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Description
一部の実施形態では、キメラ抗原受容体(CAR)は本明細書に記載されるいずれかの抗体を含む。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体は、ITAMモチーフを含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含むCARである。他の実施形態では、キメラ抗原受容体は、CD3ζ由来の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含むCARである。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体は、CD28、CD137、ICOS、およびOX40からなる群から選択される共刺激分子由来の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含むCARである。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
1nMまたはそれ未満の親和性でHIVのN−グリカンエピトープに結合するまたは結合することができる抗HIV抗体。
(項目2)
HIVを中和するまたは中和することができる、項目1に記載の抗体。
(項目3)
広域中和抗体である、項目1〜2のいずれか一項に記載の抗体。
(項目4)
HIVがHIV−1である、項目1〜3のいずれか一項に記載の抗体。
(項目5)
HIVがグループM HIV−1である、項目1〜4のいずれか一項に記載の抗体。
(項目6)
HIVがHIV−1クレードA、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、またはその任意の組合せ、サブタイプ、もしくは循環組換え形態(CRF)である、項目1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
(項目7)
糖鎖操作されてFc領域でのオリゴ糖が改変されており、糖鎖操作されていない抗体と比べた場合、増加したADCCエフェクター機能を有する、項目1〜6のいずれか一項に記載の抗体。
(項目8)
モノクローナル抗体である、項目1〜7のいずれか一項に記載の抗体。
(項目9)
ヒト抗体である、項目1〜8のいずれか一項に記載の抗体。
(項目10)
ヒト化抗体である、項目1〜8のいずれか一項に記載の抗体。
(項目11)
キメラ抗体である、項目1〜8のいずれか一項に記載の抗体。
(項目12)
完全長IgGクラス抗体である、項目9〜11のいずれか一項に記載の抗体。
(項目13)
抗体断片である、項目1〜6のいずれか一項に記載の抗体。
(項目14)
一本鎖可変断片(scFv)である、項目1〜13のいずれか一項に記載の抗体。
(項目15)
(a)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目16)
(a)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目15に記載の抗体。
(項目17)
(a)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目18)
(a)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目19)
(a)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目18に記載の抗体。
(項目20)
(a)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれかに記載の抗体。
(項目21)
(a)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目22)
(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目21に記載の抗体。
(項目23)
(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目24)
(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目25)
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目24に記載の抗体。
(項目26)
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目27)
(a)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(c)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR−H3;および
(d)配列番号10のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目28)
(a)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(c)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H3;および
(d)配列番号12のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目29)
(a)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目30)
(a)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号58アミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目29に記載の抗体。
(項目31)
(a)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目32)
(a)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目33)
(a)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目34)
(a)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号28アミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目33に記載の抗体。
(項目35)
(a)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号68アミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目33に記載の抗体。
(項目36)
(a)配列番号1のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目37)
(a)配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目38)
(a)配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号6のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目39)
(a)配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目40)
(a)配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;および
(b)配列番号10のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目41)
(a)配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;および
