JP7475272B2 - ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー - Google Patents
ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー Download PDFInfo
- Publication number
- JP7475272B2 JP7475272B2 JP2020522905A JP2020522905A JP7475272B2 JP 7475272 B2 JP7475272 B2 JP 7475272B2 JP 2020522905 A JP2020522905 A JP 2020522905A JP 2020522905 A JP2020522905 A JP 2020522905A JP 7475272 B2 JP7475272 B2 JP 7475272B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- exon
- grch38
- mrna
- nie
- intron
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 title claims description 71
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 title claims description 31
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title claims description 23
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 title claims description 23
- 238000011282 treatment Methods 0.000 title claims description 10
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 259
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 190
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 190
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 119
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 95
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 43
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 43
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 claims description 43
- 101100495925 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) chr3 gene Proteins 0.000 claims description 38
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 claims description 27
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 23
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 claims description 21
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims description 12
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 claims description 9
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims description 9
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 8
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 8
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 8
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 8
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 6
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims description 6
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 claims description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 5
- 208000001992 Autosomal Dominant Optic Atrophy Diseases 0.000 claims description 4
- 208000026553 Autosomal dominant optic atrophy, classic form Diseases 0.000 claims description 4
- 208000035110 classic form autosomal dominant optic atrophy Diseases 0.000 claims description 4
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 4
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 claims description 2
- ANCLJVISBRWUTR-UHFFFAOYSA-N diaminophosphinic acid Chemical compound NP(N)(O)=O ANCLJVISBRWUTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 2
- 238000000185 intracerebroventricular administration Methods 0.000 claims description 2
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 claims description 2
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 claims description 2
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 claims description 2
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 claims description 2
- 230000004777 loss-of-function mutation Effects 0.000 claims description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 claims description 2
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 claims description 2
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 27
- 230000002950 deficient Effects 0.000 claims 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims 1
- 108020005067 RNA Splice Sites Proteins 0.000 description 151
- 238000003559 RNA-seq method Methods 0.000 description 114
- 102100033779 Collagen alpha-4(IV) chain Human genes 0.000 description 83
- 101000710870 Homo sapiens Collagen alpha-4(IV) chain Proteins 0.000 description 83
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 78
- 101000654381 Homo sapiens Sodium channel protein type 8 subunit alpha Proteins 0.000 description 71
- 102100031371 Sodium channel protein type 8 subunit alpha Human genes 0.000 description 71
- 102100034279 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 Human genes 0.000 description 63
- 108091006418 SLC25A13 Proteins 0.000 description 63
- 102100029239 Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific Human genes 0.000 description 62
- 101000634050 Homo sapiens Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific Proteins 0.000 description 62
- 101000615498 Homo sapiens Methyl-CpG-binding domain protein 5 Proteins 0.000 description 62
- 102100021292 Methyl-CpG-binding domain protein 5 Human genes 0.000 description 62
- 102000014817 CACNA1A Human genes 0.000 description 61
- 101000722054 Homo sapiens Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial Proteins 0.000 description 61
- 101000614988 Homo sapiens Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12 Proteins 0.000 description 61
- 101000935117 Homo sapiens Voltage-dependent P/Q-type calcium channel subunit alpha-1A Proteins 0.000 description 61
- 102100021070 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12 Human genes 0.000 description 61
- 108020004485 Nonsense Codon Proteins 0.000 description 60
- 238000003766 bioinformatics method Methods 0.000 description 57
- 102100033780 Collagen alpha-3(IV) chain Human genes 0.000 description 56
- 101000710873 Homo sapiens Collagen alpha-3(IV) chain Proteins 0.000 description 56
- 102100031265 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2 Human genes 0.000 description 54
- 101000777079 Homo sapiens Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2 Proteins 0.000 description 54
- 101000880945 Homo sapiens Down syndrome cell adhesion molecule Proteins 0.000 description 54
- 102100022548 Beta-hexosaminidase subunit alpha Human genes 0.000 description 53
- 208000003019 Neurofibromatosis 1 Diseases 0.000 description 52
- 208000024834 Neurofibromatosis type 1 Diseases 0.000 description 52
- 101000610640 Homo sapiens U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 Proteins 0.000 description 51
- 102100040374 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 Human genes 0.000 description 51
- 201000007607 neuronal ceroid lipofuscinosis 3 Diseases 0.000 description 51
- 101001045440 Homo sapiens Beta-hexosaminidase subunit alpha Proteins 0.000 description 50
- 101001024120 Homo sapiens Nipped-B-like protein Proteins 0.000 description 49
- 101000684826 Homo sapiens Sodium channel protein type 2 subunit alpha Proteins 0.000 description 49
- 102100035377 Nipped-B-like protein Human genes 0.000 description 49
- 102100022440 Battenin Human genes 0.000 description 48
- 101000901683 Homo sapiens Battenin Proteins 0.000 description 48
- 101000798007 Homo sapiens RAC-gamma serine/threonine-protein kinase Proteins 0.000 description 48
- 101000628562 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase STK11 Proteins 0.000 description 48
- 102100026379 Neurofibromin Human genes 0.000 description 48
- 108010085793 Neurofibromin 1 Proteins 0.000 description 48
- 102100026715 Serine/threonine-protein kinase STK11 Human genes 0.000 description 48
- 102100035432 Complement factor H Human genes 0.000 description 47
- 101000737574 Homo sapiens Complement factor H Proteins 0.000 description 47
- 101001126977 Homo sapiens Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial Proteins 0.000 description 47
- 101001009847 Homo sapiens Retinal guanylyl cyclase 2 Proteins 0.000 description 47
- 102100030847 Retinal guanylyl cyclase 2 Human genes 0.000 description 47
- 102100037460 E3 ubiquitin-protein ligase Topors Human genes 0.000 description 46
- 101000662670 Homo sapiens E3 ubiquitin-protein ligase Topors Proteins 0.000 description 46
- 101000654386 Homo sapiens Sodium channel protein type 9 subunit alpha Proteins 0.000 description 46
- 101000860430 Homo sapiens Versican core protein Proteins 0.000 description 46
- 102100023150 Sodium channel protein type 2 subunit alpha Human genes 0.000 description 46
- 102100031367 Sodium channel protein type 9 subunit alpha Human genes 0.000 description 46
- 102100028437 Versican core protein Human genes 0.000 description 46
- MXCVHSXCXPHOLP-UHFFFAOYSA-N 4-oxo-6-propylchromene-2-carboxylic acid Chemical compound O1C(C(O)=O)=CC(=O)C2=CC(CCC)=CC=C21 MXCVHSXCXPHOLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 45
- 102100036511 Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit DHDDS Human genes 0.000 description 45
- 101000928713 Homo sapiens Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit DHDDS Proteins 0.000 description 45
- 101001098989 Homo sapiens Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial Proteins 0.000 description 45
- 102100039022 Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial Human genes 0.000 description 45
- 102100022014 Angiopoietin-1 receptor Human genes 0.000 description 44
- 101000753291 Homo sapiens Angiopoietin-1 receptor Proteins 0.000 description 44
- 101001052490 Homo sapiens Mitogen-activated protein kinase 3 Proteins 0.000 description 44
- 101000795659 Homo sapiens Tuberin Proteins 0.000 description 44
- 102100030979 Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial Human genes 0.000 description 44
- 102100024192 Mitogen-activated protein kinase 3 Human genes 0.000 description 44
- 102100032314 RAC-gamma serine/threonine-protein kinase Human genes 0.000 description 44
- 102100031638 Tuberin Human genes 0.000 description 44
- 101000641879 Homo sapiens Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP Proteins 0.000 description 43
- 101000684820 Homo sapiens Sodium channel protein type 3 subunit alpha Proteins 0.000 description 43
- 101000819146 Homo sapiens UDP-glucose 4-epimerase Proteins 0.000 description 43
- 102100023720 Sodium channel protein type 3 subunit alpha Human genes 0.000 description 43
- 102100021436 UDP-glucose 4-epimerase Human genes 0.000 description 43
- 101000926508 Homo sapiens Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3 Proteins 0.000 description 42
- 101001098982 Homo sapiens Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial Proteins 0.000 description 42
- 102100039025 Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial Human genes 0.000 description 42
- 102100030886 Complement receptor type 1 Human genes 0.000 description 41
- 102100022839 DnaJ homolog subfamily C member 8 Human genes 0.000 description 41
- 101000727061 Homo sapiens Complement receptor type 1 Proteins 0.000 description 41
- 101000903063 Homo sapiens DnaJ homolog subfamily C member 8 Proteins 0.000 description 41
- 101000961414 Homo sapiens Membrane cofactor protein Proteins 0.000 description 41
- 101000632266 Homo sapiens Semaphorin-3C Proteins 0.000 description 41
- 101000650811 Homo sapiens Semaphorin-3D Proteins 0.000 description 41
- 102100030710 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial Human genes 0.000 description 41
- 108091005770 SIRT3 Proteins 0.000 description 41
- 102100027980 Semaphorin-3C Human genes 0.000 description 41
- 102100027746 Semaphorin-3D Human genes 0.000 description 41
- 102100039373 Membrane cofactor protein Human genes 0.000 description 40
- 102100033428 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP Human genes 0.000 description 40
- 208000002761 neurofibromatosis 2 Diseases 0.000 description 40
- 208000022032 neurofibromatosis type 2 Diseases 0.000 description 40
- 102100033885 Collagen alpha-2(XI) chain Human genes 0.000 description 39
- 102100029362 Cone-rod homeobox protein Human genes 0.000 description 39
- 102100031461 Cytochrome P450 2J2 Human genes 0.000 description 39
- 102100030013 Endoribonuclease Human genes 0.000 description 39
- 102100034174 Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3 Human genes 0.000 description 39
- 101000710619 Homo sapiens Collagen alpha-2(XI) chain Proteins 0.000 description 39
- 101000919370 Homo sapiens Cone-rod homeobox protein Proteins 0.000 description 39
- 101000941723 Homo sapiens Cytochrome P450 2J2 Proteins 0.000 description 39
- 101000588964 Homo sapiens Myosin-14 Proteins 0.000 description 39
- 101000958744 Homo sapiens Myosin-7B Proteins 0.000 description 39
- 101000741788 Homo sapiens Peroxisome proliferator-activated receptor alpha Proteins 0.000 description 39
- 108091006081 Inositol-requiring enzyme-1 Proteins 0.000 description 39
- 102100032972 Myosin-14 Human genes 0.000 description 39
- 102100038831 Peroxisome proliferator-activated receptor alpha Human genes 0.000 description 39
- 102000005028 SLC6A1 Human genes 0.000 description 39
- 108060007759 SLC6A1 Proteins 0.000 description 39
- 102100031834 Unconventional myosin-VI Human genes 0.000 description 39
- 108010049787 myosin VI Proteins 0.000 description 39
- 102100029348 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 2 Human genes 0.000 description 38
- 101000989662 Homo sapiens CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 2 Proteins 0.000 description 38
- 101000822103 Homo sapiens Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7 Proteins 0.000 description 38
- 102100021511 Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7 Human genes 0.000 description 38
- 102100038495 Bile acid receptor Human genes 0.000 description 37
- 101000603876 Homo sapiens Bile acid receptor Proteins 0.000 description 37
- 101000954986 Homo sapiens Merlin Proteins 0.000 description 37
- 101000665452 Homo sapiens RNA binding protein fox-1 homolog 2 Proteins 0.000 description 37
- 101000704203 Homo sapiens Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 Proteins 0.000 description 37
- 101000610557 Homo sapiens U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 Proteins 0.000 description 37
- 102100037106 Merlin Human genes 0.000 description 37
- 102100038187 RNA binding protein fox-1 homolog 2 Human genes 0.000 description 37
- 102100031874 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 Human genes 0.000 description 37
- 102100040118 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 Human genes 0.000 description 37
- 102100028734 1,4-alpha-glucan-branching enzyme Human genes 0.000 description 36
- 102100020999 Argininosuccinate synthase Human genes 0.000 description 36
- 102100027954 BAG family molecular chaperone regulator 3 Human genes 0.000 description 36
- 102100025680 Complement decay-accelerating factor Human genes 0.000 description 36
- 102100032053 Elongation of very long chain fatty acids protein 4 Human genes 0.000 description 36
- 102100029458 Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A Human genes 0.000 description 36
- 101001058479 Homo sapiens 1,4-alpha-glucan-branching enzyme Proteins 0.000 description 36
- 101000784014 Homo sapiens Argininosuccinate synthase Proteins 0.000 description 36
- 101000697871 Homo sapiens BAG family molecular chaperone regulator 3 Proteins 0.000 description 36
- 101000856022 Homo sapiens Complement decay-accelerating factor Proteins 0.000 description 36
- 101000921354 Homo sapiens Elongation of very long chain fatty acids protein 4 Proteins 0.000 description 36
