PL178626B1 - Szczepionka polinukleotydowa, konstrukt DNA i ekspresyjny wektor plazmidowy DNA - Google Patents

Szczepionka polinukleotydowa, konstrukt DNA i ekspresyjny wektor plazmidowy DNA

Info

Publication number
PL178626B1
PL178626B1 PL94310677A PL31067794A PL178626B1 PL 178626 B1 PL178626 B1 PL 178626B1 PL 94310677 A PL94310677 A PL 94310677A PL 31067794 A PL31067794 A PL 31067794A PL 178626 B1 PL178626 B1 PL 178626B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
dna
seq
mice
sequence
virus
Prior art date
Application number
PL94310677A
Other languages
English (en)
Other versions
PL310677A1 (en
Inventor
John J. Donnely
Varavani J. Dwarki
Margaret A. Liu
Donna L. Montgomery
Suezanne E. Parker
John W. Shiver
Jeffrey B. Ulmer
Original Assignee
Merck & Co Inc
Vical Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Merck & Co Inc, Vical Inc filed Critical Merck & Co Inc
Publication of PL310677A1 publication Critical patent/PL310677A1/xx
Publication of PL178626B1 publication Critical patent/PL178626B1/pl

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2760/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses negative-sense
    • C12N2760/00011Details
    • C12N2760/16011Orthomyxoviridae
    • C12N2760/16111Influenzavirus A, i.e. influenza A virus
    • C12N2760/16122New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

1. Szczepionka polinukleotydowa, znamienna tym, ze zawiera wektor plazmidowy DNA wybrany z gru- py skladajacej sie z pnRSV, V 1, V1J, V 1R, VIJns i V1 Jneo, który obejmuje co najmniej jeden element regu- lujacy transkrypcje funkcjonalnie zwiazany z sekwencja nukleotydowa kodujaca nukleoproteine wirusa grypy, oraz farmaceutycznie dopuszczalny bufor lub nosnik. 3. Konstrukt DNA wybrany z grupy obejmujacej: (a) pn RSV-PR-NP; (b) V 1J-PR-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 12; (c) V 1 Jneo-BJ-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 20, a koniec 3' sta- nowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 21; (d) V 1 Jneo-TX-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 24, a koniec 3 sta- nowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw nr 25; (e) V 1 Jns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), który jest konstruktem o wielkosci 6,42 kb i którego koniec 5' sta- nowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 52, a koniec 3' stanowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 53; (f) V 1Jns-PA-NP (B/Panama/45/90), który jest konstruktem o wielkosci 6,54 kb i którego koniec 5' sta- nowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 56, a koniec 3' stanowi sekwencja wedlug Identyfikatora Sekw. nr 57. 4. Ekspresyjny wektor plazmidowy DNA, którym jest VI Jns o sekwencji przedstawionej na Identyfikato- rze Sekw. nr 45 (fig. 36 i fig. 17). PL PL PL PL PL PL PL PL PL