(b)配列番号12のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目42)
(a)配列番号13のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号14のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目43)
(a)配列番号15のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目44)
(a)配列番号16のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目45)
(a)配列番号16のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列、および配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目46)
(a)配列番号16のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列、および配列番号65のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目47)
(a)表4のCDR−H1、表4のCDR−H2、表4のCDR−H3、もしくはその任意の組合せ;
(b)表5のCDR−L1、表5のCDR−L2、表5のCDR−L3、もしくはその任意の組合せ;
(c)表4のV H 配列、表5のV L 配列、もしくは両方;または
(d)(a)、(b)、もしくは(c)の任意の組合せ
を含まない、項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体。
(項目48)
項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体をコードする単離された核酸。
(項目49)
項目48に記載の核酸を含むベクター。
(項目50)
項目49に記載のベクターを含む宿主細胞。
(項目51)
抗体を産生する方法であって、前記抗体が産生されるように項目50に記載の宿主細胞を培養するステップを含む方法。
(項目52)
項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体および治療剤を含む免疫コンジュゲート。
(項目53)
項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体および薬学的に許容される担体を含む医薬製剤。
(項目54)
医薬として使用するための項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲート。
(項目55)
HIV感染またはAIDSを処置するための項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲートの使用。
(項目56)
医薬の製造における項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲートの使用。
(項目57)
前記医薬がHIV感染またはAIDSの処置のためのものである、項目56に記載の使用。
(項目58)
前記医薬がHIVを中和するためのものである、項目56〜57のいずれかに記載の使用。
(項目59)
前記抗体が広域中和抗体である、項目56〜58のいずれかに記載の使用。
(項目60)
HIVがHIV−1である、項目56〜59のいずれかに記載の使用。
(項目61)
HIVがグループM HIV−1である、項目56〜60のいずれかに記載の使用。
(項目62)
HIVがHIV−1クレードA、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、またはその任意の組合せ、サブタイプ、もしくはCRFである、項目56〜61のいずれかに記載の使用。
(項目63)
HIV感染またはAIDSを有する個体を処置する方法であって、前記個体に項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲートの有効量を投与するステップを含む方法。
(項目64)
治療剤を投与するステップをさらに含む、項目63に記載の方法。
(項目65)
前記治療剤が抗ウイルス剤である、項目63に記載の方法。
(項目66)
(a)抗体と試料中に存在するHIVの間での抗体−HIV複合体の形成に許容的である条件下で、前記試料を項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体と接触させるステップと、
(b)免疫検出法により前記複合体の有無を検出するステップと
を含むHIV免疫組織化学的アッセイ。
(項目67)
前記試料が血液試料または組織試料である、項目66に記載のアッセイ。
(項目68)
抗HIV抗体またはその断片を作製するための方法であって、
(a)前記ベクターにコードされるポリペプチドの発現および抗体またはその断片の組立てを可能にする条件下で、培地中において項目50に記載の細胞を培養するステップと、
(b)前記培養された細胞または前記細胞の前記培地から前記抗体または断片を精製するステップと
を含む方法。
(項目69)
(a)項目1〜47のいずれかに記載の少なくとも1つの単離された抗HIV抗体の薬学的有効量の薬学的に許容される投与単位
を含むキット。
(項目70)
抗HIV薬剤の薬学的有効量の薬学的に許容される投与単位をさらに含む、項目69に記載のキット。
(項目71)
前記抗HIV薬剤が、非ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤、プロテアーゼ阻害剤、進入または融合阻害剤、およびインテグラーゼ阻害剤からなる群から選択される薬剤である、項目69に記載のキット。
(項目72)
対象においてHIV感染またはAIDSの診断、予後、または処置をモニターするためのキットであって、項目1〜47のいずれかに記載の少なくとも1つの単離された抗HIV抗体、および前記抗HIV抗体に特異的に結合する1つまたは複数の検出試薬を含むキット。
(項目73)
PCRを実施するための試薬をさらに含む、項目72に記載のキット。
(項目74)
質量分析を実施するための試薬をさらに含む、項目72に記載のキット。
(項目75)
項目1〜47のいずれかに記載の抗体を含む融合タンパク質またはコンジュゲート。
(項目76)
任意選択でキメラ抗原受容体(CAR)である、キメラ受容体であるまたはそれを含む、項目75に記載の融合タンパク質またはコンジュゲート。
(項目77)
項目1〜47のいずれかに記載の抗体を含むキメラ抗原受容体(CAR)。
(項目78)
前記CARがITAMモチーフを含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、項目77に記載のキメラ抗原受容体。
(項目79)
前記CARが、CD3ζ由来の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、項目77〜78のいずれか一項に記載のキメラ抗原受容体。
(項目80)
前記CARが、CD28、CD137、ICOS、およびOX40からなる群から選択される共刺激分子由来の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、項目77〜79のいずれか一項に記載のキメラ抗原受容体。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
1nMまたはそれ未満の親和性でHIVのN−グリカンエピトープに結合するまたは結合することができる抗HIV抗体。
(項目2)
HIVを中和するまたは中和することができる、項目1に記載の抗体。
(項目3)
広域中和抗体である、項目1〜2のいずれか一項に記載の抗体。
(項目4)
HIVがHIV−1である、項目1〜3のいずれか一項に記載の抗体。
(項目5)