- 101001125242 Homo sapiens Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A Proteins 0.000 description 36
- 101000955481 Homo sapiens Phosphatidylcholine translocator ABCB4 Proteins 0.000 description 36
- 101000583179 Homo sapiens Plakophilin-2 Proteins 0.000 description 36
- 101001027324 Homo sapiens Progranulin Proteins 0.000 description 36
- 101000772888 Homo sapiens Ubiquitin-protein ligase E3A Proteins 0.000 description 36
- 102100039032 Phosphatidylcholine translocator ABCB4 Human genes 0.000 description 36
- 102100030348 Plakophilin-2 Human genes 0.000 description 36
- 102100037632 Progranulin Human genes 0.000 description 36
- 102100030434 Ubiquitin-protein ligase E3A Human genes 0.000 description 36
- 102100034746 Cyclin-dependent kinase-like 5 Human genes 0.000 description 35
- 102100027768 Histone-lysine N-methyltransferase 2D Human genes 0.000 description 35
- 101000945692 Homo sapiens Cyclin-dependent kinase-like 5 Proteins 0.000 description 35
- 101001008894 Homo sapiens Histone-lysine N-methyltransferase 2D Proteins 0.000 description 35
- 101001046974 Homo sapiens KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 Proteins 0.000 description 35
- 101000992283 Homo sapiens Optineurin Proteins 0.000 description 35
- 101000701363 Homo sapiens Phospholipid-transporting ATPase IC Proteins 0.000 description 35
- 101001088739 Homo sapiens Probable inactive ribonuclease-like protein 12 Proteins 0.000 description 35
- 101001099922 Homo sapiens Retinoic acid-induced protein 1 Proteins 0.000 description 35
- 102100022903 KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 Human genes 0.000 description 35
- 108010006746 KCNQ2 Potassium Channel Proteins 0.000 description 35
- 102100031822 Optineurin Human genes 0.000 description 35
- 102100030448 Phospholipid-transporting ATPase IC Human genes 0.000 description 35
- 102100034354 Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2 Human genes 0.000 description 35
- 102100038470 Retinoic acid-induced protein 1 Human genes 0.000 description 35
- 102100030681 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3 Human genes 0.000 description 35
- 101710101741 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3 Proteins 0.000 description 35
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 35
- 101150103820 Fxn gene Proteins 0.000 description 34
- 102100022688 GATOR complex protein DEPDC5 Human genes 0.000 description 34
- 101000914673 Homo sapiens Fanconi anemia group A protein Proteins 0.000 description 34
- 101000918487 Homo sapiens Fumarylacetoacetase Proteins 0.000 description 34
- 101001044724 Homo sapiens GATOR complex protein DEPDC5 Proteins 0.000 description 34
- 101150083522 MECP2 gene Proteins 0.000 description 34
- 102100039124 Methyl-CpG-binding protein 2 Human genes 0.000 description 34
- 102100030390 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1 Human genes 0.000 description 33
- 101000583063 Homo sapiens 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1 Proteins 0.000 description 33
- 102100027280 Fanconi anemia group A protein Human genes 0.000 description 26
- 102100027525 Frataxin, mitochondrial Human genes 0.000 description 26
- YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N cycloheximide Chemical compound C1[C@@H](C)C[C@H](C)C(=O)[C@@H]1[C@H](O)CC1CC(=O)NC(=O)C1 YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N 0.000 description 24
- 238000000034 method Methods 0.000 description 14
- 101100461040 Homo sapiens NSD1 gene Proteins 0.000 description 12
- 101150038789 NSD1 gene Proteins 0.000 description 12
- -1 COL4A 4 Proteins 0.000 description 11
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 11
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 10
- 206010011878 Deafness Diseases 0.000 description 9
- 101150075435 MBD5 gene Proteins 0.000 description 9
- 231100000888 hearing loss Toxicity 0.000 description 9
- 230000010370 hearing loss Effects 0.000 description 9
- 208000016354 hearing loss disease Diseases 0.000 description 9
- 101100242906 Anopheles gambiae PBAN gene Proteins 0.000 description 8
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 8
- 230000008859 change Effects 0.000 description 8
- 102000044126 RNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 7
- 238000010240 RT-PCR analysis Methods 0.000 description 7
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 7
- 101150057990 COL4A4 gene Proteins 0.000 description 6
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101150087122 Gucy2f gene Proteins 0.000 description 6
- 101150016456 Hexa gene Proteins 0.000 description 6
- 101150034145 PRPF3 gene Proteins 0.000 description 6
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 6
- 101150020107 SCN8A gene Proteins 0.000 description 6
- 101150040067 STK11 gene Proteins 0.000 description 6
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 6
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 6
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 6
- 201000008181 benign familial infantile epilepsy Diseases 0.000 description 5
- 206010015037 epilepsy Diseases 0.000 description 5
- 208000024985 Alport syndrome Diseases 0.000 description 4
- 101150049640 CHD2 gene Proteins 0.000 description 4
- 101100220551 Homo sapiens CHD2 gene Proteins 0.000 description 4
- 108091027974 Mature messenger RNA Proteins 0.000 description 4
- 101150083321 Nf1 gene Proteins 0.000 description 4
- 101150045559 Opa1 gene Proteins 0.000 description 4
- 101150089617 PCCA gene Proteins 0.000 description 4
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 4
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 4
- 108700020471 RNA-Binding Proteins Proteins 0.000 description 4
- 101150037222 SYNGAP1 gene Proteins 0.000 description 4
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 238000001803 electron scattering Methods 0.000 description 4
- 208000003215 hereditary nephritis Diseases 0.000 description 4
- 201000004012 propionic acidemia Diseases 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- 101710159080 Aconitate hydratase A Proteins 0.000 description 3
- 101710159078 Aconitate hydratase B Proteins 0.000 description 3
- 206010003591 Ataxia Diseases 0.000 description 3
- 201000000046 Beckwith-Wiedemann syndrome Diseases 0.000 description 3
- 101150026579 CBS gene Proteins 0.000 description 3
- 101150026353 CD46 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150030967 CFH gene Proteins 0.000 description 3
- 101150038645 CLN3 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150029591 CRX gene Proteins 0.000 description 3
- 101150030134 CYP2J2 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150041164 Cacna1a gene Proteins 0.000 description 3
- 101150037478 Col11a2 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150060812 Col4a3 gene Proteins 0.000 description 3
- 208000006509 Congenital Pain Insensitivity Diseases 0.000 description 3
- 101150066790 DHDDS gene Proteins 0.000 description 3
- 101150108105 DNAJC8 gene Proteins 0.000 description 3
- 206010013952 Dysphonia Diseases 0.000 description 3
- 101150038979 ERN1 gene Proteins 0.000 description 3
- 208000002091 Febrile Seizures Diseases 0.000 description 3
- 208000027472 Galactosemias Diseases 0.000 description 3
- 208000003078 Generalized Epilepsy Diseases 0.000 description 3
- 208000010473 Hoarseness Diseases 0.000 description 3
- 101100007625 Homo sapiens CR1 gene Proteins 0.000 description 3
- 101100186034 Homo sapiens MYH14 gene Proteins 0.000 description 3
- 101100240607 Homo sapiens NIPBL gene Proteins 0.000 description 3
- 101001125496 Homo sapiens Pre-mRNA-processing factor 19 Proteins 0.000 description 3
- 101100477600 Homo sapiens SIRT3 gene Proteins 0.000 description 3
- 206010020365 Homocystinuria Diseases 0.000 description 3
- 108700000201 Hyaloideoretinal degeneration of Wagner Proteins 0.000 description 3
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 3
- 101150018665 MAPK3 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150049118 MYO6 gene Proteins 0.000 description 3
- 206010059521 Methylmalonic aciduria Diseases 0.000 description 3
- 208000021642 Muscular disease Diseases 0.000 description 3
- 201000009623 Myopathy Diseases 0.000 description 3
- 101150062702 NIPBL gene Proteins 0.000 description 3
- 101150027485 NR1H4 gene Proteins 0.000 description 3
- 108010085839 Neurofibromin 2 Proteins 0.000 description 3
- 102000007517 Neurofibromin 2 Human genes 0.000 description 3
- 101150025719 Nf2 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150068605 PKP2 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150014691 PPARA gene Proteins 0.000 description 3
- 102100029522 Pre-mRNA-processing factor 19 Human genes 0.000 description 3
- 101710105008 RNA-binding protein Proteins 0.000 description 3
- 101150009937 SIRT3 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150080511 Scn9a gene Proteins 0.000 description 3
- 101150026780 Sema3c gene Proteins 0.000 description 3
- 208000026511 Sotos syndrome 1 Diseases 0.000 description 3
- 101150005730 TOPORS gene Proteins 0.000 description 3
- 208000022292 Tay-Sachs disease Diseases 0.000 description 3
- 101150004141 Vcan gene Proteins 0.000 description 3
- 201000002504 arrhythmogenic right ventricular dysplasia 9 Diseases 0.000 description 3
- 208000035283 autosomal dominant 1 intellectual disability Diseases 0.000 description 3
- 208000032089 autosomal dominant 5 intellectual disability Diseases 0.000 description 3
- 201000000191 autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 1 Diseases 0.000 description 3
- 201000000181 autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 5 Diseases 0.000 description 3
- 208000037738 autosomal recessive channelopathy-associated congenital insensitivity to pain Diseases 0.000 description 3
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 3
- 201000004295 childhood onset epileptic encephalopathy Diseases 0.000 description 3
- 201000000464 cone-rod dystrophy 2 Diseases 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 208000021723 developmental and epileptic encephalopathy 11 Diseases 0.000 description 3
- 208000021839 developmental and epileptic encephalopathy 13 Diseases 0.000 description 3
- 208000036419 developmental and epileptic encephalopathy 94 Diseases 0.000 description 3
- 208000017009 developmental and epileptic encephalopathy, 13 Diseases 0.000 description 3
- 208000014205 familial febrile seizures Diseases 0.000 description 3
- 208000013779 familial hemiplegic migraine 1 Diseases 0.000 description 3
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 3
- 101150002054 galE gene Proteins 0.000 description 3
- 208000011836 galactose epimerase deficiency Diseases 0.000 description 3
- 208000037584 hereditary sensory and autonomic neuropathy Diseases 0.000 description 3
- 201000000887 hereditary sensory and autonomic neuropathy type 5 Diseases 0.000 description 3
- 201000001993 idiopathic generalized epilepsy Diseases 0.000 description 3
- 201000003694 methylmalonic acidemia Diseases 0.000 description 3
- 230000001314 paroxysmal effect Effects 0.000 description 3
- 208000033808 peripheral neuropathy Diseases 0.000 description 3
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 3
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 3
- 201000010667 retinitis pigmentosa 18 Diseases 0.000 description 3
- 101150003600 sema3d gene Proteins 0.000 description 3
- 210000001324 spliceosome Anatomy 0.000 description 3
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 3
- 102100030089 ATP-dependent RNA helicase DHX8 Human genes 0.000 description 2
- 208000014644 Brain disease Diseases 0.000 description 2
- 201000007547 Dravet syndrome Diseases 0.000 description 2
- 208000032274 Encephalopathy Diseases 0.000 description 2
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 2
- 208000024412 Friedreich ataxia Diseases 0.000 description 2
- 102000006479 Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108010019372 Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoproteins Proteins 0.000 description 2
- 101000864666 Homo sapiens ATP-dependent RNA helicase DHX8 Proteins 0.000 description 2
- 101001122801 Homo sapiens Pre-mRNA-processing factor 17 Proteins 0.000 description 2
- 101001122792 Homo sapiens Pre-mRNA-splicing factor 18 Proteins 0.000 description 2
- 101001122811 Homo sapiens Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 Proteins 0.000 description 2
- 101000912686 Homo sapiens Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 Proteins 0.000 description 2
- 101000874142 Homo sapiens Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 Proteins 0.000 description 2
- 101000823955 Homo sapiens Serine palmitoyltransferase 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000707546 Homo sapiens Splicing factor 3A subunit 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000707561 Homo sapiens Splicing factor 3A subunit 2 Proteins 0.000 description 2
- 101000707567 Homo sapiens Splicing factor 3B subunit 1 Proteins 0.000 description 2
- 208000036572 Myoclonic epilepsy Diseases 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- 102100028730 Pre-mRNA-processing factor 17 Human genes 0.000 description 2
- 102100028731 Pre-mRNA-splicing factor 18 Human genes 0.000 description 2
- 102100028729 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 Human genes 0.000 description 2
- 102100026136 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 Human genes 0.000 description 2
- 102100035725 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 Human genes 0.000 description 2
- 208000008425 Protein deficiency Diseases 0.000 description 2
- 102100022068 Serine palmitoyltransferase 1 Human genes 0.000 description 2
- 206010073677 Severe myoclonic epilepsy of infancy Diseases 0.000 description 2
- 102000039471 Small Nuclear RNA Human genes 0.000 description 2
- 102100031713 Splicing factor 3A subunit 1 Human genes 0.000 description 2
- 102100031712 Splicing factor 3A subunit 2 Human genes 0.000 description 2
- 102100031711 Splicing factor 3B subunit 1 Human genes 0.000 description 2
- 206010002026 amyotrophic lateral sclerosis Diseases 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 208000015114 central nervous system disease Diseases 0.000 description 2
- 208000022641 cognitive impairment with or without cerebellar ataxia Diseases 0.000 description 2
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 2
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 2
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 2
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 2
- 208000032265 familial 1 febrile seizures Diseases 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 206010053219 non-alcoholic steatohepatitis Diseases 0.000 description 2
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 238000003762 quantitative reverse transcription PCR Methods 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 208000003242 retinitis pigmentosa 31 Diseases 0.000 description 2
- 201000010685 retinitis pigmentosa 59 Diseases 0.000 description 2
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 2
