RU2016138077A - Композиция и способ для стабилизации нуклеиновых кислот в биологических образцах - Google Patents

Композиция и способ для стабилизации нуклеиновых кислот в биологических образцах Download PDF

Info

Publication number
RU2016138077A
RU2016138077A RU2016138077A RU2016138077A RU2016138077A RU 2016138077 A RU2016138077 A RU 2016138077A RU 2016138077 A RU2016138077 A RU 2016138077A RU 2016138077 A RU2016138077 A RU 2016138077A RU 2016138077 A RU2016138077 A RU 2016138077A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
composition
sample
days
kit
biological sample
Prior art date
Application number
RU2016138077A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2717644C2 (ru
RU2016138077A3 (ru
Inventor
Химан Чаим БИРНБОИМ
Линдсай ПОЦЦА
ЭРНАНДЕС Карлос Альберто МЕРИНО
Евгений Владимирович ДУКАНИН
Original Assignee
ДиЭнЭй ГЕНОТЕК ИНК.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ДиЭнЭй ГЕНОТЕК ИНК. filed Critical ДиЭнЭй ГЕНОТЕК ИНК.
Publication of RU2016138077A publication Critical patent/RU2016138077A/ru
Publication of RU2016138077A3 publication Critical patent/RU2016138077A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2717644C2 publication Critical patent/RU2717644C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/711—Natural deoxyribonucleic acids, i.e. containing only 2'-deoxyriboses attached to adenine, guanine, cytosine or thymine and having 3'-5' phosphodiester links
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713—Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Claims (95)

1. Способ стабилизации нуклеиновой кислоты, содержащейся в биологическом образце, при температуре окружающей среды, причем указанный способ включает следующие этапы:
a) получение биологического образца;
b) приведение указанного биологического образца в контакт с водной композицией, содержащей хелатирующее средство, причем указанное хелатирующее средство присутствует в концентрации по меньшей мере приблизительно 150 мМ и причем указанная композиция характеризуется значением рН по меньшей мере 9,5, для образования смеси;
c) гомогенизацию смеси согласно (b) с образованием гомогенной смеси; и
d) хранение гомогенной смеси при температуре окружающей среды.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК) или рибонуклеиновую кислоту (РНК).
3. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что указанный биологический образец выбирают из образца фекалий, образца почвы, образца канализационных вод, образца сточных вод или образца воды, предпочтительно, указанный биологический образец представляет собой образец фекалий, полученный от млекопитающего, такого как человек.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанное хелатирующее средство выбирают из 1,2-циклогександиаминтетрауксусной кислоты (CDTA), диэтилентриаминпентауксусной кислоты (DTPА), тетраазациклододекантетрауксусной кислоты (DOTA), тетраазациклотетрадекантетрауксусной кислоты (ТЕТА), дезферриоксамина или хелатирующих аналогов указанных соединений, предпочтительно указанное хелатирующее средство представляет собой CDTA.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что концентрация указанного хелатирующего средства составляет от приблизительно 150 мМ до приблизительно 500 мМ или от приблизительно 250 мМ до приблизительно 350 мМ, предпочтительно приблизительно 300 мМ.
6. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанная композиция характеризуется значением рН от 9,5 до 11,5 или от 10,5 до 11,5, предпочтительно 11.
7. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанная композиция дополнительно содержит:
по меньшей мере одно буферное средство, способное поддерживать буферные свойства в диапазоне от рН 9,5 до 11,5, такое как бета-аланин; и/или
водорастворимый органический растворитель, такой как C1-С6 алканол.
8. Способ по п. 7, отличающийся тем, что указанный водорастворимый органический растворитель представляет собой этанол, который возможно присутствует в композиции в концентрации менее чем приблизительно 30% по объему, предпочтительно менее чем приблизительно 24% по объему.
9. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанная композиция дополнительно содержит:
детергент, такой как додецилсульфат натрия; и/или
противовспенивающее средство, такое как Antifoam А.
10. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанную смесь гомогенизируют с применением средства гомогенизации; возможно указанное средство гомогенизации представляет собой по меньшей мере один шарик для перемешивания, такой как шарик для перемешивания из нержавеющей стали или шарик для перемешивания из карбида вольфрама.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что указанный способ включает образование смеси биологического образца и композиции в контейнере для образца, содержащем по меньшей мере один шарик для перемешивания, запечатывание контейнера для образца и гомогенизацию смеси посредством встряхивания смеси в присутствии по меньшей мере одного шарика для перемешивания; возможно указанное встряхивание осуществляют рукой.
12. Способ по п. 11, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один шарик для перемешивания представляет собой шарик для перемешивания из нержавеющей стали, диаметр которого составляет приблизительно 5,6-11,1 мм и плотность которого составляет по меньшей мере приблизительно 7,6 г/см3.
13. Способ по п. 12, отличающийся тем, что диаметр указанного шарика для перемешивания из нержавеющей стали составляет приблизительно 7,1-8,7 мм, и указанный контейнер для образца представляет собой круглодонную пробирку, внутренний диаметр которой составляет приблизительно 12,9 мм.