HIVがグループM HIV−1である、項目1〜4のいずれか一項に記載の抗体。
(項目6)
HIVがHIV−1クレードA、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、またはその任意の組合せ、サブタイプ、もしくは循環組換え形態(CRF)である、項目1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
(項目7)
糖鎖操作されてFc領域でのオリゴ糖が改変されており、糖鎖操作されていない抗体と比べた場合、増加したADCCエフェクター機能を有する、項目1〜6のいずれか一項に記載の抗体。
(項目8)
モノクローナル抗体である、項目1〜7のいずれか一項に記載の抗体。
(項目9)
ヒト抗体である、項目1〜8のいずれか一項に記載の抗体。
(項目10)
ヒト化抗体である、項目1〜8のいずれか一項に記載の抗体。
(項目11)
キメラ抗体である、項目1〜8のいずれか一項に記載の抗体。
(項目12)
完全長IgGクラス抗体である、項目9〜11のいずれか一項に記載の抗体。
(項目13)
抗体断片である、項目1〜6のいずれか一項に記載の抗体。
(項目14)
一本鎖可変断片(scFv)である、項目1〜13のいずれか一項に記載の抗体。
(項目15)
(a)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目16)
(a)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目15に記載の抗体。
(項目17)
(a)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目18)
(a)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目19)
(a)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目18に記載の抗体。
(項目20)
(a)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれかに記載の抗体。
(項目21)
(a)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目22)
(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目21に記載の抗体。
(項目23)
(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目24)
(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目25)
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目24に記載の抗体。
(項目26)
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目27)
(a)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(c)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR−H3;および
(d)配列番号10のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目28)
(a)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(c)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H3;および
(d)配列番号12のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目29)
(a)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目30)
(a)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号58アミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目29に記載の抗体。
(項目31)
(a)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR−L3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目32)
(a)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目33)
(a)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR−H2;および
(c)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR−H3
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目34)
(a)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号28アミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目33に記載の抗体。
(項目35)
(a)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(b)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR−L2;および
(c)配列番号68アミノ酸配列を含むCDR−L3
をさらに含む、項目33に記載の抗体。
(項目36)
(a)配列番号1のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目37)
(a)配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目38)
(a)配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号6のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目39)
(a)配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目40)
(a)配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;および
(b)配列番号10のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目41)
(a)配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;および
(b)配列番号12のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目42)
(a)配列番号13のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;
(b)配列番号14のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;または
(c)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目43)
(a)配列番号15のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目44)
(a)配列番号16のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列および(b)でのV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目45)
(a)配列番号16のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列、および配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目46)
(a)配列番号16のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;または
(b)(a)でのV H 配列、および配列番号65のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列
を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の抗体。
(項目47)
(a)表4のCDR−H1、表4のCDR−H2、表4のCDR−H3、もしくはその任意の組合せ;
(b)表5のCDR−L1、表5のCDR−L2、表5のCDR−L3、もしくはその任意の組合せ;
(c)表4のV H 配列、表5のV L 配列、もしくは両方;または
(d)(a)、(b)、もしくは(c)の任意の組合せ
を含まない、項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体。
(項目48)
項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体をコードする単離された核酸。
(項目49)
項目48に記載の核酸を含むベクター。
(項目50)
項目49に記載のベクターを含む宿主細胞。
(項目51)
抗体を産生する方法であって、前記抗体が産生されるように項目50に記載の宿主細胞を培養するステップを含む方法。
(項目52)
項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体および治療剤を含む免疫コンジュゲート。
(項目53)
項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体および薬学的に許容される担体を含む医薬製剤。
(項目54)
医薬として使用するための項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲート。
(項目55)
HIV感染またはAIDSを処置するための項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲートの使用。
(項目56)
医薬の製造における項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲートの使用。
(項目57)
前記医薬がHIV感染またはAIDSの処置のためのものである、項目56に記載の使用。
(項目58)
前記医薬がHIVを中和するためのものである、項目56〜57のいずれかに記載の使用。
(項目59)
前記抗体が広域中和抗体である、項目56〜58のいずれかに記載の使用。
(項目60)
HIVがHIV−1である、項目56〜59のいずれかに記載の使用。
(項目61)
HIVがグループM HIV−1である、項目56〜60のいずれかに記載の使用。
(項目62)
HIVがHIV−1クレードA、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、またはその任意の組合せ、サブタイプ、もしくはCRFである、項目56〜61のいずれかに記載の使用。
(項目63)
HIV感染またはAIDSを有する個体を処置する方法であって、前記個体に項目1〜47のいずれかに記載の抗体または項目52に記載の免疫コンジュゲートの有効量を投与するステップを含む方法。
(項目64)
治療剤を投与するステップをさらに含む、項目63に記載の方法。
(項目65)
前記治療剤が抗ウイルス剤である、項目63に記載の方法。
(項目66)
(a)抗体と試料中に存在するHIVの間での抗体−HIV複合体の形成に許容的である条件下で、前記試料を項目1〜47のいずれか一項に記載の抗体と接触させるステップと、
(b)免疫検出法により前記複合体の有無を検出するステップと
を含むHIV免疫組織化学的アッセイ。
(項目67)
前記試料が血液試料または組織試料である、項目66に記載のアッセイ。
(項目68)
抗HIV抗体またはその断片を作製するための方法であって、
(a)前記ベクターにコードされるポリペプチドの発現および抗体またはその断片の組立てを可能にする条件下で、培地中において項目50に記載の細胞を培養するステップと、
(b)前記培養された細胞または前記細胞の前記培地から前記抗体または断片を精製するステップと
を含む方法。
(項目69)
(a)項目1〜47のいずれかに記載の少なくとも1つの単離された抗HIV抗体の薬学的有効量の薬学的に許容される投与単位
を含むキット。
(項目70)
抗HIV薬剤の薬学的有効量の薬学的に許容される投与単位をさらに含む、項目69に記載のキット。
(項目71)
前記抗HIV薬剤が、非ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤、プロテアーゼ阻害剤、進入または融合阻害剤、およびインテグラーゼ阻害剤からなる群から選択される薬剤である、項目69に記載のキット。
(項目72)
対象においてHIV感染またはAIDSの診断、予後、または処置をモニターするためのキットであって、項目1〜47のいずれかに記載の少なくとも1つの単離された抗HIV抗体、および前記抗HIV抗体に特異的に結合する1つまたは複数の検出試薬を含むキット。
(項目73)
PCRを実施するための試薬をさらに含む、項目72に記載のキット。
(項目74)
質量分析を実施するための試薬をさらに含む、項目72に記載のキット。
(項目75)
項目1〜47のいずれかに記載の抗体を含む融合タンパク質またはコンジュゲート。
(項目76)
任意選択でキメラ抗原受容体(CAR)である、キメラ受容体であるまたはそれを含む、項目75に記載の融合タンパク質またはコンジュゲート。
(項目77)
項目1〜47のいずれかに記載の抗体を含むキメラ抗原受容体(CAR)。
(項目78)
前記CARがITAMモチーフを含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、項目77に記載のキメラ抗原受容体。
(項目79)
前記CARが、CD3ζ由来の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、項目77〜78のいずれか一項に記載のキメラ抗原受容体。
(項目80)
前記CARが、CD28、CD137、ICOS、およびOX40からなる群から選択される共刺激分子由来の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、項目77〜79のいずれか一項に記載のキメラ抗原受容体。
対形成感度およびアッセイの精度のさらなる検証として、いくつかの稀な(10,000に1細胞未満)天然のVHVL対形成が既知および公知である場合に、試料を処理した。記憶B細胞がHIV中和活性を提示する抗体について近年深く探られた、HIVエリートコントローラ患者からの末梢B細胞を得た。350,000個のB細胞を処理して、合計38,620個のフィルター処理されたVHVL対を生成した。興味深いことに、この