- 150000003384 small molecules Chemical group 0.000 description 2
- 108091029842 small nuclear ribonucleic acid Proteins 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 102100021503 ATP-binding cassette sub-family B member 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100023388 ATP-dependent RNA helicase DHX15 Human genes 0.000 description 1
- 208000009575 Angelman syndrome Diseases 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 102100033868 Cannabinoid receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710187010 Cannabinoid receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 206010008025 Cerebellar ataxia Diseases 0.000 description 1
- 206010050389 Cerebral ataxia Diseases 0.000 description 1
- 108091062157 Cis-regulatory element Proteins 0.000 description 1
- 201000011297 Citrullinemia Diseases 0.000 description 1
- 208000025809 Citrullinemia type II Diseases 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 208000028698 Cognitive impairment Diseases 0.000 description 1
- 206010018325 Congenital glaucomas Diseases 0.000 description 1
- 206010010904 Convulsion Diseases 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100038595 Estrogen receptor Human genes 0.000 description 1
- 101000742140 Foeniculum vulgare Pathogenesis-related protein Proteins 0.000 description 1
- 201000011240 Frontotemporal dementia Diseases 0.000 description 1
- 101000907886 Homo sapiens ATP-dependent RNA helicase DHX15 Proteins 0.000 description 1
- 101000924727 Homo sapiens Alternative prion protein Proteins 0.000 description 1
- 101000740685 Homo sapiens C4b-binding protein alpha chain Proteins 0.000 description 1
- 101000882584 Homo sapiens Estrogen receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001090065 Homo sapiens Peroxiredoxin-2 Proteins 0.000 description 1
- 101001105692 Homo sapiens Pre-mRNA-processing factor 6 Proteins 0.000 description 1
- 101001105683 Homo sapiens Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 Proteins 0.000 description 1
- 101000599843 Homo sapiens RelA-associated inhibitor Proteins 0.000 description 1
- 101001095807 Homo sapiens Ribonuclease inhibitor Proteins 0.000 description 1
- 101000703464 Homo sapiens SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000707569 Homo sapiens Splicing factor 3A subunit 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000808799 Homo sapiens Splicing factor U2AF 35 kDa subunit Proteins 0.000 description 1
- 101000658071 Homo sapiens Splicing factor U2AF 65 kDa subunit Proteins 0.000 description 1
- 101000577737 Homo sapiens U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 Proteins 0.000 description 1
- 206010021750 Infantile Spasms Diseases 0.000 description 1
- 208000035899 Infantile spasms syndrome Diseases 0.000 description 1
- 208000007367 Kabuki syndrome Diseases 0.000 description 1
- 201000003395 Koolen de Vries syndrome Diseases 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- 208000033180 Monosomy 22q13.3 Diseases 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 101100083515 Mus musculus Plcb1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000686934 Mus musculus Prolactin-7D1 Proteins 0.000 description 1
- 208000037004 Myoclonic-astatic epilepsy Diseases 0.000 description 1
- 208000022873 Ocular disease Diseases 0.000 description 1
- 206010030348 Open-Angle Glaucoma Diseases 0.000 description 1
- 208000026251 Opioid-Related disease Diseases 0.000 description 1
- 101100121113 Oryza sativa subsp. japonica GA20OX2 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010061334 Partial seizures Diseases 0.000 description 1
- 201000006880 Phelan-McDermid syndrome Diseases 0.000 description 1
- 102100021232 Pre-mRNA-processing factor 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100021231 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 Human genes 0.000 description 1
- 102000015097 RNA Splicing Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010039259 RNA Splicing Factors Proteins 0.000 description 1
- 102100037875 RelA-associated inhibitor Human genes 0.000 description 1
- 208000006289 Rett Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 102100030680 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 108091006175 SLC25 Proteins 0.000 description 1
- 102000034556 SLC25 Human genes 0.000 description 1
- 101000633277 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Peroxiredoxin TSA1 Proteins 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000001388 Smith-Magenis syndrome Diseases 0.000 description 1
- 102100031710 Splicing factor 3A subunit 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100038501 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit Human genes 0.000 description 1
- 102100035040 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit Human genes 0.000 description 1
- 208000015308 Stargardt disease 3 Diseases 0.000 description 1
- 208000026911 Tuberous sclerosis complex Diseases 0.000 description 1
- 208000032001 Tyrosinemia type 1 Diseases 0.000 description 1
- 108010091281 U1 Small Nuclear Ribonucleoprotein Proteins 0.000 description 1
- 102000018165 U1 Small Nuclear Ribonucleoprotein Human genes 0.000 description 1
- 108091026838 U1 spliceosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 102100028852 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 Human genes 0.000 description 1
- 201000006791 West syndrome Diseases 0.000 description 1
- 208000009437 Wolfram syndrome 2 Diseases 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 230000001668 ameliorated effect Effects 0.000 description 1
- 201000007201 aphasia Diseases 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000029560 autism spectrum disease Diseases 0.000 description 1
- 201000005822 autosomal dominant nonsyndromic deafness 13 Diseases 0.000 description 1
- 201000005751 autosomal dominant nonsyndromic deafness 4A Diseases 0.000 description 1
- 208000033966 autosomal dominant nonsyndromic hearing loss 13 Diseases 0.000 description 1
- 208000033562 autosomal dominant nonsyndromic hearing loss 4A Diseases 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 208000016617 citrullinemia type I Diseases 0.000 description 1
- 208000010877 cognitive disease Diseases 0.000 description 1
- 230000001054 cortical effect Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 208000030294 developmental and epileptic encephalopathy 12 Diseases 0.000 description 1
- 208000013798 developmental and epileptic encephalopathy, 12 Diseases 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 201000011246 dilated cardiomyopathy 1HH Diseases 0.000 description 1
- 238000000804 electron spin resonance spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 230000001037 epileptic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 1
- 201000007186 focal epilepsy Diseases 0.000 description 1
- 201000004504 glycogen storage disease IV Diseases 0.000 description 1
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 201000002159 intrahepatic cholestasis of pregnancy 3 Diseases 0.000 description 1
- 238000004969 ion scattering spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 1
- 208000016313 myoclonic-astastic epilepsy Diseases 0.000 description 1
- 208000017127 myoclonic-atonic epilepsy Diseases 0.000 description 1
- 201000010262 myofibrillar myopathy 6 Diseases 0.000 description 1
- 208000008338 non-alcoholic fatty liver disease Diseases 0.000 description 1
- 201000005040 opiate dependence Diseases 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 201000006672 primary congenital glaucoma Diseases 0.000 description 1
- 201000006366 primary open angle glaucoma Diseases 0.000 description 1
- 208000001282 primary progressive aphasia Diseases 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 201000002162 progressive familial intrahepatic cholestasis 1 Diseases 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 230000007115 recruitment Effects 0.000 description 1
- 230000011514 reflex Effects 0.000 description 1
- 230000009711 regulatory function Effects 0.000 description 1
- 230000001718 repressive effect Effects 0.000 description 1
- 210000001525 retina Anatomy 0.000 description 1
- 208000001957 retinitis pigmentosa 11 Diseases 0.000 description 1
- 208000027390 severe congenital neutropenia 3 Diseases 0.000 description 1
- 230000003584 silencer Effects 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000027039 spliceosomal complex assembly Effects 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 208000009999 tuberous sclerosis Diseases 0.000 description 1
- 201000011296 tyrosinemia Diseases 0.000 description 1
- 201000007972 tyrosinemia type I Diseases 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
- A61K31/7105—Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
- C07H21/02—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
- C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/40—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against enzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/11—Antisense
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
- C12N2310/315—Phosphorothioates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
- C12N2310/321—2'-O-R Modification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2320/00—Applications; Uses
- C12N2320/30—Special therapeutic applications
- C12N2320/33—Alteration of splicing
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Neurology (AREA)
- Neurosurgery (AREA)
- Mycology (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
[0001]本出願は、それぞれその全体が参照によって本明細書に組み込まれる、2017年10月23日に提出された米国仮出願第62/575,924号、および2018年5月4日に提出された米国仮出願第62/667,200号の利益を主張する。
[0017]一部の実施形態において、治療剤は、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除を促進する。一部の実施形態において、治療剤と接触した細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除は、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除と比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する。一部の実施形態において、治療剤は、細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルを増加させる。一部の実施形態において、治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルは、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルと比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する。一部の実施形態において、治療剤は、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる。一部の実施形態において、治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質のレベルは、対照細胞において産生される標的タンパク質のレベルと比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する。
[0019]一部の実施形態において、疾患または状態は、標的タンパク質をコードする遺伝子のハプロ不全に関連し、対象は、機能性標的タンパク質をコードする第1のアレル、および標的タンパク質が産生されないか、もしくは低下したレベルで産生される第2のアレル、または非機能性標的タンパク質もしくは部分機能性標的タンパク質をコードする第2のアレルを有する。一部の実施形態において、疾患または状態は、ソトス症候群1;ベックウィズ・ヴィーデマン症候群;家族性片麻痺性片頭痛1;発作性運動失調症2型;小児期発症てんかん性脳症;ワーグナー症候群1;視神経萎縮1型;アルポート症候群;不整脈原性右室異形成症9;神経線維腫症1型;早期乳児てんかん性脳症11;良性家族性乳児発作3;小脳性運動失調症を伴うまたは伴わない認知機能障害;早期乳児てんかん性脳症13;良性家族性乳児発作5;経路(CNS);16p11.2欠失症候群;常染色体優性精神遅滞1;網膜色素変性症18;網膜色素変性症31;常染色体優性難聴13;錐体桿体網膜ジストロフィー2;常染色体優性難聴4A;末梢神経障害、ミオパチー、嗄声、および難聴;常染色体優性難聴22;神経線維腫症2型;常染色体優性精神遅滞5;全般てんかん熱性痙攣プラス7型;ならびに家族性熱性痙攣3Bからなる群から選択される。
[0030]一部の実施形態において、対象はヒトである。一部の実施形態において、対象は非ヒト動物である。一部の実施形態において、対象は胎児、胚、または小児である。一部の実施形態において、細胞はエクスビボである。一部の実施形態において、治療剤は、対象の髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、硝子体内、または静脈内注射によって投与される。一部の実施形態において、方法は、第2の治療剤を対象に投与するステップをさらに含む。
参照による組込み
[0033]本明細書において言及される全ての刊行物、特許、および特許出願は、個々の各刊行物、特許、または特許出願が参照によって組み込まれることが具体的かつ個別的に指示される場合と同じ程度に、参照によって本明細書に組み込まれる。
スプライシングおよびナンセンス変異依存mRNA分解機構
[0115]介在配列またはイントロンは、スプライソソームと称される、大きく、高度に動的なRNA-タンパク質複合体によって除去され、このことが一次転写物と、核内低分子RNA(snRNA)と、多数のタンパク質との間の複雑な相互作用を調整する。スプライソソームは、その都度各イントロン上に規則正しく集合し、U1 snRNAによる5’スプライス部位(5’ss)またはU2経路による3’スプライス部位(3’ss)の認識から開始し、U2経路は、U2補助因子(U2AF)の3’ss領域への結合に関与して、U2が分岐点配列(BPS)に結合することを容易にする。U2AFは、ポリピリミジントラクト(PPT)を結合する、U2AF2によってコードされる65kDのサブユニット(U2AF65)、および3‘ssにおいて高度に保存されたAGジヌクレオチドと相互作用し、U2AF65が結合することを安定化させる、U2AF1によってコードされる35kDのサブユニット(U2AF35)から構成される安定なヘテロ二量体である。正確なスプライシングは、BPS/PPTユニットおよび3’ss/5’ssに加えて、イントロンまたはエクソンスプライシングエンハンサーまたはサイレンサーとして公知の、スプライス部位認識を活性化または抑制する補助配列または構造を必要とする。これらのエレメントは、同じ配列を有するが本来の部位よりも10倍多い、高等真核生物のゲノムにおける非常に過剰な潜在的または偽部位の中から、真のスプライス部位が認識されることを可能にする。エレメントはしばしば制御機能を有するが、その活性化または抑制の厳密な機構は、十分に理解されていない。
標的転写物
[0124]一部の実施形態において、本開示の方法は、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1遺伝子から転写されたmRNA前駆体におけるNIEの存在を活用する。機能性成熟ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNAを産生する、同定されたABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 NIE mRNA前駆体種のスプライシングは、NIEのエクソンスキッピングを刺激するASO等の治療剤を使用して誘導することができる。エクソンスキッピングの誘導は、NMD経路の阻害を結果的にもたらすことができる。結果として生じる成熟ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNAは、通常はNMD経路を活性化させることなく翻訳され、それにより患者の細胞におけるABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質の量を増加させ、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1欠損に関連する状態または疾患、例えば、アルポート症候群;筋萎縮性側索硬化症(ALS);アンジェルマン症候群;原発性進行性失語症;不整脈原性右室異形成症9;自閉症スペクトラム障害;拡張型心筋症1HH;筋原線維性ミオパチー6;神経セロイド(ceriod)リポフスチン症3;妊娠性肝内胆汁うっ滞症3;進行性家族性肝内胆汁うっ滞症1;シトルリン血症II型;シトルリン血症1型;大脳性運動失調症を伴うもしくは伴わない認知機能障害;コルネリア・デ・ランゲ;早期発症てんかん性脳症;てんかん・失語症スペクトラム;全般てんかん熱性痙攣プラス7型;小児期発症てんかん性脳症;早期乳児てんかん性脳症11;早期乳児てんかん性脳症12;早期乳児てんかん性脳症13;早期乳児てんかん性脳症2;発作性運動失調症2型;家族性焦点性てんかん;家族性熱性痙攣3B;フリードライヒ運動失調症;反射の保持を伴うフリードライヒ運動失調症;ガラクトースエピメラーゼ欠損症;原発先天緑内障3E;糖原病IV;GRN関連前頭側頭型認知症;B6反応型および非反応型ホモシスチン尿症;常染色体劣性HSAN2D;先天性無痛症;歌舞伎症候群;クーレン・デ・ブリーズ(Koolen-De Vries)症候群;常染色体優性精神遅滞1;メチルマロン酸尿症;家族性片麻痺性片頭痛1;ミオクロニー脱力てんかん;神経線維腫症1型;オピオイド依存症;視神経萎縮1型;フェラン・マクダーミド症候群;プロピオン酸血症;原発開放隅角緑内障;プロピオン酸血症(Propionic academia);網膜色素変性症11;網膜色素変性症18;網膜色素変性症31;網膜色素変性症59;レット症候群;良性家族性乳児発作3;良性家族性乳児発作5;スミス・マゲニス症候群;ソトス症候群1;ベックウィズ・ヴィーデマン症候群;シュタルガルト病3;テイ・サックス病;結節性硬化症;チロシン血症I型;ワーグナー症候群1;ウエスト症候群;ウォルフラム症候群2/NAFLD;15q13.3微小欠失;16p11.2欠失症候群;常染色体優性難聴13;錐体桿体網膜ジストロフィー2;常染色体優性難聴4A;末梢神経障害、ミオパチー、嗄声、および難聴;常染色体優性難聴22;神経線維腫症2型;NASH;または常染色体優性精神遅滞5の症状を軽減することができる。
、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNA前駆体転写物のエクソン内の配列を標的とする。一部の実施形態において、ASOは、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNA前駆体転写物のイントロン内の配列を標的とする。一部の実施形態において、ASOは、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNA前駆体転写物の、イントロンの一部分とエクソンの一部分の両方を含む配列を標的とする。
8 51688849);SCN8Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr12 51780202 51780271);SCN9Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr2 166304238 166304329);SEMA3Cのエクソン(GRCh38/hg38:chr7 80794854 80794957);SEMA3Dのエクソン(GRCh38/hg38:chr7 85059498 85059541);SIRT3のエクソン(GRCh38/hg38:chr11 225673 226081);STK11のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 1216268 1216398);STK11のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 1221621 1221846);SYNGAP1のエクソン(GRCh38/hg38:chr6 33448789 33448868);TOPORSのエクソン(GRCh38/hg38:chr9 32551365 32551469);VCANのエクソン(GRCh38/hg38:chr5 83544965 83545070)を標的とする。