14. Способ по п. 3, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой ДНК человека.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что указанный способ делает ДНК человека стабильной в течение:
по меньшей мере 7 дней, по меньшей мере 14 дней, по меньшей мере 30 дней или по меньшей мере 60 дней при комнатной температуре;
по меньшей мере 7 дней или по меньшей мере 14 дней при температуре от приблизительно 37°C до приблизительно 50°C; и/или
по меньшей мере 30 дней при температуре -20°C.
16. Способ по п. 3, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой микробную ДНК, и указанный способ стабилизирует профиль микробиома биологического образца.
17. Способ по п. 16, отличающийся тем, что указанный способ делает профиль микробиома биологического образца стабильным в течение:
по меньшей мере 7 дней, по меньшей мере 14 дней, по меньшей мере 30 дней или по меньшей мере 60 дней при комнатной температуре;
по меньшей мере 7 дней или по меньшей мере 14 дней при температуре от приблизительно 37°C до приблизительно 50°C; и/или
по меньшей мере 30 дней при температуре -20°C.
18. Водная композиция для стабилизации нуклеиновой кислоты, содержащейся в биологическом образце, при температуре окружающей среды, причем указанная композиция содержит хелатирующее средство, причем указанное хелатирующее средство присутствует в концентрации по меньшей мере приблизительно 150 мМ, и причем указанная композиция характеризуется значением рН по меньшей мере приблизительно 9,5.
19. Композиция по п. 18, отличающаяся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК) или рибонуклеиновую кислоту (РНК).
20. Композиция по п. 18 или 19, отличающаяся тем, что указанный биологический образец выбирают из образца фекалий, образца почвы, образца канализационных вод, образца сточных вод или образца воды, предпочтительно указанный биологический образец представляет собой образец фекалий, полученный от млекопитающего, такого как человек.
21. Композиция по п. 18, отличающаяся тем, что указанное хелатирующее средство выбирают из CDTA, DTPA, DOTA, ТЕТА, дезферриоксамина или хелатирующих аналогов указанных соединений, предпочтительно указанное хелатирующее средство представляет собой CDTA.
22. Композиция по п. 18, отличающаяся тем, что концентрация указанного хелатирующего средства составляет от приблизительно 150 мМ до приблизительно 500 мМ или от приблизительно 250 мМ до приблизительно 350 мМ, предпочтительно приблизительно 300 мМ.
23. Композиция по п. 18, отличающаяся тем, что указанная композиция характеризуется значением рН от 9,5 до 11,5 или от 10,5 до 11,5, предпочтительно 11.
24. Композиция по п. 18, отличающаяся тем, что указанная композиция дополнительно содержит:
по меньшей мере одно буферное средство, способное поддерживать буферные свойства в диапазоне рН от 9,5 до 11,5, такое как бета-аланин; и/или
водорастворимый органический растворитель, такой как C1-С6 алканол.
25. Композиция по п. 24, отличающаяся тем, что указанный водорастворимый органический растворитель представляет собой этанол, который возможно присутствует в композиции в концентрации менее чем приблизительно 30% по объему, предпочтительно менее чем приблизительно 24% по объему.
26. Композиция по п. 18, отличающаяся тем, что указанная композиция дополнительно содержит:
детергент, такой как додецилсульфат натрия; и/или
противовспенивающее средство, такое как Antifoam А.
27. Композиция по п. 20, отличающаяся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой ДНК человека.
28. Композиция по п. 20, отличающаяся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой микробную ДНК, и указанная композиция предназначена для стабилизации профиля микробиома биологического образца.
29. Набор для стабилизации нуклеиновой кислоты, содержащейся в биологическом образце, при температуре окружающей среды, причем указанный набор содержит:
a) контейнер для образца, содержащий перепломбируемое средство укупорки;
b) водную композицию, содержащую хелатирующее средство, причем указанное хелатирующее средство присутствует в концентрации по меньшей мере приблизительно 150 мМ, причем указанная композиция характеризуется значением рН по меньшей мере приблизительно 9,5 и причем указанная композиция необязательно содержится в контейнере для образца;
c) средство гомогенизации, которое необязательно содержится в контейнере для образца;
d) средство для переноса биологического образца или части указанного образца в контейнер для образца; и
e) инструкции по применению.
30. Набор по п. 29, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК) или рибонуклеиновую кислоту (РНК).
31. Набор по п. 29 или 30, отличающийся тем, что указанный биологический образец выбирают из образца фекалий, образца почвы, образца канализационных вод, образца сточных вод или образца воды, предпочтительно указанный биологический образец представляет собой образец фекалий, полученный от млекопитающего, такого как человек.
32. Набор по п. 29, отличающийся тем, что указанное хелатирующее средство выбирают из CDTA, DTPA, DOTA, ТЕТА, дезферриоксамина или хелатирующих аналогов указанных соединений, предпочительно указанное хелатирующее средство представляет собой CDTA.
33. Набор по п. 29, отличающийся тем, что концентрация указанного хелатирующего средства составляет от приблизительно 150 мМ до приблизительно 500 мМ или от приблизительно 250 мМ до приблизительно 350 мМ, предпочтительно приблизительно 300 мМ.
34. Набор по п. 29, отличающийся тем, что указанная композиция характеризуется значением рН от 9,5 до 11,5 или от 10,5 до 11,5, предпочтительно 11.
