JP6538101B2 - 基質特異性が改変されたアマドリアーゼ - Google Patents
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Description
(a)配列番号1に示すアミノ酸配列に1または数個のアミノ酸の欠失、挿入、付加、および/または置換がなされたアミノ酸配列を有し、配列番号1に示すアミノ酸配列を有するアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリルヒスチジンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減している。
(d)259位のバリン
(e)154位のセリン
(f)125位のヒスチジン
(g)261位のチロシン
(h)263位のグリシン
(i)106位のアスパラギン酸
(j)103位のグリシン
(k)355位のアラニン
(l)96位のアスパラギン酸
(s)66位のリジンまたは/および67位のバリン
(m)70位のグルタミン
(o)100位のスレオニン
(p)110位のグルタミン
(q)113位のアラニン
(r)114位のロイシン
(s)156位のアスパラギン酸
(3)配列番号1に示すアミノ酸配列のアミノ酸の以下(t)から(aj)よりなる群から選択される1つまたはそれ以上のアミノ酸に対応する位置のアミノ酸が、以下(t)から(aj)の各々に記載される置換後のアミノ酸残基へと置換されており、前記置換を行う前のアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリルヒスチジンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減しているか、および/または前記置換を行う前のアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減していることを特徴とするアマドリアーゼ:
(t)98位のグルタミン酸がプロリン以外のアミノ酸、すなわちグルタミン、ヒスチジン、リジン、アルギニン、グリシン、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、システイン、セリン、スレオニン、アスパラギン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファンに置換されている;
(u)259位のバリンがアラニン、システイン、セリンに置換されている;
(v)154位のセリンがグリシン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ヒスチジン、システインに置換されている;
(w)125位のヒスチジンがアラニン、ロイシン、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、グルタミン酸、リジン、アルギニンに置換されている;
(x)261位のチロシンがアラニン、ロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、リジンに置換されている;
(y)263位のグリシンがリジン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、グルタミン酸に置換されている;
(z)106位のアスパラギン酸が、アスパラギン酸よりも分子量の小さいアミノ酸、すなわちグリシン、アラニン、セリン、バリン、スレオニン、システイン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギンに置換されている;
(aa)103位のグリシンがリジン、アルギニン、ヒスチジンに置換されている;
(ab)355位のアラニンがリジン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、グルタミン酸に置換されている;
(ac)96位のアスパラギン酸がアラニン、アスパラギン、ヒスチジン、セリンに置換されている;
(ad)66位のリジンがグリシンまたは/および67位のバリンがプロリンに置換されている;
(ae)70位のグルタミンがプロリンに置換されている;
(af)100位のスレオニンがアルギニンに置換されている;
(ag)110位のグルタミンがアラニン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、トリプトファン、アスパラギン、ヒスチジン、リジン、アルギニンに置換されている;
(ah)113位のアラニンがグルタミン酸、リジンに置換されている;
(ai)114位のロイシンがリジン、アルギニンに置換されている;
(aj)156位のアスパラギン酸がアスパラギンに置換されている。
(ba)98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換、154位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアスパラギンへの置換および259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換;
(bb)98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換および154位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアスパラギンへの置換;
(bc)98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のグルタミンへの置換および259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換;
(bd)98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換および259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換;
(be)110位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換、154位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアスパラギンへの置換および259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換。
(ca)98位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換、110位のリジンに対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換および259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換;
(cb)98位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換および259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換;
(cc)110位のリジンに対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換および259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換。
(ak)上記(6)記載の宿主細胞を培養する工程;
(al)宿主細胞に含まれるアマドリアーゼ遺伝子を発現させる工程;および
(am)培養物からアマドリアーゼを単離する工程。
アマドリアーゼは、ケトアミンオキシダーゼ、フルクトシルアミノ酸オキシダーゼ、フルクトシルペプチドオキシダーゼ、フルクトシルアミンオキシダーゼともいい、酸素の存在下で、イミノ2酢酸若しくはその誘導体(アマドリ化合物)を酸化して、グリオキシル酸若しくはα−ケトアルデヒド、アミノ酸若しくはペプチド、および過酸化水素を生成する反応を触媒する酵素のことをいう。アマドリアーゼは、自然界に広く分布しており、微生物や、動物若しくは植物起源の酵素を探索することにより、得ることができる。微生物においては、例えば、糸状菌、酵母、若しくは細菌等から得ることができる。