[0136]一部の実施形態において、ASOは、NIEの5’末端から上流の配列を標的とする。例えば、NIE(例えば、ABCB4のエクソン8x、ASS1のエクソン9x、ATP8B1のエクソン16x、BAG3のエクソン1x、CACNA1Aのエクソン31x、CACNA1Aのエクソン36x、CACNA1Aのエクソン37x、CBSのエクソン3x、CBSのエクソン12x、CD55のエクソン1x、CDKL5のエクソン16x、CFHのエクソン3x、CHD2のエクソン30x、CHRNA7のエクソン4x、CISD2のエクソン1x、CLN3のエクソン15x、COL4A3のエクソン11x、COL4A3のエクソン41x、COL4A4のエクソン22x、COL4A4のエクソン44x、DEPDC5のエクソン20x、DHDDSのエクソン2x、ELOVL4のエクソン3x、FAHのエクソン5x、FXNのエクソン4x、GALEのエクソン4x、GBE1のエクソン3x、GRIN2Aのエクソン11x、GRNのエクソン1x、HEXAのエクソン2x、KANSL1のエクソン2x、KCNQ2のエクソン1x、KMT2Dのエクソン50x、MAPK3のエクソン8x、MBD5のエクソン13x、MECP2のエクソン2x、MUTのエクソン11x、NF1のエクソン31x、NIPBLのエクソン7x、NIPBLのエクソン38x、NSD1のエクソン11x、OPA1のエクソン6x、OPA1のエクソン28x、OPTNのエクソン1x、PCCAのエクソン1x、PCCBのエクソン5x、PCCBのエクソン6x、PKP2のエクソン4x、PLCB1のエクソン23x、PRPF3のエクソン3x、PRPF31のエクソン9x、RAI1のエクソン1x、RBFOX2のエクソン5x、SCN2Aのエクソン13x、SCN3Aのエクソン6x、SCN3Aのエクソン7x、SCN8Aのエクソン4x、SCN8Aのエクソン6x、SCN8Aのエクソン20x、SCN9Aのエクソン6x、SHANK3のエクソン24x、SLC25A13のエクソン3x、SLC25A13のエクソン6x、SLC25A13のエクソン9x、SLC25A13のエクソン11x、SLC25A13のエクソン13x、SLC6A1のエクソン1x、SPTAN1のエクソン12x、TEKのエクソン10x、TEKのエクソン15x、TOPORSのエクソン1x、TSC2のエクソン11x、TSC2のエクソン30x、UBE3Aのエクソン1x、またはVCANのエクソン7x)の5’末端から上流の配列を標的とするASOは、配列番号60~134のいずれか1つの少なくとも8個の連続的な核酸に対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、97%、または100%相補的(complimentary)である配列を含む。例えば、NIE(例えば、AKT3のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 243564285 243564388);CACNA1Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr19 13236449 13236618);CBSのエクソン(GRCh38/hg38:chr21 43059730 43060012);CD46のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 207775610 207775745);CFHのエクソン(GRCh38/hg38:chr1 196675450 196675529);CHD2のエクソン(GRCh38/hg38:chr15 92998149 92998261);CLN3のエクソン(GRCh38/hg38:chr16 28479644 28479765);COL11A2のエクソン(GRCh38/hg38:chr6 33183634 33183698);COL4A3のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 227296487 227296526);COL4A4のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 227144653 227144833);COL4A4のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 227015283 227015360);CR1のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 207637688 207637848);CRXのエクソン(GRCh38/hg38:chr19 47835403 47835579);CYP2J2のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 59904366 59904516);DHDDSのエクソン(GRCh38/hg38:chr1 26442335 26442372);DNAJC8のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 28230131 28230252);EIF2AK3のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 88582755 88582824);ERN1のエクソン(GRCh38/hg38:chr17 64102673 64102804);GALEのエクソン(GRCh38/hg38:chr1 23798311 23798484);GUCY2Fのエクソン(GRCh38/hg38:chrX 109383365 109383446);GUCY2Fのエクソン(GRCh38/hg38:chrX 109439038 109439175);HEXAのエクソン(GRCh38/hg38:chr15 72362376 72362466);HEXAのエクソン(GRCh38/hg38:chr15 72345677 72345776);MAPK3のエクソン(GRCh38/hg38:chr16 30115595 30115645);MBD5のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 148460219 148460304);MBD5のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 148490695 148490787);MBD5のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 148505761 148505830);MUTのエクソン(GRCh38/hg38:chr6 49436522 49436597);MYH14のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 50230825 50230999);MYO6のエクソン(GRCh38/hg38:chr6 75867431 75867523);NF1のエクソン(GRCh38/hg38:chr17 31249955 31250125);NF2のエクソン(GRCh38/hg38:chr22 29628658 29628773);NIPBLのエクソン(GRCh38/hg38:chr5 37048127 37048354);NR1H4のエクソン(GRCh38/hg38:chr12 100499841 100500024);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177169394 177169559);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177200761 177200783);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177247924 177248079);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177275947 177276101);OPA1のエクソン(GRCh38/hg38:chr3 193628509 193628616);OPA1のエクソン(GRCh38/hg38:chr3 193603500 193603557);PCCAのエクソン(GRCh38/hg38:chr13 100305751 100305834);PKP2のエクソン(GRCh38/hg38:chr12 32894516 32894778);PPARAのエクソン(GRCh38/hg38:chr22 46203575 46203752);PRPF3のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 150327557 150327652);PRPF3のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 150330401 150330498);SCN2Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr2 165327155 165327202);SCN8Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr12 51688758 51688849);SCN8Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr12 51780202 51780271);SCN9Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr2 166304238 166304329);SEMA3Cのエクソン(GRCh38/hg38:chr7 80794854 80794957);SEMA3Dのエクソン(GRCh38/hg38:chr7 85059498 85059541);SIRT3のエクソン(GRCh38/hg38:chr11 225673 226081);STK11のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 1216268 1216398);STK11のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 1221621 1221846);SYNGAP1のエクソン(GRCh38/hg38:chr6 33448789 33448868);TOPORSのエクソン(GRCh38/hg38:chr9 32551365 32551469);VCANのエクソン(GRCh38/hg38:chr5 83544965 83545070))の5’末端から上流の配列を標的とするASOは、配列番号135~191のいずれか1つに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、97%、または100%の配列同一性を有する配列を含むことができる。
体のエクソン11x、GRN mRNA前駆体のエクソン1x、HEXA mRNA前駆体のエクソン2x、KANSL1 mRNA前駆体のエクソン2x、KCNQ2 mRNA前駆体のエクソン1x、KMT2D mRNA前駆体のエクソン50x、MAPK3 mRNA前駆体のエクソン8x、MBD5 mRNA前駆体のエクソン13x、MECP2 mRNA前駆体のエクソン2x、MUT mRNA前駆体のエクソン11x、NF1 mRNA前駆体のエクソン31x、NIPBL mRNA前駆体のエクソン7x、NIPBL mRNA前駆体のエクソン38x、NSD1 mRNA前駆体のエクソン11x、OPA1 mRNA前駆体のエクソン6x、OPA1 mRNA前駆体のエクソン28x、OPTN mRNA前駆体のエクソン1x、PCCA mRNA前駆体のエクソン1x、PCCB mRNA前駆体のエクソン5x、PCCB mRNA前駆体のエクソン6x、PKP2 mRNA前駆体のエクソン4x、PLCB1 mRNA前駆体のエクソン23x、PRPF3 mRNA前駆体のエクソン3x、PRPF31 mRNA前駆体のエクソン9x、RAI1 mRNA前駆体のエクソン1x、RBFOX2 mRNA前駆体のエクソン5x、SCN2A mRNA前駆体のエクソン13x、SCN3A mRNA前駆体のエクソン6x、SCN3A mRNA前駆体のエクソン7x、SCN8A mRNA前駆体のエクソン4x、SCN8A mRNA前駆体のエクソン6x、SCN8A mRNA前駆体のエクソン20x、SCN9A mRNA前駆体のエクソン6x、SHANK3 mRNA前駆体のエクソン24x、SLC25A13 mRNA前駆体のエクソン3x、SLC25A13 mRNA前駆体のエクソン6x、SLC25A13 mRNA前駆体のエクソン9x、SLC25A13 mRNA前駆体のエクソン11x、SLC25A13 mRNA前駆体のエクソン13x、SLC6A1 mRNA前駆体のエクソン1x、SPTAN1 mRNA前駆体のエクソン12x、TEK mRNA前駆体のエクソン10x、TEK mRNA前駆体のエクソン15x、TOPORS mRNA前駆体のエクソン1x、TSC2 mRNA前駆体のエクソン11x、TSC2 mRNA前駆体のエクソン30x、UBE3A mRNA前駆体のエクソン1x、またはVCAN mRNA前駆体のエクソン7xの3’末端から上流(または5’側)のエクソン20x配列を標的とする。
;PPARAのイントロン(GRCh38/hg38:chr22 46198592 46215172);PRPF3のイントロン(GRCh38/hg38:chr1 150325882 150328319);PRPF3のイントロン(GRCh38/hg38:chr1 150328467 150332683);SCN2Aのイントロン(GRCh38/hg38:chr2 165326985 165331329);SCN8Aのイントロン(GRCh38/hg38:chr12 51687220 51689004);SCN8Aのイントロン(GRCh38/hg38:chr12 51774363 51786541);SCN9Aのイントロン(GRCh38/hg38:chr2 166304122 166305791);SEMA3Cのイントロン(GRCh38/hg38:chr7 80789529 80798091);SEMA3Dのイントロン(GRCh38/hg38:chr7 85055860 85065423);SIRT3のイントロン(GRCh38/hg38:chr11 224241 230451);STK11のイントロン(GRCh38/hg38:chr19 1207204 1218416);STK11のイントロン(GRCh38/hg38:chr19 1221341 1221948);SYNGAP1のイントロン(GRCh38/hg38:chr6 33447934 33451759);TOPORSのイントロン(GRCh38/hg38:chr9 32550969 32552433);またはVCANのイントロン(GRCh38/hg38:chr5 83542269 83545536)である。
hg38:chr2 166304122 166305791);SEMA3Cのイントロン(GRCh38/hg38:chr7 80789529 80798091);SEMA3Dのイントロン(GRCh38/hg38:chr7 85055860 85065423);SIRT3のイントロン(GRCh38/hg38:chr11 224241 230451);STK11のイントロン(GRCh38/hg38:chr19 1207204 1218416);STK11のイントロン(GRCh38/hg38:chr19 1221341 1221948);SYNGAP1のイントロン(GRCh38/hg38:chr6 33447934 33451759);TOPORSのイントロン(GRCh38/hg38:chr9 32550969 32552433);またはVCANのイントロン(GRCh38/hg38:chr5 83542269 83545536)内にある。
タンパク質発現
[0141]一部の実施形態において、本明細書に記載される方法は、機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質またはRNAの産生を増加させるために使用される。本明細書で使用する場合、「機能性」という用語は、処置される状態または疾患、例えば、アルポート症候群;筋萎縮性側索硬化症(ALS);アンジェルマン症候群;原発性進行性失語症;不整脈原性右室異形成症9;自閉症スペクトラム障害;拡張型心筋症1HH;筋原線維性ミオパチー6;神経セロイド(ceriod)リポフスチン症3;妊娠性肝内胆汁うっ滞症3;進行性家族性肝内胆汁うっ滞症1;シトルリン血症II型;シトルリン血症1型;大脳性運動失調症を伴うもしくは伴わない認知機能障害;コルネリア・デ・ランゲ;早期発症てんかん性脳症;てんかん・失語症スペクトラム;全般てんかん熱性痙攣プラス7型;小児期発症てんかん性脳症;早期乳児てんかん性脳症11;早期乳児てんかん性脳症12;早期乳児てんかん性脳症13;早期乳児てんかん性脳症2;発作性運動失調症2型;家族性焦点性てんかん;家族性熱性痙攣3B;フリードライヒ運動失調症;反射の保持を伴うフリードライヒ運動失調症;ガラクトースエピメラーゼ欠損症;原発先天緑内障3E;糖原病IV;GRN関連前頭側頭型認知症;B6反応型および非反応型ホモシスチン尿症;常染色体劣性HSAN2D;先天性無痛症;歌舞伎症候群;クーレン・デ・ブリーズ(Koolen-De Vries)症候群;常染色体優性精神遅滞1;メチルマロン酸尿症;家族性片麻痺性片頭痛1;ミオクロニー脱力てんかん;神経線維腫症1型;オピオイド依存症;視神経萎縮1型;フェラン・マクダーミド症候群;プロピオン酸血症;原発開放隅角緑内障;プロピオン酸血症(Propionic academia);網膜色素変性症11;網膜色素変性症18;網膜色素変性症31;網膜色素変性症59;レット症候群;良性家族性乳児発作3;良性家族性乳児発作5;スミス・マゲニス症候群;ソトス症候群1;ベックウィズ・ヴィーデマン症候群;シュタルガルト病3;テイ・サックス病;結節性硬化症;チロシン血症I型;ワーグナー症候群1;ウエスト症候群;ウォルフラム症候群2/NAFLD;15q13.3微小欠失;16p11.2欠失症候群;常染色体優性難聴13;錐体桿体網膜ジストロフィー2;常染色体優性難聴4A;末梢神経障害、ミオパチー、嗄声、および難聴;常染色体優性難聴22;神経線維腫症2型;NASH;または常染色体優性精神遅滞5のいずれか1つまたは複数の症状を取り除くのに必要なABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質またはRNAの活性または機能の量を指す。一部の実施形態において、方法は、部分機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質またはRNAの産生を増加させるために使用される。本明細書で使用する場合、「部分機能性」という用語は、疾患または状態のいずれか1つまたは複数の症状を取り除くまたは防止するのに必要な活性または機能の量よりも少ない、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質またはRNAの活性または機能の任意の量を指す。一部の実施形態において、部分機能性タンパク質またはRNAは、完全機能性タンパク質またはRNAと比べて少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%低い活性を有し得る。
ANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質をコードする第2のアレルを有する。別のそのような実施形態において、対象は、機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質をコードする第1のアレル、および部分機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質をコードする第2のアレルを有する。これらの実施形態のいずれかにおいて、アンチセンスオリゴマーは、第2のアレルから転写されたNIE含有mRNA前駆体の標的化部分に結合し、それによりmRNA前駆体からの偽エクソンのエクソンスキッピングを誘導し、機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質をコードする成熟mRNAのレベルの増加、および対象の細胞におけるABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質の発現の増加を引き起こす。
(a)(i)ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、もしくはSYNGAP1タンパク質が、野生型アレルからの産生と比較して低下したレベルで産生される、
(ii)ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、もしくはSYNGAP1タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して低下した機能を有する形態で産生される、または
(iii)ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、もしくはSYNGAP1タンパク質もしくは機能性RNAが産生されない
第1の変異アレル、および
(b)(i)ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、もしくはSYNGAP1タンパク質が、野生型アレルからの産生と比較して低下したレベルで産生される、
(ii)ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、もしくはSYNGAP1タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して低下した機能を有する形態で産生される、または
(iii)ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、もしくはSYNGAP1タンパク質が産生されない
第2の変異アレル
を有し、NIE含有mRNA前駆体は、第1のアレルおよび/または第2のアレルから転写される。これらの実施形態において、ASOは、第1のアレルまたは第2のアレルから転写されたNIE含有mRNA前駆体の標的化部分に結合し、それによりNIE含有mRNA前駆体からの偽エクソンのエクソンスキッピングを誘導し、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質をコードするmRNAのレベルの増加、および対象の細胞における標的タンパク質または機能性RNAの発現の増加を引き起こす。これらの実施形態において、NIE含有mRNA前駆体からの偽エクソンのエクソンスキッピングの結果として生じる発現レベルの増加を有する標的タンパク質または機能性RNAは、同等の野生型タンパク質と比較して低下した機能(部分機能性)を有する形態であっても、同等の野生型タンパク質と比較して完全な機能(完全機能性)を有する形態であってもよい。
エクソン包含
[0151]本明細書で使用する場合、「NIE含有mRNA前駆体」は、少なくとも1個の偽エクソンを含有するmRNA前駆体転写物である。選択的または異常なスプライシングは、成熟mRNA転写物への少なくとも1個の偽エクソンの包含を結果的にもたらし得る。「成熟mRNA」および「完全スプライスmRNA」という用語は、本明細書では交換可能に使用されて、完全にプロセシングされたmRNAを表す。少なくとも1個の偽エクソンの包含は、非生産的mRNAとなり、成熟mRNAのNMDをもたらし得る。NIE含有成熟mRNAは、時折異常なタンパク質発現をもたらす場合がある。
SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 NIE含有mRNA前駆体の標的化部分に対して相補的でないオリゴヌクレオチドであり得る。
治療剤
[0159]本開示の様々な実施形態において、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1のタンパク質発現レベルを調節する治療剤を含む組成物および方法が提供される。一部の実施形態において、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNA前駆体の選択的スプライシングを調節する組成物および方法が本明細書で提供される。一部の実施形態において、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNA前駆体のスプライシングにおいてエクソンスキッピングを誘導する、例えば、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 mRNA前駆体のスプライシングの間に偽エクソンのスキッピングを誘導する組成物および方法が本明細書で提供される。他の実施形態において、治療剤は、エクソンの包含を誘導してタンパク質発現レベルを減少させるために使用してもよい。
本開示の一態様によれば、機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質欠損に関連する状態または疾患の処置または防止の方法であって、NIE抑制剤を対象に投与して機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質のレベルを増加させるステップを含み、薬剤が、mRNA前駆体転写物の領域に結合して成熟転写物へのNIEの包含を減少させる、方法が本明細書で提供される。例えば、機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCANタンパク質欠損に関連する状態の処置または防止の方法であって、NIE抑制剤を対象に投与して機能性ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCANタンパク質のレベルを増加させるステップを含み、薬剤が、mRNA前駆体転写物のNIE(例えば、ABCB4のエクソン8x、ASS1のエクソン9x、ATP8B1のエクソン16x、BAG3のエクソン1x、CACNA1Aのエクソン31x、CACNA1Aのエクソン36x、CACNA1Aのエクソン37x、CBSのエクソン3x、CBSのエクソン12x、CD55のエクソン1x、CDKL5のエクソン16x、CFHのエクソン3x、CHD2のエクソン30x、CHRNA7のエクソン4x、CISD2のエクソン1x、CLN3のエクソン15x、COL4A3のエクソン11x、COL4A3のエクソン41x、COL4A4のエクソン22x、COL4A4のエクソン44x、DEPDC5のエクソン20x、DHDDSのエクソン2x、ELOVL4のエクソン3x、FAHのエクソン5x、FXNのエクソン4x、GALEのエクソン4x、GBE1のエクソン3x、GRIN2Aのエクソン11x、GRNのエクソン1x、HEXAのエクソン2x、KANSL1のエクソン2x、KCNQ2のエクソン1x、KMT2Dのエクソン50x、MAPK3のエクソン8x、MBD5のエクソン13x、MECP2のエクソン2x、MUTのエクソン11x、NF1のエクソン31x、NIPBLのエクソン7x、NIPBLのエクソン38x、NSD1のエクソン11x、OPA1のエクソン6x、OPA1のエクソン28x、OPTNのエクソン1x、PCCAのエクソン1x、PCCBのエクソン5x、PCCBのエクソン6x、PKP2のエクソン4x、PLCB1のエクソン23x、PRPF3のエクソン3x、PRPF31のエクソン9x、RAI1のエクソン1x、RBFOX2のエクソン5x、SCN2Aのエクソン13x、SCN3Aのエクソン6x、SCN3Aのエクソン7x、SCN8Aのエクソン4x、SCN8Aのエクソン6x、SCN8Aのエクソン20x、SCN9Aのエクソン6x、SHANK3のエクソン24x、SLC25A13のエクソン3x、SLC25A13のエクソン6x、SLC25A13のエクソン9x、SLC25A13のエクソン11x、SLC25A13のエクソン13x、SLC6A1のエクソン1x、SPTAN1のエクソン12x、TEKのエクソン10x、TEKのエクソン15x、TOPORSのエクソン1x、TSC2のエクソン11x、TSC2のエクソン30x、UBE3Aのエクソン1x、もしくはVCANのエクソン7x)を含有するイントロンの領域、または同じイントロンにおけるNIE活性化制御配列に結合する、方法が本明細書で提供される。例えば、機能性AKT3、CACNA1A、CBS、CD46、CFH、CHD2、CLN3、COL11A2、COL4A3、COL4A4、COL4A4、CR1、CRX、CYP2J2、DHDDS、DNAJC8、EIF2AK3、ERN1、GALE、GUCY2F、GUCY2F、HEXA、HEXA、MAPK3、MBD5、MBD5、MBD5、MUT、MYH14、MYO6、NF1、NF2、NIPBL、NR1H4、NSD1、NSD1、NSD1、NSD1、OPA1、OPA1、PCCA、PKP2、PPARA、PRPF3、PRPF3、SCN2A、SCN8A、SCN8A、SCN9A、SEMA3C、SEMA3D、SIRT3、STK11、STK11、SYNGAP1、TOPORS、またはVCANタンパク質欠損に関連する状態の処置または防止の方法であって、NIE抑制剤を対象に投与して機能性AKT3、CACNA1A、CBS、CD46、CFH、CHD2、CLN3、COL11A2、COL4A3、COL4A4、COL4A4、CR1、CRX、CYP2J2、DHDDS、DNAJC8、EIF2AK3、ERN1、GALE、GUCY2F、GUCY2F、HEXA、HEXA、MAPK3、MBD5、MBD5、MBD5、MUT、MYH14、MYO6、NF1、NF2、NIPBL、NR1H4、NSD1、NSD1、NSD1、NSD1、OPA1、OPA1、PCCA、PKP2、PPARA、PRPF3、PRPF3、SCN2A、SCN8A、SCN8A、SCN9A、SEMA3C、SEMA3D、SIRT3、STK11、STK11、SYNGAP1、TOPORS、またはVCANタンパク質のレベルを増加させるステップを含み、薬剤が、mRNA前駆体転写物のNIE(例えば、AKT3のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 243564285 243564388);CACNA1Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr19 13236449 13236618);CBSのエクソン(GRCh38/hg38:chr21 43059730 43060012);CD46のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 207775610 207775745);CFHのエクソン(GRCh38/hg38:chr1 196675450 196675529);CHD2のエクソン(GRCh38/hg38:chr15 92998149 92998261);CLN3のエクソン(GRCh38/hg38:chr16 28479644 28479765);COL11A2のエクソン(GRCh38/hg38:chr6 33183634 33183698);COL4A3のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 227296487 227296526);COL4A4のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 227144653 227144833);COL4A4のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 227015283 227015360);CR1のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 207637688 207637848);CRXのエクソン(GRCh38/hg38:chr19 47835403 47835579);CYP2J2のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 59904366 59904516);DHDDSのエクソン(GRCh38/hg38:chr1 26442335 26442372);DNAJC8のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 28230131 28230252);EIF2AK3のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 88582755 88582824);ERN1のエクソン(GRCh38/hg38:chr17 64102673 64102804);GALEのエクソン(GRCh38/hg38:chr1 23798311 23798484);GUCY2Fのエクソン(GRCh38/hg38:chrX 109383365 109383446);GUCY2Fのエクソン(GRCh38/hg38:chrX 109439038 109439175);HEXAのエクソン(GRCh38/hg38:chr15 72362376 72362466);HEXAのエクソン(GRCh38/hg38:chr15 72345677 72345776);MAPK3のエクソン(GRCh38/hg38:chr16 30115595 30115645);MBD5のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 148460219 148460304);MBD5のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 148490695 148490787);MBD5のエクソン(GRCh38/hg38:chr2 148505761 148505830);MUTのエクソン(GRCh38/hg38:chr6 49436522 49436597);MYH14のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 50230825 50230999);MYO6のエクソン(GRCh38/hg38:chr6 75867431 75867523);NF1のエクソン(GRCh38/hg38:chr17 31249955 312
