JP5476021B2 - フルクトシルアミノ酸オキシダーゼ改変体およびその利用 - Google Patents
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Description
本発明に係るタンパク質は、以下の(a)〜(c)の何れかに記載のタンパク質である。
(a)配列番号1に示されるアミノ酸配列においてアミノ末端から52番目のチロシン、65番目のリジン、66番目のプロリンおよび286番目のフェニルアラニンの少なくとも何れか1つが置換されたアミノ酸配列からなり、且つフルクトシルアミノ酸オキシダーゼ活性を有するタンパク質;
(b)アミノ酸配列(a)においてアミノ末端から52番目、65番目、66番目および286番目のアミノ酸以外の部位において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、且つフルクトシルアミノ酸オキシダーゼ活性を有するタンパク質;
(c)配列番号1に示されるアミノ酸配列に対する相同性が70%以上であり、配列番号1に示されるアミノ酸配列のアミノ末端から52番目のチロシン、65番目のリジン、66番目のプロリンおよび286番目のフェニルアラニンに対応するアミノ酸の少なくとも何れか1つが、配列番号1に示されるアミノ酸配列における該何れか1つのアミノ酸と対応する位置のアミノ酸と異なるアミノ酸配列からなり、且つフルクトシルアミノ酸オキシダーゼ活性を有するタンパク質。
(d)配列番号15に示すアミノ酸配列(F286W);
(e)配列番号17に示すアミノ酸配列(F286Y);
(f)配列番号19に示すアミノ酸配列(S59G+K65G+K109Q+F286Y);
(g)配列番号21に示すアミノ酸配列(S59G+K65P+P66V+K109Q+F286Y);および、
(h)配列番号23(Y52H+S59G+K65P+P66V+K109Q+F286Y)に示すアミノ酸配列。
(o)配列番号1に示されるアミノ酸配列のアミノ末端から52番目のチロシンがヒスチジンに置換されたアミノ酸配列(Y52H);
(p)配列番号1に示されるアミノ酸配列のアミノ末端から65番目のリジンがプロリンに置換されたアミノ酸配列(K65P);
(q)配列番号1に示されるアミノ酸配列のアミノ末端から66番目のプロリンがバリンに置換されたアミノ酸配列(P66V)。
本発明に係るポリヌクレオチドは、本発明に係るタンパク質をコードすることを特徴としている。
(j)配列番号16に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k)配列番号18に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l)配列番号20に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(m)配列番号22に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(n)配列番号24に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド。
本発明に係るタンパク質の製造方法は、上述の本発明に係る形質転換体を培養する工程(「培養工程」という)を含むことを特徴としている。本発明に係るタンパク質の製造方法には、培養工程の他、形質転換体を用いたタンパク質生産において含まれ得るその他の工程が含まれていてもよい。その他の工程としては、例えば、培養工程後に形質転換体が生産したタンパク質を回収する回収工程およびこのタンパク質を精製する精製工程が挙げられる。
培養工程では、本発明に係る形質転換体が栄養培地で培養されることにより、多量の組換えタンパク質を安定して生産し得る。形質転換体の培養形態は、宿主の栄養生理的性質を考慮して培養条件を選択すればよく、多くの場合は液体培養で行う。工業的には通気攪拌培養を行うのが有利である。
形質転換体がタンパク質を細胞外に分泌する場合、その培養物には本発明のタンパク質が含まれている。よって培養物を本発明に係るタンパク質としてそのまま利用することが可能である。このとき、例えばろ過および遠心分離などにより、培養液と形質転換体とを分離してもよい。
精製工程は、回収工程によって得られたタンパク質を精製する工程である。精製工程の具体的な方法は特に限定されるものではないが、例えば、本発明に係るタンパク質を含む溶液を、減圧濃縮、膜濃縮、塩析処理(例えば、硫酸アンモニウムおよび硫酸ナトリウムなどを用いる)、または親水性有機溶媒(例えばメタノール、エタノールおよびアセトンなど)による分別沈殿法に供すればよい。これらの操作によって、目的である本発明に係るタンパク質を沈殿させ、精製することができる。
本発明に係るタンパク質は、フルクトシルアミノ酸の測定方法に用いることが可能である。また本発明に係るタンパク質を利用したフルクトシルアミノ酸の測定方法は、糖化ヘモグロビンなどの糖化タンパク質の測定に適用され得る。なお、本発明に係るタンパク質として、S59G+K65G+K109Q+F286Y、S59G+K65P+P66V+K109Q+F286Y、およびY52H+S59G+K65P+P66V+K109Q+F286Yなどフルクトシルバリルヒスチジンと反応し得るタンパク質を使用する場合には、フルクトシルバリルヒスチジンの測定方法に好適に利用し得、糖化ヘモグロビンのβ鎖に特異的な測定に好適に適用され得る。以下に本発明に係るタンパク質を用いた糖化タンパク質の測定方法(以下「本発明の測定方法」という)を説明する。
(1)試料とプロテアーゼとを反応させて、試料中の糖化タンパク質を分解し、試料中の糖化タンパク質由来の糖化アミンを調製する工程(便宜上「第1工程」という)、
(2)上記(1)の工程によって得られた試料中の糖化タンパク質由来の糖化アミンに本発明に係るタンパク質を作用させる工程(便宜上「第2工程」という)、および、
(3)上記(2)の工程において発生した過酸化水素の量または消費された酸素の量を測定する工程(便宜上「第3工程」という)、を含む糖化タンパク質を測定するための方法である。
第1工程は、試料中の糖化タンパク質を分解し、試料中の糖化タンパク質由来の糖化アミンを調製する工程である。
第2工程は、第1工程によって得られた試料中の糖化タンパク質由来の糖化アミンに本発明に係るタンパク質を作用させる工程である。
第3工程は、第2工程において発生した過酸化水素の量または消費された酸素の量を測定する工程である。第3工程は過酸化水素の量または酸素の量を測定し得る方法であれば、その具体的方法は特に限定されるものではない。したがって、公知の方法が適宜適用され得る。
(5−1)糖化タンパク質測定キット
本発明に係る糖化タンパク質測定キット(以下「本発明のキット」という)は、少なくとも本発明に係るタンパク質を備えていることを特徴としている。本発明のキットに備えられている本発明に係るタンパク質の形態は特に限定されるものではないが、例えば、水溶液、懸濁液または凍結乾燥粉末などの形態が採用され得る。凍結乾燥粉末は常法に従って作製され得る。
本発明に係る糖化タンパク質測定センサー(以下「本発明のセンサー」)は、糖化タンパク質を検出するために用いられるセンサーであり、少なくとも本発明に係るタンパク質を備えている。本発明のセンサーは、本発明の測定方法の実施に用いられる。とりわけ、糖化ヘモグロビンの測定に好適に利用し得る。よって、本発明のセンサーは、本発明の測定方法の実施に用いられる物品により構成されていてもよい。上記物品の説明については、本発明の測定方法および本発明のキットの項における緩衝剤等の説明を援用することができる。
実施例におけるFAODの活性測定条件を以下に示す。
各基質に対する酵素活性は、酵素反応により生成される過酸化水素を追随するペルオキシダーゼ反応により生じた色素の吸光度の増加を測定した。まず、活性測定試薬3mlを37℃で5分間予備加温後、この活性測定試薬に、予め酵素希釈液(50mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.5))で希釈した酵素溶液0.1mlを加え、反応を開始する。37℃で5分間反応させ、500nmの吸光度変化を測定する(ΔODtest/min)。盲検は酵素溶液の代わりに酵素希釈液0.1mlを加え、上記と同様に操作を行って吸光度変化を測定した(ΔODblank/min)。得られた吸光度変化より、下記計算式に基づき酵素活性を算出した。なお、上記条件で1分間に1マイクロモルの基質を酸化する酵素量を1単位(U)とする。
活性値(U/ml)={((ΔODtest/min)−(ΔODblank/min))×3.1ml×希釈倍率}/(13×1.0cm×0.1ml)
3.1ml:全液量
13:ミリモル吸光係数
1.0cm:セルの光路長
0.1ml:酵素サンプル液量
<参考例1:アスペルギルス・ニードランス由来FAOD遺伝子のクローニング>
アスペルギルス・ニードランス(Aspergillus nidulans)FAOD遺伝子のクローニングを行うために、アスペルギルス・ニードランスのゲノムデータベース(http://www.broad.mit.edu/annotation/genome/aspergillus_group/GenomesIndex.html)を検索した。このゲノムデータベースの中から、FAD−dependent oxidoreductaseをコードすることが予測される遺伝子を抽出した。検索結果から得られた種々の遺伝子のうち、フルクトシルバリンに実質的に作用するFAODタンパク質をコードする遺伝子として、DDBJアクセッション番号AACD01000139のAspergillus nidulans FGSC A4 chromosome II ANcontig1.13(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=nuccore&id=29570992)の325868−327486に対応する遺伝子を特定した。
配列番号2に示した塩基配列を有するFAOD遺伝子を含むプラスミドの大腸菌における大量発現を試みた。FAOD遺伝子の終止コドンを除いた全長cDNA領域(配列番号2に示した塩基配列の1から1314番目の塩基まで)をPCRで増幅した。その際、アミノ酸配列のN末端側に相当する位置に、配列番号5に示すプライマーP3(5'-GGAATTCCATATGACGCCCCGAGCCAACACCAAAATCATTGTC-3')(この塩基配列における「CATATG」はNdeI認識部位)を用いてNdeI切断部位を挿入し、C末端側に相当する位置に、配列番号6に示すプライマーP4(5'-CCGCTCGAGCATCTTTGCCTCATTCCTCCACCCCGGCAT-3')(この塩基配列における「CTCGAG」はXhoI認識部位)を用いてXhoI切断部位を導入した。本DNA断片をpET−23bベクター(ノバジェン社)のNdeI−XhoI部位へT7プロモーターと正方向になるようにサブクローニングした。作製したプラスミドは、FAOD発現用プラスミドとしてpIE201と命名した。
フェオスフェリア・ノドラム由来のフルクトシルバリルヒスチジンオキシダーゼのcDNAクローニングを行うために、フェオスフェリア・ノドラムのゲノムデータベース(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi?organism=fungi&database=321614)を検索した。
配列番号29に示した塩基配列を有するフェオスフェリア・ノドラム由来FAOD遺伝子を含むプラスミドの大腸菌における大量発現を試みた。フェオスフェリア・ノドラム由来FAOD遺伝子の終止コドンを除いた全長cDNA領域(配列番号29に示した塩基配列の1番目から1311番目の塩基まで)をPCRで増幅した。その際、配列番号30に示すプライマーP5(5’-GGAATTCCATATGGCGCCCTCCAGAGCAAACACCAGTGTCATT-3’)(この塩基配列における「CATATG」はNdeI認識部位)を用いて、アミノ酸配列のN末端側にNdeI切断部位を挿入した。また、配列番号31に示すプライマーP6(5’-CCGCTCGAGCAAGTTCGCCCTCGGCTTATCATGATTCCAACC-3’)(この塩基配列における「CTCGAG」はXhoI認識部位)を用いて、アミノ酸配列のC末端側にXhoI切断部位を導入した。本DNA断片をpET−23bベクター(ノバジェン社)のNdeI−XhoI部位へT7プロモーターと正方向になるようにサブクローニングした。作製したプラスミドは、フルクトシルバリルヒスチジンオキシダーゼ発現用プラスミドとしてpIE353と命名した。
発現プラスミドpIE201および合成オリゴヌクレオチド(配列番号7および8)を用いて、KOD−Plus Site−Directed Mutagenesis Kit(東洋紡績製)を使用して、規定のプロトコールに従って変異処理操作を行い、塩基配列を決定して、配列番号1に示したアミノ酸配列の286番目のフェニルアラニンがトリプトファンに置換されたFAOD変異体(配列番号15)をコードする組換えプラスミド(pIE201−F286W)を取得した。
野生型FAOD(IE201)、およびFAOD変異体(IE201−Y52H、IE201−K65P、IE201−P66V、IE201−F286W、IE201−F286Y、IE201−S59G+K65G+K109Q+F286Y、IE201−S59G+K65P+P66V+K109Q+F286Y、IE201−Y52H+S59G+K65P+P66V+K109Q+F286Y)の精製酵素標品の酵素活性を、フルクトシルバリルヒスチジン(F−VH)およびフルクトシルバリン(F−V)をそれぞれ単独に含有する活性測定試薬を用いて測定し、熱安定性評価を実施した。その結果を表2に示す。
熱安定性(%)=[(50℃,60分間加熱処理後活性値)/(加熱処理なし活性値)]×100
発現プラスミドpIE353および合成オリゴヌクレオチド(配列番号32および33)を用いて、KOD−Plus Site−Directed Mutagenesis Kit(東洋紡績製)を使用して、規定のプロトコールに従って変異処理操作を行い、塩基配列を決定して、配列番号28に示したアミノ酸配列の282番目のフェニルアラニン(F)をコードする塩基配列(ttc)がチロシン(Y)をコードする塩基配列(tat)に置換されたFAOD変異体をコードする組換えプラスミド(pIE353−F282Y)を取得した。
熱安定性(%)=[(50℃,10分間加熱処理後活性値)/(加熱処理なし活性値)]×
100
Claims (10)
- 以下の(a)〜(c)の何れかに記載のタンパク質:
(a)配列番号1に示されるアミノ酸配列においてアミノ末端から52番目のチロシン、65番目のリジン、66番目のプロリンおよび286番目のフェニルアラニンの少なくとも何れか1つが置換されたアミノ酸配列からなり、且つフルクトシルアミノ酸オキシダーゼ活性を有するタンパク質であって、52番目のチロシンが置換されている場合はヒスチジンに置換されており、65番目のリジンが置換されている場合はプロリンまたはグリシンに置換されており、66番目のプロリンが置換されている場合はバリンに置換されており、286番目のフェニルアラニンが置換されている場合はトリプトファンまたはチロシンに置換されているタンパク質;
(b)アミノ酸配列(a)においてアミノ末端から52番目、65番目、66番目および286番目のアミノ酸以外の部位において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、且つフルクトシルアミノ酸オキシダーゼ活性を有するタンパク質;
(c)配列番号28に示されるアミノ酸配列においてアミノ末端から282番目のフェニルアラニンがチロシンに置換されたアミノ酸配列からなり、且つフルクトシルアミノ酸オキシダーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下の(d)〜(i)の何れかに記載のタンパク質であることを特徴とする請求項1に記載のタンパク質:
(d)配列番号15に示すアミノ酸配列からなるタンパク質;
(e)配列番号17に示すアミノ酸配列からなるタンパク質;
(f)配列番号19に示すアミノ酸配列からなるタンパク質;
(g)配列番号21に示すアミノ酸配列からなるタンパク質;
(h)配列番号23に示すアミノ酸配列からなるタンパク質;
(i)アミノ酸配列(d)〜(h)においてアミノ末端から52番目、65番目、66番目および286番目のアミノ酸以外の部位において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなるタンパク質。 - 請求項1または2に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
- 以下の(j)〜(n)の何れかに記載のポリヌクレオチドであることを特徴とする請求項3に記載のポリヌクレオチド:
(j)配列番号16に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k)配列番号18に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l)配列番号20に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(m)配列番号22に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(n)配列番号24に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド。 - 請求項3または4に記載のポリヌクレオチドを含んでいることを特徴とするベクター。
- 請求項5に記載のベクターを含んでいることを特徴とする形質転換体。
- 請求項6に記載の形質転換体を培養する工程を包含することを特徴とするフルクトシルアミノ酸オキシダーゼの製造方法。
- フルクトシルアミノ酸の測定方法であって、
糖化アミンに請求項1または2に記載のタンパク質を作用させる工程を包含することを特徴とする測定方法。 - 請求項1または2に記載のタンパク質を備えていることを特徴とする糖化タンパク質測定キット。
- 請求項1または2に記載のタンパク質を備えていることを特徴とする糖化タンパク質測定センサー。
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