個体は、以前の健康な試料(図7A)または一般的な健康な末梢B細胞レパートリーより大きな割合のIgGを示した。このデータセットからのVH配列を、PGT121を含むこの個体からの全ての報告された広域中和抗体(bNAb)と比較し、8つの近いまたは同一のVH配列を見出し、bNAbのこのファミリーが循環B細胞の0.03%未満に相当することを示した。決定的なことに、これらの重鎖と対になった全ての軽鎖は、予想されたような同様に稀なbNAb系統であり、以前に報告されたのと同じIgλ−V3−21/J3再配列および特質三重コドン挿入を提示したが、これは、本発明者らの方法の高い精度および感度を裏付ける。さらに、この個体からの全ての公知のおよび新たに生成されたPGT121様VHVL対の系統樹の上で(図7B)、VHおよびVLツリーは、著しく類似したトポロジーを示し、対のVHおよびVL配列は鏡のような位置を占有するが、これはおそらく共有された系統学的歴史を反映する。ここで発見された変異体対は、この規則によくあてはまる。興味深いことに、2つの公開された抗体PGT122およびPGT123は、例外として出現する;これらの2つの対形成のための裏付けは見出されなかったが、代わりにPGT122VH:PGT123VL様およびPGT123VH:PGT122VL様の対が見出され、元の報告書の未検証の対形成が解決された。8つの新規PGT様VHVL対の完全なV(D)J領域をコードするDNAを合成し、完全なIgGとして抗体を発現し、HIVの複数の偽株を中和するそれらの能力を試験した(図7C)。抗体はよく発現し、ウイルスに対して強力な中和活性を全てが示し、関連する生体試料から天然の形で対になった機能的抗体変異体を迅速に生成することにおける本発明者らのアプローチの有用性を実証した。
(実施例27)
ヒト試料
個体は、以前の健康な試料(図7A)または一般的な健康な末梢B細胞レパートリーより大きな割合のIgGを示した。このデータセットからのVH配列を、PGT121を含むこの個体からの全ての報告された広域中和抗体(bNAb)と比較し、8つの近いまたは同一のVH配列を見出し、bNAbのこのファミリーが循環B細胞の0.03%未満に相当することを示した。決定的なことに、これらの重鎖と対になった全ての軽鎖は、予想されたような同様に稀なbNAb系統であり、以前に報告されたのと同じIgλ−V3−21/J3再配列および特質三重コドン挿入を提示したが、これは、本発明者らの方法の高い精度および感度を裏付ける。さらに、この個体からの全ての公知のおよび新たに生成されたPGT121様VHVL対の系統樹の上で(図7B)、VHおよびVLツリーは、著しく類似したトポロジーを示し、対のVHおよびVL配列は鏡のような位置を占有するが、これはおそらく共有された系統学的歴史を反映する。ここで発見された変異体対は、この規則によくあてはまる。興味深いことに、2つの公開された抗体PGT122およびPGT123は、例外として出現する;これらの2つの対形成のための裏付けは見出されなかったが、代わりにPGT122VH:PGT123VL様およびPGT123VH:PGT122VL様の対が見出され、元の報告書の未検証の対形成が解決された。8つの新規PGT様VHVL対の完全なV(D)J領域をコードするDNAを合成し、完全なIgGとして抗体を発現し、HIVの複数の偽株を中和するそれらの能力を試験した(図7C)。抗体はよく発現し、ウイルスに対して強力な中和活性を全てが示し、関連する生体試料から天然の形で対になった機能的抗体変異体を迅速に生成することにおける本発明者らのアプローチの有用性を実証した。
(実施例27)
ヒト試料
Claims (28)
- 1nMまたはそれ未満の親和性でHIVのN−グリカンエピトープに結合するまたは結合することができる抗HIV抗体または抗体断片。
- HIVを中和するまたは中和することができる、請求項1に記載の抗体または抗体断片。
- HIVの2つまたはそれより多くの株またはサブタイプの感染力を阻害する、請求項1または請求項2に記載の抗体または抗体断片。
- HIVがHIV−1であり、任意選択でグループM HIV−1である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
- 完全長IgGクラス抗体または一本鎖可変断片(scFv)である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
- 糖鎖操作されてFc領域でのオリゴ糖が改変されており、糖鎖操作されていない抗体と比べた場合、増加したADCCエフェクター機能を有する、請求項1〜5のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
- モノクローナル抗体である、請求項1〜6のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
- ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
- (a)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR−H3、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR−L1、配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR−L2、および配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
(b)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR−H3、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1、配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2、および配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
(c)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR−H3、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR−L1、配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR−L2、および配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
(d)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR−H3、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR−L1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR−L2、および配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
(e)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR−H3、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR−L1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR−L2、および配列番号58アミノ酸配列を含むCDR−L3;
(f)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR−H3、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR−L1、配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR−L2、および配列番号28アミノ酸配列を含むCDR−L3;
(g)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR−H3、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR−L1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR−L2、および配列番号68アミノ酸配列を含むCDR−L3;
(h)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR−H3、および配列番号10のアミノ酸配列を有するV L 配列;または
(i)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H1、配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR−H2、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H3、および配列番号12のアミノ酸配列を有するV L 配列
を含む、請求項1〜8のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。 - (a)配列番号1のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するVH配列および配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するVL配列;
(b)配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列および配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;
(c)配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列および配列番号6のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;
(d)配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列および配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV L 配列;
(e)配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列および配列番号10のアミノ酸配列を有するV L 配列;
(f)配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列および配列番号12のアミノ酸配列を有するV L 配列;
(g)配列番号13のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列および配列番号14のアミノ酸配列を有するV L 配列;
(h)配列番号15のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;および任意選択で、配列番号2、4、6、8、10、12、14および65からなる群から選択されるV L 配列;または
(i)配列番号16のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するV H 配列;および任意選択で、配列番号2、4、6、8、10、12、14および65からなる群から選択されるV L 配列;
を含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。 - (a)表4のCDR−H1、表4のCDR−H2、表4のCDR−H3、もしくはその任意の組合せ;
(b)表5のCDR−L1、表5のCDR−L2、表5のCDR−L3、もしくはその任意の組合せ;
(c)表4のVH配列、表5のVL配列、もしくは両方;または
(d)(a)、(b)、もしくは(c)の任意の組合せ
を含まない、請求項1〜10のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。 - 請求項1〜11のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片をコードする単離された核酸。
- 請求項12に記載の核酸を含むベクター。
- 請求項13に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項1〜11のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片および治療剤を含む免疫コンジュゲートであって、任意選択で、前記治療剤が抗ウイルス剤である、免疫コンジュゲート。
- 請求項1〜11のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片および薬学的に許容される担体を含む医薬製剤。
- HIVを中和する、2つまたはそれより多くのHIVの株またはサブタイプの感染力を阻害する、HIV感染を処置する、またはAIDSを処置するための医薬の製造における請求項1〜11のいずれかに記載の抗体もしくは抗体断片、または請求項15に記載の免疫コンジュゲートの使用であって、任意選択で、HIVが、HIV−1、好ましくはグループM HIV−1である、使用。
- 前記医薬が、治療剤をさらに含み、任意選択で、前記治療剤が抗ウイルス剤である、請求項17に記載の使用。
- 医薬として使用するための、請求項1〜11のいずれかに記載の抗体または抗体断片、または請求項15に記載の免疫コンジュゲートを含む組成物。
- HIVを中和する、2つまたはそれより多くのHIVの株またはサブタイプの感染力を阻害する、HIV感染を処置する、またはAIDSを処置するための組成物であって、前記組成物が、請求項1〜11のいずれかに記載の抗体もしくは抗体断片、または請求項15に記載の免疫コンジュゲートの有効量を含み、任意選択で、前記HIVが、HIV−1、好ましくはグループM HIV−1である、組成物。
- 前記組成物が、治療剤と組み合わせて投与されることを特徴とし、任意選択で、前記治療剤が抗ウイルス剤である、請求項20に記載の組成物。
- (a)抗体または抗体断片と試料中に存在するHIVの間の複合体の形成に許容的である条件下で、前記試料を請求項1〜11のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片と接触させるステップと、
(b)免疫検出法により前記複合体の有無を検出するステップと
を含むHIV免疫組織化学的アッセイであって、任意選択で、前記試料が、血液試料または組織試料である、アッセイ。 - 抗HIV抗体または抗体断片を作製するための方法であって、
(a)前記ベクターにコードされるポリペプチドの発現および抗体またはその断片の組立てを可能にする条件下で、培地中において請求項14に記載の宿主細胞を培養するステップと、
(b)前記培養された宿主細胞または前記宿主細胞の前記培地から前記抗体または抗体断片を精製するステップと
を含む方法。 - 請求項1〜11のいずれかに記載の少なくとも1つの単離された抗HIV抗体または抗体断片の薬学的有効量の薬学的に許容される投与単位を含むキットであって、前記キットは、任意選択で、非ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤、プロテアーゼ阻害剤、進入または融合阻害剤、およびインテグラーゼ阻害剤からなる群から選択される抗HIV薬剤の薬学的有効量の薬学的に許容される投与単位をさらに含む、キット。
- 対象においてHIV感染またはAIDSの診断、予後、または処置をモニターするためのキットであって、前記キットが、請求項1〜11のいずれかに記載の少なくとも1つの単離された抗HIV抗体または抗体断片、および前記抗HIV抗体または抗体断片に特異的に結合する1つまたは複数の検出試薬を含み、任意選択で、PCRまたは質量分析を実施するための試薬をさらに含む、キット。
- 請求項1〜11のいずれかに記載の抗体または抗体断片を含む融合タンパク質またはコンジュゲート。
- 任意選択でキメラ抗原受容体(CAR)である、キメラ受容体であるまたはそれを含む、請求項26に記載の融合タンパク質またはコンジュゲート。
- キメラ抗原受容体(CAR)を含む、請求項26に記載の融合タンパク質またはコンジュゲートであって、前記CARが(a)ITAMモチーフを含む細胞内シグナル伝達ドメイン、(b)CD3ζ由来の細胞内シグナル伝達ドメイン、および/または(c)CD28、CD137、ICOS、およびOX40からなる群から選択される共刺激分子由来の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項26に記載の融合タンパク質またはコンジュゲート。
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