50125);NF2のエクソン(GRCh38/hg38:chr22 29628658 29628773);NIPBLのエクソン(GRCh38/hg38:chr5 37048127 37048354);NR1H4のエクソン(GRCh38/hg38:chr12 100499841 100500024);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177169394 177169559);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177200761 177200783);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177247924 177248079);NSD1のエクソン(GRCh38/hg38:chr5 177275947 177276101);OPA1のエクソン(GRCh38/hg38:chr3 193628509 193628616);OPA1のエクソン(GRCh38/hg38:chr3 193603500 193603557);PCCAのエクソン(GRCh38/hg38:chr13 100305751 100305834);PKP2のエクソン(GRCh38/hg38:chr12 32894516 32894778);PPARAのエクソン(GRCh38/hg38:chr22 46203575 46203752);PRPF3のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 150327557 150327652);PRPF3のエクソン(GRCh38/hg38:chr1 150330401 150330498);SCN2Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr2 165327155 165327202);SCN8Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr12 51688758 51688849);SCN8Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr12 51780202 51780271);SCN9Aのエクソン(GRCh38/hg38:chr2 166304238 166304329);SEMA3Cのエクソン(GRCh38/hg38:chr7 80794854 80794957);SEMA3Dのエクソン(GRCh38/hg38:chr7 85059498 85059541);SIRT3のエクソン(GRCh38/hg38:chr11 225673 226081);STK11のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 1216268 1216398);STK11のエクソン(GRCh38/hg38:chr19 1221621 1221846);SYNGAP1のエクソン(GRCh38/hg38:chr6 33448789 33448868);TOPORSのエクソン(GRCh38/hg38:chr9 32551365 32551469);VCANのエクソン(GRCh38/hg38:chr5 83544965 83545070))を含有するイントロンの領域、または同じイントロンにおけるNIE活性化制御配列に結合する、方法が本明細書で提供される。
4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1タンパク質であり得る。
アンチセンスオリゴマー
[0169]ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 NIE含有mRNA前駆体の標的化部分に結合することによってエクソンスキッピングを誘導するアンチセンスオリゴマーを含む組成物が本明細書で提供される。本明細書で使用する場合、「ASO」および「アンチセンスオリゴマー」という用語は、交換可能に使用され、ワトソン・クリック塩基対形成またはゆらぎ塩基対形成(G-U)によって標的核酸(例えば、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 NIE含有mRNA前駆体)配列にハイブリダイズする核酸塩基を含むポリヌクレオチド等のオリゴマーを指す。ASOは、標的配列に対して相補的な厳密な配列または非常に高い相補性(例えば、標的配列を結合するのに十分で、スプライス部位でのスプライシングを増強する相補性)を有し得る。ASOは、標的核酸(例えば、mRNA前駆体転写物の標的化部分)に結合(ハイブリダイズ)し、生理的条件下でハイブリダイズしたままでいるように設計される。典型的には、ASOは、意図された(標的化)核酸配列以外の部位にハイブリダイズする場合、標的核酸ではない限られた数の配列(標的核酸以外の少数の部位)にハイブリダイズする。ASOの設計は、mRNA前駆体転写物の標的化部分の核酸配列の存在、または、ASOが他の部位を結合し、「オフターゲット」効果を引き起こす可能性が限定されるように、ゲノムもしくは細胞のmRNA前駆体もしくはトランスクリプトーム中の他の場所における十分に類似した核酸配列の存在を考慮してもよい。当技術分野で公知の、例えば、本明細書に参照によって組み込まれる、「Reducing Nonsense-Mediated mRNA Decay」という名称の、WO2015/035091として公開されているPCT出願第PCT/US2014/054151号における任意のアンチセンスオリゴマーは、本明細書に記載される方法を実施するために使用することができる。
[0184]別段の定めのない限り、一本鎖核酸(例えば、mRNA前駆体転写物、オリゴヌクレオチド、ASO等)配列の左手末端は5’末端であり、一本鎖または二本鎖核酸配列の左手方向は5’方向と称される。同様に、核酸配列(一本鎖または二本鎖)の右手末端または方向は、3’末端または方向である。一般に、核酸中の基準点に対して5’側にある領域または配列は「上流」と称され、核酸中の基準点に対して3’側にある領域または配列は「下流」と称される。一般に、mRNAの5’方向または末端は、開始または出発コドンが位置する場所であり、3’末端または方向は、終止コドンが位置する場所である。一部の態様において、核酸中の基準点の上流にあるヌクレオチドは負の数によって明示されてもよく、基準点の下流にあるヌクレオチドは正の数によって明示されてもよい。例えば、基準点(例えば、mRNAにおけるエクソン-エクソン接合部)は「ゼロ」部位として明示されてもよく、その基準点に直に隣接する上流のヌクレオチドは「マイナス1」、例えば「-1」と明示され、その基準点に直に隣接する下流のヌクレオチドは「プラス1」、例えば「+1」と明示される。
医薬組成物
[0194]記載される組成物の薬剤および記載される方法のいずれかにおける使用のための薬剤、例えばアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む医薬組成物または製剤は、医薬業界において周知かつ公開文献に記載されている従来の技法に従って調製することができる。複数の実施形態において、対象を処置するための医薬組成物または製剤は、本明細書に記載されるような有効量の任意のアンチセンスオリゴマー、または薬学的に許容されるその塩、溶媒和物、水和物、もしくはエステルを含む。アンチセンスオリゴマーを含む医薬製剤は、薬学的に許容される賦形剤、希釈剤、または担体をさらに含んでもよい。
組合せ療法
[0199]一部の実施形態において、本開示に開示されるASOは、1種または複数種のさらなる治療剤と組み合わせて使用することができる。一部の実施形態において、1種または複数種のさらなる治療剤は低分子を含むことができる。例えば、1種または複数種のさらなる治療剤は、その全体が本明細書に参照によって組み込まれる、WO2016128343A1、WO2017053982A1、WO2016196386A1、WO201428459A1、WO201524876A2、WO2013119916A2、およびWO2014209841A2に記載されている低分子を含むことができる。一部の実施形態において、1種または複数種のさらなる治療剤は、イントロン保持を是正するために使用することができるASOを含む。
対象の処置
[0200]本明細書で提供される組成物のいずれも、個体に投与することができる。「個体」は、「対象」または「患者」と交換可能に使用することができる。個体は、哺乳動物、例えば、ヒト、または非ヒト霊長類、げっ歯類、ウサギ、ラット、マウス、ウマ、ロバ、ヤギ、ネコ、イヌ、ウシ、ブタ、もしくはヒツジ等の動物であり得る。複数の実施形態において、個体はヒトである。複数の実施形態において、個体は胎児、胚、または小児である。他の実施形態において、個体は別の真核性生物、例えば植物であり得る。一部の実施形態において、本明細書で提供される組成物は、細胞にエクスビボで投与される。
エクソンスキッピングを誘導するさらなるASOを同定する方法
[0207]ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 NIE含有mRNA前駆体のエクソンスキッピングを誘導するASOを同定または決定するための方法もまた、本開示の範囲内である。例えば、方法は、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、VCAN、AKT3、CD46、COL11A2、CR1、CRX、DNAJC8、MYH14、MYO6、NF2、SEMA3C、SEMA3D、EIF2AK3、ERN1、GUCY2F、SIRT3、NR1H4、STK11、PPARA、CYP2J2、またはSYNGAP1 NIE含有mRNA前駆体の偽エクソンスキッピングを誘導するASOを同定または決定するステップを含むことができる。mRNA前駆体の標的領域内の異なるヌクレオチドに特異的にハイブリダイズするASOは、標的イントロンのスプライシングの速度および/または範囲を向上させるASOを同定または決定するためにスクリーニングされてもよい。一部の実施形態において、ASOは、スプライシングリプレッサー/サイレンサーの結合部位を遮断するか、またはその結合部位に干渉し得る。当技術分野で公知の任意の方法は、エクソンの標的領域にハイブリダイズした場合に所望の効果(例えば、偽エクソンスキッピング、タンパク質または機能性RNA産生)を結果的にもたらすASOを同定(決定)するために使用してもよい。これらの方法は、包含エクソンと隣り合うイントロンにおける、または非包含エクソンにおける標的化領域に結合することによって包含エクソンのエクソンスキッピングを誘導するASOを同定するためにも使用することができる。使用され得る方法の一例は以下に提供される。
具体的な実施形態(A)
[0215]実施形態A1。処置を必要とする対象におけるアルポート症候群;筋萎縮性側索硬化症(ALS);アンジェルマン症候群;原発性進行性失語症;不整脈原性右室異形成症9;自閉症スペクトラム障害;拡張型心筋症1HH;筋原線維性ミオパチー6;神経セロイドリポフスチン症3;妊娠性肝内胆汁うっ滞症3;進行性家族性肝内胆汁うっ滞症1;シトルリン血症II型;シトルリン血症1型;大脳性運動失調症を伴うもしくは伴わない認知機能障害;コルネリア・デ・ランゲ;早期発症てんかん性脳症;てんかん・失語症スペクトラム;全般てんかん熱性痙攣プラス7型;小児期発症てんかん性脳症;早期乳児てんかん性脳症11;早期乳児てんかん性脳症12;早期乳児てんかん性脳症13;早期乳児てんかん性脳症2;発作性運動失調症2型;家族性焦点性てんかん;家族性熱性痙攣3B;フリードライヒ運動失調症;反射の保持を伴うフリードライヒ運動失調症;ガラクトースエピメラーゼ欠損症;原発先天緑内障3E;糖原病IV;GRN関連前頭側頭型認知症;B6反応型および非反応型ホモシスチン尿症;常染色体劣性HSAN2D;先天性無痛症;歌舞伎症候群;クーレン・デ・ブリーズ症候群;常染色体優性精神遅滞1;メチルマロン酸尿症;家族性片麻痺性片頭痛1;ミオクロニー脱力てんかん;神経線維腫症1型;オピオイド依存症;視神経萎縮1型;経路(眼);経路(中枢神経系、てんかん);フェラン・マクダーミド症候群;プロピオン酸血症;原発開放隅角緑内障;プロピオン酸血症;網膜色素変性症11;網膜色素変性症18;網膜色素変性症31;網膜色素変性症59;レット症候群;良性家族性乳児発作3;良性家族性乳児発作5;スミス・マゲニス症候群;ソトス症候群1;ベックウィズ・ヴィーデマン症候群;シュタルガルト病3;テイ・サックス病;結節性硬化症;チロシン血症I型;ワーグナー症候群1;ウエスト症候群;ウォルフラム症候群2/NAFLD;15q13.3微小欠失;または16p11.2欠失症候群を、ナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソンを含有するmRNA(NMDエクソンmRNA)であり、標的タンパク質または機能性RNAをコードするmRNAを有する対象の細胞による標的タンパク質または機能性RNAの発現を増加させることによって処置する方法であって、対象の細胞を、標的タンパク質または機能性RNAをコードするNMDエクソンmRNAの標的化部分に結合する治療剤と接触させるステップを含み、それによって、ナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソンが標的タンパク質または機能性RNAをコードするNMDエクソンmRNAから排除され、それにより標的タンパク質または機能性RNAをコードするmRNAのレベルが増加し、対象の細胞における標的タンパク質または機能性RNAの発現が増加する、方法。
[0221]実施形態A7。薬剤が、NMDエクソンmRNAの標的化部分に対して相補的なアンチセンスオリゴマー(ASO)である、実施形態A1からA6のいずれか1つに記載の方法。
[0223]実施形態A9。接触させるステップが治療剤をmRNAに接触させるステップを含み、mRNAが細胞の核にある、実施形態A1からA8のいずれか1つに記載の方法。
(a)(i)標的タンパク質が、野生型アレルからの産生と比較して低下したレベルで産生される、
(ii)標的タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して低下した機能を有する形態で産生される、または
(iii)標的タンパク質が産生されない
第1の変異アレル、および
(b)(i)標的タンパク質が、野生型アレルからの産生と比較して低下したレベルで産生される、
(ii)標的タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して低下した機能を有する形態で産生される、または
(iii)標的タンパク質が産生されない
第2の変異アレル
を有し、対象が第1の変異アレル(a)(iii).を有する場合、第2の変異アレルが(b)(i)または(b)(ii)であり、対象が第2の変異アレル(b)(iii)を有する場合、第1の変異アレルが(a)(i)または(a)(ii)であり、NMDエクソンmRNAが、(a)(i)もしくは(a)(ii)である第1の変異アレル、および/または(b)(i)もしくは(b)(ii)である第2のアレルのいずれかから転写される、実施形態A1からA11のいずれか1つに記載の方法。
[0229]実施形態A15。標的タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して完全機能性である形態で産生される、実施形態A13に記載の方法。
[0240]実施形態A26。アンチセンスオリゴマーと接触した細胞において産生される標的タンパク質または機能性RNAをコードするmRNAの総量が、対照細胞において産生される標的タンパク質または機能性RNAをコードするmRNAの総量と比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する、実施形態A1からA25のいずれか1つに記載の方法。
[0248]実施形態A34。薬剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、8から50核酸塩基、8から40核酸塩基、8から35核酸塩基、8から30核酸塩基、8から25核酸塩基、8から20核酸塩基、8から15核酸塩基、9から50核酸塩基、9から40核酸塩基、9から35核酸塩基、9から30核酸塩基、9から25核酸塩基、9から20核酸塩基、9から15核酸塩基、10から50核酸塩基、10から40核酸塩基、10から35核酸塩基、10から30核酸塩基、10から25核酸塩基、10から20核酸塩基、10から15核酸塩基、11から50核酸塩基、11から40核酸塩基、11から35核酸塩基、11から30核酸塩基、11から25核酸塩基、11から20核酸塩基、11から15核酸塩基、12から50核酸塩基、12から40核酸塩基、12から35核酸塩基、12から30核酸塩基、12から25核酸塩基、12から20核酸塩基、または12から15核酸塩基までからなる、実施形態A1からA33のいずれか1つに記載の方法。
[0253]実施形態A39。対象が非ヒト動物である、実施形態A1からA38のいずれか1つに記載の方法。
[0255]実施形態A41。細胞がエクスビボである、実施形態A1からA40のいずれか1つに記載の方法。
[0258]実施形態A44。第2の治療剤が低分子である、実施形態A43に記載の方法。
[0260]実施形態A46。第2の治療剤がイントロン保持を是正する、実施形態A43からA45のいずれか1つに記載の方法。
[0262]実施形態A48。配列番号60~134の少なくとも8個の連続的な核酸を含む領域に対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、97%、または100%の配列同一性を有する配列を含むアンチセンスオリゴマー。
[0264]実施形態A50。処置を必要とする対象を処置する方法であって、実施形態A49に記載の医薬組成物を対象に投与するステップを含み、投与するステップが、髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、または静脈内注射によるものである、方法。
(a)欠損タンパク質、または
(b)対象における欠損タンパク質を機能的に増大させるか、もしくは置き換える補償タンパク質
であり、機能性RNAが、
(c)欠損RNA、または
(d)対象における欠損機能性RNAを機能的に増大させるか、もしくは置き換える補償機能性RNA
であり、治療剤が、標的タンパク質または機能性RNAをコードするNMDエクソンmRNAからのナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソンの排除を増強し、それにより対象における標的タンパク質または機能性RNAの産生または活性を増加させる、組成物。
[0268]実施形態A54。疾患または障害が、アルポート症候群;筋萎縮性側索硬化症(ALS);アンジェルマン症候群;原発性進行性失語症;不整脈原性右室異形成症9;自閉症スペクトラム障害;拡張型心筋症1HH;筋原線維性ミオパチー6;神経セロイドリポフスチン症3;妊娠性肝内胆汁うっ滞症3;進行性家族性肝内胆汁うっ滞症1;シトルリン血症II型;シトルリン血症1型;大脳性運動失調症を伴うもしくは伴わない認知機能障害;コルネリア・デ・ランゲ;早期発症てんかん性脳症;てんかん・失語症スペクトラム;全般てんかん熱性痙攣プラス7型;小児期発症てんかん性脳症;早期乳児てんかん性脳症11;早期乳児てんかん性脳症12;早期乳児てんかん性脳症13;早期乳児てんかん性脳症2;発作性運動失調症2型;家族性焦点性てんかん;家族性熱性痙攣3B;フリードライヒ運動失調症;反射の保持を伴うフリードライヒ運動失調症;ガラクトースエピメラーゼ欠損症;原発先天緑内障3E;糖原病IV;GRN関連前頭側頭型認知症;B6反応型および非反応型ホモシスチン尿症;常染色体劣性HSAN2D;先天性無痛症;歌舞伎症候群;クーレン・デ・ブリーズ症候群;常染色体優性精神遅滞1;メチルマロン酸尿症;家族性片麻痺性片頭痛1;ミオクロニー脱力てんかん;神経線維腫症1型;オピオイド依存症;視神経萎縮1型;経路(眼);経路(中枢神経系、てんかん);フェラン・マクダーミド症候群;プロピオン酸血症;原発開放隅角緑内障;プロピオン酸血症;網膜色素変性症11;網膜色素変性症18;網膜色素変性症31;網膜色素変性症59;レット症候群;良性家族性乳児発作3;良性家族性乳児発作5;スミス・マゲニス症候群;ソトス症候群1;ベックウィズ・ヴィーデマン症候群;シュタルガルト病3;テイ・サックス病;結節性硬化症;チロシン血症I型;ワーグナー症候群1;ウエスト症候群;ウォルフラム症候群2/NAFLD;15q13.3微小欠失;または16p11.2欠失症候群である、実施形態A53に記載の組成物。
[0286]実施形態A72。治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、ホスホロチオエート連結またはホスホロジアミデート連結を含む骨格修飾を含む、実施形態A51からA71のいずれか1つに記載の組成物。
[0291]実施形態A77。治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、8から50核酸塩基、8から40核酸塩基、8から35核酸塩基、8から30核酸塩基、8から25核酸塩基、8から20核酸塩基、8から15核酸塩基、9から50核酸塩基、9から40核酸塩基、9から35核酸塩基、9から30核酸塩基、9から25核酸塩基、9から20核酸塩基、9から15核酸塩基、10から50核酸塩基、10から40核酸塩基、10から35核酸塩基、10から30核酸塩基、10から25核酸塩基、10から20核酸塩基、10から15核酸塩基、11から50核酸塩基、11から40核酸塩基、11から35核酸塩基、11から30核酸塩基、11から25核酸塩基、11から20核酸塩基、11から15核酸塩基、12から50核酸塩基、12から40核酸塩基、12から35核酸塩基、12から30核酸塩基、12から25核酸塩基、12から20核酸塩基、または12から15核酸塩基までからなる、実施形態A51からA76のいずれかに記載の組成物。
[0293]実施形態A79。処置を必要とする対象を処置する方法であって、実施形態A78に記載の医薬組成物を対象に投与するステップを含み、投与するステップが、髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、または静脈内注射によるものである、方法。
[0295]実施形態A81。第2の治療剤が低分子である、実施形態A80に記載の方法。
[0297]実施形態A83。第2の治療剤がイントロン保持を是正する、実施形態A80からA82のいずれか1つに記載の方法。
[0306]実施形態A92。アンチセンスオリゴマーがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態A84に記載の医薬組成物。
[0309]実施形態A95。アンチセンスオリゴマーが、8から50核酸塩基、8から40核酸塩基、8から35核酸塩基、8から30核酸塩基、8から25核酸塩基、8から20核酸塩基、8から15核酸塩基、9から50核酸塩基、9から40核酸塩基、9から35核酸塩基、9から30核酸塩基、9から25核酸塩基、9から20核酸塩基、9から15核酸塩基、10から50核酸塩基、10から40核酸塩基、10から35核酸塩基、10から30核酸塩基、10から25核酸塩基、10から20核酸塩基、10から15核酸塩基、11から50核酸塩基、11から40核酸塩基、11から35核酸塩基、11から30核酸塩基、11から25核酸塩基、11から20核酸塩基、11から15核酸塩基、12から50核酸塩基、12から40核酸塩基、12から35核酸塩基、12から30核酸塩基、12から25核酸塩基、12から20核酸塩基、または12から15核酸塩基までを含む、実施形態A84に記載の医薬組成物。
[0316]実施形態A102。第2の治療剤が低分子である、実施形態A101に記載の方法。
[0318]実施形態A104。第2の治療剤がイントロン保持を是正する、実施形態A101からA103のいずれか1つに記載の方法。
(a)アンチセンスオリゴマーを対象の標的細胞に接触させるステップ、
(b)アンチセンスオリゴマーを欠損ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCAN mRNA転写物にハイブリダイズするステップであり、欠損ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCAN mRNA転写物が、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCANタンパク質の機能的形態をコードすることができ、少なくとも1個のナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソンを含む、ステップ、
(c)欠損ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCAN mRNA転写物から少なくとも1個のナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソンを除去して、ABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCANタンパク質の機能的形態をコードする完全にプロセシングされたABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCAN mRNA転写物を産生するステップ、および
(d)完全にプロセシングされたABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCAN mRNA転写物からABCB4、ASS1、ATP8B1、BAG3、CACNA1A、CBS、CD55、CDKL5、CFH、CHD2、CHRNA7、CISD2、CLN3、COL4A3、COL4A4、DEPDC5、DHDDS、ELOVL4、FAH、FXN、GALE、GBE1、GRIN2A、GRN、HEXA、KANSL1、KCNQ2、KMT2D、MAPK3、MBD5、MECP2、MUT、NF1、NIPBL、NSD1、OPA1、OPTN、PCCA、PCCB、PKP2、PLCB1、PRPF3、PRPF31、RAI1、RBFOX2、SCN2A、SCN3A、SCN8A、SCN9A、SHANK3、SLC25A13、SLC6A1、SPTAN1、TEK、TOPORS、TSC2、UBE3A、またはVCANタンパク質の機能的形態を翻訳するステップ
を含む、方法。
(a)標的タンパク質もしくは機能性RNAをコードするNMDエクソンmRNAの標的化部分に結合する、
(b)スプライソソームの1つもしくは複数の成分に結合する、または
(c)(a)および(b)の組合せ
である、実施形態A107またはA108に記載の方法。
さらなる具体的な実施形態
[0324]実施形態1。ナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソン(NMDエクソン)を含み標的タンパク質をコードするmRNAを有する細胞による標的タンパク質の発現を調節する方法であって、治療剤を細胞に接触させるステップを含み、それによって治療剤がmRNAからのNMDエクソンのスプライシングを調節し、それにより標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルを調節して細胞における標的タンパク質の発現を調節し、標的タンパク質がAKT3、CACNA1A、CBS、CD46、CFH、CHD2、CLN3、COL11A2、COL4A3、COL4A4、COL4A4、CR1、CRX、CYP2J2、DHDDS、DNAJC8、EIF2AK3、ERN1、GALE、GUCY2F、GUCY2F、HEXA、HEXA、MAPK3、MBD5、MBD5、MBD5、MUT、MYH14、MYO6、NF1、NF2、NIPBL、NR1H4、NSD1、NSD1、NSD1、NSD1、OPA1、OPA1、PCCA、PKP2、PPARA、PRPF3、PRPF3、SCN2A、SCN8A、SCN8A、SCN9A、SEMA3C、SEMA3D、SIRT3、STK11、STK11、SYNGAP1、TOPORS、およびVCANタンパク質からなる群から選択される、方法。
[0327](a)標的タンパク質をコードするmRNAの標的化部分に結合する、
[0328](b)NMDエクソンのスプライシングに関与する因子の結合を調節する、または
[0329](c)(a)および(b)の組合せ
である、実施形態1または2に記載の方法。
[0331]実施形態5。標的化部分がNMDエクソンの近位にある、実施形態3または4に記載の方法。
[0342]実施形態16。標的化部分が、NMDエクソンの上流または下流のイントロンと少なくとも部分的に重複する、実施形態3から15のいずれか1つに記載の方法。
[0345]実施形態19。標的化部分が、NMDエクソンの約5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、または30個以上の連続するヌクレオチドを含む、実施形態1から18のいずれか1つに記載の方法。
[0354]実施形態28。治療剤が、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除を促進する、実施形態1から27のいずれか1つに記載の方法。
[0357]実施形態31。治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルが、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルと比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する、実施形態28から30のいずれか1つに記載の方法。
[0359]実施形態33。治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質のレベルが、対照細胞において産生される標的タンパク質のレベルと比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する、実施形態28から32のいずれか1つに記載の方法。
[0361]実施形態35。疾患または状態が、標的タンパク質をコードする遺伝子のハプロ不全に関連し、対象が、機能性標的タンパク質をコードする第1のアレル、および標的タンパク質が産生されないか、もしくは低下したレベルで産生される第2のアレル、または非機能性標的タンパク質もしくは部分機能性標的タンパク質をコードする第2のアレルを有する、実施形態34に記載の方法。
[0364](i)標的タンパク質が産生されないか、もしくは野生型アレルと比較して低下したレベルで産生される、または
[0365](ii)産生される標的タンパク質が非機能性であるか、もしくは野生型アレルと比較して部分機能性である
[0366]第1のアレル、および
[0367](iii)標的タンパク質が野生型アレルと比較して低下したレベルで産生され、産生される標的タンパク質が野生型アレルと比較して少なくとも部分機能性である、または
[0368](iv)産生される標的タンパク質が野生型アレルと比較して部分機能性である
第2のアレルを有する、実施形態2から36のいずれか1つに記載の方法。
[0374]実施形態43。治療剤と接触した細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルが、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルと比較して、約1.1から約10分の1、約1.5から約10分の1、約2から約10分の1、約3から約10分の1、約4から約10分の1、約1.1から約5分の1、約1.1から約6分の1、約1.1から約7分の1、約1.1から約8分の1、約1.1から約9分の1、約2から約5分の1、約2から約6分の1、約2から約7分の1、約2から約8分の1、約2から約9分の1、約3から約6分の1、約3から約7分の1、約3から約8分の1、約3から約9分の1、約4から約7分の1、約4から約8分の1、約4から約9分の1、約1.1分の1以下、約1.5分の1以下、約2分の1以下、約2.5分の1以下、約3分の1以下、約3.5分の1以下、約4分の1以下、約5分の1以下、または約10分の1以下である、実施形態40から42のいずれか1つに記載の方法。
[0376]実施形態45。治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質のレベルが、対照細胞において産生される標的タンパク質のレベルと比較して、約1.1から約10分の1、約1.5から約10分の1、約2から約10分の1、約3から約10分の1、約4から約10分の1、約1.1から約5分の1、約1.1から約6分の1、約1.1から約7分の1、約1.1から約8分の1、約1.1から約9分の1、約2から約5分の1、約2から約6分の1、約2から約7分の1、約2から約8分の1、約2から約9分の1、約3から約6分の1、約3から約7分の1、約3から約8分の1、約3から約9分の1、約4から約7分の1、約4から約8分の1、約4から約9分の1、約1.1分の1以下、約1.5分の1以下、約2分の1以下、約2.5分の1以下、約3分の1以下、約3.5分の1以下、約4分の1以下、約5分の1以下、または約10分の1以下である、実施形態40から44のいずれか1つに記載の方法。
[0378]実施形態47。対象が、標的タンパク質が増加したレベルで産生されるアレル、または細胞において増加した活性を示す変異標的タンパク質をコードするアレルを有する、実施形態46に記載の方法。
[0381]実施形態50。疾患または状態が中枢神経系疾患を含む、実施形態49に記載の方法。
[0383]実施形態52。疾患または状態がドラベ症候群を含む、実施形態51に記載の方法。
[0388]実施形態57。治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、8から50核酸塩基、8から40核酸塩基、8から35核酸塩基、8から30核酸塩基、8から25核酸塩基、8から20核酸塩基、8から15核酸塩基、9から50核酸塩基、9から40核酸塩基、9から35核酸塩基、9から30核酸塩基、9から25核酸塩基、9から20核酸塩基、9から15核酸塩基、10から50核酸塩基、10から40核酸塩基、10から35核酸塩基、10から30核酸塩基、10から25核酸塩基、10から20核酸塩基、10から15核酸塩基、11から50核酸塩基、11から40核酸塩基、11から35核酸塩基、11から30核酸塩基、11から25核酸塩基、11から20核酸塩基、11から15核酸塩基、12から50核酸塩基、12から40核酸塩基、12から35核酸塩基、12から30核酸塩基、12から25核酸塩基、12から20核酸塩基、または12から15核酸塩基までからなる、実施形態1から56のいずれか1つに記載の方法。
[0391]実施形態60。対象がヒトである、実施形態1から59のいずれか1つに記載の方法。
[0393]実施形態62。対象が胎児、胚、または小児である、実施形態2から60のいずれか1つに記載の方法。
[0395]実施形態64。治療剤が、対象の髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、硝子体内、または静脈内注射によって投与される、実施形態2から62のいずれか1つに記載の方法。