これらのアマドリアーゼをコードする本発明の遺伝子(以下、単に「アマドリアーゼ遺伝子」ともいう)を得るには、通常一般的に用いられている遺伝子のクローニング方法が用いられる。例えば、アマドリアーゼ生産能を有する微生物菌体や種々の細胞から常法、例えば、Current Protocols in Molecular Biology(WILEY Interscience,1989)記載の方法により、染色体DNAまたはmRNAを抽出することができる。さらにmRNAを鋳型としてcDNAを合成することができる。このようにして得られた染色体DNAまたはcDNAを用いて、染色体DNAまたはcDNAのライブラリーを作製することができる。
本発明において用いることのできるベクターとしては、上記プラスミドに限定されることなく、それ以外の、例えば、バクテリオファージ、コスミド等の当業者に公知の任意のベクターを用いることができる。具体的には、例えば、pBluescriptII SK+(STRATAGENE社製)等が好ましい。
アマドリアーゼ遺伝子の変異処理は、企図する変異形態に応じた、公知の任意の方法で行うことができる。すなわち、アマドリアーゼ遺伝子あるいは当該遺伝子の組み込まれた組換え体DNAと変異原となる薬剤とを接触・作用させる方法;紫外線照射法;遺伝子工学的手法;または蛋白質工学的手法を駆使する方法等を広く用いることができる。
上述のように得られたアマドリアーゼ遺伝子を、常法により、バクテリオファージ、コスミド、または原核細胞若しくは真核細胞の形質転換に用いられるプラスミド等のベクターに組み込み、各々のベクターに対応する宿主を常法により、形質転換または形質導入をすることができる。例えば、宿主として、エッシェリシア属に属する微生物、例えば得られた組換え体DNAを用いて、例えば、大腸菌K−12株、好ましくは大腸菌JM109株、大腸菌DH5α株(ともにタカラバイオ社製)等を形質転換またはそれらに形質導入してそれぞれの菌株を得る。
アミノ酸配列の相同性は、GENETYX−Mac (Software Development社製)のマキシマムマッチングやサーチホモロジー等のプログラム、またはDNASIS Pro(日立ソフト社製)のマキシマムマッチングやマルチプルアライメント等のプログラムにより計算することができる。
「アミノ酸に対応する位置」とは、配列番号1に示すコニオカエタ属由来のアマドリアーゼのアミノ酸配列の特定の位置のアミノ酸に対応する他の生物種由来のアマドリアーゼのアミノ酸配列における位置をいう。
上記のようにして得られた基質特異性が改善されたアマドリアーゼの生産能を有する菌株を用いて、当該アマドリアーゼを生産するには、この菌株を通常の固体培養法で培養してもよいが、可能な限り液体培養法を採用して培養するのが好ましい。
上記のような手段で得られる本発明のアマドリアーゼは、遺伝子改変等により、そのアミノ酸配列に変異を生じた結果、改変前のものと比較して基質特異性が向上していることを特徴とする。具体的には、改変前のものと比較して、「αFVHに対する反応性」に対する「εFKに対する反応性」の割合、あるいは、「αFVに対する反応性」に対する「εFKに対する反応性」の割合が低減していることを特徴とする。または、改変前のものと比較して、「αFVHに対する反応性」に対する「εFKに対する反応性」の割合、および、「αFVに対する反応性」に対する「εFKに対する反応性」の割合がいずれも低減していることを特徴とする。
アマドリアーゼの活性の測定方法としては、種々の方法を用いることができるが、一例として、以下に、本発明で用いるアマドリアーゼ活性の測定方法について説明する。
(1)試薬1:パーオキシダーゼ、4−アミノアンチピリン溶液
5.0kUのパーオキシダーゼ(キッコーマン社製)、100mgの4−アミノアンチピリン(東京化成社製)を0.1Mのリン酸カリウム緩衝液(pH7.0またはpH7.5もしくはpH8.0)に溶解し、1000mlに定容する。
500mgのTOOS(同仁化学研究所製)をイオン交換水に溶解し、100mlに定容する。
αFVH 625mg、もしくはεFK 462mgまたはαFV 419mgをイオン交換水に溶解し、10mlに定容する。
2.7mlの試薬1、100μlの試薬2、および100μlの酵素液を混和し、37℃で5分間予備加温する。その後、試薬3を100μl加えて良く混ぜた後、分光光度計(U−3010A、日立ハイテクノロジーズ社製)により、555nmにおける吸光度を測定する。測定値は、555nmにおける1分後から2分後の1分間あたりの吸光度変化とする。なお、対照液は、100μlの試薬3の代わりに100μlのイオン交換水を加える以外は前記と同様にしたものである。これを予め作製しておいた過酸化水素の標準溶液を試薬3の代わりに、また酵素液の代わりにイオン交換水を用い、その生成色素量との関係を調べたグラフを用意する。このグラフを用いて、37℃、1分当たりに生成される過酸化水素のマイクロモル数を計算し、この数値を酵素液中の活性単位とする。
Coniochaeta属由来アマドリアーゼ遺伝子(配列番号2)の組換え体プラスミドを有する大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7)株(国際公開第2007/125779号参照)を、3mlのLB−amp培地[1%(w/v)バクトトリプトン、0.5%(w/v)ペプトン、0.5%(w/v)NaCl、50μg/ml アンピシリン]に接種して、37℃で16時間振とう培養し、培養物を得た。
得られた組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、配列番号3、4の合成オリゴヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、以下の条件でPCR反応を行った。
上記の手順により得られた上記組換え体プラスミドを保持するそれぞれの大腸菌JM109株を、0.1mMのIPTGを添加したLB−amp培地3mlにおいて、30℃で16時間培養した。得られた各培養菌体を20mMのHEPES−NaOH緩衝液(pH7.0)で洗浄した後、同緩衝液に懸濁して超音波破砕処理を行い、20,000×gで10分間遠心分離して、基質特異性確認のための酵素液0.6mlを調製した。
上述の酵素液を用いて、上記のB:活性測定法に示した方法により、αFVH、αFVおよびεFKに対する酵素活性を測定した。また、比較のために、大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7)株から生産した改変前のアマドリアーゼについても、同様の測定を行った。なお、活性測定にはpH7.0に調整した試薬1:パーオキシダーゼ、4−アミノアンチピリン溶液を用いた。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の96位のアスパラギン酸を他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表2に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号41〜46)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の96位のアスパラギン酸が各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の98位のグルタミン酸を他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表3に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号47〜82)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の98位のグルタミン酸が各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の103位のグリシンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表4に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号83、84、255、256)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の103位のグリシンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の106位のアスパラギン酸を他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表5に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号85〜100)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の106位のアスパラギン酸が各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の110位のグルタミンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表6に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号101〜118)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の110位のグルタミンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の113位のアラニンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表7に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号119、120)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の113位のアラニンがリジンに置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の114位のロイシンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表8に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号121〜124)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の114位のロイシンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の125位のヒスチジンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表9に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号125〜134、257〜260)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の125位のヒスチジンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の154位のセリンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表10に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号135〜150)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の154位のセリンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の259位のバリンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表11に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号151〜154)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の259位のバリンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の261位のチロシンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表12に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号155〜162)、KOD −Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の261位のチロシンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の263位のグリシンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表13に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号163、164、261〜266)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の263位のグリシンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
基質特異性の向上に効果の高い配列番号1記載のアミノ酸配列の355位のアラニンを他のアミノ酸に置換し、基質特異性に優れた改変型アマドリアーゼの探索を試みた。組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T7 DNAを鋳型として、表14に示した合成オリゴヌクレオチド(配列番号165〜168、267〜270)、KOD −Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列の355位のアラニンが各種アミノ酸に置換された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
表15に示した各種組換え体プラスミドDNAを鋳型として、合成オリゴヌクレオチド(配列番号7、8、17、18、39、40、51、52、55、56、87、88、115、116、131、132、135、136、139、140)、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記(2)と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109株の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列に表15中の「アミノ酸変異」の欄に記載した複数のアミノ酸置換が導入された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
表16に示した使用プラスミドLおよびSを制限酵素KpnI及びHindIIIで二重消化し、使用プラスミドLから約5.3kbpのDNA断片を、使用プラスミドSから約0.8kbpのDNA断片をそれぞれアガロースゲル電気泳動により分離した後、NucleoSpin Extract II(マシュレ‐ナゲル社製)によりゲルから各DNA断片を抽出、精製した。続いて、両DNA断片をLigation high Ver.2(東洋紡績社製)を用いて連結し、連結したプラスミドDNAを用いて大腸菌JM109株を形質転換し、生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号1記載のアミノ酸配列に表16中の「アミノ酸変異」の欄に記載した複数のアミノ酸置換が導入された改変型アマドリアーゼを生産する大腸菌JM109株を得た。
野生型アマドリアーゼ、および上記のようにして得られた改変型アマドリアーゼを生産する形質転換体、大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7−Q110R)、および大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7−Q110K)、および大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7−Y261F)、および大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7−Y261W)、および大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7−E98A/V259C)、および大腸菌JM109(pKK223−3−CFP−T7−E98A/S154N/V259C)を、0.1mMのIPTGを添加したLB−amp培地40mlに植菌し、30℃で16時間培養した。得られた各培養菌体を20mMのHEPES−NaOH緩衝液(pH7.0)で洗浄した後、同緩衝液に菌体を懸濁して超音波破砕処理を行い、20,000×gで10分間遠心分離し、粗酵素液8mlを調製した。
次に、改変型アマドリアーゼを用いてHbA1cのβ鎖アミノ末端よりプロテアーゼ等により遊離されるαFVHを定量する際に、共存するεFKが測定値に与える影響について評価した。
(4)試薬4:パーオキシダーゼ、4−アミノアンチピリン溶液
7.5kUのパーオキシダーゼ(キッコーマン社製)、150mgの4−アミノアンチピリン(東京化成社製)を0.15Mのリン酸カリウム緩衝液(pH6.5)に溶解し、1000mlに定容する。
500mgのTOOS(同仁化学研究所製)をイオン交換水に溶解し、100mlに定容する。
精製した配列番号1記載のアマドリアーゼ、及び配列番号1記載のアマドリアーゼの98位のグルタミン酸をアラニンに、かつ154位のセリンをアスパラギンに、かつ259位のバリンをシステインに置換した改変型のアマドリアーゼ(配列番号271)を0.01Mのリン酸カリウム緩衝液(pH6.5)で希釈し、それぞれ1.0U/ml、2.3U/mlとなるように調製した。
αFVH 625mgをイオン交換水に溶解し、10mlに定容することにより、150mMのαFVH溶液を調製した。続いて、150mMのαFVH溶液をイオン交換水により希釈することで、90μM、180μM、270μM、360μM、450μMのαFVH溶液を調製した。
εFK 462mgをイオン交換水に溶解し、10mlに定容することで調製した150mMのεFK溶液と、(7)で調製した150mMのαFVH溶液をイオン交換水で希釈し、以下の4種類の血液モデル溶液を調製した。
8−2.215μM αFVH、215μM εFK
8−3.215μM αFVH、1075μM εFK
8−4.215μM αFVH、2150μM εFK
なお、ヘモグロビン濃度15g/dL、HbA1c6.1%(JDS値、NGSP値6.5%相当、IFCC値46.5mmol/mol相当)の血液では、ヘモグロビンの分子量を65kDaとすると、HbA1cのβ鎖アミノ末端から遊離されるαFVHの濃度は215μMとなる。
1.8mlの試薬4、100μlの試薬5、および100μlの試薬6を混和し、37℃で5分間予備加温する。その後、37℃で5分間予備加温しておいた試薬7を1000μl加えて良く混ぜた後、分光光度計(U−3010A、日立ハイテクノロジーズ社製)により、555nmにおける吸光度を測定し、その1分間あたりの吸光度変化量(ΔA555)を算出した。なお、対照液は、1000μlの試薬7の代わりに1000μlのイオン交換水を加える以外は前記と同様にしたものである。結果を図2に示した。図2から明らかなように、αFVH濃度と吸光度変化量(ΔA555)には相関関係が成立した。従って、配列番号1記載のアマドリアーゼ、及び配列番号271記載の改変型アマドリアーゼは共に、90μMから450μMの範囲でαFVHの定量に用いることができることを確認した。
1.8mlの試薬4、100μlの試薬5、および100μlの試薬6を混和し、37℃で5分間予備加温する。その後、37℃で5分間予備加温しておいた試薬8−1から8−4のいずれかを1000μl加えて良く混ぜた後、分光光度計(U−3010A、日立ハイテクノロジーズ社製)により、555nmにおける吸光度を測定し、その1分間あたりの吸光度変化量(ΔA555)を算出した。なお、対照液は、1000μlの試薬8−1から8−4の代わりに1000μlのイオン交換水を加える以外は前記と同様にしたものである。結果を表19に示した。表19から明らかなように、配列番号1記載のアマドリアーゼを用いた場合、αFVHと同濃度のεFKが共存すると、その測定値は本来の測定値と比較して3%弱の乖離が認められ、αFVHの5倍、10倍濃度のεFKが共存すると、その測定値は本来の測定値と比較して8%、17%の乖離が認められた。それに対し、配列番号271記載の改変型アマドリアーゼを用いた場合にはαFVHの同濃度、5倍濃度のεFKが共存しても、本来の測定値との乖離は1%弱であり、また、αFVHの10倍濃度のεFKが共存しても、本来の測定値との乖離は2%弱である。従って、配列番号271記載の改変型アマドリアーゼを用いれば、εFKが共存している試料でも正確にαFVHのみを定量することが可能である。
(a)アスペルギルス・ニードランスFGSC A26株からの全RNAの抽出
アスペルギルス・ニードランスFGSC A26株を、液体培地(0.4%イーストエキストラクト、1.0%マルツエキストラクト、0.1%トリプトン、0.1%リン酸2水素1カリウム、0.05%硫酸マグネシウム、2.0%グルコース、pH6.5)において、30℃で24時間培養した。培養後、回収した菌体を液体窒素で粉砕し、ISOGEN(ニッポンジーン社製)を用いて付属のプロトコールに従い全RNAを調製した。また、調製した全RNAをDNaseI(インビトロジェン社製)で処理することにより、DNAの混入を防いだ。
得られた全RNA1μgを用いて、PrimeScript RT−PCR Kit(タカラバイオ社製)により、付属のプロトコールに従ってRT−PCRを行った。このとき、逆転写反応ではKit付属のOligo dT Primerを用い、その後のPCR反応では配列番号169、170 に示した合成オリゴヌクレオチドを用いた。その結果、約1300bpのcDNA断片が特異的に増幅した。次に、この増幅したcDNA断片についてシーケンス解析を行った結果、配列番号171に示した1317bpからなる塩基配列であることがわかった。また、配列番号171より予想されるアミノ酸配列(配列番号172)は図1のアスペルキルス・ニードランス由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼの配列と一致していた。
続いて、アスペルギルス・ニードランス由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼを大腸菌で発現させるために、以下の手順を行った。まず、上記でクローニングしてきたcDNA断片は配列番号169、170に示した合成ヌクレオチド由来のNdeIサイトとBamHIサイトをそれぞれ5´末端と3´末端に有しているため、クローニングしてきたcDNA断片をNdeIとBamHI(タカラバイオ社製)の2種類の制限酵素で処理し、pET−22b(+)Vector(ノバジェン社製)のNdeI−BamHIサイトに挿入することで、組換え体プラスミドpET22b−AnFX´を取得した。
基質特異性を向上させるための点変異を導入することを目的として、組換え体プラスミドpET22b―AnFXを鋳型にして、配列番号175、176の合成オリゴヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記と同様の条件でPCR反応、大腸菌BL21(DE3)の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のフルクトシルアミノ酸オキシダーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号172記載のアミノ酸配列の153位のシステインがアスパラギン酸に置換されたアスペルギルス・ニードランス由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼ遺伝子をコードする組換え体プラスミド(pET22b−AnFX−C153D)を得た。
上記で得られた組換え体プラスミドpET22b−AnFX、pET22b−AnFX−C153D、pET22b−AnFX−V259A、pET22b−AnFX−V259C、pET22b−AnFX−G263K、pET22b−AnFX−G263Rをそれぞれ保持する大腸菌BL21(DE3)を、Overnight Express Autoinduction System 1(ノバジェン社製)の試薬を加えたLB−amp培地において30℃で18時間振とう培養した。得られた各培養菌体を10mMのリン酸カリウム緩衝液(pH7.5)に懸濁して超音波破砕処理を行い、20,000×gで10分間遠心分離することで粗酵素液を得た。この粗酵素液を用いて、上記のB:活性測定法により、αFV、αFVH及びεFKに対する酵素活性を測定し、εFK/αFVHおよびεFK/αFVを算出した。ただし、このときの活性測定の試薬1はpH7.5に調整したものを使用した。結果を表20に示す。