35. Набор по п. 29, отличающийся тем, что указанная композиция дополнительно содержит:
по меньшей мере одно буферное средство, способное поддерживать буферные свойства в диапазоне рН от 9,5 до 11,5, такое бета-аланин; и/или
водорастворимый органический растворитель, такой как C1-С6 алканол.
36. Набор по п. 35, отличающийся тем, что указанный водорастворимый органический растворитель представляет собой этанол; который возможно присутствует в композиции в концентрации менее чем приблизительно 30% по объему, менее чем приблизительно 24% по объему.
37. Набор по п. 29, отличающийся тем, что указанная композиция дополнительно содержит:
детергент, такой как додецилсульфат натрия; и/или
противовспенивающее средство, такое как Antifoam А.
38. Набор по п. 31, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой ДНК человека.
39. Набор по п. 31, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой микробную ДНК, и указанный набор предназначен для стабилизации профиля микробиома биологического образца.
40. Набор по п. 29, отличающийся тем, что указанное средство гомогенизации представляет собой по меньшей мере один шарик для перемешивания, такой как шарик для перемешивания из нержавеющей стали или шарик для перемешивания из карбида вольфрама.
41. Набор по п. 40, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один шарик для перемешивания представляет собой шарик для перемешивания из нержавеющей стали, диаметр которого составляет приблизительно 5,6-11,1 мм и плотность которого составляет по меньшей мере приблизительно 7,6 г/см3.
42. Набор по п. 41, отличающийся тем, что диаметр указанного шарика для перемешивания из нержавеющей стали составляет приблизительно 7,1-8,7 мм, и указанный контейнер для образца представляет собой круглодонную пробирку, внутренний диаметр которой составляет приблизительно 12,9 мм.
43. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой ДНК, указанный биологический образец представляет собой образец фекалий, полученный от млекопитающего, указанная композиция характеризуется значением рН от 10,5 до 11,5, предпочтительно 11, и указанная композиция содержит, по существу состоит или состоит из:
CDTA в количестве от приблизительно 250 мМ до приблизительно 350 мМ, предпочтительно приблизительно 300 мМ;
β-аланина в количестве от приблизительно 30 мМ до приблизительно 70 мМ, предпочтительно приблизительно 50 мМ;
этанола в количестве от приблизительно 21,5% до приблизительно 23,5% по объему, предпочтительно приблизительно 23,5% по объему;
додецилсульфата натрия в количестве от приблизительно 0 до приблизительно 1% (масс./об.), предпочтительно приблизительно 0,5% (масс./об.); и
Antifoam А в количестве от приблизительно 0 до приблизительно 0,2% (об./об.), предпочтительно приблизительно 0,1% (об./об.);
возможно указанный способ включает образование смеси образца фекалий и композиции в круглодонной пробирке, внутренний диаметр которой составляет приблизительно 12,9 мм и которая содержит по меньшей мере один шарик для перемешивания из нержавеющей стали, диаметр которого составляет приблизительно 5,6-11,1 мм и плотность которого составляет по меньшей мере приблизительно 7,6 г/см3, запечатывание круглодонной пробирки и гомогенизацию смеси посредством встряхивания смеси рукой в присутствии по меньшей мере одного шарика для перемешивания из нержавеющей стали.
44. Способ по п. 43, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой микробную ДНК, и указанный способ стабилизирует профиль микробиома образца фекалий, причем указанный профиль микробиома образца фекалий остается стабильным в течение:
по меньшей мере 7 дней, по меньшей мере 14 дней, по меньшей мере 30 дней или по меньшей мере 60 дней при комнатной температуре;
по меньшей мере 7 дней или по меньшей мере 14 дней при температуре от приблизительно 37°С до приблизительно 50°С; и/или
по меньшей мере 30 дней при температуре -20°С.
45. Композиция по п. 18, отличающаяся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой ДНК, указанный биологический образец представляет собой образец фекалий, полученный от млекопитающего, указанная композиция характеризуется значением рН от приблизительно 10,5 до приблизительно 11,5, предпочтительно 11, и указанная композиция содержит, по существу состоит или состоит из:
CDTA в количестве от приблизительно 250 мМ до приблизительно 350 мМ, предпочтительно 300 мМ;
β-аланина в количестве от приблизительно 30 мМ до приблизительно 70 мМ, предпочтительно 50 мМ;
этанола в количестве от приблизительно 21,5% до приблизительно 23,5% по объему, предпочтительно 23,5% по объему;
додецилсульфата натрия в количестве от приблизительно 0 до приблизительно 1% (масс./об.), предпочтительно 0,5% (масс./об.); и
Antifoam А в количестве от приблизительно 0 до приблизительно 0,2% (об./об.), предпочтительно 0,1% (об./об.).
46. Композиция по п. 45, отличающаяся тем, что указанная композиция предназначена для стабилизации профиля микробиома образца фекалий.
47. Набор по п. 29, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой ДНК, указанный биологический образец представляет собой образец фекалий, полученный от млекопитающего, указанная композиция характеризуется значением рН от 10,5 до 11,5, предпочтительно 11, и указанная композиция содержит, по существу состоит или состоит из:
CDTA в количестве от приблизительно 250 мМ до приблизительно 350 мМ, предпочтительно 300 мМ;
β-аланина в количестве от приблизительно 30 мМ до приблизительно 70 мМ, предпочтительно 50 мМ;
этанола в количестве от приблизительно 21,5% до приблизительно 23,5% по объему, предпочтительно 23,5% по объему;
додецилсульфата натрия в количестве от приблизительно 0 до приблизительно 1% (масс./об.), предпочтительно приблизительно 0,5% (масс./об.); и
Antifoam А в количестве от приблизительно 0 до приблизительно 0,2% (об./об.), предпочтительно приблизительно 0,1% (об./об.).
48. Набор по п. 47, отличающийся тем, что указанная нуклеиновая кислота представляет собой микробную ДНК, и указанный набор предназначен для стабилизации профиля микробиома биологического образца.
49. Набор по п. 48, отличающийся тем, что указанное средство гомогенизации представляет собой по меньшей мере один шарик для перемешивания из нержавеющей стали, диаметр которого составляет приблизительно 5,6-11,1 мм и плотность которого составляет по меньшей мере приблизительно 7,6 г/см3, и указанный контейнер для образца представляет собой круглодонную пробирку, внутренний диаметр которой составляет приблизительно 12,9 мм.
RU2016138077A 2014-03-07 2015-03-06 Способ, композиция и набор для стабилизации дезоксирибонуклеиновых кислот в биологических образцах RU2717644C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201461949692P 2014-03-07 2014-03-07
US61/949,692 2014-03-07
US201462057769P 2014-09-30 2014-09-30
US62/057,769 2014-09-30
PCT/CA2015/050173 WO2015131291A1 (en) 2014-03-07 2015-03-06 Composition and method for stabilizing nucleic acids in biological samples

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2016138077A true RU2016138077A (ru) 2018-04-13
RU2016138077A3 RU2016138077A3 (ru) 2018-10-23
RU2717644C2 RU2717644C2 (ru) 2020-03-24

Family

ID=54054312

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016138077A RU2717644C2 (ru) 2014-03-07 2015-03-06 Способ, композиция и набор для стабилизации дезоксирибонуклеиновых кислот в биологических образцах

Country Status (18)

Country Link
US (2) US10435735B2 (ru)
EP (1) EP3114225B1 (ru)
JP (1) JP6670765B2 (ru)
KR (1) KR102392407B1 (ru)
CN (1) CN106255753B (ru)
AU (1) AU2015226811B2 (ru)
CA (1) CA2941764C (ru)
DK (1) DK3114225T3 (ru)
ES (1) ES2880310T3 (ru)
IL (1) IL247662A0 (ru)
MX (1) MX2016011495A (ru)
PL (1) PL3114225T3 (ru)
PT (1) PT3114225T (ru)
RU (1) RU2717644C2 (ru)
SA (2) SA516371797B1 (ru)
SG (2) SG10201807736SA (ru)
WO (1) WO2015131291A1 (ru)
ZA (1) ZA201906139B (ru)

Families Citing this family (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7482116B2 (en) 2002-06-07 2009-01-27 Dna Genotek Inc. Compositions and methods for obtaining nucleic acids from sputum
EP2721140B1 (en) 2011-06-19 2016-11-23 Abogen, Inc. Devices, solutions and methods for sample collection
DK3114225T3 (da) * 2014-03-07 2021-07-26 Dna Genotek Inc Sammensætning og fremgangsmåde til stabilisering af nukleinsyrer i biologiske prøver
CA3055981A1 (en) 2017-03-15 2018-09-20 Ancestry.Com Dna, Llc Sample collection device and method
AU2018345714A1 (en) 2017-10-06 2020-05-21 Ancestry.Com Dna, Llc Systems, devices, and methods for sample collection
BR112020010274A2 (pt) 2017-11-22 2020-11-17 Ancestry. Com Dna, Llc kit de coleta de amostra incluindo tampa tendo luva seletivamente móvel
US11426734B2 (en) 2017-11-22 2022-08-30 Ancestry.Com Dna, Llc Sample collection kit including cap having selectively movable sleeve
CN107955810A (zh) * 2017-12-25 2018-04-24 宁波卡尔新材料科技有限公司 一种新型动物肝脏核酸提取试剂盒及提取方法
CN111868530A (zh) 2018-02-14 2020-10-30 萨琳格纳斯提克斯有限公司 用于检测分析物的方法和装置
CN108893523A (zh) * 2018-05-31 2018-11-27 厦门安捷致善医学数据科技有限公司 一种粪便样品常温保存液
CA3120086A1 (en) * 2018-11-14 2020-05-22 Spectrum Solutions L.L.C. Rna preservation solution and methods of manufacture and use
WO2020174442A1 (en) 2019-02-27 2020-09-03 Ancestry.Com Dna, Llc Graphical user interface displaying relatedness based on shared dna
CN109810974B (zh) * 2019-04-08 2020-11-24 珠海丽珠试剂股份有限公司 提取人类免疫缺陷病毒hiv-1核酸的试剂组合产品及其方法
EP4025301A4 (en) 2019-09-05 2023-07-19 The Regents of the University of California NON-INVASIVE METHOD FOR QUANTIFYING KIDNEY FUNCTION AND FUNCTIONAL DECLINE
CN113186185B (zh) * 2020-01-14 2023-05-26 东北林业大学 一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主dna的方法
US20210223268A1 (en) * 2020-01-21 2021-07-22 Board Of Regents Of The University Of Texas System Discriminating parkinson's disease from multiple system atrophy using alpha-synuclein pmca
CN115279901A (zh) * 2020-03-11 2022-11-01 花王株式会社 来自皮肤表面脂质的rna的制备方法
US20220064709A1 (en) * 2020-09-01 2022-03-03 Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc Compositions and Methods for Screening Biological Samples
US20240002905A1 (en) * 2020-11-11 2024-01-04 Biocept, Inc. Pathogen inactivating and nucleic acid stabilization media for microorganism collection and transport
WO2022219514A1 (en) * 2021-04-16 2022-10-20 Grifols Diagnostic Solutions Inc. Compositions and methods for storing a biological sample
WO2023019124A1 (en) * 2021-08-09 2023-02-16 University Of Central Florida Research Foundation, Inc. Method to preserve nucleic acids in water samples
WO2023150879A1 (en) * 2022-02-10 2023-08-17 Dna Genotek Inc. Methods and systems for defining test sample read count limits for a range of microbial sequence reads

Family Cites Families (99)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4663161A (en) * 1985-04-22 1987-05-05 Mannino Raphael J Liposome methods and compositions
GB8614084D0 (en) * 1986-06-10 1986-07-16 Serono Diagnostics Ltd Immunoassay
US4918178A (en) 1987-10-22 1990-04-17 Wisconsin Alumni Research Foundation Test for Johne's disease
JP2791367B2 (ja) 1988-04-21 1998-08-27 マイクロプローブ・コーポレーション 核酸抽出方法
JPH04187077A (ja) 1990-11-22 1992-07-03 Shimadzu Corp 核酸の抽出精製装置
JPH0599923A (ja) 1991-10-11 1993-04-23 Nitto Denko Corp ヒトヘモグロビンの検出方法及びそれに用いる便溶解用緩衝液
DE4204012A1 (de) * 1992-02-12 1993-08-19 Ulrich Prof Dr Zimmermann Mitogenfreie substanz, deren herstellung und verwendung
ES2210239T3 (es) 1992-04-01 2004-07-01 The Johns Hopkins University School Of Medicine Metodo para detectar acidos nucleicos de mamiferos aislados en heces y reactivos para el mismo.
DE4321904B4 (de) 1993-07-01 2013-05-16 Qiagen Gmbh Verfahren zur chromatographischen Reinigung und Trennung von Nucleinsäuregemischen
KR100230909B1 (ko) 1993-11-29 1999-12-01 다니엘 엘. 캐시앙 광범위의 유기체로부터 핵산 추출 방법
GB9506843D0 (en) 1995-04-03 1995-05-24 Chiroscience Ltd Oxidative process and products thereof
DE19530132C2 (de) 1995-08-16 1998-07-16 Max Planck Gesellschaft Verfahren zur Reinigung, Stabilisierung oder Isolierung von Nukleinsäuren aus biologischen Materialien
GB9518156D0 (en) 1995-09-06 1995-11-08 Medical Res Council Method of isolating cells
NO954667D0 (no) 1995-11-17 1995-11-17 Dagfinn Oegreid Fremgangsmåte til deteksjon av Ki-ras mutasjoner
ATE378422T1 (de) 1996-08-26 2007-11-15 Invitek Biotechnik & Biodesign Verfahren zum nachweis klinisch relevanter veränderungen der dns-sequenz des ki-ras-onkogens,seine verwendung und testkit zur früherkennung von tumoren
AU4775497A (en) 1996-09-19 1998-04-14 W. Kurt Roth Method for purifying and eventually analyzing nucleic acids from biological test samples
WO1998058081A1 (en) 1997-06-16 1998-12-23 Exact Laboratories, Inc. Methods for stool sample preparation
US6268136B1 (en) 1997-06-16 2001-07-31 Exact Science Corporation Methods for stool sample preparation
DE19858447A1 (de) 1997-12-18 1999-07-01 Invitek Gmbh Verfahren zur Isolierung von kurz- und langkettigen Nukleinsäuren
CA2319775C (en) 1998-02-02 2009-05-05 Gentra Systems, Inc. Compositions and methods for using a lysing matrix for isolating dna
EP0939118A1 (en) 1998-02-20 1999-09-01 Universiteit Maastricht Method for isolating DNA and RNA from faeces
AU4934099A (en) 1998-08-04 2000-02-28 Center For Advanced Science And Technology Incubation, Ltd. Method for enzymatic amplification of nucleic acid
AU1716500A (en) 1998-11-12 2000-06-05 University Of Virginia Patent Foundation Non-invasive detection of helicobacter pylori infection
DE19856064C2 (de) * 1998-12-04 2000-11-30 Invitek Gmbh Universelles Verfahren zur Isolierung von DNA aus beliebigen Ausgangsmaterialien
DE19900638C2 (de) 1999-01-11 2002-12-19 Max Planck Gesellschaft Methode zur Isolierung von DNA aus biologischen Materialien
US6551777B1 (en) 1999-02-25 2003-04-22 Exact Sciences Corporation Methods for preserving DNA integrity
US20020004206A1 (en) 1999-04-09 2002-01-10 Berger Barry M. Methods of screening for disease
WO2000066606A1 (en) 1999-04-30 2000-11-09 Whatman, Inc. Substrate including anionic detergent for purifying nucleic acid
US6270970B1 (en) * 1999-05-14 2001-08-07 Promega Corporation Mixed-bed solid phase and its use in the isolation of nucleic acids
US6849403B1 (en) 1999-09-08 2005-02-01 Exact Sciences Corporation Apparatus and method for drug screening
US6586177B1 (en) 1999-09-08 2003-07-01 Exact Sciences Corporation Methods for disease detection
JP2003516162A (ja) 1999-12-07 2003-05-13 エグザクト サイエンシーズ コーポレイション 核酸分析に基づく薬物スクリーニングのための装置および方法
US6919174B1 (en) 1999-12-07 2005-07-19 Exact Sciences Corporation Methods for disease detection
US7005266B2 (en) 2000-02-04 2006-02-28 Qiagen Gmbh Nucleic acid isolation from stool samples and other inhibitor-rich biological materials
DK1254238T3 (da) * 2000-02-09 2009-11-30 Basf Se Nyt elongasegen og fremgangsmåde til fremstilling af flerumættede fedtsyrer
FR2808276B1 (fr) 2000-04-26 2004-04-02 Renaud Nalin Procede d'extraction indirecte de l'adn d'organismes non cultivables et adn susceptible d'etre obtenu par ledit procede
DE10031236A1 (de) 2000-06-27 2002-01-10 Qiagen Gmbh Verwendung von Carbonsäuren und anderen Additiven in Kombination mit kationischen Verbindungen zur Stabilisierung von Nukleinsäuren in biologischen Materialien
JP4599684B2 (ja) 2000-07-26 2010-12-15 株式会社島津製作所 糞便からの核酸精製法
CU23095A1 (es) * 2000-11-07 2005-11-18 Cnic Ct Nac Investigaciones Proceso para la tipificación rápida de microorganismos y juego de reactivos empleado
US7029840B2 (en) 2000-11-15 2006-04-18 Becton, Dickinson And Company Method for preservation of cells and nucleic acid targets
US6911308B2 (en) 2001-01-05 2005-06-28 Exact Sciences Corporation Methods for detecting, grading or monitoring an H. pylori infection
DE10102338A1 (de) * 2001-01-19 2002-07-25 Basf Plant Science Gmbh Verfahren zur Expression von Biosynthesegenen in pflanzlichen Samen unter Verwendung von neuen multiplen Expressionskonstrukten
AU2002356053A1 (en) 2001-08-20 2003-03-03 Whatman, Inc. Dna purification and recovery from high particulate and solids samples
US7893228B2 (en) 2001-10-12 2011-02-22 Qiagen North American Holdings, Inc. Compositions and methods for using a solid support to purify RNA
WO2003033739A1 (en) 2001-10-12 2003-04-24 Gentra Systems, Inc. Compositions and methods for using a solid support to purify rna
US7148343B2 (en) 2001-10-12 2006-12-12 Gentra Systems, Inc. Compositions and methods for using a solid support to purify RNA
US20030109548A1 (en) * 2001-11-09 2003-06-12 Royt Paulette W. Compositions and methods of treating iron excess
WO2003097831A1 (en) 2002-05-17 2003-11-27 Gl Bio Tech Gmbh Method for nucleic acid extraction and nucleic acid purification
DE10222133A1 (de) 2002-05-17 2003-12-04 Gl Biotech Gmbh Verfahren zur Nukleinsäure-Extraktion und Nukleinsäure-Reinigung
US20030215954A1 (en) 2002-05-17 2003-11-20 Cockerill Franklin R. Nucleic acid recovery reagents and methods
JP3910198B2 (ja) 2002-05-21 2007-04-25 アークレイ株式会社 抗酸菌の溶菌方法およびそれを用いた遺伝子増幅若しくは検出方法
JP4092141B2 (ja) 2002-06-07 2008-05-28 株式会社島津製作所 核酸抽出同時精製法
US6852495B2 (en) 2002-06-06 2005-02-08 Shimadzu Corporation Process of extracting nucleic acid and process of simultaneously carrying out extraction and purification of nucleic acid
JP4092139B2 (ja) 2002-06-06 2008-05-28 株式会社島津製作所 核酸抽出法
US7482116B2 (en) 2002-06-07 2009-01-27 Dna Genotek Inc. Compositions and methods for obtaining nucleic acids from sputum
EP1391520A1 (en) 2002-08-20 2004-02-25 Becton Dickinson and Company Method for preservation of cells and nucleic acid targets
US20040157219A1 (en) 2003-02-06 2004-08-12 Jianrong Lou Chemical treatment of biological samples for nucleic acid extraction and kits therefor
FR2861085B1 (fr) 2003-10-15 2006-01-27 Bertin Technologies Sa Methode d'extraction d'acides nucleiques et son application dans l'analyse de la population microbienne de l'air
US20050239045A1 (en) 2003-12-08 2005-10-27 Arkray Inc. Microorganism or cell collecting method, and microorganism or cell collecting implement used for the method
DE102004004901B4 (de) * 2004-01-30 2006-01-05 Johannes-Gutenberg-Universität Mainz Verfahren zur Herstellung von Sorbicillacton A
US20080124714A1 (en) 2004-05-14 2008-05-29 Exact Sciences Corporation Method for Stabilizing Biological Samples for Nucleic Acid Analysis
AU2005323451B2 (en) 2004-05-21 2010-11-18 Qiagen Sciences Llc Kits and processes for removing contaminants from nucleic acids in environmental and biological samples
WO2005116081A2 (en) 2004-05-24 2005-12-08 Genvault Corporation Stable protein storage and stable nucleic acid storage in recoverable form
US20050277121A1 (en) 2004-06-11 2005-12-15 Ambion, Inc. Crude biological derivatives competent for nucleic acid detection
CA2586532C (en) * 2004-11-05 2014-03-25 Qiagen North American Holdings, Inc. Compositions and methods for purifying nucleic acids from stabilization reagents
CA2587419C (en) * 2004-11-17 2013-03-19 Forensink Corporation Inc. Compositions for marking objects with dna and methods for marking and linking an object to its owner
US8158357B2 (en) 2005-03-16 2012-04-17 Dna Genotek Inc. Compositions and method for storage of nucleic acid from bodily fluids
US20070141582A1 (en) 2005-12-15 2007-06-21 Weiwei Li Method and kit for detection of early cancer or pre-cancer using blood and body fluids
JP2007248170A (ja) * 2006-03-15 2007-09-27 Hitachi Ltd 糞便懸濁液作製用容器
WO2008021995A1 (en) 2006-08-10 2008-02-21 Cohen Ariel B Methods and compositions for detecting an analyte in a biological sample
US8080645B2 (en) * 2007-10-01 2011-12-20 Longhorn Vaccines & Diagnostics Llc Biological specimen collection/transport compositions and methods
AU2007304776A1 (en) 2006-10-06 2008-04-10 Dna Genotek Inc. Stabilizing compositions and methods for extraction of ribonucleic acid
WO2008089198A1 (en) 2007-01-15 2008-07-24 Greg Liang Sample collector and tester
JPWO2008152980A1 (ja) 2007-06-12 2010-08-26 オリンパス株式会社 生物学的試料と試薬との混合用容器及び生物学的試料と試薬との混合方法
CA2861667C (en) 2007-10-01 2017-06-13 Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc Biological specimen collection and transport system and methods of use
US20100255481A1 (en) 2007-10-30 2010-10-07 Olympus Corporation Method for detection of adenoma or cancer by genetic analysis
US9347055B2 (en) 2007-11-05 2016-05-24 Eiken Kagaku Kabushiki Kaisha Method and kit for preparation of sample for use in nucleic acid amplification
WO2009066695A1 (ja) 2007-11-20 2009-05-28 Olympus Corporation 糞便試料の調製方法、糞便試料調製用溶液、及び採便用キット
EP2816122A1 (en) 2008-02-15 2014-12-24 Mayo Foundation For Medical Education And Research Detecting neoplasm from a stool sample
WO2009133928A1 (ja) 2008-05-02 2009-11-05 アークレイ株式会社 白血球の分析方法およびそれに使用する分析試薬
JP5616786B2 (ja) 2008-05-12 2014-10-29 オリンパス株式会社 糞便処理容器
EP2314677A4 (en) 2008-07-23 2011-12-14 Olympus Corp METHOD OF TAKING NUCLEIC ACID FROM A CHAIR SAMPLE, NUCLEIC ACID ANALYSIS METHOD AND DEVICE FOR TREATING CHAIR SAMPLES
CN102131928A (zh) 2008-08-26 2011-07-20 奥林巴斯株式会社 粪便试样的调制方法、粪便试样调制用溶液、及粪便采集用试剂盒
WO2010028382A2 (en) 2008-09-05 2010-03-11 Mayo Foundation For Medical Education And Research Collecting and processing complex macromolecular mixtures
US8405379B1 (en) 2008-09-18 2013-03-26 Luc Montagnier System and method for the analysis of DNA sequences in biological fluids
JPWO2010064628A1 (ja) 2008-12-05 2012-05-10 オリンパス株式会社 核酸含有試料の調製方法、試料調製用溶液、及び核酸の解析方法
WO2010064634A1 (ja) 2008-12-05 2010-06-10 オリンパス株式会社 糞便試料の調製方法、糞便試料調製用溶液、及び採便用キット
US8427428B2 (en) 2009-03-31 2013-04-23 Key Ovation Llc Adjustable ergonomic keyboard
WO2010134245A1 (ja) 2009-05-20 2010-11-25 オリンパス株式会社 哺乳細胞由来核酸の回収方法、核酸解析方法、及び採便用キット
JPWO2010134246A1 (ja) 2009-05-20 2012-11-08 オリンパス株式会社 核酸含有試料の調製方法
JP2011250757A (ja) 2010-06-03 2011-12-15 Olympus Corp 生体試料中の核酸検出方法
US9376709B2 (en) 2010-07-26 2016-06-28 Biomatrica, Inc. Compositions for stabilizing DNA and RNA in blood and other biological samples during shipping and storage at ambient temperatures
EP2598661B1 (en) 2010-07-26 2017-09-27 Biomatrica, INC. Compositions for stabilizing dna, rna and proteins in saliva and other biological samples during shipping and storage at ambient temperatures
NZ607043A (en) 2010-08-04 2015-05-29 Borody Thomas J Compositions for fecal floral transplantation and methods for making and using them and devices for delivering them
WO2012044581A1 (en) 2010-10-01 2012-04-05 Esoterix Genetic Laboratories, Llc Enrichment of low molecular weight dna
US8530228B2 (en) 2010-12-28 2013-09-10 Bexmart Integrated versatile and systems preparation of specimens
EP2699907A1 (en) 2011-04-19 2014-02-26 Porex Corporation Cards for sample storage and delivery comprising sintered porous plastic
US20130071847A1 (en) 2011-09-19 2013-03-21 BioPet Vet Lab Methods and materials for determining the source of waste
DK3114225T3 (da) * 2014-03-07 2021-07-26 Dna Genotek Inc Sammensætning og fremgangsmåde til stabilisering af nukleinsyrer i biologiske prøver

Also Published As

Publication number Publication date
RU2717644C2 (ru) 2020-03-24
US20170166955A1 (en) 2017-06-15
MX2016011495A (es) 2017-07-11
CA2941764C (en) 2023-10-24
CN106255753A (zh) 2016-12-21
BR112016020659A8 (pt) 2021-07-13
ES2880310T3 (es) 2021-11-24
US11198899B2 (en) 2021-12-14
DK3114225T3 (da) 2021-07-26
RU2016138077A3 (ru) 2018-10-23
SG11201607364RA (en) 2016-10-28
EP3114225A4 (en) 2017-08-09
WO2015131291A1 (en) 2015-09-11
KR102392407B1 (ko) 2022-04-29
EP3114225A1 (en) 2017-01-11
US20200239931A1 (en) 2020-07-30
KR20160130287A (ko) 2016-11-10
SG10201807736SA (en) 2018-10-30
AU2015226811B2 (en) 2021-07-15
AU2015226811A1 (en) 2016-10-20
JP6670765B2 (ja) 2020-03-25
PT3114225T (pt) 2021-07-26
EP3114225B1 (en) 2021-04-21
PL3114225T3 (pl) 2021-11-08
JP2017508478A (ja) 2017-03-30
BR112016020659A2 (pt) 2017-08-15
CN106255753B (zh) 2020-11-06
ZA201906139B (en) 2023-04-26
IL247662A0 (en) 2016-11-30
US10435735B2 (en) 2019-10-08
SA516371797B1 (ar) 2021-06-07
SA521421271B1 (ar) 2022-09-11
CA2941764A1 (en) 2015-09-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016138077A (ru) Композиция и способ для стабилизации нуклеиновых кислот в биологических образцах
JP2017508478A5 (ru)
BR112016026305B1 (pt) dispositivo de recebimento de amostra, método de preservar uma biomolécula em uma amostra biológica, sistema para preservar uma biomolécula de uma amostra e kit
EA200901435A1 (ru) Гидравлические цементы, содержащие композиции карбонатных соединений
ATE493494T1 (de) Probenherstellungsverfahren mit einem alkali- stoss
ES2731077T3 (es) Procedimiento de producción de aminoácidos a partir de precursores obtenidos por fermentación anaerobia de biomasa fermentable
Martins et al. Role of surfactant headgroups on the toxicity of SLEnS-LAS mixed micelles: A case study using microtox test
CN106512933A (zh) 一种同时吸附脱除卡马西平和磺胺甲恶唑的吸附剂的制备方法
ES2340424T3 (es) Uso de un agente reductor organico para el tratamiento del agua mediante la eliminacion de cloramina, cloro y otros compuestos de cloro activo del agua de manteninimiento para organismos acuaticos.
Classen et al. Microcystin toxicosis in nursery pigs
RU2005103190A (ru) Способ химической стабилизации гальванических шламов, длительное время находящихся на хранении
RU2020108520A (ru) Способ и состав для стабилизации нуклеиновых кислот, свободных от клеток, и клеток
Chen et al. Acute toxicity and damage of tissue from benzothiazole-based ionic liquids in zebrafish (Danio rerio)
US20170335365A1 (en) Method for detecting bacteria
US10822287B2 (en) Method for producing a biologically active, microorganism-containing aqueous solution or suspension
Bulekbayeva et al. New Methods of Parasitology Diagnostic with Using Of Anti-Freeze and Auto Cool Liquid
Glukhov The results of atmogeochemical method used for searching deep-seated hydrocarbon accumulations
Ewoukem et al. Estimation test of gaseous emissions from fishponds with contrasted inputs
BR102020012234A2 (pt) composição organomineral para melhorar as características químicas, físicas e biológicas, da água trazendo sanidade ao sistema aquático
Brito et al. Preliminary results from an intervention study in children aged 2-16 years in controlling Schistosomiasis in a village from Bengo Province (Angola)
Classen et al. Intoxicación por microcistina en lechones de destete Toxicose causée par la microcystine chez des porcelets en pouponnière
Lemańska-Malinowska et al. Removal of selected sulphonamides during the ozonation process in the presence and absence of bicarbonates
Osypchuk et al. Studing conditions of sildenafil extraction by organic solvents
Mal'kov et al. Analysis of water chemistry of WWER NPP and main directions of their development; Analiz vedeniya vodno-khmicheskikh rezhimov AEhS s VVEhR i osnovnye napravleniya ikh sovershenstvovaniya
RU2007111187A (ru) Способ определения кислотного числа масла или жира