[0397]実施形態66。第2の治療剤が低分子である、実施形態1から65のいずれか1つに記載の方法。
[0399]実施形態68。第2の治療剤がイントロン保持を是正する、実施形態1から67のいずれか1つに記載の方法。
次世代配列決定を使用するRNAseqによる、転写物におけるNMD誘導エクソン包含事象の同定
[0402]全トランスクリプトームショットガン配列決定を、次世代配列決定を使用して実行して、本明細書に記載される遺伝子によって産生される転写物のスナップショットを明らかにし、NIE包含事象を同定する。この目的のために、ヒト細胞の核および細胞質画分に由来するポリA+RNAを単離し、cDNAライブラリーを、IlluminaのTruSeqストランドmRNAライブラリー調製キットを使用して構築する。ライブラリーをペアエンド配列決定し、ヒトゲノム(2009年2月、GRCh37/hg19アセンブリ)にマッピングされる100ヌクレオチドの読取りを結果として得る。図2~58は、様々な遺伝子における、異なる例示的なナンセンス変異依存mRNA分解機構(NMD)誘導エクソンの同定を示す。
シクロヘキシミド処理を介したNIEの確認
[0404]DMSO処理またはピューロマイシンもしくはシクロヘキシミド処理ヒト細胞に由来する細胞質RNA、およびエクソンにおけるプライマーを使用するRT-PCR分析により、NMD誘導エクソンに対応するバンドの存在を確認することができる。産物の同一性を、配列決定によって確認する。バンドの密度測定分析を実施して、総転写物のNMDエクソン包含率を算出する。NMDを阻害するための、シクロヘキシミドまたはピューロマイシンを用いた細胞の処理は、細胞質画分におけるNMD誘導エクソンに対応する産物の増加をもたらすことができる。図59、62、65、69、72、および75はそれぞれ、シクロヘキシミドまたはピューロマイシン処理を使用した、様々な遺伝子転写物における例示的なNIEエクソンの確認を示す。
NMDエクソン領域ASO歩行
[0405]ASO歩行を、NMDエクソン領域に関して、3’スプライス部位の直ぐ上流の配列、3’スプライス部位を横断する配列、NMDエクソンの配列、5’スプライス部位を横断する配列、および5’スプライス部位の下流の配列を標的とし、PS骨格の2’-MOE ASOを使用して実施する。ASOは、一度に5ヌクレオチド移動することによってこれらの領域を網羅するように設計する。図60、63、66、70、73、および76はそれぞれ、様々な例示的なNIEエクソン領域に関するASO歩行を示す。
RT-PCRによって評価したNMDエクソン領域ASO歩行
[0406]ASO歩行配列は、例えばRT-PCRによって評価することができる。PAGEを使用して、無試薬取込みにより、模擬処理した(Sham)、SMN統御ASO処理した(SMN)、またはヒト細胞中20μMの濃度の、本明細書で記載されるようなNMDエクソン領域を標的とする2’-MOE ASOを用いて処理されたもののSYBRセーフ染色RT-PCR産物を示すことができる。NMDエクソン包含および全長に対応する産物を定量化し、NMDエクソン包含率をプロットする。全長産物を内部対照であるRPL32に対して正規化することができ、Shamと比べた倍率変化をプロットすることができる。図71および78はそれぞれ、例示的なNIEエクソン領域の様々な例示的なASO歩行のRT-PCRを介した評価を示す。
RT-qPCRによって評価したNMDエクソン領域ASO歩行
[0407]RPL32に対して正規化したSYBRグリーンRT-qPCR増幅結果は、SYBRセーフRT-PCRによって評価することができ、Shamと比べた倍率変化としてプロットして、SYBRセーフRT-PCR結果を確認することができる同じASO取込み実験を使用して得ることができる。図61、64、67、68、71、74、77、および78はそれぞれ、例示的なNIEエクソン領域の様々な例示的なASO歩行のRT-qPCRを介した評価を示す。
CXH処理細胞における選択されたASOの用量依存的効果
[0408]PAGEを使用して、RNAiMAXトランスフェクションにより、模擬処理した(Sham、RNAiMAXのみ)、またはマウスもしくはヒト細胞中30nM、80nM、および200nMの濃度の、NMDエクソンを標的とする2’-MOE ASOを用いて処理した細胞のSYBRセーフ染色RT-PCR産物を示すことができる。NMDエクソン包含および全長に対応する産物を定量化し、NMDエクソン包含率をプロットすることができる。全長産物を内部対照であるHPRTに対してさらに正規化することができ、Shamと比べた倍率変化をプロットすることができる。
選択されたASOの硝子体内(IVT)注射
[0409]PBSを注射した(1μL)眼(-)、または10mMの濃度でASOもしくはCep290(陰性対照ASO、Gerardら、Mol.Ther.Nuc.Ac.、2015)2’-MOE ASOを注射した(1μL)眼(+)に由来するマウスのSYBRセーフ染色RT-PCR産物のPAGE。NMDエクソン包含および全長に対応する産物(を定量化し、NMDエクソン包含率をプロットすることができる。全長産物を内部対照であるGAPDHに対して正規化することができ、PBS注射と比べたASO注射の倍率変化をプロットすることができる。
選択されたASOの脳室内(ICV)注射
[0410]注射していない(-、無ASO対照)、または300μgのCep290(陰性対照ASO、Gerardら、Mol.Ther.Nuc.Ac.、2015)、2’-MOE ASOを注射した脳に由来するマウスのSYBRセーフ染色RT-PCR産物のPAGE。NMDエクソン包含および全長に対応する産物を定量化することができ、NMDエクソン包含率をプロットすることができる。Taqman PCRを、NMDエクソン接合部にまたがる2個の異なるプローブを使用して実施してもよく、産物を内部対照であるGAPDHに対して正規化することができ、Cep290を注射した脳と比べたASOを注射した脳の倍率変化をプロットすることができる。
本明細書は以下の発明の開示を包含する。
[1]ナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソン(NMDエクソン)を含み標的タンパク質をコードするmRNAを有する細胞によって標的タンパク質の発現を調節する方法であって、治療剤を細胞に接触させるステップを含み、それによって、治療剤がmRNAからのNMDエクソンのスプライシングを調節し、それにより標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルが調節され、細胞における標的タンパク質の発現が調節され、標的タンパク質が、AKT3、CACNA1A、CBS、CD46、CFH、CHD2、CLN3、COL11A2、COL4A3、COL4A4、COL4A4、CR1、CRX、CYP2J2、DHDDS、DNAJC8、EIF2AK3、ERN1、GALE、GUCY2F、GUCY2F、HEXA、HEXA、MAPK3、MBD5、MBD5、MBD5、MUT、MYH14、MYO6、NF1、NF2、NIPBL、NR1H4、NSD1、NSD1、NSD1、NSD1、OPA1、OPA1、PCCA、PKP2、PPARA、PRPF3、PRPF3、SCN2A、SCN8A、SCN8A、SCN9A、SEMA3C、SEMA3D、SIRT3、STK11、STK11、SYNGAP1、TOPORS、およびVCANタンパク質からなる群から選択される、方法。
[2]対象の細胞における標的タンパク質の発現を調節することによって、疾患または状態を処置を必要とする対象における疾患または状態を処置する方法であって、対象の細胞を、ナンセンス変異依存mRNA分解機構誘導エクソン(NMDエクソン)を含み標的タンパク質をコードする細胞中のmRNAからのNMDエクソンのスプライシングを調節する治療剤と接触させるステップを含み、それにより標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルが調節され、対象の細胞における標的タンパク質の発現が調節され、標的タンパク質が、AKT3、CACNA1A、CBS、CD46、CFH、CHD2、CLN3、COL11A2、COL4A3、COL4A4、COL4A4、CR1、CRX、CYP2J2、DHDDS、DNAJC8、EIF2AK3、ERN1、GALE、GUCY2F、GUCY2F、HEXA、HEXA、MAPK3、MBD5、MBD5、MBD5、MUT、MYH14、MYO6、NF1、NF2、NIPBL、NR1H4、NSD1、NSD1、NSD1、NSD1、OPA1、OPA1、PCCA、PKP2、PPARA、PRPF3、PRPF3、SCN2A、SCN8A、SCN8A、SCN9A、SEMA3C、SEMA3D、SIRT3、STK11、STK11、SYNGAP1、TOPORS、およびVCANタンパク質からなる群から選択される、方法。
[3]治療剤が、
(a)標的タンパク質をコードするmRNAの標的化部分に結合する、
(b)NMDエクソンのスプライシングに関与する因子の結合を調節する、または
(c)(a)および(b)の組合せ
である、[1]または[2]に記載の方法。
[4]治療剤が、NMDエクソンのスプライシングに関与する因子の、標的化部分の領域への結合に干渉する、[3]に記載の方法。
[5]標的化部分がNMDエクソンの近位にある、[3]に記載の方法。
[6]標的化部分が、NMDエクソンの5’末端の、最大約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド上流にある、[5]に記載の方法。
[7]標的化部分が、NMDエクソンの5’末端の、少なくとも約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド、約40ヌクレオチド、約30ヌクレオチド、約20ヌクレオチド、約10ヌクレオチド、約5ヌクレオチド、約4ヌクレオチド、約2ヌクレオチド、約1ヌクレオチド上流にある、[5]に記載の方法。
[8]標的化部分が、NMDエクソンの3’末端の、最大約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド下流にある、[5]に記載の方法。
[9]標的化部分が、NMDエクソンの3’末端の、少なくとも約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド、約40ヌクレオチド、約30ヌクレオチド、約20ヌクレオチド、約10ヌクレオチド、約5ヌクレオチド、約4ヌクレオチド、約2ヌクレオチド、約1ヌクレオチド下流にある、[5]に記載の方法。
[10]標的化部分が、GRCh38/hg38:chr1 243564388;GRCh38/hg38:chr19 13236618;GRCh38/hg38:chr21 43060012;GRCh38/hg38:chr1 207775610;GRCh38/hg38:chr1 196675450;GRCh38/hg38:chr15 92998149;GRCh38/hg38:chr16 28479765;GRCh38/hg38:chr6 33183698;GRCh38/hg38:chr2 227296487;GRCh38/hg38:chr2 227144833;GRCh38/hg38:chr2 227015360;GRCh38/hg38:chr1 207637688;GRCh38/hg38:chr19 47835403;GRCh38/hg38:chr1 59904516;GRCh38/hg38:chr1 26442335;GRCh38/hg38:chr1 28230252;GRCh38/hg38:chr2 88582824;GRCh38/hg38:chr17 64102804;GRCh38/hg38:chr1 23798484;GRCh38/hg38:chrX 109383446;GRCh38/hg38:chrX 109439175;GRCh38/hg38:chr15 72362466;GRCh38/hg38:chr15 72345776;GRCh38/hg38:chr16 30115645;GRCh38/hg38:chr2 148460219;GRCh38/hg38:chr2 148490695;GRCh38/hg38:chr2 148505761;GRCh38/hg38:chr6 49436597;GRCh38/hg38:chr19 50230825;GRCh38/hg38:chr6 75867431;GRCh38/hg38:chr17 31249955;GRCh38/hg38:chr22 29628658;GRCh38/hg38:chr5 37048127;GRCh38/hg38:chr12 100499841;GRCh38/hg38:chr5 177169394;GRCh38/hg38:chr5 177200761;GRCh38/hg38:chr5 177247924;GRCh38/hg38:chr5 177275947;GRCh38/hg38:chr3 193628509;GRCh38/hg38:chr3 193603500;GRCh38/hg38:chr13 100305751;GRCh38/hg38:chr12 32894778;GRCh38/hg38:chr22 46203575;GRCh38/hg38:chr1 150327557;GRCh38/hg38:chr1 150330401;GRCh38/hg38:chr2 165327155;GRCh38/hg38:chr12 51688758;GRCh38/hg38:chr12 51780202;GRCh38/hg38:chr2 166304329;GRCh38/hg38:chr7 80794957;GRCh38/hg38:chr7 85059541;GRCh38/hg38:chr11 226081;GRCh38/hg38:chr19 1216268;GRCh38/hg38:chr19 1221621;GRCh38/hg38:chr6 33448789;GRCh38/hg38:chr9 32551469;およびGRCh38/hg38:chr5 83544965からなる群から選択されるゲノム部位の、最大約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド上流にある、[5]に記載の方法。
[11]標的化部分が、GRCh38/hg38:chr1 243564388;GRCh38/hg38:chr19 13236618;GRCh38/hg38:chr21 43060012;GRCh38/hg38:chr1 207775610;GRCh38/hg38:chr1 196675450;GRCh38/hg38:chr15 92998149;GRCh38/hg38:chr16 28479765;GRCh38/hg38:chr6 33183698;GRCh38/hg38:chr2 227296487;GRCh38/hg38:chr2 227144833;GRCh38/hg38:chr2 227015360;GRCh38/hg38:chr1 207637688;GRCh38/hg38:chr19 47835403;GRCh38/hg38:chr1 59904516;GRCh38/hg38:chr1 26442335;GRCh38/hg38:chr1 28230252;GRCh38/hg38:chr2 88582824;GRCh38/hg38:chr17 64102804;GRCh38/hg38:chr1 23798484;GRCh38/hg38:chrX 109383446;GRCh38/hg38:chrX 109439175;GRCh38/hg38:chr15 72362466;GRCh38/hg38:chr15 72345776;GRCh38/hg38:chr16 30115645;GRCh38/hg38:chr2 148460219;GRCh38/hg38:chr2 148490695;GRCh38/hg38:chr2 148505761;GRCh38/hg38:chr6 49436597;GRCh38/hg38:chr19 50230825;GRCh38/hg38:chr6 75867431;GRCh38/hg38:chr17 31249955;GRCh38/hg38:chr22 29628658;GRCh38/hg38:chr5 37048127;GRCh38/hg38:chr12 100499841;GRCh38/hg38:chr5 177169394;GRCh38/hg38:chr5 177200761;GRCh38/hg38:chr5 177247924;GRCh38/hg38:chr5 177275947;GRCh38/hg38:chr3 193628509;GRCh38/hg38:chr3 193603500;GRCh38/hg38:chr13 100305751;GRCh38/hg38:chr12 32894778;GRCh38/hg38:chr22 46203575;GRCh38/hg38:chr1 150327557;GRCh38/hg38:chr1 150330401;GRCh38/hg38:chr2 165327155;GRCh38/hg38:chr12 51688758;GRCh38/hg38:chr12 51780202;GRCh38/hg38:chr2 166304329;GRCh38/hg38:chr7 80794957;GRCh38/hg38:chr7 85059541;GRCh38/hg38:chr11 226081;GRCh38/hg38:chr19 1216268;GRCh38/hg38:chr19 1221621;GRCh38/hg38:chr6 33448789;GRCh38/hg38:chr9 32551469;およびGRCh38/hg38:chr5 83544965からなる群から選択されるゲノム部位の、約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド上流にある、[5]に記載の方法。
[12]標的化部分が、GRCh38/hg38:chr1 243564285;GRCh38/hg38:chr19 13236449;GRCh38/hg38:chr21 43059730;GRCh38/hg38:chr1 207775745;GRCh38/hg38:chr1 196675529;GRCh38/hg38:chr15 92998261;GRCh38/hg38:chr16 28479644;GRCh38/hg38:chr6 33183634;GRCh38/hg38:chr2 227296526;GRCh38/hg38:chr2 227144653;GRCh38/hg38:chr2 227015283;GRCh38/hg38:chr1 207637848;GRCh38/hg38:chr19 47835579;GRCh38/hg38:chr1 59904366;GRCh38/hg38:chr1 26442372;GRCh38/hg38:chr1 28230131;GRCh38/hg38:chr2 88582755;GRCh38/hg38:chr17 64102673;GRCh38/hg38:chr1 23798311;GRCh38/hg38:chrX 109383365;GRCh38/hg38:chrX 109439038;GRCh38/hg38:chr15 72362376;GRCh38/hg38:chr15 72345677;GRCh38/hg38:chr16 30115595;GRCh38/hg38:chr2 148460304;GRCh38/hg38:chr2 148490787;GRCh38/hg38:chr2 148505830;GRCh38/hg38:chr6 49436522;GRCh38/hg38:chr19 50230999;GRCh38/hg38:chr6 75867523;GRCh38/hg38:chr17 31250125;GRCh38/hg38:chr22 29628773;GRCh38/hg38:chr5 37048354;GRCh38/hg38:chr12 100500024;GRCh38/hg38:chr5 177169559;GRCh38/hg38:chr5 177200783;GRCh38/hg38:chr5 177248079;GRCh38/hg38:chr5 177276101;GRCh38/hg38:chr3 193628616;GRCh38/hg38:chr3 193603557;GRCh38/hg38:chr13 100305834;GRCh38/hg38:chr12 32894516;GRCh38/hg38:chr22 46203752;GRCh38/hg38:chr1 150327652;GRCh38/hg38:chr1 150330498;GRCh38/hg38:chr2 165327202;GRCh38/hg38:chr12 51688849;GRCh38/hg38:chr12 51780271;GRCh38/hg38:chr2 166304238;GRCh38/hg38:chr7 80794854;GRCh38/hg38:chr7 85059498;GRCh38/hg38:chr11 225673;GRCh38/hg38:chr19 1216398;GRCh38/hg38:chr19 1221846;GRCh38/hg38:chr6 33448868;GRCh38/hg38:chr9 32551365;およびGRCh38/hg38:chr5 83545070からなる群から選択されるゲノム部位の、最大約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド下流にある、[5]に記載の方法。
[13]標的化部分が、GRCh38/hg38:chr1 243564285;GRCh38/hg38:chr19 13236449;GRCh38/hg38:chr21 43059730;GRCh38/hg38:chr1 207775745;GRCh38/hg38:chr1 196675529;GRCh38/hg38:chr15 92998261;GRCh38/hg38:chr16 28479644;GRCh38/hg38:chr6 33183634;GRCh38/hg38:chr2 227296526;GRCh38/hg38:chr2 227144653;GRCh38/hg38:chr2 227015283;GRCh38/hg38:chr1 207637848;GRCh38/hg38:chr19 47835579;GRCh38/hg38:chr1 59904366;GRCh38/hg38:chr1 26442372;GRCh38/hg38:chr1 28230131;GRCh38/hg38:chr2 88582755;GRCh38/hg38:chr17 64102673;GRCh38/hg38:chr1 23798311;GRCh38/hg38:chrX 109383365;GRCh38/hg38:chrX 109439038;GRCh38/hg38:chr15 72362376;GRCh38/hg38:chr15 72345677;GRCh38/hg38:chr16 30115595;GRCh38/hg38:chr2 148460304;GRCh38/hg38:chr2 148490787;GRCh38/hg38:chr2 148505830;GRCh38/hg38:chr6 49436522;GRCh38/hg38:chr19 50230999;GRCh38/hg38:chr6 75867523;GRCh38/hg38:chr17 31250125;GRCh38/hg38:chr22 29628773;GRCh38/hg38:chr5 37048354;GRCh38/hg38:chr12 100500024;GRCh38/hg38:chr5 177169559;GRCh38/hg38:chr5 177200783;GRCh38/hg38:chr5 177248079;GRCh38/hg38:chr5 177276101;GRCh38/hg38:chr3 193628616;GRCh38/hg38:chr3 193603557;GRCh38/hg38:chr13 100305834;GRCh38/hg38:chr12 32894516;GRCh38/hg38:chr22 46203752;GRCh38/hg38:chr1 150327652;GRCh38/hg38:chr1 150330498;GRCh38/hg38:chr2 165327202;GRCh38/hg38:chr12 51688849;GRCh38/hg38:chr12 51780271;GRCh38/hg38:chr2 166304238;GRCh38/hg38:chr7 80794854;GRCh38/hg38:chr7 85059498;GRCh38/hg38:chr11 225673;GRCh38/hg38:chr19 1216398;GRCh38/hg38:chr19 1221846;GRCh38/hg38:chr6 33448868;GRCh38/hg38:chr9 32551365;およびGRCh38/hg38:chr5 83545070からなる群から選択されるゲノム部位の、約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド下流にある、[5]に記載の方法。
[14]標的化部分が、標的タンパク質をコードするmRNAの2つの標準的なエクソン領域の間のイントロン領域に位置し、イントロン領域がNMDエクソンを含有する、[3]に記載の方法。
[15]標的化部分が、NMDエクソンと少なくとも部分的に重複する、[3]に記載の方法。
[16]標的化部分が、NMDエクソンの上流または下流のイントロンと少なくとも部分的に重複する、[3]に記載の方法。
[17]標的化部分が、5’NMDエクソン-イントロン接合部または3’NMDエクソン-イントロン接合部を含む、[3]に記載の方法。
[18]標的化部分がNMDエクソン内にある、[3]に記載の方法。
[19]標的化部分が、NMDエクソンの約5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、または30個以上の連続するヌクレオチドを含む、[3]に記載の方法。
[20]標的タンパク質をコードするmRNAが、配列番号135~191からなる群から選択される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、97%、または100%の配列同一性を有する配列を含む、[1]または[2]に記載の方法。
[21]標的タンパク質をコードするmRNAが、配列番号1~5、12、19~21、25、26、28、30、33、35、38、40、41、44、45、51、53、55~57、および192~211からなる群から選択される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、97%、または100%の配列同一性を有する遺伝子配列によってコードされる、[1]または[2]に記載の方法。
[22]mRNAの標的化部分が、配列番号135~191からなる群から選択される配列の少なくとも8個の連続的な核酸を含む領域に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、97%、または100%の配列同一性を有する配列を含む、[3]に記載の方法。
[23]薬剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、ASOが、配列番号135~191からなる群から選択される配列の少なくとも8個の連続的な核酸に対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、97%、または100%相補的である配列を含む、[1]または[2]に記載の方法。
[24]mRNAの標的化部分が、GRCh38/hg38:chr1 243564285 243564388 ;GRCh38/hg38:chr19 13236449 13236618;GRCh38/hg38:chr21 43059730 43060012;GRCh38/hg38:chr1 207775610 207775745;GRCh38/hg38:chr1 196675450 196675529;GRCh38/hg38:chr15 92998149 92998261;GRCh38/hg38:chr16 28479644 28479765;GRCh38/hg38:chr6 33183634 33183698;GRCh38/hg38:chr2 227296487 227296526;GRCh38/hg38:chr2 227144653 227144833;GRCh38/hg38:chr2 227015283 227015360;GRCh38/hg38:chr1 207637688 207637848;GRCh38/hg38:chr19 47835403 47835579;GRCh38/hg38:chr1 59904366 59904516;GRCh38/hg38:chr1 26442335 26442372;GRCh38/hg38:chr1 28230131 28230252 ;GRCh38/hg38:chr2 88582755 88582824;GRCh38/hg38:chr17 64102673 64102804;GRCh38/hg38:chr1 23798311 23798484;GRCh38/hg38:chrX 109383365 109383446;GRCh38/hg38:chrX 109439038 109439175;GRCh38/hg38:chr15 72362376 72362466;GRCh38/hg38:chr15 72345677 72345776;GRCh38/hg38:chr16 30115595 30115645;GRCh38/hg38:chr2 148460219 148460304;GRCh38/hg38:chr2 148490695 148490787;GRCh38/hg38:chr2 148505761 148505830;GRCh38/hg38:chr6 49436522 49436597;GRCh38/hg38:chr19 50230825 50230999;GRCh38/hg38:chr6 75867431 75867523;GRCh38/hg38:chr17 31249955 31250125;GRCh38/hg38:chr22 29628658 29628773;GRCh38/hg38:chr5 37048127 37048354;GRCh38/hg38:chr12 100499841 100500024;GRCh38/hg38:chr5 177169394 177169559;GRCh38/hg38:chr5 177200761 177200783;GRCh38/hg38:chr5 177247924 177248079;GRCh38/hg38:chr5 177275947 177276101;GRCh38/hg38:chr3 193628509 193628616;GRCh38/hg38:chr3 193603500 193603557;GRCh38/hg38:chr13 100305751 100305834;GRCh38/hg38:chr12 32894516 32894778;GRCh38/hg38:chr22 46203575 46203752;GRCh38/hg38:chr1 150327557 150327652;GRCh38/hg38:chr1 150330401 150330498;GRCh38/hg38:chr2 165327155 165327202;GRCh38/hg38:chr12 51688758 51688849;GRCh38/hg38:chr12 51780202 51780271;GRCh38/hg38:chr2 166304238 166304329;GRCh38/hg38:chr7 80794854 80794957;GRCh38/hg38:chr7 85059498 85059541;GRCh38/hg38:chr11 225673 226081;GRCh38/hg38:chr19 1216268 1216398;GRCh38/hg38:chr19 1221621 1221846;GRCh38/hg38:chr6 33448789 33448868;GRCh38/hg38:chr9 32551365 32551469;およびGRCh38/hg38:chr5 83544965 83545070からなる群から選択されるナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソン内にある、[3]に記載の方法。