(a)ペニシリウム・クリソゲナムNBRC9251株からの全RNAの抽出
ペニシリウム・クリソゲナムNBRC9251株を、液体培地(0.4%イーストエキストラクト、1.0%マルツエキストラクト、0.1%トリプトン、0.1%リン酸2水素1カリウム、0.05%硫酸マグネシウム、2.0%グルコース、pH6.5)において、30℃で24時間培養し、上記と同様の手順で全RNAを調製した。
得られた全RNA1μgを用いて、上記と同様にしてRT−PCRを行った。このとき、逆転写反応ではKit付属のOligo dT Primerを用い、その後のPCR反応では配列番号185、186 に示した合成オリゴヌクレオチドを用いた。その結果、約1300bpのcDNA断片が特異的に増幅した。次に、この増幅したcDNA断片についてシーケンス解析を行った結果、配列番号187に示した1317bpからなる塩基配列であることがわかった。また、配列番号187より予想されるアミノ酸配列(配列番号188)は、図1で記載したペニシリウム・ヤンシネラムの配列の69番目のロイシンがトリプトファンに、142番目のスレオニンがアラニンに置換されたものと一致していた。
続いて、ペニシリウム・クリソゲナム由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼを大腸菌で発現させるために、以下の手順を行った。まず、上記でクローニングしてきたcDNA断片は配列番号185、186に示した合成ヌクレオチド由来のNdeIサイトとBamHIサイトをそれぞれ5´末端と3´末端に有しているため、クローニングしてきたcDNA断片をNdeIとBamHI(タカラバイオ社製)の2種類の制限酵素で処理し、pET−22b(+)Vector(ノバジェン社製)のNdeI−BamHIサイトに挿入することで、組換え体プラスミドpET22b−PcFX´を取得した。
基質特異性を向上させるための点変異を導入することを目的として、組換え体プラスミドpET22b―PcFXを鋳型にして、配列番号191、192の合成オリゴヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記と同様の条件でPCR反応、大腸菌BL21(DE3)の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のフルクトシルアミノ酸オキシダーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号188記載のアミノ酸配列の110位のリジンがアルギニンに置換されたペニシリウム・クリソゲナム由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼ遺伝子をコードする組換え体プラスミド(pET22b−PcFX−K110R)を得た。
上記で得られた組換え体プラスミドpET22b−PcFX、pET22b−PcFX−K110R、pET22b−PcFX−C154D、pET22b−PcFX−G263Kをそれぞれ保持する大腸菌BL21(DE3)を、Overnight Express Autoinduction System 1(ノバジェン社製)の試薬を加えたLB−amp培地において30℃で18時間振とう培養した。得られた各培養菌体をBugBuster Protein Extraction Reagent(ノバジェン社製)を用いて溶菌した後、20,000×gで10分間遠心分離することで粗酵素液を得た。この粗酵素液を用いて、上記のB:活性測定法により、αFV、αFVH及びεFKに対する酵素活性を測定し、εFK/αFVHおよびεFK/αFVを算出した。ただし、このときの活性測定の試薬1はpH7.5に調整したものを使用した。結果を表21に示す。
既知のフルクトシルアミノ酸オキシダーゼのアミノ酸配列をもとに、ゲノムデータベース(http://www.genome.jp/tools/blast/)より検索したクリプトコッカス・ネオフォルマンス由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼ(Cryptococcus neoformans B-3501A: GENE ID: 4934641 CNBB5450 hypothetical protein)について、C末端から34アミノ酸を除いた、配列番号197で示す443アミノ酸を大腸菌で発現させることを試みた。そこで、配列番号197のアミノ酸配列をコードし、且つ大腸菌発現用にコドンを最適化した、配列番号198で示す1332bpの遺伝子(終止コドンTGAを含む)を、定法である遺伝子断片のPCRによる全合成によりcDNAを全合成することで取得した。このとき、配列番号1の5´末端、3´末端にはそれぞれNdeIサイトとBamHIサイトを付加した。また、クローニングした遺伝子配列から予想されるアミノ酸配列は図1のクリプトコッカス・ネオフォルマンス由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼのC末端から34アミノ酸を除いた配列と一致していることを確認した。
基質特異性を向上させるための点変異を導入することを目的として、組換え体プラスミドpET22b―CnFXを鋳型にして、配列番号199、200の合成オリゴヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記と同様の条件でPCR反応、大腸菌BL21(DE3)の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のフルクトシルアミノ酸オキシダーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号197記載のアミノ酸配列の100位のスレオニンがアルギニンに置換されたクリプトコッカス・ネオフォルマンス由来フルクトシルアミノ酸オキシダーゼ遺伝子をコードする組換え体プラスミド(pET22b−CnFX−T100R)を得た。
上記で得られた組換え体プラスミドpET22b−CnFX−T100R、pET22b−CnFX−S110R、pET22b−CnFX−S154N、pET22b−CnFX−V259A、pET22b−CnFX−V259C、pET22b−CnFX−S263K、pET22b−CnFX−S263Rをそれぞれ保持する大腸菌BL21(DE3)を、Overnight Express Autoinduction System 1(ノバジェン社製)の試薬を加えたLB−amp培地において30℃で18時間振とう培養した。得られた各培養菌体を10mMのリン酸カリウム緩衝液(pH7.5)に懸濁して超音波破砕処理を行い、20,000×gで10分間遠心分離することで粗酵素液を得た。この粗酵素液を用いて、上記のB:活性測定法により、αFV、αFVH及びεFKに対する酵素活性を測定し、εFK/αFVHおよびεFK/αFVを算出した。ただし、このときの活性測定の試薬1はpH7.5に調整したものを使用した。結果を表22に示す。
ネオコスモスポラ・バシンフェクタ由来ケトアミンオキシダーゼを大腸菌で発現させることを試みた。すでに明らかになっているネオコスモスポラ・バシンフェクタ由来ケトアミンオキシダーゼのアミノ酸配列を配列番号213に示した(特許文献1参照)。この配列番号213で示した441アミノ酸をコードし、且つ大腸菌発現用にコドンを最適化した、配列番号214で示す1326bpの遺伝子(終止コドンTGAを含む)を、定法である遺伝子断片のPCRによる全合成によりcDNAを全合成することで取得した。このとき、配列番号1の5´末端、3´末端にはそれぞれNdeIサイトとBamHIサイトを付加した。また、クローニングした遺伝子配列から予想されるアミノ酸配列全長は図1のネオコスモスポラ・バシンフェクタ由来ケトアミンオキシダーゼの配列と一致していることを確認した。
続いて、基質特異性を向上させるための点変異を導入することを目的として、組換え体プラスミドpET22b−NvFXを鋳型にして、配列番号215、216及び217、218及び219、220及び221、222の合成オリゴヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、上記と同様の条件でPCR反応、大腸菌BL21(DE3)の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のフルクトシルアミノ酸オキシダーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、配列番号213記載のアミノ酸配列の98位のグルタミン酸がそれぞれグルタミン、ヒスチジン、リジン、アルギニンに置換されたネオコスモスポラ・バシンフェクタ由来ケトアミンオキシダーゼ遺伝子をコードする組換え体プラスミド(pET22b−NvFX−E98Q、pET22b−NvFX−E98H、pET22b−NvFX−E98K、pET22b−NvFX−E98R)を得た。
上記で得られた組換え体プラスミドpET22b−NvFX−E98Q、pET22b−NvFX−E98H、pET22b−NvFX−E98K、pET22b−NvFX−E98R、pET22b−NvFX−E110R、pET22b−NvFX−S154N、pET22b−NvFX−S154D、pET22b−NvFX−V259A、pET22b−NvFX−V259C、pET22b−NvFX−G263K、pET22b−NvFX−G263R、pET22b−NvFX−K66GV67Pをそれぞれ保持する大腸菌BL21(DE3)を、Overnight Express Autoinduction System 1(ノバジェン社製)の試薬を加えたLB−amp培地において30℃で18時間振とう培養した。得られた各培養菌体を10mMのリン酸カリウム緩衝液(pH7.5)に懸濁して超音波破砕処理を行い、20,000×gで10分間遠心分離することで粗酵素液を得た。この粗酵素液を用いて、上記のB:活性測定法により、αFV、αFVH及びεFKに対する酵素活性を測定し、εFK/αFVHおよびεFK/αFVを算出した。ただし、このときの活性測定の試薬1はpH7.5に調整したものを使用した。結果を表23に示す。
配列番号241は熱安定性向上型変異(G184D、N272D、H388Y)を導入したユウペニシリウム・テレナム由来アマドリアーゼのアミノ酸配列であり、配列番号241のアミノ酸配列をコードする遺伝子(配列番号242)を挿入した組換え体プラスミドpUTE100K´−EFP−T5を大腸菌で発現させることにより、ユウペニシリウム・テレナム由来アマドリアーゼの活性が確認されている(国際公開第2007/125779号参照)。
上記で得られた組換え体プラスミドpUTE100K´−EFP−T5−S98A、pUTE100K´−EFP−T5−K110R、pUTE100K´−EFP−T5−V259A、pUTE100K´−EFP−T5−V259C、pUTE100K´−EFP−T5−G263Kをそれぞれ保持する大腸菌DH5α株を、0.1MのIPTGを添加したLB−amp培地において30℃で18時間振とう培養した。得られた各培養菌体を10mMのリン酸カリウム緩衝液(pH7.5)に懸濁して超音波破砕処理を行い、20,000×gで10分間遠心分離することで粗酵素液を得た。この粗酵素液を用いて、上記のB:活性測定法により、αFV、αFVH及びεFKに対する酵素活性を測定し、εFK/αFVHおよびεFK/αFVを算出した。ただし、このときの活性測定の試薬1はpH8.0に調整したものを使用した。活性測定結果を表24に示す。
ユウペニシリウム・テレナム由来アマドリアーゼ遺伝子の基質特異性向上型多重変異体を作製することで、εFKへの反応性を著しく低下させたアマドリアーゼの開発に試みた。
上記で得られた組換え体プラスミドpUTE100K´−EFP−T5−S98A/V259C、pUTE100K´−EFP−T5−K110R/C154N、pUTE100K´−EFP−T5−K110R/V259C、pUTE100K´−EFP−T5−S98A/K110R/V259Cをそれぞれ保持する大腸菌DH5α株を、0.1MのIPTGを添加したLB−amp培地において30℃で18時間振とう培養した。得られた各培養菌体を10mMのリン酸カリウム緩衝液(pH7.5)に懸濁して超音波破砕処理を行い、20,000×gで10分間遠心分離することで粗酵素液を得た。この粗酵素液を用いて、上記のB:活性測定法により、αFV、αFVH及びεFKに対する酵素活性を測定し、εFK/αFVHおよびεFK/αFVを算出した。ただし、このときの活性測定の試薬1はpH8.0に調整したものを使用した。活性測定結果を表25に示す。
配列番号272は熱安定性向上型変異(G184D、F265L、N272D、H302R、H388Y)を導入したConiochaeta属由来アマドリアーゼのアミノ酸配列であり、配列番号273の遺伝子にコードされている。
配列番号272記載のアミノ酸配列の98位のグルタミン酸をアラニンに、154位のセリンをアスパラギンに、259位のバリンをシステインに置換するために、組換え体プラスミドpKK223−3−CFP−T9 DNAを鋳型として、配列番号55、56の合成オリゴヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、[実施例1}に述べた条件と同様の条件でPCR反応、大腸菌JM109の形質転換および生育コロニーが保持するプラスミドDNA中のアマドリアーゼをコードするDNAの塩基配列決定を行った。その結果、98位のグルタミン酸がアラニンに置換された改変型アマドリアーゼをコードする組換え体プラスミド(pKK223−3−CFP−T9−E98A)を得た。
Claims (13)
- 以下の(a)および/または(b)の性質を有する改変アマドリアーゼ:
(a)配列番号172に示すアミノ酸配列に1〜10個のアミノ酸の欠失、挿入、付加、および/または置換がなされたアミノ酸配列を有し、配列番号172に示すアミノ酸配列を有するアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリルヒスチジンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減している;
(b)配列番号172に示すアミノ酸配列に1〜10個のアミノ酸の欠失、挿入、付加、および/または置換がなされたアミノ酸配列を有し、配列番号172に示すアミノ酸配列を有するアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減している、
ここで前記改変アマドリアーゼは、以下よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で以下に記載されるアミノ酸残基への置換を1つまたはそれ以上有する、
(d)配列番号1の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸の、アラニン、システイン、またはセリンへの置換、
(e)配列番号1の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸の、グリシン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、またはヒスチジンへの置換、
(h)配列番号1の263位のグリシンに対応する位置のアミノ酸の、リジン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、またはグルタミン酸への置換、
(i)配列番号1の106位のアスパラギン酸に対応する位置のアミノ酸の、アラニン、セリン、バリン、スレオニン、システイン、ロイシン、イソロイシン、またはアスパラギンへの置換、
(p)配列番号1の110位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸の、アラニン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、チロシンまたはアスパラギンへの置換、
前記改変アマドリアーゼ。 - 配列番号172に示すアミノ酸配列の以下よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で以下に記載されるアミノ酸残基への置換を1つまたはそれ以上有し、前記置換を行う前の未改変のアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリルヒスチジンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減しているか、および/または前記置換を行う前の未改変のアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減していることを特徴とする改変アマドリアーゼ、
(d)配列番号1の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸の、アラニン、システイン、またはセリンへの置換、
(e)配列番号1の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸の、グリシン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、またはヒスチジンへの置換、
(h)配列番号1の263位のグリシンに対応する位置のアミノ酸の、リジン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、またはグルタミン酸への置換、
(i)配列番号1の106位のアスパラギン酸に対応する位置のアミノ酸の、アラニン、セリン、バリン、スレオニン、システイン、ロイシン、イソロイシン、またはアスパラギンへの置換、
(p)配列番号1の110位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸の、アラニン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、チロシンまたはアスパラギンへの置換、
ここで前記置換を行う前の未改変のアマドリアーゼは、
(i)配列番号172のアミノ酸配列と95%以上のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列からなるアマドリアーゼ、
(ii)配列番号172のアミノ酸配列と97%以上のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列からなるアマドリアーゼ、
(iii)配列番号172のアミノ酸配列と99%以上のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列からなるアマドリアーゼ、
(iv) 配列番号172に示すアミノ酸配列に1〜10個のアミノ酸の置換、欠失、および/もしくは付加を有するアミノ酸配列を含むアマドリアーゼ、又は
(v)配列番号172のアミノ酸配列からなるアマドリアーゼである。 - さらに、以下よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸残基の置換を有する、請求項2に記載の改変アマドリアーゼ、
(c)配列番号1の98位のグルタミン酸
(f)配列番号1の125位のヒスチジン
(g)配列番号1の261位のチロシン
(j)配列番号1の103位のグリシン
(k)配列番号1の355位のアラニン
(l)配列番号1の96位のアスパラギン酸
(s)配列番号1の66位のリジンまたは/および67位のバリン
(m)配列番号1の70位のグルタミン
(o)配列番号1の100位のスレオニン
(q)配列番号1の113位のアラニン、
(r)配列番号1の114位のロイシン
(t)配列番号1の156位のアスパラギン酸。 - 配列番号172に示すアミノ酸配列に1〜10個のアミノ酸の置換、欠失、および/または付加を有するアミノ酸配列を含むアマドリアーゼであって、
当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の以下の(u)、(v)及び(ag)よりなる群から選択される1つまたはそれ以上のアミノ酸に対応する位置のアミノ酸が、以下の(u)、(v)及び(ag)の各々に記載される置換後のアミノ酸残基へと置換されており、
(u)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸が、アラニン、システイン、またはセリンに置換されている;
(v)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸が、グリシン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、またはヒスチジンに置換されている;
(ag)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の110位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸が、アラニン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、チロシンまたはアスパラギンに置換されている;
かつ以下の(a)および/または(b)の性質を有する改変アマドリアーゼ:
(a)前記(u)、(v)及び(ag)に記載の置換を有しない改変前の親アマドリアーゼと比較して、当該(u)、(v)及び/又は(ag)に記載の置換を有することによりα−フルクトシルバリルヒスチジンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減している;
(b)前記(u)、(v)及び(ag)に記載の置換を有しない改変前の親アマドリアーゼと比較して、当該(u)、(v)及び/又は(ag)に記載の置換を有することによりα−フルクトシルバリンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減している。 - 配列番号172に示すアミノ酸配列と90%以上のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むアマドリアーゼであって、
当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の以下の(u)、(v)及び(ag)よりなる群から選択される1つまたはそれ以上のアミノ酸に対応する位置のアミノ酸が、以下の(u)、(v)及び(ag)の各々に記載される置換後のアミノ酸残基へと置換されており、
(u)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸が、アラニン、システイン、またはセリンに置換されている;
(v)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸が、グリシン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、またはヒスチジンに置換されている;
(ag)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の110位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸が、アラニン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、チロシンまたはアスパラギンに置換されている;
かつ以下の(a)および/または(b)の性質を有する改変アマドリアーゼ:
(a)前記(u)、(v)及び(ag)に記載の置換を有しない改変前の親アマドリアーゼと比較して、当該(u)、(v)及び/又は(ag)に記載の置換を有することによりα−フルクトシルバリルヒスチジンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減している;
(b)前記(u)、(v)及び(ag)に記載の置換を有しない改変前の親アマドリアーゼと比較して、当該(u)、(v)及び/又は(ag)に記載の置換を有することによりα−フルクトシルバリンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減している。 - 改変前の親アマドリアーゼと比較して、さらに、当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の以下の(w)、(x)、(y)、(z)、(aa)、(ab)、(ac)、(ad)、(ae)、(af)、(ah)、(ai)、及び(aj)よりなる群から選択される1つまたはそれ以上のアミノ酸に対応する位置のアミノ酸が、以下の(w)、(x)、(y)、(z)、(aa)、(ab)、(ac)、(ad)、(ae)、(af)、(ah)、(ai)、及び(aj)の各々に記載される置換後のアミノ酸残基へと置換されている、請求項4に記載の改変アマドリアーゼ:
(w)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の125位のヒスチジンに対応する位置のアミノ酸が、アラニン、ロイシン、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、グルタミン酸、リジン、またはアルギニンに置換されている;
(x)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の261位のチロシンに対応する位置のアミノ酸が、アラニン、ロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、またはリジンに置換されている;
(y)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の263位のグリシンに対応する位置のアミノ酸が、リジン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、またはグルタミン酸に置換されている;
(z)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の106位のアスパラギン酸に対応する位置のアミノ酸が、アスパラギン酸よりも分子量の小さいアミノ酸、すなわちグリシン、アラニン、セリン、バリン、スレオニン、システイン、ロイシン、イソロイシン、またはアスパラギンに置換されている;
(aa)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の103位のグリシンに対応する位置のアミノ酸が、リジン、アルギニン、またはヒスチジンに置換されている;
(ab)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の355位のアラニンに対応する位置のアミノ酸が、リジン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、またはグルタミン酸に置換されている;
(ac)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の96位のアスパラギン酸に対応する位置のアミノ酸が、アラニン、アスパラギン、ヒスチジン、またはセリンに置換されている;
(ad)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の66位のリジンに対応する位置のアミノ酸が、グリシンにまたは/および67位のバリンがプロリンもしくはヒスチジンに置換されている;
(ae)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の70位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸が、プロリンに置換されている;
(af)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の100位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸が、アルギニンに置換されている;
(ah)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の113位のアラニンに対応する位置のアミノ酸が、グルタミン酸、またはリジンに置換されている;
(ai)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の114位のロイシンに対応する位置のアミノ酸が、リジン、またはアルギニンに置換されている;
(aj)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の156位のアスパラギン酸に対応する位置のアミノ酸が、アスパラギンに置換されている。 - さらに、以下の(ba)から(be)よりなる群から選択されるアミノ酸残基の置換を含む、
請求項4または5に記載の改変アマドリアーゼ:
(ba)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換、当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアスパラギンへの置換および当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換;
(bb)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換および当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアスパラギンへの置換;
(bc)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のグルタミンへの置換および当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換;
(bd)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の98位のグルタミン酸に対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換および当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換;
(be)当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の110位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸のアルギニンへの置換、当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアスパラギンへの置換および当該アマドリアーゼのアミノ酸配列中における、配列番号1に示すアミノ酸配列の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のアラニンへの置換。 - 配列番号172に示すアミノ酸配列、又は配列番号172に示すアミノ酸配列に1〜10個のアミノ酸の欠失、挿入、付加、および/若しくは置換がなされたアミノ酸配列を有し、当該アミノ酸配列においてさらに、配列番号1の263位のグリシンに対応する位置のアミノ酸のリジン若しくはアルギニンへの置換、配列番号1の154位のセリンに対応する位置のアミノ酸のアスパラギンへの置換および配列番号1の259位のバリンに対応する位置のアミノ酸のシステインへの置換を有し、前記置換を行う前の未改変のアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリルヒスチジンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減しており、かつ前記置換を行う前の未改変のアマドリアーゼと比較して、α−フルクトシルバリンに対する反応性に対するε−フルクトシルリジンに対する反応性の割合が低減していることを特徴とする改変アマドリアーゼ。
- 請求項1〜8のいずれか一項に記載の改変アマドリアーゼのアミノ酸配列をコードするアマドリアーゼ遺伝子。
- 請求項9に記載のアマドリアーゼ遺伝子を含む組換えベクター。
- 請求項10に記載の組換えベクターを含む宿主細胞。
- アマドリアーゼを製造する方法であり、以下の工程を含む方法:
(ak)請求項11に記載の宿主細胞を培養する工程;
(al)宿主細胞に含まれるアマドリアーゼ遺伝子を発現させる工程;および
(am)培養物から改変アマドリアーゼを単離する工程。 - 請求項1から請求項8のいずれか一項に記載の改変アマドリアーゼを含む、糖化ヘモグロビンの測定に用いるためのキット。
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