Description

Przedmiotem wynalazku jest szczepionka polinukleotydowa, która wprowadzona bezpośrednio do żywych tkanek kręgowców, wywołuje powstanie odpowiedzi odpornościowej rozpoznającej swoiście wirusa grypy.
W zakres wynalazku wchodzi także konstrukt DNA i ekspresyjny wektor plazmidowy DNA.
Grypa jest ostrą chorobą gorączkową wywoływaną przez zakażenie układu oddechowego wirusem grypy typu A lub B. Nasilenie grypy występuje co roku w całym świecie, z okresowymi epidemiami lub pandemiami. Grypa wywołuje poważne objawy ogólne, ciężkie choroby (jak
178 626 wirusowe zapalenie płuc) wymagające hospitalizacji i powikłania jak wtórne bakteryjne zapalenie płuc. Uważa się, że ostatnia epidemia w Stanach Zjednoczonych spowodowała wzrost śmiertelności o ponad 10000 (do 40000) rocznie i 5000-10000 zgonów rocznie w latach nie epidemicznych. Najlepszą strategiązapobiegania chorobowości i śmiertelności związanej z grypąjest szczepienie. Obecne licencjonowane szczepionki otrzymywane sąz wirusa hodowanego na jajach kurzych, inaktywowanego i zwierajątrzy szczepy wirusa (dwa szczepy A i jeden B). Dostępne są trzy typy szczepionek: cały wirus, podjednostka wirionu i oczyszczony antygen powierzchniowy. Wyłącznie dwa ostatnie stosuje się u dzieci z powodu znacznej odpowiedzi gorączkowej powodowanej przez całego wirusa. Dzieci w wieku poniżej 9 lat wymagają dwóch szczepień, podczas gdy dorośli wymagi^rątylko pojedynczego wstrzyknięcia. Jednakże, sugeruje się (patrz Medical Letter 32:89-90, Sept. 17,1993), że „korzystne jest u pacjentów szczepionych wczesną jesieniąpodanie drugiej dawki zimą lub wczesną wiosną”, z powodu obserwowanego u starszych pacjentów spadku mian przeciwciał poniżej mian ochronnych w ciągu czterech miesięcy lub krócej. Szczepionki te modyfikuje się co roku przewidując, które z najnowszych szczepów wirusowych będą występować klinicznie i które z nowych szczepów zakaźnych będą dominowały w nadchodzącym sezonie zachorowań. Ponowne szczepienie zalecane jest co roku.
A. Ograniczenia licencjonowanych szczepionek obejmują:
1) Zmienność antygenową, szczególnie w szczepie A wirusa grypy, powoduj ącąpowstanie wirusów, które nie są neutralizowane przez przeciwciała wywołane przez poprzednią szczepionkę (lub poprzednie zakażenie). Nowe szczepy powstająprzez mutacje punktowe (dryf antygenowy) i przez rearanżację (zmiana antygenowa) genów kodujących glikoproteiny powierzchniowe (hemaglutyninę [HA] i neuraminidazę), podczas gdy białka wewnętrzne są silnie zakonserwowane pośród dryfujących i zmieniających się antygenowo szczepów. Immunizacja wywołuje szczepowo specyficzną, zależną od przeciwciał odporność „homologiczną”, a nie „heterologiczną”, wspólną dla całej grupy odporność komórkową.
2. Nawet gdy dominujące, krążące szczepy wirusa grypy nie zmieniają się i nie dryfują antygenowo z roku na rok, trzeba powtarzać immunizację co roku, ponieważ zmniejszają się miana przeciwciał. Jakkolwiek, istnieją doniesienia świadczące o utrzymywaniu się przeciwciał hamujących hemaglutyninę (HI) i przeciwciał neutralizujących przez miesiące i lata z następuj ącym stopniowym spadkiem, Advisory Committee on Immunization Practices wymienia spadek mian w roku następującym po szczepieniujako powód corocznej immunizacji, nawet gdy nie nastąpił znaczący dryf czy zmiana. (Przeciwciała HI hamują zdolność wirusa grypy do aglutynacji czerwonych krwinek. Podobnie jak przeciwciała neutralizujące skierowane są one przede wszystkim przeciwko antygenowi HA. Testy zahamowania hemaglutynacji są prostsze i tańsze w wykonaniu niż testy neutralizacji, i stąd często są wykonywane w ceiu oceny zdolności przeciwciał wywołanych przeciwko jednemu ze szczepów wirusa grypy do reagowania z innym szczepem). Jak wspomniano powyżej, Medical Letter sugeruje, ze obarczone szczególnie wysokim ryzykiem osoby starsze powinny być szczepione dwukrotnie w ciągu sezonu z powodu krótkotrwałości mian ochronnych przeciwciał.
3) Efektywność szczepionekjest suboptymalna. Opracowanie szczepionki na następny sezon polega na przewidywaniu powstających szczepów krążących (drogąpróbkowania w Azji), co jest niedokładne i może powodować słaby dobór między szczepami zastosowanymi w szczepionce i aktualnie krążącymi. Ponadto, jak to miało miejsce podczas sezonu 1992-1993, nowy szczep H3N2 (A/Beijing/92) uwidocznił się klinicznie podczas ostatniej fazy sezonu grypy. Spowodowało to zmianę składu szczepionki 1993-1994, z powodu słabej reaktywności krzyżowej ze szczepem A/Beijing/92 przeciwciał wywołanych przez wcześniejszy szczep H3N2 (A/Beijing/89) z powodu zmiany antygenowej. Jednakże, z powodu długości czasu potrzebnego do wytworzenia obecnej licencjonowanej szczepionki, nowy szczep nie mógł być wprowadzony jako szczepionika podczas sezonu 1992-1993, mimo dowodów na słabą ochronę zapewnianą przez obecną szczepionkę i zwiększoną zakaźność nowego krążącego szczepu H3N2.
178 626
Nawet gdy szczepionka i krążący szczep są dobrze dobrane, licencjonowane szczepionki chronią przed chorobą tylko 70% zdrowych dzieci i młodych dorosłych i 30-40% starszych dorosłych. Stąd inne kryteria używane są do określania efektywności gdy szczepionka odpowiada krążącym szczepom. Kryteria te obejmują ochronę przed ciężkim przebiegiem choroby i wtórnymi powikłaniami, co określa się przez zapobieżenie hospitalizacji (70% dla osób starszych mieszkających w domu w stosunku do 50-60% osób starszych mieszkających w domach opieki) i zapobieżenie śmierci (80% dla osób starszych żyjących w domach opieki). Odporność populacji zdolna zmniejszyć rozprzestrzenianie się choroby w domach opieki uważana jest za jeszcze jedną zaletę szczepień.
B. Charakterystyka idealnej uniwersalnej szczepionki przeciwko grypie (cele wynalazku),
1) Powodowanie ochrony grupowej (heterologicznej). Uniwersalna szczepionka powinna chronić przed różnymi szczepami, przykładowo w obrębie podtypu H3N2, i o ile to możliwe nawet poprzez inne podtypy np. od H1N1 do H3N2. Może to być zapewniane najlepiej przez limfocyty T cytotoksyczne (CTL) rozpoznające antygeny wewnętrznych konserwatywnych białek wirusowych, jakkolwiek przeciwciała neutralizujące skierowane przeciwko konserwowanym częściowo białek związanych z błonami mogą również odgrywać pewną rolę.
2) Zwiększenie zakresu odpowiedzi przeciwciał. Ponieważ uważa się, że CTL odgrywają rolę w zdrowieniu, szczepionka oparta w większości na odpowiedzi CTL powinna skaracać czas trwania choroby (potencjalnie aż do czynieniajej subkliniczną), ale nie zapobiegajej całkowicie. Wykazano doświadczalnie, że sposób produkcji obecnych szczepionek przeciwko grypie, polegający na pasażowaniu wirusa na jajach kurzych, jest zdolny do selekcjonowania subpopulacji wirusa posiadających zmienioną antygenność HA. W wyniku, efektywność szczepionki może być zmniejszona ponieważ wywołane przeciwciała nie mogą być całkowicie efektywne w stosunku do dominującego szczepu krążącego. Stąd próbuje się wytworzyć przeciwciała, które posiadałyby rozszerzony zakres odpowiedzi w porównaniu z obecnymi szczepionkami. Sezon grypy 1992-93 dostarczył świetnego przykładu do badania ograniczeń współczesnej szczepionki, która wykorzystując szczep A/Beijing/89, wywoływała przeciwciała słabo reagujące krzyżowo z (i słabo chroniące przed) nowym szczepem A/Beijing/92, który również był bardziej zakaźny. Oba szczepy były H3N2, tzn. były tego samego podtypu. Jednak pod względem sekwencji aminokwasowej szczepy pochodne A/Beijing/92 różniły się od szczepów A/Beijing/89 tylko 11 mutacjami punktowymi (pozycje 133,135‘, 145,156,157,186,190,191,193,226i262) w regionie HA1. Nie jest wiadome czy współczesny sposób wytwarzania wpływa na brak reaktywności krzyżowej, ale poprawa zakresu odpowiedzi przeciwciał jest pożądana.
3) Przedłużony czas trwania odpowiedzi przeciwciał. Ponieważ grupa o najwyższym ryzyku chorobowości i śmiertelności z powodu zakazenia grypą (osoby starsze) jest również gr^ipią u której poziomy ochronne przeciwciał zanikają zbyt szybko, by coroczne szczepienia były efektywne, polepszona szczepionka powinna wywoływać miana ochronne przeciwciał, utrzymujące się przez dłuższy czas.
C. Polinukleotydy jako szczepionka.
Wykazano, że domięśniowe podanie konstruktów polinukleotydowych tzn. plazmidów DNA kodujących białka powoduje tworzenie in situ białek w komórkach mięśniowych. Przy użyciu plazmidów cDNA kodujących białka wirusowe, wywoływane są odpowiedzi zarówno przeciwciał jak i CTL, dostarczając homologicznej i heterologicznej ochrony przed następową ekspozycją na wirusa, ochrony homologicznej jak i między szczepowej. Każdy z typów odpowiedzi odpornościowej zapewnia potencjalną wyzszość nad istniejącymi strategiami szczepień. Użycie pNv do wywołania przeciwciał może powodować przedłużony czas trwania odpowiedzi przeciwciał jak również dostarczanie antygenu, który może posiadać sekwencję identyczną z krążącym szczepem wirusa jak również odpowiednią modyfikację potranslacyjnąi konformację natywnego białka (w stosunku do białka rekombinowanego). Wywoływanie odpowiedzi cTl w ten sposób zapewnia korzyści ochrony między szczepowej bez użycia potencjalnie chorobotwórczych wektorów czy wirusów atenuowanych.
178 626
D. Dalszy opis podstawy:
Stąd, największym problemem w opracowaniu szczepionek przeciwko wirusomjak grypa, przeciwko którym indukowane są przeciwciała neutralizujące, jest różnorodność białek otoczki wirusa pośród izolatów lub szczepów. Ponieważ, limfocyty T, zarówno myszy jak i ludzi, zdolne są rozpoznawać epitopy uzyskane z zakonserwowanych wirusowych białek wewnętrznych [J.W. Yewdell i in., Proc. Natl. Acad, Sei. USA 82,1785 (1985); A.R.M. Townsend i in., Cell 44, 959 (1986); A.J. Mc Michael i in., J. Gen. Virol. 67,719 (1986); J. Bastin i in., J. Exp. Med. 165, 1508 (1987); A.R.M. Townsend i H. Bodmer, Annu. Rev. Immunol. 7,601 (1989)], i jak się uwaza, grają istotną rolę w odpowiedzi odpornościowej na wirusy [Y.-L.Lin i B.A. Askonas, J. Exp. Med. 154,225 (1981); I. Gardner i in., Eur. J. Immunol. 4,68 (1974); K.L. Yap i G.L. Ada, Nature 273, 238 (1987); A.J. McMichael i in., New Engl. J. Med. 309, 13 (1983); P. M. Taylor i B.A. Askonas, Immunol. 58,417 (1986)] wysiłki kieruje się na opracowanie szczepionki CTL zdolnej zapewnić heterologiczną ochronę przed różnymi szczepami wirusa.
CTL CD 8+ zabijają zakazone wirusem komórki gdy ich receptory limfocytów T rozpoznają peptydy wirusowe związane z cząsteczkami MHC klasy I [R.M. Zinkernagel i P.C. Doherty, ibid, 141, 1427 (1975); R.N. Germain, Nature 353 (1991)]. Peptydy te pochodząz syntetyzowanych endogennie białek wirusowych, w zależności od umiejscowienia białka lub funkcji pełnionej w wirusie. Stąd, przez rozpoznanie epitopów zakonserwowanego białka wirusowego, CTLe mogą zapewnić ochronę międzyszczepową. Peptydy zdolne do związania się z MHC klasy I rozpoznawane przez CTL, pochodzą z białek obecnych lub przechodzących przez cytoplazmę albo siateczkę wewnątrzplazmatyczną [J.W. Yewdell i J.R. Bennink, Science 244,1072 (1989); A.R.M. Townsend i in., Nature 340,443 (1989); J.G. Nuchtern i in., ibid. 339, 223 (1989)]. Tak więc, białka egzogenne, wchodzące do szlaku przemian endosomalnych (jak w przypadku antygenów prezentowanych przez cząsteczki MHC klasy II) nie są zdolne wywoływania odpowiedzi CTL CD8+.
Większość prób wywołania odpowiedzi ze strony CTL wykorzystywała bądź replikujące wektory w celu produkcji antygenu białkowego w komórce (J.R. Benink i in., ibid. 311, 578 (1984); J.R. Benink i J.W. Yewdell, Curr. Top. Microbiol, Immunol. 163,153 (1990); C.K. Stover i in., Nature 351,456 (1991); A. Aldovini i R.A. Young, Nature 351,479 (1991); R. Schafer i in., J. Immunol. 149,53 (1992); C.S. Hahn i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89,2679 (1992)], lub skupiały się na wprowadzaniu peptydów do cytozolu [F.R. Carbone i M.J. Bevan, J. Exp. Med. 169, 603 (1989); K. Deres i in., Nature 342, 561 (1989); H. Takahashi i in., ibid. 344, 873 (1990);
D.S. Collins i in., J. Immunol. 148, 3336 (1992); M.J. Newman i in., ibid. 148, 2357 (1992)]. Oba podejścia posiadają ograniczenia mogące zmniejszać ich uzyteczność jako szczepionki. Wektory retrowirusowe posiadająograniczenia co do wielkości i struktury polipeptydów ekspresjonowanychjako białka fuzyjne przy zachowaniu zdolności rekombinowanego wirusa do replikacji [A.D. Miller, Curr. To. Microbiol. Immunol. 158,1 (1992)] i efektywności wektorów jako szczepionek do kolejnych immunizacji może być ograniczona przez odpowiedź odpornościową przeciwko samym wektorom [E.L. Cooney i in., Lancet 337, 567 (1991)]. Również wektory wirusowe i zmodyfikowane patogeny niosą ryzyko, które może ograniczać ich zastosowanie u ludzi [R.R. Redfield i in., New Engl. J. Med. 316, 673 (1987); L. Mascola i in., Arch. Intern. Med. 149,1569 (1989)]. Ponadto, dobór epitopów peptydowych które mają być prezentowane zależy od struktury antygenów MHC osobnika i stąd, szczepionki peptydowe mogą mieć ograniczoną efektywność z powodu różnorodności haplotypów MHC w populacji.
Benvenisty N. i Reshef L. [PNAS 83, 9551-9555, (1986)] wykazali, ze DNA precypitowane CaCl2 wprowadzone myszom dootrzewnowo, dożylnie czy domięśniowo może być ekspresjonowane. Domięśniowe (i.m.) wstrzyknięcie myszom wektorów ekspresyjnych DNA powoduje pobieranie DNA przez komórki mięśniowe i ekspresję białka kodowanego przez DNA [J.A. Wolff i in., Science 247,1465 (1990); G. Ascadi i in.,Nature 352, 815 (1991)]. Wykazano, że plazmidy utrzymywane są episomalnie i nie replikują. Następnie, obserwowano przetrwałą ekspresję po wstrzyknięciu do mięśni szkieletowych szczurów, ryb i naczelnych oraz mięśnia se6
178 626 rcowego szczurów [H. Lin i in., Circulation 82,2217 (1990); R.N. Kitsis i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88,4138 (1991); E. Hansen i in., FEBS Lett. 290, 73 (1991); S. Jiao i in., Hum. Gene Therapy 3,21 (1992); J.A. Wolff i in., Human Mol. Genet. 1, 363 (1992)]. Technika stosowania kwasów nukleinowych jako środków farmaceutycznych opisana została w W090/11092 (4 października 1990), w którym polinukleotydy zastosowano do szczepienia kręgowców.
Do powodzenia metody niejest konieczna immunizacja domięśniowa. Tak więc, Tang i in., [Nature, 356,152-154 (1992)] i opublikował, że wprowadzenie myszom do skóry koloidu złota opłaszczonego DNA kodującym wołowy hormon wzrostu (BGH) powoduje produkcję przeciwciał anty-BGH przez te myszy. Furth i in., [Analytical Biochemistry, 205,365-368 (1992)] wykazał, że urządzenie ,jet injector” może być użyte do transfekowania skóry, mięśni, tkanki tłuszczowej i tkanek sutka żywych zwierząt. Przeglądu różnych metod wprowadzania kwasów nukleinowych dokonał ostatnio Friedman T. [Science, 244, 1275-1281 (1989)]. Patrz również Robinson i in., Abstracts ofPapers Presented at the Meeting on Modem Approaches to New Vaccines, Including Prevention of AIDS, Cold Spring Harbor, str. 92, w którym podanie kurczakom DNA ptasiej grypy i.m., i.p., oraz i.v. spowodowało ochronę przed śmiertelną dawką wirusa. Jednakże, nie podano których genów ptasiego wirusa grypy użyto. Dodatkowo wywołano wyłącznie odpowiedź swoistąw stosunku do H7, nie wspominając o wywołaniu ochrony między szczepowej.
Szczepionkę według wynalazku można wprowadzać każdą ze znanych metod wprowadzania kwasów nukleinowych do żywych tkanek w celu wywołania ekspresji białek. Potrzeba swoistego czynnika leczniczego zdolnego do wywołania profilaktycznej odpowiedzi odpornościowej przeciwko patogenom wirusowym zaspokojona została przez niniejszy wynalazek dla wirusa grypy. Szczególnie ważna w tym podejściu terapeutycznym jest zdolność wywoływania odpowiedzi odpornościowej limfocytów T co może zapobiec zakazeniu nawet szczepami wirusowymi heterologicznymi do szczepu, z którego uzyskano antygen. Wynalazek dostarcza konstruktów DNA kodujących białka wirusowe nukleoproteiny (NP) ludzkiego wirusa grypy lub każdego innego genu wirusa grypy kodującego produkty, wywołujące swoiste CTLe.
Wirus grypy posiada genom rybonukleinowy (RNA) składający się z licznych segmentów RNA. Każdy z RNa koduje przynajmniej jeden produkt genu. Produkt gen NP wiąże się z RNA i przenosi RNA wirusowe do jądra zakażonej komórki. Sekwencja jest zakonserwowana, ze zmiennością rzędu 7% w sekwencji aminokwasów, która powstała w okresie 50 lat. Produkty genu P (PB1, PB2, PA) są odpowiedzialne za syntetyzowanie nowego RNA. Geny te sąjeszcze bardziej zakonserwowane niż gen NP. HA jest głównym produktem genu kodującego otoczkę wirusową. Jest mniej zakonserwowana niż NP. Wiąże się z receptorem komórkowym i odgrywa przez to kluczową rolę w zapoczątkowaniu nowego zakażenia. Główna odpowiedź przeciwciał neutralizujących skierowana jest przeciwko temu produktowi genu. Przeciwko temu białku skierowana jest również znacząca odpowiedź cytotoksycznych limfocytów T. Współczesne szczepionki przeciw ludzkiemu wirusowi grypy zawieraaątrzy szczepy wirusa grypy lub ich białka HA. Jednakże, z powodu zmienności sekwencji białka HA różnych szczepów, szczepionka musi być ciągle dopasowywana do szczepów, które aktualnie wywołują chorobę. Jednakże, HA zawiera kilka zakonserwowanych elementów, które indukują CTLe, jeżeli są odpowiednio prezentowane. Produkty genów NS1 i NS2 nie mają kompletnie scharakteryzowanej funkcji biologicznej, ale mogą mieć znaczenie w wywoływaniu ochronnej odpowiedzi CTL. Na koniec, produkty genów Ml i M2, które sąnieco bardziej zakonserwowane niż HA, indukująnajwiekszą odpowiedź CTL. Białkc M1 jest bardzo powszechnym produktem genu wirusowego.
Efektywność ochronna przez szczepienie przy użyciu DNA przed następującą potem ekspozycją na wirusa zademonstrowana jest przez immunizację nie replikującym plazmidowym
DNA kodującymj edno lub więcej białek wirusowych. Jest to korzystne ponieważ niej est używany żaden czynnik zakaźny, nie jest konieczne tworzenie się cząstek wirusowych i umożliwiona
178 626 jest selekcja determinant. Ponadto, ponieważ sekwencja nukleoproteiny i kilku innych genów wirusowychjest zakonserwowana wśród różnych szczepów wirusa grypy, uzyskanajest ochrona przed następową ekspozycją na zakaźny szczep wirusa grypy homologicznego lub heterologicznego do szczepu, od którego uzyskany jest sklonowany gen.
Konstrukty DNA, które mogą ulegać ekspresji po bezpośrednim wprowadzeniu, przez wstrzyknięcie lub inaczej, do tkanek zwierzęcych, są nowymi środkami profilaktycznymi. Indukująone limfocyty T cytotoksyczne (CTLe), swoiste dla antygenów wirusowych, które odpowiadają na różne szczepy wirusów, w przeciwieństwie do przeciwciał, które są w większości szczepowo swoiste. Powstawanie CTLi in vivo zwykle wymaga endogennej ekspresji antygenu, jak ma to miejsce w przypadku zakażenia wirusowego. W celu wytworzenia antygenu wirusowego do prezentacji układowi odpornościowemu, bez ograniczeń związanych z bezpośrednim dostarczaniem peptydu lub zastosowaniem wektorów wirusowych, DnA plazmidowe kodujące białka ludzkiego wirusa grypy wstrzyknięto w mięsień czworogłowy myszy BALB/c, co spowodowało powstanie swoistych dla wirusa grypy CTLi i ochronę przed następującą później ekspozycją na heterologiczny szczep wirusa grypy, mierzoną obniżaniem mian wirusa w płucach, zahamowaniem utraty masy ciała, i zwiększeniem przeżywalności. Wysokie miana przeciwciał neutralizujących przeciwko hemaglutyninie i przeciwciał przeciwko nukleoproteine wywołane zostały u rezusów, oraz obserwowano zmniejszanie mian wirusa w nozdrzach fretek po homologicznej i heterologicznej ekspozycji.
Główne obserwacje, odnoszące się do niniejszego wynalazku, obejmowały:
1) Wykazanie efektywności. Obserwowano ochronę heterologiczną w następstwie immunizacji DNA dla nukleoproteiny (NP), mierzoną zwiększeniem przezywalności, zmniejszeniem mian wirusa w płucach i zahamowaniem utraty masy ciała u myszy poddanych ekspozycji na szczep wirusa grypy odmienny od szczepu będącego źródłem genu NP. W tym przypadku, białka powierzchniowe dwóch szczepów były nieco różne (H1N1) wobec H3N2) zaś szczep na który eksponowano zwierzęta powstał w 37 lat po szczepie pierwotnym. Immunizacja fretek DNA dla NP i DNA dla białka macierzy (M1), osobno, razem lub w połączeniu z DNA dla HA, powodowała ochronę (zmniejszenie uwalniania wirusa w nozdrzach) po ekspozycji szczepem zdryfowanym antygenowo (izolat kliniczny). Nadmienić należy, ze ochrona przez immunizację mieszaniną DNA (DNA kodujące białka NP i Ml Beijing/89 i DNA kodujące HA Beijing/89 lub Hawaii/91) była u fretek lepsza w stosunku do zdryfowanego szczepu (Georgia/93) niz uzyskana licencjonowaną szczepionką (zawierającą Beijing/89). Mieszanina zawierająca DNA HA z Hawaii/91 wydawała się nieco bardziej efektywna niz mieszanina zawierająca DNA dl HA z Beijing/89. Ochrona obserwowana po użyciu mieszaniny zawierającej DNA dla HA Hawaii/91 powodowała ochronę identyczną z uzyskiwaną przy użyciu homologicznego DNA dla HA (Georgia/93), podczas gdy mieszanina z użyciem DNA dla HA Beijing/89 różniła się od ochrony homologicznej, jednak nadal była znacznie lepsza niż licencjonowany produkt. Przeciwciała przeciwko HI wywołano u wszystkich gatunków badanych włączywszy myszy, fretki, rezusy i afrykańskie małpy zielone.
2) Trwałość. W badaniach z użyciem DNA kodującego gen reporterowy, obecność DNA i ekspresji białka utrzymywała się przez co najmniej 1,5 roku (najdłuzszy badany czas dla myszy; Wolff i in., Human Mol. Genet., 1992). Stąd, jeżeli produkty genu wirusa grypy są również ekspresjonowane trwale, powstała odporność winna również być trwała. Wykazano, że przeciwciała i CTL (Yancauckas i in., DNA & Celi Biol., 1993) oraz homologiczna odporność ochronna (dane z MLR) wywołana przez wstrzyknięcie DNA wirusa grypy trwają przez ponad rok u myszy'. Wykazano, że przeciwciała trwają u rezusów przez przynajmniej rok. Długość czasu trwania odpowiedzi CTL i ochrony heterologicznej (zwiększona przeżywalność) trwają do 6 miesięcy (najdłuższy dotąd badany czas). Wystąpiło nieznaczne obniżenie stopnia ochrony heterologicznej, ale jest ona możliwa do ponownego wywołania.
178 626
3) Gradacja dawki. Badania dotyczące dawki wykonane na rezusach wykazały, że 100 pg DNA dla HA podane dwukrotnie powodowały zadowalające miana przeciwciał, które trwały przez rok. Wywołanie ochrony (zwiększona przeżywalność w następstwie ekspozycji na wirusa heterologicznego) u myszy obserwowana była z użyciem dawek rzędu 6 pg (podawane 3 razy) oraz przy użyciu pojedynczej dawki 200 pg, ale, ogólnie, zwiększenie liczby dawek (do 3) polepszyło stopień ochrony. Badania na naczelnych wykazały, że 2 wstrzyknięcia po 10 lub 100 pg DNA kodującego 3 HA i NP i Ml (ten ostatni kodujący geny H3N2 Beijing/89) powodowały miana przeciwciał przeciwko HI przypominające wywoływane przez licencjonowane szczepionki. Ważne jest by pamiętać, że badane zwierzęta nie miały uprzednio kontaktu z grypą, podczas gdy docelowa populacja kliniczna (ludzie starsi) przechodziła grypy. (Dzieciom poniżej 9 r.z. podaje się 2 wstrzyknięcia licencjonowanej szczepionki).
Krótki opis figur.
Figura 1. Wykrywanie plazmidowego DNA dla NP w mięśniach przy użyciu PCR. Myszom BALB/c wstrzykiwano trzykrotnie w odstępach trzytygodniowych, DNA dla RSV-NP lub pusty wektor (100 pg/łapę) w oba mięśnie czworogłowe, po czym zarażano grypą. Mięśnie pobierano 4 tygodnie po ostatnim wstrzyknięciu i natychmiast zamrażano w ciekłym azocie. Sproszkowywano je w buforze do lizy (25 mM Tris-H3PO4 pH 8,2 mM kwas trans-1:2-diaminocyklohexanotetra-octowy (CDTA), 2 mM DTT, 10% glicerol, 1% Triton Χ-100) w urządzeniu MIKRODISMEMBRATOR™ (B. Braun Instruments) po czym ekstrahowano wysokocząsteczkowe DNA przez ekstrakcję mieszaniną fenolu i chloroformu i precypitację etanolem. Wykonywano 40 cykli reakcji PCR (PCR wykonywano według instrukcji zestawu GENEAMP™ Perkin Elmer Cetus) w celu wykrycia obecności DNA plazmidowego dla NP w mięśniach. Wytworzono produkt PCR wielkości 772 bp. (patrz strzałki) obejmujący obszar od promotora CMV przez większość części 5' genu NP, od oligonukleotydu sensownego długości 18 bp. startującego w regionie promotora, (GTGTGCACCTCAAGCTGG, Identyfikator Sekw. nr 1) do antysensownego oligonukleotydu długości 23 bp. w części 5' sekwencji NP (CCCTTTGAGAATGTTGCACATTC, Identyfikator Sekw. nr 2). Produkt długości 722 bp. widoczny jest na żelu agarozowym barwionym bromkiem etidium w wybranych próbkach mięśni nastrzykniętych DNA dla NP, ale nie w nastrzykniętych pustym wektorem (600L). Oznaczenie powyżej każdej ze ścieżek oznacza numer identyfikacyjny myszy i prawą lub lewą łapę.
Figura 2. Wytwarzanie przeciwciał przeciwko NP u myszy, którym wstrzyknięto DNA dla NP. Myszom wstrzyknięto po 100 pg DNA dla VI -NP w każdą z łap w tygodniu 0,3 i 6, oraz pobierano krew w tygodniu 0,2, 5 i 8. Obecność IgG anty-NP w surowicy badano testem ELISA (J.J. Donnelly i in., J. Immunol. 145,3071 (1990)), używając oczyszczonego NP z komórek owadzich transfekowanych wektorem ekspresyjnym bakulowirusa. Wyniki wykreślono jako średni log10 miana ELISA ± SEM (n= 10) do czasu po pierwszej injekcji DNA dla NP. Myszy immunizowane pustym wektorem nie wytwarzały możliwych do stwierdzenia przeciwciał anty-NP.
Figura 3. Procent lizy specyficznej, oznaczany w 4 godzinnym teście uwalniania 51Cr, dla CTL uzyskanych z myszy immunizowanych DNA. Myszy immunizowano 400 pg DNA dla V1 -NP (wypełnione kółka) lub pustym wektorem (wypełnione kwadraty) i zabijano 3-4 tygodnie później. CTL do kontroli negatywnej uzyskano z myszy, które nie miały dotąd kontaktu z antygenem (puste trójkąty) i do kontroli pozytywnej od myszy wyzdrowiałych z zakażenia A/HK/68 cztery tygodnie wcześniej (wypełnione trójkąty). Wykresy przedstawiają dane z pojedynczych reprezentatywnych myszy. Dla każdego z zestawów warunków badano przynajmniej osiem myszy. Panel A: komórki śledziony restymulowane przy użyciu autologicznych splenocytów poddanych pulsowi NP 147-155 i badane w stosunku do komórek P815 poddanych pulsowi NP 147-155. Panel B: splenocyty restymulowane przy użyciu autologicznych splenocytów poddanych pulsowi NP 147-155 i badane w stosunku do komórek P815 stanowiących cel, zakażonych grypą A/Victoria/73 (H3N2) przez 6 godzin przed dodaniem CTL. Panel C: Splenocyty
178 626 restymulowane ConA i IL-2 bez dodatkowego antygenu i badane w stosunku do komórek P815 poddanych pulsowi NP 147-155. Panel D: Myszom wstrzyknięto 200 pg DNA V1 -NP na wstrzyknięcie, lub pusty wektor trzykrotnie w odstępie trzech tygodni. Śledziony pobierano 4 tygodnie po ostatniej immunizacji, splenocyty hodowano z IL-2 i ConA przez 7 dni po czym badano CTL w stosunku do komórek docelowych P815 zakażonych A/Victoria/73.
F igura 4. Utrata masy (w gramach) i zdrowienie u myszy immunizowanych DNA po ekspozycji donosowej, wykonanej bez znieczulenia, przy użyciu 104 TCID50 A/HK/68. Myszy immunizowano trzykrotnie w odstępie trzech tygodni przy użyciu DNA V1-NP lub pustego wektora lub nie nastrzykiwano ich wcale, po czym poddawano ekspozycji na wirusa 3 tygodnie po ostatniej immunizacji. Wagi grup po dziesięć myszy oznaczano w momencie ekspozycji i codziennie od dnia 4 dla myszy nastrzykniętych DnA dla NP (wypełnione kółka), pustym wektorem (puste trójkąty) i nienastrzykniętej kontroli (puste kółka). Przedstawione średnie wagi ± SEM. Myszy nastrzyknięte DNA dla Np przedstawiały znacząco mniejszą utratę masy ciała od dnia 8 do 13 w porównaniu z myszami nastrzykniętymi pustym wektorem (p<0.005) i nienastrzykniętymi myszami (p<0.01) co badano testem t. Nie było różnic istotnych statystycznie pomiędzy obiema kontrolami (p=0.8 mierzone testem t).
Figura 5. Przeżywalność myszy immunizowanych DNA po ekspozycji donosowej (wznieczuleniu) przy użyciu 1025 TCID50 A/HK/68. Myszy immunizowane trzykrotnie w odstępie trzech tygodni przy użyciu DNA V1-NP (wypełnione kółka), pustego wektora (puste kółka) lub nie nastrzykiwane wcale (puste trójkąty) poddawano ekspozycji na wirusa 3 tygodnie po ostatniej immunizacji. Procent przeżywalności pokazano dla grup po 9 lub 10 myszy. Przeżywalność myszy nastrzykniętych DNA dla NP była znacząco wyższa niz w kontroli (p=0.0004 badane testem Chi-kwadrat), podczas gdy nie było różnicy istotnej statystycznie pomiędzy nastrzykniętymi pustym wektorem a nienastrzykniętymi myszami (p=0.17 badane testem Chi-kwadrat).
Figura 6. Sekwencja wektora ekspresyjnego V1J, Identyfikator Sekw'. nr: 10.
Figura 7. Sekwencja wektora ekspresyjnego V1Jneo, Identyfikator Sekw. nr: 18.
Figura 8. Sekwencj apromotora-terminatora CMVintA-BGH, Identyfikator Sekw. nr: 11.
Figura 9. Małpie przeciwciało anty-NP
Figura 10. Zahamowanie hemaglutynacji u fretek, linią kropkowaną zaznaczono minimalne miano ochronne przeciwciał i średnią wartość oznaczona kółkiem z linią przechodzącą przez nie.
Figura 11. Przeciwciało IgG anty-NP u fretek po immunizacji przy użyciu DNA.
Figura 12. Uwalnianie wirusa grypy u fretek immunizowanych i nieimmunizowanych przy użyciu DNA.
Figura 13. Diagramy wektorów pRSV-PR-NP i V1-NP X oznacza wprowadzony region kodujący.
Figura 14. Schemat białek i szczepów wirusa grypy.
Figura 15. Schemat obróbki wewnątrzkomórkowej wstrzykniętego DNA.
Figura 16. Odporność fretek na wirusa grypy A/RP/8/34 wywołana przez immunizację genami dla HA i białek wewnętrznych.
Figura 17. Schemat wektora V1Jns.
Figura 18. Zielone małpy afrykańskie nastrzyknięto mieszaniną DNA zawierającą DNA dla HA (A/Beijing/89, B/Panama/90, A/Texas/91), DNA dla NP (A/PR/34) i DNA dla M1 (A/PR/34). Ilość każdego ze składników wynosiła 10 pg (wypełnione kwadraty) lub 100 pg (wypełnione kółka) podawane dwukrotnie w odstępie sześciotygodniowym (patrz strzałki). Dla porównania, inne zwierzęta otrzymały lijencjonowaną szczepionkę zawierąjącąpodjednostkę wirionu (puste kwadraty) i cały wirion (puste-kółka) w całkowitej dawce dla człowieka (ekwiwalent 45 pg białka; 15 pg na HA). Próbki surowic pobierano co dwa tygodnie przez 18 tygodni i badano na miano HI przeciwko HA A/Beijing/89. Dane przedstawiono jako średnią geometryczną miana HI ± SEM gdzie n=3.
178 626
Figura 19. Samicom myszy BALB/c (4-6 tygodniowym) wstrzykiwano DNA dla NP A/PR/34 (200 pg) trzykrotnie w odstępach trzytygodniowych. Kontrola negatywna obejmowała myszy nastrzyknięte DNA kontrolnym (200 pg), rekombinowanym białkiem NP (10 pg)i myszy nienastrzyknięte niczym, które nie miały dotąd kontraktu z antygenem (mock). Dla porównania badano również myszy zakażone wirusem grypy A/HK/68. CTL uzyskano 6 miesięcy po podaniu pierwszej dawki i restymulowane in vitro zakazonymi wirusem, syngenicznymi splenocytami i badano w stosunku do komórek P815 poddanych pulsowi peptydem NP w stosunku efektorów do komórek docelowych równym 10:1. Dane przedstawiono jako % lizy specyficznej ± sd, gdzie n=3.
Figura 20. Myszom C3H/HeN wstrzyknięto normalne mioblasty C2C12 (1 x 107 komórek), rekombinowane białko NP (2 pg) lub transfekowane przy użyciu NP mioblasty (1 x 107 komórek). Ilość białka NP (2 pg) była wystarczająca do wywołania odpowiedzi przeciwciał i stanowiła odpowiednik około 100 krotnej ilości białka NP obecnego w przeszczepionych, transfekowanych NP mioblastach. CTL z tych myszy przygotowano sześć tygodni po podaniu i restymulowano in vitro zakażonymi wirusem grypy splenocytami syngenicznymi. Jako kontrolę pozytywną, przygotowano CTL z myszy zakażonych wirusem grypy A/HK/68. Nietraktowane niczym (wypełnione słupki), zakażone wirusem grypy A/Victoria/73 (paskowane słupki) i transfekowane NP mioblasty (kratkowane słupki) użyto jako komórek docelowych w stosunku efektorów do komórek docelowych równym 25:1. Dane przedstawiono jako % lizy specyficznej ± sd, gdzie n=3.
Figura 21. Czterotygodniowe samice myszy BALB/c immunizowano domięśniowo przez podanie 200 pg DNA dla NP trzykrotnie z trzytygodniowymi odstępami. Myszy eksponowano trzy tygodnie po ostatniej immunizacji na 300 TCID50 A/HK/68 podanego w znieczuleniu (ekspozycj a całych dróg oddechowych). Proporcj ę myszy, które przeżyły (10 myszy na grupę) naniesiono w stosunku do czasu po ekspozycji.
Figura 22. Czterotygodniowe samice myszy BALB/c immunizowano domięśniowo przez podanie 100 pg DNA dla NP trzykrotnie z trzytygodniowymi odstępami. Myszy eksponowano trzy tygodnie po ostatniej immunizacji na 300 TCID50 A/HK/68 podanego w znieczuleniu (ekspozycja całych dróg oddechowych). Myszy ważono codziennie i obliczano proporcję wagi początkowej dla każdej myszy, która przeżyła. Wykreślono średni odsetek wagi początkowej ± SEM w stosunku do czasu po ekspozycji.
Figura 23. Czterotygodniowe samice myszy BALB/c immunizowano domięśniowo przez podanie 200 pg DNA NP trzykrotnie z trzytygodniowymi odstępami. Myszy eksponowano trzy tygodnie po ostatniej immunizacji na 2000 TCID50 A/HK/68 podanego bez znieczulenia (ekspozycja górnych dróg oddechowych). Myszy zabijano 7 dni po ekspozycji, pobierano płuca, homogenizowano i określano miana wirusa przez kolejne miareczkowanie na komórkach MDCK.
Figura 24. Czterotygodniowe samice myszy BALB/c immunizowano domięśniowo przez podanie 6.25,25,100 i 200 pg DNA dla NP trzykrotnie z trzytygodniowymi odstępami. Myszy eksponowano trzy tygodnie po ostatniej immunizacji na 300 TCID50 A/HK/68 podanego w znieczuleniu (ekspozycja całych dróg oddechowych). Proporcję myszy, które przeżyły (10 myszy na grupę) wykreślono w stosunku do czasu po ekspozycji.
Figura 25. Czterotygodniowe samice myszy BALB/c immunizowano domięśniowo przez podanie 200 pg DNA dla NP A/PR/34, DNA kontrolnego lub podanie placebo. Myszy eksponowano na 300 TCID50 A/HK/68 podanego w znieczuleniu 6,12 i 25 tygodni po trzecim wstrzyknięciu DNA. Wybrane myszy ponownie immunizowano przez podanie 200 pg DNA dla NP w 22 tygodniu i ponownie eksponowano w 25 tygodniu („Reboost”). Średnie wagi przedstawiono jako procent wagi początkowej dla każdej z grup. Waga kontroli przedstawiona zostałajako średnia wag wszystkich grup kontrolnych z ekspozycji po 6, 12 i 25-tygodniach, sumę 6 grup, które otrzymały DNA kontrolne lub placebo. Grupy zawierały początkowo po 10 zwierząt; myszy wyłączano z dalszej analizy wagi w przypadku śmierci.
178 626
Figura 26. Dorosłe (22-28 tygodniowe) samce fretek immunizowano i.m. przy użyciu 1 mg DNA kodującego NP z A/Beijing/89, 1 mg DNA kodującego Ml z A/Beijing/89 lub 1 mg obu DNA połączonych w dniu 0 i 42. Fretki kontrolne otrzymywały niekodujący DNA lub pełną ludzką dawkę (15 pg/szczep) licencjonowanej szczepionki przeciwgrypowej z całego wirusa (preparat 92-93) zawierającej A/Beijing/89 w dniu 0 i 42. Fretki eksponowano na A/Georgia/93 dnia 56. Uwalnianie wirusa w popłuczynach z nozdrzy oznaczano jak opisano powyżej. Uwalnianie wirusa dnia 3-5 porównywano z uwalnianiem u fretek, którym podano kontrolny DNA przez dwustronną analizę wariancji. Uwalnianie u fretek, którym podano DNA dla NP, Ml lub NP+M1 było znacząco mniejsze (odpowiednio p <0.0001,0.0016 i 0.0001) w porównaniu z fretkami kontrolnymi. Uwalnianie wirusa u fretek którym podawano NP (dane nie pokazane), M1 lub NP+M1 nie różniło się w sposób istotny od fretek, którym podano licencjonowaną szczepionkę (odpowiednio p=0.104,0.533 i 0.145). Dawka immunizująca 1 mg wybrana została arbitralnie; badania zależności od dawki przeprowadzono na naczelnych.
Figury 27. Grupy po 8 samców fretek, w wieku 22-25 tygodni, immunizowano przez domięśniowe podanie DNA kontrolnego, roztworu fizjologicznego soli lub DNA kodującego białka wirusa grypy A/PR/8/34, dnia 0,21 i 121, po czym poddano je ekspozycji donosowej na 200 TCID50 A/pR/8/34 dnia 148. Immunizowane zwierzęta otrzymywały 1 mg DNA dla NP, lub 2 mg połączonego DNA dla NP, NS1, PB 1, PB2 i M1 (400 pg każdego z konstruktów). Zwierzęta kontrolne otrzymywały 0,5 ml/łapę soli fizjologicznej lub 1 mg DNA kontrolnego. Do analizy grupy otrzymującej sól fizjologiczną i DNA kontrolne połączono (Kontrola), takjak to zrobiono z grupą, która otrzymywała tylko DNA dla NP i połączenie innych genów białek wewnętrznych (Białka Wewnętrzne). Wykres przedstawia miana zakaźności popłuczyn z nozdrzy, w TCID50 na 50 pl z 3 ml płynu uzyskanego z płukania nozdrzy. Nierozcieńczone popłuczyny nozdrzy (naj niższe badane rozcieńczenie) uważane było za rozcieńczenie 1:10 wysięku z nozdrzy zaś pozytywną nierozcieńczoną próbkę oznaczono wartością 1 log. Miana powyżej 1 log oznaczono na podstawie interpolacji Reed-Muench wyniku trzech powtórzeń osiągających zakaźność 50%. Próbki uznawano za negatywne gdy nierozcieńczone próbki osiągały wartość 0 log. Wartości p pokazane na wykresie obliczone zostały dla fretek immunizowanych w stosunku do nieimmunizowanych w oznaczonych dniach przy użyciu testu t dla dwóch średnich. Wartości p dla całych krzywych obliczono dwustronną analizą wariancji i wynosiły one p <0.0001 dla NP w stosunku do kontroli i p <0.001 dla połączonych DNA w stosunku do kontroli.
Figura 28. Przeżywalność myszy immunizowanych DNA i poddawanych ekspozycji na wirusa grypy. Myszom wstrzykiwano i.m. 200 pg DNA kodującego HA z A/PR/34 lub kontrolny (niekodujący) DNA, trzykrotnie w odstępach trzytygodniowych. Trzy tygodnie po ostatniej immunizacji myszy podawano ekspozycji całego układu oddechowego (przez wkroplenie donosowe w znieczuleniu), przy użyciu 1000 TCID50 A/PR/34. Dane wykreślono jako % przeżywalność wobec czasu po ekspozycji (n=9 lub 10 myszy na grupę).
Figura 29. Utrata wagi ciała u myszy immunizowanych DNA i poddawanych ekspozycji na wirusa grypy. Myszom wstrzykiwano i.m. 200 pg DNA kodującego HA z A/PR/34 lub kontrolny (niekodujący) DNA, trzykrotnie w odstępach trzytygodniowych. Trzy tygodnie po ostatniej immunizacji myszy podawano ekspozycji całego układu oddechowego (przez wkroplenie donosowe w znieczuleniu), przy użyciu 1000 TCID50 A/PR/34. Dane wykreślonojako % początkowej wagi pojedynczych zwierząt, uśrednionej dla całej grupy, wobec czasu. (Padłe zwierzęta wyłączono ze średniej).
Figura 30. Przeżywalność myszy immunizowanych DNA i poddawanych ekspozycji na wirusa grypy. Myszom wstrzykiwano i.m. 1, 10 lun 100 pg DNA kodującego HA z A/PR/34 lub kontrolny (niekodujący) DNA, trzykrotnie w odstępach trzytygodniowych. Trzy tygodnie po ostatniej immunizacji myszy podawano ekspozycji całego układu oddechowego (prze wkroplenie donosowe w znieczuleniu), przy użyciu 1000 TCID„ A/PR/34. Dane wykreślono jako % przeżywalności wobec czasu po ekspozycji (n=9 lub 10 myszy na grupę).
Figura 31 Grupy po 8 samców fretek, w wieku 22-25 tygodni, immunizowano przez domięśniowe podanie DNA kontrolnego, roztworu fizjologicznego soli lub DNA kodującego
178 626 białka wirusa grypy A/PR/8/34, dnia 0,21 i 121, po czym poddano je ekspozycji donosowej na 200 TCID50 A/PR/8/34 dnia 148. Immunizowane zwierzęta otrzymywały 1 mg DNA dla HA, lub 2 mg połączonego DNA dla HA, NP, NS1, PB1, PB2 i M 1(330 pg każdego z konstruktów). Zwierzęta kontrolne otrzymywały 0,5 ml/łapę soli fizjologicznej lub 1 mg DNA kontrolnego. Do analizy grupy otrzymujące sól fizjologiczną i DNA kontrolne połączono (Kontrola), tak jak to zrobiono z grupą, która otrzymała tylko DNA dla HA w połączeniu z innymi genami białek wewnętrznych (HA, HA+Białka Wewnętrzne). Wykres przedstawia miana zakaźności popłuczyn z nozdrzy, w TCID50 na 50 μΐ z 3 ml płynu uzyskanego z płukania nozdrzy. Nierozcieńczone popłuczyny nozdrzy (najniższe badane rozcieńczenie) uważane było za rozcieńczenie 1:10 wysięku z nozdrzy zaś pozytywną nierozcieńczoną próbkę oznaczono wartością 1 log. Miana powyżej 1 log oznaczono na podstawie interpolacji Reed-Muench wyniku trzech powtórzeń osiągających zakaźność 50%. Próbki uznawano za negatywne gdy nierozcieńczone próbki osiągały wartość 0 log. Wartości p pokazane na wykresie obliczone zostały dla fretek immunizowanych w stosunku do nieimmunizowanych w oznaczonych dniach przy użyciu testu t dla dwóch średnich. Wartości p dla całych krzywych obliczono dwustronną analizą wariancji i wynosiły one <0.0001 dla HAwstosunku do kontrolii <0.0001 dla połączonych DNA w stosunku do kontroli.