[25]mRNAの標的化部分が、GRCh38/hg38:chr1 243564285 243564388 ;GRCh38/hg38:chr19 13236449 13236618;GRCh38/hg38:chr21 43059730 43060012;GRCh38/hg38:chr1 207775610 207775745;GRCh38/hg38:chr1 196675450 196675529;GRCh38/hg38:chr15 92998149 92998261;GRCh38/hg38:chr16 28479644 28479765;GRCh38/hg38:chr6 33183634 33183698;GRCh38/hg38:chr2 227296487 227296526;GRCh38/hg38:chr2 227144653 227144833;GRCh38/hg38:chr2 227015283 227015360;GRCh38/hg38:chr1 207637688 207637848;GRCh38/hg38:chr19 47835403 47835579;GRCh38/hg38:chr1 59904366 59904516;GRCh38/hg38:chr1 26442335 26442372;GRCh38/hg38:chr1 28230131 28230252 ;GRCh38/hg38:chr2 88582755 88582824;GRCh38/hg38:chr17 64102673 64102804;GRCh38/hg38:chr1 23798311 23798484;GRCh38/hg38:chrX 109383365 109383446;GRCh38/hg38:chrX 109439038 109439175;GRCh38/hg38:chr15 72362376 72362466;GRCh38/hg38:chr15 72345677 72345776;GRCh38/hg38:chr16 30115595 30115645;GRCh38/hg38:chr2 148460219 148460304;GRCh38/hg38:chr2 148490695 148490787;GRCh38/hg38:chr2 148505761 148505830;GRCh38/hg38:chr6 49436522 49436597;GRCh38/hg38:chr19 50230825 50230999;GRCh38/hg38:chr6 75867431 75867523;GRCh38/hg38:chr17 31249955 31250125;GRCh38/hg38:chr22 29628658 29628773;GRCh38/hg38:chr5 37048127 37048354;GRCh38/hg38:chr12 100499841 100500024;GRCh38/hg38:chr5 177169394 177169559;GRCh38/hg38:chr5 177200761 177200783;GRCh38/hg38:chr5 177247924 177248079;GRCh38/hg38:chr5 177275947 177276101;GRCh38/hg38:chr3 193628509 193628616;GRCh38/hg38:chr3 193603500 193603557;GRCh38/hg38:chr13 100305751 100305834;GRCh38/hg38:chr12 32894516 32894778;GRCh38/hg38:chr22 46203575 46203752;GRCh38/hg38:chr1 150327557 150327652;GRCh38/hg38:chr1 150330401 150330498;GRCh38/hg38:chr2 165327155 165327202;GRCh38/hg38:chr12 51688758 51688849;GRCh38/hg38:chr12 51780202 51780271;GRCh38/hg38:chr2 166304238 166304329;GRCh38/hg38:chr7 80794854 80794957;GRCh38/hg38:chr7 85059498 85059541;GRCh38/hg38:chr11 225673 226081;GRCh38/hg38:chr19 1216268 1216398;GRCh38/hg38:chr19 1221621 1221846;GRCh38/hg38:chr6 33448789 33448868;GRCh38/hg38:chr9 32551365 32551469;およびGRCh38/hg38:chr5 83544965 83545070からなる群から選択されるナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソンの上流または下流にある、[3]に記載の方法。
[26]mRNAの標的化部分が、GRCh38/hg38:chr1 243564285 243564388;GRCh38/hg38:chr19 13236449 13236618;GRCh38/hg38:chr21 43059730 43060012;GRCh38/hg38:chr1 207775610 207775745;GRCh38/hg38:chr1 196675450 196675529;GRCh38/hg38:chr15 92998149 92998261;GRCh38/hg38:chr16 28479644 28479765;GRCh38/hg38:chr6 33183634 33183698;GRCh38/hg38:chr2 227296487 227296526;GRCh38/hg38:chr2 227144653 227144833;GRCh38/hg38:chr2 227015283 227015360;GRCh38/hg38:chr1 207637688 207637848;GRCh38/hg38:chr19 47835403 47835579;GRCh38/hg38:chr1 59904366 59904516;GRCh38/hg38:chr1 26442335 26442372;GRCh38/hg38:chr1 28230131 28230252 ;GRCh38/hg38:chr2 88582755 88582824;GRCh38/hg38:chr17 64102673 64102804;GRCh38/hg38:chr1 23798311 23798484;GRCh38/hg38:chrX 109383365 109383446;GRCh38/hg38:chrX 109439038 109439175;GRCh38/hg38:chr15 72362376 72362466;GRCh38/hg38:chr15 72345677 72345776;GRCh38/hg38:chr16 30115595 30115645;GRCh38/hg38:chr2 148460219 148460304;GRCh38/hg38:chr2 148490695 148490787;GRCh38/hg38:chr2 148505761 148505830;GRCh38/hg38:chr6 49436522 49436597;GRCh38/hg38:chr19 50230825 50230999;GRCh38/hg38:chr6 75867431 75867523;GRCh38/hg38:chr17 31249955 31250125;GRCh38/hg38:chr22 29628658 29628773;GRCh38/hg38:chr5 37048127 37048354;GRCh38/hg38:chr12 100499841 100500024;GRCh38/hg38:chr5 177169394 177169559;GRCh38/hg38:chr5 177200761 177200783;GRCh38/hg38:chr5 177247924 177248079;GRCh38/hg38:chr5 177275947 177276101;GRCh38/hg38:chr3 193628509 193628616;GRCh38/hg38:chr3 193603500 193603557;GRCh38/hg38:chr13 100305751 100305834;GRCh38/hg38:chr12 32894516 32894778;GRCh38/hg38:chr22 46203575 46203752;GRCh38/hg38:chr1 150327557 150327652;GRCh38/hg38:chr1 150330401 150330498;GRCh38/hg38:chr2 165327155 165327202;GRCh38/hg38:chr12 51688758 51688849;GRCh38/hg38:chr12 51780202 51780271;GRCh38/hg38:chr2 166304238 166304329;GRCh38/hg38:chr7 80794854 80794957;GRCh38/hg38:chr7 85059498 85059541;GRCh38/hg38:chr11 225673 226081;GRCh38/hg38:chr19 1216268 1216398;GRCh38/hg38:chr19 1221621 1221846;GRCh38/hg38:chr6 33448789 33448868;GRCh38/hg38:chr9 32551365 32551469;およびGRCh38/hg38:chr5 83544965 83545070からなる群から選択されるエクソンのエクソン-イントロン接合部を含む、[3]に記載の方法。
[27]産生される標的タンパク質が、全長タンパク質または野生型タンパク質である、[1]または[2]に記載の方法。
[28]治療剤が、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除を促進する、[1]または[2]に記載の方法。
[29]治療剤と接触した細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除が、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除と比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する、[28]に記載の方法。
[30]治療剤が、細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルを増加させる、[28]に記載の方法。
[31]治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルが、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルと比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する、[28]に記載の方法。
[32]治療剤が、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、[28]に記載の方法。
[33]治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質のレベルが、対照細胞において産生される標的タンパク質のレベルと比較して、約1.1から約10倍、約1.5から約10倍、約2から約10倍、約3から約10倍、約4から約10倍、約1.1から約5倍、約1.1から約6倍、約1.1から約7倍、約1.1から約8倍、約1.1から約9倍、約2から約5倍、約2から約6倍、約2から約7倍、約2から約8倍、約2から約9倍、約3から約6倍、約3から約7倍、約3から約8倍、約3から約9倍、約4から約7倍、約4から約8倍、約4から約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍増加する、[28]に記載の方法。
[34]疾患または状態が、標的タンパク質における機能喪失型変異によって誘発される、[2]に記載の方法。
[35]疾患または状態が、標的タンパク質をコードする遺伝子のハプロ不全に関連し、対象が、機能性標的タンパク質をコードする第1のアレル、および標的タンパク質が産生されないか、もしくは低下したレベルで産生される第2のアレル、または非機能性標的タンパク質もしくは部分機能性標的タンパク質をコードする第2のアレルを有する、[34]に記載の方法。
[36]疾患または状態が、ソトス症候群1;ベックウィズ・ヴィーデマン症候群;家族性片麻痺性片頭痛1;発作性運動失調症2型;小児期発症てんかん性脳症;ワーグナー症候群1;視神経萎縮1型;アルポート症候群;不整脈原性右室異形成症9;神経線維腫症1型;早期乳児てんかん性脳症11;良性家族性乳児発作3;小脳性運動失調症を伴うまたは伴わない認知機能障害;早期乳児てんかん性脳症13;良性家族性乳児発作5;経路(CNS);16p11.2欠失症候群;常染色体優性精神遅滞1;網膜色素変性症18;網膜色素変性症31;常染色体優性難聴13;錐体桿体網膜ジストロフィー2;常染色体優性難聴4A;末梢神経障害、ミオパチー、嗄声、および難聴;常染色体優性難聴22;神経線維腫症2型;常染色体優性精神遅滞5;全般てんかん熱性痙攣プラス7型;ならびに家族性熱性痙攣3Bからなる群から選択される、[35]に記載の方法。
[37]疾患または状態が、標的タンパク質をコードする遺伝子の常染色体劣性変異に関連し、対象が、
(i)標的タンパク質が産生されないか、もしくは野生型アレルと比較して低下したレベルで産生される、または
(ii)産生される標的タンパク質が非機能性であるか、もしくは野生型アレルと比較して部分機能性である
第1のアレル、および
(iii)標的タンパク質が野生型アレルと比較して低下したレベルで産生され、産生される標的タンパク質が野生型アレルと比較して少なくとも部分機能性である、または
(iv)産生される標的タンパク質が野生型アレルと比較して部分機能性である
第2のアレルを有する、[34]に記載の方法。
[38]疾患または状態が、アルポート症候群;神経セロイドリポフスチン症3;ガラクトースエピメラーゼ欠損症;B6反応型および非反応型ホモシスチン尿症;メチルマロン酸尿症;プロピオン酸血症;網膜色素変性症59;テイ・サックス病;先天性無痛症;ならびに常染色体劣性HSAN2Dからなる群から選択される、[37]に記載の方法。
[39]治療剤が、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除を促進し、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、[34]に記載の方法。
[40]治療剤が、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除を阻害する、[1]または[2]に記載の方法。
[41]治療剤と接触した細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除が、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除と比較して、約1.1から約10分の1、約1.5から約10分の1、約2から約10分の1、約3から約10分の1、約4から約10分の1、約1.1から約5分の1、約1.1から約6分の1、約1.1から約7分の1、約1.1から約8分の1、約1.1から約9分の1、約2から約5分の1、約2から約6分の1、約2から約7分の1、約2から約8分の1、約2から約9分の1、約3から約6分の1、約3から約7分の1、約3から約8分の1、約3から約9分の1、約4から約7分の1、約4から約8分の1、約4から約9分の1、約1.1分の1以下、約1.5分の1以下、約2分の1以下、約2.5分の1以下、約3分の1以下、約3.5分の1以下、約4分の1以下、約5分の1以下、または約10分の1以下である、[40]に記載の方法。
[42]治療剤が、細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルを減少させる、[40]に記載の方法。
[43]治療剤と接触した細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルが、対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルと比較して、約1.1から約10分の1、約1.5から約10分の1、約2から約10分の1、約3から約10分の1、約4から約10分の1、約1.1から約5分の1、約1.1から約6分の1、約1.1から約7分の1、約1.1から約8分の1、約1.1から約9分の1、約2から約5分の1、約2から約6分の1、約2から約7分の1、約2から約8分の1、約2から約9分の1、約3から約6分の1、約3から約7分の1、約3から約8分の1、約3から約9分の1、約4から約7分の1、約4から約8分の1、約4から約9分の1、約1.1分の1以下、約1.5分の1以下、約2分の1以下、約2.5分の1以下、約3分の1以下、約3.5分の1以下、約4分の1以下、約5分の1以下、または約10分の1以下である、[40]に記載の方法。
[44]治療剤が、細胞における標的タンパク質の発現を減少させる、[40]に記載の方法。
[45]治療剤と接触した細胞において産生される標的タンパク質のレベルが、対照細胞において産生される標的タンパク質のレベルと比較して、約1.1から約10分の1、約1.5から約10分の1、約2から約10分の1、約3から約10分の1、約4から約10分の1、約1.1から約5分の1、約1.1から約6分の1、約1.1から約7分の1、約1.1から約8分の1、約1.1から約9分の1、約2から約5分の1、約2から約6分の1、約2から約7分の1、約2から約8分の1、約2から約9分の1、約3から約6分の1、約3から約7分の1、約3から約8分の1、約3から約9分の1、約4から約7分の1、約4から約8分の1、約4から約9分の1、約1.1分の1以下、約1.5分の1以下、約2分の1以下、約2.5分の1以下、約3分の1以下、約3.5分の1以下、約4分の1以下、約5分の1以下、または約10分の1以下である、[40]に記載の方法。
[46]疾患または状態が、標的タンパク質における機能獲得型変異によって誘発される、[2]に記載の方法。
[47]対象が、標的タンパク質が増加したレベルで産生されるアレル、または細胞において増加した活性を示す変異標的タンパク質をコードするアレルを有する、[46]に記載の方法。
[48]治療剤が、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除を阻害し、細胞における標的タンパク質の発現を減少させる、[46]に記載の方法。
[49]標的タンパク質がSCN8Aを含む、[40]に記載の方法。
[50]疾患または状態が中枢神経系疾患を含む、[49]に記載の方法。
[51]疾患または状態がてんかんを含む、[50]に記載の方法。
[52]疾患または状態がドラベ症候群を含む、[51]に記載の方法。
[53]治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、ホスホロチオエート連結またはホスホロジアミデート連結を含む骨格修飾を含む、[1]または[2]に記載の方法。
[54]治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、2’-O-メチル、2’-フルオロ、または2’-O-メトキシエチル部分を含む、[1]または[2]に記載の方法。
[55]治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが少なくとも1つの修飾糖部分を含む、[1]または[2]に記載の方法。
[56]各糖部分が修飾糖部分である、[55]に記載の方法。
[57]治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、8から50核酸塩基、8から40核酸塩基、8から35核酸塩基、8から30核酸塩基、8から25核酸塩基、8から20核酸塩基、8から15核酸塩基、9から50核酸塩基、9から40核酸塩基、9から35核酸塩基、9から30核酸塩基、9から25核酸塩基、9から20核酸塩基、9から15核酸塩基、10から50核酸塩基、10から40核酸塩基、10から35核酸塩基、10から30核酸塩基、10から25核酸塩基、10から20核酸塩基、10から15核酸塩基、11から50核酸塩基、11から40核酸塩基、11から35核酸塩基、11から30核酸塩基、11から25核酸塩基、11から20核酸塩基、11から15核酸塩基、12から50核酸塩基、12から40核酸塩基、12から35核酸塩基、12から30核酸塩基、12から25核酸塩基、12から20核酸塩基、または12から15核酸塩基までからなる、[1]または[2]に記載の方法。
[58]治療剤がアンチセンスオリゴマー(ASO)であり、アンチセンスオリゴマーが、mRNAの標的化部分に対して少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%相補的である、[3]に記載の方法。
[59]標的タンパク質のmRNAレベルまたは発現レベルを評価するステップをさらに含む、[1]または[2]に記載の方法。
[60]対象がヒトである、[2]に記載の方法。
[61]対象が非ヒト動物である、[2]に記載の方法。
[62]対象が胎児、胚、または小児である、[2]に記載の方法。
[63]細胞がエクスビボである、[1]または[2]に記載の方法。
[64]治療剤が、対象の髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、硝子体内、または静脈内注射によって投与される、[2]に記載の方法。
[65]第2の治療剤を対象に投与するステップをさらに含む、[2]に記載の方法。
[66]第2の治療剤が低分子である、[65]に記載の方法。
[67]第2の治療剤がアンチセンスオリゴマーである、[65]に記載の方法。
[68]第2の治療剤がイントロン保持を是正する、[65]に記載の方法。
[69]疾患または状態が、16p11.2欠失症候群;アルポート症候群;不整脈原性右室異形成症9;神経セロイドリポフスチン症3;小脳性運動失調症を伴うまたは伴わない認知機能障害;早期乳児てんかん性脳症13;良性家族性乳児発作5;錐体桿体網膜ジストロフィー2;コルネリア・デ・ランゲ;常染色体優性難聴13;常染色体優性難聴4A;末梢神経障害、ミオパチー、嗄声、および難聴;全般てんかん熱性痙攣プラス7型;家族性熱性痙攣3B;先天性無痛症;常染色体劣性HSAN2D;小児期発症てんかん性脳症;早期乳児てんかん性脳症11;良性家族性乳児発作3;ガラクトースエピメラーゼ欠損症;B6反応型および非反応型ホモシスチン尿症;常染色体優性精神遅滞1;常染色体優性精神遅滞5;メチルマロン酸尿症;家族性片麻痺性片頭痛1;発作性運動失調症2型;NASH;神経線維腫症1型;神経線維腫症2型;視神経萎縮1型;プロピオン酸血症;網膜色素変性症18;ソトス症候群1;ベックウィズ・ヴィーデマン症候群;テイ・サックス病;ならびにワーグナー症候群1からなる群から選択される、[2]に記載の方法。
Claims (28)
- アンチセンスオリゴマー、および医薬として許容な賦形剤を含む医薬組成物であって、
アンチセンスオリゴマーは、ナンセンス変異依存RNA分解機構誘導エクソン(NMDエクソン)を含み、標的タンパク質をコードするmRNA前駆体の標的化部位に結合し;
NMDエクソンが、mRNA前駆体の選択的スプライシング事象の間に保持され、該NMDエクソンを含むプロセッシングされたmRNA転写物のナンセンス変異依存RNA分解を誘導するエクソンであり、
アンチセンスオリゴマーはmRNA前駆体からのNMDエクソンの排除を促進し、それにより標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルを増加させ、mRNA前駆体を含む細胞における標的タンパク質の発現を増加させ;
標的タンパク質がOPA1であり、
NMDエクソンがゲノム座標GRCh38/hg38:chr3 193628509
193628616のペアにより特定され、
mRNA前駆体の標的化部位が
(a)NMDエクソン内にあり、
(b)GRCh38/hg38:chr3 193628509から最大100ヌクレオチド上流(または5’方向)にあり、または
(c)NMDエクソンの5’NMDエクソン-イントロン接合部または3’NMDエクソン-イントロン接合部を含み;および
アンチセンスオリゴマーが、12~50のヌクレオチドからなり、配列番号173に対して少なくとも90%の相補性を有する、前記医薬組成物。 - アンチセンスオリゴマーと接触した細胞における、標的タンパク質をコードするmRNA前駆体からのNMDエクソンの排除が、アンチセンスオリゴマーと接触しない対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAからのNMDエクソンの排除と比較して、少なくとも1.1倍に増加する、請求項1に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーと接触した細胞において生産される、標的タンパク質をコードするプロセッシングされたmRNAのレベルが、アンチセンスオリゴマーと接触しない対照細胞における、標的タンパク質をコードするプロセシングされたmRNAのレベルと比較して、少なくとも1.1倍に増加する、請求項1または2に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーと接触した細胞において生産される標的タンパク質のレベルが、アンチセンスオリゴマーと接触しない対照細胞において生産される標的タンパク質のレベルと比較して、少なくとも1.1倍に増加する、請求項1~3のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーが、標的化部位の領域へのNMDエクソンのスプライシングに関与する因子の結合に干渉する、請求項1~4のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 標的タンパク質をコードするmRNA前駆体が、配列番号173に対して少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む、請求項1~5のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 標的タンパク質をコードするmRNA前駆体が、配列番号12に対して少なくとも90%の配列同一性を有する遺伝子配列にコードされている、請求項1~6のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 標的化部分が、配列番号173の配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む、請求項1~7のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーが、配列番号173の配列に対して100%相補的である配列を含む、請求項8に記載の医薬組成物。
- 標的化部分が、ゲノム座標のペアにより特定されるNMDエクソンと少なくとも部分的に重複する、請求項1~9のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 標的化部分が、ゲノム座標のペアにより特定されるNMDエクソンのエクソン-イントロン接合部を含む、請求項1~9のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 標的化部分がゲノム座標のペアにより特定されるNMDエクソン内にある、請求項1~9のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 標的化部分が、ゲノム座標のペアにより特定されるNMDエクソンの5個以上の連続するヌクレオチドを含む、請求項1~9のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 標的化部分が、GRCh38/hg38:chr3 193628509から最大10
0ヌクレオチド上流(または5’方向)にある、請求項1~9のいずれか1項に記載の医薬組成物。 - 産生される標的タンパク質が、全長タンパク質または野生型タンパク質である、請求項1~14のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーが、ホスホロチオエート連結またはホスホロジアミデート連結を含む骨格修飾を含む、請求項1~15のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーが、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、2’-O-メチル、2’-フルオロ、または2’-O-メトキシエチル部分を含む、請求項1~15のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーが少なくとも1つの修飾糖部分を含む、請求項1~15のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 各糖部分が修飾糖部分である、請求項18に記載の医薬組成物。
- アンチセンスオリゴマーが、16~50のヌクレオチドからなる、請求項1~19のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 疾患または状態の処置を必要とする対象における該処置において使用するための、請求項1~20のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 疾患または状態が標的タンパク質の欠損した量または活性に関連する、請求項21に記載の医薬組成物。
- 疾患または状態が、標的タンパク質における機能喪失型変異に関連する、請求項21に記載の医薬組成物。
- 疾患または状態が、標的タンパク質をコードする遺伝子のハプロ不全に関連し、対象が、機能性標的タンパク質をコードする第1のアレル、および標的タンパク質が産生されないか、もしくは低下したレベルで産生される第2のアレル、または非機能性標的タンパク質もしくは部分機能性標的タンパク質をコードする第2のアレルを有する、請求項21に記載の医薬組成物。
- 疾患または状態が、標的タンパク質をコードする遺伝子の常染色体劣性変異に関連し、対象が、
(i)標的タンパク質が産生されないか、もしくは野生型アレルと比較して低下したレベルで産生される、または
(ii)産生される標的タンパク質が非機能性であるか、もしくは野生型アレルと比較して部分機能性である
第1のアレルを有し、および
(iii)標的タンパク質が野生型アレルと比較して低下したレベルで産生され、産生される標的タンパク質が野生型アレルと比較して少なくとも部分機能性である、または
(iv)産生される標的タンパク質が野生型アレルと比較して部分機能性である
第2のアレルを有する、請求項21に記載の医薬組成物。 - 疾患または状態が、視神経萎縮1型を含む、請求項21に記載の医薬組成物。
- 対象がヒトである、請求項21~26のいずれか1項に記載の組成物。
- 治療剤が、対象の髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、硝子体内注射、または静脈内注射によって投与される、請求項21~27のいずれか1項に記載の医薬組成物。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2024015750A JP2024056778A (ja) | 2017-10-23 | 2024-02-05 | ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー |
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201762575924P | 2017-10-23 | 2017-10-23 | |
US62/575,924 | 2017-10-23 | ||
US201862667200P | 2018-05-04 | 2018-05-04 | |
US62/667,200 | 2018-05-04 | ||
PCT/US2018/057165 WO2019084050A1 (en) | 2017-10-23 | 2018-10-23 | ANTISENSE OLIGOMERS FOR THE TREATMENT OF CONDITIONS AND DISEASES BASED ON THE DECLINE OF NON-SENSE MEDIATED MRNA |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2024015750A Division JP2024056778A (ja) | 2017-10-23 | 2024-02-05 | ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2021500041A JP2021500041A (ja) | 2021-01-07 |
JP2021500041A5 JP2021500041A5 (ja) | 2021-12-02 |
JP7475272B2 true JP7475272B2 (ja) | 2024-04-26 |
Family
ID=66247689
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2020522905A Active JP7475272B2 (ja) | 2017-10-23 | 2018-10-23 | ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー |
JP2024015750A Pending JP2024056778A (ja) | 2017-10-23 | 2024-02-05 | ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2024015750A Pending JP2024056778A (ja) | 2017-10-23 | 2024-02-05 | ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20210268667A1 (ja) |
EP (1) | EP3700570A4 (ja) |
JP (2) | JP7475272B2 (ja) |
KR (1) | KR20200070367A (ja) |
CN (1) | CN111936163A (ja) |
AU (1) | AU2018355237A1 (ja) |
BR (1) | BR112020007881A2 (ja) |
CA (1) | CA3079729A1 (ja) |
GB (2) | GB2610100B (ja) |
IL (1) | IL274023A (ja) |
SG (1) | SG11202003692YA (ja) |
WO (1) | WO2019084050A1 (ja) |
Families Citing this family (41)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013163628A2 (en) | 2012-04-27 | 2013-10-31 | Duke University | Genetic correction of mutated genes |
