150998A1 (en) * | 2007-05-31 | 2008-12-11 | Becton, Dickinson And Company | Sequences and methods for detecting influenza a and influenza b virus |
US8354230B2 (en) * | 2007-12-21 | 2013-01-15 | Quest Diagnostics Investments Inc. | Multiplex detection assay for influenza and RSV viruses |
CN102170902B (zh) | 2008-08-01 | 2015-07-15 | 伽玛疫苗有限公司 | 流感疫苗 |
WO2010127252A2 (en) * | 2009-04-30 | 2010-11-04 | Vanderbilt University | Monoclonal antibodies to influenza h1n1 virus and uses thereof |
SG168423A1 (en) * | 2009-07-13 | 2011-02-28 | Agency Science Tech & Res | Influenza detection method and kit therefor |
TWI627281B (zh) | 2009-09-02 | 2018-06-21 | 百靈佳殷格翰家畜藥品公司 | 降低pcv-2組合物殺病毒活性之方法及具有改良免疫原性之pcv-2組合物 |
AR083533A1 (es) | 2010-10-22 | 2013-03-06 | Boehringer Ingelheim Vetmed | Proteinas de hemaglutinina 5 (h5) para el tratamiento y prevencion de las infecciones de gripe |
AR088028A1 (es) | 2011-08-15 | 2014-05-07 | Boehringer Ingelheim Vetmed | Proteinas h5, de h5n1 para un uso medicinal |
WO2013033092A2 (en) | 2011-09-03 | 2013-03-07 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Streptococcus suis pilus antigens |
US10383835B2 (en) | 2012-03-14 | 2019-08-20 | The Regents Of The University Of California | Treatment of inflammatory disorders in non-human mammals |
WO2014127825A1 (en) | 2013-02-21 | 2014-08-28 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | H5 proteins of h5n1 influenza virus for use as a medicament |
JP2016520534A (ja) * | 2013-03-18 | 2016-07-14 | イマクシオImaxio | インフルエンザ核タンパク質ワクチン |
WO2015048115A1 (en) | 2013-09-25 | 2015-04-02 | Zoetis Llc | Pcv2b divergent vaccine composition and methods of use |
AU2015241107B2 (en) | 2014-04-03 | 2019-10-03 | Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. | Porcine epidemic diarrhea virus vaccine |
ES2778649T3 (es) | 2015-08-31 | 2020-08-11 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Vacunas pestivirales para temblores congénitos |
MX2018003173A (es) | 2015-09-16 | 2018-05-17 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Inc | Vacunas de salmonella choleraesuis-salmonella typhimurium. |
AR109540A1 (es) | 2016-09-20 | 2018-12-19 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Moléculas promotoras para expresar antígenos virales |
EP3515480A1 (en) | 2016-09-20 | 2019-07-31 | Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH | New swine influenza vaccine |
CN109715204B (zh) | 2016-09-20 | 2023-08-22 | 勃林格殷格翰动物保健有限公司 | 新的ehv插入位点orf70 |
TW201823467A (zh) | 2016-09-20 | 2018-07-01 | 德商百靈佳殷格翰維美迪加股份有限公司 | 犬腺病毒載體 |
WO2018083154A1 (en) | 2016-11-03 | 2018-05-11 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Vaccine against porcine parvovirus |
MY191895A (en) | 2016-11-03 | 2022-07-18 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Vaccine against porcine parvovirus and porcine reproductive and respiratory syndrome virus and methods of production thereof |
JP2020506915A (ja) | 2017-01-30 | 2020-03-05 | ベーリンガー インゲルハイム アニマル ヘルス ユーエスエイ インコーポレイテッド | ブタコロナウイルスワクチン |
WO2019014144A1 (en) | 2017-07-12 | 2019-01-17 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | IMMUNOGENIC COMPOSITIONS BASED ON SENECAVIRUS TYPE A AND CORRESPONDING METHODS |
CA3072553A1 (en) | 2017-09-23 | 2019-03-28 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Paramyxoviridae expression system |
WO2019092027A1 (en) | 2017-11-09 | 2019-05-16 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Sapelovirus immunogenic compositions and uses thereof |
AU2019223768A1 (en) | 2018-02-23 | 2020-08-27 | Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. | Recombinant viral vector systems expressing exogenous feline paramyxovirus genes and vaccines made therefrom |
CA3091960A1 (en) | 2018-03-19 | 2019-09-26 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | New ehv insertion site ul43 |
AR115002A1 (es) | 2018-03-19 | 2020-11-18 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Ehv con ul18 y/o ul8 inactivados |
JP7162072B2 (ja) | 2018-03-26 | 2022-10-27 | ベーリンガー インゲルハイム アニマル ヘルス ユーエスエイ インコーポレイテッド | 免疫原性組成物を製造する方法 |
CN112867506A (zh) | 2018-09-20 | 2021-05-28 | 勃林格殷格翰动物保健有限公司 | 抗猪流行性腹泻的鼻内载体疫苗 |
EP3852797A1 (en) | 2018-09-20 | 2021-07-28 | Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH | Modified pedv spike protein |
IT201900007060A1 (it) | 2019-05-21 | 2020-11-21 | St Superiore Di Sanita | Cellule tumorali ingegnerizzate e loro usi |
IT201900012540A1 (it) | 2019-07-22 | 2021-01-22 | Humanitas Mirasole Spa | Inibitori di CHI3L1 e loro usi |
EP4100420A1 (en) | 2020-02-06 | 2022-12-14 | Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH | Polypeptides useful for detecting anti-rhabdovirus antibodies |
WO2022076979A1 (en) | 2020-10-05 | 2022-04-14 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Fusion protein useful for vaccination against rotavirus |
WO2022076977A1 (en) | 2020-10-05 | 2022-04-14 | Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. | Fusion protein comprising circoviridae capsid protein, and chimeric virus-like particles composed thereof |
US20240050555A1 (en) | 2022-04-05 | 2024-02-15 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Immunogenic composition useful for vaccination against rotavirus |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
IL86354A0 (en) * | 1987-05-22 | 1988-11-15 | Orion Yhtymae Oy | Episomal vector for the expression of selected dna fragments coding for optional polypeptides in mammalian cells and methods for the production thereof |
WO1990011092A1 (en) * | 1989-03-21 | 1990-10-04 | Vical, Inc. | Expression of exogenous polynucleotide sequences in a vertebrate |
US5643578A (en) * | 1992-03-23 | 1997-07-01 | University Of Massachusetts Medical Center | Immunization by inoculation of DNA transcription unit |
-
1994
- 1994-03-09 IL IL10891594A patent/IL108915A0/xx unknown
- 1994-03-09 EP EP94200605A patent/EP0620277A1/en not_active Withdrawn
- 1994-03-14 HU HU9502702A patent/HUT73397A/hu unknown
- 1994-03-14 SK SK1142-95A patent/SK114295A3/sk unknown
- 1994-03-14 SI SI9420014A patent/SI9420014A/sl not_active IP Right Cessation
- 1994-03-14 BR BR9406007A patent/BR9406007A/pt not_active Application Discontinuation
- 1994-03-14 WO PCT/US1994/002751 patent/WO1994021797A1/en active IP Right Grant
- 1994-03-14 CN CN94191485A patent/CN1119458A/zh active Pending
- 1994-03-14 UA UA95094152A patent/UA42715C2/uk unknown
- 1994-03-14 NZ NZ263680A patent/NZ263680A/en unknown
- 1994-03-14 CZ CZ19952373A patent/CZ290315B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1994-03-14 RO RO95-01622A patent/RO117710B1/ro unknown
- 1994-03-14 PL PL94310677A patent/PL178626B1/pl unknown
- 1994-03-16 CA CA002119175A patent/CA2119175A1/en not_active Abandoned
- 1994-03-16 DZ DZ940021A patent/DZ1759A1/fr active
- 1994-03-17 AU AU57889/94A patent/AU676258B2/en not_active Ceased
- 1994-03-17 HR HR08/089,985A patent/HRP940175A2/xx not_active Application Discontinuation
- 1994-03-17 YU YU12894A patent/YU12894A/sh unknown
- 1994-03-18 JP JP6049102A patent/JP2812352B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
1995
- 1995-09-14 FI FI954329A patent/FI954329A/fi unknown
- 1995-09-15 NO NO953649A patent/NO953649L/no not_active Application Discontinuation
- 1995-09-18 BG BG100006A patent/BG63126B1/bg unknown
-
1997
- 1997-10-22 JP JP29013797A patent/JP3608642B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
HRP940175A2 (en) | 1997-04-30 |
EP0620277A1 (en) | 1994-10-19 |
CA2119175A1 (en) | 1994-09-19 |
NO953649D0 (no) | 1995-09-15 |
NO953649L (no) | 1995-11-17 |
CZ237395A3 (en) | 1996-02-14 |
YU12894A (sh) | 1997-12-05 |
SI9420014A (en) | 1996-08-31 |
FI954329A0 (fi) | 1995-09-14 |
UA42715C2 (uk) | 2001-11-15 |
BR9406007A (pt) | 1996-01-02 |
NZ263680A (en) | 1997-05-26 |
FI954329A (fi) | 1995-09-14 |
DZ1759A1 (fr) | 2002-02-17 |
HUT73397A (en) | 1996-07-29 |
BG100006A (bg) | 1996-12-31 |
CZ290315B6 (cs) | 2002-07-17 |
JPH10113194A (ja) | 1998-05-06 |
PL310677A1 (en) | 1995-12-27 |
HU9502702D0 (en) | 1995-11-28 |
RO117710B1 (ro) | 2002-06-28 |
IL108915A0 (en) | 1994-06-24 |
AU5788994A (en) | 1994-09-22 |
BG63126B1 (bg) | 2001-04-30 |
CN1119458A (zh) | 1996-03-27 |
AU676258B2 (en) | 1997-03-06 |
JPH0795888A (ja) | 1995-04-11 |
JP2812352B2 (ja) | 1998-10-22 |
JP3608642B2 (ja) | 2005-01-12 |
WO1994021797A1 (en) | 1994-09-29 |
PL178626B1 (pl) | 2000-05-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU676258B2 (en) | Nucleic acid pharmaceuticals | |
KR101229202B1 (ko) | 인플루엔자 바이러스의 생산을 위한 다중 플라스미드 시스템 | |
CA2626266C (en) | Multi plasmid system for the production of influenza virus | |
AU696148B2 (en) | Coordinate (in vivo) gene expression | |
CN1810961B (zh) | 一种重组流感病毒及其制备方法与应用 | |
DK1748790T3 (en) | Multiplasmidsystem for the production of influenza | |
CN114014937A (zh) | 稳定化的流感血凝素茎区三聚体及其用途 | |
KR102557390B1 (ko) | 비-구조 단백질의 단편으로 구성된 뎅기 바이러스 키메라 폴리에피토프 및 이의 뎅기 바이러스 감염에 대한 면역원성 조성물에서의 용도 | |
US20040087521A1 (en) | Nucleic acid pharmaceuticals-influenza matrix | |
US20230043128A1 (en) | Multivalent influenza vaccines | |
CN115867561A (zh) | SARS-CoV蛋白、核酸构建体、病毒样蛋白(VLP)的表达及其相关方法 | |
CA2842055C (en) | Recombinant feline leukemia virus vaccine containing optimized feline leukemia virus envelope gene | |
EP1075524A2 (en) | Attenuated influenza viruses | |
AU2021269903A1 (en) | Recombinant vaccine against covid-19 based on a paramyxovirus viral vector | |
RU2193065C2 (ru) | Конструкция днк (варианты), днк-вектор, иммуногенная композиция против вируса гриппа, способ индукции иммунного ответа, вакцина и способ вакцинации | |
US20020103145A1 (en) | Immunization of infants |