Figura 32. Dorosłe (22-28 tygodniowe) samce fretek immunizowano i.m. przy użyciu 1 mg DNA kodującego HA z A/Georgia/93 w dniu 0 i 42. Fretki kontrolne otrzymywały niekodujący DNA lub pełną ludzką dawkę (15 μg/szczep) licencjonowanej szczepionki przeciwgrypowej z całego wirusa (preparat 92-93) zawierającej A/Beijmg/89 w dniu 0 i 42. Fretki eksponowano na A/Georgia/93 dnia 56. Uwalnianie wirusa w popłuczynach z nozdrzy oznaczano jak opisano powyżej. Uwalnianie wirusa dnia 1-6 porównywano z uwalnianiem u fretek, którym podano kontrolny DNA przez dwustronną analizę wariancji. Uwalnianie u fretek, którym podano DNA dla HA było znacząco mniejsze (p < 0.0001) w porównaniu z fretkami kontrolnymi.
Figura 33. Dorosłe (22-28 tygodniowe) samce fretek immunizowano i.m. przy użyciu 1 mg DNA kodującego NP z A/Hawaii/91 lub A/Beijing/89 w dniu 0 i 42. Fretki kontrolne otrzymywały niekodujący DNA lub pełną ludzką dawkę (15 μg/szczep) licencjonowanej szczepionki przeciwgrypowej z całego wirusa (preparat 92-93) zawierającej A/Beij ing/89 w dniu 0 i 42. Fretki eksponowano na A/Georgia/93 dnia 56. Uwalnianie wirusa w popłuczynach z nozdrzy oznaczano jak opisano powyżej. Uwalnianie wirusa dnia 1 -6 porównywano z uwalnianiem u fretek, którym podano kontrolny DNA przez dwustronną analizę wariancji. Uwalnianie u fretek, którym podano DNA HA A/Hawaii/91 było w sposób istotny niższe (p < 0.0001) w porównaniu z fretkami kontrolnymi. Uwalnianie wirusa u fretek którym podawano DNA HA A/Hawaii/91 różniło się w sposób istotny od fretek, którym podano licencjonowaną szczepionkę (p=0,021 dla HA A/Hawaii/91: badane dwustronnym testem ANOVA dla dni 1 -6); uwalnianie wirusa u fretek którym podawano DNA HA A/Beijing/89 (nie pokazane) nie różniło się w sposób istotny od fretek, którym podano licencjonowaną szczepionkę (p=0,058 dla HA A/Beijing/89: badane dwustronnym testem ANOVA dla dni 1-6).
Figura 34. Dorosłe (22-28 tygodniowe) samce fretek immunizowano i.m. przy użyciu 1 mg DNA kodującego HA z A/Hawaii/91 (patrz fig. 13) lub przy użyciu 330 μg każdego z DNA kodujących HA z A/Hawaii/91 i NP i Ml z A/Beijing/89, w dniu 0 i 42. Fretki kontrolne otrzymywały niekodujący DNA lub pełną ludzka dawkę (15 μg/szczep) licencjonowanej szczepionki przeciwgrypowej z całego wirusa (preparat 92-93) zawierającej A/Beijing/89 w dniu 0 i 42. Fretki eksponowano na A/Georgia/93 dnia 56. Uwalnianie wirusa w popłuczynach z nozdrzy oznaczano jak opisano powyżej. Uwalnianie wirusa dnia 1-6 porównywano z uwalnianiem u fretek, którym podano kontrolny DNA przez dwustronną analizę wariancji. Uwalnianie u fretek, którym podano DNA dla HA+NP+M1 było znacząco mniejsze (p < 0.0001) w porównaniu z fretkami kontrolnymi lub fretkami, które otrzymały DNA kodujące tylko HA (p=0.0053).
Figura 35. Dorosłe (22-28 tygodniowe) samce fretek immunizowano i.m. przy użyciu 1 mg
DNA kodującego HA z A/Georgia/93 lub przy użyciu 330 μg każdego z DNA kodującego HA z A/Hawaii/91 i NP i Ml z A/Beijing/89, w dniu 0 i 42. Fretki kontrolne otrzymywały niekodujący DNA lub pełną ludzką dawkę (15 μg/szczep) licencjonowanej szczepionki przeciwgry178 626 powej z całego wirusa (preparat 92-93) zawierającej A/Beijing/89 w dniu 0 i 42. Fretki eksponowano na A/Georgia/93 dnia 56. Uwalnianie wirusa w popłuczynach z nozdrzy oznaczano jak opisano powyżej. Uwalnianie wirusa dnia 1-6 porównywano z uwalnianiem u fretek, którym podano kontrolny DNA przez dwustronną analizę wariancji. Uwalnianie u fretek, którym podano DNA dla HA+NP+M1 nie było znacząco różne w porównaniu z fretkami, które otrzymały homologiczne DNA kodujące HA (p=0.064).
Figura 36. Sekwencja VIR.
Niniejszy wynalazek dostarcza środka farmaceutycznego, opartego na kwasach nukleinowych, mianowicie szczepionki polinukleotydowej, która po bezpośrednim wprowadzeniu do organizmu zwierzęcia, w tym kręgowców, jak ssaków i ludzie, wywołuje ekspresję kodowanych białek w organizmie zwierzęcia. Gdy białko należy do nie występujących normalnie w organizmie, z wyjątkiem sytuacji patologii, jak białko związane z wirusem grypy, nukleoproteina wirusa grypy, układ odpornościowy zwierzęcia jest aktywowany, rozwijając ochronną odporność. Ponieważ to białko egzogenne wytwarzane jest przez własne tkanki zwierzęcia, ekspresj ono wane białka obrabiane są i prezentowane przez główny układ zgodności tkankowej, MHC. Rozpoznawanie jest analogiczne do zachodzącego podczas prawdziwego zakażenia przez pokrewny mikroorganizm. Wynikiem, jak to pokazano w tym opisie, jest wywołanie odpowiedzi odpornościowej, która chroni przed zakażeniem.
Szczepionka według wynalazku zawiera wektor plazmidowy DNA wybrany z grupy składającej się z pnRSV, VI, VIJ, V1R, VI Jns i VI Jneo, który obejmuje co najmniej jeden element regulujący transkrypcję funkcjonalnie związanąz sekwencją nukleotydową koduj ącą nukleoproteinę wirusa grypy, oraz farmaceutycznie dopuszczalny bufor lub nośnik.
W zakres wynalazku wchodzą tez konstrukty DNA wybrane z (a) pn RSV-PR-NP;
(b) V1 J-PR-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 12;
(c) VI Jneo-BJ-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 20, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr. 21;
(d) V1 Jneo-TX-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 24, a koniec 3 stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 25;
(e) VI Jns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), któryjest konstruktem o wielkości 6,42 kb i którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 52, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 53;
(f) VI Jns-PA-NP (B/Panama/45/90), któryjest konstruktem o wielkości 6,54 kb i którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 56, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 57.
W zakres wynalazku wchodzi też ekspresyjny plazmidowy wektor DNA, którym jest VI Jns o sekwencji przedstawionej w Identyfikatorze Sekw. nr 45 (fig. 36 i 17).
Wynalazek dostarcza kwasów nukleinowych, które wprowadzone do zwierzęcych tkanek in vivo przez wstrzyknięcie, inhalację czy wprowadzenie analogicznym sposobem, opisanym powyżej, prowadzą do ekspresji genów ludzkiego wirusa grypy. Tak więc, wstrzyknięcie konstruktów DNA, będących przedmiotem niniejszego wynalazku, do mięśni myszy, wywołuje ekspresj ę kodowanych produktów genów. Podobnie u fretek i rezusów. W następstwie ekspozy cj i na zaraźliwego wirusa grypy, w dawkach, które zabijają zwierzęta kontrolne, zwierzęta, którym wstrzyknięto szczepionkę wykazują znacznie zmniejszoną chorobowość i śmiertelność. Stąd, wynalazek niniejszy obejmuje szczepionkę użyteczną w zapobieganiu zakażeniom wirusem grypy.
Wykazano, że konstrukty DNA kodujące białka wirusa grypy, wywołują ochronną odpowiedź odpomościowąu zwierząt. Jak to będzie opisane bardziej szczegółowo poniżej odpowiedź odpornościowa u zwierząt obejmuje wytwarzanie przeciwciał i CTL u myszy, wytwarzanie przeciwciał u fretek i naczelnych oraz ochronę przed ekspozycjąna wirusa myszy i fretek przy użyciu szczepu wirusa grypy homologicznego, zdryfowanego antygenowo i zmienionego antygenowo. Prawdopodobnie najbardziej uderzającym wynikiem immunizacji przy użyciu DNA kodującego białka wirusowe, jest zdolność do zapewniania odporności przeciwko różnym podtypom wirusa.
178 626
Sugeruje to, że dodanie do szczepionki składowej wywołującej CTL powinno służyć opanowaniu uderzenia nowych odmian powstających w trakcie sezonu lub niespodziewanych w momencie wybierania szczepów do tworzenia szczepionki na następny rok. Immunizacja fretek przy użyciu wektorów cDNA kodujących geny HA, NP i Ml zdolna była chronić bardziej efektywnie przed zdryfowanym antygenowo szczepem wirusa niz licencjonowana szczepionka. Dostarcza to przesłanek do zastosowania konstruktorów kodujących geny białek wewnętrznych w PNV.
Oczekiwane zalety nad obecnymi, licencjonowanymi szczepionkami obejmują: zwiększony zakres ochrony z powodu odpowiedzi CTL ± zwiększony zakres przeciwciał i zwiększony czas trwania ochrony. Podejście PNV unika konieczności tworzenia, wybierania i hodowaniajak ma to miejsce we współczesnych licencjonowanych szczepionkach ponieważ nowe konstrukty DNA mogą być wytwarzane bardziej bezpośrednio z izolatu klinicznego.
W jednym z wykonań wynalazku sekwencja nukleoproteiny ludzkiego wirusa grypy uzyskana ze szczepu A/PR/8/34 wklonowana została do wektora ekspresyjnego. Wektor zawiera promotor dla transkrypcji dla polimerazy RNA, i terminator transkrypcji pod koniec sekwencji kodującej NP. W korzystnym wykonaniu promotorem jest LTR wirusa mięsaka Rousa (RSV) będący silnym promotorem transkrypcyjnym. W korzystniejszym wykonaniu promotora jest promotor wirusa cytomegalii wraz z sekwencją introna A (CMV-intA). Korzystnym terminatorem transkrypcyjnym jest terminator wołowego hormonu wzrostu. Połączenie CMVintA-terminator BGH jest szczególnie korzystne. Dodatkowo, w celu nadzorowania wytwarzania środka farmaceutycznego, dodany jest korzystnie do wektora ekspresyjnego, marker oporności na antybiotyk. Użyte być mogą geny oporności na ampicylinę, geny oporności na neomycynę lub inne farmaceutycznie dopuszczalne markery oporności na antybiotyk. W najkorzystniejszym wykonaniu, gen oporności na antybiotyk koduje produkt genu oporności na neomycynę. Dalej, by wspomóc wytwarzanie w dużych ilościach środka farmaceutycznego, przez fermentację z użyciem organizmów prokariotycznych, korzystne jest by wektor posiadał początek replikacji oraz by występował w licznych kopiach. Każdy z dostępnych w handlu wektorów prokariotycznych do klonowania posiada powyższe zalety. W najkorzystniejszym wykonaniu wynalazku, korzyści te zapewniane są przez dostępne w handlu wektory znane jako pUC. Pożądane jest usunięcie zbędnych sekwencji DNA. Stąd, wjednym z wykonań wynalazku sekwencje kodujące lacZ i lacl usunięto z pUC.
W jednym z wykonań, użyto wektora ekspresyjnego pnRSV, w którym jako promotora użyto LTR wirusa mięsaka Rousa (RSV). W innym wykonaniu użyto V1, zmutowanego wektora pBR322, do którego wklonowano promotor CMV i terminator transkrypcyjny BGH. Konstruktu V1 -NP użyto do immunizacji myszy i wywołania CTLi chroniących przed ekspozycjąheterologiczną. W szczególnie korzystnym wykonaniu wynalazku, elementy VI połączono tworząc wektor ekspresyjny nazwany VIJ. Do VIJ klonowano gen wirusa grypy NP z A/PR/8/34. Wjeszcze innym wykonaniu, z V1J usunięto gen oporności na ampicylinę i zamieniono na gen oporności na neomecynę tworząc VI J-neo (Identyfikator Sekw. nr: 18; fig. 7), do którego wklonowano genNP wirusa grypy w celu zastosowania zgodnie z niniejszym wynalazkiem. W jeszcze innym wykonaniu, użyto wektora V1Jns, identycznego z V1J z wyjątkiem tego, że wytworzono unikalne miejsce restrykcyjne Sfil w pojedynczym miejscu KpnI w pozycji 2114 wektora V1J-neo. Występowanie miejsc Sfil w ludzkim genomowym DNA jest bardzo rzadkie (około 1 miejsce na 100000 zasad). Stąd, wektor ten pozwala dokładnie monitorować integrację wektora ekspresyjnego z DNA nosiciela, przez proste trawienie Sfil ekstrahowanego genomowego DNA. W dalszym ulepszeniu, użyto wektora oznaczonego V1R. W wektorze tym usunięto tyle niepotrzebnego DNA ile to jest możliwe, tworząc wysoce zwarty wektor. Wektor ten jest pochodną V1Jns i pokazany jest na figurze 36 (Identyfikator Sekw. nr 45). Wektor ten umożliwia użycie większych wstawek, zmniejszając problem niepożądanych sekwencji i polepszając pobieranie przez komórki gdy konstrukt kodujący swoiste białka wirusa grypy wprowadzony jest do otaczających tkanek. Na figurze 36, części V1Jneo (figura 7), które zostały usunięte przedstawiono jako przerwy, zaś wprowadzone sekwencje zaznaczone są wytłuszczonym drukiem, przy zachowaniu niezmienionej numeracji V1Jneo. Opisane modyfikacje wektora i opracowanie procedur
178 626 mogąbyć wykonane zgodnie z metodami znanymi znawcom dziedziny. Opisane szczególne produkty jednakże, uzyskane konwencjonalnymi środkami, są szczególnie użyteczne do komkretnych zastosowań do których zostały zaadaptowane.
Podczas gdy jedno z wykonań niniejszego wynalazku obejmuje gen NP wirusa grypy ze szczepu A/PR/8/34, bardziej korzystne wykonania obejmują użycie genu NP z bardziej współczesnego izolatu wirusa grypy. Jest to do wykonania przez przygotowanie kopii DNA genów wirusowych i klonowanie pojedynczych genów. Sekwencje wielu licznych szczepów wirusa grypy są obecnie dostępne powszechnie w GENBANK (około 509 sekwencji genów wirusa grypy typu A). Stąd, każdy z tych genów, klonowany z najnowszych izolatów Texas, Beijing czy Panama, które są szczepami zalecanymi przez Center for Disease Control jako uzyteczne w szczepionkach przeciwgrypowych, jest korzystny w niniejszym wynalazku (patrz FLU-IMMUNE® szczepionka wirusa grypy f-my Lederle, Physicians Desk Reference, 1993, str. 1232, triwalentna szczepionka oczyszczonego antygenu powierzchniowego wirusa grypy zawierająca białko hemaglutyniny z A/Texas/36/91, H1N1; A/Beijing/353/89, H3N2; B/Panama/45/90). W ceiu spójnej terminologii używana będzie następująca konwencja opisywania konstruktów DNA: „Nazwa wektora-szczep wirusa grypy-gen”. Stąd, konstrukt w którym gen NP ze szczepu A/PR/8/34 wklonowany jest do wektora ekspresyjnego V1Jneo, nazwano: „V1Jneo-PR-NP”. Oczywiście, wraz ze zmianą czynnika etiologicznego konkretny gen, optymalny do inkorporacji do środka farmaceutycznego może się zmienić. Jednakże, jak to pokazano poniżej, ponieważ wywołanajest odpowiedź limfocytów cytotoksycznych, które są zdolne do ochrony przed szczepami heterologicznymi, zmienność szczepujest mniej znacząca przy zastosowaniu szczepionek, będących przedmiotem wynalazku, w porównaniu ze szczepionkami opartymi na całym wirusie czy podjednostce polipeptydowej. Dodatkowo, ponieważ środek farmaceutyczny jest łatwy do modyfikowania przez wprowadzanie nowego genu, jest to dostosowanie łatwe do wykonania z użyciem standardowych technik biologii molekularnej.
Ponieważ sekwencja nukleoproteiny jest zakonserwowana wśród szczepów grypy, uzyskanajest ochrona przed następującąpóźniej ekspozycjąna zakaźny szczep wirusa grypy typu A, heterologicznego w stosunku do szczepu z którego sklonowano gen dla nukleoproteiny. Porównanie NP z licznych szczepów grypy typu A nie wykazało istotnych różnic w strukturze drugorzędowej [M.Gammelin i in., Virol. 170, 71, 1989] i bardzo nieliczne zmiany w sekwencji aminokwasowej [O.T. Gorman i in., J. Virol. 65, 3704, 1991], Przez okres około 50 lat, NP w szczepach ludzkich ewoluował w tempie 0,66 aminokwasu rocznie. Ponadto, wyniki pokazujące, że CTL swoiste dla A/HK/68 rozpoznają komórki docelowe poddane pulsowi syntetycznego peptyduNP (147-155) uzyskanego z sekwencji NP szczepu A/PR/8/34, wska^iyjąże epitop ulegający restrykcji H-2Kd pozostał nienaruszony przez okres 34 lat (patrz figura 2). Warte odnotowaniajest również to, że gdy gen koduje wirusowy antygen powierzchniowy, wywoływanajest znacząca odpowiedź humoralna (przeciwciał) dodatkowo do bardzo istotnej odpowiedzi limfocytów cytotoksycznych.
Wstrzyknięcie i.m. wektora ekspresyjnego DNA kodującego zakonserwowane, wewnętrzne białko grypy typu A, powoduje wytworzenie znaczącej ochronnej odporności przed następową ekspozycją na wirusa. W szczególności, wytwarzane są przeciwciała swoiste dla NP i pierwotne CTLe. Immunizacja przy użyciu DNA dla NP powoduje spadek mian wirusa w płucach, zahamowanie utraty wagi i zwiększenie przeżywalności w porównaniu z kontrolą. Ochronna odpowiedź odpomościowanie nie jest zależna od przeciwciał swoistych dla NP, jak to wykazano przez brak efektu samych przeciwciał anty-NP (patrz przykład 4) w zwalczaniu zakażenia wirusowego i zależy raczej od swoistej dla NP odporności komórkowej. Ponadto, wytworzyły się znaczne poziomy pierwotnych CTLi skierowanych przeciwko NP. Ochrona skierowana była przeciwko zakaźnemu szczepowi grypy typu A, który był heterologiczny w stosunku do szczepu, z którego sklonowano DNA. Dodatkowo, szczep, którego użyto do ekspozycji, powstał ponad trzy dziesięciolecia po szczepie A/PR/8/34, co wskazuje, ze odpowiedź odpornościowa skierowana przeciwko zakonserwowanym białkom może być efektywna mimo zmian antygenowych i dryfu antygenowego zmiennych białek powierzchniowych. Ponieważ każdy z produktów
178 626 genów wirusa grypy przejawia pewien stopień zakonserwowania, oraz ponieważ CTLe mogą być wywołane w odpowiedzi na wewnątrzkomórkową ekspresję i obróbkę MHC, możliwe jest do przewidzenia, że inne geny wirusa grypy mogą wzbudzić odpowiedź podobną do uzyskanej przy użyciu NP. Sposoby identyfikacji epitopów immunogenncyh są dobrze znane specjalistom [patrz przykładowo Shirai i in., J. Immunol. 148:1657-1667, 1992; Chopin i in., J. Immunol. \4Ί:5Ί5-5%3,1991; Calin-Laiu-ensi in., Vaccine 11:974-978,1993]. Tak więc, sklonowano wiele z tych genów, jak to pokazano przez sklonowanie i selekcjonowanie miejsc połączeń w wektorach ekspresyjnych (patrz niżej) tak, że konstrukty te są czynnikami profilaktycznymi w dostępnej postaci.
Tak więc, wynalazek dostarcza wektorów ekspresyjnych kodujących białka wirusa grypy jako immunogen. Szczepionka według wynalazku pozwala na wywoływanie międzyszczepowej odporności bez potrzeby użycia czynników samoreplikujących lub adjuwantów. Dodatkowo, immunizacja przy użyciu DNA posiada liczne zalety. Po pierwsze, takie podejście do immunizacji powinno być możliwe do zastosowania w stosunku do nowotworów jak i do czynników zakaźnych, ponieważ odpowiedź ze strony CTLi CD8+jest istotna dla obu procesów patofizjologicznych [K. Tanaka i in., Annu. Rev. Immunol. 6, 359 (1988)]. Stąd, wywołanie odpowiedzi odpornościowej przeciwko białkom kluczowym w transformacji nowotworowej może być efektywnym sposobem ochrony przed rakiem lub immunoterapią. Po drugie, wytworzenie wysokich mian przeciwciał przeciwko wyrażanym białkom po wstrzyknięciu białka wirusowego (NP) oraz DNA dla ludzkiego hormonu wzrostu [patrz przykładowo D.-c. Tang i in., Nature 356,152, 1992] wskazuje, że jest to łatwy i wysoce wydajny sposób wytwarzania szczepionek opartych na przeciwciałach, oddzielnie bądź w połączeniu ze szczepionkami opartymi na limfocytach T cytotoksycznych, skierowanych przeciwko zakonserwowanym antygenom.
Łatwość wytwarzania i oczyszczania konstruktów DNA stanowi zaletę w porównaniu z tradycyjnym oczyszczaniem białek, ułatwiając wytwarzanie szczepionek złożonych. Stąd, można przygotować wiele konstruktów kodujących, zmieszać je i podać razem. Na koniec, ponieważ po wstrzyknięciu DNA ekspresja białka utrzymuje się [H. Lin i in., Circulation 82,4138 (1991);
E. Hansen i in., FEBS Lett. 290,73 (1991); S. Jiao i in., Hum. Gene Therapy 3,21 (1992); J.A. Wolff i in., Human. Mol. Genet. 1, 363 (1992)] trwałość pamięci limfocytów B i T może być zwiększona [D. Gray i P. Małzinger, J. Exp. Med. 174,969(1991); S. Oeheniin.,ibid. 176,1273 (1992)] przedłużając długotrwałą odporność humoralnąi komórkową.
Obecne ograniczenia licencjonowanych szczepionek przeciwgrypowych uwydatniają konieczność opracowania bardziej efektywnych środków zapobiegania zakażeniom i złagodzenia choroby. Dawne szczepionki zapewniały ograniczoną ochronę, były efektywne tylko wobec kilku wybranych szczepów wirusa i traciły swoje działanie po krótkim czasie. Stąd, obecne szczepionki muszą być modyfikowane do corocznych szczepień w celu zachowania swej efektywności. Wytworzenie polepszonej odpowiedzi CTL przeciwko białkom wewnętrznym powinno zapewnić znaczną, długotrwałą i międzyszczepową odporność, które nie zapewniają licencjonowane szczepionki.
Wykazano ekspresję białka przy użyciu konstruktów PNV u myszy, fretek i naczelnych przez wykrycie odpowiedzi odpornościowej gospodarza przeciwko antygenom wirusa grypy. Wstrzyknięcie myszom DNA kodującego NP wirusa grypy spowodowało zwiększoną przeżywalność, zmniejszone miana wirusa w płucach i zmniejszenie utraty wagi w porównaniu ze zwierzętami kontrolnymi, w następstwie ekspozycji na podtypy wirusa grypy (zmienione antygenowo szczepy) różniące się DNA od wprowadzonego do konstruktów. Obserwowano również zmniejszone uwalnianie wirusa w następstwie ekspozycji na zmienione szczepy fretek immunizowanych DNA dla NP. Wyniki te wskazują, że ochrona przed znacznymi zmianami szczepów wirusa grypy wspomożona jest szczepionką DNA, zawierającą geny kodujące NP.
Odpowiedź odpornościowa na DNA wirusa grypy obserwowana była u myszy nawet przez sześć miesięcy po wstrzyknięciu, z utrzymywaniem się przeciwciał, aktywnością CTL i ochroną in vivo. Powtórne wstrzyknięcia DNA dalej zwiększająpezeżywalsość po ekspozycji
178 626 w 25 tygodni później przy użyciu szczepu wirusa grypy innego podtypu i wskazująna możliwość przypomnienia ochronnej odporności komórkowej.
Wyniki doświadczeń wskazują, że bezpośrednie wstrzyknięcie DNA zapewnia ulepszoną metodę ochrony ludzi przed zakażeniem wirusem grypy i chorobą. Warte odnotowania jest, że doświadczalną ochronę przez wstrzyknięcie DNA uzyskano przez szczepienie myszy i fretek, które nie miały dotąd kontaktu z grypą. Dorośli ludzie szczepieni DNA byliby już eksponowani na wirusa grypy. Osoby te powinny wykazywać jeszcze silniejszą odpowiedź odpornościową, prawdopodobnie o większej trawałości, w następstwie immunizacji konstruktami DNA.
Zakres dawek powinien być porównany z immunogennością w celu optymalizacji stosowanych stężeń. W doświadczeniach na małych ssakach, dawki rzędu 1 pg dNA dla NP indukowały przeciwciała i odpowiedź CTL. W osobnym doświadczeniu afrykańskim małpom zielonym, które dotąd nie miały kontaktu z antygenem, wstrzyknięto DNA kodujący NP wirusa grypy typu A. Trzy z trzech małp w każdej grupie odpowiedziały na szczepionki zawierające 10 pg lub Ϊ0ϋ pg każdego z pięciu konstruktów. W oparciu o to odkrycie możliwe do przewidzenia jest, że dawki 10, 50, 100 i 200 pg DNA są efektywne u ludzi.
Efektywność u ludzi wykazano na ochotnikach, którzy otrzymali przeciwgrypową szczepionkę DNA, po czym poddani zostali ekspozycji donosowej w celu zbadania efektywności szczepionki w stosunku do podobnych szczepów wirusa jak również szczepów wirusa grypy innych podtypów. Skład, dawkowanie i schemat podawania szczepionki oparty jest na poprzednich badaniach. Efektywność kliniczną wykazano przez określenie odsetka zakażeń, miary choroby i czasu trwania choroby. Dane kliniczne porównano z badaniami laboratoryjnymi odpowiedzi odpornościowej gospodarza i uwalniania wirusa w celu określenia czynników korelujących z ochroną.
Standardowe techniki biologii molekularnej przygotowywania i oczyszczania konstruktów DNA umożliwiają wykonanie środków farmaceutycznych opartych na DNA, będących przedmiotem wynalazku. O ile standardowe techniki biologii molekularnej są wystarczające do wytwarzania produktów niniejszego wynalazku, specyficzne konstrukty ujawnione tu zapewniają nowe środki lecznicze, które nieoczekiwanie wywołują odporność krzyżową, wynik dotychczas nieosiągalny przy zastosowaniu standardowych szczepionek opartych na inaktywowanym całym wirusie czy białku podjednostki.
Ilość DNA zdolnego do ekspresji wprowadzanego osobnikowi przyjmującemu szczepionkę zależy od siły promotorów transkrypcyjnych i translacyjnych użytych w konstrukcje DNA i od immunogenności ekspresjonowanego produktu genu. Ogólnie, podaje się domięśniowo immunologicznie i profilaktycznie efektywną dawkę rzędu 1 pg do 1 mg, najkorzystniej od około 10 pg do 300 pg. Możliwe jest również wstrzyknięcie podskórne, wprowadzenie przezskóme, oraz inne sposoby podawaniajak podanie dootrzewnowe, dożylnie czy w inhalacji. Możliwe jest również szczepienie przypominające.
DNA może być „nagi” tzn. nie związany z żadnym białkiem adjuwantem czy ińnymi czynnikami wpływającymi na układ odpornościowy biorcy. W tym przypadku DNA powinien znajdować się w fizjologicznie dopuszczalnym roztworze jak, przykładowo, roztwór fizjologiczny soli lub zbuforowany roztwór fizjologiczny soli. Alternatywnie, DNA może być związany z liposomami jak liposomy lecytynowe czy inne liposomy znane specjalistom jako mieszaniny DNA z liposomami (patrz przykładowo W09324640) lub DNA może być związany ze znanymi adiuwantami w celu wzmocnienia odpowiedzi odpornościowej, jak białko czy inny nośnik. Czynniki wspomagaj ące pobieranie DNA przez komórki jak np. j ony wapnia, białka wirusowe czy inne czynniki wspomagające transfekcję mogą być również użyte z korzyścią. Czynniki te oznaczają głównie czynniki wspomagające transfekcję oraz farmaceutycznie dopuszczalne nośniki. W znaczeniu tu użytym określenie gen dotyczy segmentu kwasu nukleinowego kodującego osobny polipeptyd. Określenie środek farmaceutyczny i szczepionka używane są zamiennie w celu określenia kompozycji użytecznej w wywoływaniu odpowiedzi odpornościowej. Określenia konstrukt i plazmid używane są zamiennie. Określenie wektor używanejest w celu określenia DNA do którego mogą być klonowane geny do zastosowania zgodnie z niniejszym wynalazkiem.
178 626
Sposób wywołania odpowiedzi odpornościowej in vivo u kręgowca, takiego jak ssak, w tym także człowiek, obejmuje: ’ ’
a) wyizolowanie genu,
b) połączenie genu z sekwencjami regulatorowymi w taki sposób, ze gen jest połączony operacyjnie z sekwencjami kontrolującymi, które po wprowadzeniu do żywej tkanki kierują zapoczątkowaniem transkrypcji i następnie translacją genu,
c) wprowadzenie genu do żywych tkanek, i
d) ewentualnie, wzmożenie odpowiedzi przy użyciu dodatkowego genu wirusa grypy.
Najkorzystniejsze zastosowanie wynalazku stanowi sposób ochrony przed heterologicznymi szczepami wirusa grypy. Uzyskiwane jest to przez podanie efektywnej immunologicznie ilości kwasu nukleinowego kodującego zakonserwowane epitopy wirusa grypy. Przykładowo, funkcję tę spełnia cały gen nukleoproteiny wirusa grypy, i uważa się, że sekwencje kodujące inne geny wirusa grypy oraz ich fragmenty kodujące zakonserwowane epitopy w obrębie tych genów powinny zapewnić odporność krzyżową..
Przykłady korzystnych konstruktów DNA kodujących białko wirusa grypy obejmują·
a) pnRSV-PR-NP,
b) V1-PR-NP,
c) V1-PR-NP, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 12,
d) V1-PR-PB1, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 13,
e) V1-PR-NS, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 14,
f) V1-PR-HA, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw-’. nr 15,
g) V1-PR-PB2, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 16,
h) V1-PR-M1, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 17,
i) V1neoBJ-NP, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 20, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 21,
j) V1 neo-TX-NP, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 24, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 25,
k) V1neo-PA-HA, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 26, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 27,
l) VIns-GA-HA (A/Georgia/03/93), wielkość konstruktu 6.56 Kb, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 46, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 47,
m) V1ns-TX-HA (A/Texas/3 6/91 ), wielkość konstruktu 6.5 6 Kb, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 48, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 49,
n) Vlns-PA-HA (B/Panama/45/90), wielkość konstruktu 6.61 Kb, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 50, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 51,
o) Vlns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), wielkość konstruktu 6.42 Kb, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 52, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 53,
p) V1ns-BJ-M1 (A/Beijing/353/89), wielkość konstruktu 5.62 Kb, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 54, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 55,
q) V1ns-PA-NP (B/Panama/45/90), wielkość konstruktu 6.54 Kb, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 56, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 57,
r) V1ns-PA-M1 (B/Panama/45/90), wielkość konstruktu 5.61 Kb, którego koniec 5' stanowi Identyfikator Sekw. nr 58, a koniec 3' stanowi Identyfikator Sekw. nr 59.
Poniższe przykłady dostarczono w celu dalszego zdefiniowania wynalazku, bez ograniczania wynalazku do specyficznych przykładów.
Przykładl. Przykład konstruktów DNA kodujących białka ludzkiego wirusa grypy. i) pnRSV-PR-NP: Gen NP z A/PR/8/34 wyizolowano z pAPR-501 [J.F. Young i in., „The
Origin ofPandemie Influenza Viruses”, W.G. Laver, wyd. (Elsevier Science Publishing Co., Inc.,
1983)] jako fragment EcoRI wielkości 1565 par zasad, końce wypełniono fragmentem Klenowa i wklonowano do traktowanego fragmentem Klenowa i fosfatazą miejsca Xbal w pRSV-BL.
pRSV-BL skonstruowano przez trawienie wektora pBL-CAT3 [B. Lucków i G. Schutz, Nuci.
Acids Res. 15,5490 (1987)] przy użyciu Xhol i Ncol w ceiu usunięcia sekwencji kodującej CAT
178 626 po czym wypełniono fragment Klenowa i religowano. Fragment zawierający promotor RSV wyizolowano jako fragment Ndel-Asp718 z pRshgmx [V. Giguere i in., Nature 330, 624 (1987)], wypełniono fragmentem klenowa i wklonowano w miejsce HindIII pośredniego wektora wytworzonego w sposób opisany powyżej (pBL-CAT pozbawiony sekwencji CAT).
ii) V1 -NP: Wektor ekspresyjny V1 skonstruowano z pCMVIE-AKIDHFR [Y. Whang i in., J. Virol. 61, 1796 (1987)]. Geny AKI i DHFR usunięto przez cięcie wektora EcoRI i religację. Wektor nie zawierał introna A w promotrze CMV, więc dodano go jako produkt PCR, w którym usunięto wewnętrzne miejsce SacI [wpozycji 1855 według numeracji B.S. Chapmana i in., Nuci. Acids Res. 19,3979(1991)] .Matry cąużytą do reakcji PCR był pCMVintA-Lux, wykonany przez ligację fragmentu Hindlll-Nhel z pCMV6al20 [patrz B.S. Chapman i in., ibid.] zawierający wzmacniacz/promotor hCMV-IEl i intron A, w miejsce HindIII i Xbal pBL3 tworząc pCMVntBL. Fragment genu lucyferazy, wielkości 1881 par zasad (Hindlll-Smal wypełniony fragmentem Klenowa) z RSV-Lux [J.R. de Wet i in., Mol. Cel. Biol. 7,725,1987] wklonowano w miejsce Sall wektora pCMVIntBL, wypełnione fragmentem klenowa i traktowane fosfatazą.
Użyto starterów obejmujących intron A: starter 5', Identyfikator Sekw. nr 5:
5'-CTATATAAGCAGAGCTCGTTTAG-3'.
starter 3', Identyfikator Sekw. nr 6:
5'-GTAGCAAAGATCTAAGGACGGTGACTGCAG-3'.
Startery użyte do usunięcia miejsca SacI: starter sensowny, Identyfikator Sekw. nr 7:
5'-GTATGTGTCTGAAAATGAGCGTGGAGATTGGGCTCGCAC-3' starter antysensowny, Identyfikator Sekw. nr 8: 5'-GTGCGAGCCCAATCTCCACGCTCATTTTCAGACACATAC-3'.
Fragment PCR cięto SacI i BgUI i wprowadzono do wektora ciętego tymi samymi enzymami. Gen NP wirusa grypy A (A/PR/8/34) wycięto z pAPR501 [J.F. Young i in., „The Origin of Pandemie Influenza Viruses”, W.G. Laver, wyd. (Elsevier Science Publishing Co., Inc., 1983)] jako fragment EcoRI wielkości 1565 par zasad i wypełniono. Wprowadzono go do VI w wypełnione miejsce Bglll tworząc V1 -NP. Plazmid namnożono w E. coli i oczyszczono metodąlizy alkalicznej [J. Sambrook, E.F. Fritsch i T. Maniatis, „Molecular Cloning, A Laboratory Manual” wyd. drugie {Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)]. Wirowany na gradiencie CsCl DNA precypitowano etanolem i rozpuszczono w 0,9% roztworze soli w stężeniu 2 mg/ml do wstrzyknięć.
Przykład2. Test limfocytów T cytotoksycznych w stosunku do ludzkiego wirusa grypy.
Limfocyty T cytotoksyczne pozyskano od myszy, które były immunizowane DNA i wyzdrowiały z zakażenia A/HK/68. Hodowle kontrolne uzyskano od myszy, którym wstrzyknięto DNA kontrolny oraz od myszy nienastrzykniętych niczym. Przygotowano zawiesinę jednokomórkową, erytrocyty usunięto przez lizę chlorkiem amonowym i hodowano splenocyty w RPMI 1640 z dodatkiem 10%o wołowej surowicy płodowej (FBS), 100 U/ml penicyliny, 100 pg/ml streptomycyny, 0,01 M HEPES (pH 7,5) oraz 2 mM L-glutaminy. Dodano równą liczbę autologicznych, napromieniowanych komórek stymulatorowych, poddanych działaniu przez 60 min. peptydowego epitopu ulegającego restrykcji H-2Kd NP 147-155 (Thr Tyr Gin Arg Thr Arg Ala Leu Val, Identyfikator Sekw. nr 9) w stężeniu 10 pM lub zakażonych wirusem grypy A/PR/8/34 (H1N1) i 10 U/ml rekombinowanej ludzkiej IL-2 (Cellular Products, Buffalo, NY) po czym hodowano przez 7 dni w temp. 37°C w atmosferze 5% CO2 i 100% względnej wilgotności. W pewnych doświadczeniach w miejsce autologicznych komórek stymulatorowych dodawano rhIL-2 (20 U/ml) i ConA (2 pg/ml). Aktywność cytotoksyczna limfocytów T oznaczana była z użyciem komórek P815 znakowanych przez 3 h przy użyciu 60 pCi 51Cr/ 106 komórek i poddanych działaniu NP 147-155 jak to opisano wyżej, lub zakażonych wirusem grypy A/Victoria/73 (H3N2). Komórki docelowe kontrolne (znakowane komórki P815 bez peptydu czy wirusa) nie były niszczone. Komórki docelowe wysiewano w gęstości 1x104 komórek/studzienkę w okrągłodennych płytkach 96-studzienkowych i inkubowano z komórkami efektorowymi przez 4 godziny w trzykrotnych powtórzeniach. Nadsącz (30 pl) pobierano z każdej ze stu20
178 626 dzienek i zliczano w liczniku scyntylacyjnym Betaplate (LKB-Wallac, Turku, Finland). Dla każdego preparatu komórek docelowych oznaczono zliczenia maksymalne, uwolnione przez dodanie 6M HCl i spontaniczne zliczenia uwolnione bez CTL. Procent lizy właściwej obliczono następująco:
[(doświadczałna-spontaniczna)/(maksymalna-spontaniczna)]x 100
Przykład 3. Wytwarzanie CTL I przeciwciał swoistych w stosunku do NP in vivo.
Myszom BALB/c wstrzykiwano w mięśnie czworogłowe obu łap cDNA plazmidowe kodujące nukleoproteinę A/PR/8/34 kierowaną przez promotor wirusa mięsaka Rousa lub wirusa cytomegalii.
Używano wektorów ekspresyjnych:
i) pnRSY-PRnp. patrz przykład 1;
ii) V1-NP, patrz przykład 1.
Używano samic myszy BALB/c, uzyskanych z Charles River Laboratories, Raleigh, NC. Myszy uzyskano w wieku 4-5 tygodni i wstępnie wstrzyknięto im DNA w wieku 5-6 tygodni. O ile nie zaznaczono inaczej, wstrzyknięcia DNA wykonywano w mięśnie czworogłowe obu łap, po 50 pl stearylnego roztworu soli zawierającego 100 pg DNA na łapę. Myszy otrzymywały 1,2 lub 3 zestawy wstrzyknięć w 3 tygodniowych odstępach. Kontrole negatywne pozostawały bez wstrzyknięć lub otrzymywały odpowiedni pusty wektor, pozbawiony wprowadzonego genu NP.
Obecność lub brak DNA plazmidowego zawierającego gen NP w mięśniach wybranych zwierząt analizowano przez PCR (fig. 1). DNA plazmidowy (DNA dla Np lub lucyferazy) stwierdzono w 44 na 48 badanych mięśni. U myszy, którym wstrzyknięto DNA dla lucyferazy, ekspresję białka wykazano aktywnością lucyferazy uzyskanąz ekstraktów mięśni, zgodnie z metodami znanymi znawcom dziedziny [J.A. Wolff i in., Science 247,1465 (1990); G. Ascardi i in., Nature352, 815 (1991); H. Lin i in., Circulation 82, 2217 (1990); R.N. Kitsis i in., Proc. Natl. Acad, Sci. USA 88,4138 (1991); E. Hansen i in., FEBS Lett. 290,73 (1991); S. Jiao i in., Hum. Gene Therapy 3,21 (1992); J.A. Wolff i in., Human Mol. Genet. 1, 363 (1992)].
Ekspresja NP w mięśniach po wstrzyknięciu DNA dla NP była poniżej granicy wykrywalności analizy met. Western biot (<1 ng) ale wykazywana produkcją swoistych dla NP przeciwciał (patrz fig. 2). Do zbadania powstawania CTL NP-swoistych pobierano śledziony 1-4 tygodni po immunizacj i po czym restymulowano splenocyty rekombinowaną, ludzką IL-2 z dodatkiem autologicznych splenocytów, które zakażono wirusem grypy A (A/PR/8/34) lub poddawano działaniu peptydowego epitopu nukleoproteiny, ulegającego restrykcji H-2Kd (reszty NP 147-155, patrz O.K. Rótzscke i in., Nature 348,252 (1990)). Splenocyty restymulowane zakażonymi wirusem lub poddanymi działaniu peptydu syngenicznymi komórkami zdolne były do zabijania komórek docelowych poddanych działaniu epitopu nukleoproteiny (fig. 3A). Wskazuje to, ze wstrzyknięcie i.m. DNA dlaNP wywołuje odpowiedni peptydpochodzący zNP wpołączeniu z MHC klasy I do indukcji swoistej odpowiedzi CTL. CTLe te zdolne są do rozpoznawania i niszczenia komórek docelowych zakażonych wirusem (fig. 3B) lub komórek docelowych poddanych działaniu peptydowego epitopu nukleoproteiny, ulegającego restrykcji H-2kd, oraz komórek docelowych zakażonych wirusem. Pokazuje to ich swoistość jak również ich zdolność do wykrywania epitopu produkowanego w zakażonych komórkach.
Bardziej surowym pomiarem immunogenności szczepionki DNA NP było badanie pierwotnej odpowiedzi CTL. Splenocyty pobrane od myszy, którym wstrzyknięto DNA dlaNP, aktywowane były przez ekspozycję na ConA i IL-2, ale nie były poddawane restymulacji in vitrokomórkami ekspresjonującymi antygen przed badaniem ich zdolności do zabijania odpowiednich celów. Splenocyty od myszy immunizowanych DNA dlaNP, po aktywacji ConA i IL-2 in vitro bez restymulacji antygenowo-swoistej, niszczyły zarówno poddane działaniu epitopujak i zakażone wirusem komórki docelowe (fig. 3C i D). Aktywność lityczna restymulowanychjak i aktywowanych splenocytów wypadała zadowalająco w porównaniu z podobnie traktowanymi splenocytami uzyskanymi od myszy, którezostały uprzednio zakażone wirusem grypy A/HK/68, zjadliwym szczepem H3N2, zaadaptowanym do myszy, powstałym w 34 lata po A/PR/8/34 (H1N1). Stąd, wstrzyknięcie DNA dla Np powoduje powstanie CTL swoistych dla epitopu
178 626 nukleoproteiny i zdolnych do wykrycia antygenu poddanego naturalnej obróbce (tzn. mogących zabijać komórki zakażone wirusem). CTL NP-swoiste wywołano również u transgenicznych myszy C3H i B6 ekspresjonujących ludzki HLA-A2.
CTL NP-swoiste wykryto w śledzionach myszy BALB/c, którym wstrzyknięto zaledwie 1 dawkę rzędu 1 pg DNA dla NP (najniższa badana dawka) (tabela 3-IV):
Tabela 3-IV
Odpowiedź CTL u myszy po pojedynczym wstrzyknięciu DNA dla NP
Szczepionka Dawka (pg) % lizy swoistej sd
DNA dla NP 400 52.5 10.7
400 80.4 10.3
DNA dla NP 200 75.6 5.4
200 44.6 4.4
DNA dla NP 100 76.7 2.9
100 35.6 8.9
DNA dla NP 50 62.9 0.6
50 76,7 7.4
DNA dla NP 10 83.2 10.1
10 37.7 25
DNA dla NP 1 44.2 0.3
1 13 2
DNA kontrolny 100 4.9 1
grypa 79 3 8.3
Tabela 3-IV: Samicom myszy BALB/c (4-6 tygodni) wstrzyknięto pojedynczą dawkę DNA dla NP A/PR/34 (V1JNP) lub kontrolny dNa (V1J) z zaznaczonej dawce. Dla porównania myszy zakazono wirusem grypy A/PR/34. CTLe pobrano po 8 tygodniach, restymulowano in vitro synergicznymi splenocytami poddanymi działaniu peptydu NP i badano w stosunku do komórek P815 poddanych działaniu peptydu NP w stosunku komórek efektorowych do docelowych równym 50:1. Dane przedstawiono jako % lizy swoistej dla pojedynczych, reprezentatywnych myszy.
Obserwacja przez czas dłuższy wykazała, że myszy które otrzymały 1 dawkę L pg DNA dla NP utrzymywały CTL swoiste dla NP przez co najmniej 4.5 miesiąca (najdłuższy badany okres). Wielkość odpowiedzi CTL o wstrzyknięciu DNA porównywana była z wywołaną zakażeniem wirusem grypy. Jednakże, odnotować należy, że analiza CTL po restymulacji antygenem in vitro niejest ilościowa. Stąd, opracowywanyjest obecnie test rozcieńczeń granicznych w celu bardziej ilościowego określenia poziomów CTL swoistych dla NP u myszy. U myszy, które otrzymały trzy dawki po 100 pg DNA dla NP, odpowiedź CTL wykryto po przynajmniej 6 miesiącach od immunizacji (figura 19). Stąd, PNV przeciwko grypie posiada zdolność wywoływania długotrwałej odpowiedzi ze strony CTL skierowanej przeciwko zakonserwowanym antygenom wirusa grypy.
Wstrzyknięcie myszom DNA dla NP powoduje produkcję wysokich mian przeciwciał IgG anty-NP (fig. 2). Uważa się, że wywołanie wysokich zmian przeciwciał IgG wymaga pomocy limfocytówT cD4+ (P. Vieira i K. Rajewsky, Int. Immunol. 2,487 (1990); J.J. Donnelly i in., J. Immunol. 145, 3071 (1990)). Pokazuje to, że NP ekspresjonowany z plazmidu in situ poddawany był obróbce do prezentacji przez zarówno MHC klasy I i klasy II.
178 626
Przykład 4. Ochrona myszy przed ekspozycjana zakaźny szczep ludzkiego wirusa grypy.
Rolę przeciwciał anty NP w ochronnej odporności przeciwko grypie wykazano przez dwa podejścia: pierwsze, oznaczono miana wirusa w płucach w doświadczeniu polegającym na biernym przeniesieniu. Samicom myszy BALB/c, w wieku <10 tygodni, podano dootrzewnowo 0,5 ml pulowanej surowicy (rozcieńczonej w 2 ml PBS) od myszy, którym podano trzy dawki po 200 μ DNA dla NP. Myszom kontrolnym podano równą objętość pulowanej normalnej surowicy mysiej, lub surowicy pulowanej od myszy, które wyzdrowiały z zakażenia A/HK/68, również w 2 ml PBS. Dawka surowicy odpornościowej przeciwko A/HK/68 została dobrana tak by miano ELISA przeciwciał anty-NP było równe z mianem surowicy pulowanej myszy nastrzykniętych DNA dla NP. Myszy poddano ekspozycji bez znieczulenia przy użyciu 104 TCID50 A/HK/68 dwie godziny po wstrzyknięciu surowicy, po czym dalsze wstrzyknięcia takiej samej objętości surowicy wykonywane były trzy dni później. Myszy zabijano 6 i 7 dni po zakażeniu i oznaczano miana wirusa w płucach w TCID50nami takjóik to opisano przez Moran [J. Immunol. 146,321,191].
Myszom, które nie miały dotąd kontaktu z antygenem, podawano surowicę anty-NP, uzyskaną od mo surowicę anty-NP, uzyskaną od myszy, którym wstrzyknięto DNA dla NP a następnie poddano ekspozycji na wirusa A/HK/68. Ekspozycję na wirusa wykonano przy użyciu zaadaptowanego do myszy szczepu A/HK/68 i utrzymywano następnie przez pasaże in vivo na myszach (Dr. I. Mbawuike, doniesienie prywatne). Roztworem wyjściowym wirusa był homogenat płuc zakażonych myszy a jego miano zakaźne wynosiło 5x108 TCID50/ml komórek MDCK. Do oznaczeń mian wirusa w płucach i badania utraty wagi ekspozycję na wirusa wykonywano przez wkroplenie donosowe 20 zawierających 104 TCID50 do nozdrzy, bez znieczulenia, co prowadziło do postępującego zakazenia płuc wirusem ale nie zabijało myszy BALB/c [Yetter R.A. i in., Infect. Immunity 29, 654,1980], W doświadczeniach nad przezywalnością, myszy poddawano ekspozycji przez wkroplenie donosowe 20 μl zawierających 102 5 TCIDjo do nozdrzy, w pełnej narkozie z użyciem ketaminy i ksylazyny; zakażenie znieczulonych myszy tą dawką powoduje raptowne zakażenie płuc co powoduje śmierć 90-100% nieimmunizowanych myszy [J.L. Schulman i E.D. Kilboume, J. Exp. Med. 118,257,1963; G.H. Scott i R.J. Sydiskis, Infect. Immunity 14,696,1974; R.A. Yetter i in., Infect. Immunity 29,654, 1980], Miana wirusa w płucach oznaczano przez miareczkowanie na komórkach MDCK (uzyskanych z ATCC, Rockville, MD) w płytkach 96-studzienkowych jak to opisano przez Moran i in., [ibid.].
Nie obserwowano zmniejszenia mian wirusa w płucach myszy, które otrzymały surowicę anty-NP(6.3±0.2; średnia±SEM; n=4) w porównaniu z myszami kontrolnymi, które otrzymały normalną surowicę (6.1±0.3; średnia±SEM; n=4) Jako kontrolę pozytywną pobrano surowice od myszy zakazonych A/HK/68 i przeniesiono biernie na cztery myszy, które uprzednio nie miały kontaktu z antygenem. Po ekspozycji na wirusa A/HK/68 nie stwierdzono zakażenia w ich płucach, co wskazywało, że surowica przeciwko całemu wirusowi chroniła całkowicie przed homologicznym wirusem. Po drugie, myszy, które uprzednio nie miały kontaktu z antygenem immunizowano oczyszczonym NP (5 μg/łapę, trzykrotnie w ciągu 6 tygodni) przez wstrzyknięcie i.m. Myszy te wytworzyły wysokie miana przeciwciał NP-swoistych ale nie wytworzyły NP-swoistych CTL i nie były chronione przed letalną dawką wirusa. Stąd, w przeciwieństwie do neutralizującego wpływu przeciwciał przeciwko całemu wirusowi, krążące przeciwciała anty-NP nie zapewniają odporności ochronnej u myszy.
Badano efektywność ochronnąin vivo iniekcji DNA dla NP, w celu stwierdzenia czy odpowiedź odpornościowa komórkowa była funkcjonalnie istotna. Bezpośrednią metodą zmierzenia efektywności odpowiedzi odpornościowej była zdolność myszy uprzednio immunizowanych DNA dla NP do oczyszczenia z postępującego, subletalnego zakazenia płuc heterologicznym szczepem wirusa grypy (A/HK/68; H3N2). Ekspozycję na wirusa przeprowadzono jak to opisano wyżej. U myszy immunizowanych DNA dla NP stwierdzono 7 dnia miana wirusa w płucach o trzy rzędy wielkości nizsze (1.0±1.0; średnia±SEM; n=4) niż u myszy kontrolnych, które nie były immunizowane (4.1±0.3; średnia±SEM; n=4) czy immunizowanych pustym wektorem
178 626 immunizowane (4.5±0.0; średnia±SEM; n-4)/ W rzeczywistości trzy spośród czterech immunizowanych myszy miały niewykry walne miana wirusa w płucach, podczas gdy żadne ze zwierząt kontrolnych nie oczyściło się z wirusa w tym czasie. Znaczna różnica w mianach wirusa w płucach widoczna w tym doświadczeniu i sześciu innych pokazuje, że odpowiedź odpornościowa przyspiesza usuwanie wirusa. Brak efektu ochronnego'kontroli pustego wektora potwierdza, że DNA sam przez się niejest odpowiedzialny za odpowiedź odpornościową. Ponadto, ponieważ wirus, na który eksponowano myszy, A/HK/68 (zakaźny, zaadaptowany do myszy szczep H3N2) był heterologiczny w stosunku do A/PR8/34 (H1N1), z którego sklonowano gen NP, odporność była ewidentnie heterotypowa.
Jako miarę wywołanej przez wirusa chorobowości, śledzono utratę wagi u myszy zakażonych subtelnie wirusem grypy A/HK/68 w następstwie immunizacji DNA dla NP (fig. 4). Myszy nienastrzyknięte i nastrzyknięte pustym wektorem służyły jako kontrola. Myszy immunizowane DNA dla NP przejawiały po zakażeniu wirusem grypy A mniejszą utratę wagi i szybszy powrót do ich wagi z przed ekspozycji, w porównaniu z myszami kontrolnymi.
Zakażenie donosowe całkowicie znieczulonych myszy wirusem grypy A, powoduje raptowną, rozprzestrzenioną replikację w płucach i śmierć w 6-8 dni po zakażeniu jeżeli zakażenie niejest kontrolowane (R.A. Yetter i in., Infect. Immunity 29,654 (1980)). Przeżywalność myszy poddanych ekspozycji tym sposobem odzwierciedla ich zdolność do ograniczenia ciężkości ostrego zakażenia płuc. Badano zdolność myszy do przeżycia ekspozycji na dwa różne szczepy wirusa grypy A/HK/68 (patrz fig. 5) i A/PR/8/34. Myszy uprzednio immunizowane DNA dla NP wykazywały 90% odsetek przeżywalności w porównaniu z 0% w grupie, która otrzymała pusty wektor i 20% w nienastrzykniętej niczym kontroli (fig. 5). We w sumie 14 doświadczeniach myszy immunizowane DNA dla NP wykazywały przynajmniej 50% większy odsetek przezywalności w porównaniu z kontrolą. Stąd, zdolność wywołanej DNA dla NP odpowiedzi odpornościowej, do efektywnego przyspieszenia zdrowienia i osłabienia choroby spowodowanej przez wirusa różnych szczepów powstałych w 34 lata później, wspiera przesłankę kierowania odpowiedzi limfocytów T cy to toksycznych na zakonserwowane białka.
Przykład 5. Izolacja genów z izolatów wirusa grypy
W depozycie ATCC znajduje się wiele z dawnych szczepów wirusa grypy („1990 Catalogue of Animal Viruses & Antisera, Chlamydiae % Rickettsiae”, wydanie 6, wymierna 20 szczepów wirusa grypy typu A i 14 szczepów wirusa grypy typu B).
A. Szczepy wirusowe i oczyszczanie:
Szczepy wirusa grypy występujące w obecnej szczepionce na sezon zachorowań 1992 uzyskano od Dr. Nancy J. Cox z Division of Viral and Rickettsial piseases, Centers of Disease Control, Atlanta, GA. Były to szczepy: (1) A/Beijing/353/89 (H3N2); (2) A/Texas/36/91 (H1N1): (3) B/Panama/45/90 i (4) A/Georgia/03/93.
Wszystkie wirusy hodowano przez pasazowanie na kurzych 9-11-dniowych embrionach jaj kurzych (z wyjątkiem A/Georgia, hodowanego na komórkach MDCK), (100-200 na preparat wirusa) i oczyszczano zmodyfikowaną metodą opisaną przez Massicota i in., (Virology 101, 242-249 (1980)). Pokrótce, zawiesinę wirusa klarowano przez odwirowanie przy 8000 rpm (wirówka Sorvall RC5C, rotor GS-3) a następnie zawirowywano przy 18000 rpm przez 2 godziny w rotorze Type 19 f-my Beckman. Peletkę wirusa zawieszano w STE (0.1 M NaCl, 20 mM Tris, pH 7.4, 1 mM EDTA) i wirowano przy 4000 rpm przez 10 minut, (wirówka Hermie Z360K) w celu usunięcia agregatów. 2 ml nadsączu nakładano na nieciągły gradient sacharozy składający się z 2 ml sacharozy 60% przykrytej 7 ml sacharozy 30% zbuforowanej STE i wirowano przy 36000 rpm (rotor SW-40, Beckman) przez 90 minut. Prążek zawierający wirusa zbierano na styku faz, rozcieńczano 10-krotnie w STE i żwirowy wano przy 30000 rpm przez 2 godziny (rotor Ti45, Beckman). Paletkę wirusa zamrażano w -70°C.
178 626
B. Ekstrakcja wirusowego RNA i synteza cDNA:
Wirusowe RNA oczyszczano z zamrożonego wirusa przez ekstrakcję izotiocyjańiańem guanidyny przy użyciu zestawu dostępnego w handlu (Stratagene, La Jolla, CA) wykorzystującego metodę Chomczynskiego i Sacchi (Anal. Biochem. 162, 156-159 (1987)). Dwuniciowe cDNA wykonano z wirusowego RNA przy użyciu dostępnego w handlu zestawu do syntezy cDNA (Pharmacia) zgodnie z instrukcją producenta z kilkoma modyfikacjami. Pierwszą nić cDNA zapoczątkowano przy użyciu syntetycznego oligodezoksynukleotydu 5'-AGCAAAAGCAGG-3', Identyfikator Sekw. Nr 30, komplementarnego do zakonserwowanej sekwencji umiejscowionej w końcu 3' wirusowego RNA wszystkich genów szczepu A. Sekwencja tajest wspólna dla wszystkich wirusowych RNA typu A i dlatego zapewnia metodę klonowania wszystkich genów wirusów grypy typu A. Po syntezie pierwszej i drugiej nici cDNA reakcję poddano ekstrakcji mieszaniną fenol/chloroform i precypitacji etanolem zamiast kontynuować według przepisu dołączonego do zestawu. cDNA o tępych końcach były bezpośrednio ligowane do wektorów VI Jneo lub V1Jns, które uprzednio trawiono enzymem restrykcyjnym Bg 1II, wypełniano końce polimeraząDNA T4 i traktowano cielęcąjelitowąfosfataząalkaliczną.
W celu poszukiwania określonych genów wirusowych pełnej długości użyto syntetycznych oligodezoksynukleotydów, które zaprojektowano by były komplementarne do końca 3'trańslacyjńej ramki odczytu danego genu wirusowego. Próbki, które wydawały się reprezentować geny pełnej długości mapowaniem restrykcyjnym i oznaczaniem długości elektroforezą na żelu agarozowym, potwierdzano sekwencjonowaniem metodą didezoksynukleotydów, miej sc połączenia genu wirusowego z wektorem V1 Jneo. Sekwencj a obu połączeń dla każdego z genów klonowanych z tych wirusów podana jest poniżej w przykładzie 8.
Podobnej strategii użyto do klonowania cDNA z obu wirusów wymienionych powyżej z wyjątkiem B/Panama/45/90, który nie posiadał wspólnej sekwencji na końcach RNA, w celu zapoczątkowania syntezy pierwszej nici cDNA użyto tu mieszaniny oligodezoksynukleotydów. Były to startery:
(1) 5-AGCAGAAGCGGAGC-3', Identyfikator Sekw. Nr 31 ; dla PB 1 i PB2;
(2) 5'-AGCAGAAAGCAGAGCA-3', Identyfikator Sekw. Nr 19; dlaNS i HA;
(3) 5'-AGCAGAAGCACGCAC-3', Identyfikator Sekw. Nr 22; dla M i (4) 5'-AGCAGAAGCACAGCA-3', Identyfikator Sekw. Nr 23; dla NP.
Dla genów klonowanych przez PCR, tępo zakończonych cDNA użyto bezpośrednio w reakcjach PCR jako matryca DNA. Startery użyte do klonowania 6 genów wirusa grypy uzyskanego przez PCR przedstawiono poniżej:
1. Gen HA z A/Georgia'O3/93 starter sensowny, Identyfikator Sekw. Nr 33:
5'-GGTACAACCATGAAGACTATCATTGCTTTGAGC-3' starter antysensowny, Identyfikator Sekw. Nr 34: 5'-CCACATAGATCTTCAAATGCAAATGTTGCA^CCTAATG-^3'.
2. Gen HA z A/Texas/36/91 starter sensowny, Identyfikator Sekw. Nr 35: y-GGT,^(^^CCATGAAAGCAAAACTACTAGTCCT^G^TTATG-3' starter antysensowny, Identyfikator Sekw. Nr 36:
5'-CCACATTCAGATGCATATTCTACACTGCAAAG-3'.
3. Gen HA z B/Panama/45/90 starter sensowny, Identyfikator Sekw. Nr 37:
5'-GGTACAACCATGAAGGCAATAATTGTACTACTCATG-3' starter antysensowny, Identyfikator Sekw. Nr 38: 5'-CCACATTTATAGACAGATGGAGCAAGAAACATTGTC-3'.
4. Gen M1 z A/Beijmg/353/89 starter sensowny, Identyfikator Sekw. nr 39.
5'-GGTACAAGATCTTCCATGCTTCTAACCGAGGTC-3' starter antysensowny, Identyfikator Sekw. Nr 40:
178 626
5'-CCACATAGATCTTCACTTGAACCGTTGC.ATCTGC.AC-3'.
5. Gen NP z B/Panama/45/90 starter sensowny, Identyfikator Sekw. Nr 41:
5'-GGTACAGGATCCACCATGTCCAACATGCiATATTGACGGC-3' starter antysensowny, Identyfikator Sekw. Nr 42: 5'-CCACATGCATCC^TAATAATCGAGGTCATCATAATCCTC-3'.
6. Gen M1 z B/Panama/45/90 starter sensowny, Identyfikator Sekw. Nr 43:
5'-GGTACAGGATCCACCATCTCGCTGTTTGCAGACACAATTCCC-3' starter antysensowny, Identyfikator Sekw. Nr 44: 5'-CCACATCCATCCTTATAGGTA^ΠTTCΓΓCACAACAGCTG-3'.
Wszystkie klony genów wirusa grypy, zarówno cDNA jak i wytworzone PCR, potwierdzono przez sekwencjonowanie przez miejsce ligacji do genu i ekspresjonowano gen w transfekowanych komórkach RD. Ekspresję wykrywano metodą immunoblot.
Konstrukty NP i M1 szczepu A/H3N2 (wektory 4 i 5) wykonano z genów szczepu A/Beijing/353/89. Geny te wybrano z powodu oczekiwanego wysokiego poziomu zakonserwowania zarówno genu NP jak i M1 oraz z powodu ich dostępności.
Z poprzednich prac, szczególnie korzystna grupa 7 wektorów ekspresyjnych połączonych w szczepionkę, obejmowała:
1. VlJns-HA (A/Georgia/03/93) 6.56 Kb
2. VlJns-HA (A/Texas/36/91) 6.56 Kb
3. VlJns-HA (B/Panama/45/90) 6.61 Kb
4. VlJns-NP (A/Beijing/353/89) 6.42 Kb
5. VlJns-Ml (A/Beijing/353/89) 5.62 Kb
6. VlJns-NP (B/Panama/45/90) 6.54 Kb
7. VlJns-M1 (B/Panama/45/90) 5.61 Kb
Odpowiednie sekwencje połączeń tych genów w wektorach ekspresyjnych podane są poniżej. W ceiu potwierdzenia, czy sklonowano odpowiedni gen, należało sekwencjonować tylko niewielki fragment konstruktorów. Przez porównanie z podobnymi znanymi genami łatwo było potwierdzić, że dany gen jest genem NP, HA, Ml itp. Przykładowo, sekwencja genu HA A/Texas jest bardzo podobna do sekwencji genu HA z A/Kiev/59/79, którego sekwencja dostępnaj est z GENBANK pod numerem M3 83 53. Podobnie, dla sekwencj i HA z B/Panama, która jest bardzo podobna z sekwencją HA z B/England/222/82, którego sekwencja dostępna jest z GENBANK pod numerem M18384. W ten sposób, można potwierdzić tożsamość każdej sklonowanej sekwencji każdego z genów z każdego z ludzkich wirusów grypy. W każdym poniższym przypadku zarówno sekwencję z końca 5'jak i 3' potwierdzono w ceiu upewnienia się, że obecny jest kompletny gen. W każdym wypadku, wytłuszczone ATG pokazuje kodon startowy genu wirusa grypy, zaś wytłuszczona sekwencja w końcu 3' oznacza kodon stop:
1. V1Jns-HA (A/Georgia/03/93) 6.56 Kb
Sekwencja 5': Identyfikator Sekw. Nr 46)
TCACCGTCCITAGATC/GGTACAACCATG/AGGACTATCAITGCITTGAGCTACAITTrATGTCT
GGTTTTCGC
Sekwencja 3': (Identyfikator Sekw. Nr 47)
TCAT<^<^TTmTGT^TTTT^TGT^<TTmG<^T^C^CG^C^TT^C^/T^CATGTGG<^(^(^T^<^(^C?AAAAAGGCAACA riAGGTGCAACATTTGCATTTG-AA/GATCTATGTGGGATCTGCTGTGC
2. V1Jns-HA (A/Texas/36/91) 6.56 Kb
Sekwencja 5': Identyfikator Sekw, Nr 48) rTAGArC/TTAAGArTAAATG/AAAGrTACTAGTCCTGTTATGTTCA^TrACATGTAGATATTGA
Sekwencja 3': (Identyfikator Sekw. Nr 49)
CrGTrGGrTTrTTrGTCGCrGTTTTCAATGAGGTrTTGTATGTTrTGrAAT<TTTrGTTrGGA
TTTTGAATATGGArCrTAATGTTT/GATCTTGrTTTGGrr
178 626
3. V1Jns-HA (B/Panama/45/90 6.61 Kb
Sekwencja 5': (Identyfikator Sekw. Nr 50)
CCTTAGATC/GGTACAACCATGAAGGCAATAATTGTACTACTCATGGTAGTAACATCCAACG
CAGATCGAATCTGCACTGGGATAACATCTTCAAACTCACCTCATGTG
Sekwencja 3': Identyfikator Sekw. Nr 51)
TTGGCTGTAACATTGATGATAGCTATTrTTATrGTTTATATGGTCTCCAGAGACAATGTTTCTT
GCTCCATCTGTCTATAAATGTGG/GATCTGCTGTGCCTT
4. V1Jns-NP (A/Beijing/353/89) 6.42 Kb
Sekwencja 5': (Identyfikator Sekw Nr 52)
GTCCTTAGATC/CACCATGGCGTCCCAAGGCACCAAACGGTCTTATGAACAGATGGAAACT
GATGGGGAACGCCAGAATGCAACT
Sekwencja 3': (Identyfikator Sekw. Nr 53)
GAAAAGGCAACGAACCCGATCGTGCCCTCTTTTGACATGAGTAATGAAGGATCTTATTTCT
TCGGAGACAATGCAGAAGAGTACGACAATTAAG/GATCTGCTGTGCCT
5. V1Jns-M1 (A/Beijing/353/89) 5.62 Kb
Sekwencja 5': (Identyfikator Sekw. Nr 54)
CTTAGATC/CAGATCTACCATGAGTCTTCTAACCGAGGTCGAAACGTATGTTCTCTCTATCGT
TCCATCAGGCCCCCTCAAAGCCGAAATCGCGCAGAGACTTGAAGATGTCTTTGCTGGGAA
AAACACAGAT
Sekwencja 3': (Identyfikator Sekw. Nr 55)
GGGACTCATCCTAGCTCCAGTACTGGTCTAAAAGATGATCTTCTTGAAAATTTGCAGACCTA
TCAGAAACGAATGiGGGGTGCAGATGCAACGGTTCAAGTGAAGATCTATGTGG/GjATCTGCT
GTGCCTT
6. V1Jns-NP (B/Panama/45/90) 6.54 Kb
Sekwencja 5': ridentyfikator Sekw. Nr 56)
CTTAGATC/CACCATGTCCAACATGGATArrGACGGTATCAACACTGGGACAATTGACAAA
ACACCGGAAGAAATAACTTCT
Sekwencja 3': (idestyfikator Sekw. Nr 57)
GTTGAAATTCCAATDAAGCA GACCC ATCCCCAAATTCrrCTrrGGGAGGGACACAGCAGAGG ATTATGATGACCTCGAnATTAAG/GATCTGCTGTG
7. V1Jns-M1 (B/Panama/45/90) 5.61 Kb
Sekwencja 5': (Identyfikator Sekw. Nr 58)
CTTAGATC/CACCATGTCGCTGTTTGGAGACACAATTGCCTACCTGCTTTCATTGACAGAAG
ATGGAGAAGGCAAAGCAGAACTAGCAGAAAAATTA
Sekwencja 3': (Identyfikator Sekw. Nr 59)
AGATCTCrrGGGGCAAGTCAAGAGAATGGGGAAGGAATTGCAAAGGATGTGATGGAAGTG
CTAAAGCAGAGCTCTATGGGAAATTCAGCTCTTGTGAAGAAATACCTATAAG/GATCTGCTGTG
Przykład 6. Wektor ekspresyjny V1J o identyfikatorze sekw. Nr 10:
Przyczyną stworzenia wektora V1J było usunięcie elementów promotora i terminatora transkrypcji z wektora V1, w celu umiejscowienia ich w lepiej określonym kontekście, stworzenia bardziej zwartego wektora i polepszenia uzyskiwania oczyszczonego plazmidu.
V1J uzyskano z wektorów VI (patrz przykład 1) i pUC18, dostępnych w handlu. VI trawiono enzymami restrykcyjnymi Sspl i EcoRI tworząc dwa fragmenty DNA. Mniejszy z fragmentów zawierający element promotora CMVintA i terminatora transkrypcji wołowego hormonu wzrostu (BÓH) kontrolujące ekspresję heterologicznych genów (Identyfikator Sekw. Nr 11), oczyszczono z żelu agarozowego do elektroforezy. Końce tego fragmentu DNA zostały wypełnione przy użyciu polimerazy DNA T4 w celu polepszenia jego ligacji do innego fragmentu DNA o „tępych końcach”.
Jako zrębu wektora ekspresyjnego użyto pUC 18. Jest on znany z produkowania znacznych ilości plazmidu, jest dobrze scharakteryzowany pod względem sekwencji i funkcji oraz posiada minimalną wielkość. Usunięto z niego cały operon lac, niepotrzebny dla celów wynalazku i mogący mieć negatywny wpływ na ilość produkowanego plazmidu i ekspresję heterologicznego genu, przez częściowe trawienie enzymem restrykcyjnym Haell. Pozostały plazmid oczyszczono z żelu agarozowego do elektroforezy, wypełniono końce polimerazaDNA T4, traktowano
178 626 cielęcą fosfatazą alkaliczną jelitową i ligowano z elementem CMVintA/BGH opisanym powyżej. Uzyskano plazmidy przejawiające dwie możliwe orientacje elementów promotora w zrębie pUC. Jedna z nich dawała znacznie większąilość plazmidu w E. coli i została oznaczona V1J (Identyfikator Sekw. Nr 10). Strukturę tego wektora potwierdzono analizą sekwencji regionów połączeń a następnie wykazano, ze daje porównywalną lub wyższą ekspresję heterologicznych genów w porównaniu z V1.
Przykład 7. Konstrukty genów wirusa grypy w wektorze ekspresyjnym V1J.
Wiele z genów szczepu wirusa grypy A/PR/8/34 sklonowano do wektora ekspresyjnego V1J, który, jak to zaznaczono w przykładzie 4, daje poziomy ekspresji równe lub wyższe niz wektor VI. Sekwencje genu PR8 są znane i dostępne w bazie danych GENBANK. Każdy ze sklonowanych poniżej genów określono na żelu wielkość fragmentu klonowanego oraz dostarczono numer, pod którym jest umieszczony w GENBANK część sekwencji, z którą go porównywano. Metoda uzyskiwania tych genów ze szczepów wirusa, przykładowo z wirusa uzyskanego z ATCC (A/PR/8/34 jest oznaczony w ATCC jak VR-95, wiele innych szczepówjest również zdeponowanych w ATCC) opisana jest w przykładzie 5.
A. Wkl.onowanie Genów PR8 doVi^)f:
1. Gen NP
Gen NP sklonowano z pAPR501 (J. R Young, U. Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Schatzman i M. Rosenberg (1983) w „Origins of Pandemie Influenza Viruses”, wyd. W. G. Laver, (Elsevier, Amsterdam) str. 129-138). Wycięto go przez cięcie pAPR501 przy użyciu EcoRI, fragment oczyszczono na żelu i wypełniono końce polimerazą GNA T4. Fragment wprowadzono do wektora V1J przeciętego Bg1ll i traktowanego polimerazą DNA T4. Klonowany fragment miał wielkość 1.6 Kb.
2. NS
Gen NS sklonowano z pAPR801 (J. F. Young, U. Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Schatzman i M. Rosenberg (1983) w „Origins ofPandemie Influenza Viruses”, wyd. W. G. Laver, (Elsevier, Amsterdam) str. 129-138). Wycięto go przez cięcie pAPR801 przy użyciu EcoRI, fragment oczyszczono na żelu i wypełniono końce polimerazą DNA T4. Fragment wprowadzono do wektora VIJ przeciętego Bg1ll traktowanego polimerazą DNA T4. Klonowany fragment miał wielkość 0.9 Kb. (Kompletny region kodujący NS zawierający NSI i NS2).
3. HA
Gen HA sklonowano z pJZ102 (J. F. Young, U. Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Schatzman i M. Rosenberg ( 1983) w „Origins ofPandemie Influenza Viruses”, wyd. W. G. Laver, (Elsevier, Amsterdam) str. 129-138). Wycięto go przez cięcie pJZ102 przy użyciu Hindlll, fragment oczyszczono na żelu i wypełniono końce polimerazą DNA T4. Fragment wprowadzono do wektora V1J przeciętego Bg1ll i traktowanego polimerazą DNA T4. Klonowany fragment miał wielkość 1.75 Kb.
4. PB1
Gen PB 1 sklonowano z pGEM1-PB 1 (miejsca połączeń 5' i 3' tych genów z wektorem sekwencjonowano w ceiu potwierdzenia tożsamości. Patrz J. F. Young, U. Desselberber, P. Graves, P. Palese, A. Schatzman i M. Rosenberg (1983) w „Origins ofPandemie Influenza Viruses”, wyd. W. G. Laver, (Elsevier, Amsterdam) str. 129-138). Wycięto go przez cięcie pGEMl-PBl przy użyciu Hindlll, fragment oczyszczono na żelu i wypełniono końce polimerazą DNA T4. Fragment wprowadzono do wektora V1J przeciętego Bg1ll i traktowanego polimerazą DNA T4. Klonowany fragment miał wielkość 2.3 Kb.
5. PB2
Gen PB2 sklonowano z pGEM 1-PB2 (miejsca połączeń 5' i 3' tych genów z wektorem sekwencjonowano w celu potwierdzenia tożsamości. Patrz J. F. Young, U. Desselberber, P. Graves,
P Palese, A. Schatzman i M. Rosenberg ( 1983) w „Origins ofPandemie Influenza Viruses”, wyd.
W. G. Laver, (Elsevier, Amsterdam) str. 129-138). Wycięto go przez cięcie pGEM1-PB2 przy użyciu BamHI i oczyszczono fragment na żelu. Fragment o „lepkich końcach” wprowadzono do
178 626 wektora V1J przeciętego Bg1ll i traktowano polimerazą DNA T4. Klonowany fragment miał wielkość 2.3 Kb.
6. ML
Gen Ml wytworzono przez PCR z plazmidu p8901 MITE. Sekwencję M tego plazmidu wytworzono przez PCR z pAPR701 (J. F. Young, U. Desselberber, P Graves, P Palese, A Schatzman i M. Rosenberg (1983) w „Origins ofPandemic Influenza Viruses”, wyd. W. G. Laver, (Elseviei; Anstercdm) sir. 129-138), przy użyciu oligomerów 5'-GGTACAAGATCTACCATGCTTCTAACCGAGGTC-3', Identyfikator Sekw. Nr 3, jako starter „sensowny” i 5'-CCACATAGATCTTCACTTGAA CCGTTGCATCTGCAC-3' Identyfikator Sekw. Nr 4, jako starter „antysensowny”. Produkt PCR oczyszczony został na żelu i wprowadzony do wektora V1J przeciętego Bg1II. Klonowany fragment miał wielkość 0.7 Kb. Koniec aminowy kodowanego Ml kodowany jest w starterze „sensownym” pokazanym powyżej jako kodon „ATG” podczas gdy kodon stop translacji Ml kodowany jest przez odwrotność kodonu „TCA”, który w kierunku sensownym tworzy kodon stop „TGA”.
B. Konstrukty Ekspresyjne Gen Wirusa Grypy-V1J:
W każdym przypadku, pokazana jest sekwencja połączenia z regionem promotora na końcu 5' (CMVintA) w klonowanym genie. Sekwencje uzyskano przez sekwencjonowanie starterem CMVintA 5'- CTAACAGACTGTTCCTTTCCATG-3', o Identyfikatorze Sekw. Nr 28, sekwencjonującym sekwencję kodującą. Pozycję, w której występuje połączenie oznaczono przez co nie oznacza żadnej nieciągłości w sekwencji. Sposób przygotowania konstruktów podsumowany jest, po wszystkich sekwencjach, poniżej. Każda z zamieszczonych sekwencji przedstawia kompletny, dostępny i możliwy do ekspresji konstrukt określonego genu wirusa grypy.
Każdy z konstruktów transfekowano przejściowo do komórek RD (ATCC CCL136), ludzkiej linii komórkowej rhabdomyosarkomy w hodowli. Czterdzieści osiem godzin po transfekcji komórki zebrano, poddano lizie, i wykonano analizę met. western blot (z wyjątkiem konstruktu V1J-PR-HA, który był badany na myszach i wzbudził swoiste przeciwciała anty-HA zanim dokonano analizy western blot, co spowodowało, że test ten stał się niepotrzebny, ponieważ obserwowano ekspresję in vivo). Przeciwciała swoiste wobec białek PB1, PB2 i NS uzyskano od Stephena Inglisa z University of Cambridge, który używał oczyszczonych białek ekspresjonowanych jako białka fuzyjne w połączeniu z β-galaktozydaząw celu wytworzenia surowic poliklonalnych. Surowica poliklonalna anty-NP wytworzona została przez immunizację królików całym wirusem A/PR/8/34. Przeciwciało anty-M1 dostępnejest w handlu z f-my Biodesignjako surowica kozia przeciw-grypowa typu A, Nr kat. B65245G. W każdym przypadku, obserwowano białko o przewidywanej wielkości, potwierdzające ekspresję in vitro kodowanych białek wirusowych.
Nomenklatura tych konstruktów jest zgodna z następującą konwencją: „Nazwa wektora-szczep grypy-gen”. W każdym przypadku sekwencję sprawdzano ze znaną sekwencją z GENBANK dla sklonowanych i sekwencjonowanych sekwencji genów A/PR/8/34. Efektywność biologiczna każdego z konstruktów zademonstrowana jest jak w przykładzie 2, 3 i 4 powyżej:
Sekwencja połączenia 5' CMVintA i genów szczepu A/PR/8/34:
1. V1J-PR-NP, IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 12: GENEBANK Nr: M38279 5'GTCACCGTCCTTAGATC/AATrCCAGCAAAAGCAGGGTAGATAATCACTCACTGAGTGACA TCAAAATCATG
2. V1J-PR-PB1. IDENTYFIKATOR SEKW, Nr 13: GENEBANK Nr: J02151 SACCGTCCTTAGATC/AGCTrGGCAAAAGCAGGCAAACCATTTGAATGGATGTCAATCCGA CCTTACTTTTCTTAAAAGTGCCAGCACAAAATGCTATAAGCACAACTTTCCC—ATAC
3. V1J-PR-NS. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 14; GENEBANK Nr: J02150 yGTCACCGTCCTTAGATC/AArrcCAGCAAAAGCAGGGTGACAAAAACATAATGGATCCAA ACACTGTGTCAAGCTTTCAGGTAGATTGCTTTCTTTGGCATGTCCGCAAACGAGTTGCAGA CCAAGAACTAGGTGAT . V1J-PR-HA. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 15: GENEBANK Nr: J02143 yTCTGCAGTCACCGTCCTTAGATC/AGCTTGGAGCAAAAGCAGGGGAAAATAAAAACAAC CAAAATGAAGGGAAACCTACTGGTCCTGTTAAGTGCACTTGCAGCTGCAGATGCAGACAC AATATGTATAGGGTACCATGCGAACAATTCAACC
178 626
5. Y1J-PR-PB2, IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 16: GENEBANK Nr: J02153 5TTTTCTGCAGTCACCGTCCTTAGATC/CCGAATTCCAGCAAAAGCAGGTCAATTATATTCAA TATGGAAAGAATAAAAGAACTAAGAAATCTAATGTCGCAGTCTGCCACCCCGGAGATACT CACAAAAACCA^CCC^I^(3(j/^C^C/aATGGCCATAAT<^yAAGAAGT
6. Y1J-PR-M1. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 17: GENEBANK Nr: J02145 5'GTCACCCTCCIΊACATCT/ACCATGACTC'TTCTAACCGAGCTCGAAACCTACGTACTCICT ATCATCCCGTCAGCCCCCCICAAACCCGAGA'ICGCACACACACTTGAAGACTICACC GAAGA
Jak łączono fragmenty:
1. V1J-PR-NP: „tępy” Bglll (wektor) z „tępym” EcoRI (NP)
2. V1J-PR-PB1: „tępy” Bg1Il (wektor) z „tępym” Hidlll (PB1)
3. V1J-PR-NS: „tępy” Bgłll (wektor) z „tępym” EcoRI (NS)
4. V1J-PR-HA: „tępy” Bg1ll (wektor) z „tępym” Hindlll (HA)
5. V1J-PR-PB2: „lepki” Bg1II (wektor) z „lepkim” BamHI (PB2)
6. V1J-PR-M1: „lepki” BgH (wektor) z „lepkim” Bg1ll (Ml)
Ml uzyskano przez PCR, z użyciem p8901-MlTE jako matrycy i starterów, które dodawały miejsce Bg1ll na obu końcach i zaczynały się 3 zasady przed ATG i kończyły się też za kodonem stop dla M1 (TGA).
Przykład 8. Wektor ekspresyjny VI Jneoo Identyfikatorze sekw. Nr 18:
Ponieważ ampicylina nie może być stosowana w fermentatorach o dużej objętości, koniecznym było usunięcie genu amp', używanego do selekcji przy użyciu antybiotyków bakterii niosących V1J. Gen amp', ze zrębu pUC plazmidu V1J, usunięto przez trawienie enzymami restrykcyjnymi Sspl i Eaml 1051. Pozostały plazmid oczyszczono przez elektroforezę na żelu agarozowym, wypełniono końce polimerazą DNA T4, i traktowano cielęcą jelitową fosfatazą alkaliczną. Dostępny w handlu gen kan', uzyskany z transpozonu 903 i zawarty w plazmidzie pUC4K, wycięto przez trawienie enzymem restrykcyjnym Pstl, oczyszczono przez elektroforezę na żelu agarozowym, wypełniono końce polimerazą DNA T4, i traktowano cielęcąjelitową fosfatazą alkaliczną. Fragment ten ligowano do szkieletu VIJ a uzyskane plazmidy o genie kan' w obu orientacjach oznaczono VI Jneo# 1 i 3. Każdy z tych plazmidów potwierdzono analizą trawieniem restrykcyjnym, sekwencjonowaniem DNA regionów połączeń i stwierdzono, że produkują podobne ilości plazmidu jak V1J. Ekspresja produktów genów heterologicznych, wektorów VłJneo, była również porównywalna do wektora V1J. Arbitralnie wybrano V1Jneo#3, oznaczony dalej jak V1 Jeno (Identyfikator Sekw. Nr 18), zawierający gen kan' w tej samej orientacji co gen amp' w V1J, jako konstrukt ekspresyjny.
Geny z każdego ze szczepów A/Beijing/353/89, A/Texas/36/91 i B/Panama/46/90 sklonowano do wektora=a V1 Jneo jako cDNA. W każdym przypadku sekwencje połączeń z końca 5' promotora (CMVintA) do klonowanego genu były sekwencjonowane z użyciem startera CMVintA: 5'CTAACAGACTGTTCCTTTCCATG3', Identyfikator Sekw. Nr 28, generującym sekwencję sekwencji kodującej. Jest ona ciągła z sekwencją kodującą terminator, której połączenie również pokazano. Sekwencję tą wygenerowano przy użyciu startera BGH: 5'GGAGTGGCACCTTCCAGG3', Identyfikator Sekw. Nr 29, który generował sekwencję nici nie kodującej. W każdym przypadku sekwencję sprawdzano w stosunku do znanych sekwencji z GENBANK sklonowanych i sekwencjonowanych genów z tego i innych izolatów wirusa. Pozycję, w której występuje połączenie oznaczono prrez co nie oznacza żadnej nieciągłości w sekwencji. W przypadku połączenia w V1Jneo-TX-HA żel sekwencyjny był ściśnięty i początkowa sekwencja była trudna do odczytania. Stąd, pierwsze 8 zasad połączenia oznaczono przez „N”. Nukleotydy te zostały potwierdzone i określone jako nukleotydy identyczne z dostępną sekwencją. Nomenklatura tych konstruktów jest zgodna z następującą konwencją: „Nazwa wektora-szczep grypy-gen”. Efektywność biologiczna każdego z konstruktów zademonstrowana jest jak w przykładach 2, 3 i 4, powyżej:
SEKWENCJA KOŃCA 5' POŁĄCZENIA CMVintA I GENÓW WIRUSA GRYPY I
KOŃCA 3' POŁĄCZENIA GENÓW WIRUSA GRYPY I TERMINATORA EKSPRESJI GBH,
RÓŻNYCH SZCZEPÓW GRYPY I BIAŁEK.
178 626
l. A/BEIJING/353/89
A. VU'nto-BJ-NP:
PROMOTOR. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 20:
5' TCACCGTCCTTAGATC/AAGCAGGGTTAATAATCACTCACTGAGTCACATCAAAATCATGG CGTCCCjAAGGCACCAAACGGTCTTAT<^?AACJAGATGGAAACTGATGGGGAACGCCAGATr
TERMINATOR. IDENTYFIKATOR SEKW, Nr 21:
5' GAGGGGCAAAC.AACAGATGGCTGGCAACTAGAAGGCACAGCAGATATTTTTrccnAzY^ GTCGTAC
II. A/TEXAS/36/91
A. VI Jneo-TX-HA
PROMOTOR. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 24:
5' CCTTAGATC/GGAAAAAAAAaACAACAACCAAAATGAAAGCAAAACTACTAGTCC
TERMINATOR. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 25:
5' GCAGATC/CTTATAmCTGAAATTCTGGTCTCAGAT
m. B/PANAMA/46/90
A. V! Jneo-PA-HA
PROMOTOR. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 26: Pierwsze 1080 zasad tej sekwencji dostępne jest w GENBANK pod numerem M65171: sekwencja uzyskana poniżej jest identyczna ze znana sekwencja: sekwencja końa 3' Identyfikator Sekw. Nr 27 (poniżej) nie została do tej pory opisana
5'ACCGTCmAGACGCAGYAGCAGACCAJTTTCTAAOArCCACAAAATGAAGGCAATAATT GTACTACTCATGGTAGTAACATCCAACGCAGATCGAATCTGC
TERMINATOR. IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 27:
5' GGCACAGCAGATC/TTTCAATAACGTTTCTTTGTAATGGTAAC
Przykład 9.
Śródskórne wstrzyknięcie genów wirusa grypy:
Protokół śródskómego wprowadzania genów był taki sam jak dla wprowadzania domięśniowego: trzy wstrzyknięcia po 200 pg, co trzy tygodnie, plazmidu V1 -PR-NP. Śledziony pobrano do testu in vitro 55 dni po trzecim wstrzyknięciu i restymulowano nonapeptydowym epitopem nukleoproteiny 147-155, Identyfikator Sekw. Nr 9. Komórki docelowe (P815, mysia mastocytomy, syngeniczna z myszami BALB/c H-2d), zakażono heterologicznym wirusem A/Victoria/73 i badano lizę swoistą przy użyciu splenocytówjako komórek efektorowych w stosunku efektorów do komórek docelowych w zakresie od 5:1 do 40:1. Kontrole negatywne przeprowadzono przez pomiar lizy komórek docelowych nie zakażonych wirusem grypy. Kontrole pozytywne przeprowadzono przez pomiar lizy komórek docelowych zakażonych wirusem grypy przez splenocyty od myszy, które otrzymały trzy wstrzyknięcia po 130 μg V1-PR-NP i przezyły zakażenie żywym wirusem grypy szczepu A/HK/68.
Wyniki: lizę swoistą uzyskano przy użyciu splenocytów od myszy, które otrzymały śródskóme wstrzyknięcie, przy wszystkich z użytych stosunkach efektorów do komórek docelowych. Nie obserwowano lizy gdy używano jako komórek efektorowych splenocytów uzyskanych od myszy nienastrzykniętych lub nastrzykniętych wektorem V1 bez wprowadzonego genu PR-NP. Dodatkowo, liza swoista uzyskana przy użyciu śródskómej drogi podania była porównywalna, przy wszystkich użytych stosunkach efektorów do komórek docelowych, do wyników uzyskanych przy użyciu podawania domięśniowego. Mierzono również miana wirusa w płucach u myszy otrzymuj ących wstrzyknięcia śródskóme i domięśniowe. Przy użyciu 5 myszy na grupę, 3 x 200 μg na dawkę, w odstępach trzytygodniowych i ekspozycji 3 tygodnie po ostatniej dawce uzyskano wyniki przedstawione poniżej:
178 626
Szczepionka Sposób podania Miano wirusa w płucach
dzień 5 dzień 7
V1-PR-NP śródskórnie 5.2±0 2 4.14=1*
VI śródskórnie 5.9±1 6.6±0.3
V1-PR-NP domięśniowo 4.6±0.4 4.5±1.Γ
Nic - 6.2±0.3 5.9±0.3
* Średni log miana ± SEM ** U jednej z myszy nie wykryto wirusa w ogóle.
Na koniec, badano odsetek przeżywalności przez dwadzieścia osiem dni. Dnia dwudziestego ósmego, spośród myszy, które otrzymały V1-PR-NP przeżyło 89%, które otrzymywały wstrzyknięcia i.m. i 50%, które otrzymywały wstrzyknięcia i.d. Nie przeżyła żadna spośród myszy otrzymujących sam wektor V1 i tylko 30% myszy nie traktowanych niczym. Doświadczenie to pokazuje, że DNA kodujący nukleoproteinę szczepu A/PR/8/34 był zdolny do indukowania CTL, które rozpoznawały nukleoproteinę heterologicznego szczepu A/Victoria/73, oraz ochronną odpowiedź odpornościową przeciwko heterologicznemu szczepowi A/HK/68.
Przykład 10. Szceepieni e naceelnych oolinukleotdeem
1. Przeciwciała przeciwko NP u rezusów: Rezusy (006 NP, 009 NP lub kontrola 101; 021) otrzymały wstrzyknięcia 1 mg/miejsce RSV-NP i.m. w trzy miejsca dnia 1. Wstrzyknięcia po 1 mg każdego z konstruktów RSV-LUX i CMV-int-LUX, konstruktorów ekspresjoenjącycC reporterowy gen lncyferacy świetlika, podano w tym samym czasie w różne miejsca. Zwierzętom podano ponowne wstrzyknięcie dnia 15 używając tej samej ilości DNA jak poprzednio oraz dodatkowo 1 mg pD5-CAT, konstruktu do ekspresji genu repertcrowege acetylotransferazy cCleramfenrkolowcj, każde w osobne miejsce. Miejsca w mięśniach, w które podano geny reporterowe pobrano drogą biopsji i badano na aktywność genów rcporterowycC. Surowicę pobierano 3, 5, 9, 11, 13 i 15 tygodni po pierwszym wstrzyknięciu. Pierwsza pozytywna próbka na przeciwciała anty-NP pobrana została w tygodniu 11 oraz również pozytywne próbki pobierano w tygodniach 13 i 15. Przeciwciała anty-NP oznaczano w teście ELISA. Wyniki pokazane są w figurze 9.
2. Przeciwciała hamujące Hemaglutynmę (HI) u rezusów: Małpom podano wstrzyknięcia
i.m. V1-PR-HA dnia 1. Dwa zwierzęta otrzymały po 1 mg, 100 pg lub 10 pg DNA w każdy z mięśni zzworogłowycC. Każde wstrzyknięcie podano w objętości 0.5 ml. Zwierzętom pobrano krew dnia 1 przed wstrzyknięciem. Wszystkim zwierzętom podano powtórnie DNA w dniu 15 i pobierano krew w odstępach 2-4 tygodniowych. Miana zahamowania Cemaglutyeiey (HI) w stosunku do A/PR/8/34 były pozytywne w 5 tygodni, 9 tygodni i 12 tygodni po pierwszym wstrzyknięciu DNA dla V1J-PR-HA. Wyniki przedstawiono poniżej w tabeli 10-1:
Tabela 10-1
Miana przeciwciał HI rezusów otrzymujących Y1J-PR-HA
REZUS# DAWKA MIANO PZECIWCIAŁ HI W TYGODNIU #
PRZED 3 TYG. 5 TYDZ. 9TYDZ. 12TYDZ.
88-010 1 mg <10 <10 320 320 320
88-0200 <10 <10 <10 40 40
88-021 100 pg <10 <10 <10 40 20
90-026 <10 <10 20 20 40
88-084 10 pg <10 20 40 20 10
90-028 <10 <10 20 <10 <10
178 626
Przykład 11. Badania nad szczepionką polinukleotydową na fretkach.
1. Zapoczątkowano badania nad szczepieniem polinukleotydami fretek, w celu określenia, czy zwierzęta mogą być chronione przed zakażeniem wirusem grypy typu A przez immunizację genami kodującymi HA (białko powierzchniowe zdolne do indukowania szczepowo-swoistych przeciwciał neutralizujących), bądź białko wewnętrzne NP, NS1, PB1, M (uważane za indukujące odpowiedź odpornościową zależną od komórek, która jest szczepowo-niezależna). Zwierzętom wstrzyknięto DNA kodujący różne geny wirusa grypy w wektorze V1J tak jak to pokazano poniżej:
Tabela 11-1
Grapa Konstrukt Dawka Liczba zwierząt immunizowanych Ekspoz. H1N1 Ekspoz. H3N2
1 V1J-HA 1000 mg 16 8 8
2 V1J-NP 1000 mg 16 8 8
3 V1J-NP+NS1+PB1+M 2000 mg całk. 16 8 8
4 V1J-HA+ NP+NS1+PB1+PB2+M 2000 mg calk. 16 8 8
5 V1J- 1000 mg 16 8 8
6 nic - 10 5 5
Całk. liczba zwierząt 90 45 45
2. W dniach 22 i 43 po immunizacji, pobierano surowice od zwierząt immunizowanych i badano w kierunku przeciwciał neutralizujących (zahamowanie hemaglutynacji - HI) i przeciwciał przeciwko nukleoproteinie (NP) testem ELISA. Zwierzętom podawano wstrzyknięcia DNA wywołującego przeciwciała przeciwko odpowiednim genom. Odzwierciedlająto figury 10,11 i 16.
3. Dnia 128, wybrane zwierzęta poddano ekspozycji na 1200 TCID50 wirusa grypy szczepu A/HK/68. Szczep ten jest heterologiczny do szczepu A/PR/8/34, który był źródłem sekwencji kodujących użytych do immunizacji i stąd ochrona świadczy o odporności opartej na zależnej od komórek, szczepowo-niezależnych mechanizmach odpornościowych. Jak to pokazano w dołączonej figurze 12, obserwowano istotne statystycznie zmniejszenie uwalniania wirusa w porównaniu z kontrolą u zwierząt immunizowanych DNA kodującym białka wewnętrzne, co potwierdza, że immunizacja polinukleotydami jest zdolna do wywołania odpowiedzi odpornościowej u fretek i, że taka odpowiedź jest ochronna.
4. Ekspozycję na homologiczny szczep A/PR/8/34 badano podobnie i wykazano podobnie efektywność ochronnąprzeciwciał neutralizujących wywołanych przez szczepienie polinukleotydami.
Przykład 12. Wytwarzanie V1Jns.
W celu polepszenia badania integracji dodano miejsce Sfil w V1Jneo. Dostępny w handlu łącznik Sfil, długości 13 par zasad (New England BioLabs), dodany został w miejscu KpnI, w sekwencji BGH wektora. V1Jneo linearyzowano przy użyciu KpnI, oczyszczono na żelu, wypełniono polimeraząDNA T4 i ligowano do posiadającego „tępe końce” łącznika Sfil. Przez mapowanie restrykcyjne wybrano izolaty klonalne i potwierdzono przez sekwencjonowanie przez łącznik. Nowy wektor oznaczono VIJns (figura 17). Ekspresja heterologicznych genów w V1Jns (z Sfil) była porównywalna z ekspresją tych samych genów w V1Jneo (z KpnI).
Przykład 13. Immunogenność
1. Odpowiedź odpornościowa humoralna
Wstrzyknięcie DNA kodującego HA, NP i M1 wirusa grypy, spowodowało humoralnąodpowiedź odpornościową u myszy, fretek oraz naczelnych (włączywszy afrykańskie małpy zielone i rezusy). Do tej pory wykazano, że PNV zawierające geny HA klonowane ze szczepów
178 626 wirusa grypy A/PR/34, B/Panama^, T/Beijińg/89, A/Texas/91, A/Hawaii/91 i A/Georgia/93 wywołuj ą przeciwciała.
a) Myszy: Wykryto testem ELISA przeciwciała przeciwko NP i Ml w surowicach myszy po wstrzyknięciu DNA. Znaczne miana przeciwciał (104-106) wywołane zostały przez ilość rzędu 1 pg DNA dla NP (A/PR/34), podanego raz (najmniejsza dawka badana), narastając w ciągu dwóch tygodni po wstrzyknięciu (najwcześniejszy badany punkt czasowy) i nie zmniejszyły się przez co najmniej 6 miesięcy po wstrzyknięciu. Przeciwciała przeciwko NP nie są neutralizujące i nie uczestniczą w ochronie. Pokazują jednakże, ekspresję białka NP in vivo po wstrzyknięciu DNA. W przeciwieństwie do powyższego, przeciwciała przeciwko HA zapewniają odporność ochronną przeciwko homologicznym szczepom wirusa grypy. Wstrzyknięcie DNA dla HA sklonowanego ze szczepu A/PR/34 spowodowało produkcję przeciwciał neutralizujących, co mierzono in vitro, w teście zahamowania hemaglutynacji (HI). Miana HI >1280 stwierdzano u wielu myszy, którym podano trzy dawki po 100 pg DNA dla HA oraz obserwowano mierzalne miana u kilku zwierząt, które otrzymały zaledwie dwie dawki po 0.1 pg. Istniała zależność od dawki pomiędzy mianem HI i dawką DNA, jak również między mianem HI i liczbą wstrzyknięć (tabela 13-1):
Tabela 13-1
Wywoływanie odpowiedzi odpornościowej humoralnej u myszy (GMT HI)
Dawka (pg) GMT HI
Liczba dawek
1 2 3
DNA dla HA (100) 75 106 260
DNA dla HA (10) 37 69 86
DNA dla HA (1) <10* 13 24
DNA dla HA (0.1) <10b <10* <10*
DNA kontrolny (100) nienastrzyknięte <10b <10b <1Qb <10b
Tabela 13-1: Samicom myszy BALB/c (4-6 tygodni) wstrzyknięto DNA dla HA (VIJHA) w zaznaczonej dawce raz, dwa lub trzy razy w odstępach trzytygodniowych. Kontrole negatywne obejmowały myszy, którym podano kontrolny DNA składający się z wektora bez wstawki genu oraz myszy, którym nic nie podawano, i które nie miały dotąd kontaktu z antygenem. Próbki surowic pobierano w siedem tygodni po pierwszej dawce i badano na obecność przeciwciał hamujących hemaglutynację (HI). Dane przedstawiono jako średnią geometryczną miana HI, gdzie n=10.
a niektóre ze zwierząt były pozytywne w badaniu na miana HI b wszystkie zwierzęta.
U każdej z badanych myszy obecność przeciwciał HI korelowała z ochronią w modelu ekspozycji na wirusa homologicznego. Odpowiedź przeciwciał HI u myszy, którym wstrzyknięto DnA dla HA (A/PR/34) pozostawała praktycznie niezmieniona przez co najmniej sześć miesięcy. Przeciwciała anty-HA, mierzone testem ELISA powstawały również u myszy pod wpływem DNA dla HA ze szczepów wirusa grypy A/Beijmg/89, B/Panama/90 i A/Texas/91.
W oparciu o doniesienia z literatury pokazujące mniejszą ekspresję genu reporterowego u starszych myszy po wstrzyknięciu DNA, badano wpływ wieku na odpowiedź odpomościowąhumoralną na HA. Ze względu na brak dostępności starych dziewiczych samic myszy, użyto starych myszy rodzicielskich w wieku około 10 miesięcy. Stare myszy rodzicielskie oraz 4-6 tygodniowe myszy dziewicze porównywano pod względem ich zdolności tworzenia przeciwciał przeciwko HA. Myszy starsze zdolne były do tworzenia przeciwciał przeciwko HA po
178 626 wstrzyknięciu DNA dla HA w dawce zaledwie 1 pg (najniższa dawka badana), ale o mianach nizszych niż myszy młodsze (Tabela 13-II).
Tabela 13-11
Wpływ wieku na odpowiedź odpornościową humoralną
Szczepionka Dawka (pg) GMT (4-6 tyg.) GMT (10 m-cy)
DNA dla HA 100 1034 110
DNA dla HA 10 338 68
DNA dla HA 1 80 20
DNA kontrolny 100 <5’ <5‘
Nienastrzyknięte - <5’ <5’
Zakażone grypą - 538 36
Tabela 13-1: Samicom myszy BALB/c (4-6 tygodniowe myszy dziewicze lub 10 m-cy stare myszy rodzicielskie) wstrzyknięto DNA dla HA szczepu A/PR/34 (V1JHA) w zaznaczonej dawce trzy razy w odstępach trzytygodniowych. Kontrole negatywne obejmowały myszy, którym podano kontrolny DNA (V1J) oraz myszy, którym nic nie podawano, i które nie miały dotąd kontaktu z antygenem. Dla porównania inne myszy zarażono subletalną dawką wirusa A/PR/34. Próbki surowic pobierano w dziewięć tygodni po pierwszej dawce i badano na obecność przeciwciał hamujących hemaglutynację (HI). Dane przedstawiono jako średnią geometryczną miana HI gdzie n=15.
a wszystkie ze zwierząt były negatywne w badaniu na miana HI
Jednakże nie był to wynik dotyczący wyłącznie PNV a raczej zmniejszonej możliwości starych myszy do generowania odpowiedzi odpornościowej humoralnej w ogóle, ponieważ starsze myszy przejawiają również słabszą odpowiedź HI, w porównaniu z młodymi myszami, po zakażeniu żywym wirusem A/PR/34. W rzeczywistości, przeciwciała HI wydają się być mniej zaburzone u szczepionych DNA myszy starszych niż starszych myszy zakażonych wirusem grypy. Ponadto, stare myszy rodzicielskie, użyte w doświadczeniu były około 50% cięzsze w porównaniu z typowymi myszami dziewiczymi w tym samym wieku, co w oparciu o badania innych z użyciem diet ograniczaj ących kalorie może wywierać u myszy negatywny wpływ na odpowiedź odpornościową. Z tego oraz innych powodów odpowiedź odpornościowa u tych myszy może nie być reprezentatywna. Mimo tego, wiek (powyżej 10 miesięcy) nie wydaje się znacząco zmniejszać zdolności szczepienia polinukleotydami do wywoływania humoralnej odpowiedzi odpornościowej, nawet w dawkach rzędu 1 pg.
b) Fretki: Wywołano odpowiedź odpornościową humoralną u fretek, którym wstrzyknięto DNA dla HA ze szczepów wirusa grypy A/PR/34, A/Beijing/89, A/Hawaii/91 i A/Georgia/93. Przeciwciała HI przeciwko A/PR/34 i przeciwciała ELISA przeciwko HA z różnych szczepów wywołane zostały odpowiednim PNV, Stwierdzono, że w surowicach od fretek, którym wstrzyknięto DNA dla HA z A/Beijing/89, A/Hawaii/91 i A/Georgia/93 stwierdza się przeciwciała HI i przeciwciała neutralizujące, ponieważ zwierzęta te chronione były przed ekspozycjąna wirusa.
c) Naczelne: (Patrz wyżej, przykład 10). Rezusy immunizowano dwukrotnie przy użyciu DNA dla HA (A/PR/34) w dawkach 10,100 i 1000 pg na łapę. Miana HI do 320 stwierdzono u zwierząt, które otrzymały dawki 100 i 1000 pg oraz miano HI 80 u jednego z dwóch zwierząt, które otrzymały dawkę 10 pg. Jak dotąd, surowice badane były przez 13 miesięcy; miana HI nie opadały znacząco od 6-13 miesięcy (tablica 13-III):
178 626
Tabela 13-III
Wytwarzanie przeciwciał HI u Rezusów
Dawka (pg) przed 1 m-c. 2 m-c. 5.5 m-ca. 13 m-cy.
2000 <10 640 160 160 80
2000 <10 40 20 20 20
200 <10 80 40 40 80
200 <10 80 40 40 20
20 <10 40 20 20 20
20 <10 <10 <10 <10 <10
Tabela 13-III: Rezusy (zarówno samce jak i samice) ważące od 4.3 do 8.8 kg otrzymały wstrzyknięcia DNA dla HA A/PR/34 (V1JHA) w ocelazcoeyzC dawkach w tygodniu 0 i 2. P’r^ć)t^kżi surowic pobierano w oznaczonym czasie po podaniu pierwszej dawki i badano na miano HI. Dane przedstawiają miana HI dla poszczególnych zwierząt.
U afrykańskich małp zielonych, którym wstrzyknięto kombinację PNV zawierającą 100 pg DNA (A/Bcijieg/89) badanie surowic 4-6 tygodni po pierwszej dawce wykazało GMT równe 29 (8 na 9 odpowiedzi). Przedstawia się to korzystnie w porównaniu z lizencjeeowaną szczepionką cawierającąpodjcdnostkę wirionu (GMT równe 16, 5/6 odpowiedzi) i licencjonowaną szczepionką zawierającą cały wirion (GMT równe 36, 6/6 odpowiedzi) w tym samym punkcie czasowym (figura 18). Obserwowano znaczny efekt dawki przypominającej, po drugiej immunizacji, u zwierząt otrzymujących dawkę 10 pg DNA dla HA (GMT równe 1.9 po pierwszej dawce i 199 po dwóch dawkach). Licencjonowana szczepionka zawierająca cały wirion przejawiała podobny efekt dawki przypominającej, podczas gdy miana HI wywołane przez podanie drugiej dawki szczepionki zawierającej podjedeosOkę wirionu były jedynie przejściowe. Do tej pory podobne poziomy przeciwciał HI oznaczane są od 18 tygodni u zwierząt immunizowaeyzh dawkami 10 pg oraz 100 pg DNA dla HA w porównaniu z najlepszą licencjonowaną szczepionką (cały wirion). Wyniki te pokazują, że PNV było przynajmniej tak efektywne w wywoływaniu przeciwciał neutralizujących jak szczepionka oparta na całym wirionie i lepsze niż szczepionka zawierająca podjednostkę wirionu. Szczepionki oparte na oczyszczonej poajedeesOcc nie były oznaczalnie immunogenne dla myszy; ale nie testowano ich na naczelnych. W tym doświadczeniu PNV zawierało 5-walentnąmicscaeinę DNA kodujących HA ze szczepów A/Beijing/89, B/Panama/90 i A/Texas/91 oraz NP i M1 z A/PR/34 tak by przypominało potencjalną szczepionkę. Badano również u tych zwierząt wywoływanie odpowiedzi odpornościowej humoralnej przeciwko innym składnikom szczepionki i wykryto przeciwciała przeciwko HA z B/Panama/90 i NP z A/PR/34. W osobnym doświadczeniu wywoływano zarówno HI jak i przeciwciała neutralizujące przeciwko HA z A/Texas/91, przez wstrzyknięcie dwóch dawek klonowanego przez PCR DNA dla HA.
2. Odpowiedź odpornościowa komórkowa. Patrz przykład 3, po wyżej.
3. Wywoływanie odpowiedzi odpornościowej
a) Odporność humoralna: Nie są wyjaśnione zjawiska prowadzące do wywoływania odpowiedzi odpornościowej humoralnej i komórkowej. By wywołać powstawanie przeciwciał (np. przeciwko Ha wirusa grypy), wydaje się, że komórki muszą ekspresjonować antygen na powierzchni błony komórkowej lub wydzielać do środowiska zcweątrckemórkowcge, Dodatkowo, transfekowane komórki powinny ekspresjonować HA o drngercędowej, trzeciorzędowej i czwartorzędowej strukturze podobnej do występującej w wirionie. W teście tworzenia rozetek, wykazano ekspresję powierzchniową HA w komórkach RD (rCabdomresarkoma, pochodzenia mioblastoidalnege) traesfckowaeycC przemijająco DNA dla HA. Erytrocyty aglutynowane na powierzchni komórek transfekowanych HA, ale nie traesfekowanycC pustym wektorem, wskazują, że HA była nie tylko ekspresjonowana na powierzchni ale również posiadała odpowiednią konformację do wiązania białek zawierających kwas sialowy.
178 626
b) Odporność komórkowa: wywoływanie odpowiedzi odpornościowej komórkowej (np. przeciwko NP wirusa grypy) wymaga obróbki proteolitycznej i prezentacji uzyskanych po niej peptydów w połączeniu z cząsteczkami MHC klasy I. Nie znana jest natura komórek prezentujących antygen, prowadzących do wywołania odpowiedzi odpornościowej po wstrzyknięciu DNA. Komórki mięśniowe ekspresjonująniski poziom MHC klasy I i, jak się uważa, nie ekspresjonująna swej powierzchni cząsteczek kostymulujących. Stąd, nie uważa się komórek mięśniowych za komórki prezentujące antygen. Jednakże, istnieją dowody sugerujące, że komórki mięśniowe biorą udział w wywoływaniu odpowiedzi odpornościowej po wstrzyknięciu i.m. DNA. Po pierwsze, ograniczone obserwacje tkanek zdolnych do internalizacji nagiego DNA plazmidowego, prowadzącej do ekspresji białka in situ pokazują, że wiele typów komórek ekspresjonuje geny reporterowe po bezpośrednim wstrzyknięciu plazmidu do tkanek, ale znacz nie mniej efektywnie niz komórki mięśniowe. Nie opisano kompletnej analizy pobierania DNA przez komórki niemięśniowe po wstrzyknięciu i.m., ale wydaje się, że jest ono jeszcze mniej efektywne. Po drugie, wykazano ekspresję genów reporterowych po wstrzyknięciu DNA i.m. w komórkach mięśni szkieletowych i serca u wielu różnych gatunków. Po trzecie, jakkolwiek odpowiedź CTL może być wywołana po wstrzyknięciu DNA innymi drogami (i.v. i i.d.), najlepszą ochronną odpowiedź odpornościową uzyskano po wstrzyknięciu DNA i.m. Po czwarte, mioblasty i miocyty mogąbyć rozpoznawane i niszczone przez CTL in vitro i niszczenie to może być wzmocnione przez uprzednie traktowanie interferonem-y, który zwiększa ekspresję MHC klasy I. Na koniec, przeszczepienie transfekowanych w sposób trwały mioblastów, ekspresjonujących NP, syngenicznym myszom, które nie miały dotąd kontaktu z antygenem, powoduje wywołanie ochronnej, komórkowej odpowiedzi odpornościowej in vivo (figura 20). Stąd, ekspresja antygenów przez komórki mięśniowejest wystarczająca do wywołania ochronnej odpowiedzi odpornościowej obserwowanej po wstrzyknięciu DNA. Ponadto, pobieranie i ekspresja DNA przez komórki niemięśniowe może nie być wymagana do wywołania ochronnej odporności. Z punktu widzenia polinukleotydów jako szczepionek może być korzystne ograniczenie pobierania DNA wyłącznie do komórek mięśniowych. Po pierwsze, miocyty są końcowo zróżnicowane i nie dzielą się. Może to być istotne dla zmniejszenia możliwości integracji plazmidowego DNA do DNA chromosomałnego i utrzymywania trwałej ekspresji antygenu, co mogłoby prowadzić do długotrwałej odpowiedzi odpornościowej. Po drugie, miocyty są wielkimi, wielojądrzastymi komórkami, które mogą się regenerować przez fuzję z mioblastami. Może to pomóc wyjaśnić dlaczego wstrzyknięcie DNA prowadzi do ekspresji białka, która może trwać przez długi czas bez śladów niszczenia komórek przez CTL.
Przykład 14. Badania nad ochroną
Immunizacja przy użyciu DNA kodującego antygeny wirusa grypy zapewnia ochronę przed śmiercią oraz chorobą, a także zmniejsza obciążenie wirusem w wielu różnych kombinacjach szczepów wirusa grypy, w dwóch szeroko uznanych modelach zakażenia grypą ludzką (myszy i fretek).
1. Heterologiczna (heterotypowa, grupowo-wspólna) ochrona nie jest zapewniana przez licencjonowaną szczepionkę opartą na zabitym wirusie, ale jest zapewniana przez szczepienie przy użyciu dNa w modelach zwierzęcych. Ochronę tą zademonstrowano, gdy zwierzętom laboratoryjnym wstrzyknięto DNA kodujący NP lub M1. Krzyżowa, komórkowa odpowiedź odpornościowa wywołana szczepieniem tymi DNA zapewniała odpowiedź ochronną.
a. Mvszy: Myszy BALB/c i C3H, którym wstrzyknięto i.m. DNA kodujący NP z A/PR/34 były chronione przed śmiercią i chorobą (ocenianą utratą wagi ciała) po ekspozycji przez zakażenie całych dróg oddechowych przy użyciu LD9 A/Hong Kong/68 (H3N2), szczepu heterotypowego (H3 wobec H1 A/PR/34). Figura 21 pokazuje przeżywalność myszy BALB/c immunizowanych trzykrotnie DNA dla NP (200 fg/dawkę) w trzytygodniowych odstępach i poddane ekspozycji trzy tygodnie po ostatniej immunizacji. Figura 22 pokazuje zahamowanie utraty wagi po ekspozycji u myszy immunizowanych w porównaniu z ciężką utratą-wagi doświadczaną przez myszy kontrolne. Figura 23 pokazuje zmniejszenie ilości wirusa w płucach siedem dni po ekspozycji górnych dróg oddechowych u myszy immunizowanych DNA dla NP
178 626 w porównaniu z myszami, którym podawano kontrolny, nie kodujący DNA. Myszy immunizowane DNa dla NP były całkowicie chronione przed śmiercią, wykazywały zmniejszoną utratę wagi i mniejsze ilości wirusa w płucach w porównaniu z myszami kontrolnymi. Ilość DNA dla NP potrzebna do ochrony myszy przez śmierciąi utratąwagi określono na <6.25 (ag na wstrzyknięcie gdy podawano trzy wstrzyknięcia DNA (figura 24). Stwierdzono, że ochrona wytwarzana przez immunizację DNA dla NP pozostaje nie zmieniona u myszy immunizowanych przez przynajmniej 3 miesiące. Poziom ochrony utrzymuje się przez 6 miesięcy, ale zmniejsza się nieznacznie pomiędzy 3 a 6 miesiącem po ostatniej immunizacji. Jednakże, ponowne szczepienie pojedynczą dawką DNA dla NP w 22 tygodniu, trzy tygodnie przed ekspozycją w 25 tygodniu, przywraca w pełni ochronę (figura 25). Stąd, immunizacja myszy DNA dla NP powoduje długotrwałą, możliwą do przypomnienia, ochronę heterołogiczną. Zdolność do wywołania odpowiedzi anamnestycznej pod wpływem powtórnego szczepienia tych zwierząt sugeruje, że pamięć immunologiczna została wywołana szczepieniem przy użyciu DNA dla NP.
b. Fretki: Fretki są powszechnie używanym modelem zakażenia wirusem grypy ludzkiej ponieważ sąpodatne na zakażenie szeroką gamą ludzkich izolatów wirusa grypy. Replikacja wirusa u fretek zachodzi głównie w nozdrzach i tchawicy i w znacznie mniejszej ilości w płucach, w przeciwieństwie do myszy, u których występuje ogromne obciążenie wirusem płuc. Zakażenie u fretek badane jest najłatwiej przez miareczkowanie wirusa w popłuczynach z nozdrzy. Fretki immunizowane DNA dla NP czy DNA dla M1, pojedynczo lub w połączeniu, ze szczepu niedawno uzyskanego od ludzi (A.Beijing.89, H3N2), wykazują znacznie zmniejszone uwalnianie wirusa w dniach 1-6 po ekspozycji na izolat krążący, A/Georgia/93 (H3N2) (figura 26). Ten izolat krążący wykazuje dryf antygenowy w stosunku do szczepu typu A/Beijing/89, tak, że licencjonowana szczepionka oparta na A/Beijing/89 zapewniała niewielką lub żadną ochronę ludzi przed chorobą wywoływaną przez A/Georgia/93. Fretki immunizowane DNA kodującym białka wewnętrzne A/PR/34 przejawiały znacznie zmniejszone uwalnianie wirusa z nozdrzy w dniach 5 i 6 po zakażeniu szczepem homotypowym, A/PR/34 (figura 27). Zmniejszenie uwalniania wirusa obserwowane było po ekspozycji na A/Georgia/93 i zarówno wczesnych jak i późnych punktach czasowych, podczas gdy po ekspozycji na A/PR/34 obserwowana była późna redukcja uwalniania wirusa; mogło to być spowodowane różnicą w zakaźności dla fretek pomiędzy oboma szczepami.
2. Homologiczna (homotypowa, typowo-specyficzna) ochrona wykazana została u zarówno myszy jak i fretek immunizowanych DNA dla HA.
a. Myszy: Myszy BALB/c immunizowane DNA dla HA (A/PR/34) były całkowicie chronione przed ekspozycją na LD90 A/PR/34. U immunizowanych myszy nie obserwowano śmierci (figura 28) ani utraty więcej jak 5% wagi ciała (figura 29) po ekspozycji, podczas gdy 90-100% zwierząt kontrolnych padło i doświadczało ciężkiej utraty wagi ciała. Miareczkowanie dawki DNA dla HA niezbędnego do uzyskania ochrony pokazało, że trzy wstrzyknięcia po 1 pg DNA dla HA było wystarczające do uzyskania pełnej ochrony (figura 30).
b. Fretki: Fretki, które immunizowano DNA kodującym HA ze szczepu A/PR/34, przejawiały znacznie mniejsze uwalnianie wirusa w dniach 1-6 po ekspozycji homologicznej w porównaniu z fretkami, które otrzymały DNA kontrolny (figura 31). Podobnie, fretki, które immunizowano DNA dla HA z A/Georgia/93 przejawiały zmniejszone uwalnianie wirusa w dniach 1i 3-7 po zakażeniu homologicznym (figura 32). Obecne były przeciwciała HI przeciwko odpowiednim szczepom w surowicach od wszystkich immunizowanych fretek (patrz wyżej). Stąd, immunizacja DNA dla HA zapewnia ochronę homologiczną.
3. Kombinacje szczepionki: Zdolność DNA dla HA do zapewnienia lepszego zakresu ochrony po połączeniu z DNA dla NP i Ml badano na fretkach.
a. Zakres ochrony przed wariantami dryfu antygenowego: dryf antygenowy, który wystąpił pomiędzy szczepami A/Beijing/89 i A/Beijing/92 był wystarczający, by wielu ludzi immunizowanych licencjonowaną szczepionką zawierającą A/Beijing/89 nie było chronionych przed chorobą spowodowaną przez wariant A/Beijing/92. W Ameryce Północnej, choroba spowodowana była przez przypominające A/Beijing/92 izolaty krążące, przykładowo, A/Georgia/93.
178 626
Izolaty krążące w Ameryce Północnej są antygenowo podobne do szczepu typowego, A/Beijmg/89, ale różnią się położeniem geograficznym miejsca wyizolowania i ich historią pasażowania, ponieważ były pasażowane raczej na komórkach ssaków niż najajach kurzych. Jednak pod względem sekwencji aminokwasowej szczepy pochodne A/Beijmg/92 różniły się od szczepów A/Beijmg/89 tylko 11 mutacjami punktowymi (pozycje 133,135, 145, 156,157, 186, 190, 191 193,226 i 262) w regionie HA1. Stąd, badano czy połączenie homotypowej odpowiedzi odpornościowej wywołanej przez DNA dla HA z krzyżową odpowiedzią CMI wywołaną przez DNA dla NP i M1 zapewni wyzszy stopień ochrony przed wariantem wynikłym z dryfu antygenowego. Immunizacja fretek szczepionką licencjonowaną zawierającą szczep A/Beijing/89 lub przy użyciu DNA dla HA z A/Beijmg/89 lub izolatów krążących przypominających A/Bejing^ (A/Hawaii/1) powodowała zmniejszenie uwalniania wirusa po ekspozycji fretek na A/Georgia/93 (figura33). Fretki, które immunizowano połączeniem PNV zawierającym DNA dla NP, Ml i HA wykazywały znacząco niższe uwalnianie wirusa w porównaniu z fretkami immunizowanymi szczepionką licencjonowaną lub tylko DNA dla HA (figura 34). W przypadku DNA dla HA z A/Hawaii/91 połączonego z DNA dla NP i Ml powstała ochrona nie była znacząco różna od ochrony maksymalnej zapewnianej przez homologiczne DNA dla HA z A/Georgia/93 (figura 35). Stąd, połączenie DNA dla HA, NP i M1 powodowało polepszoną ochronę przed wariantem wynikłym z dryfu antygenowego w porównaniu z licencjonowaną szczepionką.
b. Wpływ historii pasażowania na antygen szczepionki: Fretki immunizowane szczepionką zawierającą sekwencję DNA dla HA uzyskaną z izolatu krążącego w Stanach Zjednoczonych utrzymywano na komórkach MDCK w hodowli (A/'Hawaii/91) wykazywały mniejsze uwalnianie wirusa (p=0.021 mierzone dwustronnym testem ANOVA), niż fretki, którym podawano licencjonowaną szczepionkę opartą na zbitym wirusie zawierającą szczep A/Beijmg/89 pasażowany na jajach kurzych, gdy poddano je ekspozycji na zdryfowany antygenowo szczep A/Georgia/93 (figura33). W przeciwieństwie, fretki, którym podawano DNA dlaHA A/Beijmg/89 nie uwalniały wirusa w sposób różny (p=0.058) od fretek, które otrzymały licencjonowaną szczepionkę zawierającą identyczny wirus, po ekspozycji na A/Georgia/93. Szczepy hodowane na jajach i komórkach ssaków różniły się dwiema mutacjami w obrębie regionu HA1 genu HA (pozycje 186 i 193), które obie zlokalizowane były w antygenowym miejscu B, blisko wierzchołka monomeru HA w regionie uważanym za ważny dla wiązania się HI i przeciwciał neutralizujących. W pewnych warunkach zdolność niektórych izolatów ludzkich wirusa grypy do wiązania erytrocytów (RBC) kurzychjest początkowo bardzo niska, ale zwiększa się stopniowo przez kolejne pasaże na jajach co sugeruje, że region wiążący receptora w HA może ulegać znaczącej selekcji przez wzrost na komórkach ptasich. Wpływ małych odmienności sekwencji na efektywność szczepionek przeciwgrypowych opartych na HA u zwierząt laboratoryjnych podkreśla wagę pozostawania, na ile to możliwe, blisko sekwencji wirusa dzikiego, w trakcie przygotowywania takich szczepionek.
c. Naczelne z wyłączeniem ludzi: Naczelne nie są powszechnie stosowane w modelach ekspozycji na wirusa grypy z powodu braku klinicznej odpowiedzi na chorobę. Jednakże, badano immunogenność połączeń szczepionek PNV u naczelnych w porównaniu z licencjonowaną szczepionką opartą na zabitym wirusie. Miana przeciwciał wywołane przez połączenie PNV, zawierające HA i geny białek wewnętrznych były przynajmniej równoważne do uzyskanych przy zastosowaniu licencjonowanego produktu w sensie mian przeciwciał HI i długotrwałości odpowiedzi (patrz wyżej). Afrykańskie małpy zielone immunizowane PNV odpowiadały na PNV HA kodujące wariant zdryfowany antygenowo, pokazując, że odpowiedź typowo-swoista na PNV może być wywołana u uprzednio immunizowanych osobników. Małpy immunizowane PNV odpowiadały również na następne immunizacje przy użyciu konwencjonalnej szczepionki opartej na zabitym wirusie.
4. Wnioski: Szczepionki polinukłeotydowe przeciwko grypie są efektywne w modelach zakażenia wirusem grypy zwierząt laboratoryjnych. Ochrona homologiczna może być osiągnięta przy użyciu wektorów DNA kodujących HA, najprawdopodobniej w mechanizmie immunologicznym analogicznym do wywoływanego przez białko HA używane w obecnych licencjono178 626 wanych szczepionkach przeciwko grypie. Ochrona heterologiczna może być osiągnięta przeciwko zarówno zmienionymjak również zdryfowanym antygenowo szczepom przez dołączenie DNA kodującego zakonserwowane białka wewnętrzne wirusa grypy. Połączenie tych podejść w pojedynczej immunizacji owocuje polepszoną ochroną przeciwko odmianom zdryfowanym antygenowo w porównaniu z obecnie licencjonowanymi szczepionkami w modelu z użyciem fretek.
Przykład 15. Wykonanie wektora V1R
W próbach ciągłego doskonalenia podstawowego wektora do szczepienia, wykonano pochodną V1Jns, którą oznaczono jako V1R. Powodem konstrukcji tego wektora było uzyskanie wektora szczepionki o minimalnych rozmiarach, tzn. bez niepotrzebnych sekwencji DNA, który zachowywałby ogólnie polepszoną charakterystykę ekspresji heterologicznych genów oraz dawałby znaczną ilość plazmidu, korzystniejszą niż V1J i V1Jns. Określono, na podstawie literatury jak również z doświadczeń, że (1) regiony w zrębie pUC obejmujące początek replikacji
E. coli mogą być usunięte bez wpływu na uzyskiwaną ilość plazmidu z bakterii, (2) region 3' genu kan', następujący po ramce odczytu kanamycyny może być usunięty jeżeli zostanie w zamian wprowadzony terminator bakteryjny i (3) -300 bp od połówki 3' terminatora BGH może być usunięte bez wpływu na jego funkcje regulacyjne (zaraz po oryginalnym miejscu restrykcyjnym KpnI w elemencie BGH).
V1R skonstruowano przy użyciu PCR syntetyzuj ąc trzy segmenty DNA z V1 Jns odpowiadające elementom promotora CMVintA/terminatora BGH, początku replikacji i elementowi oporności na kanamycynę. Przy użyciu oligomerów do PCR do końców każdego z elementów dodano unikalne dla segmentu miejsca restrykcyjne: Sspl i Xhol do CMVintA/BGH; EcoRV i BamHI do genu kari i Bell i Sali do orf. Wybrano te miejsca enzymatyczne ponieważ umożliwiały one kierowaną ligację każdego z uzyskanych przez PCR segmentów DNA z następową utratą każdego z miejsc: EcoRV i Sspl pozostawiły DNA o tępym końcu gotowe do ligacji podczas gdy BamHI i Bc1I pozostawiły końce komplementarne do Sali i Xhol. Po uzyskaniu tych segmentów przez PCR, każdy z segmentów trawiono odpowiednimi enzymami restrykcyjnymi wskazanymi powyżej, a następnie ligowano w pojedynczej mieszaninie reakcyjnej wszystkie trzy segmenty DNA. Koniec 5' orf został zaprojektowany tak, że obejmował niezalezną sekwencję terminatora T2 rho, normalnie spotykaną w tym regionie tak, że powoduje terminację informacji dla genu oporności na kanamycynę. Ligowany produkt potwierdzono trawieniem restrykcyjnym (>8 enzymów) jak również sekwencjonowaniem miejsc połączeń. Uzyskiwanie dNa plazmidowego jak również ekspresja heterologicznych genów przez V1R wydawała się być podobna do V1 Jns. Uzyskane zmniejszenie wielkości wektora wyniosło 1346 bp (V1Jns=4.86 kb; V1R=3.52 kb), patrz figura 36, Identyfikator Sekw. Nr 45.
Sekwencje oligomerów do PCR użyte do syntetyzowania V1R (miejsca restrykcyjne podkreślono i podpisano w nawiasach po sekwencji):
(1) 5'GGTACAAATATTGGCTATTGGCCATTGCATACG3' [Sspl] Identyfikator Sekw. Nr 60;
(2) 5'CCACATCTCGAGGAACCGGGTCAATTCTTCAGCACC3' [Xhol] Identyfikator Sekw. Nr 61; (dla segmentu CMVintA/BGH) (3) 5'GGTACAGAJATęGGAAAGCCACGTTGTGTCTCAAAATC3' [EcoRV] Identyfikator Sekw. Nr 62;
(4) 5'CCAC.ATGCjATCCGTAATGCTCTGCCAGTGTTACAACC3' [BamHI] Identyfikator Sekw. Nr 63. (dla segmentu genu oporności na kanamycynę) (5) 5'GGTACATGATCACGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTG3' [Bcll] Identyfikator Sekw. Nr 64;
(6) 5'CCACATGTCGACCCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGG3' [Sali] Identyfikator Sekw. Nr 32.
(dla początku replikacji E. Coli).
178 626
LISTA SEKWENCJI (1) INFORMACJE OGÓLNE:
(i) ZGŁASZAJĄCY: Donnelly, John J.
Dwarki, Vivrani J.
Liu, Margaret A.
Montgomery, Donna L.
Parker, Suezanne E.
Shiver, John W.
(ii) TYTUŁ WYNALAZKU: Środki Farmaceutyczne Oparte na Kwasach Nukleinowych (iii) LICZBA SEKWENCJI: 64 ' (iv) ADRES DO KORESPONDENCJI:
(A) ADRESAT: Merck & Co., Inc.
(B) ULICA: P.O. Box 2000 (C) MIASTO: Rahway (d) STAN: New Jersey (E) KRAJ: Stany Zjednoczone Ameryki (F) KOD: 07065 (v) POSTAĆ MOŻLIWA DO ODCZYTANIA PRZEZ KOMPUTER:
(A) TYP NOŚNIKA: Dyskietka (B) KOMPUTER: Kompatybilny z IBM PC (C) SYSTEM OPERACYJNY: PC-DOS/MS-DOS (D) OPROGRAMOWANIE: Patentln rel.#1.0, ver. #1.25 (vi) DANE DOTYCZĄCE OBECNEGO ZGŁOSZENIA:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA:
(B) DATA ZGŁOSZENIA:
(C) KLASYFIKACJA:
(vii) DANE DOTYCZĄCE POPRZEDNIEGO ZGŁOSZENIA:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: US 08/032,383 (B) DATA ZGŁOSZENIA: 18 MARCA 1993 (vii) DANE DOTYCZĄCE POPRZEDNIEGO ZGŁOSZENIA:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: US 08/089,985 (B) DATA ZGŁOSZENIA: 08 LIPCA 1993 (viii) INFORMACJA O RZECZNIKU:
(A) NAZWISKO: Bencen, Gerard H (B) NUMER REJESTRACYJNY: 35,746 (C) NUMER SPRAWY: 18972Y (xi) INFORMACJA TELEKOMUNIKACYJNA:
(A) TELEFON: (908) 594-3901 (B) TELEFAX: (908) 594-4720 (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 1 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 18 par zasad (b) TYP: Kwas, nukleinowy (c) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 1: GTGTGCACCTCAAGCTGG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 2 (i) CHAIRAKTERYSTYKA SEKWENCJJ:
178 626 (A) DŁUGOŚĆ: 23 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 2: CCCTTTGAGAATGTTGCACATTC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 3 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 3: GGTACAAGATCTACCATGCTTCTAACCGAGGTC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 4 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 4: CCACATAGATCTTCACTTGAACCGTTGCATCTGCAC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 5 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 23 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 5: CTATADAAGCAGAGCTCGTTTAG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 6 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DłUGOŚĆ: 30 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 6:
178 626
GΓACCAAACATCTAAGGACGGTCACTGCAG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 7 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 39 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 7:
CTATGTGTCTG/AAAA'GdACGCGGAGATTGCCCTCGCAC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 8 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 39 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 8:
CTGCGACCCCAATCTCCACGCTCATTTTCAGACACATAC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 9 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 9 aminokwasów (b) TYP: Aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: Peptyd (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 9:
Thr Tyr Gln Arg Thr Arg Ala Leu Val (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 10 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 4432 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 10:
178 626
TCGCGCGTTT CGGTGATGAC GGTGAAAACC TCTGACACAT GCAGCTCCCG GAGACGGTCA 60
CAGCTTGTCT GTAAGCGGAT GCCGGGAGCA GACAAGGCCCG TCAGGGCGCG TCAGCGGGTG 120
TTGGCGGGTG TCGGGCCTGC CTTAACTATG CGGCATCAGA GCAGATTGTA CTGAGAGTGC 180
ACCATATGCG GTGTGAAATA CCGCACAGAT GCGTAAGGAG AAAATACCGC ATCAGATTGG 240
CTATTGGCCA TTGCATACCT TGTATCCATA TCATAATATG TACATTTATA TTGGCTCATG 300
TCCAACATTA CCCCCATGTT GACATTGATT ATTGACTACT TATTAATAGT AATCAATTAC 360
GGOGTCATTA CTTCATAGCC CATATATGGA GTTCCGCGTT ACATAACTTA CGGTAAATGG 420
CCCGCCTGGC TGACCGCCCA ACGACCCCCG CCCATTGACG TCAATAATGA CGTATGTTCC 480
CATAGTAACG CCAATAGGGA CTTTCCATTG ACGTCAATGG CTGGACTATT TACGGTAAAC 540
TGCCCACTTG GCAGTACATC AAGTGTATCA TATGCCAAGT ACGCCCCCTA TTGACGTCAA 600
TGACGGTAAA TGGCCCGCCT GCCATTATGC CCAGTACATG ACCTTATGGG actttcctac 660
TTGGCAGTAC ATCTACGTAT TAGTCATCGC TATTACCATG GTGATGCGGT TTTGGCAGTA 720
CATCAATGGG CGTGGATAGC GGTTTGACTC ACGGGCGATTT CCAAGTCTCC ACCCCATTGA 780
CGTCAATGGG agtttgtttt GGCACCAAAA TCAACGGGAC TTTCCAAAAT GTCGTAACAA 840
CTCCGCCCCA TTGACGCAAA TGGGCGGTAG GCGTGTACGG TGGGAtGGTCT ATATAAGCAG 900
AGCTCGTTTA GTGAACCGTC AGATCGCCTG GAGACGCCAT CCACGCTGTT TTGACCTCCA 960
TAGAAGACAC CGGGACCGAT CCAGCCTCCG CGGCCGGGAA CGGTGCATTG GAACGCGGAT 1020
TCCCCGTGCC AAGAGTGACG TAAGTACCGC CTATAGAGTC TATAGGCCCA CCCCCTTGGC 1080
TTCTTATGCA TGCTATACTG TTTTTGGCTT GGOCTCTATA CACCCCCGCT TCCTCATGTT 1140
ATAGGTGATG GTATAGCTTA GCCTATAGGT GTGGGTTATT GACCATTATT GACCACTCCC 1200
CTATTGGTGA CGATACTTTC CATTACTAAT CCATAACATG gctctttgcc ACAACTCTCT 1260
TTATTGGCTA TATGCCAATA CACTGTCCTT CAGAGACTGA CACGGACTCT GTATTTTTAC 1320
AGGATGGGGT CTCATTTATT ATTTACAAAT TCACATATAC AACACCACCG TCCCCAGTGC 1380
CCGCAGTTTT TATTAAACAT AACGTGGGAT CTCCACGCGA ATCTCGGGTA CGTGTTCCGG 1440
ACATGGGCTC TTCTCCGGTA GCGGCGGAGC TTCTACATCC GAGCCCTGCT CCCATGCCTC 1500
CAGCGACTCA TGGTCGCTCG GCACCTCCTT GCTCCTAACA GTGGAGGCCA GACTTAGGCA 1560
CAGCACGATG CCCACCACCA CCAGTGTGCC GCACAAGGCC GTGGCGCTAG GGTATGTGTC 1620
TGAAAATGAG CTCGGGGAGC GGCCTTGCAC CGCTGACGCA TTTGGAAGAC TTAAGGCAGC 1680
178 626
GGCAGAAGAA GATGCACGCA GCTGACTTCr TCTGTTCTCA TAAGACTCAG AGCTAACTCC 1740
CGTTCCGGTG CTGTTAACGG TCGAGCCCAG TGTAGTCTGA GCACTACTCG TT^G^GCCGC 1800
GCGCGCCACC AGACATAATA GCTCACACAC TAACAGACTG TTCCTTTCCA TCCCTCTTTT 18(30
CTGCAGTCAC CGTCCTTAGA τcΓ^ccτcτcc οηχτΆΏττ; CCAGCCATCT GTTCTTTGCC 1920
CCTCCCCCGT GCCTTCCTTG ACC^^AAG GTCCCACTCC CACTCTCCTT TCCTAATAAA 1980
ATGAGGAAAT TGCATCCCAT TGTCTCACTA GCTCTCATTC TATTCTGGGG GCTCCCGTGC 2040
GGCAGCACAG CAAGGGGGAG GATTCCCAAC ACAATAGCAG GCATCCTGGG GATCCCGTCG 2100
CCTCTATGGC TACCCAGCTG CTGAAGAATT CTCCTGCCCC AGAAACAACC 21t>0
AGGCACATCC CCTTCTCTGT GACACACCCT CTCCACGCCC CTCCTTCTTA GTTCCAGCCC 2220
CACTCAT^GG ACACTCATAG CTCACCAGCC CTCCGCCTTC AATCCCACCC GCTAAACTAC 2280
TTGGAGCGGT CTCTCCCTCC CTCATCAGCC CACCAAACCA AACCTAGCCT CCAACAGTCC 2340
GAAGAAATTA AAGCAAGATA GCCTATTAAC TCCACAGGCA GAGAAAATGC CTCCAACATC 2400
TGAGGAAGTA ATGAGAGAAA TCATAGA-ATT TCTTCCGCTT CCTCGCTCAC TCACTCGCTC 2460
CGCTCGGTCG TTCGGCTGCG GCGA(GCCCTA TCAGCTCACT CAAAGCCCCT AATACGGTTA 2520
TCCACAGAAT CAGGGGATAA CGCAG^-AA-AG AACATOT^GAG CAAAAGGCCA ^CAAAAG^CC 2580
AG^^^CGTA AAAAG^CGC σrτGcτcccc TTTTTCCATA GGCTCCGCCC CCCT^^C^GAG 2640
CATCACAAAA ATCGACGCTC AACΓCACACC TGGCCAAACC CGACAGGACT ATAAAGATAC 2700
CA^^i^-TTC CCCCTGGAAC ^σΓσΓϋσΐΌ TTCCGACCCT ^CGCTTACC 2760
GGATACCTGT CCGCCTTTCT CC:CTTCCGCA ACCCTGGCCC TTTCTCAATG CTCACGCTGT 2820
AGG^J^TCTCA G<GΓCCTTCCC TCCAACCTCG QCTGTGTGCA CGAACCCCCC 2880
GTTCAGCCCG ACCGC^GCGC CTTATCCCCT AACTATCGTC ΓTCACΓCCAA CCCGGTAAGA 2940
CACGACTTAT CGCCACTGGC AGCAGCCACT CGTAACACGA TTAGCAGAGC GAGCTATCTA 3000
GGCGCTGCTA CAGAt^TmCTT GAAGTCCTCC CCTAACTACG GCTACACTAG AACCACACΓA 3060
TTTGGTATCT GCCCTCTCCT GAAGCCAGTT ACCTTCGGA-A AAAGACΓTCC TACCTCTTGA 3120
TCCGGCAAAC AAAccAccgc TCCTACCCGT G<CrΓTTTTTC TTTCCAAGCA GCAGATTACG 3180
CGCAGAAAAA AAGG^^T^ICrCA AG^^GATC^1 TTCATCTTTT CTACGCGGTC TCACGCTCAG 3240
TGGAACGAAA ACTCACGTTA AGGCA'ΓΓTTC GTCATGAGAT TATCAAAAAG GATCTTCACC 3300
TAGATCCTTT TAAATTAAAA ATGAAGrrTT AAATCAATCT AAACTATATA TCACTAAACT 3360
TGGTCTGACA GTTACCAATO CTTAATCAGT GAG^.^^^TA TCTCAGCGAT CTCTCTATTT 3420
CGTTCATCCA 'ΙΆσΠΌΌσΐΌ ACTCCCCCTC CΓCΓACATAA CTACGATACG CGACCGCTTA 3480
CCATCTGGCC CCAGTCCTCC AATGATACCG CGAGACCCAC GCTCACCGGC TCCAGATTTA 3540
178 626
TCAGCAATAA ACCAGCCAGC CGGAAGGGCC GAGCGCAGAA GTGGTCCTGC AACTTTATCC 3600
GCCTCCATCC AGTCTATTAA TTGTTGCCGG GAAGCTAGAG TAAGTAGTTC GCCAGTTAAT 3660
agtttgcgca ACGTTGTTGC CATTGCTACA GGCATCGTGG TGTCACGCTC GTCGTTTGCT 3720
ATGGCTTCAT TCAGCTCCGG TTCCCAACGA TCAAGGCGAG TTACATGATC CCCCATGTTC 3780
TGCAAAAAAG CGGTTAGCTC CTTCGGTCCT CCGATCGTTG TCAGAAGTAA GTTGGCCGCA 3840
GTGTTATCAC TCATGGTTAT GGCAGCACTG CATAATTCTC TTACTGTCAT GCCATCCGTA 3900
AGATCGCTTTT CTGTGACTGG TGAGTACTCA ACCAAGTCAT TCTGAGAATA GTGTATGCGG 3960
CGACCGAGTT GCTCTTGCCC GGCGTCAATA CGGGATAATA CCGCGCCACA TAGCAGAACT 4020
TTAAAAGTGC TCATCATTCG AAAACCTTCT TCGGGGCGAA AACTCTCAAG GATCTTACCG 4080
CTGTTGAGAT CCAGTTCGAT GTAACCCACT CGTGCACCCA ACTGATCTTC AGCATCTTTT 4140
ACTTTCACCA GCGTTTCTGG GTGAGCAAAA ACAGGAAGGC AAAATGCCGC AAAAAAGGGA 4200
ATAAGGGCGA CACGGAAATG TTGAATACTC ATACTCTTCC TTTTTCAATA TTATTGAAGC 4260
ATTTATCAGG GTTATTGTCT CATGAGCGGA TACATATTTG aatgtattta GAAAAATAAA 4320
CAAATAGGGG TTCCGCGCAC ATTTCCCCGA AAAGTGCCAC CTGACGTCTA AGAAACCATT 4380
ATTATCATGA CATTAACCTA TAAAAATAGG CGTATCACGA GGCCCTTTCG TC 4432
(2) INi-ORMACJC A OIDENTYFIKATORA AEKW. Nr 11 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 2196 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 11:
ATTCCCTATT GGCCATTGCA TACGTTGTAT CCATATCATA ATATGTACAT TTATATTGGC 60
TCATGTCCAA CATTACCGCC ATGTTGACAT TGATTATTGA CTAGTTATTA ATAGTAATCA 120
ATTACGGGGT CATTAGTTCA TAGCCCATAT ATGGAGTTCC CCCTTACATA ACTTACGGTA 180
AATGCCCCGC CTGGCTGACC GCCCAACGAC CCCCGCCCAT TGACGTCAAT AATGACGTAT 240
GTTCCCATAG TAACGCCAAT AGGGACCTTTC CATTGACGTC aatgggtgga CTATTTACGG 300
TAAACTCCCC ACTTGGCAGT ACATCAAGTG TATCATATGC CAAGTACGCC CCCTATTGAC 360
GTCAATGACG GTAAATGGCC CCCCTGGCAT TATGCCCAGT ACATGACCTT ATGGGACTTT 420
178 626
CCTACTTGGC AGTACATCTA CGTATTAGTC ATCGCTATTA CCATGGTGAT GCGGTTTTGG 480
CAGTACATCA ATGGCCGTGG ATAGCGCTTT GACTCACGGG gatttccaag TCTCCACCCC 540
ATTGACGTCA ATGGCACTTT gttttggcac CAAAATCAAC GGGACTTTCC aaaatgtcgt 600
AACAACTCCG CCCCATTGAC GCAAATGGGC GGTAGGCGTG TACGGTGGGA GCTCTATATA 660
AGCAGAGCTC GTTTAGTGAA CCGTCAGATC GCCTGGAGAC GCCATCCACG CTGTTTTCAC 720
CTCCATAGAA GACACCGGGA CCGATCCAGC CTCCGCGGCC GGGAACGGTG CATTGGAACG 780
CGGATTCCCC GTGCCAAGAG TGACGTAAGT ACCGCCTATA GACTCTATAG GCCCACCCCC 840
TTGGCTTCTT ATGCATGCTA TACTGTTTTT GGCTTGGCGT CTATACACCC CCGCTTCCTC 900
ATGTTATAGG TGATGCTATA GCTTACCCTA TAGGTGTGGG TTATTGACCA TTATTGACCA 960
CTCCCCTATT GGTGACGATA CTTTCCATTA CTAATCCATA ACATGGCTCT TTGCCACAAC 1020
TCTCTTTATT GGCTATATGC CAATACACTG TCCTTCAGAG ACTGACACGG ACTCTGTATT 1080
TTTACAGGAT GGGCTCTCAT TTATTATTTA CAAATTCACA TATACAACAC CACCGTCCCC 1140
AGTGCCCGCA GTTTTTATTA AACATAACGT GGGATCTCCA CGCGAATCTC GGCTACGTGT 1200
TCCGGACATG GGCTCTTCTC CGGTAGCGGC GGACCTTCTA CATCCGAGCC CTGCTCCCAT 1260
CCCTCCAGCG ACTCATGGTC GCTCGGCAGC TCCTTGCTCC TAACAGTGGA GGCCAGACTT 1320
AGGCACAGCA CGATGCCCAC CACCACCAGT GTGCCGCACA AGGCCGTGGC GGTAGGGTAT 1380
GTGTCTGAAA ATGAGCTCGG GGAGCGGGCT TGCACCGCTG ACGCATTTGG AAGACTTAAG 1440
GCAGCGGCAG AAGAAGATGC AGGCAGCTGA GTTGTTGTGT TCTGATAAGA GTCAGAGGTA 1500
ACTCCCGTTG CGGTGCTGTT AACGGTGGAG GGCAGTGTAG TCTGAGCAGT ACTCGTTGCT 1560
GCCGCGCGCG CCACCAGACA TAATAGCTGA CAGACTAACA GACTGTTCCT TTCCATGGGT 1620
CTTTTCTGCA GTCACCGTCC TTAGATCTGC TGTGCCTTCT AGTTGCCAGC catctgttgt 1680
TTGCCCCTCC CCCGTGCCTT CCTTGACCCT GGAAGCTGCC ACTCCCACTG TCCTTTCCTA 1740
ATAAAATGAG GAAATTGCAT CGCATTGTCT GACTAGGTGT CATTCTATTC TGGGGGGTGG 1800
GGTGGGGCAG CACAGCAAGG GGGAGGATTG GGAAGACAAT AGCAGGCATG CTGGGGATGC 1860
GGTGGGCTCT ATGGGTACCC AGGTGCTGAA GAATTGACCC GCTTCCTCCT GGGCCAGAAA 1920
GAAGCAGGCA CATCCCCTTC TCTGTGACAC accctgtcca CGCCCCTGGT TCTTAGTTCC 1980
AGCCCCACTC ATAGGACACT CATAGCTCAG GAGGCCCTCCG CCTTCAATCC CACCCGCTAA 2040
AGTACTTGGA GCGGTCTCTC CCTCCCTCAT CAGCCCACCA AACCAAACCT AGCCTCCAAG 2100
AGTGGGAAGA AATTAAAGCA AGATAGGCTA TTAAGTGCAG AGGGAGAGAA AATGCCTCCA 2160
ACATGTGAGG AAGTAATGAG AGAAATCATA GAATTC
2196
178 626 (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SUK W. Nr 12 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 71 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 12: GTCACCGTCCrfAGATCAATTCCAGCAAAAGCAGGGTAGATAATCACTCACTGAGTGACAT CAAAATCATG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 13 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 117 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 13: ACCGTCCTT.AGATCAGCTTGGCAAAAGCAGGCAAACCATTTGAATGGArGTCAATCCGACC TTACTTTTCTTAA/^A^C^T^(^CJ^y^C^J^/^<^iAAA^j^C^(^TA^rAAGCACAAJ^m^J^J^J^TTATAC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 1^4 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 136 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 14: GTCACCGTCCTTAGATCAATTCCAGCAAAAGCAGGGTGACAAAAACATAATGGATCCAAA CACTGTGTCAAGCTTTCAGGTAGATTGCTTTCTTTGGCATGTCCGCAAACGAGTTGCAGAC CAAGAACTAGGTGAT (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 15 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 152 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI; IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 15: TCTGCAGTCACCGTCCTTAGATCAGCTTGGAGCAAAAGCAGGGGAAAATAAAAACAACCA AAATGAAGGCAAACCTACTGGTCCTGTTAAGTGCACTTGCAGCTGCAGATGCAGACACAA TATGTATAGGCTACCATGCGAACAATTCAACC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 16 (i) CJHAIRATTRYSTTYA SEKKWNCJJi (A) DŁUGOŚĆ: 162 pary zasad
178 626 (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 16: TTTTCTGCAGTCACCGTCCTTAGATCCCGAATTCCAGCAAAAGCAGGTCAATTATATTCAAT ATGGAAAGAATAAAGAACTAAGAAATCTAATGTCGCAGTCTGCCACCCCGGAGATACTCA CAAAAACCACCGTGGACCATATGGCCATAATCAAGAAGT (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 17 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 122 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 17: GTCACCGTCCTTAGATCTACCATGAGTCTTCTAACCGAGGTCGAAACGTACGTACTCTCTAT CATCCCGTCAGGCCCCCTCAAAGCCGAGATCGCACAGAGACTTGAAGAGTTGACGGAAGA (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 18 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 4864 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 18:
TCGCCCGTTT CGGTGATGAC CGTGAAAACC TCTGACACAT GCAGCTCCCG GAGA^l^A 60
CACCTTCTCT GTAAGCGCAT GCCGGGAGCA GACAAGCCCG TCAGGGCGCG TCACCCCCTG 120
TTGGCGGGTG TCGGGGCTGG CTTAACTATG CGGCATCAGA G^AGATTGTA CTGACACTGC 180
ACCATATGCG GTGTGAAATA CCGCACAGAT CCGTAAGGAG AAAATACCGC ATCAGATTGG 240
CTATTGGCCA TTGCATACCT TGTATCCATA TCATAATATG TACATTTATA ΤΙ^ΟΟΓΟΑΤΌ 300
TCCAACATTA CCGCCATGTT GACATTGATT ATTGACTAGT TATTAATACT AATCAATTAC 360
GGGGTCATTA CTTCATAGCC CATATATGGA GTTCCGCGTT ACATAACTTA OG^n^AAT^ 420
CCCGCCTCGC TGACCGCCCA ACGACCCCCG CCCATTGACG TCAATAATGA CCTATCTTCC 480
CATAGTAACG CCAATAGGGA CTTTCCATTG ACGTCAATGG CTGCACTATT TACCGTAAAC 540
TGCCCACTTG GCAGTACATC AAGTGTATCA TATGCCAAGT ACGCCCCCTA TTGACCTCAA 600
TGACGGTAAA TGGCCCCCCT GO^JATTATGC CCAGTACATG αοοττατθ^ actttcctac 660
TTGGCAGTAC ATCTACGTAT TAGTCATCGC TATTACCATG CTGATCCCCT TTTGCCAGTA 720
CATCAATCGG CGTGGATAGC GGTTTGACTC ACGGGCGATTT CCAAGTCTCC ACCCCATTGA 780
178 626
CGTCAATGGC AGTTTGTTTT GGCACCAAAA TCAACGGGAC TTTCCAAAAT GTCGTAACAA 840
CTCCCCCCCA TTGACGCAAA TGCCCGGTAG GCGTGTACGG TCGGAGCTCT ATATAAGCAG 900
AGCTCGTTTA CTGAACCGTC AGATCGCCTG GAGACGCCAT CCACGCTGTT TTGACCTCCA 960
TAGAAGACAC CGGGACCGAT CCAGCCTCCG CGGCCGGGAA CGGTGCATTG GWACCCGGAT 1020
TCCCCGTGCC AAGAGTGACG TAAGTACCGC CTATAGAGTC TATAGGCCCA CCCCCTTGG1' 1040
TTCTT^AT^GCA TGCTATACTG TTTTTGGCTT GGGGTCTATA CACCCCCGCT TCCTCATGTT 1140
ATAGGTGATG GTATAGCTTA GCCTAT^AGGT CTGGGTrATT GACCATTATT GACCAC-TCCC 1200
CTATTGGTGA CGATACTTTC CATTACTAAT CCATAACATG GCTCTTTGCC ACAACTCTCT 1260
TTATT^GGCTA TATGCCAATA CACTGTCCTT CAGAGACTGA CACGGACTCT G^jATTTTTAC 1320
AGGi^-TO^ICGT CTCATTTATT ATTTACAAAT TCACATATAC AACACCACCG TCCCCAGTGC 1380
CCGCACTrTTT TATTAAACAT AACGTGGGAT CTCCACGCGA ATCTC^GGGTA CGTCTTCCGG 1440
ACATGCGCTC TTCTCCGGTA GCGGCGGAGC TTCTACATCC GAGCCCTGCT CCCATGCCTC 1500
CAGCGACTCA TGGTCGCTCG GCAGCTCCTT GCTCCTAACA CTGGAGGCCA GACTTAGGCA 1560
CAGCACGATG CCCACCACCA CCAGTGTGCC GCACAAGGCC CTGGCGGTAG GGTATGTCTC 1620
TGAAAATGAG CTCCGGGA.GC GGCCTTGCAC CGCTGACGCA TTTCGAAGAC TTAAGCCAGC 1680
CCCAGAAGAA GATGCAGGCA GCTGAGTTGT TGTCTTCT^GA TAAGAGTCAG AGCTAACTCC 174 0
CGTTGCGGTG CTGTTAACGG TGGAGGGCAG TGTAGTCTGA OCAGTACTCG TTGCTGCCGC 1800
GCGCGCCACC AGACATAATA CCTGACAGAC TAACAGACTG TTCCTTTCCA TGGfG^tCTTTT 1860
CTGCAGTCAC CGTCCTTAGA TCT^GCT^GT^GC CTTCTAGTTG CCAGCCATCT GTTCTTTGCC 1920
CCTCCCCCGT GCCTTCCTTG ACCCTGGAAG GTGCCACTCC CACTGTCCTT TCCTAATAAA 1980
ATGAGGAAAT TGCATCGCAT TGTCTGAGTA GGTGTCATTC TATTC^^K^C^GG GGTGGGGTGG 204 0
GGCAGCACAG CAAGGGGGAG GATTGGGAAG ACAATAGCAG GCATGCTGGG GATGCGGTGG 2100
GCTCTAT^GGG TACCCAGGTG CTGAAGAATT GACCCGGTTC CTCCTGGGCC AGAAAGAAGC 2160
AGOCACATCC CCTTCTCTGT GACACACCCT GTCCACGCCC CTGGTTCTTA GTTCCAGCCC 2220
CACTCATAGG ACACTCATAG CTCACGAGCG CTCCGCCTTC AATCCCACCC GCTAAAGTAC 2280
TTGGAGCGGT CTCTCCCTCC CTCATeAGCC CACCAAACCA AACCTAGCCT CCAAGAGTGG 2340
GAAGAAATTA AAGCAAGATA GGC’TATT^AAC TGCAGAGGGA GAGAAAATGC CTCCAACATG 24 00
TGAGGAAGTA ATGAGAGAAA TCATAGAATT TCTTCCGCTT CCTCGCTCAC TGACTCGCTG 2460
CCCTCGGTCG TTCGGCTGCG GCGAGCGGTA TCAGCTCACT CAAAGGCGGT AATACGGTTA 2520
TCCACAGAAT CAGGGGATAA CGCAGGAAAG AACATGTGAG CAAAAGGCCA GCAAAAGGCC 2580
AGGAACCGTA AAAAGGCCGC GTTCCTGCCG TTTTTCCATA GCCTCCGCCC CCCTGACGAG 264 0
CATCACAAAA ATCGACGCTC AAGTCAGACC TGCCGAAACC CGACACGACT ATAAAGATAC 2700
CAGGC<GTrTC CCCCTGGAAG CGCTCTCCTC TTCCGACCCT GCCGCTTACC 27 60
178 626
GGATACCTGT CCGCCTTTCT cccttcggga agcgtggcgc tttctcaatg ctcacgctgt 2820
AGCTATCTCA gttcggtgta GGTCGTTCGC tccaagctgg gctgtgtgca cgaacccccc 2880
GTTCAGCCCG accgctgcgc cttatcccgt aactatcgtc ttgagtccaa cccggtaaga 2940
cacgacttat cgccactggc agcactcact ggtaacagga ttagcagagc gaogtatgta 3000
ggcgctgcta CAGAGTTCTT gaagtggtgg cctaactacg gctacactag aaggacagta 3060
tttggtatct GCGtCTCTGCT gaagccagtt accttcggaa aaagagttgg tagctcttga 3120
tccggcaaac aaaccaccgc tggtagcggt GGU tII IIg tttgcaagca gcagattacg 3180
cgcagaaaaa aaggatctca agaagatcct TTGATCTTTT ctacggggtc tgacgctcag 3240
tggaacgaaa .actcacgtta AGGGATTTTG gtcatgagat tatcaaaaac gatcttcacc 3300
tagatccttt taaattaaaa ATGAACITTT aaatcaatct aaagtatata tgagtaaact 3360
tggtctgaca-- gttaccaatg cttaatcagt gaggaccta tctcagcgat CTCTCTATTT 3420
cgttcatcca tagttgcctg actccggggg GGGGGCGGCGC tgaggtctgc ctcgtgaaga 3480
agctcttgct gactcatacc aggcctgaat cgccccatca tccagccaga aagtgaggga 3540
gccacggttg atgagagctt tgttgtaggt GGACCACTTG gtgattttga acttttgctt 3600
tgccacggaa CGGTCTGCGT tgtcgggaag atgcgtgatc tgatccttca actcagcaaa 3660
acttcgattt attcaacaaa GCCGCCGTCC cgtcaagtca gcgtaatgct ctgccagtgt 3720
tacaaccaat taaccaattc tgattagaaa aactcatcga gcatcaaatg aaactgcaat 3780
ttattcatat caggattatc aataccatat ttttgaaaaa GCCGTTTCTG taatgaagga 3840
gaaaactcac cgaggcactt ccataggatg gcaaig^ttcct ggtatcggtg TGCGATTCCG 3900
actcgtccaa catcaataca acctattaat TTCCCCTCGT caaaaataag gttatcaagt 3960
GAGAAATCAc catgagtgac gactgaatcc gctgagaatg gcaaaagctt ATGCATTTCT 4020
ttccagactt gttcaacagg ccagccatta cgctcgtcat caaaatcact cgcatcaacc 4080
aaacccttat TCATTCGTGA ttgcgcctga gcgagacgaa atacgcgatc «ctgttaaaa 4140
ggacaattac aaacaggaat cgaatgcaac cggcgcagga acactgccag cgcatcaaca 4200
atattttcac ctgaatcagg atattcttct aatacctgga atgctctttt CCCGGGGATC 4260
gcagtggtga gtaaccatgc atcatcagga gtacggataa aatgcttgat ggtcggaaga 4320
ggcataaatt ccgtcagcca gtttagtctg accatctcat ctgtaacatc attggcaacg 4380
ctacctttgc catgtttcag aaacaactct GGCGCATCGG gcttcccata caatcgatag 4440
attgtcgcac ctgattgccc gacattatcg cgagcccatt tatacccata taaatcagca 4500
tccatgttgg aatttaatcg cggcctcgag caagaccttt cccgttgaat atggctcata 4560
acaccccttg tattactgtt tatgtaagca GACACTTTTA ttgttcatga tgatatattt 4620
178 626
TTATCTTCTC CAATCTAACA TCAGAGATTT TGAGACACAA CGTGGCTTTC CCCCCCCCCC 4680
CATTATTGAA GCATTTATCA CGCTTATTGT CTCATGAGCG (GATACATATT TGAATGTATT 4740
TAGAAAAATA AACAAATAGG GGTTCCGCGC ACATTTCCCC GAAAAGTGCC ACCTGACGTC 4800
TAAGAAACCA TTATTATCAT GACATTAACC TATAAAAATA GGCGTATCAC GAGGCCCTTT 4860
CGTC 4864
(2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATOIRA SEKW. Nr 11 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 15 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 19: AGCAGAAAGCAGAGCA (2) INFORMACJA DO SEKW. Nr 20 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 119 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 20: TCACCGT^CCITAG^ATCAAGCAGG^G^ITAATAATC.ACTC.ACTGAGTGACATCAAAATCATGGC GTCCCAAGGCACC AAACGGTCnATGAACAGATGGAACTGATGGGGAACGCCAGATT (2) INFORMACCA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 21 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 67 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 21: GAGGGGCAAACAACAGATGGCTGGCAACTAGAAGGCACAGCAGATA'nTTn'CCTrAATTG TCGTAC (2) INFORMACJA DO IIDENTYF.IKATORA SEKW. Nr 22 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 15 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (Dj TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 22:
AGCAGAAGCACGCAC
178 626 (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 23 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 15 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 23: accagaaccacacca (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 24 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 24: CCTTAC/ArCGGAAATAAAAACAACAACCAAAATGAA (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 25 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 25: GCAGATCCTTATATrrCTGAAATTCTGGTCTCAGAT (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 26 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 102 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 26: ACCGTCCTTAGATCCAGAAGCAGAGCATTTTCTAATATCCACAAAATGAAGGCAATAArrGT ACTACTCATGGTAGTAACATCCAACGCAGATCGAATCTGC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 27 (i) CEHARACTERYSTYIKA SEKWENCJE (A) DŁUGOŚĆ: 42 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie
178 626 (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 27: GGCACAGCAGATCTTTCAATAACGTTTCTTTGTAATGGTAAC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 28 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 23 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 28: CTAACAGACTGTTCCTTTCCATG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 29 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 18 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW Nr 29: GGAGTGGCACCTTCCAGG3 (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 30 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 12 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 30: AGCAAAAGCAGG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW Nr 31 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 14 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Pojedyncza (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 31: AGCAGAAGCGGAGC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 32 (i) CHAIRAKTERYSTYIKA SEKWENCJE (A) DŁUGOŚĆ: 35 par zasad
178 626 (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 32: CCACATCTCCACCCCTAAAAAGGCCCCCTTCCTCC3 (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 33 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 33: CCTACAACCATGAAGACTATCATΓGCTTTCACC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 3-4 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 37 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 34: CCACATACATCTTCAAATCCAAATCTTCCACCTAATC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 35 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 35: CCTACAACCATCAAACCAAAACTACTACTCCTCTTATC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 36 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 32 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 36: CCACATTCACATCCATATTCTACACTCCAAAC
178 626 (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 37 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGlA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA; nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 37: GGTACAACCATGAAGGCAATAATTGTACTACTCATG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW Nr 38 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGlA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW Nr 38: CCACATTTATAGACAGATGGAGCAAGAAACATTGTC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 39 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGlA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 39: GGTACAAGATCTACCATGCTTCTAACCGAGGTC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 40 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGlA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 40: CCACATAGATCTTCACTTGAACCGTTGCATCTGCAC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 41 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 39 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGlA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie
178 626 (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 41: GGTACAGGATCCACCAIGICCAACATGGATATIGACGGC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Ni* 42 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 39 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 42: CCACATGGATCCTTAAIAATCGAGGTCAICATAATCCTC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 43 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 42 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 43: GGTACAGGATCCACCATGTCGCTGTTTGGAGACACAATTGCC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 44 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (d) TOPOLOGIA: Liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 44: CCACATGGATCC'ΠATAGGTATTΓCΓΓCACAAGAGC'IG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 45 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 3553 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Podwójna (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI; IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 45:
GATATTGGCT ATTGGCCATT GCATACGTTG TATCCATATC ATAATATGTA CATTTATATT
GGCTCATGTC CAACATTACC GCCATGTTGA CATTGATTAT TGACTAGTTA TTAATAGTAA.
120
178 626
TCAATTACGG GGTCATTAGT TCATAGCCCA TATATGGAGT TCCGCGTTAC ATAACTTACG 180
GTAAATGGCC CGCCTGGCTG ACCGCCCAAC GACCCCCGCC CATTGACGTC AATAATGACG 240
TATCTTCCCA TAGTAACGCC AATAGGGACT TTCCATTGAC GTCAATGGGT GGACTATTTA 300
CGGTAAACTG CCCACTTGGC AGTACATCAA GTGTATCATA TGCCAAGTAC GCCCCCTATT 360
GACGTCAATG ACGGTAAATG GCCCGCCTGG CATTATGCCC AGTACATGAC CTTATGGGAC 420
TTTCCTACTT GGCAGTACAT CTACGTATTA GTCATCGCTA TTACCATGGT GATGCGCTTT 480
TGGCAGTACA TCAATGGGCG TGGATAGCGG TTTGACTCAC GGGGATTTCC AAGTCTCCAC 540
CCCATTGACG TCAATGGGAG TTTGTTTTGG CACCAAAATC AACGGGACTT TCCAAAATGT- 600
CGTAACAACT CCGCCCCATT GACGCAAATG GGCGGTAGGC CTGTACGGTG GGACGGTCTAT 660
ATAAGCAGAG CTCGTTTAGT GAACCGTCAG ATCGCCTGGA GACGCCATCC ACGCTGTTTT 720
GACCTCCATA GAAGACACCG GGACCGATCC AGCCTCCGCG GCCGGGAACG GTGCATTGGA 780
ACGCGGATTC CCCGTGCCAA GAGTGACGTA AGTACCGCCT ATAGAGTCTA TAGGCCCACC 840
CCCTTGGCTT CTTATGCATG CTATACTCTT TTTGGCTTGG GCTCTATACA CCCCCGCTTC 900
CTCATGTTAT AGGTGATGGT ATAGCTTAGC CTATAGGTGT GGGTTATTGA CCATTATTGA 960
CCACTCCCCT ATTGGTGACG ATACTTTCCA TTACTAATCC ATAACATGGC TCTTTGCCAC 1020
AACTCTCTTT ATTGGCTATA TGCCAATACA CTGTCCTTCA GAGACTGACA CGGACTCTGT 1080
atttttacag GATGGGCTCT CATTTATTAT TTACAAATTC ACATATACAA CACCACCGTC 1140
CCCAGTGCCC GCAGTTTTTA TTAAACATGC TAACGTGGGA TCTCCACGCG AATCTCGGGT 1200
ACCTGTTCCG GACATGGGCT CTTCTCCGGT AGCGGCGGAG CTTCTACATC CGAGrCCTGC 1260
TCCCATCCCT CCAGCGACTC ATGGTCGCTC GGOAGCTCCT TGCTCCTAAC AGTGGAGGCC 1320
AGACTTAGGC ACAGCACGAT GCCCACCACC ACCAGTGTGC CGCACAAGGC CGTGGCGGTA 1380
GGGTATGTGT CTGAAAATGA GCTCGGGGAG CGGOCTTGCA CCGCTGACGC ATTTGGAAGA 1440
CTTAAGGCAG CGGCAGAAGA AGATGCAGGC AGCTGAGTTG TTGTGTTCTG ATAAGAGTCA 1500
GAGGTAACTC CCGTTGCGGT GCTGTTAACG GTGGAGGGCA GTGTAGTCTG AGCAGTACTC 1560
GTTGCTGCCG CGCGCGCCAC CAGACATAAT AGCTGACAGA CTAACAGACT GTTCCTTTCC 1620
ATGCCTCTTT TCTGCAGTCA CCGTCCTTAG ATCTGCTGTG CCTTCTAGTT GCCAGCCATC 1680
TGTTGTTTGC CCCTCCCCCG TGCCTTCCTT GACCCTGGAA GGTGCCACTC CCACTGTCCT 1740
TTCCTAATAA AATGAGGAAA TTGCATCGCA TTGTCTGACT AGGTCTCATT CTATTCTGGG 1800
GGGTGGGGTG GGGCAGCACA GCAAGGGGGA GGATTGGGAA GACAATAGCA GGCATGCTGG 1860
GGATGCGGTG GGCTCTATGG GTACGGCCGC AGCGGCCGTA CCCAGGTGCT GAAGAATTGA 1920
CCCGGTTCCT CGACCCGTAA AAAGGCCGCG TTGCTGGCGT TTTTCCATAG GCTCCGCCCC 1980
178 626
CCTCACGAGC ATCACAAAAA TCGACGCTGA ACTCAGAGCT G^iCGA^J^CCC GACAGGACTA 2040
TAAAGATACC AGGCCTTTTCC CCCTCGAACC TCCCTCGTCC GcτcrccrGT rCCCACCCTG 2100
CCCCTTACCG GATACCTGTC CGCcmCTC CCTT’CCCGAA GCCTGGCGCT TTCTCAAT'GC 2160
rcACGcrcτA GCTATCrCAG TTCGCTGTAG CTCOTCGCT ccAACcrc;cc CTGTGTGCAC 2220
GAACCCCCCG rr·cACcccGA CCCCTGCGCC TTATCCGGTA ACTATccrcr rGACrCCAAC 2260
CCGGTAAGAC ACGACTTATC GCCACTGGCA CCAGCCACrG GrAACACGA'T TAGCAGAGCG 2340
AGGTArGrAG GCGCTGCTAC AGAGTTCTTG AACTGCTGGC OWACTA-CGG CTACACTAGC 2400
TGAAGGACAG rArττΌσrAr CTGCGCTCTG CTOA^GCCAG AAAAAGACTT 2460
GσrAG<crc·rr GATCCGGCAA ACAAACCACC GCTGGTACCG GrG<crττττr rGrτrΌCAAc 2520
CAGCAGATTA CGCGCAGAAA AAAAGCATCT CAAGAAGATC cτΓTcArcτr •nCTACGTGA 2580
TCCCGTAATG CTCTGCCAGT GTTACAACCA ATTAACCAAT AAAACTCATC 2640
GAGCATCAAA rGAAACrGCA AτrτΆTτcAr ATCAGGATTA KAATACCAT ATmTGAAA 2700
AAGCCGTTTC rCTAATΌAAG GAGAAAACTC ACCGAGGCAG 'rTCCATACGA rGGCAAGATC 2760
CT'GGrAr·CGG T'C:TCCGATTC CGACTCGTCC AACATCAATA CAACCTATrA ATnCCCCTC 2820
GTCAAAAATA AGGTTATCAA GTGAGAAATC ACCATGAGTG ACGACIGAAT CCGGTGAGAA 2880
TGGCAAAAGC rτA,τGCAτrτ CTTTCCAGAC TTGTTCAACA GGCCAGCCAT TACGcrccrc 2940
ATCAAAATCA CTCGCATCAA ccAAAccσrr ATTCATTCGT GATTGCGCCT GAGCGAGACG 3000
AAATACGCGA rCGCTGrTAA AAGGACAATT ACAAACAGGA ATCCAArGCA ACCGGCGCAG 3060
GAACACrCCC AGCGCArCAA CAATATTTTC ACCTGAATCA GGATAnCTT CrAATACCrG 3120
GAAΓrGcrG'τr ITCZrcGGGGA rcGCAGrGGr GACTAACCAT GCATCATCAG CA<GrACGGAT 3180
AAAA‘TGCTT'G ATCCTCGGAA GAGGCATAAA 1TCCGTCAGC CAGTTTAGTC rGACCA'τcrc 3240
ATCTGTAACA rcA.rr'GGCAA cccτAccτττ GCCATGTn,C AGAAACAACT CTCGCGCATC 3300
GCOCTTCCCA TAC^AATCGAT AGATTGTCGC ACCTGA'TTGC CCGACATTAT CGCGAGCCCA 3360
TTTATACCCA TATAAATCAG CATCCATGTT GGAATτrAAr CGCCGCCTCG AGCAAGACGT 3420
ttcccgttga ArAIGGCTCA TAACACCCCT TGTArτAcr’c TTTATCTAAG CAGACACTTT 3480
rA’ΓTGτr'CAT GATGATATAT TTTTATCT'T^G TGCAArGrAA CArCACACAr nTGAGACAC 3540
AACGrGGCrT TCC
3553
178 626 (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 46 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 72 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 46: TCACCGTCCTTAGATCGGTACAACCATGAAGACTATCATTGCTITGAGCTACATTTTATGTCT GGTTTTCGC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 47 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 111 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 47: TCATGCTTTTTGCTTTGTGTTGTTTTGCTGGGGTTCATCATGTGGGCCTGCCAAAAAGGCAA CATTAGGTGCAACA TTTGCATTTGAAGATCTATGTGGGATCTGCTGTGC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 48 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 63 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTECZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 48: TTAGATCGGAACATGAAAGCAAAAlCTACTAGTCCTGTTATGTGCATTTACAGCTACATATGCA (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 49 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 102 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 49: CTGGTGCTTTTGGTCTCCCTGGGGGCAATCAGCTTGTGGATGTGTTCTAATGGGTCTTTGCA GTGTGAA.TATGCATCTGAATGTGGGATCTGCTGTGCCTT (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 50 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJE (A) DŁUGOŚĆ: 108 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie
178 626 (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 50: CCTTAGATCGGTACAACCATGAAGGCAATAA.TTGTACTACTCATGGTAGTAACATCCAACGC AGATCGAA.TCTGCACTGGGATAACATCTTCAAACTCACCTCATGTG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 51 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 102 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 51: TTGGCTGTAA.CATTGATGATA.GCTATTTTTA.TrGTTTA.TATGGTCTCC.AG.AGACAATGTTTCTT GCTCCATCTGTCTATAAATGTGGGATCTGCTGTGCCTT (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Ni- 52 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 84 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 52: GTCCTTAGArCCACC.ATl^i^^iCGTCCCAAGGCACCAAACGG^TC^lTATGAACAGATGGAAACTG ATGGGGAACGCCAGAATGCAACT (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 53 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 108 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 53: GAAAAGGCAACGAACCCGATCGTGCCCTC'nTTGACATGA.GTAATGAAGGATCTTATTTCT TCGGAGACAATGCAGAAGAGTACGACAATTAAGGATCTGCTGTGCCT (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 54 (i) OHARA^TT^^^S^^YKA SEKWNCJIi (A) DŁUGOŚĆ: 132 pary zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 54:
178 626
CTTAGATCCAGATCTACCATGAGTCTTCTAACCGAGGTCGAAACGTATGTTCTCTCTATCGT
TCCATCAGGCCCCCTCAAAGCCGAAATCGCGCAGAGACTTGAAGATGTCTTTGCTGGGAA
AAACACAGAT (2) INF01RMACCA DO IDENTAYTKATOIRA SEKW. Nr 55 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 129 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 55: GGGACTCArCCTAGCTCCAGTACTGGTCTAAAAGATGATCTTCrTGAAAATTTGCAGACCrA rCAGAAACGAATGGGGGrGCAGATGCAACGGTTCAAGrGAAGATCTArGTGGGATCrGCr GTGCCTT (2) INFOIRMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 56 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 81 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 56: CrTAGATCCACCArGTCCAACArGGArA'TrGACGGTATCCAACACTGGGACAATTGACAAAA CACCGGAAGAAATAACTTCT (2) INFOIRMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 55 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 96 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 57: GTTGAAATTCCAATrAAGCAGACCATCCCCAA'rTΓC'TTCTTTGGGAGGGACACAGCAGAGG ATTΛTGΛTGACCrCGArTA'TTAAGGATCTGCTGrG (2) INFOIRMACCA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 58 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 96 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 58: CrrAGATCCACCATGTCGCrGrTTGGAGACACAArTGCCTACCTGCT'TTCA'TrGACAGAAGA TGGAGAAGGCAAAGCAGAACTAGCAGAAAAATTA (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKACJI SEKW. Nr 59
178 626 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 123 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 59: AGATCICΊTGGGGCAAGICAAGAGAATGGGGAAGGAAΊTGCAAAGGAIGIGAIGGAAGIG CTAAAGCAGAGCTCIAIGGGAAAITCAGCICITGIGAAGAAATACCTATAAGGATCTGCIGI'G (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nit 60 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 pary zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 60: GGIACAAAIATIGGCIATTGGCCATIGCAIACG (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 61 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 61: CCACAICICGAGGAACCGGGICAATIC'ΠCAGCACC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 62 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (B) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 62: GGTACAGAIATCGGAAAAGCCACGTTGTGTCICAAAAIC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 63 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 37 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie
178 626 (iv) ANTYSENS: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 63: CCACATGGATCCGTAATCCTCTGCCAGTGTTACAACC (2) INFORMACJA DO IDENTYFIKATORA SEKW. Nr 64 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 39 par zasad (b) TYP: Kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: Obie (D) TOPOLOGIA: Obie (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (iii) HIPOTETYCZNA: nie (xi) OPIS SEKWENCJI: IDENTYFIKATOR SEKW. Nr 64: GGTACATGATCACGTAGAAAAGAICAAAGGAICTICITG
178 626 <r>
>
ŚREDNI LOG MIANA W TEŚCIE ELISA
WEEKS
TYGODNIE
FIG.2
178 626 % LIZY SWOISTEJ * LIZY SWOISTEJ % SPECIFIC LYSIS % SPECIFIC LYSIS
FIG.3A FIG.3C
178 626
FIG.4
FIG.5 o
178 626
TCGCGCGTTT CGGTGATGAC GGTGAAAACC TCTGACACAT GCAGCTCCCG
GAGACGGTCA CAGCTTGTCT GTAAGCGGAT GCCGGGAGCA GACAAGCCCG
101 TCAGGGCGCG TCAGCGGGTG TTGGCGGGTG TCGGGGCTGG CTTAACTATG
151 CGGCATCAGA GCAGATTGTA CTGAGAGTGC ACCATATGCG GTGTGAAATA
201 CCGCACAGAT GCGTAAGGAG AAAATACCGC ATCAGATTGG CTATTGGCCA
251 TTGCATACGT TGTATCCATA TCATAATATG TACATTTATA TTGGCTCATG
301 TCCAACATTA CCGCCATGTT GACATTGATT ATTGACTAGT TATTAATAGT
351 AATCAATTAC GGGCTCATTA GTTCATAGCC CATATATGGA GTTCCGCGTT
401 ACATAACTTA CGGTAAATGG CCCGCCTGGC TGACCGCCCA ACGACCCCCG
451 CCCATTGACG TCAATAATGA CGTATGTTCC CATAGTAACG CCAATAGGGA
501 CTTTCCATTG ACGTCAATGG GTGGAGTATT TACGGTAAAC TGCCCACTTG
551 GCAGTACATC AAGTGTATCA TATGCCAAGT ACGCCCCCTA TTGACGTCAA
601 TGACGGTAAA TGGCCCGCCT GGCATTATGC CCAGTACATG ACCTTATGGG
651 ACTTTCCTAC TTGGCAGTAC ATCTACGTAT TAGTCATCGC TATTACCATG
701 GTGATGCGGT TTTGGCAGTA CATCAATGGG CGTGGATAGC GGTTTGACTC
751 ACGGGG ATTT CCAAGTCTCC ACCCCATTGA CGTCAATGGG AGTTTGTTTT
801 GGCACCAAAA TCAACGGGAC TTTCCAAAAT GTCGTAACAA CTCCGCCCCA
851 TTGACGCAAA TGGGCGGTAG GCGTGTACGG TGGGAGGTCT ATATAAGCAG
901 AGCTCGTTTA GTGAACCGTC AGATCGCCTG GAGACGCCAT CCACGCTGTT
951 TTGACCTCCA TAGAAGACAC CGGGACCGAT CCAGCCTCCG CGGCCGGGAA
1001 CGGTGCATTG GAACGCGGAT TCCCCGTGCC AAGAGTGACG TAAGTACCGC
1051 CTATAGAGTC TATAGGCCCA CCCCCTTGGC TTCTTATGCA TGCTATACTG
1101 TTTTTGGCTT GGGGTCTATA CACCCCCGCT TCCTCATGTT ATAGGTGATG
1151 GTATAGCTTA GCCTATAGGT GTGGGTTATT GACCATTATT GACCACTCCC
1201 CTATTGGTGA CGATACTTTC CATTACTAAT CCATAACATG GCTCTTTGCC
FIG. 6A
178 626
ACAACTCTCT TTATTGGCTA TATGCCAATA CACTGTCCTT CAGAGACTGA
CACGGACTCT GTATJJ MAC AGG ATGGGGT CTCATTTATT ATTTACAAAT
TCACATATAC AACACCACCG TCCCCAGTGC CCGCAGTTTT TATTAAACAT
AACGTGGGAT CTCCACGCG A ATCTCGGGTA CGTGTTCCGG ACATGGGCTC
TTCTCCGGTA GCGGCGGAGC TTCTACATCC GAGCCCTGCT CCCATGCCTC
CAGCGACTCA TGGTCGCTCG GCAGCTCCTT GCTCCTAACA GTGGAGGCCA
GACTTAGGCA CAGCACGATG CCCACCACCA CCAGTGTGCC GCACAAGGCC
GTGGCGGTAG GGTATGTGTC TGAAAATGAG CTCGGGGAGC GGGCTTGCAC
CGCTGACGCA TTTGGAAGAC TTAAGGCAGC GGCAGAAGAA GATGCAGGCA
GCTGAGTTGTTGTGTTCTGA TAAGAGTCAG AGGTAACTCC CGTTGCGGTG
CTGTTAACGG TGGAGGGCAG TGTAGTCTGA GCAGTACTCG TTGCTGCCGC
GCGCGCCACC AGACATAATA GCTGACAGAC TAACAGACTG TTCCTTTCCA
TGGGTCTTTT CTGCAGTCAC CGTCCTTAG ATCTGCTGTG CCTTCTAGTT
GCCAGCCATC TGTTGTTTGC CCCTCCCCCG TGCCTTCCTT GACCCTGGAA
GGTGCCACTC CCACTGTCCT TTCCTAATAA AATGAGGAAA TTGCATCGCA
TTGTCTGAGT AGGTGTCATT CTATTCTGGG GGGTGGGGTG GGGCAGCACA
GCAAGGGGGA GGATTGGG AA GAC AAT A GCA GGCATGCTGG GGATGCGGTG
GGCTCTATGG GTACCCAGGT GCTGAAGAAT TGACCCGGTT CCTCCTGGGC
CAGAAAGAAG CAGGCACATC CCCTTCTCTG TGACACACCC TGTCCACGCC
CCTGCTTCTT AGTTCCAGCC CCACICATAG GACACTCATA GCTCAGGAGG
GCTCCGCCTT CAATCCCACC CGCTAAAGTA CTTGGAGCGG TCTCTCCCTC
CCTCATCAGC CCACCAAACC AAACCTAGCC TCCAAGAGTG GGAAGAAATT
AAAGCAAGAT AGGCTATTAA GTGCAGAGGG AGAGAAAATG CCTCCAACAT
GTG AGG AAGT AATG AG AG AA ATCATAG AAT TTCTTCCGCT TCCTCGCTCA
CTGACTCGCT GCGCTCGGTC GTTCGGCTGC GGCGAGCGGT ATCAGCTCAC
FJG.6B
178 626
2501 tcaaaggcgg taatacggtt atccacagaa tcaggggata acgcaggaaa
2551 GAACATGTGA GCAAAAGGCC AGCAAAAGGC CAGGAACCGT AAAAAGGCCG
2601 CGTTGCTGGC GTTTTTCCAT AGGCTCCGCC CCCCTGACGA GCATCACAAA
2651 AATCGACGCT CAAGTCAGAG GTGGCGAAAC CCGACAGGAC TATAAAGATA
2701 CCAGGCGTTT CCCCCTGGAA GCTCCCTCGT GCGCTCTCCT GTTCCG ACCC
2751 TGCCGCTTAC CGGATACCTG TCCGCCTTTC TCCCTTCGGG AAGCGTGGCG
2801 CTTTCTCAAT GCTCACGCTG TAGGTATCTC AGTTCGGTGT AGGTCGTTCG
2851 CTCCAAGCTG GGCTGTGTGC ACGAACCCCC CGTTCAGCCC GACCGCTGCG
2901 CCTTATCCGG TAACTATCGT CTTGAGTCCA ACCCGGTAAG ACACGACTTA
2951 TCGCCACTGG CAGCAGCCAC TGGTAACAGG ATTAGCAGAG CGAGGTATGT
3001 AGGCGGTGCT ACAGAGTTCT TGAAGTGGTG GCCTAACTAC GGCTACACTA
3051 G AAGG ACAGT ATTTGGTATC TGCGCTCTGC TG AAGCCAGT TACCTTCGG A
3101 AAAAGAGTTG GTAGCTCTTG ATCCGGCAAA CAAACCACCG CTGGTAGCGG
3151 TGGTTTTTTT GTTTGCAAGC AGCAG ATTAC GCGCAGAAAA AAAGGATCTC
3201 AAGAAGATCC TTTGATCTTT TCTACGGGGT CTGACGCTCA GTGGAACGAA
3251 AACTCACGTT AAGGGATTTT GGTCATGAGA TTATCAAAAA GGATCTTCAC
3301 CTAGATCCTT ΤΓΑΑΑΤΓΑΑΑ AATGAAGTTT TAAATCAATC TAAAGTATAT
3351 ATG AGTAAAC TTGGTCTGAC AGTTACCAAT GCITAATCAG TG AGGCACCT
3401 ATCTCAGCG A TCTGTCTATT TCGTTCATCC ATAGTTGCCT G ACTCCCCGT
3451 CGTGTAG ATA ACTACGATAC GGGAGGGCIT ACCATCTGGC CCCAGTGCTG
3501 CAATGATACC GCGAGACCCA CGCTCACCGG CTCCAGATTT ATCAGCAATA
3551 AACCAGCCAG CCGGAAGGGC CGAGCGCAGA AGTGGTCCTG CAACTTTATC
3601 CGCCTCCATC CAGTCTATTA ATTGTTGCCG GGAAGCTAGA GTAAGTAGTT
3651 CGCCAGTTAA TAGTTTGCGC AACGTTGTTG CCATTGCTAC AGGCATCGTG
3701 GTGTCACGCT CGTCGTTTGG TATGGCTTCA TTCAGCTCCG GTTCCCAACG
FIG. 6C
178 626
ATCAAGGCGA GTT AC ATG AT CCCCCATGTT GTGCAAAAAA GCGGTTAGCT
CCTTCGGTCC TCCGATCGTT GTCAGAAGTA AGTTGGCCGC AGTGTTATCA
CTCATGGTTA TGGCAGCACT GCATAATTCT CTTACTGTCA TGCCATCCGT
AAGATGCTTT TCTGTG ACTG GTGAGTACTC AACCAAGTCA TTCTGAG AAT
AGTGTATGCG GCG ACCGAGT TGCTCTTGCC CGGCGTCAAT ACGGGATAAT
ACCGCGCCAC ATAGCAGAAC TTTAAAAGTG CTCATCATTG GAAAACGTTC
TTCGGGGCGA AAACTCTCAA GGATCTTACC GCTGTTGAGA TCCAGTTCGA
TGTAACCCAC TCGTGCACCC AACTG ATCTT CAGCATCTTT TACTTTCACC
AGCGTTTCTG GGTGAGCAAA AACAGGAAGG CAAAATGCCG CAAAAAAGGG
AATAAGGGCG ACACGGAAAT GTTGAATACT CATACTCTTC CTTTTTCAAT
ATTATTGAAG CATTTATCAG GGTTATTGTC TCATGAGCGG ATACATATTT
G AATGTATTT AGAAAAATAA ACAAATAGGG GTTCCGCGCA CATTTCCCCG
AAAAGTGCCA CCTGACGTCT AAGAAACCAT TATTATCATG ACATTAACCT
ATAAAAATAG GCGTATCACG AGGCCCTTTC GTC
FI6.6D
178 626
TCGCGCGTTT CGGTGATGAC GGTGAAAACC TCTGACACAT GCAGCTCCCG
GAGACGGTCA CAGCTTGTCT GTAAGCGGAT GCCGGGAGCA GACAAGCCCG
TCAGGGCGCG TCAGCGGGTG TTGGCGGGTG TCGGGGCTGG CTTAACTATG
CGGCATCAGA GCAGATTGTA CTGAGAGTGC ACCATATGCG GTGTGAAATA
CCGCACAGAT GCGTAAGGAG AAAATACCGC ATCAGATTGG CTATTGGCCA
TTGCATACGT TGTATCCATA TCATAATATG TACATTTATA TTGGCTCATG
TCCAACATTA CCGCCATGTT GACATTGATT ATTGACTAGTTATTAATAGT
AATCAATTAC GGGGTCATTA GTTCATAGCC CATATATGGA GTTCCGCGTT
ACATAACTTA CGGTAAATGG CCCGCCTGGC TGACCGCCCA ACGACCCCCG
CCCATTGACG TCAATAATGA CGTATGTTCC CATAGTAACG CCAATAGGGA
CTTTCCATTG ACGTCAATGG GTGGAGTATT TACGGTAAAC TGCCCACTTG
GCAGTACATC AAGTGTATCA TATGCCAAGT ACGCCCCCTA TTGACGTCAA
TGACGGTAAA TGGCCCGCCT GGCATTATGC CCAGTACATG ACCTTATGGG
ACTTTCCTAC TTGGGAGTAC ATCTACGTAT TAGTCATCGC TATTACCATG
GTGATGCGGTTTTGGCAGTA CATCAATGGG CGTGGATAGC GGTTTGACTC
ACGGGGATTT CCAAGTCTCC ACCCCATTGA CGTCAATGGG AGTTTGTTTT
GGCACCAAAA TCAACGGGAC TTTCCAAAAT GTCGTAACAA CTCCGCCCCA
TTG ACGCAAA TGGGCGGTAG GCGTGTACGG TGGG AGGTCT ATATAAGCAG
AGCTCGTTTA GTGAACCGTC AGATCGCCTG GAGACGCCAT CCACGCTGTT
TTGACCTCCA TAGAAGACAC CGGGACCGAT CCAGCCTCCG CGGCCGGGAA
CGGTGCATTG G AACGCGG AT TCCCCGTGCC AAGAGTGACG TAAGTACCGC
CTATAGAGTC TATAGGCCCA CCCCCTTGGC TTCTTATGCA TGCTATACTG
TTTTTGGCTT GGGGTCTATA CACCCCCGCT TCCTCATGTT ATAGGTGATG
GTATAGCTTA GCCTATAGGT GTGGGTTATT GACCATTATT GACCACTCCC
FIG. 7A
178 626
CTATTGGTGA CGATACTTTC CATTaCTAAT CCATAACATG GCTCTTTGCC
ACAACTCTCT TTATTGGCTA TATGCCAATA CACTGTCCTT CAGAGACTG A
CACGGACTCT GTATTTTTAC AGGATGGGGT CTCATTTATT ATTTACAAAT
TCACATATAC AACACCACCG TCCCCAGTGC CCGCAGTTTT TATTAAACAT
AACGTGGGAT CTCCACGCGA ATCTCGGGTA CGTGTTCCGG ACATGGGCTC
TTCTCCGGTA GCGGCGGAGC TTCTACATCC GAGCCCTGCT CCCATGCCTC
CAGCGACTCA TGGTCGCTCG GCAGCTCCTT GCTCCTAACA GTGGAGGCCA
GACTTAGGCA CAGCACGATG CCCACCACCA CCAGTGTGCC GCACAAGGCC
GTGGCGGTAG GGTATGTGTC TGAAAATGAG CTCGGGGAGC GGGCTTGCAC
CGCTGACGCA TTTGGAAGAC TTAAGGCAGC GGCAGAAGAA GATGCAGGCA
GCTG AGTTGT TGTGTTCTGA TAAGAGTCAG AGGTAACTCC CGTTGCGGTG
CTGTTAACGG TGGAGGGCAG TGTAGTCTGA GCAGTACTCG TTGCTGCCGC
GCGCGCCACC AGACATAATA GCTGACAGAC TAACAGACTG TTCCTTTCCA
TGGGTCTTTT CTGCAGTCAC CGTCCTTAG ATCTGCTGTG CCTTCTAGTT
GCCAGCCATC TGTTGTTTGC CCCTCCCCCG TGCCTTCCTT GACCCTGGAA
GGTGCCACTC CCACTGTCCT TTCCTAATAA AATGAGGAAA TTGCATCGCA
TTGTCTGAGT AGGTGTCATT CTATTCTGGG GGGTGGGGTG GGGCAGCACA
GCAAGGGGGA GGATTGGGAA GACAATAGCA GGCATGCTGG GGATGCGGTG
GGCTCTATGG GTACCCAGGT GCTGAAG AAT TGACCCGGTT CCTCCTGGGC
CAGAAAGAAG CAGGCACATC CCCTTCTCTG TGACACACCC TGTCCACGCC
CCTGGTTCTT AGTTCCAGCC CCACTCATAG GACACTCATA GCTCAGGAGG
GCTCCGCCTT CAATCCCACC CGCTAAAGTA CTTGGAGCGG TCTCTCCCTC
CCTCATCAGC CCACCAAACC AAACCTAGCC TCCAAGAGTG GGAAGAAATT
AAAGCAAGAT AGGCTATTAA GTGCAGAGGG AGAGAAAATG CCTCCAACAT GTG AGGAAGT AATGAGAGAA ATCATAG AAT TTCTTCCGCT TCCTCGCTCą
FIG. 7B
178 626
2451 CTG ACTCGCT GCGCTCGGTC GTTCGGCTGC GGCGAGCGGT ATCAGCTCAC
2501 TCAAAGGCGG TAATACGGTT ATCCACAGAA TCAGGGGATA ACGCAGGAAA
2551 GAACATGTGA GCAAAAGGCC AGCAAAAGGC CAGGAACCGT AAAAAGGCCG
2601 CGTTGCTGGC GTTTTTCCAT AGGCTCCGCC CCCCTGACGA GCATCACAAA
2651 AATCG ACGCT CAAGTCAG AG GTGGCG AAAC CCGACAGG AC TATAAAG ATA
2701 CCAGGCGTTT CCCCCTGGAA GCTCCCTCGT GCGCTCTCCT GTTCCGACCC
2751 TGCCGCTTAC CGGATACCTG TCCGCCTTTC TCCCTTCGGG AAGCGTGGCG
2801 CTTTCTCAAT GCTCACGCTG TAGGTATCTC AGTTCGGTGT AGGTCGTTCG
2851 CTCCAAGCTG GGCTGTGTGC ACGAACCCCC CGTTCAGCCC GACCGCTGCG
2901 CCTTATCCGG TAACTATCGT CTTGAGTCCA ACCCGGTAAG ACACGACTTA
2951 TCGCCACTGG CAGCAGCCAC TGGTAACAGG ATTAGCAGAG CGAGGTATGT
3001 AGGCGGTGCT ACAGAGTTCT TG AAGTGGTG GCCTAACTAC GGCTACACTA
3051 GAAGGACAGT ATTTGGTATC TGCGCTCTGC TG AAG CC AGT TACCTTCGGA
3101 AAAAGAGTTG GTAGCTCITG ATCCGGCAAA CAAACCACCG CTGGTAGCGG
3151 TGGTTTTTTr GTTTGCAAGC AGCAGATTAC GCGCAGAAAA AAAGGATCTC
3201 AAG AAGATCC TTTGATCTTT TCTACGGGGT CTG ACGCTCA GTGG AACG AA
3251 AACTC ACGTT AAGGG ATTTT GGTCATG AG A TTATC AAAAA GG ATCTTCAC
3301 CTAG ATCCTT TTAAATTAAA AATGAAGTTT TAAATCAATC TAAAGTATAT
3351 ATG AGTAAAC TTGGTCTG AC AGTTACCAAT GCTTAATCAG TGAGGCACCT
3401 ATCTCAGCG A TCTGTCTATT TCGTTCATCC ATAGTTGCCT GACTCCGGGG
3451 GGGGGGGGCG CTGAGGTCTG CCTCGTGAAG AAGGTGTTGC TGACTCATAC
3501 CAGGCCTGAA TCGCCCCATC ATCCAGCCAG AAAGTGAGGG AGCCACGGTT
3551 G ATG AG AGCT TTGTTGTAGG TGG ACCAGTT GGTGATTTTG AACTTTTGCT
3601 TTGCCACGGA ACGGTCTGCG TTGTCGGGAA GATGCGTGAT CTGATCCTTC 3651 AACTCAGCAA AAGTTCGATT TATTCAACAA AGCCGCCGTC CCGTCAAGTC
FIG. 7C
178 626
AGCGTAATGC TCTGCCAGTG TTACAACCAA TTAACCAATT CTG ATT AG AA
AAACTCATCG AGCATCAAAT GAAACTGCAATTTATTCATA TC AGG ATT AT
CAATACCATA TTTTTGAAAA AGCCGTTTCT GTAATGAAGG AGAAAACTCA
CCGAGOCAGT TCCATAGG AT GGCAAGATCC TGGTATCGGT CTGCGATTCC
G ACTCGTCCA ACATCAATAC AA CCT ATT AA TTTCCCCTCG TCAAAAATAA
GGTTATCAAG TGAGAAATCA CCATGAGTGA CGACTGAATC CGGTGAGAAT
GGCAAAAGCT TATGCATTTC TTTCCAGACT TGTTCAACAG GCCAGCCATT
ACGCTCGTCA TCAAAATCAC TCGCATCAAC CAAACCGTTA TTCATTCGTG
ATTGCGCCTG AGCGAGACGA AATACGCGAT CGCTGTTAAA AGGACAATTA
CAAACAGGAA TCGAATGCAA CCGGCGCAGG AACACTGCCA GCGCATCAAC
AATATTTTCA CCTGAATCAG GATATTCTTC TAATACCTGG AATGCTGTTT
TCCCGGGGAT CGCAGTGGTG AGTAACCATG CATCATCAGG AGTACGGATA
AAATGCTTGA TGGTCGGAAG AGGCATAAAT TCCGTCAGCC AGTTTAGTCT
GACCATCTCA TCTGTAACAT CATTGGCAAC GCTACCTTTG CCATGTTTCA
GAAACAACTC TGGCGCATCG GGCTTCCCAT ACAATCGATA GATTGTCGCA
CCTGATTGCC CGACATTATC GCGAGCCCAT TTATACCCAT ATAAATCAGC
ATCCATGTTG GAATTTAATC GCGGCCTCGA GCAAGACGTT TCCCGTTGAA
TATGGCTCAT AACACCCCTT GTATTACTGT TTATGTAAGC AGACAGTTTT
ATTGTTCATG ATGATATATT TTTATCTTGT GCAATGTAAC ATCAGAG ATT
TTGAGACACA ACGTGGCTTT CCCCCCCCCC CCATTATTGA AGCATTTATC
AGGGTTATTG TCTCATG AGC GGATACATAT TTG AATGTAT TTAG AAAAAT
AAACAAATAG GGGTTCCGCG CACATTTCCC CGAAAAGTGC CACCTGACGT
CTAAGAAACC ATTATTATCA TG ACATTAAC CTATAAAAAT AGGCGTATCA
CGAGGCCCTT TCGTC
FIG.7D
178 626
ATTGGCTATT GGCCATTGCA TACGTTGTAT CCATATCATA ATATGTACAT
TTATATTGGC TCATGTCCAA CATTACCGCC ATGTTGACAT TGATTATTGA
101 CTAGTTATTA ATAGTAATCA ATTACGGGGT CATTAGTTCA TAGCCCATAT
151 ATGGAGTTCC GCGTTACATA ACTTACGGTA AATGGCCCGC CTGGCTGACC
201 GCCCAACGAC CCCCGCCCATTGACGTCAAT AATGACGTAT GTTCCCATAG
251 TAACGCCAAT AGGGACTITC CATTGACGTC AATGGGTGG A GTATTTACGG
301 TAAACTGCCC ACTTGGCAGT ACATCAAGTG TATCATATGC CAAGTACGCC
351 CCCTATTGAC GTCAATGACG GTAAATGGCC CGCCTGGCAT TATGCCCAGT
401 ACATGACCTT ATGGGACTTT CCTACTTGGC AGTACATCTA CGTATTAGTC
451 ATCGCTATTA CCATGGTGAT GCGGTTTTGG CAGTACATCA ATGGGCGTGG
501 ATAGCGGTTT GACTCACGGG GATTTCCAAG TCTCCACCCC ATTGACGTCA
551 ATGGGAGTTT GTTTTGGCAC CAAAATCAAC GGGACTTTCC AAAATGTCGT
601 AACAACTCCG CCCCATTGAC GCAAATGGGC GGTAGGCGTG TACGGTGGGA
651 GGTCTATATA AGCAGAGCTC GTTTAGTGAA CCGTCAGATC GCCTGGAGAC
701 GCCATCCACG CTGTTTTGAC CTCCATAGAA GACACCGGGA CCGATCCAGC
751 CTCCGCGGCC GGGAACGGTG CATTGGAACG CGGATTCCCC GTGCCAAGAG
801 TGACGTAAGT ACCGCCTATA GAGTCTATAG GCCCACCCCC TTGGCTTCTT
851 ATGCATGCTA TACTGTTTTT GGCTTGGGGT CTATACACCC CCGCTTCCTC
901 ATGTTATAGG TGATGGTATA GCTTAGCCTA TAGGTGTGGG TTATTGACCA
951 TTATTGACCA CTCCCCTATT GGTGACGATA CTTTCCATTA CTAATCCATA
1001 ACATGGCTCT TTGCCACAAC TCTCTTTATT GGCTATATGC C AATACACTG
1051 TCCTTCAGAG ACTGACACGG ACTCTGTATT TTTACAGGAT GGGGTCTCAT
1101 ΤΤΑΤΓΑΤΤΤΑ CAAATTCACA TATACAACAC CACCGTCCCC AGTGCCCGCA
1151 GTTTTTATTA AACATAACGT GGGATCTCCA CGCGAATCTC GGGTACGTGT
1201 TCCGGACATG GGCTCTTCTC CGGTAGCGGC GGAGCTTCTA CATCCG AGCC
FIG. 8A
178 626
1251 CTGCTCCCAT GCCTCCAGCG ACTCATGGTC GCTCGGCAGC TCCTTGCTCC
1301 TAACAGTGGA GGCCAGACTT AGGCACAGCA CGATGCCCAC CACCACCAGT
1351 GTGCCGCACA AGGCCGTGGC GGTAGGGTAT GTGTCTGAAA ATGAGCTCGG
1401 GGAGCGGGCT TGCACCGCTG ACGCATTTGG AAGACTTAAG GCAGCGGCAG
1451 AAGAAGATGC AGGCAGCTGA GTTGTTGTGT TCTGATAAGA GTCAGAGGTA
1501 ACTCCCGTTG CGGTGCTGTT AACGGTGGAG GGCAGTGTAG TCTGAGCAGT
1551 ACTCGTTGCT GCCGCGCGCG CCACCAGACA TAATAGCTGA CAGACTAACA
1601 GACTGTTCCT TTCCATGGGT CITITCTGCA GTCACCGTCC TTAGATCTG
1651 CTGTGCCTTC TAGTTGCCAG CCATCTGTTG TTTGCCCCTC CCCCGTGCCT
1701 TCCTTGACCC TGGAAGGTGC CACTCCCACT GTCCTTTCCT AATAAAATGA
1751 GG AAATTGCA TCGCATTGTC TG AGTAGGTG TCATTCTATT CTGGGGGGTG
1801 GGGTGGGGCA GCACAGCAAG GGGGAGGATT GGGAAGACAA TAGCAGGCAT
1851 GCTGGGGATG CGGTGGGCTC TATGGGTACC CAGGTGCTGA AGAATTGACC
1901 CGGTTCCTCC TGGGCCAGAA AG AA GCA GGC ACATCCCCTT CTCTGTGACA
1951 CACCCTGTCC ACGCCCCTGG TTCTTAGTTC CAGCCCCACT CATAGGACAC
2001 TCATAGCTCA GGAGGGCTCC GCCTTCAATC CCACCCGCTA AAGTACTTGG
2051 AGCGGTCTCT CCCTCCCTCA TCAGCCCACC AAACCAAACC TAGCCTCCAA
2101 GAGTGGGAAG AAATTAAAGC AAGATAGGCT ATTAAGTGCA GAGGGAGAGA
2151 AAATGCCTCC AACATGTGAG GAAGTAATGA GAGAAATCAT AGAATTC
FIG.8B
178 626 ο ο u u *> -u c c ο ο 22 22
Ο CN Ο
S □
m
ΟΊ »
ο
Lu.
Ο
C>l
Noamia ogn ιν (Niw/ao^) χο^Λ
091·:1 nruazoueTozoj Azjd
Noumia 09 tu iv (Niw/ao^) χο^
091si njUBZoaajozoj Azjd <s ω
w
N
Q >i
E4
178 626
MIANO PRZECIWCIAŁ HI Hl ANTIBODY TITER
FIG. 10
178 626 <
ca
100(H a
«ο φ
-P
1000.0 •ΧΣ3
SUJ
H
OQ_
N
Ł«
a.
Σ
O
10^
NP DNA NP + HA BLANK DNA DNA dla NP PUSTY DNA
FIG.11
HA DNA
DNA dla HA
178 626
ŚREDNI LOG ZARADNOŚCI POPŁUCZYN NOZDRZY + SEM ŚREDNI LOG ZAKAŹNOŚCI POPŁUCZYN NOZDRZY +SEM
LU
CZ) fc
COCKTAIL
MIESZANINA
V1JFIG.12A
SAUNĘ
3OL FI2
FIZJOLOGICZNA
SÓL FIZJOLOGICZNA .12B
178 626
Sali
FIG. 13
178 626
FIG.14A
ANT1GEN T¥P ANTYGENU ΤΥΡΕ
A/SINGAPORE 1957-1967
A/HONG KONG 1968
Singapur
FIG.14B
178 626
BIAŁKO WIRUSOWE V1RAL PROTEIN mRNA
CLASS l MHC
MHC Klasy I
INJECTEO DNA
WSTRZYKNIĘTY
CYTOTOXIC T CELL Limfocyt T cytotoksyczny
FIG.15
DNA
178 626 co <
X <0 rH
TJ z
Ω
0)
Φ iM (0 «Η
O α
«Η
Ό <
Ω <
X (0
TJ <
z o
<
zg ag z c o — id
o a:
£
co «5 ca t-l
M
Q £
α
CO o
CD M ·*) CM ·»— O
W3S + M3JJLL AUAIDUNI (00301
H3S + I0§0NZraVZ VNVIW (01)003
178 626
FIG17
178 626
Średnia geometryczna miana HI + SEM
Geometrie Mean HS Tiier ± SEM
f Week
Dose 1 Dose 2
Dawka 1 Dawka 2 Tydzień
FIG. I8
178 626
τ-,-,-1-,-,-Γ
Ο 20 40 60 80 % Specific Lysis % Lizy swoistej
100
FIG. 19
178 626
178 626
Dni po ekspozycji
FIG. 21
178 626
ŚREDNI % WAG. POCZĄTKOWEJ + SEM
Mean % of Starting Weight ± SEM
Day Afier Infeciion DNI PO ZAKAŻENIU
FIG. 22
178 626
ŚREDNI LOG MIANA WIRUSA W PŁUCACH + SEM
MEAN LOG VIRAL LUNG TITER ± SEM
Bi
NP DNA CONTROL
DNA dla NP DATA
KONTROLNY DNA
NO
INJECTłON
BEZ WSTRZYKNIĘCIA
FIG.23
178 626
100 Ί +ι +ι
DOSE (pg) dawka (pg)
FIG.24
178 626
N Ό >» •P\C χβ
*c Φ φ
o Od -H Η
*c •H Od N Ν
Φ N Ό Ό
*4 Ό O >.
N >> β -P
Ό «Ρ 0
>> N Od ΙΛ
4-> in $ CM > U t· \o od
\o α £! z ™ «Ρ CL CL
> Z Z
CL 0 φ
Z i f s-~f i ιη <0»-1 °£
tn 0 Cd Cd
to oj-P ν- £ c
_ 03 α. CL 0 0
CL 9-CC 2 O*
2 Z-' 2
«J
<u
U) c
OJ -H — Τζ>
•C u °
CU tn
Gta
LO
OJ o
Ll &ηδΐθΜ drsojo 5BIJ5U5 jo % idnjS T§en Partojfątezooj
178 626
<u
W)
C ra .c
U u
ej ra o.
U N Q
CD
C\J
O
L±Z
MS T J01LL IBJ!A βθΊ ueeyy
H3S + EsnjTn euejm 3oq pupajg
178 626
Φ c
Ν
Ł>
4J
OH
C
Φ
O
3!
ο u
4J
eo to
- '«ί- CM ο
cn c
o .c
O ł_
Q) sr
T3
O >.
N
O
CU
3!
Φ
O
O.
>\ 'C ra 2
Q £
ΓC\1 o
Lu ras i J9I!± IBJ!A “ΒΘΙΛΙ
N3S + esnjyn otre-rm afupaaę
178 626 % Przeżywalności % Survival
Day After Challenge
Dzień po ekspozycji
FIG. 28
178 626
Średni procent wagi początkowej
Mean percent of initial weighl
FIG. 29
Day affer infeciion
Dni po zakażeniu
178 626
- HA DNA (100, 10, 1 pg)
DNA dla HA
-<e s 8 >. z, c <-<
2 ί ° p
Φ
P ar c
>1 TJ M
O g(| o S -;= aJ ‘z c c «
- un r O o
CM un • O w po c
£. O ra ή ; x: ? LU O >>
N
O
JL_ °* a> S o-· φ ctf O a.
'c >* 0) <0
N u a geAf/uns %
I0§0tnVAA?3ZHd %
178 626 o
c
Ν
U
Φ*
C φ
C0
CD
CM α>
ο>
C
J0)
ΧΖ
Ο φ
<
>
co
Ω
Ό
Ο >»
Μ
Ο a
α λ
φ ο
a φ
Ή
Ν
Ω
ΡΟ ο
Ll_
W3S + J£4LL ?bjią ueai/U
Has + esnapa ouerm spupajS
178 626 <
z
Q >»
C rd o
Ul +>
c <
X <0
Φ cn c
ro x
O
Ł_
Φ ¢:
<
CO
Ω
T3
O >»
N
O
CL.
CO
Φ
O
Λ 'C
Φ
N α
FIG. 32 ras T J®1!± lBJ!A Boi ueeyy was + vsnaiA ynvih dot iNaaa§
178 626 □
ο.
α>
Ν co η
Ο *£ rC X Ch Ο
Τ3 C0 *Η Ο »-« ·Η C Ό «
ra ra
CM
β)
Ο)
C
0)
Το
JC
Τ3 ο
►>
Ν
Ο α
<α φ
ο
ο.
'C φ
>, Ν
C0 ο Ω
FIG. 33
TOS + J01!l IBJIA δοϊ oesgAj jjgg + esnjpn euBpm 3oq pupaj§
178 626
Control DNA DNA kontrolny
\O
Θ
JS O
O ^4
c •«r
0 T3 5
0
O C >»
c T-ł c
o S 0^
Ό O 5 >
O a o\o
c >>TJ Λ
Φ N O 0
o n
«Η CL 0
I—ł
Λ cloój:
CL Φ oo o
Φ N\ 0
N 0
0 N C «-
N 0 -Η 1
0 Tj
H
«»“·» r- φ j
cn
co
ra Ή — t
c Λ S
S 1
a i i
CO x cn i
Ό a> ω c ___ co ·. cn ra ! .·=: C 1 ‘co :=* I
φ o 5 £ < (0 ®
L X ~1
+
o.
z
-d
X z
a a
+ o
n. s 2 A + o < v x S
to qy
- OJ
I-,-1---!---1---,---1---J- O to W 'tf CO CM -5- O p 00
0)
O)
C ω
«0 £
O u
ω
Sż <
Ό
O >»
N
O
o.
co φ
o
o.
'C €0 n α °
PO o
Ll.
W3S WLl 1^ ji a 6oi
H3S ♦ esnayn euejm 3oq rupaaj
178 626 α
ο
X Ό
o O X
-er X O
T3 co
cfl
c σ\ ł.
•H C0\O
s \ B
o bfl O/—*
α C >
*4 O
N το > X
U «Κ co
O. Φ !» «
<
χ <0
Ο
CM
Ο
Day After Challenge
Dzień po ekspozycji iAi3S + Ϊθ-ΠΛ βθΊ uaaIA3 wag + esna^Fi euBtui 3οτ rupajs
178 626
GATATTGG CTATTGGCCA
251 TTGCATACGT TGTATCCATA TCATAATATGTACATTTATA TTGGCTCATG
301 TCCAACATTA CCGCCATGTT GACATTGATT ATTGACTAGT TATTAATAGT
351 AATCAATTAC GGGGTCATTA GTTCATAGCC CATATATGGA GTTCCGCGTT
401 ACATAACTTA CGGTAAATGG CCCGCCTGGC TGACCGCCCA ACGACCCCCG
451 CCCATTGACG TCAATAATGA CGTATGTTCC CATAGTAACG CCAATAGGGA
501 CTTTCCATTG ACGTCAATGG GTGGAGTATT TACGGTAAAC TGCCCACTTG
551 GCAGTACATC AAGTGTATCA TATGCCAAGT ACGCCCCCTA TTGACGTCAA
601 TGACGGTAAA TGGCCCGCCT GGCATTATGC CCAGTACATG ACCTTATGGG
651 ACTTTCCTAC TTGGCAGTAC ATCTACGTAT TAGTCATCGC TATTACCATG
701 GTGATGCGGT TTTGGCAGTA CATCAATGGG CGTGGATAGC GGTTTGACTC
751 ACGGGGATTT CCAAGTCTCC ACCCCATTGA CGTCAATGGG AGTTTGTTTT
801 GGCACCAAAA TCAACGGGAC TTTCCAAAAT GTCGTAACAA CTCCGCCCCA
851 TTGACGCAAA TGGGCGGTAG GCGTGTACGG TGGGAGGTCT ATATAAGCAG
901 AGCTCGTTTA GTGAACCGTC AGATCGCCTG GAGACGCCAT CCACGCTGTT
951 TTGACCTCCA TAGAAGACAC CGGGACCGAT CCAGCCTCCG CGGCCGGGAA
1001 CGGTGCATTG GAACGCGGAT TCCCCGTGCC AAGAGTGACG TAAGTACCGC
1051 CTATAG AGTC TATAGGCCCA CCCCCTTGGC TTCTTATGCA TGCTATACTG
1101 TTITIGGCTT GGGGTCTATA CACCCCCGCT TCCTCATGTT ATAGGTGATG
1151 GTATAGCTTA GCCTATAGGT GTGGGTTATT GACCATTATT GACCACTCCC
1201 CTATTGGTGA CGATACTTTC CATTACTAAT CCATAACATG GCTCTTTGCC
1251 ACAACTCTCT TTATTGGCTA TATGCCAATA CACTGTCCTT CAGAGACTG A
1301 CACGGACTCT GTATTTTTAC AGG ATGGGGT CTCATTTATT ATTTACAAAT
1351 TCACATATAC AACACCACCG TCCCCAGTGC CCGCAGTTTT TATTAAAC AT
FIG.36A
178 626
AACGTGGGAT CTCCACGCGA ATCTCGGGTA CGTGTTCCGG ACATGGGCTC
TTCTCCGGTA GCGGCGGAGC TTCTACATCC GAGCCCTGCT CCCATGCCTC
CAGCGACTCA TGGTCGCTCG GCAGCTCCTT GCTCCTAACA GTGGAGGCCA
GACTTAGGCA CAGCACGATG CCCACCACCA CCAGTGTGCC GCACAAGGCC
GTGGCGGTAG GGTATGTGTC TGAAAATGAG CTCGGGGAGC GGGCTTGCAC
CGCTGACGCA TTTGG AAG AC TTAAGGCAGC GGCAGAAGAA GATGCAGGCA
GCTGAGTTGTTGTGTTCTGA TAAGAGTCAG AGGTAACTCC CGTTGCGGTG
CTGTTAACGG TGGAGGGCAG TGTAGTCTGA GCAGTACTCG TTGCTGCCGC
GCGCGCCACC AGACATAATA GCTGACAGAC TAACAGACTG TTCCTTTCCA
TGGGTCTTTT CTGCAGTCAC CGTCCTTAG ATCTGCTGTG CCTTCTAGTT
GCCAGCCATC TGTTGTTTGC CCCTCCCCCG TGCCTTCCTT GACCCTGGAA
GGTGCCACTC CCACTGTCCT TTCCTAATAA AATGAGGAAA TTGCATCGCA
TTGTCTGAGT AGGTGTC ATT CTATTCTGGG GGGTGGGGTG GGGCAGCACA
GCAAGGGGGA GGATTGGGAA GACAATAGCA GGCATGCTGG GGATGCGGTG
GGCTCTATGG GTAC GGCCGCAGCGGCC GTACCCAGGT GCTGAAGAAT
TGACCCGGTT CCTCGACCCGT AAAAAGGCCG
CGTTGCTGGC GTTTTTCCAT AGGCTCCGCC CCCCTGACGA GCATCACAAA
AATCGACGCT CAAGTCAGAG GTGGCG AAAC CCGACAGGAC TATAAAGATA
CCAGGCGTTT CCCCCTGGAA GCTCCCTCGT GCGCTCTCCT GTTCCG ACCC
TGCCGCTTAC CGGATACCTG TCCGCCTTTC TCCCTTCGGG AAGCGTGGCG
CTTTCTCAAT GCTCACGCTG TAGGTATCTC AGTTCGGTGT AGGTCGTTCG
CTCCAAGCTG GGCTGTGTGC ACGAACCCCC CGTTCAGCCC GACCGCTGCG
CCTTATCCGG TAACTATCGT CTTGAGTCCA ACCCGGTAAG ACACGACTTA
TCGCCACTGG CAGCAGCCAC TGGTAACAGG ATTAGCAGAG CGAGGTATGT
AGGCGGTGCT ACAGAGTTCT TGAAGTGGTG GCCTAACTAC GGCTACACTA
FIG. 36 B
178 626
GAAGGACAGT ATTTGGTATC TGCGCTCTGC TG AAGCCAGT TACCTTCGGA
AAAAGAGTTG GTAGCTCTTG ATCCGGCAAA CAAACCACCG CTGGTAGCGG
TGGTTTTTTTGTTTGCAAGC AGCAGATTAC GCGCAGAAAA AAAGGATCTC
AAGAAGATCC TTTGATCTTT TCTACGTGATCC CGTAATGC TCTGCCAGTG
TTACAACCAA TTAACCAATT CTG ATT AG AA
AAACTCATCG AGCATCAAAT GAAACTGCAA TTTATTCATA TCAGGATTAT
CAATACCATA TTTTTGAAAA AGCCGTTTCT GTAATGAAGG AGAAAACTCA
CCG AGGCAGT TCCATAGG AT GGCAAG ATCC TGGTATCGGT CTGCG ATTCC
GACTCGTCCA ACATCAATAC AACCTATTAA TTTCCCCTCG TCAAAAATAA
GGTTATCAAG TGAGAAATCA CCATGAGTGA CGACTGAATC CGGTGAGAAT
GGCAAAAGCT TATGCATTTC TTTCCAGACT TGTTCAACAG GCCAGCCATT
ACGCTCGTCA TCAAAATCAC TCGCATCAAC CAAACCGTTA TTCATTCGTG
ATTGCGCCTG AGCGAGACGA AATACGCGAT CGCTGTTAAA AGGACAATTA
CAAACAGGAA TCGAATGCAA CCGGCGCAGG AACACTGCCA GCGCATCAAC
AATATTTTCA CCTG AATCAG GATATTCTTC TAATACCTGG AATGCTGTTT
TCCCGGGGAT CGCAGTGGTG AGTAACCATG CATCATCAGG AGTACGGATA
AAATGCTTGA TGGTCGGAAG AGGCATAAATTCCGTCAGCC AGTTTAGTCT
GACCATCTCA TCTGTAACAT CATTGGCAAC GCTACCTTTG CCATGTTTCA
GAAACAACTC TGGCGCATCG GGCTTCCCAT ACAATCG ATA GATTGTCGCA
CCTGATTGCC CGACATTATC GCGAGCCCAT TTATACCCAT ATAAATCAGC
ATCCATGTTG GAATTTAATC GCGGCCTCGA GCAAGACGTT TCCCGTTGAA
TATGGCTCAT AACACCCCTT GTATTACTGT TTATGTAAGC AGACAGTTTT
ATTGTTCATG ATGATATATT TTTATCTTGT GCAATGTAAC ATCAGAGATT
TTGAGACACA ACGTGGCTTT CC
FIG.36C
Departament Wydawnictw UP RP Nakład 70 egz.
Cena 6,00 zł

Claims (4)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Szczepionka polinukleotydowa, znamienna tym, że zawiera wektor plazmidowy DNA wybrany z grupy składającej się z pnRSV, VI, V1J, V1R, VI Jns i VI Jneo, który obejmuj e co naj mniej jeden element regulujący transkrypcję funkcjonalnie związany z sekwencjąnukleotydową kodującą nukleoproteinę wirusa grypy, oraz farmaceutycznie dopuszczalny bufor lub nośnik.
  2. 2. Szczepionka według zastrz. 1, znamienna tym, że zawiera jeden lub więcej konstruktów DNA wybranych spośród:
    (a) pn RSV-PR-NP;
    (b) V1J-PR-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencj a według Identyfikatora Sekw. nr 12;
    (c) V1 Jneo-BJ-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 20, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 21;
    (d) V1 Jneo-TX-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 24, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 25;
    (e) VI Jns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), który jest konstruktem o wielkości 6,42 kb i którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 52, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 53;
    (f) VlJns-PA-NP (B/Panama/45/90), który jest konstruktem wielkości 6,54 kb i którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 56, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 57.
  3. 3. Konstrukt DNA wybrany z grupy obejmującej:
    (a) pn RSV-PR-NP;
    (b) V1 J-PR-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 12;
    (c) V1Jneo-BJ-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 20, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 21;
    (d) V1 Jneo-TX-NP, którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 24, a koniec 3 stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 25;
    (e) VI Jns-BJ-NP (A/Beijing/353/89), który jest konstruktem o wielkości 6,42 kb i którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 52, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 53;
    (f) V1 Jns-PA-NP (B/Panama/45/90), który jest konstruktem o wielkości 6,54 kb i którego koniec 5' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 56, a koniec 3' stanowi sekwencja według Identyfikatora Sekw. nr 57.
  4. 4. Ekspresyjny wektor plazmidowy DNA, którym jest V1Jns o sekwencji przedstawionej na Identyfikatorze Sekw. nr 45 (fig. 36 i fig. 17).
PL94310677A 1993-03-18 1994-03-14 Szczepionka polinukleotydowa, konstrukt DNA i ekspresyjny wektor plazmidowy DNA PL178626B1 (pl)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US3238393A 1993-03-18 1993-03-18
US8998593A 1993-07-08 1993-07-08
PCT/US1994/002751 WO1994021797A1 (en) 1993-03-18 1994-03-14 Nucleic acid pharmaceuticals

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL310677A1 PL310677A1 (en) 1995-12-27
PL178626B1 true PL178626B1 (pl) 2000-05-31

Family

ID=26708344

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL94310677A PL178626B1 (pl) 1993-03-18 1994-03-14 Szczepionka polinukleotydowa, konstrukt DNA i ekspresyjny wektor plazmidowy DNA

Country Status (22)

Country Link
EP (1) EP0620277A1 (pl)
JP (2) JP2812352B2 (pl)
CN (1) CN1119458A (pl)
AU (1) AU676258B2 (pl)
BG (1) BG63126B1 (pl)
BR (1) BR9406007A (pl)
CA (1) CA2119175A1 (pl)
CZ (1) CZ290315B6 (pl)
DZ (1) DZ1759A1 (pl)
FI (1) FI954329A (pl)
HR (1) HRP940175A2 (pl)
HU (1) HUT73397A (pl)
IL (1) IL108915A0 (pl)
NO (1) NO953649L (pl)
NZ (1) NZ263680A (pl)
PL (1) PL178626B1 (pl)
RO (1) RO117710B1 (pl)
SI (1) SI9420014A (pl)
SK (1) SK114295A3 (pl)
UA (1) UA42715C2 (pl)
WO (1) WO1994021797A1 (pl)
YU (1) YU12894A (pl)

Families Citing this family (69)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5849719A (en) * 1993-08-26 1998-12-15 The Regents Of The University Of California Method for treating allergic lung disease
US6911216B1 (en) 1994-10-12 2005-06-28 Genzyme Corporation Targeted delivery via biodegradable polymers
US5736524A (en) 1994-11-14 1998-04-07 Merck & Co.,. Inc. Polynucleotide tuberculosis vaccine
DE19512142A1 (de) * 1995-03-31 1996-10-02 Immuno Ag Infektiöser cDNA-Klon des Tick-Borne Enzephalitis (TBE)-Virus, davon abgeleiteter rekombinanter Impfstoff und Herstellung desselben sowie ein pharmazeutisches Produkt, das eine replizierbare Nukleinsäure enthält
US6083925A (en) * 1995-06-07 2000-07-04 Connaught Laboratories Limited Nucleic acid respiratory syncytial virus vaccines
US6017897A (en) * 1995-06-07 2000-01-25 Pasteur Merieux Connaught Canada Nucleic acid respiratory syncytial virus vaccines
US6019980A (en) 1995-06-07 2000-02-01 Connaught Laboratories Limited Nucleic acid respiratory syncytial virus vaccines
US6537776B1 (en) 1999-06-14 2003-03-25 Diversa Corporation Synthetic ligation reassembly in directed evolution
FR2751225B1 (fr) * 1996-07-19 1998-11-27 Rhone Merieux Formule de vaccin polynucleotidique aviaire
US6204250B1 (en) 1996-11-22 2001-03-20 The Mount Sinai Medical Center Of The City Of New York Immunization of infants
ATE284613T1 (de) * 1997-02-14 2005-01-15 Merck & Co Inc Polynukleotid-impfstoff-formulierungen
UA78180C2 (uk) 1997-10-03 2007-03-15 Меріаль Кільцевий вірус свині типу ii, вакцини та діагностичні реагенти
US6517843B1 (en) 1999-08-31 2003-02-11 Merial Reduction of porcine circovirus-2 viral load with inactivated PCV-2
FR2772047B1 (fr) 1997-12-05 2004-04-09 Ct Nat D Etudes Veterinaires E Sequence genomique et polypeptides de circovirus associe a la maladie de l'amaigrissement du porcelet (map), applications au diagnostic et a la prevention et/ou au traitement de l'infection
US6686339B1 (en) 1998-08-20 2004-02-03 Aventis Pasteur Limited Nucleic acid molecules encoding inclusion membrane protein C of Chlamydia
EP1105490A1 (en) 1998-08-20 2001-06-13 Aventis Pasteur Limited Nucleic acid molecules encoding inclusion membrane protein c of chlamydia
US6693087B1 (en) 1998-08-20 2004-02-17 Aventis Pasteur Limited Nucleic acid molecules encoding POMP91A protein of Chlamydia
US6881723B1 (en) 1998-11-05 2005-04-19 Powderject Vaccines, Inc. Nucleic acid constructs
US7618797B2 (en) 1998-12-22 2009-11-17 Pfizer Inc Infectious cDNA clone of North American porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus and uses thereof
US7691389B2 (en) 1998-12-22 2010-04-06 Pfizer Inc Infectious cDNA clone of north american porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus and uses thereof
WO2000047227A2 (en) 1999-02-09 2000-08-17 Powderject Vaccines, Inc. Mycobacterium tuberculosis, immunization
US6943152B1 (en) 1999-06-10 2005-09-13 Merial DNA vaccine-PCV
JP2001151698A (ja) * 1999-09-10 2001-06-05 Nichiko Pharmaceutical Co Ltd インフルエンザワクチン
CA2721011A1 (en) 1999-10-22 2001-05-03 Aventis Pasteur Limited Modified gp100 and uses thereof
US7196066B1 (en) 1999-11-03 2007-03-27 Powderject Vaccines, Inc. DNA-vaccines based on constructs derived from the genomes of human and animal pathogens
US6852705B2 (en) 2000-01-21 2005-02-08 Merial DNA vaccines for farm animals, in particular bovines and porcines
US7078388B2 (en) 2000-01-21 2006-07-18 Merial DNA vaccines for farm animals, in particular bovines and porcines
EP1792995A3 (en) 2000-05-08 2007-06-13 Sanofi Pasteur Limited Chlamydia secretory locus orf and uses thereof
WO2001085932A2 (en) 2000-05-10 2001-11-15 Aventis Pasteur Limited Immunogenic polypeptides encoded by mage minigenes and uses thereof
US20060024670A1 (en) 2004-05-18 2006-02-02 Luke Catherine J Influenza virus vaccine composition and methods of use
US8202967B2 (en) 2006-10-27 2012-06-19 Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. H5 proteins, nucleic acid molecules and vectors encoding for those, and their medicinal use
EP2152871A4 (en) * 2007-05-31 2011-01-05 Becton Dickinson Co SEQUENCES AND METHOD FOR DETECTING INFLUENZA VIRUS A AND INFLUENZA VIRUS B
US8354230B2 (en) * 2007-12-21 2013-01-15 Quest Diagnostics Investments Inc. Multiplex detection assay for influenza and RSV viruses
WO2010012045A1 (en) 2008-08-01 2010-02-04 Gamma Vaccines Pty Limited Influenza vaccines
US8894997B2 (en) 2009-04-30 2014-11-25 Vanderbilt University Monoclonal antibodies to influenza H1N1 virus uses thereof
SG168423A1 (en) * 2009-07-13 2011-02-28 Agency Science Tech & Res Influenza detection method and kit therefor
AR078253A1 (es) 2009-09-02 2011-10-26 Boehringer Ingelheim Vetmed Metodos para reducir la actividad antivirica en composiciones pcv-2 y composiciones pcv-2 con mejor inmunogenicidad
AR083533A1 (es) 2010-10-22 2013-03-06 Boehringer Ingelheim Vetmed Proteinas de hemaglutinina 5 (h5) para el tratamiento y prevencion de las infecciones de gripe
AR088028A1 (es) 2011-08-15 2014-05-07 Boehringer Ingelheim Vetmed Proteinas h5, de h5n1 para un uso medicinal
WO2013033092A2 (en) 2011-09-03 2013-03-07 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Streptococcus suis pilus antigens
US10383835B2 (en) 2012-03-14 2019-08-20 The Regents Of The University Of California Treatment of inflammatory disorders in non-human mammals
ES2689878T3 (es) 2013-02-21 2018-11-16 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Proteínas H5 del virus de la gripe H5N1 para su uso como un medicamento
WO2014147087A1 (en) * 2013-03-18 2014-09-25 Imaxio Influenza nucleoprotein vaccines
MX2016003855A (es) 2013-09-25 2016-08-04 Zoetis Services Llc Composicion de vacuna de circovirus porcino tipo 2b divergente y procedimientos de uso.
AU2015241107B2 (en) 2014-04-03 2019-10-03 Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. Porcine epidemic diarrhea virus vaccine
US9920302B2 (en) 2015-08-31 2018-03-20 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Pestivirus vaccines for congenital tremors
AU2016323106A1 (en) 2015-09-16 2018-03-29 Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. Salmonella Choleraesuis-Salmonella Typhimurium vaccines
CN109790550B (zh) 2016-09-20 2024-02-09 勃林格殷格翰动物保健有限公司 新颖的启动子
UY37405A (es) 2016-09-20 2018-03-23 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Vectores de adenovirus canino
WO2018054822A1 (en) 2016-09-20 2018-03-29 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh New swine influenza vaccine
AU2017329669A1 (en) 2016-09-20 2019-03-21 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh New EHV insertion site ORF70
PL3534939T3 (pl) 2016-11-03 2023-06-12 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Szczepionka przeciw parwowirusowi świń i wirusowi zespołu rozrodczo-oddechowego świń oraz sposoby ich wytwarzania
KR20240090735A (ko) 2016-11-03 2024-06-21 베링거잉겔하임베트메디카게엠베하 돼지 파보바이러스에 대한 백신
AU2018212843A1 (en) 2017-01-30 2019-06-27 Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. Porcine coronavirus vaccines
CN110869047A (zh) 2017-07-12 2020-03-06 勃林格殷格翰动物保健美国有限公司 塞内卡病毒a免疫原性组合物及其方法
EP3675903A1 (en) 2017-09-23 2020-07-08 Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH Paramyxoviridae expression system
WO2019092027A1 (en) 2017-11-09 2019-05-16 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Sapelovirus immunogenic compositions and uses thereof
CN111712575B (zh) 2018-02-23 2024-07-19 勃林格殷格翰动物保健有限公司 表达外源猫副粘病毒基因的重组病毒载体系统及由其制备的疫苗
EA202092164A1 (ru) 2018-03-19 2021-02-10 Бёрингер Ингельхайм Ветмедика Гмбх Новый ehv с инактивированным ul18 и/или ul8
JP7245260B2 (ja) 2018-03-19 2023-03-23 ベーリンガー インゲルハイム フェトメディカ ゲーエムベーハー Ehv挿入部位ul43
US11957746B2 (en) 2018-03-26 2024-04-16 Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. Method of producing an immunogenic composition
JP7284822B2 (ja) 2018-09-20 2023-05-31 ベーリンガー インゲルハイム フェトメディカ ゲーエムベーハー 改変pedvスパイクタンパク質
US10905758B2 (en) 2018-09-20 2021-02-02 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Intranasal vector vaccine against porcine epidemic diarrhea
IT201900007060A1 (it) 2019-05-21 2020-11-21 St Superiore Di Sanita Cellule tumorali ingegnerizzate e loro usi
IT201900012540A1 (it) 2019-07-22 2021-01-22 Humanitas Mirasole Spa Inibitori di CHI3L1 e loro usi
JP2023513135A (ja) 2020-02-06 2023-03-30 ベーリンガー インゲルハイム フェトメディカ ゲーエムベーハー 抗ラブドウイルス抗体を検出するのに有用なポリペプチド
AU2021356630A1 (en) 2020-10-05 2023-06-08 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Fusion protein useful for vaccination against rotavirus
JP2023544403A (ja) 2020-10-05 2023-10-23 ベーリンガー インゲルハイム アニマル ヘルス ユーエスエイ インコーポレイテッド サーコウイルス科カプシドタンパク質を含む融合タンパク質、及びそれから構成されるキメラウイルス様粒子
US20240050555A1 (en) 2022-04-05 2024-02-15 Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh Immunogenic composition useful for vaccination against rotavirus

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
IL86354A0 (en) * 1987-05-22 1988-11-15 Orion Yhtymae Oy Episomal vector for the expression of selected dna fragments coding for optional polypeptides in mammalian cells and methods for the production thereof
DE69034078T2 (de) * 1989-03-21 2004-04-01 Vical, Inc., San Diego Expression von exogenen Polynukleotidsequenzen in Wirbeltieren
US5643578A (en) * 1992-03-23 1997-07-01 University Of Massachusetts Medical Center Immunization by inoculation of DNA transcription unit

Also Published As

Publication number Publication date
JP3608642B2 (ja) 2005-01-12
YU12894A (sh) 1997-12-05
HRP940175A2 (en) 1997-04-30
FI954329A0 (fi) 1995-09-14
SK114295A3 (en) 1996-02-07
PL310677A1 (en) 1995-12-27
UA42715C2 (uk) 2001-11-15
HU9502702D0 (en) 1995-11-28
HUT73397A (en) 1996-07-29
WO1994021797A1 (en) 1994-09-29
BG63126B1 (bg) 2001-04-30
JPH10113194A (ja) 1998-05-06
FI954329A (fi) 1995-09-14
BG100006A (bg) 1996-12-31
SI9420014A (en) 1996-08-31
AU5788994A (en) 1994-09-22
NZ263680A (en) 1997-05-26
AU676258B2 (en) 1997-03-06
CN1119458A (zh) 1996-03-27
NO953649D0 (no) 1995-09-15
EP0620277A1 (en) 1994-10-19
JPH0795888A (ja) 1995-04-11
IL108915A0 (en) 1994-06-24
CZ237395A3 (en) 1996-02-14
JP2812352B2 (ja) 1998-10-22
BR9406007A (pt) 1996-01-02
NO953649L (no) 1995-11-17
DZ1759A1 (fr) 2002-02-17
RO117710B1 (ro) 2002-06-28
CA2119175A1 (en) 1994-09-19
CZ290315B6 (cs) 2002-07-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
PL178626B1 (pl) Szczepionka polinukleotydowa, konstrukt DNA i ekspresyjny wektor plazmidowy DNA
AU2020260491B2 (en) Gene therapies for lysosomal disorders
AU2020205228B2 (en) Gene therapies for lysosomal disorders
AU2024204743A1 (en) HIV pre-immunization and immunotherapy
CN101528941B (zh) 在犬细胞中表达负义病毒rna的方法和组合物
KR102557390B1 (ko) 비-구조 단백질의 단편으로 구성된 뎅기 바이러스 키메라 폴리에피토프 및 이의 뎅기 바이러스 감염에 대한 면역원성 조성물에서의 용도
KR20220006527A (ko) 리소좀 장애에 대한 유전자 요법
TW200932259A (en) Genetically modified attenuated vesicular stomatitis virus, compositions and methods of use thereof
KR102416194B1 (ko) 재조합 이스파한 바이러스 벡터
AU2016339975A1 (en) Yeast-based immunotherapy against Clostridium difficile infection
US20040087521A1 (en) Nucleic acid pharmaceuticals-influenza matrix
KR20200135852A (ko) 유전자 변형 림프구의 제조 방법
KR20230033650A (ko) 코로나바이러스 백신 구조체 및 이의 제조 및 사용 방법
KR20210151785A (ko) 비바이러스성 dna 벡터 및 fviii 치료제 발현을 위한 이의 용도
KR20230051529A (ko) 리소좀 장애에 대한 유전자 요법
RU2193065C2 (ru) Конструкция днк (варианты), днк-вектор, иммуногенная композиция против вируса гриппа, способ индукции иммунного ответа, вакцина и способ вакцинации
TW202228728A (zh) 用於同時調節基因表現之組合物及方法
RU2780160C2 (ru) Рекомбинантные непатогенные конструкции вируса болезни марека, кодирующие множество гетерологичных антигенов