GB201410693D0 (en) | 2014-06-16 | 2014-07-30 | Univ Southampton | Splicing modulation |
WO2016040748A1 (en) | 2014-09-12 | 2016-03-17 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for detection of smn protein in a subject and treatment of a subject |
CA2963288A1 (en) | 2014-10-03 | 2016-04-07 | Cold Spring Harbor Laboratory | Targeted augmentation of nuclear gene output |
US10196639B2 (en) | 2015-10-09 | 2019-02-05 | University Of Southampton | Modulation of gene expression and screening for deregulated protein expression |
WO2017066497A2 (en) | 2015-10-13 | 2017-04-20 | Duke University | Genome engineering with type i crispr systems in eukaryotic cells |
US11096956B2 (en) | 2015-12-14 | 2021-08-24 | Stoke Therapeutics, Inc. | Antisense oligomers and uses thereof |
EP3390636B1 (en) | 2015-12-14 | 2021-05-19 | Cold Spring Harbor Laboratory | Antisense oligomers for treatment of dravet syndrome |
US11198867B2 (en) | 2016-06-16 | 2021-12-14 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Combinations for the modulation of SMN expression |
WO2019040923A1 (en) | 2017-08-25 | 2019-02-28 | Stoke Therapeutics, Inc. | ANTISENSE OLIGOMERS FOR THE TREATMENT OF DISEASE CONDITIONS AND OTHER DISEASES |
MX2020011695A (es) | 2018-05-04 | 2021-02-26 | Stoke Therapeutics Inc | Métodos y composiciones para el tratamiento de la enfermedad por almacenamiento de éster de colesterilo. |
CN109593771B (zh) * | 2018-07-27 | 2022-03-29 | 四川大学华西医院 | 一种人类map2k5第1100位碱基突变基因及其检测试剂盒 |
CA3162618A1 (en) | 2019-03-20 | 2020-09-24 | Peter Jungsoo PARK | Antisense oligonucleotide-based progranulin augmentation therapy in neurodegenerative diseases |
MX2021011916A (es) | 2019-03-29 | 2021-10-26 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Compuestos y metodos para modular ube3a-ats. |
KR20220104677A (ko) * | 2019-08-19 | 2022-07-26 | 스톡 테라퓨틱스, 인크. | 스플라이싱 및 단백질 발현을 조절하기 위한 조성물 및 방법 |
WO2021113541A1 (en) * | 2019-12-06 | 2021-06-10 | Stoke Therapeutics, Inc. | Antisense oligomers for treatment of conditions and diseases |
MX2022010602A (es) * | 2020-02-28 | 2022-09-09 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Compuestos y metodos para modular smn2. |
US20230124616A1 (en) * | 2020-03-06 | 2023-04-20 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Compounds and methods for modulating kcnq2 |
US20230201375A1 (en) * | 2020-04-27 | 2023-06-29 | Duke University | Targeted genomic integration to restore neurofibromin coding sequence in neurofibromatosis type 1 (nf1) |
MX2022014155A (es) * | 2020-05-11 | 2023-04-11 | The Florey Inst Of Neuroscience And Mental Health | Composiciones y metodos para tratar trastornos asociados a mutaciones de perdida de funcion en syngap1. |
EP4150092A1 (en) * | 2020-05-11 | 2023-03-22 | Stoke Therapeutics, Inc. | Opa1 antisense oligomers for treatment of conditions and diseases |
MX2023001486A (es) * | 2020-08-07 | 2023-03-27 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Compuestos y metodos para modular scn2a. |
US20240018522A1 (en) * | 2020-10-26 | 2024-01-18 | Remix Therapeutics Inc. | Oligonucleotides useful for modulation of splicing |
JP2024507717A (ja) * | 2021-02-03 | 2024-02-21 | ストーク セラピューティクス,インク. | ポリシスチン発現に関連する状態及び疾患の治療のための組成物 |
EP4337772A1 (en) * | 2021-05-10 | 2024-03-20 | Q-State Biosciences, Inc. | Compositions targeting sodium channel 1.6 |
CN113584082B (zh) * | 2021-06-22 | 2023-07-25 | 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院 | CRISPR/Cas9基因编辑系统及其在制备治疗遗传性感音神经性聋的药物中的应用 |
CN113584038B (zh) * | 2021-09-09 | 2023-11-14 | 深圳雅济科技有限公司 | 一种治疗视网膜疾病的反义寡核苷酸组合及其应用 |
CA3235593A1 (en) * | 2021-10-18 | 2023-04-27 | James M. Wilson | Compositions useful in treatment of cdkl5 deficiency disorder (cdd) |
EP4429714A2 (en) * | 2021-11-09 | 2024-09-18 | Stoke Therapeutics, Inc. | Opa1 antisense oligomers for treatment of conditions and diseases |
CN114032323B (zh) * | 2021-11-17 | 2023-08-08 | 云南省烟草农业科学研究院 | 一种与雪茄烟抗黑胫病基因紧密连锁的共显性ssr标记及其应用 |
WO2023102548A1 (en) * | 2021-12-03 | 2023-06-08 | Quralis Corporation | Treatment of neurological diseases using modulators of kcnq2 gene transcripts |
IL314620A (en) * | 2022-01-31 | 2024-09-01 | Pyc Therapeutics Ltd | A method for treating optic atrophy |
US20230265436A1 (en) * | 2022-02-24 | 2023-08-24 | Q-State Biosciences, Inc. | Therapeutics for syngap haploinsufficiency |
CN115029347B (zh) * | 2022-05-11 | 2024-02-20 | 珠海中科先进技术研究院有限公司 | 识别和调控肝肾细胞纤维化的分子监测序列、重组质粒、抑制病毒 |
WO2023235509A2 (en) * | 2022-06-01 | 2023-12-07 | Stoke Therapeutics, Inc. | Antisense oligomers for treatment of non-sense mediated rna decay based conditions and diseases |
WO2023235915A1 (en) * | 2022-06-07 | 2023-12-14 | PYC Therapeutics Limited | Compositions and methods for treatment of monogenic neurodevelopmental disorder |
WO2024005715A1 (en) * | 2022-06-28 | 2024-01-04 | Agency For Science, Technology And Research | Oligonucleotides |
KR20240139000A (ko) * | 2023-03-09 | 2024-09-20 | 고려대학교 산학협력단 | L1td1 단백질을 포함하는 신경퇴행성 질환의 예방 또는 치료용 조성물 |
CN117511947B (zh) * | 2024-01-08 | 2024-03-29 | 艾斯拓康医药科技(北京)有限公司 | 一种优化的5`utr序列及其应用 |
CN117904327B (zh) * | 2024-03-19 | 2024-07-30 | 浙江百迪生物科技有限公司 | 特异性检测人源基因的生物标志物、引物对、试剂盒及其应用 |
CN118421801A (zh) * | 2024-07-03 | 2024-08-02 | 深圳市艾斯基因科技有限公司 | 结直肠癌高甲基化靶标及其应用 |
Family Cites Families (35)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4866042A (en) | 1987-11-18 | 1989-09-12 | Neuwelt Edward A | Method for the delivery of genetic material across the blood brain barrier |
US6294520B1 (en) | 1989-03-27 | 2001-09-25 | Albert T. Naito | Material for passage through the blood-brain barrier |
US5151510A (en) | 1990-04-20 | 1992-09-29 | Applied Biosystems, Inc. | Method of synethesizing sulfurized oligonucleotide analogs |
WO1994008026A1 (en) | 1992-09-25 | 1994-04-14 | Rhone-Poulenc Rorer S.A. | Adenovirus vectors for the transfer of foreign genes into cells of the central nervous system, particularly in brain |
US5656612A (en) | 1994-05-31 | 1997-08-12 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense oligonucleotide modulation of raf gene expression |
FR2727867B1 (fr) | 1994-12-13 | 1997-01-31 | Rhone Poulenc Rorer Sa | Transfert de genes dans les motoneurones medullaires au moyen de vecteurs adenoviraux |
US6187586B1 (en) * | 1999-12-29 | 2001-02-13 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense modulation of AKT-3 expression |
US6809194B1 (en) * | 2000-05-10 | 2004-10-26 | Chiron Corporation | Akt3 inhibitors |
US20040078837A1 (en) * | 2001-08-02 | 2004-04-22 | Shannon Mark E. | Four human zinc-finger-containing proteins: MDZ3, MDZ4, MDZ7 and MDZ12 |
US6936589B2 (en) | 2001-09-28 | 2005-08-30 | Albert T. Naito | Parenteral delivery systems |
WO2004083432A1 (en) * | 2003-03-21 | 2004-09-30 | Academisch Ziekenhuis Leiden | Modulation of exon recognition in pre-mrna by interfering with the secondary rna structure |
US7374927B2 (en) * | 2004-05-03 | 2008-05-20 | Affymetrix, Inc. | Methods of analysis of degraded nucleic acid samples |
WO2007047913A2 (en) | 2005-10-20 | 2007-04-26 | Isis Pharmaceuticals, Inc | Compositions and methods for modulation of lmna expression |
US8178503B2 (en) * | 2006-03-03 | 2012-05-15 | International Business Machines Corporation | Ribonucleic acid interference molecules and binding sites derived by analyzing intergenic and intronic regions of genomes |
WO2009003694A2 (en) * | 2007-07-03 | 2009-01-08 | Andreas Reichert | Method for treating diseases related to mitochondrial dysfunction |
CA3043911A1 (en) | 2007-12-04 | 2009-07-02 | Arbutus Biopharma Corporation | Targeting lipids |
CA2717045C (en) * | 2008-03-13 | 2018-04-10 | Celera Corporation | Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis, methods of detection and uses thereof |
DK3449926T3 (da) | 2009-06-17 | 2019-11-11 | Biogen Ma Inc | Sammensætninger og fremgangsmåder til modulering af smn2-splejsning hos et individ |
BR112012026471A2 (pt) | 2010-04-19 | 2016-11-29 | Nlife Therapeutics S L | conjugado, processo para a síntese do mesmo, método para imagem de uma célula que expressa um transportador de neurotransmissor que compreende o contato da referida célula com o conjugado, processo para preparar um comporto de fórmula (ii) e (xiv) e composto |
SG10201700554VA (en) | 2011-07-19 | 2017-03-30 | Wave Life Sciences Pte Ltd | Methods for the synthesis of functionalized nucleic acids |
PE20142364A1 (es) | 2012-02-10 | 2015-01-10 | Hoffmann La Roche | Compuestos para tratar atrofia muscular espinal |
EA201492119A1 (ru) * | 2012-05-16 | 2015-05-29 | Рана Терапьютикс, Инк. | Композиции и способы для модулирования экспрессии apoa1 и abca1 |
US8729263B2 (en) | 2012-08-13 | 2014-05-20 | Novartis Ag | 1,4-disubstituted pyridazine analogs there of and methods for treating SMN-deficiency-related conditions |
UA116639C2 (uk) * | 2012-10-09 | 2018-04-25 | Рег'Юлес Терап'Ютікс Інк. | Способи лікування синдрому альпорта |
WO2014209841A2 (en) | 2013-06-25 | 2014-12-31 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Compounds for treating spinal muscular atrophy |
CA2915764A1 (en) | 2013-08-19 | 2015-02-26 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Screening method |
ES2779302T3 (es) * | 2013-09-04 | 2020-08-14 | Cold Spring Harbor Laboratory | Reducción de la degradación de ARNm con mediación sin sentido |
US20180085391A1 (en) * | 2014-08-08 | 2018-03-29 | Modernatx, Inc. | Compositions and methods for the treatment of ophthalmic diseases and conditions |
WO2016128343A1 (en) | 2015-02-09 | 2016-08-18 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Compounds for the treatment of cancer |
EP4249472A3 (en) | 2015-05-30 | 2023-12-13 | PTC Therapeutics, Inc. | Methods for modulating rna splicing |
EP3352872A4 (en) | 2015-09-24 | 2019-07-10 | The Trustees of the University of Pennsylvania | TRIPTYCENE DERIVATIVES FOR STABILIZING NUCLEIC ACID JUNITIONS |
CA3005090A1 (en) | 2015-12-14 | 2017-06-22 | Cold Spring Harbor Laboratory | Compositions and methods for treatment of liver diseases |
WO2017106370A1 (en) * | 2015-12-14 | 2017-06-22 | Cold Spring Harbor Laboratory | Compositions and methods for treatment of eye diseases |
EP4104867A3 (en) * | 2015-12-14 | 2023-03-01 | Cold Spring Harbor Laboratory | Compositions and methods for treatment of central nervous system diseases |
EP3390636B1 (en) * | 2015-12-14 | 2021-05-19 | Cold Spring Harbor Laboratory | Antisense oligomers for treatment of dravet syndrome |
-
2018
- 2018-10-23 GB GB2216904.9A patent/GB2610100B/en active Active
- 2018-10-23 JP JP2020522905A patent/JP7475272B2/ja active Active
- 2018-10-23 CN CN201880084329.7A patent/CN111936163A/zh active Pending
- 2018-10-23 BR BR112020007881-6A patent/BR112020007881A2/pt unknown
- 2018-10-23 KR KR1020207014744A patent/KR20200070367A/ko not_active Application Discontinuation
- 2018-10-23 EP EP18871437.2A patent/EP3700570A4/en active Pending
- 2018-10-23 US US16/758,776 patent/US20210268667A1/en not_active Abandoned
- 2018-10-23 AU AU2018355237A patent/AU2018355237A1/en active Pending
- 2018-10-23 SG SG11202003692YA patent/SG11202003692YA/en unknown
- 2018-10-23 CA CA3079729A patent/CA3079729A1/en active Pending
- 2018-10-23 GB GB2006322.8A patent/GB2584204B/en active Active
- 2018-10-23 WO PCT/US2018/057165 patent/WO2019084050A1/en unknown
-
2020
- 2020-04-19 IL IL274023A patent/IL274023A/en unknown
-
2023
- 2023-04-13 US US18/299,956 patent/US20240033378A1/en active Pending
-
2024
- 2024-02-05 JP JP2024015750A patent/JP2024056778A/ja active Pending
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
BMC Medical Genetics,2017年02月,Vol.18:22,pp.1-9,DOI 10.1186/s12881-017-0383-x |
Molecular Therapy - Nucleic Acids,2016年,Vol.5 e390,pp.1-8 |
Molecular Vision,2014年,Vol.20,pp.691-703 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA3079729A1 (en) | 2019-05-02 |
CN111936163A (zh) | 2020-11-13 |
GB202006322D0 (en) | 2020-06-17 |
GB2610100B (en) | 2023-08-16 |
EP3700570A4 (en) | 2021-08-04 |
KR20200070367A (ko) | 2020-06-17 |
GB2584204A (en) | 2020-11-25 |
US20240033378A1 (en) | 2024-02-01 |
BR112020007881A2 (pt) | 2020-12-22 |
GB202216904D0 (en) | 2022-12-28 |
SG11202003692YA (en) | 2020-05-28 |
EP3700570A1 (en) | 2020-09-02 |
GB2610100A (en) | 2023-02-22 |
WO2019084050A1 (en) | 2019-05-02 |
JP2024056778A (ja) | 2024-04-23 |
US20210268667A1 (en) | 2021-09-02 |
GB2584204B (en) | 2023-06-28 |
AU2018355237A1 (en) | 2020-05-21 |
IL274023A (en) | 2020-06-30 |
JP2021500041A (ja) | 2021-01-07 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7475272B2 (ja) | ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー | |
AU2023204080A1 (en) | Pre-mRNA splice switching or modulating oligonucleotides comprising bicyclic scaffold moieties, with improved characteristics for the treatment of genetic disorders | |
JP7420679B2 (ja) | 状態および疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー | |
AU2023203103A1 (en) | Antisense Molecules and Methods for Treating Pathologies | |
AU2024200142A1 (en) | RNAi therapy for Hepatitis B virus infection | |
AU2024203661A1 (en) | Alpha-1 antitrypsin (AAT) RNAi agents, compositions including AAT RNAi agents, and methods of use | |
AU2024202423A1 (en) | Compositions for modulating sod-1 expression | |
US11814622B2 (en) | OPA1 antisense oligomers for treatment of conditions and diseases | |
JP2019500347A (ja) | 網膜色素変性症18と網膜色素変性症13の処置のための組成物と方法 | |
JP2022544702A (ja) | スプライシングおよびタンパク質発現を調節するための組成物および方法 | |
AU2024201464A1 (en) | Compositions and methods for treating alpha-1 antitrypsin deficiency | |
WO2020176776A1 (en) | Antisense oligomers for treatment of conditions and diseases | |
US20240117353A1 (en) | Compositions for treatment of conditions and diseases associated with polycystin expression | |
WO2023086342A2 (en) | Opa1 antisense oligomers for treatment of conditions and diseases | |
WO2024076934A2 (en) | Compositions and methods for modulation of cftr | |
CN118510551A (zh) | 用于治疗病状和疾病的opa1反义寡聚体 | |
AU2022394667A1 (en) | Composition and method for inhibiting angiotensinogen (agt) protein expression | |
JP2024524974A (ja) | ナンセンス変異依存rna分解機構に基づく病態及び疾患の処置のためのアンチセンスオリゴマー | |
WO2024097138A1 (en) | Antisense oligomers for treatment of non-sense mediated rna decay based conditions and diseases | |
AU2022422864A1 (en) | Nucleic acid, composition and conjugate containing nucleic acid, preparation method therefor and use thereof |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20211025 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20211025 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20211213 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20221011 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20230110 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230313 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20230601 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230901 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20231005 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20240205 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20240215 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20240329 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20240416 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7475272 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |